CN113430295A - 微肽及其用于调节基因表达的用途 - Google Patents

微肽及其用于调节基因表达的用途 Download PDF

Info

Publication number
CN113430295A
CN113430295A CN202110730785.8A CN202110730785A CN113430295A CN 113430295 A CN113430295 A CN 113430295A CN 202110730785 A CN202110730785 A CN 202110730785A CN 113430295 A CN113430295 A CN 113430295A
Authority
CN
China
Prior art keywords
mippe
microrna
seq
accumulation
plant
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202110730785.8A
Other languages
English (en)
Inventor
J-P·库姆比尔
D·劳莱塞尔古斯
G·拜卡德
F·帕莱
S·普拉扎
J·卡瓦伊勒
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Guo Jiakeyanzhongxin
Universite Toulouse III Paul Sabatier
Original Assignee
Guo Jiakeyanzhongxin
Universite Toulouse III Paul Sabatier
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FR1360727A external-priority patent/FR3012471A1/fr
Application filed by Guo Jiakeyanzhongxin, Universite Toulouse III Paul Sabatier filed Critical Guo Jiakeyanzhongxin
Publication of CN113430295A publication Critical patent/CN113430295A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N37/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing organic compounds containing a carbon atom having three bonds to hetero atoms with at the most two bonds to halogen, e.g. carboxylic acids
    • A01N37/44—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing organic compounds containing a carbon atom having three bonds to hetero atoms with at the most two bonds to halogen, e.g. carboxylic acids containing at least one carboxylic group or a thio analogue, or a derivative thereof, and a nitrogen atom attached to the same carbon skeleton by a single or double bond, this nitrogen atom not being a member of a derivative or of a thio analogue of a carboxylic group, e.g. amino-carboxylic acids
    • A01N37/46—N-acyl derivatives
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N57/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing organic phosphorus compounds
    • A01N57/10—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing organic phosphorus compounds having phosphorus-to-oxygen bonds or phosphorus-to-sulfur bonds
    • A01N57/16—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing organic phosphorus compounds having phosphorus-to-oxygen bonds or phosphorus-to-sulfur bonds containing heterocyclic radicals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N65/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing material from algae, lichens, bryophyta, multi-cellular fungi or plants, or extracts thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N65/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing material from algae, lichens, bryophyta, multi-cellular fungi or plants, or extracts thereof
    • A01N65/08—Magnoliopsida [dicotyledons]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N65/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing material from algae, lichens, bryophyta, multi-cellular fungi or plants, or extracts thereof
    • A01N65/08—Magnoliopsida [dicotyledons]
    • A01N65/20—Fabaceae or Leguminosae [Pea or Legume family], e.g. pea, lentil, soybean, clover, acacia, honey locust, derris or millettia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N65/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing material from algae, lichens, bryophyta, multi-cellular fungi or plants, or extracts thereof
    • A01N65/08—Magnoliopsida [dicotyledons]
    • A01N65/28—Myrtaceae [Myrtle family], e.g. teatree or clove
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N65/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing material from algae, lichens, bryophyta, multi-cellular fungi or plants, or extracts thereof
    • A01N65/40—Liliopsida [monocotyledons]
    • A01N65/44—Poaceae or Gramineae [Grass family], e.g. bamboo, lemon grass or citronella grass
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/04—Anorexiants; Antiobesity agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K5/00—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/10—Tetrapeptides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K5/00—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/10—Tetrapeptides
    • C07K5/1002—Tetrapeptides with the first amino acid being neutral
    • C07K5/1005—Tetrapeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic
    • C07K5/1013—Tetrapeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic the side chain containing O or S as heteroatoms, e.g. Cys, Ser
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C12N15/8218—Antisense, co-suppression, viral induced gene silencing [VIGS], post-transcriptional induced gene silencing [PTGS]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
    • Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Agronomy & Crop Science (AREA)
  • Dentistry (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Pest Control & Pesticides (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)

