CN101037654A - 具有点图案加密功能的安放器和与该加密对应的检测装置 - Google Patents

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Abstract

一种检测装置,检测把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上而成的探针固定基体材料中的所述多个探针分别安放在所述多个点位置中的哪个位置上,其特征在于具有:对成为检测对象的每个探针固定基体材料,译解按照给定的信息加密的点位置图案的部件。

Description

具有点图案加密功能的安放器和与该加密对应的检测装置
本发明申请是申请号为200410059741.3、申请日为2004年6月18日、发明名称为“具有点图案加密功能的安放器和与该加密对应的检测装置”的专利申请的分案申请。
技术领域
本发明涉及在微阵列、DNA芯片等、具有能对标的物质进行特别结合的多个探针的基体材料、固相载体中,用于多个探针的固定作业中的安放器(spotter)、固定有多个探针的固定基体材料用的检测装置、以及对由安放器使用的多个探针进行分注的分注装置。
背景技术
作为把能对标的物质特别结合的多个探针(probe)固定在固相载体或基体材料表面的探针固定基体材料,能列举出DNA芯片。所谓DNA芯片是作为混合反应用探针,把具有不同碱基排列的多个DNA片断或低核苷酸排列在固相表面,以高密度来固定化的DNA探针阵列。作为固定在这样的DNA芯片上的DNA探针,选择在同时分析遗传基因的发现、变异、多态等方面有效的碱基排列组合。
作为把核酸分子在固相表面上固定为阵列状的方法,例如在美国专利第5,688,642号说明书中公开了通过固相合成,使用光刻把低核苷酸制作为所需的碱基排列的固相低核苷酸阵列。而在国际公开第95/25116号手册、美国专利第5,688,642号说明书中公开了使用喷墨法把预先制作的DNA分子安放(spot)到固相表面上的固相DNA探针阵列的制作方法。
此外,在基于探针混合反应的标的物质的检测处理步骤中,一般把用荧光物质等标识化的标的物质与固相探针阵列的探针接触,在两者间形成特别的复合体。该混合反应通常是把固相DNA探针阵列接触或浸渍在使标的物质溶解的溶液中,一面加热一面对探针,形成标的物质特别的复合体的反应,此时浓度或温度等反应条件根据探针和标的物质的组合而不同。使用荧光检测机等检测装置来观察来源于预先在标的物质的标识化中使用的荧光物质,确认探针和标的物质结合的复合体(混合体)的有无、其生成量等。
如特开2002-101878号公报所述,该DNA芯片也能在遗传基因诊断中使用。
实际在诊断中使用的遗传基因诊断用DNA芯片包含与各患者固有的遗传基因信息对应的复合体(混合体)的有无、生成量等结果(信息),例如在使用荧光标识的DNA芯片中,没有象放射元素标识那样,标识能力的随着时间经过的衰减,因此,具有能反复读取结果(信息)的优点。而因为能反复读取结果(信息),所以诊断中使用的诊断用DNA芯片和该患者的姓名如果泄漏,则即使是第三者也能知道该患者的诊断结果。
当然在医院等医疗机构中,为了把记载在病例卡等上的对于各患者的信息不泄漏给第三者,进了最大努力,采取保密措施。而在医院等中,把诊断中使用的器具、试验用具作为医疗废弃物常常委托具有适当的处理设施的外部业者进行该废弃处理。
须指出的是,在委托给该外部业者的废弃处理的阶段中,避免满足对各医疗废弃物规定的基准的存在附着可能性的“病原性物质”等向外部的泄漏、散失的物理管理状态当然是完备的。但是在该废弃处理的过程中,充分实现对“物理上的泄漏”的管理,但是对于对诊断中使用的DNA芯片上残留的“信息”的管理,时时存在不太注意的倾向。例如,在对“物理上的泄漏”的管理划分内,如果第三者能再度读取诊断中使用的DNA芯片上残留的“信息”,则即使不把DNA芯片本身拿到外部去,“信息”也有可能泄漏到外部。因此,在进行更高级的保密管理方面,就需要即使DNA芯片上残留的“信息”被泄漏到外部,也无法使该“信息”与患者的诊断结果简单地联系起来这样的技术。
例如,构成DNA芯片的各DNA探针的碱基排列用存在于一片上的DNA量是很难分析的,但是从未使用的多个DNA芯片,分离回收各DNA探针,如果变为相当量的DNA量,就有可能分析该碱基排列。即如果译解构成DNA芯片的DNA探针的碱基排列,就能判断诊断中使用的DNA芯片上残留的“信息”相当于怎样的诊断结果。如果判明诊断中使用的该DNA芯片是在哪个患者的诊断中使用,结果就会发生该患者的诊断结果泄漏到外部的事件。
因此,即使准备了多个未使用的DNA芯片,对于各DNA芯片,能防止容易分析在其上配置为阵列状的各DNA探针的碱基排列的技术在进行更高的保密管理上是需要的。
通常在医疗领域中使用的诊断用DNA芯片中,对于构成它的DNA探针能检测怎样的遗传基因信息,对使用者明确指示了信息,但是从对该DNA探针的碱基排列的提供源的社会关怀出发,有时从明确指示的信息中把该碱基排列本身除外。此外,如果能译解使用的DNA探针的碱基排列,就会产生未得到使用许可的第三者引起的模仿等在保密信息的维持上的问题。从这些观点出发,需要防止译解的技术,从而第三者也无法简单译解构成DNA芯片的DNA探针的碱基排列。
发明内容
为了解决上述课题,本发明的目的在于提供:把多种对标的物质能特别结合的探针安放(定位)在设置于固相基体材料表面上的给定阵列状点(spot)位置上来制造探针阵列时,在各探针阵列中,对安放(定位)在各矩阵状点位置上的探针分子的种类的排列图案进行不容易识别的随机变更的技术;根据进行了有关的变更处理的点(spot)图案,能变更多种探针的定位(spot)地址的安放装置;与此对应,对于根据进行有关变更处理的点图案而安放的多种探针,根据在探针阵列上检测到的信息,对于各探针,在进行实施了该变更处理的点位置的译解的基础上,检测作为目的的多种探针的方法、以及为此而使用的检测装置。
