CN1446228A

CN1446228A - 校正基因

Info

Publication number: CN1446228A
Application number: CN01813859A
Authority: CN
Inventors: 卢欣
Original assignee: Ludwig Institute for Cancer Research New York
Current assignee: Ludwig Institute for Cancer Research Ltd; Ludwig Institute for Cancer Research New York
Priority date: 2000-08-04
Filing date: 2001-08-06
Publication date: 2003-10-01
Anticipated expiration: 2021-08-06
Also published as: US20040053262A1; ES2269430T3; ATE332309T1; EP1710582A2; AU7651501A; DE60121346D1; WO2002012325A3; AU2001276515B2; DK1313762T3; PT1313762E; JP2004525605A; WO2002012325A2; CN1310942C; CY1106187T1; CA2417368A1; EP1313762A2; HK1057377A1; EP1313762B1; EP1710582A3; DE60121346T2

Abstract

本发明涉及一个肿瘤抑制基因家族的新成员(凋亡刺激蛋白，ASP)的鉴定，该基因编码可调节p53活性的多肽，以及可调节所述肿瘤抑制多肽活性的多肽。

Description

校正基因

肿瘤抑制基因编码抑制细胞生长或分裂的蛋白质，因此对于维持正常细胞的增殖、生长和分化非常重要。在当例如DNA受到损伤时，肿瘤抑制基因的突变导致异常的细胞周期进程，由此，阻止细胞周期的正常细胞周期的检查点被丢失，受损细胞的分裂难以控制。肿瘤抑制基因的产物作用于细胞的各个部位(如细胞表面、细胞质、核)，来阻断受损细胞的通过细胞循环通路(即G1，S，G2，M和cytokinesis)。

许多的肿瘤抑制基因已经被分离并测序。它们包括，在此仅例，视网膜母细胞瘤基因(Rb)，该基因的突变已经与某些癌症建立其联系，如骨癌(osteocarcoma)、膀胱癌、小细胞肺癌、乳腺癌，视网膜母细胞瘤，以及维耳姆斯瘤-1基因(WT-1)，该基因的突变还与肾胚细胞瘤和神经纤维瘤建立起联系。

肿瘤抑制基因家族，MAD(Mothers against dpp(decapentapelgic基因))和MADR(MAD相关基因)已经在许多物种中得到鉴定。这些基因编码丝氨酸/苏氨酸受体信号传输中所必须的涉及信号传导通路的蛋白质。MADR1是dpp通路信号传输中必须的。MADR2是另一个MADR，该基因的突变已经与结肠癌联系起来(6％的散发性结肠癌)。MADR2基因序列，即已知的Smad2，在WO98/07849中已经被公开了。

目前关于肿瘤抑制基因的一个最为热点的研究是p53。p53编码的蛋白质作为转录因子是一个细胞分裂周期的关键的调节因子。它是1978年被发现的(Lane和Crawford，1999)，该蛋白质显示与SV40大T抗原的结合亲和力。p53基因编码一个分子量为53kDa的含393个氨基酸的多肽。

由p53的转录活性调节的基因包含了一个位于5’端的p53识别序列。这些基因在某些情况下被激活，例如由于DNA受损导致p53在细胞水平增加时。响应p53的基因包括了mdm2(Momand等，1992)，Bax(Miyashita和Reed，1995)以及PIG-3(Polyak et al，1997)。Bax和PIG-3涉及到p53的一个最重要的功能，即诱导凋亡。凋亡或程序化的细胞死亡是一个清除受损细胞的自然过程。它对于很多细胞进程来说是很重要的，包括癌变前细胞的清除，细胞/组织的发育和内环境稳定。

如上所述，p53的一个最重要的肿瘤抑制功能就是它能够诱导凋亡。p53能够向上调节某些原凋亡基因如Bax的表达，为p53如何诱导凋亡的提供了证据。然而，比较Bax在p53(-/-)和p53(+/+)转基因鼠和野生型鼠中的表达，可以明显地看到当DNA受损时，仅在有限数量的组织表达受p53调节的Bax。因此，我们仍然不清楚为什么p53的表达只能够在特定的细胞类型诱导Bax的表达。最近的研究表明，p53发生的突变能够改变启动子特异性。两个致瘤的突变体p53基因显示出Bax启动子的反式激活作用缺陷，但能够反式激活其它p53靶基因，例如mdm2和p21waf1启动子。这些发现表明，能够反式激活如Bax基因在p53的肿瘤抑制功能中是非常重要的。

已知p53能够通过独立的或非独立的转录路径诱导凋亡。此外，p53诱导的凋亡，可以被致癌基因bc1-2阻断。然而bc1-2并不能抑制p53的反式激活功能。到目前为止，对于bc1-2是如何抑制p53诱导的凋亡的分子机制的了解是非常少的。

53BP2是一个p53结合蛋白，它最初是由Iwabuchi等于1994年发现的。53BP2通过酵母的双杂交系统分离得到，它包含了从蛋白质C末端开始的528个氨基酸。该蛋白包含一段富脯氨酸序列，4个锚蛋白重复，以及一个SH3结构域。随后它被鉴定为与Bc1-2互作用的蛋白质(Naumovski和Cleary，1996)。该蛋白的一个更长的片段被分离并被命名为bBP2/53BP2，基于体外翻译数据，作者(Naumovski和Cleary，1996)预测bBP2/53BP2蛋白包含1005个氨基酸。

为了了解p53的凋亡功能是如何能够在体内被调节的，我们用53BP2的抗体处理细胞，发现在绝大多数受测细胞中，53BP2的表达水平很低。

我们还发现内源的bBP2/53BP2出人意料地编码一蛋白，其长度大于Naumovski和Cleary预测的1005个氨基酸。该蛋白，即ASP-2，包含了1135个氨基酸。

为了更清楚地描述本发明，将使用以下术语：

i)长为528个氨基酸多肽将被称做53BP2或者ASP-2/53BP2(607-1135)

ii)长为1005个氨基酸多肽将被称做bBP2/53BP或者ASP-2/53Bbp2(130-1135)

iii)长为1135个氨基酸多肽将被称做ASP-2/53BP或者简称之为ASP-2(1-1135)。

括号中的数字代表相应于ASP-2的氨基酸数。

我们已经发现bBP2/53BP靠近C末端的一半，对p53的活性没有明显的作用。然而，ASP-2/53BP激活p53的反式激活功能。让我们更感兴趣的是，ASP-2/53BP能够特异性地加强p53对来自原凋亡相关基因，如Bax和PIG-3，的启动子的反式激活功能。

使用ASP-2的cDNA序列，进行BLAST检索并鉴定得到一克隆名为KIAA0771，它与编码bBP2/53BP的核酸序列高度同源，这表明该新鉴定的序列是编码凋亡刺激蛋白(ASP’s)家族中的一个成员。该成员被称做ASP-1。应用现有技术中已知的步移PCR技术，我们克隆得到了ASP-1 cDNA，即KIAA0771的5’上游的100bp。对该100bp序列，用BLAST程序进行检索，我们又鉴定得到了另一个EST克隆(EMBO登录号AI625004)，该克隆与该100bp序列重叠并还包含了ASP-15’端的700bp。获得EST克隆AI625004和KIAA0771，并合并亚克隆得到全长的ASP-1的cDNA序列，如图1B所示。

我们将该新核酸序列命名为ASP-1(凋亡刺激蛋白1)，它编码具有与53BP2/Bbp2同源序列的多肽。ASP-1和ASP-2序列在蛋白质水平的序列同源度如图8A所示。ASP-1和ASP-2蛋白序列在N末端和C末端部分同源性最高。

这两个基因的染色体定位也已经被鉴定。ASP-1是由位于14号染色体上的一个基因所编码。该基因的17个外显子和内含子的边界如图1C所示。绝大多数的外显子和内含子在EMBO登录号为AL049840的基因组克隆之内。启动子区域和5’末端的外显子和内含子被定位于EMBO登录号为CNS01DTD的基因组克隆之内。

此外，我们还鉴定到ASP-2的一个调节子，它抑制ASP-2对p53的激活作用。我们称该调节基因为I-ASP。在表达ASP-1和ASP-2肿瘤中，I-ASP的表达相对于正常调节的情况下被上调。这表明p53的肿瘤抑制功能在体内可以被ASP和I-ASP正调节和负调节。

本发明的第一方面是提供一种多肽，或其一部分，它包含：

i)至少一个锚蛋白重复序列；

ii)一个α螺旋区域；

iii)一个SH3结构域；

其特征在于该多肽至少能够激活p53的凋亡功能。

在本发明的一个优选实施方案中，所述多肽的特征在于由图1c或图1d所示多肽序列的至少一个区域能够与抗体，优选与单克隆抗体结合。

在本发明的另一个优选实施方案中，所述多肽包含一个p53结合位点，并进而与p53建立起联系。优选地，所述联系是能够诱导和/或加强凋亡。

在本发明的一个优选实施方案中，所述多肽是来源于哺乳动物，理想地是来源于人。

在本发明的一个优选实施方案中，所述多肽由图1c或图1d所示氨基酸序列描述，它通过至少一个氨基酸的缺失、加成、替代进行进一步修饰。

本发明的第二方面是提供一种分离的核酸分子，它包含选自以下组的DNA序列：

i)图1a或图1b所示DNA序列；

ii)能与图1a或图1b所示DNA序列杂交，且编码本发明中的肿瘤抑制多肽的DNA序列；以及

iii)i)和ii)中所述DNA序列的简并DNA序列。

在本发明的一个优选实施方案中，提供了一种分离的核酸分子，它能够在严格杂交条件下与图1a或图1b所示DNA序列退火。

在本发明的另一个优选实施方案中，所述核酸分子是cDNA。

在本发明的另一个优选实施方案中，所述核酸分子是基因组DNA。

在本发明的再一个优选实施方案中，提供了由本发明的核酸分子所编码分离的多肽。

本发明的第三方面是提供一种核酸分子，其特征在于所述核酸分子是适合促进所述核酸分子编码的多肽的重组表达的载体的一部分。

在本发明的一个优选实施方案中，所述载体是表达载体，它适于真核基因的表达。

本发明的第四方面是提供一种制备本发明多肽的方法，它包括以下步骤：

i)提供用本发明的核酸分子转化或转染的细胞；

ii)在适于表达所述多肽的条件下，培养所述细胞；以及

iii)从所述细胞中或其生长环境中纯化或分离所述多肽。

在本发明的一个优选实施案中，所述核酸分子为本发明的载体。

在本发明的一个优选方法中，所述载体编码一分泌信号，也即所述重组多肽被赋予一分泌信号，它有利于纯化所述多肽。

在本发明的另一个优选的实施方案中，所述载体编码一段附加的氨基酸序列，也即所述重组多肽被提供一段附加的氨基酸序列，它有利于从细胞中或从细胞培养介质中纯化该重组多肽。例如组氨酸标签序列，它允许重组多肽结合于镍柱，或利用生物素酰重组多肽，它可以被抗生物素蛋白柱纯化。这些都是现有技术中的方法。

本发明的第五方面是提供一种抗体或其结合部位，它至少能与本发明中多肽的一部分相结合。

在本发明的一个优选实施方案中，所述的结合部位选自以下组：F(ab’)₂、Fab、Fv和Fd片段；包含了CDR3结构域的抗体。

在本发明的一个优选实施方案中，所述抗体是单克隆抗体。

在本发明的另一个优选实施方案中，所述抗体是人源化的。

可选地，所述抗体是通过重组的方法产生的嵌合抗体。它包含所述抗体的可变区和人类抗体的恒定区。

嵌合抗体是重组抗体，其中所有来源于大鼠或小鼠抗体的V区与来自人类抗体的C区相结合。人源化抗体是重组杂交抗体，它融合了来于啮齿动物抗体的V区的互补性决定区和来自人类抗体V区的构架区。本发明中，人类抗体的C区也被应用。上述互补性决定区(CDRs)位于抗体的重链和轻链的N末端结构域内，该结构域V区的多数变化是受到限制的。这些区域在抗体分子的表面形成环状结构。这些环状结构提供了抗体和抗原间的结合表面。

产生抗体方法是现有技术中众所周知的。本领域技术人员可以从一些实验室操作课本中得到。例如：Antibodies，Lane&Harlow，Cold SpringHarbour Laboratories。

本发明的第六方面是提供转化或转染的宿主细胞，尤其是用本发明的载体转染或转化的宿主细胞，使得其至少包括本发明的核酸分子的一部分，以允许由所述核酸序列编码的多肽至少部分或大部分例如功能片段的表达。

理想地，该宿主细胞是真核细胞，例如昆虫细胞，比如来自秋粘虫运用杆状病毒表达系统。这一表达系统对于该多肽的翻译后修饰是必须的。如果这样的修饰不是必须的则可以应用原核系统。

本发明的第七方面是提供测定本发明的mRNA和/或多肽的表达的方法。

本发明的第八方面是提供一种药物或兽药组合物，其特征在于上述组合物包含了本发明中的载体。

本发明的第九方面是提供一种药物或兽药组合物，其特征在于上述组合物包含了本发明中的多肽。

在本发明的一个优选的实例方案中，所述载体和/或多肽也可任意地包括稀释剂、载体或赋形剂。

本发明的第十方面是提供一种治疗方法，它包括：

i)对动物施以本发明的有效剂量的组合物；且

ii)检测所述治疗组合物对所述动物的效果。

在本发明的一个优选的方法中，所述治疗是癌症治疗。

在本发明的一个优选的实施方案中，所述的动物是人。

在本发明的另一个优选的实施方案中，所述的效果是指诱导凋亡。

本发明的另一个方面是提供一种筛选能够调节本发明的多肽活性的试剂的方法，它包括：

i)提供一种表达本发明的多肽的细胞或细胞系；

ii)用至少一种受检试剂作用于所述细胞；并且

iii)检测所述试剂对于所述多肽的活性的影响。

本发明的另一个方面是提供一种筛选能够调节本发明中的多肽活性的试剂的方法，它包括：

i)提供至少一种根据本发明的多肽；

ii)用至少一种受检试剂作用于所述多肽；并且

iii)检测所述试剂被所述多肽的结合。

本发明的另一个方面是提供一种根据本发明的筛选方法所确认的试剂。

在本发明的一个优选的实施方案中，所述试剂是激动剂，它可以促进本发明中多肽的活性。

在本发明的另一个优选的实施方案中，所述试剂是拮抗剂，它抑制本发明中多肽的活性。优选地，所述试剂是一种多肽。

本发明的另一方面是提供一种反义的核酸分子，其中所述的分子包含了本发明的有义序列的反义序列。优选地，所述反义核酸分子包含了图1b所代表反义序列或其一部分。优选地，所述反义核酸分子包含了ASP-2序列的核苷酸的-253到839位的有义序列的反义序列。

本发明的另一方面是提供了一种分离的核酸分子，它选自以下组：

i)图10所示的DNA序列；

ii)能与图10所示的DNA序列杂交的DNA序列，它编码本发明的肿瘤抑制多肽的抑制剂；和

iii)i)和ii)中所定义的DNA序列的简并的DNA序列。

在本发明的一个优选的实施方案中，提供了一种分离的核酸分子，它能够在严格杂交条件下与图10所示的序列退火。

本发明的另一方面是提供一种多肽或该多肽的一部分，它包含：

i)至少一个锚蛋白重复；

ii)一个SH3结构域；且

其特征在于所述多肽能够抑制图1d所示多肽的激活p53的活性。

在本发明的一优选实施方案中，所述的多肽也可包含富脯氨酸区域。

本发明的另一方面是提供一种多肽，它由图11所示的氨基酸序列所代表，该多肽可通过至少一个氨基酸的缺失、加成、替代进行修饰。优选地，所述多肽是来源人类。

本发明中用于ASP-1和ASP-2的各方面和实施方案也同样适用于I-ASP。例如，产生包含有I-ASP的DNA序列的表达载体；用编码I-ASP的核酸分子转化或转染的细胞系；能与编码I-ASP的核酸序列所编码的多肽相结合的单克隆抗体或其类似物；包含编码I-ASP的核酸分子的药物组合物；包含编码I-ASP多肽的或其类似物药物组合物，；应用编码I-ASP或I-ASP多肽的核酸分子的治疗方法；检测编码I-ASP的核酸或其类似物的方法；检测I-ASP多肽或其类似物的方法。

