CN111154751A - 一种高效的提取毛干中dna的方法 - Google Patents

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Abstract

一种高效的提取毛干中DNA的方法,属于分子生物学技术领域。为了提高毛干DNA回收效率,减少色素等污染物对下游实验的干扰,扩大毛干适用范围,本发明用1%SDS和4M NaOH溶液处理样本,然后按一定比例加入SDS、DTT、PK和Ca2+进行消化,随后用EDTA溶液螯合掉Ca2+和其他离子,提高毛发消化效率,最后利用磁珠对DNA的强吸附能力吸附DNA,再使用漂洗液A处理不同类型的发干,最终获得毛干中DNA。本发明方法获得的DNA经过一轮PCR,就可以检测到核基因组的目的片段,SNP和STR分型的成功率和正确率均较高。本发明适用于动物生态、法医鉴定等各种条件下人类和动物毛干DNA的提取。

Description

一种高效的提取毛干中DNA的方法
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种高效的提取毛干中DNA的方法。
背景技术
通常,毛发样品分为具有毛囊的毛根和不具有毛囊的毛轴(或称毛干)两种,头发代谢活性强的区域称为毛根,毛根会附带很多毛囊的残留物,而毛轴属于高度角化的部分,所以具有毛囊的毛根可以从中提出高质量的mtDNA(线粒体DNA)和nuDNA(核DNA),而不具有毛囊的毛轴通常仅能够提出少量的mtDNA。曾有人研究毛发超纤维结构图谱,发现毛轴中能清晰看到线粒体,而无法看到完整的细胞核,线粒体可以为mtDNA提供保护,而失去细胞核的nuDNA会暴露在各种内切酶的环境中,发生不同程度的降解,普遍认为可提取的DNA长度不超过180bp,所以nuDNA的质量要比mtDNA的质量差很多,这就是为什么我们能很容易从毛轴中提出mtDNA而很难提出nuDNA。此外,使用DNA的原位标记技术,将nuDNA与DNA的特异性染料Hoechst 33258结合,通过荧光显微镜观察到nuDNA的存在。虽然毛轴中的DNA数量很少而且质量也比较差,但毛轴具有稳定的化学结构。其表面的硬角质层,较强的二硫键结构以及抑制微生物降解的蛋白质结构,使头发在室温不溶于水,稀酸、碱溶液以及有机溶剂,保存更长时间。在过去的20多年中,研究表明,毛发中的DNA的确可以存活更久,人们从数百年甚至上千年的古老的考古样本的毛发中提出并证明了mtDNA的存在。
目前常见的毛发的提取方法有经典有机溶剂萃取法,Chelex 110处理法,QiagenPromega等试剂盒处理法及PCR缓冲液加蛋白酶K快速提取法等方法,PCR扩增结果表明PCR缓冲液快速提取法成功率最高,为85%,其次是Chelex方法成功率为70%,而经典有机溶剂提取法和Qiagen tissue kit试剂盒法的成功率仅仅是48%和42%,其中Chelex 110处理法和试剂盒法扩增效率一般且成本过高,而经典有机溶剂萃取法需要大量的样本,且操作复杂,效率低下,此外,上述技术中存在如下问题:
(1)提取的nuDNA片段短。
之前人们检测到的nuDNA片段不会超过200bp,多数人都会选择150以下bp长度的nuDNA片段作为目的片段。
(2)PCR扩增nuDNA片段效率低。
目前所有的DNA提取方法中,即使能从毛干中提取出nuDNA,但由于提取的nuDNA的量很少或者色素等物质的干扰,使其很难直接进行下游实验,通常采用两轮PCR才可以勉强检测到目的片段。
(3)回收效率低或者色素干扰。
目前提取DNA常用DNA纯化柱进行回收,但不适合毛干中nuDNA这种短小片段的回收,在漂洗的过程中,多数片段都被洗掉;磁珠跟纯化柱相比对DNA具有更强的吸附能力,但由于磁珠的纯化能力较差,提取后的DNA原液容易有色素残留,严重影响后序实验。还有一些选择试剂盒法更加昂贵,但提取效率并没有明显的提升。
(4)目前从毛干中提取的DNA无法系统的应用到微卫星(又称STR)分型和SNP分型等核基因的分析实验中。
发明内容
为了提高DNA回收效率、扩大扩增片段范围、同时减少色素等污染物对下游实验的干扰,本发明分别从提取的前处理、消化体系和纯化回收方法进行了改进,技术方案如下:
一种高效的提取毛干中DNA的方法,步骤如下:
一、毛干的前处理:
