BR112019019049A2 - anticorpos anti-phf-tau, usos e método de fabricação dos mesmos, ácido nucleico isolado, vetor, célula hospedeira, composição farmacêutica, bem como métodos envolvendo os referidos anticorpos - Google Patents

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Abstract

a presente invenção refere-se a anticorpos monoclonais anti-phf-tau e fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos. também são descritos ácidos nucleicos que codificam os anticorpos, composições que compreendem os anticorpos, métodos para produzir os anticorpos e uso dos anticorpos para o tratamento ou a prevenção de condições como taupatias.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para ANTICORPOS ANTI-PHF-TAU, USOS E MÉTODO DE FABRICAÇÃO DOS MESMOS, ÁCIDO NUCLEICO ISOLADO, VETOR, CÉLULA HOSPEDEIRA, COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA, BEM COMO MÉTODOS ENVOLVENDO OS REFERIDOS ANTICORPOS. CAMPO DA INVENÇÃO [0001] A presente invenção refere-se a anticorpos anti-PHF-tau, ácidos nucleicos e vetores de expressão que codificam os anticorpos, células recombinantes contendo os vetores, e composições que compreendem os anticorpos. Métodos de produção dos anticorpos, métodos de uso dos anticorpos para tratar condições que incluem taupatias, e métodos de uso dos anticorpos para diagnosticar doenças como taupatias são também fornecidos.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO [0002] A doença de Alzheimer (DA) é um distúrbio degenerativo do cérebro caracterizado clinicamente por perda progressiva de memória, cognição, raciocínio, julgamento e estabilidade emocional que gradualmente leva a uma deterioração mental profunda e finalmente à morte. A DA é uma causa muito comum de insuficiência mental progressiva (demência) em seres humanos idosos e acredita-se que representa a quarta causa médica mais comum de morte nos Estados Unidos. A DA tem sido observada em grupos étnicos em todo o mundo e representa um problema de saúde pública atualmente e no futuro.
[0003] O cérebro dos indivíduos com DA apresenta lesões características denominadas placas senis (ou amiloides), angiopatia amiloide (depósitos amiloides em vasos sanguíneos) e emaranhados neurofibrilares. Grandes números dessas lesões, particularmente as placas amiloides e os emaranhados neurofibrilares de filamentos helicoidais pareados (PHF), são geralmente encontrados em várias áreas do cérebro humano importantes para a memória e a função cognitiva em
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2/106 pacientes com DA.
[0004] O cenário de tratamento atual de DA inclui apenas terapias aprovadas para tratar sintomas cognitivos em doentes com demência. Não há terapias aprovadas que modificam ou retardam a progressão da DA. Modificadores potenciais da doença incluem o anticorpo monoclonal anti-Αβ humanizado Solanezumabe, da famacêutica Eli Lilly para pacientes com DA leve e um inibidor de pequena molécula de BACE, Verubecestat, da farmacêutica Merck para pacientes com DA leve a moderado. Estas terapias, e a maioria dos outros modificadores potenciais da doença que podem ser lançados na próxima década, direcionam o Αβ (o componente principal das placas amiloides que são um dos dois sinais patológicos característicos de DA).
[0005] Os emaranhados neurofibrilares, o segundo sinal patológico característico de DA, são compostos principalmente de agregados de proteína tau hiperfosforilada. A principal função fisiológica da tau é a polimerização e estabilização de microtúbulos. A ligação do tau aos microtúbulos ocorre por interações iônicas entre cargas positivas na região de ligação de microtúbulo de tau e cargas negativas na rede de microtúbulos (Butner e Kirschner, J Cell Biol. 115(3):717-30, 1991). A proteína tau contém 85 sítios de fosforilação possíveis e a fosforilação em muitos desses sítios interfere com a função primária de tau. A tau que se liga à rede de microtúbulos axonais está em um estado de hipofosforilação, enquanto a tau agregada na DA é hiperfosforilada, fornecendo epitopos exclusivos que são distintos do pool fisiologicamente ativo de tau.
[0006] Foi descrita uma hipótese de transmissão e disseminação de taupatia que é baseada nos estágios de Braak de progressão de taupatia no cérebro humano e de disseminação de taupatia após injeções de agregados de tau em modelos pré-clínicos de tau (Frost et al., J Biol Chem. 284:12845-52, 2009; Clavaguera et al., Nat Cell Biol. 11:909-13, 2009).
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3/106 [0007] O desenvolvimento de agentes terapêuticos de prevenção ou remoção de agregação de tau tem sido de interesse por muitos anos e fármacos candidatos, incluindo compostos anti-agregação e inibidores de quinase, entraram em testes clínicos (Brunden et al., Nat Rev Drug Discov. 8:783-93, 2009). Vários estudos foram publicados que mostram os efeitos terapêuticos benéficos da imunização ativa e passiva contra tau em modelos de camundongo transgênicos (Chai et al., J Biol Chem. 286:34457-67, 2011; Boutajangout et al., J Neurochem. 118:658-67, 2011; Boutajangout et al., J Neurosci. 30:16559-66, 2010; Asuni et al., J Neurosci. 27:9115-29, 2007). A atividade foi relatada tanto com anticorpos fosfo-dirígidos (dirigidos contra fosfolipídeos) com anticorpos nãofosfo-dirigidos (Schroeder et al., J Neuroimmune Pharmacol. 11(1):9-25, 2016).
[0008] Apesar do progresso na técnica, ainda há uma necessidade por agentes terapêuticos eficazes que previnem a agregação de tau e a progressão da taupatia para tratar taupatias como DA e outras doenças neurodegenerativas.
BREVE SUMÁRIO DA INVENÇÃO [0009] A invenção satisfaz essa necessidade fornecendo anticorpos anti-PHF-tau ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que têm alta afinidade de ligação com o filamento helicoidal pareado (PHF)-tau e são seletivos para tau fosforilada. Os anticorpos da invenção foram gerados por adaptação de framework humano (HFA) de anticorpos específicos para PHF-tau de camundongo. Acredita-se que a seletividade dos anticorpos para tau fosforilada permita a eficácia contra tau patogênica sem interferir com a função de tau normal. A invenção também fornece ácidos nucleicos que codificam os anticorpos, composições que compreendem os anticorpos, e métodos de preparo e uso dos anticorpos. Os anticorpos anti-PHF-tau ou os fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos da invenção inibem as sementes de
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4/106 tau, conforme medido por ensaios celulares com o uso de sementes de tau derivadas de lisados celulares de células HEK ou de lisados de medula espinhal de camundongos transgênicos tau-mutantes. Além disso, um anticorpo quimérico com regiões variáveis de anticorpos anti-PHF-tau da invenção e regiões constantes de Ig de camundongo, como as regiões constantes de lgG2a de camundongo, bloqueou a atividade de semeadura em um modelo de camundongo transgênico taumutante in vivo.
[0010] A progressão de taupatia em um cérebro com DA segue padrões distintos e específicos de disseminação. Foi mostrado em modelos pré-clínicos que sementes de fosfo-tau extracelulares podem induzir taupatia em neurônios (Clavaguera et al., PNAS 110(23):9535-40, 2013). Acredita-se, portanto, que a taupatia pode se disseminar num mecanismo semelhante ao dos príons de uma região do cérebro para a próxima. Este processo de disseminação envolvería uma externalização das sementes de tau que podem ser absorvidas pelos neurônios vizinhos e induzir ainda taupatia. Sem ater-se à teoria, acredita-se que os anticorpos anti-PHF-tau ou os fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos da invenção evitam a agregação de tau ou a disseminação de taupatia no cérebro pela interação com sementes de fosfo-tau.
[0011] Em um aspecto geral, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou a um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a PHF-tau. Em uma modalidade específica, o anticorpo é um anticorpo monoclonal humanizado.
[0012] De acordo com um aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado no domínio rico em prolina da proteína tau. Em um aspecto mais específico, o epitopo fosforilado compreende T212 fosforilado e/ou T217 fosforilado da proteína tau, e o epitopo fosforilado
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5/106 tendo ou contendo qualquer das sequências de aminoácidos das SEQ ID NOs: 48, 52 e 54. Em algumas modalidades, um anticorpo da invenção se liga ao epítopo fosforilado que compreende T212 fosforilado e T217 fosforilado da proteína tau.
[0013] De acordo com um aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende:
(1) as regiões determinantes de complementaridade de cadeia pesada de imunoglobulina (HCDRs) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, respectivamente, e as regiões determinantes de complementaridade de cadeia leve de imunoglobulina (LCDRs) LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 16, 17 e 18, respectivamente;
(2) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 1, 2 e 3, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 13, 14 e 15, respectivamente;
(3) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 7, 8 e 9, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
(4) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 10, 11 e 12, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 22, 23 e 24, respectivamente;
(5) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 80, 81 e 9, respectivamente, e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
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6/106 (6) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 71,72, 73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
(7) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 71, 72 e 73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
(8) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
(9) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34;
(10) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34; ou (11) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
sendo que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a PHF-tau, de preferência a PHF-tau humana.
[0014] Em um aspecto mais específico, as regiões framework no domínio da região variável da cadeia pesada e no domínio da região variável da cadeia leve compreendem sequências de aminoácidos de uma imunoglobulina humana.
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7/106 [0015] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a anticorpos monoclonais isolados ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que compreendem uma região variável de cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 26, 27, 28 e 29 ou uma região Vh de qualquer cadeia pesada de qualquer uma das SEQ ID NOs: 74, 76, e 78, ou uma região variável de cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 31, 32, 33 e 34 ou uma região Vl de qualquer cadeia leve de qualquer uma das SEQ ID NOs: 75, 77 e 79.
[0016] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 45, 74, 76 e 78; e uma cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 46, 75, 77 e 79.
[0017] De acordo com um outro aspecto específico, os anticorpos monoclonais isolados ou os fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos da invenção compreendem ainda uma região constante, como uma região
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8/106 constante de IgG de cadeia pesada de humano ou camundongo, e uma região constante lambda ou kappa de cadeia leve de anticorpo de humano ou camundongo.
[0018] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um ácido nucleico isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção.
[0019] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um vetor que compreende um ácido nucleico isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção.
[0020] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a uma célula hospedeira que compreende um ácido nucleico isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção.
[0021] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a uma composição farmacêutica que compreende um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0022] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para reduzir a agregação de tau patológica ou disseminação de taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo uma composição farmacêutica da invenção.
[0023] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para tratar uma taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo uma composição farmacêutica da invenção. A taupatia inclui, mas não se limita a, uma ou mais selecionadas do grupo que consiste em doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear
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9/106 progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de Creutzfelt-Jakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de NiemannPick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica e demência pugilística (doença do boxe).
[0024] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para produzir um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo da invenção, que compreende cultivar uma célula que compreende um ácido nucleico que codifica o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antigeno sob condições para produzir o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo, e recuperar o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo da célula ou cultura celular.
[0025] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para produzir uma composição farmacêutica que compreende um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo da invenção, que compreende combinar o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação o antigeno do mesmo com um veículo farmaceuticamente aceitável para obter a composição farmacêutica.
[0026] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para detectar a presença de PHF-tau fosforilada em um indivíduo ou um método para diagnosticar uma taupatia em um indivíduo mediante a detecção da presença de PHF-tau em um indivíduo com o uso
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10/106 de um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção.
[0027] Outros aspectos, características e vantagens da invenção ficarão evidentes a partir da descrição a seguir, incluindo a descrição detalhada da invenção e suas modalidades preferenciais e as reivindicações em anexo.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS [0028] O sumário anteriormente mencionado, bem como a seguinte descrição detalhada da invenção, serão mais bem compreendidos quando lidos em conjunto com os desenhos em anexo. Deve-se compreender que a invenção não se limita às modalidades precisas mostradas nos desenhos.
[0029] A Figura 1 mostra a ligação de PT3 expresso recombinantemente (R3788) e PT3 expresso por hibridoma (hyb) com PHF-tau e tau solúvel.
[0030] A Figura 2 mostra a análise western blot de anticorpos monoclonais anti-tau de camundongo após SDS-PAGE de tau humano normal recombinante (NT) e PHF-tau insolúvel em sarcosil (PT).
[0031] As Figuras 3A a 3E mostram a análise imuno-histoquímica de PT3 no tecido do hipocampo de DA que é anti-amiloide 4G8 positivo. Os anticorpos monoclonais usados foram (A) PT 1, (B) PT2, (C) PT3, (D) AT8 e (E) HT7.
[0032] As Figuras 4A a 4E mostram a análise imuno-histoquímica de PT3 no tecido do hipocampo de controle, que é anti-amiloide 4G8 negativo. Os anticorpos monoclonais usados foram (A) PT 1, (B) PT2, (C) PT3, (D) AT8 e (E) HT7.
[0033] As Figuras 5A a 5B mostram o padrão de coloração específico para fosfo-tau de PT3 em cérebro de camundongo (A) tau nocaute ou (B) de tipo selvagem.
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11/106 [0034] As Figuras 6A a 6B mostram o padrão de coloração específico para não fosfo-tau de tau-1 em cérebro de camundongo (A) tau nocaute e (B) do tipo selvagem.
[0035] A Figura 7 mostra a estrutura cristalina do complexo de Fab de PT3 + peptídeo T212/pT217-tau, com Fab de PT3 mostrado em uma representação de preenchimento de espaço (cinza claro), e o peptídeo de tau mostrado na representação de bastão (preto).
[0036] A Figura 8 mostra a estrutura cristalina do complexo de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pT217-tau, com PT3 mostrado em fitas (cinza claro) com seus resíduos de parátopo mostrados na representação de bastão, e o peptídeo de tau mostrado na representação de bastão (preto).
[0037] A Figura 9 mostra um diagrama de interação para a estrutura de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pT217-tau, com os resíduos de peptídeo mostrados em quadrados pretos com letras brancas, os resíduos VH mostrados em cinza escuro, os resíduos VL mostrados em cinza claro, e em que as linhas pontilhas representam ligações de hidrogênio e as linhas sólidas representam contatos de van der Waals.
[0038] A Figura 10 mostra as sequências das regiões variáveis de cadeia pesada e leve de PT3-HFA, em que as variantes HFA estão alinhadas com as regiões V parentais de PT3 de camundongo (VH10 e VL7), as CDRs parentais transferidas para FRs humanos estão sublinhadas, e a numeração dos resíduos é sequencial.
[0039] A Figura 11 mostra a estrutura cristalina do complexo de B324 + peptídeo T212/pT217-tau, com B324 mostrado em uma representação de preenchimento de espaço (cinza claro), e o peptídeo de tau mostrado na representação de bastão (preto).
[0040] A Figura 12 mostra a estrutura cristalina do complexo de B324 + peptídeo pT212/pT217-tau, com B324 mostrado em fitas (cinza claro) com seus resíduos de parátopo mostrados na representação de bastão, e
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12/106 o peptídeo de tau mostrado na representação de bastão (preto). Note que D92(L) e E93(L) não têm densidade eletrônica nos átomos do grupamento carboxilato da cadeia lateral e Ογ.
[0041] A Figura 13 mostra um diagrama de interação para a estrutura de B324 + peptídeo pT212/pT217-tau, com os resíduos peptídicos mostrados nas caixas pretas com letras brancas, os resíduos VH mostrados em cinza escuro, os resíduos VL mostrados em cinza claro, e em que as linhas pontilhas representam ligações de hidrogênio e as linhas sólidas representam contatos de van der Waals.
[0042] A Figura 14 mostra um desenho esquemático do modelo celular de biossensor de FRET.
[0043] A Figura 15 mostra a inibição por PT3 de indução de agregado K18 semeada por homogenatos de células HEK contendo agregados GFP-tau P301L, conforme determinado com o uso do ensaio de BRET.
[0044] A Figura 16 mostra a inibição por PT3 de indução de agregado K18 semeada por homogenatos da medula espinhal TgP301S, conforme determinado com o uso do ensaio de FRET.
[0045] A Figura 17 mostra os resultados do ensaio de imunodepleção de extrato da espinha dorsal de TgP301 S de camundongo, com dados de 2 experimentos independentes.
[0046] A Figura 18 mostra os resultados ensaio de imunodepleção de extrato de cérebro humano com DA com dados de 2 experimentos (exceto no caso de HT7 e AT8, para os quais n=1). Ο PT3 inibe a semeadura de tau conforme determinado com o uso do ensaio de FRET. [0047] As Figuras 19A a19G mostram um desenho esquemático do modelo de injeção em camundongos transgênicos que expressam tau mutante humana P301L. As imagens imuno-histoquímicas (IHC) mostram coloração representativa de AT8 dos hemisférios injetados de camundongos injetados com (A-B) um extrato de controle 3 meses após a
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13/106 injeção, (C-D) ePHF-tau derivada de cérebro com DA um mês após a injeção e (E-F) ePHF-tau derivada de cérebro com DA três meses após a injeção. (G) Um histograma mostra dados bioquímicos representativos de camundongos tratados com quantidades crescentes de ePHF.
[0048] A Figura 20 mostra o efeito sobre a agregação de tau da administração periférica (IP) de PT3 seguida de semeadura com PHFtau derivada de cérebro com DA em camundongos transgênicos que expressam tau mutante humana P301L.
[0049] A Figura 21 mostra o efeito sobre a agregação de tau da coinjeção de doses decrescentes de PT3 seguidas de semeadura com PHF-tau derivada de cérebro com DA em camundongos transgênicos que expressam tau mutante humana P310L.
[0050] As Figuras 22A a 22C mostram o efeito sobre a agregação de tau de coinjeção combinada com administração periférica IP (via intraperitoneal) de isótipos de PT3 seguida de semeadura com PHFtau derivada de cérebro com DA em camundongos transgênicos que expressam tau mutante humana P301L. Os camundongos tratados de acordo com (A) mostram o efeito em (B) no hemisfério injetado e (C) no hemisfério não injetado.
[0051] As Figuras 23A a 23B mostram os níveis de tau agregadas em homogenatos do cérebro derivados de pacientes com PSP (paralisia supranuclear progressiva) em comparação com os níveis homogenatos de cérebro derivados de pacientes com DA. Os anticorpos monoclonais usados foram (A) AT8 e (B) PT3.
[0052] As Figuras 24A a 24J mostram que a coloração com os anticorpos AT8 (A a C) ou PT3 (D a F) nas crioseções do tecido cerebral de pacientes com DA (A, D) ou pacientes com PSP (B, C, E, F) demonstraram coloração nas regiões anatômicas afetadas em PSP. (G a J) Os controles não mostraram nenhuma coloração.
[0053] As Figuras 25A a 25H mostram sensorgramas de ligação
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14/106 obtidos por SPR para mAbs maturados por afinidade e seus Fabs com PHF-tau. As linhas sólidas (cinza) indicam ajuste cinético com o uso do modelo de ligação bivalente (mAbs) ou o modelo de Langmuir 1:1 (Fabs). (A) mAb B296 (B) mAb B711 (C) mAb B809 (D) mAb B333 (E) Fab de B296 B324(F) Fab de B711 B330(G) Fab de B809 B332 (H) Fab de B333 B331.
[0054] As Figuras 26A a 26B mostram a ligação de PT3-HFA e variantes maturadas por afinidade ao peptídeo pT212/pT217 em um experimento ELISA direto com o uso de (A) mAbs e (B) Fabs.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO [0055] Várias publicações, artigos e patentes são citados ou descritos em segundo plano e ao longo do relatório descritivo; cada uma dessas referências está aqui incorporada por referência em sua totalidade. A discussão de documentos, atos, materiais, dispositivos, artigos ou similares que tenha sido incluída no presente relatório descritivo tem o propósito de fornecer contexto para a invenção. Tal discussão não é uma admissão de que qualquer um ou todos esses assuntos façam parte da técnica anterior no que diz respeito a quaisquer invenções reveladas ou reivindicadas.
Definições [0056] Exceto onde definido em contrário, todos os termos técnicos e científicos utilizados na presente invenção têm o mesmo significado comumente compreendido pelo versado na técnica à qual essa invenção pertence. De outro modo, certos termos utilizados na presente invenção têm os significados conforme definidos no relatório descritivo. Todas as patentes, pedidos de patente publicados e publicações aqui citadas estão aqui incorporados por referência como se aqui fossem apresentados totalmente. É necessário observar que, conforme utilizadas aqui e nas reivindicações em anexo, as formas singulares um, uma, o e a incluem as respectivas formas no plural, a menos que
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15/106 o contexto determine claramente de outro modo.
[0057] Exceto onde especificado de outra forma, qualquer valor numérico, como uma concentração ou uma faixa de concentração aqui descrita, deve ser entendido como sendo modificado em todos os casos pelo termo cerca de. Dessa forma, um valor numérico tipicamente inclui ± 10% do valor mencionado. Por exemplo, uma concentração de 1 mg/ml inclui 0,9 mg/ml a 1,1 mg/ml. De modo semelhante, uma faixa de concentração de 1% a 10% (p/v) inclui 0,9% (p/v) a 11% (p/v). Como usado na presente invenção, o uso de uma faixa numérica inclui expressamente todas as subfaixas possíveis, todos os valores numéricos individuais dentro dessa faixa, incluindo números inteiros dentro dessas faixas, e frações dos valores, a menos que o contexto indique claramente de outro modo.
[0058] Como usado na presente invenção, o termo isolado significa um componente biológico (como um ácido nucleico, peptídeo ou proteína) que foi substancialmente separado, produzido à parte de ou purificado de outros componentes biológicos do organismo no qual o componente ocorre naturalmente, ou seja, outro DNA cromossômico ou extracromossômico e RNA e proteínas. Ácidos nucleicos, peptídeos e proteínas que foram isolados, dessa forma, incluem ácidos nucleicos e proteínas purificados por métodos de purificação padrão. Ácidos nucleicos, peptídeos e proteínas isolados podem ser parte de uma composição e ainda ser isolados se a composição não for parte do ambiente nativo do ácido nucleico, peptídeo ou proteína. O termo também abrange ácidos nucleicos, peptídeos e proteínas preparados por expressão recombinante em uma célula hospedeira assim como os ácidos nucleicos sintetizados quimicamente.
[0059] Como usado na presente invenção, o termo anticorpo ou imunoglobulina é usado em um sentido amplo e inclui moléculas de imunoglobulina ou anticorpo incluindo anticorpos policlonais, anticorpos monoclonais incluindo anticorpos monoclonais murinos, humanos, humanos adaptados, humanizados e quiméricos e fragmentos de anticorpos.
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16/106 [0060] Em geral, os anticorpos são proteínas ou cadeias peptídicas que apresentam especificidade de ligação para um antígeno específico. As estruturas de anticorpos são bem conhecidas. As imunoglobulinas podem ser divididas em cinco classes principais, a saber, IgA, IgD, IgE, IgG e IgM, dependendo da sequência de aminoácidos de domínio constante de cadeia pesada. IgA e IgG são, ainda, subclassificados como os isótipos IgA1, lgA2, IgG 1, lgG2, lgG3 e lgG4. Consequentemente, os anticorpos da invenção podem ser de qualquer das cinco principais classes ou subclasses correspondentes. De preferência, os anticorpos da invenção são IgG 1, lgG2, lgG3 ou lgG4. Os anticorpos da invenção incluem aqueles que têm variações em sua região de Fc de modo a ter propriedades alteradas em comparação com as regiões de Fc de tipo selvagem que incluem, mas não se limitam a, meia vida estendida, ADCC ou CDC reduzida ou aumentada e funções efetoras de Fc silenciado. As cadeias leves de anticorpos de qualquer espécie de vertebrados podem ser atribuídas a um de dois tipos claramente distintos, a saber, kappa (κ) e lambda (λ), com base nas sequências de aminoácidos de seus domínios constantes. Consequentemente, os anticorpos da invenção podem conter um domínio constante de cadeia leve kappa ou lambda. De acordo com modalidades específicas, os anticorpos da invenção incluem regiões constantes de cadeia pesada e/ou de cadeia leve de anticorpos de camundongos ou de seres humanos.
