CN101001951A - 分离转录终止序列的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及用于鉴定和分离转录终止序列的有效的高通量方法、系统和DNA构建体。本发明还涉及通过所述方法从稻中鉴定和分离的特定终止序列。
Description
技术领域
本发明涉及用于鉴定和分离转录终止序列的有效的高通量方法、系统和DNA构建体。
背景技术
植物生物技术的目标是产生具有有利的新特性(如害虫和疾病抗性、对环境胁迫(如涝、干旱、热、冷、光强、日长、化学品等等)的抗性、改进的品质(如高果实产量、延长的贮藏寿命、统一的果实形状和颜色、较高的含糖量、较高的维生素C和A含量、较低的酸度等))的植物或产生某些化学品或药物(Dunwell 2000)。此外也可以提高对非生物胁迫(干旱、盐)和/或生物胁迫(昆虫、真菌、线虫感染)的抗性。可以通过开发具有所需表型的遗传改造植物实现作物产量的提高和产量的稳定性。
对生物技术的所有领域而言,除了启动子序列以外,转录终止序列也是重组表达特定基因的基本先决条件。在动物系统中已经良好的定义了转录终止结构(Zhao等,1999;Proudfoot,1986;Kim等,2003;Yonaha和Proudfoot,2000;Cramer等,2001;Kuerstem和Goodwin,2003)。防止与性状无关的(下游)序列的不需要的转录需要RNA转录的有效终止,所述无关序列可以干扰性状性能(更多细节见下文)。特别是与独立的插入相比,多个基因表达盒局部接近的排列(如在一个T-DNA内)经常导致抑制所述构建体中一个或多个基因的基因表达(Padidam和Cao,2001)。这尤其是在需要所有盒的强基因表达的情况下会引起问题。
以前需要通过单个转录终止序列的体外或体内转录分析来分析转录终止的效率,这是基于反复试验的艰巨而耗时的方法(Yonaha和Proudfoot,1999,2000;Yarnell和Roberts,1999)。为了简化此方法,已经将单核苷酸识别探针(如信标)用于体外转录(Liu等,2002)。
在植物中,对转录终止和再起始的了解还处于初期阶段。还不存在明确定义的多腺苷酸化信号序列。Hasegawa等(2003)不能鉴定美花烟草(Nicotiana sylvestris)中在体外和体内系统中都保守的多腺苷酸化信号序列并测定初级(非多腺苷酸化的)转录物的实际长度。存在这种模糊的想法:弱终止子能产生连读,其影响位于临近表达盒的基因的表达(Padidam和Cao,2001)。对转录终止的适当控制可阻止连读至位于下游的序列(如其他表达盒)并使RNA聚合酶II更有效的循环,这将提高基因表达。通过生物信息学预测功能性的有效转录终止序列不是可行的备选方法,因为事实上不存在可进行这种预测的保守序列。预测这些序列在转录终止中的效率甚至更为遥远。此外,通过实验测定初级转录物的实际长度和序列是很困难的,因为这些结构高度不稳定,迅速转化成多腺苷酸化的转录物(Hasegawa等,2003)。
产生遗传修饰的细胞和生物(如植物)需要适当的重组DNA以引入目的基因。重组DNA通常含有一个以上的表达盒。表达盒由启动子、目的基因和终止子组成。来自临近盒的不适当的转录终止可以不利地影响表达盒中目的基因的表达。转录连读和/或多次使用相同的转录终止序列可能具有一个或多个以下缺点:
1.下游序列的不需要的表达可以引起不希望的效应(如代谢谱的变化、基因沉默等)。
2.下游序列的不需要的表达引起对去调节程序的较高障碍。
3.多次使用相同的转录终止序列可通过后生沉默导致整个转基因表达方法的失败。由于目前一组评估的转录终止序列的非常有限,因此在一种转基因生物中多次使用同一转录终止序列经常是不可避免的,已经证明这会引起整个转基因表达构建体的非故意沉默(Matzke 1994;Matzke 1989)。
4.实现包含多个基因表达盒的构建体而没有不希望的不同盒的转录相互作用。这些相互作用可以(取决于盒的方向)包括非故意的表达(如表达盒具有相同方向的读框的情况)或非故意的基因沉默(如盒的倒置方向的情况)。
因此,仍然存在尚未解决的对于严紧和备选的转录终止序列的需求(特别是在植物生物技术领域)。没有可用于鉴定有效终止转录的“严紧”终止子的简单可靠的筛选系统。因此本发明的目的是提供容易地鉴定这些终止序列和提供用于植物的严紧和备选的转录终止序列的方法。通过本发明可实现此目标。
发明内容
因此,本发明的第一个实施方案涉及用于鉴定和分离转录终止序列的方法,所述方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点改变了所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一种或多种DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选地测定其序列。
所述插入位点相对于所述附加序列的定位有多种选择。例如,插入位点可以优选在选自以下位置的位置:
i)附加序列上游,在所述启动子和所述附加序列之间,和
ii)附加序列下游,和
iii)在所述附加序列之间。
取决于插入位点与所述附加序列的定位,产生了若干特别优选的实施方案。在一个优选的实施方案中,用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’到3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点抑制了所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一种或多种DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选地测定它们的序列。
可以将一个或多个待评估其转录终止效率的序列插入筛选载体或筛选构建体。对于两个或更多拷贝的情况,在优选的实施方案中,将待评估其转录终止效率的所述DNA序列以反向重复的形式插入所述插入位点。因此,用于鉴定和分离转录终止序列的方法优选包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’到3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,和
c)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点-优选限制性或重组位点,
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)以反向重复的形式将所述DNA序列至少两个拷贝的特定DNA序列插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,其中与无插入相比,将有效的转录终止子的反向重复插入所述插入位点允许所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择筛选与无插入相比具有所述易于检测特征的构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选地测定其序列。
在本发明的另一优选实施方案中,用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’到3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,并在所述附加序列中嵌入用于插入DNA序列的一个或多个插入位点-优选限制性或重组位点,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点可抑制所述附加序列通过所述启动子序列的全长转录,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择筛选与无插入相比具有所述易于检测特征的构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入DNA序列用作转录终止序列,并任选测定其序列。
优选地,附加序列选自正选择标记、负选择标记、反选择标记、报道基因和毒性基因。对于毒性基因的情况,其中所述毒性基因可以是例如用于必需内源基因的基因沉默的构建体。
优选地,通过选自以下的方法提供待评估其转录终止效率的DNA序列:
i)通过从宿主基因组的扩增提供选择序列,和
ii)通过断裂宿主基因组提供序列文库。
更优选地,待评估其转录终止效率的DNA序列来自植物细胞。
有多种方法可用于将所述序列插入所述插入位点。优选地,通过选自以下的方法将待评估其转录终止效率的DNA序列插入所述插入位点:
i)重组克隆,和
ii)通过序列特异性限制和连接插入。
附图简述
图1-AA1:优选方法A的图解:用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)位于启动子(P1)和附加序列(AS)之间,所述附加序列能引起易于检测的特征。对于有效转录终止子(+)的情况,从启动子P1的转录在所述转录终止子处停止(以构建体下方的箭头表示)。附加序列不发生表达,不引起特征的变化(以划线圆(crossed circle)表示)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子,引起附加序列(以构建体下方的箭头表示)的表达,从而引起特征的变化(以闪电符号表示)。
A2:基于作为附加序列的终止子的优选方法A的图解。用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)位于启动子(P1)和附加序列(AS)之间,所述附加序列在该情况下由已知转录终止子(T)的反向重复组成。启动子下游的所述终止子的第二个拷贝(以颠倒字母标出)在其功能性方向。对于有效转录终止子(+)的情况,从启动子P1的转录在所述转录终止子处停止(以构建体下方的箭头标出),发生标记蛋白(M1)的正常表达(以黑色闪电符号标出)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子,引起已知转录终止子反向重复的表达,导致标记M1表达的基因沉默(GS)(以划线圆标出)。优选地,该构建体包含引起标记M2表达的其他表达盒,标记M2发挥筛选构建体的一般性存在的阳性对照的功能,引起优选不同的第二种表型(以白色闪电符号标出)。
图1-B A3:基于作为附加序列的终止子的优选方法A的图解。用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)位于不同标记基因的两个表达盒之间,所述标记基因的方向彼此头对头。通过已知转录终止子终止标记M2的盒。对于通过插入的测试终止子有效终止转录(+)的情况,从启动子P1的转录在所述转录终止子处停止(以构建体下方的箭头标出),发生标记蛋白(M1)和(M2)的正常表达(以黑色和白色闪电符号标出)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子,引起表达与从启动子P2所表达的RNA链互补的RNA链,从而导致第一种标记基因(M1)的转录物与来自第二种标记基因(M2)的组成型表达的转录物杂交。这导致标记基因M1和M2的基因都沉默(GS)(以划线圆标出)。
A4:基于作为附加序列的终止子的优选方法A的图解。用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)位于启动子(P1)和附加序列之间,在这种情况下所述附加序列由非转录DNA序列(优选已知转录终止子的片段或全长序列)组成。第二个表达盒方向与第一个盒头对头,并且携带所述DNA序列、终止子或终止子片段的第二个拷贝。对于通过插入的测试终止子有效终止转录(+)的情况,从启动子P1的转录在所述转录终止子处停止(以构建体下方的箭头标出),标记蛋白(M1)正常表达(以黑色闪电符号标出)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子,引起已知转录终止子或转录终止子片段的表达,导致第一个标记基因(M1)的转录物与带有相同3’UTR序列的来自第二个标记基因(M2)的组成型表达转录物杂交,从而导致对标记基因M1和M2表达的剂量依赖性抑制(以划线圆标出)。优选地,构建体包含第二种标记基因(M2)。由于两种标记基因表达抑制的效果取决于两类转录物之间的杂交程度,因此可以筛选中间表型,这使得可以例如通过使用不同的筛选条件来选择“弱”候选终止子序列或“严紧”候选终止子序列。
图2:B1:优选方法B的图解:用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)在附加序列(AS)下游,所述附加序列能引起易于检测的特征。以反向重复的形式插入待评估的转录终止子(TT),其中启动子下游的第一个拷贝(以颠倒字母标出)在其功能性方向。对于有效转录终止子(+)的情况,从启动子P1的转录在转录终止子的第一个拷贝处停止(以构建体下方的箭头标出),附加序列(AS)正常表达(以黑色闪电符号标出)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子的两个拷贝,引起所述转录终止子反向重复的表达,导致附加序列(AS)表达的基因沉默(GS)(以划线圆标出)。
B2:优选地,构建体包含另一表达盒,其中AS2编码与AS1不同的特征。在无效转录终止子的情况下两种表达均沉默。对于有效终止子的情况,两个特征均表达(分别以黑色和白色闪电符号标出)。
图3优选方法C的图解:用于待评估的转录终止子(TT)的插入位点(IS)位于附加序列(AS)中的内含子(IN)中,所述附加序列能引起易于检测的特征。对于有效转录终止子(+)的情况,从启动子P1的转录在所述转录终止子处停止(以构建体下方的箭头标出)。不发生附加序列的全长表达,不引起特征的变化(以划线圆标出)。对于无有效转录终止(-)的情况,从启动子P1的转录连读所述的所谓转录终止子,引起附加序列的全长表达(以构建体下方的箭头标出),从而导致特征的变化(以闪电符号标出)。
图4筛选构建体的示意图:
A:Lo523阴性对照构建体:与筛选构建体相应的未插入附加转录终止子序列的二元载体。使用此构建体转化植物细胞时将转录nptII基因。由于此基因下游不存在功能性终止子,转录向前通过nos终止子IR,引起带有发夹结构的转录物,其导致nptII基因表达的沉默。这些细胞不能在含有卡那霉素的选择培养基上生长。可以通过目测组成型表达的GFP标记基因可以区分这些非生长细胞与非转化细胞。
B:筛选构建体B:二元构建体,其含有用于从未转化细胞/植物中选择转化的细胞/植物的组成型表达报道基因的第一个表达盒,其后是含有强组成型启动子驱动的nptII选择标记的第二个表达盒。在nptII基因下游插入了农杆菌nos终止子序列的IR,它由反义方向的第一个重复和其后来自GUS报道基因的短间隔区序列以及以其功能性5’至3’方向插入的nos终止子的第二个重复组成。将待测试转录终止子活性的片段插入nptII基因和所述nos终止子IR之间。
D:Lo546阳性对照构建体C:来自构建体C的二元载体,其中在nptII和nos终止子IR之间插入了rbCs E9终止子序列的长片段。相信E9终止子发挥高效终止子的作用,因此会终止nptII基因的转录,引起表达正常表达水平的选择标记,所述选择标记使转化细胞能在卡那霉素存在下生长。
E:Lo239阴性对照构建体和用于插入候选终止子序列的基本构建体。使用此二元构建体进行转化导致具有组成型表达nptII基因的植物,产生带有确定的3’UTR的转录物。在种子发育时,通过种子特异性启动子启动β-葡糖醛酸糖苷酶标记的表达。得到的GUS转录物带有与nptII转录物相同的确定的3’序列,引起两类转录物之间的杂交,从而导致与两个标记基因相关的表型的损失。种子不能在含有卡那霉素的选择培养基上生长,并且不能在种子中检测到GUS标记。
F:Lo657阳性对照构建体。二元载体来自Lo239,在GUS标记基因和下游序列之间插入了rbCs E9终止子的长片段。通过有效终止在发育种子细胞内产生的GUS转录物,产生的转录物带有与组成型表达的nptII转录物相比不同的3’序列。两个标记盒都无干扰地转录并翻译,得到可在卡那霉素选择下生存并可检测累积的GUS蛋白的幼苗。
图5 pENTR构建体——位置1可见标记(报道基因):含有组成型启动子控制下的GFP报道基因的Gateway Entry载体A。该载体与GatewayEntry载体B Lo376(SEQ ID NO:76)以及Gateway Entry载体C Lo522a(分别为Lo522b)组合用于基于重组的阳性对照构建体的构建,并与Lo503a(分别为Lo503b)组合用于基于重组的二元阴性对照构建体和筛选构建体的构建。
图6用于阳性对照的pENTR构建体:Gateway Entry载体C含有组成型STPT启动子控制下的nptII选择标记基因。在选择标记的3’在nos终止子IR之前插入了rbCs E9终止子序列的长片段。所述构建体与Gateway Entry载体A Lo484、B Lo376和C Lo522(分别为Lo 522b)组合用于基于重组的二元阳性对照构建体的构建。
图7用于阴性对照的pENTR构建体:Gateway Entry载体C含有组成型STPT启动子控制下的nptII选择标记基因。在选择标记的3’插入了nos终止子IR。这引起nptII基因和nos终止子反向序列片段的转录,所述反向序列片段之后是功能性5’-3’方向的nos终止子序列,它默认引起转录物3’末端的发夹结构。所述构建体与Gateway Entry载体A Lo484、B Lo376和C Lo522(分别为Lo522b)组合用于基于重组的二元阳性对照构建体的构建。
图8 pSUN1构建体——阴性对照:基于重组将来自各个pENTR载体的表达盒插入Gateway Destination载体Lo 442 pSUN1-R4R3 (SEQ IDNO:77)得到的二元载体。
图9 pSUN1构建体——阳性对照:基于重组将来自各个pENTR载体的表达盒插入Gateway Destination载体Lo 442 pSUN1-R4R3(SEQ IDNO:77)得到的二元载体。
图10二元构建体Lo239-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷nosT-B2(阴性对照)和Lo657-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷E9∷nosT∷B2(阳性对照)代表图4E和F。Lo239来自带有GUS标记盒的pENTR Lo235与带有ntpII盒的pSUN目标载体Lo125 pSUN3-Gws-NPTII的基于Gateway的重组。通过在GUS标记基因下游插入rbCs E9终止子的长片段修饰Lo235后,将得到的Lo654pENTR-BnAK700∷GUS∷E9∷nosT用于与Lo125 pSUN3-GWs-NPTII基于Gateway的重组,以产生阳性对照构建体Lo657-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷E9∷nosT∷B2。
图11阴性和阳性对照构建体的筛选结果:将图10所述构建体用于拟南芥植物的花浸没转化。通过卡那霉素选择对收获的种子测试标记基因nptII的表达。来自用阳性对照构建体转化植物的种子在选择培养基上存活,显示表达nptII基因(GUS基因表达未显示,但已通过X-Gluc反应检测),而阴性对照构建体仅产生不能在卡那霉素上存活的种子,并显示不表达Gus标记基因。
图12用于鉴定目的转录终止子(TOI)的构建体的简图。
(a)用于体外转录测定的构建体。基因1和2优选与植物基因组不同源的序列。
(b-d)用于体内测定的构建体。标为“dsRNA”的区域是产生双链RNA(dsRNA)的序列。这些dsRNA下调植物细胞的必需基因(b)、负选择标记基因(SMG)(c)或报道基因如荧光蛋白(FP)。
(d)在构建体(d)中,TOI下游的DNA可以是另一报道基因或任何序列。
(e)酵母中的筛选系统:该系统允许有效筛选随机序列。对照载体含有NOS终止子、截短的NOS、无终止子或带有未鉴定序列的DNA片段。
图13 A:对照构建体(A-D)和含有潜在终止子候选者的构建体(E)。GUS可被任何报道基因或非植物同源DNA片段(包括ATG和终止密码子)替代。在对照载体中产生了四种变异:(A)260bp胭脂碱合酶终止子(NOS),包括多腺苷酸化位点、切割序列和切割序列下游的约80bp核苷酸,(B)反向NOS,(C)NOS DNA片段,包括多腺苷酸化信号和切割位点或缺乏多腺苷酸化信号和下游序列,和(D)无终止子。可以用多种基因组片段取代胭脂碱合酶终止子,可以选择所述基因组片段作为潜在终止子候选者。LuF代表作为连读区的萤光素酶基因片段(约200至300bp)。可以用非植物同源的DNA片段(如酵母基因间序列)取代LuF。章鱼碱合酶终止子位于盒的末端,以稳定包含连读产物的转录物。可以在基于pUC的载体或二元载体中构建这些构建体。TOI代表目的终止子。尽管已经在筛选系统中证明NOS仅具有中等效率,但是可以用它作为一种对照终止子用于本文所述的评估系统。
B:体外筛选系统。与连读区和多腺苷酸化RNA杂交的两个单链荧光探针,如信标探针。黑条形代表多腺苷酸化RNA。灰色条形代表连读产物。探针1(黑色星)与多腺苷酸化RNA的互补序列杂交。探针2(灰色星)与连读区的互补序列杂交。
C:对照构建体(A、C)和含有潜在终止子候选者的构建体(B、D)。RG代表任何报道基因。SMG代表任何选择标记基因。将约260bp的胭脂碱合酶终止子(NOS)用作对照终止子(A、C)。将植物基因组片段(<1kb)克隆进GUS或bar与dsRNA片段之间,以鉴定目的终止子(TOI)。由于下调转基因植物中的必需基因,表达用于必需基因(EG)的dsRNA使植物致死(A、B)。由于下调转基因植物中的选择标记基因,表达用于SMG的dsRNA引起特定选择压下的致死(C、D)。然而,由于低水平连读或不连读,强严紧终止子可限制dsRNA的表达,结果产生转基因植物。可以在基于pUC的载体或二元载体中构建这些构建体。
D:对照构建体(A)是其中克隆了对照和测试序列的载体。阳性对照载体(B)包含在GUS报道基因下游的NOS终止子序列。阴性对照载体(C)包含得自可在植物中表达的可读框的内部部分的序列,因此不应具有转录终止活性。载体(D)代表包含待测试终止子活性的推定TOI候选者的载体。这些构建体构建入pUC载体中,并用于TOI优选序列的瞬时分析。
E:对照二元载体(A、C)不包含在原始报道基因GUS下游插入的推定终止子序列。测试载体(B、D)包含将在稳定转化植物中测试转录终止活性的推定TOI候选者。载体(A、B)包含第二个报道基因DsRed2下游的NOS终止子;这些构建体将用于确定推定TOI终止GUS的效率是否影响DsRed2的表达。载体(C、D)不含有用于第二个报道基因DsRed2的转录终止序列,并且将用于测试并列于DsRed2和GUS基因的3,末端之间的TOI序列的双向转录终止活性,
图14瞬时TOI测定之后的玉米叶组织。在GUS编码序列下游不包含功能性转录终止子的载体中未观察到GUS染色(A&C)。在(+)对照(B)载体以及全部四个TOI候选序列(D-G)中,功能性终止子的存在恢复了GUS表达。
图15对照构建体(A)和含有潜在终止子候选者的构建体(B)。构建体由强组成型启动子(如玉米泛蛋白启动子)、FP1(编码荧光蛋白1的基因)、已知终止子(A:如NOS)或新终止子(B)、IRES(如EMCV)、FP2(编码荧光蛋白2的基因)和章鱼碱合酶终止子组成。
图16目的终止子(TOI)构建体(A)和对照构建体(B和C)。将TOI嵌入致死基因或报道基因的内含子之内(A)。还将构建无嵌入内含子的TOI(B),以及具有嵌入内含子的已知终止子NOS(C)的对照构建体。致死基因可以是白喉毒素片段A(DT-A)或本领域任一已知的植物致死基因。报道基因可以是绿色荧光蛋白或本领域已知在植物中具有功能的任一已知报道基因。
图17修饰的PIV2内含子。PIV内含子含有(1)共有5’识别序列,(2)5’剪接位点后的高AU含量,(3)3’剪接位点前的高AU含量,(4)共有3’识别序列,(5)共有分支点序列CURAY,(6)分支点序列和3’剪接位点之间的多聚U区域。
图18目的终止子(TOI)构建体(1)和对照构建体(2和3)。构建体4表达dsRNA分子,所述dsRNA分子将靶向含有构建体1(渗漏TOI)和构建体3RNAi的靶标区的mRNA以进行降解。ZmUbi(玉米泛蛋白启动子)、GFP(绿色荧光蛋白)、OCS(章鱼碱合酶终止子)、NOS(胭脂碱合酶终止子)、dsRNA(双链RNA)、siRNA(小干扰RNA)、RNAi(RNA干扰,沉默)。对于构建体1、2和3,所产生RNA的终点(翻译或降解)显示构建体4是否也在同一植物中表达。
图19载体pTOI3(SEQ ID NO:73)和pTOI4(SEQ ID NO:73)中插入片段的原理图。
图20用于瞬时分析的基于pUC的表达载体图。将对照和推定TOI序列克隆进此载体的Rsrl1-SacI位点。
图21在稳定转化植物中用于TOI活性分析的二元载体图。A-载体包含DsRed2报道基因下游的Nos终止子,将用于确定推定TOI终止GUS的效率是否影响DsRed2的表达。TOI序列在AvrII位点插入。B-载体不包含用于DsRed2的终止子,并且将用于评估TOI候选者的双向转录终止活性。TOI序列在SacI位点插入。
具体实施方式
一般定义
应该理解,本发明不受限于所述的具体方法、方案、细胞系、植物种或属、构建体和试剂。还应理解,本文使用的术语仅用于描述具体实施方案的目的,并不旨在限制本发明的范围,本发明的范围仅受附带的权利要求的限制。在以下描述中广泛使用了重组DNA技术中的大量术语。为了提供对说明书和权利要求书(包括给予这些术语的范围)明确而一致的理解,提供以下定义。
本文使用的术语“约”指大约、约略、在……左右或在……区域内。当术语“约”与数值范围结合使用时,它通过扩展所述数值以上和以下的边界来修饰该范围。本文中一般使用术语“约”通过上下20%(更高或更低)的变化修饰所述值以上或以下的数值。
本文使用的“或”一词指具体列表中的任一成员,还包括该列表中成员的任何组合。
术语“核苷酸”指碱基-糖-磷酸组合。核苷酸是核酸序列(DNA和RNA)的单体单元。术语核苷酸包括核糖核苷三磷酸ATP、UTP、CTP、GTP和脱氧核糖核苷三磷酸如dATP、dCTP、dITP、dUTP、dGTP、dTTP或其衍生物。这些衍生物包括如[αS]dATP、7-脱氮杂-dGTP和7-脱氮杂-dATP。本文中使用的术语核苷酸还指双脱氧核糖核苷三磷酸(ddNTP)及其衍生物。双脱氧核糖核苷三磷酸的展示性实例包括但不仅限于ddATP、ddCTP、ddGTP、ddITP和ddTTP。根据本发明,“核苷酸”可以是未标记的,或者是通过熟知的技术可检测标记的。可检测标记包括如放射性同位素、荧光标记、化学发光标记、生物发光标记和酶标记。
术语“核酸”指脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸及其单链或双链、有义或反义形式的聚合物或杂交体。除非另有说明,具体的核酸序列还暗中包括其保守性修饰的变体(如简并密码子替换)和互补序列以及明确指出的序列。本文中术语“核酸”与“基因”、“cDNA”、“mRNA”、“寡核苷酸”和“多核苷酸”可互换使用。
本文使用的短语“核酸序列”指代表核苷酸的缩写、字母、字或词的连续列表。在一个实施方案中,核酸可以是“探针”,其为相对短的核酸,长度通常小于100个核苷酸。核酸探针经常从长度约50个核苷酸至长度约10个核苷酸。核酸的“靶标区”是核酸中鉴定为重要的部分。核酸的“编码区”是核酸的部分,其置于适当调节序列控制下时,以序列特异性方式转录并翻译以产生特定多肽或蛋白质。编码区编码这样的多肽或蛋白质。
本文使用的术语“探针”指能与目的核苷酸序列杂交的寡核苷酸,它以纯化的限制性消化产物天然产生或合成、重组或通过PCR扩增产生。探针可以是单链或双链的。考虑用任何“报道分子”标记本发明使用的任何探针,从而可以以任何检测系统进行检测,所述检测系统包括但不仅限于酶(如ELISA,以及基于酶的组织化学测定)、荧光、放射性、量热、重量分析、磁性和发光系统。本发明旨在不受限于任何具体的检测系统或标记。
术语“寡核苷酸”指包含共价连接的核苷酸序列的合成或天然分子,所述核苷酸通过一个核苷酸的脱氧核糖或核糖3’位置与相邻核苷酸的脱氧核糖或核糖5’位置之间的磷酸二酯键连接。
术语“有义”应理解成指具有与靶序列同源或相同的序列的核酸,例如与蛋白转录因子结合的序列和与给定基因的表达相关的序列。根据优选的实施方案,核酸包含目的基因和允许所述目的基因表达的元件。有义RNA可在共抑制或有义抑制基因沉默方法中用于基因沉默。在转录时产生与内源基因转录物相同或至少非常相似的RNA转录物的基因的表达可以以目前尚未完全理解的基因表达抑制方式(称为共抑制)介导基因沉默(公开于Napoli 1990;Jorgensen 1996;Goring 1991;Smith 1990;Van der Krol1990)。所表达的RNA可以代表完整或部分的内源靶标。翻译不是必需的,转录已经足够。已经描述了植物中的应用(Napoli 1990;US 5,034,323)。
术语“反义”应理解成具有与靶序列(如信使RNA(mRNA)序列)互补的序列的核酸,认为通过与靶序列杂交启动对mRNA表达的阻断。为在植物宿主中的反义效应最大化,优选使用同源基因。同源是指可得自与植物宿主相同的植物物种。就本说明书而言,异源指得自不同植物或非植物物种。异源还包括基因的合成类似物,其修饰了其mRNA编码核酸序列以与宿主基因存在至少5%的差异。本领域大量描述了通过反义RNA的基因沉默(包括植物中的多种应用,如Sheehy 1988;US 4,801,340;MoI 1990)。反义方法的变化是使用α-端基异构核酸序列。这些α-端基异构序列与互补RNA形成特异性双链杂交体,其中与“正常”反义RNA(或β-核酸)相反,两条链彼此平行(Gautier 1987)。
术语“dsRNA”或“双链RNA干扰”旨在指通过表达对应于内源基因及其互补RNA链的RNA分子,从而提供可通过杂交形成双链RNA结构的两条RNA序列进行基因沉默的方法。两条RNA链可以在分开的分子上,或者可以是一个分子的部分,从而形成所称作的自身互补发夹结构。可以从例如含有双链DNA片段的“反向重复”的DNA表达形成自身互补发夹的RNA结构。在此上下文中,术语“反向重复”旨在指一个双链DNA分子中相反取向(即“头”对“头”或“尾”对“尾”的取向,以使第一个片段的有义链与第二个片段的反义链融合,反之亦然)的双链DNA片段(序列基本相同或优选相同)的取向。优选地,形成发夹的dsRNA可以包括连接两条互补链(如WO 99/53050所述)的接头(如内含子序列,例如来自马铃薯ST-LS1基因的内含子,Vancanneyt 1990)。本领域已经充分描述将dsRNAi用于多种生物,包括动物和植物生物的方法(如Matzke 2000;Fire1998;WO 99/32619;WO 99/53050;WO 00/68374;WO 00/44914;WO00/44895;WO 00/49035;WO 00/63364)。这些参考文献及其中公开的方法明确引入为参考。表达dsRNAi的细胞或生物的表型与敲除突变体相似,经常导致完全的基因沉默(Water-house 1998)。本文使用的术语“双链RNA”或“dsRNA”旨在指一个或多个核糖核酸序列,其由于互补序列而在理论上(即根据Watson和Crick的碱基配对原则)和/或实践上(如由于体外和/或体内杂交实验)能够形成双链RNA结构。本领域技术人员了解这一事实,即双链RNA结构的形成是单链和双链形式之间的平衡。优选地,双链(即杂交的)和单链(即非杂交或解离的)形式之间的关系至少为1∶10,优选至少为1∶1,更优选至少为10∶1。dsRNA的一条链与内源基因的序列基本相同。此上下文中基本相同指有效的基因沉默不需要100%的同一性,与靶序列相比,dsRNA序列可以包含插入、缺失和点突变。优选地,dsRNA序列和至少部分靶序列之间的同源性至少为60%,优选至少为80%,更优选至少为90%,最优选100%。或者,基本同一性是允许两个序列在高严格条件下杂交的同一性。靶序列中与dsRNA具有同源性的部分的长度至少为23个碱基,优选至少50个碱基,更优选至少100个碱基。靶基因的所述部分可以与基因的多个部分相似,但优选编码由所述基因转录的mRNA序列的部分。
术语“核酶”旨在指催化性RNA分子,其能够诱导靶RNA的序列特异性切割(Tanner 1999)。本领域已经公开了核酶的制备和用途(Haseloff1988;Haselhoff & Gerlach 1988;Steinecke 1992;de Feyter R 1996)。优选“锤头状”核酶(Haselhoff & Gerlach 1988)。已公开了基于定制核酶的基因沉默方法(EP 0 291 533,EP 0 321 201,EP 0 360 257)。还公开了在植物和植物细胞中的用途(Steinecke 1992;de Feyter 1996)。可以如所述(Steinecke1995)通过核酶和靶序列的二级结构及其相互作用的计算产生合适的靶序列和核酶(Bayley 1992;LIoyd 1994)。例如可以利用四膜虫L-19 IVS RNA的衍生物并几乎适用于任何靶序列(US 4,987,071;US 5,116,742)。或者,可以通过筛选多样化核酶文库选择核酶(Bartel 1993)。
术语“基因”指与适当的调节序列有效连接的编码区,所述调节序列能以某些方式调节多肽的表达。基因包括编码区(可读框,ORF)之前(上游)和之后(下游)的DNA非翻译调节区(如启动子、增强子、抑制子等)以及适当时单个编码区(即外显子)之间的间插序列(即内含子)。
当涉及结构基因时,本文使用的术语“编码区”指编码氨基酸的核苷酸序列,所述氨基酸作为mRNA分子翻译的结果可见于新生多肽中。在真核生物中,编码区的边界为编码起始密码子甲硫氨酸的核苷酸三联体“ATG”的5’侧和指定终止密码子的三个三联体(即TAA、TAG、TGA)之一的3’侧。除了含有内含子以外,基因组形式的基因还可以包括存在于RNA转录物中的位于序列5’和3’末端的序列。这些序列称为“侧翼”序列或区域(这些侧翼序列位于mRNA转录物中存在的非翻译序列的5’或3’)。5’侧翼区可以含有调节序列如启动子和增强子,它们控制或影响基因的转录。3’侧翼区可以含有指导转录终止、转录后切割和多腺苷酸化的序列。
术语“扩增”指使用聚合酶提高核苷酸序列拷贝数的任何体外方法。核酸扩增引起核苷酸整合进DNA和/或RNA分子或引物中,从而形成与模板互补的新分子。形成的核酸分子及其模板可以作为模板来合成其他核酸分子。本文使用的扩增反应可以由许多轮复制组成。DNA扩增反应包括如聚合酶链式反应(PCR)。一次PCR反应可以由5至100个“循环”的变性及DNA分子合成组成。
术语“多肽”、“肽”、“寡肽”、“多肽”、“基因产物”、“表达产物”和“蛋白质”在本文中可互换使用,指连续氨基酸残基的聚合物或寡聚物。
本文使用的术语“分离的”指物质已经从其最初环境中移出。例如,活的动物中的天然存在的多核苷酸或多肽不是分离的,但从天然系统的一些或全部共存物质中分离的相同多核苷酸或多肽则是分离的。这些多核苷酸可以是载体的一部分和/或这些多核苷酸或多肽可以是组合物的一部分,并且将是分离的,因为这种载体或组合物不是其最初环境的一部分。
优选地,在涉及核酸(如“分离的核酸序列”)时,术语“分离的”指已鉴定并从一般与其天然来源相关的至少一种污染核酸中分离的核酸序列。分离的核酸是以与其在自然界中不同的形式或背景存在的核酸。相反,非分离的核酸是以其在自然界中存在的状态存在的核酸如DNA和RNA。例如,给定的DNA序列(如基因)存在于宿主细胞染色体中相邻基因附近;RNA序列(如编码特定蛋白质的特定mRNA序列)作为与编码多种蛋白质的多种其他mRNA形成的混合物存在于细胞中。例如,编码特定性状的分离的核酸序列包括例如,通常含有所述核酸序列的细胞中的这些核酸序列,其中所述核酸序列在与天然细胞不同的染色体或染色体外位置,或者侧翼为与天然存在的核酸序列不同的核酸序列。分离的核酸序列可以以单链或双链形式存在。当使用分离的核酸序列表达蛋白质时,核酸序列将最少含有有义或编码链(即核酸序列可以是单链的)的至少一部分。或者,它可以含有有义和反义链(即核酸序列可以是双链的)。
本文使用的术语“纯化的”指从其天然环境中移出、分离或分开的分子,可以是核酸或氨基酸序列。因此“分离的核酸序列”是纯化的核酸序列。“基本纯化的”分子至少60%不含、优选至少75%不含、最优选至少90%不合与其天然共存的其他组分。
本文使用的术语“互补”或“互补性”指通过碱基配对原则相关的核苷酸序列。例如,序列5′-AGT-3′与序列5′-ACT-3′互补。互补性可以是“部分”或“全部”的。“部分”互补性是一个或多个核酸碱基不能根据碱基配对原则匹配。两核酸之间的“全部”或“完全”互补性是每一个核酸碱基都能根据碱基配对原则与另一碱基匹配。核酸链之间互补性的程度对核酸链之间杂交的效率和强度具有显著的影响。
本文使用的核酸序列的“互补序列”指核苷酸序列,其核酸显示与该核酸序列的核酸的全部互补性。
就生物、多肽或核酸序列而言,术语“野生型”、“天然”或“天然来源”指该生物是天然存在的或可得自至少一种天然存在的生物,而没有被人为改变、突变或操作。
涉及细胞使用时,术语“转基因”或“重组”指含有转基因的细胞,或者通过引入转基因改变了基因组的细胞。涉及组织或植物使用时,术语“转基因”分别指包含一个或多个含有转基因的细胞的组织或植物,或者通过引入转基因改变了基因组的组织或植物。可以通过若干方法产生转基因细胞、组织和植物,所述方法包括通过人为介入(如通过本文所述的方法)将包含核酸(通常为DNA)的“转基因”引入靶细胞或将转基因整合进靶细胞的染色体。
本文使用的术语“转基因”指通过实验操作引入细胞基因组的任何核酸序列。转基因可以是“内源DNA序列”或“异源DNA序列”(即“外源DNA”)。术语“内源DNA序列”指在其引入的细胞中天然可见的核苷酸序列,其前提为与它与天然存在序列相比不含有某种修饰(如点突变、存在选择标记基因等)。术语“异源DNA序列”指与核酸序列连接或经过操作而连接的核苷酸序列,所述核酸序列和核苷酸序列在自然界中不连接,或在自然界中在不同位置连接。异源DNA对其引入的细胞而言不是内源性的,而是得自另一细胞。异源DNA还包括含有某种修饰的内源DNA序列。异源DNA一般(尽管不必然)编码其在其中表达的细胞在正常情况下不产生的RNA和蛋白质。异源DNA的实例包括报道基因、转录和翻译调节序列、选择标记蛋白(如赋予药物抗性的蛋白质)等。优选地,就调节序列(如本发明的启动子)而言,术语“转基因”或“重组”指所述调节序列与天然环境中它不连接的核酸共价结合并毗邻。
术语“外源基因”指通过实验操作引入细胞基因组的任何核酸(如基因序列),并可包括可见于该细胞的基因序列,只要引入的基因与天然存在基因相比含有某种修饰(如点突变、存在选择标记基因等)。
“重组多肽”或“重组蛋白”指通过重组DNA技术产生的多肽或蛋白质,即用编码所需多肽或蛋白质的外源重组DNA构建体转化的细胞所产生的多肽或蛋白质。重组核酸和多肽还包括不存在于自然界,而是人为修饰、改变、突变或操作的分子。
术语“异源核酸序列”或“异源DNA”可互换使用,指与核酸序列连接的核苷酸序列,它们在自然界中不连接,或在自然界中在不同位置连接。异源DNA对其引入细胞而言不是内源性的,而是得自另一细胞。这些异源DNA一般(尽管不必然)编码其在其中表达的细胞在正常情况下不产生的RNA和蛋白质。
术语“生物”、“宿主”、“靶生物”或“宿主生物”指可以作为筛选构建体或筛选载体受体的任何原核或真核生物。本文使用的术语“宿主”包括可以遗传改造的原核或真核生物。这些宿主的实例可参阅Maniatis1989。包括完整生物以及由其产生的器官、部分、细胞、培养物和繁殖物质。优选的为微生物、非人动物和植物生物。优选的微生物为细菌、酵母、藻类或真菌。
优选的细菌是以下属的细菌:埃希氏菌属(Eschericha)、棒杆菌属(Corynebacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、欧文氏菌属(Erwina)、农杆菌属(Agrobacterium)、黄杆菌属(Flavobacterium)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、梭菌属(Clostridium)、Proionibacterium、丁酸弧菌属(Butyrivibrio)、真杆菌属(Eubacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)、Phaeodlactylum、豆形虫属(Colpidium)、被孢霉属(Mortierella)、虫霉属(Ehtomophthora)、毛霉属(Mucor)、Crypthecodinium或蓝细菌属(cyanobacteria),例如Synechocystis属。特别优选的是能够感染植物并因而转移本发明构建体的微生物。优选的微生物是来自农杆菌属的微生物,特别是根癌农杆菌。
优选的酵母为假丝酵母属(Candida)、酵母菌属(Saccharomyces)、汉逊酵母属(Hansenula)或毕赤酵母属(Pichia)。优选的真菌为曲霉属(Aspergillus)、木霉属(Trichoderma)、阿舒囊霉属(Ashbya)、链孢菌属(Neurospora)、镰刀菌属(Fusarium)、白僵菌属(Beauveria)或其他真菌。此外,就本发明目的而言,植物生物是有光合活性能力的其他生物,如藻类或蓝细菌和藓类。优选的藻类为绿藻如红球藻属(Haematococcus)、三角褐指藻(Phaedactylum tricornatum)、团藻属(Volvox)或杜氏藻属(Dunaliella)的藻类。
优选的真核细胞和生物包括植物细胞和生物、动物细胞和非人动物生物,包括真核微生物如酵母、藻类或真菌。
“非人动物生物”包括但不仅限于非人脊椎动物和无脊椎动物。优选鱼类物种、非人哺乳动物如奶牛、马、绵羊、山羊、小鼠、大鼠或猪、鸟类如鸡或鹅。优选的动物细胞包括如CHO、COS、HEK293细胞。无脊椎动物生物包括如线虫和昆虫。昆虫细胞包括如果蝇S2和灰赤夜蛾Sf9或Sf21细胞。
优选的线虫是能够侵袭植物、动物或人类生物的线虫。优选的线虫包括以下属的线虫:钩口线虫属(Ancylostoma)、鸡蛔虫属(Ascaridia)、蛔虫属(Ascaris))、仰口线虫属(Bunostomum)、新杆状线虫属(Caenorhabditis)、毛细线虫属(Capillaria)、夏氏线虫属(Chabertia)、古柏线虫属(Cooperia)、网尾线虫属(Dictyocaulus)、血矛线虫属(Haemonchus)、异刺线虫属(Heterakis)、细颈线虫属(Nematodirus)、结节线虫属(Oesophagostomum)、胃线虫属(Ostertagia)、尖尾线虫属(Oxyuris)、副蛔虫属(Parascaris)、圆线虫属(Strongylus)、弓蛔线虫属(Toxascaris)、鞭虫属(Trichuris)、毛圆线虫属(Trichostrongylus)、Tfhchonema、弓蛔虫属(Toxocara)或钩虫属(Uncinaria)。特别优选的为植物寄生线虫如伞滑刃线虫属(Bursaphalenchus)、小环线虫属(Criconemella)、Diiylenchus、茎线虫属(Ditylenchus)、球胞囊线虫属(Globodera)、螺旋线虫属(Helicotylenchus)、棘皮线虫属(Heterodera)、长针线虫属(Longidorus)、Melodoigyne、珍珠线虫属(Nacobbus)、针线虫属(Paratylenchus)、短体线虫属(Pratylenchu)、穿孔线虫属(Radopholus)、Rotelynchus、垫刃线虫属(Tylenchus)或剑线虫属(Xiphinema)。优选的昆虫包括以下属:鞘翅目(Coleoptera)、双翅目(diptera)、鳞翅目(Lepidoptera)和同翅目(Homoptera)。
优选的真菌为曲霉属、木霉属、阿舒囊霉属、链孢菌属)、镰刀菌属、白僵菌属或Indian Chem Engr.Section B.第37卷,No 1,2(1995)15页,表6中所述的其他真菌。特别优选丝状半子囊菌纲棉阿舒囊霉(Ashyagossypii)。
优选的酵母为假丝酵母属、酵母菌属、汉逊酵母属或毕赤酵母属,特别优选酿酒酵母和巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)(ATCC保藏号201178)。
本文使用的术语“植物”或“植物生物”指多个植物细胞,其高度分化成任何植物发育阶段中存在的结构。这些结构包括一种或多种植物器官,包括但不仅限于果实、嫩枝、茎、叶、花瓣等。优选作为转基因生物的宿主或靶生物尤其是植物。本发明范围内包括植物界的高等和低等植物的任何属和种。还包括成熟植物、种子、嫩枝和苗及部分、繁殖材料和来自于此的培养物,例如细胞培养物。术语“成熟植物”应理解为指处于苗之后的任何发育阶段的植物。术语“苗”应理解为指早期发育阶段的幼小的未成熟植物。
一年生、二年生、单子叶和双子叶植物是用于产生转基因植物的优选宿主生物。此外,基因表达在所有观赏植物、有用或观赏树木、花、切花、灌木或草坪中是有利的。可以提到的植物为例如但不仅限于被子植物、苔藓植物如苔纲(Hepaticae)(苔类)和Musci(藓类);蕨类植物如羊齿类、木贼和石松;裸子植物如针叶树、苏铁、银杏和买麻藤纲(Gnetatae);藻类如绿藻纲(Chlorophyceae)、褐藻纲(Phaeophyceae)、红藻纲(Rhodophyceae)、Myxophyceae、黄藻纲(Xanthophyceae)、硅藻纲(Bacillariophyceae)(硅藻)和裸藻纲(Euglenophyceae)。
优选用于食品或饲料目的的植物,如豆科(Leguminosae)如豌豆、苜蓿和大豆;禾本科(Gramineae)如稻、玉米、小麦、大麦、高粱、粟、黑麦、黑小麦或燕麦、伞形科(Umbelliferae)特别是胡萝卜属,尤其是carota(胡萝卜)和芹菜(Apium)种,特别是芹菜(Graveolens dulce)等;茄科(Solanaceae),特别是番茄属(Lycopersicon),尤其是番茄(esculentum)种和茄属,特别是马铃薯(tuberosum)和茄子(melongena),等(如烟草);以及辣椒属(Capsicum),特别是胡椒(annuum)等;豆科(Leguminosae),特别是大豆属(Glycine),尤其是max(大豆)、苜蓿、豌豆、紫花苜蓿、豆类或花生等种;十字花科(Brassicacae),特别是芸苔属,尤其是napus(欧洲油菜)、芸苔(campestris)(甜菜)、卷心菜(oleracea cv Tastie)、花椰菜(oleracea cvSnowball Y)和花茎甘蓝(oleracea cv Emperor);以及拟南芥属(Arabidopsis),尤其是拟南芥(thaliana)种等等;菊科(Compositae),特别是莴苣属(Lactuca),尤其是莴苣种(sativa)等等;紫菀科(Asteraceae)如向日葵、万寿菊、莴苣或金盏花等等;葫芦科(Cucurbitaceae)如甜瓜、南瓜/西葫芦或胡瓜和亚麻子。其他优选的为棉花、甘蔗、大麻、亚麻、辣椒和多种树木、坚果和藤蔓物种。非常特别优选拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tabacum)、万寿菊(Tagetes erecta)、金盏花(Calendula officinalis)、大豆(Gycine max)、玉米(Zea mays)、稻(Oryza sativa)、小麦(Triticumaestivum)、豌豆(Pisum sativum)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、大麦(Hordeumvulgare)、欧洲油菜(Brassica napus)。
术语“细胞”指单个细胞或细胞群体。群体可以是含有一种细胞类型的纯群体。同样,群体可以包含超过一种细胞类型。在本发明中,对细胞群体可以包含的细胞类型数没有限制。细胞可以是同步化或不同步化的,优选细胞为同步化的。
术语“器官”就植物而言(或“植物器官”)指植物的部分,可包括(但不仅限于)例如根、果实、嫩枝、茎、叶、花药、萼片、花瓣、花粉、种子等。
术语组织就植物而言(或“植物组织”)指多个植物细胞的排列,包括分化的和未分化的植物组织。植物组织可以组成植物器官的部分(如植物叶的表皮),但也组成肿瘤组织和培养物中的多种细胞类型(如单细胞、原生质体、胚、愈伤组织、原球茎样体等)。植物组织可以在植物中(in planta),在器官培养物、组织培养物或细胞培养物中。
术语“染色体DNA”或“染色体DNA序列”应理解为独立于细胞周期状态的细胞核的基因组DNA。因此染色体DNA可以组织在染色体或染色单体中,它们可以是浓缩的或解旋的。可以通过本领域已知的多种方法证明并分析染色体DNA中的插入,所述方法为如聚合酶链式反应(PCR)分析、Southern印迹分析、荧光原位杂交(FISH)和原位PCR。
本文使用的术语“结构基因”旨在指转录成mRNA的DNA序列,所述mRNA接着翻译成特定多肽的特征性氨基酸序列。
术语“目的核苷酸序列”指任何核苷酸序列,本领域技术人员可出于任何原因(如赋予改善的品质)而认为需要对其进行操作。这些核苷酸序列包括但不仅限于结构基因(如报道基因、选择标记基因、癌基因、药物抗性基因、生长因子等)的编码区和不编码mRNA或蛋白质产物的非编码调节序列(如启动子序列、多腺苷酸化序列、终止序列、增强子序列等)。
术语“表达”指基因产物的生物合成。例如,对于结构基因的情况,表达涉及结构基因转录成mRNA和任选的其后mRNA翻译成一种或多种多肽。
本文使用的术语“表达盒”或“表达构建体”旨在指待表达的任何核酸序列有效连接启动子序列和任选的促进所述核酸序列表达的其他元件(如终止子和/或多腺苷酸化序列)的组合。
本文使用的术语“启动子”、“启动子元件”或“启动子序列”指当与目的核苷酸序列连接时,能够控制目的核苷酸序列转录成mRNA的DNA序列。启动子一般(尽管不必然是)位于目的核苷酸序列的5’(即上游)(如靠近结构基因转录起始位点),启动子控制目的核酸序列向mRNA的转录并提供RNA聚合酶和起始转录的其他转录因子特异性结合的位点。抑制型启动子的转录速率应答于抑制剂而降低。诱导型启动子的转录速率应答于诱导剂而提高。组成型启动子的转录速率不特别受到调节,尽管在普遍代谢条件影响下可能发生变化。
启动子可以是组织特异性或细胞特异性的。用于启动子时,术语“组织特异性”指这样的启动子,它能够指导目的核苷酸序列在特定组织类型(如花瓣)中选择性表达,而同一核苷酸序列在不同的组织类型(如根)中的表达相对缺失。可以通过例如以下来评估启动子的组织特异性:将报道基因与启动子序列有效连接以产生报道构建体,将报道构建体引入植物基因组从而使报道构建体整合进得到的转基因植物的每种组织中,检测转基因植物的不同组织中报道基因的表达(例如检测mRNA、蛋白质或报道基因编码的蛋白质的活性)。与报道基因在其他组织中的表达水平相比,检测到报道基因在一种或多种组织中较高的表达水平表明该启动子对于检测到较高表达水平的组织具有特异性。当用于启动子时,术语“细胞类型特异性”指这样的启动子,它能够指导目的核苷酸序列在特定细胞类型中的选择性表达,而在同一组织的不同类型细胞中同一核苷酸序列的表达相对缺失。当用于启动子时,术语“细胞类型特异性”还指能促进目的核苷酸序列在单个组织内的区域中选择性表达的启动子。可以使用本领域熟知的方法评估启动子的细胞类型特异性,如GUS活性染色或免疫组织化学染色。简言之,将组织切片包埋在石蜡中,用一级抗体与石蜡切片反应,所述抗体对表达受启动子控制的目的核苷酸序列所编码的多肽产物具有特异性。使对一级抗体具有特异性的标记(如缀合过氧化物酶)的二级抗体与切片的组织结合,通过显微术检测(如用抗生物素蛋白/生物素)特异性结合。
启动子可以是组成型或可调节的。涉及启动子时,术语“组成型”指启动子能在无刺激(如热激、化学品、光等)的情况下指导有效连接的核苷酸序列转录的启动子。组成型启动子一般能指导转基因在基本上任何细胞和任何组织中表达。相反,“可调节”启动子是在存在刺激(如热激、化学品、光等)情况下能指导有效连接的核酸序列转录水平的启动子,所述转录水平与不存在刺激时有效连接的核酸序列的转录水平不同。
本文使用的术语“转录终止子”或“转录终止序列”旨在指引起或启动核酸序列由启动子启动的转录停止的序列。优选地,转录终止序列还包含导致转录物多腺苷酸化的序列。例如,转录终止子可以包含一个或多个多腺苷酸化信号序列、一个或多个多腺苷酸化附着序列和导致转录终止的多种长度的下游序列。还应理解,编码表达的RNA转录物3’非翻译区的序列下游的序列也可以是转录终止子的一部分,尽管该序列本身不表达为RNA转录物的部分。此外,转录终止子可以包含可以影响其功能的附加序列,如3’非翻译区(即编码序列终止密码子之后的基因序列)。转录终止可能涉及多种机制,包括但不仅限于RNA聚合酶II受诱导而与其DNA模板解离。几乎所有的生物反应的转录终止的效率都不是100%。本文使用的术语“转录终止效率”或“转录终止的效率”表示所述转录终止子区中转录停止(或终止)的频率与连读转录超过所述转录终止子的频率之间的比值。涉及转录终止序列时,本文使用的术语“严紧”或“有效”应理解为转录终止效率至少为10(即停止/连读比值为10∶1)的转录终止序列,优选至少100(即停止/连读比值为100∶1),更优选1000(即停止/连读比值为1000∶1)。转录可以在所述转录终止序列内的一个或多个特定碱基对处停止。因此,转录物的长度可能存在变异性。然而,转录终止优选具有低变异性,并且通过得到的转录物长度(除多腺苷酸尾以外)判断至少50%、优选至少80%、更优选至少90%终止于一个特定碱基对。
术语“有效的连接”或“有效连接”应理解为指例如调节元件(如启动子)与待表达的核酸序列以及适当时其他调节元件(如终止子)的顺序排列,其中每个调节元件都能实现其预期功能,以允许、修饰、促进或影响所述核酸序列的表达。表达可取决于核酸序列相对于有义或反义RNA的排列。为实现这一点,直接的化学连接不是必需的。遗传控制序列(如增强子序列)可以从很远的位置或从实际上其他DNA分子对靶序列发挥其功能。优选的排列是将待重组表达的核酸序列置于作为启动子的序列之后,以使两个序列彼此共价连接。启动子序列和待重组表达的核酸序列之间的距离优选小于200个碱基对,特别优选小于100个碱基对,非常特别优选小于50个碱基对。可以通过如所述(如Maniatis 1989;Silhavy 1984;Ausubel 1987;Gelvin 1990)惯用的重组和克隆技术产生有效连接和表达构建体。然而,也可以将其他序列(例如作为接头的带有限制性酶特异性切割位点的序列或作为信号肽的序列)置于两个序列之间。插入序列也可以引起表达融合蛋白。优选地,由启动子和待表达核酸序列连接组成的表达构建体可以以载体整合的形式存在,并可通过如转化插入植物基因组。
本文使用的术语“转化”指将遗传物质(如转基因)引入细胞中。细胞转化可以是稳定的或瞬时的。术语“瞬时转化”或“瞬时转化的”指在不将转基因整合进宿主细胞基因组的情况下将一个或多个转基因引入细胞。可以通过如酶联免疫吸附测定(ELISA)检测瞬时转化,其检测一个或多个转基因所编码多肽的存在。或者可以如本文所证明的,通过检测转基因(如uid A基因)所编码蛋白质(如β-葡糖醛酸糖苷酶)的活性来检测瞬时转化(如通过用在存在GUS酶时给出蓝色沉淀的X-Gluc进行染色的GUS酶组织化学测定;以及使用GUS-Light试剂盒(Tropix)的GUS酶活性化学发光测定)。术语“瞬时转化体”指瞬时整合了一种或多种转基因的细胞。
相反,术语“稳定转化”或“稳定转化的”指将一种或多种转基因引入并整合于细胞基因组,优选得到染色体整合和通过减数分裂的稳定遗传性。可以通过细胞基因组DNA与能结合一种或多种转基因的核酸序列的DNA印迹杂交检测细胞的稳定转化。或者,还可以通过细胞基因组DNA聚合酶链式反应扩增转基因序列来检测细胞的稳定转化。术语“稳定转化体”指将一种或多种转基因稳定整合进基因组DNA的细胞。因此,稳定转化体与瞬时转化体的区别在于,来自稳定转化体的基因组DNA含有一种或多种转基因,而来自瞬时转化体的基因组DNA不含有转基因。转化还包括以植物病毒载体的形式将遗传物质引入植物细胞,其涉及表染色体(epichromosomal)复制和基因表达,其就减数分裂稳定性而言可以显示可变特性。稳定转化还包括以病毒载体的形式将遗传物质引入细胞,其涉及表染色体复制和基因表达,其就减数分裂稳定性而言可以显示可变特性。
用于操作纤毛虫和藻类的克隆和转化技术为本领域所熟知(WO98/01572;Falciatore 1999;Dunahay 1995)。
原则上讲,适合植物细胞或生物的转化技术(如下文所述)也可用于动物或酵母生物和细胞。优选直接转化技术,如磷酸钙或脂质体介导的转化或者电穿孔。
术语用细菌“感染”指在条件下将靶生物样品(如细胞、组织等)与细菌共温育,以使细菌内含有的核酸序列引入靶生物样品的一个或多个细胞。
术语“农杆菌”指产生冠瘿的土壤产生的革兰氏阴性杆状植物致病细菌。术语“农杆菌”包括但不仅限于根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)(一般在感染植物中引起冠瘿)菌株和毛根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)(在感染宿主植物中引起毛根病)菌株。用农杆菌感染植物细胞一般引起感染细胞产生冠瘿碱(如胭脂碱、农杆碱、章鱼碱等)。因此,引起胭脂碱产生的农杆菌菌株(如LBA4301、C58、A208菌株)称为“胭脂碱型”农杆菌;引起章鱼碱产生的农杆菌菌株(如LBA4404、Ach5、B6菌株)称为“章鱼碱型”农杆菌;引起农杆碱产生的农杆菌菌株(如EHA105、EHA101、A281菌株)称为“农杆碱型”农杆菌。
术语“轰击”和“生物射弹轰击”指将微粒向靶生物样品(如细胞、组织等)加速以在靶生物样品中细胞的细胞膜上产生创伤和/或使微粒进入靶生物样品的方法。用于生物射弹轰击的方法为本领域所已知(如内容引入本文作为参考的US 5,584,807),并以商品提供(如氦气驱动的微粒加速器(PDS-1000/He)(BioRad)。
涉及核酸使用时,术语“同源性”或“同一性”指互补性程度。两核酸间的同源性或同一性应理解为指每种情况下在序列完整长度上的核苷酸序列同一性,其借助程序算法GAP(Wisconsin Package Version 10.0,University of Wisconsin,Genetics Computer Group(GCG),Madison,USA)使用以下参数通过比较而计算:
缺口权重:12 长度权重:4
平均匹配:2,912 平均错配:-2,003
或者,部分互补序列应理解为至少部分抑制完全互补序列与靶核酸杂交的序列,使用功能术语“基本同源”指代。可以使用低严格条件下的杂交测定(DNA或RNA印迹、溶液杂交等)检查对完全互补序列与靶序列之间杂交的抑制。在低严格条件下,基本同源的序列或探针(即能与另一目的寡核苷酸杂交的寡核苷酸)会竞争并抑制完全同源序列与靶标的结合(即杂交)。这不是说低严格条件允许非特异性结合;低严格条件需要两序列的彼此结合是特异性(即选择性)相互作用。可以使用甚至缺乏部分互补性程度(如小于约30%同一性)的第二种靶标测试非特异性结合的缺乏;在不存在非特异性结合的情况下,探针不会与第二种非互补靶标杂交。
涉及双链核酸序列如cDNA或基因组克隆使用时,术语“基本同源”指在上述低严格条件下能与双链核酸序列的一条或两条链杂交的任何探针。涉及单链核酸序列使用时,术语“基本同源”指在上述低严格条件下能与单链核酸序列杂交的任何探针。
本文使用的术语“杂交”包括“使核酸链通过碱基配对与互补链结合的任何方法”(Coombs 1994)。杂交和杂交强度(即核酸间结合的强度)受到如核酸间的互补性程度、相关条件的严格度、形成杂交体的Tm和核酸中的G∶C比等因素的影响。
本文使用的术语“Tm”指“解链温度”。解链温度是双链核酸分子群体半数解离成单链时的温度。计算核酸Tm的等式为本领域所熟知。标准参照物表明,当核酸在1M NaCl的水溶液中时,可以通过等式Tm=81.5+0.41(%G+C)简单的估计Tm值(参阅如Anderson 1985)。其他参照包括更复杂的计算,其在Tm的计算中考虑结构和序列特征。
涉及核酸杂交使用时,低严格条件包括与以下等价的条件:使用长度从约100至约1000个核苷酸的DNA探针时,在由5×SSPE(43.8g/L NaCl、6.9g/L NaH2PO4.H2O和1.85g/L EDTA,用NaOH将pH调整至7.4)、1%SDS、5×Denhardt试剂[每500ml 50×Denhardt含有:5g菲可(400型,Pharmacia)、5g BSA(Fraction V;Sigma)]和100μg/mL变性鲑精DNA组成的溶液中在68℃结合或杂交,接着在室温下用包含0.2×SSPE和0.1%SDS的溶液中洗涤。
涉及核酸杂交使用时,高严格条件包括与以下等价的条件:使用长度从约100至约1000个核苷酸的探针时,在由5×SSPE、1%SDS、5×Denhardt试剂和100μg/mL变性鲑精DNA组成的溶液中在68℃结合或杂交,接着在68℃下在包含0.1×SSPE和0.1%SDS的溶液中洗涤。
涉及杂交条件(如涉及目的杂交条件)使用时,术语“等价”指杂交条件和目的杂交条件引起具有相同范围的同源性百分比(%)的核酸序列杂交。例如,如果目的杂交条件引起第一个核酸序列与和第一个核酸序列具有80%至90%同源性的另一核酸序列杂交,如果该另一杂交条件也引起第一个核酸序列与和第一个核酸序列具有80%至90%同源性的另一核酸序列杂交,则称另一杂交条件与目的杂交条件等价。
涉及核酸杂交使用时,本领域熟知可以使用多种等价条件以包括低或高严格条件;例如考虑探针的长度和性质(DNA、RNA、碱基组成)和靶标的性质(DNA、RNA、碱基组成、存在于溶液中或固定等)以及盐浓度和其他组分(如甲酰胺、硫酸葡聚糖、聚乙二醇存在与否),并可以改变杂交溶液以产生与上文列出的条件不同但等价的低或高严格杂交条件。本领域技术人员了解,尽管可以优选高严格度以减少或消除目的核酸序列和其他核酸序列之间的非特异性结合,但也可以优选低严格度以检测与目的核酸序列具有不同同源性的多种核酸片列。
术语“识别序列”指蛋白质、化合物、DNA或RNA分子(如限制性内切核酸酶、修饰甲基化酶或重组酶)识别并结合的特定序列。就重组酶而言,识别序列通常指重组位点。例如,Cre重组酶的识别序列为loxP,它是34个碱基对的序列,由8碱基对的核心序列侧翼的两个13碱基对的反向重复(作为重组酶结合位点)组成(参阅Sauer 1994,图1)。识别序列的其他实例为重组酶λ整合酶识别的attB、attP、attL和attR序列。attB是约25个碱基对的序列,含有两个9碱基对的核心型lnt结合位点和7碱基对的重叠区。attP是约240个碱基对的序列,含有核心型lnt结合位点和臂型lnt结合位点以及辅助蛋白整合宿主因子(IHF)、FIS和切除酶(Xis)的位点(参阅Landy 1993)。可以根据本发明改造这些位点,以增强本发明方法中产物的产生。当这些改造位点缺乏使重组反应不可逆的P1或H1结构域时,这些位点可以命名为attR’或attP’以显示以某种方式修饰了这些位点的结构域。
术语“重组酶”指催化特定重组位点处DNA区段交换的酶。
术语“重组克隆”指方法,其中通过位点特异性重组酶的作用在体外或体内交换、插入、取代、替换或修饰了核酸分子区段或这些分子的群体。
术语“重组蛋白”指多肽,包括涉及与一个或多个重组位点相关的重组反应的切除或整合蛋白质、酶、辅因子或相关蛋白(Landy 1993)。
抑制盒是含有亚克隆载体中存在的选择标记的阻抑物的核酸区段。
本文使用的术语“位点特异性重组酶”指一类重组酶,其一般具有至少以下四种活性之一(或其组合):(1)识别一种或两种特定核酸序列;(2)切割所述序列;(3)与链交换相关的拓扑异构酶活性;和(4)使核酸被切割的链再连接的连接酶活性(参阅Sauer 1994)。保守性位点特异性重组与同源重组和转座的区别在于两个配偶体之间的高度特异性。链交换机制涉及在无DNA合成的情况下切割并再连接特定的DNA序列(Landy 1989)。
术语“载体”指为插入的核酸序列提供有用的生物或生物化学特性的核酸分子(优选DNA),所述特性优选为允许复制和/或转化或转染进宿主细胞和生物。实例包括质粒、噬菌体、自主复制序列(ARS)、着丝粒和能在体外或在宿主细胞中复制或向宿主细胞内的目的位置传递目的核酸区段的其他序列。载体可具有一个或多个限制性内切核酸酶识别位点,可以在所述位点以确定性方式切开序列而不丧失载体的基本生物功能,并可在所述位点剪接核酸片段以引发其复制和克隆。载体还可以提供如用于PCR的引物位点、转录和/或翻译起始和/或调节位点、重组信号、复制子、选择标记等。显然,不需要使用同源重组、转座或限制性酶的插入所需的核酸片段的方法,例如(但不仅限于)PCR片段的UDG克隆(US 5,334,575,以其整体引入本文为参考)、TA CloningTM PCR克隆(Invitrogen Corp.,Carlsbad,Calif.)等也可用于将片段克隆进按照本发明使用的克隆载体。克隆载体还可以含有适用于鉴定用克隆载体转化的细胞的一个或多个选择标记。
术语“引物”指在核酸分子(如DNA分子)的扩增或聚合中通过核苷酸单体的共价连接延长的单链或双链寡核苷酸。在优选的方面中,引物包括一个或多个重组位点或这些重组位点的部分。重组位点的部分包括目的重组位点的至少2个碱基、至少5个碱基、至少10个碱基或至少20个碱基。使用重组位点的部分时,可以通过新合成的核酸分子提供重组位点缺少的部分。这些重组位点可以位于引物中和/或一个或两个末端。优选地,临近重组位点在引物中加入附加序列,以增强或改善重组和/或重组过程中重组位点的稳定化。这些稳定序列可以是任何长度的任何序列(优选富含G/C的序列)。优选地,这些序列大小范围从1至约1000个碱基、1至约500个碱基、1至约100个碱基、1至约60个碱基、1至约25个、1至约10个、2至约10个并优选约4个碱基。优选地,这些序列长度大于1个碱基并优选长度大于2个碱基。
术语“模板”指待扩增、合成或测序的双链或单链核酸分子。在双链分子的情况下,优选在扩增、合成或测序这些分子以前使其链变性,以形成第一条和第二条链,或者可以直接使用双链分子作为模板。在单链模板的情况下,与模板的部分互补的引物在适当的条件下杂交,接着具有聚合酶活性(如DNA聚合酶和/或逆转录酶)的一种或多种多肽可以合成与所述模板的全部或部分互补的核酸分子。或者,对于双链模板,可以将一个或多个启动子与一种或多种聚合酶组合使用,以产生与模板的全部或部分互补的核酸分子。根据本发明,新合成的分子的长度可能等于或小于原始模板。此外,可以在合成或扩增中使用核酸模板群,以产生一般代表原始模板群的核酸分子群。
术语“接头”指包含一个或多个识别位点(如重组位点或用于限制性内切核酸酶的识别位点)的寡核苷酸或核酸片段或区段(优选DNA),它可以加入环形或线性DNA分子以及本文所述的其他核酸分子中。可以在环形或线性分子中的任何位置加入这些接头,尽管优选在(或接近)线性分子的一个或两个末端处加入接头。优选地,将接头置于特定的目的核酸分子的两侧(侧翼)。接头的合成(如通过寡核苷酸合成、退火方法和/或PCR)是本领域技术人员所熟知的标准技术。根据本发明,可以通过标准重组技术(如限制性消化和连接)在目的核酸分子中加入接头。例如,可以通过以下在环形分子中加入接头:首先用适当的限制性酶消化分子、在切割位点加入接头并重新形成在切割位点处含有接头的环形分子。或者,接头可以与线性分子的一个或多个(优选两个)末端直接连接,从而形成在一个或两个末端具有接头的线性分子。在本发明的一个方面中,可以将接头加入线性分子群(如cDNA文库或经切割或消化的基因组DNA)中,以形成在所述群的全部或大部分的一个并且优选两个末端含有接头的线性分子群。
本文使用的重组DNA技术以及分子和细胞生物学中使用的其他术语一般可被可应用的领域的普通技术人员理解。
发明详述
本发明的第一个主题涉及鉴定和分离转录终止序列的方法,所述方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点可改变所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一种或多种DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列的表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并(任选的)测定其序列。
通过本发明的方法可以便利的鉴定新的转录终止序列。该方法可以基于体外或体内筛选系统。本发明的筛选方法允许选择含有有效的转录终止序列的DNA序列、筛选构建体或筛选载体和/或细胞或生物(优选植物细胞和植物生物)。以前必需一个序列接一个序列地评估终止子。测试终止效率(严紧性)非常艰巨。本发明的方法效率更高并且非常灵敏,从而仅会鉴定非常严紧的终止子。通过此筛选系统鉴定的严紧终止子可用于表达盒,其降低两个盒之间的连读并提高转基因表达的稳定性。多种目的终止子的发现将提供更好的理解植物中转录终止的机会。
本文使用的术语“易于检测的特征”应以广义理解,可以包括特征的任何变化,优选表型特征的变化。“变化”在此上下文中可以包括所述特征的提高或降低。因此,所述附加序列在所述启动子控制下的表达可能引起表型特征的提高或降低。例如表达可以引起除草剂抗性(提高的抗性)或者可以通过表达如毒性基因引起毒效应(降低的成活力)。取决于插入位点相对于所述附加序列的定位(如下文所详细描述的),有效的转录终止子可能引起所述附加序列提高(优选启动)或降低(优选沉默)的表达,因此两种类型的变化都可以有利地利用。
1.插入位点的定位
插入位点相对于引起易于检测特征的附加序列可以有多种定位。
1.1变通方案A:
例如,插入位点可以位于附加序列上游(即5’方向),从而插入位点在启动子序列和所述附加序列之间(以下称为“变通方案A”)。在将有效转录终止子序列插入所述插入位点的情况下,转录将在所述附加序列之前停止,不发生进入此附加序列的连读转录。在这种情况下,有效的转录终止子将引起附加序列表达的降低或优选完全抑制。取决于引起所述易于检测特征的所述附加序列的转录(即表达)与否(两者均有可能,取决于使用的附加序列的类型),所述易于检测特征将消失或表达。在任一情况下有效的转录终止子都将导致变化的易于检测特征,它与不在插入位点中插入序列的方案相比可能是抑制或提高。
因此在本发明优选的实施方案中用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’至3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点抑制所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并(任选的)测定其序列。
如下文所述,位于插入位点下游的附加序列可以仅通过RNA的表达(即转录)(如所述附加序列形成反义RNA或dsRNA分子的情况)或通过表达(即蛋白质的转录和翻译)引起所述易于检测的特征。在后一情况下,必须保证可以发生正确的翻译。这可以通过例如避免上游ATG密码子、将序列与上游编码序列符合读框的克隆或优选地使用IRES位点来保证,后者允许甚至在ATG密码子不靠近转录物5’末端的情况下进行有效的翻译(Vagner 2001;序列参阅如http://ifr31w3.toulouse.inserm.fr/IRESdatabase/)。
1.2变通方案B:
在本发明的另一优选的实施方案中,还可以将插入位点安排在附加序列的下游(即3’方向)(以下称为“变通方案B”)。对于这种变化,优选以反向重复的形式将待插入到插入位点以评估其转录终止能力的DNA序列插入。在插入的DNA序列是有效的转录终止子的情况下,仅反向重复的第一个拷贝(即第一部分)被转录,附加序列发生正常表达。取决于引起所述易于检测特征的所述附加序列的转录(即表达)与否(两者均有可能,取决于使用的附加序列的类型),所述易于检测特征将消失或表达。在任一情况下,有效的转录终止子都将导致改变的易于检测特征,它与不在插入位点中插入序列的方案相比可能是抑制或提高。然而,如果插入弱转录终止子或完全不具有转录终止能力的序列,则完整的反向重复(即插入序列的两个拷贝)将被转录,导致包含双链发夹结构(由插入DNA序列的反向重复转录的RNA形成)的RNA的转录。这种RNA通过双链RNA干扰(dsRNAi)引起其自身表达的基因沉默(自身抑制或自身沉默),导致包含所述附加序列的表达盒的基因沉默。在这种情况下,有效的转录终止子将引起附加序列提高表达,检测特征将向与有效转录终止子的情况中相反的方向变化。因此在本发明优选的实施方案中,用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’至3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,和
c)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)以反向重复的形式将所述DNA序列的特定DNA序列的至少两个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,其中与无插入相比,将有效的转录终止子的反向重复插入所述插入位点允许附加序列通过所述启动子序列的表达,和
iv)将带有所述插入DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有所述易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并(任选的)测定其序列。
在这种变通方案的优选实施方案中使用两种不同的启动子和两种不同的附加序列。这两种表达盒以“尾对尾”的取向排列,从而使由所述启动子起始的转录彼此相反。用于反向重复的插入位点优选在两个表达盒的两个末端(尾)之间。插入弱转录终止子的反向重复将导致两个附加序列的基因沉默,而插入有效的转录终止子导致两个附加序列的表达。因此可实行对转录终止效率的双检验。优选地,序列之一选自负选择标记(从而有效的转录终止子将引起如除草剂或抗生素抗性)。另一附加序列可以选自报道基因(例如GFP或GUS,从而有效的转录终止子将引起易于检测的颜色)。
1.3变通方案C:
在本发明第三个优选的实施方案中,插入位点还可以安排在附加序列内部(例如并优选嵌入位于所述附加序列中的内含子中)(下文称为“变通方案C”)。只有在插入所述插入位点的序列不控制严紧转录终止时才产生所述附加序列的全长转录物,所述附加序列的表达将引起所述易于检测特征的改变。在将有效的转录终止子插入所述插入位点的情况下不产生全长转录物。因此在本发明优选的实施方案中,用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’至3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,并向所述附加序列嵌入用于插入DNA序列的一个或多个插入位点(优选限制性或重组位点),
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点抑制所述附加序列通过所述启动子序列的全长转录,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或者筛选载体的所述插入位点中,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并(任选的)测定其序列。
可以通过多种方法实现在附加序列内的定位。在本发明改进的实施方案中,用于转录终止子序列的插入位点位于包含于所述附加序列内的内含子中。有效的转录终止将导致内含子和附加序列的不完全转录,从而阻止由所述附加序列引起的表型的发生。待表达的附加序列可以是例如毒性基因(如白喉毒素A)或报道基因(如GFP)。下文给出了其他实例。在有效转录终止的情况下,没有建立与所述序列相对应的表型。在毒性基因的情况下,只能建立包含有效转录终止子序列的稳定转化的细胞系。在另一优选的实施方案中,用于转录终止序列的插入位点位于附加序列的第一个5’部分(编码如报道基因(如GFP))和3’部分之间,后者优选为在植物中没有同源序列的非蛋白编码序列(如以下实施例所使用的萤光素酶基因的部分或λ噬菌体的序列)。除了这种筛选构建体以外还使用了另一种表达盒,其表达对应于所述3’部分序列的反义RNA,或优选双链RNA序列。在有效转录终止子的情况下,附加序列的转录将在终止子位点停止,5’末端序列将不被翻译。在无效(渗漏)转录终止子的情况下,转录将连读至所述3’部分序列,从而建立反义或双链RNA的靶标。这会引起完整构建体(包括编码标记序列的区域)的降解,从而“沉默”相关表型(如标记信号)。
2.本发明的筛选构建体或筛选载体
用于本发明方法的筛选构建体或筛选载体可以为多种形式。原则上,允许RNA分子表达或转录的任何形式都是合适的。因此,筛选构建体或筛选载体可以是例如RNA或DNA分子,还可以是单链或双链的,可以是线性或环状的。前述备选方案的任何组合也包括在内。
筛选构建体可以有利地用于不需要复制的方案,例如下文所述的体外筛选系统。然而,优选使用筛选载体。所述筛选载体可以是RNA载体(如RNA病毒载体)或优选地DNA载体。更优选筛选载体为环状双链DNA质粒载体。
本发明筛选构建体或筛选载体的基本特征包括
a)启动子序列,和
b)在所述启动子序列下表达后引起易于检测特征的附加序列。
2.1本发明的启动子
选择的启动子优选在用于评估所述转录终止序列的体外或体内系统中具有功能。优选地,此系统与转录终止序列在其后的表达构建体中发挥功能的系统相似或相同。例如,如果希望将转录终止序列用于植物生物,则使用基于植物细胞的转录系统(体外系统如小麦胚提取物或体内系统如植物细胞或植物)。在这种情况下,启动子序列优选为能在植物中启动转录的序列,优选内源植物启动子或来自植物病原体(如植物病毒或农杆菌)的启动子。本领域技术人员已知用于本发明方法的多种转录系统或宿主的多种启动子。
作为说明,适于哺乳动物宿主的启动子(和必要时,其他转录和翻译调节信号)可来自病毒来源如腺病毒、牛乳头状瘤病毒、猿猴病毒等,其中调节信号与具有高表达水平的特定基因相连。合适的转录和翻译调节序列还可以得自哺乳动物基因,如肌动蛋白、胶原、肌球蛋白和金属硫蛋白基因。示例性真核启动子包括小鼠金属硫蛋白I基因的启动子(Hamer 1982)、疱疹病毒TK启动子(McKnight 1982)、SV40早期启动子(Benoist 1981)、劳氏肉瘤病毒启动子(Gorman 1982)、巨细胞病毒启动子(Foeking 1980)和小鼠乳腺瘤病毒启动子(一般参阅Etcheverry 1996)。或者,如果原核聚合酶由真核启动子表达,则可以使用原核启动子如噬菌体T3 RNA聚合酶启动子来控制目的基因在哺乳动物中的表达(Zhou 1990;Kaufman 1991)。
在植物中的表达优选植物特异性启动子。原则上,术语“植物特异性启动子”应理解为能控制基因(特别是外源基因)在植物或植物部分、植物细胞、植物组织或植物培养物中表达的任何启动子。在此上下文中,表达可以是例如组成型、诱导型或发育依赖性的。以下为优选的:
a)组成型启动子
“组成型”启动子指确保在植物发育的显著阶段(优选植物发育的全部时间)中在大量(优选全部)组织中表达的启动子。尤其优选使用植物启动子或来源于植物病毒的启动子。特别优选CaMV(花椰菜花叶病毒)35S转录物的启动子(Franck 1980;Odell 1985;Shewmaker 1985;Gardner 1986)或19S CaMV启动子(US 5,352,605;WO 84/02913)。其他合适的组成型启动子为稻肌动蛋白启动子(McElroy 1990)、核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶小亚基(SSU)启动子(US 4,962,028)、豆球蛋白B启动子(GenBank检索号X03677)、来自农杆菌的胭脂碱合酶启动子、TR双启动子、来自农杆菌的OCS(章鱼碱合酶)启动子、泛蛋白启动子(Holtorf S 1995)、泛蛋白1启动子(Christensen 1989,1992;Bruce等1989)、Smas启动子、肉桂醇脱氢酶启动子(US 5,683,439)、液泡ATP酶亚单位启动子、pEMU启动子(Last1991)、MAS启动子(Velten 1984)和玉米H3组蛋白启动子(Lepetit 1992;Atanassova 1992)、拟南芥腈水解酶-1基因启动子(GeneBank检索号U38846,核苷酸3862至5325或5342)或来自小麦的富含脯氨酸蛋白启动子(WO 91/13991)以及在植物中组成型表达的基因的启动子。
b)组织特异性或组织优选的启动子
其他优选的是对种子具有特异性的启动子,例如菜豆蛋白启动子(US5,504,200;Bustos等1989;Murai 1983;Sengupta-Gopalan 1985)、2S白蛋白基因启动子(Joseffson 1987)、豆球蛋白启动子(Shirsat 1989)、USP(未知种子蛋白质)启动子(Bumlein 1991a)、油菜籽蛋白基因启动子(US5,608,152;Stalberg 1996)、蔗糖结合蛋白启动子(WO 00/26388)或豆球蛋白B4启动子(LeB4;Bumlein(1991b)、拟南芥油质蛋白启动子(WO 98/45461)和芸苔Bce4启动子(WO 91/13980)。其他优选的是叶特异性和光诱导启动子,如来自cab或核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶的启动子(Simpson 1985;Timko 1985)、花药特异性启动子,如来自LAT52的启动子(Twell 1989b)、花粉特异性启动子如来自ZmI3的启动子(Guerrero等(1993)MoI GenGenet 224:161-168)和小孢子优选的启动子,如来自apg的启动子(Twell等1983)。
c)化学诱导型启动子
表达盒还可以含有化学诱导型启动子(综述文章:Gatz 1997),通过这种手段可以在特定的时间点控制外源基因在植物中的表达。类似的可以使用如PRP1启动子(Ward 1993)、水杨酸诱导型启动子(WO 95/19443)、苯磺酰胺诱导型启动子(EP 0 388 186)、四环素诱导型启动子(Gaz 1991,1992)、脱落酸诱导型启动子(EP-A1 0 335 528)或乙醇-环己酮诱导型启动子(WO 93/21334)等启动子。谷胱甘肽-S转移酶同工型II基因的启动子(GST-II-27)也是合适的,它被内源应用的安全剂如N,N-二烯丙基-2,2-二氯乙酰胺(WO 93/01294)激活,并在单子叶植物和双子叶植物的多种组织中有效。本发明可使用的其他示例性诱导型启动子包括来自应答于铜的ACE1系统的启动子(Mett 1993)或来自玉米的应答于苯磺酰胺除草剂安全剂的In2启动子(Hershey 1991;Gatz 1994)。可以使用应答于植物通常不应答的诱导剂的启动子。示例性诱导型启动子为来自胆固醇激素基因的诱导型启动子,其转录活性被糖皮质激素诱导(Schena 1991)。
特别优选的是组成型启动子。另外,可以将其他启动子与待表达的核酸序列有效连接,所述启动子使在其他植物组织或其他生物(如大肠杆菌)中的表达成为可能。原则上,合适的植物启动子是所有上述启动子。
2.2本发明的附加序列
在所述启动子序列下表达后产生易于检测特征的“附加序列”可以选自多种序列。选择可取决于多种因素,例如,在所述插入位点插入有效的转录终止子是否预期导致降低的表达(变通方案A或C)或提高的表达(变通方案B)或附加序列为其功能性形式(即产生易于检测特征的形式)。
对于预期降低的表达(变通方案A和C),优选使用编码选自报道基因、反选择标记或毒性基因的选择标记的序列。在本发明体内筛选系统的优选实施方案中,作为附加序列的毒性基因的表达将引起对所述细胞或生物(如植物细胞或植物)生长、繁殖和/或再生的抑制。因此,只有将有效(“严紧”)转录终止序列插入引起所述毒性表型的序列之间从而阻止表达抑制生长、繁殖和/或再生的序列时,细胞或生物才能存活。可以分离存活细胞并鉴定和分离转录终止序列,例如使用PCR扩增并其后测序。
对于预期提高的表达(变通方案B),优选使用编码选自报道基因、负选择标记或正选择标记的选择标记的序列。
术语“选择标记”指任何核酸或氨基酸序列,其可用于从不包含所述选择标记的细胞或生物中选择和分离包含所述选择标记的细胞和生物。选择标记可以包括以下序列:
i)通过赋予对毒性化合物的抗性而允许分离包含所述标记的细胞或生物(本文称为“负选择标记”),
ii)通过赋予包含所述选择标记的细胞或生物生长优势而允许分离所述细胞或生物(本文称为“正选择标记”)。
选择标记还可以包括通过赋予包含所述选择标记的细胞或生物生长劣势而允许分离不包含所述选择标记的细胞或生物的序列(本文称为“反选择标记”或“毒性基因”)。
选择标记可以编码活性,例如但不仅限于RNA、肽或蛋白质的产生,或者可以提供RNA、肽、蛋白质、无机和有机化合物或组合物等的结合位点。选择标记的实例包括但不仅限于:
(a)DNA区段,其编码在受体细胞或生物中提供对毒性化合物(如抗生素)的抗性的产物(“负选择标记”)。负选择标记赋予对杀生物化合物如代谢抑制剂(如2-脱氧葡萄糖-6-磷酸,WO 98/45456)、抗生素(如卡那霉素、G 418、博来霉素或潮霉素)或除草剂(如膦丝菌素或草甘膦)的抗性。特别优选的负选择标记为赋予对除草剂的抗性的选择标记。可以提到的实例为:
-膦丝菌素乙酰转移酶(PAT;也称为Bialophos抗性;bar;de Block1987;EP 0 333 033;US 4,975,374);
-赋予对Glyphosate(N-(膦酰甲基)甘氨酸)的抗性的5-烯醇式丙酮基莽草酸-3-磷酸合酶(EPSPS)(Shah 1986);
-Glyphosate降解酶(Glyphosate氧化还原酶;gox);
-Dalapon失活脱卤素酶(deh);
-失活磺酰脲和咪唑啉酮的乙酰乳酸合酶(例如带有如S4和/或Hra突变的突变ALS变体);
-降解Bromoxynil的腈水解酶(bxn);
-编码如新霉素磷酸转移酶的卡那霉素或G418抗性基因(NPTII;NPTI)(Fraley等1983);
-赋予对2-脱氧葡萄糖的抗性的2-脱氧葡萄糖-6-磷酸磷酸酶(DoGR1基因产物;WO 98/45456;EP 0 807 836)(Ran-dez-Gil等1995);
-介导对潮霉素的抗性的潮霉素磷酸转移酶(HPT)(Vanden Elzen等1985);
-二氢叶酸还原酶(Eichholtz等1987)。
赋予对抗生素抗性的细菌来源的其他负选择标记包括赋予对抗生素大观霉素抗性的aadA基因、庆大霉素乙酰转移酶、链霉素磷酸转移酶(SPT)、氨基葡糖苷-3-腺嘌呤转移酶和博来霉素抗性决定子(Hayford 1988;Jones1987;Svab 1990;HiIIe 1986)。
特别优选的是赋予对D-氨基酸(如D-丙氨酸和D-丝氨酸)产生的毒效应的抗性的负选择标记(WO 03/060133;Erikson 2004)。在此上下文中特别优选的负选择标记为来自酵母Rhodotorula gracilis(Rhodosporidiumtoruloides)的daoI基因(EC:1.4.3.3:GenBank检索号:U60066)和大肠杆菌基因dsdA(D-丝氨酸脱水酶(D-丝氨酸脱氨酶)(EC:4.3.1.18;GenBank检索号:J01603))。
适于原核或非植物真核系统的选择标记也可以基于上述用于植物的选择标记(除了表达盒基于其他宿主特异性启动子)。就哺乳动物细胞而言,优选针对新霉素(G418)、潮霉素、博来霉素、Zeocin(Gatignol 1987;Drocourt 1990)、嘌呤霉素(参阅如Kaufman 1990a,1990b)的抗性。相应的选择标记基因为本领域已知(参阅如Srivastava 1991;Romanos 1995;Markie 1996;Pfeifer 1997;Tucker 1997;Hashida-Okado 1998)。就原核生物而言,优选针对氨苄青霉素、卡那霉素、大观霉素或四环素的抗性。可以使用已公开的核苷酸序列克隆或合成选择标记基因,或者可以商业购买标记基因。
(b)编码在受体细胞或生物中具有毒性的产物的DNA区段(“反选择标记”)。反选择标记特别适用于选择确定缺失本来含有所述标记的生物(Koprek 1999)。反选择标记的实例包括胸苷激酶(TK)、胞嘧啶脱氨酶(Gleave 1999;Perera 1993;Stougaard 1993)、细胞色素P450蛋白(Koprek1999)、卤代烷脱卤素酶(Naested 1999)、iaaH基因产物(Sundaresan 1995)、胞嘧啶脱氨酶codA(Schlaman & Hooykaas 1997)或tms2基因产物(Fedoroff & Smith 1993)。本发明范围内的术语“反选择标记”一般应以广义理解,包括所有以下蛋白质:
i)本身对细胞或生物(如植物细胞)产生毒效应,或
ii)将无毒化合物X转化成有毒化合物Y。
本文使用的术语“无毒化合物X”旨在指在否则相同条件下(即除了化合物X和Y不同外,条件相同)与其转化产物Y相比显示降低(优选没有)的生物活性(优选毒性)的化合物。优选化合物Y的毒性为相应化合物X毒性的至少2倍,优选至少5倍,更优选至少10倍,最优选至少100倍。可以通过多种机制实现从X到Y的转化,包括但不仅限于水解、脱氨、皂化、去磷酸化、磷酸化、氧化或其他方式的活化、代谢或转化。化合物X可以是例如植物生长添加剂或除草剂的无活性前体。本文使用的“毒性”或“毒效应”指对细胞或生物生理的可测量的不利效应,可包括但不仅限于降低或受损的生长、降低或受损的光合作用、降低或受损的细胞分裂、降低或受损的再生或增殖等症状。
反选择标记可以是内源基因或异源基因或来自另一生物的转基因。以下反选择标记用于示例:
1.胞嘧啶脱氨酶(CodA或CDase),其中使用如5-氟胞嘧啶(5-FC)等化合物作为无毒化合物X。胞嘧啶脱氨酶催化从胞嘧啶脱氨成尿嘧啶(Kilstrup 1989;Anderson 1989)。5-FC转化成有毒代谢物(“Y”)5-氟尿嘧啶(5-FU)(Polak 1975)。5-FC具有低毒性Toxizitt(Bennett 1990)。相反,5-FU显示出抑制RNA和DNA合成的强细胞毒性效应(Calabrisi 1990;Damon 1989)。
植物和高等哺乳动物的细胞不表现显著的CDase活性,不能使5-FC脱氨(Polak 1976;Koechlin 1966)。在本发明的上下文中,将CDase作为转基因引入靶细胞。可以在筛选前完成引入(如产生稳定转化的细胞系或生物)。接着可以使用这些细胞或生物作为主细胞系或主生物。
包含所述序列的相应CDase序列、转基因生物(包括植物)以及基于如用5-FC(作为无毒底物X)处理这些细胞或生物的负选择方案为本领域已知(WO 93/01281;US 5,358,866;Gleave 1999;Perera 1993;Stougaard 1993;EP-A1 595 837;Mullen 1992;Kobayashi 1995;Schlaman 1997;XiaohuiWang 2001;Koprek 1999;Gallego 1999;Salomon 1998;Thykjaer 1997;Serino 1997;Risseeuw 1997;Blanc 1996;Corneille 2001)。胞嘧啶脱氨酶和编码它的基因可分离自多种生物,优选微生物例如新型隐球酵母(Cryptococcus neoformans)、白假丝酵母(Candida albicans)、光滑球拟酵母(Torulopsis glabrata)、申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii)、曲霉、分支孢子菌属和瓶霉属(Bennett 1990)和细菌如大肠杆菌和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)(Andersen 1989)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:S56903所述序列和经修饰以允许在真核生物中表达的EP-A1 595 873所述修饰序列。
2.细胞色素P-450酶,特别是来自浅灰链霉菌(Streptomycesgriseolus)(菌株ATCC 11796)的细菌细胞色素P-450 SU1基因产物(CYP105A1),其中使用如磺酰脲原除草剂R7402(2-甲基乙基-2-3-二氢-N-[(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基)氨基羰基]-1,2-苯并异噻唑-7-磺酰胺-1,1-二氧化物)作为无毒物质X。本领域已描述了相应序列和使用如R7402的负选择方案(O′Keefe 1994;Tissier 1999;Koprek 1999;O′Keefe 1991)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:M32238所述的序列。
3.吲哚乙酸水解酶,如来自根癌农杆菌的tms2基因产物,其中使用auxinamide化合物或萘乙酰胺(NAM)等物质作为无毒化合物X(NAM转化成植物毒性化合物萘乙酸)。本领域已描述了相应的序列和负选择方案(使用NAM作为无毒化合物X)的实现(Fedoroff 1993;Upadhyaya 2000;Depicker 1988;Karlin-Neumannn 1991;Sundaresan 1995;Cecchini 1998;Zubko 2000)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:NC_003308(Protein_id=″NP_536128.1)、AE009419、AB016260(Protein_id=″BAA87807.1)和NC002147所述的序列。
4.来自如Xanthobacter autotropicus GJ10的卤代烷脱卤素酶(dhlA基因产物)。这种脱卤素酶将二卤代烷如1,2-二氯乙烷(DCE)水解成卤代醇和无机卤化物(Naested 1999;Janssen 1994;Janssen 1989)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:M26950所述的序列。
5.胸苷激酶(TK),特别是来自病毒如单纯疱疹病毒、SV40、巨细胞病毒、水痘带状疱疹病毒的病毒TK,特别优选来自I型单纯疱疹病毒的TK(TK HSV-1),其中使用如阿昔洛韦、更昔洛韦或1,2-脱氧-2-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖-5-碘尿嘧啶(FIAU)等物质作为无毒化合物X。相应的化合物和负选择方案(例如使用阿昔洛韦、更昔洛韦或FIAU)的实现为本领域已知(Czako 1994;Wigler 1977;McKnight 1980;McKnight 1980;Preston 1981;Wagner 1981;St.Clair 1987)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:J02224、V00470和V00467所述序列。
6.鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶、次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶或叶黄素鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶,其中使用如6-硫代叶黄素或别嘌呤醇作为无毒物质X。优选来自如大肠杆菌的鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(gpt)(Besnard1987;Mzoz 1993;Ono 1997)、次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(HPRT;Jolly1983;Fenwick 1985)、叶黄素鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(如来自鼠弓形体(Toxoplasma gondii),Knoll 1998;Donald 1996)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:U10247(鼠弓形体HXGPRT)、M13422(大肠杆菌gpt)和X00221(大肠杆菌gpt)所述的序列。
7.来自如大肠杆菌的嘌呤核苷磷酸化酶(PNP,DeoD基因产物),其中使用如6-甲基嘌呤脱氧核糖核苷等化合物作为无毒化合物X。合适的化合物和实施反选择方案(如使用6-甲基嘌呤脱氧核糖核苷等化合物作为无毒化合物X)的方法为本领域技术人员所熟知(Sorscher 1994)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:M60917所述的序列。
8.膦酸单酯水解酶,其适于将例如除草剂草甘膦的无生理活性酯衍生物(如草甘膦甘油酯)转化成除草剂的活性形式。合适的化合物和实施反选择方案(如使用草甘膦甘油酯作为无毒化合物X)的方法为本领域技术人员所熟知(US 5,254,801;Dotson 1996;Dotson 1996)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:U44852所述的序列。
9.Aux-1、优选Aux-2基因产物,如来自农杆菌菌株Ti质粒的aus(Beclin 1993;Gaudin 1995)。两种酶的活性导致在植物细胞中产生吲哚乙酰胺(IAA)。Aux-1编码将色氨酸转化成吲哚乙酰胺的吲哚乙酰胺合酶(IAMS)(VanOnckelen 1986)。Aux-2编码将吲哚乙酰胺(不具有植物激素活性的化合物)转化成活性生长素吲哚乙酸的吲哚乙酰胺水解酶(IAMH)(Inze1984;Tomashow 1984;Schroder 1984)。IAMH还能转化多种吲哚酰胺型底物,如萘乙酰胺,其转化成植物生长调节剂萘乙酸(NAA)。IAMH作为反选择标记的用途描述于例如US 5,180,873。还描述了发根农杆菌(A.rhizogenes)、葡萄农杆菌(A.vitis)(Canaday 1992)和萨氏假单胞菌(Pseudomonas savastanoi)(Yamada 1985)相应的酶。还描述了作为选择性杀死某些植物组织(如花粉;US 5,426,041)或转基因植物(US 5,180,873)的反选择标记的用途。用于反选择(如通过使用萘乙酰胺)的化合物和方法为本领域技术人员已知(见上文)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:M61151、AF039169和AB025110所述的序列。
10.腺嘌呤磷酸核糖转移酶(APRT),其中使用如4-氨基吡唑并嘧啶作为无毒化合物X。用于实施反选择方案的适当化合物和方法为本领域技术人员所熟知(Wigler 1979;Taylor 1985)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。
11.Methoxinin脱氢酶,其中使用如2-氨基-4-甲氧基-丁酸(Methoxinin)作为无毒化合物X,其转化成毒性化合物甲氧基乙烯基甘氨酸(Margraff 1980)。
12.根瘤菌毒素(rhizobitoxine)合酶,其中使用2-氨基-4-甲氧基-丁酸(Methoxinin)作为无毒化合物X,其转化成2-氨基-4-[2-氨基-3-羟丙基]-反-3-丁酸(Rhizobitoxin)(Owens 1973)。
13.5-甲硫基核糖(MTR)激酶,其中使用如5-三氟甲硫基核糖(MTR-类似物,“破坏性底物”)作为无毒化合物X,其转化成毒性化合物Y二氟硫代羰酸(carbothionyldifluoride)。MTR激酶是甲硫氨酸补救途径的关键酶。在植物、细菌和原生生物中描述了相应的酶活性,但哺乳动物中则没有。可以根据确定的序列基序鉴定来自多个物种的MTR激酶(Sekowska2001;http://www.biomedcentral.com/1471-2180/1/15)。用于反选择的相应序列和方法(例如使用5-三氟甲硫基核糖)为本领域技术人员已知,并可便利地得自序列数据库(如Sekowska 2001;Cornell 1996)。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:AF212863或AC079674所述序列以及本文引入为参考的WO 03/078629和DE 10212892中所述的其他MTK激酶。
14.醇脱氢酶(Adh),特别是植物Adh-1基因产物,其中使用如转化成毒性化合物(Y)丙烯醛的优选化合物如烯丙醇作为无毒化合物X。用于实施反选择方案的合适的相应化合物和方法(如使用烯丙醇)为本领域技术人员所熟知(Wisman 1991;Jacobs 1988;Schwartz 1981)。序列可以便利地来自序列数据库。所有这些本文所述的参考文献、序列和方法明确引入为参考。特别优选GenBank检索号:X77943、M12196、AF172282、X04049或AF253472所述的序列。
15.其他优选作为反选择标记的是本身在表达所述基因或序列的细胞中表现毒性效应的“毒性基因”或“毒性序列”。实例可以包括但不仅限于编码例如以下毒性蛋白质的序列:白喉毒素A、核糖核酸酶(RNAse例如,Barnase)、核糖体抑制蛋白(RIP,如蓖麻蛋白)、爪蟾抗菌肽、DNAse、植物毒素、能引发超敏反应的蛋白质,和蛋白酶。当同时表达病原体来源的引发剂蛋白和相应的植物来源受体蛋白时可能引发超敏反应(HR)。这些相应引发剂/受体基因对及其在转基因植物中引发HR的可用性为本领域已知,例如黄枝孢(Cladosporium fulvum)的avr-基因和番茄Cf-基因(WO91/15585)或丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)的avr-基因和拟南芥RPM1基因(Grant 1995)。
其他毒性序列是抑制必需内源基因(如持家基因)的序列。本领域技术人员了解可用于抑制(“沉默”)内源基因的基因表达的多种序列和方法。涉及基因、其基因产物或所述基因产物的活性时,术语“抑制”或“沉默”应以广义理解,包括在多种表达水平使功能性受损或降低的多种机制。包括如将转录和翻译定量降低至基本完全缺乏转录和/或翻译产物(即通过使用如RNA或蛋白质印迹分析、PCR等检测方法的不可检测到)。基因沉默的合适方法可包括但不仅限于通过以下实现基因沉默:
(i)反义抑制(细节见上文),
(ii)正义抑制(共抑制)(细节见上文),
(iii)双链RNA干扰(细节见上文),
(iv)表达针对内源RNA转录物的核酶(细节见上文),
(v)表达蛋白质或DNA结合因子:还可以通过表达某些DNA或蛋白质结合因子来“沉默”内源基因的表达,所述DNA或蛋白质结合因子干扰基因产物的基因的表达或活性。例如锌指型人工转录因子可适用于任何靶序列,并因而可用于基因沉默(例如通过导向靶基因的启动子区)。已描述了产生这些因子的方法(Dreier 2001;Dreier 2000;Beerli 2000a,2000b;Segal 2000;Kang 2000;Beerli 1998;Kim 1997;Klug 1999;Tsai1998;Mapp 2000;Sharrocks 1997;Zhang 2000)。另外还可以使用(通过与得到的蛋白质相互作用)直接抑制基因产物的因子。这些蛋白质结合因子可以是例如适体(Famulok 1999)、抗体、抗体片段或单链抗体。已经描述了它们的产生(Owen 1992;Franken 1997;Whitelam 1996)。
(vi)介导基因沉默的病毒表达系统:还可以使用特定的病毒表达系统介导内源基因的基因沉默(Amplikon;Angell 1999)。这些系统和方法(称为“VIGS”,病毒诱导的基因沉默)介导与来自病毒载体系统的内源基因相似的序列的表达。通过将表达划分为“病毒的”,整个表达(包括同源内源基因的表达)被植物病毒防御机制关闭。本领域已经描述了相应方法(Ratcliff 2001;Fagard 2000;Anandalakshmi 1998;Ruiz 1998)。适于作为本发明方法的靶标的必需内源基因可以为例如选自编码细胞成活力必需的酶的基因。这些所称作的“持家基因”可以例如选自编码如ATP合酶、细胞色素C、丙酮酸激酶、氨酰基转移酶或磷酸、2-、3-羧酸和2-氧代-戊二酸易位蛋白的基因。为举例之用,表1给出了靶标酶列表,但本发明不仅限于此表中提到的酶。更多详细列表可汇集自如《Biochemistry of Plants》(Stumpf & Conn编辑,1988-1991,第1-16卷Academic Press)或《Encyclopedia of Plant Physiology》(New Series,1976,Springer-Verlag,Berlin)等。
表1:靶标酶的实例
酶 |
ATP合酶(线粒体) |
腺嘌呤核苷酸易位蛋白(线粒体) |
磷酸易位蛋白(线粒体) |
三羧酸易位蛋白(线粒体) |
二羧酸易位蛋白(线粒体) |
2-氧代-戊二酸易位蛋白(线粒体) |
细胞色素C(线粒体) |
丙酮酸激酶 |
甘油醛-3磷酸脱氢酶 |
NADPH-细胞色素P450还原酶 |
脂肪酸合酶复合体 |
甘油-3磷酸酰基转移酶 |
羟基甲基戊二酰辅酶A还原酶 |
氨酰基转移酶 |
转录因子 |
延伸因子 |
八氢番茄红素去饱和酶 |
硝酸还原酶 |
对羟基苯基丙酮酸双加氧酶(HPPD) |
转酮酶(优选EP-A1 723 017中描述并要求保护的酶) |
铁氧还蛋白氧化还原酶(优选EP-A1 1 333 098中描述并要求保护的酶) |
S-腺苷甲硫氨酸:Mg-原卟啉-IX-O-甲基转移酶(优选EP-A1 1 198 578中描述并要求保护的酶) |
Dihydrorotase(EC 3.5.2.3)(优选EP-A1 1 210 437中描述并要求保护的酶) |
磷酸核糖焦磷酸合酶(优选EP-A1 1 294 925中描述并要求保护的酶) |
天冬氨酸氨甲酰转移酶(优选EP-A1 1 259 623中描述并要求保护的酶) |
Dehydrochinate脱水酶/莽草酸脱氢酶(优选EP-A1 1 315 808中描述并要求保护的酶) |
