CN101668850B - 新的n-乙酰葡糖胺-2-表异构酶以及使用该酶生产cmp-神经氨酸的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和用于生产CMP-神经氨酸的方法,更具体涉及来源于脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC9343的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和使用所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶生产CMP-N-乙酰神经氨酸的方法。根据本发明,CMP-N-乙酰神经氨酸可使用作为廉价底物的胞苷磷酸和N-乙酰-D-葡糖胺通过一步反应被大量经济地生产。

Description

新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶以及使用该酶生产CMP-神经氨酸的方法
技术领域
本发明涉及新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和用于生产CMP-神经氨酸的方法,更具体涉及来源于脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC9343的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和使用所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶生产CMP-N-乙酰神经氨酸的方法。 
背景技术
近来,由于对糖链的结构和功能的研究迅速发展,寡聚糖、糖脂和糖蛋白以及类似物的生理活性及作为药物或功能物质的使用的发展受到人们的关注。其中,末端具有N-乙酰神经氨酸(NeuAc)的含唾液酸的糖链具有重要的功能,诸如在细胞粘着或者病毒感染时起到受体的作用。 
含唾液酸的糖链一般通过唾液酸转移酶的催化合成。唾液酸转移酶是使用CMP-N-乙酰神经氨酸(CMP-NeuAc)作为糖供体将唾液酸转移到受体,诸如糖链的酶。但是,被用作糖供体的CMP-NeuAc非常昂贵,并且仅仅供应以仅仅足够用作试剂的很少的量。 
已知的用于生产CMP-NeuAc的方法包括使用5’-胞苷三磷酸(CTP)和N-乙酰神经氨酸(NeuAc)作为底物通过CMP-NeuAc合成酶的作用合成CMP-NeuAc,但被用作生产CMP-NeuAc的原材料CTP和NeuAc非常昂贵,因此使用这些材料合成的CMP-NeuAc也非常昂贵。 
近来,发展了将乳清酸转化成尿嘧啶5’-三磷酸(UTP)的产氨短杆菌(Brevibacterium ammoniagenes)与生产催化UTP转化成CTP的反应的CTP合成酶的重组大肠杆菌和生产CMP-NeuAc合成酶的重组大肠杆 菌组合,并在重组有机体中使用乳清酸和NeuAc作为原材料合成CMP-NeuAc的方法。虽然该方法没有使用昂贵的CTP,但其并不被认为是一种实用的方法,因为该过程很复杂,例如,由于使用多种细菌菌株制备重组菌株,必须准备用于实施该过程的很大尺寸的操作台,并且仍然需要用昂贵的NeuAc作为原材料。 
同时,关于NeuAc的制备,包括从微生物中收集作为唾液酸聚合物的多聚乙酰神经氨糖酸(colominic acid)并将收集的多聚乙酰神经氨糖酸化学分解的方法是已知的,然而使用酶催化生产NeuAc的方法是新近才发展起来的。 
已经报道的生产CMP-神经氨酸(CMP-NeuAc)的方法包括:(1)通过N-乙酰-D-甘露糖胺(ManNAc)使用N-乙酰神经氨酸裂解酶或者N-乙酰神经氨酸合成酶催化生产CMP-NeuAc的方法(J.Am.Chem.Soc.,110:6481,1988;J.Am.Chem.Soc.,110:7159,1988;日本专利公开10-4961);(2)在碱性条件下通过将N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)转化成N-乙酰甘露糖胺(ManNAc)并将N-乙酰神经氨酸裂解酶或者N-乙酰神经氨酸合成酶加入到其中以生产N-乙酰神经氨酸(NeuAc)的方法(日本专利公开5-211884;Biotechnol.Bioeng.,66:2,1999;Enzyme Microb.Technol.,20,1997),(3)使用催化GlcNAc转化成MamNAc的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶,和NeuAc裂解酶或合成酶由GlcNAc生产CMP-NeuAc的方法(WO 95/26399;日本专利公开3-180190;日本专利公开2001-136982);以及(4)使用大肠杆菌和酵母菌合成CMP-N-乙酰神经氨酸的方法(WO2004/009830)。 
但是,方法(1)具有的问题在于:原材料N-乙酰甘露糖胺(ManNAc)很贵,方法(2)使用廉价的N-乙酰葡糖胺(GlcNAc),但具有的问题在于从GlcNAc和N-乙酰甘露糖胺(ManNAc)的混合物中纯化ManNAc的过程很复杂。而且,方法(3)具有的问题在于,由于GlcNAc2-表异 构酶需要昂贵的ATP,ATP必须被加入或者必须利用微生物由ATP前体腺嘌呤生产,方法(4)具有的问题在于,该过程由于使用大肠杆菌和酵母细胞而非常复杂。 
N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶已知在猪或鼠的肾脏、肝脏、脾、大脑、肠液、胸腺、胰腺、唾液腺中被发现,其性质已经使用来源于猪的酶进行了检查,并且表异构酶主要从来自动物的基因中提取并进行研究(Biochemistry,17:3363,1970;Biochem.J.,210:21,1983;PNAS,52:371,1964)。而且,作为来源于猪的基因的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶基因是已知的(J.Biol.Chem.,271:16294,1996)。在微生物中,一种蓝细菌(Cyanobacteria),集胞藻属(Synechocystis sp.)PCC 6803的全基因组序列被测定,并且从基因组中确认了N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的基因序列(DNA Research,3:109,1996;Nucleic Acids Research,26:63,1998)。同时,韩国专利公开10-2001-0102019涉及N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和编码该酶的DNA,并公开了该发明的发明人在一种蓝细菌(Cyanobacteria),集胞藻属(Synechocystis)中发现的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶并且使用DNA编码该N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的的方法。 
而且,韩国专利公开10-2006-0010706公开了如下生产CMP-N-乙酰神经氨酸的方法:通过将胞苷酸(CMP)、N-乙酰葡糖胺、丙酮酸和酵母加入到用含有由编码N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的基因和编码N-乙酰神经氨酸醛缩酶的基因的共表达载体转化的重组菌株中,从而产生神经氨酸,然后将CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶加入到产生的神经氨酸中;或者通过将胞苷酸(CMP)、N-乙酰葡糖胺、丙酮酸和酵母加入到用含有由编码N-乙酰神经氨酸醛缩酶的基因和编码CMP-N-乙酰葡糖胺合成酶的基因的共表达载体转化的重组菌株中。但是,该方法具有的问题在于,其中需要多个步骤来产生CMP-N-乙酰神经氨酸,并且用作底物的胞苷酸(CMP)转化成胞苷三磷酸(CTP)的产量很低。 
因此,本发明的发明人付出了极大的努力来开发以经济简单的方式生产CMP-N-乙酰神经氨酸的方法。结果,本发明的发明人在脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC 9343中发现了新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶并确定CMP-N-乙酰神经氨酸可通过一锅式反应(one-pot reaction)高浓度生产,所述反应使用多种底物和酶的混合物,包括N-乙酰葡糖胺-2-异构酶,所述酶通过将表达该酶的基因转化到重组载体中得到,廉价底物胞苷酸(CMP)和非常少量的NTP,从而完成了本发明。 
发明内容
本发明的主要目的在于提供新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和用于制备N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的方法,所述方法包括培养用含有编码所述酶的重组载体转化的重组微生物。 
