CN1977043A - 天然IgM抗体及其抑制剂 - Google Patents
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Abstract
本发明提供天然IgM抗体的抑制剂,可用于治疗各种炎性疾病或病症。
Description
1、政府资助 本发明得到国家卫生研究院资金No.GM52585、GM24891和GM07560的政府资助。政府具有本发明的一定权利。
2、相关申请的相互参照 本申请要求美国临时申请No.60/588648(申请时间为2004年7月16日)及美国临时申请No.60/549123(申请时间为2004年3月1日)的权益;每个临时申请均通过引用明确的结合至文中。
3、发明背景
有核细胞对低氧高度敏感,即使是多细胞组织内短时间的局部缺血也能显著影响细胞形态、基因转录及酶促过程。线粒体,作为氧代谢的主要部位,对氧浓度的变化尤其敏感,并且在缺氧期间释放活性氧中间体,对胞内组分如脂质和蛋白进行化学修饰。临床上这些效应表现为病人体内炎症应答。尽管对低氧的细胞应答进行了深入研究,但关于急性炎症的起始所知甚少。
急性炎症应答可因多种疾病和自然出现事件如中风和心肌梗塞等引起。普通的医疗操作也可能导致局部和全身炎症。留下未处理的炎症可导致显著的组织损伤,还可能最终导致多系统衰竭并死亡。在损伤后干涉炎症应答可能是减少组织损伤的一种方法。
炎性疾病及因组织损伤引起的急性炎症应答,却不能仅由细胞活动来解释。种种证据表明血清先天应答或补体系统在炎症中起主要作用。迄今的研究已经注意到因局部缺血以及再灌注而引起的组织损伤作为一类炎性病症是依赖补体的。例如,在再灌注损伤的鼠心肌模型中,用补体I型受体的可溶形式预处理的鼠,其损伤显著降低。了解补体激活如何促成炎症应答是有效的研究领域。
炎性疾病或病症可能威胁生命、昂贵且每年影响许多人。因此,炎性疾病或病症的有效治疗是必需的。
4、发明简述
一方面,本发明的特征是分离的天然免疫球蛋白(IgM)。在一个实施方案中,抗体由ATCC检索号PTA-3507所产生。在另一个实施方案中,抗体的轻链可变区包含如SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。还有一个实施方案中,抗体的重链可变区含有如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列。
另一方面,本发明的特征是IgM抑制剂及其药物制剂。在一个实施方案中,IgM抑制剂为特异结合天然IgM的肽,并因此阻碍其与抗原的结合及/或补体激活。在一个实施方案中,肽包括以下共有序列:xNNNxNNxNNNN(SEQ ID NO:14)。提供了特定的抑制肽为SEQ ID NO:16、18、20、22、24、26、28、30、34、36和38。可对抑制肽进行修饰,以提高如体内半衰期或生物利用度。也可对抑制肽进行标记以便于检测。
还一方面,本发明鉴定的核酸编码特异结合天然IgM抗体的肽,以及表达该肽的载体和宿主细胞。提供了特定的核酸,为SEQ ID NO:13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35和37。
再一方面,本发明的特征是受试者的炎性疾病的治疗方法为通过给予受试者含有这里公开的IgM抑制剂的药物组合物。
还有一个方面,本发明的特征为检测、诊断或监测受试者的炎性疾病的方法是用标记的抑制抗体。
基于以下发明详述和权利要求,本发明的其他特征和优点将会显现出来。
5、附图简述
图1显示了B-1杂交瘤22A5的IgM重链序列。(A)显示IgMCM-22(或22A5 IgM)重链核酸序列(SEQ ID NO:1),(B)显示重链序列SEQ ID NO:1(SEQ ID NO:2)相应的氨基酸序列。框架区和互补决定区(CDR)在核苷酸上标明。
图2显示了B-1杂交瘤22A5的IgM轻链序列。(A)显示IgMCM-22(或22A5 IgM)轻链核酸序列(SEQ ID NO:7),(B)显示轻链序列SEQ ID NO:7(SEQ ID NO:8)相应的氨基酸序列。框架区和互补决定区(CDR)在核苷酸上标明。
图3的条线图描述了近交系小鼠在肠内局部缺血和再灌注损伤后或无损伤(阴性)肠道通透性的改变。WT(野生型)代表亲系Cr2-/-小鼠。用混合的IgG或IgM或者对照盐溶液重新构建Cr2-/-。混合的IgM或IgG(0.5mg)在处理前约一小时静脉给予。数值为均值+标准差;n等于实验组中小鼠的数量。
图4证明在抗体不足的小鼠(RAG-1)中,通过混合来自单个B-1细胞杂交瘤无性系的IgM进行I/R损伤的重建。在剖腹手术开始前静脉注射IgM或盐溶液30分钟。再灌注结束时,取血液并计算干燥肠与血液的125I数量的比率作为通透性指数。数值表示为均值±标准差;n等于实验组所用小鼠数量。1=WT加生理盐水;2=RAG加生理盐水;3=RAG加IgM杂交瘤CM-22;4=WT阴性对照。
图5是补体和补体受体在正向选择腹膜B-1淋巴细胞时计划作用的示意图。
图6A是显示IgMCM-22特异肽的M13噬菌体展示库的ELISA筛选图。标记:□-P1克隆;×-P2克隆;○-P7克隆;◇-P8克隆。在加入不同浓度的噬菌体克隆前平板上覆盖一层IgMCM-22的溶液。所示结果为至少三次独立实验的代表性结果。
图6B的条线图显示了合成肽P8抑制IgMCM-22与噬菌体克隆P8的结合。加不同浓度的合成肽P8到IgMCM-22覆盖的平板进行ELISA后,再加入5×1011PFU的噬菌体。所示结果为至少三次独立实验的代表性结果。
图6C的条线图显示了P8肽与IgMCM-22的特异性结合。ELISA平板包被了50μg/ml的P8肽溶液,随后加入IgMCM-22或IgMCM-75至1或10μg/ml。用生物素化的大鼠抗小鼠IgM,通过抗生物素蛋白链菌素-磷酸酶和颜色反应检测IgM的结合。所示结果为至少三次独立实验的代表性结果。
图7A为一系列显微照片,显示P8肽阻断IgMCM-22介导的体内损伤。上面两格(i和ii)所示为在分别单独使用IgM或IgM与P8肽混合物对RAG-1-/-小鼠RI处理后而制备的切片(苏木精和伊红染色)。下面两格(iii和iv)所示切片制备于处理为肠再灌注损伤的野生型小鼠,再灌注前5分钟,给予小鼠盐溶液或P8肽。箭头指示损伤的病理特征。放大倍数为200×。
图7B的散布图指示每组处理动物的病理学评分均值。每个标记代表一个动物的评分。对照组为对照肽(ACGMPYVRIPTA;SEQ IDNO:61)预处理的WT小鼠,处理剂量与P8肽相似。*指示对P8处理组与未处理组通过Student t检验确定的统计学显著性(p<0.05)。
图7C是一系列显微图片,显示P8处理动物的微绒毛内缺乏IgM和补体C3或C4。肠组织代表性的冷冻切片(cryosection)在肠RI后被获得。i-viii格为未经P8预处理(i-iv格)或P8预处理(v-viii格)的IgMCM-22重建的RAG-1-/-小鼠。各组代表的冷冻切片来自未经P8预处理的WT肠(ix-xii)或经P8预处理的肠(xiii-xvi格)。切片(i,iii,v,vii,ix,xiii,xv)用抗IgM生物素及随后的抗生物素蛋白链菌素-阿糖胞苷-568(红色)(Streptavidin-Alexa-568)染色并用DAPI(紫色)复染。各格(ii,x,xiv)用抗C4-阿糖胞苷-488/FITC(绿色)染色,各格(iv,viii,xii,xvi)用抗C3-FITC(绿色)染色。放大倍数为400×。
图8A的免疫印迹显示再灌注损伤(RI)特异抗原的免疫沉淀。SDS-PAGE(10%)上检测到约250Kda的单带(箭头)。分子量标准示于左侧。肠裂解物制备自用IgMCM-22重建的RAG-1-/-小鼠,阴性对照(无局部缺血)或有局部缺血的小鼠随后都被再灌注0或15分钟。
图8B的一系列图片显示了IgMCM-22与非肌球蛋白重链II(NMHC-II)同种型(isoform)的体外结合分析结果。ELISA板用针对三种不同的NMHC-II同种型的单克隆抗体包被(左上:同种型A,右上:同种型B,左下:同种型C,右下:抗泛肌球蛋白抗体(anti-panmyosin antibody))。肠裂解物中结合的肌球蛋白重链由IgMCM-22或IgMCM-31检测。结果显示为OD405nm的均值+标准差并代表三份样品。
图8C是一副显微照片和一个散布图,显示在RAG-1-/-小鼠中由抗泛肌球蛋白修复RI损伤。RAG-1-/-小鼠用亲和纯化的抗泛肌球蛋白重建再施RI手术。左格显示用盐溶液对照和用抗泛肌球蛋白处理的RAG-1-/-形态。右格是肠损伤的病理学评分。散布图(右格)显示病理学评分,其中每个标记代表一个动物。
图9A的图显示自身肽N2的表面等离子体振子共振。自身肽N2样品的结合等温线,样品浓度从10.5μM至120μM,注射到IgMCM-22偶联的表面。
图9B的图显示了对照肽的表面等离子体振子共振。同样大小、序列随机的对照肽(AGCMPYVRIPTA:SEQ ID NO:62)的结合等温线,对照肽以117μM浓度注射到IgMCM-22偶联的表面。
图9C的图显示与1∶1兰米尔(langmuir)结合等温线拟合至图9A所示注射用稳态响应水平的非线性曲线(χ2=10)。
图9D的图显示了注射120μM自身肽N2到偶联有对照IgMCM-31的表面的结合等温线。
图10A是一系列显微图片,显示N2自身肽阻断RAG-1-/-小鼠中的RI。上面两格显示用IgMCM-22或与N2自身肽的混合物对RAG-1-/-小鼠RI处理后制备的代表性切片。下面两格的代表性切片是制备自处理为肠RI的WT小鼠,每只在再灌注前给予盐溶液或N2肽5分钟。
图10B的散布图显示每组处理动物的病理学评分的均值。每个标记代表一只小鼠。*指示基于Student t检验的统计学显著性。
图10C的一系列显微照片显示,通过自身肽N2防止了肠RI中补体经典途径的激活。肠组织的代表性的冷冻切片在肠RI后获得并用特异针对小鼠IgM、C4或C3的抗体处理(400×放大倍数)。IgMCM-22重建的RAG小鼠,i-iv格中是未经自身肽N2预处理,v-viii格中是经自身肽N2处理。野生型小鼠未经自身肽N2预处理的见ix-xii格,经自身肽N2预处理的见xiii-xvi格。i、iii、v、vii、ix、xiii、xi、xv格中的组织用抗IgM生物素染色后,用抗生物素蛋白链菌素-阿糖胞苷-568(红色)染色并用DAPI(紫色)复染。ii、vi、x和xiv格用抗C4-FITC(绿色)染色。格Iv、viii、xii、xvi用抗C3-FITC(绿色)染色。
图11显示的是小鼠非肌肉肌球蛋白重链II-A(mNMHC-IIA)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:47;Genbank检索号no:NM002410)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:48;Genebank检索号no:NP071855)。
图12显示的是人非肌肉肌球蛋白重链II-A(Hnmhc-IIA)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:49;Genbank检索号no:NM002473)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:50;Genebank检索号no:NP002464)。
图13显示的是小鼠非肌肉肌球蛋白重链II-B(mNMHC-IIB)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:51;Genebank检索号no:NM175260)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:52;Genebank检索号no:NM780469)。
图14显示的是人非肌肉肌球蛋白重链II-B(hNMHC-IIB)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:53;Genebank检索号no:NM005964)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:54;Genebank检索号no:NM005955)。
图15显示的是小鼠非肌肉肌球蛋白重链II-C(mNMHC-IIC)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:55;Genebank检索号no:AY363100)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:56;Genebank检索号no:AAQ24173)。(C)显示的核酸序列(SEQ ID NO:57;Genebank检索号no:NM028021)和(D)显示的氨基酸序列(SEQ ID NO:59;Genebank检索号no:NM024729)属于另一种非肌肉肌球蛋白重链II-C。
图16显示的是人非肌肉肌球蛋白重链II-C(hNMHC-IIC)的核酸序列(A)(SEQ ID NO:59;Genebank检索号no:NM024729)和氨基酸序列(B)(SEQ ID NO:60;Genebank检索号no:NM079005)。
6、发明详述
6.1、定义:
为方便起见,在详述、实施例和所附的权利要求书中使用的某些术语提供如下。除非另外定义,这里使用的所有技术和科学上的术语与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的具有同样意义。
这里用的“一”指的是一个或多于一个(即至少一个)的文章语法对象。举例说明,“一个要素”是指一个要素或多余一个要素。
这里使用的“氨基酸”是指天然或合成的氨基酸,包括甘氨酸和D或L型旋光异构体,以及氨基酸类似物和拟肽(peptidomimetics)。
这里用的“抗体”是指结合于分子包括免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的一段免疫活性部分,即含有一个抗原结合位点的分子。用于本发明的免疫球蛋白分子可是任一类(如IgG、IgE、IgM、IgD和IgA)或亚类。天然抗体和免疫球蛋白通常为异四聚体糖蛋白,约150,000道尔顿,由两个相同的轻链和两个相同的重链组成。每个重链在一端具有一个可变区,随后是许多恒定区。每个轻链在一端具有一个可变区,另一端为恒定区。抗体包括但不限于多克隆、单克隆、双特异性(bispecific)、嵌合、部分或完全人化的抗体、完全人的抗体(表达人免疫球蛋白基因的转基因鼠中所产生的抗体)、骆驼抗体和抗独特型抗体。一种抗体,或一般而言任一分子,如果该抗体优先结合抗原,并且例如与其他分子的交叉反应少于30%,优选20%、10%或1%,则其与该抗原(或其他分子)“特异性结合”。术语“抗体”和“免疫球蛋白”可互换使用。
这里用的“抗体片段”或“部分抗体”是指抗体的任何衍生物,小于全长。在示例性的实施方案中,抗体片段至少保留全长抗体特异结合能力的重要的一段。抗体片段的例子包括但不限于Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、Fv、dsFv双特异抗体、微抗体(minibody)、Fd片段和单链抗体。抗体片段可以通过任何方法产生。例如,抗体片段可通过酶促或化学方法分裂完整抗体而产生,可从编码部分抗体序列的基因重组产生,或可以全部或部分合成产生。抗体片段可以任选是单链抗体片段。或者,片段可包含连接在一起(例如通过二硫键)的多个链。片段也可以任选是多分子复合物。典型的功能性抗体片段包含至少约50个氨基酸,更典型的包含至少约200个氨基酸。
这里所用的“抗体结合位点”是指重链的可变区以及轻链的可变区。
这里用的“结合”或“结合的”是指可检测的分子间的关系或联系(如生化反应)。
“细胞”、“宿主细胞”或“重组宿主细胞”是可交换使用的术语。这些术语不仅是指特定实验细胞也指该细胞的子代或潜在子代。因为某种修饰由于突变或环境影响可能出现于连续的传代,事实上这种子代可能不会与亲代细胞完全相同,但是仍然包含于这里所用术语的范围内。
“包含”或“组成”用于综合的、广泛的含义,意思是可包括添加的元素。
这里用的“共有序列”是指一族相关序列中最常见的氨基酸(或核苷酸)组成的序列(参见Winnaker,从基因到克隆,1987)。在一族蛋白中,共有序列的每个位置都被该族在该位置出现频率最高的氨基酸占据。如果两个氨基酸出现的频率相等,每个都可能包含于共有序列中。“共有框架”是指免疫球蛋白共有序列的框架区。
“保守氨基酸取代”是指氨基酸残基被具有相似侧链的氨基酸残基所取代。具有相似侧链的氨基酸残基族已在本领域被确定。这些族包括具有碱性侧链的氨基酸(如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(如天冬氨酸、谷氨酸)、无电荷的极性侧链(如甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(如丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β分支侧链(如苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香族侧链(如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。因此,在天然免疫球蛋白中预测的非必需氨基酸残基可优选被另一来自相同侧链族的氨基酸残基取代。或者,在另一个实施方案中,突变可随着全部或部分天然免疫球蛋白编码序列被随机引入,例如通过饱和诱变,用生物活性筛选生成的突变体。
这里用的“可检测标记”是指能检测到的分子,包括但不限于放射性同位素标记、荧光团、化学发光部分、酶、酶底物、酶辅助因子、酶抑制剂、染料、金属离子、配体(如生物素或半抗原)等。“荧光团”指能在可检测范围内呈现荧光的物质或其部分。可能用于本发明标签的特定实例包括荧光素、若丹明、丹酰、伞形酮、德克萨斯红、鲁米诺、NADPH、β半乳糖苷酶和辣根过氧化物酶。
“抑制剂”或“IgM抑制剂”或“拮抗剂”用来指减少或阻碍(完全或部分)天然抗体和涉及炎症级联的其他分子的相互作用的物质。一种抑制剂可以拮抗一种或多种天然IgM的以下活性:(i)抑制或减少IgM和局部缺血特异性抗原之间的相互作用(如结合);(ii)抑制或减少天然IgM和补体途径中的一种成分如Clq的相互作用;(iii)通过如螯合免疫球蛋白和/或靶向其降解以中和天然IgM;或(iv)抑制或减少天然IgM的产生,如阻断IgM的合成、装配和/或翻译后修饰。抑制剂可以是蛋白或肽、抗体或其片段(如抗独特型抗体)、经修饰抗体、糖类、糖蛋白或有机小分子。
“相互作用”是指两个或多个分子间的物理联系,如结合。相互作用可以是直接的或者间接的。
这里所用的“炎性疾病”是指由一组复杂的功能性和细胞性调整引起或导致的疾病或病症,所述调整包括微循环内急性或慢性改变、液体的移动、和炎症细胞(如粒细胞)以及补体的流入和激活,并包括自身免疫性疾病。每种疾病和病症的实例包括但不限于:再灌注损伤、局部缺血损伤、中风、自身免疫性溶血性贫血、特发性血小板减少性紫癜、类风湿性关节炎、乳糜泻、高IgM免疫缺陷症、动脉硬化、冠心病、败血病、心肌炎、脑炎、移植排斥、肝炎、甲状腺炎(例如淋巴瘤性甲状腺肿、毒性弥漫性甲状腺肿)、骨质疏松症、多肌炎、皮肌炎。I型糖尿病、痛风、皮炎、斑秃、全身性红斑狼疮、藓硬化症、溃疡性结肠炎、糖尿病性视网膜病、盆腔炎、牙周病、关节炎、青少年慢性关节炎(如慢性虹膜睫状体炎)、银屑病、骨质疏松症、糖尿病的肾病、哮喘、盆腔炎、慢性肝炎、慢性肺炎、肺纤维化、肝纤维化、类风湿性关节炎、慢性肝炎、慢性肺炎、肺纤维化、肝纤维化,克罗恩病、溃疡性结肠炎、烧伤,以及中枢神经系统(CNS:如多发性硬化症)、胃肠系统、皮肤和相关结构、免疫系统、肝胆管系统或可与炎症成分一起出现的病变的身体的任何位置的其他急性和慢性炎症性疾病。
“分离”分子,如分离的IgM,是指被分离的状态或从自然环境中存在的其他分子纯化而来。
“天然IgM”用来指在哺乳动物中(如人)天然产生的IgM抗体。抗体具有五聚环结构,其中个别单体类似IgG因此具有两个轻链(κ或λ)和两个重链(μ)。另外,重链含有附加的CH4区域。单体通过邻近重链的二硫键形成五聚体。五聚环通过J链和两个重链之间的二硫键闭合。因为抗原结合位点的数目大,天然IgM抗体是有效的抗原凝集物。在受试者体内产生的天然IgM抗体对B细胞、巨噬细胞和补体系统的最初激活是至关重要的。在抗体应答中IgM是第一个合成的免疫球蛋白。
“核酸”用来指多核苷酸例如脱氧核糖核酸(DNA)及适当位置的核糖核酸(RNA)。该术语也应被理解为包括由核苷酸类似物得来的RNA或DNA类似物形式的等价物,和适用于所描述的实施方案形式的单(有义或反义)和双链多核苷酸。
“操作性连接”用来指一种并列关系,其中描述的成分所处的联系使其以预期方式发挥功能。例如,当RNA聚合酶将两个编码序列转录为单个mRNA,其随后被翻译为含有得自两个编码序列的氨基酸的单个多肽时,则一种编码序列“操作性连接”于另一种编码序列。编码序列不必一个紧接另一个,只要表达的序列最终加工产生目的蛋白。一种表达控制序列操作性连接于一种编码序列,从而使编码序列在与表达控制序列相容的条件下完成表达。这里所用的术语“表达控制序列”是指调节与其操作性连接的核酸序列表达的核酸序列。当表达控制序列控制并调节核酸序列的转录和恰当的翻译时,表达控制序列被操作性连接于核酸序列。因此,表达控制序列可包括合适的启动子、增强子、转录终止子、位于蛋白编码基因前的起始密码子(即ATG)、内含子的剪接信号,维持该基因的正确读码框使mRNA正确翻译和终止密码子。术语“控制序列”最低限度要包含其存在可影响表达的成分,还可包含其存在是有利的额外的成分,例如引导序列和融合伴侣序列(fusion partner sequence)。表达控制序列可包括一个启动子。
“患者”、“受试者”或“宿主”用来指人或非人的哺乳动物。
“肽”用来指长度相对短的氨基酸聚合物(如少于50个氨基酸)。聚合物可以是线性或分支的,可由经修饰的氨基酸组成,并可插入非氨基酸。该术语也包括被修饰过的氨基酸聚合物;所述修饰例如二硫键形成、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或其他处理,例如与标记成分偶联。
“启动子”用来指足以引导转录的最小序列。也包括本发明中那些启动子元件,其足以使依赖启动子的基因表达,表达可控制于特异的细胞型、特异的组织,或者可通过外部信号或物质诱导;这种元件可位于多核苷酸序列的5’或3’区域。组成型和诱导型的启动子都被包括于本发明中(参见Bitter等,酶学方法153:516-544,1987)。例如,当在细菌系统中纯培养时,可使用诱导型启动子例如噬菌体的pL、plac、ptrp、ptac(ptrp-lac杂合启动子)等。当在哺乳动物细胞系统中纯培养时,可使用的启动子得自哺乳动物细胞的基因组(如金属硫蛋白启动子)或得自哺乳动物病毒(如逆转录病毒长末端重复、腺病毒后期启动子、痘苗病毒7.5K启动子)。重组DNA或合成技术产生的启动子也可用于提供本发明的核酸序列的转录。可使用组织特异性调控元件。包括,例如在不同组织中差异表达的基因或病毒的调控元件。
“特异性结合”用来指两个分子间的相互作用,以形成在生理学条件下相对稳定的复合物。这里使用的术语与不同分子有关,包括例如抗体和抗原(如肽)的相互作用。特异性结合可通过解离常数来表征,至少约1×10-6M,一般至少约1×10-7M,通常至少约1×10-8M,尤其至少约1×10-9M或1×10-10M或更高。确定两个分子是否特异性结合的方法是众所周知的,包括如平衡透析法、表面等离子体振子共振等。
“严格杂交”或“在低严紧度、中度严紧度、高严紧度或极高严紧度条件下杂交”用来描述杂交和洗涤的条件。可在分子生物学通用实验方案(Current Protoclos in Molecular Biology,John Wiley &Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6:3.6)中找到进行杂交反应的规程,并通过引用结合到本文。参考文献中描述了水和非水方法并可使用任一个。这里的特异性杂交条件所指如下:1)低严紧杂交条件是在约45℃6×氯化钠/柠檬酸钠(SSC),随后在0.2×SSC、0.1%SDS至少50℃下洗两遍(对低严紧条件,洗涤温度可以升高到55℃);2)中度严紧杂交条件是在约45℃ 6×SSC,随后在0.2×SSC、0.1%SDS 60℃下洗一遍或更多遍;3)高度严紧杂交条件是在约45℃ 6×SSC,随后在0.2×SSC、0.1%SDS 65℃下洗一遍或更多遍;优选4)极高度严紧杂交条件为65℃ 0.5M磷酸钠、7%SDS,随后在0.2×SSC、0.1%SDS 65℃下洗一遍或更多遍。极高度严紧杂交条件(4)是首选条件并且是应该使用的条件,除非另外说明。序列间的同源性或序列一致性(这里所用术语可交换)的计算如下进行。
为确定两个氨基酸序列或核酸序列的一致性百分数,以最佳比对目的对序列进行比对(如为了最适比对,可在第一和第二个氨基酸或核酸的序列中引入缺口,或均引入缺口)。在优选的实施方案中,为对比目的而对齐的参考序列的长度至少为30%,优选至少为40%,更优选至少为50%、60%,并且最优选至少为参考序列长度的70%、80%、90%、100%。相应氨基酸位置或核苷酸位置的氨基酸残基或核苷酸随后被比较。当第一个序列的一个位置被与第二个序列相应位置同样的氨基酸残基或核苷酸占据时,则分子在该位置是相同的。
考虑到缺口的数量、每个缺口的长度(为使两个序列进行最佳比对而必需引入的缺口),两个序列间的一致性百分数是各序列共有的同样位置的数量函数,两个序列间的同源性百分数是各序列共有的保守位置的数量函数。序列的比对和两个序列间一致性和/或同源性百分数的确定可用数学算法来完成。在优选的实施方案中,两个氨基酸序列间的一致性百分数用Needleman和Wunsch算法((1970)J.Mol.Biol.48:444-453)确定,该算法已经被整合到GCG软件包的GAP程序中(可从www.gcg.com上获得),使用Blossum 62或PAM250矩阵及16、14、12、10、8、6或4的缺口权重和1、2、3、4、5或6的长度权重。在另一个优选的实施方案中,用GCG软件包中的GAP程序(可从www.gcg.com上获得)确定两个核苷酸序列的一致性百分数,使用NWSgapdna CMP矩阵及40、50、60、70或80的缺口权重和1、2、3、4、5或6的长度权重。尤其优选的一组参数(应该使用的参数除非另外说明)是Blossum 62评分矩阵,具有缺口罚分12、缺口扩展罚分4和移码缺口罚分5。
两个氨基酸或核苷酸序列间的一致性和/或同源性百分数可用E.Meyers和W.Miller算法((1989)CABIOS,4:11-17)进行确定,该算法已经被整合到ALIGN程序中(2.0版),使用PAM120权重剩余表、缺口长度罚分12和缺口罚分4。
“治疗”用来指任何治疗或预防或抑制受试者的病症或疾病并且包括例如:(a)预防可被诱发为但还未被诊断为具有疾病或病症的受试者出现疾病或病症;(b)抑制疾病或病症,即终止其进展;或(c)减缓或改善疾病或病症即引起缓解。因此,这里用的治疗包括例如在损伤部位修复或再生被损坏或损伤的组织或细胞,或阻止损害如手术前的预防疗法。
“载体”用来指一种核酸分子,能运送其他的已被操作性连接于该分子上的核酸,可包括质粒、粘粒或病毒载体。一类优选的载体是游离基因,即能在染色体外复制的核酸。优选载体是能自主复制和/或表达其连接的核酸的载体。载体可引导操作性连接于其上基因的表达。载体也可整合到宿主DNA。在本说明书中,由于质粒(双链DNA的环形排列)是最常使用的载体形式,“质粒”或“载体”可交换使用。但是本发明预期包括这种其他形式的载体,其具有等同的功能,以及此后在本领域已知的载体。病毒载体包括如复制缺陷逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒。
6.2、天然IgM抗体
本发明至少部分基于天然免疫球蛋白(Ig)的鉴定,尤其是天然IgM。可从保藏于美国标准培养收藏所的杂交瘤中(检索号为PTA-3507)获得特定的IgM。
由杂交瘤PTA-3507产生的IgM重链可变区核苷酸序列,IgMCM-22(也指22A5IgM)示于图1A(SEQ ID NO:1),氨基酸序列示于图1B(SEQ ID NO:2)。重链可变区的CDR1区域与SEQ ID NO:2的31至35位氨基酸(SEQ ID NO:4)相应,由SEQ ID NO:1的91-105位核苷酸(SEQ ID NO:3)编码,重链可变区的CDR2区域与SEQ ID NO:2的50至66位氨基酸(SEQ ID NO:6)相应,由SEQ ID NO:1的148-198位核苷酸编码(SEQ ID NO:3)。
IgMCM-22的轻链可变区的核苷酸序列示于图2A(SEQ IDNO:7),氨基酸序列示于图2B(SEQ ID NO:8)。轻链可变区的CDR1区域与SEQ ID NO:8的23至37位氨基酸(SEQ ID NO:10)相应,由SEQ ID NO:7的67-111位核苷酸(SEQ ID NO:9)编码,轻链可变区的CDR2区域与SEQ ID NO:8的53至59位氨基酸(SEQ ID NO:12)相应,由SEQ ID NO:7的157-177位核苷酸编码(SEQ ID NO:11)。由于遗传密码的简并性,其他核酸序列可编码这里列出的氨基酸序列。
来自任一cDNA、基因组或混合物的本发明的核酸组合物虽然常常为天然序列形式(除了修饰的限制性酶切位点等),但可依照标准技术被突变。对于编码序列,这些突变可按需要影响氨基酸序列。尤其是,与天然V、D、J、恒定区、铰链区(switch)和其他这里描述的序列实质上相同的核苷酸序列都被考虑到。
例如,分离的核酸可包含IgMCM-22(或22A5 IgM)重链可变区核苷酸序列,其具有的核苷酸序列示于图1A(SEQ ID NO:1),或包含与SEQ ID NO:1有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的序列。核酸分子可包含SEQ ID NO:3的重链CDR1核苷酸序列,或其部分。另外,核酸分子可包含SEQ ID NO:5的重链CDR2核苷酸序列,或其部分。在示例性的实施方案中,核酸分子包含SEQID NO:3的重链CDR1核苷酸序列或其部分,以及SEQ ID NO:5的重链CDR2核苷酸序列或其部分。本发明的核酸分子可包含如SEQ IDNO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5的重链序列或其组合物,或包含具有与SEQ ID NO:1、3、5至少80%、90%、95%、96%、97%、98%和99%序列一致性的核苷酸。此外,本发明的核酸分子可包含重链序列,该序列与SEQ ID NO:1、3或5在严紧条件下如低度、中度、高度或极高度严紧条件下杂交。
在另一个实施方案中,本发明特征性的核苷酸序列与编码多肽重链的核酸分子(如SEQ ID NO:2、4或6的多肽重链)具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%和99%的序列一致性。本发明特征性的核酸分子还与编码天然抗体重链可变区或其部分的核苷酸序列杂交,如SEQ ID NO:2、4或6的重链可变区。
再一个实施方案中,分离的核酸编码IgMCM-22(22A5)轻链可变区,其具有图2A(SEQ ID NO:7)所示的核苷酸序列,或与SEQ IDNO:7有至少约80%、90%、95%、96%、97%、98%、99%一致性的序列。核酸分子可包含SEQ ID NO:9的轻链CDR1核苷酸序列,或其部分。在另一个优选的实施方案中,核酸分子可包含SEQ IDNO:11的轻链CDR2核苷酸序列,或其部分。在一个示例性的实施方案中,核酸分子包含SEQ ID NO:9的轻链CDR1核苷酸序列或其部分,和SEQ ID NO:11的轻链CDR2核苷酸序列或其部分。本发明的核酸分子可包含如SEQ ID NO:7、9或11的轻链序列或其组合物,或包含与SEQ ID NO:7、9或11具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%和99%序列一致性的核苷酸。更多的核酸分子可包含在严紧条件下,如低度、中度、高度或极高度严紧条件下与SEQ IDNO:7、9或11杂交的轻链序列。
核酸分子可含有与编码多肽轻链(如SEQ ID NO:8、10或12的多肽轻链)的核酸分子至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列一致性。本发明特征性的核酸分子还与编码天然抗体轻链可变区(如SEQ ID NO:8、10或12的轻链可变区)或其部分的核苷酸序列杂交。
在另一实施方案中,本发明提供一种分离的核酸,编码包含SEQID NO:4氨基酸序列的重链CDR1区域或其部分,或其经修饰形式。该核酸仅可编码CDR1区,或编码完整的抗体重链可变区域或其片段。例如,核酸可编码的重链可变区具有含SEQ ID NO:6氨基酸序列的CDR2区域。再一个实施方案中,本发明提供分离的核酸,编码具有SEQ ID NO:6氨基酸序列或其片段或其经修饰形式组成的重链CDR2区域。该核酸仅可编码CDR2区域或编码完整的抗体重链可变区或其片段。例如,核酸可编码的轻链可变区具有含SEQ IDNO:4氨基酸序列的CDR1区域。
在又一个实施方案中,本发明提供分离的核酸,编码具有SEQ IDNO:10氨基酸序列或其片段或其经修饰形式的轻链CDR1区域。该核酸仅可编码CDR1区或编码完整的抗体轻链可变区。例如,核酸可编码的轻链可变区具有含SEQ ID NO:12氨基酸序列CDR2区域。分离的核酸也可编码含SEQ ID NO:12氨基酸序列或其片段或其修饰形式的轻链CDR2区。该核酸仅可编码CDR2区域或可编码完整的抗体轻链可变区。例如,核酸可编码的轻链可变区具有含SEQ IDNO:10氨基酸序列的CDR1区域。
编码重链或轻链可变区的核酸可以是鼠源或人源,或者可以包含鼠和人氨基酸序列的组合物。例如,核酸序列可编码的重链可变区具有SEQ ID NO:2的CDR1(SEQ ID NO:4)和/或SEQ ID NO:2的CDR2(SEQ ID NO:6),以及人的框架序列。此外,核酸可编码的轻链可变区具有SEQ ID NO:8的CDR1(SEQ ID NO:10)和/或SEQID NO:8的CDR2(SEQ ID NO:12),以及人的框架序列。本发明进一步包含的载体具有以上描述的核酸和含有表达载体的宿主细胞。
本发明的特征还有IgMCM-22重链可变区和/或轻链可变区的多肽及片段。在示例性的实施方案中,分离的多肽包含如SEQ ID NO:8、10或12的氨基酸序列或其片段或其组合物;或者SEQ ID NO:2、4或6的氨基酸序列或其片段或其组合物。本发明的多肽包括与SEQ IDNO:8、10、12、2、4或6有至少但不多于20、10、5、4、3、2或1个氨基酸的不同。示例性的多肽是保留生物活性的多肽,如能结合局部缺血特异性抗原和/或能结合补体。在另一个实施方案中,多肽包含与轻链可变区或其部分有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%和99%的序列一致性的多肽,如SEQ ID NO:8、10或12的多肽轻链可变区。在又一个实施方案中,多肽包含与重链可变区或其部分有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%和99%的序列一致性的多肽,如SEQ ID NO:2、4或6的多肽轻链可变区。再一个实施方案中,本发明特征性的多肽包含SEQ ID NO:8和SEQ IDNO:2的氨基酸序列,进一步包含IRES序列。
6.3、天然IgM抗体的抑制剂
6.3.1天然IgM抗体的肽抑制剂
本发明另外的特征是IgM抑制剂。在一个实施方案中,IgM抑制剂为特异性结合于天然IgM并因此而阻碍IgM与抗原结合的肽。这种肽可包括但不限于,下表1所述的天冬酰胺-富集肽。
表1天然IgM抗体结合肽的氨基酸序列
序列编号 | 序列 | 名称 |
14 | xNNNXNNXNNNN | 天冬酰胺-富集共有序列 |
16 | YNNNNGNYTYRN | P1 |
18 | ANTRNGATNNNM | P2 |
20 | CDSSCDSVGNCN | P3 |
22 | WNNNGRNACNAN | P4 |
24 | HNSTSNGCNDNV | P5 |
26 | NSNSRYNSNSNN | P6 |
