CN113416344B - 一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜及其制备方法 - Google Patents
一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜及其制备方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜及其制备方法,其制备方法,依次包括以下步骤:(1)将可聚合磷脂和不可聚合磷脂混合,然后加入光引发剂,混匀,得混合磷脂溶液;(2)将混合磷脂溶液涂抹至纳米孔基材上,进行溶剂挥发,得磷脂膜;(3)在纳米孔基材两侧浴池中加入离子通道缓冲液复溶,然后二次涂抹混合磷脂溶液,紫外光辐照,得纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜。本发明还包括采用上述方法制得的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜。本发明通过引入可聚合的磷脂分子,制得具有高度稳定性的磷脂双层膜,解决现有技术中人工双层膜成膜后稳定性差等问题。
Description
技术领域
本发明涉及生物科学技术领域,具体涉及一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜及其制备方法。
背景技术
随着人类恶性肿瘤、心脑血管疾病等疾病患病率的提升以及现代生物医药技术的不断发展,精准医疗已成为国家战略性新兴产业的组成部分,与此同时,大数据时代对人类复杂基因信息的分析和解读也让精准医疗正逐渐从概念成为现实。其中,基因测序作为一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,从而锁定个人病变基因,从而提前进行预防和治疗。我国是全世界人口最多的国家,民族众多、基因类型丰富、测序需求最为庞大,基因测序技术已然成为我国精准医疗发展的基石和精髓。
目前最新的四代基因测序技术(又称纳米孔测序技术)是基于电信号测序的技术,其原理是通过电场力驱动单链核酸分子穿过纳米尺寸的蛋白孔道,由于不同的碱基通过纳米孔道时产生了不同阻断程度和阻断时间的电流信号,由此可根据电流信号识别每条核酸分子上的碱基信息,从而实现对单链核酸分子的测序。相较于前几代基因测序技术,纳米孔测序技术能直接检测RNA分子和表观遗传修饰,测序速度更快且测序读长更长,但是负责产生碱基特征电流的纳米孔蛋白在生物双层膜上构像不稳定,孔道时常自发关闭,且伴随电流信号的噪音,严重影响测序的准确率和工作稳定性。目前已有的第四代基因测序仪中,使用的磷脂双层膜是通过相对较弱的亲疏水作用力结合而成的,成膜后稳定性较差,通常在24h内就会出现膜破裂现象,严重影响检测结果的准确性和稳定性。如何提高纳米孔上的膜稳定性也成了目前基因测序产业中亟待解决的问题。
发明内容
针对现有技术中的上述不足,本发明提供了一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜及其制备方法,通过引入可聚合的磷脂分子,制得具有高度稳定性的磷脂双层膜,解决现有技术中人工双层膜成膜后稳定性差等问题。
为实现上述目的,本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:提供一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,依次包括以下步骤:
(1)将可聚合磷脂和不可聚合磷脂混合,然后加入光引发剂,混匀,得混合磷脂溶液;
(2)将混合磷脂溶液涂抹至纳米孔基材上,进行溶剂挥发,得磷脂膜;
(3)在纳米孔基材两侧浴池中加入离子通道缓冲液复溶,然后二次涂抹混合磷脂溶液,紫外光辐照,得纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜。
进一步,步骤(1)中,不可聚合磷脂和可聚合磷脂摩尔比为10:1-1:10。
进一步,步骤(1)中,可聚合磷脂和光引发剂摩尔比为10:1-1:1。
进一步,不可聚合磷脂为二硬酯酰磷脂酰胆碱。
进一步,可聚合磷脂为二氧化十八碳三烯酰磷脂酰胆碱、二氧化白三烯酰磷脂酰胆碱、1-氧化十八碳三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱和1-氧化白三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱中的至少一种。
进一步,可聚合磷脂分子结构式如下:
进一步,光引发剂为2,2-二乙氧基-1-苯己酮、а-甲基苯基巯基二苯甲酮或三甲基甲酰二苯基氧化膦。
进一步,可以预涂一部分磷脂,增加后续磷脂分子与基材的结合力,具体步骤如下:
将可聚合磷脂和/或不可聚合磷脂用氯仿溶解,氩气干燥,真空干燥至少4h,然后复溶至正癸烷中,最终浓度为10mM。
进一步,步骤(2)中,纳米孔基材先经过SU-8预处理。
进一步,采用静置蒸发或氮气蒸发进行溶剂挥发。
