CN103352034A - 沉香倍半萜合酶蛋白ass4及其编码基因和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种沉香倍半萜合酶蛋白ASS4及其编码基因ASS4,所述蛋白为:(1)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(2)SEQ ID No.2所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等功能的由(1)衍生的蛋白质。本发明还提供了所述沉香倍半萜合酶蛋白ASS4的制备方法和应用。本发明的沉香倍半萜合酶蛋白ASS4可以用于体外催化沉香倍半萜,将本发明所述基因ASS4转化原核细胞、酵母或更高级的真核细胞,使其具备相应的沉香倍半萜合酶活性,从而实现大批量生产沉香倍半萜,减少珍稀濒危南药白木香资源的破坏,具有重要的经济价值和应用前景。
Description
技术领域
本发明属于生物基因工程技术领域,尤其涉及一种沉香倍半萜合酶蛋白ASS4及其编码基因和应用。
背景技术
我国传统名贵药材沉香来自珍稀濒危植物白木香Aquilariasinensis(Lour.)Gilg(中华人民共和国药典编委会.2010.中华人民共和国药典(第一部).北京:中国医药科技出版社.)。沉香入药在我国传统中医学、藏医学和印度传统医学中已有几千年的历史。香港也因其历史上盛产和出口沉香而得名。由于沉香的高价值(目前特级沉香块国际成交价高达$10000/千克)且国际市场需求极大,长期以来白木香遭到掠夺式过度砍伐,其原始林已经基本破坏殆尽(张争,杨云,魏建和,陈旭玉,孟慧,汪孟曦.白木香枝枯病病原菌的鉴定.中国中药杂志,2013,38(11)82-86.)。
健康白木香树不能产生沉香倍半萜等药效物质,树体必须受到伤害胁迫后才能够产生。虽然目前在海南岛、广东南部基地已建成树龄在8年以上的白木香基地十余个,总规模达10万株以上,但能提供市场的沉香药材还非常少,特别是优质沉香药材极其匮乏(张争,杨云,魏建和,孟慧,汪孟曦,韩晓敏,隋春.白木香茎中内源茉莉酸类和倍半萜类物质对机械伤害的响应.园艺学报,2013b,40(1):163-168.)。造成该现状的一个主要的技术瓶颈问题就是缺乏稳定、高效的白木香结香技术,难以有针对性地开展大规模、产业化人工生产沉香药材。为加速和提高白木香结香量,自20世纪30年代国内外就开展了大量人工结香技术研究,但因沉香诱导形成机制一直未得到揭示,导致稳定、高效的结香技术一直没有突破(张争,杨云,魏建和,孟慧,隋春,陈怀琼.白木香结香机理研究进展及防御反应诱导结香假说.中草药,2010,41(1):19-21.)。为解析伤害诱导白木香结香的生物合成途径及分子调控机制,项目组采用高通量RNA-seq测序技术获得了包含8万条伤害、健康白木香转录组文库,并成功地从白木香伤害转录组文库中克隆到2条伤害诱导表达的沉香倍半萜合酶基因部分序列(张争,高志晖,魏建和,徐艳红,李滢,杨云,孟慧,隋春,汪孟曦.三年生白木香机械伤害转录组学研究.药学学报,2012,47(8):1106-1110.)。
自第一个倍半萜合酶-烟草5-epi-aristolochene合酶的基因被克隆以来(Facchini P J,Chappell J.Gene family for an elicitor-inducedsesquiterpene cyclase in Tobacco.Proc Nat Acad Sci.USA,1992,89:11088-11092.),迄今为止,己有30余种植物倍半萜合酶的cDNA被克隆,包括棉花的(+)-δ-杜松烯合酶基因、荷花玉兰β-荜澄茄油萜合酶基因、金合欢烯合酶基因,在美洲油棕和青蒿中克隆到倍半萜合酶基因,在姜和罗勒中克隆到大根香叶烯-D合酶基因等。不同倍半萜合酶(sesquiterpenoid synthase)与焦磷酸金合欢酯(farnesylpyrophosphate,FPP)绑定在一起,经过异构化、离子化,重排等最后形成结构各异的倍半萜类化合物(Degenhardt J,Kollner TG,Gershenzon J.Monoterpene and sesquiterpene synthases and the origin ofterpene skeletal diversity in plants.Phytochemistry,2009,70:1621-1637.)。倍半萜合酶是合成倍半萜类次生代谢最终产物的关键酶,因此倍半萜合酶基因的克隆、分离及特性分析成为了倍半萜生物合成研究的热点和焦点。
