CN112961924A - 用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法 - Google Patents
用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN112961924A CN112961924A CN202110494861.XA CN202110494861A CN112961924A CN 112961924 A CN112961924 A CN 112961924A CN 202110494861 A CN202110494861 A CN 202110494861A CN 112961924 A CN112961924 A CN 112961924A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- metastasis
- recurrence
- dna
- cervical cancer
- risk
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法。基于本发明发现了与宫颈癌复发或转移密切相关的基因集，其中包含众多首次发现的基因，提高了评估宫颈癌复发或转移风险的可靠性。由于对于晚期及治疗后复发、转移的宫颈癌患者中，HPV所发挥的作用缺乏认识，本申请对于指导临床治疗以及对于宫颈癌防治具有重要意义。
Description
技术领域
本发明涉及用于疾病诊断的组合物、试剂和方法，具体地涉及用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法。
背景技术
宫颈癌是全球女性群体中最常见的第四大癌症之一，我国亦面临严峻情况，根据最新版全国癌症数据报道，中国女性中的宫颈癌新发病98.9万，死亡病例30.5万。大部分宫颈癌发生都与人乳头瘤病毒(HPV)感染相关。但目前HPV在局部晚期宫颈癌患者，以及治疗后复发、转移宫颈癌患者中的作用缺乏认识。目前研究数据表明，宫颈癌患者治疗后,约有31％患者易出现肿瘤未控或复发(29％-38％)，局部复发宫颈癌患者的5年生存率不到40％。由此可见，如何提前准确预测患者放化疗疗效并予以积极干预，不但能改善复发患者的预后，也是未来的重要研究方向。同时，对放化疗耐受患者，找到潜在的个体化增敏或靶向治疗的方法，对实现精准的个体化诊治具有重要的临床意义。我们的研究发现HPV在局部晚期以及治疗后复发、转移宫颈癌患者中存在特定基因某些关键位置的整合，这些特定基因相关位点的检测较为准确预测了这一类患者治疗的预后。因此，通过检查HPV感染与否和HPV基因组整合状态，指导临床治疗，对于宫颈癌防治具有重要意义。特别是对于晚期及治疗后复发、转移的宫颈癌患者中，HPV所发挥的作用缺乏认识，如果能发现HPV在该类患者的基因组中关键位置的整合位点，有可能成为这一类患者治疗关键突破点。
目前已有HPV检测方法：
1、细胞学检查(巴氏涂片、薄层液基细胞)，被HPV感染的宫颈细胞往往会出现特征性的改变，如果发现细胞出现了这些改变，报告就会提示有HPV感染。靠细胞学发现HPV感染，往往不够敏感，因为早期HPV感染的细胞可能不出现典型的形态学改变。且该方法受医师主观影响较大，需要经验丰富医生判定，假阴性高，不易推广。
2、分子检测(DNA)
2.1杂交捕获检测(HC-Ⅱ)
该法同时能检测13种高危型HPV，对宫颈高度病变的检测有很高的敏感度和特异性。缺点是不能测定具体的HPV型别。。
2.2实时荧光定量PCR技术(Cobas 4800)
实时荧光定量PCR技术在常规PCR基础上加入荧光标记探针，不同的荧光染料标记不同探针。PCR扩增在完全封闭的系统中运行，从而避免了扩增产物污染和交叉污染的可能性。该方法灵敏度高、特异性强。
2.3基因芯片法
该方法基于PCR技术和DNA芯片技术，将PCR产物与固定在DNA芯片上的HPV特异性探针进行杂交，通过Cy5-dUTP标记的探针与标签序列的结合对样本中HPV进行分型检测。该方法可同时检测24种HPV亚型，缺点是费用较高，特异性稍差。
以上分子检测方法均不能判断HPV是否在人类基因组内进行整合。
发明内容
本发明基于纳米孔测序技术对临床确认为高危型HPV感染患者的样本进行融合基因检测，发现大量新的HPV整合位点及融合基因，进一步研究发现，这些位点可以用于临床宫颈癌复发或转移风险评估。具体地，本发明包括以下内容。
本申请的第一方面，提供一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物，其由能够检测源自HPV的基因片段插入受试者靶标基因的插入位点的多条引物或探针组成，所述靶标基因由表1所示的2173个基因组成。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物，优选地，所述多条探针的序列如SEQ ID NO:1-135所示。
本申请的第二方面，提供一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的试剂盒，其包括本申请第一方面所述的引物或探针组合物。
本申请的第三方面，提供一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其包括以下步骤：
(1)利用试剂检测受试者生物样本中的插入位点信息的步骤，其中所述插入位点信息是指源自HPV的基因片段插入受试者靶标基因的信息，所述试剂包含第一方面所述的引物或探针组合物；
(2)根据插入位点信息计算评估值的步骤；和
(3)根据评估值来判断宫颈癌复发或转移风险的步骤。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，优选地，所述步骤(1)包括从接受治疗后的宫颈癌受试者采集生物样本，提取DNA，得到长度为1-5K的片段，使片段或其部分通过位于电极附近的芯片纳米孔，其中，所述电极能够检测通过所述纳米孔的电流。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，优选地，所述步骤(2)中评估值的计算包括为每一个靶标基因分配一个因子，并将所有靶标基因的因子之和作为评估值。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，优选地，如果所述靶标基因内或附近不存在源自HPV的基因片段的插入位点，则对应的靶标基因的因子设为0，如果靶标基因内或附近存在源自HPV的基因片段的插入位点，则对应的靶标基因的因子设为大于0。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，优选地，其进一步包括根据靶标基因对于复发或转移的风险程度而对靶标基团进行加权的步骤。
根据本申请所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，优选地，所述步骤(3)包括当受试者的评估值达到或超过阈值时，则将所述受试者评估为复发或转移高风险，当受试者的评估值低于阈值时，则将所述受试者评估为复发或转移低风险。
本申请的引物或探针组合物针对宫颈癌复发或转移密切相关的基因而设计开发。本申请的这些基因包含众多首次发现的基因，提高了评估宫颈癌复发或转移风险的可靠性。由于对于晚期及治疗后复发、转移的宫颈癌患者中，HPV所发挥的作用缺乏认识，本申请对于宫颈癌临床治疗的指导具有重要意义。
具体实施方式
现详细说明本发明的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本发明的限制，而应理解为是对本发明的某些方面、特性和实施方案的更详细的描述。
应理解本发明中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本发明。另外，对于本发明中的数值范围，应理解为具体公开了该范围的上限和下限以及它们之间的每个中间值。在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本发明内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内。
除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本发明所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义。虽然本发明仅描述了优选的方法和材料，但是在本发明的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料。本说明书中提到的所有文献通过引用并入，用以公开和描述与所述文献相关的方法和/或材料。在与任何并入的文献冲突时，以本说明书的内容为准。
传统检测方法在检测HPV在基因组的插入位点时存在诸多不足。例如，基于杂交捕获的HPV检测方法，可以检测已知的高危型HPV，但不能测定具体的HPV型别。应用较多的实时荧光定量PCR检测方法，虽然可以鉴定具体HPV型别，但无法判断HPV是否有与人基因组发生融合。基于NGS和探针捕获的HPV检测方法，虽然可以同时检测HPV型别和融和状态，但检测周期长，而且受NGS读长限制，对于人基因组重复序列区域附近的融合检出率比较低。
纳米孔测序属于第三代测序技术，与上述现有HPV检测方法不同，纳米孔测序不仅可以检测已知的高危型HPV，而且还能检测具体的HPV型别，更重要的是，纳米孔测序读长更长，可达1K-1Mbp，因此可以检测到人基因组重复序列区域附近的融合。正是基于此，通过设计针对高危型HPV全基因组的探针，首次发现众多的新型整合位点及融合基因，并在存在这些插入的基因中筛选得到一组能够用于宫颈癌复发或转移评估的组合。
本发明中，插入位点一般位于受试者基因组的特定基因内部或这些基因的附近，特别是位于这些基因的5’端调节区域，如启动子区等。而且本发明发现HPV DNA片段插入上述基因内或附近更容易引发宫颈癌复发或转移的结论均来源于真实临床病例，并每一个病例均有完整的长期随访资料。优选出的与宫颈癌的复发或进展密切相关的基因均根据随诊结果得以验证。
本发明中，受试者为人类，优选为疑似宫颈癌患者，或确诊为宫颈患的患者。本发明的生物样本为源自宫颈的组织或细胞或者它们的处理物。处理物包括组织或细胞的破碎或裂解液或提取物，特别是DNA提取物。
本发明的试剂盒包含用于宫颈癌预后或用于预测宫颈癌复发或转移风险的引物和/或探针。这些引物和/或探针能够与参考插入位点集中各插入位点两侧的序列互补结合，或者探针能够与包含参考插入位点的序列互补结合。
除了上述引物或探针组之外，本发明的试剂盒还可包括以政府机构规定的形式与调控制造、使用或销售诊断试剂盒相关的注意事项。另外，本发明的试剂盒还可提供有使用、储存和故障排除的详细说明书。试剂盒还可任选地设置在适合的优选用于以高通量设置的机器人操作的装置中。
在某些实施方案中，本发明的试剂盒的组分(例如，探针组)可提供为干粉。当试剂和/或组分提供为干粉时，粉末可通过添加适合的溶剂来恢复原状。预期该溶剂还可设置于另一容器中。容器通常会包括至少一种小瓶、试管、烧瓶、瓶、注射器和/或其它容器手段，其中可选等分地放置溶剂。试剂盒还可包括用于包含无菌、药学上可接受的缓冲液和/或其它溶剂的第二容器的手段。
在某些实施方案中，本发明的试剂盒的组分可以溶液形式提供，例如水溶液的形式提供。在以水溶液状态存在的情况下，这些成分的浓度或含量是本领域技术人员能够根据不同需求而方便地确定的。例如，用于储存的目的时，例如探针的浓度可以较高的形式存在，当处于工作状态或使用时，可通过例如稀释上述较高浓度的溶液来将浓度降低至工作浓度。
本发明的试剂盒可进一步包含其他试剂或成分。例如，用于进行PCR所需的DNA聚合酶、各类dNTP和离子如Mg2+等。这些其他试剂或成分是本领域技术人员已知的，并且可通过例如冷泉港的《分子克隆实验指南》第四版等公开出版物容易地获知。
在试剂盒中存在超过一种组分的情况下，该试剂盒还通常会包含可单独放置另外的组分的第二、第三或其它另外的容器。另外，可在容器中包含各多种组分的组合。
本发明的试剂盒还可包括保持或维持DNA的组分，例如抗核酸降解的试剂。此类组分可为例如或无RNase或具有抗RNase的保护的核酸酶。本文所述的任何组合物或试剂可为试剂盒中的组分。
实施例
一、临床数据收集
本发明基于中国医学科学院北京协和医院收治的33例患者的样本数据。具体地，根据收治时患者的临床情况，分为初治组和复发组。其中初治组为收治时初次临床确诊为宫颈癌，其包括患者15例。复发组为宫颈癌患者在治疗或治愈后，我院收治时临床确认复发或转移的患者，其包括患者18例，这些患者收治时的诊断情况如下表1所示。进一步定期追踪初治组患者的后期治疗和复发情况，将至少一年内未发现复发或转移的患者分至初治无进展组(10人)，将一年内出现复发或转移的患者分至初治进展组(5人)。采集所有患者的血液通过纳米孔测序分析HPV插入基因组的数据。
表1
二、实验经过
1、实验材料
临床患者的液基薄层细胞待检样本(TCT)。
2、主要测序平台和试剂
