CN116574812A - 一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 - Google Patents
一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN116574812A CN116574812A CN202310549753.7A CN202310549753A CN116574812A CN 116574812 A CN116574812 A CN 116574812A CN 202310549753 A CN202310549753 A CN 202310549753A CN 116574812 A CN116574812 A CN 116574812A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- molecular marker
- duck
- type
- utilization rate
- identifying
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 241000272525 Anas platyrhynchos Species 0.000 title claims abstract description 50
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 title claims abstract description 34
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 17
- 101150077578 ELOVL2 gene Proteins 0.000 title claims description 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 8
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 8
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 13
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 13
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 claims description 12
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims description 10
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 9
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 claims description 8
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 8
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 7
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 6
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims description 3
- 238000009395 breeding Methods 0.000 abstract description 10
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 abstract description 8
- 101000921368 Homo sapiens Elongation of very long chain fatty acids protein 2 Proteins 0.000 abstract description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 abstract description 4
- 244000144977 poultry Species 0.000 abstract description 3
- 241000272522 Anas Species 0.000 description 12
- 235000021050 feed intake Nutrition 0.000 description 11
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 101100011517 Drosophila melanogaster ELOVL gene Proteins 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 3
- 102100032050 Elongation of very long chain fatty acids protein 2 Human genes 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 2
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 102100039249 Elongation of very long chain fatty acids protein 6 Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 101000813110 Mus musculus Elongation of very long chain fatty acids protein 6 Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 108091046869 Telomeric non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N Vitamin A Natural products OC/C=C(/C)\C=C\C=C(\C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N 0.000 description 1
