CN112126608A - 一种生产羟基酪醇的工程菌 - Google Patents

一种生产羟基酪醇的工程菌 Download PDF

Info

Publication number
CN112126608A
CN112126608A CN201910554302.6A CN201910554302A CN112126608A CN 112126608 A CN112126608 A CN 112126608A CN 201910554302 A CN201910554302 A CN 201910554302A CN 112126608 A CN112126608 A CN 112126608A
Authority
CN
China
Prior art keywords
dehydrogenase
engineered bacterium
seq
hydroxytyrosol
alpha
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201910554302.6A
Other languages
English (en)
Inventor
赵华
宋田青
张婷
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Fengyang Biological Research And Development Nanjing Co ltd
Original Assignee
Fengyang Biological Research And Development Nanjing Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Fengyang Biological Research And Development Nanjing Co ltd filed Critical Fengyang Biological Research And Development Nanjing Co ltd
Priority to CN201910554302.6A priority Critical patent/CN112126608A/zh
Priority to PCT/CN2020/098114 priority patent/WO2020259585A1/zh
Publication of CN112126608A publication Critical patent/CN112126608A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0071Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205Bacterial isolates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0008Oxidoreductases (1.) acting on the aldehyde or oxo group of donors (1.2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0012Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
    • C12N9/0014Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7) acting on the CH-NH2 group of donors (1.4)
    • C12N9/0016Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7) acting on the CH-NH2 group of donors (1.4) with NAD or NADP as acceptor (1.4.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1096Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/22Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group aromatic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y101/00Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
    • C12Y101/01Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
    • C12Y101/01001Alcohol dehydrogenase (1.1.1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y102/00Oxidoreductases acting on the aldehyde or oxo group of donors (1.2)
    • C12Y102/01Oxidoreductases acting on the aldehyde or oxo group of donors (1.2) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.2.1)
    • C12Y102/01002Formate dehydrogenase (1.2.1.2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y104/00Oxidoreductases acting on the CH-NH2 group of donors (1.4)
    • C12Y104/01Oxidoreductases acting on the CH-NH2 group of donors (1.4) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.4.1)
    • C12Y104/01002Glutamate dehydrogenase (1.4.1.2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y114/00Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
    • C12Y114/14Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (1.14.14)
    • C12Y114/140094-Hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase (1.14.14.9)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y401/00Carbon-carbon lyases (4.1)
    • C12Y401/01Carboxy-lyases (4.1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/185Escherichia
    • C12R2001/19Escherichia coli

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明提供了一种生产羟基酪醇的工程菌以及通过该工程菌生产羟基酪醇的方法,利用该工程菌催化酪氨酸通过双路径生产羟基酪醇,可在较高底物浓度的基础上,得到高产率和高产量的羟基酪醇。同时,本发明制备方法简单且原料易得,价格更加低廉,具有良好的工业化应用前景。