测序平台：多种型号纳米孔测序仪
主要试剂：PCR Barcoding Kit(SQK-PBK004)
3、探针设计合成
依据CFDA发布的“HPV核酸检测及基因分型、试剂技术审查指导原则”明确的18种HPV(HPV16，18，31，33，35，39，45，51，52，56，58，59，68，26，53，66，73，82)基因组设计合成混合探针。探针序列包括如SEQ ID NO:1-135所示的序列。
4、实验方法
4.1基因组DNA提取
提取33例临床确认高危型HPV感染患者TCT样本DNA。方法参考天根生物公司的微量样品基因组DNA提取试剂盒。
4.2基因组DNA打断
采用covaris超声破碎仪将基因组DNA打断到主带1-5Kb
4.3文库构建
用带有Barcode的纳米孔建库试剂盒进行文库构建。
4.4 HPV基因组DNA捕获
18种高危型探针捕获待检样本中的HPV基因组DNA，流程参考xGen LockdownReagents(IDT)，对杂交温度和时间进行优化获取更长的含有HPV的序列片段以及更高的病毒序列比例。
4.5测序
利用纳米孔平台测序。
5、实验结果
5.1融合基因统计分析
三、结果及分析
经分析，发现在初治组的15例患者的测序数据中，有4954个基因附近或内部插入了源自HPV基因或片段，在复发组的18例患者测序数据中，有3148个基因附近或内部存在源自HPV基因或片段的插入。取在复发组中存在而在初治组无进展中不存在的基因，得到2173个基因的集合。以下简称为“复发基因集”，具体参见表2。“复发基因集”中的基因均来源于复发患者且扣除了初治无进展组中的基因，表明该基因集合中的基因与宫颈癌的复发或转移密切相关。如果在这些基因附近或内部存在HPV基因或片段的插入，则表明患者复发或转移的风险高。
表2
接下来，以各基因在复发组各患者中出现的频率进行统计。发现在复发组中有1个基因LINC00662在5个不同的患者内出现了HPV基因或片段的插入现象。有8个基因在4个不同的患者内出现了HPV基因或片段的插入现象。这8个基因分别为ALG10B、ZNF733P、TTTY23、COBL、CSMD3、DISC1FP1、DIAPH2、CNTN5。有28个基因在3个不同的患者内出现了HPV基因或片段的插入现象。这28个基因分别为INTU、LINC01387、MIR3668、HCN1、SLX4IP、GRXCR1、PAK1、PKHD1、AGTR1、EPHB1、FRK、LINC01320、LINC01361、MIR3648-1、NRG3、SLC16A7、AGAP1、LOC100507468、MCHR2、AJAP1、MIR4417、LINC00998、NEDD4L、SORL1、NRSN1、KIRREL、TUBGCP3、GRID2。另外，有282个基因在2个不同的串者内出现了HPV基因或片段的插入。其余1854个基因均在1个患者内出了一次HPV基因或片段的插入，将这些基因分类为低频插入位点基因。
为了能够对风险评估进行量化分析，对复发基因集中的每个基因分别设定均等的初始值。例如，分别为1。但在计算评估值时，根据每个基因对于风险的影响大小给予一定的影响因子或系数。这些影响因子或系数可以是插入出现的频率、基因与癌症发生的关联性大小等。为了简化说明，在此仅示例性地以插入在不同样本(复发组)基因内出的频率作为因子来评价本申请筛选得到的复发基因作为宫颈癌复发或转移风险指标的可行性。
具体地，将在4-6个样本(患者)内存在插入的基因，分别赋予系数100。将在2-3个样本内存在插入的基因分别赋予系数10。将插入1个样本的基因赋予系数1。另外，对于未检测到存在插入位点的复发基因以及不在复发基因集范围内的其他基因分别赋予系数0。例如，对于新收集的样本，预测得到复发基因集内2173个基因的数据，如果复发基因集中有ALG10B、LOC101928135和MTX2三个基因存在HPV基因或片段的插入，其他基因没有对应的HPV基因插入，则评估值＝100*1+10*1+1*1＝111。如果计算得到的评估值为0，说明患者治疗后复发或转移的风险极低或为0。如果计算得到的评估值大于1，则说明存在患者在治疗后复发或转移的风险。计算得到的评估值越高，说明患者在治疗后复发或转移的风险越高。评估值越大，说明风险越高。为了预测方便，可以设置用于评估的阈值。阈值的大小是本领域根据不同应用场景或具体情况而设定。例如可以是1、3、5、7、9或更高。为了提高预测的准确性，可以选择高的阈值，如10。
对于初治组中随诊一年内出现复发或转移的患者(共5人)作为验证集，验证本申请方法的可行性。下表3列出了初治进展组患者的临床诊断信息。
表3
对于XH00003号样本的测序数据分析，确认在复发基因集中的基因如下所示：SGCG、APOO、LINC01539、SIX2、PLPPR1、ZBTB20、SPHKAP、LINC00662、POU3F2、ADGRG7、SCHIP1、TANC1、ATG7、NASP、DCC、LOC339975、LOC101927869、LOC100506675、MIR548AB、AJAP1、UHRF2、TEKT1、TMEM261、MIR8069-1、SGCZ、CAP2、CAPZA3、CACNG3、LOC100420587、LOC284395、DKFZp686K1684、PARD3-AS1、LHX1、CYP1B1-AS1、FAM83F、TRERF1、LOC101927501、ENOX1、HCN1、NLRP8、PPM1E、MIR646HG、LINC01135、LOC101928851、CDH19、CBLN2、SLCO5A1、LINC00469、KLF5、MIR2052HG、PRCAT47、CTSC、ISG20、DISC1FP1、CRAT37、LOC643339、RGMA、LINC00535、TRIM43B、DIAPH2、MIR2113、TMEM45A、ABI3BP、CERS3、SLC9A4、KLF10、RAB9BP1、C7orf66、KLF4、PHLDB2、ATXN2、SPACA7、SPICE1、CSMD3、DSCAML1、CHSY3、EPB41L2、STAG1、KHDRBS3、IL20RB、COL22A1、TRY2P、PDIA4、LYPD6、PQLC2L、SLC4A10、BCHE、FNDC3B、CDCA7、C1orf220、PLXNA2、LINC01002、MIR4417、VCX、CDRT15P1、CYP4F29P、KIAA1217、DHRS4-AS1、RBBP6、DSC3、LINC00906、FUT10、CUL2、PTGER4、LOC388942、UBR2、RAB3B、MIR5011、LINC01515、NETO1、LINC00392、PI15、LINC01361、LINC00333、CNTN5、SLCO4C1、SLC9A2、AZIN1、TUBGCP3、FRK、GAP43、MIR3672、MGMT、MTRNR2L6、SHOX2、IQCJ、SP3、MIR7977。
对于XH00038样本，确认在复发基因集中的基因如下所示：LINC01361、DCC、SUGP2、LOC653602、BHLHE40、OR4F21、SLC16A7、PARD3B、ISM1、LIMD1、GRXCR1、PCDH18、OSTF1、MURC、LOC101928270、LINC00662、ACTL8、CSMD2、LINC01135、PLPPR4、ACBD6、CCDC185、URB2、LINC00707、KIAA1217、CCDC7、WDFY4、LINC01468、LDB3、DOCK1、FRG2B、C11orf80、TFCP2、TMCC3、TMEM132B、HTR2A、PCSK6、TP53TG3HP、LOC102723376、ADGRL1、FSHR、KCNJ3、MTX2、PTH2R、PID1、MIR646HG、CYP4F29P、DEPDC5、LOC152225、SOX2-OT、LDB2、ARHGAP24、RAPGEF2、SH3RF1、PDE4D、RAB9BP1、DNAH8、EPB41L2、MRPL32、COA1、MTERF1、HTR5A、SGCZ、LINC01605、RNF5P1、OXR1、RCL1、LOC103908605、SPATA31D1、LOC101927876、LOC101927587、CAPN8、GALNT2、SFMBT2、MBL2、SLC38A2、MIR492、NUAK1、TM2D3、ROCK1P1、SERPINB11、CBLN2、ADGRE5、GALNT14、GRB14、DNER、BMP2、ARL8B、TGFBR2、AGTR1、LINC01192、FNDC3B、LINC00616、HECW1、FUT10、TACC1、LOC100130298、MIR5681A、TMEM261、DCAF12、PLPPR1。
对于XH00057样本，确认在复发基因集中的基因如下所示：CCDC30、OR11H1、PKN2-AS1、NAV3、CCT8L2。
对于XH00027样本，确认在复发基因集中的基因如下所示：SPATS2L、RTTN、GPR39、YTHDC2、THSD7B、BAGE、PQLC2L、SLCO5A1、MIR548AB、SPATA16、ZNF608、AJAP1、LOC101928476、METTL11B、ACBD6、DSTYK、CAMK1D、PCDH15、NRG3、DYNC2H1、XRCC6BP1、LOC101927637、SACS、HS6ST3、LOC101927620、LINC01467、MEG9、MORF4L1、WIPF2、LOC101927230、CDH7、GTSCR1、LIPE-AS1、EPAS1、MARCO、GPD2、C2orf47、COL6A3、OR11H1、DLG1、LOC401134、CAMK2D、GALNT10、TINAG、MANEA、MIR4465、SLC22A1、ADAP1、VPS41、LINC00998、LOC101927066、LOC101929563、KLF4、KLF8、PBDC1、FAM46D、ZCCHC16、MIR4417、LINC01142、LOC101927653、GABRB3、MAF、TMEM92、CDH19、GALNT5、SCHLAP1、CCT8L2、RIMBP3C、SHOX2、FNDC3B、LOC101928851、FRK、ZNF733P、MAGEE1。
对于XH00009样本，确认在复发基因集中的基因如下所示：SLC2A13、KHDRBS2、TBX19、MTRNR2L7。
基于如上所述的规则计算初治进展组各样本的评估值，结果如表4所示。
表4
| 初治后进展组5个样本 | 打分 |
| XH00003 | 857 |
| XH00038 | 452 |
| XH00057 | 14 |
| XH00027 | 389 |
| XH00009 | 22 |
由表4可知，本发明的复发基因集能够很好地用于评估宫颈癌治疗后的复发或转移情况。
尽管本发明已经参考示例性实施方案进行了描述，但应理解本发明不限于公开的示例性实施方案。在不背离本发明的范围或精神的情况下，可对本发明说明书的示例性实施方案做多种调整或变化。权利要求的范围应基于最宽的解释以涵盖所有修改和等同结构与功能。
序列表
<110> 中国医学科学院北京协和医院
<120> 用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法
<130> BH2110208
<141> 2021-05-07
<150> 202010855560.0
<151> 2020-08-20
<150> 202011117181.8
<151> 2020-10-19
<160> 135
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1
cgtaaccgaa atcggttgaa ccgaaaccgg ttagtataaa agcagacatt ttatgcacca 60
aaagagaact gcaatgtttc aggacccaca ggagcgaccc agaaagttac cacagttatg 120
<210> 2
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2
cacagagctg caaacaacta tacatgatat aatattagaa tgtgtgtact gcaagcaaca 60
gttactgcga cgtgaggtat atgactttgc ttttcgggat ttatgcatag tatatagaga 120
<210> 3
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 3
tgggaatcca tatgctgtat gtgataaatg tttaaagttt tattctaaaa ttagtgagta 60
tagacattat tgttatagtt tgtatggaac aacattagaa cagcaataca acaaaccgtt 120
<210> 4
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 4
