CN103983793A - 一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液及其制备方法 - Google Patents
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Abstract
本发明属于生物技术领域,公开了一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,由丽春红、Na2CO3、NaHCO3、甘油和去离子水组成,所述的甘油和去离子水的体积比为3:1~1:20,在所述的点样缓冲液中,所述的Na2CO3的质量百分比浓度为0.05%~1%,所述的NaHCO3的质量百分比浓度为0.05%~2%,所述的丽春红的质量百分比浓度为0.01%~50%。本发明将丽春红染色剂直接加入到蛋白质芯片的点样缓冲液中,使得该缓冲液呈现红色,并用该缓冲液稀释待点样物质,于基片上点样,使得蛋白质芯片上的样点在芯片使用前即可通过图像软件或目视观察分析,对蛋白质芯片上样点的圆润及均匀程度起到一个预判的作用。
Description
技术领域:
本发明属于生物技术领域,尤其涉及一种蛋白质芯片点样缓冲液,具体来说是一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液及其制备方法。
背景技术:
生物芯片技术是上世纪90年代初发展起来的一种高通量、大规模并行分析检测技术,曾被Science杂志两度评为年度十大科技突破之一,它是利用分子间特异相互作用的原理,将多种技术(如生物化学、微加工、微电子、计算机等)融为一体的一项分析检测技术。与传统分析检测方法所不同的是,它形成的微阵列使生化分析反应过程高度集成于某一载体之上,高通量地分析检测成百上千种DNA、RNA、多肽、蛋白质等分子。目前常见的生物芯片有:基因芯片、蛋白质芯片、糖芯片以及其他小分子生物芯片。
在基因组学的研究背景下,为了满足人类对数以万计基因功能的大规模研究,基因芯片应运而生。基因芯片是依据碱基互补配对原则,将大量已知序列的核酸探针高密度有序固定于某一载体表面,从而对待检样品中大量核酸成分进行分析检测的技术,其高通量、快速、简便等优点满足了人们对基因的大规模分析检测的需求。目前,基因芯片主要应用于基因表达检测、杂交测序、疾病预测和诊断等领域。但是,基因水平上的研究只能初步了解基因表达产物的变化,而作为直接影响生命活动变化的蛋白质则需要经过转录、翻译、加工等多个调控步骤才能形成,所以对其功能和结构的研究将具有重大的科学意义。随着蛋白组学研究的兴起,如同起初对基因组学的研究一样,在利用传统方法对蛋白质组功能进行分析研究时,同样遇到了现有技术耗时、繁琐、通量低等一系列问题。在弥补这些研究方法缺陷时,人们自然而然地模仿了基因芯片的原理,从而研制出了蛋白质芯片。
蛋白质芯片是将各种蛋白质(如抗原、抗体)、多肽以及受体、配体等有序固定于某一载体(如滤膜、凝胶、玻片、纳米微珠和微孔板)之上,以分析检测样品中能与之特异相互作用的成分。虽然蛋白质芯片是在蛋白质组学的研究背景下产生的,但其应用不仅仅只局限于蛋白质组学。凡是有关抗体—抗原、蛋白质—蛋白质、蛋白质—核酸、蛋白质—脂类、蛋白质—小分子以及酶与底物相互作用的研究中,蛋白质芯片技术均有其独特的用途。目前主要应用于蛋白质组学、食品检验、疾病诊断、药物筛选、农林畜牧业、司法鉴定等领域。
虽然,蛋白质芯片经过20多年的发展,但目前所遇到的问题及技术难点仍较多,其中一难点即是,批量化生产固相蛋白质芯片中样点的质量控制问题。因当前在蛋白质芯片的实际应用中,所使用的点样缓冲液多为无色的碳酸盐或磷酸盐缓冲液,使得芯片在点样后样点仍成无色状态,导致芯片在使用前无法对其样点的形态进行预判,样点是否呈现圆润的状态,是否会在检测显色后呈现“咖啡环”现象,从而严重影响定量检测信号值的读取,甚至点样抗体是否已经点在基片上,这些都无从知晓,而现今并没有一种方法可以解决上述批量化生产蛋白质芯片的质量控制问题。
丽春红(Ponceau S),是煤焦油提炼出来的原料合成的偶氮染料,作为一种生物染色剂使用,可用于硝酸纤维素膜、PVDF膜和醋酸纤维素膜上蛋白的检测。丽春红带负电荷,可以与带正电荷的氨基酸残基结合,同时丽春红也可以与蛋白质的非极性区域相结合,从而在膜上形成红色的斑点或条带。丽春红对蛋白质的染色是可逆的,染色后可以用PBST,蒸馏水或其它适当溶液洗去。
发明内容:
针对上述现有技术中存在的缺陷,本发明所要解决的技术问题是提供一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,所述的这种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液要解决现有技术中的点样缓冲液多为无色的碳酸盐或磷酸盐缓冲液,使得芯片在点样后样点仍成无色状态,导致芯片在使用前无法对其样点的圆润及均匀程度进行预判,从而无法对蛋白质芯片的批量化生产进行质量控制的技术问题。
本发明提供了一种用于蛋白质芯片的点样缓冲液,由丽春红、Na2CO3、NaHCO3、甘油和去离子水组成,所述的甘油和去离子水的体积比为3:1~1:20,在所述的点样缓冲液中,所述的Na2CO3的质量百分比浓度为0.05%~1%,所述的NaHCO3的质量百分比浓度为0.05%~2%,所述的丽春红的质量百分比浓度为0.01%~50%。
进一步的,所述的点样缓冲液的pH为7~11。
进一步的,以1L来计算,在所述的点样缓冲液中,Na2CO3为1.59g,NaHCO3为2.93g,丽春红为10g,甘油为100mL,余量为去离子水。