Abstract

用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，以及其用于调节基因表达的用途。

Description

微肽及其用于调节基因表达的用途
本申请是2014年10月31日提交的同名发明专利申请201480070078.9的分案申请。
本发明涉及微肽(由微小RNA所编码的肽，或“miPEP”)，以及其用于调节基因表达的用途。
微小RNA(miR)是在成熟后具有大约21个核苷酸的非编码小RNA，其在转录后水平上通过降解靶mRNA或通过抑制其翻译来控制靶基因的表达。miR存在于植物和动物中。
靶基因常常是发育过程的关键基因。它们编码例如转录因子或者蛋白酶体的蛋白质。
miR的表达的调控是知之甚少的，但是尤其知道其，像大多数编码基因一样，牵涉RNA聚合物II：该酶产生初级转录物(称为“pri-miR”)，其然后通过包含尤其是Dicer类型的酶的蛋白复合体而成熟。该成熟首先导致形成miR前体(称为“pre-miR”)，其具有以包含miR和其互补序列miR*的茎-环形式的二级结构。然后，所述前体成熟，这导致形成包含miR和miR*的更短的双链RNA。然后，miR由RISC复合体来负责，所述RISC复合体切割靶基因的mRNA或者抑制其翻译。
此外，已显示，在微小RNA的初级转录物中内含子的存在增加成熟的微小RNA的表达(Schwab等人，EMBO Rep.，14(7)：615-21，2013)。然而，由于实验的困难，微小RNA的初级转录物或pri-miR很少被研究。
大约50％的真核基因在其5’UTR区域(5’非翻译区)内在编码序列的上游具有小的开放阅读框。这些小的开放阅读框(或者“上游ORF”，“uORF”)可以发挥翻译调节子的作用，这主要通过调节在mRNA上核糖体的结合和速率以顺式(cis)方式来进行，但是也按照依然未知的机制借助于由所述uORF所编码的肽以反式(trans)方式来进行(Combier等人，GeneDev，22：1549-1559，2008)。从定义本身来说，uORF存在于编码基因的上游。
最近，还发现了在长的基因间非编码RNA(lincRNA)中的小ORF，其推定的功能(如果它存在)还不知晓(Ingolia等人，Cell，147(4)：789-802，2011；Guttman&Rinn，Nature，482(7385)：339-46，2012)。
然而，关于在非编码微小RNA内编码肽的ORF的存在，还没有报道任何实例。迄今为止，微小RNA，和扩展说来，其初级转录物，总是由于其特殊的作用方式而被认为是不产生任何肽的非编码性调控RNA。
本发明的一个方面为提供能够调节微小RNA的表达的肽。
本发明的另一个方面为提供使得能够调节微小RNA的一个或多个靶基因的表达的工具。
本发明具有这样的优点：允许借助于除了微小RNA以外的工具，更容易和更有效地通过微小RNA来控制靶基因的表达。
因此，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸或12个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
因此，在第一个步骤中，所述用于检测和鉴定微肽的方法在于检测在微小RNA的初级转录物上潜在地编码肽的开放阅读框的存在。
至于第二个步骤，它使得能够表征所述肽，即测定所述肽是否相应于真正在所述细胞中产生的肽，这通过研究所述肽对于所述微小RNA的积累的影响来进行。
为了证明所述肽对于微小RNA的积累的影响，将大量的肽引入到表达所述微小RNA的第一细胞中。然后，测量所述微小RNA在该第一细胞中的积累，并与所述微小RNA在与第一细胞相同但不包含所述肽的第二细胞中的积累进行比较。
因此，观察到在所述肽存在和不存在下的细胞之间微小RNA的数量的变化表明：(i)存在有在所述微小RNA的初级转录物上编码的肽，(ii)该肽的序列由在所述微小RNA的初级转录物上鉴定出的开放阅读框所编码，和(iii)所述肽作用于所述微小RNA的积累。
因此，本发明基于由发明人作出的出人意料的双重观察结果，即一方面，存在有在微小RNA的初级转录物上存在的能够编码微肽的开放阅读框，和另一方面，所述微肽能够调节所述微小RNA的积累。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸或12个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
在本发明中，术语“微小RNA”、“非编码微小RNA”和“miR”是等价的并且可以互换使用。它们定义了具有大约21个核苷酸的小RNA分子，其不被翻译并且不导致肽或蛋白质。
然而，以该成熟形式，微小RNA确保了通过转录后机制，例如借助于RISC复合体来调控某些基因这样的功能。
微小RNA的初级转录物或“pri-miR”则相应于从DNA分子的转录开始直接获得的RNA分子。通常，该初级转录物经历一个或多个转录后修饰，所述转录后修饰通过剪切现象而引起例如特殊的RNA结构或RNA的某些部分的切割，并且导致微小RNA的前体形式或“pre-miR”，然后导致微小RNA的成熟形式或“miR”。
术语“微肽“和“miPEP”(microRNA encoded PEPtide)是等价的并且可以互换使用。它们定义了由存在于微小RNA的初级转录物上的开放阅读框所编码并且能够调节所述微小RNA的积累的肽。在本发明的范围内，微肽不应当被理解为必需是小尺寸的肽，因为“微”并不对应于肽的尺寸。
根据本发明，miPEP还可以被视为类似于转录调节物，尤其是转录激活物。这样的转录调节物可以在转录水平上起作用，从而调节pri-miR、pre-miR和miR的积累。
考虑到遗传密码的简并性，同一种微肽可以由数种核苷酸序列来编码。此类相互相差至少一个核苷酸但编码同一种肽的核苷酸序列被称为“简并序列”。
术语“开放阅读框”或“ORF”(open reading frame)是等价的并且可以互换使用。它们相应于可以潜在地编码肽或蛋白质的在DNA或RNA分子中的核苷酸序列：所述开放阅读框以起始密码子开始(起始密码子通常编码甲硫氨酸)，随后为一系列的密码子(每个密码子编码一个氨基酸)，和以终止密码子结束(终止密码子不被翻译)。
在本发明中，ORF可以被特别地命名为“miORF”，当其存在于微小RNA的初级转录物上时。
特别地，在本发明中所定义的miORF可以具有12至303个核苷酸的大小，并且编码具有3至100个氨基酸的肽。
特别地，在本发明中所定义的miORF可以具有15至303个核苷酸的大小。由于一个氨基酸由一个具有3个核苷酸的密码子来编码，因而具有15至303个核苷酸的miORF编码具有4至100个氨基酸的miPEP。
特别地，所述miORF具有15、18、21、24、27、30、33、36、39、42、45、47、51、54、57、60、63、66、69、72、75、78、81、84、87、90、93、96、99、102、105、108、111、114、117、120、123、126、129、132、135、138、141、144、147、150、153、156、159、162、165、168、171、174、177、180、183、186、189、192、195、19B、201、204、207、210、213、216、219、222、225、22B、231、234、237、240、243、246、249、252、255、258、261、264、267、270、273、276、279、282、285、2BB、291、294、297、300或303个核苷酸的大小，并且分别编码具有4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100个氨基酸的大小的miPEP。
在本发明中，“积累”是指在细胞中分子例如微小RNA或微肽的产生。
因此，在细胞中分子的积累的“调节”相应于存在于该细胞中的该分子的数量的改变。
此外，miPEP的效应可以通过miR的积累的调节，但也可以通过相应的pri-miR或pre-miR的积累的调节来进行观察。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加，特别是增加。
“积累的减少”相应于在细胞中所述分子的数量的降低。
相反地，“积累的增加”相应于在细胞中所述分子的数量的升高。
在一个有利的实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的增加。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述肽在所述细胞中的存在是由于：
-将编码所述肽的核酸引入到所述细胞中，或
-将所述肽引入到所述细胞中。
为了表征miPEP，需要拥有表达微小RNA且其中存在有待测试的所述肽的细胞模型。为此，可能的是，将肽引入到细胞中，要么通过使所述细胞与所述肽相接触，要么通过将编码所述肽的核酸引入到所述细胞中，那么所述核酸将会在所述细胞内被翻译成肽。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中步骤a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中。
微小RNA的初级转录物的5’或3’部分相应于在微小RNA的成熟过程中被切割的RNA分子的末端部分。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中。
在本发明中，野生型植物细胞相应于未由人进行遗传修饰的植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型动物细胞中，尤其是存在于野生型人细胞或野生型果蝇细胞中。
在本发明中，野生型动物细胞相应于未由人进行遗传修饰的动物细胞，尤其是人细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述指定真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞为十字花科植物例如拟南芥(Arabidopsis thaliana)，豆科植物例如大豆(Glycine max)、截形苜蓿(Medicago truncatula)和紫苜蓿(Medicago sativa)，或者茄科植物例如本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、马铃薯(Solanum tuberosum)、番茄(Solanumlycopersicum)或茄子(Solanum melongena)的植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述指定真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞为植物细胞，优选地截形苜蓿、本氏烟草或拟南芥的细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述指定真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞为动物细胞，优选地人细胞或果蝇细胞。
在上面所定义的用于检测和鉴定微肽的方法中，在鉴定了在微小RNA的初级转录物上的能够编码肽的ORF后，需要拥有具有所述微小RNA和所述肽的细胞模型，以便能够证明所述肽对于所述微小RNA的可能的效应。
因此，两种选择是可设想的：
-其中鉴定出了miORF的细胞模型和其中证明了肽对于miR的效应的细胞模型是相同的，或者
-其中鉴定出了miORF的细胞模型和其中证明了肽对于miR的效应的细胞模型是不同的。
在第一种选择中，用于观察肽的效应的细胞模型与其中分离出了所述微小RNA的初级转录物的细胞模型是相同的。在该细胞模型中，所述指定真核细胞天然地包含所述微小RNA，并且应当仅将待测试的肽引入到这些细胞中。在该背景下，所述微小RNA被称为是“内源来源的”，因为其在所述细胞中天然地存在。然而，在细胞中可以加入内源来源的微小RNA的其他拷贝，例如通过在所述细胞中引入编码所述内源来源的微小RNA的载体。
在第二种选择中，用于观察肽的效应的细胞模型与其中分离出了所述微小RNA的初级转录物的细胞模型是不同的。在该细胞模型中，所述指定真核细胞不包含所述微小RNA和待测试的肽。因此，应当将这两种成分引入到这些细胞中。在该背景下，所述微小RNA被称为是“外源来源的”，因为其不在所述细胞中天然地存在。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞之中，所述微小RNA是外源来源的，所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR或Northern印迹来进行测定。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
所述微小RNA的积累可以借助于允许对特定核酸分子进行含量分析的分子生物学技术来进行测定。
在另一个方面，本发明还涉及用于检测和鉴定其初级转录物序列包含编码miPEP的核苷酸序列的微小RNA的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了其初级转录物包含编码微肽的核苷酸序列的微小RNA的存在。
特别地，本发明涉及用于检测和鉴定其初级转录物序列包含编码miPEP的核苷酸序列的微小RNA的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有15至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的初级转录物的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了其初级转录物包含编码微肽的核苷酸序列的微小RNA的存在。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加，特别是增加。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述肽在所述细胞中的存在是由于：
-将编码所述肽的核酸引入到所述细胞中，或
-将所述肽引入到所述细胞中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中步骤a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述微小RNA存在于野生型动物细胞中，尤其是存在于野生型人细胞中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞为植物细胞，优选地截形苜蓿的细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞为动物细胞，优选地果蝇细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞和所述与上述指定真核细胞相同类型的真核细胞之中，所述微小RNA是外源来源的，所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR或Northern印迹来进行测定。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于检测和鉴定微小RNA的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
在另一个方面，本发明涉及通过实施上面所定义的方法而获得的miPEP。
更特别地，本发明涉及由通过实施上面所定义的方法而获得的核苷酸序列所编码的miPEP。换言之，本发明涉及由通过实施上面所定义的方法而检测和鉴定出的核苷酸序列所编码的miPEP。
本发明的另一个方面还涉及具有3至100个氨基酸，特别地4至100个氨基酸，尤其是4至60个氨基酸，优选地4至40个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累。
本发明的另一个方面还涉及具有4至100个氨基酸或3个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累。
本发明的另一个方面还涉及具有3个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累。
特别地，在本发明中所定义的miPEP由具有15至303个核苷酸的miORF所编码，并且具有4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100个氨基酸，特别地5、8、10、18、19、23、37、50或59个氨基酸的大小。
特别地，本发明的miPEP具有4至10个氨基酸、4至20个氨基酸、4至30个氨基酸、4至40个氨基酸、4至50个氨基酸、4至60个氨基酸、4至70个氨基酸、4至80个氨基酸、4至90个氨基酸或4至100个氨基酸的大小。
此外，应当注意，在微小RNA的初级转录物上可以鉴定出数个miORF，这表明一个微小RNA的初级转录物可以潜在地编码数个miPEP。
还应当注意，miPEP的效应通常特异于单一的微小RNA，即其产生自编码所述miPEP的初级转录物。
在观察到在miPEP存在和不存在下的细胞之间微小RNA的数量的变化后，可以证明所述miPEP对于所述微小RNA的调节。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，其中所述核苷酸序列被包含在微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，其中所述核苷酸序列相应于存在于微小RNA的所述初级转录物上的第一开放阅读框。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，所述miPEP具有碱性的等电点，优选地大于8的等电点。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，所述miPEP具有酸性的等电点。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，所述miPEP选自由SEQ IDNO：1至SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386和SEQ ID NO：355组成的肽的组(表1)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，所述miPEP选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的miPEP，其由氨基酸序列MVT组成。
在另一个方面，本发明涉及编码上面所定义的miPEP的核酸分子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的核酸分子，所述分子选自由SEQ IDNO：105至SEQ ID NO：208、SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399和SEQ ID NO：356组成的核酸的组(表2)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的核酸分子，所述分子选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR171b(SEQ ID NO：319)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：163)所编码的MtmiPEP171b1(SEQ ID NO：59)，所述MtmiPEP171b1能够调节所述miR171b在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR164a(SEQ ID NO：297)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：128)所编码的AtmiPEP164a1(SEQ ID NO：24)，所述AtmiPEP164a1能够调节所述miR164a在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR165a(SEQ ID NO：305)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：147)所编码的AtmiPEP165a(SEQ ID NO：43)，所述miPEP165a能够调节所述miR165a在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR319a(SEQ ID NO：331)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：180)所编码的AtmiPEP319a1(SEQ ID NO：76)，所述AtmiPEP319a1能够调节所述miR319a在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR319a(SEQ ID NO：331)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：181)所编码的AtmiPEP319a2(SEQ ID NO：77)，所述AtmiPEP319a2能够调节所述miR319a在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR160b(SEQ ID NO：291)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：118)所编码的AtmiPEP160b1(SEQ ID NO：14)，所述AtmiPEP160b1能够调节所述miR160b在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR169d(SEQ ID NO：427)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：425)所编码的NtmiPEP169d(SEQ ID NO：424)，所述MtmiPEP169d能够调节所述miR169d在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR171e(SEQ ID NO：322)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：167)所编码的MtmiPEP171e(SEQ ID NO：63)，所述NtmiPEP171e能够调节所述miR171e在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR1(SEQ ID NO：353)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：206)所编码的DmmiPEP1a(SEQ ID NO：102)，所述DmmiPEP1a能够调节所述miR1在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR1(SEQ ID NO：353)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：207)所编码的DmmiPEP1b(SEQ ID NO：103)，所述DmmiPEP1b能够调节所述miR1在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR8(SEQ ID NO：354)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：208)所编码的DmmiPEP8(SEQ ID NO：104)，所述DmmiPEP8能够调节所述miR8在真核细胞中的积累。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及由包含在miR155(SEQ ID NO：358)的初级转录物中的核苷酸序列(SEQ ID NO：356)所编码的HsmiPEP155(SEQ ID NO：355)，所述HsmiPEP155能够调节所述miR155在真核细胞中的积累。
在另一个方面，本发明涉及分离的肽，或者分离且纯化的肽，或者合成肽或重组肽，其包含与miPEP的序列相同的序列或由与miPEP的序列相同的序列组成，所述miPEP尤其天然地存在于植物中或存在于动物例如人中。
在另一个方面，本发明涉及包含至少一种上面所定义的核酸分子的载体。
在另一个方面，本发明还涉及至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节至少一种基因的表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述至少一种基因的表达由所述微小RNA来进行调控。
在另一个方面，本发明还涉及至少一种：
-具有4至100个氨基酸，优选地4至40个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节至少一种基因的表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述至少一种基因的表达由所述微小RNA来进行调控。
在另一个方面，本发明还涉及至少一种：
-具有4至100个氨基酸或3个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节至少一种基因的表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述至少一种基因的表达由所述微小RNA来进行调控。
在另一个方面，本发明还涉及至少一种：
-具有3个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节至少一种基因的表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述至少一种基因的表达由所述微小RNA来进行调控。
本发明基于由发明人作出的令人惊讶的观察，可能调节同一个微小RNA的一个或多个靶基因的表达，这通过借助于miPEP调节所述微小RNA的积累来进行。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述指定真核细胞为植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述指定真核细胞为十字花科植物例如拟南芥，豆科植物例如大豆、截形苜蓿和紫苜蓿，或者茄科植物例如本氏烟草、马铃薯、番茄或茄子的植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述指定真核细胞为动物细胞，尤其是人细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述指定真核细胞为动物细胞，尤其是人细胞，所述miPEP不用于人或动物身体的手术或治疗性处理，也不用于改变人类的遗传同一性。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述指定真核细胞为动物细胞，所述miPEP用于人或动物身体的手术或治疗性处理。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在所述指定真核细胞中，所述微小RNA和所述基因是内源来源的。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在所述指定真核细胞中，所述微小RNA和所述基因是外源来源的，所述指定真核细胞包含至少一种允许所述微小RNA和所述基因表达的载体。
在本发明中，表述“内源来源的”和“外源来源的”用于区分不同物种的所述微小RNA和/或所述基因，鉴于物种之间的序列保守性。
因此，术语“内源来源的”表明，所述微小RNA和/或所述基因可以天然地存在于所讨论的细胞中。然而，可以人工地在所讨论的细胞中加入内源来源的所述微小RNA和/或所述基因的其他拷贝，例如通过克隆。
相反地，术语“外源来源的”表明，所述微小RNA和/或所述基因从未天然地存在于所讨论的细胞中。它是在另一个细胞类型中或在另一个物种的生物中鉴定出的微小RNA和/或基因，因此该微小RNA和/或该基因必需人工地引入到所讨论的细胞中。
因此，在本发明中，经遗传转化的细胞可以包含2组在序列方面潜在地近似的微小RNA和/或基因，其中一组是内源来源的，而另一组是外源来源的。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在所述指定真核细胞中，所述miRNA的初级转录物和所述基因是外源来源的，所述指定真核细胞包含至少一种允许所述微小RNA的初级转录物表达的载体。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miRNA的初级转录物由人工地引入到细胞中的载体来编码。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自由SEQ IDNO：1至SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386和SEQ ID NO：355组成的肽的组(表1)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自MtmiPEP171b1(SEQ ID NO：59)、AtmiPEP164a1(SEQ ID NO：24)、AtmiPEP165a(SEQ ID NO：43)、AtmiPEP319a1(SEQ ID NO：76)和AtmiPEP319a2(SEQ ID NO：77)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自MtmiPEP171b1(SEQ ID NO：59)、AtmiPEP164a1(SEQ ID NO：24)、AtmiPEP165a(SEQ ID NO：43)、AtmiPEP319a1(SEQ ID NO：76)、AtmiPEP319a2(SEQ ID NO：77)、AtmiPEP160b1(SEQ IDNO：14)、MtmiPEP171e(SEQ ID NO：63)和MtmiPEP169d(SEQ ID NO：424)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自DmmiPEP1a(SEQ ID NO：102)、DmmiPEP1b(SEQ ID NO：103)和DmmiPEP8(SEQ ID NO：104)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP为HsmiPEP155a(SEQ ID NO：355)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自由SEQ IDNO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356组成的核酸的组(表2)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自miORF171b(SEQ ID NO：163)、miORF164a1(SEQ ID NO：128)、miORF165a(SEQ ID NO：147)、miORF319a1(SEQ ID NO：180)和miORF319a2(SEQ ID NO：181)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自miORF171b(SEQ ID NO：163)、miORF164a1(SEQ ID NO：128)、miORF165a(SEQ ID NO：147)、miORF319a1(SEQ ID NO：180)、miORF319a2(SEQ ID NO：181)、miORF160b1(SEQ ID NO：118)、miORF169d(SEQ ID NO：425)和miORF171e(SEQ ID NO：167)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自miORF1a(SEQ ID NO：206)、miORF1b(SEQ ID NO：207)和miORF8(SEQ ID NO：208)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述核酸选自miORF155(SEQ ID NO：356)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自由SEQID NO：282至SEQ ID NO：354和SEQ ID NO：358组成的核酸的组。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：282至SEQ ID NO：354和SEQ ID NO：358，
-SEQ ID NO：412至SEQ ID NO：423，或
-SEQ ID NO：427。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自miR171b(SEQ ID NO：319)、miR165a(SEQ ID NO：305)和miR319a(SEQ ID NO：331)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自miR171b(SEQ ID NO：319)、miR164a(SEQ ID NO：297)、miR165a(SEQ ID NO：305)、miR319a(SEQ ID NO：331)、miR160b(SEQ ID NO：291)、miR171e(SEQ ID NO：322)和miR169d(SEQ IDNO：427)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自miR1a(SEQ ID NO：353)和miR8(SEQ ID NO：354)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述微小RNA选自miR155(SEQ ID NO：358)。
在另一个方面，本发明特别地涉及用于在真核细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有3至100个氨基酸，优选地4至20个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在另一个方面，本发明特别地涉及用于在真核细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有4至100个氨基酸或3个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在另一个方面，本发明特别地涉及用于在真核细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有3个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
特别地，本发明涉及用于在真核细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有4至100个氨基酸，优选地4至20个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述miPEP在所述细胞中的积累是由于：
-将编码所述miPEP的核酸引入到所述细胞中，或
-将所述miPEP引入到所述细胞中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述真核细胞为植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述真核细胞为动物细胞，尤其是人细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述真核细胞为动物细胞，尤其是人细胞，所述方法不用于人或动物身体的手术或治疗性处理，也不用于改变人类的遗传同一性。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中在所述真核细胞中，所述微小RNA和所述基因是内源来源的。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中在所述真核细胞中，所述微小RNA和所述基因是外源来源的，所述真核细胞包含至少一种允许所述微小RNA和所述基因表达的载体。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述miPEP选自由SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386和SEQ IDNO：355组成的肽的组。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于调节基因表达的方法，其中所述miPEP选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR171b(SEQ IDNO：319)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施MtmiPEP171b1(SEQ ID NO：59)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述MtmiPEP171b1在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述MtmiPEP171b1的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR171b(SEQ IDNO：319)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施MtmiPEP171b1(SEQ ID NO：59)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述MtmiPEP171b1在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述MtmiPEP171b1的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节，
其中，所述基因选自基因HAM1(登录号MtGI9-TC114268)和HAM2(登录号MtGI9-TC120850)(根据数据库“Medicago truncatula Gene Expression Atlas(MtGEA)”的登录号)。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR164a(SEQ IDNO：297)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施AtmiPEP165a1(SEQ ID NO：24)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述AtmiPEP164a1在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述AtmiPEP164a1的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR165a(SEQ IDNO：305)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施AtmiPEP165a(SEQ ID NO：43)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述AtmiPEP165a在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述AtmiPEP165a的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR319a(SEQ IDNO：331)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施AtmiPEP319a1(SEQ ID NO：76)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述AtmiPEP319a1在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述AtmiPEP319a1的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR319a(SEQ IDNO：331)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施AtmiPEP319a2(SEQ ID NO：77)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述AtmiPEP319a2在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述AtmiPEP319a2的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR160b(SEQ IDNO：291)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施AtmiPEP160b1(SEQ ID NO：14)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述AtmiPEP160b1在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述AtmiPEP160b1的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR169d(SEQ IDNO：427)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施MtmiPEP169d(SEQ ID NO：424)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述MtmiPEP169d在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述MtmiPEP169d的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR171e(SEQ IDNO：322)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施MtmiPEP171e(SEQ ID NO：63)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述MtmiPEP171e在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述MtmiPEP171e的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR1(SEQ IDNO：353)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施DmmiPEP1a(SEQ ID NO：102)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述DmmiPEP1a在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述DmmiPEP1a的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR1(SEQ IDNO：353)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施DmmiPEP1b(SEQ ID NO：103)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述DmmiPEP1b在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述DmmiPEP1b的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR8(SEQ IDNO：354)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施DmmiPEP8(SEQ ID NO：104)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述DmmiPEP8在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述DmmiPEP8的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在一个特别的实施方案中，本发明涉及用于在真核细胞中调节由miR155(SEQ IDNO：358)所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施HsmiPEP155(SEQ ID NO：355)在所述真核细胞中积累的步骤，
其中，所述HsmiPEP155在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述HsmiPEP155的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节。
在另一个方面，本发明涉及经修饰的真核细胞，其包含与上面所定义的miPEP相同的肽，所述肽不依赖于携带编码所述miPEP的核苷酸序列的微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述真核细胞中。
在本发明中，术语“经修饰的真核细胞”意味着，所述真核细胞包含人工引入到所述细胞中的miPEP，其要么作为肽，要么借助于编码所述miPEP的载体。
除了人工引入到所述细胞中的miPEP之外，根据本发明的经修饰的真核细胞还包含至少一种相应于编码所述miPEP的miORF的核酸。
除了人工引入到所述细胞中的miPEP和所述miORF之外，根据本发明的经修饰的真核细胞还包含至少一种miR，其初级转录物包含所述miORF。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述微小RNA是内源来源的。
在另一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述微小RNA是外源来源的，所述经修饰的真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述细胞为植物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述植物细胞为截形苜蓿或拟南芥的细胞，所述肽选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述植物细胞为截形苜蓿或拟南芥的细胞，所述肽选自由SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：59和SEQ IDNO：77组成的肽的组。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述植物细胞为截形苜蓿或拟南芥的细胞，所述肽选自由SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：424和SEQ ID NO：63组成的肽的组。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述细胞为动物细胞。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述动物细胞为果蝇细胞，并且所述肽选自由SEQ ID NO：102、SEQ ID NO：103和SEQ ID NO：104组成的肽的组。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的经修饰的真核细胞，其中所述动物细胞为人细胞，并且所述肽选自SEQ ID NO：355。
在另一个方面，本发明涉及包含至少一个上面所定义的经修饰的真核细胞的植物。
在另一个方面，本发明还涉及包含至少一个上面所定义的经修饰的真核细胞的非人动物生物。
在另一个方面，本发明涉及组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
在另一个方面，本发明涉及组合物，其包含至少一种选自由下列组成的组的miPEP：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在另一个方面，本发明涉及杀有害生物剂组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
在另一个方面，本发明涉及植物药学组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
在另一个方面，本发明涉及诱发性组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
“诱发性组合物”是指能够赋予植物以更好的共生能力或更好的对于不同胁迫的抗性的组合物，不论所述胁迫是热性质的，是水分性质的，还是化学性质的。
为此，本发明还涉及对于植物的生长(生长的抑制，或者相反，生长的增加)和生理学(更好的菌根形成、结瘤的能力，更好的对于不同胁迫的耐受性)起作用的组合物。
特别地，本发明涉及用于促进植物的生长的组合物。
在另一个方面，本发明涉及除草剂组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
在另一个方面，本发明涉及杀昆虫剂组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP164a作为活性物质，所述miPEP164a优选地由SEQ ID NO：24组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP319a作为活性物质，所述miPEP319a优选地由SEQ ID NO：76组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP171b作为活性物质，所述miPEP171b优选地由SEQ ID NO：59组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP165a作为活性物质，所述miPEP165a优选地由SEQ ID NO：43组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP319a2作为活性物质，所述miPEP319a2优选地由SEQ ID NO：77组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP160b1作为活性物质，所述miPEP160b1优选地由SEQ ID NO：14组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP169d作为活性物质，所述miPEP169d优选地由SEQ ID NO：424组成。
在另一个方面，本发明涉及组合物，特别是植物卫生组合物，其包含miPEP171e作为活性物质，所述miPEP171e优选地由SEQ ID NO：63组成。
miPEP的可溶特性尤其由其氨基酸组成决定。可以将亲水的miPEP溶解和包装在水性溶液例如水中。可以将疏水的miPEP溶解和包装在溶剂例如有机溶剂中。
对于用miPEP对植物进行处理，所述有机溶剂为低量的对于植物来说非毒性的溶剂，即它们对于植物的发育不具有有害的效应。非限制性地，所述有机溶剂可以选自乙腈和乙酸。
还可以将miPEP溶解和包装在有机溶剂的混合物(例如，乙腈和乙酸的混合物)中。特别地，可以将miPEP溶解在包含50％乙腈、10％乙酸和40％水(体积/体积/体积)的溶液中。
优选地，将miPEP 164a和165a溶解在水中，而将miPEP 171b和319a溶解在包含50％乙腈、10％乙酸和40％水(体积/体积/体积)的溶液中。
非限制性地，上面所定义的组合物、杀有害生物剂组合物、植物药学组合物、除草剂组合物和杀昆虫剂组合物可以包含10-9M至10-4M的miPEP，尤其是10-9M、10-8M、10-7M、10- 6M、10-5M或10-4M的miPEP。
根据所设想的应用，还可以预先考虑或多或少经浓缩的组合物。例如，在应当通过撒播向植物施用miPEP的情况下，可以设想包含10-1M至10-3M的miPEP，尤其是10-1M、10-2M或10-3M的miPEP的组合物。
在另一个方面，本发明涉及上面所定义的组合物作为除草剂以便用于消除植物或减慢其生长的用途，优选地作为特异于一个种的植物或一个属的植物的除草剂。
在另一个方面，本发明涉及上面所定义的组合物作为植物药学试剂以便用于下述目的的用途：
-用于促进植物的生长和/或发育，尤其是用于调节植物的生理学参数，特别是生物量、叶表面积、开花、果实大小、植物种子的产生和/或选择，特别地用于控制植物的单性结实或雌雄同株，或用于改变植物种子的生理学参数，特别是萌发、根系建立和对于水分胁迫的抗性，或者
-用于预防或治疗植物疾病，特别地用于促进对于感染性疾病的抗性。
在另一个方面，本发明涉及上面所定义的组合物用于调节植物的生理学参数(特别是生物量、叶表面积或果实大小)的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物用于果园疏果以便增加果实大小的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物用于植物种子的产生和/或选择的用途，其中所述组合物用于控制植物的单性结实或雌雄同株。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物的用途，其中所述组合物通过叶途径或通过根途径来施用给所述植物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物用于植物种子的产生和/或选择的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物的用途，其中所述组合物用于改变所述植物种子的生理学参数，特别是根系建立、萌发和对于水分胁迫的抗性。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物的用途，其中所述组合物通过在所述植物种子上包裹或覆膜来进行施加。
在另一个方面，本发明涉及上面所定义的组合物作为杀有害生物剂以便用于消除植物的有害生物或能够被归类为此类的生物的用途，尤其是作为杀昆虫剂、杀蜘蛛剂、杀软体动物剂或杀啮齿动物剂。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物作为杀昆虫剂的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物用于消除破坏性昆虫的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物用于消除被归类为有害的动物物种或能够被归类为此类的动物物种(特别是鼠科动物，尤其是大鼠)的用途。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物作为杀有害生物剂以便用于消除植物的有害生物或能够被归类为此类的生物的用途，
尤其是作为杀昆虫剂、杀蜘蛛剂、杀软体动物剂或杀啮齿动物剂，
特别地通过将所述组合物施加在植物上或施加在与所述植物相接触的支持物上。
在另一个方面，本发明涉及上面所定义的组合物的用途，其中在植物上施加所述组合物以保护所述植物免于破坏性昆虫侵害。
在另一个方面，本发明涉及肽用于促进植物的生长的用途，其中将所述肽引入到所述植物中，所述肽所具有的氨基酸序列包含与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列或由与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列组成，
其中所述天然地存在于所述植物中的miPEP为具有4至100个氨基酸的肽，其序列由位于miR的初级转录物上的开放阅读框所编码，所述miPEP能够调节所述miR在所述植物中的积累，所述miR调控至少一种在所述植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达。
发明人令人惊讶地发现，其序列包含与在miR的初级转录物上所编码的miPEP的序列相同的序列或由与在miR的初级转录物上所编码的miPEP的序列相同的序列组成的肽的使用，使得能够促进植物的生长。
在本发明中，术语“植物”通常是指植物的整体或部分，无论其发育阶段为何(其中包括以籽或幼芽形式的植物)；植物的一个或多个器官(例如叶、根、茎、花)；植物的一个或多个细胞；或者植物的细胞团簇。
在本发明中，术语“生长”是指植物的整体或部分随时间而进行的发育。因此，植物的生长可以通过对于植物的某些部分、细胞或器官(例如叶、根、茎或者花)追踪可观察的演变性参数来测定和定量。
非限制性地，使得能够测定或定量植物的生长的参数可以尤其是：
-叶的大小、表面积、体积、质量和数目，
-花的大小和数目，
-茎(或花梗)的大小
-根的长度和数目，
-萌发的提早，
-出芽的提早，
-成花诱导(或成花转换)的提早，
-或者，细胞的数目。
在豆科植物的情况下，植物的生长还可以与结瘤的速度相关联，或者与在根上的根瘤的大小和数目相关联。
此外，在本发明中，表述“促进植物的生长”或“改善植物的生长”：
-要么表明所述植物的发育的加速(例如，对于某一植物，在给定时刻相对于参考植物而言更大的叶大小)，
-要么表明所述植物的发育的增长(例如，对于某一植物，由参考植物不能达到的更大的叶大小)，
-要么表明所述植物的发育的加速和增长。
重要的是注意，根据本发明的用途相比于在园艺中或在农业中常规使用的化学方法而言具有其是生态的这样的优点，因为miPEP是天然地存在于植物中的肽。
本发明还涉及引入到植物中的miPEP用于促进生长的用途，
所述引入的miPEP为包含与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列或由与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列组成的肽，
所述天然地存在的miPEP为具有4至100个氨基酸的肽，其序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，
所述miPEP能够调节所述miR在所述植物中的积累，所述miR调控至少一种在植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的miPEP的量和所述天然地存在的miPEP的量之和严格地高于所述天然地存在的miPEP的量。
在本发明中，表述“引入的miPEP”是指人工地引入到植物中的miPEP，这与“天然地存在于植物中的miPEP”相反。因此，在植物中引入miPEP牵涉技术步骤，所述步骤不是天然现象，并且既不相应于杂交，也不相应于选择。
引入的miPEP可以要么是在植物之外产生的肽(例如，分离的和/或经纯化的肽、合成肽或重组肽)，要么是在将编码所述miPEP的核酸非天然地引入到所述植物中之后在植物中产生的肽。
其中未引入miPEP的植物具有基础量的所述miPEP，其相应于所述天然地存在的miPEP的量。包含与所述miPEP的序列相同的序列或由与所述miPEP的序列相同的序列组成的miPEP的使用导致miPEP的总量增加，这调节其初级转录物包含编码所述miPEP的序列的miR的积累。
此外，引入的miPEP存在于所述植物中，并且其引入不影响其稳定性。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：NAC1(登录号AT1G56010.1)、NAC4(登录号AT5G07680.1)、NAC5(登录号AT5G61430.1)、CUC1(登录号AT3G15170.1)、CUC2(登录号AT5G53950.1)、TCP3(登录号AT1G53230.1)和TCP4(登录号AT3G15030.1)(根据数据库“TheArabidopsisInformation Resource(TAIR)”的登录号)。
特别地，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：NAC1、NAC4、NAC5、CUC1和CUC2。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：TCP3和TCP4。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miRNA选自miR164a和miR319a。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miR选自miR164a、miR319a、miR171b、miR165a、miR160b、miR169d和miR171e。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP选自AtmiPEP164a1、AtmiPEP319a1、AtmiPEP319a2、MtmiPEP171b1、AtmiPEP165a1、AtmiPEP160b1、MtmiPEP169d、MtmiPEP171e。
特别地，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miR164a具有由SEQ ID NO：297组成的核苷酸序列。
特别地，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miR164a具有与核苷酸序列SEQID NO：297有着至少80％的同一性，优选地至少90％的同一性的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP为AtmiPEP164a1，特别地，其中所述AtmiPEP164a1具有由SEQ ID NO：24组成的氨基酸序列。
特别地，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miR319a具有由SEQ ID NO：331组成的核苷酸序列。
特别地，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miR319a具有与核苷酸序列SEQID NO：331有着至少80％的同一性，优选地至少90％的同一性的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述miPEP为AtmiPEP319a1，特别地，其中所述AtmiPEP319a1具有由SEQ ID NO：76组成的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述植物为十字花科植物例如拟南芥，豆科植物例如大豆、截形苜蓿和紫苜蓿，或者茄科植物例如本氏烟草、马铃薯、番茄或茄子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述植物为十字花科植物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中所述植物为拟南芥。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，所述用途为用于促进拟南芥植物的生长，其中将AtmiPEP164a1引入到所述拟南芥植物中，所述AtmiPEP164a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，
所述引入的AtmiPEP164a1为其序列包含与所述天然地存在的AtmiPEP164a1的序列相同的序列或由与所述天然地存在的AtmiPEP164a1的序列相同的序列组成的肽，所述天然地存在的AtmiPEP164a1的所述序列由在miR164a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，所述miR164a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的AtmiPEP164a1的量和所述天然地存在的AtmiPEP164a1的量之和严格地高于所述天然地存在于所述拟南芥植物中的AtmiPEP164a1的量。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，所述用途为用于促进拟南芥植物的生长，其中将AtmiPEP319a1引入到所述拟南芥植物中，所述AtmiPEP319a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，
所述引入的AtmiPEP319a1为其序列包含与所述天然地存在的AtmiPEP319a1的序列相同的序列或由与所述天然地存在的AtmiPEP319a1的序列相同的序列组成的肽，所述天然地存在的AtmiPEP319a1的所述序列由在miR319a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，所述miR319a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的AtmiPEP319a1的量和所述天然地存在的AtmiPEP319a1的量之和严格地高于所述天然地存在于所述拟南芥植物中的AtmiPEP319a1的量。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中通过外部途径，优选地通过浇灌，通过喷洒，或者通过添加肥料、腐殖土、培养基质或惰性支持物，来将所述miPEP引入到植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中通过浇灌和通过喷洒来引入所述miPEP。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中通过浇灌和通过添加肥料来引入所述miPEP。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中通过喷洒和通过添加肥料来引入所述miPEP。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中通过浇灌、通过喷洒和通过添加肥料来引入所述miPEP。
事实上，发明人出人意料地发现，可能在植物上直接施加包含miPEP的组合物以调节相应的miR在植物中的积累，这表明所述miPEP被所述植物接收。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中用包含10-9M至10-4M的所述miPEP，尤其是10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5M或10-4M的所述miPEP的组合物来处理植物。
优选地，对于通过浇灌或通过喷洒来施加在植物上，所述组合物具有10-8M至10-5M的浓度。
作为补充，对于用miPEP来处理植物，可以设想或多或少经浓缩的组合物。例如，和非限制性地，在通过撒播向植物施用通过外源途径而引入的miPEP的情况下，可以使用包含10-1M至10-3M，尤其是10-2M的miPEP的更为浓缩的组合物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中经由编码所述miPEP的核酸来将所述miPEP引入到植物中，所述核酸被引入到植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的茎大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根长度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的结瘤速度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用途，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根瘤数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言增加了。
使得能够测定和定量在其中引入了miPEP的植物中的生长的参数(例如，茎的大小、叶的数目和大小、根的数目和长度、结瘤的速度或者在根上的根瘤的数目)的增加优选地通过与相同的(即同样物种和/或品种的植物)、同样年龄的且在同样条件下栽培的但其中未引入任何miPEP的植物进行比较来证明。
在另一个方面，本发明涉及用于促进植物的生长的方法，所述方法包括将miPEP引入到植物中的步骤，所述miPEP也天然地存在于所述植物中，
所述引入的miPEP为具有4至100个氨基酸的肽，其序列包含与所述天然地存在的miPEP的序列相同的序列或由与所述天然地存在的miPEP的序列相同的序列组成，所述天然地存在的miPEP的所述序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，所述miPEP能够调节所述miR的积累，所述miR调控至少一种在植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的miPEP的量和所述天然地存在的miPEP的量之和严格地高于所述天然地存在的miPEP的量。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：NAC1(登录号AT1G56010.1)、NAC4(登录号AT5G07680.1)、NAC5(登录号AT5G61430.1)、CUC1(登录号AT3G15170.1)、CUC2(登录号AT5G53950.1)、TCP3(登录号AT1G53230.1)和TCP4(登录号AT3G15030.1)。
特别地，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：NAC1、NAC4、NAC5、CUC1和CUC2。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：TCP3和TCP4。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miR选自miR164a、miR319a、miR171b、miR165a、miR160b、miR169d和miR171e。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miPEP选自AtmiPEP164a1、AtmiPEP319a1、AtmiPEP319a2、MtmiPEP171b1、AtmiPEP165a1、AtmiPEP160b1、MtmiPEP169d、MtmiPEP171e。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miRNA为miR164a，特别地，其中所述miR164a具有由SEQ ID NO：297组成的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miPEP为AtmiPEP164a1，特别地，其中所述AtmiPEP164a1具有由SEQ ID NO：24组成的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miRNA为miR319a，特别地，其中所述miR319a具有由SEQ ID NO：331组成的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述miPEP为AtmiPEP319a1，特别地，其中所述AtmiPEP319a1具有由SEQ ID NO：76组成的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述植物为十字花科植物例如拟南芥，豆科植物例如大豆、截形苜蓿和紫苜蓿，或者茄科植物例如本氏烟草、马铃薯、番茄或茄子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述植物为十字花科植物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中所述植物为拟南芥。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，所述方法用于促进拟南芥植物的生长，其中将AtmiPEP164a1引入到所述拟南芥植物中，所述AtmiPEP164a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，
所述引入的AtmiPEP164a1为包含与所述天然地存在的AtmiPEP164a1的序列相同的序列或由与所述天然地存在的AtmiPEP164a1的序列相同的序列组成的肽，所述天然地存在的AtmiPEP164a1为具有4至100个氨基酸的肽，其序列由在miR164a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，
所述AtmiPEP164a1能够增加所述miR164a的积累，所述miR164a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的AtmiPEP164a1的量和所述天然地存在的AtmiPEP164a1的量之和严格地高于所述天然地存在的AtmiPEP164a1的量。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，所述方法用于促进拟南芥植物的生长，其中将AtmiPEP319a1引入到所述拟南芥植物中，所述AtmiPEP319a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，
所述引入的AtmiPEP319a1为包含与所述天然地存在的AtmiPEP319a1的序列相同的序列或由与所述天然地存在的AtmiPEP319a1的序列相同的序列组成的肽，所述天然地存在的AtmiPEP319a1为具有4至100个氨基酸的肽，其序列由在miR319a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码，
所述AtmiPEP319a1能够增加所述miR319a的积累，所述miR319a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，
所述引入的AtmiPEP319a1的量和所述天然地存在的AtmiPEP319a1的量之和严格地高于所述天然地存在的AtmiPEP319a1的量。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中通过外部途径，优选地通过浇灌，通过喷洒，或者通过添加肥料、腐殖土、培养基质或惰性支持物，来将所述miPEP引入到植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中以包含10-9M至10-4M的所述miPEP，特别地10-9M、10-8M、10-7M、10-6M、10-5M或10-4M的所述miPEP的组合物的形式，向植物施用所述miPEP。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中经由编码所述miPEP的核酸来将所述miPEP引入到植物中，所述核酸被引入到植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的茎大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根长度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的结瘤速度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根瘤数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言增加了。
在另一个方面，本发明涉及其中根据上面所描述的用于促进植物的生长的用途或方法而引入了miPEP的植物。
在另一个方面，本发明涉及用于产生转基因植物的方法，所述方法包括：
a)将编码具有4至100个氨基酸的miPEP的核酸在允许所述miPEP表达的条件下引入到植物中或引入到所述植物的至少一个细胞中的步骤，
所述miPEP也天然地存在于所述植物中，所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述miPEP能够调节所述miR在植物中的积累，所述miR调控至少一种在植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达，和
b)在允许获得转基因植物的条件下培养在步骤a)中获得的植物或所述植物的至少一个细胞的步骤。
在另一个方面，本发明涉及用于产生转基因植物的方法，所述方法包括：
a)将编码具有4至100个氨基酸或3个氨基酸的miPEP的核酸在允许所述miPEP表达的条件下引入到植物中或引入到所述植物的至少一个细胞中的步骤，
所述miPEP也天然地存在于所述植物中，所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述miPEP能够调节所述miR在植物中的积累，所述miR调控至少一种在植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达，和
b)在允许获得转基因植物的条件下培养在步骤a)中获得的植物或所述植物的至少一个细胞的步骤。
在另一个方面，本发明涉及用于产生转基因植物的方法，所述方法包括：
a)将编码具有3个氨基酸的miPEP的核酸在允许所述miPEP表达的条件下引入到植物中或引入到所述植物的至少一个细胞中的步骤，
所述miPEP也天然地存在于所述植物中，所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述miPEP能够调节所述miR在植物中的积累，所述miR调控至少一种在植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育中所牵涉的基因的表达，和
b)在允许获得转基因植物的条件下培养在步骤a)中获得的植物或所述植物的至少一个细胞的步骤。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在步骤b)中获得的所述转基因植物具有相对于其中未引入所述核酸的相同植物而言经改善的生长。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中由引入到植物中的核酸所编码的所述miPEP的表达导致相对于其中未引入所述核酸的相同植物而言经改善的生长。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中步骤a)借助于包含所述核酸的载体(优选地质粒)来施行。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中将步骤a)的所述核酸的表达置于强启动子(优选地组成型强启动子，例如35S启动子)的控制之下。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述在植物的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因选自由下列组成的组：NAC1(登录号AT1G56010.1)、NAC4(登录号AT5G07680.1)、NAC5(登录号AT5G61430.1)、CUC1(登录号AT3G15170.1)、CUC2(登录号AT5G53950.1)、TCP3(登录号AT1G53230.1)和TCP4(登录号AT3G15030.1)。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miPEP所具有的氨基酸序列包含选自由下列组成的组的序列或由选自由下列组成的组的序列组成：SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101和SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miPEP所具有的氨基酸序列包含选自由下列组成的组的序列或由选自由下列组成的组的序列组成：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miRNA为miR164a，特别地，其中所述miR164a具有由SEQ ID NO：297组成的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miPEP为AtmiPEP164a1，特别地，其中所述AtmiPEP164a1具有由SEQ ID NO：24组成的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miRNA为miR319a，特别地，其中所述miR319a具有由SEQ ID NO：331组成的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述miPEP为AtmiPEP319a1，特别地，其中所述AtmiPEP319a1具有由SEQ ID NO：76组成的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在步骤a)中引入的所述核酸包含选自SEQ ID NO：128和SEQ ID NO：180的核苷酸序列。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述植物为十字花科植物例如拟南芥，豆科植物例如大豆、截形苜蓿和紫苜蓿，或者茄科植物例如本氏烟草、马铃薯、番茄或茄子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述转基因植物为十字花科植物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中所述转基因植物为拟南芥。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，所述方法包括：
a)将包含核苷酸序列SEQ ID NO：128(其编码由氨基酸序列SEQ ID NO：24组成的AtmiPEP164a1)的核酸在允许AtmiPEP164a1表达的条件下引入到拟南芥植物中或引入到所述拟南芥植物的至少一个细胞中的步骤，
所述AtmiPEP164a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR164a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述AtmiPEP164a1能够调节所述miR164的积累，所述miR164a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，和
b)在允许获得转基因拟南芥植物的条件下培养在步骤a)中获得的植物或所述植物的至少一个细胞的步骤。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，所述方法包括：
a)将包含核苷酸序列SEQ ID NO：180(其编码由氨基酸序列SEQ ID NO：76组成的AtmiPEP319a1)的核酸在允许AtmiPEP319a1表达的条件下引入到拟南芥植物中或引入到所述拟南芥植物的至少一个细胞中的步骤，
所述AtmiPEP319a1也天然地存在于所述拟南芥植物中，所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR319a的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述AtmiPEP319a1能够调节所述miR319的积累，所述miR319a调控至少一种在拟南芥的营养或生殖部分的发育中所牵涉的基因的表达，和
b)在允许获得转基因拟南芥植物的条件下培养在步骤a)中获得的植物或所述植物的至少一个细胞的步骤。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的产生方法，其中经由编码所述miPEP的核酸来将所述miPEP引入到植物中，所述核酸被引入到植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的茎大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的茎大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的叶大小相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的叶大小而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根数目而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根长度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根长度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的结瘤速度相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的结瘤速度而言增加了。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的用于产生转基因植物的方法，其中在其中引入了所述miPEP的植物中的根瘤数目相对于其中未引入任何miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言或者相对于其中未引入所述miPEP的具有同样年龄的相同植物的根瘤数目而言增加了。