gtgtgatttg ttaattaggt gtattaactg tcaaaagcca ctgtgtcctg aagaaaagca 60
aagacatctg gacaaaaagc aaagattcca taatataagg ggtcggtgga ccggtcgatg 120
<210> 5
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 5
tatgtcttgt tgcagatcat caagaacacg tagagaaacc cagctgtaat catgcatgga 60
gatacaccta cattgcatga atatatgtta gatttgcaac cagagacaac tgatctctac 120
<210> 6
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 6
tgttatgagc aattaaatga cagctcagag gaggaggatg aaatagatgg tccagctgga 60
caagcagaac cggacagagc ccattacaat attgtaacct tttgttgcaa gtgtgactct 120
<210> 7
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 7
acgcttcggt tgtgcgtaca aagcacacac gtagacattc gtactttgga agacctgtta 60
atgggcacac taggaattgt gtgccccatc tgttctcaga aaccataatc taccatggct 120
<210> 8
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 8
gatcctgcag gtaccaatgg ggaagagggt acgggatgta atggatggtt ttatgtagag 60
gctgtagtgg aaaaaaaaac aggggatgct atatcagatg acgagaacga aaatgacagt 120
<210> 9
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 9
gatacaggtg aagatttggt agattttata gtaaatgata atgattattt aacacaggca 60
gaaacagaga cagcacatgc gttgtttact gcacaggaag caaaacaaca tagagatgca 120
<210> 10
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 10
gtacaggttc taaaacgaaa gtatttgggt agtccactta gtgatattag tggatgtgta 60
gacaataata ttagtcctag attaaaagct atatgtatag aaaaacaaag tagagctgca 120
<210> 11
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 11
aaaaggagat tatttgaaag cgaagacagc gggtatggca atactgaagt ggaaactcag 60
cagatgttac aggtagaagg gcgccatgag actgaaacac catgtagtca gtatagtggt 120
<210> 12
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 12
ggaagtgggg gtggttgcag tcagtacagt agtggaagtg ggggagaggg tgttagtgaa 60
agacacacta tatgccaaac accacttaca aatattttaa atgtactaaa aactagtaat 120
<210> 13
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 13
gcaaaggcag caatgttagc aaaatttaaa gagttatacg gggtgagttt ttcagaatta 60
gtaagaccat ttaaaagtaa taaatcaacg tgttgcgatt ggtgtattgc tgcatttgga 120
<210> 14
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 14
cttacaccca gtatagctga cagtataaaa acactattac aacaatattg tttatattta 60
cacattcaaa gtttagcatg ttcatgggga atggttgtgt tactattagt aagatataaa 120
<210> 15
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 15
tgtggaaaaa atagagaaac aattgaaaaa ttgctgtcta aactattatg tgtgtctcca 60
atgtgtatga tgatagagcc tccaaaattg cgtagtacag cagcagcatt atattggtat 120
<210> 16
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 16
aaaacaggta tatcaaatat tagtgaagtg tatggagaca cgccagaatg gatacaaaga 60
caaacagtat tacaacatag ttttaatgat tgtacatttg aattatcaca gatggtacaa 120
<210> 17
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 17
tgggcctacg ataatgacat agtagacgat agtgaaattg catataaata tgcacaattg 60
gcagacacta atagtaatgc aagtgccttt ctaaaaagta attcacaggc aaaaattgta 120
<210> 18
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 18
aaggattgtg caacaatgtg tagacattat aaacgagcag aaaaaaaaca aatgagtatg 60
agtcaatgga taaaatatag atgtgatagg gtagatgatg gaggtgattg gaagcaaatt 120
<210> 19
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 19
gttatgtttt taaggtatca aggtgtagag tttatgtcat ttttaactgc attaaaaaga 60
tttttgcaag gcatacctaa aaaaaattgc atattactat atggtgcagc taacacaggt 120
<210> 20
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 20
aaatcattat ttggtatgag tttaatgaaa tttctgcaag ggtctgtaat atgttttgta 60
aattctaaaa gccatttttg gttacaacca ttagcagatg ccaaaatagg tatgttagat 120
<210> 21
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 21
gatgctacag tgccctgttg gaactacata gatgacaatt taagaaatgc attggatgga 60
aatttagttt ctatggatgt aaagcataga ccattggtac aactaaaatg ccctccatta 120
<210> 22
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 22
ttaattacat ctaacattaa tgctggtaca gattctaggt ggccttattt acataataga 60
ttggtggtgt ttacatttcc taatgagttt ccatttgacg aaaacggaaa tccagtgtat 120
<210> 23
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 23
gagcttaatg ataagaactg gaaatccttt ttctcaagga cgtggtccag attaagtttg 60
cacgaggacg aggacaagga aaacgatgga gactctttgc caacgtttaa atgtgtgtca 120
<210> 24
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 24
ggacaaaata ctaacacatt atgaaaatga tagtacagac ctacgtgacc atatagacta 60
ttggaaacac atgcgcctag aatgtgctat ttattacaag gccagagaaa tgggatttaa 120
<210> 25
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 25
acatattaac caccaggtgg tgccaacact ggctgtatca aagaataaag cattacaagc 60
aattgaactg caactaacgt tagaaacaat atataactca caatatagta atgaaaagtg 120
<210> 26
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 26
gacattacaa gacgttagcc ttgaagtgta tttaactgca ccaacaggat gtataaaaaa 60
acatggatat acagtggaag tgcagtttga tggagacata tgcaatacaa tgcattatac 120
<210> 27
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 27
aaactggaca catatatata tttgtgaaga agcatcagta actgtggtag agggtcaagt 60
tgactattat ggtttatatt atgttcatga aggaatacga acatattttg tgcagtttaa 120
<210> 28
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 28
agatgatgca gaaaaatata gtaaaaataa agtatgggaa gttcatgcgg gtggtcaggt 60
aatattatgt cctacatctg tgtttagcag caacgaagta tcctctcctg aaattattag 120
<210> 29
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 29
gcagcacttg gccaaccacc ccgccgcgac ccataccaaa gccgtcgcct tgggcaccga 60
agaaacacag acgactatcc agcgaccaag atcagagcca gacaccggaa acccctgcca 120
<210> 30
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 30
caccactaag ttgttgcaca gagactcagt ggacagtgct ccaatcctca ctgcatttaa 60
cagctcacac aaaggacgga ttaactgtaa tagtaacact acacccatag tacatttaaa 120
<210> 31
<211> 120
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 31
aggtgatgct aatactttaa aatgtttaag atatagattt aaaaagcatt gtacattgta 60
