CN1635142A - 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物 - Google Patents

用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物 Download PDF

Info

Publication number
CN1635142A
CN1635142A CN 200310122497 CN200310122497A CN1635142A CN 1635142 A CN1635142 A CN 1635142A CN 200310122497 CN200310122497 CN 200310122497 CN 200310122497 A CN200310122497 A CN 200310122497A CN 1635142 A CN1635142 A CN 1635142A
Authority
CN
China
Prior art keywords
paranoid schizophrenia
susceptibility
primer
gene
comt
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN 200310122497
Other languages
English (en)
Inventor
许琪
沈岩
计宏凯
季梁
原岩波
沈渔邨
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Peking University Institute Of Mental Health
Tsinghua University
Institute of Basic Medical Sciences of CAMS
Original Assignee
Peking University Institute Of Mental Health
Tsinghua University
Institute of Basic Medical Sciences of CAMS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Peking University Institute Of Mental Health, Tsinghua University, Institute of Basic Medical Sciences of CAMS filed Critical Peking University Institute Of Mental Health
Priority to CN 200310122497 priority Critical patent/CN1635142A/zh
Publication of CN1635142A publication Critical patent/CN1635142A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体地,本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH、ADH和MAO的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合,设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及COMT、ALDH、ADH和MAO四个基因在制备预测偏执型精神分裂症易感性的诊断剂中的应用。

Description

用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物
技术领域
本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体讲,本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合,设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA四个基因在制备预测偏执型精神分裂症易感性的诊断剂中的应用,及对偏执型精神分裂症的预防和治疗的指导作用。
背景技术
精神分裂症是最严重的精神疾病之一,其终身患病率高达1%。这样大的患病群体,不仅给家庭和社会带来沉重的经济负担,而且还严重威胁社会的安全和稳定。因此,确定精神分裂症的病因,建立有效的防治方法,已成为整个医学界乃至整个社会需迫切解决的问题。
大量流行病学资料表明,精神分裂症是一种具有明显遗传倾向的复杂多基因疾病,但其致病机理尚未阐明。最初,许多研究者致力于通过应用筛选单基因病致病基因的方法——定位克隆,来寻找精神分裂症易感基因,即寻找患病家系成员间共享的染色体DNA区域间的连锁,发现本病与包括染色体3p26-24,5p13,6q24-22,8p22-21,9p23,13q14-32,20p12,和22q12-13在内的许多位点都有一定的连锁关系。这进一步证实了本病是一种多基因疾病。但是,单纯利用定位克隆的策略来确定多基因病易感基因的成功报道还很少,目前对多基因病的易感基因研究还有一种方法——候选基因法,即直接研究疾病候选基因的变异与疾病之间的关系,主要基于对病例-对照的关联分析。关联分析不需要大的家系研究,而是比较某个或某一套标记在患者和正常个体的分布程度。某种标记如果在患者个体中分布十分明显,那么就可以认为该标记与疾病表型相关联。由于绝大多数多基因病(包括精神分裂症)很可能并非一个基因缺陷所致,而是多个微效基因联合作用的结果,因此,在做关联分析时,不能只观察某一个基因或某一个遗传标记在病例和对照两组人群中的分布,还应更进一步地分析不同基因型组合的分布情况。在候选基因法中,对候选基因的选择比较关键,一般主要针对与复杂疾病发生发展相关的一些通路上的基因进行研究。具体到精神分裂症,一些重要神经递质的通路成为研究的热点。
几十年来“多巴胺(DA)功能亢进假说”一直在精神分裂症发病机理研究中占主导地位。其最基本的观点是皮层下多巴胺能神经传递过度导致精神分裂症症状。在临床所使用的各种高效价抗精神病药物,大多是强有力的DA受体阻滞剂。另一方面,一些可以增加受体部位局部DA含量的药物(如:苯丙胺),可诱发类精神分裂症的症状。高香草酸(HVA)是DA的主要代谢产物之一,它在精神分裂症患者的血浆、脑脊液中均较正常人升高。另外,对脑组织DA受体结合力、密度的测定及脑成相技术CT、核磁共振成像(Magneticresonance imaging,MRI)、正电子发射断层扫描(Positron emission tomography,PET)的应用,均从不同角度证实了精神分裂症发病的“DA功能亢进假说。”
本发明人对精神分裂症发病与DA功能的关系比较感兴趣,因此进行了DA代谢通路与精神分裂症之间的关系研究。基本策略是:在精神分裂症患者和正常对照两组人群中,对DA代谢途径上涉及的酶的基因进行系统地单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)检测,然后用这些SNP数据进行关联分析,来寻找易感的SNP型组合。在DA代谢通路上一共涉及58种代谢酶,其中可在美国国家生物技术信息中心(National center for biotechnologyinformation,NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov)查到人基因序列的有23种。本发明在83个偏执型精神分裂症患者和108个正常对照中,对这23个基因中的85个已知SNPs进行了检测,最终发现了四个偏执型精神分裂症的易感基因(即COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA基因),以及这四个基因上的6个与中国北方汉族人偏执型精神分裂症相关的SNPs位点及它们之间的组合作用。由此经过深入研究完成了本发明。
发明内容
根据本发明的一个方面,提供了一种预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒,所述试剂盒包含基于SEQ ID NO:15-21的序列设计的用于PCR扩增的特异引物以及通过核酸扩增进行检测的试剂盒所含的常规组件。所述引物针对图中所示的SNP位点而设计,长度为18-26个核苷酸。优选地,所述引物选自SEQ IDNO:1-14组成的一组。
根据本发明的另一方面,提供了用于预测偏执型精神分裂症易感性的引物,所述引物为基于SEQ ID NO:15-21的序列设计的用于PCR扩增的特异引物,所述引物针对图中所示的SNP位点而设计,长度为18-26个核苷酸。优选地,所述引物选自SEQ ID NO:1-14组成的一组。
根据本发明的再一方面,提供了COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA基因作为偏执型精神分裂症易感基因在制备用于精神分裂症诊断的诊断剂中的应用。COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:15-18所示。
本发明的另一目的在于,揭示COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA基因在偏执型精神分裂症发生中重要作用的同时,指导偏执型精神分裂症的预防和治疗。
附图说明
图1示出本发明所检测的DA代谢通路上所涉及的58个代谢酶
1. 1.1.1.1         Alcohol dehydrogenase;ADH
2. 1.1.1.222       (R)-4-Hydroxyphenyllactate dehydrogenase;
3. 1.1.1.237       Hydroxyphenylpyruvate reductase;
4. 1.1.1.90        Aryl-alcohol dehydrogenase;
5. 1.10.3.1        Catechol oxidase;
6. 1.11.1.8        Iodide peroxidase;TPO
7. 1.13.11.15      3,4-Dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase;
8. 1.13.11.27      4-Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase;
9. 1.13.11.29      Stizolobate synthase;
10. 113.11.30      Stizolobinate synthase;
11. 1.13.11.4      Gentisate 1,2-dioxygenase;
12. 1.13.11.5      Homogentisate 1,2-dioxygenase;HGD
13. 1.14.13.18     4-Hydroxyphenylacetate 1-monooxygenase;
14. 1.14.13.3      4-Hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase;
15. 1.14.13.41     Tyrosine N-monooxygenase;
16. 1.14.13.42     Hydroxyphenylacetonitrile 2-monooxygenase;
17. 1.14.16.2      Tyrosine 3-monooxygenase;
18. 1.14.17.1      Dopamine beta-monooxygenase;DBH
19. 1.14.18.1      Monophenol monooxygenase;TYR
20. 1.2.1.16    Succinae-semialdehyde dehydrogenase(NAD(P)+);
21. 1.2.1.29    Aryl-aldehyde dehydrogenase;
22. 1.2.1.45    4-Carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase;
23. 1.2.1.5     Aldehyde dehydrogenase(NAD(P)+);ALDH
24. 1.2.1.53    4-Hydroxyphenylacetaldehyde dehydrogenase;
25. 1.2.1.60    5-Carboxymethyl-2-hydroxymuconic-semialdehyde dehydrogenase;
26. 1.2.3.1     Aldehyde oxidase;
27. 1.4.3.2     L-Amino-acid oxidase;
28. 1.4.3.4     Amine oxidase(flavin-containing);MAO
29. 1.4.3.6     Amine oxidase(copper-containing);DAO
30. 1.4.99.4    Aralkylamine dehydrogenase;
31. 2.1.1.25    Phenol O-methyltransferase;
32. 2.1.1.27    Tyramine N-methyltransferase;
31. 2.1.1.28    Phenylethanolamine N-methyltransferase;
34. 2.1.1.6     Catechol O-methyltransferase;COMT
35. 2.3.1.14    Glutamine N-phenylacetyltransferase;
36. 2.3.1.140   Rosmarinate synthase;
