CN107586879A - 一种用于检测亚麻ssr分子标记的引物对组、试剂盒、方法及应用 - Google Patents

一种用于检测亚麻ssr分子标记的引物对组、试剂盒、方法及应用 Download PDF

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CN107586879A CN201711041100.9A CN201711041100A CN107586879A CN 107586879 A CN107586879 A CN 107586879A CN 201711041100 A CN201711041100 A CN 201711041100A CN 107586879 A CN107586879 A CN 107586879A
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Abstract

本发明涉及一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组、试剂盒、方法及应用。本发明所述引物对组包括引物对1和引物对2,其中,引物对1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1‑2所示,引物对2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3‑4所示。本发明所述引物对组、试剂盒和方法能够准确、快速地检测控制亚麻出麻率、具有主效QTL作用的SSR分子标记——GD567和GD568,通过检测上述SSR分子标记从而评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。

Description

一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组、试剂盒、方法及 应用
技术领域
本发明涉及分子标记领域,具体而言,涉及一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组、试剂盒、方法及应用。
背景技术
分子标记是以生物体的遗传物质核酸的多态性为基础的遗传标记,具有数量丰富、遗传稳定、不受基因表达与否的限制以及操作简便等特点,并可通过分子标记直接检测基因组的遗传变异。它能从遗传物质DNA水平上准确的揭示同物种内不同种、变种、品种、品系间个体的差异,具有无与伦比的优越性。分子标记目前已被广泛应用于遗传图谱构建、基因定位等方面,并被认为是鉴别品种、品种系(含杂交种、自交系)及分析种质资源遗传多样性的有利工具。目前已有多种分子标记技术被应用于亚麻的基础性研究中,其中SSR标记由于具有扩增稳定,特异性高,共显性,开发成本相对低等优点,是目前开发最多的亚麻分子标记。利用分子标记可进行基因定位并做进一步的基因克隆、在分子水平对植物的性状进行鉴定和选择,判断目的基因在杂交后代个体中是否存在,还可以进行关联分析以明确候选基因的生理效应。
关联分析是基于自然变异群体、利用连锁不平衡规律来研究遗传变异与目标性状相关关系的研究方法。与传统的QTL相比,关联分析不需要构建作图群体、广度大、精度高、能检测到同一位点多个等位基因。2001年, Thornsberry等首次成功地将关联分析应用于植物,发现dwarf8基因不但与赤霉素新陈代谢有关,而且可以影响玉米出麻率。作物的产量、品质、抗性等性状多数是数量性状,数量性状的研究对作物的遗传改良具有重要意义,关联作图正越来越多地应用于作物数量性状的遗传研究中,并已发掘了一些与作物重要数量性状相关的标记。Kraakman等用236个AFLP标记对春大麦的产量及产量稳定性进行了关联分析,发现8个与大麦产量及5 个与产量稳定性相关联的AFLP标记。在对小麦的叶枯病(Stagonospora nodorum glume blotch)抗性进行研究中,经关联分析表明SUN2-3B的 SNG抗性与标记QSng.sfr-3BSg与相关系数很大,这与连锁分析的结果一致。黄秦军等通过关联分析在1年生欧洲黑杨和4年生欧洲黑杨中分别发现10和8个SSR标记分别与4个和6个材性性状显著相关。Jing等分析了二倍体小麦的农艺品质性状与普通小麦中46个SSR标记的相关性,发现多个标记显著关联,包括一些已知的标记。Beló等对玉米553分优良自交系的8950个SNP位点采用全基因组扫描的方法进行相关分析,结果表明油酸去饱和酶(fattyacid desaturase)基因fad2与油酸含量相关联。文自翔等在对栽培和野生大豆SSR标记与农艺品质性状进行关联分析时,分别发现 27个和34个SSR位点与16个农艺性状显著相关,并发掘了一些优异等位基因。