在一个方面，本发明还涉及通过上面所定义的产生方法而获得的转基因植物。
在另一个方面，本发明涉及包含编码miPEP的载体的转基因植物，所述miPEP也天然地存在于所述植物中，
所述天然地存在的miPEP为其序列由在miR的初级转录物上位于5’处的开放阅读框所编码的肽，所述miPEP能够调节所述miR在植物中的积累，所述miR调控至少一种基因的表达，
由引入到植物中的载体所编码的所述miPEP的表达导致相对于其中未引入所述核酸的相同植物而言所述基因的表达的调节。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述基因牵涉于植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育之中，并且由引入到植物中的核酸所编码的所述miPEP的表达导致相对于其中未引入所述核酸的相同植物而言所述转基因植物的经改善的生长。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述miPEP选自由下列组成的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在另一个方面，本发明涉及包含载体的转基因植物，
所述载体包含允许miR的初级转录物表达的核酸，
所述miR的初级转录物包含编码miPEP的开放阅读框，
所述miPEP能够调节所述miR在所述植物中的积累，所述miR调控至少一种基因在所述植物中的表达，
由引入到植物中的载体所编码的所述miPEP的表达导致相对于其中未引入所述载体的相同植物而言所述基因的表达的调节。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述核酸是内源来源的。
如果所述核酸是内源来源的，那么至少一个拷贝的所述核酸已经独立于引入到植物中的载体而天然地存在于所述植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述核酸是外源来源的。
如果所述核酸是外源来源的，那么没有任何拷贝的所述核酸天然地存在于所述植物中。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述基因牵涉于植物的营养或生殖部分(尤其是根、茎、叶或花)的发育之中，并且由引入到植物中的核酸所编码的所述miPEP的表达导致相对于其中未引入所述核酸的相同植物而言所述转基因植物的经改善的生长。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的转基因植物，其中所述miPEP选自由下列组成的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在另一个方面，本发明涉及组合物，该组合物以组合方式包含一定数量的植物种子和一定数量的肽，所述肽的序列包含与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列或由与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列组成。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，其中所述miPEP选自由下列组成的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：101，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
在一个实施方案中，本发明涉及组合物，该组合物以组合方式包含一定数量的植物(尤其是拟南芥)种子和一定数量的肽，所述肽的序列包含与AtmiPEP164a1的序列相同的序列或由与AtmiPEP164a1的序列相同的序列组成。
在一个实施方案中，本发明涉及组合物，该组合物以组合方式包含一定数量的植物(尤其是拟南芥)种子和一定数量的肽，所述肽的序列包含与AtmiPEP319a1的序列相同的序列或由与AtmiPEP319a1的序列相同的序列组成。
在一个实施方案中，本发明涉及组合物，该组合物以组合方式包含一定数量的植物(尤其是截形苜蓿)种子和一定数量的肽，所述肽的序列包含与MtmiPEP171b的序列相同的序列或由与MtmiPEP171b的序列相同的序列组成。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，对其进行配制以便形成经包裹的种子。
所述包裹可以根据在农产品加工工业中常规使用的方法来施行，并且可以通过使用能够在溶剂中或在土地中分解的材料(例如粘结剂或粘土)来获得。
根据本发明，所述包裹可以例如用于将特殊的特性赋予miPEP的组合物，或者赋予与miPEP相组合的种子的组合物。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，对其进行配制以便形成包含MtmiPEP171b的经包裹的种子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，对其进行配制以便形成包含AtmiPEP164a1的经包裹的种子。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，对其进行配制以便形成包含AtmiPEP319a1的经包裹的种子。
在另一个方面，本发明涉及药物组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
和药学上可接受的赋形剂。
在另一个方面，本发明涉及组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
所述组合物用于其作为药物(尤其是用于人或用于动物的药物)的应用。
本发明的组合物的用途可适用于人类医学和兽医学。
在另一个方面，本发明涉及组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
所述组合物用于其在预防和/或治疗牵涉患者基因表达失调的病理学状况中的应用，
所述基因的表达由微小RNA来进行调控，所述微小RNA的积累由所述miPEP来进行调节。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，其中所述病理学状况选自癌症、糖尿病、肥胖症、感染性疾病和神经变性疾病。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，其中所述病理学状况选自癌症、糖尿病、肥胖症、感染性疾病、神经变性疾病、心血管疾病和自身免疫疾病。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，其中所述病理学状况选自癌症、糖尿病、肥胖症、感染性疾病和神经变性疾病，或者选自心血管疾病和自身免疫疾病。
在一个实施方案中，本发明涉及上面所定义的组合物，其中所述病理学状况选自心血管疾病和自身免疫疾病。
在另一个方面，本发明涉及组合物，其包含至少一种：
-上面所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
所述组合物用于其在预防和/或治疗由寄生生物引起的动物或人的感染中的应用，
所述寄生生物具有其表达由微小RNA来进行调控的基因，所述微小RNA的积累由所述miPEP来进行调节。
在另一个方面，本发明涉及具有4至100个氨基酸或3个氨基酸的miPEP，其由包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，所述miPEP用于其作为药物的应用。
在另一个方面，本发明涉及特异性地识别miPEP的抗体。
特别地，本发明涉及特异性地识别AtmiPEP165a的抗体。
特别地，本发明涉及特异性地识别MtmiPEP171b的抗体。
特别地，本发明涉及特异性地识别AtmiPEP164a1的抗体。
特别地，本发明涉及特异性地识别AtmiPEP319a1的抗体。
这样的抗体可以由技术人员已知的方法来获得，例如通过将所述miPEP注射到非人动物中以起动由所述动物进行的免疫反应和抗体产生。
在另一个方面，本发明涉及用于对miPEP进行免疫定位的方法，所述方法包括用特异性地识别miPEP的抗体来标记植物的生物学样品的步骤。
特别地，本发明涉及用于借助于特异性地识别AtmiPEP165a的抗体来对AtmiPEP165a进行免疫定位的方法。
特别地，本发明涉及用于借助于特异性地识别MtmiPEP171b的抗体来对MtmiPEP171b进行免疫定位的方法。
特别地，本发明涉及用于借助于特异性地识别AtmiPEP164a1的抗体来对AtmiPEP164a1进行免疫定位的方法。
特别地，本发明涉及用于借助于特异性地识别AtmiPEP319a1的抗体来对MtmiPEP319a1进行免疫定位的方法。
在另一个方面，本发明涉及根据本发明的特异性地识别miPEP的抗体，所述抗体用于其作为药物的应用。
在另一个方面，本发明涉及药物组合物，其包含根据本发明的特异性地识别miPEP的抗体，和药学上可接受的赋形剂。
在另一个方面，本发明涉及用于产生重组肽的实验方案，所述重组肽的序列包含与上面所定义的miPEP的序列相同的序列或由与上面所定义的miPEP的序列相同的序列组成，所述实验方案包括用编码所述重组肽的表达载体转化生物的步骤。
在一个实施方案中，所述生物选自包括下列的组：细菌、酵母、真菌(除酵母之外的)、动物细胞、植物和动物。
在一个实施方案中，所述生物为大肠杆菌(Escherichia coli)。
特别地，本发明涉及上面所定义的用于产生重组肽的实验方案，所述实验方案包括下列步骤：
-将编码所述重组肽的核酸与编码标签(例如GST)的核酸相连接，
-将包含所述编码所述重组肽的核酸的表达载体引入到细菌大肠杆菌中，
-将包含该表达载体的细菌大肠杆菌在LB培养基中进行培养，优选地直至达到0.2至0.4的OD，
-用IPTG来诱导重组肽的产生，优选地进行4至5个小时，
-将所述细菌大肠杆菌进行离心并裂解，
-过滤上清液，
-在谷胱甘肽-Sepharose亲和柱上纯化所述重组肽，
-如果需要，用蛋白酶切割下GST。
在表1、2、3、4、5和6中指明了所有的miPEP、miORF、miR和miR的初级转录物的序列。
表7呈现了pri-miR171b的不同区域的DNA序列的多态性分析(当它与其他单元型相差至少一个氨基酸时，定义出一种单元型)。
Figure BDA0003137590750000311
Figure BDA0003137590750000321
Figure BDA0003137590750000331
Figure BDA0003137590750000341
Figure BDA0003137590750000351
Figure BDA0003137590750000361
Figure BDA0003137590750000371
Figure BDA0003137590750000381
Figure BDA0003137590750000391
Figure BDA0003137590750000401
Figure BDA0003137590750000411
Figure BDA0003137590750000421
Figure BDA0003137590750000431
Figure BDA0003137590750000441
Figure BDA0003137590750000451
Figure BDA0003137590750000461
Figure BDA0003137590750000471
Figure BDA0003137590750000481
Figure BDA0003137590750000491
Figure BDA0003137590750000501
Figure BDA0003137590750000511
Figure BDA0003137590750000521
Figure BDA0003137590750000531
Figure BDA0003137590750000541
Figure BDA0003137590750000551
Figure BDA0003137590750000561
Figure BDA0003137590750000571
Figure BDA0003137590750000581
Figure BDA0003137590750000591
Figure BDA0003137590750000601
Figure BDA0003137590750000611
Figure BDA0003137590750000621
Figure BDA0003137590750000631
Figure BDA0003137590750000641
Figure BDA0003137590750000651
Figure BDA0003137590750000661
Figure BDA0003137590750000671
Figure BDA0003137590750000681
Figure BDA0003137590750000691
Figure BDA0003137590750000701
Figure BDA0003137590750000711
Figure BDA0003137590750000721
Figure BDA0003137590750000731
Figure BDA0003137590750000741
Figure BDA0003137590750000751
下面的附图和实施例将会更好地举例说明本发明，但并不因此而限制本发明的范围。
附图说明
图1.在截形苜蓿中MtmiR171b(在截形苜蓿中鉴定出的miR171b)的过表达对于基因HAM1和HAM2的表达(A)或者对于侧根数目(B)的效应。
(A)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在其中过表达MtmiR171b的植物中(黑色柱)，MtmiR171b(左边的柱)、HAM1(中间的柱)或HAM2(右边的柱)的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。MtmiR171b的过表达诱导了基因HAM1和HAM2的表达减少。
(B)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在其中过表达MtmiR171b的植物中(黑色柱)观察到的侧根的平均数目。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝100)。MtmiR171b的过表达引起了侧根数目减少。
图2.在截形苜蓿中MtmiPEP171b1的过表达对于MtmiR171b以及基因HAM1和HAM2的表达(A)或者对于侧根数目(B)的效应。
(A)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在其中过表达MtmiPEP171b1的植物中(黑色柱)，MtmiPEP171b1(左图)、miR171b(右图，左边的柱)、HAM1(登录号MtGI9-TC114268)(右图，中间的柱)或HAM2(登录号MtGI9-TC120850)(右图，右边的柱)的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。MtmiPEP171b1的过表达诱导了MtmiR171b的积累增加，以及基因HAM1和HAM2的表达减少。
(B)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在其中过表达MtmiPEP171b1的植物中(黑色柱)观察到的侧根的平均数目。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝100)。MtmiPEP171b1的过表达引起了侧根数目减少。
图3.在截形苜蓿中MtmiPEP171b1对于MtmiR171b以及基因HAM1和HAM2的表达(A)和对于侧根数目(B)的效应。
(A)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在通过用0.01μM(浅灰色柱)、0.1μM(深灰色柱)或1μM(黑色柱)的MtmiPEP171b1每天浇灌1次并持续5天来进行处理的植物中，MtmiR171b(左边的柱)、HAM1(中间的柱)或HAM2(右边的柱)的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。不同浓度的MtmiPEP171b1的施加诱导了MtmiR171b的积累增加，以及基因HAM1和HAM2的表达减少。
(B)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在通过用0.1μM的MtmiPEP171b1每天浇灌1次并持续5天来进行处理的植物中(黑色柱)观察到的侧根的平均数目。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝100)。0.1μM的MtmiPEP171b1的施加引起了侧根数目减少。
(c)纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在通过用0.01μM(灰色柱)、0.1μM(深灰色柱)或1μM(黑色柱)的MtmiPEP171b1或用0.01μM的其氨基酸组成与miPEP171b相同但其序列不同的混杂肽(LIVSHLYSEKFDCMRKILRI，SEQ ID NO：428)(浅灰色柱)每天浇灌1次并持续5天来进行处理的植物中，MtmiR171b(左边的柱)、HAM1(中间的柱)或HAM2(右边的柱)的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
图4.在截形苜蓿中MtmiPEP171b1对于pre-MtmiR171b(A)和MtmiR171b(B)的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在通过用0.01μM、0.1μM或1μM的MtmiPEP171b1每天浇灌1次并持续5天来进行处理的植物中(右边的柱)，微小RNA的不同形式的前体的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝200)。不同浓度的MtmiPEP171b1的施加引起了pre-MtmiR171b(A)和MtmiR171b(B)的积累增加。
图5.在截形苜蓿中MtmiPEP171b1的过表达(A)和MtmiPEP171b1(B)对于微小RNA的不同前体的表达的效应。
纵坐标轴指明了在过表达MtmiPEP171b1的植物中微小RNA的前体的表达与在对照根中这些相同前体的表达之比(A)，或者在用MtmiPEP171b1(0.1μM)进行处理的植物中微小RNA的前体的表达与在对照根中这些相同前体的表达之比(B)。在横坐标轴上从左至右指明了所测试的微小RNA的不同前体，即pre-MtmiR171b(SEQ ID NO：246)、pre-MtmiR169(SEQID NO：359)、pre-MtmiR169a(SEQ ID NO：360)、pre-MtmiR171a(SEQ ID NO：361)、pre-MtmiR171h(SEQ ID NO：362)、pre-MtmiR393a(SEQ ID NO：363)、pre-MtmiR393b(SEQ IDNO：364)、pre-MtmiR396a(SEQ ID NO：365)和pre-MtmiR396b(SEQ ID NO：366)。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。察看到，MtmiPEP171b1仅引起对于MtmiR171b的积累的效应，而不引起对于其他miR的效应。
图6.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1的翻译对于MtmiR171b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在经转化以表达pri-MtmiR171b(白色柱)或其中密码子ATG被ATT代替的突变型pri-MtmiR171b(黑色柱)的烟草植物中，MtmiR171b的相对表达。因此，突变型pri-MtmiR171b不能够产生MtmiPEP171b1。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。察看到，MtmiPEP171b1的翻译的不存在引起了miR171b的积累强烈减少。
图7.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1的过表达对于pre-MtmiR171b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在经转化以表达MtmiR171b(左边的柱)，MtmiR171b和MtmiPEP171b1(中央的柱)，或者MtmiR171b和其中起始密码子ATG被ATT代替的MtmiORF171b的突变形式(右边的柱)的烟草植物中，pre-MtmiR171b的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。察看到，MtmiPEP171b1的表达增加了MtmiR171b的表达，并且该效应依赖于MtmiORF171b被翻译成MtmiPEP171b1。
图8.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1对于pre-MtmiR171b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在其上喷洒了2次(在取样前12小时，然后在取样前30分钟)MtmiPEP171b1(0.1μM)(右边的柱)或未喷洒(左边的柱)的经转化以表达MtmiR171b的烟草植物中，MtmiR171b的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝6)。通过喷洒来使用的肽MtmiPEP171b1诱导了MtmiR171b的积累增加。
图9.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1对于pri-miR171b(A)、pre-MtmiR171b(B)和MtmiR171b(c)的表达的效应。
纵坐标轴指明了在经修饰以表达MtmiR171b(左边的柱)或经修饰以表达MtmiR171b和过表达MtmiPEP171b1(右边的柱，图9A)或者用0.1μM的miPEP171b1(图9B和c)进行处理的烟草植物中，微小RNA的不同形式的前体的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。MtmiPEP171b1的过表达或miPEP171b1的施加增加了pri-MtmiR171b(A)、pre-MtmiR171b(B)和MtmiR171b(C)的积累。
图10.在经修饰以表达MtmiPEP171b1的烟草叶细胞中MtmiPEP171b1的定位。
照片显示了经修饰以表达单独的蛋白GFP(左边的图版)或与MtmiPEP171b1相融合的蛋白GFP(右边的图版)的烟草叶细胞。这些观察结果表明，MtmiPEP171b1定位于小核体中。
图11.在烟草的模式植物中证明的AtmiPEP165a(在拟南芥中鉴定出的)的表达对于AtmiR165a的表达的效应(A)，和AtmiPEP319a2(在拟南芥中鉴定出的)的表达对于AtmiR319a的效应(B)。
(A)纵坐标轴指明了在经修饰以表达AtmiR165a(左边的柱)或者表达AtmiR165a和AtmiPEP165a(右边的柱)的烟草植物中，AtmiR165a的相对表达。
(B)纵坐标轴指明了在经修饰以表达AtmiR319a(左边的柱)或者表达AtmiR319a和AtmiPEP319a(右边的柱)的烟草植物中，AtmiR319a的相对表达。
误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。
在这两种情况下均察看到，miORF的表达和因此miPEP的产生引起了pre-miR的积累增加。
图12.用AtmiPEP165a进行的处理对于拟南芥的根生长的效应。
照片显示了两株具有相同年龄的植物：对照植物(左边的植物)和用AtmiPEP165a进行处理的植物(右边的植物)。用AtmiPEP165a进行的处理在拟南芥中引起了非常加快的根生长的表型。绘制的图显示了响应于用剂量渐增的AtmiPEP165a进行处理而发生的pre-miR165的表达。
图13.在果蝇中鉴定出的miPEP8的序列的保守性。
从12个不同果蝇物种的miORF8的序列(SEQ ID NO：208)中推断出miPEP8的序列(SEQ ID NO：104)，并将它们进行比对。直方图显示了在所分析的12个物种中在miORF8的序列之间每个氨基酸的保守性。
图14.在所述果蝇物种中miPEP8的质量(kDa)和等电点(pI)的演变。
左边的纵坐标轴指明了miPEP8的大小(kD)。右边的纵坐标轴指明了miPEP的等电点。横坐标轴指明了miPEP的来源，即果蝇物种。察看到，尽管其大小有重大的改变(大于3倍)，但是在所研究的12个物种中miPEP的电荷保持是非常碱性的(＞9.8)。
图15.序列的添加对于miPEP的功能的效应。
对烟草叶进行转化以过表达miPEP171b。这些图显示，序列的添加(His、HA或GFP标签)不改变miPEP的功能。纵坐标轴指明了在经转化以表达MtmiR171b(左边的柱)、MtmiR171b和添加了或没有添加蛋白质标签的MtmiPEP171b1(右边的柱)的烟草植物中，pre-MtmiR171b的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝6)。察看到，MtmiPEP171b1的表达增加了MtmiR171b的表达，并且该效应不依赖于标签的存在。
图16.在截形苜蓿的根系中MtmiPEP171b1的表达。
对截形苜蓿的根进行转化以表达蛋白GUS(蓝色)与miR17b的启动子(A、E)、miPEP171b1的ATG(B、F)、整个miPEP171b1(c、G)或ATG2(在miPEP之后，位于前体上的第二个ATG)(D、H)之间的融合物。清楚地看见在根尖(A)以及侧根(E)中的miR的表达。转录融合物(B、F)和翻译融合物(c、G)在相同组织中显示出miPEP171b的表达，而随后的ATG不是有活性的(D、H)。
图17.在黑腹果蝇细胞中DmmiPEP8的表达。
对黑腹果蝇细胞进行转染以过表达DmmiPEP8(OE miPEP8)或者其翻译起始密码子经突变的miPEP8(OE miPEP8mut)。纵坐标轴指明了Pre-miR8的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(独立实验次数＝6)。察看到，DmmiPEP8的表达增加了DmmiR8的表达，并且该效应与mRNA的翻译相关联。
图18.在黑腹果蝇细胞中DmmiPEP8对于DmmiR8的积累的影响。
对黑腹果蝇细胞进行转染以过表达野生型DmmiR8(OE miR8)或者其中翻译起始密码子经突变的DmmiR8(OE miR8miPEP8mut)。纵坐标轴指明了Pre-miR8的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(独立实验次数＝2)。察看到，DmmiPEP8的存在增加了DmmiR8的表达。
图19.在智人细胞中HsmiPEP155对于HsmiR155的积累的影响。
对智人的HeLa细胞进行转染以过表达HsmiPEP155(OE miPEP155)。纵坐标轴指明了Pre-miR155的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(独立实验次数＝2)。察看到，HsmiPEP155的表达增加了HsmiR155的表达。
图20.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1的翻译对于MtmiR171b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在经转化以表达pri-miR171b(左边的柱)、其中miORF171b被删除的pri-miR171b(中间的柱)或其中密码子ATG被ATT代替的突变型pri-miR171b(右边的柱)的烟草植物中，MtmiR171b的相对表达。因此，突变型pri-miR171b不能够产生miPEP171b1。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。察看到，miPEP171b1的翻译的不存在引起了miR171b的积累强烈减少。
图21.在模式植物本氏烟草中证明的MtmiPEP171b1的过表达对于MtmiR171b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在用下列载体进行转化的烟草植物中MtmiR171b的相对表达：允许miPEP171b表达的载体，和要么第二空载体(白色柱)，要么允许MtmiPEP171b表达的载体(左边的黑色柱)，要么其中编码MtmiPEP171b的ORF的密码子ATG被ATT代替的载体(中间的黑色柱)，要么其中ORF的核苷酸序列经突变但不改变所翻译的肽的氨基酸序列的载体(由简并ORF所编码的miPEP)(右边的黑色柱)。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝30)。察看到，MtmiPEP171b1的表达增加了MtmiR171b的表达，并且该效应依赖于MtmiORF171b被翻译成MtmiPEP171b1。
图22.AtmiPEP165a对于AtmiR165a以及其靶基因(PHAVOLUTA：PHV、PHABOLUSA：PHB和REVOLUTA：REV)的积累的效应。
纵坐标轴指明了在用水(对照)或不同浓度的AtmiPEP165a(0.01μM、0.1μM、1μM或10μM)进行处理的拟南芥根中AtmiR165a、PHV、PHB和REV的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
用浓度越来越高的AtmiPEP165a处理植物证明了随AtmiPEP165a的量而变化的AtmiR165a的积累以及其靶基因的负调控的剂量依赖性效应。
图23.在拟南芥中用AtmiPEP164a进行的处理对于AtmiR164a的表达的效应。
照片显示了在用水(对照，左边的照片)或用0.1μM的溶解在水中的具有与AtmiPEP164a的序列相同的序列的合成肽(0.1μM miPEP164a)进行处理的根中，AtmiR164a的积累的Northern印迹分析的结果。使用U6 RNA作为上样对照，其使得能够定量AtmiR164a的量。
该实验独立地重复4次，并且导致相似的结果。
用0.1μM的miPEP164a处理拟南芥的芽引起了miR164a的积累增加。
图24.用AtmiPEP164a进行的处理对于拟南芥的生长的效应。
照片显示了在生长3周之后的两株植物(顶视图和侧视图)：用水进行浇灌的对照植物(A)，和用0.1μM的相应于AtmiPEP164a的合成肽的组合物进行浇灌的植物(B)。用AtmiPEP164a对拟南芥植物进行浇灌显著地增加了植物的生长。
图25.在拟南芥中用AtmiPEP165a进行的处理对于AtmiR165a的表达的效应。
照片显示了在用水(对照，左边的照片)或用0.1μM的溶解在水中的具有与AtmiPEP165a的序列相同的序列的合成肽(0.1μM miPEP165a)进行处理的根中，AtmiR165a的积累的Northern印迹分析的结果。使用U6 RNA作为上样对照，其使得能够定量AtmiR165a的量。
该实验独立地重复4次，并且导致相似的结果。
用0.1μM的miPEP165a处理拟南芥的芽引起了miR165a的积累增加。
图26.在拟南芥中AtmiPEP319a1的过表达对于AtmiR319a的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在其中过表达了AtmiPEP319a1的植物中(右边的柱)，AtmiR319a的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。AtmiPEP319a1的过表达诱导了AtmiR319a的积累增加。
图27.用AtmiPEP319a进行的处理对于拟南芥的生长的效应。
照片显示了在生长3周之后的两株植物(顶视图和侧视图)：用水进行浇灌的对照植物(A)，和用0.1μM的相应于AtmiPEP319a1的合成肽的组合物进行浇灌的植物(B)。用AtmiPEP319a1对拟南芥植物进行浇灌显著地增加了植物的生长。
图28.免疫定位
对截形苜蓿的根进行转化以表达蛋白GUS(蓝色)与miPEP171b的ATG(PromiR171b-ATG1：GUS)或ATG2(在miPEP之后，位于前体上的第二个ATG)(PromiR171b-ATG2：GUS)之间的融合物。还用抗-miPEP171b抗体(miPEP171b)来进行标记。在截形苜蓿的根中miPEP171b的免疫定位揭示了在侧根的起始位点中miPEP171b的存在，这显示了微小RNA和相应的miPEP之间的共定位。
图29.在拟南芥中AtmiPEP160b1的过表达对于AtmiR160b的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在其中过表达了AtmiPEP160b1的植物中(右边的柱)，AtmiR160b的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
AtmiPEP160b1的过表达引起了AtmiR160b的相对表达增加。
图30.AtmiPEP164a1对于AtmiR164a的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在通过用0.1μM的AtmiPEP164a1每天浇灌1次来进行处理的植物中(右边的柱)，AtmiR164a的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
AtmiPEP164a1的添加引起了AtmiR164a的相对表达增加。
图31.在拟南芥中AtmiPEP319a1的过表达对于AtmiR319a的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在其中过表达了AtmiPEP319a1的植物中(右边的柱)，AtmiR319a的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
AtmiPEP319a1的过表达引起了AtmiR319a的相对表达增加。
图32.在截形苜蓿中MtmiPEP169d对于MtmiR169d的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在通过用0.1μM的MtmiPEP169d每天浇灌1次来进行处理的植物中(右边的柱)，MtmiR169d的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
MtmiPEP169d的添加引起了MtmiR169d的相对表达增加。
图33.在截形苜蓿中MtmiPEP171e的过表达对于MtmiR171e的表达的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(左边的柱)或者在其中过表达了MtmiPEP171e的植物中(右边的柱)，MtmiR171e的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
MtmiPEP171e的过表达引起了MtmiR171e的相对表达增加。
图34.在野生型截形苜蓿植物中MtmiPEP171b1的定位。
通过用特异于MtmiPEP171b1的抗体来进行的免疫印迹，分析了不同量的合成肽MtmiPEP171b1(1、0.5或0.1nmo1)以及截形苜蓿的根的总提取物。
MtmiPEP171b1天然地产生于截形苜蓿的根中。
图35.在野生型拟南芥植物中AtmiPEP165a的存在。
上面的照片相应于在野生型拟南芥Col-0的幼小植物中(左)和在过表达AtmiPEP165a的拟南芥的幼小植物中(右)，AtmiPEP165a的量的Western印迹分析。
下面的照片相应于在野生型拟南芥Col-0的幼小植物中(左)和在过表达AtmiPEP165a的拟南芥的幼小植物中(右)，对照蛋白即微管蛋白的量的Western印迹分析。
AtmiPEP165a天然地产生于拟南芥中，并且以更大的量存在于过表达AtmiPEP165a的植物中。
图36.在拟南芥中AtmiPEP165a的作用模式。
(A)纵坐标轴指明了在对照根中(左边的柱)或者在通过用10μM的AtmiPEP165a每天浇灌1次来进行处理的根中(右边的柱)，pri-miR165a的相对表达。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝10)。
AtmiPEP165a的添加引起了AtmiR165a的相对表达增加。
(B)纵坐标轴指明了在对照根中(灰色曲线)或者在通过用10μM的AtmiPEP165a每天浇灌1次来进行处理的根中(黑色曲线)，在蛹虫草菌素(RNA合成的抑制剂)存在下，pri-miR165a的相对表达。横坐标轴指明了蛹虫草菌素处理的持续时间。
AtmiPEP165a的添加没有引起更好的pri-miR165a的稳定性。
(C)纵坐标轴指明了在野生型植物(Col-0)中或者在具有RNA聚合酶II的第二个大亚基的弱等位基因的突变型植物(nrpb2-3)中，pri-miR165a的相对表达。横坐标轴指明了所述植物是用水还是用10μM的AtmiPEP165a进行了浇灌。
与野生型植物相反，突变型植物不能够响应于AtmiPEP165a而积累AtmiR165a。
图37.在截形苜蓿中pri-miR171b对于侧根数目的效应。
纵坐标轴指明了在对照植物中(白色柱)或者在其中过表达了pri-miR171b的植物中(黑色柱)观察到的侧根的平均数目。误差条相应于平均值的标准误差(个体数目＝100)。
pri-miR171b的过表达引起了侧根数目减少。
图38.在黑腹果蝇细胞中DmmiPEP8的可翻译性。
对黑腹果蝇细胞进行转染以过表达DmmiPEP8(miPEP8：：GFP)或DmmiPEP8 mt(其翻译起始密码子已被突变(miPEP8 mt：：GFP))。作为转染对照，将产生“膜突蛋白-RFP”这种蛋白质的质粒(下面的图像)与编码DmmiPEP8(左边的图像)和DmmiPEP8 mt(右边的图像)的质粒一起进行共转染。察看到，存在于DmmiPEP8序列中的起始密码子是功能性的，因为它们允许GFP的合成(左上的图像)，而在ATG上经突变的构建体几乎不再产生GFP(右上的图像)。
因此，这些结果暗示，miPEP的ORF是功能性的。
实施例
A：在植物中的miPEP的分析
实施例1-在模式植物截形苜蓿中的表征
实施例1A-MtmiPEP171b1
a)MtmiPEP171b1(在截形苜蓿中鉴定出的miPEP171b1)的鉴定和表征
在根的分生组织区域中表达微小RNA MtmiR171b。该微小RNA的过表达尤其导致基因HAM1(登录号MtGI9-TC114268)和HAM2(登录号MtGI9-TC120850)的表达减少(图1A)，以及导致侧根数目减少(图1B)。pri-miR171b的过表达也引起侧根数目减少(图37)。
通过使用RACE-PCR技术测定了MtmiR171b的初级转录物的序列。所述初级转录物的序列的分析使得能够鉴定出数个完全出人意料的小的开放阅读框(ORF)的存在。将这些ORF命名为miORF(microRNA ORF)。这些miORF潜在地编码具有大约4至100个氨基酸的短肽。在数据库中未发现任何涉及这些miORF的显著的同源性。
第一个miORF(其被命名为MtmiORF171b)的过表达导致MtmiR171b的积累增加和基因HAM1和HAM2的表达减少(参见图2A)，以及导致侧根数目减少(图2B)，如已经在过表达MtmiR171b时所观察到的那样。
为了测定MtmiORF171b是否导致真正产生肽和上面所观察到的调控功能是否确实由所述肽所携带，在截形苜蓿的根上施加其序列与潜在地由MtmiORF171b所编码的序列相同的合成肽。该肽的施加引起了在上面在过表达MtmiORF171b时已经观察到的表型，即它引起MtmiR171b的积累增加和基因HAM1和HAM2的表达减少(参见图3A)，以及引起侧根数目减少(图3B)。
这些实验的结果证明了，MtmiORF171b编码能够调节MtmiR171b的积累以及MtmiR171b的靶基因(HAM1和HAM2)的表达的肽。将所述肽命名为MtmiPEP171b1(“miPEP”相应于microRNA encoded PEPtide)。
此外，MtPEP17161引起MtmiR171b(图4A)和pre-MtmiR171b(图4B)的积累增加。
b)miPEP171b1的特异性
测定了截形苜蓿的不同微小RNA前体(MtmiR171b SEQ ID NO：319，MtmiR169 SEQID NO：367，MtmiR169a SEQ ID NO：368，MtmiR171a SEQ ID NO：369，MtmiR171h SEQ IDNO：370，MtmiR393a SEQ ID NO：371，MtmiR393b SEQ ID NO：372，MtmiR396a SEQ ID NO：373，和MtmiR396b SEQ ID NO：374)的表达，并且在对照植物与其中过表达了编码MtmiPEP171b1的MtmiORF171b的植物之间进行了比较(图5A)，或在对照植物与在包含MtmiPEP171b1的培养基上进行培养的植物之间进行了比较(图5B)。
所获得的结果表明，MtmiPEP171b1仅引起MtmiR171b的积累增加，而不引起其他miR的积累增加，这表明miPEP仅对于其所源自的微小RNA具有效应。
c)miPEP171b1的定位
此外，在截形苜蓿的根中miPEP171b1的免疫定位揭示了在侧根的起始位点中miPEP171b1的存在，这显示了微小RNA和相应的miPEP之间的共定位(图28和34)。
实施例1B-MtmiPEP169d
关于MtmiPEP169d，在截形苜蓿中在体内证明了，MtmiPEP169d的添加引起MtmiR169d的积累(图32)。
实施例1C-MtmiPEP171e
关于MtmiPEP171e，在截形苜蓿中在体内证明了，该miPEP的过表达引起MtmiR171e的积累(图33)。
实施例2-在烟草模式植物中的表征
a)在烟草中机制的保守性
为了测定微小RNA的调控机制在其他植物物种中是否是保守的，在不同的细胞模型中测试了MtmiPEP171b1对MtmiR171b的调控。为此，将MtmiR171b和MtmiPEP171b1引入到烟草叶中。
在经转化以从能够产生MtmiPEP171b1的野生型pri-miR开始或者从不能产生MtmiPEP171b1的突变形式的pri-miR(其中MtmiORF171b的起始密码子ATG被ATT代替)开始表达MtmiR171b的烟草叶中，测量了MtmiR171b的积累(图6和图20)。MtmiPEP171b1的翻译的不存在导致MtmiR171b的积累强烈减少。
在经转化以表达单独的截形苜蓿的MtmiR171b(对照)，或者另外还表达截形苜蓿的野生型MtmiORF171b(35SmiPEP171b1ATG)或其中起始密码子ATG被ATT代替的MtmiORF171b的突变形式(35SmiPEP171b1 ATT)的烟草叶中，测量了pre-MtmiR171b的积累(图7和图21)。MtmiORF171b的表达引起pre-miR171b的积累增加，并且pre-miR171b的该积累依赖于MtmiORF171b被翻译成微肽。
同样地，在通过用MtmiPEP171b1(0.1μM)进行喷洒(在取样前12小时第一次，然后在取样前30分钟第二次)来进行处理或未处理的、经转化以表达截形苜蓿的MtmiR171b的烟草叶中，观察到MtmiPEP171b1可以直接以肽的形式通过叶喷洒来进行使用(图8)。
此外，在烟草中观察到(如在截形苜蓿中那样)，MtmiPEP171b1引起了MtmiR171b(图9A)和pre-MtmiR171b(图9B)的积累增加，但减少了pri-MtmiR171b的积累(图9C)。
所有这些结果表明，微小RNA和其靶基因在miPEP控制之下的调控机制在物种之间是保守的。
b)MtmiPEP171b1的细胞内定位
对烟草叶进行转化以过表达与荧光蛋白(GFP)相融合的截形苜蓿的MtmiPEP171b1(图10)。所获得的结果表明，miPEP定位于小核体中。
c)从数据库开始来鉴定miPEP
从植物的基因组数据库开始，搜寻了在70种miR的初级转录物内开放阅读框的存在，我们鉴定出了101种能够编码miPEP的miORF。
目前，已经表征了在拟南芥中鉴定出的AtmiPEP165a和AtmiPEP319a2。在烟草模式植物中进行的实验使得能够证明，AtmiORF165a或AtmiORF319a的过表达分别引起AtmiR165a或AtmiR319a的积累增加(图11)。
miR165a调控转录因子例如Revoluta、Phavoluta和Phabulosa。miR319调控TCP家族的基因。
实施例3-在模式植物拟南芥中的表征
实施例3A-AtmiPEP165a
关于AtmiPEP165a，在拟南芥中在体内证明了，用AtmiPEP165a进行的处理引起非常加快的根生长的表型(图12)。
此外，用浓度越来越高的miPEP165a处理植物表明了随miPEP165A的量而变化的miR165a的积累以及其靶基因(PHAVOLUTA：PHV、PHABOLUSA：PHB和REVOLUTA：REV)的负调控的剂量依赖性效应(参见图22)。
实施例3B-AtmiPEP164a
关于AtmiPEP164a，合成了它并将其用于探究在用该合成肽进行处理的拟南芥根中miR164a的积累的增加。
Northen印迹分析表明，用肽miPEP164a处理植物引起miR164a的积累增加(图23)。
通过qRT-PCR获得了相同类型的结果(图30)。
还在拟南芥中在体内证明了，用AtmiPEP164a处理植物显著地增加植物的生长(图24)。
实施例3C-AtmiPEP165a
关于AtmiPEP165a，合成了它并将其用于探究在用该合成肽进行处理的拟南芥根中miR165a的积累的增加。
Northen印迹分析表明，用肽miPEP165a处理植物引起miR165a的积累增加(图25)。
此外，为了测定miPEP对于其专有的miR的积累的作用模式，在野生型植物中和在经转化以过表达miPEP165a的植物中分析了pri-miR165a的表达(图35)。
pri-miR165a的表达在过表达miPEP165a的植物中得到促进(图36A)。
在蛹虫草菌素(RNA合成的抑制剂)存在下，pri-miR165a的量在野生型植物中与在经转化的植物中是相同的(图36B)，这表明miPEP165a不是作为RNA的稳定剂起作用，而是作为pri-miR165a的转录激活物起作用。
此外，在野生型植物(Col-0植物)中和在携带RNA聚合酶II的第二个大亚基的弱等位基因的突变型植物(nrpb2-3植物)中分析了pri-miR165a的表达。所获得的结果表明，与野生型植物相反，突变型植物没有呈现出响应于miPEP165a而发生的pri-miR165的积累的增加。这看起来表明，miPEP作为转录调节子起作用。
实施例3D-AtmiPEP319a1
关于AtmiPEP319a1，也合成了它并将其用于探究在用该合成肽进行处理的拟南芥根中miR319a的积累的增加。
qRT-PCR分析表明，AtmiPEP319a1的过表达引起miR319a的积累增加(图26和31)。
还在拟南芥中在体内证明了，用AtmiPEP319a1处理植物显著地增加植物的生长(图27)。
实施例3E-AtmiPEP160b1
关于AtmiPEP160b1，在拟南芥中在体内证明了，该miPEP的过表达引起AtmiR160b的积累(图29)。
材料和方法
生物材料
对截形苜蓿的籽的表面进行消毒，并且使所述籽在琼脂平板上在黑暗中于4℃萌发5天。然后，将幼芽在填充有没有氮且包含7.5μM磷酸盐的Fahraeus培养基(Lauresergues等人，Plant J.，72(3)：512-22，2012)的12cm的方形平板上进行培养。每天对侧根进行计数。在罐中，每两天一次用包含很少磷的改性Long Ashton培养基对植物进行浇灌(Balzergue等人，Journal of experimental botany，(62)1049-1060，2011)。
所述肽由Eurogentec或Smartox-Biotech来合成。使MtmiPEP171b1悬浮在40％水/50％乙腈/10％乙酸(v/v/v)的溶液中，和将其他肽悬浮在水中。
通过使用不同浓度(0.01、0.1、1μM)的肽溶液来实施经由用所述肽进行喷洒来进行的叶浇灌，其中在取样前12小时第一次，然后在取样前30分钟第二次。
微小RNA的反转录
按照制造商的说明书(除了用3个体积的乙醇来进行RNA的沉淀之外)，通过使用试剂Tri-Reagent(MRC)，提取了RNA。通过与六聚体相组合地使用特异性的茎-环引物RTprimer171b来进行RNA的反转录，以便实施高分子量RNA的反转录。
简而言之，将1μg的RNA添加至在25μl的最终反应混合物中的MIR171b茎-环引物(0.2μM)、六聚体(500ng)、RT缓冲液(1x)、SuperScript逆转录酶(SSIII)(一个单位)、dNTPs(每种0.2mM)、DTT(0.8mM)。为了实施反转录，进行了脉冲式反转录反应(下列循环的40次重复：16℃2分钟、42℃1分钟和50℃1秒，接着为在85℃下最终使反转录失活5分钟)。
定量RT-PCR(aRT-PCR)分析
通过使用提取试剂盒RNeasy Plant Mini Kit(Qiagen)，提取了截形苜蓿根或烟草叶的总RNA。通过使用逆转录酶SuperScript II(Invitrogen)从500ng总RNA开始来进行反转录。进行了三次重复(n＝3)，其中每次具有两次技术重复。每个实验重复二至三次。按照在Lauressergues等人(Plant J.，72(3)：512-22，2012)中所描述的方法，通过使用循环变温仪LightCyc1er 480 System(Roche Diagnostics)来进行经由qPCR的扩增。
统计学分析
通过使用Student检验或Kruskal-Wallis检验，分析了基因的相对表达或侧根的产生的平均值。误差条表示平均值的标准误差(SEM，Standard Error of the Mean)。星号指明了显著差异(p＜0.05)。
质粒构建
用Pfu聚合酶(Promega)扩增目的DNA片段。按照在Combier等人(Genes&Dev，22：1549-1559，2008)中所描述的方法，将所述DNA片段借助于酶XhoI和NotI而克隆在质粒pPEX-DsRED中以用于在组成型强启动子35S的控制之下进行过表达，和借助于酶KpnI-NcoI而克隆在质粒pPEX GUS中以用于报道基因。
对于miPEP 165a和miPEP 319a，按照在Combier等人(Genes&Dev，22：1549-1559，2008)中所描述的方法，将相应的miORF克隆在pBIN19中。
植物的转化
通过在Boisson-Dernier等人(Mol Plant-Microbe Interact，18：1269-1276，2005)中所描述的方法来获得具有用发根土壤杆菌(AgrobacteriμMRhizogenes)进行转化的根的混合式植物。通过用荧光双筒放大镜对DsRED进行观察来验证和选择经转化的根。对照根相应于用不包含载体pPEX-DsRED的发根土壤杆菌进行转化的根。烟草叶的转化按照在Combier等人(Genes&Dev，22：1549-1559，2008)中所描述的方法来进行。
Northern印迹
Northern印迹分析按照在Lauressergues等人，Plant J，72(3)：512-22，2012中所描述的实验方案来进行。
将生物学样品在包含0.1M NaCl、2％SDS、50mM Tris-HCl(pH 9)、10mMEDTA(PH 8)和20mM巯基乙醇的缓冲液中进行匀浆，并且用酚/氯仿混合物提取RNA2次并用乙醇使其沉淀。
将RNA加载在15％PAGE凝胶上，并转移到尼龙膜(HybondNX，Amersham)上。使RNA与在其末端经放射性标记的寡核苷酸探针进行杂交，以检测U6 RNA或miR164a。
杂交在55℃下进行。杂交信号通过使用感光成像仪(Fuji)来进行定量，并且用U6RNA的特异性探针的信号来进行标准化。
RNA的稳定性
对于每种条件，将2周龄的且垂直培养在固体MS培养基上的植物转移到包含1ml液体MS培养基的6-孔平板中。在与1mM miPEP一起温育16小时后，用100μg/ml的蛹虫草菌素或用水(用作对照)处理植物，并且在不同的时刻收获植物以提取和定量RNA。每个实验进行3次。
组织化学标记
用GUS进行的标记按照在Combier等人(Genes&Dev，22：1549-1559，2008)中所描述的方法来进行。样品用显微镜(axiozoom)来进行观察。
免疫定位
将苜蓿组织的根或胚芽在具有50mM的磷酸盐缓冲液(pH 7.2)的4％福尔马林(v/v)中固定2小时，然后包埋在处于水中的5％LMP琼脂糖(具有低熔点)之中。获得薄切片(100μm)并将其置于在包覆有特氟龙的载玻片上的Pbi(用于免疫学的磷酸盐缓冲液(phosphatebuffer for immunology))之中，在Pbi、2％Tween和1％牛血清白蛋白(PbiT-BSA)中封闭2小时，然后在4℃下用在BSA-PbiT中进行稀释的一抗标记过夜(12小时)。将切片用PBiT进行洗涤，并且在环境温度下与在PbiT-BSA中进行稀释的二抗一起温育2小时。然后，将载玻片在Pbi中洗涤30分钟，并安置在Citifluor(封固剂)中。一抗和稀释度为下列：1716a(1∶500，v/v)。二抗为与荧光探针Alexa Fluor 633相偶联的山羊抗兔IgG抗体(MolecularProbes)，并且以1∶1000(v/v)的稀释度进行使用。
Western印迹
按照在Combier等人(Genes&Dev，22：1549-1559，2008)中所描述的方法来获得总蛋白质提取物，并且通过SDS-PAGE来将其分开。转移在4℃下于15V在磷酸盐缓冲液中进行一夜，然后将膜在环境温度下在0.2％(v/v)的戊二醛溶液中温育45分钟。一抗以1∶1000(v/v)的稀释度进行使用，和与HRP相缀合的山羊抗兔IgG抗体作为二抗以1∶40000(v/v)的稀释度进行使用。
表8.引物的列表
Figure BDA0003137590750000861
Figure BDA0003137590750000871
Figure BDA0003137590750000881
B：在动物中的miPEP的分析
实施例4-在果蝇中候选miPEP的鉴定
a)候选miPEP的鉴定
在模式动物黑腹果蝇中通过RACE-PCR来进行的第一项研究显示了在胚胎发生过程中表达的miR(miR1和miR8)的存在。
如在植物中那样，在两种所研究的miR中的每一种之中鉴定出了miORF。例如，miR8(其由于其在昆虫生长的调控中的作用而为人所知)具有潜在地编码miPEP8的miORF。关于DmmiR1(在黑腹果蝇中鉴定出的)，其具有潜在地编码DmmiPEP1a和DmmiPEP1b的两个DmmiORF。
系统发生分析在所分析的十二个果蝇物种之中显示了miORF的存在的进化保守性，即自从它们趋异起已有超过6千万年(图13)。
此外，在果蝇中鉴定出的miPEP还具有几个与植物的miPEP的相似性。如果它们的一级序列和因此它们的大小在物种之间快速演变，那么发现了减小的大小(从32至104aa)，以及关于碱性总电荷的强烈的保守性(9.5至12的pHi)(图14)。
因此，所有这些结果在广谱的真核生物物种之中表明了由微小RNA的初级转录物所编码的调控性miPEP的存在。所发现的这些肽代表了尚未探索的天然分子储库，所述天然分子能够在植物中以及在动物中调控各种各样的基础生物学功能。
b)miPEP的表达
对黑腹果蝇细胞进行转染以过表达DmmiPEP8(从序列SEQ ID NO：494开始)或者其翻译起始密码子经突变的DmmiPEP8 mt(从序列SEQ ID NO：495开始)。作为转染对照，将产生“膜突蛋白-RFP”这种蛋白质的质粒与编码DmmiPEP8和DmmiPEP 8mt的质粒一起进行共转染。察看到，存在于DmmiPEP8序列中的起始密码子是功能性的，因为它们允许融合蛋白miPEP：：GFP(其通过GFP而可视化)的合成，而在ATG上经突变的构建体几乎不再产生GFP。
因此，这些结果暗示，miPEP的ORF是功能性的(图38)。
材料和方法
黑腹果蝇细胞
在T75瓶中，在12mL的包含1％的100U/mL青霉素和100mg/mL链霉抗生物素蛋白(Sigma)和10％的经去补体的胎牛血清的Schneider培养基(GIBCO)中培养S2细胞(在56℃下30分钟)。
借助于转染试剂盒
Figure BDA0003137590750000891
HD(Roche)，按照其建议来进行瞬时转染。常规地，将150万个预先接种在6-孔平板中(3ml培养基/孔)的S2细胞用250ng的总质粒DNA进行转染。使DNA与处于100μl OPTIMEM(GIBCO)中的Fugene(3μ1)相接触。在20分钟后，使所形成的转染试剂与在培养基中的细胞相接触。在转染后66小时，提取细胞的RNA。
编码DmmiPEP8和突变型DmmiPEP8的片段的克隆
通过PCR来扩增相应于DmmiPEP8的序列(SEQ ID NO：494)和在起始密码子上经突变的DmmiPEP8的序列(SEQ ID NO：495)的DNA片段，以用于与GFP相配合地克隆到pUAS质粒中。将昆虫细胞S2用具有下列组分的混合物来进行共转染：编码DmmiPEP8：：GFP或其突变形式DmmiPEP8 mt：：GFP的质粒；允许它们通过在肌动蛋白启动子的控制之下产生的转录因子GAL4来进行过表达的pACT-GAL4；和编码用作转染对照的“膜突蛋白-RFP”这种蛋白质(其也置于肌动蛋白启动子的控制之下)的表达载体(比例1/1/1，总共300ng)。在转染后48小时，通过向培养基中添加甲醛至最终4％(W/V)来将细胞固定10分钟。然后，将细胞用1X PBS漂洗2次，并安置在载玻片上以便在显微镜(Leica SPE)下进行观察。
表9.克隆出的序列
Figure BDA0003137590750000901
C：在人中的miPEP的表征
实施例5-HsmiPEP155的表征
借助于特异性引物通过PCR来合成或扩增目的DNA片段(HsmiPEP155和突变型miPEP)，然后借助于酶XhoI和NotI将其克隆到允许其通过转录因子GAL4进行过表达的pUAS质粒中，所述转录因子GAL4的表达由组成型强启动子来控制。
不同的构建体要么通过在HeLa细胞的基因组DNA上进行PCR扩增，要么通过在人细胞L428的总RNA上进行RT-PCR来制备。将扩增出的PCR片段用限制酶HindIII/EcoRI进行消化，然后克隆到载体pcDNA3.1中。将大肠杆菌DH5α菌株进行电穿孔，然后在固体培养基(2YT+琼脂+氨苄青霉素)上进行培养。然后，制备不同克隆的质粒DNA，并进行测序以用于验证。然后，借助于QIAfilter Plasmid Midi试剂盒(QIAGEN)来制备构建体，并保存于-20℃。
将HeLa细胞(经建立的肿瘤细胞系，ATCC CCL-2.2)在6-孔平板中在完全培养基[DMEM(1x)+Glutamax+4.5g/L葡萄糖(无丙酮酸)+1x青霉素/链霉素+1mM丙酮酸钠+10％牛血清]中进行培养，并且放置在具有37℃和5％CO2的培养箱中。
当细胞处于50％的汇合时，转染细胞。在实验开始时，用没有抗生素的完全培养基替代包含抗生素的完全培养基。
对于每个孔，制备混合物A[250μl Optimem(+Glutamax)(Gibco)+2μg DNA]和混合物B[250μl Optimem+4 μl Lipofectamine 2000(Invitrogen)]，让其在环境温度下静置5分钟。然后，将混合物B逐滴混合到混合物A中，并让其在环境温度下温育25分钟。然后，将该混合物逐滴置放于孔中。在4-5小时后，将培养基进行更换并用具有抗生素的完全培养基来替代。在转染后48小时，使细胞停止。将培养基抽吸出来并除去，用1x PBS漂洗细胞。然后，可能的是将细胞贮存于-20℃或者直接提取总RNA。
对于每个孔，通过在细胞上置放1ml Tri-Reagent(Euromedex)来提取RNA。抽吸和推出Tri-reagent数次以便正确地裂解细胞，然后将其转移到1.5ml的管中。添加0.2ml水饱和氯仿。通过涡旋振荡进行混合，然后让其在环境温度下静置2至3分钟。在4℃下以15300rpm离心5分钟。在环境温度下温育10分钟并且在4℃下以15300rpm离心15分钟后，用0.5ml异丙醇来沉淀水相。去除上清液，并且将粒状沉淀用1ml的70％乙醇来进行漂洗并在4℃下以15300rpm离心5分钟。再次去除上清液，并且将粒状沉淀在空气中干燥几分钟。
为了最好地去除潜在地残留的基因组DNA，用DNA酶处理RNA。为此，将粒状沉淀重悬浮在170μl的超纯水、20μl的10x DNA酶缓冲液和10μl的RQ1无RNA酶的DNA酶中，并且在37℃下放置30分钟。然后，在37℃下在20分钟期间添加20μl的10％SDS和5μl的蛋白酶K(20mg/ml)。
用225μl的“酚/H2O/氯仿”混合物进行最后的酚提取，并且在4℃下以15300rpm离心5分钟。
然后，在-80℃下用20μl的3M乙酸钠和600μl的100％乙醇来使水相沉淀20分钟。然后，在4℃下以15300rpm离心15分钟。去除上清液。在1m1的70％乙醇中漂洗粒状沉淀，在4℃下以15300rpm离心5分钟，再次去除上清液，并且让粒状沉淀在空气中干燥几分钟。
然后，将粒状沉淀接纳在15-20μl超纯水中，并且测定RNA的含量。
然后，将10-15μg总RNA在15％丙烯酰胺凝胶[40％丙烯酰胺/双丙烯酰胺的溶液，比例19∶1]上(在1x TBE中的7M尿素)通过Northern印迹来进行分析。在预热凝胶后，在作为迁移缓冲液的1x TBE中于400V进行迁移。然后，在转移槽中，在1V和4℃下在2小时期间将RNA电转移到0.45μm的Biodyne Plus尼龙膜上。在转移结束时，以0.124J/cm2在UV下对膜进行照射。然后，在杂交烘箱中，将膜在5x SSPE、1x Denhardt’s、1％SDS和150μg/ml酵母tRNA的缓冲液中于50℃预杂交1小时。然后，添加在5’处用γ-32p-ATP进行标记的核苷酸探针(0.5至1×106cpm/ml杂交缓冲液)，并且在50℃下杂交过夜。然后，将膜在环境温度下在0.1x SSPE/0.1％SDS中洗涤2次，并且暴露在包含BioMax HE屏(Kodak)和BioMax MS胶片(Kodak)的放射自显影盒中，以便在-80℃下检测微小RNA 24-48小时。
本说明书还包括下列内容：
1.用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
2.根据实施方式1的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加，特别是增加。
3.根据实施方式1或2的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述肽在所述细胞中的存在是由于：
-将编码所述肽的核酸引入到所述细胞中，或
-将所述肽引入到所述细胞中。
4.根据前述实施方式之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中步骤a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中。
5.根据前述实施方式之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中或存在于野生型动物细胞中，并且其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞为植物细胞，优选地十字花科植物、豆科植物或茄科植物的细胞，或者为动物细胞，优选地人细胞或果蝇细胞。
6.根据前述实施方式之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
7.根据前述实施方式之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是外源来源的，所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
8.根据前述实施方式之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR、Northern印迹、DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
9.由通过实施根据实施方式1至8之一的方法而获得的核苷酸序列所编码的miPEP。
10.具有3至100个氨基酸，优选地4至40个氨基酸的miPEP，其由在包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列之中所包含的具有12至303个核苷酸的开放阅读框所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，所述核苷酸序列被包含在微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中，
其中在观察到在miPEP存在和不存在下的细胞之间微小RNA的数量的变化后，证明了所述miPEP对于所述微小RNA的所述调节。
11.根据实施方式9或10的miPEP，所述miPEP选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
12.编码根据实施方式9至11之一所定义的miPEP的核酸分子，所述核酸分子尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425。
13.至少一种：
-根据实施方式9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节基因表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述基因的表达由所述微小RNA来进行调控，所述miPEP尤其选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424，
特别地，SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：63和SEQ ID NO：424，
所述核酸尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425，
特别地，SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：180、SEQ IDNO：181、SEQ ID NO：118、SEQ ID NO：425和SEQ ID NO：167，
所述微小RNA尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：282至SEQ ID NO：354和SEQ ID NO：358，
-SEQ ID NO：412至SEQ ID NO：423，或
-SEQ ID NO：427，
特别地，SEQ ID NO：319、SEQ ID NO：297、SEQ ID NO：305、SEQ ID NO：331、SEQ IDNO：291、SEQ ID NO：322和SEQ ID NO：427。
14.组合物，其包含至少一种：
-根据实施方式9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
所述组合物用于其作为人的或兽医学的药物的应用。
15.用于在植物或动物真核细胞，特别是人细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有3至100个氨基酸，优选地4至20个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节，
所述方法不用于人或动物身体的手术或治疗性处理，也不用于改变人类的遗传同一性。
16.包含至少一种：
-根据实施方式9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为植物药学试剂以便用于下述目的的用途，
-用于促进植物的生长和/或发育，尤其是用于调节植物的生理学参数，特别是生物量、叶表面积、开花、果实大小、植物种子的产生和/或选择，特别地用于控制植物的单性结实或雌雄同株，或用于改变植物种子的生理学参数，特别是萌发、根系建立和对于水分胁迫的抗性，或者
-用于预防或治疗植物疾病，特别地用于促进对于感染性疾病的抗性。
17.包含至少一种：
-根据实施方式9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为除草剂以便用于消除植物或减慢其生长的用途。
18.包含至少一种：
-根据实施方式9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为杀有害生物剂以便用于消除植物的有害生物或能够被归类为此类的生物的用途，
尤其是作为杀昆虫剂、杀蜘蛛剂、杀软体动物剂或杀啮齿动物剂，
特别地通过将所述组合物施加在植物上或施加在与所述植物相接触的支持物上。
本说明书还包括下列内容：
1.用于检测和鉴定由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽(miPEP)的方法，所述方法包括：
a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12至303个核苷酸的开放阅读框的步骤，然后
b)在下列之间进行比较的步骤：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在。
2.根据项目1的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加，特别是增加。
3.根据项目1或2的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述肽在所述细胞中的存在是由于：
-将编码所述肽的核酸引入到所述细胞中，或
-将所述肽引入到所述细胞中。
4.根据前述项目之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中步骤a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中。
5.根据前述项目之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中或存在于野生型动物细胞中，并且其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞为植物细胞，优选地十字花科植物、豆科植物或茄科植物的细胞，或者为动物细胞，优选地人细胞或果蝇细胞。
6.根据前述项目之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
7.根据前述项目之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中在步骤b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是外源来源的，所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
8.根据前述项目之一的用于检测和鉴定miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR、Northern印迹、DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
9.由通过实施根据项目1至8之一的方法而获得的核苷酸序列所编码的miPEP。
10.具有3至100个氨基酸，优选地4至40个氨基酸的miPEP，其由在包含在微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列之中所包含的具有12至303个核苷酸的开放阅读框所编码，所述miPEP能够调节所述微小RNA在真核细胞中的积累，所述核苷酸序列被包含在微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中，优选地在5’部分中，
其中在观察到在miPEP存在和不存在下的细胞之间微小RNA的数量的变化后，证明了所述miPEP对于所述微小RNA的所述调节。
11.根据项目9或10的miPEP，所述miPEP选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424。
12.编码根据项目9至11之一所定义的miPEP的核酸分子，所述核酸分子尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425。
13.至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
用于在指定真核细胞中调节基因表达的用途，
所述指定真核细胞能够表达微小RNA，所述微小RNA的初级转录物包含至少一种编码所述至少一种miPEP的核苷酸序列，并且所述微小RNA的积累由所述至少一种miPEP来进行调节，
所述基因的表达由所述微小RNA来进行调控，所述miPEP尤其选自由下列组成的肽的组：
-SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：355，
-SEQ ID NO：375至SEQ ID NO：386，或
-SEQ ID NO：424，
特别地，SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：63和SEQ ID NO：424，
所述核酸尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：105至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：356，
-SEQ ID NO：387至SEQ ID NO：399，或
-SEQ ID NO：425，
特别地，SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：180、SEQ IDNO：181、SEQ ID NO：118、SEQ ID NO：425和SEQ ID NO：167，
所述微小RNA尤其选自由下列组成的核酸的组：
-SEQ ID NO：282至SEQ ID NO：354和SEQ ID NO：358，
-SEQ ID NO：412至SEQ ID NO：423，或
-SEQ ID NO：427，
特别地，SEQ ID NO：319、SEQ ID NO：297、SEQ ID NO：305、SEQ ID NO：331、SEQ IDNO：291、SEQ ID NO：322和SEQ ID NO：427。
14.组合物，其包含至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
所述组合物用于其作为人的或兽医学的药物的应用。
15.用于在植物或动物真核细胞，特别是人细胞中调节由微小RNA所调控的基因表达的方法，所述方法包括实施miPEP在所述真核细胞中积累的步骤，
所述miPEP：
-具有3至100个氨基酸，优选地4至20个氨基酸的大小，和
-具有与由包含在调控所述基因的表达的微小RNA的初级转录物中的核苷酸序列所编码的肽序列相同的肽序列，和
-能够调节所述微小RNA的积累，
其中，所述miPEP在所述真核细胞中的积累诱导所述基因的表达相对于在没有所述miPEP的积累的情况下所述基因的表达而言发生调节，
所述方法不用于人或动物身体的手术或治疗性处理，也不用于改变人类的遗传同一性。
16.包含至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为植物药学试剂以便用于下述目的的用途，
-用于促进植物的生长和/或发育，尤其是用于调节植物的生理学参数，特别是生物量、叶表面积、开花、果实大小、植物种子的产生和/或选择，特别地用于控制植物的单性结实或雌雄同株，或用于改变植物种子的生理学参数，特别是萌发、根系建立和对于水分胁迫的抗性，或者
-用于预防或治疗植物疾病，特别地用于促进对于感染性疾病的抗性。
17.包含至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为植物药学试剂以便用于植物种子的产生和/或选择的用途，
其中所述组合物通过在所述植物种子上包裹或覆膜来进行施加。
18.包含至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为除草剂以便用于消除植物或减慢其生长的用途。
19.包含至少一种：
-根据项目9至11之一所定义的miPEP，
-编码所述miPEP的核酸，或
-包含所述核酸的载体，
的组合物作为杀有害生物剂以便用于消除植物的有害生物或能够被归类为此类的生物的用途，
尤其是作为杀昆虫剂、杀蜘蛛剂、杀软体动物剂或杀啮齿动物剂，
特别地通过将所述组合物施加在植物上或施加在与所述植物相接触的支持物上。
20.组合物，其以组合方式包含一定数量的植物种子和一定数量的肽，所述肽的序列包含与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列或由与天然地存在于所述植物中的miPEP的序列相同的序列组成，特别地，对所述组合物进行配制以便形成经包裹的种子。
序列表
<110> CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE - CNRS
UNIVERSITE PAUL SABATIER
<120> 微肽及其用于调节基因表达的用途
<130> WOB 13 CK TLS IPEP
<150> FR 13/60727
<151> 2013-10-31
<150> FR 14/55044
<151> 2013-10-31
<160> 495
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 33
<212> PRT
<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）
<400> 1
Met Phe Cys Ser Ile Gln Cys Val Ala Arg His Leu Phe Pro Leu His
1 5 10 15
Val Arg Glu Ile Lys Lys Ala Thr Arg Ala Ile Lys Lys Gly Lys Thr
20 25 30
Leu
<210> 2
<211> 24
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 2
Met Arg Arg Gln Thr Ser Val Pro Phe Ala Cys Lys Arg Asp Lys Glu
1 5 10 15
Ser Asp Lys Ser His Lys Glu Arg
20
<210> 3
<211> 37
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 3
Met Val Met Phe Phe Leu Asp Leu Asp Lys Asn Pro Arg Phe Asp Leu
1 5 10 15
Leu Lys Gly Leu Lys Trp Asn Leu Phe Ser Ser His Ile Ser Pro Ser
20 25 30
Leu Pro Pro Ser Leu
35
<210> 4
<211> 11
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 4
Met Lys Asp Asn Phe Pro Leu Leu Leu Arg Leu
1 5 10
<210> 5
<211> 4
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 5
Met Ser Asp Asp
1
<210> 6
<211> 16
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 6
Met Ile Tyr Ile Asn Lys Tyr Gly Ser Ile Ser Ala Val Glu Asp Asp
1 5 10 15
<210> 7
<211> 4
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 7
Met Ser Gln Arg
1
<210> 8
<211> 16
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥（Arabidopsis lyrata）
<400> 8
Met Thr Cys Pro Leu Leu Ser Leu Ser Phe Leu Leu Ser Lys Tyr Ile
1 5 10 15
<210> 9
<211> 16
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 9
Met Thr Trp Pro Leu Leu Ser Leu Ser Phe Leu Leu Ser Lys Tyr Val
1 5 10 15
<210> 10
<211> 18
<212> PRT
<213> 红荠菜（Capsella rubella）
<400> 10
Met Thr Cys Thr Leu Ser Ala Leu Ser Leu Ser Leu Asn Met Phe Arg
1 5 10 15
Val Asn
<210> 11
<211> 5
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 11
Met Phe Tyr Leu Ser
1 5
<210> 12
<211> 37
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 12
Met Val Asn Thr Ser Ser Phe Phe Ile Ser Ser Phe Ile Leu Pro Leu
1 5 10 15
Val Leu Ser Glu Ser Asn Cys Leu Leu Phe Arg Thr Ile Tyr Lys Phe
20 25 30
Ser Met Val Leu Tyr
35
<210> 13
<211> 24
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 13
Met Phe Cys Leu Leu Ile Pro Ile Phe Ser Phe Val Phe Ser Pro Asn
1 5 10 15
Arg His Leu Arg Leu Gln Glu Gln
20
<210> 14
<211> 5
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 14
Met Phe Ser Pro Gln
1 5
<210> 15
<211> 23
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 15
Met Lys Tyr Ile His Ile Leu Ile Leu Phe Lys Ser Arg Ser Thr Tyr
1 5 10 15
Lys Leu Ser Thr Asn His Ile
20
<210> 16
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 16
Met Lys Ile Pro Leu Phe Leu Pro Lys Leu
1 5 10
<210> 17
<211> 27
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 17
Met Val Ser Gly Gln Glu Asp Ser Trp Leu Lys Leu Ser Ser Leu Cys
1 5 10 15
Phe Leu Phe Leu Ser Leu Leu Asp Ser Leu Ile
20 25
<210> 18
<211> 34
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 18
Met Phe Leu Leu Ile Phe Leu Arg Leu Ile Met Ile Cys Val Cys Ser
1 5 10 15
Ser Thr Asp Phe Leu Arg Ser Val Asn Tyr Phe Cys Leu Phe Ile Tyr
20 25 30
Asp Leu
<210> 19
<211> 9
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 19
Met Ser Thr Thr Gln Glu His Arg Ser
1 5
<210> 20
<211> 25
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 20
Met Ile Leu Lys Cys Trp Ser Ser Arg Phe Leu Arg Val Ser Pro Tyr
1 5 10 15
Gln Asn Ala His Ser Leu Ser Leu Gly
20 25
<210> 21
<211> 13
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 21
Met Pro Leu Ala Val Ile Arg Gln Gly Ile Val Trp Pro
1 5 10
<210> 22
<211> 24