37. 2.4.1.178   Hydroxymandelonitrile glucosyltransferase;
38. 2.6.1.1     Aspartate transaminase;GOT
39. 2.6.1.49    Dihydroxyphenylalanine transaminase;
40. 2.6.1.5     Tyrosine transaminase;TAT
41. 2.6.1.57    Aromatic-amino-acid transaminase;
42. 2.6.1.9     Histidinol-phosphate transaminase;
43. 3.7.1.2     Fumarylacetoacetase;FAH
44. 3.7.1.5     Acylpyruvate hydrolase;
45. 4.1.1.25    Tyrosine decarboxylase;
46. 4.1.1.28    Aromatic-L-amino-acid decarboxylase;DDC
47. 4.1.1.62    Gentisate decarboxylase;
48. 4.1.1.68    5-Oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase;
49. 4.1.99.2    Tyrosine phenol-lyase;
50. 4.3.1.11    Dihydroxyphenylalanine ammonia-lyase;
51. 4.3.1.5     Phenylalanine ammonia-lyse;
52. 5.2.1.2     Maleylacetoacetate isomerase;GSTZ
53. 5.2.1.4     Maleylpyruvate isomerase;
54. 5.3.2.1     Phenylpyruvate tautomerase;PPT
55. 5.3.3.10    5-Carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase;
56. 5.4.3.6     Tyrosine 2,3-aminomutase;
57. 6.2.1.30    Phenylacetate--CoA ligase;
图2示出本发明所检测的SNPs位点及其附近DNA序列
2A:COMT基因rs174682位点(K)的上下游部分序列,K代表G/T多态性;
2B:ALDH3B1基因rs581105位点(K)的上下游部分序列,M代表A/C多态性;
2C:ADH1B基因rs1042026(R1)、rs1789882(R2)、rs1229982(K3)和rs1229984(R4)四个位点的上下游部分序列,Y1、R2、K3、Y4分别代表T/C、G/A、T/G和C/T多态性;
2D:MAOA基因rs1801291位点(Y)的上下游部分序列,Y代表T/C多态性。
具体实施方式
定义:
单核苷酸多态性(SNP):主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。
疾病易感性(精神分裂症易感性):人群对疾病(精神分裂症)容易感受的程度。
病例-对照关联分析:是一种由因及果的回顾性研究。它是先按疾病状态确定调查对象,分为病例和对照组,通过比较病例组与对照组间所研究的遗传标志出现频率的差异而获得该标志与疾病间关联的信息。
为在DA代谢通路上寻找偏执型精神分裂症易感基因,本发明人先自“京都基因及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库”( http://www.genome.ad.jp/kegg)查找到DA代谢通路上所涉及的所有58个代谢酶名称,接着采用生物信息学方法在NCBI中查找这些酶的基因序列,共查找到23个有人类基因序列的代谢酶。通过NCBI的SNPs数据库( http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP),在这23个基因中选择了85个SNPs位点,通过PCR扩增结合限制性内切酶酶切或测序的方法,对上述SNPs位点在病例组和对照组进行检测,获得个体基因型,并进行病例-对照关联分析。SNP的信息可通过生物信息学方法从公共数据库中获取。目前有多个公共数据库储存了几百万条SNP信息,并有许多生物医学网站开辟了专门的SNP网页,人们可以很方便地通过多种方式,如以基因名、登记号、染色体号、功能级别等,进行查寻。但是,这些数据库中的SNPs绝大多数只是“候选者”,是利用计算机在对多个克隆序列进行比对时发掘出来的,而非经过验证的真正SNPs,其中必然存在一部分假阳性SNPs。如以下实施例所详细讨论的,所选择的85个SNPs位点中只有58个在病人组(83人)和对照组(108人)中有多态性,在这58个SNPs位点中,发现[COMT(rs174682),ALDH3B1(rs581105)]=[(T/G),(A/C)]和[ADH1B(rs1042026),ADH1B(rs1789882),ADH1B(rs1229982),ADH1B(rs1229984)]=[(T/C),(G/G),(G/G),(T/T)]与偏执型精神分裂症发病的高风险相关;[性别,MAOA(rs1801291)]=[男性,(T/C)]和[COMT(rs174682)=[(G/G)]与偏执型精神分裂症发病的低风险相关。进一步得出结论,这6个SNPs位点所在的COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA四个基因为中国北方汉族人偏执型精神分裂症的易感基因。
因此,本发明的一个方面涉及偏执型精神分裂症易感基因:COMT、ALDH3B1、ADH1B和MAOA四个基因在预测精神分裂症易感性中的应用。基于这四个基因,可以获得各种诊断剂和试剂盒以用于预测精神分裂症的易感性。
COMT的基因组序列见NCBI数据库中NT 011519.10的3087059-3109080位核苷酸,全长22022bp,本发明所揭示的SNP位点rs174682位于该序列的第3000-4000位核苷酸,其上下游的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示。图2A示出COMT基因的部分基因组序列,其中K为SNP位点,其代表碱基G/T多态性,即该位点可以为G,也可以为T。
ALDH3B1的基因组序列见NCBI数据库中NT 033903的12950859-12969783位核苷酸,全长18924bp,本发明所揭示的SNP位点rs581105位于该序列的第12958597位核苷酸,其上下游的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示。图2B示出ALDH3B1基因的部分基因组序列,其中M为SNP位点,其代表碱基A/C多态性,即该位点可以为A,也可以为C。
ADH1B的基因组序列见NCBI数据库中NT 016354的24722364-24737262位核苷酸,全长14898bp,本发明所揭示的SNP位点rs1042026、rs1789882、rs1229982和rs1229984分别位于该序列的第24723170位、第24729757位、第24738636位和第24734023位核苷酸,这四个位点上下游的核苷酸序列如SEQ IDNO:17-20所示。图2C示出ADH1B基因的部分基因组序列,其中Y1、R2、K3和Y4分别为这四个SNP位点,其分别代表碱基T/C、G/A、T/G和C/T多态性,即Y1位点可以为T,也可以为C;R2位点可以为G,也可以为A;K3位点可以为T,也可以为G;Y4位点可以为C,也可以为T。
MAOA的基因组序列见NCBI数据库中NT 011568的329-13447位核苷酸,全长13118bp,本发明所揭示的SNP位点rs1801291位于该序列的第12781位核苷酸,其上下游的核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示。图2D示出ADH1B基因的部分基因组序列,其中Y为SNP位点,其代表碱基T/C多态性,即该位点可以为T,也可以为C。
本发明还涉及用于预测精神分裂症的引物。优选地,所述引物基于SEQ IDNO:15-21的序列而设计,由此,PCR扩增后的产物经检测可以直接测得SNP位点。当然,本发明的引物也可基于SEQ ID NO:15-21的互补序列设计,这样PCR扩增后的产物经检测将得到上述SNPs的互补碱基。本发明的引物的长度可为18-26个核苷酸。优选地,本发明的引物具有SEQ ID NO:1-14所示的序列。本领域技术人员能够理解,本发明的引物不限于这些列出的引物及其组合。
本发明进一步涉及包含本发明的一种或多种引物的试剂盒,该试剂盒用于检测精神分裂症的易感性。除了本发明的引物之外,所述试剂盒还包含运用PCR扩增、限制性内切酶酶切和测序而进行检测的试剂盒的常规组件、试剂、缓冲液等,本领域技术人员熟悉这些常规组件和检测方法。
根据本发明,可对未表现精神分裂症临床症状的人群进行如实施例所示方法的筛查,[COMT(rs174682),ALDH3B1(rs581105)]=[(T/G),(A/C)]和[ADH1B(rs1042026),ADH1B(rs1789882),ADH1B(rs1229982),ADH1B(rs1229984)]=[(T/C),(G/G),(G/G),(T/T)]的个体则组成偏执型精神分裂症的易感人群。对此类人群在日常生活中应尽量减少诱发因素,如环境因素的刺激,可降低精神分裂症的发病率。这是本发明的一个重要用途。
根据本发明,可进一步深入研究由于这些易感基因的变异有可能导致的蛋白质产物的结构与功能的缺损或改变,对特定生化通路中生物大分子的相互作用的阻碍或干扰。本发明为进一步检测相关蛋白质功能,开发新型治疗药物,开展基于遗传学背景的个体化药物治疗奠定了基础。
以下将参照实施例进一步描述本发明。这些实施例应视为说明性的而非限制性的。
实施例1  偏执型精神分裂症散发病例样本采集
鉴于精神分裂症的临床分型复杂、其本身的异质性及其与相关疾病之间的重叠可能会干扰最终的分析结果,发明人只选用偏执型精神分裂症作为研究对象,并在入组病人时采用了严格的纳入和排除标准,来保证入组样本的相对特异性。
全部病例均采自北京大学精神卫生研究所2000年3月-2001年3月期间住院的北方汉族住院患者,均经过副主任医师以上检查确诊(CCMD-II-R诊断标准)。采用神经精神病学临床评定表(SCAN)对患者进行半定量式精神科检查,所有检查均由受过SCAN培训的发明人完成(具体操作参照SCAN检查手册和说明手册中要求),并使用配套的CATEGO诊断软件进行诊断,选取同时符合国际疾病分类第十版(ICD-10)中F20有关偏执型精神分裂症的诊断标准,不包括紧张型和单纯型的病人入组。年龄限定16-45岁,发病年龄<40岁(排除晚发精神分裂症),性别不限。
排除标准:
1)脑器质性或躯体疾病所致精神障碍,或体格检查、实验室检查发现有严重的躯体疾病指征、异常生化指标或脑电图(排除癫痫患者)、心电图异常者;
2)符合ICD-10中情感障碍和分裂情感障碍诊断标准的患者;
3)药物或酒精依赖的患者(排除尼古丁、咖啡因、酒精等影响);
4)有家族性遗传疾病者;
5)妊娠或哺乳期妇女;
6)有严重自杀自伤倾向的患者;
7)严重的兴奋、冲动不合作者;
8)一个月内参加过其它科研治疗的患者。
共有83个偏执型精神分裂症患者符合以上条件,他们的相关统计学数据如表1所示。
          表1  偏执型精神分裂症散发病例的相关统计学数据
Item                             数据(x±SD)
性别                             40.6%(男性)
年龄(岁)                         24.9±5.9(16-37)
首发年龄(岁)                     22.7±5.5(16-36)
病程(年)                         2.2±3.4(0-14)
取入组病人每一成员外周血样备用。
实施例2  偏执型精神分裂症核心家系的收集
收集中国北方汉族人群中偏执型精神分裂症患者和他们健康父母双亲组成的核心家系(Trios)。患者均谷2000年-2002年间入院,诊断和排除标准与上述散发病例相同。共收集95个符合标准的家系。取所有家系每一成员外周血样备用。
在采集散发病例和家系前,确保所有成员都了解采血目的,即有知情权,血样提供人在了解所有情况并同意后,经其在“知情同意书”上签字后,再实施抽血和其它情况调查。
实施例3  健康对照样本采集
全部样本来自医院工作人员和健康献血者,要求身体健康,无严重的躯体疾病,无家族性遗传病史,无现患和既往精神疾病及精神疾病家族史,无药物滥用史。征求本人同意并签署“知情同意书”后,留取其外周血样备用。
实施例4  基因组DNA的提取
所有患者、家系成员和健康对照,均单次空腹采集外周静脉血5ml,EDTA抗凝。DNA提取步骤如下:
①在外周血中加入红细胞裂解液,摇匀后室温静置10分钟,此过程中轻轻摇动数次;
②离心(2000rpm,4℃,10分钟)后弃上清,加入RNA酶10u,蛋白酶K 0.25mg,白细胞裂解液10ml,充分混匀后37℃水浴2小时;
③加入预冷的蛋白沉淀液4ml,混匀后离心(3000rpm,4℃,15分钟),将上清取出,加入异丙醇15ml,轻轻混匀,析出絮状沉淀;
④吸出DNA沉淀,用75%的冷乙醇洗两次,吸干乙醇后,加入TE溶液溶解DNA,注明样品编号、所属家系等资料,-20℃保存备用。
实施例5  聚合酶链式反应(PCR)