本发明的另一目的在于提供通过使用所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶以及多种底物和酶的混合物的一锅式反应制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法。 
为了实现上述目的,本发明提供了具有氨基酸序列为SEQ ID NO:2的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶。 
本发明还提供了编码所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的基因,含有所述基因的重组载体,转化有所述重组载体的重组微生物,以及制备所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的方法,所述方法包括培养所述重组微生物;并回收N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶。 
本发明还提供了制备N-乙酰-D-甘露糖胺的方法,所述方法包括:将含有N-乙酰-D-葡糖胺的反应混合物在所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的存在下进行反应并回收所述N-乙酰-D-甘露糖胺。 
本发明还提供了制备神经氨酸的方法,所述方法包括:将含有丙酮酸和N-乙酰-D-甘露糖胺的反应混合物在N-乙酰神经氨酸醛缩酶(NeuNAc醛缩酶)的存在下进行反应;并回收所述神经氨酸。 
本发明还提供了制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,所述方法包括:将含有下列物质的反应混合物进行反应:(i)胞苷5’-磷酸(CMP),(ii)核苷三磷酸(NTP)或者ATP,(iii)乙酰磷酸(Pi),(iv)N-乙酰-D-葡糖胺和(v)丙酮酸,所述反应在下列物质存在下进行:(a)N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcNAc 2-表异构酶),(b)N-乙酰神经氨酸醛缩酶(NeuNAc醛缩酶),(c)胞苷5′-磷酸激酶(CMP激酶),(d)醋酸激酶和(e)CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶(CMP-NeuNAc合成酶);并且回收所述CMP-N-乙酰神经氨酸。 
通过下列详细描述和所附的权利要求书,本发明的其他特征和方面将是显而易见的。 
附图说明
图1是显示合成CMP-N-乙酰神经氨酸的过程的示意图。 
图2显示了含有N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶-编码基因(nanE)的重组载体。 
图3显示了含有N-乙酰神经氨酸醛缩酶-编码基因(nan)的重组载体。 
图4显示了含有5’磷酸激酶-编码基因(cmk)的重组载体。 
图5显示了含有醋酸激酶-编码基因(ack)的重组载体。 
图6显示了含有CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶-编码基因(neu)的重组载体。 
图7显示了所进行的十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析的结果,以检查每种酶是否被表达(第1道:标记物;第2道:胞苷5’磷酸激酶;第3道:醋酸激酶;第4道:CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶;第5道:N-乙酰神经氨酸醛缩酶;第6道:乙酰葡糖胺-2-表异构酶)。 
图8显示了所进行的十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS-PAGE)分析的结果,以检查每种纯化的酶是否被表达(第1道:标记物;第2道:纯化胞苷5’磷酸激酶;第3道:纯化醋酸激酶;第4道:纯化CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶;第5道:纯化N-乙酰神经氨酸醛缩酶;第6道:纯化乙酰葡糖胺-2-表异构酶)。 
图9显示了CMP-N-乙酰神经氨酸的1H核磁共振(1H NMR)分析结果。 
图10显示了CMP-N-乙酰神经氨酸的高效液相色谱(HPLC)分析结果。 
发明详述以及优选实施例 
在一个方面,本发明涉及在CMP-N-乙酰神经氨酸合成中涉及的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶,编码所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的基因,含有所述基因的重组载体,用所述重组载体转化的重组微生物,以及制备N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的方法,所述方法包括培养所述重组微生物。 
在本发明中,所述基因优选具有SEQ ID NO:1的碱基序列。所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶是来源于脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC 9343的酶,并且显示与集胞藻属(Synechocystis sp.)和多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相应基因具有35.06-32.9%的相似性。 
在另一方面,本发明涉及制备N-乙酰-D-甘露糖胺和神经氨酸的方法,其特征在于使用所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶。 
在还一方面,本发明涉及通过使用所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的一锅式反应制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法。 
根据本发明的CMP-N-乙酰神经氨酸可通过允许下列反应混合物来生产:(i)胞苷5’-磷酸(CMP),(ii)核苷三磷酸(NTP)或者ATP,(iii)乙酰磷酸(Pi),(iv)N-乙酰-D-葡糖胺和(v)丙酮酸,在下列物质存在下发生反应来生产:(a)N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcNAc 2-表异构酶),(b)N-乙酰神经氨酸醛缩酶(NeuNAc醛缩酶),(c)胞苷5′-磷酸 激酶(CMP激酶),(d)醋酸激酶和(e)CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶(CMP-NeuNAc合成酶)。 
根据本发明,胞苷三磷酸(CTP)由廉价底物胞苷酸(CMP)通过CMP激酶和醋酸激酶经胞苷二磷酸(CDP)以高于97%的产量来合成。作为用于所述CDP的磷酸供体,非常少量的NTP被使用,并且NDP很节约,因为其被过量乙酰Pi和醋酸激酶重新被利用。特别是,在本发明中,在反应完成之后用于除去作为杂质的ADP残余物的复杂过程可通过使用CTP来代替ATP作为用于CDP的磷酸供体而被消除。 
而且,根据本发明,N-乙酰-D-葡糖胺(GlacNAc)由N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶转化成N-乙酰-D-甘露糖胺(ManNAc),并且由ManNAc和丙酮酸通过NeuAc醛缩酶合成神经氨酸。上述合成的CTP和神经氨酸由CMP-NeuAc合成酶合成CMP-N-乙酰神经氨酸(图1)。 
在本发明中,所述核苷三磷酸(NTP)或者ATP优选由乙酰Pi和醋酸激酶再生,所述核苷三磷酸(NTP)优选为胞苷三磷酸(CTP)。 
在本发明中,所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶、N-乙酰神经氨酸醛缩酶、胞苷5’磷酸激酶、醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶优选被固定于载体上,并且所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶、N-乙酰神经氨酸醛缩酶、胞苷5’磷酸激酶、醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶优选分别由碱基序列SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:8,SEQ IDNO:11 and SEQ ID NO:14编码。 