28 | KRNNHNNHNRSN | P7 |
30 | NGNNVNGNRNNN | P8 |
32 | NVANHNNSNHGN | P9 |
34 | SYNNNNHVSNRN | P10 |
该肽也可包括下表2所述的特定的“自身肽”。
表2自身肽的氨基酸序列
序列编号 | 序列 | 名称 |
36 | LMKNMDPLNDNI | 自体-1 |
38 | LMKNMDPLNDNV | 自体-2(“N-2”) |
正如实施例中更详细描述的,自身肽与天然IgM抗体IgMCM-22结合。
除了上述肽之外,本发明包含经修饰的肽,其活性可由熟练的技术人员用已知的不同方法鉴定和/或分析。例如,肽与IgM结合的检测可用生物鉴定法、蛋白质印迹、免疫沉淀或免疫细胞化学技术,例如以下所述的方法。特别是,经修饰肽的生物活性(如,与天然IgM抗体的结合能力)可相对于P8(SEQ ID NO:30)或N2(SEQ IDNO:38)被表征。
这种经修饰的肽,当被设计为至少保留蛋白天然存在形式的一种活性时,被认为是该肽的“功能等价物”,这里有更详细的描述。例如可通过氨基酸置换、缺失或添加来产生这种经修饰肽,其置换可存在于全部或部分保守氨基酸的置换中。
例如,可合理预计的是分离的保守氨基酸置换不会对所得分子的生物活性有较大的影响,例如用异亮氨酸或缬氨酸置换亮氨酸、谷氨酸置换天冬氨酸或丝氨酸置换苏氨酸。肽氨基酸序列上的改变是否导致功能性同源物,通过评价变异体肽产生与野生型肽相似反应的能力(如结合天然IgM抗体的能力),可容易的确定。发生多于一个置换的肽可容易的用同样方法检测到。
肽的诱变作用可产生同源物,其在体内的半衰期相对于相应的野生型肽有提高。例如,改变后的肽更稳定,可抵御蛋白水解的降解作用或导致蛋白被破坏或失活的其他细胞进程。
可比对一群肽同源物的氨基酸序列,优选可能的最高同源性。该群变异体可包括如来自一个或多个物种的同源物,或来自同一物种但由于突变而不同的同源物。出现在比对序列各个位置的氨基酸都被选择以产生一组简并的组合序列(a degenerate set ofcombinatorial sequences)。在某些实施方案中,组合文库经由编码多肽文库的基因简并库产生,每个多肽至少包括一部分可能的肽序列。例如,合成寡核苷酸的混合物可酶联到基因序列,这样可能的核苷酸序列简并组可作为单个多肽表达,或者,作为一组大的融合蛋白表达(如噬菌体展示)。
有许多方法可从简并的寡核苷酸序列产生可能的同源物文库。化学合成的简并基因序列可在DNA自动合成仪中完成,合成基因可随后被连接于合适的载体以表达。基因简并组合的一个目的是在一个混合物中提供所有可能需要的肽序列的编码序列。简并寡核苷酸的合成为本领域所熟知(参见Narang,SA(1983)Tetrahedron 39:3;Itakura等(1981)Rcombinant DNA,Proc.3rd Cleveland Sympos.Macromolecules,ed.AG Walton,Amsterdam;Elsevier pp.273-289;Itakura等(1984)Annu.Rev.Biochem.53:323;Itakura等(1984)Science 198:1056;Sce等(1983)Nucleic Acid Res.11:477)。这种技术已经被用于其他蛋白的定向进化(参见Scott等(1990)Science 249:386-390;Roberts等(1992)PNAS USA 89:2429-2433;Devlin等(1990)Science 249:404-406;Cwirla等(1990)PNAS USA 87:6378-6382;以及美国专利Nos:5,223,409,5,198,346和5,096,815)。
或者,可利用突变的其他形式产生组合文库。例如,可通过使用如丙氨酸扫描诱变(alanine scanning mutagenesis)(Ruf等(1994)Biochemistry 33:1565-1572;Wang等(1994)J.Biol.Chem.269:3095-3099;Balint等(1993)Gene 137:109-118;Grodberg等(1993)Eur.J.Biochem.218:597-601;Nagashima等(1993)J.Biol.Chem.268:2888-2892;Lowman等(1991)Biochemistry 30:10832-10838;及Cunningham等(1989)Science 244:1081-1085)、接头分区诱变((Gustin等(1993)Virology 193:653-660;Brown等(1992)Mol.CellBiol.12:2644-2652;McKnight等(1982)Science 232:316))、饱和诱变(Meyers等(1986)Science 232:613)、PCR诱变(Leung等(1989)MethodCell Mol.Biol.1:11-19)或随机诱变(Miller等(1992)细菌遗传学的简明教程(A Short Course in Bacterial Genetics),CSHL Press,Cold SpringHarbor,NY;及Greener等(1994)Strategies in Mol.Biol.7:32-34)等筛选,从文库中产生并分离肽同源物。
已知在本领域有许多技术来筛选由点突变和截短(truncation)得到的组合文库的基因产物,以及筛选cDNA文库的具有一定特性(如结合天然IgM抗体的能力)的基因产物。这种技术将被广泛用于快速筛选由肽同源物的组合突变产生的基因文库。最广泛用于筛选大基因文库的典型技术包括将基因文库克隆到复制表达载体、用所得载体文库转化适当的细胞和在所需活性相对易于从编码检测产物的载体基因中分离检测的条件下表达组合基因。当必需对由组合突变技术制造的大量简并序列进行筛选时,以下描述的每个例证实验都可用于高通量分析。
在筛选实验的例证实施方案中,候选的组合基因产物过柱,柱中含有附着了结合蛋白(如IgM或其部分)的微珠。那些候选的组合基因产物被固定在柱上,可用与IgM的结合(以对天然IgM抗体结合的阻断以及炎性疾病的治疗的方式)进一步鉴定。
在另一个实施例中,基因文库可作为融合蛋白表达于病毒颗粒的表面。例如,在丝状噬菌体系统中,外源肽序列可被表达在感染性噬菌体的表面,因此获得了两个优点。首先,因为这些噬菌体在高浓度下可被用于亲和基质,所以可以一次筛选大量的噬菌体。其次,因为每个感染性噬菌体都在其表面展示组合基因产物,如果从亲和基质中回收的特定噬菌体的产量低,该噬菌体可通过下一轮感染而被扩增。几乎相同的大肠杆菌丝状噬菌体M13、fd和fl群是在噬菌体展示文库中最常用,因为外壳蛋白gIII或gVIII均可用于产生融合蛋白而不使最终包装的病毒颗粒破裂(Ladner等,PCT公布说明书WO 90/02909;Garrard等PCT公布说明书WO 92/09690;Marks等(1992)J.Biol.Chem.267:16007-16010;Griffiths等(1993)EMBO J.12:725-734;Clackson等(1991)Nature 352:624-628;及Barbas等(1992)PNAS USA 89:4457-4461)。其他的噬菌体外壳蛋白可适当的使用。
本发明也提供模拟物(如非肽物质),它能模拟真正的肽与天然IgM抗体的结合。例如,肽分子中有关天然IgM抗体识别的关键残基可被确定并用于产生结合于天然IgM抗体的拟肽(peptidomimetics)。通过与天然IgM抗体的结合以及包裹与野生型蛋白相互作用所需的关键残基,拟肽可以被用作野生型蛋白的抑制剂,因此阻止蛋白和天然IgM抗体的相互作用。可产生模拟那些与天然IgM抗体结合的残基的拟肽化合物。例如,可用苯二氮类(参见Freidinger等,肽:化学与生物学G.R.Marshall ed.,ESCOMPublisher:Leiden,Netherlands,1988)、氮杂(参见Huffman等,肽:化学与生物学,G.R.Marshall ed.,ESCOM Publisher:Leiden,Netherlands,1988)、取代的γ内酰胺环(Garvey等,肽:化学与生物学,G.R.Marshall ed.,ESCOM Publisher:Leiden,Netherlands,1988)、亚甲基酮假肽(keto-methylene pseudopeptides)(Ewenson等(1986)J.Med.Chem.29:295;及Ewenson等,肽:结构与功能(第九届美国肽专题讨论会年报Pierce Chemical Co.Rockland,IL,1985),β-折叠二肽核心(dipeptide cores)(Nagai等(1985)Tetrahedron Lett 26:647;及Sato等(1986)J Chem Soc Perkin Trans 1:1231)和氨基醇(Gordon等,(1985)Biochem Biophys Res Commun 126:419;及Dann等(1986)Biochem Biophys Res Commun 134:71)产生有这种残基的非水解产物的肽类似物。
6.3.2编码肽抑制剂的核酸
本发明特征性的核酸,编码上述肽。表3提供了示例性的核酸。
表3编码天然IgM抗体结合肽的核酸
序列编号 | 序列 | 名称 |
13 | NNN AAY AAY AAY NNN AAY AAY NNNAAY AAY AAY AAY | 天冬酰胺-富集共有序列 |
15 | TAY AAY AAY AAY AAY GGN AAY TAYCAN TAY MGN AAY | P1 |
17 | GCN AAY CAN MGN AAY GGN GCN CANAAY AAY AAY ATG | P2 |
19 | TGY GAY WSN WSN TGY GAY WSN GTNGGN AAY TGY AAY | P3 |
21 | TGG AAY AAY AAY GGN MGN AAY GCNTGY AAY GCN AAY | P4 |
23 | CAY AAY WSN ACN WSN AAY GGN TGYAAY GAY AAY GTN | P5 |
25 | AAY WSN AAY WSN MGN TAN AAN WSNAAY WSN AAY AAY | P6 |
27 | AAR MGN AAY AAY CAY AAY AAY CAYAAY MGN WSN AAY | P7 |
29 | AAY GGN AAY AAY GTN AAY GGN AAYMGN AAY AAY AAY | P8 |
31 | AAY GTN GCN AAY CAY AAY AAY WSNAAY CAY GGN AAY | P9 |
33 | WSN TAY AAY AAY AAY AAY CAY GTNWSN AAY MGN AAY | P10 |
35 | YTN ATG AAR AAY ATG GAY CCN YTNAAY GAY AAY ATH | 自体-1 |
37 | YTN ATG AAR AAY ATG GAY CCN YTNAAY GAY AAY GTN | 自体-2 |
表3中分离的核酸反应了遗传密码的简并性。尤其是,“R”对应的碱基可以是A或G;“S”对应的碱基可以是G或C;“V”对应的碱基可以是A、C或G;“Y”对应的碱基可以是C或T;“W”对应的碱基可以是A或T;“D”对应的碱基可以是A、G或T;“M”对应的碱基可以是A或C;“H”对应的碱基可以是A、C或T;“N”对应的碱基可以是A、C、G或T;“K”对应的碱基可以是G或T;“B”对应的碱基可以是C、G或T。
预期导致题述蛋白氨基酸序列变化的DNA序列多态性会存在于哺乳动物细胞中。本领域技术人员会理解,由于天然等位基因变异,编码本发明特定肽的核酸中一个或多个核苷酸的变异(从至少约1%到约3%或5%或者可能更多的核苷酸)可存在于所给物种的个体中。任一和所有这种核苷酸变异及所得氨基酸多态现象都在本发明范围内。首选的核酸编码的肽,与氨基酸序列SEQ ID NO:14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38或本发明的其他肽至少具约60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或更高同源性。核酸编码具有本发明肽活性的肽,与本发明的SEQ IDNO:14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38或其他肽有至少约60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或更高同源性,这也在本发明范围内。
单一物种的基因密码子选择偏好性似乎与该基因编码的蛋白的表达水平有关。相应的,本发明包括已被优化以提高在宿主细胞中表达的核酸序列,优化方法为改变核酸序列中的密码子使用频率以接近宿主细胞中首选的密码子使用频率。由于密码子简并性,优化核苷酸序列而不影响编码多肽的氨基酸序列是可能的。相应的,本发明涉及编码SEQ ID NO:14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38所示肽或本发明其他肽的任一核苷酸序列。
本发明范围内的核酸还可包含接头序列、修饰的限制性内切酶位点及其他对这种重组多肽的分子克隆、表达或纯化有用的序列。
编码本发明肽的核酸可含有根据所述实验计划得自任何生物体的mRNA或基因组DNA,以及本领域技术人员所普遍了解的那些。例如,可通过从生物体(如细菌、病毒、哺乳动物等)分离总mRNA而获得编码本发明肽的cDNA。可再从总mRNA制备双链cDNA,并随后用已知许多技术的任一种将cDNA插入到适当的质粒或噬菌体载体中。也可根据本发明提供的核苷酸序列信息,用建立的聚合酶链式反应技术克隆编码本发明肽的基因。
在本发明的另一方面,题述核酸(the subject nucleic acid)提供在表达载体中,含有编码本发明肽和操作性连接于至少一种调控序列的核酸序列。应该理解的是,表达载体的设计取决于要转化的宿主细胞和/或需表达的蛋白类型等因素的选择。而且,还应考虑载体的拷贝数、控制拷贝数和载体编码的其他任一蛋白(例如抗生素标记)表达的能力,。
很明显的,题述基因构建体可用于使本发明肽在培养基中传代细胞内进行表达,例如产生要纯化的蛋白或多肽,包括融合蛋白或多肽。
本发明还涉及重组基因转染的宿主细胞,以表达本发明的肽。宿主细胞可以是任何原核或真核细胞。例如,本发明的多肽可在细菌细胞(如大肠杆菌)、昆虫细胞(杆状病毒)、酵母或哺乳动物细胞中表达。本领域技术人员了解其他合适的宿主细胞。另外,宿主中发现的非典型的tRNA分子可被添加至宿主细胞以优化肽的表达。其他适于最大量表达肽的方法将被本领域技术人员所了解。
6.3.3产生肽抑制剂的方法
例如,肽抑制剂可被化学合成、被无细胞系统的核糖体合成或在细胞的核糖体中被合成。化学合成本发明的肽可用许多种本领域公认的方法来实现,包括分步固相合成(stepwise solid phasesynthesis)、通过肽片段构象辅助再连接的半合成、克隆或合成肽片段酶促连接以及化学连接(Merrifield等,J.Am.Chem.Soc.,85卷,2149页(1964),Houghten等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,82卷,5132页(1985),及Stewart和Young固相肽合成法Pierce Chem.Co,Rockford,III.(1984))。天然的化学连接用两个未保护的肽片段的选择性化学(chemoselective)反应产生暂时的硫酯连接中间体。暂时的硫酯连接中间体随后自发的经过重排以提供在连接位点具有天然肽键的全长连接产物。全长连接产物在化学上与无细胞合成产生的蛋白是相同的。全长连接产物可以随后被再折叠和/或被氧化,以形成天然的含有二硫化物的蛋白分子(参见美国专利No:6,184,344和6,174,530;及T.W.Muir等,Curr.Opin.Biotech.(1993):vol.4,p420;M.Miller,等,Science(1989):vol.246,p 1149;A.Wlodawer,等,Science(1989):vol.245,p616;L.H.Huang,等,Biochemistry(1991):vol.30,p 7402;M.Schnolzer,等,Int.J.Pept.Prot.Res.(1992):vol.40,p180-193;K.Rajarathnam,等,Science(1994):vol.264,p 90;R.E.Offord,在蛋白设计和新的治疗方法和疫苗中的蛋白质工程之化学方法.J.B.Hook,G.Poste,Eds.,(Plenum Press,New York,1990)pp.253-282;C.J.A.Wallace等J.Biol.Chem.(1992):vol.267,p 3852;L.Abrahmsen等Biochemistry(1991):vol.30,p 4151;T.K.Chang,等Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1994)91:12544-12548;M.Schnlzer等,Science(1992):vol.,3256,p 221;及K.Akaji等Chem.Pharm.Bull.(Tokyo)(1985)33:184))。
在另一备择方案中,肽的产生可以用体外翻译系统来完成。体外翻译系统通常是一种无细胞抽提液的翻译系统,其中至少含有将RNA分子翻译为蛋白所必需的最少元件。典型的体外翻译系统至少包含核糖体、tRNA、起始因子甲硫氨酰-tRNA Met、翻译相关的蛋白或复合物(例如eIF2、Eif3)、含帽结合蛋白和真核起始因子4F(eIF4)的帽结合复合物。许多种体外翻译系统在本领域是众所周知的,包括市售试剂盒。体外翻译系统的例子包括真核细胞裂解物(如兔网织红细胞裂解物)、兔卵母细胞裂解物、人细胞裂解物、昆虫细胞列裂解物及麦胚抽提物。裂解物可从制造厂家买到例如Promega公司(Madison,威斯康辛州)、Stratagene公司(La Jolla,加利福利亚州)、Amersham公司(Arlington Heights,伊利诺依州)、GIBCO/BRL公司(Grand Island,纽约)。典型的体外翻译系统含大分子如酶、翻译起始和延伸因子、化学试剂和核糖体。此外,可用体外转录系统。这种典型的系统至少包括RNA聚合酶全酶、核糖核酸及任何必需的转录起始、延伸和终止因子。体外转录和翻译可以在同一的反应中完成,从一个或多个分离的DNA产生肽。
编码肽抑制剂的核酸可由DNA传递到合适宿主细胞在体外被表达。肽的表达可通过将编码肽的核酸插入到载体上来促进,例如质粒、病毒或其他本领域所知的载体,其中载体通过插入或合并天然抗体-结合肽的遗传序列进行操纵。这种载体包含启动子序列,其促进插入宿主的遗传序列的有效转录。典型的载体包含复制起点、启动子以及可对转化的细胞进行表型选择的特异基因。适用于本发明的载体包括但不限于用于细菌中表达的基于T7表达载体(Rosenberg等Gene,56:125,1987)、用于哺乳动物细胞中表达的pMSXND表达载体(Lee和Nathans,J.Biol.Chem.,263:3521,1988)和用于昆虫细胞中表达的杆状病毒衍生载体。DNA片段可出现在载体中,载体操作连接于调控元件如启动子(例如T7、金属硫蛋白I或多角体蛋白启动子)。
编码肽抑制剂的核酸可在原核生物或真核生物中被表达。宿主可包括微生物、酵母、昆虫和哺乳动物。在原核生物中表达DNA序列(具有真核或病毒序列)的方法是本领域众所周知的。生物学功能的病毒和质粒DNA载体能在宿主中表达和复制,这是本领域已知的。这种载体能整合本发明的DNA序列。可用本领域技术人员所熟知的方法来构建载体,载体中包含天然抗体-结合肽编码序列和合适的转录/翻译控制信号。这些方法包括体外重组DNA技术、合成技术及体内重组/遗传技术(参见Maniais等描述的技术,1989分子克隆实验室手册,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.)。
许多宿主表达载体系统可被利用。包括但不限于微生物例如用重组噬菌体DNA、质粒DNA或粘粒DNA表达载体转化的细菌、用重组酵母表达载体转化的酵母、用重组病毒表达载体(如花椰菜花叶病毒CaMV、烟草花叶病毒TMV)感染的植物细胞系统、用重组病毒表达载体(如逆转录病毒、腺病毒、痘苗病毒)感染的动物细胞系统或为稳定表达设计的转化的动物细胞系统。
依赖所用的宿主/载体系统,大量适合转录和翻译元件的任一个,包括组成型和诱导型启动子、增强子元件、转录终止子等,都可用于表达载体(参见Bitter等,1987,酶学方法153:516-544)。例如,当在细菌系统中克隆时,可用诱导型启动子例如噬菌体γ的pL、plac、ptrp、ptac(ptrp-lac杂合启动子)等。当在哺乳动物细胞系统中克隆时,可用得自哺乳动物细胞基因组的启动子(如金属硫蛋白启动子)或得自哺乳动物病毒的启动子(如逆转录病毒长末端重复、腺病毒后期启动子、痘苗病毒7.5K启动子)。也可用重组DNA或合成技术产生的启动子。
在酵母中,可使用包含组成型或诱导型启动子的许多载体。综合来看,分子生物学的当前实验设计Vol.2,1988,Ed.Ausubel等,Greene Publish.Assoc.& Wiley Interscience,Ch.13;Grant等,1987,酵母的表达和分泌载体,酶学方法,Eds.Wu & Grossman,319 87,Acad.Press,N.Y.,Vol.153,pp.516-544;Glover,1986,DNA克隆,Vol.II,IRL Press,Wash.,D.C.,Ch.3;and Bitter,1987,酵母中的异源基因表达,酶学方法,Eds.Berger & Kimmel,Acad.Press,N.Y.,Vol.152,pp.673-684;及酵母菌的分子生物学,1982,Eds.Strathern et al.,ColdSpring Harbor Press,Vols.I and II.酵母组成型启动子如ADH或LEU2或诱导型启动子如GAL可被使用(酵母中的克隆,Ch.3,R.Rothstein,DNA克隆,Vol.11,实用方法,Ed.D M Glover,1986,IRLPress,Wash.,D.C.)。或者,可用促进外源DNA序列整合到酵母染色体的载体。
真核系统,优选哺乳动物表达系统可使表达的哺乳动物蛋白进行正确的翻译后修饰。真核细胞可被用作宿主细胞,其具有正确加工原始转录物、糖基化、磷酸化及有利的血浆膜基因产物的插入的细胞机制。
哺乳动物细胞系统可被设计为利用重组病毒或病毒元件引导表达。例如,当用腺病毒表达载体时,天然抗体-结合肽编码序列可被连接于腺病毒转录/翻译控制复合物如后期启动子和三联前导序列。或者,可用痘苗病毒7.5K启动子(参见Maclcett等1982,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:7415-7419;Mackett等1984,J.Virol.49:857-864;Panicali等1982,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:4927-4931)。尤其感兴趣的是基于牛乳头状瘤病毒的载体,其具有作为染色体外遗传因子复制的能力(Sarver等1981,Mol.Cell.Biol.1:486)。该DNA进入小鼠细胞后不久,质粒复制达到约每个细胞100至200个拷贝。插入cDNA的转录不需要质粒整合到宿主染色体上,因此产生高水平的表达。这些载体可通过质粒上包括的可选标记如neo基因,用于稳定的表达。或者,逆转录病毒基因组可经修饰以用作载体,该载体能引入并引导天然抗体-结合肽基因在宿主细胞的表达(Cone &Mulligan,1984,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6349-6353)。高水平表达也可以用诱导型启动子完成,包括但不限于金属硫蛋白IIA启动子及热激启动子。
要长期高产量的产生重组蛋白,首选是稳定的表达。可用合适的表达控制元件(如启动子、增强子序列、转录终止子、多腺苷酸化位点等)和可选标记控制的cDNA转化宿主细胞,而不是用含有病毒复制起点的表达载体。重组质粒中的可选标记赋予细胞对选择的抗性并使细胞将质粒稳定的整合到其染色体上,生长至形成细胞灶(foci)进而能被克隆并扩展为细胞系。例如,随着外源DNA的引入,改造后的细胞可在丰富培养基中生长1-2天,然后转换到选择性培养基。可使用许多选择系统,包括但不限于单纯性疱疹病毒胸苷激酶(Wigler等,1977,Cell 11:223)、次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(Szybalska & Szybalski,1962,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 48:2026)以及腺嘌呤磷酸核糖转移酶(Lowy等,1980,Cell 22:817)基因可分别用于tk-、hgprt-或aprt-细胞中。并且,抗代谢物抗性可被用作选择以下基因的基础:dhfr,赋予对氨甲喋呤的抗性(Wigler等,1980,Natl.Acad.Sci.USA 77:3567;O′Hare等,1981,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:1527);gpt,赋予对霉酚酸的抗性(Mulligan & Berg,1981,Proc.Natl.Acad Sci.USA 78:2072);neo,赋予对氨基葡糖苷G-418的抗性(Colberre-Garapin等,1981,J.Mol.Biol.150:1);以及hygro,赋予对潮霉素的抗性(Santerre等,1984,Gene 30:147)。另外可选择的基因包括:trpB,使细胞利用吲哚代替色氨酸;hisD,使细胞利用组胺醇(histidmol)代替组氨酸(Hartman & Mulligan,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:8047);ODC(鸟氨酸脱羧酶),赋予对鸟氨酸脱羧酶抑制剂、2-(二氟甲基)-DL-鸟氨酸(2-(difluoromethyl)-DL-omithine,DFMO)的抗性((McConlogue L.,1987,分子生物学最新简讯,ColdSpring Harbor Laboratory ed.)。
对于稳定的重组细胞系,合适的细胞类型包括但不限于以下类型的细胞:NIH 3T3(鼠科)、C2C12、L6和P19。C2C12和L6成肌细胞在培养时自然分化并形成依赖特定生长条件的肌管(Yaffe andSaxel,1977;Yaffe,1968)。P19是胚胎癌细胞系。这种细胞在如美国标准培养物保藏中心(ATCC)细胞系目录中有描述。这些细胞可被熟练的技术人员用所知的方法稳定的转化。参见Ausubel等,DNA引入哺乳动物细胞,分子生物学通用实验设计,9.5.1-9.5.6节(JohnWiley & Sons,Inc.1995)。“稳定”转化在本发明的上下文中是指细胞经至少50次分裂仍在某种程度上不死。
当宿主为真核生物时,可用于转化DNA的方法有,钙磷酸盐共沉淀、常规机械操作如显微注射、电穿孔法、脂质体包装质粒的插入或病毒载体。真核细胞也可用编码天然抗体-结合肽的DNA序列,以及编码可选表型的第二个外源DNA分子,如单纯疱疹-胸腺激酶基因转化。另外一个方式是用真核病毒载体,例如猴病毒40(SV40)或牛乳头状瘤病毒,瞬时感染或转化真核细胞并表达蛋白(参见真核病毒载体,冷泉港实验室,Gluzman ed.,1982)。
与天然抗体相互作用或为了分离和纯化天然抗体,天然抗体-结合蛋白可能需从宿主细胞分泌。因此信号序列可被用来引导在宿主细胞中合成的肽离开细胞。典型的信号序列位于核酸编码序列内,或正好在编码区域的5’末端。许多信号序列已经被鉴定,任一可在所选宿主细胞中发挥功能的信号序列可被使用。因而信号序列可与多肽同源或异源。另外,信号序列可以是用本领域熟知的DNA重组技术化学合成。
宿主细胞中产生的肽的数量可用本领域所知的标准方法评估。这种方法包括但不限于蛋白质印迹技术、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳、非变性凝胶电泳、HPLC分离、免疫沉淀作用和/或活性分析例如DNA结合凝胶移位分析。
当天然抗体-结合肽从宿主细胞中分泌时,大部分肽可能会在细胞培养基中被找到。可如果肽不分泌就会出现在细胞质(对于真核、革兰氏阳性细菌和昆虫宿主细胞)中或周质中(对于革兰氏阴性细菌宿主细胞)。
如果天然抗体-结合肽存在于胞内空间,宿主细胞通常会首先被机械性或渗透压破裂以释放细胞质内容物到缓冲溶液中。随后从溶液中分离肽。溶液中的肽的纯化因而可用许多技术完成。如果肽已被合成使其在羧基或氨基端具有标签如六组氨酸或其他小肽,肽可在一步过程中被纯化,方法为将溶液流过亲和柱,其中柱材料对标签或直接对肽(即单克隆抗体)有高亲和力。例如,多组氨酸对镍有高度特异亲和力,因此镍亲和层析柱(如Qiagen镍柱)可用来纯化(参见Ausubel等,eds.,分子生物学通用实验设计,John Wiley &Sons,New York,1994)。
另一方面,对于没有标签并且实际上不能用抗体纯化的肽来说,可用其他熟知的纯化方法。这种方法包括但不限于离子交换层析、分子筛色谱法、HPLC、联用凝胶洗脱的非变性凝胶电泳和制备型等电聚焦(preparative isoelectric focusing)(″Isoprime″仪/技术,HoeferScientific)。在某些情况下,可以联合两个或多个方法以提高纯度。预计肽主要出现在细菌的周质空间或真核细胞的细胞质中,周质或胞质的内容物包括包涵体(如革兰氏阴性细菌)如果处理的肽已经形成了这类复合物,可用任何熟练的技术人员已知的标准技术从宿主细胞抽提。例如,通过使用弗氏细胞压碎器、匀浆器和/或声裂法,宿主细胞可被裂解以释放周质内容物。匀浆随后被离心。
6.3.4天然IgM抗体的抗体抑制剂
抗体IgM的抑制剂也可以是抗体,与天然IgM竞争同抗原的结合。产生抗体的方法在本领域是众所周知的。例如,抗靶标物质(如致病免疫球蛋白或细胞上的局部缺血特异性抗原)的单克隆抗体可由多种技术产生,包括常规的单克隆抗体方法,如标准的体细胞杂交技术(Kohler和Milstein,Nature 256:495(1975))。虽然原则上,体细胞杂交过程是首选,但其他产生单克隆抗体的技术可被使用,如B淋巴细胞的病毒或致癌转化。制备杂交瘤的首选动物系统是鼠系统。小鼠中杂交瘤产生的程序已建立地很完备。免疫的实验计划和融合用免疫后脾细胞的分离技术在本领域是已知的。融合配偶体(如鼠骨髓瘤细胞)和融合过程也是已知的。
人单克隆抗体的产生可用带有人免疫球蛋白基因而不是小鼠免疫球蛋白基因的转基因小鼠进行。脾细胞来自用所需抗原免疫的转基因小鼠,并用于产生杂交瘤,杂交瘤分泌针对来自人蛋白的表位具有特异性亲和力的人mAb(参见Wood等,国际申请WO91/00906,Kucherlapati等,PCT公布说明书WO 91/10741;Lonberg等,国际申请WO 92/03918;Kay等,国际申请92/03917;Lonberg,N.等,1994 Nature 3 68:856-859;Green,L.L.等,1994 Nature Genet.7:13-21;Morrison,S.L.等,1994 Proc.~Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855;Bruggeman等,1993 Year Immuno.17:33-40;Tuaillon等,1993 PNAS 90:3720-3724;Bruggeman等,1991 Eur.J.Immunol 21:1323-1326)。在一个实施方案中,杂交瘤可产生自人CD5+、B-1细胞。或者,“人化的”鼠杂交瘤可用来识别交叉反应的“局部缺血抗原”。
单克隆抗体也可由重组DNA技术领域的技术人员已知的其他方法产生。一个备择方法,称为“组合抗体展示”方法,已经被发展来鉴定和分离具有特定的抗原特异性的抗体片段,并且可用来产生单克隆抗体(组合抗体展示的描述参见Sastry等,1989 PNAS 86:5,728;Huse等,1989 Science 246:1275;和Orlandi等,1989 PNAS 86:3833)。如上所述用抗原免疫动物后,所得B细胞集合体的抗体库中所有抗体(repertoire)都被克隆。通过使用混合的低聚物引物和PCR,用众所周知的方法获得不同群的免疫球蛋白分子的可变区DNA序列。例如,与5’引导序列(信号肽)和/或框架序列1(FR1)相应的混合的寡核苷酸引物,以及保守3’恒定区域的引物可被用于PCR从大量鼠抗体中扩增重链和轻链可变区(Larrick等,1991,BiotecXlniq7es11:152-156)。相似的策略也可用来从人抗体中扩增人重链和轻链可变区(Larrick等,1991,方法学:酶学方法手册2:106-110)。
在一个示例性的实施方案中,用标准的实验方案从B淋巴细胞如外周血细胞、骨髓或脾制剂分离RNA(如,美国专利No.4,683,202;Orlandi等,PNAS(1989)86:3833-3837;Sastry等,PNAS(1989)86:5728-5732;和Huse等,(1989)Science 246:1275-1281)。第一链cDNA的合成,除信号序列的引物外,还用特异性针对重链恒定区及每个κ和χ轻链的引物。用可变区PCR引物,重链和轻链的可变区都被扩增,各自独立或组合,并被连接于适当载体以进一步操作产生展示的包装。用于扩增方案的寡核苷酸引物可以是单一的或简并的或者在简并位置掺入次黄嘌呤核苷。限制性内切酶识别序列也可整合到引物中,使扩增的片段克隆到载体中预设的阅读框内以表达。
从免疫得来的抗体库中所有成员克隆出V基因库,通过许多展示包装进行表达,优选自丝状噬菌体形成抗体展示库。理想中,展示包装包含一个允许从非常大的多样抗体展示库中抽样、每轮亲和分离后的快速分选以及易于从纯化的展示包装中分离抗体基因的系统。除了可购买到的产生噬菌体展示库的试剂盒外(如Pharmacia重组噬菌体抗体系统,目录编号27-9400-01;StratageneSurfZAPTM噬菌体展示试剂盒,目录编号240612),特别用于产生多种抗体展示库的方法和试剂的例子可在下文中找到,如Ladner等美国专利5,223,409、Kang等国际公布说明书WO 92/18619、Dower等国际公布说明书WO 91/17271、Winter等国际公布说明书WO92/20791、Markland等国际公布说明书WO 92/15679、Breitling等国际公布说明书WO 93/01288、McCafferty等国际公布说明书WO92/01047、Garrard等国际公布说明书WO 92/09690、Ladner等国际公布说明书WO 90/02809、Fuchs等(1991)Bio/Tech7Z010gy 9:1370-1372、Hay等(1992)Huma A71tibody Hybrido771as 3:81-85、Huse等(1989)Science 246:1275-1281、Griffths等(1993)EMBO J 12:725-734、Hawkins等(1992)J.Mol.Biol.226:889-896、Clackson等(1991)Nature 352:624-628、Gram等(1992)PNAS 89:3576-3580、Garrad等(1991)Bio/Tech71010gy 9:1373-1377、Hoogenboom等(1991)Nuc.Acid Res.19:4133-4137以及Barbas等(1991)PNAS 88:7978-7982。
在特定的实施方案中,V区结构域的重链和轻链可被表达在同一多肽上,通过结合一段柔软的接头连接以形成一个单链Fv片段,scFv基因随后被克隆到所需表达载体或噬菌体基因组上。通常如McCafferty等在文献(Nature(1990)348:552-554)中所描述的,抗体完整的VH和VL区域通过柔软的(甘氨酸4-丝氨酸)3接头连接,可用于产生单链抗体,使展示包装可基于抗原亲和力进行分离。分离出来与抗原免疫反应的scFv抗体,可随后配制成用于题述方法的药物制剂。
