CN112877340A - 一种水稻基因gsnl4及其编码的蛋白质的应用 - Google Patents

一种水稻基因gsnl4及其编码的蛋白质的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种水稻基因GSNL4(Seq ID No:1、2)及其编码的蛋白质(Seq ID No:3)的应用,所述基因和蛋白质用于调控水稻的粒型和叶型,还用于提高水稻粒重及高产育种。本发明采用图位克隆技术首次在水稻中克隆到GSNL4基因,并通过转基因敲除实验鉴定了该基因的功能;本发明通过对GSNL4基因的功能解读,为进一步阐明该基因在水稻产量形成的遗传机制及其作用机理,创建水稻高产新种质打下基础,并拓展了其在水稻高产育种中的前景探索。

Description

一种水稻基因GSNL4及其编码的蛋白质的应用
技术领域
本发明涉及植物基因工程领域,特别是涉及一种水稻基因GSNL4(grain size andnarrow leaf4)及其编码的蛋白质的应用。
背景技术
水稻是我国重要的粮食作物之一,也是单子叶植物的理想模式植物。在水稻超高产育种中,粒重是决定产量的三要素之一,一般用千粒重来衡量,其与籽粒的大小呈正相关,而籽粒大小又可分为粒长、粒宽和粒厚三个粒型指标。粒型作为水稻理想株型的重要形状,对水稻产量增加起到了至关重要的作用,因此水稻粒型的研究一直是国内外育种家研究的热点和重点。随着现代分子生物学和RFLP、RAPD及SSR等标记技术的进步发展,越来越多的粒型相关基因被克隆。目前克隆了水稻粒型相关基因有:包括GS3、PGL1、PGL2、APG、GL7/GW7、GL4、TGW3、qGL3、OsGSK3、DEP1、SRS1、SRS2、SRS5、SMG1、PGL1、APG、TGW6、Gn1a、GLW7/OsSPL13、GW8、An-1、BG1、BG2、FUWA、GIF1、OsmiR397、OsFBK12、OsAGSW1、GW6a(OsglHAT1)、GL7、GW8、GS2、SRS5等,它们主要涉及到了G蛋白信号途径、植物激素、泛素-蛋白酶体途径、转录因子、激酶、蛋白分子互作、物质运输及microRNA等。对控制水稻粒型基因的克隆有助于了解水稻籽粒的发育过程和相关的调控机制,从而促进高产优质水稻新品种的培育。
为了提高水稻产量,育种家通常会采用多基因聚合来寻求突破,但聚合多个产量基因往往会带来负效应。因此除了在现有资源的基础上,需进一步发掘新的粒型控制基因,开展相关基因的克隆与功能解析,明确这些基因的分子作用机制及其调控机理,从而针对性的开展产量相关基因的分子设计育种。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种能调控水稻粒型的基因及其蛋白质。
为解决上述技术问题,本发明主要是利用图位克隆技术来获得所述基因及蛋白质。具体本发明采用如下技术方案:
一、突变体gsnl4的分离和遗传分析:
本发明的水稻粒型叶型突变体gsnl4来自粳稻品种武运粳21(W21)EMS诱变。通过与野生型的正反交实验,证明该突变体受隐性单基因控制,其中,水稻突变体相对于野生型,叶片变窄,籽粒宽度变窄,籽粒长度减小。
二、图位克隆GSNL4:
1)GSNL4的初步定位:
为了分离GSNL4基因,本发明首先组建了一个定位群体,由gsnl4与籼稻品种TN1杂交配组获得F2定位群体,再通过图位克隆的方法,利用STS、SSR等分子标记对GSNL4位点进行初步定位,将其初步定位在第4染色体上,并介于P1和P2两标记之间。
2)GSNL4的精细定位:
通过对P1和P2两个标记之间的BAC序列分析,发展新的SSR、STS标记将GSNL4精确定位于M6和M7标记之间139kb范围之内。通过分析此区段开放阅读框(ORF)推测候选基因。
3)GSNL4基因的鉴定和功能分析:
本发明通过基因编辑手段获得两个等位的gsnl4突变体,并且粒型叶型变窄,籽粒长度减少、粒重或千粒重减少。
基于上述研究结果,本发明开发了其相应的应用。
一方面,本发明提供了一种水稻基因GSNL4的应用,所述基因用于调控水稻的粒型和叶型,所述基因如(a)、(b)或(c)所示的序列:
(a)Seq ID No:1所示的基因组核苷酸序列;
(b)Seq ID No:2所示的cDNA核苷酸序列;
(c)在(a)或(b)所示的核苷酸序列中添加和/或取代和/或缺失一个或几个核苷酸而生成的可编码调控水稻粒型和叶型的蛋白质的突变基因、等位基因或衍生物。
进一步地,利用所述基因转化水稻细胞,再将转化后的水稻细胞培育成植株。
进一步地,所述粒型为粒宽和粒长,所述叶型为叶宽。
进一步地,所述基因用于提高水稻粒重及高产育种。
另一方面,本发明提供了一种水稻基因GSNL4编码的蛋白质的应用,所述蛋白质用于调控水稻的粒型和叶型;所述蛋白质如(A)或(B)所示的序列:
(A)Seq ID No:3所示的氨基酸序列;
(B)在(A)所限定的氨基酸序列中添加和/或取代和/或缺失一个或几个氨基酸且具有相同功能的由(A)衍生的蛋白质。
进一步地,所述粒型为粒宽和粒长,所述叶型为叶宽。
