CN110672767A - 一种重组蛋白糖谱分析方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种重组蛋白糖谱分析方法,包括如下步骤:S1、配制溶液,具体包括S101、配制蛋白质变性液,S102、配制PNGase F溶液;S103、配制Triton X‑100溶液。本发明利用糖谱分析研究,来反映糖蛋白的修饰情况和批间一致性;建立一种基于HPLC‑HILIC的N连接糖糖谱分析方法,用于质控此样品N连接糖糖基化修饰的批间一致性。本发明中样品预处理根据样品中的蛋白浓度进行不同处理,便于后续试验分析同时提高分析准确度。本发明中进一步提出了去除多余的2‑AB标记液的方法,有效去除多余2‑AB标记液,进一步保证分析准确性;本发明进一步采用UPLC分析中利用乙腈平衡系统至基线平稳,用下述的洗脱条件平衡色谱柱一针再进样分析,进一步提高分析准确性。

Description

一种重组蛋白糖谱分析方法
技术领域
本发明属于蛋白糖谱分析技术领域,具体为一种重组蛋白糖谱分析方法。
背景技术
糖蛋白是一类高度复杂且具有明显异质性的大分子,其中糖基化异质性是其固有特性,影响其生物活性、蛋白构象、稳定性、可溶性、药代动力学和免疫原性,最终影响其安全性、有效性和半衰期。重组人红细胞生成素(Fc)融合蛋白是利用基因工程技术,将EPO基因融合Fc基因片段后转入CHO细胞内,高效表达一种高度复杂的糖蛋白,用于治疗慢性肾功能衰竭和癌症化疗引起的贫血等。理论上这个蛋白有4个N连接糖基化位点。糖的完整性直接影响此蛋白在人体内的代谢稳定性和生物学活性,而完整的糖修饰多以唾液酸结束,已有研究表明,唾液酸化程度与此蛋白的活性呈正比关系,EPO四天线糖型含量的增加能显著增强EPO在老鼠体内的生物活性。
对于重组糖蛋白药物的质量研究和控制,近年来EMA、ICH、CFDA等先后出台相应的指导文件,提出需要对糖蛋白进行糖基化鉴定和修饰程度质控。在我国早期的细胞因子类(如EPO)的研究中,主要通过质控唾液酸的含量来间接反映其糖基化修饰程度;而随着技术的进步,尤其是国内外抗体类药物的研究,逐步开始要求进行糖谱分析研究,来反映糖蛋白的修饰情况和批间一致性;发明人经过长时间试验,提出了一种重组蛋白糖谱分析方法,用于对重组糖蛋白进行糖基化鉴定和修饰程度质控。
发明内容
本发明的目的在于:为了解决背景技术涉及的技术问题,提供一种重组蛋白糖谱分析方法。
本发明采用的技术方案如下:
一种重组蛋白糖谱分析方法,包括如下步骤:
S1、配制溶液,包括S101、配制蛋白质变性液;
S102、配制PNGase F溶液;
S103、配制Triton X-100溶液;
S104、配制酶切缓冲液;
S105、配制甲酸铵溶液;
S2、样品检测,包括S201、样品预处理;
S202、糖链的酶切处理:离心管中加入50μL上述得到的蛋白溶液、100μL酶切缓冲液和10μL蛋白变性液,混匀后沸水浴10min,室温冷却5min,加入10μL 15%TritonX100,混匀再加入8μL的PNGase F(250U/mL),混匀后37℃恒温箱中酶切2h;
S203、除蛋白和干燥:将酶切完成的溶液加入至10k超滤离心管中,14000×g离心30分钟,收集过滤液约130μL并转移至1.5mL的洁净EP管中,室温下真空离心干燥2h;
S204、2-AB标记液的配制:取700μL DMSO至1.5mL洁净离心管中,加入300μL冰醋酸,漩涡混匀得到标记缓冲液,加入到50mg 2-AB中,漩涡混匀,待完全溶解后,再加入到63mg氰基硼氢化钠中,漩涡混匀至完全溶解(可65℃预热加速溶解),即为2-AB标记液,避光保存,一个小时内使用;
S205、糖链的衍生;取10μL新配制的2-AB标记液加入至干燥糖链中,振动混匀至均一的乳白色溶液,多层封口膜封住管口置于65℃烘干箱中衍生2h,衍生结束室温冷却3分钟后加入190μL去离子水混匀用于下步;
S206、去除多余的2-AB标记液;
S207、UPLC分析:按照UPLC设备操作规程,灌注完成后,用25%水:75%乙腈平衡系统约15min(流速0.1ml/min),接上色谱柱,用25%水:75%乙腈冲洗色谱柱约5min(流速0.3ml/min),再切换至起始条件(25%流动相A:75%乙腈),平衡1~1.5h至基线平稳,用下述的洗脱条件平衡色谱柱一针再进样分析;
S3、数据处理及结果判断:包括S301、确定积分条件积分得到糖谱,峰宽20,阈值32,最小峰面积60000,积分时间为5~60分钟,共积分14个峰(见图2),RT窗口15.00%,更新RT为平均所有峰的保留时间参比和相对保留时间参比均为峰3,峰匹配除了峰3为最大面积,其余峰的峰匹配均为最接近的,积分得到的典型的糖谱;S302、结果判断,在检测待检样品时,应同时处理对照品作为质控;在规定的积分条件下,对照品应积到14个目标峰,用归一化法计算各峰面积占14个峰总面积的比例,若各峰面积的比例(%)符合下表糖谱标准,实验结果成立,否则应重检;样品结果与对照品一致且符合下表规定,判为合格;
