CN109337918A - 一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1及其克隆方法与应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1及其克隆方法与应用;所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示;克隆方法包括烟草叶片cDNA合成:提取烟草叶片总RNA,反转录得到第一链cDNA;NtCIPK1基因的PCR扩增:以烟草叶片cDNA为模板,根据NtCIPK1基因序列设计引物,进行PCR扩增,回收和纯化PCR扩增产物,并测序。应用为所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1在获得调控烟草钾含量的转基因烟草植株中的应用。本发明利用CRISPR/CAS9技术对克隆的NtCIPK1基因进行了功能鉴定。烟草NtCIPK1基因的克隆鉴定为调控烟草钾含量提供了新的基因靶标。
Description
技术领域
本发明属于遗传工程技术领域,具体涉及一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1及其克隆方法与应用。
背景技术
Ca2+在真核生物信号转导中被称为第二信使,Ca2+信号传导是植物接收外界胁迫后将信息传递给体内的重要方式之一。在植物体内主要有三种接收Ca2+信号的感受器:钙调素(CaM)、钙依赖性蛋白激酶(CDPKs)和钙调素B类似蛋白家族(CBL)。CIPK(CBL-interacting protein kinase)蛋白是植物特有的Ser/Thr蛋白激酶,属于植物SnRK3蛋白激酶亚家族。CIPKs是CBL特异性的靶蛋白激酶,CBL-CIPKs相互作用形成的网络系统接到了一系列植物对外界非生物胁迫刺激的响应。如,干旱、高盐、ABA 等。CIPKs结构上主要包含两大结构域:N端激酶结构域(PKC)和C端调节结构域。C端调节结构域是CIPKs特有的结构,并且在CIPK家族中相当保守。C端调节结构域为CBL 特异接合的NAF 结构域和能与PP2C相互作用的PPI 结构域。这2 个结构域的结构特性使得CIPKs 成为一个连接CBL 蛋白和PP2C蛋白传导信号途径的重要分子开关,从而能更好地发挥其信号调控作用。
钾元素是植物必须的大量元素,低钾环境下CBL-CIPK复合体在这一过程中的作用已经被逐渐发现。拟南芥CIPK23突变后表现对低钾胁迫敏感。进一步研究发现,CBL1/CBL9-CIPK23复合体调控钾离子通道AKT1的活性。钾被认为是烟草的品质元素,钾含量是评价烟叶品质优劣的重要指标之一。烟叶钾含量提高可以改善烟叶的组织结构,使烟叶结构细腻,而且还能提高烟叶外观色泽,使烟叶呈深橘黄色,香气足,吃味好,富有弹性和韧性,填充性增强。另外钾还可以增强烟叶糖类、色素类、芳香类物质的合成积累。烟草中还未见CIPKs蛋白基因的相关报道,克隆烟草CIPK基因,理解CIPKs对烟草钾含量的调控,进而培育高质量烟叶具有重要意义。
发明内容
本发明的第一目的在于提供一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1;第二目的在于提供所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法;第三目的在于提供所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的应用。
本发明的第一目的是这样实现的,所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
本发明的第二目的是这样实现的,包括以下步骤:
A、烟草叶片cDNA合成:提取烟草根部组织RNA,反转录得到第一链cDNA;
B、NtCIPK1基因的PCR扩增:以烟草叶片cDNA为模板,根据NtCIPK1基因序列设计引物,进行PCR扩增,回收和纯化PCR扩增产物;
C、纯化产物与载体链接,连接体系与过程如下:4μL纯化产物、1μL salt solution、1μLPCR®-BluntⅡ-TOPO(Invitrogen)混匀,25℃,水浴30min;将连接好的载体通过热激转化大肠杆菌DH5a,加液体培养基振荡培养后涂布至含100mg/L 卡那霉素的LB平板上过夜培养,挑取菌落进行菌液培养,质粒提取和PCR检测,筛选阳性克隆,对阳性克隆进行测序。
本发明的第三目的是这样实现的,所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1在调控烟草钾含量的转基因烟草植株中的应用。
