CN105331610B - 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 - Google Patents
一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 Download PDFInfo
- Publication number
- CN105331610B CN105331610B CN201510696068.2A CN201510696068A CN105331610B CN 105331610 B CN105331610 B CN 105331610B CN 201510696068 A CN201510696068 A CN 201510696068A CN 105331610 B CN105331610 B CN 105331610B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- seq
- primer
- probe
- concentration
- sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 239000000523 sample Substances 0.000 title claims abstract description 62
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims abstract description 43
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 title claims abstract description 23
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 claims abstract description 29
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims abstract description 26
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 claims abstract description 24
- 241000607598 Vibrio Species 0.000 claims abstract description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 19
- 241001333951 Escherichia coli O157 Species 0.000 claims description 22
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 17
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 13
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 12
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 10
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 claims description 6
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 claims description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 6
- 206010020718 hyperplasia Diseases 0.000 claims description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 4
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 claims description 4
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 claims description 4
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 claims description 4
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 claims description 4
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 claims description 4
- 241000186781 Listeria Species 0.000 claims description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 3
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 claims description 3
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 abstract description 13
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 abstract description 13
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 7
- 238000007689 inspection Methods 0.000 abstract description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 abstract description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 29
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 11
- 238000000034 method Methods 0.000 description 11
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 11
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 10