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 22
Met Pro Ser Trp His Asp Met Val Leu Leu Pro Tyr Val Lys His Thr
1 5 10 15
His Ala Asn Thr Arg His Ile Thr
20
<210> 23
<211> 8
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 23
Met Thr Trp Phe Phe Cys Leu Thr
1 5
<210> 24
<211> 37
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 24
Met Pro Ser Trp His Gly Met Val Leu Leu Pro Tyr Val Lys His Thr
1 5 10 15
His Ala Ser Thr His Thr His Thr His Asn Ile Tyr Gly Cys Ala Cys
20 25 30
Glu Leu Val Phe His
35
<210> 25
<211> 22
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 25
Met Ala Trp Tyr Gly Ser Phe Ala Leu Arg Lys Thr His Ser Arg Gln
1 5 10 15
His Thr His Thr His Thr
20
<210> 26
<211> 8
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 26
Met Val Trp Phe Phe Cys Leu Thr
1 5
<210> 27
<211> 7
<212> PRT
<213> 芜青（Brassica rapa）
<400> 27
Met Met Ile Ile Leu Trp Lys
1 5
<210> 28
<211> 24
<212> PRT
<213> 芜青
<400> 28
Met Leu Trp Ala Lys Leu Val Ser Phe Ser Thr Leu His Ser Leu Val
1 5 10 15
Phe Leu Leu Ser Pro Ser Phe Ala
20
<210> 29
<211> 29
<212> PRT
<213> 芜青
<400> 29
Met Pro Ser Trp His Gly Ile Val Ile Leu Pro Phe Val Lys His Thr
1 5 10 15
His Ala Asn Ile His Tyr Ser Tyr Ser Cys Val Cys Ile
20 25
<210> 30
<211> 34
<212> PRT
<213> 番木瓜（Carica papaya）
<400> 30
Met Ile Ala Cys His Pro Tyr Leu Pro Phe Pro Leu Phe Leu Ser Leu
1 5 10 15
Thr Phe Tyr Ser Ile Phe Phe Ser Pro Ser Pro Pro Ser Pro Ser Leu
20 25 30
Pro Leu
<210> 31
<211> 53
<212> PRT
<213> 番木瓜
<400> 31
Met Pro Ser Leu Leu Ala Phe Ser Pro Phe Pro Phe Ser Asn Ile Leu
1 5 10 15
Leu Asn Leu Leu Leu Pro Leu Pro Pro Phe Pro Leu Ser Ala Ile Ile
20 25 30
Thr Ile Ile Lys Pro Leu Ser Leu Ser Leu Pro Leu Ser Leu Ser Leu
35 40 45
Ser Gly Phe Ser Val
50
<210> 32
<211> 15
<212> PRT
<213> 红荠菜
<400> 32
Met Glu Leu Lys Gly Leu Arg Thr Trp Gln Leu Leu Asp Lys Val
1 5 10 15
<210> 33
<211> 14
<212> PRT
<213> 红荠菜
<400> 33
Met Pro Ser Trp His Gly Met Ala Cys Phe Tyr Cys Leu Thr
1 5 10
<210> 34
<211> 24
<212> PRT
<213> 红荠菜
<400> 34
Met Ala Trp His Gly Met Phe Leu Leu Pro Tyr Val Lys His Thr His
1 5 10 15
Ala Asn Thr Tyr Ser Leu Tyr Met
20
<210> 35
<211> 35
<212> PRT
<213> 雷蒙德氏棉（Gossypium raimondii）
<400> 35
Met Met Arg Ser Arg Ile Leu Lys Phe Gln Tyr Arg Phe Gly Met Gly
1 5 10 15
Ile Gly Gly Arg Lys Gln Leu Lys Asn Gln Leu Cys Gln Ile Gln Gly
20 25 30
Arg Ile Ser
35
<210> 36
<211> 10
<212> PRT
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 36
Met Ser Asn Ser Arg Ser Tyr Gln Leu Lys
1 5 10
<210> 37
<211> 17
<212> PRT
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 37
Met Asn Glu Asp Leu Glu Ile Ser Thr Arg Lys Arg Thr Pro Gln Leu
1 5 10 15
Cys
<210> 38
<211> 12
<212> PRT
<213> 截形苜蓿（Medicago truncatula）
<400> 38
Met Pro Lys Phe Asp Ile Phe Phe Tyr Ile Phe Val
1 5 10
<210> 39
<211> 83
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 39
Met Ser Tyr Ile Ser Leu Ser Pro Lys Leu Leu Pro Ile Asn Thr Lys
1 5 10 15
Pro Phe Pro Trp Leu Val Gln Phe Asn Phe Tyr Phe Ser Ser Asn Thr
20 25 30
Lys Cys Asn Lys Leu His Phe Leu Gly Glu Lys Leu Leu Val Gly Glu
35 40 45
Ala Gly His Val Gln Ile Leu Phe Leu Ile His Ser Leu Ile Met His
50 55 60
Ile Asn Ile Phe Cys Thr Cys Ser Pro Ser Pro Thr Arg Leu Pro His
65 70 75 80
Pro Ser Leu
<210> 40
<211> 20
<212> PRT
<213> 水稻（Oryza sativa）
<400> 40
Met Gln Thr His Ser Asn Thr Pro Gln Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Leu
1 5 10 15
Ser Leu Ser Glu
20
<210> 41
<211> 15
<212> PRT
<213> 水稻
<400> 41
Met Cys Val Cys Asp Ile Asn Met His Ser Met Leu Met Leu Leu
1 5 10 15
<210> 42
<211> 25
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 42
Met Arg Ile Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile Tyr Thr Cys Val Cys
20 25
<210> 43
<211> 18
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 43
Met Arg Val Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu
<210> 44
<211> 36
<212> PRT
<213> 埃塞俄比亚芥（Brassica carinata）
<400> 44
Met Arg Met Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile His Lys Tyr Val Tyr Met Leu Ile Gln Val Phe Asp
20 25 30
His Ile Cys Ile
35
<210> 45
<211> 27
<212> PRT
<213> 芥菜（Brassica juncea）
<400> 45
Met Arg Met Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile His Lys Tyr Val Tyr Ile Cys
20 25
<210> 46
<211> 36
<212> PRT
<213> 欧洲油菜（Brassica napus）
<400> 46
Met Arg Met Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile His Lys Tyr Val Tyr Met Ile Ile Gln Val Phe Asp
20 25 30
His Ile Cys Ile
35
<210> 47
<211> 36
<212> PRT
<213> 甘蓝（Brassica oleracea）
<400> 47
Met Arg Met Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile His Lys Tyr Val Tyr Met Leu Ile Gln Val Phe Asp
20 25 30
His Ile Cys Ile
35
<210> 48
<211> 27
<212> PRT
<213> 芜青
<400> 48
Met Arg Met Lys Leu Phe Gln Leu Arg Gly Met Leu Ser Gly Ser Arg
1 5 10 15
Ile Leu Tyr Ile His Lys Tyr Val Tyr Ile Cys
20 25
<210> 49
<211> 19
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 49
Met Leu Asp Leu Phe Arg Ser Asn Asn Arg Ile Glu Pro Ser Asp Phe
1 5 10 15
Arg Phe Asp
<210> 50
<211> 4
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 50
Met Arg Asp Arg
1
<210> 51
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 51
Met Asn Arg Lys Ile Ser Leu Ser Leu Ser
1 5 10
<210> 52
<211> 8
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 52
Met Met Gly Cys Phe Val Gly Phe
1 5
<210> 53
<211> 8
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 53
Met Gln Glu Glu Thr Tyr Glu Gly
1 5
<210> 54
<211> 59
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 54
Met Pro His Thr Asn Leu Lys Asp Leu Phe Ile Phe Ser Pro Asn Val
1 5 10 15
Phe Phe Ser Phe Ala Ile Tyr Leu His Asn Ser Trp Asn Lys Asn Tyr
20 25 30
Ile His Lys Arg Glu Asn Phe His Asn Thr Ser Phe Ala Leu Ile Phe
35 40 45
Phe Phe Ser Ser Ile Met Ser Ile Asn Tyr Gly
50 55
<210> 55
<211> 39
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 55
Met Phe Phe Phe Arg Leu Leu Phe Ile Ser Thr Ile Leu Gly Thr Lys
1 5 10 15
Thr Thr Phe Thr Asn Glu Arg Ile Phe Thr Thr Pro Leu Leu Leu Ser
20 25 30
Phe Phe Phe Phe Arg Pro Leu
35
<210> 56
<211> 6
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 56
Met Arg His Lys Glu Ser
1 5
<210> 57
<211> 34
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 57
Met Asn Leu Leu Lys Lys Glu Arg Gln Arg Arg Arg Gln Arg Ser Ile
1 5 10 15
Gly Ser His Cys Ile Ala Ser Leu Val Leu Lys Asp Gly Tyr Met Lys
20 25 30
Lys Ile
<210> 58
<211> 9
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 58
Met Val Leu Ser Gly Lys Leu Thr Phe
1 5
<210> 59
<211> 20
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 59
Met Leu Leu His Arg Leu Ser Lys Phe Cys Lys Ile Glu Arg Asp Ile
1 5 10 15
Val Tyr Ile Ser
20
<210> 60
<211> 5
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 60
Met Lys Ile Glu Glu
1 5
<210> 61
<211> 34
<212> PRT
<213> 玉蜀黍（Zea mays）
<400> 61
Met His Leu Pro Ser Thr Pro Ser Arg Pro Pro Pro Gln His Thr Ser
1 5 10 15
Leu Ser Phe Leu Gly Lys Glu Met Thr Lys Gly Thr Thr Thr Ala Cys
20 25 30
Phe Gly
<210> 62
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 62
Met Leu Ser Leu Ser His Phe His Ile Cys
1 5 10
<210> 63
<211> 23
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 63
Met Met Val Phe Gly Lys Pro Lys Lys Ala Met Leu Val Arg Phe Asn
1 5 10 15
Pro Lys Thr Asp Leu His Val
20
<210> 64
<211> 10
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 64
Met Ala Ser Ala Ala Lys Val Tyr Met Ala
1 5 10
<210> 65
<211> 6
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 65
Met Ala Ser Lys Ile Trp
1 5
<210> 66
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 66
Met Val Arg Phe Gln Leu Ser Ile Arg Asp
1 5 10
<210> 67
<211> 12
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 67
Met Cys Thr Tyr Tyr Tyr Leu Ile Asn Lys Tyr Phe
1 5 10
<210> 68
<211> 11
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 68
Met Phe Pro Ala Lys Trp Cys Arg Leu Glu Ser
1 5 10
<210> 69
<211> 22
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 69
Met Gly Ser Leu Ser Leu Phe Lys Ser Gln Leu Glu Ile Leu Met Leu
1 5 10 15
Leu Leu Ser Leu Ser Lys
20
<210> 70
<211> 20
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 70
Met Ser Val Tyr Ile His Val Pro Ile Ser Leu Asn Cys Phe Ser Pro
1 5 10 15
Lys Ser Ser Cys
20
<210> 71
<211> 11
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 71
Met Gly Val Pro Asn Phe Arg Pro Arg Asn Arg
1 5 10
<210> 72
<211> 23
<212> PRT
<213> 塞文山鼠耳芥（Arabidopsis cebennensis）
<400> 72
Met Arg Ser Arg Val Ser Phe Phe Phe Phe Lys Ile Met Leu Phe Arg
1 5 10 15
Leu Leu Gly Tyr Arg Ser Met
20
<210> 73
<211> 44
<212> PRT
<213> 塞文山鼠耳芥
<400> 73
Met His Thr Tyr Ile His Thr Ile Ser Asn Ile Ser Ser Ile Phe Phe
1 5 10 15
Cys Ser Lys Arg Ser Phe Ser Pro Phe Thr Tyr Ile Arg Ile Ile Val
20 25 30
Val Ile Asp Pro Phe Arg Ile Ala Leu Thr Phe Arg
35 40
<210> 74
<211> 22
<212> PRT
<213> 圆叶鼠耳芥（Arabidopsis halleri）
<400> 74
Met Arg Ser Arg Val Ser Leu Phe Leu Ser Phe Ser Ser Asn Phe Ala
1 5 10 15
Ala Tyr Ser Pro Arg Ser
20
<210> 75
<211> 48
<212> PRT
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 75
Met His Thr Tyr Ile Pro Ser Ser Ser Phe Pro Ile Ser Asn Ile Ser
1 5 10 15
Ser Val Phe Phe Cys Tyr Lys Arg Ser Phe Ser Pro Tyr Thr Tyr Ile
20 25 30
Arg Ile Ile Val Val Ile Asp Pro Phe Arg Ile Ala Leu Thr Phe Arg
35 40 45
<210> 76
<211> 50
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 76
Met Asn Ile His Thr Tyr His His Leu Leu Phe Pro Ser Leu Val Phe
1 5 10 15
His Gln Ser Ser Asp Val Pro Asn Ala Leu Ser Leu His Ile His Thr
20 25 30
Tyr Glu Tyr Ile Ile Val Val Ile Asp Pro Phe Arg Ile Thr Leu Ala
35 40 45
Phe Arg
50
<210> 77
<211> 19
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 77
Met Phe Gln Thr Leu Tyr Leu Phe Ile Tyr Ile His Thr Asn Ile Leu
1 5 10 15
Leu Leu Ser
<210> 78
<211> 45
<212> PRT
<213> 芜青
<400> 78
Met Phe Lys Leu Tyr Phe Ser Ala Ile Leu Ser Thr Gln Tyr Met His
1 5 10 15
Thr Tyr His His Arg Ile Ala Leu Ile Phe Leu Ser Ile Leu Tyr Pro
20 25 30
Ser Thr Asn Tyr Leu Met Ser Pro Ile Leu Asn Pro Thr
35 40 45
<210> 79
<211> 20
<212> PRT
<213> 番木瓜
<400> 79
Met Lys Ile Lys Leu Gly Phe Ser Leu Ile Lys Ile Ile Ile Leu Leu
1 5 10 15
Asp Lys Asn Ser
20
<210> 80
<211> 21
<212> PRT
<213> 红荠菜
<400> 80
Met His Pro His Thr Tyr Ile His Ile Pro Ser Ser Ser Phe Leu Ile
1 5 10 15
Ser Ser Phe Cys Leu
20
<210> 81
<211> 45
<212> PRT
<213> 巨桉（Eucalyptus grandis）
<400> 81
Met Lys His Ile Gln Arg Trp Arg Tyr Gly Glu Thr Ser Gly Arg Gln
1 5 10 15
Gly Asp Trp Lys Arg Leu Glu Ile Lys Val His Ser Asn Pro Ser Leu
20 25 30
Lys Val Lys Lys Asn Thr Asn Asn Phe Ser Ser Ser Leu
35 40 45
<210> 82
<211> 28
<212> PRT
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 82
Met Ile His Phe Asn Leu Ser Gln Trp Arg Ala Ile Cys Met Ala Asn
1 5 10 15
Phe His Leu Thr Tyr Ser Phe Leu Phe Gly Val Leu
20 25
<210> 83
<211> 21
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 83
Met His Val Tyr Leu Glu Leu Phe Met Val Ile Lys Gly Leu Gly Phe
1 5 10 15
Leu Leu Leu Val Lys
20
<210> 84
<211> 23
<212> PRT
<213> 水稻
<400> 84
Met Glu Met Ile Gln Arg Pro Cys Leu Ile Leu Lys Phe Phe Phe Lys
1 5 10 15
Leu Ser Thr Leu Tyr Ile Pro
20
<210> 85
<211> 38
<212> PRT
<213> 展叶剑叶藓（Physcomitrella patens）
<400> 85
Met Phe His Arg Arg Arg Ser Ser Val Leu Leu Pro Pro Phe Gly Gln
1 5 10 15
Thr Gln Pro Asn Pro Arg Cys Leu Pro Asp Leu Arg Phe Pro Ser Cys
20 25 30
Phe Thr Pro Cys Thr Ala
35
<210> 86
<211> 42
<212> PRT
<213> 小盐芥（Thellungiella halophila）
<400> 86
Met Thr Ile Cys Lys Val Ser Lys Ala Cys Phe Tyr Ala Gly Lys Ile
1 5 10 15
Glu Asn Ser Arg Leu Ile Lys Lys Ile Gly Ile Pro Lys Arg Glu Gly
20 25 30
Ala Pro Phe Ser Pro Ile Arg Glu Asn Gln
35 40
<210> 87
<211> 37
<212> PRT
<213> 小盐芥
<400> 87
Met Glu Ile Gln Ile Lys Lys Lys Asn Leu Tyr Ile Met Asn Thr Gln
1 5 10 15
Lys Leu Pro Asn Leu Tyr Ile Tyr Ile Tyr Lys Tyr Val Phe Ile Lys
20 25 30
Leu Met Val Val Glu
35
<210> 88
<211> 43
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 88
Met Val Pro Gln Ile Asn Leu Trp Ser Ser Arg Val Ile Leu Lys Ile
1 5 10 15
Arg Ile Asp Ser Ser Thr His Arg Glu Glu Asp His Cys Ile Gln Asn
20 25 30
His Lys His Gly Leu Ser Phe Ile Phe Ser Phe
35 40
<210> 89
<211> 16
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 89
Met Ser Leu Gln Phe Tyr Glu Arg Val Ser Phe Lys Asn Thr Val Lys
1 5 10 15
<210> 90
<211> 12
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 90
Met Thr Glu Gln Glu Glu Glu Ser Gln Met Ser Thr
1 5 10
<210> 91
<211> 39
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 91
Met Tyr Leu Gln Tyr Ile Asp Asn Val Ile Ser Ile Tyr Ser Asn Asn
1 5 10 15
Arg Arg Val Gly Arg Met Phe Ser Arg Val Pro Leu Ser Thr Ser Leu
20 25 30
Glu Ile Gln Phe Phe Ile Lys
35
<210> 92
<211> 12
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 92
Met Ser Lys Glu Ile Phe Phe Ser Pro Gly Phe Glu
1 5 10
<210> 93
<211> 44
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 93
Met Arg Thr His Glu Gln Ser Thr Ala Ile Thr Thr Leu Arg His Cys
1 5 10 15
Tyr Ser Ser Arg Phe Met Cys Ser Gln Val Thr Pro Ala Glu Leu Phe
20 25 30
Leu Tyr Arg Pro Cys Phe Ile Asn Ala Val Ala Arg
35 40
<210> 94
<211> 5
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 94
Met Lys Arg Asn Met
1 5
<210> 95
<211> 5
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 95
Met Gln Cys Glu Ile
1 5
<210> 96
<211> 4
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 96
Met Phe Cys Ala
1
<210> 97
<211> 6
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 97
Met Val Met Ala His His
1 5
<210> 98
<211> 54
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 98
Met Met Lys Pro Arg Trp Asn Cys Ser Leu Tyr Gly Ile Thr Glu Trp
1 5 10 15
Thr Asn Asn Gln Asn Gln Lys Ser Lys Arg Lys Gly Arg Arg Lys Thr
20 25 30
Gln Ile Trp Arg Ile Gly Asp Arg Leu Asp Thr Val Glu Cys Ile Thr
35 40 45
Leu Met Leu Ser Ala Tyr
50
<210> 99
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 99
Met Leu Leu Ile Ile Val Glu Leu Val Leu
1 5 10
<210> 100
<211> 14
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 100
Met Leu Cys Phe Asn Phe Arg Cys Val Arg Arg Phe Ala Glu
1 5 10
<210> 101
<211> 36
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 101
Met Tyr Thr Tyr Gln Leu Asp Asn Ser Phe Ser Trp Phe Leu Cys Thr
1 5 10 15
Arg Phe Cys Leu Tyr Arg Tyr Phe Leu Phe Asn Phe Arg Cys Phe Arg
20 25 30
Arg Phe Ser Glu
35
<210> 102
<211> 88
<212> PRT
<213> 黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）
<400> 102
Met Trp Arg Glu Val Cys Ala Gln Lys Ser Gln Thr Lys Arg Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ile Thr Gly Asn Gln Arg Arg Asn Lys Thr Lys Ala Asn Arg Lys
20 25 30
Ala Glu Thr Lys Gln Gln Lys Val Tyr Glu Phe Phe Val Gln Ala Arg
35 40 45
Glu Arg Cys Lys Thr Arg Lys Lys His Glu Lys Lys Thr Leu Lys Lys
50 55 60
Thr Lys Lys Ile Gln Asn Arg Tyr Arg Ala Val Ser Glu Asn Glu Trp
65 70 75 80
Gly Lys Gly Phe Pro Ser His Ile
85
<210> 103
<211> 36
<212> PRT
<213> 黑腹果蝇
<400> 103
Met Arg Thr Lys Lys Ser Asn Lys Lys Ala Gln Phe Tyr Tyr Gly Gln
1 5 10 15
Pro Thr Thr Lys Gln Asn Lys Ser Gln Pro Lys Ser Arg Asn Lys Ala
20 25 30
Ala Lys Ser Leu
35
<210> 104
<211> 71
<212> PRT
<213> 黑腹果蝇
<400> 104
Met Glu Pro Gly Phe Val Phe Val Leu Phe Pro Thr His Leu Ser Thr
1 5 10 15
Gln His Thr Gln Arg Glu Lys Ser Ile Leu Val Met Gly Leu Asn Leu
20 25 30
Gln Ser Ala Lys Gln Ser Asp Lys Gln Asn Ser Lys Glu Arg Lys Lys
35 40 45
Asn Thr Gln Ile Asn Ser Gln Arg Ile Pro Tyr Arg Gln Gly Gly Gln
50 55 60
Cys Ser Lys Val Leu Ser Pro
65 70
<210> 105
<211> 92
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 105
atgttctgtt caattcaatg cgtcgccaga catctgttcc ctttgcatgt aagagagata 60
aagaaagcga caagagccat aaagaaaggt aa 92
<210> 106
<211> 75
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 106
atgcgtcgcc agacatctgt tccctttgca tgtaagagag ataaagaaag cgacaagagc 60
cataaagaaa ggtaa 75
<210> 107
<211> 114
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 107
atggttatgt tttttctcga tttagacaaa aaccctagat ttgatcttct aaagggtctc 60
aaatggaatc tcttctcttc tcatatctct ccctctctcc ctccctctct ttga 114
<210> 108
<211> 36
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 108
atgaaggaca actttcctct tctccttcgg ttataa 36
<210> 109
<211> 15
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 109
atgagtgatg actga 15
<210> 110
<211> 51
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 110
atgatatata taaataaata tgggtcgata tcggctgtgg aggacgacta g 51
<210> 111
<211> 15
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 111
atgagccaaa gataa 15
<210> 112
<211> 51
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 112
atgacgtgtc ctcttctctc tctctctttc cttctctcta agtatattta g 51
<210> 113
<211> 51
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 113
atgacgtggc ctcttctctc tctctctttc cttctctcta agtatgttta g 51
<210> 114
<211> 53
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 114
atgacgtgta ctctctctgc tctatctctc tctctaaata tgtttagggt taa 53
<210> 115
<211> 18
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 115
atgttttatc tttcataa 18
<210> 116
<211> 114
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 116
atggttaata ctagtagctt tttcatttca agttttatcc ttccattggt tctttctgag 60
tcaaattgtc tcctgtttcg aaccatatat aagttttcaa tggttttgta ttaa 114
<210> 117
<211> 75
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 117
atgttttgtt tgttgattcc catcttctct tttgtctttt caccaaatcg tcatttaagg 60
cttcaagaac agtaa 75
<210> 118
<211> 18
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 118
atgttttccc ctcaatga 18
<210> 119
<211> 72
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 119
atgaaataca tacacatttt gattttattt aaatcaagat cgacgtataa gctatccacc 60
aatcatattt aa 72
<210> 120
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 120
atgaaaattc cattgtttct gccgaagctt tga 33
<210> 121
<211> 84
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 121
atggtatctg gtcaagaaga ttcctggtta aaactttcat ctctctgttt cctttttctt 60
tctttgttgg attcattaat ttga 84
<210> 122
<211> 105
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 122
atgtttcttt taatcttttt gagattaata atgatttgtg tttgttcatc aaccgatttt 60
ctcagatctg tcaattattt ttgtttattt atttatgatt tatga 105
<210> 123
<211> 30
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 123
atgtccacta ctcaagagca taggtcttga 30
<210> 124
<211> 78
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 124
atgatactaa agtgctggag ttcccggttc ctgagagtga gtccatatca aaatgcgcat 60
tcgttatcac ttggttga 78
<210> 125
<211> 42
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 125
atgcccttag cagttattag acaagggatt gtttggccct ag 42
<210> 126
<211> 75
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 126
atgccatcat ggcatgacat ggttcttttg ccttacgtaa aacacactca cgccaacaca 60
cgccacataa cataa 75
<210> 127
<211> 27
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 127
atgacatggt tcttttgcct tacgtaa 27
<210> 128
<211> 114
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 128
atgccatcat ggcatggtat ggttcttttg ccttacgtaa aacacactca cgccagcaca 60
cacacacaca cacataacat atacggatgt gcgtgtgagc tagtcttcca ttaa 114
<210> 129
<211> 69
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 129
atggcatggt atggttcttt tgccttacgt aaaacacact cacgccagca cacacacaca 60
cacacataa 69
<210> 130
<211> 27
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 130
atggtatggt tcttttgcct tacgtaa 27
<210> 131
<211> 24
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 131
atgatgataa ttttgtggaa ataa 24
<210> 132
<211> 75
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 132
atgctttggg ccaagctagt ttcttttagc actcttcact cactagtttt tcttctcagc 60
ccttcttttg cgtga 75
<210> 133
<211> 120
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 133
atgccatcat ggcatggcat tgtcattttg cctttcgtaa aacacactca cgccaacata 60
cattattcat attcatgtgt atgtatatga atgccatcat ggcatatgcc atcatggcat 120
<210> 134
<211> 105
<212> DNA
<213> 番木瓜
<400> 134
atgattgcat gccatcccta cttgcctttt ccccttttcc tttctctaac attttactca 60
atcttcttct ccccctcccc cccttccccc tctctgccat tataa 105
<210> 135
<211> 162
<212> DNA
<213> 番木瓜
<400> 135
atgccatccc tacttgcctt ttcccctttt cctttctcta acattttact caatcttctt 60
ctccccctcc cccccttccc cctctctgcc attataacca taattaaacc tctctccctc 120
tctctccctc tctctctctc tctctctggg ttctcagtat aa 162
<210> 136
<211> 48
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 136
atggaattaa aaggtttgag aacttggcag ttattagaca aggtatag 48
<210> 137
<211> 45
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 137
atgccatcat ggcatggcat ggcatgtttc tattgcctta cgtaa 45
<210> 138
<211> 90
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 138
atggcatggc atgtttctat tgccttacgt aaaacacact cacgccaaca catactcact 60
atacatgtaa ataagtatgt gcgcgtgtga 90
<210> 139
<211> 108
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 139
atgatgagat caagaatttt aaagtttcaa tatagatttg gcatgggtat tggcggcaga 60
aagcaattaa aaaaccagtt atgtcaaatt caaggtcgta tcagttaa 108
<210> 140
<211> 33
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 140
atgtcaaatt caaggtcgta tcagttaaaa tga 33
<210> 141
<211> 54
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 141
atgaatgaag atttagaaat ttcaacaagg aagaggaccc cacagctttg ttaa 54
<210> 142
<211> 39
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 142
atgcccaaat ttgatatttt tttttatata tttgtatag 39
<210> 143
<211> 231
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 143
atgtcatata tctctctctc tcctaagttg ctacctataa atactaagcc tttcccttgg 60
ttggttcaat tcaacttcta cttctcatca aacacaaagt gcaataagct tcatttcctg 120
ggtgagaagc tccttgttgg agaagcaggg cacgtgcaaa tcctctttct gattcattct 180
ctcataatgc atatcaatat cttttgcacg tgctcccctt ctccaactag g 231
<210> 144
<211> 63
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 144
atgcaaaccc actccaacac tccacaatcc acatactctc tctctctctc tctctctgag 60
tag 63
<210> 145
<211> 48
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 145
atgtgtgtgt gtgatatcaa tatgcattcg atgttgatgc tactgtag 48
<210> 146
<211> 78
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 146
atgagaatta agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatacata 60
tatacatgtg tatgttga 78
<210> 147
<211> 57
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 147
atgagggtta agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatag 57
<210> 148
<211> 111
<212> DNA
<213> 埃塞俄比亚芥
<400> 148
atgagaatga agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatatata 60
cacaaatacg tatatatgtt aatacaagtg tttgatcata tatgtatata g 111
<210> 149
<211> 84
<212> DNA
<213> 芥菜
<400> 149
atgagaatga agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatatata 60
cacaaatatg tatatatatg ttaa 84
<210> 150
<211> 111
<212> DNA
<213> 欧洲油菜
<400> 150
atgagaatga agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatatata 60
cacaaatacg tatatatgat aatacaagtg tttgatcata tatgtatata g 111
<210> 151
<211> 111
<212> DNA
<213> 甘蓝
<400> 151
atgagaatga agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatatata 60
cacaagtacg tatatatgtt aatacaagtg tttgatcata tatgtatata g 111
<210> 152
<211> 84
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 152
atgagaatga agctatttca gttgagggga atgttgtctg gatcgaggat attatatata 60
cacaaatatg tatatatatg ttaa 84
<210> 153
<211> 60
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 153
atgttggatc tctttcgatc taacaatcga attgaacctt cagatttcag atttgattag 60
<210> 154
<211> 15
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 154
atgagagata gataa 15
<210> 155
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 155
atgaacagaa aaatctctct ttctctttct tga 33
<210> 156
<211> 27
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 156
atgatgggtt gttttgtggg attttaa 27
<210> 157
<211> 27
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 157
atgcaggagg aaacatatga ggggtga 27
<210> 158
<211> 180
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 158
atgccacata caaacttgaa agatctcttc atcttttctc caaatgtttt tttttcgttt 60
gctatttatc tccacaattc ttggaacaaa aactacattc acaaacgaga gaattttcac 120
aacacctctt ttgctctcat tttttttttt tcgtccatta tgagtattaa ttatggttag 180
<210> 159
<211> 120
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 159
atgttttttt ttcgtttgct atttatctcc acaattcttg gaacaaaaac tacattcaca 60
aacgagagaa ttttcacaac acctcttttg ctctcatttt ttttttttcg tccattatga 120
<210> 160
<211> 21
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 160
atgagacata aagagagtta a 21
<210> 161
<211> 105
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 161
atgaacctcc tcaagaagga aagacagagg aggagacaaa gaagtatagg ttcacattgc 60
atagccagtt tagttttgaa ggatggatat atgaaaaaaa tatga 105
<210> 162
<211> 30
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 162
atggttctct ccggtaaatt aacattttag 30
<210> 163
<211> 63
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 163
atgcttcttc ataggctctc caaattttgc aaaattgaaa gagacatagt atatatatct 60
tag 63
<210> 164
<211> 18
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 164
atgaagattg aagagtaa 18
<210> 165
<211> 105
<212> DNA
<213> 玉蜀黍
<400> 165
atgcatctgc cttcaactcc ctctcgcccc ccaccccaac acacatctct ctcttttcta 60
gggaaggaaa tgacgaaggg gacgacgacg gcatgcttcg gctag 105
<210> 166
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 166
atgttgtctc tttctcattt tcatatctgc taa 33
<210> 167
<211> 72
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 167
atgatggtgt ttgggaagcc gaaaaaagcg atgttggtga ggttcaatcc gaagacggat 60
ttacatgtat ag 72
<210> 168
<211> 33
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 168
atggcttcag ctgcaaaagt atacatggcg tga 33
<210> 169
<211> 21
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 169
atggcttcca agatctggta a 21
<210> 170
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 170
atggttaggt tccaactaag tatacgagat taa 33
<210> 171
<211> 39
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 171
atgtgtacgt actattatct cataaataaa tatttttaa 39
<210> 172
<211> 36
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 172
atgtttccag caaaatggtg ccgtcttgag tcttga 36
<210> 173
<211> 69
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 173
atgggatctc tctctttatt taaaagtcaa ttagagatct tgatgctact tctgtccctt 60
tccaagtga 69
<210> 174
<211> 63
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 174
atgagtgtat atattcatgt acctatctct ctcaattgct tctcaccaaa atcatcttgc 60
tga 63
<210> 175
<211> 36
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 175
atgggagttc ccaactttag acctcgaaac cgataa 36
<210> 176
<211> 72
<212> DNA
<213> 塞文山鼠耳芥
<400> 176
atgagatcta gggtttcttt ctttttcttc aaaatcatgc tttttcgctt gctaggttat 60
agatccatgt aa 72
<210> 177
<211> 134
<212> DNA
<213> 塞文山鼠耳芥
<400> 177
atgcatacat acatacatac catctctaat atttcatcaa tcttcttttg ttccaaacgc 60
ctttctctcc atttacatac atacgaatca ttgttgtcat agatccgttt agaattgctt 120
taacttttag atga 134
<210> 178
<211> 69
<212> DNA
<213> 圆叶鼠耳芥
<400> 178
atgagatcta gggtttcttt gtttctttcg ttttcttcaa attttgctgc atattctcca 60
agatcatga 69
<210> 179
<211> 147
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 179
atgcatacat acataccatc atcatctttt cccatctcta atatttcatc agtcttcttt 60
tgttacaaac gctctttctc gccatataca tacataagaa tcattgttgt catagatccg 120
tttagaattg ctttaacttt tagatga 147
<210> 180
<211> 153
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 180
atgaatatac atacatacca tcatcttctt ttcccatctc tagtttttca tcaatcttct 60
gatgttccaa acgctctatc tcttcatata catacatacg aatatattat tgttgtcata 120
gatccattta gaatcacttt agcttttaga tga 153
<210> 181
<211> 60
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 181
atgttccaaa cgctctatct cttcatatac atacatacga atatattatt gttgtcatag 60
<210> 182
<211> 138
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 182
atgtttaagc tctacttctc agcaattctc tccacccaat acatgcatac ataccatcat 60
cgtatcgctc taatttttct atcaatcttg tatccttcca caaattatct tatgtctccc 120
attttaaatc ctacatag 138
<210> 183
<211> 63
<212> DNA
<213> 番木瓜
<400> 183
atgaagatta aattaggttt tagtcttatt aagattatta tattactaga caaaaacagt 60
taa 63
<210> 184
<211> 66
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 184
atgcatccac atacatacat acatatacca tcatcttctt ttctcatctc tagtttttgt 60
ttataa 66
<210> 185
<211> 138
<212> DNA
<213> 巨桉
<400> 185
atgaagcata ttcaaaggtg gagatatggg gagacttccg gaaggcaagg ggattggaaa 60
aggctcgaga tcaaagtgca tagcaaccct tcgctaaagg tgaaaaagaa tacgaataac 120
ttcagtagct cactttaa 138
<210> 186
<211> 87
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 186
atgatccatt tcaacctgtc acagtggaga gcaatttgta tggctaattt ccatctcacc 60
tattcttttc tgtttggggt tctctag 87
<210> 187
<211> 66
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 187
atgcatgtat atcttgaatt gtttatggta ataaaggggt taggatttct ccttttggtg 60
aagtga 66
<210> 188
<211> 72
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 188
atggaaatga tacaaaggcc gtgtttaatt ttaaaatttt ttttcaaact ttcaacactt 60
tacatcccat aa 72
<210> 189
<211> 117
<212> DNA
<213> 展叶剑叶藓
<400> 189
atgttccacc gtcggagatc ctcggtgctg ctacccccgt tcggccaaac ccaacccaac 60
cctaggtgtc tgccggacct ccgcttcccc tcctgcttca ccccctgcac cgcttaa 117
<210> 190
<211> 129
<212> DNA
<213> 小盐芥
<400> 190
atgacgatat gtaaagtaag caaggcatgt ttttatgcag ggaagattga aaattcaaga 60
ttaatcaaga aaattggaat accaaaaaga gagggagctc ccttcagtcc aatcagagag 120
aatcaatga 129
<210> 191
<211> 114
<212> DNA
<213> 小盐芥
<400> 191
atggagattc aaattaaaaa gaaaaactta tatataatga atacacaaaa gctacctaat 60
ctgtatatat atatatataa atatgtcttc attaaattaa tggtcgtgga atag 114
<210> 192
<211> 132
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 192
atggtacctc aaattaatct atggtcatct agggttatct tgaagattag aattgattct 60
agcacgcaca gagaggaaga tcattgcatc cagaatcaca aacatggcct atcttttatc 120
ttttcttttt ga 132
<210> 193
<211> 51
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 193
atgtctctcc aattttatga gagggtttcc ttcaagaaca cagtaaaata g 51
<210> 194
<211> 39
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 194
atgacagagc aagaagaaga aagtcaaatg tccacatga 39
<210> 195
<211> 120
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 195
atgtatctac aatatattga taatgtaata tctatatatt caaacaatcg tcgtgttggt 60
cggatgtttt ctagagttcc tctgagcact tcattggaga tacaattttt tataaaatag 120
<210> 196
<211> 39
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 196
atgagcaagg agatattttt ttcccctggg tttgaatga 39
<210> 197
<211> 133
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 197
atgagaacac acgagcaatc aacggctata acgacgctac gtcattgtta cagctctcgt 60
ttcatgtgtt ctcaggtcac ccctgctgag ctctttctct accgtccatg ttttatcaac 120
gccgtggccc gtg 133
<210> 198
<211> 18
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 198
atgaagagaa acatgtaa 18
<210> 199
<211> 18
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 199
atgcaatgtg aaatatga 18
<210> 200
<211> 15
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 200
atgttttgtg cttga 15
<210> 201
<211> 21
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 201
atggtcatgg ctcatcatta g 21
<210> 202
<211> 165
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 202
atgatgaaac ctcgatggaa ctgctctctt tatggaatca cggaatggac aaataatcaa 60
aatcagaaat cgaagcgaaa agggaggaga aaaacgcaga tttggaggat tggggacaga 120
ttagatactg ttgaatgcat cactctaatg ctatcagcct attaa 165
<210> 203
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 203
atgctgctta tcatcgtgga gttggttctg taa 33
<210> 204
<211> 45
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 204
atgctttgtt tcaatttcag gtgcgttaga aggtttgcag agtag 45
<210> 205
<211> 108
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 205
atgtacacct accagcttga taactctttt tcgtggtttc tgtgtactcg tttctgtttg 60
tacagatact tcttgttcaa tttcagatgc tttagaaggt tttcggag 108
<210> 206
<211> 267
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 206
atgtggcgcg aagtatgcgc acaaaaaagt caaacaaaaa ggcgcaattt tattacgggc 60
aaccaacgac gaaacaaaac aaaagccaac cgaaaagcag aaacaaagca gcaaaaagtt 120
tatgaatttt ttgtgcaggc gcgtgaaaga tgcaaaacga gaaaaaaaca tgaaaaaaaa 180
acattaaaaa aaacaaaaaa aatccaaaac agataccgag ctgtatccga aaacgagtgg 240
ggaaaggggt ttcccagtca catataa 267
<210> 207
<211> 111
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 207
atgcgcacaa aaaagtcaaa caaaaaggcg caattttatt acgggcaacc aacgacgaaa 60
caaaacaaaa gccaaccgaa aagcagaaac aaagcagcaa aaagtttatg a 111
<210> 208
<211> 216
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 208
atggagcctg gctttgtttt tgttttattt ccaacccact tgagcacaca gcacacacag 60
agagaaaaat caatactcgt tatgggatta aatttacaaa gcgcaaagca aagcgacaaa 120
caaaattcaa aagaaagaaa aaaaaacact caaataaact cacaaagaat tccttatcgc 180
caagggggcc aatgttctaa ggttctttcg ccttga 216
<210> 209
<211> 614
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 209
attcattgtt cactctcaaa tctcaagttc attgccattt ttaggtctct ctataaattc 60
aaatgttctg ttcaattcaa tgcgtcgcca gacatctgtt ccctttgcat gtaagagaga 120
taaagaaagc gacaagagcc ataaagaaag gtaagactct ttgaaataga gagagataag 180
gttttctctt atcttcttct catcagatct ttgtttcttt accctctttc tttctttttt 240
ttgcttttta tggttatgtt ttttctcgat ttagacaaaa accctagatt tgatcttcta 300
aagggtctca aatggaatct cttctcttct catatctctc cctctctccc tccctctctt 360
tgattctttg tcttctccag ttaaaactca gatctaacac aaagcttaaa agattctcat 420
cgtttcttgt tttctttgtt tcatcttgta gatctctgaa gttggactaa ttgtgaatga 480
aagagttggg acaagagaaa cgcaaagaaa ctgacagaag agagtgagca cacaaaggca 540
atttgcatat cattgcactt gcttctcttg cgtgctcact gctctttctg tcagattccg 600
gtgctgatct cttt 614
<210> 210
<211> 422
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 210
ctctgccttt agttctttct tttttggtaa tatatttatt tttcgttacg atttggtcaa 60
aaccctagat ttgttttcca aaagcatatc tgaaaatgaa ggacaacttt cctcttctcc 120
ttcggttata aatattctct ccggttttgc ttgtttaacc taaaagcctc agatctaact 180
ccaacacctt caaagtctgc ctcctttcca atcttctttc ttctgttcga tctctaatct 240
cagaatttgt gtcggtaagg taaaggtgat aatgagtgat gactgatgag ggagttttgg 300
gacaaatttt aagagaaacg catagaaact gacagaagag agtgagcaca caaaggcact 360
ttgcatgttc gatgcatttg cttctcttgc gtgctcactg ctctatctgt cagattccgg 420
ct 422
<210> 211
<211> 268
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 211
tcccacatcc aaagatagaa agatgtaagg tctagagtct tgttcttaat cccctaacag 60
aacaatgata tatataaata aatatgggtc gatatcggct gtggaggacg actagctacg 120
gtttcgagcc tggtcacatg cgtagagtgt gaaaggtaat taggaggtga cagaagagag 180
tgagcacaca tggtggtttc ttgcatgctt ttttgattag ggtttcatgc ttgaagctat 240
gtgtgcttac tctctctctg tcacccct 268
<210> 212
<211> 328
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 212
tcccacagcc aatgagccaa agataaagaa acacctatcc tataataatt tagagcaata 60
tacctccata atggaacatc tatatatata aaggtatccg tatatctcta tatattatat 120
tcattgagtt taaagtggct agggtttata gatgtatgtg atattaagag atatgaaaca 180
tatttgtcga cggtttgagt ggtgaggaat tgatggtgac agaagagagt gagcacacat 240
ggtggctttc ttgcatattt gaaggttcca tgcttgaagc tatgtgtgct cactctctat 300
ccgtcacccc cttctctccc tctccctc 328
<210> 213
<211> 592
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 213
aaaaaatgac gtgtcctctt ctctctctct ctttccttct ctctaagtat atttagggtt 60
aattattagg gttctttatc tctttcttca gtctttgaag tttcttcaat agctttaatt 120
gaagtgattt acctctctgg gtgtttttag tatatatatc atgtacatga tcgaatttct 180
ttctatccaa gttctcatca aaccttctca tgttttgaag agttaaaggc tttatagttt 240
gcttaggtca gatccataac atactgtatt tgacaagttt ctttgtctca cgatagatct 300
tggtctgacc aaaatgattt tctcgagaaa aaaaaagatg gaagtagagc tccttgaagt 360
tcaaacgaga gttgagcagg gtaaagaaaa gctgctaagc tatggatccc ataagcccta 420
atccttataa agaaaaaaaa ggatttggtt atatggcttg catatctcag gagctttaac 480
ttgcccttta atggctttta ctcttctttg gattgaaggg agctctacat cttctttcac 540
cttctctatt tttctttctt tattttctcc tctacagtaa tttatttgga tt 592
<210> 214
<211> 599
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 214
ttccaaaaca tgacgtggcc tcttctctct ctctctttcc ttctctctaa gtatgtttag 60
ggttaataat tagggttcct cctctctttt gttctgtctt tatatctcct tcatagctct 120
aatgtaagag atttacctct tttggtgttt ttgttaatcc acgttctcat caaaactttc 180
tcattgtttt atgaagagtt aaaggtcttt acagtttgct tatgtcagat ccataatata 240
tttgacaaga tactttgttt ttcgatagat cttgatctga cgatggaagt agagctcctt 300
aaagttcaaa catgagttga gcagggtaaa gaaaagctgc taagctatgg atcccataag 360
ccctaatcct tgtaaagtaa aaaaggattt ggttatatgg attgcatatc tcaggagctt 420
taacttgccc tttaatggct tttactcttc tttggattga agggagctct acatcttctt 480
tcaccttctc tattttttat ttttctttat ttctactcaa caattattta ttcggattca 540
tctttaattt tccgttataa tttctttttg gtaaggatta ttcgctataa tttgagaat 599
<210> 215
<211> 623
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 215
ttccaacgaa tgacgtgtac tctctctgct ctatctctct ctctaaatat gtttagggtt 60
aattagggtt cttcatctgt ctctctctct ctctctcttc agagtcttta tagcttcttc 120
caagattttt aattgaaagt aatttacctc ttttggagtt ctgtacatat agaatatcag 180
gagtcgtgtt tcttttttat caaggttctc atctaacctt tatagtattt tcattagttg 240
ataaaggtct tcatagtttg cttagatcag atcttgtctt cgtcttttcg atagatcttg 300
ttctgtccaa tatacagtga ttttatttcg agagcaaaaa agatgagagg tagagctcct 360
tgaagttcaa acgagagttt agcagggtag agaaaagctg ctaagctatg gatcccataa 420
gccctaatcc ttgttaatga taaaggattt ggttatatgg cttgcatatc tcaggagctt 480
taacttgccc tttaattgct tttactcttc tttggattga agggagctct acatcttctt 540
tgacttctct ctctattaag tctttcttta ttttcttctc tacaatagtt gttttggatc 600
ggaagatctt taagtttccc tta 623
<210> 216
<211> 612
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 216
tttcactttt gttctcctcc tccctttttt tcttttcagg attcttcttt tctatgtttt 60
atctttcata atagatctga taattttgat ttttcactat atatattatg gttaatacta 120
gtagcttttt catttcaagt tttatccttc cattggttct ttctgagtca aattgtctcc 180
tgtttcgaac catatataag ttttcaatgg ttttgtatta actcaagtat tcaacattat 240
gtctctcttt ttcttgcttg gatctctaat gctgttcata ttttaaagca taggtttagg 300
ttagatgcat gtaactgcca attaaaagaa ggtcaagagt tttttgattg tatgaatata 360
tgagttagtc aaagcagatc cacacgatta tatagaaaaa caaaggaaga agaagaggaa 420
gagctccttg aagttcaatg gagggtttag cagggtgaag taaagctgct aagctatgga 480
tcccataagc cttatcaaat tcaatataat tgatgataag gtttttttta tggatgccat 540
atctcaggag ctttcactta cccctttaat ggcttcactc ttctttggat tgaagggagc 600
tcttcatctc tc 612
<210> 217
<211> 515
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 217
catcccaccc ttaattgttt tatataaacc atttctcctc ctctctccat caccttcaat 60
ctctctcgat ctctctctgg atccccaatc tcacctccat gttttgtttg ttgattccca 120
tcttctcttt tgtcttttca ccaaatcgtc atttaaggct tcaagaacag taaccccaat 180
tcctccacaa gagggagaga aaacaaaaga tcttccaatt ccattctcgt acatgcaaat 240
cacaatccat gccatagatt gtttctattc ctccttattt attgcttgta tctgttcatg 300
catggaccag gtggagagag cattacttaa aaatagaatt agctatctgt tttaggcgaa 360
ttagtttcct tacataacca tgtatatgtc atgacgcata tacatatgta gatgtatatg 420