发明内容
针对上述问题,本发明的第一个目的在于提供一种沉香倍半萜合酶蛋白。
本发明的第二个目的在于提供编码所述蛋白的基因。
本发明的目的还在于提供上述蛋白及基因的应用。
本发明的技术方案是:从白木香中分离得到沉香倍半萜合酶基因ASS4,并在原核系统中验证其功能。
本发明提供了沉香倍半萜合酶蛋白ASS4,所述蛋白为:
(1)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(2)SEQ ID No.2所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等功能的由(1)衍生的蛋白质。
本发明还提供了所述沉香倍半萜合酶蛋白ASS4的编码基因ASS4,优选地,所述基因的cDNA序列如SEQ ID No.1所示。
本发明还提供了含有所述沉香倍半萜合酶基因ASS4的载体。优选地,所述载体为重组表达载体。
进一步优选地,所述重组表达载体为pET-28a-ASS4,所述重组表达载体pET-28a-ASS4的构建方法包括如下步骤:
(1)提取伤害处理后的白木香总RNA,以白木香总RNA为模板,合成cDNA的第一条链;
(2)以cDNA为模板,以引物ASSF和引物ASSR为引导进行PCR,扩增目的基因ASS4;
(3)将目的基因ASS4克隆至pGEM-T-easy载体,获得载体pGEM-T-ASS4;
(4)将载体pGEM-T-ASS4和pET-28a分别用BamHI和XhoI进行双酶切,回收ASS4基因片段和pET-28a载体片段,连接,获得重组表达载体pET-28a-ASS4。
步骤(2)中,PCR反应体系为:
cDNA 3μl
dNTP(2.5mM) 1μl
高保真度的PCR DNA聚合酶(Pfu Ultra Ⅱ Fusion HS DNAPolymerase) 1μl
高保真度的PCR DNA聚合酶缓冲液(Pfu Ultra Ⅱ Fusion HSDNA Polymerase Buffer) 5μl
引物ASS F 1μl
引物ASS R 1μl
ddH2O 38μl;
ASSF:5’-ggATCCATgTCTTCggCAAAACTAggTTCT-3’(SEQID No.3);
ASSR:5’-CTCgAgTCAgATTTCAATAgCATgACgCAAC-3’(SEQ ID No.4)。
PCR反应程序为:95℃5min(预变性);95℃1min(变性),69℃1min(退火每个循环降1℃),72℃2min(延伸),共16个循环;95℃1min,54℃1min,72℃2min,共35个循环;72℃10min。
步骤(3)中,由于PCR中高保真酶Pfu酶扩增片段不带A末端,应使用平末端连接试剂盒先加A末端后再连接。目的基因ASS4平末端DNA片段3′末端加A,具体的反应体系为:
反应条件为72℃,保温30min。
本发明的基因和蛋白质可以从白木香中克隆或分离得到,或者通过DNA或肤合成的方法得到。
本发明还提供了含有所述重组表达载体的宿主细胞。所述宿主细胞包括重组菌,如大肠杆菌、农杆菌、真菌等。
将本发明基因ASS4与表达载体可操作地连接,得到能够表达本发明蛋白的重组表达载体,进而可以通过诸如农杆菌介导法、基因枪法、花粉管通道法等转基因方法,将所述重组表达载体导入宿主,得到转ASS4基因的转化体,例如农作物或者树木等植物,使其具备产生沉香倍半萜功能。
本发明还提供了一种制备沉香倍半萜合酶蛋白的方法,其为将上述基因ASS4或含ASS4的重组表达载体转化细菌或真菌,通过大规模发酵生产本发明所述沉香倍半萜合酶蛋白。
本发明还提供了所述沉香倍半萜合酶基因ASS4在制备沉香倍半萜中的应用。所述应用为将上述基因ASS4或含ASS4的重组表达载体转化细菌或真菌,通过大规模发酵生产本发明所述沉香倍半萜合酶蛋白,再进一步制备沉香倍半萜。
实验证实:将原核重组表达载体pET-28a-ASS4转化到大肠杆菌BL21(DE3)pLysS中,IPTG诱导蛋白表达,纯化后,对倍半萜合成底物FPP进行催化,通过GC-MS检测,结果表明本发明的沉香倍半萜合酶可被用于将法尼基焦磷酸催化Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-、β-榄香烯(β-elemene)、α-愈创烯(α-guaiene)、α-石竹烯(α-Caryophyllene)和δ-愈创烯(δ-guaiene)等5种倍半萜。