本发明的另一方面，还提供了一种反义核酸分子，其中所述分子包含了根据本发明的有义序列的反义序列。优选地，所述反义核酸分子包含了图10所示有义序列或其一部分的反义序列。最佳地，该反义核酸分子是I-ASP的核苷酸序列的-37到536位的有义序列的反义序列。

本发明的另一方面，还提供了一种药物组合物，它包含了本发明的反义分子。

在本发明的一个优选的实施方案中，所述的反义核酸与至少一种化疗剂相结合。优选地，所述试剂是一种选自以下组的抗癌制剂：顺氯氨铂、铂黑、环磷酰胺、苯丙氨酸氮芥、卡氯芥、氨甲叶酸、5-氟二氧嘧啶、阿糖胞苷(cytarabine)、巯基嘌呤、柔毛霉素、阿霉素、外茜草素(epirubicin)、长春碱、长春新碱、更生霉素、丝裂霉素C、红豆杉醇、L-天冬酰胺酶、粒细胞集落刺激因子、一种单烯双炔(enediyne)，例如杯形生长抑制素(chalicheamicin)或望菌生长抑制素(esperamicin)、苯丁酸氮芥、ARC-C、长春地辛(vindesine)、博来霉素、和表鬼臼毒吡喃葡糖苷。其它可与前述试剂结合的试剂包括作用于肿瘤新血管系统或免疫调制剂的试剂。更佳地，作用于肿瘤新血管系统的试剂选自以下组，包含：combrestatin A4、血管紧张素(angiostatin)和endostatin。优选地，所述免疫调制剂选自：α干扰素、γ干扰素和肿瘤坏死因子α(TNFα)。

在本发明的一个优选的实施方案中，所述试剂为顺氯氨铂。

本发明的另一个方面还提供了一种制备与图1d所示序列的1-130位氨基酸相结合的单克隆抗体的方法，它包括以下步骤：

(a)用免疫原免疫具有免疫活性的哺乳动物，其中所述免疫原包括具有图1d的第1-130位氨基酸所示氨基酸序列的多肽；

(b)融合被免疫的具有免疫活性的哺乳动物的淋巴细胞和骨髓瘤细胞形成杂交瘤细胞；

(c)筛选步骤(b)的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体；

(d)培养所述杂交瘤细胞，产生单克隆活性以增殖和/或分泌所述的单克隆抗体；并

(e)从其培养物的上清中收获所述述单克隆抗体。

在本发明的一个优选方法中，所述具有免疫活性的哺乳动物是小鼠。

在一个可替代的优选方法中，所述具有免疫活性的哺乳动物是大鼠。

在本发明的再一个优选方法中，所述的哺乳动物是转基因动物，它转入了人免疫球蛋白基因或包含人免疫球蛋白基因的染色体核酸

因此，本发明一方面涉及到分离的ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽，编码这些多肽的基因，它们的功能性修饰或变异体和有用片段，以及与其相关的治疗方法。这些基因表达通过结合到p53及其相关多肽上影响凋亡。

本文所用的与核酸相关的术语“分离的”是指：i)体外扩增，例如通过聚合酶链式反应(PCR)；ii)通过克隆进行重组；iii)纯化，即通过裂解和凝胶分离；或iv)合成，例如通过化学合成。一种分离的核酸可以通过已知的DNA重组技术很容易地进行操作。

因此，载体内所包含的核苷酸序列，若其5’末端和3’末端限制性位点是已知的或其用于聚合酶链式反应(PCR)的引物序列是已知的，我们就认为该核苷酸是分离的，但是存在于天然宿主中的天然状态的核酸序列则认为不是分离的。分离的核酸可以是基本上被纯化的，但不是必须的。例如，在克隆或表达载体中分离的核酸不是纯的，因为它可以包含仅一小部分在它的宿主细胞中的物质。但这样的核酸是分离的，该处使用该术语是因为它可以通过本领域技术人员熟知的标准技术，是很容易操作的。本文所用的分离的核酸不是存在于天然的染色体中。

本文所用与多肽相关的术语“它离的”是指从其天然环境中分离并以可被鉴定或使用的足够数量存在。当指蛋白质或多肽的时候，“分离的”的意思是，例如i)通过表达性克隆选择性的产生，或ii)通过层析法或电泳纯化。分离的蛋白质或多肽可以是基本上被纯化的，但不是必须的。术语“基本上纯”是指该蛋白质或多肽基本上不含有其它可在天然状态或体内系统中发现的物质，使得它们适于其用途。基本纯的多肽可通过已知的现有技术生产。因为在药物制剂中，分离的蛋白质可以与药学上可以接受的载体相混合，该蛋白可以仅占该药物制剂很小的重量百分比。不管怎样该分离的蛋白质是指它已经从天然系统中存在的物质中分离出来，也就是说与其它蛋白质分离开。

本发明的一方面涉及编码ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽，且在严格条件下与公开与此的核酸分子杂交，尤其是与包含了图1a，图1b或图10所描述分子的编码区的分子杂交的核酸序列。

因此，本发明的一个方面是那些编码ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽且在严格条件下与本发明提供的核酸分子杂交的核酸序列。此处所用术语“严格条件”是指本领域内都很熟悉的相关参数。核酸杂交参数可以在参考书中找到，例如：分子克隆实验手册(Molecular Cloning：ALaboratary Manual，J.sambrook，et al.，eds.，第二版，Cold Spring HarborPress，Cold Spring Harbor，New york，1989)，或Current Protocols inMolecular Biology，F.M.Ausubel，et al.，eds.，JohnWiley&Sons，Inc.，NewYork。更特别地，此处所用的的严格条件是指例如于65℃下进行杂交的杂交缓冲液(3.5×SSC，0.02％菲可，0.02％聚乙烯吡咯烷酮，0.02％牛血清白蛋白，2.5mM NaH₂PO₄(pH7)，0.5％SDS，2mM EDTA)。SSC是指0.15M氯化钠/0.015M柠檬酸钠，pH值为7。SDS是指十二烷基硫酸钠；EDTA是指乙二胺四乙酸。杂交后，于室温，用SSC洗DNA转移膜两次。然后在至高到68℃下，以0.1-0.5×SSC/0.1×SDS洗膜。

还有其它的条件，试剂等等可用，它们有相似的严格程度。本领域的技术人员很熟悉这样的条件，因此在此不详述。但可理解的是，本领域技术人员能够以某种方式操纵这些条件来清楚地鉴定本发明的ASP-1，ASP-2或I-ASP核酸序列。本领域熟练的技术人员熟知筛选表达上述分子的细胞和基因文库的方法，然后常规地进行分离，紧跟着分离相关的核酸分子并进行测序。

一般而言，本发明的核苷酸和氨基酸序列与其同系物和等位基因，各自有至少90％的一致性和/或至少95％的一致性。在某些情况下，将会有至少95％的核苷酸一致性和/或97％的氨基酸一致性，在另一些情况下将达到至少98％的核苷酸一致性和/或99％的氨基酸一致性。同源性可以通过各种可以公开获得的由NCBI(Bethesda，Maryland)开发的软件来计算，它们可以通过因特网获得(http：//ncbi.nlm.hih.gov/pub/)。

可例举的工具包括可通过因特网址http：//www.ncbi.nlm.hih.gov/获得的BLAST系统，较佳地是使用缺省值。配对和串序列对比(BLOSUM30矩阵设置)以及Kyle-Doolittle亲水性分析可以通过MacVetor序列分析软件获得(Oxford Molecular Group)。前述核酸的Watson-Crick配对互补序列也包含在本发明中。

检测与在此描述的核酸序列同源的编码ASP-1，ASP-2和/或I-ASP蛋白的核酸，可采用前述条件下的DNA印迹法，并一起使用可用于检测的探针(例如放射性的，化学发光的)。DNA最终转移并洗膜后，探针信号可以被检测到，如将膜置于X光片上或磷光盘上来检测放射信号，或通过处理膜来检测化学发光信号。

本发明还包括了含有天然物质的可替代遗传编码的简并核酸序列。例如，丝氨酸残基可由以下六个遗传密码所编码：TCA、AGT、TCC、TCG、TCT和AGC。每一遗传密码都同样地编码丝氨酸残基。因此，对于本领域普通技术人员来说，很显然地任何一个编码丝氨酸核苷酸的三联密码(triplet)都可导入体内或体外的蛋白合成装置，以将丝氨酸残基结合到延伸的多肽中。同样地，编码其它氨基酸残基的三联核苷酸序列的密码子包括，但不限于：CCA、CCC、CCG、CCT(脯氨酸密码子)；CGA、CGC、CGG、CGT、AGA和AGG(精氨酸密码子)；ACA、ACC、ACG和ACT(苏氨酸密码子)；AAC和AAT(天冬酰胺酸密码子)；以及ATA、ATC和ATT(异亮氨酸密码子)。其它的氨基酸残基也类似地可被多核苷酸序列编码。因此，由于遗传密码的简并性，本发明还包含了不同于生物学上分离的核酸密码子序列的简并核酸序列，

本发明还提供了经修饰的核酸分子或多肽，它包括一个或多个核苷酸或氨基酸的增加、取代和缺失。此处的“一个或多个”是指1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，或更多个，但实质上不会改变所述分子的功能，因为我们希望这些分子的功能与原始(被修饰)的核苷酸或多肽的功能基本上相同。功能的实质性变化可以是，例如，显性失活蛋白，或失去一个或多个功能的蛋白质。

在优选的实施方案中，这些经修饰的核酸分子和/或多肽，它们编码至少保留未经修饰的核酸分子和/或多肽的一种活性和功能，例如p53的结合功能，抗原性，转录活性等。在某些实施方案中，经修饰的核酸分子编码经修饰的多肽，特别是那些本申请它处描述的具有保留氨基酸取代的多肽。这些经修饰的核酸分子在结构上与未经修饰的核酸分子相关，它们在优选实施方案中与未经修饰的核酸分子在结构上足够相关，从而经修饰的和未经修饰的核酸分子能够在高度严格条件下杂交，这在现有技术中是已知的。

例如，可以制备编码有单个变化多肽的经修饰的核酸分子。每个核酸分子可以有一个、两个或三个核苷的替代，不包括描述于此的根据遗传密码的简并性发生的核苷变化。同样地，也可以制备编码有两个氨基酸发变化多肽的经修饰的核酸分子，例如2-6个核苷的替代。本领域技术人员可以很容易地预想到许多这样的经修饰的核酸分子，包括例如编码氨基酸2和3，2和4，2和5，2和6等的密码子内的核苷替代。在前述例子中，每两个氨基酸的结合都包括经修饰的核酸分子的结合，还包括编码氨基酸替代的全部核苷替代。编码具有其它替代(即3个或更多)，增加或缺失(例如通过引入终止密码子或剪接位点)的多肽的其它核酸分子，也是本领域普通技术人员根据本发明很容易就可以想到的。前述任何核酸或多肽能够通过常规试验检测到，保留与在此公开的核酸和/或多肽结构和活性上的相关性。

本发明还提供了ASP-1，ASP-2和I-ASP的分离片段或其互补片段，其长度足以代表该序列在人的基因组中是独特(unique)的，并识别编码ASP-1，ASP-2和I-ASP多肽的核酸。这些片段之所以被认为是独特的，因为它是较长核酸的特征(signature)。独特片段是指，例如，该片段足够长，能够精确地确保在上面所定义的ASP-1，ASP-2和I-ASP之外的分子中找不到该序列，也即它特异性地鉴定ASP-1，ASP-2和I-ASP序列。独特片段包括了邻近的核苷序列，它与本申请申请日之前的公共数据库中的任何序列都不一致(例如，GenBank)，尽管某些片段可能是GenBank中已知片段的一部分。另外，公开的已知的序列的互补序列或其片段可能是ASP-1，ASP-2和I-ASP的独特片段的一部分，但不是全部。因此该独特片段在定义上不包括只含有EST和/或在本申请的最早申请日之前在公共数据库中可获得的基因序列。因此，该独特片段必须包含除GenBank中的序列或其片段之外的核苷序列。这种差异可以是GenBank中的序列的添加、缺失或替代或完全不同于GenBank中的序列的序列。

包含独特片段的ASP-1，ASP-2和I-ASP核酸分子的片段，可在印迹杂交方法中用做探针(如Southern，Northern)来鉴定所述核酸，在核酸酶保护方法中测量转录水平，或可用于如应用PCR的那些扩增方法中。本领域的技术人员都知道，在如Southem印迹和Northern印迹的某些情况下更倾向选用大探针，例如200，250，300或更多的核苷，而在诸如PCR的情况下则更倾向较小的片段。为了生成抗体或决定该多肽片段的结合情况，或为了产生免疫测定的成分，这些片段还可用于生产融合蛋白。同样地，这些片段可用于产生ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽的非融合片段，如N末端和C末端片段，或公开于此的蛋白结构域，可用于在免疫测定中制备抗体，以及如在治疗中作为与ASP-1，ASP-2和I-ASP多肽，和/或其它与p53或rel多肽结合的多肽进行竞争性结合的对象。这些片段可以更进一步用作描述于此的反义分子，它可抑制ASP-1，ASP-2和/或I-ASP核酸和多肽的表达，尤其是用于治疗目的，在此有更多的详细描述。

就象本领域的技术人员将认识到的那样，所述独特片段的大小取决于其遗传密码的完整性。因此，ASP-1，ASP-2和I-ASP核酸分子及其互补的核酸分子的某些区域将要求更长的部分来保证其独特性，而其它的区域只要求一个短部分，典型地是在12-32个核苷之间(例如，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31和32碱基长度)。该公开旨在包含每个序列的每一个片段，从第一个核苷开始，第二个核苷等等，一直到不包含末端的8个核苷，在从每个序列的第8，9，10个核苷等等的任何地方终止，直到最后一个核苷(条件是该序列是如上所述的独特的)。许多ASP-1，ASP-2和I-ASP核酸的部分，或其互补的序列，有25个或更多的核苷，它们在长度上是独特的。本领域的技术人员熟知选择这样的序列的方法，典型地是籍以独特片段能够选择性地将我们感兴趣的序列与非ASP和I-ASP核酸区分开来。尽管可以进行体外的确证杂交和确证性测序分析，但将这些片段的序列与已知数据库中的序列进行比较通常就可以但也是必需的。

片段可以是功能片段。本发明核酸分子的功能片段是保留了大的核酸分子的一些功能特性，例如编码功能性多肽，与蛋白质结合(如与p53结合)，调节可操作地连接的核酸转录，编码免疫识别抗原决定部位等。本领域的普通技术人员可以很容易地决定采用本申请所述方法和本领域众所周知的方法，采用常规实验便可决定一个片段是否是一个核酸分子的功能性片段。

如上所述，本发明包含了反义寡核苷酸，它们可以选择性地结合于编码ASP-1，ASP-2和I-ASP多肽的核酸分子，并调节p53的结合，例如转录活性或凋亡。几乎在所有的医学状况下，例如癌症和涉及异常的凋亡的情形，都期望能够调节p53活性。

