CN114350777A - 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用 - Google Patents

一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN114350777A
CN114350777A CN202111520341.8A CN202111520341A CN114350777A CN 114350777 A CN114350777 A CN 114350777A CN 202111520341 A CN202111520341 A CN 202111520341A CN 114350777 A CN114350777 A CN 114350777A
Authority
CN
China
Prior art keywords
valproic acid
epilepsy
biomarker
application
rats
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202111520341.8A
Other languages
English (en)
Inventor
王燕
李友宾
李智平
王广飞
卢金淼
李小霞
谭佳佳
熊忠玉
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hainan Medical College
Original Assignee
Hainan Medical College
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hainan Medical College filed Critical Hainan Medical College
Priority to CN202111520341.8A priority Critical patent/CN114350777A/zh
Publication of CN114350777A publication Critical patent/CN114350777A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用,该生物标记物为p21的mRNA表达水平,该生物标记物对于研究癫痫患者对丙戊酸耐药的发生机制具有深远的意义。

Description

一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用
技术领域
本发明属于疾病诊断及预测的生物标志物领域,更具体地,涉及一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用。
背景技术
癫痫是一种由大脑神经元异常放电引起的慢性疾病,为全球重点防治的五大神经、精神疾病之一。全球约有7000万患者,其中我国患病人数约有1000万,且每年新增人数高达40万。癫痫的反复发作直接损害患者大脑、影响智力,进而导致意识障碍及性格异常,对患者家庭和社会造成严重的精神和经济负担。
药物是治疗癫痫的主要方法,但近40-50%的癫痫患者对第一次抗癫痫药物单药治疗无效,30%的患者正确使用2种以上抗癫痫药物治疗后仍无法控制癫痫的发作,称为药物难治性癫痫。药物难治性癫痫是目前抗癫痫治疗急需解决的难点,主要体现在:1)虽然近来不断有新的抗癫痫药物应用于临床,但难治性癫痫的患病率并无变化;2)难治性癫痫的最终诊断通常需要2年以上,在此期间癫痫的反复发作加重患者的脑功能损伤,并延误综合治疗(如手术)的最佳治疗时机。因此,引入药物治疗评估方面的生物标志物以早期预测难治性癫痫具有重要的临床意义。
丙戊酸是传统的抗癫痫药物,在临床上应用超过50年,因其具有广泛的抗癫痫作用,目前仍是多种类型癫痫的一线用药。目前,丙戊酸耐药是目前临床上抗癫痫治疗的难点,难治性癫痫患者大多服用2种以上的抗癫痫药物,而丙戊酸往往应用于联合用药的治疗中。研究发现丙戊酸存在明显的个体差异,部分患者对丙戊酸治疗抵抗,而对丙戊酸治疗不敏感的特发性全身性癫痫患者100%后期被诊断为药物难治性癫痫,说明丙戊酸不敏感是预后不良的重要因素。因此,寻找丙戊酸疗效差异的生物标记物对预测药物难治性癫痫具有重要意义。
发明内容
针对现有技术的至少一个缺陷或改进需求,本发明提供了一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用,其目的在于预测了一种癫痫患儿对丙戊酸耐药性的潜在生物标记物,该生物标记物对于研究丙戊酸耐药的发生机制具有指导意义。
为实现上述目的,按照本发明的一个方面,提供了一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物,其特征在于,所述标记物为p21的mRNA表达水平。
优选的,所述生物标记物在丙戊酸耐药癫痫患儿中的水平明显高于丙戊酸敏感癫痫患儿中的水平。
按照本发明的另一个方面,还提供了一种上述生物标记物在作为预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的标记物中的应用。
总体而言,通过本发明所构思的以上技术方案与现有技术相比,能够取得下列有益效果:
本发明通过应用丙戊酸敏感和丙戊酸耐药的癫痫患儿全血转录组结合癫痫大鼠的转录组进行整合分析,探索能够预测癫痫患儿对丙戊酸反应性的生物标记物,对于研究癫痫患者对丙戊酸耐药的发生机制,以及预测药物难治性癫痫具有重要意义。
附图说明
图1是本发明实施例提供的丙戊酸敏感组(n=3)和耐药组(n=3)转录组学分析;其中A)全血转录组学-热图;B)全血转录组学-信号通路富集分析;C)海马组织转录组学-热图;D)海马组织转录组学-信号通路富集分析图;
图2是本发明实施例提供的丙戊酸敏感组(n=3)和耐药组(n=3)大鼠全血和海马组织的共同差异基因;其中A)韦恩图;B)全血和海马组织中12个共同差异基因的表达情况(P<0.05);
图3是本发明实施例提供的p21和plek2基因在丙戊酸敏感和耐药大鼠全血、海马组织和患儿全血中的表达情况;其中A)p21;B)plek2;
图4是本发明实施例提供的p21和plek2基因在戊四唑致痫大鼠、丙戊酸敏感和耐药大鼠海马组织中的表达情况(n=6);其中A)p21;B)plek2图;
图5是本发明实施例提供的p21在戊四唑致痫大鼠、丙戊酸敏感和耐药大鼠海马组织中的表达情况(n=5);其中A)尼氏染色(海马DG区);B)Western blot曝光图;C)蛋白表达统计分析图。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。此外,下面所描述的本发明各个实施方式中所涉及到的技术特征只要彼此之间未构成冲突就可以相互组合。
实施例1:预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物的筛选
本发明第一实施例提供一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物,该生物标记物的筛选方法如下:
本实施例用到的主要试剂如下表所示:
Figure BDA0003408433570000031
Figure BDA0003408433570000041
本实施例用到的主要仪器如下表所示:
Figure BDA0003408433570000042
本实施例用到的测序接头引物如下表所示:
Figure BDA0003408433570000043
(一)样本采集
对大鼠腹腔注射戊四唑28天,建立慢性癫痫大鼠模型,随后给予连续口服丙戊酸14天,分别筛分出丙戊酸敏感和丙戊酸耐药两组大鼠作为样本采集对象,每一组各大鼠3只,样本量n=3。收集口服丙戊酸第14天的两组大鼠的全血和海马组织样本,-80℃保存。
(二)抽提样本中总RNA及其质量检测
本实施例中采用Trizol(Invitrogen公司)法提取全血/组织中的总RNA,提取步骤如下:
(1)提取海马组织RNA时,研钵高温高压灭菌,每50-100mg组织液氮研磨后,将粉末用液氮遇冷的药匙转移至预先装有1ml Trizol的EP管中,充分混匀(粉末总体积不能超过Trizol体积的10%)用1ml Trizol试剂裂解;
提取全血RNA时,在0.5ml小鼠全血中加入3ml的Trizol,震荡摇匀,
(2)将上述裂解液,室温15-30℃静置5min;
(3)加入0.2ml氯仿,震荡摇均匀,室温静置5min后,12000rpm 4℃离心15min;
(4)将上清液移至新的1.5ml离心管中,加入等体积-20℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,冰上静置10min;然后12000rpm 4℃离心10min,弃上清;
(5)向沉淀中加入1ml 70%DEPC-EtOH清洗沉淀,12000rpm 4℃离心15min,弃上清保留沉淀,室温干燥10min;
(6)加入30μl RNase-free水溶解RNA沉淀。
基因组DNA的去除:本实施例使用DNase I(TaKara)去除总RNA基因组DNA,具体操作步骤参考TaKara反转录试剂盒的操作说明书,本实施例不做累述。
RNA质量检测:本实施例中分别采用2100Bioanalyser(Agilent)、ND-2000(NanoDrop Technologies)方法检测RNA样品的OD值,以保证使用合格的样品(OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,RIN≥6.5,28S:18S≥1.0,>2μg)。质量检测合格的RNA样品-80℃保存。
(三)总RNA检测测序
