CN108085287B - 一种重组谷氨酸棒状杆菌、其制备方法及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了一种重组谷氨酸棒状杆菌,其能有效解决现有谷氨酸棒状杆菌外源蛋白表达量低的技术问题。该重组谷氨酸棒状杆菌中的肽聚糖内切酶基因mepA、细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和胞内蛋白酶基因clpC均被敲除,同时ABC转运体基因Ncgl0909过量表达。此外,本法还提供了该重组谷氨酸棒状杆菌的制备方法及其应用。

Description

一种重组谷氨酸棒状杆菌、其制备方法及其应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种重组谷氨酸棒状杆菌、其制备方法及其应用。
背景技术
谷氨酸棒状杆菌属于棒状杆菌属,为革兰氏阳性菌。普遍认为谷氨酸棒状杆菌无毒素、无致病性、不产芽孢,被公认是安全菌株(GRAS)。同时谷氨酸棒状杆菌具有生长快速,遗传背景清晰,具有良好的蛋白分泌系统等优点,过去50年里被广泛应用于氨基酸的生产,比如谷氨酸、赖氨酸等,还被应用于食品工业,动物饲料的生产。近些年来也被用于药用蛋白及前体的表达,是一种安全的医药蛋白表达宿主,具有很高的应用价值。
但在实际应用中发现,外源蛋白表达量不尽如人意,因此,有必要对谷氨酸棒状杆菌的宿主菌进行改造使其更有利于外源蛋白的表达。
发明内容
针对上述问题,本发明提供了一种重组谷氨酸棒状杆菌,其能有效解决现有谷氨酸棒状杆菌外源蛋白表达量低的技术问题,此外,本法还提供了该重组谷氨酸棒状杆菌的制备方法及其应用。
其技术方案是这样的,一种重组谷氨酸棒状杆菌,所述重组谷氨酸棒状杆菌中的肽聚糖内切酶基因mepA、细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和胞内蛋白酶基因clpC均被敲除,同时ABC转运体基因Ncgl0909过量表达。
进一步的,重组前的谷氨酸棒状杆菌为C. glutamicum ATCC 13032。
上述重组谷氨酸棒状杆菌的制备方法,其特征在于:所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC的敲除采用crispr/cas9基因敲除技术,ABC转运体基因Ncgl0909的过量表达采用启动子替换技术。
进一步的,所述crispr/cas9基因敲除技术包括以下步骤:
(1)设计sgRNA,所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC对应的sgRNA的核苷酸分别如SEQ ID No.1、No.2和No.3所示;
(2)构建同源修复序列,所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC的同源修复序列分别如SEQ ID No.4、No.5和No.6所示;
(3)整合sgRNA和同源修复序列到载体pcas9allinone中,所述载体pcas9allinone的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示,分别形成所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC敲除的载体pcas9allinone-mepA、pcas9allinone-porB和pcas9allinone-clpC;
(4)构建基因敲除载体,将上述载体pcas9allinone-mepA、pcas9allinone-porB和pcas9allinone-clpC逐个转入到所述谷氨酸棒状杆菌中,经过筛选得到重组菌株3。
进一步的,所述启动子替换技术包括以下步骤:
(1)设计sgRNA,所述启动子为tac启动子,tac启动子的sgRNA的核苷酸序列如 IDNo.7所示;
(2)构建同源修复序列,整合有tac启动子的同源修复序列如SEQ ID No.8所示;
(3) 整合sgRNA和同源修复序列到载体pcas9allinone中,形成载体pcas9allinone-0909;
(4)获得重组谷氨酸棒状杆菌,将载体pcas9allinone-0909转入重组菌株3中,筛选得到重组谷氨酸棒状杆菌。
上述重组谷氨酸棒状杆菌在外源蛋白表达中的应用。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:在对谷氨酸棒状杆菌进行改造中,并没有影响到菌株的生长速度,且能够显著提高外源蛋白的表达量;本发明提供的菌株可作为外源蛋白高效表达的宿主。
附图说明
图1为基因敲除载体构建示意图,图中geneRARM、geneLARM分别代表待敲除基因的上下游同源序列。
图2为基因过表达载体构建示意图,geneRARM、geneLARM分别代表Ncgl0909基因的上下游同源序列。
图3为基因改造后验证电泳图,其中,M: Marker DL10000; 1:mepA基因敲除验证;2:mepa基因野生型对照;3:porb基因敲除验证;4:porb基因野生型对照;5:clpc基因敲除验证;6:clpc基因野生型对照;7:Ncgl0909基因过表达验证;8:Ncgl0909基因野生型对照。
图4为改造后菌株表达GFP结果,其中,1:野生型菌株;2:表达EGFP的野生型菌株;3-4: 表达EGFP的重组菌株4;M: Marker 26610。
图5 改造后菌株表达BNP结果,其中,M: Marker 26610; 1:野生型菌株;2:野生型菌株表达BNP; 3:重组菌株表达BNP。
具体实施方式
下面结合实例及附图对本发明作进一步的描述,但本发明的实施方不局限于此。
下述实施例或应用例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例或应用例中所用的材料、试剂,基因合成等,如无特殊说明,均可从商业途径获得。
下述实施例或应用例中所用大肠杆菌DH5α购买自TAKARA。
下述实施例或应用例中所用谷氨酸棒状杆菌C. glutamicum ATCC 13032购买自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)。