S4、检测后处理:在试验结束后应切换50%水溶液冲洗系统后再用85%乙腈保存色谱柱和UPLC系统;每次使用完后拆下色谱柱,接上配套的PEEK头,置于阴凉处妥善保存;用两通连接设备管路;并及时清理实验台面、实验所用耗材及实验样品。
其中,所述S101中配制蛋白质变性液:称取0.02g十二烷基胺磺酸钠溶解于10mL超纯水中,再加入71μLβ-巯基乙醇,混匀,4℃保存备用。
其中,所述S102中配制PNGase F溶液:先将装PNGase F(50U,粉末状)的棕色玻璃瓶正立状态轻轻敲十下,加入200μL超纯水溶解并混匀,形成250U/mLPNGase F溶液,并用PCR管分装,每管20μL,-20℃保存备用;
其中,所述S103、配制Triton X-100溶液:称取0.15g Triton X-100,加入超纯水至1mL混匀形成15%TritonX-100溶液,4℃保存备用;
其中,所述S104中配制酶切缓冲液:称取1.51g十二水磷酸氢二钠、0.13g二水磷酸二氢钠,用100mL超纯水溶解,其可用磷酸或者氢氧化钠调节pH为7.5±0.1。
其中,所述S105中配制甲酸铵溶液:称取甲酸铵3.15g,用900mL超纯水溶解,用甲酸调pH至4.5,再用超纯水定容至1L,0.22μm针头过滤器过滤,超声15min,配制成50mmol/L,pH4.5的甲酸铵溶液。
其中,所述S201中样品预处理,包括S2011、将SUBS-4对照品和样品用稀释缓冲液(20mmol/LPB+30mmol/LNaCl,pH7.0)稀释至3mg/ml;
S2012、若待测样品的缓冲液不是稀释缓冲液时,取300μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,加入300μL原液缓冲液再离心10min,再重复操作1次,蛋白回收率以90%计估算,最后用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,使蛋白浓度在3mg/ml或以上,Lowry检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml;
S2013、若样品中的蛋白浓度低于3mg/mL时,取500μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,蛋白回收率以90%计估算,使蛋白浓度在3mg/mL或以上,Lowry法检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml。
其中,S206、去除多余的2-AB标记液:包括如下步骤:S2061、重悬脱盐柱,去掉脱盐柱顶部和底部的盖子,使保存液流入柱床至底部出口不再有液滴滴出;S2062、用超纯水注满脱盐柱,使超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,重复3次,丢弃流出液;
S2063、将衍生完成的约200μL糖链衍生物用移液枪加入脱盐柱中;
S2064、待样品流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,再加入500μL超纯水;
S2065、待超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出后,再取1.5mL洁净离心管置于脱盐柱底部收集口,加入0.5mL超纯水洗脱并收集。
S2066、将收集到的洗脱液用0.22μm针头过滤器(SLGV R04 NL)过滤,4℃短时间保存备用。
其中S207、UPLC分析中具体色谱条件如下:柱温:40℃,进样体积:2μl,流动相A:50mmol/L甲酸铵(pH4.5),流动相C:100%乙腈,W2475检测器参数:λex=330nm,λem=420nm,洗脱条件见下表:
Figure BDA0002238093570000051
综上所述,由于采用了上述技术方案,本发明的有益效果是:
1、本发明利用糖谱分析研究,来反映糖蛋白的修饰情况和批间一致性;建立一种基于HPLC-HILIC的N连接糖糖谱分析方法,用于质控此样品N连接糖糖基化修饰的批间一致性。
2、本发明中样品预处理根据样品中的蛋白浓度进行不同处理,便于后续试验分析同时提高分析准确度。
3、本发明中进一步提出了去除多余的2-AB标记液的方法,有效去除多余2-AB标记液,进一步保证分析准确性。