本发明人为了解决所述课题,发现在制造在固定基体材料上固定多个探针的基体材料时,即使固定在得到的探针固定基体材料上的多个探针种类全体相同时,对各探针固定基体材料,例如在各制造批、各制造基体材料、各制造日、各制造月、各制造装置、各制造工厂、各制造者(制造厂商)、各使用区域、各产品修正、或者任意的时刻,通过变更固定各探针的点位置,对于安放在各点地址中的探针种类,能实现加密。在有关发现的基础上,本发明人证明能使在制造在固定基体材料上固定多个探针的基体材料时使用的安放器成为在基体材料上安放多个对标的物质能特别结合的探针时,对各探针固定基体材料,能按照给定的信息变更安放探针的位置(图案)的安放器(spotter),从而完成本发明。
本发明的安放器(spotter),是把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上的、在探针固定基体材料的制造中使用的、在点位置上安放探针的安放器,其特征在于:包括:
根据对所述多个探针分别分配所述多个点位置中的任意一个的、由一群点地址构成的点位置图案来安放各探针的部件;和对每个进行制造的探针固定基体材料,按照给定信息对该点位置图案进行加密的点位置图案加密部件。
此时,所述点位置图案加密部件具有:预先存储能适用于所述探针固定基体材料的多个点位置图案,对每个进行制造的探针固定基体材料,按照所述给定的信息来选择所述多个点位置图案中的一个的机构;具有对每个进行制造的探针固定基体材料变更该选择的点位置图案的功能。或者所述点位置图案加密部件具有:对每个进行制造的探针固定基体材料,把所述给定信息作为密钥,对基准点位置图案进行加密处理,制造出新的点位置图案的机构;具有对每个进行制造的探针固定基体材料,变更该制造出的点位置图案的功能。
须指出的是,在本发明的安放器(spotter)中,所述给定信息是按进行制造的每个探针固定基体材料而设定的个别信息,至少包含所制造的探针固定基体材料的识别中使用的制造批号、制造编号(制造序列号)、制造日期和时间、制造装置编号、制造者(制造厂商)、工厂识别编号、制造地区编号、使用地区编号、制造修正编号、任意信息、或它们的组合、或根据这些信息通过类推或计算而唯一导出的信息。
而在本发明的安放器中,与上述的点位置图案变更部件对应,还希望具有:在所述固相基体材料上,或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载所述预先给予选择的点位置图案的图案编号的部件。或者,还希望具有:在所述固相基体材料上,或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载用于解除所述加密处理的密钥的部件。
并且,安放所述各探针的部件能采用使用喷墨技术给予探针的方式。
此外,本发明也提供使用上述本发明的安放器制造的探针固定基体材料的发明。即本发明的探针固定基体材料把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置,其特征在于:使用具有上述的结构的任意一个的本发明的安放器,进行所述多个探针向固相基体材料上的安放。例如,固定在所述固相基体材料上的多个探针是DNA片断,所述探针固定基体材料能具有DNA微阵列的形状。
此外,本发明也涉及具有译解所述本发明的探针固定基体材料中的加密的点图案的功能,并且能检测基于探针固定基体材料上的多个探针的标的物质的检测装置。
即本发明的检测装置检测把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上的探针固定基体材料中的所述多个探针分别安放在所述多个点位置中的哪个位置,其特征在于:具有:对成为检测对象的每个探针固定基体材料,译解按照给定的信息加密的点位置图案的部件。此时,使用具有对所述固相基体材料或设置在所述固相基体材料上的框架记载预先给予所述选择的点位置图案的图案编号的部件的上述本发明的安放器,进行所述探针固定基体材料中的所述多个探针对固相基体材料上的安放;检测装置的特征在于:具有:读取对所述固相基体材料或设置在所述固相基体材料上的框架记载的所述图案编号的部件;根据读取的图案编号和预先分别给予多个点位置图案的一群图案编号,特定对该探针固定基体材料选择的点位置图案的部件。或者,使用具有对所述固相基体材料或设置在所述固相基体材料上的框架记载用于解除所述加密处理的密钥的部件的安放器,进行所述探针固定基体材料中的所述多个探针对固相基体材料上的安放;检测装置的特征在于:具有:读取解除该加密的密钥的部件;根据读取的解除加密的密钥,通过解除在制造出该新的点位置图案的过程中实施的加密,特定对该探针固定基体材料制造出的点位置图案的部件。
并且,本发明也是在预先把多个探针分注到安放器用的多井板中的步骤中使用的分注装置的发明,例如是在各探针的安放中使用针安放法时,用与点图案对应的配置,预先把多个探针分注到针安放装置用的多井板的过程中使用的分注装置的发明。即本发明是分注多个探针的分注装置,此时,也提供具有能按照给定信息变更分注探针的位置图案的结构的分注装置。
即本发明的分注装置在把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上的探针固定基体材料的制造中使用,对安放器用的多井板分注所述多个探针,其特征在于:具有:根据由对所述多个探针分别分配所述多个点位置中的任意一个的一群点地址构成的点位置图案,向所述多井板上的对应的井中分注各探针的部件;对每个进行制造的探针固定基体材料,按照给定信息变更该点位置图案的点位置图案加密部件;根据对每个进行制造的探针固定基体材料变更的所述点位置图案,分配所述多井板上的井的部件。须指出的是,该分注装置作为安放器,适合在使用通过针安放法把探针安放到点位置的针安放装置时使用。此时,所述点位置图案加密部件具有预先存储能适用于所述探针固定基体材料的多个点位置图案,对每个进行制造的探针固定基体材料,按照给定信息选择所述多个点位置图案中的一个的机构,具有对每个进行制造的探针固定基体材料变更该选择的点位置图案的功能。或者,所述点位置图案加密部件具有对每个进行制造的探针固定基体材料,以给定信息为密钥,把基准点位置图案加密,制造出新的点位置图案的机构,具有对每个进行制造的探针固定基体材料变更该制造出的点位置图案的功能。