由于持家基因一般高度保守,可以使用来自其他(植物)物种的异源探针从待产生抗性的物种中分离相应基因。参考本发明的教导,本领域技术人员能够不需要过度实验就可以分离这些基因。
(c)编码通过提高或改善的再生、生长、繁殖、增殖而赋予受体细胞或生物优势的产物的DNA区段(“正选择标记”)。如来自根癌农杆菌(菌株:PO22;Genbank检索号:AB025109)的异戊烯基转移酶(细胞分裂素生物合成的关键酶)等基因可促进转化植物的再生(如通过在无细胞分裂素的培养基上选择)。已经描述了相应的选择方法(Ebinuma等2000a,2000b)。赋予转化植物与未转化植物相比的生长优势的其他正选择标记描述于例如EP-A 0 601 092。生长刺激选择标记可包括(但不仅限于)β-葡糖醛酸糖苷酶(与例如细胞分裂素葡糖苷酸组合)、甘露糖-6-磷酸异构酶(与甘露糖组合)、UDP-半乳糖-4-表异构酶(与例如半乳糖组合),其中优选甘露糖-6-磷酸异构酶与甘露糖的组合。
(d)编码易于鉴定的产物的DNA区段(“报道基因”或“报道蛋白”或“报道分子”,如表型标记如β-半乳糖苷酶、绿色荧光蛋白(GFP)和细胞表面蛋白)。术语“报道基因”、“报道蛋白”或“报道分子”旨在指任何易于定量的蛋白质(或其编码序列),其通过如颜色或酶活性使得可以评估所述蛋白质的存在或所述报道基因的表达。报道基因编码易于定量的蛋白质,并通过其颜色或酶活性使得可以评估转化效率、表达位置或表达时间。在此上下文中非常特别优选编码如以下报道蛋白质(Schenborn 1999)的基因:绿色荧光蛋白(GFP)(Sheen 1995;Haseloff 1997;Reichel 1996;Tian1997;WO 97/41228;Chui 1996;Leffel 1997)、NAN报道基因(Kavanagh2002;WO 03/052104)、氯霉素转移酶、萤光素酶(Ow 1986;Millar 1992)、水母发光蛋白基因(Prasher 1985)、β-半乳糖苷酶、R基因座基因(编码在植物组织中调节花青苷色素的产生(红色)的蛋白质,从而使得可以不加入其他辅助物质或显色底物而直接分析启动子活性)(Dellaporta 1988;Ludwig 1990),非常特别优选β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)(Jefferson 1987b;1987a)。通过将组织与5-溴-4-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖醛酸温育后的蓝色来检测β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)的表达;通过光发射检测细菌萤光素酶(LUX)的表达;通过与萤光素温育后的光发射检测萤火虫萤光素酶(LUC)的表达;通过用5-溴-4-氯-3-吲哚基-β-D-半乳吡喃糖苷染色组织后的亮蓝色来检测半乳糖苷酶的表达。报道基因还可以用作可评分标记而作为抗生素抗性标记的替代。这些标记用于检测转移的基因的存在或测量其表达水平。只有在细胞的修饰效率高时,在植物中使用可评分标记鉴定或标记遗传修饰的细胞才能良好工作。
(e)编码在受体细胞中抑制细胞功能的产物的DNA区段;
(f)抑制上文(a)-(e)中任一DNA区段的活性的DNA区段;
(g)与修饰底物的产物(如限制性内切核酸酶)结合的DNA区段;
(h)编码可被蛋白质、RNA、DNA或化学品识别的特定核苷酸识别序列的DNA区段;
(i)在缺失或不存在时在受体细胞中直接或间接赋予对特定化合物的细胞杀伤的抗性或敏感性的DNA区段;
(j)编码在受体细胞中抑制基因产物活性的产物的DNA区段;
(k)编码在受体细胞中本来缺乏的产物的DNA区段(如tRNA基因、营养缺陷型标记),和;
(l)可用于分离或鉴定目的分子的DNA区段(如特异性蛋白质结合位点)。
在本发明优选的实施方案中,在有效的转录终止子引起附加序列表达降低的情况下(特别是方法A,其中将转录终止子插入所述附加序列和启动子之间),所述附加序列可以是已知转录终止子序列(如nos终止子)的反向重复,所述转录终止子序列以使其中第二个拷贝(位于启动子更下游的拷贝)为其“正常”取向(组成功能性转录终止子)的方式定位。必须注意,这种反向重复转录终止子的降低表达引起位于插入位点上游的序列的提高的表达(或较不沉默的表达)。在这些序列编码例如标记的情况下,可以观察到提高的抗性或信号。
优选地,这种转录终止子(下文的“第二个转录终止子”)与待评估其转录终止效率的序列不同。在这种情况下,优选使用其他序列,所述序列优选位于启动子和插入位点之间,并编码如选择标记或报道基因。在这种方案中,有效的转录终止序列会停止转录,并不引起所述第二个转录终止子的反向重复的转录。因此,启动子和插入位点之间的序列将发生正常表达(引起表达选择标记或报道基因)。在插入位点插入的序列不是有效转录终止子的情况下,转录将连读至所述第二个转录终止子的反向重复。这样的构建体将通过dsRNAi导致其自身基因的沉默。因此启动子和插入位点之间的序列不发生表达(使选择标记或报道基因的表达沉默)。已经描述了基于转录终止子(如NOS终止子)的反向重复序列的自身作用基因沉默(Brummell 2003)。
2.3筛选构建体或筛选载体的其他元件
除了启动子和附加序列以外,筛选构建体或筛选载体还可以包含其他元件(如遗传控制序列)。术语“遗传控制序列”应以广义理解,指对本发明的筛选构建体或筛选载体的实现或功能有影响的所有序列。例如,遗传控制序列在原核或真核生物中修饰转录和翻译。遗传控制序列还包括基因的5’非翻译区、内含子或非编码3’区,例如肌动蛋白-1内含子或Adh1-S内含子1、2和6(一般参考《The Maize Handbook》,第116章,Freeling和Walbot编辑,Springer,New York(1994))。已经证明它们在基因表达的调节中可能发挥重要作用。因此,已经证明5’非翻译序列可增强异源基因的瞬时表达。可提到的翻译增强子的实例为烟草花叶病毒5’前导序列(Gallie,1987)等。此外,它们可促进组织特异性(Rouster,1998)。
筛选构建体或筛选载体还可以有利地包含一个或多个与启动子有效连接的增强子序列,它使核酸序列的重组表达提高。还可以在待重组表达的核酸序列的3’末端插入额外有利的序列,如其他调节元件或其他转录终止序列。
在本发明的一些实施方案(例如变通方案A或C)中,筛选构建体或筛选载体中还可以包含已知的转录终止序列(优选在附加序列之后)和任选地多腺苷酸化信号序列。适合作为控制序列的多腺苷酸化信号为植物多腺苷酸化信号,优选与来自根癌农杆菌T-DNA多腺苷酸化信号基本对应的多腺苷酸化信号,尤其是OCS(章鱼碱合酶)终止子和NOS(胭脂碱合酶)终止子。表达载体不必须含有转录终止和多腺苷酸化信号序列,因为这些元件可以由克隆的基因或基因片段提供。
本发明的筛选构建体或筛选载体还可以包含其他功能性元件。术语功能性元件应以广义理解,指对本发明筛选构建体或筛选载体的产生、扩增或功能有影响的所有元件。功能性元件可以包括例如(但不仅限于)选择标记基因(包括负、正和反选择标记,细节见上文)、报道基因以及
1)复制起点,其确保本发明的表达盒或载体在例如大肠杆菌中扩增。可以提到的实例为ORI(DNA复制起点)、pBR322 ori或P15A ori(Maniatis1989)。用于在大肠杆菌中具有功能性的复制系统的其他实例为ColE1、pSC101、pACYC184等。作为大肠杆菌复制系统的补充或替代,可以使用宽宿主范围复制系统,如P-1不相容质粒(如pRK290)的复制系统。这些质粒特别有效的与有甲或卸甲Ti质粒一起将T-DNA转移到植物物种宿主。表达载体还可以包含SV40起点。此元件可用于在表达SV40大T抗原的细胞系中进行附加型复制和挽救。
2)农杆菌介导的转化所必需的元件,例如T-DNA的右和/或(任选的)左边界或vir区。
3)克隆位点:克隆位点可以优选是多克隆位点。任何多克隆位点都可以使用,并可通过商业途径获得。
4)S/MAR(支架/基质附着区)。基质附着区(MAR)有效定义为在体外与核基质(核支架蛋白)特异性结合的DNA元件,已经提出其在体内介导染色质对核支架的附着。它们还可能在体内介导染色质与核支架的结合并改变间期核中基因组的拓扑学。当MAR位于转基因的任一侧时,其存在通常引起转基因生物(特别是植物)或细胞系中更高、更稳定的表达,最可能是通过使基因沉默最小化(综述:Allen 2003)。已经描述了多种S/MARS序列及其对基因表达的影响(Sidorenko 2003;Allen 1996;Villemure 2001;Mlynarova 2002)。可以优选使用S/MAR元件减少非故意的基因沉默(Mlynarova 2003)。S/MAR的实例为鸡溶菌酶A元件(Stief 1989)。
5)进一步修饰转录、翻译和/或表达的蛋白质的转运的序列。例如表达的蛋白质可以是包含分泌信号序列的嵌合蛋白。分泌信号序列与目的基因有效连接,以使两个序列在正确的读码框中连接并定位,以指导新合成的目的多肽进入宿主细胞的分泌途径。分泌信号序列一般位于编码目的氨基酸序列的核苷酸序列的5’,尽管某些分泌信号序列可能位于目的核苷酸序列的其他位置(US 5,037,743,US 5,143,830)。表达载体还可以包含编码辅助纯化目的多肽的肽标签的核苷酸序列。可用于分离重组多肽的肽标签包括聚组氨酸标签(对镍螯合树脂具有亲和力)、c-myc标签、钙调素结合蛋白(用钙调素亲和层析分离)、物质P、RYIRS标签(与抗RYIRS抗体结合)、Glu-Glu标签和FLAG标签(与抗FLAG抗体结合,参阅如Luo 1996;Morganti 1996和Zheng 1997)。编码这些肽标签的核酸分子可来自例如Sigma-Aldrich Corporation(St.Louis,Mo.)。
本文公开和要求保护的所有组合物和方法都可以按照本发明的公开内容无需过度实验就可以产生和执行。尽管在优选实施方案中已经描述了本发明的组合物和方法,但对本领域技术人员而言显而易见的是,可以对本文所述的组合物、方法和方法的步骤或步骤的顺序应用多种改变而不背离本发明的概念、精神和范围。更具体的,显然可以用在化学和生理上都相关的某些物质代替本文所述的物质而得到相同或相似的结果。对本领域技术人员而言显而易见的这些类似的替换和修饰都认为是在如附带的权利要求书所定义的本发明精神、范围和概念内。本文引用的所有出版物、专利和专利申请都为其所有目的引入本文作为参考。
2.4本发明的合适载体
涉及从一个细胞转移DNA区段至另一细胞的核酸分子时,本文使用的术语“载体”和“运载体”可互换使用。本文使用的术语“筛选载体”指重组DNA分子,其至少包含所述启动子的上文定义的元件和发挥评估插入序列的转录终止效率的功能的附加序列。
本发明的方法不受限于本文公开的载体。能够表达核酸序列并优选地将目的核酸序列引入细胞(如植物细胞)的任何载体都考虑在本发明的范围内。载体一般包含与允许将载体克隆进细菌或噬菌体宿主的元件组合的上文定义的本发明必要元件。载体优选(但不必须)含有在宽范围的原核宿主中具有功能性的复制起点。一般(但不必须)包括选择标记以允许选择带有目的载体的细胞。载体的实例可以是质粒、粘粒、噬菌体、病毒或农杆菌。下文给出了用于个体转化技术的更具体的实例。
优选可以使表达构建体可能稳定整合进宿主基因组的载体。在将DNA注射或电穿孔进细胞(如植物细胞)的情况下,对质粒没有任何特别的要求。可以使用简单质粒,如pUC系列。如果需要从转化细胞再生完整植物,则在质粒中需要存在额外的选择标记基因。有多种可能的质粒载体可供将外源基因引入植物中,这些载体通常含有用于在大肠杆菌中增殖的复制起点和用于选择转化细菌的标记基因。实例为pBR322、pUC系列、M13mp系列、pACYC184等。
用于本发明的优选载体包括原核载体、真核载体或可以在多种原核和/或真核系统间穿梭的载体(如穿梭载体)。优选的真核载体包括可以在酵母细胞、植物细胞、鱼细胞、真核细胞、哺乳动物细胞或昆虫细胞中复制的载体。优选的原核载体包括在革兰氏阴性和/或革兰氏阳性菌中复制的载体,更优选在埃希氏菌、沙门氏菌、芽孢杆菌、链霉菌、农杆菌、根瘤菌或假单胞菌属细菌中复制的载体。更优选在大肠杆菌和农杆菌中都能复制的载体。用于本发明的真核载体包括在酵母细胞、植物细胞、哺乳动物细胞(特别是人细胞)、真菌细胞、昆虫细胞、鱼细胞等中增殖和/或复制的载体。重要的具体载体包括但不仅限于克隆载体、测序载体、表达载体、融合载体、双杂交载体、基因治疗载体和反向双杂交载体。取决于具体的载体,这些载体可用于原核和/或真核系统中。
按照本发明可以使用任何载体构建本发明的筛选载体。具体的,可以按照本发明改造本领域已知的载体和市售的载体(及其变体或衍生物)以包含用于本发明方法的一个或多个重组位点。这些载体可得自如Invitrogen、Vector Laboratories Inc.、Invitrogen、Promega、Novagen、NEB、Clontech、Boehringer Mannheim、Pharmacia、EpiCenter、OriGenes TechnologiesInc.、Stratagene、PerkinElmer、Pharmingen、Life Technologies,Inc.和Research Genetics。其后可以将这些载体用于克隆或亚克隆目的核酸分子。特别重要的载体一般类别包括原核和/或真核克隆载体、表达载体、融合载体、双杂交或反向双杂交载体、用于不同宿主的穿梭载体、诱变载体、转录载体、用于接受大插入片段的载体等。
其他重要的载体包括病毒来源的载体(M13载体、入噬菌体载体、腺病毒载体和逆转录病毒载体)、高、低和可调拷贝数载体、具有在单一宿主中组合使用的兼容复制子的载体(pACYC184和pBR322)和真核附加型复制载体(pCDM8)。
特别重要的载体包括原核表达载体如pcDNA II、pSL301、pSE280、pSE380、pSE420、pTrcHisA、B和C、pRSET A、B和C(InVitrogen,Inc.)、pGEMEX-1和pGEMEX-2(Promega,Inc.)、pET载体(Novagen,Inc.)、pTrc99A、pKK223-3、pGEX载体、pEZZ18、pRIT2T和pMC1871(Pharmacia,Inc.)、pKK233-2和pKK388-1(Clontech,Inc.)和pProEx-HT(Life Technologies,Inc.)及其变体和衍生物。还可以从如以下真核表达载体产生载体供体:pFastBac、pFastBacHT、pFastBacDUAL、pSFV和pTet-Splice(Life Technologies,Inc.)、pEUK-C 1、pPUR、pMAM、pMAMneo、pBI101、pBI121、pDR2、pCMVEBNA和pYACneo(Clontech)、pSVK3、pSVL、pMSG、pCH110和pKK232-8(Pharmacia,Inc.)、p3′SS、pXT1、pSG5、pPbac、pMbac、pMC1neo和pOG44(Stratagene,Inc.)和pYES2、pAC360、pBlueBacHis A、B和C、pVL1392、pBsueBacIII、pCDM8、pcDNAI、pZeoSV、pcDNA3、pREP4、pCEP4和pEBVHis(Invitrogen,Inc.)及其变体或衍生物。
特别重要的其他载体包括pUC18、pUC19、pBlueScript、pSPORT、粘粒、噬菌粒、YAC(酵母人工染色体)、BAC(细菌人工染色体)、P1(大肠杆菌噬菌体)、pQE70、pQE60、pQE9(quagan)、pBS载体、PhageScript载体、BlueScript载体、pNH8A、pNH16A、pNH18A、pNH46A(Stratagene)、pcDNA3(Invitrogen)、pGEX、pTrsfus、pTrc99A、pET-5、pET-9、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia)、pSPORT1、pSPORT2、pCMVSPORT2.0和pSV-SPORT1(Life Technologies,Inc.)及其变体或衍生物。
其他重要的载体包括来自Invitrogen的pTrxFus、pThioHis、pLEX、pTrcHis、pTrcHis2、pRSET、pBlueBacHis2、pcDNA3.1/His、pcDNA3.1(-)/Myc-His、pSecTag、pEBVHis、pPIC9K、pPIC3.5K、pAO815、pPICZ、pPICZα、pGAPZ、pGAPZα、pBlueBac4.5、pBlue-BacHis2、pMelBac、pSinRep5、pSinHis、pIND、pIND(SP1)、pVgRXR、pcDNA2.1.pYES2、pZErGO1.1、pZErO-2.1、pCR-Blunt、pSE280、pSE380、pSE420、pVL1392、pVL1393、pCDM8、pcDNA1.1、pcDNA1.1/Amp、pcDNA3.1、pcDNA3.1/Zeo、pSe、SV2、pRc/CMV2、pRc/RSV、pREP4、pREP7、pREP8、pREP9、pREP10、pCEP4、pEBVHis、pCR3.1、pCR2.1、pCR3.1-Uni和pCRBac;来自Pharmacia的λExCell、λgt11、pTrc99A、pKK223-3、pGEX-1λT、pGEX-2T、pGEX-2TK、pGEX-4T-1、pGEX-4T-2、pGEX-4T-3、pGEX-3X、pGEX-5X-1、pGEX-5X-2、pGEX-5X-3、pEZZ18、pRIT2T、pMC1871、pSVK3、pSVL、pMSG、pCH110、pKK232-8、pSL1180、pNEO和pUC4K;来自NoVagen的pSCREEN-1 b(+)、pT7Blue(R)、pT7Blue-2、pCITE-4abc(+)、pOCUS-2、pTAg、pET-32LIC、pET-30LIC、pBAC-2cp LIC、pBACgus-2cp LIC、pT7Blue-2 LIC、pT7Blue-2、λSCREEN-1、λBlueSTAR、pET-3abcd、pET-7abc、pET9abcd、pET11abcd、pET12abc、pET-14b、pET-15b、pET-16b、pET-17b-pET-17xb、pET-19b、pET-20b(+)、pET-21abcd(+)、pET-22b(+)、pET-23abcd(+)、pET-24abcd(+)、pET-25b(+)、pET-26b(+)、pET-27b(+)、pET-28abc(+)、pET-29abc(+)、pET-30abc(+)、pET-31b(+)、pET-32abc(+)、pET-33b(+)、pBAC-1、pBACgus-1、pBAC4x-1、pBACgus4x-1、pBAC-3cp、pBACgus-2cp、pBACsurf-1、pIg、Signal pIg、pYX、Selecta Vecta-Neo、SelectaVecta-Hyg和Selecta Vecta-Gpt;来自Clontech的pLexA、pB42AD、pGBT9、pAS2-1、pGAD424、pACT2、pGAD GL、pGAD GH、pGAD10、pGilda、pEZM3、pEGFP、pEGFP-1、pEGFP-N、pEGFP-C、pEBFP、pGFPnV、pGFP、p6xHis-GFP、pSEAP2-Basic、pSEAP2-Contral、pSEAP2-Promoter、pSEAP2-Enhancer、pβgal-Basic、pβgal-Control、pβgal-Promoter、pβgal-Enhancer、pCMVβ、pTet-Off、pTet-On、pTK-Hyg、pRetro-Off、pRetro-On、piRES1neo、pIRES1hyg、pLXSN、pLNCX、pLAPSN、pMAMneo、pMAMneo-CAT、pMAMneo-LUC、pPUR、pSV2neo、pYEX4T-1/2/3、pYEX-S1、pBacPAK-His、pBacPAK8/9、pAcUW31、BacPAK6、pTriplEx、λgt10、λgt11、pWE15、和λTriplEx;来自Stratagene的Lambda ZAP II、pBK-CMV、pBK-RSV、pBluescriptIIKS+/-、pBluescript IISK+/-、pAD-GAL4、pBD-GAL4 Cam、pSurfscript、Lambda FIX II、Lambda DASH、Lambda EMBL3、Lambda EMBL4、SuperCos、pCR-Scrigt Amp、pCR-Script Cam、pCR-Script Direct、pBS+/-、pBC KS+/-、pBC SK+/-、Phageseript、pCAL-n-EK、pCAL-n、pCAL-c、pCAL-kc、pET-3abcd、pET-11′abcd、pSPUTK、pESP-1、pCMVLacI、pOPRSVI/MCS、pOPI3 CAT、pXT1、pSG5、pPbac、pMbac、pMC1neo、pMC1neo PoIy A、pOG44、pOG45、pFRTβGAL、pNEOβGAL、pRS403、pRS404、pRS405、pRS406、pRS413、pRS414、pRS415和pRS416。
特别重要的双杂交和反向双杂交载体包括pPC86、pDBLeu、pDBTrp、pPC97、p2.5、pGAD1-3、pGAD10、pACt、pACT2、pGADGL、pGADGH、pAS2-1、pGAD424、pGBT8、pGBT9、pGAD-GAL4、pLexA、pBD-GAL4、pHISi、pHISi-1、placZi、pB42AD、pDG202、pJK202、pJG4-5、pNLexA、pYESTrp及其变体或衍生物。
在大肠杆菌中表达的优选载体为pQE70、pQE60和pQE-9(QIAGEN,Inc.);pBluescript载体、phagescript载体、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene Cloning Systems,Inc.);ptrc99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia Biotech,Inc.)。
在真核动物系统表达的优选载体包括pWLNEO、pSv2CAT、pOG44、pXT1和pSG(Stratagene Inc.);pSVK3、pBPV、pMSG和pSVL(PharmaciaBiotech,Inc.)。诱导型载体的实例为pTet-tTak、pTet-Splice、pcDNA4/TO、pcDNA4/TO/LacZ、pcDNA6/TR、pcDNA4/TO/Myc-His/LacZ、pcDNA4/TO/Myc-His A、pcDNA4/TO/Myc-His B、pcDNA4/TO/Myc-HisC、pVgRXR(In vitrogen,Inc.)或pMAM-系列(Clontech,Inc.;GenBank检索号:U02443)。
在酵母中表达的优选载体包括如pYES2、pYD1、pTEFI/Zeo、pYES2/GS、pPICZ、pGAPZ、pGAPZalph、pPIC9、pPIC3.5、PHIL-D2、PHIL-SI、pPIC3SK、pPIC9K和PA0815(Invitrogen,Inc.)。
本文以下描述了用于植物转化的优选载体,优选包括用于农杆菌介导的转化的载体。根癌农杆菌和发根农杆菌是能遗传转化植物细胞的植物致病性土壤细菌。根癌农杆菌和发根农杆菌各自的Ti和Ri质粒携带负责遗传转化植物的基因(Kado 1991)。本发明的载体可以基于农杆菌Ti或Ri质粒,从而可以利用进入植物基因组的天然DNA转移系统。
作为高度发展的寄生现象的一部分,农杆菌将其基因组信息的确定部分(T-DNA,两侧为约25bp的重复,称为左和右边界)转移进植物细胞的染色体DNA(Zupan 2000)。通过所谓vir基因(原始Ti质粒的部分)的组合作用介导所述DNA转移。为利用这个天然系统,开发了缺乏原始肿瘤诱导基因的Ti质粒(“卸甲载体”)。在进一步改进(所谓的“双元载体系统”)中,通过整合进便于操作的穿梭载体而将T-DNA与Ti质粒的其他功能性元件(如vir基因)物理分离(EP-A1 0 120 516;US 4,940,838)。这些双元载体包含(除了卸甲T-DNA及其边界序列以外)用于在农杆菌和大肠杆菌中复制的原核序列。农杆菌介导的转化的优点是通常仅边界侧翼的DNA被转移进基因组,并且优选仅插入1个拷贝。用于农杆菌介导的基因转移的农杆菌载体系统和方法的描述为本领域已知(Miki 1993;Gruber 1993;Moloney1989。)已经深入研究和描述了T-DNA用于转化植物细胞的用途(EP-A1120 516;Hoekema 1985;Fraley 1985和An 1985)。已知多种双元载体,其中一些是市售的,例如pBIN19(Clontech Laboratories,Inc.USA)。
因此,对于农杆菌介导的转化,可以将筛选构建体整合入特定的质粒,或者筛选载体可以由特定质粒组成,例如穿梭载体或中间载体或双元载体。如果将Ti或Ri用于转化,以侧翼区的形式将Ti或Ri质粒T-DNA的至少右边界(多数情况下为右和左边界)与待引入的转基因表达构建体连接。优选使用双元载体。双元载体能在大肠杆菌和农杆菌中复制。它们可以包含选择标记基因和接头或多聚接头(用于插入例如待转移的表达构建体),其两侧为右和左T-DNA边界序列。可以直接将它们转移进农杆菌(Holsters1978)。选择标记基因允许选择转化的农杆菌,例如赋予对卡那霉素抗性的nptII基因。在这种情况下作为宿主生物的农杆菌应该已经含有带有vir区的质粒。后者是将T-DNA转移进植物细胞所需要的。以这种方式转化的农杆菌可用于转化植物细胞。已经深入研究并描述了T-DNA用于转化植物细胞的用途(EP-A1 0 120 516;Hoekema 1985;An 1985,另见下文)。
通常的双元载体基于“宽宿主范围”质粒,如来自P型质粒RK2的pRK252(Bevan 1984)或pTJS75(Watson 1985)。这些质粒多数来自pBIN19(Bevan 1984)。已知多种双元载体,其中一些是市售的,例如pBI101.2或pBIN19(Clontech Laboratories,Inc.USA)。其他载体在大小和操作上进行了改进(如pPZP,Hajdukiewicz 1994)。改进的载体系统还描述于WO 02/00900。
在优选的实施方案中,用于本发明实践的农杆菌菌株包括章鱼碱菌株如LBA4404或农杆碱菌株如EHA101或EHA105。用于DNA转移的合适的根癌农杆菌菌株为例如EHA101pEHA101(Hood 1986)、EHA105[pEHA105](Li 1992)、LBA4404[pAL4404](Hoekema 1983)、C58C1[pMP90](Koncz 1986)和C58C1[pGV2260](Deblaere 1985)。其他合适的菌株为胭脂碱菌株根癌农杆菌C58。其他合适的菌株为根癌农杆菌C58C1(Van Laerebeke 1974)、A136(Watson等1975)或LBA4011(Klapwijk 1980)。在优选的实施方案中,用于转化与植物酚化合物预培养的植物组织的农杆菌菌株含有L,L-琥珀碱(succinamopine)型Ti质粒,优选卸甲质粒如pEHA101。在另一优选的实施方案中,用于转化与植物酚化合物预培养的植物组织的农杆菌菌株含有章鱼碱型Ti质粒,优选卸甲质粒如pAL4404。通常在使用章鱼碱型Ti质粒或辅助质粒时,优选缺失或失活virF基因。在优选的实施方案中,农杆菌菌株用于转化与植物酚化合物如乙酰丁香酮预培养的植物组织。本发明的方法还可以与特定的农杆菌菌株组合使用以进一步提高转化效率,例如由于存在突变或嵌合virA或virG基因而改变了vir基因的表达和/或其诱导的农杆菌菌株(如Hansen 1994;Chen 1991;Scheeren-Groot 1994)。
可以通过普通DNA重组技术修饰双元载体或任何其他载体,将其在大肠杆菌中增殖,并通过电穿孔或其他转化技术引入农杆菌(Mozo 1990)。按本领域所述培养和使用农杆菌。例如,可以在补充了适当抗生素(如50mg/L大观霉素)的YP培养基(5g/L酵母提取物、10g/L蛋白胨、5g/L Nail、15g/L琼脂,pH6.8)上将包含载体的农杆菌菌株培养3天。用接菌环从固体培养基上收集细菌并重悬。就本发明而言,通过如实施例中所述插入位点特异性重组位点来提供与农杆菌相容的载体。
构建载体之后,可以在宿主细胞中增殖载体以合成用于产生核酸聚合物的核酸分子。载体(常称为“穿梭载体”)能在至少两种无关表达系统中复制。为促进这种复制,载体应该包含至少两个复制起点,每个起点在一种复制系统中有效。穿梭载体一般能在真核系统和原核系统中复制。这使得可以在真核宿主(“表达细胞类型”)中检测蛋白质表达,并在原核宿主(“扩增细胞类型”)中扩增载体。作为示例,一个复制起点可以来自SV40,而另一个复制起点可以来自pBR322。本领域技术人员了解多种合适的复制起点。
构建载体之后,一般在宿主细胞中增殖载体。便利地在原核宿主细胞如大肠杆菌或枯草芽孢杆菌中进行载体增殖。合适的大肠杆菌菌株包括BL21(DE3)、BL21(DE3)pLysS、BL21(DE3)pLysE、DB2、DB3.1、DH1、DH4I、DH5、DH5I、DH5IF、DH5IMCR、DH10B、DH10B/p3、DH11S、C600、HB101、JM101、JM105、JM109、JM110、K38、RR1、Y1088、Y1089、CSH18、ER1451和ER1647(参阅如Brown编辑,Molecular BiologyLabfax(Academic Press 1991))。合适的枯草芽孢杆菌菌株包括BR151、YB886、MI119、MI120和B170(参阅如Hardy 1985)。在原核宿主中增殖载体的标准技术为本领域技术人员所熟知(参阅如Ausubel 1995;Wu1997)。
3.将作为转录终止子评估的序列
将使用本发明方法评估其作为转录终止子序列的效率的序列可以来自多种来源。在本发明的一个实施方案中,可以评估相信发挥转录终止子功能的序列的效率。这些序列可以来自如基因编码序列的下游区(如包含编码3’非翻译区的区域和其他下游基因组序列),优选来自mRNA转录物末端周围的区域。多种这样的序列可以来自基因组和cDNA文库的比较。可以通过如从相应的宿主生物分离(通过本领域技术人员已知的多种克隆方法,如通过使用适当引物寡核苷酸的聚合酶链式反应)或直接通过DNA合成获得待插入筛选载体或筛选构建体的插入位点的相应核酸序列。
在优选的实施方案中,待插入以进行评估的DNA分子为双链线性DNA分子。所述分子的末端可以是平末端(即没有5’和/或3’突出端)或“粘”末端(即具有5’和/或3’突出端)。优选地,DNA分子末端可以带有突出端,所述突出端允许插入限制性内切核酸酶切割位点,以便于插入到插入位点。DNA分子的长度和分子量可以不同。在优选的实施方案中,分子大小从约50到约5000个碱基对,优选从约60到约2000个碱基对,更优选从约70到约1000个碱基对,最优选从约80到约500个碱基对。
除了教导的这种方法(基于可以推测具有一定转录终止效率的序列)以外,在本发明的另一个优选的实施方案中,筛选DNA序列的文库以获得有效的转录终止序列。此实施方案不需要任何先前的序列信息,优选仅基于有效转录终止的表型(在实践中难于与序列信息关联)。使用的DNA序列文库可以是合成文库或天然存在的DNA分子的文库或合成和天然存在的DNA分子的混合物。优选地,DNA分子文库是天然存在分子的文库,它可来自一种或多种生物的基因组DNA和/或cDNA。更优选地,文库来自生物(优选植物)的基因组DNA。
在优选的实施方案中,DNA文库的DNA分子是双链线性DNA分子。所述分子的末端可以是平末端(即没有5’和/或3’突出端)或“粘”末端(即具有5’和/或3’突出端)。文库的DNA分子的长度和分子量可以不同。在优选的实施方案中,分子大小从约50到约5000个碱基对,优选从约60到约2000个碱基对,更优选从约70到约1000个碱基对,最优选从约80到约500个碱基对。
可以通过本领域技术人员已知的多种方法从基因组和/或cDNA产生DNA分子的文库。例如,可以通过用内切核酸酶完全或部分消化来随机剪切DNA而产生文库。优选地,文库来自使用限制性内切核酸酶的完全消化,所述内切核酸酶优选具有4碱基识别位点(如Sau3A)。断裂(如通过限制性消化)后,可以通过如本领域已知的如分子量排阻层析(使用如SuperoseTM柱,Amersham Bioscience,Inc.的大小排阻层析)或凝胶电泳分离(如上文确定的)优选分子量的DNA分子(实例见Ellegren 1989)。
在本发明另一优选的实施方案中,可以对选择的序列评估其作为转录终止子序列的性能。这些序列可以是例如基因编码序列下游的区域(如包括编码3’非翻译区的区域和其他下游基因组序列的区域),优选来自mRNA转录物末端周围的区域。可以通过在计算机芯片上(in silico)检索基因组数据库(如拟南芥或稻)来产生这些序列。
在一个优选的实施方案中,对部分(或优选全部)植物基因组(如稻或拟南芥基因组)筛选可能的来自植物的终止子候选者。使用以下标准鉴定并确定可以在本发明方法中进一步分析的转录终止子序列候选者:
1.鉴定和/或分离配对基因之间符合预定义基因间距离标准的基因间区。这些基因可以优选具有头对尾的取向(即转录以同一方向进行),或优选地尾对尾取向(即彼此方向相反)。在头对尾的情况下,本文使用的术语“基因间区”指“尾”序列的终止密码子和“头”序列的起始密码子或(如果已知)“头”序列的启动子区起始之间的序列(但不排他)。在尾对尾取向中,本文使用的术语“基因间区”指两个编码序列的终止密码子之间的序列(但不排他)。优选地,来自尾对尾取向的配对基因的基因间区优选鉴定的长度为从约400到3000个碱基对、优选从约700到约2000个碱基对。可以通过多种方法进行鉴定,包括全基因组测序(如对于先前未知的序列)或在计算机芯片上筛选已知的序列(如拟南芥或稻基因组)。为此目的可以使用已有的数据库,如来自The Institute of Genome Research(TIGR;PUB_tigr_rice_genome_v4.nt (v03212003),PUB_tigr_rice_cds_Oct022003.nt,pubOSest0603(ncbi))的最新的数据。
2.鉴定和/或分离两侧均为高表达水平基因的基因间序列。在此上下文中使用的术语“高表达”或“高表达水平”指为同一mRNA来源(即细胞或组织)中肌动蛋白表达水平的至少5%,优选至少10%,更优选至少30%,更优选至少50%的表达水平。可以通过多种方法判断表达,所述方法包括但不仅限于非标准化EST文库中的EST数、RNA印迹分析、RT-PCR等。一个或两个基因的低表达已被鉴定为通过连读转录实现的基因沉默的指示物。可以通过实验(如体外或体内的,如使用通过芯片或微阵列技术产生的表达概况分析)或优选在计算机芯片上通过简单的计数非标准化EST/cDNA文库中每个基因的EST数来描述表达水平,所述EST数可以代表表达水平。
3.鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列两侧均为基因,其表达图式优选独立于另一配对基因的表达图式。在此上下文中,术语“独立表达图式”指例如在其组织和/或发育调节中第一个基因的表达与第二个基因的表达不同。配对基因的表达图式的独立性和相关性已被鉴定为连读转录的指示物。可以通过比较所述配对基因在多种器官或组织中的表达水平而实验地(如体外或体内的,如通过芯片技术的表达概况分析)或优选在计算机芯片上通过简单的计数非标准化EST/cDNA文库中每个基因的EST数来分析表达概况,所述EST数可以代表表达水平。
4.鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列的一侧(或优选两侧)为来自所述配对基因的mRNA转录物的长度具有低变异性的基因。通过如EST、cDNA文库或数据库中多于一个转录物末端的存在来指示这种变异性。转录物长度的变异性已被鉴定为转录终止中低严格度的指示。可以通过实验(如通过RT PCR)或优选地在计算机芯片上通过简单分析数据库中EST或cDNA克隆的3’末端来分析转录物长度的变异性。
尽管基因间定位(步骤1)是前提,但在本发明优选的实施方案中,某基因间序列的标准2、3、4和基因间序列的长度(标准1的一部分)都得到标准评分。将所述分数相加(分数可以乘以某些反映标准的不同影响的权重指标)得到最终分数,其指示该序列作为转录终止子和隔离子(isolator)的潜力(见下文)。可以通过在一个或多个本发明的筛选系统中评估所述基因间区的序列来证实这种分数和潜力。最高的权重给予标准2(高表达概况),其后是标准1(独立表达概况)和标准3(转录物长度的低变异性)。下文指出了优选的基因间区长度,但看起来对操作(即其后的克隆和转化步骤)的影响大于对所述区域功能性的影响。
由此鉴定的基因间区不仅适用于单基因表达盒,而且尤其适用于多基因表达盒,所述多基因表达盒不仅在一个序列中提供两个基因的转录终止,而且允许通过使其连读转录干扰最小化而有效“分离”所述两个表达盒(从而提供“隔离子”),所述干扰已被证明是多基因表达盒构建体中特别严重的问题。涉及序列(优选位于两个表达盒之间)时,本文使用的术语“隔离子”旨在指所述序列使一个表达盒对从另一表达盒转录的影响最小化或防止该影响,从而使两个表达盒彼此隔离的能力。下文实施例1.2给出了实施此方法以提供基因间序列的优选实施方案和其他信息。
因此,本发明的另一实施方案涉及用于鉴定和/分离基因间区(优选具有高转录终止和/或隔离子潜力)的方法,所述方法包括以下选择标准的至少一种,优选至少两种,更优选至少三种,最优选全部:
1.鉴定和/或分离配对序列间符合预定义基因间距离标准的基因间区。
2.鉴定和/或分离两侧均为高表达水平基因的基因间序列。
3.鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列两侧均为表达图式优选独立于另一配对基因表达图式的基因。
4.鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列的一侧(或优选两侧)为来自所述配对基因的mRNA转录物的长度具有低变异性的基因。
基因间区侧翼的配对基因优选具有尾对尾取向。优选地,来自尾对尾取向的配对基因的基因间区鉴定为长度从约400到3000个碱基对、优选从约700到约2000个碱基对。
因此,本发明优选的实施方案涉及鉴定和/或分离具有转录终止潜力的基因间区的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a)鉴定和/或分离配对基因间具有约400到3000个碱基对的基因间距离的基因间区,和
b)鉴定和/或分离两侧均为具有高表达水平基因的基因间序列。更优选地,所述方法包括以下步骤:
c)鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列两侧均为表达图式优选独立于另一配对基因表达图式的基因,和
d)鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列的一侧(或优选两侧)为来自所述配对基因的mRNA转录物的长度具有低变异性的基因。
基因间序列最优选地
a)位于尾对尾定位(即所述基因的表达方向彼此相反)的基因之间和/或
b)从侧翼基因各自的终止密码子起测量的长度为约700到约2000个碱基对。
基于所述方法鉴定了来自稻基因组的序列,并发现其有希望作为转录终止子序列。所述序列描述于SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108。
本发明的另一实施方案涉及所述序列在转基因表达构建体中用于终止转录的用途。更优选所述序列作为多基因表达构建体中隔离子的用途。
本发明的另一实施方案涉及转基因表达构建体,所述表达构建体在5’-3’方向上包含
a)在植物中具有功能的启动子序列,和
b)与所述启动子a)有效连接的待表达的目的核酸序列,和
c)选自以下的至少一个序列:
i)SEQ IDNO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、 28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108描述的序列,和
ii)与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列具有至少60%、优选80%、更优选90%、最优选95%同源性的序列,所述序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iii)在低严格条件下、优选在高严格条件下与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列杂交的序列,所述序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iv)i)、ii)和iii)中所述序列的至少50个连续碱基对、优选至少100个连续碱基对、更优选至少250个连续碱基对、最优选至少500个连续碱基对的片段,
其中所述序列c)与所述启动子a)和/或所述目的核酸b)异源,并介导从所述启动子a)的表达的终止。
本发明的另一实施方案涉及包含至少两个表达盒的转基因表达构建体,所述表达盒具有在5’-3’方向上包含如下的结构:
a1)在植物中具有功能的第一个启动子序列,和
b1)与所述启动子a1)有效连接的待表达的第一个目的核酸序列,和
c)选自以下组成的组的至少一个序列:
i)SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108描述的序列,和
ii)与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列具有至少60%、优选80%、更优选90%、最优选95%同源性的序列,所述序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iii)在低严格条件下、优选在高严格条件下与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列杂交的序列,所述序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iv)i)、ii)和iii)中所述序列的至少50个连续碱基对、优选至少100个连续碱基对、更优选至少250个连续碱基对、最优选至少500个连续碱基对的片段,
和
b2)待表达的第二个目的核酸序列,和
a2)在植物中具有功能的第二个启动子序列,其与所述目的核酸序列b2)有效连接,
其中所述序列c)与选自启动子a1)、启动子a2)、目的核酸b1)和目的核酸b2)的至少一种元件异源,并介导从所述启动子a1)和a2)的表达的终止。
由于上述转录终止子序列不引起蛋白质表达,因此可以接受较高程度的变异性而不改变功能性。
本发明的方法还可用于鉴定较大的序列中负责转录终止的区域。这使得可以缺失不必要的序列和提供用于转录终止的小序列,这是基因表达载体的构建中的重要目标。导致大载体的大序列与无效转化和构建体的不稳定性相关。优选地,此类鉴定可以通过向筛选载体或者筛选构建体插入较大序列的片段来实现。可以通过如核酸酶介导的较大序列5’和/或3’末端截短(通过限制酶或非特异性核酸酶如Ba/31)产生这些片段。相应的方法为本领域技术人员所熟知。
可以寻求鉴定转录终止必要区域的较大序列可以是例如基因编码序列的天然下游区,它是转基因构建体中使用的启动子的来源(如包含编码3’非翻译区的区域和其他下游基因组序列的区域),优选来自mRNA转录物周围的区域。将启动子与其天然转录终止子(以及它们之间的目的异源序列)组合以获得最佳表达结果是有利的。从前必须使用非常长的3’非翻译区以保证有效的转录终止,或者必须对缩短的序列进行繁重的测试,然而本发明的方法允许快速有效地将潜在的转录终止子限制到其必需元件。
4.将DNA分子插入筛选载体
可以通过多种方法将待评估其转录终止效率的DNA分子插入筛选载体。优选通过一种或多种选自以下的方法实现插入:
a)插入到限制性位点:本领域技术人员了解可用于实施本发明方法的多种序列特异性内切核酸酶。合适的内切核酸酶可以是例如II型限制性内切核酸酶或人工(如嵌合)核酸酶。优选以所述内切核酸酶仅切割插入位点的方式选择的限制性内切核酸酶。这些限制性内切核酸酶可以优选包括具有至少8个碱基对的识别位点的稀有切割内切核酸酶(如NotI)或者甚至是具有非常长的识别序列的回归内切核酸酶(Belfort 1997;Jasin 1996;Internet:http://rebase.neb.com/rebase/re-base.homing.html;Roberts2001)。优选的回归内切核酸酶的实例包括但不仅限于F-SceI、I-CeuI、I-ChuI、I-DmoI、I-CpaI、I-CpaII、I-CreI、I-CsmI、F-TevI、F-TevII、I-TevI、I-TevII、I-AniI、I-CvuI、I-LlaI、I-NanI、I-MsoI、I-NitI、I-NjaI、I-PakI、I-PorI、I-PpoI、I-ScaI、I-Ssp6803I、PI-PkoI、PI-PkoII、PI-PspI、PI-TfuI、PI-TliI。最优选I-CeuI、I-SceI、I-PpoI、PI-PspI和PI-SceI。
b)插入到重组位点:在本发明优选的实施方案中,通过使用重组蛋白实现将DNA区段插入筛选构建体或筛选载体的插入位点,所述重组蛋白包括重组酶和相关辅因子和蛋白质。基于本文提供的教导和指导,还可以使用来自多种生物的多种重组系统。参阅如Hoess 1986;Abremski 1986;Campbell,1992;Qian 1992;Araki 1992。它们中的许多都属于重组酶的整合酶家族(Argos 1986)。它们中研究最充分的可能是来自λ噬菌体的整合酶/att系统(Landy 1993)、来自噬菌体P1的Cre/loxP系统(Hoess 1990)和来自酿酒酵母2μ环状质粒的FLP/FRT系统(Braoch 1982)。用于重组酶介导的克隆的详细方法、(用作插入位点的)合适的重组位点和相应的重组酶描述于例如整体引入本文作为参考的US 5,888,732。优选的系统为GatewayTM克隆系统(Invitrogen,Inc.)。相应的即用型λ整合酶及其相应辅因子的混合物可得自Invitrogen Inc.(GatewayTM LR ClonaseTM Plus酶)。
还可以使用包括两种方法的组合的方法。然而,将待评估的序列直接插入(即在一步克隆程序中)几乎已完成的筛选构建体或筛选载体中并不是必须的。例如,可以先将它与附加序列连接,然后插入适当的构建体或载体中,从而构成评估方法中使用的最终筛选构建体或筛选载体。原则上,装配筛选构建体或筛选载体多个部分的方法和可能性不计其数,但它们是本领域技术人员所熟知和确定的。
就插入到插入位点而言,待插入的DNA序列可以与接头连接,所述接头提供分别用于限制性内切核酸酶或重组酶的适当识别序列。然而,对于限制性内切核酸酶的情况,在使用基因组消化物作为DNA序列文库的情况下不需要接头。这时用于消化的限制性酶应该产生与切割的插入位点相容的DNA末端。
5.体外筛选系统
以体外筛选系统进行时,可以例如使用识别单链核苷酸的灵敏荧光探针便利地在RNA水平检测附加序列(优选位于插入位点下游(即3’方向))的表达。这些特征也应理解为易于检测的特征。在将有效的转录终止子序列插入这些序列之前的情况下,将获得降低的、优选不显著或完全无法观察到的信号。
在体外筛选系统中,可以使用市售的体外转录系统(如小麦胚核提取物、HeLa核提取物、兔网织红细胞提取物或来自目的植物的核提取物)在RNA水平检测位于插入位点中插入的转录终止序列下游序列的转录,所述体外转录系统优选与单链识别荧光探针(如信标探针)组合。多种合适的体外转录/翻译系统是本领域已知并市售的(如ActiveProTM、PROTEINscriptTM II、Retic Lysate IVTTM(经处理)和Retic LysateIVTTM-96、Wheat Germ IVTTM,均可得自Ambion,Inc.,Austin,USA)。在这种情况下不涉及植物转化。因此,可以在简单基础上(如基于pUC)构建筛选构建体或筛选载体。优选地,将包含不同转录终止序列的筛选构建体或筛选载体置于96孔平板中用于体外转录。荧光探针在发生连读时杂交。发生的转录终止越严紧,在连读区中检测到的荧光产物越少。可以通过位于转录终止序列上游但仍受启动子控制的序列的表达使连读产物的量归一化。
6.体内筛选系统
在优选的实施方案中,本发明的方法在体内实现,优选在寻求有效转录终止子的靶生物中实现。体内筛选系统允许平行地对多个DNA序列评估其作为转录终止序列的性能。因此,可以使用DNA序列文库,并插入筛选构建体或筛选载体中以得到包含多种不同DNA序列的筛选构建体或筛选载体的文库。以使每个细胞或生物优选仅包含所述文库的一种筛选构建体或筛选载体(包含待评估转录终止能力的一种特定DNA序列)的方式将所述筛选构建体或筛选载体文库插入细胞或生物。因此,如下文更详细描述的,此优选实施方案不需要在评估转录终止能力之前分选多种筛选构建体或筛选载体,这使得该方法更为高效。因此,在优选的实施方案中,本发明的方法涉及鉴定和分离转录终止序列的方法,所述方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点可改变所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导来自从启动子序列表达的细胞或生物,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征来细胞或生物,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并(任选的)测定其序列。
所有上文指出的优选变通方案(如变通方案A、B或C)还可以有利地与所述体内系统组合。在本发明的体内筛选系统中,位于插入位点下游(在3’末端)的序列的表达优选引起易于检测的表型。“引起”包括启动或抑制易于检测的表型。例如,位于插入位点下游(在3’末端)的序列可以编码引起表型的蛋白质,或者它可以编码引起所述引起表型的蛋白质表达的抑制的RNA(如反义或双链RNA)。上文给出了多个实例。
在本发明体内筛选系统的优选实施方案中,位于插入位点下游(在3’末端)的序列的表达将引起抑制所述细胞或生物(如植物细胞或植物)的生长、繁殖和/或再生的表型,因此在本发明上下文中应理解为对所述细胞和/或生物(如植物细胞或植物)具有“毒性”。因此,只有将严紧转录终止序列插入所述引起毒性表型的序列之前,从而阻止这种生长、繁殖和/或再生的抑制性序列的表达时,细胞(或生物)才能生存。可以分离存活的细胞,可以通过如使用PCR扩增并接着测序来鉴定和分离该转录终止子序列。
为进行体内系统中的筛选,优选将筛选构建体或筛选载体转化进细胞、组织或生物中。转化生物或转化细胞的产生需要将目的DNA引入目的宿主细胞。多种方法可用于称为转化的这一操作(还可参阅Keown 1990)。例如,可以通过显微注射或通过用DNA包被的微粒轰击直接引入DNA。还可以化学透化细胞(例如使用聚乙二醇),以使DNA能够通过扩散进入细胞。还可以通过与其他含有DNA的单位如小细胞、细胞、溶酶体或脂质体进行原生质体融合而引入DNA。引入DNA的另一种合适方法为电穿孔,其中通过电脉冲使细胞可逆透化。
宿主细胞或生物可以是任何原核或真核生物。优选上文定义的哺乳动物细胞、非人哺乳动物生物、植物细胞和植物生物。优选将本发明的筛选构建体或筛选载体引入真核细胞。可以优选插入基因组(如质体或染色体DNA),但也可以在染色体外或表染色体(epichromosomal)存在。优选的真核细胞为哺乳动物细胞、真菌细胞、植物细胞、昆虫细胞、鸟类细胞等。合适的哺乳动物宿主细胞实例包括非洲绿猴肾细胞(Vero;ATCC CRL1587)、人胚肾细胞(293-HEK;ATCC CRL 1573)、幼仓鼠肾细胞(BHK-21,BHK-570,ATCC CRL 8544,ATCC CRL 10314)、犬肾细胞(MDCK;ATCC CCL 34)、中国仓鼠卵巢细胞(CHO-K1;ATCC CCL61;CHODG44(Chasin 1986))、大鼠垂体细胞(GH1;ATCC CCL82)、HeLa S3细胞(ATCC CCL2.2)、大鼠肝细胞瘤细胞(H-4-II-E;ATCC CRL 1548)、SV40转化的猴肾细胞(COS-1;ATCC CRL 1650)和小鼠胚细胞(NIH-3T3;ATCC CRL 1658)。
可以使用多种标准技术将筛选构建体或筛选载体引入宿主细胞,所述技术包括磷酸钙转染、脂质体介导的转染、微粒介导的递送、电穿孔等。可以选择并繁殖转染细胞,以提供包含稳定整合进宿主细胞基因组的目的基因的重组宿主细胞。
筛选载体可以是用于杆状病毒系统的杆状病毒表达载体。杆状病毒系统提供了将目的克隆基因引入昆虫细胞的有效手段。合适的表达载体基于苜蓿银纹夜蛾(Autographa californica)核型多角体病毒(AcMNPV),含有熟知的启动子如果蝇热休克蛋白(hsp)70启动子、苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒立即早期基因启动子(ie-1)和延迟早期39K启动子、杆状病毒p10启动子和果蝇金属硫蛋白启动子。产生重组杆状病毒的第二种方法利用基于转座子的系统(Luckow 1993)。以BAC-to-BAC试剂盒(Life Technologies,Rockville,Md.)销售利用转移载体的这种系统。这种系统利用含有Tn7转座子的转移载体PFASTBAC(Life Technologies),Tn7转座子将编码目的多肽的DNA转移进杆状病毒基因组,其以称为“杆粒”(bacmid)的大质粒维持于大肠杆菌中(参阅Hill-Perkins 1990;Bonning 1994和Chazenbalk1995)。此外,转移载体可以包括与编码在所表达的多肽的C或N端的表位标签(例如Glu-Glu表位标签)的DNA的框内融合(Grussenmeyer 1985)。使用本领域已知的计数将含有目的基因的转移载体转化进大肠杆菌,并筛选含有指示重组杆状病毒的破坏的lacZ基因的杆粒。接着使用常规技术分离含有重组杆状病毒基因组的杆粒DNA。将重组病毒或杆粒用于转染宿主细胞。合适的昆虫宿主细胞包括来自草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)蛹卵巢细胞系IPLB-Sf-21的细胞系,如Sf9(ATCC CRL 1711)、Sf21AE和Sf21(Invitrogen Corporation;San Diego,Calif.)以及Drosophila Schneider-2细胞和来自粉纹夜蛾(Trichoplusia ni)的HIGH FIVE TM细胞系(Invitrogen)(US 5,300,435)。可以使用市售的无血清培养基生长和维持细胞。合适的培养基为用于Sf9细胞的Sf900 IITM (Life Technologies)或ESF921TM(Expression Systems)和用于粉纹夜蛾细胞的Ex-cellO405TM (JRHBiosciences,Lenexa,Kans.)或Express FiveTM(Life Technologies)。使用重组病毒时,通常将细胞由约2-5×105个细胞的接种密度培养至1-2×106个细胞,这时以0.1至10(更一般的接近3)的感染复数加入重组病毒原种。Bailey1991、Patel 1995、Ausubel 1995(16-37至16-57页)、Richardson 1995和Lucknow,1996提供了用于杆状病毒系统的已建立技术。
也可以使用真菌细胞包括酵母细胞作为用本发明筛选构建体或筛选载体转化的宿主细胞。就此而言,特别重要的酵母种包括酿酒酵母、巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)和甲醇毕赤酵母(Pichia methanolica)。用于在酵母中表达的合适的启动子包括来自GAL1(半乳糖)、PGK(磷酸甘油激酶)、ADH(醇脱氢酶)、AOX1(醇氧化酶)、HIS4(组氨醇脱氢酶)的启动子等。已经设计了许多酵母克隆载体,并可以便利地使用。这些载体包括基于Ylp的载体如Ylp5、YRp载体如YRp17、YEp载体如YEp13和YCp载体如YCp19。用外源DNA转化酿酒酵母并由此产生重组多肽的方法公开于例如US 4,599,311、US 4,931,373、US 4,870,008、US 5,037,743和US 4,845,075。通过由选择标记确定的表型、通常的药物抗性或在缺乏特定营养物(如亮氨酸)的情况下生长的能力选择转化的细胞。用于酿酒酵母的示例性载体系统为POTI载体系统((US 4,931,373),它允许通过在含有葡萄糖的培养基上生长来选择转化的细胞。用于酵母的其他合适的启动子和终止子包括来自糖酵解酶基因(参阅如US 4,599,311、US 4,615,974和US 4,977,092)和醇脱氢酶基因的那些。还可参阅US 4,990,446、5,063,154、5,139,936和4,661,454。
用于其他酵母的转化系统为本领域所已知,所述酵母包括多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)、脆壁克鲁维酵母(Kluyveromycesfragilis)、玉蜀黍黑粉菌(Ustilago maydis)、巴斯德毕赤酵母、甲醇毕赤酵母、季也蒙毕赤酵母(Pichia guillermondii)和麦芽糖假丝酵母(Candidamaltosa)。参阅如Gleeson 1986和US 4,882,279。可以按照McKnight等(US4,935,349)的方法利用曲霉细胞。已经公开了用于转化产黄头孢(Acremonium chrysogenum)的方法(US 5,162,228)。已经公开了用于转化链孢霉的方法(US 4,486,533)。
例如,公开了甲醇毕赤酵母作为产生重组蛋白的宿主的用途(US5,716,808、US 5,736,383、Raymond 1998、WO 97/17450、WO 97/17451、WO 98/02536和WO 98/02565)。用于转化甲烷毕赤酵母的DNA分子一般制备为双链环状质粒,其优选在转化前线性化。对于甲烷毕赤酵母中的多肽产生,质粒中的启动子和终止子可以是甲烷毕赤酵母基因(如甲烷毕赤酵母醇利用基因(AUG1或AUG2))的启动子和终止子。其他有用的启动子包括二羟基丙酮合酶(DHAS)、甲酸脱氢酶(FMD)和过氧化氢酶(CAT)基因。为了促进DNA整合进宿主染色体,优选质粒的完整表达区段两侧均为宿主DNA序列。对于需要使甲醇的使用最小化的大规模工业方法,可以使用缺失两种甲醇利用基因(AUG1和AUG2)的宿主细胞。为了产生分泌的蛋白,可以使用液泡蛋白酶基因(PEP4和PRB1)缺陷型宿主细胞。使用电穿孔以便于含有编码目的多肽的DNA的质粒整合进甲烷毕赤酵母细胞。可以通过电穿孔转化甲烷毕赤酵母细胞,其中使用指数衰减,脉冲电场的场强从2.5至4.5kVcm,优选约3.75kV/cm,时间常数(t)从1至40毫秒,最优选约20毫秒。
用于将核酸分子引入细菌、酵母、昆虫、哺乳动物和植物细胞的标准方法由例如Ausubel(1995)提供。用于表达和回收通过哺乳动物细胞系统产生的外源蛋白质的一般方法由例如Etcheverry 1996提供。已经描述了从杆状病毒系统分离重组蛋白的确定方法(Richardson 1995)。
特别优选将筛选构建体或筛选载体转移进植物细胞、组织和/或生物。将转基因表达构建体或载体引入植物组织的方法可包括但不仅限于例如电注射(electroinjection)(Nan 1995;Griesbach 1992)、与脂质体、溶酶体、细胞、小细胞或其他可融合的脂质表面体融合(Fraley 1982);聚乙二醇(Krens1982)、提高游离DNA摄入的化学品、使用病毒转化等。此外,使用基因枪的生物射弹法、电穿孔、在含DNA的溶液中温育干胚和显微注射也可以使用。
可以使用基于原生质体的方法(例如用于稻),其中通过脂质体、PEG或电穿孔将DNA递送至原生质体(Shimamoto 1989;Datta 1990b)。通过电穿孔转化涉及应用短的高压电场在细胞膜中产生“孔”,DNA通过所述孔摄入。这些方法可用于例如产生稳定转化的单子叶植物(Paszkowski 1984;Shillito 1985;Fromm 1986),特别是稻(Shimamoto 1989;Datta 1990b;Hayakawa 1992)。
粒子轰击或“生物射弹”是广泛使用的植物(特别是单子叶植物)转化方法。在“生物射弹”(微粒介导的DNA递送)方法中,用DNA包裹微粒粒子,并通过机械装置加速至高至足以穿透植物细胞壁和核的速度(WO91/02071)。外源DNA整合进宿主DNA,产生转化的细胞。“生物射弹”方法有许多变化(Sanford 1990;Fromm 1990;Christou 1988;Sautter 1991)。该方法已被用于产生稳定转化的单子叶植物,包括稻、玉米、小麦、大麦和燕麦(Christou 1991;Gordon-Kamm 1990;Vasil 1992;Wan 1994)。
除了这些“直接”转化技术以外,还可以通过根癌农杆菌或发根农杆菌通过细菌感染进行转化。这些菌株含有在农杆菌感染后转移至植物的质粒(Ti或Ri质粒)。称为T-DNA(转移DNA)的质粒部分整合进植物细胞的基因组(载体的描述见上文)。为将DNA转移进植物细胞,将植物外植体与转基因根癌农杆菌或发根农杆菌共培养。可以使用适当的培养基从感染的植物材料(如叶、根或茎节段,还包括原生质体或植物细胞悬液)开始,再生完整植物,所述培养基可以含有如用于选择转化的细胞的抗生素或杀生物剂。接着可以对获得的植物筛选引入的DNA的存在,在这种情况下所述DNA为本发明的表达构建体。一旦DNA整合进宿主基因组,所述基因型一般是稳定的,并且所述插入也可见于后代。整合的表达构建体一般含有选择标记,其将对杀生物剂(如除草剂)或抗生素(如卡那霉素、G418、博来霉素、潮霉素或膦丝菌素)的抗性传递给植物。选择标记使得可以从未转化细胞中选择转化细胞(McCormick 1986)。可以以惯常的方式培养和杂交得到的植物。应该培养两个或更多世代以确保基因组整合是稳定并且遗传的。相关领域中已经详细描述了上述方法(例如Jenes 1993和Potrykus 1991)。
本领域技术人员了解,可以通过本领域已知的多种方法增强农杆菌转化的效率。例如,在农杆菌培养物中包括天然损伤应答分子如乙酰丁香酮(AS)已经表明可提高根癌农杆菌的转化效率(Shahla 1987)。或者,可以通过损伤待转化的靶组织来提高转化效率。可以通过如冲击、浸软、用微粒轰击等实现对植物组织的损伤(参阅如Bidney 1992)。
已经报道了多种用于植物(特别是单子叶植物)转化的其他方法,包括如“花粉管法”(WO 93/18168;Luo 1988)、将DNA大量注射进花分蘖中(Du1989;de Ia Pena 1987)、将农杆菌注射进发育的颖果(WO 00/63398)和种子在DNA溶液中的组织温育(Topfer 1989)。在胚胎发生开始时将外源DNA直接注射进受精植物胚珠公开于WO 94/00583。WO 97/48814公开了产生稳定转化的能育小麦的方法和通过农杆菌转化小麦的系统,它基于新鲜分离或预培养的未成熟胚、胚胎发生愈伤组织和悬浮细胞。
可能需要将目的核酸序列靶向植物基因组的特定基因座。可以通过如使用农杆菌来源的序列的同源重组实现目的核酸序列在植物细胞基因组中的定点整合。一般的,将植物细胞与含有寻靶载体的农杆菌菌株温育,在所述载体中,与靶基因座内DNA序列同源的序列侧翼为农杆菌转移DNA(T-DNA)序列,如上文所述(US 5,501,967,其完整内容引入本文作为参考)。本领域技术人员了解,可以使用寻靶载体实现同源重组,所述寻靶载体含有与靶定的植物基因的任何部分同源的序列,所述部分属于基因的调节元件或基因的编码区。可以在植物基因的任何区域实现同源重组,只要待靶定的位点侧翼区的核酸序列是已知的。
需要同源重组时,使用的寻靶载体可以是取代型或插入型(US5,501,967)。取代型载体一般含有与靶基因组序列同源并位于异源核酸序列(如选择标记基因序列)侧翼的两个区域。取代型载体导致插入选择标记基因,从而破坏靶基因。插入型载体含有与靶基因同源的单个区域,导致将完整的寻靶载体插入靶基因。
如果选择标记是引入的DNA的一部分,则可以从未转化细胞中选择转化细胞,即含有整合进宿主细胞DNA的引入的DNA的细胞。
可以在用于随机整合和定点整合的构建体中使用正选择标记基因。正选择标记基因包括抗生素抗性基因和除草剂抗性基因等。表达这些标记基因的转化细胞能在杀死未转化野生型的所述抗生素或除草剂浓度存在下存活。实例为传递对除草剂膦丝菌素(双丙氨磷;Vasil 1992;Weeks 1993;Rathore 1993)的抗性的bar基因、传递对卡那霉素的抗性的nptII基因、传递对潮霉素的抗性的hpt基因或传递对除草剂草甘膦、遗传霉素(G-418)(氨基葡糖苷)(Nehra 1994)、草甘膦(Della-Cioppa等1987)的抗性的EPSP基因和ALS基因(chlorsulphuron抗性)。上文公开了其他优选的选择和筛选标记基因。
构建体中还可以包括负选择标记基因。在用于同源重组的构建体中优选使用与正选择标记基因组合的一个或多个负选择标记基因。负选择标记一般置于同源重组事件相关区域以外。负选择标记基因对以可表达方式将这些基因整合进其基因组的细胞提供劣势(优选致死性)。由于存在负选择标记基因,在基因组中随机整合了用于同源重组的寻靶载体的细胞将受到损坏或被杀死。在构建体中包括正选择标记的情况下,只有在基因组中整合了正选择标记的细胞可以存活。负选择标记基因的选择对本发明而言不是关键的,只要其在转化植物细胞中编码功能性多肽即可。负选择标记基因可以选自例如来自农杆菌Ti质粒的aux-2基因、来自SV40的tk基因、来自浅灰链霉菌的细胞色素P450、来自玉米或拟南芥的Adh基因等。可以使用编码能够将对植物细胞无害的物质转化成对植物细胞有害的物质的酶的任何基因。上文公开了其他优选的负选择标记。
然而,还可以通过本领域已知的多种(不基于选择标记的)其他方法证明和分析表达盒或载体在染色体DNA中的插入,所述方法包括但不仅限于基因组DNA的限制性作图、PCR分析、DNA-DNA杂交、DNA-RNA杂交、DNA序列分析等。更具体地,这些方法可包括如PCR分析、DNA印迹分析、荧光原位杂交(FISH)和原位PCR。
一旦产生了转化的植物细胞,就可以使用本领域技术人员已知的方法获得完整植物。因此,本发明提供转基因植物。本发明的转基因植物不仅限于其中每个细胞都表达本文提供的启动子序列控制下的目的核酸序列的植物。本发明的范围内还包括含有至少一个表达目的核酸序列的细胞的任何植物(如嵌合植物)。转基因植物优选(但不必须)在多于一个细胞中、更优选在一种或多种组织中包含目的核酸序列。
得到含有表达载体的转基因植物组织之后,可以使用本领域已知的方法从此转基因植物组织再生转基因植物。本文使用的术语“再生”指从植物细胞、植物细胞组、植物部分或植物块(如从原生质体、愈伤组织、原球茎样体或组织部分)培养完整植物。
可以从转化的原生质体再生来自下列示例属的植物物种:草莓属(Fragaria)、百脉根属(Lotus)、苜蓿属(Medicago)、驴食草属(Onobrychis)、三叶草属(Trifolium)、葫芦巴属(Trigonella)、豇豆属(Vigna)、柑橘属(Citrus)、亚麻属(Linum)、老鹳草属(Geranium)、木薯属(Manihot)、胡萝卜属(Daucus)、拟南芥属(Arabidopsis)、芸苔属(Brassica)、萝卜属(Raphanus)、芥属(Sinapis)、颠茄属(Atropa)、辣椒属(Capsicum)、茛菪属(Hyoscyamus)、番茄属(Lycopersicon)、烟草属(Nicotiana)、茄属(Solarium)、牵牛属(Petunia)、毛地黄属(Digitalis)、十大功劳属(Majorana)、Ciohorium、向日葵属(Helianthus)、莴苣属(Lactuca)、雀麦属(Bromus)、天门冬属(Asparagus)、金鱼草属(Antirrhinum)、Hererocallis、龙面花属(Nemesia)、天竺葵属(Pelargonium)、黍属(Panicum)、狼尾草属(Pennisetum)、毛茛属(Ranunculus)、千里光属(Senecio)、美人襟属(Salpiglossis)、黄瓜属(Cucumis)、Browaalia、大豆属(Glycine)、豌豆属(Pisum)、黑麦草属(Lolium)、玉蜀黍属(Zea)、小麦属(Triticum)、高粱属(Sorghum)和曼陀罗属(Datura)。
为了从转基因原生质体再生转基因植物,首先提供转化的原生质体悬液或含有转化的外植体的培养皿。形成愈伤组织,可以从愈伤组织诱导嫩枝,接着生根。或者,可以在愈伤组织中诱导体细胞胚形成。这些体细胞胚像天然胚一样萌发形成植物。培养基一般含有多种氨基酸和植物激素,如生长素和细胞分裂素。在培养基中加入谷氨酸和脯氨酸也是有利的,特别是对于如玉米和苜蓿等物种。有效的再生取决于培养基、基因型和培养史。可以经验性地控制这三种变量,以得到可重现的再生。
还可以从培养的细胞或组织再生植物。已经显示能够从单个转化细胞再生而得到完整转基因植物的双子叶植物包括如苹果(Malus pumila)、黑莓(Rubus)、黑莓/覆盆子杂种(Rubus)、覆盆子(Rubus)、胡萝卜(Daucuscarota)、花椰菜(Brassica oleracea)、芹菜(Apium graveolens)、黄瓜(Cucumis sativus)、茄子(Solanum melongena)、莴苣(Lactuca sativa)、马铃薯(Solanum tuberosum)、油菜(Brassica napus)、野生大豆(Glycinecanescens)、草莓(Fragaria ananassa)、番茄(Lycopersicon esculentum)、胡桃(Juglans regia)、甜瓜(Cucumis melo)、葡萄(Vitis vinifera)和芒果(Mangifera indica)。已经显示能够从单个转化细胞再生而得到完整转基因植物的单子叶植物包括如稻(Oryza sativa)、黑麦(Secale cereale)和玉米(Zeamays)。
此外,还在以下植物中观察到了从细胞(不一定是转化的)再生完整植物:杏(Prunus armeniaca)、芦笋(Asparagus officinalis)、香蕉(hybridMusa)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、樱桃(hybrid Prunus)、葡萄(Vitisvinifera)、芒果(Mangifera indica)、甜瓜(Cucumis melo)、咖啡黄葵(Abelmoschus esculentus)、洋葱(hybrid Allium)、橙(Citrus sinensis)、木瓜(Carrica papaya)、桃(Prunus persica)、欧洲李(Prunus domestica)、梨(Pyrus communis)、菠萝(Ananas comosus)、西瓜(Citrullus vulgaris)和小麦(Triticum aestivum)。
将再生植物转移至标准土壤环境并以常规方式栽培。在表达载体稳定整合进再生转基因植物之后,可以通过无性繁殖或通过有性杂交将其转移至其他植物。例如,在无性繁殖的作物中,可以通过插条或通过组织培养技术繁殖成熟的转基因植物,以产生多个相同的植物。在种子繁殖的作物中,将成熟转基因植物自交以产生能通过孟德尔遗传将转基因传递至后代的纯合近交植物。近交植物产生含有目的核酸序列的种子。可以培养这些种子以产生可产生所选表型的植物。近交植物还可用于通过使近交植物与其他近交植物杂交产生杂种来产生新的杂种。
可以通过PCR分析、抗生素或除草剂抗性、酶分析和/或DNA印迹验证转化来证实细胞、组织和植物的转基因性质。可以获得并分析再生植物的后代以确认转基因是否可遗传。转基因的遗传力也证实了植物中转基因的稳定转化。可以以惯常的方式繁殖得到的植物。应该培养两个或更多世代以确保基因组整合是稳定并可遗传的。已经描述了相应方法(Jenes 1993;Potrykus 1991)。
7.筛选、分离的进行和转录终止序列的用途
将待评估其转录终止效率的一种或多种DNA序列或甚至是序列文库插入筛选构建体或筛选载体之后,将这些载体交付适当的体外或体内筛选系统。
取决于使用的附加序列,可以通过本领域技术人员熟知的多种方法检测易于检测的特征或其变化。可以通过设置某些截断限制来控制筛选系统的“输出”(如不同转录终止子序列的数目)及其效率。例如颜色或荧光的某一强度(在特征为颜色的情况下)、针对毒性化合物的某一抗性(在特征为抗性的情况下)。
来自筛选过程的筛选构建体、筛选载体或含有它们的细胞或生物可用于分离和分析其中包含的转录终止序列。可以通过多种方法进行分离,包括但不仅限于插入位点中的序列的PCR介导的扩增,其中使用对所述插入位点侧翼已知区域具有特异性的引物。
分离的转录终止子序列可在生物技术中用于多种目的,优选用于需要严紧转录终止控制(即低连读频率)的基因表达构建体的构建。可以按照已描述(如Maniatis 1989;Silhavy 1984;和Ausubel 1987)的多种惯用重组和克隆技术产生这些表达盒(在5’-3’方向上由例如启动子、目的基因和分离的转录终止序列组成)。本领域技术人员了解,在此上下文中可以使用多种序列作为目的基因,例如用于提高食品和饲料的品质、产生化学品、精细化学品或药物(如维生素、油、碳水化合物,Dunwell 2000)、赋予对除草剂的抗性或赋予雄性不育。此外,可以增强生长、产量和对非生物和生物胁迫因素(如真菌、病毒、线虫或昆虫)的抗性。可以通过过表达蛋白质或降低内源蛋白质的表达(如表达相应的反义(Sheehy 1988;US 4,801,340;MoI1990)或双链RNA(Matzke 2000;Fire 1998;Waterhouse 1998;WO99/32619;WO 99/53050;WO 00/68374;WO 00/44914;WO 00/44895;WO00/49035;WO 00/63364))来赋予有利特性。
本领域普通技术人员会理解,对本文所述方法和应用的其他合适的修饰和改变是显而易见的,并可以不背离本发明或其任何实施方案而产生这些修饰和改变。详细描述本发明之后,同样可以通过下文实施例可以更清楚地理解,所述实施例仅以说明目的包括于此,并不旨在限定本发明。
序列
1.SEQ ID NO:1双元表达载体
Lo546b-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo522b
2.SEQ ID NO:2双元表达载体
Lo546a-pSUN1-R4-Lo484∷ Lo376∷Lo522a
3.SEQ ID NO:3核酸构建体
Lo522b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
4.SEQ ID NO:4核酸构建体
Lo522a-pENTR-C1-STPT-npfII-IRnos
5.SEQ ID NO:5双元表达载体
Lo523b-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503b
6.SEQ ID NO:6双元表达载体
Lo523a-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503a
7.SEQ ID NO:7核酸构建体
Lo503b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
8.SEQ ID NO:8核酸构建体
Lo503a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
9.SEQ ID NO:9核酸构建体
Lo484-pENTR-A1-inv-35s-GFP-E9
10.SEQ ID NO:10-46:编码适于作为转录终止子和表达盒隔离子的序列的来自稻(Oryza sativa sbsp.japonica)的核酸序列
11.SEQ ID NO:47:引物1(SacI、AvrII、SpeI,OCS 5′)
5’-CG GAGCTC CCTAGG ACTAGT tcgaccggcatgccc-3’
12.SEQ ID NO:48引物2 (NotI,OCS 3′)
5’-CC GCGGCCGC agcttggacaatcag-3’
13.SEQ ID NO:49引物3(AvrII、XmaI,RsrII,LuF5′)
5’-CG CCTAGG CCCGGG CGGACCG cattaagaagggccc-3′
14.SEQ ID NO:50引物4(SpeI,LuF3′)
5’-CG ACTAGT agagagttctcagagc-3’
15.SEQ ID NO:51引物5(RsrII、BspEI、靶基因序列5′)
5’CG CGGACCG TCCGGA-N-3’
[N代表优选10至20个碱基的基因特异性序列]
16.SEQ ID NO:52引物6(SpeI、AgeI、靶基因序列3′)
5’CG ACTAGT ACCGGT-N-3’
[N代表优选10至20个碱基的基因特异性序列]
17.SEQ ID NO:53 pTOI3
18.SEQ ID NO:54 pTOI4
19.SEQ ID NO:55 寡核苷酸引物Loy482-NosT-upper-SalI
5’-AAATTTGTCGACCGATCGGTCAAACATT-3’
20.SEQ ID NO:56 寡核苷酸引物Loy483-NosT-Lower-HindIII
5’-AAATTTAAGCTTCCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3’
21.SEQ ID NO:57 寡核苷酸引物Loy494-Gus_upper_SalI_间隔臂
5’-TTTTAGTCGACACGCTGGACTGGCATGAACT-3’
22.SEQ ID NO:58 寡核苷酸引物Loy492-NosT-lower-BglII SpeI
5’-TTTTAAGATCTACTAGTCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3’
23.SEQ ID NO:59 寡核苷酸引物Loy493_Gus_upper_SalL_间隔臂
5’-TTTAAGTCGACAAGTCGGCGGCTTTTCTGCT-3’
24.SEQ ID NO:60 寡核苷酸引物Loy492-NosT-loWer-BglII SpeI
5’-TTTTAAGATCTACTAGTCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3’
25.SEQ ID NO:61 寡核苷酸引物JMTOIprim1
5′-GGTTCCAAGGTACCAAAACAATGGGCGCTGATGATGTTGTT-
GAT-3’
26.SEQ ID NO:62 寡核苷酸引物JMTOIprim2
5′-AAGGTAGAAGCAGAAACTTACCTGGATACGTCACTTTGACCA-3’
27.SEQ ID NO:63 寡核苷酸引物JMTOIprim3
5′-TGGTCAAAGTGACGTATCCAGGTAAGTTTCTGCTTCTACCTT-3’
28.SEQ ID NO:64 寡核苷酸引物JMTOIprim4
5’-GGTTCCAAGGATCCATTTATTTTGAAAAAAATATTTG-3’
29.SEQ ID NO:65 寡核苷酸引物JMTOIprim5
5’-GGTTCCAAGGATCCAGTATATAGCAATTGCTTTTC-3’
30.SEQ ID NO:66 寡核苷酸引物JMTOIprim6
5’-CGAGAACCTTCGTCAGTCCTGCACATCAACAAATTTTGGTCAT-
AAAAAAAAAAATATTAGAAAAGTTATAAATTAAAATATAC-3’
31.SEQ ID NO:67 寡核苷酸引物JMTOIprim7
5’-CTAATATTTTTTTTTTTATGACCAAAATTTGTTGATGTGCAGGAC-
TGACGAAGGTTCTCGCAC-3’
32.SEQ ID NO:68 寡核苷酸引物JMTOIprim8
5’-TTGGAACCACTAGTTTATCGCCTGACACGATTTCCTGC-3’
33.SEQ ID NO:69 寡核苷酸引物JMTOIprim9
5’-GGTTCCAAGGATCCGATCGTTCAAACATTTGGCAA-3’
34.SEQ ID NO:70 寡核苷酸引物JMTOIprim10
5’-GGTTCCAAGGATCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3’
35.SEQ ID NO:71 筛选构建体pJMTOI1
36.SEQ ID NO:72 筛选构建体pJMTOI2
37.SEQ ID NO:73 筛选构建体pJMTOI3
38.SEQ ID NO:74 筛选构建体pJMTOI4
39.SEQ ID NO:75 筛选构建体pJMTOI5
40.SEQ ID NO:76 Lo376-pENTR-B2
41.SEQ ID NO:77 Lo442 pSUN1-R4R3-M20(OCS10)(目标载体)
42.SEQ ID NO:78 双元载体
Lo239-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷nosT-B2(10414bp)
43.SEQ ID NO:79 双元载体Lo657-pSUN3-GWs-B1-
BnAK700∷GUS∷E9∷nosT∷B2(11153bp)
44.SEQ ID NO:80 GFP-引物5:
5’-CGGCCTAGGGGCGCCCGGACCGagctgttcaccggca-3’
45.SEQ ID NO:81GFP-引物6:
5’-CGG ACT AGT gat gta gcc ctc agg-3’
46.SEQ ID NO:82 引物7:
5’-CGA GCT CGT GCC TTT TGG ATC G-3’
47.SEQ ID NO:83 引物8:
5’-CGG TCC GAA CGT GGT TGG-3’
48.SEQ ID NO:84 引物9:
5’-CGA GCT CGG CCC TAT GAA TTG G-3’
49.SEQ ID NO:85 引物10:
5’-CGG TCC GTC TCC TTC TGC ACA C-3’
50.SEQ ID NO:86 引物11:
5’-CGA GCT CGA TGC ATT CCT TGG AT-3’
51.SEQ ID NO:87 引物12:
5’-CCT AGG GTT TGG AGG TAT CAA G-3’
52.SEQ ID NO:88 引物13:
5’-CGA GCT CCG TCC GAT GTG ATT CCG TC-3’
53.SEQ ID NO:89 引物14:
5’-CCT AGG GGC AGT GTC GGC GGT T-3’
54.SEQ ID NO:90 引物15:
5’-CGA GCT CCA GAG TGA CAG ACA GTG A-3’
55.SEQ ID NO:91 引物16:
5’-CCT AGG TCT TCA ACT GTC CCC A-3’
56.SEQ ID NO:92 稻终止子BPST.3(1,137bp)。此序列是
SEQ ID NO:45所述序列的功能等价物。
57.SEQ ID NO:93 稻终止子BPST.4(BPST.3的反向互补序列)(1,137bp)。此序列是SEQ ID NO:45所述序列的功能性等价物。
58.SEQ ID NO:94 人工序列,载体pRJB058(6,849 bp))
59.SEQ ID NO:95 来自pRJB062的插入片段:插入pRJB058的SacI-RsrII片段的Nos终止子(Nos-T)序列(257bp)
60.SEQ ID NO:96 来自pRJB064的插入片段:插入SacI消化并用T4 DNA聚合酶补平的pRJB058片段的ORF序列(1,089bp)
61.SEQ ID NO:97 来自pRJB066的插入片段:插 SacI消化并用T4 DNA聚合酶补平的PRJB058片段的稻BPST.1序列(1,420bp)
62.SEQ ID NO:98 来自pRJB065的插入片段:插入SacI消化并用T4 DNA聚合酶补平的pRJB058片段的稻BPST.2序列(1,414bp)
63.SEQ ID NO:99 来自pRJB067的插入片段:插入SacI消化并用T4 DNA聚合酶补平的pRJB058片段的稻BPST.3序列(1,165bp)
64.SEQ ID NO:100 来自pRJB068的插入片段:插入SacI消化并用T4 DNA聚合酶补平的pRJB058片段的稻BPST.4(BPST.3的反向互补序列)序列(1,165bp)
65.SEQ ID NO:101 BPST.5-MCS:带有EcoRI和AvrII位点的稻BPST.5序列(1,305bp)
66.SEQ ID NO:102 BPST.6-MCS:带有EcoRI和AvrII位点的稻BPST.6序列(1,350bp)
67.SEQ ID NO:103 BPST.7-MCS:带有EcoRI和SacI位点的稻BPST.7序列(1,532bp)
68.SEQ ID NO:104 BPST.8-MCS:带有EcoRI位点的稻BPST.8序列(BPST.7的反向互补序列)(1,532bp)
69.SEQ ID NO:105 来自pRJB058的双元载体pRLI024(16,914bp)
70.SEQ ID NO:106 来自pRLI024的双元载体pRLI031(15,919bp)
71.SEQ ID NO:107 稻终止子BPST.7(1,499bp)。此序列是
SEQ ID NO:11所述序列的功能性等价物。
72.SEQ ID NO:108 稻终止子BPST.8(BPST.3的反向互补序列)(1,499bp)。此序列是SEQ ID NO:11所述序列的功能性等价物。
实施例
化学品
除非另有说明,实施例中的化学品和试剂得自Sigma ChemicalCompany(St.Louis,MO),限制性内切核酸酶来自New England Biolabs(Beverly,MA)或Roche(Indianapolis,IN),寡核苷酸由MWG Biotech Inc.(High Point,NC)合成,生物化学或分子生物学测定相关的其他修饰酶或试剂盒来自Clontech(Palo Alto,CA)、Pharmacia Biotech(Piscataway,NJ)、Promega Corporation(Madison,Wl)或Stratagene(La JoIIa,CA)。用于细胞培养基的材料得自Gibco/BRL(Gaithersburg,MD)或DIFCO(Detroit,MI)。按Sambrook(1989)所述进行用于本发明目的的克隆步骤,如限制性切割、琼脂糖凝胶电泳、纯化DNA片段、将核酸转移至硝酸纤维素和尼龙膜、连接DNA片段、转化大肠杆菌细胞、培养细菌、繁殖噬菌体和重组DNA的序列分析。使用ABI激光荧光DNA测序仪按照Sanger (Sanger1977)的方法对重组DNA分子测序。
实施例1:开发用于鉴定转录终止子的基因组文库
按照Qiagen植物DNA制备试剂盒(目录号12143)制备来自靶植物的基因组DNA。将1μg基因组DNA用四碱基对切割酶(如Sau3A)在37℃消化过夜或者在Hamilton注射器中机械剪切或超声处理,接着电泳(0.8%琼脂糖凝胶)并使用QIAEX II Gel Extraction Kit(目录号20021)进行凝胶纯化。将断裂的基因组DNA(500至1000bp)克隆进本文所述的筛选构建体或筛选载体。将得到的构建体和载体文库批量转化进植物细胞(见下文)。
实施例2:在计算机芯片上鉴定作为转录终止子评估的序列
除了本文所述提供用于评估其作为转录终止子序列的适用性的序列(如通过实施例1提供的基因组序列)的其他方法以外,还可以通过在计算机芯片上检索基因组数据库(如拟南芥或稻的基因组数据库)来提供序列。因此,使用来自Institute of Genome Research(TIGR;PUB_tigr_rice_genome_v4.nt (v03212003)、PUB_tigr_rice_cds_Oct022003.nt、pubO-Sest0603(ncbi))的最新数据对整个稻基因组序列筛选潜在的植物来源终止子候选者。此筛选系统包括三个主要组分:
1)鉴定符合预定义的(如700至2000bp)基因间距离标准的配对基因;
2)测定鉴定的配对基因的表达水平和表达图式;
3)通过基因组作图在基因间序列中选择终止子候选者。
基因组作图需要以下行为:
(1)手动验证基因组序列的基因模型、编码序列(CDS)的读框和基因间结构,和(2)基于EST序列比对和CDS选择潜在目的转录终止子候选者。
2.1鉴定目的配对基因
根据最近发表的日本稻(rice japonica)基因组序列和56056个已注释的稻CDS,检索来自基因组区的56056个已注释CDS的起点和终点的坐标并计算基因间距离。产生200bp/间隔的基因间距离频数分布表,以定义适当的基因间距离。为获得潜在终止子候选者的最大值,使用700至2000bp范围内的基因间距离,导致鉴定了16058对稻基因(由头对尾、尾对头和尾对尾取向的配对基因组成)。
首先,将每对鉴定的稻CDS与稻EST数据库进行blast比对以搜索EST同源物序列。使用拼接比对基因鉴定应用程序GeneSeqerTM(1.9版(2002年10月22日),Department of Zoology & Genetics,Iowa StateUniversity,Ames,IA 50011-3260)将与EST同源的已鉴定序列作图到获得稻CDS的同一稻基因组区上。使用MyGV(1.0版(来自NewLink Genetics,2901 South Loop Drive,Suite 3900,Ames,Iowa 50010)应用程序通过图形显示GeneSeqerTM基因组作图结果来仔细验证内在基因模型,包括5’末端外显子、3’末端外显子、CDS读框和两个基因之间的基因间结构。潜在的基因终止子候选者为
1)配对CDS读框必须是头对尾、尾对尾或尾对头取向。尾对尾取向(即所述基因的表达的方向彼此相反)是最需要的,因为基因间序列不含有启动子序列,可以使基因间序列长度最小化;
2)根据序列比对的EST序列必须证实且支持已注释CDS及其基因模型。
在这些基因间区域中,鉴定优选区域用于进一步分析,所述优选区域位于具有尾对尾定位(即所述基因的表达的方向彼此相反)的基因之间。
2.2测定基因表达水平和表达图式
将每对已鉴定稻CDS(即对应于基因间区域的侧翼基因)用于鉴定与稻EST数据库具有高同一性的相应EST序列,其中使用blastn检索,期望值设为1.0e-20。已鉴定EST序列(推测与稻CDS相同的序列)用于检索基因表达概况分析数据,所述数据来自cDNA文库克隆分布或微阵列表达。总体而言,簇/变体大小超过100个来自cDNA文库的克隆的基因认为是高水平表达的,来自微阵列表达研究的信号强度超过前25%分位数的也是如此。需要将两个配对基因的高表达丰度作为基因选择的标准。此外,可以使用在cDNA文库上的克隆分布或使用在不同实验间的微阵列表达数据评估配对基因的共表达图式。计算线性相关系数以确定基因表达的图式。证明为独特表达图式的配对基因是所希望的。使用这些标准选择了5279对稻CDs序列。
2.3确定转录物长度变异性
优选地与基因间区域侧翼基因相应的EST序列比对的3’末端必须证明就转录物长度而言具有低变异性程度。已发现这是强终止子信号的预兆。
基于以上标准,选择了37个潜在的基因间基因组序列(SEQ ID NO:10至46)用于在本发明的筛选系统中进行测试,以鉴定目的终止子。所有这些序列都位于上文所述优选的尾对尾取向的基因之间。
实施例3:用于鉴定目的终止子的体外筛选系统
开发了高通量筛选方法以在mRNA水平鉴定转录终止子。该方法包括体外转录,其中使用与多腺苷酸化RNA区和连读区杂交的单链荧光探针,如信标探针。将连读产物的荧光量与多腺苷酸化RNA的量进行比较。较强和较严紧的终止子将显示较少的连读产物量。构建对照载体以建立筛选系统(见图13以及之前对此图的说明)。
这些构建体的启动子优选为强组成型启动子(如玉米泛蛋白启动子)。为测定未偶联的转录,可以将SP6或T7噬菌体启动子用于体外转录。表达盒中的编码序列可以是任何报道基因或基因组DNA,其在5’末端包含起始密码子并在3’末端包含终止密码子,与植物基因组不具有序列同源性(如来自酵母基因组的基因间序列)。可以用任何其他已知终止子替代胭脂碱合酶终止子,作为对照或未表征基因组DNA片段以鉴定潜在的终止子候选者。
3.1载体构建
载体pBPSMM268含有GUS∷马铃薯内含子基因及其后的NOS终止子区。通过以下步骤向此载体加入玉米泛蛋白启动子∷内含子:用StuI和SmaI消化pMM268,接着平末端连接从pBPSCER043的StuI消化得到的泛蛋白启动子∷内含子片段,产生载体pTOI01。
为确保未在推定的转录终止子处发生转录终止的mRNA的有效转录物加工,将OCS终止子区克隆进pTOI01。通过以下步骤产生pTOI02:用SacI和NotI消化pTOI01,并连接使用引物1和2(SEQ ID NO 47和48)通过PCR扩增载体p1bxSuperGusQC的OCS终止子产生的SacI/NotI片段。
引物1(SacI、AvrII、SpeI,OCS 5’;SEQ ID NO:47):
5′-CG GAGCTC CCTAGG ACTAGT tcgaccggcatgccc-3′
引物2 (NotI,OCS3′;SEQ ID NO:48):
5′-CC GCGGCCGC agcttggacaatcag-3′
将萤火虫萤光素酶基因的片段克隆进插入位点中待评估转录终止子序列的下游,以作为仅在功能很差的终止子存在时转录的唯一序列。通过用AvrII和SpeI消化pTOI02并连接进PCR扩增产生的AvrII/SpeI片段来产生pTOI03,所述PCR扩增使用引物3和4(SEQ ID NO:49和50)从载体pGL3(R2.2)基础载体(Promega目录号E6441)扩增萤火虫萤光素酶基因(LuF)的240 bp片段。
引物3(AvrII、XmaI、RsrII,LuF5′;SEQ ID NO:49):
5′-CG CCTAGG CCCGGG CGGACCG cattaagaagggccc-3′
引物4(SpeI LuF3′;SEQ ID NO:50):
5′-CG ACTAGT agagagttctcagagc-3′
载体pTOI03是用于产生测试推定的转录终止子序列的构建体的基础载体。载体pTOI04包含加入了正向NOS的pTOI03,并且通过将来自pBPSCR043的含有NOS的SacI片段插入pTOI03的唯一SacI位点而产生。(阳性对照-NOS)。载体pTOI05包含加入了反向NOS的pTOI03,通过将来自pBPSCR043的反向NOS SacI片段插入pTOI03的唯一SacI位点而产生。(阴性对照-反向NOS)。
通过PCR扩增来自稻基因组DNA的推定的终止子序列(选自SEQ IDNO:10至46描述的序列)来产生载体pTOI06-pTOI10,从而在序列的5’末端产生SacI位点,在3’末端产生RsrII位点。(注:如果单个基因组元件的序列排除了这两种限制性酶的使用,则可以将备选酶AvrII或XmaI用于克隆的目的)。转录终止子的来源可以来自在计算机芯片上的筛选系统和含有500至1000bp片段的基因组文库。
3.2 BMS悬浮培养细胞的制备
在含有2%(重量/体积)蔗糖和2mg/L 2,4-二氯代苯氧基乙酸的Murashige和Skoog(MS)液体培养基中繁殖Black Mexican Sweetcorn(BMS)悬浮培养的细胞。每周将5mL稳定期细胞转移至125mL新鲜培养基,并在黑暗中在27℃、130转/分钟(rpm)运行的旋转摇床上培养。
3.3核提取物的制备
HeLa核提取物购自Promega(HeLaScribeNuclear Extract;目录号E3092)。如所描述的从BMS制备核提取物(Moreno等人,1997)。在新鲜培养三天后,通过在4℃以2000rpm(对于800mL玻璃锥形瓶为1200rpm,170×g)将500mL管离心10分钟来收获对数生长期的BMS悬浮培养细胞。打散细胞沉淀并重悬于冷HBSS(Hank平衡盐溶液;Sigma目录号H9269)。将细胞转移至50mL Corning管并在4℃以1200rpm离心。目测收集细胞提及(PCV)。打散沉淀并重悬于5×PCV的低渗缓冲液,接着在冰上使细胞膨胀10分钟。以1200rpm将细胞离心10分钟。移去上清液。在沉淀中加入一倍体积的含有0.1%NP-40的PCV低渗缓冲液并重悬细胞。将重悬细胞转移至冷的dounce匀浆器并在加入1×PMSF(500×:8.71mg/mL)之前测量总体积。将细胞匀浆10至15次并检查细胞以得到80%至90%的细胞裂解。避免过度匀浆细胞是至关重要的。在一小部分细胞中加入锥虫蓝并在显微镜下检查细胞裂解。蓝色的细胞代表细胞裂解。将细胞裂解液迅速转移至Corex 30ml管中。加入0.1体积的蔗糖恢复缓冲液并温和混合。转子和离心机必须预冷。立即在有制动的Beckman JA-20转子中以10000rpm离心细胞2分钟。小心的移出含有胞质的上清液并通过加入甘油至20%(体积/体积)并储存于-70℃来保存。用移液管分离沉淀并转移至超速离心管中的核重悬缓冲液(3mL/109个细胞),接着加入N-α-甲苯磺酰基-L-赖氨酸氯甲基酮(TLCK)蛋白酶抑制剂(250×:10mg/mL,1mM HCI中)、亮抑酶肽(2000×:1mg/mL,dH2O中)、抑酶肽(Sigma目录号A1153;1000×:1mg/mL,dH2O中)和胃蛋白酶抑制剂A(Sigma目录号P4265;2,000×:1mg/mL,MeOH中)至1倍。使管平衡,轻柔摇动30分钟并在2℃以35000rpm在Ti454(或42000rpm在Ti70.a中)离心90分钟。将上清液转移至另一超速离心管并目测体积。在30分钟中将0.33g(NH4)2SO4/mL洒到提取物上,或者在冰上每次加入后搅拌或摇动直至盐溶解。随着蛋白质的沉淀,溶液变成乳白色,在4℃再搅拌或摇动20分钟,接着在Ti45中以35000rpm(或在Ti70.1中以32000rpm)离心30分钟。将沉淀重悬于少于1mL的透析缓冲液中(109个细胞/mL)。在超过200体积的透析缓冲液(2L)中将重悬的细胞透析一小时。透析期间更换缓冲液后再透析4小时。将经透析的提取物以35000rpm离心1小时,接着以小等分试样保存于-80℃。
低渗缓冲液
10mM HEPES,pH7.9(KOH)
0.75mM亚精胺
0.15mM精胺
0.1mM EDTA
0.1mM EGTA,pH7.5(KOH)
1mM DTT
10mM KCl
(在使用前加入蛋白酶抑制剂和DTT)
10×蔗糖恢复缓冲液
500mM HEPES,pH7.9(KOH)
7.5mM亚精胺
1.5mM精胺
10mM KCl
2mM EDTA
10mM DTT
1×蔗糖
恢复缓冲液=1体积10×盐+9体积75%(重量/体积)蔗糖
核重悬缓冲液
20mM HEPES,pH7.9(KOH)
0.75mM亚精胺
0.15mM精胺
0.2mM EDTA
2mM EGTA,pH7.5(KOH)
1mM DTT
25%甘油
10%饱和硫酸铵
(在使用前加入蛋白酶抑制剂和DTT)
透析缓冲液
20mM HEPES,pH7.9(KOH)
20%甘油
100mM KCl
0.2mM EDTA
0.2mM EGTA,pH7.5(KOH)
2mM DTT
(在使用前加入蛋白酶抑制剂和DTT)
3.4体外测定系统
用于分子信标探针的引物序列选自(1)GUS和NOS之间,用于检测多腺苷酸化产物和(2)截短的萤火虫萤光素酶基因内,用于检测连读产物。使用Beacon Designer 3.0设计探针。选择了两种不同报道染料用于此测定(如Texas Red、Rhodamine Red、Tamra、Joe、Tox、Oregon green等)。
通过在37℃用NotI酶进行限制性酶消化使构建体线性化,接着电泳(0.8%琼脂糖凝胶)并使用QIAEX II凝胶提取试剂盒(目录号20021)进行凝胶纯化。在总体积25μL的反应溶液(15μL 1∶1比例(体积/体积)HeLa和BMS核提取物的混合物,400μM ATP、CTP、GTP、UTP,400nM终浓度的两种信标探针,5mM MgCl2,mg/mL BSA)中加入1μg线性化单模板。将反应溶液在室温下温育2小时。使用Cytofluor多孔平板读数器在485nm激发波长和530nm发射波长处监控反应进展(Razik和Quatrano,1997;Yammaguchi等,1998;Liu等,2002)。如果待评估的特定转录终止子序列提供有效的转录终止,则与探针1互补的序列的表达将远高于探针2特异性序列的表达。如果序列不能有效终止,则探针1:探针2表达的比值将较低。计算多腺苷酸化RNA和连读产物之间所获得产量的比值,以确定潜在的终止子候选者(见图13B和上文对该附图的说明)。除了使用单链荧光探针以外,还可以使用逆转录酶(RT)-PCR按照本领域的方案检测产量的比值。
实施例4:用于鉴定目的终止子的体内筛选系统
4.1载体构建
4.1.1 pUC表达载体
载体pBPSMM268含有GUS∷马铃薯内含子基因和其后的NOS终止子区。通过以下步骤在此载体中加入玉米泛蛋白启动子∷内含子:用StuI和SmaI消化pMM268,接着平末端连接得自pBPSCER043的StuI消化的泛蛋白启动子∷内含子片段,产生载体pRJB051。
将绿色荧光蛋白(GFP-f)基因的片段克隆进插入位点中待评估转录终止子序列的下游,以作为仅在功能很差的终止子存在时转录的唯一序列。通过用AvrII和SpeI消化pRJB051并连接进PCR扩增产生的AvrII/SpeI片段来产生pRJB058,所述PCR扩增使用GFP引物5和6(SEQ ID NO:80和81)从载体pALGFP1扩增GFP基因(GFP-F)的260bp片段。
GFP-引物5(AvrII、KasI、RsrII,AKR GFP19 5′;SEQ ID NO:80):
5′-CGG CCT AGG GGC GCC CGG ACC Gag ctg ttc acc ggc a-3′
GFP-引物6(SpeI,S GFP 2813′;SEQ ID NO:81):
5′-CGG ACT AGT gat gta gcc ctc agg-3′
载体pRJB058是用于产生测试推定的转录终止子序列的构建体的基础载体。载体pRJB062(SEQ ID NO:95)包含加入了正向NOS的pRJB058(SEQ ID NO:94),通过将来自pBPSCR043的含有NOS的SacI片段插入pTOI03的唯一SacI位点而产生。(阳性对照-NOS)。
载体pRJB063(SEQ ID NO:95的反向互补序列)包含加入了反向NOS的pRJB058,通过将来自pBPSCR043的反向NOS SacI片段插入pTOI03的唯一SacI位点而产生。(阴性对照-反向NOS)。
载体pRJB064(SEQ ID NO:96)包含加入了来自pRJB018的1.1KbORF片段的pRJB048。该序列包含来自已知可读框的内部片段,并因而应具有最小的内在转录终止活性,因此将此载体作为推定的TOI的特定转录终止的阴性对照。通过将来自pRJB018的1.1Kb HpaI/StuI片段连接进用SacI消化并用3’-5-外切核酸酶处理的pRJB058,产生载体pRJB064。
载体pRJB065(SEQ ID NO:98)和pRJB066(SEQ ID NO:97)分别包含加入了稻基因组DNA BPST.2(SEQ ID NO:33的反向互补序列)和BPST.1(SEQ ID NO:33)的pRJB058。通过用引物7和8(SEQ ID NO:82和83)扩增稻基因组DNA产生1.4Kb PCR产物:
引物7:5′-CGA GCT CGT GCC TTT TGG ATC G-3′
引物8:5′-CGG TCC GAA CGT GGT TGG-3′
TOPO克隆PCR产物以产生pTOPO BPST.1(SEQ ID NO:33)和BPST.2(SEQ ID NO:33的反向互补序列)。将由pTOPO BPST.1和BPST.2的EcoRI消化和T4 DNA聚合酶补平反应得到的1.4Kb片段连接进用SacI消化并用3’-5-外切核酸酶处理的pRJB058。pRJB065(SEQ ID NO:98)代表得到的包含BPST.2推定终止子的载体,pRJB066(SEQ ID NO:97)代表包含BPST.1序列的连接产物。
载体pRJB067(SEQ ID NO:99)和pRJB068(SEQ ID NO:100)分别包含加入了稻基因组DNA BPST.3(SEQ ID NO:92)和BPST.4(SEQ IDNO:92的反向互补序列)的pRJB058。通过用引物9和10(SEQ ID NO:84和85)扩增稻基因组DNA产生1.1Kb PCR产物:
引物9:5′-CGA GCT CGG CCC TAT GAA TTG G-3′
引物10:5′-CGG TCC GTC TCC TTC TGC ACA C-3′
TOPO克隆PCR产物以产生pTOPO BPST.3和BPST.4。将由pTOPOBPST.3和BPST.4的EcoRI消化和T4 DNA聚合酶补平反应得到的1.1Kb片段连接进用SacI消化并用3’-5-外切核酸酶处理的pRJB058。pRJB067(SEQ ID NO:99)代表得到的包含BPST.3推定终止子的载体,pRJB068(SEQ ID NO:100)代表包含BPST.4序列的连接产物。
BPST.5(SEQ ID NO:18)产生来自使用引物11和12(SEQ ID NO:86和87)的稻基因组DNA扩增的1.2Kb PCR产物:
引物11:5′-CGA GCT CGA TGC ATT CCT TGG AT-3′
引物12:5′-CCT AGG GTT TGG AGG TAT CAA G-3′
BPST.6(SEQ ID NO:10)产生使用引物13和14(SEQ ID NO:88和89)从稻基因组DNA扩增的1.3Kb PCR产物:
引物13:5′-CGA GCT CCG TCC GAT GTG ATT CCG TC-3′
引物14:5′-CCT AGG GGC AGT GTC GGC GGT T-3′
BPST.7(SEQ ID NO:107)和BPST.8(SEQ ID NO:108的反向互补序列)产生使用引物15和16(SEQ ID NO:90和91)从稻基因组DNA扩增的1.5Kb PCR产物:
引物15:5′-CGA GCT CCA GAG TGA CAG ACA GTG A-3′
引物16:5′-CCT AGG TCT TCA ACT GTC CCC A-3′
如上文所述将其他TOI候选者分离并克隆进pUC表达载体。
4.1.2双元载体
为在稳定转化的玉米植物中评估推定的TOI序列的转录终止,制备了用于农杆菌介导的玉米转化的双元载体。在附带的序列表中提供了用于载体pRLI024和pRLI031的全长T-DNA序列(分别为SEQ ID NO:105和106)。通过交换终止子区由它们产生其他载体。
通过以下步骤产生载体pRLI024:将pRJB058的4.9Kb PvuII片段连接进用PmeI消化的pLM150,产生pJB077。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed2表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRJB077,以产生pRLI024(SEQ ID NO:105)。
通过以下步骤产生载体pRLI025:将pRJB062的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:95)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pJB078。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1 Kb DsRed2表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRJB078,以产生pRLI025。
通过以下步骤产生载体pRLI026:将pRJB064的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:96)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pJB079。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRJB079,以产生pRLI026。
通过以下步骤产生载体pRLI027:将pRJB066的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:97)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pJB080。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRJB080,以产生pRLI027。
通过以下步骤产生载体pRLI028:将pRJB065的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:98)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pJB081。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRJB081,以产生pRLI028。
通过以下步骤产生载体pRLI029:将pRJB067的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:99)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pRLI022。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRLI022,以产生pRLI029。
通过以下步骤产生载体pRLI030:将pRJB068的4.9Kb PvuII片段(SEQ ID NO:100)连接进用PmeI消化的pLM150,产生pRLI023。通过FseI/PacI消化从载体pLM299释放3.1Kb DsRed表达盒并连接进用FseI/PacI消化的pRLI023,以产生pRLI030。
产生了备选系列的双元载体,以评估推定的TOI指导双向转录终止的能力。对于这些载体,将TOI序列以尾对尾取向克隆进两个报道表达盒之间。
用SacI消化载体pLI024(SEQ ID NO:105)以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI031(SEQ ID NO:106)。
用SacI消化载体pLI025以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI032。
用SacI消化载体pLI026以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI033。
用SacI消化载体pLI027以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI034。
用SacI消化载体pLI028以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI035。
用SacI消化载体pLI029以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI036。
用SacI消化载体pLI030以去除950bp Nos-T和来自DsRed ORF和TOI MCS之间的间插序列。使载体重新环化以产生pLI037。
如上述将其他TOI候选者分离并克隆进双元载体。
4.2用于鉴定目的终止子的测定
测试构建体包含由玉米泛蛋白启动子驱动的GUS报道基因和用于插入推定的TOI和控制序列的酶位点。TOI功能性筛选基于以下原理:在不存在功能性终止子区时,GUS mRNA将不会被有效加工,从而不能支持GUS蛋白质的高翻译水平。这些瞬时分析的结果示于表2和图14。在TOI克隆位点缺乏插入的载体不能驱动可检测的GUS表达(pRJB058;SEQ IDNO:94)这一发现支持了实验理论。插入胭脂碱合酶(Nos)终止子能回复GUS表达(pRJB062;SEQ ID NO:95)。插入来自外源蛋白质编码基因(ORF序列)内部部分的序列不引起GUS表达(pRJB064;SEQ ID NO:96),表明在pRJB062中可见的GUS表达是由于Nos的内在转录终止活性,而不是由于在该位点插入任一DNA序列引起的非特异性效应。BPST.1(SEQ IDNO:33)和BPST.2(SEQ ID NO:33的反向互补序列)显示与用Nos(+)对照载体所看到的相当的GUS表达水平。BPST.3(SEQ ID NO:92)和BPST.4(SEQ ID NO:92的反向互补序列)始终引起显著的GUS表达,其水平似乎稍低于用Nos观察到的水平。
表2.测试终止子候选者的瞬时GUS表达
终止子候选者 | GUS表达* | |
BPST(空)-(pRJB058;SEQ ID NO:94) | - | 0% |
BPST(+)-Nos(pRJB062;SEQ ID NO:95) | ++++ | 100% |
BPST(-)-ORF(pRJB064;SEQ ID NO:96) | - | 0% |
BPST.1(pRJB066;SEQ ID NO:97) | ++++ | 100% |
BPST.2(pRJB065;SEQ ID NO:98) | ++++ | 100% |
BPST.3(pRJB067;SEQ ID NO:99) | +++ | 80% |
BPST.4(pRJB068;SEQ ID NO:100) | +++ | 80% |
*GUS组织化学测定:一系列GUS活性(-无表达至++++高表达)。
在GUS编码序列下游不包含功能性转录终止子的载体(pRJB058和pRJB064;分别为SEQ ID NO:94和96)中未观察到GUS染色。在(+)对照(pRJB062;SEQ ID NO:95)载体以及所有四种TOI候选序列(pRJB065-pRJB068,SEQ ID示于表2)中功能性终止子的存在都回复了GUS表达。
4.3稳定转化的玉米中终止子候选者的分析
使用农杆菌介导的转化(实施例11.4)将双元载体pBPSLI027、pBPSLI028、pBPSLI029和pBPSLI030转化进玉米。将BPST.1(SEQ IDNO:33)、BPST.2(SEQ ID NO:33的反向互补序列)、BPST.3(SEQ ID NO:92)或BPST.4(SEQ ID NO:92的反向互补序列)终止子控制下的GUS表达水平和模式与NOS-t控制下的进行比较。BPST.1、BPST.2、BPST.3和BPST.4应显示与瞬时测定(表2)中的观察相似的水平。此结果将表明瞬时测定可作为模式系统使用,因此是用于鉴定功能性转录终止子的重要筛选系统之一。然而,应该通过产生稳定转化的转基因植物证实瞬时测定中获得的结果。
实施例5:用于鉴定潜在转录终止子的使用基因沉默的体内筛选系统
开发了高通量筛选系统以鉴定并分离严紧转录终止序列。此方法可以节约时间,并且不涉及RNA分析。由于dsRNA分子甚至在少量时也很有效,因此仅会鉴定非常严紧的终止子(图13C)。
如上文更详细描述的,RNA可优选选自
a)编码下调必需植物基因表达的反义RNA或优选双链RNA。原则上在纯合敲除中具有致死表型的任何基因都是适用的(如八氢番茄红素去饱和酶、硝酸盐还原酶、HPPD、乙酰羟酸合酶等);
b)编码其表达对转基因植物产生致死效应的毒性蛋白质的RNA(负选择标记如TK、codA、tyrA、白喉毒素等)。此外,适于作为除草剂靶标的任何内源基因都可用于上述方法(表1)。
5.1用于RNAi的载体构建
对于使用RNAi下调机制评估转录终止的实验,修饰pTOI03以用适当的dsRNA盒取代LuF。适当的RNAi盒包含对靶基因特异的200至300bp,其后是约150-200bp的间隔区序列,其后是基因特异性序列的反向重复,这样在转录时由形成dsRNA茎区的基因特异性序列形成发夹结构。RNAi靶标可以是在下调后提供致死性或可筛选表型的任何基因(如AHAS、bar、除草剂靶基因(见表1)或其他必需内源基因如持家基因)。通过PCR使用引物5和6(SEQ ID NO:51和52)扩增产生基因特异性序列,其中使用适当的限制性位点用于正向和反向取向:
引物5(RsrII,BspEI,靶基因序列5′;SEQ ID NO:51):
5′CG CGGACCG TCCGGA-N-3′
[N:优选10至20个碱基的基因特异性序列]
引物6(SpeI,AgeI,靶基因序列3′;SEQ ID NO:52):
5′-CG ACTAGT ACCGGT-N-3’
[N:优选10至20个碱基的基因特异性序列]
通过:(1)用RsrII和SpeI消化的pTOI03,(2)用RsrII和AgeI消化的靶基因PCR产物,(3)具有AgeI和BspEI末端的间隔区序列,和(4)用BspEI和SpeI消化的靶基因PCR产物之间的四向连接(four-way ligation)产生RNAi载体(pTOI11)。
5.2用于鉴定目的终止子的测定
通过轰击植物组织或培养细胞(实施例9.1)、通过PEG介导的(或类似方法)将DNA引入植物原生质体(实施例9.2)或通过农杆菌介导的转化(实施例9.3)进行这些实验。用于这些实验的靶组织可以是植物组织(如叶或根)、培养细胞(如玉米BMS)或用于农杆菌方案的植物组织(如未成熟胚)。
可以从计算机芯片上的转录终止子序列筛选或通过随机基因组片段文库得到作为潜在转录终止子序列的序列。只有在稳定转化的情况下植物才能在其后的世代中存活,其中在编码毒性RNA的序列之前插入有效的终止子(从而阻断其表达)。分离存活的植物,使用PCR扩增终止子序列并测序。
实施例6:使用双顺反子RNA检测的体内筛选系统
开发了利用来自脑心肌炎病毒(EMCV)(一种小RNA病毒)的内部核糖体进入位点(IRES)或植物中任一功能性IRES的系统。已经显示EMCVIRES在植物中与规范的帽介导翻译平行地有效指导内部编码蛋白质的翻译(Urwin等,2000)。此方法允许在植物组织中筛选潜在终止子序列,并提供比较多个序列之间相对终止效率的筛选。为进行这些实验,产生了含有两种可区分的荧光蛋白(FP1和FP2)的潜在双顺反子元件,其中这两个可区分的荧光蛋白被待评估的转录终止子和IRES分开。如果特定的待评估转录终止子序列提供有效的转录终止,则FP1的表达将远高于FP2的表达。如果序列不能有效终止,则FP1∶FP2表达的比值将较低。
6.1载体构建
测试构建体包含以下元件(以从5’到3’的顺序描述)。靶组织的强组成型启动子用于驱动RNA的表达,如用于在玉米叶组织中表达的泛蛋白或ScBV。最近端的可读框编码FP1(如DsRed21),其后是用于插入潜在转录终止子序列元件的限制性位点。紧靠用于待评估的转录终止子序列的插入位点下游的是脑心肌炎病毒(EMCV)IRES元件,其后是FP2(如GFP)的可读框,其后是已知的植物转录终止子。需要存在这种下游终止子以稳定未被转录终止子序列有效终止的转录物,从而允许检测编码FP2的mRNA。如果进行农杆菌介导的转化实验,则载体必须在表达盒和选择标记基因侧翼包含LB和RB T-DNA元件(图15)。
实施例7:基于nos终止子的反向重复的系统
7.1产生用于筛选终止子活性的阳性和阴性双元载体对照构建体
为测试序列的转录终止效率,产生了这样的构建体:其具有在ntpII标记基因上游的强组成型启动子(STPT启动子),其后是克隆了推定的终止子序列的短MCS以及来自根癌农杆菌nos基因的3’-UTR的反向重复,其中第一个重复元件相对于STPT启动子是反义取向的。无推定终止子序列的这种排列作为阴性对照:由于反向nos元件不引起转录物截短和多腺苷酸化,因此在得到的转录物中掺入了两种取向的nosT,这产生了具有3’发夹结构的转录物,引起dsRNA介导的基因特异性RNA降解,从而沉默nptII基因。将核酮糖-二磷酸羧化酶E9终止子区克隆进nptII基因和nos反向重复(nos-IR)之间作为阳性对照,其导致nptII转录物的正确终止和nptII的表达。
7.2克隆pENTR-A1-inv-35s-GFP-E9
插入终止子E9:用BamHI和KpnI打开Lo394-pENTR-A1-inv。用BamHI和KpnI从Lo424-pENTR-A1-inv-P2-E9分离E9终止子并定向连接入打开的Lo394。得到的构建体命名为Lo483-pENTR-A1-inv-E9。位点的取向为attL_4-E9-attR1。
7.3与mGFP5er基因一起插入CaMV 35S启动子
用HindIII/SmaI从Lo409-pENTR-35s-GFP5er-GUS分离CaMV 35S启动子和维多利亚水母(Aquorea Victoria)绿色荧光蛋白基因mGFP5er基因,并以定向连接进用 HindIII/EcoRV打开的Lo483-pENTR-A1-Inv-E9。位点的取向为attL4-35s-mGFP5er-E9-attR1。得到的构建体命名为Lo484-pENTR-A1-inv-35s-GFP-E9(SEQ ID NO:9)。
7.4克隆pENTR-C1-STPT-nptII-nosIR
插入STPT启动子和nptII基因:用BamHI打开Lo393-pENTR-C1。用BamHI从Lo441-pENTR1A-STPT-nptII-CatpA切出STPT启动子和nptII基因,并不定向(undirected)连接进打开的Lo393。通过菌落PCR和其后的对照消化鉴定带有正确取向的克隆。位点的取向为attR2-STPT-nptII-attL3。得到的构建体命名为Lo485-pENTR-C1-STPT-nptII。
7.5以有义取向插入终止子nosT
使用突出端引物Loy482-NosT-upper-SalI和Loy483-NosT-Lower-HindIII(SEQ ID NO:55和56)通过PCR从Lo114-pSUN3-Gus-nos扩增来自根癌农杆菌的胭脂碱合酶(nos)基因的257bp 3’-UTR区。
Loy482-NosT-upper-SalI (SEQ ID NO:55):
5′-AAATTTGTCGACCGATCGGTCAAACATT-3′
Loy483-NosT-Lower-HindIII(SEQ ID NO:56):
5′-AAATTTAAGCTTCCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3′
用SalI/HindIII消化得到的282 bp PCR片段并定向克隆进用SacI/HindIII打开的Lo485-pENTR-C1-STPT-nptII。位点的取向为attR2-STPT-nptII-nosT-attL3。得到的构建体命名为Lo486-pENTR-C1-STPT-nptII-nos。
7.6在nptII基因和有义nosT之间插入反义取向的第二个nos终止子元件和来自gus基因3’区的填充序列
从Lo400-pENTR1A(B)-Ln-Prom2-TypDra-nosT中将nosT和gus基因3’区的部分一起扩增。因此设计在gus序列加入SalI位点并在nosT末端加入SpeI位点和BglII位点的引物。制备了两类构建体,其中一类在nosT反向重复之间包含129bp gus间隔区序列,另一类由IR之间的155bp间隔区组成。用引物Loy494-Gus-upper-SalI-间隔区和Loy492-NosT-Lower-BglII-SpeI(SEQ ID NO:57和58)扩增较短的形式。
Loy494-Gus-upper-SalI-间隔区(SEQ ID NO:57):
5′-TTTTAGTCGACACGCTGGACTGGCATGAACT-3′
Loy492-NosT-Lower-BglII-SpeI(SEQ ID NO:58):
5′-TTTTAAGATCTACTAGTCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3′
使用Loy493-Gus-upper-SalI-间隔区和Loy492-NosT-lower-BglII-SpeI扩增较长的形式。
Loy493-Gus-upper-SalI-间隔区(SEQ ID NO:59):
5′-TTTAAGTCGACAAGTCGGCGGCTTTTCTGCT-3′
Loy492-NosT-lower-BglII-SpeI(SEQ ID NO:60):
5 ′-TTTTAAGATCTACTAGTCCGATCTAGTAACATAG
ATGACA-3′
用SalI/BglII消化得到PCR片段并连接进用SalI/BglII打开的Lo486-pENTR-C1-STPT-nptII-nos。这使得nptII可读框后为相对STPT启动子为反义取向的nos 3’-UTR、分别来自gus序列的反义取向的129 bp间隔区或155bp间隔区和有义取向的第二个nosT。位点取向为attR2-STPT-nptII-as nosT-间隔区-s nosT-attL3。得到的构建体命名为Lo503a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos(SEQ ID NO:8)(IR之间具有较短的间隔区)和Lo503b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos(SEQ ID NO:7)(IR之间具有较长的间隔区)。
7.7产生阴性对照构建体
7.7.1三重LR反应产生作为阴性对照的双元表达载体
使用LRplus重组酶混合物用质粒Lo484-pENTR-A1-inv-35s-GFP-E9、Lo376-pENTR-B2(无插入片段;SEQID NO:76)和Lo503a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos或者用Lo503b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos和Lo442-pSUN1-R4R3(SEQ IDNO:77)分别按照生产商的说明书进行三重LR反应。得到的双元植物转化载体分别命名为Lo523a-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503a(SEQ ID NO:6)和Lo523b-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503b(SEQ ID NO:5)。
7.8产生阳性对照构建体
7.8.1在IRnos上游插入E9终止子
用BamHI/EcoRV从Lo444-pGST-δ-KpnI-LUC+分离E9终止子。用SpeI打开Lo503,用Pfu torbo聚合酶将5’突出端完全补平,并用BglII再次切割。将E9终止子的BglII/EcoRv片段分别定向连接进打开的载体Lo503a和Lo503b(先用SpeI消化并补平,再用BamHI消化)。位点取向为attR2-STPT-nptII-E9-IRnos-attL3。得到的构建体命名为Lo522a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos(SEQ ID NO:4)(IR之间带有较短的间隔区)和Lo522b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos(SEQ ID NO:3)(IR之间带有较长的间隔区)。
7.8.2三重LR反应以产生作为阳性对照的双元表达载体
使用LR plus重组酶混合物用质粒Lo484-pENTR-A1-inv-35s-GFP-E9、Lo376-pENTR-B2(无插入片段;SEQ ID NO:76)和Lo522a-pENTR-C1-STPT-nptII-E9-IRnos或者用Lo522b-pENTR-C1-STPT-nptII-E9-IRnos和Lo442-pSUN1-R4R3(SEQID NO:77)分别按照生产商的说明书进行三重LR反应。得到的双元植物转化载体分别命名为Lo546a-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo522a(SEQ IDNO:2)和Lo546b-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo522b(SEQ ID NO:1)。
实施例8.使用头对头取向的两种表达盒的基于nos终止子反向重复的系统。
8.1产生用于筛选终止子活性的阳性和阴性双元载体对照构建体
为测试推定的终止子序列的转录终止效率而产生了这样的构建体:其带有β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)标记基因上游的强种子特异性启动子(BnAK启动子),其后是克隆了推定的终止子序列的短MCS和来自根癌农杆菌nos基因的3'-UTR区。此构建体中的第二个表达盒含有来自根癌农杆菌nos基因的启动子,其后是nptII标记基因和3’nos UTR。两个表达盒的取向均为头对头方式。在转基因植物中,无推定终止子序列的这种排列作为阴性对照:由于右手和左手表达盒都使用nos终止子,因此在得到的转录物中掺入了两种取向的nosT,产生带有互补的3’序列的GUS和nptII转录物,引起两种mRNA的杂交,从而导致序列特异性RNA降解以及β-葡糖醛酸糖苷酶和nptII基因的完全或部分沉默。作为阳性对照,将核酮糖二磷酸羧化酶E9终止子区克隆到GUS基因和nosT之间,引起转录物的正确截短并使GUS高水平表达。由于不存在互补序列,因此带有3’Tnos UTR的来自nptII标记基因的转录物不与GUS转录物相互作用,并且nptII表达不受损(图1A3)。
8.2克隆Lo239-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷nosT-B2
插入启动子:通过Lo229的HindIII/BamHI消化分离种子特异性启动子BnAK700,并插入载体Lo215 pENTR-MCS∷GUS∷nosT中以产生Lo235 pENTR-B-BnAK700∷GUS∷nosT。
通过Lo235与Gateway目的载体Lo125 pSUN3-GWs-NPTII的LR反应产生Lo 239(SEQ ID NO:78)(图10)。
8.3克隆Lo657-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS∷E9∷nosT∷B2
插入E9终止子:用Ecl136II切割Gateway Entry载体Lo235产生平末端。通过用EcoRV和KpnI限制性切割Lo489产生E9插入片段并用Klenow片段补平。将平末端插入片段连接进线性化载体以产生Lo654pENTR-BnAK700∷GUS.E9∷nosT。通过L0654与Gateway目标载体Lo125 pSUN3-GWs-NPTII的LR反应产生Lo657(SEQ ID NO:79)(图10)。
实施例9:通过将目的序列嵌入致死基因或报道基因内含子中开发用于鉴定终止子的体内筛选系统
将目的终止子(TOI)嵌入致死基因(包括但不仅限于白喉毒素片段A(DT-A))或报道基因(包括但不仅限于绿色荧光蛋白(GFP))的内含子中(见图16A)。如果转录终止的效率低(“渗漏”TOI),则全长致死或报道基因有一定的转录。带有嵌入TOI的内含子从转录的RNA中去除,允许翻译全长致死或报道蛋白。在使用致死基因的实例中,全长DT-A的表达杀死细胞。如果由于有效的转录终止(“严紧”TOI),TOI不允许产生连读RNA产物,则仅有部分蛋白质被翻译,植物细胞可以存活。在使用GFP的实例中,渗漏TOI得到全长GFP和发出绿色荧光的细胞。严紧TOI仅产生部分GFP蛋白,细胞不发出荧光。构建对照构建体,其没有内含子中嵌入的TOI(图16B)和具有内含子中嵌入的已知终止子NOS(图16C)。
优选地,在这些构建体中使用强组成型启动子,如玉米泛蛋白启动子(Zmubi)。在盒的末端加入章鱼碱合酶终止子(OCS)以稳定连读产物。使用的内含子序列是经修饰以提高内含子剪接效率的马铃薯内含子(PIV2)。修饰的PIV2内含子含有以下元件以在植物中促进有效的内含子识别和剪接(图17):
(1)在5’剪接位点由中等AU含量(外显子)向高AU含量(内含子)的过渡。
(2)在3’剪接位点由高AU含量(内含子)向中等AU含量(外显子)的过渡。
(3)共有5’剪接识别序列CAG/GUAAGU。“/”代表剪接位点。
(4)共有3’识别序列GCAG/G。
(5)3’剪接位点上游的共有分支点序列CURAY。
(6)紧靠分支点序列下游和3’剪接位点上游的多聚U段。
在接近内含子中心处加入BamHI限制性位点以用于插入目的转录终止子(TOI)。BamHI位点与Sau3AI相容,因此可理想地用于插入通过部分Sau3AI消化产生的基因组DNA片段。可以用其他限制性位点替换BamHI位点,以适应通过其他方法产生的TOI文库。可以将图15的盒置于双元载体中用于农杆菌介导的植物转化,或者置于基于pUC的载体中用于生物射弹转化。还参阅上面对图16的说明。
9.1载体构建
使用上文所述的亲本载体pTOI03构建图16中的构建体2(DT-A形式)。用KpnI和SpeI消化pTOI03以去除GUSint基因而留下ZmUbi启动子和OCS终止子。通过使用以下引物的重叠PCR将DT-A基因前一半的3’末端与PIV2内含子前一半的5’末端融合:
JMTOIprim1(SEQ ID NO:61)
5′-GGTTCCAAGGTACCAAAACAATGGGCGCTGATGATGTTGTTGAT-3’
JMTOIprim2(SEQ ID NO:62)
5′-AAGGTAGAAGCAGAAACTTACCTGGATACGTCACTTTGACCA-3’
JMTOIprim3(SEQ ID NO:63)
5′-TGGTCAAAGTGACGTATCCAGGTAAGTTTCTGCTTCTACCTT-3’
JMTOIprim4(SEQ ID NO:64)
5′-GGTTCCAAG GATCCATTTATTTTGAAAAAAATATTTG-3’
此重叠PCR将KpnI位点置于融合序列DT-A部分的5’末端,其后是ATG起始密码子,其之前是用于增强翻译的碱基AAAACA。它还产生DT-A和内含子序列之间的共有5’剪接位点和5’剪接位点下游133 bp的BamHI位点。通过使用下列引物的重叠PCR将PIV2内含子后一半的3’末端与DT-A基因后一半的5’末端融合:
JMTOIprim5(SEQ ID NO:65)
5’-GGTTCCAAGGATCCAGTATATAGCAATTGCTTTTC-3’
JMTOIprim6(SEQ ID NO:66)
5’-CGAGAACCTTCGTCAGTCCTGCACATCAACAAATTTTGGTCAT
AAAAAAAAAAATATTAGAAAAGTTATAAATTAAAATATAC-3’
JMTOIprim7(SEQ ID NO:67)
5’-CTAATATTTTTTTTTTTATGACCAAAATTTGTTGATGTGCAGGA
CTGACGAAGGTTCTCGCAC-3’
JMTOIprim8(SEQ ID NO:68)
5’-TTGGAACCACTAGTTTATCGCCTGACACGATTTCCTGC-3’
此重叠PCR将BamHI位点置于PCR产物的5’末端。加入了在相对于3’剪接位点+36至+26位置的11个连续U的序列片段和PIV2内含子中天然CTAAT共有分支点序列下游两个碱基以及PIv2和DT-A序列之间的共有3’剪接位点。此重叠PCR还在DT-A可读框末端产生TAA终止密码子,其后是SpeI限制酶位点。用KpnI和BamHI消化第一种重叠PCR产物,用BamHI和SpeI消化第二种PCR产物,以三向连接将两种PCR产物与用KpnI和SpeI消化的pTOI03连接,以产生pJMTO11(SEQ IDNO:71)。该构建体包含以下特征:
特征 位置(碱基)
ZmUbi启动子 (1)..(1988)
编码序列的DT-A5′末端 (2007)..(2268)
内含子 (2269)..(2488)
编码序列的DTA-A3’末端 (2489)..(2811)
OCS终止子 (2818)..(3030)
通过使用以下PCR引物将BamHI位点置于NOS终止子末端来构建图16C中的构建体3(DT-A形式):
JMTOIprim9(SEQ ID NO:69)
5’-GGTTCCAAGGATCCGATCGTTCAAACATTTGGCAA-3’
JMTOIprim10(SEQ ID NO:70)
5’-GGTTCCAAGGATCCGATCTAGTAACATAGATGACA-3’
用BamHI消化此PCR产物并连接进pJMTOl1的PIV2内含子中的唯一BamHI位点。筛选连接产生的质粒以鉴定具有正确的NOS取向的质粒,得到pJMTOI2(SEQ ID NO:72)。该构建体包含以下特征:
特征 位置(碱基)
ZmUbi启动子 (1)..(1988)
编码序列的DT-A5′末端 (2007)..(2268)
内含子5’末端 (2269)..(2380)
Nos终止子 (2387)..(2639)
内含子3′末端 (2646)..(2747)
编码序列的DTA-A3’末端 (2748)..(3070)
OCS终止子 (3077)..(3289)
实施例10:有效终止子的体内筛选
在此实施例中,将目的终止子(TOI)置于报道基因(如绿色荧光蛋白(GFP))和与植物基因没有或几乎没有同源性并且是dsRNA介导的RNA沉默的靶标的序列之间(图18)。每个这些元件都在单个启动子的控制之下,在此实施例中为玉米泛蛋白启动子(ZmUbi)。在植物中表达时,如果TOI不终止质粒(渗漏TOI),则完整转录物(包括编码GFP的区域)通过RNA沉默降解。如果TOI发挥终止子功能,则RNA将不是RNA沉默的靶标并将产生GFP,产生发出绿色荧光蛋白的植物(图18)。可以通过基因组DNA的断裂或通过更具选择性的方法获得TOI。
将BamHI位点置于图18中构建体3的GFP和间隔区之间的接点处,用于插入TOI(构建体1)或NOS终止子(构建体2,pJMTOI3,SEQ ID NO:73)。BamHI位点与Sau3AI相容,因而可以理想地用于插入通过部分Sau3AI消化产生的基因组DNA片段。可以用其他限制性位点替换BamHI位点,以适应通过其他方法产生的TOI文库。图18的盒可以置于双元载体中用于农杆菌介导的植物转化。构建体2(pJMTOI3)包含以下特征:
特征 位置(碱基)
ZmUbi启动子 (1)..(1988)
GFP (2001)..(2696)
NOS终止子 (2703)..(2955)
间隔区 (2962)..(3161)
RNAi靶标 (3162)..(3461)
OCS终止子 (3468)..(3680)
为进行此实施例中描述的终止子筛选,必须建立能有效沉默含有RNAi靶区域的RNA的植物株系。在此实施例中使用拟南芥作为宿主生物,然而该筛选可用于可被转化的任何植物物种。可以使用已建立的转化和遗传筛选技术按以下步骤获得可有效沉默的植物。
1)用图18中的构建体3(pJMTOI4,SEQ ID NO:74)转化野生型拟南芥。选择具有构建体3单拷贝并发出强绿色荧光的T1植物。构建体3(pJMTOI4)包含以下特征:
特征 位置(碱基)
ZmUbi启动子 (1)..(1988)
GFP (2001)..(2696)
间隔区 (2703)..(2902)
RNAi靶标 (2903)..(3202)
OCS终止子 (3209)..(3421)
2)用图18中的构建体4(pJMTOI5,SEQ ID NO:75)转化荧光T1植物。从此转化中选择这样的T1植物:构建体3为单拷贝为半合子,构建体4为单拷贝,并且不再发出绿色荧光(沉默植物)。构建体4(pJMTOI5)包含以下特征:
特征 位置(碱基)
ZmUbi启动子 (1)..(1988)
RNAi靶标有义 (2001)..(2300)
间隔区 (2309)..(2595)
RNAi靶标反义 (2602)..(2901)
NOS终止子 (2908)..(3160)
3)得到关于构建体4(pJMTOI5)的T2植物,其对于构建体4为纯合的、构建体3为无效的。为了产生额外的沉默植物,可以从步骤3中分离的植物得到T3植物。
建立含有构建体4的拟南芥沉默株系之后,可以用含有质粒TOI文库的构建体1和对照构建体2和3(分别为图18中pJMTOI3和pJMTOI4)转化此株系。T1植物发出程度相似的荧光,选择转化了构建体2的植物用于进一步分析。如果选择的植物具有单一整合体,则靶定GFP和RNAi靶区域的定量RT-PCR可以确定实验TOI是否作为有效的终止子。用构建体2(pJMTOI3)和构建体3(pJMTOI4)的转化的植物的RT-PCR作为对照。如果选择的植物具有构建体1的多个整合体,则可以从T2世代获得单一整合体。可以通过PCR扩增和克隆来自选择的植物的TOI。
实施例11:用于鉴定目的终止子的测定
通过轰击植物组织或培养细胞(实施例11.1)、通过PEG介导(或类似方法)的将DNA引入植物原生质体(实施例11.2)或通过农杆菌介导的转化(实施例11.3)进行这些实验。用于这些实验的靶组织可以是植物组织(如已描述叶组织可最好地支持IRES介导的翻译(Urwin等,2000))、培养的植物细胞(如玉米BMS)或用于农杆菌方案的植物胚。
可以通过计算机芯片上的转录终止子序列筛选或通过随机基因组片段文库得到作为潜在转录终止子序列的序列。通过定量报道基因的表达或使用本领域方案通过RT-PCR测定两种不同报道基因的表达比率,以确定潜在的强和严紧的终止子候选者。
11.1使用微粒轰击进行瞬时测定
使用Qiagen质粒试剂盒(目录号12143)分离质粒构建体。按照Sanford等(1993)所述方案将DNA沉淀到0.6μM金颗粒(Bio-Rad目录号165-2262)上并使用PDS-1000/He系统设备(Bio-Rad)加速到靶组织上(两周龄的玉米叶、BMS培养的细胞等)。室温下在无菌条件下进行所有的DNA沉淀和轰击步骤。
将2mg金颗粒(2mg/3次轰击)重悬于100%乙醇,接着在Eppendorf管中以2000转/分钟(rpm)在Beckman Microfuge 18离心机中离心。将沉淀在无菌蒸馏水中洗涤一次,离心并重悬于25μL 1μg/μL的总DNA中。在管中加入以下试剂:220μL H2O、250μL 2.5M CaCl2、50μL 0.1M亚精胺、游离碱。将DNA溶液短暂涡旋后置于冰上5分钟,接着在BeckmanMicrofuge 18离心机中以500rpm离心5分钟。除去上清液。将沉淀重悬于600μL乙醇,接着以14000rpm离心1分钟。将最终的沉淀重悬于36μL乙醇,立即使用或在轰击前在冰上存放长达4小时。就轰击而言,将二周龄玉米叶剪下约1cm长,置于2英寸直径的无菌Whatman滤纸上。对于BMS培养的细胞的情况,将5mL一周龄悬浮细胞缓慢真空过滤到置于滤器上的2英寸直径滤纸单元上以除去多余的液体。轰击之前,将盛有植物材料的滤纸置于渗透诱导培养基(N6 1-100-25,0.2M甘露醇、0.2M山梨糖醇)上在27℃置于黑暗中2-3小时。轰击前几分钟,将滤纸从培养基上取出并置于打开的无菌培养皿上以使愈伤组织表面部分干燥。为保持植物材料的位置,将灭菌的丝网筛放在样品上。用10μL金-DNA溶液轰击每个平板,对于叶材料以2200psi轰击一次,对于BMS培养的细胞以1100psi轰击两次。轰击之后,将盛有样品的滤纸转移至MS基础培养基上,并在黑暗中以27℃温育2天,接着进行瞬时测定。使用本领域的方案通过定量报道基因表达或RT-PCR测定报道基因的瞬时表达水平,以确定潜在的强且严紧的终止子候选者。
11.2使用原生质体的瞬时测定
按照Sheen(1990)开发的方案进行原生质体的分离。在25℃下将玉米苗在黑暗中保持10天并在制备原生质体以前光照20小时。将叶的中间部分剪成0.5mm的条(长度约6cm),并在含有1%(重量/体积)纤维素RS、0.1%(重量/体积)离析酶R10(均来自Yakult Honsha,Nishinomiya,Japan)、0.6M甘露醇、10mM Mes(pH5.7)、1mM CaCl2、1mM MgCl2、10mM β-巯基乙醇和0.1%BSA(重量/体积)的酶溶液中23℃下温育3小时,接着以80rpm轻柔摇动10分钟以释放原生质体。通过以100×g离心2分钟、在冷的0.6M甘露醇溶液中洗涤一次、离心并重悬于冷的0.6M甘露醇(2×106/mL)来收集原生质体。
将总体积100μL无菌水中的总计50μg质粒DNA加入0.5mL玉米原生质体悬液(2×106个细胞/mL)中并轻柔混合。加入0.5mL PEG溶液(40%PEG 4000、100mM CaNO3、0.5甘露醇)并轻柔摇动下在70℃预热,接着加入4.5mL MM溶液(0.6M甘露醇、15mM MgCl2和0.1%MES)。将此混合物在室温下温育15分钟。通过以600rpm沉淀5分钟并重悬于1.0mLMMB溶液[0.6M甘露醇,4mM Mes(pH5.7)和雀麦草花叶病毒(BMV)盐(任选)]将原生质体洗涤两次,接着在黑暗中以25℃温育48小时。最终洗涤步骤之后,将原生质体收集在3mL MMB培养基中,并在25℃黑暗中温育48小时。使用本领域的方案通过定量报道基因表达或RT-PCR来测定报道基因的瞬时表达水平,以确定潜在的强且严紧的终止子候选者。
11.3双子叶植物和单子叶植物中农杆菌介导的转化
11.3.1转基因拟南芥(哥伦比亚)植物的转化和再生
为产生转基因拟南芥植物,用上文所述的多种载体构建体转化根癌农杆菌(菌株C58C1 pGV2260)。接着将农杆菌菌株用于产生转基因植物。为此,将一个转化的农杆菌菌落在4mL培养基(培养基:含50μg/mL卡那霉素和25μg/mL利福平的YEB培养基)中以28℃温育过夜。接着将此培养物用于接种相同培养基中的400mL培养物,将其温育过夜(28℃,220rpm)并离心(GSA转子,8000rpm,20分钟)。将沉淀重悬于渗入培养基(1/2MS培养基、0.5g/L MES、pH5.8、50g/L蔗糖)。将悬液装入植物箱(Duchefa),并加入100ml SILWET L-77(用聚环氧烷修饰的七甲基三硅氧烷;Osi Specialties Inc.,目录号P030196)至终浓度为0.02%。在干燥器中将装有8至12株植物的植物箱暴露于真空10至15分钟,接着自然充气。重复2或3次。其后将所有植物种在装有湿润土壤的花盆中,并在长日照条件下(日间温度22至24℃,夜间温度19℃,相对大气湿度65%)培养。6周后收获种子。
或者可以通过根转化获得转基因拟南芥植物。使用最大为8周龄植物的白色根嫩枝。为此,使用保持在无菌条件下1MS培养基(1%蔗糖、100mg/L肌醇、1.0mg/L硫胺、0.5mg/L吡哆醇、0.5mg/L烟酸、0.5g MES,pH5.7、0.8%琼脂)中的植物。将根在愈伤组织诱导培养基上培养3天(1×Gamborg B5培养基、2%葡萄糖、0.5g/L巯基乙醇、0.8%琼脂、0.5mg/L2,4-D(2,4-二氯代苯氧基乙酸)、0.05mg/L细胞分裂素)。将长度0.5cm的根节段转移至10至20mL液体愈伤组织诱导培养基(组成如上述,但未补充琼脂)中,接种1mL上述过夜农杆菌培养物(28℃、200rpm在LB中培养)并摇动2分钟。使过剩的培养基流出后,将根外植体转移至具有琼脂的愈伤组织诱导培养基,其后转移至无琼脂的愈伤组织诱导液体培养基(含500mg/L羧噻吩青霉素,SmithKline Beecham Pharma GmbH,Munich),摇动下温育并最终转移至根诱导培养基(5mg/L 2-异戊烯基腺嘌呤磷酸、0.15mg/L吲哚-3-乙酸、50mg/L卡那霉素、500mg/L羧噻吩青霉素)。5周后并且更换1或2次培养基之后,将小绿色嫩枝转移至萌发培养基(1MS培养基、1%蔗糖、100mg/L肌醇、1.0mg/L硫胺、0.5mg/L吡哆醇、0.5mg/L烟酸、0.5g MES,pH5.7、0.8%琼脂)并再生成植物。
11.3.2作物植物的转化和再生
就转化作物植物的目的而言,可以实施使用标准转化和再生技术的农杆菌介导的植物转化(Gelvin 1995;Glick 1993)。例如,可以通过子叶或下胚轴转化来转化油菜(Moloney 1989;De Block 1989)。农杆菌和植物的选择中使用的抗生素取决于用于转化的双元载体和农杆菌菌株。一般使用卡那霉素作为选择植物标记进行油菜的选择。可以使用例如Mlynarova(1994)所述技术进行亚麻(Linum usitatissimum)中的农杆菌介导的基因转移。可以使用如EP-A1 0 424 047或EP-A1 0 397 687、US 5,376,543、US 5,169,770中所述技术进行大豆的转化。可以使用如US 5,591,616中所述技术进行玉米或其他单子叶植物的转化。使用粒子轰击、聚乙二醇介导的DNA摄取或通过碳化硅纤维技术的植物转化描述于例如Freeling & Walbot(1993)″The maize handbook″ISBN 3-540-97826-7,Springer Verlag New York)。
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<223>RB
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gattagcctt ttcaatttca gaaagaatgc taacccacag atggttagag aggcttacgc 120
agcaggtctc atcaagacga tctacccgag caataatctc caggaaatca aataccttcc 180
caagaaggtt aaagatgcag tcaaaagatt caggactaac tgcatcaaga acacagagaa 240
agatatattt ctcaagatca gaagtactat tccagtatgg acgattcaag gcttgcttca 300
caaaccaagg caagtaatag agattggagt ctctaaaaag gtagttccca ctgaatcaaa 360
ggccatggag tcaaagattc aaatagagga cctaacagaa ctcgccgtaa agactggcga 420
acagttcata cagagtctct tacgactcaa tgacaagaag aaaatcttcg tcaacatggt 480
ggagcacgac acacttgtct actccaaaaa tatcaaagat acagtctcag aagaccaaag 540
ggcaattgag acttttcaac aaagggtaat atccggaaac ctcctcggat tccattgccc 600
agctatctgt cactttattg tgaagatagt ggaaaaggaa ggtggctcct acaaatgcca 660
tcattgcgat aaaggaaagg ccatcgttga agatgcctct gccgacagtg gtcccaaaga 720
tggaccccca cccacgagga gcatcgtgga aaaagaagac gttccaacca cgtcttcaaa 780
gcaagtggat tgatgtgata tctccactga cgtaagggat gacgcacaat cccactatcc 840
ttcgcaagac ccttcctcta tataaggaag ttcatttcat ttggagagaa cacgggggac 900
tctagaggat ccaaggagat ataacaatga agactaatct ttttctcttt ctcatctttt 960
cacttctcct atcattatcc tcggccgaat tcagtaaagg agaagaactt ttcactggag 1020
ttgtcccaat tcttgttgaa ttagatggtg atgttaatgg gcacaaattt tctgtcagtg 1080
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gaaaactacc tgttccatgg ccaacacttg tcactacttt ctcttatggt gttcaatgct 1200
tttcaagata cccagatcat atgaagcggc acgacttctt caagagcgcc atgcctgagg 1260
gatacgtgca ggagaggacc atcttcttca aggacgacgg gaactacaag acacgtgctg 1320
aagtcaagtt tgagggagac accctcgtca acaggatcga gcttaaggga atcgatttca 1380
aggaggacgg aaacatcctc ggccacaagt tggaatacaa ctacaactcc cacaacgtat 1440
acatcatggc cgacaagcaa aagaacggca tcaaagccaa cttcaagacc cgccacaaca 1500
tcgaagacgg cggcgtgcaa ctcgctgatc attatcaaca aaatactcca attggcgatg 1560
gccctgtcct tttaccagac aaccattacc tgtccacaca atctgccctt tcgaaagatc 1620
ccaacgaaaa gagagaccac atggtccttc ttgagtttgt aacagctgct gggattacac 1680
atggcatgga tgaactatac aaacatgatg agctttaaga gaacggatcc ccatctgcgg 1740
ccgcctcgag catatgctag aggatcctct agctagagct ttcgttcgta tcatcggttt 1800
cgacaacgtt cgtcaagttc aatgcatcag tttcattgcg cacacaccag aatcctactg 1860
agtttgagta ttatggcatt gggaaaactg tttttcttgt accatttgtt gtgcttgtaa 1920
tttactgtgt tttttattcg gttttcgcta tcgaactgtg aaatggaaat ggatggagaa 1980
gagttaatga atgatatggt ccttttgttc attctcaaat taatattatt tgttttttct 2040
cttatttgtt gtgtgttgaa tttgaaatta taagagatat gcaaacattt tgttttgagt 2100
aaaaatgtgt caaatcgtgg cctctaatga ccgaagttaa tatgaggagt aaaacacttg 2160
tagttgtacc attatgctta ttcactaggc aacaaatata ttttcagacc tagaaaagct 2220
gcaaatgtta ctgaatacaa gtatgtcctc ttgtgtttta gacatttatg aactttcctt 2280
tatgtaattt tccagaatcc ttgtcagatt ctaatcattg ctttataatt atagttatac 2340
tcatggattt gtagttgagt atgaaaatat tttttaatgc attttatgac ttgccaattg 2400
attgacaaca tgcatcaatc gaccgggtac ccaagtttgt acaaaaaagc aggctggtac 2460
ccggggatcc tctaggtcga ccagatctga tatctgcggc cgcctcgagc atatgggcat 2520
gcaagcttgg cgtaatcatg gacccagctt tcttgtacaa agtggggtac ccggggatcc 2580
tgatagctta tactcaaatt caacaagtta tatataaatg tatagatact acaatatcat 2640
taacaaaagt caccttaaat aaatacacat atcttttatg ttctctattg ttttgcgtac 2700
gctaacacaa tttctcatat gcaaaaggat gaatgagtaa caaattacct cataagaaca 2760
atcatctttg cttacatact aatacaataa tcactcaatc aaccaataac atcaatcaca 2820
taggtttaca tacaataatc actcaatcaa cttcataaga agaatcatgt ttacttaatt 2880
catcaattat ccccaaaaac accactatta agtataaact acaacatatt tgtagtgatg 2940
ggtcaacatt tttatcatat ttaaactcgg gttccctcaa atcgagaaat agtgaacatg 3000
taatattaat tttaaatcgc aattacagaa attaattgaa tttggtcaaa tggacagaat 3060
tttatagatt gggtggaact agaaaaaaaa aaaaaaagag tatagggtga attgagtaca 3120
tgaaagtaca tggtaatcct agttaaacgc ataatacatg tgggttcatt tgtatttttt 3180
tgtaacttac gagtaaactg gctacaacaa aaaaaaatta gaagattttt ttgttttgta 3240
gaaaacccta attttagtta tagttgtata actttgataa aattataaaa ttgtattacg 3300
aaaaaagtaa taagatattc aaaaaagcct agaataacgt atatgactat gagcatgaaa 3360
ctgcaagtca aatgctgaca gacaaccata aacaaaagaa attaaataga gataccttta 3420
aaataagtaa aatttcattt ataaaaaatc tactttcttg tgaatctgtc acgttcaata 3480
atttgaagac cactcaacat acaaggtaaa taatgaaaaa taaaatctac caaaatttca 3540
atcattatta tcttccaaaa aaacaaaatt atacagatga tgatggtgat atggaacttc 3600
gattggctaa tattcactgt gtctctaaaa accatccact tatcaagata agatggaccc 3660
tacactcatc caatctaaac cagtatctca agattcttat ctaattacat cattctctac 3720
cgttagatga aattgaccat taaccctacc ataactccat acaccgcgag atactggatt 3780
aaccaaatcg agatcatcgt agccgtccga tcaacaagta ccatctcttg aaatactcga 3840
aatcctcata agtccgtccc tctttgctct cactatcaaa actctgaatt tcgatttcat 3900
ctagagtcga gcccgggcga tatcggatct cgactctagt cgagggccca tgggagcttg 3960
gattgaacaa gatggattgc acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg 4020
ctatgactgg gcacaacaga caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc 4080
gcaggggcgc ccggttcttt ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca 4140
ggacgaggca gcgcggctat cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct 4200
cgacgttgtc actgaagcgg gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga 4260
tctcctgtca tctcaccttg ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg 4320
gcggctgcat acgcttgatc cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat 4380
cgagcgagca cgtactcgga tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga 4440
gcatcagggg ctcgcgccag ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgcgca tgcccgacgg 4500
cgaggatctc gtcgtgaccc atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg 4560
ccgcttttct ggattcatcg actgtggccg gctgggtgtg gcggaccgct atcaggacat 4620
agcgttggct acccgtgata ttgctgaaga gcttggcggc gaatgggctg accgcttcct 4680
cgtgctttac ggtatcgccg ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga 4740
cgagttcttc tgagcgggac ccaagctagc ttcgacggat cctctagcat atgctcgagg 4800
cggccgcaga tatcagatcc tctagctaga gctttcgttc gtatcatcgg tttcgacaac 4860
gttcgtcaag ttcaatgcat cagtttcatt gcgcacacac cagaatccta ctgagtttga 4920
gtattatggc attgggaaaa ctgtttttct tgtaccattt gttgtgcttg taatttactg 4980
tgttttttat tcggttttcg ctatcgaact gtgaaatgga aatggatgga gaagagttaa 5040
tgaatgatat ggtccttttg ttcattctca aattaatatt atttgttttt tctcttattt 5100
gttgtgtgtt gaatttgaaa ttataagaga tatgcaaaca ttttgttttg agtaaaaatg 5160
tgtcaaatcg tggcctctaa tgaccgaagt taatatgagg agtaaaacac ttgtagttgt 5220
accattatgc ttattcacta ggcaacaaat atattttcag acctagaaaa gctgcaaatg 5280
ttactgaata caagtatgtc ctcttgtgtt ttagacattt atgaactttc ctttatgtaa 5340
ttttccagaa tccttgtcag attctaatca ttgctttata attatagtta tactcatgga 5400
tttgtagttg agtatgaaaa tattttttaa tgcattttat gacttgccaa ttgattgaca 5460
acatgcatca atcgacctgc agcccaagct tgatctagtc cgatctagta acatagatga 5520
caccgcgcgc gataatttat cctagtttgc gcgctatatt ttgttttcta tcgcgtatta 5580
aatgtataat tgcgggactc taatcataaa aacccatctc ataaataacg tcatgcatta 5640
catgttaatt attacatgct taacgtaatt caacagaaat tatatgataa tcatcgcaag 5700
accggcaaca ggattcaatc ttaagaaact ttattgccaa atgtttgaac gatcggggaa 5760
attcgagctc ggtagcaatt cccgaggctg tagccgacga tggtgcgcca ggagagttgt 5820
tgattcattg tttgcctccc tgctgcggtt tttcaccgaa gttcatgcca gtccagcgtt 5880
tttgcagcag aaaagccgcc gacttgtcga ccgatcggtc aaacatttgg caataaagtt 5940
tcttaagatt gaatcctgtt gccggtcttg cgatgattat catataattt ctgttgaatt 6000
acgttaagca tgtaataatt aacatgtaat gcatgacgtt atttatgaga tgggttttta 6060
tgattagagt cccgcaatta tacatttaat acgcgataga aaacaaaata tagcgcgcaa 6120
actaggataa attatcgcgc gcggtgtcat ctatgttact agatcgggaa gcttggcgta 6180
atcatggcaa ctttattata caaagttggc attataaaaa agcattgctt atcaatttgt 6240
tgcaacgaac aggtcactat cagtcaaaat aaaatcatta ttcaacttta ttatacatag 6300
ttgataattc actggccgga tctgcttggt aataattgtc attagattgt ttttatgcat 6360
agatgcactc gaaatcagcc aattttagac aagtatcaaa cggatgttaa ttcagtacat 6420
taaagacgtc cgcaatgtgt tattaagttg tctaagcgtc aatttgttta caccacaata 6480
tatcctgcca ccagccagcc aacagctccc cgaccggcag ctcggcacaa aatcaccacg 6540
cgttaccacc acgccggccg gccgcatggt gttgaccgtg ttcgccggca ttgccgagtt 6600
cgagcgttcc ctaatcatcg accgcacccg gagcgggcgc gaggccgcca aggcccgagg 6660
cgtgaagttt ggcccccgcc ctaccctcac cccggcacag atcgcgcacg cccgcgagct 6720
gatcgaccag gaaggccgca ccgtgaaaga ggcggctgca ctgcttggcg tgcatcgctc 6780
gaccctgtac cgcgcacttg agcgcagcga ggaagtgacg cccaccgagg ccaggcggcg 6840
cggtgccttc cgtgaggacg cattgaccga ggccgacgcc ctggcggccg ccgagaatga 6900
acgccaagag gaacaagcat gaaaccgcac caggacggcc aggacgaacc gtttttcatt 6960
accgaagaga tcgaggcgga gatgatcgcg gccgggtacg tgttcgagcc gcccgcgcac 7020
gtctcaaccg tgcggctgca tgaaatcctg gccggtttgt ctgatgccaa gctggcggcc 7080
tggccggcca gcttggccgc tgaagaaacc gagcgccgcc gtctaaaaag gtgatgtgta 7140
tttgagtaaa acagcttgcg tcatgcggtc gctgcgtata tgatgcgatg agtaaataaa 7200
caaatacgca aggggaacgc atgaaggtta tcgctgtact taaccagaaa ggcgggtcag 7260
gcaagacgac catcgcaacc catctagccc gcgccctgca actcgccggg gccgatgttc 7320
tgttagtcga ttccgatccc cagggcagtg cccgcgattg ggcggccgtg cgggaagatc 7380
aaccgctaac cgttgtcggc atcgaccgcc cgacgattga ccgcgacgtg aaggccatcg 7440
gccggcgcga cttcgtagtg atcgacggag cgccccaggc ggcggacttg gctgtgtccg 7500
cgatcaaggc agccgacttc gtgctgattc cggtgcagcc aagcccttac gacatatggg 7560
ccaccgccga cctggtggag ctggttaagc agcgcattga ggtcacggat ggaaggctac 7620
aagcggcctt tgtcgtgtcg cgggcgatca aaggcacgcg catcggcggt gaggttgccg 7680
aggcgctggc cgggtacgag ctgcccattc ttgagtcccg tatcacgcag cgcgtgagct 7740
acccaggcac tgccgccgcc ggcacaaccg ttcttgaatc agaacccgag ggcgacgctg 7800
cccgcgaggt ccaggcgctg gccgctgaaa ttaaatcaaa actcatttga gttaatgagg 7860
taaagagaaa atgagcaaaa gcacaaacac gctaagtgcc ggccgtccga gcgcacgcag 7920
cagcaaggct gcaacgttgg ccagcctggc agacacgcca gccatgaagc gggtcaactt 7980
tcagttgccg gcggaggatc acaccaagct gaagatgtac gcggtacgcc aaggcaagac 8040
cattaccgag ctgctatctg aatacatcgc gcagctacca gagtaaatga gcaaatgaat 8100
aaatgagtag atgaatttta gcggctaaag gaggcggcat ggaaaatcaa gaacaaccag 8160
gcaccgacgc cgtggaatgc cccatgtgtg gaggaacggg cggttggcca ggcgtaagcg 8220
gctgggttgt ctgccggccc tgcaatggca ctggaacccc caagcccgag gaatcggcgt 8280
gagcggtcgc aaaccatccg gcccggtaca aatcggcgcg gcgctgggtg atgacctggt 8340
ggagaagttg aaggccgcgc aggccgccca gcggcaacgc atcgaggcag aagcacgccc 8400
cggtgaatcg tggcaagcgg ccgctgatcg aatccgcaaa gaatcccggc aaccgccggc 8460
agccggtgcg ccgtcgatta ggaagccgcc caagggcgac gagcaaccag attttttcgt 8520
tccgatgctc tatgacgtgg gcacccgcga tagtcgcagc atcatggacg tggccgtttt 8580
ccgtctgtcg aagcgtgacc gacgagctgg cgaggtgatc cgctacgagc ttccagacgg 8640
gcacgtagag gtttccgcag ggccggccgg catggccagt gtgtgggatt acgacctggt 8700
actgatggcg gtttcccatc taaccgaatc catgaaccga taccgggaag ggaagggaga 8760
caagcccggc cgcgtgttcc gtccacacgt tgcggacgta ctcaagttct gccggcgagc 8820
cgatggcgga aagcagaaag acgacctggt agaaacctgc attcggttaa acaccacgca 8880
cgttgccatg cagcgtacga agaaggccaa gaacggccgc ctggtgacgg tatccgaggg 8940
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cgagatcgag ctagctgatt ggatgtaccg cgagatcaca gaaggcaaga acccggacgt 9060
gctgacggtt caccccgatt actttttgat cgatcccggc atcggccgtt ttctctaccg 9120
cctggcacgc cgcgccgcag gcaaggcaga agccagatgg ttgttcaaga cgatctacga 9180
acgcagtggc agcgccggag agttcaagaa gttctgtttc accgtgcgca agctgatcgg 9240
gtcaaatgac ctgccggagt acgatttgaa ggaggaggcg gggcaggctg gcccgatcct 9300
agtcatgcgc taccgcaacc tgatcgaggg cgaagcatcc gccggttcct aatgtacgga 9360
gcagatgcta gggcaaattg ccctagcagg ggaaaaaggt cgaaaaggtc tctttcctgt 9420
ggatagcacg tacattggga acccaaagcc gtacattggg aaccggaacc cgtacattgg 9480
gaacccaaag ccgtacattg ggaaccggtc acacatgtaa gtgactgata taaaagagaa 9540
aaaaggcgat ttttccgcct aaaactcttt aaaacttatt aaaactctta aaacccgcct 9600
ggcctgtgca taactgtctg gccagcgcac agccgaagag ctgcaaaaag cgcctaccct 9660
tcggtcgctg cgctccctac gccccgccgc ttcgcgtcgg cctatcgcgg ccgctggccg 9720
ctcaaaaatg gctggcctac ggccaggcaa tctaccaggg cgcggacaag ccgcgccgtc 9780
gccactcgac cgccggcgcc cacatcaagg caccctgcct cgcgcgtttc ggtgatgacg 9840
gtgaaaacct ctgacacatg cagctcccgg agacggtcac agcttgtctg taagcggatg 9900
ccgggagcag acaagcccgt cagggcgcgt cagcgggtgt tggcgggtgt cggggcgcag 9960
ccatgaccca gtcacgtagc gatagcggag tgtatactgg cttaactatg cggcatcaga 10020
gcagattgta ctgagagtgc accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag 10080
aaaataccgc atcaggcgct cttccgcttc ctcgctcact gactcgctgc gctcggtcgt 10140
tcggctgcgg cgagcggtat cagctcactc aaaggcggta atacggttat ccacagaatc 10200
aggggataac gcaggaaaga acatgtgagc aaaaggccag caaaaggcca ggaaccgtaa 10260
aaaggccgcg ttgctggcgt ttttccatag gctccgcccc cctgacgagc atcacaaaaa 10320
tcgacgctca agtcagaggt ggcgaaaccc gacaggacta taaagatacc aggcgtttcc 10380
ccctggaagc tccctcgtgc gctctcctgt tccgaccctg ccgcttaccg gatacctgtc 10440
cgcctttctc ccttcgggaa gcgtggcgct ttctcatagc tcacgctgta ggtatctcag 10500
ttcggtgtag gtcgttcgct ccaagctggg ctgtgtgcac gaaccccccg ttcagcccga 10560
ccgctgcgcc ttatccggta actatcgtct tgagtccaac ccggtaagac acgacttatc 10620
gccactggca gcagccactg gtaacaggat tagcagagcg aggtatgtag gcggtgctac 10680
agagttcttg aagtggtggc ctaactacgg ctacactaga aggacagtat ttggtatctg 10740
cgctctgctg aagccagtta ccttcggaaa aagagttggt agctcttgat ccggcaaaca 10800
aaccaccgct ggtagcggtg gtttttttgt ttgcaagcag cagattacgc gcagaaaaaa 10860
aggatctcaa gaagatcctt tgatcttttc tacggggtct gacgctcagt ggaacgaaaa 10920
ctcacgttaa gggattttgg tcatgcatga tatatctccc aatttgtgta gggcttatta 10980
tgcacgctta aaaataataa aagcagactt gacctgatag tttggctgtg agcaattatg 11040
tgcttagtgc atctaacgct tgagttaagc cgcgccgcga agcggcgtcg gcttgaacga 11100
atttctagct agacattatt tgccgactac cttggtgatc tcgcctttca cgtagtggac 11160
aaattcttcc aactgatctg cgcgcgaggc caagcgatct tcttcttgtc caagataagc 11220
ctgtctagct tcaagtatga cgggctgata ctgggccggc aggcgctcca ttgcccagtc 11280
ggcagcgaca tccttcggcg cgattttgcc ggttactgcg ctgtaccaaa tgcgggacaa 11340
cgtaagcact acatttcgct catcgccagc ccagtcgggc ggcgagttcc atagcgttaa 11400
ggtttcattt agcgcctcaa atagatcctg ttcaggaacc ggatcaaaga gttcctccgc 11460
cgctggacct accaaggcaa cgctatgttc tcttgctttt gtcagcaaga tagccagatc 11520
aatgtcgatc gtggctggct cgaagatacc tgcaagaatg tcattgcgct gccattctcc 11580
aaattgcagt tcgcgcttag ctggataacg ccacggaatg atgtcgtcgt gcacaacaat 11640
ggtgacttct acagcgcgga gaatctcgct ctctccaggg gaagccgaag tttccaaaag 11700
gtcgttgatc aaagctcgcc gcgttgtttc atcaagcctt acggtcaccg taaccagcaa 11760
atcaatatca ctgtgtggct tcaggccgcc atccactgcg gagccgtaca aatgtacggc 11820
cagcaacgtc ggttcgagat ggcgctcgat gacgccaact acctctgata gttgagtcga 11880
tacttcggcg atcaccgctt cccccatgat gtttaacttt gttttagggc gactgccctg 11940
ctgcgtaaca tcgttgctgc tccataacat caaacatcga cccacggcgt aacgcgcttg 12000
ctgcttggat gcccgaggca tagactgtac cccaaaaaaa cagtcataac aagccatgaa 12060
aaccgccact gcgttccatg gacatacaaa tggacgaacg gataaacctt ttcacgccct 12120
tttaaatatc cgattattct aataaacgct cttttctctt aggtttaccc gccaatatat 12180
cctgtcaaac actgatagtt taaactgaag gcgggaaacg acaatcagat ctagtaggaa 12240
acagctatga ccatgattac gccaagctat cgattacgcc aagctat 12287
<210>2
<211>12261
<212>DNA
<213>双元表达载体Lo546a-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo522a
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(21)
<223>attB4重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(49)..(905)
<223>CaMV 35S启动子
<220>
<221>misc_feature
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<223>编码mGFP5er
<220>
<221>终止子
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<222>(2432)..(2455)
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<223>STPT启动子
<220>
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<222>(3930)..(4777)
<223>编码nptII
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<221>终止子
<222>(4816)..(5494)
<223>E9终止子
<220>
<221>终止子
<222>(5500)..(5752)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(5881)..(6143)
<223>nos终止子
<g20>
<221>misc_feature
<222>(6257)..(6277)
<223>互补序列:attB3重组位点
<220>
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<222>(6296)..(6510)
<223>LB
<220>
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<222>(8219)..(9326)
<223>repA
<220>
<221>rep_origin
<222>(10075)..(10921)
<223>互补序列:ColE1
<220>
<221>misc_feature
<222>(11090)..(11881)
<223>互补序列:aadA标记(spectomycin)
<220>
<221>misc_feature
<222>(12055)..(12200)
<223>RB
<400>2
caactttgta tagaaaagtt ggccatgatt acgccaagct tgcatgcctg caggtcccca 60
gattagcctt ttcaatttca gaaagaatgc taacccacag atggttagag aggcttacgc 120
agcaggtctc atcaagacga tctacccgag caataatctc caggaaatca aataccttcc 180
caagaaggtt aaagatgcag tcaaaagatt caggactaac tgcatcaaga acacagagaa 240
agatatattt ctcaagatca gaagtactat tccagtatgg acgattcaag gcttgcttca 300
caaaccaagg caagtaatag agattggagt ctctaaaaag gtagttccca ctgaatcaaa 360
ggccatggag tcaaagattc aaatagagga cctaacagaa ctcgccgtaa agactggcga 420
acagttcata cagagtctct tacgactcaa tgacaagaag aaaatcttcg tcaacatggt 480
ggagcacgac acacttgtct actccaaaaa tatcaaagat acagtctcag aagaccaaag 540
ggcaattgag acttttcaac aaagggtaat atccggaaac ctcctcggat tccattgccc 600
agctatctgt cactttattg tgaagatagt ggaaaaggaa ggtggctcct acaaatgcca 660
tcattgcgat aaaggaaagg ccatcgttga agatgcctct gccgacagtg gtcccaaaga 720
tggaccccca cccacgagga gcatcgtgga aaaagaagac gttccaacca cgtcttcaaa 780
gcaagtggat tgatgtgata tctccactga cgtaagggat gacgcacaat cccactatcc 840
ttcgcaagac ccttcctcta tataaggaag ttcatttcat ttggagagaa cacgggggac 900
tctagaggat ccaaggagat ataacaatga agactaatct ttttctcttt ctcatctttt 960
cacttctcct atcattatcc tcggccgaat tcagtaaagg agaagaactt ttcactggag 1020
ttgtcccaat tcttgttgaa ttagatggtg atgttaatgg gcacaaattt tctgtcagtg 1080
gagagggtga aggtgatgca acatacggaa aacttaccct taaatttatt tgcactactg 1140
gaaaactacc tgttccatgg ccaacacttg tcactacttt ctcttatggt gttcaatgct 1200
tttcaagata cccagatcat atgaagcggc acgacttctt caagagcgcc atgcctgagg 1260
gatacgtgca ggagaggacc atcttcttca aggacgacgg gaactacaag acacgtgctg 1320
aagtcaagtt tgagggagac accctcgtca acaggatcga gcttaaggga atcgatttca 1380
aggaggacgg aaacatcctc ggccacaagt tggaatacaa ctacaactcc cacaacgtat 1440
acatcatggc cgacaagcaa aagaacggca tcaaagccaa cttcaagacc cgccacaaca 1500
tcgaagacgg cggcgtgcaa ctcgctgatc attatcaaca aaatactcca attggcgatg 1560
gccctgtcct tttaccagac aaccattacc tgtccacaca atctgccctt tcgaaagatc 1620
ccaacgaaaa gagagaccac atggtccttc ttgagtttgt aacagctgct gggattacac 1680
atggcatgga tgaactatac aaacatgatg agctttaaga gaacggatcc ccatctgcgg 1740
ccgcctcgag catatgctag aggatcctct agctagagct ttcgttcgta tcatcggttt 1800
cgacaacgtt cgtcaagttc aatgcatcag tttcattgcg cacacaccag aatcctactg 1860
agtttgagta ttatggcatt gggaaaactg tttttcttgt accatttgtt gtgcttgtaa 1920
tttactgtgt tttttattcg gttttcgcta tcgaactgtg aaatggaaat ggatggagaa 1980
gagttaatga atgatatggt ccttttgttc attctcaaat taatattatt tgttttttct 2040
cttatttgtt gtgtgttgaa tttgaaatta taagagatat gcaaacattt tgttttgagt 2100
aaaaatgtgt caaatcgtgg cctctaatga ccgaagttaa tatgaggagt aaaacacttg 2160
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gcaaatgtta ctgaatacaa gtatgtcctc ttgtgtttta gacatttatg aactttcctt 2280
tatgtaattt tccagaatcc ttgtcagatt ctaatcattg ctttataatt atagttatac 2340
tcatggattt gtagttgagt atgaaaatat tttttaatgc attttatgac ttgccaattg 2400
attgacaaca tgcatcaatc gaccgggtac ccaagtttgt acaaaaaagc aggctggtac 2460
ccggggatcc tctaggtcga ccagatctga tatctgcggc cgcctcgagc atatgggcat 2520
gcaagcttgg cgtaatcatg gacccagctt tcttgtacaa agtggggtac ccggggatcc 2580
tgatagctta tactcaaatt caacaagtta tatataaatg tatagatact acaatatcat 2640
taacaaaagt caccttaaat aaatacacat atcttttatg ttctctattg ttttgcgtac 2700
gctaacacaa tttctcatat gcaaaaggat gaatgagtaa caaattacct cataagaaca 2760
atcatctttg cttacatact aatacaataa tcactcaatc aaccaataac atcaatcaca 2820
taggtttaca tacaataatc actcaatcaa cttcataaga agaatcatgt ttacttaatt 2880
catcaattat ccccaaaaac accactatta agtataaact acaacatatt tgtagtgatg 2940
ggtcaacatt tttatcatat ttaaactcgg gttccctcaa atcgagaaat agtgaacatg 3000
taatattaat tttaaatcgc aattacagaa attaattgaa tttggtcaaa tggacagaat 3060
tttatagatt gggtggaact agaaaaaaaa aaaaaaagag tatagggtga attgagtaca 3120
tgaaagtaca tggtaatcct agttaaacgc ataatacatg tgggttcatt tgtatttttt 3180
tgtaacttac gagtaaactg gctacaacaa aaaaaaatta gaagattttt ttgttttgta 3240
gaaaacccta attttagtta tagttgtata actttgataa aattataaaa ttgtattacg 3300
aaaaaagtaa taagatattc aaaaaagcct agaataacgt atatgactat gagcatgaaa 3360
ctgcaagtca aatgctgaca gacaaccata aacaaaagaa attaaataga gataccttta 3420
aaataagtaa aatttcattt ataaaaaatc tactttcttg tgaatctgtc acgttcaata 3480
atttgaagac cactcaacat acaaggtaaa taatgaaaaa taaaatctac caaaatttca 3540
atcattatta tcttccaaaa aaacaaaatt atacagatga tgatggtgat atggaacttc 3600
gattggctaa tattcactgt gtctctaaaa accatccact tatcaagata agatggaccc 3660
tacactcatc caatctaaac cagtatctca agattcttat ctaattacat cattctctac 3720
cgttagatga aattgaccat taaccctacc ataactccat acaccgcgag atactggatt 3780
aaccaaatcg agatcatcgt agccgtccga tcaacaagta ccatctcttg aaatactcga 3840
aatcctcata agtccgtccc tctttgctct cactatcaaa actctgaatt tcgatttcat 3900
ctagagtcga gcccgggcga tatcggatct cgactctagt cgagggccca tgggagcttg 3960
gattgaacaa gatggattgc acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg 4020
ctatgactgg gcacaacaga caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc 4080
gcaggggcgc ccggttcttt ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca 4140
ggacgaggca gcgcggctat cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct 4200
cgacgttgtc actgaagcgg gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga 4260
tctcctgtca tctcaccttg ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg 4320
gcggctgcat acgcttgatc cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat 4380
cgagcgagca cgtactcgga tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga 4440
gcatcagggg ctcgcgccag ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgcgca tgcccgacgg 4500
cgaggatctc gtcgtgaccc atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg 4560
ccgcttttct ggattcatcg actgtggccg gctgggtgtg gcggaccgct atcaggacat 4620
agcgttggct acccgtgata ttgctgaaga gcttggcggc gaatgggctg accgcttcct 4680
cgtgctttac ggtatcgccg ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga 4740
cgagttcttc tgagcgggac ccaagctagc ttcgacggat cctctagcat atgctcgagg 4800
cggccgcaga tatcagatcc tctagctaga gctttcgttc gtatcatcgg tttcgacaac 4860
gttcgtcaag ttcaatgcat cagtttcatt gcgcacacac cagaatccta ctgagtttga 4920
gtattatggc attgggaaaa ctgtttttct tgtaccattt gttgtgcttg taatttactg 4980
tgttttttat tcggttttcg ctatcgaact gtgaaatgga aatggatgga gaagagttaa 5040
tgaatgatat ggtccttttg ttcattctca aattaatatt atttgttttt tctcttattt 5100
gttgtgtgtt gaatttgaaa ttataagaga tatgcaaaca ttttgttttg agtaaaaatg 5160
tgtcaaatcg tggcctctaa tgaccgaagt taatatgagg agtaaaacac ttgtagttgt 5220
accattatgc ttattcacta ggcaacaaat atattttcag acctagaaaa gctgcaaatg 5280
ttactgaata caagtatgtc ctcttgtgtt ttagacattt atgaactttc ctttatgtaa 5340
ttttccagaa tccttgtcag attctaatca ttgctttata attatagtta tactcatgga 5400
tttgtagttg agtatgaaaa tattttttaa tgcattttat gacttgccaa ttgattgaca 5460
acatgcatca atcgacctgc agcccaagct tgatctagtc cgatctagta acatagatga 5520
caccgcgcgc gataatttat cctagtttgc gcgctatatt ttgttttcta tcgcgtatta 5580
aatgtataat tgcgggactc taatcataaa aacccatctc ataaataacg tcatgcatta 5640
catgttaatt attacatgct taacgtaatt caacagaaat tatatgataa tcatcgcaag 5700
accggcaaca ggattcaatc ttaagaaact ttattgccaa atgtttgaac gatcggggaa 5760
attcgagctc ggtagcaatt cccgaggctg tagccgacga tggtgcgcca ggagagttgt 5820
tgattcattg tttgcctccc tgctgcggtt tttcaccgaa gttcatgcca gtccagcgtg 5880
tcgaccgatc ggtcaaacat ttggcaataa agtttcttaa gattgaatcc tgttgccggt 5940
cttgcgatga ttatcatata atttctgttg aattacgtta agcatgtaat aattaacatg 6000
taatgcatga cgttatttat gagatgggtt tttatgatta gagtcccgca attatacatt 6060
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aaataaaatc attattcaac tttattatac atagttgata attcactggc cggatctgct 6300
tggtaataat tgtcattaga ttgtttttat gcatagatgc actcgaaatc agccaatttt 6360
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gttgtctaag cgtcaatttg tttacaccac aatatatcct gccaccagcc agccaacagc 6480
tccccgaccg gcagctcggc acaaaatcac cacgcgttac caccacgccg gccggccgca 6540
tggtgttgac cgtgttcgcc ggcattgccg agttcgagcg ttccctaatc atcgaccgca 6600
cccggagcgg gcgcgaggcc gccaaggccc gaggcgtgaa gtttggcccc cgccctaccc 6660
tcaccccggc acagatcgcg cacgcccgcg agctgatcga ccaggaaggc cgcaccgtga 6720
aagaggcggc tgcactgctt ggcgtgcatc gctcgaccct gtaccgcgca cttgagcgca 6780
gcgaggaagt gacgcccacc gaggccaggc ggcgcggtgc cttccgtgag gacgcattga 6840
ccgaggccga cgccctggcg gccgccgaga atgaacgcca agaggaacaa gcatgaaacc 6900
gcaccaggac ggccaggacg aaccgttttt cattaccgaa gagatcgagg cggagatgat 6960
cgcggccggg tacgtgttcg agccgcccgc gcacgtctca accgtgcggc tgcatgaaat 7020
cctggccggt ttgtctgatg ccaagctggc ggcctggccg gccagcttgg ccgctgaaga 7080
aaccgagcgc cgccgtctaa aaaggtgatg tgtatttgag taaaacagct tgcgtcatgc 7140
ggtcgctgcg tatatgatgc gatgagtaaa taaacaaata cgcaagggga acgcatgaag 7200
gttatcgctg tacttaacca gaaaggcggg tcaggcaaga cgaccatcgc aacccatcta 7260
gcccgcgccc tgcaactcgc cggggccgat gttctgttag tcgattccga tccccagggc 7320
agtgcccgcg attgggcggc cgtgcgggaa gatcaaccgc taaccgttgt cggcatcgac 7380
cgcccgacga ttgaccgcga cgtgaaggcc atcggccggc gcgacttcgt agtgatcgac 7440
ggagcgcccc aggcggcgga cttggctgtg tccgcgatca aggcagccga cttcgtgctg 7500
attccggtgc agccaagccc ttacgacata tgggccaccg ccgacctggt ggagctggtt 7560
aagcagcgca ttgaggtcac ggatggaagg ctacaagcgg cctttgtcgt gtcgcgggcg 7620
atcaaaggca cgcgcatcgg cggtgaggtt gccgaggcgc tggccgggta cgagctgccc 7680
attcttgagt cccgtatcac gcagcgcgtg agctacccag gcactgccgc cgccggcaca 7740
accgttcttg aatcagaacc cgagggcgac gctgcccgcg aggtccaggc gctggccgct 7800
gaaattaaat caaaactcat ttgagttaat gaggtaaaga gaaaatgagc aaaagcacaa 7860
acacgctaag tgccggccgt ccgagcgcac gcagcagcaa ggctgcaacg ttggccagcc 7920
tggcagacac gccagccatg aagcgggtca actttcagtt gccggcggag gatcacacca 7980
agctgaagat gtacgcggta cgccaaggca agaccattac cgagctgcta tctgaataca 8040
tcgcgcagct accagagtaa atgagcaaat gaataaatga gtagatgaat tttagcggct 8100
aaaggaggcg gcatggaaaa tcaagaacaa ccaggcaccg acgccgtgga atgccccatg 8160
tgtggaggaa cgggcggttg gccaggcgta agcggctggg ttgtctgccg gccctgcaat 8220
ggcactggaa cccccaagcc cgaggaatcg gcgtgagcgg tcgcaaacca tccggcccgg 8280
tacaaatcgg cgcggcgctg ggtgatgacc tggtggagaa gttgaaggcc gcgcaggccg 8340
cccagcggca acgcatcgag gcagaagcac gccccggtga atcgtggcaa gcggccgctg 8400
atcgaatccg caaagaatcc cggcaaccgc cggcagccgg tgcgccgtcg attaggaagc 8460
cgcccaaggg cgacgagcaa ccagattttt tcgttccgat gctctatgac gtgggcaccc 8520
gcgatagtcg cagcatcatg gacgtggccg ttttccgtct gtcgaagcgt gaccgacgag 8580
ctggcgaggt gatccgctac gagcttccag acgggcacgt agaggtttcc gcagggccgg 8640
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ccaagaacgg ccgcctggtg acggtatccg agggtgaagc cttgattagc cgctacaaga 8940
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cagaagccag atggttgttc aagacgatct acgaacgcag tggcagcgcc ggagagttca 9180
agaagttctg tttcaccgtg cgcaagctga tcgggtcaaa tgacctgccg gagtacgatt 9240
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ggtcacacat gtaagtgact gatataaaag agaaaaaagg cgatttttcc gcctaaaact 9540
ctttaaaact tattaaaact cttaaaaccc gcctggcctg tgcataactg tctggccagc 9600
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ccgcttcgcg tcggcctatc gcggccgctg gccgctcaaa aatggctggc ctacggccag 9720
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aaggcaccct gcctcgcgcg tttcggtgat gacggtgaaa acctctgaca catgcagctc 9840
ccggagacgg tcacagcttg tctgtaagcg gatgccggga gcagacaagc ccgtcagggc 9900
gcgtcagcgg gtgttggcgg gtgtcggggc gcagccatga cccagtcacg tagcgatagc 9960
ggagtgtata ctggcttaac tatgcggcat cagagcagat tgtactgaga gtgcaccata 10020
tgcggtgtga aataccgcac agatgcgtaa ggagaaaata ccgcatcagg cgctcttccg 10080
cttcctcgct cactgactcg ctgcgctcgg tcgttcggct gcggcgagcg gtatcagctc 10140
actcaaaggc ggtaatacgg ttatccacag aatcagggga taacgcagga aagaacatgt 10200
gagcaaaagg ccagcaaaag gccaggaacc gtaaaaaggc cgcgttgctg gcgtttttcc 10260
ataggctccg cccccctgac gagcatcaca aaaatcgacg ctcaagtcag aggtggcgaa 10320
acccgacagg actataaaga taccaggcgt ttccccctgg aagctccctc gtgcgctctc 10380