本发明还提供一种所述烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的重组载体。
本发明还提供提供一种所述烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的表达盒。
本发明还提供一种所述烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的转基因细胞系。
本发明还提供一种所述烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的重组菌。
本发明还提供一种利用CRSIPR/CAS9编辑技术对烟草NtCIPK1基因进行功能鉴定的方法,具体包括以下步骤:
(1)构建CRISPR/CAS9载体
A、根据NtCIPK1 基因组序列设计CRISPR/CAS9靶位点(PAM),即GGAAAGAAGGGAATGCGAGTTGG,该靶位点位于第一外显子。
B、靶位点引物设计
根据A设计的靶位点合成靶位点引物:
P1:5’- ATTGGGAAAGAAGGGAATGCGAGT -3’,
P2:5’- AAACACTCGCATTCCCTTCTTTCC -3’;
其中P1灰色区域为靶位点TGG前的20个核苷酸,P2中灰色区域为P1灰色区域的反向互补序列。
C、在靶位点两侧设计编辑材料的检测引物,
CIPK1dF: 5’-ATCTAAGCAGCGGATTGACG-3’,
CIPK1dR: 5’-AGCAGAGAGAGAGAGACCTGA-3’,扩增长度410bp。
D、制备dsDNA
将步骤B中设计合成的引物通过退火形成互补DNA oligo,具体步骤如下:
反应体系50μL,包括SdF 20μL,SdR 20μL,10×Annealing buffer 5μL,灭菌双蒸水5μL。退火程序为:95℃,5min;90℃,1 min;80℃,1 min;70℃,1 min;60℃,1 min;50℃,1min;40℃,1 min;30℃,1 min;20℃,1 min;10℃,1 min。
E、酶切pHSE401载体,并与步骤D所制备dsDNA进行连接。
利用BsaI酶对pHSE401载体进行酶切,酶切体系50μL,包括:质粒 5μL,10×buffer5μL,BsaI 2μL,灭菌双蒸水38μL。37℃酶切1h。
酶切后对酶切产物进行电泳检测分析,可见1200bp 和 11520bp两个条带,回收11520bp的酶切产物备用;
利用T4 DNA连接酶将所回收的大片段酶切产物与步骤D所制备dsDNA进行连接,连接时20μL体系进行:所回收载体酶切产物 3μL,退火所形成dsDNA产物 10μL,T4 DNA buffer 2μL,T4 DNA 连接酶 1μL,灭菌双蒸水 4μL。16℃过夜连接;
F、测序验证
将步骤E中连接产物转化大肠杆菌,筛选阳性克隆(pHSE401载体抗性为kan)并进行菌落PCR检测,
菌落PCR检测时,所用引物设计:
U6-26p F:5’-TGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGC-3’ ;
P2:5’-AAACACTCGCATTCCCTTCTTTCC-3’;
对菌落PCR检测验证正确的阳性克隆菌株培养扩增后进一步进行测序分析,测序时所用引物为:
U6-26p-F: 5’-TGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGC-3’。
对测序结果进行分析,选择构建正确的克隆(pHSE401-CIPK1)保存备用。
(2)农杆菌转化
从-80℃冰箱中取出农杆菌感受态细胞(C58C1),放置冰上溶解后加入载体pHSE401-CIPK1 4μL;液氮速冻1分钟,转入37℃水浴5分钟,再冰浴2分钟,向混合物中加入1mL LB液体培养基,28℃、220rpm培养3~4小时;培养物涂布于含有卡那霉素100mg/L和利福平25mg/L的LB固体培养基上,28℃倒置培养2~3天,可见含有目标载体的农杆菌克隆。
(3)烟草转化
A、挑取含有目标载体的农杆菌克隆,在含有那霉素和利福平的LB平板上划线,28℃培养2~3天;刮取划线菌斑接菌于含有那霉素和利福平的MS培养基中,28℃,220rpm震荡培养,菌液浓度达到OD=0.5~0.8时进行侵染;
B、将烟草叶片置于500mL广口瓶中,加入适量75%乙醇,漂洗1min;弃乙醇,加入0.1%的HgCl2溶液,置摇床上室温振荡15~30分钟;弃溶液,用无菌水冲洗6遍;
