CN101768643A - 辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物。本发明提供的方法,包括如下步骤:以小麦基因组DNA为模板,分别用引物对甲和引物对乙进行PCR扩增;如果引物对甲的扩增产物中具有402bp的DNA片段且引物乙的扩增产物中不具有404bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1a;如果引物对乙的扩增产物中具有404bp的DNA片段且引物甲的扩增产物中不具有402bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1b;基因型为TaCwi-A1a的小麦的千粒重在统计学上大于基因型为TaCwi-A1b的小麦品种。本发明可以用于培育高千粒重的优良小麦品种,避免筛选千粒重较低的小麦品种。可在发育早期筛选小麦品种,从而优化杂交组合,加快育种速度,降低育种成本。
Description
技术领域
本发明涉及一种辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物。
背景技术
小麦是世界上最重要的粮食作物之一,它提供的热量和蛋白占人类营养成分的20%以上,全世界有超过35%的人口以小麦为主粮。我国的小麦种植面积、总产和消费量居世界首位,其产量约占我国粮食总产量的1/5。
提高小麦产量是小麦育种的一个重要目标。小麦的单位面积产量是由单位面积穗数、每穗粒数和平均粒重构成的。千粒重在产量构成因素中对产量的直接贡献最大,在群体条件下提高平均单穗粒重是提高品种群体产量潜力的关键。研究表明不同类型小麦品种(多穗型、中间型和大穗型)千粒重每增加1个单位(g),产量分别增加151、157和147kg。小麦产量的高低总是伴随着粒重的高低而同步变化的,在增产年份中,粒重占增产因素的比重达87.4%;而在减产年份,因粒重下降造成产量下降占到94.2%。千粒重在产量构成因素中受遗传特征的影响最大,其遗传主要受加性效应的基因控制,广义遗传力高达59-80%。也有研究结果表明千粒重受三组基因控制,一些微效基因起一定辅助作用。
小麦籽粒粒重受多种因素影响,其中灌浆是影响小麦生长、发育的重要生理过程,其持续时间和速率决定小麦籽粒大小或重量,但灌浆持续时间和灌浆速率受品种、环境、栽培措施等条件的影响。有研究认为小麦籽粒最大粒重主要由灌浆速率和灌浆持续期来决定,但也有研究表明灌浆速率的影响大于灌浆持续时间。不同小麦品种籽粒粒重的差异很大,而其差异主要是由灌浆速率不同引起的,而灌浆速率主要受遗传因素控制,是高产育种的重要选择指标。但多年来一直无法直接对籽粒灌浆性状及其基因进行有效选择,成为育种的瓶颈问题。
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,在筛选水稻遗传资源的基础上,通过构建遗传定位群体,成功分离了控制水稻籽粒发育中蔗糖运输卸载和灌浆的关键功能基因GIF1,研究表明GIF1是水稻驯化过程中起重要作用的一个基因。人工选择可以使现代栽培稻的GIF1基因有严格的组织表达特异性,有利于籽粒灌浆,使水稻产量提高。GIF1基因是控制蔗糖转化酶的一种基因。光合产物以蔗糖的形式被运输到籽粒中,而转化酶可将光合产物的蔗糖不可逆地裂解形成葡萄糖和果糖,植物酸性转化酶主要有两大类:一类结合于细胞壁上,称之为细胞壁结合的转化酶(cell wall—bound invertase,CWI),另一类存在于液泡中,称之为可溶性酸性转化酶(solubleacid invertase,SAI)。在所有形式的转化酶中,不溶性转化酶(即CWI)是库器官形成中决定库强的一个关键酶。玉米芯和胚乳中CWI活性缺失的玉米突变体,在早期籽粒形成阶段,籽粒生长即明显受到抑制,成熟时,粒重只有正常籽粒的1/5。对转基因胡萝卜的研究表明,降低CWI活性,植株不能形成主根。CWI在大麦籽粒形成早期的时空表达和蔗糖运输的一致性,表明其在碳水化合物分配方面起到关键作用。对水稻中OsCIN1基因的RNA原位杂交表明,CWI在籽粒形成阶段中对碳水化合物的供应起决定作用。Sturm和Chrispeels(1990)首先从胡萝卜中分离出了细胞壁结合转化酶(CWI)基因,随后在马铃薯、拟南芥、烟草、番茄和葡萄等植物中也分离到编码该酶的全长或部分的核苷酸序列。目前,有关GIF基因在小麦中的克隆并没有报道。
功能标记(Functional marker)是一类基于基因特征序列开发的标记,与目标基因共分离,大大提高了选择的准确性,在MAS中有着广泛应用前景。而小麦千粒重是一个数量性状,受基因型、环境及其互作的影响。因此,克隆和开发小麦GIF基因对小麦高产育种具有重要意义。
发明内容
本发明的目的是提供辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物。
本发明提供的辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法,包括如下步骤:以小麦基因组DNA为模板,分别用引物对甲和引物对乙进行PCR扩增;如果引物对甲的扩增产物中具有402bp的DNA片段且引物乙的扩增产物中不具有404bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1a;如果引物对乙的扩增产物中具有404bp的DNA片段且引物甲的扩增产物中不具有402bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1b;基因型为TaCwi-A1a的小麦的千粒重在统计学上大于基因型为TaCwi-A1b的小麦品种;所述引物对甲由序列表的序列6所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成;所述引物对乙由序列表的序列5所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成。
本发明还保护序列表的序列6所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成的引物对甲。
本发明还保护序列表的序列5所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成的引物对乙。
本发明同时保护所述引物对甲和/或所述引物对乙在制备辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒中的应用。
本发明还保护一种辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒,包括所述引物对甲和/或权利要求3所述引物对乙。
所述方法,所述应用,所述试剂盒中,所述小麦可为普通小麦。
本发明还保护序列表的序列6所示DNA、序列表的序列7所示DNA和序列表的序列8所示DNA组成的引物组合物。
所述方法,所述引物对甲,所述引物对乙,所述试剂盒和所述引物组合物均可应用于小麦育种。
本发明还保护如下(a)或(b)或(c)或(d)的蛋白质:
(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)由序列表中序列3所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(c)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与小麦千粒重性状相关的由序列1衍生的蛋白质;
(d)将序列3的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与小麦千粒重性状相关的由序列3衍生的蛋白质。
编码所述蛋白的基因也属于本发明的保护范围,所述基因是如下1)或2)或3)或4)的DNA分子:
1)序列表中序列2所示的DNA分子;
2)序列表中序列4所示的DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的DNA序列杂交且编码小麦千粒重性状相关蛋白的DNA分子;
4)与1)或2)或3)限定的DNA序列具有90%以上同源性且编码小麦千粒重性状相关蛋白的DNA分子。
本发明所提供的蛋白及其编码基因,与小麦籽粒粒重性状有着紧密的相关性。本发明还提供了基于该小麦粒重高低相关蛋白基因等位变异的特异性功能标记,利用该标记可以对小麦粒重高低相关基因的变异进行分子标记辅助选择,从而培育高粒重的优良小麦品种,避免筛选粒重较低的小麦品种。应用本发明提供的蛋白及其编码基因以及功能标记辅助选择,可在发育早期筛选小麦品种,从而优化杂交组合,加快育种速度,降低育种成本。本发明提供的检测小麦粒重高低的方法操作简单,可以避免环境等因素对小麦籽粒粒重的影响、稳定可靠,对快速小麦高产育种具有重要的理论意义和经济价值。本发明对小麦籽粒粒重的基因工程改良将起到重要作用,同时也有助于小麦籽粒粒重的遗传和分子生物学的进一步研究,对高产小麦品种的培育也具有重大意义。
附图说明
图1为来源于普通小麦的2个籽粒粒重相关蛋白TaCwi-A1a与TaCwi-A1b的序列对比。