- 210000000579 abdominal fat Anatomy 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000000546 chi-square test Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000037149 energy metabolism Effects 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 230000004136 fatty acid synthesis Effects 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 210000003746 feather Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000037356 lipid metabolism Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 235000020978 long-chain polyunsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000012257 pre-denaturation Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000011222 transcriptome analysis Methods 0.000 description 1
- 235000019155 vitamin A Nutrition 0.000 description 1
- 239000011719 vitamin A Substances 0.000 description 1
- 229940045997 vitamin a Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/124—Animal traits, i.e. production traits, including athletic performance or the like
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P60/00—Technologies relating to agriculture, livestock or agroalimentary industries
- Y02P60/80—Food processing, e.g. use of renewable energies or variable speed drives in handling, conveying or stacking
- Y02P60/87—Re-use of by-products of food processing for fodder production
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，所述核苷酸序列的第480位碱基为G或A。本发明通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，根据基因型对鸭的饲料利用率性状进行选择，建立了一种家禽饲料利用率早期选择的育种方法，该法简单、快速、低成本、不需要特殊的仪器，适合分子标记辅助育种实验的需要。
Description
技术领域
本发明属于分子标记技术领域，具体涉及一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用。
背景技术
剩余采食量(Residual Feed Intake，RFI)被定义为在给定体重和体增重的情况下，动物实际饲料摄入量和预期饲料摄入量之间的差值，因此RFI的数值越大，相对的饲料效率也越低，近些年，越来越多的育种工作者开始采用RFI作为衡量饲料效率的主要指标，并且随着时代发展，这种趋势越来越明显，这是因为使用RFI来进行选育不仅能考虑到日增重和代谢体重，而且对于上市体重等重要经济性状的影响也比较微弱，并且RFI的遗传力在0.2～0.4(Chen C，Su Z，Li Y，et al.Estimation of the genetic parameters oftraits relevant to feed efficiency：result from broiler lines divergent forhigh or low abdominal fat content[J].Poult Sci，2021，100(2)：461-466；Zhang Y，Guo Z B，Xie M，et al.Genetic parameters for residual feed intake in a randompopulation of Pekin duck[J].Asian-Australas J Anim Sci，2017，30(2)：167-170.)，属于中等遗传力性状，因此可以使用RFI作为育种时的饲料效率衡量指标。
超长链脂肪酸延伸酶2(ELOVL2)是ELOVL延伸酶家族成员，ELOVL家族在长链多不饱和脂肪酸的延伸反应中起重要作用，Zhao等对生猪饲料效率进行研究，从约克夏猪肝脏中鉴定了300个转录本，发现猪高低饲料转化率组ELOVL2基因表达差异显著(Zhao Y，HouY，Liu F，et al.Transcriptome analysis reveals that vitamin A metabolism in theliver affects feed efficiency in pigs[J].G3(Bethesda)，2016，6(11)：3615-3624.)；Zhang等对不同剩余采食量湖羊肝脏长非编码核糖核酸的转录组进行分析，发现ELOVL2基因在不同RFI的湖羊肝脏中差异表达，并且发现ELOVL2基因与能量代谢有关，ELOVL2基因主要功能是调控动物体内脂肪酸合成和脂肪沉积，转录组学分析表明RFI与脂质代谢相关基因的表达水平显著相关，脂肪沉积会消耗能量降低饲料利用率(Zhang D Y，Zhang X X，LiG Z，et al.Transcriptome analysis of long noncoding RNAs ribonucleic acidsfrom the livers of Hu sheep with different residual feed intake[J].Animal，2021，15(2)：100098.)。
因此ELOVL2基因可能是影响鸭饲料效率的重要候选基因，目前ELOVL2基因研究主要集中在小鼠、鱼类和人，家禽方面研究较少，研究内容主要集中在脂肪酸调控和脂质沉积方面，深入研究ELOVL2基因变异与表达对肉鸭饲料转化率的影响及其分子机制，对提高肉鸭的饲料效率降低肉鸭的养殖成本有重要的现实意义。
“强英鸭”属于白羽肉鸭，历经10年自主培育而成，促进了我国肉鸭品种国产化，“强英鸭”商品代鸭早期生长速度快、饲料转化率高、成活率高，40日龄上市，平均体重3.35kg，平均料重比为1.89：1，基于上述内容，提出一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用。
发明内容
本发明的目的就在于提供一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用，与现有技术相比，针对于鸭的饲料利用率性状相关的候选基因(ELOVL2基因)的SNP(单核苷酸多态性)分子标记，以解决常规表型育种选育进展缓慢，实现早期鉴定饲料利用率性状这一难题。
本发明通过以下技术方案来实现上述目的：
