CN117089550A - 苹果MhMYB4基因及在提高植物抗旱性中的应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种苹果MhMYB4基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。通过转基因技术，将含有MhMYB4基因的载体转入番茄(Micro‑Tom)和‘王林’苹果愈伤组织中，发现过量表达MhMYB4基因增强了番茄和‘王林’苹果愈伤的抗旱能力，而沉默MhMYB4基因使‘王林’苹果愈伤的抗旱能力减弱。这对苹果抗旱遗传改良及抗逆新品种选育具有重要意义。

Description

苹果MhMYB4基因及在提高植物抗旱性中的应用

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及苹果MhMYB4基因及在提高植物抗旱性中的应用。

背景技术

苹果(Malus×domestica Borkh)具有很高的营养价值，并且深受消费者的喜爱，是世界四大水果之一。在我国北方地区苹果具有广泛的栽培，其栽培面积和产量均居全球首位。我国苹果的栽培地区主要分布在山地、丘陵、旱地等地区，这些地区自然条件较差，经常遇到极端天气和自然灾害。降雨分布不均衡导致果树经常受到干旱等自然胁迫，严重影响苹果的生产，农业的发展也受到巨大影响，给果农造成严重的经济损失。因此，增强苹果的抗旱能力和提高苹果的产量尤为重要。

MYB家族在植物中普遍存在，并且是植物中最大的基因家族之一。研究表明，MYB转录因子具有调节植物生长发育、抗生物胁迫和非生物胁迫的作用。在本研究中，我们鉴别发现了一个响应干旱胁迫的MYB转录因子，将其命名为MhMYB4。利用转基因技术获得转基因番茄和苹果愈伤，进行功能验证表明MhMYB4在植物抗旱过程中发挥重要作用，这对苹果抗旱遗传改良及抗逆新品种选育具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种苹果MhMYB4基因及在提高植物抗旱性中的应用。

为了实现上述目的，本发明的技术方案如下：

一种苹果的MhMYB4基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述的核苷酸序列由600个碱基组成。

一种苹果的MhMYB4蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。所述的序列由199个氨基酸残基组成。

包含上述苹果MhMYB4基因的过表达载体也落入本发明的保护范围，本发明所选用的过表达载体为农杆菌过表达载体。

本发明最重要的发明点在于通过干旱处理实验，发现该基因能够提高植物抗旱性。也就是说，该基因或蛋白或过表达载体在提高植物抗旱性方面具有重要的作用。本发明采取稳定遗传转化的方法获得转基因番茄和转基因苹果愈伤。通过自然干旱处理转基因番茄，测量相关生理指标，表明过表达MhMYB4基因提高了番茄的抗旱能力。为了进一步证明MhMYB4基因在苹果中的功能，通过遗传转化获得转基因苹果愈伤的过表达和沉默株系，通过甘露醇进行模拟干旱处理，进一步说明MhMYB4基因在苹果抗旱过程中发挥的功能。

上述植物包括苹果、番茄，但不限于此，凡是可以利用转基因技术将MhMYB4基因的过表达载体转入该植物中，均可以获得相同的技术效果。

本发明所述抗旱性具体表现：过表达MhMYB4基因能够降低番茄叶片或苹果愈伤组织中的相对电导率、MDA含量、O₂-含量以及H₂O₂含量；沉默该基因则会增加苹果愈伤组织中的相对电导率、MDA含量、O₂-含量以及H₂O₂含量。

本发明还保护一种植物育种方法，其特征在于，所述方法为(1)或(2)或(3)：

(1)通过增加目的植物中MhMYB4蛋白的活性，获得抗旱性强于目的植物的植株；

(2)通过促进目的植物中MhMYB4基因的表达，获得抗旱性强于目的植物的植株；

(3)通过沉默目的植物中MhMYB4基因，获得抗旱性低于目的植物的植株。

其中，本发明所述目的植物是苹果、番茄。

目的基因，也称靶标基因，在基因工程设计和操作中，被用于基因重组、改变受体细胞性状和获得预期表达产物的基因。可以是生物体本身的，也可以是来自不同生物体的。

本发明中，对于适用于本发明的植物或目的植物没有特别的限制，只要其适合进行基因的转化操作，如各种农作物、花卉植物、或林业植物等。所述的植物比如可以是(不限于)：双子叶植物、单子叶植物或裸子植物。