用带有Oligo(dT)的磁珠富集RNA,向得到的RNA中加入Fragmentation Buffer使其片断成为200bp的短片段,再以片断后的RNA为模板,用随机六碱基随机引物(randomhexamers)和逆转录酶合成cDNA第一链,并加入缓冲液、dNTPs、RNase H和DNA polymeraseI合成cDNA第二链,经过QiaQuick PCR试剂盒纯化并加EB缓冲液洗脱经末端修复、加碱基A,加测序接头,再经琼脂糖凝胶电泳回收目的大小片段,并进行PCR扩增,从而完成整个文库制备工作,构建好的文库用Illumina HiSeq xten/NovaSeq 6000测序平台进行进行Solexa测序,测序读长为PE 150。
(四)原始数据的处理
鉴于Solexa测序技术所得数据错误率对结果的影响,本实施例使用SeqPrep和Sickle软件对原始数据进行质量预处理和质量评估,划窗去除低质量片段,得到Clean的序列数据,并对Clean序列进行长度分布统计。
数据质量预处理步骤:
1)去除低质量read:质量阈值20(错误率=1%),比例阈值40%;
2)去除Reads中含N部分比例较大序列:比例阈值4%;
3)去除接头序列(Illumina universal adapter AGATCGGAAGAGC)。
(五)显著差异基因的筛选
(1)差异基因分析
使用cuffdiff命令做差异分析,首先挑选两个样本中比对Reads总和大于或等于10的基因(NO TEST阈值为10);其次,进行Fold change检验;再进行T检验;然后对P值进行FDR校正得到Q值;最后,通过t检验的显著差异表达基因(满足校正值Q<0.05的基因)
(2)差异基因Go富集分析
采用DAVID在线网站(https://david-d.ncifcrf.gov),分别对上调和下调差异基因(P<0.05且fold change>2且Q<0.05)的生物过程(Biological process,BP)、分子功能(Molecular function,MF)和细胞组分(Cellular component,CC)进行显著性富集的GOterm,P<0.05的GO term定义为差异基因能够显著富集的GO term。
(3)差异基因Pathway显著性富集分析
DAVID在线网站(https://david-d.ncifcrf.gov),同时对上调和下调差异基因(P<0.05且fold change>2且Q<0.05)进行KEGG通路分析,将P<0.05的通路定义为差异基因中能够显著富集的通路。
(五)原始数据的处理数据结果分析
通过建立慢性癫痫大鼠模型,筛分出丙戊酸敏感和丙戊酸耐药两组大鼠,对两组大鼠的全血和海马组织进行转录组测序,差异基因GO富集分析和Pathway显著性富集分析,筛选出显著差异表达基因。
(1)丙戊酸敏感和耐药大鼠全血和海马组织的共同差异基因
结果表明,如图1所示,在丙戊酸敏感和耐药大鼠全血中共有434个基因的mRNA含量存在显著差异(P<0.05),且差异倍数>1.5倍,其中288个基因(fam131a、f3和p21等)上调,146个基因(ctrb1、fbl和asic4等)下调,差异基因主要富集于28条信号通路(P<0.05)(图1A和B)。
两组大鼠海马组织中共有264个差异表达基因(P<0.05),且差异倍数>1.5倍,其中125个基因(tprkb、krt16和p21等)上调,139个基因(aldh18a1、spatc1l和kdm4d等)下调,差异基因主要富集于13条信号通路(图1C和D)
如图2A的韦恩图所示,丙戊酸敏感和耐药大鼠血液和海马组织共有12个共同差异表达基因,分别为p21、AABR070596323、tor3a、sema3g、cdkl1、cpne8、dusp1、chid1、plek2、cdc20、mybl2和kif4a,如图2B所示是全血和海马组织中这12个差异基因的表达情况,其中p21、AABR070596323、tor3a、sema3g、dusp1和plek2基因在丙戊酸耐药大鼠全血和海马组织中的mRNA表达均显著高于丙戊酸敏感大鼠,而cpne8基因的表达则相反。
(2)丙戊酸敏感和耐药大鼠全血和海马组织中的共同差异基因与丙戊酸患儿全血的差异基因进行对比
将上述在全血和海马组织中表达一致的7个显著差异基因(p21、AABR070596323、tor3a、sema3g、dusp1、plek2、cpne8)与丙戊酸患儿全血的差异基因进行对比,丙戊酸患儿全血的差异基因参见本申请发明人发表的文章RNA-seq analysis of blood of valproicacid-responsive and non-responsive pediatric patients with epilepsy.(WangYan,Zhiping Li-Exp Ther Med 2019,18(1):373-383),结果如图3所述,仅有p21和plek2在丙戊酸耐药患儿全血中的表达明显高于敏感患儿,与大鼠的结果一致。
实施例2:从mRNA水平和蛋白水平验证两个显著差异基因p21和plek2的表达
(一)扩大样本量验证丙戊酸敏感和耐药大鼠海马组织中的p21和plek2的mRNA表达
采集戊四唑致痫大鼠、丙戊酸敏感大鼠和丙戊酸耐药大鼠的海马组织样本,扩大样本量,构建戊四唑致痫组(PZT)、丙戊酸敏感组(Response)和丙戊酸耐药组(Nonesponse)作为实验对象,本实施例采用荧光定量PCR方法对戊四唑致痫组、丙戊酸敏感组和丙戊酸耐药组海马组织中p21和plek2的mRNA表达进行测定。具体操作步如下:
对每份样本的mRNA反转录,反应体系包括总RNA5ul(约200ng)、dNTPmix(100mM)0.15ul、MultiscribeRTenzyme(50U/ul)1.00ul、10×RTBuffer 1.5ul、RNase Inhibitor0.19ul、Nucleasefreewater 4.16ul、TaqManMicroRNAAssays 3ul,总体积为15ul。
反转录条件:16℃反应30分钟、42℃30分钟、85℃5分钟,然后于4℃保存。
每份mRNA实时荧光定量PCR检测扩增体系包括Taq Man Universal Master MixII(AppliedBiosystems,CA)5ul、Taq Man MicroRNA Assays(AppliedBiosystems,CA)0.5ul、ddH2O2.5ul、反转录产物2ul,总体积为10ul。miRNA实时荧光定量PCR反应过程为:95℃预变性10分钟、95℃变性15秒及60℃延伸1分钟共40个循环。每个样本进行六次反应,取其平均值。
如图4所示是荧光定量PCR验证戊四唑致痫大鼠、丙戊酸敏感大鼠和丙戊酸耐药大鼠的海马组织中p21和plek2的mRNA表达情况,结果如图4所示,与戊四唑致痫组(PZT)相比,丙戊酸敏感组(Response)和丙戊酸耐药组(Nonesponse)p21的mRNA表达均降低,且丙戊酸耐药组(Nonesponse)p21的mRNA表达明显高于丙戊酸敏感组(Response)(图4A),该结果与转录组分析相一致;而丙戊酸敏感组(Response)和耐药组(Nonesponse)的plek2的mRNA表达均升高。上述结果说明,扩大样本量后丙戊酸敏感组(Response)和耐药组(Nonesponse)大鼠海马组织中p21的mRNA表达水平与转录组分析相一致,而plek2则不同。整合转录组分析结果和mRNA表达验证结果可以筛选得出p21与丙戊酸的耐药密切相关,p21的mRNA表达水平是预测丙戊酸耐药的潜在生物标志物。
(二)验证丙戊酸敏感和耐药大鼠海马组织中的p21蛋白表达
对戊四唑致痫组(PZT)、丙戊酸敏感组(Response)和丙戊酸耐药组(Nonesponse)海马组织的石蜡切片进行尼氏染色,尼氏染色步骤如下:
1)常规脱蜡至水(二甲苯I、二甲苯II各15min,然后梯度酒精脱水:100%I、100%II、95%、90%、80%、70%、50%各5min)
2)蒸馏水冲洗3次,每次5min
3)然后置于60℃温箱用1%甲苯胺蓝染色40min(或用焦油紫染色30s)
4)蒸馏水洗净染料后,于分别置于70%,80%和95%以及100%乙醇中脱水,再用二甲苯透明
5)最后用中性树胶封片。
在显微镜下观察尼氏染色的结果,结果如图5A所示,与戊四唑致痫组相比,丙戊酸敏感组(Response)大鼠DG区的神经元数目明显增加,而丙戊酸耐药组(Nosesponse)并无显著变化。
用Western blot方法验证p21蛋白表达,采用蛋白抽提液和蛋白酶抑制剂提取细胞总蛋白,BCA法测定总蛋白浓度,用Western blot方法检测p21的蛋白表达水平。
如图5B和C的结果显示,与戊四唑致痫大鼠相比,丙戊酸敏感大鼠海马组织中的p21明显下降,而p21在丙戊酸耐药大鼠海马组织中并无显著变化,且敏感组(Response)和耐药组(Nosesponse)中p21蛋白的表达存在统计学差异,提示过表达的p21与丙戊酸的耐药密切相关。
本申请通过对丙戊酸敏感和耐药大鼠全血和海马组织进行转录组学分析,整合癫痫患儿的全血转录组学结果筛选得到p21在癫痫大鼠和癫痫患儿全血中的高表达与丙戊酸的耐药密切相关,p21的mRNA表达水平是预测丙戊酸耐药的潜在生物标志物。
本申请实施例中大鼠p21基因的核苷酸序列如序列表ID NO.1所示;
本申请实施例中人p21基因的核苷酸序列如序列表ID NO.2所示;
本申请实施例中大鼠plek2基因的核苷酸序列如序列表ID NO.3所示;
本申请实施例中人plek2基因的核苷酸序列如序列表ID NO.4所示;
本申请实施例中大鼠tor3a基因的核苷酸序列如序列表ID NO.5所示;
本申请实施例中大鼠sema3g基因的核苷酸序列如序列表ID NO.6所示;
本申请实施例中大鼠cdkl1基因的核苷酸序列如序列表ID NO.7所示;
本申请实施例中大鼠cpne8基因的核苷酸序列如序列表ID NO.8所示;
本申请实施例中大鼠dusp1基因的核苷酸序列如序列表ID NO.9所示;
本申请实施例中大鼠chid1基因的核苷酸序列如序列表ID NO.10所示;
本申请实施例中大鼠cdc20基因的核苷酸序列如序列表ID NO.11所示;
本申请实施例中大鼠mybl2基因的核苷酸序列如序列表ID NO.12所示;
本申请实施例中大鼠kif4a基因的核苷酸序列如序列表ID NO.13所示.