tactgcagtg tcgtctacat ggcattggac aggacataat gtaaaacata aaagtgcaat 120
<210> 32
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 32
tgttacactt acatatgata gtgaatggca acgtgaccaa tttttgtctc aagttaaaat 60
accaaaaact attacagtgt ctactggatt tatgtctata tgacaaatct tgatactgca 120
<210> 33
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 33
tccacaacat tactggcgtg ctttttgctt tgcttttgtg tgcttttgtg tgtctgccta 60
ttaatacgtc cgctgctttt gtctgtgtct acatacacat cattaataat attggtatta 120
<210> 34
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 34
ctattgtgga taacagcagc ctctgcgttt aggtgtttta ttgtatatat tatatttgtt 60
tatataccat tatttttaat acatacacat gcacgctttt taattacata atgtatatgt 120
<210> 35
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 35
acataatgta attgttacat ataattgttg tataccataa cttactattt tttctttttt 60
attttcatat ataatttttt tttttgtttg tttgtttgtt ttttaataaa ctgttattac 120
<210> 36
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 36
ttaacaatgc gacacaaacg ttctgcaaaa cgcacaaaac gtgcatcggc tacccaactt 60
tataaaacat gcaaacaggc aggtacatgt ccacctgaca ttatacctaa ggttgaaggc 120
<210> 37
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 37
aaaactattg ctgatcaaat attacaatat ggaagtatgg gtgtattttt tggtgggtta 60
ggaattggaa cagggtcggg tacaggcgga cgcactgggt atattccatt gggaacaagg 120
<210> 38
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 38
cctcccacag ctacagatac acttgctcct gtaagacccc ctttaacagt agatcctgtg 60
ggcccttctg atccttctat agtttcttta gtggaagaaa ctagttttat tgatgctggt 120
<210> 39
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 39
gcaccaacat ctgtaccttc cattccccca gatgtatcag gatttagtat tactacttca 60
actgatacca cacctgctat attagatatt aataatactg ttactactgt tactacacat 120
<210> 40
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 40
aataatccca ctttcactga cccatctgta ttgcagcctc caacacctgc agaaactgga 60
gggcatttta cactttcatc atccactatt agtacacata attatgaaga aattcctatg 120
<210> 41
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 41
gatacattta ttgttagcac aaaccctaac acagtaacta gtagcacacc cataccaggg 60
tctcgcccag tggcacgcct aggattatat agtcgcacaa cacaacaggt taaagttgta 120
<210> 42
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 42
gaccctgctt ttgtaaccac tcccactaaa cttattacat atgataatcc tgcatatgaa 60
ggtatagatg tggataatac attatatttt tctagtaatg ataatagtat taatatagct 120
<210> 43
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 43
ccagatcctg actttttgga tatagttgct ttacataggc cagcattaac ctctaggcgt 60
actggcatta ggtacagtag aattggtaat aaacaaacac tacgtactcg tagtggaaaa 120
<210> 44
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 44
tctataggtg ctaaggtaca ttattattat gatttaagta ctattgatcc tgcagaagaa 60
atagaattac aaactataac accttctaca tatactacca cttcacatgc agcctcacct 120
<210> 45
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 45
acttctatta ataatggatt atatgatatt tatgcagatg actttattac agatacttct 60
acaaccccgg taccatctgt accctctaca tctttatcag gttatattcc tgcaaataca 120
<210> 46
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 46
acaattcctt ttggtggtgc atacaatatt cctttagtat caggtcctga tatacccatt 60
aatataactg accaagctcc ttcattaatt cctatagttc cagggtctcc acaatataca 120
<210> 47
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 47
attattgctg atgcaggtga cttttattta catcctagtt attacatgtt acgaaaacga 60
cgtaaacgtt taccatattt tttttcagat gtctctttgg ctgcctagtg aggccactgt 120
<210> 48
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 48
ctacttgcct cctgtcccag tatctaaggt tgtaagcacg gatgaatatg ttgcacgcac 60
aaacatatat tatcatgcag gaacatccag actacttgca gttggacatc cctattttcc 120
<210> 49
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 49
tattaaaaaa cctaacaata acaaaatatt agttcctaaa gtatcaggat tacaatacag 60
ggtatttaga atacatttac ctgaccccaa taagtttggt tttcctgaca cctcatttta 120
<210> 50
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 50
taatccagat acacagcggc tggtttgggc ctgtgtaggt gttgaggtag gtcgtggtca 60
gccattaggt gtgggcatta gtggccatcc tttattaaat aaattggatg acacagaaaa 120
<210> 51
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 51
tgctagtgct tatgcagcaa atgcaggtgt ggataataga gaatgtatat ctatggatta 60
caaacaaaca caattgtgtt taattggttg caaaccacct ataggggaac actggggcaa 120
<210> 52
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 52
aggatcccca tgtaccaatg ttgcagtaaa tccaggtgat tgtccaccat tagagttaat 60
aaacacagtt attcaggatg gtgatatggt tgatactggc tttggtgcta tggactttac 120
<210> 53
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 53
tacattacag gctaacaaaa gtgaagttcc actggatatt tgtacatcta tttgcaaata 60
tccagattat attaaaatgg tgtcagaacc atatggcgac agcttatttt tttatttacg 120
<210> 54
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 54
aagggaacaa atgtttgtta gacatttatt taatagggct ggtactgttg gtgaaaatgt 60
accagacgat ttatacatta aaggctctgg gtctactgca aatttagcca gttcaaatta 120
<210> 55
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 55
ttttcctaca cctagtggtt ctatggttac ctctgatgcc caaatattca ataaacctta 60
ttggttacaa cgagcacagg gccacaataa tggcatttgt tggggtaacc aactatttgt 120
<210> 56
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 56
tactgttgtt gatactacac gcagtacaaa tatgtcatta tgtgctgcca tatctacttc 60
agaaactaca tataaaaata ctaactttaa ggagtaccta cgacatgggg aggaatatga 120
<210> 57
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 57
tttacagttt atttttcaac tgtgcaaaat aaccttaact gcagacgtta tgacatacat 60
acattctatg aattccacta ttttggagga ctggaatttt ggtctacaac ctcccccagg 120
<210> 58
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 58
aggcacacta gaagatactt ataggtttgt aacatcccag gcaattgctt gtcaaaaaca 60
tacacctcca gcacctaaag aagatcccct taaaaaatac actttttggg aagtaaattt 120
<210> 59
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 59