本发明还提供了所述沉香倍半萜合酶基因ASS4在制备转基因植物中的应用。
本发明还提供了所述沉香倍半萜合酶基因ASS4在提高植物沉香倍半萜合成中的应用。所述应用为将所述基因ASS4或含ASS4的重组表达载体转化植物,使所述植物具备相应的沉香倍半萜合酶活性,从而实现大批量生产沉香倍半萜。
优选地,所述植物为烟草、拟南芥或番茄等。
本发明沉香倍半萜合酶蛋白ASS4可以用于体外催化沉香倍半萜,将本发明所述基因ASS4转化原核细胞、酵母或更高级的真核细胞,包括植物细胞和哺乳动物细胞,植物细胞如烟草、拟南芥、番茄等,使其具备相应的沉香倍半萜合酶活性,从而实现大批量生产沉香倍半萜,减少珍稀濒危南药白木香资源的破坏,具有重要的经济价值和应用前景。
附图说明
图1是白木香总RNA电泳图。
图2是白木香沉香倍半萜合酶ASS4基因的PCR扩增电泳图,其中,M:DL2000;1:PCR产物。
图3是重组表达质粒pET-28a-ASS4诱导表达产物检测,其中,M:Marker;1:pET-28a载体;2、3:IPTG诱导蛋白表达;4:未加IPTG诱导表达。
图4是蛋白纯化产物检测,其中,M:Marker;1:ASS4纯化蛋白。
图5是ASS4蛋白催化FPP产物的总离子流图,其中,Mcounts表示丰度,代表物质的响应值,1:Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-;2:β-榄香烯(β-elemene);3:α-愈创烯(α-guaiene);4:α-石竹烯(α-Caryophyllene);5:δ-愈创烯(δ-guaiene)。
图6是Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-的质谱图及标准品质谱图,其中,左图为Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-的质谱图,右图为标准品质谱图。
图7是β-榄香烯(β-elemene)的质谱图及标准品质谱图,其中,左图为β-榄香烯(β-elemene)的质谱图,右图为标准品质谱图。
图8是α-愈创烯(α-guaiene)的质谱图及标准品质谱图,其中,左图为α-愈创烯(α-guaiene)的质谱图,右图为标准品质谱图。
图9是α-石竹烯(α-Caryophyllene)的质谱图及标准品质谱图,其中,左图为α-石竹烯(α-Caryophyllene)的质谱图,右图为标准品质谱图。
图10是δ-愈创烯(δ-guaiene)的质谱图及标准品质谱图,其中,左图为δ-愈创烯(δ-guaiene)的质谱图,右图为标准品质谱图。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。在不背离本发明精神和实质的情况下,对本发明方法、步骤或条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。
若未特别指明,本发明实施例中所用的实验材料、试剂和仪器等均可市售获得,若未具体指明,实施例中所用的技术手段均为本领域技术人员所熟知的常规手段。
pGEM-T-easy载体购自Promega公司。
M-MLV RTase cDNA Synthesis Kit购自宝生物工程(大连)有限公司。
Total RNA Purification Kit试剂盒购自LC Sciences公司。
普通DNA产物纯化试剂盒购自北京天根生化科技(北京)有限公司。
平末端连接试剂盒购自宝生物工程(大连)有限公司。
实施例1ASS4的克隆
1.1白木香总RNA的提取及检测
取伤害处理后白木香茎部,液氮研磨成细粉,称取0.5g细粉,依照Total RNA Purification Kit试剂盒方法提取白木香总RNA。具体步骤如下:
(1)取白木香粉末500mg,加入600μl裂解液(Lysis Solution)后混匀样品。
(2)混合均匀后,12000rpm离心2min,将上清液转移到新的离心管中。
(3)加入与上清液等体积(约600μl)的70%的乙醇,充分震荡,涡旋混匀。
(4)将离心柱放入离心管中加入上述液体,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液。