根据本发明,CMP-N-乙酰神经氨酸的合成成本可极大地降低,因为CMP-N-乙酰神经氨酸可通过纯化每种高表达酶并将纯化的酶固定在聚合物小珠,诸如几丁质上,在一步工序中被合成,不需要进行重复的合成步骤。酶的固定可使用常规酶固定化方式(共价结合,使用多官能团试剂交联,吸附,微囊化等等)来进行。酶的纯化可使用常规酶纯化方式来进行(盐析,等电点沉淀,透析,各种色谱过程,等等),使用所 述纯化工艺得到的辅酶或者纯化的酶可被使用,并且将所述酶固定在聚合物小珠上的过程可使用常规的酶固定化过程来进行。使用所述过程纯化的酶在其被固定在聚合物小珠上的状态下可被使用20次以上,因此回收酶的成本降低,其回收步骤被简化。 
根据本发明,将所述各种底物和酶的混合物进行一锅式反应,因此,每种酶的反应能力可被最大化,并且CMP-N-乙酰神经氨酸可以超过90%的高产量被合成,即便使用很少量的酶和底物也是如此。特别值得一提的是,在其中N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶单独反应的情况下,CMP-N-乙酰神经氨酸的合成产量将低于50%,但当进行一锅式反应时,CMP-N-乙酰神经氨酸可以超过90%的高产量被合成。 
在本发明中使用的N-乙酰神经氨酸醛缩酶、CMP激酶、醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶是已知的酶,并且可按照常规方式来制备。但是,优选使用重组DNA技术来制备这些酶,包括所述基因的克隆,含有克隆的DNA片段的重组载体的构建,含有被引入到其中的重组载体的转化体的构建,以及通过转化体的培养的目标酶蛋白质的生产。用于转化的宿主细胞没有特别的限制,但考虑到操作和方便,优选使用大肠杆菌。 
作为在本发明中使用的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶,使用从脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC 9343的新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶编码基因。脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC的基因组DNA的全部序列被测定(US7,090,973),但N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的功能仍然未知。 
在本文中,术语“载体”指的是含有DNA序列的DNA构建体,所述DNA序列可操作地与能够影响DNA在合适宿主中的表达的合适控制序列连接。载体的例子包括质粒、噬菌体粒子或者简单的潜在基因插入物。一旦被转化到合适宿主中,载体可复制并独立于宿主基因组起作用, 或者在一些情况下可整合到基因组本身中。在本文中,术语“质粒”和“载体”有时候被互换使用,因为质粒是目前最常用的载体形式。出于本发明的目的,优选使用质粒载体。可用于该目的的典型质粒载体包括如下:(a)复制起点,通过其有效地发生复制,使每个宿主细胞中数百个质粒载体被形成;(b)抗生素抗性基因,使用质粒载体转化的宿主细胞通过其可被选择;和(c)限制性内切酶消化位点,外源DNA片段可插入到其中。即便合适的限制性内切酶消化位点在载体中不存在,常规合成的寡核苷酸接头或连接子的使用也使载体和外源DNA片段之间很容易连接(ligation)。 
在连接之后,载体应当被转化到合适的宿主细胞中。转化可以使用公知的氯化钙法很容易实现。选择性电转化(Neumann等人,EMBO J.,1:841,1982)也可在所述宿主细胞的转化中使用。 
为了大量的表达基因,本领域已知的表达载体可在本发明中使用。 
当核酸被设置成与另一核酸序列成功能关系时,其“可操作地连接”。“可操作地连接”意味着,基因和一个或多个调节序列以这种方式连接:当合适分子(例如转录活化蛋白)结合到调节序列上时允许基因表达。例如,如果DNA被表达为在参与多肽分泌中的蛋白质,用于前置序列或者分泌型前导序列可操作地连接到用于多肽的所述DNA;如果编码序列影响序列的转录,启动子或增强子可操作地与该编码序列连接;或者如果编码序列被定位以便翻译,核糖体结合位点可操作地与该编码序列连接。一般说来,“可操作地连接”的意思是被连接的DNA序列是相邻的,并且在分泌型前导序列的情况下,相邻并在开放阅读框中存在。但是,增强子不一定要相邻。连接通过在常规限制位点连接来实现。如果所述位点不存在,合成的寡核苷酸接头或者连接子按照常规实践被使用。 
对本领域技术人员来说公知的是,为了增加转染的基因在宿主细胞中的表达水平,基因应当可操作地连接到可在所选表达宿主中起作用的 转录和翻译控制序列中。优选地,相应基因和表达控制序列包含在包括选择性标记物和复制起始区的表达载体中。当表达宿主是真核细胞时,表达载体应当进一步包括在真核表达宿主细胞中有用的表达标记物。 
使用所述重组载体转化的宿主细胞构成了本发明的另一方面。在本文中,术语“转化”指的是将DNA引入到宿主细胞中,使DNA可复制,或者作为构成染色体的一部分(integrant)或者作为染色体外构件。 
当然,应当理解,在本发明中提到的载体在表达DNA序列的功能并不相同。同样地,对于相同的表达系统,所用到的宿主细胞也不能起到完全一样的作用。但是,本领域技术人员可选择合适的载体,表达控制序列和宿主细胞,而不背离本发明的精神,并且不需要过度的进行实验。例如,在载体的选择中,宿主细胞必须被考虑。这是因为载体将会在其中复制。而且,载体的复制数和控制复制数的能力以及由载体编码的其他蛋白质例如抗生物标记物的表达应当被考虑。 
实施例
此后,将参照实施例更详细地描述本发明。对本领域技术人员来说显而易见的是,这些实施例仅仅用于说明的目的,而不应当理解为对本发明范围的限制。 
实施例1:基因的克隆和转化
1-1:编码N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的nanE基因(SEQ ID NO:1)的克隆和转化
为了消除将N-乙酰-D-葡糖胺异构化成N-乙酰-D-甘露糖胺的步骤(其在实现增加CMP-N-乙酰神经氨酸的制备产量并降低生产成本的目标中作为最大问题指出),N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcNAc2表异构酶)从各种来源寻找。 
三种N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶状基因从厌氧微生物脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC 9343(NC_003228)中被发现。 
用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的候选基因No.1位于947856-949034的区域中,具有1179bp大小,并显示了与苜蓿根瘤菌(Rhizobium meliloti)和人类(Homo sapiens)的相应基因具有23.68-24.44%的相似性。 
用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的候选基因No.2位于1996625-1997809的范围内,具有1185bp的大小,并显示了与集胞藻属(Synechocystis sp).和多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相应基因具有35.06-32.9%的相似性。 
用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的候选基因No.3位于4765592-4766353的范围内,具有762bp的大小,并显示了与红小梨形菌属(Rhodopirellula baltica)和集胞藻属(Synechocystis sp)的相应基因具有48.18-34.97%的相似性。 
将每个基因插入到pET表达载体(Novagen)中,所述表达载体然后被转化到BL21(DE3)pLysS表达菌株中。结果,观察到用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的候选基因No.1和2高表达为可溶性蛋白质,但候选基因No.3不表达为可溶性蛋白质,但表达为不溶性蛋白质。 
为了检测高表达候选基因No.1和2的活性,用于表达N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶和N-乙酰神经氨酸醛缩酶的候选基因No.1和2以及其活性被测定,使用N-乙酰-D-葡糖胺和丙酮酸作为底物在一步法过程中发生反应。产生的神经氨酸使用糖分析系统(Metrohm)进行分析。 