一旦显示在展示包装(如丝状噬菌体)表面后,抗体库用目标抗原或其肽片段筛选以鉴定并分离表达具有抗原特异性的抗体的包装。编码所选抗体的核酸可从展示包装(如从噬菌体基因组)中获得,并通过标准的重组DNA技术亚克隆到其他表达载体中。
获得对表面蛋白具有高亲和力的特异的抗体分子可依照本领域所知的其他方法,如包括筛选库的方法(Ladner,R.C.等,美国专利5,233,409;Ladner,R.C.等,美国专利5,403,484)。另外,这些库可用于筛选以获得模拟抗体结构决定簇的结合决定域。
尤其是,依照蛋白质相互作用原理,特定抗体分子的Fv结合表面与其目标配体相互作用,因此VH和VL的序列数据(后者可以是κ或χ链类型)可用于本领域技术人员已知的蛋白质工程技术。用以前确定的得自NMR研究或晶体学数据的其他抗体三维结构,通过建模程序,可从抗体序列信息中获得包含结合决定域的蛋白质表面详细资料。参见Bajorath,J.和S.Sheriff,1996,蛋白质:结构、功能和遗传学.24(2),152-157;Webster,D.M.和A.R.Rees,1995,在S.Paul,Ed.,分子生物学方法51,抗体工程实验方案中的″抗体结合位点的分子建模″.,Humana出版社,Totowa,NJ,pp 17-49;以及Johnson,G.、Wu,T.T.和E.A.Kabat,1995,″Seqhunt:A program toscreen aligned nucleotide and amino acid sequences,″in Methods i71MolecularBiol.51,op.cit.,pp 1-15。
在一个实施方案中,多样的多肽库通过展示包装群被表达以形成肽展示库。理想的展示包装包含一个允许从非常大的多样肽展示库中抽样、每轮亲和分离后的快速分选以及易于从纯化的展示包装中分离肽编码基因的系统。肽展示库可以在如原核生物和病毒上,它们可被快速扩增,相对易于操作,可得到大量的无性系。首选的展示包装包括,如营养型的菌细胞、细菌芽孢,最优选细菌病毒(尤其是DNA病毒)。不过,本发明也考虑到使用真核细胞,包括酵母及其芽孢作为可能的展示包装。噬菌体展示库如上所述。
其他技术包括用适当的“受体”,如目标抗原,进行亲和层析,随后用常规技术(如质谱分析法和NMR)鉴定分离的结合剂或配体。优选缀合了标签(如荧光团、比色检测用酶、放射性同位素或发光化合物)的可溶受体,通过检测标签来指示配体结合。或者,固定化的化合物可被有选择性的释放,并穿膜弥散与受体相互作用。
组合文库的化合物也可与“标签”一起合成以编码文库每个成员的标识(identity)(参见W.C.Still等国际公布说明书WO 94/08051)。一般而言,该方法的特点在于使用无活性但易于检测到的可附加到固相载体或化合物上的标签。当检测到活性物质时,通过鉴定唯一的伴随标签来确定化合物的标识。这种标记方法允许合成大文库的化合物,在文库中的全套所有化合物可在很低的水平被鉴定。
本发明的抗体可以产生自非人类生物体如大鼠或小鼠的可变区或其部分,如互补决定区(CDR或CDRs)。嵌合抗体、CDR移植抗体和人化抗体都在本发明之内。产生自非人类生物体如大鼠或小鼠的抗体,以及经修饰(如在可变框架或恒定区进行修饰以减少在人体中的抗原性)的抗体都在本发明之内。只要抗体具有至少一个抗原结合部分则任何修饰都在本发明范围之内。
嵌合抗体(如小鼠-人单克隆抗体)可通过本领域已知的重组DNA技术来产生。例如,编码鼠类(或其他种类)单克隆抗体分子Fc恒定区的基因被限制性酶消化,以除去编码鼠Fc的区域,并被编码人Fc恒定区的等价的基因部分替换(参见Robinson等国际专利公布说明书PCT/US86/02269;Alcira等,欧洲专利公布说明书184,187;Taniguchi,M.,欧洲专利公布说明书171,496;Morrison等,欧洲专利公布说明书173,494;Neuberger等,国际公布说明书WO86/01533;Cabilly等,美国专利No.4,816,567;Cabilly等,欧洲专利公布说明书125,023;Better等(1988 Science 240:1041-1043);Liu等(1987)PNAS 84:3439-3443;Liu等,1987,J.Immunol.139:3521-3526;Sun等(1987)PNAS 84:214-218;Nishimura等,1987,Ca71c.Res.47:999-1005;Wood等(1985)Nature 314:446-449;以及Shaw等,1988,J.Natl.CancerInst.80:1553-1559)。
嵌合抗体的进一步人源化可通过用人Fv可变区等同的序列替换与抗原结合不直接相关的Fv可变区的序列。提供的产生人源化抗体的一般方法有Morrison,S.L.1985,Science 229:1202-1207;Oi等,1986,BioTechniques 4:214以及Queen等US 5,585,089、US 5,693,761和US 5,693,762,以上所有内容均通过引用结合至本文。这些方法包括分离、操作和表达编码全部或部分免疫球蛋白Fv可变区的核酸序列,该可变区来自至少一个重链或轻链。这种核酸的来源对本领域技术人员是众所周知的,例如可从7E3(一种产生抗GPIIbIIIa抗体的杂交瘤)中获得。编码嵌合抗体的重组DNA或其片段可随后被克隆到合适的表达载体上。可通过CDR取代择一性的产生适合的人化抗体。美国专利5,225,539;Jones等1986 Nature 321:552-525;Verhoeyan等1988 Science 239:1534;及Beidler等1988 J Imnauft.ol.141:4053-4060。
人源化的或CDR移植的抗体可通过CDR移植技术或CDR取代来产生,其中免疫球蛋白链的一个、两个或全部CDR都可被取代。参见美国专利5,225,539;Jones等1986 Nature 321:552-525;Verhoeyan等1988 Science 239:1534;Beidler等1988 J.Immunol.141:4053-4060;Winter US 5,225,539,以上全部内容均通过引用清楚的结合至本文。Winter描述了一种CDR移植方法,可用来制备本发明的人化抗体(申请于1987年3月26日,英国专利申请GB2188638A;Winter US 5,225,539),其内容通过引用清楚的结合至本文。
人化或CDR移植的抗体会有至少一种或两种但通常是全部受体CDR(免疫球蛋白链的重链和/或轻链)被供体CDR取代。优选的供体可以是啮齿动物抗体如大鼠或小鼠抗体,受体可以是人框架或人共有框架。通常,提供CDR的免疫球蛋白被称作“供体”而提供框架的免疫球蛋白被称作“受体”。在一个实施方案中,供体免疫球蛋白为非人类的(如啮齿动物)。受体框架可以是自然出现的(如人)框架或共有框架,或与之具有约85%或更高、优选90%、95%、99%或更高一致性的序列。
特定抗体的全部CDR可被至少一部分非人类CDR取代或仅仅若干CDR被非人类CDR取代。仅在需要结合人化抗体到Fc受体时,CDR的取代才有数量上的要求。
也在本发明范围内的是嵌合和人化抗体,其中特异性氨基酸已被替换、删除或插入。尤其优选在框架区有氨基酸置换的人化抗体,如此以提高与抗原的结合。例如,人化抗体会具有与供体框架残基或除受体框架残基外其他的氨基酸一致的框架残基。如另外一个例子,在具有小鼠CDR的人化抗体中,位于人框架区的氨基酸可被位于小鼠抗体相应位置的氨基酸替换。已知这种置换在一些实例中提高人化抗体与抗原的结合。
本发明的抗体片段可用本领域技术人员已知的常规步骤获得。例如,用胃蛋白酶消化抗体,产生F(ab’)2片段及多种小片段。巯基乙醇还原抗体,产生单个的重链和轻链。用木瓜蛋白酶消化抗体产生Fab片段和Fc片段。
另一方面,本发明的特点还在于经修饰的天然免疫球蛋白,例如其作为激动剂(模拟)或拮抗剂发挥作用。优选经修饰的天然免疫球蛋白,如经修饰的病原性免疫球蛋白,作为补体激活的拮抗剂发挥作用。病原性免疫球蛋白的变异体可通过诱变产生,如不连续点突变、序列的插入或删除或截短的病原性免疫球蛋白。天然免疫球蛋白的激动剂可保留与天然存在型蛋白基本上相同的生物活性或其中部分活性。天然免疫球蛋白的拮抗剂可抑制一种或多种病原性免疫球蛋白的天然出现型的活性,方式为例如能够结合于局部缺血的特异性抗原但不能激活补体途径。因此,特异的生物效应可通过用限定功能的变异体治疗来产生。
在一个实施方案中,在天然免疫球蛋白(如病原性IgM)中结合Clq的位点可被突变,使其不再能结合Clq。例如,IgG的CH2区域及IgM的CH4区域可被突变(参见WO 94/29351),这两个区域已知含有Clq结合位点。例如,IgG的CH2区域的部分羧基末端(残基231至239,优选234至239)可被突变,该区域表现为介导Clq结合及随后的补体激活。另一个实施例中,Wright等例证了在IgM恒定区的单核苷酸变化使抗体不能引发补体依赖细胞溶解。单核苷酸的改变导致在第三恒定区的436位氨基酸上编码丝氨酸残基而不是正常的脯氨酸残基(Wright等1988,J.Biol.Chem.263:11221)。氨基酸置换可发生于抗体以改变补体结合或活性,这在本领域是众所周知的(参见Wright等1988,J.Biol.Chem.263:11221;Shulman等(1986),Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:7678-7682;Arya等,(1994)J.Imnaisraol.253:1206-1212;Poon等,(1995)J.Biol.Claem.270:8571-8577,以上全部内容均通过引用结合至本文)。相应的在一个实施方案中,本发明的抗体具有改变补体结合或活性的突变。有氨基酸的添加、删除或取代的抗体在此都被称作经修饰抗体或经改变抗体。可被熟练的技术人员理解的是,用于在核苷酸或氨基酸序列上产生这种改变的方法会依据所需结果而不同。
天然免疫球蛋白的变异体可通过以激动剂或拮抗剂活性筛选突变体的组合文库来进行鉴定,所述突变体如天然免疫球蛋白截短突变体。
片段文库如天然免疫球蛋白的N端、C端或内部片段的编码序列可用于产生多样的片段群以筛选及随后选择该蛋白的变异体。尤其优选的变异体为添加或删除半胱氨酸残基,或者为添加或删除其中被糖基化的残基的变异体。
通过点突变或截短获得的组合文库基因产物的筛选方法,及为具有所选特性的基因产物而筛选cDNA文库的方法。递归的总体诱变作用(Recursive ensemble mutagenesis)(REM)是一种提高文库中功能性突变频率的方法,可与筛选实验联合用于变异体的鉴定(Arkin和Yourvan(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:7811-7815;Delgrave等(1993)Protein Engineering 6(3):327-331)。
细胞水平的分析可被用来分析多种文库。例如,可用表达载体文库转染细胞系,如通常对蛋白质的应答为底物依赖方式的细胞系。然后质粒DNA可从能通过病原性免疫球蛋白底物抑制或(二选一的)增强信号转导的细胞中回收,并且进一步鉴定单克隆。
本发明的特点也在于制造天然免疫球蛋白的方法,如具有非野生型活性(如天然存在的免疫球蛋白的拮抗剂或激动剂或超激动剂)的病原性免疫球蛋白。方法包括:改变天然免疫球蛋白的序列如通过替换或删除非保守区域的一个或多个残基、结构域或这里公开的残基,并测试改变后多肽的所需活性。
另外,本发明的特点是制造天然免疫球蛋白的片段或类似物的方法,如具有生物活性被改变的病原性免疫球蛋白,其活性与自然存在的病原性免疫球蛋白不同。方法包括:序列的改变,如通过置换或删除病原性免疫球蛋白的一个或多个残基,如改变非保守区域的序列或结构域或这里公开的残基,并测试改变后多肽的所需活性。在一个示例性的实施方案中,经修饰的天然免疫球蛋白激活补体的能力可被降低。例如,与补体结合和/或激活有关的一个或多个氨基酸残基被突变。
在某个实施方案中,经修饰的天然抗体可至少含有SEQ ID NO:8(SEQ ID NO:10)的CDR1区或其抗原结合部分,以及/或至少含有SEQ ID NO:8(SEQ ID NO:12)的CDR2区或其抗原结合部分。在另一个实施方案中,经修饰的抗体可至少含有SEQ ID NO:2(SEQ IDNO:4)的CDR1区或其抗原结合部分,以及/或至少含有SEQ ID NO:2(SEQ ID NO:6)的CDR2区或其抗原结合部分。在一个示例性的实施方案中,经修饰的抗体含有SEQ ID NO:8(SEQ ID NO:10)的CDR1区和SEQ ID NO:8(SEQ ID NO:12)的CDR2区或其抗原结合部分。在另一个示例性的实施方案中,经修饰的抗体含有SEQ ID NO:2(SEQ ID NO:4)的CDR1区和SEQ ID NO:2(SEQ ID NO:6)的CDR2区或其抗原结合部分。经修饰的抗体也可含有SEQ ID NO:8(SEQ IDNO:10)的CDR1区和SEQ ID NO:8(SEQ ID NO:12)的CDR2区并且经修饰的抗体包含SEQ ID NO:2(SEQ ID NO:4)的CDR1区和SEQ ID NO:2(SEQ ID NO:6)的CDR2区或其抗原结合部分。
经修饰的天然抗体可以是人抗体,对局部缺血特异性抗原有亲和力,相似的,例如大于、小于或等于以ATCC检索号保藏的PTA-3507的杂交瘤产生的抗体亲和力。再一个实施方案中,天然抗体可以是非人类如奶牛、山羊、小鼠、大鼠、绵羊、猪或兔的抗体。在一个示例性的实施方案中,非人类抗体为鼠类抗体。天然抗体也可是重组抗体。在一个示例性的实施方案中,天然抗体为人源化的抗体。经修饰的天然抗体可以是IgG或IgM抗体。在另一个实施方案中,分离的天然免疫球蛋白与以ATCC检索号保藏的PTA-3507的杂交瘤产生的免疫球蛋白具有同样的抗原特异性。
6.4鉴定添加的抑制剂的筛选实验
可从一个或多个(如多数)测试化合物中鉴定天然IgM抗体与抗原或补体途径的成分之间相互作用的其他抑制剂,包含(i)在使天然IgM抗体与抗原或补体途径的成分的结合能够发生的情况下,提供包括天然IgM抗体及抗原或补体途径的成分的反应混合物;(ii)用一个或多个测试化合物(如组合文库的成员)与天然IgM抗体和抗原或补体途径的成分接触;及(iii)检测在所给测试化合物存在时相对于缺少测试化合物时,天然IgM抗体和抗原或补体途径的成分结合的任何改变。在所给测试化合物存在时,相对于缺少测试化合物时所检测到的,天然IgM抗体和抗原或补体途径的成分之间结合水平的改变(如降低)说明测试化合物是天然IgM抗体和抗原或补体途径的成分之间相互作用的抑制剂。
该方法可进一步包括用一个或多个测试化合物预处理天然IgM抗体。预处理后的天然IgM抗体可随后被注射到天然免疫球蛋白缺乏的小鼠中。
在某些实施方案中,这些方法在体外完成。在一个示例性的实施方案中,接触步骤在体内实施。在一个示例性的实施方案中,抗原为肌球蛋白。在另一个实施方案中,抗原为从受试者如患有再灌注或局部缺血损伤的病人获得的内皮组织或溶胞产物。再一个示例性的实施方案中,补体途径的成分是经典补体激活途径的成分。此外的实施方案中,补体途径的成分为CI分子或其亚基(如Clq)。
在示例性的实施方案中,要么天然IgM抗体要么抗原(或两者)被可检测到的信号如荧光团、比色检测用酶、放射性同位素或发光化合物等标记。此外该方法可包括至少一个步骤的重复,如用文库的第二或后继成员或多数成员接触的步骤。
在一个示例性的实施方案中,多种测试化合物,如文库成员被测试。多种测试化合物如文库成员可包括至少10、102、103、104、105、106、107或108种化合物。优选的实施方案中,多种测试化合物如文库成员的结构或功能特性相同。测试化合物可以是肽或有机小分子。
在一个实施方案中,抑制剂是可在组合文库中被鉴定的有机小分子。在一个实施方案中,本发明提供了抑制剂文库。组合文库的合成在本领域是众所周知的并已有综述(参见E.M.Gordon等,J.Med.Chenu.(1994)37:1385-1401;DeWitt,S.H.;Czamik,A.W.Acc.Chem.Res.(1996)29:114;Armstrong,R.W.;Combs,A.P.;Tempest,P.A.;Brown,S.D.;Keating,T.A.Acc.Claem.Res.(1996)29:123;Ellman,J.A.Acc.CAlem.Res.(1996)29:132;Gordon,E.M.;Gallop,M.A.;Patel,D.V.Acc.Claem.Res.(1996)29:144;Lowe,G.Chem.Soc.Rev.(1995)309,Blondelle等Trends Anal.Chem..(1995)14:83;Chen等J..Am.Chem.Soc.(1994)116:2661;美国专利5,359,115,5、362,899及5,288,514;PCT公布说明书WO 92/10092、WO 93/09668、WO 91/07087、WO 93/20242、WO 94/08051)。
本发明化合物的文库可依照多种方法制备,有一些是本领域已知的。例如,“分离-混合”(split-pool)策略可被用于以下方法:珠状功能化聚合支持体被放置于多个反应器内;适合固相肽合成的多种聚合支持体是已知的,有一些可购买到(例如,参见M.Bodansky的“肽合成原则”第二版Springer-Verlag,Berlin(1993))。向每份微珠中加入不同活化氨基酸的溶液,使反应进行以产生多个固定化的氨基酸,每个反应器产生一种。各份衍生微珠随后被洗涤、“混合”(即调配),混合的微珠再被分开,将每份放置到单独的反应器内。另一种活化的氨基酸随后被加入每份微珠。重复合成循环直到获得所需长度的肽。每个合成循环加入的氨基酸残基可以是随机选择的;或者,可选择氨基酸以提供“偏好”文库,例如文库中抑制剂的某些部分是非随机选择的,提供与已知肽(该肽能与抗体相互作用)的已知结构(如抗独特型抗体的抗原结合位点)具有相似性或同源性的抑制剂。可理解的是,用该方法易于产生广泛的多种肽、拟肽或非肽化合物。
“分离-混合”策略产生的肽(如抑制剂)库如可用于制备本发明测试化合物文库。在另一个例证的合成中,“diversomer文库”由Hobbs Dewitt等人的方法制造(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6909(1993))。其他的合成方法包括Houghten的“茶袋法”(tea-bag)技术(参见Houghten等Nature 354:84-86(1991))也可依照题述发明用于合成化合物文库。化合物文库可被筛选以确定是否文库的任一成员都具有所需活性,如果是则鉴定活性种类。筛选组合文库的方法已有描述(参见上述Gordon等JMed.Chem.)。可溶的化合物文库可用适当的受体通过亲和层析进行筛选以分离受体的配体,随后用常规技术(如质谱测定法、NMR等)鉴定分离的配体。固定的化合物可用可溶受体通过接触化合物进行筛选;优选与标签缀合的(如荧光团、比色检测用酶、放射性同位素或发光化合物等)的可溶受体,通过检测标签来指示配体的结合。或者,固定的化合物可被有选择性的释放,并可穿膜弥散与受体相互作用。用于筛选本发明文库的示例性实验如下所述。
在一个实施方案中,可筛选本发明的化合物与天然免疫球蛋白相互作用的能力,方法为分析各化合物直接与免疫球蛋白结合的活性或抑制免疫球蛋白与局部缺血抗原之间相互作用的活性,例如通过测试化合物与免疫球蛋白和溶胞产物(如上皮细胞)的温育(如在单孔或多孔板比如标准的96孔微孔板中)。在该实施方案中,各个化合物的活性可被确定。无测试化合物的一个或多个孔可被用作对照。温育后,每个测试化合物的活性可通过各个孔的实验来确定。因此,多个化合物的活性可被平行测定。
6.5经修饰的抑制剂及药物和诊断制剂
例如,IgM的抑制剂经修饰可提高溶解性和/或促进纯化、鉴别、检测和/或结构鉴定。示例性的修饰包括如添加:谷胱甘肽S-转移酶、A蛋白、G蛋白、钙调蛋白结合肽、硫氧还蛋白、麦芽糖结合蛋白、HA、myc、多精氨酸、多组氨酸、多组氨酸-天冬氨酸或FLAG融合蛋白与标签。在不同的实施方案中,IgM抑制剂可包含一个或多个异源融合。例如,肽可含有相同融合区域的多重拷贝或可含有两个或多个不同区域的融合。融合可出现在肽的N端、肽的C端,或既在N端又在C端。本发明范围也包括本发明肽之间的接头序列以及融合区域,该区域是为了易于构建融合蛋白、或者优化蛋白的表达或融合蛋白的结构参数。在另一个实施方案中,为了在蛋白表达后或此后除去标签,肽可被构建为在融合蛋白和本发明肽之间含有蛋白酶切割位点。合适的内切蛋白酶例子如Xa因子和TEV蛋白酶。
制造融合基因的技术是众所周知的。基本上,按照常规技术,使用用平末端或粘末端连接、限制性核酸内切酶消化以提供合适的末端、适当补平粘末端、碱性磷酸酶处理以避免不需要的连接、以及酶连接,来完成各种编码不同多肽序列的DNA片段的连接。在另一个实施方案中,融合基因可通过常规技术来合成,包括自动DNA合成仪。或者,基因片段的PCR扩增可用锚定引物完成,引物使连续的基因片段之间产生互补突出端,随后可经退火以产生嵌合基因序列(参见分子生物学通用实验方案,Ausubel等编著,John Wiley &Sons:1992)。
IgM抑制剂可以在连接于聚合物的价键的基础上进行化学修饰。典型的聚合物是水溶性的,以便抑制剂附着其上而不会在水相环境例如生理环境下沉淀。聚合物可具有单个的反应基团,如酰化作用的活性酯或烃化作用的醛,使聚合程度可被控制。优选的活性醛是水溶性的聚乙二醇丙醛,或其单C1-C10烷氧基或芳氧基衍生物(参见美国专利5,252,714)。聚合物可以是分支或无分支的。优选的,对于治疗用途的终产物的制备,聚合物应是药学上可接受的。水溶性聚合物或所需的其混合物,可选自如聚乙二醇(PEG)、单甲氧基聚乙二醇、葡聚糖、纤维素或其他基于糖类的聚合物、聚-(N-乙烯基吡咯酮)聚乙二醇、丙二醇同聚物、聚丙烯氧化物/环氧乙烷共聚物、聚氧乙烯多元醇(如丙三醇)和聚乙烯醇。
可用如同位素标签标记IgM抑制剂,以易于用核磁共振或其他合适的方法检测。示例性的同位素标签包括放射性同位素标记例如钾40(40K)、碳14(14C)、氚(3H)、硫35(35S)、磷32(32P)、锝99m(99mTc)、铊201(201Tl)、镓67(67Ga)、铟111(111In)、碘123(123I)、碘131(131I)、钇90(90Y)、钐153(153Sm)、铼186(186Re)、铼188(188Re)、镝165(165Dy)和钬166(166Ho)。同位素标记也可以是非零核自旋的原子,包括如氢1(1H)、氢2(2H)、氚3(3H)、磷31(31P)、钠23(23Na)、氮14(14N)、氮15(15N)、碳13(13C)和氟19(19F)。在某些实施方案中,用同位素标记对抑制剂进行均匀标记,如其中至少50%、70%、80%、90%、95%或98%的抑制剂被标记。在其他的实施方案中,同位素标记位于抑制剂中一个或多个特有的部位,例如标签可以被特异的整合于肽的一个或多个亮氨酸残基。单个抑制剂可含有两个或多个不同的同位素标记,例如肽可既含15N又含有13C标记。
抑制剂可用荧光标签进行标记。在一个示例性的实施方案中,抑制剂与异源的多肽序列融合,该序列产生可检测的荧光信号,包括如绿色荧光蛋白(GFP)、增强的绿色荧光蛋白(EGFP)、海洋肠腔动物(Renilla reniformis)绿色荧光蛋白、GFPmut2、GFPuv4、增强的黄色荧光蛋白(EYFP)、增强的蓝绿荧光蛋白(ECFP)、增强的蓝色荧光蛋白(EBFP)、柠檬色和来自圆盘海葵(discosoma)的红色荧光蛋白(dsRED)。
天然抗体抑制剂(包括天然IgM抗体结合肽或经修饰的天然IgM抗体)的毒性和治疗效果可通过标准的在细胞培养或实验动物中的药学程序来确定,例如确定LD50(总数50%的致死剂量)和ED50(总数50%有治疗效果的剂量)。毒性和疗效的剂量比为治疗指数,可被表达为LD50/ED50的比值。优选显示巨大疗效的天然抗体抑制剂。虽然可使用有毒副作用的天然抗体抑制剂或天然抗体结合肽,但是应小心设计递药系统将这种肽或经修饰的抗体对准作用组织的位点,以使对非发炎细胞的潜在损伤减小到最低并因此降低副作用。
从细胞培养实验和动物实验得到的数据可被用于计算人体中使用剂量的范围。天然抗体抑制剂或天然抗体结合肽的剂量优选在包括ED50的循环浓度的范围内,很少或没有毒性。剂量可根据使用的剂型和采取的给药途径在此范围内变动。对于任何本发明方法中用抑制剂或的肽来说,治疗上的有效剂量最初可从细胞培养实验进行评价。在动物模型中剂量可被计算为完成循环的血浆浓度范围,包括在细胞培养中确定的IC50(即测试化合物对症状的抑制达到最大程度的一半时的浓度)。这种信息可用于更准确的确定人体中的有用剂量。例如通过高效液相色谱可测量血浆中的水平。
在另一个实施方案中,天然抗体抑制剂的单次团注剂(bolus)包括天然IgM抗体结合肽和经修饰的天然IgM抗体,在组织损伤之前、同时或随后给药。典型的单剂量注射可在组织损伤后的数小时、数天或数周。本发明部分基于天然IgM抗体抑制剂阻止再灌注损伤这一发现。单剂量给药可立即在损伤位点附近给予或在如引流或流到损伤位点的脉管附近给予。
天然IgM抗体抑制剂例如天然IgM抗体结合肽或经修饰天然IgM抗体的最初给药要在靶器官或组织损伤的时间点前。这可能对确定为有患再灌注损伤危险的受试者是有用的,例如有再灌注损伤病史或快要经历手术的那些受试者。
还一个实施方案中,天然IgM抗体抑制剂的单次团注随后可以进行天然IgM抗体抑制剂的连续输注给药或另外的团注递药。可连续数小时、数天、数周、数月或数年时间给予抑制剂。此外,考虑到在给予天然抗体结合肽或其他天然抗体抑制剂之前或随后,结合给予另外的治疗剂剂。可与天然IgM抗体抑制剂一起给药的其他的治疗剂剂,包括但不限于抗凝剂和补体抑制剂。
题述抑制剂可以在药学可接受的载体中提供或配制为多种给药方式,包括全身或局部或定位给药。技术和配方通常可在Remmington’s药物科学(Meade Publishing Co.,Easton,PA.)中找到。在某些实施方案中,提供经粘膜或经皮肤递送的抑制剂。对于这种给药,适于透过屏障的渗透剂与多肽一起用于制剂中。这种渗透剂是在本领域被广为人知,包括如跨粘膜给药的胆汁盐和夫西地酸衍生物。此外,可用去污剂以利于渗透。跨粘膜给药可通过鼻腔喷雾或用拴剂进行。对于局部给药,本发明的抑制剂可如本领域普遍所知的被配制为软膏、药膏、凝胶或乳剂。
用载体、赋形剂和添加剂或助剂将天然IgM抗体抑制剂制成适合给予受试者的形式,从而制备本发明的药用组合物。经常用到的载体或助剂包括碳酸镁、二氧化钛、乳糖、甘露醇和其他糖类、滑石粉、乳蛋白质、明胶、淀粉、维生素、纤维素及其衍生物、动物和植物油、聚乙二醇,和溶剂如无菌水、乙醇、丙三醇和多元醇。静脉内载体包括液体和营养补充剂。防腐剂包括抗微生物剂、抗氧化剂、螯合剂和惰性气体。其他药物可接受的载体包括含水溶液,无毒辅料包括盐、防腐剂、缓冲剂等,例如Remington‘s药物科学(Remington′s Pharmaceutical Sciences,15th ed.Easton:MackPublishing Co.,1405-1412,1461-1487(1975))和国家配方手册(TheNational Formulary XIV.,14th ed.Washington:American PharmaceuticalAssociation(1975))中所描述的,因此其内容通过引用结合至本文。依照本领域常规技术调整PH和药用组合物的不同成分的精确浓度。参见Goodman和Gilman的治疗的药理基础(The PharmacologicalBasis for Therapeutics(7th ed.))。
优选以剂量单位制备和给予药用组合物。固态的剂量单位是片剂、胶囊和栓剂,并包括如基于藻酸盐的pH依赖性释放凝胶胶囊。对于受试者的治疗,依赖化合物的活性、给药方式、病症的性质和严重度、受试者的年龄和体重,每日剂量不同是必要的。不过在特定情况下,较高或较低的日常剂量可能是适当的。每日剂量的给药既可通过以单剂量单位或若干较小剂量的形式进行单次给药也可通过以特定间隔细分剂量的多次给药来完成。
依照本发明药用组合物可以治疗上的有效剂量被局部或全身给子。该用途的有效剂量当然依赖于疾病的严重度和受试者的体重及全身状况。如上所述,外用剂量对在原位使用药用组合物给药的量可提供有用的指导,动物模型可用来确定治疗特定病症的有效剂量。例如Langer,Science,249:1527,(1990)和Gilman等(eds.)(1990)描述了不同的见解,每种都通过引用结合至本文。
在一个实施方案中,本发明提供了一种药用组合物,用于给予需要这种治疗的受试者以天然抗体结合蛋白。“给予”本发明的药用组合物可通过任何技术人员已知的方式来实现。优选的“受试者”为哺乳动物,最优选为人类。
通过注射、快速输注、鼻咽吸收、皮肤吸收、直肠和口服,天然IgM抗体抑制剂可以胃肠外、肠道给药。用于肠胃外给药的药物可接受的载体制剂包括无菌或水的或非水溶液、混悬液和乳浊液。非水溶剂的例子是丙二醇、聚乙二醇、植物油如橄榄油,和可注射的有机酯类如油酸乙酯。封闭敷料的载体可用于提高皮肤渗透性及增强抗原的吸收。用于内服的液体剂型一般可由含有液体剂型的脂质体溶液组成。合适的固体或液体药物剂型是如颗粒剂、散剂、片剂、包衣片剂、(微)胶囊、栓剂、糖浆剂、乳剂、混悬液、膏剂、气雾剂、滴剂或安瓿形式的可注射溶液,也有延长活性物质释放的药剂,其制剂中的辅料和添加剂和/或助剂如崩解剂、粘合剂、包衣剂、溶胀剂、润滑剂、调味剂、增甜剂和包含本领域常用的惰性稀释剂如纯水的酏剂。疾病或病症是胃肠道病症时,优选口服制剂或栓剂。
无菌的注射液的制备可通过将天然抗体结合肽以所需量(如约10μg到约10mg/kg)掺入适当溶剂并随后灭菌,例如过滤除菌。此外,可通过标准技术如冷冻干燥或真空干燥来制备散剂。
在另一个实施方案中,为持续释放的特征,与生物可降解的载体一起制备天然IgM抗体抑制剂以在胃肠道持续释放,或使植入长效活性剂的靶器官预期位点的活性有持续释放特征。生物可降解聚合物包括如乙烯-醋酸乙烯共聚物、聚酐、聚乙醇酸、聚乳酸、胶原、多正酯类和聚乙酸。也可使用脂质体制剂。
另外一种递送天然IgM抗体抑制剂(如天然IgM抗体结合肽)的方式是通过递送表达天然抗体结合肽的细胞到需要修复的位点或组织。或者,细胞可与不同载体结合来递送,包括生物相容的、生物降解的或非生物降解的海绵(如胶原或其他细胞外基质材料)、棉花、聚乙醇酸、肠线、纤维素、明胶、葡聚糖、聚酰胺、聚酯、聚苯乙烯、聚丙烯、聚丙烯酸脂、聚乙烯、聚碳酸酯、聚四氟乙烯或形成三维结构的硝酸纤维素化合物(参见Naughton等的美国专利5,858,721,其公开内容通过引用结合至本文)。
任何与有效成分相容的给药途径均可被使用。优选肠胃外给药,如皮下、肌肉或静脉注射。给予的有效成分的剂量依照年龄、体重和病人的个体反应遵医嘱。
病人每日的非体重剂量可在约2.5-5.0mg/kg之间,如约2.5-3.0mg/Kg、约3.0-3.5mg/Kg、约3.5-4.0mg/Kg、约4.0-4.5mg/Kg及大约4.5-5.0mg/Kg。
肠胃外给药的药用组合物可被制备为注射型,包含有效成分和合适的载体。肠胃外投药的载体是本领域众所周知的,包括如水、盐水溶液、林格氏液和或葡萄糖。
载体可包括小量赋形剂以维持药物制剂的稳定性和等渗性。
所引用溶液的制备可依照普通方式完成。
本发明已用参考文献描述了具体的实施方案,但说明书的内容包含所有由本领域技术人员不需超出权利要求书的含义和目的而进行的修改和置换。若需要,组合物可出现于一个包装或分药装置内,其中可包含一个或多个含有有效成分的单位剂型。例如包装可包含金属或塑料薄片,如泡罩包装。包装或分药装置可附有服药说明。
6.6可用天然IgM抗体抑制剂治疗的疾病与病症
IgM抑制剂,例如天然IgM抗体结合肽或经修饰的天然IgM抗体,可用于治疗许多通过结合天然IgM抗体触发的炎性疾病及病症。例如,抑制剂可用来治疗炎性疾病或病症如再灌注损伤、局部缺血损伤、中风、自身免疫溶血性贫血、特发性血小板减少性紫癜、类风湿性关节炎、乳糜泻、高IgM免疫缺陷症、动脉硬化、冠状动脉疾病、脓毒症、心肌炎、脑炎、移植排斥、肝炎、甲状腺炎(如Hashimoto′s甲状腺炎、格雷夫斯病)、骨质疏松症、多肌炎、皮肌炎、I型糖尿病、痛风、皮炎、斑秃、全身性红斑狼疮、硬化性苔藓、溃疡性结肠炎、糖尿病性视网膜病、盆腔炎、牙周病、关节炎、幼年慢性关节炎(如慢性虹膜睫状体炎)、牛皮癣、骨质疏松症、糖尿病型肾病、哮喘、盆腔炎、慢性肝炎、慢性肺炎、肺纤维化、肝纤维化、类风湿性关节炎、克罗恩病、溃疡性结肠炎、烧伤(或热损伤)以及其他中枢神经系统(CNS;如多发性硬化症)、肠胃系统、皮肤和关联结构、免疫系统、肝胆管系统、或机体任何可与炎性成分一起出现的病变位点上的急性和慢性疾病。
炎性病症如再灌注或局部缺血损伤可在自然出现事件后产生,如中风或心肌梗塞。再灌注或局部缺血损伤也可在手术过程期间或其后发生。能引起损伤的示例性的手术操作包括选自血管成形术、支架操作、经皮腔内斑块旋切术和搭桥术的脉管矫正技术。在一个示例性的实施方案中,再灌注或局部缺血损伤出现在心血管组织如心脏。
此外,通过结合天然IgM抗体触发的受试者的疾病或病症可被治疗或预防,方法为通过从受试者除去或灭活天然或病原性IgM和/或产生病原性免疫球蛋白的B细胞(如这里所描述的B-1细胞),从而减少受试者体内病原性免疫球蛋白和/或B细胞的量。
这里描述的方法可包括从受试者体内除去或灭活病原性免疫球蛋白,如这里所述的病原性IgM,和/或产生病原性免疫球蛋白的B细胞(如这里所描述的B-1细胞),从而减少受试者体内病原性免疫球蛋白和/或B细胞的量。
在一个实施方案中,去除或灭活步骤先体外后体内进行。病源性免疫球蛋白或B细胞可通过血液过滤疗法被除去。或者,可用B细胞特异性抗体(如抗B-1抗体或抗CD5抗体或抗CD11G/CD18)除去B细胞。病原性免疫球蛋白如IgM的去除可通过用固定化抗原(如局部缺血特异性抗原)或固定的抗独特型抗体接触受试者的血液进行。去除或灭活病原性免疫球蛋白的步骤可通过给予受试者抗独特型抗体来完成。在另一个实施方案中,去除或灭活B细胞的步骤可通过给予受试者与毒素(如蓖麻毒素或白喉毒素)配对的B细胞靶向部分(如抗体或其抗原结合片段,或抗原)来完成。受试者为哺乳动物,如啮齿类(如小鼠)或灵长类(如人类)。在一个示例性的实施方案中,受试者在下述自然出现的事件如中风后有持续的再灌注或局部缺血损伤,并且在自然出现的事件后数分钟、一到五小时、五到十小时、十到二十小时、一到五天内完成去除步骤。在另外一个示例性的实施方案中,再灌注或局部缺血损伤出现在心血管组织如心脏中,再灌注或局部缺血损伤的预防和/或减少是通过在手术操作之前、期间和/或随后从受试者除去病原性免疫球蛋白和/或B细胞。例如,去除步骤可在手术操作前至少一到五小时、五到十小时、十到二十小时或一、二、三天前完成。去除步骤也可在手术操作期间和之后以适当的时间间隔继续。
6.7诊断分析
本发明进一步提供检测生物样品中天然IgM抗体存在的方法。检测受试者的天然IgM抗体,尤其是哺乳动物,特别是人类,将提供诊断受试者体内炎性疾病或病症的诊断方法。大体上,该方法包括用化合物或能检测样品中本发明天然IgM抗体或本发明核酸的试剂来接触生物样品。术语“生物样品”当用于诊断分析时意为包括分离自受试者的组织、细胞和生物液,也包括受试者体内存在的组织、细胞和液体。
本发明的检测方法可用来在体外以及体内检测生物样品中天然IgM抗体或本发明核酸的存在。例如,体外检测本发明核酸的技术包括Northern杂交和原位杂交。体外检测本发明多肽的技术包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、Western印迹、免疫沉淀、免疫荧光、放射免疫测定和竞争性结合测定。
诊断用核酸可从患者的细胞和组织如骨、血、肌肉、软骨和皮肤获得。核酸如DNA和RNA可直接用于检测或可在分析前被扩增如通过用酶的PCR或其他扩增技术。利用扩增,个体内存在的原核生物的种类和菌株特性可通过原核生物基因的基因型的分析得到。缺失和插入可通过对比参考序列的基因型,扩增产物大小的改变而检测到。点突变可通过核酸如扩增的DNA与本发明核酸(该核酸可被标记)的杂交来进行鉴定。完全配对序列通过核糖核酸酶消化或通过解链温度的不同与错配双链相区别。DNA序列差别也可通过DNA片段的凝胶电泳迁移率(有或无变性剂)改变或通过直接的DNA测序而被检测到。参见Myers等,Science,230:1242(1985)。特殊位置的序列改变也可通过核酸酶保护实验来揭示,如核糖核酸酶和S1保护实验或化学裂解方法。参见如Cotton等,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,85:4397-4401(1985)。