图2为CWI21/CWI22标记对14个不同粒重材料的多态性检测。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。下述实施例中的%,如无特殊说明,均为质量百分含量。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。所有引物合成均由北京奥科生物公司完成。实施例中所用小麦材料均获自中国农业科学院作物科学研究所的国家种质库。
实施例1、与小麦籽粒粒重相关的蛋白及其编码基因的获得
一、TaCwi-A1a蛋白及其编码基因的获得
TaCwi-A1a蛋白编码基因的获得采取电子克隆结合常规PCR扩增的方法。根据水稻粒重相关基因GIF基因(GenBank Accession Number:EU095553)在小麦EST数据库中进行BLAST检索,将筛选得到的EST分别进行拼接,随后根据CK206103、CD927722、CJ673133、D927242电子拼接得到的全长CWI基因,采用Primier Primer5软件设计3对引物C1、C2、C3,从小麦品种豆麦的基因组DNA中获得真正的CWI基因序列。
PCR反应以小麦基因组DNA为模板,在MJ Research PTC-200PCR仪上进行,20μlPCR反应体系为:模板DNA 50ng,Taq酶1U(北京天根生化科技公司),上、下游引物(5μmol·L-1)各1.0μl,dNTP(25μmol·L-1)0.2μl,10×PCR缓冲液2μl,用无菌蒸馏水补充反应体系至20μl。PCR反应采用步降(Touch down)退火程序:首先95℃5min;然后95℃60s,由66℃开始,每个循环的退火温度降低0.3℃,退火时间1min 30s,72℃2min,共40个循环;最后72℃10min,4℃保温。PCR扩增产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳分离,采用缓冲体系为1×TAE溶液,用北京‘六一’厂的DYC-34A型电泳槽,200V电压电泳30分钟,0.5%溴化乙锭(Ethidium bromide,EB)染色10分钟,蒸馏水漂洗后在Multi Genius Bio-Imaging System成像系统上用紫外灯扫描成像并存入计算机。在紫外灯下将目标带挖下来,克隆至pMD18-T载体上进行测序。测序由上海生工生物工程技术服务有限公司(http://www.sangon.com)完成。
为了保证C1、C2、C3扩增片段位于2A染色体上,每对引物都要在中国春缺体-四体系N2A-T2B、N2B-T2A和N2D-T2B中验证,以确保其PCR扩增的基因组专一性。为防止PCR过程中和测序过程中发生碱基错配和误读,每个PCR反应和测序反应都要重复2到4次,每一段序列只有在至少两次测序结果完全一样的情况下才能最终确定,否则还要继续测定。序列比对采用DNAMAN软件(http://www.lynnon.com)进行,得到用于扩增2A染色体上CWI基因全长的三对引物(表1)。基因组中内含子的位置根据GIF基因的mRNA序列和基因组DNA的序列比对来确定。确定其内含子区及起始密码子和终止密码子,并将外显子进行拼接,翻译获得TaCwi-A1a蛋白序列。
表1用于扩增小麦2A染色体上TaCwi基因全长的引物序列
TaCwi-A1a蛋白的序列如序列表的序列1所示,编码基因如序列表的序列2所示。
二、TaCwi-A1b蛋白及其编码基因的获得
TaCwi-A1b蛋白及其编码基因的获得与TaCwi-A1a的获得方法完全相同,所用小麦品种为洋小麦。
TaCwi-A1b蛋白的序列如序列表的序列3所示,编码基因如序列表的序列4所示。
实施例2、小麦籽粒粒重性状与基因型的相关性分析
一、功能标记引物的设计
根据序列表中的序列2、序列4设计两组引物CWI21(引物对乙;P1/P2)和CWI22(引物对甲;P3/P2)如下:
P1(上游引物):5’-GTGGTGATGAGTTCATGGTTAAG-3’(序列5);
P3(上游引物):5’-GGTGATGAGTTCATGGTTAAT-3’(序列6)
P2(下游引物):5’-AGAAGCCCAACATTAAATCAAC-3’(序列7)。
用引物对乙,可以扩增序列表中序列4所示核苷酸中404bp的DNA片段,不能扩增序列表中序列2所示核苷酸中的DNA片段;用引物对甲可以扩增序列表中序列2所示核苷酸中402bp的DNA片段,不能扩增出序列表中序列4所示核苷酸中的DNA片段。
二、小麦籽粒粒重与所述基因的相关性分析
材料I:192份中国冬小麦栽培品种(2001年种植于河南安阳);
材料II:117份中国冬小麦栽培品种(2008年种植于四川成都);
材料III:130份中国冬小麦农家品种(2008年种植于四川成都);
材料IV:48份中国冬小麦农家品种(2008年种植北京)。
1、小麦籽粒千粒重的测定
按GB/T 5519-2008检测小麦籽粒千粒重。
2、小麦基因型的测定
提取各个小麦的基因组DNA,分别按以下步骤进行检测:
①以小麦基因组DNA为模板,分别用CWI21和CWI22进行PCR扩增。
PCR反应体系:模板DNA 50ng,Taq酶1U(北京天根生化科技公司),上、下游引物(5μmol·L-1)各1μl,dNTP(25μmol·L-1)0.2μl,10×PCR缓冲液2μl,用无菌蒸馏水补充反应体系至20μl。
PCR反应程序:首先95℃、5min;然后95℃、1min,58℃(CWI21)或60℃(CWI22)、1min,72℃、1min20s,共40个循环;最后72℃、8min。扩增产物于4℃保存。
②将PCR扩增产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。
图2为14个样本的鉴定结果;泳道M表示分子量标准(Marker);泳道01至14分别为以下品种的小麦:豆麦、中麦9号、川麦39、SW18390、内麦8、山农664、川麦43,凤麦24、石4185、临旱917、豫麦21、绵阳26、川农16、扬麦10;A为CWI22扩增结果,B为CWI21扩增结果。
如果用引物对乙扩增出404bp的条带,而同时用引物对甲扩增不出402bp的条带,说明基因型为TaCwi-A1b;如果引物对甲扩增出402bp的条带,而用引物对乙没有扩增出404bp的条带,说明基因型为TaCwi-A1a。
材料I的192个样本中,146个样本的基因型为TaCwi-A1a,46个样本基因型为TaCwi-A1b。材料I中的小麦的品种、来源、千粒重测定结果和基因型分析结果见表2。
材料II的117个样本中,102个样本的基因型为TaCwi-A1a,15个样本的基因型为TaCwi-A1b。材料II中的小麦的品种、来源、千粒重测定结果和基因型分析结果见表3。
材料III的130个样本中,5个样本的基因型为TaCwi-A1a,125个样本的基因型为TaCwi-A1b。材料III中的小麦的品种、来源、千粒重测定结果和基因型分析结果见表4。
材料IV的48个样本中,5个样本的基因型为TaCwi-A1a,43个样本的基因型为TaCwi-A1b。材料IV中的小麦的品种、来源、千粒重测定结果和基因型分析结果见表5。
表2材料I 192份中国冬小麦品种千粒重测定结果和基因型分析结果
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
1 | PH85-1-1 | a | 56.7 |
2 | 鄂86642 | a | 55.9 |
3 | 临旱6114 | a | 55.7 |
4 | 山东955 | a | 55.2 |
5 | 临旱619 | a | 54.1 |
6 | 鄂81027 | a | 54.0 |
7 | 宁97-41 | a | 53.8 |
8 | 烟239 | a | 53.7 |
9 | 中麦9号 | a | 53.5 |
10 | 99G46 | a | 53.0 |
11 | 临旱619 | a | 53.0 |
12 | 鄂81027 | a | 52.7 |
13 | 宁97-41 | a | 52.6 |
14 | 烟239 | a | 52.3 |
15 | 中麦9号 | a | 52.1 |
16 | 99G46 | a | 52.0 |
17 | 临旱619 | a | 52.0 |
18 | 鄂81027 | a | 51.8 |
19 | 宁97-41 | a | 51.7 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
20 | 烟239 | a | 51.6 |
21 | CA9550 | a | 51.4 |
22 | 京9428 | a | 51.3 |
23 | 河北农大341 | a | 51.2 |
24 | 京冬8 | a | 51.0 |
25 | 云麦42 | a | 51.0 |
26 | 中育6号 | a | 51.0 |
27 | 白玉149 | a | 50.7 |
28 | 云麦46 | b | 50.6 |
29 | 绵阳980127 | a | 50.4 |
30 | 豫麦34号 | a | 50.3 |
31 | 鲁95(6)161 | a | 50.0 |
32 | 临丰615 | a | 49.9 |
