CN103789287A - 具有转糖基活性的α-半乳糖苷酶AgaAJB07及其基因、重组载体、重组菌株 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种具有转糖基活性的α-半乳糖苷酶AgaAJB07及其基因、重组载体、重组菌株。本发明提供了一种来源于中生根瘤菌(Mesorhizobium sp.)的α-半乳糖苷酶AgaAJB07,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,且本发明提供了上述α-半乳糖苷酶的编码基因agaAJB07,α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组载体和α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组菌株。本发明的α-半乳糖苷酶具有以下性质:最适pH6.5;经0.2M pH7.0–9.0缓冲液在37℃下处理1h,仍能保持75%以上的活性;最适温度45℃;在37℃及50℃下稳定;可水解密二糖、棉籽糖及水苏糖;具有转糖基活性,可催化密二糖、半乳糖、葡萄糖、甘露糖及木糖的转糖基反应。

Description

具有转糖基活性的α-半乳糖苷酶AgaAJB07及其基因、重组载体、重组菌株
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,具体地说是一种具有转糖基活性的α-半乳糖苷酶AgaAJB07及其基因、重组载体、重组菌株。
背景技术
α-半乳糖苷酶(α-galactosidase,EC3.2.1.22)又叫密二糖酶(melibiase),可催化水解密二糖、棉籽糖、水苏糖和毛蕊花糖等低聚糖底物及半乳甘露聚糖等多聚糖底物中的α-半乳糖苷键。α-半乳糖苷酶可应用于饲料、食品和医疗等行业中。在饲料行业中,α-半乳糖苷酶制剂可促进动物对营养物质的消化,提高饲料利用率;在食品行业中,α-半乳糖苷酶制剂可以减少棉籽糖等在豆奶中的含量,增加人类对豆类营养的吸收;在医疗行业中,α-半乳糖苷酶可将B型红细胞改造成O型红细胞及治疗Fabry疾病等(Zhou et al.,Appl Microbiol Biotechnol,2010,88:1297–1309)。
某些α-半乳糖苷酶还具有转半乳糖基作用,以pNPG(p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside)和密二糖为半乳糖基供体,以pNPG、单糖、二糖以及低聚糖(如麦芽低聚糖、纤维素低聚糖和甘露低聚糖等)作受体,将半乳糖基团专一地以α-1,6或α-1,4糖苷键转移到受体上,形成α-半乳糖苷低聚糖(如水苏糖和α-半乳糖基-β-环糊精),从而应用于食品和医疗等行业中(Nakaiet al.,FEBS J,2010,277:3538–3551)。已发现的具有转半乳糖基作用的α-半乳糖苷酶多来源于霉菌,不同α-半乳糖苷酶催化糖苷键水解、转半乳糖基的速率及受体专一性均存在差异(郝桂娟等,中国畜牧兽医,2013,40:149–154)。
发明内容
本发明的目的是提供一种具有转糖基活性的α-半乳糖苷酶AgaAJB07。
本发明的再一目的是提供编码上述α-半乳糖苷酶的基因。
本发明的另一目的是提供包含上述基因的重组载体。
本发明的另一目的是提供包含上述基因的重组菌株。
本发明所述α-半乳糖苷酶AgaAJB07可得自中生根瘤菌(Mesorhizobiumsp.)。AgaAJB07的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
本发明的α-半乳糖苷酶AgaAJB07总共含721个氨基酸,理论分子量为78.8kDa。该酶的最适pH值为6.5,在pH6.0–7.5的范围内维持45%以上的酶活性;经pH7.0–9.0的缓冲液处理1h,该酶酶活剩余达75%以上;该酶最适温度为45℃;在37℃及50℃下稳定,在60℃时半衰期小于10min;在pH6.5及45℃下,该酶对2mM pNPG(p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside)的比活为15.9±0.2Umg-1,对0.5%(w/v)的密二糖(melibiose)、棉籽糖(raffinose)和水苏糖(stachyose)的比活分别为11.7±0.3、0.07±0.01和0.03±0.004U mg-1
本发明提供了编码上述α-半乳糖苷酶的基因agaAJB07,该基因序列如SEQID NO.2所示。
