CN114317458A - 具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物 - Google Patents

具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物 Download PDF

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CN114317458A CN202111671401.6A CN202111671401A CN114317458A CN 114317458 A CN114317458 A CN 114317458A CN 202111671401 A CN202111671401 A CN 202111671401A CN 114317458 A CN114317458 A CN 114317458A
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Abstract

本发明涉及病害防治领域,特别是涉及具有杀菌效果的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物。本发明具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体,所述的大肠杆菌噬菌体包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5;或者,大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和/或大肠杆菌噬菌体ZJRP5,上述噬菌体的保藏编号为CCTCC NO.M 2021779~CCTCC NO.M 2021783。本发明所述大肠杆菌噬菌体拥有较宽的宿主范围,能够有效防治大肠杆菌感染。

Description

具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物
技术领域
本发明涉及病害防治领域,特别是涉及具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物。
背景技术
肠致病性大肠杆菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)是引起家兔腹泻的主要病原菌,该菌具有高度传染性,严重制约了兔产业的健康发展。临床上常用抗生素进行防治,然而细菌耐药性问题的日益加剧致使养殖业发展和公共卫生安全面临严峻挑战。
大肠杆菌主要是环境中粪便通过污染水、土壤和饲料等途径,最后被动物食用所感染。常采用的方式方法:环境卫生消毒、口服或注射抗生素、口服或注射疫苗,达到治疗和预防大肠杆菌感染的目的,但由于其血清型众多及细菌耐药性问题,导致抗生素、疫苗使用受限。因此使用噬菌体来治疗耐药菌成为一种替代方案。但是,目前没有能够同时针对多种大肠杆菌的噬菌体。
发明内容
为了解决上述问题,本发明提供了具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物。本发明所述大肠杆菌噬菌体拥有较宽的宿主范围,能够有效防治大肠杆菌感染。
为了实现上述目的,本发明提供如下技术方案:
本发明提供了具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体,所述大肠杆菌噬菌体包括大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichiacoli phage)ZJRP4和大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5;或者,包括大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichiacoli phage)ZJRP4或大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5;
所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1的保藏编号为CCTCC NO.M 2021779;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP2的保藏编号为CCTCC NO.M 2021780;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP3的保藏编号为CCTCC NO.M 2021781;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP4的保藏编号为CCTCC NO.M2021782;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP5的保藏编号为CCTCC NO.M 2021783。
本发明提供了上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体在制备杀菌药物或制备防治大肠杆菌引起的传染病药物中的应用。
优选的,所述传染病包括大肠杆菌病。
本发明提供了一种杀菌剂,所述杀菌剂的有效成分包括上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5中的一种或几种。
优选的,所述杀菌剂的有效成分包括上述技术方案所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5。
优选的,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2和大肠杆菌噬菌体ZJRP3的浓度分别为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4的浓度为1×106PFU/mL~2×1010PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5的浓度为1×105PFU/mL~2×1010PFU/mL。
本发明提供了一种杀菌药物,所述药物的有效成分包括上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体。
本发明提供了一种消毒剂或清洁剂,有效成分包括上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体。
本发明提供了一种饲料添加剂组合物,有效成分包括上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体。
优选的,靶标病菌包括大肠杆菌。
有益效果:本发明具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体,所述大肠杆菌噬菌体包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5;或者,大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和/或大肠杆菌噬菌体ZJRP5;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1的保藏编号为CCTCC NO.M 2021779;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP2的保藏编号为CCTCC NO.M 2021780;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP3的保藏编号为CCTCC NO.M 2021781;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP4的保藏编号为CCTCC NO.M 2021782;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP5的保藏编号为CCTCC NO.M 2021783。本发明所述大肠杆菌噬菌体拥有较宽的宿主范围,能够防治大肠杆菌感染。试验结果表明,本发明所述大肠杆菌噬菌体中大肠杆菌噬菌体ZJRP1可裂解2株大肠杆菌,大肠杆菌噬菌体ZJRP2可裂解6株大肠杆菌。大肠杆菌噬菌体ZJRP3可裂解6株大肠杆菌,大肠杆菌噬菌体ZJRP4可裂解3株大肠杆菌,大肠杆菌噬菌体ZJRP5可裂解8株致病性大肠杆菌,能有效防治兔大肠杆菌感染。可见本发明提供的噬菌体拥有较宽的宿主范围,为宽谱噬菌体,用新西兰实验兔评估噬菌体ZJRP1~ZJRP5的抗大肠杆菌分离株大肠埃希氏菌(Escherichia coli)ZJRE1的作用效果,结果显示噬菌体ZJRP1~ZJRP5在体内外均能杀灭大肠杆菌,应用于制备防治兔大肠杆菌感染的药物中可实现杀菌的效果。
生物保藏说明息
大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCC NO.M 2021779。
大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCC NO.M 2021780。
大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP3,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCC NO.M 2021781。
大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP4,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCC NO.M 2021782。
大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCC No.M 2021783。
大肠埃希氏菌(Escherichia coli)ZJRE1,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏地址为中国.武汉.武汉大学,邮编为430072,保藏日期为2021年6月25日,保藏编号为CCTCCN.M 2021778。
附图说明
图1为噬菌体Ⅰ~Ⅴ的形态图;
图2为噬菌体Ⅰ~Ⅴ在不同pH下稳定性比较图,其中A为噬菌体Ⅰ,B为噬菌体Ⅱ,C为噬菌体Ⅲ,D为噬菌体Ⅳ,E为噬菌体Ⅴ,phage survival rates为噬菌体存活率;
图3为噬菌体Ⅰ~Ⅴ在不同温度条件下热稳定性比较图,其中A为噬菌体Ⅰ,B为噬菌体Ⅱ,C为噬菌体Ⅲ,D为噬菌体Ⅳ,E为噬菌体Ⅴ;
图4为噬菌体Ⅰ~Ⅴ的一步生长曲线图,其中A为噬菌体Ⅰ,B为噬菌体Ⅱ,C为噬菌体Ⅲ,D为噬菌体Ⅳ,E为噬菌体Ⅴ;
图5为ZJRP1的全基因组比对进化树;
图6为ZJRP2的全基因组比对进化树;
图7为ZJRP3的全基因组比对进化树;
图8为ZJRP4的全基因组比对进化树;
图9为ZJRP5的全基因组比对进化树;
图10为不同噬菌体组合物在感染细菌后不同时间下OD600值比较,其中A为ZJRP1、ZJRP2、ZJRP3、ZJRP4、ZJRP5每种噬菌体单独感染宿主菌后不同时间点的OD600值,B为2种噬菌体组合物ZJRP2+3、ZJRP2+4、ZJRP3+4、ZJRP3+5感染后不同时间点的OD600值,C为ZJRP1+3+5、ZJRP1+2+4、ZJRP1+2+3+4+5噬菌体组合物感染后不同时间点的OD600值;