检测本发明核酸(如含有题述核酸序列所示的序列)的检测剂,包括能与本发明核酸杂交的被标记的核酸探针。核酸探针可含有如本发明核酸的全长序列,或其等价物,或其部分,例如长度至少为15、30、50、100、250或500个核苷酸并且足以在严紧条件下与题述核酸序列或其互补序列特异性结合的寡核苷酸。本发明多肽(如含有题述氨基酸序列的氨基酸序列)的检测剂,包括能与本发明天然IgM抗体结合的被标记抗抗体。抗独特型抗体可以是多克隆或单克隆。一个完整的抗独特型抗体或其片段可被使用。对探针或抗体的标记也包括通过偶联(如物理连接)可检测的物质到探针或抗体而直接标记,还包括通过与其他可被直接检测的反应物反应来间接标记探针或抗体。间接标记的例子包括用荧光标记的二抗和用生物素末端标记的DNA探针来检测一抗,使得它能够被荧光标记的抗生物素蛋白链菌素检测到。
在特定的实施方案中,生物样品中本发明核酸的检测包括在聚合酶链式反应(参见美国专利No.4,683,195和4,683,202),如锚定PCR或RACE PCR或者在连接酶链式反应(LCR)中使用探针/引物(参见Landegran等(1988)Science 241:1077-1080;和Nakazawa等(1994)PNAS 91:360-364),后者可特用于区别本发明多核苷酸的正向同源物(参见Abravaya等(1995)Nucleic Acids Res.23:675-682)。该方法可包括以下步骤:从病人收集细胞样品;从样品细胞中分离核酸(例如基因组核酸和/或mRNA);在可使多核苷酸发生杂交或扩增(如果存在)的条件下,用一个或多个与本发明核酸特异性杂交的引物接触核酸样品;和检测扩增产物的存在或缺乏,或检测扩增产物的大小并与对照样品的长度进行比较。
一方面,本发明精心设计(contemplate)出样品中天然IgM抗体存在的检测方法,方法包括:(a)提供待检测天然IgM抗体存在的样品;(b)在允许抗独特型抗体与其配体作用的条件下,用抗独特型抗体接触样品,该抗体反应性对抗来自该物种题述氨基酸序列的8个连续氨基酸残基;及(c)检测抗独特型抗体与其配体的相互作用,从而检测样品中天然IgM抗体的存在。
另一方面,本发明精心设计了样品中天然IgM抗体的检测方法,方法包括:(a)提供检测存在天然IgM抗体的样品;(b)在允许抗独特型抗体与其配体作用的条件下,用特异性结合来自本发明此类多肽的抗独特型抗体接触样品;及(c)检测抗独特型抗体与其配体的相互作用,从而检测样品中此类多肽的存在。
在另一个实施例中,本发明精心设计了对患有与天然IgM抗体存在相关的炎性疾病或病症的患者诊断方法,包括:(a)从病人获得生物样品;(b)检测样品中本发明多肽的存在或缺失,如天然IgM抗体或编码本发明多肽的核酸;及(c)基于患者样品中本发明多肽或编码本发明多肽的核酸的存在,对患有这种炎性疾病的患者进行诊断。
本发明的诊断实验也可用于监测对患有与天然IgM抗体相关的炎性疾病或病症的个体的治疗有效性。例如,用天然IgM抗体治疗剂治疗之前和之后,本发明核酸或本发明多肽的存在和/或量可在患有与天然IgM抗体相关炎性疾病或病症的个体中可被检测到。用治疗剂对个体治疗后,本发明多核苷酸或多肽水平的任何改变可提供有关治疗过程的有效性的信息。特别是,生物样品中存在的本发明多核苷酸或多肽水平的无变化或降低表明对抗这种疾病或病症的治疗是成功的。
或者,本发明多肽如天然IgM抗体可在受试者体内被检测到,通过将特异针对本发明多肽的标记抗体引入受试者体内,如检测天然IgM抗体的抗独特型抗体。例如,抗独特型抗体可被放射性核素标记,其在受试者体内的存在和定位可通过标准显像技术被检测到。
“放射性核素”是指能产生可探测图像的分子,可通过肉眼或适当仪器如正电子发射断层扫描术(PET)和单光子发射断层扫描成像(SPECT)被检测到。用于本公开的放射性核素包括穿透光子发射体,包含γ发射体和x射线发射体。这些射线伴随核转化如电子俘获、β发射和同质异能跃迁。有用的放射性核素包括那些具80和400keV之间的光子及正电子发生器、511keV湮灭光子和可接受的辐射剂量(由于光子被吸收)、颗粒和半衰期的物质。放射性核素包括元素的放射性同位素。放射性核素的例子包括123I、125I、99mTc、18F、68Ga、62Cu、111In、131I、186Re、188Re、90Y、212Bi、211At、89Sr、166Ho、153Sm、67Cu、64Cu、100Pd、212Pb、109Pd、67Ga、94Tc、105Rh、95Ru、11C和76Br。
在一个实施方案中,识别本发明天然IgM抗体的抗独特型抗体可用99mTc进行标记。99mTc是通常用于核医学的放射性核素,综合了所需的物理性质以及6hr半衰期和140kev γ能量(85%作为γ光子),并且因为易于从钼发生器洗脱而具有的广泛的可用性。
公布的显像剂可以以下方式使用。显像剂的有效量(1至50mci)可与药物可接受的载体结合,用于显像研究。根据本公开,公布的显像剂“有效量”被定义为足以产生临床应用仪器可接受的图像的量。本公开显像剂的有效量可在多次注射中给予。本公开显像剂的有效量依据多种因素而变动,如个体的易感性程度、年龄、性别及个体的体重、个体的特异反应和剂量。本公开显像剂的有效量也依照仪器和胶片相关的因素而变动。这种因素的优化完全在本领域技术人员的技术水平内。
用于诊断目的的显像剂的量和成像研究的持续时间取决于治疗病症的性质和严重性、患者经历的治疗处置的性质和患者的特异反应。最终,主治医师会决定给予每个患者的显像剂的量和成像研究的持续时间。
本公开药物可接受的载体可包括任一和全部的溶剂、分散介质、涂层、抗菌剂和抗真菌剂、等渗剂、吸收延迟剂等。这种药学活性物质的介质和剂是本领域众所周知的。本公开的显像剂还可以在合适的稀释剂或佐剂中给予个体,与酶抑制剂或在合适的载体如人血清白蛋白或脂质体中共给药。补充的活性化合物也可被加入到本公开的显像剂。药物可接受的稀释剂包括生理盐水及水缓冲液。这里精心设计的佐剂包括间苯二酚、非离子型表面活性剂例如聚氧乙烯油基醚和聚乙烯十六烷基醚。酶抑制剂包括胰蛋白酶抑制剂、焦碳酸二乙酯和抑肽酶(trasylol)。脂质体包括水包油包水CGF乳剂及常规脂质体(Strejan等(1984)J.Neuroiniiizunol.7,27)。
在一个实施方案中,本公开的显像剂被肠胃外注射给予(静脉、肌肉或皮下注射)。显像剂可配制为无菌、无热源、肠胃外可接受的水溶液。制备这种在pH、等渗性、稳定性等方面有规范(due)肠胃外可接受的溶液,在本领域技术范围内。适合肠胃外投药的本发明的某些药用组合物包含一种或多种显像剂以及药物可接受的无菌粉末,临用前重建为无菌的可注射溶液或分散体,其可含有抗氧化剂、缓冲液、制菌剂、使制剂与目标受者的血液等渗的溶质或悬浮剂或增稠剂。除了心血管显像剂,注射液用制剂应该包括等渗载体如氯化钠溶液、林格氏液、葡萄糖溶液、葡萄糖和氯化钠溶液、乳酸林格氏溶液、葡聚糖溶液、山梨醇溶液、含有聚乙烯醇的溶液、或包含表面活性剂和粘性增强剂的渗透平衡溶液、或本领域已知的其他载体。用于本公开的制剂也可包括稳定剂、防腐剂、缓冲剂、抗氧化剂或本领域技术人员已知的其他添加物。
本发明还包括检测生物样品中天然IgM抗体存在的试剂盒。例如,试剂盒可包含能检测生物样品中本发明多核苷酸或多肽的标记的化合物或剂;确定样品中天然IgM抗体量的工具;及比较样品中天然IgM抗体量与标准量的工具。未标记的化合物也可与化合物标记的说明书一起被提供。化合物或剂可被包装在合适的容器中。试剂盒可进一步包含用试剂盒检测本发明多核苷酸或多肽的说明书。
实施例
本发明经总体上描述后,通过参考以下实施例可更易于理解,所举实施例仅仅是用来说明本发明的某些方面和实施方案,而不是为了以任何方式限制本发明。
实施例1:局部缺血-再灌注损伤的机理
该实施例显示补体系统缺陷的小鼠对局部缺血-再灌注损伤有抵抗力。
为了检验局部缺血-再灌注损伤的机理,缺乏补体C3的小鼠被处理为后肢模型。基于渗透指数约50%的减少,C3-/-小鼠部分的免于损伤(参见Weiser等(1996)J.Exp.Med.1857-1864)。因此,在该鼠类模型中,补体C3是诱导完全损伤所必需的。
Weiser等人的实验没有对补体如何被激活进行鉴定。至少可通过三种不同途径(经典激活途径、凝集素活化途径或旁路激活途径)激活血清补体系统。了解与哪种途径有关,对揭示损伤机理是重要的。例如,经典激活途径可被IgM和IgG免疫球蛋白同种型或被血清识别蛋白C-反应性蛋白非常有效的激活。而凝集素活化途径的激活在识别特异性糖以后,如甘露聚糖结合凝集素(MBL)对甘露聚糖的识别(Epstein等,(1996)Im 771unol 8,29-35)。在这两个途径中,补体C4是与C2形成催化中心组分C3的裂解的酶复合体所必需的。相对而言,旁路激活途径自发激活,导致C3转化成其激活型(C3b)并附着在外源或自身组织上。当通过灭活或置换C3转化酶(Muller-Eberhard,H.J.,(1988)Ann.Rev.Biochem.57,321-347)所有的宿主细胞都表达补体途径放大的抑制剂时,该途径被紧紧控制住。一种确定相关途径的方法是利用C4缺陷小鼠,即不能通过经典或凝集素途径形成C3转化酶。在后肢模型中比较C3或C4缺陷小鼠与野生型对照,揭示C4对完全损伤的诱导也是必需的(上述Weiser等)。这一重要发现说明抗体或MBL可能是有关的。
实施例2:天然IgM介导局部缺血再灌注(I/R)损伤
该实施例显示免疫球蛋白缺陷的小鼠对局部缺血-再灌注损伤有抵抗力。
为了确定I/R损伤的介导是否涉及抗体,完全缺乏免疫球蛋白的小鼠RAG2-/-(重组酶激活基因-2缺陷)与肠模型中补体缺乏动物一起鉴定。明显的是,RAG2-/-小鼠受到保护,其水平与在补体缺乏动物(上述Weiser等)中观察到的类似。由于RAG2-/-动物也缺少成熟淋巴细胞,所以重要的是确定致病效应是抗体依赖性的(Shinkai等(1992)Cell 68,855-867)。为证实损伤的介导是通过血清抗体,缺陷动物用正常小鼠血清(上述Weiser等)或纯化的IgM(Williams等(1999)J.Appl.Physiol 86;938-42)重建。在两种情况下,重建的RAG2-/-小鼠不再受到保护并回复损伤。在后面的实验中,肠损伤模型用于此模型,损伤被认为主要受补体介导。
这些结果的解释是,在局部缺血期间新生抗原要么被表达要么被暴露于上皮细胞表面。循环的IgM表现出识别新的决定簇,结合并激活补体的经典激活途径。虽然抗原的性质是未知的,似乎是IgM而不是IgG主要负责激活补体,理由是用混合的IgG重建的缺陷小鼠未显著回复小鼠的损伤。一个备择假说是存在另外一个起始事件如识别改变的内皮表面的MBL途径,诱导低水平的补体激活,从而暴露新的抗原位点并通过IgM的结合放大该途径。
实施例3:病原性IgM为B-1细胞的产物
既然大部分循环IgM被认为代表天然抗体,即种系基因的重排产物,有可能淋巴细胞的B-1成分缺乏小鼠也可受到保护。B-1细胞具有与较多的常规B-2细胞不同的表型,因为其表达低水平的IgD和CD23,并且大部分表达细胞表面蛋白CD5(Hardy等,(1994)Inmlunol.Rev.:137,91;Kantor等(1993)Aiiiiu.Rev.I7nmunol.11,501-538,1993)。B-1细胞以小鼠中循环的减少、外围淋巴结和脾脏的有限频率的为特征,主要集中在腹膜腔内。为了检验作为病原性IgM来源的B-1细胞的作用,抗体缺乏小鼠(RAG2-/-)用5×105腹膜B-1细胞重建并在处理前静息约30天。循环IgM水平在过继性转移后的一个月内达到近乎正常的范围。在肠局部缺血模型中对B-1细胞重建小鼠的鉴定证实B-1细胞是病原性IgM的主要来源(参见上述Williams等(1999))。这是重要的观察结果,因为B-1细胞天然抗体的所有组成成分比常规B-2细胞所预期的要有限的多。因此,病原性抗体代表种系产物是可能的。
实施例4:Cr2-/-小鼠免于局部缺血再灌注损伤
Cr2-/-敲除小鼠的初步鉴定显示B-1a或CD5+B-1细胞的频率大约减少50%(Ahearn等(1996)Isamnaity 4:251-262)。但是对另一品系的Cr2缺乏小鼠的鉴定未鉴别到相似的减少(Molina等(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93,3357-3361)。CD5+细胞频率的不同是否是由于品系背景的变化或环境的不同还是未知。尽管在Cr2-/-小鼠中B-1细胞频率降低,但IgM循环水平是在正常范围内。这些发现说明在Cr2缺乏动物中IgM的所有组成成分可能是不同的。为检验该假说,鉴定肠I/R模型小鼠。令人惊讶的是,Cr2-/-小鼠同完全抗体缺乏的小鼠一样受到保护(图3)。比较肠模型处理后5天的存活率,证明WT与Cr2缺乏动物相比死亡率显著增加。与增加的死亡率相一致的是,从处理后WT或Cr2-/-缺乏小鼠收获的组织切片上观察到损伤明显减少。
肠粘膜层的重度损伤在WT小鼠或用混合的IgM或B-1细胞重建的Cr2-/-小鼠中被观察到。通过对比,分离自处理后Cr2-/-小鼠的组织切片与阴性对照的切片类似。因此,尽管IgM的循环水平正常,Cr2缺乏小鼠免受损伤。这些结果不仅证实了B-1细胞作为病原性抗体的重要性也说明补体系统不明原因的与天然抗体所有组成成分的形成或维持有关。例如,补体可涉及B-1细胞的正向选择。
实施例5:病原性IgM的鉴定
该实施例描述了从正常B-1细胞产生特异的杂交瘤克隆及对产生病原性IgM的单克隆的鉴定。病原性IgM被显示出在抗体缺陷小鼠体内回复损伤。
在患有补体受体CD21/CD35缺乏的小鼠中的研究,显示小鼠缺少病原性抗体。这一发现在意料之外,因为其血液中含有正常水平的IgM。这些发现导致的假说为,特异的B细胞群,称作B-1细胞负责分泌病原性IgM。例如,将正常小鼠的B-1细胞移植入受体缺乏小鼠(Cr2-/-)回复损伤,确定B-1细胞的重要性。为了鉴定负责损伤的特异性的一种或多种抗体,从正常小鼠收获并富集腹膜B-1细胞群,构建一组杂交瘤克隆。从腹膜细胞的富集部分制备杂交瘤的一般方法包括从七天前用IL-10处理的小鼠收获腹膜细胞,再用磁珠进行负选择富集CD23阴性B细胞。富集的B细胞用FACS进行分析,然后用IgM、Mac-1和CD23特异的Mab染色。富集的群进一步通过与LPS培养24小时而被激活。激活的细胞在PEG存在下用融合配偶体骨髓瘤细胞杂交并在HAT-选择性培养基中生长。通过ELISA筛选杂交瘤的IgM分泌克隆,阳性孔被扩展以纯化IgM。
通过混合各个克隆的等量的IgM产物,分析22个分泌IgM的杂交瘤克隆。用混合的IgM处理的抗体缺乏小鼠与用来自血清的混合IgM处理小鼠的观察结构相似,回复了损伤。这一发现证实病原性IgM在22个杂交瘤中生成。混合抗体划分为两部分,即1-11和12-22,用两部分处理小鼠,发现病原性抗体被划分到含有22号克隆的群。最后,用克隆17或22重建小鼠。克隆22回复损伤而其他克隆都没有(见图4)。
实施例6:补体参与B-1细胞选择
提出两个不同的模型来解释B-1细胞的发育。谱系假说提出B-1细胞在胎儿早期作为特殊群发育(上述Kantor等,1993)。或者,B-1细胞从与常规B细胞同样的祖细胞发育而来,但依赖其环境(即遭遇抗原),他们发育为B-1或保留B-2细胞表现型(Wortis,H.H.(1992)Int.Rev.Immunol.8,235;Clarke,J.(1998)Exp.Med.187,1325-1334)。不论其起源,已知B-1细胞不与B-2细胞以同样的频率由成人骨髓补足,其表现型更类似于胎儿早期肝B细胞或新生儿骨髓(BM)细胞。与早期起源一致的是,其所有组成成分倾向于偏好表达更多邻近的VH基因和N核苷酸的加入有限(Gu et al.(1990)EMBO J 9,2133;Feeney,J.(1990)Exp.Med.172,1377)。考虑到由成人BM干细胞补给的减少,这似乎是适当的,即B-1细胞是自我更新的,抗原刺激对其更新、分化甚至起始选择可能是重要的(Hayakawa等(1986)Eur.J.Immunol.16,1313)。的确为常规模型所固有,B-1细胞必需是抗原选择的。
支持B细胞受体(BCR)信号需要B-1细胞正向选择的证据来自BCR信号改变的突变小鼠。例如,通过CD19、vav或Btk信号的BCR损伤显著影响了B-1细胞的发育。相对的,在诸如CD22或SHIP-1缺乏小鼠中缺失负向选择可导致B-1细胞频率的增加(O′Keefe等(1996)Science 274,798-801;Shultz等(1993)Cell 73,1445)。最近用具有两种不同免疫球蛋白转基因(VH12(B-1细胞表现型)或VHB1-8(B-2细胞表现型))的小鼠进行了巧妙的研究,证实B-1细胞通过自体抗原进行正向选择的观点。例如,单独表达VH12或与B1-8一起表达的B细胞发育为B-1细胞表现型。然而,如果有也只有很少的B细胞被鉴定为仅表达B1-8转基因。因此,这些结果说明遭遇自身PtC的转基因B细胞导致那些表达VH12的细胞扩展。B-1细胞的选择最近由Hardy等人报道(1994)Immunol.Rev.137,91)。在他们的模型中,选择表达特异针对Thy1.1的免疫球蛋白转基因的B细胞,并在表达同源抗原的小鼠中扩展。相对的,转基因B-1细胞在表达替代的异型Thy1.1的小鼠中未被找到。
补体在何处配合B-1细胞发育呢?B-1细胞频率的全面减少及表达I/R损伤有关的IgM的B-1细胞更特别缺少,说明CD21/CD35在正向选择或维持B-1细胞中的作用。补体的一个可能作用是在遭遇同源抗原时增强BCR信号。对CD21/CD35缺乏小鼠的生化研究和分析证明共受体信号在常规B细胞的激活和存活方面的重要性(Carroll,M.C.,(1998)Ann.Rev.Innrzunol.16,545-568;Fearon等(1995)Aiiiiu.Rev.lintizunol.13,127-149)。很可能B-1细胞同样利用共受体信号来增强BCR信号。例如,细菌表达典型的B-1细胞抗原例如磷酸胆碱,并且用补体配体C3d包被细菌可增强共受体与BCR的交联及增强总体信号不是不适当的。因此,较低水平表达的抗原可能需要补体增强作用以使得同源B细胞对其识别和扩展或被正向选择。补体受体另外的作用是将抗原定位于淋巴样隔室内的滤泡树突细胞(FDC)上。不过,既然主要的B-1细胞群占据腹膜组织,细胞是否会遇到淋巴样结构内的FDC还不清楚。B-1细胞经历正向选择的真实位点或多位点是未知的。可能在胚胎发育早期或在新生儿BM中这些细胞必须遭遇同源抗原。若情况如此,可预计在这些隔室中的基质细胞上补体受体结合抗原以递呈给B细胞。可能补体受体能参与发育的两个阶段。首先,补体受体可能增强在最初的正向选择中的抗原信号。其次,作为选择的B-1细胞在外周位点被补足,补体受体可再次参与BCR信号的增强作用。
图5是提出的补体和补体受体在正向选择腹膜B-1淋巴细胞中作用的示意图。补体-配体包被抗原(自身和非自身)的相互作用导致CD21/CD19共受体与细胞表面的BCR的共连接,导致信号和正向选择增强。
实施例7:实施例8-11的材料与方法
噬菌体展示肽库和肽合成
依据厂家推荐,12-mer的M13展示库(纽英伦生物技术公司,MA)用包被有IgMCM-22的MBL-微珠进行四轮筛选并用包被有IgMCM-75的微珠进行2轮筛选。从富集库中选出噬菌体克隆,至少确定10个克隆的有关噬菌体基因的核苷酸序列。所选肽在哈佛大学蛋白组学中心或纽英伦肽公司(Gardner,MA)合成,纯度大于95%。
结合实验
如前所述(Zhang等(2004)PNAS USA 101:3886-91)完成结合测定ELISA。简短的说,结合噬菌体或噬菌体特异肽的IgM通过用饱和量的抗原包被96孔板来确定。阻断后,加入IgM(1或10μg/ml)37℃作用2hr。洗板并随后用碱性磷酸酶标记的羊抗鼠IgM(Sigma,MO)显影。IgM与NMHC-II的结合通过培养预先包被了特异的兔抗(NMHC-11 A & B;Covance Research Products;NMHC-II C为Adelstein(NHLBI,NIH,Bethesda,MD)所赠)或泛肌球蛋白Hc(Sigma,MO)的96孔板确定,而肠溶胞产物制备自IgMCM-22重建的RAG-1-/-小鼠,如所述进行阴性处理或缺血处理(Zhang等(2004)PNAS USA 101:3886-91)。如所述制备溶胞产物用于免疫沉淀(见下)。碱性磷酸酶标记的羊抗鼠IgM(S igma,MO)随后被用于检测结合的IgM。
肠RI模型
如以前所述完成RI的手术设计(Zhang等(2004)PNAS USA 101:3886-91)。简短的说,进行剖腹手术,微型夹(压力125g,Roboz,MD)被用于上部肠系膜动脉,用缝合丝线限制空肠区段20cm的两侧的循环。局部缺血40分钟后,移走微型夹,通过恢复脉管弓形组织的搏动并变为粉红色确定肠系膜动脉的再灌注。闭合切口,所有动物保温3小时。重建的RAG-1-/-动物接受与肽或盐液混合的IgM,在剖腹手术开始前30分钟静脉注射0.2ml。WT动物用盐液或肽处理,在再灌注前静脉注射5分钟。再灌注结束时,采集空肠的局部缺血区段,切下中央的4cm用于病理分析。
组织病理学和免疫组织化学分析
肠组织的冷冻切片用苏木精和伊红(H&E)染色并通过光镜检查粘膜损伤。病理学评分的评价基于Chiu的程序(Chiu等Arch Surg101:484-488,1970;Chiu等Arch Surg 101:478-483,1970),包括如所述(Zhang等(2004)PNAS USA 101:3886-91)直接检查4cm长空肠的所有微绒毛。对免疫荧光而言,冷冻切片与4%(W/V)多聚甲醛固定,与生物素标记的抗鼠IgM(Becton Dickinson,CA)温育不同时间,随后用抗生物素蛋白链菌素-Alexa-568(1∶500稀释,分子探针,OR)温育1小时。通过用FITC标记的兔抗huC4c(DAKO,CO),然后用抗-兔-Alexa 488(Molecular Probes,OR)对C4沉淀物染色来检测。通过用生物素标记的抗鼠C4对连续切片染色1小时,随后用抗生物素蛋白链菌素-FITC(Becton Dickinson,CA)染色来确定抗C4c染色的特异性。通过用FITC标记的抗C3(DAKO,CO)处理来检测C3沉淀物。切片被包埋在有DAPI(分子探针,OR)的抗退色的封固剂内。
抗体结合肽的SPR分析
IgM抗体(IgMCM-22或IgMCM-31)通过胺偶联被固定在Biacore SPRCM5芯片的流动池中,密度为33400个响应单位(RU),如所述的(Vorup-Jensen等PNAS USA 100:1873-1878,2003)约33ng/mm2。简短的说,参照流动池用偶联氨基乙醇-HCl来制备。稀释于PBS运行缓冲液(running buffer)的肽分别流过偶联IgM的表面和参照,25℃流速为10μl/min,数据收集率为10Hz。注射阶段持续240s(注射阶段的结束用图9A、B和C上部的箭头标识)。通过从IgM偶联表面的应答曲线扣除对照池的应答来得到结合等温线。随后每次运行后,通过注射40μl 0.05%(v/v)的聚氧乙烯脱水山梨醇单月桂酸酸酯/PBS使表面再生。
免疫沉淀冷冻组织在溶解缓冲液(含有去垢剂和多种酶抑制剂)中匀浆。溶胞产物的样品被用来分析总蛋白质含量(Biorad试剂盒)以确保分析蛋白的水平相似。溶胞产物与包被了大鼠抗小鼠IgM的琼脂糖微珠4℃混合1hr。随后微珠被小心沉淀收集,在溶解缓冲液中洗涤,然后在还原条件下于SDS样品缓冲液中煮沸以洗脱结合的复合物。样品在6%(W/V)聚丙烯酰胺SDS胶中分离,随后固定并用考马斯蓝或银染剂染色以鉴定蛋白带。
通过串联质谱法鉴定蛋白
从SDS凝胶上切下单个的考马斯蓝染色带,脱色并如前所述经酶消化(Borodovsky等Cherra Biol 9:1149-1159,2002)。用纳流(nanoflow)液偶联的色谱系统(Waters Cap LC)分离肽,并通过串联质谱仪(Q-TOF micro,Waters,MA)确定氨基酸序列。MS/MS数据被处理并用Mascot(Matrixscience)检索数据库Swissprot、TREMBL/New或NCBY非冗余数据库。
实施例8:结合天然IgM抗体的富含天冬酰胺肽的鉴定
我们之前鉴定了在肠RI模型中结合局部缺血组织的天然IgM抗体(IgMCM-22)的杂交瘤克隆,这支持了我们的假设即局部缺血组织相对于正常组织有变化,并且在局部缺血过程中表达的新的表位是自身先天反应的靶标。为鉴定被病原性IgMCM-22结合的配体,用包被有特异性IgM的微珠筛选随机12-mer氨基酸序列的M13噬菌体展示库。
四轮特异性筛选和两轮用对照IgM(克隆IgMCM-75)筛选后,分离到10个噬菌体克隆并测序了有关的M13基因序列的核苷酸序列。值得注意的是,全部10个克隆都包含天冬酰胺-富集序列。用IgMCM-22的相对结合测定选出5个克隆,这些克隆中的一个,P8有最高结合效率,被选出做进一步研究(表4和图6A)。
表4结合IgMCM-22的噬菌体展示肽
噬菌体克隆 | 序列 | 序列编号 |
P1 | YNNNNGNYTYRN | 16 |
P2 | ANTRNGATNNNM | 18 |
P3 | CDSSCDSVGNCN | 20 |
P4 | WNNNGRNACNAN | 22 |
P5 | HNSTSNGCNDNV | 24 |
P6 | NSNSRYNSNSNN | 26 |
P7 | KRNNHNNHNRSN | 28 |
P8 | NGNNVNGNRNNN | 30 |
P9 | NVANHNNSNHGN | 32 |
P10 | SYNNNNHVSNRN | 34 |
天冬酰胺-富集共有序列 | xNNNxNNxNNNN | 14 |
12氨基酸肽(P8)基于噬菌体序列被合成并分析其对噬菌体P8与IgMCM-22结合的抑制作用(图6B)。产生50%抑制的P8肽增加量的滴定,预计浓度为10μmole。本实验表明,基于噬菌体表面表达的多种结合位点,总体的结合亲和力是适当的。该结果说明结合噬菌体P8的IgMCM-22对肽区是特异的,合成肽可被用作真实抗原的模拟位。为进一步鉴定P8肽与IgMCM-22的结合,用肽包被ELISA板并用IgMCM-22或对照IgMCM-75测试结合(图6C)。在1μg/ml的较低浓度下,两个IgM都不结合上述背景。不过,在10μg/ml时,IgMCM-22明显比IgMCM-75结合的更多。总的说来,这三个结果说明肽P8特异性结合IgMCM-22并可被用来鉴定真实抗原。
实施例9:天冬酰胺-富集肽P8阻断肠RI
上述研究已经证明在RAG-1-/-小鼠中的肠RI是IgM依赖的并且仅IgMCM-22足以回复损伤。意料中的,再灌注前用IgMCM-22而非生理盐水重建RAG-1-/-小鼠导致RI(如7A(i)和图7B)。通过对比,在局部缺血小鼠注射前混合IgMCM-22与P8显著阻碍了表观的损伤(意味着病理学评分6±3对31±31;p<0.001)(图7Aii和图7B)。前面用IgMCM-22的肽滴定说明P8最适浓度为10μM,足以阻断50-100μg的IgMCM-22(0.1-0.2μM)。
RI后对再灌注肠组织(空肠)的连续切片进行免疫组织学分析鉴定出IgM和补体C3及C4共定位于用IgMCM-22重建的RAG-1-/-小鼠的微绒毛内(图7Ci-vi)。通过对比,制备自接受P8小鼠的切片显示没有IgM或补体结合的证据(图7Cv-viii)。在IgMCM-22重建的阴性对照中没有观察到IgM或补体的结合,也没有在用对照IgMCM-31重建的RAG-1-/-小鼠或仅用盐液重建的RAG-1-/-小鼠中观察到(Zhang等(2004)PNAS USA 101:3886-91)。因此,P8阻碍IgMCM-22的结合并诱导体内损伤。
可引发RAG-1-/-小鼠中RI的单一天然IgM抗体的鉴定引出了在局部缺血组织上表达的可能新表位的数目以及在野生型(WT)小鼠的所有组成成分中IgM病原性克隆相应数目的普遍性问题。基于天然IgM的所有组成成分相对较少的当前理解,有限的抗体数目是可被预测的(Herzenberg等branauTaol Today 14:79-83,discussion 88-90,1993;Arnold等J ExpMed 179:1585-1595,1994)。此外,天然IgM抗体的配体被认为是高度保守的结构,在数量上也可能是有限的。为了测试P8是否代表主要自体抗原的模拟位,在肠模型再灌注前,用P8(约10μM)处理WT小鼠5分钟。在再灌注前,对用盐水或对照肽处理的小鼠空肠组织经分析,鉴定出如所预期的对微绒毛造成显著损伤(图7Aiii)。通过对比,再灌注前用P8预处理5分钟的WT小鼠阻断表观损伤(是指病理学评分5±3对24±16及23±19;p分别小于0.005和0.027)(图7A(iv)和图7B)。如所预期的,IgM、C4和C3共定位于RI处理的WT小鼠的微绒毛内(图7Cix-xii)。通过对比,在给予P8小鼠的再灌注组织中没有观察到表观的IgM或补体沉积物(图7Cxiii-xvi)。这些结果表明引发RI所必需的关键表位的数量是有限的,因为单个肽阻断损伤和IgM及补体的沉积。
实施例10:IgMCM-22对自身肽的免疫沉淀作用
用P8的氨基酸序列对基因组数据库进行同源性检索显示没有精确的匹配。因此,免疫沉淀方法用来鉴定用IgMCM-22重建RAG-1-/-小鼠的局部缺血抗原/多种抗原。
用优化量的IgMCM-22重建RAG-1-/-小鼠,处理为肠局部缺血并以不同长度的时间再灌注,即在采集组织前0分钟或15分钟。IgM抗原的免疫复合物在不同的时间点从空肠的溶胞产物中分离,在诱导条件下通过SDS-PAGE分离。染色胶的分析表明所有时间点在较低的分子量有共同的带(图8A)。不过,在15分钟时,鉴定出一个高分子量(>200kD)的带(图8A)。
从染色胶上切下蛋白带,酶消化并用所述的串连质谱对肽进行分析(Kocks等Mol Cell Proteonzics 2:1188-1197,2003)。被洗脱的肽的分析表明共同带约25、50和75kDa,分别代表免疫球蛋白轻链(Lc)和IgG重链(Hc)及IgM Hc。高分子量带的分析产生的肽序列与非肌肉肌球蛋白重链(NMHC)II型A及C同种型同源(表5)。
表5:质谱测定结果
匹配的蛋白 | 质谱测定的肽序列 |
小鼠非肌肉肌球蛋白的重链II-A(gi/20137006;GenBankTM检索号:NP071855)总分=130;匹配的肽=6 | VVFQEFR(MS-1;SEQ ID NO:39)CNGVLEGIR(MS-2;SEQ ID NO:40)KFDQLLAEEK(MS-3;SEQ ID NO:41)KFDQLLAEEK EQADFAIEALAK(MS-4;SEQ ID NO:42)QLLQANPILEAFGNAK(MS-5;SEQID NO:43) |
小鼠非肌肉肌球蛋白重链II-C(gi/33638127;GenBankTM检索号:AAQ24173)总分=133;匹配的肽=7 | CNGVLEGIRVKPLLQVTR(MS-6;SEQ ID NO:44)KFDQLLAEEK KFDQLLAEEKEQADFALEALAK LAQAEEQLEQESR(MS-7;SEQ ID NO:45)QLLQANPILEAFGNAK(MS-8;SEQID NO:46) |
*分数为-10×Log(P),其中P为观察到的匹配为随机事件的概率。个别离子分数>53说明一致性或广泛的同源性(p<0.05)。
在相似的实验中用从WT小鼠制备的溶胞产物处理肠RI 3小时,相似大小的200kD带也被观察到,并且序列分析鉴定为NMHC-A和C肽。
在小鼠和人类基因组中已鉴定II型NMHC的三种形式(A、B和C)(Golomb等J Biol Chem 279:2800-2808,2004;Kelley等,JCell Biol 134:675-687,1996)。所有的真核细胞都表达II型NMHC,但三种同种型的分布不同。NMHC-II的A和B大约有85%的同源性;而NMHC-II C约有65%相似性(Golomb等,J Biol Chem 279:2800-280S,2004)。这三个同种型在小鼠和人类中高度保守。
为证实IgMCM-22与II型NMHC的结合,使用了ELISA方法。板包被有特异性针对NMHC三种形式的抗体或泛肌球蛋白抗体,以从制备自RAG-1-/-小鼠空肠的溶胞产物捕获有关抗原。随后,IgMCM-22或IgMCM-31被加入并用标记的抗鼠IgM抗体显像。NMHC-II的全部三种亚型都被观察到与IgMCM-22而不是IgMCM-31超过本底结合(图8B)。结合的序列分析及ELISA结果表明IgMCM-22识别II型NMHC的保守区域。
为确定肌球蛋白是否被暴露给局部缺血后的循环抗体,用纯化的兔抗泛肌球蛋白重链的IgG流分重建RAG-1-/-小鼠。在用兔IgG重建RAG-1-/-小鼠后,假处理小鼠的组织分析显示没有损伤或IgG沉积的证据。通过对比,在再灌注前,用泛肌球蛋白IgG重建的局部缺血的RAG-1-/-小鼠发展出比盐水对照显著的RI(33±11对11±8,p<0.028)(图8C)。相应的,局部缺血后肌球蛋白被暴露于循环抗体。
比较三种NMHC-II同种型的序列与P8肽序列,鉴定出一个表观同源性的区域(表6)。全部三种同种型包括与P8序列相似的基序NxxxxNxNx。为进一步研究制备12个氨基酸的自身肽(N2)序列(NMHC-II C同种型)。
表6:NMHC II A-C的保守同源性序列
噬菌体克隆 | 序列 |
P8 | NGNNVNGNRNNN(SEQ ID NO:30) |
共有序列 | XNNNx(N/D)NxN(N/D)N(N/v)(SEQ ID NO:14) |
NMHC-II | 序列 |
小鼠II A(542-556) | LMKNMDPLNDI(SEQ ID NO:36) |
人类II A(585-596) | LMKNMDPLNDI |
小鼠II B(592-603) | LMKNMDPLNDNV(N2;SEQ ID NO:38) |
人类II B(592-603) | LMKNMDPLNDNV |
小鼠II C(607-619) | LMKNMDPLNDNV(N2;SEQ ID NO:38) |
人类II C(611-622) | LMKNMDPLNDNV |
用等离子体振子共振分析检测结合IgMCM-22的表面区域(图9)。N2肽被注射到偶联有IgMCM-22的表面(图9A),产生强烈的响应,从稳态响应水平计算的相应的Kd值为12361μM(均值±SD,n=2)(图9C)。相反,当对照肽被注射到特异IgM偶联的表面时(图9B)或当N2肽被注射到偶联IgMCM-31对照的表面时(图9D),没有观察到结合。
实施例11:自身肽N2阻断肠RI
为检测N2与致病性IgM的功能性结合,重建RAG-1-/-小鼠并在RI模型中处理前约100纳摩尔的肽(或盐水对照)与IgMCM-22混合。制备自IgMCM-22和盐水处理的小鼠再灌注空肠组织切片的组织学分析如所预期的鉴定出损伤和IgM与补体沉积(图5Ai和5B)。通过对比,再灌注前混合了IgMCM-22的N2肽防止损伤(平均病理学评分13±8对31±10;p<0.049)(图10Aii和10B)。此外,当IgMCM-22与N2肽在注射到RAG-1-/-小鼠前混合时,再灌注空肠内未观察到IgM和补体的沉积(图10Ci-viii)。因此,如用合成肽P8所观察到的,自身肽N2阻断体内IgMCM-22的功能性结合。
为检测自身肽N2是否代表肠RI中主要的自身表位,在肠模型中再灌注损伤前用约40μM的合成肽P8处理WT小鼠。盐水处理WT小鼠的组织切片的组织学分析鉴定出所预期的损伤和IgM及补体的沉积(图10Aiii和10Cix-xii)。通过对比,用自身肽N2处理WT小鼠,阻断两种损伤(平均病理学评分8±5对22±17)并阻断IgM及补体的沉积(图10Aiv,图10B,图10Cxiii-xvi)。这些结果说明II型NMHC蛋白内的保守区域代表肠模型中局部缺血后天然IgM结合的主要的抗原表位。
通过引用而结合
这里提到的所有出版物、专利和专利申请书都通过引用整体结合到本文中,如同每个出版物或专利个体都被特异的和个别的表明以通过引用而结合到本文中。在冲突的情况下,本申请包括这里的任何定义会加以调整。
任何多核苷酸和多肽序列也是通过完整引用来整合的,引用其进入关联的公开数据库的检索号,如在环球网上扩展域名为tigr.org的基因组研究院(TIGR)和或在环球网上扩展域名为ncbi.nlm.nih.Gov的美国国立生物技术信息中心(NCBI)。
等价物
本领域技术人员只用常规实验就会认识或能确定本发明这里描述的特定实施方案的许多等价物。通过以下权利要求书,这种等价物被特地包括其中。
序列表
<110>CARROLL,MICHAEL C.
MOORE JR.,FRANCIS D.
HECHTMAN,HERBERT B.
