BR112016011840A2 - método para tipificação de dna de um gene hla, e, conjunto de iniciadores - Google Patents

método para tipificação de dna de um gene hla, e, conjunto de iniciadores

Info

Publication number
BR112016011840A2
BR112016011840A2 BR112016011840A BR112016011840A BR112016011840A2 BR 112016011840 A2 BR112016011840 A2 BR 112016011840A2 BR 112016011840 A BR112016011840 A BR 112016011840A BR 112016011840 A BR112016011840 A BR 112016011840A BR 112016011840 A2 BR112016011840 A2 BR 112016011840A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
hla
primer set
exon
dna
base sequence
Prior art date
Application number
BR112016011840A
Other languages
English (en)
Other versions
BR112016011840B1 (pt
Inventor
Inoko Hidetoshi
Mitsunaga Shigeki
Suzuki Shingo
Shiina Takashi
Wada Yuki
Original Assignee
Genodive Pharma Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Genodive Pharma Inc filed Critical Genodive Pharma Inc
Publication of BR112016011840A2 publication Critical patent/BR112016011840A2/pt
Publication of BR112016011840B1 publication Critical patent/BR112016011840B1/pt

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

[problema] a presente invenção aborda o problema de prover um método e kit para perfilagem de dna de genes hla usando um sequenciador massivamente paralelo de alto rendimento. [solução] a presente invenção se refere a um método para a perfilagem de dna de genes hla, dito método sendo caracterizado por incluir: (1) uma etapa para preparar um conjunto de iniciadores que anela especificamente ao éxon 4 e íntron 1 e inclui éxon 2 e éxon 3 de pelo menos um gene alvo selecionado do grupo que consiste em hla-drb1, hla-drb3, hla-drb4, hla-drb5, hla-dqb1 e hla-dpb1 na sequência de base do genoma humano; (2) uma etapa para amplificar uma amostra (dna) por pcr usando o conjunto de iniciadores; (3) uma etapa para determinar a sequência de base do produto de pcr amplificado; e (4) uma etapa para realizar uma pesquisa de homologia em um banco de dados.
BR112016011840-5A 2013-11-27 2014-11-27 Método para tipificação de dna de um gene hla, e, conjunto de iniciadores BR112016011840B1 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2013-244624 2013-11-27
JP2013244624 2013-11-27
PCT/JP2014/081464 WO2015080226A1 (ja) 2013-11-27 2014-11-27 超並列高速シークエンサーによる簡便なhla遺伝子のdnaタイピング方法およびキット

Publications (2)

Publication Number Publication Date
BR112016011840A2 true BR112016011840A2 (pt) 2017-09-26
BR112016011840B1 BR112016011840B1 (pt) 2023-02-23

Family

ID=53199162

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112016011840-5A BR112016011840B1 (pt) 2013-11-27 2014-11-27 Método para tipificação de dna de um gene hla, e, conjunto de iniciadores

Country Status (8)