aaaggaaaag ttttctgcag acctagatca gtttccttta ggacgcaaat ttttactaca 60
agcaggattg aaggccaaac caaaatttac attaggaaaa cgaaaagcta cacccaccac 120
<210> 60
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 60
ctcatctacc tctacaactg ctaaacgcaa aaaacgtaag ctgtaagtat tgtatgtatg 60
ttgaattagt gttgtttgtt gtgtatatgt ttgtatgtgc ttgtatgtgc ttgtaaatat 120
<210> 61
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 61
taagttgtat gtgtgtttgt atgtatggta taataaacac gtgtgtatgt gtttttaaat 60
gcttgtgtaa ctattgtgtc atgcaacata aataaactta ttgtttcaac acctactaat 120
<210> 62
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 62
tgtgttgtgg ttattcattg tatataaact atatttgcta catcctgttt ttgttttata 60
tatactatat tttgtagcgc cagcggccat tttgtagctt caaccgaatt cggttgcatg 120
<210> 63
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 63
ctttttggca caaaatgtgt ttttttaaat agttctatgt cagcaactat ggtttaaact 60
tgtacgtttc ctgcttgcca tgcgtgccaa atccctgttt tcctgacctg cactgcttgc 120
<210> 64
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 64
caaccattcc attgtttttt acactgcact atgtgcaact actgaatcac tatgtacatt 60
gtgtcatata aaataaatca ctatgcgcca acgccttaca taccgctgtt aggcacatat 120
<210> 65
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 65
ttttggcttg ttttaactaa cctaattgca tatttggcat aaggtttaaa cttctaaggc 60
caactaaatg tcaccctagt tcatacatga actgtgtaaa ggttagtcat acattgttca 120
<210> 66
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 66
tttgtaaaac tgcacatggg tgtgtgcaaa ccgttttggg ttacacattt acaagcaact 60
tatataataa tactaaacta caataattca tgtataaaac taagggcgta accgaaatcg 120
<210> 67
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 67
tgggtgtgtg caaaccgttt tgggttacac atttacaagc aacttatata ataatactaa 60
actacaataa ttcatgtata aaactaaggg cgtaaccgaa atcggttgaa ccgaaaccgg 120
<210> 68
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 68
acataatgta attgttacat ataattgttg tataccataa cttactattt tttctttttt 60
attttcatat ataatttttt tttttgtttg tttgtttgtt ttttaataaa ctgttattac 120
<210> 69
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 69
aaaagggagt aaccgaaaac ggtcgggacc gaaaacggtg tatataaaag atgtgagaaa 60
cacaccacaa tactatggcg cgctttgagg atccaacacg gcgaccctac aagctacctg 120
<210> 70
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 70
atctgtgcac ggaactgaac acttcactgc aagacataga aataacctgt gtatattgca 60
agacagtatt ggaacttaca gaggtatttg aatttgcatt taaagattta tttgtggtgt 120
<210> 71
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 71
atagagacag tataccgcat gctgcatgcc ataaatgtat agatttttat tctagaatta 60
gagaattaag acattattca gactctgtgt atggagacac attggaaaaa ctaactaaca 120
<210> 72
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 72
ctgggttata caatttatta ataaggtgcc tgcggtgcca gaaaccgttg aatccagcag 60
aaaaacttag acaccttaat gaaaaacgac gatttcacaa catagctggg cactatagag 120
<210> 73
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 73
gccagtgcca ttcgtgctgc aaccgagcac gacaggaacg actccaacga cgcagagaaa 60
cacaagtata atattaagta tgcatggacc taaggcaaca ttgcaagaca ttgtattgca 120
<210> 74
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 74
tttagagccc caaaatgaaa ttccggttga ccttctatgt cacgagcaat taagcgactc 60
agaggaagaa aacgatgaaa tagatggagt taatcatcaa catttaccag cccgacgagc 120
<210> 75
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 75
cgaaccacaa cgtcacacaa tgttgtgtat gtgttgtaag tgtgaagcca gaattgagct 60
agtagtagaa agctcagcag acgaccttcg agcattccag cagctgtttc tgaacaccct 120
<210> 76
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 76
gtcctttgtg tgtccgtggt gtgcatccca gcagtaagca acaatggctg atccagaagg 60
tacagacggg gagggcacgg gttgtaacgg ctggttttat gtacaagcta ttgtagacaa 120
<210> 77
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 77
aaaaacagga gatgtaatat cagatgacga ggacgaaaat gcaacagaca cagggtcgga 60
tatggtagat tttattgata cacaaggaac attttgtgaa caggcagagc tagagacagc 120
<210> 78
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 78
acaggcattg ttccatgcgc aggaggtcca caatgatgca caagtgttgc atgttttaaa 60
acgaaagttt gcaggaggca gcacagaaaa cagtccatta ggggagcggc tggaggtgga 120
<210> 79
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 79
tacagagtta agtccacggt tacaagaaat atctttaaat agtgggcaga aaaaggcaaa 60
aaggcggctg tttacaatat cagatagtgg ctatggctgt tctgaagtgg aagcaacaca 120
<210> 80
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 80
gattcaggta actacaaatg gcgaacatgg cggcaatgta tgtagtggcg gcagtacgga 60
ggctatagac aacgggggca cagagggcaa caacagcagt gtagacggta caagtgacaa 120
<210> 81
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 81
tagcaatata gaaaatgtaa atccacaatg taccatagca caattaaaag acttgttaaa 60
agtaaacaat aaacaaggag ctatgttagc agtatttaaa gacacatatg ggctatcatt 120
<210> 82
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 82
tacagattta gttagaaatt ttaaaagtga taaaaccacg tgtacagatt gggttacagc 60
tatatttgga gtaaacccaa caatagcaga aggatttaaa acactaatac agccatttat 120
<210> 83
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 83
attatatgcc catattcaat gtctagactg taaatgggga gtattaatat tagccctgtt 60
gcgttacaaa tgtggtaaga gtagactaac agttgctaaa ggtttaagta cgttgttaca 120
<210> 84
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 84
cgtacctgaa acttgtatgt taattcaacc accaaaattg cgaagtagtg ttgcagcact 60
atattggtat agaacaggaa tatcaaatat tagtgaagta atgggagaca cacctgagtg 120
<210> 85
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 85
gatacaaaga cttactatta tacaacatgg aatagatgat agcaattttg atttgtcaga 60
aatggtacaa tgggcatttg ataatgagct gacagatgaa agcgatatgg catttgaata 120
<210> 86
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 86
tgccttatta gcagacagca acagcaatgc agctgccttt ttaaaaagca attgccaagc 60