33 | 临汾125 | a | 49.5 |
34 | 临汾98-6269 | a | 49.5 |
35 | 河农2552 | a | 49.2 |
36 | 运97169 | a | 49.1 |
37 | 徐858 | b | 49.1 |
38 | 济麦1号 | a | 49.1 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
39 | 川89-107 | a | 48.9 |
40 | 农大116 | a | 48.6 |
41 | 濮优9175 | a | 48.5 |
42 | 西农6426 | b | 48.5 |
43 | 99P102 | a | 48.3 |
44 | 85中33 | a | 48.2 |
45 | 中优9507 | a | 48.0 |
46 | 京农97-86 | a | 48.0 |
47 | 临汾137 | b | 48.0 |
48 | 鲁麦22 | a | 48.0 |
49 | 99G66 | a | 47.8 |
50 | PH85-16 | a | 47.8 |
51 | 中梁88376 | a | 47.5 |
52 | 临汾5232 | a | 47.5 |
53 | 99G80 | a | 47.4 |
54 | 郑州9023 | b | 47.1 |
55 | 豫麦62号 | b | 47.1 |
56 | 晋麦61 | a | 47.0 |
57 | 沧核030 | a | 47.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
58 | 农大99-5009 | b | 46.8 |
59 | 宁97-18 | a | 46.5 |
60 | 徐州26号 | a | 46.4 |
61 | 晋麦60 | a | 46.4 |
62 | 农大3213 | a | 46.2 |
63 | 扬96G25 | b | 45.9 |
64 | 山农60182 | a | 45.9 |
65 | 农大3395 | a | 45.8 |
66 | 农大3197 | a | 45.8 |
67 | 96C1 | a | 45.7 |
68 | 丰优6号 | a | 45.7 |
69 | 周麦13号 | a | 45.6 |
70 | 晋农216 | b | 45.5 |
71 | 98中18 | a | 45.5 |
72 | 豫麦57 | a | 45.5 |
73 | 绵阳940112 | b | 45.4 |
74 | 周91177 | a | 45.4 |
75 | 皖麦19号 | a | 45.4 |
76 | 京农8318 | a | 45.3 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
77 | 淮麦18 | a | 45.3 |
78 | 晋麦67 | a | 45.2 |
79 | 京冬10号 | a | 45.2 |
80 | 883 | a | 45.1 |
81 | 冀5066 | a | 45.1 |
82 | 中育5号 | a | 45.0 |
83 | 烟475 | a | 44.9 |
84 | 宁9940 | b | 44.9 |
85 | 中梁88303 | b | 44.8 |
86 | 992-17 | b | 44.8 |
87 | 93中6(37) | b | 44.7 |
88 | 农大3291 | a | 44.6 |
89 | R59 | a | 44.6 |
90 | R57 | a | 44.5 |
91 | 丰抗2号 | a | 44.4 |
92 | 鄂66378 | b | 44.4 |
93 | R25 | b | 44.1 |
94 | 鄂91727 | a | 44.1 |
95 | 北京837 | a | 44.1 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
96 | CA9722 | a | 44.0 |
97 | 绵阳960107 | a | 43.8 |
98 | 山农413863 | a | 43.8 |
99 | 豫农94268 | a | 43.7 |
100 | 9(54) | a | 43.6 |
101 | 郑州992 | a | 43.5 |
102 | 豫麦50号 | b | 43.5 |
103 | 豫麦70号 | a | 43.5 |
104 | 云麦39 | b | 43.5 |
105 | N9209-3 | b | 43.4 |
106 | 西农12208019 | a | 43.3 |
107 | 原冬107 | a | 43.1 |
108 | 冀3475 | b | 43.1 |
109 | PH82-2-2 | a | 43.0 |
110 | 烟优361 | a | 43.0 |
111 | 安农98005 | b | 43.0 |
112 | 豫麦2号 | a | 43.0 |
113 | 中优9844 | a | 43.0 |
114 | 中作8131-1 | a | 43.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
115 | 陕354 | b | 42.9 |
116 | 冀麦38 | b | 42.9 |
117 | 陕优225 | a | 42.7 |
118 | 宁99415-8 | a | 42.6 |
119 | 宁9952 | a | 42.6 |
120 | 晋农215 | a | 42.5 |
121 | 陕302518 | b | 42.5 |
122 | 宁9548 | b | 42.5 |
123 | 皖麦18 | a | 42.5 |
124 | 徐州25号 | b | 42.5 |
125 | 兰考24号 | a | 42.4 |
126 | 德麦4号 | a | 42.2 |
127 | 豫麦47号 | a | 42.2 |
128 | 绵阳99-17 | a | 42.1 |
129 | 晋麦50 | a | 42.0 |
130 | 豫麦63号 | b | 42.0 |
131 | 冀麦24 | a | 42.0 |
132 | CA9532 | a | 41.9 |
133 | 陕160 | a | 41.8 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
134 | 小偃54 | a | 41.8 |
135 | 风麦24 | b | 41.8 |
136 | 烟99-5 | a | 41.7 |
137 | 豫麦51号 | a | 41.7 |
138 | 豫麦35号 | a | 41.6 |
139 | 安农91168 | a | 41.6 |
140 | 皖麦38 | a | 41.6 |
141 | 宁9766 | a | 41.5 |
142 | 农大3214 | a | 41.4 |
143 | 山农990525 | a | 41.4 |
144 | 农大152 | a | 41.3 |
145 | 中麦16号 | b | 41.3 |
146 | 烟2801 | a | 41.3 |
147 | 陕9314 | b | 41.3 |
148 | 宁9247 | b | 41.2 |
149 | 冀Z76 | a | 41.1 |
150 | 陕623 | b | 41.0 |
151 | 川育12 | a | 41.0 |
152 | 运丰早101 | a | 41.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
153 | 郑州974 | b | 40.9 |
154 | 引11-12 | b | 40.9 |
155 | 山农1355 | a | 40.8 |
156 | 陕229 | a | 40.7 |
157 | HS97-10 | b | 40.5 |
158 | 高优503 | a | 40.2 |
159 | CA9632 | a | 40.1 |
160 | RF-1 | a | 40.1 |
161 | 京411 | a | 40.0 |
162 | 郑州81-1 | a | 40.0 |
163 | 豫麦49号 | a | 40.0 |
164 | 陕93302 | b | 40.0 |
165 | 西农1163-20 | b | 40.0 |
166 | 皖麦33 | a | 40.0 |
167 | 淮麦17 | b | 39.8 |
168 | 原冬971 | a | 39.6 |
169 | 宁9-159 | a | 39.6 |
170 | 晋麦45 | a | 39.5 |
171 | 西农336 | b | 39.2 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
172 | 陕253 | a | 39.0 |
173 | 晋农218 | a | 38.6 |
174 | 绵阳26 | b | 38.6 |
175 | 临旱917 | b | 38.0 |
