WO2022181273A1 - ペプチド測定における品質管理用標準溶液、及びペプチド測定の品質管理 - Google Patents
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Abstract
Description
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含む、QC標準試料。
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含むQC標準試料の測定を行う開始QC工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う中間QC工程と、
前記検体測定工程と、前記中間QC工程とを所定回数繰り返す工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う最終QC工程と、
を含む、ペプチド測定方法。
前記開始QC工程、前記中間QC工程、及び前記最終QC工程において測定された各QC標準試料中の前記安定同位体標識されたペプチドのレベルが、所定の基準値に対して、-20%以上+20%以下の正常範囲内であれば、当該QC標準試料の測定は合格とし、一方、前記正常範囲の外であれば、当該QC標準試料の測定は不合格とする判定工程と、
各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方が合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用し、一方、各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方又は一方が不合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用しないと決定する採否決定工程と、
を含む、上記のペプチド測定方法。
ペプチドを含んでいる血液試料と、
該血液試料にスパイクされるべき安定同位体標識されたペプチドと、
を含む、QC標準試料キット。
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含んでいる。
まず、分析対象物質について詳しく説明する。
HDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
APP672-704(Aβ1-33)(配列番号2):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIG
APP677-711(Aβ6-40)(配列番号3):
HDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP672-706(Aβ1-35)(配列番号4):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLM
APP672-708(Aβ1-37)(配列番号5):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVG
APP674-711(Aβ3-40)(配列番号6):
EFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP672-711(Aβ1-40)(配列番号7):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
OxAPP672-711(OxAβ1-40)(配列番号8):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV (Met 706が酸化されている)
APP672-713(Aβ1-42)(配列番号9):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA
APP669-711(配列番号10):
VKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP672-709(Aβ1-38)(配列番号11):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
APP672-710(Aβ1-39)(配列番号12):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGV
APP672-713(Aβ1-42)レベルに対するAPP669-711レベルの比:
APP669-711/APP672-713(Aβ1-42)、
APP672-713(Aβ1-42)レベルに対するAPP672-711(Aβ1-40)レベルの比:
APP672-711(Aβ1-40)/APP672-713(Aβ1-42)、
APP672-713(Aβ1-42)レベルに対するAPP674-711(Aβ3-40)レベルの比:
APP674-711(Aβ3-40)/APP672-713(Aβ1-42)、及び
APP672-713(Aβ1-42)レベルに対するAPP672-710(Aβ1-39)レベルの比:
APP672-710(Aβ1-39)/APP672-713(Aβ1-42)
などもアルツハイマー病に関して、有効なバイオマーカーである。
対象ペプチド測定用QC標準試料は、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含んでいる。
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含んでもよい。
安定同位体標識されたSIL-Aβ1-42は、PheとIleの炭素原子が13Cで置換されているものであってもよく、あるいは、全ての窒素原子14Nが15Nに置換されたものであってもよい。
安定同位体標識されたSIL-Aβ1-40は、PheとIleの炭素原子が13Cで置換されているものであってもよく、あるいは、全ての窒素原子14Nが15Nに置換されたものであってもよい。
安定同位体標識されたSIL-APP669-711は、PheとIleの炭素原子が13Cで置換されているものであってもよく、あるいは、全ての窒素原子14Nが15Nに置換されたものであってもよい。
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられる場合には、