下述实施例或应用例中所用载体骨架pXMJ19购自Addgene。
下述实施例或应用例中所用连接液solutionI购买自TaKaRa公司,货号 D6020A。
下述实施例或应用例中所用Gibson Assembly Master Mix溶液购买自NEB( NewEngland Biolabs)公司,货号E2611S。
下述实施例或应用例中大肠杆菌的培养使用LB培养基,培养基配方为:胰蛋白胨10g、酵母提取物 5g、NaCl 10g,去离子水 1L。
下述实施例或应用例中谷氨酸棒状杆菌的培养使用LBB培养基,培养基配方为:胰蛋白胨 10g、酵母提取物 5g、NaCl 10g,脑心浸液 10g、去离子水1L。
下述实施例或应用例中谷氨酸棒状杆菌的转化子培养使用LBHIS培养基,培养基配方为:胰蛋白胨 5g、酵母提取物 2.5g、NaCl 5g、脑心浸液 18.5g、山梨醇 91g、去离子水1L。
实施例1
1、谷氨酸棒状杆菌三个基因敲除载体和一个基因过表达载体的构建
porb核苷酸序列如Gene ID: 1018962 所示,mepa核苷酸序列如Gene ID:1020444所示;clpc核苷酸序列如Gene ID: 1020624 所示;Ncgl0909 核苷酸序列如GeneID: 1018938所示。
以谷氨酸棒状杆菌C. glutamicum ATCC 13032基因组中相关基因为模板设计sgRNA。
其中,porb核苷酸序列、mepa核苷酸序列以及clpc核苷酸序列的Gene ID和C. glutamicum ATCC 13032的核苷酸序列均是已公开。
用于敲除的sgRNA 应该具有5′-(N20)-NGG-3′结构,并位于基因序列中,设计mepa、prob、clpc相应的sgRNA,分别如序列SEQ ID No.1、No.2和No.3所示。依据sgRNA 合成两条寡核苷酸链,寡核苷酸退后成双链后,用连接酶连接到AjuI酶切纯化后的CRISPR/Cas9敲除载体pcas9allinone中,载体pcas9allinone的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示,其构建方法参见申请号为CN201710576441.X(公开号为CN107384951A,公开日期为2017年11月24日)的发明专利申请。寡核苷酸退火的具体操作为,两条寡核苷酸链摩尔比1:1,无菌水补齐到20μL,94℃ 5min,每分钟降温0.5℃,直到温度降为40℃。取2μL用于后续的连接。
以谷氨酸棒状杆菌C. glutamicum ATCC 13032基因组DNA为模板,利用引物mepALF mepALR 扩增mepA上游同源序列,利用mepARF mepARR 扩增mpeA基因下游同源序列,上游同源序列包含目的基因上游300bp的长度,下游同源序列包含目的基因下游300bp的长度,利用同源重组的方式重组上下游同源序列为同源修复序列。上游同源序列、下游同源序列和载体片段摩尔比1:1:1, Gibson Assembly Master Mix溶液 5μL,无菌水补齐到10μL ,50℃反应30min;同源修复序列的如SEQ ID No.4所示。热击转化E.coliDH5α感受态细胞;均匀涂布于含有30μg/mL氯霉素的LB固体培养基上,37℃倒置培养16h;挑选阳性克隆子,提取质粒即为载体pcas9allinone-mepA,如图1所示。
同样的,分别扩增porB clpC 上下游同源序列,并融合上下游同源序列为同源修复序列序列如SEQ ID No.5 、No.6 所示,引物序列如下表所示。分别构建proB和clpC敲除质粒pcas9allinone-porB和pcas9allinone-clpC。
Figure 793301DEST_PATH_IMAGE001
用于过表达的sgRNA 具有5′-(N20)-NGG-3′结构,并位于目的基因启动子区域。设计0909 sgRNA 序列,如SEQ ID No.7 所示。依据sgRNA 合成两条寡核苷酸链,寡核苷酸退后成双链后,用连接酶连接到AjuI酶切纯化后的CRISPR/Cas9敲除载体pcas9allinone中。
以谷氨酸棒状杆菌C. glutamicum ATCC 13032基因组为DNA为模板,利用0909LF0909LR 扩增Ncgl0909上游同源序列,利用引物0909RF 0909RR 扩增Ncgl0909下游同源序列,利用tacF tacR、以pXMJ19 质粒为模板扩增tac 启动子,利用同源重组技术融合0909上游序列tac启动子下游序列,构成0909 同源修复序列,如SEQ ID No.8 所示。
纯化后的同源修复序列和载体片段摩尔比1:1, Gibson Assembly Master Mix溶液 10μL,无菌水补齐到20μL ,50℃反应30min;热击转化E.coliDH5α感受态细胞;均匀涂布于含有30μg/mL氯霉素的LB固体培养基上,37℃倒置培养16h;挑选阳性克隆子,提取质粒即为Ncgl0909基因的过表达载体pcas9allinone-0909,如图2所示。
2、重组菌株的构建
重组菌1 mepA基因敲除
将载体pcas9allinone-mepA通过电转的方式转化到谷氨酸棒状杆菌C. glutamicum ATCC 13032中。取1μg DNA共转化谷氨酸棒状杆菌感受态,电击转化条件为1800v,50ms,恢复培养后涂布于含有氯霉素的IPTG LBHIS固体培养基,30℃培养36h在平板上筛选克隆子进行PCR及测序验证,验证正确的即为mepA敲除菌株,得到重组菌株1。验证结果如图4所示。
挑取mepa敲除菌株接种于5ml LBB 培养基中,37℃培养16h,划线于不含抗生素的lbb 平板,通过温敏复制子消去敲除质粒,用于下一步的敲除。
重组菌2 porB基因的敲除
操作方法同步骤1 区别在于出发菌株为上一步中得到的mepA敲除菌株。使用的载体为pcas9allinone-porB, 挑取平板上的单菌落用同源片段引物porBLF 和porBRR PCR验证获得目的菌株,同时把扩增出来的片段进行测序验证,最终根据基因型及测序结果挑选正确的菌株及porB基因敲除菌株,得到的重组菌株2。基因型验证结果如图3所示。
重组菌3 clpC基因的敲除
操作方法同步骤1, 区别在于出发菌株为上一步得到的mepA proB 敲除菌株。使用的载体为pcas9allinone-clpC。挑取平板上的克隆子用引物clpCLF clpCRR 验证,同时把扩增出来的片段进行测序验证。 最终根据基因型及测序结果挑选正确的菌株及clpC敲除菌株,得到的重组菌株3。基因型验证结果如图3所示。
重组菌4 0909 基因的过表达
操作方法同步骤1,区别在于出发菌株为上一步的到的mepA proB clpC 敲除菌株,使用的载体为pcas9allinone-0909。敲除平板上的克隆子用引物0909LF 0909RR 验证,同时把扩增出来的片段测序验证。通过基因型及测序结果确定正确的菌株即为Ncgl0909基因的过表达菌株,得到重组菌株4,即所需重组谷氨酸棒状杆菌。基因型验证记过如图3所示。
其中,肽聚糖内切酶基因mepA敲除后该位置的序列如SEQ ID No.11所示,细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB敲除后该位置的序列如SEQ ID No.10所示,胞内蛋白酶基因clpC敲除后该位置的序列如SEQ ID No.12所示,同时ABC转运体基因Ncgl0909增设tac启动子后该位置的序列如SEQ ID No.13所示。
应用例1
1、GFP在最终菌株中的表达
在商用载体pXMJ19基础上,在多克隆位点插入GFP基因构建gfp表达载体p19-egfp。以质粒p19-egfp为表达质粒,用电转的方法转入菌株4。将阳性谷氨酸棒状杆菌接种于5ml LBB 培养基中, 30 °C、230 r/min 培养过夜,1%接种量接种于另一含50ML培养基中,相同条件下培养24 h。
样品收集后用PBS 缓冲液洗2 次,PBS重悬并将OD600 调到0.5 左右,分两管。一管使用多功能酶标仪Synergy H4 测定荧光强度。激发波长为488 nm,发射波长为507 nm.同时测量od600吸光度。利用荧光纸比吸光度为单位od荧光强度。
另一管超声破碎后12000rpm离心取上清,利用SDS-PAGE检测,结果如图4所示,实验结果表明GFP在重组菌中的表达量要高于野生型。
应用例2
2、脑钠肽(BNP)是一种肽类激素,它具有排钠利尿、舒张血管以及抗肾素的作用.血液中此种肽的检测被广泛用于鉴定心衰患者和检测心衰的严重程度。具有很高的应用价值。
以质粒pXMJ19为基础,在多克隆位点插入BNP基因构建BNP表达载体 pXMJ19-BNP。以质粒pXMJ19-BNP为表达质粒。用电转的方法转入菌株4. 将阳性谷氨酸棒状杆菌接种于5ml LBB 培养基中, 30 °C、230 r/min 培养过夜,1%接种量接种于另一含50ML培养基中,相同条件下培养24 h。
样品收集后用PBS 缓冲液洗2 次,PBS重悬并将OD600 调到0.5 左右,冰上超声破碎。破碎也离心收集上清。用SDS-PAGE及多功能酶标仪Synergy H4 测定BNP表达量。
结果如图5所示,实验结果表明BNP在重组菌中的表达量要高于野生型。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大学
<120> 一种重组谷氨酸棒状杆菌、其制备方法及其应用
<130> 2017
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<210> 8
<211> 732
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> 人工序列(artificial sequence)
<400> 8
ggaaagacac cgtcggcctg ccaccgggag caaccgcaac tttagccgtg gaatttggcc 60
actacccaga cccgcaatgg ccctacatgt atcactgcca catgctctac cacgaggatc 120
aaggcatgat ggggcagttc gtcatcgtgg agccaggcga cgagccggcg gcggtgctgg 180
ggtcgggcac gggctccagc attgactccg ccggcggaca tgcgcactag ttctggcgtc 240
aggcagccat cggaagctgt ggtatggctg tgcaggtcgt aaatcactgc ataattcgtg 300
tcgctcaagg cgcactcccg ttctggataa tgttttttgc gccgacatca taacggttct 360
ggcaaatatt ctgaaatgag ctgttgacaa ttaatcatcg gctcgtataa tgtgtggaat 420
tgtgagcgga taacaatttc acacaggaaa cagaattaat atgacaacga caccagcaat 480
cgacgtaaca gacctcgtga gaacctacgg cgactacacc gcagtcaagg gcctgaattt 540
ccatgtacag cgcggtgaag tatttggtct gctcggcacc aacggggccg gcaaaacctc 600
caccttggaa gtcatcgaag gactttccgc acccagctcc ggcaccgtgc gcatctccgg 660
gcttgacccc gttgccgacc gcgcgatcct gcgccccgag ctcggcatca tgctgcaatc 720
aggcggcctg cc 732
<210> 9
<211> 11285
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> 人工序列(artificial sequence)
<400> 9
ggccgcgttg ctggcgtttt tccataggct ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg 60
acgctcaagt cagaggtggc gaaacccgac aggactataa agataccagg cgtttccccc 120
tggaagctcc ctcgtgcgct ctcctgttcc gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc 180
ctttctccct tcgggaagcg tggcgctttc tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc 240
ggtgtaggtc gttcgctcca agctgggctg tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg 300
ctgcgcctta tccggtaact atcgtcttga gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc 360
actggcagca gccactggta acaggattag cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga 420
gttcttgaag tggtggccta actacggcta cactagaagg acagtatttg gtatctgcgc 480
tctgctgaag ccagttacct tcggaaaaag agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac 540
caccgctggt agcggtggtt tttttgtttg caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg 600
atctcaagaa gatcctttga tcttttctac ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc 660
acgttaaggg attttggtca tgagattatc aaaaaggatc ttcacctaga tccttttaaa 720
ttaaaaatga agttttaaat caatctaaag tatatatgag taaacttggt ctgacagtta 780
ccaatgctta atcagtgagg cggaagggca ccaataactg ccttaaaaaa attacgcccc 840
gccctgccac tcatcgcagt actgttgtaa ttcattaagc attctgccga catggaagcc 900
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atcaaaactg gtgaaactca cccagggatt ggctgagacg aaaaacatat tctcaataaa 1080
ccctttaggg aaataggcca ggttttcacc gtaacacgcc acatcttgcg aatatatgtg 1140
tagaaactgc cggaaatcgt cgtggtattc actccagagc gatgaaaacg tttcagtttg 1200
ctcatggaaa acggtgtaac aagggtgaac actatcccat atcaccagct caccgtcttt 1260
cattgccata cggaactccg gatgagcatt catcaggcgg gcaagaatgt gaataaaggc 1320
cggataaaac ttgtgcttat ttttctttac ggtctttaaa aaggccgtaa tatccagctg 1380
aacggtctgg ttataggtac attgagcaac tgactgaaat gcctcaaaat gttctttacg 1440
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cttagctcct gaaaatctcg tcgaagctcg gcggatttgt cctactcaag ctgatccgac 1560
aaaatccaca cattatccca ggtgtccgga tcggtcaaat acgctgccag ctcatagacc 1620
gtatccaaag catccggggc tgatccccgg cgccagggtg gtttttcttt tcaccagtga 1680
gacgggcaac agctgattgc ccttcaccgc ctggccctga gagagttgca gcaagcggtc 1740
cacgtggttt gccccagcag gcgaaaatcc tgtttgatgg tggttaacgg cgggatataa 1800
catgagctgt cttcggtatc gtcgtatccc actaccgaga tatccgcacc aacgcgcagc 1860
ccggactcgg taatggcgcg cattgcgccc agcgccatct gatcgttggc aaccagcatc 1920
gcagtgggaa cgatgccctc attcagcatt tgcatggttt gttgaaaacc ggacatggca 1980
ctccagtcgc cttcccgttc cgctatcggc tgaatttgat tgcgagtgag atatttatgc 2040
cagccagcca gacgcagacg cgccgagaca gaacttaatg ggcccgctaa cagcgcgatt 2100
tgctggtgac ccaatgcgac cagatgctcc acgcccagtc gcgtaccgtc ttcatgggag 2160
aaaataatac tgttgatggg tgtctggtca gagacatcaa gaaataacgc cggaacatta 2220
gtgcaggcag cttccacagc aatggcatcc tggtcatcca gcggatagtt aatgatcagc 2280
ccactgacgc gttgcgcgag aagattgtgc accgccgctt tacaggcttc gacgccgctt 2340
cgttctacca tcgacaccac cacgctggca cccagttgat cggcgcgaga tttaatcgcc 2400
gcgacaattt gcgacggcgc gtgcagggcc agactggagg tggcaacgcc aatcagcaac 2460
gactgtttgc ccgccagttg ttgtgccacg cggttgggaa tgtaattcag ctccgccatc 2520
gccgcttcca ctttttcccg cgttttcgca gaaacgtggc tggcctggtt caccacgcgg 2580
gaaacggtct gataagagac accggcatac tctgcgacat cgtataacgt tactggtttc 2640
acattcacca ccctgaattg actctcttcc gggcgctatc atgccatacc gcgaaaggtt 2700
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tgatccgggc ttatcgactg cacggtgcac caatgcttct ggcgtcaggc agccatcgga 2820
agctgtggta tggctgtgca ggtcgtaaat cactgcataa ttcgtgtcgc tcaaggcgca 2880
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aatgagctgt tgacaattaa tcatcggctc gtataatgtg tggaattgtg agcggataac 3000
aatttcacac aggaaacaga attaattaag cttaaaggag gacaactaat ggataaaaag 3060
tattccattg gcctggacat cggcaccaat tctgtgggtt gggcagtcat caccgacgaa 3120
tacaaggtcc catccaagaa gttcaaggtg ctcggtaata ccgatcgcca ctctatcaag 3180
aaaaacctga tcggcgccct gctcttcgac tccggcgaaa ccgcagaagc aacccgtctc 3240
aagcgtaccg cacgtcgccg ctacacccgc cgtaagaatc gcatctgcta cctccaggaa 3300
atcttctcta atgagatggc aaaggtggat gactcctttt tccaccgcct cgaagagtcc 3360
ttcctggtgg aagaggacaa gaaacacgag cgccatccta tcttcggcaa tattgtcgat 3420
gaagtcgcat atcatgaaaa atacccaacc atttaccatc tccgtaaaaa actcgtcgat 3480
tccaccgata aggcagatct ccgcctgatc tatctggcac tggcccacat gatcaagttt 3540
cgtggccact tcctgatcga aggtgacctc aatccagaca attccgacgt ggacaagctg 3600
ttcatccagc tggtgcaaac ctacaaccag ctctttgagg aaaacccaat caacgcatct 3660
ggcgtcgacg caaaagccat cctgtccgcc cgtctctcca agtctcgtcg cctcgaaaac 3720
ctcattgccc agctccctgg cgagaagaaa aacggtctgt tcggcaatct gatcgccctg 3780
tctctgggtc tgaccccaaa tttcaaatcc aactttgatc tcgcagaaga tgccaagctg 3840
cagctctcta aggacaccta cgatgatgac ctggataacc tcctcgccca gatcggcgac 3900
cagtacgccg atctcttcct cgcagccaag aacctctctg acgcaattct gctgtccgac 3960
atcctgcgcg tgaacaccga aatcactaag gcaccactct ctgcctccat gattaagcgc 4020
tacgacgagc atcatcagga tctcactctc ctcaaagccc tggtccgcca gcagctccca 4080
gagaagtaca aggaaatctt tttcgaccaa tccaaaaacg gctacgcagg ttacatcgat 4140
ggcggcgcct ctcaggaaga gttttacaaa ttcattaagc caatcctcga aaagatggac 4200
ggcaccgagg aactgctggt gaaactcaac cgtgaagatc tcctgcgcaa acagcgcacc 4260
ttcgacaacg gttccattcc tcaccagatc cacctgggcg aactgcacgc aatcctccgc 4320
cgtcaagagg acttctaccc attcctgaag gacaaccgtg aaaagatcga aaagattctc 4380
accttccgca tcccttacta cgtgggtcct ctcgcccgtg gcaattcccg cttcgcctgg 4440
atgactcgca aatctgaaga gaccatcacc ccttggaact ttgaggaagt cgtcgataaa 4500
ggcgcctctg cccaatcctt catcgagcgc atgaccaact tcgacaagaa cctcccaaac 4560
gagaaagtgc tgcctaagca ttccctcctg tacgagtact ttactgtcta caatgagctg 4620
actaaggtga agtatgtcac tgaaggcatg cgtaagccag cctttctctc cggcgagcag 4680
aaaaaggcaa tcgtcgacct cctgtttaaa accaaccgca aagtgactgt gaaacagctc 4740
aaggaagatt actttaaaaa aatcgaatgc ttcgattctg tggaaatctc cggcgtggag 4800
gatcgtttca acgcctccct gggtacctat cacgacctcc tgaagattat caaggacaaa 4860
gattttctgg ataacgagga aaacgaggac attctcgagg acattgtgct gaccctgacc 4920
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gacaaggtca tgaagcaact caagcgccgc cgctataccg gttggggccg tctctcccgt 5040
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aaagaggaca tccagaaagc ccaagtgtcc ggtcaaggcg actccctgca cgaacacatc 5220
gccaatctgg caggttcccc agcaatcaag aagggcatcc tgcagaccgt caaggtggtg 5280
gacgaactcg tcaaagtgat gggtcgccac aaaccagaaa acatcgtcat cgagatggcc 5340
cgtgagaacc agaccaccca gaaaggccag aaaaactccc gtgagcgcat gaagcgcatt 5400
gaagaaggca ttaaagagct cggctctcag atcctgaaag agcatcctgt cgagaacacc 5460
caactgcaga atgagaagct gtatctgtat tatctccaga acggccgcga catgtacgtc 5520
gaccaggaac tggacatcaa ccgtctctct gattacgatg tggaccatat cgtccctcag 5580
tctttcctga aagacgactc tattgacaac aaagtcctca cccgctccga caagaaccgc 5640
ggcaagtccg ataacgtgcc atccgaggag gtcgtgaaga agatgaagaa ctactggcgc 5700
cagctgctca acgccaagct gatcactcag cgcaagttcg ataacctgac caaggccgaa 5760
cgtggtggtc tctccgagct cgacaaggca ggctttatca agcgccaact cgtggagact 5820
cgccaaatca ctaaacacgt cgcccagatc ctcgactccc gcatgaatac caagtacgat 5880
gaaaatgaca agctcatccg cgaagtgaaa gtcattaccc tgaagtccaa actggtctct 5940
gactttcgca aggatttcca gttctacaag gtccgcgaga ttaataacta tcatcatgca 6000
cacgatgcat acctcaacgc agtcgtgggt accgcactga tcaagaagta ccctaaactg 6060
gagtccgagt tcgtctatgg cgactacaag gtgtacgacg tccgcaaaat gattgccaag 6120
tccgagcagg agatcggcaa agcaactgcc aaatatttct tttactccaa catcatgaac 6180
ttcttcaaga ccgaaatcac cctcgccaac ggtgaaatcc gcaaacgtcc actcatcgag 6240
actaatggtg aaaccggcga gatcgtctgg gacaagggcc gtgacttcgc aaccgtccgc 6300
aaggtcctct ccatgccaca ggtcaacatc gtgaaaaaga ccgaggtgca aaccggcggc 6360
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aacaccacta aaaattaata gtccctagac aagacaaacc cccgtgcgag ctaccaactc 9660
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<210> 10
<211> 1976
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> 人工序列(artificial sequence)
<400> 10
ggagtggaca agtcacgatc gttggaacac aacaggtttg cggcactcaa tgctgcgtca 60
tcaatttggt tggggtccgc taccccatca ccgtttgcat ccaatcccat aagtcgccac 120
gtttccggaa tgaactgcat gggacctacc gcgcgatcat attcagtatc gccatctaat 180
tccccaccat cagtgtcggg aatttccgca aaccccggtg aaccatcaag tggaacgccg 240
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ttgcagccag gccacgcagt actcgcgatg agctctgcgt ttccataagc cgcaatcgct 420
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gtgcgtccat ctgcctctgt atcaatttgc ggaacttcta caccacgcgc cggcggaaca 540
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agcaaaacat cccccagttc gcttttcatg tgctcatcat cgccaccatg aatcgcttca 1740
ataaactcct gcgattcttc ttccagatac ggaatcaaac tctcatgggt ttgcgtgcgt 1800
tcccactcgc cgcggcccac ggccgcccgc atgacgccga cggcctcatg caaagggttg 1860
aggggcgcgt cgataagcag cgtgctttgc ggttttgcga tgataaacca ggaggcgctt 1920
gtcgacgtct tgatccccca tttttcaata tcaaatggaa aatcgggatc gataga 1976
<210> 11
<211> 2010
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> 人供序列(artificial sequence)
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ccttcaatac aagggatgca tccttatatg agtccgccag ctttgagagc acctctgccc 60
tacccaaacc cacagcaaaa ccagggccgt ccacgtttcg cttcggctcc ccaatcacga 120
tccccacgat cacgcttggc tgcaccgatg ccagcacccg cactccggcg cgctgagtcc 180
acttctggat ctgtgtttca gctttcgcat gatcaggtga ggtggctgcc aatgctctta 240
gaggagtgtc ggcgggaacg tcatacatcg cagcacccca taaaagctct gacagttcag 300
agccttccga gaccgctttg ccgatccatt ctgaccttcg caccgaatcg gcgatcgccg 360
tggcgacctc gtgatcgcgg tacacccttg tggcacgcgt agaaaaggca tcattgaccg 420
cccacatcag tgtggaccag cgcagcattc tgccgggatc aatattgtat tccgggccca 480
actgcaccaa atgctccaga atttccccca gagacatccg aaaaccgtgc agcacacttc 540
ccagcggcac attttgcgct atacgttcgt cggcaagcct taaagcctca ggcaagtcct 600
cggcctttgg ctcggtgccc gcgttaatca cgcgaataat caaggccgta ttgcgtatcg 660
acgactccct gatcggcccc gcgtcaacga gctcatagcc cgggatcgta gcgagcaact 720
ttgcggcggt gccctccgca atatccggcg catcggcatc caaacgtgcg agcaattctt 780
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cgctagccgt tcgtgggata cgggtgaaat aaaagaaact gcaggtcatc ttagttgatg 1080
acctgcagtt tctgtttgtg cgcctggaga gacttgaact ctcacgtcct aggacactgg 1140
aacctaaatc cagcgcgtct gccaattccg ccacaagcgc ttaatgcggg ttttactata 1200
catggtgtag tcccaaatta actaatgcgg gtgaccaact gcaccgtaaa aaaaattcgc 1260
ttatcgtaaa tcagcaggta gaataacact ctatgagcga gccagggcca tccggggtta 1320
aagaaaagaa gaaagtaaag gcaagtcaca ttgtctttct tctcatttgt tttatcgcag 1380
cctgcgcgtt ggcgtggtgg cagtggtcaa gattccagtc cgggtctgga actttccaaa 1440
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ggatcttcct gagtgggcac gattcgttcc 2010
<210> 12
<211> 2044
<212> DNA
<213> Artificial
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<223> 人工序列(artificial sequence)
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cggcgcgctt tccggaggcg aacaacgacg ccttgatttg gcctgcgcac tgcttggcga 1140
cccctcaatt ttgttcctcg acgaa 1165

Claims (1)

1.一种重组谷氨酸棒状杆菌在外源蛋白表达中的应用,其特征在于:所述外源蛋白为脑钠肽;
重组后的谷氨酸棒状杆菌中的肽聚糖内切酶基因mepA、细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和胞内蛋白酶基因clpC均被敲除,同时ABC转运体基因Ncgl0909过量表达;
重组前的谷氨酸棒状杆菌为C. glutamicum ATCC 13032;
所述重组谷氨酸棒状杆菌的制备方法包括,所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC的敲除采用crispr/cas9基因敲除技术,ABC转运体基因Ncgl0909的过量表达采用启动子替换技术;
所述crispr/cas9基因敲除技术包括以下步骤:
S1、设计sgRNA,所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC对应的sgRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID No.1、SEQ IDNo.2和SEQ ID No.3所示;
S2、构建同源修复序列,所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC的同源修复序列分别如SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示;
S3、整合步骤S1获得的sgRNA和步骤S2获得的同源修复序列到载体pcas9allinone中,所述载体pcas9allinone的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示,分别形成所述肽聚糖内切酶基因mepA、所述细胞膜表面阴离子通道蛋白基因porB和所述胞内蛋白酶基因clpC的敲除载体pcas9allinone-mepA、pcas9allinone-porB和pcas9allinone-clpC;
S4、构建基因敲除载体,将上述载体pcas9allinone-mepA、pcas9allinone-porB和pcas9allinone-clpC逐个转入到所述重组前的谷氨酸棒状杆菌中,经过筛选得到含有基因敲除载体的重组菌株;
所述启动子替换技术包括以下步骤:
S1’、设计sgRNA, sgRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示,sgRNA位于目的基因启动子区域;
S2’、构建同源修复序列,整合有tac启动子的同源修复序列如SEQ ID No.8所示;
S3’、 整合步骤S1’获得的sgRNA和步骤S2’获得的同源修复序列到载体pcas9allinone中,形成载体pcas9allinone-0909;
S4’、获得重组谷氨酸棒状杆菌,将载体pcas9allinone-0909转入步骤S4获得的含有基因敲除载体的重组菌株中,筛选得到重组谷氨酸棒状杆菌。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109370974B (zh) * 2018-12-03 2020-12-01 江南大学 一种高产l-赖氨酸的重组谷氨酸棒状杆菌及其构建方法
CN111518735A (zh) * 2019-02-02 2020-08-11 江南大学 一种谷氨酸棒状杆菌重组菌、制备方法和应用
CN111073841A (zh) * 2019-11-25 2020-04-28 华农(肇庆)生物产业技术研究院有限公司 一种可有效表达外源蛋白的棒状杆菌atcc 13032改良菌种以及构建方法
CA3199126A1 (en) * 2020-12-11 2022-06-16 Byoung Hoon Yoon Mutant atp-dependent protease, and method for producing l-amino acid using same

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102124119A (zh) * 2008-04-30 2011-07-13 巴斯夫欧洲公司 使用具有降低的异柠檬酸脱氢酶活性的微生物生产精细化学药品的方法
CN106701810A (zh) * 2016-12-12 2017-05-24 江南大学 一种谷氨酸棒状杆菌的基因编辑系统及其应用
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1315744A1 (en) * 2000-09-09 2003-06-04 Degussa AG Nucleotide sequences which code for the clpc gene

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102124119A (zh) * 2008-04-30 2011-07-13 巴斯夫欧洲公司 使用具有降低的异柠檬酸脱氢酶活性的微生物生产精细化学药品的方法
CN106701810A (zh) * 2016-12-12 2017-05-24 江南大学 一种谷氨酸棒状杆菌的基因编辑系统及其应用
CN107384951A (zh) * 2017-07-14 2017-11-24 江南大学 一种谷氨酸棒状杆菌的基因编辑载体、制备方法、系统及其应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 chromosome, complete genome;登录号:NC_003450.3;《GenBank》;20160803;参见序列及相关信息 *
Efcient gene editing in Corynebacterium glutamicum using the CRISPR/Cas9 system;Feng Peng等;《Microbial Cell Factories》;20171114;第16卷;第1-13页,参见摘要、第6页右栏第2段-第7页右栏第1段、第10页左栏第3段-第11页右栏第1段、图2、图5、图7 *
外源蛋白表达过程中谷氨酸棒状杆菌转录组及代谢产物的多变元分析;孙杨等;《食品与发酵工业》;20170831;第43卷(第8期);第8-13页,参见摘要、第10页左栏第1段 *

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