tattatatat gtatgcctgg ctccctgtat gccatatgct gagcccatcg agtatcgatg 480
acctccgtgg atggcgtatg aggagccatg catat 515
<210> 218
<211> 276
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 218
actcataact ctccccaaat tcttgaccaa aaatatccgc cactttctct ctggttcatg 60
ttttcccctc aatgaaatac atacacattt tgattttatt taaatcaaga tcgacgtata 120
agctatccac caatcatatt taagggttcc cgtatacata tatactatat atatatatgg 180
aataatagtc gtgcctggct ccctgtatgc cacaagaaaa catcgattta gtttcaaaat 240
cgatcactag tggcgtacag agtagtcaag catgac 276
<210> 219
<211> 243
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 219
ctctaactca tccttctctt ctatgaaaat tccattgttt ctgccgaagc tttgatcagt 60
acttctcttt tgcttgatct cggtttttga ccagtttatt gcgtcgatca atgcattgaa 120
agtgactaca tcggggttcc gatttttttt gttcttcata tgatgaagcg gaaacagtaa 180
tcaaccctgg tttagtcact ttcactgcat taatcaatgc atttgtaaaa agagggaaaa 240
gca 243
<210> 220
<211> 537
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 220
ctagaagaaa aaaccagatc tataaagttt gttattaaaa gatagagaga gaggagggat 60
gtagtaggcc aataggcaaa tcagagaatc acaaatggta tctggtcaag aagattcctg 120
gttaaaactt tcatctctct gtttcctttt tctttctttg ttggattcat taatttgaca 180
tatctctatc atcacactga ttctctttct cccagtttgt ctgcagatgc atgtgtgtaa 240
tctagggtat atgtttttgt ccatttggtt tcataaggca ataaagatcc agctatttac 300
tacttgtggt atagattttg actgttgaat tttcagatct gatgtgtttc gtttgatccg 360
attcggaaaa tttatgtttc gttgacattt tggagtttag ttggaagaag agtgagagtc 420
gctggaggca gcggttcatc gatctcttcc tgtgaacaca ttaaaaatgt aaaagcatga 480
atagatcgat aaacctctgc atccagcgtt tgcctcttgt atctttctta ttgactt 537
<210> 221
<211> 261
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 221
ctgcatctat ccacctctct ctgtaaattt atctaaatgt ttcttttaat ctttttgaga 60
ttaataatga tttgtgtttg ttcatcaacc gattttctca gatctgtcaa ttatttttgt 120
ttatttattt atgatttatg aatgaggaaa gagtgaagtc gctggaggca gcggttcatc 180
gatcaattcc tgtgaatatt tatttttgtt tacaaaagca agaatcgatc gataaacctc 240
tgcatccagc gctgcttgct c 261
<210> 222
<211> 481
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 222
tatcacagtt ctcatcaaat atttgaaagt atcaaacaaa aaaaggagag tgagaaaaat 60
aaagagagag atagagagag atcatgtcca ctactcaaga gcataggtct tgattggtgg 120
aagacaagta ccttagataa accgaccaaa acccggtgga taaaatcgag ttccaacctc 180
ttcaacgaca acgatttcaa cactctcttc caggaacaac ttcctccagg cagatgatac 240
taaagtgctg gagttcccgg ttcctgagag tgagtccata tcaaaatgcg cattcgttat 300
cacttggttg aacccatttg gggatttaaa tttggaggtg aaatggaacg cgtaattgat 360
gactcctacg tggaacctct tcttaggaag agcacggtcg aagaagtaac tgcgcagtgc 420
ttaaatcgta gatgctaaag tcgttgaaga ggacttggaa cttcgatatt atcccccgtg 480
t 481
<210> 223
<211> 471
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 223
agtagggttg gaaaattttt ttacattttt actctaaaat agaatagagt tggagatgcc 60
cttagcagtt attagacaag ggattgtttg gccctagcga tcctctcttc actctctcac 120
ttttgtagtt caacccttct tttgcgtgag atgccatcat ggcatgacat ggttcttttg 180
ccttacgtaa aacacactca cgccaacaca cgccacataa cataaataaa ttatatatac 240
atatacgtat gtgcgtgtga gtcttccatt aatgcaatct ttgggcctat atatatatac 300
aaaccttcca taaccaaagt tatcatacta caaaagctct ctcgtacttg gaaatgcggg 360
tgagaatctc catgttggag aagcagggca cgtgcaaacc aacaaacacg aaatccgtct 420
catgtgtttt gcacgtactc cccttctcca acatgagctc ctgacccatt g 471
<210> 224
<211> 466
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 224
agacaagccc ccacactaaa aaaacagtaa tatggaataa aaaaaagctt tcaaaactta 60
gcagttatta gacaaggtat tgtttggccc tagctagcga tcgtttagct ctcttcactc 120
tctcactttt ttagttcaac ccttcttttg cgtgagatgc catcatggca tggtatggtt 180
cttttgcctt acgtaaaaca cactcacgcc agcacacaca cacacacaca taacatatac 240
ggatgtgcgt gtgagctagt cttccattaa tgcaatcttt gggcctatat atacaaacct 300
ttccataacc aaagttctca tactacaaac gcccctcatg tgcttggaaa tgcgggtgag 360
aatctccatg ttggagaagc agggcacgtg caaaccaaca aacacgaaat ccgtctcatt 420
tgcttatttg cacgtactta acttctccaa catgagctct tcaccc 466
<210> 225
<211> 450
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 225
agacaacccc acgttttaaa ataagaaatg atgataattt tgtggaaata aaagctagta 60
tacttttgca ataattagac aaggtattga tgctttgggc caagctagtt tcttttagca 120
ctcttcactc actagttttt cttctcagcc cttcttttgc gtgaaatgcc atcatggcat 180
ggcattgtca ttttgccttt cgtaaaacac actcacgcca acatacatta ttcatattca 240
tgtgtatgta tatgaatgtt ccattaatgc aatctttggg gcctatatat acgaagctta 300
catcaccaaa gctctcatat tacaaaagct cacatatata cttggaaatg taggtgagaa 360
cctccatgtt ggagaagcag ggcacgtgca aaccaaaaaa catgaaatct gtttcatatg 420
ctttgcacgt gctcccctcc tccaacatga 450
<210> 226
<211> 513
<212> DNA
<213> 番木瓜
<400> 226
agacaacact cctctttgtt cccttcctca cgtatccact tttgaaattt gtaatttgtg 60
tgcaccacca tgattgcatg ccatccctac ttgccttttc cccttttcct ttctctaaca 120
ttttactcaa tcttcttctc cccctccccc ccttccccct ctctgccatt ataaccataa 180
ttaaacctct ctccctctct ctccctctct ctctctctct ctctgggttc tcagtataaa 240
tgcagctctg cttatacttc cacacctata tatatatacc tgacccttct tcacctcctt 300
catccacctc ctccttcttc cccaaaactt tcttaactgt tctctgcata catatatatc 360
cacatacata tatatatata tagagagaga gtgagacaga gaggttaccg aggcaattgg 420
gtgagtagct ccctgttgga gaagcagggc acgtgcaaat tctccatggc tttcccctct 480
ttgcacgtgc tccccttctc caacatgggt tcc 513
<210> 227
<211> 464
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 227
cggccacccc cacatttaac aagaaaaaaa ctgatggaat taaaaggttt gagaacttgg 60
cagttattag acaaggtata gtttggccct agcttctttt aatttagctc tctccactct 120
cacacttttc aactttcacc cttctcttgc gtgagtcgcg agatgccatc atggcatggc 180
atggcatgtt tctattgcct tacgtaaaac acactcacgc caacacatac tcactataca 240
tgtaaataag tatgtgcgcg tgtgagtctt ccatccatca atgcaatctt tggggctata 300
tatatacaaa ccttttccat aaccaaagct ctcatataaa ctacaaaagg ctcacttggg 360
aaatgcgggt gagaatctcc acgttggaga agcagggcac gtgcaaacca acaaacacga 420
aaccctcctc atgtgctttg cacgtactcc ccttctccaa catg 464
<210> 228
<211> 571
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 228
gaaaacccaa gttcaggcta acaagttatc tgatgatgag atcaagaatt ttaaagtttc 60
aatatagatt tggcatgggt attggcggca gaaagcaatt aaaaaaccag ttatgtcaaa 120
ttcaaggtcg tatcagttaa aatgaatgaa gatttagaaa tttcaacaag gaagaggacc 180
ccacagcttt gttaaattaa gtgtgtggtt tttataatta tcatctcgaa agtttcataa 240
tatcaattag attaaaacat ctctgaattt cataattaca aaccagatag atagatacat 300
gaaaacttag accccagaga tctgtcttta aagaatgccc acttctagac tcaatctcta 360
ttactctctt tttttctctc tctctctctt cggaaaaact tgtatataaa taaatgacac 420
tttctttgct ttctgcactc aactcatgaa cttgaaaagc tttacttgga tgggttggtt 480
gggggtgagt atctcttgtt ggagaagcag ggcacgtgca agttcctatg tttaagtgaa 540
ctttgcacgt gctccccttc tccaccgtga g 571
<210> 229
<211> 592
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 229
gaagagaaaa aacctagtgt aaaatttgat atactcttta tgtatagtac gaatgttttt 60
ttaaaaatta tgtaaaaaat gataaaataa taactaacta aattaacagt aaaattagaa 120
aagtaaaata ctatgcccaa atttgatatt tttttttata tatttgtata gattattatt 180
atttgatatg taaagtccaa ttaaaaattt gttttaacta agatttgaac taggttttct 240
taaaagactc atcttttact tcaaatttat ttatcatttg aattcaatca ctttctaata 300
ttattattat tatttccacc atactcattg cttctgccac gttactttag ttagatctct 360
tatgtcatat atctctctct ctcctaagtt gctacctata aatactaagc ctttcccttg 420
gttggttcaa ttcaacttct acttctcatc aaacacaaag tgcaataagc ttcatttcct 480
gggtgagaag ctccttgttg gagaagcagg gcacgtgcaa atcctctttc tgattcattc 540
tctcataatg catatcaata tcttttgcac gtgctcccct tctccaacta gg 592
<210> 230
<211> 520
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 230
atgcaaaccc actccaacac tccacaatcc acatactctc tctctctctc tctctctgag 60
taggagtaca tgtgtgtgtg tgatatcaat atgcattcga tgttgatgct actgtagcca 120
tcttgtggct atataaaccc agcaggcagc agcacagctt agctagagag ccatattgca 180
tgcacactcg ctaatctctt ttctctactc tacttgcatt acaccacctc tgcattgcac 240
ttcagttcat tcattccact gatgcatgga tcgatgttgc taccttcttc tcttctcctc 300
atgcatccat gcatcgatct cacctagctt cttcctcatc ctctctcgat cgattacaag 360
agaaaagtgt ttgctgttct tgctatcgat ctacaggtga gtaggttctt gttggagaag 420
cagggtacgt gcaaaatgca caccggttgg tcgagctaat taacaagctc tgacgaccat 480
ggtgatcgaa tgcacgtgct ccccttctcc accatggcct 520
<210> 231
<211> 501
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 231
ctagggttta ggaatgacga cttgtttctg ttgtgtctta ttaaaagccc atcttcgtct 60
ccgccactca tcattccctc atcataacac catcatcacc attcaccaac ctctctctct 120
ttctctctct cctctcgatc tacaacaaaa tgtgaatctg ctaagatcga ttatcatgag 180
aattaagcta tttcagttga ggggaatgtt gtctggatcg aggatattat acatatatac 240
atgtgtatgt tgatacatgt gatcatagag agtatcctcg gaccaggctt catccccccc 300
aacatgttat tgcctctgat caccatatat atgtcgttac atttcatggt taattacttg 360
cacaaatcac aaaagcttgg tttgtaactt tctatgacct tttttaatga ctttgaatct 420
ttcatgcatg acttcttaag agtagattta cacatttgcg gatccgttta tgctttttgc 480
ttttgtttcg tttatatata t 501
<210> 232
<211> 484
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 232
ctagggttta ggaatgacga cctgtttctg ttgtgtctta ttaaaagccc atcttcgtct 60
ccgccactca tcattccctc atcataacac catcatcacc attcaccaac ctctctctct 120
ctctcctcta tcactctcta caacaaaaat ttgtgaatct gctaagatcg attatcatga 180
gggttaagct atttcagttg aggggaatgt tgtctggatc gaggatatta tagatatata 240
catgtgtatg ttaatgattc aagtgatcat agagagtatc ctcggaccag gcttcatccc 300
ccccaacatg ttattgcctc tgatcaccat ttattgttac attttttttt gttaattact 360
tgcgcaaatt acaaaagctt ggtttttgtg atgactttga atctttcttg catggcttct 420
taagagtaga tttacggatc cgtctatgct ttttgctttt tgtttcgttt atttgtattt 480
aaac 484
<210> 233
<211> 552
<212> DNA
<213> 埃塞俄比亚芥
<400> 233
gagatcaatg aaattatcct gccaaataaa acgtgtgacg tttattcaaa aatatatgca 60
ttagatgctt tgatattaaa atatttcctt ttaaaagcta gctagggttt aggaatgacg 120
agttgtgtct tattaaaagc ccttcttctc ctccgccact catcattccc tcatcataac 180
accatcatca ccattcaccc acctctcctc tttctctctc tctctctctc tctctctctc 240
tagaacaaca agtgagaatc tgctaaaata ttgtgactat tatcatgaga atgaagctat 300
ttcagttgag gggaatgttg tctggatcga ggatattata tatacacaaa tacgtatata 360
tgttaataca agtgtttgat catatatgta tatagattat tctcggacca ggcttcatcc 420
cccctaacat gttattgcct ctgatcacca gattctatca actcttcgct tattattttg 480
tcacaaacaa gtaataagct cataattttc tttgagtctt tcagcatcgt ttcattatgt 540
ttttcgaatc cg 552
<210> 234
<211> 566
<212> DNA
<213> 芥菜
<400> 234
gagatcaatg aaattatcct gccaaataaa acgtgtgacg tttattcaaa aatatatgca 60
ttaaatgctt tgatattaaa atatttcctt ttaaaagcta gctagggttt aggaatgacg 120
agttgtgtct tattaaaagc ccttcttctc ctccgccact catcattccc tcatcataac 180
accatcatca ccattcatcc acctcttctc tcctctctct ctctctctct ctctctctct 240
ctctctctct ctctagaaca acaagtgaga atctgctaaa atattgtgat tattatcatg 300
agaatgaagc tatttcagtt gaggggaatg ttgtctggat cgaggatatt atatatacac 360
aaatatgtat atatatgtta atatcagtgt ttgatcatat atatgtatat agattattct 420
cggaccaggc ttcatccccc ctaacatgtt attgcctctg atcaccagat tctatcaact 480
cttagcttat tatttgtcac aaacaagtaa taagctcaat aatgtctttg agtctttcag 540
catcgtttca tatgttttcg aatccg 566
<210> 235
<211> 549
<212> DNA
<213> 欧洲油菜
<400> 235
gatatcaatg aaattatcct gccaaataaa acgtgtgacg tttattcaaa aatatatgct 60
ttaaatgctt tcatattaaa atatttcctt ttaaaagcta gctagggttt aggaatgacg 120
agttgtgtct tattaaaagc ccttcttctc ctccgccact catcattccc tcatcataac 180
accatcatca ccattcaccc acctctcctc tttctctctc tctctctctc tctctctctc 240
tagaacaaca agtgagaatc tgctaaaata ttgtgactat tatcatgaga atgaagctat 300
ttcagttgag gggaatgttg tctggatcga ggatattata tatacacaaa tacgtatata 360
tgataataca agtgtttgat catatatgta tatagattat tctcggacca ggcttcatcc 420
cccctaacat gttattgcct ctgatcacca gattctatca actcttcgct tattatttgt 480
cacaaacaag taataagctc aataatgtct ttgagtcttt cagcatcgtt tcatatgttt 540
tcgaatccg 549
<210> 236
<211> 543
<212> DNA
<213> 甘蓝
<400> 236
gggatcaatg aaaattatcc tgccaaataa aaacgtgtga cgtttatcca aaaatatatg 60
cattaaatgc tgtgatatga agtatttcct ttaaaagcta gctagggttt aggaattacg 120
agttgtgttt tattaaaagc ccttcttctc ctccgccact catcattccc tcatcataac 180
accatcatca ccattcaccc acctctcctc tttctctctc tctctctctc tctctagaac 240
aacaagtgag aatctgctaa aatattgtga ctattatcat gagaatgaag ctatttcagt 300
tgaggggaat gttgtctgga tcgaggatat tatatataca caagtacgta tatatgttaa 360
tacaagtgtt tgatcatata tgtatataga ttattctcgg accaggcttc atccccccta 420
acatgttatt gcctctgatc accagattct atcaactctt cgcttattat ttgtcacaaa 480
caagtagtaa gctcaataat gtctttgagc ctttcagcat cgtttcatat gttttcgaat 540
ccg 543
<210> 237
<211> 566
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 237
gagatcaatg aaattatcct gccaaataaa acgtgtgacg tttattcaaa aatatatgca 60
ttaaatgctt tgatattaaa atatttcctt ttaaaagcta gctagggttt aggaatgacg 120
agttgtgtct tattaaaagc ccttcttctc ctccgccact catcattccc tcatcataac 180
accatcatca ccattcatcc acctcttctc tcctctctct ctctctctct ctctctctct 240
ctctctctct ctctagaaca acaagtgaga atctgctaaa atattgtgat tattatcatg 300
agaatgaagc tatttcagtt gaggggaatg ttgtctggat cgaggatatt atatatacac 360
aaatatgtat atatatgtta atatcagtgt ttgatcatat atatgtatat agattattct 420
cggaccaggc ttcatccccc ctaacatgtt attgcctctg atcaccagat tctatcaact 480
cttagcttat tatttgtcac aaacaagtaa taagctcaat aatgtctttg agtctttcag 540
catcgtttca tatgttttcg aatccg 566
<210> 238
<211> 414
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 238
catcatcacc actcacttat cttcttctcc atctctctct ctgcttctcc cttaatctta 60
gccgggtctc gtgggggacg aacatagaaa gagagagata taaagatata tattcagaaa 120
ccctagattc tataatttcg actgaaaaga aaaaggggct ttctcttttg aggggactgt 180
tgtctggctc gaggactctg gctcgctcta ttcatgttgg atctctttcg atctaacaat 240
cgaattgaac cttcagattt cagatttgat tagggtttta gcgtcttcgg accaggcttc 300
attcccccca attgttgctc cctgtttact ccatatttct tccttctttt caaattaggg 360
tttcagatcc agtgaatgaa cccttgttaa aggtttgatc tcttacctta cttt 414
<210> 239
<211> 328
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 239
tctcatcatt ctcttcatca tcaccacatt catctctctc tctctctctc tctctctctc 60
tttctcttcc ttgatcttag ccggatctgt tgggggacga acacatgaga gatagataaa 120
atataagaaa tttctcgaaa aaacctaata gaaaaaggtc tgtttcttaa agaagaagaa 180
gaagaggatt taaagaggga tttttctttt gaggggactg ttgtctggct cgaggactct 240
tattctaata caatctcatt tgaatacatt cagatctgat gattgattag ggttttagtg 300
tcgtcggacc aggcttcatt ccccccaa 328
<210> 240
<211> 192
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 240
tgatgaacag aaaaatctct ctttctcttt cttgatctgc tacggtgaag tctatggtgc 60
accggcatct gatgaagctg ccagcatgat ctaattagct ttctttatcc tttgttgtgt 120
ttcatgacga tggttaagag atcagtctcg attagatcat gttcgcagtt tcacccgttg 180
actgtcgcac cc 192
<210> 241
<211> 846
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 241
aaccacaaag taccgctgct attttctttt tacgtctttg tatttgcatc gtctaagaga 60
atgatgggtt gttttgtggg attttaatgc aggaggaaac atatgagggg tgattaaggc 120
aaaaacctta agatgtggtc atttagatac atggagtcaa actaagaatg gaccttggcg 180
aaagcttctt cacggtcaag atttaaaatc aggtacgaca ctgtgtacgt gagagagaga 240
gagagagaga gaaagagatt atagaaagaa agagatgtat cacaataaag gagtatattt 300
agggtcacag gtggtggaga tataggtatg cagggccaag gctctaatct cttcatagcc 360
ctattgattt tgtccctctc tctctctctt tcttcctctc ttagctgtat gcattatgat 420
gcgtctttta attcactgtt tcaggcttct ttaattcgtg gtgtctctct cctttttacc 480
caaccatctc ttaaaatttt taacatctgt tcctcaaatc ctctctcatc tctttctata 540
agtatctata gcgcctctta aaccacaaag catcacctct gtcttctctc atctcctttc 600
tgtattctct ttcattgcct tcacgtctgt tgcaatttct ccacttcttg agcttccgtt 660
ttttacaatt attgatccgt caaatatgtg agatttgcac aacttgttgc tcaggtattt 720
tgaagacaag tccacaaggg aacaagtgaa gctgccagca tgatctatct ttggttaaga 780
gatgaatgtg gaaacatatt gcttaaaccc aagctaggtc atgctctgac agcctcactc 840
cttcct 846
<210> 242
<211> 571
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 242
gagcaagaca atgccacata caaacttgaa agatctcttc atcttttctc caaatgtttt 60
tttttcgttt gctatttatc tccacaattc ttggaacaaa aactacattc acaaacgaga 120
gaattttcac aacacctctt ttgctctcat tttttttttt tcgtccatta tgagtattaa 180
ttatggttag ggaatcttac agaatgaaaa tgaaggtgtg aatggattgt ctcatctaaa 240
gccttgaatg tgggaaaaag gccattgttg ttcagccaag gatgacttgc cggtagcttg 300
tattatgatt actctatatt cgatttatat tatggagatg atggtttata tatatttact 360
tatctacata gttttagttg attttttttc gtacgtaata taatacgaaa aagtatttac 420
ttatttatat atgtgtgttg gggcaagaag tgtaaccaag ctagcccggc aagtcatcta 480
tggctatgca actgtctctt cctctcattc taggcttacg atgacacgta aaaaatccca 540
aatatcacta atatgatatg aatatggatg a 571
<210> 243
<211> 241
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 243
aggcatgaga cataaagaga gttaaatata atgaagaaga gaggtctaat atggcgaaaa 60
gagtcatgtt taatagccaa ggatgacttg cctgatcttt ttcacctcca tgattcaatt 120
ttaagttcgt ggattttgga ttattatgcg tttaaaaggt ataataattt gagatcatgt 180
tgaatcttgc gggttaggtt tcaggcagtc tctttggcta tcttgacatg ctttcttcat 240
c 241
<210> 244
<211> 689
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 244
gaattttgat ttatgaacct cctcaagaag gaaagacaga ggaggagaca aagaagtata 60
ggttcacatt gcatagccag tttagttttg aaggatggat atatgaaaaa aatatgaaga 120
gagagaagag agaagaagag gaggattaaa gagggtgagg ccagcttttg tgctttggta 180
gtagatgagg tttaaatgct ccataccttc catttccttc tctcttaccc taatttaatt 240
cttcctctcc tttataactc cccacagaca ttctcacttc tcctcctcac acttcacatc 300
aacacttctt tcttgttttt tcattttaca atgtttcctt tgatatccgc actttaagca 360
tgagagagtc cctttgatat tggcctggtt cactcagatc ttacctgacc acacacgtag 420
atatacatta ttctctctag attatctgat tgagccgcgc caatatctca gtactctctc 480
gtctctattt tggactttgt ggtcttgtag atcgatttgt atgtgtgtgt tgaaatggag 540
acaagtactt gtaacttctt tgttgttata ttgtttacct ataggctgat gtcataaact 600
cttttgatct tgtttctaac ttccagattc ttgaaaaatc aagtcgtgtg tgtgtctcca 660
tggaagcctt ttccatttct tcctttcca 689
<210> 245
<211> 452
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 245
actcataaac tttgctactg gccgcatttc tattttctcc ttcgattctt ctaattcgta 60
ctttggtttc tgacgtccct aaaattttta gacagtaaga gtttctccag gatccgatgg 120
ttctctccgg taaattaaca ttttagtgtc aatagtcatt tatacatatt tttatttcac 180
tttttgtttt gtttattggt tttctggagc taagtggaga ttatagtcga acaagagtgg 240
ttttatgcaa ggtaacgcga gatattagtg cggttcaatc aaatagtcgt cctcttaact 300
catggagaac ggtgttgttc gattgagccg tgccaatatc acgcggtaaa ccaaaaatgg 360
caaagatagt tattataacc ttaaaggtat gtatcattat cgttttattg tttcaatttt 420
gattaatggc tttgatattt catttttttt tt 452
<210> 246
<211> 767
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 246
attggtcaaa catacataca gtagcactag ctggtttcat tattccacta tgcttcttca 60
taggctctcc aaattttgca aaattgaaag agacatagta tatatatctt agcaaggaga 120
aattcaggat attgaggatg aagattgaag agtaatcagt gatgaagaaa gcaagcaagg 180
tattggcgcg cctcaatttg aatacatggc tataaaaatg catcatatca gccatgtagt 240
ttgattgagc cgcgtcaata tcttgtttcc atctccaaat ttaccaatct catcaaatca 300
aattaacacc acaatcaagg ctttcattta atgcagtcaa aataggttga ccttatcatc 360
gaagaaattg ttttctcatt cctatcgaag ttggacttgc cgaaaatgct cgaaagcatg 420
tgttttagtt cgacaggcga aaaagttacc gaaggacaat ttggttgtgg ttcggataag 480
atcaagcaac ggatattttc aagacacgtt cgaaattcaa atcaaatgga taagtatcgt 540
tagtttactg cagttatagt tttaaattca aatctaggca gttgtttcta tttgtataaa 600
tagtagtttt tccctaggga aaaggggtcg caattcaatc atacaaaaaa cttacaatca 660
aattatccgc atggaagaga gaaacgagtc acaagttgca atgtatgaac atgtgtacca 720
atttacattc aatcagtaca atttaagttc atttccataa aaaaaaa 767
<210> 247
<211> 854
<212> DNA
<213> 玉蜀黍
<400> 247
accagggtta ggtatccatc cacacagcaa tgcatctgcc ttcaactccc tctcgccccc 60
caccccaaca cacatctctc tcttttctag ggaaggaaat gacgaagggg acgacgacgg 120
catgcttcgg ctagctcgtt ggtgctagga caagggcgga ggtattggcg cgcctcaatc 180
cgaaggcgtg gctgatagat tggcgcggca gccatgttct tggattgagc cgcgtcaata 240
tctccccttg cctgtcccgt acctagctag cttgcttgcc tcactgatcg atgtcgtccc 300
tatttcatgg agaagctgat gattgattat tctcacaagc aagaactgtc tgatctgttg 360
cctgcatcga tcaggatcta tatgctggag agttcacaag aacatggaca gaactcgctt 420
caacaaccga tcaatcgatt gattaggtat gtacctacct catatgcctc agctcttcgt 480
tatggatttc ttcaaccgaa gggtcagtaa gctcttggtt ccatgccact gcgtgaacta 540
agcgttcaca aaatccgttc cmcggcatga accaagcact caaaatcgca tgcagcatct 600
ttcgtttcaa aaaaaaattg acttytgaaa acaatagatg aatcagtttc aaacatatat 660
gattatccat tttctcaacc gggaatttat atctcgttgg gatgcaaaac cgttcagtag 720
taaaactact ccacgagtat aaactgtttc agttatttta ctattaatta gttacccgta 780
tgctgttatg gtttctatat atctataagt aaaccttact taaataagat agttatacaa 840
aaaaaaaaaa aaaa 854
<210> 248
<211> 660
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 248
caagaaaaaa cattgaaata gctcatgttg tctctttctc attttcatat ctgctaaaaa 60
aagaaccgtg ttttctaaac tggtttaacg gtaagtacct gtctctagta acttacctat 120
caatttgttc caatcattta cttgctttga cttatttggt ttccttttgt tttgtttttc 180
tttaatatgt ggatggagtt tggtgtaata agcaactgaa gagtcgatga gcgcactatc 240
ggacatcaaa tacgagatat tggtgcggtt caatcagaaa accgtactct tttgttttaa 300
agatcggttt atttgattga gccgtgccaa tatcacgcgt ttaaatagtt taaagattct 360
atgttagttg atgtgatcaa tcaaggtatg aatctatatc aattctctta tgcatagttt 420
tatatttaca gagatgaggt attatcaatg tctatcgtcg aggatcacgc tcttacttat 480
gttatatttc tatataattt tattaattag ttttctaaaa gagaaggaca atttaaaatt 540
attttaaaga gtttttttta agtagttttg ttttcatgtt tatcttctgc aggctctgaa 600
gttaggatag taacaagaaa aaagacagaa aaaaagaaga aaattcatat acattcgtga 660
<210> 249
<211> 225
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 249
gaataagtga atattatcga tatttatatc atatatcaac ttttcttctg tgcttgcttg 60
caaatttgca attaagcttt tttgatctta tgtaagagaa tattattgat gatggtgttt 120
gggaagccga aaaaagcgat gttggtgagg ttcaatccga agacggattt acatgtatag 180
agttgtaaaa tacgatctca gattgagccg cgccaatatc acttt 225
<210> 250
<211> 367
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 250
ccacaaaact ataactagct agaagcttta atcgccttat ttattataat aataataata 60
aatatggctt cagctgcaaa agtatacatg gcgtgatatt gatccggctc atctatatct 120
tcaagttcaa tcatccatat tcatatcaat ttcagacgag ccgaatcaat atcactcttg 180
tttgcttcat tgcatattaa ttatatactt catttataag ttatagtttg ccatatatat 240
attagattga ttctgcagaa gtagacagga gtggtgttgt ttctgctcat cttattaaat 300
aatgaatgaa tgaatgacat ttgcttactt ataagacgag ccgaatcaat atcactccag 360
tacacct 367
<210> 251
<211> 712
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 251
ctctctctct ctctctctct catctgtgtt ctagatctca ccaggtcttt ctctggttaa 60
tatatggctt ccaagatctg gtaatatgtt ataaatacgt catacttaag cttttttcaa 120
atcaaaaata gaaatttgtg ggtttgtctc gttttactat tttagcagta tatattaaga 180
agttcagatg ttattcgatc atctgttttt gcttcccctc tgccatcttt atcttttagg 240
gtttcaattc tttttcactt ttttcttctg gtttggagat ggttaggttc caactaagta 300
tacgagatta aatttgacat cttagttact tcaaaattcc ttcaatcaaa acaagtcatc 360
tcgactattc cgccatgttt gtatatacat atttatatat tatatatatg aaggtacgag 420
tttctagtgt ctataaatta agaaggttaa gtaccatata gatgatattt gttaagtagt 480
aagtcactca aagtttgagt ttgggtttga gtttgagttt gagtttgagt ttgagagaca 540
aaagattact acaagaagat tgttaaacaa aaatggaaga ctaatttccg gagccacggt 600
cgttgttggc tgctgtggca tcatcaagat tcacatctgt tgatggacgg tggtgattca 660
ctctccacaa agttctctat gaaaatgaga atcttgatga tgctgcatcg gc 712
<210> 252
<211> 714
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 252
acttgcacct ctcactccct ttctctaact agtcttgtgt gcacccattt atgtgtacgt 60
actattatct cataaataaa tatttttaaa attagatgca tttattgata tgaaaaagtt 120
acaagattag tttgttgtgt gtgagacttt ggatcgacag atcgaaaaat taactaaccg 180
gtcagtattg aatatcaact attatatgct ccatgcattc gcttatagtt tcacacaatt 240
tgttttcttc acggtctaaa atcagaagat tccatatatt ttcttatgac gtaaaaggac 300
cacttataag ttgacacgtc agcccttgga ttcgtgaggt ttttctctct acttcaccta 360
tctacttttc ctcatatccc actgcttttc tccttcttgt tcttgttttt ctcgtttttt 420
tcttcttctt ctccaagaaa atagagatcg aaaagattag atctattttg tgtagcaaga 480
aattatcatt ttcgtttctt cattcatata ttgttctatt atgttgtaca ataatagata 540
ctcgatctct tgtgcgtgcg taaattttat acaagttgtc ggcggatcca tggaagaaag 600
ctcatctgtc gttgtttgta ggcgcagcac cattaagatt cacatggaaa ttgataaata 660
ccctaaatta gggttttgat atgtatatga gaatcttgat gatgctgcat caac 714
<210> 253
<211> 324
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 253
tcaccaaata ggctcttctt tatcgcttca tatatataaa agtctacatc tatctctttc 60
taggtcacta gctagactct agattaagga ttgaaattag ggtttcatgt ttccagcaaa 120
atggtgccgt cttgagtctt gaaaagatcc aagacaaaac caaatcacta catacatccc 180
tatcatcaac cagctactgt tcgctgttgg agcatcatca agattcacaa atcatcaagt 240
attcgtgtaa ataaacccat ttatgattag atttttgatg tatgtatgag aatcttgatg 300
atgctgcagc tgcaatcagt ggct 324
<210> 254
<211> 531
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 254
tgtcatattg agaactcttt agcctttggc ttctgttcct gacacttgta tagtgaagtg 60
ggcttgtgtt atatagatgg gatctctctc tttatttaaa agtcaattag agatcttgat 120
gctacttctg tccctttcca agtgatttta cgtcgaccaa ctagcttttt tcatatgagt 180
gtatatattc atgtacctat ctctctcaat tgcttctcac caaaatcatc ttgctgattc 240
atttgctgtc tgaatcctct tgctttcctc tttgcttttt catttgttga tttaaaccat 300
gggagttccc aactttagac ctcgaaaccg ataaggatct ttctctgcgg ttgaaatagc 360
taggttctcg atgaataggc tagcctttgg tggatgttat cagccagtag tcgcagatgc 420
agcaccatta agattcacaa gagatgtggt tccctttgct ttcgcctctc gatccgcaga 480
aaagggttcc ttatcgagtg ggaatcttga tgatgctgca tcagcaaata c 531
<210> 255
<211> 618
<212> DNA
<213> 塞文山鼠耳芥
<400> 255
ttgtatccat agtgtatttc ctcgcatcta ccatccattt tctacgcctc tctctctctc 60
tttctccatc aaatcttgtt ttgttcaaac tctctctctc atcaattctc tccatacaat 120
acatgcatac atacatacat accatctcta atatttcatc aatcttcttt tgttccaaac 180
gctctttctc tccatttaca tacatacgaa tcattgttgt catagatccg tttagaattg 240
ctttaacttt tagatgagat ctagggtttc tttctttttc ttcaaaatca tgctttttcg 300
cttgctaggt tatagatcca tgtaagttta gagtagatgt acacacacac gctcggacac 360
ttattaaata catgttgata cacttaatac tcgctgtttt gaattgatgt tgtaggaata 420
tataaatgta gagagagctt ccttgagtcc attcacaggt cggatatgat ccaattagct 480
tccgactcat tcatccaaat accgagtcgc caaaattcaa attagactcg ttaaatgaat 540
gaatgatgcg gtagacaaat tggatcattg attctctttg attggactga agggagctcc 600
ctctctcttc tgtattcc 618
<210> 256
<211> 660
<212> DNA
<213> 圆叶鼠耳芥
<400> 256
ttgtatccat agtgtatttc ctcgcatcta ccatccattt tctacgcctc actctctctt 60
tctccatcaa atcttgtttt gatcaaactc tctctctctc tctctcatca attgtctcca 120
tacaatacat acataccatc atctttccca tctctaatat ttcatcaatc ttcttttgtt 180
caaacgctct tcctctccat atacatatac atacatacga atcacattgg tgtcatagat 240
ccgtttagaa ttgctttaac ttttagatga gatctagggt ttctttgttt ctttcgtttt 300
cttcaaattt tgctgcatat tctccaagat catgattttt cgcttgctag gttatagatc 360
catgcaaata tagagtagat ttacacacac acacgctcgg acacttatta catacatgtt 420
gatacactta atactcgctg tttttaattg atgttgtagg aatatatata tgtagagaga 480
gcttccttga gtccattcac aggtcgtgat atgatccaat tagcttccga ctcattcatc 540
caaataccga gtcgccaaaa ttcgaactag actcgttaaa tgaatgaatg atgcggtaga 600
caaattggat cattgattct ctttgattgg actgaaggga gctccctctc tcttctgtat 660
<210> 257
<211> 632
<212> DNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 257
ttgtatccat agtgtatttc ctcgcatcta ccatccattt tctacgcctc tctctttctc 60
catcaaatct tgttttgttc caactctctc tctcatcaat tcattccata caatacatgc 120
atacatacat accatcatca tcttttccca tctctaatat ttcatcagtc ttcttttgtt 180
acaaacgctc tttctcgcca tatacataca taagaatcat tgttgtcata gatccgttta 240
gaattgcttt aacttttaga tgagatctag ggtttctttc tttttcttca atttttgctg 300
catattcttc aaaatcatga tttttcgctt gctaggttat agatccatgc aaatatagag 360
tagatgtaca cacattcacg ctcggacact tattacatac atgttgatac acttaatact 420
cgctgttttg aatggatgtt gtaggaatat atatgtagag agagcttcct tgagtccatt 480
cacaggtcgt gatatgatcc aattagcttc cgactcattc atccaaatac cgagtcgcca 540
aaattcgaac tagactcgtt aaatgaatga atgatgcggt agacaaattg gatcattgat 600
tctctttgat tggactgaag ggagctccct ct 632
<210> 258
<211> 646
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 258
ttgtatccgc agtgtatttc ctcgcatcta ccatcccttt tctacgcctc tctccctctc 60
tctctttctc catcaaatct tgttttgttc aaactctctc tctctcatct attctctcca 120
tacaatacat gaatatacat acataccatc atcttctttt cccatctcta gtttttcatc 180
aatcttctga tgttccaaac gctctatctc ttcatataca tacatacgaa tatattattg 240
ttgtcataga tccatttaga atcactttag cttttagatg agatctaggg tttctttgtt 300
ttctttcaaa ttttgttgca tattcttcta aatcatggtt tttcgcttgc taggttatag 360
atccatgcaa atatggagta gatgtacaaa cacacgctcg gacgcatatt acacatgttc 420
atacacttaa tactcgctgt tttgaattga tgttttagga atatatatgt agagagagct 480
tccttgagtc cattcacagg tcgtgatatg attcaattag cttccgactc attcatccaa 540
ataccgagtc gccaaaattc aaactagact cgttaaatga atgaatgatg cggtagacaa 600
attggatcat tgattctctt tgattggact gaagggagct ccctct 646
<210> 259
<211> 660
<212> DNA
<213> 芜青
<400> 259
ttgtatccat tgtgtatttc cttgcatcca tcaataaatt ttatgttacg cctctctatt 60
atttctctct acatcacact gtcttatgtt taagctctac ttctcagcaa ttctctccac 120
ccaatacatg catacatacc atcatcgtat cgctctaatt tttctatcaa tcttgtatcc 180
ttccacaaat tatcttatgt ctcccatttt aaatcctaca tagatccaca catacgaatt 240
attcttgtct gaagatccat ccatttacga ttgctttaac ttttacatga gatctagggc 300
ttctttattt ttcttcaaat cttgctgcat atatttcaag atcatgcttt tcggcttgct 360
agggttctag atccatggat gtatagcgta catacataca cgcactaatt catacctgta 420
gtttgtacgg agaacatcat aaaatatcac tgtttggaat taatcgtgta ggaaatatag 480
ataggtaggg agcttccttt agtccattca cagatcatga tatgatccaa ttagcttccg 540
actcattcat ccaaataccg agtcacgaaa atttcaactt agactcgtta aatgaatgaa 600
tgatgcggta aacaaattgg atcattgatt ctctctgatt ggactgaagg gagctccctc 660
<210> 260
<211> 932
<212> DNA
<213> 番木瓜
<400> 260
ctatatccct gtcaaatagt acttggtttt gttttagcca caaatcttct ggtcttgcaa 60
agttccttct gatctctccc cctttctcat tttttcctcc tcttatatat ggatcatcaa 120
tttgctgtac acacacacac atttactgta gtgataatta gctagctaat ttgttagtat 180
gtaaattaga tcccaagtac cctgttatat ttttttaggc ttatcctatg catacctgat 240
agtacaagaa cttagtttgt aattaggtac ttggtagtag ggttagatta attactgtct 300
tgaaagagaa cttatccaac aaatagagct atgaagatta aattaggttt tagtcttatt 360
aagattatta tattactaga caaaaacagt taaatttttt taattgggta attaggtact 420
tagcaatagg gttagattaa ttactgtttt gaaagagaac ctacctacaa atagagttga 480
aatgattatg ttttagtctt actaagattg tcatatttct ggaaaaaaac aaatcttgaa 540
acagataatt cagatagtca tgatcaatgg aaaaaacatc atgggtgtgt gcttaattaa 600
gctaatatat atatatatga agatataatg ttatgcacac tagctatgaa tttgtaagaa 660
taatgaagga taaagatgat atatttagat gttataagtg taagtaaggt ggaatgggtt 720
gatgggtagt agtagtagta gtagagatga ttggtggaga gagcttcctt cagcccactc 780
atggatgggt atgaaggggt agaagtagct gccgactcat tcattcagcc actcagtatg 840
taaactcgtc ccactgttga ctgtatgaat gatgcgggag atatttttac atccatcttt 900
ctctgtgctt ggactgaagg gagctccttc tt 932
<210> 261
<211> 702
<212> DNA
<213> 红荠菜
<400> 261
ttgtatccat agtgtatttc ctcgcatcta ccatctacta ttttctacgc ctctctctct 60
ttatccctct atctctttct tcatcaaatc ttcttttgtt caaagtctct ctcatcattt 120
ttctctatac acatacatgc atccacatac atacatacat ataccatcat cttcttttct 180
catctctagt ttttgtttat aaattttgtt ccaaggatct gtatctctcc aataaagata 240
catacaaatt attgttgtca tagatctatt agaattgctt taacttttat atgagatcta 300
ggatttcttc cttttctttc aaaatttgct gcatattttt caaaatcatg atttatcgct 360
tgctaggttc tagatccatg caaatttaga gtatttttac acacacacac gcttggacac 420
aagtacatac atgtagtttt cttttatgtg gtgaaaagta cataacatgt agtttatagt 480
tactagtcgc tatataattt aaaattgatg ttataggaat atatgtacgg agagagcttc 540
cttgagtcca ttcacaggtc gtgatatgat ccaattagct tccgactcat tcatccaaat 600
accgagtctc accaaaattg gaacaagact tgttaaatga atgaatgatg cggtagacaa 660
attggatcat tgattctctt tgattggact gaagggagct cc 702
<210> 262
<211> 767
<212> DNA
<213> 巨桉
<400> 262
tcgtttccca tccccatttc atagaataat gccaccaaac aaagaagcat tagctcaaag 60
actaattacc atctgtttta ttgatagata cgtgcgaaac ggtgattgtt ttttcccaaa 120
taagaaacca aaatgaagca tattcaaagg tggagatatg gggagacttc cggaaggcaa 180
ggggattgga aaaggctcga gatcaaagtg catagcaacc cttcgctaaa ggtgaaaaag 240
aatacgaata acttcagtag ctcactttaa attccgaaac attaaacaaa tcaaatctcc 300
ctcgccctcc ttgcctcctc tctttaccta tataaagcca ccgccccttc aatgaaatcc 360
acgagtggaa ggtcacagta tagtagggtc ctgcaaaggg agagcgagag cggctccact 420
gtctacctat aagcagttcc tttcttttgt ttacatgtct gttgcacctc accgagtttt 480
tctattctct ttcctctggt tggttagcag atttctcagg ggacttccct cctcccttga 540
ggatccttct cttgaagcga tatgtctcga atgggtaaga gagagagagg aagggagctt 600
tcttcagtcc acccatggga cgtgttgggt tttaattagc tgccgactca ttcatccaaa 660
taccgagcga gagcaagtaa cagagctccg taaatgaatg gatgatgcgg gagtcttgtt 720
gattcccaag ctttccgtga ttggactgaa gggagctccc tctatct 767
<210> 263
<211> 612
<212> DNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 263
gcgtatcctt ccacttacgg attcaccata gctgctatag cccgagtttg cttgtcataa 60
tagaaataaa ctaagggaga aaaaagctct ccactctcgc ctttttcttc ttcgagtctc 120
tctctttgac tggcctttgt gcaaagatct tcctttttta aacagtcgct ttctttactc 180
tccctttccc ttctttctct taattgctaa agcagcttcc acttccactc actttaaccc 240
atgatccatt tcaacctgtc acagtggaga gcaatttgta tggctaattt ccatctcacc 300
tattcttttc tgtttggggt tctctagtct agggttgcat gacatgagag acatggctct 360
tttttttttt tttcagttca caggtgttta tatatgttgt tgtgttattt tgtcttaaag 420
ctttgtgatt gatgatctga taggtaagag agagctttct tcagtccact catgggatgg 480
ggatggggtt taattagctg ccgactcatt catccaaata ctgtgttaca aaacccagta 540
aatgagtgaa tgatgcggga gacaaattga atcctaatct tcctgtgctt ggactgaagg 600
gagctccctc cc 612
<210> 264
<211> 675
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 264
atttatccaa tcatgttgct ctcacttctt ttcagcagtt ctgttgatat caccctttta 60
gttgaagctt tggattcatg actttatgag atggtaaatc tttaaattaa gtttaagtat 120
gcacttgatt tgtttatata atttgtttat ttagatttta aaccctaagt tgactttttt 180
aatttgattt aaattatgat atgattgtta tttggcttac catggtcata atttagggtt 240
tagaagatgc atgtatatct tgaattgttt atggtaataa aggggttagg atttctcctt 300
ttggtgaagt gagaaaatct cataattttg ttctgaaggt agtttttaag atttagggtt 360
atgggttctt tgtttgaatg ctttttcaag tctttttcaa tgatatttgc ctagatctgt 420
tttaattttg aattaaaatt ctgggtttgg attaatatta ttgaagatta ttattaatta 480
atttattaga aatagatgaa gagagcttcc ttcagtccac tcatggaagg gtaaggggtt 540
tgaatttacc tgctgactca ttgattcaaa cacaatagac aattatgggg ttatgctatt 600
gtgaattgtg tgaatgatgc aggaggtgaa tttcttcctt ttcttctttg cttggactga 660
agggagtctc ccttt 675
<210> 265
<211> 866
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 265
ttatatctga cgcgttgtaa tcctgtttaa ttagggcttt gcccatttct tttgacccct 60
tccggacatt cgctagttgg aaccttgttt tactcctagc agtgtactgt gtagtactta 120
ttacgagcaa acgtaaaaat aaataaatgg aaatgataca aaggccgtgt ttaattttaa 180
aatttttttt caaactttca acactttaca tcccataaaa agcttactat acatacaaac 240
ttccaacctt ttcgtcacat cgtatctaat ttcaactaaa cttttaattt tagcgtgaac 300
taaacacagc cgaagcccgg ccacattctc actattttta ttcattttat catgcctgtg 360
atgtcacgcc ttggccctat ttaataggcc ttctccattt ctctccatat gatgtcttct 420
cttctctatc cctcttgcca tcttctatct tccctcttgc acccatcttt gtgataactt 480
ctactagctc ctctcctact accagtcata ccactctcac aaatcctcca agatccgcat 540
ggggagaagc tccaaaagtt tcgtggttag tttaatttca tgcttgtttg ctgccgtttt 600
tcatgttgat ctgatcttaa tatatgtaga ctgctgttaa catattcttt taatttgatg 660
gaagaagcga tcgatggatg gaagagagcg atccttcagt ccactcatgg gcggtgctag 720
ggtcgaatta gctgccgact cattcaccca caatgccaag caagaaacgc ttgagatagc 780
gaagcttagc agatgagtga atgaagcggg agagtaacgt tccgatctcg cgccgtcttt 840
gcttggactg aagggtgctc cctcct 866
<210> 266
<211> 801
<212> DNA
<213> 展叶剑叶藓
<400> 266
tgggatccac acgagtaatt attccctctc tcatgcatca caacttggac ttgcccagct 60
tttacctctc tccatgttcc accgtcggag atcctcggtg ctgctacccc cgttcggcca 120
aacccaaccc aaccctaggt gtctgccgga cctccgcttc ccctcctgct tcaccccctg 180
caccgcttaa atttgcacct cgtagtattt atctatgccc catttcagat gacttgcatg 240
acacccatct ggattcgtct ccaggcgcct tgtcgtatct attcgctatc agtctttctt 300
tcagtctgtc tttctgccaa gcacaccgtg ctggtggtgg tgctatcagt cgaagcagtc 360
gccgaagggt ccttgtatcc agccctcacc ggagacagtt cgcttcgggg tggggagaac 420
tgttgagacc gtcgatgttg catgcagcag cactggcgaa ggtgcttctg atactgggta 480
ttccagcctc gccgctcggt gcactgcagg tacgtggtta catgacacta ctgtgtgggt 540
agtctgggca caagtagatc gacatgccag atttggcccg tatgcgtgta tgtgcggtta 600
tgttcccgtt tcgattgcgg ataccttgat tgtggagctc cgtttcggtc caatagtggc 660
tgcgacggaa ggtggtcccg ctgccgaatc acacgtccgg gttgcttatc ggggcagggc 720
cccgatacgg tatccgaacg tttgtcccgg gaactggtcg accttccgcc cggcgtctct 780
tggactgaag ggagctccac t 801
<210> 267
<211> 819
<212> DNA
<213> 小盐芥
<400> 267
ttttatacaa ataatgttcg ataacactaa accctagcca tccaactaat agacaaaacc 60
ctacttgtaa tttacaaccg caaattccca gagaacagag taactacgag agagagatgg 120
agattcaaat taaaaagaaa aacttatata taatgaatac acaaaagcta cctaatctgt 180
atatatatat atataaatat gtcttcatta aattaatggt cgtggaatag aaaaaggaaa 240
acctaatttg atcgctaggg cttatcagag taaagatggt taaccttcaa aagatgacta 300
attaaccggg gagataatta aaagattaaa tacgccaaca gagagttaag agataccaga 360
tttaaattcc acaatttggt catgttcttc ttcacgtatt catgacgatg tctgaattat 420
agagaaaccc aaaatataaa atgttaattt taccagacat ttacatacca ataactctat 480
gacgatatgt aaagtaagca aggcatgttt ttatgcaggg aagattgaaa attcaagatt 540
aatcaagaaa attggaatac caaaaagaga gggagctccc ttcagtccaa tcagagagaa 600
tcaatgaccc aatttgtcta ccgcatcatt cattcattta acaagtctag ctcgaattct 660
tggtgactcg gtatttggat gaatgagtcg gaagctaatt ggatcatatc acgacctatg 720
aatggactca aggaagctct ctacaaatgt attcctacca catcaaccca aatatagtga 780
ttacagatgc tgttctcact gtagactaca tttacgttt 819
<210> 268
<211> 503
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 268
agacatctct tcttctctca tctctctttt cttctctctt ttcctcacat aaactctctt 60
tttttactat taaatccata tggtacctca aattaatcta tggtcatcta gggttatctt 120
gaagattaga attgattcta gcacgcacag agaggaagat cattgcatcc agaatcacaa 180
acatggccta tcttttatct tttctttttg atctaagtca ctgttttatg ctatatatag 240
tataatcaaa ttctttacat gtgcttgtat gtatgcgtat atatagtaac ggaattgtta 300
atatgcttat agatgttgag ttggtggagg aagagagctt tcttcggtcc actcatggag 360
taatatgtga gatttaattg actctcgact cattcatcca aataccaaat gaaagaattt 420
gttctcatat ggtaaatgaa tgaatgatgc gagagacaaa ttgagtcttc acttctctat 480
gcttggactg aagggagctc cct 503
<210> 269
<211> 365
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 269
tcttattcca tcacaatcat ctagggtttt aagccaagct tatatagccc gtcataaaga 60
gaactcatct gcctctctct caataccaat aaatatcacc accgtccttc tctcctatca 120
ctattcaatc tatcgcaaac tcctttatgt ctctccaatt ttatgagagg gtttccttca 180
agaacacagt aaaatagatt ggatctttaa acttttgttc cttttcatga gggtttgaca 240
aagattttct tacagtcatc tttggcattc tgtccacctc cttctataca tatatgcatg 300
tgtatatata tatgcgtttc gtgtgaaaga aggaggtggg tatactgcca atagagatct 360
gttag 365
<210> 270
<211> 134
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 270
ttgtatcatg acagagcaag aagaagaaag tcaaatgtcc acatgagttc cctttaacgc 60
ttcattgttg aatactcaaa gccacattgg tttgtatata acactgaagt gtttgggggg 120
actcttggtg tcat 134
<210> 271
<211> 229
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 271
tttcaaaccc taacactctt ataaaccgat tcgccaaaat gtatctacaa tatattgata 60
atgtaatatc tatatattca aacaatcgtc gtgttggtcg gatgttttct agagttcctc 120
tgagcacttc attggagata caatttttta taaaatagtt ttctactgaa gtgtttgggg 180
gaactcccgg gctgattcgg tattttaaat tcagtagact agctagctg 229