根据所要检测的SNP位点上下游的DNA序列,使用Primer 3软件( http:// www-genome.wi.mit.edu/cgi-bin/primer/primer3 www.cgi)设计引物,在本发明中存在多态性的58个SNPs位点及其上下游引物和PCR退火温度如表2所示。PCR反应体系为20μl,其中含10mM Tris-HCl(pH8.3),50ml KCl,1.5mM MgCl2,0.01%(w/v)gelatin,200μM dNTPs,上下游引物各0.4μM,0.5u Taq DNA聚合酶,DNA模板30-50ng。PCR扩增条件为:①94℃,5min②94℃,30s③退火温度,30s④72℃,30s-1min(第②至第④步骤循环35次)⑤72℃,10min。取PCR产物5μl用2%琼脂糖凝胶电泳,以DNA marker DL 2000为分子量标准品。所扩增片断长度如表2所示。
实施例6  限制性内切酶酶切
在PCR扩增后的反应体系中,加入适量相对应的限制性内切酶及其酶切缓冲液,在适当的酶切温度下保温2h。所选用的内切酶名称及反应温度如表2所示。经12%聚丙烯酰胺电泳,根据酶切图谱判断基因型。一般存在三种基因型:完全切开的纯合基因型,未切开的纯合基因型,既有切开又有未切开的杂合基因型。
表2  检测的58个SNPs位点及相应引物PCR/酶切反应条件
                     基因所在      SNP ID       SNP                               PCR         PCR         限制性
基因名称   EC编号                                      引物序列(5′→3′)
                     染色体区域    编号*        形式                              退火温度    产物长度    内切酶名称
ADH1B      1.1.1.1   4q22          rs1693425    C/T    F:ACCAGTCGAAAATCCACAGC    59℃        236bp       Hae III
                                                       R:TCCTGTCTCATGCCTTTGTG
ADH1B      1.1.1.1   4q22          rs1042026    G/A    F:TGTGGGGCATTTTATTTGAG    58℃        235bp       Hpy188 I
                                                       R:GAGGGGACCCTTTTACTTGC
ADH1B      1.1.1.1   4q22          rs1789882    G/A    F:GCCTATCTGCTGTTATGGGC    59℃        185bp       ScrF I
                                                       R:CGAAAAATCCACACCTCCAT
ADH1B      1.1.1.1   4q22          rs1229982    G/T    F:AGGGCGACCTTGTCCTAGAT    57℃        327bp       Fnu4H I
                                                       R:GGCACTGAGACTCACACCAAG
ADH1B      1.1.1.1   4q22          rs1229984    A/G    F:TGGTGGCTGTAGGAATCTGTC   59℃        238bp       Msl I
                                                       R:TGTGCAAGCACTTTCGTCTC
ADH1C      1.1.1.1   4q22          rs1042758    A/G    F:CAGAGCGAAGCAGGTCAAATC   58℃        391bp       Ssp I
                                                       R:GCTCCTTAACCTTGGGCATAAC
ADH4       1.1.1.1   4q22          rs1800760    A/T    F:TTAAATGGGCGATTCTGAGG    58℃        402bp       Apo I
                                                       R:CTTGCTTACTTTGCCCTTGG
ADH5       1.1.1.1   4q21-q25      rs1154413    A/C    F:TTGATTTGAACGTCACCCAG    59℃        224bp       Bts I
                                                       R:ACTGACGCATATGCAGCTTG
ADH5       1.1.1.1   4q21-q25      rs1154414    T/C    F:CACCAGCATTGTATGGGAGAT   59℃        224bp       Psi I
                                                       R:CACAAAGAACCCATCACCACT
ADH5       1.1.1.1   4q21-q25      rs1154411    C/T    F:ACATACTGGCTCATGCTCCC    59℃        419bp       Hae III
                                                       R:TGTGTATGGGTTGCAAAGGAC
ADH7       1.1.1.1   4q23-q24      rs729147     A/G    F:ACTCCTCGAGTTCATGCCAC    58℃        203bp       Mwo I
                                                       R:GTTGAAGCGCCTGAAAACAT
ADH7       1.1.1.1   4q23-q24      rs971074     A/G    F:ACTCAGTGGCACCTACAGCC    58℃        166bp       DPn II
                                                       R:TCCTCTCCACAGGTCAAACC
ADH7       1.1.1.1   4q23-q24      rs284786     A/T    F:ATGCTGGCAAATAGCCTTGT    56℃        467bp       BSaB I
                                                       R:AAGTCTTGTGAGCACCTGGG
续表2
                     基因所在      SNP ID      SNP                                 PCR          PCR         限制性
基因名称   EC编号                                     引物序列(5′→3′)
                     染色体区域    编号*       形式                                退火温度     产物长度    内切酶名称
ADH7       1.1.1.1   4q23-q24      rs894369    C/G     F:ATGCTGGCAAATAGCCTTGT     56℃         467bp       Hinc II
                                                       R:AAGTCTTGTGAGCACCTGGG
ADH7       1.1.1.1   4q23-q24      rs284787    C/T     F:TTTCAGGCGCTTCAACACTTT    56℃         438bp       Dde I
                                                       R:TTAAGGGACGGGCACATTTTT
ALDH3A     1.2.1.5   17p11.2       rs887241    C/T     F:TCCTCCAACATCTCAGCAACTC   61℃         358bp       Bts I
                                                       R:CCTGGAGGGCAACTCACCTTGT
ALDH3A     1.2.1.5   17p11.2       rs917520    G/T     F:ATCACTGCCCACTCCGTGTC     61℃         290bp       Hinf I
                                                       R:TGCCTGCATTTGCTGAGTTAGA
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs2010404   G/T     F:GAGAAATAGCCAGAAGACCTTG   56℃         726bp       Sph I
                                                       R:TGACCACGGTCCTAAGCAGAG
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs105147    A/G     F:GAAGTTGTTCAGGCAAAGAGGG   55℃         268bp       Bsp 1286 I
                                                       R:GAGGTTCACGGTGATTGCAACT
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs598156    A/C     F:GAAAGTGAGAACGCTGACGGCT   60℃         407bp       Hha I
                                                       R:ACCCTAAGTCAGATCCCATCCCTG
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs581105    T/G     F:GAAAGTGAGAACGCTGACGGCT   60℃         407bp       Ahd I
                                                       R:ACCCTAAGTCAGATCCCATCCCTG
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs475325    G/A     F:AGACCCGAATCAATAGGGACATT  59℃         252bp       Hha I
                                                       R:TGGGCTTCGCTGGTCCTCT
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs15518     T/C     F:ATTACAGAATTGTTACCCAACGCC 59℃         356bp       Hpy188 I
                                                       R:TCTCACCTCCCAAGTCCCACTT
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs1003777   G/A     F:GGCTGGGGGAATTTATCACT     59℃         387bp       ECoR I
                                                       R:GAACCTTCACTACCGGGTCAG
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs1551888   C/T     F:CTGATGATCCCCTCCACCTAC    59℃         558bp       Tsp509 I
                                                       R:CCCTGGAACTACCCACTGAAC
