CN108018351A - 一种与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及BDNF基因单核苷酸多态性rs6265作为与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物及其在检测摄入高脂食物所致代谢疾病中的应用。研究发现,rs6265单核苷酸多态性特异的增加对高脂食物的敏感性,从而导致肥胖与及相关的血糖调节失衡,因此rs6265单核苷酸多态性可作为与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物。根据检测结果与健康正常个体比较,判断或提示rs6265G/A单核苷酸多态性特异地增加与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的风险因素。本发明还提供了含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品及其在产业中的应用。
Description
技术领域
本发明属于生物医学领域,涉及BDNF基因单核苷酸多态性rs6265作为与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物及其在检测摄入高脂食物所致代谢疾病中的应用,特别涉及BDNF基因rs6265位点标志物在人群对摄入高脂食物所致肥胖易感性筛查和指导或辅助指导高脂饮食中的应用。
背景技术
肥胖是全世界一个流行病并引发许多严重的健康问题。随着中国经济发展和生活水平不断提高,中国过去二十年来肥胖率急剧上升。目前,中国肥胖人口世界第一,肥胖率高居世界第二,仅次于美国。众所周知,肥胖极大地增加患发2型糖尿病、心血管疾病、许多癌症和一些神经退行性疾病如老年痴呆症的概率。在现代社会里,导致肥胖增加的原因很复杂,既包括内在的遗传因素,例如基因突变、缺失或单核苷酸多态性,也包括外在因素,例如生活习惯的改变(长期坐着办公以及运动量减少)和高热量食物的摄取。这些内、外部因素一起促使现代社会肥胖率的快速增长。
目前,基因组关联分析鉴定出若干个脑源性神经营养因子(BDNF)基因内或附近的单核苷酸多态性(SNPs),流行病学统计学研究暗示这些单核苷酸多态性与体重指数(BMI)有一定的关联。但是,关于具体哪些单核苷酸多态性以及它们如何影响体重从而导致肥胖,人们并不清楚。BDNF全基因组有许多不同的转录体,但是核心编码区(63495..64238)是一致的,具体序列可参考NCBI Reference Sequence:NC_000011.10。其中rs6265多态性(GTG>ATG,or UTU>ATU,Valine>Methionine)就是位于该编码区的63690-63692。rs6265也叫BDNFVal66Met,是人染色体11p113上的一个二等位多态性的SNP位点,该变异是转换(G/A,在其互补链上则为C/T),所述rs6265位点是G时,所编码的氨基酸为Val,当其位点是A时,编码的氨基酸为Met。它与脑源性神经营养因子(BDNF)基因内或附近的其它单核苷酸多态性不同,rs6265是人类基因组上常见的一个单核苷酸多态性,尤为重要的是,已有研究表明,这个SNP在东亚人中,例如中国人和日本人,出现频率很高。超过50%的中国人携带一个rs6265SNP,而大约20%的中国人携带两个rs6265SNPs。而在美国白种人中,只有不到2%的人携带两个rs6265SNPs。虽然有研究提rs6265与人体重指数有一定的相关性,但其通过什么方式影响体重指数尚未揭示。
发明内容
本发明的目的是发现一种与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物。本发明的第二个目的是提供所述生物标志物在预测摄入高脂食物所致代谢疾病产品中的应用。本发明的第三个目的是提供所述生物标志物在指导或辅助指导高脂饮食中的应用。
为解决上述技术问题,本发明通过构建携带rs6265多态性的转基因小鼠,我们发现当喂养低脂常规食物时,转基因小鼠与对照组食物摄取相当,体重相当。然而,当喂养高脂食物时,与对照组小鼠相比,携带两个rs6265单核苷酸多态性的转基因小鼠体重急剧增长,在短短的6周内变胖。同时,只携带一个rs6265单核苷酸多态性的转基因小鼠也在喂养高脂食物后显着性的增加体重。
喂养高脂食物后,与对照组小鼠相比,转基因小鼠表现出更差的血糖控制,(葡萄糖耐受性实验)、更高的空腹血糖水平以及更低的胰岛素敏感性(胰岛素耐受性实验)。当喂养低脂常规食物时,转基因小鼠与对照小鼠摄取类似多的卡路里(无显着性差异);然而,当喂养高脂食物时,转基因小鼠摄取的卡路里远超对照小鼠(超过50%的增加)。而最令人惊讶的是,当喂养高糖但低脂食物时,转基因小鼠摄取与对照小鼠差不多的卡路里。
这些结果综合一起表明rs6265单核苷酸多态性特异的增加对高脂食物的敏感性,从而导致肥胖与及相关的血糖调节失衡,因此rs6265单核苷酸多态性可作为与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物。
一方面,本发明提供了一种用于鉴别与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物在制备检测产品中用途,所述方法包括:
(1)、检测样品基因组中rs6265的多态性或基因型;
(2)、根据检测结果与健康正常个体/群体比较,判断或提示rs6265G/A单核苷酸多态性特异地增加与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的风险因素;其中,所述生物标志物是人染色体11P13上的一个二等位多态性的SNP位点rs6265。rs6265位于染色体27658369处。
上述用途中,与正常健康个体/人群相比,两个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,体重发生显著增加。
上述用途中,与正常健康个体/人群相比,只有一个等位基因上出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,增加的体重也高于正常个体/群体。
上述用途中,与正常健康个体/人群相比,两个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体或只有一个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,表现出更差的血糖控制,更高的空腹血糖水平,以及更低的胰岛素敏感性。
上述用途中,所述摄入高脂食物所致代谢疾病包括摄入高脂食物所致肥胖,摄入高脂食物所致肥胖易感性,以及和摄入高脂食物所致糖耐受异常等,包含且不限于2型糖尿病。
此外,本发明还提供了rs6265单核苷酸多态性在下述A1)-A6)中的任一用途:
A1)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测肥胖易感性产品中的应用;
A2)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致代谢疾病产品中的应用;
A3)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致肥胖产品中的应用;
A4)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致肥胖易感性产品中的应用;
A5)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的单核苷酸多态性的产品中的应用;
A6)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备指导或辅助指导高脂饮食相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。
检测人基因组中rs6265的多态性或基因型具体可为检测rs6265的核苷酸种类,也可以检测其编码的氨基酸类型。
上述用途中,所述检测产品包括扩增包括rs6265在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物;和/或,所述检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质可为所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。
另一方面,本发明还提供了含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品。
本发明提供了一种含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品,所述产品包括扩增包括rs6265在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物。优选的,所述产品包括扩增人基因组中rs6265的PCR引物和/或单碱基延伸引物。更优选的,所述产品包括扩增人基因组中rs6265的PCR引物,包括选自如下组的引物:
引物方案A:
上游引物1:ccctgcagaatggcctggaattac
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物1:ggacgtgtacaagtctgcgtcc
野生型纯合子:一条约400bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约400bp扩增片段,一条约100bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约100bp扩增片段。
引物方案B:
上游引物3:tccgaggacaaggtggcttggc
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物2:ccctcatggacatgtttgcagc
野生型纯合子:一条约300bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约300bp扩增片段,一条约200bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约200bp扩增片段。
引物方案C:
上游引物4:gagtttatcaccaagacataaa
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物3:gtcaatttttgtattcctccagcag
野生型纯合子:一条约500bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约500bp扩增片段,一条约150bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约150bp扩增片段。
扩增mRNA中rs6265相对应位点多态性的cDNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物,包括选自如下组的引物:
引物方案D:
上游引物5:atgaccatccttttcc ttactatgg
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物4:gggtcagagtggcgccggaccc
野生型纯合子:一条约416bp扩增片段;
单核苷酸多态性杂合子:一条约416bp扩增片段,一条约200bp扩增片段;
单核苷酸多态性纯合子:一条约200bp扩增片段。
所述产品可为试剂或试剂盒,还可为由试剂或试剂盒和仪器组成的系统,如由引物和DNA测序仪组成的系统,由PCR试剂和DNA测序试剂和DNA测序仪组成的系统,由TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR仪和进行基因分型的模块以及TaqMan探针技术所需要的其他试剂组成的系统,由探针、PCR引物对以及连接酶检测反应(LDR)所需要的其他试剂和仪器组成的系统,由PCR引物对、单碱基延伸引物、芯片、PCR仪、进行基因分型的模块和/或Sequenom MassArray技术所需要的其他试剂和仪器组成的系统。
在实际应用中,检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质可包含但不限于下述至少一种方法,所需的试剂和/或仪器:DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片、TaqMan探针技术和Sequenom MassArray技术。其中,利用Sequenom MassArray技术确定rs6265的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器包括PCR引物对、基于单碱基延伸反应的延伸引物、磷酸酶(如虾碱性磷酸酶(shrimpalkaline phosphatase,SAP))、树脂、芯片、MALDI-TOF(matrix-assisted laserdesorption/ionization–time of fligh,基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱)和/或Sequenom MassArray技术所需要的其他试剂和仪器;利用TaqMan探针技术确定rs6265的多态性基因型所需的试剂和/或仪器包括TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR仪、进行基因分型的模块(如7500System SDS software)和/或TaqMan探针技术所需要的其他试剂;SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片和/或基于荧光分子DNA结合反应的芯片。
优选的,上述的含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品,包括试剂、试剂盒以及由试剂或试剂盒和仪器组成的系统,进一步可应用于制备如下相关的检测产品:
a)检测与检测摄入高脂食物所致代谢疾病相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
b)鉴定或辅助鉴定与摄入高脂食物所致肥胖易感性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
c)指导或辅助指导高脂饮食相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
d)检测摄入高脂食物所致肥胖易感性产品。
另一方面,本发明还提供了含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品在产业中的进一步应用。
如前所述,rs6265单核苷酸多态性特异的增加对高脂食物的敏感性,从而导致肥胖与及相关的血糖调节失衡,因此rs6265单核苷酸多态性可作为与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物,根据检测结果与健康正常个体/群体比较,判断或提示rs6265G/A单核苷酸多态性特异地增加与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的风险因素。
具体实施方式
实施例1 BDNF基因单核苷酸多态性rs6265在摄入高脂食物所致肥胖及摄入高脂食物所致代谢疾病中的作用。
Bdnf Met/Met转基因小鼠10只和Bdnf Val/Val对照小鼠14只,10周之前喂养低脂食物,之后开始喂养高脂食物并持续6周。高脂食物喂养开始两周期间每天检测食物摄取,同时每周测取小鼠体重。
结果表明,Bdnf Met/Met转基因小鼠,在高脂喂养6周后体重迅速增加(Bdnf Val/Val对照组小鼠体重由24.5±0.5克/只增长到33.3±0.9克/只,平均增重8.9±0.7克/只;Bdnf Met/Met转基因小鼠体重:由27.2±0.6克/只增长到46.3±1.0克/只,平均增重19.1.±0.5克/只,见附表1.体重对比表),可见,Bdnf Met/Met转基因小鼠比对照组小鼠多增重115%。
低脂食物喂养时,Bdnf Met/Met转基因小鼠与Bdnf Val/Val对照组小鼠相比,Bdnf Met/Met转基因小鼠仅多摄取14%的卡路里(Bdnf Val/Val对照组小鼠摄入热量为10.4±0.4千卡/天;Bdnf Met/Met转基因小鼠摄入热量为11.9±0.5千卡/天);然而,高脂食物喂养时,Bdnf Met/Met转基因小鼠比对照组小鼠多摄取57%的卡路里(Bdnf Val/Val对照组小鼠摄入热量为12.1±0.2千卡/天;Bdnf Met/Met转基因小鼠摄入热量为19.0±0.6千卡/天,见附表2.能量摄取对比表),这一能量摄取差异的变大直接导致Bdnf Met/Met转基因小鼠出现摄入高脂所致肥胖。