176 | 凤麦27 | b | 38.0 |
177 | 烟农15 | a | 37.9 |
178 | 安农94022 | a | 37.7 |
179 | CA8686 | a | 37.6 |
180 | 豫农95339 | a | 37.0 |
181 | 云麦44 | a | 36.7 |
182 | Y10-8 | b | 36.6 |
183 | 西农8925-13 | a | 36.4 |
184 | 农大139 | b | 35.8 |
185 | 临优1583 | a | 35.7 |
186 | 运丰早898 | b | 35.1 |
187 | 山东94(6)006 | a | 35.0 |
188 | 豫麦25号 | a | 34.9 |
189 | 藁城8901 | a | 34.5 |
190 | 陕898-33 | a | 33.5 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
191 | 山东955159 | a | 33.4 |
192 | 豫麦21号 | b | 32.4 |
表3材料II中117份小麦品种千粒重测定结果和基因型分析结果
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
1 | 川麦39 | a | 55.0 |
2 | 川育20 | a | 54.8 |
3 | W3734 | a | 54.4 |
4 | 川麦43 | a | 54.2 |
5 | 省预41 | a | 54.2 |
6 | 川07002 | a | 52.7 |
7 | 内麦8号 | a | 52.6 |
8 | 省预25 | a | 52.4 |
9 | MY05Z13 | a | 51.8 |
10 | 省预14 | a | 51.7 |
11 | 川农23 | a | 51.6 |
12 | 川麦32 | b | 51.5 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
13 | 省预55 | a | 51.5 |
14 | 省预3 | a | 51.5 |
15 | 省预57 | a | 51.2 |
16 | 省预2 | a | 50.7 |
17 | SW18390 | a | 50.5 |
18 | 省预15 | a | 50.5 |
19 | 川07005 | a | 50.1 |
20 | 省预59 | a | 50.0 |
21 | 川07001 | a | 49.9 |
22 | 省预46 | a | 49.6 |
23 | 省预7 | a | 49.6 |
24 | 省预9 | a | 49.4 |
25 | 省预28 | a | 49.3 |
26 | 省预10 | a | 49.3 |
27 | D002 | a | 49.3 |
28 | 省预56 | a | 49.2 |
29 | 省预36 | a | 49 |
30 | 省预39 | a | 49 |
31 | 玉脉1号 | a | 48.9 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
32 | 省预8 | b | 48.8 |
33 | 07间434 | a | 48.8 |
34 | 省预18 | a | 48.5 |
35 | 内麦9号 | a | 48.4 |
36 | 川07225 | a | 48.4 |
37 | 省预50 | a | 48.3 |
38 | 省预13 | a | 48.2 |
39 | 华2459 | b | 48.1 |
40 | 川育18 | a | 48.1 |
41 | MY-68 | a | 48.0 |
42 | 绵麦38 | a | 47.8 |
43 | 省预11 | a | 47.8 |
44 | 省预1 | a | 47.6 |
45 | 省预48 | a | 47.5 |
46 | 绵06-367 | a | 46.8 |
47 | 省预6 | a | 46.8 |
48 | 毕2002-2 | b | 46.8 |
49 | 川麦44 | a | 46.7 |
50 | SW29073 | a | 46.6 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
51 | 省预16 | a | 46.6 |
52 | 省预29 | a | 46.3 |
53 | 省预49 | a | 46.3 |
54 | LA0758 | a | 46.3 |
55 | 省预32 | a | 46.0 |
56 | 省预58 | a | 46.0 |
57 | 川育34713 | a | 46.0 |
58 | SW2808 | a | 45.8 |
59 | 川育17 | b | 45.8 |
60 | 川麦42 | a | 45.7 |
61 | XK055-3 | a | 45.7 |
62 | 川00030 | b | 45.6 |
63 | 省预35 | a | 45.6 |
64 | 省预54 | a | 45.5 |
65 | 07RC766 | a | 45.4 |
66 | 省预23 | a | 45.3 |
67 | 内5220 | a | 45.2 |
68 | 省预24 | b | 45.2 |
69 | B991 | a | 45.2 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
70 | 省预53 | a | 44.8 |
71 | 川07品661 | a | 44.8 |
72 | 省预34 | a | 44.4 |
73 | 内5375 | a | 44.4 |
74 | 58769-6 | a | 44.1 |
75 | 省预33 | b | 44.0 |
76 | 省预40 | a | 43.9 |
77 | 贵州98-18 | a | 43.7 |
78 | 省预12 | a | 43.6 |
79 | 襄麦28 | a | 43.3 |
80 | 省预31 | a | 43.2 |
81 | 省预20 | b | 43.0 |
82 | 省预22 | a | 43.0 |
83 | 灌46324 | b | 43.0 |
84 | 南育2号 | a | 42.9 |
85 | 川麦107 | a | 42.8 |
86 | 省预21 | a | 42.7 |
87 | 川06品9 | a | 42.6 |
88 | 省预4 | a | 42.4 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
89 | 08J46 | a | 42.0 |
90 | 川农12 | a | 41.8 |
91 | XK027-4 | a | 41.6 |
92 | 省预30 | a | 41.6 |
93 | 云麦56 | a | 41.5 |
94 | 省预5 | a | 41.4 |
95 | 省预19 | a | 41.1 |
96 | 扬麦12号 | a | 40.9 |
97 | 省预17 | a | 40.8 |
98 | LM07-25 | a | 40.4 |
99 | 川农16 | a | 40.3 |
100 | 省预27 | a | 40.2 |
101 | 绵06-394 | a | 39.6 |
102 | 绵阳26 | b | 39.3 |
103 | 省预38 | b | 38.8 |
104 | 川农17 | a | 38.3 |
105 | Aug-80 | a | 38.2 |
106 | LA-2078 | a | 37.8 |
107 | 凤麦24 | b | 37.8 |
编号 | 品种 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
108 | 扬麦13 | a | 37.7 |
109 | 省预26 | b | 37.0 |
110 | 省预60 | a | 36.0 |
111 | 省预44 | a | 35.0 |
112 | 川育12 | a | 32.6 |
113 | 扬麦9号 | a | 30.0 |
114 | 扬麦158 | a | 28.9 |
115 | 扬麦10号 | b | 27.3 |
116 | 绵阳11 | a | 26.3 |
117 | 繁六 | a | 25.8 |
表4材料III中130份小麦品种千粒重测定结果和基因型分析结果
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
1 | 彰明鱼尾兰麦 | a | 47.0 |
2 | 平武一根麦 | b | 45.5 |
3 | 小红麦 | b | 41.5 |
4 | 白老来变 | b | 40.5 |
5 | 红春麦 | b | 40.0 |
6 | 金黄麦 | b | 40.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
7 | 苏麦 | a | 40.0 |
8 | 海盐种 | b | 38.5 |