Description

一种生产羟基酪醇的工程菌
技术领域
本发明属于生物工程技术领域,特别涉及一种生产羟基酪醇的大肠杆菌工程菌。
背景技术
羟基酪醇(Hydroxytyrosol,HT),化学名为3,4-二羟基苯乙醇,是在橄榄油中发现的最强大的抗氧化剂之一,比白藜芦醇具有更强的氧自由基吸收能力,表现出多种生物活性。已有研究表明其在抗肿瘤,抗血栓,调血脂和抗动脉硬化,抗病原微生物,防治视网膜黄斑变性,保护软骨和抗骨质疏松等多方面具有药理作用,在医药,保健食品,化妆品和食品添加剂等领域有着广阔的应用前景和开发潜力。
当前,羟基酪醇的合成方法主要包括植物提取,化学合成,以及生物合成。在自然资源中,HT主要以酯的形式广泛存在于橄榄植物中。从新鲜的橄榄叶、橄榄花或橄榄油厂废水中提取为当前市场上的主要生产方式,中国发明专利申请CN201610883391.5公开了一种橄榄叶羟基酪醇的提取工艺;中国发明专利申请CN201710195462.7公开了一种从橄榄叶中提取羟基酪醇的方法。提取过程中需要使用强酸性水蒸汽,纯化过程繁琐且费用昂贵,回收率比较低,原材料的来源不稳定,且由于羟基酪醇在植物提取过程中有氧化倾向,植物提取最终获得的产物纯度只能达到20%-40%。化学合成较易获得较高纯度的羟基酪醇产品,例如,CN201110357075.1、CN201210342015.7,但目前已知的化学合成路线中涉及价格昂贵的催化剂,或者反应的步骤较多,此外,有机合成过程中涉及较多有机溶剂和金属氧化物,因此从技术和成本考虑,该方法不适用于工业化生产。因此通过微生物法生产受到了广泛的关注。
目前已有部分报道使用微生物法生产羟基酪醇。中国发明专利申请CN201510242626.8公开了一种大肠杆菌中过表达来源于大肠杆菌的单加氧酶基因簇HpaBC,以葡萄糖为底物从头开始合成羟基酪醇,由于羟基酪醇对基因的毒性,最终羟基酪醇的产量为349.05mg/L产率仅为0.017mol/mol,从头合成的羟基酪醇产量到菌株自身代谢通量和代谢调节的影响,难以实现高的生产速率和得率。2012年,Yasuharu Satoh等人报道使用一株工程大肠杆菌,使用1mM酪氨酸为底物,依次通过酪氨酸羟化酶,L-多巴脱羧酶,酪胺氧化酶,醇脱氢酶作用下生成0.19±0.0056mM羟基酪醇,产率仅为0.19mol/mol,该方法中羟基酪醇的得率较低,中间产物积累较多,且菌株对底物的消耗速率较慢(1mM酪氨酸消耗需要将近72h)。
中国发明专利申请CN201711054680.5公开了异源代谢途径生产酪醇及羟基酪醇的方法。该方案在宿主中表达了芳香氨基转移酶(aromatic aminotransferase,ArAT),酮酸脱羧酶(Ketoacid decarboxylase,KDC),醇脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)来生产酪醇,再在4-羟基苯乙酸羟化酶的作用下来生产羟基酪醇。从简单碳源出发,羟基酪醇产量能达到647±35mg/L,以6g/L(33mM)酪氨酸为底物时,羟基酪醇产量能达到1243±165mg/L(8mM),产率仅为0.24mol/mol。该方案的缺点是需要外加许多昂贵的辅酶磷酸吡哆醛(PLP)和还原型辅酶Ⅰ(NADH)。另外,该方案体系中除了目标化合物羟基酪醇的积累,还有L-左旋多巴作为副产物产出,使得羟基酪醇产率较低。
现有技术已知羟基酪醇的以葡萄糖为底物从头合成受到菌株自身代谢的影响导致最终产量低(低于1g/L),耗时长(大于48h),产率低;以酪氨酸为底物的生物转化方法,因缺乏辅因子再生体系,以及中间产物较多,催化效率随着反应持续导致辅因子不足,难以将更多的底物进行转化,最终导致催化的效率低,产率低。目前底物浓度最高做到为6g/L(33mM),产率仅有0.24mol/mol。基于目前各种方法的缺陷,研究一种可实现高浓度底物持续性转化,可工业化生产、同时利用廉价底物可以高效生产羟基酪醇的方法非常有必要。
发明内容
基于目前各种方法的缺陷,本发明提供了一种生产羟基酪醇的工程菌以及利用该工程菌生产羟基酪醇的方法,实现了廉价底物酪氨酸到羟基酪醇的双路径高效生产。
为实现上述发明目的,本发明采用以下技术方案予以实现:
本发明一方面提供了一种生产羟基酪醇的工程菌,所述大肠杆菌工程菌同时表达6种酶,分别为4-羟基苯乙酸3-单加氧酶(HpaBC)、甲酸脱氢酶(FDH)、L-α-氨基酸转氨酶(ArAT)、L-谷氨酸脱氢酶(GDH)、α-酮酸脱羧酶(KDC)和醇脱氢酶(ADH)。
在本发明的一些实施方案中,所述工程菌同时表达的6种酶是通过双质粒共表达编码所述6种酶的基因实现的。
在本发明的一些实施方案中,所述双质粒为pRSFDuet-1和pETDuet-1。
在本发明的一些实施方案中,所述pRSFDuet-1装载编码4-羟基苯乙酸3-单加氧酶的基因和编码甲酸脱氢酶的基因;所述pETDuet-1装载编码L-α-氨基酸转氨酶的基因、编码L-谷氨酸脱氢酶的基因、编码α-酮酸脱羧酶的基因和编码醇脱氢酶的基因。
在本发明的一些实施方案中,所述pETDuet-1装载编码4-羟基苯乙酸3-单加氧酶的基因和编码甲酸脱氢酶的基因;所述pRSFDuet-1装载编码L-α-氨基酸转氨酶的基因、编码L-谷氨酸脱氢酶的基因、编码α-酮酸脱羧酶的基因和编码醇脱氢酶的基因。
在本发明的一些实施方案中,所述工程菌是通过将pRSFDuet-1和pETDuet-1质粒转化到宿主Escherichia coli(大肠杆菌)B21感受态细胞中得到的。
在本发明的一些实施方案中,所述4-羟基苯乙酸3-单加氧酶(HpaBC)来自大肠杆菌Escherichia coli BL21(DE3)。
在本发明的一些实施方案中,所述4-羟基苯乙酸3-单加氧酶(HpaBC)的核苷酸序列是NCBI上accession NO为:NC_001136.10,REGION:complement(1234218..1236125)。
在本发明的一些实施方案中,所述甲酸脱氢酶来自Mycobacteriumintracellulare胞内分枝杆菌(M.iFDH)。
在本发明的一些实施方案中,所述甲酸脱氢酶的氨基酸序列是NCBI上accessionNO为WP_009957650.1。
在本发明的一些实施方案中,所述甲酸脱氢酶M.iFDH的氨基酸序列使用在线分析工具http://www.jcat.de/按照大肠杆菌密码子进行核苷酸序列优化,优化后的序列为SEQID NO:1。
在本发明的一些实施方案中,所述L-α-氨基酸转氨酶(ArAT)来自大肠杆菌Escherichia coli BL21(E.cTyrB)或酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae BY4741(ScARO8)。
在本发明的一些实施方案中,所述L-α-氨基酸转氨酶的氨基酸序列是NCBI上accession NO为NP_418478.1、NP_011313.1的序列。
在本发明的一些实施方案中,所述L-α-氨基酸转氨酶的核苷酸序列是NCBI上accession NO为:NC_000913.3 REGION:complement(4267114..4268307)、NC_001139.9REGION:complement(116059..117561)的序列。
在本发明的一些实施方案中,所述L-谷氨酸脱氢酶来自酿酒酵母Saccharomycescerevisiae S288C(ScGDH2)。
在本发明的一些实施方案中,所述L-谷氨酸脱氢酶的核苷酸序列是NCBI上accession NO为:NC_001136 REGION:complement(70640..73918)。
在本发明的一些实施方案中,所述L-谷氨酸脱氢酶的氨基酸序列是NCBI上accession NO为NP_010066.1。
在本发明的一些实施方案中,所述α-酮酸脱羧酶来自酿酒酵母Saccharomycescerevisiae S288C(ScARO10)。
在本发明的一些实施方案中,所述α-酮酸脱羧酶的核苷酸序列是NCBI上accession NO为:NC_001136.10,REGION:complement(1234218..1236125)。
在本发明的一些实施方案中,所述α-酮酸脱羧酶的氨基酸序列是NCBI上accession NO为NP_010668.3。
在本发明的一些实施方案中,所述醇脱氢酶来自厌氧嗜热芽孢杆菌Anoxybacillus geothermalis(BsADH)或Lactobacillus brevis短乳杆菌(LbADH)。
在本发明的一些实施方案中,所述醇脱氢酶的氨基酸序列是NCBI上accession NO为WP_044744228.1和WP_107696682。
在本发明的一些实施方案中,所述醇脱氢酶BsADH和LbADH的氨基酸序列,使用在线分析工具http://www.jcat.de/按照大肠杆菌密码子进行核苷酸序列优化,优化后的序列分别为SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3。
本发明另一方面提供了一种生产羟基酪醇的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)将上述实施方案中所述的工程菌放入磷酸盐缓冲液中;
(2)加入酪氨酸和含甲酸根的化合物进行催化反应。
在本发明的一些实施方案中,所述含甲酸根的化合物选自甲酸、甲酸钠、甲酸铵或甲酸钙。
在本发明的一些实施方案中,所述催化反应条件为:pH 6.0-9.0,温度15-40℃,时间1-48小时。
本发明的再一方面提供了所述工程菌在生产羟基酪醇中的应用。
术语“产率”指催化过程中,消耗单位数量的底物(酪氨酸)而实际获得的目标产物(羟基酪醇)的产量与理论计算的目标产物产量的比值。例如:消耗1mM酪氨酸,理论上应获得1mM羟基酪醇,实际获得0.6mM羟基酪醇,则产率为0.6mM/1mM,即0.6mol/mol。
术语“双路径”指以一种底物出发,通过生成不同的中间产物,最终得到相同的产物。本发明体系中,添加酪氨酸作为出发底物,一条路径通过L-α-氨基酸转氨酶、L-谷氨酸脱氢酶、α-酮酸脱羧酶生成中间体酪醇,再通过4-羟基苯乙酸3-单加氧酶和甲酸脱氢酶将酪醇转化为最终产物羟基酪醇;另一条路径则将底物酪氨酸先转化成中间产物左旋多巴,再将左旋多巴转化为最终产物羟基酪醇。
术语“底物剩余量”指添加一定量底物至催化体系,反应一定时间后,检测催化体系中未发生转化的底物量,该量为底物剩余量。
本发明的有益效果:
本发明提供了一种生产羟基酪醇的工程菌,该工程菌可以同时表达6种酶,利用该工程菌催化酪氨酸通过双路径生产羟基酪醇,并且实现胞内辅因子的再生和自平衡,可在较高底物浓度的基础上,得到高产率和高产量的羟基酪醇。同时,本发明制备方法简单且原料易得,价格更加低廉,具有良好的工业化应用前景。
附图说明
图1为双路径催化酪氨酸生产羟基酪醇,其中,图1a为第一条通路,酪氨酸通过L-α-氨基酸转氨酶(ArAT)生成4-羟基苯丙酮酸,再通过α-酮酸脱羧酶(KDC),醇脱氢酶(ADH)生成酪醇,最后通过4-羟基苯乙酸3-单加氧酶(HpaBC)将酪醇转化为羟基酪醇;此过程中,L-谷氨酸脱氢酶(GDH)将L-谷氨酸(glutamate)脱氢生成α-酮戊二酸(α-Ketoglutaricacid)和NADH,这两种化合物又分别是L-α-氨基酸转氨酶和醇脱氢酶的辅酶,因此本发明可实现α-酮戊二酸和NADH的自循环再生,实现胞内辅因子的自平衡;甲酸脱氢酶(FDH)在将甲酸根氧化为CO2的同时,还原NAD+到NADH;图1b为第二条通路,酪氨酸通过4-羟基苯乙酸3-单加氧酶(HpaBC)可生成L-多巴,L-多巴也可依次通过L-α-氨基酸转氨酶(ArAT),α-酮酸脱羧酶(KDC)、醇脱氢酶(ADH)生成羟基酪醇。类似的,L-谷氨酸脱氢酶(GDH)实现α-酮戊二酸(α-Ketoglutaric acid)和NADH的再生,甲酸脱氢酶实现NADH的再生。