(5)加入400μl含有DNAseI的洗涤液,12000rpm离心1min,倒掉废液。
(6)重复步骤(5)。
(7)用400μl的洗涤液洗柱子,12000rpm离心1min。重复洗柱一次。
(8)倒掉收集管中废液,将离心柱放回收集管中离心2min,室温下放置一段时间使其变干,弃掉收集管。
(9)将离心柱放入试剂盒中的1.7ml抽提管内,加入50μl抽提液。
(10)12000rpm离心2min。为提高所提取的RNA浓度,将所提RNA重新加入离心柱中,12000rpm离心2min。
采用1%琼脂糖凝胶电泳检测RNA,白木香总RNA电泳图如图1所示。采用Nano-Drop2000核酸/蛋白定量仪,检测RNA浓度,剩余RNA置于-80℃保存备用。
1.2cDNA第一条链的合成
以白木香总RNA为模板,参照M-MLV RTase cDNA SynthesisKit说明书的方法合成cDNA的第一条链。
(1)在微量离心管中配制表1所示反应液,全量20μl。
表1
(2)轻柔搅拌混匀。
(3)室温放置10min后,42℃反应1h。
(4)冰中冷却2min。
1.3引物的设计
根据白木香高通量测序结果,运用DNAMAN和Primer5.0软件设计特异引物如下:
ASSF:5’-ggATCCATgTCTTCggCAAAACTAggTTCT-3’(SEQID No.3);
ASSR:5’-CTCgAgTCAgATTTCAATAgCATgACgCAAC-3’(SEQ ID No.4)。
引物由上海生物工程技术服务有限公司合成。
1.4RT-PCR扩增及电泳检测
以反转录产物cDNA为模板,以引物ASSF和引物ASSR为引导,进行PCR扩增。反应体系如表2所示:
表2
根据引物合成的退火温度,设置了touch-down PCR程序,保证得到较好的扩增效果。
PCR程序:95℃5min(预变性);95℃1min(变性),69℃1min(退火每个循环降1℃),72℃2min(延伸),共16个循环;95℃1min,54℃1min,72℃2min,共35个循环;72℃10min。4℃保存。PCR产物在1%琼脂糖凝胶上进行电泳检测,电泳图如图2所示。
1.5PCR产物纯化
采用普通DNA产物纯化试剂盒纯化PCR产物,操作步骤如下:
(1)向吸附柱中加入500μl平衡液,12000rpm离心1min,弃掉废液。
(2)在PCR产物中加入5倍PCR反应液体积的结合液,充分混匀。
(3)所得溶液加入吸附柱,放置2min,12000rpm离心60s,倒掉废液。
(4)加入600μl漂洗液,12000rpm,离心60s,倒掉废液。
(5)再次加入600μl漂洗液,12000rpm离心60s,倒掉废液。
(6)12000rpm离心2min,尽量除尽漂洗液。放置数分钟,彻底晾干。
(7)将吸附柱放到一个干净离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加30μl洗脱缓冲液,室温放置2min,12000rpm离心2min,收集纯化产物溶液。
(8)为了提高DNA的回收量,将离心得到的溶液重新加回离心吸附柱中,重复步骤(7)。
1.6目的片段与pGEM-T-easy载体的连接与转化
由于PCR中高保真酶Pfu酶扩增片段不带A末端,应使用平末端连接试剂盒先加A末端后再连接。
(1)向纯化后的平末端DNA片段3′末端加A,具体的反应体系如表3所示。
表3
(2)反应条件:72℃,保温30min。
(3)pGEM-T-easy载体在冰上融化,短暂离心,避免液体挂在离心管壁上。
(4)按照表4所示内容,在无菌离心管中加入各成分,具体的量根据PCR产物浓度而定,使载体与片段的摩尔比控制在1:3-1:8。将加A末端后的目的片段和pGEM-T-easy载体连接,获得载体pGM-T-ASS4。
表4
(5)轻微混合后,短暂离心。16℃过夜。
(6)转化过程:
(a)向含有Amp抗生素的固体琼脂平板表面加入16μl IPTG(50mg/ml),40μl X-gal(20mg/ml),均匀后避光37℃放置1-2h,使X-gal中的二甲基甲酰胺挥发干净。
(b)转入感受态细胞:
i.取5μl连接产物加入到E.coli TOP10感受态细胞中,轻微混匀,冰浴30min。
ii.42℃水浴90s,冰浴2min。