在此所用术语“反义寡核苷酸”或“反义”是描述寡核苷酸，更确切地说是寡核糖核苷酸、寡脱氧核糖核苷酸、经修饰的寡核糖核苷酸、或经修饰的寡脱氧核糖核苷酸，它们在生理条件下于包含特定基因的DNA或转录该基因的mRNA杂交，从而抑制所述基因和/或所述mRNA的翻译。通过与靶基因或转录本的杂交，反义分子被设计用于干涉靶基因的转录或翻译。本领域技术人员能够识别该反义寡核苷酸的精确长度，它与靶基因的互补程度取决于所选择的特定的靶基因，包括靶基因的序列和包含该序列的特定碱基。优选地所述反义寡核苷酸被构建用于在生理条件下与靶基因选择性地结合，也就是说，在生理条件下它与靶序列杂交的程度实质上大于与靶细胞中的其它序列。基于在此所述的ASP-1，ASP-2和I-ASP核酸序列，或基于其等位的或同源的基因组序列和/或cDNA序列，本领域的技术人员可以容易地选择并合成根据本发明的任一适合的反义分子。例如，可以制备“染色体基因步移(gene walk)”，其含一系列15-30个核苷的寡核苷酸，它们跨越ASP-1，ASP-2和I-ASP的核酸长度，接着检测其对相应的ASP-1，ASP-2或I-ASP表达的抑制。可选地，可在寡核苷酸间留下5-10个核苷的裂口来减少合成和检测的寡核苷酸数目。

为了达到完全地选择性有效抑制，所述反义挂核苷酸应该包含至少10个，更佳地至少15个连续的碱基，它们与靶序列互补。尽管在某些情况下，经修饰的寡核苷酸短至7个碱基长度也已被成功地用做反义寡核苷酸(Wagner et al.，Nature Biotechnol.14：840-844，1996)。最优地，所述反义寡核苷酸包含20-30个碱基的互补序列。尽管反义寡核苷酸可以是选做基因或mRNA转录本的任一区域的反义序列，但在优选的实施方案中的反义寡核苷酸对应于N末端或5’上游的位点，例如翻译起始位点、转录起始位点或启动子位点。此外，3’-非翻译区可作为靶序列。现有技术中采用了靶向mRNA的剪接位点，但是当可替代的mRNA剪接发生的时候它不是优选的。此外，反义序列更佳地是靶向到不期望mRNA的二级结构的位点(参见，例如，Sainio等，Cell Mol.Neurobiol.14(5)：439-457，1994)，在这些位点也不期望结合蛋白质。最后，尽管在此只描述了ASP-1，ASP-2和I-ASP的cDNA序列，但是本领域的普通技术人员可以容易地获得相应于这些cDNA的基因组DNA。因此，本发明还提供了可与ASP-1，ASP-2或I-ASP的基因组DNA互补的反义寡核苷酸。相似地，得到与cDNA和基因组DNA等位的或同源的反义序列也不需要付出过多的试验。

在一组实施方案中，本发明的反义寡核苷酸可以包含“天然的”脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、或它们的任意结合。也就是说，一个天然核苷的5’末端可以通过磷酸二酯键和另一个天然核苷的3’末端共价结合起来，就象在天然系统中一样。这些寡核苷酸可通过已知方法制备，如人工或自动合成器。它们也可由载体重组产生。

然而，在本发明的一些优选实施方案中，反义寡核苷酸还可以包含经修饰的寡核苷酸。也就是说，寡核苷酸可以被多种方式所修饰，所述方式不阻止它们与靶序列杂交，但是加强了它们的稳定性或导向性或加强了它们的治疗效果。

所用术语“经修饰的寡核苷酸”是指这样的寡核苷酸，其中(1)至少两个核苷通过合成核苷酸间键合共价连接(也就是，不同于一个核苷的5’末端通过磷酸二酯键和另一个核苷的3’末端共价结合)和/或(2)与核酸非正常地结合的化学基团共价连接到所述寡核苷酸上。优选的合成核苷酸间键合是硫代磷酸酯、烷基膦酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸酯、烷基硫代磷酸酯、氨基磷酸酯、氨基甲酸酯、碳酸酯、磷酸三脂、乙酰胺酯、羧甲基酯和多肽。

术语“经修饰的寡核苷酸”还包含了与经修饰的碱基和/或糖共价结合的寡核苷酸。例如，经修饰的寡核苷酸包括寡核苷酸具有糖骨架，它与低分子量的除3’位的羟基和5’磷酸基团外的有机基团共价连接。因此，经修饰的寡核苷酸可以包括2’-氧-烷基核糖基团。此外，经修饰的寡核苷酸可以包含如树胶醛醣代替核糖。因此，本发明预期药物制剂包含了能在生理条件下与编码ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽的核酸互补和杂交的经修饰的反义分子，以及药学上可接受的载体。

反义寡核苷酸可作为药物组合物的一部分给药。这样的药物组合物可以包括与任何现有技术中已知的、标准的生理上和/或药学上可接受的载体组合的反义寡核苷酸。该药物组合物应当是无菌的并包含治疗有效剂量的反义寡核苷酸，它以适于施用于病人的重量或体积为单位。所述载体的特性取决于歌给药途径。生理上和药学上可接受的载体包括稀释剂、填充剂、盐、缓冲剂、稳定剂、增溶剂以及其它现有技术中已知的物料。

所用术语“载体(vector)”可以是通过限制性酶切和连接被导入其中一段所期望序列的任意的核酸，用于在不同的遗传环境中运输或在宿主细胞中表达。尽管RNA载体也是可获得的，但载体通常是指包含DNA的载体。载体包括，但不限于，质粒、嗜菌体和病毒基因组。一个克隆载体是能够在宿主细胞中复制的，更典型地它还含有一个或多个可决定性地切割载体的核酸内切酶位点，并连接了感兴趣的DNA序列，这样新的重组载体保留了其在宿主细胞中复制的能力。在质粒的情况下，当质粒的拷贝数增加时，目的序列的复制可在宿主菌发生很多次；或在宿主细胞通过有丝分裂进行增殖前，目的序列仅在每个细胞复制一次。在噬菌体的情况下，复制可能在裂解阶段很活跃或在溶原阶段是被动的。表达载体是通过限制性酶切和连接导入其中所期望的DNA序列，使得其可操作地连于调节序列且可作为RNA的转录本表达。载体还可以包括一个或多个标记子序列，适于鉴定是否被载体转化或转染的细胞。标记子包括，例如，编码蛋白质的基因，该蛋白质能增强或减弱其对抗生素或其它化合物抗性或敏感性；及编码酶的基因，该酶的活性可以通过现有技术中的标准技术检测(例如，β半乳糖苷酶、荧光素酶或碱性磷酸酶)；和基因，它能明显地影响转化或转染细胞、宿主、克隆或色斑(如各种荧光蛋白质，例如绿色荧光蛋白，GFP)的表型。优选的载体是那些能够自主复制并表达存在于DNA片段中并与可其可操作地连接的结构基因产物。

这里所述的编码序列和调节序列被“可操作地”连接，是按照将编码序列表达或转录置于调节序列的影响和控制之下的方式将它们以共价方式相连接。如果期望编码序列被翻译成功能蛋白质，所述两个DNA序列被可操作地连接，诱导5’调节区启动子使编码序列被转录。如果两个DNA序列的连接不是可操作地，(1)导致移码突变的发生，(2)干扰启动子区启动编码序列的转录，或(3)影响相应的RNA转录本被翻译成蛋白质的能力。因此，启动子区应该被可操作地连于编码序列，如果启动子区域可以影响上述DNA序列的转录，其结果是将导致转录本能够被翻译成所期望的蛋白质或多肽。

用于基因表达所需要的调节序列的准确性质会因物种或细胞类型的不同而不同，但大致上都将包括，必需的5’非转录和5’非翻译序列，它们分别与转录和翻译的启动相关，比如TATA框，加帽序列，CAAT序列等。特别地，上述5’非转录调节序列包括了一个启动子区域，它包含与其可操作地相连的基因的转录控制的启动子序列。调节序列也可以如所望包括一个加强子序列，或上游活化子序列。本发明的载体可选地包括5’先导序列或信号序列。本领域的普通技术人员都能够选择并设计合适的载体。

表达载体包含了表达所必需的所有元件，可以通过商业途径获得并为本领域技术人员熟知。参见，例如，Sambrook et al.，Molecular Cloning：A Laboratory Manual，第二版，Cold Spring Harbour Laboratories Press，1989。细胞通过遗传工程手段导入了编码ASP-1，ASP-2和/或I-ASP多肽或片段或其变异体的异源DNA或RNA的细胞中。所述异源DNA或RNA被可置于转录元件的可操作控制下，使得异源DNA在宿主细胞中表达。

哺乳动物细胞理想的mRNA表达系统有如pcDNA3.1和pRc/CMV(从Invitrogen获得，Carlsbad，CA)，它们包含了一个选择标记子，例如赋予其G418抗性(促进选择稳定的转染细胞系)的基因，和人巨细胞病毒(CMV)增强子-启动子序列。此外，适于在灵长类或犬的细胞中表达的是pCEP4载体(Invitrogen)，它包含了一个EB病毒(EBV)复制起始点，作为多拷贝的染色体外遗传因子促进质粒的维持。另一个表达载体是包含了多肽延长因子1α的pEF-BOS质粒，它能够提高体外转录的效率。质粒已由Mishizuma和Nagata所描述(Nuc.Acids Res.18：5322。1990)，将其用于转染试验也已被公开，例如，Demoulin(Mol.Cell.Biol.16：4710-4716)。还有一个理想的表达载体是腺病毒，这已被Stratforrd-Perricaudet所描述，它缺损E 1和E3蛋白(J.Clin.Invest 90：626-630，1992)。腺病毒用作腺P1A重组体由Wamier等公开，对小鼠皮内注射以产生P1A的免疫作用(Int.J.Cancer，67：303-310，1996)。

本发明还包含表达试剂盒，这使得本领域技术人员可以构建所需的表达载体。这样的表达试剂盒至少包括了前面所讨论的编码序列的各分离的部分。可以根据需要添加其它组分，只要前面所说的必需的序列被包含在其中。

本发明还容许在细胞和动物中剔除了pcDNA3基因的构建体，为研究p53活性、凋亡、和癌症的某些方面提供素材。

本发明还提供了一种分离的多肽，它包括已公开的ASP-1、ASP-2和I-ASP多肽及其片段。这些多肽是有用的，例如，单独地或作为融合蛋白检测和调节p53的结合，调节凋亡、产生抗体、和作为免疫测定的组分。

通常，ASP-1、ASP-2和I-ASP多肽的片段具有与前面讨论的核酸相同的特征和特性。本领域技术人员都能认识到，独特片段的大小将取决于如该片段是否包含了保守蛋白区域的一部分这样的因素。因此，ASP-1、ASP-2和/或I-ASP多肽的一些区域将要求更长的部分来满足独特性，而其它区域则只需要较短的部分，典型的是在5-12个(即，5，6，7，8，9，10，11，12个氨基酸长)氨基酸之间。

ASP-1、ASP-2和/或I-ASP多肽的片段更佳地是保留了该多肽明显的功能特征。保留于多肽的独特片段的功能特征包括与p53或rel的结合，与抗体作用，和酶的活性。例如，如本文所例举，ASP-1、ASP-2和/或I-ASP多肽的某些片段能够用做与本发明的方法得到的ASP-1、ASP-2和/或I-ASP的全长多肽的功能等价物，包括，例如结合p53，调节凋亡等等。其它ASP-1、ASP-2和/或I-ASP多肽片段可以根据其功能特征筛选。例如，本领域的常规技术可以构建ASP-1、ASP-2和/或I-ASP片段的重组体并采用后面实施例部分描述的方法检测这些片段，例如与p53多肽结合。本领域的技术人员也都精通选择独特氨基酸片段的方法，尤其是基于独特片段的功能以选择性地将感兴趣的序列从非家族成员中筛选出来。通常仅需将该片段序列于在已知的公共数据库中的那写进行比较，这是必需的。

本发明包含上述ASP-1、ASP-2和I-ASP多肽的变异体。本文所用的ASP-1、ASP-2和I-ASP多肽的“变异体”是指包含了多肽的原始氨基酸序列一个或多个修饰。对ASP-1、ASP-2和/或I-ASP多肽施以能够产生变异体的修饰1)来降低或者消除ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的活性，例如与另一多肽结合；2)来加强ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的功能，例如在表达系统中的蛋白稳定性或蛋白之间结合的稳定性；或3)提供相对于ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的新的活性或功能，例如增加抗原决定部位或可检测的部分。ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的修饰尤其是发生在编码ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的核酸上的修饰，可以包括缺失、点突变、平截、氨基酸替代和增加一个或多个氨基酸或非氨基酸部分。与变异体相关的“一个或多个”是指1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30个或更多的改变。可选地，修饰可以直接在多肽上进行，比如通过裂解，增加连接子分子，增加如生物素的可检测部分，增加脂肪酸等等。修饰也包含了融合蛋白，该融合蛋白包含了ASP-1、ASP-2或I-ASP氨基酸序列的全部或部分。

一般说来，变异体包括被特异性修饰的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽来改变多肽与其生理活性无关的性质。例如半胱氨酸残基可以被替换或缺失以阻止得到不希望的二硫键。相似地，某些氨基酸的改变通过消除在表达系统中被蛋白酶的蛋白质水解以加强ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的表达(例如，在含KEX2蛋白酶活性酵母系统中的二碱基氨基酸)。

编码ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的核酸发生的突变更适宜保持氨基酸编码序列的阅读框，也更适于不在核酸内产生由于杂交形成的二级结构的区域，比如对变异体多肽表达有害的发卡结构或环状结构。

通过选择氨基酸替代可以获得突变，或通过编码多肽的核酸内选择位点的随机变异的发生。变异体多肽随后被表达并检测其一种或多种活性来决定什么样的突变提供了具有所期望特性的变异体多肽。还可以对变异体(或非变异体ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽进一步突变，它们是这些多肽的氨基酸序列的沉默突变，但提供了更佳的在特定的宿主细胞翻译的密码子。例如适于在E.coli中翻译的密码子，是本领域普通技术人员众所周知的。此外其它的突变也可以发生在ASP-1、ASP-2或I-ASP基因或cDNA克隆的非编码序列来提高多肽的表达。变异体ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的活性可以通过以下方法检测，将编码它们的核酸分子克隆到细菌或哺乳动物表达载体，将该载体导入合适的宿主细胞，表达变异体ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽，并检测本文所公开的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的功能活性。例如，变异体ASP多肽可以通过p53的结合进行检测，这在实施例中有描述。其它变异体多肽的制备可能适于检测另外的活性，这是本领域普通技术人员众所周知的。

本领域技术人员还将认识到，发生在ASP-1、ASP-2或I-ASP的保守性氨基酸替代可以提供前述多肽的功能上相当的变异体，也就是说，该变异体保留了ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的功能。如本文所述，“保守性氨基酸替代”是指这样的氨基酸替代，即不改变被氨基酸替代的蛋白质相对电荷和大小特征。变异体可按照本领域普通技术人员所熟知的改变多肽序列的方法来获得，在一些描述这样的方法的参考书中可以获得这样的方法，例如，Molecular Cloning：A Laboratary Manual，J.sambrook，et al.，eds.，第二版，Cold Spring Harbor Press，Cold Spring Harbor，Newyork，1989，或Current Protocols in Molecular Biology，F.M.Ausubel，et al.，eds.，JohnWiley&Sons，Inc.，New York。具有代表性的与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽功能等同的突变体包括了其氨基酸序列的一个或多个保守性氨基酸的替代。氨基酸的保守性替代包括在以下组中发生的氨基酸替代：(a)M，I，L，V；(b)F，Y，W；(c)K，R，H；(d)A，G；(e)S，T；(f)Q，N；和(g)E，D。

发生在ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的氨基酸序列的的保守性氨基酸替代能生成与其功能等同的变异体，典型地是通过改变编码ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的核酸。这样的替代可由本领域的普通技术人员通过多种方法获得。例如，通过PCR定向突变产生氨基酸替代，根据Kunkel所公开的方法的定点突变(Kunkel，Proc.Nat.Acad.U.S.A.82：488-492，1985)，或通过编码ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的基因的化学合成。如氨基酸替代在ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的小独特片段上，如p53结合位点缩氨酸，可以通过直接合成缩氨酸得到这样的缩氨酸替代。与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽功能等同的片段的功能活性可以通过如下方法检测，将编码被改变的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的基因克隆到细菌或哺乳动物表达载体上，将该载体导入合适的宿主细胞，表达经改变的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽，并检测本申请所述的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的功能活性。化学合成得到的缩氨酸可以直接通过功能进行鉴定，例如，与p53结合的功能。