ALDH3B     1.2.1.5   Chr.11        rs1871031   A/G     F:AGACACGGACTTCTGCCATT     59℃         262bp       Pst I
                                                       R:GTGTGTCTGCGTGTGGACTT
续表2
                        基因所在    SNP ID      SNP                                 PCR         PCR产物     限制性内切
基因名称    EC编号                                     引物序列(5′→3′)
                        染色体区域  编号*       形式                                退火温度    长度        酶名称
AOX1        1.2.1.5     17q25       rs1405984   C/T    F:ATAGGAAGCACCCACACCAG      59℃        195bp       Alu I
                                                       R:CCAATATGCCAGGCTTCACT
AOX1        1.2.1.5     17q25       rs1527945   C/T    F:GGACTGTCCAGTTCATCCGT      59℃        314bp       HpyCH4 IV
                                                       R:CTTGGTACCCGCAATATCGT
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs4818      C/G    F:TCGTGGACGCCGTGATTCAGG     64℃        217bp       Bcl I
                                                       R:AGGTCTGACAACGGGTCAGGC
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs165688    G/A    F:TCGTGGACGCCGTGATTCAGG     64℃        217bp       Nla III
                                                       R:AGGTCTGACAACGGGTCAGGC
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs165599    A/G    F:TCCTTCTCAACTGCCATTCC      59℃        664bp       Hpa II
                                                       R:TATCCATAGGAGTGGGCTGG
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs933269    C/T    F:CGGGACCATCTGTTGAGACT      59℃        572bp       Aci I
                                                       R:TACCAATGCCTATGCCATCAT
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs740603    A/G    F:TTAGAGCCAGAGGTGTCAAGCC    61℃        207bp       BsaA I
                                                       R:CCCGTGAGGTCCACATTCCCT
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs174694    G/T    F:TGGAGGGCCTTGTGAGGTGG      63℃        317bp       Bgl I
                                                       R:AGTGTCTCCCAGGGCCTAGTGG
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs174682    T/G    F:AACAGAAGGCTCACACGCTT      60℃        294bp       Ase I
                                                       R:AATTTGTGGGCAGCAAGTC
COMT        2.1.1.6     22q11.2     rs165656    C/G    F:TCGCCAGGTTAGGGTTTATG      59℃        467bp       Fau I
                                                       R:TGGCATAGGAGATCCCACTC
DAO         1.4.3.6     12q24       rs1049748   T/C    F:AGCAGACGCAGTACTCCTGG      61℃        246bp       Dde I
                                                       R:ACACACTGAGGGAAGCCACT
DAO         1.4.3.6     12q24       rs1049793   C/G    F:CAGCAGCATCTACCACCAGAACG   60℃        253bp       PPuM I
                                                       R:GTGACCTCTGAACTTGCCGT
DBH         1.14.17.1   9q34        rs2007153   A/G    F:AGCAGCTTCGTTTGGACAATTC    58℃        300bp       BsaA I
                                                       R:AGGGCCCTTCTTAGATTCCATAT
续表2
                          基因所在        SNP ID       SNP                                 PCR         PCR产物     限制性内切
基因名称    EC编号                                            引物序列(5′→3′)
                          染色体区域      编号*        形式                                退火温度    长度        酶名称
DBH         1.14.17.1     9q34            rs2005663    A/T    F:AGCAGCTTCGTTTGGACAATTC    58℃        300bp       Hph I
                                                              R:AGGGCCCTTCTTAGATTCCATAT
DDC         4.1.1.28      7p11            rs921450     C/T    F:CCTTCATCCTGTAGGCCAAA      59℃        331bp       MSL I
                                                              R:TCTTGGTTCAGTTGTGCAGC
DDC         4.1.1.28      7p11            rs1451374    A/G    F:GAGGCCCTTAGCACATGAGT      59℃        243bp       HpycH4 V
                                                              R:AGGGATGGGAGTGCATCATA
DDC         4.1.1.28      7p11            rs1451373    G/A    F:GAGGCCCTTAGCACATGAGT      59℃        243bp       Hha I
                                                              R:AGGGATGGGAGTGCATCATA
DDC         4.1.1.28      7p11            rs6263       A/G    F:CTGTGCCGTTAAGAGGGACCTT    52℃        222bp       Nla III
                                                              R:CAAGTGCTGCCGAACTTACA
FAH         3.7.1.2       15q23-25        rs1370274    A/G    F:ACCACGTGCTTCTCACCACT      54℃        195bp       测序
                                                              R:GGGATACTCCCTGGGTTTTC
GSTZ1       5.2.1.2       14q24.3         rs1046428    C/T    F:CAGCTGGCCATCATTGAGTAT     56℃        172bp       Afl III
                                                              R:AGTGTGTCAGGTGTGCAAGG
GOT2        2.6.1.1       16q21           rs1803168    C/T    F:AGTAATGTCCCTGGTGCGAG      56℃        290bp       Hpa II
                                                              R:TTGGTGCGATGACTTTCTTG
HGD         1.13.11.5     3q21-23         rs2042482    A/T    F:CAACATGTGAACGCTTGGTT      56℃        289bp       EcoR V
                                                              R:GATTGTAGGGGCAGACCTGAG
MAOA        1.4.3.4       Xp11.23         rs6323       G/T    F:TGCAGCTCACATCTGAGGTA      58℃        210bp       Fnu4H I
                                                              R:GCCTACCCTTCTTCTTCCAG
MAOA        1.4.3.4       Xp11.23         rs1801291    T/C    F:GCACAGAGACTGCCACAAAG      59℃        213bp       ECoR V
                                                              R:AGTGCCCAGAGTCACCAAAC
MAOB        1.4.3.4       Xp11.23         rs1040399    C/T    F:ATGCAGTTCCTTGCCTTCACTAC   59℃        265bp       Taq I
                                                              R:ATGAAAACTGACGGTGGGAG
PPT         5.3.2.1       1p32            rs140185     A/G    F:GCCTAACCCAGAAACGACTG      59℃        597bp       Mse I
                                                              R:AATGTCACTACAGGTGGCCC
续表2
