CN1590563A - 一种生物非整倍体的检测方法 - Google Patents

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CN1590563A CN 200410021619 CN200410021619A CN1590563A CN 1590563 A CN1590563 A CN 1590563A CN 200410021619 CN200410021619 CN 200410021619 CN 200410021619 A CN200410021619 A CN 200410021619A CN 1590563 A CN1590563 A CN 1590563A
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侯一平
李英碧
颜静
张
应斌武
邓建强
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Sichuan University
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Abstract

一种生物非整倍体的检测方法,其特征是按以下步骤进行:a.从胎儿细胞样本中提取样本DNA;b.采用荧光复合扩增方式对样本DNA中的特定STR位点进行扩增,所述特定STR位点的杂合度大于0.6,在同一染色体上至少选取6个STR位点作为所述特定STR位点,所述特定STR位点为四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点;c.对等位基因峰的数目进行辩认,当观察到同一染色体上的两个以上的特定STR位点具有三个等位基因峰时,认定该染色体为非整倍体。本发明对用于复合扩增的STR位点进行了选取,严格选择多态性好的四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点,增加了位点个数,采用了特定的检测判定方法,使检测结果的判定更加直观而明确。

Description

一种生物非整倍体的检测方法
技术领域
本发明涉及一种生物非整倍体的检测方法。
背景技术
生物学中的整倍体是指体细胞中的染色体数目是正常单倍体配子中染色体数N的整倍数。大多数的真核生物为二倍体,即一个正常体细胞内的染色体数为2N,如人类正常体细胞中有2*23条染色体。非整倍体为任何不是整倍体的染色体数目,可见于低等真核生物、哺乳动物和人类。但人类明显较其它生物更容易发生非整倍体,并且多为染色体的三体性。后者通常引起自发性流产、胎儿死亡和多种先天性畸形综合征,是人类生殖生物学中的重要问题。目前,人类还没有有效的措施防止染色体的异常分离,消除非整倍体发生给个人、家庭和社会带来的负担,因此,提高生物非整倍体的检测水平尤为重要。
对胎儿细胞进行核型分析是已有的生物非整倍体检测方法,这个过程包括胎儿细胞的体外培养和中期胎儿细胞的核型分析。细胞的体外培养需要一定数量的存活细胞和相当的专业技术知识,在下列几种情况下都可能无法实施核型分析:1、细胞培养失败。据统计,细胞培养失败的发生率约为1-2%;2、收集的细胞数目有限,不能得出明确的结论。因此,为确保足够的培养物用于核型分析,必须获得大于5ml的羊水。当一次羊水穿刺抽出的羊水量少于5ml时,就不得不进行反复的羊水穿刺,从而增加了感染和损伤的风险。3、培养物被污染。有文献报道,即使在经验丰富的试验室,母体细胞的污染率也可达10-14%。4、由于细胞培养仅限于存活细胞,因此某些特殊的样本无法进行核型分析,如一些妊娠产物以及福尔马林固定或石蜡包埋样本。此外,传统的生物非整倍体的检测方法最为显著的缺点是细胞培养过程耗时太长,大致需要两周左右的时间,这就易于造成处理上的延误。因此,迅速、准确的检测技术非常有价值。
近年来,荧光原位杂交(fluorecent in situ hybridization,FISH)和定量荧光PCR(quantitative fluorecent polymerase chain reaction,QF-PCR)已经应用于生物非整倍体的检测。就荧光原位杂交检测生物非整倍体的方法而言,间期细胞的荧光原位杂交可不必进行细胞培养,大大缩短了诊断所需的时间;商业化探针的应用提高了FISH的敏感性和特异性。但另一方面,这顶诊断技术仍然具有一定的局限性:1、在未培养的羊水中,荧光标记的探针会与细胞骨架非特异性地结合,使背景不清晰,FISH的有效性大大降低。2、必须要有完整的细胞用于分析。3、对实验人员的专业技能要求较高。4、母体细胞的污染会导致对实验结果的错误解释。5、相较QF-PCR,FISH分析耗时长、成本高,限制了其对样本的高通量检测。