依照本文所述，本发明有很多用途，其中一些在本文的其它部分描述。首先，依据本发明能够得到完整的分离的ASP-1、ASP-2或I-ASP蛋白质分子。本领域的技术人员熟知获得分离的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽分子的各种方法。该多肽可通过层析法或免疫识别从天然产生该多肽的细胞中纯化。可选地，可将表达载体导入细胞来引起多肽的生成。在另一个方法中，mRNA转录本可以通过微注射或别的方式导入细胞中来引起编码多肽的生成。mRNA的转录产物在无细胞抽提物，如网织红细胞裂解物的翻译系统中进行翻译成多肽。用来分离ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的方法熟知的技术。它们包括免疫层析、HPLC、过筛以及亲合层析等多种方法。

对ASP-1、ASP-2或I-ASP核酸分子的分离也使得本领域技术人员可以通过表达这些分子从而诊断特征性的紊乱(或其相对缺失)。这些方法包括确定ASP-1、ASP-2或I-ASP核酸的表达，以及/或从其衍生的多肽。在前一种条件下，这种确定可以用标准的核酸检测方法进行，比如如下所述的聚合酶链式反应或通过标记杂交探针得到。

本发明通过p53以及rel与ASP-1、ASP-2或I-ASP等蛋白的结合，对p53以及rel进行分离。对于ASP-1、ASP-2或I-ASP的结合活性的确定，从而使得本领域技术人员对蛋白活性和下游功能的调节成为可能，比如凋亡。这里将描述更多的用途。

在某些实施方案中，本发明提供从ASP-1、ASP-2或I-ASP衍生的“显性抑制(dominant negative)”多肽。所谓的显性抑制肽是一种蛋白的非活性变异体。用一种与细胞器作用的非活性变异蛋白替换掉与细胞器作用的活性蛋白或让它同活性蛋白竞争，由此减弱活性蛋白的作用。比如，一个与配体结合的显性抑制受体不会对这种结合发生响应并传递信号，从而降低这种配体表达的生物学作用。同样的，一个与正常的靶蛋白作用但不使该蛋白磷酸化的显性抑制的非活性催化激酶将导致响应细胞信号的靶蛋白磷酸化作用的减弱。相似地又如，在基因的控制区域与另一个转录因子结合或与一个启动子点结合但不增加基因转录的显性抑制的转录因子，通过占据启动子的结合位点，虽不增加转录但使得正常转录因子的效果下降。

最后的结论是：在细胞中表达一种显性抑制肽将降低活性蛋白的功效。本领域技术人员可以评估一种蛋白的显性抑制变异体的潜能，并运用标准的突变形成技术生产一种或多种显性抑制变异体多肽。比如，通过公开于此的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的教导，普通的本领域技术人员就可以对ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽进行特异点突变的引入，扫描突变，部分基因的删减或截除等等(U.S.Patent No.5,580,723；Sambrook等，分子克隆：实验手册，第二版，Cold Spring Harbor Laboratoary出版，1989)本领与普通技术人员可以检测突变多肽的群体检测从而减少选择的活性(比如p53的结合，凋亡的调节)和/或者保持这种活性。其它的制备或检测蛋白的显性抑制变异体的类似的方法也为本领域技术人员所掌握。

本发明还包括一些试剂。比如一些多肽，它们与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽结合，与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽以及它们的结合配对物如p53等的复合物结合。这种结合试剂将被用于比如监测测定，检测ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽以及ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽与其结合配对物的复合物的存在与否，以及在纯化过程中分离ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽，ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽同其结合配对物的复合物。这样的试剂也可以被用于通过如与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的结合，或与其结合配对物的结合，或与两者的结合，来ASP-1、ASP-2或I-ASP抑制ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽，或它们的结合配对物的活性。

此外，本发明肽结合试剂，比如它们可以是与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽具有选择性结合的抗体或抗体片段。抗体包括依据常规方法制备的多克隆抗体和单克隆抗体。

特别要强调的一点，正如该领域众所周知的，只有抗体分子的一小部分一抗体决定簇参与抗体与抗原决定簇的结合(Clark，W.R.1986 TheExperimental Foundations of Modern Immunology Wiley & Sons，Inc.，NewYork；Roitt，I.1991 Essential Immunology，7th Ed.，Blackwell ScientificPublications，Oxford)。比如pFc’和Fc区域是补体级联反应的受动器但并不与抗原结合。一个pFc’区域被酶解掉的抗体或是生成的没有pFc’区域的抗体，指定的一个F(ab’)₂片段，仍然保留了抗体完整的与抗原结合的位点。与之类似，一个抗体的Fc区域被酶解掉或者生成的没有Fc区域的抗体，指定的一个Fab片段，仍然保留了抗体分子与抗原的完整结合位点。Fab片段是由抗体的一个共价结合的轻链和记为Fd的部分抗体重链。这个Fd片段是决定抗体特异性的主要部分(一个Fd片段可以与多达十种不同的轻链相联系，而不改变抗体的特异性)，并且Fd片段分离中仍然保留与抗原决定簇的结合能力。

在抗体的抗原结合部位，本领域周知有互补决定区(CDR)和骨架区(FRs)，互补决定区直接与抗原的抗原决定簇相作用，骨架区则保留了抗原决定簇的三级结构(Clark，1986；Roitt，1991)。在重链Fd区及IgS的免疫球蛋白的轻链中都有四个骨架区(RF1-RF4)分别分布于三个互补决定区(CDR1-CDR3)。这些互补决定区(CDR)，特别是CDR3区而且主要是重链的CDR3，主导决定抗体的特异性。

现有技术已经证实哺乳动物抗体的非CDR区域可以被保留了原抗体表位特征的同种或异种抗体的类似区域的所代替。这些在发展和使用“人性化”的抗体的过程中已被非常清楚地证实，其中那些非人类的CDR通过与人的FR或Fc/pFc’区域共价键连在一起产生功能性抗体。参见美国专利4,816,567；5,225,539；5,585,089；5,693,762；和5,859,205。

例如，PCT国际公开WO 92/04381教导了人类murineRSV抗体的制备和使用，该抗体中，murine FR区域的至少一部分被人源的FR区域所替代。此抗体中含有具有结合抗原能力的完整抗体片段，通常被称为嵌合(chimeric)抗体。

通过转人类的免疫球蛋白基因到非人类的动物体内使之免疫的方法，人的单克隆抗体可以被完全制备。见USP 5,814,318；5,877,397；6,091,001；6114598。

对本领域技术人员是非常明显的，本发明也适用于F(ab’)₂，Fab，Fv，Fd的片段；嵌合抗体，其中，Fc、FR、CDR1、CDR2或轻链CDR3区被一些人类或其它非人类的同源序列替换；嵌合F(ab’)₂片段抗体，其中FR、CDR1、CDR2或轻链CDR3区被一些人类的或非人类的同源序列所代替；嵌合Fab片段抗体，其中的FR、CDR1、CDR2或轻链CDR3区被人类的或其它非人类的同源序列替换；以及嵌合Fd片段抗体，其中的FR、CDR1和/或CDR2区域被人类的或非人类的同源序列所代替。本发明也包括所谓的单链抗体。

本发明包括了多种大小和类型的多肽，它们可以特异地与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽相结合，以及与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽和它们的结合配对物的复合物相结合。这些多肽可以通过天然资源获得，而不是通过抗体技术。比如，这些多肽结合试剂可以由简并肽文库提供，这种文库可以容易地被制备成溶液或固定形式，也可以制备成噬菌体表面呈现抗体库。合成肽组合文库也可合成包括一个或多个氨基酸的肽。文库也可以是合成具有肽与非合成肽部分的文库。

噬菌体呈现(display)技术可以特定高效的确定发明的结合肽。简言之，制备的噬菌体抗体库(使用m13，fd或lambada噬菌体)，使用常规的处理可以呈现插入的4到约80个氨基酸残基。比如这种插入是可以代表一个全简并或不对称的阵列。这样就可以选择载噬菌体的插入与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽结合。这一过程可以通过几轮的反复筛选与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的结合的噬菌体重复进行。重复的过程导致了载有特定序列的噬菌体的富积。通过DNA测序分析可以确定表达肽的序列。这样就可以确定出一个可以与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽结合的最小的线性序列部分。我们可以用一个不对称的文库来重复这一过程，该文库中含有全部或部分的最小线性部分的插入，在它的上游或下游再加上一个或多个简并残基。酵母的双杂交体系扫描方法也可以用于确定与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽相结合的多肽。这样，本发明的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或者其片段可以用于扫描肽文库，包括噬菌体呈现文库，从而确定和选择本发明ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的肽结合配对物。这些所述的分子是可以被用来进行筛选测定，进行纯化，用与直接抑制ASP-1、ASP-2或I-ASP的功能以及用于本领域技术人员熟悉的其它目的。

本发明也包括ASP-1、ASP-2或I-ASP的cDNA序列在表达载体中的应用，它们被转染到寄主细胞或细胞系，包括原核的(如大肠杆菌)或真核的(如CHO，COS，酵母表达系统以及在昆虫中的重组杆状病毒)。除了在哺乳动物如人、鼠、大颊鼠、猪、山羊，灵长动物等的细胞中有用外，它们也在广泛的多组织型中起作用，包括原生细胞及细胞系。特别的例子包括角质细胞，外周血白细胞、纤维原细胞，骨髓干细胞和胚胎干细胞。表达载体是需要相关序列的，上述的核酸序列连入到一个启动子。

本发明还包括转基因非人类动物。在这里，“转基因非人类动物”包括具有一个或多个外源核酸分子整合到生殖系细胞和/或体细胞的非人类动物。这种转基因动物包括具有通过同源重组得到的纯合或杂合基因裂变的剔除(knockout)动物，以及具有游离的或染色体整合的表达载体的动物。剔除动物可以通过现在熟悉的胚胎干细胞同源重组制备。这种重组可以通过cre/lox系统或其它本领域技术人员熟知的的重组酶系统而实现。在某些实施方案中，重组酶系统本身是依赖条件表达的，比如在特定组织或细胞型中在胚胎或胚胎发育后期的特定阶段，由于外源的复合物诱导表达的增加或减少等。一般来说，在这种系统中使用的条件表达载体使用不同的启动子来控制所要的基因表达模式(比如时间或空间的)。条件型启动子也被连接到ASP-1、ASP-2或I-ASP的核酸分子上，从而以一种可调控的或条件倚赖的模式提高这些核酸分子的表达。一些对于ASP-1、ASP-2或I-ASP活性或表达进行反式作用的负调控子也被连入上述条件性的启动子。这种反式作用的调空子包括反义核酸分子，编码显性抑制分子的核酸分子，以及对ASP-1、ASP-2或I-ASP核酸特异性的核糖酶分子等等。这些非人类转基因动物对于指导由于提高或降低了的ASP-1、ASP-2或I-ASP表达所形成的症状的诊断或治疗效果的生理生化作用实验是很有帮助的。其它用途对本领域技术人员来说是明显的。

本发明也关注基因治疗，体外基因治疗在美国专利5,399,346中有所概括，以及提交的专利案卷历史中，它们是公众可得到的。它包括在体外为含有缺陷基因的个体细胞中引入一个该基因的功能性拷贝，并且再将这个经遗传工程处理的细胞送回到该个体中。该基因的功能性拷贝由一调控元件控制，使得该基因在所述遗传工程细胞中得以表达。大量的转染和转导技术以及适当的表达载体对本领域技术人员是很熟悉的，其中某些描述于PCT申请WO95/0654。使用载体如腺病毒、反转录病毒、疱疹病毒以及靶向脂质体在体内的基因治疗也是基于这一发明。

本发明还提供了一种高效的鉴定在ASP-1、ASP-2或I-ASP调节细胞功能水平上具有活性的药理试剂或为可作为该试剂活性化合物。该功能特别之p53的结合活性及凋亡。一般来说，这种筛选方法包括确定化合物与ASP-1、ASP-2或I-ASP互作活性，包括p53的结合等，尽管该方法也用来测定可以增强ASP-1、ASP-2或I-ASP的活性的化合物。该方法也适于进行自动化和高通量的化合物的筛选。这种通过筛选方法对药理试剂检测的靶治疗指示只限于那些靶细胞功能与通过改变含ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或其片段以及一种或多种天然的ASP-1、ASP-2或I-ASP细胞内结合靶(如p53)的复合物的形成有关的情形。靶的指示信号包括凋亡。

本发明还提供了药理试剂的多种检测，包括标记的体外蛋白-蛋白检测，电泳位移检测，免疫测定，基于细胞的二维或三维杂交扫描检测，表达检测等。杂交扫描用于是由于检测转快速测定与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或片段与特定内靶细胞相结合的转染核酸的效率。转染的核酸可以编码，比如组合肽文库或反义分子。常规的检测试剂比如GAL4融合蛋白是本领域熟知的。可以效法基于细胞水平的检测，将融合到GAL4 DNA结合区的编码ASP多肽的核酸，和以与融合到转录活性区如VP16的ASP互作的编码p53区域的核酸，转染细胞。该细胞也包含了连入基因表达调控区中的报道基因，比如一个或多个GAL4结合位点。当ASP以及p53融合多肽结合后，GAL4 DNA结合域就与VP16的转录活性区相互靠近，报道基因的转录被激活，从而引起报道基因的转录。调节ASP多肽介导细胞功能的试剂多肽可以通过报道基因的表达变化而被检测出来。鉴定报道基因表达变化的方法是本领域的常规技术。

当ASP-1、ASP-2或I-ASP片段不是通过转染的核酸生产出来时，它们在本发明方法中是作为一个分离的多肽被加入检测混合物中。尽管这ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽也可以通过生物抽提出来，但优选是由重组产生。重组产生的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽包括含有与其它多肽融合的ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽的嵌合蛋白，比如可以提供或加强蛋白间结合，序列特异的核酸结合(如GAL4)，加强ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽在检测条件下稳定性或提供可检测的部分，如GFP或Flag抗原决定簇标记蛋白的多肽。

检测混合物中包括天然的细胞内的ASP结合靶，比如p53或者可以和ASP互作的片段。可使用天然ASP结合靶蛋白，经常是使用其部分(如肽或核酸片段)，或者其类似物(主要是为进行检测目的而模仿了天然结合靶的ASP结合特性)，只要所述部分或其类似物在检测中，提供与ASP片段可测的亲和性和亲合力。

检测混合物中还包括一些候选的药理试剂。典型地，用多种检测混合物与不同浓度的试剂平行试验得到各种浓度下的检测效果。一般，我们选用其中的一个浓度作为负对照，即试剂低于检测限的浓度或零浓度。这些候选试剂包括各种化学物质，特别是有机化合物。优选地，这些侯选药理试剂是分子量较小的有机化合物，即大于50而小于约2500，优选小于约1000，较优选小于约500。候选试剂包括具有可以与多肽或核酸进行互作的必须的化学官能团，典型地包括至少胺，羰基，羟基或羧基，优选至少两个化学官能团，较优选为至少三个化学官能团。这些药理试剂可以包含有碳环或杂环结构，和/或由一个或多个上述提及的的官能团取代的芳环或多芳环结构。候选试剂也可以是一些生物分子，比如：肽、糖类、脂肽酸、甾醇、类异戊二烯、嘌呤、嘧啶，其衍生物或其结构类似物，或它们的结合物。如果所述试剂是核酸，则一般是DNA或RNA分子，也可是在此定义的经修饰的核酸分子。

候选试剂可以从多种来源中获得，包括人工合成的和天然的化合物文库。例如，通过多种随机或特定的有机化合物和生物分子的合成来获得，包括随机寡核苷酸的表达，合成的有机组合文库，随机肽的噬菌体呈现文库等。天然化合物包括细菌、真菌、动物和植物的抽提物的文库是可得到的，也是容易制备的。此外，这些天然的或合成的文库或化合物可以通过常规的化学、物理或分子生物学手段加以修饰。还有，可以通过直接或随机化学修饰这些药理试剂生产其结构类似物，例如，酰基化，烷基化，酯基化，酰胺化等。