                       基因所在      SNP ID     SNP                                 PCR          PCR产物     限制性内切
基因名称    EC编号                                     引物序列(5′→3′)
                       染色体区域    编号*      形式                                退火温度     长度        酶名称
PPT         5.3.2.1    1p32          rs140186   G/A    F:GCCTAACCCAGAAACGACTG      59℃         597bp       EcoN I
                                                       R:AATGTCACTACAGGTGGCCC
PPT         5.3.2.1    6p21.3        rs140184   A/G    F:TCAAGGAAGCACACACCAACAC    58℃         381bp       BstX I
                                                       R:TCCATTGACCACACTTTGGAT
TAT         2.6.1.5    16q22.1       rs2032921  C/T    F:TCAAGTATTCAACGGCCACTT     56℃         197bp       Rsa I
                       -q22.3                          R:CCTCCCTGCATTCTCATTTT
TPO         1.11.1.8   2p25          rs1399390  G/A    F:AGAAGAACCCGAGTGGGAGT      60℃         311bp       Aci I
                                                       R:GAGTTACACAGGGTCCGCAT
TPO         1.11.1.8   2p25          rs938328   G/A    F:GTCAAAAGTTTGGGCGTAGC      59℃         472bp       Hpy188 I
                                                       R:AATAAGACACCAAGCCCACGG
TYR         1.14.18.1  11q14-q21     rs1042602  C/A    F:CTCTGGCAACTTCATGGGAT      62℃         533bp       DPn II
                                                       R:AGAATGATGCTGGGCTGAGT
*SNP ID编号是指这些SNPs在NCBI数据库中的编号( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)
实施例7  测序
当被检测的SNP位点不处于已有的限制性内切酶识别序列中时,通过对PCR产物直接测序的办法来检测该位点。本发明中对于FAH基因的rs1370274位点检测,就是使用ABI 3700测序仪对其相应PCR产物进行测序所得。
实施例8  数据处理
经检测,58个SNPs位点在均符合Hardy-Weinberg平衡。将这些58个SNPs位点进行随机组合,观察各种组合的频率在病例和对照两组中的分布情况,经SPSS统计软件10.0版分析,发现有4种组合在两组中的差异有统计学意义,如表3所示。
从表3中可以看出,[COMT(rs174682),ALDH3B1(rs581105)]=[(T/G),(A/C)]和[ADH1B(rs1042026),ADH1B(rs1789882),ADH1B(rs1229982),ADH1B(rs1229984)]=[(T/C),(G/G),(G/G),(T/T)]在病例组中的出现频率显著高于对照组,因此这两种基因型组合与偏执型精神分裂症发病的高风险相关;而[性别,MAOA(rs1801291)]=[男性,(T/C)]和[COMT(rs174682)=[(G/G)]在对照组中的出现频率显著高于病例组,因此这两种基因型组合与偏执型精神分裂症发病的低风险相关。
表3  四种阳性SNPs型在病例组和对照组的分布及统计分析结果
SNP型                                      病例组   对照组   P值         对应疾病
[COMT(rs174682),ALDH3B1(rs581105)]
                                           56       23       <0.001     高风险
=[(T/G),(A/C)]
[ADH1B(rs1042026)(rs1789882)(rs1229982)
                                           16       0        <0.001     高风险
(rs1229984)]=[(T/C),(G/G),(G/G),(T/T)]
[性别,MAOA(rs1801291)]=[男性,(T/C)]      0       28       <0.001     低风险
[COMT(rs174682)=[(G/G)]                    6       50       <0.001     低风险
                               序列表
<110>中国医学科学院基础医学研究所
     清华大学
     北京大学精神卫生研究所
<120>用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物
<160>18
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>1
aacagaaggc tcacacgctt                                        20
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>2
aattttgtgg gcagcaagtc                                        20
<210>3
<211>22
<212>DNA
<213>人工序列
<400>3
gaaagtgaga acgctgacgg ct                                     22
<210>4
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>4
accctaagtc agatcccatc cctg                                   24
<210>5
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>5
tgtggggcat tttatttgag                                        20
<210>6
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>6
gaggggaccc ttttacttgc                                        20
<210>7
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>7
gcctatctgc tgttatgggc                                        20
<210>8
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>8
cgaaaaatcc acacctccat                                        20
<210>9
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>9
agggcgacct tgtcctagat                                        20
<210>10
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<400>10
ggcactgaga ctcacaccaa g                                      21
<210>11
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<400>11
tggtggctgt aggaatctgt c                                      21
<210>12
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>12
tgtgcaagca  ctttcgtctc                                       20
<210>13
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>13
gcacagagac tgccacaaag                                        20
<210>14
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>14
agtgcccaga gtcaccaaac                                        20
<210>15
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>15
tttttaggtt tttttttttt tttttttttg agacagagtc ccgctgtgtt gctcaggctg   60
gagtgcagtg gcacgatctc ggctcactgc aacctccgcc tcctgggctc aagcgattct  120
cctgcctcag ccccccaagt agctgggatt acaggtgtgc accatcacac ccagctaatt  180
tttgtatttt tagtagagat ggggtttcac cacactggcc aggctggtct tgaactcctg  240
accccaggtg acctgcccac cttggccttc caaagtgttg ggattacagg cgtgagtcac  300
cgcgtccggc cctaaataac attttttatt tgacagcacc ttgcatgaaa ttctgtaggg  360
tccagcccta cagggtctgt gggtttttct ccccgtgtgc agagatgaga gatcgtagaa  420
atgaagacac aagacaaaga gatagaagaa aagacagctg ggcccgggga ccactaccac  480
caagatgcgg agaccagtag tggccccgaa tgccaggctg cgctgttatt tattggatac  540
aagacaaggg ggcagggtaa ggagtgtgag ccatctccag tgacaggtaa ggtcacatgg  600
gtcacgtgtc cactggacgg gggcccttcc ctgtttggca gccgaggcgg acagcgagag  660
gagacagctt atgtcattat ttctgtattt cagagacctt tagtactttc actaattttg  720
ttactgctag ttagaaggca tagccaggta cagggtggaa catgaaagcg gaccaggagc  780
gtgactgctt aagcacagca tcacagggag acggttaggc ctccggataa ctgtgggcag  840
acctgacact ccacaagagg tggttgagca gagtcttctc taactcccac agggaaaggg  900
agacttcctt tcccggtctg ctaagtaacg ggtgcttttt ctaggcactg acgcaactgc  960
tagaccaagg tccgctaagt aacaggcgtc ttcccaggcg ctgacgttac cactagacca 1020
aggagccctc tagtggccct gtccgggcat aacagaaggc tcacacgctt gtcttctggt 1080
cacttctcac cgtgtccctt cagctcttat cactgtatgg cctggtttct cctaggttat 1140
aattgtagag cgaagattat tataatattg gaataaagat taattgctac aaactaatga 1200
ttaacaatat tcatatataa tcatatctat gatctatatc taatgtaact attcttattt 1260