图11为不同处理试验第5天血清内毒素含量图;
图12为感染动物的回肠组织切片图;
其中图5~图10中,ZJRP1为大肠杆菌噬菌体ZJRP1,ZJRP2为大肠杆菌噬菌体ZJRP2,ZJRP3为大肠杆菌噬菌体ZJRP3,ZJRP4为大肠杆菌噬菌体ZJRP4,ZJRP5为大肠杆菌噬菌体ZJRP5,ZJRE1为大肠埃希氏菌ZJRE1,ZJRP2+3为大肠杆菌噬菌体ZJRP2和大肠杆菌噬菌体ZJRP3,ZJRP2+4为大肠杆菌噬菌体ZJRP2和大肠杆菌噬菌体ZJRP4,ZJRP3+5为大肠杆菌噬菌体ZJRP3和大肠杆菌噬菌体ZJRP5,ZJRP1+3+5为大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP3和大肠杆菌噬菌体ZJRP5,ZJRP1+2+4为大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2和大肠杆菌噬菌体ZJRP4,ZJRP1+2+3+4+5为大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5;
图11和图12中A为A组,B为B组,C为C组,D为D组。
具体实施方式
本发明提供了具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体,所述大肠杆菌噬菌体包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5;或者,大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP4和/或大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5;或者,包括大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichiacoli phage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP4或大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5。在本发明中,所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1的保藏编号为CCTCC NO.M 2021779;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP2的保藏编号为CCTCC NO.M 2021780;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP3的保藏编号为CCTCC NO.M 2021781;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP4的保藏编号为CCTCC NO.M 2021782;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP5的保藏编号为CCTCC NO.M 2021783。
在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1的形态为:由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,其头部直径约为65nm,尾鞘尾管长度约为95nm。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1的生物学特性为:噬菌体的最佳感染复数为0.001;噬菌体在pH为3和5的条件下存活率超过90%,pH为7条件下噬菌体存活率为26%,pH为9条件下噬菌体全部死亡;热稳定性测定在37℃和42℃条件下存活率接近100%;噬菌体一步生长曲线结果显示,噬菌体的潜伏期为16~19min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为162个子代噬菌。本发明所述噬菌体ZJRP1的基因组长度为68201bp,GC含量46.16%的,其全序列进行BLAST比较结果该噬菌体与大肠杆菌噬菌体EC ML-117有96%的同一性;T4-like噬菌体的衣壳蛋白,不仅充当噬菌体遗传信息的保护包裹作用,同时在噬菌体组装等方面起着重要作用,作为典型的保守基因,常常用于遗传学和生物多样性分析,噬菌体ZJRP1 phage minor capsid protein基因(参考基因序列GenBank:JX128258.1)的序列如SEQ ID No.1所示:TCTGCACTTGCAGTGTATCGCCCATCCAGGAGGACCGATGTCACCCTTTTTGAACTTCAACTCTCCGCCAACTTCCCATAGACGCTTGTCATCAAGTTTGAATCTCATTCCGTCGACATGTTCATGAGAGATTCGCGGCTCCTTTCCTGCTCCTGAGTGCGCCCATTCAAATTCTTCAACTCCATTCTGGCGCATCCTTTCATCGCTTAGAACGCAATACAATTTGCTTGTCTGGTCTTTAGCGATTAAGTCGACTCTCTTTGCAGAGAAGTGTTTTACGTTTCGCAGCGCCGCCTGAATGCCTGACGTGCCTTGCTGGGCTGGGTCGGGCGAAGTCAGCGAAAGCATGACTGCTTCGTACACTCTGTTGTGAATATCCTCGCCGACCTTAGTCACTAGAGTCGTGTTAAACGTCTCGCTTGTTCTAAGAGTGTTCTCAACGAATTTGTTATATGTGGCCTTTGGCGCTTCTATGCCTGCGGACTTAAGGCTGGCGAATGTAGCAGAAGTAGCACCCTTTTCAACCGACTTGATAAAATCAGCGGCAATCTTCGACCCAACACGAGCAAACGCCTTTGCCCATTTCAGCTGCAGACGTTTCATAAGAGTTTGGAATGTTGAATCAGCAGAGTCTTGCGCAAAGAACTTCTGCACCTGCTTCTTTTCAAGCCACTCTGAAATTCCTGCCTGATAGTCATCAATCATCGCATAGCAAAGACCTTTCATCTCACGACGGTAGGCCATCGCAATAGCGTTTGATGGGATTATCGGACTGCCGCGCCCGATTCTATCGGGTGAGCGGCGTTCACGTTTTTTCGAAGCTTTA,即该噬菌体的特异性衣壳蛋白基因序列。本发明所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1可裂解2株致病性大肠杆菌。
在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP2的形态为:由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,其头部直径约为70nm,尾鞘尾管长度约为95nm。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3的生物学特性为:噬菌体的最佳感染复数为0.001,噬菌体在pH为7条件下存活率超过85%,pH为3、5或9的条件下,噬菌体全部死亡,热稳定性测定在37℃和42℃条件下存活率接近100%。噬菌体一步生长曲线结果显示,噬菌体的潜伏期为16~19min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为155个子代噬菌。本发明所述噬菌体ZJRP2的基因组长度为137511bp,GC含量43.61%的,其全序列进行BLAST比较结果该噬菌体与肠杆菌噬菌体naam有93%的同一性;噬菌体ZJRP2 structural protein基因(参考基因序列GenBank:MN850630.1)的序列如SEQ ID No.2所示:ATGCCATATTTAGATAAAGTGGTAGATGTTACAGTTAACCTCGGAACCCAGCCTATTGACACTGTAGGTTTCGAAACTCCGCTGTTCATCGCTATCCACAACAACTTTACTGAGCGAGCTCGCGTATATGCGGAGCTGGATCAGATGGTGGAAGACGGTTTCGCACAAGGCTCTGCAGCTTATGAGTTTGCAGCAAAAGCTTTCGGCGGTGTATTCCCTCCACAGTATGTCATGATCGGCAGACAGGCAAAAGAAAAAACCACTGTAGATTTTAAAGGTATTGCTGCCGCAGCTGATACCGATGTCGTAATGACTATTGCAAAAGGTAGCTACAATACTTCTCTGATAGTGCCTATCTCTGGTGGAACAGGTGCAACTCAGATTGCAGAGTCCATGAAGACTAAAATCGAAGCAGATGATAACTTGGACGATATCACTGTAGCGGCTGAAGACGGTGTTATCACCATCACTGGTGACTGTACTGTTGGTTATCATACTGGTAACTATACAATCAAAAATATCGCCAATGCTGAAAAACCTTCTACAGTAGTTGATAAGATCAATGCTGAGCGTGACAACTGGTACTTCCTGTGCCATGAAGACCACACCGACATTGAAGCATGTGCTAAGTGGGCTCAGGCCAACTACAAGCTGCACGTCTACTCTACGGCAGAAGATGTGACTGGCAAAGATAGTAACATCGCTACCAAACTGAAAGCTGCACAATATGACAGTGTCGGTATGTACGATCCTCGTGCAGATAAGGATTTCCCGGAGGGTGGTATCATAGGTGCTATGGCATCCAACGATCCGTCCTATGGTGACAGTTTGCACTTAAAACAGATGCCGGGTGTGATTGCACCATCTTTGACTTTAACTCAGCGTATGGCGATTTGGGAAAACCACGTTAACTTCTACAGAATGATTAACGGTGTTGGCGCTTTCTGGGAAGGTAAGTGTGCTTCAGGTCAGTATGCAGACGCTATTCGTTTTGCACACTGGATCAAGTTCAGATCTGAAGAATCCATGTTCGGGTACATGCATCGCCGCTCCAACATGGGTTTAAGCATGAAGATGTCTGATGATGATCTTCCGGTTATCAAGTCTGTTCTGATGAACAACCCGATCAATACTGGCATTAAGAATGGTGCGATCCTGACAGGTTTTGACGAAGACAATAATGTATTCTACGACCCGATCATCACAGTTCCTAAGCGTGCAGAAATTCCAACCAATCAGTTGGCTGCTCGTGTTCTGGAAGGTGTGAAAGTAGAACTGGTGTATAACAACGCTCTGCACTTCGTCCGTATCCGGATCAACGTCCTTCTGGACAAAGTTGGTTCTAAATCCACCAATGCTGTTGCAATGACTGAATAA,即该噬菌体的特异性序列。本发明所述大肠杆菌噬菌体ZJRP2可裂解6株致病性大肠杆菌。