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 241000607272 Vibrio parahaemolyticus Species 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 5
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 4
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 4
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000037065 Subacute sclerosing leukoencephalitis Diseases 0.000 description 3
- 206010042297 Subacute sclerosing panencephalitis Diseases 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 3
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- 230000031700 light absorption Effects 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 239000006210 lotion Substances 0.000 description 3
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 description 3
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 3
- NJPPVKZQTLUDBO-UHFFFAOYSA-N novaluron Chemical compound C1=C(Cl)C(OC(F)(F)C(OC(F)(F)F)F)=CC=C1NC(=O)NC(=O)C1=C(F)C=CC=C1F NJPPVKZQTLUDBO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- FFRBMBIXVSCUFS-UHFFFAOYSA-N 2,4-dinitro-1-naphthol Chemical compound C1=CC=C2C(O)=C([N+]([O-])=O)C=C([N+]([O-])=O)C2=C1 FFRBMBIXVSCUFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 2
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 238000003491 array Methods 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000003795 desorption Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 235000012055 fruits and vegetables Nutrition 0.000 description 2
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- YLWAQARRNQVEHD-PBZHRCKQSA-N tazettine Chemical compound O([C@]1(O)CN2C)CC3=CC=4OCOC=4C=C3[C@]31[C@@H]2C[C@H](OC)C=C3 YLWAQARRNQVEHD-PBZHRCKQSA-N 0.000 description 2
- 241001478240 Coccus Species 0.000 description 1
- 206010011409 Cross infection Diseases 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000305071 Enterobacterales Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 101100412102 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) rec2 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000006142 Luria-Bertani Agar Substances 0.000 description 1
- 206010029803 Nosocomial infection Diseases 0.000 description 1
- 108020003540 O-antigen polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- XEEPVFFWNATEGX-IUHNQTRMSA-N Tazettadiol Natural products C1=C(CO)C([C@]23[C@H](O)CN(C)[C@H]2C[C@@H](C=C3)OC)=CC2=C1OCO2 XEEPVFFWNATEGX-IUHNQTRMSA-N 0.000 description 1
- 206010047400 Vibrio infections Diseases 0.000 description 1
- 235000009754 Vitis X bourquina Nutrition 0.000 description 1
- 235000012333 Vitis X labruscana Nutrition 0.000 description 1
- 240000006365 Vitis vinifera Species 0.000 description 1
- 235000014787 Vitis vinifera Nutrition 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000011010 flushing procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004907 flux Effects 0.000 description 1
- 235000021393 food security Nutrition 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000000703 high-speed centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000005374 membrane filtration Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011169 microbiological contamination Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 239000002574 poison Substances 0.000 description 1
- 231100000614 poison Toxicity 0.000 description 1
- KLJOYDMUWKSYBP-SLEMLFNQSA-N pretazettine Natural products CO[C@H]1C[C@@H]2N(C)C[C@@H]3O[C@@H](O)c4cc5OCOc5cc4[C@]23C=C1 KLJOYDMUWKSYBP-SLEMLFNQSA-N 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- YLWAQARRNQVEHD-UHFFFAOYSA-N sekisanoline Natural products CN1CC2(O)OCC3=CC=4OCOC=4C=C3C32C1CC(OC)C=C3 YLWAQARRNQVEHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012772 sequence design Methods 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种检测鲜活农产品中致病菌的五重PCR引物及探针和试剂盒,包括5对引物对,5对引物对分别为:沙门氏菌正向引物,沙门氏菌反向引物;金黄色葡萄球菌正向引物,金黄色葡萄球菌反向引物;大肠杆菌O‑157正向引物,大肠杆菌O‑157反向引物;副溶血弧菌正向引物,副溶血弧菌反向引物;单核细胞增生李斯特菌正向引物,单核细胞增生李斯特菌反向引物。序列信息见SEQ ID No.1‑10所示。本发明可同时检测5种致病菌,引物之间的干扰小,非特异性扩增反应少,保证了检测的灵敏度与特异性,既提高检测速度降又降低了检验成本。
Description
技术领域
本发明涉及致病菌检测技术领域,特别涉及一种检测鲜活农产品中致病菌的五重PCR引物及探针和试剂盒。
背景技术
鲜活农产品是我国消费者除粮食外最主要的食物营养来源,在日常生活中占据着举足轻重的位置。鲜活农产品在原料,加工,储藏,运输过程中容易受到多种病原微生物(主要是细菌和真菌)的侵染。因微生物侵染产生的病害发生后的交叉感染会造成果蔬的大量损失,失去商品价值,极大地限制了果蔬产业的发展。同时被各种病原微生物污染的鲜活农产品一旦被消费者购买、食用会造成食物中毒,疾病传播等严重后果,危害食品安全,给消费者的身体健康和生命安全带来巨大威胁。
基因芯片检测微生物的基本原理是在芯片表面合成待检验微生物的特异性核酸探针,微生物样品DNA经荧光标记PCR扩增,然后再与芯片上寡核苷酸点杂交,最后通过扫描仪分析荧光分布模式来确定检测样品是否存在某些特定微生物。与传统的检测方法(细菌培养、生化鉴定、血清分型等)相比,基因芯片技术的先进性主要体现在:①基因芯片可以实现微生物的高通量和并行检测,一次实验即可得出全部结果;②操作简便快速,整个检测只需24h基本可以出结果(而传统方法一般需4~7d);③特异性强,敏感性高。
多重PCR(multiplex PCR)是在普通PCR的基础上加以改进,于一个PCR反应体系中加入多对特异性引物,针对多个DNA模板或同一模板的不同区域扩增多个目的片段的PCR技术。采用这一技术可同时扩增多种病原微生物特异核酸序列,可大大提高病原微生物的检测效率。目前同时对食品或食源性疾病多种病原菌进行分子诊断时常常采用多重PCR方法,因为该方法可同时检测3~4种病原菌,既提高检测速度降又降低了检验成本,由此得到广泛应用。但传统的多重PCR体系中,由于存在多对引物,引物之间的干扰以及引物与模板的错配而造成灵敏度下降与非特异性扩增反应增加等问题,制约多重PCR技术的发展。
发明内容
本发明的目的在于提供一种检测鲜活农产品中致病菌的五重PCR引物,可同时检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、大肠杆菌O-157和单核细胞增生李斯特菌等5种致病菌,引物之间的干扰小,非特异性扩增反应少,保证了检测的灵敏度与特异性,既提高检测速度降又降低了检验成本。
本发明还提供了检测上述五重PCR引物扩增产物的探针。
同时本发明还提供了检测鲜活农产品中致病菌的试剂盒。
本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种检测鲜活农产品中致病菌的五重PCR引物,包括5对引物对,5对引物对分别为:沙门氏菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.1所示,沙门氏菌反向引物序列信息见SEQID No.2所示;
金黄色葡萄球菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.3所示,金黄色葡萄球菌反向引物序列信息见SEQ ID No.4所示;
大肠杆菌O-157正向引物,序列信息见SEQ ID No.5所示,大肠杆菌O-157反向引物序列信息见SEQ ID No.6所示;
副溶血弧菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.7所示,副溶血弧菌反向引物序列信息见SEQ ID No.8所示;
单核细胞增生李斯特菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.9所示,单核细胞增生李斯特菌反向引物序列信息见SEQ ID No.10所示。
本发明针对沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、大肠杆菌O-157和单核细胞增生李斯特菌,筛选出各个菌种种间特异性强同时种内保守性强的基因区段设计引物。引物特异性强,本发明特定设计的5对引物对,引物之间的干扰小,非特异性扩增反应少,保证了检测的灵敏度与特异性,既提高检测速度降又降低了检验成本。
一种用于检测五重PCR引物扩增的PCR产物的探针,包括5组探针,5组探针分别为:
检测沙门氏菌的探针20个,序列见SEQ ID No.132~151所示;
检测金黄色葡萄球菌的探针24个,序列见SEQ ID No.108~131所示;
检测大肠杆菌O-157的探针25个,序列见SEQ ID No.11~35所示;
检测副溶血弧菌的探针46个,序列见SEQ ID No.62~107所示;
检测单核细胞增生李斯特菌的探针26个,序列见SEQ ID No.36~61所示。
为了精确检测细菌加强检测效率,本发明针对五重PCR引物扩增的PCR产物设计了特定的DNA探针,探针固定在基因芯片上,便于大通量、快速检测,检测精度高。一种检测鲜活农产品中致病菌的检测试剂盒,包括五重PCR反应体系和具有针对5种致病菌设计的DNA探针的原位合成芯片,所述五重PCR反应体系以总体积50μL计,其组成如下:
10×Ex Taq buffer 10μL,
浓度为2.5mmol/L的dATP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dTTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dGTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dCTP 0.75μL,
浓度为1nmol/μL的cy3-dCTP 2.0μL,
引物混合物 5.0μL,
DNA模板 20ng或10ng,
浓度为5U/μL的Ex Taq酶 0.5μL,
ddH2O 补足至50μL。
本发明在反应体系中掺入一定比例的cy3-dCTP是为了在PCR产物中渗入荧光素,在后续的杂交反应中,如果带有荧光素的PCR产物与芯片上的探针成功杂交,则在杂交清洗完毕后,以扫描仪对芯片进行扫描时(扫描波长根据染料进行选择,比如cy3采用532nm)成功杂交的探针位置会发荧光,从而可以得知样品中是否存在探针对应的细菌。
本发明的试剂盒结合多重PCR技术和基因芯片技术,可同时检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、大肠杆菌O-157和单核细胞增生李斯特菌等5种致病菌,该方法具有准确性高,灵敏度高,特异性强,高效快速等优点。
作为优选,所述引物混合物的由以下引物混合而成:
浓度为20mmol/L的沙门氏菌正向引物19μL,浓度为20mmol/L的沙门氏菌反向引物19μL;
浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌反向引物20μL;
浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157正向引物7.3μL,浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157反向引物7.3μL;
浓度为20mmol/L的副溶血弧菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的副溶血弧菌反向引物20μL;
浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌反向引物20μL。
作为优选,针对5种致病菌设计的DNA探针如下:
检测沙门氏菌的探针20个,序列见SEQ ID No.132~151所示;
检测金黄色葡萄球菌的探针24个,序列见SEQ ID No.108~131所示;
检测大肠杆菌O-157的探针25个,序列见SEQ ID No.11~35所示;
检测副溶血弧菌的探针46个,序列见SEQ ID No.62~107所示;
检测单核细胞增生李斯特菌的探针26个,序列见SEQ ID No.36~61所示。
本发明的有益效果是:五重PCR引物,可同时检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、大肠杆菌O-157和单核细胞增生李斯特菌等5种致病菌,引物之间的干扰小,非特异性扩增反应少,保证了检测的灵敏度与特异性,既提高检测速度降又降低了检验成本。
附图说明
图1是荧光多重PCR验证结果图;图中:1、五种菌混合,2、副溶血弧菌(理论扩增长度440bp)3、沙门氏菌(理论扩增长度932bp),4、金黄色葡萄球菌(理论扩增长度547bp),5、单核细胞增生李斯特菌(理论扩增长度958bp),6、大肠杆菌O-157(理论扩增长度350bp),L、Marker。
图2是沙门氏菌荧光多重PCR产物杂交结果图。
图3是金黄色葡萄球菌荧光多重PCR产物杂交结果图。
图4是大肠杆菌O-157荧光多重PCR产物杂交结果图。
图5是副溶血弧菌荧光多重PCR产物杂交结果图。
图6是单核细胞增生李斯特菌荧光多重PCR产物杂交结果图。
具体实施方式
下面通过具体实施例,并结合附图,对本发明的技术方案作进一步的具体说明。
本发明中,若非特指,所采用的原料和设备等均可从市场购得或是本领域常用的。下述实施例中的方法,如无特别说明,均为本领域的常规方法。
仪器和试剂
仪器
梯度PCR仪器(MG96G杭州朗基),电泳仪(EPS-100 1上海天能),凝胶成像系统(TAN-2500天能),微量分光光度计(ASP-3700 ATCGene),扫描仪(GenePix 4000BMolecular Devices)。
试剂(市售)
Ex Taq(TaKaRa RR001A)
Deoxynucleotide(dNTP)Solution Set(NEB N0446S)
CY3-DCTP(GE Healthcare PA53021)
LCS_beads(LC Sciences)
20×SSPE(Ambion AM9767)
SDS(Sigma L-5750)
100×BSA(NEB B9001S)
EDTA(Shanghai Zeheng CSJ6088-500G Amresco分装)
Nuclease-free water(Qiagen 129117)
Formamide(HCONH2)(Amresco 4660C97)
Hybridization buffer(杂交液HB):6×SSPE,25%Formamide(N-甲酰脱乙酰秋水仙碱),PH 6.6 to 6.8
Wash buffer(洗液WB):500μL HB,500μL H2O,20μL 10%SDS,注意,Wash buffer要现配现用。
100×heat-treated BSA:100×BSA(10mg/ml)60℃孵育30min降至室温。以0.2μm滤膜过滤后存储于-20℃备用。
Blocking buffer(封闭液BSA):153μL HB,2μL of 100×heat-treated BSA*
Stripping buffer(解吸缓冲液SP)0.3mM EDTA,50%Formamide(N-甲酰脱乙酰秋水仙碱)pH=6.63。
实施例:
1、引物设计
从NCBI数据库下载了5种病原菌132株系基因组,在每个菌种中选出1个株系基因组序列,将选出的基因组序列用BLAT软件进行两两比对,找出任意两个基因组之间的相似序列,对每一个菌种基因组,根据得到的各个有相似性比对结果的序列区间,做一个互补取反操作,得到特异于该菌种的序列区间。这一步的目的是初步筛选,缩小筛选范围。将这些筛选出来的区段在NCBI数据库上进行手工blast比对,筛选出种特异的基因区段。筛选得到的种特异基因区段再进行种内的alignment,最终找到在待检病原菌的基因序列中种内同源性>95%,种间同源性<75%的基因序列区段(各个菌种种间特异性强同时种内保守性强的基因区段)。作为引物探针设计的基础。
各菌种筛选出的备用序列所在基因见表1:
表1
菌种 | 筛选出的备用序列所在基因 |
沙门氏菌(Salmonella) | hila |
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) | SasH |
大肠杆菌O-157(O:157Escherichia coli) | O antigen polymerase |
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) | DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2 |
单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes) | hly |
根据筛选出的序列设计多重PCR引物,引物合成委托生物公司完成,引物序列见表2:
表2
2、病原菌定量菌液的制备
将上述病原菌的标准菌株培养至对数期,通过LB琼脂平板计数测得每mL菌落数,将菌样分别用生理盐水进行10倍连续稀释至10-8CFU/mL。
3、病原菌基因组DNA提取:
取2步定量细菌悬液1mL放入1.5mL eppendof管,15000rpm高速离心5min,倒去上清,以细菌基因组DNA提取试剂盒(天根生化科技DP302)进行DNA提取,得到的DNA溶液,定量后作为DNA模板使用。
4、荧光多重PCR
10×Ex Taq buffer 10μL,
dATP(2.5mmol/L) 1.0μL,
dTTP(2.5mmol/L) 1.0μL,
dGTP(2.5mmol/L) 1.0μL,
dCTP(2.5mmol/L) 0.75μL,
cy3-dCTP(1nmol/μL) 2.0μL,
引物混合物 5.0μL,
DNA模板 20ng或10ng,
Ex Taq酶(5U/μL) 0.5μL,
ddH2O 补足至50μL。
引物混合物的配制:各个引物稀释至20mM,按照表3配制引物混合物:
表3
PCR扩增程序
在反应体系中掺入一定比例的cy3-dCTP是为了在PCR产物中渗入荧光素,在后续的杂交反应中,如果带有荧光素的PCR产物与芯片上的探针成功杂交,则在杂交清洗完毕后,以扫描仪对芯片进行扫描时(扫描波长根据染料进行选择,比如cy3采用532nm,)成功杂交的探针位置会发荧光,从而可以得知样品中是否存在探针对应的细菌。
荧光多重PCR验证结果见图1,结果可见,多重扩增效果良好,混合模板扩增中沙门氏菌和单核细胞增生李斯特菌扩增产物长度相差过小,无法用电泳进行分辨,但可在下一步芯片杂交中进行确认。
5、芯片探针设计
针对各个菌种的多重PCR产物序列进行探针设计,芯片探针序列见表4:
表4
芯片探针排布:五种病原菌检测探针单次重复构成一个16×10的亚阵列,16×10的亚阵列共九个,这九个亚阵列以3行空白为间隔,构成一个大阵列。与大阵列间隔3行空白另有一个五种病原菌检测探针单次重复构成的一个6×30的亚阵列。
6、多重PCR产物纯化和荧光渗入密度计算
荧光掺入多重PCR产物以LCS_beads磁珠进行纯化,去除多余的引物和杂质后,以ASP-3700微量分光光度计进行测量260nm和550nm吸光值以确定荧光渗入密度。荧光渗入密度的计算:
荧光掺入密度(FOI)=(A/E)×10×106×【324.5/(吸光值260nm×50)】
FOI在20-50最适宜杂交。A=cy3在550nm的吸光值。E=消光系数:cy3=150000。
产物荧光掺入情况:
荧光多重PCR产物 | A260 | A550 | FOI |
单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes) | 0.012 | 0.241 | 21.54356846 |
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) | 0.02 | 0.255 | 33.93464052 |
大肠杆菌O‐157(O:157Escherichia coli) | 0.02 | 0.333 | 25.98598599 |
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) | 0.015 | 0.215 | 30.18604651 |
沙门氏菌(Salmonella) | 0.009 | 0.182 | 21.3956044 |
各个样品均达到杂交标准。
7、芯片杂交和扫描
7.1芯片杂交流程
A清洗系统
连接通路,换上废旧芯片,用以下溶液进行清洗系统:
(1)1ml于95℃预热的1%SDS,在最高速下循环清洗20min;
(2)排除1%SDS于废液管后,用3ml Nuclease-free water(无核酸酶水)进行清洗;
(3)1ml于95℃预热的Nuclease-free water,在最高速下循环清洗5-6min;
(4)排除Nuclease-free water于废液管后,用3ml Nuclease-free water进行清洗。
B芯片清洗
(1)更换新的芯片,用1ml Stripping buffer(解吸缓冲液SP)于结合速度下循环清洗20min(注意转换进液方向以排除芯片中气泡);
Stripping buffer成分:0.3mM EDTA,50%Formamide.PH 6.6 to 6.8,该缓冲液可以清洗掉已经杂交在探针上的核酸序列。
(2)扫描仪对清洗后的芯片进行扫描。
备注:以上系统清洗和芯片清洗过程中芯片台座温度均为40℃。
这一步骤是为了将芯片上可能存在的杂质以及可能杂交上的核酸序列清洗掉,得到比较干净均一的背景,准备杂交。
C样本杂交
(1)1ml Hybridization buffer(杂交液HB)于结合速度(500μl/min)下循环清洗10min;Hybridization buffer(杂交液HB)成分:6×SSPE,25%Formamide,PH 6.6 to 6.8,Hybridization buffer(杂交液HB)为杂交反应提供一个适宜的PH环境和盐离子浓度,其中的Formamide可以降低DNA双链的Tm值,使样品在30℃时进行杂交反应。
(2)1ml Blocking buffer(封闭液BSA)于结合速度下循环清洗5-6min;
Blocking buffer(封闭液BSA):148μL HB,2μL of 100×heat-treated BSA,该缓冲液中的BSA可以封闭芯片上无探针部分,以降低芯片背景信号。
(3)杂交样品制备:200ng纯化后的多重PCR产物+等体积Hybridization buffer(杂交液HB,最终体积50ul),95℃变性5min后迅速置于冰上3min,将制备的样本加入到Blocking buffer中,混匀后于于结合速度下循环运行16hrs进行杂交。
设定杂交时间为16h是为了使杂交反应时间足够长,达到反应平衡,实际操作中可以适当调整。
备注:样本杂交过程芯片台座温度为40℃。
D杂交后清洗
(1)1ml Hybridization buffer(杂交液HB)于清洗速度(100μl/min)下循环清洗20min(芯片台座温度32℃);
(2)1ml Wash buffer(洗液WB)于清洗速度下,在40℃下循环清洗20min。Washbuffer(洗液WB):500μL HB,500μL Nuclease-free water,20μL 10%SDS,注意,Washbuffer要现配现用。
E芯片扫描
根据GenePix 4000B的说明设定相关的光电倍增管(PMT=300-400)、聚焦距离(focal position=100-150)和扫描波长(532nM)等对芯片进行扫描。
7.2各个菌种荧光多重PCR产物杂交实验
将各个菌种荧光多重PCR产物纯化测定FOI值后,与芯片进行杂交反应。
各个菌种荧光多重PCR产物杂交结果见下图2-6。
8、方法现场验证
随机选择50份日常检测样本,以出入境行业标准检测方法(SN/T)和本发明的检测方法对上述5种病原菌作平行检测,并以SN/T检测方法的检测结果为标准来验证基因芯片检测的特异性与灵敏度。行业标准检测方法编号为:大肠杆菌O157(SN/T 1059.5-2006),沙门氏菌(SN/T T0170-2010),金黄色葡萄球菌(SN/T 0172-2010),单核细胞增生李斯特菌(GB/T 4789.30-2010)。
结果,随机选择50份日常检测样本,以出入境行业标准检测方法(SN/T)和本发明的检测方法对上述5种病原菌平行检测结果一致,未见假阳性与假阴性结果。
一种检测鲜活农产品中致病菌的检测试剂盒,包括五重PCR反应体系和具有针对5种致病菌设计的DNA探针的原位合成芯片,所述五重PCR反应体系以总体积50μL计,其组成如下:
10×Ex Taq buffer 10μL,
浓度为2.5mmol/L的dATP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dTTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dGTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dCTP 0.75μL,
浓度为1nmol/μL的cy3-dCTP 2.0μL,
引物混合物 5.0μL,
DNA模板 20ng或10ng,
浓度为5U/μL的Ex Taq酶 0.5μL,
ddH2O 补足至50μL。
所述引物混合物的由以下引物混合而成:
浓度为20mmol/L的沙门氏菌正向引物19μL,浓度为20mmol/L的沙门氏菌反向引物19μL;浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌反向引物20μL;浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157正向引物7.3μL,浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157反向引物7.3μL;浓度为20mmol/L的副溶血弧菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的副溶血弧菌反向引物20μL;浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌反向引物20μL。针对5种致病菌设计的DNA探针如下:
检测沙门氏菌的探针20个,序列见SEQ ID No.132~151所示;
检测金黄色葡萄球菌的探针24个,序列见SEQ ID No.108~131所示;
检测大肠杆菌O-157的探针25个,序列见SEQ ID No.11~35所示;
检测副溶血弧菌的探针46个,序列见SEQ ID No.62~107所示;
检测单核细胞增生李斯特菌的探针26个,序列见SEQ ID No.36~61所示。
以上所述的实施例只是本发明的一种较佳的方案,并非对本发明作任何形式上的限制,在不超出权利要求所记载的技术方案的前提下还有其它的变体及改型。
Claims (5)
1.一种检测鲜活农产品中致病菌的五重PCR引物,包括5对引物对,其特征在于,5对引物对分别为:
沙门氏菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.1所示,沙门氏菌反向引物序列信息见SEQID No.2所示;
金黄色葡萄球菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.3所示,金黄色葡萄球菌反向引物序列信息见SEQ ID No.4所示;
大肠杆菌O-157正向引物,序列信息见SEQ ID No.5所示,大肠杆菌O-157反向引物序列信息见SEQ ID No.6所示;
副溶血弧菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.7所示,副溶血弧菌反向引物序列信息见SEQ ID No.8所示;
单核细胞增生李斯特菌正向引物,序列信息见SEQ ID No.9所示,单核细胞增生李斯特菌反向引物序列信息见SEQ ID No.10所示。
2.一种用于检测权利要求1所述五重PCR引物扩增的PCR产物的探针,包括5组探针,其特征在于,5组探针分别为:
检测沙门氏菌的探针20个,序列见SEQ ID No.132~151所示;
检测金黄色葡萄球菌的探针24个,序列见SEQ ID No.108~131所示;
检测大肠杆菌O-157的探针25个,序列见SEQ ID No.11~35所示;
检测副溶血弧菌的探针46个,序列见SEQ ID No.62~107所示;
检测单核细胞增生李斯特菌的探针26个,序列见SEQ ID No.36~61所示。