tatatatttt ctttattata ctggaacagc tcgtgccctc ggtctcttgc ctcggcacct 1320
gggcgacttg ctgcccacaa aattcaccat tgaaataaac ctaattagtt taacatctct 1380
cttataaggt cacaggacag atcctttgag gtcttccagg ggccctccag gaaatctcaa 1440
gtcagtctga gatcaagaca atgtcacagg ccacatgcag tggttcacgc ctataatccc 1500
aacactttgg gagtccgagg agggaggact ccttgagccc aggagtttga gaccagcctg 1560
agaaacatgc tgaggccctg tctctacaaa acaaaaagtt gaaaaattag ctgggcatgg 1620
tggtacatgt ctgtagtccc atgtactctg aagactgagg cgggaggatc acttgagccc 1680
aggagttcaa ggttgcagtg agctgtaatt gcaccactgc actccagcct cagtaacaga 1740
gtgagactct gtcactaaaa aaaatttagg ctgggtgcag cggctcacgc ctataatccc 1800
agcattttgg gaggtcaagg tggacagatc acctgagatc aggagttcaa gaccaggctg 1860
gccaacatgg caaaacccca cctgtactaa aaatacaaaa attagctggg cgtggtgcca 1920
tgtgcctgtg gtcccagcta cttgggaggc tgagacagca gaattgctta agcctgggag 1980
gcagaggtta cagtgagccc agatcacacc atggcactcc agcctgggta acagagcgag 2040
actctgtctc aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaatttaa agaaacttta tacataaatc 2100
<210>16
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>16
gcatctgccc agcgtcacgt gcaccctctc agttaaccct ttggtgaatc tggttgggca   60
accacaccca gtggccccca gaagaggctc agagagagtg tgttcttgcc caagggcatg  120
cagccaggaa gagcagagcc agagtttgaa cctggctcaa aatagcccag tctcccaaag  180
tcaggtccca ggtgacctag gaggtgtggc gggcaggcca ccaggctcat ggggccagag  240
cacaggctgt gggaaagtcc gtgtggaagg caccttcccc cagcctcagt ggctaggagg  300
tgccagtggg cgtggcgtct tcctccctct tggggctcag ctgtagccct ggccttgccc  360
ctggttcgct gagtgacctc aggcagggca tctccttctc tgggcttcgc tggtcctctg  420
gcccatccag caccccactg gcccgtcccc ctctgccctg acccgggaga gcctgcaccc  480
cataacctca ggcgctgcct cagccaggga gccagcctgg ccccagtgtc cctgacctgt  540
tctccagcgg cctgcagcct gctgcctggc tggtctctcc tcccttgggg cgcagagggc  600
agggagcact ggctagccga gagcaggaca atgtccctat tgattcgggt ctcctcactc  660
ctgcttagaa gcctgacagt ggccctggcc cctgggctgt gggaactgac agcatttacc  720
taggggtggc tgtgcctgtg tctcctgtgg accaatctcc accctgctct ttgggagact  780
gaggtgggag gattgtttga ggccaggagt tcaagaccta cctaggcaac acagcaaggc  840
actctgcaaa aaatcaaaac aaactttttt tgaaattaaa aaaaaacaaa accctaagtc  900
agatcccatc cctgctcttc tcaggagtcc ttgcctggct gcctggcccc ctcaccttgc  960
ccactctgct tcttgctaaa caggagcaga gcaagcgcac agccacctcg gggcctttgc 1020
agccgccagg gcctctgccc aaagtatgcc gcctcccagt acccacgact tgcttgttcc 1080
ttgacttcag gtcactgctc caatgtgacc gccgcctgga gacctgcact gaccgctttg 1140
taaaaacagc acacacacac atgctcatgt ggatgtatac atgtgcacac ctgtgcacgc 1200
ccacagccac acgctccagc agtctccacc cccaccctgc tccatgattt ccctagcaca 1260
gccacgtcct aatggagccg tcagcgttct cactttcaca tggaacgact gccccctgca 1320
aggtcggcct cagggccggt ccctctgttt ggcacagaga cagcacctca cacaggaagc 1380
acgcactgaa catggagtga gtgagtgaac gaatgaatga aaatgaatga atgagttgtg 1440
gaagcaggcc ctgcctggag gaggctgtgc cctcctgcca actctgggaa tcctggccca 1500
ccctgacccc acccacttcc tgcagtcagc cttcgagtcg gaggtgtctg aggttgccat 1560
cagccagggc gaggtcaccc tggccctcag gaactccggg cctggatgaa ggacgagcgt 1620
gtgcccaaga acctggtgag ccggccgggc tgaggcgggc agggggctca ggggatattt 1680
gctcccacag ggtggcccct ctgggtggga gctggctgct gaggggccgg ggtgctgagc 1740
acttaatttc atccccggct cccggcccag gccacgcagc tggactccgc cttcatccgg 1800
aaggagccct ttggcctggt cctcatcatt gcgccctgga actatccgct gaacctgacg 1860
ctggtgcccc tcgtgggagc cctcgctgca ggtgagagct gggcctgccc cttccggtca 1920
cccttctccg ctcgaggcct cagggccacc catggatccc aggaggacat gggagaactg 1980
gcccaggtgg caaagaggac tgtctggtcc accgtccccg ggctgtgtgg ccctgggccc 2040
gtcatgttac ctctctgaac caggttctgc atctgaaagt gggtgaggct gatgcctgcc 2100
<210>17
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>17
atatacattt gtatatgtgt atatatgtat gtgtatatat atatctacta ggaaaatata   60
ttgcttaagg tgtttgtgcc atttcttagt taccaatttt acattctgca ttcacagcat  120
ttgccatccc atctctacac ttaaagccac catattactt ttaattactt tatacacatt  180
ttcagtcatc atctaaataa tcatttatag ccacaaacta atactgttta gtcaatgaag  240
cactttcatc agcaaaaatt acagattttt tgaacatgat tctgggaata gttcagtttt  300
tacaattagt aattgaggct ttgtcatatg aagcaagaaa tctgctatta ttttaaaaaa  360
tcaattgtat atcgaccata aagaaatagt ataaaagtca taaaaacact gccatttact  420
gtagtaaaat gtggggcatt ttatttgagt tcctaagaaa tttcctgtat ttagaactct  480
tggaccttca ctacttgtaa atgtgagtct atcctttacc ttaccctagc ttttacccca  540
gggatttggt acatttttat tagaaaaagg aaaatgtcga cagtgaaaac tgagacagag  600
ttagaagact tcaatcacaa tggcccagca tgtgtatgtt cagggcaagt aaaagggtcc  660
cctccactgg gattcgatga ctaaagatta tgaagatacc aaaaatgcaa gaagtcacag  720
gaatattttt cctcaatggc aaaggtgaca cagtagaatg gttaagaagg aaggtttgtt  780
ggcttcaatt ccccagctga tgttcaacac tttatttact tctcacttga attttaaatt  840
ttcctgaaaa ataatttccc atcaatttcc atttctttgg aaagccccca tgtgtaattt  900
attgataaca tctctgaaga gctgaattaa tgatatttcc tagctgttgc tccagatctt  960
gtagggtaga ggaggctgaa gactgctaca ggggaaggca tctctattgc ctcaaaacgt 1020
caggacggta cggatactgc aataggaaag aagagacatt gtgttaacat ttagacaacc 1080
cacatgcttg ttgtgagagt ccaaggagca tctgaggtgt cttagtgaaa atctgtctgt 1140
gatcccagct accctatttc catccccata catttggttc aagaaaaagg aagttcatct 1200
tttttggttt tcttttcttt tctttttttc tccaatctta atctcactca caacatcctg 1260
agtatgcctg tcatttcaat tgtacattaa ttctacatta gcatcttcaa aaaatcattt 1320
ttgtgtgccc acgttcctgg tataataagg aatataaaac aacagtggat aataacttgc 1380
agtaagttct tactatttgt cacattcttc gtgcattttc ttaaacttca acctaaacat 1440
<210>18
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>18
tgattctctt gcctcagcct ccggagtagc tgggattaca ggtatgcact acaccaccat   60
acctggctaa tttttgtatt tttagtagag actgctgact tttcaaagta ttcagtccaa  120
ctaatattgg gtactagcta tgtgccaggc actgtccagt ttctgtgata aaatacagtg  180
atgtcttaaa gcagtcaatt tccttagggc atatttttgt taataaaaca gcagttggcc  240
taaaattgct catttccttt ggccaaatac taacatgtta aaaatctgaa atttattaag  300
aacataggca aaattgttaa accatttttg ttaagaatgt aggagaaaaa taaaacattc  360
caatttgaga acagaattta tattatttat gtttacttga acttatattt tttaactaaa  420
aattaataaa gtaaatctat aattgctcag ttaagaaaaa caaacccttt tcttttcctc  480
