CN103864927B

CN103864927B - 视黄醇结合蛋白(rbp)单域抗体编码序列及其应用

Info

Publication number: CN103864927B
Application number: CN201410095996.9A
Authority: CN
Inventors: 万亚坤; 孙燕燕; 李光辉; 母亚雯
Original assignee: Southeast University
Current assignee: Southeast University
Priority date: 2014-03-14
Filing date: 2014-03-14
Publication date: 2016-04-13
Anticipated expiration: 2034-03-14
Also published as: CN103864927A

Abstract

本发明公开了一种视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链，包括框架区FR和互补决定区CDR，公开了框架区FR选自下组的FR的氨基酸序列和互补决定区CDR氨基酸序列，本发明还公开了两种视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体，还公开了两种DNA分子，它编码本发明所述的视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链或本发明所述的视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体，还公开了一种宿主细胞，它可以表达视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体。通过本发明所公布的单域抗体基因序列及宿主细胞，该单域抗体能够在大肠杆菌内高效表达，应用于视黄醇结合蛋白(RBP)检测试剂的研发。

Description

视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体编码序列及其应用

技术领域

本发明属于生物医学或生物制药技术领域，涉及针对于视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体。

背景技术

视黄醇结合蛋白是血液中维生素的转运蛋白，由肝脏合成、广泛分布于血液、脑脊液、尿液及其他体液中。测定视黄醇结合蛋白能早期发现肾小管的功能损害，并能灵敏反映肾近曲小管的损害程度，还可作为肝功能早期损害和监护治疗的指标。

对于RBP的测定，现广泛采用ELISA法；此法简便快速，而这种检测方法是基于将视黄醇结合蛋白(RBP)免疫绵羊获得的抗体来实现的。但是这种传统意义上的抗体稳定性差、灵敏度低、生产成本高，所有因素均限制了对于视黄醇结合蛋白(RBP)的检测。1993年比利时科学家首次在Nature报道：在骆驼血液中的抗体，有一半没有轻链，而且更让人惊喜的是，这些缺失轻链的“重链抗体”能像正常抗体一样与抗原等靶标紧密结合，另外不像scFv那样互相沾粘，甚至聚集成块。这种抗体只包含一个重链可变区和两个常规的CH2与CH3区，更重要的是单独克隆并表达出来的VHH区具有很好的结构稳定性与抗原结合活性，分子量只是普通抗体的1/10，所以VHH也称Nanobody（单域抗体）；与此同时单域抗体化学性质也更加灵活，稳定性好，可溶性高，表达容易且利用微生物即可大量地获得，容易偶联其他分子，因此应用单域抗体为研发视黄醇结合蛋白(RBP)检测试剂具有广阔的前景。

发明内容

发明目的：本发明所要解决的技术问题是提供针对视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体，同时提供该单域抗体的编码序列及该单域抗体在制备检测的应用。

技术方案：为实现上述目的，本发明的第一方面，提供了一种视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体，包括框架区FR和互补决定区CDR，所述框架区FR选自下组的FR的氨基酸序列中任意一种：SEQIDNO：1所示的FR1，SEQIDNO：2所示的FR2，SEQIDNO：3所示的FR3，SEQIDNO：4所示的FR4；或SEQIDNO：5所示的FR1，SEQIDNO：6所示的FR2，SEQIDNO：7所示的FR3，SEQIDNO：8所示的FR4；

所述互补决定区CDR选自下组的CDR的氨基酸序列中任意一种：

SEQIDNO：9所示的CDR1，SEQIDNO：10所示的CDR2，SEQIDNO：11所示的CDR3；或SEQIDNO：12所示的CDR1，SEQIDNO：13所示的CDR2，SEQIDNO：14所示的CDR3；

优选地，所述的视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链，它具有SEQIDNO：15和SEQIDNO：16所示的氨基酸序列。

本发明第二方面，一种视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体，它针对视黄醇结合蛋白(RBP)表位的单域抗体，包括两条具有SEQIDNO：15和SEQIDNO：16所示氨基酸序列的VHH链。

本发明第三方面，提供了一种DNA分子，它编码选自下组的蛋白质：本发明所述的视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链，或本发明所述的视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体。