4、本发明进一步采用UPLC分析中利用乙腈平衡系统至基线平稳,用下述的洗脱条件平衡色谱柱一针再进样分析,进一步提高分析准确性。
附图说明
图1为本发明的积分条件截图;
图2为本发明中积分糖谱图。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
1.实验准备
1.1主要材料如下表:
Figure BDA0002238093570000061
1.2主要仪器如下表:
Figure BDA0002238093570000071
2溶液配制
2.1蛋白质变性液
称取0.02g十二烷基胺磺酸钠溶解于10mL超纯水中,再加入71μLβ-巯基乙醇,混匀,4℃保存备用;
2.2 250U/mLPNGase F溶液
先将装PNGase F(50U,粉末状)的棕色玻璃瓶正立状态轻轻敲十下,加入200μL超纯水溶解并混匀,用PCR管分装,每管20μL,-20℃保存备用;
2.3 15%Triton X-100
称取0.15g Triton X-100,加入超纯水至1mL混匀,4℃保存备用;
2.4酶切缓冲液(50mmol/LPB,pH 7.5)
称取1.51g十二水磷酸氢二钠、0.13g二水磷酸二氢钠,用100mL超纯水溶解,其pH应为7.5±0.1,可用磷酸或者氢氧化钠调节pH。
2.5甲酸铵溶液(50mmol/L,pH4.5)
称取甲酸铵3.15g,用900mL超纯水溶解,用甲酸调pH至4.5,再用超纯水定容至1L,0.22μm针头过滤器过滤,超声15min。
3.检测方法
3.1蛋白缓冲液的更换
3.1.1将SUBS-4对照品和样品用稀释缓冲液(20mmol/L PB+30mmol/L NaCl,pH7.0)稀释至3mg/mL。
3.1.2若待测样品的缓冲液不是稀释缓冲液时,取300μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,加入300μL原液缓冲液再离心10min,再重复操作1次,蛋白回收率以90%计估算,最后用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,使蛋白浓度在3mg/mL或以上,Lowry检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml。
3.1.3若样品中的蛋白浓度低于3mg/mL时,取500μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,蛋白回收率以90%计估算,使蛋白浓度在3mg/mL或以上,Lowry法检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml。
3.2糖链的酶切
离心管中加入50μL上述得到的蛋白溶液、100μL酶切缓冲液和10μL蛋白变性液,混匀后沸水浴10min,室温冷却5min,加入10μL 15%Triton X100,混匀再加入8μL的PNGase F(250U/mL),混匀后37℃恒温箱中酶切2h。
3.3除蛋白和干燥
将酶切完成的溶液加入至10k超滤离心管中,14000×g离心30分钟,收集过滤液约130μL并转移至1.5mL的洁净EP管中,室温下真空离心干燥2h;
3.4 2-AB标记液的配制
取700μL DMSO至1.5mL洁净离心管中,加入300μL冰醋酸,漩涡混匀得到标记缓冲液,加入到50mg 2-AB中,漩涡混匀,待完全溶解后,再加入到63mg氰基硼氢化钠中,漩涡混匀至完全溶解(可65℃预热加速溶解),即为2-AB标记液,避光保存,一个小时内使用;
3.5糖链的衍生
取10μL新配制的2-AB标记液加入至干燥糖链中,振动混匀至均一的乳白色溶液,多层封口膜封住管口置于65℃烘干箱中衍生2h,衍生结束室温冷却3分钟后加入190μL去离子水混匀用于下步;
3.6去除过多的2-AB(具体操作步骤如下)
重悬脱盐柱,去掉脱盐柱顶部和底部的盖子,使保存液流入柱床至底部出口不再有液滴滴出;
用超纯水注满脱盐柱,使超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,重复3次,丢弃流出液;
将衍生完成的约200μL糖链衍生物用移液枪加入脱盐柱中;
待样品流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,再加入500μL超纯水;
待超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出后,再取1.5mL洁净离心管置于脱盐柱底部收集口,加入0.5mL超纯水洗脱并收集。
将收集到的洗脱液用0.22μm针头过滤器(SLGV R04 NL)过滤,4℃短时间保存备用,但应尽快进行UPLC分析。