须指出的是,所述给定信息是对每个进行制造的探针固定基体材料设定的个别的信息,至少包含所制造的探针固定基体材料的识别中使用的制造批号、制造编号(制造序列号)、制造日期和时间、制造装置编号、制造者(制造厂商)、工厂识别编号、制造地区编号、使用地区编号、制造修正编号、任意信息、或它们的组合、或根据这些信息通过类推或计算而唯一导出的信息。
同时,本发明也提供在所述本发明的安放器或分注装置中,按照给定信息变更安放或分注探针的位置图案的操作中使用的程序。
即规定本发明的点位置图案的变更动作的程序能由计算机执行,在把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置时使用,其特征在于:把由对所述多个探针分别分配所述多个点位置的任意一个的一群点地址构成的信息定义为点位置图案,该程序包括:输入给定信息的操作;按照输入的给定信息特定对应的点位置图案的操作;输出特定的对应点位置图案的操作。此时,按照所述输入的给定信息选择对应的操作能包含:把从预先存储的能适用于制造的探针固定基体材料的多个点位置图案中选择的一个特定为所述对应的点位置图案的步骤。或者,按照所述程序中规定的所述输入的给定信息特定对应的点位置图案的操作能包含:把通过以所述给定信息作为密钥,对基准点位置图案进行加密处理,新制造出的点位置图案特定为所述对应的点位置图案的步骤。
此外,本发明的规定分注位置图案的变更动作的程序能由计算机执行,在把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置时使用,其特征在于:把由对所述多个探针分别分配所述多个点位置的任意一个的一群点地址构成的信息定义为点位置图案,根据所述点位置图案,把使各探针与安放器用的多井板上的各井对应的一群井的位置信息定义为分注位置图案,至少该程序包含:输入给定信息的操作;按照输入的给定信息,特定对应的点位置图案的操作;通过进行从特定的对应的点位置图案向该分注位置图案的变换,特定对应的分注位置图案的操作;输出特定的对应的分注位置图案的操作。须指出的是,该安放器是基于针安放法的安放装置。此时,按照所述输入的给定信息,特定对应的点位置图案的操作能包含:把从预先存储的能应用于制造的探针固定基体材料的多个点位置图案中选择的一个特定为所述对应的点位置图案的步骤。或者,按照所述输入的给定信息,特定对应的点位置图案的操作能包含:把通过以所述给定信息作为密钥,对基准点位置图案进行加密处理,新制造出的点位置图案特定为所述对应的点位置图案的步骤。
须指出的是,在上述的本发明的程序中,所述给定信息是对每个进行制造的探针固定基体材料设定的个别的信息,至少包含所制造的探针固定基体材料的识别中使用的制造批号、制造编号(制造序列号)、制造日期和时间、制造装置编号、制造者(制造厂商)、工厂识别编号、制造地区编号、使用地区编号、制造修正编号、任意信息、或它们的组合、或根据这些信息通过类推或计算而唯一导出的信息。
本发明也提供在上述的本发明的检测装置中,对于安放在探针固定基体材料上的各探针,规定译解加密的点图案的操作的程序的发明。即本发明规定译解加密的点图案的操作的程序能在计算机上执行,在检测把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相载体或基体材料的表面的探针固定基体材料中的所述多个探针分别安放在所述多个点位置中的哪个位置的装置中使用,其特征在于:把由表示安放多个探针的点位置的一群点地址构成的信息定义为点位置图案,具有根据从该探针固定基体材料得到的检测信息,译解对成为检测对象的每个探针固定基体材料按照给定信息进行加密处理的点位置图案的功能;该程序包含:输入从所述探针固定基体材料得到的检测信息的操作;从输入的检测信息取出用于译解所述探针固定基体材料的点位置图案的部分信息的操作;根据取出的所述部分信息,译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作;输出所述译解的点位置图案的操作。在译解用的程序中,使用具有在所述固相基体材料上或对设置在所述固相基体材料上的框架记载预先给予所述选择的点位置图案的图案编号的部件的本发明的安放器,进行所述探针固定基体材料中所述多个探针向固相基体材料上的安放,用于译解所述探针固定基体材料上的点位置图案的部分信息是该记载的图案编号,根据取出的所述部分信息,译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作能包含:根据所述记载的图案编号、预先分别给予多个点位置图案的图案编号,把给予该记载的图案编号的点位置图案特定为译解的图案编号的步骤。此外,在本发明的译解用的程序中,使用具有在所述固相基体材料上或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载对所述加密处理解除该加密的密钥的部件的本发明的安放器,进行所述探针固定基体材料中所述多个探针向固相基体材料上的安放,用于译解所述探针固定基体材料的点位置图案的部分信息是在所述固相基体材料上或对设置在所述固相基体材料上的框架记载的解除所述加密的密钥,根据取出的所述部分信息,译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作能包含:根据解除所述加密的密钥,解除所述实施的加密,把对该探针固定基体材料制造出的点位置图案特定为译解的点位置图案的步骤。
本发明对于上述的本发明的程序,以用计算机能执行的表现形式记述该程序的计算机可读记录媒体的形态提供,即存储本发明的程序的计算机可读记录媒体是在计算机可读记录媒体上存储用计算机能执行的表现形式记述的至少一个程序,其特征在于:所述程序的至少一个是具有所述结构任意一个的本发明的程序。