结果,可以看到,用于表达N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的候选基因No.1没有活性,而用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶候选基因No.2具有非常好的活性。而且,将候选基因的活性在相同条件下(50mM N-乙酰D-葡糖胺,100-200mM丙酮酸10mM MgCl2,50mM-100mM Tris HCl,30-40℃)与人N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(有机体=″Homosapiens,ene=″RENBP″,由_编码=″NM_002910.4:203..1456″)的活性进行比较,结果,用于N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶候选基因No.2显示了非常 高的反应速度和产量。因此,候选基因No.2被选择作为N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶。 
为了克隆编码N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcNAc-表异构酶)的nanE基因(SEQ ID NO:2)使用脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)NCTC9343的染色体DNA作为模板和SEQ ID NO:3以及SEQ ID NO:4作为引物通过PCR扩增: 
SEQ ID NO:3:5′-ct gcc atg gtt atg aat act aca g 
SEQ ID NO:4:5′-aat gga tcc tta ttt ttc tga cag 
PCR扩增使用1μl(10pmol)的DNA,1μl的每种引物,4μl的Primix(Genotech)和14μl的蒸馏水在防蒸发(Mastercycler)梯度PCR系统(Ependorf)中进行30个循环,每个循环在96℃下变性1min,在40.2℃下退火1min并在72℃下延伸2min。 
扩增的PCR产物使用质粒微-沉淀试剂盒(plasmid mini-prep kit,Solgent)纯化,然后通过加入70%的乙醇沉淀DNA。沉淀的DNA通过琼脂糖凝胶电泳分析以纯化1.2-kb的DNA片段。纯化的DNA使用限制性内切酶NcoI和BamHI消化,并使用连接酶与使用相同的限制性内切酶NcoI和BamHI消化的质粒pET28a(+)(Novagen)T4 DNA(Takara)连接(图2)。 
重组载体被引入到大肠杆菌XL-Blue中以得到抗卡那霉素的转化体,从而从其中分离质粒pNANEe。pNANEe质粒是其中含有脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)的nanE基因的结构基因的DNA片段被插入到pET28a(+)的T7启动子的NcoI-BamHI消化位点下游的质粒。 
使用通过氯化钙处理将质粒引入到菌株中的方法(J.Mol.Biol.,53:159,1970)将重组基因引入到高表达菌株大肠杆菌BL21(DE3)(Invitrogen)中。得到的转化体被命名为“E.coli/pNANe”。 
1-2:编码N-乙酰神经氨酸醛缩酶的nanA基因的克隆和转化
为了克隆编码N-乙酰神经氨酸醛缩酶的nanA基因(SEQ ID NO:5),nanA基因使用大肠杆菌K-12C600的染色体DNA作为模板和SEQ IDNO:6以及SEQ ID NO:7作为引物通过PCR进行扩增: 
SEQ ID NO:6:5′-ggtatccatggcaacgaatttacg 
SEQ ID NO:7:5′-ggtaggctcgagcgaggggaaac 
PCR扩增使用1μl(10pmol)的DNA,1μl的每种引物,4μl的Primix(Genotech)和14μl的蒸馏水在Mastercycler梯度PCR系统(Ependorf)中进行30个循环,每个循环在96℃下变性1min,在50.2℃下退火1min并在72℃下延伸2min。 
扩增的PCR产物使用质粒微-沉淀试剂盒(plasmid mini-prep kit,Solgent)纯化,然后通过加入70%的乙醇沉淀DNA。沉淀的DNA通过琼脂糖凝胶电泳分析以纯化0.9-kb的DNA片段。纯化的DNA使用限制性内切酶NcoI和XhoI消化,并使用连接酶与使用相同的限制性内切酶NcoI和XhoI消化的质粒pET32a(+)(Novagen)T4 DNA(Takara)连接(图3)。得到的载体被转化到大肠杆菌XL-Blue中以得到抗氨苄青霉素的转化体,从而从其中分离质粒pNANa。pNANa质粒是其中含有E.coli K-12C600的nanE基因的结构基因的DNA片段被插入到pET32a(+)的T7启动子的NcoI-XhoI消化位点下游的质粒。 
使用通过氯化钙处理将质粒引入到菌株中的方法(J.Mol.Biol.,53:159,1970)将重组基因引入到高表达菌株大肠杆菌BL21(DE3)pLysS(Invitrogen)中。得到的转化体被命名为“E.coli/pNANa”。 
1-3:编码胞苷5’-磷酸激酶的cmk基因的克隆和转化
为了克隆编码胞苷5’-磷酸激酶的cmk基因(SEQ ID NO:8),cmk基因使用大肠杆菌K-12的染色体DNA作为模板和SEQ ID NO:9以及SEQ ID NO:10作为引物通过PCR进行扩增: 
SEQ ID NO:9:5′-cat atg acggca att gcc ccg gtt att ac 
SEQ ID NO:10:5′-gaa ttc ggt cgc tta tgc gag agc c 
PCR扩增使用1μl(10pmol)的DNA,1μl的每种引物,4μl的Primix(Genotech)和14μl的蒸馏水在Mastercycler梯度PCR系统(Ependorf)中进行30个循环,每个循环在96℃下变性1min,在55.7℃下退火1min并在72℃下延伸2min。 
扩增的PCR产物使用质粒微-沉淀试剂盒(plasmid mini-prep kit,Solgent)纯化,然后通过加入70%的乙醇沉淀DNA。沉淀的DNA通过琼脂糖凝胶电泳分析以纯化0.7-kb的DNA片段。纯化的DNA使用限制性内切酶NdeI和EcoRI消化,并使用连接酶与使用相同的限制性内切酶NdeI和EcoRI消化的质粒pET22b(+)(Novagen)T4 DNA(Takara)连接(图4)。得到的载体被引入到大肠杆菌XL-Blue中以得到抗氨苄青霉素的转化体,从而从其中分离质粒pCMK。质粒pCMK是其中含有E.coli K-12C600的cmk基因的结构基因的DNA片段被插入到pET22b(+)的T7启动子的NdeI和EcoRI消化位点下游的质粒。 
使用通过氯化钙处理将质粒引入到菌株中的方法(J.Mol.Biol.,53:159,1970)将重组基因引入到高表达菌株大肠杆菌BL21(DE3)pLysS(Invitrogen)中。得到的转化体被命名为“E.coli/pCMK”。 
1-4:编码醋酸激酶的ack基因的克隆和转化
为了克隆编码醋酸激酶的ack基因(SEQ ID NO:11),ack基因使用大肠杆菌K-12的染色体DNA作为模板和SEQ ID NO:12以及SEQ IDNO:13作为引物通过PCR进行扩增: 
SEQ ID NO:12:5′-catatgtcgagtaagttagtttctg 
SEQ ID NO:13:5′-gaatcctcaggcagtcaggcggctcgcgtc 
PCR扩增使用1μl(10pmol)的DNA,1μl的每种引物,4μl的Primix(Genotech)和14μl的蒸馏水在Mastercycler梯度PCR系统(Ependorf)中进行30个循环,每个循环在96℃下变性1min,在58.7℃下退火1min并 在72℃下延伸2min。 
扩增的PCR产物使用质粒微-沉淀试剂盒(plasmid mini-prep kit,Solgent)纯化,然后通过加入70%的乙醇沉淀DNA。沉淀的DNA通过琼脂糖凝胶电泳分析以纯化1.2-kb的DNA片段。纯化的DNA使用限制性内切酶NdeI和EcoRI消化,并使用连接酶与使用相同的限制性内切酶NdeI和EcoRI消化的质粒pET24ma(+)(Novagen)T4 DNA(Takara)连接(图5)。得到的载体被转化引入到大肠杆菌XL-Blue中以得到抗卡那霉素的转化体,从而从其中分离质粒pACKa。 
质粒pACKa是其中含有E.coli K-12C600染色体DNA的ack基因的结构基因的DNA片段被插入到pET24ma(+)的T7启动子的NdeI和EcoRI消化位点下游的质粒。 
使用通过氯化钙处理将质粒引入到菌株中的方法(J.Mol.Biol.,53:159,1970)将重组基因引入到高表达菌株大肠杆菌BL21(DE3)pLysS(Invitrogen)中。得到的转化体被命名为“E.coli/pACKa”。 
1-5:编码CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶的neu基因的克隆和转化