<120>天然IgM抗体及其抑制剂
<130>CRA-002.01
<140>11/069,834
<141>2005-03-01
<150>60/588,648
<151>2004-07-16
<150>60/549,123
<151>2004-03-01
<160>65
<170>PatentIn Ver.3.3
<210>1
<211>402
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>1
caggttcagc tgcagcagtc tggggctgag ctggtgaagc ctggggcctc agtgaagatt 60
tcctgcaaag cttctggcta cgcattcagt agctactgga tgaactgggt gaagcagagg 120
cctggaaagg gtcttgagtg gattggacag atttatcctg gagatggtga tactaactac 180
aacggaaagt tcaagggcaa ggccacactg actgcagaca aatcctccag cacagcctac 240
atgcagctca gcagcctgac ctctgaggac tctgcggtct atttctgtgc aagagaagat 300
tactacggta gtgactggta cttcgatgtc tggggcacag ggaccacggt caccgtctcc 360
tcaggtaagc tggctttttt ctttctgcac attccattct ga 402
<210>2
<211>133
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>2
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Gln Ile Tyr Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Asp Tyr Tyr Gly Ser Asp Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly
100 105 110
Thr Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Lys Leu Ala Phe Phe Phe
115 120 125
Leu His Ile Pro Phe
130
<210>3
<211>15
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>3
agctactgga tgaac 15
<210>4
<211>5
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>4
Ser Tyr Trp Met Asn
1 5
<210>5
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<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>5
cagatttatc ctggagatgg tgatactaac tacaacggaa agttcaaggg caaggcc 57
<210>6
<211>17
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>6
Gln Ile Tyr Pro Gly Asp Gly Asp Thr Asn Tyr Asn Gly Lys Phe Lys
1 5 10 15
Gly
<210>7
<211>324
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>7
attgtgatga cccagtctgc tgcttcctta gctgtatctc tggggcagag ggccaccatc 60
tcatacaggg ccagcaaaag tgtcagtaca tctggctata gttatatgca ctggaaccaa 120
cagaaaccag gacagccacc cagactcctc atctatcttg tatccaacct agaatctggg 180
gtccctgcca ggttcagtgg cagtgggtct gggacagact tcaccctcaa catccatcct 240
gtggaggagg aggatgctgc aacctattac tgtcagcaca ttagggagct tacacgttcg 300
gaggggggac caagctggaa ataa 324
<210>8
<211>107
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>8
Ile Val Met Thr Gln Ser Ala Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly Gln
1 5 10 15
Arg Ala Thr Ile Ser Tyr Arg Ala Ser Lys Ser Val Ser Thr Ser Gly
20 25 30
Tyr Ser Tyr Met His Trp Asn Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro Arg
35 40 45
Leu Leu Ile Tyr Leu Val Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Ala Arg
50 55 60
Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His Pro
65 70 75 80
Val Glu Glu Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln His Ile Arg Glu
85 90 95
Leu Thr Arg Ser Glu Gly Gly Pro Ser Trp Lys
100 105
<210>9
<211>45
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>9
agggccagca aaagtgtcag tacatctggc tatagttata tgcac 45
<210>10
<211>15
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>10
Arg Ala Ser Lys Ser Val Ser Thr Ser Gly Tyr Ser Tyr Met His
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<210>11
<211>21
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>11
cttgtatcca acctagaatc t 21
<210>12
<211>7
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>12
Leu Val Ser Asn Leu Glu Ser
1 5
<210>13
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(1)..(3)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(13)..(15)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(22)..(24)
<223>a、c、g或t
<400>13
nnnaayaaya aynnnaayaa ynnnaayaay aayaay 36
<210>14
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<220>
<221>MOD_RES
<222>(1)
<223>多种氨基酸
<220>
<221>MOD_RES
<222>(5)
<223>多种氨基酸
<220>
<221>MOD_RES
<222>(8)
<223>多种氨基酸
<400>14
Xaa Asn Asn Asn Xaa Asn Asn Xaa Asn Asn Asn Asn
1 5 10
<210>15
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(18)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(27)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(33)
<223>a、c、g或t
<400>15
tayaayaaya ayaayggnaa ytayacntay mgnaay 36
<210>16
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>16
Tyr Asn Asn Asn Asn Gly Asn Tyr Thr Tyr Arg Asn
1 5 10
<210>17
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
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<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
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<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(12)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(18)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<400>17
gcnaayacnm gnaayggngc nacnaayaay aayatg 36
<210>18
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>18
Ala Asn Thr Arg Asn Gly Ala Thr Asn Asn Asn Met
1 5 10
<210>19
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(9)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(12)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(27)
<223>a、c、g或t
<400>19
tgygaywsnw sntgygayws ngtnggnaay tgyaay 36
<210>20
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>20
Cys Asp Ser Ser Cys Asp Ser Val Gly Asn Cys Asn
1 5 10
<210>21
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(15)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(18)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(33)
<223>a、c、g或t
<400>21
tggaayaaya ayggnmgnaa ygcntgyaay gcnaay 36
<210>22
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>22
Trp Asn Asn Asn Gly Arg Asn Ala Cys Asn Ala Asn
1 5 10
<210>23
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(9)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(12)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(15)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(36)
<223>a、c、g或t
<400>23
cayaaywsna cnwsnaaygg ntgyaaygay aaygtn 36
<210>24
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>24
His Asn Ser Thr Ser Asn Gly Cys Asn Asp Asn Val
1 5 10
<210>25
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(6)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(12)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(15)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(18)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(30)
<223>a、c、g或t
<400>25
aaywsnaayw snmgntanaa nwsnaaywsn aayaay 36
<210>26
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>26
Asn Ser Asn Ser Arg Tyr Asn Ser Asn Ser Asn Asn
1 5 10
<210>27
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(6)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(30)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(33)
<223>a、c、g或t
<400>27
aarmgnaaya aycayaayaa ycayaaymgn wsnaay 36
<210>28
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>28
Lys Arg Asn Asn His Asn Asn His Asn Arg Ser Asn
1 5 10
<210>29
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(6)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(15)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(27)
<223>a、c、g或t
<400>29
aayggnaaya aygtnaaygg naaymgnaay aayaay 36
<210>30
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>30
Asn Gly Asn Asn Val Asn Gly Asn Arg Asn Asn Asn
1 5 10
<210>31
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(6)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(9)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(33)
<223>a、c、g或t
<400>31
aaygtngcna aycayaayaa ywsnaaycay ggnaay 36
<210>32
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>32
Asn Val Ala Asn His Asn Asn Ser Asn His Gly Asn
1 5 10
<210>33
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(3)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(27)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(33)
<223>a、c、g或t
<400>33
wsntayaaya ayaayaayca ygtnwsnaay mgnaay 36
<210>34
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>34
Ser Tyr Asn Asn Asn Asn His Val Ser Asn Arg Asn
1 5 10
<210>35
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(3)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<400>35
ytnatgaara ayatggaycc nytnaaygay aayath 36
<210>36
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>36
Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Ile
1 5 10
<210>37
<211>36
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的DNA序列
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(3)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(21)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(24)
<223>a、c、g或t
<220>
<221>经修饰的碱基(modified_base)
<222>(36)
<223>a、c、g或t
<400>37
ytnatgaara ayatggaycc nytnaaygay aaygtn 36
<210>38
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>38
Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val
1 5 10
<210>39
<211>7
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>39
Val Val Phe Gln Glu Phe Arg
1 5
<210>40
<211>9
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>40
Cys Asn Gly Val Leu Glu Gly Ile Arg
1 5
<210>41
<211>10
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>41
Lys Phe Asp Gln Leu Leu Ala Glu Glu Lys
1 5 10
<210>42
<211>12
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>42
Glu Gln Ala Asp Phe Ala Ile Glu Ala Leu Ala Lys
1 5 10
<210>43
<211>16
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>43
Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala Lys
1 5 10 15
<210>44
<211>9
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>44
Val Lys Pro Leu Leu Gln Val Thr Arg
1 5
<210>45
<211>13
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>45
Leu Ala Gln Ala Glu Glu Gln Leu Glu Gln Glu Ser Arg
1 5 10
<210>46
<211>16
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>46
Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala Lys
1 5 10 15
<210>47
<211>7355
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>47
tgggcagggc acggaaggct caagaacctg acctgctgca gcttccagtc tcgcgttcgc 60
cccaccccgc cgcgccgccc gagcgctcga gaaagtccac tcggaagaac cagcgcctgt 120
tccccgggca gacccaggtt caggtcctgg ccgcaagtca ccatggctca gcaggctgca 180
gacaagtacc tctatgtgga taaaaacttc atcaataacc cgctggccca agctgactgg 240
gctgccaaga agttggtatg ggtgccttcc agcaagaatg gctttgaacc agctagcctc 300
aaggaggagg tgggagaaga ggccattgta gagctggtag agaatgggaa gaaggtgaag 360
gtgaacaagg acgacatcca gaagatgaac ccacccaagt tctccaaggt ggaggacatg 420
gcagagctca cgtgcctcaa cgaagcttcg gtgctgcaca acctcaagga gcgatactac 480
tcagggctta tctacaccta ttcaggcctg ttctgtgtgg tcatcaaccc ttataagaac 540
ctgcccatct actcagagga gatcgtggag atgtacaagg gcaagaagag gcacgagatg 600
ccaccccaca tctacgccat cacagatact gcctaccgga gcatgatgca ggaccgggaa 660
gatcagtcca tcctgtgcac gggggagtct ggagcaggga agacagagaa caccaagaaa 720
gtcatccagt acctggcaca tgtggcctcc tcacacaaga gcaagaagga ccagggggag 780
ttggagcggc agctgctaca ggccaaccct atcctagagg cctttggaaa cgccaagacg 840
gtgaagaatg acaactcctc tcgattcggt aaattcattc gtatcaactt tgatgtcaat 900
ggctacattg ttggtgccaa cattgagact tatcttctgg agaaatctcg tgctatccgc 960
caagccaaag aggagcggac cttccacatc ttctactacc tgctgtctgg ggccggagaa 1020
cacctgaaga ctgatctcct gttggagcca tacaacaaat accgcttcct gtccaacggg 1080
cacgtcacca tccctgggca gcaggacaag gacatgttcc aggagacaat ggaggccatg 1140
agaattatgg gtatcccaga ggatgagcag atgggcttgc tgcgggtcat ctctggggtc 1200
cttcagcttg gcaacattgc cttcaagaag gagcggaaca ctgaccaggc gtccatgccg 1260
gacaacacag ctgctcaaaa ggtgtcccac ctcctgggga tcaatgtgac cgacttcacc 1320
agaggcatcc tcaccccacg catcaaggtg ggcagagact atgtgcagaa ggcgcagact 1380
aaagagcagg ctgactttgc cattgaggcc ttggccaagg ctacctatga gcggatgttc 1440
cgctggctgg tgcttcgcat caacaaagct ctggacaaga ccaagaggca gggcgcctca 1500
tttatcggga tcctggacat cgctggcttt gagatctttg atctgaactc cttcgagcag 1560
ctgtgcatca actacaccaa cgagaagctg cagcagctgt tcaaccacac catgttcatc 1620
ctggagcagg aggagtacca gcgagagggc atcgagtgga acttcatcga cttcggcctg 1680
gacctgcagc cctgcatcga cctcattgag aagccggcgg gtcccccagg catcctggcc 1740
ctgctagatg aggagtgctg gtttcctaag gccactgaca agagcttcgt ggagaaggtg 1800
gtgcaggagc agggcaccca ccccaagttc cagaagccca agcaactgaa ggacaaggct 1860
gatttctgca ttatccacta tgccggcaag gtggactata aagctgacga gtggctgatg 1920
aagaacatgg accccttgaa cgacaacatc gccacgctgc ttcaccagtc ctcagacaag 1980
tttgtctctg agctgtggaa ggatgtggat cggatcattg gcttggacca agtggctgga 2040
atgtccgaga cagcactacc tggtgccttc aagacccgga agggcatgtt ccgtactgtc 2100
ggacagctgt acaaggagca gctggccaag ctcatggcca cgttgaggaa taccaacccc 2160
aacttcgtgc gctgcatcat tcccaaccat gagaagaagg ccggcaaact ggacccgcac 2220
ttggtgctgg accagctgcg ctgcaatggc gtccttgagg gcatccggat ctgccgccag 2280
ggctttccca acagggtggt cttccaggag ttccggcaga ggtatgagat cctcaccccc 2340
aactccatcc cgaagggctt catggatggc aagcaagcgt gtgtgctcat gatcaaagcc 2400
ttggagcttg acagcaacct gtaccgcatc ggccagagca aagtgttctt ccgggcagga 2460
gtgctagccc acctggagga agagcgggac ctgaagatca ccgatgtcat cattggcttc 2520
caggcctgct gcaggggcta cctggccagg aaggcctttg ccaagaggca gcaacagctg 2580
accgccatga aggtcctaca gaggaactgt gctgcgtacc tcaggctgcg caactggcag 2640
tggtggaggc tcttcaccaa ggtcaagccc ctgttgaact caataagaca tgaggatgag 2700
ctgttagcca aggaggcgga actgacaaag gttcgagaga aacatctggc tgcagagaac 2760
aggctgacag agatggagac gatgcagtct cagctcatgg cagagaagct gcagcttcag 2820
gagcagctgc aggcggagac agagctgtgt gccgaggctg aggagctccg ggcccgtctg 2880
acagcgaaga agcaggagct ggaggagatc tgccatgacc tggaggccag ggtggaggag 2940
gaggaggagc gctgccagta cctgcaggcc gagaagaaga agatgcagca gaacatccag 3000
gaacttgagg agcagttgga ggaggaggag agcgcccggc agaagctgca gcttgagaag 3060
gtgaccaccg aggccaagct gaagaaactg gaggaggacc agatcatcat ggaggaccag 3120
aactgcaaac tggccaagga gaagaaactg ctggaagaca gagtagctga attcactacc 3180
aacctcatgg aagaggagga gaagtccaag agcctggcca agctcaagaa caagcacgag 3240
gcaatgatca ccgacctgga agagcgcctc cgtagggagg agaagcagag gcaggagttg 3300
gagaagaccc gtcgcaagct ggagggagac tccacagacc tcagtgacca gattgctgag 3360
ctccaggcgc agatagcaga gctcaagatg cagctggcca agaaggagga ggagttgcag 3420
gctgccttgg ccagagtgga agaagaagct gctcagaaga atatggccct gaagaagatc 3480
cgagaactgg aaactcagat ctctgagctc caggaggacc tggagtcgga gcgagcctcc 3540
aggaataaag ccgagaagca gaaacgggat ctgggagagg agctggaggc gctgaagaca 3600
gagctggagg acacgctgga ctccacggct gcccagcagg agctgaggtc gaagcgtgag 3660
caggaggtga gcatcctgaa gaagactctg gaggacgagg ccaagaccca tgaggcccag 3720
atccaggaga tgaggcagaa gcactcacag gctgtggagg agctggcaga tcagttggag 3780
cagacgaagc gggtaaaagc tacccttgag aaggcgaagc agaccctgga gaatgagcgg 3840
ggagagctgg ccaatgaggt gaaggccctg ctgcaaggca agggcgactc agagcacaag 3900
cgcaagaagg tggaggcgca gctgcaagaa ctgcaggtca agttcagcga gggagagcgc 3960
gtgcgaaccg aactggccga caaggtcacc aagctgcagg ttgaactgga cagtgtgacc 4020
ggtctcctta gccagtctga cagcaagtcc agcaagctta cgaaggactt ctctgcgctg 4080
gagtcccagc ttcaggacac acaggagttg ctccaggagg agaaccggca gaagctgagc 4140
ctgagcacca agctcaagca gatggaggat gagaaaaact ccttcaggga gcagctggag 4200
gaggaggagg aggccaagcg caacttggag aagcagatcg ccacgctcca tgcccaggtg 4260
accgacatga agaagaagat ggaggacggt gtagggtgcc tggagactgc agaggaggcg 4320
aagcggaggc ttcagaagga cttggaaggc ctgagccagc ggcttgagga gaaggtggct 4380
gcctacgata agctggagaa gaccaagaca cggctgcagc aggagctgga cgacctgctg 4440
gttgacctgg accaccagcg gcagagcgtc tccaacctgg aaaagaagca gaagaagttc 4500
gaccagctcc tagccgagga gaagaccatc tcggccaagt atgcagagga gcgtgaccga 4560
gctgaggctg aggcccgtga gaaggagaca aaggcgctat cactggcccg ggcgcttgag 4620
gaggccatgg agcagaaggc agagctggag cggctcaaca agcagttccg cacggagatg 4680
gaggacctca tgagctccaa ggatgacgtg ggcaagagtg tccacgagct ggagaagtcc 4740
aagcgggcct tggagcagca ggtggaggag atgaagaccc agctggagga gctggaggat 4800
gagctgcagg ccacggagga tgccaagctc cgcctggagg tgaacctgca ggccatgaag 4860
gcccagtttg agcgggatct gcagggccgg gatgaacaga gcgaggagaa gaagaagcag 4920
ctggtcagac aggtgcggga gatggaggcg gagctggagg atgagaggaa gcagcgctcc 4980
atggccatgg ccgcacgcaa gaaactggag atggatctga aggacctgga ggcacacatt 5040
gacacagcca ataagaaccg ggaagaggcc atcaaacagc tgcggaagct tcaggcccag 5100
atgaaggact gcatgcggga gctggacgac acgcgcgcct cccgggagga gatcctggcg 5160
caggccaagg agaatgagaa gaagctgaag agcatggagg ccgagatgat tcagctgcag 5220
gaggaactgg cagctgctga gcgtgctaag cgtcaggccc aacaggaacg ggacgagctg 5280
gctgatgaga tcgccaacag cagtggcaaa ggggccctag cattagagga gaagcggcga 5340
ctggaggccc gcattgccct gctggaggag gagctggagg aggaacaggg caacacggag 5400
ctgatcaacg atcggctgaa gaaggccaac ctgcagatcg accaaataaa caccgacctg 5460
aacctggaac gcagccacgc acagaagaat gagaatgcgc gacagcagct ggaacgccag 5520
aacaaggagc tcaaggccaa gctgcaggaa atggagagtg ctgtcaagtc caaatacaag 5580
gcctccatcg cggccttgga ggccaaaatt gcacagctgg aggaacagct ggacaacgag 5640
accaaggagc gccaggcagc ctccaagcag gtgcgccgga cggagaagaa gctgaaggac 5700
gtgctgctgc aggtggagga cgagcggagg aacgcggaac agttcaagga ccaggctgac 5760
aaggcgtcca cccgcctgaa gcagcttaaa cggcagctag aggaggctga agaggaggcc 5820
cagcgggcca atgcctcacg ccggaagctg cagcgtgagc tggaagatgc cacagagacc 5880
gctgatgcta tgaaccgcga ggtcagctcc ctgaagaaca aactgaggcg tggggacctg 5940
ccatttgtcg tgactcgccg aattgttcgg aaaggcactg gcgactgctc agacgaggag 6000
gtcgacggta aagcagatgg ggccgatgcc aaggcagctg aataggagct tctcctgcag 6060
cccaggcgga tggacaaacg gctctgcctc cctcccccaa ccctccacac ccctgccttg 6120
agactgctct gaccatgtcc ccctcctccc aaggccttcc cgagggcatt ggcttcctct 6180
gctgcagccc ttccagtcct ccataccctt tgagaatctg ataccaaaga gtccaggctg 6240
gctcaggccg gatgacccac agggtcttgt cctccttgcc tgaaagcacg ggtggtgggc 6300
aagaagggcg gccattggag taggcacaag agttttctat gaatctattt tgtcttcaga 6360
taaagatttt gatagctcag gcctctagta gtgttaccct ccccgacctc ggctgtcccc 6420
gtcccccgtc ccccctgctg ttggcaatca cacacggtaa cctcatacct gccctatggc 6480
ccccttccct gggccctatt ggtccagaag gagcctctgt ctgggtgcag aacatggggc 6540
actctgggaa tccccccact cccttctggg cagcactggt gcctctgctc ctccgactgt 6600
aaaccgtctc aagtgcaatg cccctcccct cccttgccaa ggacagaccg tcctggcacc 6660
ggggcaaacc agacagggca tcagggccac tctagaaagg ccaacagcct tccggtggct 6720
tctcccagca ctctagggga ccaaatatat ttaatggtta agggacttgc agggcctggc 6780
agccagaata tccaagggct ggagcccact gtgcgctctg gtgcctctcc taggactggg 6840
gccaagggtg gtcgagctgt gccacccact ctatagcttc aagtctgcct tccacaagga 6900
tgcttttgaa agaaaaaaaa aggttttatt tttcccttct tgtagtaagt gctctagttc 6960
tgggtgtctt cactgccttg ccctggaact gtgtttagaa gagagtagct tgccctacaa 7020
tgtctacact ggtcgctgag ttccctgcgc actgcacctc actgtttgta aatgctgtga 7080
ttaggttccc ttatggcagg aaggcttttt ttttcttttt ttttttcttt tctttttttt 7140
ttttttaaag gaaaaccagt caaatcatga agccacatac gctagagaag ctgaatccag 7200
gtcccaaagg cgctgtcata aaggagcaag tgggacccgc accccttttt ttatataata 7260
caagtgcctt agcatgtgtc gcagctgtca ccactacagt aagctggttt acagatgttt 7320
ccactgagcg tcacaataaa gagtaccatg tccta 7355
<210>48
<211>1960
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>48
Met Ala Gln Gln Ala Ala Asp Lys Tyr Leu Tyr Val Asp Lys Asn Phe
1 5 10 15
Ile Asn Asn Pro Leu Ala Gln Ala Asp Trp Ala Ala Lys Lys Leu Val
20 25 30
Trp Val Pro Ser Ser Lys Asn Gly Phe Glu Pro Ala Ser Leu Lys Glu
35 40 45
Glu Val Gly Glu Glu Ala Ile Val Glu Leu Val Glu Asn Gly Lys Lys
50 55 60
Val Lys Val Asn Lys Asp Asp Ile Gln Lys Met Asn Pro Pro Lys Phe
65 70 75 80
Ser Lys Val Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu Asn Glu Ala Ser
85 90 95
Val Leu His Asn Leu Lys Glu Arg Tyr Tyr Ser Gly Leu Ile Tyr Thr
100 105 110
Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr Lys Asn Leu Pro
115 120 125
Ile Tyr Ser Glu Glu Ile Val Glu Met Tyr Lys Gly Lys Lys Arg His
130 135 140
Glu Met Pro Pro His Ile Tyr Ala Ile Thr Asp Thr Ala Tyr Arg Ser
145 150 155 160
Met Met Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys Thr Gly Glu Ser
165 170 175
Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile Gln Tyr Leu Ala
180 185 190
His Val Ala Ser Ser His Lys Ser Lys Lys Asp Gln Gly Glu Leu Glu
195 200 205
Arg Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala
210 215 220
Lys Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg
225 230 235 240
Ile Asn Phe Asp Val Asn Gly Tyr Ile Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr
245 250 255
Tyr Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Ile Arg Gln Ala Lys Glu Glu Arg
260 265 270
Thr Phe His Ile Phe Tyr Tyr Leu Leu Ser Gly Ala Gly Glu His Leu
275 280 285
Lys Thr Asp Leu Leu Leu Glu Pro Tyr Asn Lys Tyr Arg Phe Leu Ser
290 295 300
Asn Gly His Val Thr Ile Pro Gly Gln Gln Asp Lys Asp Met Phe Gln
305 310 315 320
Glu Thr Met Glu Ala Met Arg Ile Met Gly Ile Pro Glu Asp Glu Gln
325 330 335
Met Gly Leu Leu Arg Val Ile Ser Gly Val Leu Gln Leu Gly Asn Ile
340 345 350
Ala Phe Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp Gln Ala Ser Met Pro Asp Asn
355 360 365
Thr Ala Ala Gln Lys Val Ser His Leu Leu Gly Ile Asn Val Thr Asp
370 375 380
Phe Thr Arg Gly Ile Leu Thr Pro Arg Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr
385 390 395 400
Val Gln Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln Ala Asp Phe Ala Ile Glu Ala
405 410 415
Leu Ala Lys Ala Thr Tyr Glu Arg Met Phe Arg Trp Leu Val Leu Arg
420 425 430
Ile Asn Lys Ala Leu Asp Lys Thr Lys Arg Gln Gly Ala Ser Phe Ile
435 440 445
Gly Ile Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu Ile Phe Asp Leu Asn Ser Phe
450 455 460
Glu Gln Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe
465 470 475 480
Asn His Thr Met Phe Ile Leu Glu Gln Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly
485 490 495
Ile Glu Trp Asn Phe Ile Asp Phe Gly Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile
500 505 510
Asp Leu Ile Glu Lys Pro Ala Gly Pro Pro Gly Ile Leu Ala Leu Leu
515 520 525
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530 535 540
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565 570 575
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Leu Tyr Arg Ile Gly Gln Ser Lys Val Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu
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Glu Leu Asp Ser Val Thr Gly Leu Leu Ser Gln Ser Asp Ser Lys Ser
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Thr Leu His Ala Gln Val Thr Asp Met Lys Lys Lys Met Glu Asp Gly
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Val Gly Cys Leu Glu Thr Ala Glu Glu Ala Lys Arg Arg Leu Gln Lys
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Lys Lys Gln Lys Lys Phe Asp Gln Leu Leu Ala Glu Glu Lys Thr Ile
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Met Lys Thr Gln Leu Glu Glu Leu Glu Asp Glu Leu Gln Ala Thr Glu
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Glu Arg Lys Gln Arg Ser Met Ala Met Ala Ala Arg Lys Lys Leu Glu
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1700 1705 1710
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Gln Ile Asn Thr Asp Leu Asn Leu Glu Arg Ser His Ala Gln Lys Asn
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Ile Ala Ala Leu Glu Ala Lys Ile Ala Gln Leu Glu Glu Gln Leu Asp
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Asn Glu Thr Lys Glu Arg Gln Ala Ala Ser Lys Gln Val Arg Arg Thr
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Glu Lys Lys Leu Lys Asp Val Leu Leu Gln Val Glu Asp Glu Arg Arg
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Lys Gln Leu Lys Arg Gln Leu Glu Glu Ala Glu Glu Glu Ala Gln Arg
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Glu Thr Ala Asp Ala Met Asn Arg Glu Val Ser Ser Leu Lys Asn Lys
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Leu Arg Arg Gly Asp Leu Pro Phe Val Val Thr Arg Arg Ile Val Arg
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Lys Gly Thr Gly Asp Cys Ser Asp Glu Glu Val Asp Gly Lys Ala Asp
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Gly Ala Asp Ala Lys Ala Ala Glu
1955 1960
<210>49
<211>7474
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<400>49
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ggccgagatg atccagttgc aggaggaact ggcagccgcg gagcgtgcca agcgccaggc 5280
ccagcaggag cgggatgagc tggctgacga gatcgccaac agcagcggca aaggagccct 5340
ggcgttagag gagaagcggc gtctggaggc ccgcatcgcc cagctggagg aggagctgga 5400
ggaggagcag ggcaacacgg agctgatcaa cgaccggctg aagaaggcca acctgcagat 5460
cgaccagatc aacaccgacc tgaacctgga gcgcagccac gcccagaaga acgagaatgc 5520
tcggcagcag ctggaacgcc agaacaagga gcttaaggtc aagctgcagg agatggaggg 5580
cactgtcaag tccaagtaca aggcctccat caccgccctc gaggccaaga ttgcacagct 5640
ggaggagcag ctggacaacg agaccaagga gcgccaggca gcctgcaaac aggtgcgtcg 5700
gaccgagaag aagctgaagg atgtgctgct gcaggtggat gacgagcgga ggaacgccga 5760
gcagtacaag gaccaggccg acaaggcatc tacccgcctg aagcagctca agcggcagct 5820
ggaggaggcc gaagaggagg cccagcgggc caacgcctcc cgccggaaac tgcagcgcga 5880
gctggaggac gccactgaga cggccgatgc catgaaccgc gaagtcagct ccctaaagaa 5940
caagctcagg cgcggggacc tgccgtttgt cgtgccccgc cgaatggccc ggaaaggcgc 6000
cggggatggc tccgacgaag aggtagatgg caaagcggat ggggctgagg ccaaacctgc 6060
cgaataagcc tcttctcctg cagcctgaga tggatggaca gacagacacc acagcctccc 6120
cttcccagac cccgcagcac gcctctcccc accttcttgg gactgctgtg aacatgcctc 6180
ctcctgccct ccgccccgtc cccccatccc gtttccctcc aggtgttgtt gagggcattt 6240
ggcttcctct gctgcatccc cttccagctc cctcccctgc tcagaatctg ataccaaaga 6300
gacagggccc gggcccaggc agagagcgac cagcaggctc ctcagccctc tcttgccaaa 6360
aagcacaaga tgttgaggcg agcagggcag gcccccgggg aggggccaga gttttctatg 6420
aatctatttt tcttcagact gaggcctttt ggtagtcgga gcccccgcag tcgtcagcct 6480
ccctgacgtc tgccaccagc gcccccactc ctcctccttt ctttgctgtt tgcaatcaca 6540
cgtggtgacc tcacacacct ctgccccttg ggcctcccac tcccatggct ctgggcggtc 6600
cagaaggagc aggccctggg cctccacctc tgtgcagggc acagaaggct ggggtggggg 6660
gaggagtgga ttcctcccca ccctgtccca ggcagcgcca ctgtccgctg tctccctcct 6720
gattctaaaa tgtctcaagt gcaatgcccc ctcccctcct ttaccgagga cagcctgcct 6780
ctgccacagc aaggctgtcg gggtcaagct ggaaaggcca gcagccttcc agtggcttct 6840
cccaacactc ttggggacca aatatattta atggttaagg gacttgtccc aagtctgaca 6900
gccagagcgt tagaggggcc agcggccctc ccaggcgatc ttgtgtctac tctaggactg 6960
ggcccgaggg tggtttacct gcaccgttga ctcagtatag tttaaaaatc tgccacctgc 7020
acaggtattt ttgaaagcaa aataaggttt tcttttttcc cctttcttgt aataaatgat 7080
aaaattccga gtctttctca ctgcctttgt ttagaagaga gtagctcgtc ctcactggtc 7140
tacactggtt gccgaattta cttgtattcc taactgtttt gtatatgctg cattgagact 7200
tacggcaaga aggcattttt tttttttaaa ggaaacaaac tctcaaatca tgaagtgata 7260
taaaagctgc atatgcctac aaagctctga attcaggtcc cagttgctgt cacaaaggag 7320
tgagtgaaac tcccacccta cccccttttt tatataataa aagtgcctta gcatgtgttg 7380
cagctgtcac cactacagta agctggttta cagatgtttt ccactgagca tcacaataaa 7440
gagaaccatg tgctaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa 7474
<210>50
<211>1960
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>50
Met Ala Gln Gln Ala Ala Asp Lys Tyr Leu Tyr Val Asp Lys Asn Phe
1 5 10 15
Ile Asn Asn Pro Leu Ala Gln Ala Asp Trp Ala Ala Lys Lys Leu Val
20 25 30
Trp Val Pro Ser Asp Lys Ser Gly Phe Glu Pro Ala Ser Leu Lys Glu
35 40 45
Glu Val Gly Glu Glu Ala Ile Val Glu Leu Val Glu Asn Gly Lys Lys
50 55 60
Val Lys Val Asn Lys Asp Asp Ile Gln Lys Met Asn Pro Pro Lys Phe
65 70 75 80
Ser Lys Val Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu Asn Glu Ala Ser
85 90 95
Val Leu His Asn Leu Lys Glu Arg Tyr Tyr Ser Gly Leu Ile Tyr Thr
100 105 110
Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr Lys Asn Leu Pro
115 120 125
Ile Tyr Ser Glu Glu Ile Val Glu Met Tyr Lys Gly Lys Lys Arg His
130 135 140
Glu Met Pro Pro His Ile Tyr Ala Ile Thr Asp Thr Ala Tyr Arg Ser
145 150 155 160
Met Met Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys Thr Gly Glu Ser
165 170 175
Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile Gln Tyr Leu Ala
180 185 190
Tyr Val Ala Ser Ser His Lys Ser Lys Lys Asp Gln Gly Glu Leu Glu
195 200 205
Arg Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala
210 215 220
Lys Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg
225 230 235 240
Ile Asn Phe Asp Val Asn Gly Tyr Ile Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr
245 250 255
Tyr Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Ile Arg Gln Ala Lys Glu Glu Arg
260 265 270
Thr Phe His Ile Phe Tyr Tyr Leu Leu Ser Gly Ala Gly Glu His Leu
275 280 285
Lys Thr Asp Leu Leu Leu Glu Pro Tyr Asn Lys Tyr Arg Phe Leu Ser
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Asn Gly His Val Thr Ile Pro Gly Gln Gln Asp Lys Asp Met Phe Gln
305 310 315 320
Glu Thr Met Glu Ala Met Arg Ile Met Gly Ile Pro Glu Glu Glu Gln
325 330 335
Met Gly Leu Leu Arg Val Ile Ser Gly Val Leu Gln Leu Gly Asn Ile
340 345 350
Val Phe Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp Gln Ala Ser Met Pro Asp Asn
355 360 365
Thr Ala Ala Gln Lys Val Ser His Leu Leu Gly Ile Asn Val Thr Asp
370 375 380