进一步地,所述蛋白质用于提高水稻粒重及高产育种。
本发明利用一个引起水稻籽粒和叶片变窄的突变体,通过图位克隆技术首次在水稻中克隆到了GSNL4基因,并利用转基因敲除实验鉴定了该基因的功能。通过对GSNL4基因的功能解读,为进一步阐明该基因在水稻产量形成的遗传机制及其作用机理,创建水稻高产新种质打下基础,并拓展了其在水稻高产育种中的前景探索。
附图说明
上述仅是本发明技术方案的概述,为了能够更清楚了解本发明的技术手段,以下结合附图与具体实施方式对本发明作进一步的详细说明。
图1是突变体gsnl4与野生型材料的表型,其中(a)为整个植株表型对比图;(b)为叶片表型对比图;(c)为籽粒宽度对比图;(d)为籽粒长度对比图;
图2是GSNL4基因在水稻第4染色体上的初步定位图;
图3是GSNL4基因的精细定位图;
图4是pCAMBIA1300-CAS9-GSNL4载体图谱;
图5是PCA1301-GSNL4载体图谱。
具体实施方式
实施例1:
1、水稻材料:
水稻(Oryza sativa L.)粒型叶型突变体gsnl4(grain size and narrow leaf4)的原始野生型为粳稻品种武运粳21(W21)。如图1所示,为突变体gsnl4与野生型材料的表型,从图中可以看出,水稻突变体相对于野生型,叶片变窄,籽粒宽度变窄,籽粒长度减小。
水稻(Oryza sativa L.)粒型叶型突变体gsnl4的获得过程具体如下:
粳稻品种武运粳21的种子经过EMS诱变后,种植于大田,收取种子继续种植,从M2代中分离出来的一个窄粒窄叶突变体,暂时将其命名为gsnl4(grain size and narrowleaf4)。将该突变体进行多代自交,获得能稳定遗传的突变体植株。
将突变体材料gsnl4和野生型材料武运粳21进行正反交,即以突变体gsnl4为母本,武运粳21为父本进行杂交;同时以武运粳21为母本,gsnl4为父本进行杂交。获得的F1带植株均变现为野生型性状,说明控制该性状的基因受隐性核基因控制。正反交获得的F1代植株自交获得F2群体,表现出野生型表型的单株与突变体表型的单株数的遗传分离比符合3:1,说明该表型是由一对隐性核基因控制的。
2、分析和定位群体:
纯合的gsnl4突变体和籼稻品种TN1进行杂交,F1代自交,得到2965株F2群体;并从2965株F2群体中选出720株具有gsnl4突变表型的个体(即表现为窄粒窄叶)作为定位群体。在成熟期每株收取全部突变体表型的叶片,用来提取总DNA。
3、SSR和STS标记定位GSNL4基因
采用CTAB法提取用于基因定位的水稻叶片基因组DNA。取大约0.2g水稻叶片置于2ml EP管内,直接加入CTAB和钢珠,利用植物组织研磨器将组织破碎,氯仿抽提,乙醇沉淀,ddH2O2溶解,最后获得基因组DNA。每一个PCR反应用1μl DNA样品,体系为10ul。
GSNL4基因的初步定位:从gsnl4与TN1杂交组合的F2群体720株隐性单株中随机选取21株隐性单株,组成混池,利用已公布的234对近似均匀分布于各条染色体上B套引物,获得连锁位置,然后利用196株隐性单株,利用混池定位确定的连锁且具有多态性的引物,根据已知的反应条件进行PCR扩增,具体如下:
与目标基因连锁的STS引物为:
P1F:AAGTGCGGCTGTTTGATTT
P1R:CACCCACAGAGTTCTTCCA
PCR反应体系为:水稻基因组DNA 1ul,2×PCR Mix 5ul,10cM F/R引物各1ul,ddH2O2 2ul,总体系10ul。
PCR扩增条件具体为:94℃预变性4分钟;94℃变性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸30秒,35个循环;72℃补齐10分钟;
经4%琼脂糖凝胶电泳分离和Gel-Red染色,检测PCR产物的多态性,将GSNL4初步定位在第4号染色体长臂上STS标记P1和P2之间,如图2所示。
GSNL4基因的精细定位:利用gsnl4与TN1组合的F2群体中共计720(720-196=324)株隐性个体,在初定位的基础上继续设计STS标记,最终将GSNL4精确定位于M6和M7标记之间139kb范围之内,如图3所示。
STS标记引物序列为:
M6F:5’-TGAGCTGTACAAGCAAACGC-3’
M6R:5’-GGGAGAAATCCTCGAATTGG-3’;
M7F:5’-CGGTACATCACGGTATCAAATCG-3’
M7R:5’-TAAATGCTGGAGCGATGCTAACC-3’.
PCR反应体系为:水稻基因组DNA 1ul,2×PCR Mix 5ul,,10uM F/R引物各1ul,ddH2O2 2ul,总体系10ul。
PCR扩增条件具体为:94℃预变性4分钟;94℃变性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸30秒,40个循环;72℃补齐10分钟。
产物检测:在含有Gel-Red的4.0%的琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察并拍照记录结果。