ctgttccgac cctgccgctt accggatacc tgtccgcctt tctcccttcg ggaagcgtgg 10440
cgctttctca tagctcacgc tgtaggtatc tcagttcggt gtaggtcgtt cgctccaagc 10500
tgggctgtgt gcacgaaccc cccgttcagc ccgaccgctg cgccttatcc ggtaactatc 10560
gtcttgagtc caacccggta agacacgact tatcgccact ggcagcagcc actggtaaca 10620
ggattagcag agcgaggtat gtaggcggtg ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact 10680
acggctacac tagaaggaca gtatttggta tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg 10740
gaaaaagagt tggtagctct tgatccggca aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt 10800
ttgtttgcaa gcagcagatt acgcgcagaa aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct 10860
tttctacggg gtctgacgct cagtggaacg aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatgc 10920
atgatatatc tcccaatttg tgtagggctt attatgcacg cttaaaaata ataaaagcag 10980
acttgacctg atagtttggc tgtgagcaat tatgtgctta gtgcatctaa cgcttgagtt 11040
aagccgcgcc gcgaagcggc gtcggcttga acgaatttct agctagacat tatttgccga 11100
ctaccttggt gatctcgcct ttcacgtagt ggacaaattc ttccaactga tctgcgcgcg 11160
aggccaagcg atcttcttct tgtccaagat aagcctgtct agcttcaagt atgacgggct 11220
gatactgggc cggcaggcgc tccattgccc agtcggcagc gacatccttc ggcgcgattt 11280
tgccggttac tgcgctgtac caaatgcggg acaacgtaag cactacattt cgctcatcgc 11340
cagcccagtc gggcggcgag ttccatagcg ttaaggtttc atttagcgcc tcaaatagat 11400
cctgttcagg aaccggatca aagagttcct ccgccgctgg acctaccaag gcaacgctat 11460
gttctcttgc ttttgtcagc aagatagcca gatcaatgtc gatcgtggct ggctcgaaga 11520
tacctgcaag aatgtcattg cgctgccatt ctccaaattg cagttcgcgc ttagctggat 11580
aacgccacgg aatgatgtcg tcgtgcacaa caatggtgac ttctacagcg cggagaatct 11640
cgctctctcc aggggaagcc gaagtttcca aaaggtcgtt gatcaaagct cgccgcgttg 11700
tttcatcaag ccttacggtc accgtaacca gcaaatcaat atcactgtgt ggcttcaggc 11760
cgccatccac tgcggagccg tacaaatgta cggccagcaa cgtcggttcg agatggcgct 11820
cgatgacgcc aactacctct gatagttgag tcgatacttc ggcgatcacc gcttccccca 11880
tgatgtttaa ctttgtttta gggcgactgc cctgctgcgt aacatcgttg ctgctccata 11940
acatcaaaca tcgacccacg gcgtaacgcg cttgctgctt ggatgcccga ggcatagact 12000
gtaccccaaa aaaacagtca taacaagcca tgaaaaccgc cactgcgttc catggacata 12060
caaatggacg aacggataaa ccttttcacg cccttttaaa tatccgatta ttctaataaa 12120
cgctcttttc tcttaggttt acccgccaat atatcctgtc aaacactgat agtttaaact 12180
gaaggcggga aacgacaatc agatctagta ggaaacagct atgaccatga ttacgccaag 12240
ctatcgatta cgccaagcta t 12261
<210>3
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<212>DNA
<213>核酸构建体L0522b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
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<221>终止子
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<223>互补序列
<220>
<221>终止子
<222>(427)..(470)
<223>互补序列
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<221>misc_feature
<222>(591)..(747)
<223>attR2
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<221>启动子
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<223>STPT启动子
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<222>(2112)..(2959)
<223>nptII
<220>
<221>终止子
<222>(2998)..(3676)
<223>E9终止子
<220>
<221>终止子
<222>(3682)..(3934)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(4089)..(4351)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4370)..(4465)
<223>互补序列:attL3
<220>
<221>misc_feature
<222>(4650)..(5459)
<223>卡那霉素抗性
<400>3
ctttcctgcg ttatcccctg attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga 60
taccgctcgc cgcagccgaa cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga 120
gcgcccaata cgcaaaccgc ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca 180
cgacaggttt cccgactgga aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaata cgcgtaccgc 240
tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa aggccatccg tcaggatggc cttctgctta 300
gtttgatgcc tggcagttta tggcgggcgt cctgcccgcc accctccggg ccgttgcttc 360
acaacgttca aatccgctcc cggcggattt gtcctactca ggagagcgtt caccgacaaa 420
caacagataa aacgaaaggc ccagtcttcc gactgagcct ttcgttttat ttgatgcctg 480
gcagttccct actctcgcgt taacgctagc atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa 540
aacgacggcc agtcttaagc tcgggccctg cagctctaga gctcgaattc tacaggtcac 600
taataccatc taagtagttg gttcatagtg actgcatatg ttgtgtttta cagtattatg 660
tagtctgttt tttatgcaaa atctaattta atatattgat atttatatca ttttacgttt 720
ctcgttcaac tttcttgtac aaagtggggt acccggggat cctgatagct tatactcaaa 780
ttcaacaagt tatatataaa tgtatagata ctacaatatc attaacaaaa gtcaccttaa 840
ataaatacac atatctttta tgttctctat tgttttgcgt acgctaacac aatttctcat 900
atgcaaaagg atgaatgagt aacaaattac ctcataagaa caatcatctt tgcttacata 960
ctaatacaat aatcactcaa tcaaccaata acatcaatca cataggttta catacaataa 1020
tcactcaatc aacttcataa gaagaatcat gtttacttaa ttcatcaatt atccccaaaa 1080
acaccactat taagtataaa ctacaacata tttgtagtga tgggtcaaca tttttatcat 1140
atttaaactc gggttccctc aaatcgagaa atagtgaaca tgtaatatta attttaaatc 1200
gcaattacag aaattaattg aatttggtca aatggacaga attttataga ttgggtggaa 1260
ctagaaaaaa aaaaaaaaag agtatagggt gaattgagta catgaaagta catggtaatc 1320
ctagttaaac gcataataca tgtgggttca tttgtatttt tttgtaactt acgagtaaac 1380
tggctacaac aaaaaaaaat tagaagattt ttttgttttg tagaaaaccc taattttagt 1440
tatagttgta taactttgat aaaattataa aattgtatta cgaaaaaagt aataagatat 1500
tcaaaaaagc ctagaataac gtatatgact atgagcatga aactgcaagt caaatgctga 1560
cagacaacca taaacaaaag aaattaaata gagatacctt taaaataagt aaaatttcat 1620
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accagtatct caagattctt atctaattac atcattctct accgttagat gaaattgacc 1920
attaacccta ccataactcc atacaccgcg agatactgga ttaaccaaat cgagatcatc 1980
gtagccgtcc gatcaacaag taccatctct tgaaatactc gaaatcctca taagtccgtc 2040
cctctttgct ctcactatca aaactctgaa tttcgatttc atctagagtc gagcccgggc 2100
gatatcggat ctcgactcta gtcgagggcc catgggagct tggattgaac aagatggatt 2160
gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc ggctatgact gggcacaaca 2220
gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca gcgcaggggc gcccggttct 2280
ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg caggacgagg cagcgcggct 2340
atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg ctcgacgttg tcactgaagc 2400
gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag gatctcctgt catctcacct 2460
tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg cggcggctgc atacgcttga 2520
tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc atcgagcgag cacgtactcg 2580
gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa gagcatcagg ggctcgcgcc 2640
agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgcg catgcccgac ggcgaggatc tcgtcgtgac 2700
ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat ggccgctttt ctggattcat 2760
cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac atagcgttgg ctacccgtga 2820
tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc ctcgtgcttt acggtatcgc 2880
cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt gacgagttct tctgagcggg 2940
acccaagcta gcttcgacgg atcctctagc atatgctcga ggcggccgca gatatcagat 3000
cctctagcta gagctttcgt tcgtatcatc ggtttcgaca acgttcgtca agttcaatgc 3060
atcagtttca ttgcgcacac accagaatcc tactgagttt gagtattatg gcattgggaa 3120
aactgttttt cttgtaccat ttgttgtgct tgtaatttac tgtgtttttt attcggtttt 3180
cgctatcgaa ctgtgaaatg gaaatggatg gagaagagtt aatgaatgat atggtccttt 3240
tgttcattct caaattaata ttatttgttt tttctcttat ttgttgtgtg ttgaatttga 3300
aattataaga gatatgcaaa cattttgttt tgagtaaaaa tgtgtcaaat cgtggcctct 3360
aatgaccgaa gttaatatga ggagtaaaac acttgtagtt gtaccattat gcttattcac 3420
taggcaacaa atatattttc agacctagaa aagctgcaaa tgttactgaa tacaagtatg 3480
tcctcttgtg ttttagacat ttatgaactt tcctttatgt aattttccag aatccttgtc 3540
agattctaat cattgcttta taattatagt tatactcatg gatttgtagt tgagtatgaa 3600
aatatttttt aatgcatttt atgacttgcc aattgattga caacatgcat caatcgacct 3660
gcagcccaag cttgatctag tccgatctag taacatagat gacaccgcgc gcgataattt 3720
atcctagttt gcgcgctata ttttgttttc tatcgcgtat taaatgtata attgcgggac 3780
tctaatcata aaaacccatc tcataaataa cgtcatgcat tacatgttaa ttattacatg 3840
cttaacgtaa ttcaacagaa attatatgat aatcatcgca agaccggcaa caggattcaa 3900
tcttaagaaa ctttattgcc aaatgtttga acgatcgggg aaattcgagc tcggtagcaa 3960
ttcccgaggc tgtagccgac gatggtgcgc caggagagtt gttgattcat tgtttgcctc 4020
cctgctgcgg tttttcaccg aagttcatgc cagtccagcg tttttgcagc agaaaagccg 4080
ccgacttgtc gaccgatcgg tcaaacattt ggcaataaag tttcttaaga ttgaatcctg 4140
ttgccggtct tgcgatgatt atcatataat ttctgttgaa ttacgttaag catgtaataa 4200
ttaacatgta atgcatgacg ttatttatga gatgggtttt tatgattaga gtcccgcaat 4260
tatacattta atacgcgata gaaaacaaaa tatagcgcgc aaactaggat aaattatcgc 4320
gcgcggtgtc atctatgtta ctagatcggg aagcttggcg taatcatggc aactttatta 4380
tacaaagttg gcattataaa aaagcattgc ttatcaattt gttgcaacga acaggtcact 4440
atcagtcaaa ataaaatcat tatttggagc tccatggtag cgttaacgcg gccatcccct 4500
atagtgagtc gtattacatg gtcatagctg tttcctggca gctctggccc gtgtctcaaa 4560
atctctgatg ttacattgca caagataaaa atatatcatc atgaacaata aaactgtctg 4620
cttacataaa cagtaataca aggggtgtta tgagccatat tcaacgggaa acgtcgaggc 4680
cgcgattaaa ttccaacatg gatgctgatt tatatgggta taaatgggct cgcgataatg 4740
tcgggcaatc aggtgcgaca atctatcgct tgtatgggaa gcccgatgcg ccagagttgt 4800
ttctgaaaca tggcaaaggt agcgttgcca atgatgttac agatgagatg gtcagactaa 4860
actggctgac ggaatttatg cctcttccga ccatcaagca ttttatccgt actcctgatg 4920
atgcatggtt actcaccact gcgatccccg gaaaaacagc attccaggta ttagaagaat 4980
atcctgattc aggtgaaaat attgttgatg cgctggcagt gttcctgcgc cggttgcatt 5040
cgattcctgt ttgtaattgt ccttttaaca gcgatcgcgt atttcgtctc gctcaggcgc 5100
aatcacgaat gaataacggt ttggttgatg cgagtgattt tgatgacgag cgtaatggct 5160
ggcctgttga acaagtctgg aaagaaatgc ataaactttt gccattctca ccggattcag 5220
tcgtcactca tggtgatttc tcacttgata accttatttt tgacgagggg aaattaatag 5280
gttgtattga tgttggacga gtcggaatcg cagaccgata ccaggatctt gccatcctat 5340
ggaactgcct cggtgagttt tctccttcat tacagaaacg gctttttcaa aaatatggta 5400
ttgataatcc tgatatgaat aaattgcagt ttcatttgat gctcgatgag tttttctaat 5460
cagaattggt taattggttg taacactggc agagcattac gctgacttga cgggacggcg 5520
caagctcatg accaaaatcc cttaacgtga gttacgcgtc gttccactga gcgtcagacc 5580
ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag atcctttttt tctgcgcgta atctgctgct 5640
tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg tggtttgttt gccggatcaa gagctaccaa 5700
ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca gagcgcagat accaaatact gtccttctag 5760
tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga actctgtagc accgcctaca tacctcgctc 5820
tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca gtggcgataa gtcgtgtctt accgggttgg 5880
actcaagacg atagttaccg gataaggcgc agcggtcggg ctgaacgggg ggttcgtgca 5940
cacagcccag cttggagcga acgacctaca ccgaactgag atacctacag cgtgagcatt 6000
gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa aggcggacag gtatccggta agcggcaggg 6060
tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc cagggggaaa cgcctggtat ctttatagtc 6120
ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc gtcgattttt gtgatgctcg tcaggggggc 6180
ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg cctttttacg gttcctggcc ttttgctggc 6240
cttttgctca catgtt 6256
<210>4
<211>6230
<212>DNA
<213>核酸构建体Lo522a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
<220>
<221>终止子
<222>(268)..(295)
<223>互补序列:终止子
<220>
<221>终止子
<222>(427)..(470)
<223>互补序列:终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(591)..(747)
<223>attR2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(763)..(2081)
<223>STPT启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2112)..(2959)
<223>nptII
<220>
<221>终止子
<222>(2998)..(3676)
<223>E9终止子
<220>
<221>终止子
<222>(3682)..(3934)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(4063)..(4325)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4344)..(4439)
<223>互补序列:attL3重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(4624)..(5433)
<223>卡那霉素抗性
<400>4
ctttcctgcg ttatcccctg attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga 60
taccgctcgc cgcagccgaa cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga 120
gcgcccaata cgcaaaccgc ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca 180
cgacaggttt cccgactgga aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaata cgcgtaccgc 240
tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa aggccatccg tcaggatggc cttctgctta 300
gtttgatgcc tggcagttta tggcgggcgt cctgcccgcc accctccggg ccgttgcttc 360
acaacgttca aatccgctcc cggcggattt gtcctactca ggagagcgtt caccgacaaa 420
caacagataa aacgaaaggc ccagtcttcc gactgagcct ttcgttttat ttgatgcctg 480
gcagttccct actctcgcgt taacgctagc atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa 540
aacgacggcc agtcttaagc tcgggccctg cagctctaga gctcgaattc tacaggtcac 600
taataccatc taagtagttg gttcatagtg actgcatatg ttgtgtttta cagtattatg 660
tagtctgttt tttatgcaaa atctaattta atatattgat atttatatca ttttacgttt 720
ctcgttcaac tttcttgtac aaagtggggt acccggggat cctgatagct tatactcaaa 780
ttcaacaagt tatatataaa tgtatagata ctacaatatc attaacaaaa gtcaccttaa 840
ataaatacac atatctttta tgttctctat tgttttgcgt acgctaacac aatttctcat 900
atgcaaaagg atgaatgagt aacaaattac ctcataagaa caatcatctt tgcttacata 960
ctaatacaat aatcactcaa tcaaccaata acatcaatca cataggttta catacaataa 1020
tcactcaatc aacttcataa gaagaatcat gtttacttaa ttcatcaatt atccccaaaa 1080
acaccactat taagtataaa ctacaacata tttgtagtga tgggtcaaca tttttatcat 1140
atttaaactc gggttccctc aaatcgagaa atagtgaaca tgtaatatta attttaaatc 1200
gcaattacag aaattaattg aatttggtca aatggacaga attttataga ttgggtggaa 1260
ctagaaaaaa aaaaaaaaag agtatagggt gaattgagta catgaaagta catggtaatc 1320
ctagttaaac gcataataca tgtgggttca tttgtatttt tttgtaactt acgagtaaac 1380
tggctacaac aaaaaaaaat tagaagattt ttttgttttg tagaaaaccc taattttagt 1440
tatagttgta taactttgat aaaattataa aattgtatta cgaaaaaagt aataagatat 1500
tcaaaaaagc ctagaataac gtatatgact atgagcatga aactgcaagt caaatgctga 1560
cagacaacca taaacaaaag aaattaaata gagatacctt taaaataagt aaaatttcat 1620
ttataaaaaa tctactttct tgtgaatctg tcacgttcaa taatttgaag accactcaac 1680
atacaaggta aataatgaaa aataaaatct accaaaattt caatcattat tatcttccaa 1740
aaaaacaaaa ttatacagat gatgatggtg atatggaact tcgattggct aatattcact 1800
gtgtctctaa aaaccatcca cttatcaaga taagatggac cctacactca tccaatctaa 1860
accagtatct caagattctt atctaattac atcattctct accgttagat gaaattgacc 1920
attaacccta ccataactcc atacaccgcg agatactgga ttaaccaaat cgagatcatc 1980
gtagccgtcc gatcaacaag taccatctct tgaaatactc gaaatcctca taagtccgtc 2040
cctctttgct ctcactatca aaactctgaa tttcgatttc atctagagtc gagcccgggc 2100
gatatcggat ctcgactcta gtcgagggcc catgggagct tggattgaac aagatggatt 2160
gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc ggctatgact gggcacaaca 2220
gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca gcgcaggggc gcccggttct 2280
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atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg ctcgacgttg tcactgaagc 2400
gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag gatctcctgt catctcacct 2460
tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg cggcggctgc atacgcttga 2520
tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc atcgagcgag cacgtactcg 2580
gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa gagcatcagg ggctcgcgcc 2640
agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgcg catgcccgac ggcgaggatc tcgtcgtgac 2700
ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat ggccgctttt ctggattcat 2760
cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac atagcgttgg ctacccgtga 2820
tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc ctcgtgcttt acggtatcgc 2880
cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt gacgagttct tctgagcggg 2940
acccaagcta gcttcgacgg atcctctagc atatgctcga ggcggccgca gatatcagat 3000
cctctagcta gagctttcgt tcgtatcatc ggtttcgaca acgttcgtca agttcaatgc 3060
atcagtttca ttgcgcacac accagaatcc tactgagttt gagtattatg gcattgggaa 3120
aactgttttt cttgtaccat ttgttgtgct tgtaatttac tgtgtttttt attcggtttt 3180
cgctatcgaa ctgtgaaatg gaaatggatg gagaagagtt aatgaatgat atggtccttt 3240
tgttcattct caaattaata ttatttgttt tttctcttat ttgttgtgtg ttgaatttga 3300
aattataaga gatatgcaaa cattttgttt tgagtaaaaa tgtgtcaaat cgtggcctct 3360
aatgaccgaa gttaatatga ggagtaaaac acttgtagtt gtaccattat gcttattcac 3420
taggcaacaa atatattttc agacctagaa aagctgcaaa tgttactgaa tacaagtatg 3480
tcctcttgtg ttttagacat ttatgaactt tcctttatgt aattttccag aatccttgtc 3540
agattctaat cattgcttta taattatagt tatactcatg gatttgtagt tgagtatgaa 3600
aatatttttt aatgcatttt atgacttgcc aattgattga caacatgcat caatcgacct 3660
gcagcccaag cttgatctag tccgatctag taacatagat gacaccgcgc gcgataattt 3720
atcctagttt gcgcgctata ttttgttttc tatcgcgtat taaatgtata attgcgggac 3780
tctaatcata aaaacccatc tcataaataa cgtcatgcat tacatgttaa ttattacatg 3840
cttaacgtaa ttcaacagaa attatatgat aatcatcgca agaccggcaa caggattcaa 3900
tcttaagaaa ctttattgcc aaatgtttga acgatcgggg aaattcgagc tcggtagcaa 3960
ttcccgaggc tgtagccgac gatggtgcgc caggagagtt gttgattcat tgtttgcctc 4020
cctgctgcgg tttttcaccg aagttcatgc cagtccagcg tgtcgaccga tcggtcaaac 4080
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taatttctgt tgaattacgt taagcatgta ataattaaca tgtaatgcat gacgttattt 4200
atgagatggg tttttatgat tagagtcccg caattataca tttaatacgc gatagaaaac 4260
aaaatatagc gcgcaaacta ggataaatta tcgcgcgcgg tgtcatctat gttactagat 4320
cgggaagctt ggcgtaatca tggcaacttt attatacaaa gttggcatta taaaaaagca 4380
ttgcttatca atttgttgca acgaacaggt cactatcagt caaaataaaa tcattatttg 4440
gagctccatg gtagcgttaa cgcggccatc ccctatagtg agtcgtatta catggtcata 4500
gctgtttcct ggcagctctg gcccgtgtct caaaatctct gatgttacat tgcacaagat 4560
aaaaatatat catcatgaac aataaaactg tctgcttaca taaacagtaa tacaaggggt 4620
gttatgagcc atattcaacg ggaaacgtcg aggccgcgat taaattccaa catggatgct 4680
gatttatatg ggtataaatg ggctcgcgat aatgtcgggc aatcaggtgc gacaatctat 4740
cgcttgtatg ggaagcccga tgcgccagag ttgtttctga aacatggcaa aggtagcgtt 4800
gccaatgatg ttacagatga gatggtcaga ctaaactggc tgacggaatt tatgcctctt 4860
ccgaccatca agcattttat ccgtactcct gatgatgcat ggttactcac cactgcgatc 4920
cccggaaaaa cagcattcca ggtattagaa gaatatcctg attcaggtga aaatattgtt 4980
gatgcgctgg cagtgttcct gcgccggttg cattcgattc ctgtttgtaa ttgtcctttt 5040
aacagcgatc gcgtatttcg tctcgctcag gcgcaatcac gaatgaataa cggtttggtt 5100
gatgcgagtg attttgatga cgagcgtaat ggctggcctg ttgaacaagt ctggaaagaa 5160
atgcataaac ttttgccatt ctcaccggat tcagtcgtca ctcatggtga tttctcactt 5220
gataacctta tttttgacga ggggaaatta ataggttgta ttgatgttgg acgagtcgga 5280
atcgcagacc gataccagga tcttgccatc ctatggaact gcctcggtga gttttctcct 5340
tcattacaga aacggctttt tcaaaaatat ggtattgata atcctgatat gaataaattg 5400
cagtttcatt tgatgctcga tgagtttttc taatcagaat tggttaattg gttgtaacac 5460
tggcagagca ttacgctgac ttgacgggac ggcgcaagct catgaccaaa atcccttaac 5520
gtgagttacg cgtcgttcca ctgagcgtca gaccccgtag aaaagatcaa aggatcttct 5580
tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc tgcttgcaaa caaaaaaacc accgctacca 5640
gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta ccaactcttt ttccgaaggt aactggcttc 5700
agcagagcgc agataccaaa tactgtcctt ctagtgtagc cgtagttagg ccaccacttc 5760
aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc gctctgctaa tcctgttacc agtggctgct 5820
gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccggg ttggactcaa gacgatagtt accggataag 5880
gcgcagcggt cgggctgaac ggggggttcg tgcacacagc ccagcttgga gcgaacgacc 5940
tacaccgaac tgagatacct acagcgtgag cattgagaaa gcgccacgct tcccgaaggg 6000
agaaaggcgg acaggtatcc ggtaagcggc agggtcggaa caggagagcg cacgagggag 6060
cttccagggg gaaacgcctg gtatctttat agtcctgtcg ggtttcgcca cctctgactt 6120
gagcgtcgat ttttgtgatg ctcgtcaggg gggcggagcc tatggaaaaa cgccagcaac 6180
gcggcctttt tacggttcct ggccttttgc tggccttttg ctcacatgtt 6230
<210>5
<211>11614
<212>DNA
<213>双元表达载体Lo523b-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503b
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(21)
<223>attB3重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(49)..(905)
<223>CaMVC 35S启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(912)..(1719)
<223>编码mGFP5er
<220>
<221>终止子
<222>(1762)..(2431)
<223>E9终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2432)..(2455)
<223>attB1重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(2542)..(2565)
<223>attb2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(2581)..(3899)
<223>STPT启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(3930)..(4777)
<223>编码nptII
<220>
<221>终止子
<222>(4827)..(5079)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(5234)..(5496)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(5610)..(5630)
<223>互补序列:attB3重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(5649)..(5863)
<223>LB
<220>
<221>misc_feature
<222>(7572)..(8679)
<223>repA
<220>
<221>rep_origin
<222>(9428)..(10274)
<223>互补序列:ColE1
<220>
<221>misc_feature
<222>(10443)..(1 1234)
<223>互补序列:aadA标记(spectomycin)
<220>
<221>misc_feature
<222>(11408)..(11553)
<223>RB
<400>5
caactttgta tagaaaagtt ggccatgatt acgccaagct tgcatgcctg caggtcccca 60
gattagcctt ttcaatttca gaaagaatgc taacccacag atggttagag aggcttacgc 120
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caagaaggtt aaagatgcag tcaaaagatt caggactaac tgcatcaaga acacagagaa 240
agatatattt ctcaagatca gaagtactat tccagtatgg acgattcaag gcttgcttca 300
caaaccaagg caagtaatag agattggagt ctctaaaaag gtagttccca ctgaatcaaa 360
ggccatggag tcaaagattc aaatagagga cctaacagaa ctcgccgtaa agactggcga 420
acagttcata cagagtctct tacgactcaa tgacaagaag aaaatcttcg tcaacatggt 480
ggagcacgac acacttgtct actccaaaaa tatcaaagat acagtctcag aagaccaaag 540
ggcaattgag acttttcaac aaagggtaat atccggaaac ctcctcggat tccattgccc 600
agctatctgt cactttattg tgaagatagt ggaaaaggaa ggtggctcct acaaatgcca 660
tcattgcgat aaaggaaagg ccatcgttga agatgcctct gccgacagtg gtcccaaaga 720
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gcaagtggat tgatgtgata tctccactga cgtaagggat gacgcacaat cccactatcc 840
ttcgcaagac ccttcctcta tataaggaag ttcatttcat ttggagagaa cacgggggac 900
tctagaggat ccaaggagat ataacaatga agactaatct ttttctcttt ctcatctttt 960
cacttctcct atcattatcc tcggccgaat tcagtaaagg agaagaactt ttcactggag 1020
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gagagggtga aggtgatgca acatacggaa aacttaccct taaatttatt tgcactactg 1140
gaaaactacc tgttccatgg ccaacacttg tcactacttt ctcttatggt gttcaatgct 1200
tttcaagata cccagatcat atgaagcggc acgacttctt caagagcgcc atgcctgagg 1260
gatacgtgca ggagaggacc atcttcttca aggacgacgg gaactacaag acacgtgctg 1320
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aggaggacgg aaacatcctc ggccacaagt tggaatacaa ctacaactcc cacaacgtat 1440
acatcatggc cgacaagcaa aagaacggca tcaaagccaa cttcaagacc cgccacaaca 1500
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gccctgtcct tttaccagac aaccattacc tgtccacaca atctgccctt tcgaaagatc 1620
ccaacgaaaa gagagaccac atggtccttc ttgagtttgt aacagctgct gggattacac 1680
atggcatgga tgaactatac aaacatgatg agctttaaga gaacggatcc ccatctgcgg 1740
ccgcctcgag catatgctag aggatcctct agctagagct ttcgttcgta tcatcggttt 1800
cgacaacgtt cgtcaagttc aatgcatcag tttcattgcg cacacaccag aatcctactg 1860
agtttgagta ttatggcatt gggaaaactg tttttcttgt accatttgtt gtgcttgtaa 1920
tttactgtgt tttttattcg gttttcgcta tcgaactgtg aaatggaaat ggatggagaa 1980
gagttaatga atgatatggt ccttttgttc attctcaaat taatattatt tgttttttct 2040
cttatttgtt gtgtgttgaa tttgaaatta taagagatat gcaaacattt tgttttgagt 2100
aaaaatgtgt caaatcgtgg cctctaatga ccgaagttaa tatgaggagt aaaacacttg 2160
tagttgtacc attatgctta ttcactaggc aacaaatata ttttcagacc tagaaaagct 2220
gcaaatgtta ctgaatacaa gtatgtcctc ttgtgtttta gacatttatg aactttcctt 2280
tatgtaattt tccagaatcc ttgtcagatt ctaatcattg ctttataatt atagttatac 2340
tcatggattt gtagttgagt atgaaaatat tttttaatgc attttatgac ttgccaattg 2400
attgacaaca tgcatcaatc gaccgggtac ccaagtttgt acaaaaaagc aggctggtac 2460
ccggggatcc tctaggtcga ccagatctga tatctgcggc cgcctcgagc atatgggcat 2520
gcaagcttgg cgtaatcatg gacccagctt tcttgtacaa agtggggtac ccggggatcc 2580
tgatagctta tactcaaatt caacaagtta tatataaatg tatagatact acaatatcat 2640
taacaaaagt caccttaaat aaatacacat atcttttatg ttctctattg ttttgcgtac 2700
gctaacacaa tttctcatat gcaaaaggat gaatgagtaa caaattacct cataagaaca 2760
atcatctttg cttacatact aatacaataa tcactcaatc aaccaataac atcaatcaca 2820
taggtttaca tacaataatc actcaatcaa cttcataaga agaatcatgt ttacttaatt 2880
catcaattat ccccaaaaac accactatta agtataaact acaacatatt tgtagtgatg 2940
ggtcaacatt tttatcatat ttaaactcgg gttccctcaa atcgagaaat agtgaacatg 3000
taatattaat tttaaatcgc aattacagaa attaattgaa tttggtcaaa tggacagaat 3060
tttatagatt gggtggaact agaaaaaaaa aaaaaaagag tatagggtga attgagtaca 3120
tgaaagtaca tggtaatcct agttaaacgc ataatacatg tgggttcatt tgtatttttt 3180
tgtaacttac gagtaaactg gctacaacaa aaaaaaatta gaagattttt ttgttttgta 3240
gaaaacccta attttagtta tagttgtata actttgataa aattataaaa ttgtattacg 3300
aaaaaagtaa taagatattc aaaaaagcct agaataacgt atatgactat gagcatgaaa 3360
ctgcaagtca aatgctgaca gacaaccata aacaaaagaa attaaataga gataccttta 3420
aaataagtaa aatttcattt ataaaaaatc tactttcttg tgaatctgtc acgttcaata 3480
atttgaagac cactcaacat acaaggtaaa taatgaaaaa taaaatctac caaaatttca 3540
atcattatta tcttccaaaa aaacaaaatt atacagatga tgatggtgat atggaacttc 3600
gattggctaa tattcactgt gtctctaaaa accatccact tatcaagata agatggaccc 3660
tacactcatc caatctaaac cagtatctca agattcttat ctaattacat cattctctac 3720
cgttagatga aattgaccat taaccctacc ataactccat acaccgcgag atactggatt 3780
aaccaaatcg agatcatcgt agccgtccga tcaacaagta ccatctcttg aaatactcga 3840
aatcctcata agtccgtccc tctttgctct cactatcaaa actctgaatt tcgatttcat 3900
ctagagtcga gcccgggcga tatcggatct cgactctagt cgagggccca tgggagcttg 3960
gattgaacaa gatggattgc acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg 4020
ctatgactgg gcacaacaga caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc 4080
gcaggggcgc ccggttcttt ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca 4140
ggacgaggca gcgcggctat cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct 4200
cgacgttgtc actgaagcgg gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga 4260
tctcctgtca tctcaccttg ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg 4320
gcggctgcat acgcttgatc cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat 4380
cgagcgagca cgtactcgga tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga 4440
gcatcagggg ctcgcgccag ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgcgca tgcccgacgg 4500
cgaggatctc gtcgtgaccc atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg 4560
ccgcttttct ggattcatcg actgtggccg gctgggtgtg gcggaccgct atcaggacat 4620
agcgttggct acccgtgata ttgctgaaga gcttggcggc gaatgggctg accgcttcct 4680
cgtgctttac ggtatcgccg ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga 4740
cgagttcttc tgagcgggac ccaagctagc ttcgacggat cctctagcat atgctcgagg 4800
cggccgcaga tatcagatct actagtccga tctagtaaca tagatgacac cgcgcgcgat 4860
aatttatcct agtttgcgcg ctatattttg ttttctatcg cgtattaaat gtataattgc 4920
gggactctaa tcataaaaac ccatctcata aataacgtca tgcattacat gttaattatt 4980
acatgcttaa cgtaattcaa cagaaattat atgataatca tcgcaagacc ggcaacagga 5040
ttcaatctta agaaacttta ttgccaaatg tttgaacgat cggggaaatt cgagctcggt 5100
agcaattccc gaggctgtag ccgacgatgg tgcgccagga gagttgttga ttcattgttt 5160
gcctccctgc tgcggttttt caccgaagtt catgccagtc cagcgttttt gcagcagaaa 5220
agccgccgac ttgtcgaccg atcggtcaaa catttggcaa taaagtttct taagattgaa 5280
tcctgttgcc ggtcttgcga tgattatcat ataatttctg ttgaattacg ttaagcatgt 5340
aataattaac atgtaatgca tgacgttatt tatgagatgg gtttttatga ttagagtccc 5400
gcaattatac atttaatacg cgatagaaaa caaaatatag cgcgcaaact aggataaatt 5460
atcgcgcgcg gtgtcatcta tgttactaga tcgggaagct tggcgtaatc atggcaactt 5520
tattatacaa agttggcatt ataaaaaagc attgcttatc aatttgttgc aacgaacagg 5580
tcactatcag tcaaaataaa atcattattc aactttatta tacatagttg ataattcact 5640
ggccggatct gcttggtaat aattgtcatt agattgtttt tatgcataga tgcactcgaa 5700
atcagccaat tttagacaag tatcaaacgg atgttaattc agtacattaa agacgtccgc 5760
aatgtgttat taagttgtct aagcgtcaat ttgtttacac cacaatatat cctgccacca 5820
gccagccaac agctccccga ccggcagctc ggcacaaaat caccacgcgt taccaccacg 5880
ccggccggcc gcatggtgtt gaccgtgttc gccggcattg ccgagttcga gcgttcccta 5940
atcatcgacc gcacccggag cgggcgcgag gccgccaagg cccgaggcgt gaagtttggc 6000
ccccgcccta ccctcacccc ggcacagatc gcgcacgccc gcgagctgat cgaccaggaa 6060
ggccgcaccg tgaaagaggc ggctgcactg cttggcgtgc atcgctcgac cctgtaccgc 6120
gcacttgagc gcagcgagga agtgacgccc accgaggcca ggcggcgcgg tgccttccgt 6180
gaggacgcat tgaccgaggc cgacgccctg gcggccgccg agaatgaacg ccaagaggaa 6240
caagcatgaa accgcaccag gacggccagg acgaaccgtt tttcattacc gaagagatcg 6300
aggcggagat gatcgcggcc gggtacgtgt tcgagccgcc cgcgcacgtc tcaaccgtgc 6360
ggctgcatga aatcctggcc ggtttgtctg atgccaagct ggcggcctgg ccggccagct 6420
tggccgctga agaaaccgag cgccgccgtc taaaaaggtg atgtgtattt gagtaaaaca 6480
gcttgcgtca tgcggtcgct gcgtatatga tgcgatgagt aaataaacaa atacgcaagg 6540
ggaacgcatg aaggttatcg ctgtacttaa ccagaaaggc gggtcaggca agacgaccat 6600
cgcaacccat ctagcccgcg ccctgcaact cgccggggcc gatgttctgt tagtcgattc 6660
cgatccccag ggcagtgccc gcgattgggc ggccgtgcgg gaagatcaac cgctaaccgt 6720
tgtcggcatc gaccgcccga cgattgaccg cgacgtgaag gccatcggcc ggcgcgactt 6780
cgtagtgatc gacggagcgc cccaggcggc ggacttggct gtgtccgcga tcaaggcagc 6840
cgacttcgtg ctgattccgg tgcagccaag cccttacgac atatgggcca ccgccgacct 6900
ggtggagctg gttaagcagc gcattgaggt cacggatgga aggctacaag cggcctttgt 6960
cgtgtcgcgg gcgatcaaag gcacgcgcat cggcggtgag gttgccgagg cgctggccgg 7020
gtacgagctg cccattcttg agtcccgtat cacgcagcgc gtgagctacc caggcactgc 7080
cgccgccggc acaaccgttc ttgaatcaga acccgagggc gacgctgccc gcgaggtcca 7140
ggcgctggcc gctgaaatta aatcaaaact catttgagtt aatgaggtaa agagaaaatg 7200
agcaaaagca caaacacgct aagtgccggc cgtccgagcg cacgcagcag caaggctgca 7260
acgttggcca gcctggcaga cacgccagcc atgaagcggg tcaactttca gttgccggcg 7320
gaggatcaca ccaagctgaa gatgtacgcg gtacgccaag gcaagaccat taccgagctg 7380
ctatctgaat acatcgcgca gctaccagag taaatgagca aatgaataaa tgagtagatg 7440
aattttagcg gctaaaggag gcggcatgga aaatcaagaa caaccaggca ccgacgccgt 7500
ggaatgcccc atgtgtggag gaacgggcgg ttggccaggc gtaagcggct gggttgtctg 7560
ccggccctgc aatggcactg gaacccccaa gcccgaggaa tcggcgtgag cggtcgcaaa 7620
ccatccggcc cggtacaaat cggcgcggcg ctgggtgatg acctggtgga gaagttgaag 7680
gccgcgcagg ccgcccagcg gcaacgcatc gaggcagaag cacgccccgg tgaatcgtgg 7740
caagcggccg ctgatcgaat ccgcaaagaa tcccggcaac cgccggcagc cggtgcgccg 7800
tcgattagga agccgcccaa gggcgacgag caaccagatt ttttcgttcc gatgctctat 7860
gacgtgggca cccgcgatag tcgcagcatc atggacgtgg ccgttttccg tctgtcgaag 7920
cgtgaccgac gagctggcga ggtgatccgc tacgagcttc cagacgggca cgtagaggtt 7980
tccgcagggc cggccggcat ggccagtgtg tgggattacg acctggtact gatggcggtt 8040
tcccatctaa ccgaatccat gaaccgatac cgggaaggga agggagacaa gcccggccgc 8100
gtgttccgtc cacacgttgc ggacgtactc aagttctgcc ggcgagccga tggcggaaag 8160
cagaaagacg acctggtaga aacctgcatt cggttaaaca ccacgcacgt tgccatgcag 8220
cgtacgaaga aggccaagaa cggccgcctg gtgacggtat ccgagggtga agccttgatt 8280
agccgctaca agatcgtaaa gagcgaaacc gggcggccgg agtacatcga gatcgagcta 8340
gctgattgga tgtaccgcga gatcacagaa ggcaagaacc cggacgtgct gacggttcac 8400
cccgattact ttttgatcga tcccggcatc ggccgttttc tctaccgcct ggcacgccgc 8460
gccgcaggca aggcagaagc cagatggttg ttcaagacga tctacgaacg cagtggcagc 8520
gccggagagt tcaagaagtt ctgtttcacc gtgcgcaagc tgatcgggtc aaatgacctg 8580
ccggagtacg atttgaagga ggaggcgggg caggctggcc cgatcctagt catgcgctac 8640
cgcaacctga tcgagggcga agcatccgcc ggttcctaat gtacggagca gatgctaggg 8700
caaattgccc tagcagggga aaaaggtcga aaaggtctct ttcctgtgga tagcacgtac 8760
attgggaacc caaagccgta cattgggaac cggaacccgt acattgggaa cccaaagccg 8820
tacattggga accggtcaca catgtaagtg actgatataa aagagaaaaa aggcgatttt 8880
tccgcctaaa actctttaaa acttattaaa actcttaaaa cccgcctggc ctgtgcataa 8940
ctgtctggcc agcgcacagc cgaagagctg caaaaagcgc ctacccttcg gtcgctgcgc 9000
tccctacgcc ccgccgcttc gcgtcggcct atcgcggccg ctggccgctc aaaaatggct 9060
ggcctacggc caggcaatct accagggcgc ggacaagccg cgccgtcgcc actcgaccgc 9120
cggcgcccac atcaaggcac cctgcctcgc gcgtttcggt gatgacggtg aaaacctctg 9180
acacatgcag ctcccggaga cggtcacagc ttgtctgtaa gcggatgccg ggagcagaca 9240
agcccgtcag ggcgcgtcag cgggtgttgg cgggtgtcgg ggcgcagcca tgacccagtc 9300
acgtagcgat agcggagtgt atactggctt aactatgcgg catcagagca gattgtactg 9360
agagtgcacc atatgcggtg tgaaataccg cacagatgcg taaggagaaa ataccgcatc 9420
aggcgctctt ccgcttcctc gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg gctgcggcga 9480
gcggtatcag ctcactcaaa ggcggtaata cggttatcca cagaatcagg ggataacgca 9540
ggaaagaaca tgtgagcaaa aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa ggccgcgttg 9600
ctggcgtttt tccataggct ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg acgctcaagt 9660
cagaggtggc gaaacccgac aggactataa agataccagg cgtttccccc tggaagctcc 9720
ctcgtgcgct ctcctgttcc gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc ctttctccct 9780
tcgggaagcg tggcgctttc tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc ggtgtaggtc 9840
gttcgctcca agctgggctg tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg ctgcgcctta 9900
tccggtaact atcgtcttga gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc actggcagca 9960
gccactggta acaggattag cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga gttcttgaag 10020
tggtggccta actacggcta cactagaagg acagtatttg gtatctgcgc tctgctgaag 10080
ccagttacct tcggaaaaag agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac caccgctggt 10140
agcggtggtt tttttgtttg caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg atctcaagaa 10200
gatcctttga tcttttctac ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc acgttaaggg 10260
attttggtca tgcatgatat atctcccaat ttgtgtaggg cttattatgc acgcttaaaa 10320
ataataaaag cagacttgac ctgatagttt ggctgtgagc aattatgtgc ttagtgcatc 10380
taacgcttga gttaagccgc gccgcgaagc ggcgtcggct tgaacgaatt tctagctaga 10440
cattatttgc cgactacctt ggtgatctcg cctttcacgt agtggacaaa ttcttccaac 10500
tgatctgcgc gcgaggccaa gcgatcttct tcttgtccaa gataagcctg tctagcttca 10560
agtatgacgg gctgatactg ggccggcagg cgctccattg cccagtcggc agcgacatcc 10620
ttcggcgcga ttttgccggt tactgcgctg taccaaatgc gggacaacgt aagcactaca 10680
tttcgctcat cgccagccca gtcgggcggc gagttccata gcgttaaggt ttcatttagc 10740
gcctcaaata gatcctgttc aggaaccgga tcaaagagtt cctccgccgc tggacctacc 10800
aaggcaacgc tatgttctct tgcttttgtc agcaagatag ccagatcaat gtcgatcgtg 10860
gctggctcga agatacctgc aagaatgtca ttgcgctgcc attctccaaa ttgcagttcg 10920
cgcttagctg gataacgcca cggaatgatg tcgtcgtgca caacaatggt gacttctaca 10980
gcgcggagaa tctcgctctc tccaggggaa gccgaagttt ccaaaaggtc gttgatcaaa 11040
gctcgccgcg ttgtttcatc aagccttacg gtcaccgtaa ccagcaaatc aatatcactg 11100
tgtggcttca ggccgccatc cactgcggag ccgtacaaat gtacggccag caacgtcggt 11160
tcgagatggc gctcgatgac gccaactacc tctgatagtt gagtcgatac ttcggcgatc 11220
accgcttccc ccatgatgtt taactttgtt ttagggcgac tgccctgctg cgtaacatcg 11280
ttgctgctcc ataacatcaa acatcgaccc acggcgtaac gcgcttgctg cttggatgcc 11340
cgaggcatag actgtacccc aaaaaaacag tcataacaag ccatgaaaac cgccactgcg 11400
ttccatggac atacaaatgg acgaacggat aaaccttttc acgccctttt aaatatccga 11460
ttattctaat aaacgctctt ttctcttagg tttacccgcc aatatatcct gtcaaacact 11520
gatagtttaa actgaaggcg ggaaacgaca atcagatcta gtaggaaaca gctatgacca 11580
tgattacgcc aagctatcga ttacgccaag ctat 11614
<210>6
<211>11588
<212>DNA
<213>双元表达载体Lo523a-pSUN1-R4-Lo484∷Lo376∷Lo503a
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(21)
<223>attB4重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(49)..(905)
<223>CaMV 35S启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(912)..(1719)
<223>编码mGFP5er
<220>
<221>终止子
<222>(1762)..(2431)
<223>Ep终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2432)..(2455)
<223>attB1重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(2542)..(2565)
<223>attb2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(2581)..(3899)
<223>STPT启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(3930)..(4777)
<223>编码nptII
<220>
<221>终止子
<222>(4827)..(5079)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(5208)..(5470)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(5323)..(5837)
<223>LB
<220>
<221>misc_feature
<222>(5584)..(5604)
<223>互补序列:attB3重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(7546)..(8653)
<223>repA
<220>
<221>rep_origin
<222>(9402)..(10248)
<223>互补序列:ColE1
<220>
<221>misc_feature
<222>(10417)..(11208)
<223>互补序列:aadA标记(spectomycin)
<220>
<221>misc_feature
<222>(11382)..(11527)
<223>RB
<400>6
caactttgta tagaaaagtt ggccatgatt acgccaagct tgcatgcctg caggtcccca 60
gattagcctt ttcaatttca gaaagaatgc taacccacag atggttagag aggcttacgc 120
agcaggtctc atcaagacga tctacccgag caataatctc caggaaatca aataccttcc 180
caagaaggtt aaagatgcag tcaaaagatt caggactaac tgcatcaaga acacagagaa 240
agatatattt ctcaagatca gaagtactat tccagtatgg acgattcaag gcttgcttca 300
caaaccaagg caagtaatag agattggagt ctctaaaaag gtagttccca ctgaatcaaa 360
ggccatggag tcaaagattc aaatagagga cctaacagaa ctcgccgtaa agactggcga 420
acagttcata cagagtctct tacgactcaa tgacaagaag aaaatcttcg tcaacatggt 480
ggagcacgac acacttgtct actccaaaaa tatcaaagat acagtctcag aagaccaaag 540
ggcaattgag acttttcaac aaagggtaat atccggaaac ctcctcggat tccattgccc 600
agctatctgt cactttattg tgaagatagt ggaaaaggaa ggtggctcct acaaatgcca 660
tcattgcgat aaaggaaagg ccatcgttga agatgcctct gccgacagtg gtcccaaaga 720
tggaccccca cccacgagga gcatcgtgga aaaagaagac gttccaacca cgtcttcaaa 780
gcaagtggat tgatgtgata tctccactga cgtaagggat gacgcacaat cccactatcc 840
ttcgcaagac ccttcctcta tataaggaag ttcatttcat ttggagagaa cacgggggac 900
tctagaggat ccaaggagat ataacaatga agactaatct ttttctcttt ctcatctttt 960
cacttctcct atcattatcc tcggccgaat tcagtaaagg agaagaactt ttcactggag 1020
ttgtcccaat tcttgttgaa ttagatggtg atgttaatgg gcacaaattt tctgtcagtg 1080
gagagggtga aggtgatgca acatacggaa aacttaccct taaatttatt tgcactactg 1140
gaaaactacc tgttccatgg ccaacacttg tcactacttt ctcttatggt gttcaatgct 1200
tttcaagata cccagatcat atgaagcggc acgacttctt caagagcgcc atgcctgagg 1260
gatacgtgca ggagaggacc atcttcttca aggacgacgg gaactacaag acacgtgctg 1320
aagtcaagtt tgagggagac accctcgtca acaggatcga gcttaaggga atcgatttca 1380
aggaggacgg aaacatcctc ggccacaagt tggaatacaa ctacaactcc cacaacgtat 1440
acatcatggc cgacaagcaa aagaacggca tcaaagccaa cttcaagacc cgccacaaca 1500
tcgaagacgg cggcgtgcaa ctcgctgatc attatcaaca aaatactcca attggcgatg 1560
gccctgtcct tttaccagac aaccattacc tgtccacaca atctgccctt tcgaaagatc 1620
ccaacgaaaa gagagaccac atggtccttc ttgagtttgt aacagctgct gggattacac 1680
atggcatgga tgaactatac aaacatgatg agctttaaga gaacggatcc ccatctgcgg 1740
ccgcctcgag catatgctag aggatcctct agctagagct ttcgttcgta tcatcggttt 1800
cgacaacgtt cgtcaagttc aatgcatcag tttcattgcg cacacaccag aatcctactg 1860
agtttgagta ttatggcatt gggaaaactg tttttcttgt accatttgtt gtgcttgtaa 1920
tttactgtgt tttttattcg gttttcgcta tcgaactgtg aaatggaaat ggatggagaa 1980
gagttaatga atgatatggt ccttttgttc attctcaaat taatattatt tgttttttct 2040
cttatttgtt gtgtgttgaa tttgaaatta taagagatat gcaaacattt tgttttgagt 2100
aaaaatgtgt caaatcgtgg cctctaatga ccgaagttaa tatgaggagt aaaacacttg 2160
tagttgtacc attatgctta ttcactaggc aacaaatata ttttcagacc tagaaaagct 2220
gcaaatgtta ctgaatacaa gtatgtcctc ttgtgtttta gacatttatg aactttcctt 2280
tatgtaattt tccagaatcc ttgtcagatt ctaatcattg ctttataatt atagttatac 2340
tcatggattt gtagttgagt atgaaaatat tttttaatgc attttatgac ttgccaattg 2400
attgacaaca tgcatcaatc gaccgggtac ccaagtttgt acaaaaaagc aggctggtac 2460
ccggggatcc tctaggtcga ccagatctga tatctgcggc cgcctcgagc atatgggcat 2520
gcaagcttgg cgtaatcatg gacccagctt tcttgtacaa agtggggtac ccggggatcc 2580
tgatagctta tactcaaatt caacaagtta tatataaatg tatagatact acaatatcat 2640
taacaaaagt caccttaaat aaatacacat atcttttatg ttctctattg ttttgcgtac 2700
gctaacacaa tttctcatat gcaaaaggat gaatgagtaa caaattacct cataagaaca 2760
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catcaattat ccccaaaaac accactatta agtataaact acaacatatt tgtagtgatg 2940
ggtcaacatt tttatcatat ttaaactcgg gttccctcaa atcgagaaat agtgaacatg 3000
taatattaat tttaaatcgc aattacagaa attaattgaa tttggtcaaa tggacagaat 3060
tttatagatt gggtggaact agaaaaaaaa aaaaaaagag tatagggtga attgagtaca 3120
tgaaagtaca tggtaatcct agttaaacgc ataatacatg tgggttcatt tgtatttttt 3180
tgtaacttac gagtaaactg gctacaacaa aaaaaaatta gaagattttt ttgttttgta 3240
gaaaacccta attttagtta tagttgtata actttgataa aattataaaa ttgtattacg 3300
aaaaaagtaa taagatattc aaaaaagcct agaataacgt atatgactat gagcatgaaa 3360
ctgcaagtca aatgctgaca gacaaccata aacaaaagaa attaaataga gataccttta 3420
aaataagtaa aatttcattt ataaaaaatc tactttcttg tgaatctgtc acgttcaata 3480
atttgaagac cactcaacat acaaggtaaa taatgaaaaa taaaatctac caaaatttca 3540
atcattatta tcttccaaaa aaacaaaatt atacagatga tgatggtgat atggaacttc 3600
gattggctaa tattcactgt gtctctaaaa accatccact tatcaagata agatggaccc 3660
tacactcatc caatctaaac cagtatctca agattcttat ctaattacat cattctctac 3720
cgttagatga aattgaccat taaccctacc ataactccat acaccgcgag atactggatt 3780
aaccaaatcg agatcatcgt agccgtccga tcaacaagta ccatctcttg aaatactcga 3840
aatcctcata agtccgtccc tctttgctct cactatcaaa actctgaatt tcgatttcat 3900
ctagagtcga gcccgggcga tatcggatct cgactctagt cgagggccca tgggagcttg 3960
gattgaacaa gatggattgc acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg 4020
ctatgactgg gcacaacaga caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc 4080
gcaggggcgc ccggttcttt ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca 4140
ggacgaggca gcgcggctat cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct 4200
cgacgttgtc actgaagcgg gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga 4260
tctcctgtca tctcaccttg ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg 4320
gcggctgcat acgcttgatc cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat 4380
cgagcgagca cgtactcgga tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga 4440
gcatcagggg ctcgcgccag ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgcgca tgcccgacgg 4500
cgaggatctc gtcgtgaccc atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg 4560
ccgcttttct ggattcatcg actgtggccg gctgggtgtg gcggaccgct atcaggacat 4620
agcgttggct acccgtgata ttgctgaaga gcttggcggc gaatgggctg accgcttcct 4680
cgtgctttac ggtatcgccg ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga 4740
cgagttcttc tgagcgggac ccaagctagc ttcgacggat cctctagcat atgctcgagg 4800
cggccgcaga tatcagatct actagtccga tctagtaaca tagatgacac cgcgcgcgat 4860
aatttatcct agtttgcgcg ctatattttg ttttctatcg cgtattaaat gtataattgc 4920
gggactctaa tcataaaaac ccatctcata aataacgtca tgcattacat gttaattatt 4980
acatgcttaa cgtaattcaa cagaaattat atgataatca tcgcaagacc ggcaacagga 5040
ttcaatctta agaaacttta ttgccaaatg tttgaacgat cggggaaatt cgagctcggt 5100
agcaattccc gaggctgtag ccgacgatgg tgcgccagga gagttgttga ttcattgttt 5160
gcctccctgc tgcggttttt caccgaagtt catgccagtc cagcgtgtcg accgatcggt 5220
caaacatttg gcaataaagt ttcttaagat tgaatcctgt tgccggtctt gcgatgatta 5280
tcatataatt tctgttgaat tacgttaagc atgtaataat taacatgtaa tgcatgacgt 5340
tatttatgag atgggttttt atgattagag tcccgcaatt atacatttaa tacgcgatag 5400
aaaacaaaat atagcgcgca aactaggata aattatcgcg cgcggtgtca tctatgttac 5460
tagatcggga agcttggcgt aatcatggca actttattat acaaagttgg cattataaaa 5520
aagcattgct tatcaatttg ttgcaacgaa caggtcacta tcagtcaaaa taaaatcatt 5580
attcaacttt attatacata gttgataatt cactggccgg atctgcttgg taataattgt 5640
cattagattg tttttatgca tagatgcact cgaaatcagc caattttaga caagtatcaa 5700
acggatgtta attcagtaca ttaaagacgt ccgcaatgtg ttattaagtt gtctaagcgt 5760
caatttgttt acaccacaat atatcctgcc accagccagc caacagctcc ccgaccggca 5820
gctcggcaca aaatcaccac gcgttaccac cacgccggcc ggccgcatgg tgttgaccgt 5880
gttcgccggc attgccgagt tcgagcgttc cctaatcatc gaccgcaccc ggagcgggcg 5940
cgaggccgcc aaggcccgag gcgtgaagtt tggcccccgc cctaccctca ccccggcaca 6000
gatcgcgcac gcccgcgagc tgatcgacca ggaaggccgc accgtgaaag aggcggctgc 6060
actgcttggc gtgcatcgct cgaccctgta ccgcgcactt gagcgcagcg aggaagtgac 6120
gcccaccgag gccaggcggc gcggtgcctt ccgtgaggac gcattgaccg aggccgacgc 6180
cctggcggcc gccgagaatg aacgccaaga ggaacaagca tgaaaccgca ccaggacggc 6240
caggacgaac cgtttttcat taccgaagag atcgaggcgg agatgatcgc ggccgggtac 6300
gtgttcgagc cgcccgcgca cgtctcaacc gtgcggctgc atgaaatcct ggccggtttg 6360
tctgatgcca agctggcggc ctggccggcc agcttggccg ctgaagaaac cgagcgccgc 6420
cgtctaaaaa ggtgatgtgt atttgagtaa aacagcttgc gtcatgcggt cgctgcgtat 6480
atgatgcgat gagtaaataa acaaatacgc aaggggaacg catgaaggtt atcgctgtac 6540
ttaaccagaa aggcgggtca ggcaagacga ccatcgcaac ccatctagcc cgcgccctgc 6600
aactcgccgg ggccgatgtt ctgttagtcg attccgatcc ccagggcagt gcccgcgatt 6660
gggcggccgt gcgggaagat caaccgctaa ccgttgtcgg catcgaccgc ccgacgattg 6720
accgcgacgt gaaggccatc ggccggcgcg acttcgtagt gatcgacgga gcgccccagg 6780
cggcggactt ggctgtgtcc gcgatcaagg cagccgactt cgtgctgatt ccggtgcagc 6840
caagccctta cgacatatgg gccaccgccg acctggtgga gctggttaag cagcgcattg 6900
aggtcacgga tggaaggcta caagcggcct ttgtcgtgtc gcgggcgatc aaaggcacgc 6960
gcatcggcgg tgaggttgcc gaggcgctgg ccgggtacga gctgcccatt cttgagtccc 7020
gtatcacgca gcgcgtgagc tacccaggca ctgccgccgc cggcacaacc gttcttgaat 7080
cagaacccga gggcgacgct gcccgcgagg tccaggcgct ggccgctgaa attaaatcaa 7140
aactcatttg agttaatgag gtaaagagaa aatgagcaaa agcacaaaca cgctaagtgc 7200
cggccgtccg agcgcacgca gcagcaaggc tgcaacgttg gccagcctgg cagacacgcc 7260
agccatgaag cgggtcaact ttcagttgcc ggcggaggat cacaccaagc tgaagatgta 7320
cgcggtacgc caaggcaaga ccattaccga gctgctatct gaatacatcg cgcagctacc 7380
agagtaaatg agcaaatgaa taaatgagta gatgaatttt agcggctaaa ggaggcggca 7440
tggaaaatca agaacaacca ggcaccgacg ccgtggaatg ccccatgtgt ggaggaacgg 7500
gcggttggcc aggcgtaagc ggctgggttg tctgccggcc ctgcaatggc actggaaccc 7560
ccaagcccga ggaatcggcg tgagcggtcg caaaccatcc ggcccggtac aaatcggcgc 7620
ggcgctgggt gatgacctgg tggagaagtt gaaggccgcg caggccgccc agcggcaacg 7680
catcgaggca gaagcacgcc ccggtgaatc gtggcaagcg gccgctgatc gaatccgcaa 7740
agaatcccgg caaccgccgg cagccggtgc gccgtcgatt aggaagccgc ccaagggcga 7800
cgagcaacca gattttttcg ttccgatgct ctatgacgtg ggcacccgcg atagtcgcag 7860
catcatggac gtggccgttt tccgtctgtc gaagcgtgac cgacgagctg gcgaggtgat 7920
ccgctacgag cttccagacg ggcacgtaga ggtttccgca gggccggccg gcatggccag 7980
tgtgtgggat tacgacctgg tactgatggc ggtttcccat ctaaccgaat ccatgaaccg 8040
ataccgggaa gggaagggag acaagcccgg ccgcgtgttc cgtccacacg ttgcggacgt 8100
actcaagttc tgccggcgag ccgatggcgg aaagcagaaa gacgacctgg tagaaacctg 8160
cattcggtta aacaccacgc acgttgccat gcagcgtacg aagaaggcca agaacggccg 8220
cctggtgacg gtatccgagg gtgaagcctt gattagccgc tacaagatcg taaagagcga 8280
aaccgggcgg ccggagtaca tcgagatcga gctagctgat tggatgtacc gcgagatcac 8340
agaaggcaag aacccggacg tgctgacggt tcaccccgat tactttttga tcgatcccgg 8400
catcggccgt tttctctacc gcctggcacg ccgcgccgca ggcaaggcag aagccagatg 8460
gttgttcaag acgatctacg aacgcagtgg cagcgccgga gagttcaaga agttctgttt 8520
caccgtgcgc aagctgatcg ggtcaaatga cctgccggag tacgatttga aggaggaggc 8580
ggggcaggct ggcccgatcc tagtcatgcg ctaccgcaac ctgatcgagg gcgaagcatc 8640
cgccggttcc taatgtacgg agcagatgct agggcaaatt gccctagcag gggaaaaagg 8700
tcgaaaaggt ctctttcctg tggatagcac gtacattggg aacccaaagc cgtacattgg 8760
gaaccggaac ccgtacattg ggaacccaaa gccgtacatt gggaaccggt cacacatgta 8820
agtgactgat ataaaagaga aaaaaggcga tttttccgcc taaaactctt taaaacttat 8880
