CN106701648B - 一株高产l-异亮氨酸的基因工程菌及其构建方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一株高产L‑异亮氨酸的谷氨酸棒杆菌基因工程菌,该菌是将谷氨酸棒杆菌Corynebacterium glutamicum H5菌株敲除了编码精氨基琥珀酸合成酶的argG基因及编码氨基转移酶的alaT基因,且在alaT基因被敲除的位点插入了编码乙酰羟酸还原异构酶的ilvC基因的操纵子,所述谷氨酸棒杆菌Corynebacterium glutamicum H5保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2016609。本发明还公开了该基因工程菌的构建方法及应用,本发明提供的基因工程菌用于发酵生产L‑异亮氨酸,可提高产量和糖酸转化率。
Description
技术领域
本发明涉及一株高产L-异亮氨酸的基因工程菌,其构建方法及应用,属于生物技术领域。
背景技术
L-异亮氨酸,又称L-异白氨酸,化学名为L-α-氨基-β-甲基戊酸,属于天冬氨酸族非极性、输水性氨基酸的一种。L-异亮氨酸作为人体必需的8种氨基酸之一,是合成人体激素、酶类的原料,具有促进蛋白质合成和抑制分解的效果,成年人每天需要从外界摄取20mg/kg(体重)的L-异亮氨酸。因此,L-异亮氨酸在食品、医药、饲料和运动保健领域具有广泛的应用及商业价值。
由于L-异亮氨酸具有2个不对称碳原子,所以用化学合成方法生产比较困难,成本很高。生物转化法制造L-异亮氨酸是将α氨基丁酸和α-氧代丁酸等作为前体原料进行生物合成,但由于原料昂贵,同样存在生产成本过高的问题。因此,通过微生物发酵来生产L-异亮氨酸是一种必然的发展趋势。
CN 105176907 A公布了一株通过重组大肠杆菌构建的L-异亮氨酸基因工程菌,通过大肠杆菌发酵生产L-异亮氨酸,最终产量为16.05±0.16g/L,糖酸转化率达40.78%。
CN 104480057 A构建了alr基因缺陷的谷氨酸棒杆菌宿主菌,再将fusA、frr、ilvBN、ilvA、ppnk等基因连接到过表达载体,然后电转入alr缺陷的宿主菌中,获得一株谷氨酸棒杆菌基因工程菌,通过发酵产L-异亮氨酸,产量达到28.6g/L。
CN 105886431 A公布了一株诱变筛选得到的谷氨酸棒杆菌菌株,通过发酵产L-异亮氨酸,产量为28g/L。
CN 104212756 A公布了一株过表达fusA基因的谷氨酸棒杆菌基因工程菌,摇瓶发酵产L-异亮氨酸为8.7g/L。
发明内容
本发明的目的是提供一株高产L-异亮氨酸的基因工程菌及其构建和应用。本发明根据筛选得到的谷氨酸棒杆菌突变菌株Corynebacterium glutamicum H5的代谢特点,利用基因工程技术来改造其基因组,通过敲除或者插入相关基因,减弱代谢支路的杂酸如丙氨酸、缬氨酸等的合成;增加L-异亮氨酸的前体如天冬氨酸及苏氨酸的合成,促进碳通量更多流向L-异亮氨酸合成途径,使其在发酵过程中能大幅提高产L-异亮氨酸的能力,从而降低生产成本,具有广阔的工业应用前景。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
一株高产L-异亮氨酸的基因工程菌,命名为C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC,其分类为谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum),该基因工程菌是将谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)H5菌株敲除了编码精氨基琥珀酸合成酶的argG基因及编码氨基转移酶的alaT基因,且在alaT基因被敲除的位点插入了编码乙酰羟酸还原异构酶的ilvC基因的操纵子。
其构建方法包括以下步骤:
(1)出发菌株是本实验室筛选得到的突变菌株,命名为Corynebacteriumglutamicum H5,其分类为谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum),属于革兰氏阳性菌。
(2)利用EcoRI/SalI双酶切载体pk18mobsacB,回收5.6kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物,扩增argG基因上游1.22kb的核苷酸片段argG-L、及下游1.31kb的核苷酸片段argG-R,通过GIBSON连接上述3个片段,构建重组质粒argG-pk18mobsacB,该质粒即argG基因的敲除载体。其中,扩增argG-L、argG-R上下游片段所用的引物为:
argG-L-FP:5‘-CTATGACATGATTACGAATTCGTGCCACTGGTGAACTCCTTG-3’
argG-L-RP:5‘-TGAAAAGGTGGCTTATGCATGTGTTGAAAGGGTTGGTATT-3’
argG-R-FP:5‘-AACCCTTTCAACACATGCATAAGCCACCTTTTCAAGCATC-3’
argG-R-RP:5‘-AGGTCGACTCTAGAGGATCCTTCTTCATCAGTGAGATCGA-3’
(3)将步骤(2)中的重组质粒转化步骤(1)中所述出发菌株Corynebacteriumglutamicum H5,通过同源重组获得argG基因缺陷的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargG。
(4)继续利用EcoRI/SalI双酶切载体pk18mobsacB,回收5.6kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物,扩增alaT基因上游1.42kb的核苷酸片段alaT-L、及下游1.51kb的核苷酸片段alaT-R,通过GIBSON连接上述3个片段,构建包含alaT基因上下游片段的重组质粒alaT-pk18mobsacB,该质粒即alaT基因的敲除载体。其中,扩增alaT上下游片段的引物为:
alaT-L-FP:5‘-ATGACATGATTACGAATTCGCCACTTTGGACTAATCAATAT-3’
alaT-L-RP:5‘-ATGCGGCCGCTTTTATGCATTGGAAGGTTGGCGATCATG-3’