最终,本发明提供组合上述本发明的探针固定基体材料和检测装置的遗传基因诊断系统,即本发明的遗传基因诊断系统使用把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相载体或基体材料的表面的探针固定基体材料,把样品中包含的标的物质与对所述探针固定基体材料上的该标的物质能特别结合的探针结合,进行结合的标的物质的检测,其中:使用的所述探针固定基体材料是具有所述结构中的任意一个的本发明的探针固定基体材料,具有在所述结合的标的物质的检测中,使用所述结构中的任意一个的本发明的检测装置的系统结构。
并且,为了在所述的本发明中使用,本发明也提供在记录媒体上记录预先制作的多种点位置图案的记录媒体,即本发明的记录媒体之一记录有用于上述本发明的安放器的多种点位置图案,其中:所述安放器的点位置图案加密部件具有:预先存储能适用于所述探针固定基体材料的多个点位置图案,对每个进行制造的探针固定基体材料,按照给定的信息从所述多种点位置图案中选择一个的机构;具有对每个进行制造的探针固定基体材料变更该选择的点位置图案的功能。
此外,本发明的记录媒体之一记录有用于上述本发明的分注装置的多种点位置图案,其中:所述分注装置中的点位置图案加密部件具有:预先存储能适用于所述探针固定基体材料的多个点位置图案,对每个进行制造的探针固定基体材料,按照给定的信息从所述多种点位置图案中选择一个的机构;具有对每个进行制造的探针固定基体材料变更该选择的点位置图案的功能。
此外,本发明的记录媒体之一记录有用于上述本发明的检测装置的多个点位置图案,其中:所述检测装置使用所述安放器进行成为对向的所述探针固定基体材料中所述多个探针向固相基体材料上的安放,具有:读取在该探针固定基体材料的固相基体材料上或对设置在该固相基体材料上的框架记载的所述图案编号的部件;存储预先分别给予所述多个点位置图案的图案编号、与各自对应的一群点地址,根据读得到图案编号,特定对该探针固定基体材料选择的点位置图案的部件。
根据本发明,对于在探针固定基体材料上固定的多个探针,进行点地址的变更的点位置的加密变得容易,所以象遗传基因诊断用DNA芯片那样,残留在使用后的DNA芯片上的标的物质的结合结果本身相当于各患者的个人信息,第三者即使观察有关的使用后的DNA芯片,把探针固定顺序加密的结果是能减小由第三者从该使用完毕的DNA芯片简单译解诊断结果的危险性。
医疗领域中使用的探针固定基体材料的制作中使用的多个探针本身例如对于DNA芯片上的各DNA探针,明确指出对于检测对象的标的物质的信息,但是从对DNA探针的碱基排列的提供源的社会关怀出发,有时从明确指出的信息把各DNA芯片的碱基排列本身除外。此外,如果能译解使用的DNA探针的碱基排列,就会产生未得到使用许可的第三者进行模仿等保密信息的维持上的问题。从这些观点出发,通过使用本发明,第三者无法简单地译解构成DNA芯片的DNA探针的碱基排列,非常有助于防止以模仿为目的的译解。
从以下的与附图结合的描述中,本发明的其他特征和优势将变得明显,在附图中,相似的参照符号指明相同或相似的部分。
附图说明
下面简要说明附图。
附图构成本说明书的一部分,用于描述本发明的实施例,说明本发明的原理。
图1是模式地表示本发明的安放器在分配探针固定基体材料的各探针的点地址时,点位置图案的变更操作的点位置图案的选择方式一例和相当于该选择操作的数据流图表的图。
图2是说明把16种探针安放为微阵列状时的点图案的一例的图。
图3是表示使用生成随机数的算法,生成把16种探针安放为微阵列状时的点图案的算法一例的图。
图4是表示生成的点图案中的分配给微阵列状的各点地址的探针种类(探针编号)的排列图。
图5是模式地表示根据本发明的检测装置的对探针固定基体材料的检测结果、点图案编号的信息,进行探针固定基体材料的各探针的点地址的判别、对各探针的检测结果的关联操作的一例、相当于该操作的数据流图表的图。
具体实施方式
下面,结合附图来详细描述本发明的实施例。
下面,进一步详细说明本发明。
本发明的安放器在制造在固定基体材料上固定多个探针的基体材料时,即使固定在得到的探针固定基体材料上的多个探针种类全体相同时,在各探针固定基体材料本身中,按照其制造批量、各制造基体材料、各制造日、各制造月、各制造装置、各制造工厂、各制造者(制造厂商)、各使用区域、各产品修正、或者任意的时刻,通过变更固定各探针的点位置,对于安放在各点地址中的探针种类,能实现加密。
本发明在作为对象的探针固定基体材料中,安放多个探针,并固定的固相基体材料是按照制作的探针固定基体材料的使用用途适当选择的,未特别限定固相基体材料本身。例如固相基体材料为把多个探针安放为阵列状,并且固定的微阵列型时,如果考虑使用有关微阵列状的探针的标的物质检测的使用情况和高的通用性,就适合使用表现平板的表面的固相基体材料即玻璃衬底或塑料衬底。在玻璃衬底中,在衬底材料本身中不含碱成分的无碱玻璃衬底或石英衬底是更希望的基体材料的一例。此外,对于这些固相基体材料,在其表面安放各种探针,进行固定化的过程中能使用的固定化方法已经报告过多种。
作为在基体材料上固定探针的方法,已经按照探针的每个种类提出各种方法,按照目的加以使用。例如,众所周知的有:对DNA探针应用固相合成法,通过在基体材料上进行具有目的的碱基排列的DNA分子的合成,制作固定在基体材料上的DNA探针的方法;在基体材料上给予另外制作的DNA,使DNA结合到基体材料上并固定的方法。须指出的是,在把另外制作的DNA给予基体材料上的安放操作中,使用针法或冲压法或喷墨法等方法。
作为在基体材料上进行配置为阵列状的DNA探针的合成的方法,众所周知的有:例如美国专利第51438545号说明书中所述,从固相合成基体材料上的选择的区域,通过活化剂除去5’末端的保护基,使具有能除去的保护基的单体作用于所述选择的区域,通过重复与5’末端结合的操作,在基体材料上合成分别具有作为目的的碱基排列的单体(DNA分子)的方法。
本发明的安放器通常采用把另外制作的探针安放在基体材料表面,固定化的方式,但是也包含:采用应用上述的固相合成法,在基体材料上合成目的的探针,作为固定在在该点地址(部位)的探针的方式,实现等价的安放状态的装置。