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされているとよい。QC標準試料の組成が、実際の測定対象試料(検体)の組成条件に近くなり好ましい。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされているとよい。QC標準試料の組成が、実際の測定対象試料(検体)の組成条件に近くなり好ましい。
SIL-Aβ1-40の濃度:45~121pM
SIL-Aβ1-42の濃度:4~13pM
SIL-APP669-711の濃度:4~11pM
のようにすればよい。ただし、このような範囲に限定されることはない。また、実際の存在量(pM)の比と質量分析のピーク強度の比とは必ずしも一致しないため、上記質量分析ピーク強度比としての基準を用いることが有用である。ペプチドによって免疫沈降(IP)収率やMSのイオン化効率が異なるため、実際のペプチド濃度比と質量分析ピーク強度の比とは異なり得る。
本発明の一実施形態において、図1を参照して、多検体血液試料中の対象ペプチドを測定する方法は、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含むQC標準試料の測定を行う開始QC工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う中間QC工程と、
前記検体測定工程と、前記中間QC工程とを所定回数繰り返す工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う最終QC工程と、
を含む。
前記開始QC工程、前記中間QC工程、及び前記最終QC工程において測定された各QC標準試料中の前記安定同位体標識されたペプチドのレベルが、所定の基準値に対して、-20%以上+20%以下の正常範囲内であれば、当該QC標準試料の測定は合格とし、一方、前記正常範囲の外であれば、当該QC標準試料の測定は不合格とする判定工程と、
各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方が合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用し、一方、各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方又は一方が不合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用しないと決定する採否決定工程と、
を含んでいてもよい。
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含んでもよい。
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられ、
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記QC標準試料中において、前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされているとよい。QC標準試料の組成が、実際の測定対象試料(検体)の組成条件に近くなり好ましい。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされているとよい。QC標準試料の組成が、実際の測定対象試料(検体)の組成条件に近くなり好ましい。
質量分析法は、特に限定されないが、マトリックス支援レーザー脱離イオン化(MALDI)質量分析法、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析法などによる質量分析法が含まれる。例えば、MALDI-TOF(マトリックス支援レーザー脱離イオン化-飛行時間)型質量分析装置、MALDI-IT(マトリックス支援レーザー脱離イオン化-イオントラップ)型質量分析装置、MALDI-IT-TOF(マトリックス支援レーザー脱離イオン化-イオントラップ-飛行時間)型質量分析装置、MALDI-FTICR(マトリックス支援レーザー脱離イオン化-フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴)型質量分析装置、ESI-QqQ(エレクトロスプレーイオン化-三連四重極)型質量分析装置、ESI-Qq-TOF(エレクトロスプレーイオン化-タンデム四重極-飛行時間)型質量分析装置、ESI-FTICR(エレクトロスプレーイオン化-フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴)型質量分析装置等を用いることができる。
本発明の一実施形態において、対象ペプチド測定用のQC標準試料キットは、
ペプチドを含んでいる血液試料と、
該血液試料にスパイクされるべき安定同位体標識されたペプチドと、
を含む。
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)と、
を含んでもよい。前記QC標準試料キットには、その他の必要な成分を含むことができる。その他の必要な成分としては、例えば、内部標準として用いられるSIL-Aβ1-38、各種緩衝溶液などが挙げられる。
QC試料(標準血漿)の準備方法のプロトコル例を示す。
SIL-Aβ1-40は、rPeptide(Watkinsville, GA, USA)を使用した。SIL-Aβ1-40は、Aβ1-40の全ての窒素原子が15Nで置換されているものである。
SIL-Aβ1-42は、rPeptide(Watkinsville, GA, USA)を使用した。SIL-Aβ1-42は、Aβ1-42の全ての窒素原子が15Nで置換されているものである。
SIL-APP669-711は、rPeptide(Watkinsville, GA, USA)を使用した。SIL-APP669-711は、APP669-711の全ての窒素原子が15Nで置換されているものである。
[1] 1mg/mL BSA、0.1%(w/v)DDM、50mM Tris-HCl buffer(pH9.0)で希釈した50nMのSIL-Aβ1-40、5nMのSIL-Aβ1-42、及び5nMのSIL-APP669-711の各100μLずつを、100mLのヒト血漿に添加した。これを「SILスパイク血漿-1」と称する。
[2] SILスパイク血漿-1を転倒混和により十分に混合した。
[4] 900μL分取・凍結した内の1本を融解し、連続免疫沈降法(Consecutive Immunoprecipitation; cIP)-質量分析(cIP-MS)を実施した(IP繰り返し回数3回)。IP-MS操作の詳細は、以下のとおりであった。
アミロイドβタンパク質(Aβ)の3-8残基をエピトープとする抗Aβ抗体(IgG)のクローン6E10(Covance社)を用意した。