在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3的形态为:由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,头部直径约为70nm,尾鞘尾管长度约为95nm。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3的生物学特性为:噬菌体的最佳感染复数为0.001;噬菌体在pH为7条件下存活率超过85%,pH为3、5或9的条件下,噬菌体全部死亡;热稳定性测定在37℃和42℃条件下存活率接近100%;噬菌体一步生长曲线结果显示,噬菌体的潜伏期为11~14min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为114个子代噬菌。本发明所述噬菌体ZJRP3的基因组长度为136351bp,GC含量43.70%的,其全序列进行BLAST比较结果该噬菌体与大肠杆菌噬菌体V5有95%的同一性;噬菌体ZJRP3 tail fiber protein基因(参考基因序列GenBank:LR694611.1)的序列如SEQ ID No.3所示:TTAAGCATAAGATATGGTGATCCATTGACCGTTTACAAATTTTTGAATAGCTCCAGTCCAATAGTCGCCCTGATACGGGTGTTTATAGGCGTAATTGCCGGAGCACATTACATGCCCAGGGTATACTCTTGATTCTCTGTAGGTGGTTCTGAAACGGTTTGCTATCCTTACATCTTCAACACCCCTACTAGGCATAGGAATAGTAAGGTTACCACTACTGTCTGCGCTACTACCATTTACCCTGCGGACCACGTTTCTTCCACCAACTGTTGCATATTGACCCCTGGCGGTTTTATCGTTACAATCTACTCTTCCATCTATTTGAGCGCTGCCGCAGGATTGTTGTCCATTAACAGTGGCTCTAGGTATCGTTACCGCATTAGCATTTGCAGAGGAGCTTTTTGCATCATTGCATTCAAGATTTCCTTGGATAGCCAGTCTTGCACGGTTGGCAGTTATAGCATTGAGCTTCATAGCCGAAAACACAGGCTGCCCACCAGAAGGTTGAAATCTCCAACGGAAACCGTCTATTTGGTGAGAGGGATCATCAAGGTCTGTGCCGTCAGCACCACCGATGTTGTCCATAATCCAGAAATCCATCATCGTCTTGTCTGGAGTTATGGTGGTGTATATCGCCGCACTATCTGTTGACGCGGATGCAAACTCGATTCTTTGAAGACCTAAAGTTTGAGTCTGGATCATTGTGTCTCCAGCCTTGTCAACATAAAGGTCATCCATTTCTTCAGGCGAGTATACATTGAGAACTTGACGTGCAGCAGCTTTGTCTGGAACGTCTGCCAGATTATTAGTGACCCTTAAGAATCTATTATCCCATCCTGGGACAACATCTTCTGTTAAATGCTTTAGCCACGCAGAGAGCATGTGGAGTTCAAAGTTAACAACTTCACATGCTATCCTTTGTGTCATATCCCAACCTTTCAATCTCTCTTCTTTGTTCGGTTGAGATTTGTTCAACTCTCCTGTATTTTCAAGCACAACATCCTGATTGGCCCAAATATCAAGAGGGATAACTGGTTTAGTCAT,即该噬菌体的特异性序列。本发明所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3可裂解6株致病性大肠杆菌。
在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4的形态为:由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,头部直径约为95nm,尾鞘尾管长度约为100nm。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4的生物学特性为:噬菌体的最佳感染复数为0.1,噬菌体在pH为7条件下存活率超过90%,大肠杆菌噬菌体ZJRP4在pH为5条件下存活率为75%,pH为3或9条件下,噬菌体全部死亡,热稳定性测定在37℃和42℃条件下存活率接近100%。噬菌体一步生长曲线结果显示,噬菌体ZJRP4的的数量随着时间没有明显扩增。本发明所述噬菌体ZJRP4的基因组长度为1167091bp,GC含量40.40%的,其全序列进行BLAST比较结果该噬菌体与大肠杆菌噬菌体karroe有98%的同一性;噬菌体ZJRP4 capsid vertex protein基因(参考基因GenBank:MN850574.1)的序列如SEQ ID No.4所示:ATGACTCATATTTTTACTGAACTGTTGCGGGAATCTACTTCCTCAGTAGCTAACCAGACAGCGCGACCGCAACTATTATCATTAACTCGCGCGGTAAACAACCTGATTTTCTCTGATCTGGTAGCAATCCAGCCAACGGATCAACCAGTATCTGCATTGTACGGCCTACGTTATCTTAATCGTGATGGTCAGATGACTTTCCGAACTGCTACAACCTATGGTGGCGCGGCTGGTGATCGCACAGAGATTGAAGAGTTTTCAAAAGAAAAATCTTATAACGAAGGCGCACTATTCAAATCAGACGATGTTGTATACGAAGTTGTGACCGCTGGTACAGTCGGTGAAGATGCCGAAACTCCAGAAGCTGCAATCTTTAAAGGCATAATGACAAACAAAATTCGTTTCTATAGCGATTGTGCATCGGTAGAATACTTTGAAGATAAAAACACCGAAATTTCGTCTACCTCTATGCAGTTTGATAAATGGCAGGTTAATGTAGGTTCCCGTAAACTGAAAACCTCGTTCACCACTGAATTAATGCAGGATCTTGAGGCAAGCCAAATCAACTCTGAAAACTCTGTAATTGATCTTCTGGCTACTGTTGCTTCCGAAGAGATCAACAAAGATATTATTCAGAAGTTGATCACTGTATCATCTCGCTATAAAATTAAAGGGATCACCCCTGATGGCGTACTTTCTCTCGTTAGCGTTCAGGATGCACCAACACAAGCGCGTGAACTTTACCGCTATGCTTGCGAAATGAGCAATCAAATGTTGCGGACTTCCTCCTTTGCTGGTACATACGTTTTGGCGTCTTCTCGCGTGGTTGGCCTCCTGCAATCTACCGGATGGATGGAAGAAACCGACAATGCTCTAAGCGAAGGTCGTCTACGTTGCGGTCTGGAAGTGTACGCAGACACGACAACACCTTTCGATTATATGCTCGTTGGTTGTAAGCACATGATCGGTGATATGGAGAGTGTAGGTTCTCTGTTCTACTCCCCATATACAGAAGCCGACGGCGCTGGCGCGTATAAGAGTGTAATTGACCCTAATAGCTTCCAGCATCATGTAGCTATTATGAATCGTTATTCACTCTCTGTCAACCCATATACATCAAAAGTTGATCAGGAAGAACACCAGGTCATCAAGGGTGACGATTGGGGTAAAATGGCTGGACGTTCAGAAATGTCCTACATTTTAGGAATCGAACTGCCACCGCTTGAGATTGACAACGCTTAA,即该噬菌体的特异性序列。本发明所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4可裂解3株致病性大肠杆菌。
在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5的形态为:由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,头部直径约为95nm,尾鞘尾管长度约为100nm。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5的生物学特性为:噬菌体的最佳感染复数为0.01,噬菌体在pH为7条件下存活率超过90%,噬菌体ZJRP5在pH为5条件下存活率为89%,pH为3或9条件下,噬菌体全部死亡,热稳定性测定在37℃和42℃条件下存活率接近100%。噬菌体一步生长曲线结果显示,噬菌体的潜伏期为16~19min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为166个子代噬菌。本发明所述噬菌体ZJRP2的基因组长度为166580bp,GC含量40.25%的,其全序列进行BLAST比较结果该噬菌体与大肠杆菌噬菌体ECD7有97%的同一性;噬菌体ZJRP5head vertexprotein基因(参考NCBI Reference Sequence:NC_041936.1)的序列如SEQ ID No.5所示:ATGACTCATATTTTTACTGAACTGTTGCGGGAATCTACTTCCTCAGTAGCTAACCAGACAGCGCGACCGCAACTATTATCATTAACTCGCGCGGTAAACAACCTGATTTTCTCTGATCTGGTAGCAATCCAGCCAACGGATCAACCAGTATCTGCATTGTACGGCCTACGTTATCTTAATCGTGATGGTCAGATGACTTTCCGAACTGCTACAACCTACGGTGGCGCGGCTGGTGATCGCACAGAGATTGAAGAGTTTTCAAAAGAAAAATCTTATGACGAAGGCGCACTGTTCAAATCAGACGATGTTGTATACGAAGTTGTGACCGCTGGTACAGTCGGTGAAGATGCCGAAACTCCAGAAGCTGCAATCTTTAAAGGCGTAATGACAAACAAAATTCGTTTCTATAGCGATTGTGCATCGGTAGAATACTTTGAAGATAAAAACACCGAAATTTCGTCTACCTCTATGCAGTTTGATAAATGGCAGGTTAATGTAGGTTCTCGTAAACTGAAAACCTCATTCACGACCGAATTGATGCAGGATCTTGAGGCAAGCCAAATCAACTCTGAAAACTCTGTAATTGATCTTCTGGCTACTGTTGCTTCCGAAGAGATCAACAAAGATATTATTCAGAAGTTGATCACTGTATCATCTCGCTATAAAATTAAAGGGATCACCCCTGATGGCGTACTTTCTCTCGTTAGCGTTAAGGATGCACCAACACAAGCGCGTGAACTTTACCGCTATGCTTGCGAAATGAGCAATCAAATGTTGCGGACTTCCTCCTTTGCTGGTACATACGTTTTGGCGTCTTCTCGCGTGGTTGGCCTCCTGCAATCTACCGGTTGGATGGAAGAAACCGACAATGCTCTAAGTGAAGGTCGTCTGCGTTGCGGTCTGGAAGTGTACGCAGACACAACGACACCTTTCGATTATATGCTCGTTGGTTGTAAGCACATGATCGGTGATATGGAGAGTGTAGGTTCTCTGTTCTACTCCCCATATACAGAAGCCGACGGCGCTGGCGCGTATAAGAGCGTAATTGACCCTAATAGCTTCCAGCATCATGTAGCTATTATGAATCGTTATTCACTCTCTGTCAACCCATACACATCAAAAGTTGATCAGGAAGAACACCAGGTCATCAAGGGTGACGATTGGGGTAAAATGGCTGGACGCTCTGAAATGTCCTACATTTTAGGAATCGAACTGCCACCGCTTGAGATTGACAACGCTTAA,即该噬菌体的特异性序列。本发明所述大肠杆菌噬菌体ZJRP2可裂解8株致病性大肠杆菌。