此外,作为把预先准备的探针安放在基体材料上后,固定在基体材料的表面上的方法,众所周知的有:例如如特开平8-23975号公报所述,用具有碳二酰亚胺基的高分子化合物制作基体材料本身,或在基体材料上承担由具有碳二酰亚胺基的高分子化合物构成的固定用的材料层,使具有与该碳二酰亚胺基的反应性的生物学上的活性物质接触存在于基体材料表面的具有碳二酰亚胺基的高分子化合物,通过与该碳二酰亚胺基的反应,进行共价键性的固定的方法。此外,众所周知的有:如特开平8-334509号公报所述,在生物学的活性物质的检测中,使用通过在具有碳二酰亚胺的化合物上,进行通过该碳二酰亚胺基的共价键的形成,进行固定的方法,进行检测的方法。
而且,在特开2001-178442号公报中,记载了以下方法:用液相使能使用硫醇修饰剂导入的在末端部具有硫醇基(-SH)的DNA片断,和把具有能与该硫醇基(-SH)反应而形成共价键的反应性置换基的链状分子在与所述反应性置换基所在的链端不同的其他末端固定在表面上的固相载体接触,据此,通过硫醇基(-SH)和该反应性置换基的反应,在DNA片断和链状分子之间形成共价键,把DNA片断固定到固相载体表面上。此外,换记载有:作为能与硫醇基(-SH)反应而形成共价键的反应性置换基的一个例子,能使用从由马来亚胺二伊鲁基、α、β-不饱和羰基(>C=C=O)、α-卤羰基(-COX)、卤化烃基(-(CnH2n)-X)、氮丙啶-2-伊鲁基、二硫基(-S-S-)构成的群选择的包含反应性官能团的置换基。
对于把安放在基体材料上的各种探针的固定的方法如上所述,只是对DNA片断的固定方法,就至少很多方法。须指出的是,在本发明中,对于安放的探针种类或它的固定方法、机构,并未特别限制。
此外,作为把探针安放在基体材料上的方法,能列举出把在水性媒体中溶解或分散探针的水溶液给予基体材料表面的方法,例如通过特开平11-187900号公报中描述的喷墨法或针法或针和环法等,安放在具有碱基性基的基体材料表面。
对于使用探针的水溶液的安放方法,在上述的各种安放方法中,特别是喷墨法能以高密度安放到正确的位置,所以是适用于本发明的安放方法。当安放的基体材料表面是电极等时,与使用基于针的接触的针法相比,如果使用以非接触进行安放的喷墨法,就具有不会发生对电极等的表面的机械接触引起的损伤的优点。在基于喷墨法的安装中,使用在极细的喷嘴中注入包含探针的液体,对该喷嘴的顶端附近在瞬间进行加热加热,从喷嘴的顶端使极小容量的包含探针的液滴飞出,在空间飞翔,附着到基体材料表面的步骤。此时,从喷嘴喷出的液滴量是极微量的,但是该量具有表现高的再现性的优点。在基于把喷出的液滴量正确地控制为极微量的喷墨法的安放方法中,如果构成包含探针的液体的媒体成分是从喷墨头喷出液滴时,对媒质的探针实质上不造成影响的,并且是满足使用喷墨头能正常喷出的媒体组成,就为未特别限定。例如使用的喷墨头为对媒体给予热量并使其喷出的机构的泡沫喷墨头时,希望包含丙三醇、硫代二甘醇、异丙醇、乙炔醇的水性媒体作为包含探针的液体中包含的媒体成分。例如,当探针是DNA片断时,适合使用包含丙三醇5~10质量%、硫代二甘醇5~10质量%、乙炔醇0.5~1质量%的水性媒体。此外,使用的喷墨头是使用压电元件使液体喷出的压电喷墨头时,希望包含乙二醇、异丙醇的水性媒体作为包含探针的液体中包含的媒体成分。例如,当探针是DNA片断时,适合使用包含乙二醇5~10质量%、异丙醇0.5~2质量%的水性媒体。
从喷墨头喷出使用具有所述的媒体组成的水性媒体制作的包含探针的液体,附着到基体材料上时,液滴点的形状变为圆形,此外附着的液滴的点范围不会伴随着水性媒体的浸润而扩大。当以高密度安放包含探针的液滴时,也能抑制相邻的点间,水性媒体彼此渗出,点连结的现象。如果使用喷墨法,把哪个探针安放在哪个位置上的点地址控制能用程序容易地变更,所以在有必要变更各探针的点地址的本发明中,是合适的安放法。须指出的是,在本发明中,包含提供给点的液体的制作中使用的水性媒体的组成并不局限于以上列举的组成。
探针固定基体材料使用固定在基体材料上的多个探针,能同时实施样品中包含的多个标的物质的检测或定量。由于这些优点,DNA芯片适合于多种遗传基因发现或一碱基多态的分析等,至少有在使用这些遗传基因分析的研究领域的用途和进行遗传基因诊断的医疗领域的用途等两大使用领域。此时,当在遗传基因诊断的用途中使用DNA芯片时,各患者的诊断中使用的DNA芯片表示遗传基因诊断结果,如果判明固定在DNA芯片上的探针的存在部位和使用该DNA芯片的患者的姓名,则即使是第三者也能判断读出该患者的个人信息即诊断结果。此时,即使是固定的多种探针相同的DNA芯片,通过变更各探针的点位置(图案),进行使第三者不易特定固定在DNA芯片上的探针的存在部位的处理,即使第三者得到患者的姓名、使用完毕的DNA芯片,也能大幅度地降低擅自分析各患者的诊断结果的危险性。
本发明的安放器中使用的变更各探针的点位置(图案)的方法的一例有对于各探针固定基体材料,例如按照图1所示的过程,准备按照产品信息(探针信息)201预先生成的多种点图案203,根据制造编号(序列号)202,从预先生成的多种点图案(点图案集)203实施一种点图案的选择204的方法。每次按照分别为各探针固定基体材料选择的一种点图案204,生成控制基于安放器的安放在各点地址上的探针的配置的安放器控制命令205,变更安放器的动作206。例如当探针固定基体材料是把16种探针安放在配置为矩阵状的16点地址中时,如图2所示,按照该产品信息(探针信息),从预先生成的多个点图案中,例如选择10种点图案的集合作为点图案集203。须指出的是,101表示安放的各探针。对于各探针固定基体材料,把其制造编号(序列号)202数值化为自然数,并且根据制造编号(序列号)变更点图案,当下一位的数字为1时,为图案编号1的图案,当下一位的数字为2时,为图案编号2的图案。