同时,高脂喂养后的Bdnf Met/Met转基因小鼠与对照小鼠相比空腹血糖显着升高(Bdnf Val/Val对照组小鼠血糖浓度为:91.2±5.6mg/dL;Bdnf Met/Met转基因小鼠血糖浓度为:147.8±10.0mg/dL),并且胰岛素敏感性显着的降低。
另外值得指出的是,当喂养低脂但高糖食物时,Bdnf Met/Met转基因小鼠与对照小鼠相比在食物摄取和体重上并无显着性差异。这些结果综合起来提示着BDNF Val66Met单核苷酸多态性特异地增加由高脂食物引发的肥胖及其相关症状,例如血糖失调和胰岛素敏感性降低。
实施例2一种以rs6265为生物标志物识别摄入高脂食物所致肥胖易感人群的方法
一、研究对象
本发明以征得测试者同意的前提下,选取具有高脂饮食习惯的确诊的50例单纯性肥胖人群者为研究对象,所有研究对象均为汉族人。
二、血液和临床资料收集
取受试者外周静脉血5ml,作抗凝处理后保存。
三、全血基因组DNA提取
使用DNA提取试剂盒,提取全血基因组DNA。
操作步骤如下:
1、样品的处理:
a、在血液样品中加入2-3倍体积的红细胞裂解液,充分颠倒混匀,12000rpm离心1min,小心吸去上清,沉淀应为白色或淡红色,如果裂解不彻底,可重复以上述步骤一次。向沉淀中加200ul溶液YA,振荡至彻底混匀。
b、如果处理的血样为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的血液,其红细胞为有核细胞,因此处理量为5-20u1,不需要再用红细胞裂解液处理,直接加200ul溶液YA,振荡至彻底混匀。
2、向悬浮液中加入20ul的RNase A(10mg/ml),充分颠倒混匀,室温放置10min。
3、加入20ul的蛋白酶K(10mg/ml),充分颠倒混匀,65℃水浴消化30-60min,消化期间可颠倒离心管混匀数次,直至样品消化完全为止。
4、加入200ul溶液YB,再加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀,不影响DNA的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入吸附柱中,室温放置2min。
5、12000rpm离心2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
6、向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入600ul漂洗液,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm离心2min,将吸附柱敞口置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续的实验如酶切、PCR等。
9、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加50-200ul经65℃水浴预热的洗脱液,室温放置5min,12000rpm离心1min。
10、离心所得洗脱液可再加入吸附柱中,12000rpm离心2min,即可得到高质量的基因组DNA。
四、基因组DNA含量和纯度的检测
用全波长紫外/可见光扫描分光亮度计准确测定每份样本DNA含量和OD比值(A260/A230、A260/A280)。通常A260/A280≈1.8代表样本DNA是纯净的。
6、设计引物
检测rs6265的多态性的引物为以下两组:
上游引物1:GACTCTGGAGAGCGTGAATGG
上游引物2:GGCTGACACTTTCGAACACA
下游引物:GGACGTGTACAAGTCTGCGTCC
7、PCR扩增目的片段
应用以上引物进行PCR扩增,PCR反应体系为20ul,其中含10mM Tris-HCl(PH8.4),50mM KCl,1.5mM MgCl2,200uM dNTP,上下游引物各0.4uM,Taq聚合酶1U,DNA模板30-50ng,PCR扩增条件为:1、94℃5min,2、96℃45s,59℃60s,72℃60s 3个循环,3、95℃45s,59℃65s,72℃60s 5个循环,4、94℃45s,57℃60s,72℃60s,32个循环,5、72℃10min。
8、测序判定基因型
取PCR产物5ul用1.5%琼脂糖凝胶电泳,以DNA marker为分子量标准品进行鉴定
野生型纯合子(Bdnf Val/Val):一条约150bp片段;
单核苷酸多态性杂合子(Bdnf Met/Val):一条约150bp扩增片段,一条约100bp扩增片段;
单核苷酸多态性杂纯合子(Bdnf Met/Met):一条约100bp扩增片段。
凝胶成像系统观察合格后,取相应片段进行测序验证。
9、结果判定
rs6265碱基为(A)的个体为摄入高脂食物所致肥胖易感人群,肥胖组中,单核苷酸多态性杂纯合子为(Bdnf Met/Met)31人,占总数的62%;单核苷酸多态性杂合子(BdnfMet/Val)为16人,占总数的32%;野生型纯合子(Bdnf Val/Val)为3人,占总数的6%。
实施例3一种以rs6265为生物标志物指导高脂饮食的试剂盒
本发明实施例提供了一种以检测rs6265从而指导高脂饮食的试剂盒,试剂盒包括:全血基因组DNA提取试剂(promega)、PCR引物、PCR反应液、阳性对照、阴性对照。
具体地,引物设计方案如下:
引物方案A:
上游引物1:ccctgcagaatggcctggaattac
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物1:ggacgtgtacaagtctgcgtcc
野生型纯合子:一条约400bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约400bp扩增片段,一条约100bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约100bp扩增片段。
引物方案B:
上游引物3:tccgaggacaaggtggcttggc
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物2:ccctcatggacatgtttgcagc
野生型纯合子:一条约300bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约300bp扩增片段,一条约200bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约200bp扩增片段。
引物方案C:
上游引物4:gagtttatcaccaagacataaa
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物3:gtcaatttttgtattcctccagcag
野生型纯合子:一条约500bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约500bp扩增片段,一条约150bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约150bp扩增片段。
选择其中一种引物方案,在试剂盒中,10μmol/L上游引物各0.75μl,10μmol/L下游引物1.5μl。
PCR反应液包括:含Mg2+的5×PCR缓冲液5μl、2.5mmol/L dNTPs1.5μl、5U/μl Taq酶0.2μl和20ng/μl的模板DNA 2μl。
PCR扩增反应的条件为:92~97℃预变性10min;92~97℃变性5s;57~62℃退火35s;3~5个循环;92~97℃变性10~15s;55~60℃退火40s;40~45个循环。
结果解读与饮食指导:单核苷酸多态性杂合子与单核苷酸多态性纯合子需严格控制高脂饮食。
实施例4一种以RT-PCR为手段识别摄入高脂食物所致肥胖易感人群的方法
本发明实施例提供了一种以RT-PCR为手段,从mRNA水平检测rs6265从而识别高脂食物所致肥胖易感人群的方法,方法如下:
根据Invitrogen Trizol使用说明从组织或血液里提取总RNA;
用New England BioLabs(NEB)M-MuLV反转录酶把RNA反转录为cDNA,作为PCR反应的模板;
引物方案D:
上游引物5:atgaccatccttttcc ttactatgg
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物4:gggtcagagtggcgccggaccc
PCR反应条件参照实施例3;
结果解读:
野生型纯合子:一条约416bp扩增片段;单核苷酸多态性杂合子:一条约416bp扩增片段,一条约200bp扩增片段;单核苷酸多态性纯合子:一条约200bp扩增片段。
附表1.体重对比表
小鼠编号 | 高脂前体重(克) | 高脂6周后体重(克) | 体重增加(克) |
对照1 | 25.4 | 36.6 | 11.2 |
对照2 | 21.9 | 30.8 | 8.9 |
对照3 | 25.4 | 35.2 | 9.8 |
对照4 | 20.7 | 26.1 | 5.4 |
对照5 | 25.4 | 35.4 | 10 |
对照6 | 24.5 | 31.2 | 6.7 |
对照7 | 25.9 | 32.5 | 6.6 |
对照8 | 23.2 | 30.5 | 7.3 |
对照9 | 26 | 38.1 | 12.1 |
对照10 | 26.7 | 34.7 | 8 |
对照11 | 23.2 | 29.2 | 6 |
对照12 | 23 | 32.4 | 9.4 |
对照13 | 24.1 | 38.3 | 14.2 |
对照14 | 27.4 | 35.7 | 8.3 |
对照组平均 | 24.5 | 33.3 | 8.9 |
标准误(SE) | 0.5 | 0.9 | 0.7 |
突变1 | 32 | 51.7 | 19.7 |
突变2 | 25.3 | 45.1 | 19.8 |
突变3 | 28.3 | 48.3 | 20 |
突变4 | 25.2 | 44.2 | 19 |
突变5 | 26.6 | 42.4 | 15.8 |
突变6 | 27.3 | 48.4 | 21.1 |
突变7 | 25.5 | 42.1 | 16.6 |
突变8 | 26.5 | 46.4 | 19.9 |
突变9 | 26.9 | 45.5 | 18.6 |
突变10 | 28.5 | 49 | 20.5 |
突变组平均 | 27.2 | 46.3 | 19.1 |
标准误(SE) | 0.6 | 1.0 | 0.5 |
统计学差异(p值) | 0.003 | 4.0936E-09 | 1.3E-10 |
4.0936E-09和1.3E-10均为Excel上的科学计数法,其数值都远远小于0.003.个人认为,高脂食物喂养后的体重增加差异是最重要的参考标准。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,students’t-test
附表2.能量摄取对比表
4.3E-06均为Excel上的科学计数法,远远小于0.001.*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,students’t-test。
Claims (10)
1.一种用于鉴别与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的生物标志物在制备检测产品中的用途,包括:
(1)、检测样品基因组中rs6265的多态性或基因型;
(2)、根据检测结果与健康正常个体/群体比较,判断或提示rs6265G/A单核苷酸多态性特异地增加与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的风险因素;
其中,所述生物标志物是人染色体11P13上的一个二等位多态性的SNP位点rs6265。
2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:与正常健康个体/人群相比,两个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,体重发生显着增加。
3.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:与正常健康个体/人群相比,只有一个等位基因上出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,增加的体重也高于正常个体/群体。
4.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:与正常健康个体/人群相比,两个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体或只有一个等位基因上均出现rs6265G/A转换的个体/群体,摄入高脂食物的条件下,表现出更差的血糖控制,更高的空腹血糖水平,以及更低的胰岛素敏感性。
5.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:所述摄入高脂食物所致代谢疾病包括摄入高脂食物所致肥胖,摄入高脂食物所致肥胖易感性,以及和摄入高脂食物所致糖耐受异常等,包含且不限于2型糖尿病。
6.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:所述用途包括rs6265单核苷酸多态性在下述A1)-A6)中的任一用途:
A1)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测肥胖易感性产品中的应用;
A2)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致代谢疾病产品中的应用;
A3)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致肥胖产品中的应用;
A4)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测摄入高脂食物所致肥胖易感性产品中的应用;
A5)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备检测与摄入高脂食物所致代谢疾病相关的单核苷酸多态性的产品中的应用;
A6)检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的物质在制备指导或辅助指导高脂饮食相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。
7.一种含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品,所述产品包括扩增包括rs6265在内的基因组DNA片段或扩增mRNA中rs6265相对应位点多态性的cDNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物。
8.根据权利要求7所述的产品,其特征在于:所述产品包括扩增人基因组中rs6265的PCR引物,包括选自如下组的引物:
引物方案A:
上游引物1:ccctgcagaatggcctggaattac
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物1:ggacgtgtacaagtctgcgtcc
引物方案B:
上游引物3:tccgaggacaaggtggcttggc
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物2:ccctcatggacatgtttgcagc
引物方案C:
上游引物4:gagtttatcaccaagacataaa
上游引物2:ggctgacactttcgaacacA
下游引物3:gtcaatttttgtattcctccagcag。
9.根据权利要求7所述的产品,所述产品包括扩增mRNA中rs6265相对应位点多态性的cDNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物,包括选自如下组的引物:
引物方案D:
上游引物5:atgaccatccttttcc ttactatgg
上游引物2:ggctgacactttcgaacaca
下游引物4:gggtcagagtggcgccggaccc。
10.根据权利要求6-9任一项所述的含有检测人基因组中rs6265的多态性或基因型的产品,进一步可应用于制备如下相关的检测产品:
a)检测与检测摄入高脂食物所致代谢疾病相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
b)鉴定或辅助鉴定与摄入高脂食物所致肥胖易感性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
c)指导或辅助指导高脂饮食相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
d)检测摄入高脂食物所致肥胖易感性产品。
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