定量荧光PCR方法利用了基因组中广泛分布的短串联重复序列(shorttandem repeats,以下简称STR)。STR通常由2~6bp的核心序列串联重复而成,具有高度的多态性,易于采用复合扩增方式进行扩增。而荧光复合扩增是目前世界上应用最普遍的复合扩增方法,通常是在各个靶序列其中一条引物的一端标记上荧光物质,利用自动激光荧光遗传分析仪对产物进行检测。STR的扩增产物在电泳时按片段大小分离,根据荧光峰的数目和强度确定每个等位基因的拷贝数,从而反映特定染色体的拷贝数。正常的杂合子个体会产生高度相近的两个峰,纯合子则表现为单独的一个STR峰。由于PCR(聚合酶链式反应)扩增方法和荧光检测的应用,这种检测方法非常灵敏,可用于少量样本的检测,如母体血液中收集的胎儿细胞或胎儿DNA,也可确定母体细胞的污染。尤为重要的是,这种方法非常迅速,DNA的提取和扩增仅需5个小时左右,每个荧光产物的分析会在半小时内完成。加之易于实现自动化,有可能对36~96个样本同时进行检测,因此几十个,甚至几百个样本的检测结果可在一天内得到。对于定量荧光PCR检测方法的检测结果的认定目前还很有争议,因为这种方法本身尚存在一些问题。首先,目前的定量荧光PCR检测方法仅选取了每条染色体上的2-4个STR位点进行复合扩增。对一个特定的染色体来说,仅由2-4个STR位点构成的检测系统通常不能保证检测出所有的非整倍体,尤其当STR位点的杂合度不高时。在许多运用定量荧光PCR检测方法的检测中,总有部分样本不能提供信息,即一条染色体上的几个位点均表现为一个STR峰,无法分辨是正常还是非整倍体的纯合子。尤为重要的是,定量荧光PCR检测方法在检测到两个峰时,将峰高或峰面积的比值与事先建立的正常参考值范围对照,作为判断是否是非整倍体的依据之一,这使该方法的有效性大大降低。PCR是个复杂的反应过程,扩增产物量和模板量并不是简单的线性关系,当出现两个等位基因峰时,对结果的判断在实际操作中比较复杂。若两个峰的高度或面积的比值接近正常参考值范围的界值,对结果的判断就会模棱两可;多个靶位点的复合扩增,由于荧光峰的重叠,其位置和强度有时也难以解释;某些位点存在优势扩增现象,很容易导致误诊,尤其是在模板量少时。当出现优势扩增时,或是由于片段小的等位基因过度扩增而将染色体的非整倍体误判为正常的二倍体,或是由于正常二倍体个体的一个等位基因扩增效率低而被误判为非整倍体。在实践中,定量荧光PCR通常是作为一种辅助的检测方法而与传统的细胞遗传学方法联合使用,最后的检测结果仍需通过细胞遗传学的方法获得。由此看来,利用短串联重复序列进行非整倍体的检测要真正成为一种更准确、快速的生物非整倍体的检测技术,取代传统的核型分析,还有待于作更进一步的改进。
发明内容
本发明的目的是改进上述现有的定量荧光PCR检测方法,提供一种能够迅速、准确地对一种特定的染色体进行生物非整倍体检测的方法。
本发明的生物非整倍体的检测方法按以下步骤进行:
a、从胎儿细胞样本中提取样本DNA;
b、采用荧光复合扩增方式对样本DNA中的特定STR位点进行扩增,所述特定STR位点的杂合度大于0.6,在同一染色体上至少选取6个STR位点作为所述特定STR位点,所述特定STR位点为四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点;
c、对等位基因峰的数目进行辩认,当观察到同一染色体上的两个以上的特定STR位点具有三个等位基因峰时,认定该染色体为非整倍体
在本发明的步骤a中,胎儿细胞样本可来自羊水、绒毛膜、母体的外周血,甚至福尔马林固定或石蜡包埋的组织,可以采用常规的酚-氯仿法或Chelex法提取样本DNA。
在本发明的步骤b中,特定STR位点的选取是基于以下考虑:1、选择多态性好的STR位点。所谓多态性是指同一群体中一个基因座存在两个或两个以上等位基因的现象。一个基因座的多态性程度越高,应用该基因座进行进行遗传学分析的效能就越高。多数STR位点都具有高度的多态性,其多态性源于核心序列重复次数的个体差异。通常认为复制滑脱是这种差异形成的机制。多态性好的STR位点会在正常群体的大部分个体中产生长度不同的PCR扩增产物,即对每个多态性好的位点来说,大部分的正常个体都会是杂合子,因此PCR产物的荧光定量分析会表现为两个荧光峰,相应于该位点的两个等位基因。在染色体的非整倍体中,额外的染色体多来自母体,位点多态性越好,母体具有不同等位基因的可能性就越大。同时,与父体等位基因不同的可能性也大,染色体的非整倍体在该位点表现为三个荧光峰的可能性也就越大。在群体遗传学中常用杂合度对位点的多态性进行定量评估。因此,在建立检测系统时,应选用杂合度大于0.6的STR位点。2、增加所选用的STR位点个数。对特定染色体三体的检测系统来说,其效能不仅取决于STR位点的多态性,也与STR位点的数目有关。毫无疑问,当分析的STR位点数目增多时,系统的效能就会增加,因此在两个以上的STR位点观察到染色体的非整倍体具有三个不同等位基因的可能性就会增加,对非整倍体的确定也就更有统计学上的意义。根据我们的研究,至少应选用6个以上的STR位点。3、选择四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点,即位点的核心序列由4bp或5bp核苷酸构成。这两类微卫星不仅具有高度的多态性,而且扩增更忠实,分型也更准确。
在本发明中,采用了荧光复合扩增技术,该技术可以直接沿用本申请人的中国发明专利申请03135377.0号中所公开内容。采用该技术之后,在一个反应体系中有多对引物同时扩增多个目标序列,从而大幅度地简化了操作程序,节省了时间,达到了用少量检材对生物非整倍体进行检测的目的。
