CN106811484B - 一种牛pdhb基因腺病毒干扰载体构建及其鉴定方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体构建及其鉴定方法,序列为:SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3。构建方法包括:载体用BamH I,EcoR I双酶切;酶切完成后胶回收;目的片断利用3’和5’的单链退火获得:目的片段与载体连接反应;转化感受态细胞:DH5a;转化后挑菌,摇菌14小时,测序;将重组腺病毒载体质粒PDHB shRNA与pHBAd‑BHG骨架载体共转染HEK293A细胞,获得重组腺病毒Ad‑PDHB shRNA。本发明的shRNA1、shRNA2和shRNA3对PDHB基因的干扰效率分别为:95.12%、12.69%和97.76%。
Description
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,尤其涉及一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体及其构建方法。
背景技术
牛丙酮酸脱氢酶β亚基(Pyruvate dehydrogenaseβsubunit,PDHB)基因催化丙酮酸成为乙酰辅酶A(acetyl-CoA),是将糖酵解和三羧酸循环代谢途径连接起来的关键酶。研究表明PDHB基因的表达水平与IMF含量成正相关。通过对大理石纹含量高和低的两组牛骨骼肌进行差显PCR(ddPCR)分析,发现PDHB基因的表达存在显著差异(Sasaki,Nagai etal.2006)。在对猪IMF的研究中,也发现PDHB基因的表达水平与IMF成正相关(Serao,Veroneze et al.2011)。在对瘦肉型和脂肪型北京鸭的肝脏进行蛋白质组学比较研究发现,PDHB基因的蛋白表达量存在显著差异(Zheng,Chang et al.2014)。我们的前期研究中也发现:在瘦肉型(长白猪)和脂肪型(蓝塘猪)猪中的PDHB基因的蛋白表达量存在显著差异(Bernard,Torbati et al.2013)。因此,我们推测PDHB基因可能在肌内脂肪的形成过程中起着重要的作用。我们还对牛PDHB基因的启动子进行研究发现CCAAT增强子结合蛋白β(CCAAT/enhancer binding proteinα,C/EBPβ)和肌细胞生成素(Myogenin,MYOG)很可能是调控该基因表达的关键转录因子(Li,Zhang et al.2016)。通过构建牛PDHB基因腺病毒干扰载体,能够有效解决在牛肌内前体脂肪细胞中持续敲低PDHB基因的表达,为研究牛PDHB基因的功能提供有效的技术支撑。
综上所述,现有的牛肌内前体脂肪细胞中PDHB基因的表达持续敲低。
发明内容
本发明的目的在于提供一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体构建及其鉴定方法,旨在解决现有的牛肌内前体脂肪细胞中PDHB基因的表达持续敲低的问题。
本发明是这样实现的,一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体,所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的序列为:SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3。
本发明的另一目的在于提供一种所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法,所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法包括以下步骤:
步骤一,载体用BamH I,EcoR I双酶切;
步骤二,酶切完成后胶回收;
步骤三,目的片断利用3’和5’的单链退火获得:
步骤四,处理好的目的片段与载体连接反应;
步骤五,转化感受态细胞:DH5a;
步骤六,转化后的B-PDHB shRNA平板挑菌,37℃250转/分钟摇菌14小时,将菌液送测序公司测序。
进一步,所述酶切体系如下。
进一步,所述酶切完成后胶回收具体包括:
1)DNA电泳结束后,用洁净刀片在紫外线灯下切出相应片段;
2)含DNA的琼脂糖胶块装入1.5ml离心管,估算其体积;加入500μl(<150μl凝胶)或3~4倍(>150μl凝胶)凝胶体积的Buffer PS溶胶结合液;
3)离心管置于50℃~60℃水浴5~10min,每隔2~3min取出混悬震荡10sec,至琼脂糖凝胶完全溶解,室温放置5min冷却;
4)将少于700μl融化胶液转移至插入套管的离心柱内,于台式离心机上高速离心1min,弃去套管内废液,再将离心柱插入套管;
5)多于700μl的剩余融化胶液,加入同一离心柱内,重复步骤4);
6)向离心柱内加入Buffer PW洗涤液)700μl,高速离心1min,弃去套管内废液,将离心柱插入套管;
7)高速离心1~2min后,取出离心柱,弃去套管;
8)将离心柱插入一个新的1.5ml离心管,在离心柱内硅胶膜中心位置加入30~50μl Elution Buffer洗脱液;室温放置2~5min,高速离心1min,离心管中即得纯化的DNA溶液;
9)获得的DNA溶液,可直接应用于后续实验中,或保存于-20℃备用。
进一步,所述目的片断利用3’和5’的单链退火获得包括:
退火程序:
进一步,所述转化感受态细胞:DH5a具体包括:
1)吸取连接产物(体积≤10uL)于50-100uL感受态细胞中,混合均匀,在冰上放置30min;
2)将离心管放到42℃水浴中,热激90s,取出后迅速放于冰上,冷却1-2min;
3)向离心管中加入5倍体积的LB液体培养基,37℃振荡培养45-60min;
4)8,000rpm离心30s,去部分上清,留100uL左右培养液,移液枪吸打均匀后,用三角涂布棒涂布在选择性LB平板上;
5)倒置培养皿于37℃培养12-16h,待单菌落长出后,挑取单菌落。
本发明的另一目的在于提供一种由所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体构建的重组腺病毒的PDHB shRNA。
本发明对构建的重组腺病毒PDHB shRNA进行鉴定,腺病毒PDHB shRNA侵染牛肌内前体脂肪细胞48h,shRNA1、shRNA2和shRNA3对PDHB基因的干扰效率分别为:95.12%、12.69%和97.76%。
附图说明
图1是本发明实施例提供的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法流程图。
图2是本发明实施例提供的pHBAd-U6-Scramble-CMV-GFP干扰载体图谱。
图3是本发明实施例提供的酶切完成后胶回收示意图;
图中:左:回收载体pHBAd-U6-Scramble-CMV-GFP;右:DNA Marker;(Marker从上至下依次为:12000bp,8000bp,6000bp,5000bp,4000bp,3000bp,2500bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp)。
图4是本发明实施例提供的干扰效率检测结果示意图。
图5是本发明实施例提供的病毒Ad-shRNA2侵染牛肌内前体脂肪细胞示意图。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
下面结合附图对本发明的应用原理作详细的描述。
本发明实施例提供的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的序列为:
牛-PDHB shRNA1的序列为:SEQ ID NO:1
AATTCGAGGATCATAGATACTCCCATATCTTTCAAGAGAAGATATGGGAGTATCTATGATCCTCTTTTTTG。
牛-PDHB shRNA2的序列为:SEQ ID NO:2
AATTCGCTGCAACAGTACTGTCTAAATTCAAGAGATTTAGACAGTACTGTTGCAGCTTTTTTG。
牛-PDHB shRNA3的序列为:SEQ ID NO:3
AATTCGCCTCAGGTTAAGGACATCATATTTGTTCAAGAGACAAATATGATGTCCTTAACCTGAGGTTTTTTG。
如图1所示,本发明实施例提供的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法包括以下步骤:
S101:载体用BamH I,EcoR I双酶切;
S102:酶切完成后胶回收;
S103:目的片断利用3’和5’的单链退火获得:
S104:处理好的目的片段与载体连接反应;
S105:转化感受态细胞:DH5a;
S106:转化后的B-PDHB shRNA平板挑菌,37℃250转/分钟摇菌14小时,将菌液送测序公司测序。
下面结合具体实施例对本发明的应用原理作进一步的描述。
一、腺病毒载体构建
1.1实验材料
实验试剂
载体及目的基因信息
pHBAd-U6-Scramble-CMV-GFP干扰载体图谱如图2。
首先用EcoR I,BamH I酶切载体,切掉Scramble序列获得骨架,之后把目的序列插入U6启动子之后来调控其表达,该腺病毒载体中含有CMV启动子调控的GFP基因表达。
干扰序列设计如下:
SiRNA1序列:GAGGATCATAGATACTCCCATATCT
shRNA1序列:
SiRNA2序列:GCTGCAACAGTACTGTCTAAA
shRNA2序列:
SiRNA3序列:CCTCAGGTTAAGGACATCATATTTG
shRNA3序列:
1.2实验流程
B-PDHB shRNA的构建
1.2.1引物由上海桑尼生物合成PAGE胶纯化的oligo序列,分别稀释至100uM
1.2.2载体用BamH I,EcoR I双酶切,酶切体系如下。
1.2.3酶切完成后胶回收,如图3所示。
1)DNA电泳(建议使用TAE缓冲液进行琼脂糖凝胶电泳)结束后,用洁净刀片在紫外线灯下切出相应片段。仔细将胶块中无DNA部分去除掉。
2)含DNA的琼脂糖胶块装入1.5ml离心管,估算其体积。加入500μl(<150μl凝胶)或3~4倍(>150μl凝胶)凝胶体积的Buffer PS(溶胶结合液)。
3)离心管置于50~60℃水浴5~10min,每隔2~3min取出混悬震荡10sec,至琼脂糖凝胶完全溶解,室温放置5min冷却。
4)将少于700μl融化胶液转移至插入套管的离心柱内,于台式离心机上高速离心1min,弃去套管内废液,再将离心柱插入套管。
5)多于700μl的剩余融化胶液,加入同一离心柱内,重复步骤4。
6)向离心柱内加入Buffer PW(洗涤液)700μl,高速离心1min,弃去套管内废液,将离心柱插入套管。
7)此步骤可省略,直接进行步骤8。向离心柱内加入Buffer PW(洗涤液)200μl,高速离心1~2min。
8)高速离心1~2min后,小心取出离心柱,不要沾上套管内的废液。弃去套管。
9)将离心柱插入一个新的1.5ml离心管,在离心柱内硅胶膜中心位置加入30~50μl Elution Buffer(洗脱液),不要触及硅胶膜;室温放置2~5min,高速离心1min,离心管中即得纯化的DNA溶液。
10)获得的DNA溶液,可直接应用于后续实验中,或保存于-20℃备用。
1.2.4目的片断利用3’和5’的单链退火获得:
退火程序:
1.2.5处理好的目的片段与载体连接反应体系:
以上连接液在
16℃过夜。
1.2.6转化(感受态细胞:DH5a),具体步骤:
1)吸取连接产物(体积≤10uL)于50-100uL感受态细胞中,轻轻混合均匀,在冰上放置30min;
2)将离心管放到42℃水浴中,热激90s(严格控制热击时间),取出后迅速放于冰上,冷却1-2min;
3)向离心管中加入5倍体积的LB液体培养基,37℃振荡培养45-60min;
4)8,000rpm离心30s,去部分上清,留100uL左右培养液,移液枪吸打均匀后,用三角涂布棒涂布在选择性LB平板(含相应抗生素)上;
5)倒置培养皿于37℃培养12-16h,待单菌落长出后,挑取单菌落进行后续实验步骤。
抗性:Amp;37℃,培养过夜
1.2.7转化后的B-PDHB shRNA平板挑菌,37℃250转/分钟摇菌14小时,将菌液送测序公司测序。
1.3实验结果:
B-PDHB shRNA1测序结果:(下划线区域为目的序列)TGAATTACGATCTGGCTTTATATATCTTGTGGAAGGACGAAACACCGGTCCGCAGAATTCGAGGATCATAGATACTCCCATATCTTTCAAGAGAAGATATG GGAGTATCTATGATCCTCTTTTTTGGATCCATTAGGCGGCCGCGTGGATAACCGTATTACCGCCATGCATTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGACGCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGTCGAGCTGGACGGCGACGTAACGGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCG
B-PDHB shRNA2测序结果:(下划线区域为目的序列)
TGATTTCTTGGCTTTATATATCTTGTGGAAGGACGAAACACCGGTCCGCAGAATTCGCTGCAACAGTAC TGTCTAAATTCAAGAGATTTAGACAGTACTGTTGCAGCTTTTTTGGATCCATTAGGCGGCCGCGTGGATAACCGTATTACCGCCATGCATTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGACGCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCC
B-PDHB shRNA3测序结果:(下划线区域为目的序列)
ACCCGAGCTTGGCTTTATATATCTTGTGGAAGGACGAAACACCGGTCCGCAGAATTCGCCTCAGGTTAA GGACATCATATTTGTTCAAGAGACAAATATGATGTCCTTAACCTGAGGTTTTTTGGATCCATTAGGCGGCCGCGTGGATAACCGTATTACCGCCATGCATTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGACGCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGGCAGTGCTTCAG
二、重组腺病毒PDHB shRNA腺病毒的生产实验流程
2.1材料
人胚肾细胞系HEK293cell由汉恒生物公司长期保存;DMEM购于Hyclone公司;LipofiterTM转染试剂为汉恒生物产品;胎牛血清、胰酶购于Hyclone公司;60mm培养皿、10cm培养皿、96孔板、移液管(5ml,10ml)、15ml及50ml离心管均购自NEST公司;双抗购自invitrogen公司;滤膜滤器购自Millipore公司。
2.2方法
2.2.1大量制备重组质粒
1)将对数生长期的菌液2ml加入100mL含100ug/ml Amp的LB培养基中;
2)37℃300rpm震荡摇菌过夜;
3)用康为世纪中提质粒试剂盒提取质粒;
2.2.2重组腺病毒载体的包装,收毒及扩增;
2.2.2.1铺细胞:
转染前一天,将293细胞接种于60mm培养皿,培养基为DMEM+10%Hyclon胎牛血清,置37℃含5%CO2的培养箱中培养过夜。
2.2.2.2转染
待细胞生长至底面积的长满到70~80%时,取重组腺病毒载体质粒PDHB shRNA及骨架质粒pHBAd-BHG,用LipofiterTM转染试剂进行转染。具体步骤为:
a.转染前2小时更换完全培养基。取2ug重组腺病毒载体质粒PDHB shRNA,4ug骨架质粒pHBAd-BHG。用300μl的DMEM培养液进行稀释,室温放置5min。
b.取15ul的LipofiterTM,用300μl的DMEM培养液进行稀释,室温放置5min。
c.将两者混和,室温避光放置20min。然后将混合物加入到60mm培养皿中,8字摇晃后置于37℃含5%CO2的培养箱中培养。
注:LipofiterTM转染试剂为汉恒生物产品,使用说明参考LipofiterTM说明书。
2.2.2.3换液
转染6小时后,更换新鲜的细胞培养液。
2.2.2.4收毒(P1):
每天观察细胞出毒迹象。出毒现象为细胞变大变圆,呈葡萄状,并开始出现明显噬斑。待细胞大部分病变并从底部脱落进行收毒。将60mm培养皿中所有细胞及培养液收于15ml离心管中。
2.2.2.5冻融:
打开恒温水浴锅至37℃,将15ml离心管在液氮及37℃水浴反复冻融三次。3000rpm离心5分钟,收集含病毒的上清液,弃沉淀。该上清即为Ad-PDHB shRNA第一代毒种(P1),将作为随后大量病毒扩增的毒种。
三、重组腺病毒PDHB shRNA干扰效率检测
3.1材料
本试验用到的牛肌内前体脂肪细胞分离自出生3日龄的秦川公牛背最长肌;DMEM培养基、胎牛血清FBS、胰蛋白酶Trypsin 0.25%EDTA均购自美国invitrogen公司;荧光定量PCR试剂盒购自大连宝生物(TaKaRa)公司;DNA引物合成由英潍捷基(上海)贸易有限公司完成。
3.2方法
当牛肌内前体脂肪细胞生长到80%左右时,分别侵染高滴度病毒Ad-PDHB和Ad-EGFP。侵染48h后观察绿色荧光表情况,收集细胞提取总RNA,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测检测PDHB基因的表达情况。定量引物为PDHB-RT-F:TCTGAGATGGGCTTTGCTGG,PDHB-RT-R:TGACCTGGTCGATGGCTTGC,PCR产物大小为109bp。以牛GAPDH基因(Accession No.NM_001034034)作为内参,引物为:GAPDH-RT-F:CCAACGTGTCTGTTGTGGAT,GAPDH-RT-R:CTGCTTCACCACCTTCTTGA,PCR产物大小为80bp。
3.3结果
如图4所示,腺病毒PDHB shRNA侵染牛肌内前体脂肪细胞48h,shRNA1、shRNA2和shRNA3对PDHB基因的干扰效率分别为:95.12%、12.69%和97.76%。
如图5所示,腺病毒Ad-shRNA2侵染牛肌内前体脂肪细胞48h,检测到荧光表达。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