taaaactctt aaaacccgcc tggcctgtgc ataactgtct ggccagcgca cagccgaaga 8940
gctgcaaaaa gcgcctaccc ttcggtcgct gcgctcccta cgccccgccg cttcgcgtcg 9000
gcctatcgcg gccgctggcc gctcaaaaat ggctggccta cggccaggca atctaccagg 9060
gcgcggacaa gccgcgccgt cgccactcga ccgccggcgc ccacatcaag gcaccctgcc 9120
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 9180
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 9240
ttggcgggtg tcggggcgca gccatgaccc agtcacgtag cgatagcgga gtgtatactg 9300
gcttaactat gcggcatcag agcagattgt actgagagtg caccatatgc ggtgtgaaat 9360
accgcacaga tgcgtaagga gaaaataccg catcaggcgc tcttccgctt cctcgctcac 9420
tgactcgctg cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact caaaggcggt 9480
aatacggtta tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag caaaaggcca 9540
gcaaaaggcc aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata ggctccgccc 9600
ccctgacgag catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc cgacaggact 9660
ataaagatac caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg ttccgaccct 9720
gccgcttacc ggatacctgt ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc tttctcatag 9780
ctcacgctgt aggtatctca gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg gctgtgtgca 9840
cgaacccccc gttcagcccg accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc ttgagtccaa 9900
cccggtaaga cacgacttat cgccactggc agcagccact ggtaacagga ttagcagagc 9960
gaggtatgta ggcggtgcta cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg gctacactag 10020
aaggacagta tttggtatct gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa aaagagttgg 10080
tagctcttga tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt ggtttttttg tttgcaagca 10140
gcagattacg cgcagaaaaa aaggatctca agaagatcct ttgatctttt ctacggggtc 10200
tgacgctcag tggaacgaaa actcacgtta agggattttg gtcatgcatg atatatctcc 10260
caatttgtgt agggcttatt atgcacgctt aaaaataata aaagcagact tgacctgata 10320
gtttggctgt gagcaattat gtgcttagtg catctaacgc ttgagttaag ccgcgccgcg 10380
aagcggcgtc ggcttgaacg aatttctagc tagacattat ttgccgacta ccttggtgat 10440
ctcgcctttc acgtagtgga caaattcttc caactgatct gcgcgcgagg ccaagcgatc 10500
ttcttcttgt ccaagataag cctgtctagc ttcaagtatg acgggctgat actgggccgg 10560
caggcgctcc attgcccagt cggcagcgac atccttcggc gcgattttgc cggttactgc 10620
gctgtaccaa atgcgggaca acgtaagcac tacatttcgc tcatcgccag cccagtcggg 10680
cggcgagttc catagcgtta aggtttcatt tagcgcctca aatagatcct gttcaggaac 10740
cggatcaaag agttcctccg ccgctggacc taccaaggca acgctatgtt ctcttgcttt 10800
tgtcagcaag atagccagat caatgtcgat cgtggctggc tcgaagatac ctgcaagaat 10860
gtcattgcgc tgccattctc caaattgcag ttcgcgctta gctggataac gccacggaat 10920
gatgtcgtcg tgcacaacaa tggtgacttc tacagcgcgg agaatctcgc tctctccagg 10980
ggaagccgaa gtttccaaaa ggtcgttgat caaagctcgc cgcgttgttt catcaagcct 11040
tacggtcacc gtaaccagca aatcaatatc actgtgtggc ttcaggccgc catccactgc 11100
ggagccgtac aaatgtacgg ccagcaacgt cggttcgaga tggcgctcga tgacgccaac 11160
tacctctgat agttgagtcg atacttcggc gatcaccgct tcccccatga tgtttaactt 11220
tgttttaggg cgactgccct gctgcgtaac atcgttgctg ctccataaca tcaaacatcg 11280
acccacggcg taacgcgctt gctgcttgga tgcccgaggc atagactgta ccccaaaaaa 11340
acagtcataa caagccatga aaaccgccac tgcgttccat ggacatacaa atggacgaac 11400
ggataaacct tttcacgccc ttttaaatat ccgattattc taataaacgc tcttttctct 11460
taggtttacc cgccaatata tcctgtcaaa cactgatagt ttaaactgaa ggcgggaaac 11520
gacaatcaga tctagtagga aacagctatg accatgatra cgccaagcta tcgattacgc 11580
caagctat 11588
<210>7
<211>5583
<212>DNA
<213>核酸构建体Lo503b-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
<220>
<221>终止子
<222>(268)..(295)
<223>互补序列
<220>
<221>终止子
<222>(427)..(470)
<223>互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(591)..(747)
<223>attR2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(763)..(2081)
<223>STPT启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2112)..(2959)
<223>nptII
<220>
<221>终止子
<222>(3009)..(3261)
<223>互补序列:nos终止子
<220>
<221>终止子
<222>(3416)..(3678)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(3697)..(3792)
<223>互补序列:attL3重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(3977)..(4786)
<223>卡那霉素抗性
<400>7
ctttcctgcg ttatcccctg attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga 60
taccgctcgc cgcagccgaa cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga 120
gcgcccaata cgcaaaccgc ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca 180
cgacaggttt cccgactgga aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaata cgcgtaccgc 240
tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa aggccatccg tcaggatggc cttctgctta 300
gtttgatgcc tggcagttta tggcgggcgt cctgcccgcc accctccggg ccgttgcttc 360
acaacgttca aatccgctcc cggcggattt gtcctactca ggagagcgtt caccgacaaa 420
caacagataa aacgaaaggc ccagtcttcc gactgagcct ttcgttttat ttgatgcctg 480
gcagttccct actctcgcgt taacgctagc atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa 540
aacgacggcc agtcttaagc tcgggccctg cagctctaga gctcgaattc tacaggtcac 600
taataccatc taagtagttg gttcatagtg actgcatatg ttgtgtttta cagtattatg 660
tagtctgttt tttatgcaaa atctaattta atatattgat atttatatca ttttacgttt 720
ctcgttcaac tttcttgtac aaagtggggt acccggggat cctgatagct tatactcaaa 780
ttcaacaagt tatatataaa tgtatagata ctacaatatc attaacaaaa gtcaccttaa 840
ataaatacac atatctttta tgttctctat tgttttgcgt acgctaacac aatttctcat 900
atgcaaaagg atgaatgagt aacaaattac ctcataagaa caatcatctt tgcttacata 960
ctaatacaat aatcactcaa tcaaccaata acatcaatca cataggttta catacaataa 1020
tcactcaatc aacttcataa gaagaatcat gtttacttaa ttcatcaatt atccccaaaa 1080
acaccactat taagtataaa ctacaacata tttgtagtga tgggtcaaca tttttatcat 1140
atttaaactc gggttccctc aaatcgagaa atagtgaaca tgtaatatta attttaaatc 1200
gcaattacag aaattaattg aatttggtca aatggacaga attttataga ttgggtggaa 1260
ctagaaaaaa aaaaaaaaag agtatagggt gaattgagta catgaaagta catggtaatc 1320
ctagttaaac gcataataca tgtgggttca tttgtatttt tttgtaactt acgagtaaac 1380
tggctacaac aaaaaaaaat tagaagattt ttttgttttg tagaaaaccc taattttagt 1440
tatagttgta taactttgat aaaattataa aattgtatta cgaaaaaagt aataagatat 1500
tcaaaaaagc ctagaataac gtatatgact atgagcatga aactgcaagt caaatgctga 1560
cagacaacca taaacaaaag aaattaaata gagatacctt taaaataagt aaaatttcat 1620
ttataaaaaa tctactttct tgtgaatctg tcacgttcaa taatttgaag accactcaac 1680
atacaaggta aataatgaaa aataaaatct accaaaattt caatcattat tatcttccaa 1740
aaaaacaaaa ttatacagat gatgatggtg atatggaact tcgattggct aatattcact 1800
gtgtctctaa aaaccatcca cttatcaaga taagatggac cctacactca tccaatctaa 1860
accagtatct caagattctt atctaattac atcattctct accgttagat gaaattgacc 1920
attaacccta ccataactcc atacaccgcg agatactgga ttaaccaaat cgagatcatc 1980
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cctctttgct ctcactatca aaactctgaa tttcgatttc atctagagtc gagcccgggc 2100
gatatcggat ctcgactcta gtcgagggcc catgggagct tggattgaac aagatggatt 2160
gcacgcaggt tctccggccg cttgggtgga gaggctattc ggctatgact gggcacaaca 2220
gacaatcggc tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca gcgcaggggc gcccggttct 2280
ttttgtcaag accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg caggacgagg cagcgcggct 2340
atcgtggctg gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg ctcgacgttg tcactgaagc 2400
gggaagggac tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag gatctcctgt catctcacct 2460
tgctcctgcc gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg cggcggctgc atacgcttga 2520
tccggctacc tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc atcgagcgag cacgtactcg 2580
gatggaagcc ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa gagcatcagg ggctcgcgcc 2640
agccgaactg ttcgccaggc tcaaggcgcg catgcccgac ggcgaggatc tcgtcgtgac 2700
ccatggcgat gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat ggccgctttt ctggattcat 2760
cgactgtggc cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac atagcgttgg ctacccgtga 2820
tattgctgaa gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc ctcgtgcttt acggtatcgc 2880
cgctcccgat tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt gacgagttct tctgagcggg 2940
acccaagcta gcttcgacgg atcctctagc atatgctcga ggcggccgca gatatcagat 3000
ctactagtcc gatctagtaa catagatgac accgcgcgcg ataatttatc ctagtttgcg 3060
cgctatattt tgttttctat cgcgtattaa atgtataatt gcgggactct aatcataaaa 3120
acccatctca taaataacgt catgcattac atgttaatta ttacatgctt aacgtaattc 3180
aacagaaatt atatgataat catcgcaaga ccggcaacag gattcaatct taagaaactt 3240
tattgccaaa tgtttgaacg atcggggaaa ttcgagctcg gtagcaattc ccgaggctgt 3300
agccgacgat ggtgcgccag gagagttgtt gattcattgt ttgcctccct gctgcggttt 3360
ttcaccgaag ttcatgccag tccagcgttt ttgcagcaga aaagccgccg acttgtcgac 3420
cgatcggtca aacatttggc aataaagttt cttaagattg aatcctgttg ccggtcttgc 3480
gatgattatc atataatttc tgttgaatta cgttaagcat gtaataatta acatgtaatg 3540
catgacgtta tttatgagat gggtttttat gattagagtc ccgcaattat acatttaata 3600
cgcgatagaa aacaaaatat agcgcgcaaa ctaggataaa ttatcgcgcg cggtgtcatc 3660
tatgttacta gatcgggaag cttggcgtaa tcatggcaac tttattatac aaagttggca 3720
ttataaaaaa gcattgctta tcaatttgtt gcaacgaaca ggtcactatc agtcaaaata 3780
aaatcattat ttggagctcc atggtagcgt taacgcggcc atcccctata gtgagtcgta 3840
ttacatggtc atagctgttt cctggcagct ctggcccgtg tctcaaaatc tctgatgtta 3900
cattgcacaa gataaaaata tatcatcatg aacaataaaa ctgtctgctt acataaacag 3960
taatacaagg ggtgttatga gccatattca acgggaaacg tcgaggccgc gattaaattc 4020
caacatggat gctgatttat atgggtataa atgggctcgc gataatgtcg ggcaatcagg 4080
tgcgacaatc tatcgcttgt atgggaagcc cgatgcgcca gagttgtttc tgaaacatgg 4140
caaaggtagc gttgccaatg atgttacaga tgagatggtc agactaaact ggctgacgga 4200
atttatgcct cttccgacca tcaagcattt tatccgtact cctgatgatg catggttact 4260
caccactgcg atccccggaa aaacagcatt ccaggtatta gaagaatatc ctgattcagg 4320
tgaaaatatt gttgatgcgc tggcagtgtt cctgcgccgg ttgcattcga ttcctgtttg 4380
taattgtcct tttaacagcg atcgcgtatt tcgtctcgct caggcgcaat cacgaatgaa 4440
taacggtttg gttgatgcga gtgattttga tgacgagcgt aatggctggc ctgttgaaca 4500
agtctggaaa gaaatgcata aacttttgcc attctcaccg gattcagtcg tcactcatgg 4560
tgatttctca cttgataacc ttatttttga cgaggggaaa ttaataggtt gtattgatgt 4620
tggacgagtc ggaatcgcag accgatacca ggatcttgcc atcctatgga actgcctcgg 4680
tgagttttct ccttcattac agaaacggct ttttcaaaaa tatggtattg ataatcctga 4740
tatgaataaa ttgcagtttc atttgatgct cgatgagttt ttctaatcag aattggttaa 4800
ttggttgtaa cactggcaga gcattacgct gacttgacgg gacggcgcaa gctcatgacc 4860
aaaatccctt aacgtgagtt acgcgtcgtt ccactgagcg tcagaccccg tagaaaagat 4920
caaaggatct tcttgagatc ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa 4980
accaccgcta ccagcggtgg tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa 5040
ggtaactggc ttcagcagag cgcagatacc aaatactgtc cttctagtgt agccgtagtt 5100
aggccaccac ttcaagaact ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt 5160
accagtggct gctgccagtg gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 5220
gttaccggat aaggcgcagc ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt 5280
ggagcgaacg acctacaccg aactgagata cctacagcgt gagcattgag aaagcgccac 5340
gcttcccgaa gggagaaagg cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga 5400
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aaacgccagc aacgcggcct ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ttgctcacat 5580
gtt 5583
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<212>DNA
<213>核酸构建体Lo503a-pENTR-C1-STPT-nptII-IRnos
<220>
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<223>互补序列
<220>
<221>终止子
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<223>互补序列
<220>
<221>misc_feature
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<223>attR2重组位点
<220>
<221>启动子
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<223>STPT启动子
<220>
<221>misc_feature
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<223>nptII
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<221>终止子
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<223>互补序列:nos终止子
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<221>终止子
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<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
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<220>
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gcagttccct actctcgcgt taacgctagc atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa 540
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ctagaaaaaa aaaaaaaaag agtatagggt gaattgagta catgaaagta catggtaatc 1320
ctagttaaac gcataataca tgtgggttca tttgtatttt tttgtaactt acgagtaaac 1380
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atacaaggta aataatgaaa aataaaatct accaaaattt caatcattat tatcttccaa 1740
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<211>5047
<212>DNA
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<223>互补序列
<220>
<221>终止子
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<223>互补序列
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<221>nisc feature
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<221>misc_feature
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<220>
<221>misc_feature
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tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa aggccatccg tcaggatggc cttctgctta 300
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actacataat actgtaaaac acaacatatg cagtcactat gaaccaacta cttagatggt 3240
attagtgacc tgtagaattc gagctctaga gctgcagggc ggccatcccc tatagtgagt 3300
cgtattacat ggtcatagct gtttcctggc agctctggcc cgtgtctcaa aatctctgat 3360
gttacattgc acaagataaa aatatatcat catgaacaat aaaactgtct gcttacataa 3420
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cggaatttat gcctcttccg accatcaagc attttatccg tactcctgat gatgcatggt 3720
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ggaaaaacgc cagcaacgcg gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg ccttttgctc 5040
acatgtt 5047
<210>10
<211>1313
<212>DNA
<213>稻(Oryza sativa)
<400>10
cgtccgatgt gattccgtcc tcttgattgt tttccttccc cctaattttt gttgcatacg 60
cggagagaag ctttagcttt aagaggttaa ctggcggcac ctcaatttct ttgggcttca 120
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cccatgaaga actgaaaaca aatgaatgca aaactaaaat tgtcttagtt ctgtcgacaa 1260
atgccaactg ctataatcgt acatgcgtct ccgaagaaac cgccgacact gcc 1313
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<213>稻
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gcagaaaata ataataatct aaatatgaag tgtaaatttt ctttgggcaa atgcataaaa 840
attgggaaaa gacaaaaaaa taaaacataa tcaaaatatg aactggaaaa ggtttaaaaa 900
aaatacaaaa cacataatca aaatatgcaa atatgaacta taaattttct ttgggcaaac 960
gcaatgtttt taggaagatg tgagcttttt ttccttaacc aaatcagcct aaaggcaaag 1020
accatcagag aactgtcata atctgattat cctgatctca ctcgtcaact tttcttccag 1080
gaagataata tgagaataca gaacaatgag gacaactcga cgcaacagtc agtggggagg 1140
agcaagcttg gaggagtcaa atagctcaaa cagtcatgca caatacttga tatggcctgg 1200
tctaccaaag cagtttttct ggatgtctct cttgggaaga tacatcattt tgttccccca 1260
cgaaaggcta caacaccctg attaacacaa gcaaaagttt cacccaaata catcctacag 1320
aatcattcct caactcccag agagcaaaag gtataaaaga accgtttcgg tatagtcaag 1380
caagctatct aagcagaatc aatggaacaa tgcgaaattc cgagcatcag aaccagcagt 1440
gcgtatggat ggctgtcatc agaacctgcg gagcccacga tcaaacatcc ttgcagatgg 1500
gcactcatat gacatatgac ccctcccacc gcaggtgcca cagatcatgg ttgtcatgca 1560
gttgcggctg atgtgccctg gcttgccaca caagcggcag gtaatgtcac ggaaagggcc 1620
gccctgtatc tctgaagaaa tggtcgtttt ttgacagttc cgagcaagat gcccagagac 1680
attgcacagg ttgcaaacag gctcgttcgt gcactcccga g 1721
<210>23
<211>1599
<212>DNA
<213>稻
<400>23
acccatcaat taatctcttt tcttttctta atctattttt cttctctttg caatcactcc 60
tcctatttgt gcgatagcgt gcatgggcca tgtgacaatc tcttgtgatg aatggatgat 120
cacgcgtgct acctaaccta ccagatcgcc atatcaggct atcgctgatc gcgtgatctg 180
tagtatcaca tccgtttgtg tgggggtaaa atcagccatc ttcctgtaat aaaatagaat 240
gattttccat tagactcact gatcattggc tgtgaaattt gccggccgcc tgttcatcag 300
ttatctcgat caaggcttca acttttactg tggtatgccg gctcctagct ggaaaatgtt 360
gaggacaaaa actcttcttc aacccaaaga taacacaacc atcctgaatt tggttgtagg 420
ggacgcaaat tcaaaaccat aattttctgg tcacaataat tgatgtgttc aagataacct 480
gctctgctct gaattttctg tcatcttaat taattacagc tgccttgaat cgttcagaca 540
atacacgata tcttagttga ctcggaaata aaatgaacga atgaatctaa agacgagcct 600
tgcgtggatt gcaaattggc aaaggcagca cagatgctcc cgtcactcgc ttagaataac 660
aagccacaaa cacaacacaa gaacaaagag aatttgcttt gtgcaagatt cttctaatgc 720
gattacatca agaatctgtt actgtcagtg tcactgtcaa ccatttgcac aacgggcggg 780
ccttgacgtt ccagcatttt tgacgacgaa aaagtggaga aaagagagga gacaaaataa 840
cagtcttgcg tggcaccgcc tggagtccac gtcactttga acggctctgc tacaacgata 900
cacccggcaa gacagcaact tgcattgtgt ttatcattgg tggctcaaaa tcacagcaaa 960
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tcccacgata agctgaatct atcatactcg actgccagta tttggtcagt ttccatacac 1080
ggttagctga atcttgcctt cacaaattaa cagttttttt ccaccctgca agattgcatt 1140
ataataaacc tgtaacattt aagctatcga cagagacgtc agtaaaagga acaaccagcc 1200
agtttgcaat agcttatctg cttataatag gaagatgaac tctaactggc agtggcacag 1260
atcactgtga gaaataagaa ataacatgac tggttccatt tagcacaggc acatcaaagt 1320
ataccttttc ttcccagcta taccactaac tggaatgaat accatcgtat gtttcaatct 1380
tgtcaagaaa cgaataaaaa tatcttcatg cggacagggt tccaacaata gtaaaaaagg 1440
aaaaaagaat acagacgcat aattgccaat cctctacttt catctacata gctgtgcaac 1500
aaatgcttct ctgagctgca ccacatttta aactcaatac ggtattctgt gcaggtttgc 1560
caaaacaaaa aatgctaatg atctcgcccc atcaaccac 1599
<210>24
<211>715
<212>DNA
<213>稻
<400>24
agtatcatgt tggcatgttc ggttgttctt gtttgttcgt gggtggaaac ttacattggt 60
tggaacataa caatacagaa tagggaatac tagtcagttt ggcatctgtt tagtttgatg 120
atatgacttg gtgatgatat atactcgaga tttgtttctc tcttctgcgt tttgaagaat 180
ttaggagctg taaatctgag ggcattatat atcgagatta cttctgcttc tgttgatcct 240
tttgcatgtt acttttcact gttaccaact agcagctgct cttatgcaca ggccctagcg 300
aacactaacc accattgcac tgacaaatca caaacaaaaa agaactccca tgcaaatttt 360
ggaatctata actcatcacc tctcattcgt aatagaatcg atcctgctag aaaagaggga 420
caaaaagagg gggaaaaaca aacatcaggt actccaaaaa gggccaagct taccaggact 480
acatctgaaa ttctgaatag acgtatatgc tacaattagt aaaccaatat caccactgct 540
ctcccttgcc acaaaacaag ggaagcttca atttatgacc cgatttttgc tgataatctc 600
tcacataaac ccaactcaac acataccctc ttcccgaatg ttgataattc caacccacga 660
aaatatcaaa ctttttcacc gacgcatagc aaccgaggca tagcaactaa ctcgc 715
<210>25
<211>1191
<212>DNA
<213>稻
<400>25
ggcagctggt cacgcttagc ggcggccggt ccggtgctag ccttctcctg agcttgtgtg 60
ttggcgatgt tggtgtgtgg gtggtggatt ttttttcttt ttcctggtta cgaccctcca 120
gggttataat attgtaattt tttcctgctc tatcaatata attttgcacc gtctcgtgcg 180
agtcgttcaa aaaaaaataa aggtagtttt taaaaaaaaa aatctaattt acagatgtat 240
tggatgagtt tgaccatgtg acatatgcat ggataaatat gttaaaatca ttacttaaat 300
cttttgtttt tttatctact tgttctatct tccatacaaa taagtatcaa tataatatta 360
gtataaaatt attatataaa ttgagaactt atgattgata tattaatata ttatatcagt 420
tatttaaaac taaccgttta agtttctcaa ttcataaaac cacaatccaa aattacttta 480
gacggtaata taaagggtct tataaagttt aggaggctag atatccgata atttaaaatc 540
cagagcataa gatagactca catacaatgt ttatgtggta tacgcctata tggacttttt 600
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tataaaaaaa tatttttcat ttcatagtag ccaccaatat ctggaatgct ggatgatact 720
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aaacaataag ctattaagca taccggccgt cctcttgctg tttttaacgc atttgtagac 840
atatgtggtt tgagtaccaa ttcaatacaa agcaagagga gcagtacaaa ctaaatggta 900
ctcacacaat gaagcaaggt gaacttccaa atatctgcaa ccattattta cagaagataa 960
tagctattta gacagctatg agcctcacac atgtaccttt gaatcgccaa acaaatactt 1020
ctagcgcatt tatatatgaa catataatgg agccaacaca tcatttacaa ccaacatccc 1080
agtgagttat ttgtttggat caccactaac ttcgcaggca acctatgatt tgctctataa 1140
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<211>791
<212>DNA
<213>稻
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actttggtct accttttgta tgatagatat taagttaaga agtatgagac atcgatattg 60
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tagatctgta actacaatat tgcttaatta tgagcttaca taagctagca gcaactgcac 600
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aggatgctgt t 791
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<212>DNA
<213>稻
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cgaaggccca ggttttcgct tttatgctgc agctagttcg ttctcatttg aggtgggaag 60
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tatcagtaca tcacacgcat ccacacatac aaagcatccc agaagggatt gcaacccaaa 840
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aggctgtaac actaacacga gaagcaaact tgaagaatgc tgaggaaacg catctagcac 960
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tattataacc ccttcgtcct aaattccagg tttcaaaatt ctactcacaa gcatacatca 1140
tttaataagg gacattactg tcttttattc ttaaacttaa tctatgctaa acaacataaa 1200
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tttagtagtg tcactgtcga tacacctaat ttaacaccat aatatctcca actctccaca 1320
acacaaggac tgctgataaa ataaatgcac ttctttagga gaataatgtg ctcatcaagg 1380
ccatgtacaa aatatttctc caaaaagttc aacaaaggtt ccaggtaccc gtacagcaag 1440
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<212>DNA
<213>稻
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tattagcgct cttttggcgg tgctgggtag tagaatgtag aatcgtttct tgttgattcc 180
ctgaactgat ccagatcaaa catcttctaa aggttctgcg atgcaatgct agctgcagac 240
gggagatggt acagggggtc gttttgctac tttgccgccg atgttgtagg gtgtgtagac 300
agactgtaga tgaataatgt cagtaacacc tgtggggggt tcagtgctag tgggctgcaa 360
aacttgagca ctgcttcgat caaattgtgt ctttgattat gaaattatgg aatccagcac 420
aggcaggtaa taatttcgta atagagcata aacaatttgt gaccttaggt gcgaagaaca 480
taaagctgac caaggtgaag taatattgat gcattgtgcg ctgcatttaa tttggttgtt 540
gaattcagag tacgtattta aataggtgtc cggaggggaa aatgtacaca aatgtttact 600
ccgtttgctg tgcatctcgc agtgatacaa aaaaatacaa atcaaaccac gctaaaaaat 660
ttagtcagtt gctcgtcttc agaattcagt cctcaaatat ttttaatgtt tcctccatgg 720
ctgctcgtcc gttcattttg cactcgtttt gctctctgtg aactggagag ccccagaggt 780
tctctttttg catgtaatct gagtttctga tcaaccattc agcctggcta agaaaaccat 840
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atcgccagtt actacttact tactaacagc gtccgggaac aggagttgag ccaaagaggc 960
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acgtcctgtt ttcactttca aacttgagca ttcagtttag acgaggtact tgattttttt 1080
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cccttctcct gtgttttgcg ctaataattc catcctgcac atggcatctc tgaggaatca 1200
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aagcacgcat caccatatga aacataacat agcaaatcat acgggcgcct aaatgcgtgc 1560
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<212>DNA
<213>稻
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gcgtattcca attttttgat ttacgaattc ttcccgtgag ctcaagcaaa gagtggctct 60
gcagaacagt taagatctga tgcatagcca agttatatgg gttatgtatg tcaacaaatc 120
attgctcccc cccccccccc cagagatgta ttagtctgta tttcggcatt actcatttgg 180
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ttaatatggc gattggtgtt acttcgctat ttgattgggt tattattgta gcctgaatat 300
tacattacaa accttcaatt ctgtagcaat agctttttat tagagaaatt ttacgggctc 360
ttaacgagat accgagaggt accacatttt tctgtaatgt accaagaaca aaaaaagtga 420
tactctcttt ataatccttg taaaaacaaa aggtaccaaa atgataactt ggaatactta 480
tcaagagctg taaaaatgac ccttggagca acggtgtaat tatactttaa gacaaaacga 540
tatagctata acccgaaaca aaagatcaaa tgtaagccta aaattagcta ttgcaaggag 600
ctgaaaaggc acttatgttc caatcaaatt atgtaagaat catattcctt tattctttca 660
tattggtgaa gccgtaccgt gtcagtatag gctgattttt ttacattaaa gcaaaaaaaa 720
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g 781
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<212>DNA
<213>稻
<220>
<221>misc_feature
<222>(183)..(183)
<223>可以代表任何碱基(a,t,c,g)
<220>
<221>misc_feature
<222>(426)..(426)
<223>可以代表任何碱基(a,t,c,g)
<400>30
ttattttcca gttctggtgg tcacttccag ttgtgttttt actgtacaat tagggctctg 60
ttgggaggca acatatccta tgcacacagg ccctcacgta tacacacgtg cacatcaact 120
aaaaaatgtc accaaaaaat ctagaaaaaa tcatacatat actttcaatt gtattacacc 180
tanggttaaa atcttaatgt caaattcatt atattttagc cgtaacaaaa aaaaaacaaa 240
aaatctgaca gttttaaggt tacaattttg tcagcatttt atcttttttg ttattctcta 300
tgtacaataa atttgaagat gcgactttgc atgtagatgt aatactattg aaagtacatg 360
tatgaatttt actagaattt tttgtgataa tttttagttg gtatacacgg tgtgtatacg 420
tgaggncctg tgtgcatagg atacgctccc ctgttgggac gactatttta agggattttt 480
tcaataggaa ttagtccaat tcataccaaa atccttaaaa aaaaaatcct ctattctgaa 540
ggccttaagg acctattcgt tttggagaaa tttcagagga tttggatttt taagaattaa 600
ttcctatcat tgccatttgg tttataggaa tgtagacata ggaaaatcaa ggaattcttc 660
ctttcctaca agttgtagag agaaaacata agaaattttt cgtcttctta aatctcttgg 720
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<212>DNA
<213>稻
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ttcaagttgc atcgccactt atgaacactc catgaacact taattctgga ggcatgattg 60
gtccgtggga ttaagacatc ttgatagact gcagtggagc ccagcccata atctgaagaa 120
ctcattaccg actcttggct gaagtgcttc ggagtgattg atgccattct gtcatgtgat 180
caagttcatg tccatactac atacgtcgtc tggtccttta gagcaacatg acttcaggac 240
gttgctatca acggctattg atgataaact agtaataaaa tttgtcgatg aaattacttg 300
ccgtgataaa tgattccgtt gtcgccaggt tacagttatt caacgtaaga acttcatatt 360
cattctagaa accaacacta ttcatcacca ttttcctcat ccccgaaaaa ctttgaccag 420
tacctctgtt tttgccaccc ccctccctcc ccggccacaa ggtgtagaat caagtgccat 480
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tttggataat agtacctccg ccttaaaata tatggatttt tcggattagg cacgagtaat 660
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<212>DNA
<213>稻
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cagaaggaga tcaagaatgt ctttggcgag acattgcttc gacattgctt cagtgtcaaa 60
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tccacacaag cacaagaggc atactagaaa tatatgaggc aaaaaagaga ggaagaacat 240
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tttccatctt tcccatgttt ccaatctctg ctcgccctat tctctactct ctttccatct 360
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ttcccagcat gcataaatcc ctaagcggtg gggacgctct gctccctgat ggcgctcaga 540
cgcctaggga cgctttttaa accatgattg agattcctcc acgacgatca cctccatcca 600
gtttctcgct ccacattcta tccggcgatg agaatttgtt ttttatcaaa taactatcac 660
aaagctgcta gcccttcccc aaatccaccc ctacctctct cactgttgct actgttgatt 720
tttgcctaga catcagcatc actggataga acatgcaatg aggaactaga tggagtgagc 780
ttggtaaagg aattaattgg tgattgccat actttagcag cagcaaagca atgtctgaca 840
ctaagaacca cttgattttc ttgaggacag gagtctctgt tcctctagtt atttgtagga 900
attggactag gagcttcaag aacatggtgt tatgcggttg aatttgccat aggcagatca 960
atggagctcc catagtggca gcaatgaggg tgaataatgg acttcaagca taagttcaaa 1020
gaccagaagt ggactatttc tgaatttagt ccgaaaaatg aactttggga cgaaaagtat 1080
ggacttcatc catatcaaaa ccatgaccaa acataacttc tttcgaaatc catactgcac 1140
aaacatacat gtgccttttt ttaaaagata ttgggtaaag tgtatttgtg ccatgaatgg 1200
ctgctatcag gaatgcaatc tccacatgtt gtagcattgt taaaagctaa aactgcaaga 1260
ttttgcacca agtaata 1277
<210>33
<211>1381
<212>DNA
<213>稻
<400>33
tgccttttgg atcgaaagat gcagttgttt tgctgctgaa ggcatcctca tgtctgttac 60
tttgatatgg tcttgaaata aatcttcgtt tacaagagaa caacactctg ttttatcttg 120
ttttgtgtgc cagaagcctg ctgaacaatt ttatgtcaat ttctttgcta ctaagaaagt 180
tatgcaccaa aatgaaggga aattctgtga agtttgtaat tttcaagtga ttggcattat 240
tctgtttagt tcgtgcagtg ccatgttcct tatataatca cagaacatgt aaaaggccga 300
aatattttcc ttgtcatttt ccatgcgaga acggcctttc gatgagactg gaaagtcctg 360
caataactat tgtccaaaat aacacacggc tctctaccga ttcacatcaa aaccaaccca 420
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ggaagtttat catggcatat acttgccttt caaagaccct aattttcaaa gtgaacatgg 600
gactttcaga ctacagataa cctcaatcga taacatcacc gaaaattcga tattactaca 660
aagattttgg ttgaaaactt ctctgaaccc aatttaaata caagtcgccc tcggtgatgg 720
ctactcgcca ttccacgctc acagttgcag ttcacacttg caaaatgaaa aaaaaaatct 780
tctgaacagc aatcatcaac cggttcgacc tcaggatcat cacagaaatg aaaaggacga 840
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attattaatt caacaggaga tgctcgttaa agacaatata gttctgtaat ttgtaacaac 960
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tcactatata tacgcactat agcttcacat gactaaaatt ataacatgac ataatttctt 1260
tcgtataaat tagccccagg aagcttctgt ccgaatcgcc atcttgggag caataaatat 1320
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t 1381
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<213>稻
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gtaactccag caatttactc ccaaccaata caattgcaca attgtgccct aaatttaata 60
ccagataagc taataagtga tctcttaaaa tgtctgtgat ctagggacct ggccatttga 120
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agtgagatct tacaacagtg tatgggagtt tt 1172
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tattatcaag gcttgtaatg ttagatgctc ttatattaca ctatgaagtg tcaactttca 300
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tgcagttgtg tgcagaagga ga 1162
<210>46
<211>1297
<212>DNA
<213>稻
<400>46
tgttttgtca agctcccgct tgggaaaagc ttggtttttt tgttacgtgt tttgacctgg 60
aacaacattt gacacatgtc ttttgatctc attgtctgtt tttcaagccc aataagaatt 120
tgggtcgagc attgttttag gatcgaccat atacagtacc tctctttgca ttacaatgaa 180
gagcagttaa tttgggtcac tttttacatc tttactgaag tagaaacgcg tcctctgtct 240
gtgacagttt ttttgttctc cagattgttt gccgcttttt acttgcctga tacctgtgat 300
agtagtacta gatgtagatg gttgtactgg gcgaaattca gcgaggctag gagttttgga 360
ggattttggt tgaactagtt tctgcgagaa ttcaataaaa tttctgaatt atgatggagc 420
cacggagaac aagcaatctg aaagaagata cgcaggtact gcgagtgtag tgcagccaga 480
agcaagttat ccgtagcttg tgaaagcaca gttggcttct tctacccaaa atataagaac 540
ctattaacca aaatataaga acctattaac gaatgagata ttttctagta ctaagtatat 600
tttctagtac taagtccata ttcgtagtac taggaaatgc cccatccgat ttaagttcaa 660
attcgtagta ttaggaaatg tcctatccgg ttctaggtta ttgtacttaa gaacagatgg 720
agtaggaaac taggttattg tacttaagaa cggatggagt aggaaacaac ggtgtactca 780
cacagagctg attgtctgaa caatcttcca gaggtcatca aactgctgat cagatcagaa 840
aaaaagattg aaattttgga tctcaatacc atttttacct gtcttgaacg gattgcaaca 900
atatgcattc agaactttag acatgcatac atactgcatt ggaaatgcgt ggaacaaaaa 960
cccatacctg ccttatggga actataagaa atatgttgta cattagcaac aaagtgaatt 1020
tccaatacaa acataagatc atcaatatta tccatgataa ataaaaatac agggctggta 1080
taagcaacat acaatctccg cttgttcaga acctaaaatt tgtttacagt tgtaccacat 1140
ggtatgctct ctacaactaa tgctactaag gaaatttcac agcatcgcga cagaacaaac 1200
aacagatgac atatcagtaa ctaaaatcat gtgttctgat atgtccagct gatgaggcat 1260
gcaaaacttc aggagatcag aaccctctac ttcaaag 1297
<210>47
<211>35
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物引物1(SacI,AvrII,SpeI,OCS 5’)
<400>47
cggagctccc taggactagt tcgaccggca tgccc 35
<210>48
<211>25
<212>DNA
<213>引物2(NotI,OCS 3’)
<400>48
ccgcggccgc agcttggaca atcag 25
<210>49
<211>36
<212>DNA
<213>引物3(AvrII,XmaI,RsrII,LuF 5’)
<400>49
cgcctaggcc cgggcggacc gcattaagaa gggccc 36
<210>50
<211>24
<212>DNA
<213>引物4(SpeI LuF 3’)
<400>50
cgactagtag agagttctca gagc 24
<210>51
<211>16
<212>DNA
<213>引物5(RsrII,BspEI,靶标gene seq 5’)
<220>
<221>misc_feature
<222>(16)..(16)
<223>n代表待扩增的靶序列的优选10到20个碱基
<400>51
cgcggaccgt ccggan 16
<210>52
<211>15
<212>DNA
<213>引物6(SpeI,AgeI,靶标gene seq 3’)
<220>
<221>misc_feature
<222>(15)..(15)
<223>n代表待扩增的靶序列的优选10到20个碱基
<400>52
cgactagtac cggtn 15
<210>53
<211>4811
<212>DNA
<213>pTOI3
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(100)
<223>attL2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(147)..(2134)
<223>泛蛋白启动子+内含子
<220>
<221>内含子
<222>(2551)..(2739)
<223>PIV2内含子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4218)..(4242)
<223>目的转录终止子的插入位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(4243)..(4482)
<223>萤光素酶片段(Lu-F)
<220>
<221>终止子
<222>(4489)..(4701)
<223>ocs终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4712)..(4811)
<223>attL1重组位点
<400>53
caaataatga ttttattttg actgatagtg acctgttcgt tgcaacaaat tgataagcaa 60
tgctttctta taatgccaac tttgtacaag aaagctgggt cggcgcgcca agcttgcatg 120
cctgcaggca tgcaagcttc cgcggctgca gtgcagcgtg acccggtcgt gcccctctct 180
agagataatg agcattgcat gtctaagtta taaaaaatta ccacatattt tttttgtcac 240
acttgtttga agtgcagttt atctatcttt atacatatat ttaaacttta ctctacgaat 300
aatataatct atagtactac aataatatca gtgttttaga gaatcatata aatgaacagt 360
tagacatggt ctaaaggaca attgagtatt ttgacaacag gactctacag ttttatcttt 420
ttagtgtgca tgtgttctcc tttttttttg caaatagctt cacctatata atacttcatc 480
cattttatta gtacatccat ttagggttta gggttaatgg tttttataga ctaatttttt 540
tagtacatct attttattct attttagcct ctaaattaag aaaactaaaa ctctatttta 600
gtttttttat ttaatagttt agatataaaa tagaataaaa taaagtgact aaaaattaaa 660
caaataccct ttaagaaatt aaaaaaacta aggaaacatt tttcttgttt cgagtagata 720
atgccagcct gttaaacgcc gtcgacgagt ctaacggaca ccaaccagcg aaccagcagc 780
gtcgcgtcgg gccaagcgaa gcagacggca cggcatctct gtcgctgcct ctggacccct 840
ctcgagagtt ccgctccacc gttggacttg ctccgctgtc ggcatccaga aattgcgtgg 900
cggagcggca gacgtgagcc ggcacggcag gcggcctcct cctcctctca cggcaccggc 960
agctacgggg gattcctttc ccaccgctcc ttcgctttcc cttcctcgcc cgccgtaata 1020
aatagacacc ccctccacac cctctttccc caacctcgtg ttgttcggag cgcacacaca 1080
cacaaccaga tctcccccaa atccacccgt cggcacctcc gcttcaaggt acgccgctcg 1140
tcctcccccc ccccccccct ctctaccttc tctagatcgg cgttccggtc catggttagg 1200
gcccggtagt tctacttctg ttcatgtttg tgttagatcc gtgtttgtgt tagatccgtg 1260
ctgctagcgt tcgtacacgg atgcgacctg tacgtcagac acgttctgat tgctaacttg 1320
ccagtgtttc tctttgggga atcctgggat ggctctagcc gttccgcaga cgggatcgat 1380
ttcatgattt tttttgtttc gttgcatagg gtttggtttg cccttttcct ttatttcaat 1440
atatgccgtg cacttgtttg tcgggtcatc ttttcatgct tttttttgtc ttggttgtga 1500
tgatgtggtc tggttgggcg gtcgttctag atcggagtag aattctgttt caaactacct 1560
ggtggattta ttaattttgg atctgtatgt gtgtgccata catattcata gttacgaatt 1620
gaagatgatg gatggaaata tcgatctagg ataggtatac atgttgatgc gggttttact 1680
gatgcatata cagagatgct ttttgttcgc ttggttgtga tgatgtggtg tggttgggcg 1740
gtcgttcatt cgttctagat cggagtagaa tactgtttca aactacctgg tgtatttatt 1800
aattttggaa ctgtatgtgt gtgtcataca tcttcatagt tacgagttta agatggatgg 1860
aaatatcgat ctaggatagg tatacatgtt gatgtgggtt ttactgatgc atatacatga 1920
tggcatatgc agcatctatt catatgctct aaccttgagt acctatctat tataataaac 1980
aagtatgttt tataattatt tcgatcttga tatacttgga tgatggcata tgcagcagct 2040
atatgtggat ttttttagcc ctgccttcat acgctattta tttgcttggt actgtttctt 2100
ttgtcgatgc tcaccctgtt gtttggtgtt acttctgcag ggtacccccg ggtggtcagt 2160
cccttatgtt acgtcctgta gaaaccccaa cccgtgaaat caaaaaactc gacggcctgt 2220
gggcattcag tctggatcgc gaaaactgtg gaattgatca gcgttggtgg gaaagcgcgt 2280
tacaagaaag ccgggcaatt gctgtgccag gcagttttaa cgatcagttc gccgatgcag 2340
atattcgtaa ttatgcgggc aacgtctggt atcagcgcga agtctttata ccgaaaggtt 2400
gggcaggcca gcgtatcgtg ctgcgtttcg atgcggtcac tcattacggc aaagtgtggg 2460
tcaataatca ggaagtgatg gagcatcagg gcggctatac gccatttgaa gccgatgtca 2520
cgccgtatgt tattgccggg aaaagtgtac gtaagtttct gcttctacct ttgatatata 2580
tataataatt atcattaatt agtagtaata taatatttca aatatttttt tcaaaataaa 2640
agaatgtagt atatagcaat tgcttttctg tagtttataa gtgtgtatat tttaatttat 2700
aacttttcta atatatgacc aaaatttgtt gatgtgcagg tatcaccgtt tgtgtgaaca 2760
acgaactgaa ctggcagact atcccgccgg gaatggtgat taccgacgaa aacggcaaga 2820
aaaagcagtc ttacttccat gatttcttta actatgccgg aatccatcgc agcgtaatgc 2880
tctacaccac gccgaacacc tgggtggacg atatcaccgt ggtgacgcat gtcgcgcaag 2940
actgtaacca cgcgtctgtt gactggcagg tggtggccaa tggtgatgtc agcgttgaac 3000
tgcgtgatgc ggatcaacag gtggttgcaa ctggacaagg cactagcggg actttgcaag 3060
tggtgaatcc gcacctctgg caaccgggtg aaggttatct ctatgaactg tgcgtcacag 3120
ccaaaagcca gacagagtgt gatatctacc cgcttcgcgt cggcatccgg tcagtggcag 3180
tgaagggcca acagttcctg attaaccaca aaccgttcta ctttactggc tttggtcgtc 3240
atgaagatgc ggacttacgt ggcaaaggat tcgataacgt gctgatggtg cacgaccacg 3300
cattaatgga ctggattggg gccaactcct accgtacctc gcattaccct tacgctgaag 3360
agatgctcga ctgggcagat gaacatggca tcgtggtgat tgatgaaact gctgctgtcg 3420
gctttaacct ctctttaggc attggtttcg aagcgggcaa caagccgaaa gaactgtaca 3480
gcgaagaggc agtcaacggg gaaactcagc aagcgcactt acaggcgatt aaagagctga 3540
tagcgcgtga caaaaaccac ccaagcgtgg tgatgtggag tattgccaac gaaccggata 3600
cccgtccgca agtgcacggg aatatttcgc cactggcgga agcaacgcgt aaactcgacc 3660
cgacgcgtcc gatcacctgc gtcaatgtaa tgttctgcga cgctcacacc gataccatca 3720
gcgatctctt tgatgtgctg tgcctgaacc gttattacgg atggtatgtc caaagcggcg 3780
atttggaaac ggcagagaag gtactggaaa aagaacttct ggcctggcag gagaaactgc 3840
atcagccgat tatcatcacc gaatacggcg tggatacgtt agccgggctg cactcaatgt 3900
acaccgacat gtggagtgaa gagtatcagt gtgcatggct ggatatgtat caccgcgtct 3960
ttgatcgcgt cagcgccgtc gtcggtgaac aggtatggaa tttcgccgat tttgcgacct 4020
cgcaaggcat attgcgcgtt ggcggtaaca agaaagggat cttcactcgc gaccgcaaac 4080
cgaagtcggc ggcttttctg ctgcaaaaac gctggactgg catgaacttc ggtgaaaaac 4140
cgcagcaggg aggcaaacaa tgaatcaaca actctcctgg cgcaccatcg tcggctacag 4200
cctcgggaat tgctaccgag ctccctaggc ccgggcggac cgcattaaga agggccctgc 4260
tcccttctac cctctggagg atggcaccgc tggcgagcag ctgcacaagg ccatgaagag 4320
gtatgccctg gtgcctggca ccattgcctt caccgatgcc cacattgagg tggacatcac 4380
ctatgccgag tacttcgaga tgtctgtgcg cctggccgag gccatgaaga ggtacggcct 4440
gaacaccaac caccgcatcg tggtgtgctc tgagaactct ctactagttc gaccggcatg 4500
ccctgcttta atgagatatg cgagacgcct atgatcgcat gatatttgct ttcaattctg 4560
ttgtgcacgt tgtaaaaaac ctgagcatgt gtagctcaga tccttaccgc cggtttcggt 4620
tcattctaat gaatatatca cccgttacta tcgtattttt atgaataata ttctccgttc 4680
aatttactga ttgtccaagc tgcggccgcg gagcctgctt ttttgtacaa agttggcatt 4740
ataaaaaagc attgctcatc aatttgttgc aacgaacagg tcactatcag tcaaaataaa 4800
atcattattt g 4811
<210>54
<211>5053
<212>DNA
<213>pTOI4
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(100)
<223>attL2重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(147)..(2134)
<223>泛蛋白启动子+内含子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2158)..(4163)
<223>编码葡糖醛酸糖苷酶(GUS)+内含子
<220>
<221>内含子
<222>(2551)..(2739)
<223>PIV2内含子
<220>
<221>终止子
<222>(4225)..(4478)
<223>nos终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4485)..(4724)
<223>萤光素酶片段(Lu-F)
<220>
<221>终止子
<222>(4731)..(4943)
<223>ocs终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4954)..(5053)
<223>attL1重组位点
<400>54
caaataatga ttttattttg actgatagtg acctgttcgt tgcaacaaat tgataagcaa 60
tgctttctta taatgccaac tttgtacaag aaagctgggt cggcgcgcca agcttgcatg 120
cctgcaggca tgcaagcttc cgcggctgca gtgcagcgtg acccggtcgt gcccctctct 180
agagataatg agcattgcat gtctaagtta taaaaaatta ccacatattt tttttgtcac 240
acttgtttga agtgcagttt atctatcttt atacatatat ttaaacttta ctctacgaat 300
aatataatct atagtactac aataatatca gtgttttaga gaatcatata aatgaacagt 360
tagacatggt ctaaaggaca attgagtatt ttgacaacag gactctacag ttttatcttt 420
ttagtgtgca tgtgttctcc tttttttttg caaatagctt cacctatata atacttcatc 480
cattttatta gtacatccat ttagggttta gggttaatgg tttttataga ctaatttttt 540
tagtacatct attttattct attttagcct ctaaattaag aaaactaaaa ctctatttta 600
gtttttttat ttaatagttt agatataaaa tagaataaaa taaagtgact aaaaattaaa 660
caaataccct ttaagaaatt aaaaaaacta aggaaacatt tttcttgttt cgagtagata 720
atgccagcct gttaaacgcc gtcgacgagt ctaacggaca ccaaccagcg aaccagcagc 780
gtcgcgtcgg gccaagcgaa gcagacggca cggcatctct gtcgctgcct ctggacccct 840
ctcgagagtt ccgctccacc gttggacttg ctccgctgtc ggcatccaga aattgcgtgg 900
cggagcggca gacgtgagcc ggcacggcag gcggcctcct cctcctctca cggcaccggc 960
agctacgggg gattcctttc ccaccgctcc ttcgctttcc cttcctcgcc cgccgtaata 1020
aatagacacc ccctccacac cctctttccc caacctcgtg ttgttcggag cgcacacaca 1080
cacaaccaga tctcccccaa atccacccgt cggcacctcc gcttcaaggt acgccgctcg 1140
tcctcccccc ccccccccct ctctaccttc tctagatcgg cgttccggtc catggttagg 1200
gcccggtagt tctacttctg ttcatgtttg tgttagatcc gtgtttgtgt tagatccgtg 1260
ctgctagcgt tcgtacacgg atgcgacctg tacgtcagac acgttctgat tgctaacttg 1320
ccagtgtttc tctttgggga atcctgggat ggctctagcc gttccgcaga cgggatcgat 1380
ttcatgattt tttttgtttc gttgcatagg gtttggtttg cccttttcct ttatttcaat 1440
atatgccgtg cacttgtttg tcgggtcatc ttttcatgct tttttttgtc ttggttgtga 1500
tgatgtggtc tggttgggcg gtcgttctag atcggagtag aattctgttt caaactacct 1560
ggtggattta ttaattttgg atctgtatgt gtgtgccata catattcata gttacgaatt 1620
gaagatgatg gatggaaata tcgatctagg ataggtatac atgttgatgc gggttttact 1680
gatgcatata cagagatgct ttttgttcgc ttggttgtga tgatgtggtg tggttgggcg 1740
gtcgttcatt cgttctagat cggagtagaa tactgtttca aactacctgg tgtatttatt 1800
aattttggaa ctgtatgtgt gtgtcataca tcttcatagt tacgagttta agatggatgg 1860
aaatatcgat ctaggatagg tatacatgtt gatgtgggtt ttactgatgc atatacatga 1920
tggcatatgc agcatctatt catatgctct aaccttgagt acctatctat tataataaac 1980
aagtatgttt tataattatt tcgatcttga tatacttgga tgatggcata tgcagcagct 2040
atatgtggat ttttttagcc ctgccttcat acgctattta tttgcttggt actgtttctt 2100
ttgtcgatgc tcaccctgtt gtttggtgtt acttctgcag ggtacccccg ggtggtcagt 2160
cccttatgtt acgtcctgta gaaaccccaa cccgtgaaat caaaaaactc gacggcctgt 2220
gggcattcag tctggatcgc gaaaactgtg gaattgatca gcgttggtgg gaaagcgcgt 2280
tacaagaaag ccgggcaatt gctgtgccag gcagttttaa cgatcagttc gccgatgcag 2340
atattcgtaa ttatgcgggc aacgtctggt atcagcgcga agtctttata ccgaaaggtt 2400
gggcaggcca gcgtatcgtg ctgcgtttcg atgcggtcac tcattacggc aaagtgtggg 2460
tcaataatca ggaagtgatg gagcatcagg gcggctatac gccatttgaa gccgatgtca 2520
cgccgtatgt tattgccggg aaaagtgtac gtaagtttct gcttctacct ttgatatata 2580
tataataatt atcattaatt agtagtaata taatatttca aatatttttt tcaaaataaa 2640
agaatgtagt atatagcaat tgcttttctg tagtttataa gtgtgtatat tttaatttat 2700
aacttttcta atatatgacc aaaatttgtt gatgtgcagg tatcaccgtt tgtgtgaaca 2760
acgaactgaa ctggcagact atcccgccgg gaatggtgat taccgacgaa aacggcaaga 2820
aaaagcagtc ttacttccat gatttcttta actatgccgg aatccatcgc agcgtaatgc 2880
tctacaccac gccgaacacc tgggtggacg atatcaccgt ggtgacgcat gtcgcgcaag 2940
actgtaacca cgcgtctgtt gactggcagg tggtggccaa tggtgatgtc agcgttgaac 3000
tgcgtgatgc ggatcaacag gtggttgcaa ctggacaagg cactagcggg actttgcaag 3060
tggtgaatcc gcacctctgg caaccgggtg aaggttatct ctatgaactg tgcgtcacag 3120
ccaaaagcca gacagagtgt gatatctacc cgcttcgcgt cggcatccgg tcagtggcag 3180
tgaagggcca acagttcctg attaaccaca aaccgttcta ctttactggc tttggtcgtc 3240
atgaagatgc ggacttacgt ggcaaaggat tcgataacgt gctgatggtg cacgaccacg 3300
cattaatgga ctggattggg gccaactcct accgtacctc gcattaccct tacgctgaag 3360
agatgctcga ctgggcagat gaacatggca tcgtggtgat tgatgaaact gctgctgtcg 3420
gctttaacct ctctttaggc attggtttcg aagcgggcaa caagccgaaa gaactgtaca 3480
gcgaagaggc agtcaacggg gaaactcagc aagcgcactt acaggcgatt aaagagctga 3540
tagcgcgtga caaaaaccac ccaagcgtgg tgatgtggag tattgccaac gaaccggata 3600
cccgtccgca agtgcacggg aatatttcgc cactggcgga agcaacgcgt aaactcgacc 3660
cgacgcgtcc gatcacctgc gtcaatgtaa tgttctgcga cgctcacacc gataccatca 3720
gcgatctctt tgatgtgctg tgcctgaacc gttattacgg atggtatgtc caaagcggcg 3780
atttggaaac ggcagagaag gtactggaaa aagaacttct ggcctggcag gagaaactgc 3840
atcagccgat tatcatcacc gaatacggcg tggatacgtt agccgggctg cactcaatgt 3900
acaccgacat gtggagtgaa gagtatcagt gtgcatggct ggatatgtat caccgcgtct 3960
ttgatcgcgt cagcgccgtc gtcggtgaac aggtatggaa tttcgccgat tttgcgacct 4020
cgcaaggcat attgcgcgtt ggcggtaaca agaaagggat cttcactcgc gaccgcaaac 4080
cgaagtcggc ggcttttctg ctgcaaaaac gctggactgg catgaacttc ggtgaaaaac 4140
cgcagcaggg aggcaaacaa tgaatcaaca actctcctgg cgcaccatcg tcggctacag 4200
cctcgggaat tgctaccgag ctccgatcgt tcaaacattt ggcaataaag tttcttaaga 4260
ttgaatcctg ttgccggtct tgcgatgatt atcatataat ttctgttgaa ttacgttaag 4320
catgtaataa ttaacatgta atgcatgacg ttatttatga gatgggtttt tatgattaga 4380
gtcccgcaat tatacattta atacgcgata gaaaacaaaa tatagcgcgc aaactaggat 4440
aaattatcgc gcgcggtgtc atctatgtta ctagatccgg accgcattaa gaagggccct 4500
gctcccttct accctctgga ggatggcacc gctggcgagc agctgcacaa ggccatgaag 4560
aggtatgccc tggtgcctgg caccattgcc ttcaccgatg cccacattga ggtggacatc 4620
acctatgccg agtacttcga gatgtctgtg cgcctggccg aggccatgaa gaggtacggc 4680
ctgaacacca accaccgcat cgtggtgtgc tctgagaact ctctactagt tcgaccggca 4740
tgccctgctt taatgagata tgcgagacgc ctatgatcgc atgatatttg ctttcaattc 4800
tgttgtgcac gttgtaaaaa acctgagcat gtgtagctca gatccttacc gccggtttcg 4860
gttcattcta atgaatatat cacccgttac tatcgtattt ttatgaataa tattctccgt 4920
tcaatttact gattgtccaa gctgcggccg cggagcctgc ttttttgtac aaagttggca 4980
ttataaaaaa gcattgctca tcaatttgtt gcaacgaaca ggtcactatc agtcaaaata 5040
aaatcattat ttg 5053
<210>55
<211>28
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy482-NosT-upper-SalI
<400>55
aaatttgtcg accgatcggt caaacatt 28
<210>56
<211>36
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy483-NosT-Lower-HindIII
<400>56
aaatttaagc ttcccgatct agtaacatag atgaca 36
<210>57
<211>31
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy494-Gus_upper_SalI_间隔区
<400>57
ttttagtcga cacgctggac tggcatgaac t 31
<210>58
<211>40
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy492-NosT-lower-BglII SpeI
<400>58
ttttaagatc tactagtccg atctagtaac atagatgaca 40
<210>59
<211>31
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy493_Gus_upper_SalI_间隔区
<400>59
tttaagtcga caagtcggcg gcttttctgc t 31
<210>60
<211>40
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物Loy492-NosT-lower-BglII SpeI
<400>60
ttttaagatc tactagtccg atctagtaac atagatgaca 40
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<211>44
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim1
<400>61
ggttccaagg taccaaaaca atgggcgctg atgatgttgt tgat 44
<210>62
<211>42
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim2
<400>62
aaggtagaag cagaaactta cctggatacg tcactttgac ca 42
<210>63
<211>42
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim3
<400>63
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<211>37
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim4
<400>64
ggttccaagg atccatttat tttgaaaaaa atatttg 37
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<211>35
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim5
<400>65
ggttccaagg atccagtata tagcaattgc ttttc 35
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<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim6
<400>66
cgagaacctt cgtcagtcct gcacatcaac aaattttggt cataaaaaaa aaaatattag 60
aaaagttata aattaaaata tac 83
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<211>63
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim7
<400>67
ctaatatttt tttttttatg accaaaattt gttgatgtgc aggactgacg aaggttctcg 60
cac 63
<210>68
<211>38
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim8
<400>68
ttggaaccac tagtttatcg cctgacacga tttcctgc 38
<210>69
<211>35
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim9
<400>69
ggttccaagg atccgatcgt tcaaacattt ggcaa 35
<210>70
<211>35
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物JMTOIprim10
<400>70
ggttccaagg atccgatcta gtaacataga tgaca 35
<210>71
<211>3030
<212>DNA
<213>pJMTOI1
<220>
<221>启动子
<222>(1)..(1988)
<223>玉米泛蛋白启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2007)..(2268)
<223>编码白喉毒素A的序列的5’-部分
<220>
<221>内含子
<222>(2269)..(2488)
<220>
<221>misc_feature
<222>(2489)..(2811)
<223>编码白喉毒素A的序列的3’-部分
<220>
<221>终止子
<222>(2818)..(3030)
<223>ocs终止子
<400>71
tgcagtgcag cgtgacccgg tcgtgcccct ctctagagat aatgagcatt gcatgtctaa 60
gttataaaaa attaccacat attttttttg tcacacttgt ttgaagtgca gtttatctat 120
ctttatacat atatttaaac tttactctac gaataatata atctatagta ctacaataat 180
atcagtgttt tagagaatca tataaatgaa cagttagaca tggtctaaag gacaattgag 240
tattttgaca acaggactct acagttttat ctttttagtg tgcatgtgtt ctcctttttt 300
tttgcaaata gcttcaccta tataatactt catccatttt attagtacat ccatttaggg 360
ttttagggtta atggttttta tagactaatt tttttagtac atctatttta ttctatttta 420
gcctctaaat taagaaaact aaaactctat tttagttttt ttatttaata gtttagatat 480
aaaatagaat aaaataaagt gactaaaaat taaacaaata ccctttaaga aattaaaaaa 540
actaaggaaa catttttctt gtttcgagta gataatgcca gcctgttaaa cgccgtcgac 600
gagtctaacg gacaccaacc agcgaaccag cagcgtcgcg tcgggccaag cgaagcagac 660
ggcacggcat ctctgtcgct gcctctggac ccctctcgag agttccgctc caccgttgga 720
cttgctccgc tgtcggcatc cagaaattgc gtggcggagc ggcagacgtg agccggcacg 780
gcaggcggcc tcctcctcct ctcacggcac cggcagctac gggggattcc tttcccaccg 840
ctccttcgct ttcccttcct cgcccgccgt aataaataga caccccctcc acaccctctt 900
tccccaacct cgtgttgttc ggagcgcaca cacacacaac cagatctccc ccaaatccac 960
ccgtcggcac ctccgcttca aggtacgccg ctcgtcctcc cccccccccc ccctctctac 1020
cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact tctgttcatg 1080
tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga 1140
cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg gggaatcctg 1200
ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg tttcgttgca 1260
tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt 1320
catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt 1380
ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt ttggatctgt 1440
atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga aatatcgatc 1500
taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga tgctttttgt 1560
tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt 1620
agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca 1680
tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga taggtataca 1740
tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc tattcatatg 1800
ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat tatttcgatc 1860
ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt agccctgcct 1920
tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg 1980
tgttacttct gcagggtacc aaaacaatgg gcgctgatga tgttgttgat tcttctaaat 2040
cttttgtgat ggaaaacttt tcttcgtacc acgggactaa acctggttat gtagattcca 2100
ttcaaaaagg tatacaaaag ccaaaatctg gtacacaagg aaattatgac gatgattgga 2160
aagggtttta tagtaccgac aataaatacg acgctgcggg atactctgta gataatgaaa 2220
acccgctctc tggaaaagct ggaggcgtgg tcaaagtgac gtatccaggt aagtttctgc 2280
ttctaccttg taagtttctg cttctacctt tgatatatat ataataatta tcattaatta 2340
gtagtaatat aatatttcaa atattttttt caaaataaat ggatccagta tatagcaatt 2400
gcttttctgt agtttataag tgtgtatatt ttaatttata acttttctaa tatttttttt 2460
tttatgacca aaatttgttg atgtgcagga ctgacgaagg ttctcgcact aaaagtggat 2520
aatgccgaaa ctattaagaa agagttaggt ttaagtctca ctgaaccgtt gatggagcaa 2580
gtcggaacgg aagagtttat caaaaggttc ggtgatggtg cttcgcgtgt agtgctcagc 2640
cttcccttcg ctgaggggag ttctagcgtt gaatatatta ataactggga acaggcgaaa 2700
gcgttaagcg tagaacttga gattaatttt gaaacccgtg gaaaacgtgg ccaagatgcg 2760
atgtatgagt atatggctca agcctgtgca ggaaatcgtg tcaggcgata aactagttcg 2820
accggcatgc cctgctttaa tgagatatgc gagacgccta tgatcgcatg atatttgctt 2880
tcaattctgt tgtgcacgtt gtaaaaaacc tgagcatgtg tagctcagat ccttaccgcc 2940
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<211>3289
<212>DNA
<213>pJMTOI2
<220>
<221>启动子
<222>(1)..(1988)
<223>玉米泛蛋白启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2007)..(2268)
<223>编码白喉毒素A的序列的5’-部分
<220>
<221>内含子
<222>(2269)..(2380)
<223>内含子的5’-部分
<220>
<221>终止子
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<223>nos终止子
<220>
<221>内含子
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<220>
<221>misc_feature
<222>(2747)..(3070)
<223>编码白喉毒素A的序列的3’-部分
<220>
<221>终止子
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<223>ocs终止子
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tgcagtgcag cgtgacccgg tcgtgcccct ctctagagat aatgagcatt gcatgtctaa 60
gttataaaaa attaccacat attttttttg tcacacttgt ttgaagtgca gtttatctat 120
ctttatacat atatttaaac tttactctac gaataatata atctatagta ctacaataat 180
atcagtgttt tagagaatca tataaatgaa cagttagaca tggtctaaag gacaattgag 240
tattttgaca acaggactct acagttttat ctttttagtg tgcatgtgtt ctcctttttt 300
tttgcaaata gcttcaccta tataatactt catccatttt attagtacat ccatttaggg 360
tttagggtta atggttttta tagactaatt tttttagtac atctatttta ttctatttta 420
gcctctaaat taagaaaact aaaactctat tttagttttt ttatttaata gtttagatat 480
aaaatagaat aaaataaagt gactaaaaat taaacaaata ccctttaaga aattaaaaaa 540
actaaggaaa catttttctt gtttcgagta gataatgcca gcctgttaaa cgccgtcgac 600
gagtctaacg gacaccaacc agcgaaccag cagcgtcgcg tcgggccaag cgaagcagac 660
ggcacggcat ctctgtcgct gcctctggac ccctctcgag agttccgctc caccgttgga 720
cttgctccgc tgtcggcatc cagaaattgc gtggcggagc ggcagacgtg agccggcacg 780
gcaggcggcc tcctcctcct ctcacggcac cggcagctac gggggattcc tttcccaccg 840
ctccttcgct ttcccttcct cgcccgccgt aataaataga caccccctcc acaccctctt 900
tccccaacct cgtgttgttc ggagcgcaca cacacacaac cagatctccc ccaaatccac 960
ccgtcggcac ctccgcttca aggtacgccg ctcgtcctcc cccccccccc ccctctctac 1020
cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact tctgttcatg 1080
tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga 1140
cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg gggaatcctg 1200
ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg tttcgttgca 1260
tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt 1320
catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt 1380
ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt ttggatctgt 1440
atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga aatatcgatc 1500
taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga tgctttttgt 1560
tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt 1620
agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca 1680
tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga taggtataca 1740
tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc tattcatatg 1800
ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat tatttcgatc 1860
ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt agccctgcct 1920
tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg 1980
tgttacttct gcagggtacc aaaacaatgg gcgctgatga tgttgttgat tcttctaaat 2040
cttttgtgat ggaaaacttt tcttcgtacc acgggactaa acctggttat gtagattcca 2100
ttcaaaaagg tatacaaaag ccaaaatctg gtacacaagg aaattatgac gatgattgga 2160
aagggtttta tagtaccgac aataaatacg acgctgcggg atactctgta gataatgaaa 2220
acccgctctc tggaaaagct ggaggcgtgg tcaaagtgac gtatccaggt aagtttctgc 2280
ttctaccttg taagtttctg cttctacctt tgatatatat ataataatta tcattaatta 2340
gtagtaatat aatatttcaa atattttttt caaaataaat ggatccgatc gttcaaacat 2400
ttggcaataa agtttcttaa gattgaatcc tgttgccggt cttgcgatga ttatcatata 2460
atttctgttg aattacgtta agcatgtaat aattaacatg taatgcatga cgttatttat 2520
gagatgggtt tttatgatta gagtcccgca attatacatt taatacgcga tagaaaacaa 2580
aatatagcgc gcaaactagg ataaattatc gcgcgcggtg tcatctatgt tactagatcg 2640
gatccagtat atagcaattg cttttctgta gtttataagt gtgtatattt taatttataa 2700
cttttctaat attttttttt ttatgaccaa aatttgttga tgtgcaggac tgacgaaggt 2760
tctcgcacta aaagtggata atgccgaaac tattaagaaa gagttaggtt taagtctcac 2820
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<212>DNA
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<221>启动子
<222>(1)..(1988)
<223>玉米泛蛋白启动子
<220>
<221>misc_feature
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<223>dsRNAi靶标sequence
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tgcagtgcag cgtgacccgg tcgtgcccct ctctagagat aatgagcatt gcatgtctaa 60
gttataaaaa attaccacat attttttttg tcacacttgt ttgaagtgca gtttatctat 120
ctttatacat atatttaaac tttactctac gaataatata atctatagta ctacaataat 180
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tattttgaca acaggactct acagttttat ctttttagtg tgcatgtgtt ctcctttttt 300
tttgcaaata gcttcaccta tataatactt catccatttt attagtacat ccatttaggg 360
tttagggtta atggttttta tagactaatt tttttagtac atctatttta ttctatttta 420
gcctctaaat taagaaaact aaaactctat tttagttttt ttatttaata gtttagatat 480
aaaatagaat aaaataaagt gactaaaaat taaacaaata ccctttaaga aattaaaaaa 540
actaaggaaa catttttctt gtttcgagta gataatgcca gcctgttaaa cgccgtcgac 600
gagtctaacg gacaccaacc agcgaaccag cagcgtcgcg tcgggccaag cgaagcagac 660
ggcacggcat ctctgtcgct gcctctggac ccctctcgag agttccgctc caccgttgga 720
cttgctccgc tgtcggcatc cagaaattgc gtggcggagc ggcagacgtg agccggcacg 780
gcaggcggcc tcctcctcct ctcacggcac cggcagctac gggggattcc tttcccaccg 840
ctccttcgct ttcccttcct cgcccgccgt aataaataga caccccctcc acaccctctt 900
tccccaacct cgtgttgttc ggagcgcaca cacacacaac cagatctccc ccaaatccac 960
ccgtcggcac ctccgcttca aggtacgccg ctcgtcctcc cccccccccc ccctctctac 1020
cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact tctgttcatg 1080
tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga 1140
cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg gggaatcctg 1200
ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg tttcgttgca 1260
tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt 1320
catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt 1380
ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt ttggatctgt 1440
atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga aatatcgatc 1500
taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga tgctttttgt 1560
tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt 1620
agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca 1680
tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga taggtataca 1740
tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc tattcatatg 1800
ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat tatttcgatc 1860
ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt agccctgcct 1920
tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg 1980
tgttacttct gcagggtacc atggctcagt caaagcacgg tctaacaaaa gaaatgacaa 2040
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acaggtcttt tctctttgag gatggagcag tttgcatatg taatgcagat ataacagtga 2340
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tgccggactg gcacttcatc cagcataagc tcacccgtga agaccgcagc gatgctaaga 2640
atcagaaatg gcatctgaca gaacatgcta ttgcatccgg atctgcattg ccctgaggat 2700
ccgatcgttc aaacatttgg caataaagtt tcttaagatt gaatcctgtt gccggtcttg 2760
cgatgattat catataattt ctgttgaatt acgttaagca tgtaataatt aacatgtaat 2820
gcatgacgtt atttatgaga tgggttttta tgattagagt cccgcaatta tacatttaat 2880
acgcgataga aaacaaaata tagcgcgcaa actaggataa attatcgcgc gcggtgtcat 2940
ctatgttact agatcggatc catcaccgtt tgtgtgaaca acgaactgaa ctggcagact 3000
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gatttcttta actatgccgg aatccatcgc agcgtaatgc tctacaccac gccgaacacc 3120
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gactggcagg tggtggccaa tggtgatgtc agcgttgaac tgcgtgatgc ggatcaacag 3240
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caaccgggtg aaggttatct ctatgaactg tgcgtcacag ccaaaagcca gacagagtgt 3360
gatatctacc cgcttcgcgt cggcatccgg tcagtggcag tgaagggcga acagttcctg 3420
attaaccaca aaccgttcta ctttactggc tttggtcgtc aactagttcg accggcatgc 3480
cctgctttaa tgagatatgc gagacgccta tgatcgcatg atatttgctt tcaattctgt 3540
tgtgcacgtt gtaaaaaacc tgagcatgtg tagctcagat ccttaccgcc ggtttcggtt 3600
cattctaatg aatatatcac ccgttactat cgtattttta tgaataatat tctccgttca 3660
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<211>3421
<212>DNA
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<220>
<221>启动子
<222>(1)..(1988)
<223>玉米泛蛋白启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2001)..(2696)
<223>编码绿色荧光蛋白(GFP)
<220>
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<220>
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<220>
<221>终止子
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<223>ocs终止子
<400>74
tgcagtgcag cgtgacccgg tcgtgcccct ctctagagat aatgagcatt gcatgtctaa 60
gttataaaaa attaccacat attttttttg tcacacttgt ttgaagtgca gtttatctat 120
ctttatacat atatttaaac tttactctac gaataatata atctatagta ctacaataat 180
atcagtgttt tagagaatca tataaatgaa cagttagaca tggtctaaag gacaattgag 240
tattttgaca acaggactct acagttttat ctttttagtg tgcatgtgtt ctcctttttt 300
tttgcaaata gcttcaccta tataatactt catccatttt attagtacat ccatttaggg 360
tttagggtta atggttttta tagactaatt tttttagtac atctatttta ttctatttta 420
gcctctaaat taagaaaact aaaactctat tttagttttt ttatttaata gtttagatat 480
aaaatagaat aaaataaagt gactaaaaat taaacaaata ccctttaaga aattaaaaaa 540
actaaggaaa catttttctt gtttcgagta gataatgcca gcctgttaaa cgccgtcgac 600
gagtctaacg gacaccaacc agcgaaccag cagcgtcgcg tcgggccaag cgaagcagac 660
ggcacggcat ctctgtcgct gcctctggac ccctctcgag agttccgctc caccgttgga 720
cttgctccgc tgtcggcatc cagaaattgc gtggcggagc ggcagacgtg agccggcacg 780
gcaggcggcc tcctcctcct ctcacggcac cggcagctac gggggattcc tttcccaccg 840
ctccttcgct ttcccttcct cgcccgccgt aataaataga caccccctcc acaccctctt 900
tccccaacct cgtgttgttc ggagcgcaca cacacacaac cagatctccc ccaaatccac 960
ccgtcggcac ctccgcttca aggtacgccg ctcgtcctcc cccccccccc ccctctctac 1020
cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact tctgttcatg 1080
tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga 1140
cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg gggaatcctg 1200
ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg tttcgttgca 1260
tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt 1320
catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt 1380
ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt ttggatctgt 1440
atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga aatatcgatc 1500
taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga tgctttttgt 1560
tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt 1620
agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca 1680
tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga taggtataca 1740
tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc tattcatatg 1800
ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat tatttcgatc 1860
ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt agccctgcct 1920
tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg 1980
tgttacttct gcagggtacc atggctcagt caaagcacgg tctaacaaaa gaaatgacaa 2040
tgaaataccg tatggaaggg tgcgtcgatg gacataaatt tgtgatcacg ggagagggca 2100
ttggatatcc gttcaaaggg aaacaggcta ttaatctgtg tgtggtcgaa ggtggaccat 2160
tgccatttgc cgaagacata ttgtcagctg cctttatgta cggaaacagg gttttcactg 2220
aatatcctca agacatagct gactatttca agaactcgtg tcctgctggt tatacatggg 2280
acaggtcttt tctctttgag gatggagcag tttgcatatg taatgcagat ataacagtga 2340
gtgttgaaga aaactgcatg tatcatgagt ccaaatttta tggagtgaat tttcctgctg 2400
atggacctgt gatgaaaaag atgacagata actgggagcc atcctgcgag aagatcatac 2460
cagtacctaa gcaggggata ttgaaagggg atgtctccat gtacctcctt ctgaaggatg 2520
gtgggcgttt acggtgccaa ttcgacacag tttacaaagc aaagtctgtg ccaagaaaga 2580
tgccggactg gcacttcatc cagcataagc tcacccgtga agaccgcagc gatgctaaga 2640
atcagaaatg gcatctgaca gaacatgcta ttgcatccgg atctgcattg ccctgaggat 2700
ccatcaccgt ttgtgtgaac aacgaactga actggcagac tatcccgccg ggaatggtga 2760
ttaccgacga aaacggcaag aaaaagcagt cttacttcca tgatttcttt aactatgccg 2820
gaatccatcg cagcgtaatg ctctacacca cgccgaacac ctgggtggac gatatcaccg 2880
tggtgacgca tgtcgcgcaa gactgtaacc acgcgtctgt tgactggcag gtggtggcca 2940
atggtgatgt cagcgttgaa ctgcgtgatg cggatcaaca ggtggttgca actggacaag 3000
gcactagcgg gactttgcaa gtggtgaatc cgcacctctg gcaaccgggt gaaggttatc 3060
tctatgaact gtgcgtcaca gccaaaagcc agacagagtg tgatatctac ccgcttcgcg 3120
tcggcatccg gtcagtggca gtgaagggcg aacagttcct gattaaccac aaaccgttct 3180
actttactgg ctttggtcgt caactagttc gaccggcatg ccctgcttta atgagatatg 3240
cgagacgcct atgatcgcat gatatttgct ttcaattctg ttgtgcacgt tgtaaaaaac 3300
ctgagcatgt gtagctcaga tccttaccgc cggtttcggt tcattctaat gaatatatca 3360
cccgttacta tcgtattttt atgaataata ttctccgttc aatttactga ttgtccaagc 3420
t 3421
<210>75
<211>3160
<212>DNA
<213>pJMTO15
<220>
<221>启动子
<222>(1)..(1988)
<223>玉米泛蛋白启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(2001)..(2300)
<223>用于dsRNAi靶标的dsRNA的正义链
<220>
<221>misc_feature
<222>(2309)..(2595)
<223>间隔区
<220>
<221>misc_feature
<222>(2602)..(2901)
<223>用于dsRNAi靶标的dsRNA的反义链
<220>
<221>终止子
<222>(2908)..(3160)
<223>nos终止子
<400>75
tgcagtgcag cgtgacccgg tcgtgcccct ctctagagat aatgagcatt gcatgtctaa 60
gttataaaaa attaccacat attttttttg tcacacttgt ttgaagtgca gtttatctat 120
ctttatacat atatttaaac tttactctac gaataatata atctatagta ctacaataat 180
atcagtgttt tagagaatca tataaatgaa cagttagaca tggtctaaag gacaattgag 240
tattttgaca acaggactct acagttttat ctttttagtg tgcatgtgtt ctcctttttt 300
tttgcaaata gcttcaccta tataatactt catccatttt attagtacat ccatttaggg 360
tttagggtta atggttttta tagactaatt tttttagtac atctatttta ttctatttta 420
gcctctaaat taagaaaact aaaactctat tttagttttt ttatttaata gtttagatat 480
aaaatagaat aaaataaagt gactaaaaat taaacaaata ccctttaaga aattaaaaaa 540
actaaggaaa catttttctt gtttcgagta gataatgcca gcctgttaaa cgccgtcgac 600
gagtctaacg gacaccaacc agcgaaccag cagcgtcgcg tcgggccaag cgaagcagac 660
ggcacggcat ctctgtcgct gcctctggac ccctctcgag agttccgctc caccgttgga 720
cttgctccgc tgtcggcatc cagaaattgc gtggcggagc ggcagacgtg agccggcacg 780
gcaggcggcc tcctcctcct ctcacggcac cggcagctac gggggattcc tttcccaccg 840
ctccttcgct ttcccttcct cgcccgccgt aataaataga caccccctcc acaccctctt 900
tccccaacct cgtgttgttc ggagcgcaca cacacacaac cagatctccc ccaaatccac 960
ccgtcggcac ctccgcttca aggtacgccg ctcgtcctcc cccccccccc ccctctctac 1020
cttctctaga tcggcgttcc ggtccatggt tagggcccgg tagttctact tctgttcatg 1080
tttgtgttag atccgtgttt gtgttagatc cgtgctgcta gcgttcgtac acggatgcga 1140
cctgtacgtc agacacgttc tgattgctaa cttgccagtg tttctctttg gggaatcctg 1200
ggatggctct agccgttccg cagacgggat cgatttcatg attttttttg tttcgttgca 1260
tagggtttgg tttgcccttt tcctttattt caatatatgc cgtgcacttg tttgtcgggt 1320
catcttttca tgcttttttt tgtcttggtt gtgatgatgt ggtctggttg ggcggtcgtt 1380
ctagatcgga gtagaattct gtttcaaact acctggtgga tttattaatt ttggatctgt 1440
atgtgtgtgc catacatatt catagttacg aattgaagat gatggatgga aatatcgatc 1500
taggataggt atacatgttg atgcgggttt tactgatgca tatacagaga tgctttttgt 1560
tcgcttggtt gtgatgatgt ggtgtggttg ggcggtcgtt cattcgttct agatcggagt 1620
agaatactgt ttcaaactac ctggtgtatt tattaatttt ggaactgtat gtgtgtgtca 1680
tacatcttca tagttacgag tttaagatgg atggaaatat cgatctagga taggtataca 1740
tgttgatgtg ggttttactg atgcatatac atgatggcat atgcagcatc tattcatatg 1800
ctctaacctt gagtacctat ctattataat aaacaagtat gttttataat tatttcgatc 1860
ttgatatact tggatgatgg catatgcagc agctatatgt ggattttttt agccctgcct 1920
tcatacgcta tttatttgct tggtactgtt tcttttgtcg atgctcaccc tgttgtttgg 1980
tgttacttct gcagggtacc ctgtaaccac gcgtctgttg actggcaggt ggtggccaat 2040
ggtgatgtca gcgttgaact gcgtgatgcg gatcaacagg tggttgcaac tggacaaggc 2100
actagcggga ctttgcaagt ggtgaatccg cacctctggc aaccgggtga aggttatctc 2160
tatgaactgt gcgtcacagc caaaagccag acagagtgtg atatctaccc gcttcgcgtc 2220
ggcatccggt cagtggcagt gaagggcgaa cagttcctga ttaaccacaa accgttctac 2280
tttactggct ttggtcgtca ggcgcgccta ctccccgagt ctgaaccgct cgatcgaacc 2340
tcactcaaca ttgacgagag cgagtcgtct aactcttgca gcctctttgc gtcgtgaaag 2400
ctctctggaa gaagaagatt ctcatcagga tccccgagaa actcggataa gagactcaca 2460
gagtagccat gctcggtcac aacgctacaa tggtccaagc tcgtaagctc gaagccgaag 2520
tccagatctg tgctggcgaa gtcgatgtcg gacttaagaa cttcctccaa atggcggtcg 2580
cagtcttcaa attcgctcga gtgacgacca aagccagtaa agtagaacgg tttgtggtta 2640
atcaggaact gttcgccctt cactgccact gaccggatgc cgacgcgaag cgggtagata 2700
tcacactctg tctggctttt ggctgtgacg cacagttcat agagataacc ttcacccggt 2760
tgccagaggt gcggattcac cacttgcaaa gtcccgctag tgccttgtcc agttgcaacc 2820
acctgttgat ccgcatcacg cagttcaacg ctgacatcac cattggccac cacctgccag 2880
tcaacagacg cgtggttaca gactagtgat cgttcaaaca tttggcaata aagtttctta 2940
agattgaatc ctgttgccgg tcttgcgatg attatcatat aatttctgtt gaattacgtt 3000
aagcatgtaa taattaacat gtaatgcatg acgttattta tgagatgggt ttttatgatt 3060
agagtcccgc aattatacat ttaatacgcg atagaaaaca aaatatagcg cgcaaactag 3120
gataaattat cgcgcgcggt gtcatctatg ttactagatc 3160
<210>76
<211>2665
<212>DNA
<213>Lo376-pENTR-B2
<220>
<221>终止子
<222>(269)..(295)
<223>互补序列:T2终止子
<220>
<221>终止子
<222>(427)..(470)
<223>互补序列:T1终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(569)..(668)
<223>attL1重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(755)..(853)
<223>互补序列:attL2重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(1059)..(1868)
<223>卡那霉素抗性
<400>76
ctttcctgcg ttatcccctg attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga 60
taccgctcgc cgcagccgaa cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga 120
gcgcccaata cgcaaaccgc ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca 180
cgacaggttt cccgactgga aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaata cgcgtaccgc 240
tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa aggccatccg tcaggatggc cttctgctta 300
gtttgatgcc tggcagttta tggcgggcgt cctgcccgcc accctccggg ccgttgcttc 360
acaacgttca aatccgctcc cggcggattt gtcctactca ggagagcgtt caccgacaaa 420
caacagataa aacgaaaggc ccagtcttcc gactgagcct ttcgttttat ttgatgcctg 480
gcagttccct actctcgcgt taacgctagc atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa 540
aacgacggcc agtcttaagc tcgggcccca aataatgatt ttattttgac tgatagtgac 600
ctgttcgttg caacaaattg atgagcaatg cttttttata atgccaactt tgtacaaaaa 660
agcaggctgg tacccgggga tcctctaggt cgaccagatc tgatatctgc ggccgcctcg 720
agcatatggg catgcaagct tggcgtaatc atggacccag ctttcttgta caaagttggc 780
attataagaa agcattgctt atcaatttgt tgcaacgaac aggtcactat cagtcaaaat 840
aaaatcatta tttgccatcc agctgatccg gtgcaggttg gcggcggcgt gcgtagcgaa 900
gaatccccta tagtgagtcg tattacatgg tcatagctgt ttcctggcag ctctggcccg 960
tgtctcaaaa tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa 1020
aactgtctgc ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa 1080
cgtcgaggcc gcgattaaat tccaacatgg atgctgattt atatgggtat aaatgggctc 1140
gcgataatgt cgggcaatca ggtgcgacaa tctatcgctt gtatgggaag cccgatgcgc 1200
cagagttgtt tctgaaacat ggcaaaggta gcgttgccaa tgatgttaca gatgagatgg 1260
tcagactaaa ctggctgacg gaatttatgc ctcttccgac catcaagcat tttatccgta 1320
ctcctgatga tgcatggtta ctcaccactg cgatccccgg aaaaacagca ttccaggtat 1380
tagaagaata tcctgattca ggtgaaaata ttgttgatgc gctggcagtg ttcctgcgcc 1440
ggttgcattc gattcctgtt tgtaattgtc cttttaacag cgatcgcgta tttcgtctcg 1500
ctcaggcgca atcacgaatg aataacggtt tggttgatgc gagtgatttt gatgacgagc 1560
gtaatggctg gcctgttgaa caagtctgga aagaaatgca taaacttttg ccattctcac 1620
cggattcagt cgtcactcat ggtgatttct cacttgataa ccttattttt gacgagggga 1680
aattaatagg ttgtattgat gttggacgag tcggaatcgc agaccgatac caggatcttg 1740
ccatcctatg gaactgcctc ggtgagtttt ctccttcatt acagaaacgg ctttttcaaa 1800
aatatggtat tgataatcct gatatgaata aattgcagtt tcatttgatg ctcgatgagt 1860
ttttctaatc agaattggtt aattggttgt aacactggca gagcattacg ctgacttgac 1920
gggacggcgc aagctcatga ccaaaatccc ttaacgtgag ttacgcgtcg ttccactgag 1980
cgtcagaccc cgtagaaaag atcaaaggat cttcttgaga tccttttttt ctgcgcgtaa 2040
tctgctgctt gcaaacaaaa aaaccaccgc taccagcggt ggtttgtttg ccggatcaag 2100
agctaccaac tctttttccg aaggtaactg gcttcagcag agcgcagata ccaaatactg 2160
ttcttctagt gtagccgtag ttaggccacc acttcaagaa ctctgtagca ccgcctacat 2220
acctcgctct gctaatcctg ttaccagtgg ctgctgccag tggcgataag tcgtgtctta 2280
ccgggttgga ctcaagacga tagttaccgg ataaggcgca gcggtcgggc tgaacggggg 2340
gttcgtgcac acagcccagc ttggagcgaa cgacctacac cgaactgaga tacctacagc 2400
gtgagctatg agaaagcgcc acgcttcccg aagggagaaa ggcggacagg tatccggtaa 2460
gcggcagggt cggaacagga gagcgcacga gggagcttcc agggggaaac gcctggtatc 2520
tttatagtcc tgtcgggttt cgccacctct gacttgagcg tcgatttttg tgatgctcgt 2580
caggggggcg gagcctatgg aaaaacgcca gcaacgcggc ctttttacgg ttcctggcct 2640
tttgctggcc ttttgctcac atgtt 2665
<210>77
<211>7686
<212>DNA
<213>Lo442 pSUN1-R4R3-M20(OCS10)(目的地载体)
<220>
<221>misc_feature
<222>(8)..(153)
<223>RB(右边界)
<220>
<221>misc_feature
<222>(215)..(339)
<223>attR4重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(1004)..(1684)
<223>互补序列:氯霉素抗性
<220>
<221>misc_feature
<222>(1792)..(1916)
<223>互补序列:attR3重组位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(1935)..(2149)
<223>LB(左边界)
<220>
<221>misc_feature
<222>(3858)..(4965)
<223>编码repA
<220>
<221>rep_origin
<222>(5715)..(6560)
<223>互补序列:ColE1起点
<220>
<221>misc_feature
<222>(6729)..(7520)
<223>互补序列:aadA标记(spectomycin)
<400>77
ttccatggac atacaaatgg acgaacggat aaaccttttc acgccctttt aaatatccga 60
ttattctaat aaacgctctt ttctcttagg tttacccgcc aatatatcct gtcaaacact 120
gatagtttaa actgaaggcg ggaaacgaca atcagatcta gtaggaaaca gctatgacca 180
tgattacgcc aagctatcga ttacgccaag ctatcaactt tgtatagaaa agttgaacga 240
gaaacgtaaa atgatataaa tatcaatata ttaaattaga ttttgcataa aaaacagact 300
acataatact gtaaaacaca acatatccag tcactatggt cgacctgcag actggctgtg 360
tataagggag cctgacattt atattcccca gaacatcagg ttaatggcgt ttttgatgtc 420
attttcgcgg tggctgagat cagccacttc ttccccgata acggagaccg gcacactggc 480
catatcggtg gtcatcatgc gccagctttc atccccgata tgcaccaccg ggtaaagttc 540
acgggggact ttatctgaca gcagacgtgc actggccagg gggatcacca tccgtcgccc 600
gggcgtgtca ataatatcac tctgtacatc cacaaacaga cgataacggc tctctctttt 660
ataggtgtaa accttaaact gcatttcacc agcccctgtt ctcgtcggca aaagagccgt 720
tcatttcaat aaaccgggcg acctcagcca tcccttcctg attttccgct ttccagcgtt 780
cggcacgcag acgacgggct tcattctgca tggttgtgct taccgaaccg gagatattga 840
catcatatat gccttgagca actgatagct gtcgctgtca actgtcactg taatacgctg 900
cttcatagca tacctctttt tgacatactt cgggtataca tatcagtata tattcttata 960
ccgcaaaaat cagcgcgcaa atacgcatac tgttatctgg cttttagtaa gccggatcct 1020
ctagattacg ccccgcctgc cactcatcgc agtactgttg taattcatta agcattctgc 1080
cgacatggaa gccatcacaa acggcatgat gaacctgaat cgccagcggc atcagcacct 1140
tgtcgccttg cgtataatat ttgcccatgg tgaaaacggg ggcgaagaag ttgtccatat 1200
tggccacgtt taaatcaaaa ctggtgaaac tcacccaggg attggctgag acgaaaaaca 1260
tattctcaat aaacccttta gggaaatagg ccaggttttc accgtaacac gccacatctt 1320
gcgaatatat gtgtagaaac tgccggaaat cgtcgtggta ttcactccag agcgatgaaa 1380
acgtttcagt ttgctcatgg aaaacggtgt aacaagggtg aacactatcc catatcacca 1440
gctcaccgtc tttcattgcc atacggaatt ccggatgagc attcatcagg cgggcaagaa 1500
tgtgaataaa ggccggataa aacttgtgct tatttttctt tacggtcttt aaaaaggccg 1560
taatatccag ctgaacggtc tggttatagg tacattgagc aactgactga aatgcctcaa 1620
aatgttcttt acgatgccat tgggatatat caacggtggt atatccagtg atttttttct 1680
ccattttagc ttccttagct cctgaaaatc tcgacggatc ctaactcaaa atccacacat 1740
tatacgagcc ggaagcataa agtgtaaagc ctggggtgcc taatgcggcc gccatagtga 1800
ctggatatgt tgtgttttac agtattatgt agtctgttt t ttatgcaaaa tctaatttaa 1860
tatattgata tttatatcat tttacgtttc tcgttcaact ttattataca tagttgataa 1920
ttcactggcc ggatctgctt ggtaataatt gtcattagat tgtttttatg catagatgca 1980
ctcgaaatca gccaatttta gacaagtatc aaacggatgt taattcagta cattaaagac 2040
gtccgcaatg tgttattaag ttgtctaagc gtcaatttgt ttacaccaca atatatcctg 2100
ccaccagcca gccaacagct ccccgaccgg cagctcggca caaaatcacc acgcgttacc 2160
accacgccgg ccggccgcat ggtgttgacc gtgttcgccg gcattgccga gttcgagcgt 2220
tccctaatca tcgaccgcac ccggagcggg cgcgaggccg ccaaggcccg aggcgtgaag 2280
tttggccccc gccctaccct caccccggca cagatcgcgc acgcccgcga gctgatcgac 2340
caggaaggcc gcaccgtgaa agaggcggct gcactgcttg gcgtgcatcg ctcgaccctg 2400
taccgcgcac ttgagcgcag cgaggaagtg acgcccaccg aggccaggcg gcgcggtgcc 2460
ttccgtgagg acgcattgac cgaggccgac gccctggcgg ccgccgagaa tgaacgccaa 2520
gaggaacaag catgaaaccg caccaggacg gccaggacga accgtttttc attaccgaag 2580
agatcgaggc ggagatgatc gcggccgggt acgtgttcga gccgcccgcg cacgtctcaa 2640
ccgtgcggct gcatgaaatc ctggccggtt tgtctgatgc caagctggcg gcctggccgg 2700
ccagcttggc cgctgaagaa accgagcgcc gccgtctaaa aaggtgatgt gtatttgagt 2760
aaaacagctt gcgtcatgcg gtcgctgcgt atatgatgcg atgagtaaat aaacaaatac 2820
gcaaggggaa cgcatgaagg ttatcgctgt acttaaccag aaaggcgggt caggcaagac 2880
gaccatcgca acccatctag cccgcgccct gcaactcgcc ggggccgatg ttctgttagt 2940
cgattccgat ccccagggca gtgcccgcga ttgggcggcc gtgcgggaag atcaaccgct 3000
aaccgttgtc ggcatcgacc gcccgacgat tgaccgcgac gtgaaggcca tcggccggcg 3060
cgacttcgta gtgatcgacg gagcgcccca ggcggcggac ttggctgtgt ccgcgatcaa 3120
ggcagccgac ttcgtgctga ttccggtgca gccaagccct tacgacatat gggccaccgc 3180
cgacctggtg gagctggtta agcagcgcat tgaggtcacg gatggaaggc tacaagcggc 3240
ctttgtcgtg tcgcgggcga tcaaaggcac gcgcatcggc ggtgaggttg ccgaggcgct 3300
ggccgggtac gagctgccca ttcttgagtc ccgtatcacg cagcgcgtga gctacccagg 3360
cactgccgcc gccggcacaa ccgttcttga atcagaaccc gagggcgacg ctgcccgcga 3420
ggtccaggcg ctggccgctg aaattaaatc aaaactcatt tgagttaatg aggtaaagag 3480
aaaatgagca aaagcacaaa cacgctaagt gccggccgtc cgagcgcacg cagcagcaag 3540
gctgcaacgt tggccagcct ggcagacacg ccagccatga agcgggtcaa ctttcagttg 3600
ccggcggagg atcacaccaa gctgaagatg tacgcggtac gccaaggcaa gaccattacc 3660
gagctgctat ctgaatacat cgcgcagcta ccagagtaaa tgagcaaatg aataaatgag 3720
tagatgaatt ttagcggcta aaggaggcgg catggaaaat caagaacaac caggcaccga 3780
cgccgtggaa tgccccatgt gtggaggaac gggcggttgg ccaggcgtaa gcggctgggt 3840
tgtctgccgg ccctgcaatg gcactggaac ccccaagccc gaggaatcgg cgtgagcggt 3900
cgcaaaccat ccggcccggt acaaatcggc gcggcgctgg gtgatgacct ggtggagaag 3960
ttgaaggccg cgcaggccgc ccagcggcaa cgcatcgagg cagaagcacg ccccggtgaa 4020
tcgtggcaag cggccgctga tcgaatccgc aaagaatccc ggcaaccgcc ggcagccggt 4080
gcgccgtcga ttaggaagcc gcccaagggc gacgagcaac cagatttttt cgttccgatg 4140
ctctatgacg tgggcacccg cgatagtcgc agcatcatgg acgtggccgt tttccgtctg 4200
tcgaagcgtg accgacgagc tggcgaggtg atccgctacg agcttccaga cgggcacgta 4260
gaggtttccg cagggccggc cggcatggcc agtgtgtggg attacgacct ggtactgatg 4320
gcggtttccc atctaaccga atccatgaac cgataccggg aagggaaggg agacaagccc 4380
ggccgcgtgt tccgtccaca cgttgcggac gtactcaagt tctgccggcg agccgatggc 4440
ggaaagcaga aagacgacct ggtagaaacc tgcattcggt taaacaccac gcacgttgcc 4500
atgcagcgta cgaagaaggc caagaacggc cgcctggtga cggtatccga gggtgaagcc 4560
ttgattagcc gctacaagat cgtaaagagc gaaaccgggc ggccggagta catcgagatc 4620
gagctagctg attggatgta ccgcgagatc acagaaggca agaacccgga cgtgctgacg 4680
gttcaccccg attacttttt gatcgatccc ggcatcggcc gttttctcta ccgcctggca 4740
cgccgcgccg caggcaaggc agaagccaga tggttgttca agacgatcta cgaacgcagt 4800
ggcagcgccg gagagttcaa gaagttctgt ttcaccgtgc gcaagctgat cgggtcaaat 4860
gacctgccgg agtacgattt gaaggaggag gcggggcagg ctggcccgat cctagtcatg 4920
cgctaccgca acctgatcga gggcgaagca tccgccggtt cctaatgtac ggagcagatg 4980
ctagggcaaa ttgccctagc aggggaaaaa ggtcgaaaag gtctctttcc tgtggatagc 5040
acgtacattg ggaacccaaa gccgtacatt gggaaccgga acccgtacat tgggaaccca 5100
aagccgtaca ttgggaaccg gtcacacatg taagtgactg atataaaaga gaaaaaaggc 5160
gatttttccg cctaaaactc tttaaaactt attaaaactc ttaaaacccg cctggcctgt 5220
gcataactgt ctggccagcg cacagccgaa gagctgcaaa aagcgcctac ccttcggtcg 5280
ctgcgctccc tacgccccgc cgcttcgcgt cggcctatcg cggccgctgg ccgctcaaaa 5340
atggctggcc tacggccagg caatctacca gggcgcggac aagccgcgcc gtcgccactc 5400
gaccgccggc gcccacatca aggcaccctg cctcgcgcgt ttcggtgatg acggtgaaaa 5460
cctctgacac atgcagctcc cggagacggt cacagcttgt ctgtaagcgg atgccgggag 5520
cagacaagcc cgtcagggcg cgtcagcggg tgttggcggg tgtcggggcg cagccatgac 5580
ccagtcacgt agcgatagcg gagtgtatac tggcttaact atgcggcatc agagcagatt 5640
gtactgagag tgcaccatat gcggtgtgaa ataccgcaca gatgcgtaag gagaaaatac 5700
cgcatcaggc gctcttccgc ttcctcgctc actgactcgc tgcgctcggt cgttcggctg 5760
cggcgagcgg tatcagctca ctcaaaggcg gtaatacggt tatccacaga atcaggggat 5820
aacgcaggaa agaacatgtg agcaaaaggc cagcaaaagg ccaggaaccg taaaaaggcc 5880
gcgttgctgg cgtttttcca taggctccgc ccccctgacg agcatcacaa aaatcgacgc 5940
tcaagtcaga ggtggcgaaa cccgacagga ctataaagat accaggcgtt tccccctgga 6000
agctccctcg tgcgctctcc tgttccgacc ctgccgctta ccggatacct gtccgccttt 6060
ctcccttcgg gaagcgtggc gctttctcat agctcacgct gtaggtatct cagttcggtg 6120
taggtcgttc gctccaagct gggctgtgtg cacgaacccc ccgttcagcc cgaccgctgc 6180
gccttatccg gtaactatcg tcttgagtcc aacccggtaa gacacgactt atcgccactg 6240
gcagcagcca ctggtaacag gattagcaga gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc 6300
ttgaagtggt ggcctaacta cggctacact agaaggacag tatttggtat ctgcgctctg 6360
ctgaagccag ttaccttcgg aaaaagagtt ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc 6420
gctggtagcg gtggtttttt tgtttgcaag cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct 6480
caagaagatc ctttgatctt ttctacgggg tctgacgctc agtggaacga aaactcacgt 6540
taagggattt tggtcatgca tgatatatct cccaatttgt gtagggctta ttatgcacgc 6600
ttaaaaataa taaaagcaga cttgacctga tagtttggct gtgagcaatt atgtgcttag 6660
tgcatctaac gcttgagtta agccgcgccg cgaagcggcg tcggcttgaa cgaatttcta 6720
gctagacatt atttgccgac taccttggtg atctcgcctt tcacgtagtg gacaaattct 6780
tccaactgat ctgcgcgcga ggccaagcga tcttcttctt gtccaagata agcctgtcta 6840
gcttcaagta tgacgggctg atactgggcc ggcaggcgct ccattgccca gtcggcagcg 6900
acatccttcg gcgcgatttt gccggttact gcgctgtacc aaatgcggga caacgtaagc 6960
actacatttc gctcatcgcc agcccagtcg ggcggcgagt tccatagcgt taaggtttca 7020
tttagcgcct caaatagatc ctgttcagga accggatcaa agagttcctc cgccgctgga 7080
cctaccaagg caacgctatg ttctcttgct tttgtcagca agatagccag atcaatgtcg 7140
atcgtggctg gctcgaagat acctgcaaga atgtcattgc gctgccattc tccaaattgc 7200
agttcgcgct tagctggata acgccacgga atgatgtcgt cgtgcacaac aatggtgact 7260
tctacagcgc ggagaatctc gctctctcca ggggaagccg aagtttccaa aaggtcgttg 7320
atcaaagctc gccgcgttgt ttcatcaagc cttacggtca ccgtaaccag caaatcaata 7380
tcactgtgtg gcttcaggcc gccatccact gcggagccgt acaaatgtac ggccagcaac 7440
gtcggttcga gatggcgctc gatgacgcca actacctctg atagttgagt cgatacttcg 7500
gcgatcaccg cttcccccat gatgtttaac tttgttttag ggcgactgcc ctgctgcgta 7560
acatcgttgc tgctccataa catcaaacat cgacccacgg cgtaacgcgc ttgctgcttg 7620
gatgcccgag gcatagactg taccccaaaa aaacagtcat aacaagccat gaaaaccgcc 7680
actgcg 7686
<210>78
<211>10414
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>双元载体Lo239-pSUN3-GWs-B1-BnAK700∷GUS::nosT-B2
<220>
<221>misc_recomb
<222>(4)..(28)
<223>attB1 Gateway重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(56)..(724)
<223>p-BnAK启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(749)..(2560)
<223>编码c-GUS(E.coli)的cds
<220>
<221>终止子
<222>(2631)..(2883)
<223>t-NOS胭脂氨酸合成酶终止子
<220>
<221>misc_recomb
<222>(2895)..(2919)
<223>attB2 Gateway重组位点
<220>
<221>终止子
<222>(2972)..(3224)
<223>互补序列:t-NOS胭脂氨酸合成酶终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(3300)..(4094)
<223>互补序列:编码c-NptII的cds赋予卡那霉素抗性
<220>
<221>启动子
<222>(4126)..(4413)
<223>互补序列:来自胭脂氨酸合成酶基因的p-NOS启动子
<220>
<221>misc_structure
<222>(4464)..(4678)
<223>互补序列:b-LB Left T-DNA边界
<220>
<221>misc_structure
<222>(10227)..(10372)
<223>互补序列:b-RB右T-DNA边界
<400>78
atcacaagtt tgtacaaaaa agcaggcttt aaaggaacca attcagtcga cacgaagctt 60
tcgaggctaa cgttggtgga gatgttaagg cacggcatct tctcttcttc ttcttttttg 120
tttgtttgtt tgtttcgctc tctatcactc actcgatcga tccccagtct tcttttcggg 180
aaagctgtgt cagaccaatt atattccatc tttaatttgg ccctttttat tattcgctat 240
ggcccaacat ttcaggccca atttatacga ttataaatat aaccacttga ttgtgctgcc 300
gctcagctga atagtactcc ctccgttttt taatataaat cgttttacag ttatgcacgt 360
aaattaagaa aaccattaac tttttatatt ttctaaacaa aaacatcatt aattatttac 420
ttactcacaa ttcaaccaat agaaaaatag aagatatatt accattggtc atacaacatt 480
aattattaat aaattttaca tagaaaaccg aaaacgacat ataatttgga acaaaaaaat 540
ttctctaaaa ctacttatat taaaaaacgg agagagtata tttaactagt tcgtcttact 600
gacaaattga agaggcagac caagacacgc ggctcctcga tggctgtctt atgccaagtg 660
gcggtgcctg cttctgcatt aaataggtag aagaactcta attacagaag ctcgaggtag 720
ataggatccc cgggtaggtc agtcccttat gttacgtcct gtagaaaccc caacccgtga 780
aatcaaaaaa ctcgacggcc tgtgggcatt cagtctggat cgcgaaaact gtggaattga 840
tcagcgttgg tgggaaagcg cgttacaaga aagccgggca attgctgtgc caggcagttt 900
taacgatcag ttcgccgatg cagatattcg taattatgcg ggcaacgtct ggtatcagcg 960
cgaagtcttt ataccgaaag gttgggcagg ccagcgtatc gtgctgcgtt tcgatgcggt 1020
cactcattac ggcaaagtgt gggtcaataa tcaggaagtg atggagcatc agggcggcta 1080
tacgccattt gaagccgatg tcacgccgta tgttattgcc gggaaaagtg tacgtatcac 1140
cgtttgtgtg aacaacgaac tgaactggca gactatcccg ccgggaatgg tgattaccga 1200
cgaaaacggc aagaaaaagc agtcttactt ccatgatttc tttaactatg ccggaatcca 1260
tcgcagcgta atgctctaca ccacgccgaa cacctgggtg gacgatatca ccgtggtgac 1320
gcatgtcgcg caagactgta accacgcgtc tgttgactgg caggtggtgg ccaatggtga 1380
tgtcagcgtt gaactgcgtg atgcggatca acaggtggtt gcaactggac aaggcactag 1440
cgggactttg caagtggtga atccgcacct ctggcaaccg ggtgaaggtt atctctatga 1500
actgtgcgtc acagccaaaa gccagacaga gtgtgatatc tacccgcttc gcgtcggcat 1560
ccggtcagtg gcagtgaagg gcgaacagtt cctgattaac cacaaaccgt tctactttac 1620
tggctttggt cgtcatgaag atgcggactt gcgtggcaaa ggattcgata acgtgctgat 1680
ggtgcacgac cacgcattaa tggactggat tggggccaac tcctaccgta cctcgcatta 1740
cccttacgct gaagagatgc tcgactgggc agatgaacat ggcatcgtgg tgattgatga 1800
aactgctgct gtcggcttta acctctcttt aggcattggt ttcgaagcgg gcaacaagcc 1860
gaaagaactg tacagcgaag aggcagtcaa cggggaaact cagcaagcgc acttacaggc 1920
gattaaagag ctgatagcgc gtgacaaaaa ccacccaagc gtggtgatgt ggagtattgc 1980
caacgaaccg gatacccgtc cgcaaggtgc acgggaatat ttcgcgccac tggcggaagc 2040
aacgcgtaaa ctcgacccga cgcgtccgat cacctgcgtc aatgtaatgt tctgcgacgc 2100
tcacaccgat accatcagcg atctctttga tgtgctgtgc ctgaaccgtt attacggatg 2160
gtatgtccaa agcggcgatt tggaaacggc agagaaggta ctggaaaaag aacttctggc 2220
ctggcaggag aaactgcatc agccgattat catcaccgaa tacggcgtgg atacgttagc 2280
cgggctgcac tcaatgtaca ccgacatgtg gagtgaagag tatcagtgtg catggctgga 2340
tatgtatcac cgcgtctttg atcgcgtcag cgccgtcgtc ggtgaacagg tatggaattt 2400
cgccgatttt gcgacctcgc aaggcatatt gcgcgttggc ggtaacaaga aagggatctt 2460
cactcgcgac cgcaaaccga agtcggcggc ttttctgctg caaaaacgct ggactggcat 2520
gaacttcggt gaaaaaccgc agcagggagg caaacaatga atcaacaact ctcctggcgc 2580
accatcgtcg gctacagcct cgggaattgc taccgagctc gaatttcccc gatcgttcaa 2640
acatttggca ataaagtttc ttaagattga atcctgttgc cggtcttgcg atgattatca 2700
tataatttct gttgaattac gttaagcatg taataattaa catgtaatgc atgacgttat 2760
ttatgagatg ggtttttatg attagagtcc cgcaattata catttaatac gcgatagaaa 2820
acaaaatata gcgcgcaaac taggataaat tatcgcgcgc ggtgtcatct atgttactag 2880
atcgggaatt ctagacccag ctttcttgta caaagtggtg ataattcact ggccgtcgtt 2940
ttacaacgac tcagagcttg acaggaggcc cgatctagta acatagatga caccgcgcgc 3000
gataatttat cctagtttgc gcgctatatt ttgttttcta tcgcgtatta aatgtataat 3060
tgcgggactc taatcataaa aacccatctc ataaataacg tcatgcatta catgttaatt 3120
attacatgct taacgtaatt caacagaaat tatatgataa tcatcgcaag accggcaaca 3180
ggattcaatc ttaagaaact ttattgccaa atgtttgaac gatcggggat catccgggtc 3240
tgtggcggga actccacgaa aatatccgaa cgcagcaaga tctagagctt gggtcccgct 3300
cagaagaact cgtcaagaag gcgatagaag gcgatgcgct gcgaatcggg agcggcgata 3360
ccgtaaagca cgaggaagcg gtcagcccat tcgccgccaa gctcttcagc aatatcacgg 3420
gtagccaacg ctatgtcctg atagcggtcc gccacaccca gccggccaca gtcgatgaat 3480
ccagaaaagc ggccattttc caccatgata ttcggcaagc aggcatcgcc atgggtcacg 3540
acgagatcct cgccgtcggg catgcgcgcc ttgagcctgg cgaacagttc ggctggcgcg 3600
agcccctgat gctcttcgtc cagatcatcc tgatcgacaa gaccggcttc catccgagta 3660
cgtgctcgct cgatgcgatg tttcgcttgg tggtcgaatg ggcaggtagc cggatcaagc 3720
gtatgcagcc gccgcattgc atcagccatg atggatactt tctcggcagg agcaaggtga 3780
gatgacagga gatcctgccc cggcacttcg cccaatagca gccagtccct tcccgcttca 3840
gtgacaacgt cgagcacagc tgcgcaagga acgcccgtcg tggccagcca cgatagccgc 3900
gctgcctcgt cctgcagttc attcagggca ccggacaggt cggtcttgac aaaaagaacc 3960
gggcgcccct gcgctgacag ccggaacacg gcggcatcag agcagccgat tgtctgttgt 4020
gcccagtcat agccgaatag cctctccacc caagcggccg gagaacctgc gtgcaatcca 4080
tcttgttcaa tcatgcgaaa cgatccagat ccggtgcaga ttatttggat tgagagtgaa 4140
tatgagactc taattggata ccgaggggaa tttatggaac gtcagtggag catttttgac 4200
aagaaatatt tgctagctga tagtgacctt aggcgacttt tgaacgcgca ataatggttt 4260
ctgacgtatg tgcttagctc attaaactcc agaaacccgc ggctgagtgg ctccttcaac 4320
gttgcggttc tgtcagttcc aaacgtaaaa cggcttgtcc cgcgtcatcg gcgggggtca 4380
taacgtgact cccttaattc tccgctcatg atcagattgt cgtttcccgc cttcagttta 4440
aactatcagt gtttgacagg atcctgcttg gtaataattg tcattagatt gtttttatgc 4500
atagatgcac tcgaaatcag ccaattttag acaagtatca aacggatgtt aattcagtac 4560
attaaagacg tccgcaatgt gttattaagt tgtctaagcg tcaatttgtt tacaccacaa 4620
tatatcctgc caccagccag ccaacagctc cccgaccggc agctcggcac aaaatcacca 4680
cgcgttacca ccacgccggc cggccgcatg gtgttgaccg tgttcgccgg cattgccgag 4740
ttcgagcgtt ccctaatcat cgaccgcacc cggagcgggc gcgaggccgc caaggcccga 4800
ggcgtgaagt ttggcccccg ccctaccctc accccggcac agatcgcgca cgcccgcgag 4860
ctgatcgacc aggaaggccg caccgtgaaa gaggcggctg cactgcttgg cgtgcatcgc 4920
tcgaccctgt accgcgcact tgagcgcagc gaggaagtga cgcccaccga ggccaggcgg 4980
cgcggtgcct tccgtgagga cgcattgacc gaggccgacg ccctggcggc cgccgagaat 5040
gaacgccaag aggaacaagc atgaaaccgc accaggacgg ccaggacgaa ccgtttttca 5100
ttaccgaaga gatcgaggcg gagatgatcg cggccgggta cgtgttcgag ccgcccgcgc 5160
acgtctcaac cgtgcggctg catgaaatcc tggccggttt gtctgatgcc aagctggcgg 5220
cctggccggc cagcttggcc gctgaagaaa ccgagcgccg ccgtctaaaa aggtgatgtg 5280
tatttgagta aaacagcttg cgtcatgcgg tcgctgcgta tatgatgcga tgagtaaata 5340
aacaaatacg caaggggaac gcatgaaggt tatcgctgta cttaaccaga aaggcgggtc 5400
aggcaagacg accatcgcaa cccatctagc ccgcgccctg caactcgccg gggccgatgt 5460
tctgttagtc gattccgatc cccagggcag tgcccgcgat tgggcggccg tgcgggaaga 5520
tcaaccgcta accgttgtcg gcatcgaccg cccgacgatt gaccgcgacg tgaaggccat 5580
cggccggcgc gacttcgtag tgatcgacgg agcgccccag gcggcggact tggctgtgtc 5640
cgcgatcaag gcagccgact tcgtgctgat tccggtgcag ccaagccctt acgacatatg 5700
ggccaccgcc gacctggtgg agctggttaa gcagcgcatt gaggtcacgg atggaaggct 5760
acaagcggcc tttgtcgtgt cgcgggcgat caaaggcacg cgcatcggcg gtgaggttgc 5820
cgaggcgctg gccgggtacg agctgcccat tcttgagtcc cgtatcacgc agcgcgtgag 5880
ctacccaggc actgccgccg ccggcacaac cgttcttgaa tcagaacccg agggcgacgc 5940
tgcccgcgag gtccaggcgc tggccgctga aattaaatca aaactcattt gagttaatga 6000
ggtaaagaga aaatgagcaa aagcacaaac acgctaagtg ccggccgtcc gagcgcacgc 6060
agcagcaagg ctgcaacgtt ggccagcctg gcagacacgc cagccatgaa gcgggtcaac 6120
tttcagttgc cggcggagga tcacaccaag ctgaagatgt acgcggtacg ccaaggcaag 6180
accattaccg agctgctatc tgaatacatc gcgcagctac cagagtaaat gagcaaatga 6240
ataaatgagt agatgaattt tagcggctaa aggaggcggc atggaaaatc aagaacaacc 6300
aggcaccgac gccgtggaat gccccatgtg tggaggaacg ggcggttggc caggcgtaag 6360
cggctgggtt gtctgccggc cctgcaatgg cactggaacc cccaagcccg aggaatcggc 6420
gtgagcggtc gcaaaccatc cggcccggta caaatcggcg cggcgctggg tgatgacctg 6480
gtggagaagt tgaaggccgc gcaggccgcc cagcggcaac gcatcgaggc agaagcacgc 6540
cccggtgaat cgtggcaagc ggccgctgat cgaatccgca aagaatcccg gcaaccgccg 6600
gcagccggtg cgccgtcgat taggaagccg cccaagggcg acgagcaacc agattttttc 6660
gttccgatgc tctatgacgt gggcacccgc gatagtcgca gcatcatgga cgtggccgtt 6720
ttccgtctgt cgaagcgtga ccgacgagct ggcgaggtga tccgctacga gcttccagac 6780
gggcacgtag aggtttccgc agggccggcc ggcatggcca gtgtgtggga ttacgacctg 6840
gtactgatgg cggtttccca tctaaccgaa tccatgaacc gataccggga agggaaggga 6900
gacaagcccg gccgcgtgtt ccgtccacac gttgcggacg tactcaagtt ctgccggcga 6960
gccgatggcg gaaagcagaa agacgacctg gtagaaacct gcattcggtt aaacaccacg 7020
cacgttgcca tgcagcgtac gaagaaggcc aagaacggcc gcctggtgac ggtatccgag 7080
ggtgaagcct tgattagccg ctacaagatc gtaaagagcg aaaccgggcg gccggagtac 7140
atcgagatcg agctagctga ttggatgtac cgcgagatca cagaaggcaa gaacccggac 7200
gtgctgacgg ttcaccccga ttactttttg atcgatcccg gcatcggccg ttttctctac 7260
cgcctggcac gccgcgccgc aggcaaggca gaagccagat ggttgttcaa gacgatctac 7320
gaacgcagtg gcagcgccgg agagttcaag aagttctgtt tcaccgtgcg caagctgatc 7380
gggtcaaatg acctgccgga gtacgatttg aaggaggagg cggggcaggc tggcccgatc 7440
ctagtcatgc gctaccgcaa cctgatcgag ggcgaagcat ccgccggttc ctaatgtacg 7500
gagcagatgc tagggcaaat tgccctagca ggggaaaaag gtcgaaaagg tctctttcct 7560
gtggatagca cgtacattgg gaacccaaag ccgtacattg ggaaccggaa cccgtacatt 7620
gggaacccaa agccgtacat tgggaaccgg tcacacatgt aagtgactga tataaaagag 7680
aaaaaaggcg atttttccgc ctaaaactct ttaaaactta ttaaaactct taaaacccgc 7740
ctggcctgtg cataactgtc tggccagcgc acagccgaag agctgcaaaa agcgcctacc 7800
cttcggtcgc tgcgctccct acgccccgcc gcttcgcgtc ggcctatcgc ggccgctggc 7860
cgctcaaaaa tggctggcct acggccaggc aatctaccag ggcgcggaca agccgcgccg 7920
tcgccactcg accgccggcg cccacatcaa ggcaccctgc ctcgcgcgtt tcggtgatga 7980
cggtgaaaac ctctgacaca tgcagctccc ggagacggtc acagcttgtc tgtaagcgga 8040
tgccgggagc agacaagccc gtcagggcgc gtcagcgggt gttggcgggt gtcggggcgc 8100
agccatgacc cagtcacgta gcgatagcgg agtgtatact ggcttaacta tgcggcatca 8160
gagcagattg tactgagagt gcaccatatg cggtgtgaaa taccgcacag atgcgtaagg 8220
agaaaatacc gcatcaggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct gcgctcggtc 8280
gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa 8340
tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt 8400
aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa 8460
aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt 8520
ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg 8580
tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg taggtatctc 8640
agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc 8700
gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta 8760
tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct 8820
acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaaggacagt atttggtatc 8880
tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa 8940
caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa 9000
aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca gtggaacgaa 9060
aactcacgtt aagggatttt ggtcatgcat gatatatctc ccaatttgtg tagggcttat 9120
tatgcacgct taaaaataat aaaagcagac ttgacctgat agtttggctg tgagcaatta 9180
tgtgcttagt gcatctaacg cttgagttaa gccgcgccgc gaagcggcgt cggcttgaac 9240
gaatttctag ctagacatta tttgccgact accttggtga tctcgccttt cacgtagtgg 9300
acaaattctt ccaactgatc tgcgcgcgag gccaagcgat cttcttcttg tccaagataa 9360
gcctgtctag cttcaagtat gacgggctga tactgggccg gcaggcgctc cattgcccag 9420
tcggcagcga catccttcgg cgcgattttg ccggttactg cgctgtacca aatgcgggac 9480
aacgtaagca ctacatttcg ctcatcgcca gcccagtcgg gcggcgagtt ccatagcgtt 9540
aaggtttcat ttagcgcctc aaatagatcc tgttcaggaa ccggatcaaa gagttcctcc 9600
gccgctggac ctaccaaggc aacgctatgt tctcttgctt ttgtcagcaa gatagccaga 9660
tcaatgtcga tcgtggctgg ctcgaagata cctgcaagaa tgtcattgcg ctgccattct 9720
ccaaattgca gttcgcgctt agctggataa cgccacggaa tgatgtcgtc gtgcacaaca 9780
atggtgactt ctacagcgcg gagaatctcg ctctctccag gggaagccga agtttccaaa 9840
aggtcgttga tcaaagctcg ccgcgttgtt tcatcaagcc ttacggtcac cgtaaccagc 9900
aaatcaatat cactgtgtgg cttcaggccg ccatccactg cggagccgta caaatgtacg 9960
gccagcaacg tcggttcgag atggcgctcg atgacgccaa ctacctctga tagttgagtc 10020
gatacttcgg cgatcaccgc ttcccccatg atgtttaact ttgttttagg gcgactgccc 10080
tgctgcgtaa catcgttgct gctccataac atcaaacatc gacccacggc gtaacgcgct 10140
tgctgcttgg atgcccgagg catagactgt accccaaaaa aacagtcata acaagccatg 10200
aaaaccgcca ctgcgggggt tccatggaca tacaaatgga cgaacggata aaccttttca 10260
cgccctttta aatatccgat tattctaata aacgctcttt tctcttaggt ttacccgcca 10320
atatatcctg tcaaacactg atagtttaaa ctgaaggcgg gaaacgacaa tcagatctag 10380
taggaaacag ctatgaccat gattacgcca agct 10414
<210>79
<211>11152
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>双元载体Lo657-pSUN3-GWs-B1-BnAK700::GUS::E9::nosT::g2
<220>
<221>misc_recomb
<222>(4)..(28)
<223>attB1 Gateway重组位点
<220>
<221>启动子
<222>(56)..(724)
<223>p-BnAK启动子
<220>
<221>misc_feature
<222>(749)..(2560)
<223>cds encoding c-GUS(E.coli)
<220>
<221>终止子
<222>(2691)..(3355)
<223>t-E9终止子
<220>
<221>终止子
<222>(3369)..(3621)
<223>t-NOS胭脂氨酸合成酶终止子