图2为双路径催化酪氨酸生产羟基酪醇示意图。ArAT:L-α-氨基酸转氨酶;GDH:L-谷氨酸脱氢酶;KDC:α-酮酸脱羧酶;ADH:醇脱氢酶;HpaBC:4-羟基苯乙酸3-单加氧酶;FDH:甲酸脱氢酶;α-Ketoglutaric acid:α-酮戊二酸;glutamate:L-谷氨酸。
具体实施方式
实施例1菌株构建
a)基因合成
本发明涉及的基因M.iFDH(WP_009957650.1)、BsADH(WP_044744228.1)、LbADH(WP_107696682)均通过在线网址http://www.jcat.de/进行大肠杆菌密码子优化,获得的人工核苷酸序列(SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3)由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。
b)设计引物
设计引物,引物序列如表1所示
c)基因克隆
本发明涉及的基因TyrB(NC_000913.3 REGION:complement(4267114..4268307))、4-羟基苯乙酸3-单加氧酶HpaBC(NC_012971 REGION:4498788..4500880)使用表1中的引物(SEQ ID NO:4-SEQ ID NO:7),以大肠杆菌Escherichia coli str.K-12基因组为模板进行PCR扩增。
本发明涉及的基因ARO8(NC_001139.9 REGION:complement(116059..117561))、L-谷氨酸脱氢酶ScGDH2(NC_001136 REGION:complement(70640..73918))、α-酮酸脱羧酶ARO10(NC_001136.10,REGION:complement(1234218..1236125))均使用表1中的引物(SEQID NO:8-SEQ ID NO:13),以酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae S288C基因组为模板进行PCR扩增。
本发明涉及的基因醇脱氢酶(BsADH,WP_044744228.1;LbADH,WP_107696682)、甲酸脱氢酶(M.iFDH,WP_009957650.1),均使用表1中的引物(SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:20),以步骤1中公司合成的包含目标基因的质粒为模板进行PCR扩增。
设计引物,引物序列如表1.1所示
表1:扩增基因所用到的引物
Figure BDA0002106423120000051
Figure BDA0002106423120000061
d)重组质粒pETDuet-E.cTyrB
将pETDuet-1载体质粒采用EcoRI/HindIII双酶切,酶切载体胶回收;将胶回收的载体酶切产物与步骤3中获得的TyrB片段使用南京金斯瑞生物科技有限公司的GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法参考试剂盒的使用说明书;随后将10uL连接液转入100uL TOP10感受态细胞,冰浴30min后于42℃水浴中热激90s进行热休克处理,立即冰浴2min,然后加入1mL不含抗生素的LB培养液,37℃培养1h使菌体复苏。最后将含pRSFDuet-1重组质粒的细胞均匀涂布在含卡那霉素的LB平板上,挑单菌落,使用引物MB-118-TyrB-F/MB-119-TyrB-R(SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5)做菌落PCR验证其正确性,条带正确的单克隆进行DNA测序以保证其准确性,最后保存正确转化子,得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因的重组质粒pETDuet-E.cTyrB。
e)重组质粒pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2
将pETDuet-E.cTyrB载体质粒采用HindIII单酶切,酶切载体胶回收;
将胶回收的载体酶切产物与步骤3中获得的ScGDH2片段使用GenBuilderTMCloningKit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB-120-ScGDH2-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:11),得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因和L-谷氨酸脱氢酶的重组质粒pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2。
f)重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH
将pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2,采用NdeI/KpnI双酶切,酶切载体胶回收;将步骤3中获得Sc ARO10胶回收片段与BsADH胶回收片段,使用引物MB-122-ScARO10-F/MB-125-BsADH-R(SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:15)进行overlap PCR,片段胶回收;
将胶回收的载体酶切产物与overlap PCR片段产物使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB-122-ScARO10-F/MB-125-BsADH-R(SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:15),得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因,L-谷氨酸脱氢酶基因,α-酮酸脱羧酶基因、醇脱氢酶基因的重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH。
g)重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-LbADH
将pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2,采用NdeI/KpnI双酶切,酶切载体胶回收;将步骤3中获得Sc ARO10胶回收片段与LbADH胶回收片段,使用引物MB-122-ScARO10-F/MB-127-LbADH-R(SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:17)进行overlap PCR,片段胶回收;
将胶回收的载体酶切产物与overlap PCR片段产物使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB-122-ScARO10-F/MB-127-LbADH-R(SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:17),得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因,L-谷氨酸脱氢酶基因,α-酮酸脱羧酶基因、醇脱氢酶基因的重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-LbADH。
h)重组质粒pETDuet-ARO8-ScGDH2-ScARO10-BsADH
将pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH采用BamHI/NotI双酶切,酶切载体胶回收;使用引物MB-146-A-ScGDH2-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:18,SEQ ID NO:11)对ScGDH2进行PCR,获得片段ScGDH2-1片段胶回收;
将步骤3中获得ARO8胶回收片段与上述ScGDH2-1胶回收片段,使用引物MB144-ARO8-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:11)进行overlap PCR,片段胶回收;
将胶回收的载体酶切产物与overlap PCR片段产物使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB144-ARO8-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:11),得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因,L-谷氨酸脱氢酶基因,α-酮酸脱羧酶基因、醇脱氢酶基因的重组质粒pETDuet-ARO8-ScGDH2-ScARO10-BsADH。
i)重组质粒pETDuet-ARO8-ScGDH2-ScARO10-LbADH
将pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-LbADH采用BamHI/NotI双酶切,酶切载体胶回收;
使用引物MB-146-A-ScGDH2-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:18,SEQ ID NO:11)对ScGDH2进行PCR,获得片段ScGDH2-1片段胶回收;
将步骤3中获得ARO8胶回收片段与上述ScGDH2-1胶回收片段,使用引物MB144-ARO8-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:11)进行overlap PCR,片段胶回收;
将胶回收的载体酶切产物与overlap PCR片段产物使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB144-ARO8-F/MB-121-ScGDH2-R(SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:11),得到如下质粒:含有L-α-氨基酸转氨酶基因,L-谷氨酸脱氢酶基因,α-酮酸脱羧酶基因、醇脱氢酶基因的重组质粒pETDuet-ARO8-ScGDH2-ScARO10-LbADH。
j)重组质粒pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH
将pRSFDuet-1载体质粒采用SacI/SalI I双酶切,酶切载体胶回收;将胶回收的载体酶切产物与步骤3中获得HpaBC胶回收片段使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB-128-petDuet-M1-seq-F/MB-129-petDuet-M1-seq-R(SEQ ID NO:21,SEQ ID NO:22),得到如下质粒:含有4-羟基苯乙酸3-单加氧酶基因的重组质粒pRSFDuet-HpaBC;
将pRSFDuet-HpaBC载体质粒采用NdeI/XhoI双酶切,酶切载体胶回收;将胶回收的载体酶切产物与步骤3中获得M.iFDH胶回收片段使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同上,后续连接产物转化同上,菌落PCR引物选用MB-130-petDuet-M2-seq-F/MB-131-T7t-seq-R(SEQ ID NO:23,SEQ ID NO:24),得到如下质粒:含有4-羟基苯乙酸3-单加氧酶基因,甲酸脱氢酶基因的重组质粒pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH。