本发明所述大肠杆菌噬菌体均可裂解多株致病性大肠杆菌,拥有较宽的宿主范围,能够防治大肠杆菌感染。本发明所属噬菌体为宽谱噬菌体,特别是在防治兔大肠杆菌感染临床检测中可实现杀菌的效果,在兔大肠杆菌感染防控领域有相关产品具有应用及产品研发前景。而且本发明将大肠杆菌噬菌体ZJRP1~ZJRP5混合使用其杀菌效果相较于单独菌株的杀菌效果更优,而且能够显著降低动物模型中内毒素的含量,减少致病性大肠杆菌对小肠绒毛的破坏,达到有效防治致病性大肠杆菌。因此,本发明所述大肠杆菌噬菌体或含有所述大肠杆菌噬菌体的杀菌剂或含有所述大肠杆菌噬菌体的药物能够用于防治大肠杆菌。
本发明提供了上述的大肠杆菌噬菌体在制备杀菌药物或制备防治或预防大肠杆菌引起的传染病药物中的应用。在本发明中,所述传染病优选包括大肠杆菌病。本发明所述噬菌体具有较宽的宿主范围,能够对多种大肠杆菌起到杀菌的作用。
本发明提供了一种杀菌剂,所述杀菌剂的有效成分包括上述技术方案所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5中的一种或几种,优选包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5。在本发明中,所述杀菌剂中有效活性成分优选为大肠杆菌噬菌体增殖液。
在本发明中,当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1时,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1增殖液中的大肠杆菌噬菌体ZJRP1的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为4×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为6×104PFU/mL~9×109PFU/mL;当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP2时,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP2增殖液的大肠杆菌噬菌体ZJRP2的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为5×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为7×104PFU/mL~8×109PFU/mL;当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP3时,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3增殖液中的大肠杆菌噬菌体ZJRP3的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为8×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为9×104PFU/mL~7×109PFU/mL;当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP4时,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4增殖液中的大肠杆菌噬菌体ZJRP4的浓度优选为1×106PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为4×106~1×1010PFU/mL,更优选为6×106~9×109PFU/mL;当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP5时,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5增殖液中的大肠杆菌噬菌体ZJRP5的浓度优选为1×105PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为3×105PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为5×105PFU/mL~8×108PFU/mL。当所述杀菌剂包括大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5时,所述杀菌剂中5种噬菌体混合物终浓度优选为2×109PFU/mL;所述杀菌剂中大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5的终浓度分别优选为4×108PFU/mL;所述杀菌剂优选由大肠杆菌噬菌体ZJRP1增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP2增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP3增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP4增殖液和大肠杆菌噬菌体ZJRP5增殖液混合而成;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP2增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP3增殖液、大肠杆菌噬菌体ZJRP4增殖液和大肠杆菌噬菌体ZJRP5增殖液的体积比优选为1:1:1:1:1,即五种大肠杆菌噬菌体的等体积添加。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP1的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为4×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为6×104PFU/mL~9×109PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP2增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP2的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为5×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为7×104PFU/mL~8×109PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP3增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP3的浓度优选为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为8×104PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为9×104PFU/mL~7×109PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP4的浓度优选为1×106PFU/m~2×1010PFU/mL,进一步优选为4×106~1×1010PFU/mL,更优选为6×106~9×109PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP5的浓度优选为1×105PFU/mL~2×1010PFU/mL,进一步优选为3×105PFU/mL~1×1010PFU/mL,更优选为5×105PFU/mL~8×108PFU/mL。在本发明中,所述杀菌剂的靶标病菌包括大肠杆菌。本发明通过动物模型实验验证本发明所述杀菌剂能够有效防治兔大肠杆菌。
本发明提供了一种杀菌药物,所述药物的有效成分包括上述大肠杆菌噬菌体。在本发明中,所述杀菌剂中有效活性成分优选为大肠杆菌噬菌体增殖液。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP1~ZJRP5的浓度已经在前述进行详细的描述,在此不做赘述。在本发明中,所述杀菌药物的靶标病菌优选包括大肠杆菌。
本发明提供了一种消毒剂或清洁剂,有效成分包上述的大肠杆菌噬菌体ZJRP5。在本发明中,所述杀菌剂中有效活性成分优选为大肠杆菌噬菌体ZJRP5增殖液。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP1~ZJRP5的浓度已经在前述进行详细的描述,在此不做赘述。在本发明中,所述消毒剂或清洁剂的靶标病菌优选包括大肠杆菌。本发明提供的消毒剂或清洁剂以上述大肠杆菌噬菌体为活性组分,能够对大肠杆菌起到较好的杀灭效果。
本发明提供了一种饲料添加剂组合物,有效成分包括上述的大肠杆菌噬菌体。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体中的活性成分优选为大肠杆菌噬菌体增殖液。在本发明中,所述大肠杆菌噬菌体增殖液中大肠杆菌噬菌体ZJRP1~ZJRP5的浓度已经在前述进行详细的描述,在此不作赘述。在本发明中,所述饲料添加剂组合物的靶标病菌优选包括大肠杆菌。本发明以上述大肠杆菌噬菌体为活性成分作为饲料添加剂,能够通过饲喂的方式有效防治动物的大肠杆菌导致的传染病。
为了进一步说明本发明,下面结合附图和实施例对本发明提供的大肠杆菌噬菌体ZJRP5及其应用和杀菌剂、药物进行详细地描述,但不能将它们理解为对本发明保护范围的限定。
实施例1噬菌体分离纯化与形态观察
宿主菌:宿主菌为兔致病性大肠杆菌:大肠埃希氏菌ZJRE1(CCTCC No.M2021778),分离自腹泻病兔,为肠致病性大肠杆菌,后续实施例采用的宿主菌均为兔致病性大肠杆菌ZJRE1(CCTCC No.M 2021778)。
试验样品前处理:将采集的兔粪便样本置于15mL离心管,加入0.9%生理盐水10mL和采集的污水样本5mL,4℃冰箱过夜,6000r·min-1离心10min,取上清,0.22μm过滤除菌,得到50个过滤粪便和污水样品,4℃冰箱保存备用。
宿主菌培养物制备:宿主菌TSA平板(购于OXOID公司)常规划线培养,挑取单个接种于2mL TSB菌落培养基(购于OXOID公司)中,37℃恒温摇床培养12h,得到培养宿主菌培养物。
噬菌体扩增及初筛:取20μL宿主菌培养物接种于2mL TSB(购于OXOID公司)培养基中,37℃恒温摇床培养,每隔30min测量菌液OD值(美国Spectramax多功能酶标仪),直至菌液浓度OD600值为0.2;
向摇菌管中分别加入过滤粪便和污水样品1.5mL,37℃摇床内过夜,培养液置于2mL离心管中,4000r·min-1离心10min,取上清,通过0.22μm滤器过滤,得样品滤液,4℃冰箱备用;取宿主菌100μL涂布于TSA平板上,在TSA平板背面画出大的正方形,再均等分成9个正方形格子并进行标号,将50个样品滤液根据平板标号进行点滴,每份样品10μL,37℃恒温培养箱过夜培养。