为了克隆编码CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶的neu基因(SEQ IDNO:14),neu基因使用脑膜炎球菌(Neisseria meningitides)(KoramBiotech)的染色体DNA作为模板和SEQ ID NO:15以及SEQ ID NO:16作为引物通过PCR进行扩增: 
SEQ ID NO:15:5′-aagcatatggaaaaacaaaatattgcg 
SEQ ID NO:16:5′-gtggaattcttagctttccttgtg 
PCR扩增使用1μl(10pmol)的DNA,1μl的每种引物,4μl的Primix(Genotech)和14μl的蒸馏水在Mastercycler梯度PCR系统(Ependorf)中进行30个循环,每个循环在96℃下变性1min,在57.7℃下退火1min并在72℃下延伸2min。 
扩增的PCR产物使用质粒微-沉淀试剂盒(plasmid mini-prep kit, Solgent)纯化,然后通过加入70%的乙醇沉淀DNA。沉淀的DNA通过琼脂糖凝胶电泳分析以纯化0.7-kb的DNA片段。纯化的DNA使用限制性内切酶NdeI和EcoRI消化,并使用连接酶与使用相同的限制性内切酶NdeI和EcoRI消化的质粒pET32a(+)(Novagen)T4 DNA(Takara)连接(图6)。得到的载体被引入到大肠杆菌XL-Blue中以得到抗氨苄青霉素的转化体,从而从其中分离质粒pSYNb。质粒pSYNb是其中含有脑膜炎球菌(Neisseria meningitides)的synB基因的结构基因的DNA片段被插入到pET24ma(+)的T7启动子的NdeI和EcoRI消化位点下游的质粒。 
使用通过氯化钙处理将质粒引入到菌株中的方法(J.Mol.Biol.,53:159,1970)将重组基因引入到高表达菌株大肠杆菌BL21(DE3)(Invitrogen)中。得到的转化体被命名为“E.coli/pSYNb”。 
实施例2:酶表达分析
将通过在LB培养基中培养每种转化体E.coli/pNANe,E.coli/pNANa,E.coli/pCMK,E.coli/pACKa和E.coli/pSYNb得到的500ml种子培养物接种到5升的LB培养基中。当细胞浓度(OD600)达到大约3-5时,收获细胞。含有各种酶的转化体的培养条件在下表1中显示。收获的细胞使用超声破碎仪(disruptor)或者法式压滤壶(French press)破碎,然后每种酶的表达通过十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行分析(图7)。 
结果,可以观察到由插入到每种转化体中的基因编码的酶被大量的表达。 
表1:制备每种酶的菌株的培养条件 
  酶   培养条件   主要培养   条件   IPTG浓度   (5L培养   物)   表达诱导条   件
  胞苷5’-磷酸激酶   37℃   37℃,   1M IPTG   37℃,12h
[0104] 
  (CMK)  (氨苄青霉  素)   pH 7.0   5ml  (0D600=3~5)
  醋酸激酶(ACK)  37℃(卡那   霉素)   37℃,   pH 7.0   1M IPTG   5ml  37℃,12h  (0D600=3~5)
  CMP-N-乙酰神经氨酸  合成酶(NEU)  37℃(氨苄  青霉素)   37℃,  pH 7.0   1M IPTG  2ml  20℃,12h (0D600=3~5)
  N-乙酰神经氨酸醛缩  酶(NAN)  37℃(氨苄  青霉素)   37℃,  pH 7.0   1M IPTG  5ml  37℃,12h (0D600=3~5)
  N-乙酰葡糖胺-2-表异  构酶  37℃(卡那  霉素)   37℃,  pH 7.0   1M IPTG  5ml  37℃,12h (0D600=3~5)
实施例3:酶的纯化
将所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcAc2-异构酶),N-乙酰神经氨酸醛缩酶(NeuAc醛缩酶),胞苷5′-磷酸激酶,醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶(CMP-NeuAc合成酶)使用硫酸铵沉淀并使用离子交换树脂柱纯化(蛋白质纯化技术“Protein purification techniques”,第二版,Oxford University Press,2001)。 
用于每种酶沉淀的硫酸铵的浓度可在30-80%的范围内适当调节。每种酶使用硫酸铵在低于10℃的冰箱中,优选的是3-5℃,并搅拌1-5小时被沉淀。 
将沉淀的酶溶解在微量的50mM Tris HCl(pH7.5)缓冲液中并通过透析膜脱盐。纯化并浓缩的酶溶液在填充有强离子交换树脂的UNO sphereQ(Bio-RAD)柱上使用洗脱液A(20mM Tris HCl(pH7.5))和洗脱液B(20mM Tris HCl/1M NaCl(pH7.5))作为洗脱液梯度洗脱来纯化。纯化的酶通过十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行分析(图8)。 
实施例4:酶的固定
将3升2.5%的戊二醛加入到1kg(大约1升)的聚合物小珠中,然 后在室温下搅拌2小时以活化聚合物小珠。活化的聚合物小珠被过滤然后清洗,并将实施例3中纯化的每种酶以每克聚合物小珠3mg的量加入到聚合物小珠中。然后,将混合物在室温下搅拌6小时以将酶固定在聚合物小珠上。酶固定化的程度和量参考Bradford法(Anal.Biochem.,72:248,1976)进行分析。 
实施例5:CMP-N-乙酰神经氨酸的合成
将使用2M NaOH在37℃下保持pH 6.5-8.0的20-100g的20-80mM胞苷5′-磷酸(CMP,Shanghai QZU Bioscience&Biotechnology),34.15-136.6g的20-80mM N-乙酰-D-葡糖胺(Shanghai Jiubang Chemical),33.9-101.7g的40-120mM丙酮酸,30.9g的20mM MgCl2·H2O(Duksan),3.72g的1mM CTP(Sigma),84-525g的80-500mM乙酰磷酸(Sigma)和7升的50mM Tris HCl缓冲液(pH 7.0)与在实施例4中制备的聚合物小珠混合,所述聚合物小珠上固定有胞苷磷酸激酶(CMK)、醋酸激酶(ACK)、NeuAc醛缩酶(NAN)、CMP-NeuAc合成酶(NEU)和GlcNAc-2-表异构酶。然后,将混合物在反应器中搅拌5-12小时。 
为了分离并检测反应上清液,Thermo 42柱(Thermo ElectronCorporation)被使用,并且使用洗脱液A(100mM KH2PO4/K2HPO4)和洗脱液B(甲醇)以90%(洗脱液A):10%(洗脱液B)的比例进行高效液相色谱(HPLC)。结果,可以看到,CMP-N-乙酰神经氨酸以大约90%的产量被合成。 
实施例6:CMP-神经氨酸的纯化
将在实施例5中合成的CMP-N-乙酰神经氨酸注入到阴离子交换树脂柱(Dowex-1x2;Cl-形式)的上部,并用盐浓度梯度洗脱。所需材料的洗脱百分比再次被浓缩并通过葡聚糖(Sephadex G-10)凝胶渗透脱盐,从而得到高纯度的终产物。产物通过冰冻干燥浓缩。通过每个纯化步骤并通过核磁共振(NMR)和高效液相色谱(HPLC)分析,CMP-N-乙酰神 经氨酸最终产量达到81%(图9和图10)。 
工业实用性 
如上面详细描述的那样,本发明具有提供使用新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶大量生产CMP-N-乙酰神经氨酸的方法的效果。根据本发明,CMP-N-乙酰神经氨酸可使用作为廉价底物的胞苷酸和N-乙酰-D-葡糖胺通过一步反应大量生产。而且,CMP-N-乙酰神经氨酸可以低成本生产,因为核苷三磷酸(NTP)或ATP可以通过乙酰Pi和醋酸激酶再生。 
虽然已经参照特定特征对本发明进行了详细描述,但本领域技术人员将会理解,该描述仅仅用于说明优选实施例,而不是限制本发明的范围。因此,本发明的实际范围将由所附的权利要求书及其等同技术限定。 
FP06KR832.ST25
SEQUENCE LISTING
<110>基因化学株式会社
<120>新的N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶以及使用该酶生产CMP-神经氨酸的方法
<130>FP09KR832
<140>PCT/KR2007/006367
<141>2007-12-07
<150>10-2006-0128422
<151>2006-12-15
<160>16
<170>PatentIn version 3.2
<210>1
<211>1185
<212>DNA
<213>Bacteroides fragilis
<400>l
atgaatacta cagaatattt acagacttgg tctgactctt ataaaaatga catgataagc       60