<110>西北农林科技大学
<120> 一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体及其构建方法
<160> 3
<210>1
<211> 71
<212> DNA
<213>人工序列
<400> 核苷酸序列
AATTCGAGGATCATAGATACTCCCATATCTTTCAAGAGAAGATATGGGAGTATCTATGATCCTCTTTTTTG
<210>2
<211> 63
<212> DNA
<213>人工序列
<400> 核苷酸序列
AATTCGCTGCAACAGTACTGTCTAAATTCAAGAGATTTAGACAGTACTGTTGCAGCTTTTTTG
<210>3
<211> 72
<212> DNA
<213>人工序列
<400> 核苷酸序列
AATTCGCCTCAGGTTAAGGACATCATATTTGTTCAAGAGACAAATATGATGTCCTTAACCTGAGGTTTTTTG
Claims (6)
1.一种牛PDHB基因腺病毒干扰载体,其特征在于,所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的shRNA序列为:SEQ ID NO:2。
2.一种如权利要求1所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法,其特征在于,所述牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法包括以下步骤:
步骤一,载体用BamH I,EcoR I双酶切;
步骤二,酶切完成后胶回收;
步骤三,目的片断利用3’和5’的单链退火获得:
步骤四,处理好的目的片段与载体连接反应;
步骤五,转化感受态细胞:DH5a;
步骤六,转化后的B-PDHB shRNA平板挑菌,37℃250转/分钟摇菌14小时,将菌液送测序公司测序。
4.如权利要求2所述的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法,其特征在于,所述酶切完成后胶回收具体包括:
1)DNA电泳结束后,用洁净刀片在紫外线灯下切出相应片段;
2)含DNA的琼脂糖胶块装入1.5ml离心管,估算其体积;加入500μl(<150μl凝胶)或3~4倍(>150μl凝胶)凝胶体积的Buffer PS溶胶结合液;
3)离心管置于50℃~60℃水浴5~10min,每隔2~3min取出混悬震荡10sec,至琼脂糖凝胶完全溶解,室温放置5min冷却;
4)将少于700μl融化胶液转移至插入套管的离心柱内,于台式离心机上高速离心1min,弃去套管内废液,再将离心柱插入套管;
5)多于700μl的剩余融化胶液,加入同一离心柱内,重复步骤4);
6)向离心柱内加入Buffer PW洗涤液)700μl,高速离心1min,弃去套管内废液,将离心柱插入套管;
7)高速离心1~2min后,取出离心柱,弃去套管;
8)将离心柱插入一个新的1.5ml离心管,在离心柱内硅胶膜中心位置加入30~50μlElution Buffer洗脱液;室温放置2~5min,高速离心1min,离心管中即得纯化的DNA溶液;
9)获得的DNA溶液,可直接应用于后续实验中,或保存于-20℃备用。
5.如权利要求2所述的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法,其特征在于,所述目的片断利用3’和5’的单链退火获得包括:
体系:20ul
10X Buffer:2ul;
100mM Tris-cl pH7.5;
1M NaCl;
10mM EDTA;
shDNA-R/shDNA-F:1/1ul;
H2O:16ul;
退火程序:
95℃ 10分钟;
75℃ 10分钟;
55℃ 10分钟;
35℃ 10分钟;
15℃ 10分钟。
6.如权利要求2所述的牛PDHB基因腺病毒干扰载体的构建方法,其特征在于,所述转化感受态细胞:DH5a具体包括:
1)吸取连接产物(体积≤10uL)于50-100uL感受态细胞中,混合均匀,在冰上放置30min;
2)将离心管放到42℃水浴中,热激90s,取出后迅速放于冰上,冷却1-2min;
3)向离心管中加入5倍体积的LB液体培养基,37℃振荡培养45-60min;
4)8,000rpm离心30s,去部分上清,留100uL左右培养液,移液枪吸打均匀后,用三角涂布棒涂布在选择性LB平板上;
5)倒置培养皿于37℃培养12-16h,待单菌落长出后,挑取单菌落。
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