taaatattta aaagattgtg ccacaatgtg caaacattat aggcgagccc aaaaacgaca 120
<210> 87
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 87
aatgaatatg tcacagtgga tacgatttag atgttcaaaa atagatgaag ggggagattg 60
gagaccaata gtgcaattcc tgcgatacca acaaatagag tttataacat ttttaggagc 120
<210> 88
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 88
cttaaaatca tttttaaaag gaacccccaa aaaaaattgt ttagtatttt gtggaccagc 60
aaatacagga aaatcatatt ttggaatgag ttttatacac tttatacaag gagcagtaat 120
<210> 89
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 89
atcatttgtg aattccacta gtcatttttg gttggaaccg ttaacagata ctaaggtggc 60
catgttagat gatgcaacga ccacgtgttg gacatacttt gatacctata tgagaaatgc 120
<210> 90
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 90
gttagatggc aatccaataa gtattgatag aaagcacaaa ccattaatac aactaaaatg 60
tcctccaata ctactaacca caaatataca tccagcaaag gataatagat ggccatattt 120
<210> 91
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 91
agaaagtaga ataacagtat ttgaatttcc aaatgcattt ccatttgata aaaatggcaa 60
tccagtatat gaaataaatg acaaaaattg gaaatgtttt tttgaaagga catggtccag 120
<210> 92
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 92
attagatttg cacgaggaag aggaagatgc agacaccgaa ggaaaccctt tcggaacgtt 60
taagtgcgtt gcaggacaaa atcatagacc actatgaaaa tgacagtaaa gacatagaca 120
<210> 93
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 93
gccaaataca gtattggcaa ctaatacgtt gggaaaatgc aatattcttt gcagcaaggg 60
aacatggcat acagacatta aaccaccagg tggtgccagc ctataacatt tcaaaaagta 120
<210> 94
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 94
aagcacataa agctattgaa ctgcaaatgg ccctacaagg ccttgcacaa agtgcataca 60
aaaccgagga ttggacactg caagacacat gcgaggaact atggaataca gaacctactc 120
<210> 95
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 95
actgctttaa aaaaggtggc caaacagtac aagtatattt tgatggcaac aaagacaatt 60
gtatgaccta tgtagcatgg gacagtgtgt attatatgac tgatgcagga acatgggaca 120
<210> 96
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 96
aaacggctac ctgtgtaagt cacaggggat tgtattatgt aaaggaaggg tacaacacgt 60
tttatataga atttaaaagt gaatgtgaaa aatatgggaa cacaggtacg tgggaagtac 120
<210> 97
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 97
attttgggaa taatgtaatt gattgtaatg actctatgtg cagtaccagt gacgacacgg 60
tatccgctac tcagcttgtt aaacagctac agcacacccc ctcaccgtat tccagcaccg 120
<210> 98
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 98
tgtccgtggg caccgcaaag acctacggcc agacgtcggc tgctacacga cctggacact 60
gtggactcgc ggagaagcag cattgtggac ctgtcaaccc acttctcggt gcagctacac 120
<210> 99
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 99
ctacaggcaa caacaaaaga cggaaactct gtagtggtaa cactacgcct ataatacatt 60
taaaaggtga cagaaacagt ttaaaatgtt tacggtacag attgcgaaaa catagcgacc 120
<210> 100
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 100
actatagaga tatatcatcc acctggcatt ggacaggtgc aggcaatgaa aaaacaggaa 60
tactgactgt aacataccat agtgaaacac aaagaacaaa atttttaaat actgttgcaa 120
<210> 101
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 101
ttccagatag tgtacaaata ttggtgggat acatgacaat gtaatacata tgctgtagta 60
ccaatatgtt atcacttatt tttttatttt gcttttgtgt atgcatgtat gtgtgctgcc 120
<210> 102
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 102
atgtcccgct tttgccatct gtctgtatgt gtgcgtatgc atgggtattg gtatttgtgt 60
atattgtggt aataacgtcc cctgccacag cattcacagt atatgtattt tgttttttat 120
<210> 103
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 103
tgcccatgtt actattgcat atacatgcta tattgtcttt acagtaattg tataggttgt 60
tttatacagt gtattgtaca ttgtatattt tgttttatac cttttatgct ttttgtattt 120
<210> 104
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 104
ttgtaataaa agtatggtat cccaccgtgc cgcacgacgc aaacgggctt cggtaactga 60
cttatataaa acatgtaaac aatctggtac atgtccacct gatgttgttc ctaaggtgga 120
<210> 105
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 105
gggcaccacg ttagcagata aaatattgca atggtcaagc cttggtatat ttttgggtgg 60
acttggcata ggtactggca gtggtacagg gggtcgtaca gggtacattc cattgggtgg 120
<210> 106
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 106
gcgttccaat acagtggtgg atgttggtcc tacacgtccc ccagtggtta ttgaacctgt 60
gggccccaca gacccatcta ttgttacatt aatagaggac tccagtgtgg ttacatcagg 120
<210> 107
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 107
tgcacctagg cctacgttta ctggcacgtc tgggtttgat ataacatctg cgggtacaac 60
tacacctgcg gttttggata tcacaccttc gtctacctct gtgtctattt ccacaaccaa 120
<210> 108
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 108
ttttaccaat cctgcatttt ctgatccgtc cattattgaa gttccacaaa ctggggaggt 60
ggcaggtaat gtatttgttg gtacccctac atctggaaca catgggtatg aggaaatacc 120
<210> 109
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 109
tttacaaaca tttgcttctt ctggtacggg ggaggaaccc attagtagta ccccattgcc 60
tactgtgcgg cgtgtagcag gtccccgcct ttacagtagg gcctaccaac aagtgtcagt 120
<210> 110
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 110
ggctaaccct gagtttctta cacgtccatc ctctttaatt acatatgaca acccggcctt 60
tgagcctgtg gacactacat taacatttga tcctcgtagt gatgttcctg attcagattt 120
<210> 111
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 111
tatggatatt atccgtctac ataggcctgc tttaacatcc aggcgtggga ctgttcgctt 60
tagtagatta ggtcaacggg caactatgtt tacccgcagc ggtacacaaa taggtgctag 120
<210> 112
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 112
ggttcacttt tatcatgata taagtcctat tgcaccttcc ccagaatata ttgaactgca 60
gcctttagta tctgccacgg aggacaatga cttgtttgat atatatgcag atgacatgga 120
<210> 113
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 113
ccctgcagtg cctgtaccat cgcgttctac tacctccttt gcatttttta aatattcgcc 60
cactatatct tctgcctctt cctatagtaa tgtaacggtc cctttaacct cctcttggga 120
