CN115850354A - 一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 - Google Patents
一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115850354A CN115850354A CN202211428163.0A CN202211428163A CN115850354A CN 115850354 A CN115850354 A CN 115850354A CN 202211428163 A CN202211428163 A CN 202211428163A CN 115850354 A CN115850354 A CN 115850354A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- efrotomycin
- efrotomycins
- polyketide
- lividans
- sbt18
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Landscapes
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
技术领域:
本发明属于工业微生物领域,具体涉及聚酮类化合物efrotomycins A1-A4和efrotomycin B1及其制备方法和应用。
背景技术:
Efrotomycin属于elfamycin家族抗生素,作用于细菌延长因子从而抑制蛋白质合成,因而具有窄谱抗菌活性。本发明从放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679中分离得到了新颖的糖基化elfamycin抗生素:efrotomycins A1-A4,并通过异源表达efrotomycin的生物合成基因簇获得了非糖基化的efrotomycin B1。
发明内容:
本发明的目的是克服现有技术中的缺陷,提供聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用。
本发明的第一个目的是提供聚酮类化合物efrotomycins A1-A4(1-4)和efrotomycin B1(5),其结构如式(I)所示:
本发明的第二个目的是提供一种重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112,其特征在于,是将聚酮类化合物efrotomycin的生物合成基因簇转化到Streptomyces lividansSBT18中而获得。
本发明的第三个目的是提供放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679在制备所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4中的应用。
本发明的第四个目的提供是重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112在制备聚酮类化合物efrotomycin B1中的应用。
本发明的第五个目的提供所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4的制备方法,其特征在于,所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4是从放线菌A.cihanbeyliensisDSM 45679的发酵培养物中分离得到的。
优选,具体步骤为:
a、将放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679用AM3培养基发酵培养,获得发酵培养物,离心分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用大孔树脂XAD-16吸附,然后用丙酮洗脱;菌丝体用甲醇浸提并超声破碎细胞,两者回收有机溶剂后剩余的水相用乙酸乙酯萃取,减压浓缩至干,得到放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的AM3培养基粗提物;
b、将粗提物经正相硅胶柱层析分离,用氯仿/甲醇作为洗脱剂,依次从体积比100:0,10:1,4:1,2:1,0:100梯度洗脱,收集氯仿/甲醇体积比10:1洗脱下来的流分Fr.2;流份Fr2经正相硅胶柱层析分离,从环己烷/乙酸乙酯2:1、环己烷/乙酸乙酯1:1、环己烷/乙酸乙酯1:2、乙酸乙酯、丙酮,v/v为洗脱剂进行梯度洗脱,收集乙酸乙酯洗脱的流份Fr2-4;流份Fr2-4用凝胶柱层析,以氯仿/甲醇1:1,v/v为洗脱剂进行分离,得到流份Fr2-4-1-Fr2-4-4;流份Fr2-4-2经中压反相色谱,以水和乙腈为洗脱剂进行梯度洗脱,得到流份Fr2-4-2-1-Fr2-4-2-13;流份Fr2-4-2-8经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin A1和efrotomycinA2;流份Fr2-4-2-7经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin A3和efrotomycin A4。