<220>
<221>misc_recomb
<222>(3633)..(3657)
<223>attB2 Gateway重组位点
<220>
<221>终止子
<222>(3710)..(3962)
<223>互补序列:t-NOS胭脂氨酸合成酶终止子
<220>
<221>misc_feature
<222>(4038)..(4832)
<223>互补序列:cds encoding c-NptII confers卡那霉素抗性
<220>
<221>启动子
<222>(4864)..(5151)
<223>互补序列:p-NOS启动子from the noplaine synthase gene
<220>
<221>misc_structure
<222>(5202)..(5416)
<223>互补序列:b-LB Left T-DNA border
<220>
<221>misc_structure
<222>(10965)..(11109)
<223>互补序列:b-RB Right T-DNA border
<400>79
atcacaagtt tgtacaaaaa agcaggcttt aaaggaacca attcagtcga cacgaagctt 60
tcgaggctaa cgttggtgga gatgttaagg cacggcatct tctcttcttc ttcttttttg 120
tttgtttgtt tgtttcgctc tctatcactc actcgatcga tccccagtct tcttttcggg 180
aaagctgtgt cagaccaatt atattccatc tttaatttgg ccctttttat tattcgctat 240
ggcccaacat ttcaggccca atttatacga ttataaatat aaccacttga ttgtgctgcc 300
gctcagctga atagtactcc ctccgttttt taatataaat cgttttacag ttatgcacgt 360
aaattaagaa aaccattaac tttttatatt ttctaaacaa aaacatcatt aattatttac 420
ttactcacaa ttcaaccaat agaaaaatag aagatatatt accattggtc atacaacatt 480
aattattaat aaattttaca tagaaaaccg aaaacgacat ataatttgga acaaaaaaat 540
ttctctaaaa ctacttatat taaaaaacgg agagagtata tttaactagt tcgtcttact 600
gacaaattga agaggcagac caagacacgc ggctcctcga tggctgtctt atgccaagtg 660
gcggtgcctg cttctgcatt aaataggtag aagaactcta attacagaag ctcgaggtag 720
ataggatccc cgggtaggtc agtcccttat gttacgtcct gtagaaaccc caacccgtga 780
aatcaaaaaa ctcgacggcc tgtgggcatt cagtctggat cgcgaaaact gtggaattga 840
tcagcgttgg tgggaaagcg cgttacaaga aagccgggca attgctgtgc caggcagttt 900
taacgatcag ttcgccgatg cagatattcg taattatgcg ggcaacgtct ggtatcagcg 960
cgaagtcttt ataccgaaag gttgggcagg ccagcgtatc gtgctgcgtt tcgatgcggt 1020
cactcattac ggcaaagtgt gggtcaataa tcaggaagtg atggagcatc agggcggcta 1080
tacgccattt gaagccgatg tcacgccgta tgttattgcc gggaaaagtg tacgtatcac 1140
cgtttgtgtg aacaacgaac tgaactggca gactatcccg ccgggaatgg tgattaccga 1200
cgaaaacggc aagaaaaagc agtcttactt ccatgatttc tttaactatg ccggaatcca 1260
tcgcagcgta atgctctaca ccacgccgaa cacctgggtg gacgatatca ccgtggtgac 1320
gcatgtcgcg caagactgta accacgcgtc tgttgactgg caggtggtgg ccaatggtga 1380
tgtcagcgtt gaactgcgtg atgcggatca acaggtggtt gcaactggac aaggcactag 1440
cgggactttg caagtggtga atccgcacct ctggcaaccg ggtgaaggtt atctctatga 1500
actgtgcgtc acagccaaaa gccagacaga gtgtgatatc tacccgcttc gcgtcggcat 1560
ccggtcagtg gcagtgaagg gcgaacagtt cctgattaac cacaaaccgt tctactttac 1620
tggctttggt cgtcatgaag atgcggactt gcgtggcaaa ggattcgata acgtgctgat 1680
ggtgcacgac cacgcattaa tggactggat tggggccaac tcctaccgta cctcgcatta 1740
cccttacgct gaagagatgc tcgactgggc agatgaacat ggcatcgtgg tgattgatga 1800
aactgctgct gtcggcttta acctctcttt aggcattggt ttcgaagcgg gcaacaagcc 1860
gaaagaactg tacagcgaag aggcagtcaa cggggaaact cagcaagcgc acttacaggc 1920
gattaaagag ctgatagcgc gtgacaaaaa ccacccaagc gtggtgatgt ggagtattgc 1980
caacgaaccg gatacccgtc cgcaaggtgc acgggaatat ttcgcgccac tggcggaagc 2040
aacgcgtaaa ctcgacccga cgcgtccgat cacctgcgtc aatgtaatgt tctgcgacgc 2100
tcacaccgat accatcagcg atctctttga tgtgctgtgc ctgaaccgtt attacggatg 2160
gtatgtccaa agcggcgatt tggaaacggc agagaaggta ctggaaaaag aacttctggc 2220
ctggcaggag aaactgcatc agccgattat catcaccgaa tacggcgtgg atacgttagc 2280
cgggctgcac tcaatgtaca ccgacatgtg gagtgaagag tatcagtgtg catggctgga 2340
tatgtatcac cgcgtctttg atcgcgtcag cgccgtcgtc ggtgaacagg tatggaattt 2400
cgccgatttt gcgacctcgc aaggcatatt gcgcgttggc ggtaacaaga aagggatctt 2460
cactcgcgac cgcaaaccga agtcggcggc ttttctgctg caaaaacgct ggactggcat 2520
gaacttcggt gaaaaaccgc agcagggagg caaacaatga atcaacaact ctcctggcgc 2580
accatcgtcg gctacagcct cgggaattgc taccgagatc tgcggccgcg gcgcgccaat 2640
tgactagtag gcctatcgat taattaaggc cgcctcgagc atatgctaga ggatcctcta 2700
gctagagctt tcgttcgtat catcggtttc gacaacgttc gtcaagttca atgcatcagt 2760
ttcattgcgc acacaccaga atcctactga gtttgagtat tatggcattg ggaaaactgt 2820
ttttcttgta ccatttgttg tgcttgtaat ttactgtgtt ttttattcgg ttttcgctat 2880
cgaactgtga aatggaaatg gatggagaag agttaatgaa tgatatggtc cttttgttca 2940
ttctcaaatt aatattattt gttttttctc ttatttgttg tgtgttgaat ttgaaattat 3000
aagagatatg caaacatttt gttttgagta aaaatgtgtc aaatcgtggc ctctaatgac 3060
cgaagttaat atgaggagta aaacacttgt agttgtacca ttatgcttat tcactaggca 3120
acaaatatat tttcagacct agaaaagctg caaatgttac tgaatacaag tatgtcctct 3180
tgtgttttag acatttatga actttccttt atgtaatttt ccagaatcct tgtcagattc 3240
taatcattgc tttataatta tagttatact catggatttg tagttgagta tgaaaatatt 3300
ttttaatgca ttttatgact tgccaattga ttgacaacat gcatcaatcg accggctcga 3360
atttccccga tcgttcaaac atttggcaat aaagtttctt aagattgaat cctgttgccg 3420
gtcttgcgat gattatcata taatttctgt tgaattacgt taagcatgta ataattaaca 3480
tgtaatgcat gacgttattt atgagatggg tttttatgat tagagtcccg caattataca 3540
tttaatacgc gatagaaaac aaaatatagc gcgcaaacta ggataaatta tcgcgcgcgg 3600
tgtcatctat gttactagat cgggaattct agacccagct ttcttgtaca aagtggtgat 3660
aattcactgg ccgtcgtttt acaacgactc agagcttgac aggaggcccg atctagtaac 3720
atagatgaca ccgcgcgcga taatttatcc tagtttgcgc gctatatttt gttttctatc 3780
gcgtattaaa tgtataattg cgggactcta atcataaaaa cccatctcat aaataacgtc 3840
atgcattaca tgttaattat tacatgctta acgtaattca acagaaatta tatgataatc 3900
atcgcaagac cggcaacagg attcaatctt aagaaacttt attgccaaat gtttgaacga 3960
tcggggatca tccgggtctg tggcgggaac tccacgaaaa tatccgaacg cagcaagatc 4020
tagagcttgg gtcccgctca gaagaactcg tcaagaaggc gatagaaggc gatgcgctgc 4080
gaatcgggag cggcgatacc gtaaagcacg aggaagcggt cagcccattc gccgccaagc 4140
tcttcagcaa tatcacgggt agccaacgct atgtcctgat agcggtccgc cacacccagc 4200
cggccacagt cgatgaatcc agaaaagcgg ccattttcca ccatgatatt cggcaagcag 4260
gcatcgccat gggtcacgac gagatcctcg ccgtcgggca tgcgcgcctt gagcctggcg 4320
aacagttcgg ctggcgcgag cccctgatgc tcttcgtcca gatcatcctg atcgacaaga 4380
ccggcttcca tccgagtacg tgctcgctcg atgcgatgtt tcgcttggtg gtcgaatggg 4440
caggtagccg gatcaagcgt atgcagccgc cgcattgcat cagccatgat ggatactttc 4500
tcggcaggag caaggtgaga tgacaggaga tcctgccccg gcacttcgcc caatagcagc 4560
cagtcccttc ccgcttcagt gacaacgtcg agcacagctg cgcaaggaac gcccgtcgtg 4620
gccagccacg atagccgcgc tgcctcgtcc tgcagttcat tcagggcacc ggacaggtcg 4680
gtcttgacaa aaagaaccgg gcgcccctgc gctgacagcc ggaacacggc ggcatcagag 4740
cagccgattg tctgttgtgc ccagtcatag ccgaatagcc tctccaccca agcggccgga 4800
gaacctgcgt gcaatccatc ttgttcaatc atgcgaaacg atccagatcc ggtgcagatt 4860
atttggattg agagtgaata tgagactcta attggatacc gaggggaatt tatggaacgt 4920
cagtggagca tttttgacaa gaaatatttg ctagctgata gtgaccttag gcgacttttg 4980
aacgcgcaat aatggtttct gacgtatgtg cttagctcat taaactccag aaacccgcgg 5040
ctgagtggct ccttcaacgt tgcggttctg tcagttccaa acgtaaaacg gcttgtcccg 5100
cgtcatcggc gggggtcata acgtgactcc cttaattctc cgctcatgat cagattgtcg 5160
tttcccgcct tcagtttaaa ctatcagtgt ttgacaggat cctgcttggt aataattgtc 5220
attagattgt ttttatgcat agatgcactc gaaatcagcc aattttagac aagtatcaaa 5280
cggatgttaa ttcagtacat taaagacgtc cgcaatgtgt tattaagttg tctaagcgtc 5340
aatttgttta caccacaata tatcctgcca ccagccagcc aacagctccc cgaccggcag 5400
ctcggcacaa aatcaccacg cgttaccacc acgccggccg gccgcatggt gttgaccgtg 5460
ttcgccggca ttgccgagtt cgagcgttcc ctaatcatcg accgcacccg gagcgggcgc 5520
gaggccgcca aggcccgagg cgtgaagttt ggcccccgcc ctaccctcac cccggcacag 5580
atcgcgcacg cccgcgagct gatcgaccag gaaggccgca ccgtgaaaga ggcggctgca 5640
ctgcttggcg tgcatcgctc gaccctgtac cgcgcacttg agcgcagcga ggaagtgacg 5700
cccaccgagg ccaggcggcg cggtgccttc cgtgaggacg cattgaccga ggccgacgcc 5760
ctggcggccg ccgagaatga acgccaagag gaacaagcat gaaaccgcac caggacggcc 5820
aggacgaacc gtttttcatt accgaagaga tcgaggcgga gatgatcgcg gccgggtacg 5880
tgttcgagcc gcccgcgcac gtctcaaccg tgcggctgca tgaaatcctg gccggtttgt 5940
ctgatgccaa gctggcggcc tggccggcca gcttggccgc tgaagaaacc gagcgccgcc 6000
gtctaaaaag gtgatgtgta tttgagtaaa acagcttgcg tcatgcggtc gctgcgtata 6060
tgatgcgatg agtaaataaa caaatacgca aggggaacgc atgaaggtta tcgctgtact 6120
taaccagaaa ggcgggtcag gcaagacgac catcgcaacc catctagccc gcgccctgca 6180
actcgccggg gccgatgttc tgttagtcga ttccgatccc cagggcagtg cccgcgattg 6240
ggcggccgtg cgggaagatc aaccgctaac cgttgtcggc atcgaccgcc cgacgattga 6300
ccgcgacgtg aaggccatcg gccggcgcga cttcgtagtg atcgacggag cgccccaggc 6360
ggcggacttg gctgtgtccg cgatcaaggc agccgacttc gtgctgattc cggtgcagcc 6420
aagcccttac gacatatggg ccaccgccga cctggtggag ctggttaagc agcgcattga 6480
ggtcacggat ggaaggctac aagcggcctt tgtcgtgtcg cgggcgatca aaggcacgcg 6540
catcggcggt gaggttgccg aggcgctggc cgggtacgag ctgcccattc ttgagtcccg 6600
tatcacgcag cgcgtgagct acccaggcac tgccgccgcc ggcacaaccg ttcttgaatc 6660
agaacccgag ggcgacgctg cccgcgaggt ccaggcgctg gccgctgaaa ttaaatcaaa 6720
actcatttga gttaatgagg taaagagaaa atgagcaaaa gcacaaacac gctaagtgcc 6780
ggccgtccga gcgcacgcag cagcaaggct gcaacgttgg ccagcctggc agacacgcca 6840
gccatgaagc gggtcaactt tcagttgccg gcggaggatc acaccaagct gaagatgtac 6900
gcggtacgcc aaggcaagac cattaccgag ctgctatctg aatacatcgc gcagctacca 6960
gagtaaatga gcaaatgaat aaatgagtag atgaatttta gcggctaaag gaggcggcat 7020
ggaaaatcaa gaacaaccag gcaccgacgc cgtggaatgc cccatgtgtg gaggaacggg 7080
cggttggcca ggcgtaagcg gctgggttgt ctgccggccc tgcaatggca ctggaacccc 7140
caagcccgag gaatcggcgt gagcggtcgc aaaccatccg gcccggtaca aatcggcgcg 7200
gcgctgggtg atgacctggt ggagaagttg aaggccgcgc aggccgccca gcggcaacgc 7260
atcgaggcag aagcacgccc cggtgaatcg tggcaagcgg ccgctgatcg aatccgcaaa 7320
gaatcccggc aaccgccggc agccggtgcg ccgtcgatta ggaagccgcc caagggcgac 7380
gagcaaccag attttttcgt tccgatgctc tatgacgtgg gcacccgcga tagtcgcagc 7440
atcatggacg tggccgtttt ccgtctgtcg aagcgtgacc gacgagctgg cgaggtgatc 7500
cgctacgagc ttccagacgg gcacgtagag gtttccgcag ggccggccgg catggccagt 7560
gtgtgggatt acgacctggt actgatggcg gtttcccatc taaccgaatc catgaaccga 7620
taccgggaag ggaagggaga caagcccggc cgcgtgttcc gtccacacgt tgcggacgta 7680
ctcaagttct gccggcgagc cgatggcgga aagcagaaag acgacctggt agaaacctgc 7740
attcggttaa acaccacgca cgttgccatg cagcgtacga agaaggccaa gaacggccgc 7800
ctggtgacgg tatccgaggg tgaagccttg attagccgct acaagatcgt aaagagcgaa 7860
accgggcggc cggagtacat cgagatcgag ctagctgatt ggatgtaccg cgagatcaca 7920
gaaggcaaga acccggacgt gctgacggtt caccccgatt actttttgat cgatcccggc 7980
atcggccgtt ttctctaccg cctggcacgc cgcgccgcag gcaaggcaga agccagatgg 8040
ttgttcaaga cgatctacga acgcagtggc agcgccggag agttcaagaa gttctgtttc 8100
accgtgcgca agctgatcgg gtcaaatgac ctgccggagt acgatttgaa ggaggaggcg 8160
gggcaggctg gcccgatcct agtcatgcgc taccgcaacc tgatcgaggg cgaagcatcc 8220
gccggttcct aatgtacgga gcagatgcta gggcaaattg ccctagcagg ggaaaaaggt 8280
cgaaaaggtc tctttcctgt ggatagcacg tacattggga acccaaagcc gtacattggg 8340
aaccggaacc cgtacattgg gaacccaaag ccgtacattg ggaaccggtc acacatgtaa 8400
gtgactgata taaaagagaa aaaaggcgat ttttccgcct aaaactcttt aaaacttatt 8460
aaaactctta aaacccgcct ggcctgtgca taactgtctg gccagcgcac agccgaagag 8520
ctgcaaaaag cgcctaccct tcggtcgctg cgctccctac gccccgccgc ttcgcgtcgg 8580
cctatcgcgg ccgctggccg ctcaaaaatg gctggcctac ggccaggcaa tctaccaggg 8640
cgcggacaag ccgcgccgtc gccactcgac cgccggcgcc cacatcaagg caccctgcct 8700
cgcgcgtttc ggtgatgacg gtgaaaacct ctgacacatg cagctcccgg agacggtcac 8760
agcttgtctg taagcggatg ccgggagcag acaagcccgt cagggcgcgt cagcgggtgt 8820
tggcgggtgt cggggcgcag ccatgaccca gtcacgtagc gatagcggag tgtatactgg 8880
cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc accatatgcg gtgtgaaata 8940
ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgct cttccgcttc ctcgctcact 9000
gactcgctgc gctcggtcgt tcggctgcgg cgagcggtat cagctcactc aaaggcggta 9060
atacggttat ccacagaatc aggggataac gcaggaaaga acatgtgagc aaaaggccag 9120
caaaaggcca ggaaccgtaa aaaggccgcg ttgctggcgt ttttccatag gctccgcccc 9180
cctgacgagc atcacaaaaa tcgacgctca agtcagaggt ggcgaaaccc gacaggacta 9240
taaagatacc aggcgtttcc ccctggaagc tccctcgtgc gctctcctgt tccgaccctg 9300
ccgcttaccg gatacctgtc cgcctttctc ccttcgggaa gcgtggcgct ttctcatagc 9360
tcacgctgta ggtatctcag ttcggtgtag gtcgttcgct ccaagctggg ctgtgtgcac 9420
gaaccccccg ttcagcccga ccgctgcgcc ttatccggta actatcgtct tgagtccaac 9480
ccggtaagac acgacttatc gccactggca gcagccactg gtaacaggat tagcagagcg 9540
aggtatgtag gcggtgctac agagttcttg aagtggtggc ctaactacgg ctacactaga 9600
aggacagtat ttggtatctg cgctctgctg aagccagtta ccttcggaaa aagagttggt 9660
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cagattacgc gcagaaaaaa aggatctcaa gaagatcctt tgatcttttc tacggggtct 9780
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agcggcgtcg gcttgaacga atttctagct agacattatt tgccgactac cttggtgatc 10020
tcgcctttca cgtagtggac aaattcttcc aactgatctg cgcgcgaggc caagcgatct 10080
tcttcttgtc caagataagc ctgtctagct tcaagtatga cgggctgata ctgggccggc 10140
aggcgctcca ttgcccagtc ggcagcgaca tccttcggcg cgattttgcc ggttactgcg 10200
ctgtaccaaa tgcgggacaa cgtaagcact acatttcgct catcgccagc ccagtcgggc 10260
ggcgagttcc atagcgttaa ggtttcattt agcgcctcaa atagatcctg ttcaggaacc 10320
ggatcaaaga gttcctccgc cgctggacct accaaggcaa cgctatgttc tcttgctttt 10380
gtcagcaaga tagccagatc aatgtcgatc gtggctggct cgaagatacc tgcaagaatg 10440
tcattgcgct gccattctcc aaattgcagt tcgcgcttag ctggataacg ccacggaatg 10500
atgtcgtcgt gcacaacaat ggtgacttct acagcgcgga gaatctcgct ctctccaggg 10560
gaagccgaag tttccaaaag gtcgttgatc aaagctcgcc gcgttgtttc atcaagcctt 10620
acggtcaccg taaccagcaa atcaatatca ctgtgtggct tcaggccgcc atccactgcg 10680
gagccgtaca aatgtacggc cagcaacgtc ggttcgagat ggcgctcgat gacgccaact 10740
acctctgata gttgagtcga tacttcggcg atcaccgctt cccccatgat gtttaacttt 10800
gttttagggc gactgccctg ctgcgtaaca tcgttgctgc tccataacat caaacatcga 10860
cccacggcgt aacgcgcttg ctgcttggat gcccgaggca tagactgtac cccaaaaaaa 10920
cagtcataac aagccatgaa aaccgccact gcgggggttc catggacata caaatggacg 10980
aacggataaa ccttttcacg cccttttaaa tatccgatta ttctaataaa cgctcttttc 11040
tcttaggttt acccgccaat atatcctgtc aaacactgat agtttaaact gaaggcggga 11100
aacgacaatc agatctagta ggaaacagct atgaccatga ttacgccaag ct 11152
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<211>37
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物5
<400>80
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<400>81
cggactagtg atgtagccct cagg 24
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<211>22
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<213>寡核苷酸引物7
<400>82
cgagctcgtg ccttttggat cg 22
<210>83
<211>18
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物8
<400>83
cggtccgaac gtggttgg 18
<210>84
<211>22
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物9
<400>84
cgagctcggc cctatgaatt gg 22
<210>85
<211>22
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物10
<400>85
cggtccgtct ccttctgcac ac 22
<210>86
<211>23
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物11
<400>86
cgagctcgat gcattccttg gat 23
<210>87
<211>22
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物12
<400>87
cctagggttt ggaggtatca ag 22
<210>88
<211>26
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物13
<400>88
cgagctccgt ccgatgtgat tccgtc 26
<210>89
<211>22
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物14
<400>89
cctaggggca gtgtcggcgg tt 22
<210>90
<211>25
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物15
<400>90
cgagctccag agtgacagac agtga 25
<210>91
<211>22
<212>DNA
<213>寡核苷酸引物16
<400>91
cctaggtctt caactgtccc ca 22
<210>92
<211>1137
<212>DNA
<213>稻
<220>
<221>终止子
<222>(1)..(1137)
<223>BPST.3
<400>92
ggaatgtatt tgaccataca aaaaccgtac aaagtgtagg gttctaatta gcaaatgtaa 60
gtttgtaatt cttctgtcta aatgtagtgt gttgaggtgg tcagttgccg tgactggctc 120
tttcagatgg taattacaaa gaaatgtaac attaatgttg taacaagggt gccattttgt 180
ttctgattcc agatgaaaag gaaaaactat tccatattct gcaggattaa acgtttctgc 240
tgttcacaac aggtaaagtc actccacttc agggaaagac agcaaaatca tttcttttac 300
acagacttta gataaccctt ttttttgggg ttcttggtat atgccaactt ttgtagcctg 360
caccagaaac aaaaatgaag acttttgcta aagatgtaaa agtggcatga tgtcctggat 420
gaccaaataa ttcatgacaa atggattaaa agagcccaat atctgaaaga gactggccag 480
cagccactaa tgtcaccaac cacatatgta acacttggtg cataattcaa gagggagcat 540
ctcctccaga atcaggattg aaaggtacaa cctcatagta aatcctcgga atatagcatg 600
tgcagcataa gaatatatca gtgttgtgct gggtaagaaa ccacatgaac caattaggaa 660
taaataatca tgctgaaatt atagcaatgc ttgcaatttg caaacgataa agctagacgc 720
gggttgctgg aataacaatc catctccaac aaaatagtac agaatataac tgaatggcca 780
gctcagaccc taacagaatt gaaaagctgg attcatcagc actccattga gcaatctaga 840
tcaggaaaga gcatagatgc ataatgaact gagatccctt caaaatgact aactaatatt 900
tttttttctt ataaaagagt ttacaacagt acaaccacga agatcagcac taccattact 960
gattttgtta acatagagtg atttatcatg tgtgccagac aaacaacaga tacattcata 1020
catagcataa cttacagcac atgatacaga ctacggagaa cggttaatct taaaataaaa 1080
acaaaaaaac aaggaggcaa agcttatttt gcctgggatt catctaaatg cagttgt 1137
<210>93
<211>1137
<212>DNA
<213>稻
<220>
<221>终止子
<222>(1)..(1137)
<223>BPST.4
<400>93
acaactgcat ttagatgaat cccaggcaaa ataagctttg cctccttgtt tttttgtttt 60
tattttaaga ttaaccgttc tccgtagtct gtatcatgtg ctgtaagtta tgctatgtat 120
gaatgtatct gttgtttgtc tggcacacat gataaatcac tctatgttaa caaaatcagt 180
aatggtagtg ctgatcttcg tggttgtact gttgtaaact cttttataag aaaaaaaaat 240
attagttagt cattttgaag ggatctcagt tcattatgca tctatgctct ttcctgatct 300
agattgctca atggagtgct gatgaatcca gcttttcaat tctgttaggg tctgagctgg 360
ccattcagtt atattctgta ctattttgtt ggagatggat tgttattcca gcaacccgcg 420
tctagcttta tcgtttgcaa attgcaagca ttgctataat ttcagcatga ttatttattc 480
ctaattggtt catgtggttt cttacccagc acaacactga tatattctta tgctgcacat 540
gctatattcc gaggatttac tatgaggttg tacctttcaa tcctgattct ggaggagatg 600
ctccctcttg aattatgcac caagtgttac atatgtggtt ggtgacatta gtggctgctg 660
gccagtctct ttcagatatt gggctctttt aatccatttg tcatgaatta tttggtcatc 720
caggacatca tgccactttt acatctttag caaaagtctt catttttgtt tctggtgcag 780
gctacaaaag ttggcatata ccaagaaccc caaaaaaaag ggttatctaa agtctgtgta 840
aaagaaatga ttttgctgtc tttccctgaa gtggagtgac tttacctgtt gtgaacagca 900
gaaacgttta atcctgcaga atatggaata gtttttcctt ttcatctgga atcagaaaca 960
aaatggcacc cttgttacaa cattaatgtt acatttcttt gtaattacca tctgaaagag 1020
ccagtcacgg caactgacca cctcaacaca ctacatttag acagaagaat tacaaactta 1080
catttgctaa ttagaaccct acactttgta cggtttttgt atggtcaaat acattcc 1137
<210>94
<211>6849
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>载体pRJB058
<220>
<221>启动子
<222>(204)..(2191)
<223>ZmUbi
<220>
<221>内含子
<222>(1186)..(2191)
<223>i-ZmUbi
<220>
<221>misc_feature
<222>(2224)..(4224)
<223>编码GUS的cds
<220>
<221>内含子
<222>(2609)..(2797)
<223>i-PIV2
<220>
<221>misc_feature
<222>(4284)..(4299)
<223>TOI克隆位点
<220>
<221>misc_feature
<222>(4304)..(4567)
<223>GFP-片段
<400>94
caggaaacag ctatgaccat gtaatacgac tcactatagg ggatatcagc tggatggcaa 60
ataatgattt tattttgact gatagtgacc tgttcgttgc aacaaattga taagcaatgc 120
tttcttataa tgccaacttt gtacaagaaa gctgggtcgg cgcgccaagc ttgcatgcct 180
gcaggcatgc aagcttccgc ggctgcagtg cagcgtgacc cggtcgtgcc cctctctaga 240
gataatgagc attgcatgtc taagttataa aaaattacca catatttttt ttgtcacact 300
tgtttgaagt gcagtttatc tatctttata catatattta aactttactc tacgaataat 360
ataatctata gtactacaat aatatcagtg ttttagagaa tcatataaat gaacagttag 420
acatggtcta aaggacaatt gagtattttg acaacaggac tctacagttt tatcttttta 480
gtgtgcatgt gttctccttt ttttttgcaa atagcttcac ctatataata cttcatccat 540
tttattagta catccattta gggtttaggg ttaatggttt ttatagacta atttttttag 600
tacatctatt ttattctatt ttagcctcta aattaagaaa actaaaactc tattttagtt 660
tttttattta atagtttaga tataaaatag aataaaataa agtgactaaa aattaaacaa 720
atacccttta agaaattaaa aaaactaagg aaacattttt cttgtttcga gtagataatg 780
ccagcctgtt aaacgccgtc gacgagtcta acggacacca accagcgaac cagcagcgtc 840
gcgtcgggcc aagcgaagca gacggcacgg catctctgtc gctgcctctg gacccctctc 900
gagagttccg ctccaccgtt ggacttgctc cgctgtcggc atccagaaat tgcgtggcgg 960
agcggcagac gtgagccggc acggcaggcg gcctcctcct cctctcacgg caccggcagc 1020
tacgggggat tcctttccca ccgctccttc gctttccctt cctcgcccgc cgtaataaat 1080
agacaccccc tccacaccct ctttccccaa cctcgtgttg ttcggagcgc acacacacac 1140
aaccagatct cccccaaatc cacccgtcgg cacctccgct tcaaggtacg ccgctcgtcc 1200
tccccccccc cccccctctc taccttctct agatcggcgt tccggtccat ggttagggcc 1260
cggtagttct acttctgttc atgtttgtgt tagatccgtg tttgtgttag atccgtgctg 1320
ctagcgttcg tacacggatg cgacctgtac gtcagacacg ttctgattgc taacttgcca 1380
gtgtttctct ttggggaatc ctgggatggc tctagccgtt ccgcagacgg gatcgatttc 1440
atgatttttt ttgtttcgtt gcatagggtt tggtttgccc ttttccttta tttcaatata 1500
tgccgtgcac ttgtttgtcg ggtcatcttt tcatgctttt ttttgtcttg gttgtgatga 1560
tgtggtctgg ttgggcggtc gttctagatc ggagtagaat tctgtttcaa actacctggt 1620
ggatttatta attttggatc tgtatgtgtg tgccatacat attcatagtt acgaattgaa 1680
gatgatggat ggaaatatcg atctaggata ggtatacatg ttgatgcggg ttttactgat 1740
gcatatacag agatgctttt tgttcgcttg gttgtgatga tgtggtgtgg ttgggcggtc 1800
gttcattcgt tctagatcgg agtagaatac tgtttcaaac tacctggtgt atttattaat 1860
tttggaactg tatgtgtgtg tcatacatct tcatagttac gagtttaaga tggatggaaa 1920
tatcgatcta ggataggtat acatgttgat gtgggtttta ctgatgcata tacatgatgg 1980
catatgcagc atctattcat atgctctaac cttgagtacc tatctattat aataaacaag 2040
tatgttttat aattatttcg atcttgatat acttggatga tggcatatgc agcagctata 2100
tgtggatttt tttagccctg ccttcatacg ctatttattt gcttggtact gtttcttttg 2160
tcgatgctca ccctgttgtt tggtgttact tctgcagggt acccccgggt aggtcagtcc 2220
cttatgttac gtcctgtaga aaccccaacc cgtgaaatca aaaaactcga cggcctgtgg 2280
gcattcagtc tggatcgcga aaactgtgga attggtcagc gttggtggga aagcgcgtta 2340
caagaaagcc gggcaattgc tgtgccaggc agttttaacg atcagttcgc cgatgcagat 2400
attcgtaatt atgcgggcaa cgtctggtat cagcgcgaag tctttatacc gaaaggttgg 2460
gcaggccagc gtatcgtgct gcgtttcgat gcggtcactc attacggcaa agtgtgggtc 2520
aataatcagg aagtgatgga gcatcagggc ggctatacgc catttgaagc cgatgtcacg 2580
ccgtatgtta ttgccgggaa aagtgtacgt aagtttctgc ttctaccttt gatatatata 2640
taataattat cattaattag tagtaatata atatttcaaa tatttttttc aaaataaaag 2700
aatgtagtat atagcaattg cttttctgta gtttataagt gtgtatattt taatttataa 2760
cttttctaat atatgaccaa aatttgttga tgtgcaggta tcaccgtttg tgtgaacaac 2820
gaactgaact ggcagactat cccgccggga atggtgatta ccgacgaaaa cggcaagaaa 2880
aagcagtctt acttccatga tttctttaac tatgccggaa tccatcgcag cgtaatgctc 2940
tacaccacgc cgaacacctg ggtggacgat atcaccgtgg tgacgcatgt cgcgcaagac 3000
tgtaaccacg cgtctgttga ctggcaggtg gtggccaatg gtgatgtcag cgttgaactg 3060
cgtgatgcgg atcaacaggt ggttgcaact ggacaaggca ctagcgggac tttgcaagtg 3120
gtgaatccgc acctctggca accgggtgaa ggttatctct atgaactgtg cgtcacagcc 3180
aaaagccaga cagagtgtga tatctacccg cttcgcgtcg gcatccggtc agtggcagtg 3240
aagggcgaac agttcctgat taaccacaaa ccgttctact ttactggctt tggtcgtcat 3300
gaagatgcgg acttgcgtgg caaaggattc gataacgtgc tgatggtgca cgaccacgca 3360
ttaatggact ggattggggc caactcctac cgtacctcgc attaccctta cgctgaagag 3420
atgctcgact gggcagatga acatggcatc gtggtgattg atgaaactgc tgctgtcggc 3480
tttaacctct ctttaggcat tggtttcgaa gcgggcaaca agccgaaaga actgtacagc 3540
gaagaggcag tcaacgggga aactcagcaa gcgcacttac aggcgattaa agagctgata 3600
gcgcgtgaca aaaaccaccc aagcgtggtg atgtggagta ttgccaacga accggatacc 3660
cgtccgcaag gtgcacggga atatttcgcg ccactggcgg aagcaacgcg taaactcgac 3720
ccgacgcgtc cgatcacctg cgtcaatgta atgttctgcg acgctcacac cgataccatc 3780
agcgatctct ttgatgtgct gtgcctgaac cgttattacg gatggtatgt ccaaagcggc 3840
gatttggaaa cggcagagaa ggtactggaa aaagaacttc tggcctggca ggagaaactg 3900
catcagccga ttatcatcac cgaatacggc gtggatacgt tagccgggct gcactcaatg 3960
tacaccgaca tgtggagtga agagtatcag tgtgcatggc tggatatgta tcaccgcgtc 4020
tttgatcgcg tcagcgccgt cgtcggtgaa caggtatgga atttcgccga ttttgcgacc 4080
tcgcaaggca tattgcgcgt tggcggtaac aagaaaggga tcttcactcg cgaccgcaaa 4140
ccgaagtcgg cggcttttct gctgcaaaaa cgctggactg gcatgaactt cggtgaaaaa 4200
ccgcagcagg gaggcaaaca atgaatcaac aactctcctg gcgcaccatc gtcggctaca 4260
gcctcgggaa ttgctaccga gctccctagg gggcgcccgg accgagctgt tcaccggcat 4320
cgtgcccatc ctgatcgagc tgaatggcga tgtgaatggc cacaagttca gcgtgagcgg 4380
cgagggcgag ggcgatgcca cctacggcaa gctgaccctg aagttcatct gcaccaccgg 4440
caagctgcct gtgccctggc ccaccctggt gaccaccctg agctacggcg tgcagtgctt 4500
ctcacgctac cccgatcaca tgaagcagca cgacttcttc aagagcgcca tgcctgaggg 4560
ctacatcact agttaagact ggccgtcgtt ttacaacgtc gtgactggga aaacatccat 4620
gctagcgtta acgcgagagt agggaactgc caggcatcaa ataaaacgaa aggctcagtc 4680
ggaagactgg gcctttcgtt ttatctgttg tttgtcggtg aacgctctcc tgagtaggac 4740
aaatccgccg ggagcggatt tgaacgttgt gaagcaacgg cccggagggt ggcgggcagg 4800
acgcccgcca taaactgcca ggcatcaaac taagcagaag gccatcctga cggatggcct 4860
ttttgcgttt ctacaaactc ttcctggcta gcggtacgcg tattaattgc gttgcgctca 4920
ctgcccgctt tccagtcggg aaacctgtcg tgccagctgc attaatgaat cggccaacgc 4980
gcggggagag gcggtttgcg tattgggcgc tcttccgctt cctcgctcac tgactcgctg 5040
cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact caaaggcggt aatacggtta 5100
tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag caaaaggcca gcaaaaggcc 5160
aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata ggctccgccc ccctgacgag 5220
catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc cgacaggact ataaagatac 5280
caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg ttccgaccct gccgcttacc 5340
ggatacctgt ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc tttctcatag ctcacgctgt 5400
aggtatctca gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg gctgtgtgca cgaacccccc 5460
gttcagcccg accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc ttgagtccaa cccggtaaga 5520
cacgacttat cgccactggc agcagccact ggtaacagga ttagcagagc gaggtatgta 5580
ggcggtgcta cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg gctacactag aagaacagta 5640
tttggtatct gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa aaagagttgg tagctcttga 5700
tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt ggtttttttg tttgcaagca gcagattacg 5760
cgcagaaaaa aaggatctca agaagatcct ttgatctttt ctacggggtc tgacgctcag 5820
tggaacgacg cgtaactcac gttaagggat tttggtcatg agcttgcgcc gtcccgtcaa 5880
gtcagcgtaa tgctctgcca gtgttacaac caattaacca attctgatta gaaaaactca 5940
tcgagcatca aatgaaactg caatttattc atatcaggat tatcaatacc atatttttga 6000
aaaagccgtt tctgtaatga aggagaaaac tcaccgaggc agttccatag gatggcaaga 6060
tcctggtatc ggtctgcgat tccgactcgt ccaacatcaa tacaacctat taatttcccc 6120
tcgtcaaaaa taaggttatc aagtgagaaa tcaccatgag tgacgactga atccggtgag 6180
aatggcaaaa gtttatgcat ttctttccag acttgttcaa caggccagcc attacgctcg 6240
tcatcaaaat cactcgcatc aaccaaaccg ttattcattc gtgattgcgc ctgagcgaga 6300
cgaaatacgc gatcgctgtt aaaaggacaa ttacaaacag gaatcgaatg caaccggcgc 6360
aggaacactg ccagcgcatc aacaatattt tcacctgaat caggatattc ttctaatacc 6420
tggaatgctg tttttccggg gatcgcagtg gtgagtaacc atgcatcatc aggagtacgg 6480
ataaaatgct tgatggtcgg aagaggcata aattccgtca gccagtttag tctgaccatc 6540
tcatctgtaa catcattggc aacgctacct ttgccatgtt tcagaaacaa ctctggcgca 6600
tcgggcttcc catacaagcg atagattgtc gcacctgatt gcccgacatt atcgcgagcc 6660
catttatacc catataaatc agcatccatg ttggaattta atcgcggcct cgacgtttcc 6720
cgttgaatat ggctcataac accccttgta ttactgttta tgtaagcaga cagttttatt 6780
gttcatgatg atatattttt atcttgtgca atgtaacatc agagattttg agacacgggc 6840
cagagctgc 6849
<210>95
<211>257
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入pRJB058的SacI-RsrII片段的Nos-T序列
<220>
<221>终止子
<222>(3)..(254)
<223>插入pJB058的SacI-RsrII位点的Nos终止子
<400>95
cgatcgttca aacatttggc aataaagttt cttaagattg aatcctgttg ccggtcttgc 60
gatgattatc atataatttc tgttgaatta cgttaagcat gtaataatta acatgtaatg 120
catgacgtta tttatgagat gggtttttat gattagagtc ccgcaattat acatttaata 180
cgcgatagaa aacaaaatat agcgcgcaaa ctaggataaa ttatcgcgcg cggtgtcatc 240
tatgttacta gatccgg 257
<210>96
<211>1089
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入SacI消化的并且T4 DNA聚合酶补平的pRJB058片段的ROF序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(3)..(1088)
<223>克隆到pRJB058的补平的SacI位点的内部ORF序列
<400>96
cgaacaacaa aaaaaccatc ccgaacaacc tggttgaaaa ctacctgacc ccgatgtctc 60
tggcatactg gttcatggat gatggtggta aatgggatta caacaaaaac tctaccaaca 120
aatcgatcgt actgaacacc cagtctttca ctttcgaaga agtagaatac ctggttaagg 180
gtctgcgtaa caaattccaa ctgaactgtt acgtaaaaat caacaaaaac aaaccgatca 240
tctacatcga ttctatgtct tacctgatct tctacaacct gatcaaaccg tacctgatcc 300
cgcagatgat gtacaaactg ccgaacacta tctcctccga aactttcctg aaaggtacca 360
aaggtgggat acgaaaagac cgaagaggag ggagaatgtt gaaacacaag cgccagagag 420
atgatgggga gggcaggggt gaagtggggt ctgctggaga catgagagct gccaaccttt 480
ggccaagccc gctcatgatc aaacgctcta agaagaacag cctggccttg tccctgacgg 540
ccgaccagat ggtcagtgcc ttgttggatg ctgagccccc catacctcta ttccgagtat 600
gatcctacca gacccttcag tgaagcttcg atgatgggct tactgaccaa cctggcagac 660
agggagctgg ttcacatgat caactgggcg aagagggtgc caggctttgt ggatttgacc 720
ctccatgatc aggtccacct tctagaatgt gcctggctag agatcctgat gattggtctc 780
gtctggcgct ccatggaaca cccggggaag ctcctgtttg ctcctaactt gctcctggac 840
aggaatcaag gtaaatgtgt ggaaggcatg gtggagatct tcgacatgct gctggctaca 900
tcatctcggt tccgcatgat gaatctgcag ggagaggagt ttgtgtgcct caaatctatt 960
attttgctta attctggagt gtacacattt ctgtccagca ccctgaagtc tctggaagag 1020
aaggaccata tccaccgagt cctggacaag atcacagaca ctttgatcca cctgatggcc 1080
aaggcaggc 1089
<210>97
<211>1414
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入SacI消化的并且T4 DNA聚合酶补平的pRJB058的片段的稻BPST.1序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(18)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(19)..(1402)
<223>插入pRJB058的SacI位点的BPST.1序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1403)..(1414)
<223>RsrII/EcoRI MCS
<400>97
aattcgccct tcggaccgtg ccttttggat cgaaagatgc agttgttttg ctgctgaagg 60
catcctcatg tctgttactt tgatatggtc ttgaaataaa tcttcgttta caagagaaca 120
acactctgtt ttatcttgtt ttgtgtgcca gaagcctgct gaacaatttt atgtcaattt 180
ctttgctact aagaaagtta tgcaccaaaa tgaagggaaa ttctgtgaag tttgtaattt 240
tcaagtgatt ggcattattc tgtttagttc gtgcagtgcc atgttcctta tataatcaca 300
gaacatgtaa aaggccgaaa tattttcctt gtcattttcc atgcgagaac ggcctttcga 360
tgagactgga aagtcctgca ataactattg tccaaaataa cacacggctc tctaccgatt 420
cacatcaaaa ccaacccaaa cgctctctct gttgcttgtg ttctggactt ctctgagcgc 480
agttcaggag tctcgagtgt gcctcaacag tacatgttaa acataaaact gccattgaag 540
attaccacca accatattgg aagtttatca tggcatatac ttgcctttca aagaccctaa 600
ttttcaaagt gaacatggga ctttcagact acagataacc tcaatcgata acatcaccga 660
aaattcgata ttactacaaa gattttggtt gaaaacttct ctgaacccaa tttaaataca 720
agtcgccctc ggtgatggct actcgccatt ccacgctcac agttgcagtt cacacttgca 780
aaatgaaaaa aaaaatcttc tgaacagcaa tcatcaaccg gttcgacctc aggatcatca 840
cagaaatgaa aaggacgagg aatctcaatt taagaaagtt cctatccaaa tatccaacaa 900
aaatctgact gtctggctat tattaattca acaggagatg ctcgttaaag acaatatagt 960
tctgtaattt gtaacaacac aagagcctga ggatataacg agttacaaac atgctgccgt 1020
tgcagcatgg tcatcaatat acaacattac aacaacatat ggggatcgca gaacactccc 1080
attccacgat tttacaacat atgcttcaca acacgttata aatacatggt tgtaccgagc 1140
tgtagagaga cagccagcac gtcccaacta caaatgcaca ctagccaaca gcaaacataa 1200
aaactactct ctggtaagtc actatatata cgcactatag cttcacatga ctaaaattat 1260
aacatgacat aatttctttc gtataaatta gccccaggaa gcttctgtcc gaatcgccat 1320
cttgggagca ataaatatac tggcattctt cacaatggat gcattattta catatatata 1380
cttcttctcc aaccacgttc gagctcgaag ggcg 1414
<210>98
<211>1414
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入SacI消化的并且T4 DNA聚合酶补平的pRJB058的片段的稻BPST.2序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(14)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(15)..(1398)
<223>插入pRJB058的补平的SacI位点的BPST.2序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1399)..(1414)
<223>RsrII/EcoRI MCS
<400>98
cgcccttcga gctcgaacgt ggttggagaa gaagtatata tatgtaaata atgcatccat 60
tgtgaagaat gccagtatat ttattgctcc caagatggcg attcggacag aagcttcctg 120
gggctaattt atacgaaaga aattatgtca tgttataatt ttagtcatgt gaagctatag 180
tgcgtatata tagtgactta ccagagagta gtttttatgt ttgctgttgg ctagtgtgca 240
tttgtagttg ggacgtgctg gctgtctctc tacagctcgg tacaaccatg tatttataac 300
gtgttgtgaa gcatatgttg taaaatcgtg gaatgggagt gttctgcgat ccccatatgt 360
tgttgtaatg ttgtatattg atgaccatgc tgcaacggca gcatgtttgt aactcgttat 420
atcctcaggc tcttgtgttg ttacaaatta cagaactata ttgtctttaa cgagcatctc 480
ctgttgaatt aataatagcc agacagtcag atttttgttg gatatttgga taggaacttt 540
cttaaattga gattcctcgt ccttttcatt tctgtgatga tcctgaggtc gaaccggttg 600
atgattgctg ttcagaagat tttttttttc attttgcaag tgtgaactgc aactgtgagc 660
gtggaatggc gagtagccat caccgagggc gacttgtatt taaattgggt tcagagaagt 720
tttcaaccaa aatctttgta gtaatatcga attttcggtg atgttatcga ttgaggttat 780
ctgtagtctg aaagtcccat gttcactttg aaaattaggg tctttgaaag gcaagtatat 840
gccatgataa acttccaata tggttggtgg taatcttcaa tggcagtttt atgtttaaca 900
tgtactgttg aggcacactc gagactcctg aactgcgctc agagaagtcc agaacacaag 960
caacagagag agcgtttggg ttggttttga tgtgaatcgg tagagagccg tgtgttattt 1020
tggacaatag ttattgcagg actttccagt ctcatcgaaa ggccgttctc gcatggaaaa 1080
tgacaaggaa aatatttcgg ccttttacat gttctgtgat tatataagga acatggcact 1140
gcacgaacta aacagaataa tgccaatcac ttgaaaatta caaacttcac agaatttccc 1200
ttcattttgg tgcataactt tcttagtagc aaagaaattg acataaaatt gttcagcagg 1260
cttctggcac acaaaacaag ataaaacaga gtgttgttct cttgtaaacg aagatttatt 1320
tcaagaccat atcaaagtaa cagacatgag gatgccttca gcagcaaaac aactgcatct 1380
ttcgatccaa aaggcacggt ccgaagggcg aatt 1414
<210>99
<211>1165
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入SacI消化的并且T4 DNA聚合酶补平的pRJB058的片段的稻BPST.3序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(13)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(14)..(1150)
<223>插入pRJB058的补平的SacI位点的BPST.3序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1151)..(1165)
<223>RsrII/EcoRI MCS
<400>99
ggccctatga attggaatgt atttgaccat acaaaaaccg tacaaagtgt agggttctaa 60
ttagcaaatg taagtttgta attcttctgt ctaaatgtag tgtgttgagg tggtcagttg 120
ccgtgactgg ctctttcaga tggtaattac aaagaaatgt aacattaatg ttgtaacaag 180
ggtgccattt tgtttctgat tccagatgaa aaggaaaaac tattccatat tctgcaggat 240
taaacgtttc tgctgttcac aacaggtaaa gtcactccac ttcagggaaa gacagcaaaa 300
tcatttcttt tacacagact ttagataacc cttttttttg gggttcttgg tatatgccaa 360
cttttgtagc ctgcaccaga aacaaaaatg aagacttttg ctaaagatgt aaaagtggca 420
tgatgtcctg gatgaccaaa taattcatga caaatggatt aaaagagccc aatatctgaa 480
agagactggc cagcagccac taatgtcacc aaccacatat gtaacacttg gtgcataatt 540
caagagggag catctcctcc agaatcagga ttgaaaggta caacctcata gtaaatcctc 600
ggaatatagc atgtgcagca taagaatata tcagtgttgt gctgggtaag aaaccacatg 660
aaccaattag gaataaataa tcatgctgaa attatagcaa tgcttgcaat ttgcaaacga 720
taaagctaga cgcgggttgc tggaataaca atccatctcc aacaaaatag tacagaatat 780
aactgaatgg ccagctcaga ccctaacaga attgaaaagc tggattcatc agcactccat 840
tgagcaatct agatcaggaa agagcataga tgcataatga actgagatcc cttcaaaatg 900
actaactaat attttttttt cttataaaag agtttacaac agtacaacca cgaagatcag 960
cactaccatt actgattttg ttaacataga gtgatttatc atgtgtgcca gacaaacaac 1020
agatacattc atacatagca taacttacag cacatgatac agactacgga gaacggttaa 1080
tcttaaaata aaaacaaaaa aacaaggagg caaagcttat tttgcctggg attcatctaa 1140
atgcagttgt gtgcagaagg agacg 1165
<210>100
<211>1165
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>插入SacI消化的并且T4 DNA聚合酶补平的pRJB058的片段稻BPST.4序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(15)
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(15)
<223>EcoRI/SacI
<220>
<221>终止子
<222>(16)..(1152)
<223>插入pRJB058的SacI位点的BPST.4序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1153)..(1165)
<223>AvrII/EcoRI
<400>100
cgtctccttc tgcacacaac tgcatttaga tgaatcccag gcaaaataag ctttgcctcc 60
ttgttttttt gtttttattt taagattaac cgttctccgt agtctgtatc atgtgctgta 120
agttatgcta tgtatgaatg tatctgttgt ttgtctggca cacatgataa atcactctat 180
gttaacaaaa tcagtaatgg tagtgctgat cttcgtggtt gtactgttgt aaactctttt 240
ataagaaaaa aaaatattag ttagtcattt tgaagggatc tcagttcatt atgcatctat 300
gctctttcct gatctagatt gctcaatgga gtgctgatga atccagcttt tcaattctgt 360
tagggtctga gctggccatt cagttatatt ctgtactatt ttgttggaga tggattgtta 420
ttccagcaac ccgcgtctag ctttatcgtt tgcaaattgc aagcattgct ataatttcag 480
catgattatt tattcctaat tggttcatgt ggtttcttac ccagcacaac actgatatat 540
tcttatgctg cacatgctat attccgagga tttactatga ggttgtacct ttcaatcctg 600
attctggagg agatgctccc tcttgaatta tgcaccaagt gttacatatg tggttggtga 660
cattagtggc tgctggccag tctctttcag atattgggct cttttaatcc atttgtcatg 720
aattatttgg tcatccagga catcatgcca cttttacatc tttagcaaaa gtcttcattt 780
ttgtttctgg tgcaggctac aaaagttggc atataccaag aaccccaaaa aaaagggtta 840
tctaaagtct gtgtaaaaga aatgattttg ctgtctttcc ctgaagtgga gtgactttac 900
ctgttgtgaa cagcagaaac gtttaatcct gcagaatatg gaatagtttt tccttttcat 960
ctggaatcag aaacaaaatg gcacccttgt tacaacatta atgttacatt tctttgtaat 1020
taccatctga aagagccagt cacggcaact gaccacctca acacactaca tttagacaga 1080
agaattacaa acttacattt gctaattaga accctacact ttgtacggtt tttgtatggt 1140
caaatacatt ccaattcata gggcc 1165
<210>101
<211>1305
<212>DNA
<213>人工的
<22g0>
<223>来自稻的具有5’和3’-多个克隆位点接头的终止子序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(18)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(19)..(1292)
<223>BPST.5
<220>
<221>misc_feature
<222>(1294)..(1305)
<223>AvrII/EcoRI MCS
<400>101
aattcgccct tcgagctcga tgcattcctt ggattgttcc caatgtattc cagaaatcat 60
agttttgatg ccaaagttgg tcttcggtat ttgttacttg gagatggcaa atcgacttga 120
gcaatgttaa agttttgggc atttaaatta tagacctttg cttggcacgg ttagcttgtt 180
tcaaatccgt tgtttgttgt ggaatgtgtt tcacatatgt ggtaggtgaa gaatctcatt 240
atggttcgct gtttcattct cttgcgttta tcacccgctg tctgctaact tagggtgtgt 300
ttagtcctcg tcaaaattgg aagtttggtt gaaattggaa caatgtgacg aaaaagttga 360
aatttttttt gtgggtagga aagttttgat gtgatagaaa agttggaagt ttaaaaaaaa 420
agtttagaac taaactcggc cctagtcaat ttacccttac tattaggcat tatccccgct 480
gtctgctaac ctagtcaatt tacccttgta ttattactag gcattatcct tgcctccgtt 540
agtggtttgt tcttgagagc ggccaggtag gaaaattcca cttgaagagg agtgcgttac 600
gccggcctct tgccattatc atcgtttgta ttgatatgca gaaatagaaa gaaaaaccta 660
ggattttgat gaaaataaat cggatataga tatcataaaa cacattggaa cttgagatgg 720
agagaactct agatattttc catgagattg ttacctaatt cctactttcc tacaaaatct 780
tatgaaactg ccattcgaaa ggaatatcgt aggattctcg agtcccaatc cgttccagaa 840
aggtaaatcg gaacaatggt acgaaaaatc tgtccccatt ggatcataag acttggacgg 900
tctatcccat ggtactaagg gttttggaaa gaattttgca gaatttgaat ggatgtatcc 960
tatacacaag ttttctgtgt acacatcgta cacatcaact aacaattttt accaaaaatc 1020
taggaacaaa ttcacatgtt ctatcatgag ttatcacaca ttcacacgtt catatcttgg 1080
ttaaatctga acagcaggct gtaaataaac cacaaaagtc tccaaattat gggcctcaac 1140
agtaatcaat atcgtttcct cagacggcaa ttgccagttt gccacaacag ccatgttggc 1200
taacatttga tacattcgga gtactgcttg aatttgcagg ctctccctaa ccttattatc 1260
cctatagtct ttgactcttg atacctccaa accctaggaa gggcg 1305
<210>102
<211>1350
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自稻的具有5’和3’-多个克隆位点接头的终止子序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(18)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(19)..(1332)
<220>
<221>misc_feature
<222>(1333)..(1350)
<223>AvrII/EcoRI MCS
<400>102
gaattcgccc ttcgagctcc gtccgatgtg attccgtcct cttgattgtt ttccttcccc 60
ctaatttttg ttgcatacgc ggagagaagc tttagcttta agaggttaac tggcggcacc 120
tcaatttctt tgggcttcag catgggttaa gaccacctaa taatcctgtc gcattcttgc 180
tcttggaaaa gtttcttcca acattgcagt ccagtcagag aatggcctgt aataattagt 240
gacaaaatta tagcagtaga tagaatctgt tcattcaagt tcttcaaatt actgggccaa 300
gcttcaatgt cattttttgc ttaactcgtg ctcgtgctgt tatagtttac aactatcttc 360
tttacctgcc cataaccaat gtgaccatcg aatcaaacgt atgtggcggt gaatcccgtt 420
gcttgtgcgt tgctagattt ttgaggtcgc cttctgttcc aaattccaat catttgaatt 480
cgaagggatt acctgtcgac tgcgcatacg atcttttatt gagaatattt gctaggtgtg 540
ggagttcctg cgtgtgttcg tttagtggac gtgcgtatgt gagcatgtgc tatatgttgt 600
gcttcgtgaa aactcagctt cttttcatca agatcggcac ctctgcttat cacctaatcc 660
catcattcca atagcaacat aacatagatg tgacacatcc tatacatgat attgggatgg 720
agagagtatt cctaagatgc atctctaccc tttctcttcg aatgcacatt tattgggagt 780
catttttaat gtgcatttgt gcaaactggt accatggaac cctagtgcta ccctaacaga 840
tatgctccat cgtcactaca aactcttgtt tacatccaca aactactgct tggaagggca 900
cgctgacatt tgatcagaag aaagaatgac atgggtgcca aagttatgga tcagtgtggt 960
gaaattcgag aataaccgac aagatacttc tcaatcttgt cacaataaga gggttatttt 1020
tgtttagtac agtacaacta acgataccgc acaaaaaacg gtgaacgcga tatcgcacaa 1080
aaaaaagagc aacacgtttg aattatattc aggtttgcta ctgcaatcca acaccatctc 1140
ataactacat tatcctaatc gagccttttt aagtaatgag gccagtacaa ttaaaaaagg 1200
tgccgtagac aatagcaaac ccatgaagaa ctgaaaacaa atgaatgcaa aactaaaatt 1260
gtcttagttc tgtcgacaaa tgccaactgc tataatcgta catgcgtctc cgaagaaacc 1320
gccgacactg cccctaggaa gggcgaattc 1350
<210>103
<211>1532
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自稻的具有5’和3’-多个克隆位点接头的终止子序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(19)
<223>EcoRI/SacI MCS
<220>
<221>终止子
<222>(20)..(1518)
<220>
<221>misc_feature
<222>(1519)..(1532)
<223>EcoRI位点
<400>103
gaattcgccc ttcgagctcc agagtgatag acagtgctac ttgctagcct tttttatgag 60
cacccttttt ggccttttag ttcctcatta gctaagagat gtgatgagtg aggttttatt 120
ttttggcttt gtttggagtt ttgctttgga ggaagataga gaagccttta gaatgagttg 180
tgatggagga tcacatagtt tgtctcaggt ttacaatgtg cggtaaaaaa aaggaaggaa 240
ataaagtgat gttagaatat acagtttttt aatccatttc tacagcttca aattctcgat 300
tgagcggcac gttctttgaa atgttcatag caaagcaaat caaacgaaat ggatgagatt 360
tgaaactaag aaactgcact tgacaaagca cgctgcgctc tctgaaattc atgttcagca 420
gaacgccttt cagaaattca tgttctgctg ctgcaggaag gcagctaaga actccatgca 480
ataaaaatat aaaatgcagt gcagttatta gttagtgtag tagtaatcta agaaacaaca 540
ggtttaacag aatattacct tcaaaaacat cccctcaaat caagactcgg aaatcaacac 600
cattctgaaa ctagatgcaa tactgcgctc ctaatggaat cttcagtggt tactcctaca 660
cgccactaaa aaaaacgggc tttggaaaaa cgtcaccctg aaaacaagag ctcagtaaaa 720
ataccactct aaaatcttgc agcatgcatt atcacaaaag cagatcaatc cgtaattgta 780
tttatgctgc atataccgtg atattttctg tgatcctctg cactatcttc agctcatcag 840
ctgcatattt tgaagccgga ctgatggctc atcgctttgt ttcggcttat tgtgatagcc 900
atccatgcgt tgacgaaaga tttagatata tcacaatttt aaccaagttc agagcaatgt 960
tagctttagc tgatgatata cacggcgcac tgattgccgc cgttattttc agagccttgt 1020
aaaacctgaa acaaattgtg tctccaaatt cttactagta ctgcagacat agcggatttg 1080
ttttcaggat gaattatcac aaaggtaagt caattcatag ccatattacg caagttcaaa 1140
actgcaggcc acaccatacg tttctgaaag tagaaacaag agatcttgca gcagatcacc 1200
actaaagaag cagtaaccgc aaaaaattat aacataatcc agaattaaca cttcgcagca 1260
ttactgaatt cactttaata gcacttctca tcatgaacta gtacaacaac ataactgtcc 1320
agtggaaatg tgaaatgcat acaccaagta atggtccata acatgaacta tatggataca 1380
acaacgttct tatttcgctc atatatacat gaaataagtc ttgcacgtct tggttactta 1440
ataggtgcga taatcgccgt aggcttttag aagaagaaaa aaaagtgagc ctgcaaagtt 1500
cctggggaca gttgaagacc aagggcgaat tc 1532
<210>104
<211>1532
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自稻的具有5’和3’-多个克隆位点接头的终止子序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(15)
<223>EcoRI位点
<220>
<221>终止子
<222>(16)..(1514)
<220>
<221>misc_feature
<222>(1515)..(1532)
<223>EcoRI/SacI MCS
<400>104
cgaattcgcc cttggtcttc aactgtcccc aggaactttg caggctcact tttttttctt 60
cttctaaaag cctacggcga ttatcgcacc tattaagtaa ccaagacgtg caagacttat 120
ttcatgtata tatgagcgaa ataagaacgt tgttgtatcc atatagttca tgttatggac 180
cattacttgg tgtatgcatt tcacatttcc actggacagt tatgttgttg tactagttca 240
tgatgagaag tgctattaaa gtgaattcag taatgctgcg aagtgttaat tctggattat 300
gttataattt tttgcggtta ctgcttcttt agtggtgatc tgctgcaaga tctcttgttt 360
ctactttcag aaacgtatgg tgtggcctgc agttttgaac ttgcgtaata tggctatgaa 420
ttgacttacc tttgtgataa ttcatcctga aaacaaatcc gctatgtctg cagtactagt 480
aagaatttgg agacacaatt tgtttcaggt tttacaaggc tctgaaaata acggcggcaa 540
tcagtgcgcc gtgtatatca tcagctaaag ctaacattgc tctgaacttg gttaaaattg 600
tgatatatct aaatctttcg tcaacgcatg gatggctatc acaataagcc gaaacaaagc 660
gatgagccat cagtccggct tcaaaatatg cagctgatga gctgaagata gtgcagagga 720
tcacagaaaa tatcacggta tatgcagcat aaatacaatt acggattgat ctgcttttgt 780
gataatgcat gctgcaagat tttagagtgg tatttttact gagctcttgt tttcagggtg 840
acgtttttcc aaagcccgtt ttttttagtg gcgtgtagga gtaaccactg aagattccat 900
taggagcgca gtattgcatc tagtttcaga atggtgttga tttccgagtc ttgatttgag 960
gggatgtttt tgaaggtaat attctgttaa acctgttgtt tcttagatta ctactacact 1020
aactaataac tgcactgcat tttatatttt tattgcatgg agttcttagc tgccttcctg 1080
cagcagcaga acatgaattt ctgaaaggcg ttctgctgaa catgaatttc agagagcgca 1140
gcgtgctttg tcaagtgcag tttcttagtt tcaaatctca tccatttcgt ttgatttgct 1200
ttgctatgaa catttcaaag aacgtgccgc tcaatcgaga atttgaagct gtagaaatgg 1260
attaaaaaac tgtatattct aacatcactt tatttccttc ctttttttta ccgcacattg 1320
taaacctgag acaaactatg tgatcctcca tcacaactca ttctaaaggc ttctctatct 1380
tcctccaaag caaaactcca aacaaagcca aaaaataaaa cctcactcat cacatctctt 1440
agctaatgag gaactaaaag gccaaaaagg gtgctcataa aaaaggctag caagtagcac 1500
tgtctatcac tctggagctc gaagggcgaa tt 1532
<210>105
<211>16914
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自pRJB058的双元载体
<220>
<221>misc_feature
<222>(47)..(71)
<223>LB的互补序列
<220>
<221>启动子
<222>(187)..(986)
<223>ZmAHAS
<220>
<221>misc_feature
<222>(987)..(2903)
<223>编码ZmAHAS的cds
<220>
<221>终止子
<222>(2902)..(4112)
<223>ZmAHAS的互补序列
<220>
<221>启动子
<222>(4177)..(6164)
<223>ZmUbi
<220>
<221>内含子
<222>(5159)..(6164)
<223>ZmUbi
<220>
<221>misc_feature
<222>(6209)..(6886)
<223>编码DsRed2的cds
<220>
<221>终止子
<222>(6918)..(7170)
<223>NOS
<220>
<221>misc_feature
<222>(7614)..(7877)
<223>GFP片段的互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(7879)..(7901)
<223>TOI克隆位点的互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(7957)..(9957)
<223>互补序列:编码GUS的cds
<220>
<221>内含子
<222>(9384)..(9572)
<223>PIV2的互补序列
<220>
<221>内含子
<222>(9990)..(10995)
<223>ZmUbi的互补序列
<220>
<221>启动子
<222>(9990)..(11977)
<223>ZmUbi的互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(12147)..(12170)
<223>RB的互补序列
<400>105
gtgattttgt gccgagctgc cggtcgggga gctgttggct ggctggtggc aggatatatt 60
gtggtgtaaa caaattgacg cttagacaac ttaataacac attgcggacg tttttaatgt 120
actgaattgg atccgcccgg gcggtacccg gggatcctct agaactagtg gatcccccgg 180
gctgcaggtc aacggatcac ctatcaacat cccagctaaa aacagtaaaa agggggaaaa 240
cgtgggtgag ttgagtctgt cttgtggaaa aaacgtttta gtttctcctg gaattaacaa 300
taaaaacagt tgaacaagat tgactgttcc tccgggaggg tttggaacat cgttacagat 360
gtgagcgaaa ggtgaggaaa cagagcggag ggcttggagg tgacctcggt agtcgacgcc 420
ggagttgagc ttgatgacga caccgtactg gcgtaccagg cctagtagtg aacaccgggc 480
ctgaagctgt cgccgccgct gctcatcttg tgggctgtgc ccggtgtccc tgttgcggat 540
tgcgggtggc agcctggcag gtgggtgcga cccgtttgga ctccctgatc tgggcccttt 600
gtgtcagtac cgtctgtact ccgatgacat gcacaccgtc gtccacagtc aagtccacaa 660
tctcccctct ttttttaacg gaatagttca aaatctcctt gacgcacgct atcgtgtacc 720
agcgctcact ggacaccacg tttgtaatcc acgccgacac gtcggtccca cgtcgacagg 780
ccccaccgtc cggtctgtag cgtgtacgta ttcgggcgac ggacgtgtcg tcgtcgtctt 840
gcgagtccca ttcccatcac catctgagcc acacatcctc tgaacaaaag cagggaggcc 900
tctacgcaca tccccctttc tcccactccg tgtccgtggc acccacccca aaccctcgcg 960
ccgcctccga gacagccgcc gcaaccatgg ccaccgccgc cgccgcgtct accgcgctca 1020
ctggcgccac taccgctgcg cccaaggcga ggcgccgggc gcacctcctg gccacccgcc 1080
gcgccctcgc cgcgcccatc aggtgctcag cggcgtcacc cgccatgccg atggctcccc 1140
cggccacccc gctccggccg tggggcccca ccgatccccg caagggcgcc gacatcctcg 1200
tcgagtccct cgagcgctgc ggcgtccgcg acgtcttcgc ctaccccggc ggcgcgtcca 1260
tggagatcca ccaggcactc acccgctccc ccgtcatcgc caaccacctc ttccgccacg 1320
agcaagggga ggcctttgcg gcctccggct acgcgcgctc ctcgggccgc gtcggcgtct 1380
gcatcgccac ctccggcccc ggcgccacca accttgtctc cgcgctcgcc gacgcgctgc 1440