作为一种优选方式，所述的“植物”包括但不限于：苹果、拟南芥，凡是具有该基因或者与之同源的基因均适用。

本发明中所说的“植物”包括整株植物，其亲本和子代植株以及植物的不同部位，包括种子、果实、芽、茎、叶、根(包括块茎)、花、组织和器官，在这些不同的部分均有我们目的基因或者核酸。这里所提及的“植物”也包括植物细胞、悬浮培养物、愈伤组织、胚、分生组织区、配子体、孢子体、花粉和小孢子，同样，其中每种前述对象包含目的基因/核酸。

本发明包括任何植物细胞，或任何由其中的方法获得或可获得的植物，以及所有的植物部分及其繁殖体。本专利也包含由任何前述方法所获得的转染细胞、组织、器官或完整植物。唯一的要求是子代表现出相同的基因型或表型特征，使用本专利中的方法获得的子代特性相同。

本发明还扩展到如上所述的植物的可收获的部分，但不限于种子、叶、果实、花、茎、根、根茎、块茎和球茎。同时进一步涉及植株收获后的其他衍生物，如干燥颗粒或粉末、油、脂肪和脂肪酸、淀粉或蛋白质。本发明还涉及由相关植物获得的食品或食品添加剂。

本发明的优点：

本发明通过植物基因工程技术，从平邑甜茶实生苗中分离克隆出抗旱相关基因MhMYB4完整编码区段的DNA片段，并验证了该基因的功能，发现过表达MhMYB4基因能提高转基因材料的抗旱能力，而沉默该基因则降低植物的抗旱能力，有利于从分子机制上阐明MhMYB4基因在提高其抗旱能力方面的作用，并且对苹果抗旱定向遗传改良和砧木选育有重要意义。

附图说明

图1是MhMYB4基因PCR扩增产物电泳图；

图2是qRT-PCR检测MhMYB4转基因番茄的表达，其中WT为野生型，OE-2、OE-3和OE-4为三个过表达转基因番茄株系；

图3是MhMYB4转基因番茄在干旱处理下的表型图；

图4是MhMYB4转基因番茄在干旱胁迫下的生理指标测定，其中，A：相对电导率，B：丙二醛含量，C：超氧阴离子含量，D：过氧化氢含量；

图5是MhMYB4转基因番茄在干旱胁迫下的DAB和NBT染色；

图6是qRT-PCR检测MhMYB4转基因苹果愈伤的表达，其中WT为野生型，OE-2、OE-4为两个过表达株系，RNAi-1为干扰株系(沉默株系)；

图7是三个转基因愈伤株系(OE-2、OE-4、RNAi-1)和WT在干旱(Mannitol)处理下生长情况；

图8是MhMYB4转基因苹果愈伤在干旱(Mannitol)处理15天时的生理指标测定，其中，A：相对电导率，B：丙二醛含量，C：超氧阴离子含量，D：过氧化氢含量；

图9是MhMYB4转基因苹果愈伤在干旱胁迫下的DAB染色图。

具体实施方式

下面结合具体实施例来进一步描述本发明，本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但下述实施例中所涉及的具体实验方法如无特殊说明，均为常规方法或按照制造厂商说明书建议的条件实施。

若未特别指明，实施例中所用技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。下述实施例中的试验方法，如无特别说明，均为常规方法。如无特殊说明，所采用的试剂及材料，均可以从市场中购买获得。

除非另行定义，文中所使用的所有专业与科学用语与本领域熟练人员所熟悉的意义相同。此外，任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可应用于本发明中。文中所述的较佳实施方法与材料仅作示范之用。