优选,放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679发酵培养的方法为:将活化的放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养3d得到种子液;将种子液以10%,v/v的接种量接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养5-7d后得到发酵培养物;AM3培养基:黄豆粉5g,细菌学蛋白胨15g,可溶性淀粉15g,甘油15g,CaCO3 2g,海盐30g,加纯净水至1L,pH 7.2-7.4。
本发明的第六个目的是提供聚酮类化合物efrotomycin B1的制备方法,其特征在于,所述的聚酮类化合物efrotomycin B1是从重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的发酵培养物中分离得到的。
优选,具体步骤为:
a、将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112用AM3培养基发酵培养,获得发酵培养物,离心分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用大孔树脂XAD-16吸附,然后用丙酮洗脱;菌丝体用甲醇浸提并超声破碎细胞,两者回收有机溶剂后剩余的水相用乙酸乙酯萃取,减压浓缩至干,得到重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的AM3培养基粗提物;
b、将粗提物经正相硅胶柱层析分离,用氯仿、氯仿/甲醇4:1、氯仿/甲醇2:1、甲醇,v/v进行梯度洗脱,依次得到流份Fr1-Fr4;将氯仿/甲醇4:1,v/v洗脱的流份Fr2用凝胶柱层析,以氯仿/甲醇1:1,v/v为洗脱剂进行分离,得到流份Fr2-1-Fr2-4;流份Fr2-2经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin B1。
优选,重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112发酵培养的方法为:将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养5-7d后得到发酵培养物。
本发明的第七个目的是提供所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4、efrotomycin B1或其药用盐在制备抗菌药物中的应用。所述的抗菌药物是抗藤黄微球菌和链霉菌的药物。
本发明从放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的AM3培养基发酵培养物中分离得到了4个新化合物efrotomycins A1-A4,并在异源宿主S.lividans SBT18成功表达了包含聚酮类化合物efrotomycin生物合成基因簇的BAC质粒pCSG8112,产生了新化合物efrotomycin B1;聚酮类化合物efrotomycins A1-A4和efrotomycin B1具有抗藤黄微球菌和链霉菌活性,能用于制备抗藤黄微球菌和链霉菌的活性药物。
本发明的放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679公开于文献:Tatar,D.;Sazak,A.;Guven,K.;Cetin,D.;Sahin,N.Int.J.Syst.Evol.Microbiol.2013,63,3739-3743。该菌株本申请人也持有,保证自20年内向公众提供。
本发明的异源表达宿主链霉菌S.lividans SBT18公开于文献:Peng,Q.Y.;Gao,G.X.;Lu,J.;Long,Q.S.;Chen,X.F.;Zhang,F.;Xu,M.;Liu,K.;Wang,Y.M.;Deng,Z.X.;Li,Z.Y.;Tao,M.F.Front.Microbiol.2018,9。该菌株本申请人也持有,保证自20年内向公众提供。
附图说明:
图1是聚酮类化合物efrotomycins A1-A4和efrotomycin B1的化合物结构。
图2是efrotomycin生物合成基因簇示意图。
图3是efrotomycin生物合成基因簇在BAC质粒pCSG8112中的位置。
图4是efrotomycin生物合成基因簇在S.lividans SBT18中异源表达的HPLC图谱。(i)异源表
达宿主菌S.lividans SBT18包含质粒pSET152;(ii)异源表达宿主菌S.lividansSBT18包含质粒pCSG8112;(iii)化合物efrotomycins A1-A4(1-4)的标准品。
图5是化合物1-5对链霉菌毒性的纸片扩散实验。
图6是化合物efrotomycin A1(1)的HR-ESI-MS谱图。
图7是化合物efrotomycin A1(1)的1H NMR(δH 7.70-4.20)谱图。
图8是化合物efrotomycin A1(1)的1H NMR(δH 4.20-0.50)谱图。
图9是化合物efrotomycin A1(1)的13C和DEPT135 NMR谱图。
图10是化合物efrotomycin A1(1)的HSQC谱图。
图11是化合物efrotomycin A1(1)的COSY谱图。
图12是化合物efrotomycin A1(1)的HMBC谱图。
图13是化合物efrotomycin A1(1)的ROESY谱图。
图14是化合物efrotomycin A1(1)的J-HMBC谱图。
图15是化合物efrotomycin A2(2)的HR-ESI-MS谱图。
图16是化合物efrotomycin A2(2)的1H NMR(δH 7.70-4.10)谱图。
图17是化合物efrotomycin A2(2)的1H NMR(δH 4.20-0.40)谱图。