3.7 UPLC分析
按照UPLC设备操作规程,灌注完成后,用25%水:75%乙腈平衡系统约15min(流速0.1ml/min),接上色谱柱,用25%水:75%乙腈冲洗色谱柱约5min(流速0.3ml/min),再切换至起始条件(25%流动相A:75%乙腈),平衡1~1.5h至基线平稳,用下述的洗脱条件平衡色谱柱一针再进样分析,具体色谱条件如下:
柱温:40℃,进样体积:2μl,流动相A:50mmol/L甲酸铵(pH4.5),流动相C:100%乙腈,W2475检测器参数:λex=330nm,λem=420nm,洗脱条件见下表:
Figure BDA0002238093570000101
3.8数据处理及结果判断
3.8.1积分条件
峰宽20,阈值32,最小峰面积60000,积分时间为5~60分钟,共积分14个峰(见图2),RT窗口15.00%,更新RT为平均所有峰的保留时间参比和相对保留时间参比均为峰3,峰匹配除了峰3为最大面积,其余峰的峰匹配均为最接近的(见图1),积分得到的典型的糖谱见图2。
3.8.2结果判断
在检测待检样品时,应同时处理对照品作为质控。在规定的积分条件下,对照品应积到14个目标峰,用归一化法计算各峰面积占14个峰总面积的比例,若各峰面积的比例(%)符合下表糖谱标准,实验结果成立,否则应重检;样品结果与对照品一致且符合下表规定,判为合格。
Figure BDA0002238093570000111
3.9注意事项
3.9.1禁止使用100%有机相或100%水相冲洗色谱柱;
3.9.2灌注完成后,应用25%水:75%乙腈平衡系统,之后再接色谱柱;
3.9.3流动相A是含盐流动相,在试验结束后应切换50%水溶液冲洗系统后再用85%乙腈保存色谱柱和UPLC系统(每次使用完后拆下色谱柱,接上配套的PEEK头,置于阴凉处妥善保存;用两通连接设备管路)。及时清理实验台面、实验所用耗材及实验样品。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (9)

1.一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:包括如下步骤:
S1、配制溶液,包括S101、配制蛋白质变性液;
S102、配制PNGase F溶液;
S103、配制Triton X-100溶液;
S104、配制酶切缓冲液;
S105、配制甲酸铵溶液;
S2、样品检测,包括S201、样品预处理;
S202、糖链的酶切处理:离心管中加入50μL上述得到的蛋白溶液、100μL酶切缓冲液和10μL蛋白变性液,混匀后沸水浴10min,室温冷却5min,加入10μL 15%Triton X100,混匀再加入8μL 250U/mL的PNGase F,混匀后37℃恒温箱中酶切2h;
S203、除蛋白和干燥:将酶切完成的溶液加入至10k超滤离心管中,14000×g离心30分钟,收集过滤液约130μL并转移至1.5mL的洁净EP管中,室温下真空离心干燥2h;
S204、2-AB标记液的配制:取700μL DMSO至1.5mL洁净离心管中,加入300μL冰醋酸,漩涡混匀得到标记缓冲液,加入到50mg 2-AB中,漩涡混匀,待完全溶解后,再加入到63mg氰基硼氢化钠中,漩涡混匀至完全溶解,即为2-AB标记液,避光保存,一个小时内使用;
S205、糖链的衍生:取10μL新配制的2-AB标记液加入至干燥糖链中,振动混匀至均一的乳白色溶液,多层封口膜封住管口置于65℃烘干箱中衍生2h,衍生结束室温冷却3分钟后加入190μL去离子水混匀用于下步;
S206、去除多余的2-AB标记液;
S207、UPLC分析:按照UPLC设备操作规程,灌注完成后,用25%水:75%乙腈平衡系统15min,流速0.1ml/min,接上色谱柱,用25%水:75%乙腈冲洗色谱柱约5min,流速0.3ml/min,再切换至起始条件,25%流动相A:75%乙腈,平衡1~1.5h至基线平稳,用下述的洗脱条件平衡色谱柱一针再进样分析;
S3、数据处理及结果判断:包括S301、确定积分条件积分得到糖谱,峰宽20,阈值32,最小峰面积60000,积分时间为5~60分钟,共积分14个峰,RT窗口15.00%,更新RT为平均所有峰的保留时间参比和相对保留时间参比均为峰3,峰匹配除了峰3为最大面积,其余峰的峰匹配均为最接近的;S302、结果判断,在检测待检样品时,应同时处理对照品作为质控;在规定的积分条件下,对照品应积到14个目标峰,用归一化法计算各峰面积占14个峰总面积的比例,若各峰面积的比例%符合相应糖谱标准,实验结果成立,否则应重检;样品结果与对照品一致且符合下表规定,判为合格;
Figure RE-FDA0002289710780000021
S4、检测后处理:在试验结束后应切换50%水溶液冲洗系统后再用85%乙腈保存色谱柱和UPLC系统;每次使用完后拆下色谱柱,接上配套的PEEK头,置于阴凉处妥善保存;用两通连接设备管路。
2.如权利要求1所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S101中配制蛋白质变性液,称取0.02g十二烷基胺磺酸钠溶解于10mL超纯水中,再加入71μL β-巯基乙醇,混匀,4℃保存备用。
3.如权利要求1所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S102中配制PNGase F溶液,先将装50U,粉末状的PNGase F于棕色玻璃瓶正立状态轻轻敲十下,加入200μL超纯水溶解并混匀,形成250U/mL PNGase F溶液,并用PCR管分装,每管20μL,-20℃保存备用。
4.如权利要求1所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S103、配制Triton X-100溶液;称取0.15g Triton X-100,加入超纯水至1mL混匀形成15%Triton X-100溶液,4℃保存备用。
5.如权利要求1所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S104中配制酶切缓冲液;称取1.51g十二水磷酸氢二钠、0.13g二水磷酸二氢钠,用100mL超纯水溶解,其可用磷酸或者氢氧化钠调节pH为7.5±0.1。
6.如权利要求1所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S105中配制甲酸铵溶液;称取甲酸铵3.15g,用900mL超纯水溶解,用甲酸调pH至4.5,再用超纯水定容至1L,0.22μm针头过滤器过滤,超声15min,配制成50mmol/L,pH4.5的甲酸铵溶液。
7.如权利要求1-6任一所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:所述S201中样品预处理,包括S2011、将SUBS-4对照品和样品用稀释缓冲液为20mmol/L PB+30mmol/LNaCl,pH7.0稀释至3mg/ml;
S2012、若待测样品的缓冲液不是稀释缓冲液时,取300μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,加入300μL原液缓冲液再离心10min,再重复操作1次,蛋白回收率以90%计估算,最后用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,使蛋白浓度在3mg/ml或以上,Lowry检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml;
S2013、若样品中的蛋白浓度低于3mg/mL时,取500μL蛋白溶液加入10K超滤离心管14000×g离心10min,用适量的原液缓冲液分两次洗下蛋白,蛋白回收率以90%计估算,使蛋白浓度在3mg/mL或以上,Lowry法检测蛋白浓度,再用稀释缓冲液稀释至3mg/ml。
8.如权利要求7所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:S206、去除多余的2-AB标记液;包括如下步骤:S2061、重悬脱盐柱,去掉脱盐柱顶部和底部的盖子,使保存液流入柱床至底部出口不再有液滴滴出;
S2062、用超纯水注满脱盐柱,使超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,重复3次,丢弃流出液;
S2063、将衍生完成的约200μL糖链衍生物用移液枪加入脱盐柱中;
S2064、待样品流入柱床至底部出口不再有液滴滴出,再加入500μL超纯水;
S2065、待超纯水流入柱床至底部出口不再有液滴滴出后,再取1.5mL洁净离心管置于脱盐柱底部收集口,加入0.5mL超纯水洗脱并收集;
S2066、将收集到的洗脱液用0.22μm针头过滤器SLGV R04 NL过滤,4℃短时间保存备用。
9.权利要求8所述的一种重组蛋白糖谱分析方法,其特征在于:S207、UPLC分析中具体色谱条件如下:柱温:40℃,进样体积:2μl,流动相A:pH4.5的50mmol/L甲酸铵,流动相C:100%乙腈,W2475检测器参数:λex=330nm,λem=420nm,洗脱条件见下表:
Figure RE-FDA0002289710780000051
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