alaT-R-FP:5‘-CAATGCATAAAAGCGGCCGCATCTCCTTTGCATCACATAC-3’
alaT-R-RP:5‘-TTGCATGCCTGCAGGTCGACCGGTGTTTCCACCATGCGG-3’
(5)将将步骤(4)中的重组质粒转化步骤(3)中所述的基因工程菌C.glutamicumH5ΔargG,通过同源重组获得alaT基因缺陷的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT。
(6)利用NsiI/NotI双酶切载体alaT-pk18mobsacB,回收8.7kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物扩增ilvC基因片段;以大肠杆菌表达载体PVB220为模板,设计引物扩增PlacUV5启动子片段;以大肠-谷氨酸棒杆菌穿梭载体PXMJ19为模板,设计引物扩增终止子rrnB片段;通过GIBSON连接上述4个片段,构建重组质粒ilvC-alaT-pk18mobsacB,该质粒即为ilvC操纵子的插入载体。其中,ilvC操纵子包括PlacUV5启动子、ilvC基因及rrnB终止子3个片段。扩增3个片段所用的引物为:
placUV5 FP:5‘-TCGCCAACCTTCCAATGCATGTAGAGGATCGAGATCTCCA-3’
placUV5 RP:5‘-TAAAGCAGTTCAATAGCCATATGGCTGCTGCCCATGGAAT-3’
ilvC FP:5‘-ATTCCATGGGCAGCAGCCATATGGCTATTGAACTGCTTTA-3’
ilvC RP:5‘-tctcatccgccaaaacagccTTAAGCGGTTTCTGCGCGAG-3’
rrnB FP:5‘-CTCGCGCAGAAACCGCTTAAggctgttttggcggatgaga-3’
rrnB RP:5‘-TGCAAAGGAGATGCGGCCGCagagtttgtagaaacgcaaa-3’
(7)将步骤(6)中的插入载体转化步骤(5)中所述的工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT,通过同源重组获得在alaT基因被敲除的位点插入了ilvC操纵子的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC。
所述的基因工程菌的应用,在于通过发酵生产L-异亮氨酸,其方法为:将基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC活化后转接种子培养基培养,种液再转接至5L发酵罐直接发酵,最终L-异亮氨酸产量为48g/L。
所述活化培养基配方为:玉米浆5%、胰蛋白胨1%、氯化钠0.5%、硫酸铵0.4%、葡萄糖0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、丙氨酸0.004%、琼脂粉2%,余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
所述种子培养基配方为:葡萄糖3%、硫酸铵2.5%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、碳酸钙4%、丙氨酸0.004%、余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
所述发酵培养基配方为:葡萄糖16%、硫酸铵0.8%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、丙氨酸0.004%,余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
本发明的有益效果是:本发明根据谷氨酸棒杆菌突变菌株Corynebacteriumglutamicum H5的代谢特点,利用基因工程技术来改造H5的基因组,通过敲除或者插入相关基因,减弱代谢支路的杂酸如丙氨酸、缬氨酸等的合成、增加L-异亮氨酸的前体如天冬氨酸及苏氨酸的合成,促进碳通量更多流向L-异亮氨酸合成途径,使其在发酵过程中能大幅提高产L-异亮氨酸的能力,L-异亮氨酸的产酸率相对出发菌株提高了2.18倍,在5L发酵罐中,L-异亮氨酸产量达48g/L,糖酸转化率达18%以上,大幅降低了生产成本,具有广阔的工业应用前景。
具体实施方式
以下结合实施例对本发明的技术方案进行详细地说明。
实施例1 L-异亮氨酸突变菌株H5的获得
1.1材料与试剂
谷氨酸棒杆菌ATCC13032,为广泛应用的标准菌株,购自上海复祥生物科技有限公司;
硫酸二乙酯(EDS),购自武汉申试化工;蛋白胨、酵母、玉米浆等购自Biosharp公司;丙氨酸、磺胺胍、S-(2-氨基乙基)-L-半胱氨酸盐酸盐、α-氨基丁酸、DL-α-氨基-β-羟基戊酸等均购自sigma公司;其余化学药品试剂均为国药分析纯。
1.2制备出发型菌株
以谷氨酸棒杆菌ATCC13032为出发菌株,在LBG固体培养基上活化,31℃培养12h;
从斜面接种一环菌体到30mL LBG培养基中,31℃、200rpm,培养12h;取菌液1mL,12000rpm离心2min,弃上清,用生理盐水对细胞进行洗涤3次,用pH7.0的磷酸缓冲液重悬菌体,制成10-3-10-7倍的菌悬液备用。
LBG培养基配方为:蛋白胨1.0%、酵母0.5%、氯化钠1.0%、葡萄糖0.5%,余量为去离子水,pH为6.5-7.0。
1.3 EDS诱变筛选
取2-10mL菌悬液,加入过无菌瓶中,加入1%(V/V)硫酸二乙酯,反应0.5-1h;用无菌水稀释103倍,涂布于含有磺胺胍、S-(2-氨基乙基)-L-半胱氨酸盐酸盐、α-氨基丁酸、DL-α-氨基-β-羟基戊酸等L-异亮氨酸结构类似物的抗性筛选培养基上,31℃,培养6-48h待单菌落长出;
单菌落转接10mL发酵培养基,31℃,200rpm振荡培养72h,HPLC检测各单菌落发酵得到的L-异亮氨酸产量,其中,出发菌株ATCC13032产L-异亮氨酸小于0.02g/L,突变株H5产L-异亮氨酸为22g/L。将该突变菌株命名为Corynebacterium glutamicum H5,并于2016年11月1日保藏于位于湖北省武汉市武汉大学内的中国典型培养物保藏中心(CCTCC),保藏编号为CCTCC NO:M2016609。