图18是化合物efrotomycin A2(2)的13C和DEPT135 NMR谱图。
图19是化合物efrotomycin A2(2)的HSQC谱图。
图20是化合物efrotomycin A2(2)的COSY谱图。
图21是化合物efrotomycin A2(2)的HMBC谱图。
图22是化合物efrotomycin A2(2)的ROESY谱图。
图23是化合物efrotomycin A2(2)的J-HMBC谱图。
图24是化合物efrotomycin A3(3)的HR-ESI-MS谱图。
图25是化合物efrotomycin A3(3)的1H NMR(δH 7.70-4.00)谱图。
图26是化合物efrotomycin A3(3)的1H NMR(δH 4.00-0.50)谱图。
图27是化合物efrotomycin A3(3)的13C和DEPT135 NMR谱图。
图28是化合物efrotomycin A3(3)的HSQC谱图。
图29是化合物efrotomycin A3(3)的COSY谱图。
图30是化合物efrotomycin A3(3)的HMBC谱图。
图31是化合物efrotomycin A3(3)的ROESY谱图。
图32是化合物efrotomycin A3(3)的J-HMBC谱图。
图33是化合物efrotomycin A4(4)的HR-ESI-MS谱图。
图34是化合物efrotomycin A4(4)的1H NMR(δH 7.70-4.00)谱图。
图35是化合物efrotomycin A4(4)的1H NMR(δH 4.10-0.60)谱图。
图36是化合物efrotomycin A4(4)的13C和DEPT135 NMR谱图。
图37是化合物efrotomycin A4(4)的HSQC谱图。
图38是化合物efrotomycin A4(4)的COSY谱图。
图39是化合物efrotomycin A4(4)的HMBC谱图。
图40是化合物efrotomycin A4(4)的ROESY谱图。
图41是化合物efrotomycin A4(4)的J-HMBC谱图。
图42是化合物efrotomycin B1(5)的HR-ESI-MS谱图。
图43是化合物efrotomycin B1(5)的1H NMR(δH 7.80-4.00)谱图。
图44是化合物efrotomycin B1(5)的1H NMR(δH 4.20-0.50)谱图。
图45是化合物efrotomycin B1(5)的13C和DEPT135 NMR谱图。
图46是化合物efrotomycin B1(5)的HSQC谱图。
图47是化合物efrotomycin B1(5)的COSY谱图。
图48是化合物efrotomycin B1(5)的HMBC谱图。
图49是化合物efrotomycin B1(5)的ROESY谱图。
图50是化合物efrotomycin B1(5)的J-HMBC谱图。
具体实施方式:
以下实施例是对本发明的进一步说明,而不是本发明的限制。
1.放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679中efrotomycins A1-A4的分离
通过培养基筛选,选用AM3培养基对放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679进行放大发酵培养,萃取后获得发酵粗提物,然后采用正相、反相、凝胶、HPLC等分离手段从发酵粗提物分离得到了4个聚酮类化合物efrotomycins A1-A4(图1)。
2.聚酮类化合物efrotomycins A1-A4生物合成基因簇的定位与异源表达
聚酮类化合物efrotomycins A1-A4属于elfamycin家族抗生素,以elfamycin家族抗生素中已报道的kirromycin生物合成基因簇为导向,通过比较基因组学在放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的基因组中定位了efrotomycin的生物合成基因簇efr(图2)。为验证efr基因簇是否负责efrotomycins的合成,将筛选得到的包含efr基因簇的BAC质粒pCSG8112进行异源表达,结果在异源宿主S.lividans SBT18中成功表达了efr基因簇(图4),并分离得到了异源表达产物efrotomycin B1。
3.聚酮类化合物efrotomycins A1-A4和efrotomycin B1的生物活性评价
采用Mueller-Hinton肉汤微量稀释法对聚酮类化合物efrotomycins A1-A4和efrotomycin B1进行抗菌活性评价,发现5个化合物对藤黄微球菌Micrococcus luteusSCSIO ML01均具有中等程度的抑制作用。采用纸片扩散实验测试化合物1-5对3个链霉菌的毒性,发现5个化合物对链霉菌S.albus Del14均具有毒性,efrotomycins A1(1)和efrotomycin B1(5)对链霉菌S.lividans SBT18和S.coelicolor YF11也有毒性(图5)。
以下进一步提供实施实例,这些实施实例有助于理解本发明,仅用作说明而不是对本发明的限制。
实施例1:聚酮类化合物efrotomycins A1-A4的分离和制备
1.放大发酵培养
将放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679在ISP4培养基固体平板上活化后,刮取适量菌丝体接种到50mL AM3培养基中,28℃摇床200rpm培养3d得到种子液;将种子液以10%,v/v的接种量接入含200mL AM3培养基(共15L)的三角瓶中,28℃摇床200rpm培养5-7d后得到发酵培养物。