[0061] Em adição aos domínios constantes de cadeia leve e pesada, os anticorpos contêm regiões variáveis de cadeia leve e pesada. Uma região variável de cadeia leve ou pesada de imunoglobulina consiste em uma região framework interrompida por sítios de ligação ao antígeno. Os sítios de ligação ao antígeno são definidos com o uso de vários termos e esquemas de numeração da seguinte forma:
(i) Kabat: Regiões determinantes de complementaridade ou CDRs são com base na variabilidade da sequência (Wu e Kabat, J Exp
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Med. 132:211-50 (1970)). Em geral, o sítio de ligação ao antígeno tem três CDRs em cada região variável (por exemplo, HCDR1, HCDR2 e HCDR3 na região variável de cadeia pesada (VH) e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 na região variável de cadeia leve (VL));
(ii) Chothia: O termo região hipervariável, HVR ou HV se refere às regiões de um domínio variável de anticorpo que são hipervariáveis em estrutura conforme definido por Chothia e Lesk (Chothia e Lesk, J Mol Biol. 196:901-17, 1987). Em geral, o sítio de ligação ao antígeno tem três regiões hipervariáveis em cada VH (H1, H2, H3) e VL (L1, L2, L3). Os sistemas de numeração bem como as anotações de CDRs e VHS foram revistos por Abhinandan e Martinho (Abhinandan e Martin, Mol Immunol. 45:3832-9, 2008);
(iii) IMGT: Uma outra definição das regiões que formam o sítio de ligação a antígeno foi proposta por Lefranc (Lefranc et al., Dev Comp Immunol. 27:55-77, 2003) com base na comparação dos domínios V de imunoglobulinas e receptores das células T. O banco de dados da International ImMunoGeneTics (IMGT) fornece uma numeração e uma definição padronizadas dessas regiões. A correspondência entre delineações de CDRs, HVs e IMGT é descrita em Lefranc et al., 2003, Id.;
(iv) AbM: Um compromisso entre os esquemas de numeração Kabat e Chothia é a convenção de numeração AbM descrita por Martin (Martin ACR (2010) Antibody Engineering, eds Kontermann R, Dubel S (Springer-Verlag, Berlin), Vol 2, pp 33-51).
(v) O sítio de ligação ao antígeno pode também ser delineado com base em Specificity Determining Residue Usage (SDRU) (Almagro, Mol Recognit. 17:132-43, 2004), em que SDR, se refere a resíduos de aminoácidos de uma imunoglobulina que estão diretamente envolvidos no contato com antígeno.
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18/106 [0062] Framework ou sequências de framework são as sequências remanescentes na região variável de um anticorpo diferente daqueles definidos para serem as sequências do sítio de ligação ao antígeno. Como a definição exata de um sítio de ligação a antígeno pode ser determinada por várias delineações, conforme descrito acima, a sequência de framework exata depende da definição do sítio de ligação a antígeno. As regiões framework (FRs) são as porções mais altamente conservadas dos domínios variáveis. Os domínios variáveis de cadeias leves e pesadas nativas compreendem quatro FRs (FR1, FR2, FR3 e FR4, respectivamente) que geralmente adotam uma configuração de folha-beta, conectados pelas três alças hipervariáveis. As alças hipervariáveis em cada cadeia são mantidas juntas muito próximas pela FRs e, com as alças hipervariáveis de outras cadeias, contribuem para a formação de sítio de ligação ao antígeno dos anticorpos. A análise estrutural dos anticorpos revelou a relação entre a sequência e o formato do sítio de ligação formado pelas regiões determinantes de complementaridade (Chothia et ai., J. Mol. Biol. 227: 799-817, 1992; Tramontane et al., J. Mol. Biol. 215:175182,1990). Apesar de sua alta variabilidade da sequência, cinco das seis alças adotam apenas um pequeno repertório de conformações de cadeia principais, chamado estruturas canônicas. Essas conformações são, em primeiro lugar, determinadas pelo comprimento das alças e, em segundo lugar, pela presença de resíduos muito importantes em certas posições nas alças e nas regiões framework que determinam a conformação através de seu empacotamento, a ligação ao hidrogênio ou a capacidade para assumir conformações não usuais de cadeia principal.
[0063] Como usado na presente invenção, o termo fragmento de ligação de antígeno se refere a um fragmento de anticorpo como, por exemplo, um diacorpo, um Fab, um Fab', um F(ab')2, um fragmento Fv (dsFv), um fragmento Fv, um dissulfeto estabilizadas fragmento Fv
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19/106 (dsFv), a (dsFv)2, um dsFv biespecífico dsFv-dsFv'), um diacorpo estabilizado por dissulfureto (diacorpo ds), uma molécula de anticorpo de cadeia única (scFv), um anticorpo de domínio único (sdab), urn dimero de scFv (diacorpo bivalente), um anticorpo multiespecífico formado a partir de uma porção de um anticorpo compreendendo uma ou mais CDRs, um anticorpo de domínio único camelizado, um nanocorpo, um anticorpo de domínio, um anticorpo de domínio bivalente ou qualquer outro fragmento de anticorpo que se liga a um antígeno, mas não compreende uma estrutura do anticorpo. Um fragmento de ligação a antígeno é capaz de se ligar ao mesmo antígeno ao qual o anticorpo parental ou um fragmento de anticorpo parental se liga. De acordo com modalidades específicas, o fragmento de ligação ao antígeno compreende uma região variável de cadeia leve, uma região constante de cadeia leve e um segmento Fd da região constante da cadeia pesada. De acordo com outras modalidades específicas, o fragmento de ligação ao antígeno compreende Fab e F(ab').
[0064] Como usado na presente invenção, o termo anticorpo humanizado se refere a um anticorpo não humano que é modificado para aumentar a homologia de sequência àquela de um anticorpo humano, de modo que as propriedades de ligação ao antígeno do anticorpo sejam retidas, mas sua antigenicidade no corpo humano seja reduzida.
[0065] Como usado na presente invenção, o termo epitopo se refere a um sítio em um antígeno ao qual uma imunoglobulina, anticorpo, ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, se liga especificamente. Os epitopos podem ser formados tanto de aminoácidos contíguos quanto de aminoácidos não contíguos justapostos pela dobra (ou dobramento) terciária de uma proteína. Os epitopos formados de aminoácidos contíguos são tipicamente retidos na exposição aos solventes desnaturantes, enquanto os epitopos formados por dobramento terciário são tipicamente perdidos no tratamento com solventes desnaturantes. Um epitopo tipicamente inclui
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20/106 ao menos 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 ou 15 aminoácidos em uma conformação espacial única. Métodos para determinar a conformação espacial de epitopos incluem, por exemplo, cristalografia de raios X e ressonância magnética nuclear bidimensional. Consulte, por exemplo, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66, G. E. Morris, Ed. 1996).
[0066] Como usado na presente invenção, o termo tau ou proteína tau se refere a uma proteína abundante no sistema nervoso central e periférico que tem múltiplas isoformas. No sistema nervoso central (SNC) humano, seis grandes isoformas principais com tamanho na faixa de 352 a 441 aminoácidos de comprimento existem devido ao splicing alternativo (Hanger et al., Trends Mol Med. 15:112-9 (2009)). As isoformas diferem umas das outras pela inclusão regulada de 0 a 2 inserções N-terminais e 3 ou 4 repetições de ligação de microtúbulos dispostas em tandem e são chamadas de 0N3R (SEQ ID NO: 64), 1N3R (SEQ ID NO: 65), 2N3R (SEQ ID NO: 66), 0N4R (SEQ ID NO: 67), 1N4R (SEQ ID NO: 68) e 2N4R (SEQ ID NO: 69). Como usado na presente invenção, o termo tau de controle se refere à isoforma de tau da SEQ ID NO: 69 que é desprovida de fosforilação e outras modificações pós-traducionais. Como usado na presente invenção, o termo tau inclui proteínas que compreendem mutações, por exemplo, mutações pontuais, fragmentos, inserções, deleções e variantes juncionais de tau tipo selvagem de comprimento total. O termo tau também abrange modificações pós-traducionais da sequência de aminoácidos de tau. As modificações pós-traducionais incluem, mas não se limitam a, fosforilação.
[0067] A proteína tau se liga aos microtúbulos e regula o transporte de carga através das células, um processo que pode ser modulado pela fosforilação de tau. Na doença de Alzheimer e distúrbios relacionados, a fosforilação anormal de tau é prevalente e pensada preceder e/ou de
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21/106 sencadear a agregação de tau em fibrilas, denominada filamentos helicoidais pareados (PHF). O constituinte principal de PHF é a tau hiperfosforilada. Como usado na presente invenção, o termo filamento helicoidal pareado de tau ou PHF-tau se refere a agregados tau em filamentos helicoidais pareados. Duas grandes regiões na estrutura de PHF são evidentes em microscopia eletrônica, a cobertura difusa e o filamento do núcleo; sendo que a cobertura difusa é sensível à proteólise e localizada fora dos filamentos, e o núcleo resistente à protease de filamentos forma a cadeia principal de PHFs Proc Natl Acad Sei USA. 85:4884-8, 1988).
[0068] Um anticorpo humanizado isolado que se liga a PHF-tau ou um anticorpo anti-PHF-tau humanizado isolado, como usado aqui, se refere a um anticorpo anti-PHF-tau humanizado que é substancialmente isento de outros anticorpos que têm diferentes especificidades antigênicas (por exemplo, um anticorpo anti-PHF-tau humanizado isolado é substancialmente isento de anticorpos que especificidade se ligam a outros antígenos diferentes de PHF-tau). Um anticorpo anti-PHF-tau humanizado isolado pode, entretanto, ter reatividade cruzada com outros antígenos relacionados, por exemplo, de outras espécies (como homólogos de espécies PHF-tau).
[0069] Como usado na presente invenção, o termo liga-se especificamente ou ligação específica se refere à capacidade de um anticorpo anti-PHF-tau da invenção de se ligar a um alvo predeterminado com uma constante de dissociação (Kd) de cerca de 1x10-6 M ou mais forte, por exemplo, de cerca de 1 x10-7 M ou menos, cerca de 1x10-8 M ou menos, cerca de 1 x10-9 M ou menos, cerca de 1 x10_1° M ou menos, cerca de 1 x10 11 M ou menos, cerca de 1x10-12 M ou menos ou cerca de 1x10-13 M ou menos. O termo KD é obtido da razão entre Kd e Ka (isto é, Kd/Ka) e é expresso como uma concentração molar (M). Os valores de KD para os anticorpos podem ser determinados com o uso
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22/106 dos métodos na técnica em vista da presente descrição. Por exemplo, o valor de KD de um anticorpo anti-PHF-tau pode ser determinado com o uso de ressonância de plásmon de superfície, como com o uso de um sistema biossensor, por exemplo, um sistema Biacore®, um instrumento Proteon (BioRad), um instrumento KinExA (Sapidyne), ELISA ou ensaios de ligação competitiva conhecidos pelas pessoas versadas na técnica. Tipicamente, um anticorpo anti-PHF-tau se liga a um alvo predeterminado (ou seja, PHF-tau) com uma Kd que é ao menos dez vezes menor que sua Kd para um alvo não específico, conforme medido através da ressonância de plásmon de superfície com o uso de, por exemplo, um Proteon Instrument (BioRad). Os anticorpos antiPHF-tau que se ligam especificamente à PHF-tau podem, entretanto, ter reatividade cruzada com outros alvos relacionados, por exemplo, com o mesmo alvo predeterminado de outras espécies (homólogos). [0070] Como usado na presente invenção, o termo polinucleotídeo, chamado de molécula de ácido nucleico, nucleotídeos ou ácidos nucleicos, se refere a qualquer polirribonucleotídeo ou polidesoxirribonucleotídeo, que pode ser RNA ou DNA não modificado ou RNA ou DNA modificado. Os polinucleotídeos incluem, mas não se limitam, ao DNA de fita simples e dupla, DNA que é uma mistura de regiões de fita simples e dupla, RNA de fita simples e dupla e RNA que é a mistura de regiões de fita simples e dupla, moléculas híbridas que compreendem DNA e RNA que podem ser de fita simples ou, mais tipicamente, fita dupla, ou uma mistura de regiões de fita simples e fita dupla. Além disso, polinucleotídeo refere-se a regiões de fita tripla que compreendem RNA ou DNA ou ambos RNA e DNA. O termo polinucleotídeo inclui DNAs ou RNAs contendo uma ou mais bases modificadas e DNAs ou RNAs com a cadeia principal modificada para estabilidade ou por outros motivos. Bases modificadas incluem, por exemplo, bases tritiadas e bases incomuns, como inosina. Uma variedade de modificações pode ser feita no
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DNA e no RNA; dessa forma, polinucleotídeo abrange formas quimicamente, enzimaticamente ou metabolicamente modificadas de polinucleotídeos como tipicamente encontradas na natureza, assim como as formas químicas de DNA e RNA características de vírus e células. Polinucleotídeo também abrange cadeias relativamente curtas de ácido nucleico, com frequência, chamadas de oligonucleotídeos.
[0071] Como usado na presente invenção, um vetor é um replicon, no qual outro segmento de ácido nucleico pode ser operacionalmente inserido de forma a ocasionar a replicação ou a expressão do segmento. [0072] Como usado na presente invenção, o termo célula hospedeira se refere a uma célula que compreende uma molécula de ácido nucleico da invenção. A célula hospedeira pode ser qualquer tipo de célula, por exemplo, uma célula primária, uma célula em cultura ou uma célula de uma linhagem celular. Em uma modalidade, uma célula hospedeira é uma célula transfectada com uma molécula de ácido nucleico da invenção. Em outra modalidade, uma célula hospedeira é uma progenia ou uma progenia potencial de tal célula transfectada. A progenia de uma célula pode ou não ser idêntica à célula original, por exemplo, devido a mutações ou influências ambientais que podem ocorrer nas gerações subsequentes ou integração da molécula de ácido nucleico no genoma da célula hospedeira.
[0073] O termo expressão como usado aqui, se refere à biossíntese de um produto gênico. Esses termos abrangem a transcrição de um gene no RNA. O termo também abrange a tradução do RNA em um ou mais polipeptideos e abrange, ainda, todas as modificações pós-transcricionais e pós-traducionais de ocorrência natural. O anticorpo expresso humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a PHF-tau pode estar dentro do citoplasma de uma célula hospedeira, no meio extracelular, como no meio de crescimento de uma cultura celular, ou ancorado à membrana celular.
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24/106 [0074] Como usado na presente invenção, o termo veículo se refere a qualquer excipiente, diluente, carga, sal, tampão, estabilizador, solubilizador, óleo, lipídio, vesícula contendo lipídio, microesfera, encapsulação em lipossomas ou outro material bem conhecido na técnica para uso em formulações farmacêuticas. Deve-se compreender que as características do veículo, excipiente ou diluente dependerão da via de administração para uma aplicação particular. Como usado na presente invenção, o termo veículo farmaceuticamente aceitável se refere a um material não tóxico que não interfere com a eficácia de uma composição de acordo com a invenção ou com a atividade biológica de uma composição de acordo com a invenção. De acordo com modalidades específicas, em vista da presente descrição, qualquer veículo farmaceuticamente aceitável adequado ao uso na composição farmacêutica de anticorpo pode ser usado na invenção.
[0075] Com usado na presente invenção, o termo indivíduo se refere a um animal e, de preferência, um mamífero. De acordo com modalidades particulares, o indivíduo é um mamífero que inclui um não primata (por exemplo, um camelo, jumento, zebra, vaca, porco, cavalo, cabra, ovelha, gato, cachorro, rato, coelho, porquinho-da-índia ou camundongo) ou um primata (por exemplo, um macaco, chimpanzé ou ser humano). Em modalidades particulares, o indivíduo é um ser humano.
[0076] Como usado na presente invenção, o termo quantidade terapeuticamente eficaz se refere a uma quantidade de um ingrediente ou componente ativo que induz a resposta biológica ou medicinal desejada em um indivíduo. Uma quantidade terapeuticamente eficaz pode ser determinada empiricamente e de maneira rotineira, em relação à finalidade declarada. Por exemplo, testes in vitro podem ser opcionalmente usados para ajudar a identificar faixas de dosagem ótimas. A seleção de uma determinada dose eficaz específica pode ser determinada (por exemplo,
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25/106 através de ensaios clínicos) pelos versados na técnica com base na consideração de vários fatores, incluindo a doença a ser tratada ou evitada, os sintomas envolvidos, a massa corpórea do paciente, o estado imune do paciente e outros fatores conhecidos pelo versado na técnica. A dosagem que precisa ser empregada na formulação também irá depender da via de administração e da gravidade da doença, e deve ser decidida de acordo com o julgamento do profissional e as circunstâncias de cada paciente. As dosagens eficazes podem ser extrapoladas de curvas de resposta à dosagem, derivadas dos sistemas de teste de modelo de animal ou in vitro.
[0077] Como usados na presente invenção, os termos tratar, tratando e tratamento destinam-se a referir a uma melhora ou reversão de ao menos um parâmetro físico mensurável relacionado a uma taupatia que é não necessariamente discernível no indivíduo, mas que pode ser discernível no indivíduo. Os termos tratar, tratando e tratamento também podem se referir a causar a regressão, evitar a progressão ou, pelo menos, diminuir a progressão da doença, distúrbio ou condição. Em uma modalidade específica, tratar, tratando e tratamento referem-se a um alívio, prevenção do desenvolvimento ou início, ou redução na duração de um ou mais sintomas associados à taupatia. Em uma modalidade particular, tratar, tratando e tratamento referem-se à prevenção da recorrência da doença, distúrbio ou condição. Em uma modalidade particular, tratar, tratando e tratamento referem-se a um aumento na sobrevivência de um indivíduo que tem a doença, distúrbio ou condição. Em uma modalidade particular, tratar, tratando e tratamento referem-se à eliminação da doença, distúrbio ou condição no indivíduo.
[0078] Como usado aqui uma taupatia abrange qualquer doença neurodegenerativa que envolve a agregação patológica da tau no cé
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26/106 rebro. Além da DA familiar e esporádica, outras taupatias exemplificadoras são demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de CreutzfeltJakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, e encefalopatia traumática crônica, como demência pugilística (doença do boxe) (Morris et al., Neuron, 70:410-26, 2011).
[0079] Como usado uso na presente invenção, o termo em combinação, no contexto da administração de duas ou mais terapias a um indivíduo, se refere ao uso de mais de uma terapia. O uso do termo em combinação não restringe a ordem em que as terapias são administradas a um indivíduo. Por exemplo, uma primeira terapia (por exemplo, uma composição aqui descrita) pode ser administrada antes de (por exemplo, 5 minutos, 15 minutos, 30 minutos, 45 minutos, 1 hora, 2 horas, 4 horas, 6 horas, 12 horas, 16 horas, 24 horas, 48 horas, 72 horas, 96 horas, 1 semana, 2 semanas, 3 semanas, 4 semanas, 5 semanas, 6 semanas, 8 semanas ou 12 semanas antes), concomitantemente com, ou posteriormente a (por exemplo, 5 minutos, 15 minutos, 30 minutos, 45 minutos, 1 hora, 2 horas, 4 horas, 6 horas, 12 horas, 16 horas, 24 horas, 48 horas, 72 horas, 96 horas, 1 semana, 2 semanas, 3 semanas, 4 semanas, 5 semanas, 6 semanas, 8 semanas ou 12 semanas depois) da administração de uma segunda terapia a um indivíduo.
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Anticorpos anti-PHF-tau [0080] Em um aspecto geral, a invenção se refere a anticorpos monoclonais isolados ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que se ligam a PHF-tau. Tais anticorpos anti-PHF-tau podem ter as propriedades de ligação de um epitopo fosforilado em PHF-tau ou ligação a um epitopo não fosforilado em PHF-tau. Os anticorpos anti-PHF-tau podem ser úteis como agentes terapêuticos, e como reagentes de pesquisa ou diagnóstico para detectar PHF-tau em amostras biológicas, por exemplo, em tecidos ou células.
[0081] De acordo com um aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo no domínio rico em prolina da proteína tau. Em um aspecto mais específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a um a proteína tau fosforilada em um epitopo que compreende os resíduos T212 e/ou T217 fosforilados. Em um aspecto mais específico, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a um epitopo fosforilado de qualquer das SEQ ID NOs: 48, 52 e 54. Em um aspecto ainda mais específico, a invenção se refere a um anticorpo monoclonal isolado ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a um epitopo fosforilado da SEQ ID NO: 48. O anticorpo da invenção pode ser um anticorpo humanizado.
[0082] A Tabela 1 mostra as regiões variáveis de cadeia pesada e leve para 5 mAbs humanizados que se ligam a fosfo-tau pela SEQ ID NO. As sequências de cadeia pesada e leve também são mostradas para o mAb humanizado B296. Este mAb foi maturado por afinidade (consulte a Tabela 3).
[0083] A Tabela 2 mostra resíduos do sítio de ligação a antígeno
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28/106 (isto é, regiões CDR) de anticorpos exemplificadores da invenção definidos de acordo com os esquemas de numeração de Chothia, ABM, Kabat e IMGT. As sequências de aminoácido das regiões variáveis de cadeia pesada exemplificadoras são mostradas nas SEQ ID NOs: 26 a 29, e as sequências de aminoácidos das regiões variáveis de cadeia leve exemplificadoras são mostradas nas SEQ ID NOs: 31 a 34.
[0084] A Tabela 3 mostra as sequências de anticorpos monoclonais maturados por afinidade gerados a partir de B296 (isto é, B333, B711 e B809). As sequências da região variável estão sublinhadas nas sequências de cadeia pesada e leve. Os aminoácidos em negrito aminoácidos nas CDRs dos anticorpos monoclonais maturados por afinidade indicam uma substituição em comparação com a sequência da CDR B296. As sequências da CDR são determinadas vv de numeração de Kabat.
Tabela 1: mAbs de fosfo-tau humanizado
mAb Vh Vl Cadeia pesada Cadeia leve
B235 26 31
B252 28 34
B280 26 34
B282 28 31
B296 27 31 45 46
Tabela 2: Seauências de CDF para os domínios VH (VH10) e VL (VL7)
do anticorpo anti-PHF-tau humanizado B296
Esquema de numeração de Chothia
ID da região V CDR-1 CDR-2 CDR-3
VH10 GFTFSSY (SEQ ID NO: 1) SKGGN (SEQ ID NO: 2) GWGDYGWFAY (SEQ ID NO: 3
VL7 ASQDINRYLN (SEQ ID NO: 13) RANRLLD (SEQ ID NO: 14) LQYDEFPLT (SEQ ID NO: 15)
Esquema de numeração de ABM
CDR-1 CDR-2 CDR-3
VH10 GFTFSSYAMS (SEQ ID NO: 4) SISKGGNTY (SEQ ID NO: 5) GWGDYGWFAY (SEQ ID NO: 6)
VL7 KASQDINRYLN (SEQ ID NO: 16) RANRLLD (SEQ ID NO: 17) LQYDEFPLT (SEQ ID NO: 18)
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Esquema de numeração de Kabat
CDR-1 CDR-2 CDR-3
VH10 SYAMS (SEQ ID NO: 7) SISKGGNTYYADSVK G (SEQ ID NO: 8) GWGDYGWFAY (SEQ ID NO: 9)
VL7 KASQDINRYLN (SEQ ID NO: 19) RANRLLD (SEQ ID NO: 20) LQYDEFPLT (SEQ ID NO: 21)
Esquema de numeração de IMGT
CDR-1 CDR-2 CDR-3
VH10 GFTFSSYA (SEQ ID NO: 10) ISKGGNT (SEQ ID NO: 11) ARGWGDYGWFAYW (SEQ ID NO: 12)
VL7 QDINRY (SEQ ID NO: 22) RAN (SEQ ID NO: 23) LQYDEFPLT (SEQ ID NO: 24)
Tabela 3: Afinidade maturada B296
mAb Nome SEQ ID NO Sequência
PT1B333
VH CDR1 80 SSYAMS
CDR2 81 SISKGGNTYYADSVKG
CDR3 9 GWGDYGWFAY
Cadeia pe- sada 74 QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLE
WVASISKGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAV
YYCARGWGDYGWFAYWGQVTLVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSG
GTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLS SVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPC PAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKF NWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKC KVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLT CLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLT VDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
Vl CDR1 70 KASQDINRWLN
CDR2 20 RANRLLD
CDR3 21 LQYDEFPLT
Cadeia leve 75 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDINRWLNWFQQKPGKAPK
SLIYRANRLLDGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCLQ
YDEFPLTFGQGTKLEIK RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCL
LNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLT LSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
PT1B711
Vh CDR1 71 TSYAMS
CDR2 72 SITKGGNTYYADSVKG
CDR3 73 GWGIYGWFAY
Cadeia pe- sada 76 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTSYAMSWVRQAPGK
GLEWVASITKGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLR
AEDTAVYYCARGWGIYGWFAYWGQVTLVTVSS ASTKGPSVFPL
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mAb Nome SEQ ID NO Sequência
APSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFP AVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKK VEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTP EVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQP REPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQ PENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMH EALHNHYTQKSLSLSPGK
VL CDR1 70 KASQDINRWLN
CDR2 20 RANRLLD
CDR3 21 LQYDEFPLT
Cadeia leve 77 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDINRWLNWFQQKPGKAP
KSLIYRANRLLDGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC
LQYDEFPLTFGQGTKLEIK RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASV
VCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS TLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
PT1B809
Vh CDR1 71 TSYAMS
CDR2 72 SITKGGNTYYADSVKG
CDR3 73 GWGIYGWFAY
Cadeia pe- sada 78 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTSYAMSWVRQAPG
KGLEWVASITKGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNS
LRAEDTAVYYCARGWGIYGWFAYWGQVTLVTVSS ASTKGPSVF
PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHT FPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVD KKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR TPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK GQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWES NGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCS VMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
Vl CDR1 19 KASQDINRYLN
CDR2 20 RANRLLD
CDR3 21 LQYDEFPLT
Cadeia leve 79 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDINRYLNWFQQKPG
KAPKSLIYRANRLLDGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPED
FATYYCLQYDEFPLTFGQGTKLEIK RTVAAPSVFIFPPSDE
QLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTE QDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTK SFNRGEC
0085] Os anticorpos humanizados têm resíduos de framework da região variável substancialmente de um anticorpo humano (chamado de anticorpo aceptor) e regiões determinantes de complementaridade subs
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31/106 tancialmente de um anticorpo não humano (isto é, anticorpo de camundongo), (chamado de imunoglobulina doadora). Consulte Queen et ai., Proc. Natl. Acad. Sei. EUA. 86:10029-10033, 1989, WO 90/07861, US5693762, US5693761, US5585089, US5530101 e US5225539. As regiões constantes, se estiverem presentes, são também substancialmente ou inteiramente de uma imunoglobulina humana. Os domínios variáveis humanos são geralmente escolhidos dentre anticorpos humanos cujas sequências de framework apresentam um alto grau de identidade com os domínios murinos da região variável dos quais as CDRs foram derivadas. Os resíduos de framework da região variável de cadeia pesada e leve podem ser derivados das mesmas, ou diferentes, sequências de anticorpos humanos. As sequências de anticorpos humanos podem ser as sequências de anticorpos humanos de ocorrência natural ou podem ser sequências consenso de vários anticorpos humanos. (Consulte US 92/22653). Certos aminoácidos dos resíduos de framework da região variável humana são selecionados para substituição com base em sua possível influência na conformação de CDR e/ou na ligação ao antígeno. A investigação de tais possíveis influências é por modelagem, análise das características dos aminoácidos em locais específicos, ou observação empírica dos efeitos de substituição ou mutagênese de aminoácidos específicos.