一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，即所述ELOVL2基因具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述分子标记为G或A，所述分子标记位于所述核苷酸序列的第480位。
一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。
一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，包括以下步骤：
(1)提取鸭翅静脉血液总DNA；
(2)以所述分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列为目标序列设计特异性扩增引物，以所述总DNA为模板，利用特异性扩增引物进行PCR扩增，获得扩增产物；
(3)对扩增产物进行基因分型检测和测序，获得待测鸭的分子标记类型；
(4)根据分子标记类型判断鸭饲料利用率性状。
作为本发明的进一步优化方案，所述特异性扩增引物的序列为：
SEQ ID NO.2：Forward primer：GGAACCCACCAGGAAAGAC；
SEQ ID NO.3：Reverse primer：GTGAGCCAAGGAGACCAAG。
作为本发明的进一步优化方案，所述基因分型检测方法为通过酶切扩增产物获得酶切产物，利用琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测，根据图像进行基因分型，若酶切产物：
包含1条条带，则为AA型；
包含2条条带，则为GG型；
包含3条条带，则为GA型。
作为本发明的进一步优化方案，若待测鸭分子标记类型为AA型，该鸭饲料利用率性状较差；若待测鸭分子标记类型为GG型，该鸭饲料利用率性状最好；若待测鸭分子标记类型为GA型，该鸭饲料利用率性状中等。
作为本发明的进一步优化方案，利用1.5％-2.0％浓度的琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测。
本发明提具有如下有益效果：
本发明通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，根据基因型对鸭的饲料利用率性状进行选择，建立了一种家禽饲料利用率早期选择的育种方法，该法简单、快速、低成本、不需要特殊的仪器，适合分子标记辅助育种实验的需要。
附图说明
图1为部分样品PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳图；
图2为部分样品PCR扩增产物经酶切获得的酶切产物的琼脂糖凝胶电泳图；
图3为鸭ELOVL2基因中G95803706A位点(为SEQ ID NO.1中第480位点)基因型验证测序结果。
具体实施方式
下面结合附图对本申请作进一步详细描述，有必要在此指出的是，以下具体实施方式只用于对本申请进行进一步的说明，不能理解为对本申请保护范围的限制，该领域的技术人员可以根据上述申请内容对本申请作出一些非本质的改进和调整。
1、材料
本实施例所用方法如无特别说明均为本领域的技术人员所知晓的常规方法，所用的试剂等材料，如无特别说明，均为市售购买产品。
2、方法
2.1引物设计
从鸭基因组数据库中找到如SEQ ID NO.1所示的ELOVL2基因对应的DNA序列，并以ELOVL2基因DNA部分序列(分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列)为模板，设计特异性扩增引物，特异性扩增引物序列如下所示：
SEQ ID NO.2：Forward primer：GGAACCCACCAGGAAAGAC；
SEQ ID NO.3：Reverse primer：GTGAGCCAAGGAGACCAAG。
该引物的可扩增区域的长度为623bp，序列如SEQ ID NO.4所示，其中包含G95803706A位点(为SEQ ID NO.1中第480位点)G/A突变的分子标记。
2.2提取血液总DNA
选取强英鸭505只，翅静脉采血，提取血液总DNA，利用天根生物科技有限公司生产的血液DNA提取试剂盒提取鸭翅静脉血样中总DNA，提取步骤按照试剂盒说明书进行即可。
2.3 PCR扩增
利用上海翊圣生物公司生产的Mix，通过已合成的测序特异性引物对ELOVL2基因的目的片段，进行PCR扩增反应，PCR扩增体系如表1所示：
表1 PCR扩增体系
| 组分 | 用量 |
| DNA模板 | 1μL |
| Forward primer | 1μL |
| Reveres primer | 1μL |
| Mix | 10μL |
| ddH2O | 7μL |
| 总计 | 20μL |
PCR反应条件为：95℃预变性5min；第一步95℃变性45s；第二步64.8℃退火45s(退火温度根据引物而设定)；第三步72℃延伸30s，其中第二步到第三步循环31次，共32个循环；72℃延伸10min。
2.4 PCR扩增产物检测与测序
利用2％质量比的琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物，如图1所示，在凝胶成像仪成像后获得获得一条长度近似623bp的条带，与预测的长度一致，说明获得了目的片段，将PCR产物送到北京擎科生物科技有限公司(南京)，序列如SEQ ID NO.4所示，与预测结果一致。
2.5基因分型
2.5.1配置如表2所示的酶切体系，酶切条件为37℃水浴1小时，利用北京百奥莱博科技有限公司Psp XI限制性内切酶酶切PCR扩增产物；
表2酶切体系
| 组分 | 用量 |
| PCR扩增产物 | 0.4μL |
| Psp XI | 0.4μL(5U/μL) |
| buffer | 2μL |
| ddH2O | 7.2μL |
| 总计 | 10μL |
2.5.2利用1.5％质量比低电压琼脂糖凝胶电泳检测，获得如图2所示的结果(部分结果)；其中，若酶切产物：包含1条条带，为AA型；包含2条条带，为GG型；包含3条条带，为GA型。
2.6酶切测序验证
将基因酶切分型琼脂糖凝胶电泳图进行统计，获得GG、GA、AA三种分型，对这三种分型分别挑选一个个体进行测序比对，测序比对图如图3所示，测序结果中G突变成A，箭头标出了突变位置，与酶切分型结果一致。
2.7效果验证
为确定鸭ELOVL2基因G95803706A位点的G/A多态性与鸭重要表型性状关联性，以2.2中的505只强英鸭为试验材料，统计21～42日龄采食量(ADFI)、平均日增重(ADG)、代谢体增重(MBW0.75)、料重比(FCR)、剩余采食量(RFI)，采用2.5基因分型方法，对505只强英鸭，进行基因分型，结果如表3所示：
表3不同表型个体基因型检测结果
实验结论：卡方检验结果显示，试验鸭群体基因型处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
2.8统计分析
用SAS9.4软件中最小二乘分析法分析三种基因型与鸭饲料利用率性状之间的关联性，不同基因型与各性状间的关联分析结果见如表4所示：
表4鸭ELOVL2基因型与鸭饲料利用率性状关联分析
注：同行不同小写字母表示差异显著(P＜0.05)，同一行不同大写字母表示差异极显著(P<0.01)。