其它的试剂也可包括在混合物中。它们包括盐、缓冲剂、中性蛋白(如清蛋白)、清洁剂等，将利于优化蛋白-蛋白互作或蛋白与核酸互作。这些试剂会减少反应组分的非特异性和背景反应。提高检测效率的另外试剂，如蛋白酶抑制剂，核酸抑制剂、杀菌剂等诸如此类的物质也可使用。

前述检测物质的混合物物都是要依据条件进行孵育，由此除了提到的候选药理试剂，ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽与细胞结合靶或其部分或其类似物的特异结合。加入组分的顺序，孵育时间、温度以及其它检测参数可以容易地预先确定。该实验方法仅包括参数的最优化而不是指检测的基本组成。孵育温度从4℃-40℃。孵育时间优选为最小化以方便快速的高通量检测，典型地为0.1-10小时。。

在孵育完成以后，可以通过任何对使用者方便的常规方法检测ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽与一个或多个结合靶特异结合存在与否。对于细胞自由结合型检测，需要增加一个将结合与未结合组分分离开的分离步骤。这种分离工艺可以通过多种方式完成。方便的是将至少以种族分固定在固体基体上，这样，非结合部分就很容易被分离掉。这些固体基体可以由不同的材料制成不同的形状，象微孔板、微珠、量液棒、树脂颗粒等。它们的选材主要基于最大的信燥比，较小的背景结合，从而利于分离且成本低。

分离方法要受因素的影响，比如从样本池中移除微珠或量液棒，清除或稀释样本池，比如微空板孔、沉淀微珠、颗粒，层吸柱或以洗液或溶剂过滤。分离步骤优选包括多步的沉淀和清洗。比如固体基是微孔板，可以用含有不参与特异结合的如盐、缓冲液、去污剂和一些非特异性蛋白的常规孵育组分的洗液洗板孔若干次。如果固体基是磁珠，它可以用洗液漂洗一次到数次，并用磁铁吸附分离。

对于细胞基检测可用任何常规的方式进行，如双式三杂交扫描。在ASP-1、ASP-2或I-ASP与靶分子作用的报道基因转录检测中引起的转录典型地编码直接或间接可检的产物，如β-gal的活性，荧光素酶的活性等等。对于细胞自由结合检测中，组分之一常包括或耦合到一个可检测的标签。现在有多种标签可供选用，比如直接检出的(如放射性、荧光、光密度或电子密度等)；或间接检出的(如抗原决定簇标签，象FLAG抗原决定簇标签，酶标记标签如辣根过氧化物酶等)。这些标记需要可以与ASP-1、ASP-2或I-ASP的结合配对物相结合，或者整合到其结合配对物结构中。

对于标签检测有不同的方法，主要是基于标签及其它检测组分的性质。例如这些标签当与固体基质结合或分离后可被检测出来。标签可以通过光密度或电子密度直接检测，直接检测放射性的放射量或非放射的能量转移等。当然，也可以通过间接手段检测，如抗体偶联，链霉素和生物素偶联等。这些都是常规技术。

本发明提供ASP-1、ASP-2或I-ASP特异结合试剂，鉴定以及制备这些试剂的方法，它们在诊断、治疗和药物研究中的使用。例如ASP-1、ASP-2或I-ASP特异药理试剂可用于多种诊断和治疗中，特别是对于涉及到有关ASP通路的不适使用相关的疾病或疾病预防，比如细胞凋亡等。新的ASP-1、ASP-2或I-ASP的特异结合试剂包括ASP-1、ASP-2或I-ASP特异结合抗体或其它天然的细胞内结合试剂。通过双杂交的方法检测，对于非天然的细胞内结合试剂通过化学文库的方法来确定。

一般来说，ASP-1、ASP-2或I-ASP与一种结合试剂的结合的特异性常表现出一个稳定的结合常数。对于与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽选择性结合靶的稳定常数至小浓度约10⁷M^-1，优选是至少约10⁸M^-1，最好约10⁹M^-1。多种基于细胞和无细胞检测可用于体现ASP-1、ASP-2或I-ASP的特异结合。基于细胞的检测包括其中ASP-1、ASP-2或I-ASP介导转录的抑制或升高的一、二或三杂交扫描。无细胞检测分为ASP-1、ASP-2或I-ASP蛋白结合检测和免疫测定等。其它用于筛选与ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽结合的试剂的检测包括荧光共振能量转移(FRET)和凝胶阻滞电泳分析(EMSA)。

根据是否将核酸导入到宿主体内或体外，使用了不同的技术将本发明的核酸导入细胞。所述技术包括磷酸钙-核酸共沉淀转染，与DEAE相关的核酸转染，与包含目标核酸的反转录病毒相关的转染，脂质体介导转录等多种方法。对于特定的用途，优选将核酸导入特定的细胞。在此情况下，通过本发明的核酸导入到细胞(如反转录病毒或其它病毒，脂质体)中的载体可具有一个附在其上的靶定分子。例如靶细胞上对表膜蛋白特异识别的抗体分子或靶细胞受体的配体可以被结合到或整合入核酸传送载体。例如，当脂质体被用来导入本发明的核酸时，与内吞相关细胞膜蛋白结合的蛋白可被整合入脂质体的结构中，以便实现靶定和/或方便进入细胞。这些蛋白包括对特定细胞型有向性的衣壳蛋白或其片段，蛋白内循环的抗体，细胞内定位蛋白以及延长细胞内半衰期的蛋白等。如本领域技术人员熟知的，聚合物传送系统已成功地将核酸传递如细胞。应用该系统，甚至通过口服也可传送核酸。

当给药时，本发明的组合物以药物学上可接受的制剂形式给药。这些制剂通常药物学上可接受浓度的盐、缓冲剂、防腐剂、相容介质，以及有免疫辅助能力的试剂如佐剂、细胞因子，及任选的其它治疗试剂如化疗剂。

本发明的治疗剂可以通过常规的方法给药，如注射或逐级渗透。也可以通过口服、静脉注射、腹腔注射、肌肉注射、心内注射、皮下注射或脑内注射。如果是用抗体进行治疗，优选采用肺喷雾的方法给药。这种制备含抗体气雾剂传递系统对本领域技术人员是一种成熟技术。通常，这种系统必须使用不会显著降低抗体的生物学活性的组分，如抗体决定簇的结合能力(Sciarra & Cutie，气雾剂，Rimington′s PharmaceuticalScience，18版，1990，pp1694-1712)。本领域技术人员无需额外的实验，便可容易地决定生产抗体气雾剂的参数和条件。当使用本发明的反义制剂时，缓慢的静脉给药是优选的。

本发明的组合物以有效量给药。“有效量”是指组合物单独或与其它药剂使用时得到预期效果。在治疗特定疾病如癌症的情况下，预期的效果是抑制疾病的恶化。它可包括暂时性的减缓疾病的发展，更好的是永久阻止疾病的发展。这可以通过常规方法监测或用本发明涉及的诊断方法监测。

当然，这种剂量是依赖于治疗的特定病症，病症的严重程度，患者的自身状况(包括年龄、身体状况、身材及体重等)，治疗周期，共治疗的情况(如有)。给药的特定途径以及医护人员的专业知识及技能。这些因素都是本领域的常规技术，不需要更多的实验即可获得。一般最优选择是使用单组分或联合组分的最大剂量，其最高的安全剂量遵从医嘱。然而本领域技术人员可以理解，基于药学、心理学或其它可能的原因，患者可以持续使用较低的剂量或可允许的剂量。

前述的方法中所用的药物组合物优选经过无菌的，在适合于患者给药的重量剂量或体积剂量中含有有效量的ASP-1、ASP-2或I-ASP或编码ASP-1、ASP-2或I-ASP的核酸，以产生预期效果。这种效果如可以通过这里描述的报道系统来检测ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物对信号转导的增强还是抑制；通过检测象基因表达等下游效果；或检测ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物的生理效果，如肿瘤的抑制、病征的减弱及调控凋亡等。与之相似，反义的ASP-1、ASP-2或I-ASP分子用于检测用反义组合物处理的细胞内个体基因的表达。其它很多测定对本领域技术人员是已知的并可对用来检测反应(效果)。

ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或核酸对个体的使用剂量根据不同的参数选择，特别是与使用方式及个体的状态相关。其它的因素包括预期要进行治疗的时间。如果初始使用的剂量效果不很显著，在患者可以忍受的范围内，可使用较高剂量(或是有效高剂量，通过不同的多个传递途径)。

一般来说，ASP-1、ASP-2或I-ASP以现有技术中任意的标准方法形成制剂，并以1ng-1mg剂量给药，优选范围为10ng-100μg。在使用编码ASP-1、ASP-2或I-ASP的核酸或其变异体时，按照标准方法制剂成1ng-0.1mg剂量给药。其它ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物的给药方案对本领域技术人员是已知的，其中剂量、注射时间、注射部位、注射方式(如肿瘤内注射)等，依据前述变化。除了在人体上应用外，ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物还应用于其它哺乳动物，以进行实验或兽医治疗的目的，可基本上按上述条件进行。施用对象是哺乳动物，优选是人类，此外还包括非人类的灵长类、牛、马、猪、绵羊、山羊、狗、猫及啮齿类动物。

在给药时，本发明的药物制剂以药物上可接受的剂量和药物上可接受组合物形式应用。术语“药物(上)可接受的”是指没有毒性成分，它不会干扰活性成分的生物活性效果。所述制剂通常含有盐、缓冲剂、防腐剂、相容载体和任意的其它治疗剂。作为药物使用，要求盐是药物可接受的，非药物可接受的盐可以用于配制成药物可接受的盐，它们也属于本发明的范围之内。这样的药理和药物可接受的盐包括，但并不限于，由以下的酸制备的那些：盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、顺丁烯二酸、乙酸、水杨酸、柠檬酸、甲酸、丙二酸、琥珀酸等。药物可接受的盐也可制成碱金属或碱土金属盐，如钠、钾或钙盐。

如果有必要，ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物可以与药物可接受的载体相结合。这里使用的术语“药物可接受的载体”是指一种或多种相容的固体或液体填充剂，稀释剂或成胶囊物质，它们适宜对人类给药。术语“载体”是指由有机或无机成分，天然或合成的，可以与活性成分相结合并方便使用的物质。药物组合物的成分也可与本发明的分子共混，或相互混合，但不会导致各成分的相互作用而减弱预期的药物活性。

药用组合物可包括适宜的缓冲液，包括其盐中的醋酸、其盐中的柠檬酸、其盐中的硼酸及其盐中的磷酸等。

药用组合物可任意包括适宜的防腐剂，如杀藻胺、氯丁醇、对羟基苯甲酸酯及乙基汞硫代水杨酸钠。

药用组合物可方便的使用单位剂量形式，可以用制药技术中任意已知的方法配制。所有方法都包括把活性物质与由一种或多种作为附加成分的载体结合。一般来说，这些组合物通过将活性化合物与液体载体、细分的固体载体、或两者混合形成均一的混合物，如果有必要，还可形成特定形状的产品。

那些适合口服给药的组合物可以为各种单位，如胶囊、片剂、锭剂等，它们均含有预定量的活性化合物。其它组合物有水中悬浮液或非水液体如糖浆、药酒或乳剂。

对于适合于胃肠外给药的组合物方便包括ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或核酸无菌水或非水的制剂，优选与受者血液等渗。所述制剂使用适当的分散剂或湿润剂或悬浮剂根据已知方法配制。无菌的可注射制剂也可是由无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂如1，3-丁二醇中制成可注射的溶液或悬浮液。在可接受的载体中，可以使用水、林格液及等渗的氯化钠溶液。此外，无菌固定油也可以作为溶剂或悬浮介质。为此目的，无刺激性固定油也会被利用。如单或二甘油脂。此外一些脂肪酸如油酸也可被用于制备注射制剂。适合于口服、皮下注射、静脉注射、肌肉注射的载体制剂的给药参见Rimington’s Pharmaceutical Science，MackPublishing Co.，Easton，PA。

本发明的另一方面，ASP-1、ASP-2或I-ASP多肽或核酸用作生产调控细胞凋亡的药物。这些药物装入小瓶或试剂盒以便治疗个体使用。在某些实施方案中，其它的具有相同效果或影响ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物的药剂都可以放入该试剂盒，比如一些化疗剂。试剂盒包括说明书或其它说明怎样以试剂盒中的ASP-1、ASP-2或I-ASP组合物和任何其它组分给药的打印材料。

通过下面的具体实施例和图表示例性阐述本发明的实施方案。

图1A代表ASP-1的DNA序列；图1B代表ASP-2的DNA序列；图1C代表ASP-1的蛋白序列；图1D表示ASP-2的蛋白序列；图1E是ASP-1的基因组图谱。

图2A代表ASP-1的mRNA的Northern印迹结果；图2B为ASP-2的mRNA的Northem印迹结果；图2C为ASP-1及ASP-2的mRNA的northern印迹结果，以及作为对照的肌动蛋白的mRNA的northern印迹结果

图3A为GST-53BP的重组GST-53BP SDS聚丙烯酰胺凝胶的考马斯亮兰的染色结果；图3B为ASP-2的单克隆抗体DX54.10的western印迹结果；图3C为ASP-2的western印迹结果。

图4A代表ASP-2与p53的western印迹结果；图4B为ASP-2/Bbp2质粒的DNA序列的部分；4C示意了ASP-2与ASP-2/Bbp2的分子量差。

图5A显示不同的p53特异启动子在p53、ASP-1和ASP-2结合条件下刺激作用；图5B为ASP-1和ASP-2对p53转活性的影响。

图6代表ASP-1和ASP-2对PIG-3启动子的激活，包括各种截断的ASP多肽表达的western印迹结果。

图7A为ASP-1和ASP-2协同p53蛋白的凋亡功能；图7B为ASP-2对p53蛋白的凋亡功能的协同作用；图7C为含有C端的半个ASP-2表现了对p53蛋白凋亡功能的抑制影响；图7D为ASP-2协同p53、p73和p63的凋亡功能。

图8A为ASP-1、ASP-2或I-ASP的同源比较。Saos-2细胞用载体、p53(5μg)、I-ASP(10μg)或p53+I-ASP转染，然后共同孵育16小时。细胞在NP40溶解缓冲液和1000μg的Saos-2细胞溶胞产物中溶解，用于与结合在谷光甘肽珠上的I-ASP多克隆抗体进行免疫共沉淀。使用兔子的多抗p53抗体CM1通过抗原抗体复合物的western印迹检测p53的存在；图8B中，Saos-2细胞用ASP-1(8μg)或ASP-2(4μg)，I-ASP(5μg)和p53(50ng)转染。40μl的相应在10％的胶中电泳。用V5抗体检测ASP-1，用DX54.10检测ASP-2，I-ASP由鼠的抗I-ASP抗体检测，p53由DO1检测，PCNA由抗PCNA抗体检测(图8E)；图8C显示由ASP-1或ASP-2诱导的p53的凋亡功能，I-ASP抑制p53诱导凋亡功能；图8D显示ASP-1和ASP-2激活及I-ASP抑制p53应答启动子，Bax。

图9A代表在表达p53(1μg/10cm碟)或p53181C(1.6μg/10cm碟)或p53181L(2μg/10cm碟)的Saos-2细胞在ASP-1(10μg/10cm碟)或ASP-2(10μg/10cm碟)是否存在的条件下含有sub-G1DNA含量(凋亡细胞)的细胞百分数。图9B表示在Saos-2细胞中，ASP-1或ASP-2(分别为8和4μg)对p53及它的两个突变体的转录激活活性的影响，p53(50-75ng)或p53181C(50ng)或p53181L(50ng)对报道基因Bax-luc的转录激活。在有ASP-1或ASP-2存在的条件下，不同的p53结构的转录激活活性是只存在p53的不同构建体时的两倍；图9C为40μl的转录溶胞产物与用抗-p53(DO1)，抗ASP-2(DX54.10)及抗ASP-1(V5)抗体检测的蛋白的western印迹结果。