iii.加入600μl不含抗生物的LB培养基,150rpm,37℃震荡培养45min。
iv.混匀菌液,吸取少量加到含有Ampr的LB固体琼脂培养基上,涂均。干燥后倒置平板,37℃培养16h。
(7)检测:
将平板上的白色菌落接种于3ml LB(含有终浓度为50μg/ml的氨苄青霉素)液体培养基中,37℃,200rpm震荡,培养过夜,保存菌种后提取质粒,应用PCR方法鉴定插入片段是否正确。
PCR体系如表5所示:
表5
PCR程序:Lid 114℃,95℃3min;95℃30s,60℃30s,72℃30s,共30个循环;72℃5min,4℃保存。
PCR产物在1%琼脂糖凝胶上电泳检测,获得阳性菌液。
1.7测序鉴定:
将阳性菌液送由Invitrogrn Biotechlogy Co.,Ltd英骏公司测序,得到正确的阳性转化子。
沉香倍半萜合酶蛋白ASS4的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示,其编码基因ASS4的cDNA序列如SEQ ID No.1所示。
实施例2沉香倍半萜合酶基因ASS4的功能验证
2.1白木香倍半萜合酶基因原核重组表达载体的构建
2.1.1碱裂解法提取质粒
采用TIANGEN公司的高纯度质粒小提中量试剂盒提取质粒,具体操作如下:
(1)向吸附柱中加入500μl的平衡液,12000rpm,离心1min,倒掉废液。
(2)取15ml菌液加入离心管中,12000rpm,离心1min,除净上清。
(3)加入500μl溶液Ⅰ,斡旋悬浮细菌细胞沉淀。
(4)加入500μl溶液Ⅱ,翻转6~8次使菌体充分裂解。
(5)加入700μl的溶液Ⅲ,上下翻转6~8次,充分混匀,出现白色絮状沉淀,12000rpm离心10min。
(6)将上清液分次加入过滤柱,12000rpm,离心2min,收集滤过溶液分次加入吸附柱中。
(7)12000rpm,离心1min,倒掉废液。
(8)加入500μl的去蛋白液,12000rpm,离心1min,倒掉废液。
(9)加入600μl漂洗液,12000rpm离心1min,倒掉废液。
(10)再加入600μl的漂洗液,12000rpm离心1min,倒掉废液。
(11)12000rpm,离心2min,除去吸附柱中残余漂洗液,室温放置晾干,约15min。
(12)将吸附柱置于干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μl TB,放置2min,12000rpm,离心1min,将质粒溶液收集到离心管中。
分别提取pGM-T-ASS4质粒和pET-28a质粒,1%琼脂糖凝胶电泳检测,存于-20℃保存备用。
2.1.2pGEM-T-ASS4和pET-28a载体的酶切
通过Primer5.0和DNAMAN序列分析软件,筛选出pGEM-T-ASS4质粒和pET-28a质粒上均具有的酶切位点,BamHI和XhoI,对质粒进行双酶切,操作如下:
将pGEM-T-ASS4质粒和pET-28a质粒分别用BamHI和XhoI双酶切,双酶切体系如表6所示:
表6
(1)酶切混合物混匀后,30℃酶切3h。酶切产物用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测并回收ASS4基因片段和pET-28a载体片段。
(2)取2μl回收产物用Nano-Drop2000核酸/蛋白定量仪检测产物浓度,并根据浓度设计连接体系。
2.1.3目的片段与载体连接转化
根据载体与目的片段的浓度,使其摩尔比控制在1:3-1:8,反应体系如表7所示:
表7
混匀后置16℃连接过夜。
取5μl连接产物,加到E.coli TOP10感受态细胞中,轻弹混匀,冰浴30min。42℃水浴90s,再冰浴2min。向离心管中加入600μl 37℃不含抗生素的LB培养基,150rpm,37℃震荡培养45min。,吸取100μl菌液,加到含有Kanr的LB固体琼脂培养基上,均匀涂开。待平板表面干燥后,倒置平板,37℃培养16h。
挑取单菌落到3ml LB液体培养基,置于37℃ 200rpm摇床过夜。对菌液进行PCR检测,PCR扩增产物在1%琼脂糖凝胶上电泳检测。阳性菌液送由上海英潍捷基生物技术有限公司测序,获得正确的转化子。
2.1.4重组质粒pET-28a-ASS4的提取
采用高纯度质粒小提中量试剂盒提取pET-28a-ASS4质粒,方法同上。在1%琼脂糖凝胶上电泳检测。
2.2白木香倍半萜合酶的表达