9 | 短麦 | b | 38.0 |
10 | 巫山小麦 | a | 37.8 |
11 | 大红麦 | b | 37.5 |
12 | 青兰麦 | b | 37.0 |
13 | 白长梢 | b | 36.5 |
14 | 红芒麦 | b | 35.0 |
15 | 紫皮丝瓜头 | b | 35.0 |
16 | 皮龙2号 | b | 35.0 |
17 | 草鞋底 | b | 35.0 |
18 | 营山三月黄 | b | 34.0 |
19 | 红壳洋麦 | b | 34.0 |
20 | 沐川本地光头小麦 | b | 33.5 |
21 | 铁堡麦 | b | 33.5 |
22 | 锉刀丝瓜头 | b | 33.5 |
23 | 露子青 | b | 33.5 |
24 | 小光头 | b | 33.5 |
25 | 细籽细麦 | b | 33.0 |
26 | 大黄皮 | b | 32.5 |
27 | 红麦 | b | 32.5 |
28 | 火烧百日麦 | b | 32.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
29 | 海盐种 | b | 32.0 |
30 | 雪里青 | b | 32.0 |
31 | 洋小麦 | b | 32.0 |
32 | 白光浪头 | b | 32.0 |
33 | 打鼓锤 | b | 32.0 |
34 | 车锏子 | b | 32.0 |
35 | 红芒小麦 | b | 32.0 |
36 | 白皮小麦 | b | 32.0 |
37 | 大蚰子 | b | 31.5 |
38 | 毛蒲 | b | 31.5 |
39 | 中江长芒白小麦 | b | 31.0 |
40 | 南充大光头小麦 | b | 31.0 |
41 | 红蚰子 | a | 31.0 |
42 | 长芒芒 | b | 31.0 |
43 | 有芒小麦 | b | 31.0 |
44 | 放赈 | b | 31.0 |
45 | 三合六棱 | b | 31.0 |
46 | 通江红麦 | b | 30.5 |
47 | 红长萁 | b | 30.5 |
48 | 罗旁头 | b | 30.5 |
49 | 霉前五 | b | 30.5 |
50 | 河婆麦 | b | 30.5 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
51 | 蓬安三月黄 | b | 30.0 |
52 | 井研小麦 | b | 30.0 |
53 | 长秆车锏子 | b | 30.0 |
54 | 大黄皮 | b | 30.0 |
55 | 洋小麦2 | a | 30.0 |
56 | 颖上红 | b | 30.0 |
57 | 白葫芦头 | b | 30.0 |
58 | 六柱头洋小麦 | b | 29.5 |
59 | 小玉花 | b | 29.5 |
60 | 大红袍 | b | 29.5 |
61 | 红橹麦 | b | 29.5 |
62 | 四川原古宋大红花(1) | b | 29.0 |
63 | 射洪大榆 | b | 29.0 |
64 | 六柱头 | b | 29.0 |
65 | 长萁白壳 | b | 29.0 |
66 | 虾儿红 | b | 29.0 |
67 | 鸭舌子 | b | 29.0 |
68 | 大红芒 | b | 29.0 |
69 | 泸县白麦子(2) | b | 28.5 |
70 | 黄县大粒 | b | 28.5 |
71 | 有芒长四方 | b | 28.5 |
72 | 红芒麦 | b | 28.5 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
73 | 白壳早梅 | b | 28.5 |
74 | 丈四黄 | b | 28.0 |
75 | 毛头麦 | b | 28.0 |
76 | 车锏子 | b | 28.0 |
77 | 毛头子 | b | 28.0 |
78 | 四川原古宋大红花(2) | b | 27.5 |
79 | 光头麦 | b | 27.5 |
80 | 蚂蚱头火麦 | b | 27.0 |
81 | 百脚子 | b | 27.0 |
82 | 瘸腿麦 | b | 27.0 |
83 | 鸭嘴子 | b | 27.0 |
84 | 仓蒲子 | b | 27.0 |
85 | 西南早 | b | 27.0 |
86 | 红壳麦 | b | 27.0 |
87 | 白壳麦 | b | 27.0 |
88 | 油麦 | b | 27.0 |
89 | 四川长须须油条 | b | 26.7 |
90 | 泸县无芒红花麦 | b | 26.5 |
91 | 小红麦 | b | 26.5 |
92 | 红壳矮萁 | b | 26.5 |
93 | 和尚头 | b | 26.0 |
94 | 早小麦 | b | 26.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
95 | 葫芦头 | b | 26.0 |
96 | 秃头麦(乙) | b | 26.0 |
97 | 北碚赤壳涿麦 | b | 25.5 |
98 | 观音杜麦 | b | 25.5 |
99 | 盐边青稞麦 | b | 25.0 |
100 | 金钗种 | b | 25.0 |
101 | 菜子黄 | b | 24.0 |
102 | 菜子黄 | b | 24.0 |
103 | 无芒鸭子嘴 | b | 24.0 |
104 | 霉前五 | b | 24.0 |
105 | 早十天 | b | 23.5 |
106 | 黄芒子 | b | 23.0 |
107 | 通江小红麦 | b | 22.5 |
108 | 白光头 | b | 22.5 |
109 | 红芒麦 | b | 22.5 |
110 | 红麦 | b | 22.5 |
111 | 四川无名小麦 | b | 22.0 |
112 | 江北大脑壳 | b | 22.0 |
113 | 葫芦头 | b | 22.0 |
114 | 和尚头 | b | 22.0 |
115 | 钻头白壳 | b | 22.0 |
116 | 康定本地黄花麦 | b | 21.5 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
117 | 白毛麦 | b | 21.5 |
118 | 尖头白 | b | 21.5 |
119 | 红小麦 | b | 20.5 |
120 | 南江青杠麦 | b | 20.0 |
121 | 宜山小麦 | b | 19.0 |
122 | 红蚂蚱麦 | b | 18.5 |
123 | 鸭嘴小麦 | b | 18.5 |
124 | 金包银 | b | 18.0 |
125 | 葫芦头 | b | 17.5 |
126 | 小红芒 | b | 17.3 |
127 | 五花头 | b | 17.0 |
128 | 天等小麦 | b | 16.5 |
129 | 齐头白 | b | 15.0 |
130 | 红芒红 | b | 13.5 |
表5材料IV中48份小麦品种千粒重测定结果和基因型分析结果
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
1 | 白洋麦 | a | 40.0 |
2 | 红春麦 | a | 38.5 |
3 | 火烧头 | b | 38.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
4 | 亮麦 | b | 38.0 |
5 | 长腰麦 | b | 35.5 |
6 | 高芒麦 | a | 35.5 |
7 | 白光头 | b | 34.5 |
8 | 红光头 | b | 34.0 |
9 | 白葫芦头(无芒) | b | 33.0 |
10 | 尖头白 | b | 33.0 |
11 | 大蚰子 | b | 32.0 |
12 | 小红麦 | b | 31.0 |
13 | 大红麦 | b | 30.0 |
14 | 车锏子 | b | 30.0 |
15 | 下府麦 | b | 30.0 |
16 | 白秃头 | b | 30.0 |
17 | 三月黄 | b | 29.5 |
18 | 白壳红(无芒) | a | 29.5 |
19 | 白葫芦头(长芒) | b | 29.5 |
20 | 红兰麦 | b | 29.5 |
21 | 短钻子头 | b | 29.0 |
22 | 小麦 | b | 29.0 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
23 | 白糠亮麦 | b | 29.0 |
24 | 黄县大粒 | b | 29.0 |
25 | 一支花 | b | 29.0 |
26 | 大白芒 | b | 29.0 |
27 | 小红花 | b | 29.0 |
28 | 红芒麦 | b | 29.0 |
29 | 红蚂蚱麦 | b | 28.0 |
30 | 蚂蚱头麦 | b | 28.0 |
31 | 红芒麦 | b | 28.0 |
32 | 离子3号 | b | 27.5 |