双层平板法分离噬菌体及纯化:配置分离所需半固体培养基:取3g TSB和4g TSA,加入200mL去离子水,高压灭菌,55℃温箱保存备用;将平板出现空斑的样本按照标号找出对应噬菌体滤液等比例进行梯度稀释,稀释至10-2、10-3。取稀释至10-2、10-3的噬菌体稀释液各100μL与宿主菌混合(菌液浓度OD600值为0.2),37℃恒温培养箱孵育20min,得孵育液;将半固体培养基5mL分别加入孵育液中,轻轻混匀;混合均匀的半固体培养基倒入TSA平板中,37℃培养过夜,观察噬菌斑;
挑取透光度良好,个体较大的单噬菌斑于1mL SM溶液(购于百奥莱德生物公司)中获得噬菌体液,各取100μL噬菌体液和100μL宿主菌液(宿主菌液的制备方法同“噬菌体扩增及初筛”)混合均匀,继续用双层平板法培养噬菌体,如此重复三次。直至形成的噬菌斑形状和大小基本一致,得纯化后的噬菌体Ⅰ、噬菌体Ⅱ、噬菌体Ⅲ、噬菌体Ⅳ和噬菌体Ⅴ。
纯化后的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液制备:(1)取20μL实施例1制备得到的宿主菌培养物接种于2mL TSB(购于OXOID公司)培养基中,37℃恒温摇床培养,每隔30min测量菌液OD值(美国Spectramax多功能酶标仪),直至菌液浓度OD600值为0.2(即宿主菌的对数生长期);(2)分别挑取纯化后的噬菌体Ⅰ~Ⅴ液的单个噬菌斑,接种于3mL处于宿主菌中,37℃160r/min振荡培养肉眼可见液体澄清,之后10000rpm离心10min,再用0.22μm的滤器过滤,即可得到纯化后的噬菌体Ⅰ~Ⅴ液增殖液。将增殖后的噬菌体用于后续研究,或加入50%的甘油或10%DMSO混合均匀后于-80℃保藏。
电镜观察形态结构:取纯化后的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液20μL滴在铜网上,静置10min后,用滤纸在铜网侧面将剩余的液体吸取,再在铜网上滴2%磷钨酸10μL,同样吸取剩余液体,静置干燥后放于飞利浦CM100型透射电镜100kv条件下观察噬菌体形态。结果显示如图1所示:噬菌体Ⅰ~Ⅴ结构均为由六角形的头部、可收缩的尾鞘和尾管组成,其中噬菌体Ⅰ头部直径约为65nm,尾鞘尾管长度约为95nm;噬菌体Ⅱ头部直径约为70nm,尾鞘尾管长度约为95nm;噬菌体Ⅲ头部直径约为70nm,尾鞘尾管长度约为95nm;噬菌体Ⅳ头部直径约为95nm,尾鞘尾管长度约为100nm;噬菌体Ⅴ头部直径约为95nm,尾鞘尾管长度约为100nm。
实施例2噬菌体Ⅰ~ⅤpH稳定性测定
双层平板法测定噬菌体Ⅰ~Ⅴ效价:制备得到的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液(参照实施例1)分别用无菌生理盐水10倍梯度稀释,得稀释增殖液。做双层板,下层为10mL LB固体培养基,上层为100μL稀释增殖液、500μL宿主菌液的培养物(培养物为稀释增殖液和宿主菌液混合后37℃水浴5min所得)和5mL LB半固体培养基,待凝固后,倒置37℃恒温培养箱中培养18h观察是否有噬菌斑。每个浓度重复3次,噬菌斑计数,计算噬菌体效价。计算公式如下:噬菌体效价(pfu/mL)=平均噬菌斑数目×稀释倍数×10。
不同pH条件下噬菌体Ⅰ~Ⅴ的稳定性测定:将500μL噬菌体增殖液(TSB调整浓度至1×109PFU/mL)用1mmol/L的NaOH和HC1调节TSB pH为3、5、7、9,分别于37℃温箱孵育1h后,用双层平板法测定噬菌体效价,双层平板的测定结果如表1和图2所示。
表1 不同pH条件下噬菌体Ⅰ~Ⅴ的效价和存活率
Figure BDA0003452387140000101
由表1和图2记载的可知,双层平板法测定噬菌体效价和存活率(不同PH值处理前噬菌体效价/不同PH值处理后噬菌体效价*100%)计算结果如表1和图2所示。噬菌体Ⅰ在pH为3和5的条件下效价仍接近109PFU/mL、存活率超过90%,pH为7条件下噬菌体效价略下降,但仍保持108PFU/mL左右、存活率为26%,pH为9条件下噬菌体全部死亡;噬菌体Ⅱ和噬菌体Ⅲ在pH为7条件下效价仍接近109PFU/mL,存活率超过88%,pH为3、5和9的条件下,噬菌体全部死亡;噬菌体Ⅳ和噬菌体Ⅴ在pH为5、7条件下效价仍接近109PFU/mL,噬菌体Ⅳ和噬菌体Ⅴ在pH为7条件下存活率超过94%,噬菌体Ⅳ在pH为5条件下存活率为79%,噬菌体Ⅴ在pH为5条件下存活率为94%,pH为3和9条件下,噬菌体全部死亡。
实施例3噬菌体Ⅰ~Ⅴ热稳定性测定
分别取500μL实施例2制备得到的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液(TSB调整浓度至1×109PFU/mL)于试管中,分别放置于37℃、42℃、50℃、60℃恒温水浴锅中,静置1h后取出,冰浴冷却10min。分别取100μL冷却所得噬菌体液用双层平板法测定噬菌体效价,结果见表2与图3。
表2 不同微温度条件下噬菌体Ⅰ~Ⅴ的效价和存活率
Figure BDA0003452387140000102
Figure BDA0003452387140000111
由表2与图3记载的可知,双层平板法测定噬菌体效价和成活率结果如表2和图3所示,噬菌体Ⅰ~噬菌体Ⅴ在37℃和42℃条件下的存活率均都接近100%;在50℃条件下噬菌体存活率为55%~70%之间,且随着温度升高,噬菌体存活率也随之降低;在55℃条件下,5种噬菌体的存活率为40%~55%之间;在60℃条件下,5种噬菌体的存活率急剧下降基本不到1%。噬菌体Ⅰ~噬菌体Ⅴ在37℃和42℃条件下的效价均在109PFU/mL左右;随温度升高噬菌体效价也随之下降,但在50℃条件下仍接近109PFU/mL左右;在60℃条件下,噬菌体Ⅰ~噬菌体Ⅳ的效价急剧下降到106PFU/mL至107PFU/mL左右。
实施例4噬菌体Ⅰ~Ⅴ一步生长曲线测定
按照实施例1方法,获得宿主菌培养物,取50μL宿主菌接种于5mL TSB培养基中,按实施例1培养菌液浓度至OD600≈0.2(TSB调整浓度至1×107CFU/mL),取900μL菌液分别与100μL浓度为1×107PFU/mL的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液(制备方法参照实施例1,TSB调整浓度至1×108PFU/mL)分别混合置于37℃恒温培养箱孵育10min。噬菌体充分吸附宿主菌后,6000r·min-1离心5min,弃上清液,加入10mL的TSB重悬。然后将该混合培养物TSB稀释100倍后置于37℃、200rpm摇床中培养,每隔5min,用双层平板法测定噬菌体效价,噬菌体的裂解量则以曲线中的噬菌体计数与潜伏期噬菌体计数的比值表示(Zhang C.,Li W.,Liu W.,Zou L.,Yan C.,Lu K.,Ren H.2013.T4-like phage Bp7,a potential antimicrobialagent for controllingdrug-resistant Escherichia coli in chickens.Appl.Environ.Microbiol.,79:5559-5565.https://doi.org/10.1128/)。结果如表3和图4所示。
表3 菌体Ⅰ一步生长曲线测定数据
Figure BDA0003452387140000121
噬菌体一步生长曲线结果如表3和图4所示,噬菌体Ⅰ的潜伏期为16~19min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为162个子代噬菌体;噬菌体Ⅱ的潜伏期为16-19min,一个细胞的噬菌体最高的裂解量为155个子代噬菌体;噬菌体Ⅲ的潜伏期为11~14min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为114个子代噬菌体;噬菌体Ⅳ的数量随着时间没有明显扩增;噬菌体Ⅴ的潜伏期为16~19min,一个细胞的噬菌体最高裂解量为166个子代噬菌体。
实施例5噬菌体Ⅰ~Ⅴ最佳感染复数(MOI)测定
感染复数MOI:感染情况下,噬菌体与宿主菌细胞的数量比值,即每个细胞感染噬菌体的数目。
具体步骤为:(1)制备噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液(方法同实施例2);(2)分别将噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液滴度用TSB调整到约为1.0×109PFU/mL的5种噬菌体裂解液,然后用TSB进行连续10倍比稀释,分别得到浓度为1.0×109、1.0×108、1.0×107、1.0×106、1.0×105、1.0×104PFU/mL的噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖稀释液。(3)按照实施例1方法,获得宿主菌培养物,取50μL宿主菌培养物接种于5mL TSB培养基中,37℃震荡培养12h,调整浓度至1×108CFU/mL,得宿主菌液。(4)噬菌体Ⅰ~Ⅴ增殖液稀释液分别与浓度约为1.0×108CFU/mL的宿主菌混合后,37℃摇床震荡培养8h,将培养所得培养物6000r·min-1离心5min,收集上清并稀释,采用双层平板法进行测定噬菌体Ⅰ~Ⅴ效价的测定,结果如表4所示。
表4 噬菌体Ⅰ~Ⅴ效价的测定数值
Figure BDA0003452387140000131
由表4记载的可知,噬菌体Ⅰ~Ⅲ浓度为1×105PFU/mL、宿主菌浓度为1×108CFU/mL时,即噬菌体Ⅰ~Ⅲ与宿主菌感染比为0.01时,效价和扩增比值最高,噬菌体Ⅳ浓度为1×107PFU/mL、宿主菌浓度为1×108CFU/mL时,即噬菌体Ⅳ与宿主菌感染比为0.1时,效价和扩增比值最高,噬菌体Ⅴ浓度为1×106PFU/mL、宿主菌浓度为1×108CFU/mL时,即噬菌体Ⅰ与宿主菌感染比为0.01时,噬菌体Ⅴ效价和扩增比值最高。
实施例6噬菌体Ⅰ~Ⅴ全基因组高通量测序
本实施例由苏州金唯智生物科技有限公司进行高通量测序。扩增得到的噬菌体Ⅰ~Ⅴ的基因组特征如表5所示,噬菌体Ⅰ的基因组长度为68201bp,GC含量46.16%,T4-like噬菌体的衣壳蛋白,不仅充当噬菌体遗传信息的保护包裹作用,同时在噬菌体组装等方面起着重要作用,作为典型的保守基因,常常用于遗传学和生物多样性分析,噬菌体Ⅰ~Ⅴ的特异性序列如SEQ ID No.1~5所示;对该噬菌体的全序列制作系统进化树,结果如图5所示,为Wifcevirus属,BLAST比较结果与大肠杆菌噬菌体EC ML-117有96%的同一性(查询覆盖率=93%;E值=0.0),代表菌属为大肠杆菌噬菌体WFC,因此命名为大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP1;噬菌体Ⅱ的基因组长度为137511bp,GC含量43.61%,对该噬菌体的全序列制作系统进化树,结果如图6所示,为Vequintavirinae亚科,Vequintavirus属,BLAST比较结果噬菌体Ⅱ与大肠杆菌噬菌体naam有93%的同一性(查询覆盖率=94%;E值=0.0),因此命名为大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP2;噬菌体Ⅲ的基因组长度为136351bp,GC含量43.70%,对该噬菌体的全序列制作系统进化树,结果如图7所示,为Vequintavirinae亚科,Vequintavirus属,BLAST比较结果与大肠杆菌噬菌体V5有95%的同一性(查询覆盖率=97%;E值=0.0),代表菌属为大肠杆菌噬菌体V5,因此命名为大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP3;菌体Ⅳ的基因组长度为167091bp,GC含量40.40%,对该噬菌体的全序列制作系统进化树,结果如图8所示,为Tevenvirinae亚科,Krischvirus属,BLAST比较结果与大肠杆菌噬菌体karroe有98%的同一性(查询覆盖率=95%;E值=0.0),因此命名为大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP5;菌体Ⅴ的基因组长度为166580bp,GC含量40.25%,对该噬菌体的全序列制作系统进化树,结果如图9所示,为Tevenvirinae亚科,Krischvirus属,BLAST比较结果与大肠杆菌噬菌体ECD7有97%的同一性(查询覆盖率=91%;E值=0.0),代表菌属为大肠杆菌噬菌体T4,因此命名为大肠杆菌噬菌体(Escherichia coli phage)ZJRP5。