ISP4培养基:可溶性淀粉10g,(NH4)2SO4 2g,K2HPO4 1g,CaCO3 2g,NaCl 1g,MgSO4·7H2O 1g,1×微量元素1mL,海盐30g,加纯净水至1L,pH 7.2-7.4。
AM3培养基:黄豆粉5g,细菌学蛋白胨15g,可溶性淀粉15g,甘油15g,CaCO3 2g,海盐30g,加纯净水至1L,pH 7.2-7.4。
2.发酵液的萃取
发酵培养物3900rpm离心20min后分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用2L大孔树脂XAD-16吸附,然后用15L丙酮洗脱;菌丝体用1L甲醇浸提4次,每次超声破碎细胞1h。然后用旋转蒸发仪回收两部分中的有机溶剂,剩余的水相合并后用1L乙酸乙酯萃取10次,旋转蒸发仪回收乙酸乙酯后得到放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的AM3培养基粗提物。
3.化合物的分离
将放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的AM3培养基粗提物(30.0g)用氯仿甲醇(体积比1:1)溶解,加入70mL 100-200目硅胶旋蒸拌样,以拌样硅胶(70mL)/分离硅胶(200mL)1:3干法装柱,用氯仿/甲醇作为洗脱剂进行梯度洗脱(氯仿、氯仿/甲醇10:1、氯仿/甲醇4:1、氯仿/甲醇2:1、甲醇,v/v),依次得到流份Fr1到Fr5。将流份Fr2(氯仿/甲醇10:1洗脱流份,10.0g)再次用氯仿甲醇(体积比1:1)溶解,加入20mL 100-200目硅胶旋蒸拌样,以拌样硅胶(20mL)/分离硅胶(100mL)1:5干法装柱,用环己烷/乙酸乙酯作为洗脱剂进行梯度洗脱(环己烷/乙酸乙酯2:1、环己烷/乙酸乙酯1:1、环己烷/乙酸乙酯1:2、乙酸乙酯、丙酮,v/v),依次得到流份Fr2-1到Fr2-5。将流份Fr2-4(乙酸乙酯洗脱流份)用SephadexLH-20凝胶柱层析(120cm×3cm,氯仿/甲醇1:1,v/v)进行分离,每10mL接收一瓶,根据TLC检测结果合并得到流份Fr2-4-1到Fr2-4-4。将流份Fr2-4-2(第6-13瓶)经中压反相色谱(YMC*GELODS-A-HG,12nm S-50μm)用A相/B相=水/乙腈(v/v)根据以下程序进行洗脱:10%B(0-20min),10%B-20%B(20-30min),20%B(30-50min),20%B-30%B(50-60min),30%B(60-90min),30%B-40%B(90-110min),40%B(110-140min),40%B-50%B(140-150min),50%B(150-170min),50%B-70%B(170-180min),70%B(180-200min),70%B-90%B(200-210min),90%B(210-240min),依次得到流份Fr2-4-2-1到Fr2-4-2-13。
将流份Fr2-4-2-8[40%B-50%B(140-150min)洗脱流份]采用半制备高效液相色谱(Phenomenex Kinetex C18,250mm×10.0mm,5μm;A相为水,B相为乙腈,48%的B相等度洗脱;流速为2.5mL·min-1;检测波长为360nm)纯化得到化合物efrotomycin A1(1)(Rt=20.0min)和efrotomycin A2(2)(Rt=22.0min)。将流份Fr2-4-2-7[40% B(110-140min)洗脱流份]采用半制备高效液相色谱(Phenomenex Kinetex C18,250mm×10.0mm,5μm;A相为水,B相为乙腈,45%的B相等度洗脱;流速为2.5mL·min-1;检测波长为360nm)纯化得到化合物efrotomycin A3(3)(Rt=18.0min)和efrotomycin A4(4)(Rt=19.5min)。
4.化合物的结构鉴定
化合物1-4的结构根据HR-ESI-MS、1H NMR、13C NMR、DEPT135、HSQC、COSY、HMBC、ROESY和J-HMBC谱图进行鉴定,其核磁数据归属见表1和表2。化合物efrotomycin A1(1)的谱图见图6-14,efrotomycin A2(2)的谱图见图15-23,efrotomycin A3(3)的谱图见图24-32,efrotomycin A4(4)的谱图见图33-41。
由此确定化合物1-4的结构式如下所示:
表1.化合物1和2的1H(700MHz)和13C(175MHz)核磁数据(CD3OD)
续表
表2.化合物3和4的1H(700MHz)和13C(175MHz)核磁数据(CD3OD)
续表
实施例2:聚酮类化合物efrotomycins A1-A4生物合成基因簇的定位
聚酮类化合物efrotomycins A1-A4属于elfamycin家族抗生素。在elfamycin家族抗生素中,kirromycin、factumycin和aurodox的生物合成基因簇已经被报道。以kirromycin的生物合成基因簇为导向,通过比较基因组学在放线菌A.cihanbeyliensisDSM 45679的基因组(GenBank accession no.VFML01000000)中定位了efrotomycin的生物合成基因簇efr(GenBank accession no.OP381654,图2)。efrotomycin基因簇efr与kirromycin基因簇kir的相似度较高,含有20个开放阅读框(表3),其中5个trans-AT PKS基因(efrAI、efrAII和efrAIV-efrAVI)、2个trans-AT基因(efrCI和efrCII)、1个PKS/NRPS基因(efrAIII)、1个NRPS基因(efrB)和1个环化酶基因(efrH)负责聚酮骨架的合成。另外5个基因,包括2个糖基转移酶基因(efrGI和efrGII)、2个甲基转移酶基因(efrMIII和efrMIV)和1个还原酶基因(efrOIV)负责二糖单元的合成与组装。剩余的2个P450酶基因(efrOI和efrOII)、2个甲基转移酶基因(efrMI和efrMII)和1个双加氧酶基因(efrOIII)可能编码后修饰酶。然而,kir基因簇中编码前体供应蛋白、转运蛋白、调控蛋白和一些未知功能蛋白的基因在efr基因簇中不存在(表3)。