k)包含单质粒菌株构建:将上述构建的不同质粒,分别取1uL转入100uLEscherichia coli BL21(DE3)感受态细胞,转化方法同上,分别得到含有不同基因组合的大肠杆菌重组菌株。
实施例2 L-α-氨基酸转氨酶的筛选
从实施例1中获得的二种含L-α-氨基酸转氨酶基因的重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pETDuet-ARO8-ScGDH2-ScARO10-BsADH,分别在Escherichiacoli BL21(DE3)中得到进行诱导表达。诱导表达方法:将过夜培养的重组大肠杆菌按体积比为1%的量转接到400mL TB发酵培养基中,当细胞OD600达到0.6-0.8后,加入终浓度为2mM的IPTG,在18℃诱导表达培养20h。催化方法:诱导表达结束后,4℃、6000rpm、12分钟离心收集细胞。于50ml 50mM pH 7.0磷酸盐缓冲液中,细胞OD600为20,加入如表2中所示的左旋多巴或者酪氨酸,于30℃反应,时间24小时。转化结束后液相色谱测定羟基酪醇,结果如表2所示。
表2:不同L-α-氨基酸转氨酶加入酪氨酸或左旋多巴的催化比较
Figure BDA0002106423120000081
通过以上对比实验,我们发现两种来源的L-α-氨基酸转氨酶都可以实现目标化合物的高效转化,并且产率都能达到99%以上。最终我们选取了大肠杆菌自身来源的TyrB用于后续双通路合成羟基酪醇,更有利于在大肠杆菌中的表达。
实施例3醇脱氢酶的筛选
从实施例1中获得二种含醇脱氢酶基因的重组质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-LbADH,分别在Escherichia coliBL21(DE3)中进行诱导表达。诱导表达方法:将过夜培养的重组大肠杆菌按体积比为1%的量转接到400mL TB发酵培养基中,当细胞OD600达到0.6-0.8后,加入终浓度为2mM的IPTG,在18℃诱导表达培养20h。催化方法:诱导表达结束后,4℃、6000rpm、12分钟离心收集细胞。于50ml 50mM pH 7.0磷酸盐缓冲液中,细胞OD600为20,加入不同浓度酪氨酸或者左旋多巴,于30℃反应,时间24小时。转化结束后液相色谱测定羟基酪醇,结果如表3-1、表3-2以及表3-3所示。
表3-1不同醇脱氢酶加入约1mM底物催化比较
Figure BDA0002106423120000091
表3-2不同醇脱氢酶加入约10mM底物催化比较
Figure BDA0002106423120000092
Figure BDA0002106423120000101
表3-3不同醇脱氢酶加入约30mM底物催化比较
Figure BDA0002106423120000102
从表3-1、表3-2以及表3-3的对比实验结果可以看出,加入较低浓度的底物如1mM左右时,得到目标化合物的产率达到99%以上;加入10mM左右的底物浓度时,由酪氨酸催化得到酪醇的产率达到100%,由L-多巴催化得到羟基酪醇的产率达到83%以上;加入较高的底物浓度如30mM左右时,得到目标化合物的产率仍可以达到99%以上;表明这二种工程菌在底物浓度高的时候仍可以实现和低底物浓度时相同的催化效果,解决了目前底物浓度较高,产率较低的问题。
另外,鉴于两种来源的醇脱氢酶都可以实现目标化合物的高效转化,产率和催化速率相当,考虑到厌氧嗜热芽孢杆菌来源的BsADH在较高的温度下仍然具备较好的催化活力,有利于提高菌株工艺优化的空间,最终我们选取了厌氧嗜热芽孢杆菌来源的BsADH用于后续双路径合成羟基酪醇。
实施例4酪氨酸通过双路径合成羟基酪醇
本实验对用于表达六种酶的载体采取了两种组合方法进行比较,一种使用pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH双质粒(质粒构建见实施例1);另外一种则将基因对应的载体进行调换,即pETDuet-HpaBC-M.iFDH和pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH双质粒。
pETDuet-HpaBC-M.iFDH质粒的构建:
a)将pETDuet-1载体质粒采用SacI/XhoI双酶切,酶切载体胶回收;
b)将pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH质粒采用SacI/XhoI双酶切,获得片段HpaBC-M.iFDH胶回收;
c)将上述获得的酶切载体与HpaBC-M.iFDH片段使用T4连接酶进行连接,方法参考T4连接酶的使用说明书;
d)连接产物的大肠杆菌转化方法同实施例1,转化后的大肠杆菌均匀涂布在含氨苄霉素的LB平板上37℃过夜培养。
e)挑单菌落,使用引物MB-128-petDuet-M1-seq-F/MB-131-T7t-seq-R(SEQ IDNO:21,SEQ ID NO:24)做菌落PCR验证其正确性,条带正确的单克隆进行DNA测序以保证其准确性,最后保存正确转化子;
pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH质粒的构建:
a)将pRSFDuet-1载体质粒采用NcoI/XhoI双酶切,酶切载体胶回收;
b)将pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH质粒采用XbaI/PacI双酶切,获得片段E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH胶回收;
c)将上述获得的酶切载体与E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH片段使用GenBuilderTMCloning Kit试剂盒进行连接,方法同实施例1,后续连接产物转化与菌落筛选方法同上。
双质粒菌株表达:
对于第一种组合,pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH双质粒,取1uL质粒pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH转入到100uL实施例3使用的包含质粒pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH的Escherichia coli BL21(DE3)感受态细胞,转化方法同前,得到含有6种基因的双质粒大肠杆菌重组菌株E.coli BL21(DE3)/pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH,pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH;
对于第二种组合,pETDuet-HpaBC-M.iFDH和pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH双质粒组合,取1uL质粒pETDuet-HpaBC-M.iFDH转入到100uL Escherichia coliBL21(DE3)感受态细胞,方法同前;取1uL质粒pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH转入到100uL上述构建的含pETDuet-HpaBC-M.iFDH质粒的感受态细胞,得到含有6种基因的双质粒大肠杆菌重组菌株E.coli BL21(DE3)/pETDuet-HpaBC-M.iFDH,pRSFDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH;
将上述构建的两种菌株分别进行表达。采取与实施例2相同的诱导表达方法,诱导后收集菌体于50ml 50mM pH 7.0磷酸盐缓冲液中,细胞OD600为20,酪氨酸浓度为46mM,甲酸铵浓度为50mM,于30℃反应,时间24小时。转化结束后液相色谱测定羟基酪醇。结果如表4所示。
表4:双路径合成羟基酪醇
Figure BDA0002106423120000121
以上结果表明采取pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH双质粒体系时,羟基酪醇的生产量和产率显著高于另外一种组合。
采取pETDuet-E.cTyrB-ScGDH2-ScARO10-BsADH和pRSFDuet-HpaBC-M.iFDH双质粒体系生产羟基酪醇,底物酪氨酸廉价易得,并且可在较高底物浓度下,得到2.5g/L羟基酪醇。现有技术中,以1mM酪氨酸为底物,产率仅为0.19(mol/mol),通过本发明的双路径生产羟基酪醇,底物浓度增加到了46mM,并且羟基酪醇的产率提高了252%,解决了目前底物浓度高,羟基酪醇产率低,产量少的问题。
序列信息
SEQ ID NO:1编码M.iFDH的核苷酸序列
atggctaaatgcgttatggttctgtacccggacccggttgacggttacccgccggcttacgctcgtgactctatcccgaccatccacggttacccggacggttctaccgttccgaccccgtctaccatcgacttcaccccgggtgaactgctgggttgcgtttctggtgctctgggtctgcgtaaattcttcgaagacgctggtcacgaactggttgttacctctgacaaagacggtccggactctgaattcgaacgtgctctgccggacgctgaaatcgttatctctcagccgttctggccggcttacctgaccaaagaacgtatcgctaaagctccgaaactgaaactggctctgaccgctggtatcggttctgaccacgttgacctggacgctgctaaagaacgtggtatcaccgttgctgaagttacctactctaactctatctctgttgctgaacacgctgttatgcagatcctggctctggttcgtaacttcgttccgtctcaccgttgggctgttgaaggtggttggaacatcgctgactgcgttgaacgtgcttacgacctggaaggtatggacgttggtgttatcgctgctggtcgtatcggtcgtgctgttctgcgtcgtctggctccgttcgacgttaacctgcactacaccgacacccgtcgtctggctccggaagttgaaaaagaactgaacgttaccttccacccgaccgttcaggaactggttcgtgctgttgacgttgtttctatccactctccgctgtacgctgacacccgtgctatgttcgacgaaaaactgatctctaccatgcgtcgtggttcttacatcgttaacaccgctcgtgctgaagaaaccgttccggaagctatcgctgacgctctgcgttctggtcagctgggtggttacgctggtgacgtttggtacccgcagccgccgccggttgctcacccgtggcgtaccatgccgaacaacgctatgaccccgcacgtttctggtaccaccctgtctgctcaggctcgttacgctgctggtacccgtgaaatcctggaatcttggttcgctggtaccccgatccgtccggaatacctgatcgttgaaggtggtcgtctggctggtaccggtgctctgtcttaccagaaataa
SEQ ID NO:2编码BsADH的核苷酸序列
