AR078912A1 - Loci geneticos asociados con la resistencia a la roya tropical en maiz - Google Patents

Abstract

Métodos y composiciones para identificar plantas de maíz que presentan un aumento o una disminucion de la resistencia a la roya tropical. Los métodos usan marcadores moleculares para la identificacion y seleccion de plantas con mayor resistencia a la roya tropical o para la identificacion y exclusion de plantas con menor resistencia a la roya tropical. Las plantas de maíz generadas con los métodos de la solicitud también son una característica de la misma. También son de interés los métodos usados para correlacionar la variacion alélica con un rasgo de interés. Reivindicacion 1: Un método para seleccionar una planta de maíz con resistencia mejorada a la roya tropical que comprende : a. detectar en la planta de maíz un primer alelo marcador que está unido y asociado con: i. una supresion de ôTö en la posicion 16 de PHMTR; o ii. un haplotipo ôGAGö en las posiciones 337-339 de la secuencia de referencia SEQ ID NO:167; y b. seleccionar la planta de maíz que tiene el primer alelo marcador. - Reivindicacion 19: Un método para identificar una o más variaciones alélicas asociadas con una forma deseable de un rasgo que comprende: a. alinear las secuencias sin procesar con una relacion de costos de apertura: extension mayor que 10; b. eliminar las colas de secuenciamiento (ruido); c. eliminar la variacion alélica aleatoria; d. aplicar el método UPGMA (método no ponderado de grupo par con media aritmética) al alineamiento resultante; e. repetir las etapas c-d hasta que un fenograma identifique un grupo unico de líneas con la forma deseable del rasgo; y f. identificar una o más variaciones alélicas asociadas con la forma de deseable de un rasgo.