aacatcatgc ccttttggat gaaatatggt tgggatcgca agaacggagg tgtttatacc      120
tgcgtcgacc gtgatggtca gttgatggat accaccaaat ctgtttggtt ccaagggaga      180
tttgctttta catgttcata tgcatataat cacattgagc gtaatactga atggttggca      240
gctgcgaaaa gcactctcga tttcatagaa gcacattgtt ttgatacgga tggacgtatg      300
ttttttgaag taaccgagac cggattacct attcgtaaac gtcgttatgt cttttctgaa      360
acatttgctg ctattgcaat gtccgaatat gccattgcat caggagatca tagttatgct      420
gtaaaagctt tgaaattgtt caatgatatc cgtcacttcc tttcgactcc gggaatcctg      480
gagcccaaat attgtgaacg tgtacagatg aagggacatt ctattattat gattcttatc      540
aatgtagctt cccgcattcg cgccgctatt aacgatccgg ttttggatcg gcaaatagag      600
gagtctatag caattctgca caaagacttt atgcatccgg agtttaaagc tctgcttgag      660
actgtaggtc ccaatggaga gtttatagat acgaacgcca ctcgtaccat taatcccggt      720
cattgtatcg agacctcatg gtttattttg gaagaagcca agaaccgcaa ttgggataag      780
gaaatggttg atacagcact tacgattctg gattggtcgt gggagtgggg ctgggacaaa      840
gaatacgggg gtattataaa tttccgtgat tgtcgaaacc tgccttcaca ggattatgcc      900
catgacatga agttctggtg gccacagacc gaagcgatta tcgcaactct atatgcgtat      960
caagctacta aaaatgaaaa atatctggct atgcataaac agatcagtga ctggacttat      1020
gcccattttc ctgatgcaga gtttggtgaa tggtatgggt atctccatcg tgacggaacg      1080
atttctcagc ctgcgaaagg aaatctgttt aagggaccat tccacattcc tagaatgatg      1140
acgaaaggct acgcactttg tcaggaatta ctgtcagaaa aataa                      1185
<210>2
<211>394
<212>PRT
<213>Bacteroides fragilis
<400>2
Met Asn Thr Thr Glu Tyr Leu Gln Thr Trp Ser Asp Ser Tyr Lys Asn
1               5                   10                  15
Asp Met Ile Ser Asn Ile Met Pro Phe Trp Met Lys Tyr Gly Trp Asp
            20                  25                  30
Arg Lys Asn Gly Gly Val Tyr Thr Cys Val Asp Arg Asp Gly Gln Leu
        35                  40                  45
Met Asp Thr Thr Lys Ser Val Trp Phe Gln Gly Arg Phe Ala Phe Thr
    50                  55                  60
Cys Ser Tyr Ala Tyr Asn His Ile Glu Arg Asn Thr Glu Trp Leu Ala
65                  70                  75                  80
Ala Ala Lys Ser Thr Leu Asp Phe Ile Glu Ala His Cys Phe Asp Thr
                85                  90                  95
Asp Gly Arg Met Phe Phe Glu Val Thr Glu Thr Gly Leu Pro Ile Arg
            100                 105                 110
Lys Arg Arg Tyr Val Phe Ser Glu Thr Phe Ala Ala Ile Ala Met Ser
        115                 120                 125
Glu Tyr Ala Ile Ala Ser Gly Asp His Ser Tyr Ala Val Lys Ala Leu
    130                 135                 140
Lys Leu Phe Asn Asp Ile Arg His Phe Leu Ser Thr Pro Gly Ile Leu
145                 150                 155                 160
Glu Pro Lys Tyr Cys Glu Arg Val Gln Met Lys Gly His Ser Ile Ile
                165                 170                 175
Met Ile Leu Ile Asn Val Ala Ser Arg Ile Arg Ala Ala Ile Asn Asp
            180                 185                 190
Pro Val Leu Asp Arg Gln Ile Glu Glu Ser Ile Ala Ile Leu His Lys
        195                 200                 205
Asp Phe Met His Pro Glu Phe Lys Ala Leu Leu Glu Thr Val Gly Pro
    210                 215                 220
Asn Gly Glu Phe Ile Asp Thr Asn Ala Thr Arg Thr Ile Asn Pro Gly
225                 230                 235                 240
His Cys Ile Glu Thr Ser Trp Phe Ile Leu Glu Glu Ala Lys Asn Arg
                245                 250                 255
Asn Trp Asp Lys Glu Met Val Asp Thr Ala Leu Thr Ile Leu Asp Trp
            260                 265                 270
Ser Trp Glu Trp Gly Trp Asp Lys Glu Tyr Gly Gly Ile Ile Asn Phe
        275                 280                 285
Arg Asp Cys Arg Asn Leu Pro Ser Gln Asp Tyr Ala His Asp Met Lys
    290                 295                 300
Phe Trp Trp Pro Gln Thr Glu Ala Ile Ile Ala Thr Leu Tyr Ala Tyr
305                 310                 315                 320
Gln Ala Thr Lys Asn Glu Lys Tyr Leu Ala Met His Lys Gln Ile Ser