3.一种采用权利要求1所述五重PCR引物制备的检测鲜活农产品中致病菌的检测试剂盒,包括五重PCR反应体系和具有针对5种致病菌设计的DNA探针的原位合成芯片,其特征在于:所述五重PCR反应体系以总体积50μL计,其组成如下:
10×Ex Taq buffer 10μL,
浓度为2.5mmol/L的dATP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dTTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dGTP 1.0μL,
浓度为2.5mmol/L的dCTP 0.75μL,
浓度为1nmol/μL的cy3-dCTP 2.0μL,
引物混合物5.0μL,
DNA模板20ng或10ng,
浓度为5U/μL的Ex Taq酶0.5μL,
ddH2O补足至50μL。
4.根据权利要求3所述的检测试剂盒,其特征在于:所述引物混合物由以下引物混合而成:
浓度为20mmol/L的沙门氏菌正向引物19μL,浓度为20mmol/L的沙门氏菌反向引物19μL;
浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的金黄色葡萄球菌反向引物20μL;
浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157正向引物7.3μL,浓度为20mmol/L的大肠杆菌O-157反向引物7.3μL;
浓度为20mmol/L的副溶血弧菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的副溶血弧菌反向引物20μL;
浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌正向引物20μL,浓度为20mmol/L的单核细胞增生李斯特菌反向引物20μL。
5.根据权利要求3所述的检测试剂盒,其特征在于:针对5种致病菌设计的DNA探针如下:
检测沙门氏菌的探针20个,序列见SEQ ID No.132~151所示;
检测金黄色葡萄球菌的探针24个,序列见SEQ ID No.108~131所示;
检测大肠杆菌O-157的探针25个,序列见SEQ ID No.11~35所示;
检测副溶血弧菌的探针46个,序列见SEQ ID No.62~107所示;
检测单核细胞增生李斯特菌的探针26个,序列见SEQ ID No.36~61所示。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201510696068.2A CN105331610B (zh) | 2015-10-22 | 2015-10-22 | 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201510696068.2A CN105331610B (zh) | 2015-10-22 | 2015-10-22 | 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN105331610A CN105331610A (zh) | 2016-02-17 |
CN105331610B true CN105331610B (zh) | 2018-09-18 |
Family
ID=55282376
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201510696068.2A Active CN105331610B (zh) | 2015-10-22 | 2015-10-22 | 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN105331610B (zh) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN112626244B (zh) * | 2020-12-30 | 2022-03-29 | 山东省眼科研究所 | 眼科临床微生物快速检测用探针、芯片、引物、试剂盒和应用 |
CN114381536B (zh) * | 2022-01-21 | 2024-05-17 | 江西省检验检测认证总院食品检验检测研究院 | 五种食源性致病菌的多重pcr检测引物组、试剂盒和方法 |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR100671501B1 (ko) * | 2005-02-28 | 2007-01-19 | 삼성에버랜드 주식회사 | 식중독 검출용 프라이머 및 이를 이용한 세균성 식중독 검출방법 |
KR100994820B1 (ko) * | 2007-09-13 | 2010-11-16 | 주식회사 코젠바이오텍 | 식중독 병원체의 검출 방법 및 신속한 검출 키트 |
CN101570783B (zh) * | 2009-03-20 | 2012-01-11 | 曹际娟 | 水产品中9种致病性微生物检测试剂盒及检测方法 |
EP2559761A4 (en) * | 2010-04-14 | 2013-10-02 | Toyo Seikan Kaisha Ltd | PCR PRIMER ASSEMBLY, PCR REACTION FLUID, AND METHOD OF DETECTING BACTERIA CAUSING FOOD INTOXICATION |
JP5851395B2 (ja) * | 2010-05-12 | 2016-02-03 | 東洋製罐グループホールディングス株式会社 | 食中毒菌検出用担体、及び食中毒菌の検出方法 |
CN102286612B (zh) * | 2010-06-18 | 2014-10-22 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 一种致病微生物快速检测试剂盒 |
CN102181545B (zh) * | 2011-04-11 | 2014-06-18 | 深圳国际旅行卫生保健中心 | 食源性致病菌检测试剂盒及检测方法 |
CN103131760A (zh) * | 2011-12-05 | 2013-06-05 | 中国人民解放军军事医学科学院卫生学环境医学研究所 | 一种可以同时检测六种治病微生物的悬浮芯片检测方法 |
CN103484546B (zh) * | 2013-09-17 | 2015-07-01 | 北京卓诚惠生生物科技有限公司 | 十四种食源性致病菌多重pcr检测引物组和试剂盒 |
-
2015