张军等在SSR标记与大豆农艺性状QTL的关联分析中,共检测到 45个SSR位点与大豆农艺性状的11个QTL显著相关,其中有22个标记位点与家系连锁定位的QTL区间重叠。姚明哲等通过关联分析在茶树中共鉴定出5个EST-SSR标记与表型性状显著关联(P<0.01)。Agramal等仅用123个SSR标记对103份水稻种质进行产量及其构成因子的关联分析,发现与产量、籽粒宽、籽粒长宽比显著相关的5个标记,还发现6个与籽粒长及4个与千粒重显著相关的标记。目前基于AFLP、SSR、SNP等标记,采用基因组扫描方法,在甜菜、大麦、小麦、玉米、大豆等作物重要性状的关联分析研究上取得了重要进展,但在既往的研究中,关联分析的方法还很少用于亚麻的研究中。
但目前分子标记在亚麻中的关联分析研究非常少,其中一项Soto-Cerda 等利用407份亚麻核心种质材料进行全基因组扫描,关联与纤用亚麻和油用亚麻的双向选择相关的潜在的非中性基因组区域,并对细胞壁合成、木质素形成、脂肪酸生物合成相关等候选基因进行分析,但这些指标和出麻率没有相关性。另外Soto-Cerda还利用GWAS技术找到与油用亚麻产量相关的SNPs标记50余个。本专利的申请人在2013年利用关联分析技术研究亚麻出麻率的主效应基因的研究找到了4个与出麻率相关的SSR标记,但亚麻的出麻率是数量性状遗传,受为数甚多的基因支配;各个基因对性状的作用都很微小,这些基因彼此间没有显隐性关系,而其作用一般是累加的,目前找到与亚麻出麻率关联的4个SSR遗传标记还较少,在实际应用中受到限制,通过本专利新找到的2个亚麻出麻率主效数量性状的SSR位点能进一步丰富SSR标记在亚麻的分子育种,基因克隆,种植鉴定中的应用价值。
有鉴于此,特提出本发明。
发明内容
本发明的第一目的在于提供一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组,所述引物对组能够用于准确、快速地检测控制亚麻出麻率、具有主效 QTL作用的SSR分子标记——GD567和GD568,通过检测上述SSR分子标记从而评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。
本发明的第二目的在于提供一种用于检测亚麻SSR分子标记的试剂盒,所述试剂包括前述引物对组。
本发明的第三目的在于提供一种检测亚麻SSR分子标记的方法,本发明所述方法能够准确、快速地检测控制亚麻出麻率、具有主效QTL作用的 SSR分子标记——GD567和GD568,通过检测上述SSR分子标记从而评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。
本发明的第四目的在于提供前述方法在高产亚麻种质资源的鉴定或高产亚麻育种中的应用。
本发明的第五目的在于提供一种分离的SSR标志物。
本发明的第六目的在于提供一种亚麻中控制出麻率的主效数量性状位点。
为了实现本发明的上述目的,特采用以下技术方案:
一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组,所述引物对组包括引物对1和引物对2,其中,引物对1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示,引物对2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3-4所示。
出麻率属于亚麻重要的农艺性状,具有重大的社会经济效应。但亚麻出麻率属于数量性状遗传,目前关于亚麻出麻率的分子标记数量少,更未获得对亚麻出麻率具有决定性作用的主效数量性状分子标记。本发明检测 124份亚麻核心种质资源的SSR分子标记,并对其进行连锁不平衡分析、群体结构分析以及亚麻株高关联分析,最终出人意料地获得获得与出麻率由显著关联的两个SSR分子标记(GD567和GD568),所述两个SSR分子标记为控制出麻率的主效QTL。本发明所述引物对组的引物对1和引物对2分别用于分子标记GD567和GD568的PCR扩增,通过检测上述SSR 分子标记可以有效评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。
本发明还涉及一种用于检测亚麻SSR分子标记的试剂盒,所述试剂盒包括前述引物对组。
在一些具体的实施方式中,所述试剂盒中还包括水、PCR缓冲液、 dNTPs、DNA聚合酶、上样缓冲液和分子量标记物中的一种或多种。
在一些具体的实施方式中,所述DNA聚合酶选自所述DNA聚合酶选自Taq、Bst、Vent、Phi29、Pfu、Tru、Tth、Tl1、Tac、Tne、Tma、Tih、 Tf1、Pwo、Kod、Sac、Sso、Poc、Pab、Mth、Pho、ES4DNA聚合酶、Klenow 片段;更优选地,所述DNA聚合酶为Taq DNA聚合酶;特别优选地,所述Taq DNA聚合酶为热启动Taq DNA聚合酶。
本发明还涉及一种检测亚麻SSR分子标记的方法,所述方法包括:
(1)提取亚麻样品的基因组DNA;
(2)以所述基因组DNA为模板,使用前述引物对组进行PCR扩增;
(3)根据PCR扩增产物,鉴定所述亚麻样品的SSR分子标记。
本发明所述方法能够快速、准确、有效地检测控制出麻率的主效QTL ——GD567和GD568,从而有效评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。
在一些具体的实施方式中,所述方法在进行PCR扩增时,所述引物对 1的退火温度为58~60℃,优选为50.5℃;所述引物对2的退火温度为 59~61℃,优选为60℃。
在一些具体的实施方式中,所述亚麻选自ABYSSINIA、Mogilevskiy、 Hesan 1、Madefolvi Rek、Molar、SV 60066、KVL 5008、B-70、B-71、B-74、 B-79、SV 65066,80-41018、KVL 5040、Smolenskiy G4918x Aoyagi、B-130、中亚麻2号、B-153、6628、6696、6595、6551、Nike、Artemida、Temida、 Mirazh、Blue no 180、戴安娜、蒙古二号、USPEA、Argos、r8709-4-4-6-12、 col17290050-6-6-2、r8744-12、晋亚7号、定亚21、宁亚17、垻选三号、定亚22号、Selena、gc-220、gc-224中的一种或多种。
本发明还涉及上述方法在高产亚麻种质资源的鉴定或高产亚麻育种中应用。
本发明还涉及分离的SSR标志物,其由前述引物对组扩增获得。
在一些具体的实施方式中,所述SSR标志物分别包括重复SSR基序 (AGA)n和(AG)m,其中,所述n和m为自然数,优选地,所述n为14,m为12。
本发明还涉及一种亚麻中控制出麻率的主效数量性状位点,所述分子标记编号为GD567和GD568的微卫星标记。
本发明还涉及一种获得亚麻中控制出麻率的主效数量性状位点的方法,包括如下步骤:
(1)利用350对SSR标记引物,对124份亚麻种质进行检测以得到亚麻种质具有多态性的378个SSR标记的基因型;
(2)利用Tassel软件的连锁不平衡分析程序,分析步骤一中得到的该多份亚麻种质的SSR标记的基因型,计算出连锁不平衡配对检测的K矩阵图,SSR标记的基因型相互连锁的基因只保留一个;
(3)利用Structure软件和该多份亚麻种质具有多态性的378个SSR 标记的基因型对所述多份亚麻种质进行群体结构分析生成Q值矩阵;
(4)利用Tassel软件的GLM程序,以步骤三中得到的Q值作为协方差,在显著性水平P<0.01下,将分子标记数据和所述多份亚麻种质出麻率的数量性状数据进行GLM程序线性模型的逻辑回归率检验,输出各SSR 位点的显著性水平P及其对表型变异的解释率R2数据;
(5)重复步骤四,对两年(2011年和2012年)的表型变异进行分析 (6)选取步骤五中在两年的表型中共同存在的显著性水平P<0.01的 SSR位点,以得到亚麻中控制出麻率的主效数量性状基因。
在一些具体的实施方式中,所述的获得亚麻中控制出麻率的主效数量性状位点的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,利用Structure软件进行群体结构分析时,设定亚群数目k=1-10,每个K值运行3次,通过计算Δ K确定亚麻的最合适种群结构;
在一些具体的实施方式中,所述的获得亚麻中的出麻率数据的方法中,所述步骤(5)中,所述多份亚麻种质的多年出麻率的数量性状数据为两年的各个亚麻品种的出麻率数据。
在一些具体实施方式中,所述多份亚麻种质为124份亚麻种质。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:
本发明检测124份亚麻核心种质资源的SSR分子标记,并对其进行连锁不平衡分析、群体结构分析以及亚麻株高关联分析,最终出人意料地获得获得与出麻率由显著关联的两个SSR分子标记(GD567和GD568),所述两个SSR分子标记为控制出麻率的主效QTL。基于上述SSR分子标记,本发明获得用于检测上述SSR分子标记的引物对组、试剂盒,建立相应的检测方法以及应用,通过检测上述SSR分子标记有效评价待测样品的出麻率高低,在高产亚麻种质资源的鉴定以及高产亚麻品种的选育方面具有广泛的应用前景。
附图说明
为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案,下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本发明的一些实施方式,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为350对SSR引物的变性聚丙烯酰氨凝胶垂直电泳条带图的部分结果;
图2为全基因组连锁不平衡直观图的结果;
图3为群体结构分析中对数似然值随亚群个数的变化的结果图;
图4为群体结构分析中△K值随亚群个数变化的结果图。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购买获得的常规产品。
实施例1亚麻核心种质资源的出麻率基本统计分析
将亚麻分别于2011年和2012年种植于云南省祥云试验地种植,采用随机区组设计,每份资源种植在4m2小区内,每份资源每个小区随机调查 20株,具体的亚麻核心种质具体参见表1。调查亚麻的出麻率,调查方法参考《亚麻种质资源描述规范和数据标准》采集和整理(王玉富等,2006)。
将124份亚麻核心种质出麻率性状的数据导入SPSS18.0软件,进行描述性统计分析,输出最大值、最小值、平均值、标准差、变异系数、偏度值和峰度值。本发明检测的两年亚麻的出麻率基本统计分析结果如表2所示,2011年出麻率的最大值为0.275,最小值为0.058,平均为0.157;2012 年出麻率出麻率的最大值为0.278,最小值为0.082,平均为0.153。
表1 124份亚麻核心种质
表2出麻率基本统计分析
实施例2 124份亚麻核心种质资源的分子标记多态性检测
1、基因组DNA的提取(用omega试剂盒提取)
1)将亚麻种子置于培养箱中培养出苗,待幼苗长到4-5cm左右,取1-2 克幼苗置于一个1.5ml的离心管中,用镊子夹住离心管,浸入液氮以冷冻样本,用研磨棒研成粉末。加入600μL Buffer P1涡旋混匀,确保所有的组织团都分散均匀。置于65℃水浴10min,中途混匀2次。
2)加入140μL Buffer P2,涡旋混匀,13000rpm离心10min,小心取上清(不超过700μL),转入新的1.5ml离心管中,加入500μL异丙醇,颠倒混匀。
3)13000rpm离心2min,弃上清,用纸巾将多余上清液吸干。加入300μL 65℃的超纯水(已加入Rnase)涡旋混匀,溶解DNA,65℃水浴5min。加入150μL Buffer P3及300μL冰乙醇,混匀。
4)将结合柱和收集管置好,结合柱标号(GPS预处理:取新的结合柱装在收集管中,加入200μL Buffer GPS平衡缓冲液,室温放置5min, 13000rpm离心2min,弃滤液。加入700μL灭菌水,室温放置5min,13000rpm 离心2min,弃滤液,结合柱处理好),将约750μL混匀液转入处理好的结合柱中,13000rpm离心1min,弃收集管及液体。
5)将结合柱置于新的收集管中,加入650μL DNA Wash Buffer, 13000rpm离心1min,弃液体,重复一次,13000rpm空甩柱子离心4min,以甩干柱子的膜基质。
6)将结合柱转入新的1.5ml离心管中,加入100μL65℃预热的Elution Buffer至新的柱子膜中央,在65℃温箱中置5min,13000rpm离心1min以洗脱DNA。再用100μL洗脱液重复一次,共收集200μLDNA洗脱液,编号,装盒置-20℃冷藏。
2、SSR引物合成
利用基因组测序序列开发的350对亚麻SSR引物(其中包括SEQ ID NO:1-2和SEQID NO:3-4),由北京六合华大基因科技股份有限公司合成引物。
3、SSR-PCR扩增
1)PCR反应体系:Eppendorf PCR管中反应总体积为10μL,具体反应体系如下:
2)PCR扩增条件
最后保温在4℃。扩增反应均在Biometra PCR仪上进行。
4、聚丙烯酰胺凝胶电泳
对SSR引物扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳。
1)所需试剂的配制
①45%丙烯酰胺溶液 200mL 用棕色瓶装置室温
丙烯酰胺86.8g
N,N-亚甲双丙稀酰胺3.2g
加水至120mL,37℃促溶,用硝酸纤维素膜(0.45μm)过滤,随后蒸馏水定容至200mL,PH保持在7以下。
②10×TBE贮存液1L
Tris碱108g
硼酸55g
EDTA(0.5mol/L,PH8.0) 40mL
加蒸馏水定容到1L。
③10%过硫酸铵
0.4g过硫酸铵加水定容至4mL。
④显色液
氢氧化钠6g
硼砂0.07g
加水定容至400mL。
2)凝胶的制备
①玻璃板的清洗及硅化
用去污粉将玻璃板洗净,再用蒸馏水冲洗,随后用无水乙醇擦净晾干,最后用擦镜纸蘸取玻璃硅烷将其硅化,晾干。
②电泳槽组装
③配胶:
最后加入过硫酸铵600μL,TEMED45μL,混匀后立即灌胶。
3)电泳
将样品与适量6×loading buffer混合,点入加样孔中,使用1×TBE缓冲液,在恒功率9W下电泳4~5个小时,待二甲苯青到达胶板末端。
4)银染
①染色:将胶放入含有400mL染色液(0.5%AgNO3)的托盘中,再将托盘放置到摇床上,轻摇30min。②漂洗:用蒸馏水水洗2次,以洗净表面所含银离子。③显色:将胶板转入含有400mL显色液和1.6mL甲醛的托盘中,在摇床上摇至显带为止。
5)照相:将胶放入加有蒸馏水的白瓷盘中,用数码相机照相,然后取出用保鲜膜保存,具体电泳结果参见说明书附图图1。
6)数据分析:利用QuantityOne 4.6.3软件,结合人工读带,同一位置上清晰的条带记为1,无条带记为0,确定变异数目,获得位点等位变异矩阵。采用Powermarker 3.25(Liu,et al.)计算多态信息含量(PIC),多态性条带数。利用Structure 2.2(Pritchard,etal.,2007)软件,计算材料相应的Q值 (第i个材料其基因组变异源于第k个群体的概率),采用混合模型和等位变异发生频率相关模型进行群体遗传结构分析。
实施例3连锁不平衡分析
本实施例应用TASSEL软件的Linkage Disequilibrium分析程序,对378 个多态性位点进行群体连锁不平衡分析:
将统计的分子标记的条带转换为等位基因形式,计算LD配对检测的K 矩阵图,分析群体LD水平,输出R2和显著性水平P值,对存在完全连锁的标记只保留其中一个。分析结果如图2所示,得到基因组内连锁不平衡的分布情况。试验得到总共378个标记的71064(即378个标记的任意组合数)个组合,当P<0.01时,仅1893个位点处于LD,占总位点组合数的2.66%。本发明所使用的124个材料连锁不平衡水平很低,适合于全基因组关联分析策略进行初定位。
实施例4群体结构分析
本实施例运用STRCTURE软件对124份亚麻核心种质进行群体结构分析。设定K值为1~10,每个K值运行3次,根据似然值最大的原则,选择合适的K值。群体结构会增加群体的连锁不平衡率,使原本不相关的性状与基因呈现连锁状态,出现假阳性。因此需要对样本的群体结构进行校正。
将350对多态性引物的分子标记数据运用STRUCTURE软件进行群体结构检验,将群体划分为1到10(K=1,2,3,…,10)的亚群进行3次重复的测试,确认类群数目。将亚群测试过程中运行得出的对数似然值LnP (D)的平均数,绘制成与亚群数K相关的折线图,如图3所示。由图3 可知,随着亚群数目K的增加,后验概率对数随之增大,不能确定K的取值。所以采用△K的方法确定K值,采用Evanno等(2005)提出的方法求得△K,绘制△K与K的相关关系图,来确定最佳亚群数,如图4所示。
实施例5SSR位点与亚麻出麻率的关联分析
本实施例运用TASSEL软件的GLM程序,以得到的群体Q值以作为协方差,在显著性水平P<0.01下,将分子数据分别与亚麻2年的出麻率数据进行Q+GLM的逻辑回归率检验,输出各位点的显著性水平P及其对表型变异的解释率R2,如表3所示部分结果,寻找与性状相关联的分子标记。 2年共有2个标记检测与出麻率有显著性关联,2个标记分别为GD567和GD568,在两年均被检测到与出麻率显著关联,可以认为是控制出麻率的主效QTL,标记的引物信息见表4。
表3与出麻率性状显著相关的分子标记(P<0.05)
表4与亚麻出麻率关联标记的引物序列
最后应说明的是:以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对其限制;尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明,但本领域的普通技术人员应当理解:其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换;而这些修改或者替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国农业科学院麻类研究所
<120> 一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组、试剂盒、方法及应用
<160> 6
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gatgatcctc caatcgtcgt 20
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
tgcgatgatt tcatcttttc a 21
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
tcttgggttt atccactgcc 20
<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
ttctcccaac tctgcttcgt 20
<210> 5
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
ataataataa taataataat aataataata ataataataa ta 42
<210> 6
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
agagagagag agagagagag agag 24

Claims (10)

1.一种用于检测亚麻SSR分子标记的引物对组,其特征在于,所述引物对组包括引物对1和引物对2,其中,引物对1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示,引物对2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3-4所示。
2.一种用于检测亚麻SSR分子标记的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述引物对组。
3.根据权利要求2所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括水、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、上样缓冲液和分子量标记物中的一种或多种。
4.根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述DNA聚合酶选自所述DNA聚合酶选自Taq、Bst、Vent、Phi29、Pfu、Tru、Tth、Tl1、Tac、Tne、Tma、Tih、Tf1、Pwo、Kod、Sac、Sso、Poc、Pab、Mth、Pho、ES4 DNA聚合酶、Klenow片段;更优选地,所述DNA聚合酶为Taq DNA聚合酶;特别优选地,所述Taq DNA聚合酶为热启动Taq DNA聚合酶。
5.一种检测亚麻SSR分子标记的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)提取亚麻样品的基因组DNA;
(2)以所述基因组DNA为模板,使用权利要求1所述引物对组进行PCR扩增;
(3)根据PCR扩增产物,鉴定所述亚麻样品的SSR分子标记。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在进行PCR扩增时,所述引物对1的退火温度为58~60℃,优选为50.5℃;所述引物对2的退火温度为59~61℃,优选为60℃。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述亚麻选自ABYSSINIA、Mogilevskiy、Hesan 1、Madefolvi Rek、Molar、SV 60066、KVL 5008、B-70、B-71、B-74、B-79、SV 65066,80-41018、KVL 5040、Smolenskiy G4918x Aoyagi、B-130、中亚麻2号、B-153、6628、6696、6595、6551、Nike、Artemida、Temida、Mirazh、Blue no 180、戴安娜、蒙古二号、USPEA、Argos、r8709-4-4-6-12、col17290050-6-6-2、r8744-12、晋亚7号、定亚21、宁亚17、垻选三号、定亚22号、Selena、gc-220、gc-224中的一种或多种。
8.权利要求6~7任一项所述方法在高产亚麻种质资源的鉴定或高产亚麻育种中应用。
9.分离的SSR标志物,其由权利要求1所述引物对组扩增获得。
10.根据权利要求9所述分离的SSR标志物,其特征在于,所述SSR标志物分别包括重复SSR基序(AGA)n和(AG)m,其中,所述n和m为自然数,优选地,所述n为14,m为12。
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