表5 噬菌体Ⅰ~Ⅴ基因组特征
核酸 基因组长度(bp) GC含量(%) BLAST比较相似
噬菌体Ⅰ dsDNA 68201 46.16 大肠杆菌噬菌体ECML-117
噬菌体Ⅱ dsDNA 137511 43.61 大肠杆菌噬菌体VB-EcoM
噬菌体Ⅲ dsDNA 136351 43.70 大肠杆菌噬菌体V5
噬菌体Ⅳ dsDNA 167091 40.40 大肠杆菌噬菌体karroe
噬菌体Ⅴ dsDNA 166580 40.25 大肠杆菌噬菌体ECD7
实施例7体外条件下噬菌体ZJRP1~ZJRP5及其组合对宿主菌的作用效果
(1)按照实施例1方法,获得宿主菌培养物,取50μL宿主菌接种于5mL TSB培养基中,37℃震荡培养,所得培养液的浓度D600≈0.2,得培养液;
(2)按实施例2进行噬菌体ZJRP1~ZJRP5增殖液制备,得到噬菌体ZJRP1增殖液、噬菌体ZJRP2增殖液、噬菌体ZJRP3增殖液、噬菌体ZJRP4增殖液、噬菌体ZJRP5增殖液;采用SMH缓冲液按实施例5得到的最佳MIO值进行浓度调整,噬菌体ZJRP1、噬菌体ZJRP2、噬菌体ZJRP3增殖液调整浓度1×104PFU/mL,噬菌体ZJRP4增殖液调整浓度1×106PFU/mL,噬菌体ZJRP5增殖液调整浓度1×105PFU/mL,进行组合,分为ZJRP2+ZJRP3组、ZJRP2+ZJRP4组、ZJRP3+ZJRP4组、ZJRP3+ZJRP5组、ZJRP1+ZJRP3+ZJRP5组ZJRP1+ZJRP2+ZJRP4组、ZJRP1+ZJRP2+ZJRP3+ZJRP4+ZJRP5组、ZJRP1组、ZJRP2组、ZJRP3组、ZJRP4组、ZJRP5组,依次记为1~12组,每个组中各噬菌体增殖液组分等比体积配比;
(3)取100μL宿主菌培养物与分别与100μL 1~12组的增殖液混合,同时设置宿主菌对照组(13组),即只含有100μL培养液,置于37℃恒温培养箱孵育10min。1~12组的增殖液中噬菌体充分吸附宿主菌后,6000r·min-1离心5min,弃上清液,将所得白色沉淀用10mLTSB培养液重悬,37℃摇床震荡培养,分别在0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、22、24h后,取样测定OD600值对比细菌浓度,结果见表6和图10。
表6 不同时间测定得到的OD600
Figure BDA0003452387140000141
Figure BDA0003452387140000151
Figure BDA0003452387140000161
由表6和图5记载的可知,噬菌体优化的过程中1~12组感染宿主菌1h内菌液OD600升高,此时噬菌体与宿主菌相互吸附;噬菌体1~12组感染宿主菌2~8h内,菌液OD600下降,6h出现不同程度浮动,噬菌体1~12组开始裂解宿主菌;噬菌体感染宿主菌8h后,菌液OD600上升。2组在20h和22h菌液OD600较低,2组在24h后菌液OD600较低。多种噬菌体组合物优化结过程中噬菌体6组7h内菌液OD600下降,7h后上升,其余噬菌体组合均在2~8h菌液OD600下降,8h开始上升,6组和7组在20h时菌液OD600相接近,7组在22和24h时菌液OD600较低,因此,混合噬菌体组中优选7组,即ZJRP1+ZJRP2+ZJRP3+ZJRP4+ZJRP5组。
实施例8噬菌体宿主谱测定
本实施例采用的15株大肠杆菌均购于中国兽医微生物菌种保藏管理中心(http://cvcc.ivdc.org.cn/),详见表7。
首先将待测大肠杆菌的菌液分别接种到TSB培养基(购于OXOID生物公司)中,37℃摇床震荡培养18h,调整浓度至1×108CFU/mL,取100μL均匀涂布在TSA平板上,静置干燥后,在TSA平板背面画出大小均等9个正方形格子并进行标号;
将噬菌体ZJRP1~ZJRP5增殖液(采用实施例2的方式获得)分别根据平板标号进行点滴,噬菌体ZJRP1~ZJRP5增殖液的用量每格为10μL,待干燥后,37℃恒温培养箱培养18h,观察噬菌斑情况,对宿主菌裂解情况标注并统计。采用点滴法对噬菌体宿主谱进行测定,结果见表7。
表7 噬菌体宿主谱测定结果
大肠杆菌菌株E.coli ZJRP1 ZJRP2 ZJRP3 ZJRP4 ZJRP5
大肠杆菌CCTCC2021778 + + + + +
大肠杆菌CVCC2939 - - + - -
大肠杆菌CVCC2917 - + - - -
大肠杆菌CVCC2889 - - - - +
大肠杆菌CVCC2881 - - - - +
大肠杆菌CVCC1454 - + - - -
大肠杆菌CVCC1510 - - - - +
大肠杆菌CVCC200 - - - - +
大肠杆菌CVCC2592 - - - - +
大肠杆菌CVCC1501 - + + + -
大肠杆菌CVCC1343 - + + + -
大肠杆菌CVCC1490 - + - - +
大肠杆菌CVCC227 - - + - -
大肠杆菌CVCC249 - - - - +
大肠杆菌CVCC232 - - + - -
大肠杆菌CVCC1495 + - - - -
注:“+”表示敏感,“-”表示不敏感。
由表7记载的可知,噬菌体ZJRP1可裂解2株大肠杆菌(CCTCC2021778、CVCC1495),噬菌体ZJRP2可裂解6株大肠杆菌(CCTCC2021778、CVCC2917、CVCC1454、CVCC1501、CVCC1343、CVCC1490),噬菌体ZJRP3可裂解6株大肠杆菌(CCTCC2021778、CVCC2939、CVCC1501、CVCC1343、CVCC227、CVCC232),噬菌体ZJRP4可裂解3株大肠杆菌(CCTCC2021778、CVCC1501、CVCC134),噬菌体ZJRP5可裂解8株大肠杆菌(CCTCC2021778、CVCC2889、CVCC2881、CVCC1510、CVCC200、CVCC2592、CVCC1490、CVCC249)。
实施例9噬菌体抗兔大肠杆菌效果
试验方案:35日龄新西兰实验兔(新西兰肉兔)18只,随机分为3组,即A组、B组、C组、D组,每组6只。
A组、B组、C组、D组分别为空白对照组、攻毒对照组、灌胃噬菌体ZJRP5裂解液、灌胃噬菌体ZJRP1~5裂解液组。
试验开始前1天,实验兔断食断水,试验开始前10min每只实验兔口服500μLNaCO3溶液,以减少实验兔体内胃酸。
A组口服灌胃50mLPBS溶液;B、C、D组分别灌胃50mL浓度为4×108CFU/mL攻毒用宿主菌培养物(按照实施例1方法获得宿主菌培养物,取1000μL宿主菌接种于100mL TSB培养基中,37℃震荡培养18h,调整浓度至2×1010CFU/mL,得攻毒用宿主菌培养物);C组口服30mL浓度为2×109PFU/mL的噬菌体ZJRP5增殖按实施例2方法制备),每隔8小时进行灌胃噬菌体ZJRP5增殖液,共3次;D组口服30mL浓度为2×109PFU/mL的噬菌体ZJRP1~5增殖液(按实施例2方法制备每种噬菌体增殖液,按实施例2方法测定效价计数后,PBS调整浓度至2×109PFU/mL,5种噬菌体等体积等量添加,噬菌体混合物终浓度为2×109PFU/mL),D组每8小时进行灌胃噬菌体ZJRP1~5增殖液。饲喂5天,持续观察记录实验兔精神状况和腹泻率。在试验5天内,A组兔食欲正常、运动自如,并无腹泻等临床症状;B组共3只实验兔发生腹泻,1只实验兔死亡;C组共1只实验兔发生腹泻,其余实验兔食欲正常、运动自如,并无腹泻等临床症状;D组兔食欲正常、运动自如,并无腹泻等临床症状。
分别于感染前1天,感染后第3天、第5天对所有实验兔进行体重称量称量结果见表8和表9,同时每只实验兔采集100μL新鲜血液放置于含有1%肝素钠的抗凝试剂管中,其中含有1%肝素钠的抗凝试剂中肝素钠的用量为2μL,在全自动血液分析仪上测定血液白细胞含量和嗜中性粒细胞的含量,检测结果见表10和表11。
表8 不同天数实验兔的重量(ɡ)
Figure BDA0003452387140000181
表9 感染宿主菌后噬菌体ZJRP5治疗兔增重变化(ɡ)
试验天数 A组 B组 C组 D组
0~3d 增重变化 73±3<sup>a</sup> -3.8±3<sup>b</sup> 54±5<sup>a</sup> 65±5<sup>a</sup>
0~5d 增重变化 95±13<sup>a</sup> 14.2±6<sup>b</sup> 118±20<sup>c</sup> 142±18<sup>c</sup>
注:肩标不同字母表示显著差异。
由表8和表9记载的可知,B组在0~3天体重下降且增重为负(P<0.05);C组和D组相对于A组体重增长不显著,但在0~5天,C组和D组相对于A组的增重有显著差异(P<0.05),D组相对于C组增重没有显著差异。由此可见,在感染宿主菌的情况下,本发明所述噬菌体能够提高实验兔的重量。
表10 血液白细胞(WBC)的含量(103/μL)
0d 3d 5d
A组 6.93±3.95 8.61±4.50<sup>a</sup> 11.95±5.12<sup>a</sup>
B组 4.48±2.24 13.83±1.91<sup>b</sup> 19.18±2.77<sup>c</sup>
C组 4.6±2.29 10.26±3.13<sup>b</sup> 13.88±3.27<sup>a</sup>
D组 3.52±1.20 5.72±3.27<sup>a</sup> 10.23±4.99<sup>b</sup>
注:肩标不同字母表示显著差异。
表11 血液嗜中性粒细胞(W-LCC)的含量(103/μL)
0d 3d 5d
A组 1.08±1.50 1.53±1.30<sup>a</sup> 2.4±1.74<sup>a</sup>
B组 0.53±0.20 6.07±6.06<sup>c</sup> 6.6±7.34<sup>c</sup>
C组 0.80±0.69 2.22±0.91<sup>a</sup> 2.76±1.40<sup>a</sup>
D组 0.57±0.18 1.41±0.86<sup>b</sup> 1.88±1.36<sup>b</sup>
注:肩标不同字母表示显著差异。
由表10和表11记载的可知,B组白细胞(WBC)数量和嗜中性粒细胞(W-LCC)的比例显著升高。B组的WBC数量在第3天相对于A组显著上升(P<0.05),与噬菌体C组差异不显著。在第5天,B组的WBC数量继续上升,相对于其他三组都有显著差异,特别是噬菌体D组。B组在第3、5天的W-LCC数量显著高于其他三组,噬菌体D组相对于C组W-LCC数量有显著差异(P<0.05)。