进一步,步骤(3)中,离子通道缓冲液为0.1M氯化钾溶液和5mM HEPES溶液的混合液,pH值为7.4。
进一步,步骤(3)中,在波长254-365nm和功率5-50W紫外光下辐照10min-2h,辐照温度为4-37℃。
进一步,通过以下方法以确定磷脂双分子层的形成:
S1:在纳米孔两侧缓冲液中接入Ag/AgCl参比电极并施加+150mV的外加电压,观察电阻变化,若有高于15GΩ的电阻产生,则证明在纳米孔上形成了磷脂膜;
S2:通过在纳米孔两侧施加1V的外加电压,若两侧电阻减小到初始数值,则进一步证明已形成的磷脂膜被破坏,此时只需通过再次涂抹成膜即可。
进一步,磷脂膜的紫外辐照交联具体步骤如下:
S1:通过在纳米孔两侧持续施加5mV方波脉冲的电流,并监测电阻值变化,以验证磷脂膜在聚合过程中保持完好性;
S2:将紫外灯放置在距纳米孔1cm的位置对磷脂膜进行紫外辐照,实现混合磷脂的原位光交联;
S3:选取丙甲苷肽作为跨膜蛋白,在纳米孔一侧缓冲液中加入2μL丙甲苷肽溶液(60ng/mL)并施加-150mV偏置电压使跨膜蛋白嵌入磷脂膜;
S4:通过测量聚合磷脂膜的使用寿命和击穿电压来证明其稳定性;在膜两侧施加-150mV到+150mV的动态电压(每2min增减50mV),记录磷脂膜破裂的平均时间以确定其使用寿命。通过施加从0到2000mV的递增电压(每50ms增加10mV),测得聚合磷脂膜的击穿电压值。
上述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法制得的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜。
综上所述,本发明具有以下优点:
1、本发明通过引入可聚合的磷脂分子,制得具有高度稳定性的磷脂双层膜,解决现有技术中人工双层膜成膜后稳定性差等问题。制备时,通过不同比例的可聚合磷脂和不可聚合磷脂混合形成磷脂溶液,混合磷脂通过与纳米孔基材间的亲疏水作用力形成磷脂双层膜,随后通过紫外辐照实现磷脂膜的原位光交联,最终得到具有优异可重复性及高稳定性的新型聚合磷脂双层膜。
2、本发明提出了使用可聚合磷脂和不可聚合磷脂制备的混合磷脂双层膜的新方法,通过紫外辐照使混合磷脂发生内部交联,在保留了磷脂膜流动性的前提下,极大地提高了磷脂膜的使用寿命和稳定性,同时又不影响跨膜蛋白的嵌入,该方法还具有极高的重复性,未来有望能够用于基因测序工作以提高仪器生产效率及使用稳定性。还能够极大的提升第四代基因测序的稳定性及其使用寿命,同时该方法依靠其优异的可重复性,能够很好地提升相关仪器的生产效率,降低生产成本。
具体实施方式
实施例1
一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜,其制备方法依次包括以下步骤:
S1:选取聚苯乙烯作为纳米孔基材,并对其进行SU-8预处理,得到极性增强表面。
S2:在黄光保护下,将DSPC溶液(10mM)和DOOTrPC溶液(10mM)按照1:1摩尔比混合,得到混合磷脂溶液。
S3:将混合磷脂涂抹至纳米孔上,静置15min待溶剂蒸发。
S4:在纳米孔两侧浴池中各加入1mL离子通道缓冲液(0.1M KCl,5mMHEPES,pH7.5)使溶剂挥发后的磷脂分子复溶。
S5:吸取2μL混合磷脂溶液复涂至纳米孔,观测参比电极间的电阻变化情况,得到稳定未交联的磷脂双层膜。
S6:利用紫外灯(4750μW/cm2,波长254nm)在距纳米孔1cm位置对磷脂膜进行紫外交联15min,得到聚合磷脂双层膜。
S7:在一侧浴池中加入2μL丙甲苷肽溶液并施加-150mV偏置电压使其嵌入交联后的磷脂膜中,得到跨膜蛋白活化的交联磷脂双层膜。
实施例2
一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜,其制备方法依次包括以下步骤:
S1:选取聚苯乙烯作为纳米孔基材,并对其进行SU-8预处理,得到极性增强表面。
S2:在黄光保护下,将DSPC溶液(10mM)、DOOTrPC溶液(10mM)和OOTrSPC(10mM)按照1:1:1摩尔比混合,得到混合磷脂溶液。
S3:将混合磷脂涂抹至纳米孔上,静置15min待溶剂蒸发。
S4:在纳米孔两侧浴池中各加入1mL离子通道缓冲液(0.1M KCl,5mM HEPES,pH7.5)使溶剂挥发后的磷脂分子复溶。
S5:吸取2μL混合磷脂溶液复涂至纳米孔,观测参比电极间的电阻变化情况,得到稳定未交联的磷脂双层膜。
S6:利用紫外灯(4750μW/cm2,波长254nm)在距纳米孔1cm位置对磷脂膜进行紫外交联15min,得到聚合磷脂双层膜。
S7:在一侧浴池中加入2μL丙甲苷肽溶液并施加-150mV偏置电压使其嵌入交联后的磷脂膜中,得到跨膜蛋白活化的交联磷脂双层膜。
实施例3
一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜,其制备方法依次包括以下步骤:
S1:选取聚苯乙烯作为纳米孔基材,并对其进行SU-8预处理,得到极性增强表面。
S2:在黄光保护下,将DSPC溶液(10mM)、DOLPC溶液(10mM)和OLSPC溶液(10mM)按照1:1:1摩尔比混合,得到混合磷脂溶液。