将毛干置于酒精中浸泡5min~10min后蒸干,然后与质量分数1%-2%的SDS溶液混合,60℃~65℃条件下加热30min~40min;取出毛干清洗后,再将毛干置于4mol/L的NaOH溶液中,65℃~70℃浸泡15s~35s,取出清洗后,用酒精浸泡5min~10min;
二、毛干的消化:
将经过前处理后的毛干置于处理液中,56℃消化3h~4h,然后再加入PK溶液消化1h,再加入EDTA溶液56℃温育30min~40min,得到毛干消化液;所述处理液由消化液A、PK溶液、SDS溶液和DTT溶液配制而成,所述消化液A为含有50mmol/LTris-HCl、10mmol/L Ca2+和100mmol/LNaCl的水溶液;
三、消化液提纯:
1)将步骤二得到的毛干消化液与氯仿溶液按照1:1的体积比混合后静置3min~4min,然后离心,取上清;
2)向上清液中加入等体积异丙醇,混匀后加入磁珠,静置3min~4min,然后进行磁分离,弃废液;
3)然后,利用漂洗液A对磁珠进行漂洗,弃废液;所述漂洗液A为异丙醇和TE的混合液,pH=8;如步骤2)中上清液无色,则不需要步骤3);
4)然后,利用体积分数为70%~75%乙醇对磁珠进行漂洗,弃废液;
5)然后,将磁珠离心后进行磁分离,弃废液,晾干磁珠,去除乙醇;
6)再将磁珠与洗脱液混合,56℃加热10min~15min,离心后进行磁分离,得到的上清液即为毛干DNA。
进一步地限定,步骤一中所述酒精体积浓度为95%。
进一步地限定,步骤一中所述毛干与SDS溶液的用量比为:(1-10)mg:750μL。
进一步地限定,步骤一中将毛干与质量分数1%的SDS溶液混合,温度为65℃条件下加热30min;取出毛干清洗后,再将毛干置于4mol/L的NaOH溶液中,65℃浸泡20s。
进一步地限定,步骤二中所述毛干的消化,具体为:每1mg~10mg毛干中加入消化液A335μL,10mg/ml的PK溶液50μL,质量分数为15%的SDS溶液40μL,体积分数为15.4%的DTT溶液50μL,56℃消化3h后,再加入30μL 10mg/ml的PK溶液,继续消化1h,再加入0.5mol/L的EDTA溶液25μL,56℃消化30min。
进一步地限定,步骤三所述消化液提纯中,步骤1)中所述离心为12000rpm离心5min~10min。
进一步地限定,步骤三中所述漂洗液A中异丙醇的体积分数为30%~35%。
进一步地限定,步骤三中所述晾干为室温晾干5min~10min。
进一步地限定,步骤三所述磁珠与洗脱液混合后,56℃加热15min。
有益效果
本发明的技术创新性主要体现在:
(1)用1%~2%SDS和4mol/LNaOH溶液处理的样本,可以去掉大量细菌DNA和外源DNA的污染,但对核DNA的影响很小,极大的减小了大量的细菌DNA对后续分子实验的干扰。
(2)在消化体系中,按一定比例加入SDS、DTT、PK(蛋白酶K)和Ca2+可以极大的提高消化效率,随后用EDTA溶液螯合掉Ca2+和其他离子,避免对后续实验的干扰。消化4h~6h即可进行后续实验,缩短了以往提取毛发的消化时间。
(3)选择磁珠纯化消化液并用漂洗液A进行漂洗,即保证了磁珠对DNA极强的吸附能力,又避免了色素的干扰。
本发明所得的有益效果如下:
(1)本方法提取后的DNA可扩增的nuDNA片段可以达到250bp左右,个别个体扩增片段达到330bp左右,且成功率较高,而以往人们所能扩出来的nuDNA片段不超过200bp,成功率很低;mtDNA片段的扩增长度可达到1400bp,如有需要完全支持更长的mtDNA片段的扩增。
(2)本方法可以极大的提高PCR扩增nuDNA的效果,以前的提取方法提出来的DNA大多需要进行两轮扩增,才能检测到nuDNA的目的片段,而通过本方法提出来的DNA只需一轮PCR,就可以检测到核基因的目的片段。
(3)本方法适合各种动物的不同类型的毛发。以前的提取方法仅见于蓝狐等动物的毛发,而对于大多数动物的毛发,则很难提取出满足后续实验要求的DNA。
(4)本方法提取的DNA可以供SNP分型和STR分型。在已经做过的实验中,SNP分型的成功率和正确率(一次实验检测结果,与肌肉DNA分型对比)分别达到94%和94.7%,之前还没有人可以将毛干中的DNA应用到核DNA的SNP分型中;STR分型成功率为95%,分型正确率81%(一次实验检测结果,与肌肉DNA分型结果对比),以前STR成功分型的报道极为鲜见。