实验结论：从表4中可以看出，对于ELOVL2基因G95803706A位点而言，AA和GA型个体的日龄采食量(ADFI)显著高于GG型个体，AA和GA型个体的料重比(FCR)和剩余采食量(RFI)极显著高于GG型个体，三种基因型在平均日增重(ADG)和代谢体增重(MBW0.75)方面无显著差异，由此可得出，GG基因型个体饲料利用率性状最好，GA基因型个体饲料利用率性状中等，AA基因型个体饲料利用率性状较差。
上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式，其描述较为具体和详细，但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明构思的前提下，还可以做出若干变形和改进，这些都属于本发明的保护范围。
Claims (7)
1.一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，所述核苷酸序列的第480位碱基为G或A。
2.一种如权利要求1所述的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。
3.一种利用如权利要求1所述的分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)提取鸭翅静脉血液总DNA；
(2)以所述分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列为目标序列设计特异性扩增引物，以所述总DNA为模板，利用特异性扩增引物进行PCR扩增，获得扩增产物；
(3)对扩增产物进行基因分型检测和测序，获得待测鸭的分子标记类型；
(4)根据分子标记类型判断鸭饲料利用率性状。
4.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，所述特异性扩增引物的序列为：
SEQ ID NO.2：Forward primer：GGAACCCACCAGGAAAGAC；
SEQ ID NO.3：Reverse primer：GTGAGCCAAGGAGACCAAG。
5.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，所述基因分型检测方法为通过酶切扩增产物获得酶切产物，利用琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测，根据图像进行基因分型，若酶切产物：
包含1条条带，则为AA型；
包含2条条带，则为GG型；
包含3条条带，则为GA型。
6.根据权利要求5所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，
若待测鸭分子标记类型为AA型，该鸭饲料利用率性状较差；
若待测鸭分子标记类型为GG型，该鸭饲料利用率性状最好；
若待测鸭分子标记类型为GA型，该鸭饲料利用率性状中等。
7.根据权利要求5所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，利用1.5％-2.0％浓度的琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310549753.7A CN116574812B (zh) | 2023-05-15 | 2023-05-15 | 一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310549753.7A CN116574812B (zh) | 2023-05-15 | 2023-05-15 | 一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN116574812A true CN116574812A (zh) | 2023-08-11 |
| CN116574812B CN116574812B (zh) | 2024-05-17 |
Family
ID=87535364
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202310549753.7A Active CN116574812B (zh) | 2023-05-15 | 2023-05-15 | 一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN116574812B (zh) |
Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20110057971A (ko) * | 2009-11-25 | 2011-06-01 | 한국 한의학 연구원 | Ｅｌｏｖｌ２의 일배체를 바이오 마커로 이용한 뇌졸중 진단방법 |
| CN104694650A (zh) * | 2015-03-13 | 2015-06-10 | 广东智威农业科技股份有限公司 | 一种鉴别鸡饲料利用效率的分子检测方法及其应用和试剂盒 |
| CN113846171A (zh) * | 2021-10-11 | 2021-12-28 | 安徽农业大学 | 一种基于pik3r1基因鉴定鸡饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
| CN114703298A (zh) * | 2022-05-09 | 2022-07-05 | 安徽农业大学 | 一种基于神经肽基因npy鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用 |
| CN114703299A (zh) * | 2022-05-09 | 2022-07-05 | 安徽农业大学 | 一种基于神经肽y5受体npy5r基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用 |
| CN116555442A (zh) * | 2023-05-23 | 2023-08-08 | 安徽农业大学 | 一种基于atp2a2基因鉴定鸡饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
| CN116606937A (zh) * | 2023-05-15 | 2023-08-18 | 安徽农业大学 | 一种基于osbpl8基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
-
2023
- 2023-05-15 CN CN202310549753.7A patent/CN116574812B/zh active Active
Patent Citations (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20110057971A (ko) * | 2009-11-25 | 2011-06-01 | 한국 한의학 연구원 | Ｅｌｏｖｌ２의 일배체를 바이오 마커로 이용한 뇌졸중 진단방법 |
| CN104694650A (zh) * | 2015-03-13 | 2015-06-10 | 广东智威农业科技股份有限公司 | 一种鉴别鸡饲料利用效率的分子检测方法及其应用和试剂盒 |