优选地，所述的DNA分子，其特征在于，它具有选自下组的DNA序列：SEQIDNO：17和SEQIDNO：18。

本发明的第四方面，提供了一种表达载体，它含SEQIDNO：17和SEQIDNO：18

所示的核苷酸序列。

本发明的第五方面，提供了一种宿主细胞，其特征在于，它含有权利要求6所述的表达载体。

本发明的第六方面，提供了本发明所述的视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体用于检测视黄醇结合蛋白(RBP)的用途。

有益效果：与现有技术相比，本发明的优点如下：本发明将血液中提取的视黄醇结合蛋白(RBP)免疫新疆双峰驼，随后利用该骆驼外周血淋巴细胞建立了针对于视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体基因库，试验中将视黄醇结合蛋白(RBP)偶联在酶标板上，以此形式的抗原利用噬菌体展示技术筛选免疫性的单域抗体基因库（骆驼重链抗体噬菌体展示基因库），从而获得了针对视黄醇结合蛋白(RBP)特异性的单域抗体基因，将此基因转至大肠杆菌中，从而建立了能在大肠杆菌中高效表达的单域抗体株。

附图说明

图1是单域抗体的基因电泳图；其中泳道1是DNA分子标准，泳道2是PCR扩增重链抗体可变区片段。

图2是构建单域抗体的噬菌体展示文库时，文库库容测定图。

图3是对于所构建的视黄醇结合蛋白(RBP)特异性的单域抗体文库进行的菌落PCR电泳图；其中泳道1是DNA分子标准，泳道2-25是在所构建的视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体文库中随机的挑取克隆，通过菌落PCR检测文库的插入率，计算结果表明文库插入率至100%。

图4是用噬菌体的酶联免疫方法（ELISA）筛选特异性单个阳性克隆的模式图；其中1是将载脂蛋白偶联在酶标板上，2是单域抗体，3是鼠抗HA抗体，4是山羊抗小鼠碱性磷酸酶标记的抗体，5是碱性磷酸酶显色液。

图5是表达的视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体，经镍柱树脂凝胶亲和层析纯化后的SDS-PAGE的电泳图；其中泳道1是蛋白分子标准，泳道2、3是250毫摩尔咪唑洗脱液所洗脱下来的单域抗体。

图6为视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体检测特异性分析的模式图。

图7为视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体检测特异性分析的模式图。

具体实施方式

本发明首先将人血液中提取的视黄醇结合蛋白(RBP)免疫一只新疆单峰驼，经过5次免疫之后提取该单峰驼外周血淋巴细胞并构建了视黄醇结合蛋白(RBP)特异的单域重链抗体文库。将视黄醇结合蛋白(RBP)偶联在NUNC酶标板上，展示蛋白质的正确空间结构，使得视黄醇结合蛋白(RBP)的抗原表位得以暴露出来，以此形式的抗原利用噬菌体展示技术筛选视黄醇结合蛋白(RBP)免疫性的单域抗体基因库（骆驼重链抗体噬菌体展示基因库），而获得了能在大肠杆菌中高效表达的单域抗体株。

下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。

实施例1：针对于视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体文库的构建：

（1）由人血液中提取的视黄醇结合蛋白(RBP)（购自南京汇标生物科技有限公司），用于免疫所用的视黄醇结合蛋白(RBP)的浓度为500μg/mL，每次免疫将0.5mg脂蛋白A1与弗氏佐剂等体积混合，免疫一只新疆单峰驼(句容圣龙家畜养殖厂)，每周一次，共免疫5次，除第一次使用完全的弗氏佐剂（购自sigma），剩余几次全部使用弗式不全佐剂（购自sigma），免疫过程中刺激B细胞表达抗原特异性的单域抗体。（2）5次免疫结束后，提取骆驼外周血淋巴细胞100mL并提取总RNA参照QIAGEN公司提供的RNA提取试剂盒。（3）按照Super-ScriptIIIFIRSTSTRANDSUPERMIX试剂盒说明书，将提取的RNA反转录成cDNA。用巢式PCR扩增重链抗体的可变区片段：

第一轮PCR：

上游引物GTCCTGGCTGCTCTTCTACAAGGC

下游:GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC

扩增重链抗体引导肽和抗体CH2之间的片段，54℃退火，25个循环；结果如图1显示该片段的大小约为700bp，即从左到右的DNA条带分别是：第一为DNA的分子Marker，第二单域抗体基因电泳带约为700bp。