上記SILスパイク血漿-1の250μLに、安定同位体標識されたAβ1-38(SIL-Aβ1-38)を11pMで含んでいる第一IP反応緩衝液(0.2%(w/v) DDM, 0.2%(w/v)NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl(pH7.4), 300mM NaCl) 250μLを混合させた後、氷上で5~60分間静置させた。SIL-Aβ1-38は、PheとIleの炭素原子が13Cで置換されているものであり、マススペクトルのシグナル強度を標準化するための内部標準として用いた。その血漿を抗Aβ IgG固定化ビーズと混ぜて、4℃のペルチェチラーで1時間振盪およびピペッティング攪拌させた。
その後、前記抗体ビーズを第一IP洗浄緩衝液(0.1% DDM, 0.1% NTM、50mM Tris-HCl(pH7.4)、150mM NaCl)100μLで1回洗浄、50mM 酢酸アンモニウム緩衝液50μLで1回洗浄した後、第一IP溶出液(0.1% DDM含有する50mM Glycine buffer (pH2.8))により抗体ビーズに結合しているAβ及びAβ様ペプチド(すなわち、APP派生型ペプチド)を溶出させた。
得られた溶出液を第二IP反応緩衝液(0.2%(w/v)DDM, 800mM GlcNAc, 300mM Tris-HCl(pH7.4), 300mM NaCl)と混合させて、第一精製溶液を得た。
得られた第一精製溶液を、別途の抗Aβ抗体固定化ビーズと混ぜて、4℃のペルチェチラーで1時間振盪およびピペッティング攪拌させた。
その後、抗Aβ抗体固定化ビーズを第二洗浄緩衝液(0.1% DDM, 150mM Tris-HCl(pH7.4)、150mM NaCl)50μLで2回洗浄、50mM 酢酸アンモニウム緩衝液50μLで1回洗浄、さらにH2O 30μLで1回洗浄した後、第二IP溶出液(5mM塩酸を含有する70%(v/v) アセトニトリル)8μL(又は、実験室の湿度により9μL)により抗体ビーズに結合しているAβ及びAβ様ペプチド(APP派生型ペプチド)を溶出させた。このようにして、第二精製溶液を得た。第二精製溶液を質量分析に供した。
n-Nonyl-β-D-thiomaltoside (NTM) [cmc:0.116%]
Linear TOF用のマトリックスとして、α-cyano-4-hydroxycinnamic acid(CHCA)を用いた。マトリックス溶液はCHCA 1mgを70%(v/v)アセトニトリル1mLで溶解することによって調製した。マトリックス添加剤として、0.4%(w/v) methanediphosphonic acid(MDPNA)を用いた。1mg/mLのCHCA溶液と0.4%(w/v)MDPNAを等量混合した後、その0.5μLをμFocus MALDI plateTM 900μm(Hudson Surface Technology, Inc., Fort Lee, NJ)上へ滴下し、乾固させた。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3
の場合は、[実験例2:SILアミロイドペプチド比基準値決定]へと進んだ。基準範囲外の場合は次項[実験例1-2:SILアミロイドペプチド比調整]へと進んだ。
[1] 前項実験例1-1の[3]で凍結保存した残りのSILスパイク血漿-1を室温にて静置して解凍した。
[2] 前項実験例1-1の[3]で900μL分取・凍結した内の別の1本が残っていれば、これを解凍して上記[1]の解凍液に混合した。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比を28.0、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比を1.0
と定め、前項実験例1-1の[5]における測定値と、前記目標値の中間点(中間目標値)を目指し、50nMのSIL-Aβ1-40、5nMのSIL-Aβ1-42、及び5nMのSIL-APP669-711の必要量を上記[1]の解凍液に添加した。(最終目標値を目指して添加すると添加しすぎる場合が多いので、あえて中間目標値を目指して添加した。)
[4] 上記[3]の液を転倒混和により十分に混合した。これを「SILスパイク血漿-2」と称する。
[6] 900μL分取・凍結した内の1本を融解し、連続免疫沈降法(Consecutive Immunoprecipitation; cIP)-質量分析(cIP-MS)を実施した(IP繰り返し回数3回)。IP-MS操作の詳細は、前項実験例1-1のとおりであった。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3
の場合は、[実験例2:SILアミロイドペプチド比基準値決定]へと進んだ。基準範囲外の場合は次項[9]以降へと進み、3度目のスパイクを行った。
[10] 上記[5]で900μL分取・凍結した内の別の1本が残っていれば、これを解凍して上記[9]の解凍液に混合した。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比を28.0、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比を1.0
と定め、これを目指し、50nMのSIL-Aβ1-40、5nMのSIL-Aβ1-42、及び5nMのSIL-APP669-711の必要量を上記[9]の解凍液に添加した。
[12] 上記[11]の液を転倒混和により十分に混合した。これを「SILスパイク血漿-3」と称する。
[14] 900μL分取・凍結した内の1本を融解し、連続免疫沈降法(Consecutive Immunoprecipitation; cIP)-質量分析(cIP-MS)を実施した(IP繰り返し回数3回)。IP-MS操作の詳細は、前項実験例1-1のとおりであった。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3
の場合は、[実験例2:SILアミロイドペプチド比基準値決定]へと進んだ。基準範囲外の場合は上記[9]に戻り、上記[9]~[16]の手順に従い、さらなるスパイクとIP-MS操作を、算出した値が前記基準範囲内となるまで繰り返した。
[1] 前記SIL-アミロイドペプチド比が前記基準範囲内:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3
に入ったSILスパイク血漿を標準血漿とした。
[2] 凍結保存したSILスパイク血漿を室温にて静置して解凍した。
[3] 900μL分取・凍結した内の別の1本が残っていれば、これを解凍して上記[2]の解凍液に混合した。