试验的第5天同时对剩余的血液离心分离血清并分装,使用兔内毒素酶联免疫分析试剂盒按照说明书上操作步骤进行测定,测定结果见表12和图11。
表12 血清内毒素的含量(nq/mL)
A组 8.072392 39.38921 7.185544 11.80454 20.89474 6.150888
B组 106.1615 66.51198 101.4501 54.15154 109.598 91.25134
C组 63.35258 41.27376 15.40736 63.35258 68.91386 57.99454
D组 81.79163 19.02866 15.64755 22.31739 49.69882 32.27595
注:肩标不同字母表示显著差异。
血清内毒素含量检测结果由表12和图6记载的可知,B组血清中内毒素含量显著高于其他三组(P<0.05)。而接受噬菌体防治的C组和D组的试验兔与B组相比血清内毒素含量显著降低,且D组血清内毒素下降最多(P<0.05)。可见,本发明所述噬菌体能够降低实验兔的内毒素含量,达到有效防治致病性大肠杆菌。
为观察宿主菌对小肠绒毛的粘附情况,将实验兔攻毒感染后取回肠组织做切片观察,实验兔在宿主菌感染后第5天处死。取回肠用生理盐水清洗,然后放入4%多聚甲醛组织固定液中再做组织石蜡切片,切片的组织样本用苏木精-伊红染色后在显微镜下观察和拍照。结果如图7所示:A组实验兔肠黏膜层绒毛完整且饱满,排列整齐(图12中的A)。B组实验兔肠黏膜层绒毛排列紊乱,绒毛明显萎缩、断裂、脱落,绒毛内出血点明显,提示可能是由于宿主菌定殖在肠道绒毛而引发炎症(图12中的B)。噬菌体C组和D组实验兔肠绒毛结构较为完整,接近正常形态(图12中的C和图12中的D)。可见,本发明所述噬菌体能够减少致病性大肠杆菌对小肠绒毛的破坏,有效防治致病性大肠杆菌感染。
由上述实施例记载的可知,本发明所述大肠杆菌噬菌体拥有较宽的宿主范围,能够防治大肠杆菌感染。试验结果表明,本发明所述大肠杆菌噬菌体可裂解多株致病性大肠杆菌,能有效防治兔大肠杆菌感染。可见该株噬菌拥有较宽的宿主范围,为宽谱噬菌体,特别是在防治兔大肠杆菌感染临床检测中可实现杀菌的效果,在兔大肠杆菌感染防控领域有相关产品具有应用及产品研发前景。
虽然本发明已以较佳的实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可以做各种改动和修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。
序列表
<110> 浙江省农业科学院
<120> 具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体及其应用和杀菌剂、药物
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 826
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
tctgcacttg cagtgtatcg cccatccagg aggaccgatg tcaccctttt tgaacttcaa 60
ctctccgcca acttcccata gacgcttgtc atcaagtttg aatctcattc cgtcgacatg 120
ttcatgagag attcgcggct cctttcctgc tcctgagtgc gcccattcaa attcttcaac 180
tccattctgg cgcatccttt catcgcttag aacgcaatac aatttgcttg tctggtcttt 240
agcgattaag tcgactctct ttgcagagaa gtgttttacg tttcgcagcg ccgcctgaat 300
gcctgacgtg ccttgctggg ctgggtcggg cgaagtcagc gaaagcatga ctgcttcgta 360
cactctgttg tgaatatcct cgccgacctt agtcactaga gtcgtgttaa acgtctcgct 420
tgttctaaga gtgttctcaa cgaatttgtt atatgtggcc tttggcgctt ctatgcctgc 480
ggacttaagg ctggcgaatg tagcagaagt agcacccttt tcaaccgact tgataaaatc 540
agcggcaatc ttcgacccaa cacgagcaaa cgcctttgcc catttcagct gcagacgttt 600
cataagagtt tggaatgttg aatcagcaga gtcttgcgca aagaacttct gcacctgctt 660
cttttcaagc cactctgaaa ttcctgcctg atagtcatca atcatcgcat agcaaagacc 720
tttcatctca cgacggtagg ccatcgcaat agcgtttgat gggattatcg gactgccgcg 780
cccgattcta tcgggtgagc ggcgttcacg ttttttcgaa gcttta 826
<210> 2
<211> 1377
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
atgccatatt tagataaagt ggtagatgtt acagttaacc tcggaaccca gcctattgac 60
actgtaggtt tcgaaactcc gctgttcatc gctatccaca acaactttac tgagcgagct 120
cgcgtatatg cggagctgga tcagatggtg gaagacggtt tcgcacaagg ctctgcagct 180
tatgagtttg cagcaaaagc tttcggcggt gtattccctc cacagtatgt catgatcggc 240
agacaggcaa aagaaaaaac cactgtagat tttaaaggta ttgctgccgc agctgatacc 300
gatgtcgtaa tgactattgc aaaaggtagc tacaatactt ctctgatagt gcctatctct 360
ggtggaacag gtgcaactca gattgcagag tccatgaaga ctaaaatcga agcagatgat 420
aacttggacg atatcactgt agcggctgaa gacggtgtta tcaccatcac tggtgactgt 480
actgttggtt atcatactgg taactataca atcaaaaata tcgccaatgc tgaaaaacct 540
tctacagtag ttgataagat caatgctgag cgtgacaact ggtacttcct gtgccatgaa 600
gaccacaccg acattgaagc atgtgctaag tgggctcagg ccaactacaa gctgcacgtc 660
tactctacgg cagaagatgt gactggcaaa gatagtaaca tcgctaccaa actgaaagct 720
gcacaatatg acagtgtcgg tatgtacgat cctcgtgcag ataaggattt cccggagggt 780
ggtatcatag gtgctatggc atccaacgat ccgtcctatg gtgacagttt gcacttaaaa 840
cagatgccgg gtgtgattgc accatctttg actttaactc agcgtatggc gatttgggaa 900
aaccacgtta acttctacag aatgattaac ggtgttggcg ctttctggga aggtaagtgt 960
gcttcaggtc agtatgcaga cgctattcgt tttgcacact ggatcaagtt cagatctgaa 1020
gaatccatgt tcgggtacat gcatcgccgc tccaacatgg gtttaagcat gaagatgtct 1080
gatgatgatc ttccggttat caagtctgtt ctgatgaaca acccgatcaa tactggcatt 1140
aagaatggtg cgatcctgac aggttttgac gaagacaata atgtattcta cgacccgatc 1200
atcacagttc ctaagcgtgc agaaattcca accaatcagt tggctgctcg tgttctggaa 1260
ggtgtgaaag tagaactggt gtataacaac gctctgcact tcgtccgtat ccggatcaac 1320
gtccttctgg acaaagttgg ttctaaatcc accaatgctg ttgcaatgac tgaataa 1377
<210> 3
<211> 1044
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
ttaagcataa gatatggtga tccattgacc gtttacaaat ttttgaatag ctccagtcca 60
atagtcgccc tgatacgggt gtttataggc gtaattgccg gagcacatta catgcccagg 120
gtatactctt gattctctgt aggtggttct gaaacggttt gctatcctta catcttcaac 180
acccctacta ggcataggaa tagtaaggtt accactactg tctgcgctac taccatttac 240
cctgcggacc acgtttcttc caccaactgt tgcatattga cccctggcgg ttttatcgtt 300
acaatctact cttccatcta tttgagcgct gccgcaggat tgttgtccat taacagtggc 360
tctaggtatc gttaccgcat tagcatttgc agaggagctt tttgcatcat tgcattcaag 420
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aaacacaggc tgcccaccag aaggttgaaa tctccaacgg aaaccgtcta tttggtgaga 540
gggatcatca aggtctgtgc cgtcagcacc accgatgttg tccataatcc agaaatccat 600
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aaactcgatt ctttgaagac ctaaagtttg agtctggatc attgtgtctc cagccttgtc 720
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gacaacatct tctgttaaat gctttagcca cgcagagagc atgtggagtt caaagttaac 900