<210> 114
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 114
tgtgcctgta tacacgggtc ctgatattac attaccatct actacctctg tatggcccat 60
tgtatcaccc acggcccctg cctctacaca gtatattggt atacatggta cacattatta 120
<210> 115
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 115
tttgtggcca ttatattatt ttattcctaa gaaacgtaaa cgtgttccct atttttttgc 60
agatggcttt gtggcggcct agtgacaata ccgtatatct tccacctcct tctgtggcaa 120
<210> 116
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 116
gagttgtaaa taccgatgat tatgtgactc gcacaagcat attttatcat gctggcagct 60
ctagattatt aactgttggt aatccatatt ttagggttcc tgcaggtggt ggcaataagc 120
<210> 117
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 117
aggatattcc taaggtttct gcataccaat atagagtatt tagggtgcag ttacctgacc 60
caaataaatt tggtttacct gatactagta tttataatcc tgaaacacaa cgtttagtgt 120
<210> 118
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 118
gggcctgtgc tggagtggaa attggccgtg gtcagccttt aggtgttggc cttagtgggc 60
atccatttta taataaatta gatgacactg aaagttccca tgccgccacg tctaatgttt 120
<210> 119
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 119
ctgaggacgt tagggacaat gtgtctgtag attataagca gacacagtta tgtattttgg 60
gctgtgcccc tgctattggg gaacactggg ctaaaggcac tgcttgtaaa tcgcgtcctt 120
<210> 120
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 120
tatcacaggg cgattgcccc cctttagaac ttaaaaacac agttttggaa gatggtgata 60
tggtagatac tggatatggt gccatggact ttagtacatt gcaagatact aaatgtgagg 120
<210> 121
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 121
taccattgga tatttgtcag tctatttgta aatatcctga ttatttacaa atgtctgcag 60
atccttatgg ggattccatg tttttttgct tacggcgtga gcagcttttt gctaggcatt 120
<210> 122
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 122
tttggaatag agcaggtact atgggtgaca ctgtgcctca atccttatat attaaaggca 60
caggtatgcg tgcttcacct ggcagctgtg tgtattctcc ctctccaagt ggctctattg 120
<210> 123
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 123
ttacctctga ctcccagttg tttaataaac catattggtt acataaggca cagggtcata 60
acaatggtgt ttgctggcat aatcaattat ttgttactgt ggtagatacc actcgcagta 120
<210> 124
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 124
ccaatttaac aatatgtgct tctacacagt ctcctgtacc tgggcaatat gatgctacca 60
aatttaagca gtatagcaga catgttgagg aatatgattt gcagtttatt tttcagttgt 120
<210> 125
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 125
gtactattac tttaactgca gatgttatgt cctatattca tagtatgaat agcagtattt 60
tagaggattg gaactttggt gttccccccc cgccaactac tagtttggtg gatacatatc 120
<210> 126
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 126
gttttgtaca atctgttgct attacctgtc aaaaggatgc tgcaccggct gaaaataagg 60
atccctatga taagttaaag ttttggaatg tggatttaaa ggaaaagttt tctttagact 120
<210> 127
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 127
tagatcaata tccccttgga cgtaaatttt tggttcaggc tggattgcgt cgcaagccca 60
ccataggccc tcgcaaacgt tctgctccat ctgccactac gtcttctaaa cctgccaagc 120
<210> 128
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 128
gtgtgcgtgt acgtgccagg aagtaatatg tgtgtgtgta tatatatata catctattgt 60
tgtgtttgta tgtcctgtgt ttgtgtttgt tgtatgattg cattgtatgg tatgtatggt 120
<210> 129
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 129
tgttgttgta tgttgtatgt tactatattt gttggtatgt ggcattaaat aaaatatgtt 60
ttgtggttct gtgtgttatg tggttgcgcc ctagtgagta acaactgtat ttgtgtttgt 120
<210> 130
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 130
ggtatgggtg ttgcttgttg ggctatatat tgtcctgtat ttcaagttat aaaactgcac 60
accttacagc atccatttta tcctacaatc ctccattttg ctgtgcaacc gatttcggtt 120
<210> 131
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 131
gcctttggct tatgtctgtg gttttctgca caatacagta cgctggcact attgcaaact 60
ttaatctttt gggcactgct cctacatatt ttgaacaatt ggcgcgcctc tttggcgcat 120
<210> 132
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 132
ataaggcgca cctggtatta gtcattttcc tgtccaggtg cgctacaaca attgcttgca 60
taactatatc cactccctaa gtaataaaac tgcttttagg cacatatttt agtttgtttt 120
<210> 133
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 133
tacttaagct aattgcatac ttggcttgta caactacttt catgtccaac attctgtcta 60
cccttaacat gaactataat atgactaagc tgtgcataca tagtttatgc aaccgaaata 120
<210> 134
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 134
ggttgggcag cacatactat acttttcatt aatactttta acaattgtag tatataaaaa 60
agggagtaac cgaaaacggt cgggaccgaa aacggtgtat ataaaagatg tgagaaacac 120
<210> 135
<211> 120
<212> DNA
<213> ARTIFICIAL SEQUENCE
<400> 135
agctgtgcat acatagttta tgcaaccgaa ataggttggg cagcacatac tatacttttc 60
attaatactt ttaacaattg tagtatataa aaaagggagt aaccgaaaac ggtcgggacc 120
Claims (9)
1.一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物，其特征在于，由能够检测源自HPV的基因片段插入受试者靶标基因的插入位点的多条引物或探针组成，所述靶标基因由表1所示的2173个基因组成。
2.根据权利要求1所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物，其特征在于，所述多条探针的序列如SEQ ID NO:1-135所示。
3.一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的试剂盒，其特征在于，其包括根据权利要求1或2所述的引物或探针组合物。
4.一种用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)利用试剂检测受试者生物样本中的插入位点信息的步骤，其中所述插入位点信息是指源自HPV的基因片段插入受试者靶标基因的信息，所述试剂包含根据权利要求1或2所述的引物或探针组合物；
(2)根据插入位点信息计算评估值的步骤；和
(3)根据评估值来判断宫颈癌复发或转移风险的步骤。
5.根据权利要求4所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，所述步骤(1)包括从接受治疗后的宫颈癌受试者采集生物样本，提取DNA，得到长度为1-5K的片段，使片段或其部分通过位于电极附近的芯片纳米孔，其中，所述电极能够检测通过所述纳米孔的电流。
6.根据权利要求4所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，所述步骤(2)中评估值的计算包括为每一个靶标基因分配一个因子，并将所有靶标基因的因子之和作为评估值。
7.根据权利要求6所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，如果所述靶标基因内或附近不存在源自HPV的基因片段的插入位点，则对应的靶标基因的因子设为0，如果靶标基因内或附近存在源自HPV的基因片段的插入位点，则对应的靶标基因的因子设为大于0。
8.根据权利要求7所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，进一步包括根据靶标基因对于复发或转移的风险程度而对靶标基团进行加权的步骤。