第二轮PCR：

以第一轮PCR产物作模板，

上游引物：GATGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGRGGAGG

下游引物：GGACTAGTGCGGCCGCTGGAGACGGTGACCTGGGT扩增重链抗体FR1区和长、短铰链区之间的片段(长片段和短片段)，60℃退火，17个循环，回收目的片段，结果如图1显示，该片段的大小约为500bp，即从左到右的DNA条带分别是：第一为DNA分子Marker，第二单域抗体基因电泳带约为500bp。（4）使用限制性的内切酶（购自NEB）PstI及NotI酶切20μgpComb3噬菌体展示载体（Biovector供应）及10μgVHH并用T4DNA连接酶（购自TaKaRa公司）连接两个片段。（5）将连接产物电转化至电转感受态细胞TG1（北京神州红叶科技有限公司）中，构建视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体噬菌体展示文库并测定库容，库容的大小为2.5×10⁸,结果如图2显示。与此同时，通过菌落PCR检测引物使用第二轮PCR引物，Tm55℃。图3显示菌落PCR结果。文库构建完成后，为检测文库的插入率，我们随机的选取24颗克隆做菌落PCR。结果显示：即我们的插入率已达到90%以上。

实施例2：针对视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体筛选过程：

（1）将溶解在PBS中的100μg/mL的视黄醇结合蛋白(RBP)包被在NUNC酶标板上，4℃放置过夜，同时设立负对照。（2）第二天两个孔中分别加入200μL1%牛奶，室温封闭2小时。（3）2小时后，加入100μL噬菌体（8×10¹¹tfu免疫骆驼单域抗体噬菌展示基因库），在室温下作用1小时。(4）用PBST（PBS中含有0.05%吐温20）洗5遍，以洗掉不结合的噬菌体。(5）用三乙基胺（100mM）将与视黄醇结合蛋白(RBP)特异性结合的噬菌体解离下，并感染处于对数期生长的大肠杆菌TG1，产生并纯化噬菌体用于下一轮的筛选，相同筛选过程重复2轮。结果如图4显示：在不断地筛选的过程中，阳性的克隆将不断地被富集，从而达到了利用噬菌体展示技术筛取抗体库中视黄醇结合蛋白(RBP)特异抗体的目的。

实施例3：用噬菌体的酶联免疫方法（ELISA）筛选特异性单个阳性克隆：

该实验的原理模式图如图5所示，具体检测如下：

（1）从3-4轮筛选后含有噬菌体的细胞培养皿中，挑选96个单个菌落并接种于含有100μg/mL的氨苄青霉素的TB培养基(1LTB培养基中含有2.3g磷酸二氢钾，12.52g磷酸氢二钾，12g蛋白胨，24g酵母提取物，4mL甘油)中，生长至对数期后，加终浓度1mmol的IPTG，28℃培养过夜。（2）利用渗透法获得粗提抗体，并将抗体转移到经抗原包被的ELISA板中，在室温下放置1小时。（3）用PBST洗去未结合的抗体，加入一抗mouseanti-HAtagantibody（抗鼠抗HA抗体，购自北京康为世纪生物科技有限公司），在室温下放置1小时。（4）用PBST洗去未结合的抗体，加入二抗anti-mousealkalinephosphataseconjugate（山羊抗小鼠碱性磷酸酶标记抗体，购自艾美捷科技有限公司），在室温下放置1小时。（5）用PBST洗去未结合的抗体，加入碱性磷酸酶显色液，于ELISA仪上，在405nm波长，读取吸收值。（6）当样品孔OD值大于对照孔OD值3倍以上时，判为阳性克隆孔。（7）将阳性克隆孔的菌转摇在含有100μg/mL的LB液体中以便提取质粒并进行测序。

根据序列比对软件VectorNTI及IMGT分析软件分析各个克隆株的基因序列，把CDR1，CDR2，CDR3序列相同的株视为同一克隆株，而其序列不同的株视为不同克隆株，最终共有2株不同的抗体。其抗体的VHH链的氨基酸序列分别如SEQIDNO：15,SEQIDNO：16所示。