4、基因预测和比较分析:
根据精细定位的结果,在139kb范围内根据RAP-DB(http://rapdb.dna.affrc.go.jp/)的预测,发现在此区间内共有9个候选基因,根据网站中基因功能的预测,我们首先设计了一个基因的测序引物,采用PCR方法分别从gsnl4和野生型品种基因组中扩增出这一个候选基因进行测序分析。具体如下:
目标基因测序引物的序列:
S1F:TTCAAGTCTGGGCAATGCAC
S1R:CCACCGCGCCATAAACTTTA
S2F:TAAAGTTTATGGCGCGGTGG
S2R:TGCGCAGAATAGTTCAGTCG
S3F:CGACTGAACTATTCTGCGCA
S3R:ATAATCCCTTGTGGCGAGCA
S4F:TGCTCGCCACAAGGGATTAT
S4R:CGTCACCTCAACCTTCACAC
S5F:GTGTGAAGGTTGAGGTGACG
S5R:CTGCAATGGAAGGACTGGAA
S6F:TTCCAGTCCTTCCATTGCAG
S6R:TGCTCCTCCCCAAACAGATT
PCR扩增体系:水稻基因组DNA 5ul,2×KOD Buffer 25ul,2mM dNTP 10ul,10uMF/R引物个3.0ul,KOD FX DNA聚合酶1ul,ddH2O 3ul,总体系50ul。
PCR扩增条件:94℃预变性4分钟;98℃变性1分钟,60℃退火30秒,68℃延伸1分钟,32个循环;68℃补齐10分钟。
发现其中该基因的基因组DNA片段中,突变体gsnl4扩增的产物与野生型品种比较有1个碱基突变。在该位点前后各150bp左右设计前后引物,利用该对引物,继续扩增野生型和突变体DNA,进行测序比较,并重复三次,发现突变体gsnl4与野生型比较在该位点均存在单碱基突变。根据RAP-DB的关于该基因的注释,该基因编码的是一个AGO蛋白。
检测引物为:
M-F:CAGTCCTTCCATTGCAGCTG
M-R:GTTCGTGAGGGTTTGCAACT
实施例2:
敲除载体构建:如图4,分别在其基因外显子上设计两个靶位点,首先构建到中间载体gRNA上,然后构建到pCAMBIA1300-Cas9敲除载体上。
基因编辑靶位点为:
gRNA1:AGAACTGGGTCTGGCAGCAC
gRNA2:ACATGCTCAGACCGCAGGGC
基因编辑检测引物为:
C1F:TCTCCTCTTTGCGCACCATT
C1R:TGGTATTGGACATGTGGGGC
C2F:CACCTGTAGCTGGAACTTGCT
C2R:CCCCCACCTGAAAAGTAGGAC
GFP载体的构建(如图5所示)。GFP载体引物序列为:
G-F:5’-TACAATTACAGTCGACATGGTGAAGAAGAAAAGAACTG-3’
G-R:5’-ATCCTCTAGAGTCGACGCAGTAAAACATGACACG-3’;
通过电击的方法将质粒转入农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)株系EHA105中,然后通过农杆菌介导转化水稻愈伤。我们利用武粳稻21幼胚诱导的愈伤组织,经过诱导培养基培养3周后,挑选生长旺盛的愈伤用作转化的受体。用含有双元质粒载体的EHA105菌株侵染水稻愈伤,在黑暗、25℃条件下共培养3天后,在含有40mg/LHygromycin的筛选培养基上培养。筛选抗性愈伤在含有50mg/L预分化培养基上培养10天左右。将预分化的愈伤转至分化培养基上,在光照条件下培养。一个月左右得到抗性转基因植株。通过上述基因编辑手段获得一个与gsnl4等位的突变体(与gsnl4为同一基因,不同突变位点),并且粒型叶型均变窄,籽粒长度减少、粒重或千粒重减少。证明本发明正确克隆到了相关基因。
以上列举的仅是本发明的若干个具体实施例。有必要指出,本发明不局限于以上实施例,对于本领域的普通技术人员能从本发明公开的内容直接导出或联想到的所有变形,均应认为是本发明的保护范围。
序列表
<110> 中农常乐(深圳)生物育种技术有限公司
<120> 一种水稻基因GSNL4及其编码的蛋白质的应用
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 14650
<212> DNA
<213> 稻属水稻(Oryza sativa)
<400> 1
atggcgctgc agttggagaa tggccgtccc catcatcatc aaggtatgcc tgcccatgcc 60
gtcgcccccc cacctccctc ggctctctcc cgttttcggc aaccctttgc cttttgaggc 120
gattctatcg ttttcttccc ctttttttcc tcccctcttc gtcctgtccc atcagatcgt 180
atacagttgg cgtcgaggcc gcgtccacac acgacgcgtc agtgcttgcg cgcgtgaggg 240