aacttcacat gctatccttt gtgtcatatc ccaacctttc aatctctctt ctttgttcgg 960
ttgagatttg ttcaactctc ctgtattttc aagcacaaca tcctgattgg cccaaatatc 1020
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<210> 4
<211> 1242
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
atgactcata tttttactga actgttgcgg gaatctactt cctcagtagc taaccagaca 60
gcgcgaccgc aactattatc attaactcgc gcggtaaaca acctgatttt ctctgatctg 120
gtagcaatcc agccaacgga tcaaccagta tctgcattgt acggcctacg ttatcttaat 180
cgtgatggtc agatgacttt ccgaactgct acaacctatg gtggcgcggc tggtgatcgc 240
acagagattg aagagttttc aaaagaaaaa tcttataacg aaggcgcact attcaaatca 300
gacgatgttg tatacgaagt tgtgaccgct ggtacagtcg gtgaagatgc cgaaactcca 360
gaagctgcaa tctttaaagg cataatgaca aacaaaattc gtttctatag cgattgtgca 420
tcggtagaat actttgaaga taaaaacacc gaaatttcgt ctacctctat gcagtttgat 480
aaatggcagg ttaatgtagg ttcccgtaaa ctgaaaacct cgttcaccac tgaattaatg 540
caggatcttg aggcaagcca aatcaactct gaaaactctg taattgatct tctggctact 600
gttgcttccg aagagatcaa caaagatatt attcagaagt tgatcactgt atcatctcgc 660
tataaaatta aagggatcac ccctgatggc gtactttctc tcgttagcgt tcaggatgca 720
ccaacacaag cgcgtgaact ttaccgctat gcttgcgaaa tgagcaatca aatgttgcgg 780
acttcctcct ttgctggtac atacgttttg gcgtcttctc gcgtggttgg cctcctgcaa 840
tctaccggat ggatggaaga aaccgacaat gctctaagcg aaggtcgtct acgttgcggt 900
ctggaagtgt acgcagacac gacaacacct ttcgattata tgctcgttgg ttgtaagcac 960
atgatcggtg atatggagag tgtaggttct ctgttctact ccccatatac agaagccgac 1020
ggcgctggcg cgtataagag tgtaattgac cctaatagct tccagcatca tgtagctatt 1080
atgaatcgtt attcactctc tgtcaaccca tatacatcaa aagttgatca ggaagaacac 1140
caggtcatca agggtgacga ttggggtaaa atggctggac gttcagaaat gtcctacatt 1200
ttaggaatcg aactgccacc gcttgagatt gacaacgctt aa 1242
<210> 5
<211> 1242
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
atgactcata tttttactga actgttgcgg gaatctactt cctcagtagc taaccagaca 60
gcgcgaccgc aactattatc attaactcgc gcggtaaaca acctgatttt ctctgatctg 120
gtagcaatcc agccaacgga tcaaccagta tctgcattgt acggcctacg ttatcttaat 180
cgtgatggtc agatgacttt ccgaactgct acaacctacg gtggcgcggc tggtgatcgc 240
acagagattg aagagttttc aaaagaaaaa tcttatgacg aaggcgcact gttcaaatca 300
gacgatgttg tatacgaagt tgtgaccgct ggtacagtcg gtgaagatgc cgaaactcca 360
gaagctgcaa tctttaaagg cgtaatgaca aacaaaattc gtttctatag cgattgtgca 420
tcggtagaat actttgaaga taaaaacacc gaaatttcgt ctacctctat gcagtttgat 480
aaatggcagg ttaatgtagg ttctcgtaaa ctgaaaacct cattcacgac cgaattgatg 540
caggatcttg aggcaagcca aatcaactct gaaaactctg taattgatct tctggctact 600
gttgcttccg aagagatcaa caaagatatt attcagaagt tgatcactgt atcatctcgc 660
tataaaatta aagggatcac ccctgatggc gtactttctc tcgttagcgt taaggatgca 720
ccaacacaag cgcgtgaact ttaccgctat gcttgcgaaa tgagcaatca aatgttgcgg 780
acttcctcct ttgctggtac atacgttttg gcgtcttctc gcgtggttgg cctcctgcaa 840
tctaccggtt ggatggaaga aaccgacaat gctctaagtg aaggtcgtct gcgttgcggt 900
ctggaagtgt acgcagacac aacgacacct ttcgattata tgctcgttgg ttgtaagcac 960
atgatcggtg atatggagag tgtaggttct ctgttctact ccccatatac agaagccgac 1020
ggcgctggcg cgtataagag cgtaattgac cctaatagct tccagcatca tgtagctatt 1080
atgaatcgtt attcactctc tgtcaaccca tacacatcaa aagttgatca ggaagaacac 1140
caggtcatca agggtgacga ttggggtaaa atggctggac gctctgaaat gtcctacatt 1200
ttaggaatcg aactgccacc gcttgagatt gacaacgctt aa 1242

Claims (10)

1.具有杀菌作用的大肠杆菌噬菌体,其特征在于,所述大肠杆菌噬菌体包括大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichiacoliphage)ZJRP4和大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP5;或者,包括大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP1、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP2、大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP3、大肠杆菌噬菌体(Escherichiacoliphage)ZJRP4或大肠杆菌噬菌体(Escherichia coliphage)ZJRP5;
所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1的保藏编号为CCTCC NO.M 2021779;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP2的保藏编号为CCTCC NO.M 2021780;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP3的保藏编号为CCTCC NO.M 2021781;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP4的保藏编号为CCTCC NO.M 2021782;所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP5的保藏编号为CCTCC NO.M 2021783。
2.权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体在制备杀菌药物或制备防治大肠杆菌引起的传染病药物中的应用。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述传染病包括大肠杆菌病。
4.一种杀菌剂,其特征在于,所述杀菌剂的有效成分包括权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5中的一种或几种。
5.根据权利要求4所述的杀菌剂,其特征在于,所述杀菌剂的有效成分包括权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2、大肠杆菌噬菌体ZJRP3、大肠杆菌噬菌体ZJRP4和大肠杆菌噬菌体ZJRP5。
6.根据权利要求4或5所述的杀菌剂,其特征在于,所述大肠杆菌噬菌体ZJRP1、大肠杆菌噬菌体ZJRP2和大肠杆菌噬菌体ZJRP3的浓度分别为1×104PFU/mL~2×1010PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP4的浓度为1×106PFU/mL~2×1010PFU/mL;所述大肠杆菌噬菌体ZJRP5的浓度为1×105PFU/mL~2×1010PFU/mL。
7.一种杀菌药物,其特征在于,所述药物的有效成分包括权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体。
8.一种消毒剂或清洁剂,其特征在于,有效成分包括权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体。
9.一种饲料添加剂组合物,其特征在于,有效成分包括权利要求1所述的大肠杆菌噬菌体。
10.根据权利要求4~6任一项所述的杀菌剂或权利要求7所述的杀菌药物或根据权利要求8所述的消毒剂、清洁剂或根据权利要求9所述的饲料添加剂组合物,其特征在于,靶标病菌包括大肠杆菌。
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