表3.Efrotomycin生物合成基因簇的基因功能注释
续表
实施例3:包含efrotomycin生物合成基因簇BAC质粒的筛选
根据efrotomycin生物合成基因簇的上下游边界基因设计检测引物Efr-testF1/R1和Efr-testF2/R2(表4)对放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的BAC文库进行筛选,获得阳性BAC质粒pCSG8112,经末端测序确认pCSG8112包含efrotomycin生物合成基因簇的所有基因(图3)。
表4.本发明中使用的引物
实施例4:重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的构建
通过三亲本接合转移的方法将BAC质粒pCSG8112导入异源宿主S.lividans SBT18中,接合转移过程具体说明如下:链霉菌S.lividans SBT18在MS固体培养基平板上培养5-7d后,用已灭菌竹签刮取适量的孢子收集于500μL TSB培养基中,振荡混匀,50℃热激10min,28℃摇床200rpm复苏2h,作为接合转移的受体菌。将供体菌EscherichiacoliDH10B/pCSG8112接种于5mL LB液体培养基中(含50μg·mL-1阿泊拉霉素),同时将助体菌E.coli ET12567/pUB307接种于5mL LB液体培养基中(含50μg·mL-1卡那霉素和50μg·mL-1氯霉素),37℃摇床200rpm过夜培养。然后取100μL过夜培养的E.coliDH10B/pCSG8112和E.coli ET12567/pUB307分别转接到10mL LB液体培养基中(含50μg·mL-1阿泊拉霉素-针对供体菌的LB液体培养基,或含50μg·mL-1卡那霉素和50μg·mL-1氯霉素-针对助体菌的LB培养基),37℃摇床200rpm培养3-4h至OD600值约为0.6,3900rpm离心10min收集2种菌体,用10mL无抗的LB液体培养基清洗2次,分别悬浮于250μLLB液体培养基中。最后将250μL供体菌、250μL助体菌和500μL受体菌混匀,涂布于Mg2+终浓度为20mM的ISP4培养基无抗固体平板上,吹干,28℃培养箱倒置培养18-20h。将平板取出,用含抗生素的水(含50μg·mL-1阿泊拉霉素和100μg·mL-1甲氧苄啶)覆盖平板,吹干后置于28℃培养箱倒置培养5-7d。待接合子长出后,划线到MS培养基固体平板上(含50μg·mL-1阿泊拉霉素和100μg·mL-1甲氧苄啶)。28℃培养箱倒置培养2d后,提取接合子的基因组DNA用检测引物Efr-testF1/R1和Efr-testF2/R2(表4)进行验证,阳性克隆即为重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112。
实施例5:重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的发酵检测
将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112在MS培养基固体平板上(含50μg·mL-1阿泊拉霉素和100μg·mL-1甲氧苄啶)培养5d后,用已灭菌竹签刮取少量菌体接种于50mL AM3培养基中,28℃摇床200rpm培养5d后取样5mL菌体,加入5mL丁酮萃取,超声破碎30min后3900rpm离心10min,取上清于2mL离心管中,旋转蒸干有机溶剂,剩余粗提物加入50μL DMSO溶解并进样HPLC检测。
HPLC条件:色谱柱为Phenomenex Kinetex C18,150mm×4.6mm,5μm;流动相A相:10%乙腈/水(v/v)+0.1%的甲酸(v/v),B相:90%的乙腈/水(v/v);进样程序:5%B-80%B(0-20min),80%B-100%B(20-21min),100%B(21-25min),100%B-5%B(25-26min),5%B(26-30min),检测波长360nm,流速1mL·min-1。
结果发现重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112能够产生与efrotomycins A1-A4(1-4)保留时间不同的efrotomycin同系物,而对照菌株S.lividans SBT18/pSET152中并无efrotomycin同系物产生(图4)。
实施例6:聚酮类化合物efrotomycin B的分离和制备
1.放大发酵培养
将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112在MS培养基固体平板上(含50μg·mL-1阿泊拉霉素和100μg·mL-1甲氧苄啶)活化后,刮取适量菌丝体接种到含50mL AM3培养基(共20L)的三角瓶中,28℃摇床200rpm培养5-7d后得到发酵培养物。
2.发酵液的萃取