发酵培养基配方为:葡萄糖24.0%、硫酸铵0.8%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、磷酸氢二钾0.12%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、丙氨酸0.004%,余量为去离子水,pH为7。
实施例2基因工程菌C.glutamicumH5ΔargG的构建
2.1实验材料与试剂
质粒pk18mobsacB、大肠杆菌DH5α均为商业途径购买;
DNA聚合酶(KOD DNA Polymerase)购自toyobo东洋纺(上海)生物科技有限公司;限制性内切酶(EcoRI、SalI、NsiI、NotI)、DNAmarker、质粒小提取试剂盒、DNA胶回收纯化试剂盒,均购自takara宝生物工程(大连)有限公司;Gibson克隆重组试剂盒购自NEB北京公司;硫酸卡那霉素购自Biosharp公司;蔗糖等其余化学药品试剂均为国药分析纯。
2.2敲除载体argG-pk18mobsacB的构建
利用EcoRI/SalI双酶切载体pk18mobsacB,反应体系为:质粒1ug、10×buffer5ul、BamHI 1ul、EcoRI 1ul、补水至50ul,37℃酶切5h。1%琼脂糖凝胶电泳检测并DNA胶回收纯化试剂盒回收5.6kb核苷酸片段;
甘油保存的菌株Corynebacterium glutamicum H5接种至1-4mL的LBG液体培养基中,31℃、200rpm振荡培养16h;取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用天根基因组提取试剂盒抽提基因组DNA。
以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计argG基因上下游片段argG-L(SEQ ID NO:1所示)、argG-R(SEQ ID NO:2所示)的引物:
argG-L-FP:5‘-CTATGACATGATTACGAATTCGTGCCACTGGTGAACTCCTTG-3’
argG-L-RP:5‘-TGAAAAGGTGGCTTATGCATGTGTTGAAAGGGTTGGTATT-3’
argG-R-FP:5‘-AACCCTTTCAACACATGCATAAGCCACCTTTTCAAGCATC-3’
argG-R-RP:5‘-AGGTCGACTCTAGAGGATCCTTCTTCATCAGTGAGATCGA-3’
高保真KOD聚合酶PCR扩增1.22kb的核苷酸片段argG-L、及1.31kb的核苷酸argG-R。PCR反应体系(50ul)为:5×PCR buffer10μL、dNTP 5μL、引物各1.5μL、模板1μL、KOD酶1μL、加水至50μL。反应条件为:95℃5min,95℃30s,55℃30s,68℃2min,30个循环;68℃10min。1%琼脂糖凝胶电泳检测且DNA胶回收纯化试剂盒回收1.1kb的2个PCR产物。
Gibson克隆重组试剂盒重组上述双酶切产物及两个PCR产物,重组产物转化大肠杆菌DH5α,涂布于含硫酸卡那霉素的平板,经过37℃过夜培养后,挑选转化子送武汉天一辉远生物技术公司测序,测序正确的转化子即含有重组质粒argG-pk18mobsacB。
2.3 Corynebacterium glutamicum H5基因组敲除argG基因
将测序正确的转化子转接3mL LB培养基,37℃、200rpm振荡培养16h,取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用质粒小量提取试剂盒抽提质粒。将质粒转入出发菌株Corynebacterium glutamicum H5中,转化产物涂布于含硫酸卡那霉素的LBHIS固体培养基中,30℃培养48h至长出转化子,挑选转化子转接3mL LB培养基,30℃、200rpm振荡培养24h,菌液稀释涂布于含10%蔗糖的平板,30℃培养48h至长出单菌落,挑选单菌落分别接种于含硫酸卡那霉素的平板及含10%蔗糖的平板,挑选在10%的蔗糖平板上生长而在硫酸卡那霉素平板上不生长的单菌落送测序,测序正确的单菌落即为argG基因缺陷的工程菌C.glutamicum H5ΔargG。
LBHIS培养基配方为:蛋白胨1%、酵母0.5%、氯化钠1%、脑心津液2%、山梨醇4%、琼脂粉2%、硫酸卡那霉素100ug/mL、余量为去离子水,pH为7。
10%蔗糖培养基配方为:蛋白胨1%、酵母0.5%、氯化钠1%、葡萄糖0.5%、蔗糖10%、余量为去离子水,pH为7。
实施例3基因工程菌C.glutamicumH5ΔargGΔalaT的构建
3.1敲除载体alaT-pk18mobsacB的构建
利用EcoRI/SalI双酶切载体pk18mobsacB,反应体系为:质粒1ug、10×buffer5ul、BamHI1ul、EcoRI1ul、补水至50ul,37℃酶切5h。1%琼脂糖凝胶电泳检测并DNA胶回收纯化试剂盒回收5.6kb核苷酸片段;
甘油保存的菌株Corynebacterium glutamicum H5接种至1-4mL的LBG液体培养基中,31℃、200rpm振荡培养16h;取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用天根基因组提取试剂盒抽提基因组DNA。
以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计alaT基因上下游片段alaT-L(SEQ ID NO:3所示)、alaT-R(SEQ ID NO:4所示)的引物:
alaT-L-FP:5‘-ATGACATGATTACGAATTCGCCACTTTGGACTAATCAATAT-3’
alaT-L-RP:5‘-ATGCGGCCGCTTTTATGCATTGGAAGGTTGGCGATCATG-3’
alaT-R-FP:5‘-CAATGCATAAAAGCGGCCGCATCTCCTTTGCATCACATAC-3’
alaT-R-RP:5‘-TTGCATGCCTGCAGGTCGACCGGTGTTTCCACCATGCGG-3’
高保真KOD聚合酶PCR扩增1.42kb的核苷酸片段alaT-L、及1.51kb的核苷酸片段alaT-R。PCR反应体系(50ul)为:5×PCR buffer 10μL、dNTP 5μL、引物各1.5μL、模板1μL、KOD酶1μL、加水至50μL。反应条件为:95℃5min,95℃30s,55℃30s,68℃2min,30个循环;68℃10min。1%琼脂糖凝胶电泳检测且DNA胶回收纯化试剂盒回收1.5kb的2个PCR产物。
Gibson克隆重组试剂盒重组上述双酶切产物及两个PCR产物,重组产物转化大肠杆菌DH5α,涂布于含硫酸卡那霉素的平板,经过37℃过夜培养后,挑选转化子送武汉天一辉远生物技术公司测序,测序正确的转化子即含有重组质粒alaT-pk18mobsacB。
3.2 C.glutamicum H5ΔargG基因组敲除alaT基因
将测序正确的转化子转接3mL LB培养基,37℃、200rpm振荡培养16h,取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用质粒小量提取试剂盒抽提质粒。将质粒转入出发菌株C.glutamicum H5ΔargG中,转化产物涂布于含硫酸卡那霉素的LBHIS固体培养基中,30℃培养48h至长出转化子,挑选转化子转接3mL LB培养基,30℃、200rpm振荡培养24h,菌液稀释涂布于含10%蔗糖的平板,30℃培养48h至长出单菌落,挑选单菌落分别接种于含硫酸卡那霉素的平板及含10%蔗糖的平板,挑选在10%的蔗糖平板上生长而在硫酸卡那霉素平板上不生长的单菌落送测序,测序正确的单菌落即为alaT基因缺陷的工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT。
实施例4基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC的构建
4.1实验材料
质粒pk18mobsacB、PVB220、PXMJ19等均为商业途径购买。
4.2插入载体ilvC-alaT-pk18mobsacB的构建
利用NsiI/NotI双酶切载体pk18mobsacB,反应体系为:质粒1ug、10×buffer 5ul、NsiI 1ul、NotI 1ul、补水至50ul。37℃酶切5h。1%琼脂糖凝胶电泳检测并DNA胶回收纯化试剂盒回收8.7kb核苷酸片段。
甘油保存的菌株Corynebacterium glutamicum H5接种至1-4mL的LBG液体培养基中,31℃、200rpm振荡培养16h;取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用天根基因组提取试剂盒抽提基因组DNA。
以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物ilvC FP/RP,高保真KOD聚合酶PCR扩增ilvC基因片段(SEQ ID NO:6所示);以大肠杆菌表达载体PVB220为模板,设计引物placUV5 FP/RP,高保真KOD聚合酶PCR扩增PlacUV5启动子片段(SEQ ID NO:5所示);以大肠杆菌-谷氨酸棒杆菌穿梭载体PXMJ19为模板,设计引物rrnB FP/RP,高保真KOD聚合酶PCR扩增终止子rrnB片段(SEQ ID NO:7所示);PCR反应体系(50ul)为:5×PCRbuffer 10μL、dNTP 5μL、引物各1.5μL、模板1μL、KOD酶1μL、加水至50μL。反应条件为:95℃5min,95℃30s,55℃30s,68℃2min,30个循环;68℃10min。扩增3个片段所用的引物分别为:
placUV5 FP:5‘-TCGCCAACCTTCCAATGCATGTAGAGGATCGAGATCTCCA-3’
placUV5 RP:5‘-TAAAGCAGTTCAATAGCCATATGGCTGCTGCCCATGGAAT-3’
ilvC FP:5‘-ATTCCATGGGCAGCAGCCATATGGCTATTGAACTGCTTTA-3’
ilvC RP:5‘-tctcatccgccaaaacagccTTAAGCGGTTTCTGCGCGAG-3’
rrnB FP:5‘-CTCGCGCAGAAACCGCTTAAggctgttttggcggatgaga-3’
rrnB RP:5‘-TGCAAAGGAGATGCGGCCGCagagtttgtagaaacgcaaa-3’
1%琼脂糖凝胶电泳检测且DNA胶回收纯化试剂盒回收3个PCR产物。Gibson克隆重组试剂盒重组上述双酶切产物3个PCR产物,重组产物转化大肠杆菌DH5α,涂布于含硫酸卡那霉素的平板,经过37℃过夜培养后,挑选转化子送武汉天一辉远生物技术公司测序,测序正确的转化子即含有重组质粒ilvC-alaT-pk18mobsacB,该质粒中ilvC操纵子包括PlacUV5启动子、ilvC基因及rrnB终止子3个片段。
4.3 C.glutamicum H5ΔargGΔalaT基因组中插入ilvC操纵子
将测序正确的转化子转接3mL LB培养基,37℃、200rpm振荡培养16h,取1-4mL的菌液,10,000rpm离心2分钟,弃上清;湿菌体用质粒小量提取试剂盒抽提质粒。将质粒转入出发菌株C.glutamicum H5ΔargGΔalaT中,转化产物涂布于含硫酸卡那霉素的LBHIS固体培养基中,30℃培养48h至长出转化子,挑选转化子转接3mL LB培养基,30℃、200rpm振荡培养24h,菌液稀释涂布于含10%蔗糖的平板,30℃培养48h至长出单菌落,挑选单菌落分别接种于含硫酸卡那霉素的平板及含10%蔗糖的平板,挑选在10%的蔗糖平板上生长而在硫酸卡那霉素平板上不生长的单菌落送测序,测序正确的单菌落即为工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC。
实施例5菌株的培养、发酵
5.1种子培养
取一支甘油管保存的工程菌菌种C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC,室温放置融化,吸取1mL菌液至固态活化培养基上划线,30℃培养16h;从活化培养基上挑一接种环菌苔转接到种子培养基中,30℃、200rpm振荡培养16h。
活化培养基配方为:玉米浆5%、胰蛋白胨1%、氯化钠0.5%、硫酸铵0.4%、葡萄糖0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、丙氨酸0.004%、琼脂粉2%,余量为去离子水,pH为7。
种子培养基培养为:葡萄糖3%、硫酸铵2.5%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、碳酸钙4%、丙氨酸0.004%、余量为去离子水,pH为7。
5.2发酵培养
按10%的体积比接种种子至3L发酵培养基中,控温30℃,氨水控制pH在7.0,通过调整转速及通气量维持溶氧在30%,当残糖含量低于1.5%时,流加80%的葡萄糖,维持残糖含量在1.5~2.5%,发酵时间为65h。最终通过HPLC检测到发酵液中L-异亮氨酸含量为4.8%。
发酵培养基配方为:葡萄糖16%、硫酸铵0.8%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、丙氨酸0.004%,余量为去离子水,pH为7。
序列表
<110> 武汉远大弘元股份有限公司
<120> 一株高产L-异亮氨酸的基因工程菌及其构建方法和应用
<160> 7
<210> 1
<211> 1220
<212> DNA
<213> 精氨基琥珀酸合成酶上游argG-L核苷酸片段
<400> 1
GTGCCACTGGTGAACTCCTTGTCCGATGATCTGCACCCATGCCAGATTCTGGCTGATCTGCAGACCATCGTGGAAAACCTCAGCCCTGAAGAAGGCCCAGCAGGCCTTAAGGGTAAGAAGGCTGTGTACCTGGGCGATGGCGACAACAACATGGCCAACTCCTACATGATTGGCTTTGCCACCGCGGGCATGGATATCTCCATCATCGCTCCTGAAGGGTTCCAGCCTCGTGCGGAATTCGTGGAGCGCGCGGAAAAGCGTGGCCAGGAAACCGGCGCGAAGGTTGTTGTCACCGACAGCCTCGACGAGGTTGCCGGCGCCGATGTTGTCATCACCGATACCTGGGTATCCATGGGTATGGAAAACGACGGCATCGATCGCACCACACCTTTCGTTCCCTACCAGGTCAACGATGAGGTCATGGCGAAAGCTAACGACGGCGCCATCTTCCTGCACTGCCTTCCTGCCTACCGCGGCAAAGAAGTGGCAGCCTCCGTGATTGATGGACCAGCGTCCAAAGTTTTCGATGAAGCAGAAAACCGCCTCCACGCTCAGAAAGCACTGCTGGTGTGGCTGCTGGCCCACCAGCCGAGGTAAGACATGTCCCTTGGCTCAACCCCGTCAACACCGGAAAACTTAAATCCCGTGACTCGCACTGCACGCCAAGCTCTCATTTTGCAGATTTTGGACAAACAAAAAGTCACCAGCCAGGTACAACTGTCTGAATTGCTGCTGGATGAAGGCATCGATATCACCCAGGCCACCTTGTCCCGAGATCTCGATGAACTCGGTGCACGCAAGGTTCGCCCCGATGGGGGACGCGCCTACTACGCGGTCGGCCCAGTAGATAGCATCGCCCGCGAAGATCTCCGGGGTCCGTCGGAGAAGCTGCGCCGCATGCTTGATGAACTGCTGGTTTCTACAGATCATTCCGGCAACATCGCGATGCTGCGCACCCCGCCGGGAGCTGCCCAGTACCTGGCAAGTTTCATCGATAGGGTGGGGCTGAAAGAAGTCGTTGGCACCATCGCTGGCGATGACACCGTTTTCGTTCTCGCCCGTGATCCGCTCACAGGTAAAGAACTAGGTGAATTACTCAGCGGGCGCACCACTTAAAGCGCCCCTAGTTCAAGGCTTGTTAATCGCTTGTTAATGCAGGCAGGTAAGGTATAACCCGAGTGTTTTTTCGAGGAATACCAACCCTTTCAACACATGCATAA
<210> 2
<211> 1313
<212> DNA
<213> 精氨基琥珀酸合成酶下游argG-R核苷酸片段
<400> 2
AAGCCACCTTTTCAAGCATCCAGACTAGAACTTCAAGTATTTAGAAAGTAGAAGAACACCACATGGAACAGCACGGAACCAATGAAGGTGCGCTGTGGGGCGGCCGCTTCTCCGGTGGACCCTCCGAGGCCATGTTCGCCTTGAGTGTCTCCACTCATTTCGACTGGGTTTTGGCCCCTTATGATGTGTTGGCCTCCAAGGCACACGCCAAGGTTTTGCACCAAGCAGAGCTACTTTCTGATGAAGATCTAGCCACCATGCTGGCTGGGCTTGATCAGCTGGGCAAGGATGTCGCCGACGGAACCTTCGGTCCGCTGCCTTCTGATGAGGATGTGCACGGCGCGATGGAACGCGGTCTGATTGACCGCGTTGGTCCTGAGGTGGGCGGCCGTCTGCGCGCTGGTCGTTCCCGCAATGACCAGGTGGCAACCCTGTTCCGCATGTGGGTCCGCGACGCAGTGCGCGACATCGCGCTGGGAACAACCGAGCTTGTCGACGCCCTCAGCGCCCAAGCTAAGGCACATGCAGACGCGATCATGCCAGGCAAGACCCACTTCCAGGCAGCTCAGCCGGTCCTTCTGGCACACCAGCTGCTGGCACACGCACAGCCTTTGCTGCGCGATATTGATCGTATCCGTGACCTGGACAAGCGTCTTGCGGTGTCTCCTTACGGTTCCGGCGCACTTGCTGGTTCCTCTTTGAAGCTCAACCCTGAAGCAATCGCTGAAGAACTCGGCTTTGATTCCGCAGCAGATAACTCCATTGATGCCACCAGCTCCCACGATTTCGCATCTGAAACCGCCTTCGTGCTGGCGCAGCTTGCAGTGGATATGTCCCGCTTGGCTGAAGAAATCATCGCATGGTGCACCCCAGAATTTGGTTACATCACCTTGTCTGATTCCTGGTCCACAGGCAGCTCAATCATGCCGCAGAAGAAGAACCCTGACGTGGCAGAGCTGACCCGTGGCAAGTCTGGTCGCTTGATCGGTAACCTCACCGGTCTGCTGGCTACCCTGAAGGCACAGCCTTTAGCGTACAACCGCGACCTGCAGGAAGATAAGGAACCAATCGTAGATTCCGTGGCGCAGCTCAACCTGCTGCTCCCTGCAATGACTGGTTTGGTTTCCACCTTGACCTTCAACACCGAGCGCATGCGTGAACTTGCACCAGCAGGTTTCACCCTTGCCACCGACTTGGCTGAGTGGATGGTGCGCCAGGGCGTTCCATTCCGTGAGGCACACGAAGCATCCGGCGCTTGCGTGCGGATCGCGGAGTCCAGGGGAGTGGACCTTATCGATCTCACTGATGAAGAA