[5] 全ての分注品を-60℃以下で一旦凍結した。
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5、及び
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3
に入っていれば、その値が基準値として決定された。算出されたアミロイドペプチド比のいずれか一方又は両方が上記基準範囲外の場合は、標準血漿の調製から再度実施した。
<1> S/N閾値について、
SIL-Aβ1-38のS/N閾値:15
SIL-Aβ1-40のS/N閾値:3
SIL-Aβ1-42のS/N閾値:3
SIL-APP669-711のS/N閾値:3
基準値1:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比、及び
基準値2:
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比
・基準値との相対誤差が20%を超えるデータは大きいものから取り除いて再計算する。
・基準値毎に独立とする。すなわち、基準値1で20%超えるので取り除いても、基準値2で20%以下であれば採用する。
基準値を決定する段階では、測定誤差を考慮して異常値を取り除いていき、最終的にN=27のデータのうち、その80%以上として22データ以上が残ればその残ったデータで平均値を求め基準値として定める。例えば、あるスペクトルでSIL-Aβ1-40のピーク位置に夾雑物ピークが重なってSIL-Aβ1-40のピーク強度が異常だった場合には基準値1(SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比)のデータは除かれるが、一方、SIL-APP669-711とSIL-Aβ1-42のピークは正しく検出されるため基準値2(SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比)は採用される。
基準値1:25.0~32.5
基準値2:0.7~1.3
ここでは、上記プロトコル例により準備したQC試料(標準血漿)を用いて、測定対象の血中アミロイドペプチド検体(検体数:42)をIP-MS測定した。
測定対象の各検体は、内部標準として、SIL-Aβ1-38(AnaSpec,San Jose, CA, USA)が添加され、前項実験例1-1のとおりの連続免疫沈降法に準じてIP操作されたものであった。
Linear TOF用のマトリックスとして、α-cyano-4-hydroxycinnamic acid(CHCA)を用いた。マトリックス溶液はCHCA 1mgを70%(v/v)アセトニトリル1mLで溶解することによって調製した。マトリックス添加剤として、0.4%(w/v) methanediphosphonic acid(MDPNA)を用いた。1mg/mLのCHCA溶液と0.4%(w/v)MDPNAを等量混合した後、その0.5μLをμFocus MALDI plateTM 900μm(Hudson Surface Technology, Inc., Fort Lee, NJ)上へ滴下し、乾固させた。
まず、前記QC標準試料のMS測定を行った(開始QC工程)。
次に、IP後の測定対象の各検体(検体数:9)のMS測定を行った(検体測定工程)。
続いて、前記QC標準試料のMS測定を行った(中間QC工程)。
次に、前記検体測定工程と、前記中間QC工程とを所定回数(3回)繰り返した(繰り返し工程)。
次に、IP後の測定対象の各検体(検体数:6)のMS測定を行った(検体測定工程)。
続いて、前記QC標準試料のMS測定を行った(最終QC工程)。
検体1~9がウェル1B~2G上に載せられ(検体測定工程)、QC標準試料2がウェル2F上に載せられ(中間QC工程)、
検体11~19がウェル2E~3F上に載せられ(検体測定工程)、QC標準試料3がウェル3E上に載せられ(中間QC工程)、
検体18~27がウェル3D~4C上に載せられ(検体測定工程)、QC標準試料4がウェル4B上に載せられ(中間QC工程)、
検体28~29がウェル4A~5A上に載せられ(検体測定工程)、QC標準試料5がウェル6H上に載せられ(中間QC工程)、
検体37~42がウェル6G~6B上に載せられ(検体測定工程)、最後に、
QC標準試料6がプレートウェル6A上に載せられている(最終QC工程)。
前記開始QC工程、前記中間QC工程、及び前記最終QC工程において用いられた各QC標準試料中の前記安定同位体標識されたペプチドのレベルの比は、
基準値1:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42の比が25.0~32.5の範囲内、及び
基準値2:
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42の比が0.7~1.3の範囲内
を満たしている。
上記実際の基準値1、及び基準値2に対して、-20%以上+20%以下の正常範囲内であれば、当該QC標準試料は合格と判定し、一方、前記正常範囲の外であれば、当該QC標準試料は不合格とした(判定工程)。
合格基準を満たしたQC試料に挟まれた実試料の測定値のみを採用する。
対象ペプチド測定用QC標準試料であって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含む、QC標準試料。
前記血液試料が、全血液、血漿、及び血清からなる群から選ばれる、上記(1)に記載のQC標準試料。
前記血液試料が、ペプチドがスパイクされた疑似血液、疑似血漿、及び疑似血清からなる群から選ばれる、上記(1)に記載のQC標準試料。
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、測定対象の前記ペプチドと化学的に同じ又は類似の構造であり且つ安定同位体標識されたペプチドを含んでいる、上記(1)~(3)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
測定対象の前記ペプチドは、複数種のペプチドを含み、
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、測定対象の前記複数種のペプチドとそれぞれ化学的に同じ又は類似の構造であり且つ安定同位体標識された複数種のペプチドを含んでいる、上記(1)~(4)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、所定の基準範囲内の量で含まれている、上記(1)~(5)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