发酵培养物3900rpm离心20min后分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用1L大孔树脂XAD-16吸附,然后用10L丙酮洗脱;菌丝体用1L甲醇浸提4次,每次超声破碎细胞1h。然后用旋转蒸发仪回收两部分中的有机溶剂,剩余的水相合并后用1L乙酸乙酯萃取10次,旋转蒸发仪回收乙酸乙酯后得到重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的AM3培养基粗提物。
3.化合物的分离
将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的AM3培养基粗提物(13.2g)用氯仿甲醇(体积比1:1)溶解,加入50mL 100-200目硅胶旋蒸拌样,以拌样硅胶(50mL)/分离硅胶(150mL)1:3干法装柱,用氯仿/甲醇作为洗脱剂进行梯度洗脱(氯仿、氯仿/甲醇4:1、氯仿/甲醇2:1、甲醇,v/v),依次得到流份Fr1到Fr4。将流份Fr2(氯仿/甲醇4:1洗脱流份)用Sephadex LH-20凝胶柱层析(120cm×3cm,氯仿/甲醇1:1,v/v)进行分离,每10mL接收一瓶,根据TLC检测结果合并得到流份Fr2-1到Fr2-4。将流份Fr2-2(第14-25瓶)采用半制备高效液相色谱(Phenomenex Kinetex C18,250mm×10.0mm,5μm;A相为水,B相为乙腈,50%的B相等度洗脱;流速为2.5mL·min-1;检测波长为360nm)纯化得到化合物efrotomycin B1(5)(Rt=17.0min)。
4.化合物的结构鉴定
化合物5的结构根据HR-ESI-MS、1H NMR、13C NMR、DEPT135、HSQC、COSY、HMBC、ROESY和J-HMBC谱图进行鉴定,其核磁数据归属见表5。化合物efrotomycin B1(5)的谱图见图42-50。
由此确定化合物5的结构式如下所示:
表5.化合物5的1H(700MHz)和13C(175MHz)核磁数据(CD3OD)
实施例7:化合物1-5的抗菌活性测定
采用Mueller-Hinton肉汤微量稀释法测定了聚酮类化合物efrotomycins A1-A4(1-4)和efrotomycin B1(5)对5种革兰氏阳性菌Enterococcus faecalis ATCC 29212、Staphylococcus aureus ATCC 29213、methicillin-resistant Staphylococcus aureusshhs-A1(clinical sample)、Micrococcus luteus SCSIO ML01、Bacillus subtilis 1064和3种革兰氏阴性菌Acinetobacter baumannii 19606、E.coli ATCC 25922、Klebsiellapneumoniae ATCC 13883的抑制活性。8种指示菌用MH培养基37℃摇床200rpm培养16h后,用无菌MH培养基稀释到OD600值约为0.04-0.06,再稀释10倍加入到96孔板中;加入样品后,等倍稀释到样品终浓度为64-0.125μg·mL-1,每个浓度3个平行;37℃静置培养18h,用酶标仪测定各孔在波长600nm处的吸光值,并计算各个化合物的最小抑菌浓度(MIC),抑制率(%)=[1-(A样品-A样品背景)/(A阴性对照-A空白对照)]×100%,抑制率>80%时的样品浓度即为MIC值。结果发现聚酮类化合物efrotomycins A1-A4(1-4)和efrotomycin B1(5)对藤黄微球菌Micrococcus luteus SCSIO ML01均具有中等程度的抑制作用(表6)。
表6.化合物1-5的抗菌活性
a.Van:Vancomycin,革兰氏阳性菌的阳性对照;b.Cip:Ciprofloxacin,革兰氏阴性菌的阳性对照。
实施例8:化合物1-5的链霉菌毒性测定
采用平板纸片扩散法测试了聚酮类化合物efrotomycins A1-A4(1-4)和efrotomycin B1(5)对3种链霉菌S.lividans SBT18、S.albus Del14和S.coelicolor YF11的毒性。将链霉菌S.lividans SBT18、S.albus Del14和S.coelicolor YF11在MS固体平板上培养5-7d后,用已灭菌竹签刮取适量的孢子收集于500μL TSB培养基中,混匀后涂布于MS固体平板上,吹干后将直径6mm已灭菌滤纸片贴于平板表面,加入5μL样品(浓度为2mg·mL-1)于滤纸片上,28℃倒置培养24h,DMSO和apramycin分别为阴性和阳性对照。结果发现化合物1-5对链霉菌S.albus Del14均具有明显毒性,化合物efrotomycins A1(1)和efrotomycin B1(5)对链霉菌S.lividans SBT18和S.coelicolor YF11也具有毒性(图5)。
Claims (10)
2.一种重组菌株Streptomyces lividans SBT18/pCSG8112,其特征在于,是将权利要求1所述的聚酮类化合物efrotomycin的生物合成基因簇转化到Streptomyces lividansSBT18中而获得。
3.放线菌Amycolatopsis cihanbeyliensis DSM 45679在制备权利要求1中所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4中的应用。
4.权利要求2所述的重组菌株Streptomyces lividans SBT18/pCSG8112在制备权利要求1中所述的聚酮类化合物efrotomycin B1中的应用。
