CN1281142A - 用于生物芯片质量鉴定的色点检查法 - Google Patents
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Abstract
一种用于生物芯片质量鉴定的色点检查法,其特征是首先向制芯片用的每种液体生物样品中加入色素,再根据样品在芯片上的排列特点和所设定的颜色特征编制色点分布样,用摄像机对排样后的芯片进行观察,并把采集到的图象信号通过电脑与色点分布样进行比较,最后由检测仪器发出关于被检生物芯片质量的信号。本发明能进行及时检验,减少大损失的可能性,能对每一芯片都进行检验,保证质量,易于自动化,提高生产效率,适用于产业化生产。
Description
本发明涉及一种用于生物芯片质量鉴定的色点检查法。
生物(基因)芯片可用于诊断人类的遗传病,制作生物芯片方法之一是把生物样品例如核酸样品点放在介质面例如玻璃片上。每一生物芯片均由数千乃至上万个生物样品构成,而生物样品如核酸样品均为无色透明液体,因此把生物样品排列到芯片介质面上所形成的是无色的高密度的微点(0.2mm以下,>1000点/cm2),用常规仪器难以鉴定其质量。对芯片质量的要求包括如下几方面:a样品不能缺失;b样品点排列顺序不能错位;c样品点大小一致;d样品点中分子分布一致;e样品点排列整齐。对于样品是否缺失,样品点是否大小一致以及样品点是否排列整齐等质量问题,目前通过观察芯片样品点的盐结晶的办法来检查,但这种办法必须在芯片制作完成数小时以后才能使用。样品点排列的顺序及样品点中分子分布是否一致,则需要用复杂的分子生物学方法进行检验。按这些方法用抽样及对试产产品进行全面检查以后,也不能保证批量生产出来的产品的质量。目前,还没有对每个芯片都能及时地作出全面检查的方法。
本发明的目的是提供一种用于生物芯片质量鉴定的色点检查法,它能克服现有方法的上述缺点。
一种用于生物芯片质量鉴定的色点检查法,其特征是首先向制芯片用的每种液体生物样品中加入色素,再根据样品在芯片上的排列特点和所设定的颜色特征编制色点分布样,用摄像机对排样后的芯片进行观察,并把采集到的图象信号通过电脑与色点分布样进行比较,最后由检测仪器根据比较结果发出关于被检生物芯片质量的信号。
本发明的优点是能在芯片制作过程中(排样)进行及时检验,减少大损失的可能性,能对每一芯片都进行检验,保证质量,易于自动化,提高生产效率,适用于产业化生产。
下面通过实施例说明本发明。
制作一种基因芯片,共有一千个核酸探针点。制作之前准备十种色素,这些色素的吸光峰波长在400nm-700nm之间。每二个色素之间的吸光峰波长的差值不小于20nm,并把每种色素都调出三种不同浓度,共构成三十种颜色特征。用电脑对这一千个样品点随机配置一颜色特征,并构成一色点分布样存于电脑,同时编排出一样品颜色特征表,根据这一颜色特征表向一千个核酸探针样品分别加入指定的色样样品,用排样机把加色的探针样品按设计顺序排列到介质片上。完成排样后用CCD相机摄取芯片图像,把此图像与色点分布样比较。比较内容包括①探针点的颜色(决定于吸光峰波长)②颜色深浅(决定于浓度)③色点的大小④色点的排列顺序⑤色点的排列规格(整齐程度)⑥色点内的颜色分布等,根据以上比较结果,电脑可得出探针点是否有缺失,有无错位,是否符合规则(大小,整齐性,分子分布一致性)的结论。如果所有指标相符,电脑会发出“合格”信号,如有不一致,则会发出“不合格”信号。
本实施例中所述的液体生物样品为核酸(DNA,RNA)样品、蛋白质样品、碳水化合物样品、脂类样品或源于生物体的样品,或上述样品的混合物。所述的色素是人造色素、天然色素或是人造或天然的荧光色素,或是多种色素的混合物;这些色素的吸光峰波长在可见光范围(400-700nm),荧光色素的荧光峰波长在可见光至红外光光谱范围。所述的颜色特征包括色素的种类及其浓度。
Claims (4)
1.一种用于生物芯片质量鉴定的色点检查法,其特征是首先向制芯片用的每种液体生物样品中加入色素,再根据样品在芯片上的排列特点和所设定的颜色特征编制色点分布样,用摄像机对排样后的芯片进行观察,并把采集到的图象信号通过电脑与色点分布样进行比较,最后由检测仪器根据比较结果发出关于被检生物芯片质量的信号。
2.如权利要求1所述的色点检查法,其特征是所述的液体生物样品为核酸(DNA,RNA)样品、蛋白质样品、碳水化合物样品、脂类样品或源于生物体的样品,或上述样品的混合物。
3.如权利要求1所述的色点检查法,其特征是所述的色素是人造色素、天然色素或是人造或天然的荧光色素,或是多种色素的混合物;这些色素的吸光峰波长在可见光范围(400-700nm),荧光色素的荧光峰波长在可见光至红外光光谱范围。
4.如权利要求1所述的色点检查法,其特征是所述的颜色特征包括色素的种类及其浓度。
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