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ggttaggtta gtttgccatg ctgcctctgt taaatagagt cagctcgtta cccagcaagg 480
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tacattgatt ttttttttgg gatgtttttc tttctacata tagttagaca tgatcttttg 3540
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tatagtactt catctgtctc aaaataaatg cagcgtctta tttaaaaaag attatgatta 3960
gtatttttat tgttattaga tgataaaaca tgaatagtac tttatgtgtg actaaatttt 4020
ttaatatttt ttataaattt tttaaataag acggatagtc aaaacgctaa acacgaatat 4080
ctatggcttc acttattttg ggacgaggta ctactactcc tatataagca ctggctactt 4140
tattaattta tcaatgtagc aggagcacaa aaggaggagc atcatacagt tggctcgtag 4200
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Met Ala Leu Gln Leu Glu Asn Gly Arg Pro His His His Gln Val Pro
1 5 10 15
Ile Met Val Lys Lys Lys Arg Thr Gly Ser Gly Ser Thr Gly Glu Ser
20 25 30
Ser Gly Glu Ala Pro Gly Ala Pro Gly His Gly Ser Ser Gln Arg Ala
35 40 45
Glu Arg Gly Pro Gln Gln His Gly Gly Gly Arg Gly Trp Val Pro Gln
50 55 60
His Gly Gly Arg Gly Gly Gly Gln Tyr Gln Gly Arg Gly Gly His Tyr
65 70 75 80
Gln Gly Arg Gly Gly Gln Gly Ser His His Pro Gly Gly Gly Pro Pro
85 90 95
Glu Tyr Gln Gly Arg Gly Gly Pro Gly Ser His His Pro Gly Gly Gly
100 105 110
Pro Pro Asp Tyr Gln Gly Arg Gly Gly Ser Gly Ser His His Pro Gly
115 120 125
Gly Gly Pro Pro Glu Tyr Gln Pro Arg Asp Tyr Gln Gly Arg Gly Gly
130 135 140
Pro Arg Pro Arg Gly Gly Met Pro Gln Pro Tyr Tyr Gly Gly Pro Arg
145 150 155 160
Gly Ser Gly Gly Arg Ser Val Pro Ser Gly Ser Ser Arg Thr Val Pro
165 170 175
Glu Leu His Gln Ala Pro His Val Gln Tyr Gln Ala Pro Met Val Ser
180 185 190
Pro Thr Pro Ser Gly Ala Gly Ser Ser Ser Gln Pro Ala Ala Glu Val
195 200 205
Ser Ser Gly Gln Val Gln Gln Gln Phe Gln Gln Leu Ala Thr Arg Asp
210 215 220
Gln Ser Ser Thr Ser Gln Ala Ile Gln Ile Ala Pro Pro Ser Ser Lys
225 230 235 240
Ser Val Arg Phe Pro Leu Arg Pro Gly Lys Gly Thr Tyr Gly Asp Arg
245 250 255
Cys Ile Val Lys Ala Asn His Phe Phe Ala Glu Leu Pro Asp Lys Asp
260 265 270
Leu His Gln Tyr Asp Val Ser Ile Thr Pro Glu Val Thr Ser Arg Gly
275 280 285
Val Asn Arg Ala Val Met Phe Glu Leu Val Thr Leu Tyr Arg Tyr Ser
290 295 300
His Leu Gly Gly Arg Leu Pro Ala Tyr Asp Gly Arg Lys Ser Leu Tyr
305 310 315 320
Thr Ala Gly Pro Leu Pro Phe Ala Ser Arg Thr Phe Glu Ile Thr Leu
325 330 335
Gln Asp Glu Glu Asp Ser Leu Gly Gly Gly Gln Gly Thr Gln Arg Arg
340 345 350
Glu Arg Leu Phe Arg Val Val Ile Lys Phe Ala Ala Arg Ala Asp Leu
355 360 365
His His Leu Ala Met Phe Leu Ala Gly Arg Gln Ala Asp Ala Pro Gln
370 375 380
Glu Ala Leu Gln Val Leu Asp Ile Val Leu Arg Glu Leu Pro Thr Thr
385 390 395 400
Arg Tyr Ser Pro Val Gly Arg Ser Phe Tyr Ser Pro Asn Leu Gly Arg
405 410 415
Arg Gln Gln Leu Gly Glu Gly Leu Glu Ser Trp Arg Gly Phe Tyr Gln
420 425 430
Ser Ile Arg Pro Thr Gln Met Gly Leu Ser Leu Asn Ile Asp Met Ser
435 440 445
Ser Thr Ala Phe Ile Glu Pro Leu Pro Val Ile Asp Phe Val Ala Gln
450 455 460
Leu Leu Asn Arg Asp Ile Ser Val Arg Pro Leu Ser Asp Ser Asp Arg
465 470 475 480
Val Lys Ile Lys Lys Ala Leu Arg Gly Val Lys Val Glu Val Thr His
485 490 495
Arg Gly Asn Met Arg Arg Lys Tyr Arg Ile Ser Gly Leu Thr Ser Gln
500 505 510
Ala Thr Arg Glu Leu Ser Phe Pro Val Asp Asp Arg Gly Thr Val Lys
515 520 525
Thr Val Val Gln Tyr Phe Leu Glu Thr Tyr Gly Phe Ser Ile Gln His
530 535 540
Thr Thr Leu Pro Cys Leu Gln Val Gly Asn Gln Gln Arg Pro Asn Tyr
545 550 555 560
Leu Pro Met Glu Val Cys Lys Ile Val Glu Gly Gln Arg Tyr Ser Lys
565 570 575
Arg Leu Asn Glu Lys Gln Ile Thr Ala Leu Leu Lys Val Thr Cys Gln
580 585 590
Arg Pro Gln Glu Arg Glu Leu Asp Ile Leu Arg Thr Val Ser His Asn
595 600 605
Ala Tyr His Glu Asp Gln Tyr Ala Gln Glu Phe Gly Ile Lys Ile Asp
610 615 620
Glu Arg Leu Ala Ser Val Glu Ala Arg Val Leu Pro Pro Pro Arg Leu
625 630 635 640
Lys Tyr His Asp Ser Gly Arg Glu Lys Asp Val Leu Pro Arg Val Gly
645 650 655
Gln Trp Asn Met Met Asn Lys Lys Met Val Asn Gly Gly Arg Val Asn
660 665 670
Asn Trp Ala Cys Ile Asn Phe Ser Arg Asn Val Gln Asp Ser Ala Ala
675 680 685
Arg Gly Phe Cys His Glu Leu Ala Ile Met Cys Gln Ile Ser Gly Met
690 695 700
Asp Phe Ala Leu Glu Pro Val Leu Pro Pro Leu Thr Ala Arg Pro Glu
705 710 715 720
His Val Glu Arg Ala Leu Lys Ala Arg Tyr Gln Asp Ala Met Asn Met
725 730 735
Leu Arg Pro Gln Gly Arg Glu Leu Asp Leu Leu Ile Val Ile Leu Pro
740 745 750
Asp Asn Asn Gly Ser Leu Tyr Gly Asp Leu Lys Arg Ile Cys Glu Thr
755 760 765
Asp Leu Gly Leu Val Ser Gln Cys Cys Leu Thr Lys His Val Phe Lys
770 775 780
Met Ser Lys Gln Tyr Leu Ala Asn Val Ala Leu Lys Ile Asn Val Lys
785 790 795 800
Val Gly Gly Arg Asn Thr Val Leu Val Asp Ala Leu Thr Arg Arg Ile
805 810 815
Pro Leu Val Ser Asp Arg Pro Thr Ile Ile Phe Gly Ala Asp Val Thr
820 825 830
His Pro His Pro Gly Glu Asp Ser Ser Pro Ser Ile Ala Ala Val Val
835 840 845
Ala Ser Gln Asp Trp Pro Glu Val Thr Lys Tyr Ala Gly Leu Val Ser
850 855 860
Ala Gln Ala His Arg Gln Glu Leu Ile Gln Asp Leu Phe Lys Val Trp
865 870 875 880
Gln Asp Pro His Arg Gly Thr Val Thr Gly Gly Met Ile Lys Glu Leu
885 890 895
Leu Ile Ser Phe Lys Arg Ala Thr Gly Gln Lys Pro Gln Arg Ile Ile
900 905 910
Phe Tyr Arg Asp Gly Val Ser Glu Gly Gln Phe Tyr Gln Val Leu Leu
915 920 925
Tyr Glu Leu Asp Ala Ile Arg Lys Ala Cys Ala Ser Leu Glu Pro Asn
930 935 940
Tyr Gln Pro Pro Val Thr Phe Val Val Val Gln Lys Arg His His Thr
945 950 955 960
Arg Leu Phe Ala Asn Asn His Asn Asp Gln Arg Thr Val Asp Arg Ser
965 970 975
Gly Asn Ile Leu Pro Gly Thr Val Val Asp Ser Lys Ile Cys His Pro
980 985 990
Thr Glu Phe Asp Phe Tyr Leu Cys Ser His Ala Gly Ile Gln Gly Thr
995 1000 1005
Ser Arg Pro Ala His Tyr His Val Leu Trp Asp Glu Asn Lys Phe Thr
1010 1015 1020
Ala Asp Glu Leu Gln Thr Leu Thr Asn Asn Leu Cys Tyr Thr Tyr Ala
1025 1030 1035 1040
Arg Cys Thr Arg Ser Val Ser Ile Val Pro Pro Ala Tyr Tyr Ala His
1045 1050 1055
Leu Ala Ala Phe Arg Ala Arg Phe Tyr Met Glu Pro Glu Thr Ser Asp
1060 1065 1070
Ser Gly Ser Met Ala Ser Gly Ala Ala Thr Ser Arg Gly Leu Pro Pro
1075 1080 1085
Gly Val Arg Ser Ala Arg Val Ala Gly Asn Val Ala Val Arg Pro Leu
1090 1095 1100
Pro Ala Leu Lys Glu Asn Val Lys Arg Val Met Phe Tyr Cys
1105 1110 1115

Claims (7)

1.一种水稻基因GSNL4的应用,其特征在于,所述基因用于调控水稻的粒型和叶型,所述基因如(a)、(b)或(c)所示的序列:
(a)Seq ID No:1所示的基因组核苷酸序列;
(b)Seq ID No:2所示的cDNA核苷酸序列;
(c)在(a)或(b)所示的核苷酸序列中添加和/或取代和/或缺失一个或几个核苷酸而生成的可编码调控水稻粒型和叶型的蛋白质的突变基因、等位基因或衍生物。
2.根据权利要求1所述的水稻基因GSNL4的应用,其特征在于,利用所述基因转化水稻细胞,再将转化后的水稻细胞培育成植株。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述粒型为粒宽和粒长,所述叶型为叶宽。
4.根据权利要求1或2所述的水稻基因GSNL4的应用,其特征在于,所述基因用于提高水稻粒重及高产育种。