[0086] Por exemplo, quando um aminoácido difere entre um resíduo de framework de murino de região variável e um resíduo de framework humano de região variável selecionado, o aminoácido de framework humano deve ser substituído pelo aminoácido de framework equivalente a partir do anticorpo de camundongo quando é razoavelmente esperado que o aminoácido: (1) se liga não covalente ao antígeno diretamente, (2) está em posição adjacente a uma região CDR (3) interage de outro modo interage com uma região CDR (por exemplo, está dentro de cerca de 6 angstroms de uma região CDR), ou (4)
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32/106 participa na interface VL-VH.
[0087] Outros candidatos para substituição são aminoácidos do framework humano aceptores que são incomuns para uma imunoglobulina humana naquela posição. Estes aminoácidos podem ser substituídos com aminoácidos da posição equivalente do anticorpo de camundongo doador ou das posições equivalentes de imunoglobulinas humanas mais típicas. Outros candidatos para substituição são aminoácidos do framework humano aceptores que são incomuns para uma imunoglobulina humana naquela posição. Os frameworks da região variável das imunoglobulinas humanizadas geralmente mostram ao menos 85% de identidade de sequência com uma sequência de framework da região variável humana ou consenso de tais sequências.
[0088] A humanização de anticorpos pode ser realizada com o uso de métodos bem conhecidos, como resurfacing de resíduos determinantes de especificidade (SDRR) (US2010/0261620), (Padlan et al., Mol. Immunol. 28:489-98, 1991), super-humanização (WO 04/006955) e human string content optimization (US7657380). As sequências de framework humanas úteis para enxerto ou humanização podem ser selecionadas a partir de bases de dados relevantes pelas pessoas versadas na técnica. Os frameworks selecionados podem ser ainda modificados para a preservar ou melhorar a afinidade de ligação por técnicas como aquelas reveladas em Queen et al., 1989, Id. De acordo com modalidades específicas, os métodos para humanizar anticorpos anti-PHF-tau a partir de anticorpos parentais de camundongo incluem aqueles descritos no Exemplo 4 abaixo.
[0089] Os anticorpos da presente invenção podem ser produzidos por uma variedade de técnicas, por exemplo pelo método de hibridoma (Kohler e Milstein, Nature. 256:495-7, 1975). Os anticorpos monoclonais quiméricos contendo uma região variável de cadeia leve e cadeia pesada derivados de um anticorpo doador (tipicamente murino) em associação
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33/106 com regiões constantes de cadeia leve e pesada derivados de um anticorpo aceptor (tipicamente uma outra espécie de mamífero como humano) podem ser preparados por um método revelado no documento US4816567. Os anticorpos monoclonais enxertados por CDR que têm CDRs derivadas de uma imunoglobulina doadora não humana (tipicamente murina) e as partes derivadas de imunoglobulina restantes da molécula sendo derivadas de uma ou mais imunoglobulinas humanas podem ser preparados por técnicas conhecidas pelos versados na técnica como a revelada em US5225539. Os anticorpos monoclonais totalmente humanos desprovidos de quaisquer sequências não humanas podem ser preparados a partir de camundongos transgênicos de imunoglobulina humana por técnicas mencionadas em (Lonberg et al., Nature. 368:856-9, 1994; Fishwild et al., Nat Biotechnol. 14:845-51, 1996; Mendez etal., Nat Genet. 15:146-56, 1997). Os anticorpos monoclonais humanos podem também ser preparados e otimizados a partir de bibliotecas de exibição em fago (Knappik et al., J Mol Biol. 296:57-86, 2000; Krebs et al., J Immunol Methods. 254:67-84, 2001; Shi et al., J Mol Biol. 397:385-96, 2010).
[0090] Os anticorpos monoclonais da presente invenção compreendendo um anticorpo que tem uma HCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 1,4, 7, 10, 71,80; uma HCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 2, 5, 8, 11,72, 81; uma HCDR3 de qualquer das SEQ ID NOs: 3,6,9, 12, 73; uma LCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 13, 16, 19, 22, 70; uma LCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 14, 17, 20, 23; uma LCDR3 de qualquer das SEQ ID NOs: 15, 18, 21,24. A invenção também abrange anticorpos monoclonais que têm sequências de CDR que são ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idênticas, de preferência ao menos 99% idênticas a uma HCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 1, 4, 7, 10, 71, 80; uma HCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 2, 5, 8, 11,72, 81; uma HCDR3
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34/106 de qualquer das SEQ ID NOs: 3, 6, 9, 12, 73; uma LCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 13, 16, 19, 22, 70; uma LCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 14, 17, 20, 23; uma LCDR3 de qualquer das SEQ ID NOs: 15, 18, 21,24.
[0091] De acordo com um aspecto específico, a invenção se refere a anticorpos humanizados isolados ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que compreendem:
(1) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, respectivamente LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 16, 17 e 18, respectivamente;
(2) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 1, 2 e 3, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 13, 14 e 15, respectivamente;
(3) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 7, 8 e 9, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
(4) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 10, 11 e 12, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 22, 23 e 24, respectivamente;
(5) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 80, 81 e 9, respectivamente, e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
(6) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 71, 72, 73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID
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NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
(7) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 71, 72 e 73, respectivamente, e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptideos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
(8) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
(9) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34;
(10) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34; ou (11) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
sendo que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo se liga ao PHF-tau, de preferência, ao PHF-tau humano, e sendo que as regiões framework no domínio da região variável da cadeia pesada e no domínio da região variável da cadeia leve compreendem sequências de aminoácidos de uma imunoglobulina humana. [0092] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptideos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao
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36/106 menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica às SEQ ID NOs: 26, 27, 28 ou 29, ou uma região variável de cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica às SEQ ID NOs: 31,32, 33 ou 34.
[0093] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, com mais preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95% idêntica, e com mais preferência 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável em uma cadeia pesada de qualquer das SEQ ID NOs: 74, 76, e 78, ou uma região variável de cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável em uma cadeia leve de qualquer das SEQ ID NOs: 75, 77 e 79.
[0094] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 26, e uma região variável de cadeia leve tendo a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e
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37/106 com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 31.
[0095] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção refere-se a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 28 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 34.
[0096] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção referese a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 26 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80% do polipeptídeo, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 34.
[0097] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção refere-se a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a
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38/106 máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 28 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 31.
[0098] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção refere-se a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 27 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 31.
[0099] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada tendo a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, com mais preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95% idêntica, e com a máxima preferência 98%, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável na cadeia pesada da SEQ ID NO: 74, e uma região variável de cadeia leve tendo a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável na cadeia leve da SEQ ID NO: 75.
[0100] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção referese a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno
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39/106 do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada tendo a sequência de polipeptídeos de ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, com mais preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95% idêntica, com mais preferência 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável na cadeia pesada da SEQ ID NO: 76 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável na cadeia leve da SEQ ID NO: 77. [0101] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção refere-se a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma região variável de cadeia pesada tendo a sequência de polipeptídeos de ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, com mais preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95% idêntica, com mais preferência 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável na cadeia pesada da SEQ ID NO: 78 e uma região variável de cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica à região variável na cadeia leve da SEQ ID NO: 79.
[0102] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 45 e uma cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência
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40/106 ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 46. De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende uma cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 45, e uma cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 46.
[0103] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 74 e uma cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 75. De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende uma cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 74, e uma cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 75.
[0104] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 76 e uma cadeia leve que tem
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41/106 uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 77. De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende uma cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 76, e uma cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 77.
[0105] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo humanizado isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que compreende uma cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 78 e uma cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 79. De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende uma cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 78, e uma cadeia leve que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 79.
[0106] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, que compreende uma região constante de lgG1 de cadeia pesada humana e uma região constante kappa de cadeia leve humana.
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42/106 [0107] De acordo com um outro aspecto específico, a invenção se refere a um anticorpo isolado humanizado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, sendo que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno se liga à PHF-tau humana com uma constante de dissociação (Kd) de 5χ10“9 M ou menos, de preferência uma Kd de 1x10“9 M ou menos ou 1x10“1° M ou menos, sendo que Kd é medida por análise de ressonância de plasmón de superfície, como pelo uso de um sistema Biacore ou ProteOn.
[0108] A atividade funcional de anticorpos humanizados e fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que se ligam à PHF-tau pode ser caracterizada por métodos conhecidos na técnica e conforme descrito na presente invenção. Os métodos para caracterizar anticorpos e fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que se ligam à PHFtau incluem, mas não se limitam a, ensaios de afinidade e especificidade, incluindo análise Biacore, ELISA e FACS; análise imuno-histoquímica; ensaios celulares in vitro e ensaios em vivo com injeção para determinar a eficácia dos anticorpos na inibição da semeadura de tau; ensaios de citotoxicidade celular para detectar a presença de atividade de citotoxicidade mediada por célula dependente de anticorpo (ADCC) e de atividade de citotoxicidade dependente de complemento (CDC) dos anticorpos; etc. De acordo com modalidades específicas, os métodos para caracterizar anticorpos e fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos que se ligam ao PHF-tau incluem aqueles descritos nos Exemplos 5, 6, 8 e 9 abaixo. Um anticorpo parental de camundongo exemplificador de anticorpos humanizados que se ligam ao PHF-tau mas não controlam tau é o anticorpo PT3, que tem uma região variável de cadeia pesada da SEQ ID NO: 25 e uma região variável de cadeia leve (VL) da SEQ ID NO: 30 (consulte por exemplo, a patente US n° 9.371.376 que está aqui incorporada a título de referência em sua totalidade).
[0109] Várias metodologias bem conhecidas podem ser utilizadas
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43/106 para determinar o epitopo de ligação dos anticorpos da invenção. Por exemplo, quando as estruturas de ambos os componentes individuais são conhecidas, a ancoragem de proteína de proteína silico pode ser executada para identificar sítios compatíveis de interação. A troca de hidrogênio deutério (H/D) pode ser executada com o antígeno e o complexo anticorpo para mapear regiões no antígeno que são ligadas pelo anticorpo. A mutagênese do ponto ou segmento do antígeno pode ser usada para localizar os aminoácidos importantes para a ligação de anticorpo. A estrutura cocristalina de um complexo de anticorpo-antígeno é usada para identificar resíduos que contribuem para o epitopo e o parátopo. De acordo com modalidades específicas, os métodos para determinar o epitopo de ligação dos anticorpos da invenção incluem aqueles descritos nos Exemplos 2, 3 e 7 abaixo.
[0110] Os anticorpos da invenção podem ser biespecíficos ou multiespecíficos. Um anticorpo biespecífico exemplificador pode se ligar a dois epitopos distintos em PHF-tau ou pode se ligar ao PHF-tau e beta amiloide (Abeta). Um outro anticorpo biespecífico exemplificador pode ligar PHF-tau e um receptor de transcitocose de barreira cerebral endógena como receptor de insulina, receptor de transferência, receptor de fator-1 de crescimento similar à insulina e receptor de lipoproteína. Um anticorpo exemplificador é do tipo IgG 1.
[0111] As propriedades de atuador imunológico dos anticorpos da invenção podem ser acentuadas ou silenciadas através de modificações Fc por técnicas conhecidas para aqueles versados na técnica. Por exemplo, as funções efetoras de Fc como a ligação de C1q, citotoxicidade dependente de complemento (CDC), citotoxicidade mediada por célula dependente de anticorpo (ADCC), fagocitose, regulação descendente de receptores de superfície celular (por exemplo, receptor de célula B; BCR), etc. podem ser fornecidas e/ou controladas por meio da modificação dos resíduos no Fc responsável por essas atividades. As
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44/106 propriedades farmacocinéticas podem também ser acentuadas por resíduos mutantes no domínio Fc que estendem a meia-vida do anticorpo (Strohl, Curr Opin Biotechnol. 20:685-91 (2009).
[0112] Além disso, os anticorpos da invenção podem ser modificados após a tradução por processos, como glicosilação, isomerização, deglicosilação ou modificação covalente de ocorrência não natural, como a adição de porções de poli(glicol etilênico) (peguilação) e lipidação. Tais modificações podem ocorrer in vivo ou in vitro. Por exemplo, os anticorpos da invenção podem ser conjugados ao poli(glicol etilênico) (PEGuilado) para otimizar seus perfis farmacocinéticos. A conjugação pode ser realizada por técnicas conhecidas das pessoas versadas na técnica. Foi demonstrado que a conjugação de anticorpos terapêuticos com PEG acentua a farmacodinâmica enquanto não interfere com a função (Knight et al., Plateles. 15:409-18, 2004; Leong et al., Cytokine. 16:106-19, 2001; Yang et al., Protein Eng. 16:761-70, 2003).
[0113] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um ácido nucleico isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção. Será entendido pelos versados na técnica que a sequência de codificação de uma proteína pode ser alterada (por exemplo, substituída, deletada, inserida, etc.) sem alterar a sequência de aminoácidos da proteína. Consequentemente, será entendido pelos versados na técnica que sequências de ácido nucleico que codificam anticorpos humanizados ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos da invenção podem ser alterados sem alterar as sequências de aminoácidos das proteínas. Polinucleotídeos isolados exemplificadores são polinucleotídeos que codificam polipeptídeos que compreendem as CDRs de cadeia pesada de imunoblogulina HCDR1, HCDR2 e HCDR3 mostradas nas SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, respectivamente, ou polipeptídeos que compreende CDRs de cadeia leve de imunoglobulina LCDR1. LCDR2 e LCDR3 mostrados nas SEQ ID NOs: 16,
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45/106 e 18, respectivamente. Outros polinucleotídeos isolados exemplificadores são polinucleotídeos tendo as sequências mostradas nas SEQ ID NOs: 36 a 39 ou 41 a 44, que codificam as regiões variáveis de anticorpo da invenção. Outros polinucleotídeos que, dada a degeneração do código genético ou preferências de códon em um dado sistema de expressão, codificam os anticorpos da invenção, também estão dentro do escopo da invenção. Os ácidos nucleicos isolados da presente invenção podem ser feitas com o uso de técnicas recombinantes ou sintéticas bem conhecida. O DNA que codifica a anticorpos monoclonais é prontamente isolado e sequenciado com o uso de métodos conhecidos na técnica. Quando uma hibridoma é produzida, tais células podem servir como uma fonte de tal DNA. Alternativamente, técnicas de exibição em que a sequência de codificação e o produto de tradução são ligados, como bibliotecas de exibição de fago ou ribossomal, podem ser usadas. [0114] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um vetor que compreende um ácido nucleico isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção. Qualquer vetor conhecido pelos versados na técnica, em vista da presente descrição, pode ser usado, como um plasmídeo, cosmídeo, um vetor de fago ou um vetor viral. Em algumas modalidades, o vetor é um vetor de expressão recombinante como um plasmídeo. O vetor pode incluir qualquer elemento para estabelecer uma função convencional de um vetor de expressão, por exemplo, um promotor, elemento de ligação ao ribossoma, terminador, intensificador, marcador de seleção e origem de replicação. O promotor pode ser um promotor constitutivo, induzível ou reprimível. Vários vetores de expressão capazes de liberar ácidos nucleicos a uma célula são conhecidos na técnica e podem ser usados na presente invenção para a produção de um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo na célula. Técnicas de clonagem convencionais ou síntese de gene artificiais podem
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46/106 ser usadas para gerar um vetor de expressão recombinante de acordo com as modalidades da invenção.
[0115] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a uma célula hospedeira que compreende um polinucleotídeo isolado que codifica um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção. Qualquer célula hospedeira conhecida pelos versados na técnica em vista da presente descrição pode ser usada para a expressão recombinante de anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos da invenção. Tais células hospedeiras podem ser células eucarióticas, células bacterianas, células vegetais ou células de arquea. As células eucarióticas exemplificadoras podem ser de origem de mamífero, de inseto, de aves ou de outra origem animal. As células eucarióticas de mamífero incluem linhagens celulares imortalizadas, como linhagens celulares de hibridoma ou mieloma, como linhagens celulares de murino SP2/0 (American Type Culture Collection (ATCC), Manassas, Va, EUA CRL-1581), NSO (European Collection of Cell Cultures (ECACC), Salisbury, Wiltshire, Reino Unido, ECACC n° 85110503), FO (ATCC CRL-1646) e Ag653 (ATCC CRL-1580). Uma linhagem celular de mieloma humana exemplificadora é U266 (ATTC CRL-TIB-196). Outras linhagens celulares úteis incluem aquelas derivadas de células de ovário de hamster chinesa (CHO) como CHO-K1 SV (Lonza Biologies), CHO-K1 (ATCC CRL-61, Invitrogen) ou DG44.
[0116] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método de produção de um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção, que compreende cultivar uma célula que compreende um polinucleotídeo que codifica o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo sob condições para produzir um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção, e recuperar o anticorpo ou o fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da célula ou cultura celular
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47/106 (por exemplo, do sobrenadante). Os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antigeno dos mesmos expressos podem ser colhidos das células e purificados de acordo com técnicas convencionais conhecidas na técnica.
Composições farmacêuticas e métodos de tratamento [0117] Anticorpos anti-PHF-tau da invenção ou fragmentos dos mesmos da invenção podem ser usados para tratar, reduzir ou evitar sintomas em pacientes que têm uma doença neurodegenerativa que envolve agregação patológica de tau dentro do cérebro, ou uma taupatia, como pacientes que sofrem de DA.
[0118] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a uma composição farmacêutica que compreende uma molécula de ácido nucleico que codifica uma proteína de fusão da invenção e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0119] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para tratar ou reduzir sintomas de uma doença, distúrbio ou condição, como uma taupatia, em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo uma composição farmacêutica da invenção.
[0120] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método para reduzir a agregação de tau patológica ou disseminação de taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo uma composição farmacêutica da invenção.
[0121] De acordo com modalidades da invenção, a composição farmacêutica compreende uma quantidade terapeuticamente eficaz do anticorpo monoclonal anti-PHF-tau ou fragmento de ligação ao antigeno do mesmo. Como usado aqui com referência aos anticorpos anti-PHFtau humanizados ou fragmentos de ligação ao antigeno dos mesmos, uma quantidade terapeuticamente eficaz significa uma quantidade do anticorpo monoclonal anti-PHF-tau ou fragmento de ligação ao antigeno
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48/106 do mesmo que resulta no tratamento de uma doença, distúrbio ou condição; evita ou retarda a progressão da doença, distúrbio ou condição; ou reduz ou alivia completamente os sintomas associados à doença, distúrbio ou condição do sistema imune.
[0122] De acordo com as modalidades particulares, uma quantidade terapeuticamente eficaz se refere à quantidade de terapia que é suficiente para alcançar um, dois, três, quatro ou mais dos seguintes efeitos: (i) reduzir ou melhorar a gravidade da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (ii) reduzir a duração da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (iii) evitar a progressão da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (iv) causar a regressão da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (v) evitar o desenvolvimento ou o início da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (vi) evitar a recorrência da doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (vii) reduzir a hospitalização de um indivíduo que tem a doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (viii) reduzir o período de hospitalização de um indivíduo que tem a doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (ix) aumentar a sobrevida de um indivíduo com a doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo; (xi) inibir ou reduzir a doença, distúrbio ou condição a ser tratado, ou um sintoma associado ao mesmo em um indivíduo; e/ou (xii) melhorar ou aprimorar o efeito profilático ou terapêutico (ou os efeitos profiláticos e terapêuticos) de outra terapia.
[0123] De acordo com modalidades específicas, a doença, distúrbio ou condição a ser tratada é uma taupatia. De acordo com modalidades mais específicas, a doença, distúrbio ou condição a ser tratada, inclui,
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49/106 mas não se limita a, doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de CreutzfeltJakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica, ou demência pugilística (doença do boxe).
[0124] Um fenotipo de comportamento relacionado a taupatia inclui, mas não se limita a, disfunção cognitiva, alteração e desinibição precoces da personalidade, apatia, abulia, mutismo, apraxia, perseveração, movimentos/comportamentos estereotipados, hiperoralidade, desorganização, incapacidade de planejar ou organizar tarefas sequenciais, egoísmo/insensibilidade, traços antissociais, uma falta de empatia, hesitação, discurso agramático com frequentes erros parafrásicos mas com compreensão relativamente preservada, prejuízo da compreensão e dificuldades para encontrar as palavras, instabilidade lentamente progressiva da marcha, retropulsões, congelamento, quedas frequentes, rigidez axial não responsiva à levodopa, paralisia supranuclear do olhar, sacadas em onda quadrada, sacadas verticais lentas, paralisia pseudobulbar, apraxia dos membros, distonia, perda sensorial cortical, e tremor responsive rigidez axiais, paralisia supranuclear do olhar, onda quadrada corrompas, lento saccades verticais, paralisia pseudobulbar,
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50/106 membro apraxia, distonia, perda sensorial corticais, e tremores.
[0125] Os pacientes passíveis de tratamento incluem, mas não se limitam a, indivíduos assintomáticos em risco de DA ou outras taupatia, bem como pacientes atualmente mostrando sintomas. Os pacientes passíveis de tratamento incluem indivíduos que têm um risco genético conhecido de DA, como uma história familiar de DA ou presença de fatores de risco genético no genoma. Os fatores de risco exemplificadores são mutações na proteína precursora amiloide (APP), especialmente na posição 717 e nas posições 670 e 671 (mutações Hardy e Swedish, respectivamente). Outros fatores de risco são mutações nos genes de presenilina PS1 e PS2 e em ApoE4, histórico familiar de hipercolesterolemia ou ateroesclerose. Os indivíduos atualmente sofrendo de DA podem ser reconhecidos a partir de característica demência pela presença dos fatores de risco descritos acima. Além disso, uma série de testes de diagnóstico estão disponíveis para identificar os indivíduos que têm DA. Estes incluem medição dos níveis de fluido cerebroespinhal-tau e Abeta 42. Níveis elevados de tau e diminuídos de Abeta 42 significam a presença de DA. Os indivíduos que sofrem de DA podem também ser diagnosticados por DA e critérios de associação de distúrbios relacionados.