与前述现有同类方法相比,本发明对用于复合扩增的STR位点进行了选取,严格选择多态性好的四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点,增加了位点个数,保证了检测系统的效能,使检测更有统计学的意义,同时,采用了特定的检测判定方法,使检测结果的判定更加直观而明确,能真正实现快速、高通量地进行生物非整倍体检测的目的。因此,本发明有望取代传统的核型分析,具有更高的实用价值。
本发明的内容结合以下实施例作更进一步的说明,但本发明的内容不仅限于实施例中所涉及的内容。
具体实施方式
实施例1:本实施例的生物非整倍体的检测方法按以下步骤进行:
a、采用酚-氯仿法从胎儿细胞样本中提取样本DNA。本实施例中的胎儿细胞样本来自母体的羊水。
b、采用荧光复合扩增方式对样本DNA中的特定STR位点进行扩增。在本实施例中,按以下原则选择特定的STR位点:所述特定STR位点的杂合度大于0.6,在同一染色体上至少选取6个STR位点作为所述特定STR位点,所述特定STR位点为四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点。综合考虑上述选用STR基因座的各个因素,我们选择了位于18号染色体上的九个STR基因座作为扩增位点:D18S1362、D18S866、GATA173A03、GATA166D05、GATA41G05、GATA177C03、D18S977、D18S1364、D18S877。
这些基因座均查自互联网上的GDB基因数据库,各基因座的引物序列分别为:
D18S1362基因座:
    F:5 ′--CAGAATTCCTAGATTCCTATCTCT-3′
    R:5 ′--CCACCATACTAGCATGAGCC-3′
D18S866基因座:
    F:5′--TAACTATGTTGATGGATGAATGG-3′
    R:5′--TGAATAGGTTGGAAAAATTTCC-3′
GATA173A03基因座:
    F:5′--GAAAAAGCCAGCGAGTACTG-3′
    R:5′--TCATGCCTGTATCTATCACTGC-3′
GATA166D05基因座:
    F:5′--TTAAGAATGAAATGTTCTAATTCCG-3′
    R:5′--TTGTCACAGAAAGGGATGGT-3′
GATA41G05基因座:
    F:5′--TGTTTATTTGTTTGACTCAATGG-3′
    R:5′--GAGTGAATGCTGTACAAACAGC-3′
GATA177C03基因座:
    F:5′--CTCTCTTCATCCACCATTGG-3′
    R:5′--GCTGTCAGAGACCTGTGTTG-3′
D18S977基因座:
    F:5′--CAGTGCTTTGGCTATATCTATCT-3′
    R:5′--TAACCTAGAAAAGGGCACTAGC-3′
D18S1364基因座:
    F:5′--TCAAATTTTTAAGTCTCACCAGG-3′
    R:5′--GCCTGTAGAAAGCAACAACC-3′
D18S877基因座:
    F:5′--GATGATAGAGATGGCACATGA-3′
    R:5 ′--TCTTCATACATGCTTTATCATGC-3′
采用本申请人在中国发明专利申请03135377.0号中公开的多色荧光物复合扩增STR引物设计方法,对这九个位点进行复合扩增。D18S1362、D18S866、GATA173A03为一组,标记一种颜色的荧光。非人类基因组的短引物对为:
  PA′(5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-3 ′)
  PB1′(5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGAC-3′)
在PB1′中,荧光物质F1为市售的蓝色荧光标记物FAM。
这对短引物分别与该组三个基因座的原始引物构成了复合扩增体系中各基因座的长引物。
D18S1362基因座的长引物:
    F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
             -CAGAATTCCTAGATTCCTATCTCT-3′
    R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGAC
               -CCACCATACTAGCATGAGCC-3 ′
D18S866基因座的长引物:
    F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-
             -TAACTATGTTGATGGATGAATGG-3′
    R:5 ′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGAC
            -TGAATAGGTTGGAAAAATTTCC-3′
GATA173A03基因座的长引物:
    F:5 ′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
              -GAAAAAGCCAGCGAGTACTG-3′