Country Link
US (1) US10494673B2 (pt)
EP (1) EP3075863B1 (pt)
JP (1) JP6643902B2 (pt)
CN (1) CN106103738B (pt)
AU (1) AU2014355369B2 (pt)
BR (1) BR112016011840B1 (pt)
CA (1) CA2931828C (pt)
WO (1) WO2015080226A1 (pt)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP6308724B2 (ja) * 2013-05-09 2018-04-11 ジェノダイブファーマ株式会社 Hla遺伝子のマルチプレックスdnaタイピング方法及びキット
CN106381331B (zh) * 2016-08-31 2019-09-03 中国水产科学研究院珠江水产研究所 草鱼生长速度相关的snp标记及其应用
JP6798697B2 (ja) * 2017-02-13 2020-12-09 国立大学法人京都大学 Hla遺伝子のpcrプライマーセット及びそれを用いたシークエンス法
WO2018167153A1 (en) 2017-03-17 2018-09-20 Novozymes A/S Improved filamentous fungal host cell
WO2019045775A1 (en) * 2017-09-01 2019-03-07 Orig3N, Inc. SECRETED COMPOSITIONS DERIVED FROM INDUCED PLURIPOTENT STEM CELLS, AND ASSOCIATED SYSTEMS AND METHODS
CN108048546A (zh) * 2017-10-10 2018-05-18 上海荻硕贝肯医学检验所有限公司 用于hla基因高分辨率分型的引物、试剂盒及方法
KR20190059780A (ko) * 2017-11-23 2019-05-31 (주)오상헬스케어 실시간 중합 효소 연쇄 반응을 이용한 hla 대립유전자 검사 키트
US11608530B1 (en) 2018-04-18 2023-03-21 One Lambda, Inc. Single reaction multiplex PCR primer design for amplifying multiple HLA class I and II genes
EP3626835A1 (en) 2018-09-18 2020-03-25 Sistemas Genómicos, S.L. Method for genotypically identifying both alleles of at least one locus of a subject's hla gene
CN111057706A (zh) * 2019-10-09 2020-04-24 西安市中心血站(陕西省血液中心) 一组引物以及hla-dpb1基因测序分型的检测方法
CN117265091A (zh) * 2023-10-31 2023-12-22 江苏伟禾生物科技有限公司 一种用于hla-drb3/4/5基因分型的引物组、试剂盒及应用
CN117512085A (zh) * 2023-11-21 2024-02-06 江苏伟禾生物科技有限公司 一种用于检测hla-dpb1基因分型的引物组及试剂盒

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0216000A (ja) 1988-07-01 1990-01-19 Fujitsu Ltd 組立定尺プリント基板の切断装置
EP2186911B1 (en) 1997-06-26 2015-01-21 BIO-Rad Medical Diagnostics GmbH A method for determining the Histocompatibility Locus Antigen Class II
JPH11216000A (ja) 1997-10-29 1999-08-10 Shionogi & Co Ltd Hla−a対立遺伝子型の判別方法
EP2319942B1 (en) 1999-04-09 2013-08-14 Innogenetics N.V. Method for the amplificiation of HLA class I alleles
EP1711621A4 (en) 2003-10-28 2008-06-18 Dynal Biotech Llc PRIMERS, METHODS AND KITS FOR THE AMPLIFICATION OR DETECTION OF HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN ALLELES
US20100086914A1 (en) 2008-10-03 2010-04-08 Roche Molecular Systems, Inc. High resolution, high throughput hla genotyping by clonal sequencing
EP2203567B1 (en) 2007-10-16 2011-05-11 Roche Diagnostics GmbH High resolution, high throughput hla genotyping by clonal sequencing
US20100261189A1 (en) * 2008-10-03 2010-10-14 Roche Molecular Systems, Inc. System and method for detection of HLA Variants
CN101928770B (zh) * 2009-09-18 2012-02-29 深圳市血液中心 人类白细胞抗原HLA-Cw基因测序分型的方法
CN101892317B (zh) 2010-07-29 2012-08-22 苏州大学 Hla高分辨基因测序试剂盒
CN101962676B (zh) 2010-08-31 2011-08-31 深圳市血液中心 人类白细胞抗原hla基因测序分型方法
CN103890190B (zh) 2011-07-21 2016-08-17 吉诺戴夫制药株式会社 Hla基因的dna分型方法和试剂盒
JP6308724B2 (ja) * 2013-05-09 2018-04-11 ジェノダイブファーマ株式会社 Hla遺伝子のマルチプレックスdnaタイピング方法及びキット

Also Published As

Publication number Publication date
CA2931828C (en) 2022-07-12
WO2015080226A1 (ja) 2015-06-04
CN106103738A (zh) 2016-11-09
JPWO2015080226A1 (ja) 2017-03-16
EP3075863A1 (en) 2016-10-05
AU2014355369A1 (en) 2016-06-23
US10494673B2 (en) 2019-12-03
EP3075863B1 (en) 2019-03-13
CA2931828A1 (en) 2015-06-04
US20170029885A1 (en) 2017-02-02
BR112016011840B1 (pt) 2023-02-23
JP6643902B2 (ja) 2020-02-12
EP3075863A4 (en) 2017-06-14
CN106103738B (zh) 2020-08-28
AU2014355369B2 (en) 2020-08-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112016011840A2 (pt) método para tipificação de dna de um gene hla, e, conjunto de iniciadores
Zhang et al. On the analysis of the illumina 450k array data: probes ambiguously mapped to the human genome
Miao et al. Genome-wide transcriptome analysis of mRNAs and microRNAs in Dorset and Small Tail Han sheep to explore the regulation of fecundity
BR112018009105A2 (pt) método para detectar anomalia cromossómica em embrião usando cultura de blastocisto
BR112015028027A2 (pt) método para tipagem de dna de hla, e, conjunto de iniciadores e kit para tipagem de dna de um gene de hla
BR112012033760A2 (pt) detecção não invasiva de anormalidades genéticas fetais
Zhang et al. Circular RNA alterations are involved in resistance to avian leukosis virus subgroup-J-induced tumor formation in chickens
BR112017008082A2 (pt) composições e métodos para detectar um vírus de rna
RU2017100015A (ru) Набор или устройство для обнаружения рака желчных путей и способ обнаружения
EP4279612A3 (en) Analysis of fragmentation patterns of cell-free dna
BR112016019267B8 (pt) Método para construir um perfil de dna, biblioteca de ácido nucléico, método para construir uma biblioteca de ácido nucléico, pluralidade de iniciadores e kit
BRPI0816393A2 (pt) Método para determinar o número de cópias relativo de uma sequência de polinucleotídeo alvo em um genoma de um indivíduo
BRPI1013410A2 (pt) processos de pcr para a caracterização da região não traduzida a 5' dos genes fmr1 e fmr2
Sun et al. Epigenetic DNA methylation in the promoters of peroxisome proliferator-activated receptor γ in chicken lines divergently selected for fatness
BR112013023960A2 (pt) método de análise de uma amostra de sangue de um indivíduo para a presença de um marcador de doença
BR112013025459A2 (pt) análise de alto rendimento de bordas de transgenes
BR112012018545A2 (pt) método de determinação e confirmação da presença de um hpv em uma amostra
WO2012174119A3 (en) Compositions and methods for detection of cronobacter spp. and cronobacter species and strains
Chen et al. High-throughput sex identification by melting curve analysis in blue-breasted quail and chicken
BR112012021260A2 (pt) marcador genético para o diagnóstico de demência com corpos de lewy.
ZA202205645B (en) Identification and analysis of microbial samples by rapid incubation and nucleic acid enrichment
BR112017025577A2 (pt) métodos, suportes e kits para análise de cgh reforçada
BR112014023296A2 (pt) métodos para fazer tipagem de uma amostra de um paciente com hepatite b, para determinar se um paciente com hepatite b tem uma chance melhorada de um resultado positivo do tratamento da hepatite b, se um indivíduo tem uma predisposição genética para uma chance melhorada para um resultado positivo de tratamento da hepatite b, para identificar um gene, e para ensaiar quanto a presença de ácido nucleico, kit de partes ou arranjo ou microarranjo ou vetor, usos de pelo menos um polinucleotídeo isolado, de um kit de partes ou arranjo ou microarranjo ou vetor e de meios para determinar um nível de expressão de carnitina e/ou um derivado de carnitina
Roodgar et al. Inducible nitric oxide synthase (iNOS) regulatory region variation in non-human primates
BR112018071186A8 (pt) Rna, pluralidade de rnas, construto de interferência por rna dirigida por dna, composição, método para inibir a expressão de uma proteína, método para tratar distrofia muscular oculofaríngea e kit

Legal Events

Date Code Title Description
B06U Preliminary requirement: requests with searches performed by other patent offices: procedure suspended [chapter 6.21 patent gazette]
B350 Update of information on the portal [chapter 15.35 patent gazette]
B06A Patent application procedure suspended [chapter 6.1 patent gazette]
B09A Decision: intention to grant [chapter 9.1 patent gazette]
B16A Patent or certificate of addition of invention granted [chapter 16.1 patent gazette]

Free format text: PRAZO DE VALIDADE: 20 (VINTE) ANOS CONTADOS A PARTIR DE 27/11/2014, OBSERVADAS AS CONDICOES LEGAIS