[0126] Os anticorpos anti-PHF-tau da invenção são adequados tanto como agentes terapêuticos e profiláticos para tratar ou evitar doenças neurodegenerativas que envolvem agregação patológica da tau, como DA ou outras taupatias. Em pacientes assintomáticos, o tratamento pode começar em qualquer idade (por exemplo, cerca de 10, 15, 20, 25, 30 anos). Normalmente, no entanto, não é necessário iniciar o tratamento até que um paciente atinja cerca de 40, 50, 60 ou 70 anos. O tratamento tipicamente envolve múltiplas dosagens durante um período de tempo. O tratamento pode ser monitorado por testes de anticorpo, ou respostas de células T ou células B ativadas ao agente terapêutico ao longo do tempo. Se a resposta falhar, uma dose de reforço
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51/106 pode ser indicada.
[0127] Em aplicações profiláticas, as composições ou medicamentos farmacêuticos são administrados a um paciente suscetível a, ou de outro modo em risco de, DA em uma quantidade suficiente para eliminar ou reduzir o risco, diminuir a gravidade, ou retardar o início da doença, incluindo sintomas bioquímicos, histológicos e/ou comportamentais da doença, suas complicações e fenótipos patológicos intermediários apresentados durante o desenvolvimento da doença. Em aplicações terapêuticas, as composições ou medicamentos são administrados a um paciente suspeito de, ou que já sofre de tal distúrbio, como uma doença, em uma quantidade suficiente para reduzir, interromper, ou desacelerar quaisquer dos sintomas da doença (bioquímicos, histológicos e/ou comportamentais). A administração de um agente terapêutico pode reduzir ou eliminar disfunção cognitiva leve em pacientes que ainda não desenvolveram a patologia característica de Alzheimer.
[0128] A quantidade terapeuticamente eficaz ou a dosagem pode variar de acordo com vários fatores, como a doença, distúrbio ou condição a ser tratada, os meios de administração, o sítio alvo, o estado fisiológico do indivíduo (incluindo, por exemplo, idade, peso corporal, saúde), se o indivíduo é um ser humano ou um animal, outros medicamentos administrados, e se o tratamento é profilático ou terapêutico. As dosagens de tratamento são idealmente tituladas para otimizar a segurança e a eficácia.
[0129] Os anticorpos da invenção podem ser preparados na forma de composições farmacêuticas contendo uma quantidade terapeuticamente eficaz do anticorpo como um ingrediente ativo em um veículo farmaceuticamente aceitável. Os veículos podem ser líquidos, como água e óleos, incluindo aqueles de origem de petróleo, animal, vegetal ou sintética, como óleo de amendoim, óleo de soja, óleo mineral, óleo de gergelim e similares. Por exemplo, podem ser usadas solução salina a
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0,4% e glicina a 0,3%. Estas soluções são estéreis e, em geral, isentas de matéria particulada. Elas podem ser esterilizadas através de técnicas de esterilização convencionais bem conhecidas (por exemplo, filtração). As composições podem conter substâncias auxiliares farmaceuticamente aceitáveis conforme exigido para aproximá-las das condições fisiológicas, como agentes tamponantes e ajustadores de pH, estabilizantes, espessantes, lubrificantes e corantes, etc. A concentração dos anticorpos da invenção em tal formulação farmacêutica pode variar amplamente, isto é, desde menor que cerca de 0,5%, habitualmente a ou ao menos cerca de 1% até tanto quanto 15% ou 20%, em peso, e será selecionada principalmente com base na dosagem exigida, nos volume de fluido, nas viscosidades, etc., de acordo com o modo específico de administração selecionado.
[0130] O modo de administração para uso terapêutico dos anticorpos da invenção pode ser qualquer via adequada que libere o agente ao hospedeiro. Por exemplo, as composições descritas na presente invenção podem ser formuladas de modo a serem adequadas para a administração parenteral, por exemplo, intradérmica, via intramuscular, intraperitoneais, intravenosa, subcutânea, intranasal ou administração intracraniana, ou eles podem ser administrados no fluido cerebroespinhal do cérebro ou na espinha dorsal.
[0131] O tratamento pode ser dado em um esquema de dose única, ou como um cronograma de doses múltiplas em que um curso primário de tratamento pode ser com 1 a 10 doses separadas, seguido de outras doses administradas em intervalos de tempo subsequentes necessários para manter e/ou reforçar a resposta, por exemplo, a 1 a 4 meses para uma segunda dose e, se necessário, uma ou mais doses subsequentes após vários meses. Exemplos de cronogramas de tratamento adequados incluem: (i) 0, 1 mês e 6 meses, (ii) 0, 7 dias e 1 mês, (iii) 0 e 1 mês, (iv) 0 e 6 meses, ou outros cronogramas suficientes para obter as respostas desejadas que se espera reduzam os sintomas
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53/106 da doença, ou reduzir a gravidade da doença.
[0132] Os anticorpos da invenção podem ser liofilizados para armazenamento e reconstituídos em um veículo adequado antes do uso. Esta técnica mostrou-se eficaz com preparações de proteínas convencionais e as técnicas de reconstituição e de liofilização conhecidas na técnica podem ser utilizadas.
[0133] De acordo com modalidades específicas, uma composição usada no tratamento de uma taupatia pode ser usado em combinação com outros agentes que são eficazes para o tratamento de doenças neurodegenerativas relacionados. No caso de DA, os anticorpos da invenção podem ser administrados em combinação com agentes que reduzem ou evitam a deposição de beta amiloide (Abeta). É possível que as patologias de PHF-tau e Abeta sejam sinérgicas. Portanto, a terapia de combinação que direciona a depuração de ambos PHF-tau e Abeta e patologias relacionadas a Abeta ao mesmo tempo pode ser mais eficaz do que o direcionamento de cada um individualmente. No caso da doença de Parkinson e doenças neurodegenerativas associadas, a modulação imunológica para limpar formas agregadas da proteína alfa-sinucleína é também uma terapia emergente. Uma terapia de combinação que tem como alvo a remoção de ambas as proteínas tau e alfa-sinucleína simultaneamente pode ser mais eficaz do que direcionar qualquer proteína individualmente.
[0134] Em um outro aspecto geral, a invenção se refere a um método de produção de uma composição farmacêutica que compreende um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção, que compreende combinar um anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo com um veículo farmaceuticamente aceitável para obter a composição farmacêutica.
Métodos de diagnóstico e kits [0135] Os anticorpos monoclonais anti-PHF-tau da invenção podem ser usados em métodos de diagnóstico de DA ou outras taupatias em um
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54/106 indivíduo.
[0136] Dessa forma, em um outro aspecto geral, a invenção se refere a métodos para detectar a presença de PHF-tau em um indivíduo ou métodos para diagnosticar taupatias em um indivíduo mediante a detecção da presença de PHF-tau em um indivíduo com o uso de um anticorpo monoclonal ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo da invenção.
[0137] A tau fosforilada pode ser detectada em uma amostra biológica de um indivíduo (por exemplo, amostra de sangue, soro, plasma, fluido intersticial, fluido cerebroespinhal) pelo contato da amostra biológica com o reagente anticorpo de diagnóstico, e detectar a ligação do anticorpo reagente de diagnóstico com a tau fosforilada na amostra do indivíduo. Ensaios para realizar a detecção incluem métodos bem conhecidos como ELISA, imuno-histoquímica, western blot, ou imageamento in vivo. Um anticorpo de diagnóstico exemplificador é o anticorpo PT3 da invenção.
[0138] Anticorpos de diagnóstico ou reagentes similares podem ser administrados através de injeção intravenosa no corpo do paciente, ou diretamente no cérebro por qualquer via adequada que libere o agente ao hospedeiro. A dosagem do anticorpo deve estar dentro das mesmas faixas dos métodos de tratamento. Tipicamente, o anticorpo é marcado, embora em alguns métodos, o anticorpo primário com afinidade pela tau fosforilada seja não marcado, e um agente de marcação secundário é usado para se ligar ao anticorpo primário. A escolha da marcação depende dos meios de detecção. Por exemplo, um marcador fluorescente é adequado para detecção óptica. O uso de marcadores paramagnéticos é adequado para detecção tomográfica sem intervenção cirúrgica. Marcadores radioativos podem também ser detectados com o uso de PET ou SPECT.
[0139] O diagnóstico é feito comparando-se o número, tamanho,
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55/106 e/ou a intensidade de PHF-tau marcada, agregados de tau, e/ou emaranhados neurofibrilares em uma amostra do indivíduo ou no indivíduo, aos valores de base correspondentes. Os valores da linha de base podem representar os níveis médios em uma população de indivíduos saudáveis. Os valores da linha de base podem também representar níveis anteriores determinados no mesmo indivíduo.
[0140] Os métodos de diagnóstico descritos acima podem também ser usados para monitorar a resposta do indivíduo à terapia mediante a detecção da presença de tau fosforilada em um indivíduo antes, durante ou após o tratamento. Uma diminuição nos valores em relação à linha de base sinaliza uma resposta positiva ao tratamento. Os valores podem também aumentar temporariamente em fluidos biológicos conforme o tau patológico é eliminado do cérebro.
[0141] A presente invenção é ainda direcionada a um kit para executar os métodos de diagnóstico e monitoramento descritos acima. Tipicamente, tais kits contêm um reagente de diagnóstico, como os anticorpos da invenção, e, opcionalmente, um marcador detectável. O anticorpo de diagnóstico em si pode conter o marcador detectável (por exemplo, molécula fluorescente, biotina, etc.) que é detectável diretamente ou por meio de uma reação secundária detectável (por exemplo, reação com estreptavidina). Alternativamente, um segundo reagente contendo o marcador detectável pode ser usado, sendo que o segundo reagente tem especificidade de ligação para o anticorpo primário. Em um kit diagnóstico adequado para medir PHF-tau em uma amostra biológica, os anticorpos do kit podem ser fornecidos pré-ligados a uma fase sólida, como aos poços de uma placa de microtitulador.
[0142] O conteúdo de todas as referências citadas (incluindo referências da literatura, patentes concedidas, pedidos de patente publicados, e todos os pedidos de patentes copendentes) ao longo deste pedido estão aqui expressamente incorporadas a título de referência.
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Modalidades [0143] A descrição também fornece as seguintes modalidades não limitadoras.
[0144] A modalidade 1 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado no domínio rico em prolina da proteína tau.
[0145] A modalidade 2 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado que compreende T212 fosforilado da proteína tau, de preferência, o anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a um epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 54.
[0146] A modalidade 3 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado que compreende T217 fosforilado da proteína tau, de preferência, o anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a um epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 52.
[0147] A modalidade 4 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado que compreende T212 fosforilado e T217 fosforilado da proteína tau, de preferência, o anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a um epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 48.
[0148] A modalidade 5 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno que compreende:
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57/106 (1) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, respectivamente LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 16, 17 e
18, respectivamente;
(2) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 1, 2 e 3, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 13, 14 e 15, respectivamente;
(3) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 7, 8 e 9, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
(4) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 10, 11 e 12, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 22, 23 e 24, respectivamente;
(5) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 80, 81 e 9, respectivamente, e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
(6) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 71,72,73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
(7) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 71, 72 e 73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs:
19, 20 e 21, respectivamente;
(8) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3
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58/106 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
(9) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34;
(10) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 34; ou (11) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptideos da SEQ ID NO: 31;
sendo que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a PHF-tau, e sendo que as regiões framework no domínio da região variável da cadeia pesada e no domínio da região variável da cadeia leve compreendem sequências de aminoácidos a partir de uma imunoglobulina humana.
[0149] A modalidade 6 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptideos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica às SEQ ID NOs: 26, 27, 28 ou 29, ou uma região variável de cadeia leve que tem uma sequência de polipeptideos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência
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100% idêntica às SEQ ID NOs: 31,32, 33 ou 34.
[0150] A modalidade 7 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno que compreende uma região variável de cadeia pesada que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica às SEQ ID NOs: 74, 76, e 78, ou uma região variável de cadeia leve que tem uma sequência de polipeptídeos ao menos 80%, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à região variável em uma cadeia leve de qualquer das SEQ ID NOs: 75, 77 e 79.
[0151] A modalidade 8 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno que compreende:
(1) uma Vh que tem a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e a VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
(2) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 28 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34;
(3) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34;
(4) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 28 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
(5) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 27 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
(6) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 74 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da cadeia leve da
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SEQ ID NO: 75;
(7) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da cadeia pesada da SEQ ID NO: 76 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da cadeia leve da SEQ ID NO: 77; ou (8) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da cadeia pesada da SEQ ID NO: 78 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da cadeia leve da SEQ ID NO: 79.
[0152] A modalidade 9 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação ao antígeno compreendendo uma cadeia pesada que tem a sequência de polipeptídeos ao menos 80, de preferência, ao menos 85%, com mais preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95% idêntica, com amis preferência ao menos 98% idêntica, com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 45 e uma cadeia leve que tem a sequência ao menos 80% do polipeptídeo, de preferência ao menos 85%, de preferência ao menos 90%, com mais preferência ao menos 95%, com mais preferência ao menos 98% idêntica, e com a máxima preferência 100% idêntica à SEQ ID NO: 46.
[0153] A modalidade 10 é o anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação de antígeno de qualquer das modalidades 1 a 9, que compreende uma região constante de IgG 1 de cadeia pesada humana e uma região constante kappa de cadeia leve humana.
[0154] A modalidade 11 é o anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 10, sendo que o anticorpo ou fragmento de ligação a antígeno se liga a PHFtau humano com um Kd de 5χ10-9 M ou menos, de preferência um Kd de 1 x 10’9 M ou menos ou 1 χ 10“1° M ou menos, sendo que a Kd é medida por análise de ressonância de plásmon de superfície, como pelo uso de um sistema Biacore.
[0155] A modalidade 12 é um ácido nucleico isolado que codifica o anticorpo monoclonal ou o fragmento de ligação a antígeno de qualquer
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61/106 das modalidades 1 a 12.
[0156] A modalidade 13 é um vetor que compreende o ácido nucleico isolado da modalidade 12.
[0157] A modalidade 14 é uma célula hospedeira que compreende o ácido nucleico da modalidade 13.
[0158] A modalidade 15 é uma composição farmacêutica que compreende o anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11 e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0159] A modalidade 16 é um método para reduzir a agregação patológica de tau ou a disseminação de taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo a composição farmacêutica da modalidade 15.
[0160] A modalidade 17 é um método de tratamento de uma taupatia, em um indivíduo que necessita do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo uma quantidade terapeuticamente eficaz da composição farmacêutica da modalidade 15.
[0161] A modalidade 18 é o método da modalidade 17, que compreende ainda administrar ao indivíduo um agente adicional para tratar a taupatia no indivíduo que precisa do mesmo.
[0162] A modalidade 19 é um método para tratar uma taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, que compreende administrar ao indivíduo a composição farmacêutica da modalidade 15, sendo que a taupatia é selecionada do grupo que consiste em taupatia ser selecionada do grupo que consiste em doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibri
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62/106 lares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de CreutzfeltJakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica e demência pugilística (doença do boxe).
[0163] A modalidade 20 é o método da modalidade 19, que compreende ainda administrar ao indivíduo um agente adicional para tratar a taupatia no indivíduo que precisa do mesmo.
[0164] A modalidade 21 é um método para produzir o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11, que compreende cultivar uma célula que compreende um ácido nucleico que codifica o anticorpo ou fragmento de ligação a antígeno sob condições para produzir o anticorpo ou fragmento de ligação a antígeno, e recuperar o anticorpo ou o fragmentos de ligação ao antígeno da célula ou cultura celular.
[0165] A modalidade 22 é um método para produzir uma composição farmacêutica que compreende o anticorpo monoclonal ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11, que compreende combinar o anticorpo ou fragmento de ligação a antígeno com um veículo farmaceuticamente aceitável para obter a composição farmacêutica.
[0166] A modalidade 23 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11 para uso no tratamento de uma taupatia, em um indivíduo que precisa do mesmo.
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63/106 [0167] A modalidade 24 é um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11 ou da composição farmacêutica da modalidade 15 para uso no tratamento de uma taupatia, como doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de Creutzfelt-Jakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica, ou demência pugilística (doença do boxe), em um indivíduo que precisa do mesmo.
[0168] A modalidade 25 é um uso de um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11 para a fabricação de um medicamento no tratamento de uma taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo.
[0169] A modalidade 26 é um uso de um anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno de qualquer das modalidades 1 a 11 para a fabricação de um medicamento para tratar uma taupatia, com doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com
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64/106 grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-StrãusslerScheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de Creutzfelt-Jakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica, ou demência pugilística (doença do boxe), em um indivíduo que precisa do mesmo.
[0170] A modalidade 27 é um método para detectar a presença de tau fosforilada em uma amostra biológica de um indivíduo, que compreende colocar a amostra biológica em contato com o anticorpo ou fragmento de ligação a antigeno de qualquer das modalidades 1 a 11, e detectar a ligação do anticorpo ou fragmento de ligação a antigeno com a PHF-tau na amostra do indivíduo.
[0171] A modalidade 28 é o método da modalidade 27, em que a amostra biológica é um sangue, soro, plasma, fluido intersticial ou amostra de fluido espinal cerebral.
[0172] A modalidade 29 é um método para diagnosticar uma taupatia em um indivíduo mediante a detecção da presença de tau fosforilada em uma amostra biológica do indivíduo, que compreende colocar a amostra biológica em contato com o anticorpo ou fragmento de ligação a antigeno de qualquer das modalidades 1 a 11, e detectar a ligação do anticorpo ou fragmento de ligação a antigeno com o PHF-tau na amostra do indivíduo.
Exemplos [0173] Os exemplos a seguir da invenção são fornecidos para ilustrar ainda a natureza da invenção. Deve-se compreender que os exemplos a seguir não limitam a invenção e que o escopo da invenção é
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65/106 determinado pelas reivindicações em anexo.
Exemplo 1 - Caracterização de anticorpo [0174] Ο PT3 e um conjunto de anticorpos derivados da imunização de um camundongo Balb/c com PHF-tau enriquecido (ePHF-tau) de cérebro com DA foi testado quanto à seletividade alvo para fosfotau versus não fosfo-tau em um ensaio imunoabsorvente ligado a enzima direta (ELISA), Western blot e imuno-histoquímica (IHC). Ο PT3 é um anticorpo derivado de hibridoma de camundongo que tem a sequência de aminoácidos da região variável de cadeia pesada da SEQ ID NO: 25 e a sequência de aminoácidos da região variável da cadeia leve da SEQ ID NO: 30. As sequências da CDR para os domínios VH e VL de PT3 são mostrados na patente US n° 9.371.376. Ο PT3 foi humanizado com o uso do método de adaptação de framework humano (HFA) (consulte o Exemplo 4) para gerar anticorpos anti-fosfotau humanizados da invenção (consulte as Tabelas 1 e 2). Ο B296 humanizado tem as mesmas sequências da CDR que PT3. O mAb B296 humanizado foi maturado por afinidade para gerar anticorpos adicionais da invenção (consulte a Tabela 3).
ELISA [0175] Ο PT3 recombinante como IgG 1 de camundongo (mlgG1) foi avaliado quanto à ligação com PHF-tau e tau do tipo selvagem humano recombinante em formato ELISA. Este PT3 derivado recombinantemente foi comparado com ο PT3 purificado derivado de hibridoma. Os resultados demonstraram curvas de titulação de ligação comparáveis entre bateladas de anticorpos derivados de hibridoma purificados e PT3 recombinantemente derivados (Figura 1). Forte ligação estava presente no PHF-tau, e ligação mínima estava presente no tau solúvel nas concentrações mais altas.
Western Blot [0176] A análise Western blot foi realizada com PT3 contra tau humana
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66/106 recombinante, não fosforilada, purificada e PHT-tau insolúvel em sarcosil preparadas de cérebro com DA. Ο PT3 mostrou uma reatividade seletiva com PHF-tau, similar aos anticorpos de referência fosfo-seletivos AT8 pS202/pT205/pS208 (Mercken et al., ACTA Neuropathol. 84(3):265-72, 1992; Malia et al., Proteins. 84:427-434, 2016) e AT100 pT212/pS214 (Mercken et al., 1992, Id.; Hoffmann et al., Biochemistry. 36(26):8114-24,1997) (Figura 2). O anticorpo de referência fosfo-independente HT7 (Mercken, Ph.D. Thesis: University of Antwerp, Wilrijk-Antwerp, 1991) reagiu com tau recombinante e PHF-tau. BT2, que é direcionado a um epítopo que é fosfo-sensível, reagiu apenas com tau recombinante não fosforilada em S199/S202 (Mercken, 1991, Id.). Em outros experimentos de western blot, ο PT3 mostrou uma fraca reatividade com o tau recombinante mesmo quando transferido (blotted) a uma concentração mais alta. Imuno-histoguímica em cérebro humano [0177] Análise imuno-histoquímica foi realizado em seções do cérebro com DA e de controle que foram embebidas em parafina e fixadas em formalina para confirmar a reatividade com taupatia in situ. Ο PT3 mostrou um padrão de reatividade similar, mas mais forte, ao controle positivo, anticorpo diagnóstico taupatia-específico de referência AT8 (Figura 3). Nenhuma reação significativa com tau normal no cérebro de controle foi detectada sob essas condições experimentais (Figura 4).
Imuno-histoquímica em camundongos do tipo nocauteados (knock-out do tipo selvagem e nocauteados tau [0178] A análise de IHC foi realizada com PT3 em cérebro de camundongo nocauteado de tipo selvagem e knockout tau. A análise de IHC com PT3 em cérebro de camundongo do tipo selvagem indica que um grupamento selecionado de tau do tipo selvagem pode ser observado sob condições de conservação ótima do epítopo. O padrão de coloração de PT3 revela uma localização somatodentritica (Figura 5, seta), reminiscente da
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67/106 coloração descrita na literatura para anticorpos anti-fosfo-tau em tecido derivado de biópsia em seres humanos e ratos (Matsuo et al., Neuron. 13(4):989-1002,1994). O padrão típico de coloração axonal não-fosfo para tau, conforme observado com o anticorpo tau-1 (Figura 6, seta) não está presente, indicando que PT3 tem reatividade limitada com o pool fisiologicamente importante de tau ligado a microtúbulo. A ausência de reatividade em o tau nocautear Animais confirma o tau especificidade do PT3 padrão de coloração.
[0179] A presença de fosforilação no epítopo de PT3 (pT212/pT217, consulte o Exemplo 2) no cérebro de camundongo do tipo selvagem é suportada pela detecção de fosforilação no camundongo homólogo de T212 e T217 em análise por espectrometria de massa por Morris et al. (NatNeurosci. 18(8):1183-9, 2015). Sugere que o epítopo de PT3 também estará presente em um estágio inicial de fosforilação da tau e formação do agregado, que seria preferível para um epítopo do anticorpo terapêutico.
Avaliação da ligação por ressonância de plásmon de superfície (SPR, surface plasmon resonance) [0180] As interações com PHF-tau e tau recombinante foram avaliadas por SPR em instrumentos ProteOn (Bio Rad, Hercules, CA, EUA) e Biacore (Biacore, Uppsala, Suécia) para anticorpos anti-PHF-tau PT1 e PT3. O anticorpo tau total HT7 foi testado como um controle positivo, e AT8 foi testado como um anticorpo anti-PHF-tau de referência.
[0181] As Tabelas 4 e 5 mostram resultados representativos da avaliação de afinidade dos anticorpos com PHF-tau e tau recombinante. O anticorpo monoclonal PT3 mostrou ligação muito apertada ao PHF-tau (Tabela 4).
Tabela 4. Afinidades medidas com ProteOn SPR para hibridoma e mAbs e Fabs recombinantes com PHF-tau
Nome mAb/Fab kon (1/Ms) kOff(1/s) Kd (pM) a
mAbHT7 (7,06±0,62)x105 (9,26±2,77)x10'5 131±41
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mAb PT1 (hyb) 2,01x105 6,47x10'5 322
mAb PT3 (rec mG2a) (3,12±0,40) x10® <5,0x10'5 <16
Fab PT3 (1,83±0,08)x10® (1,15±0,02)x10‘4 63±3
mAb AT8 (hyb) (2,30±0,19) x10® (2,11 ±0,07) x10'4 92±8
Fab AT8 (8,89±0,87) x105 (2,30±0,14) x10'2 25.844±2.995
Para n>3 réplicas, o desvio padrão é relatado;
hyb, mAb expresso por hibridoma; rec, mAb recombinante;
a Os valores de Kd em parênteses foram obtidos por exclusão da concentração de mAb injetada de 75 nM.
[0182] A afinidade de ligação aparente (Kd) de PT3-mG2a recombinante foi igual a ou mais forte que 16 pM com velocidades de dissociação muito lentas. Apenas uma ligação muito fraca ao tau recombinante foi observada para PT3 expresso por hibridoma em uma de quatro réplicas (Tabela 5).