Phe Thr Arg Gly Ile Leu Thr Pro Arg Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr
385 390 395 400
Val Gln Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln Ala Asp Phe Ala Ile Glu Ala
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420 425 430
Ile Asn Lys Ala Leu Asp Lys Thr Lys Arg Gln Gly Ala Ser Phe Ile
435 440 445
Gly Ile Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu Ile Phe Asp Leu Asn Ser Phe
450 455 460
Glu Gln Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe
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Asn His Thr Met Phe Ile Leu Glu Gln Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly
485 490 495
Ile Glu Trp Asn Phe Ile Asp Phe Gly Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile
500 505 510
Asp Leu Ile Glu Lys Pro Ala Gly Pro Pro Gly Ile Leu Ala Leu Leu
515 520 525
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Gln Leu Lys Asp Lys Ala Asp Phe Cys Ile Ile His Tyr Ala Gly Lys
565 570 575
Val Asp Tyr Lys Ala Asp Glu Trp Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu
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Asn Asp Asn Ile Ala Thr Leu Leu His Gln Ser Ser Asp Lys Phe Val
595 600 605
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625 630 635 640
Gly Met Phe Arg Thr Val Gly Gln Leu Tyr Lys Glu Gln Leu Ala Lys
645 650 655
Leu Met Ala Thr Leu Arg Asn Thr Asn Pro Asn Phe Val Arg Cys Ile
660 665 670
Ile Pro Asn His Glu Lys Lys Ala Gly Lys Leu Asp Pro His Leu Val
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Tyr Glu Ile Leu Thr Pro Asn Ser Ile Pro Lys Gly Phe Met Asp Gly
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Leu Tyr Arg Ile Gly Gln Ser Lys Val Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu
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Lys Arg Gln Gln Gln Leu Thr Ala Met Lys Val Leu Gln Arg Asn Cys
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Ala Ala Tyr Leu Lys Leu Arg Asn Trp Gln Trp Trp Arg Leu Phe Thr
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Leu Ala Arg Val Glu Glu Glu Ala Ala Gln Lys Asn Met Ala Leu Lys
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Leu Gly Glu Glu Leu Glu Ala Leu Lys Thr Glu Leu Glu Asp Thr Leu
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Ser Lys Leu Thr Lys Asp Phe Ser Ala Leu Glu Ser Gln Leu Gln Asp
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Thr Leu His Ala Gln Val Ala Asp Met Lys Lys Lys Met Glu Asp Ser
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Met Lys Thr Gln Leu Glu Glu Leu Glu Asp Glu Leu Gln Ala Thr Glu
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Lys Gln Leu Val Arg Gln Val Arg Glu Met Glu Ala Glu Leu Glu Asp1585 1590 1595 1600
Glu Arg Lys Gln Arg Ser Met Ala Val Ala Ala Arg Lys Lys Leu Glu
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Met Asp Leu Lys Asp Leu Glu Ala His Ile Asp Ser Ala Asn Lys Asn
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Arg Gln Ala Gln Gln Glu Arg Asp Glu Leu Ala Asp Glu Ile Ala Asn
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Gln Ile Asn Thr Asp Leu Asn Leu Glu Arg Ser His Ala Gln Lys Asn
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Glu Asn Ala Arg Gln Gln Leu Glu Arg Gln Asn Lys Glu Leu Lys Val
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Ile Thr Ala Leu Glu Ala Lys Ile Ala Gln Leu Glu Glu Gln Leu Asp
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<213>小鼠(Mus musculus)
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gatagttttc caggaattca gacagagata tgagatccta actcccaatg ctattcctaa 2460
aggcttcatg gatggcaaac aggcgtgtga gcgaatgatc cgagctttag aactggaccc 2520
aaacctgtat agaattggac agagcaagat atttttccga gctggagttt tggcgcactt 2580
agaagaagaa agagatttaa aaatcactga tatcatcatc tttttccaag ctgtatgcag 2640
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caaggatgtg gaggcgctga gccagcggct ggaggagaag gtcctggcgt atgacaagct 4500
ggagaagacc aagaaccggc tgcaacaaga actggatgac ctgacggtgg acctggacca 4560
ccagcgccag atcgtctcca acttggagaa gaaacagaag aagttcgacc agctgttggc 4620
agaagaaaag ggcatctctg ctcgctatgc agaagagcgg gaccgggctg aagctgaggc 4680
cagagagaaa gaaaccaaag cgctctccct ggcgcgggcc cttgaggagg ccttggaggc 4740
gaaggaggaa ttcgagaggc agaacaagca gcttcgagca gacatggaag acctgatgag 4800
ctctaaagac gatgtgggga agaacgtcca cgagcttgag aaatccaagc gagccttgga 4860
gcagcaggtg gaggagatgc ggacccagct ggaggagctg gaggacgagc tgcaggccac 4920
tgaggatgcc aagctccgcc tggaagtcaa catgcaggcc atgaaggccc agtttgagag 4980
ggacctgcaa acccgagatg agcagaatga agaaaagaag cggctgctgc ttaagcaggt 5040
gcgggagctc gaggcagagc tggaggatga gcggaaacag cgggcactgg ctgtggcgtc 5100
aaagaagaag atggagatag acctgaagga cctggaggct cagatcgagg ctgcgaacaa 5160
agcccgggat gaagtgatca agcagcttcg caaacttcag gcacagatga aggattacca 5220
gcgtgaacta gaagaggctc gagcatctag agatgagatt tttgctcaat ccaaagaaag 5280
tgaaaagaaa ctgaagagtc tagaagcaga aattcttcag ctgcaagagg agctggcctc 5340
atccgagcga gcccgccgac acgcagagca ggagcgagac gagctggctg atgagatcgc 5400
caacagcgcc tctggaaagt ctgcgctgtt ggatgagaag cggcgcctgg aagcgcggat 5460
cgcacagctg gaagaggagc tggaggagga gcagagcaac atggagctgc tcaatgaccg 5520
cttccgcaag accacgctgc aggtggacac actgaacaca gagctggcag cagagcgcag 5580
cgctgcccag aagagtgaca atgcccgcca gcagctggag cgacaaaaca aggagctgaa 5640
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cctggaagcc aagattgggc agctggagga gcagcttgag caggaagcca aggagcgagc 5760
agctgccaac aaactagtcc gtcgaacaga gaagaaactg aaagaaatct tcatgcaggt 5820
tgaagacgag cgtcggcatg cggatcagta taaggagcag atggagaagg ctaatgccag 5880
gatgaagcag cttaaacgac agttggaaga ggctgaggaa gaggccacac gtgccaacgc 5940
atctcggcgt aaactccaaa gggagctgga cgacgccact gaggccaatg aaggcctgag 6000
ccgcgaggtc agcactctca agaaccggct caggcggggc ggtccaatca gcttttcttc 6060
aagccgatct ggccggcgcc agctgcacat tgagggggca tcgctagagc tgtcagatga 6120
cgacacagaa agtaagacca gtgatgtcaa tgacacacag ccaccccaat cagaataggc 6180
acaggaggtc agaggtgatg ctgaggacag gccagaactc atcccagcac cagtctgctt 6240
gagccctgca ctcactgctc gggaatggca agctcccaga ttccttccag gaaagtcaac 6300
tgtgtcttaa ggctttgcgg cctgcgcaga ctatatcctg cttcagacta gatacaattg 6360
ccccttttta tatatacacc tccacaagac atgcgtatta aacagattgt ctcatcgttg 6420
catctatttt ccatgtattc atcaagagac cattttatga cacattaaga agaaagaacc 6480
tttttgaaac aaactccagg ccctttgttg ccagtggctg ggcctaaggg ttgccccggg 6540
accgtgctca gctgctctgc atgccctgtc ctactgacag gtaccttagt tctgtgttca 6600
tgtggccctg acccttcctt caaccacacc tggtctctta gaacattgtg aacctaacct 6660
gcacttgtgt ctctcatttc ctgtgaatag tgatcactgt ctcagtgagc aaactgggag 6720
aggggctttg gcggcttagg ggtgggtttg gattggggaa gcagcatcca tttggggttc 6780
tcctgcccat ctcccaaggg gtgaccctgc ccctcaaatt catggtgtcc ccaccgtctc 6840
aatgtgaata gtctcagagc tctgtgcaca gagaggacag tggccacaac acataaggtg 6900
ccccgggtgg cagccatcac agtaacttcc aggtggtctc ctgagtgtct ggcttgataa 6960
tgccctcaat tcaggagtga gcctctgtga cccttggggt gctcgcagaa ggcctctcca 7020
agcagtcaag ccctcttgca aattcagcca ctgctttgag cccaaaacgg gaatattagt 7080
tttatgtcgg aggtgtgttc caagtttgtc aatgaggcta tagcctcaag aagatgccat 7140
ctgcctgaat gttgacatgc cagcgggcgt gtgacccttc attttccctt tcccttcctt 7200
tggacagtgt tacaatgaac acttagcatt ctgtttttgg ttgatagttg agcaaactga 7260
cattacagaa agtgccttag acactacagt actaagacaa tgttaaatat attatttgcc 7320
tctataacaa cttaatgtat taagttctga ctgtgcttca tatcatgtac ctctctagtg 7380
aagtagatgc gcaaacattc agtgacagca aatcagtgtt agtgacaagc cccgaccgtg 7440
gcgatgtgct ggaaaacacg gaccttttgg gttaaaagct ttaacatctg tgaggaagaa 7500
ctggtcacat gggtttggaa tctttgattt cccctgtatg aattgtactg gctgttgacc 7560
accagacacc tgactgcaaa tatcttttct tgtattccca tatttctaga caatgatttt 7620
tgtaagacaa taaatttatt cattatagaa aaaaaaaaaa aaaaaa 7666
<210>52
<211>1976
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>52
Met Ala Gln Arg Thr Gly Leu Glu Asp Pro Glu Arg Tyr Leu Phe Val
1 5 10 15
Asp Arg Ala Val Ile Tyr Asn Pro Ala Thr Gln Ala Asp Trp Thr Ala
20 25 30
Lys Lys Leu Val Trp Ile Pro Ser Glu Arg His Gly Phe Glu Ala Ala
35 40 45
Ser Ile Lys Glu Glu Arg Gly Asp Glu Val Met Val Glu Leu Ala Glu
50 55 60
Asn Gly Lys Lys Ala Met Val Asn Lys Asp Asp Ile Gln Lys Met Asn
65 70 75 80
Pro Pro Lys Phe Ser Lys Val Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu
85 90 95
Asn Glu Ala Ser Val Leu His Asn Leu Lys Asp Arg Tyr Tyr Ser Gly
100 105 110
Leu Ile Tyr Thr Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr
115 120 125
Lys Asn Leu Pro Ile Tyr Ser Glu Asn Ile Ile Glu Met Tyr Arg Gly
130 135 140
Lys Lys Arg His Glu Met Pro Pro His Ile Tyr Ala Ile Ser Glu Ser
145 150 155 160
Ala Tyr Arg Cys Met Leu Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys
165 170 175
Thr Gly Glu Ser Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile
180 185 190
Gln Tyr Leu Ala His Val Ala Ser Ser His Lys Gly Arg Lys Asp His
195 200 205
Asn Ile Pro Gly Glu Leu Glu Arg Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile
210 215 220
Leu Glu Ser Phe Gly Asn Ala Lys Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser
225 230 235 240
Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg Ile Asn Phe Asp Val Thr Gly Tyr Ile
245 250 255
Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr Tyr Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Val
260 265 270
Arg Gln Ala Lys Asp Glu Arg Thr Phe His Ile Phe Tyr Gln Leu Leu
275 280 285
Ser Gly Ala Gly Glu His Leu Lys Ser Asp Leu Leu Leu Glu Gly Phe
290 295 300
Asn Asn Tyr Arg Phe Leu Ser Asn Gly Tyr Ile Pro Ile Pro Gly Gln
305 310 315 320
Gln Asp Lys Asp Asn Phe Gln Glu Thr Met Glu Ala Met His Ile Met
325 330 335
Gly Phe Ser His Glu Glu Ile Leu Ser Met Leu Lys Val Val Ser Ser
340 345 350
Val Leu Gln Phe Gly Asn Ile Ser Phe Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp
355 360 365
Gln Ala Ser Met Pro Glu Asn Thr Val Ala Gln Lys Leu Cys His Leu
370 375 380
Leu Gly Met Asn Val Met Glu Phe Thr Arg Ala Ile Leu Thr Pro Arg
385 390 395 400
Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr Val Gln Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln
405 410 415
Ala Asp Phe Ala Val Glu Ala Leu Ala Lys Ala Thr Tyr Glu Arg Leu
420 425 430
Phe Arg Trp Leu Val His Arg Ile Asn Lys Ala Leu Asp Arg Thr Lys
435 440 445
Arg Gln Gly Ala Ser Phe Ile Gly Ile Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu
450 455 460
Ile Phe Glu Leu Asn Ser Phe Glu Gln Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn
465 470 475 480
Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe Asn His Thr Met Phe Ile Leu Glu Gln
485 490 495
Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly Ile Glu Trp Asn Phe Ile Asp Phe Gly
500 505 510
Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile Asp Leu Ile Glu Arg Pro Ala Asn Pro
515 520 525
Pro Gly Val Leu Ala Leu Leu Asp Glu Glu Cys Trp Phe Pro Lys Ala
530 535 540
Thr Asp Lys Thr Phe Val Glu Lys Leu Val Gln Glu Gln Gly Ser His
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Ser Lys Phe Gln Lys Pro Arg Gln Leu Lys Asp Lys Ala Asp Phe Cys
565 570 575
Ile Ile His Tyr Ala Gly Lys Val Asp Tyr Lys Ala Asp Glu Trp Leu
580 585 590
Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val Ala Thr Leu Leu His
595 600 605
Gln Ser Ser Asp Arg Phe Val Ala Glu Leu Trp Lys Asp Val Asp Arg
610 615 620
Ile Val Gly Leu Asp Gln Val Thr Gly Met Thr Glu Thr Ala Phe Gly
625 630 635 640
Ser Ala Tyr Lys Thr Lys Lys Gly Met Phe Arg Thr Val Gly Gln Leu
645 650 655
Tyr Lys Glu Ser Leu Thr Lys Leu Met Ala Thr Leu Arg Asn Thr Asn
660 665 670
Pro Asn Phe Val Arg Cys Ile Ile Pro Asn His Glu Lys Arg Ala Gly
675 680 685
Lys Leu Asp Pro His Leu Val Leu Asp Gln Leu Arg Cys Asn Gly Val
690 695 700
Leu Glu Gly Ile Arg Ile Cys Arg Gln Gly Phe Pro Asn Arg Ile Val
705 710 715 720
Phe Gln Glu Phe Arg Gln Arg Tyr Glu Ile Leu Thr Pro Asn Ala Ile
725 730 735
Pro Lys Gly Phe Met Asp Gly Lys Gln Ala Cys Glu Arg Met Ile Arg
740 745 750
Ala Leu Glu Leu Asp Pro Asn Leu Tyr Arg Ile Gly Gln Ser Lys Ile
755 760 765
Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu Ala His Leu Glu Glu Glu Arg Asp Leu
770 775 780
Lys Ile Thr Asp Ile Ile Ile Phe Phe Gln Ala Val Cys Arg Gly Tyr
785 790 795 800
Leu Ala Arg Lys Ala Phe Ala Lys Lys Gln Gln Gln Leu Ser Ala Leu
805 810 815
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820 825 830
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835 840 845
Arg Gln Glu Glu Glu Leu Gln Ala Lys Asp Glu Glu Leu Leu Lys Val
850 855 860
Lys Glu Lys Gln Thr Lys Val Glu Gly Glu Leu Glu Glu Met Glu Arg
865 870 875 880
Lys His Gln Gln Leu Leu Glu Glu Lys Asn Ile Leu Ala Glu Gln Leu
885 890 895
Gln Ala Glu Thr Glu Leu Phe Ala Glu Ala Glu Glu Met Arg Ala Arg
900 905 910
Leu Ala Ala Lys Lys Gln Glu Leu Glu Glu Ile Leu His Asp Leu Glu
915 920 925
Ser Arg Val Glu Glu Glu Glu Glu Arg Asn Gln Ile Leu Gln Asn Glu
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Lys Lys Lys Met Gln Ala His Ile Gln Asp Leu Glu Glu Gln Leu Asp
945 950 955 960
Glu Glu Glu Gly Ala Arg Gln Lys Leu Gln Leu Glu Lys Val Thr Ala
965 970 975
Glu Ala Lys Ile Lys Lys Met Glu Glu Glu Val Leu Leu Leu Glu Asp
980 985 990
Gln Asn Ser Lys Phe Ile Lys Glu Lys Lys Leu Met Glu Asp Arg Ile
995 1000 1005
Ala Glu Cys Ser Ser Gln Leu Ala Glu Glu Glu Glu Lys Ala Lys Asn
1010 1015 1020
Leu Ala Lys Ile Arg Asn Lys Gln Glu Val Met Ile Ser Asp Leu Glu
1025 1030 1035 1040
Glu Arg Leu Lys Lys Glu Glu Lys Thr Arg Gln Glu Leu Glu Lys Ala
1045 1050 1055
Lys Arg Lys Leu Asp Gly Glu Thr Thr Asp Leu Gln Asp Gln Ile Ala
1060 1065 1070
Glu Leu Gln Ala Gln Val Asp Glu Leu Lys Val Gln Leu Thr Lys Lys
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His Lys Asn Asn Ala Leu Lys Val Ala Arg Glu Leu Gln Ala Gln Ile
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Ala Glu Lys Gln Lys Arg Asp Leu Ser Glu Glu Leu Glu Ala Leu Lys
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Arg Thr Lys Arg Glu Gln Glu Val Ala Glu Leu Lys Lys Ala Leu Glu
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Asp Glu Thr Lys Asn His Glu Ala Gln Ile Gln Asp Met Arg Gln Arg
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His Ala Thr Ala Leu Glu Glu Leu Ser Glu Gln Leu Glu Gln Ala Lys
1205 1210 1215
Arg Phe Lys Ala Asn Leu Glu Lys Asn Lys Gln Gly Leu Glu Thr Asp
1220 1225 1230
Asn Lys Glu Leu Ala Cys Glu Val Lys Val Leu Gln Gln Val Lys Ala
1235 1240 1245
Glu Ser Glu His Lys Arg Lys Lys Leu Asp Ala Gln Val Gln Glu Leu
1250 1255 1260
His Ala Lys Val Ser Glu Gly Asp Arg Leu Arg Val Glu Leu Ala Glu
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Lys Ala Asn Lys Leu Gln Asn Glu Leu Asp Asn Val Ser Thr Leu Leu
1285 1290 1295
Glu Glu Ala Glu Lys Lys Gly Ile Lys Phe Ala Lys Asp Ala Ala Gly
1300 1305 1310
Leu Glu Ser Gln Leu Gln Asp Thr Gln Glu Leu Leu Gln Glu Glu Thr
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Arg Gln Lys Leu Asn Leu Ser Ser Arg Ile Arg Gln Leu Glu Glu Glu
1330 1335 1340
Lys Asn Ser Leu Gln Glu Gln Gln Glu Glu Glu Glu Glu Ala Arg Lys
1345 1350 1355 1360
Asn Leu Glu Lys Gln Val Leu Ala Leu Gln Ser Gln Leu Ala Asp Thr
1365 1370 1375
Lys Lys Lys Val Asp Asp Asp Leu Gly Thr Ile Glu Ser Leu Glu Glu
1380 1385 1390
Ala Lys Lys Lys Leu Leu Lys Asp Val Glu Ala Leu Ser Gln Arg Leu
1395 1400 1405
Glu Glu Lys Val Leu Ala Tyr Asp Lys Leu Glu Lys Thr Lys Asn Arg
1410 1415 1420
Leu Gln Gln Glu Leu Asp Asp Leu Thr Val Asp Leu Asp His Gln Arg
1425 1430 1435 1440
Gln Ile Val Ser Asn Leu Glu Lys Lys Gln Lys Lys Phe Asp Gln Leu
1445 1450 1455
Leu Ala Glu Glu Lys Gly Ile Ser Ala Arg Tyr Ala Glu Glu Arg Asp
1460 1465 1470
Arg Ala Glu Ala Glu Ala Arg Glu Lys Glu Thr Lys Ala Leu Ser Leu
1475 1480 1485
Ala Arg Ala Leu Glu Glu Ala Leu Glu Ala Lys Glu Glu Phe Glu Arg
1490 1495 1500
Gln Asn Lys Gln Leu Arg Ala Asp Met Glu Asp Leu Met Ser Ser Lys
1505 1510 1515 1520
Asp Asp Val Gly Lys Asn Val His Glu Leu Glu Lys Ser Lys Arg Ala
1525 1530 1535
Leu Glu Gln Gln Val Glu Glu Met Arg Thr Gln Leu Glu Glu Leu Glu
1540 1545 1550
Asp Glu Leu Gln Ala Thr Glu Asp Ala Lys Leu Arg Leu Glu Val Asn
1555 1560 1565
Met Gln Ala Met Lys Ala Gln Phe Glu Arg Asp Leu Gln Thr Arg Asp
1570 1575 1580
Glu Gln Asn Glu Glu Lys Lys Arg Leu Leu Leu Lys Gln Val Arg Glu
1585 1590 1595 1600
Leu Glu Ala Glu Leu Glu Asp Glu Arg Lys Gln Arg Ala Leu Ala Val
1605 1610 1615
Ala Ser Lys Lys Lys Met Glu Ile Asp Leu Lys Asp Leu Glu Ala Gln
1620 1625 1630
Ile Glu Ala Ala Asn Lys Ala Arg Asp Glu Val Ile Lys Gln Leu Arg
1635 1640 1645
Lys Leu Gln Ala Gln Met Lys Asp Tyr Gln Arg Glu Leu Glu Glu Ala
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Arg Ala Ser Arg Asp Glu Ile Phe Ala Gln Ser Lys Glu Ser Glu Lys
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Lys Leu Lys Ser Leu Glu Ala Glu Ile Leu Gln Leu Gln Glu Glu Leu
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Ala Ser Ser Glu Arg Ala Arg Arg His Ala Glu Gln Glu Arg Asp Glu
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Leu Ala Asp Glu Ile Ala Asn Ser Ala Ser Gly Lys Ser Ala Leu Leu
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Asp Glu Lys Arg Arg Leu Glu Ala Arg Ile Ala Gln Leu Glu Glu Glu
1730 1735 1740
Leu Glu Glu Glu Gln Ser Asn Met Glu Leu Leu Asn Asp Arg Phe Arg
1745 1750 1755 1760
Lys Thr Thr Leu Gln Val Asp Thr Leu Asn Thr Glu Leu Ala Ala Glu
1765 1770 1775
Arg Ser Ala Ala Gln Lys Ser Asp Asn Ala Arg Gln Gln Leu Glu Arg
1780 1785 1790
Gln Asn Lys Glu Leu Lys Ala Lys Leu Gln Glu Leu Glu Gly Ala Val
1795 1800 1805
Lys Ser Lys Phe Lys Ala Thr Ile Ser Ala Leu Glu Ala Lys Ile Gly
1810 1815 1820
Gln Leu Glu Glu Gln Leu Glu Gln Glu Ala Lys Glu Arg Ala Ala Ala
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Asn Lys Leu Val Arg Arg Thr Glu Lys Lys Leu Lys Glu Ile Phe Met
1845 1850 1855
Gln Val Glu Asp Glu Arg Arg His Ala Asp Gln Tyr Lys Glu Gln Met
1860 1865 1870
Glu Lys Ala Asn Ala Arg Met Lys Gln Leu Lys Arg Gln Leu Glu Glu
1875 1880 1885
Ala Glu Glu Glu Ala Thr Arg Ala Asn Ala Ser Arg Arg Lys Leu Gln
1890 1895 1900
Arg Glu Leu Asp Asp Ala Thr Glu Ala Asn Glu Gly Leu Ser Arg Glu
1905 1910 1915 1920
Val Ser Thr Leu Lys Asn Arg Leu Arg Arg Gly Gly Pro Ile Ser Phe
1925 1930 1935
Ser Ser Ser Arg Ser Gly Arg Arg Gln Leu His Ile Glu Gly Ala Ser
1940 1945 1950
Leu Glu Leu Ser Asp Asp Asp Thr Glu Ser Lys Thr Ser Asp Val Asn
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Asp Thr Gln Pro Pro Gln Ser Glu
1970 1975
<210>53
<211>7619
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<400>53
actgaggcgc tggatctgtg gtcgcggctg gggacgtgcg cccgcgccac catcttcggc 60
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agtatcaaag aagaacgggg agatgaagtt atggtggagt tggcagagaa tggaaagaaa 300
gcaatggtca acaaagatga tattcagaag atgaacccac ctaagttttc caaggtggag 360
gatatggcag aattgacatg cttgaatgaa gcttccgttt tacataatct gaaggatcgc 420
tactattcag gactaatcta tacttattct ggactcttct gtgtagttat aaacccttac 480
aagaatcttc caatttactc tgagaatatt attgaaatgt acagagggaa gaagcgtcat 540
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atgtttcgta ccgttgggca actctacaaa gaatctctca ccaagctgat ggcaactctc 2100
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aaattggatc cacacctagt cctagatcag cttcgctgta atggtgtcct ggaagggatc 2220
cgaatctgtc gccagggctt ccctaaccga atagttttcc aggaattcag acagagatat 2280
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cgaatgatcc gggctttaga attggaccca aacttgtaca gaattggaca gagcaagata 2400
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gcccttaaag ttgtgcgaga gctacaagcc caaattgctg aacttcagga agactttgaa 3480
tccgagaagg cttcacggaa caaggccgaa aagcagaaaa gggacttgag tgaggaactg 3540
gaagctctga aaacagagct ggaggacacg ctggacacca cggcagccca gcaggaacta 3600
cgtacaaaac gtgaacaaga agtggcagag ctgaagaaag ctcttgagga ggaaactaag 3660
aaccatgaag ctcaaatcca ggacatgaga caaagacacg caacagccct ggaggagctc 3720
tcagagcagc tggaacaggc caagcggttc aaagcaaatc tagagaagaa caagcagggc 3780
ctggagacag ataacaagga gctggcgtgt gaggtgaagg tcctgcagca ggtcaaggct 3840
gagtctgagc acaagaggaa gaagctcgac gcgcaggtcc aggagctcca tgccaaggtc 3900
tctgaaggcg acaggctcag ggtggagctg gcggagaaag caagtaagct gcagaatgag 3960
ctagataatg tctccaccct tctggaagaa gcagagaaga agggtattaa atttgctaag 4020
gatgcagcta gtcttgagtc tcaactacag gatacacagg agcttcttca ggaggagaca 4080
cgccagaaac taaacctgag cagtcggatc cggcagctgg aagaggagaa gaacagtctt 4140
caggagcagc aggaggagga ggaggaggcc aggaagaacc tggagaagca agtgctggcc 4200
ctgcagtccc agttggctga taccaagaag aaagtagatg acgacctggg aacaattgaa 4260
agtctggaag aagccaagaa gaagcttctg aaggacgcgg aggccctgag ccagcgcctg 4320
gaggagaagg cactggcgta tgacaaactg gagaagacca agaaccgcct gcagcaggag 4380
ctggacgacc tcacggtgga cctggaccac cagcgccagg tcgcctccaa cttggagaag 4440
aagcagaaga agtttgacca gctgttagca gaagagaaga gcatctctgc tcgctatgcc 4500
gaagagcggg accgggccga agccgaggcc agagagaaag aaaccaaagc cctgtcactg 4560
gcccgggccc tcgaggaagc cctggaggcc aaggaggagt ttgagaggca gaacaagcag 4620
ctccgagcag acatggaaga cctcatgagc tccaaagatg atgtgggaaa aaacgttcac 4680
gaacttgaaa aatccaaacg ggccctagag cagcaggtgg aggaaatgag gacccagctg 4740
gaggagctgg aagacgaact ccaggccacg gaagatgcca agcttcgtct ggaggtcaac 4800
atgcaggcca tgaaggcgca gttcgagaga gacctgcaaa ccagggatga gcagaatgaa 4860
gagaagaagc ggctgctgat caaacaggtg cgggagctcg aggcggagct ggaggatgag 4920
aggaaacagc gggcgcttgc tgtagcttca aagaaaaaga tggagataga cctgaaggac 4980
ctcgaagccc aaatcgaggc tgcgaacaaa gctcgggatg aggtgattaa gcagctccgc 5040
aagctccagg ctcagatgaa ggattaccaa cgtgaattag aagaagctcg tgcatccaga 5100
gatgagattt ttgctcaatc caaagagagt gaaaagaaat tgaagagtct ggaagcagaa 5160
atccttcaat tgcaggagga acttgcctca tctgagcgag cccgccgaca cgccgagcag 5220
gagagagatg agctggcgga cgagatcacc aacagcgcct ctggcaagtc cgcgctgctg 5280
gatgagaagc ggcgtctgga agctcggatc gcacagctgg aggaggagct ggaagaggag 5340
cagagcaaca tggagctgct caacgaccgc ttccgcaaga ccactctaca ggtggacaca 5400
ctgaacgccg agctagcagc cgagcgcagc gccgcccaga agagtgacaa tgcacgccag 5460
caactggagc ggcagaacaa ggagctgaag gccaagctgc aggaactcga gggtgctgtc 5520
aagtctaagt tcaaggccac catctcagcc ctggaggcca agattgggca gctggaggag 5580
cagcttgagc aggaagccaa ggaacgagca gccgccaaca aattagtccg tcgcactgag 5640
aagaagctga aagaaatctt catgcaggtt gaggatgagc gtcgacacgc ggaccagtat 5700
aaagagcaga tggagaaggc caacgctcgg atgaagcagc ttaaacgcca gctggaggaa 5760
gcagaagaag aagcgacgcg tgccaacgca tctcggcgta aactccagcg ggaactggat 5820
gatgccaccg aggccaacga gggcctgagc cgcgaggtca gcaccctgaa gaaccggctg 5880
aggcggggtg gccccatcag cttctcttcc agccgatctg gccggcgcca gctgcacctt 5940
gaaggagctt ccctggagct ctccgacgat gacacagaaa gtaagaccag tgatgtcaac 6000
gagacgcagc caccccagtc agagtaaagt tgcaggaagc cagaggaggc aatacagtgg 6060
gacagttagg aatgcacccg gggcctcctg cagatttcgg aaattggcaa gctacgggat 6120
tccttcctga aagatcaact gtgtcttaag gctctccagc ctatgcatac tgtatcctgc 6180
ttcagactta ggtacaattg ctcccctttt tatatataga cacacacagg acacatatat 6240
taaacagatt gtttcatcat tgcatctatt ttccatatag tcatcaagag accattttat 6300
aaaacatggt aagacccttt ttaaaacaaa ctccaggccc ttggttgcgg gtcgctgggt 6360
tattggggca gcgccgtggt cgtcactcag tcgctctgca tgctctctgt catacagaca 6420
ggtaacctag ttctgtgttc acgtggcccc cgactcctca gccacatcaa gtctcctaga 6480
ccactgtgga ctctaaactg cacttgtctc tctcatttcc ttcaaataat gatcaatgct 6540
atttcagtga gcaaactgtg aaaggggctt tggaaagagt aggaggggtg ggctggatcg 6600
gaagcaacac ccatttgggg ttaccatgtc catcccccaa ggggggccct gcccctcgag 6660
tcgatggtgt cccgcatcta ctcatgtgaa ctggccttgg cgagggctgg tctgtgcata 6720
gaagggatag tggccacact gcagctgagg ccccaggtgg cagccatgga tcatgtagac 6780
ttccagatgg tctcccgaac cgcctggctc tgccggcgcc ctcctcacgt caggagcaag 6840
cagccgtgga cccctaagcc gagctggtgg aaggcccctc cctgtcgcca gccgggccct 6900
catgctgacc ttgcaaattc agccgctgct ttgagcccaa aatgggaata ttggttttgt 6960
gtccgaggct tgttccaagt ttgtcaatga ggtttatgga gcctccagaa cagatgccat 7020
cttcctgaat gttgacatgc cagtgggtgt gactccttca tttttccttc tcccttccct 7080
ttggacagtg ttacagtgaa cacttagcat cctgtttttg gttggtagtt aagcaaactg 7140
acattacgga aagtgcctta gacactacag tactaagaca atgttgaata tatcattcgc 7200
ctctataaca atttaatgta ttcagttttg actgtgcttc atatcatgta cctctctagt 7260
caaagtggta ttacagacat tcagtgacaa tgaatcagtg ttaattctaa atccttgatc 7320
ctctgcaatg tgcttgaaaa cacaaacctt ttgggttaaa agctttaaca tctattagga 7380
agaatttgtc ctgtgggttt ggaatcttgg attttccccc tttatgaact gtactggctg 7440
ttgaccacca gacacctgac cgcaaatatc ttttcttgta ttcccatatt tctagacaat 7500
gatttttgta agacaataaa tttattcatt atagatattt gcgcctgctc tgtttacttg 7560
aagaaaaaag cacccgtgga gaataaagag acctcaataa acaagaataa tcatgtgaa 7619
<210>54
<211>1976
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>54
Met Ala Gln Arg Thr Gly Leu Glu Asp Pro Glu Arg Tyr Leu Phe Val
1 5 10 15
Asp Arg Ala Val Ile Tyr Asn Pro Ala Thr Gln Ala Asp Trp Thr Ala
20 25 30
Lys Lys Leu Val Trp Ile Pro Ser Glu Arg His Gly Phe Glu Ala Ala
35 40 45
Ser Ile Lys Glu Glu Arg Gly Asp Glu Val Met Val Glu Leu Ala Glu
50 55 60
Asn Gly Lys Lys Ala Met Val Asn Lys Asp Asp Ile Gln Lys Met Asn
65 70 75 80
Pro Pro Lys Phe Ser Lys Val Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu
85 90 95
Asn Glu Ala Ser Val Leu His Asn Leu Lys Asp Arg Tyr Tyr Ser Gly
100 105 110
Leu Ile Tyr Thr Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr
115 120 125
Lys Asn Leu Pro Ile Tyr Ser Glu Asn Ile Ile Glu Met Tyr Arg Gly
130 135 140
Lys Lys Arg His Glu Met Pro Pro His Ile Tyr Ala Ile Ser Glu Ser
145 150 155 160
Ala Tyr Arg Cys Met Leu Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys
165 170 175
Thr Gly Glu Ser Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile
180 185 190
Gln Tyr Leu Ala His Val Ala Ser Ser His Lys Gly Arg Lys Asp His
195 200 205
Asn Ile Pro Gly Glu Leu Glu Arg Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile
210 215 220
Leu Glu Ser Phe Gly Asn Ala Lys Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser
225 230 235 240
Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg Ile Asn Phe Asp Val Thr Gly Tyr Ile
245 250 255
Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr Tyr Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Val
260 265 270
Arg Gln Ala Lys Asp Glu Arg Thr Phe His Ile Phe Tyr Gln Leu Leu
275 280 285
Ser Gly Ala Gly Glu His Leu Lys Ser Asp Leu Leu Leu Glu Gly Phe
290 295 300
Asn Asn Tyr Arg Phe Leu Ser Asn Gly Tyr Ile Pro Ile Pro Gly Gln
305 310 315 320
Gln Asp Lys Asp Asn Phe Gln Glu Thr Met Glu Ala Met His Ile Met
325 330 335
Gly Phe Ser His Glu Glu Ile Leu Ser Met Leu Lys Val Val Ser Ser
340 345 350
Val Leu Gln Phe Gly Asn Ile Ser Phe Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp
355 360 365
Gln Ala Ser Met Pro Glu Asn Thr Val Ala Gln Lys Leu Cys His Leu
370 375 380
Leu Gly Met Asn Val Met Glu Phe Thr Arg Ala Ile Leu Thr Pro Arg
385 390 395 400
Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr Val Gln Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln
405 410 415
Ala Asp Phe Ala Val Glu Ala Leu Ala Lys Ala Thr Tyr Glu Arg Leu
420 425 430
Phe Arg Trp Leu Val His Arg Ile Asn Lys Ala Leu Asp Arg Thr Lys
435 440 445
Arg Gln Gly Ala Ser Phe Ile Gly Ile Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu
450 455 460
Ile Phe Glu Leu Asn Ser Phe Glu Gln Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn
465 470 475 480
Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe Asn His Thr Met Phe Ile Leu Glu Gln
485 490 495
Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly Ile Glu Trp Asn Phe Ile Asp Phe Gly
500 505 510
Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile Asp Leu Ile Glu Arg Pro Ala Asn Pro
515 520 525
Pro Gly Val Leu Ala Leu Leu Asp Glu Glu Cys Trp Phe Pro Lys Ala
530 535 540
Thr Asp Lys Thr Phe Val Glu Lys Leu Val Gln Glu Gln Gly Ser His
545 550 555 560
Ser Lys Phe Gln Lys Pro Arg Gln Leu Lys Asp Lys Ala Asp Phe Cys
565 570 575
Ile Ile His Tyr Ala Gly Lys Val Asp Tyr Lys Ala Asp Glu Trp Leu
580 585 590
Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val Ala Thr Leu Leu His
595 600 605
Gln Ser Ser Asp Arg Phe Val Ala Glu Leu Trp Lys Asp Val Asp Arg
610 615 620
Ile Val Gly Leu Asp Gln Val Thr Gly Met Thr Glu Thr Ala Phe Gly
625 630 635 640
Ser Ala Tyr Lys Thr Lys Lys Gly Met Phe Arg Thr Val Gly Gln Leu
645 650 655
Tyr Lys Glu Ser Leu Thr Lys Leu Met Ala Thr Leu Arg Asn Thr Asn
660 665 670
Pro Asn Phe Val Arg Cys Ile Ile Pro Asn His Glu Lys Arg Ala Gly
675 680 685
Lys Leu Asp Pro His Leu Val Leu Asp Gln Leu Arg Cys Asn Gly Val
690 695 700
Leu Glu Gly Ile Arg Ile Cys Arg Gln Gly Phe Pro Asn Arg Ile Val
705 710 715 720
Phe Gln Glu Phe Arg Gln Arg Tyr Glu Ile Leu Thr Pro Asn Ala Ile
725 730 735
Pro Lys Gly Phe Met Asp Gly Lys Gln Ala Cys Glu Arg Met Ile Arg