S3:将混合磷脂涂抹至纳米孔上,静置15min待溶剂蒸发。
S4:在纳米孔两侧浴池中各加入1mL离子通道缓冲液(0.1M KCl,5mM HEPES,pH7.5)使溶剂挥发后的磷脂分子复溶。
S5:吸取2μL混合磷脂溶液复涂至纳米孔,观测参比电极间的电阻变化情况,得到稳定未交联的磷脂双层膜。
S6:利用紫外灯(4750μW/cm2,波长254nm)在距纳米孔1cm位置对磷脂膜进行紫外交联15min,得到聚合磷脂双层膜。
S7:在一侧浴池中加入2μL丙甲苷肽溶液并施加-150mV偏置电压使其嵌入交联后的磷脂膜中,得到跨膜蛋白活化的交联磷脂双层膜。
实施例4
实施例4与实施例1相比,区别在于:使用纯非聚合磷脂二硬酯酰磷脂酰胆碱(DSPC)制备磷脂膜。
实施例5
实施例5与实施例1相比,区别在于:紫外灯交联时间缩短至10min。
实施例6
实施例6与实施例1相比,区别在于:紫外灯交联时间延长至20min。
实施例7
实施例7与实施例1相比,区别在于:先在一侧浴池中加入2μL丙甲苷肽溶液并施加-150mV偏置电压,待通道蛋白成功嵌入未交联的磷脂双层膜之后,再对其进行紫外交联15min。
实施例8
实施例8与实施例1相比,区别在于:使用溶血素作为跨膜蛋白使用,在一侧浴池中加入2μLα-HL溶液并施加+40mV偏置电压使其嵌入交联后的磷脂膜中。
在不同条件下制备具有蛋白通道的磷脂膜,并测定其击穿电压和磷脂膜寿命,其结果见表1。表1中,磷脂1为二硬酯酰磷脂酰胆碱(DSPC);磷脂2为二氧化十八碳三烯酰磷脂酰胆碱(DOOTrPC);磷脂3为二氧化白三烯酰磷脂酰胆碱(DOLPC);磷脂4为1-氧化十八碳三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱(OOTrSPC);磷脂5为1-氧化白三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱(OLSPC)。
表1不同条件下所制备的具有蛋白通道的磷脂膜的稳定性
由表1可知,通过对比编号4中传统的磷脂膜可以看出,传统磷脂膜的寿命较短,仅4个小时,通过掺杂具有聚合能力的磷脂分子,磷脂膜的稳定性可大幅改善,寿命最高可达100小时左右,提高25倍左右,同时击穿电压提升至2000mV。
虽然本发明的具体实施方式对本发明进行了详细地描述,但不应理解为对本专利的保护范围的限定。在权利要求书所描述的范围内,本领域技术人员不经创造性劳动即可作出的各种修改和变形仍属本专利的保护范围。
Claims (6)
1.一种纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,其特征在于,依次包括以下步骤:
(1)将可聚合磷脂和不可聚合磷脂混合,然后加入光引发剂,混匀,得混合磷脂溶液;所述不可聚合磷脂为二硬酯酰磷脂酰胆碱;所述可聚合磷脂为二氧化十八碳三烯酰磷脂酰胆碱、二氧化白三烯酰磷脂酰胆碱、1-氧化十八碳三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱和1-氧化白三烯酰基-2-硬酯酰-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱中的至少一种;所述光引发剂为2,2-二乙氧基-1-苯己酮、а-甲基苯基巯基二苯甲酮或三甲基甲酰二苯基氧化膦;
(2)将混合磷脂溶液涂抹至纳米孔基材上,进行溶剂挥发,得磷脂膜;
(3)在纳米孔基材两侧浴池中加入离子通道缓冲液复溶,然后二次涂抹混合磷脂溶液,紫外光辐照,得纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜;所述离子通道缓冲液为0.1M氯化钾溶液和5mM HEPES溶液的混合液,pH值为7.4。
2.如权利要求1所述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,其特征在于,步骤(1)中,所述不可聚合磷脂和可聚合磷脂摩尔比为10:1-1:10。
3.如权利要求1所述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,其特征在于,步骤(1)中,所述可聚合磷脂和光引发剂摩尔比为10:1-1:1。
4.如权利要求1所述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,其特征在于,步骤(2)中,所述纳米孔基材先经过SU-8预处理。
5.如权利要求1所述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法,其特征在于,步骤(3)中,在波长254-365nm和功率5-50W紫外光下辐照10min-2h,辐照温度为4-37℃。
6.根据权利要求1-5任一项所述的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜的制备方法制得的纳米孔基因测序用光交联磷脂双层膜。
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