                325                 330                 335
Asp Trp Thr Tyr Ala His Phe Pro Asp Ala Glu Phe Gly Glu Trp Tyr
            340                 345                 350
Gly Tyr Leu His Arg Asp Gly Thr Ile Ser Gln Pro Ala Lys Gly Asn
        355                 360                 365
Leu Phe Lys Gly Pro Phe His Ile Pro Arg Met Met Thr Lys Gly Tyr
    370                 375                 380
Ala Leu Cys Gln Glu Leu Leu Ser Glu Lys
385                 390
<210>3
<211>24
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>3
ctgccatggt tatgaatact acag                                           24
<210>4
<211>24
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>4
aatggatcct tatttttctg acag                                           24
<210>5
<211>893
<212>DNA
<213>Escherichia coli
<400>5
atggcaacga atttacgtgg cgtaatggct gcactcctga ctccttttga ccaacaacaa    60
gcactggata aagcgagtct gcgtcgcctg gttcagttca atattcagca gggcatcgac      120
ggtttatacg tgggtggttc gaccggcgag gcctttgtac aaagcctttc cgagcgtgaa      180
caggtactgg aaatcgtcgc cgaagagggc aaaggtaaga ttaaactcat cgcccacgtc      240
ggttgcgtca cgaccgccga aagccaacaa cttgcggcat cggctaaacg ttatggcttc      300
gatgccgtct ccgccgtcac gccgttctac tatcctttca gctttgaaga acactgcgat      360
cactatcggg caattattga ttcggcggat ggtttgccga tggtggtgta caacattcca      420
gccctgagtg gggtaaaact gaccctggat cagatcaaca cacttgttac attgcctggc      480
gtaggtgcgc tgaaacagac ctctggcgat ctctatcaga tggagcagat ccgtcgtgaa      540
catcctgatc ttgtgctcta taacggttac ggagaaatct tcgcctctgg tctgctggcg      600
ggcgctgatg gtggtatcgg cagtacctac aacatcatgg gctggcgcta tcaggggatc      660
gttaaggcgc tgaaagaagg cgatatccag accgcgcaga aactgcaaac tgaatgcaat      720
aaagtcattg atttactgat caaaacgggc gtattccgcg gcctgaaaac tgtcctccat      780
tatatggatg tcgtttctgt gccgctgtgc cgcaaaccgt ttggaccggt agatgaaaaa      840
tatcagccag aactgaaggc gctggcccag cagttgatgc mgagcgcggg tga             893
<210>6
<2ll>24
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>6
ggtatccatg gcaacgaatt tacg                                            24
<210>7
<211>23
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>7
ggtaggctcg agcgagggga aac                                             23
<210>8
<211>663
<212>DNA
<213>Escherichia coli
<400>8
atgaagacat acaagattgc cgttgatggg cctgctgcga gcggaaaaag cagcacatcc    60
gacttggttg caaggaaact ggggttttcc catctgatat ctggaaatct gtatagagct    120
gtgacatatg gtctggtaag gcgctttgga gaggtgcgtc caggagacga ggaacagaaa    180
agatttgttc ttgagctgag tatagaggta aggaacaaca gggtattcct agacggagag    240
gacgtgtcgg agagcctccg taaggaggtg gtcgaccgcc acgttgtttc tgttgcaagg    300
gagaaatata tccgggaaaa agtgtttaca attcagaggt cggtgataga ccttgagaag    360
aggggaatag ttgtggatgg aagagatata gccaccagga taatgccaaa tgcagatctg    420
aaggtgtttc ttacagcaag cccggagacg agggccagaa gaagatacat ggaaggcggg    480
tctgagtcct acgaggaact gctcgagtcc ataaaaaaaa gagatcacaa cgatagaaca    540
agggagcatg atccccttgt tgccacctgc gattctattg ttatcgaaaa tgacagcatg    600
acattggagg aaacagccga cgaaatcata aggctcttca gaagagtaga gtcttttaat    660
taa                                                                  663
<210>9
<2ll>29
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>9
catatgacgg caattgcccc ggttattac                                      29
<210>10
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<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>10
gaattcggtc gcttatgcga gagcc                                          25
<210>11
<211>1203
<212>DNA
<213>Escherichia cOli
<400>11
atgtcgagta agttagtact ggttctgaac tgcggtagtt cttcactgaa atttgccatc    60
atcgatgcag taaatggtga agagtacctt tctggtttag ccgaatgttt ccacctgccc    120
gaagcacgta tcaaatggaa aatggacggc aataaacagg aagcggcttt aggtgcaggc    180
gccgctcaca gcgaagcgct caactttatc gttaatacta ttctggcaca aaaaccagaa    240
ctgtctgcgc agctgactgc tatcggtcac cgtatcgtac acggcggcga aaagtatacc    300