<210> 272
<211> 220
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 272
tggtaataga aatgagcaag gagatatttt tttcccctgg gtttgaatga acatcattga 60
gtgcatcgtt gatgtaattt tacttatttt attccattgt tgaattaatt aaagaagtat 120
atatcagcgt tgcattcaat tatgtttttc taattttcag gaaatacaaa aaaaatgaaa 180
aaaaaaaatc acttaaaaga ccttgagagt tcttttgact 220
<210> 273
<211> 225
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 273
ggatatcgaa actcaaactg taacagtcct tttattactg gtttagaaga tagataaata 60
ttgttaaggt agtggatctc gacagggttg atatgagaac acacgagcaa tcaacggcta 120
taacgacgct acgtcattgt tacagctctc gtttcatgtg ttctcaggtc acccctgctg 180
agctctttct ctaccgtcca tgttttatca acgccgtggc ccgtg 225
<210> 274
<211> 165
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 274
tcttatagag atgaagagaa acatgtaaac tcactagttt tagggcgcct ctccattggc 60
aggtccttta cttccaaata tacacataca tatatgaata tcgaaaattt ccgatgatcg 120
atttataaat gacctgccaa aggagagttg ccctgaaact ggttc 165
<210> 275
<211> 187
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 275
caataactca aaatgcaatg tgaaatatga agaatatatt aaatagtagt gaagatgcat 60
gtttatgaag acagagagat aatgtatggt tggattactg ggcgaatact cctatggcag 120
atcgcattgg ctagatatgc aagtaaaatg cttctctgcc aaaggagatt tgccccgcaa 180
ttcatcc 187
<210> 276
<211> 235
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 276
atttaggtct ctcttcttct tcttcttttt cttcttgagc gccggcgaaa aaagtctctg 60
tgagaaaaag atacgacgat tgtcattaga agagtcgtat tacatgtttt gtgcttgaat 120
ctaattcaac aggctttatg taagagattc tttaacaatt cctataatct ttgttgttgg 180
attagattca cgcacaaact cgtaatctgt cttttcgatt tttaccagat ctgtc 235
<210> 277
<211> 944
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 277
aattatatcc atggtcatgg ctcatcatta gtcgcactgc tctccttttc tcaaagttta 60
aattcgacat ttggtaaaat gatgaaacct cgatggaact gctctcttta tggaatcacg 120
gaatggacaa ataatcaaaa tcagaaatcg aagcgaaaag ggaggagaaa aacgcagatt 180
tggaggattg gggacagatt agatactgtt gaatgcatca ctctaatgct atcagcctat 240
taatagcgtc ctatattttc gaagactttt aatgtttagg gttatggatt tttcgagcga 300
agcatggaga gatgttgaat tggatactat aggatttggt acaacacata catatgttct 360
gcttctgcaa aactaacata tcaagttcag agaaaccagt aagtcgttga atattttatt 420
atccattcaa cgctttcttc ttttggatca tgtcttgttt gcttgaccac ttcttcttgc 480
ttaagaggat ggacaatata taaaaactgg agccttcttt ttctatgaat gcttatcatc 540
gcggagttga tctgttcaat tcacctgcca ttggatgctt tttttatata tacttcactg 600
ttcaatttca gatgctttag aaggtttgcg gagtagctag agaatctggt atcttcagtt 660
cttcaatttc agctacttgg tatcagcttc gtcattgtat atcaacacat tcttaatata 720
taatactact ttttcatcca ttaaacccct tacaatgtcg agtaaacgaa gcatctgtcc 780
cctggtattg tcttcgagct tggtgttttt ttctagccaa ctccaagttc tcgagttgat 840
cattgtttgt attcttgaga cattatttgg ggacgagatg ttttgttgac tcgatataag 900
aaggggcttt atggaagaaa ttgtagtatt atatatcgag agtg 944
<210> 278
<211> 420
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 278
ctataaatgc tgcttatcat cgtggagttg gttctgtaaa catttgaaaa ttctgaacag 60
tttcacctgc cattggatgc tttgtttcaa tttcaggtgc gttagaaggt ttgcagagta 120
gctagagaat ctcgtatctt cactttctgc tacttggtat cagcttcgtc actttatatc 180
aacacattct taatatacaa tactactttt tcatccatta atccccttac aatgtcgagt 240
aaacgaagca tctgtcccct ggtattgtct tcgagcttgg tgtgtttttc tagccagccc 300
caagttctcg agttgatcat tgtttgtatt ctgacacatt atttggggac gagatgtttt 360
gttgactcga tataagaagg ggctttatgg aagaaattgt agtattatat attgagaatg 420
<210> 279
<211> 383
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 279
tagtataacc gctgatgtac acctaccagc ttgataactc tttttcgtgg tttctgtgta 60
ctcgtttctg tttgtacaga tacttcttgt tcaatttcag atgctttaga aggttttcgg 120
agtggctaga gatctgttat ctgtatgaac agctacttgg tatcagcttc gtcattttat 180
caacacattc ttaatataca atacttcttt ttcatgcatt aagcccctta caatgtcgag 240
taaacaaagc atgtgtccgc taatattgtc ttcgagcttg gtatttttgt attctgatac 300
ggtatttggg gacgacatct tttgttgact cgatataaga agggggtttg tggaagaaat 360
tgtagtatta tatatcaaga atg 383
<210> 280
<211> 2164
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 280
tttgtggaac acattcgacc cactgaaaaa ttgatataat ttaatgaaag tgcataaaaa 60
tggtggacag tgcattaaac tgagcattga acacaaaggc cgctcagcaa attgctaatt 120
aaaattcacg attgccattt cacctgacac gttgacgatt ttcattacaa ttcgattatg 180
tttcgttgca gggaatttta aatgttaatt gccaagaatg tttcaacaaa ttcatttctc 240
attaatgtgt cttttcattt aattttatgt tgtatgagct gcacgagaaa tgagttgtac 300
ttttagttcg acggcagagt catgaatgtt cggcaaagaa tgtaataata actatcctct 360
ttagacaaat atagatacaa atctatcaga ttctaaaagt agaataatca attaatcaga 420
aagctaaaaa taaataggca tatttatatt ttaatgcgga tttttgaagt tcaacgggag 480
aaatgaatcc tttttaccag ccacaggcgc aatttgcaac agaaagtgta gcagaagtac 540
tcctcgaata tttccctgct ccaggagtca tccatgtggt ttcgaggcac acatttgaca 600
aactcatgcc ccgctatttg ttgtaaaaac acaatcgcac acatggccgc atttcggcga 660
cttccagaga gcggtacact taaggcggcc tgggaaacgc ctgcaatctg ctggtcgcga 720
actgcagatt gcatccatgt gccaggcgac catgcgacca tgtgaccatg tgcccgcccg 780
acgcctcgca gcccacatcc tgcccatcga gggcacaact cagcgtgggt attgccgctc 840
cggctgcttc aagtaggtaa aaaccgagaa gattgaggat gaatgtatga gtatgagaaa 900
atactcggcg gaacatatgc tgccgggctt gacctgaccc tgcctcatgt gtgggtctcc 960
gatttaattt taggcaccta tataaacgcg tgtttacact gcagccagaa cacagtcgcc 1020
gtcttcagtt cgcgccgtca actcctcgat cgatcgatcg catcgtctcg gatcgaatag 1080
agctgggctt ctgctccgga gctacatcgc cgtacttgtc ggacgagtgt ggtgatgaaa 1140
agtcgcttag tccgggattc ctgccagatc tctaagggat gagctggcat cccaggctgg 1200
ccatgtggcg cgaagtatgc gcacaaaaaa gtcaaacaaa aaggcgcaat tttattacgg 1260
gcaaccaacg acgaaacaaa acaaaagcca accgaaaagc agaaacaaag cagcaaaaag 1320
tttatgaatt ttttgtgcag gcgcgtgaaa gatgcaaaac gagaaaaaaa catgaaaaaa 1380
aaacattaaa aaaaacaaaa aaaatccaaa acagataccg agctgtatcc gaaaacgagt 1440
ggggaaaggg gtttcccagt cacatataaa cacacttcag tgcgcttaaa aattgcttta 1500
ttgcagttgg actataaaaa cgcacggcag cgaacaccgc acaacaaaaa ggacgagcag 1560
aagtgggcaa ataaaacgaa agctcttaaa cgaaaaacag gaaaatttgc atgccacaaa 1620
aataagcata aggatttgcc gcgcacaaag tagaagcaaa aaggaattgc ccaaatgcag 1680
ccacaaaaga ctgtggcaaa tgttttgcag cttgcccctt tttccctgca attaccgtca 1740
gtcgttgtca ttattcagca gattatatgg ttttgcttat tccggaccac catcatcatc 1800
atcattatca tcatcttcgg taagttagac aatcccataa aaaactgtcc aagtgagtag 1860
tgccaccaaa agttagccgc gttgtggaaa atccaaaaca aagaccatcc catattcagc 1920
ctttgagagt tccatgcttc cttgcattca atagttatat tcaagcatat ggaatgtaaa 1980
gaagtatgga gcgaaatctg gcgagacatc ggagttgaaa ctaaaactga aatttgattg 2040
aaacagaagt agaaccgtaa tgaaatgaat gaaatattaa cccgtttcta caatccctga 2100
ataaaattat taattaatta tagagcgggc taattttaca atatatattg attttttttt 2160
gaag 2164
<210> 281
<211> 919
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 281
attctttttt ggtgctcgat cgtgacggtt tgctcgcgct ctccgctgcg ccgctctttc 60
cgttgcatat gtgtgcgggc gttattgtgc atgtttccgg tggccgaaaa aaaatagtaa 120
aataaaatat agaaaacaga aaccaagaat aataacagcc atacgataaa cagtgtgcca 180
atgtgtgtgt ctgtgtgtgt gtgcatctcg cgtaacaaca ataattgcat ttatcggatg 240
gcgccagctt caatttaatt ataaataaca tgttcaactt tttatactat tttccctgcg 300
tcaaagtggg cgttgcaact gcccccggaa aatcacgcgc cccggttcaa agttaaagtt 360
tgctgggtaa cgcacacaca cacacacaca atcactcaca cgcggtcaca cgcacatttc 420
aataaactaa tggagcctgg ctttgttttt gttttatttc caacccactt gagcacacag 480
cacacacaga gagaaaaatc aatactcgtt atgggattaa atttacaaag cgcaaagcaa 540
agcgacaaac aaaattcaaa agaaagaaaa aaaaacactc aaataaactc acaaagaatt 600
ccttatcgcc aagggggcca atgttctaag gttctttcgc cttgagaact ttgagcttcc 660
tctggcaaag gagattataa tgtacaaata atgttgcaat aaccagttga aaccaatgga 720
ataccgaatc ttgctaatta gcaaggacat ctgttcacat cttaccgggc agcattagat 780
cctttttata actctaatac tgtcaggtaa agatgtcgtc cgtgtcctta accttcagta 840
ccaccaacag cagcagcagc accaaaaaaa aaaaaaaaaa aatgcgtaaa aatccaaaca 900
aatcataaaa gtcgaagga 919
<210> 282
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 282
ugacagaaga gagugagcac 20
<210> 283
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 283
ugacagaaga gagugagcac 20
<210> 284
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 284
ugacagaaga gagugagcac 20
<210> 285
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 285
ugacagaaga gagugagcac 20
<210> 286
<211> 21
<212> RNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 286
uuuggauuga agggagcucu a 21
<210> 287
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 287
uuuggauuga agggagcucu a 21
<210> 288
<211> 21
<212> RNA
<213> 红荠菜
<400> 288
uuuggauuga agggagcucu a 21
<210> 289
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 289
uuuggauuga agggagcucu u 21
<210> 290
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 290
ugccuggcuc ccuguaugcc a 21
<210> 291
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 291
ugccuggcuc ccuguaugcc a 21
<210> 292
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 292
ucaaugcauu gaaagugacu a 21
<210> 293
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 293
ucgauaaacc ucugcaucca g 21
<210> 294
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 294
ucgauaaacc ucugcaucca g 21
<210> 295
<211> 24
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 295
uugaagagga cuuggaacuu cgau 24
<210> 296
<211> 21
<212> RNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 296
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 297
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 297
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 298
<211> 21
<212> RNA
<213> 芜青
<400> 298
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 299
<211> 21
<212> RNA
<213> 番木瓜
<400> 299
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 300
<211> 21
<212> RNA
<213> 红荠菜
<400> 300
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 301
<211> 21
<212> RNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 301
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 302
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 302
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 303
<211> 21
<212> RNA
<213> 水稻
<400> 303
uggagaagca ggguacgugc a 21
<210> 304
<211> 21
<212> RNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 304
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 305
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 305
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 306
<211> 21
<212> RNA
<213> 埃塞俄比亚芥
<400> 306
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 307
<211> 21
<212> RNA
<213> 芥菜
<400> 307
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 308
<211> 21
<212> RNA
<213> 欧洲油菜
<400> 308
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 309
<211> 21
<212> RNA
<213> 甘蓝
<400> 309
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 310
<211> 21
<212> RNA
<213> 芜青
<400> 310
ucggaccagg cuucaucccc c 21
<210> 311
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 311
ucggaccagg cuucauuccc c 21
<210> 312
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 312
ucggaccagg cuucauuccc c 21
<210> 313
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 313
ugaagcugcc agcaugaucu a 21
<210> 314
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 314
ugaagcugcc agcaugaucu a 21
<210> 315
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 315
cagccaagga ugacuugccg g 21
<210> 316
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 316
uagccaagga ugacuugccu g 21
<210> 317
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 317
ugauugagcc gcgccaauau c 21
<210> 318
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 318
uugagccgug ccaauaucac g 21
<210> 319
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 319
ugauugagcc gcgucaauau c 21
<210> 320
<211> 21
<212> RNA
<213> 玉蜀黍
<400> 320
ggauugagcc gcgucaauau c 21
<210> 321
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 321
uugagccgug ccaauaucac g 21
<210> 322
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 322
agauugagcc gcgccaauau c 21
<210> 323
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 323
cgagccgaau caauaucacu c 21
<210> 324
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 324
agaaucuuga ugaugcugca u 21
<210> 325
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 325
gcagcaccau uaagauucac 20
<210> 326
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 326
agaaucuuga ugaugcugca g 21
<210> 327
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 327
ggaaucuuga ugaugcugca u 21
<210> 328
<211> 21
<212> RNA
<213> 塞文山鼠耳芥
<400> 328
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 329
<211> 21
<212> RNA
<213> 圆叶鼠耳芥
<400> 329
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 330
<211> 21
<212> RNA
<213> 琴叶鼠耳芥
<400> 330
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 331
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 331
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 332
<211> 21
<212> RNA
<213> 芜青
<400> 332
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 333
<211> 21
<212> RNA
<213> 番木瓜
<400> 333
uuggacugaa gggagcuccu u 21
<210> 334
<211> 19
<212> RNA
<213> 红荠菜
<400> 334
uuggacugaa gggagcucc 19
<210> 335
<211> 21
<212> RNA
<213> 巨桉
<400> 335
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 336
<211> 21
<212> RNA
<213> 雷蒙德氏棉
<400> 336
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 337
<211> 22
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 337
uuggacugaa gggagucucc cu 22
<210> 338
<211> 21
<212> RNA
<213> 水稻
<400> 338
uuggacugaa gggugcuccc u 21
<210> 339
<211> 20
<212> RNA
<213> 展叶剑叶藓
<400> 339
cuuggacuga agggagcucc 20
<210> 340
<211> 20
<212> RNA
<213> 小盐芥
<400> 340
uggacucaag gaagcucucu 20
<210> 341
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 341
uuggacugaa gggagcuccc u 21
<210> 342
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 342
uuggcauucu guccaccucc 20
<210> 343
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 343
cugaaguguu uggggggacu c 21
<210> 344
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 344
cugaaguguu ugggggaacu c 21
<210> 345
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 345
ucauugagug caucguugau g 21
<210> 346
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 346
uguguucuca ggucaccccu g 21
<210> 347
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 347
ugccaaagga gaguugcccu g 21
<210> 348
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 348
ugccaaagga gauuugcccc g 21
<210> 349
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 349
uuagauucac gcacaaacuc g 21
<210> 350
<211> 22
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 350
uuggggacga gauguuuugu ug 22
<210> 351
<211> 22
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 351
uuggggacga gauguuuugu ug 22
<210> 352
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 352
ccccuuacaa ugucgaguaa a 21
<210> 353
<211> 22
<212> RNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 353
uggaauguaa agaaguaugg ag 22
<210> 354
<211> 23
<212> RNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 354
uaauacuguc agguaaagau guc 23
<210> 355
<211> 17
<212> PRT
<213> 智人（Homo sapiens）
<400> 355
Met Glu Met Ala Leu Met Val Ala Gln Thr Arg Lys Gly Lys Ser Val
1 5 10 15
Val
<210> 356
<211> 53
<212> DNA
<213> 智人
<400> 356
tggagatggc tctaatggtg gcacaaacca ggaaggggaa atctgtggtt taa 53
<210> 357
<211> 1500
<212> DNA
<213> 智人
<400> 357
gccgagcccg ggcccagcgc cgcctgcagc ctcgggaagg gagcggatag cggagccccg 60
agccgcccgc agagcaagcg cggggaacca aggagacgct cctggcactg cagataactt 120
gtctgcattt caagaacaac ctaccagaga ccttacctgt caccttggct ctcccaccca 180
atggagatgg ctctaatggt ggcacaaacc aggaagggga aatctgtggt ttaaattctt 240
tatgcctcat cctctgagtg ctgaaggctt gctgtaggct gtatgctgtt aatgctaatc 300
gtgatagggg tttttgcctc caactgactc ctacatatta gcattaacag tgtatgatgc 360
ctgttactag cattcacatg gaacaaattg ctgccgtggg aggatgacaa agaagcatga 420
gtcaccctgc tggataaact tagacttcag gctttatcat ttttcaatct gttaatcata 480
atctggtcac tgggatgttc aaccttaaac taagttttga aagtaaggtt atttaaaaga 540
tttatcagta gtatcctaaa tgcaaacatt ttcatttaaa tgtcaagccc atgtttgttt 600
ttatcattaa cagaaaatat attcatgtca ttcttaattg caggttttgg cttgttcatt 660
ataatgttca taaacacctt tgattcaact gttagaaatg tgggctaaac acaaatttct 720
ataatatttt tgtagttaaa aattagaagg actactaacc tccagttata tcatggattg 780
tctggcaacg ttttttaaaa gatttagaaa ctggtacttt cccccaggta acgattttct 840
gttcaggcaa cttcagttta aaattaatac ttttatttga ctcttaaagg gaaactgaaa 900
ggctatgaag ctgaattttt ttaatgaaat atttttaaca gttagcaggg taaataacat 960
ctgacagcta atgagatatt ttttccatac aagataaaaa gatttaatca aaaaatttca 1020
tatttgaaat gaagtcccaa atctaggttc aagttcaata gcttagccac ataatacggt 1080
tgtgcgagca gagaatctac ctttccactt ctaagcctgt ttcttcctcc atatggggat 1140
aatactttac aaggttgttg tgaggcttag atgagataga gaattattcc ataagataat 1200
caagtgctac attaatgtta tagttagatt aatccaagaa ctagtcaccc tactttatta 1260
gagaagagaa aagctaatga tttgatttgc agaatattta aggtttggat ttctatgcag 1320
tttttctaaa taaccatcac ttacaaatat gtaaccaaac gtaattgtta gtatatttaa 1380
tgtaaacttg ttttaacaac tcttctcaac attttgtcca ggttattcac tgtaaccaaa 1440
taaatctcat gagtctttag ttgatttaaa ataaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500
<210> 358
<211> 23
<212> RNA
<213> 智人
<400> 358
uaauacuguc agguaaagau guc 23
<210> 359
<211> 337
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 359
ttagggtttt cagctcatgg taataaaaat gtcatctaat gtcttgcatg tgggaatgag 60
gtcatatatg cagccaagga tgacttgccg gcgagcctct ttcgatactt ttatgacata 120
attaatcatg tggatagcca aggtactaaa ctcactttgc actaaaacaa atatttttgc 180
tttagtgcaa acttagttta ggcgcttcgc aacggctagt caaatgtcct agttccaatg 240
tgattggttg tccggcaagt cgtctctggc tacgtaaagg cctccttttt tcatgctaga 300
tttttgatga tttgatatag ccacacatat tttggaa 337
<210> 360
<211> 121
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 360
aagaggcaga gagagtaatg cagccaagga tgacttgccg acaacattgg cgaatgttca 60
tgtgatttct gcctcattgt gccggcaagt tgtccttggc tatgttagtc tctcatcttc 120
t 121
<210> 361
<211> 114
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 361
tgaattcccc tccgcttttt gatgttggct tgtctcaatc aaatcaaagt tcttgaaatt 60
tgagttcttt agtctgattg agtcgtgcca atatcatatt aagcgataaa agtc 114
<210> 362
<211> 367
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 362
ccacaaaact ataactagct agaagcttta atcgccttat ttattataat aataataata 60
aatatggctt cagctgcaaa agtatacatg gcgtgatatt gatccggctc atctatatct 120
tcaagttcaa tcatccatat tcatatcaat ttcagacgag ccgaatcaat atcactcttg 180
tttgcttcat tgcatattaa ttatatactt catttataag ttatagtttg ccatatatat 240
attagattga ttctgcagaa gtagacagga gtggtgttgt ttctgctcat cttattaaat 300
aatgaatgaa tgaatgacat ttgcttactt ataagacgag ccgaatcaat atcactccag 360
tacacct 367
<210> 363
<211> 135
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 363
aactgcaact tgaggaggca tccaaaggga tcgcattgat cctataatat ttcaacttta 60
gtcactttaa ttttctctca tataatactt aattgggatc atgccatccc tttggatttc 120
tcctttagta gctac 135
<210> 364
<211> 119
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 364
aggcatccaa agggatcgca ttgatcccaa atctaattaa gtccctagct acttaattaa 60
caacttaatt tccttaatat ctcataatat ttgggatcat gctatccctt tggattcat 119
<210> 365
<211> 93
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 365
tgcttttcca cagctttctt gaacttcttt cgtatcttaa atctgttttc aagattaaaa 60
gtcctagaag ctcaagaaag ctgtgggaga ata 93
<210> 366
<211> 95
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 366
tattcttcca cagctttctt gaactgcatc caaattgagt tcctttgcat tgccatggcc 60
attgttttgc ggttcaataa agctgtggga agata 95
<210> 367
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 367
cagccaagga ugacuugccg g 21
<210> 368
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 368
cagccaagga ugacuugccg a 21
<210> 369
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 369
ugauugaguc gugccaauau c 21
<210> 370
<211> 20
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 370
gagccgaauc aauaucacuc 20
<210> 371
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 371
uccaaaggga ucgcauugau c 21
<210> 372
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 372
uccaaaggga ucgcauugau c 21
<210> 373
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 373
uuccacagcu uucuugaacu u 21
<210> 374
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 374
uuccacagcu uucuugaacu g 21
<210> 375
<211> 15
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 375
Met Met Leu His Ile Thr His Arg Phe Glu Ser Asp Val Gly Cys
1 5 10 15
<210> 376
<211> 4
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 376
Met Leu Tyr Val
1
<210> 377
<211> 14
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 377
Met Phe Met Arg Arg Gly Leu Val Tyr Asn Asn Ile Tyr Ile
1 5 10
<210> 378
<211> 17
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 378
Met Met Lys Val Cys Asp Glu Gln Asp Gly Glu Ala Gly His Val His
1 5 10 15
Tyr
<210> 379
<211> 28
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 379
Met Lys Lys Arg Ile Thr Arg Ile Asn Leu Glu Glu Gln Ile Lys Lys
1 5 10 15
Thr Leu Asp Asp Ser Arg Thr Arg Leu His Ser Pro
20 25
<210> 380
<211> 10
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 380
Met Lys Lys Ile Gly Ser Ile Asp Ser Phe
1 5 10
<210> 381
<211> 6
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 381
Met Thr Cys Arg Phe Lys
1 5
<210> 382
<211> 11
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 382
Met Lys Asn Glu Asn Leu Cys Gly Ser Gln Gly
1 5 10
<210> 383
<211> 45
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 383
Met Lys Cys Met Met Lys Lys Arg Gly Leu Thr Trp Arg Lys Ala Ser
1 5 10 15
Cys Leu Val Ala Lys Asp Asp Leu Pro Asp Leu Phe Arg Leu His Asp
20 25 30
Ser Ile Ser Asn Ser Cys Ile Leu Asp Tyr Tyr Thr Phe
35 40 45
<210> 384
<211> 7
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 384
Met Phe Pro Arg Glu Ser Leu
1 5
<210> 385
<211> 29
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 385
Met Thr Leu Ser Val Phe Phe His Ser Phe Leu Glu Leu Gln Asn Phe
1 5 10 15
Phe Arg Phe Phe Phe Phe Ser Phe Asp Ile Ser Tyr Ala
20 25
<210> 386
<211> 23
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 386
Met Ser Leu Ala Lys Gly Glu Leu Pro Cys His Cys Phe Arg Leu Asn
1 5 10 15
Thr Val Tyr Asn Arg Phe Cys
20
<210> 387
<211> 48
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 387
atgatgttgc atatcacaca taggtttgag agtgatgttg gttgttga 48
<210> 388
<211> 15
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 388
atgctgtatg tatag 15
<210> 389
<211> 45
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 389
atgttcatgc gtagaggttt ggtatacaac aatatataca tataa 45
<210> 390
<211> 54
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 390
atgatgaagg tgtgtgatga gcaagatgga gaagcagggc acgtgcatta ctag 54
<210> 391
<211> 87
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 391
atgaagaaga gaatcactcg aattaatttg gaagaacaaa ttaagaaaac cctagatgat 60
tctcggacca ggcttcattc cccctaa 87
<210> 392
<211> 33
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 392
atgaagaaga tcggtagtat tgattcattt taa 33
<210> 393
<211> 21
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 393
atgacttgcc gatttaaatg a 21
<210> 394
<211> 12
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 394
atggtgacat ga 12
<210> 395
<211> 36
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 395
atgaagaatg agaacttgtg tggtagccaa ggatga 36
<210> 396
<211> 138
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 396
atgaagtgta tgatgaagaa gagaggtcta acatggcgga aagcgtcatg tttagtagcc 60
aaggatgact tgcctgatct ttttcgcctc cacgattcaa tttcaaattc atgcattttg 120
gattattata ccttttaa 138
<210> 397
<211> 24
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 397
atgtttccga gagagtccct ctga 24
<210> 398
<211> 90
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 398
atgaccctct ctgtattctt ccacagcttt cttgaactgc aaaacttctt cagatttttt 60
tttttttctt ttgatatctc ttacgcataa 90
<210> 399
<211> 72
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 399
atgtcacttg ccaaaggaga gttgccctgt cactgcttcc gcttaaacac agtctataac 60
cggttctgct aa 72
<210> 400
<211> 331
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 400
ctttgtcact tcatacactc cctattgtct atatatatat atatacttac acatattcaa 60
acattataat acttaattac acatacatac tttatgatgt tgcatatcac acataggttt 120
gagagtgatg ttggttgttg acagaagata gagagcacta aggatgacat gcaagtacat 180
acatatatat catcacaccg catgtggatg ataaaatatg tataacaaat tcaaagaaag 240
agagggagag aaagagagag aacctgcatc tctactcttt tgtgctctct atacttctgt 300
caccaccttt atctcttctt ctctctaacc t 331
<210> 401
<211> 304
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 401
atttactctt caccgccctc tctctatata tagtctctat cctcacatat tatatatcaa 60
accgcaagaa tgctgtatgt atagtggagg gtgatagtgt ggttgctgac agaagataga 120
gagcactaag gatgctatgc aaaacagaca cagatatgtg tttctaattg tatttcatac 180
tttaacctca aagttgatat aaaaaaagaa agaaagatag aagagctaga agactatctg 240
catctctatt cctatgtgct ctctatgctt ctgtcatcac ctttctttct ctatttctct 300
ctac 304
<210> 402
<211> 245
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 402
aaccaaaact cttcaacatt tctctctgac tacttcattt cctcttccca acagttaaaa 60
aaagttctga ttcgattcaa gccaagatcc acgtataaag atatgttcat gcgtagaggt 120
ttggtataca acaatatata catataatag tttgtcgtta tgcctggctc cctgtatgcc 180
acgagtggat accgattttg gttttaaaat cggctgccgg tggcgtacaa ggagtcaagc 240
atgac 245
<210> 403
<211> 240
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 403
atacattctc tctttctctc tctctctctc tctcatcccg gcccagttat gtggtcggag 60
agaatgatga aggtgtgtga tgagcaagat ggagaagcag ggcacgtgca ttactagctc 120
atatatacac tctcaccaca aatgcgtgta tatatgcgga attttgtgat atagatgtgt 180
gtgtgtgttg agtgtgatga tatggatgag ttagttcttc atgtgcccat cttcaccatc 240
<210> 404
<211> 280
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 404
tcacacatac ctttctttct cttcttcttc ttacgaaaag tttcatcaca ttcacattat 60
ctttaacttt ggtctctttt cttttttgtc tcttttctct tcttgataac gtggttctag 120
tcttgattaa ttcattgttg tgcgatttag tgttgagagg attgttgtct ggctcgaggt 180
catgaagaag agaatcactc gaattaattt ggaagaacaa attaagaaaa ccctagatga 240
ttctcggacc aggcttcatt ccccctaacc tacttatcgc 280
<210> 405
<211> 179
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 405
atttagcttc ttcttcttct tcttcttctg tctacttaca taaagttatc cttgctttgg 60
tttagggttg agaggaatat tgtctggctc gaggtcatga agaagatcgg tagtattgat 120
tcattttaaa gagtgaaatc cctaaatgat tctcggacca ggcttcattc cccccaacc 179
<210> 406
<211> 376
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 406
tagtattcat aagcaccaaa acaaatatgt agagatctcc tcttccattc tctattgtta 60
ctttcgagaa gaaacataca aaacacatac atttttcttt tgtttgtggt tttcatatat 120
acaagtgggt atagctagtg aaacgcgaat gtgacgaaag tagtgtgcag ccaaggatga 180
cttgccgatt taaatgatct ttctttatac tctattaaga caatttagtt tcaaactttt 240
tttttttttt ttttttgaag gattcaggaa gaaattagga tatattattc cgtataaaat 300
acaagatata taaaaccaaa aagaaaaagt aacatgatcg gcaagttgtc cttggctaca 360
cgttactttg tgtcgc 376
<210> 407
<211> 77
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 407
actcatcaac aacctcttca taaatacata aatcatataa gagaaaatgg tgacatgaag 60
aatgagaact tgtgtgg 77
<210> 408
<211> 248
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 408
aggcaaaaac atatagagag taatgaagtg tatgatgaag aagagaggtc taacatggcg 60
gaaagcgtca tgtttagtag ccaaggatga cttgcctgat ctttttcgcc tccacgattc 120
aatttcaaat tcatgcattt tggattatta taccttttaa agtataatag gtcaaatatc 180
atgttgaatc ttgcgggtta ggtttcaggc agtctctttg gctatcttga catgcttttt 240
ccatccat 248
<210> 409
<211> 187
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 409
attcactccc ttcttcttct taatctcctt acagttacag acattctctc acttgcgttc 60
ttgtttcttt tacaaaacag atacactatg tttccgagag agtccctctg atattggcct 120
ggttcactca gattctcttt tactaactca tctgattgag ccgtgtcaat atctcagtcc 180
tctctcg 187
<210> 410
<211> 246
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 410
tctcacaact tcaacttccc tctttctcta tattacgctt ttgcccctca ctccctcttt 60
ccacaattag ggtttcgtct gctctacatg accctctctg tattcttcca cagctttctt 120
gaactgcaaa acttcttcag attttttttt ttttcttttg atatctctta cgcataaaat 180
agtgattttc ttcatatctc tgctcgattg atttgcggtt caataaagct gtgggaagat 240
acagac 246
<210> 411
<211> 631
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 411
gaataaccaa ccagccttct ctcaaagcaa accaaaaaga aaaaccaaca ttgaaagagg 60
aagttacgat aagcggagca gtaatagggc atctttctat tggcaggcga cttggctatt 120
tgtatctttt gtgttcttga ctattggcta tgtcacttgc caaaggagag ttgccctgtc 180
actgcttccg cttaaacaca gtctataacc ggttctgcta atatcaatcc ttcttttgga 240
catgtccaaa gccgagattg attgatagag aattggtctc tctggctaca aaactagtgc 300
ggttctctcg atttaagttt taatagcatt cactttgcac attgcatctt tcacatcaaa 360
tttccatttc atcaaccatc taaacctctt tgttagcttt gatataagca acgatctaaa 420
gtctaaaaac cattaatcct ctgaaaaaaa agacaatttc gatggttcta ttatgtttct 480
ccaatgcaga aattgtatcg tctgaattat agtagatttt ttctagacta aagtgtaaac 540
caagacgaat ctgcactaac aagacacacc aatagacttt acagagaaag gttacgagtt 600
ttgaaaatat taacggacca tagtcatcgc g 631
<210> 412
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 412
uugacagaag auagagagca c 21
<210> 413
<211> 20
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 413
ugacagaaga uagagagcac 20
<210> 414
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 414
ugccuggcuc ccuguaugcc a 21
<210> 415
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 415
uggagaagca gggcacgugc a 21
<210> 416
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 416
ucggaccagg cuucauuccc c 21
<210> 417
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 417
ucggaccagg cuucauuccc c 21
<210> 418
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 418
cagccaagga ugacuugccg a 21
<210> 419
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 419
uagccaagga ugacuugccu g 21
<210> 420
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 420
uagccaagga ugacuugccu g 21
<210> 421
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 421
ugauugagcc gugucaauau c 21
<210> 422
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 422
uuccacagcu uucuugaacu g 21
<210> 423
<211> 21
<212> RNA
<213> 拟南芥
<400> 423
ugccaaagga gaguugcccu g 21
<210> 424
<211> 13
<212> PRT
<213> 截形苜蓿
<400> 424
Met Val Lys Glu Ser Phe Met Glu Arg Leu Lys Val Arg
1 5 10
<210> 425
<211> 42
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 425
atggtcaaag agtctttcat ggagaggttg aaagtgagat ga 42
<210> 426
<211> 291
<212> DNA
<213> 截形苜蓿
<400> 426
tggataagtt aatttatggt caaagagtct ttcatggaga ggttgaaagt gagatgaagc 60
caaggatgac ttgccggtat aatagtaatt tgccacaaat ctagatagct attagctatg 120
tttggatggg cggtgagatt aacaaaatta cagcagcatt gtgattttgt tgatgcttta 180
aagtgtagtt tttatcaaaa ttacagtggt tcactgtaat tatgagaatc tcaccgtcaa 240
tctaaatatg catttagttt catttccggc aggtcatcct tcggctatat t 291
<210> 427
<211> 21
<212> RNA
<213> 截形苜蓿
<400> 427
aagccaagga ugacuugccg g 21
<210> 428
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 428
Leu Ile Val Ser His Leu Tyr Ser Glu Lys Phe Asp Cys Met Arg Lys
1 5 10 15
Ile Leu Arg Ile
20
<210> 429
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 429
tccccaaatt cttgaccaaa 20
<210> 430
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 430
ttgaggggaa aacatgaacc 20
<210> 431
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 431
acgaaatccg tctcatttgc 20
<210> 432
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 432
gggtgaagag ctcatgttgg 20
<210> 433
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 433
tgaggggaat gttgtctgg 19
<210> 434
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 434
gaagcctggt ccgaggata 19
<210> 435
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 435
cgagtcgcca aaattcaaac 20
<210> 436
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 436
gctcccttca gtccaatcaa 20
<210> 437
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 437
gcaactgcag tggaatagca 20
<210> 438
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 438
gcgaccttca tgggttctaa 20
<210> 439
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 439
ctcagcatca gcaacgtgat 20
<210> 440
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 440
aactctgcta gggcctcctc 20
<210> 441
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 441
tcacaactcc tcagcattcg 20
<210> 442
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 442
acccaatcaa cagcagttcc 20
<210> 443
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 443
ggtaacattg tgctcagtgg 20
<210> 444
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 444
ctcggccttg gagatccaca 20
<210> 445
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 445
tcatcgatga atatacatac ataccatcat 30
<210> 446
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 446
tccggatcct ctaaaagcta aagtgattct aaa 33
<210> 447
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 447
tcatcgagag agagcttcct tgagtc 26
<210> 448
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 448
tccggatcca gagggagctc ccttcagt 28
<210> 449
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 449
tcatcggttg aggggaatgt tgtctg 26
<210> 450
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 450
tccggatccg ttggggggga tgaagcc 27
<210> 451
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 451
tcatcgatga gggttaagct atttcagt 28
<210> 452
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 452
tccggatcct aatatcctcg atccagacaa c 31
<210> 453
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 453
cgcctcaatt tgaatacatg g 21
<210> 454
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 454
acgcggctca atcaaactac 20
<210> 455
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 455
gcactagctg gtttcattat tcc 23
<210> 456
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 456
ttgcaaaatt tggagagcct a 21
<210> 457
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 457
aagcgatgtt ggtgaggttc 20
<210> 458
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 458
cggctcaatc tgagatcgta t 21
<210> 459
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 459
gggcggtgag attaacaaaa 20
<210> 460
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 460
cctgccggaa atgaaactaa 20
<210> 461
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 461
tcatcgatga tggtgtttgg gaagcc 26
<210> 462
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 462
tccggatcct acatgtaaat ccgtcttcgg 30
<210> 463
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 463
aggcttcttc ataggctctc c 21
<210> 464
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 464
tcagtccgct cgaggaataa gtgaatatta tcgatattt 39
<210> 465
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 465
aaggaaaaaa gcggccgcaa agtgatattg gcgcggct 38
<210> 466
<211> 67
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 466
tagcatgtta ttacaccgct taagtaagtt ctgtaagata gagcgcgata ttgtttacat 60
tagctag 67
<210> 467
<211> 67
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 467
cgtactagct aatgtaaaca atatcgcgct ctatcttaca gaacttactt aagcggtgta 60
ataacat 67
<210> 468
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 468
aaaaggtctc gccataagca tagtggaata atgaaacc 38
<210> 469
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 469
aaaaggtctc gccatttcca tacctgaatt tctcctt 37
<210> 470
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 470
aaaaggtctc gccatcttca tcctcaatat cctaattc 38
<210> 471
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 471
aggtctcgac acagatatat atactatgtc tctttcaatt ttgc 44
<210> 472
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 472
aaaggtctcg ccatgaccat tttcccacga atatg 35
<210> 473
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 473
aaggtctcga cacaagcata gtggaataat gaaacc 36
<210> 474
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 474
aaggtctcga cacagatata tatactatgt ctctttca 38
<210> 475
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 475
gaattcctgc ccatggtttt cg 22
<210> 476
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 476
cgaaaaccat gggcaggaat tc 22
<210> 477
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 477
cagtcccgac ttaagctcaa tac 23
<210> 478
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 478
gtattgagct taagtcggga ctg 23
<210> 479
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 479
aaaggtctcc tagcttggtc aaacatacat acagtagcac tag 43
<210> 480
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 480
aaaggtctcg cgtaaaattg tactgattga atgtaaattg gtacac 46
<210> 481
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 481
tagcatgttt tcccctcaat ga 22
<210> 482
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 482
cgtatcattg aggggaaaac at 22
<210> 483
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 483
aaaggtctcc tagcactcat aactctcccc aaattc 36
<210> 484
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 484
aaaggtctcg cgtagaaaga atgttcgaaa aacaatg 37
<210> 485
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 485
aggtctccaa atcatgaagc aggcagtaat aacct 35
<210> 486
<211> 64
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 486
aggtctcgcg tactaagcgt aatctggaac atcgtatggg tataatatcc tcgatccaga 60
caac 64
<210> 487
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 487
aggtctcgcc atagtggcgg agacgaagat g 31
<210> 488
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 488
aggtctcgcc attaatatcc tcgatccaga caac 34
<210> 489
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 489
aggtctccaa attaaactgt cagtgcatgg atgt 34
<210> 490
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 490
aggtctcgac acattcacaa atttttgttg tagagag 37
<210> 491
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 491
aggtctcgac acattaacaa atttttgttg tagagag 37
<210> 492
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 492
aggtctcgac actagcagat tcacaaattt ttgttg 36
<210> 493
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引物
<400> 493
aggtctcgac accctcatga taatcgatct tagca 35
<210> 494
<211> 272
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<400> 494
cgcacacaca cacacacaca atcactcaca cgcggtcaca cgcacatttc aataaactaa 60
tggagcctgg ctttgttttt gttttatttc caacccactt gagcacacag cacacacaga 120
gagaaaaatc aatactcgtt atgggattaa atttacaaag cgcaaagcaa agcgacaaac 180
aaaattcaaa agaaagaaaa aaaaacactc aaataaactc acaaagaatt ccttatcgcc 240
aagggggcca atgttctaag gttctttcgc ct 272
<210> 495
<211> 272
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 经突变的序列
<400> 495
cgcacacaca cacacacaca atcactcaca cgcggtcaca cgcacatttc aataaactaa 60
gtgagcctgg ctttgttttt gttttatttc caacccactt aagcacacag cacacacaga 120
gagaaaaatc aatactcgtt agtggattaa atttacaaag cgcaaagcaa agcgacaaac 180
aaaattcaaa agaaagaaaa aaaaacactc aaataaactc acaaagaatt ccttatcgcc 240
aagggggcca atgttctaag gttctttcgc ct 272