740 745 750
Ala Leu Glu Leu Asp Pro Asn Leu Tyr Arg Ile Gly Gln Ser Lys Ile
755 760 765
Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu Ala His Leu Glu Glu Glu Arg Asp Leu
770 775 780
Lys Ile Thr Asp Ile Ile Ile Phe Phe Gln Ala Val Cys Arg Gly Tyr
785 790 795 800
Leu Ala Arg Lys Ala Phe Ala Lys Lys Gln Gln Gln Leu Ser Ala Leu
805 810 815
Lys Val Leu Gln Arg Asn Cys Ala Ala Tyr Leu Lys Leu Arg His Trp
820 825 830
Gln Trp Trp Arg Val Phe Thr Lys Val Lys Pro Leu Leu Gln Val Thr
835 840 845
Arg Gln Glu Glu Glu Leu Gln Ala Lys Asp Glu Glu Leu Leu Lys Val
850 855 860
Lys Glu Lys Gln Thr Lys Val Glu Gly Glu Leu Glu Glu Met Glu Arg
865 870 875 880
Lys His Gln Gln Leu Leu Glu Glu Lys Asn Ile Leu Ala Glu Gln Leu
885 890 895
Gln Ala Glu Thr Glu Leu Phe Ala Glu Ala Glu Glu Met Arg Ala Arg
900 905 910
Leu Ala Ala Lys Lys Gln Glu Leu Glu Glu Ile Leu His Asp Leu Glu
915 920 925
Ser Arg Val Glu Glu Glu Glu Glu Arg Asn Gln Ile Leu Gln Asn Glu
930 935 940
Lys Lys Lys Met Gln Ala His Ile Gln Asp Leu Glu Glu Gln Leu Asp
945 950 955 960
Glu Glu Glu Gly Ala Arg Gln Lys Leu Gln Leu Glu Lys Val Thr Ala
965 970 975
Glu Ala Lys Ile Lys Lys Met Glu Glu Glu Ile Leu Leu Leu Glu Asp
980 985 990
Gln Asn Ser Lys Phe Ile Lys Glu Lys Lys Leu Met Glu Asp Arg Ile
995 1000 1005
Ala Glu Cys Ser Ser Gln Leu Ala Glu Glu Glu Glu Lys Ala Lys Asn
1010 1015 1020
Leu Ala Lys Ile Arg Asn Lys Gln Glu Val Met Ile Ser Asp Leu Glu
1025 1030 1035 1040
Glu Arg Leu Lys Lys Glu Glu Lys Thr Arg Gln Glu Leu Glu Lys Ala
1045 1050 1055
Lys Arg Lys Leu Asp Gly Glu Thr Thr Asp Leu Gln Asp Gln Ile Ala
1060 1065 1070
Glu Leu Gln Ala Gln Ile Asp Glu Leu Lys Leu Gln Leu Ala Lys Lys
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Glu Glu Glu Leu Gln Gly Ala Leu Ala Arg Gly Asp Asp Glu Thr Leu
1090 1095 1100
His Lys Asn Asn Ala Leu Lys Val Val Arg Glu Leu Gln Ala Gln Ile
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Ala Glu Leu Gln Glu Asp Phe Glu Ser Glu Lys Ala Ser Arg Asn Lys
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Ala Glu Lys Gln Lys Arg Asp Leu Ser Glu Glu Leu Glu Ala Leu Lys
1140 1145 1150
Thr Glu Leu Glu Asp Thr Leu Asp Thr Thr Ala Ala Gln Gln Glu Leu
1155 1160 1165
Arg Thr Lys Arg Glu Gln Glu Val Ala Glu Leu Lys Lys Ala Leu Glu
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Glu Glu Thr Lys Asn His Glu Ala Gln Ile Gln Asp Met Arg Gln Arg
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His Ala Thr Ala Leu Glu Glu Leu Ser Glu Gln Leu Glu Gln Ala Lys
1205 1210 1215
Arg Phe Lys Ala Asn Leu Glu Lys Asn Lys Gln Gly Leu Glu Thr Asp
1220 1225 1230
Asn Lys Glu Leu Ala Cys Glu Val Lys Val Leu Gln Gln Val Lys Ala
1235 1240 1245
Glu Ser Glu His Lys Arg Lys Lys Leu Asp Ala Gln Val Gln Glu Leu
1250 1255 1260
His Ala Lys Val Ser Glu Gly Asp Arg Leu Arg Val Glu Leu Ala Glu
1265 1270 1275 1280
Lys Ala Ser Lys Leu Gln Asn Glu Leu Asp Asn Val Ser Thr Leu Leu
1285 1290 1295
Glu Glu Ala Glu Lys Lys Gly Ile Lys Phe Ala Lys Asp Ala Ala Ser
1300 1305 1310
Leu Glu Ser Gln Leu Gln Asp Thr Gln Glu Leu Leu Gln Glu Glu Thr
1315 1320 1325
Arg Gln Lys Leu Asn Leu Ser Ser Arg Ile Arg Gln Leu Glu Glu Glu
1330 1335 1340
Lys Asn Ser Leu Gln Glu Gln Gln Glu Glu Glu Glu Glu Ala Arg Lys
1345 1350 1355 1360
Asn Leu Glu Lys Gln Val Leu Ala Leu Gln Ser Gln Leu Ala Asp Thr
1365 1370 1375
Lys Lys Lys Val Asp Asp Asp Leu Gly Thr Ile Glu Ser Leu Glu Glu
1380 1385 1390
Ala Lys Lys Lys Leu Leu Lys Asp Ala Glu Ala Leu Ser Gln Arg Leu
1395 1400 1405
Glu Glu Lys Ala Leu Ala Tyr Asp Lys Leu Glu Lys Thr Lys Asn Arg
1410 1415 1420
Leu Gln Gln Glu Leu Asp Asp Leu Thr Val Asp Leu Asp His Gln Arg
1425 1430 1435 1440
Gln Val Ala Ser Asn Leu Glu Lys Lys Gln Lys Lys Phe Asp Gln Leu
1445 1450 1455
Leu Ala Glu Glu Lys Ser Ile Ser Ala Arg Tyr Ala Glu Glu Arg Asp
1460 1465 1470
Arg Ala Glu Ala Glu Ala Arg Glu Lys Glu Thr Lys Ala Leu Ser Leu
1475 1480 1485
Ala Arg Ala Leu Glu Glu Ala Leu Glu Ala Lys Glu Glu Phe Glu Arg
1490 1495 1500
Gln Asn Lys Gln Leu Arg Ala Asp Met Glu Asp Leu Met Ser Ser Lys
1505 1510 1515 1520
Asp Asp Val Gly Lys Asn Val His Glu Leu Glu Lys Ser Lys Arg Ala
1525 1530 1535
Leu Glu Gln Gln Val Glu Glu Met Arg Thr Gln Leu Glu Glu Leu Glu
1540 1545 1550
Asp Glu Leu Gln Ala Thr Glu Asp Ala Lys Leu Arg Leu Glu Val Asn
1555 1560 1565
Met Gln Ala Met Lys Ala Gln Phe Glu Arg Asp Leu Gln Thr Arg Asp
1570 1575 1580
Glu Gln Asn Glu Glu Lys Lys Arg Leu Leu Ile Lys Gln Val Arg Glu
1585 1590 1595 1600
Leu Glu Ala Glu Leu Glu Asp Glu Arg Lys Gln Arg Ala Leu Ala Val
1605 1610 1615
Ala Ser Lys Lys Lys Met Glu Ile Asp Leu Lys Asp Leu Glu Ala Gln
1620 1625 1630
Ile Glu Ala Ala Asn Lys Ala Arg Asp Glu Val Ile Lys Gln Leu Arg
1635 1640 1645
Lys Leu Gln Ala Gln Met Lys Asp Tyr Gln Arg Glu Leu Glu Glu Ala
1650 1655 1660
Arg Ala Ser Arg Asp Glu Ile Phe Ala Gln Ser Lys Glu Ser Glu Lys
1665 1670 1675 1680
Lys Leu Lys Ser Leu Glu Ala Glu Ile Leu Gln Leu Gln Glu Glu Leu
1685 1690 1695
Ala Ser Ser Glu Arg Ala Arg Arg His Ala Glu Gln Glu Arg Asp Glu
1700 1705 1710
Leu Ala Asp Glu Ile Thr Asn Ser Ala Ser Gly Lys Ser Ala Leu Leu
1715 1720 1725
Asp Glu Lys Arg Arg Leu Glu Ala Arg Ile Ala Gln Leu Glu Glu Glu
1730 1735 1740
Leu Glu Glu Glu Gln Ser Asn Met Glu Leu Leu Asn Asp Arg Phe Arg
1745 1750 1755 1760
Lys Thr Thr Leu Gln Val Asp Thr Leu Asn Ala Glu Leu Ala Ala Glu
1765 1770 1775
Arg Ser Ala Ala Gln Lys Ser Asp Asn Ala Arg Gln Gln Leu Glu Arg
1780 1785 1790
Gln Asn Lys Glu Leu Lys Ala Lys Leu Gln Glu Leu Glu Gly Ala Val
1795 1800 1805
Lys Ser Lys Phe Lys Ala Thr Ile Ser Ala Leu Glu Ala Lys Ile Gly
1810 1815 1820
Gln Leu Glu Glu Gln Leu Glu Gln Glu Ala Lys Glu Arg Ala Ala Ala
1825 1830 1835 1840
Asn Lys Leu Val Arg Arg Thr Glu Lys Lys Leu Lys Glu Ile Phe Met
1845 1850 1855
Gln Val Glu Asp Glu Arg Arg His Ala Asp Gln Tyr Lys Glu Gln Met
1860 1865 1870
Glu Lys Ala Asn Ala Arg Met Lys Gln Leu Lys Arg Gln Leu Glu Glu
1875 1880 1885
Ala Glu Glu Glu Ala Thr Arg Ala Asn Ala Ser Arg Arg Lys Leu Gln
1890 1895 1900
Arg Glu Leu Asp Asp Ala Thr Glu Ala Asn Glu Gly Leu Ser Arg Glu
1905 1910 1915 1920
Val Ser Thr Leu Lys Asn Arg Leu Arg Arg Gly Gly Pro Ile Ser Phe
1925 1930 1935
Ser Ser Ser Arg Ser Gly Arg Arg Gln Leu His Leu Glu Gly Ala Ser
1940 1945 1950
Leu Glu Leu Ser Asp Asp Asp Thr Glu Ser Lys Thr Ser Asp Val Asn
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Glu Thr Gln Pro Pro Gln Ser Glu
1970 1975
<210>55
<211>6442
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>55
ccttttctgt ccaggccgag gcctctggac cgccctgggc gccgaccatg gctgcagtga 60
ccatgtccgt gtctgggagg aaggtagcct ccaggccagg cccggtgcct gaggcagccc 120
aatcgttcct ctacgcgccc cggacgccaa atgtaggtgg ccctggaggg ccacaggtgg 180
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agcagctgcc catctacacg gaggccattg ttgaaatgta ccggggcaag aagcgccatg 540
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tggagggcat cgtggggctg gagcaagtaa gcagccttgg agatggccca ccgggaggcc 2040
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tcctcgaggg tatacgcatc tgtcgccaag gcttccccaa ccgcatcctc ttccaggagt 2280
tccgacagcg ctatgaaatc ctcaccccga acgctattcc caagggcttc atggacggca 2340
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gccaaagcaa gatcttcttc cgggcagggg tcctggccca gctggaggag gagcgggacc 2460
tgaaagtcac cgacatcata gtgtctttcc aggcagcggc acggggctac ctggcccgta 2520
gggctttcca gagacggcag cagcagcaga gtgctctgag ggtgatgcag agaaactgtg 2580
ctgcctacct caagctcagg aactggcagt ggtggaggct gttcatcaag gtgaagcccc 2640
tgctgcaggt gacacggcag gatgaggtgc tgcaggcgcg cgcccaggag ctgcagaaag 2700
ttcaggagct gcagcagcag agcgctcgtg aagtggggga actgcagggt cgagtggcac 2760
agctagagga ggagcgcacg cgcctggctg agcagcttcg agcagaagcc gagctctgct 2820
ctgaggccga ggagacgcgg gcgcgactgg ctgcccggaa gcaggagctg gagctggtgg 2880
tgacagagct ggaggcacga gtgggcgagg aagaagagtg cagccggcag ctgcagagtg 2940
agaagaagag gctgcagcag catatccagg agctagagag ccacctggaa gctgaggagg 3000
gtgcccggca gaagctacag ctggagaagg tgaccacaga ggccaagatg aagaaatttg 3060
aggaggacct gctgctcctg gaggaccaga attccaagct gagcaaggag cggaggctgc 3120
tggaggagcg gctggctgag ttctcctcac aggcagcaga agaggaagag aaagtcaaaa 3180
gtctcaacaa gctgaggctc aaatatgaag ccacaatctc agacatggaa gaccggctga 3240
agaaggagga gaagggacgc caggaactag agaagctgaa gcgacggctg gacggggaga 3300
gctcagagct tcaggagcag atggtggagc agaagcagag ggcagaggaa ctgctcgcac 3360
agctgggccg caaggaggat gagctgcagg ccgccctgct cagggcagag gaagagggtg 3420
gtgcccgtgc ccagttgctc aagtccctgc gagaggcaca ggctggcctt gctgaggctc 3480
aggaggacct ggaagctgag cgggtagcca gggccaaggc ggagaagcag cgccgggacc 3540
tgggcgagga gttggaggcc ctacgtgggg agctcgagga cactctggat tccaccaacg 3600
cccagcagga gctgcggtcc aagagggagc aggaggtgac agagctgaag aaagcattgg 3660
aagaggagtc ccgtgcccat gaggtgtcca tgcaggagct gagacagagg catagccagg 3720
cactggtgga gatggccgag cagttggagc aagcccggag gggcaaaggt gtgtgggaga 3780
agactcggct atccctggag gctgaggtgt ccgagctgaa ggccgagctg agcagcctgc 3840
agacctcgag acaggagggt gagcagaaga ggcgccgcct ggagtcccag ctacaggagg 3900
tccagggccg atccagtgat tcggagcggg ctcggtctga ggctgctgag aagctgcaga 3960
gagcccaggc ggaacttgag agcgtgtcca cagccctgag tgaggcggag tccaaagcca 4020
tcaggctggg caaggagctg agcagtgcag agtcccagct gcatgacacc caggaactgc 4080
ttcaggagga gaccagggca aagctggcct tggggtcccg tgtgcgtgcc ctagaggccg 4140
aggcggcggg gcttcgggag cagatggaag aggaggtggt tgccagggaa cgggctggcc 4200
gggagctgca gagcacgcag gcccagctct ctgaatggcg gcgccgccag gaagaagagg 4260
ctgcggtgct ggaggctggg gaggaggctc ggcgccgtgc agcccgggag gcagagaccc 4320
tgacccagcg cctggcagaa aagactgagg ctgtagaacg actggagcga gcccggcgcc 4380
gactgcagca ggagttggac gatgccactg tggatctggg gcagcagaag cagctcctga 4440
gcacactgga gaagaagcag cggaaatttg accagctcct ggcagaggag aaggctgcag 4500
ttctacgggc tgtggaagac cgtgaacgga tagaggccga aggccgggag cgagaggccc 4560
gggccctgtc gctgacccgg gccctggaag aggagcagga ggcccgggag gagctggaga 4620
ggcagaaccg tgctctgagg gctgagctgg aagcactgct gagcagcaag gatgacgtgg 4680
gcaagaacgt gcacgagctg gagcgagccc gtaaggcggc tgaacaggca gccagtgacc 4740
tgcggacaca ggtgacagaa ttggaggatg agctgacagc cgcagaggat gccaagctgc 4800
gcctggaggt gactgtgcag gctctgaagg ctcaacatga acgcgacctg cagggccgcg 4860
atgatgccgg tgaggagagg cggaggcagc tggccaagca gctaagagac gcagaggtag 4920
agcgcgatga ggaacggaag cagagggcac tggctatggc tgcccgcaag aagctggagc 4980
tggaactgga ggagttgaag gcgcagacat ctgctgctgg gcagggcaag gaagaggcag 5040
tgaagcagct gaagaagatg caggtccaga tgaaggagct gtggcgggag gtagaggaga 5100
cgcgtagctc ccgcgacgag atgtttaccc tgagcaggga aaatgagaag aagctcaagg 5160
ggctggaagc tgaggtgctg cgtctgcaag aggaacttgc tgcctcagac cgagcccgga 5220
ggcaggccca gcaagacaga gacgagatgg cagaggaggt ggccagtggc aatcttagca 5280
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agctggagga agaacagaac aactcggagc tgctcaagga ccattaccga aagctagtgc 5400
tacaggtcga gtccctcacc acagaactgt ctgccgaacg aagtttctca gccaaggccg 5460
agagtggacg gcagcagctg gagcggcaga tccaggaact gcgggcccgc ttgggtgaag 5520
aggatgctgg agcccgagcc aggcagaaaa tgctgatcgc tgctctggag tctaaactgg 5580
cccaggcaga ggagcagctg gagcaggaga gcagggagcg catcctctct ggcaagctgg 5640
tacgcagagc tgagaagcgg ctgaaggagg tagttcttca ggtggatgaa gagcgcaggg 5700
tggctgacca ggtccgggac cagctggaga aaagcaacct ccggctgaag cagctcaaga 5760
ggcagctgga ggaggcagag gaggaggcat ctcgggcaca ggctggtcgg aggcggctgc 5820
agcgggagct ggaggacgtc actgagtctg cagaatccat gaaccgggag gtgaccacgc 5880
tgaggaacag gctccggcgt ggcccactta cattcaccac acggactgtg cgccaggtgt 5940
tccggctgga agagggcgtg gcttctgacg aggaagaggc tgaaggagct gaacctggct 6000
ctgcaccagg ccaggagccg gaggctccgc cccctgccac accccaatga tccagtctgt 6060
cctagatgcc ccaaggacag agccctttcc agtgcccctc ctggtttgca ctttgaaatg 6120
gcactgtcct ctggcacttt ctggcattga tgaaccctcc tgggacccca ggacccctgc 6180
ccactggggg ccccaaacca aggagctggg tgggagggag gccatgatgg tctctcttgt 6240
tagagaaaca aaattgaacg tggatgtcaa gaatgtcctg tctgcaccta ttttcagcag 6300
gcctgtcccc tggagagggc aggcagggtg cttccatccc ctctcagtat cttgccctct 6360
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tccagacact aaagaaataa aa 6442
<210>56
<211>2000
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>56
Met Ala Ala Val Thr Met Ser Val Ser Gly Arg Lys Val Ala Ser Arg
1 5 10 15
Pro Gly Pro Val Pro Glu Ala Ala Gln Ser Phe Leu Tyr Ala Pro Arg
20 25 30
Thr Pro Asn Val Gly Gly Pro Gly Gly Pro Gln Val Glu Trp Thr Ala
35 40 45
Arg Arg Met Val Trp Val Pro Ser Glu Leu His Gly Phe Glu Ala Ala
50 55 60
Ala Leu Arg Asp Glu Gly Glu Glu Glu Ala Glu Val Glu Leu Ala Glu
65 70 75 80
Ser Gly Arg Arg Leu Arg Leu Pro Arg Asp Gln Ile Gln Arg Met Asn
85 90 95
Pro Pro Lys Phe Ser Lys Ala Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu
100 105 110
Asn Glu Ala Ser Val Leu His Asn Leu Arg Glu Arg Tyr Tyr Ser Gly
115 120 125
Leu Ile Tyr Thr Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr
130 135 140
Lys Gln Leu Pro Ile Tyr Thr Glu Ala Ile Val Glu Met Tyr Arg Gly
145 150 155 160
Lys Lys Arg His Glu Val Pro Pro His Val Tyr Ala Val Thr Glu Gly
165 170 175
Ala Tyr Arg Ser Met Leu Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys
180 185 190
Thr Gly Glu Ser Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile
195 200 205
Gln Tyr Leu Ala His Val Ala Ser Ser Pro Lys Gly Arg Lys Glu Pro
210 215 220
Gly Val Pro Ala Ser Val Ser Thr Met Ser Tyr Gly Glu Leu Glu Arg
225 230 235 240
Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala Lys
245 250 255
Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg Ile
260 265 270
Asn Phe Asp Ile Ala Gly Tyr Ile Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr Tyr
275 280 285
Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Ile Arg Gln Ala Lys Asp Glu Cys Ser
290 295 300
Phe His Ile Phe Tyr Gln Leu Leu Gly Gly Ala Gly Glu Gln Leu Lys
305 310 315 320
Ala Asp Leu Leu Leu Glu Pro Cys Ser His Tyr Arg Phe Leu Thr Asn
325 330 335
Gly Pro Ser Ser Ser Pro Gly Gln Glu Arg Glu Leu Phe Gln Glu Thr
340 345 350
Leu Glu Ser Leu Arg Val Leu Gly Leu Leu Pro Glu Glu Ile Thr Ala
355 360 365
Met Leu Arg Thr Val Ser Ala Val Leu Gln Phe Gly Asn Ile Val Leu
370 375 380
Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp Gln Ala Thr Met Pro Asp Asn Thr Ala
385 390 395 400
Ala Gln Lys Leu Cys Arg Leu Leu Gly Leu Gly Val Thr Asp Phe Ser
405 410 415
Arg Ala Leu Leu Thr Pro Arg Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr Val Gln
420 425 430
Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln Ala Asp Phe Ala Leu Glu Ala Leu Ala
435 440 445
Lys Ala Thr Tyr Glu Arg Leu Phe Arg Trp Leu Val Leu Arg Leu Asn
450 455 460
Arg Ala Leu Asp Arg Ser Pro Arg Gln Gly Ala Ser Phe Leu Gly Ile
465 470 475 480
Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu Ile Phe Gln Leu Asn Ser Phe Glu Gln
485 490 495
Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe Asn His
500 505 510
Thr Met Phe Val Leu Glu Gln Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly Ile Pro
515 520 525
Trp Thr Phe Leu Asp Phe Gly Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile Asp Leu
530 535 540
Ile Glu Arg Pro Ala Asn Pro Pro Gly Leu Leu Ala Leu Leu Asp Glu
545 550 555 560
Glu Cys Trp Phe Pro Lys Ala Thr Asp Lys Ser Phe Val Glu Lys Val
565 570 575
Ala Gln Glu Gln Gly Ser His Pro Lys Phe Gln Arg Pro Arg Asn Leu
580 585 590
Arg Asp Gln Ala Asp Phe Ser Val Leu His Tyr Ala Gly Lys Val Asp
595 600 605
Tyr Lys Ala Ser Glu Trp Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp
610 615 620
Asn Val Ala Ala Leu Leu His Gln Ser Thr Asp Arg Leu Thr Ala Glu
625 630 635 640
Ile Trp Lys Asp Val Glu Gly Ile Val Gly Leu Glu Gln Val Ser Ser
645 650 655
Leu Gly Asp Gly Pro Pro Gly Gly Arg Pro Arg Arg Gly Met Phe Arg
660 665 670
Thr Val Gly Gln Leu Tyr Lys Glu Ser Leu Ser Arg Leu Met Ala Thr
675 680 685
Leu Ser Asn Thr Asn Pro Ser Phe Val Arg Cys Ile Val Pro Asn His
690 695 700
Glu Lys Arg Ala Gly Lys Leu Glu Pro Arg Leu Val Leu Asp Gln Leu
705 710 715 720
Arg Cys Asn Gly Val Leu Glu Gly Ile Arg Ile Cys Arg Gln Gly Phe
725 730 735
Pro Asn Arg Ile Leu Phe Gln Glu Phe Arg Gln Arg Tyr Glu Ile Leu
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Thr Pro Asn Ala Ile Pro Lys Gly Phe Met Asp Gly Lys Gln Ala Cys
755 760 765
Glu Lys Met Ile Gln Ala Leu Glu Leu Asp Pro Asn Leu Tyr Arg Val
770 775 780
Gly Gln Ser Lys Ile Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu Ala Gln Leu Glu
785 790 795 800
Glu Glu Arg Asp Leu Lys Val Thr Asp Ile Ile Val Ser Phe Gln Ala
805 810 815
Ala Ala Arg Gly Tyr Leu Ala Arg Arg Ala Phe Gln Arg Arg Gln Gln
820 825 830
Gln Gln Ser Ala Leu Arg Val Met Gln Arg Asn Cys Ala Ala Tyr Leu
835 840 845
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Leu Leu Gln Val Thr Arg Gln Asp Glu Val Leu Gln Ala Arg Ala Gln
865 870 875 880
Glu Leu Gln Lys Val Gln Glu Leu Gln Gln Gln Ser Ala Arg Glu Val
885 890 895
Gly Glu Leu Gln Gly Arg Val Ala Gln Leu Glu Glu Glu Arg Thr Arg
900 905 910
Leu Ala Glu Gln Leu Arg Ala Glu Ala Glu Leu Cys Ser Glu Ala Glu
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Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ala Ala Arg Lys Gln Glu Leu Glu Leu Val
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Val Thr Glu Leu Glu Ala Arg Val Gly Glu Glu Glu Glu Cys Ser Arg
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Gln Leu Gln Ser Glu Lys Lys Arg Leu Gln Gln His Ile Gln Glu Leu
965 970 975
Glu Ser His Leu Glu Ala Glu Glu Gly Ala Arg Gln Lys Leu Gln Leu
980 985 990
Glu Lys Val Thr Thr Glu Ala Lys Met Lys Lys Phe Glu Glu Asp Leu
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Leu Leu Leu Glu Asp Gln Asn Ser Lys Leu Ser Lys Glu Arg Arg Leu
1010 1015 1020
Leu Glu Glu Arg Leu Ala Glu Phe Ser Ser Gln Ala Ala Glu Glu Glu1025 1030 1035 1040
Glu Lys Val Lys Ser Leu Asn Lys Leu Arg Leu Lys Tyr Glu Ala Thr
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Ile Ser Asp Met Glu Asp Arg Leu Lys Lys Glu Glu Lys Gly Arg Gln
1060 1065 1070
Glu Leu Glu Lys Leu Lys Arg Arg Leu Asp Gly Glu Ser Ser Glu Leu
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Gln Glu Gln Met Val Glu Gln Lys Gln Arg Ala Glu Glu Leu Leu Ala
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Gln Leu Gly Arg Lys Glu Asp Glu Leu Gln Ala Ala Leu Leu Arg Ala
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Glu Glu Glu Gly Gly Ala Arg Ala Gln Leu Leu Lys Ser Leu Arg Glu
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Ala Gln Ala Gly Leu Ala Glu Ala Gln Glu Asp Leu Glu Ala Glu Arg
1140 1145 1150
Val Ala Arg Ala Lys Ala Glu Lys Gln Arg Arg Asp Leu Gly Glu Glu
1155 1160 1165
Leu Glu Ala Leu Arg Gly Glu Leu Glu Asp Thr Leu Asp Ser Thr Asn
1170 1175 1180
Ala Gln Gln Glu Leu Arg Ser Lys Arg Glu Gln Glu Val Thr Glu Leu
1185 1190 1195 1200
Lys Lys Ala Leu Glu Glu Glu Ser Arg Ala His Glu Val Ser Met Gln
1205 1210 1215
Glu Leu Arg Gln Arg His Ser Gln Ala Leu Val Glu Met Ala Glu Gln
1220 1225 1230
Leu Glu Gln Ala Arg Arg Gly Lys Gly Val Trp Glu Lys Thr Arg Leu
1235 1240 1245
Ser Leu Glu Ala Glu Val Ser Glu Leu Lys Ala Glu Leu Ser Ser Leu
1250 1255 1260
Gln Thr Ser Arg Gln Glu Gly Glu Gln Lys Arg Arg Arg Leu Glu Ser
1265 1270 1275 1280
Gln Leu Gln Glu Val Gln Gly Arg Ser Ser Asp Ser Glu Arg Ala Arg
1285 1290 1295
Ser Glu Ala Ala Glu Lys Leu Gln Arg Ala Gln Ala Glu Leu Glu Ser
1300 1305 1310
Val Ser Thr Ala Leu Ser Glu Ala Glu Ser Lys Ala Ile Arg Leu Gly
1315 1320 1325
Lys Glu Leu Ser Ser Ala Glu Ser Gln Leu His Asp Thr Gln Glu Leu
1330 1335 1340
Leu Gln Glu Glu Thr Arg Ala Lys Leu Ala Leu Gly Ser Arg Val Arg
1345 1350 1355 1360
Ala Leu Glu Ala Glu Ala Ala Gly Leu Arg Glu Gln Met Glu Glu Glu
1365 1370 1375
Val Val Ala Arg Glu Arg Ala Gly Arg Glu Leu Gln Ser Thr Gln Ala
1380 1385 1390
Gln Leu Ser Glu Trp Arg Arg Arg Gln Glu Glu Glu Ala Ala Val Leu
1395 1400 1405
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Leu Thr Gln Arg Leu Ala Glu Lys Thr Glu Ala Val Glu Arg Leu Glu
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Arg Ala Arg Arg Arg Leu Gln Gln Glu Leu Asp Asp Ala Thr Val Asp
1445 1450 1455
Leu Gly Gln Gln Lys Gln Leu Leu Ser Thr Leu Glu Lys Lys Gln Arg
1460 1465 1470
Lys Phe Asp Gln Leu Leu Ala Glu Glu Lys Ala Ala Val Leu Arg Ala
1475 1480 1485
Val Glu Asp Arg Glu Arg Ile Glu Ala Glu Gly Arg Glu Arg Glu Ala
1490 1495 1500
Arg Ala Leu Ser Leu Thr Arg Ala Leu Glu Glu Glu Gln Glu Ala Arg
1505 1510 1515 1520
Glu Glu Leu Glu Arg Gln Asn Arg Ala Leu Arg Ala Glu Leu Glu Ala
1525 1530 1535
Leu Leu Ser Ser Lys Asp Asp Val Gly Lys Asn Val His Glu Leu Glu
1540 1545 1550
Arg Ala Arg Lys Ala Ala Glu Gln Ala Ala Ser Asp Leu Arg Thr Gln
1555 1560 1565
Val Thr Glu Leu Glu Asp Glu Leu Thr Ala Ala Glu Asp Ala Lys Leu
1570 1575 1580
Arg Leu Glu Val Thr Val Gln Ala Leu Lys Ala Gln His Glu Arg Asp
1585 1590 1595 1600
Leu Gln Gly Arg Asp Asp Ala Gly Glu Glu Arg Arg Arg Gln Leu Ala
1605 1610 1615
Lys Gln Leu Arg Asp Ala Glu Val Glu Arg Asp Glu Glu Arg Lys Gln
1620 1625 1630
Arg Ala Leu Ala Met Ala Ala Arg Lys Lys Leu Glu Leu Glu Leu Glu
1635 1640 1645
Glu Leu Lys Ala Gln Thr Ser Ala Ala Gly Gln Gly Lys Glu Glu Ala
1650 1655 1660
Val Lys Gln Leu Lys Lys Met Gln Val Gln Met Lys Glu Leu Trp Arg
1665 1670 1675 1680
Glu Val Glu Glu Thr Arg Ser Ser Arg Asp Glu Met Phe Thr Leu Ser
1685 1690 1695
Arg Glu Asn Glu Lys Lys Leu Lys Gly Leu Glu Ala Glu Val Leu Arg
1700 1705 1710
Leu Gln Glu Glu Leu Ala Ala Ser Asp Arg Ala Arg Arg Gln Ala Gln
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Gln Asp Arg Asp Glu Met Ala Glu Glu Val Ala Ser Gly Asn Leu Ser
1730 1735 1740
Lys Ala Ala Thr Leu Glu Glu Lys Arg Gln Leu Glu Gly Arg Leu Ser
1745 1750 1755 1760
Gln Leu Glu Glu Glu Leu Glu Glu Glu Gln Asn Asn Ser Glu Leu Leu
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Lys Asp His Tyr Arg Lys Leu Val Leu Gln Val Glu Ser Leu Thr Thr
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Glu Leu Ser Ala Glu Arg Ser Phe Ser Ala Lys Ala Glu Ser Gly Arg
1795 1800 1805
Gln Gln Leu Glu Arg Gln Ile Gln Glu Leu Arg Ala Arg Leu Gly Glu
1810 1815 1820
Glu Asp Ala Gly Ala Arg Ala Arg Gln Lys Met Leu Ile Ala Ala Leu
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Glu Ser Lys Leu Ala Gln Ala Glu Glu Gln Leu Glu Gln Glu Ser Arg
1845 1850 1855
Glu Arg Ile Leu Ser Gly Lys Leu Val Arg Arg Ala Glu Lys Arg Leu
1860 1865 1870
Lys Glu Val Val Leu Gln Val Asp Glu Glu Arg Arg Val Ala Asp Gln
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Val Arg Asp Gln Leu Glu Lys Ser Asn Leu Arg Leu Lys Gln Leu Lys
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Arg Gln Leu Glu Glu Ala Glu Glu Glu Ala Ser Arg Ala Gln Ala Gly
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Arg Arg Arg Leu Gln Arg Glu Leu Glu Asp Val Thr Glu Ser Ala Glu
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Ser Ala Pro Gly Gln Glu Pro Glu Ala Pro Pro Pro Ala Thr Pro Gln
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<213>小鼠(Mus musculus)
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gtcaccgaca tcatagtgtc tttccaggca gcggcacggg gctacctggc ccgtagggct 2460
ttccagagac ggcagcagca gcagagtgct ctgagggtga tgcagagaaa ctgtgctgcc 2520
tacctcaagc tcaggaactg gcagtggtgg aggctgttca tcaaggtgaa gcccctgctg 2580
caggtgacac ggcaggatga ggtgctgcag gcgcgcgccc aggagctgca gaaagttcag 2640
gagctgcagc agcagagcgc tcgtgaagtg ggggaactgc agggtcgagt ggcacagcta 2700
gaggaggagc gcacgcgcct ggctgagcag cttcgagcag aagccgagct ctgctctgag 2760
gccgaggaga cgcgggcgcg actggctgcc cggaagcagg agctggagct ggtggtgaca 2820
gagctggagg cacgagtggg cgaggaagaa gagtgcagcc ggcagctgca gagtgagaag 2880
aagaggctgc agcagcatat ccaggagcta gagagccacc tggaagctga ggagggtgcc 2940
cggcagaagc tacagctgga gaaggtgacc acagaggcca agatgaagaa atttgaggag 3000
gacctgctgc tcctggagga ccagaattcc aagctgagca aggagcggag gctgctggag 3060
gagcggctgg ctgagttctc ctcacaggca gcagaagagg aagagaaagt caaaagtctc 3120
aacaagctga ggctcaaata tgaagccaca atctcagaca tggaagaccg gctgaagaag 3180
gaggagaagg gacgccagga actagagaag ctgaagcgac ggctggacgg ggagagctca 3240
gagcttcagg agcagatggt ggagcagaag cagagggcag aggaactgct cgcacagctg 3300
ggccgcaagg aggatgagct gcaggccgcc ctgctcaggg cagaggaaga gggtggtgcc 3360
cgtgcccagt tgctcaagtc cctgcgagag gcacaggctg gccttgctga ggctcaggag 3420
gacctggaag ctgagcgggt agccagggcc aaggcggaga agcagcgccg ggacctgggc 3480
gaggagttgg aggccctacg tggggagctc gaggacactc tggattccac caacgcccag 3540
caggagctgc ggtccaagag ggagcaggag gtgacagagc tgaagaaagc attggaagag 3600
gagtcccgtg cccatgaggt gtccatgcag gagctgagac agaggcatag ccaggcactg 3660
gtggagatgg ccgagcagtt ggagcaagcc cggaggggca aaggtgtgtg ggagaagact 3720
cggctatccc tggaggctga ggtgtccgag ctgaaggccg agctgagcag cctgcagacc 3780
tcgagacagg agggtgagca gaagaggcgc cgcctggagt cccagctaca ggaggtccag 3840
ggccgatcca gtgattcgga gcgggctcgg tctgaggctg ctgagaagct gcagagagcc 3900
caggcggaac ttgagagcgt gtccacagcc ctgagtgagg cggagtccaa agccatcagg 3960
ctgggcaagg agctgagcag tgcagagtcc cagctgcatg acacccagga actgcttcag 4020
gaggagacca gggcaaagct ggccttgggg tcccgtgtgc gtgccctaga ggccgaggcg 4080
gcggggcttc gggagcagat ggaagaggag gtggttgcca gggaacgggc tggccgggag 4140
ctgcagagca cgcaggccca gctctctgaa tggcggcgcc gccaggaaga agaggccgcg 4200
gtgctggagg ctggggagga ggctcggcgc cgtgcagccc gggaggcaga gaccctgacc 4260
cagcgcctgg cagaaaagac tgaggctgta gaacgactgg agcgagcccg gcgccgactg 4320
cagcaggagt tggacgatgc cactgtggat ctggggcagc agaagcagct cctgagcaca 4380
ctggagaaga agcagcggaa atttgaccag ctcctggcag aggagaaggc tgcagttcta 4440
cgggctgtgg aagaccgtga acggatagag gccgaaggcc gggagcgaga ggcccgggcc 4500
ctgtcgctga cccgggccct ggaagaggag caggaggccc gggaggagct ggagaggcag 4560
aaccgtgctc tgagggctga gctggaagca ctgctgagca gcaaggatga cgtgggcaag 4620
aacgtgcacg agctggagcg agcccgtaag gcggctgaac aggcagccag tgacctgcgg 4680
acacaggtga cagaattgga ggatgagctg acagccgcag aggatgccaa gctgcgcctg 4740
gaggtgactg tgcaggctct gaaggctcaa catgaacgcg acctgcaggg ccgcgatgat 4800
gccggtgagg agaggcggag gcagctggcc aagcagctaa gagacgcaga ggtagagcgc 4860
gatgaggaac ggaagcagag ggcactggct atggctgccc gcaagaagct ggagctggaa 4920
ctggaggagt tgaaggcgca gacatctgct gctgggcagg gcaaggaaga ggcagtgaag 4980
cagctgaaga agatgcaggt ccagatgaag gagctgtggc gggaggtaga ggagacgcgt 5040
agctcccgcg acgagatgtt taccctgagc agggaaaatg agaagaagct caaggggctg 5100
gaagctgagg tgctgcgtct gcaagaggaa cttgctgcct cagaccgagc ccggaggcag 5160
gcccagcaag acagagacga gatggcagag gaggtggcca gtggcaatct tagcaaggca 5220
gccaccctgg aggaaaaacg gcagctggag gggcgactga gccagttgga agaggagctg 5280
gaggaagaac agaacaactc ggagctgctc aaggaccatt accgaaagct agtgctacag 5340
gtcgagtccc tcaccacaga actgtctgcc gaacgaagtt tctcagccaa ggccgagagt 5400
ggacggcagc agctggagcg gcagatccag gaactgcggg cccgcttggg tgaagaggat 5460
gctggagccc gagccaggca gaaaatgctg atcgctgctc tggagtctaa actggcccag 5520
gcagaggagc agctggagca ggagagcagg gagcgcatcc tctctggcaa gctggtacgc 5580
agagctgaga agcggctgaa ggaggtagtt cttcaggtgg atgaagagcg cagggtggct 5640
gaccaggtcc gggaccagct ggagaaaagc aacctccggc tgaagcagct caagaggcag 5700
ctggaggagg cagaggagga ggcatctcgg gcacaggctg gtcggaggcg gctgcagcgg 5760
gagctggagg acgtcactga gtctgcagaa tccatgaacc gggaggtgac cacgctgagg 5820
aacaggctcc ggcgtggccc acttacattc accacacgga ctgtgcgcca ggtgttccgg 5880
ctggaagagg gcgtggcttc tgacgaggaa gaggctgaag gagctgaacc tggctctgca 5940
ccaggccagg agccggaggc tccgccccct gccacacccc aatgatccag tctgtcctag 6000
atgccccaag gacagagccc tttccagtgc ccctcctggt ttgcactttg aaatggcact 6060
gtcctctggc actttctggc attgatgaac cctcctggga ccccaggacc cctgcccact 6120
gggggcccca aaccaaggag ctgggtggga gggaggccat gatggtctct cttgttagag 6180
aaacaaaatt gaacgtggat gtcaagaatg tcctgtctgc acctattttc agcaggcctg 6240
tcccctggag agggcaggca gggtgcttcc atcccctctc agtatcttgc cctctttttt 6300
ggggggaagt ggggtgtctg tgtgctcata gggtaatgct catggcccct catgctccag 6360
acactaaaga aataaaa 6377
<210>58
<211>1992
<212>PRT
<213>小鼠(Mus musculus)
<400>58
Met Ala Ala Val Thr Met Ser Val Ser Gly Arg Lys Val Ala Ser Arg
1 5 10 15
Pro Gly Pro Val Pro Glu Ala Ala Gln Ser Phe Leu Tyr Ala Pro Arg
20 25 30
Thr Pro Asn Val Gly Gly Pro Gly Gly Pro Gln Val Glu Trp Thr Ala
35 40 45
Arg Arg Met Val Trp Val Pro Ser Glu Leu His Gly Phe Glu Ala Ala
50 55 60
Ala Leu Arg Asp Glu Gly Glu Glu Glu Ala Glu Val Glu Leu Ala Glu
65 70 75 80
Ser Gly Arg Arg Leu Arg Leu Pro Arg Asp Gln Ile Gln Arg Met Asn
85 90 95
Pro Pro Lys Phe Ser Lys Ala Glu Asp Met Ala Glu Leu Thr Cys Leu
100 105 110
Asn Glu Ala Ser Val Leu His Asn Leu Arg Glu Arg Tyr Tyr Ser Gly
115 120 125
Leu Ile Tyr Thr Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val Ile Asn Pro Tyr
130 135 140
Lys Gln Leu Pro Ile Tyr Thr Glu Ala Ile Val Glu Met Tyr Arg Gly