測定対象の前記ペプチドが、アミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、上記(1)~(6)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、安定同位体標識されたアミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、上記(1)~(7)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
測定対象の前記ペプチドが、Aβ1-42(配列番号9)、Aβ1-38(配列番号11)、Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つを含む、上記(1)~(8)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含む、上記(1)~(9)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
測定対象の前記ペプチドが、
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられ、
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされている、上記(1)~(10)のうちのいずれかに記載のQC標準試料。
前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされている、上記(11)に記載のQC標準試料。
多検体血液試料中の対象ペプチドを測定する方法であって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含むQC標準試料の測定を行う開始QC工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う中間QC工程と、
前記検体測定工程と、前記中間QC工程とを所定回数繰り返す工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う最終QC工程と、
を含む、ペプチド測定方法。
前記各検体測定工程において、1つ以上9つ以下の血液試料の連続測定を行う、上記(13)に記載のペプチド測定方法。
さらに、
前記開始QC工程、前記中間QC工程、及び前記最終QC工程において測定された各QC標準試料中の前記安定同位体標識されたペプチドのレベルが、所定の基準値に対して、-20%以上+20%以下の正常範囲内であれば、当該QC標準試料の測定は合格とし、一方、前記正常範囲の外であれば、当該QC標準試料の測定は不合格とする判定工程と、
各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方が合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用し、一方、各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方又は一方が不合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用しないと決定する採否決定工程と、
を含む、上記(13)又は(14)に記載のペプチド測定方法。
測定対象の前記ペプチドが、アミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、上記(13)~(15)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、安定同位体標識されたアミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、上記(13)~(16)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
測定対象の前記ペプチドが、Aβ1-42(配列番号9)、Aβ1-38(配列番号11)、Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つを含む、上記(13)~(17)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含む、上記(13)~(18)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
測定対象の前記ペプチドが、
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられ、
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記QC標準試料中において、前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされている、上記(13)~(19)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
前記QC標準試料中において、前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされている、上記(20)に記載のペプチド測定方法。
免疫沈降法(Immunoprecipitation; IP)-質量分析(IP-MS)、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)、又はガスクロマトグラフィー-質量分析(GC-MS)により測定を行う、上記(13)~(21)のうちのいずれかに記載のペプチド測定方法。
対象ペプチド測定用のQC標準試料キットであって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、
該血液試料にスパイクされるべき安定同位体標識されたペプチドと、
を含む、QC標準試料キット。
前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)と、
を含む、上記(23)に記載のQC標準試料キット。
Claims (24)
- 対象ペプチド測定用QC標準試料であって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含む、QC標準試料。 - 前記血液試料が、全血液、血漿、及び血清からなる群から選ばれる、請求項1に記載のQC標準試料。
- 前記血液試料が、ペプチドがスパイクされた疑似血液、疑似血漿、及び疑似血清からなる群から選ばれる、請求項1に記載のQC標準試料。
- 前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、測定対象の前記ペプチドと化学的に同じ又は類似の構造であり且つ安定同位体標識されたペプチドを含んでいる、請求項1に記載のQC標準試料。
- 測定対象の前記ペプチドは、複数種のペプチドを含み、
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、測定対象の前記複数種のペプチドとそれぞれ化学的に同じ又は類似の構造であり且つ安定同位体標識された複数種のペプチドを含んでいる、請求項1に記載のQC標準試料。 - 前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドは、所定の基準範囲内の量で含まれている、請求項1に記載のQC標準試料。
- 測定対象の前記ペプチドが、アミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、請求項1に記載のQC標準試料。
- 前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、安定同位体標識されたアミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、請求項1に記載のQC標準試料。
- 測定対象の前記ペプチドが、Aβ1-42(配列番号9)、Aβ1-38(配列番号11)、Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つを含む、請求項1に記載のQC標準試料。
- 前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含む、請求項1に記載のQC標準試料。
- 測定対象の前記ペプチドが、
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられ、
前記血液試料にスパイクされた前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされている、請求項1に記載のQC標準試料。 - 前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされている、請求項11に記載のQC標準試料。 - 多検体血液試料中の対象ペプチドを測定する方法であって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、該血液試料にスパイクされた安定同位体標識されたペプチドとを含むQC標準試料の測定を行う開始QC工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う中間QC工程と、
前記検体測定工程と、前記中間QC工程とを所定回数繰り返す工程と、
1つ又は複数の血液試料の測定を行う検体測定工程と、
前記QC標準試料の測定を行う最終QC工程と、
を含む、ペプチド測定方法。 - 前記各検体測定工程において、1つ以上9つ以下の血液試料の連続測定を行う、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- さらに、
前記開始QC工程、前記中間QC工程、及び前記最終QC工程において測定された各QC標準試料中の前記安定同位体標識されたペプチドのレベルが、所定の基準値に対して、-20%以上+20%以下の正常範囲内であれば、当該QC標準試料の測定は合格とし、一方、前記正常範囲の外であれば、当該QC標準試料の測定は不合格とする判定工程と、
各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方が合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用し、一方、各検体測定工程の直前QC工程で行われたQC標準試料の測定及び直後QC工程で行われたQC標準試料の測定の両方又は一方が不合格とされた当該検体測定工程における前記1つ又は複数の血液試料の測定結果は採用しないと決定する採否決定工程と、
を含む、請求項13に記載のペプチド測定方法。 - 測定対象の前記ペプチドが、アミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- 前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、安定同位体標識されたアミロイドベータ(Aβ)関連ペプチドである、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- 測定対象の前記ペプチドが、Aβ1-42(配列番号9)、Aβ1-38(配列番号11)、Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つを含む、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- 前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、SIL-Aβ1-42、SIL-Aβ1-38、SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)を含む、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- 測定対象の前記ペプチドが、
Aβ1-42(配列番号9)と、
Aβ1-40(配列番号7)、及びAPP669-711(配列番号10)からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
測定されたペプチドレベルの比:
Aβ1-40/Aβ1-42、及び/又は
APP669-711/Aβ1-42
がバイオマーカーとして用いられ、
前記QC標準試料に含まれる前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つと、
を含み、
前記QC標準試料中において、前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42
が所定の基準範囲内とされている、請求項13に記載のペプチド測定方法。 - 前記QC標準試料中において、前記安定同位体標識されたペプチドの存在量の比:
SIL-Aβ1-40/SIL-Aβ1-42が、25.0~32.5、及び/又は
SIL-APP669-711/SIL-Aβ1-42が、0.7~1.3