    R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGAC
            -TCATGCCTGTATCTATCACTGC-3′
GATA166D05、GATA41G05、GATA177C03为一组,标记另一种不同颜色的荧光。非人类基因组的短引物对为:
  PA′(5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-3 ′)
  PB2 ′(5′--F2-TAATACGACTCAGTAT AGGGACAG-3′)
在PB2′中,荧光标记物F2为市售的现有黄色荧光标记物NED。
这对短引物分别与该组三个基因座的原始引物构成了复合扩增体系中各基因座的长引物。
    GATA166D05基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                 -TTAAGAATGAAATGTTCTAATTCCG-3′
        R:5′--F2-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                   -TTGTCACAGAAAGGGATGGT-3′
    GATA4 1G05基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                  -TGTTTATTTGTTTGACTCAATGG-3′
        R:5′--F2-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
               -GAGTGAATGCTGTACAAACAGC-3′
    GATA177C03基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                 -CTCTCTTCATCCACCATTGG-3′
        R:5′--F2-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                 -GCTGTCAGAGACCTGTGTTG-3′
D18S977、D18S1364、D18S877为一组,标记另一种不同颜色的荧光。非人类基因组的短引物对为:
PA′(5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-3′)
PB3′(5′--F3-TAATACGACTCAATATAGGGATAA-3′)
在PB3′中,荧光标记物F3为市售的现有绿色荧光标记物JOE。
这对短引物分别与该组三个基因座的原始引物构成了复合扩增体系中各基因座的长引物。
    D18S977基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                 -CAGTGCTTTGGCTATATCTATCT-3′
        R:5′--F3-TAATACGACTCAATATAGGGATAA
                  -TAACCTAGAAAAGGGCACTAGC-3′
    D18S1364基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                 -TCAAATTTTTAAGTCTCACCAGG-3′
        R:5 ′--F3-TAATACGACTCAATATAGGGATAA
                    -GCCTGTAGAAAGCAACAACC-3′
    D18S877基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC
                    -GATGATAGAGATGGCACATGA-3′
        R:5′--F3-TAATACGACTCAATATAGGGATAA
                    -TCTTCATACATGCTTTATCATGC-3′
复合扩增反应在PE-9600扩增仪中进行。PCR反应体系中的成份主要有:模板DNA(人类基因组序列)、长引物对、短引物对、耐热DNA聚合酶、MgCl2、脱氧核苷三磷酸dNTP、BSA(小牛血清蛋白)、1×Buffer(缓冲液)和双蒸水DDH20。其中,DNA耐热聚合酶、Mg12和10×Buffer(缓冲液)直接由市售的PCR试剂盒(生产厂家为华美,品名为耐热TaqDNA聚合酶)提供。
PCR反应体系中各成分的浓度如下:
    DDH2O:                 12.3μL
    dNTP:                   7.5μl(200μM)
    10Xbuffer                3.75μL、
    各短引物                 0.3μl(400nM)
    各长引物                 0.3μl(40nM)
    Taq酶                    1μl(3u)