本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。
本领域的技术人员容易理解,以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 海南医学院
<120> 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用
<141> 2021-11-22
<160> 13
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1872
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 1
gggatgcatc tatcttgtga tatgtaccag ccacaggcac catgtccgat cctggtgatg 60
tccgacctgt tccacacagg agcaaagtat gccgtcgtct gttcggtccc gtggacagtg 120
agcagttgag ccgcgattgc gatgcgctca tggcgagctg tctccaggag gcccgagaac 180
ggtggaactt tgacttcgcc actgagacgc cactggaggg caactacgtc tgggagcgtg 240
ttcggagccc agggctgccc aagatctacc tgagccctgg gtcccgccgc cgtgatgacc 300
tgggagggga caagaggccc agtacctcct cggccctgct gcaggggcca gggccagctc 360
cggaggacca cgtggccttg tcgctgtctt gcactctggt gtctcacgcc cctgagaggc 420
ctgaagactc cccgggcggg accgggacat ctcagggccg aaaacggagg cagaccagcc 480
taacagattt ctatcactcc aagcgccgat tggtcttctg caagagaaag ccctgaagtg 540
cccacgggag gctcgccttc ttctgctgtg ggtcaggagg cctcttcccc atcttctgcc 600
ttagccttca ttcagtgtgt cttaattatt atttgtgttt taatttaaac ttctcctgta 660
tatactctgc ctgccccctc ccagcctcca aacttagtta tttaaaaaac aaaacaaaac 720
aatgaaatta gtaggacggt aggctcctta gtgctgtttt tttttttttt tttttttttt 780
tttttatgta gaccattatt taagtccttc tcaacccaag ctgtgtttct gatcctggcg 840
ggatggtcct ggcgggatgg tcgcactggc ctcatgccat ctgcatctcg catctcgccc 900
aatccccgcc cctcccccct aactcctccc ccgcccccac tccctgcctg gttccttgcc 960
acttcttacc tgggggcgat cctcagacct gaatagcact ttggacaact gagtaggact 1020
tcggggtctc cttgtcacct ctaaggcccg ctaggatgac agtgaagcag tcacagccta 1080
gaacaaagat gcccggttag gacctaagcg taccgtccag agccttgaca tttactcaga 1140
cctgtgaaga tcctttgcca ctcctgggga ccccgcctcc cctgtgggtc tctgccagct 1200
gcccctctat ttttgagggt taatctggtg atctgctgct ctcccttcct cagacccttc 1260
ccctccccag gttggcagga ggcatccttt ccctcgccac ggctcagtgg accagaaggg 1320
aacgggtaca cagggtacac taagtggggt ttcctggtcc tacctcaggc agctccagtg 1380
gcaactgccc ttcttatggg tctagggtag gtccttggtg acgagacggg cttcccagag 1440
catccctgtg tgtgtggtat gtggtggtgg tggggggtgg acttatctgg gatggggacc 1500
ccagccgctg aagtcctcag tgacttgtcc catttcttag tagttgtaca aggagtcagg 1560
ccaagatggt gcctcggggg ctgagggagc tcacaggaac tgagcagtga ctggtccttt 1620
cccagtattg aatactgagc ccctgtgggt gtcgaagcac ttagtgggtc tggccccaac 1680
cccaaacacc cctgtttctg taacaccctg agctggactg tttatcttta gccgggagaa 1740
catgtatttt ggtcccttcc ctgtctccgc tcagattgta aacctcccac gtgtggggat 1800
cacaccctgc actgtcccga atctttacac cctatcccaa agctggtgct caataaatac 1860
ttctagatga tt 1872
<210> 2
<211> 2117
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 2
gaggtgtgag cagctgccga agtcagttcc ttgtggagcc ggagctgggc gcggattcgc 60
cgaggcaccg aggcactcag aggaggcgcc atgtcagaac cggctgggga tgtccgtcag 120
aacccatgcg gcagcaaggc ctgccgccgc ctcttcggcc cagtggacag cgagcagctg 180
agccgcgact gtgatgcgct aatggcgggc tgcatccagg aggcccgtga gcgatggaac 240
ttcgactttg tcaccgagac accactggag ggtgacttcg cctgggagcg tgtgcggggc 300
cttggcctgc ccaagctcta ccttcccacg gggccccggc gaggccggga tgagttggga 360
ggaggcaggc ggcctggcac ctcacctgct ctgctgcagg ggacagcaga ggaagaccat 420
gtggacctgt cactgtcttg tacccttgtg cctcgctcag gggagcaggc tgaagggtcc 480
ccaggtggac ctggagactc tcagggtcga aaacggcggc agaccagcat gacagatttc 540
taccactcca aacgccggct gatcttctcc aagaggaagc cctaatccgc ccacaggaag 600
cctgcagtcc tggaagcgcg agggcctcaa aggcccgctc tacatcttct gccttagtct 660
cagtttgtgt gtcttaatta ttatttgtgt tttaatttaa acacctcctc atgtacatac 720
cctggccgcc ccctgccccc cagcctctgg cattagaatt atttaaacaa aaactaggcg 780
gttgaatgag aggttcctaa gagtgctggg catttttatt ttatgaaata ctatttaaag 840
cctcctcatc ccgtgttctc cttttcctct ctcccggagg ttgggtgggc cggcttcatg 900
ccagctactt cctcctcccc acttgtccgc tgggtggtac cctctggagg ggtgtggctc 960
cttcccatcg ctgtcacagg cggttatgaa attcaccccc tttcctggac actcagacct 1020
gaattctttt tcatttgaga agtaaacaga tggcactttg aaggggcctc accgagtggg 1080
ggcatcatca aaaactttgg agtcccctca cctcctctaa ggttgggcag ggtgaccctg 1140
aagtgagcac agcctagggc tgagctgggg acctggtacc ctcctggctc ttgatacccc 1200
cctctgtctt gtgaaggcag ggggaaggtg gggtcctgga gcagaccacc ccgcctgccc 1260
tcatggcccc tctgacctgc actggggagc ccgtctcagt gttgagcctt ttccctcttt 1320
ggctcccctg taccttttga ggagccccag ctaccctttt tctccagctg ggctctgcaa 1380
ttcccctctg ctgctgtccc tcccccttgt cctttccctt cagtaccctc tcagctccag 1440
gtggctctga ggtgcctgtc ccacccccac ccccagctca atggactgga aggggaaggg 1500
acacacaaga agaagggcac cctagttcta cctcaggcag ctcaagcagc gaccgccccc 1560
tcctctagct gtgggggtga gggtcccatg tggtggcaca ggcccccttg agtggggtta 1620
tctctgtgtt aggggtatat gatgggggag tagatctttc taggagggag acactggccc 1680
ctcaaatcgt ccagcgacct tcctcatcca ccccatccct ccccagttca ttgcactttg 1740
attagcagcg gaacaaggag tcagacattt taagatggtg gcagtagagg ctatggacag 1800
ggcatgccac gtgggctcat atggggctgg gagtagttgt ctttcctggc actaacgttg 1860
agcccctgga ggcactgaag tgcttagtgt acttggagta ttggggtctg accccaaaca 1920
ccttccagct cctgtaacat actggcctgg actgttttct ctcggctccc catgtgtcct 1980
ggttcccgtt tctccaccta gactgtaaac ctctcgaggg cagggaccac accctgtact 2040
gttctgtgtc tttcacagct cctcccacaa tgctgaatat acagcaggtg ctcaataaat 2100
gattcttagt gacttta 2117
<210> 3
<211> 1553
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 3
ctcacctgga ctggcgacat ggaggacggc gtgcttaagg agggtttcct tgtgaagagg 60
ggccacattg tccacaactg gaaggcacga tggttcatcc tccggcagaa cacactcctg 120
tattacaagc tggagggcgg ccggcgagtg accccgccca aggggaggat cgtcctcgat 180
ggctgcacca tcacctgtcc ctgcctggag tatgaaaacc ggccgctcct cattaaactg 240
aagacccgaa cttccactga gtacttcctg gaggcctgtt ctcgagagga gagagatgcc 300
tgggcctttg agataacagg ggctatccac gcagggcagc cgggaaagat ccaacaactc 360
cacatactaa agaactcctt caagttatcc ccgaacatca gcctgcatcg aattgtggac 420
aagatgcatg acaccagcag cggactccgg ccgagcccca acatggagca gggaagcacc 480
tacaaaaaga ccttcctggg ctcctccctg gtggactggc tcatctccag caactttgca 540
gccagccgtc tggaggcagt gaccctggcc tccatgctta tggaagagaa cttcctcagg 600
ccagtagggg tccggagcat ggatgctatt cgctctgggg atctggccga gcagtttctg 660
gatgactcca cagccctgta cacttttgct gaaagctaca agaagaaggt aagctccaag 720
gaggaaatca gtctcagcac catggagtta agtggcatag tggtcaaaca aggctaccta 780
tccaagcagg ggcacaagag gaagaactgg aaggtacgcc gatttgttct gaggaaggac 840
ccagctttcc tgcattacta tgacccttcc aaagaagata acaggccagt aggtgggttt 900
tctcttcgtg gttcccttgt gtctgcactg gaggataatg gtgttcctac tggagttaaa 960
ggtaatgtcc aaggaaacct cttcaaagtg attacgaagg atgacacaca ctattatatc 1020
caggccagca acaaggctga gcgagcagaa tggattgaag ctatcaagaa gctaacatga 1080
tctaaggagc agaccagggt cctcattgga tacagatgag actacctgga gaactggagt 1140
acttttgggg ctggggatgt ggctcagtgt tagaggacct gcctggcaat cttgaggccc 1200
caggttcaat tcttggtacc gtttaaaaaa acaaaaaaac caaaaaacct ttaccattgt 1260
acatttgcac ctctttggag actgctcaag ttggctcctc acatgacagt ggggattcga 1320
tttcctgtct tcttatgacc aactttcaaa gctggaccag ctcttaggtg agcagcatct 1380
tgactttgct cttcagaaca gaaatctgcg tccttgggga ccatagtacc acctctcaat 1440
tggaacacta actctggttt tgctatatta aataccctag tctcaagaca gctctcttaa 1500
ctgatttcag caactcagta tctctgggct taataaagat tgacatctgt ctc 1553
<210> 4