除非另有说明，本发明的实施将使用本领域技术人员显而易见的植物学常规技术、微生物、组织培养、分子生物学、化学、生物化学、DNA重组及生物信息学技术。这些技术均在已经公开的文献中进行了充分解释，另外，本发明所采用的DNA提取、系统发育树的构建、基因编辑方法、基因编辑载体的构建、基因编辑植物获得等方法，除了下述实施例采用的方法外，采用现有文献中已经公开的方法均能实现。

此处使用的“核酸”、“核酸序列”、“核苷酸”、“核酸分子”或“多聚核苷酸”术语意思是指包括分离的DNA分子(例如，cDNA或者基因组DNA)，RNA分子(例如，信使RNA)，自然类型，突变类型，合成的DNA或RNA分子，核苷酸类似物组成的DNA或RNA分子，单链或是双链结构。这些核酸或多聚核苷酸包括基因编码序列、反义序列及非编码区的调控序列，但不仅限于此。这些术语包括一个基因。“基因”或“基因序列”广泛用来指一有功能的DNA核酸序列。因此，基因可能包括基因组序列中的内含子和外显子，和/或包括cDNA中的编码序列，和/或包括cDNA及其调控序列。在特殊实施方案中，例如有关分离的核酸序列，优先默认其为cDNA。

“表达载体”，是指在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等)，使目的基因能够表达的载体。

“农杆菌介导转化法”，指将目的基因插入到经过改造的T-DNA区，借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合，然后通过细胞和组织培养技术，再生出转基因植株的技术。

实施例1苹果MhMYB4基因的克隆

一、平邑甜茶实生苗叶片RNA提取及反转录

1、利用CTAB法提取总RNA

(1)称取平邑甜茶叶片约0.1g，在液氮中研磨成细粉，加入600μLCTAB提取液(表1)，漩涡振荡2min，65℃水浴10min；

表1 CTAB提取液

(2)将离心管取出，加入(600μL)氯仿：异戊醇(24：1)，漩涡振荡混匀，4℃，13,000rpm离心5min；

(3)上清液转移至新离心管中，重复步骤(2)；

(4)得到的上清液转移至新离心管中，加入1/3体积8mol·L^-1LiCl₂(不要涡旋振荡)，在4℃冰箱中放置过夜；

(5)将离心管放入离心机进行4℃离心，离心20min后，倒掉上清液底部可以看到沉淀，将离心管倒置于纸巾上去除多余液体；

(6)制备SSTE缓冲液(表2)，取400μL缓冲液溶解沉淀，置于冰上；

表2 SSTE缓冲液

(7)向离心管中加入等体积氯仿：异戊醇(24：1)，涡旋混匀，20℃下13,000rpm离心5min；

(8)小心吸取上清到新的离心管中，加入2倍体积的无水乙醇，上下颠倒混匀，-80℃放置30min；

(9)将样品在4℃下进行13,000rpm离心，离心20min后，弃上清液，用75％的乙醇洗涤沉淀2次，室温下开盖5-7min，加入20μL DEPC-H₂O溶解沉淀，-80℃冻存。

2、反转录cDNA

使用诺唯赞“HiScriptIII Q RT SuperMix for qPCR(+gDNAwiper)”试剂盒按照说明进行反转录，取上一步RNA产物为模板，在0.2ml的微量离心管中进行两步反应，首先配制基因组gDNA去除混合体系(表3)，在离心管中依次加入4*gDNA wiper Mix 4μL，RNA模板1pg-1μg，加入RNase free ddH₂O定容至16μL，移液枪轻轻混打均匀，离心，PCR仪上42℃反应2min；

将上一步反应产物取出，加入4μL 5*HiScriptIII qRT SuperMix至总体积为20μL，用枪头轻轻混匀，将微量离心管放在PCR仪上37℃，15min；85℃，5s；产物即为eDNA，反应结束后取出待用或-20℃保存。