    BSA                      3.75μL
    MgCl2                    3μl(2.25mM)
    DNA模板:                2.5μL(约3ng)
    总体积:                 37.5μL
复合扩增采用热启动技术,共循环28轮,循环参数如下:
    预变性:94℃             3分钟
    变性:  94℃             50秒
    复性:  56℃             50秒
    延伸:  72℃             30秒          4个循环
    变性:  94℃             50秒
    复性:  56℃             30秒
    延伸:  72℃             30秒          24个循环
    延伸:  72℃             10分钟
c、对等位基因相应荧光峰的数目进行辩认,当观察到同一染色体上两个以上的特定STR位点具有三个等位基因峰时,认定该染色体中存在非整倍体。在本实施例中,利用ABI310遗传分析仪(PE,美国)对上述复合扩增过程所得到的PCR扩增产物进行检测分析。用PCR产物0.4μl与分型标准物GS500 ROX size standard 0.2μl、变性剂Hi-DiTMformamide 13μl混匀编号,放入自动进样盘。电进样15000V、5s.电泳15000V,24分钟。用DateCollection软件收集数据,Genescan3.7软件分析数据,用修改过的AmpFISTR PLUS kit Kazam macro文件在Genetype3.7软件自动分型。等位基因的辨认通过与等位基因分型标准物比较来确认,窗口范围+/-0.5bp.这样,通过直接观察是否有两个以上的STR位点具有三个等位基因峰,我们可以检测到染色体中是否存在生物非整倍体。
实施例2:本实施例中的检测方法与实施例1相似。所不同的是,在本实施例中,选择了位于X号染色体上的六个STR基因座:DXS6805、DXS9894、DXS9896、GATA192D07、DXS7132、GATA160B08,以及Y染色体的两个位点DYS434、DYS438作为复合扩增的位点。
这些基因座均查自互联网上的CHLC数据库,各基因座的引物序列分别为:
    DXS6805基因座:
        F:5′--ACAGCAAGAAGATGGCTGTC-3′
        R:5′--AGCAGCATGACTCCAGAATC-3′
    DXS9894基因座:
        F:5′--TGCACTTAATATCTGGTGATGG-3′
        R:5′--ATTTCTTTCCCTCTGCAACC-3′
    DXS9896基因座:
        F:5′--CCAGCCTGGCTGTTAGAGTA-3′
        R:5′--ATATTCTTATATTCCATATGGCACA-3′
    GATA192D07基因座:
        F:5′--TCTACTACCGTACCCATAATCTATC-3′
        R:5′--AGGAATGCTTTAAAAGTGATGC-3′
    DXS7132基因座:
        F:5′--AGCCCATTTTCATAATAAATCC-3′
        R:5′--AATCAGTGCTTTCTGTACTATTGG-3′
    GATA160B08基因座:
        F:5′--GAGCCCAGACACACATATCC-3′
        R:5′--TGAGCACTGAATATACAGGTGG-3′
    DYS438基因座:
        F:5 ′--TGGGGAATAGTTGAACGGTAA-3 ′
        R:5 ′--GTGGCAGACGCCTATAATCC-3′
    DYS434基因座:
        F:5′--CACTCCCTGAGTGCTGGATT-3′
        R:5′--GGAGATGAATGAATGGATGGA-3′
采用本申请人在中国发明专利申请03135377.0号中公开的多色荧光物复合扩增STR引物设计方法,对这八个位点进行复合扩增。DXS6805、DXS9894、DXS9896、GATA192D07为一组,标记一种颜色的荧光。非人类基因组的短引物对为:
    PA′(5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-3′)
    PB1′(5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGAC-3′)
在PB1′中,荧光物质F1为市售的蓝色荧光标记物FAM。
这对短引物分别与该组三个基因座的原始引物构成了复合扩增体系中各基因座的长引物。
    DXS6805基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
               -ACAGCAAGAAGATGGCTGTC-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                   -AGCAGCATGACTCCAGAATC-3′