图10表示I-ASP的DNA序列。

图11表示I-ASP的蛋白序列。

图12表示ASP家族在体内对p53的凋亡功能的高度调控。U2OS和MCF-7是野生型p53蛋白细胞表达系，用表达蛋白的质粒转染，可以和细胞表面标记子的CD20(A-E)一同显示。这种转染的细胞通过FACS鉴定分析。条状图显示了含有sub-G1这种凋亡特征DNA的转染细胞的百分比。产生ASP-1、ASP-2或I-ASP的反义RNA的质粒标记为α-ASP-1、α-ASP-2或α-I-ASP。人HPC16的病毒致癌蛋白E6记为E6。图12B、12D中细胞是由质粒转染。然后，这些转染了的U2OS和MCF-7细胞在含有抗癌药物顺铂浓度为5和3μg/ml的培养液中培养。30小时后，收集细胞进行分析。对F和G，U2OS和MCF-7细胞都是由表达蛋白的质粒转染的。细胞固定后，通过两次免疫荧光标记，图12G中显现出ASP或p53与内源的Bax或mdm2的共表达。图12F是200个U2OS或MCF-7只转染载体或ASP质粒，用于检测过量的内源Bax的过量表达。条状图是至少三次独立实验的平均结果。

图13A表明ASP家族成员与p65、IkB和p53的互作。图13B是在Saos细胞中表达或共表达编码ASP-2，IkB及p53诱导凋亡的状况。图13C和13D表明IkB在ASP-2存在或不存在的条件下，对p53蛋白在Bax及mdm2启动子上的转录激活功能的调节能力。

图14A图示为野生型p65与删除突变Δp65对报道报道质粒NFkB的转录激活能力；图14B图示表达或共表达p53、ASP-2、p65及Δp65对细胞的诱导凋亡。

图15A图示Bc1-2对ASP-1及ASP-2在p53H175-L诱导凋亡的刺激抑制能力。图15B图示Bc1-XL对ASP-1及ASP-2在p53H175-L的无效抑制；图15C说明Bc1-2对通过ASP-1、ASP-2进行的p53诱导凋亡的抑制作用。

图16说明I-ASP对E7的转换功能的增强；图16B说明I-ASP增强细胞对顺铂的抵抗作用。

表1代表从40对正常的及I级和II级表达野生型p53的乳腺瘤中获得的RNA样本，并对其进行ASP-1、ASP-2或I-ASP的mRNA表达情况进行的汇总。

实施例1

为了了解ASP家族如何在体内行使功能，我们使用northern印迹的方法对表达ASP-1和ASP-2的组织进行区别并加以研究。如图2A和2B，ASP-1和ASP-2的mRNA在人的所有组织中均有表达，是一条5.5-5kb的特异转录带，但是ASP-1和ASP-2的表达量有所不同。在心脏、骨骼肌及肾脏中ASP-1和ASP-2都有最高的表达。有趣的是，ASP-1和ASP-2的表达方式有一些小小的不同。ASP-1在心脏有高水平的表达，比在骨骼肌及肾脏中要高出许多。而ASP-2在心脏、骨骼肌及肾脏中的表达水平是相似的。此外，在人的肝脏组织中也可以检测到ASP-1的高水平的表达。实施例2

已知ASP家族成员在其mRNA水平上具有特异组织分布模式，重要的是研究如何控制它们在蛋白水平上的表达。我们使用GST融合蛋白产生对ASP-2的抗体。将ASP-2跨过第698-1135氨基酸的编码区亚克隆到细菌表达质pGHX2TK的EcoR I位点。这样，74kDa的GST-ASP-2(698-1135氨基酸)的蛋白产生了(如图3A)。用GST-53BP2蛋白免疫兔子和小鼠。从兔子和小鼠中获得的抗血清用转染了表达ASP-2片段的质粒pCMV Bam neo ASP-2/53BP2(607-1135)的Saos-2的细胞裂解液进行检测。pCMV Bam neo ASP-2/53BP2(607-1135)是由包括抗原决定簇9E10的ASP-2的PCR产物插入到Bam HI的位点构建而成的。通过转染表达ASP-2或对照质粒的Saos-2细胞裂解液进行检测。兔子的多抗pAbASP-2/77及小鼠的单抗DX54-10与DX54-7被鉴定出来，如图3B所示。小鼠的单抗DX54.10不与GST发生交叉反应，只是识别Saos-2裂解液中的ASP-2。DX54.10只是识别转染ASP-2或GST-ASP-2而对GST-p27融合蛋白不与识别。说明其对ASP-2的识别是特异的。

由于单抗对Saos-2细胞中转染产生的ASP-2有特异的识别，使得我们可以在第一时间对内源表达的ASP-2进行研究。为了确定与抗体结合的反应带确实是内源ASP-2，用抗体DX54.10上清液与结合到谷光甘肽珠上的GST蛋白或GST-53BP2蛋白进行反应，将这些珠在DX54.10的上清液中在转轮上孵育1小时，然后弃去旧珠，换用新珠，如此反复3次。图3C显示了转染的ASP-2/53BP2片段(607-1135)及其与上述的与珠孵育过的上清液进行反应，其中出现了特异条带的的孵育GST珠的上清液而不是孵育GST-ASP-2珠的上清液。这表明DX54.10与293个细胞及Tero细胞全裂解液中特异识别的蛋白是内源的ASP-2，并且DX54.10对该蛋白有特异识别的功能。实施例3

使用上述的抗ASP-2抗体，我们主要通过外源蛋白表达研究体内的p53是否与ASP-2互作。将表达质粒转染入Saos-2细胞，并使用抗ASP-2抗体DX54.10及对照抗体pAb423(一种对SV40巨T-抗原的抗体)与之进行免疫共沉淀。如图4A，通过western印迹分析首次显示了p53与ASP-2的免疫复合物，表明体内p53与ASP-2是互作的。这种互作是特异的，因为对照抗体并没有显示p53或ASP-2。在该图中有一个矛盾的地方就是内源的ASP-2与转染的ASP-2(现在知道是bBP2(130-1135))蛋白在SDS PAGE的位移不同，其中一个可以解释的原因是基于bBP2的序列，在它的序列中有两个潜在的ATG密码子，表现为其cDNA为571和757。其中757的密码子是在体外的转录-翻译共同进行中使用的，其编码蛋白大小为1005个氨基酸。而表达质粒53BP2/bBP2cDNA就是以757的密码子作为起始进行构建的(Naumovski and Cleary，1996)。但是，基于图4A的结果，事实上蛋白在体外的转录并不是从757的密码子开始的。将bBP2的5’端进行网上比对(BLAST search)发现bBP2的412bp-514bp与载体有很高的同源性。通过对ASP-2/bBP2质粒重新测序，我们发现这样的序列并不存在于4B的图中。因为在bBP2的412bp-514bp的区段中有终止密码而在该部分序列中没有，这使我门认为ASP-2的启动位点在上游的757位。通过与老鼠的ASP-2进行比较(用人的ASP-2的cDNA筛库得到)，我们认为ASP-2的起始点在新的ASP-2的cDNA的246bp。这使得ASP-2是一个具有1135个氨基酸较大的内源蛋白。

为了深入研究，含有两个ATG起始位(412bp-514bp)的53BP2/Bbp2cDNA克隆到哺乳动物表达载体pcDNA3中。最终的pcDNA3-ASP-2/bBP2质粒(1-1135)被转染到Saos-2细胞并表达内源和外源的ASP-2，并被其抗体DX54-10检出。如图4C所示，pcDNA3-ASP-2表达产物ASP-2的分子量与内源的ASP-2相同。从此结果，我们认为内源的ASP-2使用第一个ATG，并且全长包括1135个氨基酸。依此结果，我们很有必要定义一下克隆的名称以与它们的实际序列相对应。ASP-2是代表具有全长1135个氨基酸的蛋白。ASP-2/bBP2与ASP-2/53BP2分别代表130-1135及607-1135氨基酸的蛋白。

此外，如图4A所示，内源的ASP-2或ASP-2/bBP2都可以在体内与p53互作。实施例4

p53是一个转录因子，它所转录激活的靶基因包括mdm-2，Bax以及cyclin G，并且数目成上升势头。最初分离ASP-2/53BP2在某种程度上是作为一个抑制p53的因子，因为它可以抑制p53的DNA靶定活性，主要是因为它可以在体外与p53的DNA靶定中心相结合(Iwabuchi等.，1993)。所以对于p53，ASP-2/53BP2可以是细胞内的SV40肿瘤病毒的大抗原等同物。所以有人预测ASP-2应该有致癌基因的活性。但是ASP-2/53BP2的行为却表明它对肿瘤的抑制生长的作用比促进活性要强(Naumovski and Cleary，1996)。这种差异可被归结到最初的ASP-2/53BP2克隆只具有C-端部分的蛋白。很可能是从C-末端开始到全长的ASP-2蛋白对p53蛋白具有不同的功能。我们也不清楚ASP-1对p53蛋白有什么影响。

为了揭示ASP家族成员对p53活性产生的影响，我们首先研究了在转录报道基因检测中的依赖p53的转录活性。将五个p53报道质粒转入对p53无反应的细胞中，它们是由p53的启动子中得到的靶定基因：mdm-2、Bax、cyclin G和p21 Waf-1以及一个合成的启动子结构PG并启动荧光素酶的表达。通过体外DNA结合实验及对突变p53的转录激活功能的研究，将一些已知的与p53靶定的结合位点分为两类(Ludwig et al.，1996)。类Bax位点对p53的转录刺激很弱，而类mdm2位点可以被p53高效刺激。有趣的是，与p53共表达ASP-1或ASP-2将使p53对Bax启动子的刺激增强10-50倍。与之对应的是，与p53共表达ASP-1或ASP-2对mdm2及cyclin G的启动活性的刺激是非常平和的(图5A)。

ASP-2/53BP2对mdm 2及cyclin G启动子没有刺激作用，对p21Waf-1及PG的作用也是很弱的。

ASP-2/53BP2可以特异的激活Bax启动子活性而不是mdm2第一次表明p53特异启动子是可以在细胞内进行调控的。由于Bax是p53前细胞凋亡的靶基因，我们不禁要问是否ASP家族可以特异性的刺激那些已知的启动细胞凋亡的p53靶基因的转录活性。PIG-3就是这样的一个基因。通过瞬间转染报道基因的检测，如图5A，我们可以实现ASP-1和ASP-2对PIG-3转录活性的特异性调控。

最近表明，p53的转录激活功能可以被一个常规的转录辅激活蛋白激活。这引起我们极大的兴趣，是否ASP家族成员也象p300/CBP类蛋白一样，并不只对p53特异，而是可以激活大量的转录因子。其中被验证的一个转录因子是E2F1。象p53一样，E2F1的转录激活功能可以被p300/CBP的共表达所激活。但是与p300/CBP共表达ASP-1或ASP-2不能激活几种已知的报道启动子的转录激活功能。包括cyclin A、b-myb以及合成的启动子3xwt(图5B)。这一结果表明ASP-1和ASP-2特异性的调节p53的转录激活功能。既然这个常规的转录激活蛋白p300/CBP可以结合并刺激p53和E2F1的转录激活功能，这暗示了ASP-1和ASP-2二者都可以独立地刺激p300/CBP所刺激的p53的转录激活功能。实施例5

我们知道共表达ASP可以特异性的刺激p53的转录激活功能，那么确定具有活性的ASP所需的最小区域就是很重要的。我们使用了三种版本的ASP-2来鉴定它们对于p53的转录激活功能的影响差异。正如预料的，全长的ASP-2(1135aa)可以刺激p53的转录激活功能达7倍，有趣的是，共表达(1105aa)只刺激p53的转录激活功能达2倍，此外共表达ASP-2/53BP2(607-1135aa)减弱了刺激p53的转录激活功能达50％(图6)。ASP-2/bBP2的这种减弱并不是由于表达不足(图6A)，这是由于ASP-2/bBP2只缺少了ASP-2前面的130个氨基酸所导致的。这些数据表明全长的蛋白对于ASP特异性的刺激p53的转录激活功能是必须的。ASP-2/53BP2的刺激p53的转录激活功能的减弱表明它可以作为一种显性抑制突变抑制ASP-2的刺激p53的转录激活功能的活性。实施例6

ASP-1和ASP-2有特异的刺激p53在Bax和PIG-3启动子的转录激活功能，可以预料，当ASP-1和ASP-2共表达可以增强p53的诱导细胞凋亡。我们假设如果ASP-1和ASP-2的刺激p53的转录激活功能是经它们自身实现的，那么它们自己将对Bax凋亡功能的影响是很微弱的。我们在Saos-2细胞中验证我们的假设，并表达低水平的ASP-2，这种细胞是没有p53的。在这一实验中要检测p53的量，由于要通过滴定来检测，所以17％的转染的细胞凋亡了。我们通过共转染细胞表面标记子CD20来确定凋亡。有趣的是，单独表达ASP-1或ASP-2只引起低水平的凋亡，根据观察，单独的ASP-1或ASP-2只可以很弱的促进Bax启动子的活性，所以更可能的是ASP-1和ASP-2在p76和p63作用效果。共表达p53与ASP-1或ASP-2却导致了凋亡致死的细胞显著升高。接近50％的转染细胞死于凋亡(图7A)。这种增强凋亡的协同作用特异于p53，因为共表达E2F1与ASP-1或ASP-2只是导致了凋亡致死的细胞的百分比有一点提高(图7B)。

我们也使用ASP-2的突变体ASP-2/53BP2来验证ASP通过增强p53的转录激活功能从而刺激了p53的凋亡功能的假设。ASP-2/53BP2是用来在Bax启动子上抑制ASP-2的刺激p53的转录激活功能。并且希望当ASP-2、ASP-2/53BP2与p53共表达后p53的凋亡功能不会增强。事实就是这样的。当p53与ASP-2共表达导致了接近50％的转染细胞死于凋亡，但是当ASP-2、ASP-2/53BP2与p53共表达后，只有30％的细胞死于凋亡。这就说明ASP-2只可以通过增强p53的转录激活功能从而刺激了p53的凋亡功能(图7C)。

我们也研究了ASP对于p53家族成员，p73和p63，的凋亡功能的影响。结果示于图7D。共表达ASP-1或ASP-2可以增强p53家族所有成员的凋亡功能的影响。这说明ASP家族是一个新的肿瘤抑制家族。实施例7

最近分离到的一个序列reL相关抑制子(RAI)，它被确定为一个有315氨基酸的p65rel结合蛋白。它的与C端的半段ASP-1或ASP-2序列同源(图8A)。如ASP-2的突变体53BP2/ASP-2(600-1128)并表现如下特征。RAI没有ASP-1或ASP-2的α螺旋域但却有一个富含脯氨酸的区域，ankryin重复和SH3域。在RAI中也有ASP-2的与p53接触的残基。为了研究RAI，我们命名它为I-ASP，并将其编码区克隆到哺乳动物表达载体pcDNA3上。我们也合成了I-ASP中的肽段(RLQPALPPEAQSVPELEE)，该片段在ASP-1或ASP-2中没有相似序列。对这段肽的老鼠的特异抗体不与ASP-1或ASP-2发生交叉反应(数据未给出)。用该抗体与转染了I-ASP的Saos-2细胞免疫共沉淀结果表明I-ASP也可以与p53互作(图8B)。象ASP-2的突变体53BP2/ASP-2(600-1128)，单独表达I-ASP不会引起细胞凋亡。I-ASP与p53共表达则会引起轻微的p53的凋亡功能的抑制。当ASP-1或ASP-2与它们共表达时，I-ASP对p53的凋亡功能表现显著影响。在图8C中证实了这一点，共表达的I-ASP抑制了ASP-1或ASP-2引起的p53的凋亡功能的增强。当I-ASP与ASP-1或ASP-2共表达，I-ASP废除了ASP-1或ASP-2在Bax启动子的增强p53的凋亡功能的活性(图8D)。共表达I-ASP并不显著改变p53或ASP的表达水平(图8E)。这些结果说明在体内ASP-1和ASP-2的前-凋亡功能可以被天然的I-ASP所抑制。这种ASP-1、ASP-2和I-ASP表达水平的平衡决定了细胞的命运，比如生存还是死亡。实施例8

最近的研究表明一些p53的凋亡缺陷突变可以转录激活许多p53靶基因启动子，包括mdm2、p21waf1，但是对于前凋亡基因象Bax、PIG-3和IGF-BP3。在所有研究的p53的凋亡缺陷突变中，181L和181C备受关注。p53的181位残基的突变在人的许多肿瘤型中都有报道，包括乳腺癌和子宫癌。通过p53和53BP2的结晶结构，这个p53的181残基被确定为p53与53BP2的作用位点，该位点不是DNA作用位点。为了证实晶体结构的预言，前期实验表明181L和181C都可以结合DNA并且可与许多p53靶基因启动子结合，包括mdm2、p21waf1。但是有趣的是这两个突变的诱导凋亡的能力及抑制变形能力都下降。既然ASP与p53可以特异的增强p53的凋亡功能，我们假定181L和181C的减弱凋亡功能可能是基于在这两个突变上缺乏与ASP诱导凋亡的共同操作。我们检测了ASP与这两个来源于肿瘤的p53突变，181L和181C的凋亡诱导功能。如图9A所示，共表达ASP-1或ASP-2不能增强p53突变的凋亡功能，而在相同的实验中，共表达ASP则显著地提高野生型p53的细胞凋亡的功能。随后，我们也测试了ASP对p53反式激活功能的影响。与我们所观察到的突变的181残基能够影响ASP活化的p53介导的凋亡的能力相一致，ASP-1或ASP-2的共表达不能够刺激突变的p53、181C在BAX基因启动子区的反式激活功能。ASP对突变的p53和181L的影响也相似。ASP之所以不能激活p53突变体并非由于缺乏蛋白的表达。所有这些结果表明：ASP-1、ASP-2不能够刺激两种与凋亡前基因相关的两种p53突变体的反式激活功能可能提供了一种分子机制。在诱导的凋亡的过程中通过这种机制这两种突变的p53分子得到了保护。这也可以解释为什么在人类的一些肿瘤中，突变位点发生在p53座位上。这些结果还表明了ASP的共激活功能对于p53的肿瘤抑制功能的重要作用。实施例9.