tcgattccgt ccccatggtc gccatcacgg gacaggtgcc gcgacgcatg attggcaccg 1500
acgccttcca ggagacgccc atcgtcgagg tcacccgctc catcaccaag cacaactacc 1560
tggtcctcga cgtcgacgac atcccccgcg tcgtgcagga ggctttcttc ctcgcctcct 1620
ctggtcgacc ggggccggtg cttgtcgaca tccccaagga catccagcag cagatggcgg 1680
tgcctgtctg ggacaagccc atgagtctgc ctgggtacat tgcgcgcctt cccaagcccc 1740
ctgcgactga gttgcttgag caggtgctgc gtcttgttgg tgaatcccgg cgccctgttc 1800
tttatgttgg cggtggctgc gcagcatctg gtgaggagtt gcgacgcttt gtggagctga 1860
ctggaatccc ggtcacaact actcttatgg gcctcggcaa cttccccagc gacgacccac 1920
tgtctctgcg catgctaggt atgcatggca cggtgtatgc aaattatgca gtggataagg 1980
ccgatctgtt gcttgcactt ggtgtgcggt ttgatgatcg tgtgacaggg aagattgagg 2040
cttttgcaag cagggctaag attgtgcacg ttgatattga tccggctgag attggcaaga 2100
acaagcagcc acatgtgtcc atctgtgcag atgttaagct tgctttgcag ggcatgaatg 2160
ctcttcttga aggaagcaca tcaaagaaga gctttgactt tggctcatgg aacgatgagt 2220
tggatcagca gaagagggaa ttcccccttg ggtataaaac atctaatgag gagatccagc 2280
cacaatatgc tattcaggtt cttgatgagc tgacgaaagg cgaggccatc atcggcacag 2340
gtgttgggca gcaccagatg tgggcggcac agtactacac ttacaagcgg ccaaggcagt 2400
ggttgtcttc agctggtctt ggggctatgg gatttggttt gccggctgct gctggtgctt 2460
ctgtggccaa cccaggtgtt actgttgttg acatcgatgg agatggtagc tttctcatga 2520
acgttcagga gctagctatg atccgaattg agaacctccc ggtgaaggtc tttgtgctaa 2580
acaaccagca cctggggatg gtggtgcagt gggaggacag gttctataag gccaacagag 2640
cgcacacata cttgggaaac ccagagaatg aaagtgagat atatccagat ttcgtgacga 2700
tcgccaaagg gttcaacatt ccagcggtcc gtgtgacaaa gaagaacgaa gtccgcgcag 2760
cgataaagaa gatgctcgag actccagggc cgtacctctt ggatataatc gtcccacacc 2820
aggagcatgt gttgcctatg atccctaatg gtggggcttt caaggatatg atcctggatg 2880
gtgatggcag gactgtgtac tgatctaaaa tccagcaagc aactgatcta aaatccagca 2940
agcaccgcct ccctgctagt acaagggtga tatgttttta tctgtgtgat gttctcctgt 3000
attctatctt tttttgtagg ccgtcagcta tctgttatgg taatcctatg tagcttccga 3060
ccttgtaatt gtgtagtctg ttgttttcct tctggcatgt gtcataagag atcatttaag 3120
tgccttttgc tacatataaa taagataata agcactgcta tgcagtggtt ctgaattggc 3180
ttctgttgcc aaatttaagt gtccaactgg tccttgcttt tgttttcgct atttttttcc 3240
ttttttagtt attattatat tggtaatttc aactcaacat atgatgtatg gaataatgct 3300
agggctgcaa tttcaaacta ttttacaaac cagaatggca ttttcgtggt ttgaggggag 3360
tgaaaaaaaa tgaggcattt gactgaatta gttacctgat ccattttcgt ggtttggatc 3420
attggaatta aattccattc taataatagt aattttggca tatatcaatt aagttaattc 3480
ggttttatgc aaaatatatt tgtatactat tattatcaag atgtcggaga tatttatatg 3540
ctacattttt actatacagg agtgagatga agagtgtcat gtaagttaca cagtagaaac 3600
aaattctatt aatgcataaa atcatttcca tcatccaccc tatgaatttg agatagacct 3660
atatctaaac tttgaaaagt ggttgaatat caaattccaa attaaataag ttattttatt 3720
gagtgaattc taatttctct aaaacgaagg gatctaaacg ccctctaaag ctaatttgga 3780
aactcaaact ttcttagcat tggaggggat tgagaaaaaa tattaattca ttttcatctc 3840
aatcattcaa tctccaaaga gatttgagtt ccttattagt ctgttccatg catcaaatcg 3900
gctcaatgtg tcattatttg ccatgacgat tgacgagttg ttctggggcc tagcgctttc 3960
cacgccgatg tgctggggcc tggtcctgga gaagacagct tgatatttaa agctatcaat 4020
tgtttcaatt gattcccact tcatttttct aaatgtagaa aacggtgacg tataagaaaa 4080
agaatgaatt aggactttta ttccgtacac taatctagag cggccgcaag cttgtacaac 4140
gcgtaccggt taattaaggt accaagcttc cgcggctgca gtgcagcgtg acccggtcgt 4200
gcccctctct agagataatg agcattgcat gtctaagtta taaaaaatta ccacatattt 4260
tttttgtcac acttgtttga agtgcagttt atctatcttt atacatatat ttaaacttta 4320
ctctacgaat aatataatct atagtactac aataatatca gtgttttaga gaatcatata 4380
aatgaacagt tagacatggt ctaaaggaca attgagtatt ttgacaacag gactctacag 4440
ttttatcttt ttagtgtgca tgtgttctcc tttttttttg caaatagctt cacctatata 4500
atacttcatc cattttatta gtacatccat ttagggttta gggttaatgg tttttataga 4560
ctaatttttt tagtacatct attttattct attttagcct ctaaattaag aaaactaaaa 4620
ctctatttta gtttttttat ttaatagttt agatataaaa tagaataaaa taaagtgact 4680
aaaaattaaa caaataccct ttaagaaatt aaaaaaacta aggaaacatt tttcttgttt 4740
cgagtagata atgccagcct gttaaacgcc gtcgacgagt ctaacggaca ccaaccagcg 4800
aaccagcagc gtcgcgtcgg gccaagcgaa gcagacggca cggcatctct gtcgctgcct 4860
ctggacccct ctcgagagtt ccgctccacc gttggacttg ctccgctgtc ggcatccaga 4920
aattgcgtgg cggagcggca gacgtgagcc ggcacggcag gcggcctcct cctcctctca 4980
cggcaccggc agctacgggg gattcctttc ccaccgctcc ttcgctttcc cttcctcgcc 5040
cgccgtaata aatagacacc ccctccacac cctctttccc caacctcgtg ttgttcggag 5100
cgcacacaca cacaaccaga tctcccccaa atccacccgt cggcacctcc gcttcaaggt 5160
acgccgctcg tcctcccccc ccccccccct ctctaccttc tctagatcgg cgttccggtc 5220
catggttagg gcccggtagt tctacttctg ttcatgtttg tgttagatcc gtgtttgtgt 5280
tagatccgtg ctgctagcgt tcgtacacgg atgcgacctg tacgtcagac acgttctgat 5340
tgctaacttg ccagtgtttc tctttgggga atcctgggat ggctctagcc gttccgcaga 5400
cgggatcgat ttcatgattt tttttgtttc gttgcatagg gtttggtttg cccttttcct 5460
ttatttcaat atatgccgtg cacttgtttg tcgggtcatc ttttcatgct tttttttgtc 5520
ttggttgtga tgatgtggtc tggttgggcg gtcgttctag atcggagtag aattctgttt 5580
caaactacct ggtggattta ttaattttgg atctgtatgt gtgtgccata catattcata 5640
gttacgaatt gaagatgatg gatggaaata tcgatctagg ataggtatac atgttgatgc 5700
gggttttact gatgcatata cagagatgct ttttgttcgc ttggttgtga tgatgtggtg 5760
tggttgggcg gtcgttcatt cgttctagat cggagtagaa tactgtttca aactacctgg 5820
tgtatttatt aattttggaa ctgtatgtgt gtgtcataca tcttcatagt tacgagttta 5880
agatggatgg aaatatcgat ctaggatagg tatacatgtt gatgtgggtt ttactgatgc 5940
atatacatga tggcatatgc agcatctatt catatgctct aaccttgagt acctatctat 6000
tataataaac aagtatgttt tataattatt tcgatcttga tatacttgga tgatggcata 6060
tgcagcagct atatgtggat ttttttagcc ctgccttcat acgctattta tttgcttggt 6120
actgtttctt ttgtcgatgc tcaccctgtt gtttggtgtt acttctgcag ggtacggatc 6180
cggcgcgcca ctagtcccgg tcgccaccat ggcctcctcc gagaacgtca tcaccgagtt 6240
catgcgcttc aaggtgcgca tggagggcac cgtgaacggc cacgagttcg agatcgaggg 6300
cgagggcgag ggccgcccct acgagggcca caacaccgtg aagctgaagg tgaccaaggg 6360
cggccccctg cccttcgcct gggacatcct gtccccccag ttccagtacg gctccaaggt 6420
gtacgtgaag caccccgccg acatccccga ctacaagaag ctgtccttcc ccgagggctt 6480
caagtgggag cgcgtgatga acttcgagga cggcggcgtg gcgaccgtga cccaggactc 6540
ctccctgcag gacggctgct tcatctacaa ggtgaagttc atcggcgtga acttcccctc 6600
cgacggcccc gtgatgcaga agaagaccat gggctgggag gcctccaccg agcgcctgta 6660
cccccgcgac ggcgtgctga agggcgagac ccacaaggcc ctgaagctga aggacggcgg 6720
ccactacctg gtggagttca agtccatcta catggccaag aagcccgtgc agctgcccgg 6780
ctactactac gtggacgcca agctggacat cacctcccac aacgaggact acaccatcgt 6840
ggagcagtac gagcgcaccg agggccgcca ccacctgttc ctgtagcggc cgccctgcag 6900
ggagctcgaa tttccccgat cgttcaaaca tttggcaata aagtttctta agattgaatc 6960
ctgttgccgg tcttgcgatg attatcatat aatttctgtt gaattacgtt aagcatgtaa 7020
taattaacat gtaatgcatg acgttattta tgagatgggt ttttatgatt agagtcccgc 7080
aattatacat ttaatacgcg atagaaaaca aaatatagcg cgcaaactag gataaattat 7140
cgcgcgcggt gtcatctatg ttactagatc gggaattcgg gcccggccgg ccagatcttg 7200
attgtcgttt cccgccttca gtttctggca cgacaggttt cccgactgga aagcgggcag 7260
tgagcgcaac gcaattaata cgcgtaccgc tagccaggaa gagtttgtag aaacgcaaaa 7320
aggccatccg tcaggatggc cttctgctta gtttgatgcc tggcagttta tggcgggcgt 7380
cctgcccgcc accctccggg ccgttgcttc acaacgttca aatccgctcc cggcggattt 7440
gtcctactca ggagagcgtt caccgacaaa caacagataa aacgaaaggc ccagtcttcc 7500
gactgagcct ttcgttttat ttgatgcctg gcagttccct actctcgcgt taacgctagc 7560
atggatgttt tcccagtcac gacgttgtaa aacgacggcc agtcttaact agtgatgtag 7620
ccctcaggca tggcgctctt gaagaagtcg tgctgcttca tgtgatcggg gtagcgtgag 7680
aagcactgca cgccgtagct cagggtggtc accagggtgg gccagggcac aggcagcttg 7740
ccggtggtgc agatgaactt cagggtcagc ttgccgtagg tggcatcgcc ctcgccctcg 7800
ccgctcacgc tgaacttgtg gccattcaca tcgccattca gctcgatcag gatgggcacg 7860
atgccggtga acagctcggt ccgggcgccc cctagggagc tcggtagcaa ttcccgaggc 7920
tgtagccgac gatggtgcgc caggagagtt gttgattcat tgtttgcctc cctgctgcgg 7980
tttttcaccg aagttcatgc cagtccagcg tttttgcagc agaaaagccg ccgacttcgg 8040
tttgcggtcg cgagtgaaga tccctttctt gttaccgcca acgcgcaata tgccttgcga 8100
ggtcgcaaaa tcggcgaaat tccatacctg ttcaccgacg acggcgctga cgcgatcaaa 8160
gacgcggtga tacatatcca gccatgcaca ctgatactct tcactccaca tgtcggtgta 8220
cattgagtgc agcccggcta acgtatccac gccgtattcg gtgatgataa tcggctgatg 8280
cagtttctcc tgccaggcca gaagttcttt ttccagtacc ttctctgccg tttccaaatc 8340
gccgctttgg acataccatc cgtaataacg gttcaggcac agcacatcaa agagatcgct 8400
gatggtatcg gtgtgagcgt cgcagaacat tacattgacg caggtgatcg gacgcgtcgg 8460
gtcgagttta cgcgttgctt ccgccagtgg cgcgaaatat tcccgtgcac cttgcggacg 8520
ggtatccggt tcgttggcaa tactccacat caccacgctt gggtggtttt tgtcacgcgc 8580
tatcagctct ttaatcgcct gtaagtgcgc ttgctgagtt tccccgttga ctgcctcttc 8640
gctgtacagt tctttcggct tgttgcccgc ttcgaaacca atgcctaaag agaggttaaa 8700
gccgacagca gcagtttcat caatcaccac gatgccatgt tcatctgccc agtcgagcat 8760
ctcttcagcg taagggtaat gcgaggtacg gtaggagttg gccccaatcc agtccattaa 8820
tgcgtggtcg tgcaccatca gcacgttatc gaatcctttg ccacgcaagt ccgcatcttc 8880
atgacgacca aagccagtaa agtagaacgg tttgtggtta atcaggaact gttcgccctt 8940
cactgccact gaccggatgc cgacgcgaag cgggtagata tcacactctg tctggctttt 9000
ggctgtgacg cacagttcat agagataacc ttcacccggt tgccagaggt gcggattcac 9060
cacttgcaaa gtcccgctag tgccttgtcc agttgcaacc acctgttgat ccgcatcacg 9120
cagttcaacg ctgacatcac cattggccac cacctgccag tcaacagacg cgtggttaca 9180
gtcttgcgcg acatgcgtca ccacggtgat atcgtccacc caggtgttcg gcgtggtgta 9240
gagcattacg ctgcgatgga ttccggcata gttaaagaaa tcatggaagt aagactgctt 9300
tttcttgccg ttttcgtcgg taatcaccat tcccggcggg atagtctgcc agttcagttc 9360
gttgttcaca caaacggtga tacctgcaca tcaacaaatt ttggtcatat attagaaaag 9420
ttataaatta aaatatacac acttataaac tacagaaaag caattgctat atactacatt 9480
cttttatttt gaaaaaaata tttgaaatat tatattacta ctaattaatg ataattatta 9540
tatatatatc aaaggtagaa gcagaaactt acgtacactt ttcccggcaa taacatacgg 9600
cgtgacatcg gcttcaaatg gcgtatagcc gccctgatgc tccatcactt cctgattatt 9660
gacccacact ttgccgtaat gagtgaccgc atcgaaacgc agcacgatac gctggcctgc 9720
ccaacctttc ggtataaaga cttcgcgctg ataccagacg ttgcccgcat aattacgaat 9780
atctgcatcg gcgaactgat cgttaaaact gcctggcaca gcaattgccc ggctttcttg 9840
taacgcgctt tcccaccaac gctgaccaat tccacagttt tcgcgatcca gactgaatgc 9900
ccacaggccg tcgagttttt tgatttcacg ggttggggtt tctacaggac gtaacataag 9960
ggactgacct acccgggggt accctgcaga agtaacacca aacaacaggg tgagcatcga 10020
caaaagaaac agtaccaagc aaataaatag cgtatgaagg cagggctaaa aaaatccaca 10080
tatagctgct gcatatgcca tcatccaagt atatcaagat cgaaataatt ataaaacata 10140
cttgtttatt ataatagata ggtactcaag gttagagcat atgaatagat gctgcatatg 10200
ccatcatgta tatgcatcag taaaacccac atcaacatgt atacctatcc tagatcgata 10260
tttccatcca tcttaaactc gtaactatga agatgtatga cacacacata cagttccaaa 10320
attaataaat acaccaggta gtttgaaaca gtattctact ccgatctaga acgaatgaac 10380
gaccgcccaa ccacaccaca tcatcacaac caagcgaaca aaaagcatct ctgtatatgc 10440
atcagtaaaa cccgcatcaa catgtatacc tatcctagat cgatatttcc atccatcatc 10500
ttcaattcgt aactatgaat atgtatggca cacacataca gatccaaaat taataaatcc 10560
accaggtagt ttgaaacaga attctactcc gatctagaac gaccgcccaa ccagaccaca 10620
tcatcacaac caagacaaaa aaaagcatga aaagatgacc cgacaaacaa gtgcacggca 10680
tatattgaaa taaaggaaaa gggcaaacca aaccctatgc aacgaaacaa aaaaaatcat 10740
gaaatcgatc ccgtctgcgg aacggctaga gccatcccag gattccccaa agagaaacac 10800
tggcaagtta gcaatcagaa cgtgtctgac gtacaggtcg catccgtgta cgaacgctag 10860
cagcacggat ctaacacaaa cacggatcta acacaaacat gaacagaagt agaactaccg 10920
ggccctaacc atggaccgga acgccgatct agagaaggta gagagggggg ggggggggga 10980
ggacgagcgg cgtaccttga agcggaggtg ccgacgggtg gatttggggg agatctggtt 11040
gtgtgtgtgt gcgctccgaa caacacgagg ttggggaaag agggtgtgga gggggtgtct 11100
atttattacg gcgggcgagg aagggaaagc gaaggagcgg tgggaaagga atcccccgta 11160
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ccgccacgca atttctggat gccgacagcg gagcaagtcc aacggtggag cggaactctc 11280
gagaggggtc cagaggcagc gacagagatg ccgtgccgtc tgcttcgctt ggcccgacgc 11340
gacgctgctg gttcgctggt tggtgtccgt tagactcgtc gacggcgttt aacaggctgg 11400
cattatctac tcgaaacaag aaaaatgttt ccttagtttt tttaatttct taaagggtat 11460
ttgtttaatt tttagtcact ttattttatt ctattttata tctaaactat taaataaaaa 11520
aactaaaata gagttttagt tttcttaatt tagaggctaa aatagaataa aatagatgta 11580
ctaaaaaaat tagtctataa aaaccattaa ccctaaaccc taaatggatg tactaataaa 11640
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taaaaagata aaactgtaga gtcctgttgt caaaatactc aattgtcctt tagaccatgt 11760
ctaactgttc atttatatga ttctctaaaa cactgatatt attgtagtac tatagattat 11820
attattcgta gagtaaagtt taaatatatg tataaagata gataaactgc acttcaaaca 11880
agtgtgacaa aaaaaatatg tggtaatttt ttataactta gacatgcaat gctcattatc 11940
tctagagagg ggcacgaccg ggtcacgctg cactgcagcc gcggaagctt gcatgcctgc 12000
aggcatgcaa gcttggcgcg ccgacccagc tttcttgtac aaagttggca ttataagaaa 12060
gcattgctta tcaatttgtt gcaacgaaca ggtcactatc agtcaaaata aaatcattat 12120
ttgccatcca gaaactatca gtgtttgaca ggatatattg gcgggtaaac ctaagagaaa 12180
agagcgttta ttagaataat cggatattta aaagggcgtg aaaaggttta tccgttcgtc 12240
catttgtatg tgcatgccaa ccacagggtt cccctcggga gtgcttggca ttccgtgcga 12300
taatgacttc tgttcaacca cccaaacgtc ggaaagcctg acgacggagc agcattccaa 12360
aaagatccct tggctcgtct gggtcggcta gaaggtcgag tgggctgctg tggcttgatc 12420
cctcaacgcg gtcgcggacg tagcgcagcg ccgaaaaatc ctcgatcgca aatccgacgc 12480
tgtcgaaaag cgtgatctgc ttgtcgctct ttcggccgac gtcctggcca gtcatcacgc 12540
gccaaagttc cgtcacagga tgatctggcg cgagttgctg gatctcgcct tcaatccggg 12600
tctgtggcgg gaactccacg aaaatatccg aacgcagcaa gatcgtcgac caattcttga 12660
agacgaaagg gcctcgtgat acgcctattt ttataggtta atgtcatgat aataatggtt 12720
tcttagacgt caggtggcac ttttcgggga aatgtgcgcg gaacccctat ttgtttattt 12780
ttctaaatac attcaaatat gtatccgctc atgagacaat aaccctgata aatgcttcaa 12840
taatattgaa aaaggaagag tatgagtatt caacatttcc gtgtcgccct tattcccttt 12900
tttgcggcat tttgccttcc tgtttttgct cacccagaaa cgctggtgaa agtaaaagat 12960
gctgaagatc agttgggtgc acgagtgggt tacatcgaac tggatctcaa cagcggtaag 13020
atccttgaga gttttcgccc cgaagaacgt tttccaatga tgagcacttt taaagttctg 13080
ctatgtggcg cggtattatc ccgtgttgac gccgggcaag agcaactcgg tcgccgcata 13140
cactattctc agaatgactt ggttgagtac tcaccagtca cagaaaagca tcttacggat 13200
ggcatgacag taagagaatt atgcagtgct gccataacca tgagtgataa cactgcggcc 13260
aacttacttc tgacaacgat cggaggaccg aaggagctaa ccgctttttt gcacaacatg 13320
ggggatcatg taactcgcct tgatcgttgg gaaccggagc tgaatgaagc cataccaaac 13380
gacgagcgtg acaccacgat gccggggggg gggggggggg acatgaggtt gccccgtatt 13440
cagtgtcgct gatttgtatt gtctgaagtt gtttttacgt taagttgatg cagatcaatt 13500
aatacgatac ctgcgtcata attgattatt tgacgtggtt tgatggcctc cacgcacgtt 13560
gtgatatgta gatgataatc attatcactt tacgggtcct ttccggtgat ccgacaggtt 13620
acggggcggc gacctcgcgg gttttcgcta tttatgaaaa ttttccggtt taaggcgttt 13680
ccgttcttct tcgtcataac ttaatgtttt tatttaaaat accctctgaa aagaaaggaa 13740
acgacaggtg ctgaaagcga gctttttggc ctctgtcgtt tcctttctct gtttttgtcc 13800
gtggaatgaa caatggaacc cccccccccc ccccctgcag caatggcaac aacgttgcgc 13860
aaactattaa ctggcgaact acttactcta gcttcccggc aacaattaat agactggatg 13920
gaggcggata aagttgcagg accacttctg cgctcggccc ttccggctgg ctggtttatt 13980
gctgataaat ctggagccgg tgagcgtggg tctcgcggta tcattgcagc actggggcca 14040
gatggtaagc cctcccgtat cgtagttatc tacacgacgg ggagtcaggc aactatggat 14100
gaacgaaata gacagatcgc tgagataggt gcctcactga ttaagcattg gtaactgtca 14160
gaccaagttt actcatatat actttagatt gatttaaaac ttcattttta atttaaaagg 14220
atctaggtga agatcctttt tgataatctc atgaccaaaa tcccttaacg tgagttttcg 14280
ttccactgag cgtcagaccc cgtagaaaag atcaaaggat cttcttgaga tccttttttt 14340
ctgcgcgtaa tctgctgctt gcaaacaaaa aaaccaccgc taccagcggt ggtttgtttg 14400
ccggatcaag agctaccaac tctttttccg aaggtaactg gcttcagcag agcgcagata 14460
ccaaatactg tccttctagt gtagccgtag ttaggccacc acttcaagaa ctctgtagca 14520
ccgcctacat acctcgctct gctaatcctg ttaccagtgg ctgctgccag tggcgataag 14580
tcgtgtctta ccgggttgga ctcaagacga tagttaccgg ataaggcgca gcggtcgggc 14640
tgaacggggg gttcgtgcac acagcccagc ttggagcgaa cgacctacac cgaactgaga 14700
tacctacagc gtgagctatg agaaagcgcc acgcttcccg aagggagaaa ggcggacagg 14760
tatccggtaa gcggcagggt cggaacagga gagcgcacga gggagcttcc agggggaaac 14820
gcctggtatc tttatagtcc tgtcgggttt cgccacctct gacttgagcg tcgatttttg 14880
tgatgctcgt caggggggcg gagcctatgg aaaaacgcca gcaacgcggc ctttttacgg 14940
ttcctggcct tttgctggcc ttttgctcac atgttctttc ctgcgttatc ccctgattct 15000
gtggataacc gtattaccgc ctttgagtga gctgataccg ctcgccgcag ccgaacgacc 15060
gagcgcagcg agtcagtgag cgaggaagcg gaagagcgcc tgatgcggta ttttctcctt 15120
acgcatctgt gcggtatttc acaccgcata tggtgcactc tcagtacaat ctgctctgat 15180
gccgcatagt taagccagta tacactccgc tatcgctacg tgactgggtc atggctgcgc 15240
cccgacaccc gccaacaccc gctgacgcgc cctgacgggc ttgtctgctc ccggcatccg 15300
cttacagaca agctgtgacc gtctccggga gctgcatgtg tcagaggttt tcaccgtcat 15360
caccgaaacg cgcgaggcag cagatccccc gatcaagtag atacactaca tatatctaca 15420
atagacatcg agccggaagg tgatgtttac tttcctgaaa tccccagcaa ttttaggcca 15480
gtttttaccc aagacttcgc ctctaacata aattatagtt accaaatctg gcaaaagggt 15540
tgaccggggg gggggggaaa gccacgttgt gtctcaaaat ctctgatgtt acattgcaca 15600
agataaaaat atatcatcat gaacaataaa actgtctgct tacataaaca gtaatacaag 15660
gggtgttatg agccatattc aacgggaaac gtcttgctcg aggccgcgat taaattccaa 15720
catggatgct gatttatatg ggtataaatg ggctcgcgat aatgtcgggc aatcaggtgc 15780
gacaatctat cgattgtatg ggaagcccga tgcgccagag ttgtttctga aacatggcaa 15840
aggtagcgtt gccaatgatg ttacagatga gatggtcaga ctaaactggc tgacggaatt 15900
tatgcctctt ccgaccatca agcattttat ccgtactcct gatgatgcat ggttactcac 15960
cactgcgatc cccgggaaaa cagcattcca ggtattagaa gaatatcctg attcaggtga 16020
aaatattgtt gatgcgctgg cagtgttcct gcgccggttg cattcgattc ctgtttgtaa 16080
ttgtcctttt aacagcgatc gcgtatttcg tctcgctcag gcgcaatcac gaatgaataa 16140
cggtttggtt gatgcgagtg attttgatga cgagcgtaat ggctggcctg ttgaacaagt 16200
ctggaaagaa atgcataagc ttttgccatt ctcaccggat tcagtcgtca ctcatggtga 16260
tttctcactt gataacctta tttttgacga ggggaaatta ataggttgta ttgatgttgg 16320
acgagtcgga atcgcagacc gataccagga tcttgccatc ctatggaact gcctcggtga 16380
gttttctcct tcattacaga aacggctttt tcaaaaatat ggtattgata atcctgatat 16440
gaataaattg cagtttcatt tgatgctcga tgagtttttc taatcagaat tggttaattg 16500
gttgtaacac tggcagagca ttacgctgac ttgacgggac ggcggctttg ttgaataaat 16560
cgaacttttg ctgagttgaa ggatcagatc acgcatcttc ccgacaacgc agaccgttcc 16620
gtggcaaagc aaaagttcaa aatcaccaac tggtccacct acaacaaagc tctcatcaac 16680
cgtggctccc tcactttctg gctggatgat ggggcgattc agggatcaca ggcagcaacg 16740
ctctgtcatc gttacaatca acatgctacc ctccgcgaga tcatccgtgt ttcaaacccg 16800
gcagcttagt tgccgttctt ccgaatagca tcggtaacat gagcaaagtc tgccgcctta 16860
caacggctct cccgctgacg ccgtcccgga ctgatgggct gcctgtatcg agtg 16914
<210>106
<211>15919
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自pRLI024的双元载体
<220>
<221>misc_feature
<222>(47)..(71)
<223>LB的互补序列
<220>
<221>启动子
<222>(187)..(986)
<223>ZmAHAS
<220>
<221>misc_feature
<222>(987)..(2903)
<223>编码ZmAHAS的cds
<220>
<221>终止子
<222>(2902)..(4112)
<223>ZmAHAS
<220>
<221>启动子
<222>(4177)..(6164)
<223>ZmUbi
<220>
<221>内含子
<222>(5159)..(6164)
<223>ZmUbi
<220>
<221>misc_feature
<222>(6209)..(6886)
<223>编码DsRed2的cds
<220>
<221>misc_feature
<222>(6902)..(6907)
<223>TOI克隆位点的互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(6962)..(8962)
<223>互补序列:编码GUS的cds
<220>
<221>内含子
<222>(8389)..(8577)
<223>PIV2的互补序列
<220>
<221>内含子
<222>(8995)..(10000)
<223>ZmUbi的互补序列
<220>
<221>启动子
<222>(8995)..(10982)
<223>ZmUbi的互补序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(11152)..(11175)
<223>RB的互补序列
<400>106
gtgattttgt gccgagctgc cggtcgggga gctgttggct ggctggtggc aggatatatt 60
gtggtgtaaa caaattgacg cttagacaac ttaataacac attgcggacg tttttaatgt 120
actgaattgg atccgcccgg gcggtacccg gggatcctct agaactagtg gatcccccgg 180
gctgcaggtc aacggatcac ctatcaacat cccagctaaa aacagtaaaa agggggaaaa 240
cgtgggtgag ttgagtctgt cttgtggaaa aaacgtttta gtttctcctg gaattaacaa 300
taaaaacagt tgaacaagat tgactgttcc tccgggaggg tttggaacat cgttacagat 360
gtgagcgaaa ggtgaggaaa cagagcggag ggcttggagg tgacctcggt agtcgacgcc 420
ggagttgagc ttgatgacga caccgtactg gcgtaccagg cctagtagtg aacaccgggc 480
ctgaagctgt cgccgccgct gctcatcttg tgggctgtgc ccggtgtccc tgttgcggat 540
tgcgggtggc agcctggcag gtgggtgcga cccgtttgga ctccctgatc tgggcccttt 600
gtgtcagtac cgtctgtact ccgatgacat gcacaccgtc gtccacagtc aagtccacaa 660
tctcccctct ttttttaacg gaatagttca aaatctcctt gacgcacgct atcgtgtacc 720
agcgctcact ggacaccacg tttgtaatcc acgccgacac gtcggtccca cgtcgacagg 780
ccccaccgtc cggtctgtag cgtgtacgta ttcgggcgac ggacgtgtcg tcgtcgtctt 840
gcgagtccca ttcccatcac catctgagcc acacatcctc tgaacaaaag cagggaggcc 900
tctacgcaca tccccctttc tcccactccg tgtccgtggc acccacccca aaccctcgcg 960
ccgcctccga gacagccgcc gcaaccatgg ccaccgccgc cgccgcgtct accgcgctca 1020
ctggcgccac taccgctgcg cccaaggcga ggcgccgggc gcacctcctg gccacccgcc 1080
gcgccctcgc cgcgcccatc aggtgctcag cggcgtcacc cgccatgccg atggctcccc 1140
cggccacccc gctccggccg tggggcccca ccgatccccg caagggcgcc gacatcctcg 1200
tcgagtccct cgagcgctgc ggcgtccgcg acgtcttcgc ctaccccggc ggcgcgtcca 1260
tggagatcca ccaggcactc acccgctccc ccgtcatcgc caaccacctc ttccgccacg 1320
agcaagggga ggcctttgcg gcctccggct acgcgcgctc ctcgggccgc gtcggcgtct 1380
gcatcgccac ctccggcccc ggcgccacca accttgtctc cgcgctcgcc gacgcgctgc 1440
tcgattccgt ccccatggtc gccatcacgg gacaggtgcc gcgacgcatg attggcaccg 1500
acgccttcca ggagacgccc atcgtcgagg tcacccgctc catcaccaag cacaactacc 1560
tggtcctcga cgtcgacgac atcccccgcg tcgtgcagga ggctttcttc ctcgcctcct 1620
ctggtcgacc ggggccggtg cttgtcgaca tccccaagga catccagcag cagatggcgg 1680
tgcctgtctg ggacaagccc atgagtctgc ctgggtacat tgcgcgcctt cccaagcccc 1740
ctgcgactga gttgcttgag caggtgctgc gtcttgttgg tgaatcccgg cgccctgttc 1800
tttatgttgg cggtggctgc gcagcatctg gtgaggagtt gcgacgcttt gtggagctga 1860
ctggaatccc ggtcacaact actcttatgg gcctcggcaa cttccccagc gacgacccac 1920
tgtctctgcg catgctaggt atgcatggca cggtgtatgc aaattatgca gtggataagg 1980
ccgatctgtt gcttgcactt ggtgtgcggt ttgatgatcg tgtgacaggg aagattgagg 2040
cttttgcaag cagggctaag attgtgcacg ttgatattga tccggctgag attggcaaga 2100
acaagcagcc acatgtgtcc atctgtgcag atgttaagct tgctttgcag ggcatgaatg 2160
ctcttcttga aggaagcaca tcaaagaaga gctttgactt tggctcatgg aacgatgagt 2220
tggatcagca gaagagggaa ttcccccttg ggtataaaac atctaatgag gagatccagc 2280
cacaatatgc tattcaggtt cttgatgagc tgacgaaagg cgaggccatc atcggcacag 2340
gtgttgggca gcaccagatg tgggcggcac agtactacac ttacaagcgg ccaaggcagt 2400
ggttgtcttc agctggtctt ggggctatgg gatttggttt gccggctgct gctggtgctt 2460
ctgtggccaa cccaggtgtt actgttgttg acatcgatgg agatggtagc tttctcatga 2520
acgttcagga gctagctatg atccgaattg agaacctccc ggtgaaggtc tttgtgctaa 2580
acaaccagca cctggggatg gtggtgcagt gggaggacag gttctataag gccaacagag 2640
cgcacacata cttgggaaac ccagagaatg aaagtgagat atatccagat ttcgtgacga 2700
tcgccaaagg gttcaacatt ccagcggtcc gtgtgacaaa gaagaacgaa gtccgcgcag 2760
cgataaagaa gatgctcgag actccagggc cgtacctctt ggatataatc gtcccacacc 2820
aggagcatgt gttgcctatg atccctaatg gtggggcttt caaggatatg atcctggatg 2880
gtgatggcag gactgtgtac tgatctaaaa tccagcaagc aactgatcta aaatccagca 2940
agcaccgcct ccctgctagt acaagggtga tatgttttta tctgtgtgat gttctcctgt 3000
attctatctt tttttgtagg ccgtcagcta tctgttatgg taatcctatg tagcttccga 3060
ccttgtaatt gtgtagtctg ttgttttcct tctggcatgt gtcataagag atcatttaag 3120
tgccttttgc tacatataaa taagataata agcactgcta tgcagtggtt ctgaattggc 3180
ttctgttgcc aaatttaagt gtccaactgg tccttgcttt tgttttcgct atttttttcc 3240
ttttttagtt attattatat tggtaatttc aactcaacat atgatgtatg gaataatgct 3300
agggctgcaa tttcaaacta ttttacaaac cagaatggca ttttcgtggt ttgaggggag 3360
tgaaaaaaaa tgaggcattt gactgaatta gttacctgat ccattttcgt ggtttggatc 3420
attggaatta aattccattc taataatagt aattttggca tatatcaatt aagttaattc 3480
ggttttatgc aaaatatatt tgtatactat tattatcaag atgtcggaga tatttatatg 3540
ctacattttt actatacagg agtgagatga agagtgtcat gtaagttaca cagtagaaac 3600
aaattctatt aatgcataaa atcatttcca tcatccaccc tatgaatttg agatagacct 3660
atatctaaac tttgaaaagt ggttgaatat caaattccaa attaaataag ttattttatt 3720
gagtgaattc taatttctct aaaacgaagg gatctaaacg ccctctaaag ctaatttgga 3780
aactcaaact ttcttagcat tggaggggat tgagaaaaaa tattaattca ttttcatctc 3840
aatcattcaa tctccaaaga gatttgagtt ccttattagt ctgttccatg catcaaatcg 3900
gctcaatgtg tcattatttg ccatgacgat tgacgagttg ttctggggcc tagcgctttc 3960
cacgccgatg tgctggggcc tggtcctgga gaagacagct tgatatttaa agctatcaat 4020
tgtttcaatt gattcccact tcatttttct aaatgtagaa aacggtgacg tataagaaaa 4080
agaatgaatt aggactttta ttccgtacac taatctagag cggccgcaag cttgtacaac 4140
gcgtaccggt taattaaggt accaagcttc cgcggctgca gtgcagcgtg acccggtcgt 4200
gcccctctct agagataatg agcattgcat gtctaagtta taaaaaatta ccacatattt 4260
tttttgtcac acttgtttga agtgcagttt atctatcttt atacatatat ttaaacttta 4320
ctctacgaat aatataatct atagtactac aataatatca gtgttttaga gaatcatata 4380
aatgaacagt tagacatggt ctaaaggaca attgagtatt ttgacaacag gactctacag 4440
ttttatcttt ttagtgtgca tgtgttctcc tttttttttg caaatagctt cacctatata 4500
atacttcatc cattttatta gtacatccat ttagggttta gggttaatgg tttttataga 4560
ctaatttttt tagtacatct attttattct attttagcct ctaaattaag aaaactaaaa 4620
ctctatttta gtttttttat ttaatagttt agatataaaa tagaataaaa taaagtgact 4680
aaaaattaaa caaataccct ttaagaaatt aaaaaaacta aggaaacatt tttcttgttt 4740
cgagtagata atgccagcct gttaaacgcc gtcgacgagt ctaacggaca ccaaccagcg 4800
aaccagcagc gtcgcgtcgg gccaagcgaa gcagacggca cggcatctct gtcgctgcct 4860
ctggacccct ctcgagagtt ccgctccacc gttggacttg ctccgctgtc ggcatccaga 4920
aattgcgtgg cggagcggca gacgtgagcc ggcacggcag gcggcctcct cctcctctca 4980
cggcaccggc agctacgggg gattcctttc ccaccgctcc ttcgctttcc cttcctcgcc 5040
cgccgtaata aatagacacc ccctccacac cctctttccc caacctcgtg ttgttcggag 5100
cgcacacaca cacaaccaga tctcccccaa atccacccgt cggcacctcc gcttcaaggt 5160
acgccgctcg tcctcccccc ccccccccct ctctaccttc tctagatcgg cgttccggtc 5220
catggttagg gcccggtagt tctacttctg ttcatgtttg tgttagatcc gtgtttgtgt 5280
tagatccgtg ctgctagcgt tcgtacacgg atgcgacctg tacgtcagac acgttctgat 5340
tgctaacttg ccagtgtttc tctttgggga atcctgggat ggctctagcc gttccgcaga 5400
cgggatcgat ttcatgattt tttttgtttc gttgcatagg gtttggtttg cccttttcct 5460
ttatttcaat atatgccgtg cacttgtttg tcgggtcatc ttttcatgct tttttttgtc 5520
ttggttgtga tgatgtggtc tggttgggcg gtcgttctag atcggagtag aattctgttt 5580
caaactacct ggtggattta ttaattttgg atctgtatgt gtgtgccata catattcata 5640
gttacgaatt gaagatgatg gatggaaata tcgatctagg ataggtatac atgttgatgc 5700
gggttttact gatgcatata cagagatgct ttttgttcgc ttggttgtga tgatgtggtg 5760
tggttgggcg gtcgttcatt cgttctagat cggagtagaa tactgtttca aactacctgg 5820
tgtatttatt aattttggaa ctgtatgtgt gtgtcataca tcttcatagt tacgagttta 5880
agatggatgg aaatatcgat ctaggatagg tatacatgtt gatgtgggtt ttactgatgc 5940
atatacatga tggcatatgc agcatctatt catatgctct aaccttgagt acctatctat 6000
tataataaac aagtatgttt tataattatt tcgatcttga tatacttgga tgatggcata 6060
tgcagcagct atatgtggat ttttttagcc ctgccttcat acgctattta tttgcttggt 6120
actgtttctt ttgtcgatgc tcaccctgtt gtttggtgtt acttctgcag ggtacggatc 6180
cggcgcgcca ctagtcccgg tcgccaccat ggcctcctcc gagaacgtca tcaccgagtt 6240
catgcgcttc aaggtgcgca tggagggcac cgtgaacggc cacgagttcg agatcgaggg 6300
cgagggcgag ggccgcccct acgagggcca caacaccgtg aagctgaagg tgaccaaggg 6360
cggccccctg cccttcgcct gggacatcct gtccccccag ttccagtacg gctccaaggt 6420
gtacgtgaag caccccgccg acatccccga ctacaagaag ctgtccttcc ccgagggctt 6480
caagtgggag cgcgtgatga acttcgagga cggcggcgtg gcgaccgtga cccaggactc 6540
ctccctgcag gacggctgct tcatctacaa ggtgaagttc atcggcgtga acttcccctc 6600
cgacggcccc gtgatgcaga agaagaccat gggctgggag gcctccaccg agcgcctgta 6660
cccccgcgac ggcgtgctga agggcgagac ccacaaggcc ctgaagctga aggacggcgg 6720
ccactacctg gtggagttca agtccatcta catggccaag aagcccgtgc agctgcccgg 6780
ctactactac gtggacgcca agctggacat cacctcccac aacgaggact acaccatcgt 6840
ggagcagtac gagcgcaccg agggccgcca ccacctgttc ctgtagcggc cgccctgcag 6900
ggagctcggt agcaattccc gaggctgtag ccgacgatgg tgcgccagga gagttgttga 6960
ttcattgttt gcctccctgc tgcggttttt caccgaagtt catgccagtc cagcgttttt 7020
gcagcagaaa agccgccgac ttcggtttgc ggtcgcgagt gaagatccct ttcttgttac 7080
cgccaacgcg caatatgcct tgcgaggtcg caaaatcggc gaaattccat acctgttcac 7140
cgacgacggc gctgacgcga tcaaagacgc ggtgatacat atccagccat gcacactgat 7200
actcttcact ccacatgtcg gtgtacattg agtgcagccc ggctaacgta tccacgccgt 7260
attcggtgat gataatcggc tgatgcagtt tctcctgcca ggccagaagt tctttttcca 7320
gtaccttctc tgccgtttcc aaatcgccgc tttggacata ccatccgtaa taacggttca 7380
ggcacagcac atcaaagaga tcgctgatgg tatcggtgtg agcgtcgcag aacattacat 7440
tgacgcaggt gatcggacgc gtcgggtcga gtttacgcgt tgcttccgcc agtggcgcga 7500
aatattcccg tgcaccttgc ggacgggtat ccggttcgtt ggcaatactc cacatcacca 7560
cgcttgggtg gtttttgtca cgcgctatca gctctttaat cgcctgtaag tgcgcttgct 7620
gagtttcccc gttgactgcc tcttcgctgt acagttcttt cggcttgttg cccgcttcga 7680
aaccaatgcc taaagagagg ttaaagccga cagcagcagt ttcatcaatc accacgatgc 7740
catgttcatc tgcccagtcg agcatctctt cagcgtaagg gtaatgcgag gtacggtagg 7800
agttggcccc aatccagtcc attaatgcgt ggtcgtgcac catcagcacg ttatcgaatc 7860
ctttgccacg caagtccgca tcttcatgac gaccaaagcc agtaaagtag aacggtttgt 7920
ggttaatcag gaactgttcg cccttcactg ccactgaccg gatgccgacg cgaagcgggt 7980
agatatcaca ctctgtctgg cttttggctg tgacgcacag ttcatagaga taaccttcac 8040
ccggttgcca gaggtgcgga ttcaccactt gcaaagtccc gctagtgcct tgtccagttg 8100
caaccacctg ttgatccgca tcacgcagtt caacgctgac atcaccattg gccaccacct 8160
gccagtcaac agacgcgtgg ttacagtctt gcgcgacatg cgtcaccacg gtgatatcgt 8220
ccacccaggt gttcggcgtg gtgtagagca ttacgctgcg atggattccg gcatagttaa 8280
agaaatcatg gaagtaagac tgctttttct tgccgttttc gtcggtaatc accattcccg 8340
gcgggatagt ctgccagttc agttcgttgt tcacacaaac ggtgatacct gcacatcaac 8400
aaattttggt catatattag aaaagttata aattaaaata tacacactta taaactacag 8460
aaaagcaatt gctatatact acattctttt attttgaaaa aaatatttga aatattatat 8520
tactactaat taatgataat tattatatat atatcaaagg tagaagcaga aacttacgta 8580
cacttttccc ggcaataaca tacggcgtga catcggcttc aaatggcgta tagccgccct 8640
gatgctccat cacttcctga ttattgaccc acactttgcc gtaatgagtg accgcatcga 8700
aacgcagcac gatacgctgg cctgcccaac ctttcggtat aaagacttcg cgctgatacc 8760
agacgttgcc cgcataatta cgaatatctg catcggcgaa ctgatcgtta aaactgcctg 8820
gcacagcaat tgcccggctt tcttgtaacg cgctttccca ccaacgctga ccaattccac 8880
agttttcgcg atccagactg aatgcccaca ggccgtcgag ttttttgatt tcacgggttg 8940
gggtttctac aggacgtaac ataagggact gacctacccg ggggtaccct gcagaagtaa 9000
caccaaacaa cagggtgagc atcgacaaaa gaaacagtac caagcaaata aatagcgtat 9060
gaaggcaggg ctaaaaaaat ccacatatag ctgctgcata tgccatcatc caagtatatc 9120
aagatcgaaa taattataaa acatacttgt ttattataat agataggtac tcaaggttag 9180
agcatatgaa tagatgctgc atatgccatc atgtatatgc atcagtaaaa cccacatcaa 9240
catgtatacc tatcctagat cgatatttcc atccatctta aactcgtaac tatgaagatg 9300
tatgacacac acatacagtt ccaaaattaa taaatacacc aggtagtttg aaacagtatt 9360
ctactccgat ctagaacgaa tgaacgaccg cccaaccaca ccacatcatc acaaccaagc 9420
gaacaaaaag catctctgta tatgcatcag taaaacccgc atcaacatgt atacctatcc 9480
tagatcgata tttccatcca tcatcttcaa ttcgtaacta tgaatatgta tggcacacac 9540
atacagatcc aaaattaata aatccaccag gtagtttgaa acagaattct actccgatct 9600
agaacgaccg cccaaccaga ccacatcatc acaaccaaga caaaaaaaag catgaaaaga 9660
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tatgcaacga aacaaaaaaa atcatgaaat cgatcccgtc tgcggaacgg ctagagccat 9780
cccaggattc cccaaagaga aacactggca agttagcaat cagaacgtgt ctgacgtaca 9840
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aacatgaaca gaagtagaac taccgggccc taaccatgga ccggaacgcc gatctagaga 9960
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gggtggattt gggggagatc tggttgtgtg tgtgtgcgct ccgaacaaca cgaggttggg 10080
gaaagagggt gtggaggggg tgtctattta ttacggcggg cgaggaaggg aaagcgaagg 10140
agcggtggga aaggaatccc ccgtagctgc cggtgccgtg agaggaggag gaggccgcct 10200
gccgtgccgg ctcacgtctg ccgctccgcc acgcaatttc tggatgccga cagcggagca 10260
agtccaacgg tggagcggaa ctctcgagag gggtccagag gcagcgacag agatgccgtg 10320
ccgtctgctt cgcttggccc gacgcgacgc tgctggttcg ctggttggtg tccgttagac 10380
tcgtcgacgg cgtttaacag gctggcatta tctactcgaa acaagaaaaa tgtttcctta 10440
gtttttttaa tttcttaaag ggtatttgtt taatttttag tcactttatt ttattctatt 10500
ttatatctaa actattaaat aaaaaaacta aaatagagtt ttagttttct taatttagag 10560
gctaaaatag aataaaatag atgtactaaa aaaattagtc tataaaaacc attaacccta 10620
aaccctaaat ggatgtacta ataaaatgga tgaagtatta tataggtgaa gctatttgca 10680
aaaaaaaagg agaacacatg cacactaaaa agataaaact gtagagtcct gttgtcaaaa 10740
tactcaattg tcctttagac catgtctaac tgttcattta tatgattctc taaaacactg 10800
atattattgt agtactatag attatattat tcgtagagta aagtttaaat atatgtataa 10860
agatagataa actgcacttc aaacaagtgt gacaaaaaaa atatgtggta attttttata 10920
acttagacat gcaatgctca ttatctctag agaggggcac gaccgggtca cgctgcactg 10980
cagccgcgga agcttgcatg cctgcaggca tgcaagcttg gcgcgccgac ccagctttct 11040
tgtacaaagt tggcattata agaaagcatt gcttatcaat ttgttgcaac gaacaggtca 11100
ctatcagtca aaataaaatc attatttgcc atccagaaac tatcagtgtt tgacaggata 11160
tattggcggg taaacctaag agaaaagagc gtttattaga ataatcggat atttaaaagg 11220
gcgtgaaaag gtttatccgt tcgtccattt gtatgtgcat gccaaccaca gggttcccct 11280
cgggagtgct tggcattccg tgcgataatg acttctgttc aaccacccaa acgtcggaaa 11340
gcctgacgac ggagcagcat tccaaaaaga tcccttggct cgtctgggtc ggctagaagg 11400
tcgagtgggc tgctgtggct tgatccctca acgcggtcgc ggacgtagcg cagcgccgaa 11460
aaatcctcga tcgcaaatcc gacgctgtcg aaaagcgtga tctgcttgtc gctctttcgg 11520
ccgacgtcct ggccagtcat cacgcgccaa agttccgtca caggatgatc tggcgcgagt 11580
tgctggatct cgccttcaat ccgggtctgt ggcgggaact ccacgaaaat atccgaacgc 11640
agcaagatcg tcgaccaatt cttgaagacg aaagggcctc gtgatacgcc tatttttata 11700
ggttaatgtc atgataataa tggtttctta gacgtcaggt ggcacttttc ggggaaatgt 11760
gcgcggaacc cctatttgtt tatttttcta aatacattca aatatgtatc cgctcatgag 11820
acaataaccc tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg aagagtatga gtattcaaca 11880
tttccgtgtc gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc cttcctgttt ttgctcaccc 11940
agaaacgctg gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg ggtgcacgag tgggttacat 12000
cgaactggat ctcaacagcg gtaagatcct tgagagtttt cgccccgaag aacgttttcc 12060
aatgatgagc acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta ttatcccgtg ttgacgccgg 12120
gcaagagcaa ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat gacttggttg agtactcacc 12180
agtcacagaa aagcatctta cggatggcat gacagtaaga gaattatgca gtgctgccat 12240
aaccatgagt gataacactg cggccaactt acttctgaca acgatcggag gaccgaagga 12300
gctaaccgct tttttgcaca acatggggga tcatgtaact cgccttgatc gttgggaacc 12360
ggagctgaat gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc acgatgccgg gggggggggg 12420
gggggacatg aggttgcccc gtattcagtg tcgctgattt gtattgtctg aagttgtttt 12480
tacgttaagt tgatgcagat caattaatac gatacctgcg tcataattga ttatttgacg 12540
tggtttgatg gcctccacgc acgttgtgat atgtagatga taatcattat cactttacgg 12600
gtcctttccg gtgatccgac aggttacggg gcggcgacct cgcgggtttt cgctatttat 12660
gaaaattttc cggtttaagg cgtttccgtt cttcttcgtc ataacttaat gtttttattt 12720
aaaataccct ctgaaaagaa aggaaacgac aggtgctgaa agcgagcttt ttggcctctg 12780
tcgtttcctt tctctgtttt tgtccgtgga atgaacaatg gaaccccccc cccccccccc 12840
tgcagcaatg gcaacaacgt tgcgcaaact attaactggc gaactactta ctctagcttc 12900
ccggcaacaa ttaatagact ggatggaggc ggataaagtt gcaggaccac ttctgcgctc 12960
ggcccttccg gctggctggt ttattgctga taaatctgga gccggtgagc gtgggtctcg 13020
cggtatcatt gcagcactgg ggccagatgg taagccctcc cgtatcgtag ttatctacac 13080
gacggggagt caggcaacta tggatgaacg aaatagacag atcgctgaga taggtgcctc 13140
actgattaag cattggtaac tgtcagacca agtttactca tatatacttt agattgattt 13200
aaaacttcat ttttaattta aaaggatcta ggtgaagatc ctttttgata atctcatgac 13260
caaaatccct taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca gaccccgtag aaaagatcaa 13320
aggatcttct tgagatcctt tttttctgcg cgtaatctgc tgcttgcaaa caaaaaaacc 13380
accgctacca gcggtggttt gtttgccgga tcaagagcta ccaactcttt ttccgaaggt 13440
aactggcttc agcagagcgc agataccaaa tactgtcctt ctagtgtagc cgtagttagg 13500
ccaccacttc aagaactctg tagcaccgcc tacatacctc gctctgctaa tcctgttacc 13560
agtggctgct gccagtggcg ataagtcgtg tcttaccggg ttggactcaa gacgatagtt 13620
accggataag gcgcagcggt cgggctgaac ggggggttcg tgcacacagc ccagcttgga 13680
gcgaacgacc tacaccgaac tgagatacct acagcgtgag ctatgagaaa gcgccacgct 13740
tcccgaaggg agaaaggcgg acaggtatcc ggtaagcggc agggtcggaa caggagagcg 13800
cacgagggag cttccagggg gaaacgcctg gtatctttat agtcctgtcg ggtttcgcca 13860
cctctgactt gagcgtcgat ttttgtgatg ctcgtcaggg gggcggagcc tatggaaaaa 13920
cgccagcaac gcggcctttt tacggttcct ggccttttgc tggccttttg ctcacatgtt 13980
ctttcctgcg ttatcccctg attctgtgga taaccgtatt accgcctttg agtgagctga 14040
taccgctcgc cgcagccgaa cgaccgagcg cagcgagtca gtgagcgagg aagcggaaga 14100
gcgcctgatg cggtattttc tccttacgca tctgtgcggt atttcacacc gcatatggtg 14160
cactctcagt acaatctgct ctgatgccgc atagttaagc cagtatacac tccgctatcg 14220
ctacgtgact gggtcatggc tgcgccccga cacccgccaa cacccgctga cgcgccctga 14280
cgggcttgtc tgctcccggc atccgcttac agacaagctg tgaccgtctc cgggagctgc 14340
atgtgtcaga ggttttcacc gtcatcaccg aaacgcgcga ggcagcagat cccccgatca 14400
agtagataca ctacatatat ctacaataga catcgagccg gaaggtgatg tttactttcc 14460
tgaaatcccc agcaatttta ggccagtttt tacccaagac ttcgcctcta acataaatta 14520
tagttaccaa atctggcaaa agggttgacc gggggggggg ggaaagccac gttgtgtctc 14580
aaaatctctg atgttacatt gcacaagata aaaatatatc atcatgaaca ataaaactgt 14640
ctgcttacat aaacagtaat acaaggggtg ttatgagcca tattcaacgg gaaacgtctt 14700
gctcgaggcc gcgattaaat tccaacatgg atgctgattt atatgggtat aaatgggctc 14760
gcgataatgt cgggcaatca ggtgcgacaa tctatcgatt gtatgggaag cccgatgcgc 14820
cagagttgtt tctgaaacat ggcaaaggta gcgttgccaa tgatgttaca gatgagatgg 14880
tcagactaaa ctggctgacg gaatttatgc ctcttccgac catcaagcat tttatccgta 14940
ctcctgatga tgcatggtta ctcaccactg cgatccccgg gaaaacagca ttccaggtat 15000
tagaagaata tcctgattca ggtgaaaata ttgttgatgc gctggcagtg ttcctgcgcc 15060
ggttgcattc gattcctgtt tgtaattgtc cttttaacag cgatcgcgta tttcgtctcg 15120
ctcaggcgca atcacgaatg aataacggtt tggttgatgc gagtgatttt gatgacgagc 15180
gtaatggctg gcctgttgaa caagtctgga aagaaatgca taagcttttg ccattctcac 15240
cggattcagt cgtcactcat ggtgatttct cacttgataa ccttattttt gacgagggga 15300
aattaatagg ttgtattgat gttggacgag tcggaatcgc agaccgatac caggatcttg 15360
ccatcctatg gaactgcctc ggtgagtttt ctccttcatt acagaaacgg ctttttcaaa 15420
aatatggtat tgataatcct gatatgaata aattgcagtt tcatttgatg ctcgatgagt 15480
ttttctaatc agaattggtt aattggttgt aacactggca gagcattacg ctgacttgac 15540
gggacggcgg ctttgttgaa taaatcgaac ttttgctgag ttgaaggatc agatcacgca 15600
tcttcccgac aacgcagacc gttccgtggc aaagcaaaag ttcaaaatca ccaactggtc 15660
cacctacaac aaagctctca tcaaccgtgg ctccctcact ttctggctgg atgatggggc 15720
gattcaggga tcacaggcag caacgctctg tcatcgttac aatcaacatg ctaccctccg 15780
cgagatcatc cgtgtttcaa acccggcagc ttagttgccg ttcttccgaa tagcatcggt 15840
aacatgagca aagtctgccg ccttacaacg gctctcccgc tgacgccgtc ccggactgat 15900
gggctgcctg tatcgagtg 15919
<210>107
<211>1499
<212>DNA
<213>稻
<220>
<221>终止子
<222>(1)..(1499)
<400>107
cagagtgata gacagtgcta cttgctagcc ttttttatga gcaccctttt tggcctttta 60
gttcctcatt agctaagaga tgtgatgagt gaggttttat tttttggctt tgtttggagt 120
tttgctttgg aggaagatag agaagccttt agaatgagtt gtgatggagg atcacatagt 180
ttgtctcagg tttacaatgt gcggtaaaaa aaaggaagga aataaagtga tgttagaata 240
tacagttttt taatccattt ctacagcttc aaattctcga ttgagcggca cgttctttga 300
aatgttcata gcaaagcaaa tcaaacgaaa tggatgagat ttgaaactaa gaaactgcac 360
ttgacaaagc acgctgcgct ctctgaaatt catgttcagc agaacgcctt tcagaaattc 420
atgttctgct gctgcaggaa ggcagctaag aactccatgc aataaaaata taaaatgcag 480
tgcagttatt agttagtgta gtagtaatct aagaaacaac aggtttaaca gaatattacc 540
ttcaaaaaca tcccctcaaa tcaagactcg gaaatcaaca ccattctgaa actagatgca 600
atactgcgct cctaatggaa tcttcagtgg ttactcctac acgccactaa aaaaaacggg 660
ctttggaaaa acgtcaccct gaaaacaaga gctcagtaaa aataccactc taaaatcttg 720
cagcatgcat tatcacaaaa gcagatcaat ccgtaattgt atttatgctg catataccgt 780
gatattttct gtgatcctct gcactatctt cagctcatca gctgcatatt ttgaagccgg 840
actgatggct catcgctttg tttcggctta ttgtgatagc catccatgcg ttgacgaaag 900
atttagatat atcacaattt taaccaagtt cagagcaatg ttagctttag ctgatgatat 960
acacggcgca ctgattgccg ccgttatttt cagagccttg taaaacctga aacaaattgt 1020
gtctccaaat tcttactagt actgcagaca tagcggattt gttttcagga tgaattatca 1080
caaaggtaag tcaattcata gccatattac gcaagttcaa aactgcaggc cacaccatac 1140
gtttctgaaa gtagaaacaa gagatcttgc agcagatcac cactaaagaa gcagtaaccg 1200
caaaaaatta taacataatc cagaattaac acttcgcagc attactgaat tcactttaat 1260
agcacttctc atcatgaact agtacaacaa cataactgtc cagtggaaat gtgaaatgca 1320
tacaccaagt aatggtccat aacatgaact atatggatac aacaacgttc ttatttcgct 1380
catatataca tgaaataagt cttgcacgtc ttggttactt aataggtgcg ataatcgccg 1440
taggctttta gaagaagaaa aaaaagtgag cctgcaaagt tcctggggac agttgaaga 1499
<210>108
<211>1499
<212>DNA
<213>稻
<220>
<221>终止子
<222>(1)..(1499)
<400>108
gagacaaact atgtgatcct ccatcacaac tcattctaaa ggcttctcta tcttcctcca 60
aagcaaaact ccaaacaaag ccaaaaaata aaacctcact catcacatct cttagctaat 120
gaggaactaa aaggccaaaa agggtgctca taaaaaaggc tagcaagtag cactgtctat 180
cactctgtct tcaactgtcc ccaggaactt tgcaggctca cttttttttc ttcttctaaa 240
agcctacggc gattatcgca cctattaagt aaccaagacg tgcaagactt atttcatgta 300
tatatgagcg aaataagaac gttgttgtat ccatatagtt catgttatgg accattactt 360
ggtgtatgca tttcacattt ccactggaca gttatgttgt tgtactagtt catgatgaga 420
agtgctatta aagtgaattc agtaatgctg cgaagtgtta attctggatt atgttataat 480
tttttgcggt tactgcttct ttagtggtga tctgctgcaa gatctcttgt ttctactttc 540
agaaacgtat ggtgtggcct gcagttttga acttgcgtaa tatggctatg aattgactta 600
cctttgtgat aattcatcct gaaaacaaat ccgctatgtc tgcagtacta gtaagaattt 660
ggagacacaa tttgtttcag gttttacaag gctctgaaaa taacggcggc aatcagtgcg 720
ccgtgtatat catcagctaa agctaacatt gctctgaact tggttaaaat tgtgatatat 780
ctaaatcttt cgtcaacgca tggatggcta tcacaataag ccgaaacaaa gcgatgagcc 840
atcagtccgg cttcaaaata tgcagctgat gagctgaaga tagtgcagag gatcacagaa 900
aatatcacgg tatatgcagc ataaatacaa ttacggattg atctgctttt gtgataatgc 960
atgctgcaag attttagagt ggtattttta ctgagctctt gttttcaggg tgacgttttt 1020
ccaaagcccg ttttttttag tggcgtgtag gagtaaccac tgaagattcc attaggagcg 1080
cagtattgca tctagtttca gaatggtgtt gatttccgag tcttgatttg aggggatgtt 1140
tttgaaggta atattctgtt aaacctgttg tttcttagat tactactaca ctaactaata 1200
actgcactgc attttatatt tttattgcat ggagttctta gctgccttcc tgcagcagca 1260
gaacatgaat ttctgaaagg cgttctgctg aacatgaatt tcagagagcg cagcgtgctt 1320
tgtcaagtgc agtttcttag tttcaaatct catccatttc gtttgatttg ctttgctatg 1380
aacatttcaa agaacgtgcc gctcaatcga gaatttgaag ctgtagaaat ggattaaaaa 1440
actgtatatt ctaacatcac tttatttcct tccttttttt taccgcacat tgtaaacct 1499
Claims (21)
1.用于鉴定和/或分离转录终止序列的方法,所述方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下表达时产生易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点改变了所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选地测定它们的序列。
2.权利要求1的方法,其中相对于所述附加序列而言,所述插入位点位于选自以下的位置:
i)附加序列的上游,在所述启动子和所述附加序列之间,和
ii)附加序列下游,和
iii)在所述附加序列之间。
3.权利要求1或2的方法,其中将所述待评估其转录终止效率的DNA序列以反向重复的形式插入所述插入位点中。
4.权利要求1至3中任一项的方法,其中用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’至3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,和
c)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的特定DNA序列的至少两个拷贝以反向重复的形式插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,其中与无插入相比,将有效转录终止子的反向重复插入所述插入位点允许所述附加序列通过所述启动子序列表达,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有所述易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选地测定它们的序列。
5.权利要求1或2的方法,其中用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’到3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,和
c)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点抑制了所述附加序列通过所述启动子序列的表达,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点中,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选测定它们的序列。
6.权利要求5的方法,其中所述附加序列为已知转录终止子序列的反向重复,其以所述启动子序列下游的所述重复的第二个拷贝为组成功能性转录终止子的取向的方式定位,并且其中所述筛选构建体或筛选载体在所述插入位点和所述启动子之间含有产生易于检测表型的其他序列,并且其中由于所述已知的转录终止子的所述反向重复表达的缘故,所述插入位点中不存在有效转录终止子将引起所述其他序列表达的沉默。
7.权利要求1或2的方法,其中用于鉴定和分离转录终止序列的方法包括以下步骤:
i)提供筛选构建体或筛选载体,其在5’到3’方向上包含:
a)启动子序列,和
b)至少一个附加序列,所述序列在所述启动子序列下的表达导致易于检测的特征,和在所述附加序列中嵌入的用于插入DNA序列的一个或多个插入位点,优选限制性或重组位点,
其中与无插入相比,将有效的转录终止子插入所述插入位点抑制了所述附加序列通过所述启动子序列的全长转录,和
ii)提供待评估其转录终止能力的一个或多个DNA序列,和
iii)将所述DNA序列的一个或多个拷贝插入所述筛选构建体或筛选载体的所述插入位点,和
iv)将带有所述插入的DNA序列的所述筛选构建体或筛选载体引入适于诱导从所述启动子序列表达的体外或体内转录系统,和
v)鉴定和/或选择与无插入相比具有改变的易于检测特征的筛选构建体或筛选载体,和
vi)从所述鉴定和/或选择的筛选构建体或筛选载体中分离插入的DNA序列用作转录终止序列,并任选测定它们的序列。
8.权利要求7的方法,其中所述插入位点位于所述附加序列中包含的内含子中。
9.权利要求7的方法,其中所述附加序列包含编码标记蛋白的第一个5’部分和不编码蛋白质且与所述转录系统的内源序列无同源性的第二个3’部分,并且其中所述插入位点位于所述5’部分和3’部分之间,并且其中为了选择和/或鉴定的目的,将第二个表达盒引入所述转录系统,所述第二个表达盒包含在所述转录系统中具有功能的启动子和与其有效连接的序列,该序列编码与所述3’部分互补的反义或双链RNA分子。
10.权利要求1至9中任一项的方法,其中所述附加序列选自正选择标记、负选择标记、反选择标记、报道基因和毒性基因。
11.权利要求10的方法,其中所述毒性基因是用于使必需内源基因或选择标记基因沉默的构建体。
12.权利要求1至11中任一项的方法,其中通过选自以下的方法提供所述待评估其转录终止效率的DNA序列:
i)通过从宿主基因组扩增提供选择的序列,和
ii)通过断裂宿主基因组提供序列文库,和
iii)提供合成序列的文库,和
iv)通过权利要求13至15中任一项要求保护的方法提供选择的序列。
13.权利要求12的方法,其中所述待评估其转录终止效率的DNA序列来自真核生物。
14.权利要求12或13的方法,其中所述待评估其转录终止效率的DNA序列来自植物。
15.权利要求1至14中任一项的方法,其中通过选自以下的方法将所述待评估其转录终止效率的DNA序列插入所述插入位点:
i)重组克隆,和
ii)通过特异性限制和连接插入。
16.用于鉴定和/或分离具有转录终止潜力的基因间区域的方法,所述方法至少包括以下步骤:
a)鉴定和/或分离或分离配对基因之间基因间距离为约400至3000个碱基对的基因间区域,和
b)鉴定和/或分离两侧均为具有高表达水平的基因的基因间序列。
17.权利要求16的方法,其中还包括以下步骤:
c)鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列两侧均为表达图式优选独立于另一配对基因表达图式的基因,和
d)鉴定和/或分离基因间序列,所述基因间序列的一侧或优选两侧为来自所述配对基因的mRNA转录物的长度具有低变异性的基因。
18.权利要求16或17的方法,其中所述基因间区域
a)位于具有尾对尾定位的基因之间和/或
b)从侧翼基因各自的终止密码子测量的长度为约700至约2000个碱基对。
19.转基因表达构建体,其在5’-3’方向上包含
a)在植物中具有功能的启动子,和
b)与所述启动子a)有效连接的待表达的目的核酸序列,和
c)选自以下的至少一个序列:
i)SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108描述的序列,和
ii)与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108所述的序列具有至少60%、优选80%、更优选90%、最优选95%的同源性的序列,该序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iii)在低严格条件下、优选在高严格条件下与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列杂交的序列,该序列能在植物细胞或生物中终止转录,和
iv) i)、ii)和iii)中所述序列的至少50个连续碱基对、优选至少100个连续碱基对、更优选至少250个连续碱基对、最优选至少500个连续碱基对的片段,
其中所述序列c)与所述启动子a)和/或所述目的核酸b)异源,并介导从所述启动子a)诱导的表达的终止。
20.转基因表达构建体,其包含至少两个表达盒,所述表达盒具有在5’-3’方向上包含如下的结构
a1)在植物中具有功能的第一个启动子序列,和
b1)与所述启动子a1)有效连接的待表达的第一个目的核酸序列,和
c)选自以下的至少一个序列:
i)SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108描述的序列,和
II)与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列具有至少60%、优选80%、更优选90%、最优选95%的同源性的序列,所述序列能在植物细胞或生物中终止转录,和
iii)在低严格条件下、优选在高严格条件下与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列杂交的序列,所述序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iv) i)、ii)和iii)中所述序列的至少50个连续碱基对、优选至少100个连续碱基对、更优选至少250个连续碱基对、最优选至少500个连续碱基对的片段,
和
b2)待表达的第二个目的核酸序列,和
a2)在植物中具有功能的第二个启动子序列,其与所述目的核酸序列b2)有效连接,
其中所述序列c)与选自启动子a1)、启动子a2)、目的核酸b1)和目的核酸b2)的至少一种元件异源,并介导从所述启动子a1)和a2)诱导的表达的终止。
21.选自:
i)SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107和108描述的序列,和
ii)与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列具有至少60%、优选80%、更优选90%、最优选95%的同源性的序列,该序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和
iii)在低严格条件下、优选在高严格条件下与SEQ ID NO:10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、92、93、107或108描述的序列杂交的序列,该序列能够在植物细胞或生物中终止转录,和iv) i)、ii)和iii)中所述序列的至少50个连续碱基对、优选至少100个连续碱基对、更优选至少250个连续碱基对、最优选至少500个连续碱基对的片段,
组成的组的序列作为转录终止子和/或隔离子的用途。
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