の基準範囲内とされている、請求項20に記載のペプチド測定方法。 - 免疫沈降法(Immunoprecipitation; IP)-質量分析(IP-MS)、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)、又はガスクロマトグラフィー-質量分析(GC-MS)により測定を行う、請求項13に記載のペプチド測定方法。
- 対象ペプチド測定用のQC標準試料キットであって、
ペプチドを含んでいる血液試料と、
該血液試料にスパイクされるべき安定同位体標識されたペプチドと、
を含む、QC標準試料キット。 - 前記安定同位体標識されたペプチドが、
SIL-Aβ1-42と、
SIL-Aβ1-40、及びSIL-APP669-711からなる群から選ばれる少なくとも1つ(ここで、“SIL-”とは安定同位体標識された(Stable isotope labeled)ことを意味する)と、
を含む、請求項23に記載のQC標準試料キット。
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Citations (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060154318A1 (en) * | 2004-06-09 | 2006-07-13 | Anderson Norman L | Stable isotope labeled polypeptide standards for protein quantitation |
WO2010095365A1 (ja) * | 2009-02-23 | 2010-08-26 | 国立大学法人東北大学 | 質量分析装置を用いたタンパク質定量のための評価用ペプチド、人工標準タンパク質、及びタンパク質の定量方法 |
WO2012093622A1 (ja) * | 2011-01-07 | 2012-07-12 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置、分析法およびキャリブレーション試料 |
JP2014066710A (ja) * | 2006-07-21 | 2014-04-17 | Amgen | サンプル中のヘプシジンを検出および/または測定する方法 |
WO2015178398A1 (ja) | 2014-05-22 | 2015-11-26 | 株式会社 島津製作所 | 脳内のアミロイドβペプチド蓄積状態を評価するサロゲート・バイオマーカー及びその分析方法 |
JP2017020970A (ja) * | 2015-07-14 | 2017-01-26 | 花王株式会社 | 8−ヒドロキシ−2’−デオキシグアノシンの定量方法 |
WO2017047529A1 (ja) | 2015-09-16 | 2017-03-23 | 株式会社 島津製作所 | 脳内のアミロイドβ蓄積状態を評価するマルチプレックスバイオマーカー及びその分析方法 |
WO2017212348A1 (en) * | 2016-06-06 | 2017-12-14 | Uvic Industry Partnerships Inc. | Assay for quantitation of proteins and peptides using stable isotope standards |
JP2018169377A (ja) * | 2017-03-30 | 2018-11-01 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフ質量分析方法及び装置 |
JP2019024326A (ja) * | 2017-07-25 | 2019-02-21 | 大陽日酸株式会社 | 標識代謝物の製造方法、代謝物の定量方法、及び標識代謝物製造キット |
JP2019190841A (ja) * | 2018-04-18 | 2019-10-31 | 株式会社島津製作所 | 分析方法、分析装置およびプログラム |
JP2020511668A (ja) * | 2017-02-10 | 2020-04-16 | シー2エヌ ダイアグノスティクス リミテッド ライアビリティ カンパニー | 生物流体中の生体分子の濃度を測定するための方法 |
WO2021005857A1 (ja) * | 2019-07-05 | 2021-01-14 | 株式会社 島津製作所 | アミロイドベータに対するモノクローナル抗体、及びその抗体を用いるアミロイドベータ関連ペプチドの測定方法 |
JP2022007101A (ja) * | 2020-06-25 | 2022-01-13 | シスメックス株式会社 | Aβペプチドを測定するための抗体セット、Aβペプチドの測定方法及び試薬キット |
JP2022022524A (ja) * | 2020-06-25 | 2022-02-07 | シスメックス株式会社 | Aβペプチドの測定方法及びその方法に用いられる試薬組成物 |
-
2022
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Patent Citations (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060154318A1 (en) * | 2004-06-09 | 2006-07-13 | Anderson Norman L | Stable isotope labeled polypeptide standards for protein quantitation |
JP2014066710A (ja) * | 2006-07-21 | 2014-04-17 | Amgen | サンプル中のヘプシジンを検出および/または測定する方法 |
WO2010095365A1 (ja) * | 2009-02-23 | 2010-08-26 | 国立大学法人東北大学 | 質量分析装置を用いたタンパク質定量のための評価用ペプチド、人工標準タンパク質、及びタンパク質の定量方法 |
WO2012093622A1 (ja) * | 2011-01-07 | 2012-07-12 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置、分析法およびキャリブレーション試料 |
WO2015178398A1 (ja) | 2014-05-22 | 2015-11-26 | 株式会社 島津製作所 | 脳内のアミロイドβペプチド蓄積状態を評価するサロゲート・バイオマーカー及びその分析方法 |