33 | 光头小麦 | b | 27.5 |
34 | 红葫芦头 | a | 27.0 |
35 | 鱼鳞白 | b | 27.0 |
36 | 白秃头 | b | 27.0 |
37 | 红芒红 | b | 26.0 |
38 | 葫芦头 | b | 26.0 |
39 | 白皮麦 | b | 26.0 |
40 | 葫芦头 | b | 26.0 |
41 | 有芒小麦 | b | 25.5 |
编号 | 品种名称 | 基因型分析结果a:TaCwi-A1a;b:TaCwi-A1b | 千粒重(g) |
42 | 白壳红(长芒) | b | 24.5 |
43 | 河南光头麦 | b | 24.5 |
44 | 光脑麦 | b | 24.5 |
45 | 三月黄 | b | 24.0 |
46 | 罗城小麦 | b | 23.0 |
47 | 秃把麦 | b | 19.5 |
48 | 钻头白亮 | b | 18.0 |
对不同基因型小麦的籽粒粒重进行统计分析,发现有显著差异,见表6。
表6小麦等位变异与籽粒粒重高低关系的统计分析结果
通过小麦千粒重与所述基因的相关性分析,得出以下结论:以小麦基因组DNA为模板,分别用引物甲和引物对进行扩增,如果用引物对乙扩增出404bp的条带,而同时用引物对甲扩增不出402bp的条带,说明基因型为TaCwi-A1b,具有低千粒重;如果用引物对甲扩增出402bp的条带,而用引物对乙没有扩增出404bp的条带,说明基因型为TaCwi-A1a,具有高千粒重。基因型为TaCwi-A1a的小麦品种的千粒重在统计学上大于基因型为TaCwi-A1b的小麦品种。
序列表
<110>中国农业科学院作物科学研究所
<120>辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法及其专用引物
<130>CGGNARY102160
<160>7
<210>1
<211>588
<212>PRT
<213>小麦属普通小麦(Triticum aestivum L.)
<400>1
Met Val Val Leu Gly Gly Arg Val Ala Trp Ala Cys Ser Val Leu Leu
1 5 10 15
Leu Leu Gln Leu Ala Gly Ala Ser His Val Val Tyr Glu Thr His Leu
20 25 30
Leu Glu Ala Glu Ala Ala Ala Ala Asp Val Pro Pro Ser Ile Leu Asp
35 40 45
Pro Glu Leu Ser Thr Gly Tyr His Phe Arg Pro Ile Lys Asn Trp Ile
50 55 60
Asn Asp Pro Asn Ala Pro Met Phe Tyr Lys Gly Trp Tyr His Phe Phe
65 70 75 80
Tyr Gln Tyr Asn Pro Lys Gly Ala Val Trp Gly Asn Ile Val Trp Ala
85 90 95
His Ser Val Ser Arg Asp Leu Ile Asn Trp Val Ala Leu Glu Thr Ala
100 105 110
Ile Gln Pro Ser Ile Lys Ser Asp Lys Tyr Gly Cys Trp Ser Gly Ser
115 120 125
Ala Thr Ile Leu Arg Asp Gly Thr Pro Ala Ile Met Tyr Thr Gly Ile
130 135 140
Asp Arg Gly Asp Ile Asn Tyr Glu Val Gln Asn Ile Ala Phe Pro Lys
145 150 155 160
Asn Lys Ser Asp Pro Leu Leu Arg Glu Trp Val Lys Pro Lys Ser Asn
165 170 175
Pro Ile Ile Val Pro Glu Gly Gly Ile Asn Ala Thr Gln Phe Arg Asp
180 185 190
Pro Thr Thr Ala Trp Tyr Ala Asp Gly His Trp Arg Leu Leu Ile Gly
195 200 205
Ala Leu Ser Gly Ala Ser Arg Gly Val Ala Tyr Val Tyr Arg Ser Arg
210 215 220
Asp Phe Met Arg Trp Thr Arg Val Arg Lys Pro Leu His Ser Ala Pro
225 230 235 240
Thr Gly Met Trp Glu Cys Pro Asp Leu Tyr Pro Val Thr Val Asp Gly
245 250 255
Arg Gln Asn Gly Leu Asp Thr Ser Val Thr Ser Ser Pro Lys Val Lys
260 265 270
His Val Leu Lys Asn Ser Leu Asp Leu Arg Arg Tyr Asp Tyr Tyr Thr
275 280 285
Val Gly Thr Tyr Asp Arg Lys Thr Glu Arg Tyr Val Pro Asp Asn Pro
290 295 300
Ala Gly Asp Glu His His Leu Arg Tyr Asp Tyr Gly Asn Phe Tyr Ala
305 310 315 320
Ser Lys Thr Phe Tyr Asp Pro Val Lys Arg Arg Arg Ile Leu Trp Gly
325 330 335
Trp Ala Asn Glu Ser Asp Thr Ala Val Asp Asp Val Ala Lys Gly Trp
340 345 350
Ala Gly Ile Gln Ala Ile Pro Arg Lys Val Trp Leu Asp Pro Ser Gly
355 360 365
Arg Gln Leu Met Gln Trp Pro Val Glu Glu Leu Glu Ala Leu Arg Ala
370 375 380
Lys Lys Pro Val Ser Leu Lys Asp Arg Val Val Lys Arg Gly Glu His
385 390 395 400
Val Glu Val Thr Gly Leu Arg Ser Ser Gln Ala Asp Val Glu Val Ser
405 410 415
Phe Glu Val Pro Ser Leu Glu Gly Ala Glu Ala Leu Asp Pro Ala Leu
420 425 430
Ala Asn Asp Ala Gln Lys Leu Cys Ser Leu Arg Gly Ala Asp Val Glu
435 440 445
Gly Gly Val Gly Pro Phe Gly Leu Trp Val Leu Ala Ser Ser Lys Leu
450 455 460
Glu Glu Lys Thr Ala Val Phe Phe Gln Val Phe Lys Ala Ala Arg Asn
465 470 475 480
Ile Asn Ser Thr Lys Pro Val Val Leu Met Cys Ser Asp Pro Thr Thr
485 490 495
Ser Ser Leu Asn Pro Asn Leu Tyr Lys Pro Thr Phe Ala Gly Phe Val
500 505 510
Asp Thr Asp Ile Ala Lys Gly Lys Ile Ser Leu Arg Ser Leu Ile Asp
515 520 525
Arg Ser Val Ile Glu Ser Phe Gly Ala Gly Gly Arg Thr Cys Ile Leu
530 535 540
Ser Arg Val Tyr Pro Thr Leu Ala Leu Gly Lys Asn Ala His Leu His
545 550 555 560
Val Phe Asn Asn Gly Lys Ala Asp Ile Lys Val Ser Gln Leu Thr Ala
565 570 575
Trp Glu Met Lys Lys Pro Ala Leu Met Asn Gly Ala
580 585
<210>2
<211>3506
<212>DNA
<213>小麦属普通小麦(Triticum aestivum L.)
<400>2
gccccagtgt gagagcaatg gtagttctcg ggggaagagt tgcatgggca tgctcggtgc 60
tgctgctgtt gcagctcgcc ggggcgtcgc atgtcgtcta cgagacccac ctcctggagg 120
cggaggcggc ggcggccgac gtgccgcctt cgattcttga ccccgagctg agcacggggt 180