Tabela 5: Afinidades medidas com SPR/Biacore para hibridoma e mAbs e Fabs recombinantes com tau recombinante
Nome mAb/Fab kon (1/Ms) koft (1/s) Kd (pM)
mAb HT7 (3,86±2,00)x10® (1,18±0,54)x102 3,050±2,110
mAb PT1 (hyb) Sem ligação significativa a
mAb PT3 (hyb) Baixa ligação observada apenas em 1 de 4 réplicas a
mAb PT3 (rec mG2a) Sem ligação
Fab PT3 Sem ligação
mAb AT8 (hyb) Sem ligação a
hyb, mAb expresso por hibridoma; rec, recombinante;
a Testado em ProteOn com tau recombinante da Sigma Aldrich (St. Louis, MO, EUA) (0,12 a 75 nM nas diluições 5x) que foi posteriormente determinado como sendo agregado. Para todas as outras amostras testadas, tau recombinante gerado in-house foi usado no Biacore.
[0183] Devido à natureza multimérica/agregada do PHF-tau com múltiplas cópias do epítopo e a natureza bivalente das IgGs, a afinidade dos anticorpos monoclonais foi influenciada pela avidez nesse formato de estudo. A afinidade de Fab fornece informações sobre a afinidade intrínseca
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69/106 do anticorpo. O Fab de PT3 mostrou uma forte afinidade de ligação intrínseca com PHF-tau (Kd, = 63 pM) e uma taxa de dissociação lenta (Tabela 4). A reatividade do Fab com tau recombinante em SPR Biacore estava abaixo do limite de detecção sob as condições da análise (Tabela 5).
[0184] Os estudos de caracterização demonstraram que PT3 se liga seletivamente a PHF-tau e que PT3 tem uma alta afinidade em relação ao PHF-tau derivado do cérebro com DA.
Exemplo 2 - Mapeamento do epitopo de PT3 [0185] O epitopo de PT3 foi determinado por ressonância de plásmon de superfície (ProteOn) com um painel de fosfopeptídeos representados na Tabela 6.
[0186] Materiais e Métodos. O Fab de PT3 (B187) foi produzido como uma versão quimérica com uma região variável de camundongo e uma região constante IgG 1/k humana, com uma etiqueta His6x no terminal C da cadeia pesada (VH10, SEQ ID NO: 25) e VL7 (SEQ ID NO: 30). O Fab foi produzido por expressão temporária em células HEK-293, purificado por cromatografia de afinidade com níquel, e dialisado em 20 mM de Tris, pH 7,4, 50 mM de NaCI (Sino Biologicals).
[0187] A afinidade de ligação do Fab de PT3 em relação a cada um do catorze fosfopeptídeos tau mostrados na Tabela 6 foi avaliada por ressonância de plasmón de superfície (SPR) com o uso de Bio-Rad ProteOn XPR36. Os peptídeos foram sintetizados por métodos químicos convencionais (New England Peptide) com biotina de cadeia curta e uma porção PEG4 no terminal N. O peptídeo radbiotinilado foi capturado em urn chip de biossensor NLC revestido com neutravidina e um fluxo de Fab de PT3 escorreu sobre superfície para medir parâmetros cinéticos.
[0188] Todos os experimentos foram realizados a 25°C com o uso de solução salina tamponada com fosfato, pH de 7,4, 0,005% de Tween-20 (PBST), que foi usado como tampão de corrida e tampão e diluição de amostra. Antes de executar as amostras, o chip NLC foi condicionado NLC
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70/106 executando STFT sobre a superfície do chip durante 1 horas. Aproximadamente 5 a 10 RU de peptídeo foi capturado na superfície do circuito integrado por diluição do peptídeo para 10 ng/mL em PBST e injeção sobre os canais de fluxo a 30 pL/min durante 100 segundos. Diluições seriais de Fab PT3 (1,1 a 90 nM) foram analisadas e, com a exceção do peptídeo-8, cada concentração foi medida em duplicata. Após a captura de peptídeos, a titulação de anticorpo foi injetada a 60 pL/min por 3 minutos (fase de associação), seguido de 300 segundos de tampão apenas (fase de dissociação).
[0189] Os dados foram duplamente referenciados por subtração da resposta interposta e as curvas geradas pela injeção de tampão apenas. A superfície do chip foi regenerada com o uso de uma única injeção de 0,85% de ácido fosfórico a 30 pL/min durante 100 segundos de tempo de contato, seguido de quatro injeções de tampão de corrida antes da próxima injeção de titulação de anticorpos. O processamento dos dados e a análise cinética foram feitas com o uso de software do instrumento. Os dados foram analisados com o uso de um modelo de ligação simples Langmuir 1:1.
[0190] Resultados. As constantes de velocidade de cinética e afinidades de ligação de equilíbrio para o Fab de PT3 são mostradas na Tabela 6. Tabela 6: Dados de afinidade de ProteOn SPR para ligação de Fab PT3 aos peptídeos
Nome do peptídeo Sítios fosforilados Sequência*** KD média (nM) Faixa de KD ou Desvio-padrão (nM) ka média (1/Ms) faixa de ka ou Desvio-pa- drão (1/Ms) kd média (1/S) faixa de kd ou STDEV (1/S) #de réplicas
Peptídeo-1 212/214/217 GTPGSRSR(pT)P(pS)LP(pT)PPTRE PKK (SEQ ID NO: 47 0,26 0,14-0,38 1,27 E+06 (0,87- 1,67) E+06 2,80 E-04 (2,36 - 3,24) E-04 2
Peptídeo-2 212/217 GTPGSRSR(pT)PSLP(pT)PPTREPK K(SEQ ID NO: 48 0,27 0,09 - 0,45 7,64 E+05 (5,46 - 9,82) E+05 1,68 E-04 (0,91 - 2,45) E-04 2
Peptídeo-3* 214/217 GTPGSRSRTP(pS)LP(pT)PPTREPK K(SEQ ID NO: 49 5,57 1,64 1,04 E+06 2,83 E+06 5,47 E-03 1,77 E-04 3
Peptídeo-4 210/217 GTPGSR(pS)RTPSLP(pT)PPTREPK K(SEQ ID NO: 50 6,60 6,48-6,71 9,68 E+05 (9,22 - 9,68) E+05 6,27 E-03 (6,19-6,27) E-03 2
Peptídeo-5 210/214/217 GTPGSR(pS)RTP(pS)LP(pT)PPTRE PKK (SEQ ID NO: 51 8,70 6,6- 10,8 7,04 E+05 (5,45 - 8,63) E+05 5,84 E-03 (5,69 - 5,98) E-03 2
Peptídeo-6 217 GTPGSRSRTPSLP(pT)PPTREPKK (SEQ ID NO: 52 11,4 10,9- 11,9 5,41 E+05 (5,24 - 5,58) E+05 6,16 E-03 (6,06 - 6,25) E-03 2
Peptídeo-7 212/214 GTPGSRSR(pT)P(pS)LPTPPTREPK K(SEQ ID NO: 53 13,5 11,3- 15,7 4,22 E+05 (3,57 - 4,87) E+05 5,55 E-03 (5,49 - 5,60) E-03 2
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71/106
Nome do peptídeo Sítios fosforilados Sequência*** KD média (nM) Faixa de KD ou Desvio-padrão (nM) ka média (1/Ms) faixa de ka ou Desvio-pa- drão (1/Ms) kd média (1/S) faixa de kd ou STDEV (1/S) #de réplicas
Peptídeo-8** 212 GTPGSRSR(pT)PSLPTPPTREPKK (SEQ ID NO: 54 23 n/a 2,81 E+05 n/a 6,46 E-03 n/a 1
Peptídeo-9 214 GTPGSRSRTP(pS)LPTPPTREPKK (SEQ ID NO: 55 >500 n/a n/a n/a n/a n/a 1
Peptídeo-10 210/214 GTPGSR(pS)RTP(pS)LPTPPTREPK K(SEQ ID NO: 56 >500 n/a n/a n/a n/a n/a 2
Peptídeo-11# 208/212/214 SPGTPG(pS)RSR(pT)P(pS)LPTPPT (SEQ ID NO: 57 nenhuma li- gação n/a n/a n/a n/a n/a 1
Peptídeo-12 210 GTPGSR(pS)RTPSLPTPPTREPKK (SEQ ID NO: 58 nenhuma li- gação n/a n/a n/a n/a n/a 2
Peptídeo-13 214/220 GTPGSRSRTP(pS)LPTPP(pT)REPK K(SEQ ID NO: 59 nenhuma li- gação n/a n/a n/a n/a n/a 2
Peptídeo-C Nenhum GTPGSRSRTPSLPTPPTREPKK (SEQ ID NO: 60 nenhuma li- gação n/a n/a n/a n/a n/a 4
Para n=2, a faixa é relatada;
* Para o peptídeo-3, n=3, o desvio padrão é relatado;
** Para o peptídeo-8, n=1, nenhuma média ou faixa é relatada;
*** A menos que observado, todos os peptídeos incluem resíduos de tau 204 a 225 (isoforma 2N4R) e contêm uma porção de biotina de cadeia curta (SCBiot) e dPEG4 no N-terminal e uma amida no C-terminal ;
# O peptídeo-11 inclui os resíduos de tau 202 a 220 (isoforma 2N4R).
[0191] O Fab de PT3 mostrou ligação aos peptídeos fosforilados nanomolares em T212 ou T217, e a ligação de Fab PT3 foi reforçada quando ambos T212 e T217 foram fosforilados. A melhor ligação de Fab PT3 foi com peptídeos contendo pT212 e/ou pT217. O Fab de PT3 ligado com afinidade similar ao peptídeo de tau fosforilado em T212/T217 (peptídeo-2) e ao peptídeo de tau fosforilado em T212/S214/T217 (peptídeo-1), demonstrou que a fosforilação adicional em S214 não acentua a ligação do Fab de PT3.0 Fab de PT3 apresentou apenas uma ligação muito fraca com o peptídeo pS214-tau (peptídeo-9). Pouco ou nenhum efeito de ligação foi observado quando S210 foi fosforilado sozinho ou em combinação com outros resíduos fosforilados. A fosforilação em T220 pareceu contribuir para a perda de atividade de ligação para Fab de PT3 (peptídeo-9 em comparação com o peptídeo-13). Nenhuma atividade de ligação foi detectada para Fab
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72/106 de PT3 contra peptídeo tau não fosforilado (peptídeo-C). PT3 se liga a um fosfoepitopo no domínio rico em prolina de tau.
[0192] Os estudos de ligação sugerem que o epítopo de PT3 inclui pT212 e ρΤ217, e que um epítopo de ligação máxima de PT3 inclui pT212/pT217 tau duplamente fosforilado. O epítopo de PT3 é distinto de outros epitopos relatados para anticorpos anti-tau fosfo-dependente, como AT8 (pS202/pT205/pS208; Malia et ai., 2016 Id.), AT180 (pT231; Goedert et al., Biochemical J. 301 (Pt3):871-877), AT270 (pT181; Goedert et al., Id.), PHF1 (pS396/pS404; Otvos et al., J Neurosci Res. 39(6):669-73, 1994), 12E8 (pS262; Seubert et al., J Biol Chem. 270(32):18917-22,1995), anticorpo anti-tau pS422 (Collin et ai., Brain. 137(Pt 10):2834-46, 2014), e anticorpo anti-tau pS409 (Lee et al., Cell Rep. 16(6):1690-700, 2016).
Exemplo 3 - Estrutura cristalina do complexo de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pT217-tau [0193] As coestruturas do Fab de PT3 (B187) com dois fosfopeptídeos tau foram determinadas por cristalografia de raios de X, que levou à identificação do epítopo tau e do parátopo de PT3.
[0194] Preparação e cristalização da amostra. Os peptídeos para cristalização foram sintetizadas por New England Peptides e tinham as seguintes sequências: Ac-GSRSR(pT)P(pS)LP(pT)PPT-OH (SEQ ID NO:
61) que corresponde aos resíduos 207 a 220 de tau-441 (isoforma 2N4R) fosforilados nos resíduos T212, S214 e T217 (peptídeo pT212/pS214/pT217-tau) e Ac-SR(pT)PSLP(pT)PPTRE-OH (SEQ ID NO:
62) , que corresponde aos resíduos 210 a 222 fosforilados em T212 e T217 (peptídeo pT212/pT217-tau). Os peptídeos liofilizados foram dissolvidos em 100 mM de Tris, pH 8,5 a cerca de 55 mg/mL.
[0195] O Fab de PT3 foi concentrado até 19,64 ou 17,76 mg/mL e misturado com um excesso molar de 10,7 ou 9,3 vezes do peptídeo pT212/pS214/pT217-tau ou do peptídeo pT212/pT217-tau para trazer a
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73/106 concentração final do complexo final para 16,9 e 16,7 mg/mL em 20 mM de Tris, e pH 7,5, 100 mM ou 50 mM de NaCI, respectivamente. A cristalização foi realizada com telas in-house e PEGs (Qiagen) com o uso do robô de cristalização Mosquito, e mistura de 150 nl_ do complexo e 150 nl_ de solução de reservatório. Os cristais para difração foram obtidos nas seguintes condições: Complexo de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pS214/pT217-tau em 0,1 M de acetato, pH 4,5, 18% de PEG 3350, 0,2 MgCL, e complexo de Fab PT3 + peptídeo pT212/pT217-tau em 20% de PEG 3350, 0,2 M de fosfato de amônio (monobásico).
[0196] Coleta de dados e determinação da estrutura. Um cristal do complexo de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pS214/pT217-tau foi coletado de 0,1 M de acetato, pH 4,5, 18% de PEG 3350, 0,2 M de MgCk (licor mãe) e misturado com solução crioprotetora composta do licor mãe suplementado com 20% de glicerol. O cristal foi resfriado rapidamente em nitrogênio líquido, e os dados foram coletados em um gerador de raios X de microfoco Rigaku MicroMaxTM- 007HF equipado com óptica confocal OsmicTM Varimax™, detector CCD Saturno 944, e um sistema de crioresfriamento X-stream™ 2000 (Rigaku).
[0197] Os dados foram processados com XDS (Kabsch, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 66(Pt 2):125-32, 2010). A substituição molecular foi realizada com faser McCoy et al., J Appl Crystallogr. 40(Pt 4):658-674, 2007) na suite de programas PHENIX (Adams et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 66(Pt 2):213-21,2010) com o uso de Fab H3-23:L1-39 (PDB ID: 5119) Fab como o modelo de busca. Phenix.xtriage identificou a geminação pseudomeroédrica no cristal com 7% de fração geminada. O refinamento foi feito usando-se refino das geminações para a maioria das construções de modelo. O modelo de construção foi com Coot (Emsley e Cowtan, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 60(Pt 12 Pt 1):2126-32, 2004) e o refinamento foi com phenix.refine (Adams etal., 2010, Id.). A fase final do refinamento foi sem refinamento
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74/106 duplo, uma vez que foi posteriormente determinado esse refinamento duplo não melhorou os mapas. Os dados e as estatísticas de refinamento são mostrados na Tabela 7.
Tabela 7: Dados de raios de X e estatísticas de refinamento
Complexo de Fab de PT3+peptídeo pT212/pS214/pT217-tau Complexo de Fab de PT3+peptídeo pT212/pT217-tau
Beamline/detector Rigaku MicroMax- 007HF / Saturn 944 APS IMCA-CAT/ Pilatus 6M
Dados
Comprimento de onda (A) 1,5418 1,000
Faixa de resolução (A) 30-2,5 (2,6-2,5) 8,94-2,0 (2,05-2,00)
Grupo espacial C2 C2
Eixos de células de unidade (A) 125,21,83,50, 167,41 126,24, 83,66, 166,87
Ângulos da célula unitária (°) 90,00,91,71,90,00 90,00, 92,50, 90,00
Moléculas/unidade assimétrica 3 3
Vm (Â3/Da)/solv.(%) 2,92 - 58 3,08/60
Completeza (%) 97,0 (89,3) 99,2 (99,6)
Rintegração 0,108 (0,318) 0,053 (0,555)
/ /σ(Ι) média 4,9 (1,7) 13,09 (2,49)
N° de reflexões medidas 177373 (11739) 384718 (27833)
N° de reflexões únicas 57942 (3878) 116430 (8607)
Fator B (Wilson) (À2) 29,1 36,49
Estatística de refinamento
N° de átomos 11165 10968
N° de moléculas de água 961 779
Rtrabalho/Rlivre (%) 19,4/23,1 18,6-21,3
R.m.s.d. de geometria ideal
Comprimentos de ligação (À) 0,005 0,008
Ângulos de ligação (°) 1,005 1,215
Fatores B médios (Â2) 26,87 41,2
Gráfico de Ramachandran
Resíduos em regiões favorecidas (%) 97,23 98,31
Resíduos em regiões permitidas (%) 2,47 1,62
Resultados fora dos limites (%) 0,31 0,08
Os valores do envoltório de alta resolução são indiciados em parêntesis. [0198] Um cristal único do complexo PT3 Fab + peptídeo
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T212/pT217-tau foi extraído da gota de cristalização, imerso durante alguns segundos na solução do reservatório (20% de PEG 33500, 0,2 M de fosfato de amônio (monobásico)) suplementado com 20% de glicerol e resfriado rapidamente em nitrogênio líquido. Os dados foram coletados na linha de luz 17-ID-B IMCA-CAT, Advanced Photon Source (Argonne, IL, EUA) a 100 K. As intensidades de difração foram coletadas em um detector de Pilatus 6M em uma rotação de 180° com um tempo de exposição de 0,5 seg por imagem de meio grau. Os dados foram processados com XDS (Kabsch, 2010, Id.) na resolução máxima de 2,0 Á. A estrutura foi determinada por substituição molecular com o programa Phaser (McCoy et ai., 2007, Id.) usando a estrutura de PT3 Fab + peptídeo pT212/pS214/pT217-tau como modelo de busca. O refino da estrutura foi realizado com phenix.refine com o uso de NCS (Adams et ai., 2010, Id. Os ajustes de modelo foram feitos com o uso do programa Coot (Emsley e Cowtan, 2004, Id.). A coleta de dados de raios X e estatísticas de refino são dadas na Tabela 7. As distâncias de contato intermoleculares foram calculadas com CONTACT (Collaborative Computational Project, número 4, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 50(Pt 5):760-3, 1994) usando-se um corte de distância de 4,0 Á e inspecionado visualmente com Pymol. [0199] Análise estrutural. A estrutura de Fab de PT3 Fab com o peptídeo pT212/pS214/pT217-tau foi determinada em uma resolução de 2,5 Á. Existem três cópias do complexo por unidade assimétrica conforme descrito abaixo para a estrutura de Fab de PT3 + peptídeo pT212/pT217-tau. A estrutura mostra que PT3 não interage com o fosfato de pS214 quando T212 e T217 são também quando fosforilados (dados não mostrados), que é apoiado pelo mapeamento dos fosfopeptídeos por ProteOn (Exemplo 2).
[0200] A estrutura de Fab de PT3 com o peptídeo pT212/pT217-tau foi determinada por cristalografia de raios X em uma resolução de 2,0 Á (Figura 7). Existem três cópias do complexo na unidade assimétrica (cópia
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1: cadeias A, C, E; cópia 2: cadeias B D, F; cópia 3: cadeias H, L, P) consistindo em cadeias pesadas A, C, e H, cadeias leves B, D, e L, e cadeias de peptídeo E, F, e P. As três cópias foram muito similares - as regiões variáveis estavam dentro de 0,3 Á rmsd. As Figuras 7 a 8 são da cópia 3 (cadeias H, L, P). Conforme visto na Figura 7, as cadeias de Fab pesadas e leves formam um bolso de ligação rasa, e o peptídeo se deposita através do Fab. O fosfopeptídeo de tau está em uma conformação estendida com características consistentes com a estrutura secundária hélice poliprolin-ll.
[0201] Resíduos de paratopo de Fab de PT3 e de epítopo de peptídeo de pT212/pT217-tau que compreendem a interface de interação são mostrados nas Figuras 8 e 9, e na Tabela 8. A interface entre PT3 e seu epítopo de peptídeo é composta de interações van der Waals e eletrostáticas, que se estendem a partir dos resíduos de peptídeo 211 a 221. A estrutura do Fab de PT3 no complexo com o peptídeo pT212/pT217tau mostra que o epítopo inclui os fosfatos de pT212 e pT217. O grupo hidroxila da cadeia pesada Y32 forma uma ligação de hidrogênio importante com um oxigênio do fosfato de pT212. O grupo hidroxila da cadeia lateral de T28 (VH) também forma uma ligação de hidrogênio com um oxigênio do fosfato de pT212. A cadeia pesada K53 forma uma importante interação de ponte salina com pT217. A cadeia pesada W99 forma interações hidrofóbicas com os resíduos da cadeia lateral de L215 e P216 do peptídeo. O resíduo da cadeia pesada W104 tem interações extensivas com o peptídeo e também faz parte da interface VH/VL. A cadeia leve Y32 forma uma interação hidrofóbica com P219. As interações eletrostáticas com os fosfatos de pT212 e pT217 são críticas para a seletividade de PT3 para fosfo-tau, e as interações hidrofóbicas ainda contribuem para a alta afinidade de PT3 para pT212/pT217-tau (Exemplo 5) e PHF-tau (Exemplos 1 e 6).
Tabela 8: Epitope e parátopo de PT3 Fab + peptídeo pT212/pT217-tau.
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Os resíduos de Fab de PT3 VH ou VL que interagem com resíduos de peptídeo pT212/pT217-tau são indicados. As interações de ligação ao hidrogênio são indicadas em negrito.
Vh Peptídeo Vl
T28 R211
F27, T28, S31, Y32 pT212
S31 P213
S31, K53 S214
S31, Y32, K53, W99 L215
W99, G100 P216
S52, K53, W104 pT217
W99, G100, G103, W104 P218
G100, D101 P219 Y32
W104 T220 Y91, D92, E93, F94, L96
R221 D92, E93, F94
zxemplo 4 - Adaptação de framework humano para PT3 [0202] O anticorpo anti-tau de camundongo PT3 foi humanizado com o uso do método de adaptação de framework humano (HFA) (Fransson et al., J Mol Biol. 398(2):214-31,2010). Para a adaptação de framework humano, as CDRs foram definidas de acordo com Martin (Martin e Thornton, J Mol Biol. 263(5):800-15, 1996). Para encontrar a melhor combinação de HC e LC humanizadas, várias sequências da região V pesada e leve humana foram selecionadas para o teste. Quatro regiões variáveis de cadeia pesada de PT3 adaptadas a um framework humano e quatro regiões variáveis de cadeia leve de PT3 adaptadas a um framework humano foram projetadas e geradas como lgG1 de cadeia pesada humana completa e moléculas kappa de cadeia leve humana (Figura 10). Com base na similaridade de sequência com a VH e VL de PT3 de camundongo em apenas as regiões framework (FR), genes variáveis (V) na linhagem germinativa humana (4paraVH: IGHV3-23*01, IGHV3-33*01, IGHV3-1T01 elGHVI3*01; 4 para VL: IGVK1-16*01, IGVK1-16*01+, IGKV1-39*01 e IGKV224*01) foram selecionados para produzir variantes VH e VL adaptadas a um framework humano. VL78 (IGVK1-16*01+) é um mutante de ponto único de VL77 (IGVK1 -16*01) e contém uma mutação D56S para eliminar
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78/106 um risco potencial de isomerização. Os nomes dos 16 anticorpos monoclonais da variante HFA resultantes da combinação das quatro HC-HFA e quatro moléculas de LC-HFA são mostrados na Tabela 9.
