RU2017118904A - Тонкое картирование и подтверждение локуса qtl, ответственного за признаки содержания волокон и цвета оболочки семян, и идентификация маркеров snp для маркер-опосредованного отбора на эти признаки в линии канолы с желтой оболочкой семян (ysc) yn01-429 и в ее линии дифференцировки - Google Patents

Claims (43)

1. Способ идентификации локуса количественных признаков, ассоциированного с желательными питательными признаками канолы, где указанный способ включает:

анализ популяции растений или зародышевой плазмы канолы на желательные питательные признаки;

определение генотипа растений или зародышевой плазмы канолы с использованием по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:111;

картирование растений или зародышевой плазмы канолы на присутствие локуса количественных признаков (QTL), ассоциированного с маркерами; и

ассоциацию QTL с желательным питательным признаком.

2. Способ по п. 1, где по меньшей мере один маркер включает полиморфизм по одному нуклеотиду (SNP).

3. Способ по п. 1, где растение или зародышевая плазма канолы имеет низкое содержание волокна и YSC в линии YN01-429 или в ее линии дифференцировки.

4. Маркер по п. 1.

5. Выделенная и/или рекомбинантная нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, ассоциированную с QTL,

где QTL ассоциируется с желательным питательным признкаом в растении или в зародышевой плазме канолы; и

где QTL также ассоциируется по меньшей мере с одним маркером, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:111.

6. Маркер по п. 5, где указанный маркер содержит SNP.

7. Последовательность по п. 5, где указанная последовательность идентифицирована в YSC-линии YN01-429 или в ее линии дифференцировки.

8. Растение или зародышевая плазма канолы по п. 5.

9. Растение или зародышевая плазма канолы по п. 5, где растение или зародышевая плазма канолы содержат признаки низкого содержания волокна и YSC в YSC-линии YN01-429 или в ее линии дифференцировки.

10. Способ селекции растения или зародышевой плазмы канолы, содержащих желательные питательные признаки, где указанный способ включает:

детектирование в растении или в зародышевой плазме канолы по меньшей мере одного маркера, сцепленного с QTL и выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:111, где QTL ассоциируется с желательным питательным признаком в растении или в зародышевой плазме канолы; и

отбор растения или зародышевой плазмы канолы исхоля из присутствия маркера.

11. Способ по п. 10, который также включает анализ образца нуклеиновой кислоты растения или зародышевой плазмы канолы на присутствие QTL.

12. Способ по п. 10, где маркер включает по меньшей мере одну аллельную форму SNP.

13. Способ по п. 10, где растение или зародышевая плазма канолы содержат признаки низкого содержания волокна и YSC в YSC-линии YN01-429.

14. Растение или зародышевая плазма канолы по п. 10.

15. Маркер по п. 10.

16. Мука, полученная из семян растения по п. 8.

17. Мука, полученная из семян растения по п. 14.

18     18. Способ идентификации растения канолы, которое имеет пониженное содержание волокна, где указанный способ включает детектирование в зародышевой плазме растения канолы по меньшей мере одного аллеля маркерного локуса, где

a. маркерный локус локализован в хромосомном интервале, включающем DBSNP01120 и DBSNP02172 и фланкированном ими; и

b. по меньшей мере один аллель ассоциируется с пониженным содержанием волокна.

19. Способ по п. 18, где маркерный локус локализован в хромосомном интервале, включающем суб-DBSNP01120 и суб-DBSNP02172 и фланкированном ими.

20. Способ по п. 18, где растение канолы принадлежит к гетерозисной группе растений с жестким стеблем.

21. Растение канолы, идентифицированное способом по п. 18.

22. Способ идентификации растения канолы, которое имеет пониженное содержание волокна, где указанный способ включает детектирование в зародышевой плазме растения канолы гаплотипа, включающего аллели в одном или более маркерных локусах, где

a. один или более маркерных локусов локализованы в хромосомном интервале, включающем DBSNP01120 и DBSNP02172 и фланкированном ими; и

b. гаплотип ассоциируется с пониженным содержанием волокна.

23. Способ по п. 22, где один или более маркерных локусов локализованы в хромосомном интервале, включающем DBSNP01120 и DBSNP02172 и фланкированном ими.

24. Растение канолы, идентифицированное способом по п. 22, где указанное растение канолы содержит в своей зародышевой плазме гаплотип, ассоциированный с пониженным содержанием волокна, где указанный гаплотип содержит аллели в одном или более маркерных локусах, локализованных в хромосомном интервале, включающем DBSNP01120 и DBSNP02172 и фланкированном ими.

25. Способ маркер-опосредуемой селекции растения канолы, включающий

a. получение первого растения канолы, имеющего по меньшей мере один аллель маркерного локуса, где указанный маркерный локус локализован в хромосомном интервале, включающем DBSNP01120 и DBSNP02172 и фланкированном ими, и где аллель маркерного локуса ассоциируется с пониженным содержанием волокна;

b. скрещивание первого растения канолы со вторым растением канолы;

c. анализ потомства на присутствие по меньшей мере одного аллеля; и

d. селекцию потомства растений, имеющего по меньшей мере один аллель.

26. Способ по п. 25, где маркерный локус локализован в хромосомном интервале, включающем DBSNP357221 и DBSNP222231 и фланкированном ими.

27. ПОТОМСТВО РАСТЕНИЯ КАНОЛЫ, ВЫБРАННОЕ СПОСОБОМ ПО П. 25, ГДЕ УКАЗАННОЕ РАСТЕНИЕ ИМЕЕТ ПО МЕНЬШЕЙ МЕРЕ ОДИН АЛЛЕЛЬ МАРКЕРНОГО ЛОКУСА, ГДЕ УКАЗАННЫЙ МАРКЕРНЫЙ ЛОКУС ЛОКАЛИЗОВАН В ХРОМОСОМНОМ ИНТЕРВАЛЕ, ВКЛЮЧАЮЩЕМ DBSNP01120 И DBSNP02172 И ФЛАНКИРОВАННОМ ИМИ.