<210> 3
<211> 1420
<212> DNA
<213> 氨基转移酶上游alaT-L核苷酸片段
<400> 3
GCCACTTTGGACTAATCAATATCTTCACCTGGTTTTTTCTGGAAACCCACACCTCATCCGGTCAGTACCACCTCGGCACCGTCTTTCATGGCAAGCACAACATTATTGTTGAGCACTCTCAACCCTTTCACCGAAGTGACACCTACCTTTATTTCTTAGGATTCCAGGCTTTCGCCATTGGTGGCGATGACGTCGCGGCACCAATCAAAGGACTTCTTCTTGTAGCGCTTCAAGATTCCTGAGCCGCCGTCGTCGAGGTATTTGATGCGGTAGTCATCGTTTACTGTTGGGCCGGAGGGTCCGTCGATAAGCACGTCCTTTGCTCCTAGTCCGTTTTCGACGATGAACAGTGGCTTCTGCCAGCGCTCCCAGTAGTTGTTCAGGACGATGCGCAAACCGAGGGGATCAACTTGCCAACCCCATTCGGAAGCCGCGAGAGTGGGGCTGACCACTCCGCCGATGATGTTACCGCCACCGGTTGAGTAGTTTTCGGGGTTGTGGGCTTCACATACGGACATGTAATAGGAGAAGGAAATGAAATCGACGGTGTTTTTTTAAAATCTCACGGTCTTCATCTGTGATGTCGATGGTGATACCCTTTCGCGGAATTTGCGCAGCAAGTAGCCTGGGTATTCGCCACGGACGTGAATATCGCCGAAGGCATAGTCCTCGTGGGACTTTTGCTGGGCGGTAAGTTGATCGCGTGGGTCCGGGGTAATGCCATAACGAGGAACGGCAATAATCATGCAACCGATCTGGTTTTGTGGGTCGATCTCATGAGCAATCTTAGTTGCCAAAGCACTTGCTACTCAATCATGGTAAACAGCCTGGTCGCAGTCCTTCACGATTCAAACTTTGCCTTCCGCTACGCCTTCCACCTGATCATCATAGAAGACGGTGAAGTAACAGCAGCCGGAGATCCCACAGAGATCGTCACTGCGGGACTGATCGAAGAAGTCTACAACGTCAAAGCCTGTGCATCCCAGACCCCGTGAACAGCAAACCGATGATCGTGCCACTGGAAAGATCTTAGGCAGCCGTGGGATTACACCCTTTTAGAGTTAGAACAGTAAAAATTCGCCCAATAGCTTTCAACTACGCACACAAAGTGGCAACATTGAGCGGGTGACTACAGACAAGCGCAAAACCTCTAAGACCACCGACACCGCCAACAAGGCTGTGGGCGCGGATCAGGCGGCGCGTCCCACTCGGCGAACAACTCGCCGCATCTTCGATCAGTCGGAGAAGATGAAGGACGTGCTGTACGAGATCCGTGGCCCGGTGGCCGCGGAGGCGGAACGCATGGAGCTTGATGGGCACAACATCTTAAAGCTCAACACGGGAAATCCAGCCGTGTTCGGATTCGATGCCCCCGACGTGATTATGCGTGACATGATCGCCAACCTTCCAATGCATAAAA
<210> 4
<211> 1509
<212> DNA
<213> 氨基转移酶下游alaT-R核苷酸片段
<400> 4
GCGGCCGCATCTCCTTTGCATCACATACAACGGTCTATCCAAGGCATACCGCGTCGCAGGATACCGAGCTGGCTGGATGGTATTGACTGGACCAAAGCAATACGCACGTGGATTTATTGAGGGCCTCGAACTCCTCGCAGGCACTCGACTCTGCCCGAATGTCCCAGCTCAGCACGCTATTCAGGTGGCTCTCGGTGGACGCCAGTCCATCTACGACCTCACTGGCGAACACGGCCGACTCTTGGAACAGCGCAACATGGCATGGACGAAACTCAACGAAATCCCAGGTGTCAGCTGTGTGAAACCAATGGGAGCTCTATACGCGTTCCCCAAGCTCGACCCCAACGTGTACGAAATCCACGACGACACCCAACTCATGCTGGATCTTCTCCGTGCCGAGAAAATCCTCATGGTTCAGGGCACTGGCTTCAACTGGCCACATCACGATCACTTCCGAGTGGTCACCCTGCCATGGGCATCCCAGTTGGAAAACGCAATTGAGCGCCTGGGTAACTTCCTGTCCACTTACAAGCAGTAGTAGTTGTTAGGATTCACCACGAATCTCAGGATTTTTGAGATTCGTGGTGAATTTTTGCGTTTTCCAGTCAGGCTCTTGCAACTTTCGGACCGATTTCAGAGGGGCGGAGCTGGTTTGTGGTGGATCCTTGCAATGGAACCGCTTAGGAATACCAAGTTGGAGGCCAGGGTGTTGGGATTGCAAAAATCCGTCCCCAGTTCGTTGTAAAATATCGATCTTGATCGAATATTAGAGCTAATATTGGACTATTATGCAAAAACTCGTTCGATTCAAGGATCTCCTAGCGATCTGAGACGAGAAGTTGGACAGCTAACCTGCAGAAACCTTGCAAGAATCACAACAGCCCCAATGGCCTCAAAAGTCACGCCCTCAGAATCGCTGCCAAGCGTCTAAATCCCCTAAAACGGGACAATAGGTCACTGGGCGATCCCAAGCCCTTAAAACGTGATCCTTAAATACCCACTGTCCTCTATTCTGGGTTAGGCTTCACTGGGTAAAAGTGCCTGCCTATGCCTGAAACTTGAGCATGGCAACAGCAAGGAGACACCGTGGGAAAACATGCAGCTGAAACATCGGAACCGAAGAAAAATTCACCGTGGCGCATTGGTTTGTTGACGTTTTTGATTTCTTCAGTTGTCGTGACGCTGGTGGGCATGGTGATGCTGTGGCCGGATTCTGATGATGTGGTGTTGGCGGATAACTTTTCGCAGACGTTTGCGGGAAATCATGAGCAGGTGGATGGAACGATCACGCTCGTTGATAATTCTGCGTGTAATTCGCCAGACACCGGCCGAGTTTTTGCGGAAAGCCCCACGATTTCTGCGGAGCCGGCAACGTTGGAGTGCGTGCGTGCACTCGTAGACATCACATCGGGTGCCAATGAGGGGCAGAAAACTCAGCTGATCACTTACGCGCAACCTGGTGATCCGGAGTTTTCCGAGGGCGACAAGATCCGCATGGTGGAAACACCG
<210> 5
<211> 116
<212> DNA
<213> 启动子PlacUV5
<400> 5
GTAGAGGATCGAGATCTCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGAATTCCATGGGCAGCAGCCAT
<210> 6
<211> 1017
<212> DNA
<213> 乙酰羟酸还原异构酶ilvC
<400> 6
ATGGCTATTGAACTGCTTTATGATGCTGACGCTGACCTCTCCTTGATCCAGGGCCGTAAGGTTGCCATCGTTGGCTACGGCTCCCAGGGCCACGCACACTCCCAGAACCTCCGCGATTCTGGCGTTGAGGATGTCATTGGTCTGCACGAGGGCTCCAAGTCCGCAGAGAAGGCAAAGGAAGCAGGCTTCGAGGACAAGACCACCGCTGAGGCTGCAGCTTGGGCTGACGTCATCATGCTCCTGGCTCCAGACACCTCCCAGGCAGAAATCTTCACCAACGACATCGAGCCAAACCTGAACGCAGGCGACGCACTGCTGTTCGGCCACGGCCTGAACATTCACTTCGACCTGATCAAGCCAGCTGACGACATCATCGTTGGCATGGTTGCGCCAAAGGGCCCAGGCCACTTGGTTCGCCGTCAGTTCGTTGATGGCAAGGGTGTTCCTTGCCTCATCGCAGTCGACCAGGACCCAACCGGAACCGCACAGGCTCTGACCCTGTCCTACGCAGCAGCAATCGGTGGCGCACGCGCAGGCGTTATCCCAACCACCTTCGAAGCTGAGACCGTCACCGACCTCTTCGGCGAGCAGGCTGTTCTCTGCGGTGGCACCGAGGAACTGGTCAAGGTTGGCTTCGAGGTTCTCACCGAAGCTGGCTACGAGCCAGAGATGGCATACTTCGAGGTTCTTCACGAGCTCAAGCTCATCGTTGACCTCATGTTCGAAGGTGGCATCAGCAACATGAACTACTCTGTTTCTGACACCGCTGAGTTCGGTGGCTACCTCTCCGGCCCACGCGTCATCGATGCAGACACCAAGTCCCGCATGAAAGACATCCTGACCGATATCCAGGACGGCACCTTCACCAAGCGCCTCATCGCAAACGTTGAGAACGGCAACACCGAGCTTGAGGGCCTTCGTGCTTCCTACAACAACCACCCAATCGAGGAGACCGGCGCTAAGCTCCGCGACCTCATGAGCTGGGTCAAGGTTGACGCTCGCGCAGAAACCGCTTAA
<210> 7
<211> 426
<212> DNA
<213> 终止子rrnB
<400> 7
GGCTGTTTTGGCGGATGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCAGAACGCAGAAGCGGTCTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGGCAGTAGCGCGGTGGTCCCACCTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCCTGAGTAGGACAAATCCGCCGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGTTTCTACAAACTCT
Claims (6)
1.一株高产L-异亮氨酸的基因工程菌,命名为C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC,其分类为谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum),该基因工程菌是将谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)H5菌株敲除了编码精氨基琥珀酸合成酶的argG基因及编码N-乙酰鸟氨酸-δ-氨基转移酶的alaT基因,且在alaT基因被敲除的位点插入了编码乙酰羟酸还原异构酶的ilvC基因的操纵子,所述谷氨酸棒杆菌H5菌株保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2016609。
2.如权利要求1所述的高产L-异亮氨酸的基因工程菌的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)出发菌株是筛选得到的突变菌株,命名为Corynebacterium glutamicum H5,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2016609,其分类为谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum),属于革兰氏阳性菌;