须指出的是,在图2所示的各点图案中,各点地址所示的数字是表示16种探针的种类的编号(下面称作探针编号)。在任意的点图案中,以各探针编号表示的探针代表相同的探针种类,此时,这一群在探针固定基体材料上公共的各探针编号相当于哪个探针种类的信息相当于产品信息(探针信息)。此外,在16个点地址中配置16种探针的方法(点图案)的总数存在16!个,但是从其中,作为图案编号1~10,把10个点图案按顺序选择的方法的总数变为非常大的数,为(16!)·(16!-1)…(16!-9)·(16!-10)个。换言之,图2所示的图案编号1~10的点图案集的选择本身能进行相同选择的可能性极低,成为加密的状态。因此,对于各探针固定基体材料,即使采用选择与各制造编号(序列号)202的下一位数值相同的图案编号的简便选择基准,也成为高度加密的状态。
并且,在根据该制造编号(序列号),从点图案集之中选择一个图案编号的操作中,如果采用更复杂的选择操作,则变为更高度加密的状态。例如,把构成点图案集的图案种类变更为n个,把所述10进制的自然数记载的制造编号(序列号)变换为n进制的记载,并且通过采用选择与下一位数字相同的图案编号的选择基准,第三者无法推测包含从10进制到n进制的变换操作的事实,所以成为更高度加密的状态。或者,对10进制的自然数记载的制造编号(序列号)的数值进行任意的演算处理,例如对于把各位数字相加得到的值,以n进制记载,采用选择与下一位数字相同的图案编号的选择基准,则包含多级的数值处理操作的事实是第三者无法推测的,所以成为更高度加密的状态。
在上述的说明中,为了简化说明,使用探针种类数和点(点地址数)相同的事例。但是,实际上,为了加密而准备的点图案的探针种类数和实际的产品所必要的探针数没必要一致,此外,与实际的产品所必要的探针数匹配,准备对应的点图案时要费工夫,有时点图案的管理变得负载。例如当探针种类数比点数(点地址数)还少时,可以是在各点图案中,把实际安放的探针种类安放到分配有探针编号的点地址中,把剩余的点地址空出的状态。例如,在图2所示的例子中是16种探针用的点图案,但是在实际使用的探针为10种时,有安放到探针编号1~10用的点地址上,并在探针编号为11~16用的点地址上不进行安放的方法。
代替设置什么也不安放的空出状态的地址,也考虑到安放多个虚设的探针或相同的探针的情形。如果使用刚才的例子具体说明,则是在什么也不安放的探针编号11~16用的点地址中,把与产品的检测对象无直接关系的探针作为虚设的探针或重复安放探针编号1、2等已经安放在其他位置(地址)的探针的方法。此时,与单纯加密时相比,第三者的译解变得更加困难。
并且,在图2的例子中,安放各探针的点地址是配置在正方形上的矩阵形状,但是并不局限于该矩阵形状,可以是纵的点数和横的点数不同的长方形、多边形,也可以为了提高点的密度,把点配置为细密充填的格子状(蜂窝状),并未特别限制矩阵的形状。
此外,当探针种类数n比点地址数m还多时,可以对一个点地址,混合2种探针,进行安放。
而如上所述,根据各探针固定基体材料的特征的给定信息选择点图案时,使用的给定信息除了制造编号(序列号),例如可以是把制造日期和时间变换为序列的数值,作为在各探针固定基体材料间变更的给定信息而使用的方法。当然,也可以是给予各探针固定基体材料的随机值,可以是包含制造批号、制造装置编号、制造地区编号、使用地区编号、产品修改编号等的数值。须指出的是,在本发明中,根据各探针固定基体材料的特征的给定信息选择点图案的操作并不局限于上述的举例。
此外,没必要总把点图案集内置于安放器中,可以在安放器中设置能输入点图案集的装置,适时输入点图案集。具体而言,也可以是在安放器中设置软盘读取装置,从所述读取装置输入预先记录在软盘上的点图案集的方法。
而使用由本发明的安放器进行点的形成的各探针固定基体材料,评价与各探针特别结合的标的物质的有无时,使用的当事者希望本身在检测时能简便识别在使用的探针固定基体材料中,在各点地址行配置有哪个探针编号的探针。如果考虑这一点,就希望在各探针固定基体材料中,在微阵列内的探针固定部位以外的区域、探针固定基体材料用的框架等上记载使用了哪个点图案的信息。记述对于使用的点图案的信息等的方法考虑有二维代码、条形码、色码等,但是并不局限于这些代码记载法。例如,在各探针固定基体材料的结果的检测时,使用以荧光扫描仪观测的方法时,如果是使用荧光物质,在微阵列内的未固定探针的区域中描绘二维代码,用荧光扫描仪检测基于该二维代码的荧光的方式,就不需要新的检测设备,所以希望是该方法。
须指出的是,在此所说的框架不仅是狭义的框架,例如用于从污染物质或物理上的冲击保护探针固定基体材料的保护材料或构造支撑体,也包含意味着作为产品的封装或捆包材料、使用说明书等文件、其他的信息记录媒体等能与探针固定基体材料一体提供的附属物的广义的框架。
此外,根据所述的各探针固定基体材料的特征的给定信息选择点图案时,代替从预先特定的点图案构成的点图案集选择的方法,也可以采用每次根据给定的信息生成点图案的方法。例如,当在16个点地址中安放16种探针时,按照图3所示的生成排列图案的算法,根据给定信息例如制造编号(序列号),生成把探针编号重新排列的随机数A(1)、A(2)、…A(16),如图4所示,根据该随机数列,把探针编号分配给16个点地址的矩阵排列,能生成一个点图案。图4的102表示加密的点上的探针编号。即图3所示的算法中,在模拟随机数列的生成步骤中,采用根据给定信息例如制造编号(序列号)唯一选择的种子的值,生成一系列的模拟随机数列。对各探针固定基体材料,根据给定信息例如制造编号(序列号)而唯一选择的种子的值例如如果选择与所述10进制的自然数记载的制造编号(序列号)的下一位数字相同的值,就生成分别不同的10种点图案。
在本发明中,随机数列意味着数列x1、x2、x3…的排列在外观上是不规则的,任意的xk变为xk<C的可能性只依存于C,不依存于xk-1。特别在本发明中,通常使用数列x1、x2、x3…由自然数构成的。
随机数中存在:没有偏移的某范围的自然数值以等概率出现的一样分布的随机数;出现概率不是等概率,X方分布、γ分布、三角分布、正态分布、对数分布、波松分布等各种概率分布的随机数。
当在计算机等中使用随机数列时,一般使用根据给定算法生成的模拟随机数。此外,在计算机中能使用的生成一样分布的模拟随机数的算法中,知道有线性合同法(103)、Knuth的随机数发生法、M系列随机数、Wichmann-Hill的随机数发生法等很多方法。须指出的是,在本发明中,使用一样分布的模拟随机数时,并未特别限定应用的一样分布的模拟随机数的算法。