    DXS9896基因座基因座的长引物:
        F:5 ′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
                  -CCAGCCTGGCTGTTAGAGTA-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGA
                -ATATTCTTATATTCCATATGGCACA-3′
    DXS9894基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
               -TGCACTTAATATCTGGTGATGG-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGA
               -ATTTCTTTCCCTCTGCAACC-3 ′
    GATA192D07基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
                -TCTACTACCGTACCCATAATCTATC-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGA
                 -AGGAATGCTTTAAAAGTGATGC-3′
以DXS7132、GATA160B08、DYS434、DYS438为一组,标记另一种不同颜色的荧光。非人类基因组的短引物对为:
    PA′(5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATAC-3′)
    PB2′(5′--F1-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG-3′)
在PB1′中,荧光物质F1为市售的红色荧光标记物ROX。
这对短引物分别与该组三个基因座的原始引物构成了复合扩增体系中各基因座的长引物。
    DXS7132基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
              -AGCCCATTTTCATAATAAATCC-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCACTATAGGGAGA
              -AATCAGTGCTTTCTGTACTATTGG-3′
    GATA160B08基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
                  -GAGCCCAGACACACATATCC-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                  -TGAGCACTGAATA TACAGGTGG-3′
    DYS438基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
               -TGGGGAATAGTTGAACGGTAA-3′
        R:5 ′--F1-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                -GTGGCAGACGCCTATAATCC-3′
    DYS434基因座的长引物:
        F:5′--GTTCTT-ATTTAGGTGACACTATAGAATA
                  -CACTCCCTGAGTGCTGGATT-3′
        R:5′--F1-TAATACGACTCAGTATAGGGACAG
                  -GGAGATGAATGAATGGATGGA-3′
本实施例中的检测系统其具体操作过程与实施例1相类似,故从略。这样,根据样本是否能扩增出Y染色体上的等位基因,在X染色体上是否有两个以上的STR位点表现为三个峰,即可快速检测到染色体中是否存在生物非整倍体。
需要说明的是,参照实施例1和实施例2,选取其它染色体上一定数量的适当STR位点,同样可构建有统计学意义的检测系统,对其它的生物非整倍体进行快速的检测。

Claims (1)

1、一种生物非整倍体的检测方法,其特征是按以下步骤进行:
a、从胎儿细胞样本中提取样本DNA;
b、采用荧光复合扩增方式对样本DNA中的特定STR位点进行扩增,所述特定STR位点的杂合度大于0.6,在同一染色体上至少选取6个STR位点作为所述特定STR位点,所述特定STR位点为四核苷酸或五核苷酸重复的STR位点;
c、对等位基因峰的数目进行辩认,当观察到同一染色体上的两个以上的特定STR位点具有三个等位基因峰时,认定该染色体为非整倍体。
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