<211> 1513
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 4
gcttcctggg cgccgtgggc gcggactgcg cgggctgcgc gggtgccgag gagcgcgagg 60
cgcggggaag gcgcacctgg ggtggccctg gcgtgcgggc ggcgacatgg aggacggcgt 120
gctcaaggag ggcttcctgg tcaagagggg ccacattgtc cacaactgga aggcgcgatg 180
gttcatcctt cggcagaaca cgctggtgta ctacaagctt gaggggggtc ggagagtgac 240
ccctcccaag ggccggatcc tcctggatgg ctgcaccatc acctgcccct gcctggagta 300
tgaaaaccga ccgctcctca ttaagctgaa gactcaaaca tccacggagt acttcctgga 360
ggcctgttct cgagaggagc gggatgcctg ggcctttgag atcaccgggg ctattcatgc 420
agggcagccg gggaaggtcc agcagctgca cagcctgaga aactccttca agctgccccc 480
gcacatcagc ctgcatcgca ttgtggacaa gatgcacgat agcaacaccg gaatccgttc 540
aagccccaac atggagcagg gaagcaccta taaaaagacc ttcctcggct cctccctggt 600
ggactggctc atctccaaca gcttcacggc cagccgtctg gaggcggtga ccctggcctc 660
catgctcatg gaggagaact tcctcaggcc tgtgggtgtc cgaagcatgg gagccattcg 720
ctctggggat ctggccgagc agttcctgga tgactccaca gccctgtaca cttttgctga 780
gagctacaaa aagaagataa gccccaagga agaaattagc ctgagcactg tggagttaag 840
tggcacggtg gtgaaacaag gctacctggc caagcaggga cacaagagga aaaactggaa 900
ggtgcgtcgc tttgttctaa ggaaggatcc agctttcctg cattactatg acccttccaa 960
agaagagaac aggccagtgg gtgggttttc tcttcgtggt tcactcgtgt ctgctctgga 1020
agataatggc gttcccactg gggttaaagg gaatgtccag ggaaacctct tcaaagtgat 1080
tactaaggat gacacacact attacattca ggccagcagc aaggctgagc gagccgagtg 1140
gattgaagct atcaaaaagc taacatgaca aggacctgag ggaaccagga ttcctccctc 1200
ctaccagatg acacagacaa gagttcctgg agaatgggag tgttaagact tttgacttct 1260
ttgtaagttt tgtactgctt tggagagtga atgctgccaa gagttcctca gattacaaac 1320
agcagtggtg ccatttcctt ccccatcttc atgttacaaa cctggaaagg ctagaacagc 1380
cattaggcgt cagcatcttg acttttcccc agcatcacaa acagccattt cctcgggcac 1440
caaagtaggt tccctttgtt ggaacaatta cactggccat gccataatgt tgaataaaac 1500
tctcttctta tga 1513
<210> 5
<211> 1813
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 5
agtcatgttt tttggcgctt tctggttgtt gctgctgctg ctgctgccgc cgctgcgccc 60
cccgggagcg cagggccacc gcggtgccaa gagcccggag caggaggccg acgagcccat 120
cccttggcca agcatccaac gcctgcggga gcagctgagg acggccggga ccctctccaa 180
acggtactgg gcgctcttca gctgcacctt gtggccggat cactgtgaag atcaggagac 240
ccccgtgccg cctctgggct ggagccttcc tctgtggggc cggcggtcgc tggatatgct 300
cacttcatgg ttctgccgct ttcaggactg ctgcagcgcg ggaaactgca ggatctccaa 360
caacttcaca ggcttagaat cagaccttcg tgtgcgactg catggccagc atctcgctag 420
caagctggtc ctagaagcag tgaagggtta cttagagatg ccccaagttg gcaaggctct 480
ggctctgtca ttccacggct ggtctggcac aggcaagaac ttcgtggcac ggatgctggt 540
ggacaacctg tatcgggacg gaatgaggag tgactgtgtc aagatgttta tctctacctt 600
ccatttccca caccccaagt atgtggactt atataaggag gacttgcaga ggcagatgca 660
ggagacgcag cggcgctgcc agcagagcac gttcgtcttt gacgaagcgg agaagctgca 720
cccggggcta ctggagctgc ttgaacccta cctggaaccg aggagccccg agacccatgg 780
agctgagctg cccagagcca tcttcctcct tctcagtaac cttgggggca gtgtcatcaa 840
tgaggtggtc ctaggtttgc tcaaggctgg atggtccagg gaggaaatta cgttgcagca 900
cttggagatg ccccttcagg ctgagatcat aaagtctgca gacagcagct ttggctccag 960
ccgtctcctg aagaaacacc ttattgatct ctttatcccc ttcctgccac tggagtaccg 1020
ccatgtgagg ctgtgtgtcc gagatgcctt cctgggccag gatctcccat acacagaaga 1080
ggccctggat gaaattgcca agatgatgac atacgtccct gaggaagagc agcttttctc 1140
ctctcagggt tgcaaatcca tttcccagag aatcaacctt gtcttgcctt gagagtggct 1200
cctttgctcc cggaacagtc tttttccatc agccagatgc cctagtgtcc agcaaccact 1260
gcttccagct agtgtgcaga agggcagctc ctaaaaacca cttggtgcct taaaaaccca 1320
cactctagac tgaggtcagg aagccagtgg aaggcccaag caccaaaggg tcctcagaac 1380
actccctaca gtctcttggc accatagctc ttcctggaaa gccgctggaa tggagtatga 1440
gcctgaggcc ccagaatcct tgggctacag aacaaggaag atgaaagatg tgtggaccag 1500
caggagtgtg gctctggtct gcaggtttgg ctggctctcc ggggtaggga gatgggcagc 1560
ttctgcatgt gagcagacca gcaaagggcc ttagtctaaa gagaaaacct ttcaaaacat 1620
gatgggtgtg gcacacacct gtgaccctag cacttggcag gctaatacag gagagagctg 1680
aagaaacctg agctgccagg caggcttgac aaacaaaacc ccataggtgt gtagctaagg 1740
catgttctgt tctgcagact gaaaactttg aggccttgtc atgtgtgatt aaatgtattt 1800
ttctaacatc ctt 1813
<210> 6
<211> 3626
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 6
cagcaggatc agagggcagc tcatctttcc ccccagcatg gcccgctgct ccgcttgggc 60
catctgctgc ctcctgggga gccttctgtt ccacatgggc agcccgaacc ctggtcccag 120
caccagtgtg cctcgtctgc ggctctccta cagagatctc ctgactacca accgctctgc 180
catctttctg ggtccacggg gctccctaga cctccaagtc atgtacctgg atgagtatcg 240
ggaccgcctc tttctgggag gccgagatgc cctttactct ctgagactgg atcaggcatg 300
gccagatccc cgggaggtct tgtggccgcc gcagcccgga cagaaggtgg aatgtgtccg 360
aaagggaaaa gaccctttga ccgagtgtgc caacttcgtg cgggtcttac aaccccacaa 420
ccggacccat ctgctggcct gcggcactgg cgccttccag cccatctgca ccttcatcac 480
agtggggcat cggggggagc atgtgctcca cttggatcct agcagcatcg aaaatggaag 540
ggggcgttgc ccacacgagc ccagccgtcc cttcgccagt acctttgtag gtggggagct 600
gtacacgggc ctcactgctg atttcctcgg acgtgaggcc atgattttcc ggagtggggg 660
tccccgacca gccctgcgtt ctgactctga ccagagcctc ctacatgatc cccggtttgt 720
gatggctgct cggatcccag ataactccga ccgggatgat gacaaagtgt acttcttctt 780
ctctgagact gtcccttcac cagatggtgg cccaggtcat gtcaccgtca gccgcgtggg 840
tcgagtctgt gtgaatgatg ctggtggcca gcgggtgctg gtgaataaat ggagcacgtt 900
cctcaaggcc aggctggtat gctctgtgcc tggccctggc ggggctgaga ctcactttga 960
ccagctggag gatgtgttcc tgctgtggcc aaaggcaggg aagaacctcg aggtgtatgc 1020
gctgttcagc actgtcagtg ctgtgttccg gggctttgct gtctgtgtgt accacatggt 1080
agacatctgg gaggtcttca acgggccctt cgctcaccga gatggccctc aacatcagtg 1140
gggaccctat gggggcaagg tgcccttccc ccggcctggt gtgtgtccca gcaagatgac 1200
cgcacagccc ggccgaccct ttggcagcac caaggactac ccggatgagg tgctgcagtt 1260
tgtccgaggc cacccgctca tgttccagcc tgtgaggcct cggcgtggcc gccccgtcct 1320
ggtcaaaact cacctggctc agcaactgtg ccagatcgtg gtggacagag tggaggctga 1380
ggatgggacc tacgatgtca tcttcctagg gactgattca ggttctgtgc tcaaaatcat 1440
cgctctccag ggtagtggct tacccgaacc ggaagaggtg gttctggagg agctccaggt 1500
gtttaaggta ccaacaccca tcactgagat ggagatctct gtcaaaaggc aaacgctgta 1560
tgtgggctct ccactgggcg tggcccggct gcagctgcac cagtgtgaga cttatggcag 1620
tgcctgcgct gagtgctgcc tggcccggga cccatactgt gcttgggacg gcacttcctg 1680
tgcccgctac cgccccagct cgggcaagcg caggttccga cgacaggaca tccgacatgg 1740
caatcctgct gtgcagtgtc tgggccaggg ccagagccaa gacaaagcct cgggactggt 1800
gaccagagtc tttggcacag agcacaacag taccttcctt gagtgccggc ccaagtctcc 1860
ccaggctgca gtgcgctggt tcttacaaag gccaggggat aagggggctg accaggtgaa 1920
gacagatgag cgagttgtgc agacggacca ggggcttctg ttccgaaggc tcagccgcct 1980
tgatgcaggg aactacacct gtaccactct ggagcacggc ttctcccaga ccgtggttcg 2040
ttttgccctg gaggtgattg cggctgtgca gctggacagc ctgttccttc gggagccaag 2100
gctggaggag ccctcagcct ggcgaagtgt ggcttctgcc tcacccaaga cttggtataa 2160
ggacatcctt cagctcactg gtttcgccaa cctgccccgc gtggatgagt actgcgaacg 2220
tgtgtggtgc aggggtgtcg gggagcgctc gggctccttc cgcggaaagg gaaagcaggc 2280
gaagggcaag agctgggcgg ggctagagct gggcaggaag atgaagagcc gggtgcaggc 2340
tgagcacaat cggacccccc gggaggtaga agccacatag aagatggctg aggtgggggt 2400
ggtcggactg ggctgggaga ctcaacaacc tctctctccc acccggctag gaaaaggagt 2460
ccaggacgcc tgattacctc ttagagaaaa tctctaccac ctacaggaaa gaccaggggc 2520
tggtgggagg ggccttgcat ctcagcctac tcccggccct tctctgtgtt ctcagtccca 2580
ggctggaact ggcacctcca gaccacttgt agtcccaagg ggcacgctat ttgttctcag 2640
agatggtgtg gcttccggag cacatttccg gttgtgccca gaggcaagtt gggtgggttt 2700
ttcccagctt gccaaacaat ggccattctg agtgaccctc tgagtgggtg tacgggtggc 2760
tctgaggggg tatattggga gtccgtcaga ggaggggaaa gtagattcct aaggtagtac 2820
ccgttaagaa actcttgccc caacagaggt gtgagagaag gtgggaggcg ctgcggaggt 2880
ggggtcgcgc tggttacctg ccttcatgct ttggaatctt tgattccttg tgtccgccca 2940
ctaccgtctc atactcacag aggcaagact tgctggaacc tggaggtggc ctgggcctcg 3000
cccccttttt aaaccggaaa gattgtctta cagtacgata cccttttccc aggtcctaaa 3060
ttatcagacc aggcttgccg gggtgcccac acgtcaccat cagagccact tcctgaggat 3120
caggggaagg ttctgtggac caaagagagg aagaaggcag ctggagggta ggagtgggaa 3180
gcatgggcta cctttctgag ggcgaggcgg gcacgttcag gcctgggagg ttaggaatgg 3240
atggacactc tgagaactgc agccagtgat caggatcagc atcctgggct ttgtctagag 3300
ccacaaggaa ctagagacag gtgggtctgt ggctccatgg gcaggtgtca tcaaggatca 3360
aagtgacagc agttggttca ggagccactg ggcatgccaa ctatttccaa cccttcagtc 3420
tctattgagg gggtcatgag ggttcattta taagaccccc atgttttttt gtggtacttg 3480
ggattgaatc gagggtctcc tgaatgctag ataaatgctc caccactgag ttagagcccg 3540
gctctctctg tgggagaaca ggaagaagaa agctggtatg gtaaatcctg ctgctttggg 3600
ggctggggtt ggggatgagt gacaag 3626
<210> 7
<211> 1861
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 7
gcatttagtt gatgaggctc gagagcgatc ggttctcgta tttcataagc gacctttaaa 60
aactatatga aaatccgttc tcaagaagac gtgctcctct gtaatggaaa aatacgaaaa 120
aattggaaag attggagaag gttcctatgg ggtagtgttc aagtgcagaa acagagacac 180
gggtcagatc gtggccatca agaggtttct ggaaaccgaa gatgaccctg tcataaagaa 240
aatcgccctt cgagaaatcc gcatgctcaa gcaactcaag catcccaacc tcgtcagcct 300
cctggaagtc ttccgcagga agcggcggct tcacctggtg ttcgagtact gccaccacac 360
ggtgcttcac gagctggaca gatatcagag gggggtacca gagcctctcg tgaagaacat 420
aacttggcag acactgcagg ctgtgaattt ctgccataaa cacaactgca tacacagaga 480
tgtgaagccg gaaaacattc tcatcaccaa acactcagtc attaagctct gtgactttgg 540
gtttgcacgg cttctcactg gacctggtga ctactacact gactacgtgg ccaccaggtg 600
gtaccgctca cctgagctgc tagtgggaga cacacagtat ggccccccag tagatgtctg 660
ggcaattggg tgtgtgtttg ctgagttgct gtccggagtg cctctgtggc caggaaaatc 720
cgatgtggac cagctctatc tgataaggaa aaccctgggg gacctcattc ccaggcacca 780
gcaagtattt agcatgaatc agtacttcag tggggtgaaa attccagacc ctgaagacat 840
ggaaacactt gagttgaagt ttccaaacat ctcctactct gctctgggct tcttaaaggg 900
ctgcctccac atggaccctg ctgagaggct gacatgtgaa cagctattgc agcatccgta 960
ttttgacagc attcgagacg ttggggaatt ggcaagacca catgacaaac caacaaggaa 1020
gaccctgaga cagagtagaa agcacttgac tgggttgcag cacctgcctc agctaaccag 1080
cagcagcgtc ctccccgctc tggacaggaa gaagtaccac tgtggtacca ggaactttaa 1140
ctaccacttt ccaaatattt aaggagctgg cagagtaatg aagaattgat caataatttg 1200
cagaaatgta tacatttgac tcctgtcttg accacacatc aggagaaaac acgaacagga 1260
agctggaggt tatttgccag gatatgaggg aaattccgga tccagacttc catgcttggt 1320
ggagatgtcc agagaagaga gcaggagctt gggacatctc tgcatcttcc ttttctaagc 1380
agcagagctt atggacagaa tataaactgt acctaagccc gcagctgcaa cattagataa 1440
tgtcagaaga cctgggctgc agtttgctct ctgccacacg cagagagtac atcaagaaat 1500
gtcctgggtt ggggatttag ctcagtggta gagcgcttgc ctaggaagcg caaggccctg 1560
ggttcggtcc ccagctccca aaaaaagaac caaaaaaaga gaaatgtcct ggggttgggg 1620
atttagctca gtggtagagc gcttgcctag gaagcacaag gccctgggtt cagtccccag 1680
ctccaggaaa aaaaaagaaa aaaaaaaaga aaaaaagaaa tgtccagggt tggggatttg 1740
gctcagtggt agagcgctta cctagcaagc acaaggccct gggttcaatc cccagctccg 1800
gaaaaaaaaa aaaaaaaaga aagaaagaaa gaaagaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860
a 1861
<210> 8
<211> 3380
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 8
tcgcgacgag gtccgcctct tccctcccct tcccgcgccg cctccgcctc cttcctctgc 60
ctccaccctc accccttccc gtcggtgcgg agctcggctc cgagcagcgc tcagcccgcc 120
gcagcttgga tgtgggctcg ggacaagtgc tctgcgcctc cgctcgagat ggacagccgc 180
tacaccagcg ccacgggcat cggggacttg aaccagctga gtgcggccat ccctgccaca 240
cgcgtggagg tgtcggtgtc ctgcagaaat cttcttgata gagatacatt ttctaagtct 300
gatccaattt gtgtcttata tacacaagca gttggaaaca aagaatggag agagtttgga 360
agaactgaag tgattgataa tactttgaat cctgattttg taagaaagtt tattctggat 420
tatttctttg aagaaagaga gaatcttcgt tttgacttgt atgatgttga ttcaaagagt 480
cccaacctgt ccaaacatga ctttctggga caagtgtttt gtacattggg ggagattgtt 540
ggttcacagg gaagtcgtct ggaaaagcca atagtaggaa ttccaggcag gaaatgtgga 600
acaatcatac taaccgcgga ggagctcaac tgctgcaggg atgccgtcct gatgcagttc 660
tgtgcaaaca aattggataa gaaggatttc tttgggaagt cagatccttt ccttgtattt 720
tatcgaagca atgaggacgg aagctttaca atttgtcaca agacagaagt ggtcaaaaac 780
actctcaacc ctgtgtggca agccttcaag atctcagtga gagccttgtg caatggggat 840
tatgacagaa caatcaaagt ggaggtctat gactgggacc gagacggaag tcatgatttc 900
attggggaat ttacaacaag ctatcgggaa ctctcaagag gacagtcaca attcaatgtc 960
tatgaggtgg tgaatcccaa gaagaaagga aaaaagaaaa agtacactaa ttcaggaaca 1020
gtaaccttat tgtccttctt ggtagaaaca gaagtctcct tcctggacta tattaaagga 1080
gggacacaga tcaacttcac ggtggccatt gattttacgg catcaaatgg aaaccctgcc 1140
cagcccactt ctctccacta catgaaccct tatcaactga atgcctatgg aatggccctc 1200
aaggctgtag gagaaatcgt ccaagattat gacagcgaca agatgttccc agcccttggt 1260
ttcggtgcaa agctccctcc agatggaagg atatctcacg agtttgcctt gaatggcaac 1320
cctcagaatc cttactgtga cggcattgaa ggagtcatgg aagcttacta tagaagtctg 1380
aaatctgtgc agttgtacgg gccaaccaac tttgctcccg taataaacca cgtagcaaga 1440
tatgcatcct ctgtaaaaga tggctcccag tactttgtgc tcctcattgt gacggacggc 1500
gtcatctcag atatggctca gactaaagaa tccatagtaa acgcctccaa gctccccatg 1560
tcaataatta tagtaggtgt tggccctgca gaatttgatg caatggttga actggatggg 1620
gatgatgtga gagtttcctc cagagggaaa tatgccgaaa gagacattgt acagtttgtg 1680
ccattcaggg attatattga ccgaagtgga aaccacatcc tgagcatggc tagactggcc 1740
aaagatgtct tagctgagat ccctgagcag ttcctctcct acatgagagc cagaggaatt 1800
aagccatcgc ccgcacctcc gccctacacc cctcccacac acgtgctgca gacgcagata 1860
tgaccgcatc ctgatgccga cgtccctcac acgccagtca gaactgcgaa gcctgttctt 1920
tgatcctggt gctctgctat gaaccaggga aggggacttt ctcagcgtgg tttcagcagt 1980
actggggaaa atgtgctttc ttggatccaa aattaattct cttcctaaac caaaactgta 2040
aatatggttg ttgcatgagc aaccggggaa ataatggttt aaatgcttga agcgaagtag 2100
agatgtcttc tctaattttt gaatatattt tttttgtttt gttctcgacg gaatagtcca 2160
tttccaatgt attattggga aaaagcacaa gctacgtttt taacacaaat gttgtccttg 2220
actgctacat atataggccg gcagtctctg tgtcgatgtt tacacgttac tactttttaa 2280
atttcaatac ttttataact gttcttaaga ctaagtttta aatattgaat cctttgtctt 2340
ctaaattgca atagctataa ccacaggagc aatatctctt tgaatgactg tctggacact 2400
tgcagtatga gtgagggaag agaaggaggt agatcactaa ggcaatctcc ttcacgatta 2460
atacccgtca tcagttttgg ccaatagcgg gagtttctat ttataaacag atgaggccct 2520
gtaatatgca tcttttcatg gcctttgggt ttaaatttag actgcggtca atttgtcttt 2580
cgcaatgcaa actagaagca acaaacaggc aaacattgtg aactgttaat gcacagaata 2640
cacgttgtat caaaaccacc atccttacga tgctatcatt taatgagtaa aaccaagact 2700
gtaactccaa accatgtagc aggtattttg aaccttgtat tacgttgtat cctgtctaga 2760
tattttaatt caaagggata ctgcctctct cgctcgggat ttgcgttctc accctcccac 2820
ctcgactcac gggtttcaca ggctgaagtc tcttgtgaat cctcagttcc acgtacacga 2880
ccccgtgact cagcgcacaa cacatttgtg aaataaactc acccctgtgg cccgacctgc 2940
ctgtgtgtga aatagcccac ccctccgccc tgatctgcct gctcacaatc aattctaaat 3000
agttttcaat gtacagtttt tatacaaact acagttttgt gaagtcatgt ctacatttct 3060
ttagaacaaa tggccttaaa ttctcacaga attcctggaa atgattgtga attgccttca 3120
aaatacagaa atgtgtattc gttgttcttt tcgtgtcaac ggtgtgactg ctttctaacc 3180
tctctgcctc cccctctttg ctacttggat tggtcctatt gtacgtgctc ttgccacaac 3240
ttgaccttcg gtgactttta taagcatgaa actgttttac tggaaaaaaa tgcatactcc 3300
tcatagctaa caggatcaca gttccgtaac tgtgatatga actgtccatt tttaagtacc 3360
tattaaaaat ctttaaaagg 3380
<210> 9
<211> 1937
<212> DNA
<213> Rattus norvegicus
<400> 9
gcagcaaagg actggcgggc gggacgcgcg gtgaagccag attaggatca gcgagcactt 60
gaggatttag ggccacaaaa aaccgcacaa gatcgacaga ctatttctgg agagctgcag 120
aacgggcacg ctggggtcgc tggtgctggc catggtgatg gaggtgggca tcctggacgc 180
cggggggctg cgcgcgctgc tgcgagagcg cgccgctcag tgcctgcttc tggattgtcg 240
ctccttcttc gccttcaacg ccggccacat cgtgggctca gtgaacgtgc gcttcagcac 300
catcgtgcgg cgccgcgcca agggcgccat gggcctggag catatcgtgc cgaacaccga 360
actgcgcggc cgcctgctgg ccggagccta tcacgccgta gtgctgctgg acgaacgcag 420
cgccgccctg gacggcgcca agcgcgacgg caccctggcc ctggccgcgg gcgcgctctg 480
ccgagaagcg cgctccactc aagtcttctt cctccaagga ggatatgaag cgttttcggc 540
ttcctgccct gagctgtgca gcaaacagtc cacccccatg gggctcagcc tcccgctgag 600
tactagtgtg cctgacagtg cagaatccgg atgcagctcc tgtagcaccc ctctctacga 660
ccaggggggc ccagtggaga tcctgtcctt cctgtacctg ggcagtgctt accatgcttc 720
ccggaaagat atgctcgacg ccttgggtat cactgctttg atcaacgtct cggccaattg 780
tcctaaccac tttgagggtc actaccagta caagagcatc cctgtggagg acaaccacaa 840
ggcagacatt agctcctggt tcaacgaggc gattgacttt atagactcca tcaaggatgc 900
tggaggaagg gtgtttgtgc actgccaggc cggcatctcc aggtcagcca ccatctgcct 960
tgcttacctc atgaggacta accgagtgaa gctggacgag gcctttgagt tcgtgaagca 1020
gaggcggagt attatctccc ccaacttcag cttcatgggc cagctgctgc aatttgagtc 1080
ccaagtactg gcccctcact gttctgcaga agctgggagc ccggccatgg ctgtccttga 1140
ccggggcacc tctactacaa cggtcttcaa cttccctgtc tccatccctg ttcaccccac 1200
gaacagtgcc ctgaactacc ttcaaagccc catcacaacc tctccgagct gctgaagggc 1260
caggggaggt gtggagtttc acgtgccacc gggacgacac tcctcccatg ggaggagcaa 1320
tgcaataact ctgggagagg ctcatgtgag ctggtcctta tttatttaac accccccccc 1380
ccaaacacct cccgagttcc actgagttcc caagcagtca taacaatgac ttgaccgcaa 1440
gacatttgct gaactcagcc cgttcgggac caatatattg tgggtacatc gagcccctct 1500
gacaaaacag ggcagaaggg aaaggactct gtttgagcca gtttcttccc ttgcctgttt 1560
tttctagaaa cttcgtgctt gacataccta ccagtattaa ccattcccga tgacatacac 1620
gtttgagagt tttaccttat ttatttttgt gtgggtgggt ggtctgccct cacaaatgtc 1680
attgtctact catagaagaa cgaaatacct cactttttgt gtttgcgtac tgtactatct 1740
tgtaaataga cccagagcag gctttcagca ctgatggacg aagccagtgt tggtttgttt 1800
gtagctttta gctatcaaca gttgtatgtt tgtttattta tgatctgaag taatatattt 1860
cttcttctga gaagacattt tgttactagg atgacttttt ttttatacag cagaataaat 1920
tatgacattt ctattga 1937
<210> 10
<211> 1446
<212> DNA
<213> Rattus leucopus
<400> 10
ttctggccgg tctcctgaca tgaagccccc tagacccaga gattggttcc tgctgtgaca 60
tgcctaccat gtggccactt cttcatgtcc tctggcttgc tctggtctgt ggctctgttc 120
acaccaccct gtcaaagtca gatgccaaaa aagctgcctc aaagacgctg ctggaaaaga 180
ctcagttttc ggataaacct gtccaagacc ggggtctggt ggtgacggac atcaaagctg 240
aggatgtggt tcttgaacat cgtagctact gctcagcaag ggctcgggag agaaactttg 300
ctggagaggt cctaggctat gtcactccat ggaacagcca tggctatgat gttgccaagg 360
tctttgggag caagttcaca cagatctcac cagtctggtt gcagctgaag agacgtggtc 420
gggagatgtt tgaaatcaca ggcctccatg atgtggacca agggtggatg cgagctgtca 480
agaagcatgc caaaggcgtg cgcatagtgc ctcggcttct gtttgaagac tggacttacg 540
atgatttccg aagcgtccta gacagtgagg atgagataga agagctcagc aagactgtgg 600
tacaggtggc aaagaaccag cattttgacg gctttgtggt ggaggtctgg agccagttgc 660
tgagccagaa acatgtaggc ctcattcaca tgcttactca cttggctgag gcgctgcacc 720
aggccaggct gctggtcatt ctggtcatcc cacctgctgt cacccctggg actgaccagc 780
tgggcatgtt tacacacaag gagtttgagc agctggcccc catactagat ggcttcagcc 840
tcatgacata cgactactcc acatcacagc agcctggccc taatgctcca ttgtcatgga 900
tccgagcctg tgttcaggtc ctagacccca agtcacagtg gcgtagcaag atcctcctgg 960
gattgaactt ctatggcatg gattatgcag cctccaagga tgcccgtgag cctgtcattg 1020
gagccaggta catacagacg ctgaaggacc acaggccccg tgtggtatgg gacagccagg 1080
ctgcggaaca cttctttgag tacaagaaga atcgcggcgg gaggcacgtt gtcttctacc 1140
caacgctgaa gtctctgcag gtgcggctgg agctagccag ggagctgggc gtcggggtct 1200
ccatctggga gctgggccaa ggcctggatt acttctatga cctgctgtag gctggaaagc 1260
aaccctcaag tgactggact tttctaagcc atggagtcaa tggtgaaata taggcctctt 1320
ctcttgttta ctgtgagaca gctgctatgg ccctcagcag gacccactgc atgggggttt 1380
cctgatccag gatataaatt gggatccttt ctacttaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
aaaaaa 1446
<210> 11
<211> 1774
<212> DNA
<213> Rattus leucopus
<400> 11
ggcgtgcctt tagccggtca gaaaagaacg cattcggcac ttctacagac gcactgagga 60
gtcagggatt tgtgtttggg agaggtttac gaagaggtgc tgggctggtg cgaactgtgg 120
caggcagagc ccaggagtcc tgcgaggtcc tgagtttggt cgcctctcac ccccctcccc 180
ggtagacggg ccatggcgca gttcgtgttc gagagcgatt tgcattcact gcttcaactg 240
gacgcgccca tccccaatgc accgattgct cgctggcagc gcaaagcaaa agaagccaca 300
ggcccagccc cctcgcctat gcgggccgcc aacagatcac acagcgccgg tcggaccccg 360
ggccgaactc ctggcaaatc taattctaag gttcagacca cccctagcaa acctggaggt 420
gaccgctata tcccccaacg tagtgcttcc caaatggagg tggccagctt cctcttgagc 480
aaggagaacc agccggaaga cgggggtacg cccaccaaga aggagcatca gaaagcctgg 540
gctcggaacc tgaacggttt tgatgtggag gaagccaaga tcctcaggct cagtggaaaa 600
cctcagaatg ccccagaagg ctaccagaac agattgaaag tactctacag ccagaaagcc 660
acgcctggct ccagtcggaa ggcttgcaga tacattcctt ccctgccaga caggattctt 720
gatgcccctg aaatccggaa tgactactac ctgaatcttg tcgattggag ctctggaaat 780
gtattagctg tggcactgga caacagtgtg tacttatgga acgctggttc cggtgacatc 840
ctgcagctgt tgcaaatgga gcagcctggg gactacatat catccgtggc ctggatcaaa 900
gagggcaact acctggctgt gggcaccagt aatgctgagg tgcagctatg ggatgtgcag 960
cagcagaaac ggcttcgaaa catgaccagc cactctgctc gagtaagctc cctgagttgg 1020
aacagctata tcctgtcaag tggttcacga tctggccaca tccaccacca cgatgttcga 1080
gtagcagaac accatgtggc cacactgagt ggccatagcc aggaagtatg tgggctgcgc 1140
tgggccccag atggacgaca tctggcaagc ggtggcaatg ataacattgt caacgtgtgg 1200
cctagtggtc ctggagaaag tggctgggtt cccctgcaga cattcactca acatcaaggt 1260
gctgtcaagg ctgttgcatg gtgtccctgg cagtccaata tcctggcaac aggaggaggt 1320
accagtgacc gacacattcg catttggaac gtctgctctg gagcctgtct gagtgctgtg 1380
gatgtgcatt cccaggtgtg ctccatcctc tggtctcccc actataagga gctcatctca 1440
ggccatggct ttgcccagaa ccagctggtt atttggaagt acccaaccat ggccaaggtg 1500
gcagagctca aaggtcacac agcccgggtc ctgagtctca ccatgagtcc agacggggcc 1560
acagtggcat ctgcagcagc cgatgagact ctgcggctct ggcgctgctt tgagctggac 1620
cctgcccttc ggcgggagcg ggaaaaagcc agcacatcta aaagtagcct catccaccaa 1680
ggcatccggt gaaagacaac cctttctttt cccttcttga ttttgttgtt tatttttttc 1740
taataaagtt catatcttcc tttcttgtgt tcca 1774
<210> 12
<211> 3710
<212> DNA
<213> Rattus leucopus
<400> 12
aaagtggttc agtgcgctcc ctaggcagct gcagttcctg ggaacgtgcg acaagacctg 60
cagacacgct gacgcctcag agcaccgcct ggggcccgga gcggccggtg cagcctgagt 120
cctgaccccg gcccggctcc cgctccgggc tcggccggcg ggcgtaaggg cgcggcgggg 180
tccgggccgg ggggatgtct cggcggacgc gctgtgagga actggatgag ttacgctacc 240
aggacacgga ctcagacctc ctggagcaga gagacaacaa atgtaaggtc aaatggaccc 300
acgaggagga tgagctactg agggccctgg tgaggcagtt tggacagcaa gactggaagt 360
tcctggccag tcactttcct aaccgcacag accagcaatg ccagtaccgg tggctgaggg 420
ttttgaatcc agaccttgtt aagggaccgt ggaccaaaga ggaagatcag aaggtcattg 480
agctggtcaa gaagtacggc acaaaacagt ggacgctcat tgccaagcac ctgaagggcc 540
gtcttgggaa gcagtgtcgt gagcgctggc acaaccatct caaccctgag gtgaagaagt 600
cctgctggac agaggaggaa gatcggatca tctgtgaggc ccataaagtg ctgggcaacc 660
gctgggctga gatcgccaag atgctgccag ggaggacaga caatgctgtg aagaatcact 720
ggaattccac catcaaaagg aaagtcgaca cgggagggtt cccaaacgag tccagagact 780
gcaagcctgt ctacttgctc ttggagctcg aggacaagga ttaccaacag aatgtccagc 840
ctgtggaagg cccgggaagt cttgtgagca gctggcccct ggcgccctct actgtgaagg 900
aggaggagag cagcgaggag gaggctgccg tggctactac ttctaaggaa cacaagcagg 960
agcccgtccc cactgatctg ggggaagtgc gcaccccaga gcccctggaa ttcctcaagc 1020
gtgaatacca ggaggaatcc tccccagaaa caagcctgcc ctacaagtgg gtggtggagg 1080
ccgcgaacct cctcatccct gctgtggagt ccagcctctc cgaagctctg gacttgatcg 1140
agtcggaccc cgatgcttgg tgtgacctca gtaaatttga tcttcctgaa gaaccgtctg 1200
cagagggcag tgtcaacagt agcccagtgc aactccagac accgcagcag cagcaacagc 1260
accagcaggc actgtcattc caccaggctg ccacaccagg gcccagtgtg actgagtatc 1320
gccttgatgg ccacactatt tcagacctga gccggagcag ccggggagag ctgatcccca 1380
tttccccaag cactgagttt gggggctcag gcattggcac accgccctca gtgctcaagc 1440
gacagaagaa acggcgcgtg gccctgtcgc ctgtcacaga gaacagtgcc agcttgtcct 1500
tcctggactc ctgtaatagc cttaccccga agagcacacc tgtcaaaacc cttcccttct 1560
ctccttccca gtttctgaac ttctggaaca aacaggatac cctggagttg gagagcccct 1620
ccctgacgtc cactccggtg tgcagccaaa aggtggtagt caccacaccc ttgcacaggg 1680
ataagacgcc cctgcaccag aagtatccat cgtttgtaac cccagatcag aagtattcca 1740
tggacaacac tccccacaca ccaaccccgt tcaagaatgc tctggagaaa tatggaccac 1800
tgaaacccct gccccaaacc ccacacctgg aagaggactt gaaggaggtg cttcgttccg 1860
aggctggcat tgagctcatc attgaggatg acatgagacc cgagaaacag aagagaaagc 1920
ctgggctccg gcgaagccct atcaagaagg ttcggaagtc tctggctctt gacattgtgg 1980
atgaggatgg gaagatgatg tcatcgacct cgcccaagac tctgtccttg ccaaccagtg 2040
tcccatccag ctcctctggc ttcatcttgc cgggtatcaa ggaggataac agcctgctca 2100
accagggctt cctacaggcc aaacccgaga aggtggtggc cacccagaag ccccggagcc 2160
acattccagc ccctgctcct atgacccgtg cctggaagac ggtggcctgt gggggcacta 2220
aagaccagct cttcatgcaa gagaaggccc ggcagctcct gggccgtctg aagtccagcc 2280
acacatctcg gaccctcatt ctgtcctgag gggcttgcag ggaacaagcc agctctcatg 2340
tttacagggg tagggtgtgg ggtaaggtgt gcgttgaagt cacattaaat gaccagcttc 2400
aggaagtctt ctgccagccc ctcagtctgc tcaggtggca gaagtcacat ggtacatctc 2460
ttcccccggt ctagcctttg tgaagttcct ggtggtgcta atagaacaaa gtcccactcc 2520
tgggcctgcc tgccctccgc ccagtgccac aaggagccct attaggttct cccaggctct 2580
catccagact cctgcttagg atgggggtgt ggcgaggggt gctccttccc tcgtttgttg 2640
gtacactgtc tccacaataa aataccgttc tccctatgca gccccgactc tgccctctga 2700
gtcttgaagt gccttgaagg ccctctcctg acacgtaggc ctgtagacct ctgttcttgg 2760
gtacagcttt acccagtgag catctctgca aagctcccaa gagctctgag tggatgaaga 2820
tgggttctga gaacctgtta gaacggtgta ttcacctttg ccctgatgcc tcagggccat 2880
ggcttggggc atgggtggtt cttatggctt ccacggagca gctgctgcct taagccgagc 2940
ctgccatagg taagaccatt aatataggta gagggatgga tggcaggcct ttcgactctg 3000
gccaatgtgt ggaaggctgc ccagctcctg gatcttttat cctgaattgg tggcagccat 3060
ggcctgggct gtcacctccc ttggagtcag tgggtagagc gtggtccata gttcagtcag 3120
ttaagagctt gactagggag atgctgagcc taatgtctac gttaggaagt gttgttttct 3180
gtagcctgcc tgggtgtccc tgggttggga gttagatgga cctatgggag gtctagactt 3240
agtcctggtt aaagggagac ttgaggcaaa tgttctccaa ctgggcaaga gataacgtct 3300
gaagaagact gcgctagcac accggagtcc aggcgctctc ctgtaaaaga tacgggagcc 3360
gggctgtgct ctcacactgt gcctactgca gcctccttgt ctgagcccca tgctcagtga 3420
gcagcacctg cctcacccct ggctctctag ttcttttctc agaatggcta aggcgactag 3480
cagccacgcg tgtgtgcggt ctgtgcttga gaaggcatgg tggaggacag gctgtcaagc 3540
agaggataaa ggctgctggt gcctaccagg ctctcctaca gtcggggctc tctaaggggt 3600
gccgcagcct gcatttaggg gggctctttt aaccctggaa tttcctcata gacacacgca 3660
aatgtgtgcc ttcttgtcag ccaagttgac aataaagagt agcaaattgt 3710
<210> 13
<211> 4572
<212> DNA
<213> Rattus leucopus
<400> 13
gtccgtgtac ttttcacagg ctgtacgcgc tccgattggc tggcgcctct gggatcaatt 60
tgaaacttgg cggttaaagc tccggttgga acagggcgcc agggaagatc ggggaaggga 120
cgtttagttt gacaccattt tcgccttgca gtattgggac tgacaaacca ttaggcggtg 180
gccaagagtg acaggacaca gtgatcctgc tgggagggag agtgcatcag cgagttccga 240
gtctcctacg gcctgagaag ggcctttcta ctcctgccaa cctcggaagg ttcctgggag 300
agctggcttc acttggccag gacacctgct gagctggtac catgaaagaa gaggtgaagg 360
gaattcctgt aagagtggca ctgcgttgtc gcccccttgt ctctaaagag attaatgagg 420
gctgccagac gtgcctttct tttgtgcccg gagagcctca ggtggtggtt ggtactgata 480
aatcatttac ctacgatttt gtgtttgacc cctctactga acaggaagag gtctttaata 540
cagcagtagc tccactcata aaaggcgtgt ttaaaggata caatgcaact gtcctggcct 600
atgggcagac tggatctggg aagacttatt caatgggagg tgcatacact gcagaacaag 660
aacatgactc agccattggg gttattccca gggtaataca actgctcttc aaagaaatta 720
ataaaaagac tgactttgaa tttactctga aagtgtctta cttggagatt tataatgaag 780
aaattttgga ccttctatgt tcatctcgtg agaaagcatc tcaaataaat atccgggagg 840
atcctaagga aggcataaag attgtgggac tgacggagaa gactgtgcta gttgcctcgg 900
acactgtttc ctgtctagag cagggtaaca actgcaggac tgtggcctcc acagctatga 960
actcccagtc atctcggtct catgccatct ttacaatctc catcgagcaa aggaagaaaa 1020
atgacaaaaa tagcagtttc cgttccaagc tgcatcttgt agaccttgct ggatcagaaa 1080
gacagaagaa aaccaaggcc gagggagatc gtctgaaaga gggtattaat atcaatcgag 1140
gccttctgtg cttgggaaat gtaattagtg ctcttggaga tgacaaaaag ggtaactttg 1200
tgccctacag agattccaag ctgactcgac tgcttcaaga ttctctagga ggcaatagcc 1260
atactcttat gatcgcctgt gtgagtcctg ctgattccaa cctagaggaa acattaaata 1320
cccttcgcta tgctgacaga gcaagaaaaa tcaagaacaa acctattatt aatattgatc 1380
cccaggcagc tgaactaaat caccttaaac aacaggtcca acagctgcag gtcttgttgc 1440
tacaagccca tggaggcacc ttgcctggga atataaatgt gaaaccatca gaaaacctcc 1500
agtccctgat ggagaagaat cagtctctgg tggaagagaa tgaaaaatta agtcgtggtc 1560
tgagtgaggc agctggtcag acagcccaga tgttggagag gatcattttg actgagcaag 1620
caaatgagaa aatgaatgcc aagctagaag aactcagaca gcatgcagcc tgcaaagtgg 1680
atcttcaaaa gctagcagaa acattggaag accaggaagt aaaagaaaac atagagatca 1740
tttgcaacct acaacaagcg attgcccggt tgtctgatga agcggttgct tgcatgactg 1800
caaccatcga tactgcaggg gaagtagaca ctcaagagca aagcagtcca gataccagca 1860
ggtcttctga tgttttcagc actcaacatg ctctccgtca agctcagatg tccaaggagc 1920
tgattgagtt gaataaagaa cttgcattga aagaagccct agctaagaag atgacccaga 1980
atgacaacca gctacagccc attcagttcc agtaccagga taatattaaa aatctagaat 2040
tggaagtcct cagtctacag aaggaaaaag aagaattggt tcttgaactt caaacagcaa 2100
agaaggatgt caaccaagcc aagttgagcg aacgccgtcg caaacgtctt caggagctgg 2160
agggtcaaat agctgagttg aaaaagaaac ttcatgaaca gtccaaactt ctgaagctga 2220
aggaaaccac tgagcttact gtctccaagc tgaaccagga gatacggatg atgaaaaacc 2280
agcgagtcca gttaatgcgt caaatgaaag aggatgctga gaagtttagg cagtggaagc 2340
aacaaaaaga caaagaagta atccagctaa aagaacggga tcgtaaaagg caatacgaac 2400
tgctcaaact tgaaagaaac ttccagaaac agtctaatgt gctcagacgt aaaactgagg 2460
aggcagcagc tgctaacaaa cgtcttaagg atgctctcca aaagcaaaag gaggttgcag 2520
aaaaacggaa agagacccag agccgtggaa tggaaggcac tgcagctcga atgaagagtt 2580
ggcttggaaa tgaaatcgag gttatggtca gtaccgagga agccaaaagg catctgaatg 2640
accttcttga agagagaaag atccttgctc aggatgtggc acaactcaaa gaaaaaagag 2700
aatctggaga gaatccacct cctaaactcc gaaggcgcac attctcacga gatgaagtgc 2760
atggtcaaga ttcaggagca gaggattcta tttcaaagca gattgaaagc ctggagagtg 2820
aattggagct caggagtgct cagattgcag acctacagca aaagcttctg gatgctgaaa 2880
gtgaagacca gccaaaacaa cgctgggaga atattgccac gattctcgaa gccaaatgtg 2940
ccataaagta tttagttgga gagctggtct cctccaaaat acaggtgagc aaactggaaa 3000
gcggcctgag tcagagcaag gccagctgta ttgaagtgca gaagatgctg tttgaggaac 3060
aaaatcattt tgctaaaata gagaccgagt tgaaagaaga gctggtcaga gtggagcagc 3120
agcaccagga aaaggtgttg taccttctca gtcagctgca gcaatgccaa gtgacagaga 3180
aacagctgga ggagtcggtt agtgagaagg aacagcagct gctgagcacc ctgaaatgtc 3240
aggaggaaga gcttaggaag atgcaagaag tgtgtgagca aaatcagcag cttctgcaag 3300
aaaacagtgc catcaagcag aaactgaacc tcctccaagt agtcagcaaa gagaaacccc 3360
atcttgtgag aaatatcctc cagtctccgg actcttcctt tgaatatatt ccacctaagc 3420
ccaaaccttt ccgtattaaa gaaaaatgcc cagagaaaag cttcgccatc gaggacctgc 3480
agtattattc agagacttct gtggctgagg aggagaatga ggacagtgat gaccatgctg 3540
atgaggagtg gatcccaaca aaattagtca aggtgtccaa gaagaacatc caagggtgtt 3600
cctgcaaagg ctggtgtggg aacaagcaat gtggatgcag aaagcaaaag tcagactgta 3660
atggggcctg cagctgtgac cccacaaaat gccgcaaccg ccatcacagc caggacaact 3720
cagatgttat tgagctaaac caagattctg aaaactcctt caaactggaa gatcccacag 3780
aggtgacctc aggattaagc ttcttcaacc ctgtttgtac gactcccagt agcaagatcc 3840
taaaagaaat gtgtgatgca gatcaggtgc tgctgaggca gcctgatttt gcctcttcct 3900
ctgaccatct agaactgaaa cctattgcat cagaaacaca agaaaataag gccatgggga 3960
agaagaagaa gcgagctcta gccagcaata ccagcttctt ctctggctgc tcccctattc 4020
aagaagagtc ccactgaggt tagggccact gtctcttctg tctgccctgg acacactctg 4080
aggctgcagc acagagggga agggcactaa tgacttctgt agcttttagg tcctgctatt 4140
gagaaaagga gaataagtcc ctgaaaggaa gagggcctct actgtctaag ctctctgcct 4200
acaaaaacta ctttgcttct ttagaaggtg ctgaaccttc tactggagag agaaccaact 4260
gaccttcctg atactcaaga ggaaccagtc cccaggacag tctagctcgc tctctgtgag 4320
cagttgagtt gtatcttcat ggagtcgagg tcaacatgtt cttctcttat gatcacatca 4380
gcttaatgga cgagtgggat ggtgacctgg ctcgactccg tcaccacacc tcaggaattg 4440
ggcagggagc ttccctgctc cattccaact ccggacttta caaacccttc aactgtccgt 4500
cacccatgtt actgaagtga atgaaacatt ttaaaaatgt taaaataaat aaaccttagc 4560
tcatctacta tt 4572

Claims (3)

1.一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物,其特征在于,所述生物标记物为p21的mRNA表达水平。
2.如权利要求1所述的生物标记物,所述生物标记物在丙戊酸耐药癫痫患儿中的水平明显高于丙戊酸敏感癫痫患儿中的水平。
3.一种如权利要求1所述的生物标记物在作为预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的标记物中的应用。
CN202111520341.8A 2021-12-13 2021-12-13 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用 Pending CN114350777A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111520341.8A CN114350777A (zh) 2021-12-13 2021-12-13 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111520341.8A CN114350777A (zh) 2021-12-13 2021-12-13 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN114350777A true CN114350777A (zh) 2022-04-15

Family

ID=81099922

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202111520341.8A Pending CN114350777A (zh) 2021-12-13 2021-12-13 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN114350777A (zh)

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2005047546A2 (en) * 2003-11-05 2005-05-26 Wisconsin Alumni Research Foundation Diagnostic and prognostic methods and compositions for seizure- and plasticity-related disorders
CN106011236A (zh) * 2016-05-18 2016-10-12 湖州市中心医院 一种基于癫痫患者的丙戊酸血药浓度与基因多态性的分析方法
CN108120842A (zh) * 2016-11-30 2018-06-05 北京大学 一种用于癫痫预测的生物标志物
CN108117591A (zh) * 2016-11-30 2018-06-05 北京大学 一种用于癫痫诊断的生物标记物
CN113192649A (zh) * 2021-06-01 2021-07-30 山东英盛生物技术有限公司 一种指导癫痫疾病个体化精准用药的系统

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2005047546A2 (en) * 2003-11-05 2005-05-26 Wisconsin Alumni Research Foundation Diagnostic and prognostic methods and compositions for seizure- and plasticity-related disorders
CN106011236A (zh) * 2016-05-18 2016-10-12 湖州市中心医院 一种基于癫痫患者的丙戊酸血药浓度与基因多态性的分析方法
CN108120842A (zh) * 2016-11-30 2018-06-05 北京大学 一种用于癫痫预测的生物标志物
CN108117591A (zh) * 2016-11-30 2018-06-05 北京大学 一种用于癫痫诊断的生物标记物
CN113192649A (zh) * 2021-06-01 2021-07-30 山东英盛生物技术有限公司 一种指导癫痫疾病个体化精准用药的系统

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DANIELA CUKOVIC ET AL.: "Exosomes in Epilepsy of Tuberous Sclerosis Complex: Carriers of Pro-Inflammatory MicroRNAs", 《NONCODING RNA》, vol. 7, no. 3, pages 4 - 5 *
HENGLING CHEN ET AL.: "Integrative analysis of gene expression associated with epilepsy in human epilepsy and animal models", 《MOL MED REP》, vol. 16, no. 6, pages 4920 - 4926 *
SHU AIZAWA ET AL.: "Valproate administration to mice increases hippocampal p21 expression by altering genomic DNA methylation", 《NEUROREPORT》, vol. 26, no. 15, pages 915 - 920 *
吴华敏 等: "耐药性癫痫及其分子遗传学机制研究", 《癫痫杂志》, vol. 5, no. 6, pages 458 - 462 *
钱若兵,傅先明主编: "《癫痫防治与管理》", 30 November 2018, 安徽科学技术出版社, pages: 93 *
韩玉增: "儿童难治性癫痫易感基因的检测研究分析", 《中国优秀硕士学位论文全文数据库 医药卫生科技辑》, no. 11, pages 060 - 27 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107475375B (zh) 一种用于与微卫星不稳定性相关微卫星位点进行杂交的dna探针库、检测方法和试剂盒
KR102622309B1 (ko) 염색체 상호작용의 검출
CN103930563B (zh) 用于预测癌症复发的方法和装置
WO2014075911A1 (en) Diagnostic mirna markers for alzheimer
WO2011069100A2 (en) Microrna and use thereof in identification of b cell malignancies
KR102029775B1 (ko) 비근침윤성 방광암 진단용 바이오마커 및 이의 용도
JP6076901B2 (ja) 被験者の血液サンプル中の疾患マーカーの存在の分析方法
CN107674916B (zh) 一种环状rna在结直肠癌生物标志物中的应用
WO2014114802A1 (en) Non-invasive prenatal genetic diagnostic methods
CN111748618A (zh) 一种帕金森病早期诊断的生物标志物及其应用
CN108676872A (zh) 一种与哮喘相关的生物标志物及其应用
CN107312852A (zh) 心肌梗死诊断标志物组合物
CN111690748A (zh) 使用高通量测序检测微卫星不稳定的探针组、试剂盒及微卫星不稳定的检测方法
CN106811517A (zh) 一种用于检测c-MET基因外显子14跳读突变的组合物及试剂盒
AU2010290828A1 (en) MicroRNA expression signature in peripheral blood of patients affected by hepatocarcinoma or hepatic cirrhosis and uses thereof
WO2014166303A2 (en) Use of multiomic signature to predict diabetes
CN107988370B (zh) 一种circRNA基因在制备诊断慢性粒细胞性白血病试剂中的应用
CN110951870A (zh) miRNA表达量在预测氯吡格雷治疗疗效中的应用
CN103757122B (zh) 基于AllGlo探针荧光定量PCR的hsa-miR-188-5p检测试剂盒及其检测方法
CN114350777A (zh) 一种预测癫痫患儿对丙戊酸耐药性的生物标记物及其应用
CN113564162B (zh) 同源重组修复基因捕获探针组、试剂盒及其应用
CN110592219B (zh) 一种用于乳腺癌的lncRNA诊治标志物
WO2016179814A1 (zh) 与乳头状甲状腺瘤相关的基因
CN107674915B (zh) 一种环状rna在结直肠癌生物标志物中的应用
WO2016112031A1 (en) Method of epigenetic analysis for determining clinical genetic risk

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination