CN106967722A - 与水牛泌乳相关基因srebp1及其作为分子标记的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，属于家畜分子标记领域，所述基因片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第8358bp、15306bp处分别有C8358T、G15306T单碱基突变，且该8358bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关，该15306bp的SNP位点与水牛产奶量、乳蛋白率和乳糖率显著相关。本发明公开了检测序列表SEQ ID NO:1的各碱基突变位点所需的上下游引物序列。本发明的应用，可以提高奶水牛产奶性能，为选育具有高产奶量、奶中乳蛋白率高、奶中乳糖率高的优良的奶水牛提供技术支撑和奠定理论基础。
Description
【技术领域】
本发明涉及技术领域，具体涉及一种动物分子标记领域。具体涉及与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用。
【背景技术】
水牛是我国南方特有的种畜资源，而较低的产奶量和繁殖性能已成为了影响其产业发展的两大科学问题。显然，利用先进的分子标记技术应用于优良奶水牛种质资源的选育将会有效的提高选种效率。
产奶性状是奶水牛的一个重要经济性状，由多种微效基因决定，是一种典型的由多基因控制的数量性状。克隆奶水牛泌乳性能相关基因并探讨其遗传特性，以提高奶水牛生产性能，为选育具有高产奶量的优良的奶水牛品种提供技术支撑和奠定理论基础。
众所知周，SREBP是一种膜结合蛋白，属于碱性螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链转录因子家族，主要通过糖酵解和脂肪生成而在能量平衡中发挥重要作用(Eberle et al.,2004；Jeon et al.,2012)。先前研究发现，脊椎动物表达两种SREBP基因(SREBP1和SREBP2)，SREBP1基因主要激活脂肪酸的合成(Horton et al.,2002)。在人和小鼠上，SREBP1基因通过第一外显子的一个可变剪接表达2个亚型蛋白，即SREBP1a和SREBP1c，而牛上并未发现(Eberle et al.,2004；Hoashi et al.,2007)。到目前为止，已有许多研究证实SREBP1基因对动物的生产性状具有显著的遗传效应，如肥胖(Liu et al.,2014)、脂肪酸组成(Hoashiet al.,2007)以及胴体(Matsuhashi et al.,2011)。起初，Abe等(2008)和Morris等(2007)在牛SREBP1基因上鉴定出一个QTL区域，位于牛19号染色体的60-80cM处，对脂肪组织中的脂肪酸的组成具有影响作用。随后，Rincon等(2012)报道了牛SREBP1基因rs41912290位点对低脂乳综合征具有影响。此外，Manunza A.等(2012)在奶山羊SREBP1中鉴定出c.353C>T位点显著影响乳组成。然而，迄今为止尚无有关水牛SREBP1基因作为水牛产奶性状的分子标记研究报道。
【发明内容】
本发明的发明目的在于：针对上述存在的问题，提供与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，以提高奶水牛产奶量生产性能，为选育具有高产奶量的优良的奶水牛品种提供技术支撑和奠定理论基础。
为了实现上述目的，本发明采用的技术方案如下：
本发明提供了与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ NO:1所示，其中在SEQ NO:1的第8358bp、15306bp处分别有C8358T、G15306T单碱基突变，其引物对的DNA序列如下所示：
(ⅰ)获得C8358T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:2：5’-CTGTGAGCGTGGGCTCCTGCGGG-3’；
反向引物SEQ NO:3：5’-GTCATTGATGGAAGAGCGGTAG-3’；
(ⅱ)获得G15306T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:4：5’-GAGCTCTTACCTGCAGCTTCT-3’；
反向引物SEQ NO:5：5’-CTCTCGGCCGCTGATACGG-3’。
所述的分子标记为水牛产奶性状的遗传标记，且与水牛产奶性状相关的SREBP1基因上的分子标记是通过PCR-DNA测序与飞行时间质谱法检测完成，而所述的应用为奶水牛的早期选育。
本发明水牛产奶性状SREBP1基因8358bp、15306bp处SNP位点的获取方法，包括如下步骤：
(1)待测水牛基因组DNA提取；
(2)目的片段扩增及测序：随机50头水牛基因组DNA进行混池，以作为PCR反应模板，利用引物对SEQ NO:2和SEQ NO:3以及SEQ NO:4和SEQ NO:5分别进行PCR扩增，获得的扩增产物进行测序，利用DNAStar 7.0Seqman生物信息分析软件对测序结果进行比对，获取候选的SREBP1基因SNP位点；
(3)基因分型：针对384头水牛基因组DNA样本，利用飞行时间质谱法进行候选SNP位点的分型，根据质谱峰图判读各样本位点的基因型；
(4)关联分析：利用SAS9.4软件GLM程序对水牛个体的SNP分型结果以及产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率数据进行数据分析，获得与水牛的产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率显著相关的SNP位点的分子标记。
本发明水牛产奶性状基因SREBP1作为分子标记的应用，具体步骤如下：
(Ⅰ)对待选育水牛进行静脉采取提取DNA样本；
(Ⅱ)针对针对核苷酸序列SEQ ID NO:1中8358bp、15306bp处的SNP位点，利用飞行时间质谱仪检测上述步骤(3)中所述的DNA并对样本进行基因分型，利用Typer4.0软件检测质谱峰并判读各样本位点基因型。
(III)应用SREBP1中的C8358T-CC的基因型进行判定和选育产奶量高的奶水牛；应用SREBP1中的G15306T-GT的基因型进行判定和选育产奶量高、奶中乳蛋白率高的奶水牛；应用SREBP1中的G15306T-TT的基因型进行判定和选育奶中乳糖率高的奶水牛。
综上所述，由于采用了上述技术方案，本发明的有益效果是：
(一)提供一种与水牛泌乳相关基因SREBP1，并将其作为分子标记予以应用；
(二)提高奶水牛产奶量生产性能，为选育具有高产奶量、奶中乳蛋白率高、奶中乳糖率高的优良的奶水牛提供技术支撑和奠定理论基础。
对本发明更详细描述可参见实例部分。
【附图说明】
图1—SNP 8358分型结果展示。
图2—SNP 15306分型结果展示。
【具体实施方式】
实施例1：水牛基因组总DNA的制备
采用血液基因组DNA提取试剂盒制备水牛基因组总DNA(天根，北京)，具体操作步骤如下：
(1)取全血500μL置于1.5mL离心管，加入等体积的细胞裂解液CL，颠倒混匀，12000rpm离心1min，吸取上清，留下沉淀；加入等体积的细胞裂解液CL，重复此步骤一次；加入4μL RNAase(100mg/mL)，振荡15sec，室温静置5min；
(2)加入20μL Proteinase K溶液，混匀，加入200μL缓冲液GB，充分颠倒混匀，56℃放置10min，期间颠倒混匀数次，溶液应变清亮；
(3)加入200μL无水乙醇，充分颠倒混匀；此时可能会出现絮状沉淀；
(4)将上述所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱CB3放入收集管中)，12000rpm离心1min，倒掉收集管中的废液，将吸附柱CB3放入收集管中；
(5)向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD，12000rpm离心1min，倒掉收集管中的废液，将吸附柱CB3放入收集管中；
(6)向吸附柱CB3中加入600μL漂洗液PW，12000rpm离心1min，倒掉收集管中的废液，将吸附柱CB3放入收集管中；重复此操作一次；
(7)12000rpm离心2min，倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟，以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液；
(8)将吸附柱CB3转入1.5mL离心管中，向吸附膜中间位置悬空滴加50-200μL洗脱缓冲液TB，室温放置2-5min，12000rpm离心2min，将溶液收集到离心管中；
(9)存放于-20℃冰箱中保存备用。
实施例2：水牛产奶性状SREBP1基因分子标记的获取
1、引物设计：以SEQ NO：1为模板，利用Primer5.0引物设计软件，经Oligo软件检测，确定用于扩增水牛SREBP1基因的正方向引物，并委托大连宝生物技术有限公司合成，其中用于扩增所述基因的正反向引物的DNA序列如SEQ ID NO:2-5所示。
2、PCR扩增反应
随机选择50头水牛基因组DNA样本进行混池，以作为PCR反应的模板。
(1)PCR反应：反应总体积为40μL，其中水牛DNA混合池模板1μL，10X LA Taq Mix20μL，引物混合物(10mM each)2μL和ddH2O 17μL。
(2)PCR反应程序：94℃/3min；94℃/30sec，60℃/30sec，72℃/1.5min，30个循环；72℃10min；4℃保存
3、PCR产物测序、分析及分子标记初筛
将获得的扩增产物送至深圳华大科技有限公司测序。利用NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)网站的BLAST工具对测序结果进行分析，判定结果的真实性，并利用DNAStar 7.0Seqman生物信息分析软件对测序结果进行比对，获取候选的SREBP1基因SNP位点，见表1。
表1水牛SREBP1基因SNP位点
4、水牛基因SREBP1的SNP分型检测
选定384头水牛个体，利用Sequenom公司的MALDI-TOF技术针对初步筛选的SNP位点进行基因分型检测，其步骤如下：
(a)DNA样品质控：通过琼脂糖凝胶电泳检测DNA浓度，纯度和降解程度；通过紫外分光光度计检测OD260/OD280数值，调整DNA终浓度在30-50ng/μL之间。
(b)引物设计、合成与质检：根据候选的SNP位点通过Sequenom公司的ASSAYDESIGN3.1软件进行引物设计，委托大连宝生物技术有限公司合成引物，通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF)进行质检，检测实际分子量与理论分子量是否一致，引物纯度是否达到实验要求。随后进行引物稀释：①PCR引物储备液制备：配置PCR引物储备液，终浓度为100p(μmoL/L)；②单碱基延伸引物储备液制备：配置单碱基延伸引物储备液，500p(μmoL/L)。
(c)PCR反应：反应总体积为5μL，即ddH2O 1.8μL，10*Buffer 0.5μL，Mg2+0.4μL，dNTP 0.1μL，Hotstar 0.2μL，F primer/R primer 1μL，待检测DNA样品1μL(20-50ng)；反应条件为：95℃/2min；94℃/30sec，56℃/30sec,72℃/1min,45个循环；72℃延伸/5min；
(d)SAP酶消化反应：SAP反应总体积为2*460μL，即ddH2O 1.53*460μL，SAP Buffer0.17*460μL，SAP Enzyme0.3*460μL；SAP反应程序：37℃/40min；85℃/5min；25℃/保存；
(e)单碱基延伸反应：单碱基延伸反应总体积为2*460μL，即ddH2O 0.619*460μL，10*iplex buffer 0.2*460μL，Terminator mix 0.2*460μL，引物0.94*460μL，单碱基延伸酶0.041*460μL；单碱基延伸反应程序如下：
(f)树脂纯化：将384孔板中的反应产物加入16μL三蒸水，在离心机中离心2000转离心3min；加入树脂，在反转摇匀仪上做树脂纯化反应35min，脱盐；反应完成后在离心机2000转离心3min；将脱盐处理后的样品点在样品靶上，自然结晶；
(g)质谱检测及数据收集与分析：运行MALDI-TOF-MS反应，利用Typer4.0软件检测质谱峰，并根据质谱峰图判读各样本位点基因型。其中水牛产奶性状SREBP1基因C8358T、G15306T位点的基因分型结果见图1至图2。
5、关联分析
性状-标记关联分析的模型为：Yijklm＝μ+Yi+Pj+Sk+DIMl+Gm+eijklm,其中Yijklm为性状观察值；μ为均值,Yi为产犊效应,Pj为胎次效应,Sk为产犊季节效应；DIMl为泌乳天数效应,Gm为基因型效应,eijklm为随机误差。分析结果采用Bonferroni多重比较进行验证。结果表明，摩拉和杂交奶水牛SREBP1基因的该8358bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关(P<0.05)，该15306bp的SNP位点与水牛产奶量、乳蛋白率和乳糖率显著相关(P<0.05)。由此获取了水牛产奶性状SREBP1基因的分子标记。
实施例3：与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用
试验水牛群的品种是杂交奶水牛群。在水牛群中对SREBP1基因C8358T、G15306T位点的不同基因型与水牛产奶性状进行关联分析。
水牛SREBP1C8358T、G15306T位点关联分析结果见表2所示。由表2中可以得出基因型与水牛产奶性状显著相关(P<0.05)。对C8358T位点，携带CC基因型的水牛个体产奶量高于TC和TT型个体。对G15306T位点，携带GT基因型的水牛个体产奶量高于其他基因型的个体。对G15306T而言，携带GT基因型的水牛个体产的奶中乳蛋白率高于其他基因型的个体。对G15306T而言，携带TT基因型的水牛个体产的奶中乳糖率高于其他基因型的个体。
综上，可以应用SREBP1C8358T-CC、G15306T-GT等基因型进行判定和选育产奶量高的奶水牛；G15306T–GT基因型进行判定和选育产奶的奶中乳蛋白率高的奶水牛；G15306T-TT的基因型进行判定和选育奶中乳糖率高的奶水牛。这对于组建高产奶水牛核心群具有重要意义。
表2 SREBP1基因C8358T、G15306T与产奶性状关联分析
注：同行数据，不同字母表示差异极显著(P<0.05)；相同字母表示差异不显著(P>0.05)以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式，其描述较为具体和详细，但并不能因此而理解为对本发明范围的限制。应当指出的是，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明构思的前提下，还可以做出若干变形和改进，这些都属于本发明的保护范围。因此，本发明的保护范围应以所附权利要求为准。
SEQUENCE LISTING
<110> 广西壮族自治区水牛研究所
<120> 与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用
<130> 2017
<160> 1
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 16265
<212> DNA
<213> 水牛种
<220>
<221> misc_feature
<222> (601)..(617)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 1
aaccgccgcc gggaacccag tttccgagga acttttcgcg ggcgctgggc accaccgagt 60
tccgggcggg acgcgaacgc gcggagcggc tgcggcgggc ccggcggacc tccgagagga 120
ggtgactgcg ccatggacga gccacccttc aacgaagcgg ccttggagct ggcgctggcc 180
gagccgtgcg agctggacgc ggcgctgctc accgacatag aaggtgcgtc agggccactg 240
ggctccgcgc acgggcggcg ccgggccggg ggcgcggagg gcgtcggggc gcggcccgcg 300
cctctgtgcg gagcgctccg cgtctctgcc ccgagggctg cgggcctcgc ggtcctgtcc 360
ccgcggagct gcccgtgccc gctgggtcct gtaggaggct cggcgctgag cacgtgcgcc 420
tctgggcgcc ccggcccgca ccccgcggcc accgagtcct cagtcgcgag gcggcgttgg 480
cgagagccgg ggacccggcg tcgccgatgc cccgccccgc cccggccttg acgtcagcag 540
gaggttactc tcggtcgttc cctccggccg gagagttcag ctcggcgccc gcgctcctgc 600
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 660
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 720
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 780
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 900
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 960
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1020
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1080
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1140
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1200
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1260
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1320
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1380
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1440
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1500
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1560
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1620
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1680
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1740
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1980
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2160
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2220
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2280
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2340
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2400
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2460
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2520
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2580
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2640
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2700
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2760
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2820
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2880
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2940
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3000
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3060
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3120
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3180
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3240
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3300
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3360
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3420
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3480
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3540
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3600
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3720
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3780
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3900
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3960
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4140
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4200
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4260
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4320
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4380
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4440
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4500
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4560
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4620
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4680
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4740
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4860
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4920
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 4980
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5040
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5100
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5160
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5220
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5280
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5340
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5400
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5460
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5520
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5580
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5640
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5700
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5760
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5820
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5880
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 5940
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6000
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6060
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6120
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6180
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6240
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6300
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6360
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6420
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6480
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6540
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6600
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6660
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6720
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6840
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6900
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 6960
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7020
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7080
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7140
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7200
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7260
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7320
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7380
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7440
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7500
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7560
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7620
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7680
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7740
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7800
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7860
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 7920
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 8040
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 8100
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 8160
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 8220
ctgtgagcgt gggctcctgc gggtggcttt ttgtttctgt ggcgttgctc ccacgtgtac 8280
actgtgtcgg gggtggggcg tgaagacaca cagcacctgc tgcactgctg ctcacagctt 8340
ttcctcctcc ccgcagacat gcttcagctc atcaacaacc aagacagcga cttcccgagc 8400
ctattcgacc cgccctacgc cgggggcgga gcagggacca cagaccctgc cagtcccgac 8460
gccagctccc tgggcagcct gtccccacct ccttccacga tgagctcctc acttgaaggc 8520
ttcctggggg tgaacaaggc gacaccccca cccttgtccc ctccccagcc tgcgcccacc 8580
cccctgaaga tatacccatc tgtgcctgcc ttctccccgg ggcctgggat caaggaggag 8640
ccagcgcccc tgactgtcct ccagcccacc accccccagc cccttcctgg agctctcctg 8700
ccgcagagtg ttgcggccac caccccaccg cagttcagct ctgctcccat tgtgggctac 8760
cccagccctc caggaggttt cacaggtaag gagggcgtgt ggaggtggga gtcaggtgct 8820
tttggtggag gagtttgcag gctttagcag tcgggcccct gctctgtggc tggaggcgcc 8880
tgctcaccag tagttctcgg gctcctgtgg acgaagcact tctctcgctg cccggggtcc 8940
acaccagctg cccttctgca gagtgattct tggctaggag gctggcatac ttgcatcaga 9000
gccctgggca gagccatcca gataggaacc cacggccaca ggggtagtga ctcatcccgg 9060
gtcacatggt gatgaggacc tgggggacgg gttggaagtg ggttgcgata gcctgtgtcc 9120
tcagccccag ccttcatctc tgcaggaccc ctccggggag cagctcgcag tcactggctg 9180
gcctgccact ggcttccctg ccaggggtcc cgcccgtctc cttgcacagc caggttcaga 9240
gtgcggcccc ccagcagctg ttgacagcca cagccacccc cacggtggcc cctggagcaa 9300
cctctgtgac ctcccagata cagcaggtcc cggtcctgct gcagccccac ttcatcaagg 9360
cagattcgtt gctcctgacg accgtgaaaa cagatgtggg agcccccttg aaagcggcgg 9420
gcatccgctc cctgggccct ggcactgctg ttcaggcagc gcccttgcag gtagggggct 9480
tgggcagggt gggggtgggt ggcttgggtg gggtgggggg cggcgaggtt tgctcacatg 9540
tccacctgct aactctgcct ggccctgcag accctggtga gtggcggggc catcctggcc 9600
acagtgccac tggtagtaga cactgacaag ctgcccatca accgacttgc cagtggcaag 9660
gctccaggct cggcgcagag ccgcggcgag aagcgtacag cccacaatgc catcgagaaa 9720
cgctaccgct cttccatcaa tgacaagatc gttgagctca aggacctggt ggtgggcacc 9780
gaggccaagg tgtgggctga ggccctaaca gggtggctct gggcaagcag gcacctggga 9840
ggaggaggag gaggaggagg atggggctgg gcagacagtc ctggggcccc agcctcctcg 9900
ggcctggcag ctctgttcag gtgagcttca gggaagcccc gggtggcaca ggctcttcca 9960
ggtgctgggg atttagcaga ggacagacag agatcctgct gttgagtagc tgatgttcta 10020
gcagggtgcg ggggtgccaa cagacctggg ttggggtacg ccaggtggca taagtgctgt 10080
gctggagaga agagggatgg gggaagttgc aaacctaagt tgggtggtcc gggaaggcct 10140
cacaaaggtg atgtgatgtg tgaacagagg cctggaggag gtgagagagt gaggcataag 10200
gtggagtgat gttgacagca gccagccagg tgctgttgtc tgtatcttac ttacctgggc 10260
ggcaggttct aggggaggaa tgttcccagg gagtaggaat agcagatgca gatctcctga 10320
ggcgattgtg ttgcaaagca gccctgccct ctcgcttcag tgccaagctc tctggcctga 10380
ccacttgtgc catctccctc ccaccccacc cctgcagttg aataaatctg ccgtcttgcg 10440
caaggccatc gactacatcc gcttccttca gcacagcaac cagaagctca agcaggagaa 10500
cctgagtctg cgcactgctg tccacaaaag cagtgagtgc tggccctccc tggctcgcag 10560
ctcccccagg tcctgagctc caatttgggg tgaggtgggg tgtggagctc actccagcct 10620
gctcctctct ggcccacaga atcgctgaag gacctggtgt cggcttgtgg cagtggaggt 10680
agcacagatg tgcccatgca gggcatgaag ccagaggtgg tggacaccct gagtccaccc 10740
ccctcagacg ccggctcgcc ctcccagagc agccccttgt cccttggcag caggggcagt 10800
agcagcggtg gaagtggcag tgactcggag cctgacagcc cggtctttga ggacggccag 10860
gtggggcctg cagtgttgtt cccttcttgt catccagcaa cttcctccga gccccaggac 10920
tggatcaggt ccctcacaca tcccacctcc ccttttatag acagaagaaa gacagggctg 10980
aggggttccc atagtaaggc agggggcaga gttgacccct ccttcctgga gctgtgctct 11040
ctgggtcatg ctgccctgtt ctcaccgccc tgcccacccc cccaggtgaa tccagagctg 11100
ctgcccgctc cccacagcca gggcatgctg gaccgctctc gcttggccct gtgcgcgctc 11160
gtcttcctct gtctctcctg caaccccttg gcctccctgc tgggtagccg gggtcctgct 11220
ggtccctccg acaccaccag catcaaccac ggtcccaggc gcagcatgct gggtgctgag 11280
ggcagaggta gggtggtagg aggggggctc tcgcagaggt ggatcccgtc ctgtgggctt 11340
ggggctctgg atttcctggg tgcccagcct ctgtgtcccc agcttctgtc tgcccccaga 11400
tggtcctggc tgggccccgt ggctgctgcc cccactggtc tggctgatga atgggctgct 11460
ggtgctcttc tccttggcac ttctctttgt ctacggagaa ccagtcactc ggccccactc 11520
atgccccgcc gtgcacttct ggaggcatcg caagcaggcc gacctggacc tggccagggt 11580
aagtggccag accctggggg atgggaacag gcaaggctgg gaccccgagc agtgtctggg 11640
aaggtgctgg gcataccgtg gacctcccct gttctcccca ctcctgacta ccccttcgac 11700
tcctgtggac ccctgggggc ccagcctgtg ctgctgggga tggtgtggtc ctcacgggag 11760
gcccaaggtg gaggggtagc acagccccac gtttcttacc tgaaaacccc tcacccccag 11820
ggggactttg cccaggctgc ccagcagctg tggctggccc tgcgggcctt gggccggcct 11880
ctgcccacct cccacctgga cctggcctgc agcctgctct ggagcctcat ccgccacctg 11940
ctgcagcgtc tctgggtggg ccgctggctg gccggctggg cagggggcct acggagggac 12000
agggccctac aggcagatgc tcgcaccagc gcccgtgacg cagccctcgt ctaccacaag 12060
ctgcaccagc tgcacaccat gggtatgcaa gcgagggctg gccccccggg gtcctgctgc 12120
ctccacacca cccttggcct cacgccctct tatcttccag gaaagtactc aggtgggcac 12180
ctcgctgctg ccaacctggc gctgagtgcc ctgaacctgg ctgagtgtgc gggagatgct 12240
gtgtctgtgg ccacgctggc tgagatctac gtggccgctg cgctcagggt caaggccagt 12300
ctgccccggg ccttgcattt tctgacgtga gtaggtggtg accagtgagg gctctgtgga 12360
taggtgaggg ctgcacagaa aggcacgtgg ttatgggggc ggctgtgggc ccgctgtggt 12420
ctcagccagg tttcagtttg atggcccgtt ccttccttcc tcaacagcgc ttcttcctga 12480
gcagtgcccg ccaggcctgc ctggcacaga gcggttcagt gccccttgcc atgcaatggc 12540
tctgccaccc tgtgggccac cgtttcttcg tggatggcaa ctgggccctg tgcagcgccc 12600
cgagggacag cttgtacagc gtggctggga acccaggtgc cttctctccc tgggcccttc 12660
cccgtgccca cccctttccc cacagctggc cgcctcctcc atcccccgtt cccattcctc 12720
atgcctatcc ctggtcagtc tcttgtccct gcctctctgc tgtcctggcc caccctggcg 12780
gctgccctgc catctggtgt ggctatgggg atgtgctgat ggggaggcca acctgggtct 12840
gtctcagctg gggctcttca gaggcaaaca gaaagacagg gggcgggggg ccaggggtct 12900
gattcaagag gtgctccaga caacatcacc atgcagtgag gaggtcgggc aagggcgtgc 12960
atcccaggtg ggttatcctg tccacaggcg ggcggagtgt ttatctacca gctttcaatt 13020
gtctcagagc caggccctcc cgtgcccaga aaagatccct agtgcaggga ggtgcctgtg 13080
cacaggaggg gtggggccat tctcgcccct ccacttgctc actcttctcc acagtggatc 13140
ccctggccca ggtgactcaa ctgttccgtg aacatctctt ggagcgagca ctgaattgtg 13200
tggcccagcc cagccccagt cctggatcag ctgaggggga caagagtgca gagccgccct 13260
gggcaggggt ttcctgttgg ggccaaggca gaagtgtcat ggttggacct ccctctgcac 13320
tggttctggc ttcatgggaa gagcatggtg agaccccaag gacatagaac aaagctgggg 13380
gcagggttgg gggtagggca cgagcatgca gcctgtgctc actcggactc ctgcagggca 13440
cggggcaggt gctccaccaa tgggtacagc ctctcggctg cctcctcatc ccgccgaagc 13500
caggagttct cagatgccct ggggtacctg cagctgctga acagctgttc ggacgtggcc 13560
ggagctctta cctgcagctt ctccatcagc tccagcatgg ctgccacccc cggcgctggg 13620
gctgagggca tcacaggtcg ggggctcacc gggggtggca gccatgctgg agctgatgga 13680
gaagctgcag gtaggagctc cggccacggc acagacccgg tggccaagtg gtgggcctct 13740
ctgacagctg tggtgaccca ctggcttcgg cgggatgagg aggcagccga gaggctgtac 13800
ccattggtgg agcacctgcc ccgtgccctg caggagtccg agtgagcaca ggctgcatgc 13860
tcgtgcccta cccccaaccc tgcccccagc tttgttctat gtccttgggg tctcaccatg 13920
ctcttcccat gaagccagaa ccagtgcaga gggaggtcca accatgacac ttctgccttg 13980
gccccaacag gaaacccctg cccagggcgg ctctgcrctc cttcaaggct gcccggacca 14040
tcctaggccg tgggaaggct gagtctggcc cagccagcct ggcaatgtgt gagaaggcca 14100
gtgggtacct gcaggacagc ctggccacca caccagctga cagctccatt gacaaggtaa 14160
gggctggggc caggggcctg gcccgtctca ggggccttgg cctttccact ccctggatgg 14220
tcccccttgg gctgcagaag actgcagggt cagcccaaca gcacaggacg ggggacccag 14280
ccggccttgc cttctggcta aggcttgggt cccggggaga gtggctgctc cctctggcct 14340
cagtgttgcc ctcctaggag gagggtgggg tgaacatgtg gcagggccct ccttggaggc 14400
tgccgcgcag gccggcgggg gcgtggggcc tggagagcgg gcggccccgc ggtgcattgc 14460
tgttgcattg catgtgtgag gcgggtgcag tgcctcggca gtgcagcccg gagccggccc 14520
ctggcaccgc gggcccccta gccttctctc ccacagccag aggccctgac ccctgccctg 14580
ccctaccacc acccccaggc catgcagctg ctcctgtgtg acctgctcct tgtggcgcgc 14640
accagcctct ggcagcggca gaagctgccg gcacccaccc aggcctctca gggccctgga 14700
ggtggggccc aggcctctgc cctcgagctt cgtggtttcc agagggacct gagtggcctg 14760
aggcgtctgg cacagaacgt ccggcctgcc atgcggaggg tgagtgccca cagagtcctg 14820
acttgtgatg gggacagaca tgaggtgtct gaagggagtg gggcctgacc tgaacctctc 14880
ctggttcctc ctgcccaggt attcctacat gaagccactg cccgactgat ggcaggggcc 14940
agcccggcgc ggacacacca gcttctggat cgcagcctga ggaggagggt cggcccctgc 15000
aaaggaggtg agaaggccgg ctggcccagg tgggaagggt ctcaggccag gtgaaggctg 15060
cagagggaga ccgtaagaca cacaggagcc ttgggacttc gatgggagcc ctaacctgag 15120
actcggggga aactgtcctt tgtggagcac tcgctctgtg ctccagggga agcagcggaa 15180
gggaccagct agctgcatgg cagcccaaga ccaaaggcgt gggggcgcag gcaggaccag 15240
gcggcagggg cggggccggg gcctgagccc cgcccctggc gcggccccgc ccctgacgtg 15300
ctcccgtgcg cgtgcgcagg cggagcggcg gagctggagt cgcggcccac gaggcgggag 15360
caggccgagg ctttgctgct ggcctcctgc tacctgccgc ccggctttct gtcggcgccc 15420
gggcagcgcg tgggcatgct ggccgaggcg gcgcgcacgc tcgagaagct cggtgaccgc 15480
cggctgctgc acgactgtca gcagatgttc atgctccagg gagactggac ccggtgtgac 15540
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gcccgcagcc accggatgtg gggtatcccc ccccactctg caggtttccc acgccggccc 15840
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tcccgcactc ggcgcgcggt ggccaggata gtgctggccc ctggtggccg gctggggaat 15960
taccggggcc tgccgccgcc gccggatgtc acgtgctccc agtgacaccg ctcctgggtg 16020
tcatgggccc ccagtccgca gctttccccc tccatccaga gagaagggag ggaccacttc 16080
accgacccga gggacccggc ccccaggtcc tccctctctt ctagggagac caggcatagg 16140
ccataccgga gtccaccaga actttgccct tcacggccca agcaggcttt ggcctttagc 16200
gttttttatt ttcttaaaaa gagaagtttt gtacaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 16260
aaaaa 16265
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 2
ctgtgagcgt gggctcctgc ggg 23
<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 3
gtcattgatg gaagagcggt ag 22
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 4
gagctcttac ctgcagcttc t 21
<210> 5
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 5
ctctcggccg ctgatacgg 19
Claims (6)
1.与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因，其特征在于：其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第8358bp、15306bp处分别有C8358T、G15306T单碱基突变，且该8358bp的SNP位点与水牛产奶量显著相关，该15306bp的SNP位点与水牛的产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中的乳糖率显著相关。
2.根据权利要求1所述的与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因，其特征在于：其第8358bp、15306bp的SNP位点是通过以下步骤获得的：
a.待测水牛基因组DNA提取；
b.目的片段扩增及测序：随机取50头水牛基因组DNA进行混池，以作为PCR反应模板，利用正、反引物进行PCR技术扩增，获得的扩增产物进行测序，利用DNAStar 7.0Seqman生物信息分析软件对测序结果进行比对，获取候选SREBP1基因SNP位点；
c.基因分型：针对384头水牛基因组DNA样本，利用飞行时间质谱法进行候选SNP位点的分型，根据质谱峰图判读各样本位点的基因型；
d.关联分析：利用SAS9.4软件GLM程序对水牛个体的SNP分型结果以及产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率数据进行数据分析，获得与水牛的产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率显著相关的SNP位点。
3.根据权利要求2所述的与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因，其特征在于：步骤b中用于PCR技术扩增的正、反引物分别为：
(ⅰ)获得C8358T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:2：5’-CTGTGAGCGTGGGCTCCTGCGGG-3’；
反向引物SEQ NO:3：5’-GTCATTGATGGAAGAGCGGTAG-3’；
(ⅱ)获得G15306T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:4：5’-GAGCTCTTACCTGCAGCTTCT-3’；
反向引物SEQ NO:5：5’-CTCTCGGCCGCTGATACGG-3’。
4.根据权利要求1、2或3所述的与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因作为分子标记的应用，其特征在于：所述的应用是指用于奶水牛的选育。
5.根据权利要求4所述的与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因作为分子标记的应用，其特征在于：所述奶水牛的选育包括以下具体步骤：
①对选育水牛进行静脉采取提取DNA样本；
②针对核苷酸序列SEQ ID NO:1中8358bp、15306bp处的SNP位点，利用飞行时间质谱仪检测上述步骤①中所述的DNA样本进行基因分型，利用Typer4.0软件检测质谱峰并判读各样本位点基因型。
6.根据权利要求5所述的与水牛泌乳性状相关的SREBP1基因作为分子标记的应用，其特征在于：应用SREBP1中的C8358T-CC的基因型进行判定和选育产奶量高的奶水牛；应用SREBP1中的G15306T-GT的基因型进行判定和选育产奶量高、奶中乳蛋白率高的奶水牛；应用SREBP1中的G15306T-TT的基因型进行判定和选育产奶中乳糖率高的奶水牛。
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