表3基因组gDNA去除混合体系

二、cDNA全长序列的获得

设计特异性引物MhMYB4-F，MhMYB4-R，以反转录合成的cDNA为模板进行PCR扩增。

PCR反应程序：95℃预变性7min；95℃变性30s，55℃退火15s，72℃延伸10s，35次循环；72℃延伸5min。

表4 PCR扩增体系

PCR产物用1.2％琼脂糖凝胶进行电泳，琼脂糖凝胶电泳图如图1所示，使用DNA回收纯化试剂盒进行目的条带的回收，并通过零背景ZT4-Blunt(Amp⁺)快速载体克隆试剂盒进行T载体的连接，将连接产物转化至大肠杆菌感受态细胞DH5α，将转化产物涂至加有氨苄抗素的LB平板培养基上，37℃倒置培养12-16h；挑取单菌落进行PCR验证，并将条带正确的菌液送至上海生工生物公司进行测序。得到MhMYB4基因序列，ORF为600bp，编码199个氨基酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。测序正确的单克隆，使用天根质粒提取试剂盒提取ZT4-Blunt-MhMYB4的质粒DNA并置于-20℃保存，用于后续功能验证实验。

实施例2：MhMYB4基因过表达载体的构建

以ZT4-Blunt-MhMYB4质粒为模板，对目的基因进行扩增并回收。将pSAK277载体质粒用NEB公司的Kpn I和Xho I限制性内切酶进行双酶切，酶切产物使用DNA凝胶回收试剂盒进行纯化回收，纯化产物保存于-20℃。通过同源重组将目的基因构建到pSAK277载体上。

实施例3：MhMYB4基因沉默载体的构建

以ZT4-Blunt-MhMYB4质粒为模板克隆一段保守序列。将克隆得到的核苷酸序列通过BP反应构建到pDONOR222中间载体上，然后进行LR反应将序列构建到pK7WIWG2D载体上。

实施例4：MhMYB4转基因番茄的获得

挑取饱满的番茄种子放在三角瓶中，用75％的酒精和3％次氯酸钠溶液清洗种子，将清洗过的种子接种到MS培养基上。一周后，选用子叶完全展开的幼苗，用手术刀将子叶从叶柄处切下，并横割成2-3段，把切好的子叶平展在铺有灭菌滤纸的KCMS培养基上，放于培养箱暗培养1d。将暗培养后的子叶悬浮于农杆菌液体中，盖上盖子后用手轻轻晃动，侵染时间约4min。倒掉悬浮液，用无菌滤纸吸干残留菌液，再将侵染后的外植体放回KCMS培养基中，暗环境下共培养2d。将经过共培养的外植体转移到2Z芽诱导培养基上，大约15d会产生愈伤并形成芽点。当形成1cm左右的幼苗时，将它从茎基部切断，放到R生根培养基中进行生根培养。提取番茄叶片的RNA，检测番茄中MhMYB4基因表达量。如图2所示，与对照相比，OE-2、OE-3和OE-4番茄株系中MhMYB4基因表达量明显上升。

实施例5：MhMYB4转基因番茄抗旱性鉴定

将野生型和3个转基因株系(OE-2、OE-3、OE-4)番茄种子进行温汤浸种，等种子发芽后将其点播在方钵(18cmx12.5cm×15cm)中，一盆点播一颗种子，每个株系点播30盆，共120盆，于人工气候室(22℃；光照16h/黑暗8h)内生长。30d后对番茄植株进行干旱处理。将植株进行充分供水后，停止浇水，进行自然干旱。6d后观察表型，并进行MhMYB4的抗旱性分析，试验中设置3次生物学重复。试验结果显示，干旱处理前野生型与转基因番茄长势一致。干旱处理6d后，野生型番茄出现了明显的萎蔫，所有叶片都向下卷曲皱缩，而转基因番茄只有轻微的卷曲(图3)。测量相关生理指标发现干旱处理后，转基因番茄株系的相对电导率(图4A)、丙二醛含量(图4B)、超氧阴离子含量(图4C)以及过氧化氢含量(图4D)明显低于WT，并且DAB和NBT染色(图5)更浅。以上结果表明MhMYB4基因在植物抗旱过程中发挥重要作用。