本发明通过PCR的方法分离克隆了α-半乳糖苷酶AgaAJB07的编码基因agaAJB07,其全长2166bp,起始密码为ATG,终止密码为TGA。经BLAST比对,该α-半乳糖苷酶AgaAJB07与GenBank中Rhodobacter sp.SW2来源的潜在α-半乳糖苷酶(EEW27035)具有最高的一致性,为51.6%;与确证活性的Pseudoalteromonas sp.KMM701来源α-半乳糖苷酶(ABF72189)的一致性为37.3%。说明α-半乳糖苷酶AgaAJB07是一种新的α-半乳糖苷酶。
本发明还提供了包含上述α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组载体,优选为pEasy-E2-agaAJB07。将本发明的α-半乳糖苷酶基因插入到表达载体中,使其核苷酸序列与表达调控序列相连接。作为本发明的一个最优选的实施方案,将本发明的α-半乳糖苷酶基因和表达载体pEasy-E2通过T-A方式相连接,得到重组大肠杆菌表达质粒pEasy-E2-agaAJB07。
本发明还提供了包含上述α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组菌株,优选所述菌株为大肠杆菌、酵母菌、芽孢杆菌或乳酸杆菌,优选为重组菌株BL21(DE3)/agaAJB07。
本发明制备α-半乳糖苷酶AgaAJB07的方法按以下步骤进行:
1)用上述的重组载体转化宿主细胞,得重组菌株;
2)培养重组菌株,诱导重组α-半乳糖苷酶表达;
3)回收并纯化所表达的α-半乳糖苷酶AgaAJB07。
其中,优选所述宿主细胞为大肠杆菌细胞,优选将重组大肠杆菌表达质粒转化大肠杆菌细胞BL21(DE3),得到重组菌株BL21(DE3)/agaAJB07。
本发明提供了一个新的α-半乳糖苷酶基因,其编码的α-半乳糖苷酶最适pH6.5;经0.2M pH7.0–9.0缓冲液在37℃下处理1h,仍能保持75%以上的活性;最适温度45℃;在37℃及50℃下稳定;可水解密二糖、棉籽糖及水苏糖;具有转糖基活性,可催化密二糖、半乳糖、葡萄糖、甘露糖及木糖的转糖基反应。该酶可应用于食品及医疗行业。
附图说明
图1:在大肠杆菌中表达的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的SDS-PAGE分析,其中,M:蛋白质Marker;1和2:含有重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的大肠杆菌菌体破碎上清液;3:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07。
图2:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的pH活性。
图3:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的pH稳定性。
图4:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的热活性。
图5:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的热稳定性。
图6:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07对不同底物的转糖基产物分析,其中,CK-Mel,CK-Man,CK-Gal,CK-Glu,CK-Xyl:分别是在400mM密二糖、400mM甘露糖及40mM pNPG、400mM半乳糖及40mM pNPG、400mM葡萄糖及40mM pNPG、400mM木糖及40mM pNPG底物中加入失活的AgaAJB07(95℃下处理10min);S-Mel:以400mM密二糖为转糖基的供体和受体进行反应;S-Man,S-Gal,S-Glu,S-Xyl:分别以400mM甘露糖、半乳糖、葡萄糖、木糖为转糖基的受体,以40mM pNPG为转糖基的供体进行反应。pNPG:p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside,Suc:蔗糖,Mel:密二糖(melibiose),Raf:棉籽糖(raffinose),Sta:水苏糖(stachyose),Gal:半乳糖,Glu:葡萄糖,Man:甘露糖,Xyl:木糖,MelT:密二糖转糖基产物,GalT:半乳糖转糖基产物,GluT:葡萄糖转糖基产物,ManT:甘露糖转糖基产物,XylT:木糖转糖基产物。
具体实施方式
以下结合具体实施例,对本发明进行详细说明。
试验材料和试剂