5.一种权利要求1所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4的制备方法,其特征在于,所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4是从放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679的发酵培养物中制备得到的。
6.根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于,具体步骤如下:
a、放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679发酵培养,获得发酵培养物,离心分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用大孔树脂吸附后用丙酮洗脱,菌丝体用甲醇浸提并超声破碎细胞,两者回收有机溶剂后剩余的水相用乙酸乙酯萃取,减压浓缩至干,得到粗提物;
b、将粗提物经正相硅胶柱层析分离,用氯仿/甲醇作为洗脱剂,依次从体积比100:0,10:1,4:1,2:1,0:100梯度洗脱,收集氯仿/甲醇体积比10:1洗脱下来的流分Fr.2;流份Fr2经正相硅胶柱层析分离,从环己烷/乙酸乙酯2:1、环己烷/乙酸乙酯1:1、环己烷/乙酸乙酯1:2、乙酸乙酯、丙酮,v/v为洗脱剂进行梯度洗脱,收集乙酸乙酯洗脱的流份Fr2-4;流份Fr2-4用凝胶柱层析,以氯仿/甲醇1:1,v/v为洗脱剂进行分离,得到流份Fr2-4-1-Fr2-4-4;流份Fr2-4-2经中压反相色谱,以水和乙腈为洗脱剂进行梯度洗脱,得到流份Fr2-4-2-1-Fr2-4-2-13;流份Fr2-4-2-8经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin A1和efrotomycinA2;流份Fr2-4-2-7经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin A3和efrotomycin A4;
所述的放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679发酵培养的方法为:将活化的放线菌A.cihanbeyliensis DSM 45679接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养3d得到种子液;将种子液以10%,v/v的接种量接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养5-7d后得到发酵培养物;每升AM3培养基:黄豆粉5g,细菌学蛋白胨15g,可溶性淀粉15g,甘油15g,CaCO32g,海盐30g,加纯净水至1L,pH 7.2-7.4。
7.一种权利要求1所述的聚酮类化合物efrotomycin B1的制备方法,其特征在于,所述的聚酮类化合物efrotomycin B1是从权利要求2所述的重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112的发酵培养物中制备得到的。
8.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于,具体步骤为:
a、将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112发酵培养,获得发酵培养物,离心分别收集发酵液和菌丝体,发酵液用大孔树脂吸附后用丙酮洗脱,菌丝体用甲醇浸提并超声破碎细胞,两者回收有机溶剂后剩余的水相用乙酸乙酯萃取,减压浓缩至干,得到粗提物;
b、将粗提物经正相硅胶柱层析分离,用氯仿/甲醇作为洗脱剂,依次从体积比100:0,4:1,2:1,0:100梯度洗脱,收集氯仿/甲醇体积比4:1洗脱下来的流分Fr.2;流份Fr2用凝胶柱层析,以氯仿/甲醇1:1,v/v为洗脱剂进行分离,得到流份Fr2-1-Fr2-4;流份Fr2-2经半制备HPLC纯化得到化合物efrotomycin B1;
所述的重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112发酵培养的方法为:将重组菌株S.lividans SBT18/pCSG8112接入AM3培养基中,28℃,200rpm培养5-7d后得到发酵培养物。每升AM3培养基:黄豆粉5g,细菌学蛋白胨15g,可溶性淀粉15g,甘油15g,CaCO3 2g,海盐30g,加纯净水至1L,pH 7.2-7.4。
9.权利要求1中所述的聚酮类化合物efrotomycins A1-A4、efrotomycin B1或其药用盐在制备抗菌药物中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述的抗菌药物是抗藤黄微球菌或链霉菌的药物。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211428163.0A CN115850354A (zh) | 2022-11-15 | 2022-11-15 | 一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211428163.0A CN115850354A (zh) | 2022-11-15 | 2022-11-15 | 一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN115850354A true CN115850354A (zh) | 2023-03-28 |
Family
ID=85663525