accacttccg gccgataaag aactggatca atggtacatg cccactgacc catctctcct 240
gctcgagcta gagcgaagct tagagctagc taggcagacc tccttctttt gcatggctaa 300
agaaaccaac ggtgtgtagt agcactagct cgtccttgct cttcggacaa ctgaacttca 360
aaaccatgca tggccggcgg agggtgggtg gtcagtttct tgggccatac aagaaacttt 420
cgtaatcgtg tccatttatg ttttgttact aaatttagct aggtcatacg gtgctcagtt 480
tgtgtagtac cactatactg ctttacaaga agcaagaaca tgcatgcttt aggactagct 540
ctcagtgaac tgactacggt cacggggctc ctccggtgtc cagtgagcta gagctgcttt 600
agctagcttg cacttgtgtg gcctgagcag tatcctactc ctaataccgt ggattagttt 660
aataacgatg catatatttt attttatttg caaaggttta taactggctc taacttgacg 720
gttttttttt atcatcatca tgttggtggt tgccggatgc cacaccagat cccaacggta 780
cgtcgtcctt ctcccgcgct tgttttaata tcctgtcacg cgtctctgtc gcgtcttcaa 840
tttgatgcta tctgctacaa gaatccgtgt tctgcaactt gcaaccccgt tgaacagcaa 900
cgccttttcg tcctgattat acgtactagc taaacaacac atatacaggc atgcatgcat 960
gcatgctgca tggctcgtga actcgcagcc ccatacacaa accattaacg aatgaaaata 1020
attggctcgc cattaacctt cactgagata atctcttcat gggaatgtga actggacttg 1080
tgatttggtg aaatttggtg catgcagcgc ccatgttcta caaggggtgg taccatttct 1140
tctaccagta caaccccaag ggggcggtgt ggggcaacat cgtgtgggcg cactcggtgt 1200
cgcgcgacct catcaactgg gtggcgctgg agacggccat ccagcccagc atcaagtccg 1260
acaagtacgg ctgctggtcg ggctcggcca ccatcctgcg cgacggcacg ccggcgatca 1320
tgtacacggg catcgaccgc ggcgacatca actacgaggt gcagaacatc gccttcccca 1380
agaacaagtc ggacccgctg ctccgcgagt gggtcaagcc caagagcaac ccgatcatcg 1440
tgccggaggg cggcatcaac gccacccaat tccgggaccc gaccaccgcg tggtacgccg 1500
acggccactg gcggctgctc atcggcgccc tctctggcgc gtcccgcggc gtggcgtacg 1560
tgtaccggag ccgcgacttc atgcggtgga cgcgggtgag gaagccgctg cactcggcgc 1620
ccacggggat gtgggagtgc ccggacctgt acccggtcac ggtggacggc cggcagaacg 1680
ggctcgacac ctccgtcacg tccagcccca aggtgaagca cgtgctgaag aacagcctcg 1740
acctgcgccg ctacgactac tacaccgtcg gcacctacga ccggaagacg gagcggtacg 1800
tgccggacaa ccccgccggc gacgagcacc acctgcggta cgactacggc aacttctacg 1860
cctccaagac gttctacgac cccgtcaagc gccgccgcat cctctggggc tgggccaacg 1920
agtccgacac cgccgtcgac gacgtcgcca agggatgggc cggaatccag gtagctgcct 1980
aatcatatca tatgctggtg tacgtagtaa ccaaaaaact ttcatgtgca ccatgcatgc 2040
atggtctcag ttattatccg tgtgatattt tcaggcgatt ccgaggaagg tttggctgga 2100
cccgagtggg aggcagctga tgcagtggcc cgtggaggag cttgaggcgc tgagggcgaa 2160
aaagccggtg agtctcaagg accgggtggt gaagcgggga gagcacgtcg aggtcaccgg 2220
gctacgaagc tcacaggtga gcgtgcgtgc ctttctgagt tagttcgtgt gcaatcaagg 2280
tgacattttc tagtctagga ccaaaaggcg atcgagatca ctatgtacgt actgccttgc 2340
cttgagtggc gccggccctg cagaatatat tgcccagcca gtagtatgtg ttatcctgga 2400
ccgtgctatc ttatccggcg cgcttctcat ccgagttgtg tccagtgtgc agtgcccact 2460
ctcttgtgcc ttttctactc cgtagatttc actacacctg tcctgcactt taacctcagc 2520
tcggcgtcat gcgttctgtt ccggtccatt acagcttaga aaactagact cgtcgtcacg 2580
cgcacattgg cattggcctt gcacgcacac ctccaatcta gctaggctcc aactgaactg 2640
gtgcaaccta acaatagatc gttttaattt gaccaacata atgtctgttc ccttttgtaa 2700
gcgtgtggtg atgagttcat ggttaattac cggactaact tgtttcatca ggctgacgtc 2760
gaggtgagct ttgaggtgcc gagcctggag ggagcggagg cgctggaccc ggcgctagcc 2820
aacgacgccc agaagctgtg cagcttgagg ggtgccgacg tggaaggcgg cgtgggcccc 2880
ttcggtctgt gggtgctcgc ctcgtccaag ctggaggaga agacggcggt cttcttccag 2940
gtgttcaagg ccgcgcgcaa catcaacagc accaagccgg tggtcctcat gtgctccgac 3000
cccaccacgt aatgacatct cctgatcctc atttctccct taaattcatt atttctcacg 3060
catgtgacat gcacacatta gctagcgttg atttaatgtt gggcttcttt gctcggtgca 3120
ggtcatcttt gaacccgaac ctctacaagc cgacgttcgc aggctttgtt gatactgaca 3180
tagcgaaggg caagatatct ctgaggagtc tggtacgata ttggctacca tatgttcctc 3240
atctcgtaca tacaatatat aagttaacaa atggatcatt cgtactgctt ttgtttgccc 3300
atactttctc tgtctagatt gatcggtccg tcatcgagag cttcggggca ggaggcagga 3360
cctgcatcct ctcccgggtt tatccaacgc tcgccctagg caagaacgct caccttcatg 3420
ttttcaacaa cggcaaggcg gacatcaagg tgtcacagct cacggcgtgg gagatgaaga 3480
agccagcgct catgaacggt gcttag 3506
<210>3
<211>588
<212>PRT
<213>小麦属普通小麦(Triticum aestivum L.)