| CN113846171A (zh) * | 2021-10-11 | 2021-12-28 | 安徽农业大学 | 一种基于pik3r1基因鉴定鸡饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
| CN114703298A (zh) * | 2022-05-09 | 2022-07-05 | 安徽农业大学 | 一种基于神经肽基因npy鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用 |
| CN114703299A (zh) * | 2022-05-09 | 2022-07-05 | 安徽农业大学 | 一种基于神经肽y5受体npy5r基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用 |
| CN116606937A (zh) * | 2023-05-15 | 2023-08-18 | 安徽农业大学 | 一种基于osbpl8基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
| CN116555442A (zh) * | 2023-05-23 | 2023-08-08 | 安徽农业大学 | 一种基于atp2a2基因鉴定鸡饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 |
Non-Patent Citations (5)
| Title |
|---|
| DANDAN WANG, ET AL.: "ELOVL gene family plays a virtual role in response to breeding selection and lipid deposition in different tissues in chicken (Gallus gallus)", 《BMC GENOMICS 》, no. 23, 17 October 2022 (2022-10-17) * |
| ONTERU S K, ET AL.: "Whole genome association studies of residual feed intake and related traits in the pig", 《PLOS ONE》, vol. 8, no. 6, 26 June 2013 (2013-06-26) * |
| 母童等: "静原鸡ELOVL2基因遗传多态性研究", 《中国畜牧兽医》, vol. 45, no. 3, 20 March 2018 (2018-03-20) * |
| 王敏等: "脂肪酸结合蛋白基因多态及其与肉鸡屠宰性能的关联分析", 《畜牧兽医杂志》, vol. 34, no. 2, 10 March 2015 (2015-03-10) * |
| 金四华等: "肉鸭PRKAG2基因表达水平与饲料效率性状的相关性分析", 《安徽农业大学学报》, vol. 45, no. 4, 28 August 2018 (2018-08-28) * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN116574812B (zh) | 2024-05-17 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN103898107B (zh) | 影响猪生长性状的主效snp标记及其在种猪生产性能遗传改良中的应用 | |
| CN103911373B (zh) | 影响猪肉脂肪酸组分的主效snp标记及其在种猪肉质性状遗传改良中的应用 | |
| CN109694915B (zh) | 一种与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用 | |
| CN113913538B (zh) | 一种与鸡屠体性状相关的snp分子标记及应用 | |
| CN106498052B (zh) | 一个影响山羊早期生长的分子标记、检测方法及其应用 | |
| CN109371143B (zh) | 与猪生长性状相关联的snp分子标记 | |
| CN110643716B (zh) | 一种与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用 | |
| CN109811063B (zh) | 一种与猪生长速度相关的snp分子标记及其应用 | |
| CN108728552A (zh) | 一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及应用 | |
| CN114908176B (zh) | 一种与鸡屠体和生长性状相关的分子标记及其应用 | |
| CN112195253B (zh) | 一种提高鸡肉脂肪酸c14:0含量的snp位点及其选育优质鸡品系的方法 | |
| CN111926086B (zh) | 一种影响鸡体斜长的分子标记及其应用 | |
| CN105063021A (zh) | 与猪脂肪沉积相关的snp分子标记及其应用 | |
| CN116606937B (zh) | 一种基于osbpl8基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 | |
| CN116555442B (zh) | 一种基于atp2a2基因鉴定鸡饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 | |
| CN101921852B (zh) | 一种检测黄牛AdPLA基因单核苷酸多态性的方法 | |
| CN112921101A (zh) | 一种与绵羊剩余采食量相关的分子标记及其应用 | |
| CN103243155B (zh) | 黄牛cidec基因单核苷酸多态性位点的快速检测方法与应用 | |
| CN104593363A (zh) | 一种肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记及其应用 | |
| CN107858440A (zh) | 一种与猪初生重性状相关的snp标记及其用途 | |
| CN116574812B (zh) | 一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用 | |
| CN110079613A (zh) | 荷斯坦牛热应激耐受能力的分子标记及检测方法 | |
| CN112176073B (zh) | 鸡屠体性状相关的pros1基因分子标记及应用 | |
| CN108034734A (zh) | 一种筛选不同乳蛋白率奶牛的方法及其专用试剂盒 | |
| CN110157809B (zh) | 一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记检测试剂盒及其应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| GR01 | Patent grant |