atgaaagccgctgtagttgaacaatttaaggaaccattaaaaataaaagaagtagaaaaaccaaccatttcatatggagaagtattagtccgcattaaagcatgcggtgtttgtcatactgacttgcatgccgctcacggcgattggccggtaaaaccaaaacttcctttaatccctggccatgaaggagtaggaattgttgaagaagtaggtccaggcgtaacccatttaaaagtgggcgaccgcgttggaattccttggttatattctgcatgcggccattgtgattattgtttaagcggccaagagacattatgtgagcaccaaaaaaacgctggctactctgttgatggagggtatgcagaatattgcagagcggcagcagactatgtggttaaaattcctgacaacttatcatttgaagaagctgccccaattttctgcgccggagttactacctataaagcgttaaaagtaacaggggcaaaaccaggagaatgggtagcaatttacggtatcggcggccttggacacgttgccgttcaatacgcgaaggcgatgggacttaatgtcgttgctgttgatatcggcgacgaaaaacttgaacttgcaaaagaacttggcgctgatcttgttgtaaaccctttgaaagaagatgcagcgaaatttatgaaagagaaagtcggcggagttcacgcagcagtcgtaacagctgtatctaagccagcgtttcaatctgcgtacaattctatccgcagaggcggagcttgtgtgcttgtcggattgccaccggaagaaatgcctattccaatttttgatacggttttaaatggaatcaaaatcatcggttccattgtcggcacgcggaaagacctgcaagaagcgctccaattcgcagcggaaggtaaagtaaaaaccattattgaagtgcaacctcttgaaaaaattaatgaagtatttgacagaatgctaaaaggtcaaattaacgggcgtgtagttttaacgttagaagataaataa
SEQ ID NO:3编码LbADH的核苷酸序列
atgcagatcaaaaccgctttctctgacggtacctctgaacagctgaaaatcatcgacgctaccctggacgaaccgaaagctaacgaagttctgatcaaaatggttgctaccggtgtttgccacaccgacaccgctggtcgtgacggtctgaccaccccgctgccggtttctctgggtcacgaaggtgctggtatcgttgaacaggttggttcttctgttatggacctgcagccgggtgaccacgttgttctgtctttcgcttactgcggtcgttgccagcactgcctgaccggtcacccgggtatgtgcgaacacttcaacgaactgaacttcgctggtcacaacttcgacggttctcaccgtatccacaccctggacggtcagccgatctctaccttcttcggtcagtcttctttctctacccacaccgttgttgaccagcacaacgttatcaaagttgacccgaccgttgacctgcgtctgctgggtccgctgggttgcggtatccagaccggtgctggtaccatcctgaactacctgcagccgaaattcggtgaatctctggttatcttcggtaccggtgctgttggtctgtctgctatcatggctgctaaaatcaccggtgctaaccacatcatcgctatcgacatcttcgacaaccgtctggctctggctaaagaactgggtgctaccgaagttatcaactctcaccaggctgacgttgaagctaccctgaaagaaatcctgccgaccggtgctgactacgctatcgacaccaccggtgtttctccggttgttatgaacgctctgcacgctctgaaaccgggtggtgaatgcgctgttgttggtatgggtcgtggtctgaccttcaacctgatggacgacctgatggctgaaggtaaaaaaatctctggtgttatcgaaggtgacgctatcccgcagctgttcatcccgaaactggttgactactacaaacagggtcgtttcccgttcgacaaactgatcaaattctacgacttcgaccagatcaacgacggtttcgctgcttctaaagacggttctgttctgaaaccggttatcaccttctaa
SEQ ID NO:4 MB-118-TyrB-F
acagccaggatccgaattcggtgtttcaaaaagttgacgcctac
SEQ ID NO:5 MB-119-TyrB-R
cattatgcggccgcaagcttttacatcaccgcagcaaac
SEQ ID NO:6 MB-114-pETDuet-HpaBC-F-SacI
gccaggatccgaattcgagctcgatgaaaccagaagatttccgcg
SEQ ID NO:7 MB-115-pETDuet-HpaBC-R-SalI
gcggccgcaagcttgtcgacttaaatcgcagcttccatttccagc
SEQ ID NO:8 MB-144-ARO8-F
caccatcatcaccacagccaggatccgaattcgatgactttacctgaatcaaaagact
SEQ ID NO:9 MB-145-ARO8-R
aagcttctatttggaaataccaaattcttcgtat
SEQ ID NO:10 MB-120-ScGDH2-F
acaacgtgtggcaaaggcgtttgctgcggtgatgtaaaagctttaagaaggagatataccatgctttttgataacaaaaatcgcgSEQ ID NO:11 MB-121-ScGDH2-R
cttaagcattatgcggccgctcaagcacttgcctccg
SEQ ID NO:12 MB-122-ScARO10-F
tataagaaggagatatacatatggcacctgttacaattgaaaag
SEQ ID NO:13 MB-123-ScARO10-R
ggtatatctccttcttagagctcctattttttatttcttttaagtgccgctg
SEQ ID NO:14 MB-124-ARO10-BsADH-F
gagctctaagaaggagatataccatgaaagccgctgtagttg
SEQ ID NO:15 MB-125-BsADH-R
ttaccagactcgagggtaccttatttatcttctaacgttaaaactacacgc
SEQ ID NO:16 MB-126-ARO10-LbADH-F
gagctctaagaaggagatataccatgcagatcaaaaccgctttc
SEQ ID NO:17 MB-127-LbADH-R
ttaccagactcgagggtaccgaaggtgataaccggtttcagaacag
SEQ ID NO:18 MB-146-A-ScGDH2-F
gtatttccaaatagaagctttaagaaggagatataccatgctttttgataacaaaaatcgc
SEQ ID NO:19 MB-104-NdeI-M.iFDH-F
tataagaaggagatatacatatggctaaatgcgttatggttctg
SEQ ID NO:20 MB-105-MiFDH-SacI-R
cgaaagtcactcgcgttcatggtatatctccttcttagagctcttatttctggtaagacagagcaccg
SEQ ID NO:21 MB-128-petDuet-M1-seq-F
atgcgtccggcgtaga
SEQ ID NO:22 MB-129-petDuet-M1-seq-R
gattatgcggccgtgtacaa
SEQ ID NO:23 MB-130-petDuet-M2-seq-F
ttgtacacggccgcataatc
SEQ ID NO:24 MB-131-T7t-seq-R
gctagttattgctcagcgg
序列表
<110> 枫杨生物研发(南京)有限公司
<120> 一种生产羟基酪醇的工程菌
<160> 24
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1155
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
atggctaaat gcgttatggt tctgtacccg gacccggttg acggttaccc gccggcttac 60
gctcgtgact ctatcccgac catccacggt tacccggacg gttctaccgt tccgaccccg 120
tctaccatcg acttcacccc gggtgaactg ctgggttgcg tttctggtgc tctgggtctg 180
cgtaaattct tcgaagacgc tggtcacgaa ctggttgtta cctctgacaa agacggtccg 240
gactctgaat tcgaacgtgc tctgccggac gctgaaatcg ttatctctca gccgttctgg 300
ccggcttacc tgaccaaaga acgtatcgct aaagctccga aactgaaact ggctctgacc 360
gctggtatcg gttctgacca cgttgacctg gacgctgcta aagaacgtgg tatcaccgtt 420
gctgaagtta cctactctaa ctctatctct gttgctgaac acgctgttat gcagatcctg 480
gctctggttc gtaacttcgt tccgtctcac cgttgggctg ttgaaggtgg ttggaacatc 540
gctgactgcg ttgaacgtgc ttacgacctg gaaggtatgg acgttggtgt tatcgctgct 600
ggtcgtatcg gtcgtgctgt tctgcgtcgt ctggctccgt tcgacgttaa cctgcactac 660
accgacaccc gtcgtctggc tccggaagtt gaaaaagaac tgaacgttac cttccacccg 720
accgttcagg aactggttcg tgctgttgac gttgtttcta tccactctcc gctgtacgct 780
gacacccgtg ctatgttcga cgaaaaactg atctctacca tgcgtcgtgg ttcttacatc 840
gttaacaccg ctcgtgctga agaaaccgtt ccggaagcta tcgctgacgc tctgcgttct 900
ggtcagctgg gtggttacgc tggtgacgtt tggtacccgc agccgccgcc ggttgctcac 960
ccgtggcgta ccatgccgaa caacgctatg accccgcacg tttctggtac caccctgtct 1020
gctcaggctc gttacgctgc tggtacccgt gaaatcctgg aatcttggtt cgctggtacc 1080
ccgatccgtc cggaatacct gatcgttgaa ggtggtcgtc tggctggtac cggtgctctg 1140
tcttaccaga aataa 1155
<210> 2
<211> 1020
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
atgaaagccg ctgtagttga acaatttaag gaaccattaa aaataaaaga agtagaaaaa 60
ccaaccattt catatggaga agtattagtc cgcattaaag catgcggtgt ttgtcatact 120
gacttgcatg ccgctcacgg cgattggccg gtaaaaccaa aacttccttt aatccctggc 180
catgaaggag taggaattgt tgaagaagta ggtccaggcg taacccattt aaaagtgggc 240
gaccgcgttg gaattccttg gttatattct gcatgcggcc attgtgatta ttgtttaagc 300
ggccaagaga cattatgtga gcaccaaaaa aacgctggct actctgttga tggagggtat 360
gcagaatatt gcagagcggc agcagactat gtggttaaaa ttcctgacaa cttatcattt 420
gaagaagctg ccccaatttt ctgcgccgga gttactacct ataaagcgtt aaaagtaaca 480
ggggcaaaac caggagaatg ggtagcaatt tacggtatcg gcggccttgg acacgttgcc 540
gttcaatacg cgaaggcgat gggacttaat gtcgttgctg ttgatatcgg cgacgaaaaa 600
cttgaacttg caaaagaact tggcgctgat cttgttgtaa accctttgaa agaagatgca 660
gcgaaattta tgaaagagaa agtcggcgga gttcacgcag cagtcgtaac agctgtatct 720
aagccagcgt ttcaatctgc gtacaattct atccgcagag gcggagcttg tgtgcttgtc 780
ggattgccac cggaagaaat gcctattcca atttttgata cggttttaaa tggaatcaaa 840
atcatcggtt ccattgtcgg cacgcggaaa gacctgcaag aagcgctcca attcgcagcg 900
gaaggtaaag taaaaaccat tattgaagtg caacctcttg aaaaaattaa tgaagtattt 960
gacagaatgc taaaaggtca aattaacggg cgtgtagttt taacgttaga agataaataa 1020
<210> 3
<211> 1089
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
atgcagatca aaaccgcttt ctctgacggt acctctgaac agctgaaaat catcgacgct 60
accctggacg aaccgaaagc taacgaagtt ctgatcaaaa tggttgctac cggtgtttgc 120
cacaccgaca ccgctggtcg tgacggtctg accaccccgc tgccggtttc tctgggtcac 180
gaaggtgctg gtatcgttga acaggttggt tcttctgtta tggacctgca gccgggtgac 240
cacgttgttc tgtctttcgc ttactgcggt cgttgccagc actgcctgac cggtcacccg 300
ggtatgtgcg aacacttcaa cgaactgaac ttcgctggtc acaacttcga cggttctcac 360
cgtatccaca ccctggacgg tcagccgatc tctaccttct tcggtcagtc ttctttctct 420
acccacaccg ttgttgacca gcacaacgtt atcaaagttg acccgaccgt tgacctgcgt 480
ctgctgggtc cgctgggttg cggtatccag accggtgctg gtaccatcct gaactacctg 540
cagccgaaat tcggtgaatc tctggttatc ttcggtaccg gtgctgttgg tctgtctgct 600
atcatggctg ctaaaatcac cggtgctaac cacatcatcg ctatcgacat cttcgacaac 660
cgtctggctc tggctaaaga actgggtgct accgaagtta tcaactctca ccaggctgac 720
gttgaagcta ccctgaaaga aatcctgccg accggtgctg actacgctat cgacaccacc 780
ggtgtttctc cggttgttat gaacgctctg cacgctctga aaccgggtgg tgaatgcgct 840
gttgttggta tgggtcgtgg tctgaccttc aacctgatgg acgacctgat ggctgaaggt 900
aaaaaaatct ctggtgttat cgaaggtgac gctatcccgc agctgttcat cccgaaactg 960
gttgactact acaaacaggg tcgtttcccg ttcgacaaac tgatcaaatt ctacgacttc 1020
gaccagatca acgacggttt cgctgcttct aaagacggtt ctgttctgaa accggttatc 1080
accttctaa 1089
<210> 4
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
acagccagga tccgaattcg gtgtttcaaa aagttgacgc ctac 44
<210> 5
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
cattatgcgg ccgcaagctt ttacatcacc gcagcaaac 39
<210> 6
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
gccaggatcc gaattcgagc tcgatgaaac cagaagattt ccgcg 45
<210> 7
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
gcggccgcaa gcttgtcgac ttaaatcgca gcttccattt ccagc 45
<210> 8
<211> 58
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
caccatcatc accacagcca ggatccgaat tcgatgactt tacctgaatc aaaagact 58
<210> 9
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
aagcttctat ttggaaatac caaattcttc gtat 34
<210> 10
<211> 85
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
acaacgtgtg gcaaaggcgt ttgctgcggt gatgtaaaag ctttaagaag gagatatacc 60
atgctttttg ataacaaaaa tcgcg 85
<210> 11
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
cttaagcatt atgcggccgc tcaagcactt gcctccg 37
<210> 12
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
tataagaagg agatatacat atggcacctg ttacaattga aaag 44
<210> 13
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
ggtatatctc cttcttagag ctcctatttt ttatttcttt taagtgccgc tg 52
<210> 14
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
gagctctaag aaggagatat accatgaaag ccgctgtagt tg 42
<210> 15
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
ttaccagact cgagggtacc ttatttatct tctaacgtta aaactacacg c 51
<210> 16
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
gagctctaag aaggagatat accatgcaga tcaaaaccgc tttc 44
<210> 17
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
ttaccagact cgagggtacc gaaggtgata accggtttca gaacag 46
<210> 18
<211> 61
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
gtatttccaa atagaagctt taagaaggag atataccatg ctttttgata acaaaaatcg 60
c 61
<210> 19
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
tataagaagg agatatacat atggctaaat gcgttatggt tctg 44
<210> 20
<211> 68
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
cgaaagtcac tcgcgttcat ggtatatctc cttcttagag ctcttatttc tggtaagaca 60
gagcaccg 68
<210> 21
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 21
atgcgtccgg cgtaga 16
<210> 22
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 22
gattatgcgg ccgtgtacaa 20
<210> 23
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 23
ttgtacacgg ccgcataatc 20
<210> 24
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 24
gctagttatt gctcagcgg 19

Claims (18)

1.一种生产羟基酪醇的工程菌,其特征在于,所述工程菌同时表达6种酶,分别为4-羟基苯乙酸3-单加氧酶、甲酸脱氢酶、L-α-氨基酸转氨酶、L-谷氨酸脱氢酶、α-酮酸脱羧酶和醇脱氢酶。
2.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述工程菌同时表达的6种酶是通过双质粒共表达编码所述6种酶的基因实现的。
3.根据权利要求2所述的工程菌,其特征在于,所述双质粒为pRSFDuet-1和pETDuet-1。
4.根据权利要求3所述的工程菌,其特征在于,所述pRSFDuet-1装载编码4-羟基苯乙酸3-单加氧酶的基因和编码甲酸脱氢酶的基因;所述pETDuet-1装载编码L-α-氨基酸转氨酶的基因、编码L-谷氨酸脱氢酶的基因、编码α-酮酸脱羧酶的基因和编码醇脱氢酶的基因。
5.根据权利要求3所述的工程菌,其特征在于,所述pETDuet-1装载编码4-羟基苯乙酸3-单加氧酶的基因和编码甲酸脱氢酶的基因;所述pRSFDuet-1装载编码L-α-氨基酸转氨酶的基因、编码L-谷氨酸脱氢酶的基因、编码α-酮酸脱羧酶的基因和编码醇脱氢酶的基因。
6.根据权利要求4或5所述的工程菌,其特征在于,所述工程菌是通过将pRSFDuet-1和pETDuet-1质粒转化到宿主大肠杆菌B21感受态细胞中得到的。
7.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述4-羟基苯乙酸3-单加氧酶来自于大肠杆菌。
8.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述甲酸脱氢酶来自于胞内分枝杆菌。
9.根据权利要求8所述的工程菌,其特征在于,所述编码甲酸脱氢酶的核苷酸序列为SEQ ID NO:1。
10.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述L-α-氨基酸转氨酶来自于大肠杆菌或酿酒酵母。
11.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述L-谷氨酸脱氢酶来自于酿酒酵母。
12.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述α-酮酸脱羧酶来自于酿酒酵母。
13.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于,所述醇脱氢酶来自于厌氧嗜热芽孢杆菌或短乳杆菌。
14.根据权利要求13所述的工程菌,其特征在于,所述来自于厌氧嗜热芽孢杆菌的编码醇脱氢酶的核苷酸序列为SEQ ID NO:2;所述来自于短乳杆菌的编码醇脱氢酶的核苷酸序列为SEQ ID NO:3。
15.一种生产羟基酪醇的方法,包括以下步骤:
(1)将权利要求1-14任一项所述的工程菌放入磷酸盐缓冲液中;
(2)加入酪氨酸和含甲酸根的化合物进行催化反应。
16.根据权利要求15所述的生产羟基酪醇的方法,其特征在于,所述含甲酸根的化合物选自甲酸、甲酸钠、甲酸铵或甲酸钙。
17.根据权利要求15所述的生产羟基酪醇的方法,其特征在于,所述催化反应条件为:pH 6.0-9.0,温度15-40℃,时间1-48小时。
18.权利要求1-14任一项所述的工程菌在生产羟基酪醇中的应用。
CN201910554302.6A 2019-06-25 2019-06-25 一种生产羟基酪醇的工程菌 Pending CN112126608A (zh)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910554302.6A CN112126608A (zh) 2019-06-25 2019-06-25 一种生产羟基酪醇的工程菌
PCT/CN2020/098114 WO2020259585A1 (zh) 2019-06-25 2020-06-24 一种生产羟基酪醇的工程菌

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910554302.6A CN112126608A (zh) 2019-06-25 2019-06-25 一种生产羟基酪醇的工程菌

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN112126608A true CN112126608A (zh) 2020-12-25

Family

ID=73850043

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910554302.6A Pending CN112126608A (zh) 2019-06-25 2019-06-25 一种生产羟基酪醇的工程菌

Country Status (2)

Country Link
CN (1) CN112126608A (zh)
WO (1) WO2020259585A1 (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113025546A (zh) * 2021-03-18 2021-06-25 江南大学 一种多酶级联转化l-酪氨酸生产酪醇的方法
CN113493758A (zh) * 2021-05-31 2021-10-12 江南大学 一株缩短发酵周期的产酪醇重组大肠杆菌及其应用

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104099379B (zh) * 2013-04-08 2019-04-30 中国科学院天津工业生物技术研究所 一种在大肠杆菌中生物合成酪醇的方法及应用
CN107586752B (zh) * 2017-08-04 2019-12-24 江南大学 一种工程菌及其应用
CN109370967B (zh) * 2018-10-23 2021-11-23 江南大学 一种工程菌及其在酪醇生产中的应用
CN109295113A (zh) * 2018-10-23 2019-02-01 江南大学 一种生产羟基酪醇的方法

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113025546A (zh) * 2021-03-18 2021-06-25 江南大学 一种多酶级联转化l-酪氨酸生产酪醇的方法
CN113493758A (zh) * 2021-05-31 2021-10-12 江南大学 一株缩短发酵周期的产酪醇重组大肠杆菌及其应用
CN113493758B (zh) * 2021-05-31 2022-08-02 江南大学 一株缩短发酵周期的产酪醇重组大肠杆菌及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
WO2020259585A1 (zh) 2020-12-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR20140027541A (ko) 이산화탄소 고정 경로를 도입한 미생물
CN112210524B (zh) 一种联产3-羟基丙酸和1,3-丙二醇的基因工程菌及其构建方法和应用
CN107686850B (zh) 一种利用共表达重组菌株转化生产α-酮戊二酸的方法
US10294479B2 (en) Candida carbonyl reductase and method for preparing (R)-lipoic acid precursor
CN108949652B (zh) 一种工程菌及其生产咖啡酸的应用
WO2022174597A1 (zh) 一种用于l-肌氨酸生产的基因工程菌及构建方法与应用
CN111748508B (zh) 一种高产羟基酪醇的大肠杆菌构建方法及应用
CN116590209A (zh) 一种产d-泛酸的基因工程菌、构建方法及应用
WO2020259585A1 (zh) 一种生产羟基酪醇的工程菌
CN109371070B (zh) 一种高产α-酮异戊酸的方法
CN108913724B (zh) 一种以丙二酸盐为原料合成3-羟基丙酸的制备方法及其相应重组细胞和应用
CN108410831B (zh) 酮酸还原酶、基因、工程菌及在合成手性芳香2-羟酸中的应用
Ke et al. Efficient gamma-aminobutyric acid bioconversion by engineered Escherichia coli
CN108949649B (zh) 一种工程菌及其在生产左旋多巴中的应用
WO2015031504A1 (en) RECOMBINANT PATHWAY AND ORGANISMS FOR MALONYL-CoA SYNTHESIS
CN108949647B (zh) 一种工程菌及其在生产l-酪氨酸中的应用
CN109679978B (zh) 一种用于制备l-2-氨基丁酸的重组共表达体系及其应用
CN108949650B (zh) 一种丹参素的生产方法及工程菌
CN112126614B (zh) 一种利用全细胞转化制备覆盆子酮的方法
US10870870B2 (en) Engineering strain and application thereof in production of Danshensu
CN108949653B (zh) 一种工程菌及其在丹参素生产中的应用
CN110628849A (zh) 氧化态烟酰胺类辅因子再生的方法
CN112501092B (zh) 阻断甘油-葡萄糖代谢途径的Diolis梭菌碱基编辑突变株
CN108949651B (zh) 一种工程菌及其以廉价底物生产对羟基苯乳酸的应用
CN111826405B (zh) 一种生物催化还原丙酮酸产d-乳酸的方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication

Application publication date: 20201225