<400>3
Met Val Val Leu Gly Gly Arg Val Ala Trp Ala Cys Ser Val Leu Leu
1 5 10 15
Leu Leu Gln Leu Ala Gly Ala Ser His Val Val Tyr Glu Thr His Leu
20 25 30
Leu Glu Ala Glu Ala Ala Ala Ala Asp Val Pro Pro Ser Ile Leu Asp
35 40 45
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50 55 60
Asn Asp Pro Asn Ala Pro Met Phe Tyr Lys Gly Trp Tyr His Phe Phe
65 70 75 80
Tyr Gln Tyr Asn Pro Lys Gly Ala Val Trp Gly Asn Ile Val Trp Ala
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115 120 125
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130 135 140
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Asn Lys Ser Asp Pro Leu Leu Arg Glu Trp Val Lys Pro Lys Ser Asn
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Pro Thr Thr Ala Trp Tyr Ala Asp Gly His Trp Arg Leu Leu Ile Gly
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Ala Leu Ser Gly Ala Ser Arg Gly Val Ala Tyr Val Tyr Arg Ser Arg
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His Val Leu Lys Asn Ser Leu Asp Leu Arg Arg Tyr Asp Tyr Tyr Thr
275 280 285
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Ala Gly Asp Glu His His Leu Arg Tyr Asp Tyr Gly Asn Phe Tyr Ala
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Ser Lys Thr Phe Tyr Asp Pro Val Lys Arg Arg Arg Ile Leu Trp Gly
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Ala Gly Ile Gln Ala Ile Pro Arg Lys Val Trp Leu Asp Pro Ser Gly
355 360 365
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Asp Thr Asp Ile Ala Lys Gly Lys Ile Ser Leu Arg Ser Leu Ile Asp
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565 570 575
Trp Glu Met Lys Lys Pro Ala Leu Met Asn Gly Ala
580 585
<210>4
<211>3506
<212>DNA
<213>小麦属普通小麦(Triticum aestivum L.)
<400>4
gccccagtgt gagagcaatg gtagttctcg ggggaagagt tgcatgggca tgctcggtgc 60
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tagcgaaggg caagatatct ctgaggagcc tggtacgata ttggctacca tatgttcctc 3240
atctcgtaca tacaatatat aagttaacaa atggatcatt cgtactgatt ttgtttgccc 3300
atactttctc tgtctagatt gatcggtccg tcatcgagag cttcggggca ggaggcagga 3360
cctgcatcct ctcccgggtt tatccaacgc tcgccctagg caagaacgct caccttcatg 3420
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<210>5
<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>
<400>5
gtggtgatga gttcatggtt aag 23
<210>6
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>
<400>6
ggtgatgagt tcatggttaa t 21
<210>7
<211>22
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>
<400>7
agaagcccaa cattaaatca ac 22
Claims (10)
1.辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的方法,包括如下步骤:以小麦基因组DNA为模板,分别用引物对甲和引物对乙进行PCR扩增;如果引物对甲的扩增产物中具有402bp的DNA片段且引物乙的扩增产物中不具有404bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1a;如果引物对乙的扩增产物中具有404bp的DNA片段且引物甲的扩增产物中不具有402bp的DNA片段,待测小麦的基因型为TaCwi-A1b;基因型为TaCwi-A1a的小麦的千粒重在统计学上大于基因型为TaCwi-A1b的小麦品种;所述引物对甲由序列表的序列6所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成;所述引物对乙由序列表的序列5所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成。
2.序列表的序列6所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成的引物对甲。
3.序列表的序列5所示DNA和序列表的序列7所示DNA组成的引物对乙。
4.权利要求2所述引物对甲和/或权利要求3所述引物对乙在制备辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒中的应用。
5.辅助鉴定具有不同千粒重性状小麦的试剂盒,包括权利要求2所述引物对甲和/或权利要求3所述引物对乙。
6.如权利要求1所述方法,如权利要求4所述应用,如权利要求5所述试剂盒,其特征在于:所述小麦为普通小麦。
7.序列表的序列6所示DNA、序列表的序列7所示DNA和序列表的序列8所示DNA组成的引物组合物。
8.权利要求1所述方法,权利要求2所述引物对甲,权利要求3所述引物对乙,权利要求5所述试剂盒或权利要求7所述引物组合物在小麦育种中的应用。
9.如下(a)或(b)或(c)或(d)的蛋白质:
(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)由序列表中序列3所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(c)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与小麦千粒重性状相关的由序列1衍生的蛋白质;
(d)将序列3的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与小麦千粒重性状相关的由序列3衍生的蛋白质。
10.编码权利要求9所述蛋白质的基因,是如下1)或2)或3)或4)的DNA分子:
1)序列表中序列2所示的DNA分子;
2)序列表中序列4所示的DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的DNA序列杂交且编码小麦千粒重性状相关蛋白的DNA分子;
4)与1)或2)或3)限定的DNA序列具有90%以上同源性且编码小麦千粒重性状相关蛋白的DNA分子。
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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