在人类的肿瘤细胞中发现所有四种与p53部分相连的53BP2都发生了突变。我们知道ASP-1和ASP-2的表达可以显著地增强P53的凋亡功能。这表明：在人的肿瘤细胞中ASP-1、ASP-2的表达水平可以负调控野生型p53的表达。与此观点相符，通过基因排列分析发现在一种极度恶性的人乳腺癌细胞中ASP-2的表达降低了。为了提供进一步的体内证据，我们使用一种半量反转录PCR技术来分析一组配对的正常人的RNA及40个乳腺癌病人的肿瘤细胞RNA来研究ASP-1和ASP-2的表达情况。应该强调的是：40个乳腺癌细胞中都有野生型p53的表达。在人的乳腺癌细胞中ASP-1、ASP-2的表达水平经常降低(表1和图9D的代表数据)。在40个癌样品中24个表达了ASP-1，9个表达了ASP-2。有趣的是：8/9的肿瘤细胞在ASP-2表达减少的同时ASP-1的表达也减少。这种表达模式好象说明ASP-1的负选择压要高于ASP-2。这与受测试的40个乳腺癌病人的实际情况一致。在该实验中ASP-1的表达显著减少(大于75％的信号减少)或根本不表达的情况发生的频率要高于ASP-2，分别为60％和22.5％。鉴于同一个体中正常组织和癌组织ASP-1和ASP-2表达水平的显著差异，我们认为在肿瘤细胞中存在一种ASP-1、ASP-2表达丧失的选择优势。这些结果与我们前面观察到的现象也是一致的，ASP结合削弱的p53突变体181L和181C即使在ASP存在的情况下也不能有效地诱导凋亡。我们的实验支持这样的观点：在人类乳腺癌中ASP家族蛋白起抑制肿瘤生成的作用。

与ASP-1、ASP-2相比，在正常的及所测试的人乳腺组织中I-ASP的表达量通常要低。然而，与正常组织相比在8个肿瘤组织中发现了I-ASP的过量表达。更惊奇的现象是I-ASP的过量表达与ASP-1、ASP-2的正常表达相关连。在7种I-ASP过量表达的肿瘤中没有发现任何ASP-1、ASP-2表达的降低。这种结果支持I-ASP在体内上作为ASP-1、ASP-2的天然抑制物的生物重要性。实施例10

为了研究内源性的ASP家族成员在调控内源p53诱导的凋亡中的作用，我们把ASP-1、ASP-2导入表达野生型p53的两种细胞系中。当ASP-1、ASP-2在这些细胞中表达时可以诱发细胞的程序性死亡。从人类乳头癌病毒中获得的病毒癌蛋白E6可以与P53结合并且有效的使之降解，阻止ASP-1、ASP-2诱导的凋亡，这表明ASP-1、ASP-2能够诱导依赖于P53的凋亡。

我们还研究了由于DNA损伤而引发的53BP2和I-ASP对内源P53介导的凋亡的显著抑制作用。在加入顺铂(或顺氯氨铂，一种抗癌药)之前，U2OS和MCF7细胞用编码HPV16E6、I-ASP或53BP2的质粒转染。由于顺铂的作用而发生程序性死亡的细胞所占的百分数用荧光激活细胞分类术测定(图12B)。用顺铂处理可使20％的转染细胞发生程序性死亡。E6的表达使程序性死亡的细胞所占的百分数降至15％以下。这表明U2OS细胞中顺铂诱导p53依赖性的凋亡。与之类似I-ASP或53BP2的表达可以阻止顺铂诱导的细胞死亡到与E6相似的程度。这些结果表明：内源性p53的凋亡功能可以被ASP家族成员的高表达水平所调控。

为了进一步证明ASP家族成员在调控P53介导的凋亡中所起的显著作用，我们采用了反义抑制的方法。我们克隆了ASP-1、ASP-2、I-ASPcDNA的5’端片段，并且以反义方向克隆到乳腺表达载体中以测定反义RNA在ASP家族成员体内蛋白质合成中所起的显著作用。反义ASP-1的表达仅仅抑制ASP-1介导的凋亡，并不影响ASP-2介导的凋亡。相似的情况也发生在反义的ASP-2中。在相同的条件下，反义ASP-1、ASP-2的共表达并不能影响Bax介导的凋亡进一步说明了反义ASP-1、ASP-2的特殊作用。因此，我们又研究了在DNA损伤时内源ASP-1、ASP-2对内源P53介导的凋亡功能的调控。在加入顺铂之前，U2OS和MCF-7细胞用各种不同的表达质粒转染。荧光激活细胞分类术表明：20％-30％的对照转染细胞耐受顺铂的作用。E6的表达使程序性死亡的细胞百分数减少到一半，表明在这些细胞中顺铂能够通过依赖和不依赖P53的途径诱导凋亡。反义RNAASP-1或ASP-2的表达可以抑制顺铂介导的凋亡到E6那样的程度，与53BP2和I-ASP类似。这表明：回应DNA损伤，内源的ASP-1、ASP-2在调控P53介导的凋亡功能中起着重要的作用。

我们猜想由于顺氯氨铂的作用，内源ASP-1、ASP-2对P53介导的凋亡的刺激作用由于这些细胞中I-ASP的高水平表达而可能被忽略。因为I-ASP的高表达可以阻止ASP-1、ASP-2增强P53的凋亡功能。为了研究I-ASP的抗凋亡作用，我们用反义I-ASP转染U2OS和MCF-7细胞，反义I-ASP诱导的P53依赖性凋亡被E6的共表达所消除。用反义I-ASP消除I-ASP的抗凋亡功能也可以使ASP-1、ASP-2的凋亡功能增强。与反义ASP-1、ASP-2不同，反义I-ASP的表达并不阻碍顺氯氨铂诱导的程序性死亡。程序性死亡细胞增多的现象经常发生。这些结果表明：ASP-1、ASP-2在体内可以特异地刺激P53的凋亡功能。内源的I-ASP可以阻碍内源P53介导的凋亡，并且还是ASP的抑制物。

反义核酸分子从ASP-1、ASP-2，I-ASP的cDNA获得，并且使用跨越下列核苷酸的引物从各自的质粒克隆中扩增出来。(相对与起始密码子ATG)：-74-923；-253-839；-37-536分别对应于ASP-1、ASP-2，I-ASP。扩增片段用QIAquick PCR纯化试剂盒纯化。并且连接于RcDNA3。1/V5-HisTOPO载体。包含ASP-1、ASP-2，I-ASP反义DNA的质粒用QIAGEN公司的质粒纯化试剂盒纯化。实施例11

文献报道P53和NF kaappaB的p65RelA在相应应力时，对调节凋亡起着非常重要的作用。然而对于在体内这两种程序凋亡机制时如何协同作用的还知道的很少。人们也做了一些实验来看在p53和NF kaappab之间是否又相互作用。最初的证据来自最近的实验发现：p53可以诱导NF-kaappaB的DNA结合活性。更重要的是p65 rel A的抑制物Ikb能够阻碍p53的凋亡功能。然而并不清楚p53是如何诱导p65的DNA结合活性以及Ikb是如何阻碍p53的的凋亡功能的。

有趣的是，在酵母的杂交分析中人们最近发现：ASP-2和I-ASP能够与NF-kaappaB的一个组成部件p65 relA相互作用。I-ASP能够阻碍p65的反式激活功能，尽管不如Ikb有效。ASP-2及I-ASP和rel A p65的作用区域与rel A p65与p53的作用区域非常相似。因此在53和p65 rel A与ASP-2和I-ASP的作用之间可能存在一些竞争作用。因为ASP家族成员有时是P65和P65之间的普通成分，我们推测ASP家族成员可能与p53和NF-kaappaB的凋亡功能相关。在这种模式下，p53通过与核I-ASP的相互作用诱导P65DNA结合活性是之与DNA结合。另外，通过结合p56和释放I-ASP，Ikb可以阻碍p53介导的凋亡。细胞核内I-ASP浓度的增加可以p53相互作用，并且阻止ASP-2或ASP-1对p53的反式激活功能的促进作用。如果这种假说是正确的，我们可以预见在ASP-2或ASP-1的存在下，Ikb的表达可以对p53介导的凋亡起到非常显著的作用。

表13B中的结果与这种假说一致。在Ikb表达的细胞中，7.2％的细胞发生凋亡，而仅用载体转染的细胞发生凋亡的仅有4.6％。Ikb对于P53介导的凋亡的作用也很小，因为p53表达的细胞中程序性死亡的百分数为12％，而p53和Ikb都表达的细胞中程序性死亡的细胞为11％。

这可能归因于在Saos-2细胞中非常低的ASP-1和ASP-2的表达水平。与前述结果一致，ASP-2的共同表达显著地加强了p53的凋亡功能。在p53+ASP2转染的细胞中，凋亡细胞占30％。让我们感兴趣的是，在这种情况下，Ikb的共同表达显示出最重要的影响。Ikb的共同表达能够使p53和ASP-2诱导下的凋亡细胞数量从30％减至16％。这一结果表明，Ikb能够通过阻止ASP-2激活p53的功能来抑制p53诱导的凋亡。当Ikb与p53共同表达时，我们也得到相似的结果。

我们已经说明ASP-2可以通过特异性激活p53对如Bax这样的原凋亡基因的启动子来增强p53的凋亡功能。因此，我们还检测了在ASP2存在或不存在的情况下，Ikb对p53作用于Bax和mdm2启动子的反式激活功能的影响，参见图13C和13D。如前所述，ASP-2和p53的共同表达增强了p53的反式激活功能大约8倍。在同样的情形下，Ikb的表达并没有显示任何可以检测的对Bax启动子报道基因活性的抑制，这表明在Saos-2细胞中，Ikb不抑制Bax启动子的转录活性是非特异性的。50ng的Ikb与p53的共同表达仅仅显示对p53反式激活功能的很小抑制。然而，当Ikb，ASP-2和p53被共同表达时，Ikb能够显著地抑制ASP-2介导的p53反式激活功能的激活(图13D)。

我们已经阐明ASP-1和ASP-2可以特异性激活p53对Bax启动子的反式激活功能，而对mdm2启动子却没有同样的作用。因此，如果Ikb的确是通过ASP-2特异性地抑制p53的反式激活功能，它将不能显示明显的对mdm2启动子活性的抑制。在相同的条件下，我们还检测了Ikb抑制p53对mdm2启动子活性的反式激活功能的能力。如图13D所示，p53对mdm2启动子的反式激活作用，在ASP-2的共同表达的情形下是极小的。尤其重要的是，即使在ASP-2存在的情况下，Ikb也几乎不抑制p53对mdm2启动子的反式激活功能。此处这些结果是第一次提出Ikb可以通过阻止ASP-1或ASP-2激活p53的反式激活功能来抑制p53的凋亡功能。

为了进一步地研究与p53和NFkb通径相关的ASP家族的功能，我们还研究了ASP-2和p65 relA对p53的凋亡功能的互作效应。基于图13A的工作模型，p65/ASP互作可以促进ASP蛋白进入核内，因此可发生p53/ASP互作和核I-ASP释放以结合核p65。p65的176-406残基与ASP-2和I-ASP发生结合。

作为一个转录因子，p65可以反式激活很多靶基因。因为p53诱导的凋亡要求p65的存在，也与NFkB增加的DNA结合能力有关系，这表明p65的DNA结合能力可能是与p53协作诱导凋亡时是必须的。能够同时与p53和p65结合将ASP家族蛋白置于一个中心角色。一个可能是ASP结合p65可能介导了p53诱导的p65的DNA结合能力。然而，p53的共同表达不能够诱导p65对其报道基因的转录活性。p53和ASP-2的共同表达也没有显示对p65的反式激活功能的任何显著的作用。这一结果表明ASP不是传递p53到p65的信号的报道基因。虽然如此，ASP能够使得p65协同p53诱导凋亡。我们检测了ASP的活动是否需要p65NFkB的DNA结合能力。移去p65N末端包括DNA结合区域的100个氨基酸。当检测NFkb报道基因质粒时，由此产生的该△p65构建体没有转录活性。如果该ASP-p65互作是p53和NFkB路径的介质，△p65对p53的凋亡功能的影响将与全长的p65相似。否则△p65将是没有活性的，因为它不能反式激活它的任何靶基因(图14A)。图14B所示结果表明在ASP-2存在的情形下，不仅p65和△p65都能激活p53的凋亡功能，且△p65在加强p53的凋亡功能上甚至更活跃。这可能归因于△p65较p65更核心(nuclear)。从△p65获得的数据强有力地表明p65可以不依赖于p65的DNA结合能力而影响p53的凋亡功能。因此，ASP-2-p65互作可以是这一作用的原理。实施例12

Bc1-2癌蛋白的抗凋亡功能已经被很好地确立了。有趣的是，Bc1-2能抑制p53诱导的凋亡。而且，Bc1-2还可以与ASP-2互作。然而，对于该互作的生物学结果我们还一无所知。Bc1-2是如何阻止p53诱导的凋亡也还是未知的。采用以上提及的实验系统，我们研究了Bc1-2是否是通过阻止ASP-1和ASP-2激活p53来抑制p53诱导的凋亡。