(2)利用EcoRI/SalI双酶切质粒pk18mobsacB,回收5.6kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物,扩增argG基因上游1.22kb的核苷酸片段argG-L、及下游1.31kb的核苷酸片段argG-R,通过GIBSON连接上述3个片段,构建重组质粒argG-pk18mobsacB,该质粒即为argG基因的敲除载体,其中,扩增argG-L、argG-R核苷酸片段所用的引物为:
argG-L-FP:5‘-CTATGACATGATTACGAATTCGTGCCACTGGTGAACTCCTTG-3’
argG-L-RP:5‘-TGAAAAGGTGGCTTATGCATGTGTTGAAAGGGTTGGTATT-3’
argG-R-FP:5‘-AACCCTTTCAACACATGCATAAGCCACCTTTTCAAGCATC-3’
argG-R-RP:5‘-AGGTCGACTCTAGAGGATCCTTCTTCATCAGTGAGATCGA-3’
(3)将步骤(2)中的重组质粒转化步骤(1)中所述出发菌株Corynebacteriumglutamicum H5,通过同源重组获得argG基因缺陷的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargG;
(4)继续利用EcoRI/SalI双酶切质粒pk18mobsacB,回收5.6kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物,扩增alaT基因上游1.42kb的核苷酸片段alaT-L、及下游1.51kb的核苷酸片段alaT-R,通过GIBSON连接上述3个片段,构建重组质粒alaT-pk18mobsacB,该质粒即alaT基因的敲除载体,其中,扩增alaT-L、alaT-R核苷酸片段的引物为:
alaT-L-FP:5‘-ATGACATGATTACGAATTCGCCACTTTGGACTAATCAATAT-3’
alaT-L-RP:5‘-ATGCGGCCGCTTTTATGCATTGGAAGGTTGGCGATCATG-3’
alaT-R-FP:5‘-CAATGCATAAAAGCGGCCGCATCTCCTTTGCATCACATAC-3’
alaT-R-RP:5‘-TTGCATGCCTGCAGGTCGACCGGTGTTTCCACCATGCGG-3’
(5)将步骤(4)中的重组质粒转化步骤(3)中所述的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargG,通过同源重组获得alaT基因缺陷的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT;
(6)利用NsiI/NotI双酶切重组质粒alaT-pk18mobsacB,回收8.7kb核苷酸片段;以Corynebacterium glutamicum H5基因组为模板,设计引物扩增ilvC基因片段;以大肠杆菌表达载体PVB220为模板,设计引物扩增PlacUV5启动子片段;以大肠-谷氨酸棒杆菌穿梭载体PXMJ19为模板,设计引物扩增终止子rrnB片段;通过GIBSON连接上述4个片段,构建重组质粒ilvC-alaT-pk18mobsacB,该质粒即为ilvC操纵子的插入载体。其中,ilvC操纵子包括PlacUV5启动子、ilvC基因及rrnB终止子3个片段,扩增3个片段所用的引物为:
placUV5 FP:5‘-TCGCCAACCTTCCAATGCATGTAGAGGATCGAGATCTCCA-3’
placUV5 RP:5‘-TAAAGCAGTTCAATAGCCATATGGCTGCTGCCCATGGAAT-3’
ilvC FP:5‘-ATTCCATGGGCAGCAGCCATATGGCTATTGAACTGCTTTA-3’
ilvC RP:5‘-tctcatccgccaaaacagccTTAAGCGGTTTCTGCGCGAG-3’
rrnB FP:5‘-CTCGCGCAGAAACCGCTTAAggctgttttggcggatgaga-3’
rrnB RP:5‘-TGCAAAGGAGATGCGGCCGCagagtttgtagaaacgcaaa-3’
(7)将步骤(6)中的插入载体转化步骤(5)中所述的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT,通过同源重组获得在alaT基因被敲除的位点插入了ilvC操纵子的基因工程菌C.glutamicum H5ΔargGΔalaT::ilvC。
3.权利要求1所述的基因工程菌在发酵生产L-异亮氨酸中的应用,其特征在于:将菌种活化培养后转接种子培养基培养,种液转接至发酵罐直接发酵。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于:所述活化培养的培养基配方为:玉米浆5%、胰蛋白胨1%、氯化钠0.5%、硫酸铵0.4%、葡萄糖0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、丙氨酸0.004%、琼脂粉2%,余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
5.如权利要求3所述的应用,其特征在于:所述种子培养基配方为:葡萄糖3%、硫酸铵2.5%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、碳酸钙4%、丙氨酸0.004%、余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
6.如权利要求3所述的应用,其特征在于:所述发酵培养基配方为:葡萄糖16%、硫酸铵0.8%、玉米浆3.5%、酵母膏0.3%、丝肽粉0.3%、磷酸氢二钾0.1%、硫酸镁0.05%、维生素B1 0.00003%、生物素0.00002%、硫酸铁0.00001%、丙氨酸0.004%,余量为去离子水,pH为7,均为重量百分比。
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
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PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
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