2.2.1表达载体pET-28a-ASS4对大肠杆菌BL21(DE3)pLysS感受态细胞的转化及蛋白的表达
(1)将阳性克隆质粒pET-28a-ASS4转化到原核表达菌株Eco.liBL21(DE3)pLysS感受态细胞,通过菌落PCR鉴定并筛选阳性单菌落。
(2)取阳性菌液,接种到5ml含Camr、Kanr的LB液体培养基中,于37℃ 250rpm培养基中震荡培养过夜。
(3)取10ml培养物接种到500ml相同的培养基中,在37℃250rpm培养基中震荡培养4h至OD 600为0.5-0.6,加入IPTG至终浓度0.5mM,诱导培养一定时间,4℃ 5000rpm离心10min收集菌体。
(4)将菌体重悬于预冷PBS溶液(150mM NaCl,16mMNa2HPO4,4mM NaH2PO4,pH7.3)中,超声波破碎菌体,4℃ 5000rpm离心10min,所得上清液进行SDS-PAGE分析。
2.2.2聚丙烯凝胶电泳(SDS-PAGE)检测
通过聚丙烯凝胶电泳检测蛋白的表达情况,需要配置结构均匀的凝胶。配置胶液时,APS和TEMED最后加入,保证配置过程中出现凝结现象。根据目的蛋白分子量大小选择合适的SDS-PAGE分离胶配制浓度,具体操作步骤如下:
(1)制备分离胶:装配好凝胶模具,将30% Acr-Bis(29:1)、1.5m Tris-HCl(pH8.8)、10%SDS和ddH2O混合均匀,再加入10%APS和TEMED,轻轻搅拌均匀,避免产生气泡。在模具中加入适当分离胶溶液,然后再上面覆盖1层水,以保持凝胶表明平整。静置,待出现清晰界面后,胶已聚合。
(2)制备浓缩胶:弃掉分离胶上的水层,将不同体积的30%Acr-Bis(29:1)、0.5m Tris-HCl(pH6.8)、10%SDS和ddH2O混合均匀,再加入10%APS和TEMED,轻轻搅拌均匀,避免产生气泡。将配制好的浓缩胶加到分离胶上直至模具顶端。小心插入梳子,避免产生气泡。静置至胶聚合。
(3)移去梳子,加入Tris-甘氨酸缓冲液,冲洗加样孔数次,将电源负极与上槽相连。取15μl破碎后的菌体上清液,加入等体积的2×SDS上样缓冲液。
(4)混匀混合液,煮沸5min,向孔中加入15μl混合液,用80V电压电泳至溴酚蓝进入分离胶,提高电压到120V,继续电泳至溴酚蓝达到凝胶底部;
(5)染色:取下凝胶,加入蒸馏水加热至煮沸为止,弃去蒸馏水。加入快速染色体(主成分为靠马斯亮蓝G-250),加热至沸腾为止,弃去染色液。加入蒸馏水,加热煮沸为止,弃去蒸馏水,重复用蒸馏水煮沸脱色直至背景清晰。
2.2.3原核表达条件优化
影响E.coli中可溶性靶蛋白表达量的因素有温度、抗生素浓度、IPTG终浓度、诱导时间。降低诱导的温度可以提高可溶性靶蛋白的表达量;降低IPTG的浓度以减弱诱导强度,可以提高可溶性蛋白的表达量倍半萜合酶的表达;延长培养的时间可以提高可溶性靶蛋白的表达量。
重组表达质粒pET-28a-ASS4诱导表达产物检测图如图3所示。2.2.4ASS4蛋白的纯化
采用BIO-RAD公司的Profinia Protein Purification System纯化系统,纯化超声后蛋白上清液。纯化后得到的蛋白用SDS-PAGE分析。取5ml提取溶于PBS缓冲液中的ASS4蛋白,用0.22μm过滤膜过滤,放到进样口处,在出样口处放置干净的离心管,选择对应的程序,开始纯化。纯化后产物通过SDS-PAGE检测,检测图如图4所示。
2.3原核表达蛋白酶促反应
2.3.1ASS4蛋白的酶促反应
(1)酶促反应体系如下:总体系为200μl,含有Tris-HCl缓冲液buffer(25mM,pH7.0),10%甘油,100mM MgSO4,5mM DTT,46μM FPP,50μl蛋白纯化产物。
(2)混匀后在30℃温育1h。
(3)用固相微萃取SPME吸附挥发物质0.5h。
(4)采用气质联用仪对催化产物进行检测。
ASS4蛋白催化FPP产物的总离子流图如图5所示,其中,1:Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-;2:β-榄香烯(β-elemene);3:α-愈创烯(α-guaiene);4:α-石竹烯(α-Caryophyllene);
5:δ-愈创烯(δ-guaiene)。
2.3.2气质联用(GC-MS)分析
产物使用美国Varian 450气相与Varian 300质谱联用仪进行分析,色谱柱选用30m×0.25mm×0.25μm VF-5MS石英毛细管柱。GC-MS条件:电离方式EI,电子能量70eV,载气为氦气,流速为1mL/min,进样口温度250℃,起始温度为80℃,以5℃/min升至220℃,保持10min,再以10℃/min升至240℃,保持3min。扫描质量质范围30~500amu。
倍半萜产物:Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-的质谱图及标准品质谱图如图6所示(图6中左图为Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-的质谱图,右图为标准品质谱图);倍半萜产物:β-榄香烯(β-elemene)的质谱图及标准品质谱图如图7所示(图7中左图为β-榄香烯(β-elemene)的质谱图,右图为标准品质谱图);倍半萜产物:α-愈创烯(α-guaiene)的质谱图及标准品质谱图如图8所示(图8中左图为α-愈创烯(α-guaiene)的质谱图,右图为标准品质谱图);倍半萜产物:α-石竹烯(α-Caryophyllene)的质谱图及标准品质谱图如图9所示(图9中左图为α-石竹烯(α-Caryophyllene)的质谱图,右图为标准品质谱图);倍半萜产物:δ-愈创烯(δ-guaiene)的质谱图及标准品质谱图如图10所示(图10中左图为δ-愈创烯(δ-guaiene)的质谱图,右图为标准品质谱图)。结果表明本发明的沉香倍半萜合酶可被用于将法尼基焦磷酸催化Cyclohexane,1-ethenyl-1-methyl-2,4-bis(1-methylethenyl)-、β-榄香烯(β-elemene)、α-愈创烯(α-guaiene)、α-石竹烯(α-Caryophyllene)、δ-愈创烯(δ-guaiene)等5种倍半萜。
虽然,上文中已经用一般性说明、具体实施方式及试验,对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
Claims (10)
1.沉香倍半萜合酶蛋白ASS4,其特征在于,所述蛋白为:
(1)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(2)SEQ ID No.2所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等功能的由(1)衍生的蛋白质。
2.权利要求1所述沉香倍半萜合酶蛋白ASS4的编码基因。
3.根据权利要求2所述的基因,其特征在于,所述基因的cDNA序列如SEQ ID No.1所示。
4.含有权利要求2或3所述基因的重组表达载体。
5.根据权利要求4所述的重组表达载体,其特征在于,所述重组表达载体为pET-28a-ASS4,其构建方法包括如下步骤:
(1)提取伤害处理后的白木香总RNA,以白木香总RNA为模板,合成cDNA的第一条链;
(2)以cDNA为模板,以引物ASSF和引物ASSR为引导进行PCR,扩增目的基因ASS4;
(3)将目的基因ASS4克隆至pGEM-T-easy载体,获得载体pGEM-T-ASS4;
(4)将载体pGEM-T-ASS4和pET-28a分别用BamHI和XhoI进行双酶切,回收ASS4基因片段和pET-28a载体片段,连接,获得重组表达载体pET-28a-ASS4。
7.根据权利要求5所述的重组表达载体,其特征在于,步骤(2)中,PCR反应程序为:95℃5min;95℃变性1min,69℃退火1min,72℃延伸2min,共16个循环,其中,每个循环退火步骤温度降1℃;95℃1min,54℃1min,72℃2min,共35个循环;72℃10min。
8.含有权利要求4-7任一项所述重组表达载体的宿主细胞。
9.一种制备沉香倍半萜合酶蛋白ASS4的方法,其特征在于,所述方法为将权利要求2或3所述基因或权利要求4-7任一项所述重组表达载体转化细菌或真菌,通过发酵生产所述沉香倍半萜合酶蛋白。
10.权利要求2或3所述基因在提高植物沉香倍半萜合成中的应用,其特征在于,所述应用为将权利要求2或3所述基因或权利要求4-7任一项所述重组表达载体转化植物,使所述植物具备相应的沉香倍半萜合酶活性,进一步生产沉香倍半萜。
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