(5)本方法成本低廉。使用本方法每样本的提取成本在9元以下,经过组装试剂盒等措施,在保证提取效果的同时,成本还可以进一步降低。
附图说明
图1核基因片段(142bp,250bp)和线粒体DNA片段(1450bp左右)电泳图,(A)为线粒体DNA片段(CYTB,1430bp左右),(B)为核DNA片段(GAPDH,250bp),(C)为核DNA片段(GAPDH,142bp),(D)为核DNA片段(GAPDH,329bp),数字为样品编号;1为实施例1梅花鹿DNA样本,2、3为实施例2梅花鹿DNA样本,4、5为实施例3华南虎DNA样本,6、7为实施例4蓝狐绒毛样本,8、9为实施例5蓝狐针毛DNA样本c:阴性对照;M:Marker,条带大小从上到下为2000bp、1000bp、750bp、500bp、250bp、100bp;
图2微卫星分型比较,(右)华南虎肌肉DNA进行微卫星分型的结果(对照组),(左)华南虎毛干DNA分型微卫星分型的结果,其中横坐标数值为片段长度(bp),纵坐标为对应片段的信号峰强度;
图3从毛干中提取的DNA片段分布图,T3是虎针毛毛干DNA,Ar4是蓝狐绒毛毛干DNA,横坐标为片段大小(bp),纵坐标为浓度(pg/μL);
图4部分SNP分型数据的比较,W1-W6为狼肌肉DNA的SNP分型结果,WH1-WH6个体毛干DNA的SNP分型结果。
具体实施方式
实施例1.以梅花鹿为例描述毛干中DNA的提取。
一、毛干的前处理:
取待提取毛发适量(根据自己提取的量而定),放入含有雕牌洗衣粉的水溶液中清洗,随后用去离子水清洗两遍,最后将毛发放入医用酒精(体积分数95%)中浸泡10min,蒸干备用。称量1mg毛发,置于1.5mlEP管中,加入750μLSDS溶液(质量分数1%),放置在65℃水浴锅水浴30min,取出清洗两遍,放入新的EP管中,随后用65℃的NaOH溶液(4mol/L)浸泡20s,取出,无菌的双蒸水清洗两遍,用体积分数95%医用酒精浸泡5min,蒸干备用。
注:用NaOH溶液浸泡毛发时要严格控制时间,否则毛发受损严重会影响后续实验,不同类型的毛也可根据实际情况适当增加或减少浸泡时间。此步骤在去除细菌DNA的同时也会降低mtDNA的量,因此在一般实验中(如PCR扩增、STR或SNP分型)如果没有必要去除细菌DNA,可以省去此步骤。
二、毛干的消化:
向经过前处理后的毛干中加入处理液:消化液A 335μL(50mmol/LTris-HCl、10mMCa2+、100mmol/LNaCl)、PK溶液(10mg/ml)50μL、SDS(质量分数15%)溶液40μL和DTT(体积分数15.4%)溶液50μL;震荡,56℃水浴消化3h后,在加入30μLPK溶液(10mg/ml),震荡,继续消化1h,加入EDTA(0.5mol/L)溶液25μL,震荡,56°水浴30min,得到毛干消化液,取出备用。
三、消化液提纯
1.向步骤二得到的毛干消化液中加入500μl氯仿(实验要在通风橱或生物安全柜中操作,注意防护),轻柔混匀15s,静置3min,12000rpm离心10min。
2.取出离心管,小心吸取上清溶液(尽量吸净上清溶液,但不要吸取中间层)于新的1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,颠倒混匀10sec,再向离心管中加入30μL磁珠(使用前将磁珠震荡混合均匀),振荡混匀1min,室温静置3min,期间颠倒混匀2次,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液。
3.取下离心管,向离心管中加入700μL的漂洗液A(异丙醇和TE 3:7体积比混合得到的混合液,pH=8)轻柔混匀10s(如果磁珠凝结成小块可适当增加震荡力度使磁珠尽量的分散开),将离心管置于磁力加上进行磁分离,吸取废液,如步骤2的上清液(DNA混合液)无色,则不需要此步骤,此步骤主要处理色素的干扰。
4.从磁力架上取下离心管,向离心管中加入650μL漂洗液B(70%乙醇),轻柔混匀1min~2min,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液,重复步骤4一次。
5.将离心管10000rpm离心1min,再置于磁力架上进行磁分离,再次吸弃废液,室温开盖晾干5-10min,至乙醇完全挥发。