Claims (26)

1.用于检测、鉴定和使用由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽miPEP的方法，
其中所述检测和鉴定如下实施：
(a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12～303个核苷酸的开放阅读框，然后
(b)在下列之间进行比较：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在，且
其中所述使用是：
(c)通过将所述miPEP或编码所述miPEP的多核苷酸引入到真核细胞来使用所述miPEP调节能够表达所述微小RNA的所述真核细胞中所述微小RNA的积累。
2.根据权利要求1的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加。
3.根据权利要求2的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的增加。
4.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中步骤(a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中。
5.根据权利要求5的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中步骤(a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’部分中。
6.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中或存在于野生型动物细胞中，并且其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为植物细胞，或者为动物细胞。
7.根据权利要求7的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为十字花科植物、豆科植物或茄科植物的植物细胞。
8.根据权利要求7的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为从由人细胞或果蝇细胞组成的组中选择的动物细胞。
9.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
10.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞之中，
所述微小RNA是外源来源的，
所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
11.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR、Northern印迹、DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
12.根据权利要求1～3之任一项的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中在步骤(c)中使用之前，将所述miPEP或编码所述miPEP的多核苷酸与赋形剂、稀释剂或溶剂混合。
13.根据权利要求12的用于检测、鉴定和使用miPEP的方法，其中所述赋形剂、稀释剂或溶剂包含选自下列的组分：乙腈，乙酸，乙腈和乙酸的混合物，水和乙腈的混合物，水和乙酸的混合物，及水、乙腈和乙酸的混合物。
14.用于检测、鉴定和合成由包含在微小RNA的初级转录物序列中的核苷酸序列所编码的微肽miPEP的方法，
其中所述检测和鉴定如下实施：
(a)检测包含在所述微小RNA的初级转录物序列中的具有12～303个核苷酸的开放阅读框，然后
(b)在下列之间进行比较：
·在由相对于所述开放阅读框的核苷酸序列而言相同或简并的核苷酸序列所编码的肽存在下，所述微小RNA在表达所述微小RNA的指定真核细胞中的积累，其中所述肽不依赖于所述微小RNA的初级转录物的转录而存在于所述细胞中，和
·在所述肽不存在下，所述微小RNA在与上述表达所述微小RNA的指定真核细胞相同类型的真核细胞中的积累，
其中，相对于所述微小RNA在所述肽不存在下的积累而言所述微小RNA在所述肽存在下的积累的调节表明了由所述开放阅读框所编码的微肽的存在，且
其中所述合成是：
(c)合成所述miPEP或编码所述miPEP的多核苷酸。
15.根据权利要求14的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的减少或增加。
16.根据权利要求15的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累的调节为所述微小RNA的积累的增加。
17.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中步骤(a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’或3’部分中。
18.根据权利要求17的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中步骤(a)的所述开放阅读框被包含在所述微小RNA的所述初级转录物的5’部分中。
19.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中所述微小RNA存在于野生型植物细胞中或存在于野生型动物细胞中，并且其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为植物细胞，或者为动物细胞。
20.根据权利要求19的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为十字花科植物、豆科植物或茄科植物的植物细胞。
21.根据权利要求19的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞为从由人细胞或果蝇细胞组成的组中选择的动物细胞。
22.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞之中，所述微小RNA是内源来源的。
23.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中在步骤(b)中所使用的所述真核细胞之中，
所述微小RNA是外源来源的，
所述真核细胞包含允许所述微小RNA表达的载体。
24.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中所述微小RNA的积累通过使用定量RT-PCR、Northern印迹、DNA芯片或RNA芯片来进行测定。
25.根据权利要求14～16之任一项的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中在步骤(c)中合成之前，将所述miPEP或编码所述miPEP的多核苷酸与赋形剂、稀释剂或溶剂混合。
26.根据权利要求25的用于检测、鉴定和合成miPEP的方法，其中所述赋形剂、稀释剂或溶剂包含选自下列的组分：乙腈，乙酸，乙腈和乙酸的混合物，水和乙腈的混合物，水和乙酸的混合物，及水、乙腈和乙酸的混合物。
CN202110730785.8A 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途 Pending CN113430295A (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR1360727A FR3012471A1 (fr) 2013-10-31 2013-10-31 Micropeptides et leur utilisation pour moduler l'expression de genes
FR13/60727 2013-10-31
FR1455044 2014-06-03
FR14/55044 2014-06-03
CN201480070078.9A CN105874083B (zh) 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201480070078.9A Division CN105874083B (zh) 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN113430295A true CN113430295A (zh) 2021-09-24