C、将叶片取出,用无菌吸水纸洗去表面液体,取无菌叶片用剪刀切成1cm×1cm的小片,将切成小片的烟草叶片放入含目标载体的无菌MS液体培养基悬浮菌液中,静置15~20min;取出烟草叶片,用无菌滤纸吸去多余菌液,于含有6-BA (0.02mg/L)、NAA (2mg/L)的MS培养基中25℃暗培养两天;将烟草叶片转入分化培养基中,切口接触培养基,分化培养基为含有6-BA (0.5mg/L)、NAA (0.1mg/L)、潮霉素(20mg/L)、头孢霉素(500mg/L)的MS培养基,每2~3周继代一次,切口处逐渐形成愈伤组织,最后分化出芽;
D、将长至3~5cm的芽切下,转入MS培养基诱导生根,生根后的转基因植株由生根培养基中取出,用自来水洗净培养基,移植于灭菌的营养土中。
(4)测序筛选编辑材料
T0代转基因苗生长1周左右,选取20株烟苗取叶片并利用DNeasy Plant Mini Kit(QIAGEN)提取DNA,利用步骤(1)C中设计的引物CIPK1dF/CIPK1dR进行扩增,扩增产物纯化后利用正向引物测序。对测序结果分析,获得一株缺失14个碱基的编辑材料(图4)。种植该编辑材料T1代通过测序筛选编辑纯合单株收种获得T2代。
(5)编辑材料钾含量
温室盆栽种植编辑纯合材料NtCIPK1-CP及对照。每株按5g纯氮使用烟草专用复合肥(氮﹕磷﹕钾=10﹕10﹕15),分5次施入。现蕾期取中部叶(9-11位叶),杀青后检测钾含量。结果见图5,编辑材料叶片钾含量比对照都显著降低。
本发明利用同源克隆技术从烟草中得到一个烟草蛋白激酶基因NtCIPK1,利用CRISPR/CAS9编辑技术对NtCIPK1进行功能验证,结果表明NtCIPK1基因功能缺失后烟叶钾离子含量显著降低。烟草中NtCIPK1基因的鉴定还未见报道,该基因的鉴定为通过调控基因的表达调控烟草钾含量提供了新基因。
附图说明
图1为利用引物对NtCIPK1F / NtCIPK1R扩增NtCIPK1基因CDS产物的琼脂糖凝胶电泳图,扩增产物大小约为1365bp,M:DL2000,1:NtCIPK1 CDS PCR产物;
图2 为NtCIPK1基因组织特异性表达分析结果,NtCIPK1基因在叶部表达量最高,根部次之,茎部最低;
图3 为NtCIPK1蛋白与拟南芥AtCIPK1蛋白序列比对,其中S_TKc为预测的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶区,CIPK_c为C端调节结构域;
图4为CRISPR/CAS9编辑NtCIPK1基因材料编辑靶位点测序结果,其中;NtCIPK1-PAM为编辑靶位点,NtCIPK1-Wild为野生型序列,NtCIPK1-CP为编辑材料序列,NtCIPK1-CP材料缺失14个碱基。
图5为NtCIPK1基因编辑材料与对照中部烟叶钾含量比较,NtCIPK1-CP为编辑材料,CK为对照。NtCIPK1-CP钾含量比对照降低35.77%。
具体实施方式
下面结合实施例和附图对本发明作进一步的说明,但不以任何方式对本发明加以限制,基于本发明教导所作的任何变换或替换,均属于本发明的保护范围。
本发明所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
本发明所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法,包括以下步骤:
A、烟草叶片cDNA合成:提取烟草根部组织RNA,反转录得到第一链cDNA;
B、NtCIPK1基因的PCR扩增:以烟草叶片cDNA为模板,根据NtCIPK1基因序列设计引物,进行PCR扩增,回收和纯化PCR扩增产物;
C、纯化产物与载体链接,连接体系与过程如下:4μL纯化产物、1μL salt solution、1μLPCR®-BluntⅡ-TOPO(Invitrogen)混匀,25℃,水浴30min;将连接好的载体通过热激转化大肠杆菌DH5a,加液体培养基振荡培养后涂布至含100mg/L 卡那霉素的LB平板上过夜培养,挑取菌落进行菌液培养,质粒提取和PCR检测,筛选阳性克隆,对阳性克隆进行测序。
B步骤中所述的引物为:
NtCIPK1F:5’- ATGGTATTGATACAGCAAGAAG -3’
NtCIPK1R:5’- TCATAATTTGGTGGGCAAGAGCTC -3’。
B步骤中所述的PCR反应体系是50μL,包括:200ng cDNA,5×Phusion HF反应缓冲液10μL,10mM dNTP 1μL,2U的Phusion® High-Fidelity DNA Polymerase,10μM的正反向引物各1μL,补水至50μL。
B步骤中所述的PCR扩增的反应条件是:98℃,30秒;98℃,7秒;60℃,20秒;72℃,30秒;35个循环;72℃延伸7分钟。
本发明所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的应用为所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1在调控烟草钾含量的转基因烟草植株中的应用。
含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的重组载体。
含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的表达盒。
含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的转基因细胞系或重组菌。
下面以具体实施案例对本发明做进一步说明:
实施例1
烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆
A、根据拟南芥AtCIPK1基因的蛋白序列(EFH61473.1)搜索NCBI数据库得到烟草中同源基因NtCIPK1序列,利用此序列设计基因克隆引物:
正向引物:NtCIPK1F:5’- ATGGTATTGATACAGCAAGAAG -3’
反向引物:NtCIPK1R:5’- TCATAATTTGGTGGGCAAGAGCTC -3’
B、提取烟草根部组织RNA,反转录得到第一链cDNA;
C、以反转录得到的第一链cDNA作为模板,用引物NtCIPK1F / NtCIPK1R进行PCR扩增,PCR产物经琼脂糖凝胶电泳分离后回收并纯化(图1);
D、纯化产物与载体连接,连接体系与过程如下:4μL纯化产物、1μL salt solution、1μLPCR®-BluntⅡ-TOPO(Invitrogen)混匀,25℃,水浴30min;将连接好的载体通过热激转化大肠杆菌DH5a,加液体培养基振荡培养后涂布至含100mg/L 卡那霉素的LB平板上过夜培养,挑取菌落进行菌液培养,质粒提取和PCR检测,筛选阳性克隆,对阳性克隆进行测序。
实施例2
烟草NtCIPK1基因组织特异性表达分析
A、种植栽培烟草云烟87,旺长期提取根、茎、叶片RNA,反转录得到第一链cDNA。
B、根据NtCIPK1基因序列设计qRT-PCR引物
QF:5’- TGGCAGAGATTAAAGAGGATGAG -3’,
QR:5’- ACATCCCAATTAGCTGAAAGGC -3’。
以烟草Actin基因作为内参,Actin-F:CTGAGGTCCTTTTCCAACCA和Actin-RTACCCGGGAACATGGTAGAG。以根、茎、叶片cDNA为模板进行荧光定量PCR,反应在RocheLightCycler 480上利用LightCycler 480 SYBR Green I master进行,20 µL体系含有 10µL LightCycler 480 SYBR Green I master(2×),正反引物各1 µL(10 µmol/L),cDNA 1µL(反转录产物稀释4倍),7 µL 灭菌蒸馏水。反应程序如下:95℃预变性 5 min;95℃变性20 s,60℃退火 15 s,72℃延伸15 s,45个循环。荧光定量PCR结果采用2-△△Ct方法计算NtCIPK1基因的相对表达量。每个处理设3个生物学重复,由Excel软件绘制柱状图(图2)。结果表明,NtCIPK1基因在叶部表达量最高,根部次之,茎部最低。
实施例3
烟草NtCIPK1基因编码蛋白保守域分析
将NtCIPK1蛋白与拟南芥AtCIPK1蛋白进行多序列比对(图3)。NtCIPK1具有CIPK蛋白保守结构域,如跨膜区丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶区S_TKc,C端调节结构域CIPK_c,且NtCIPK1蛋白与拟南芥AtCIPK1蛋白同源性较高。
实施例4
利用CRSIPR/CAS9编辑技术对烟草NtCIPK1基因进行功能鉴定
(1)构建CRISPR/CAS9载体
A、根据NtCIPK1 基因组序列设计CRISPR/CAS9靶位点(PAM),即GGAAAGAAGGGAATGCGAGTTGG,该靶位点位于第一外显子。
B、靶位点引物设计
根据A设计的靶位点合成靶位点引物:
P1:5’- ATTGGGAAAGAAGGGAATGCGAGT -3’,
P2:5’- AAACACTCGCATTCCCTTCTTTCC -3’;
其中P1灰色区域为靶位点TGG前的20个核苷酸,P2中灰色区域为P1灰色区域的反向互补序列。
C、在靶位点两侧设计编辑材料的检测引物,
CIPK1dF: 5’- ATCTAAGCAGCGGATTGACG-3’,
CIPK1dR: 5’-AGCAGAGAGAGAGAGACCTGA-3’,扩增长度410bp。
D、制备dsDNA
将步骤B中设计合成的引物通过退火形成互补DNA oligo,具体步骤如下:
反应体系50μL,包括SdF 20μL,SdR 20μL,10×Annealing buffer 5μL,灭菌双蒸水5μL。退火程序为:95℃,5min;90℃,1 min;80℃,1 min;70℃,1 min;60℃,1 min;50℃,1min;40℃,1 min;30℃,1 min;20℃,1 min;10℃,1 min。
E、酶切pHSE401载体,并与步骤D所制备dsDNA进行连接。
利用BsaI酶对pHSE401载体进行酶切,酶切体系50μL,包括:质粒 5μL,10×buffer5μL,BsaI 2μL,灭菌双蒸水38μL。37℃酶切1h。
酶切后对酶切产物进行电泳检测分析,可见1200bp 和 11520bp两个条带,回收11520bp的酶切产物备用;
利用T4 DNA连接酶将所回收的大片段酶切产物与步骤D所制备dsDNA进行连接,连接时20μL体系进行:所回收载体酶切产物 3μL,退火所形成dsDNA产物 10μL,T4 DNA buffer 2μL,T4 DNA 连接酶 1μL,灭菌双蒸水 4μL。16℃过夜连接;
F、测序验证
将步骤E中连接产物转化大肠杆菌,筛选阳性克隆(pHSE401载体抗性为kan)并进行菌落PCR检测,
菌落PCR检测时,所用引物设计:
U6-26p F:5’-TGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGC-3’;
P2:5’-AAACACTCGCATTCCCTTCTTTCC-3’;
对菌落PCR检测验证正确的阳性克隆菌株培养扩增后进一步进行测序分析,测序时所用引物为:
U6-26p-F: 5’-TGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGC-3’。
对测序结果进行分析,选择构建正确的克隆(pHSE401-CIPK1)保存备用。
(2)农杆菌转化
从-80℃冰箱中取出农杆菌感受态细胞(C58C1),放置冰上溶解后加入载体pHSE401-CIPK1 4μL;液氮速冻1分钟,转入37℃水浴5分钟,再冰浴2分钟,向混合物中加入1mL LB液体培养基,28℃、220rpm培养3~4小时;培养物涂布于含有卡那霉素100mg/L和利福平25mg/L的LB固体培养基上,28℃倒置培养2~3天,可见含有目标载体的农杆菌克隆。
(3)烟草转化
A、挑取含有目标载体的农杆菌克隆,在含有那霉素和利福平的LB平板上划线,28℃培养2~3天;刮取划线菌斑接菌于含有那霉素和利福平的MS培养基中,28℃,220rpm震荡培养,菌液浓度达到OD=0.5~0.8时进行侵染;
B、将烟草叶片置于500mL广口瓶中,加入适量75%乙醇,漂洗1min;弃乙醇,加入0.1%的HgCl2溶液,置摇床上室温振荡15~30分钟;弃溶液,用无菌水冲洗6遍;
C、将叶片取出,用无菌吸水纸洗去表面液体,取无菌叶片用剪刀切成1cm×1cm的小片,将切成小片的烟草叶片放入含目标载体的无菌MS液体培养基悬浮菌液中,静置15~20min;取出烟草叶片,用无菌滤纸吸去多余菌液,于含有6-BA (0.02mg/L)、NAA (2mg/L)的MS培养基中25℃暗培养两天;将烟草叶片转入分化培养基中,切口接触培养基,分化培养基为含有6-BA (0.5mg/L)、NAA (0.1mg/L)、潮霉素(20mg/L)、头孢霉素(500mg/L)的MS培养基,每2~3周继代一次,切口处逐渐形成愈伤组织,最后分化出芽;
D、将长至3~5cm的芽切下,转入MS培养基诱导生根,生根后的转基因植株由生根培养基中取出,用自来水洗净培养基,移植于灭菌的营养土中。
(4)测序筛选编辑材料
T0代转基因苗生长1周左右,选取20株烟苗取叶片并利用DNeasy Plant Mini Kit(QIAGEN)提取DNA,利用步骤(1)C中设计的引物CIPK1dF/CIPK1dR进行扩增,扩增产物纯化后利用正向引物测序。对测序结果分析,获得一株缺失14个碱基的编辑材料(图4)。种植该编辑材料T1代通过测序筛选编辑纯合单株收种获得T2代。
(5)编辑材料钾含量
温室盆栽种植编辑纯合材料NtCIPK1-CP及对照。每株按5g纯氮使用烟草专用复合肥(氮﹕磷﹕钾=10﹕10﹕15),分5次施入。现蕾期取中部叶(9-11位叶),杀青后检测钾含量。结果见图5,编辑材料叶片钾含量比对照都显著降低。
SEQUENCE LISTING
<110> 云南省烟草农业科学研究院
<120> 一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1及其克隆方法与应用
<130> 2018
<160> 8
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1365
<212> DNA
<213> NtCIPK1核苷酸序列
<400> 1
atggtattga tacagcaaga agaagaaata agaagtgaaa gaggaaagaa gggaatgcga 60
gttgggaaat acgaacttgg aaaaacttta ggagaaggta attttggcaa agttaagtac 120
gcaaaacaca aagattctgg ccaatctttt gctatcaaaa ttttggagaa aaatcgaatt 180
caagatctta gaatcaccga tcagataaag agggagatta aaaccttaaa agtcctcaag 240
catccaaatg tggtcagatt atacgaggtc ttagcaagca aaaccaagat ttacatggtg 300
ctggaatatg taaatggtgg tgaattattt gacagaattg cttctgaagg aaaactagca 360
gaaacacaag gcagaaaact ctttcaacaa ttaattgatg gtgttagtta ttgccatgac 420
aaaggtgtct tccatagaga cctcaagcta gagaatgtcc tcattgatgc agaaaaaaac 480
ataaagatta cagattttgg actaagtgca ttacctcaac acttaaggga tgacggcttg 540
ttgcatacaa catgtggtag ccccaactac gttgctcctg aaattctttc taacagagga 600
tacgatggcg cgacatcaga tacatggtca tgtggagtca tcttatatgt cattctcact 660
ggttttttac cctttgatga tagaaatctt gcagttcttt atcaaaagat ttttaagggg 720
gatgcaccag taccaaaatg gttatctcaa ggagcaaaga atcttataaa gaggattctt 780
gatccaaatc cgcatactcg cataacaatg gcagagatta aagaggatga gtggttcaaa 840
caagactata ctcctgctaa tcctgatgaa tatgaagatt ttgaagatga tcatgcatcc 900
tcagatgatg aagtgttgac agtacatgaa gcaccacttg atacagaaag agatccagaa 960
tcaccttctg ttatcaataa tgcctttcag ctaattggga tgtcctcatg ttttgatctt 1020
tctggatttt ttgaaaatga ggatgcctct gagaggaaga tcagattcac atctaatctc 1080
tctccaaaag aattgctaga gaggattgag catttagcag tgcaaatggg atttcaagtc 1140
cagaaaaaac ctggaaagtt gaaagtattg ctagaacaca aaggtcaaaa aactcaagcc 1200
agtctttcaa tagtagcaga ggtttttgag attagcacat ccttgtatgt tgtagagtta 1260
caaaaatctt caggggattc tacggtatat agagagttat gcaataggtt atcaaatgaa 1320
ttgggtgtcc agcaaagtca agagctcttg cccaccaaat tatga 1365
<210> 2
<211> 454
<212> PRT
<213> NtCIPK1氨基酸序列
<400> 2
Met Val Leu Ile Gln Gln Glu Glu Glu Ile Arg Ser Glu Arg Gly Lys
1 5 10 15
Lys Gly Met Arg Val Gly Lys Tyr Glu Leu Gly Lys Thr Leu Gly Glu
20 25 30
Gly Asn Phe Gly Lys Val Lys Tyr Ala Lys His Lys Asp Ser Gly Gln
35 40 45
Ser Phe Ala Ile Lys Ile Leu Glu Lys Asn Arg Ile Gln Asp Leu Arg
50 55 60
Ile Thr Asp Gln Ile Lys Arg Glu Ile Lys Thr Leu Lys Val Leu Lys
65 70 75 80
His Pro Asn Val Val Arg Leu Tyr Glu Val Leu Ala Ser Lys Thr Lys
85 90 95
Ile Tyr Met Val Leu Glu Tyr Val Asn Gly Gly Glu Leu Phe Asp Arg
100 105 110
Ile Ala Ser Glu Gly Lys Leu Ala Glu Thr Gln Gly Arg Lys Leu Phe
115 120 125
Gln Gln Leu Ile Asp Gly Val Ser Tyr Cys His Asp Lys Gly Val Phe
130 135 140
His Arg Asp Leu Lys Leu Glu Asn Val Leu Ile Asp Ala Glu Lys Asn
145 150 155 160
Ile Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ser Ala Leu Pro Gln His Leu Arg
165 170 175
Asp Asp Gly Leu Leu His Thr Thr Cys Gly Ser Pro Asn Tyr Val Ala
180 185 190
Pro Glu Ile Leu Ser Asn Arg Gly Tyr Asp Gly Ala Thr Ser Asp Thr
195 200 205
Trp Ser Cys Gly Val Ile Leu Tyr Val Ile Leu Thr Gly Phe Leu Pro
210 215 220
Phe Asp Asp Arg Asn Leu Ala Val Leu Tyr Gln Lys Ile Phe Lys Gly
225 230 235 240
Asp Ala Pro Val Pro Lys Trp Leu Ser Gln Gly Ala Lys Asn Leu Ile
245 250 255
Lys Arg Ile Leu Asp Pro Asn Pro His Thr Arg Ile Thr Met Ala Glu
260 265 270
Ile Lys Glu Asp Glu Trp Phe Lys Gln Asp Tyr Thr Pro Ala Asn Pro
275 280 285
Asp Glu Tyr Glu Asp Phe Glu Asp Asp His Ala Ser Ser Asp Asp Glu
290 295 300
Val Leu Thr Val His Glu Ala Pro Leu Asp Thr Glu Arg Asp Pro Glu
305 310 315 320
Ser Pro Ser Val Ile Asn Asn Ala Phe Gln Leu Ile Gly Met Ser Ser
325 330 335
Cys Phe Asp Leu Ser Gly Phe Phe Glu Asn Glu Asp Ala Ser Glu Arg
340 345 350
Lys Ile Arg Phe Thr Ser Asn Leu Ser Pro Lys Glu Leu Leu Glu Arg
355 360 365
Ile Glu His Leu Ala Val Gln Met Gly Phe Gln Val Gln Lys Lys Pro
370 375 380
Gly Lys Leu Lys Val Leu Leu Glu His Lys Gly Gln Lys Thr Gln Ala
385 390 395 400
Ser Leu Ser Ile Val Ala Glu Val Phe Glu Ile Ser Thr Ser Leu Tyr
405 410 415
Val Val Glu Leu Gln Lys Ser Ser Gly Asp Ser Thr Val Tyr Arg Glu
420 425 430
Leu Cys Asn Arg Leu Ser Asn Glu Leu Gly Val Gln Gln Ser Gln Glu
435 440 445
Leu Leu Pro Thr Lys Leu
450
<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213> NtCIPK1F
<400> 3
atggtattga tacagcaaga ag 22
<210> 4
<211> 24
<212> DNA
<213> NtCIPK1R
<400> 4
tcataatttg gtgggcaaga gctc 24
<210> 5
<211> 24
<212> DNA
<213> P1
<400> 5
attgggaaag aagggaatgc gagt 24
<210> 6
<211> 24
<212> DNA
<213> P2
<400> 6
aaacactcgc attcccttct ttcc 24
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> CIPK1dF
<400> 7
atctaagcag cggattgacg 20
<210> 8
<211> 21
<212> DNA
<213> CIPK1dR
<400> 8
agcagagaga gagagacctg a 21
Claims (10)
1.一种烟草蛋白激酶基因NtCIPK1,其特征在于所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.根据权利要求1所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1,其特征在于所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.一种权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法,其特征在于包括以下步骤:
A、烟草叶片cDNA合成:提取烟草根部组织RNA,反转录得到第一链cDNA;
B、NtCIPK1基因的PCR扩增:以烟草叶片cDNA为模板,根据NtCIPK1基因序列设计引物,进行PCR扩增,回收和纯化PCR扩增产物;
C、纯化产物与载体链接,连接体系与过程如下:4μL纯化产物、1μL salt solution、1μLPCR®-BluntⅡ-TOPO(Invitrogen)混匀,25℃,水浴30min;将连接好的载体通过热激转化大肠杆菌DH5a,加液体培养基振荡培养后涂布至含100mg/L 卡那霉素的LB平板上过夜培养,挑取菌落进行菌液培养,质粒提取和PCR检测,筛选阳性克隆,对阳性克隆进行测序。
4.根据权利要求3所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法,其特征在于B步骤中所述的引物为:
NtCIPK1F:5’- ATGGTATTGATACAGCAAGAAG -3’
NtCIPK1R:5’- TCATAATTTGGTGGGCAAGAGCTC -3’。
5.根据权利要求3所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法,其特征在于B步骤中所述的PCR反应体系为:总体积50μL,包括:200ng cDNA,5×Phusion HF反应缓冲液10μL,10mM dNTP 1μL,2U的Phusion® High-Fidelity DNA Polymerase,10μM的正反向引物各1μL,补水至50μL。
6.根据权利要求3所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的克隆方法,其特征在于B步骤中所述的PCR扩增的反应程序为: 98℃,30秒;98℃,7秒;60℃,20秒;72℃,30秒;35个循环;72℃延伸7分钟。
7.一种权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的应用,其特征在于所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1在调控烟草钾含量的转基因烟草植株中的应用。
8.一种含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的重组载体。
9.一种含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的表达盒。
10.一种含有权利要求1或2所述的烟草蛋白激酶基因NtCIPK1的转基因细胞系或重组菌。
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-
2018
- 2018-11-13 CN CN201811348441.5A patent/CN109337918A/zh active Pending
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