tagaggaaat atgacttgag acaggtttgg gtaattgatg gaagagaaga tttctcataa  540
caaaaattaa acaagccaca taacaaacag atgatgggaa atttccattc atcattaaaa  600
atatccttta tacataaaac atatattttg ctgcctaaat gcatcttcca ggttgcagag  660
gcagaaatct cagggcatgt catggtacat accatggtgt caagccgacc gatgacttca  720
aacgaaaaat ccacacctcc atcagtcatt tcctttagca cttcctggat gggtttcttg  780
tagtcttgag ggttgatgca ttcagtggca cccaactctt tggcctttgc aaatttgtcc  840
ttgttgatgt ccaccgcaat gattctggct gctccagctg ctttacagcc cataacagca  900
gataggccga cccctcccag gccaaacaca gcacaggtag agcctggggt gacctgtgtt  960
ttcagaaaat gcaaaaatag attaagtgat gattgttaga aagtgcctaa gcttcataaa 1020
gtgccatgcg taggtgttta tcaagaacta ctcagactct tttgtccaac cgtttatcaa 1080
aacctctttt ggcttcagtt gctttatttt taaattcaag gggatgaact agttgagtgg 1140
ttttcaaact gatgcatatt agattcatct ggggagcttt acaaaatatc ccacagtcca 1200
ggtcacagcc catgtcaatt aaatgaggaa tctctgcagg tggactcagt ccccaggtga 1260
ctccaatggg aaggtcaggc tgggaaccag gggactggat gatctttgag atccagatgg 1320
cagtgattac aatcttgaag ggactgtcaa ttgctgaaat cccttgatag ccagcttcag 1380
taactcatac atacacaacg gcaatatttg gaaaacaaaa taagtggaaa aggctactcc 1440
<210>19
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>19
aggcagtatg gggcagcggt gatggcatgg cttgtgggac caggccaacc cagttcctta   60
cttgttctgt gtacttggac ttattatttc actgaatttt ttttgcctta atttccttat  120
ctgtgagatg aagatgaata atggcgtcat tttaaaggac tgtttgtgaa taaatgaaat  180
aatccttgta aagcactcat catggagttt tgcagatagg agcaccctcc taaatgttag  240
ctacaattat tattcatgaa agaaagctca cagtttatag tgaaaagaca cgcaggaaac  300
caagtctaca tatcagcctg gctgggaagt gccctatcac aggggtcagt taatgctttg  360
ggaacagaga cagagttgct attcagaatg aaggactcag gggaggcatt gtagaggaac  420
aggcatttgt ggcagatttt aaataattgt gagaaatgga gcaaaatcct cactggatca  480
tttccattac cctttgatca atgtagctag tatcctcatg gctttccaag cataggagtt  540
tgatttttct tttatccaca cttggaggcg tcataaaact atacaggcaa ctatttaatt  600
agatatagtc tgtcaatatg aacatgttag catagaggac atatttctct aaaattgcca  660
agggaacatt tcagtaagct ttaattatgt aggcactgag actcacacca agactgagaa  720
acattcaccc aatagaaaag caaaggaggt cctatgattt tagttgctgc tagtttggaa  780
aggtatgacg gaaagaagat agccccagat aacctggctt tagccttctc atccaactat  840
tcctcaccat tctccaatac agggcctatg ctctttagaa gcatgtatct ctgtggtcct  900
ccaaagagga atccattcct cattcaagct cttgctcatc atgctttttc tcttcttttc  960
tgtccctctg gcccattcaa atcctaccca aactttgaga tctaggacaa ggtcgccctt 1020
gtggagatat gttaacgcca tctcacagtc atgcttcact tctttccatc cctgtcatac 1080
tagcatccct cctgtggttt tagggcccat tctcttttgt ggcctttata tttagtgtag 1140
agatcagtct cctaagttct actggaaatt tctggtcaga gatgttcttg aatttcattt 1200
aaatcttcaa ctgtacctag tttcatgtgt acaataggtg tttaatgaaa gattgttgaa 1260
ttcttgtgct cctttatgtt aggacacgca ctgttctatg agcagtccca taatccagaa 1320
gatctggtgt ctcctcttta agggattaca gattagcagt gggattggct gtggtcaggt 1380
agagaagaca gagaaccctc ctgtgaagca ggaagtggtg agtgccagga gaaagttcaa 1440
<210>20
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>20
tgatggtggg atggttcctt ctacgtttct ttcatttcct ttcacctagc ctgtttcatt   60
gattccatgc tcaggaagag acaccatgtt ggaagaggaa attggtgaag gagctgcata  120
ggtcacctaa gaaaaggtca tgtttattca tccgtagcca tgtagcctcc attttgtgaa  180
ctcagcacag aacagtttcc acatttactt tttttccctc ctcccgtttc tacttctatc  240
tgggccctga cagaagacag tgttcagcca acactaacac agaattactg gactatgaat  300
gccacactgg taggcactgt gtctcttttg atcctcacat atctccaggc tctaacctgg  360
tgcctggctt ctagtagata ctcggtacat aatggttgaa gggtacaata catgagtgcc  420
tgaatgcata catgcttggg tcaggcaggc agagagggaa agaggaaact cctgaagtcc  480
tggctgcgcg gtgaccttgt gcaagcactt tcgtctctca ttgccttggt ttccttatcc  540
aggctgggaa atcctggatg gtgaaccaca cgtgttccct gagtgtgaat cctgtacctg  600
gtttgactgt agtcacccct tctccaacac tctccacgat gccggctgcc tcatggccta  660
aaatcacagg aaggggggtc accaggttgc cactaaccac gtggtcatct gtgcgacaga  720
ttcctacagc caccatctac agaataaaga gaagctgttc agattcagaa aagattgtaa  780
ctagatgaat ttaacatacc caaattcctg aaattgtgtt tctaaaatgt atttgagggt  840
tttgctacta atccctacta ttcctaaata tgaaagattc agtttatccc caaggttatt  900
cagtctaaag cccttctcta ccttcccttc ttgaattaaa caatttagaa taatctgtga  960
aataattgat tctgaaatat ttaagtctta tgtaagaatg cacgctttaa aaaatagaag 1020
tagaaatagc aaagtaacac atggaaaata tctaatatta attgattttg aagtcttgat 1080
atatatcctt tggaattttt ttctgtacaa acataaattc ttttgtattt tactggaatt 1140
atactgtatg tactctttga tcatttttta aaaatttaaa atttatattt atacctttcc 1200
ttgacaacaa atgtaatttt atcttctggg tgatcatata agatatgcct cttagtggat 1260
ttttggatgt ttccattttt aatgttctct gagtttttta aatgtaaaat gaaatataaa 1320
tggaaaaata tttcacctta atgcgaactt cataagcctt aggaggtgca acctccacat 1380
cctcaatgga aaagggcttc tttacctccc atagcacagc tgctttgcat ttgattacct 1440
<210>21
<211>2100
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<400>21
gttgagatga aggccatcag ggtggggggc aggacatgca gcttgggaga gttcatgaaa   60
ctagctgtgg acatggcagg agtcaaagcc aaaaagttgg aggggacagc tgtccattca  120
gtccagccct tctttgtaag aggagaccca tttccttgct ctcagccagt ccccagagaa  180
gttcagagaa gctaactgta cagaggttgt tttcttaaag agacacaccc atataatgtc  240
tcaggtctct cctttgccag aaatgatagt tgacgtccct gtcttcccac ctgccactgc  300
agttcctcct gacacactgg gagtgcctgc aaagctggat ctgtggctgt tttcaagaag  360
agtgcacctt cccccgagaa agacaggaca gggagaagaa tggactgcca acaggaaaca  420
gcaaagaaat ctgatttggg gattgaatac atgttcttat attccagctc tggctggctt  480
ggaaaagatc aacatcccct ttaatgattg atgatctgat ggcctgattc tccctgactt  540
gaaagttcag atcctctatg cagatccaga aagcaaaaag tggcctttca ccttgggcta  600
agtcatacgg gtgtttttta aacagtctga atttctgtgc cttctgcaga ctaaatgagg  660
gcagtgattg gctcatttac cctgcccacc ttcccaagta actctgtgta acctcttggt  720
tcccttgaag ggtgattcgt caacccgtgg gcaggatttt ctttgcgggc acagagactg  780
ccacaaagtg gagcggctac atggaagggg cagttgaggc tggagaacga gcagctaggg  840
aggtaagcag gaaagcccag gctctctccc tcccgagtcac ggcaacgtt tttggcatct  900
ggtcttgcta gttcttgaca ctgatagaat ctgtatgtcc atttctctgc ccctcactca  960
tggggctcat ctgtggctag cagggccttg aatctgtaga aactatacag cctcttttca 1020
taataccatg gtgactttct ttcaggtctt aaatggtctc gggaaggtga ccgagaaaga 1080