Family

ID=52016107

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201480070078.9A Active CN105874083B (zh) 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途
CN202110730785.8A Pending CN113430295A (zh) 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201480070078.9A Active CN105874083B (zh) 2013-10-31 2014-10-31 微肽及其用于调节基因表达的用途

Country Status (14)

Country Link
US (3) US20150121569A1 (zh)
EP (3) EP3063300B1 (zh)
JP (2) JP6506278B2 (zh)
CN (2) CN105874083B (zh)
BR (1) BR112016009697A2 (zh)
CA (1) CA2927427C (zh)
DK (3) DK3536804T3 (zh)
ES (2) ES2907768T3 (zh)
HU (1) HUE044944T2 (zh)
LT (1) LT3063300T (zh)
PL (2) PL3536804T3 (zh)
PT (2) PT3536804T (zh)
RS (1) RS58834B1 (zh)
WO (1) WO2015063431A1 (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN115093484A (zh) * 2022-06-27 2022-09-23 苏州乙水茉生物科技有限公司 miPEP156a与噁霉灵偶联体及其制备方法和应用
CN115710588A (zh) * 2022-11-10 2023-02-24 西南大学 超量表达bna-miR166f在改良油菜收获指数等复杂数量性状中的应用
CN117683103A (zh) * 2023-11-24 2024-03-12 南京林业大学 一种小肽miPEP166i及其在植物组织培养中的应用

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3152228B1 (fr) * 2014-06-03 2022-05-04 Université Toulouse III-Paul Sabatier Utilisation de micropeptides pour favoriser la symbiose mycorhizienne
EP3152309B1 (fr) * 2014-06-03 2020-09-02 Université Toulouse III-Paul Sabatier Utilisation de micropeptides pour favoriser la croissance des plantes
FR3061179A1 (fr) * 2016-12-22 2018-06-29 Universite Toulouse Iii-Paul Sabatier Peptides therapeutiques
EP3604529A4 (en) * 2017-03-29 2021-01-06 Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences MICRO-RNA AND USES THEREOF IN THE PREVENTION AND TREATMENT OF MEDICAL SIGNS AND / OR SYNDROME OF FIBROPLASIA
EP3539975A1 (en) * 2018-03-15 2019-09-18 Fundació Privada Institut d'Investigació Oncològica de Vall-Hebron Micropeptides and uses thereof
CN108690123B (zh) * 2018-06-21 2021-11-19 上海交通大学医学院 短肽在制备免疫调节药物中的应用
CN110540589B (zh) * 2019-01-08 2021-07-20 西南大学 一种多肽、多肽修饰的脂质载体及应用
CN112301029B (zh) * 2019-07-31 2023-02-24 上海交通大学医学院附属仁济医院 靶向调节miRNA的功能性小肽、其获得方法及其应用
CN111500579A (zh) * 2020-04-23 2020-08-07 九圣禾种业股份有限公司 棉花miR164a和NAC100L及其在调控植物黄萎病抗性中的应用
FR3141177A1 (fr) 2022-10-19 2024-04-26 Université Toulouse III - Paul Sabatier Nouveaux peptides et leur utilisation pour moduler l’accumulation d’une proteine
FR3141176A1 (fr) 2022-10-19 2024-04-26 Université Toulouse III - Paul Sabatier Nouveaux peptides et leur utilisation pour moduler l’accumulation d’une proteine

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101203611A (zh) * 2005-04-19 2008-06-18 巴斯福植物科学有限公司 控制基因表达的改良方法
US20080227085A1 (en) * 2003-01-17 2008-09-18 Pellegrini Matthew C Methods and Systems for the Identification of Rna Regulatory Sequences and Compounds that Modulate their Function
US20120100613A1 (en) * 2002-07-19 2012-04-26 University Of South Carolina Compositions and Methods for the Modulation of Gene Expression in Plants
WO2013096567A2 (en) * 2011-12-21 2013-06-27 Duke University The hsf-like transcription factor, tbf1, is a major molecular switch for growth-to-defense transition in plants

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US50106A (en) * 1865-09-26 Combined knife

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120100613A1 (en) * 2002-07-19 2012-04-26 University Of South Carolina Compositions and Methods for the Modulation of Gene Expression in Plants
US20080227085A1 (en) * 2003-01-17 2008-09-18 Pellegrini Matthew C Methods and Systems for the Identification of Rna Regulatory Sequences and Compounds that Modulate their Function
CN101203611A (zh) * 2005-04-19 2008-06-18 巴斯福植物科学有限公司 控制基因表达的改良方法
WO2013096567A2 (en) * 2011-12-21 2013-06-27 Duke University The hsf-like transcription factor, tbf1, is a major molecular switch for growth-to-defense transition in plants

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
AXEL BRENNTCKE ET AL.: "Micropeptide als Gen-Regulatoren", 《BIOL. UNSERER ZEIT》, vol. 40, no. 1, pages 371, XP055168530, DOI: 10.1002/biuz.201090090 *
DOMINIQUE LAURESSERGUES ET AL.: "Primary transcripts of microRNAs encode regulatory peptides", 《NATURE》, vol. 520, no. 7545, pages 90 - 93, XP055225397, DOI: 10.1038/nature14346 *
MÁXIMO IBO GALINDO ET AL.: "Peptides encoded by short ORFs control development and define a new eukaryotic gene family", 《PLOS BIOL》, vol. 83, pages 1052 - 1062 *
NICHOLAS T INGOLIA ET AL.: "Ribosome profiling of mouse embryonic stem cells reveals the complexity and dynamics of mammalian proteomes", 《CELL》, vol. 147, no. 4, pages 789 - 802, XP028109265, DOI: 10.1016/j.cell.2011.10.002 *
REBECCA SCHWAB ET AL.: "Enhanced microRNA accumulation through stemloop-adjacent introns", 《EMBO REP》, vol. 14, no. 7, pages 615 - 621, XP055253590, DOI: 10.1038/embor.2013.58 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN115093484A (zh) * 2022-06-27 2022-09-23 苏州乙水茉生物科技有限公司 miPEP156a与噁霉灵偶联体及其制备方法和应用
CN115710588A (zh) * 2022-11-10 2023-02-24 西南大学 超量表达bna-miR166f在改良油菜收获指数等复杂数量性状中的应用
CN115710588B (zh) * 2022-11-10 2024-05-03 西南大学 超量表达bna-miR166f在改良油菜收获指数等复杂数量性状中的应用
CN117683103A (zh) * 2023-11-24 2024-03-12 南京林业大学 一种小肽miPEP166i及其在植物组织培养中的应用
CN117683103B (zh) * 2023-11-24 2024-05-14 南京林业大学 一种小肽miPEP166i及其在植物组织培养中的应用

Also Published As

Publication number Publication date
RS58834B1 (sr) 2019-07-31
BR112016009697A2 (pt) 2017-12-05
EP3536804B1 (fr) 2022-01-05
EP4032985B1 (fr) 2024-03-13
HUE044944T2 (hu) 2019-11-28
DK3536804T3 (da) 2022-02-21
ES2907768T3 (es) 2022-04-26
CN105874083A (zh) 2016-08-17
DK3063300T3 (da) 2019-06-17
LT3063300T (lt) 2019-06-10
EP3063300B1 (fr) 2019-03-06
JP2019170379A (ja) 2019-10-10
EP3536804A1 (fr) 2019-09-11
CA2927427C (fr) 2023-09-19
DK4032985T3 (da) 2024-06-17
US20150121569A1 (en) 2015-04-30
WO2015063431A1 (fr) 2015-05-07
EP4032985A1 (fr) 2022-07-27
EP3063300A1 (fr) 2016-09-07
PT3536804T (pt) 2022-02-09
CN105874083B (zh) 2021-08-20
PL3063300T3 (pl) 2019-08-30
PL3536804T3 (pl) 2022-06-27
US20200131234A1 (en) 2020-04-30
US20160251402A1 (en) 2016-09-01
ES2729402T3 (es) 2019-11-04
JP2017504308A (ja) 2017-02-09
JP6506278B2 (ja) 2019-04-24
US20200031884A1 (en) 2020-01-30
PT3063300T (pt) 2019-07-05
CA2927427A1 (fr) 2015-05-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN113430295A (zh) 微肽及其用于调节基因表达的用途
AU2017203438B2 (en) Plants resistant to insect pests
AU2023204276A1 (en) Novel CRISPR-associated transposases and uses thereof
CA2583722C (en) Nematode resistant transgenic plants
CN115175556B (zh) 与大豆中锈病抗性相关联的新颖的遗传基因座
US20030093837A1 (en) Polynucleotides for seed trait alteration
CN110452908A (zh) 在昆虫害虫中下调基因表达
CN101883783A (zh) 具有增强的产量相关性状的植物及其制备方法
CN101605902A (zh) 具有增强的产量相关性状和/或提高的非生物胁迫抗性的植物和制备该植物的方法
KR20170032317A (ko) 담배 프로테아제 유전자
KR20170101929A (ko) 딱정벌레류 해충을 방제하기 위한 염색질 재형성 유전자의 모 RNAi 억제
KR20150096765A (ko) 식물 조절 요소 및 그의 용도
CN111542610A (zh) 精确基因组编辑的新策略
KR102308873B1 (ko) 단위결과 제어 유전자 및 그 이용
KR20170106314A (ko) 노린재류 해충을 방제하기 위한 염색질 재형성 유전자의 모 RNAi 억제
KR20140135719A (ko) 종자 활력의 조절
US10563214B2 (en) Use of micropeptides for promoting plant growth
CN101595222A (zh) 具有改良的种子产量相关性状的植物及其制备方法
CN114729357A (zh) 调节植物开花的rna分子
KR20220165764A (ko) 니코티아나 타바쿰에서 니코틴 수준을 조절하는 방법
CN115867565A (zh) 用于改善对大豆锈病的抗性的方法
US12024543B2 (en) Micropeptides and use of same for modulating gene expression
CN114746555A (zh) 大豆属调节元件及其用途
JP2006055125A (ja) 遺伝子の転写抑制機能を有する新規ペプチドおよびこれをコードするポリヌクレオチド、並びにその利用
AU2005229721A1 (en) Expression cassettes for seed-preferential expression in plants

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination