CN112533958A - 识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白 - Google Patents

识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白 Download PDF

Info

Publication number
CN112533958A
CN112533958A CN201980050318.1A CN201980050318A CN112533958A CN 112533958 A CN112533958 A CN 112533958A CN 201980050318 A CN201980050318 A CN 201980050318A CN 112533958 A CN112533958 A CN 112533958A
Authority
CN
China
Prior art keywords
antibody
amino acid
protein
acid sequence
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201980050318.1A
Other languages
English (en)
Inventor
相马雅子
久我洋
益田刚
河村淳子
石桥裕美
安田哲
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Daiichi Sankyo Co Ltd
Original Assignee
Daiichi Sankyo Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Daiichi Sankyo Co Ltd filed Critical Daiichi Sankyo Co Ltd
Publication of CN112533958A publication Critical patent/CN112533958A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/44—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material not provided for elsewhere, e.g. haptens, metals, DNA, RNA, amino acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
    • A61K31/407—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil condensed with other heterocyclic ring systems, e.g. ketorolac, physostigmine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/47—Quinolines; Isoquinolines
    • A61K31/4738—Quinolines; Isoquinolines ortho- or peri-condensed with heterocyclic ring systems
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
    • A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
    • A61K47/68037—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug being a camptothecin [CPT] or derivatives
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6889—Conjugates wherein the antibody being the modifying agent and wherein the linker, binder or spacer confers particular properties to the conjugates, e.g. peptidic enzyme-labile linkers or acid-labile linkers, providing for an acid-labile immuno conjugate wherein the drug may be released from its antibody conjugated part in an acidic, e.g. tumoural or environment
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2827—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against B7 molecules, e.g. CD80, CD86
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/46—Hybrid immunoglobulins
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K17/00—Carrier-bound or immobilised peptides; Preparation thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/5308—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for analytes not provided for elsewhere, e.g. nucleic acids, uric acid, worms, mites
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6854—Immunoglobulins
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/94—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving narcotics or drugs or pharmaceuticals, neurotransmitters or associated receptors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/53—DNA (RNA) vaccination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Mycology (AREA)

Abstract

识别抗体‑药物缀合物(其中由下式代表的药物经由接头缀合至抗体)的药物部分的蛋白；用于测量已经向其施用抗体‑药物缀合物的哺乳动物中的抗体‑药物缀合物的血浆中的浓度的方法；以及用于检查使用所述蛋白的哺乳动物中的抗体‑药物缀合物的组织分布的方法。

Description

识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白
[技术领域]
本发明涉及识别具有依沙替康（exatecan）的衍生物作为组分的抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白；用于通过使用所述蛋白定量用所述抗体-药物缀合物施用的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法；和用于确定其组织分布的方法。
[背景技术]
具有与抗体(其结合在癌细胞的表面上表达的抗原并且还能够细胞内化)缀合的具有细胞毒性的药物的抗体-药物缀合物(ADC)可以将药物选择性递送至癌细胞，且因此预期其引起药物在癌细胞内积聚并杀死癌细胞(非专利参考文献1至5)。
与开发小分子化合物和抗体相似，在将抗体-药物缀合物开发为药物产品时，药代动力学研究(PK研究)是必不可少的。这是因为，通过基于动物中的PK研究结果和药理学研究结果以及安全性试验结果之间的相关性的理解在人中实施PK研究，可以获得对计划临床试验设计以及考虑人中的有效性和安全性有用的信息。
抗体-药物缀合物的PK研究基本上通过定量施用的抗体-药物缀合物的血浆中的浓度来实施。作为用于定量抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法，可以例举ELISA方法。例如，抗体-药物缀合物的血浆中的浓度可以通过以下步骤来定量：(1)使抗体-药物缀合物与具有固定在其上的抗原的板接触以形成复合物，(2)使能够识别所述抗体-药物缀合物并用标志物标记的蛋白与所述复合物接触以形成进一步的复合物；且然后，(3)基于通过酶促反应产生的颜色/光检测所述标志物。
然而，如果使用识别抗体-药物缀合物的抗体部分的蛋白，则通过计算定量血浆-浓度，不仅包括保留所述药物的抗体-药物缀合物的浓度，而且还包括从其中释放所述药物的抗体-药物缀合物的浓度(更具体地，基本上是单独的抗体部分)，并且不能准确地进行测定。
用于通过ELISA方法使用识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白定量抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法是已知的(非专利参考文献6至11)。
作为抗体-药物缀合物之一，具有抗体和作为拓扑异构酶I抑制剂的依沙替康的衍生物作为其组分的抗体-药物缀合物是已知的(专利参考文献1至7，非专利参考文献12至15)。由于这些抗体-药物缀合物发挥特别优异的抗肿瘤作用并且具有安全性，因此它们目前在临床研究中。
尚不知道用于在保留药物的同时定量具有依沙替康的衍生物作为组分的抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法。
[引文列表]
[专利文献]
[专利参考文献1] 国际公开号WO 2014/057687
[专利参考文献2] 国际公开号WO 2014/061277
[专利参考文献3] 国际公开号WO 2015/098099
[专利参考文献4] 国际公开号WO 2015/115091
[专利参考文献5] 国际公开号WO 2015/146132
[专利参考文献6] 国际公开号WO 2015/155976
[专利参考文献7] 国际公开号WO 2015/155998
非专利文献
[非专利参考文献1] Ducry, L., 等人, Bioconjugate Chem. (2010) 21, 5-13.
[非专利参考文献2] Alley, S. C., 等人, Current Opinion in ChemicalBiology (2010) 14, 529-537.
[非专利参考文献3] Damle N. K. Expert Opin. Biol. Ther. (2004) 4,1445-1452.
[非专利参考文献4] Senter P. D., 等人, Nature Biotechnology (2012) 30,631-637.
[非专利参考文献5] Howard A. 等人, J Clin Oncol 29: 398-405.
[非专利参考文献6] Xie H. 等人, J Pharmacol Exp Ther. (2004) 308 (3),1073-1082.
[非专利参考文献7] Sanderson RJ. 等人, Clinical Cancer Research (2005)Vol.11, 843-852.
[非专利参考文献8] Stephan JP. 等人, Bioconjugate Chem. 2008, 19,1673-1683.
[非专利参考文献9] Stephan JP. 等人, Bioanalysis (2011) 3 (6), 677-700.
[非专利参考文献10] Kaur S. 等人, Bioanalysis (2013) 5 (2), 201-226.
[非专利参考文献11] Dere R. 等人, Bioanalysis (2013) 5 (9), 1025-1040.
[非专利参考文献12] Ogitani Y. 等人, Clinical Cancer Research (2016)22 (20), 5097-5108.
[非专利参考文献13] Ogitani Y. 等人, Cancer Science (2016) 107, 1039-1046.
[非专利参考文献14] Doi T, 等人, Lancet Oncol 2017; 18: 1512-22.
[非专利参考文献15] Takegawa N, 等人, Int. J. Cancer: 141, 1682-1689(2017)。
[发明概述]
[技术问题]
本发明的一个目标是提供识别具有依沙替康的衍生物作为组分的抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白；用于通过使用所述蛋白定量用所述抗体-药物缀合物施用的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法；和用于确定其组织分布的方法。
[问题的解决方案]
作为解决上述问题的努力研究的结果，本发明人发现，通过特异性免疫筛选获得的蛋白特异性识别具有依沙替康的衍生物作为组分的抗体-药物缀合物的药物部分。此外，他们建立了用于通过使用所述蛋白定量用所述抗体-药物缀合物施用的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法；和用于确定其组织分布的方法。
因此，本发明提供了以下[1]至[51]。
[1] 识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白，其中由下式代表的药物经由接头与抗体缀合：
[式1]
Figure 589321DEST_PATH_IMAGE001
。
[2] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式2]
Figure 506462DEST_PATH_IMAGE002
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
[3] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式3]
Figure 286199DEST_PATH_IMAGE003
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
[4] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式4]
Figure 743725DEST_PATH_IMAGE004
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
[5] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式5]
Figure 558097DEST_PATH_IMAGE005
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
[6] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式6]
Figure 380560DEST_PATH_IMAGE006
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
[7] 根据[1]所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式7]
Figure 460642DEST_PATH_IMAGE007
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
[8] 根据[1]至[7]中任一项所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数在2至8的范围内。
[9] 根据[1]至[8]中任一项所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的抗体是抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7-H3抗体、抗GPR20抗体或抗CDH6抗体。
[10] 根据[1]至[9]中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白对所述抗体-药物缀合物的识别特性基本上独立于所述抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数的任何差异。
[11] 识别由下式代表的药物的蛋白：
[式8]
Figure 659543DEST_PATH_IMAGE008
。
[12] 识别由下式代表的药物的蛋白：
[式9]
Figure 328421DEST_PATH_IMAGE009
。
[13] 识别由下式代表的药物的蛋白：
[式10]
Figure 384102DEST_PATH_IMAGE010
。
[14] 识别由下式代表的药物的蛋白：
[式11]
Figure 138431DEST_PATH_IMAGE011
。
[15] 根据[1]至[14]中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白是抗体。
[16] 根据[15]所述的蛋白，其中所述蛋白是
a)由重链和轻链组成的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:1代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:2代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3；且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3，
b)由重链和轻链组成的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:7代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:8代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3；且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3，
c)由重链和轻链组成的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:9代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:10代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3；且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3，或
d)由重链和轻链组成的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:11代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:12代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:13代表的氨基酸序列组成的CDRH3；且所述轻链包含由SEQ ID NO:14代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由WAS代表的三肽组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3。
[17] 根据[16]所述的蛋白，其中所述蛋白是由重链和轻链组成的抗体，所述重链包含由氨基酸序列组成的重链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至141组成；且所述轻链包含由氨基酸序列组成的轻链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至127组成。
[18] 根据[17]所述的蛋白，其中所述蛋白是小鼠抗体。
[19] 根据[17]所述的蛋白，其中所述蛋白是由重链和轻链组成的抗体，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至477组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至234组成。
[20] 根据[17]所述的蛋白，其中所述蛋白是嵌合抗体。
[21] 根据[17]所述的蛋白，其中所述蛋白是兔嵌合抗体。
[22] 根据[17]所述的蛋白，其中所述蛋白是由重链和轻链组成的抗体，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:19的氨基酸残基20至464组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:20的氨基酸残基21至233组成。
[23] 根据[15]所述的蛋白，其中所述蛋白是其中根据[19]或[22]所述的抗体的重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的抗体。
[24] 根据[15]所述的蛋白，其中所述蛋白是由与根据[19]或[22]所述的抗体的氨基酸序列具有至少95%同一性的氨基酸序列组成的抗体。
[25] 根据[15]所述的蛋白，其中所述蛋白是由与根据[19]或[22]所述的抗体的氨基酸序列具有至少99%同一性的氨基酸序列组成的抗体。
[26] 根据[15]所述的蛋白，其中所述蛋白是与根据[19]或[22]所述的抗体竞争对所述药物的识别特性的抗体。
[27] 根据[1]至[14]中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白是根据[15]至[26]中任一项所述的抗体的抗原结合片段。
[28] 根据[27]所述的蛋白，其中所述抗体的抗原结合片段是Fab、F(ab')2、Fab'或Fv。
[29] 通过使用根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白来定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法。
[30] 根据[29]所述的方法，其包括以下步骤：(1)使血浆中的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的抗体-药物缀合物的靶标抗原的板接触，以形成复合物；(2)使用标志物标记的根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物；且然后(3)检测所述标志物。
[31] 根据[29]所述的方法，其包括以下步骤：(1)使血浆中的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白的板接触，以形成复合物；(2)使能够识别所述抗体-药物缀合物的抗体部分并用标志物标记的第二蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物；且然后(3)检测所述标志物。
[32] 通过使用根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白来定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的从所述抗体-药物缀合物释放的药物的血浆中的浓度的方法。
[33] 根据[32]所述的方法，其包括以下步骤：(1)在用标志物标记的竞争性药物存在的情况下，使血浆中的从所述抗体-药物缀合物释放的药物与具有在其上固定的根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白的板接触，以形成复合物；和(2)检测所述标志物。
[34] 使用根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白来鉴定已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布的方法。
[35] 根据[34]所述的方法，其包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物与根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白接触，以形成复合物，(2)使能够识别根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白并用标志物标记的第二蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物，且然后(3)检测所述标志物。
[36] 根据[34]所述的方法，其包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物与用标志物标记的根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白接触，以形成复合物；且然后(2)检测所述标志物。
[37] 根据[30]、[31]、[33]、[35]或[36]所述的方法，其中所述标志物是生色试剂，且通过感测所述标志物的颜色来进行所述标志物的检测。
[38] 根据[30]、[31]、[33]、[35]或[36]所述的方法，其中所述标志物是酶，且所述标志物的检测通过感测由底物和酶之间的反应引起的发光或显色来进行。
[39] 根据[30]、[31]、[33]、[35]或[36]所述的方法，其中所述标志物是发光物质，且所述标志物的检测通过感测基于电化学反应的所述标志物的发光来进行。
[40] 多核苷酸，其编码根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白。
[41] 载体，其包含根据[40]所述的多核苷酸。
[42] 转化的宿主细胞，其包含根据[40]所述的多核苷酸。
[43] 转化的宿主细胞，其包含根据[41]所述的载体。
[44] 用于产生根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白的方法，其包括以下步骤：培养根据[42]或[43]所述的宿主细胞；且然后从培养步骤中获得的培养产物纯化蛋白。
[45] 组合物，其包含根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白。
[46] 试剂盒，其包含根据[1]至[28]中任一项所述的蛋白或根据[45]所述的组合物。
[47] 根据[46]所述的试剂盒，其用于定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物的血浆中的浓度。
[48] 根据[46]所述的试剂盒，其用于鉴定已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布。
[49] 抗体，其包含重链和轻链，所述重链包含由氨基酸序列组成的重链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至141组成；且所述轻链包含由氨基酸序列组成的轻链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至127组成。
[50] 根据[49]所述的抗体，其包含重链和轻链，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至477组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至234组成。
[51] 根据[49]所述的抗体，其包含重链和轻链，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:19的氨基酸残基20至464组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:20的氨基酸残基21至233组成。
[本发明的有利效果]
本发明提供了识别具有依沙替康的衍生物作为组分的抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白；通过使用所述蛋白定量用所述抗体-药物缀合物施用的哺乳动物中的抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法；和用于确定其组织分布的方法。
[附图简述]
[图1]图1显示小鼠抗体1A3的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:15)。
[图2]图2显示小鼠抗体1A3的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:16)。
[图3]图3显示编码小鼠抗体1A3的重链可变区的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQID NO:17)。
[图4]图4显示编码小鼠抗体1A3的轻链可变区的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQID NO:18)。
[图5]图5显示兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:19)。
[图6]图6显示兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:20)。
[图7]图7显示抗HER2抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:21)。
[图8]图8显示抗HER2抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:22)。
[图9]图9显示抗HER3抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:23)。
[图10]图10显示抗HER3抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:24)。
[图11]图11显示抗TROP2抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:25)。
[图12]图12显示抗TROP2抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:26)。
[图13]图13显示抗B7-H3抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:27)。
[图14]图14显示抗B7-H3抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:28)。
[图15]图15显示当小鼠抗体1A3用作捕获试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图16]图16显示当小鼠抗体8B2用作捕获试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图17]图17显示当小鼠抗体11B1用作捕获试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图18]图18显示当小鼠抗体1A3用作检测试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图19]图19显示当小鼠抗体8B2用作检测试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图20]图20显示当小鼠抗体11B1用作检测试剂时HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)的校准曲线。
[图21]图21显示当小鼠抗体1A3用作检测试剂时B7-H3-ADC(I)(DAR8)和B7-H3-ADC(I)(DAR4)的校准曲线。
[图22]图22显示当小鼠抗体8B2用作检测试剂时B7-H3-ADC(I)(DAR8)和B7-H3-ADC(I)(DAR4)的校准曲线。
[图23]图23显示当小鼠抗体11B1用作检测试剂时B7-H3-ADC(I)(DAR8)和B7-H3-ADC(I)(DAR4)的校准曲线。
[图24]图24显示用于定量小鼠中的HER2-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图25]图25显示用于定量猴中的HER3-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图26]图26显示用于定量猴中的TROP2-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图27]图27显示用于定量猴中的B7-H3-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图28]图28显示编码人轻链信号序列和人κ链恒定区的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQ ID NO:29)。
[图29]图29显示编码兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQ IDNO:30)。
[图30]图30显示编码兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQ IDNO:31)。
[图31]图31显示抗GPR20抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:32)。
[图32]图32显示抗GPR20抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:33)。
[图33]图33显示抗CDH6抗体的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:34)。
[图34]图34显示抗CDH6抗体的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:35)。
[图35]图35显示使用兔嵌合抗体1A3的免疫染色的图像。比较裸小鼠的免疫染色的图像，向所述裸小鼠中皮下移植人头颈癌细胞系FaDu并分别用TROP2-ADC (I)和抗TROP2Ab施用。
[图36]图36显示使用兔嵌合抗体1A3的免疫染色的图像。比较裸小鼠的图像，向所述裸小鼠皮下移植过表达GPR20的人胃肠道间质瘤细胞系GIST-T1/GPR20并用GPR20-ADC(I)施用，和不用GPR20-ADC (I)施用。
[图37]图37显示使用兔嵌合抗体1A3的免疫染色的图像。比较裸小鼠的图像，向所述裸小鼠皮下移植取自具有透明细胞肾细胞癌的患者的肿瘤组织并用CDH6-ADC (I)施用，和不用CDH6-ADC (I)施用。
[图38]图38显示使用兔嵌合抗体1A3的免疫染色的图像。比较裸小鼠的图像，向所述裸小鼠皮下移植取自具有透明细胞肾细胞癌的患者的肿瘤组织，用CDH6-ADC (I)施用，并用先前制备或未制备的小鼠抗体1A3和化合物(2)的混合物或小鼠抗体1A3和SN-38的混合物染色。
[图39]图39显示用于定量小鼠中的GPR20-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图40]图40显示用于定量人中的HER2-ADC (I)的血浆中的浓度的校准曲线。
[图41]图41显示竞争性抑制小鼠抗体1A3对HER2-ADC (I)的识别的化合物的抑制率。
[实施方案的描述]
在下文中，描述了用于实施本发明的优选模式。给出以下描述的实施方案仅仅用于举例说明本发明的典型实施方案的一个实例，而无意于限制本发明的范围。
1.定义
在本发明中，“蛋白”与“肽”或“多肽”同义。
在本发明中，“蛋白”优选是抗体或抗体的抗原结合片段。只要其具有类似于抗体的识别抗原的功能，“蛋白”可以是除了抗体和抗体的抗原结合片段以外的任何蛋白(抗体替代物)。抗体替代物的实例包括支架蛋白，诸如纤连蛋白、蛋白A、脂质运载蛋白、TrxA、A-结构域、锚蛋白重复序列、APPI和结合Ras的AF-6 (Kasper Binz H. 等人, CurrentOpinion in Biotechnology 2005, 16: 459-469, Kasper Binz H. 等人, NatureBiotechnology 23 (10) 2005, 1257-1268, Skerra A., Current Opinion inBiotechnology 2007, 18: 295-304, Nygren P., FEBS Journal 275 (2008) 2668-2676, Gronwall C. 等人, Journal of Biotechnology 140 (2009) 254-269)。
在本发明中，“抗体”是指具有识别特定抗原的功能的糖蛋白。抗体的实例包括多克隆抗体、单克隆抗体、嵌合抗体、兔型抗体、人源化抗体和人抗体。
在本发明中，有时以“免疫原”的含义使用“抗原”。
在本发明中，“抗体的抗原结合片段”是指具有识别抗原的功能的抗体的部分片段，并且与“抗体的功能片段”同义。抗体的抗原结合片段的实例包括但不限于Fab、F(ab')2、scFv、Fab'和单链免疫球蛋白。抗体的功能片段可以通过用酶、诸如木瓜蛋白酶和胃蛋白酶处理全长抗体分子来获得。除此之外，抗体的功能片段可以是使用重组基因在适当的宿主细胞中产生的重组蛋白。
本发明的蛋白“识别”抗原的短语是指本发明的蛋白通过分子间的力(诸如静电相互作用、范德华力和氢键)结合抗原。可以例如通过检测由各种免疫化学方法生成的信号来检查本发明的蛋白对抗原的“识别”。
本发明的蛋白对抗原的“识别特性”是不同的短语意指本发明的蛋白与抗原的结合强度和行为是基本上不同的。可以例如通过比较由各种免疫化学方法生成的信号强度和/或比较代表抗原的浓度和信号的强度的校准曲线来检查本发明的蛋白对抗原的“识别特性”是否不同。
被本发明的蛋白识别的“部分”是指被本发明的蛋白识别的靶标中的特定部分结构。被本发明的蛋白识别的靶标被称为“抗原”，且被本发明的蛋白识别的特定部分有时被称为“表位”。
已知抗体的每条重链和轻链具有三个互补决定区(CDR)。互补决定区也称为高变区(高变结构域)，其为抗体的每条重链和轻链的可变区内存在并且具有特别高的一级结构突变率的位点。CDR通常存在于重链和轻链的多肽链各自的一级结构上的三个离散位点中。在本发明中，抗体的互补决定区表达如下：重链中的互补决定区从重链氨基酸序列的氨基末端起依次表示为CDRH1、CDRH2和CDRH3；而轻链中的互补决定区从轻链氨基酸序列的氨基末端起依次表示为CDRL1、CDRL2和CDRL3。在三级结构中，这些区域彼此靠近存在，并且参与对抗原的特异性的确定。
在本发明中，“基因”是指包含编码蛋白或其互补链的氨基酸的核苷酸序列的核苷酸，例如，在“基因”的含义中包括多核苷酸、寡核苷酸、DNA、mRNA、cDNA和cRNA，其为包含编码蛋白的氨基酸的核苷酸序列或其互补链的核苷酸。如上所提及的基因由单链、双链或三链或更大链的核苷酸组成。一对DNA链和RNA链、核糖核苷酸(RNA)和脱氧核糖核苷酸(DNA)在单一核苷酸链上共同存在，并且在“基因”的含义中包括包含这种核苷酸链的双链或三链或更大链。
在本发明中，“核苷酸”与“核酸”同义；例如，在“核苷酸”的含义中包括DNA、RNA、探针、寡核苷酸、多核苷酸和引物。这种核苷酸是由单链、双链或三链体链或更大链组成的核苷酸。一对DNA链和RNA链、核糖核苷酸(RNA)和脱氧核糖核苷酸(DNA)在单一核苷酸链上共同存在，并且在“核苷酸”的含义中包括一对包含这种核苷酸链的双链或三链或更大链。
在本发明中，“细胞”包括源自动物的各种细胞，继代培养细胞，原代培养细胞，细胞株，重组细胞和微生物。
2. 抗体-药物缀合物
在本发明中，“抗体-药物缀合物”是指经由接头缀合抗体和药物而获得的缀合物。
在本发明中，“药物-接头”是指抗体-药物缀合物的部分结构，且其由接头和药物组成。
本发明的蛋白的特征在于识别抗体-药物缀合物(在下文中被称为“根据本发明的抗体-药物缀合物”)的药物部分，其中由下式代表的药物(在下文中被称为“化合物(1)”)和抗体经由接头缀合：
[式12]
Figure 875443DEST_PATH_IMAGE012
。
化合物(1)是一种被称为依沙替康的抗肿瘤药(也可以由IUPAC名称表示：(1S,9S)-1-氨基-9-乙基-5-氟-1,2,3,9,12,15-六氢-9-羟基-4-甲基-10H,13H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-10,13-二酮，或化学名称：(1S,9S)-1-氨基-9-乙基-5-氟-2,3-二氢-9-羟基-4-甲基-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-10,13 (9H,15H)-二酮)，且已知其具有拓扑异构酶I抑制活性。
注意，本发明的蛋白还可以识别化合物(1)本身。
根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体的实例包括但不特别限于抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7-H3抗体、抗CD3抗体、抗CD30抗体、抗CD33抗体、抗CD37抗体、抗CD56抗体、抗CD98抗体、抗DR5抗体、抗EGFR抗体、抗EPHA2抗体、抗FGFR2抗体、抗FGFR4抗体、抗FOLR1抗体、抗VEGF抗体、抗CD20抗体、抗CD22抗体、抗CD70抗体、抗PSMA抗体、抗CEA抗体、抗间皮素抗体、抗A33抗体、抗CanAg抗体、抗Cripto抗体、抗G250抗体、抗MUC1抗体、抗GPNMB抗体、抗整联蛋白抗体、抗腱生蛋白-C抗体、抗SLC44A4抗体、抗GPR20抗体和抗CDH6抗体。此外，可以优选地例举抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7-H3抗体、抗GPR20抗体和抗CDH6抗体。
在本发明中，“抗HER2抗体”是指特异性结合HER2(人表皮生长因子受体2型；ErbB-2)且优选地通过结合HER2而在表达HER2的细胞中具有内化活性的抗体。
抗HER2抗体的实例包括曲妥珠单抗(美国专利号5821337)和帕妥珠单抗(国际公开号WO 01/00245)。优选地，可以例举曲妥珠单抗。
在本发明中，“抗HER3抗体”是指特异性结合HER3 (人表皮生长因子受体3型；ErbB-3)且优选地通过结合HER3而在表达HER3的细胞中具有内化活性的抗体。
抗HER3抗体的实例包括帕特里单抗(U3-1287)，U1-59 (国际公开号WO 2007/077028)，MM-121 (seribantumab)，国际公开号WO 2008/100624中描述的抗ERBB3抗体，RG-7116 (lumretuzumab)和LJM-716 (elgemtumab)。优选地，可以例举帕特珠单抗和U1-59。
在本发明中，“抗TROP2抗体”是指特异性结合TROP2 (TACSTD2：肿瘤相关钙信号转导子2；EGP-1)且优选地通过结合TROP2而在表达TROP2的细胞中具有内化活性的抗体。
抗TROP2抗体的实例包括hTINA1-H1L1 (国际公开号WO 2015/098099)。
在本发明中，“抗-B7-H3抗体”是指特异性结合B7-H3(B细胞抗原#7同源物3；PD-L3；CD276)且优选地通过结合B7-H3而在表达B7-H3的细胞中具有内化活性的抗体。
抗B7-H3抗体的实例包括M30-H1-L4(国际公开号WO 2014/057687)。
在本发明中，“抗GPR20抗体”是指特异性结合GPR20 (G蛋白偶联受体20)且优选地通过结合GPR20而在表达GPR20的细胞中具有内化活性的抗体。
抗GPR20抗体的实例包括h046-H4e/L7(国际公开号WO 2018/135501)。
在本发明中，“抗CDH6抗体”是指特异性结合CDH6(钙黏着蛋白-6)且优选地通过结合CDH6而在表达CDH6的细胞中具有内化活性的抗体。
抗CDH6抗体的实例包括H01L02 (国际公开号WO 2018/212136)。
本发明的蛋白的特征在于特异性识别优选具有由下式代表的药物-接头的抗体-药物缀合物(在下文中被称为“抗体-药物缀合物(I)”)的药物部分：
[式13]
Figure 710413DEST_PATH_IMAGE013
其中A代表与抗体的连接位置，且所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合；
具有由下式代表的药物-接头的抗体-药物缀合物(下文中被称为“抗体-药物缀合物(II)”)：
[式14]
Figure 140257DEST_PATH_IMAGE014
其中A代表与抗体的连接位置，且所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合；或
具有由下式代表的药物-接头的抗体-药物缀合物(下文中被称为“抗体-药物缀合物(III)”)：
[式15]
Figure 381883DEST_PATH_IMAGE015
其中A代表与抗体的连接位置，所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
抗体-药物缀合物(I)至(III)的每个药物-接头连接至在链间二硫键位点(重链之间的两个位点，以及重链和轻链之间的两个位点)处形成的硫醇基团(换言之，半胱氨酸残基的硫原子)。
更优选地，本发明的蛋白的特征在于特异性识别抗体-药物缀合物(I)的药物部分。
抗体-药物缀合物(I)也可以由下式代表：
[式16]
Figure 657006DEST_PATH_IMAGE016
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。n的含义与所谓缀合的药物分子的平均数(DAR；药物：抗体比)的含义相同，并且指示每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
注意，根据本发明的抗体-药物缀合物的每个抗体分子的缀合的药物分子的平均数可以例如通过如下来测定：基于抗体-药物缀合物及其缀合前体在280nm和370nm的两个波长处的UV吸光度的测量值的计算方法(UV方法)，或基于对通过用还原剂处理抗体-药物缀合物获得的片段的HPLC测量值定量的计算方法(HPLC方法)。
在迁移至癌细胞中之后，抗体-药物缀合物(I)在接头部分处切割，以释放由下式代表的化合物：
[式17]
Figure 362794DEST_PATH_IMAGE017
(下文中被称为“化合物(2)”)。
推测化合物(2)通过分解由下式代表的化合物的缩醛胺结构而形成：
[式18]
Figure 697960DEST_PATH_IMAGE018
(下文中被称为“化合物(3)”)
推测其通过切割本发明中使用的抗体-药物缀合物的接头部分而形成。
推测化合物(2)是抗体-药物缀合物(I)的抗肿瘤活性的原始来源，并且已经证实其具有拓扑异构酶I抑制作用(Ogitani Y. 等人, Clinical Cancer Research, 2016,Oct 15;22 (20): 5097-5108, Epub 2016 Mar 29)。
注意，本发明的蛋白还可以识别从抗体-药物缀合物(I)释放的化合物(2)本身。
抗体-药物缀合物(II)也可以由下式代表：
[式19]
Figure 426882DEST_PATH_IMAGE019
其中所述药物-接头经由硫醚键与抗体缀合。n的含义与所谓DAR的含义相同，并且指示每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
在迁移至癌细胞中之后，抗体-药物缀合物(II)在接头部分处切割，以释放由下式代表的化合物：
[式20]
Figure 505697DEST_PATH_IMAGE020
(下文中被称为“化合物(4)”)
注意，本发明的蛋白还可以识别从抗体-药物缀合物(II)释放的化合物(4)本身。
所述抗体-药物缀合物(III)也可以由下式代表：
[式21]
Figure 816723DEST_PATH_IMAGE021
其中所述药物-接头经由硫醚键与抗体缀合。n的含义与所谓DAR的含义相同，并且指示每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
在迁移至癌细胞中之后，抗体-药物缀合物(III)在接头部分处切割，以释放由下式代表的化合物(下文中被称为“化合物(5)”)：
[式22]
Figure 588370DEST_PATH_IMAGE022
注意，本发明的蛋白还可以识别从抗体-药物缀合物(III)释放的化合物(5)本身。
在本发明中，"抗HER2抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗HER2抗体。
所述抗HER2抗体优选为包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:21的氨基酸残基1至449组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:22的氨基酸残基1至214组成的氨基酸序列组成；或为包含由SEQ ID NO:21代表的氨基酸序列组成的重链和由SEQ IDNO:2代表的氨基酸序列组成的轻链的抗体。
所述抗HER2抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至8，甚至更优选为7至8，甚至更优选为7.5至8，且甚至更优选为约8。
所述抗HER2抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2015/115091中的描述来产生。
在本发明中，"抗HER3抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗HER3抗体。
所述抗HER3抗体优选为抗体，其包含重链和轻链，所述重链由以下组成：由SEQ IDNO:23的氨基酸残基26至35的氨基酸序列组成的CDRH1，由SEQSEQ NO:23的氨基酸残基50至65的氨基酸序列组成的CDRH2，和由SEQ ID NO:23的氨基酸残基98至106的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链由以下组成：由SEQ ID NO:24的氨基酸残基24至39的氨基酸序列组成的CDRL1，由SEQ ID NO:24的氨基酸残基56至62的氨基酸序列组成的CDRL2，和由SEQ IDNO:24的氨基酸残基95至103的氨基酸序列组成的CDRL3；
更优选地，包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:23的氨基酸残基1至117的氨基酸序列组成的重链可变区，且所述轻链包含由SEQ ID NO:24的氨基酸残基1至113组成的轻链可变区；和甚至更优选地，包含由SEQ ID NO:23代表的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:24代表的氨基酸序列组成的轻链的抗体，或其中所述重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的所述抗体的变体。
所述抗HER3抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至8，甚至更优选为7至8，甚至更优选为7.5至8，且甚至更优选为约8。
所述抗HER3抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2015/155998中的描述来产生。
在本发明中，"抗TROP2抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗TROP2抗体。
所述抗TROP2抗体优选为包含重链和轻链的抗体，所述重链由以下组成：由SEQ IDNO:25的氨基酸残基50至54的氨基酸序列组成的CDRH1，由SEQSEQ NO:25的氨基酸残基69至85的氨基酸序列组成的CDRH2，和由SEQ ID NO:25的氨基酸残基118至129的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链包含：由SEQ ID NO:26的氨基酸残基44至54的氨基酸序列组成的CDRL1，由SEQ ID NO:26的氨基酸残基70至76的氨基酸序列组成的CDRL2，和由SEQ ID NO:26的氨基酸残基109至117的氨基酸序列组成的CDRL3；
更优选地，包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:25的氨基酸残基20至140的氨基酸序列组成的重链可变区，且所述轻链包含由SEQ ID NO:26的氨基酸残基21至129组成的轻链可变区；和
甚至更优选地，包含由SEQ ID NO:25的氨基酸残基20至470的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:26的氨基酸残基21至234的氨基酸序列组成的轻链的抗体，或其中所述重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的所述抗体的变体。
所述抗TROP2抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至5，甚至更优选为3.5至4.5，且甚至更优选为约4。
所述抗TROP2抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2015/098099中的描述来产生。
在本发明中，"抗B7-H3抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗B7-H3抗体。
所述抗B7-H3抗体优选为包含重链和轻链的抗体，所述重链包含：由SEQ ID NO:27的氨基酸残基50至54的氨基酸序列组成的CDRH1，由SEQSEQ NO:27的氨基酸残基69至85的氨基酸序列组成的CDRH2，和由SEQ ID NO:27的氨基酸残基118至130的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链由以下组成：由SEQ ID NO:28的氨基酸残基44至53的氨基酸序列组成的CDRL1，由SEQ ID NO:28的氨基酸残基69至75的氨基酸序列组成的CDRL2，和由SEQ ID NO:28的氨基酸残基108至116的氨基酸序列组成的CDRL3；
更优选地，包含重链和轻链的抗体，所述重链含有由SEQ ID NO:27的氨基酸残基20至141的氨基酸序列组成的重链可变区，且所述轻链包含由SEQ ID NO:28的氨基酸残基21至128组成的轻链可变区；和
甚至更优选地，包含由SEQ ID NO:27的氨基酸残基20至471的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:28的氨基酸残基21至233的氨基酸序列组成的轻链的抗体，或其中所述重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的所述抗体的变体。
所述抗B7-H3抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至5，甚至更优选为3.5至4.5，且甚至更优选为约4。
所述抗B7-H3抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2014/057687中的描述来产生。
在本发明中，"抗GPR20抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗GPR20抗体。
所述抗GPR20抗体优选为包含重链和轻链的抗体，所述重链由以下组成：由SEQ IDNO:32的氨基酸残基45至54的氨基酸序列组成的CDRH1，由SEQSEQ NO:32的氨基酸残基69至78的氨基酸序列组成的CDRH2，和由SEQ ID NO:32的氨基酸残基118至131的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链由以下组成：由SEQ ID NO:33的氨基酸残基44至54的氨基酸序列组成的CDRL1，由SEQ ID NO:33的氨基酸残基70至76的氨基酸序列组成的CDRL2，和由SEQ IDNO:33的氨基酸残基109至117的氨基酸序列组成的CDRL3；
更优选地，包含重链和轻链的抗体，所述重链含有由SEQ ID NO:32的氨基酸残基20至142的氨基酸序列组成的重链可变区，且所述轻链含有由SEQ ID NO:33的氨基酸残基21至129组成的轻链可变区；和
甚至更优选地，包含由SEQ ID NO:32的氨基酸残基20至472的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:33的氨基酸残基21至234的氨基酸序列组成的轻链的抗体，或其中所述重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的所述抗体的变体。
所述抗GPR20抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至8，甚至更优选为7至8，甚至更优选为7.5至8，且甚至更优选为约8。
所述抗GPR20抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2018/135501中的描述来产生。
在本发明中，"抗CDH6抗体-药物缀合物"是指抗体-药物缀合物，使得根据本发明的抗体-药物缀合物中的抗体是抗CDH6抗体。
所述抗CDH6抗体优选为包含重链和轻链的抗体，所述重链由以下组成：由SEQ IDNO:34的氨基酸残基45至54的氨基酸序列组成的CDRH1，由SEQSEQ NO:34的氨基酸残基69至78的氨基酸序列组成的CDRH2，和由SEQ ID NO:34的氨基酸残基118至130的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链由以下组成：由SEQ ID NO:35的氨基酸残基44至54的氨基酸序列组成的CDRL1，由SEQ ID NO:35的氨基酸残基70至76的氨基酸序列组成的CDRL2，和由SEQ IDNO:35的氨基酸残基109至116的氨基酸序列组成的CDRL3；
更优选地，包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:34的氨基酸残基20至141的氨基酸序列组成的重链可变区，且所述轻链包含由SEQ ID NO:35的氨基酸残基21至128组成的轻链可变区；和
甚至更优选地，包含由SEQ ID NO:34的氨基酸残基20至471的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:35的氨基酸残基21至233的氨基酸序列组成的轻链的抗体，或其中所述重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的所述抗体的变体。
所述抗CDH6抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数优选为2至8，更优选为3至8，甚至更优选为7至8，进一步更优选为7.5至8，且甚至更优选为约8。
所述抗CDH6抗体-药物缀合物可以参考公开、诸如国际公开号WO 2018/212136中的描述来产生。
3. 本发明的蛋白的产生
本发明的蛋白可以优选作为抗体(在下文中被称为“本发明的抗体”)获得。本发明的抗体可以通过如下获得：用通过经由接头缀合化合物(1)或其衍生物和载体蛋白而获得的抗原蛋白免疫动物，和收集体内产生的抗体，且然后将其纯化。
作为抗原蛋白，可以使用通过将载体蛋白添加至例如由下式代表的化合物而制备的蛋白：
[式23]
Figure 539009DEST_PATH_IMAGE023
(在下文中被称为“化合物”(6))。
载体蛋白没有特别限制，只要其可以诱导免疫应答，即使其为小抗原诸如小分子化合物或肽。例如，可以使用牛甲状腺球蛋白和牛血清白蛋白(BSA)和匙孔
Figure 421514DEST_PATH_IMAGE025
血蓝蛋白(KLH)。
从获得的抗血清中，可以使用阳性对照和阴性对照通过ELISA方法选择具有期望特性的抗血清。
作为阳性对照，例如，可以例举化合物(1)、化合物(2)和化合物(6)。可以使用这些作为阳性对照来选择具有高抑制作用的抗血清。
注意，已知在酸性水性溶剂(例如，约pH3)中，化合物(1)的内酯环的平衡向闭环移动；而在碱性水性溶剂(例如，约pH10)中，该环向开环移动。为了选择无论内酯环是开环还是闭环都识别化合物(1)本身的基本骨架的抗体，可以使用具有还原的内酯环的化合物，例如由下式代表的化合物：
[式24]
Figure 836315DEST_PATH_IMAGE026
(在下文中被称为“化合物(7)”)作为阳性对照。可以选择具有高抑制作用的抗血清作为阳性对照。注意，为了在相同水平选择识别抗体的化合物(1)和化合物(7)，优选排除特别高地识别化合物(7)而不是化合物(1)的抗体部分。
可以将根据本发明的抗体-药物缀合物(优选地，抗体-药物缀合物(I)、(II)和(III))用作阳性对照。可以使用这些作为阳性对照来选择具有高抑制作用的抗血清。
为了排除识别远离化合物(1)的基本骨架定位的部分的抗体，例如，可以使用由环己烷环、靠近接头的部分结构组成且由下式代表的化合物：
[式25]
Figure 778863DEST_PATH_IMAGE027
(在下文中被称为“化合物(8)”)作为阴性对照。使用此作为阴性对照，可以排除表现出高抑制作用的抗血清。
可以通过克隆如上所提及选择的抗血清来获得产生本发明的抗体的细胞。
根据本领域已知的方法(例如，Kohler和Milstein, Nature (1975) 256, p.495-497, Kennet, R. 编, Monoclonal Antibodies, p.365-367, Plenum Press, N.Y.(1980))，将产生本发明的抗体的细胞与骨髓瘤细胞融合以建立杂交瘤细胞，从其中可以获得单克隆抗体。这种方法的实例更具体地描述于在2009年4月16日公开的国际公开号WO09/48072和WO10/117011(在2010年10月14日公开)中。
可以均匀地纯化获得的抗体。为了分离和纯化抗体，可以使用用于蛋白的常规分离和纯化方法。可以适当地选择和组合例如柱色谱、通过过滤器过滤、超滤、盐析、透析、用于制备的聚丙烯酰胺凝胶电泳和等电点电泳来分离和纯化抗体(Strategies for ProteinPurification and Characterization: A Laboratory Course Manual, Daniel R.Marshak等人，编, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1996), Antibodies: ALaboratory Manual. Ed Harlow and David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory(1988)；然而，分离和纯化方法不限于这些。
色谱的实例包括亲和色谱、离子交换色谱、疏水色谱、凝胶过滤色谱、反相色谱和吸附色谱。这些色谱方法可以使用液相色谱诸如HPLC和FPLC实施。待用于亲和色谱中的柱包括蛋白A柱和蛋白G柱。使用蛋白A柱的柱的实例包括Hyper D、POROS和Sepharose F.F.(Pharmacia)。还可以使用具有在其上固定的抗原的载体和利用对抗原的结合能力来纯化抗体。
本发明的抗体的进一步特征在于其对根据本发明的抗体-药物缀合物的识别特性基本上独立于所述抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数(DAR)的任何差异。所述抗体具有这种特征的事实可以例如基于以下事实来证实：对具有高DAR (DAR8)的抗体-药物缀合物的校准曲线与对具有低DAR (DAR4)的抗体-药物缀合物的校准曲线基本上没有不同。
作为如上所述获得的本发明的抗体，例如，可以例举小鼠抗体1A3。小鼠抗体1A3的重链可变区的氨基酸序列是由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至141组成的氨基酸序列，且编码所述氨基酸序列的核苷酸序列是由SEQ ID NO:17的核苷酸残基58至423组成的核苷酸序列。小鼠抗体1A3的轻链可变区的氨基酸序列是由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至127组成的氨基酸序列；且编码所述氨基酸序列的核苷酸序列是由SEQ ID NO:18的核苷酸残基61至381组成的核苷酸序列。
如果本发明的抗体是具有源自小鼠抗体1A3的所有6个CDR序列的抗体，并且特异性识别根据本发明的抗体-药物缀合物的药物部分，则其为令人满意的。已知几种用于确定CDR序列的方法。例如，例举Abm定义、Chothia定义、Kabat定义和Imgt (注册商标)(国际ImMunoGeneTics信息系统(注册商标))。本发明的抗体的CDR序列可以通过所述方法中的任一种来定义。
根据Abm定义，本发明的抗体的重链可变区具有由SEQ ID NO:1代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDYGMV)，由SEQ ID NO:2代表的氨基酸序列组成的CDRH2(YISSGSSAIY)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3 (PPRYDVYSAWFAY)；且本发明的抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1(KASQDVGSAVV)，由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ IDNO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Chothia定义，本发明的抗体的重链可变区具有由SEQ ID NO:7代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDY)，由SEQ ID NO:8代表的氨基酸序列组成的CDRH2 (SSGSSA)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3 (PPRYDVYSAWFAY)；且本发明的抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (KASQDVGSAVV)，由SEQ IDNO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Kabat定义，本发明的抗体的重链可变区具有由SEQ ID NO:9代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (DYGMV)，由SEQ ID NO:10代表的氨基酸序列组成的CDRH2(YISSGSSAIYYADTVKG)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3(PPRYDVYSAWFAY)；且本发明的抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (KASQDVGSAVV)，由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Imgt (注册商标)定义，本发明的抗体的重链可变区具有由SEQ ID NO:11代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDYG)，由SEQ ID NO:12代表的氨基酸序列组成的CDRH2 (ISSGSSAI)，和由SEQ ID NO:13代表的氨基酸序列组成的CDRH3(ARPPRYDVYSAWFAY)；且本发明的抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:14代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (QDVGSA)，由WAS(色氨酸-丙氨酸-丝氨酸)代表的三肽组成的CDRL2，和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
本发明的抗体不仅包括上面提及的单克隆抗体，还包括通过添加用于降低异源抗原性的人工修饰而获得的基因重组抗体，诸如嵌合抗体、人源化抗体、兔型抗体或小鼠型抗体。这些抗体可以使用已知方法产生。
作为嵌合抗体，可以例举其中抗体可变区和恒定区源自不同物种的抗体，例如，其中小鼠或大鼠来源的抗体可变区与人来源的抗体恒定区连接的嵌合抗体(Proc. Natl.Acad. Sci. USA, 81, 6851-6855, (1984))。作为另一个实例，可以例举其中小鼠或大鼠来源的抗体可变区连接至兔来源的抗体恒定区的嵌合抗体。
作为兔嵌合抗体的具体实例，可以例举抗体(兔嵌合抗体1A3)，其包含含有小鼠抗体1A3来源的重链可变区和兔抗体来源的重链恒定区的重链和含有小鼠抗体1A3来源的轻链可变区和兔抗体来源的轻链恒定区的轻链。所述兔嵌合抗体1A3的重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:19的氨基酸残基20至464组成；而所述兔嵌合抗体1A3的轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:20的氨基酸残基21至233组成。
作为用于癌症研究的非临床动物模型，经常使用小鼠。如果使用小鼠抗体，为了避免与内源性小鼠IgG竞争，可以使用的方法受到限制。然后，使用兔嵌合抗体，因为可以在同一平台上比较小鼠来源的样品和人类来源的样品，并且对转化研究有用。
作为人源化抗体，可以例举通过将单独的互补决定区(CDR)整合至人来源的抗体中而获得的抗体(Nature (1986) 321, pp. 522-525)，以及通过将框架的氨基酸残基的一部分以及CDR序列移植至人抗体而获得的抗体(WO 90/07861)。作为兔型抗体，可以例举通过将单独的互补决定区(CDR)整合至兔来源的抗体中而获得的抗体，以及通过将框架的氨基酸残基的一部分以及CDR序列移植至兔抗体中而获得的抗体。
已知在通过培养哺乳动物细胞产生的抗体中，在重链的羧基末端的赖氨酸残基被缺失(Journal of Chromatography A, 705: 129-134 (1995))。还已知从重链羧基末端缺失两个氨基酸残基(甘氨酸和赖氨酸)，并且将位于羧基末端的脯氨酸残基新酰胺化(Analytical Biochemistry, 360: 75-83 (2007))。然而，重链序列的这种缺失和修饰不影响抗体的抗原-结合亲和力和效应子功能(补体的活化、抗体-依赖性细胞的细胞毒性等)。因此，在本发明中，包括进行这种修饰的抗体，并且可以例举其中在重链的羧基末端已经缺失一个或两个氨基酸的缺失变体，通过缺失变体的酰胺化而获得的变体(例如，其中羧基末端脯氨酸残基已被酰胺化的重链)等。根据本发明在抗体的重链的羧基末端具有缺失的缺失变体的类型不限于上述变体的类型，只要抗原结合亲和力和效应子功能是保守的。构成根据本发明的抗体的两条重链可以是选自全长重链和上述缺失变体或这些中的任何两者的组合的重链中的任一种。每种缺失变体的量的比率有时可能受到产生根据本发明的抗体的培养的哺乳动物细胞的类型和培养条件的影响；然而，作为本发明的抗体的主要组分，可以例举其中在两条重链的两者中已经缺失在羧基末端的一个氨基酸残基的情况。
本发明的抗体可以是由与小鼠抗体1A3或兔嵌合抗体1A3的氨基酸序列具有至少95%(优选至少99%)同一性的氨基酸序列组成的抗体，只要维持本发明的抗体的特征。
两种类型的氨基酸序列之间的同一性可以通过使用Blast的默认参数确定(Nucl.Acids Res., 25, p.3389-3402 (1997))。可以通过访问互联网www.ncbi.nlm.nih.gov/blast来使用Blast。
本发明的抗体可以是与小鼠抗体1A3或兔嵌合抗体1A3竞争根据本发明的对抗体-药物缀合物的药物部分的识别特性的抗体。
关于根据本发明的对抗体-药物缀合物的药物部分的识别特性评估通过如上文所提及的方法获得的抗体。以这种方式，可以选择合适的抗体。作为用于比较抗体的特性的另一指标，可以例举抗体的稳定性。差示扫描量热法(DSC)是一种快速且准确地测量转变中点温度(Tm)的方法，所述转变中点温度(Tm)是蛋白结构的相对稳定性的良好指标。可以通过DSC测量Tm值并进行比较它们来比较热稳定性的差异。已知抗体的储存稳定性在一定程度上显示与抗体的热稳定性的相关性(Lori Burton, 等人, Pharmaceutical Developmentand Technology (2007) 12, p.265-273)。可以基于热稳定性作为指标来选择合适的抗体。可以例举用于选择抗体的另一种指标，在适当的宿主细胞中的高产率和在水溶液中的低粘结性。由于最高产生的抗体并不总是具有高热稳定性，因此有必要基于上面提及的指标通过综合判断来选择最合适的抗体。
通过使用适当的接头连接抗体的重链和轻链的全长序列来获得单链免疫球蛋白的方法是已知的(Lee, H-S, 等人, Molecular Immunology (1999) 36, p.61-71,Shirrmann, T. 等人, mAbs (2010), 2, (1) p.1-4)。如果将这种单链免疫球蛋白二聚化，则可以获得与基本上为四聚体的抗体的那些相似的结构和活性。本发明的抗体可以是具有单个重链可变区而没有轻链序列的抗体。这种抗体(被称为单结构域抗体(sdAb)或纳米抗体)实际上在骆驼或美洲驼中发现，并且被报道具有抗原结合能力(Muyldemans S.等人, Protein Eng. (1994) 7 (9), 1129-35, Hamers-Casterman C. 等人, Nature(1993) 363 (6428) 446-8)。上述抗体可以被解释为本发明的抗体的抗原结合片段。
如果通过一次分离抗体基因且然后将其引入适当的宿主中来产生抗体，则可以使用宿主和表达载体的适当组合。作为抗体基因的实例，可以例举具有编码说明书中所述的抗体的重链序列的基因和编码轻链序列的基因的组合的抗体基因。如果转化宿主细胞，则可以将具有重链序列的基因和具有轻链序列的基因插入相同的表达载体或不同的表达载体中。如果使用真核细胞作为宿主，则可以使用动物细胞、植物细胞和真核微生物。动物细胞的实例包括(1)哺乳动物细胞，例如，猴细胞，诸如COS细胞(Gluzman, Y. Cell (1981)23, p.175-182, ATCC CRL-1650)，小鼠成纤维细胞NIH3T3 (ATCC No. CRL-1658)和中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞，ATCC CCL-61)二氢叶酸还原酶缺陷株(Urlaub, G.和Chasin, L.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (1980) 77, p.4126-4220)。如果使用原核细胞，例如，可以列举大肠杆菌和枯草芽孢杆菌。通过转化将期望的抗体基因引入这些细胞并在体外培养转化体来获得抗体。在以下的培养方法中，产率根据抗体的序列而不同。可以基于作为指标的产率从具有等效结合活性的抗体选择作为药物容易生产的抗体。
本发明的抗体的同种型不受限制，例如，可以例举IgG (IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgM、IgA(IgA1、IgA2)、IgD或IgE。可以例举优选地，IgG或IgM，进一步优选地，IgG1或IgG2。
本发明的抗体可以是具有抗体的抗原结合位点的抗体的抗原结合片段或其修饰片段。抗体的片段可以通过如下获得：用蛋白酶诸如木瓜蛋白酶或胃蛋白酶处理抗体或通过基因工程改造方法修饰抗体基因，并在适当的培养细胞中表达修饰的基因。在这些抗体片段中，具有全长抗体分子的全部或部分功能的片段可以被称为抗体的抗原结合片段。
抗体片段的实例包括Fab、F(ab')2、Fv、通过经由适当的接头连接重链和轻链的Fv而获得的单链Fv (scFv)、一种或多种双抗体、线性抗体和由抗体片段形成的多特异性抗体。此外，在抗体片段中包括Fab'(其为通过在还原条件下处理F(ab')2而获得的抗体的可变区的单价片段)。
本发明的抗体可以是对至少两种类型的抗原具有特异性的多特异性抗体。通常，这种分子结合两种类型的抗原(即，双特异性抗体)。本发明的多特异性抗体包括对两种类型或更多种类型的抗原(例如，3种类型)具有特异性的抗体。
本发明的多特异性抗体可以是全长抗体或该抗体的片段(例如，F(ab')2双特异性抗体)。所述双特异性抗体可以通过如下产生：连接两种类型的抗体的重链和轻链(HL对)或将产生不同单克隆抗体的杂交瘤细胞融合以产生产生双特异性抗体的融合细胞(Millstein等人, Nature (1983) 305, p.537-539)。
本发明的抗体可以是单链抗体(也称为scFv)。通过将重链可变区和轻链可变区经由多肽接头连接来获得单链抗体(Pluckthun, The Pharmacology of MonoclonalAntibodies, 113 (由Rosenberg和Moore编辑, Springer Verlag, New York, p.269-315(1994), Nature Biotechnology (2005), 23, p.1126-1136)。或者，通过经由多肽接头连接两个scFv产生的BiscFv片段可以用作双特异性抗体。
用于产生单链抗体的方法是本领域中已知的(参见，例如，美国专利号4,946,778，美国专利号5,260,203，美国专利号5,091,513，美国专利号5,455,030)。在scFv中，重链可变区和轻链可变区经由将不形成缀合物的接头、优选多肽接头连接(Huston, J. S. 等人,Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (1988), 85, p.5879-5883)。scFv中的重链可变区和轻链可变区可以衍生自相同的抗体或不同的抗体。作为连接可变区的多肽接头，例如，使用由12至19个残基组成的单链肽。
编码scFv的DNA可以如下获得。在编码抗体的重链或重链可变区的DNA和编码轻链或轻链可变区的DNA中，选择编码氨基酸序列的全部或期望部分的DNA。使用选择为模板的DNA和定义其两个末端的引物对，实施PCR扩增。另外，使用编码多肽接头部分的DNA与限定两个末端以分别连接至重链和轻链的引物对的组合，实施扩增。
一旦产生编码scFv的DNA，就可以根据常规方法获得包含DNA的表达载体和用所述表达载体转化的宿主。而且，使用宿主，可以根据常规方法获得scFv。这些抗体片段可以以与上述相同的方式(即获得基因并通过使用宿主表达该基因)产生。
本发明的抗体可以被多聚化并且对抗原的亲和力增强。待多聚化的抗体可以是识别相同抗原的多个表位的单一类型或多种抗体。作为使抗体多聚化的方法，可以例举IgGCH3结构域和两个scFv的结合，与链霉抗生物素蛋白的结合以及螺旋-转角-螺旋基序的引入等。
本发明的抗体可以是多克隆抗体，其是氨基酸序列不同的多种类型的抗体的集合。作为多克隆抗体，例如，可以例举CDR不同的多种类型的抗体的集合。作为多克隆抗体，培养产生不同抗体的细胞的集合，并且可以使用从培养物纯化的抗体(参见WO2004/061104)。
为了修饰抗体，可以使用与各种分子、诸如聚乙二醇(PEG)结合的抗体。
本发明的抗体可以是其中抗体与另一种药物缀合的缀合物(免疫缀合物)。这种抗体的实例包括与放射性物质和具有药理学作用的化合物结合的抗体(NatureBiotechnology (2005) 23, p.1137-1146)。
4. 本发明的蛋白的用途
本发明的蛋白可以用于检测方法、诸如ELISA(酶联免疫吸附测定)方法、ECL(电化学发光)方法、RIA(放射免疫测定)方法、ELISPOT(酶联免疫斑点)方法、斑点印迹方法、octalony方法、CIE(对流免疫电泳)方法、CLIA(化学发光免疫测定)和FCM(流式细胞术)；和免疫组织化学(IHC)方法中，且优选用于ELISA方法、ECL方法和IHC方法中。
ELISA和ECL方法可以用作用于定量用本发明的抗体-药物缀合物施用的哺乳动物(本发明中的“哺乳动物”的实例包括但不限于人、小鼠、大鼠、猴和兔)中的抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法。
更具体地，包括以下步骤：(1)使血浆中含有的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的抗体-药物缀合物的抗原的板接触，以形成复合物，(2)使用标志物标记的本发明的蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物，且然后，(3)检测所述标志物。
此外，可以包括以下步骤：(1)使血浆中含有的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的本发明的蛋白的板接触，以形成复合物，(2)使能够识别所述抗体-药物缀合物的抗体部分并用标志物标记的第二蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物，且然后，(3)检测所述标志物。
ELISA和ECL方法也可以用作用于定量用本发明的抗体-药物缀合物施用的哺乳动物中的从所述药物-缀合物释放的药物(例如，化合物(1)、化合物(2)、化合物(4)和化合物(5))的血浆中的浓度的方法。
更具体地，包括以下步骤：(1)在用标志物标记的竞争性药物存在的情况下，使血浆中含有的从抗体-药物缀合物释放的药物与具有在其上固定的本发明的蛋白的板接触以形成复合物和(2)检测所述标志物。
IHC方法可以用作用于测定用本发明的抗体-药物缀合物施用的例如哺乳动物中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布的方法。
更具体地，包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物与本发明的蛋白接触以形成复合物，(2)使能够识别本发明的蛋白并用标志物标记的第二种蛋白与所述复合物接触以形成另外的复合物，且然后，(3)检测所述标志物。
而且，可以包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物与用标志物标记的本发明的蛋白接触以形成复合物，且然后，(2)检测所述标志物。
在本发明中，“标志物”是指生成可检测信号的物质或作用于另一种物质以生成可检测信号的物质。所述标志物的实例包括荧光物质、酶、酶片段、酶底物、酶抑制剂、辅酶、催化剂、染料、发光材料、敏化剂和放射性物质。
在本发明中，短语“用标志物标记”意指标记直接连接或用插入它们之间的部分结构(例如，接头)连接。标记中包括使用生物素和抗生物素蛋白(或链霉抗生物素蛋白)之间相互作用的连接。
为了用标志物标记本发明的蛋白，例如，使具有标志物作为组分的试剂(具有活性酯基)与本发明的蛋白的赖氨酸残基反应以形成酰胺键；然而，标记方法不限于此。
如果所述标志物是荧光物质，则可以通过感测标志物的荧光来检测标志物。
荧光物质的实例包括DyLight (注册商标) 350，DyLight (注册商标) 405，DyLight (注册商标) 488，DyLight (注册商标) 550，DyLight (注册商标) 594，DyLight(注册商标) 633，DyLight (注册商标) 650，DyLight (注册商标) 680，DyLight (注册商标) 747，DyLight (注册商标) 755，DyLight (注册商标) 800，Alexa Fluor (注册商标)350，Alexa Fluor (注册商标) 405，Alexa Fluor (注册商标) 488，Alexa Fluor (注册商标) 532，Alexa Fluor (注册商标) 546，Alexa Fluor (注册商标) 555，Alexa Fluor (注册商标) 568，Alexa Fluor (注册商标) 594，Alexa Fluor (注册商标) 647，Alexa Fluor(注册商标) 680，Alexa Fluor (注册商标) 750，BODIPY (注册商标) FL，香豆素，Cy (注册商标) 3，Cy (注册商标) 5，Cy (注册商标)，Fluorescein (FITC) Oregon Green (注册商标)，Pacific Blue，Pacific Green，Pacific Orange，四甲基罗丹明(TRITC)和TexasRed (注册商标)。
此外，可以使用纳米晶体、诸如Qdot (注册商标) 525，Qdot (注册商标) 565，Qdot (注册商标) 605，Qdot (注册商标) 655，Qdot (注册商标) 705和Qdot (注册商标)800和荧光蛋白、诸如别藻蓝蛋白(APC)，R-藻红蛋白(R-PE)，青色荧光蛋白(CFP)，绿色荧光蛋白(GFP)和红色荧光蛋白(RFP)作为荧光物质。
如果所述标志物是酶，则通过感测由酶和底物之间的反应产生的光或颜色来检测标志物。
作为酶，例如，可以例举过氧化物酶(例如，辣根过氧化物酶；HRP等)。在这种情况下，作为酶的底物，例如，可以例举TMB (3,3',5,5'-四甲基联苯胺)，DAB (3,3'-二氨基联苯胺四盐酸盐)，OPD(邻苯二胺)和ABTS (3 -乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)。
作为另一种酶，可以例举碱性磷酸酶。在这种情况下，作为酶的底物，例如，可以例举BCIP (5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸酯)和PNPP (ρ-硝基苯基磷酸酯)。
作为另一种酶，可以例举荧光素酶。在这种情况下，作为酶的底物，例如，可以例举荧光素和腔肠素(Coelenterazine)。
作为另一种酶，可以例举β-半乳糖苷酶。在这种情况下，作为酶的底物，例如，可以例举邻硝基苯基-β-D-吡喃半乳糖苷(ONPG)。
如果所述标志物是发光材料，则通过基于电化学反应感测来自所述标志物的发光来检测所述标志物。
作为发光材料，例如，可以例举钌络合物，优选钌-吡啶络合物，且更优选钌(II)三(联吡啶)络合物。
所述电化学反应可以在例如三丙胺(TPA)存在的情况下实施。更具体地，TPA阳离子自由基和三价钌络合物通过电极反应产生。TPA阳离子自由基立即损失氢离子为具有强还原作用的TPA自由基，其与三价钌络合物反应以发光。
如果所述标志物是放射性物质，则通过感测从所述标志物发出的辐射来检测所述标志物。
所述放射性物质的实例包括氚(3H)、碳-14 (14C)、氮-15 (15N)、硫-35 (35S)、钇-90 (90Y)、锝-99 (99Tc)、铟-111 (111In)、碘-125 (125I)和碘-131 (131I)。
本发明的蛋白可以用作通过添加pH缓冲剂、渗透压调节剂、盐、稳定剂、防腐剂、显影剂、敏化剂和抗凝剂等而形成的组合物(在下文中被称为“本发明的组合物”)的组分。
本发明的蛋白(或本发明的组合物)可以用作包含组合的用于测定的材料和试剂的试剂盒(在下文中被称为“本发明的试剂盒”)的组分。所述试剂可以以液体或冻干状态在相同容器或不同容器中提供，这取决于稳定性的程度。可以选择在本发明的试剂盒中提供的试剂的量和比率，使得可以为特定用途提供最佳的结果。除了本发明的蛋白(或本发明的组合物)以外，本发明的试剂盒还可以含有例如用于附接标志物的试剂，酶的底物，封闭剂，聚合物试剂，抗原活化溶液，校准物，稀释缓冲液，洗涤缓冲液，固定缓冲液，固定的抗体，检测抗体和微量滴定孔等。此外，可以含有用于使用本发明的试剂盒的说明书。使用该试剂盒，可以证实所述抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布，并且可以定量血浆-浓度等。
[实施例]
将通过以下所示的实施例的方式具体描述本发明。然而，本发明不限于这些。这些实施例不应被解释为以任何方式限制本发明。注意，除非另有指明，否则以下实施例中关于基因操作的各个操作根据"Molecular Cloning" (由Sambrook, J., Fritsch, E. F. 和Maniatis, T.撰写，由Cold Spring Harbor Laboratory Press在1989年出版)中描述的方法或根据市售试剂和试剂盒(如果采用它们的话)所附的说明书进行实施。在说明书中，未指定的试剂、溶剂和起始原料可以容易地从商业来源获得。
[实施例1] 化合物的合成
i) 8-[(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)氧基]-N-(4-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-4-氧代丁基)-8-氧代辛烷酰胺(化合物(6))的合成
[式26]
Figure 216798DEST_PATH_IMAGE028
向4-氨基-N-[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]丁酰胺(0.032 g, 0.050 mmoL) (国际公开号WO 2014/057687中描述的实施例1的步骤2中获得的化合物)的N,N-二甲基甲酰胺 (0.5 mL)溶液中添加三乙胺(7 μL, 0.050 mmoL)和辛二酸二(N-琥珀酰亚胺基)酯(20.4 mg, 0.055 mmoL)。将反应溶液在室温下搅拌20分钟。在减压下蒸发溶剂。获得的残余物通过硅胶柱色谱法[氯仿-氯仿:甲醇= 9 : 1 (v/v)]纯化，以获得作为浅黄色固体的标题化合物(16.0 mg, 41%)。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 0.87 (3H, t, J = 7.6 Hz), 1.18-1.37 (4H,m), 1.40-1.50 (2H, m), 1.54-1.64 (2H, m), 1.65-1.74 (2H, m), 1.78-1.93 (2H,m), 2.02 (2H, t, J = 7.6 Hz), 2.09-2.20 (4H, m), 2.40 (3H, s), 2.60-2.68 (2H,m), 2.80 (4H, s), 3.00-3.08 (2H, m), 3.13-3.21 (2H, m), 5.19 (2H, dd, J =32.0, 18.0 Hz), 5.37-5.47 (2H, m), 5.53-5.60 (1H, m), 6.52 (1H, s), 7.30 (1H,s), 7.74-7.82 (2H, m), 8.44 (1H, d, J = 8.5 Hz)。
MS (APCI) m/z: 774 (M+H)+
ii) 4-氨基-N-[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9,10-二羟基-4-甲基-13-氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]丁酰胺三氟乙酸盐(化合物(7))的合成
[式27]
Figure 951929DEST_PATH_IMAGE029
步骤1：
首先，将(4-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-4-氧代丁基)氨基甲酸叔丁酯(0.092 g, 0.148 mmoL) (国际公开号WO 2014/057687中描述的实施例1的步骤1中获得的化合物)溶解于甲醇(1.6 mL)中并在冰上冷却。向其中添加硼氢化钠(0.028 g, 0.740 mmoL)，并将反应溶液在冰冷却下搅拌20分钟。将所述溶液用甲醇(10 mL)和氯仿(50 mL)稀释，并向其中添加10%柠檬酸水溶液，且然后用氯仿萃取。将获得的有机层用10%柠檬酸水溶液洗涤，随后用饱和盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并过滤。在减压下蒸发溶剂。获得的残余物通过硅胶柱色谱法[氯仿:甲醇= 100 : 0 – 95 : 5 (v/v)]纯化，以获得作为浅黄色固体的(4-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-13-氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-4-氧代丁基)氨基甲酸叔丁酯(0.078 g, 85%)。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 0.89 (3H, t, J = 7.4 Hz), 1.31 (9H, s),1.62-1.73 (4H, m), 2.08-2.18 (4H, m), 2.39 (3H, s), 2.91 (2H, q, J = 6.5 Hz),3.12-3.20 (2H, m), 4.49 (1H, d, J = 17.2 Hz), 4.61 (1H, d, J = 17.2 Hz), 4.97(1H, s), 4.99 (1H, d, J = 4.7 Hz), 5.10 (2H, d, J = 18.8 Hz), 5.21 (2H, d, J= 18.8 Hz), 5.54-5.58 (1H, m), 6.74-6.82 (2H, m), 7.33 (1H, s), 7.78 (1H, d,J = 11.0 Hz), 8.40 (1H, d, J = 8.6 Hz)。
步骤2：
将以上步骤1中获得的化合物(0.078 g, 0.125 mmoL)添加至二氯甲烷(2 mL)中。将反应溶液在冰上冷却，并添加三氟乙酸盐(2mL)。将反应溶液搅拌40分钟。在减压下蒸发溶剂。获得的残余物通过硅胶柱色谱法[氯仿-具有氯仿:甲醇:水= 7 : 3 : 1 (v/v/v)的分配比的有机层]纯化。将获得的固体溶解于甲醇中，并添加乙醚。将所得沉淀物过滤并在真空下干燥以获得黄色-固体的标题化合物(0.045 g, 56%)。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 0.89 (3H, t, J = 7.4 Hz), 1.71 (2H, q, J= 7.4 Hz), 1.80-1.88 (2H, m), 2.09-2.19 (2H, m), 2.27 (2H, t, J = 7.0 Hz),2.40 (3H, s), 2.84 (2H, t, J = 7.6 Hz), 3.13-3.20 (2H, m), 4.50 (1H, d, J =17.2 Hz), 4.62 (1H, d, J = 17.2 Hz), 4.97-5.02 (2H, m), 5.09 (1H, d, J = 18.8Hz), 5.21 (1H, d, J = 18.8 Hz), 5.55-5.59 (1H, m), 6.79 (1H, d, J = 4.7 Hz),7.34 (1H, s), 7.64-7.75 (3H, m), 7.79 (1H, d, J = 11.3 Hz), 8.53 (1H, d, J =8.6 Hz)。
MS (APCI) m/z: 523 (M+H)+
iii) 4-氨基-N-环己基-丁酰胺盐酸盐(化合物(8))的合成
[式28]
Figure 424498DEST_PATH_IMAGE030
步骤1：
首先，将4-(叔丁氧基羰基氨基)丁酸(0.492 g, 2.42 mmoL)溶解于二氯甲烷(15mL)和N,N-二甲基甲酰胺(2 mL)中，且然后添加N-羟基琥珀酰亚胺(0.279 g, 2.42 mmoL)和EDCI (1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐) (0.464 g, 2.42 mmoL)。将反应溶液在室温下搅拌30分钟。将反应溶液逐滴添加至环己胺(0.200 g, 2.02 mmoL)的二氯甲烷溶液(2 mL)中，并在室温下搅拌20分钟。将反应溶液用二氯甲烷稀释，并添加10%柠檬酸水溶液，且然后用二氯甲烷萃取。将获得的有机层用饱和碳酸氢钠溶液洗涤，经硫酸钠干燥并过滤。在减压下蒸发溶剂。获得的残余物通过硅胶柱色谱法[己烷:乙酸乙酯= 50 : 50– 25 : 75 (v/v)]纯化，以获得作为无色油状物的N-[4-(环己基氨基)-4-氧代-丁基]氨基甲酸叔丁酯(0.308 g, 54%)。
1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ: 1.08-1.23 (4H, m), 1.29-1.42 (2H, m), 1.44(9H, s), 1.66-1.75 (2H, m), 1.77-1.83 (2H, m), 1.86-1.95 (2H, m), 2.17 (2H,t, J = 7.0 Hz), 3.11-3.21 (2H, m), 3.69-3.82 (1H, m), 4.75 (1H, brs), 5.89(1H, brs)。
步骤2：
将以上步骤1中获得的化合物(0.200 g, 0.703 mmoL)溶解于乙酸乙酯(50 mL)和二氧杂环己烷(10 mL)中。添加4N二氧杂环盐酸盐(10 mL)，并将混合物搅拌2小时。过滤生成的沉淀，在真空下干燥，以获得作为无色固体的标题化合物(0.098 g, 63%)。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 1.06-1.30 (5H, m), 1.50-1.58 (1H, m),1.62-1.82 (6H, m), 2.16 (2H, t, J = 7.2 Hz), 2.69-2.79 (2H, m), 3.45-3.58(1H, m), 4.73 (1H, brs), 7.89 (1H, d, J = 7.8 Hz), 7.96-8.10 (2H, m)。
MS (APCI) m/z: 185 (M+H)+
[实施例2]抗体-药物缀合物的产生
i)抗B7-H3抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO 2014/057687中所述的产生方法并使用抗B7-H3抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:27的氨基酸残基20至471组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:28的氨基酸残基21至233组成的氨基酸序列组成)，产生抗B7-H3抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗B7-H3抗体缀合(在本发明中被称为“B7-H3-ADC (I)”)：
[式29]
Figure 537948DEST_PATH_IMAGE031
其中A代表与所述抗体的连接位置。
ii)抗B7-H3抗体-药物缀合物的产生(2)
根据国际公开号WO 2014/057687中所述的产生方法并使用抗B7-H3抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:27的氨基酸残基20至471组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:28的氨基酸残基21至233组成的氨基酸序列组成)，产生抗B7-H3抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗B7-H3抗体缀合(在本发明中被称为“B7-H3-ADC (II)”)：
[式30]
Figure 463179DEST_PATH_IMAGE032
其中A代表与所述抗体的连接位置。
iii)抗B7-H3抗体-药物缀合物的产生(3)
根据国际公开号WO 2014/057687中所述的产生方法并使用抗B7-H3抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:27的氨基酸残基20至471组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:28的氨基酸残基21至233组成的氨基酸序列组成)，产生抗B7-H3抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗B7-H3抗体缀合(在本发明中被称为“B7-H3-ADC (III)”)：
[式31]
Figure 749804DEST_PATH_IMAGE033
其中A代表与所述抗体的连接位置。
iv)抗HER2抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO 2015/115091中所述的产生方法并使用抗HER2抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:21的氨基酸残基1至449组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:22的氨基酸残基1至214组成的氨基酸序列组成)，产生抗HER2抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗HER2抗体缀合(在本发明中被称为“HER2-ADC (I)”)：
[式32]
Figure 811300DEST_PATH_IMAGE034
其中A代表与所述抗体的连接位置。
v)抗HER3抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO 2015/155998中所述的产生方法并使用抗HER3抗体(包含由SEQ ID NO:23代表的氨基酸序列组成的重链和由SEQ ID NO:24代表的氨基酸序列组成的轻链的抗体)，产生抗HER3抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗HER3抗体缀合(在本发明中被称为“HER3-ADC (I)”)：
[式33]
Figure 95651DEST_PATH_IMAGE035
其中A代表与所述抗体的连接位置。
vi)抗TROP2抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO 2015/098099中所述的产生方法并使用抗TROP2抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:25的氨基酸残基20至470组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:26的氨基酸残基21至234组成的氨基酸序列组成)，产生抗HER3抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗TROP2抗体缀合(在本发明中被称为“TROP2-ADC (I)”)：
[式34]
Figure 321227DEST_PATH_IMAGE036
其中A代表与所述抗体的连接位置。
[实施例3] 单克隆抗体的产生
i)抗原蛋白的制备
作为抗原蛋白，使用通过将充当载体蛋白的牛甲状腺球蛋白添加至化合物(6)而制备的抗原蛋白(在下文中被称为“抗原蛋白(1)”)和通过将BSA添加至化合物(6)而制备的抗原蛋白(在下文中被称为“抗原蛋白(2)”)。
ii)免疫
在免疫中，使用BALB/cAnNCrlCrlj (BALB/c)小鼠(4个个体)和B6D2F1/Crlj(BDF1)雌性小鼠(4个个体)(Charles River Laboratories Japan Inc.)。在初级免疫时，皮下和皮内施用抗原蛋白(1)和弗氏完全佐剂(由Wako Pure Chemical Industries Ltd.制造)的混合物。第二次免疫以后，皮下和皮内施用抗原蛋白(1)和弗氏不完全佐剂(由WakoPure Chemical Industries Ltd.制造)的混合物。以7天的间隔实施施用，总共4次。
iii)评估抗血清的抗体滴度
在免疫之前和通过四次施用免疫后，将BALB/c小鼠(4个个体)和BDF1小鼠(4个个体)的血清各自稀释最多达200至204800倍。使用抗原蛋白(2)和B7-H3-ADC(II)作为阳性对照以及BSA作为阴性对照检查稀释液的抗体滴度。将抗原蛋白(2)、B7-H3-ADC (II)和BSA固定至ELISA免疫板。使免疫之前和通过四次施用免疫之后的稀释小鼠血清在37℃下与免疫板反应30分钟。洗涤后，使辣根过氧化物酶缀合的抗小鼠IgG (抗小鼠IgG-HRP)在37℃下反应30分钟。洗涤后，添加邻苯二胺二盐酸盐(OPD)溶液。显色终止后，测量490 nm处的吸光度。证实针对阳性对照的抗体滴度在所有个体中都增加。
iv)抑制ELISA
通过四次施用免疫后，向BALB/c小鼠(4个个体)和BDF1小鼠(4个个体)的血清中添加化合物(6)、化合物(7)和化合物(1)作为阳性对照以及化合物(8)作为阴性对照并计算抗原蛋白(2)的未吸收率。将稀释至50000倍的小鼠血清以及经制备以具有12.5、25、50和100μg/mL的浓度的化合物(6)、化合物(8)、化合物(7)和化合物(1)混合，并使其在4℃下反应过夜，且然后添加至具有在其上固定的抗原蛋白(2)的ELISA免疫板中，并使其在37℃下反应30分钟。洗涤后，使抗小鼠IgG-HRP在37℃下反应30分钟。洗涤后，添加OPD溶液。显色终止后，测量490 nm处的吸光度。根据以下表达式计算未吸收率：
未吸收率(%) = (a/b) × 100
a：添加浓度为12.5 μg/mL的阳性对照或阴性对照的吸光度
b：不含阳性对照的样品或不含阴性对照的样品的吸光度
在小鼠血清中的任一种中，发现作为阳性对照的化合物(6)和化合物(1)以及一些个体中的化合物(7)具有高抑制作用。然而，在所述血浆中均未发现对作为阴性对照的化合物(8)的高抑制作用。从具有表现出对化合物(7)的高抑制作用且对化合物(8)的无高抑制作用的血清的BALB/c小鼠和BDF1小鼠各自中，选择个体。淋巴结和脾脏取自每个个体，并用于产生杂交瘤。
v)杂交瘤的产生
通过PEG方法将取自iv)中选择的个体的淋巴结细胞和脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞融合。使用出现的杂交瘤细胞的培养上清液，筛选产生抗体的杂交瘤细胞。
vi)评估与抗原蛋白的特异性结合(2)
将抗原蛋白(2)固定至ELISA免疫板，并将培养的产生抗体的杂交瘤细胞的上清液稀释两倍，并在37℃下反应120分钟。洗涤后，使抗小鼠IgG-HRP在37℃下反应30分钟。洗涤后，添加OPD溶液。显色终止后，测量490 nm处的吸光度。选择产生显示0.2或以上的OD值的培养上清液的11种杂交瘤株系作为阳性。
vii)交叉检查
使用化合物(6)、化合物(1)、B7-H3-ADC (II)、B7-H3-ADC (I)和B7-H3-ADC (III)作为阳性对照以及化合物(8)和化合物(7)作为用于证实反应是否进行的化合物，将vi)中选择为阳性的11种株系进行抑制ELISA。将选择为阳性并在vi)中获得的11种株系的培养上清液稀释两倍。向每种培养上清液中添加如上所提及的阳性对照和用于证实反应是否进行的化合物，以便获得25μg/m的最终浓度。在4℃下实施反应过夜后，将反应溶液添加至具有在其上固定的抗原蛋白(2)的ELISA免疫板中，并使其在37℃下反应30分钟。洗涤后，使抗小鼠IgG-HRP在37℃下反应30分钟。洗涤后，添加OPD溶液。显色终止后，测量490 nm处的吸光度。选择表现出对抗原蛋白(2)的高反应性并被证实阳性对照具有抑制作用的八种株系并进行初级克隆。
viii)初级克隆、初级筛选
通过有限稀释克隆在vii)中选择的八种株系。接种杂交瘤以满足60个细胞/96孔板的比率，并添加小鼠胸腺细胞以满足5 × 106个细胞/孔的比率。使用含有TIL (Immuno-Biological Laboratories Co., Ltd.)的10% FBS实施培养。抑制ELISA以与vii)中相同的方式实施。选择八种株系 × 6个亚克隆，其被证实具有特异性。
ix)初级交叉检查
检查在viii)中选择的8种株系 × 6个亚克隆对B7-H3-ADC (II)和B7-H3-ADC(I)的反应性。将B7-H3 C1结构域LotB7_OmJ1用固定缓冲液稀释至1 µg/mL，以100 µL/板的比率添加至Maxi-Sorp板中，并使其在4℃下固定过夜。第二天，从板移取培养基，并以180 µL/板的比率添加含有5% BSA的PBS。使板在室温下静置3小时。用含有0.05% Tween20的PBS洗涤两次后，以100μL的比率添加经制备以具有0.1 μg/mL的浓度的B7-H3-ADC (II)和B7-H3-ADC (I)并使其在室温下静置约一小时。用含有0.05%Tween20的PBS洗涤两次后，每板添加50 μL从900 μg/mL以3的共同比率连续稀释7次的杂交瘤上清液。使板在室温下静置一小时。用含有0.05% Tween20的PBS洗涤两次后，每板添加100 µL稀释5000倍的过氧化酶AffiniPure山羊抗小鼠IgG, Fcγ片段特异性(Jackson Immuno Research LABORATORIES,INC.)。使板在室温下静置一小时。用含有0.05% Tween20的PBS洗涤3次后，每板添加100 μLHRP底物(OPD片剂)并实施显色反应。通过每板添加100 µL 1M HCl终止显色反应后，通过ARVO (PerkinElmer)测量450 nm处的吸光度。在所有8种株系 × 6个亚克隆中，证实对B7-H3-ADC (II)和B7-H3-ADC (I)的反应性。其中，高度反应性的4种株系 × 6个亚克隆通过初级校准曲线进行证实。
x)通过初级校准曲线进行证实
通过ELISA检查在ix)中选择的4种株系 × 6个亚克隆对B7-H3-ADC (I) (DAR7)和B7-H3-ADC (I) (DAR5)的反应性。将AffiniPure山羊抗小鼠IgG, Fcγ片段特异性(Jackson Immuno Research Inc.)用包被缓冲液稀释至1 μg/mL，并以100 μL/板的比率添加至Maxi-Sorp板，且然后，使其在4℃下固定过夜。第二天，从板移取培养基。用PBS洗涤后，以100 μL/板的比率添加含有10% BSA的PBS。使板在37℃下静置2.5小时。从板移取培养基，将杂交瘤4种株系 × 6个亚克隆用含有2% BSA和0.2%聚山梨醇酯20(在下文中被称为“PS20”)的PBS稀释至最高达10、25和100 ng/mL。将每种稀释液以100 µL/板的比率添加至板中。使板在37℃下静置一小时。用含有0.05% PS20的PBS洗涤四次后，将B7-H3-ADC (I)(DAR7)和B7-H3-ADC (I) (DAR5)用含有2% BSA、0.2% Tween20的PBS稀释至1、2.5、10、25、100和250 ng/mL。以100 µL/板的比率添加每种稀释液。使板在37℃下静置一小时。用含有0.05% PS20的PBS洗涤四次后，以100 µL/板的比率添加用含有2% BSA、0.2% PS20的PBS稀释至7500倍的山羊抗人κ-HRP (Southern Biotechnology Associates，Inc.)。使板在室温下静置一小时。用含有0.05% PS20的PBS洗涤四次后，以100 µL/孔的比率添加TMB可溶性试剂(ScyTek Laboratories)，并实施显色反应。在通过以100 µL/孔的比率添加TMB终止缓冲液(ScyTek Laboratories)终止显色反应后，通过VersaMax (由Molecular Devices制造)测量450 nm处的吸光度(参考650 nm)。根据以下表达式计算相对误差，并选择具有较小值的克隆
相对误差(%)= {(测量值DAR7)/(DAR5的测量值)-1} × 100
其中，对4种株系 × 2个亚克隆进行次级克隆。
xi)次级克隆，筛选
对x)中选择的4种株系 × 2个亚克隆进行次级克隆。每个克隆从阳性孔选择三个孔。以该方式，选择总共24个克隆。以与vi)中相同的方式检查针对抗原蛋白(2)的抗体滴度。此外，使用化合物(6)、化合物(1)、B7-H3-ADC (II)，B7-H3-ADC (I)和B7-H3-ADC (III)作为阳性对照以及化合物(8)和化合物(7)作为用于证实反应是否进行的化合物，以与vii)中相同的方式实施抑制ELISA。
xii)通过次级校准曲线进行证实
在xi)中选择的24个克隆中，消除与化合物(1)相比表现出对化合物(7)的特别高的反应性的6个克隆。剩余18个克隆经证实对HER2-ADC (I) (DAR8)、HER2-ADC (I) (DAR4)和HER2-ADC (I) (DAR2)的反应性以及通过Gyrolab xP工作站(GYROS PROTEINTechnologies)实施的校准曲线的形成。作为捕获试剂，使用生物素-SP-缀合的AffiniPure山羊抗小鼠IgG, Fcγ特异性(Jackson Immuno Research LABORATORIES, INC.)，并用含有0.01% PS20的PBS将其浓度控制为172.5 nM。将细胞培养上清液的浓度用Rexxip CCS(GYROS PROTEIN Technologies)控制为200 ng/mL。将HER2-ADC (I) (DAR8)、HER2-ADC(I) (DAR4)和HER2-ADC (I) (DAR2)用含有0.01% PS20的PBS从1000 ng/mL以4的共同比率连续稀释6倍。作为检测试剂，使用Alexa Fluor (注册商标) 647标记试剂盒(ThermoFisher Scientific Inc.)标记山羊抗人κ (Southern Biotechnology Associates，Inc.)，并将其浓度用Rexxip F控制为10 nM。将以上制备的试剂、细胞培养上清液和用于校准曲线的样品添加于96-孔PCR板中，并与Gyrolab Bioaffy 200一起设置在Gyrolab xP工作站中。通过4-步(2xC)-A-D (向导方法)实施测量。使用Gyrolab Evaluator软件，根据4-参数逻辑模型(权重：响应)实施校准曲线的回归。评估的所有18个克隆都与HER2-ADC (I)的DAR无关，并且未发现株系之间的反应性的差异。因此，选择源自同一株系并且具有高IgG浓度的三个克隆(1A3、8B2、11B1)，并进行小量生产。
xiii)制备用蛋白A纯化的抗体并进行交叉检查
将xii)中选择的三个克隆(1A3、8B2、11B1)各自在滚瓶中的无血清培养基(ASF104(N))中培养。收集培养上清液后，实施通过0.45 μm过滤器的过滤和通过蛋白A柱的纯化。向具有以50 ng/孔/50μL的比率固定的抗原蛋白(2)的ELISA免疫板中，添加含有用蛋白A纯化的三个克隆并从5 μg/mL以2的共同比率连续稀释10倍的溶液(50μL)，并使其在37℃下反应30分钟。洗涤后，使抗小鼠IgG-HRP在37℃下反应30分钟。洗涤后，添加OPD溶液。显色终止后，测量490 nm处的吸光度。所有用蛋白A纯化的抗体都显示令人满意的对抗原蛋白(2)的反应性。
xiv)证实用蛋白A纯化的抗体的校准曲线
通过使用Gyrolab xP工作站检查xiii)中用蛋白A纯化的三个克隆(1A3、8B2、11B1)对HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)和B7-H3-ADC (I) (DAR8)和B7-H3-ADC (I) (DAR4)的反应性。
作为捕获试剂，使用用蛋白A纯化并用EZ-Link NHS-LC-生物素(Thermo FisherScientific Inc.)标记的三个克隆，并将其浓度用含有0.01% PS20的PBS控制为700 nM。将HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)各自用Rexxip HN从1000 ng/mL以4的共同比率连续稀释6倍。作为本文使用的检测试剂，使用通过使用Alexa Fluor (注册商标) 647标记试剂盒标记的山羊抗人κ (Southern Biotechnology Associates, Inc.)，并将其浓度用Rexxip F控制为10 nM。将制备的试剂和抗体-药物缀合物(用于校准曲线的样品)添加于96-孔PCR板中，并与Gyrolab Bioaffy 200一起设置在Gyrolab xP工作站中。通过200-3W-001-A (向导方法)实施测量。使用4-参数逻辑模型(权重：响应)和Gyrolab Evaluator软件实施校准曲线的回归。克隆1A3的校准曲线显示于图15中，克隆8B2的校准曲线显示于图16中，且克隆11B1的校准曲线显示于图17中。所有克隆都显示对HER2-ADC (I)的反应性，而与DAR无关。
此外，作为捕获试剂，使用用EZ-Link NHS-LC-生物素标记的人Her2/ErbB2蛋白(ACROBiosystems)和也用生物素标记的B7-H3 C1结构域。将它们的浓度用含有0.01% PS20的PBS控制为700 nM。将HER2-ADC (I) (DAR8)和HER2-ADC (I) (DAR4)和B7-H3-ADC (I)(DAR8)和B7-H3-ADC (I) (DAR4)用Rexxip HN从1000 ng/mL以4的共同比率连续稀释6倍。作为检测试剂，使用用蛋白A纯化并使用DyLight650 (注册商标)标记试剂盒(ThermoFisher Scientific Inc.)标记的三个克隆(1A3、8B2、11B1)。将它们的浓度用Rexxip F控制为10 nM。将制备的试剂和用于抗体-药物缀合物的校准曲线的样品添加于96-孔PCR板中，将其与Gyrolab Bioaffy 200一起设置在Gyrolab xP工作站中。通过200-3W-001-A (向导方法)实施测量。根据4-参数逻辑模型(加权；响应)通过Gyrolab Evaluator软件实施校准曲线的回归。关于对HER2-ADC (I)的反应性，克隆1A3的校准曲线显示于图18中，克隆18B2的校准曲线显示于图19中，且克隆11B1的校准曲线显示于图20中。关于对B7-H3-ADC(I)的反应性，克隆1A3的校准曲线显示于图21中，克隆8B2的校准曲线显示于图22中，且克隆11B1的校准曲线显示于图23中。所有克隆都显示对HER2-ADC (I)和B7-H3-ADC (I)的反应性，而与DAR无关。
从所述结果证实，所有克隆都具有对抗体-药物缀合物的反应性，而与DAR和抗体部分的差异无关，并且可用作捕获试剂和检测试剂两者。在克隆中，选择表现出最大信号值的克隆1A3，并意欲用于检测根据本发明的抗体-药物缀合物。
xv)小鼠单克隆抗体的同种型的确定
通过小鼠单克隆同种型分析测试试剂盒(由AbD Serotec制造)来确定xiv)中获得的克隆1A3的小鼠单克隆抗体(在下文中被称为“小鼠抗体1A3”)的同种型。作为结果，证实同种型为IgG2b, κ链。
xvi)单克隆抗体的基因克隆和N末端氨基酸的测序分析
使用TRIzol试剂(LIFE TECHNOLOGIES)从产生小鼠抗体1A3的杂交瘤制备总RNA。对纯化的小鼠抗体1A3的N末端氨基酸实施测序分析(Edman测序)。此外，通过抗体基因克隆分析克隆1A3的核苷酸序列。作为抗体基因克隆的结果，获得重链可变区的单一序列和轻链可变区的单一序列。作为分析的结果，证实纯化的小鼠抗体1A3的N末端氨基酸序列与通过抗体基因克隆获得的克隆1A3的核苷酸序列的N末端氨基酸序列匹配。
小鼠抗体1A3的重链的氨基酸序列由SEQ ID NO:15代表。由SEQ ID NO:15的氨基酸残基1至19组成的氨基酸序列代表信号序列；由其氨基酸残基20至141组成的氨基酸序列代表重链可变区；且由其氨基酸残基142至477组成的氨基酸序列代表重链恒定区。
小鼠抗体1A3的轻链的氨基酸序列由SEQ ID NO:16代表。由SEQ ID NO:16的氨基酸残基1至20组成的氨基酸序列代表信号序列；由其氨基酸残基21至127组成的氨基酸序列代表轻链可变区；且由其氨基酸残基128至234组成的氨基酸序列代表轻链恒定区。
编码小鼠抗体1A3的重链的氨基酸序列的核苷酸序列由SEQ ID NO:17代表。由SEQID NO:17的核苷酸残基1至57组成的核苷酸序列代表信号序列；且由其核苷酸残基58至423组成的核苷酸序列编码重链可变区的氨基酸序列。
编码小鼠抗体1A3的轻链的氨基酸序列的核苷酸序列由SEQ ID NO:18代表。由SEQID NO:18的核苷酸残基1至60组成的核苷酸序列代表信号序列；且其核苷酸61至459的核苷酸序列编码重链可变区的氨基酸序列。
此外，分析了CDR。
根据Abm的定义，发现小鼠抗体1A3的重链可变区具有由SEQ ID NO:1代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDYGMV)，由SEQ ID NO:2代表的氨基酸序列组成的CDRH2(YISSGSSAIY)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3 (PPRYDVYSAWFAY)；且小鼠抗体1A3的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1(KASQDVGSAVV)，由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ IDNO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Chothia的定义，发现小鼠抗体1A3的重链可变区具有由SEQ ID NO:7代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDY)，由SEQ ID NO:8代表的氨基酸序列组成的CDRH2(SSGSSA)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3 (PPRYDVYSAWFAY)；且小鼠抗体1A3的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (KASQDVGSAVV)，由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Kabat的定义，发现小鼠抗体1A3的重链可变区具有由SEQ ID NO:9代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (DYGMV)，由SEQ ID NO:10代表的氨基酸序列组成的CDRH2(YISSGSSAIYYADTVKG)，和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3(PPRYDVYSAWFAY)；且小鼠抗体1A3的轻链可变区具有由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (KASQDVGSAVV)，由SEQ ID NO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2 (WASTRHT)，和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
根据Imgt (注册商标)的定义，发现小鼠抗体1A3的重链可变区具有由SEQ ID NO:11代表的氨基酸序列组成的CDRH1 (GFTFSDYG)，由SEQ ID NO:12代表的氨基酸序列组成的CDRH2 (ISSGSSAI)，和由SEQ ID NO:13代表的氨基酸序列组成的CDRH3(ARPPRYDVYSAWFAY)；且小鼠抗体1A3的轻链可变区具有由SEQ ID NO:14代表的氨基酸序列组成的CDRL1 (QDVGSA)，由WAS(色氨酸-丙氨酸-丝氨酸)代表的三肽组成的CDRL2，和由SEQID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3 (QQYSSYPVT)。
[实施例4]非临床研究中的血浆浓度的测量
使用实施例2中获得的小鼠抗体1A3，开发用于测量小鼠中的HER2-ADC (I)的血浆中的浓度的方法和用于测量猴中的HER3-ADC (I)、TROP2-ADC (I)和B7-H3-ADC (I)的血浆中的浓度的方法。可以通过用充当检测试剂的DyLight650(注册商标)或Alexa Fluor(注册商标) 647标记小鼠抗体1A3来使用它。即使选择其中之一，也可以测量根据本发明的抗体-药物缀合物的血浆浓度。此外，可以制备校准曲线，其与DAR和抗体部分的差异无关，并且可以将其用于测量根据本发明的抗体-药物缀合物的血浆中的浓度。
i) HER2-ADC (I)
用于测量小鼠中的HER2-ADC (I)的血浆中的浓度的方法由Gyrolab xP工作站开发。作为捕获试剂，生物素化的小鼠抗(抗HER2 Ab)独特型Ab(本文中，“(抗HER2 Ab)”)是指包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:21的氨基酸残基1至449组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:22的氨基酸残基1至214组成的氨基酸序列组成) (13C1)(IBL)。用含有0.1% PS20的PBS将其浓度控制为350 nM。通过用以Rexxip HN稀释100倍的小鼠血浆将HER2-ADC (I)的浓度控制为0、0.150、0.200、0.600、1.60、4.00、16.0、40.0、100和140 μg/mL来制备用于校准曲线的样品。使用通过DyLight650(注册商标)标记试剂盒标记的小鼠抗体1A3作为检测试剂，并用Rexxip F将其浓度控制为10 nM。将这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并在Gyrolab xP工作站中与Gyrolab Bioaffy 200一起设置。使用200-3W-002-A (PMT1)作为测量向导。使用Gyrolab Evaluator 3.3.9.175根据5-参数逻辑模型实施回归分析。校准曲线显示于图24中。
用于测量小鼠中的总抗体(抗HER2抗体和HER2-ADC(I))的血浆中的浓度的方法由Gyrolab xP工作站开发。使用生物素化的小鼠抗(抗HER2 Ab)独特型Ab (13C1) (IBL)作为捕获试剂，并用含有0.1% PS20的PBS将其浓度控制为350 nM。通过用以Rexxip HN稀释100倍的小鼠血浆将HER2-ADC (I)的浓度控制为0、0.150、0.200、0.600、1.60、4.00、16.0、40.0、100和140 μg/mL来制备用于校准曲线的样品。使用Alexa Fluor (注册商标) 647抗人IgG, Fcγ抗体(Jakckson Immno Research Laboratories, Inc.)作为检测试剂，并用Rexxip F将其浓度控制为10 nM。将制备的这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并在Gyrolab xP工作站中与Gyrolab Bioaffy 200一起设置。使用200-3W-002-A(PMT1)作为测量向导。使用Gyrolab Evaluator 3.3.9.175根据5-参数逻辑模型实施回归分析。
浓度的测量结果显示于表1中。
[表1]
Figure 349226DEST_PATH_IMAGE037
ii) HER3-ADC (I)
用于测量猴中的HER3-ADC (I)的血浆中的浓度的方法由Gyrolab xP工作站开发。获得验证。使用用EZ-Link 磺基-NHS-LC-生物素 (Thermo Fisher Scientific Inc.)标记的HER3 (重组人ErbB-3/HER3蛋白, ACRO biosystems)作为捕获试剂，并用含有0.1% PS20的PBS将其浓度控制为700 nM。用于校准曲线的样品通过如下制备：用猴血浆将HER3-ADC(I)的浓度控制为0、0.0750、0.100、0.250、0.750、2.25、6.75、20.0、38.0和48.0 μg/mL，并用含有聚山梨醇酯20的PBS和Rexxip AN (GYROS PROTEIN Technologies)将其进一步稀释100倍。使用用Alexa Fluor (注册商标)647标记试剂盒标记的小鼠抗体1A3作为检测试剂，并用Rexxip F将其浓度控制为10 nM。将制备的这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并设置在Gyrolab xP工作站中。使用200-3W-002-A (PMT5)作为测量向导。使用Gyrolab Evaluator 3.3.7.171根据4-参数逻辑模型(权重：响应)实施回归分析。校准曲线显示于图25中。
iii) TROP2-ADC (I)
用于测量猴中的TROP2-ADC (I)的血浆中的浓度的方法由Gyrolab xP工作站开发。获得验证。使用用EZ-Link 磺基-NHS-LC-生物素标记的新的hTrop2 (批号V35,Daiichi Sankyo co., ltd.)作为捕获试剂，并用含有0.1% PS20的PBS将其浓度控制为350nM。使用的用于校准曲线的样品是通过用猴血浆将TROP2-ADC (I)的浓度控制为0、0.00750、0.0100、0.0250、0.0750、0.250、0.750、2.50、7.50和10.0 μg/mL来制备的那些，并用Rexxip HN (GYROS PROTEIN Technologies)将样品进一步稀释10倍。使用用AlexaFluor (注册商标)647标记试剂盒标记的小鼠抗体1A3作为检测试剂，并用Rexxip F将其浓度控制为10 nM。将这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并设置在Gyrolab xP工作站中。使用200-3W-002-A (PMT1)作为测量向导。使用Gyrolab Evaluator3.3.7.171根据4-参数逻辑模型(权重：响应)实施回归分析。校准曲线显示于图26中。
iv) B7-H3-ADC (I)
用于测量猴中的B7-H3-ADC (I)的血浆测量中的浓度的方法由Gyrolab xP工作站开发。获得验证。使用用EZ-Link 磺基-NHS-LC-生物素 (Thermo Fisher ScientificInc.)标记的B7-H3 C1结构域(批号B7_OmJ1, Daiichi Sankyo co., ltd.)作为捕获试剂，并用含有0.1% PS20的PBS将其浓度控制为700 nM。用于校准曲线的样品通过如下制备：用小鼠血浆将B7-H3-ADC (I)的浓度控制为0、0.0750、0.100、0.250、0.750、2.25、6.75、20.0、38.0和48.0 μg/mL，并用含有聚山梨醇酯20的PBS和Rexxip HN (GYROS PROTEINTechnologies)将其进一步稀释50倍。使用用Alexa Fluor (注册商标)647标记试剂盒标记的小鼠抗体1A3作为检测试剂，并用Rexxip F将其浓度控制为10 nM。将这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并设置在Gyrolab xP工作站中。使用200-3W-001-A(PMT5)作为测量向导。使用Gyrolab Evaluator 3.3.7.171根据4-参数逻辑模型(权重：响应)实施回归分析。校准曲线显示于图27中。
[实施例5]使用小鼠抗体1A3的免疫染色
i)使用皮下移植的人来源的肿瘤证实可染色性
向高度免疫缺陷的小鼠(NOG小鼠)中皮下移植人来源的肿瘤。在施用根据本发明的抗体-药物缀合物之后，取出肿瘤组织以制备石蜡包埋的样本。然后，检查小鼠抗体1A3的可染色性。肿瘤组织取自未施用根据本发明的抗体-药物缀合物的NOG小鼠，并用作阴性对照。使用Autostainer Link预处理系统(PT Link，由DAKO制造)和抗原修复溶液(TargetRetrieval Solution Low pH，由DAKO制造)实施脱蜡和抗原活化。使用自动染色装置(DakoAutostainer Link 48：由DAKO制造)实施以下染色操作。用EnVision FLEX WASH BUFFER(由DAKO制造)洗涤后，添加Peroxidase Block 3% H2O2 (由DAKO制造)；实施孵育；并用EnVision FLEX WASH BUFFER实施洗涤。添加无血清的Protein Block (由DAKO制造)；实施孵育；并通过吹气除去液体。小鼠抗体1A3用REAL Antibody Diluent (由DAKO制造)稀释并反应。用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤后，添加EnVision + System-HRP LabelledPolymer Anti-Mouse #K4000 (由DAKO制造)；实施孵育；且然后实施用EnVision FLEXWASH BUFFER洗涤。
添加DAKO Liquid DAB + Substrate Chromogen System并实施孵育；且实施用EnVision FLEX WASH BUFFER进行洗涤。添加EnVision FLEX Hematoxylin并实施孵育；并实施用EnVision FLEX WASH BUFFER和离子交换水洗涤。
证实用根据本发明的抗体-药物缀合物施用的NOG小鼠可以用小鼠抗体1A3令人满意地染色，并且染色强度随着小鼠抗体1A3的浓度增加而增加。另外，证实未用根据本发明的抗体-药物缀合物施用的NOG小鼠没有用小鼠抗体1A3染色。注意，由于NOG小鼠在B细胞中有缺陷，已知背景没有用小鼠来源的内源性IgG染色(Ito M, 等人 Blood 100 (9): 3175-3182, 2002)。
ii)小鼠抗体1A3的特异性的证实
将小鼠抗体1A3与化合物(2)或SN-38混合后，将混合物用于免疫染色。基于分子量，抗体1A3:化合物(2):SN-38的混合比被定义为0.1:0.04:0.03。以与i)中相同的方式实施染色。
证实通过将其与化合物(2)混合，小鼠抗体1A3的可染色性消失。还证实通过将其与SN-38混合，小鼠抗体1A3的可染色性不会消失。
[实施例6]兔嵌合抗体的制备
i)设计源自小鼠抗体1A3的兔嵌合抗体
如下设计源自小鼠抗体1A3的兔嵌合抗体(在下文中被称为“兔嵌合抗体1A3”)。通过将兔的重链恒定区IGHG*02和轻链恒定区IGKC2*01连接至克隆1A3的两条链的相应可变区，参照IMGT(注册商标)设计兔嵌合抗体的序列。
兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列由SEQ ID NO:19代表。由SEQ ID NO:19的氨基酸残基1至19组成的氨基酸序列代表信号序列；由其氨基酸残基20至141组成的氨基酸序列代表重链可变区，且其氨基酸残基142至464的氨基酸序列代表重链恒定区。
兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列由SEQ ID NO:20代表。由SEQ ID NO:20的氨基酸残基1至20组成的氨基酸序列代表信号序列；由其氨基酸残基21至127组成的氨基酸序列代表轻链可变区；且由其氨基酸残基128至233组成的氨基酸序列代表轻链恒定区。
ii)抗体表达载体pCMA-LK的构建
通过使用In-Fusion Advantage PCR克隆试剂盒(CLONTECH)，将通过用限制性酶XbaI和PmeI消化质粒pcDNA3.3-TOPO/LacZ (Invitrogen)而获得的片段(约5.4 kb)连接至具有编码人轻链信号序列和人κ链恒定区的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQ ID NO:29)的DNA片段，以获得pcDNA3.3/LK。
通过从pcDNA3.3/LK除去新霉素表达单位来构建pCMA-LK。
iii)兔嵌合抗体1A3重链表达载体的构建
合成具有编码兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列(SEQ ID NO:19)的核苷酸序列(SEQ ID NO:30)的DNA片段(GENEART)。SEQ ID NO:30的核苷酸残基26至82的核苷酸序列代表信号序列；核苷酸残基83至448的核苷酸序列编码重链可变区的氨基酸序列；且核苷酸残基449至1417的核苷酸序列编码恒定区的氨基酸序列。
将通过使用In-Fusion HD PCR克隆试剂盒(CLONTECH)合成的DNA片段连接至DNA片段(其通过用XbaI和PmeI消化pCMA-LK并除去编码轻链信号序列和人κ链恒定区的氨基酸序列的核苷酸序列(SEQ ID NO:29)而制备)，以构建兔嵌合抗体1A3重链表达载体。
iv)兔嵌合抗体1A3轻链表达载体的构建
合成具有编码兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列(SEQ ID NO:20)的核苷酸序列(SEQ ID NO:31)的DNA片段(GENEART)。SEQ ID NO:31的核苷酸残基26至85的核苷酸序列代表信号序列；核苷酸残基86至406的核苷酸序列编码轻链可变区的氨基酸序列；且核苷酸残基407至724的核苷酸序列编码恒定区的氨基酸序列。以与iii)中相同的方式构建兔嵌合抗体1A3轻链表达载体。
v)兔嵌合抗体1A3的产生
根据手册将FreeStyle 293F细胞(Invitrogen)继代培养。将对数生长期期间的FreeStyle 293F细胞(Invitrogen)(2.4 × 109)接种于Optimum Growth 5L Flask(Thomson)中，用FreeStyle293表达培养基(Invitrogen)稀释以制备1.88 × 106个细胞/mL。向Opti-Pro SFM培养基(Invitrogen)(40 mL)中，添加0.48 mg兔嵌合抗体1A3重链表达载体、0.72 mg兔嵌合抗体1A3轻链表达载体和3.6 mg聚乙烯亚胺(Polyscience #24765)。将混合物轻轻搅拌，再使其静置5分钟，且然后添加至FreeStyle 293F细胞中。将混合物在8% CO2培养箱中在37℃下孵育4小时，同时以90 rpm的速率摇动。此后，添加1200 mL的EX-CELL VPRO培养基(SAFC Biosciences)、18 mL的GlutaMAX I (GIBCO)和60 mL的Yeastolate Ultrafiltrate (GIBCO)。将混合物在8% CO2培养箱中在37℃下培养7天，同时以90 rpm的速率摇动。通过一次性胶囊滤器(Advantec #CCS-045-E1H)过滤所得的培养上清液，以获得含有兔嵌合抗体1A3的培养上清液。
vi)兔嵌合抗体1A3的纯化
v)中获得的培养物上清液通过rProtein A亲和色谱的单一步骤进行纯化。将培养上清液施加至用以PBS平衡的MabSelectSuRe装入的柱(由GE Healthcare Bioscience制造)，且然后用PBS(体积为柱子体积的两倍或更多倍)洗涤。随后，用2M精氨酸盐酸盐溶液(pH4.0)进行洗脱，并收集含有抗体的级分。透析收集的级分(Slide-A-Lyzer DialysisCassette，公司：Thermo Scientific)以进行PBS缓冲液置换。通过Centrifugal UF FilterDevice VIVASPIN20 (截止分子量UF10K，公司：Sartorius)浓缩抗体，并将IgG的浓度控制为2 mg/mL或以上。最后，通过Minisart-Plus过滤器(Sartorius)进行过滤以获得纯化的兔嵌合抗体1A3的样品。
[实施例7]抗体-药物缀合物的产生
i)抗GPR20抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO 2018/135501中所述的产生方法并使用抗GPR20抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:32的氨基酸残基20至472组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:33的氨基酸残基21至234组成的氨基酸序列组成)，产生抗GPR20抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗GPR20抗体缀合(在本发明中被称为“GPR20-ADC (I)”)：
[式35]
Figure 530809DEST_PATH_IMAGE038
其中A代表与所述抗体的连接位置。
.
ii)抗CDH6抗体-药物缀合物的产生(1)
根据国际公开号WO2018/212136中所述的产生方法并使用抗CDH6抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:34的氨基酸残基20至471组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:35的氨基酸残基21至233组成的氨基酸序列组成)，产生抗CDH6抗体-药物缀合物，其中由下式代表的药物-接头经由硫醚键与抗CDH6抗体缀合(在本发明中被称为“CDH6-ADC (I)”)：
[式36]
Figure 720482DEST_PATH_IMAGE039
其中A代表与所述抗体的连接位置。
[实施例8]使用兔嵌合抗体1A3的免疫染色
i)施用TROP2-ADC (I)后使用皮下移植的人来源的肿瘤证实可染色性
向免疫缺陷小鼠(裸小鼠)皮下移植人头颈癌细胞系FaDu。施用TROP2-ADC (I)后，取出肿瘤组织以制备石蜡包埋的样本。然后，检查兔嵌合抗体1A3的可染色性。肿瘤组织取自向其施用抗TROP2抗体(包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ ID NO:25的氨基酸残基20至470的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:26的氨基酸残基21至234的氨基酸序列组成，在下文中被称为"Anti-TROP2 Ab")的裸小鼠，并用作阴性对照。脱蜡和抗原活化使用Autostainer Link预处理系统(PT Link，由DAKO制造)和抗原修复溶液(TargetRetrieval Solution Low pH，由DAKO制造)在97℃下实施40分钟。以下染色操作使用自动染色装置(Dako Autostainer Link 48：由DAKO制造)在室温下实施。用EnVision FLEXWASH BUFFER (由DAKO制造)洗涤一次后，添加REAL Peroxidase-Blocking Solution (由DAKO制造)；实施孵育5分钟；并用EnVision FLEX WASH BUFFER实施洗涤一次。添加无血清的Protein Block (由DAKO制造)；实施孵育30分钟，并通过吹气除去液体。将兔嵌合抗体1A3用REAL Antibody Diluent (由DAKO制造)稀释至0.1 μg/mL，并进行反应30分钟。用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤3次后，添加EnVision+ System-HRP Labelled PolymerAnti-Rabbit (由DAKO制造)；实施孵育30分钟；且然后，实施用EnVision FLEX WASHBUFFER洗涤两次。
添加DAKO Liquid DAB + Substrate Chromogen System，并实施孵育，总共10分钟。并实施用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤一次。添加EnVision FLEX Hematoxylin，并实施孵育5分钟；并用EnVision FLEX WASH BUFFER和离子交换水洗涤总共3次。
图35显示典型的染色图像。兔嵌合抗体1A3显示令人满意的对用TROP2-ADC (I)施用的动物的皮下肿瘤组织的可染色性；相反，兔嵌合抗体1A3没有显示对用抗TROP2 Ab施用的动物的皮下肿瘤组织的可染色性。
ii)施用GPR20-ADC (I)后使用皮下移植的人来源的肿瘤证实可染色性
向免疫缺陷小鼠(裸小鼠)皮下移植过表达GPR20的人胃肠道间质瘤细胞系GIST-T1/GPR20。施用GPR20-ADC (I)后，取出肿瘤组织以制备石蜡包埋的样本。然后，检查兔嵌合抗体1A3的可染色性。肿瘤组织取自未用GPR20-ADC (I)施用的小鼠，并用作阴性对照。以与i)中相同的方式实施染色。
图36显示典型的染色图像。兔嵌合抗体1A3显示令人满意的对用GPR20-ADC (I)施用的动物的皮下肿瘤组织的可染色性；而兔嵌合抗体1A3没有显示对未用GPR20-ADC (I)施用的动物的皮下肿瘤组织的可染色性。
[实施例9]使用小鼠抗体1A3的免疫染色
i)施用CDH6-ADC (I)后使用皮下移植的人来源的肿瘤证实可染色性
向高度免疫缺陷的小鼠(NOG小鼠)皮下移植取自具有透明细胞肾细胞癌的患者的人肿瘤。施用CDH6-ADC (I)后，取出肿瘤组织以制备石蜡包埋的样本。然后，检查小鼠抗体1A3的可染色性。肿瘤组织取自未向其施用CDH6-ADC (I)的NOG小鼠，并用作阴性对照。脱蜡和抗原活化使用Autostainer Link预处理系统(PT Link，由DAKO制造)和抗原修复溶液(Target Retrieval Solution Low pH，由DAKO制造)在97℃下实施40分钟。以下染色操作使用自动染色装置(Dako Autostainer Link 48：由DAKO制造)在室温下实施。用EnVisionFLEX WASH BUFFER (由DAKO制造)洗涤一次后，添加Peroxidase Block 3% H2O2 (由DAKO制造)；实施孵育5分钟；并用EnVision FLEX WASH BUFFER实施洗涤一次。添加无血清的Protein Block (由DAKO制造)；实施孵育30分钟，并通过吹气除去液体。将小鼠抗体1A3用REAL Antibody Diluent (由DAKO制造)稀释以落入0.03 μg/mL至0.3 μg/mL的范围内，并进行反应60分钟。用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤3次后，添加EnVision + System-HRPLabelled Polymer Anti-Mouse #K4000 (由DAKO制造)；实施孵育30分钟；且然后，实施用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤两次。
添加DAKO Liquid DAB + Substrate Chromogen System，并实施孵育，总共10分钟；并实施用EnVision FLEX WASH BUFFER洗涤一次。添加EnVision FLEX Hematoxylin，并实施孵育5分钟；并实施用EnVision FLEX WASH BUFFER和离子交换水洗涤总共3次。
图37显示典型的染色图像。小鼠抗体1A3显示令人满意的对用CDH6-ADC (I)施用的动物的可染色性，并且染色强度随着小鼠抗体1A3的浓度增加而增加。相反，小鼠抗体1A3没有显示对用CDH6-ADC (I)施用的动物的可染色性。注意，由于NOG小鼠在B细胞中有缺陷，因此已知在小鼠来源的内源IgG中未观察到背景染色(Ito M, 等人 Blood 100 (9):3175-3182, 2002)。
ii)小鼠抗体1A3的特异性的证实
将小鼠抗体1A3与化合物(2)或SN-38混合后，混合物用于免疫染色。
注意，化合物(2)是由下式代表的化合物：
[式37]
Figure 682622DEST_PATH_IMAGE040
SN-38是由下式代表的化合物：
[式38]
Figure 248732DEST_PATH_IMAGE041
。
基于分子量，将小鼠抗体1A3:化合物(2):SN-38的混合比定义为0.1:0.04:0.03。以与i)中相同的方式进行染色。
图38显示典型的染色图像。通过与化合物(2)混合，小鼠抗体1A3的染色能力消失，但通过与SN-38混合，则没有消失。由此证明，小鼠抗体1A3特异性识别组织中的化合物(2)。
[实施例10]非临床研究中的血浆中的浓度的测定
由Gyrolab xP工作站(GYROS PROTEIN Technologies)开发用于测量小鼠中的GPR20-ADC (I)的血浆中的浓度的方法。作为捕获试剂，通过使用标记试剂盒(ChromaLinkBiotin Protein Labeling Kit, Solulink)用生物素标记的小鼠抗体1A3，并将其浓度用含有0.1% PS20的PBS控制为700 nM。通过将GPR20-ADC (I)的浓度用小鼠血浆控制为0、5、10、20、50、100、200、500、1000、2000、5000、10000 ng/mL制备用于校准曲线的样品并用Rexxip AN (GYROS PROTEIN Technologies)稀释至10倍。作为检测试剂，小鼠抗-(抗-GPR20 Ab)(在本文中，“(抗-GPR20 Ab)”)代表包含重链和轻链的抗体，所述重链由SEQ IDNO:32的氨基酸残基20至472组成的氨基酸序列组成，且所述轻链由SEQ ID NO:33的氨基酸残基21至234组成的氨基酸序列组成)独特型Ab (71C1) (IBL)用DyLight650(注册商标)标记试剂盒标记并投入使用，并将其浓度用Rexxip F (GYROS PROTEIN Technologies)控制为10 nM。将这些试剂和用于校准曲线的样品添加至96-孔PCR板中，并设置在Gyrolab xP工作站。使用Bioaffy200，通过200-3W-002-A (PMT1)测量向导。通过使用Gyrolab Evaluator3.3.9.175在4-参数逻辑模型中实施回归分析(权重：响应)。校准曲线显示于图39中。
[实施例11]非临床研究中的血浆浓度的测定
通过使用ECL开发用于测量人中的HER2-ADC (I)的血浆中的浓度的方法。HighBind板(Meso Scale Diagnostics, LLC: MSD)用小鼠抗体1A3包被，且然后洗涤。用封闭缓冲液(含有BSA和PS20的PBS)进行封闭后，将HER2-ADC (I)的浓度控制为0、200、400、800、1600、3200、6400、12800、20000和25600 ng/mL，用测定稀释液稀释1000倍，并用作用于校准曲线的样品。将通过EZ-Link 磺基-NHS-LC-LC生物素(Thermo Fisher Scientific Inc.)和磺基-标签链霉抗生物素蛋白(MSD)用生物素标记的生物素化的小鼠抗-(抗-HER2)独特型Ab(13C1)(IBL)预孵育以制备检测溶液。向添加用于校准曲线的样品、孵育和洗涤的板中添加检测溶液，以形成复合物。然后，将4 × Read Buffer T (MSD)用纯净水稀释两倍，并添加至洗涤的板。通过MSD SECTOR Imager 6000(控制软件：MSD Discovery Workbench版本3.0.18)进行测量。通过4-参数逻辑模型(权重：1/响应2)进行回归分析。校准曲线显示于图40中。
[实施例12]被小鼠抗体1A3识别的化学结构的证实
使用Gyrolab xP工作站(GYROS PROTEIN Technologies)，通过与HER2-ADC (I)的竞争抑制来检查被小鼠抗体1A3识别的化学结构。作为用于竞争抑制中的化合物，选择化合物(1)、化合物(2)、化合物(7)、化合物(8)、化合物(9)、化合物(10)、化合物(11)、拓扑替康和鲁比替康。
注意，化合物(1)是由下式代表的化合物：
[式39]
Figure 550400DEST_PATH_IMAGE042
化合物(2)是由下式代表的化合物：
[式40]
Figure 222559DEST_PATH_IMAGE043
化合物(7)是由下式代表的化合物：
[式41]
Figure 609678DEST_PATH_IMAGE044
化合物(8)是由下式代表的化合物：
[式42]
Figure 979480DEST_PATH_IMAGE045
。
化合物(9)是由下式代表的化合物：
[式43]
Figure 870075DEST_PATH_IMAGE046
(Sugimori M. 等人, J Med. Chem. 1994, 3033-3039)。
化合物(10)是由下式代表的化合物：
[式44]
Figure 729447DEST_PATH_IMAGE047
(美国专利号5834476)。
化合物(11)是由下式代表的化合物：
[式45]
Figure 338283DEST_PATH_IMAGE048
(Atsumi R. 等人, Arzneimittel-Forschung 2001, 253-257)。
拓扑替康是由下式代表的化合物：
[式46]
Figure DEST_PATH_IMAGE049
鲁比替康是由下式代表的化合物：
[式47]
Figure 511775DEST_PATH_IMAGE050
作为捕获试剂，使用通过标记试剂盒(ChromaLink Biotin Protein LABELINGKit, Solulink)用生物素标记的小鼠抗体1A3。将其浓度用含有0.1%PS20的PBS控制为700nM。用于竞争抑制中的化合物，化合物(1)、化合物(2)、化合物(7)、化合物(8)、化合物(9)、化合物(10)、化合物(11)、拓扑替康和鲁比替康分别溶解于DMSO中。将溶液各自用RexxipHN (GYROS PROTEIN Technologies)中的10%或20% DMSO稀释，以制备0、1和100 μg/mL稀释溶液。向其中各自以等量添加700 nM小鼠抗体1A3溶液。将混合物搅拌，并使其在室温下在暗处反应1小时或更长时间。将HER2-ADC (I)的浓度用Rexxip HN控制为0、0.244、0.977、3.91、15.6、62.5、250和1000 ng/mL。作为检测试剂，小鼠抗-(抗-HER2 Ab)独特型Ab(13C1) (IBL)通过DyLight650(注册商标)标记试剂盒标记并投入使用。将其浓度用RexxipF (GYROS PROTEIN Technologies)控制为10 nM。将上述溶液设置在Gyrolab xP工作站，并通过使用Gyrolab Bioaffy 200在200-3W-002-A (PMT5)实施测量。通过使用GyrolabEvaluator 3.4.0.24在4-参数逻辑模型中(权重：响应)实施回归分析。根据竞争抑制化合物的浓度制备HER2-ADC (I)的校准曲线。通过将浓度为250 ng/mL的HER2-ADC (I)的响应与未添加化合物(浓度为0 ng/mL)的情况下的响应进行比较，计算抑制率(%)。
显示抑制率的图表显示于图41中。化合物(1)、化合物(2)、化合物(7)和化合物(9)显示强竞争抑制作用。相反，化合物(8)、化合物(10)、化合物(11)、拓扑替康和鲁比替康没有表现出竞争抑制。从结果证实，小鼠抗体1A3特异性识别具有化合物(1)的基本骨架和位置4处的甲基的化学结构。
[序列表自由文本]
SEQ ID NO:1 - CDRH1
SEQ ID NO:2 - CDRH2
SEQ ID NO:3 - CDRH3
SEQ ID NO:4 - CDRL1
SEQ ID NO:5 - CDRL2
SEQ ID NO:6 - CDRL3
SEQ ID NO:7 - CDRH1
SEQ ID NO:8 - CDRH2
SEQ ID NO:9 - CDRH1
SEQ ID NO:10 - CDRH2
SEQ ID NO:11 - CDRH1
SEQ ID NO:12 - CDRH2
SEQ ID NO:13 - CDRH3
SEQ ID NO:14 - CDRL1
SEQ ID NO:15 - 小鼠抗体1A3的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:16 - 小鼠抗体1A3的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:17 – 编码小鼠抗体1A3的重链可变区的氨基酸序列的核苷酸序列
SEQ ID NO:18 – 编码小鼠抗体1A3的轻链可变区的氨基酸序列的核苷酸序列
SEQ ID NO:19 – 兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:20 – 兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:21 - 抗HER2抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:22 - 抗HER2抗体的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:23 - 抗HER3抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:24 - 抗HER3抗体的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:25 - 抗TROP2抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:26 - 抗TROP2抗体的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:27 - 抗B7-H3抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:28 - 抗B7-H3抗体的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:29 - 编码人轻链信号序列和人κ链恒定区的氨基酸序列的核苷酸序列
SEQ ID NO:30 – 编码兔嵌合抗体1A3的重链的氨基酸序列的核苷酸序列
SEQ ID NO:31 – 编码兔嵌合抗体1A3的轻链的氨基酸序列的核苷酸序列
SEQ ID NO:32 - 抗GPR20抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:33 - 抗GPR20抗体的轻链的氨基酸序列
SEQ ID NO:34 - 抗CDH6抗体的重链的氨基酸序列
SEQ ID NO:35 - 抗CDH6抗体的轻链的氨基酸序列。
Figure IDA0002920202220000011
Figure IDA0002920202220000021
Figure IDA0002920202220000031
Figure IDA0002920202220000041
Figure IDA0002920202220000051
Figure IDA0002920202220000061
Figure IDA0002920202220000071
Figure IDA0002920202220000081
Figure IDA0002920202220000091
Figure IDA0002920202220000101
Figure IDA0002920202220000111
Figure IDA0002920202220000121
Figure IDA0002920202220000131
Figure IDA0002920202220000141
Figure IDA0002920202220000151
Figure IDA0002920202220000161
Figure IDA0002920202220000171
Figure IDA0002920202220000181
Figure IDA0002920202220000191
Figure IDA0002920202220000201
Figure IDA0002920202220000211
Figure IDA0002920202220000221
Figure IDA0002920202220000231
Figure IDA0002920202220000241
Figure IDA0002920202220000251
Figure IDA0002920202220000261
Figure IDA0002920202220000271
Figure IDA0002920202220000281
Figure IDA0002920202220000291
Figure IDA0002920202220000301
Figure IDA0002920202220000311
Figure IDA0002920202220000321
Figure IDA0002920202220000331
Figure IDA0002920202220000341
Figure IDA0002920202220000351

Claims (51)

1.识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白，其中由下式代表的药物经由接头与抗体缀合：
[式1]
Figure 311001DEST_PATH_IMAGE001
。
2.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式2]
Figure 696983DEST_PATH_IMAGE002
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
3.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式3]
Figure 804616DEST_PATH_IMAGE003
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
4.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的药物-接头由下式代表：
[式4]
Figure 668667DEST_PATH_IMAGE004
其中A代表与所述抗体的连接位置，且
所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合。
5.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式5]
Figure 748619DEST_PATH_IMAGE005
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
6.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式6]
Figure 649710DEST_PATH_IMAGE006
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
7.根据权利要求1所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物由下式代表：
[式7]
Figure 182322DEST_PATH_IMAGE007
其中所述药物-接头经由硫醚键与所述抗体缀合，且n代表每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数在2至8的范围内。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的蛋白，其中所述抗体-药物缀合物中的抗体是抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7-H3抗体、抗GPR20抗体或抗CDH6抗体。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白对所述抗体-药物缀合物的识别特性独立于所述抗体-药物缀合物中每个抗体分子缀合的药物-接头的单元的平均数的任何差异。
11.识别由下式代表的药物的蛋白：
[式8]
Figure 584485DEST_PATH_IMAGE008
。
12.识别由下式代表的药物的蛋白：
[式9]
Figure 315680DEST_PATH_IMAGE009
。
13.识别由下式代表的药物的蛋白：
[式10]
Figure 574623DEST_PATH_IMAGE010
。
14.识别由下式代表的药物的蛋白：
[式11]
Figure 670231DEST_PATH_IMAGE011
。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白是抗体。
16.根据权利要求15所述的蛋白，其中所述蛋白是
a)包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:1代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:2代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ IDNO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3：
b)包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:7代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:8代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ IDNO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3：
c)包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:9代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:10代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:3代表的氨基酸序列组成的CDRH3；且所述轻链包含由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ IDNO:5代表的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3：或
d)包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:11代表的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:12代表的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:13代表的氨基酸序列组成的CDRH3，且所述轻链包含由SEQ ID NO:14代表的氨基酸序列组成的CDRL1、由WAS代表的三肽组成的CDRL2和由SEQ ID NO:6代表的氨基酸序列组成的CDRL3。
17.根据权利要求16所述的蛋白，其中所述蛋白是包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由氨基酸序列组成的重链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至141组成；且所述轻链包含由氨基酸序列组成的轻链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至127组成。
18.根据权利要求17所述的蛋白，其中所述蛋白是小鼠抗体。
19.根据权利要求17所述的蛋白，其中所述蛋白是包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至477组成的氨基酸序列，且所述轻链包含由SEQ IDNO:16的氨基酸残基21至234组成的氨基酸序列。
20.根据权利要求17所述的蛋白，其中所述蛋白是嵌合抗体。
21.根据权利要求17所述的蛋白，其中所述蛋白是兔嵌合抗体。
22.根据权利要求17所述的蛋白，其中所述蛋白是包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由SEQ ID NO:19的氨基酸残基20至464组成的氨基酸序列，且所述轻链包含由SEQ IDNO:20的氨基酸残基21至233组成的氨基酸序列。
23.根据权利要求15所述的蛋白，其中所述蛋白是其中根据权利要求19或22所述的抗体的重链的羧基末端的赖氨酸残基缺失的抗体。
24.根据权利要求15所述的蛋白，其中所述蛋白是由与根据权利要求19或22所述的抗体的氨基酸序列具有至少95%同一性的氨基酸序列组成的抗体。
25.根据权利要求15所述的蛋白，其中所述蛋白是由与根据权利要求19或22所述的抗体的氨基酸序列具有至少99%同一性的氨基酸序列组成的抗体。
26.根据权利要求15所述的蛋白，其中所述蛋白是与根据权利要求19或22所述的抗体竞争对所述药物的识别特性的抗体。
27.根据权利要求1至14中任一项所述的蛋白，其中所述蛋白是根据权利要求15至26中任一项所述的抗体的抗原结合片段。
28.根据权利要求27所述的蛋白，其中所述抗体的抗原结合片段是Fab、F(ab')2、Fab'或Fv。
29.通过使用根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白来定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物的血浆中的浓度的方法。
30.根据权利要求29所述的方法，其包括以下步骤：(1)使血浆中的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的抗体-药物缀合物的靶标抗原的板接触，以形成复合物；(2)使用标志物标记的根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物；且然后(3)检测所述标志物。
31.根据权利要求29所述的方法，其包括以下步骤：(1)使血浆中的抗体-药物缀合物与具有在其上固定的根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白的板接触，以形成复合物；(2)使能够识别所述抗体-药物缀合物的抗体部分并用标志物标记的第二蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物；且然后(3)检测所述标志物。
32.通过使用根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白来定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的从所述抗体-药物缀合物释放的药物的血浆中的浓度的方法。
33.根据权利要求32所述的方法，其包括以下步骤：(1)在用标志物标记的竞争性药物存在的情况下，使血浆中的从所述抗体-药物缀合物释放的药物与具有在其上固定的根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白的板接触，以形成复合物；和(2)检测所述标志物。
34.使用根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白来鉴定已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的所述抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布的方法。
35.根据权利要求34所述的方法，其包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物与根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白接触，以形成复合物，(2)使能够识别根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白并用标志物标记的第二蛋白与所述复合物接触，以形成另外的复合物，且然后(3)检测所述标志物。
36.根据权利要求34所述的方法，其包括以下步骤：(1)使组织中的抗体-药物缀合物和/或从所述抗体-药物缀合物释放的药物与用标志物标记的根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白接触，以形成复合物；且然后(2)检测所述标志物。
37.根据权利要求30、31、33、35或36所述的方法，其中所述标志物是荧光物质，且通过感测由所述标志物发射的荧光来进行所述标志物的检测。
38.根据权利要求30、31、33、35或36所述的方法，其中所述标志物是酶，且所述标志物的检测通过感测由底物和酶之间的反应引起的发光或显色来进行。
39.根据权利要求30、31、33、35或36所述的方法，其中所述标志物是发光物质，且所述标志物的检测通过感测基于电化学反应的所述标志物的发光来进行。
40.多核苷酸，其编码根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白。
41.载体，其包含根据权利要求40所述的多核苷酸。
42.转化的宿主细胞，其包含根据权利要求40所述的多核苷酸。
43.转化的宿主细胞，其包含根据权利要求41所述的载体。
44.用于产生根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白的方法，其包括以下步骤：培养根据权利要求42或43所述的宿主细胞；且然后从培养步骤中获得的培养产物纯化蛋白。
45.组合物，其包含根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白。
46.试剂盒，其包含根据权利要求1至28中任一项所述的蛋白或根据权利要求45所述的组合物。
47.根据权利要求46所述的试剂盒，其用于定量已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物的血浆中的浓度。
48.根据权利要求46所述的试剂盒，其用于鉴定已经向其施用抗体-药物缀合物的哺乳动物中的抗体-药物缀合物和/或从抗体-药物缀合物释放的药物的组织分布。
49.包含重链和轻链的抗体，所述重链包含由氨基酸序列组成的重链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至141组成；且所述轻链包含由氨基酸序列组成的轻链可变区，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至127组成。
50.根据权利要求49所述的包含重链和轻链的抗体，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:15的氨基酸残基20至477组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:16的氨基酸残基21至234组成。
51.根据权利要求49所述的包含重链和轻链的抗体，所述重链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:19的氨基酸残基20至464组成；且所述轻链由氨基酸序列组成，所述氨基酸序列由SEQ ID NO:20的氨基酸残基21至233组成。
CN201980050318.1A 2018-07-27 2019-07-26 识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白 Pending CN112533958A (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2018140912 2018-07-27
JP2018-140912 2018-07-27
PCT/JP2019/029379 WO2020022475A1 (ja) 2018-07-27 2019-07-26 抗体－薬物コンジュゲートの薬物部位を認識する蛋白質