tatctgggta caagaacctg aatcaaaggt aagtttggtg actctgggca ctatctctcc 1140
ttagaccaat catggaacat aaaactcaca tctcccttct tctagcctcc gatttaatta 1200
tagatgcaac tatcccaggg gtctccatgc atggatcttg cagtgttttg ttcctccttg 1260
tcagcatgag ttttttgctc atgatctgtg ttccttcatc taggacgttc cagcggtaga 1320
aatcacccac accttctggg aaaggaacct gccctctgtt tctggcctgc tgaagatcat 1380
tggattttcc acatcagtaa ctgccctggg gtttgtgctg tacaaataca agctcctgcc 1440
acggtcttga agttctgttc ttatgctctc tgctcactgg ttttcaatac caccaagagg 1500
aaaatattga caagtttaaa ggctgtgtca ttgggccatg tttaagtgta ctggatttaa 1560
ctacctttgg cttaattcca atcattgtta aagtaaaaac aattcaaaga atcacctaat 1620
taatttcagt aagatcaagc tccatcttat ttgtcagtgt agatcaactc atgttaattg 1680
atagaataaa gccttgtgat cactttctga aattcacaaa gttaaacgtg atgtgctcat 1740
cagaaacaat ttctgtgtcc tgtttttatt cccttcaatg caaaatacat gatgatttca 1800
gaaacaaagc atttgacttt ctgtctgtgg aggtggagta ggtgaaggcc cagcctgtaa 1860
ctgtcctttt tcttccctta ggcaatggtg aactgtcatt acagagccta gaggctcaca 1920
gcctcctgga ggaagcagcc tccactttgg atcaggaaat agtaaaggaa agcagtgttg 1980
ggggtagcgg catgcagacc ctcagaccag aatggggaca tcttgtggtc tgctgcctca 2040
ggaatctcct gaccacttgt agtccctccg acttctctag acatctagtc tcagtgctag 2100

Claims (9)

1、偏执型精神分裂症易感性的预测方法,其特征在于体外检测COMT、ALDH3B1、ADH1B、MAOA四个基因中单核苷酸多态性(SNP)特定组合型的存在。
2、用于预测偏执型精神分裂症易感性的引物,所述引物为基于SEQ ID NO:15-21的序列而设计的用于PCR扩增的特异引物,所述引物针对图2中所示的SNP位点而设计,长度为18-26个核苷酸。
3、如权利要求2所述的引物,其包含选自SEQ ID NO:1-14组成的一组的任一种序列。
4、用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒,其包含如权利要求2-3任一项所述的引物。
5、COMT、ALDH3B1、ADH1B、MAOA四个基因在制备用于预测偏执型精神分裂症易感性的诊断剂中的应用。
6、根据权利要求3的试剂盒用于偏执型精神分裂症易感性的预测。
7、根据权利要求1的方法用于偏执型精神分裂症的遗传定性。
8、根据权利要求1的方法用于偏执型精神分裂症的诊断。
9、根据权利要求1的方法用于偏执型精神分裂症的药物开发。
CN 200310122497 2003-12-26 2003-12-26 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物 Pending CN1635142A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN 200310122497 CN1635142A (zh) 2003-12-26 2003-12-26 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN 200310122497 CN1635142A (zh) 2003-12-26 2003-12-26 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN1635142A true CN1635142A (zh) 2005-07-06

Family

ID=34844537

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN 200310122497 Pending CN1635142A (zh) 2003-12-26 2003-12-26 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN1635142A (zh)

Cited By (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007085127A1 (fr) * 2006-01-27 2007-08-02 National Human Genome Center At Shanghai Méthode permettant de pronostiquer l'efficacité thérapeutique de la nitroglycérine contre l'angine de poitrine sévère et trousse prévue à cet effet
CN101033487B (zh) * 2006-03-07 2011-04-06 中国医学科学院阜外心血管病医院 检测与原发性高血压相关的KLK1基因rs5517多态的方法
CN103773880A (zh) * 2014-02-07 2014-05-07 上海市长宁区精神卫生中心 用于检测rs6461563位点核苷酸的物质在早期评价精神分裂症患病风险中的应用
CN103834730A (zh) * 2014-02-20 2014-06-04 中国医学科学院基础医学研究所 Zfp28的变异位点在制备诊断精神分裂症的试剂盒中的用途
CN105132525A (zh) * 2014-05-29 2015-12-09 中国医学科学院基础医学研究所 miRNA分子在精神分裂症的诊断和预后中的用途
CN105543390A (zh) * 2016-02-04 2016-05-04 青岛市肿瘤医院 一种检测型偏执型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN106434881A (zh) * 2016-08-30 2017-02-22 张建华 一种检测紧张型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN106434880A (zh) * 2016-08-30 2017-02-22 张建华 一种检测单纯型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN112921100A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 宁波海尔施基因科技有限公司 一种检测人类压力敏感度基因型的试剂盒和方法

Cited By (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007085127A1 (fr) * 2006-01-27 2007-08-02 National Human Genome Center At Shanghai Méthode permettant de pronostiquer l'efficacité thérapeutique de la nitroglycérine contre l'angine de poitrine sévère et trousse prévue à cet effet
CN101033487B (zh) * 2006-03-07 2011-04-06 中国医学科学院阜外心血管病医院 检测与原发性高血压相关的KLK1基因rs5517多态的方法
CN103773880A (zh) * 2014-02-07 2014-05-07 上海市长宁区精神卫生中心 用于检测rs6461563位点核苷酸的物质在早期评价精神分裂症患病风险中的应用
CN103773880B (zh) * 2014-02-07 2015-07-15 上海市长宁区精神卫生中心 用于检测rs6461563位点核苷酸的物质在早期评价精神分裂症患病风险中的应用
CN103834730A (zh) * 2014-02-20 2014-06-04 中国医学科学院基础医学研究所 Zfp28的变异位点在制备诊断精神分裂症的试剂盒中的用途
CN105132525A (zh) * 2014-05-29 2015-12-09 中国医学科学院基础医学研究所 miRNA分子在精神分裂症的诊断和预后中的用途
CN105132525B (zh) * 2014-05-29 2018-11-09 中国医学科学院基础医学研究所 miRNA分子在精神分裂症的诊断和预后中的用途
CN105543390A (zh) * 2016-02-04 2016-05-04 青岛市肿瘤医院 一种检测型偏执型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN106434881A (zh) * 2016-08-30 2017-02-22 张建华 一种检测紧张型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN106434880A (zh) * 2016-08-30 2017-02-22 张建华 一种检测单纯型精神分裂症易感性的引物及试剂盒
CN112921100A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 宁波海尔施基因科技有限公司 一种检测人类压力敏感度基因型的试剂盒和方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN1177059C (zh) 与il-1基因座多态性相关之炎性疾病的预测方法
CN1497049A (zh) 雄激素受体复合物-相关蛋白
CN1890384A (zh) 与炎性疾病的治疗功效相关的遗传多态性的用途
CN1496410A (zh) 方法
CN1496412A (zh) 用于评估中国血统的人种发展2型糖尿病危险性的方法和组合物
CN1635142A (zh) 用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物
CN1193102C (zh) 黑皮质素-4受体基因及其作为动物脂肪含量、体重增加和/或饲料消耗的遗传标记的用途
CN1662651A (zh) 心肌梗塞风险的诊断方法
CN1503847A (zh) 用于鉴定牛脊椎畸形综合征携带者的遗传试验
CN1891822A (zh) 具有特定单核苷酸多态性的th基因及其检测方法和用途
CN1678741A (zh) 用于检测基因多态性的方法
CN1761760A (zh) hsgk1基因中新的多态性在诊断高血压中的用途和sgk基因家族在诊断和治疗长Q/T综合征中的用途
CN1211486C (zh) 编码前神经肽y原突变体,一种信号肽的突变体,的dna分子及其应用
CN1771337A (zh) 包含单核苷酸多态性且与结肠癌有关的多核苷酸、包括该多核苷酸的微阵列和诊断试剂盒以及用该多核苷酸诊断结肠癌的方法
CN1928083A (zh) 人类异源物质代谢酶基因的单核苷酸多态性及其在诊断和治疗大肠癌方面之应用
CN1526111A (zh) 可用于评估干扰素疗效的多态标记
CN101033487A (zh) 检测与原发性高血压相关的KLK1基因rs5517多态的方法
CN1552875A (zh) 瘢痕疙瘩与增生性瘢痕差异表达基因文库及其构建方法
CN1969044A (zh) Dna阵列与单核苷酸多态性的检测方法
CN1634963A (zh) 一种冠心病相关基因及其检测方法和用途
CN1961074A (zh) 包含与ⅱ型糖尿病有关的单核苷酸多态性的多核苷酸、包含该多核苷酸的微阵列和诊断试剂盒以及使用它们分析多核苷酸的方法
CN101037690A (zh) 具有新的单核苷酸多态性的brca1基因变体和其编码的蛋白质变体
CN1958605A (zh) Spg3a基因突变、其编码产物及其应用
CN101056994A (zh) 将患者鉴定为用长效beta激动剂治疗的候选者并用于通过分析beta2肾上腺素能受体基因中的多态性来预测患者对长效beta2激动剂治疗的反应的方法
CN1871361A (zh) 使用半乳凝集素-2基因内单碱基多态性进行的炎症性疾病的判定方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C02 Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001)
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication