一种融合蛋白及其载体的构建方法和应用
技术领域
本发明公开了一种融合蛋白,具体地说,是一种用于验证TALEN质粒对的转染效率以及在细胞中的活性及其验证其它质粒的转染效率的融合蛋白,本发明还公开了该融合蛋白的构建方法和应用。
背景技术
小鼠鸟氨酸脱羧酶(MODC)的中部和C-末端的氨基酸包含两个PEST序列的降解域,这两个降解域促进该蛋白的降解,使蛋白的半衰期很短,该特点在基因功能研究上有很大的应用。
类转录激活因子效应物核酸酶(transcript ion act ivator-like effectornuclease,TALEN)技术是一种崭新的分子生物学工具。TALEN技术目前已经广泛应用于基因修饰。
尤其是动物模型和细胞模型的建立。但是,在制作细胞模型,或者敲除细胞某一个基因的时候。都需要把TALEN质粒对通过Lipo2000或者病毒的形式转到细胞中去,但是由于缺乏一个对照,TALEN的转染效率和切割活性存在一个未知数。
发明内容
针对上述问题,本发明的目的在于建立一种使TALEN技术作为细胞株更加科学有效的融合蛋白及其载体的构建方法。
为此,本发明提供的前一个技术方案是这样的:该融合蛋白结构为EGFP-_mODC_NLS。
本发明提供的另一个技术方案是这样的:该融合蛋白的表达载体包含一个EGFP-_mODC_NLS融合蛋白及其一对切割NLS的TALEN质粒对。
进一步的,上述的融合蛋白载体的结构为CMV-EGFP_mODC_NLS。
本发明的另一个目的是提供该融合蛋白的表达载体的制备方法,该方法依次包括下述步骤:
A)构建CMV-EGFP_mODC_NLS表达载体:
1)用引物GFP_F:ATGGTGAGCAAGGGCGAGGA和引物Gfp_R:GGCTCAGCTATGATTCTCACTCCCTTGTACAGCTCGTCCATGCCGA去扩展EGFP,回收PCR片段;
2)用引物mODC_F:TCGGCATGGACGAGCTGTACAAGGGAGTGAGAATCATAGCTGAGCCA和引物mODC_R:TCAATCAATTAGACTTTTCTCTTTTTCTTTGGTACCTTCCTCTTCTTTTTGGGCACATTGATCCTAGCAGAAGCAC扩展mODC片段;
3)融合步骤1)制备的PCR片段和步骤2)制备的mODC片段后,克隆到慢病毒表达载体上。
B)用Gold gate的方法构建针对NLS的TALEN质粒对
1)TALEN_F识别的序列是:TCTGCTAGGATCAATGTGCC;
2)TALEN_R识别的序列是:TTTTCTCTTTTTCTTTGGTA。
C)pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒载体的制备
将pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒表达载体和辅助质粒转染到293细胞,然后制备pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒;同时制备表达TALEN_F和TALEN_R的慢病毒。
D)pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS稳定表达细胞系的制备
pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒感染细胞C57B6胚胎干细胞;
E)C57B6_EGFP稳定表达EGFP的细胞株感染TALEN_F和TALEN_R质粒对。
本发明提供的融合蛋白用于切割NLS信号的TALEN质粒对以及原核表达EGFP_mODC_NLS_TALEN_R蛋白和EGFP_mODC_NLS_TALEN_R蛋白。
本发明提供的融合蛋白用于验证TALEN质粒对的转染效率以及在细胞中的活性。
与现有技术相比,本发明提供的技术方案制备方法简单,使用该方法或者制备的稳定表达EGFP_mODC_NLS的细胞株可以很好的用于对照实验,使得TALEN技术做细胞株更加科学有效,该方法不仅可以用于基因功能研究的对照实验,也可以用于药物靶点筛选。
具体实施例
下面结合具体实施例,对本发明的权利要求做进一步的详细说明,但不构成对本发明的任何限制,任何在本发明权利要求保护范围内所做的有限次的修改,仍在本发明的权利要求保护范围之内。
实施例1