Tabela 9: Variantes de PT3-HFA· B234 contém as regiões variáveis do camundongo parental e foi incluído como um controle positivo. O gene da linhagem qerminativa humana correspondente é indicado entre parênteses. VL78 (IGVK1-16*01+) contém uma mutação de ponto único de VL77 (IGVK1-16*01)·
VH10 (PT3) (SEQ ID NO:35) VH91 (IGHV3-23*01) (SEQ ID NO:36) VH92 (IGHV3-33*01) (SEQ ID NO:37) VH93 (IGHV3-11*01) (SEQ ID NO:38) VH94 (IGHV1 -3*01) (SEQ ID NO:39)
VL7 (PT3) (SEQ ID NO:40) B234
VL77 (IGVK1-16‘01) (SEQ ID NO:41) B235 B296 B282 B268
VL78 (IGVK1-16*01+) (SEQ ID NO:42) B250 B236 B297 B283
VL79 (IGKV1-39*01) (SEQ ID NO:43) B265 B251 B237 B298
VL80 (IGKV2-24*01) (SEQ ID NO:44) B280 B266 B252 B238
[0203] A clonagem e a síntese de DNA para o painel de 16 variantes HFA-PT3 (hlgGI/κ) foram realizadas por métodos-padrão. O DNA foi transfectado em células HEK (Expi293) por protocolos padrão, e os sobrenadantes celulares foram coletados após 5 dias em cultura. O sobrenadante clarificado foi purificado com o uso de uma Protein BioSolutions ProteinMaker (Gaithersburg, MD, EUA) para purificação paralela de alto rendimento pela captura de IgG na resina MabSelectSure Protein A pré-equilibrada em 1x dPBS, pH 7,2. Após a lavagem da coluna com 1x de dPBS, pH 7,2, o anticorpo monoclonal foi eluído com o uso de 0,1 M de acetato de sódio, em pH 3,5. As frações de eluição foram neutralizadas pela adição
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79/106 de 2,5% M de Tris-HCI, pH 7,2 a 20% em volume, e a formulação de proteína final foi 0,08 M Na de acetato de Na, 0,5 M de Tris HCI, pH 7,1.
[0204] A avaliação inicial do painel de HFA foi com base no rendimento da purificação, perfil de cromatografia líquida de alto desempenho de exclusão de tamanho (SE-HPLC), ligação a PHF-tau em ensaios de ligação ELISA e caracterização biofísica.
[0205] O Fab de B296 (B324) e o Fab de B252 (B326) também foram gerados por pareamento das regiões variáveis de HC e LC dos anticorpos monoclonais correspondentes com uma lgG1 humana/região constante κ e uma etiqueta 6xHis no terminal C da cadeia pesada. B324 e B326 foram expressos em células HEK (Expi293) e purificados por um método similar conforme descrito (Zhao et al., Protein ExprPurif. 67(2):182-9, 2009).
Exemplo 5 - Caracterização de anticorpos PT3-HFA por SPR em fosfopeptídeos [0206] Um subconjunto de variantes de anticorpos monoclonais de ressonância de plasmón de superfície selecionados com base em caracterização biofísica e ligação por ELISA ao PHF, foram analisados por ressonância de plásmon de superfície (SPR) com um instrumento ProteOn XPR36 para ligação aos seguintes fosfopeptídeos: peptídeo pT212/pT217-tau (peptídeo-2, SEQ ID NO: 48) e peptídeo pT212-tau (peptídeo-8, SEQ ID NO: 54). Todos os experimentos foram realizados a 25°C com o uso de PBST, pH 7,4, (Bio-Rad Cat# 176-2720), que foi usado como tampão de corrida e tampão de diluição de amostra.
[0207] Ligação de anticorpo/peptídeo monoclonal. Após o pré-condicionamento com PBST, uma superfície do biossensor foi preparada revestindo-se um chip sensor GLC Biorad com Fc anti-humano (Jackson 109-005 -098) a uma densidade de aproximadamente 6.500 RU. A IgG humana foi acoplada por amina à superfície do chip com o uso de EDC/NHS e, então, lavada com etanolamina. Os anticorpos foram diluídos
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80/106 a 2 pg/mL em PBST e injetados sobre a superfície por 5 minutos a 30 pL/min para alcançar uma densidade máxima de 900 a 1000 RU. Os peptídeos foram injetados como analitos a 60 pL/min por 3 min, seguido de 5 min de dissociação. O peptídeo-2 foi diluído em PBST para gerar uma série de concentração 3x (0 a 30 nM) e medido em duplicata. Medições únicas de ligação do anticorpo monoclonal ao peptídeo-8 foram feitas na faixa de concentração 0 a 100 nM.
[0208] Ligação de Fab/peptídeo. O peptídeo biotinilado foi capturado em um chip de biossensor NLC revestido com neutravidina précondicionados com PBST, e o Fab foi passado sobre a superfície para os medir parâmetros cinéticos. Aproximadamente 5 a 10 RU de peptídeo foram capturados na superfície do chip por diluição do peptídeo para 10 ng/ml_ em PBST e injeção sobre os canais de fluxo a 30 pL/min durante 100 s. As diluições seriais de Fab de PT3 (1,1 nM para 90 nM) foram injetadas a 60 pL/min durante 3 minutos (fase de associação), seguido de 300 seg de tampão apenas (fase de dissociação).
[0209] Dupla referência aos dados foi feita por subtração da resposta interposta, e as curvas geradas pela injeção de tampão apenas. A superfície do chip foi regenerada com 0,85% de ácido fosfórico, seguido de injeção de PBST antes da próxima injeção de titulação de anticorpos. O processamento e a análise dos dados foram feitos com o uso de um software. Os dados foram ajustados com o uso de um modelo de ligação simples Langmuir 1:1.
[0210] As constantes de taxa cinética e as afinidades de ligação de equilíbrio para IgGs de PT3-GHA em relação ao peptídeo-8 são mostradas na Tabela 10. B234 contém as regiões variáveis de PT3 de camundongo e a região constante de IgG 1 /κ humana. Dentre as variantes humanizadas, B296 mostrou a ligação mais forte com o peptídeo-8 (pT212-tau).
Tabela 10: Dados de afinidade de ProteOn SPR para ligação do painel
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81/106 de mAb de PT3-HFA ao peptideo-8
Amostra Descrição da Proteína ka média, (1/Ms) kd média, (1/s) Kd média, nM
B234 PT3 camundongo, hlgG1 2,31 E+06 8,02E-03 3,48
B235 VH91 /VL77 Sem ligação
B252 VH93/ VL80 7,42E+05 2,42E-02 32,6
B280 VH91 /VL80 2,18E+05 7,57E-03 34,7 (ajuste insuficiente dos dados)
B282 VH93/ VL77 4,42E+05 3,82E-02 86,5
B296 VH92/ VL77 8,56E+05 2,30E-02 26,8
n=2 para todos os anticorpos [0211] As constantes de taxa cinética e as afinidades de ligação de equilíbrio para IgGs de PT3-GHA em relação ao peptídeo-2 são mostradas na Tabela 11. B252 e B296 mostraram a ligação mais forte com o peptídeo-2 (pT212/pT217-tau), com valores médios de Kd e de 172 e 190 pM, respectivamente.
Tabela 11: Dados de afinidade de ProteOn SPR para ligação do painel de mAb de PT3-HFA ao peptídeo-2
Amostra Descrição da Proteína ka média, (1/Ms) Faixa de ka kd média, (1/s) Faixa de kd KD média, pM Faixa de KD (pM)
B234 PT3 de camundongo, hlgG1 9,35 E+06 (8,7-10) E+06 3,25 E-04 (2,42-4,08) E-04 29,2 27,8-30,6
B235 VH91 /VL77 3,21 E+06 (2,84-3,58) E+06 5,69 E-03 (5,28-6,10) E-03 1790 1710-1860
B252 VH93 / VL80 5,75 E+06 (3,95-7,54) E+06 9,01 E-04 (8,56-9,46) E-04 172 (126-217)
B280 VH91 /VL80 4,71 E+06 (2,21-7,20) E+06 2,74 E-03 (2,46-3,01) E-03 769 (418-1120)
B282 VH93 / VL77 3,12 E+06 (2,34-3,89) E+06 1,32 E-03 (1,24-1,40) E-03 445 (360-529)
B296 VH92 / VL77 5,00 E+06 (3,10-6,90) E+06 8,26 E-04 (7,88-8,63) E-04 190 (125-255)
n=2 para todos os anticorpos [0212] A afinidade dos Fabs de B296 e B252 foi medida no peptídeo pT212/pT217-tau (peptídeo-2) por ProteOn e comparada ao Fab parental de camundongo B187 (Tabela 12). Houve um aumento de 2,7 a 5,1 x na taxa de dissociação e um aumento de 3,5 a 5,6x nos valores de Kd para os Fabs-HFA comparados ao camundongo parental. O Fab de B296 (B324) mostrou uma afinidade maior pelo peptídeo pT212/pT217-tau do que o Fab de B252 (B326), e também uma velocidade de dissociação mais lenta.
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Tabela 12: Dados de afinidade de ProteOn SPR pelos Fabs de PT3HFA que se ligam ao peptídeo-2
Amostra Descrição ka média, (1/Ms) Faixa de ka (1/Ms) kd média, (1/s) Faixa de kD (1/s) KD média, (pM) Faixa de KD (pM)
B187 Fab parental de PT3 de camundongo 7,76 E+05 (4,91-10,6) E+05 6,39 E-05 (4,93-7,84) E-05 87,4 (73,8-101)
B324 Fab de B296 6,10 E+05 (4,27-7,93) E+05 1,74 E-04 (1,61-1,86) E-04 305 (234-376)
B326 Fab de B252 7,10 E+05 (5,07-9,12) E+05 3,29 E-04 (3,04-3,53) E-04 493 (387-599)
n=2 para todos os Fabs
Exemplo 6 - Caracterização de anticorpos PT3-HFA por SPR em PHFtau e tau recombinante [0213] Um subconjunto de anticorpos monoclonais de PT3-HFA foi testado quanto à ligação a PHF-tau isolado do cérebro com doença de Alzheimer. Todas as interações foram estudadas a 25°C usando PBS a pH 7,4, suplementado com 3 mM de EDTA, e 0,005% de Tween-20 como o tampão de corrida e do sistema. HT7 (Pierce, catálogo #MN1000), um anticorpo anti-tau de camundongo, foi usado como um controle positivo.
[0214] A interação dos anticorpos monoclonais anti-tau com PHF-tau foi analisada por ProteOn com o uso de uma superfície do biossensor preparada por acoplamento por captura de PHF-tau com o uso de HT7 como o reagente de captura. PHF-tau foi preparada por duas centrifugações a 5.000xg a 5°C durante 10 min; o sobrenadante da segunda centrifugação foi então diluído 1/40 em tampão de corrida. Para preparar o chip, ο HT7 foi imobilizado covalentemente à superfície de um chip sensor GLC (ProteOn) de acordo com as instruções do fabricante para química de acoplamento de amina (-5.000 unidades de resposta (RU)). O tampão de acoplamento foi acetato de sódio a 10 mM, pH 4,5. Após a imobilização de HT7, PHF-tau foi injetada e capturada (-300 RU) por HT7. Após a captura, PHF-tau foi covalentemente imobilizada ao chip do senso por ativação do chip de acordo com as instruções do fabricante para química de acoplamento de amina. Os sítios reativos restantes fo
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83/106 ram bloqueados pela injeção de etanolamina. Após a preparação e estabilização da superfície modificada de PHF-tau e da superfície de referência (não contendo antígeno), os anticorpos anti-tau foram diluídos no tampão de corrida e injetados em solução (0,12 a 75 nM nas diluições 5x). A associação foi monitorada durante 3 minutos (120 μΙ_ injetados a 40 pL/minuto). A mistura foi agitada durante 15 minutos. A regeneração da superfície do sensor foi realizada com o uso de 10 mM Gly pH 2,0. Os dados para anticorpos monoclonais foram ajustados com o uso de um modelo de ligação bivalente no qual a afinidade aparente (Kd) foi relatada como a razão de kOff/kOn. Um modelo de ligação Langmuir 1:1 foi usado para a análise cinética dos Fabs.
[0215] A maioria dos anticorpos monoclonais de HFA reteve uma ligação forte similar à do anticorpo monoclonal PT3 parental de camundongo, na faixa de 27 a 165 pM (Tabela 13). B252 e B296, os dois anticorpos monoclonais HFA do topo, apresentaram afinidades de 32 e 27 pM, respectivamente. B235 foi o anticorpo monoclonal que apresentou a afinidade mais fraca (165 pM) dentre os anticorpos desse painel. B324 (Fab de B296) e B326 (Fab de B252) foram avaliados quanto à ligação com PHF-tau e mostram uma Kd, 2,5 e 3,3 vezes mais fraca, respectivamente, do que o Fab de PT3 parental de camundongo de B187. B324 mostrou uma afinidade 1,3 vezes mais forte (Kd) e uma taxa de dissociação 1,7 vezes mais lenta de vezes do que B326. As afinidades de Fab foram mais fracas do que seu anticorpo monoclonal correspondente, sugerindo avidez para o anticorpo monoclonal em relação ao PHF-tau. B352, uma variante de lgG4 de B296 com as mesmas regiões variáveis, também foi testado quanto à ligação a PHF-tau e a afinidade (43 pM) foi de 2 vezes àquela de B296 (Tabela 11).
Tabela 13: Afinidades medidas com ProteOn SPR para mAbs e Fabs de PT3-HFA com PHF-tau
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Amostras Descrição kon (1/Ms) fcoff (1/s) KD (pM)
HT7 camundongo (+ Ctrl) (5,69±0,99) E+05 (1,10±0,18) E-04 193±46
B17(mAb) PT3 de camundongo, muG2a (2,48±0,20) E+06 (2,68±0,43) E-05 11±1,9
B234 (mAb) PT3 de camundongo, hlgG1 (2,23±0,13) E+06 (2,71 ±0,17) E-05 12±1,0
B235 (mAb) VH91 / VL77 (4,90±0,34) E+05 (8,06±0,24) E-05 165±12
B252 (mAb) VH93 / VL80 (1,32±0,09) E+06 (4,28±0,19) E-05 32±2,6
B280 (mAb) VH91 / VL80 (1,02±0,03) E+06 (5,63±0,28) E-05 55±3,3
B282 (mAb) VH93 / VL77 (6,65±0,09) E+05 (4,08±0,25) E-05 61 ±3,9
B296 (mAb) VH92 / VL77 (1,07±0,02) E+06 (2,93±0,19) E-05 27±1,8
B297 (mAb) VH93 / VL78 (1,44±0,07) E+06 (6,03±0,32) E-05 42±3,0
B187 (Fab) Fab PT3 (1,67±0,05) E+06 (1,13±0,04) E-05 68±3
B326 (Fab) B252 Fab (1,02±0,05) E+06 (2,30±0,04) E-04 224±12
B324 (Fab) B296 Fab (8,16±0,45) E+05 (1,36±0,06) E-04 167±12
B352 (lgG4 MAB) B296 como hlgG4 (2,55±0,56) E+05 (1,11 ±0,54) E-05 43 ±23
mAbs: n=2 com 3 réplicas em cada experimento
Fabs: n=2 com 2 réplicas em cada experimento
B352: n=2 com 4 réplicas em cada experimento [0216] A interação dos anticorpos e Fabs monoclonais anti-tau com tau de controle expresso recombinantemente (isoforma de tau humana 2N4R 441 aa, etiqueta His6x no terminal N, SEQ ID NO: 63) foi estudada com urn Biacore T200. Uma superfície do biossensor foi preparada pelo acoplamento de um anticorpo (Ab) anti-lgG humana específico de IgG ou anti-Fd à superfície de um chip de sensor CM5 de acordo com as instruções do fabricante para a química de acoplamento de amina (-6.500 unidades de resposta (RU). O tampão de acoplamento foi acetato de sódio a 10 mM, pH 4,5. Os anticorpos anti-tau foram diluídos no tampão de corrida e injetados para obter uma captura de ao menos 5 RU. A captura de anticorpos ou Fabs monoclonais anti-tau foi seguida de injeção de tau de controle expresso recombinantemente em solução (0,12 a 75 nM nas diluições 5x). A associação foi monitorada durante 3 minutos (150 μΙ_ de injetados a 50 pL/minuto). A dissociação foi monitorada até se observar uma diminuição de ao menos 5% do sinal para uma determinação de taxa de dissociação adequada. A regeneração da superfície do sensor foi obtida com
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0,85% de ácido fosfórico seguido de 50 mM de NaOH. Os dados para os anticorpos e os Fabs monoclonais foram ajustados usando se um modelo de ligação de Langmuir 1:1 se ligação foi observada.
[0217] Nenhum dentre B324 e B326 mostrou ligação significativa ao tau de controle. B296 também não mostrou nenhuma ligação com o tau de controle.
Exemplo 7 - Estrutura cristalina do complexo de B324 + peptídeo pT212/pT217-tau [0218] A coestrutura de B324 com o peptídeo pT212/pT217-tau (SEQ ID NO: 62) foi determinada por cristalografia de raios X, o que levou à identificação do epitope tau e do parátopo B324 (e B296).
[0219] Preparação e cristalização da amostra. B324, que é o Fab de B296 com VH92 e VL77, foi produzido por expressão temporária em células HEK 293, e purificado por cromatografia de afinidade com níquel, SEC, e troca iônica em um tampão final de 20 mM de MES, pH 6,0, 0,2 M de NaCI. O peptídeo pT212/pT217-tau (SEQ ID NO: 62), descrito no Exemplo 3, foi usado para cocristalização. Para a preparação do complexo de Fab B324 + peptídeo pT212/pT217-tau, um excesso molar de 10 vezes do peptídeo foi adicionado.
[0220] A cristalização do Fab B324 + peptídeo pT212/pT217-tau foi realizada a 9 a 18 mg/mL em 20 mM de MES, pH 6,0, 0,2M de NaCI. A triagem de cristalização inicial foi realizada com o robô de cristalização Mosquito pelo método de difusão de vapor em gota sentada a 20°C com o uso de duas telas in-house e PEGs (QIAGEN). Os cristais apareceram a partir de 0,1 M de acetato de sódio, pH 4,6, 20% de PEG 10K e as sementes foram produzidas por homogeneização mecânica com um kit SeedBead (Hampton Research) para uso em triagem de otimização adicional.
[0221] Coleta de dados e determinação da estrutura. Um cristal apareceu a partir de 0,1 M de acetato de sódio, pH 5,5, 37% de
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PEG200, e o mesmo foi coletado e resfriado rapidamente em nitrogênio líquido sem crioproteção para coleta de dados por difração de raios X. Os dados de cristalografia foram coletados na Advanced Photon Source (Argonne, IL, EUA) na linha de luz IMCA-CAT 17-ID-B a 100 K. As intensidades de difração foram coletadas em um detector Pilatus 6M em uma rotação de 180° com uma exposição de 0,5 seg por imagem de meio grau. Os dados foram processados com XDS (Kabsch, 2010, Id.) na resolução máxima de 2,6 Á. A estrutura cristalina por raios X de B324 X no complexo com peptídeo pT212/pT217-o foi resolvida por substituição molecular com Phaser (de McCoy et al., 2007, Id.) com o uso de uma estrutura de Fab relacionada como um modelo de busca e refinada com Refmac (Murshudov et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 53(Pt 3):240-55, 1997) (Tabela 14). As distâncias de contato intermolecular foram calculadas com CONTACT (Collaborative Computational Project, 1994, Id.) com o uso de um corte de distância de 4,0 Á e inspecionadas visualmente com Pymol.
Tabela 14: Dados de raios X
Coleta de Dados
Conteúdo B324 +Peptídeo pT212/pT217-tau
Licor-mãe 0,1 M de NaAc 5,5, 37% de PEG 200
Crio Nenhum
Fonte/Detector APS IMCA-CAT 17ID-B/Pilatus 6M
Comprimento de onda (À) 1,000
Temperatura (K) 100
Distância (mm) 450
Rotação total (°) 180 **
Exp(sec)/0,5° 0,5
Grupo espacial I222
Eixos de células de unidade (Â) 97,60, 104,43, 133,35
Ângulos da célula unitária (°) 90, 90, 90
Moléculas/unidade assimétrica 1
Vm (À3/Da)/solv.(%) 3,43 / 64
Resolução (Â) 30-2,6 2,67-2,60
Nenhuma reflexão medida 113.798 6.597
n° de reflexões únicas 21.019 (1.367)
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Completeza (%) 98,6 (87,6)
Redundância 5,4 (4,8)
R-integ ração 0,040 (0,417)
<Ι/σ> (não média) 10,8 (1,1)
<Ι/σ> (média) 24,5 (3,5)
Fator B (Wilson) (Â2) 69,4
Estatísticas de refinamento
N° de átomos 3331
Rtrabalho/Rlivre 0,230/0,265
r.m.s.d. a partir da ideal
geometria
Comprimentos de ligação (À) 0,005
Ângulos de ligação (°) 1,027
Fatores B médios (Â2) 96,2
Gráfico de Ramachandran
Resíduos em regiões
favorecidas (%) 95,14%
Resíduos em regiões
permitidas (%) 3,94%
Resultados fora dos limites (%) 0,93%
Os valores do envoltório de alta resolução são indicados em parêntesis.
[0222] Análise estrutural. A estrutura geral da interação de B324 + peptídeo pT212/pT217-tau é mostrada na Figura 11. O peptídeo pT212/pT217-tau se ajuste em um sulco formado na interface da VH e VL de B324. A interface entre B324 e o peptídeo pT212/pT217-tau é compreendida de interações de van der Waals e eletrostáticas, que se estendem a partir dos resíduos de peptídeo 211 a 221 (Figura 12). As seguintes CDRs estão envolvidas na ligação direta com o peptídeo pT212/pT217-tau: CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L3. A estrutura de B324 no complexo com o peptídeo pT212/pT217-tau mostra que o epítopo inclui os fosfatos de pT212 e pT217. Um diagrama da interação dos resíduos de Fab B324 e resíduos de peptídeo p212/pT217-tau é mostrado na Figura 13. Alguns das principais interações são conforme exposto a seguir: cada um dentre o grupo hidroxila de Y32 da VH e o grupo hidroxila de T28 da VH forma ligações de hidrogênio com diferentes oxigênios
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88/106 de fosfato de pT212; há interações hidrofóbicas entre as cadeias laterais Y32 da VH e W99 da VH e os grupos metila de L215 do peptídeo de tau; ο K53 da VH forma uma interação de ponte salina com o resíduo de peptídeo tau pT217; a cadeia lateral W104 da VH forma uma interação hidrofóbica com o grupo metila de pT217 e uma interação de empilhamento CH-π com P218, e faz parte da interface de VH/VL; a indolamida de W104 da VH forma uma ligação de hidrogênio com a hidroxila de T220 da cadeia lateral; há uma interação hidrofóbica entre a cadeia lateral Y32 e P219 da VL; há uma interação hidrofóbica entre L96 e o grupo metila de T220 de VL; e uma interação hidrofóbica é formada pela cadeia lateral F94 da VL e o grupo metila de T220. As interações eletrostáticas com os fosfates de pT212 e pT217 são críticas para a seletividade de B324 para fosfo-tau, e as interações hidrofóbicas ainda contribuem para a alta afinidade de B324 para o peptídeo pT212/pT217-tau (Exemplo 5) e PHF-tau (Exemplo 6). O epítopo e parátopo de PT3 e B324 de camundongo são muito similares, indicando que nem o epítopo nem o parátopo são significativamente alterados após a humanização (Figuras 9 e 13, Tabelas 8 e 15).
Tabela 15: Epitope e parátopo de B324+peptíde opT212/pT217-tau. Resíduos de B324 de VH ou VL que interagem com resíduos de peptídeo tau pT212/pT217 são indicados. As interações de ligação ao hidrogênio são indicadas em negrito.
VH Peptídeo VL
G26, T28 R211
F27, T28, S31, Y32 pT212
S31 P213
S31 S214
S31, Y32, K53, W99 L215
K53, W99, G100 P216
S52, K53, W104 pT217
G100, W104 P218
G100, D101 P219 Y32
W104 T220 Y91, D92, E93, F94, L96
R221 D92, E93, F94
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Exemplo 8 - Teste funcional em ensaios celulares [0223] Ο PT3 foi testado quanto à inibição da semeadura de tau em dois tipos de ensaios celulares: ensaios de coincubação e ensaios de depleção. Ambos os tipos de ensaio fazem uso de células HEK que expressam dois fragmentos de tau K18 marcados com cromóforo que geram um sinal quando em estreita proximidade, por exemplo, devido a agregação. Quando as células são tratadas com sementes de tau agregado e fosforilado de comprimento total derivado de diferentes fontes, um agregado de K18 é induzido que pode ser quantificado pela alteração da razão de transferência de energia de ressonância por bioluminescência (isto é, ensaio BRET) ou pela contagem de células positivas à transferência de energia de ressonância por fluorescência (FRET) com o uso de separação de células ativadas por fluorescência (FACS) (isto é, ensaio FRET; Figura 14) (Holmes et al.,2014, PNAS 111 (41 ):E4376-85).
Ensaio de coincubação de homoqenatos de células HEK (ensaio BRET) [0224] Homogenatos contendo sementes de tau para a coincubação foram gerados a partir de uma linhagem celular HEK que superexpressam GFP-tauP301L estável que contém tau de comprimento GFP-marcado agregado induzido por K18. As células recipientes foram células HEK que expressam de modo estável K18/P301L-NanoLuc e K18/P301 L-HaloTag. As sementes de tau foram coincubadas com o anticorpo de teste e as células HEK contendo cromóforo-K18 receptoras durante 72 h. A formação do agregado de K18 foi medida pela alteração da razão BRET (590 nm/450 nm). Ο PT3 bloqueou a indução agregada em 46,97% a 300 nM, 18,02% a 30 nM e 12,57% a 3 nM (Figura 15).