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202211428163.0A Pending CN115850354A (zh) | 2022-11-15 | 2022-11-15 | 一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN115850354A (zh) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN117510441A (zh) * | 2023-11-16 | 2024-02-06 | 云南大学 | 一种具有抗植物病原菌活性的酮类化合物penlactone A及其制备方法 |
-
2022
- 2022-11-15 CN CN202211428163.0A patent/CN115850354A/zh active Pending
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN117510441A (zh) * | 2023-11-16 | 2024-02-06 | 云南大学 | 一种具有抗植物病原菌活性的酮类化合物penlactone A及其制备方法 |
CN117510441B (zh) * | 2023-11-16 | 2024-04-26 | 云南大学 | 一种具有抗植物病原菌活性的酮类化合物penlactone A及其制备方法 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP2514828B1 (en) | Process for preparing purified ansamitocins | |
US20080044861A1 (en) | Methods for Recovering Isoflavones from Fermentation Processes | |
CN115850354A (zh) | 一种聚酮类化合物efrotomycin及其制备方法和应用 | |
Ciciliato et al. | Antibiotics GE23077, novel inhibitors of bacterial RNA polymerase I. taxonomy, isolation and characterization | |
JP4054576B2 (ja) | 抗生物質トリプロペプチン類およびその製造法 | |
CN111170975B (zh) | 抗生素lobophorin及其制备方法和应用 | |
CN109762046B (zh) | 环肽类抗生素及其制备方法和在制备抗结核分枝杆菌药物中的应用 | |
US6287827B1 (en) | Halo- or hydroxy-substituted nocathiacin antibiotics | |
EP0327009A1 (en) | WS-9326A, WS-9326B and their derivatives | |
WO1995034558A1 (en) | Chondramides, production methods, compositions comprising chondramides and cultures for chondramide production | |
CN114989190B (zh) | 一类大环内酯类化合物kongjuemycins及其制备方法和应用 | |
CN114349762B (zh) | 一类骨架新颖的6/6/6/6/5/5环生物碱类化合物及其在制备抗菌药物中的应用 | |
CN111285828A (zh) | 化合物proximicin及其制备方法和应用 | |
NZ244774A (en) | Protein-associated chromophore from actinomadura, pharmaceutical compositions and production | |
JP2592468B2 (ja) | 新規抗生物質ベナノマイシンaおよびbならびにその製造法 | |
NO164038B (no) | Mikrobiologisk frete for fremstilling av antracykl inderivater ved fermentering av streptomyces purpurascenshpl y-11472, dsm 2658. | |
CN115626942A (zh) | lobophorins N1-N3及其制备方法和应用 | |
EP0064555B1 (en) | Antibiotic 5057b | |
JPH08208690A (ja) | ペプチド化合物 | |
EP0289354A2 (en) | Antibiotic TAN-950A, its production and use | |
CN118063531A (zh) | 大环内酯类化合物PA-46101s C-E的制备及其应用 | |
CN114540376A (zh) | 一种抗肿瘤聚酮类化合物及其制备方法和用途 | |
JP3063804B2 (ja) | 新規マクロライド抗生物質sf2748物質およびその製造法 | |
CN112300109A (zh) | 一种fluorene类抗生素及其制备方法和在制备抗肿瘤药物和酶抑制剂中的应用 | |
AU2012201869B2 (en) | Methods for the production of ansamitocins |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |