CN114317519A - 一种血液基因组dna提取试剂盒及其使用方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及DNA提取领域,公开了一种血液基因组DNA提取试剂盒及其使用方法,包括包括细胞裂解液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液。细胞裂解液组分包括:浓度2~8M的盐酸胍或异硫氰酸胍中的一种、浓度20mM或50mMpH8.4的Tris‑HCl、浓度25mM的EDTA和浓度1%~20%的表面活化剂;洗涤缓冲液组分包括:浓度20mMpH8.4的的Tris‑HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;洗脱缓冲液组分包括:浓度10mMpH7.0的Tirs‑HCl或10mMpH8.0的TE缓冲液中的一种。本发明提供的血液基因组DNA提取试剂盒在室温条件下储存和操作,其采用的磁珠法提取,操作简单,对全血样本可直接处理无需分离细胞,整个提取过程30min即可完成,提取效率高,获得的DNA浓度和纯度较好,方便下游进行基因检测操作。
Description
技术领域
本发明涉及DNA提取领域,具体而言,涉及一种血液基因组DNA提取试剂盒及其使用方法。
背景技术
基因组DNA提取是PCR扩增、文库构建和测序工作的基础,临床工作中常用的离体标本包括血液、器官组织和脱落细胞,其中血液样本使用最为广泛。目前,临床用于血液基因组DNA提取方法包括吸附柱法和磁珠法,吸附柱法由于操作过程中需要离心等步骤,受限于离心机通量,遇到样本量大的情况时,需要耗费非常长的时间。
与柱提法相比,磁珠具有良好的表面效应和体积效应,磁珠表面积激增,微球官能团密度和选择性吸附能力大大增加,导致其吸附平衡时间缩短。此外磁珠的物理和化学性质稳定,能耐受一定浓度的酸碱溶液和微生物降解,具有一定的生物相容性,不会对生物体造成明显的伤害。磁珠法提取DNA目前在临床上已得到广泛的应用,然而,不同厂家的磁珠法核酸提取法其效率差别很大,存在DNA提取试剂存储条件要求高,操作方法复杂,提取用时长,获得的DNA浓度和纯度不够高的问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种血液基因组DNA提取试剂盒及其使用方法,旨在解决现有技术中,DNA提取试剂存储条件要求高,DNA提取操作方法复杂、用时长,获得的DNA浓度和纯度不够高的问题。
本发明是这样实现的,一种血液基因组DNA提取试剂盒,包括细胞裂解液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液,
所述细胞裂解液包括如下组分:浓度2~8M的盐酸胍或异硫氰酸胍中的一种、浓度20mM或50mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA和浓度1%~20%的表面活化剂;
所述洗涤缓冲液包括如下组分:浓度20mM pH 8.4的的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
所述洗脱缓冲液包括如下组分:浓度10mM pH 7.0的Tirs-HCl或10mM pH8.0的TE缓冲液中的一种。
进一步的,所述表面活化剂为5%SDS和1%Triton X-100的组合。
进一步的,所述表面活化剂为tween 20、NP-40、CTAB中1-3种的组合。
进一步的,所述盐酸胍或异硫氰酸胍中的一种的浓度为6M。
进一步的,所述细胞裂解液还包括0.5MNH4+。
一种血液基因组DNA提取试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
(1)将200μL全血与所述细胞裂解液等体积混匀,室温条件下振荡混匀10min;
(2)加入20μL磁珠颗粒,每2min将液体中的磁珠混匀悬浮一次,10min后加磁场将磁珠分离出来,此时DNA仍吸附在磁珠表面;
(3)将磁珠转移至500μL所述洗涤缓冲液中,混匀洗涤2min,加入磁场弃洗涤后的所述洗涤缓冲液,此时DNA吸附在磁珠表面;
(4)将磁珠转移至600μL80%的乙醇溶液中,混匀洗涤1min,加入磁场弃洗涤后的乙醇溶液,此时DNA仍吸附在磁珠表面;
(5)将磁珠转移至100μL所述洗脱缓冲液中,混匀2min,此时DNA从磁珠表面游离出来,加入磁场即得到纯化好的DNA。
与现有技术相比,本发明提供的血液基因组DNA提取试剂盒在室温条件下储存和操作,无需特殊条件,其使用方法简单,裂解不需要额外的加热或蛋白酶处理,对全血样本可直接处理无需分离细胞,整个提取过程30min即可完成。本发明的血液基因组DNA提取试剂不使用苯酚氯仿等有毒的有机溶剂,对操作人员无毒害作用。本发明提取效率高,获得的DNA浓度和纯度较好,方便下游进行基因检测操作。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
本发明提供的血液基因组DNA提取试剂盒,包括细胞裂解液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液。细胞裂解液中含有高离盐和表面活性剂,能破坏细胞表面的跨膜蛋白,使细胞膜破裂,释放出来的核酸在高离环境中与磁珠吸附结合,洗涤缓冲液含有低浓度的盐离子,可以去除磁珠表面的杂质,最后经过洗脱缓冲液洗脱即可获得纯化的DNA。
本发明的细胞裂解液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液的实施例组分如下:
具体实施例1:
细胞裂解包括组分:浓度6M的盐酸胍、浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl(三羟甲基氨基甲烷盐酸盐)、浓度25mM的EDTA(乙二胺四乙酸)、浓度5%SDS(十二烷基硫酸钠)、浓度1%Triton X-100(聚乙二醇辛基苯基醚);
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl(三羟甲基氨基甲烷盐酸盐)、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA(乙二胺四乙酸)和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 7.0的Tirs-HCl(三羟甲基氨基甲烷盐酸盐)。
具体实施例2:
细胞裂解包括组分:浓度6M的盐酸胍、浓度50mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA、浓度5%SDS和浓度1%Triton X-100;
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 7.0的Tirs-HCl。
具体实施例3:
细胞裂解包括组分:浓度2M的异硫氰酸胍、浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA、浓度6%tween 20(吐温-20或山梨醇酐单月桂酸酯聚氧乙烯(20)醚)和浓度2%CTAB(十六烷基三甲基溴化铵);
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 8.0的TE缓冲液。
具体实施例4:
细胞裂解包括组分:浓度5M的异硫氰酸胍、浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA、浓度8%tween 20、浓度2%NP-40(乙基苯基聚乙二醇)和浓度2%CTAB;
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 8.0的TE缓冲液。
具体实施例5:
细胞裂解包括组分:浓度8M的异硫氰酸胍、浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA、浓度8%tween 20、2%NP-40和2%CTAB;
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 8.0的TE缓冲液。
具体实施例6:
细胞裂解包括组分:浓度6M的盐酸胍、浓度50mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA、浓度5%SDS、浓度1%Triton X-100和浓度0.5M NH4+;
洗涤缓冲液包括组分:浓度20mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
洗脱缓冲液包括组分:浓度10mM pH 7.0的Tirs-HCl。
血液基因组DNA提取试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
(1)将200μL全血与细胞裂解液等体积混匀,室温条件下振荡混匀10min;
(2)加入20μL磁珠颗粒(优选超顺氧化硅纳米磁珠),每2min将液体中的磁珠混匀悬浮一次,10min后加磁场将磁珠分离出来,此时DNA吸附在磁珠表面;
(3)将磁珠转移至500μL洗涤缓冲液中,混匀洗涤2min,加入磁场弃洗涤后的洗涤缓冲液,此时DNA吸附在磁珠表面;
(4)将磁珠转移至600μL80%的乙醇溶液中,混匀洗涤1min,加入磁场弃洗涤后的乙醇溶液,此时DNA吸附在磁珠表面;
(5)将磁珠转移至100μL洗脱缓冲液中,混匀2min,此时DNA从磁珠表面游离出来,加入磁场即得到纯化好的DNA。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (6)
1.一种血液基因组DNA提取试剂盒,包括细胞裂解液、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液,其特征在于:
所述细胞裂解液包括如下组分:浓度2~8M的盐酸胍或异硫氰酸胍中的一种、浓度20mM或50mM pH 8.4的Tris-HCl、浓度25mM的EDTA和浓度1%~20%的表面活化剂;
所述洗涤缓冲液包括如下组分:浓度20mM pH 8.4的的Tris-HCl、浓度0.5M的NaCl、浓度1mM的EDTA和80%无水乙醇;
所述洗脱缓冲液包括如下组分:浓度10mM pH 7.0的Tirs-HCl或10mM pH8.0的TE缓冲液中的一种。
2.如权利要求1所述的血液基因组DNA提取试剂盒,所述表面活化剂为5%SDS和1%Triton X-100的组合。
3.如权利要求1所述的血液基因组DNA提取试剂盒,所述表面活化剂为tween 20、NP-40、CTAB中1-3种的组合。
4.如权利要求1所述的血液基因组DNA提取试剂盒,所述盐酸胍或异硫氰酸胍中的一种的浓度为6M。
5.如权利要求1-2所述的血液基因组DNA提取试剂盒,所述细胞裂解液还包括0.5MNH4+。
6.如权利要求1-5所述的血液基因组DNA提取试剂盒的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将200μL全血与所述细胞裂解液等体积混匀,室温条件下振荡混匀10min;
(2)加入20μL磁珠颗粒,每2min将液体中的磁珠混匀悬浮一次,10min后加磁场将磁珠分离出来,此时DNA仍吸附在磁珠表面;
(3)将磁珠转移至500μL所述洗涤缓冲液中,混匀洗涤2min,加入磁场弃洗涤后的所述洗涤缓冲液,此时DNA吸附在磁珠表面;
(4)将磁珠转移至600μL80%的乙醇溶液中,混匀洗涤1min,加入磁场弃洗涤后的乙醇溶液,此时DNA仍吸附在磁珠表面;
(5)将磁珠转移至100μL所述洗脱缓冲液中,混匀2min,此时DNA从磁珠表面游离出来,加入磁场即得到纯化好的DNA。
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