1、菌株及载体:中生根瘤菌(Mesorhizobium sp.)同文献报道菌种性质,如中国普通微生物菌种保藏管理中心菌株Mesorhizobium loti CGMCC1.2559;DNA聚合酶、dNTP及pMD18-T载体购自TaKaRa公司,大肠杆菌Escherichia coliBL21(DE3)和表达载体pEasy-E2购自北京全式金生物技术有限公司。
2、酶类及其它生化试剂:DNA聚合酶、dNTP和pMD18-T载体购自TaKaRa公司;pNP(p-nitrophenol)、pNPG(p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside)、半乳糖、葡萄糖、甘露糖、木糖、乳糖、蔗糖、密二糖(melibiose)购自Sigma公司;棉籽糖(raffinose)购自美国Amresco公司;水苏糖(stachyose)购自日本东京化成工业株式会社(TCI);其它都为国产试剂(均可从普通生化试剂公司购买得到)。
3、培养基:
LB培养基:Peptone10g,Yeast extract5g,NaCl10g,加蒸馏水至1000ml,pH自然(约为7)。固体培养基在此基础上加2.0%(w/v)琼脂。
说明:以下实施例中未作具体说明的分子生物学实验方法,均参照《分子克隆实验指南》(第三版)J.萨姆布鲁克一书中所列的具体方法进行,或者按照试剂盒和产品说明书进行。
实施例1:α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的克隆
提取中生根瘤菌基因组DNA:将液体培养2d的菌液离心取菌体,加入1mL溶菌酶,37℃处理60min,再加入裂解液,裂解液组成为:50mM Tris,20mMEDTA,Nacl500mM,2%SDS(w/v),pH8.0,70℃水浴裂解60min,每隔10min混匀一次,在4℃下10000rpm离心5min。取上清于酚/氯仿中抽提除去杂蛋白,再取上清加入等体积异丙醇,于室温静置5min后,4℃下10000rpm离心10min。弃上清,沉淀用70%的乙醇洗涤两次,真空干燥,加入适量TE溶解,置于-20℃备用。
表1.α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的克隆与表达引物
Figure BDA0000458796250000051
根据糖苷水解酶第36家族的保守序列([F/L/V]-[L/V]-[L/M/V]-D-D-G-W-F和E-P-E-M-[V/I]-[N/S]-[P/E])合成了简并引物GH36F和GH36R(表1)。以中生根瘤菌总DNA为模板进行PCR扩增。PCR反应参数为:94℃变性5min;然后94℃变性30sec,43℃退火30sec,72℃延伸30sec,30个循环后72℃保温10min。PCR结果得到一约184bp片段,将该片段回收后与pMD18-T载体相连,然后送北京六合华大基因科技股份有限公司广州分公司测序。
根据测序得到的核甘酸序列,设计热不对称交错PCR(简称TAIL-PCR)上游特异性引物2条,并将它们分别命名为usp1和usp2;另设计下游特异性引物4条,并将它们分别命名为dsp1、dsp2、dsp3、dsp4(表1)。以中生根瘤菌基因组DNA为模板,通过TAIL-PCR得到已知基因序列的侧翼序列,TAIL-PCR反应参数参照文献设置(Zhou JP et al.,Appl Biochem Biotech2010,160:1277–1292),特异性引物退火温度为67℃。扩增产物送北京六合华大基因科技股份有限公司广州分公司测序。测序结果与已知基因序列片段相拼接,得到α-半乳糖苷酶基因agaAJB07,该基因序列如SEQ ID NO.2所示。
实施例2:重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的制备
以agaAJB07F和agaAJB07R为引物对(表1),中生根瘤菌基因组DNA为模板,进行PCR扩增。PCR反应参数为:94℃变性5min;然后94℃变性30sec,70℃退火30sec,72℃延伸2min30sec,30个循环后72℃保温10min。PCR结果得到α-半乳糖苷酶基因agaAJB07,并在该基因3’端引入突出的A碱基。将α-半乳糖苷酶基因agaAJB07和表达载体pEasy-E2通过T-A方式相连接,获得含有agaAJB07重组表达质粒pEasy-E2-agaAJB07。将pEasy-E2-agaAJB07转化大肠杆菌BL21(DE3),获得重组大肠杆菌菌株BL21(DE3)/agaAJB07。