9.根据权利要求4所述的用于评估宫颈癌复发或转移风险的方法，其特征在于，所述步骤(3)包括当受试者的评估值达到或超过阈值时，则将所述受试者评估为复发或转移高风险，当受试者的评估值低于阈值时，则将所述受试者评估为复发或转移低风险。
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202010855560 | 2020-08-20 | ||
| CN2020108555600 | 2020-08-20 | ||
| CN202011117181.8A CN112176065A (zh) | 2020-08-20 | 2020-10-19 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
| CN2020111171818 | 2020-10-19 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN112961924A true CN112961924A (zh) | 2021-06-15 |
| CN112961924B CN112961924B (zh) | 2022-08-26 |
Family
ID=73950906
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202011117181.8A Pending CN112176065A (zh) | 2020-08-20 | 2020-10-19 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
| CN202110494861.XA Active CN112961924B (zh) | 2020-08-20 | 2021-05-07 | 用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法 |
Family Applications Before (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202011117181.8A Pending CN112176065A (zh) | 2020-08-20 | 2020-10-19 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (2) | CN112176065A (zh) |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN113502353A (zh) * | 2021-07-07 | 2021-10-15 | 武汉凯德维斯生物技术有限公司 | 与宫颈癌发生相关的高中危型hpv的整合高频基因位点的应用 |
| CN115612743A (zh) * | 2022-12-14 | 2023-01-17 | 中国医学科学院北京协和医院 | Hpv整合基因组合及其在预测宫颈癌复发和转移中的用途 |
| CN116769975A (zh) * | 2023-08-15 | 2023-09-19 | 江苏美克医学技术有限公司 | Hpv检测引物组、试剂盒及其应用 |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN111647598B (zh) * | 2020-02-11 | 2022-09-06 | 昆明医科大学 | 一种抑制hsa_circ_0027477表达的siRNA及其应用 |
| CN112176065A (zh) * | 2020-08-20 | 2021-01-05 | 中国医学科学院北京协和医院 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
| CN113249491A (zh) * | 2021-07-06 | 2021-08-13 | 四川省医学科学院·四川省人民医院 | 用于诊断子宫内膜癌的生物标志物及其产品和应用 |
| CN113444804B (zh) * | 2021-07-14 | 2022-03-15 | 武汉大学中南医院 | 宫颈癌预后相关基因及其在制备宫颈癌预后预测诊断产品中的应用 |
| CN114085909A (zh) * | 2021-11-09 | 2022-02-25 | 重庆医科大学 | Top1作为宫颈癌标志物和/或治疗靶点的应用 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104830869A (zh) * | 2015-04-30 | 2015-08-12 | 珠海雅马生物工程有限公司 | 与宫颈癌发生相关的hpv整合的基因位点及其应用 |
| WO2018207022A1 (en) * | 2017-05-10 | 2018-11-15 | Genomic Vision | Association between integration of high-risk hpv genomes detected by molecular combing and the severity and/or clinical outcome of cervical lesions |
| CN112176065A (zh) * | 2020-08-20 | 2021-01-05 | 中国医学科学院北京协和医院 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US9506117B2 (en) * | 2012-02-21 | 2016-11-29 | Oslo Universitetssykehus Hf | Methods and biomarkers for detection and prognosis of cervical cancer |
| CN110172530A (zh) * | 2019-05-31 | 2019-08-27 | 杭州链康医学检验实验室有限公司 | 一种用于hpv检测的探针及检测方法 |
| CN110724765A (zh) * | 2019-10-30 | 2020-01-24 | 元码基因科技（北京）股份有限公司 | 含hpv整合位点的基因及其应用 |
-
2020
- 2020-10-19 CN CN202011117181.8A patent/CN112176065A/zh active Pending
-
2021
- 2021-05-07 CN CN202110494861.XA patent/CN112961924B/zh active Active
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104830869A (zh) * | 2015-04-30 | 2015-08-12 | 珠海雅马生物工程有限公司 | 与宫颈癌发生相关的hpv整合的基因位点及其应用 |
| WO2018207022A1 (en) * | 2017-05-10 | 2018-11-15 | Genomic Vision | Association between integration of high-risk hpv genomes detected by molecular combing and the severity and/or clinical outcome of cervical lesions |
| CN112176065A (zh) * | 2020-08-20 | 2021-01-05 | 中国医学科学院北京协和医院 | 用于宫颈癌预后或预测宫颈癌复发或转移风险的试剂和方法 |
Cited By (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN113502353A (zh) * | 2021-07-07 | 2021-10-15 | 武汉凯德维斯生物技术有限公司 | 与宫颈癌发生相关的高中危型hpv的整合高频基因位点的应用 |
| CN115612743A (zh) * | 2022-12-14 | 2023-01-17 | 中国医学科学院北京协和医院 | Hpv整合基因组合及其在预测宫颈癌复发和转移中的用途 |
| CN116769975A (zh) * | 2023-08-15 | 2023-09-19 | 江苏美克医学技术有限公司 | Hpv检测引物组、试剂盒及其应用 |
| CN116769975B (zh) * | 2023-08-15 | 2023-11-24 | 江苏美克医学技术有限公司 | Hpv检测引物组、试剂盒及其应用 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN112961924B (zh) | 2022-08-26 |
| CN112176065A (zh) | 2021-01-05 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN112961924B (zh) | 用于评估宫颈癌复发或转移风险的引物或探针组合物、试剂和方法 | |
| CN110452984A (zh) | 一种用于宫颈癌甲基化检测的甲基化基因组合、引物和探针组合、试剂盒及其使用方法 | |
| CN113308544B (zh) | 用于dna甲基化检测的试剂及食管癌检测试剂盒 | |
| CN104805206A (zh) | 检测tert基因启动子突变的试剂盒及其检测方法 | |
| CN113930516B (zh) | 宫颈癌相关基因甲基化的引物、试剂盒、模型及构建方法 | |
| CN103667514A (zh) | 一种人白介素28b基因多态性荧光pcr检测试剂盒 | |
| WO2016192252A1 (zh) | 系统性红斑狼疮生物标志物及其诊断试剂盒 | |
| CN110699446B (zh) | 一种与非综合征型唇腭裂诊断相关的SNP标志物rs3174298及其应用 | |
| KR20110094041A (ko) | 정상 안압 녹내장 질환 감수성 유전자 및 그 이용 | |
| CN112266983B (zh) | 一种用于检测人乳头瘤病毒hpv16和hpv18的探针组及其试剂盒 | |
| CN101880715A (zh) | 一种肝癌肝移植术后复发预测试剂盒 | |
| CN113355414A (zh) | 食管癌检测试剂盒及其应用 | |
| KR20210113083A (ko) | SARS-CoV-2 진단용 조성물, 키트 및 이를 이용한 SARS-CoV-2의 진단방법 | |
| CN105177164A (zh) | 一种用于宫颈癌早期筛查的分子标记和检测引物 | |
| CN112280866A (zh) | 荧光定量pcr技术筛查急性早幼粒细胞白血病相关14种融合基因的方法、引物及探针 | |
| CN109457031B (zh) | BRCA2基因g.32338309A＞G突变体及其在乳腺癌辅助诊断中的应用 | |
| CN111154883B (zh) | 一种乳腺癌相关基因PIK3CA位点g.179220986A＞T突变体及其应用 | |
| KR101449562B1 (ko) | 암 검출에 사용하기 위한 3.4 케이비 미토콘드리아 디엔에이 결실 | |
| CN109913481B (zh) | PIK3CA基因g.179224821G＞A突变及其在乳腺癌辅助诊断中的应用 | |
| Magnusson et al. | Analysis of loss of heterozygosity in microdissected tumor cells from cervical carcinoma using fluorescent dUTP labeling of PCR products | |
| Macerola et al. | Digital gene expression analysis on cytology smears can rule out malignancy in follicular-patterned thyroid tumors | |
| CN111154875A (zh) | 一种乳腺癌基因ERBB2位点g.39711928A>G突变体及其应用 | |
| WO2019027005A1 (ja) | 結核菌遺伝系統特異的に結核症発症のリスクを判定する方法 | |
| CN111808950B (zh) | 一种甲状腺乳头状癌miRNA标志物及其应用 | |
| EP1432832A2 (en) | Detection and quantification of human herpes viruses |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| GR01 | Patent grant |