实施例6：过表达MhMYB4苹果愈伤组织的获得

将准备侵染的野生型‘王林’苹果愈伤组织接种至液体培养基上，摇15天，颜色为金黄时可用于侵染。挑选生长状态良好的苹果愈伤组织，将愈伤组织放在置于农杆菌中浸泡15min，用灭菌的纱布吸干农杆菌菌液，接种到无抗生素的培养基上，暗培养2天。后用灭菌水加头孢(500mg·L^-1)洗3次，时间5-8min，洗去多余的农杆菌。用灭菌的纱布将水吸干后，转移至加继代培养基上，铺成薄薄的一层。继代筛选3-5次后，提取RNA检测苹果愈伤中MhMYB4基因表达量。如图6所示，与对照相比，OE-2和OE-4愈伤株系中MhMYB4基因表达量明显上升，而RNAi-1中表达量较低。

实施例7：MhMYB4转基因苹果愈伤组织对干旱敏感性分析

将生长状态良好且一致的野生型和转基因苹果愈伤组织分别置于MS+6-BA(0.4mg·L^-1)+2，4-D(1.5mg·L^-1)和MS+6-BA(0.4mg·L^-1)+2，4-D(1.5mg·L-¹)+Mannitol(150mmol·L^-1)培养基上，并在25℃暗室进行培养。15d后观测表型，并进行了MhMYB4的抗旱性分析，所有试验均设置3个生物学重复。试验结果显示，在对照培养基上，WT与3个转基因愈伤组织(OE-2、OE-4、RNAi-1)长势一致，而在150mM Mannitol(甘露醇)处理后，发现OE-2和OE-4的长势优于WT，而RNAi-1的长势则较弱(图7)。随后检测了甘露醇处理后的转基因愈伤组织的抗逆生理指标发现，相比于WT，OE-2和OE-4转基因株系的相对电导率(图8A)、丙二醛含量(图8B)、超氧阴离子含量(图8C)以及过氧化氢含量(图8D)更低，RNAi-1则更高。DAB染色结果显示，OE-2和OE-4染色较浅，RNAi-1染色最深(图9)。以上结果表明MhMYB4基因在苹果抗旱过程中发挥正向调控作用。

综上，从苹果中分离得到了MhMYB4基因，并通过对转基因番茄和苹果愈伤的功能验证分析发现，MhMYB4基因在植物的抗旱方面具有显著效果，这对于苹果新品种的选育具有重要意义。

以上所述之实施例，只是本发明的较佳实施例而已，仅仅用以解释本发明，并非限制本发明实施范围，对于本技术领域的技术人员来说，当然可根据本说明书中所公开的技术内容，通过置换或改变的方式轻易做出其它的实施方式，故凡在本发明的原理上所作的变化和改进等，均应包括于本发明申请专利范围内。

Claims (8)

1.一种苹果MhMYB4基因，其特征在于，所述MhMYB4基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.一种编码权利要求1所述MhMYB4基因的蛋白，其特征在于，所述蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。

3.包含权利要求1所述苹果MhMYB4基因的过表达载体。

4.权利要求1所述基因或权利要求2所述蛋白或权利要求3所述过表达载体在提高植物抗旱性方面的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述植物为苹果、番茄。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，过表达MhMYB4基因能够降低番茄叶片或苹果愈伤组织中的相对电导率、MDA含量、O₂-含量以及H₂O₂含量；沉默该基因则会增加苹果愈伤组织中的相对电导率、MDA含量、O₂-含量以及H₂O₂含量。

7.一种植物育种方法，其特征在于，所述方法为(1)或(2)或(3)：

(1)通过增加目的植物中MhMYB4蛋白的活性，获得抗旱性强于目的植物的植株；

(2)通过促进目的植物中MhMYB4基因的表达，获得抗旱性强于目的植物的植株；

(3)通过沉默目的植物中MhMYB4基因，获得抗旱性低于目的植物的植株。

8.根据权利要求7所述的植物育种方法，其特征在于，所述目的植物为苹果、番茄。