US20170184573A1 (en) | 2014-05-22 | 2017-06-29 | Shimadzu Corporation | SURROGATE BIOMARKER FOR EVALUATING INTRACEREBRAL AMYLOID ß PEPTIDE ACCUMULATION AND METHOD FOR ANALYSIS THEREOF |
JP2017020970A (ja) * | 2015-07-14 | 2017-01-26 | 花王株式会社 | 8−ヒドロキシ−2’−デオキシグアノシンの定量方法 |
US20180238909A1 (en) | 2015-09-16 | 2018-08-23 | Shimadzu Corporation | Multiplex biomarker for use in evaluation of state of accumulation of amyloid b in brain, and analysis method for said evaluation |
WO2017047529A1 (ja) | 2015-09-16 | 2017-03-23 | 株式会社 島津製作所 | 脳内のアミロイドβ蓄積状態を評価するマルチプレックスバイオマーカー及びその分析方法 |
WO2017212348A1 (en) * | 2016-06-06 | 2017-12-14 | Uvic Industry Partnerships Inc. | Assay for quantitation of proteins and peptides using stable isotope standards |
JP2020511668A (ja) * | 2017-02-10 | 2020-04-16 | シー2エヌ ダイアグノスティクス リミテッド ライアビリティ カンパニー | 生物流体中の生体分子の濃度を測定するための方法 |
JP2018169377A (ja) * | 2017-03-30 | 2018-11-01 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフ質量分析方法及び装置 |
JP2019024326A (ja) * | 2017-07-25 | 2019-02-21 | 大陽日酸株式会社 | 標識代謝物の製造方法、代謝物の定量方法、及び標識代謝物製造キット |
JP2019190841A (ja) * | 2018-04-18 | 2019-10-31 | 株式会社島津製作所 | 分析方法、分析装置およびプログラム |
WO2021005857A1 (ja) * | 2019-07-05 | 2021-01-14 | 株式会社 島津製作所 | アミロイドベータに対するモノクローナル抗体、及びその抗体を用いるアミロイドベータ関連ペプチドの測定方法 |
JP2022007101A (ja) * | 2020-06-25 | 2022-01-13 | シスメックス株式会社 | Aβペプチドを測定するための抗体セット、Aβペプチドの測定方法及び試薬キット |
JP2022022524A (ja) * | 2020-06-25 | 2022-02-07 | シスメックス株式会社 | Aβペプチドの測定方法及びその方法に用いられる試薬組成物 |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
"Procedures for large-scale metabolic profiling of serum and plasma using gas chromatography and liquid chromatography coupled to mass spectrometry", NATURE PROTOCOLS, vol. 6, no. 7, 2011, pages 1060 - 1083 |
ANONYMOUS: "Reliability assurance of proteome data", MEDICAL PROTEOSCOPE, JP, 21 June 2014 (2014-06-21), JP, pages 1 - 2, XP055962476, Retrieved from the Internet <URL:http://www.medicalproteoscope.com/technology/proteome_data/> [retrieved on 20220919] * |
LANSHOEFT CHRISTIAN, WOLF THIERRY, WALLES MARKUS, BARTEAU SAMUEL, PICARD FRANCK, KRETZ OLIVIER, CIANFÉRANI SARAH, HEUDI OLIVIER: "The flexibility of a generic LC–MS/MS method for the quantitative analysis of therapeutic proteins based on human immunoglobulin G and related constructs in animal studies", JOURNAL OF PHARMACEUTICAL AND BIOMEDICAL ANALYSIS, ELSEVIER B.V., AMSTERDAM, NL, vol. 131, 1 November 2016 (2016-11-01), AMSTERDAM, NL , pages 214 - 222, XP055927505, ISSN: 0731-7085, DOI: 10.1016/j.jpba.2016.08.039 * |
PERCY ANDREW J.; CHAMBERS ANDREW G.; YANG JUNCONG; JACKSON ANGELA M.; DOMANSKI DOMINIK; BURKHART JULIA; SICKMANN ALBERT; BORCHERS : "Method and platform standardization in MRM-based quantitative plasma proteomics", JOURNAL OF PROTEOMICS, ELSEVIER, AMSTERDAM, NL, vol. 95, 7 August 2013 (2013-08-07), AMSTERDAM, NL , pages 66 - 76, XP028784947, ISSN: 1874-3919, DOI: 10.1016/j.jprot.2013.07.026 * |
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