- 2015-10-22 CN CN201510696068.2A patent/CN105331610B/zh active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN105331610A (zh) | 2016-02-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Maukonen et al. | Methodologies for the characterization of microbes in industrial environments: a review | |
Dorigo et al. | Molecular approaches to the assessment of biodiversity in aquatic microbial communities | |
JP4481491B2 (ja) | 核酸の検出方法 | |
Baums et al. | Luminex detection of fecal indicators in river samples, marine recreational water, and beach sand | |
CA2698476A1 (en) | Method for detecting bacteria and fungi | |
CN103820558B (zh) | 一种用于检测海产品中九种致病性弧菌的基因芯片 | |
CN103898108A (zh) | 对河流弧菌o2,o4,o13,o15和o18特异的核苷酸及其应用 | |
JP2017163970A (ja) | 黄色ブドウ球菌を検出するためのオリゴヌクレオチド | |
EP2871243B1 (en) | Nucleic acids and methods for detecting pathogens and beneficial microorganisms | |
Osek et al. | Listeria monocytogenes in foods—From culture identification to whole‐genome characteristics | |
CN105331688B (zh) | 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr检测方法及其检测试剂盒 | |
CN105331610B (zh) | 一种检测鲜活农产品中致病菌的五重pcr引物及探针和试剂盒 | |
CN102676664A (zh) | 同时检测多种水产品致病菌的荧光定量pcr引物和探针及检测方法 | |
Abd-El-Haleem et al. | Multiplex-PCR and PCR-RFLP assays to monitor water quality against pathogenic bacteria | |
CN103160587B (zh) | 10种常见致病军团菌的基因分型芯片及检测用试剂盒 | |
Tamerat et al. | Application of molecular diagnostic techniques for the detection of E. coli O157: H7: a review | |
Böhme et al. | Detection of food spoilage and pathogenic bacteria based on ligation detection reaction coupled to flow‐through hybridization on membranes | |
CN104450930A (zh) | 一种副溶血性弧菌的分子检测方法及其应用 | |
Galluzzi et al. | Current molecular techniques for the detection of microbial pathogens | |
KR101299627B1 (ko) | 식중독 세균 동시 검출용 프라이머 및 이의 용도 | |
Lübeck et al. | PCR technology and applications to zoonotic food-borne bacterial pathogens | |
Thongphueak et al. | Development of the rapid test kit for the identification of Campylobacter spp. Based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) in combination with a lateral flow dipstick (LFD) and gold nano-DNA probe (AuNPs) | |
Van Der Wolf et al. | Bacterial pathogens: detection and identification methods | |
CN101613762A (zh) | 水产品中致病细菌检测基因芯片试剂盒 | |
US12123062B2 (en) | Methods and compositions for determining Salmonella presence and concentration using PCR primers of varying amplification efficiencies |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
CP01 | Change in the name or title of a patent holder | ||
CP01 | Change in the name or title of a patent holder |
Address after: 116600, No. 18 West Liaohe Road, Dalian economic and Technological Development Zone, Liaoning, Dalian Patentee after: DALIAN MINZU University Patentee after: HANGZHOU LIANCHUAN BIOTECHNOLOGY Co.,Ltd. Address before: 116600, No. 18 West Liaohe Road, Dalian economic and Technological Development Zone, Liaoning, Dalian Patentee before: DALIAN MINZU University Patentee before: HANGZHOU LC BIOTECH Co.,Ltd. |