进一步的,所述的点样缓冲液的pH为9.6。
本发明和已有技术相比,其技术进步是显著的,具有如下的优点及效果:
(1)本发明所提供的含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,使得蛋白质芯片在完成点样步骤后,即可呈现肉眼可见的红色,使得蛋白质芯片上的样点在芯片使用前即可通过图像软件或目视观察分析,对蛋白质芯片上样点的圆润及均匀程度起到一个预判的作用,从而对蛋白质芯片的批量化生产进行质量控制;
(2)本发明所使用丽春红为常见的生物染色剂,其带负电荷,可以与带正电荷的氨基酸残基结合,同时丽春红也可以与蛋白质的非极性区域相结合,从而在基片上形成红色的斑点或条带。丽春红对蛋白质的染色是可逆的,染色后可以用PBST,蒸馏水或其它适当溶液洗去,并不会对蛋白质芯片的检测显色效果产生影响;
(3)本发明提供的点样缓冲液中所用的甘油,具有使蛋白质芯片中样点的形态更为圆润饱满以及保持一定的持水性;
(4)本发明提供的点样缓冲液中所用的Na2CO3、NaHCO3,具有使该点样缓冲液pH值维持在一定的范围之内,使得待点样物质能够更稳定地固定于基片之上。
本发明和已有技术相比,其技术进步是显著的。本发明将丽春红染色剂加入到蛋白质芯片的点样缓冲液中,使得该缓冲液呈现红色,并用该缓冲液稀释待点样物质,于基片上点样,使得蛋白质芯片上的样点在芯片使用前即可通过图像软件或目视观察分析,对蛋白质芯片上样点的圆润及均匀程度起到一个预判的作用,从而对蛋白质芯片的批量化生产进行质量控制。
附图说明:
图1蛋白质芯片点样后使用前实物图。
图2蛋白质芯片检测显色后实物图。
具体实施方式:
本发明提供了一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,还包括一个所述点样缓冲液的制备方法。就当前通用技术而言,在蛋白质芯片的点样环节中,所使用的点样缓冲液均为无色的碳酸盐或磷酸盐缓冲液。本发明采用添加丽春红的有色点样缓冲液,使得蛋白质芯片在点样完成后即可使样点呈现有色状态,并在后续的封闭或杂交过程中,有色的丽春红即被洗脱至无色,不会影响后续检测的显色效果。下面结合具体实施例对本发明作进一步说明,但本发明并不限于以下实施例。
实施例1
一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,其组分为:丽春红质量百分比浓度为10%;Na2CO3质量百分比浓度为0.15%;NaHCO3质量百分比浓度为0.3%;甘油150mL;去离子水850mL。
上述一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液的制备方法,具体步骤为:
(1)依次将丽春红、Na2CO3、NaHCO3按比例溶解于去离子水中;
(2)将甘油按比例加入上述配制好的溶液中,搅拌均匀,得含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液。
采用上述方法所制得蛋白质芯片点样缓冲液的点样效果如图1所示,并用该芯片所得的检测显色效果如图2所示。
实施例2
一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,其组分为:丽春红质量百分比浓度为0.01%;Na2CO3质量百分比浓度为1%;NaHCO3质量百分比浓度为2%;甘油10mL;去离子水990mL。
上述一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液的制备方法,具体步骤为:
(1)依次将丽春红、Na2CO3、NaHCO3按比例溶解于去离子水中;
(2)将甘油按比例加入上述配制好的溶液中,搅拌均匀,得含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液。
实施例3
一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液,其组分为:丽春红质量百分比浓度为50%;Na2CO3质量百分比浓度为0.05%;NaHCO3质量百分比浓度为0.05%;甘油500mL;去离子水500mL。
上述一种含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液的制备方法,具体步骤为:
(1)依次将丽春红、Na2CO3、NaHCO3按比例溶解于去离子水中;
(2)将甘油按比例加入上述配制好的溶液中,搅拌均匀,得含丽春红的蛋白质芯片点样缓冲液。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
Claims (3)
1.一种用于蛋白质芯片的点样缓冲液,其特征在于:由丽春红、Na2CO3、NaHCO3、甘油和去离子水组成,所述的甘油和去离子水的体积比为3:1~1:20,在所述的点样缓冲液中,所述的Na2CO3的质量百分比浓度为0.05%~1%,所述的NaHCO3的质量百分比浓度为0.05%~2%,所述的丽春红的质量百分比浓度为0.01%~50%。
2.如权利要求1所述的一种用于蛋白质芯片的点样缓冲液,其特征在于:所述的点样缓冲液的pH为7~11。
3.如权利要求1所述的一种用于蛋白质芯片的点样缓冲液,其特征在于:以1L来计算,在所述的点样缓冲液中,Na2CO3为1.59g,NaHCO3为2.93g,丽春红为10g,甘油为100mL,余量为去离子水。
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