Ensaio de coincubação da medula espinhal (ensaio FRET) [0225] Homogenatos contendo sementes de tau para a coincubação foram gerados da medula espinhal de animais transgênicos P301S
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90/106 de 22 a 23 semanas de idade que contêm tau humano transgênico agregado. Para sensibilidade aumentada, as células recipientes usadas no ensaio foram células HEK que expressaram de modo estável K18/P301S-YFP e K18/P301S-CFP. As sementes de tau foram coincubadas com o anticorpo de teste e as células HEK contendo cromóforo-K18 receptoras durante 72 h. A formação do agregado de K18 foi medida pela contagem de células FRET-positivas por FACS. Ο PT3 bloqueou a indução agregada em 34,03% a 300 nM, 37,02% a 30 nM e 30,68% a 3 nM (Figura 16).
Ensaios celulares de imunodeficiência [0226] Ensaios de imunodepleção foram realizados para investigar se o valor de inibição percentual máximo estava relacionado à densidade dos epitopos nas sementes ou ao número de sementes que contêm o epitopo de PT3. Nos ensaios de imunodepleção, as sementes de tau foram incubadas com anticorpo de teste e removidas da solução com microesferas de proteína G. O sobrenadante esgotado foi testado quanto à capacidade de semeadura residual nas células HEK contendo cromóforo-K18 e analisado por FACS, conforme anteriormente descrito (Holmes etal., Proc Natl Acad Sei U S A. 111 (41 ):E4376-85, 2014).
[0227] Homogenatos contendo sementes de tau para a imunodepleção foram gerados da medula espinhal de animais transgênicos P301S de 22 a 23 semanas de idade (Figura 17) ou de tecido de cérebro com DA humano criopreservado (Figura 18). No ensaio de imunodepleção de cérebro com DA humano, o sobrenadante após a depleção foi testado na presença do reagente de transfecção Lipofectamine2000 para obter uma janela de análise aceitável. A semeadura de tau podería ser quase completamente (>90%) esgotada com PT3 nos extratos da medula espinhal extratos tanto quanto nos homogenatos totais de cérebro com DA humano (Figuras 17 e 18).
Resultados
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91/106 [0228] Ο ΡΤ3 inibiu as sementes de tau derivadas de lisatos de células HEK e lisatos da medula espinhal de TYgP301S. A inibição máxima obtida nos ensaios foi diferente para diferentes anticorpos anti-fosfo-tau e para as diferentes sementes (Tabela 16). Os valores de inibição observados para PT3 a 300 nM foram 46,97 ± 5,87% para sementes de células HEK, e 34,03 ± 2,05% para extratos da medula espinhal de TgP301 S. Os diferentes valores de inibição máxima de anticorpos fosfo-tau nos diferentes ensaios de células podem apontar para diferenças no status da fosforilação das sementes de tau usadas. As sementes de tau geradas na medula espinhal de TgP301S são de origem neuronal e espera-se que tenham mais similaridades com as sementes de PHF-tau do que com as sementes de tau de origem de células HEK, e isso podería explicar as eficácias genericamente mais altas observadas com os anticorpos de fosfotau contra os extratos do cordão espinhal em comparação com os lisatos de células HEK.
[0229] A semeadura de tau podería ser quase completamente esgotada com PT3 nos extratos de medula espinhal e nos homogenatos de cérebro humano com DA, e esse resultado sugere que a falta de inibição completa nos experimentos de coincubação com o material de semeadura da medula espinhal não foi resultante da presença de sementes desprovidas de epitopos de PT3 mas sim da densidade limitada dos epitopos nas sementes.
Tabela 16: Resumo dos resultados dos testes funcionais nos ensaios celulares
MAb Ensaio de coincubação de BRET/GFPtauP301L Ensaio de coincubação de medula espinhal de FRET/P301S Ensaio de imunodepleção de medula espinhal de FRET/P301S Ensaio de imunodepleção de homogenate de FRET/cérebro humano com DA
PT3 46,97±5,87 34,03 ±2,05 96,24± 0,43 92,24±2,30
AT8 10,52±9,48 26,4±1,74 96,71 ±0,42 80,69±5,79
HT7 65,44±1,08a 73,51 ±1,78b 99,16±0,21 82,99±0,68
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A unidade é a % de controle negativo, média de diferentes experimentos; a concentração do anticorpo em todos os ensaios foi 300 nM exceto pora inibição em 166,67 nM e b inibição a 89,99 nM.
[0230] O mecanismo de ação da terapia com anticorpos tau é ainda uma questão de debate e múltiplos mecanismos têm sido propostos. Recentemente, a depuração mediada por anticorpos de sementes extracelulares por células microgliais foi sugerida como um mecanismo de ação dominante (Funk et al., J Biol Hem. 290(35):21652-62, 2015 e McEwan et al., 2017, PNAS 114:574-9). Neste contexto, a imunodepleção do material de semeadura derivado de cérebro humano pode ser considerada o resultado celular mais translacional, e a alta eficácia do anticorpo de camundongo parental PT3 nesse tipo de ensaio celular sugere que as versões de HFA de PT3 serão agentes terapêuticos eficazes.
Exemplo 9 - Eficácia de PT3 de murino no modelo de injeção de ePHF in vivo [0231] Para avaliar a eficácia do anticorpo tau in vivo, camundongos que apresentam patologia de tau cerebral são sistemas de modelo essenciais (Julien et al., Methods Mol Biol. 849:473-91, 2012). Vários desses modelos foram descritos, e eles podem ser genericamente divididos em três grupos: 1) camundongos transgênicos tau que superexpressam tau WT ou mutante (por exemplo, P301L ou P301S) com os mutantes que mostram patologia grave após 5 a 9 meses, dependendo da cepa (Allen et al., J Neurosci. 22(21):9340-51, 2002; Scattoni et al., Behav Brain Res. 208(1):250-7, 2010; Terwel et al., J Biol Chem. 280(5):3963-73, 2005; Yoshiyama et al., Neuron. 53(3):337-51,2007); 2) camundongos com expressão espaço-temporalmente regulada de tau mutante (por exemplo, P301L) (Liu et al., Brain Imaging Behav. 6(4):610-20, 2012) ou fragmento pró-agregante (por exemplo, K18) (Mocanu et al., J Neurosci. 28(3):737-48, 2008); e 3) camundongos com expressão de tau mutante
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93/106 e de APP que apresentam placa e patologias de tau (Oddo et al., J Neurochem. 102(4):1053-63, 2007).
[0232] Embora os camundongos que expressam tau mutante desenvolvam uma patologia forte, o início da patologia pode variar entre os animais, causando variabilidade nos estudos, e a contribuição relativa da agregação e disseminação de tau autônomo celular para o sinal de agregação de tau total não é clara. Portanto, modelos que podem ser usados para eficazmente estudar a semeadura e disseminação de tau (por exemplo, de Calignon et al., 2012, Neuron. 73(4):685-97, 2012; Liu et al., Id.) são de grande valor. O valor translacional de tais modelos é ainda reforçado pela constatação de que a injeção de camundongos ALZ17 (uma cepa que expressa tau humana normal) com homogenatos de cérebro derivados de diferentes taupatias induz a formação de inclusões de tau com uma morfologia que se assemelha a taupatia no cérebro humano. Por exemplo, a injeção de camundongos com material de amostras de doença por grãos argirofílicos resultou em depósitos com uma estrutura esferoidal ou semelhante a vírgula característica da própria doença, e a patologia de tau similar à DA foi observada em camundongos injetados com material com DA (Clavaguera et al., 2013, PNAS 110(23):9535-40).
[0233] Dessa forma, foi estabelecido um modelo de injeção de camundongos transgênicos P301L, em que um fragmento pró-agregante de tau, como fibrilas sintéticas de K18 (Li e Lee, Biochemistry. 45(51):15692-701,2006) é injetado ou sementes de PFH-tau derivadas de cérebro com DA humano são injetadas em regiões corticais ou do hipocampo de modelos de camundongos transgênicos P301 em uma idade na qual a agregação autônoma celular não se iniciou. O modelo de injeção visa mimetizar o componente crítico de semeadura extracelular de disseminação de tau. A semente de K18 ou PHF-tau semente injetada induz taupatia no local da injeção e, em menor grau, na região
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94/106 conectada contralateral (Peeraer et al., Neurobiol Dis. 73:83-95, 2015). O modelo permite testar o potencial anti-semeadura de anticorpos, como os anticorpos anti-tau da invenção, quando coinjetados com as sementes de PHF-tau derivado do cérebro ou com as fibrilas K18 (Iba et al., 2015, J Neurosci. 33(3):1024-37, 2013; Iba et al., Acta Neuropathol. 130(3):349-62).
[0234] Um esquema do modelo de injeção de camundongo transgênico P301L é mostrado na Figura 19. Resumidamente, a injeção cortical de uma fração insolúvel em sarcosil de cérebro com DA post-mortem desencadeia um aumento progressivo lento de agregação de tau. No hemisfério injetado, os primeiros sinais são medidos 1 mês após a injeção e continuam por mais 3 meses após a injeção. Cinco meses após a injeção, alguns animais começam a formar emaranhados desencadeados pela mutação P301L (Terwel et al., 2005, Id.). Os níveis de coloração de AT8 aumentam entre 1 e 3 meses (Figuras 19C a D e 19E a F) e, portanto, experimentos de eficácia do anticorpo são analisados 2 meses após a coinjeção. Ainda, a injeção hipocampal de uma fração insolúvel em sarcosil de cérebro com DA post-mortem desencadeia um aumento progressivo dependente de dose de agregação de tau medido pela análise de MesoScale Discoveries (MSD) da fração insolúvel em sarcosil dos hemisférios injetados (Figura 19G). Tratamento animal e injeções intracranianas [0235] Para estudos de injeção, foram usados na cirurgia camundongos transgênicos com tau-P301L, que expressam a isoforma mais longa de tau humana com a mutação P301L (tau-4R/2N-P301L) (Terwel et al., 2005, Id.) com 3 meses de idade. Todos os experimentos foram realizados em conformidade com protocolos aprovados pelo comitê de ética local. Para a cirurgia estereotáxica, os camundongos receberam uma injeção unilateral (hemisfério direito) no córtex (AP +2,0, ML +2,0 de bregma, DC, 2,7 mm da dura-máter) ou no hipocampo (AP -2,0, ML +2,0 (do bregma),
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DV 1,8 mm de (da dura)) 3 μΙ_ (velocidade de 0,25 pL/min) com uma preparação insolúvel em sarcosil de tecido de DA post-mortem (filamentos helicoidais pareados enriquecidos, ePHF) na presença ou ausência de anticorpos monoclonais. No caso de injeções intraperitoneais (IP) com anticorpos ou solução salina, os tratamentos (20 mg/kg, 2x/semana) foram iniciados 1 semana antes da injeção intracraniana e continuaram até os camundongos serem sacrificados para dissecção (2 meses após a injeção intracraniana).
Procedimento de extração [0236] O tecido de camundongo do hemisfério injetado foi pesado e homogeneizado em 6 volumes de tampão de homogeneização (10 mM de Tris HCI (pH 7,6). O homogenato foi centrifugado a 27 000 x g durante 20 minutos, e após a coleta de uma alíquota do sobrenadante resultante (homogenato total), 1 % de N-lauroilsarcosina foi adicionado. Após 90 minutos (900 rpm, 37°C), as soluções foram novamente centrifugadas a 184 000 x g durante 1 hora. Os sobrenadantes foram mantidos como fração solúvel em sarcosil, enquanto o pélete contendo o material insolúvel em sarcosil foi ressuspenso em tampão de homogeneização.
Análise bioquímica [0237] O anticorpo de revestimento (anticorpo anti-AT8 ou um anticorpo tau total) foi diluído em PBS (1 pg/mL) e aliquotado em placas MSD (30 uL por poço) (L15XA, Mesoscale Discoveries), que foram incubadas de um dia para o outro a 4°C. Após a lavagem com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% de Tween-20, as placas foram bloqueadas com 0,1% de caseína em PBS e lavadas novamente com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% de Tween-20. Após a adição das amostras e padrões (ambos diluídos em 0,1% de caseína em PBS), as placas foram incubadas de um dia para o outro a 4°C. Subsequentemente, as placas foram lavadas com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% Tween-20, e anticorpo de detecção conjugado SULFOTAG™ em 0,1% de caseína em PBS foi adicionado e incubado durante
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96/106 h à temperatura ambiente e com agitação a 600 rpm. Após uma lavagem final (5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% Tween-20), 150 μΙ_ de 2X de tampão T foram adicionados e as placas foram lidas com um imageador MSD. Os sinais brutos foram normalizados contra uma curva padrão que consistia em 16 diluições de uma preparação insolúvel em sarcosil de cérebro com DA post-mortem (ePHF) e foram expressos como unidades arbitrárias (AU, arbitrary units) de ePHF. A análise estatística (ANOVA com Bonferroni pós-teste) foi realizada com o software GraphPad Prism. Resultados [0238] A atividade de PT3 de camundongo sob o modelo de coinjeção cortical (Figura 19) foi confirmada em quatro estudos independentes. Os camundongos foram dosados perifericamente de acordo com a Tabela 17 e os resultados são mostrados na Figura 20. Além disso, o aprimoramento do modelo (Figura 19D) permitiu reduzir a dose de ePHF-tau e a dose do anticorpo coinjetado, conforme mostrado na Tabela 18, com os resultados mostrados na Figura 21. Com o uso dessa dose mais baixa de ePHF-tau, verificou-se que ο PT3 também tem um efeito significativo na redução de tau agregada quando administrada perifericamente (P<0,0001; Figura 21).
Tabela 17: Dose periférica
Grupo Quantidade de ePHF (pmol) Quantidade de coinjeção de Ab (pmol) Anticorpo IP n
igG 0,2 5 20 mg/kg (2x/w) 12
PT3 0,2 - 20 mg/kg (2x/w) 13
PT3 0,2 5 5
Tabela 18: Dosagem de coiniecão
Grupo Quantidade de ePHF (pmol) Quantidade de coinjeção de Ab (pmol) n
igG 0,2 5 14
PT3 0,2 5 15
PT3 0,2 0,5 15
PT3 0,2 0,05 15
[0239] A coinjeção de isotipos de ePHF e PT3, incluindo a variante lgG2a PT3-HFA (que contém as regiões variáveis VH92 (SEQ ID NO:27) e VL77 (SEQ ID NO:31) nas regiões constantes de
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97/106 mlgG2a/kappa) de acordo com o layout na Figura 19A, atenuou a agregação de tau induzida por ePHF em camundongos P301L (Figura 22). As injeções foram feitas no córtex. (não no hipocampo). O efeito foi observado no hemisfério injetado (dados bioquímicos, Figura 22B) e no hemisfério não injetado (coloração IHCAT100, Figura 22C). Ambos os isótipos lgG2a e IgG 1 reduziram significativamente a indução de taupatia quando coinjetados com o PHF-tau derivado de cérebro com DA (p<0,0001). Os resultados foram confirmados em IHC no hemisfério contralateral.
[0240] Embora a invenção tenha sido descrita em detalhes e com referência a modalidades específicas da mesma, ficará evidente para o versado na técnica que várias alterações e modificações podem ser feitas na mesma sem que se afaste do espírito e do escopo da invenção.
Exemplo 10 - Comparação entre tau de PSP e tau de DA [0241] A paralisia supranuclear progressiva (PSP) é um distúrbio neurodegenerativo raro e fatal caracterizado por parkinsonismo, instabilidade postural e quedas, paralisia supranuclear do olhar, e demência (Steele et al., 1964, Archives of Neurology 10:333-359). Patologicamente existe um acúmulo preferencial de tau com 4 repetições (4R) no tronco cerebral e gânglios basais bem como outras regiões do cérebro (Dickson DW. Handbook of Clinical Neurology 2008;89:487-491; Williams & Lees, 2009, The Lancet Neurology 8:270-279). Dada a ausência de outras patologias como amiloide, a PSP é considerada uma taupatia primária, e os dados do modelo animal sugerem que a tau de PSP pode passar por semeadura análoga àquela que hipoteticamente ocorre em DA (Clavaguera et al. 2013,PNAS 110:9535-9540; Sanders et al., 2014, Neuron 82:1271-1288). Como tal, a PSP pode ser tratada com o anticorpo da invenção. Uma série de experimentos foi realizada para caracterizar as semelhanças da tau de PSP e a PHF-tau de DA.
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Métodos [0242] Tecido do cérebro humano: Tecidos criopreservados de duas regiões do cérebro tipicamente altamente afetadas de pacientes com PSP (n=5) diagnosticados clinicamente (núcleo caudado = CAU e putâmen = PUT) e de uma região cerebral menos afetada (giro frontal superior = GFS) e das mesmas regiões cerebrais para dois pacientes de controle (=GFS) foram obtidos do banco de cérebros dos Países Baixos. O tecido foi usado para análise com os ensaios de agregação e na coloração de imuno-histoquímica descritos abaixo. Tecido criopreservado de 9 pacientes esporádicos com DA foi obtido junto à Universidade de Pennsylvania (EUA) e usado para análise com ensaios de agregação. Tecido criopreservado de 1 paciente com DA foi obtido junto à Universidade de Newcastle e usado para coloração de imunohistoquímica. [0243] Homogeneização do tecido cerebral: O tecido criopreservado foi homogeneizado em 10 mM de Tris 150 mM de NaCI, pH 7,4, filtro: 0,22 μιτι + inibidores de protease isentos de mini EDTA completos (Roche, cat # 11 836 170 001) com um homogeneizador dounce a 1000 rpm durante 10 golpes para obter 10% w/v de homogenatos. Os homogenatos foram centrifugados a 27.000xg, 10 min a 4°C e o sobrenadante foi armazenado em alíquotas a -80°C até ser usado.
[0244] Ensaios de agregação: Um imunoensaio MSD em sanduíche específico para agregação foi realizado no qual os anticorpos de fosfotau AT8 e PT3 foram usados como anticorpos de captura e detecção. O anticorpo de revestimento foi diluído em PBS (1 pg/mL) e aliquotado em placas MSD (30 uL por poço) (L15XA, Mesoscale Discoveries) que foram incubadas a 4°C. Após a lavagem com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% de Tween-20, as placas foram bloqueados com 0,1% de caseína em PBS e lavadas novamente com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% de Tween-20. Após a adição das amostras e padrões (ambas diluídas em 0,1 % de caseína em PBS) as placas foram incubadas a 4°C. Subsequentemente, as placas
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99/106 foram lavadas com 5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% Tween-20, e o anticorpo de detecção conjugado SULFO-TAG™ em 0,1% de caseína em PBSfoi adicionado e incubado durante 2 h à temperatura ambiente e com agitação a 600 rpm. Após uma lavagem final (5 x 200 μΙ_ de PBS/0,5% de Tween20), 150 μΙ_ de 2X de tampão T foram adicionados e as placas foram lidas com um imageador MSD. Os sinais em bruto são normalizados contra uma curva padrão que consiste em 7 diluições de um homogenato de cérebro dom DA total e expressos como valores interpelados como percentagem desse padrão.
[0245] Imuno-histoquímica: O tecido criopreservado de cérebro humano foi cortado com um criostato (20 pm de espessura) e armazenado a -80°C antes do uso. As seções foram secas, seguido de fixação com formalina, bloqueio de peroxidase endógena com 3% de peróxido de hidrogênio (DAKO, Glostrup, Dinamarca, S2023) e permeabilização em PBS1x + 0,3% de Triton X-100 durante 1 hora. Os anticorpos primários (PT3 0,4 pg/mL; AT8 0,4 pg/mL) foram diluídos em diluente de anticorpo com componentes redutores de fundo (DAKO, S3022) e aplicados às seções durante 1 hora. Após lavagem extensiva, as lâminas foram incubadas com anticorpo secundário anti-camundongo conjugado com HRP (Envision, DAKO, K4000), seguindo-se de marcação com diaminobenzidina cromogênica (DAKO, K4368). As lâminas foram contracoradas com hematoxilina, desidratadas e montadas com meio de montagem orgânico (Vectamount, Vector labs, Burlingame, CA, EUA, H-5000). Uma imagem foi realizada com um equipamento NanoZoomer Hamamatsu 2,0 rs (Hamamatsu Photonics, Shizuoka, Japão).
Resultados [0246] Ensaios de agregação·. Ensaios de agregação foram realizados para caracterizar o grau de fosforilação da tau de PSP. Os agregados reativos de PT3 estavam presentes em cérebro com PSP, embora os níveis de agregação foram inferiores no cérebro com DA (Figura 23).
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Os resultados obtidos com o anticorpo de referência AT8 foram semelhantes aos observados com PT3. Esses resultados sugerem que todos os sítios de fosforilação avaliados com o uso de vários anticorpos fosfotau estão presentes na tau de PSP embora haja poucos agregados de tau em PSP em comparação com DA.
[0247] Imuno-histoquímica: A marcação com o anticorpo PT3 sobre crioseções de DA ou do PSP cérebro demonstrou coloração nas regiões anatômicas (isto é, caudados e putamen) afectados em PSP (FIG. 24). As marcas neuropatológicas de PSP, incluindo neurônios tau+ e astrócitos com tufos, foram detectadas pelo anticorpo de fosfo-tau PT3. Os resultados obtidos com AT8 foram similares aos observados com PT3. Conclusões [0248] Os dados disponíveis sugerem que PT3 se liga à tau de PSP. Exemplo 11 - Maturação de afinidade de PT3-HFA
Caracterização de ligação de SPR de anticorpos maturados por afinidade com PHF-tau [0249] Os anticorpos monoclonais maturados por afinidade foram testados quanto à ligação a PHF-tau isolado de cérebro com doença de Alzheimer. Estudos de cinética e afinidade de ligação foram realizados com o uso do sistema ProteOn XPR36Tri (Bio Rad, Hercules, CA, EDUA) a 25°C com PBS pH 7,4, suplementado com 3 mM de EDTA e 0,005% de Tween-20 como tampão de funcionamento ou de sistema.
[0250] Um chip sensor GLC foi covalentemente imobilizado com um anticorpo anti-tau de camundongo, HT7 (ThermoFisher, catálogo # MN1000) usando-se o protocolo recomendado pelo fornecedor para química de acoplamento de amina (-5000 unidades de resposta, RU). O tampão de acoplamento foi 10 mM de acetato de sódio com pH 4,5. O PHF-tau foi preparado por centrifugação dupla a 5000xg e 5°C durante 10 minutos. O sobrenadante da segunda centrifugação foi diluído em tampão de corrida (1/125) e acoplado por captura à superfície imobilizada
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HT7 (-300 RU). Após o acoplamento de captura, a superfície foi ativada e desativada para gerar uma superfície de PHF-tau homogênea para estudos de ligação de anticorpo. Os anticorpos anti-tau e seus Fabs (preparados em tampão de corrida, 0,024 a 75 nM em diluições de 50 vezes) foram injetados a 50 pL/min sobre a superfície de PHF-tau para medir a ligação. Os perfis de associação e dissociação foram monitorados por 4 minutos e 2 horas, respectivamente. Após a dissociação, o sensor chip foi regenerado com o uso de múltiplas injeções de 10 mM de glicina fr pH de 2,0 e tampão de corrida. Uma superfície de referência (sem qualquer PHF-tau) foi usada para monitorar a ligação não específica dos mAbs ou Fabs injetados. O anticorpo HT7 foi usado como um controle positivo. Os sensorgramas de ligação para mAbs foram ajustados com o uso de um modelo de ligação bivalente em que a ligação acionada por avidez ou afinidade aparente (Kd) foi relatada como a razão entre a taxa de dissociação e a taxa de associação (Wfen). Um modelo de ligação de Langmuir 1:1 foi usado para análise cinética de Fabs.