6.从磁力架上取下离心管,加入100μL洗脱液,振荡混匀,56℃水浴15min,每隔2min-3min轻摇离心管混匀5次-7次。将离心管从水浴锅中取出,10000rpm离心1min,置于磁力架或磁铁上进行磁分离,小心吸取上清至新的离心管中,所得上清即为目的DNA,可直接进行下游实验或于适当条件保存。
实施例2.与实施例1的不同在于,本实施例中所述的梅花鹿的毛发用量为5mg。
具体方法如下:
一、毛干的前处理:
取待提取毛发适量(根据自己提取的量而定),放入含有雕牌洗衣粉的水溶液中清洗,随后用去离子水清洗两遍,最后将毛发放入医用酒精(体积分数95%)中浸泡10min,蒸干备用。
称量两份5mg的鹿毛,置于1.5mlEP管中,其中一份加入750μL SDS溶液(质量分数1%),放置在60℃水浴锅水浴40min,取出清洗两遍,放入新的EP管中,随后用68℃的NaOH溶液(4mol/L)浸泡15s,取出,无菌的双蒸水清洗两遍,用医用酒精浸泡10min,蒸干备用。注:用NaOH溶液浸泡毛发时要严格控制时间,否则毛发受损严重会影响后续实验,不同类型的毛也可根据实际情况适当增加或减少浸泡时间。此步骤在去除细菌DNA的同时也会降低mtDNA的量,本实施例中另外一份鹿毛DNA不经NaOH处理,用于PCR扩增、STR或SNP分型。
二、毛干的消化:
向经过前处理后的毛干中加入处理液:消化液A 335μL(50mM Tris-HCl,10mM Ca2 +,100mM NaCl),PK溶液(10mg/ml)50μL,SDS(质量分数15%)溶液40μL和DTT(体积分数15.4%)溶液50μL;震荡,56℃水浴消化3h后,在加入30μLPK溶液(10mg/ml),震荡,继续消化1h,加入EDTA(0.5M)溶液25μL,震荡,56℃水浴40min,得到毛干消化液,取出备用。
三、消化液提纯
1.向毛干消化液中加入500μL氯仿(实验要在通风橱或生物安全柜中操作,注意防护),轻柔混匀15s,静置4min,12000rpm离心10min。
2.取出离心管,小心吸取上清溶液(尽量吸净上清溶液,但不要吸取中间层)于新的1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,颠倒混匀10sec,再向离心管中加入30μL磁珠(使用前将磁珠震荡混合均匀),振荡混匀1min,室温静置4min,期间颠倒混匀2次,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液。
3.取下离心管,向离心管中加入700μL的漂洗液A(异丙醇和TE 3:7体积比混合得到的混合液,pH=8)轻柔混匀10s(如果磁珠凝结成小块可适当增加震荡力度使磁珠尽量的分散开),将离心管置于磁力加上进行磁分离,吸取废液,如步骤2的上清溶液无色,则不需要此步骤,此步骤主要处理色素的干扰。
4.从磁力架上取下离心管,向离心管中加入650μL漂洗液B(75%乙醇),轻柔混匀1min~2min,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液,重复步骤4一次。
5.将离心管10000rpm离心1min,再置于磁力架上进行磁分离,再次吸弃废液,室温开盖晾干5-10min,至乙醇完全挥发。
6.从磁力架上取下离心管,加入100μL洗脱液,振荡混匀,56℃水浴10min,每隔2min~3min轻摇离心管混匀5~7次。将离心管从水浴锅中取出,10000rpm离心1min,置于磁力架或磁铁上进行磁分离,小心吸取上清至新的离心管中,所得上清即为目的DNA,可直接进行下游实验或于适当条件保存。
实施例3.与实施例1的不同在于,本实施例中步骤1)中所用的毛干为华南虎毛干。
具体方法如下:
一、毛干的前处理:
取待提取毛发适量(根据自己提取的量而定),放入含有雕牌洗衣粉的水溶液中清洗,随后用去离子水清洗两遍,最后将毛发放入医用酒精(体积分数95%)中浸泡10min,蒸干备用。
称量两份5mg的毛发,置于1.5mlEP管中,其中一份加入750μL SDS溶液(质量分数1%),放置在65℃水浴锅水浴30min,取出清洗两遍,放入新的EP管中,随后用65℃的NaOH溶液(4mol/L)浸泡35s,取出,无菌的双蒸水清洗两遍,用医用酒精浸泡5min,蒸干备用。
注:用NaOH溶液浸泡毛发时要严格控制时间,否则毛发受损严重会影响后续实验,不同类型的毛也可根据实际情况适当增加或减少浸泡时间。此步骤在去除细菌DNA的同时也会降低mtDNA的量,本实施例中另外一份鹿毛DNA不经NaOH处理,用于PCR扩增、STR或SNP分型。
二、毛干的消化:
向经过前处理后的毛干中加入处理液:消化液A 335μL(50Mm Tris-HCl、10mmol/LCa2+,100mmol/LNaCl),PK溶液(10mg/ml)50μL,SDS(质量分数15%)溶液40μL和DTT(体积分数15.4%)溶液50μL;震荡,56℃水浴消化4h后,在加入30μLPK溶液(10mg/ml),震荡,继续消化1h,加入EDTA(0.5M)溶液25μL,震荡,56℃水浴30min,得到毛干消化液,取出备用。
三、消化液提纯
1.向毛干消化液中加入500μl氯仿(实验要在通风橱或生物安全柜中操作,注意防护),轻柔混匀15s,静置3min,12000rpm离心10min。
2.取出离心管,小心吸取上清溶液(尽量吸净上清溶液,但不要吸取中间层)于新的1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,颠倒混10s,再向离心管中加入30μL磁珠(使用前将磁珠震荡混合均匀),振荡混匀1min,室温静置3min,期间颠倒混匀2次,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液。
3.取下离心管,向离心管中加入700μL的漂洗液A(异丙醇和TE 3:7体积比混合得到的混合液,pH=8)轻柔混匀10s(如果磁珠凝结成小块可适当增加震荡力度使磁珠尽量的分散开),将离心管置于磁力加上进行磁分离,吸取废液,如步骤2的上清液(即废液)无色,则不需要此步骤,此步骤主要处理色素的干扰。
4.从磁力架上取下离心管,向离心管中加入650μL漂洗液B(70%乙醇),轻柔混匀1-2min,将离心管置于磁力架上进行磁分离,吸弃废液,重复步骤4一次。
5.将离心管10000rpm离心1min,再置于磁力架上进行磁分离,再次吸弃废液,室温开盖晾干5min~10min,至乙醇完全挥发。
6.从磁力架上取下离心管,加入100μL洗脱液,振荡混匀,56℃水浴15min,每隔2min~3min轻摇离心管混匀5~7次。将离心管从水浴锅中取出,10000rpm离心1min,置于磁力架或磁铁上进行磁分离,小心吸取上清至新的离心管中,所得上清即为目的DNA,可直接进行下游实验或于适当条件保存。
实施例4.重复实施例2,与实施例2的不同在于,本实施例中所述的毛干为蓝狐绒毛毛干。
实施例5.重复实施例2,与实施例2的不同在于,本实施例中所述的毛干为蓝狐针毛毛干。
参照上述DNA提取方法,本发明还分别提取了狼、狗等动物的毛干DNA。
考察本发明所述的提取DNA的方法的实验效果。
以GAPDH基因为例,通用引物Primer1,扩增产物长为142bp,序列如下:
F:GGTCAGACAACATTTGCCACA/R:ACAGCAGGTTTGTACTTTTTAGGTG。
华南虎DNA扩增引物Primer2,扩增产物长为250bp,序列如下:
F:CTGGTATGCTGCTGGGGTG/R:TGTGTTGGGTGATGAACGGG。
以本发明方法提取的毛干DNA为模板,经一轮PCR扩增即可得到目的片段,nuDNA片段可以达到250bp左右,个别个体扩增片段达到330bp左右,如引物A329(F:GAAACCGCAAAATTGGAC\R:GATCAAGAATTTAAAGCCCAT,用于蓝狐样本扩增)。
以CYTB基因为例,引物Primer3F:CCHCCATAAATAGGNGAAGG/R:WAGAAYTTCAGCTTTGGG,扩增毛干中线粒体DNA,以本发明方法提取的毛干DNA为模板,经一轮PCR扩增即可得到目的片段,mtDNA片段可以达到1430bp,如图1所示。
以梅花鹿和老虎的肌肉组织提取的DNA微卫星分型为对照,STR分型成功率为95%,分型正确率81%。如图2所示。以蓝狐的毛发作为研究对象,对所有样本进行荧光定量PCR,均得出有效的数值,如表1所示。
表1部分样本荧光定量实验结果,Sample1-5是蓝狐针毛,6-10是蓝狐绒毛。
Figure BDA0002366416630000091
使用2100expert-High Sensitivity DNAAssay试剂盒和Agilent 2100对所有样本进行分析,结果表明,毛干中的DNA片段主要在200bp以下和10kbp左右(此试剂盒检测的范围在10k以下),片段在10kbp左右的DNA大片段多数是细菌DNA,也有可能含有少量的线粒体,如图3所示,其中T3为老虎毛干DNA片段分布,Ar4为蓝狐绒毛的DNA片段分布。
在SNP分型实验中得到的灰狼、宠物狗和梅花鹿样本的SNP位点基因分型结果,结果表明,在灰狼和宠物狗的SNP位点的平均分型成功率为96.25%(90%~100%),匹配成功率(与肌肉组织DNA分型结果对比)为98.7%(90%~100%)。肉牛的SNP位点的平均分型成功率为85.42%(66.67%~100%),匹配成功率为87.80%(66.67%~100%),如图4所示为狼SNP结果。

Claims (9)

1.一种高效的提取毛干中DNA的方法,其特征在于,步骤如下:
一、毛干的前处理:
将毛干置于酒精中浸泡5min~10min后蒸干,然后与质量分数1%-2%的SDS溶液混合,60℃~65℃条件下加热30min~40min;取出毛干清洗后,再将毛干置于4mol/L的NaOH溶液中,65℃~70℃浸泡15s~35s,取出清洗后,用酒精浸泡5min~10min;
二、毛干的消化:
将经过前处理后的毛干置于处理液中,56℃消化3h~4h,然后再加入PK溶液消化1h,再加入EDTA溶液56℃温育30min~40min,得到毛干消化液;所述处理液由消化液A、PK溶液、SDS溶液和DTT溶液配制而成,所述消化液A为含有50mmol/LTris-HCl、10mmol/L Ca2+和100mmol/LNaCl的水溶液;
三、消化液提纯:
1)将步骤二得到的毛干消化液与氯仿溶液按照1:1的体积比混合后静置3min~4min,然后离心,取上清;
2)向上清液中加入等体积异丙醇,混匀后加入磁珠,静置3min~4min,然后进行磁分离,弃废液;
3)然后,利用漂洗液A对磁珠进行漂洗,弃废液;所述漂洗液A为异丙醇和TE的混合液,pH=8;如步骤2)中上清液无色,则不需要步骤3);
4)然后,利用体积分数为70%~75%乙醇对磁珠进行漂洗,弃废液;
5)然后,将磁珠离心后进行磁分离,弃废液,晾干磁珠,去除乙醇;
6)再将磁珠与洗脱液混合,56℃加热10min~15min,离心后进行磁分离,得到的上清液即为毛干DNA。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤一中所述酒精体积浓度为95%。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤一中所述毛干与SDS溶液的用量比为:(1-10)mg:750μL。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤一中将毛干与质量分数1%的SDS溶液混合,温度为65℃条件下加热30min;取出毛干清洗后,再将毛干置于4mol/L的NaOH溶液中,65℃浸泡20s。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤二中所述毛干的消化,具体为:每1mg~10mg毛干中加入消化液A 335μL,10mg/ml的PK溶液50μL,质量分数为15%的SDS溶液40μL,体积分数为15.4%的DTT溶液50μL,56℃消化3h后,再加入30μL 10mg/ml的PK溶液,继续消化1h,再加入0.5mol/L的EDTA溶液25μL,56℃消化30min。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤三所述消化液提纯中,步骤1)中所述离心为12000rpm离心5min~10min。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤三中所述漂洗液A中异丙醇的体积分数为30%~35%。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤三中所述晾干为室温晾干5min~10min。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤三所述磁珠与洗脱液混合后,56℃加热15min。
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