取含有重组质粒pEasy-E2-agaAJB07的重组大肠杆菌菌株BL21(DE3)/agaAJB07,以0.1%的接种量接种于LB(含100μg mL-1Amp)培养液中,37℃快速振荡16h。然后将此活化的菌液以1%接种量接种到新鲜的LB(含100μg mL-1Amp)培养液中,快速振荡培养约2–3h(OD600达到0.6–1.0)后,加入终浓度0.7mM的IPTG进行诱导,于20℃继续振荡培养约20h或26℃振荡培养约8h。12000rpm离心5min,收集菌体。用适量的pH7.0Tris-HCl缓冲液悬浮菌体后,于低温水浴下超声波破碎菌体。以上胞内浓缩的粗酶液经13,000rpm离心10min后,吸取上清并用Nickel-NTA Agarose和0–500mM的咪唑分别亲和和纯化目的蛋白。SDS-PAGE结果(图1)表明,重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07在大肠杆菌中得到了表达,经纯化后,产物为单一条带。
实施例3:纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的性质测定
1、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的活性分析
实施例2纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的活性测定方法采用pNPG法:将pNPG溶于0.2M缓冲液中,使其终浓度为2mM;反应体系含50μL适量酶液,450μL的2mM底物;底物在反应温度下预热5min后,加入酶液再反应10min,然后加2.0mL1M Na2CO3终止反应,冷却至室温后在405nm波长下测定释放出的pNP;1个酶活单位(U)定义为每分钟分解pNPG产生1μmol pNP所需的酶量。对底物棉籽糖和水苏糖的活性测定方法采用DNS法:将底物溶于0.2M缓冲液中,使其终浓度为0.5%;反应体系含50μL适量酶液,450μL底物;底物在反应温度下预热5min后,加入酶液后再反应适当时间,然后加2.0mL DNS终止反应,沸水煮5min,冷却至室温后在540nm波长下测定OD值;1个酶活单位(U)定义为在给定的条件下每分钟分解底物产生1μmol还原糖(以半乳糖计)所需的酶量。对底物密二糖的活性测定方法采用葡萄糖氧化酶法:将底物溶于0.2M缓冲液中,使其终浓度为0.5%(w/v);反应体系含50μL适量酶液,450μL底物;底物在反应温度下预热5min后,加入酶液后再反应10min,然后根据葡萄糖氧化酶-过氧化物酶法原理,利用葡萄糖测定试剂盒(上海荣盛生物药业有限公司,CAT361500)说明书测定酶活性;1个酶活单位(U)定义为在给定的条件下每分钟分解底物产生1μmol葡萄糖所需的酶量。
2、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的pH活性和pH稳定性测定:
酶的最适pH测定:将α-半乳糖苷酶AgaAJB07在37℃下和0.2M pH5.0–10.0的缓冲液中进行酶促反应。酶的pH稳定性测定:将酶液置于0.2M pH5.0–10.0的缓冲液中,在37℃下处理1h,然后在pH6.5及37℃下进行酶促反应,以未处理的酶液作为对照。缓冲液为:0.2M McIlvaine buffer(pH5.0–8.0)和0.2Mglycine-NaOH(pH9.0–10.0)。以pNPG为底物,反应10min,测定纯化的AgaAJB07的酶学性质。结果表明:AgaAJB07的最适pH为6.5,在pH6.0–7.5的范围内维持45%以上的酶活性(图2);经pH7.0–9.0的缓冲液处理1h,仍能保持75%以上的活性(图3)。
3、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的热活性及热稳定性测定:
酶的热活性测定:在pH6.5的缓冲液中,于10–60℃下进行酶促反应。酶的热稳定性测定:将同样酶量的酶液分别置于37℃、50℃和60℃中,处理0–60min后,在pH6.5及37℃下进行酶促反应,以未处理的酶液作为对照。以pNPG为底物,反应10min,测定纯化的AgaAJB07的酶学性质。结果表明:AgaAJB07的最适温度为45℃(图4);该酶在37℃及50℃下稳定,在60℃时半衰期小于10min(图5)。
4、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07的动力学参数测定:
酶的动力学参数一级反应时间测定:在pH6.5及45℃下,以1.0mM pNPG或10mM密二糖为底物,依次在酶促反应的1–30min内终止反应并测定酶活性,计算出酶活性与反应时间的比值,若在一定时间内该比值保持稳定,则此时间为一级反应时间。用0.1–2.0mM pNPG或4.0–40.0mM密二糖为底物,在pH6.5、45℃和一级反应时间下,根据Lineweaver-Burk方法测定Km、Vmax和kcat。经测定,在45℃及pH6.5条件下,AgaAJB07对pNPG的Km、Vmax和kcat分别为0.14mM-1、15.55μmol min-1mg-1和20.96s-1,对密二糖的Km、Vmax和kcat分别为34.63mM-1、129.87μmol min-1mg-1和175.02s-1
5、不同金属离子及化学试剂对纯化的重组AgaAJB07活力的影响:
在酶促反应体系中加入1.0mM的金属离子及化学试剂,研究其对酶活性的影响。在37℃及pH6.5条件下,以pNPG为底物测定酶活性。结果(表2)表明,1.0mM的SDS、HgCl2及AgNO3可完全抑制AgaAJB07;CuSO4对AgaAJB07具一定的抑制作用(剩余酶活83.8%);PbAC和ZnSO4对AgaAJB07有促进作用,分别提高酶活约0.2倍和0.5倍;其余金属离子和化学试剂对AgaAJB07的影响较小。
表2.金属离子及化学试剂对纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07活力的影响
Figure BDA0000458796250000081
6、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07对底物的降解:
在pH6.5及45℃下,该酶对2mM pNPG的比活为15.9±0.2U mg-1,对0.5%(w/v)的密二糖(melibiose)、棉籽糖(raffinose)和水苏糖(stachyose)的比活分别为59.0±2.3、0.08±0.01和0.03±0.004U mg-1
7、纯化的重组α-半乳糖苷酶AgaAJB07对不同底物的转糖基产物分析:
转糖基反应体系为每毫升底物含1U酶液,反应在pH6.5及37℃下进行,反应时间为24h。转糖基供体和受体为同一底物时,底物用40mM的pNPG或400mM的密二糖、棉籽糖、水苏糖;转糖基供体和受体为不同底物时,供体底物为40mM的pNPG,受体底物为400mM的半乳糖、葡萄糖、甘露糖、木糖、乳糖、蔗糖、棉籽糖或水苏糖。转糖基产物分析采用薄层层析法(使用青岛海洋化工有限公司的高效薄层层析硅胶板G型),层析步骤如下所示:
(1)配制展开剂(冰醋酸20mL,双蒸水20mL,正丁醇40mL,混匀),取适量倒入展开槽,静置30min左右;
(2)将硅胶板放在110℃烘箱中活化30min,冷却后划线,点样(每次0.5μL,吹干,共点3次);
(3)将点样的一端硅胶板朝下放入展开槽中,点样点不要没入展开剂;
(4)待展开剂到距硅胶板上沿1.5cm时,取出硅胶板,吹干,再展开一次;
(5)第二次展开结束后,硅胶板直接浸入适量显色剂(1g二苯胺溶于50mL丙酮中,溶解后加入1mL苯胺及5mL85%的磷酸,混匀,现用现配);
(6)几秒钟后,立即取出硅胶板并放置于90℃烘箱中10–15min,使斑点显色。
结果表明:当转糖基供体和受体为同一底物时,AgaAJB07可使400mM的密二糖作为转糖基的供体和受体,使密二糖获得半乳糖基(图6),而不能催化40mM的pNPG或400mM的棉籽糖及水苏糖的转糖基反应;当供体底物为40mM的pNPG时,AgaAJB07可使400mM的半乳糖、葡萄糖、甘露糖及木糖获得半乳糖基(图6),而不能催化乳糖、蔗糖、棉籽糖及水苏糖的转糖基反应。
应当理解的是,对本领域普通技术人员来说,可以根据上述说明加以改进或变换,而所有这些改进和变换都应属于本发明所附权利要求的保护范围。
Figure IDA0000458796340000011
Figure IDA0000458796340000021
Figure IDA0000458796340000031
Figure IDA0000458796340000041
Figure IDA0000458796340000061
Figure IDA0000458796340000071

Claims (4)

1.一种α-半乳糖苷酶AgaAJB07,其特征在于其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.一种编码权利要求1所述的α-半乳糖苷酶AgaAJB07的α-半乳糖苷酶基因agaAJB07,其特征在于其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
3.一种包含权利要求2所述α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组载体。
4.一种包含权利要求2所述α-半乳糖苷酶基因agaAJB07的重组菌株。
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