[0251] O anticorpo humano parental (B296) mostrou uma forte ligação com PHF-tau (Kd =6,2 pM) e foi dominado por uma taxa de dissociação muito lenta, em que não mais que 5% de dissociação do mAb foi observada durante 2 horas (Tabela 19, Figura 25). Os anticorpos maturados por afinidade mostraram um aprimoramento na ligação com PHFtau com afinidades na faixa de 1,8 a 2,5 pM. B711 e B809 mostraram um aprimoramento de 3 vezes nas taxas de associação em comparação com o anticorpo parental, as taxas de dissociação, entretanto, foram virtualmente indistinguíveis entre todos os anticorpos (Figura 25). Os Fabs, de modo geral, mostraram uma ordem de magnitude mais fraca de ligação a PHF-tau em comparação com seus mAbs correspondentes, sugerindo uma ligação induzida por avidez dos mAbs a PHF-tau. Ο B324 (Fab do mAb parental, B296), ligou-se a PHF-tau com uma afinidade intrínseca de 63,2 PM. Os Fabs dos mAbs maturados por afinidade mostraram um
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102/106 aprimoramento similar de afinidades com valores na faixa de 15,6 a 31 pM. Os dois Fabs, B330 (Fab de B711) e B332 (Fab de 809), mostraram, além disso, uma melhoria similar de 3 a 4 vezes taxas de associação que seus mAbs correspondentes.
Tabela 19: Cinética de ligação de ProteOn SPR e afinidades de mAbs maturados por afinidade e seus Fabs com PHF-tau
Amostras Descrição /ion (x1061/Ms) /í„ff (x10-51/s) KD (pM)
B296 (mAb) mAb humanizado parental 1,89 ±0,09 1,17 ±0,09 6,2 ±0,5
B711 (mAb) B296 maturado por afinidade 6,17(5,72-6,61) 1,13 (1,08 -1,17) 1,8 (1,6-2,1)
B809 (mAb) B296 maturado por afinidade 6,45 ±1,18 1,27 ± 0,15 2,0 ±0,5
B333 (mAb) B296 maturado por afinidade 2,68 ±0,23 0,68 ±0,08 2,5 ±0,4
B324 (Fab) Fab de B296 1,43 ±0,06 9,03 ±0,08 63,2 ±2,8
B330 (Fab) Fab de B711 4,60 (4,53 - 4,66) 7,15 (6,94-7,36) 15,6 (15,3 -15,8)
B332 (Fab) Fab de B809 4,64 ±0,29 12,0 ±0,12 25,8 ±1,7
B331 (Fab) Fab de B333 1,72 ±0,07 5,31 ±0,10 31,0 ±1,5
N = 2 a 3 réplicas dentro de um experimento. Valores reportados como média ± DP (ou faixa)
Ligação ao fosfopeptídeo por ELISA [0252] A ligação ao peptídeo fosfo-tau foi analisada por ELISA, em que o peptídeo (10 ng/mL) foi diretamente revestido à placa de um dia para o outro. Após a lavagem da placa e bloqueio com 0,1% de caseína em PBS, as placas foram incubadas com diferentes concentrações de HFAPT3 (B296) e variantes maturadas por afinidade de mAbs HFA-PT3 (B809, B333 e B711) (Figura 26A). Após a incubação com anticorpos, as placas foram lavadas e 50 pL por poço de anticorpo anti-Fab marcado com HRPO (laboratórios de inóculo celular Jackson (diluído 1:10000 em tampão de bloqueio). Após uma outra etapa de lavagem, a detecção foi feita com TMB uma etapa (Thermo Scientific) de acordo com as instruções dos fabricantes. As placas foram analisadas em leitora EnVision® 2102 Multilabel Reader (Perkin Elmer, Waltham, MA, EUA). As curvas de ligação foram geradas com o uso do software GraphPad Prism7.0. A partir das curvas de ligação na Figura 26A pode-se ver que ο B296 apresentou a afinidade
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103/106 mais baixa enquanto ο B711 mostrou uma ligação mais potentes em comparação com B296 mas também com B333 e B809. Isso sugere que B711 é o anticorpo PT3 humanizado com a maior afinidade para o peptídeo pT217. Um experimento similar com Fabs (Figura 26B) demonstrou que M333 (a Fab de B711) tinha ligação peptídica similar em comparação com B187, o Fab da molécula de PT3 parental. Novamente, M324 (Fab de B296, HFA-PT3) apresentou ligação mais fraca em comparação com Fab parental e variantes maturadas por afinidade de PT3-HFA.
Tabela 20: Sumário dos resultados da ligação de pT217 com ELISA
EC50 (pM)
Fab Média DP
B187 109,82 73,70037
M324 340,8333 121,6609
M330 106,5133 62,22259
mAbs Média DP
B296 433,425 139,2647
B809 91,6675 59,01867
B333 164,345 92,99161
B711 70,745 48,86815
N = 2 réplicas em ao menos 2 experimentos. Valores reportados como média ± DP.
Referências
Abhinandan e Martin, Mol Immunol. 45:3832-9, 2008
Adams et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 66(Pt 2):213-21,2010
Allen et al., J Neurosci. 22(21):9340-51,2002
Almagro, Mol Recognit. 17:132-43, 2004
Asuni et al., J Neurosci. 27:9115-29, 2007
Boutajangout et al., J Neurochem. 118:658-67, 2011
Boutajangout et al., J Neurosci. 30:16559-66, 2010
Brunden et al., Nat Rev Drug Discov. 8:783-93, 2009
Butner e Kirschner, J Cell Biol. 115(3):717-30, 1991
Chai et al., J Biol Chem. 286:34457-67, 2011
Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 108/124
104/106
Chothia e Lesk, J Mol Biol. 196:901-17, 1987
Clavaguera et al., Nat Cell Biol. 11:909-13, 2009
Clavaguera et al., Proc Natl Acad Sci USA. 110(23):9535-40, 2013
Clavaguera et al., Proc Natl Acad Sci USA. 110(23):9535-40, 2013 Collaborative Computational Project, Number 4, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 50(Pt 5):760-3, 1994
Collin et al., Brain. 137(Pt 10):2834-46, 2014 de Calignon et al., Neuron. 73(4):685-97, 2012
Emsley e Cowtan, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 60(Pt 12 Pt 1 ):212632, 2004
Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)
Fishwild etal., Nat Biotechnol. 14:845-51, 1996
Fransson etal., J Mol Biol. 398(2):214-31,2010
Frost et al., J Biol Chem. 284:12845-52, 2009
Funket al., J Biol Chem. 290(35):21652-62, 2015
Goedert etal., Biochemical J. 301 (Pt3) :871-877
Hanger et al., Trends Mol Med. 15:112-9, 2009
Hoffmann et al., Biochemistry. 36(26):8114-24, 1997
Holmes etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 111(41):E4376-85, 2014
Iba et al., Acta Neuropathol. 130(3):349-62, 2015
Iba et al., J Neurosci. 33(3):1024-37, 2013
Julien et al., Methods Mol Biol. 849:473-91,2012
Kabsch, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 66(Pt 2):125-32, 2010
Knappik et al., J Mol Biol. 296:57-86, 2000
Knight et al., Platelets. 15:409-18, 2004
Kohler e Milstein, Nature. 256:495-7, 1975
Krebs et al., J Immunol Methods. 254:67-84, 2001
Lee et al., Cell Rep. 16(6):1690-700, 2016
Lefranc et al., Dev Comp Immunol. 27:55-77, 2003
Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 109/124
105/106
Leong et al., Cytokine. 16:106-19, 2001
Li e Lee, Biochemistry. 45(51):15692-701,2006
Liu et al., Brain Imaging Behav. 6(4):610-20, 2012
Lonberg etal., Nature. 368:856-9, 1994
Malia et al., Proteins. 84:427-434, 2016
Martin e Thornton, J Mol Biol. 263(5):800-15, 1996
Matsuo et al., Neuron. 13(4):989-1002, 1994
McCoy et al., J Appl Crystallogr. 40(Pt 4):658-674, 2007
McEwan et al., 2017, PNAS 114(3):574-9
Mendez etal., Nat Genet. 15:146-56, 1997
Mercken et al., Acta Neuropathol. 84(3):265-72, 1992
Mercken, Ph.D. Thesis: University of Antwerp, Wilrijk-Antwerp, 1991
Mocanu et al., J Neurosci. 28(3):737-48, 2008
Morris et al., Nat Neurosci. 18(8):1183-9, 2015
Morris et al., Neuron, 70:410-26, 2011
Murshudov et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 53(Pt 3):240-55, 1997
Oddo et al., J Neurochem. 102(4):1053-63, 2007
Otvos et al., J Neurosci Res. 39(6):669-73, 1994
Padlan et al., Mol. Immunol. 28:489-98, 1991
Peeraer et al., Neurobiol Dis. 73:83-95, 2015
Queen et al., Proc Natl Acad Sci USA. 86:10029-33, 1989
Scattoni et al., BehavBrain Res. 208(1):250-7, 2010
Schroeder et al., J Neuroimmune Pharmacol. 11 (1 ):9-25, 2016
Seubert etal., J Biol Chem. 270(32):18917-22, 1995
Shi et al., J Mol Biol. 397:385-96, 2010
Stroh I, Curr Opin Biotechnol. 20:685-91,2009
Terwel et al., J Biol Chem. 280(5):3963-73, 2005
Wischik et al. Proc Natl Acad Sci USA. 85:4884-8, 1988
Wu e Kabat, J Exp Med. 132:211-50, 1970
Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 110/124
106/106
Yang et al., Protein Eng. 16:761-70, 2003
Yoshiyama et al., Neuron. 53(3):337-51,2007
Zhao et al., Protein Expr Purif. 67(2):182-9, 2009
Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 111/124

Claims (25)

  1. REIVINDICAÇÕES
    1. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno do mesmo, caracterizado por se ligar a uma proteína tau fosforilada em um epitopo fosforilado que compreende (a) T212 fosforilado e T217 fosforilado da proteína tau, e o epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO:48.
    (b) T217 fosforilado da proteína tau, e o epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO:52; ou (c) T212 fosforilado da proteína tau, e o epitopo fosforilado tendo ou contendo a sequência de aminoácidos da SEQ ID NO:54.
  2. 2. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo anticorpo monoclonal compreender uma HCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 1,4, 7, 10, 71,80; uma HCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 2, 5, 8, 11,72, 81; uma HCDR3 de qualquer das SEQ ID NOs: 3,6,9, 12, 73; uma LCDR1 de qualquer das SEQ ID NOs: 13, 16, 19, 22, 70; uma LCDR2 de qualquer das SEQ ID NOs: 14, 17, 20, 23; uma LCDR3 de qualquer das SEQ ID NOs: 15, 18, 21,24.
  3. 3. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 2, caracterizado por compreender:
    (a) regiões determinantes de complementaridade de cadeia pesada de imunoglobulina (HCDRs) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 7, 8 e 9, respectivamente, e regiões determinantes de complementaridade de cadeia leve de imunoglobulina (LCDRs) LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
    (b) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 1, 2 e 3, respectivamente, e LCDR1,
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    LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 13, 14 e 15, respectivamente;
    (c) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 16, 17 e 18, respectivamente;
    (d) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 10, 11 e 12, respectivamente, e LCDR1, LCDR3 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 22, 23 e 24, respectivamente;
    (e) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeo das SEQ ID NO NQs:80, 81 e 9, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
    (f) HCDR1 HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 71, 72, 73, respectivamente e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 70, 20 e 21, respectivamente;
    (g) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 71, 72 e 73, respectivamente, e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 tendo as sequências de polipeptídeos das SEQ ID NOs: 19, 20 e 21, respectivamente;
    (h) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 tendo uma região Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
    (i) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34;
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 113/124
    3/8 (j) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34; ou (k) HCDR1, HCDR2 e HCDR3 de uma região Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 28 e LCDR1, LCDR2 e LCDR3 de uma região Vl tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
    em que o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo se liga a PHF-tau.
  4. 4. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 3, caracterizado por compreender uma região variável de cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 26, 27, 28 e 29, e uma região variável de cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a qualquer uma das SEQ ID NOs: 31,32, 33 e 34.
  5. 5. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 4, caracterizado por compreender uma região variável de cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos de qualquer das SEQ ID NOs: 26, 27, 28 e 29, e uma região variável de cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos de qualquer das SEQ ID NOs: 31,32, 33 e 34.
  6. 6. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 3, caracterizado por compreender uma região variável de cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a Vh de uma cadeia pesada tendo um sequência de polipeptídeos de qualquer das SEQ ID NOs: 45, 74, 76 e 78, e uma região variável de cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a uma VL de uma
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 114/124
    4/8 cadeia leve de qualquer das SEQ ID NOs: 31,75, 77 e 79.
  7. 7. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 6, caracterizado por compreender uma região variável de cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos de uma Vh de uma cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeo de qualquer das SEQ ID NOs: 45, 74, 76 e 78, e uma região variável de cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos de uma VL de uma cadeia leve de qualquer da SEQ ID NOs: 31,75, 77 e 79.
  8. 8. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 3, caracterizado por compreender:
    (a) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
    (b) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO:
    28 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34;
    (c) uma Vh tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 26 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 34;
    (d) uma Vh tendo uma sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 28 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
    (e) uma Vh tendo uma sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 27 e uma VL tendo a sequência de polipeptídeos da SEQ ID NO: 31;
    (f) uma Vh de uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 74 e uma Vl de uma cadeia leve da SEQ ID NO: 75;
    (g) uma Vh de uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 76 e uma Vl de uma cadeia leve da SEQ ID NO: 77; ou (h) uma Vh de uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 78 e uma Vl de uma cadeia leve da SEQ ID NO: 79.
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 115/124
    5/8
  9. 9. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 8, caracterizado por compreender uma cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a qualquer das SEQ ID NOs: 45, 74, 76 e 78, e uma cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos ao menos 95% idêntica a qualquer das SEQ ID NOs: 46, 75, 77 e 79.
  10. 10. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 9, caracterizado por compreender uma cadeia pesada tendo uma sequência de polipeptídeo de qualquer das SEQ ID NOs: 45, 74, 76 e 78, e uma cadeia leve tendo uma sequência de polipeptídeos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 46, 75, 77 e 79.
  11. 11. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com a reivindicação 10, caracterizado por compreender:
    (a) uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 45, e uma cadeia leve da SEQ ID NO: 46;
    (b) a cadeia pesada da SEQ ID NO: 74, e uma cadeia leve da SEQ ID NO: 75;
    (c) uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 76, e uma cadeia leve da SEQ ID NO: 77; ou (d) uma cadeia pesada da SEQ ID NO: 78, e uma cadeia leve da SEQ ID NO: 79.
  12. 12. Anticorpo monoclonal isolado ou fragmento de ligação a antígeno, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado por compreender uma região constante de IgG 1 de cadeia pesada humana e uma região constante kappa de cadeia leve humana.
  13. 13. Ácido nucleico isolado, caracterizado por codificar o anticorpo monoclonal ou o fragmento de ligação a antígeno como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 12.
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 116/124
    6/8
  14. 14. Vetor, caracterizado por compreender o ácido nucleico isolado como definido na reivindicação 13.
  15. 15. Célula hospedeira, caracterizada por compreender o vetor como definido na reivindicação 14.
  16. 16. Composição farmacêutica, caracterizada por compreender o anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação ao antígeno como definido em qualquer uma das modalidades 1 a 12 e um veículo farmaceuticamente aceitável.
  17. 17. Método para reduzir a agregação patológica de tau ou a disseminação de taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, caracterizado por compreender administrar ao indivíduo a composição farmacêutica como definida na reivindicação 16.
  18. 18. Método para tratar uma taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo, caracterizado por compreender administrar ao indivíduo a composição farmacêutica como definida na reivindicação 16.
  19. 19. Método, de acordo com a reivindicação 18, caracterizado por a taupatia ser selecionada do grupo que consiste em doença de Alzheimer familiar, doença de Alzheimer esporádica, demência frontotemporal com parkinsonismo ligado ao cromossomo 17 (FTDP-17), paralisia supranuclear progressiva, degeneração corticobasal, doença de Pick, gliose progressiva subcortical, demência apenas com emaranhados, emaranhados neurofibrilares difusos com calcificação, demência com grãos argirofílicos, complexo esclerose lateral amiotrófica-parkinsonismo-demência, síndrome de Down, doença de Gerstmann-Strãussler-Scheinker, doença de Hallervorden-Spatza, miosite por corpos de inclusão, doença de Creutzfelt-Jakob, atrofia de múltiplos sistemas, doença de Niemann-Pick tipo C, angiopatia amiloide cerebral causada pela proteína príon, panencefalite esclerosante subaguda, distrofia miotônica, doença do neurônio motor não Guamaniana com emaranhados neurofibrilares, parkinsonismo pós-encefalítico, encefalopatia traumática crônica e
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 117/124
    7/8 demência pugilística (doença do boxe).
  20. 20. Método para produzir o anticorpo monoclonal ou o fragmento de ligação ao antigeno como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 12, caracterizado por compreender cultivar uma célula que compreende um ácido nucleico que codifica o anticorpo ou o fragmento de ligação ao antigeno sob condições para produzir o anticorpo ou o fragmento de ligação ao antigeno, e recuperar o anticorpo ou o fragmento de ligação ao antigeno da célula ou cultura celular.
  21. 21. Método para detectar a presença de PHF-tau em uma amostra biológica de um indivíduo, caracterizado por compreender colocar a amostra biológica em contato com o anticorpo ou o fragmento de ligação ao antigeno como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 12, e detectar a ligação do anticorpo ou do fragmento de ligação ao antigeno ao PHF-tau na amostra do indivíduo.
  22. 22. Método, de acordo com a reivindicação 21, caracterizado por a amostra biológica ser uma amostra de sangue, soro, plasma, fluido intersticial, ou fluido cérebro-espinhal.
  23. 23. Uso do anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação ao antigeno como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 12, caracterizado pelo fato de que é na fabricação de um medicamento ou composição para reduzir a agregação patológica de tau ou a disseminação de taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo.
  24. 24. Uso do anticorpo monoclonal isolado ou o fragmento de ligação ao antigeno como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 12, caracterizado pelo fato de que é na fabricação de um medicamento ou composição para tratar uma taupatia em um indivíduo que precisa do mesmo.
  25. 25. Invenção, caracterizada em quaisquer formas de suas concretizações ou em qualquer categoria aplicável de reivindicação, por exemplo, de produto ou de processo ou uso ou qualquer outro tipo de
    Petição 870190111237, de 31/10/2019, pág. 118/124
    8/8 reivindicação englobada pela matéria inicialmente descrita, revelada ou ilustrada no pedido de patente.
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Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SG10201707855YA (en) 2013-03-13 2017-10-30 Prothena Biosciences Ltd Tau immunotherapy
EP3452508A1 (en) 2016-05-02 2019-03-13 Prothena Biosciences Limited Antibodies recognizing tau
CA3022673A1 (en) 2016-05-02 2017-11-09 Prothena Biosciences Limited Tau immunotherapy
MX2019009817A (es) 2017-02-17 2019-11-21 Denali Therapeutics Inc Anticuerpos anti-tau y metodos de uso de los mismos.
IL270375B1 (en) 2017-05-02 2024-08-01 Prothena Biosciences Ltd Antibodies that recognize tau
CN111630064B (zh) 2017-10-16 2023-06-27 卫材R&D管理有限公司 抗Tau抗体及其用途
TW202100550A (zh) 2019-03-03 2021-01-01 愛爾蘭商普羅帝納生物科學公司 識別ｔａｕ之抗體
AU2020283534B2 (en) 2019-05-31 2024-05-16 Eli Lilly And Company Compounds and methods targeting human tau
JP7181438B2 (ja) * 2019-08-06 2022-11-30 アプリノイア セラピューティクス リミテッド 病理学的タウ種に結合する抗体及びその使用
WO2021205359A1 (en) * 2020-04-08 2021-10-14 Janssen Biotech, Inc. Anti-phf-tau antibodies and uses thereof
IL299822A (en) * 2020-07-14 2023-03-01 Janssen Pharmaceutica Nv A blood-based test to detect tauopathy or amyloidogenic disease
CA3199808A1 (en) * 2020-10-26 2022-05-05 Janssen Pharmaceutica Nv Method of safe administration of anti-tau antibody
CN116916955A (zh) * 2020-10-26 2023-10-20 詹森药业有限公司 减少人类受试者中的Tau的方法
MX2023008317A (es) * 2021-02-19 2023-07-24 Eisai R&D Man Co Ltd Anticuerpo anti tau fosforilada en la treonina 217 (pt217).
EP4314048A1 (en) 2021-03-26 2024-02-07 Janssen Biotech, Inc. Anti-tau antibodies and uses thereof
WO2023092004A1 (en) 2021-11-17 2023-05-25 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions and methods for the treatment of tau-related disorders
CN117003863A (zh) * 2022-04-28 2023-11-07 厦门大学 针对p-tau 217的抗体及其用途
CN116948024B (zh) * 2023-09-14 2024-02-06 北京凯祥弘康生物科技有限公司 抗Tau蛋白的捕获抗体
CN116948023B (zh) * 2023-09-14 2024-02-09 北京凯祥弘康生物科技有限公司 Tau蛋白抗体及其应用

Family Cites Families (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US5225539A (en) 1986-03-27 1993-07-06 Medical Research Council Recombinant altered antibodies and methods of making altered antibodies
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
IL162181A (en) 1988-12-28 2006-04-10 Pdl Biopharma Inc A method of producing humanized immunoglubulin, and polynucleotides encoding the same
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
AU675916B2 (en) 1991-06-14 1997-02-27 Genentech Inc. Method for making humanized antibodies
WO1993008302A1 (en) 1991-10-25 1993-04-29 Itt Automotive Europe Gmbh Monoclonal antibodies directed against the microtubule-associated protein tau
WO1995017429A1 (en) 1993-12-21 1995-06-29 Innogenetics N.V. Monoclonal antibodies specific for phf-tau, hybridomas secreting them, antigen recognition by these antibodies and their applications
US6121003A (en) 1994-07-29 2000-09-19 Innogentics N.V. Monoclonal antibodies specific for an epitope of phosphorylated tau, and their use
EP2298809A3 (en) 2001-07-12 2012-02-15 FOOTE, Jefferson Super humanized antibodies
ES2567198T3 (es) 2003-01-24 2016-04-20 Applied Molecular Evolution, Inc. Antagonistas de la IL-1 beta humana
EP1697741A4 (en) 2003-12-04 2008-02-13 Xencor Inc PROCESS FOR PRODUCING PROTEIN VARIANTS WITH INCREASED HOST STRUCTURE CONTENT AND COMPOSITIONS THEREOF
EP1720908A2 (en) 2004-02-17 2006-11-15 Absalus, Inc. Super-humanized antibodies against respiratory syncytial virus
US20070048785A1 (en) 2004-06-09 2007-03-01 Lin Laura L Anti-IL-13 antibodies and complexes
EP1790664A1 (en) 2005-11-24 2007-05-30 Ganymed Pharmaceuticals AG Monoclonal antibodies against claudin-18 for treatment of cancer
JP5406027B2 (ja) 2006-08-04 2014-02-05 ノバルティス アーゲー ＥｐｈＢ３特異的抗体およびその使用
JP2010235447A (ja) 2007-07-30 2010-10-21 Igaku Seibutsugaku Kenkyusho:Kk 炎症性サイトカインの抑制剤
WO2010045340A1 (en) 2008-10-14 2010-04-22 Centocor Ortho Biotech Inc. Methods of humanizing and affinity-maturing antibodies
US9403904B2 (en) * 2008-11-07 2016-08-02 Fabrus, Inc. Anti-DLL4 antibodies and uses thereof
US9968574B2 (en) 2009-05-15 2018-05-15 The University Of Kentucky Research Foundation Treatment of MCI and Alzheimer's disease
JP5917394B2 (ja) 2009-06-10 2016-05-11 ニューヨーク・ユニバーシティ 病理学的タウタンパク質の免疫学的標的化方法
US8609097B2 (en) 2009-06-10 2013-12-17 Hoffmann-La Roche Inc. Use of an anti-Tau pS422 antibody for the treatment of brain diseases
US8912355B2 (en) 2009-09-29 2014-12-16 University Of Ottawa Heart Institute Linoleic phospholipids and uses thereof for inhibiting inflammatory and neurodegenerative processes
DK2488867T3 (da) 2009-10-14 2020-11-09 Janssen Biotech Inc Fremgangsmåder til affinitetsmodning af antistoffer
ES2566602T3 (es) 2010-04-09 2016-04-14 Aveo Pharmaceuticals, Inc. Anticuerpos anti-ErbB3
WO2012045882A2 (en) 2010-10-07 2012-04-12 Ac Immune S.A. Pharmaceutical composition
EP2627672B1 (en) 2010-10-11 2018-08-01 Biogen Idec International Neuroscience GmbH Human anti-tau antibodies
BR112014015323B1 (pt) * 2011-12-20 2022-09-27 Janssen Biotech, Inc Anticorpos anti-phf-tau, seu método de produção, polinucleotídeo isolado que codifica uma vh de anticorpo, e vetor

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