agctccgtag tgatcgatga gtctgttatt cagggtatca aagatgcagc ttcttttgca    360
ccgctgcaca acccggctca cctgatcggt atcgaagaag ctctgaaatc tttcccacag    420
ctgaaagaca aaaacgttgc tgtatttgac accgcgttcc accagactat gccggaagag    480
tcttacctct acgccctgcc ttacaacctg tacaaagagc acggcatccg tcgttacggc    540
gcgcacggca ccagccactt ctatgtaacc caggaagcgg caaaaatgct gaacaaaccg    600
gtagaagaac tgaacatcat cacctgccac ctgggcaacg gtggttccgt ttctgctatc    660
cgcaacggta aatgcgttga cacctctatg ggcctgaccc cgctggaagg tctggtcatg    720
ggtacccgtt ctggtgatat cgatccggcg atcatcttcc acctgcacga caccctgggc    780
atgagcgttg acgcaatcaa caaactgctg accaaagagt ctggcctgct gggtctgacc    840
gaagtgacca gcgactgccg ctatgttgaa gacaactacg cgacgaaaga agacgcgaag    900
cgcgcaatgg acgtttactg ccaccgcctg gcgaaataca tcggtgccta cactgcgctg    960
atggatggtc gtctggacgc tgttgtattc actggtggta tcggtgaaaa tgccgcaatg    1020
gttcgtgaac tgtctctggg caaactgggc gtgctgggct ttgaagttga tcatgaacgc    1080
aacctggctg cacgtttcgg caaatctggt ttcatcaaca aagaaggtac ccgtcctgcg    1140
gtggttatcc caaccaacga agaactggtt atcgcgcaag acgcgagccg cctgactgcc    1200
tga                                                                  1203
<210>12
<211>25
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>12
catatgtcga gtaagttagt ttctg                                          25
<210>13
<211>30
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>13
gaatcctcag gcagtcaggc ggctcgcgtc                                    30
<210>14
<211>687
<212>DNA
<213>Neisseria meningitidis
<400>14
atggaaaaac aaaatattgc ggttatactt gcgcgccaaa actccaaagg attgccatta    60
aaaaatctcc ggaaaatgaa tggcatatca ttacttggtc atacaattaa tgctgctata    120
tcatcaaagt gttttgaccg cataattgtt tcgactgatg gcgggttaat tgcagaagaa    180
gctaaaaatt tcggtgtcga agtcgtccta cgccctgcag agctggcctc cgatacagcc    240
agctctattt caggtgtaat acatgcttta gaaacaattg gcagtaattc cggcacagta    300
accctattac aaccaaccag tccattacgc acaggggctc atattcgtga agctttttct    360
ctatttgatg agaaaataaa aggatccgtt gtctctgcat gcccaatgga gcatcatcca    420
ctaaaaaccc tgcttcaaat caataatggc gaatatgccc ccatgcgcca tctaagcgat    480
ttggagcagc ctcgccaaca attacctcaa gcatttaggc ctaatggtgc aatttacatt    540
aatgatactg cttcactaat tgcaaataat tgttttttta tcgccccaac caaactttat    600
attatgtctc atcaagactc tatcgatatt gatactgagc ttgatttaca acaggcagaa    660
aacattctta atcacaagga aagctaa                                        687
<210>15
<211>27
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>primer
<400>15
aagcatatgg aaaaacaaaa tattgcg                                        27
<210>16
<211>24
<212>DNA
<213>Artificial
<220>
<223>Drimer
<400>16
gtggaattct tagctttcct tgtg                                           24

Claims (6)

1.一种制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,所述方法包括:
将含有下列物质的反应混合物进行反应:(i)胞苷5’-磷酸(CMP),(ii)核苷三磷酸(NTP),(iii)乙酰磷酸(Pi),(iv)N-乙酰-D-葡糖胺和(v)丙酮酸,所述反应在下列物质存在下进行:(a)N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶(GlcNAc2-表异构酶),(b)N-乙酰神经氨酸醛缩酶(NeuNAc醛缩酶),(c)胞苷5’-磷酸激酶(CMP激酶),(d)醋酸激酶和(e)CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶(CMP-NeuNAc合成酶);并且回收所述CMP-N-乙酰神经氨酸。
2.根据权利要求1的制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,其特征在于,所述核苷三磷酸(NTP)由乙酰Pi和醋酸激酶再生。
3.根据权利要求1或2的制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,其特征在于,所述核苷三磷酸(NTP)是胞苷三磷酸(CTP)。
4.根据权利要求1的制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,其特征在于,所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶的氨基酸序列为SEQ ID NO:2。
5.根据权利要求1的制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,其特征在于,所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶、N-乙酰神经氨酸醛缩酶、胞苷5’-磷酸激酶、醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶被固定在载体上。
6.根据权利要求1的制备CMP-N-乙酰神经氨酸的方法,其特征在于,所述N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶、N-乙酰神经氨酸醛缩酶、胞苷5’-磷酸激酶、醋酸激酶和CMP-N-乙酰神经氨酸合成酶分别由碱基序列SEQID NO:1,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:11以及SEQ ID NO:14编码。
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