实施例4：单域抗体在宿主菌大肠杆菌中表达、纯化：

（1）将前面测序分析所获得两种单域抗体亚克隆至表达性的载体PET32a中，并将测序鉴定正确的重组质粒转化到表达型宿主菌DE3中，其涂布在含有100μg/mL氨苄青霉素的LB固体培养基的板上，37℃过夜。（2）挑选单个菌落接种在15mL含有氨苄青霉素的LB培养液中，37℃摇床培养过夜。（3）接种1mL的过夜菌种至330mLLB培养基中，37℃摇床培养，培养到OD值达到0.6-1时，加入IPTG，28℃摇床培养过夜，（4）第二天，离心收菌。（5）将菌体破碎以获得抗体粗提液。（6）经镍柱离子亲和层析纯化抗体蛋白，为获得高纯度的抗体，采用咪唑梯度洗脱法，低浓度咪唑洗脱液（50mmol）用于洗去杂带，高浓度咪唑洗脱液（250mmol，500mmol）最终可制备纯度达90%以上的蛋白。图6所示从左到右的条带分别是：第一为标准蛋白分子，第二、第三250mmol咪唑的洗脱液洗脱的蛋白样品；结果显示，单域抗体经过该纯化后，其纯度可达到95%以上。

实施例5：视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体检测特异性分析：

（1）将视黄醇结合蛋白(RBP)前白蛋白包被在酶标板上，同时做空白孔对照，各包被两个孔，将载脂蛋白单域抗体及对照抗体前白蛋白单域抗体分别转移到经抗原包被的ELISA板中，在室温下放置1小时。（2）用PBST洗去未结合的抗体，加入一抗mouseanti-HAtagantibody（抗鼠抗HA抗体，购自北京康为世纪生物科技有限公司），在室温下放置1小时。（3）用PBST洗去未结合的抗体，加入二抗anti-mousealkalinephosphataseconjugate（山羊抗小鼠碱性磷酸酶标记抗体，购自艾美捷科技有限公司），在室温下放置1小时。（4）用PBST洗去未结合的抗体，加入碱性磷酸酶显色液，于ELISA仪上，在405nm波长，读取吸收值。结果显示视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体能特异性的识别载脂蛋白。模式图见图7，结果如下：

以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出：对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