在从以往知道的生成模拟随机数的算法的多数中,如果考虑称作种子的成为用于生成模拟随机数列的基础的数字,则按照该种子生成不同的模拟随机数列。须指出的是,因为是对各种子的值分别生成一个模拟随机数列的算法,所以,如果判明使用的各种子的值,就能再度生成相同的模拟随机数列。如果使用该特性,在检测时能确定当初的安放步骤中的点图案的生成时使用的模拟随机数生成算法的种类和该种子的值,就能再度生成该探针固定基体材料中选择的点图案。即在检测时,能判明该探针固定基体材料的各探针是用哪个点图案安放的。
预先选则当初的安放步骤中的点图案的生成时使用的模拟随机数生成算法,而种子的值可以使用把该探针固定基体材料的制造编号或制造日期和时间变换为序列的自然数的值,使用该值的方式;或者代替制造编号或制造日期和时间,使用制造装置编号等。如果是该探针固定基体材料所固有的值,则可以是随机设定的值。须指出的是,在检测时,如果使用该探针固定基体材料使用的种子的值,进行点图案的判别,则当该探针固定基体材料为微阵列时,希望在该微阵列内的探针固安放置以外的区域或设置在探针固定基体材料上的框架等上记载作为加密译解密钥而使用的种子的值。例如,当对于使用探针固定基体材料的探针结果,采用以荧光扫描仪观察的检测方式时,使用荧光物质,把包含种子的信息变换为二维代码,在微阵列内的未固定探针的位置中描画,通过用荧光扫描仪检测该荧光,在探针结果的基础上,成为能读取二维代码的信息的形态。使用荧光物质记载包含该种子的值的信息的形态不需要新的检测设备,所以是希望的方法之一。
本发明的安放器中使用的生成点图案的算法、生成模拟随机数的算法并不局限于上述的例子,此外,作为加密译解密钥的记述方法,列举有二维代码、条形码、色码等,但是并不局限于这些方法。
变更该点图案的功能没必要内置在具有多个探针的基体材料的制造装置中,也考虑到例如预先在计算机上生成几个点图案,变换为制造装置的动作记述数据,在某时刻改变它,实质上变更点图案的方法。
如上所述,在本发明的安放器中,当变更探针固定基体材料上的安放位置时,适合采用具有能容易进行该位置变更的优点的喷墨方式。此外,当在安放中使用针法时,一般来说,把包含探针的液体分注到井板中,把分注到各井中的液体取到各针的顶端,安放到对应的位置。与喷墨方式相比,在针法时,能安放的位置或顺序由使用的针的配置特定。因此,可以采用在向井板分注时,通过变更分注到各井中的探针的种类即分注图案,变更安放到各点地址中的探针的种类,实质上变更点图案的方式。
此外,井板的使用并不局限于针法,在喷墨法中,考虑到采用例如向能同时安放多种包含探针的媒体的喷墨用头中注入多种包含探针的媒体时,预先把这些包含探针的媒体分注到井板上,从井板向喷墨用头供给的步骤。此时,也存在使驱动喷墨头的装置和程序一定,对该井板进行分注时,通过变更分注图案来变更点图案的方法。
通过使用上述本发明的安放器而制作的探针固定基体材料的对标的物质的检测结果,例如在DNA芯片中,在与预先实施了标识的标的物质的混合反应后,使用实施的标识来进行检测。此时,根据怎样对标的物质进行标识,使用的检测方法不同。例如,当标识是使用若丹明等荧光物质的荧光标识时,有能观测该荧光标识的荧光扫描仪或荧光显微镜。须指出的是,对标的物质的标识方法或对应的检测方法并不局限于所列举的荧光标识。
而在检测中,虽然判明实现与哪个标的物质的特别结合的点地址,但是,如果无法识别配置在该点地址中的探针的种类,则无法解释产生哪个探针与标的物质的结合反应等检测结果。因此,与检测同时,有必要确定在使用的探针固定基体材料中,配置在各点地址中的探针种类即点图案,有必要解释哪个探针与标的物质反应。
例如,当在探针固定基体材料上记载有点图案编号或点图案的生成中使用的模式随机数的种子、译解密钥等信息时,同时检测这些信息,能译解对应的点图案。而当不在探针固定基体材料上,在设置在探针固定基体材料上的框架或在在此包含在框架的概念中的容纳探针固定基体材料的封装等上记载有点图案编号或译解密钥等信息,而无法同时检测时,有必要另外读取,对译解装置输入这些信息。
作为另外输入点图案编号或译解密钥等信息的方法,除了使用附属于译解装置的键盘输入,考虑到另外设置条形码或二维代码、色码等的读码器,读取并输入的方法,但是并不局限于这些列举的方法。须指出的是,能在结束检测操作后,独立实施译解处理,因此,可以选择与检测装置分离设置译解装置的形态、内置于装置中的形态的任意形态。
在探针固定基体材料上记载上述的点图案编号、模拟随机数的种子、译解密钥等信息,在与探针结合的标的物质的检测的同时,使用相同的检测方法,进行读取时,读取它,通过把译解的机构内置于检测装置中,能在检测操作的同时,进行译解。
当在对标的物质的标识中使用荧光物质,检测荧光时,如果使用荧光物质在未固定探针的区域中记载点图案编号、模拟随机数的种子、译解密钥等信息,就不需要新的检测设备,所以希望是该方法。
作为本发明的检测装置的装置结构的一例,图5表示在对标的物质的标识中使用荧光物质,此外,也能使用荧光物质把点图案编号的信息记载到探针固定基体材料上的能应用于探针固定基体材料的装置结构例。探针固定基体材料为DNA芯片的形态时,对样品进行混合反应后,预先对标的物质以荧光物质作为标识,用荧光观测用的检测设备302观察通过混合反应,与探针形成特别的混合体的标的物质的有无和量。与该混合结果的检测操作301一起,通过检测设备302也观察以荧光物质记录到探针固定基体材料上的点图案编号的记述部位。结果,在混合结果的检测操作301中,得到在哪个点地址中观测到荧光标识的存在,或者把量的测定结果作为混合结果307而得到。通过观侧以荧光物质记载到探针固定基体材料上的点图案编号的记述部位,作为编码的信息,读取点图案编号的检测303,作为点图案编号304输入。
进行从表示在安放操作中使用的与各点图案编号对应的点地址中的探针配置的点图案集,选择分配给读取的点图案编号304的点图案,特定点地址的分析操作306。进行从分析的安放有各探针编号的探针的点地址308、用各点地址检测的混合结果307、表示各探针编号的探针进行与怎样的标的物质特别结合的产品信息(探针信息)311,抽出用于测定的样品中包含哪个标的物质、或者对于含量的信息的诊断操作309。抽出的诊断信息能原封不动地输出,此外,加上与该诊断信息对应的解释,能作为诊断结果310输出。
须指出的是,点图案集305没必要预先内置于检测装置中,例如可以在检测装置中设置能输入点图案集的装置,适时输入点图案集。具体而言,也可以是在检测装置中设置软盘读取装置,从所述读取装置输入预先记录在软盘上的点图案集的方法。
此外,当不是从所述点图案集选择的方法,而采用每次根据给定信息生成点图案的方式时,用输入或自动检测译解装置中使用的模拟随机数生成算法的种类或它的种子的值,根据上述的点图案的制作方法,制作同样的点图案。如上所述,如果特定模拟随机数生成算法的种类和种子的值,就能生成与由安放器制作的点图案相同的图案,所以使用它,进行从由检测装置检测的混合结果、表示各探针编号的探针与怎样的标的物质进行特别的结合的产品信息(探针信息),抽出用于测定的样品中包含哪个标的物质、或者对于含量的信息的诊断操作。该抽出的诊断信息能原封不动地输出,此外,加上与该诊断信息对应的解释,能作为诊断结果输出。须指出的是,该译解装置也可以包含在检测装置等中。
因此,本发明并不局限于以上所描述的实施例,对本领域技术人员来说,可以很容易地对上述实施例进行各种变形和修改,但这些变形和修改只要不脱离本发明的精神和宗旨,就都应属于本发明的保护范围。

Claims (7)

1.一种检测装置,检测把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上而成的探针固定基体材料中的所述多个探针分别安放在所述多个点位置中的哪个位置上,其特征在于具有:
对成为检测对象的每个探针固定基体材料,译解按照给定的信息加密的点位置图案的部件。
2.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于:
根据从能应用于该探针固定基体材料的给定的多个点位置图案中选择的一个,来进行该探针固定基体材料中的、所述多个探针向固相基体材料上的安放;
在该固相基体材料上、或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载有预先给予该选择的点位置图案的图案编号;
包括:读取该记载的图案编号的部件;和
根据所读取的图案编号和预先分别给予该多个点位置图案的一群图案编号,来特定对该探针固定基体材料选择的点位置图案的部件。
3.根据权利要求1所述的检测装置,其特征在于:
把给定信息作为密钥对基准点位置图案进行加密处理,根据新制造出的点位置图案,来进行该探针固定基体材料中的、所述多个探针向固相基体材料上的安放;
在所述固相基体材料上、或者对设置在所述固相基体材料上的框架,记载有用于解除所述加密处理的密钥;
具有:读取用于解除该加密的密钥的部件;和
根据该读取的用于解除加密的密钥,解除在制造出该新的点位置图案的过程中实施的加密处理,据此来特定对该探针固定基体材料制造出的点位置图案的部件。
4.一种方法,在检测装置中使用,该检测装置检测把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上而成的探针固定基体材料中的所述多个探针分别安放在所述多个点位置中的哪个位置上,其特征在于:
把由表示分别安放该多个探针的点位置的一群点地址构成的信息定义为点位置图案,具有根据从该探针固定基体材料得到的检测信息、译解对成为检测对象的每个探针固定基体材料按照给定信息被加密处理的点位置图案的功能;
该方法包含:
输入从所述探针固定基体材料得到的检测信息的操作;
从输入的检测信息中取出用于译解所述探针固定基体材料的点位置图案的部分信息的操作;
根据取出的所述部分信息来译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作;和
输出所述译解的点位置图案的操作。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:
根据从能应用于该探针固定基体材料的给定多个点位置图案中选择的一个,来进行所述探针固定基体材料中的、所述多个探针向固相基体材料上的安放;
在该固相基体材料上,或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载有预先给予该选择的点位置图案的图案编号;
用于译解所述探针固定基体材料中的点位置图案的部分信息是该记载的图案编号;
根据取出的所述部分信息来译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作包含:根据所述记载的图案编号、和预先分别给予多个点位置图案的图案编号,把给予该记载的图案编号的点位置图案特定为译解的图案编号的步骤。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:
把给定信息作为密钥对基准点位置图案进行加密处理,根据新制造出的点位置图案,来进行所述探针固定基体材料中的、所述多个探针向固相基体材料上的安放;
在所述固相基体材料上、或对设置在所述固相基体材料上的框架,记载用于解除所述加密处理的密钥;
用于译解该探针固定基体材料中的点位置图案的部分信息是用于解除所述加密处理的密钥;
根据取出的所述部分信息来译解该探针固定基体材料的点位置图案的操作包含:根据用于解除所述加密的密钥,来解除所述实施的加密处理,据此来把对该探针固定基体材料制造出的点位置图案特定为译解的点位置图案的步骤。
7.一种遗传基因诊断装置,使用把对标的物质能特别结合的多个探针固定在固相基体材料上的多个点位置上而成的探针固定基体材料,使样品中的标的物质与所述探针固定基体材料上的对该标的物质能特别结合的探针结合,并进行所结合的标的物质的检测,其特征在于:
具有在所述结合的标的物质的检测中使用权利要求1所述的检测装置的装置结构。
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