本发明提供的一种融合蛋白结构为EGFP-_mODC_NLS。
其制备方法是:
将带有重组质粒EGFP-_mODC_NLS的大肠杆菌BL21菌种扩大培养,在12-18℃经IPTG过夜诱导,收集所得到的EGFP-_mODC_NLS蛋白菌体,经过高压破碎后离心获得可溶性的上清,进行Ni柱亲和层析;待目的蛋白与Ni柱结合之后,先用漂洗液洗涤,在用洗脱缓冲液洗涤,在用脱盐柱将洗脱组分中的高盐缓冲液置换成含有20%甘油的PBS溶液,之后进行SDS-PAGE的检测,所得即为纯化的EGFP-_mODC_NLS蛋白。
本发明提供的一种融合蛋白的表达载体,包含一个EGFP-_mODC_NLS融合蛋白及其一对切割NLS的TALEN质粒对;其结构为CMV-EGFP_mODC_NLS。
上述的融合蛋白的表达载体的制备方法,依次包括下述步骤:
A)构建CMV-EGFP_mODC_NLS表达载体:
1)用引物GFP_F:ATGGTGAGCAAGGGCGAGGA和引物Gfp_R:GGCTCAGCTATGATTCTCACTCCCTTGTACAGCTCGTCCATGCCGA去扩展EGFP,回收PCR片段;
2)用引物mODC_F:TCGGCATGGACGAGCTGTACAAGGGAGTGAGAATCATAGCTGAGCCA和引物mODC_R:TCAATCAATTAGACTTTTCTCTTTTTCTTTGGTACCTTCCTCTTCTTTTTGGGCACATTGATCCTAGCAGAAGCAC扩展mODC片段;
3)融合步骤1)制备的PCR片段和步骤2)制备的mODC片段后,克隆到慢病毒表达载体上。
B)用Gold gate的方法构建针对NLS的TALEN质粒对
1)其中TALEN_F识别的序列是:TCTGCTAGGATCAATGTGCC;TALEN_R识别的序列是:TTTTCTCTTTTTCTTTGGTA。
C)pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒载体的制备
将pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒表达载体和辅助质粒转染到293细胞,然后制备pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒;同时制备表达TALEN_F和TALEN_R的慢病毒。
D)pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS稳定表达细胞系的制备
pLV_CMV-EGFP_mODC_NLS慢病毒感染细胞C57B6胚胎干细胞;
E)C57B6_EGFP稳定表达EGFP的细胞株感染TALEN_F和TALEN_R质粒对。
C57B6_EGFP稳定表达EGFP的单克隆挑选出来后,扩大培养制备成稳定表达GFP的C57B6细胞株,然后感染TALEN_F和TALEN_R质粒对。6个小时后,观察发现EGFP定位在细胞质里面,而细胞核没有GFP。
该融合蛋白用于切割NLS信号的TALEN质粒对以及原核表达EGFP_mODC_NLS_TALEN_R蛋白和EGFP_mODC_NLS_TALEN_R蛋白或者用于验证TALEN质粒对的转染效率以及在细胞中的活性。
具体方法为:
对细胞内源性基因CXCR4与CCR5的敲除,用EGFP_mODC_NLS的C57B6细胞株作为对照。
首先设计细胞内源性基因CCR5的TALEN质粒对,TALEN-CCR5_L,TALEN-CCR5_R。
制备TALEN-CCR5_L,TALEN-CCR5_R慢病毒。
用打靶NLS序列的TALEN慢病毒感染稳定表达EGFP_mODC_NLS的C57B6细胞;用TALEN-CCR5_L,TALEN-CCR5_R慢病毒感染另外的C57B6细胞。感染24小时后,发现稳定表达EGFP_mODC_NLS的C57B6细胞GPF从细胞核转移到细胞质。同时收集细胞,提取转染TALEN-CCR5_L,TALEN-CCR5_R慢病毒的细胞基因组,利用引物(CCR5_F1:CTGCCTCCGCTCTACTCACTGGT与CCR5_R1:ATTCCTGGGAGAGACGCAAACAC)扩增含有打靶位点的片段,作测序验证,结果显示,使用该方法ALEN-CCR5_L,TALEN-CCR5_R对细胞内源基因CCR5有切割活性,该方法可以成功用于对照实验。