5.一种水稻基因GSNL4编码的蛋白质的应用,其特征在于,所述蛋白质用于调控水稻的粒型和叶型;所述蛋白质如(A)或(B)所示的序列:
(A)Seq ID No:3所示的氨基酸序列;
(B)在(A)所限定的氨基酸序列中添加和/或取代和/或缺失一个或几个氨基酸且具有相同功能的由(A)衍生的蛋白质。
6.根据权利要求5所述的水稻基因GSNL4编码的蛋白质的应用,其特征在于,所述粒型为粒宽和粒长,所述叶型为叶宽。
7.根据权利要求5或6所述的水稻基因GSNL4编码的蛋白质的应用,其特征在于,所述蛋白质用于提高水稻粒重及高产育种。
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Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101177683A (zh) * 2007-11-20 2008-05-14 中国水稻研究所 水稻叶形态建成调控基因rlal1及其应用
CN102317312A (zh) * 2008-12-17 2012-01-11 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状和/或非生物胁迫耐受性的植物和用于制备此类植物的方法
CN104561085A (zh) * 2013-10-18 2015-04-29 北京大学 OsAGO18基因在提高水稻对水稻条纹叶枯病抗性中的应用
CN110343158A (zh) * 2019-08-06 2019-10-18 中国水稻研究所 水稻半卷叶基因srl10及其应用
US20200362359A1 (en) * 2017-08-03 2020-11-19 Plantform Corporation Transient silencing of argonaute1 and argonaute4 to increase recombinant protein expression in plants
CN112094845A (zh) * 2020-09-27 2020-12-18 四川农业大学 一种改良植物农艺性状和抗性的核酸及其应用

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101177683A (zh) * 2007-11-20 2008-05-14 中国水稻研究所 水稻叶形态建成调控基因rlal1及其应用
CN102317312A (zh) * 2008-12-17 2012-01-11 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状和/或非生物胁迫耐受性的植物和用于制备此类植物的方法
CN104561085A (zh) * 2013-10-18 2015-04-29 北京大学 OsAGO18基因在提高水稻对水稻条纹叶枯病抗性中的应用
US20200362359A1 (en) * 2017-08-03 2020-11-19 Plantform Corporation Transient silencing of argonaute1 and argonaute4 to increase recombinant protein expression in plants
CN110343158A (zh) * 2019-08-06 2019-10-18 中国水稻研究所 水稻半卷叶基因srl10及其应用
CN112094845A (zh) * 2020-09-27 2020-12-18 四川农业大学 一种改良植物农艺性状和抗性的核酸及其应用

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KAWAHARA,Y. ET AL: "ACCESSION NO. AP014960, Oryza sativa Japonica Group DNA, chromosome 4, cultivar: Nipponbare, complete sequence", 《GENBANK》 *
KAWAHARA,Y.ET AL: "ACCESSION NO.BAS90531,Os04g0566500 [Oryza sativa Japonica Group]", 《GENBANK》 *
LIANG WU ET AL: "Rice MicroRNA Effector Complexes and Targets", 《PLANT CELL》 *
无: "ACCESSION NO.XP_015636291,protein argonaute 1B isoform X1 [Oryza sativa Japonica Group]", 《GENBANK》 *
李有涵: "OsAGO1b对水稻生长发育的调控", 《中国博士学位论文全文数据库农业科技辑》 *
李磊等: "抑制OsAGO1a基因的表达导致水稻叶片近轴面卷曲", 《中国水稻科学》 *

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