新增证据表明p53通过转录的依赖和非依赖两条途径来诱导凋亡。我们已经证明，ASP-1和ASP-2通过特异性地加强DNA结合和p53对如Bax和PIG3凋亡基因的启动子的反式激活功能，来激活p53的凋亡功能。我们还感兴趣于研究ASP是否可以非依赖性地加强p53的反式激活功能导致的凋亡功能。p53的一个突变体p53H175-L，它通过一段前导序列靶向线粒体，并已知可以不依赖于p53的反式激活功能诱导凋亡功能。在Saos-2细胞中通过表达野生型p53或没有转录活性的p53和p53H175-L可诱导发生凋亡。与以前的报道相一致地，野生型p53的凋亡功能通过ASP-1和ASP-2被激活。然而，ASP-1和ASP-2的共同表达不能够加强p53H175-L的凋亡功能。尤其重要的是，只有野生型p53诱导的凋亡功能被Bc1-2的共同表达所抑制。在同样的条件下，Bc1-2的共同表达不能抑制p53H175-L诱导的凋亡(图15A)。对p53诱导的凋亡的选择性抑制在Bc1-XL，另一Bc1-2家族的凋亡抑制子的共同表达情形下是观察不到的(图15B)。ASP对p53的凋亡功能的激活能力和Bc1-2对p53的凋亡功能的抑制能力之间的联系，表明Bc1-2是通过阻止ASP激活p53来抑制p53诱导的凋亡功能。这被图3C所示的数据所确证，即Bc1-2能够非常有效地阻止ASP-1和ASP-2加强p53的凋亡功能。实施例13

到目前为止，我们已经知道了I-ASP能够在不同的细胞系中抑制p53诱导的凋亡，且其表达水平在体内的乳腺癌细胞中被上调。所有这些数据表明I-ASP可以成为癌基因。由于p53的肿瘤抑制功能被认为与其诱导凋亡的能力最为相关，很有可能p53诱导的凋亡功能的抑制可以消除p53的肿瘤抑制功能。为了检测I-ASP的致癌功能，用表达I-ASP的质粒和癌基因，E7转染大鼠的胚胎成纤维细胞(REFs)。I-ASP的表达显著地加强了E7的转化功能(图16A)。这表明I-ASP的确是一个癌基因。

由于绝大多数化疗药物是DNA损伤试剂，通过依赖p53的路径诱导凋亡功能，我们认为I-ASP抑制的凋亡的功能可以使细胞更能够抵抗如顺氯铂胺这样的化疗药物的细胞毒素效应。用表达I-ASP的质粒转染MCF-7细胞(人的一个乳腺癌细胞系)。比较表达和不表达I-ASP的MCF-7细胞中的顺氯铂胺细胞毒素的细胞抗性。图16B所示结果表明I-ASP的表达能够增强细胞抗性约2.5倍。这种顺氯铂胺细胞抗性的增加对于癌症治疗在生物学上是非常显著的。因此，I-ASP的高水平的表达不仅可以解释为什么野生型p53在某些人类的肿瘤细胞中是非功能性的。它还可以预测应答治疗的肿瘤。最后，用I-ASP超表达细胞可以允许将来对更为有效的化疗药物进行鉴定。

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表1.表达野生型p53的人类乳腺癌样本(I级和II级)

中的ASPP的mRNA表达肿瘤 ASP1 ASP2 I-ASP

1 ↓ + -
1 ↓ + -	2 ↓ + -
3 ↓ + -	2 ↓ + -
3 ↓ + -	4 ↓ + -
5 ↓ + -	4 ↓ + -
5 ↓ + -	6 ↓ + -
7 ↓ ↓ -	6 ↓ + -
7 ↓ ↓ -	8 + + ↑
9 ↓ ↓ -	8 + + ↑
9 ↓ ↓ -	10 ↓ ↓ -
11 ↓ + -	10 ↓ ↓ -
11 ↓ + -	12 ↓ ↓ -
13 ↓ ↓ -	12 ↓ ↓ -
13 ↓ ↓ -	14 ↓ + -
15 ↓ ↓ -	14 ↓ + -
15 ↓ ↓ -	16 ↓ ↓ -
17 + + ↑	16 ↓ ↓ -
17 + + ↑	18 ↓ + -
19 ↓ + -	18 ↓ + -
19 ↓ + -	20 + + ↑
21 + + -	20 + + ↑
21 + + -	22 + + -

23 ↓ + -
23 ↓ + -	24 + + -
25 + + ↑	24 + + -
25 + + ↑	26 + ↓ -
27 ↓ ↓ -	26 + ↓ -
27 ↓ ↓ -	28 + + ↑
29 + + -	28 + + ↑
29 + + -	30 ↓ + -
31 + + ↑	30 ↓ + -
31 + + ↑	32 + + -
33 ↓ + -	32 + + -
33 ↓ + -	34 ↓ + -
35 + + -	34 ↓ + -
35 + + -	36 + + -
37 + + -	36 + + -
37 + + -	38 + + ↑
39 ↓ + -	38 + + ↑
39 ↓ + -	40 ↓ + ↑

Claims

1.一种分离的多肽，它包括：

i)至少一个锚蛋白重复序列；

ii)一个α螺旋区域；以及

iii)一个SH3结构域；

其特征在于所述多肽至少能够诱导p53的凋亡功能。

2.根据权利要求1的分离的多肽，其中所述多肽能够结合在完整的天然蛋白质抗体上。

3.根据权利要求1或2的分离的多肽，它包括包含在图1d中氨基酸序列1-130位的序列。

4.根据权利要求1-3中任一权利要求的分离的多肽，其中所述多肽来源于哺乳动物，更佳地来源于人。

5.根据权利要求1-4中任一权利要求的分离的多肽，其中图1d所示的氨基酸序列通过至少一个氨基酸的缺失、加成、取代而进一步修饰。

6.一种分离的核酸分子，包括一段DNA序列，该序列选自：

i)图1a或图1b所示DNA序列；

ii)能与图1a或图1b所示DNA序列杂交，且编码权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的DNA序列；以及

iii)i)和ii)中所述DNA序列的简并DNA序列。

7.根据权利要求6所述的分离的核酸分子，它在严格杂交条件下与图1a或图1b所示DNA序列退火。

9.根据权利要求6或7所述的分离的核酸序列，其中所述的核酸分子是cDNA。

10.根据权利要求6或7所述的分离的核酸分子，其中所述的核酸分子是基因组DNA。

11.一种载体，它含有权利要求6-10任一项所述的核酸分子。

12.根据权利要求11的载体，其中所述载体适于促进权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的重组表达。

13.一种分离的多肽，它由权利要求6-10任一权利要求的核酸分子编码。

14.一种用权利要求6-10中任一项所述的核酸或权利要求11或12所述的载体转化或转染的细胞。

15.一种制备权利要求1-5中任一项所述的多肽的方法，包括：

i)提供用权利要求6-10中任一权利要求所述的核酸分子转化或转染的细胞；

ii)在适于表达所述多肽的条件下，培养所述细胞；以及

iii)从所述细胞中或其生长环境中纯化所述多肽。

16.根据权利要求15所述的方法，其中所述的核酸分子是权利要求11或12所述的载体。

17.根据权利要求16的方法，其中所述的载体编码一分泌信号以促进权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的纯化。

18.一种能与权利要求1-5任一权利要求所述的多肽的至少一部分特异性结合的抗体，或其结合部位。

19.根据权利要求18所述的抗体，其中所述抗体是单克隆抗体。

20.根据权利要求19所述的抗体，其中所述抗体是人源化、但非人的抗体。

21.一种药物组合物，其特征在于所述组合物包含权利要求11或12所述的载体。

22.一种药物组合物，其特征在于所述组合物包含权利要求1-5中任一权利要求所述的多肽。

23.根据权利要求21或22所述的药物组合物，它还包括稀释剂、载体或赋形剂。

24.一种治疗癌症的方法，它包括对动物以有效量的权利要求1-5中任一权利要求所述的多肽或权利要求11或12所述的载体给药。

25.根据权利要求24的方法，其中所述的动物是人。

26.根据权利要求24或25的方法，其中所述的方法诱导凋亡。

27.用做药物的，根据权利要求1-5中任一权利要求所述的多肽或权利要求11或12所述的载体。

28.权利要求11或12所述的载体的用途，用于生产治疗癌症的药物。

29.权利要求1-5中任一权利要求所述的多肽的用途，它用于生产治疗癌症的药物。

30.一种筛选可调节权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的活性的试剂的方法，它包括：

i)提供表达权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的细胞；

ii)使至少一种受试试剂作用于所述细胞；并

iii)监测所述试剂对多肽活性的影响。

31.一种筛选可调节权利要求1-5中任一权利要求所述多肽活性的试剂的方法，它包括：

i)提供权利要求1-5中权利要求1-5中所述的多肽；

ii)使至少一种受测试剂作用于所述多肽；并

iii)监测所述试剂被所述多肽结合的情况。

32.权利要求30或31方法所确认的试剂。

33.根据权利要求32的试剂，其中所述试剂是激动剂，它促进权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的活性。

34.根据权利要求32的试剂，其中所述试剂是拮抗剂，它抑制权利要求1-5中任一权利要求所述多肽的活性。

35.根据权利要求32-34中任一权利要求的试剂，其中该试剂为多肽。

36.一种分离的核酸分子，选自：

i)图10所示的DNA序列；

ii)与图10所示的DNA序列杂交的DNA序列，它编码权利要求1-5的肿瘤抑制基因多肽的抑制剂；以及

iii)i)和ii)中所述DNA序列的简并DNA序列。

37.一种分离的核酸分子，它在严格杂交条件下与图10所示DNA序列退火。

38.一种分离的多肽，它包括：

iv)至少一个锚蛋白重复序列；

v)一个SH3结构域；

其特征在于所述多肽能够抑制p53对权利要求1-5中任一权利要求的多肽的刺激活性。

39.根据权利要求38所述的分离的多肽，其中该多肽还包括一个富脯氨酸区域。

40.一种分离的多肽，如图11的氨基酸序列所示，该多肽通过至少一个氨基酸的缺失、加成、取代而进一步修饰。

41.根据权利要求38-40中任一权利要求所述的分离的多肽，其中该多肽是人源的。

42.一种检测权利要求1-5中任一权利要求或权利要求38-41中任一权利要求所述的多肽存在的方法，它包括：

i)提供受检测的样品；

ii)提供适于用试剂检测所述多肽的试验条件；以及

iii)用所述试剂检测所述多肽的存在。

43.根据权利要求42所述的检测方法，其中所述样品是组织样。

44.根据权利要求43所述的检测方法，其中所述组织样是乳腺组织。

45.根据权利要求42-44中任一权利要求的检测方法，其中所述的试剂是抗体。

46.根据权利要求45所述的检测方法，其中该方法是免疫测定。

47.一种检测权利要求6-10任一权利要求，或者权利要求36或37核酸存在的方法，它包括：

i)提供受检测的样品；

ii)提供适于用试剂检测所述核酸的试验条件；

iii)用所述试剂检测所述核酸的存在。

48.根据权利要求47所述的检测方法，其中所述样品是组织样。

49.根据权利要求48所述的检测方法，其中所述组织样是乳腺组织。

50.根据权利要求47-49中任一权利要求所述的检测方法，其中所述试剂是能与所述核酸杂交的核酸。

51.根据权利要求50所述的检测方法，其中所述核酸是至少一个寡核苷酸。

52.根据权利要求51所述的检测方法，其中该方法是聚合酶链反应检测。

53.一种药物组合物，它包括一种抗体，该抗体可与权利要求38-41中任一权利要求的多肽相结合。

54.根据权利要求53所述的药物组合物，其中所述的抗体是单克隆抗体。

55.一种能与图11所示多肽及其类似物相结合的抗体的应用，它用于制造治疗癌症的药物。

56.根据权利要求55的抗体的应用，其中所述癌症为乳腺癌。

57.一种反义核酸分子，它包含权利要求6-10中任一权利要求的有义序列的反义序列。

58.根据权利要求57所述的反义核酸分子，它包含全部或部分的图1a或图1b所示有义序列的反义序列。

59.根据权利要求57或58所述的反义核酸分子，其中所述反义序列包含全部或部分图1b所示序列的第-253-839位核苷酸。

60.一种反义的核酸分子，它包含权利要求36或37有义序列的反义序列。

61.根据权利要求60的反义核酸分子，它包含全部或部分的图10所示有义序列的反义序列。

62.根据权利要求60或61所述的反义核酸分子，其中所述的反义序列包含全部或部分图10所示序列的第-37-536位核苷酸。

63.一种药物组合物，它包含权利要求57-62中任一权利要求所述的反义分子。

64.一种载体，它包含权利要求36或者37所述的核酸分子。

65.一种细胞生长抑制活性试剂的鉴定方法，它包括：

i)提供选自下列组的核酸所编码的多肽，它包括：

a)根据权利要求36或37所述的核酸；

b)与a)中序列杂交并编码权利要求1-5的肿瘤抑制多肽的抑制剂

的核酸；

c)上述a)或b)中所述序列的简并核酸序列；

ii)提供至少一种候选试剂；

iii)提供一种由i)和ii)结合的配制品；

iv)检测或测量所述试剂的细胞生长抑制活性；或者任选地

v)检测试剂对于选择的细胞种类的生长和/或细胞分裂的效果。

66.根据权利要求65所述的方法，其中所述的多肽由图10所示的核酸序列编码。

67.根据权利要求65或66所述的方法，其中所述多肽由细胞表达。

68.根据权利要求67所述的方法，其中所述细胞是癌细胞。

69.根据权利要求65-68中任一权利要求所述的方法，其中所述多肽被过量表达。

70.根据权利要求65-69中任一权利要求所述的方法，其中所述细胞由权利要求36或37所述的核酸，或由权利要求64所述的载体转化或者转染。

71.一种组合药物制剂，它包含至少一种权利要求60-62任一权利要求所述的反义核酸分子和一种化疗剂。

72.根据权利要求71所述的制剂，其中所述的化疗剂是一种抗癌制剂，选自以下组，它包含：顺氯氨铂、铂黑、环磷酰胺、苯丙氨酸氮芥、卡氯芥、氨甲叶酸、5-氟二氧嘧啶、阿糖胞苷(cytarabine)、巯基嘌呤、柔毛霉素、阿霉素、外茜草素(epirubicin)、长春碱、长春新碱、更生霉素、丝裂霉素C、红豆杉醇、L-天冬酰胺酶、粒细胞集落刺激因子、单烯双炔(enediyne)，例如杯形生长抑制素(chalicheamicin)或望菌生长抑制素(esperamicin)、苯丁酸氮芥、ARC-C、长春地辛(vindesine)、博来霉素、和表鬼臼毒吡喃葡糖苷。

73.根据权利要求72所述的制剂，其中所述制剂是顺铂。

74.一种组合药物制剂，它包含权利要求53或54的组合物，和一种化疗剂。

75.根据权利要求74所述的制剂，其中所述的化疗剂是一种选自以下组的抗癌试剂，它包含：顺铂、卡波铂、环磷酰胺、苯丙氨酸氮芥、卡氯芥、氨甲叶酸、5-氟二氧嘧啶、阿糖胞苷(cytarabine)、巯基嘌呤、柔毛霉素、阿霉素、外茜草素(epirubicin)、长春碱、长春新碱、更生霉素、丝裂霉素C、红豆杉醇、L-天冬酰胺酶、粒细胞集落刺激因子、单烯双炔(enediyne)，例如杯形生长抑制素(chalicheamicin)或望菌生长抑制素(esperamicin)、苯丁酸氮芥、ARC-C、长春地辛(vindesine)、博来霉素、和表鬼臼毒吡喃葡糖苷。

76.一种制备单克隆抗体的方法，该单克隆抗体与图1d所示氨基酸序列的1-130位相结合，所述方法包含以下步骤：

a)以一免疫原免疫具有免疫活性的哺乳动物，其中所述免疫原包含具有图1d第1-130位所示氨基酸的氨基酸序列的多肽；

b)以myeloma细胞融合被免疫的具有免疫活性的哺乳动物的淋巴细胞和骨髓瘤细胞形成杂种细胞；

c)筛选步骤b)中的杂种细胞产生的单克隆抗体；

d)培养该单克隆活性杂种细胞以增殖和/或分泌所述单克隆抗体；且

e)从所述培养液上清中收获该单克隆抗体。

77.根据权利要求76所述的方法，其中所述的具有免疫活性的哺乳动物为小鼠。

78.根据权利要求76所述的方法，其中所述的具有免疫活性的哺乳动物为大鼠。

79.根据权利要求76-78任一权利要求所述的方法，其中所述的鼠是转基因鼠，它转入了人免疫球蛋白基因或包含人免疫球蛋白基因的染色体核酸。