145 150 155 160
Lys Lys Arg His Glu Val Pro Pro His Val Tyr Ala Val Thr Glu Gly
165 170 175
Ala Tyr Arg Ser Met Leu Gln Asp Arg Glu Asp Gln Ser Ile Leu Cys
180 185 190
Thr Gly Glu Ser Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr Lys Lys Val Ile
195 200 205
Gln Tyr Leu Ala His Val Ala Ser Ser Pro Lys Gly Arg Lys Glu Pro
210 215 220
Gly Val Pro Gly Glu Leu Glu Arg Gln Leu Leu Gln Ala Asn Pro Ile
225 230 235 240
Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala Lys Thr Val Lys Asn Asp Asn Ser Ser
245 250 255
Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg Ile Asn Phe Asp Ile Ala Gly Tyr Ile
260 265 270
Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr Tyr Leu Leu Glu Lys Ser Arg Ala Ile
275 280 285
Arg Gln Ala Lys Asp Glu Cys Ser Phe His Ile Phe Tyr Gln Leu Leu
290 295 300
Gly Gly Ala Gly Glu Gln Leu Lys Ala Asp Leu Leu Leu Glu Pro Cys
305 310 315 320
Ser His Tyr Arg Phe Leu Thr Asn Gly Pro Ser Ser Ser Pro Gly Gln
325 330 335
Glu Arg Glu Leu Phe Gln Glu Thr Leu Glu Ser Leu Arg Val Leu Gly
340 345 350
Leu Leu Pro Glu Glu Ile Thr Ala Met Leu Arg Thr Val Ser Ala Val
355 360 365
Leu Gln Phe Gly Asn Ile Val Leu Lys Lys Glu Arg Asn Thr Asp Gln
370 375 380
Ala Thr Met Pro Asp Asn Thr Ala Ala Gln Lys Leu Cys Arg Leu Leu
385 390 395 400
Gly Leu Gly Val Thr Asp Phe Ser Arg Ala Leu Leu Thr Pro Arg Ile
405 410 415
Lys Val Gly Arg Asp Tyr Val Gln Lys Ala Gln Thr Lys Glu Gln Ala
420 425 430
Asp Phe Ala Leu Glu Ala Leu Ala Lys Ala Thr Tyr Glu Arg Leu Phe
435 440 445
Arg Trp Leu Val Leu Arg Leu Asn Arg Ala Leu Asp Arg Ser Pro Arg
450 455 460
Gln Gly Ala Ser Phe Leu Gly Ile Leu Asp Ile Ala Gly Phe Glu Ile
465 470 475 480
Phe Gln Leu Asn Ser Phe Glu Gln Leu Cys Ile Asn Tyr Thr Asn Glu
485 490 495
Lys Leu Gln Gln Leu Phe Asn His Thr Met Phe Val Leu Glu Gln Glu
500 505 510
Glu Tyr Gln Arg Glu Gly Ile Pro Trp Thr Phe Leu Asp Phe Gly Leu
515 520 525
Asp Leu Gln Pro Cys Ile Asp Leu Ile Glu Arg Pro Ala Asn Pro Pro
530 535 540
Gly Leu Leu Ala Leu Leu Asp Glu Glu Cys Trp Phe Pro Lys Ala Thr
545 550 555 560
Asp Lys Ser Phe Val Glu Lys Val Ala Gln Glu Gln Gly Ser His Pro
565 570 575
Lys Phe Gln Arg Pro Arg Asn Leu Arg Asp Gln Ala Asp Phe Ser Val
580 585 590
Leu His Tyr Ala Gly Lys Val Asp Tyr Lys Ala Ser Glu Trp Leu Met
595 600 605
Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val Ala Ala Leu Leu His Gln
610 615 620
Ser Thr Asp Arg Leu Thr Ala Glu Ile Trp Lys Asp Val Glu Gly Ile
625 630 635 640
Val Gly Leu Glu Gln Val Ser Ser Leu Gly Asp Gly Pro Pro Gly Gly
645 650 655
Arg Pro Arg Arg Gly Met Phe Arg Thr Val Gly Gln Leu Tyr Lys Glu
660 665 670
Ser Leu Ser Arg Leu Met Ala Thr Leu Ser Asn Thr Asn Pro Ser Phe
675 680 685
Val Arg Cys Ile Val Pro Asn His Glu Lys Arg Ala Gly Lys Leu Glu
690 695 700
Pro Arg Leu Val Leu Asp Gln Leu Arg Cys Asn Gly Val Leu Glu Gly
705 710 715 720
Ile Arg Ile Cys Arg Gln Gly Phe Pro Asn Arg Ile Leu Phe Gln Glu
725 730 735
Phe Arg Gln Arg Tyr Glu Ile Leu Thr Pro Asn Ala Ile Pro Lys Gly
740 745 750
Phe Met Asp Gly Lys Gln Ala Cys Glu Lys Met Ile Gln Ala Leu Glu
755 760 765
Leu Asp Pro Asn Leu Tyr Arg Val Gly Gln Ser Lys Ile Phe Phe Arg
770 775 780
Ala Gly Val Leu Ala Gln Leu Glu Glu Glu Arg Asp Leu Lys Val Thr
785 790 795 800
Asp Ile Ile Val Ser Phe Gln Ala Ala Ala Arg Gly Tyr Leu Ala Arg
805 810 815
Arg Ala Phe Gln Arg Arg Gln Gln Gln Gln Ser Ala Leu Arg Val Met
820 825 830
Gln Arg Asn Cys Ala Ala Tyr Leu Lys Leu Arg Asn Trp Gln Trp Trp
835 840 845
Arg Leu Phe Ile Lys Val Lys Pro Leu Leu Gln Val Thr Arg Gln Asp
850 855 860
Glu Val Leu Gln Ala Arg Ala Gln Glu Leu Gln Lys Val Gln Glu Leu
865 870 875 880
Gln Gln Gln Ser Ala Arg Glu Val Gly Glu Leu Gln Gly Arg Val Ala
885 890 895
Gln Leu Glu Glu Glu Arg Thr Arg Leu Ala Glu Gln Leu Arg Ala Glu
900 905 910
Ala Glu Leu Cys Ser Glu Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ala Ala
915 920 925
Arg Lys Gln Glu Leu Glu Leu Val Val Thr Glu Leu Glu Ala Arg Val
930 935 940
Gly Glu Glu Glu Glu Cys Ser Arg Gln Leu Gln Ser Glu Lys Lys Arg
945 950 955 960
Leu Gln Gln His Ile Gln Glu Leu Glu Ser His Leu Glu Ala Glu Glu
965 970 975
Gly Ala Arg Gln Lys Leu Gln Leu Glu Lys Val Thr Thr Glu Ala Lys
980 985 990
Met Lys Lys Phe Glu Glu Asp Leu Leu Leu Leu Glu Asp Gln Asn Ser
995 1000 1005
Lys Leu Ser Lys Glu Arg Arg Leu Leu Glu Glu Arg Leu Ala Glu Phe
1010 1015 1020
Ser Ser Gln Ala Ala Glu Glu Glu Glu Lys Val Lys Ser Leu Asn Lys
1025 1030 1035 1040
Leu Arg Leu Lys Tyr Glu Ala Thr Ile Ser Asp Met Glu Asp Arg Leu
1045 1050 1055
Lys Lys Glu Glu Lys Gly Arg Gln Glu Leu Glu Lys Leu Lys Arg Arg
1060 1065 1070
Leu Asp Gly Glu Ser Ser Glu Leu Gln Glu Gln Met Val Glu Gln Lys
1075 1080 1085
Gln Arg Ala Glu Glu Leu Leu Ala Gln Leu Gly Arg Lys Glu Asp Glu
1090 1095 1100
Leu Gln Ala Ala Leu Leu Arg Ala Glu Glu Glu Gly Gly Ala Arg Ala
1105 1110 1115 1120
Gln Leu Leu Lys Ser Leu Arg Glu Ala Gln Ala Gly Leu Ala Glu Ala
1125 1130 1135
Gln Glu Asp Leu Glu Ala Glu Arg Val Ala Arg Ala Lys Ala Glu Lys
1140 1145 1150
Gln Arg Arg Asp Leu Gly Glu Glu Leu Glu Ala Leu Arg Gly Glu Leu
1155 1160 1165
Glu Asp Thr Leu Asp Ser Thr Asn Ala Gln Gln Glu Leu Arg Ser Lys
1170 1175 1180
Arg Glu Gln Glu Val Thr Glu Leu Lys Lys Ala Leu Glu Glu Glu Ser
1185 1190 1195 1200
Arg Ala His Glu Val Ser Met Gln Glu Leu Arg Gln Arg His Ser Gln
1205 1210 1215
Ala Leu Val Glu Met Ala Glu Gln Leu Glu Gln Ala Arg Arg Gly Lys
1220 1225 1230
Gly Val Trp Glu Lys Thr Arg Leu Ser Leu Glu Ala Glu Val Ser Glu
1235 1240 1245
Leu Lys Ala Glu Leu Ser Ser Leu Gln Thr Ser Arg Gln Glu Gly Glu
1250 1255 1260
Gln Lys Arg Arg Arg Leu Glu Ser Gln Leu Gln Glu Val Gln Gly Arg
1265 1270 1275 1280
Ser Ser Asp Ser Glu Arg Ala Arg Ser Glu Ala Ala Glu Lys Leu Gln
1285 1290 1295
Arg Ala Gln Ala Glu Leu Glu Ser Val Ser Thr Ala Leu Ser Glu Ala
1300 1305 1310
Glu Ser Lys Ala Ile Arg Leu Gly Lys Glu Leu Ser Ser Ala Glu Ser
1315 1320 1325
Gln Leu His Asp Thr Gln Glu Leu Leu Gln Glu Glu Thr Arg Ala Lys
1330 1335 1340
Leu Ala Leu Gly Ser Arg Val Arg Ala Leu Glu Ala Glu Ala Ala Gly
1345 1350 1355 1360
Leu Arg Glu Gln Met Glu Glu Glu Val Val Ala Arg Glu Arg Ala Gly
1365 1370 1375
Arg Glu Leu Gln Ser Thr Gln Ala Gln Leu Ser Glu Trp Arg Arg Arg
1380 1385 1390
Gln Glu Glu Glu Ala Ala Val Leu Glu Ala Gly Glu Glu Ala Arg Arg
1395 1400 1405
Arg Ala Ala Arg Glu Ala Glu Thr Leu Thr Gln Arg Leu Ala Glu Lys
1410 1415 1420
Thr Glu Ala Val Glu Arg Leu Glu Arg Ala Arg Arg Arg Leu Gln Gln
1425 1430 1435 1440
Glu Leu Asp Asp Ala Thr Val Asp Leu Gly Gln Gln Lys Gln Leu Leu
1445 1450 1455
Ser Thr Leu Glu Lys Lys Gln Arg Lys Phe Asp Gln Leu Leu Ala Glu
1460 1465 1470
Glu Lys Ala Ala Val Leu Arg Ala Val Glu Asp Arg Glu Arg Ile Glu
1475 1480 1485
Ala Glu Gly Arg Glu Arg Glu Ala Arg Ala Leu Ser Leu Thr Arg Ala
1490 1495 1500
Leu Glu Glu Glu Gln Glu Ala Arg Glu Glu Leu Glu Arg Gln Asn Arg
1505 1510 1515 1520
Ala Leu Arg Ala Glu Leu Glu Ala Leu Leu Ser Ser Lys Asp Asp Val
1525 1530 1535
Gly Lys Asn Val His Glu Leu Glu Arg Ala Arg Lys Ala Ala Glu Gln
1540 1545 1550
Ala Ala Ser Asp Leu Arg Thr Gln Val Thr Glu Leu Glu Asp Glu Leu
1555 1560 1565
Thr Ala Ala Glu Asp Ala Lys Leu Arg Leu Glu Val Thr Val Gln Ala
1570 1575 1580
Leu Lys Ala Gln His Glu Arg Asp Leu Gln Gly Arg Asp Asp Ala Gly
1585 1590 1595 1600
Glu Glu Arg Arg Arg Gln Leu Ala Lys Gln Leu Arg Asp Ala Glu Val
1605 1610 1615
Glu Arg Asp Glu Glu Arg Lys Gln Arg Ala Leu Ala Met Ala Ala Arg
1620 1625 1630
Lys Lys Leu Glu Leu Glu Leu Glu Glu Leu Lys Ala Gln Thr Ser Ala
1635 1640 1645
Ala Gly Gln Gly Lys Glu Glu Ala Val Lys Gln Leu Lys Lys Met Gln
1650 1655 1660
Val Gln Met Lys Glu Leu Trp Arg Glu Val Glu Glu Thr Arg Ser Ser
1665 1670 1675 1680
Arg Asp Glu Met Phe Thr Leu Ser Arg Glu Asn Glu Lys Lys Leu Lys
1685 1690 1695
Gly Leu Glu Ala Glu Val Leu Arg Leu Gln Glu Glu Leu Ala Ala Ser
1700 1705 1710
Asp Arg Ala Arg Arg Gln Ala Gln Gln Asp Arg Asp Glu Met Ala Glu
l715 1720 1725
Glu Val Ala Ser Gly Asn Leu Ser Lys Ala Ala Thr Leu Glu Glu Lys
1730 1735 1740
Arg Gln Leu Glu Gly Arg Leu Ser Gln Leu Glu Glu Glu Leu Glu Glu
1745 1750 1755 1760
Glu Gln Asn Asn Ser Glu Leu Leu Lys Asp His Tyr Arg Lys Leu Val
1765 1770 1775
Leu Gln Val Glu Ser Leu Thr Thr Glu Leu Ser Ala Glu Arg Ser Phe
1780 1785 1790
Ser Ala Lys Ala Glu Ser Gly Arg Gln Gln Leu Glu Arg Gln Ile Gln
1795 1800 1805
Glu Leu Arg Ala Arg Leu Gly Glu Glu Asp Ala Gly Ala Arg Ala Arg
1810 1815 1820
Gln Lys Met Leu Ile Ala Ala Leu Glu Ser Lys Leu Ala Gln Ala Glu
1825 1830 1835 1840
Glu Gln Leu Glu Gln Glu Ser Arg Glu Arg Ile Leu Ser Gly Lys Leu
1845 1850 1855
Val Arg Arg Ala Glu Lys Arg Leu Lys Glu Val Val Leu Gln Val Asp
1860 1865 1870
Glu Glu Arg Arg Val Ala Asp Gln Val Arg Asp Gln Leu Glu Lys Ser
1875 1880 1885
Asn Leu Arg Leu Lys Gln Leu Lys Arg Gln Leu Glu Glu Ala Glu Glu
1890 1895 1900
Glu Ala Ser Arg Ala Gln Ala Gly Arg Arg Arg Leu Gln Arg Glu Leu
1905 1910 1915 1920
Glu Asp Val Thr Glu Ser Ala Glu Ser Met Asn Arg Glu Val Thr Thr
1925 1930 1935
Leu Arg Asn Arg Leu Arg Arg Gly Pro Leu Thr Phe Thr Thr Arg Thr
1940 1945 1950
Val Arg Gln Val Phe Arg Leu Glu Glu Gly Val Ala Ser Asp Glu Glu
1955 1960 1965
Glu Ala Glu Gly Ala Glu Pro Gly Ser Ala Pro Gly Gln Glu Pro Glu
1970 1975 1980
Ala Pro Pro Pro Ala Thr Pro Gln
1985 1990
<210>59
<211>6786
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<400>59
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ccatgtcggt gcccgggcgg aaggcgcccc ccaggccggg cccagtgccc gaggcggccc 120
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ccccgcaggt ggagtggacg gcccggcgtc tcgtgtgggt gccttcggag cttcacgggt 240
tcgaggcggc ggcgctgcgg gacgaaggcg aggaggaggc ggaggtggag ctggcggaga 300
gcgggaggcg gctgcgactg ccgcgggacc agatccagcg catgaacccg cccaagttca 360
gcaaggccga ggacatggcc gagctgacct gcctcaacga ggcctcggtc ctgcacaacc 420
tccgggagcg gtactactcc ggcctcatct acacgtactc cggccttttc tgtgtggtca 480
tcaacccgta caagcagctt cccatctaca cagaagccat tgtggagatg taccggggca 540
agaagcgcca cgaggtgcca ccccacgtgt acgcagtgac cgagggggcc tatcggagca 600
tgctgcagga tcgtgaggac cagtccattc tctgcactgg agagtctgga gctgggaaga 660
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acatcatcgt ctccttccag gcagctgccc ggggatacct ggctcgcagg gccttccaga 2520
agcgccagca gcagcagagc gccctgaggg tgatgcagcg gaactgcgcg gcctacctca 2580
agctgagaca ctggcagtgg tggcggctgt ttaccaaggt gaagccactg ctgcaggtga 2640
cgcggcagga tgaggtgctg caggcacggg cccaggagct gcagaaagtg caggagctac 2700
agcagcagag cgcccgcgaa gttggggagc tccagggccg agtggcacag ctggaagagg 2760
agcgcgcccg cctggcagag caattgcgag cagaggcaga actgtgtgca gaggccgagg 2820
agacgcgggg gaggctggca gcccgcaagc aggagctgga gctggtggtg tcagagctgg 2880
aggctcgcgt gggcgaggag gaggagtgca gccgtcaaat gcaaaccgag aagaagaggc 2940
tacagcagca catacaggag ctagaggccc accttgaggc tgaggagggt gcgcggcaga 3000
agctgcagct ggagaaggtg acgacagagg caaaaatgaa gaaatttgaa gaggacctgc 3060
tgctcctgga agaccagaat tccaagctga gcaagagcgg aagctgctgg aagatcgtct 3120
ggccgagttc tcatcccagg cagctgagga ggaggagaag gtcaagagcc tcaataagct 3180
acggctcaaa tatgaggcca caatcgcaga catggaggga ccgcctacgg aaggaggaga 3240
agggtcgcca ggagctggag aagctgaagc ggaggctgga tggggagagc tcagagctgc 3300
aggagcagat ggtggagcag caacagcggg cagaggagct gcgggcccag ctgggccgga 3360
aggaggagga gctgcaggct gccctggcca gggcagaaga cgagggtggg gcccgggccc 3420
agctgctgaa atccctgcgg gaggctcaag cagccctggc cgaggcccag gaggacctgg 3480
agtctgagcg tgtggccagg accaaggcgg agaagcagcg ccgggacctg ggcgaggagc 3540
tggaggcgct gcggggcgag ctggaggaca cgctggactc caccaacgca cagcaggagc 3600
tccggtccaa gagggaacag gaggtgacgg agctgaagaa gactctggag gaggagactc 3660
gcatccacga ggcggcagtg caggagctga ggcagcgcca cggccaggcc ctgggggagc 3720
tggcggagca gctggagcag gcccggaggg gcaaaggtgc atgggagaag acccggctgg 3780
ccctggaggc cgaggtgtcc gagctgcggg cagaactgag cagcctgcag actgcacgtc 3840
aggagggtga gcagcggagg cgccgcctgg agttacagct gcaggaggtg cagggccggg 3900
ctggtgatgg ggagagggca cgagcggagg ctgctgagaa gctgcagcga gcccaggctg 3960
aactggagaa tgtgtctggg gcgctgaacg aggctgagtc caaaaccatc cgtcttagca 4020
aggagctgag cagcacagaa gcccagctgc acgatgccca ggagctgctg caggaggaga 4080
ccagggcgaa attggccttg gggtcccggg tgcgagccat ggaggctgag gcagccgggc 4140
tgcgtgagca gctggaggag gaggcagctg ccagggaacg ggcgggccgt gaactgcaga 4200
ctgcccaggc ccagctttcc gagtggcggc ggcgccagga ggaggaggca ggggcactgg 4260
aggcagggga ggaggcacgg cgccgggcag cccgggaggc cgaggccctg acccagcgcc 4320
tggcagaaaa gacagagacc gtggatcggc tggagcgggg ccgccgccgg ctgcagcagg 4380
agctggacga cgccaccatg gacctggagc agcagcggca gcttgtgagc accctggaga 4440
agaagcagcg caagtttgac cagcttctgg cagaggagaa ggcagctgta cttcgggcag 4500
tggaggaacg tgagcgggcc gaggcagagg gccgggagcg tgaggctcgg gccctgtcac 4560
tgacacgggc actggaggag gagcaggagg cacgtgagga gctggagcgg cagaaccggg 4620
ccctgcgggc tgagctggag gcactgctga gcagcaagga tgacgtcggc aagagcgtgc 4680
atgagctgga acgagcctgc cgggtagcag aacaggcagc caatgatctg cgagcacagg 4740
tgacagaact ggaggatgag ctgacagcgg ccgaggatgc caagctgcgt ctggaggtga 4800
ctgtgcaggc tctcaagact cagcatgagc gtgacctgca gggccgtgat gaggctggtg 4860
aagagaggcg gaggcagctg gccaagcagc tgagagatgc agaggtggag cgggatgagg 4920
agcggaagca gcgcactctg gccgtggctg cccgcaagaa gctggaggga gagctggagg 4980
agctgaaggc tcagatggcc tctgccggcc agggcaagga ggaggcggtg aagcagcttc 5040
gcaagatgca ggcccagatg aaggagctat ggcgggaggt ggaggagaca cgcacctccc 5100
gggaggagat cttctcccag aatcgggaaa gtgaaaagcg cctcaagggc ctggaggctg 5160
aggtgctgcg gctgcaggag gaactggccg cctcggaccg tgctcggcgg caggcccagc 5220
aggaccggga tgagatggca gatgaggtgg ccaatggtaa ccttagcaag gcagccattc 5280
tggaggagaa gcgtcagctg gaggggcgcc tggggcagtt ggaggaagag ctggaggagg 5340
agcagagcaa ctcagagctg ctcaatgacc gctaccgcaa gctgctcctg caggtagagt 5400
cactgaccac agagctgtca gctgagcgca gtttctcagc caaggcagag agcgggcggc 5460
agcagctgga acggcagatc caggagctac ggggacgcct gggtgaggag gatgctgggg 5520
cccgtgcccg ccacaagatg accattgctg cccttgagtc taagttggcc caggctgagg 5580
agcagctaga gcaagagacc agagagcgca tcctctctgg aaagctggtg cgcagagctg 5640
agaagcggct taaagaggtg gtgctccagg tggaggagga gcggagggtg gctgaccagc 5700
tccgggacca gctggagaag ggaaaccttc gagtcaagca gctgaagcgg cagctggagg 5760
aggccgagga ggaggcatcc cgggctcagg ctggccgccg gaggctgcag cgtgagctgg 5820
aagatgtcac agagtcggcc gagtccatga accgtgaagt gaccacactg aggaaccggc 5880
ttcgacgcgg ccccctcacc ttcaccaccc gcacggtgcg ccaggtcttc cgactagagg 5940
agggcgtggc atccgacgag gaggcagagg aagcacagcc tgggtctggg ccatccccgg 6000
agcctgaggg gtccccacca gcccaccccc agtgacccta ccctgtcccc agatgcacta 6060
acagatgggg cccagccccc ttcctccctg gaccccacgg gcccctgtcc caggaacccc 6120
gccctctgac ttcttgccct ttggaaatgg tgcagcactc tggcatttat cacccccacc 6180
tgggtcccct gcaacctccc atcaaaggat gacccctaaa cacagaggag cggggcaggc 6240
agggaggcaa ggactggagc taccttgctt gttgggggac tgggtacagt tggcaagctg 6300
tgtttccatc agctccctgt cctcctttct tccctcgtta ttgatctata gacattagga 6360
agggagtgag acggctcctc caccatcctc agccagtgca acccattccc tctgcttctc 6420
tctctctctc tctctctccc tccctctcct tccctaccct ctcaccatct ttcttggcct 6480
ctctgagggt ctctctgtgc atctttttag gaatctcgct ctcactctct acgtagccac 6540
tctccttccc ccatttctgc gtccacccct gaactcctga gcgacagaag ccccaggcct 6600
ccaccagcct tgaacccttg caaaggggca ggacaagggg acccctctca ctcctgctgc 6660
tgcccatgct ctgccctccc ttctggttgc tctgagggtt cggagcttcc ctctgggact 6720
aaaggagtgt cctttaccct cccagcctcc aggctctggc agaaataaac tccaacccga 6780
ctggac 6786
<210>60
<211>1995
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>60
Met Ala Ala Val Thr Met Ser Val Pro Gly Arg Lys Ala Pro Pro Arg
1 5 10 15
Pro Gly Pro Val Pro Glu Ala Ala Gln Pro Phe Leu Phe Thr Pro Arg
20 25 30
Gly Pro Ser Ala Gly Gly Gly Pro Gly Ser Gly Thr Ser Pro Gln Val
35 40 45
Glu Trp Thr Ala Arg Arg Leu Val Trp Val Pro Ser Glu Leu His Gly
50 55 60
Phe Glu Ala Ala Ala Leu Arg Asp Glu Gly Glu Glu Glu Ala Glu Val
65 70 75 80
Glu Leu Ala Glu Ser Gly Arg Arg Leu Arg Leu Pro Arg Asp Gln Ile
85 90 95
Gln Arg Met Asn Pro Pro Lys Phe Ser Lys Ala Glu Asp Met Ala Glu
100 105 110
Leu Thr Cys Leu Asn Glu Ala Ser Val Leu His Asn Leu Arg Glu Arg
115 120 125
Tyr Tyr Ser Gly Leu Ile Tyr Thr Tyr Ser Gly Leu Phe Cys Val Val
130 135 140
Ile Asn Pro Tyr Lys Gln Leu Pro Ile Tyr Thr Glu Ala Ile Val Glu
145 150 155 160
Met Tyr Arg Gly Lys Lys Arg His Glu Val Pro Pro His Val Tyr Ala
165 170 175
Val Thr Glu Gly Ala Tyr Arg Ser Met Leu Gln Asp Arg Glu Asp Gln
180 185 190
Ser Ile Leu Cys Thr Gly Glu Ser Gly Ala Gly Lys Thr Glu Asn Thr
195 200 205
Lys Lys Val Ile Gln Tyr Leu Ala His Val Ala Ser Ser Pro Lys Gly
210 215 220
Arg Lys Glu Pro Gly Val Pro Gly Glu Leu Glu Arg Gln Leu Leu Gln
225 230 235 240
Ala Asn Pro Ile Leu Glu Ala Phe Gly Asn Ala Lys Thr Val Lys Asn
245 250 255
Asp Asn Ser Ser Arg Phe Gly Lys Phe Ile Arg Ile Asn Phe Asp Val
260 265 270
Ala Gly Tyr Ile Val Gly Ala Asn Ile Glu Thr Tyr Leu Leu Glu Lys
275 280 285
Ser Arg Ala Ile Arg Gln Ala Lys Asp Glu Cys Ser Phe His Ile Phe
290 295 300
Tyr Gln Leu Leu Gly Gly Ala Gly Glu Gln Leu Lys Ala Asp Leu Leu
305 310 315 320
Leu Glu Pro Cys Ser His Tyr Arg Phe Leu Thr Asn Gly Pro Ser Ser
325 330 335
Ser Pro Gly Gln Glu Arg Glu Leu Phe Gln Glu Thr Leu Glu Ser Leu
340 345 350
Arg Val Leu Gly Phe Ser His Glu Glu Ile Ile Ser Met Leu Arg Met
355 360 365
Val Ser Ala Val Leu Gln Phe Gly Asn Ile Ala Leu Lys Arg Glu Arg
370 375 380
Asn Thr Asp Gln Ala Thr Met Pro Asp Asn Thr Ala Ala Gln Lys Leu
385 390 395 400
Cys Arg Leu Leu Gly Leu Gly Val Thr Asp Phe Ser Arg Ala Leu Leu
405 410 415
Thr Pro Arg Ile Lys Val Gly Arg Asp Tyr Val Gln Lys Ala Gln Thr
420 425 430
Lys Glu Gln Ala Asp Phe Ala Leu Glu Ala Leu Ala Lys Ala Thr Tyr
435 440 445
Glu Arg Leu Phe Arg Trp Leu Val Leu Arg Leu Asn Arg Ala Leu Asp
450 455 460
Arg Ser Pro Arg Gln Gly Ala Ser Phe Leu Gly Ile Leu Asp Ile Ala
465 470 475 480
Gly Phe Glu Ile Phe Gln Leu Asn Ser Phe Glu Gln Leu Cys Ile Asn
485 490 495
Tyr Thr Asn Glu Lys Leu Gln Gln Leu Phe Asn His Thr Met Phe Val
500 505 510
Leu Glu Gln Glu Glu Tyr Gln Arg Glu Gly Ile Pro Trp Thr Phe Leu
515 520 525
Asp Phe Gly Leu Asp Leu Gln Pro Cys Ile Asp Leu Ile Glu Arg Pro
530 535 540
Ala Asn Pro Pro Gly Leu Leu Ala Leu Leu Asp Glu Glu Cys Trp Phe
545 550 555 560
Pro Lys Ala Thr Asp Lys Ser Phe Val Glu Lys Val Ala Gln Glu Gln
565 570 575
Gly Gly His Pro Lys Phe Gln Arg Pro Arg His Leu Arg Asp Gln Ala
580 585 590
Asp Phe Ser Val Leu His Tyr Ala Gly Lys Val Asp Tyr Lys Ala Asn
595 600 605
Glu Trp Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val Ala Ala
610 615 620
Leu Leu His Gln Ser Thr Asp Arg Leu Thr Ala Glu Ile Trp Lys Asp
625 630 635 640
Val Glu Gly Ile Val Gly Leu Glu Gln Val Ser Ser Leu Gly Asp Gly
645 650 655
Pro Pro Gly Gly Arg Pro Arg Arg Gly Met Phe Arg Thr Val Gly Gln
660 665 670
Leu Tyr Lys Glu Ser Leu Ser Arg Leu Met Ala Thr Leu Ser Asn Thr
675 680 685
Asn Pro Ser Phe Val Arg Cys Ile Val Pro Asn His Glu Lys Arg Ala
690 695 700
Gly Lys Leu Glu Pro Arg Leu Val Leu Asp Gln Leu Arg Cys Asn Gly
705 710 715 720
Val Leu Glu Gly Ile Arg Ile Cys Arg Gln Gly Phe Pro Asn Arg Ile
725 730 735
Leu Phe Gln Glu Phe Arg Gln Arg Tyr Glu Ile Leu Thr Pro Asn Ala
740 745 750
Ile Pro Lys Gly Phe Met Asp Gly Lys Gln Ala Cys Glu Lys Met Ile
755 760 765
Gln Ala Leu Glu Leu Asp Pro Asn Leu Tyr Arg Val Gly Gln Ser Lys
770 775 780
Ile Phe Phe Arg Ala Gly Val Leu Ala Gln Leu Glu Glu Glu Arg Asp
785 790 795 800
Leu Lys Val Thr Asp Ile Ile Val Ser Phe Gln Ala Ala Ala Arg Gly
805 810 815
Tyr Leu Ala Arg Arg Ala Phe Gln Lys Arg Gln Gln Gln Gln Ser Ala
820 825 830
Leu Arg Val Met Gln Arg Asn Cys Ala Ala Tyr Leu Lys Leu Arg His
835 840 845
Trp Gln Trp Trp Arg Leu Phe Thr Lys Val Lys Pro Leu Leu Gln Val
850 855 860
Thr Arg Gln Asp Glu Val Leu Gln Ala Arg Ala Gln Glu Leu Gln Lys
865 870 875 880
Val Gln Glu Leu Gln Gln Gln Ser Ala Arg Glu Val Gly Glu Leu Gln
885 890 895
Gly Arg Val Ala Gln Leu Glu Glu Glu Arg Ala Arg Leu Ala Glu Gln
900 905 910
Leu Arg Ala Glu Ala Glu Leu Cys Ala Glu Ala Glu Glu Thr Arg Gly
915 920 925
Arg Leu Ala Ala Arg Lys Gln Glu Leu Glu Leu Val Val Ser Glu Leu
930 935 940
Glu Ala Arg Val Gly Glu Glu Glu Glu Cys Ser Arg Gln Met Gln Thr
945 950 955 960
Glu Lys Lys Arg Leu Gln Gln His Ile Gln Glu Leu Glu Ala His Leu
965 970 975
Glu Ala Glu Glu Gly Ala Arg Gln Lys Leu Gln Leu Glu Lys Val Thr
980 985 990
Thr Glu Ala Lys Met Lys Lys Phe Glu Glu Asp Leu Leu Leu Leu Glu
995 1000 1005
Asp Gln Asn Ser Lys Leu Ser Lys Ser Gly Ser Cys Trp Lys Ile Val
1010 1015 1020
Trp Pro Ser Ser His Pro Arg Gln Leu Arg Arg Arg Arg Arg Ser Arg
1025 1030 1035 1040
Ala Ser Ile Ser Tyr Gly Ser Asn Met Arg Pro Gln Ser Gln Thr Trp
1045 1050 1055
Arg Asp Arg Leu Arg Lys Glu Glu Lys Gly Arg Gln Glu Leu Glu Lys
1060 1065 1070
Leu Lys Arg Arg Leu Asp Gly Glu Ser Ser Glu Leu Gln Glu Gln Met
1075 1080 1085
Val Glu Gln Gln Gln Arg Ala Glu Glu Leu Arg Ala Gln Leu Gly Arg
1090 1095 1100
Lys Glu Glu Glu Leu Gln Ala Ala Leu Ala Arg Ala Glu Asp Glu Gly
1105 1110 1115 1120
Gly Ala Arg Ala Gln Leu Leu Lys Ser Leu Arg Glu Ala Gln Ala Ala
1125 1130 1135
Leu Ala Glu Ala Gln Glu Asp Leu Glu Ser Glu Arg Val Ala Arg Thr
1140 1145 1150
Lys Ala Glu Lys Gln Arg Arg Asp Leu Gly Glu Glu Leu Glu Ala Leu
1155 1160 1165
Arg Gly Glu Leu Glu Asp Thr Leu Asp Ser Thr Asn Ala Gln Gln Glu
1170 1175 1180
Leu Arg Ser Lys Arg Glu Gln Glu Val Thr Glu Leu Lys Lys Thr Leu
1185 1190 1195 1200
Glu Glu Glu Thr Arg Ile His Glu Ala Ala Val Gln Glu Leu Arg Gln
1205 1210 1215
Arg His Gly Gln Ala Leu Gly Glu Leu Ala Glu Gln Leu Glu Gln Ala
1220 1225 1230
Arg Arg Gly Lys Gly Ala Trp Glu Lys Thr Arg Leu Ala Leu Glu Ala
1235 1240 1245
Glu Val Ser Glu Leu Arg Ala Glu Leu Ser Ser Leu Gln Thr Ala Arg
1250 1255 1260
Gln Glu Gly Glu Gln Arg Arg Arg Arg Leu Glu Leu Gln Leu Gln Glu
1265 1270 1275 1280
Val Gln Gly Arg Ala Gly Asp Gly Glu Arg Ala Arg Ala Glu Ala Ala
1285 1290 1295
Glu Lys Leu Gln Arg Ala Gln Ala Glu Leu Glu Asn Val Ser Gly Ala
1300 1305 1310
Leu Asn Glu Ala Glu Ser Lys Thr Ile Arg Leu Ser Lys Glu Leu Ser
1315 1320 1325
Ser Thr Glu Ala Gln Leu His Asp Ala Gln Glu Leu Leu Gln Glu Glu
1330 1335 1340
Thr Arg Ala Lys Leu Ala Leu Gly Ser Arg Val Arg Ala Met Glu Ala
1345 1350 1355 1360
Glu Ala Ala Gly Leu Arg Glu Gln Leu Glu Glu Glu Ala Ala Ala Arg
1365 1370 1375
Glu Arg Ala Gly Arg Glu Leu Gln Thr Ala Gln Ala Gln Leu Ser Glu
1380 1385 1390
Trp Arg Arg Arg Gln Glu Glu Glu Ala Gly Ala Leu Glu Ala Gly Glu
1395 1400 1405
Glu Ala Arg Arg Arg Ala Ala Arg Glu Ala Glu Ala Leu Thr Gln Arg
1410 1415 1420
Leu Ala Glu Lys Thr Glu Thr Val Asp Arg Leu Glu Arg Gly Arg Arg
1425 1430 1435 1440
Arg Leu Gln Gln Glu Leu Asp Asp Ala Thr Met Asp Leu Glu Gln Gln
1445 1450 1455
Arg Gln Leu Val Ser Thr Leu Glu Lys Lys Gln Arg Lys Phe Asp Gln
1460 1465 1470
Leu Leu Ala Glu Glu Lys Ala Ala Val Leu Arg Ala Val Glu Glu Arg
1475 1480 1485
Glu Arg Ala Glu Ala Glu Gly Arg Glu Arg Glu Ala Arg Ala Leu Ser
1490 1495 1500
Leu Thr Arg Ala Leu Glu Glu Glu Gln Glu Ala Arg Glu Glu Leu Glu
1505 1510 1515 1520
Arg Gln Asn Arg Ala Leu Arg Ala Glu Leu Glu Ala Leu Leu Ser Ser
1525 1530 1535
Lys Asp Asp Val Gly Lys Ser Val His Glu Leu Glu Arg Ala Cys Arg
1540 1545 1550
Val Ala Glu Gln Ala Ala Asn Asp Leu Arg Ala Gln Val Thr Glu Leu
1555 1560 1565
Glu Asp Glu Leu Thr Ala Ala Glu Asp Ala Lys Leu Arg Leu Glu Val
1570 1575 1580
Thr Val Gln Ala Leu Lys Thr Gln His Glu Arg Asp Leu Gln Gly Arg
1585 1590 1595 1600
Asp Glu Ala Gly Glu Glu Arg Arg Arg Gln Leu Ala Lys Gln Leu Arg
1605 1610 1615
Asp Ala Glu Val Glu Arg Asp Glu Glu Arg Lys Gln Arg Thr Leu Ala
1620 1625 1630
Val Ala Ala Arg Lys Lys Leu Glu Gly Glu Leu Glu Glu Leu Lys Ala
1635 1640 1645
Gln Met Ala Ser Ala Gly Gln Gly Lys Glu Glu Ala Val Lys Gln Leu
1650 1655 1660
Arg Lys Met Gln Ala Gln Met Lys Glu Leu Trp Arg Glu Val Glu Glu
1665 1670 1675 1680
Thr Arg Thr Ser Arg Glu Glu Ile Phe Ser Gln Asn Arg Glu Ser Glu
1685 1690 1695
Lys Arg Leu Lys Gly Leu Glu Ala Glu Val Leu Arg Leu Gln Glu Glu
1700 1705 1710
Leu Ala Ala Ser Asp Arg Ala Arg Arg Gln Ala Gln Gln Asp Arg Asp
1715 1720 1725
Glu Met Ala Asp Glu Val Ala Asn Gly Asn Leu Ser Lys Ala Ala Ile
1730 1735 1740
Leu Glu Glu Lys Arg Gln Leu Glu Gly Arg Leu Gly Gln Leu Glu Glu
1745 1750 1755 1760
Glu Leu Glu Glu Glu Gln Ser Asn Ser Glu Leu Leu Asn Asp Arg Tyr
1765 1770 1775
Arg Lys Leu Leu Leu Gln Val Glu Ser Leu Thr Thr Glu Leu Ser Ala
1780 1785 1790
Glu Arg Ser Phe Ser Ala Lys Ala Glu Ser Gly Arg Gln Gln Leu Glu
1795 1800 1805
Arg Gln Ile Gln Glu Leu Arg Gly Arg Leu Gly Glu Glu Asp Ala Gly
1810 1815 1820
Ala Arg Ala Arg His Lys Met Thr Ile Ala Ala Leu Glu Ser Lys Leu
1825 1830 1835 1840
Ala Gln Ala Glu Glu Gln Leu Glu Gln Glu Thr Arg Glu Arg Ile Leu
1845 1850 1855
Ser Gly Lys Leu Val Arg Arg Ala Glu Lys Arg Leu Lys Glu Val Val
1860 1865 1870
Leu Gln Val Glu Glu Glu Arg Arg Val Ala Asp Gln Leu Arg Asp Gln
1875 1880 1885
Leu Glu Lys Gly Asn Leu Arg Val Lys Gln Leu Lys Arg Gln Leu Glu
1890 1895 1900
Glu Ala Glu Glu Glu Ala Ser Arg Ala Gln Ala Gly Arg Arg Arg Leu
1905 1910 1915 1920
Gln Arg Glu Leu Glu Asp Val Thr Glu Ser Ala Glu Ser Met Asn Arg
1925 1930 1935
Glu Val Thr Thr Leu Arg Asn Arg Leu Arg Arg Gly Pro Leu Thr Phe
1940 1945 1950
Thr Thr Arg Thr Val Arg Gln Val Phe Arg Leu Glu Glu Gly Val Ala
1955 1960 1965
Ser Asp Glu Glu Ala Glu Glu Ala Gln Pro Gly Ser Gly Pro Ser Pro
1970 1975 1980
Glu Pro Glu Gly Ser Pro Pro Ala His Pro Gln
1985 1990 1995
<210>61
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>61
Ala Cys Gly Met Pro Tyr Val Arg Ile Pro Thr Ala
1 5 10
<210>62
<211>12
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的肽
<400>62
Ala Gly Cys Met Pro Tyr Val Arg Ile Pro Thr Ala
1 5 10
<210>63
<211>11
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>63
Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Ile
1 5 10
<210>64
<211>12
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>64
Leu Met Lys Asn Met Asp Pro Leu Asn Asp Asn Val
1 5 10
<210>65
<211>15
<212>PRT
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列说明:合成的接头肽
<400>65
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
Claims (47)
1.一种分离的核酸,所述核酸编码含有SEQ ID NO:14的肽。
2.权利要求1的分离的核酸,其中所述核酸为SEQ ID NO:13。
3.一种分离的核酸,所述核酸编码含有SEQ ID NO:16、18、20、22、24、26、28、30或32的肽。
4.权利要求3的分离的核酸,其中所述核酸为SEQ ID NO:15、17、19、21、23、25、27、29或31。
5.权利要求3的分离的核酸,其中所述肽含有SEQ ID NO:30。
6.权利要求4的分离的核酸,其中所述核酸为SEQ ID NO:29。
7.一种分离的核酸,所述核酸编码的肽包含SEQ ID NO:48、50、52、54、56、58或60的天然IgM抗体结合部分。
8.一种分离的核酸,所述核酸编码包含SEQ ID NO:36或38的肽。
9.权利要求8的分离的核酸,其中所述肽包含SEQ ID NO:38。
10.权利要求1、3、7或8的分离的核酸,所述核酸操作性连接于启动子。
11.一种载体,所述载体含有权利要求10的核酸。
12.一种宿主细胞,所述细胞含有权利要求11的载体。
13.一种组合物,所述组合物含有氨基酸序列为SEQ ID NO:14的肽。
14.一种组合物,所述组合物含有氨基酸序列为SEQ ID NO:16、18、20、22、24、26、28、30或32的肽。
15.权利要求14的组合物,其中所述肽包含SEQ ID NO:30。
16.一种组合物,所述组合物含有氨基酸序列为SEQ ID NO:36或38的肽。
17.权利要求16的组合物,其中所述肽包含SEQ ID NO:38。
18.权利要求13、14或16的组合物,其中所述肽被聚乙二醇化。
19.权利要求13、14或16的组合物,其中所述肽被可检测的标签标记。
20.一种治疗炎性疾病或病症的方法,所述方法包括给予受试者权利要求13、14或16的组合物。
21.权利要求20的方法,其中所述炎性疾病或病症为再灌注损伤。
22.权利要求20的方法,其中所述受试者为哺乳动物。
23.权利要求20的方法,其中所述受试者为人。
24.一种分离的核酸分子,所述核酸分子选自:
a)一种核酸分子,所述分子含有的核苷酸序列与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:5的核苷酸序列至少有96%的一致性;
b)一种核酸分子,所述分子含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:5的核苷酸序列;或者
c)一种核酸分子,所述分子在严紧条件下与SEQ ID NO:1的核苷酸序列杂交。
25.一种分离的核酸分子,所述分子编码含有SEQ ID NO:2、SEQID NO:4或SEQ ID NO:6的氨基酸序列的多肽。
26.一种载体,所述载体含有权利要求24的核酸。
27.一种细胞,所述细胞合有权利要求26的核酸。
28.一种分离的核酸分子,所述分子选自:
a)一种核酸分子,所述分子含有的核苷酸序列与SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:11的核苷酸序列至少有96%的一致性;
b)一种核酸分子,所述分子含有SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:11的核苷酸序列;或者
c)一种核酸分子,所述分子在严紧条件下与SEQ ID NO:7的核苷酸序列杂交。
29.一种分离的核酸分子,所述分子编码含有SEQ ID NO:8、SEQID NO:10或SEQ ID NO:12的氨基酸序列的多肽。
30.一种载体,所述载体含有权利要求28的核酸。
31.一种细胞,所述细胞含有权利要求30的核酸。
32.一种分离的多肽,所述多肽含有SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:6的氨基酸序列。
33.一种分离的多肽,所述多肽含有SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:10或SEQ ID NO:12的氨基酸序列。
34.一种分离的天然免疫球蛋白,或其抗原结合部分,所述蛋白具有以下一种或多种特性:(i)能与局部缺血特异性抗原相互作用;(ii)能固定补体;或(iii)由B细胞亚群产生。
35.权利要求34的分离的天然免疫球蛋白,所述蛋白为IgM。
36.权利要求34的分离的天然免疫球蛋白,其中免疫球蛋白由B-1细胞产生。
37.权利要求34的分离的天然免疫球蛋白,所述蛋白由ATCC保藏号为PTA-3507的细胞产生。
38.权利要求34的分离的天然免疫球蛋白,其中的免疫球蛋白为重组抗体。
39.一种含有权利要求24的核酸序列的抗体,所述抗体与局部缺血特异性抗原结合。
40.一种含有权利要求28的核酸序列的抗体,所述抗体与局部缺血特异性抗原结合。
41.权利要求39的抗体,所述抗体进一步含有权利要求28的核酸序列。
42.权利要求41的抗体,所述抗体含有编码SEQ ID NO:2的多肽的核酸序列及编码SEQ ID NO:8的多肽的核酸序列。
43.一种经修饰的天然免疫球蛋白,所述蛋白具有改变补体结合或活性的突变。
44.权利要求43的经修饰的天然免疫球蛋白,所述蛋白能与局部缺血特异性抗原相互作用。
45.权利要求43的经修饰的天然免疫球蛋白,所述蛋白为IgM。
46.权利要求43的经修饰的天然免疫球蛋白,所述蛋白为IgG。
47.一种组合物,所述组合物含有治疗上有效量的权利要求43的抗体及药物可接受的载体。
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