SEQUENCELISTING

<110>东南大学

<120>视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体编码序列及其应用

<130>

<160>18

<170>PatentInversion3.3

<210>1

<211>25

<212>PRT

<213>人工序列

<400>1

GlnValGlnLeuGlnGluSerGlyGlyGlyProValGlnAlaGlyGly

151015

SerLeuArgLeuSerCysAlaValSer

2025

<210>2

<211>17

<212>PRT

<213>人工序列

<400>2

MetGlyTrpPheArgGlnAlaProGlyLysGluArgGluGlyValAla

151015

Ala

<210>3

<211>38

<212>PRT

<213>人工序列

<400>3

TyrTyrAlaAspSerValLysGlyArgPheThrIleSerGlnAsnVal

151015

AlaLysAsnThrLeuAspLeuGlnMetAsnSerLeuLysProGluAsp

202530

ThrAlaMetTyrTyrCys

35

<210>4

<211>11

<212>PRT

<213>人工序列

<400>4

TrpGlyGlnGlyThrGlnValThrValSerSer

1510

<210>5

<211>25

<212>PRT

<213>人工序列

<400>5

GlnValGlnLeuGlnGluSerGlyGlyGlySerValGlnThrGlyGly

151015

SerLeuArgLeuSerCysValValSer

2025

<210>6

<211>17

<212>PRT

<213>人工序列

<400>6

MetGlyTrpPheArgGlnAlaProGlyLysGluArgGluGluValAla

151015

Thr

<210>7

<211>38

<212>PRT

<213>人工序列

<400>7

TyrTyrAlaAspSerValLysGlyArgPheThrIleSerGlnAspAsn

151015

AlaLysAsnThrLeuTyrLeuGlnMetAsnSerLeuLysProGluAsp

202530

ThrGlyMetTyrPheCys

35

<210>8

<211>11

<212>PRT

<213>人工序列

<400>8

ArgGlyGlnGlyThrGlnValThrValSerSer

1510

<210>9

<211>8

<212>PRT

<213>人工序列

<400>9

LysTyrProTyrSerGlySerCys

15

<210>10

<211>9

<212>PRT

<213>人工序列

<400>10

AlaMetPheThrGlyThrGlySerThr

15

<210>11

<211>21

<212>PRT

<213>人工序列

<400>11

AlaValAspLeuLeuProArgSerThrArgCysLeuAspTyrGlyLeu

151015

ArgThrTyrAsnTyr

20

<210>12

<211>8

<212>PRT

<213>人工序列

<400>12

GlyHisSerTyrSerArgLysCys

15

<210>13

<211>9

<212>PRT

<213>人工序列

<400>13

ThrPheTyrThrGlyAspGlyArgThr

15

<210>14

<211>18

<212>PRT

<213>人工序列

<400>14

AlaAlaAspArgArgValAsnCysAspLeuLeuGlnSerThrPheTyr

151015

AsnTyr

<210>15

<211>128

<212>PRT

<213>人工序列

<400>15

GlnValGlnLeuGlnGluSerGlyGlyGlyProValGlnAlaGlyGly

151015

SerLeuArgLeuSerCysAlaValSerLysTyrProTyrSerGlySer

202530

CysMetGlyTrpPheArgGlnAlaProGlyLysGluArgGluGlyVal

354045

AlaAlaMetPheThrGlyThrGlySerThrTyrTyrAlaAspSerVal

505560

LysGlyArgPheThrIleSerGlnAsnValAlaLysAsnThrLeuAsp

65707580

LeuGlnMetAsnSerLeuLysProGluAspThrAlaMetTyrTyrCys

859095

AlaValAspLeuLeuProArgSerThrArgCysLeuAspTyrGlyLeu

100105110

ArgThrTyrAsnTyrTrpGlyGlnGlyThrGlnValThrValSerSer

115120125

<210>16

<211>125

<212>PRT

<213>人工序列

<400>16

GlnValGlnLeuGlnGluSerGlyGlyGlySerValGlnThrGlyGly

151015

SerLeuArgLeuSerCysValValSerGlyHisSerTyrSerArgLys

202530

CysMetGlyTrpPheArgGlnAlaProGlyLysGluArgGluGluVal

354045

AlaThrPheTyrThrGlyAspGlyArgThrTyrTyrAlaAspSerVal

505560

LysGlyArgPheThrIleSerGlnAspAsnAlaLysAsnThrLeuTyr

65707580

LeuGlnMetAsnSerLeuLysProGluAspThrGlyMetTyrPheCys

859095

AlaAlaAspArgArgValAsnCysAspLeuLeuGlnSerThrPheTyr

100105110

AsnTyrArgGlyGlnGlyThrGlnValThrValSerSer

115120125

<210>17

<211>384

<212>DNA

<213>人工序列

<400>17

caggtgcagctgcaggagtctgggggaggaccggtgcaggctggagggtctctgagactc60

tcctgtgcagtctctaaatacccctacagtggcagctgcatgggctggttccgccaggct120

ccagggaaggagcgcgagggggtcgcagctatgttcactggtactggtagcacatactat180

gccgactccgtgaagggccgattcaccatctcccaaaacgtcgccaagaacaccctggat240

ctccaaatgaacagcctgaaacctgaggacactgccatgtactactgtgcggtagatctt300

ttgccccgctcgacccgatgcctagactatgggttgcggacgtataactactggggccag360

gggacccaggtcaccgtctcctca384

<210>18

<211>375

<212>DNA

<213>人工序列

<400>18

caggtgcagctgcaggagtctggaggaggctcggtgcagactggagggtctctgagactc60

tcctgtgtagtttctggacacagctacagtaggaagtgcatgggctggttccgccaggct120

ccagggaaggagcgcgaggaagtcgcaactttttatactggtgacggtaggacatactat180

gccgactccgtgaagggccgattcaccatctcccaagacaacgccaagaacacgctgtat240

ctccaaatgaacagcctgaaacctgaggacactggcatgtacttctgcgcggcagatcgg300

cgtgttaactgcgatctccttcaaagcactttttataactaccgggggcaggggacccag360

gtcaccgtctcctca375

Claims

1.一种视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链，其特征在于，它具有SEQIDNO：15或SEQIDNO：16所示的氨基酸序列。

2.一种视黄醇结合蛋白(RBP)单域抗体，其特征在于，它针对视黄醇结合蛋白(RBP)表位的单域抗体，包括具有SEQIDNO：15或SEQIDNO：16所示氨基酸序列的VHH链。

3.一种DNA分子，其特征在于，它编码选自下组的蛋白质：权利要求1所述的视黄醇结合蛋白(RBP)的单域抗体的VHH链。

4.根据权利要求3所述的DNA分子，其特征在于，它具有选自下组的DNA序列：SEQIDNO：17或SEQIDNO：18。

5.一种表达载体，其特征在于，它含SEQIDNO：17或SEQIDNO：18所示的核苷酸序列。