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN112533958A true CN112533958A (zh) 2021-03-19

Family

ID=69180447

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201980050318.1A Pending CN112533958A (zh) 2018-07-27 2019-07-26 识别抗体-药物缀合物的药物部分的蛋白

Country Status (9)

Country Link
US (1) US20210169852A1 (zh)
EP (1) EP3831853A4 (zh)
JP (2) JP7406488B2 (zh)
KR (1) KR20210040059A (zh)
CN (1) CN112533958A (zh)
AU (1) AU2019311596A1 (zh)
CA (1) CA3107732A1 (zh)
IL (1) IL280296A (zh)
WO (1) WO2020022475A1 (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023138635A1 (zh) * 2022-01-18 2023-07-27 甘李药业股份有限公司 一种依喜替康衍生物-抗体偶联物及其医药用途

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3572428A4 (en) * 2017-01-17 2020-12-30 Daiichi Sankyo Company, Limited ANTI-GPR20 ANTIBODY AND ANTI-GPR20 ANTIBODY MEDICINAL CONJUGATE
AU2020285681A1 (en) * 2019-05-29 2022-01-27 Daiichi Sankyo Company, Limited Dosage of an antibody-drug conjugate
CN113274507A (zh) * 2020-02-20 2021-08-20 亚飞（上海）生物医药科技有限公司 靶向递送和激活的免疫刺激性偶联复合物的制备和用途
AU2021359457A1 (en) * 2020-10-12 2023-05-11 Baili-Bio (Chengdu) Pharmaceutical Co., Ltd. Camptothecin derivative and its ligand-drug conjugate
US20230123041A1 (en) * 2021-07-19 2023-04-20 Recurium Ip Holdings, Llc Immunoconjugates and methods
US11806405B1 (en) 2021-07-19 2023-11-07 Zeno Management, Inc. Immunoconjugates and methods
WO2023228095A1 (en) * 2022-05-24 2023-11-30 Daiichi Sankyo Company, Limited Dosage regimen of an anti-cdh6 antibody-drug conjugate

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3101032A1 (en) * 2014-01-31 2016-12-07 Daiichi Sankyo Company, Limited Anti-her2 antibody-drug conjugate
WO2017002776A1 (ja) * 2015-06-29 2017-01-05 第一三共株式会社 抗体－薬物コンジュゲートの選択的製造方法

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4946778A (en) 1987-09-21 1990-08-07 Genex Corporation Single polypeptide chain binding molecules
US5260203A (en) 1986-09-02 1993-11-09 Enzon, Inc. Single polypeptide chain binding molecules
US5091513A (en) 1987-05-21 1992-02-25 Creative Biomolecules, Inc. Biosynthetic antibody binding sites
IL162181A (en) 1988-12-28 2006-04-10 Pdl Biopharma Inc A method of producing humanized immunoglubulin, and polynucleotides encoding the same
US5637770A (en) 1991-01-16 1997-06-10 Daiichi Pharmaceutical Co., Ltd. Hexa-cyclic compound
EP1400536A1 (en) 1991-06-14 2004-03-24 Genentech Inc. Method for making humanized antibodies
AU784045B2 (en) 1999-06-25 2006-01-19 Genentech Inc. Humanized anti-ErbB2 antibodies and treatment with anti-ErbB2 antibodies
CA2512647C (en) 2003-01-07 2013-10-08 Symphogen A/S Method for manufacturing recombinant polyclonal proteins
AR056857A1 (es) 2005-12-30 2007-10-24 U3 Pharma Ag Anticuerpos dirigidos hacia her-3 (receptor del factor de crecimiento epidérmico humano-3) y sus usos
EP3248617A3 (en) 2007-02-16 2018-02-21 Merrimack Pharmaceuticals, Inc. Antibodies against erbb3 and uses thereof
SI2206727T1 (sl) 2007-10-11 2015-06-30 Daiichi Sankyo Company, Limited Protitelo, ki cilja osteoklast - soroden protein Siglec-15
US8575316B2 (en) 2009-04-09 2013-11-05 Daiichi Sankyo Company, Limited Anti-Siglec-15 antibody
KR102584005B1 (ko) 2012-10-11 2023-09-27 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 글리신아미드 화합물의 제조 방법
JP6272230B2 (ja) 2012-10-19 2018-01-31 第一三共株式会社 親水性構造を含むリンカーで結合させた抗体−薬物コンジュゲート
RU2743077C2 (ru) 2013-12-25 2021-02-15 Дайити Санкио Компани, Лимитед Конъюгат анти-trop2 антитело-лекарственное средство
JP2017114763A (ja) 2014-03-26 2017-06-29 第一三共株式会社 抗ｃｄ９８抗体−薬物コンジュゲート
ES2859648T3 (es) 2014-04-10 2021-10-04 Daiichi Sankyo Co Ltd Conjugado anticuerpo-fármaco anti-HER3
WO2015155976A1 (ja) 2014-04-10 2015-10-15 第一三共株式会社 抗ｈｅｒ２抗体－薬物コンジュゲート
JP6943872B2 (ja) 2016-03-25 2021-10-06 ジェネンテック， インコーポレイテッド 多重全抗体及び抗体複合体化薬物定量化アッセイ
EP3572428A4 (en) 2017-01-17 2020-12-30 Daiichi Sankyo Company, Limited ANTI-GPR20 ANTIBODY AND ANTI-GPR20 ANTIBODY MEDICINAL CONJUGATE
TW202330036A (zh) 2017-05-15 2023-08-01 日商第一三共股份有限公司 抗體-藥物結合物之製造方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3101032A1 (en) * 2014-01-31 2016-12-07 Daiichi Sankyo Company, Limited Anti-her2 antibody-drug conjugate
WO2017002776A1 (ja) * 2015-06-29 2017-01-05 第一三共株式会社 抗体－薬物コンジュゲートの選択的製造方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
YUSUKE OGITANI等: "Wide application of a novel topoisomerase I inhibitor-based drug conjugation technology", BIOORG MED CHEM LETT., vol. 26, pages 5069 - 5072, XP055852728, DOI: 10.1016/j.bmcl.2016.08.082 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023138635A1 (zh) * 2022-01-18 2023-07-27 甘李药业股份有限公司 一种依喜替康衍生物-抗体偶联物及其医药用途

Also Published As

Publication number Publication date
TW202019973A (zh) 2020-06-01
JP7502549B2 (ja) 2024-06-18
US20210169852A1 (en) 2021-06-10
KR20210040059A (ko) 2021-04-12
EP3831853A4 (en) 2022-06-01
JP2024045098A (ja) 2024-04-02
WO2020022475A1 (ja) 2020-01-30
CA3107732A1 (en) 2020-01-30
JPWO2020022475A1 (ja) 2021-08-12
EP3831853A1 (en) 2021-06-09
JP7406488B2 (ja) 2023-12-27
AU2019311596A1 (en) 2021-01-28
IL280296A (en) 2021-03-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7502549B2 (ja) 抗体－薬物コンジュゲートの薬物部位を認識する蛋白質
US20180142032A1 (en) Anti-lamp1 antibodies and antibody drug conjugates, and uses thereof
JP6749901B2 (ja) モノクローナル抗ｇｐｃ−１抗体およびその使用
US20190284274A1 (en) Erfe specific antibodies compositions and methods of use
KR20210093961A (ko) Amh에 대해 특이적인 항체 및 이의 용도
CN114008075A (zh) 人源化抗vegf单克隆抗体
JPWO2019189874A1 (ja) Ｄｕｐａｎ−２抗原と特異的に反応するモノクローナル抗体およびその製造方法。
WO2019189874A1 (ja) Ｄｕｐａｎ－２抗原と特異的に反応するモノクローナル抗体およびその製造方法。
US11795238B2 (en) Anti-idiotype antibodies targeting anti-CD70 chimeric antigen receptor
WO2022114163A1 (ja) Ｈｅｒ２標的化剤
EP4079758A1 (en) Semg2 antibody and use thereof
TWI846717B (zh) 辨識抗體-藥物結合物之藥物部位的蛋白質
CN115505043A (zh) 特异性结合糖基化ceacam5的抗体
CN110596369A (zh) 一种用于检测人tim-3表达水平的试剂盒
TWI782000B (zh) 抗ｇｐｒ２０抗體、其製造方法及其應用
CN110579610A (zh) 用于检测t细胞活化的v域免疫抑制因子的试剂盒
JPWO2019189882A1 (ja) Ｎｃｃ−ｓｔ−４３９抗原と特異的に反応するモノクローナル抗体およびその製造方法。
CN117285637B (zh) 一种抗独特型抗体及其应用
US20240117069A1 (en) Materials and Methods for Monitoring Cancer by Administering an Anti-MCL1 Antibody
CN108727493B (zh) 抗Stathmin单克隆抗体及其用途
CN118078986A (zh) 一种抗Nectin-4单克隆抗体药物或其衍生物的特异性结合剂及其应用
CN110794144A (zh) 用于检测诱导性免疫共刺激分子的试剂盒及其用途
JP2024506694A (ja) 増強されたリンカー標的化のための材料及び方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination