WO2020122182A1 - 分子内水素結合可能な官能基を有するアミノ酸とそれらのアミノ酸を含むペプチド化合物、およびそれらの製造方法 - Google Patents

分子内水素結合可能な官能基を有するアミノ酸とそれらのアミノ酸を含むペプチド化合物、およびそれらの製造方法 Download PDF

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    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Definitions

  • the present invention relates to an amino acid capable of improving the membrane permeability of a peptide compound, a peptide compound containing the amino acid, and a method for producing them.
  • Non-patent Document 1 Non-patent Document 1
  • Cyclosporine A and polymyxin B are typical examples of peptide drugs. Focusing on these structures, the characteristic point is that the peptide is a peptide containing some unnatural amino acids represented by N-methyl amino acids, or that it is a cyclic peptide.
  • An unnatural amino acid is an amino acid that is not naturally encoded in mRNA.
  • these unnatural structural sites or cyclic structures are also included. It is very interesting that the drug contributes to the site of action in the living body and the pharmacokinetics by contributing to the pharmacokinetics.
  • Non-Patent Document 1 As a condition for improving membrane permeability (a condition necessary to satisfy drug-likeness) in which a medium-molecular peptide can contribute to improvement in pharmacokinetics, for example, having a cyclic portion, N-substituted amino acid number, Conditions such as the range of the number of amino acid residues and lipophilicity have been reported (Patent Document 1). There is also a report that an N-methyl amino acid which is an unnatural amino acid was focused on and an N-methyl peptide library was produced by translational synthesis (Patent Document 2). Further, in order for the target and the drug to form a complex, the interaction between the target and the drug is important, and the important one among them is the hydrogen bond (Non-Patent Document 3).
  • Non-Patent Document 1 A proton donor is essential for forming hydrogen bonds, but it can have a negative effect on membrane permeability.
  • N-methylation of amino acids is known to be successful as one of the methods for improving membrane permeability (Patent Document 1).
  • Other than N-methylation of amino acids it has been considered that the masking of protons by utilizing an amide bond contained in the main chain affects the membrane permeability (Non-Patent Document 2).
  • the improvement of the interaction between the target molecule and the peptide is essential for the creation of a peptide useful for medicine.
  • Patent Documents 1 and 2 describe suggestions from the viewpoint of N-methylation of the amide bond site of amino acids, which are the constituent units of peptides, the number of amino acid residues, and lipophilicity, , Consideration on the structural characteristics when a heteroatom represented by an oxygen atom or a nitrogen atom necessary for forming a hydrogen bond which is considered to be advantageous for binding to a target molecule is introduced into the side chain of an amino acid Not done.
  • Non-Patent Document 1 describes examples of peptide drugs and cyclization methods for cyclic peptides, but does not suggest a correlation between membrane permeability and amino acid structure.
  • Non-Patent Document 2 exemplifies peptide drugs, there is no suggestion that the structural conversion of the amino acids that make up the peptides is linked to their usefulness for drugs, and the consideration of known compounds is only made. However, its versatility in medicine is limited.
  • the present invention has been made in view of the situation in which the design of peptide compounds, particularly the effect on the membrane permeability, has been carried out without paying attention to the structural characteristics of each amino acid.
  • An object of the present invention is to provide an amino acid that improves the amino acid and a peptide compound containing the amino acid.
  • the present inventors have found the following as means for solving the above problems and completed the invention. That is, an amino acid that has a heteroatom necessary for improving the interaction with the target molecule in the side chain of the amino acid and can further mask the proton on the amino acid side chain by intramolecular hydrogen bonding within the same amino acid side chain.
  • a peptide compound containing the amino acid was produced, and membrane permeability was evaluated.
  • the peptide compound containing the amino acid was compared with a peptide compound containing an amino acid that does not undergo intramolecular hydrogen bonding. Then, it was found that the membrane permeability is excellent.
  • the amino acid having a side chain for intramolecular hydrogen bonding is designed so that the proton donor and the proton acceptor can have a pseudo cyclic structure, preferably a 4-membered ring, 5-membered ring, 6-membered ring, or 7-membered ring. It was found that such a structure is effective.
  • the number of amino acid residues constituting the peptide optimal for membrane permeation of the peptide compound containing the amino acid the number of N-substituted amino acid residues, the ratio of N-substituted amino acid residues contained in the peptide, the range of cLogP, the aroma, The number of rings was found.
  • This invention includes the following in one specific, non-limiting aspect.
  • [1] A peptide compound in which two or more amino acids are linked, wherein at least one of the amino acids can form a hydrogen bond in its side chain.
  • [2] The peptide compound according to [1], wherein the amino acid capable of forming a hydrogen bond in the side chain can form a pseudo 4- to 7-membered ring in the side chain.
  • R 1 is hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, or a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2A and R 2B are hydrogen in which R 2A is hydrogen or C 1 -.
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl, or R 2A and R 2B are the groups to which they are attached.
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 3 is a single bond or —CHR 4 —
  • R 4 is hydrogen, or C 1 -C 4 alkyl, or a group represented by formula 1 or formula 2
  • Formula 1 and Formula 2 are respectively the following formulas: Is expressed in the formula, * Indicates the point of attachment
  • Q 1 and Q 2 are independently a single bond, C 1 -C 4 alkylene, or C 2 -C 4 heteroalkylene containing one oxygen atom
  • a 1 is -O- or -S-
  • L 1 is a direct group which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • a chain C 1 -C 3 alkylene, A 2 is a single bond, —O—, or —S—, L 2 is a single bond or is one or more substituents selected from the group consisting of fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • a linear C 1 -C 3 alkylene which may be substituted X is —OH, —NR Z1 R Z2 , or —CONR Z1 R Z2 , or contains 1 to 3 heteroatoms, optionally substituted by oxo or one or more halogen 5 ⁇ 6-membered saturated or unsaturated heterocyclyl;
  • R Z1 and R Z2 are independently selected from the group consisting of hydrogen, —OH, C 1 -C 4 alkyl, and C 1 -C 4 alkylsulfonyl
  • Y is —OH, C 1 -C 4 alkylsulfonylamino, —NR Z3 R Z4 , or —CONR Z3 R Z4 , or contains 1 to 3 heteroatoms and is substituted by oxo or halogen.
  • R Z3 and R Z4 are independently selected from the group consisting of hydrogen, —OH, C 1 -C 4 alkyl, and C 1 -C 4 alkylsulfonyl, Z is hydrogen or C 1 -C 4 alkyl, However, when A 2 is —O— or —S—, Z is not hydrogen,
  • the amino acid represented by formula A contains at least one group represented by formula 1 or formula 2.
  • R 1 is a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2A and R 2B are independently hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, or R 2A and R 2B are 4-6 membered together with the carbon atom to which they are attached.
  • R 3 is a single bond or —CHR 4 —
  • R 1 forms a 4- to 6-membered heterocycle together with the nitrogen atom to which R 1 is bonded, R 2A , and the carbon atom to which R 2A is bonded, and the heterocycle has the formula 1 or Having a group represented by formula 2,
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 3 is a single bond or —CHR 4 —,
  • R 1 is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2A is a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 3 is a single bond or —CHR 4 —
  • R 1 is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2A and R 2B are independently hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2A and R 2B are 4-6 membered together with the carbon atom to which they are attached.
  • R 3 is —CHR 4 —
  • R 4 is a group represented by formula 1 or formula 2,
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene
  • a 1 is —O— or —S—
  • L 1 is a straight chain which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of C 1 -C 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • X is -OH
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene
  • a 1 is —O— or —S—
  • L 1 is a straight chain which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of C 1 -C 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • X is -CONR Z1 R Z2
  • R Z1 is C 1 -C 4 alkyl
  • R Z2 is hydrogen
  • the peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene
  • a 1 is —O— or —S—
  • L 1 is a straight chain which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of C 1 -C 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • X is a 5-6 membered saturated or unsaturated heterocyclyl containing 1-3 heteroatoms and optionally substituted by oxo or by one or more halogens
  • the peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • Q 1 is a single bond
  • a 1 is —O— or —S—
  • L 1 is a straight chain which may be substituted with one or more substituents selected from the group consisting of C 1 -C 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O).
  • X is -OH
  • [12] The peptide compound according to any one of [3] to [11], wherein Q 1 is CH 2 —.
  • [13] The peptide compound according to any one of [3] to [12], wherein A 1 is —O—.
  • L 1 is —CH 2 —, —(CH 2 ) 2 —, —(CH 2 ) 3 —, —CH 2 CH(CH 3 )—, —CH 2 CH(CF 3 )—, —CH 2 C(CH 3 ) 2 —, —(CH 2 ) 2 CH(CH 3 )—, —CH 2 C(CH 3 ) 2 CH 2 —, —(CH 2 ) 2 C(CH 3 ) 2 —, and
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, L 2 is a single bond, Y is -CONR Z3 R Z4 , A 2 is -O-, or -S-, Z is C 1 -C 4 alkyl, The peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, L 2 is a single bond, Y is -CONR Z3 R Z4 , A 2 is a single bond, Z is hydrogen, The peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, L 2 is a single bond, Y is C 1 -C 4 alkylsulfonylaminocarbonyl, A 2 is -O-, or -S-, Z is C 1 -C 4 alkyl, The peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, L 2 is a single bond, Y is -OH, A 2 is -O-, or -S-, Z is C 1 -C 4 alkyl, The peptide compound according to any one of [3] to [7].
  • [29] The peptide compound according to any one of [1] to [28], wherein the ratio of the number of N-substituted amino acids to the total number of amino acids is 30% or more.
  • [34] A group consisting of: The amino acid according to [33], which is selected from: [35] A protected amino acid, wherein the amino group and/or the carboxyl group contained in the amino acid according to [33] or [34] is protected by a protecting group.
  • the amino-protecting group is selected from the group consisting of Fmoc group, Boc group, Cbz group, Alloc group, nosyl group, dinitronosyl group, t-Bu group, trityl group, and cumyl group, and/or The protected amino acid according to [35], wherein the protective group for the carboxyl group is selected from the group consisting of a methyl group, an allyl group, a t-Bu group, a trityl group, a cumyl group, a methoxytrityl group, and a benzyl group.
  • FIG. 6 is a diagram showing a relationship between ClogP/totalAA and Papp when a cyclic peptide compound having no Trp side chain is used as a population.
  • FIG. 3 is a diagram showing a relationship between ClogP/totalAA and Papp when a cyclic peptide compound having a Trp side chain is used as a population. It is a figure showing the relation between ARC of a cyclic peptide compound and cell membrane permeability. For example, it is a diagram of a potential energy surface (Potential energy surface) in the side chain partial structure of Ser(NMe-Aca).
  • FIG. 1 it is a diagram showing the conformational distribution of crystal structures (Crystal structures) using the results of X-ray structural analysis registered in CSD in the side chain partial structure of Ser(NMe-Aca).
  • FIG. 1 it is a diagram of a potential energy curved surface in a side chain partial structure of Ser(EtOH), bAla(3R-MeOEtOH), and bAla(2S-MeOEtOH).
  • the conformational distribution of the crystal structure was calculated. It is the figure shown.
  • alkyl is a monovalent group derived from an aliphatic hydrocarbon by removing one arbitrary hydrogen atom, and refers to a hetero atom (an atom other than carbon and hydrogen atoms) in the skeleton. ) Or unsaturated carbon-carbon bonds and has a subset of hydrocarbyl or hydrocarbon radical structures containing hydrogen and carbon atoms.
  • the alkyl group includes a straight chain or a branched chain.
  • the alkyl group is an alkyl group having 1 to 20 carbon atoms (C 1 -C 20 , hereinafter "C p -C q "means that the carbon number is p to q).
  • a C 1 -C 6 alkyl group a C 1 -C 5 alkyl group, a C 1 -C 4 alkyl group, a C 1 -C 3 alkyl group and the like can be mentioned.
  • the alkyl include methyl, ethyl, propyl, butyl, pentyl, hexyl, isopropyl, tert-butyl group, sec-butyl group, 1-methylpropyl group, 1,1-dimethylpropyl group and 2,2.
  • heteroalkyl means a group containing preferably 1 to 5 heteroatoms in the skeleton of the “alkyl”, preferably C 2 -C 10 heteroalkyl, C 2 -C 6 hetero. Examples thereof include alkyl. Specific examples of the heteroalkyl include —CH 2 OCH 3 , —CH 2 OCH 2 CH 3 , —CH(CH 3 )OCH 3 , and —CH 2 CH 2 N(CH 3 ) 2 .
  • halogen atom in the present specification includes F, Cl, Br, and I, and F or Cl is preferably exemplified.
  • fluoroalkyl in the present specification means a group in which one or more hydrogen atoms of the above “alkyl” are substituted with a fluorine atom, preferably C 1 -C 6 fluoroalkyl, C 1 -C 4 fluoro Alkyl, C 1 -C 2 fluoroalkyl and the like can be mentioned.
  • fluoroalkyl include trifluoromethyl group, 2,2,2-trifluoroethyl group, pentafluoroethyl group, 2,2,3,3-tetrafluoropropyl group, heptafluoropropyl group, trifluoromethoxy group.
  • 2,2,2-trifluoroethoxy group pentafluoroethoxy group, 2,2,3,3-tetrafluoropropoxy group, heptafluoropropoxy group and the like.
  • alkylsulfonyl used herein means a sulfonyl group to which the above “alkyl” is bonded (ie, —SO 2 -alkyl).
  • alkylsulfonyl include C 1 -C 6 alkylsulfonyl, C 1 -C 4 alkylsulfonyl and the like, and specific examples include methylsulfonyl, ethylsulfonyl, n-propylsulfonyl, i-propylsulfonyl and the like. Be done.
  • alkylsulfonylamino means a group in which one hydrogen atom of an amino group (—NH 2 ) is substituted with the above “alkylsulfonyl”.
  • alkylsulfonylamino include C 1 -C 6 alkylsulfonylamino, C 1 -C 4 alkylsulfonylamino and the like, and specific examples include methylsulfonylamino, ethylsulfonylamino, n-propylsulfonylamino, i. -Propylsulfonylamino and the like.
  • alkenyl group in the present specification is a monovalent group having at least one double bond (two adjacent sp 2 carbon atoms). Depending on the arrangement of double bonds and substituents (if present), the double bond geometry can assume the Mais (E) or sixteen (Z), cis or trans configurations.
  • alkenyl group include linear or branched ones, and include linear chains containing an internal olefin and the like. Preferred is a C 2 -C 10 alkenyl group, and more preferred is a C 2 -C 6 alkenyl group.
  • alkenyl examples include, for example, vinyl group, allyl group, 1-propenyl group, 2-propenyl group, 1-butenyl group, 2-butenyl group (including cis and trans), and 3-butenyl group. , A pentenyl group, a hexenyl group and the like.
  • alkynyl is a monovalent group having at least one triple bond (two adjacent SP carbon atoms). Included are straight or branched chain alkynyl groups, including internal alkylene. A C 2 -C 10 alkynyl group is preferable, and a C 2 -C 6 alkynyl group is more preferable. Specific examples of alkynyl include an ethynyl group, a 1-propynyl group, a propargyl group, a 3-butynyl group, a pentynyl group and a hexynyl group.
  • cycloalkyl means a saturated or partially saturated cyclic monovalent aliphatic hydrocarbon group and includes a monocycle, a bicyclo ring and a spiro ring. Preferable one is C 3 -C 10 cycloalkyl.
  • the cycloalkyl group may be partially unsaturated. Specific examples of cycloalkyl include cyclopropyl, cyclobutyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl, bicyclo[2.2.1]heptyl and the like.
  • aryl means a monovalent aromatic hydrocarbon ring, and preferably C 6 -C 10 aryl is mentioned. Specific examples of the aryl include phenyl and naphthyl.
  • heteroaryl refers to one aromatic ring containing preferably 1 to 5 heteroatoms in the atoms constituting the ring (also referred to as “in the ring” in the present specification).
  • a valent group is meant and may be partially saturated.
  • the ring may be monocyclic or two fused rings (eg, bicyclic heteroaryl fused with benzene or monocyclic heteroaryl).
  • the number of atoms constituting the ring is preferably 5-10 (5-10 membered heteroaryl).
  • heteroaryl examples include imidazolyl, thiazolyl, oxadiazolyl, thiadiazolyl, oxadiazolonyl, thiadiazolonyl, tetrazolyl, pyridyl, indolyl and the like.
  • “having a hetero atom in the ring” means containing a hetero atom in the atoms constituting the ring, and examples of such a ring include an aromatic heterocycle such as pyridine and piperidine. , Non-aromatic heterocycles such as morpholine, pyrrolidine, or azetidine. Further, when the hetero atom is an oxygen atom, it is described as “having an oxygen atom in the ring”.
  • the “heterocyclic group” means a group having at least one hetero atom (eg, N, O, S, etc.) in the ring, and is also called a saturated heterocyclyl group or an unsaturated heterocyclyl group.
  • the hetero atom is preferably N or O, the number of hetero atoms is preferably 1 or 2, and is preferably a 4- to 6-membered ring.
  • the heterocyclic group may be substituted with an alkyl group, a fluoroalkyl group, oxo or a halogen atom.
  • heterocyclic group examples include a pyridyl group, a piperidino group, a morpholino group, a pyrrolidino group, an oxadiazolonyl group, and an azetidinyl group.
  • arylalkyl is a group containing both aryl and alkyl, and means, for example, a group in which at least one hydrogen atom of the alkyl is substituted with aryl, and preferably "C" 5 -C 10 aryl C 1 -C 6 alkyl".
  • benzyl and the like can be mentioned.
  • alkylene means a divalent group derived by removing any one hydrogen atom from the above “alkyl”.
  • alkylene include C 1 -C 2 alkylene, C 1 -C 3 alkylene, C 1 -C 4 alkylene, C 1 -C 5 alkylene and C 1 -C 6 alkylene.
  • alkylene examples include —CH 2 —, —(CH 2 ) 2 —, —(CH 2 ) 3 —, CH(CH 3 )CH 2 —, —C(CH 3 ) 2 —, —(CH 2 ) 4 —, CH(CH 3 )CH 2 CH 2 —, —C(CH 3 ) 2 CH 2 —, —CH 2 CH(CH 3 )CH 2 —, —CH 2 C(CH 3 ) 2 —, — CH 2 CH 2 CH(CH 3 )—, —(CH 2 ) 5 —, —(CH 2 ) 6 — and the like can be mentioned.
  • heteroalkylene means a divalent group derived by removing one arbitrary hydrogen atom from the above “heteroalkyl”, and is a C 2 -C 6 heteroalkylene, C 2 -C 5 Heteroalkylene, C 2 -C 4 heteroalkylene, C 2 -C 3 heteroalkylene, C 2 heteroalkylene and the like can be mentioned.
  • specific examples of the heteroalkylene containing an oxygen atom as a hetero atom in the group include —CH 2 O—, —OCH 2 —, —CH 2 OCH 2 —, —OCH 2 CH 2 —, —CH 2 CH 2 O- and the like.
  • the “arylene” means a divalent group derived by removing one arbitrary hydrogen atom from the aryl.
  • Arylene may be a single ring or a condensed ring.
  • the number of atoms constituting the ring is not particularly limited, but is preferably 6 to 10 (C 6 -C 10 arylene).
  • Specific examples of the arylene include phenylene and the like.
  • heteroarylene means a divalent group derived by removing one arbitrary hydrogen atom from the above heteroaryl.
  • the heteroarylene may be a single ring or a condensed ring.
  • the number of atoms constituting the ring is not particularly limited, but is preferably 5 to 10 (5- to 10-membered heteroarylene).
  • Specific examples of the heteroarylene include imidazoldiyl, pyridinediyl, oxadiazolediyl, thiazolediyl, thiadiazolediyl and the like. ..
  • the “condensed ring structure” refers to a cyclic structure in which a plurality of rings share two or more atoms in a cyclic compound having two or more rings.
  • the “condensed ring structure with two or more aromatic rings” refers to a cyclic compound having two or more aromatic rings, in which a plurality of aromatic rings share two or more atoms.
  • examples of the condensed ring structure include an indole skeleton, a benzofuran skeleton, a benzimidazole skeleton, a quinoline skeleton, and a bicyclo[4.4.0]decane.
  • the substituent is, for example, an alkyl group, a fluoroalkyl group, an alkoxy group, a fluoroalkoxy group, an alkenyl group, or an alkenyloxy group.
  • heterocycle in the present specification means a non-aromatic monovalent or divalent heterocycle having preferably 1 to 5 heteroatoms in the atoms constituting the ring.
  • the heterocycle may have a double and/or triple bond in the ring, a carbon atom in the ring may be oxidized to form a carbonyl, and may be a monocycle, a condensed ring or a spiro ring.
  • the number of atoms constituting the ring is preferably 3 to 12 (3 to 12 membered heterocycle), more preferably 4 to 7 (4 to 7 membered heterocycle), and further preferably 5 to 6 ( 5-6 membered heterocycle).
  • heterocycle examples include piperazine, pyrrolidine, piperidine, morpholine, homomorpholine, (R)-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazine, (S)-hexahydropyrrolo[1,2-a ] Pyrazine, 3-oxopiperazine, 2-oxopyrrolidine, azetidine, 2-oxoimidazolidine, oxetane, dihydrofuran, tetrahydrofuran, dihydropyran, tetrahydropyran, tetrahydropyridine, thiomorpholine, pyrazolidine, imidazoline, oxazolidine, isoxazolidine, thiazolidine , Imidazolidine, isothiazolidine, thiadiazolidine, oxazolidone, benzodioxane, benzoxazoline, dioxolane, dioxane and tetrahydrothiopyran
  • the present invention provides a peptide compound in which two or more amino acids are linked, wherein at least one amino acid (specifically, for example, one, two, three, four, or more) Is a amino acid capable of forming a hydrogen bond in its side chain.
  • the “peptide compound” in the present invention includes a linear or cyclic peptide compound in which two or more amino acids are linked.
  • the cyclic peptide compound has the same meaning as "a peptide compound having a cyclic portion".
  • amino acid in the present specification includes natural amino acids and unnatural amino acids.
  • the “natural amino acid” in the present specification means Gly, Ala, Ser, Thr, Val, Leu, Ile, Phe, Tyr, Trp, His, Glu, Asp, Gln, Asn, Cys, Met, Lys, Arg, Pro.
  • the unnatural amino acid is not particularly limited, but examples thereof include ⁇ -amino acids, D-type amino acids, N-substituted amino acids, ⁇ , ⁇ -disubstituted amino acids, amino acids whose side chains differ from natural amino acids, and hydroxycarboxylic acids. As the amino acid in the present specification, any configuration is allowed.
  • the selection of the side chain of the amino acid is not particularly limited, but in addition to a hydrogen atom, for example, an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an aryl group, a heteroaryl group, an aralkyl group, a cycloalkyl group, a spiro-bonded cycloalkyl group.
  • a hydrogen atom for example, an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an aryl group, a heteroaryl group, an aralkyl group, a cycloalkyl group, a spiro-bonded cycloalkyl group.
  • Freely selected from the base may have a substituent, and the substituent is not limited, and any substituent including a halogen atom, an O atom, an S atom, an N atom, a B atom, a Si atom, or a P atom can be given.
  • One or two or more
  • examples thereof include an optionally substituted alkyl group, alkenyl group, alkynyl group, aryl group, heteroaryl group, aralkyl group, cycloalkyl group and the like.
  • the amino acid in the present specification may have a side chain “which can form an intramolecular hydrogen bond” described later.
  • the amino acid in the present specification may be a compound having a carboxy group and an amino group in the same molecule (even in this case, imino acids such as proline and hydroxyproline are also amino acids). included).
  • substituent derived from halogen examples include fluoro (-F), chloro (-Cl), bromo (-Br), iodo (-I) and the like.
  • oxy examples include alkoxy, cycloalkoxy, alkenyloxy, alkynyloxy, aryloxy, heteroaryloxy, aralkyloxy and the like.
  • carbonyl examples include formyl (—C ⁇ O—H), alkylcarbonyl, cycloalkylcarbonyl, alkenylcarbonyl, alkynylcarbonyl, arylcarbonyl, heteroarylcarbonyl, aralkylcarbonyl and the like. ..
  • Examples of carbonyloxy include alkylcarbonyloxy, cycloalkylcarbonyloxy, alkenylcarbonyloxy, alkynylcarbonyloxy, arylcarbonyloxy, heteroarylcarbonyloxy, aralkylcarbonyloxy and the like. ..
  • thiocarbonyl examples include alkylthiocarbonyl, cycloalkylthiocarbonyl, alkenylthiocarbonyl, alkynylthiocarbonyl, arylthiocarbonyl, heteroarylthiocarbonyl, aralkylthiocarbonyl and the like.
  • carbonylthio examples include alkylcarbonylthio, cycloalkylcarbonylthio, alkenylcarbonylthio, alkynylcarbonylthio, arylcarbonylthio, heteroarylcarbonylthio, aralkylcarbonylthio and the like. ..
  • aminocarbonyl examples include alkylaminocarbonyl, cycloalkylaminocarbonyl, alkenylaminocarbonyl, alkynylaminocarbonyl, arylaminocarbonyl, heteroarylaminocarbonyl, aralkylaminocarbonyl and the like.
  • Examples of carbonylamino include alkylcarbonylamino, cycloalkylcarbonylamino, alkenylcarbonylamino, alkynylcarbonylamino, arylcarbonylamino, heteroarylcarbonylamino, aralkylcarbonylamino and the like. ..
  • compounds in which the H atom bonded to the N atom in —NH—C ⁇ O—R is further substituted with alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, or aralkyl are included.
  • Examples of oxycarbonylamino include alkoxycarbonylamino, cycloalkoxycarbonylamino, alkenyloxycarbonylamino, alkynyloxycarbonylamino, aryloxycarbonylamino, heteroaryloxycarbonylamino, aralkyloxy. Carbonylamino and the like can be mentioned. In addition to these, compounds in which the H atom bonded to the N atom in —NH—C ⁇ O—OR is further substituted with alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, or aralkyl are included.
  • Examples of sulfonylamino include alkylsulfonylamino, cycloalkylsulfonylamino, alkenylsulfonylamino, alkynylsulfonylamino, arylsulfonylamino, heteroarylsulfonylamino, aralkylsulfonylamino and the like.
  • compounds in which the H atom bonded to the N atom in —NH—SO 2 —R is further substituted with alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, or aralkyl are included.
  • aminosulfonyl examples include alkylaminosulfonyl, cycloalkylaminosulfonyl, alkenylaminosulfonyl, alkynylaminosulfonyl, arylaminosulfonyl, heteroarylaminosulfonyl, aralkylaminosulfonyl and the like.
  • compounds in which the H atom bonded to the N atom in —SO 2 —NHR is further substituted with alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, or aralkyl are included.
  • sulfamoylamino examples include alkylsulfamoylamino, cycloalkylsulfamoylamino, alkenylsulfamoylamino, alkynylsulfamoylamino, arylsulfamoylamino, hetero Arylsulfamoylamino, aralkylsulfamoylamino and the like can be mentioned.
  • the two H atoms bonded to the N atom in —NH—SO 2 —NHR are substituents independently selected from the group consisting of alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, and aralkyl. They may be substituted, and these two substituents may form a ring.
  • thio are selected from alkylthio, cycloalkylthio, alkenylthio, alkynylthio, arylthio, heteroarylthio, aralkylthio and the like.
  • sulfinyl examples include alkylsulfinyl, cycloalkylsulfinyl, alkenylsulfinyl, alkynylsulfinyl, arylsulfinyl, heteroarylsulfinyl, aralkylsulfinyl and the like.
  • sulfonyl examples include alkylsulfonyl, cycloalkylsulfonyl, alkenylsulfonyl, alkynylsulfonyl, arylsulfonyl, heteroarylsulfonyl, aralkylsulfonyl and the like.
  • secondary amino examples include alkylamino, cycloalkylamino, alkenylamino, alkynylamino, arylamino, heteroarylamino, aralkylamino and the like.
  • tertiary amino are each independently selected from alkyl(aralkyl)amino and the like, alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, aralkyl and the like. , And an amino group having any two substituents, and these two optional substituents may form a ring.
  • Examples of substituted amidino include three substituents R, R', and R" on the N atom are alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, hetero. Examples include groups independently selected from aryl and aralkyl, such as alkyl(aralkyl)(aryl)amidino.
  • R, R', R", and R"' are alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl. , A heteroaryl, an aralkyl, a group independently selected from the above, or a group in which these form a ring.
  • aminocarbonylamino examples include R, R′, and R′′ selected from hydrogen atom, alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, and aralkyl. Examples include groups independently selected from each other, or groups forming a ring.
  • substituent derived from the B atom examples include boryl (-BR(R')) and dioxyboryl (-B(OR)(OR')). These two substituents R and R'are each independently selected from alkyl, cycloalkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, aralkyl, etc., or they may form a ring. ..
  • an amino acid means a molecule having at least one amino group and at least one carboxyl group in the molecule, but in the present specification.
  • a hydroxycarboxylic acid having a hydroxyl group and a carboxyl group in the molecule can also be included in the amino acid of the present invention.
  • hydroxycarboxylic acid may be referred to as hydroxyamino acid.
  • ⁇ amino acid means that the amino group and the carboxyl group in the amino acid molecule have the same carbon bonded to each other, and the substituent on the carbon is called the side chain of the amino acid.
  • the amino group, the carboxyl group, and the series of carbon atoms to which they are bound in the amino acid molecule are called the main chain of the amino acid.
  • the main chain amino group of an amino acid may be unsubstituted (NH 2 group) or may be substituted (that is, —NHR group: R is an optionally substituted alkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, Represents a heteroaryl, aralkyl or cycloalkyl, and a carbon chain bonded to the N atom and a carbon atom at the ⁇ -position may form a ring like proline).
  • An amino acid in which the main chain amino group is substituted is referred to as “N-substituted amino acid” in the present specification.
  • N-substituted amino acid in the present specification is preferably N-alkyl amino acid, N—C 1 -C 6 alkyl amino acid, N—C 1 -C 4 alkyl amino acid, N-methyl amino acid, “intramolecular hydrogen bond Examples include, but are not limited to, N-substituted amino acids having "formable" side chains.
  • amino acid constituting the peptide compound in the present specification includes all isotopes corresponding to each.
  • An “amino acid” isotope is one in which at least one atom has been replaced with an atom having the same atomic number (proton number) but different mass numbers (sum of protons and neutrons).
  • isotopes contained in the "amino acid" constituting the peptide compound of the present invention include a hydrogen atom, a carbon atom, a nitrogen atom, an oxygen atom, a phosphorus atom, a sulfur atom, a fluorine atom, a chlorine atom, and the like, respectively, 2 H, 3 H, 13 C, 14 C, 15 N, 17 O, 18 O, 32 P, 35 S, 18 F, 36 Cl and the like are included.
  • the “linear peptide compound” in the present invention is a compound formed by linking a natural amino acid and/or an unnatural amino acid with an amide bond or an ester bond, and as long as it is a compound having no cyclic portion, It is not particularly limited.
  • the total number of natural amino acids or non-natural amino acids constituting the linear peptide compound is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 20. , 25, 30 and a preferable range is 6 to 20, 7 to 19, 7 to 18, 7 to 17, 7 to 16, 7 to 15, 8 to 14, 9 It is up to 13.
  • the “cyclic peptide compound” in the present invention is formed by connecting a natural amino acid and/or an unnatural amino acid with an amide bond or an ester bond, and is not particularly limited as long as it is a compound having a cyclic portion.
  • the total number of natural amino acids or unnatural amino acids constituting the cyclic peptide compound is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 20, 25. , 30 can be used, and the preferred range is 6 to 20, 7 to 19, 7 to 18, 7 to 17, 7 to 16, 7 to 15, 8 to 14, 9 to 13. It is an individual.
  • the “cyclic portion” of a peptide compound means a cyclic portion formed by connecting two or more amino acid residues.
  • the “linear portion” used when referring to the partial structure of the cyclic peptide compound is a portion that is not included in the main chain structure of the cyclic portion and has at least one on the chain of the portion. It has one amide bond and/or ester bond.
  • the number of amino acids constituting the cyclic portion of the cyclic peptide compound in the present specification is not limited, for example, 2 or more, 3 or more, 4 or more, 6 or more, 7 or more, 8 or more, 9 or more, 10 or more, 11 or more, 12 or more, 30 or less, 20 or less, 18 or less, 16 or less, 15 or less, 14 or less, 13 or less, 12 or less, 11 or less, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 13, 14, 15, and 16 Is mentioned.
  • the number of amino acids forming the cyclic portion is preferably 2 to 30, 2 to 15, or 5 to 15 and 5 to 14, 7 to 14, or 8 to 14 is more preferable, 8 to 13, 9 to 13, 8 to 12, 8 to 11, or 9 to 12 is further preferable, and 9 to 11 is particularly preferable.
  • the number of amino acids in the linear portion is preferably 0 to 8, more preferably 0 to 5, and even more preferably 0 to 3.
  • the “linear portion” in the present specification may include natural amino acids and unnatural amino acids (including amino acids that have been chemically modified or skeleton-converted).
  • the peptide compound or cyclic peptide compound in the present specification is preferably one that does not have an ester bond in the cyclic portion or the linear portion.
  • the cyclic peptide compound in the present specification does not have at least one selected from the group consisting of (A) to (C) below in the side chain of the peptide moiety of the cyclic portion or linear portion. It may be a cyclic peptide compound: (A) Indole skeleton; (B) a condensed ring structure with two or more aromatic rings; (C) an unsubstituted hydroxyphenyl group. Among these, a cyclic peptide compound having no (A) or (C) in the side chain of the cyclic part is preferable, and a cyclic peptide compound having no (B) or (C) in the side chain of the cyclic part is more preferable.
  • the “condensed ring structure of two or more aromatic rings” may be a “condensed ring structure”.
  • the cyclic peptide compounds herein can have a molecular weight of 500-2000.
  • the cyclic peptide compound in the present specification is at least one selected from the group consisting of (A) methylthio group and (B) thiol group in the side chain of the peptide moiety of the cyclic moiety or the linear moiety. Or a cyclic peptide compound having neither or both.
  • the OH group of the carboxyl group of the main chain in the first amino acid is the nitrogen of the amino group of the main chain in the second amino acid. Substitution with atomic moieties forms peptide compounds.
  • the OH group of the carboxyl group of the main chain in the first amino acid is the oxygen of the hydroxyl group of the main chain in the second hydroxyamino acid. Substitution with atomic moieties forms peptide compounds.
  • a peptide compound when a peptide compound is formed by linking a natural amino acid and/or an unnatural amino acid with an amide bond or an ester bond, two or more amino acids are consecutively connected by an amide bond and/or an ester bond. Are bound to form a peptide compound.
  • a site linked by an amide bond and/or an ester bond of a peptide compound may be referred to as a “peptide site” in the present specification.
  • the bonding mode of the cyclization part is not limited to an amide bond or an ester bond.
  • the bonding mode of the cyclized portion include an amide bond, a carbon-carbon bond, a disulfide bond, an ester bond, a thioester bond, a thioether bond, a lactam bond, a bond via a triazole structure, and a bond via a fluorophore structure.
  • the cyclic peptide compound in the present specification preferably has an amide bond in the cyclized portion.
  • the “bonding mode of the cyclized portion” refers to the bonding mode of the site where cyclization is formed by the cyclization reaction.
  • the “peptide compound” in the present invention in addition to the above-mentioned condition of the total number of natural amino acids and unnatural amino acids, or alone, at least two N-substituted amino acids (preferably 2, 3, 4, 5, 6, 7,8,9,10,11,12,13,14,15,20,25,30, particularly preferably 5,6 or 7, with a preferred range of 2 to 30, 3 to 30, 6 to (20, 7 to 19, 7 to 18, 7 to 17, 7 to 16, 7 to 15, 8 to 14, 9 to 13), and at least one amino acid that is not N-substituted It can be a linear or cyclic peptide, including.
  • N-substituted examples include, but are not limited to, substitution of a hydrogen atom bonded to an N atom with a methyl group, an ethyl group, a propyl group, a butyl group, a hexyl group, or the like.
  • the N-substituted amino acid include amino acids in which an amino group contained in a natural amino acid is N-methylated, N-ethylated, N-propylated, N-butylated, or N-pentylated. -Methyl amino acid, N-ethyl amino acid, N-propyl amino acid, N-butyl amino acid, N-pentyl amino acid.
  • N-substituted Converting an N-unsubstituted amino acid to an N-substituted amino acid is called N-substituted, and is sometimes called N-alkylation, N-methylation, or N-ethylation.
  • the ratio of the number of N-substituted amino acids contained in the peptide compound in the present invention is 30% or more, 40% or more, 50% or more, 60% or more, 70% or more, 80% or more of the total number of amino acids constituting the peptide compound. It is illustrated.
  • the number of N-substituted amino acids contained in the peptide moiety of the cyclic peptide compound in the present specification is preferably 2 or more or 3 or more, more preferably 4 or more, 5 or more, or 6 or more, and 7 or more. Is more preferable, 8 or more is particularly preferable, and 20 or less, 15 or less, 14 or less, 13 or less, 12 or less, 10 or less, 9 or less are preferably exemplified.
  • the number of N-substituted amino acids contained in the cyclic peptide compound in the present specification is 30% or more, 40% or more, 50% or more, 60% or more, 70% or more, 80% or more of the number of amino acids constituting the cyclic portion.
  • the N-substituted amino acid referred to herein may be preferably an N-alkyl amino acid, more preferably an N-methyl amino acid. That is, in one non-limiting aspect, the number of N-substituted amino acids is exemplified as the number of N-alkyl amino acids or the number of N-methyl amino acids. When the number of amino acids constituting the cyclic portion is 8, the number of N-substituted amino acids is preferably 3-7. When the number of amino acids constituting the cyclic portion is 9, the number of N-substituted amino acids is preferably 3-8.
  • the number of amino acids constituting the cyclic portion is 10
  • the number of N-substituted amino acids is preferably 3-8.
  • the number of N-substituted amino acids is preferably 4-9.
  • the number of amino acids constituting the cyclic portion is 12, the number of N-substituted amino acids is preferably 4-10.
  • the number of amino acids constituting the cyclic portion is 13, the number of N-substituted amino acids is preferably 4-11.
  • the number of amino acids constituting the cyclic portion is 14, the number of N-substituted amino acids is preferably 5-12.
  • amino acid that constitutes a peptide compound may be referred to as “amino acid residue”.
  • the “peptide compound” in the present specification may include a pharmaceutically acceptable salt thereof or a solvate thereof.
  • side chain is used in a context such as a side chain of an amino acid or a side chain of a cyclic portion of a cyclic peptide compound, and means a portion not included in each main chain structure.
  • the “number of amino acids” refers to the number of amino acid residues (amino acid units) constituting a peptide compound, and includes the amide bond, the ester bond, and the bond of the cyclization part that connect amino acids. It means the number of amino acid units generated upon cleavage.
  • the pKa used in the present specification refers to the actually measured pKa.
  • a pKa value obtained by ADMET Predictor described later is referred to as a calculated pKa.
  • the Basic pKa used in the present specification refers to the actually measured Basic pKa unless otherwise indicated.
  • the Basic pKa value obtained by ADMET Predictor described later is referred to as Basic calculated pKa.
  • ⁇ pKa and Basic pKa can be obtained by the usual method. For example, it can be measured by the method described in Experimental Chemistry Course 5 "Thermal Measurement and Equilibrium", page 460 (edited by The Chemical Society of Japan, published by Maruzen Co., Ltd.). More specifically, it can be measured by the method described in Reference Example 3-1. Also, when the pKa value of the side chain of the amino acid to be measured and the Basic pKa value are difficult to obtain due to the influence of other functional groups, only the pKa of the target functional group and Basic pKa can be measured, It is possible to measure by appropriately protecting other functional groups with a protecting group or the like.
  • acidic side chain means a side chain having a pKa of 10 or less
  • basic side chain means a side chain having a Basic pKa of 4 or more.
  • a side chain having a pKa of more than 10 and a side chain having a Basic pKa of less than 4 are defined as neutral side chains.
  • the peptide compound or cyclic peptide compound in the present specification may contain an amino acid having an acidic side chain that does not hydrogen bond intramolecularly in addition to an amino acid having a side chain capable of intramolecular hydrogen bonding. it can.
  • the pKa of the acidic side chain may be 3.5-10.
  • the pKa of the acidic side chain is preferably 3.5 or more, more preferably 3.9 or more, more preferably 4.5 or more, more preferably 5.0 or more, more preferably 5.5 or more, More preferably, it is 5.7 or more.
  • the Basic pKa is preferably 10 or less.
  • the preferable pKa range is preferably 3.5 to 10, 3.9 to 10, 4.5 to 10, 5.0 to 10, or 5.5 to 10, 5.7 to 10.
  • the calculated pKa is preferably 3.5 or more, more preferably 4.5 or more, 5.0 or more, 5.4 or more, 8.0 or more, 8.3 or more.
  • the calculated pKa is preferably 10 or less.
  • the preferable range of the calculated pKa is preferably 3.5 to 10, 4.5 to 10, 5.0 to 10, 5.4 to 10, 8.0 to 10, or 8.3 to 10.
  • the peptide compound or the cyclic peptide compound in the present specification contains an amino acid having a basic side chain that does not intramolecularly hydrogen bond other than an amino acid having a side chain capable of intramolecular hydrogen bonding.
  • the Basic pKa of the basic side chain may be 4.0-10.
  • the basic side chain has a Basic pKa of preferably 10 or less, more preferably 9.5 or less, 9.0 or less, 8.5 or less, 7.5 or less, or 7.2 or less, and 6.5. The following are particularly preferred.
  • the Basic pKa is preferably 4.0 or more.
  • the range of the Basic pKa is 4.0 to 10, 4.0 to 9.5, 4.0 to 9.0, 4.0 to 8.5, 4.0 to 7.5, 4.0 to 7.2, 4.0 to 6.5 are preferably exemplified.
  • the Basic calculated pKa is preferably 10 or less, 9.5 or less, 9.0 or less, 8.8 or less, 8.6 or less, 8.5 or less, 7.5 or less. Or less, or 6.5 or less is more preferable.
  • the Basic calculation pKa is preferably 4.0 or more.
  • the range of the basic calculation pKa is 4.0 to 10, 4.0 to 9.5, 4.0 to 9.0, 4.0 to 8.8, 4.0 to 8.6, 4.0. ⁇ 8.5, 4.0 to 7.5, and 4.0 to 6.5 are preferably exemplified.
  • the number or ratio of aromatic rings contained in the side chain of the peptide moiety may influence the membrane permeability of the cyclic peptide compound, as shown in the reference example below. If the number or ratio of aromatic rings contained in the side chain of the peptide moiety exceeds a certain number, the probability of obtaining a compound having high membrane permeability may be reduced. That is, the number of aromatic rings can negatively affect the membrane permeability.
  • negative impact used in the context of the effect of the invention means an effect that cancels the effect of the invention. For example, assuming that the effect of the invention that should originally be exerted is 100%, and the effect is 30%, 20%, 10%, or 5% or less, there is a "negative effect". be able to.
  • the number of aromatic rings contained in the side chain of the peptide moiety of the cyclic peptide compound in the present specification is preferably 5 or less, and 0, 1, 2, for high membrane permeability. , Or 3 is preferred, and 0 to 3, 1 to 3 are preferred ranges.
  • the ratio of the number of aromatic rings contained in the side chain of the peptide moiety to the number of amino acids constituting the peptide moiety is preferably 40% or less, 35% or less, 30% or less, 27% or less, 25% or less. , Preferably 20% or less.
  • the “number of aromatic rings” refers to the number of aromatic rings contained in the side chain of the peptide portion of the cyclic peptide compound.
  • high membrane permeability limits the number of aromatic rings that can be included in the cyclic peptide compounds herein, while including side chains that can form intramolecular hydrogen bonds.
  • the amino acid is preferably present in the cyclic portion, which is a site that can contribute to binding with the target molecule. That is, in one embodiment, the peptide compound in the present specification is a cyclic peptide compound, and the cyclic portion of the cyclic peptide compound contains an amino acid containing an aromatic ring in a side chain capable of forming an intramolecular hydrogen bond.
  • the number of aromatic rings contained in the cyclic portion of the peptide compound is 1, 2, or 3, and the number of aromatic rings is, for example, 1 to 3 or 2 to 3.
  • the peptide compound in the present specification is a cyclic peptide compound, and the cyclic portion of the cyclic peptide compound contains an amino acid containing an aromatic ring in a side chain capable of forming an intramolecular hydrogen bond
  • the ratio of the number of aromatic rings contained in the cyclic portion to the total number of aromatic rings contained in the compound is, for example, 30% or more, 40% or more, 60% or more, 80% or more, or 100%.
  • the membrane permeability of the peptide compound in the present invention can be measured by the method for measuring membrane permeability described in International Publication No. 2018/124162.
  • P app of the peptide compound of the present invention is 1.0 ⁇ 10 ⁇ 7 cm/sec or more, 5.0 ⁇ 10 ⁇ 7 cm/sec or more, 8.0 ⁇ 10 ⁇ 7 cm/sec. Seconds or more is preferable, 9.0 ⁇ 10 ⁇ 7 cm/sec or more is more preferable, 1.0 ⁇ 10 ⁇ 6 cm/sec or more is further preferable, and 3.0 ⁇ 10 ⁇ 6 cm/sec or more is particularly preferable.
  • the “membrane permeability coefficient (P app )” in the present specification means a value measured using the measuring method (improved method) described in WO2018/124162.
  • ClogP of the cyclic peptide compound in the present specification is preferably 4 or more, more preferably 5 or more, further preferably 6 or more, particularly preferably 8 or more, and 18 or less, 17 or less, 16 or less. It is preferably exemplified, and 4 to 18, 5 to 17, and 6 to 16 are exemplified.
  • ClogP in this specification is a distribution coefficient calculated by a computer, and can be calculated using Daylight Version 4.9 of Daylight Chemical Information Systems, Inc.
  • the lower limit of ClogP/totalaa of the cyclic peptide compound in the present specification is preferably 1.0 or higher, more preferably 1.1 or higher, and even more preferably 1.2 or higher.
  • the upper limit of ClogP/totalaa is preferably 1.8 or less, 1.7 or less, 1.6 or less, 1.5 or less. Examples of the ClogP/totalaa range are 1.0 to 1.8, 1.0 to 1.7, 1.1 to 1.6, and 1.1 to 1.5.
  • total aa (also referred to as “total AA”) means the number of amino acids constituting the peptide site of the peptide compound.
  • the total aa of a cyclic peptide compound in which the cyclic portion is composed of 10 amino acids and the linear portion is composed of 1 amino acid is 11.
  • ClogP/totalaa is calculated by dividing ClogP by totalaa.
  • the peptide compounds herein preferably have good metabolic stability.
  • the number of amino acids contained in the peptide compound is preferably 8 or more, more preferably 9 or more, still more preferably 11 or more.
  • the peptide compound of the present invention has at least one amino acid capable of forming a hydrogen bond (ie, intramolecular hydrogen bond) in its side chain, specifically, for example, one or two amino acids. Includes three, four, or more.
  • the side chain of an amino acid in the present specification includes a chain bonded to a carbon atom (eg, ⁇ , ⁇ , or ⁇ -carbon atom) contained in an amino acid and a chain bonded to a nitrogen atom.
  • a carbon atom eg, ⁇ , ⁇ , or ⁇ -carbon atom
  • the length of the amino acid side chain can be determined by the method described in Reference Example 1.
  • the N-terminal of the amino acid unit is capped with an acetyl group and the C-terminal with a methylamino group, and conformation is generated by LowModeMD of the molecular modeling software MOE (Chemical Computing Group), and the side chain site is bound to the atom (
  • MOE Chemical Computing Group
  • the side chain site is bound to the atom (
  • it can be determined by measuring the distance from the ⁇ -carbon atom (C ⁇ carbon)) to the farthest atom on the same side chain (excluding hydrogen atom).
  • the “long side chain” refers to a side chain having a length of 5.4 ⁇ or more.
  • the side chains of amino acids are preferably long side chains due to intramolecular hydrogen bonding.
  • the length of the long side chain is preferably 5.4 angstroms or more, more preferably 5.6 angstroms or more, further preferably 5.8 angstroms or more, and particularly preferably 6.0 angstroms or more.
  • the upper limit of the length of the side chain is not particularly limited, but 20 angstroms or less, 15 angstroms or less, 13 angstroms or less, 12 angstroms or less, 11 angstroms or less, 10 angstroms or less, 9.0 angstroms or less, 8.8 angstroms or less, Examples are 8.5 angstroms or less, and 8.0 angstroms or less.
  • Examples of the length of the long side chain include 5.4 to 20 angstrom, 6.0 to 20 angstrom, 6.0 to 15 angstrom, 6.0 to 13 angstrom, and 6.0 to 10 angstrom. ..
  • the "long side chain” is preferably (i) a side chain that does not contain an amide bond on its side chain or contains one amide bond, and (ii) an amide bond on that side chain. It may be a side chain containing no bond. That is, in one non-limiting embodiment, a cyclic peptide compound having in its cyclic portion an amino acid which does not have two or more amide bonds in its side chain and has a long side chain of 6.0 to 11 angstroms in length. Are preferably exemplified. The long side chain in the present specification may or may not have an aromatic ring.
  • the amino acid capable of forming an intramolecular hydrogen bond is preferably a long side chain amino acid.
  • the presence or absence of an intramolecular hydrogen bond can be determined by, for example, X-ray structure analysis or chemical shift by 1 H NMR. In general, it is said that when the temperature-dependent chemical shift change amount is ⁇ 2 ppb/K, there is a clear hydrogen bond, and when it is >4 ppb/K, there is no hydrogen bond.
  • the conformational analysis by computational chemistry as exemplified in Example 3 is also a method used to judge whether there is a possibility of forming an intramolecular hydrogen bond.
  • the peptide compound of the present invention has at least one amino acid capable of forming a pseudo W-membered ring in its side chain, specifically, for example, 1, 2, 3, 4, or Including more.
  • the “pseudo W-membered ring” does not have a cyclic structure formed by a covalent bond, but means that a conformation is fixed by an intramolecular hydrogen bond to form a pseudo cyclic structure.
  • “W” represents the size of a ring selected from a natural number of 3 or more, and the atom forming the pseudo ring portion is a hydrogen atom that is a proton donor and an atom that is directly bonded to the hydrogen atom, It must contain 3 atoms of proton acceptor capable of forming hydrogen bond with proton donor.
  • W representing the ring size of the ring structure of the pseudo ring structure may be 3 or more, preferably 4 to 7, or 5 to 7, and more preferably 5 to 6.
  • a hydrogen atom of a hydroxyl group which is a proton donor and an oxygen atom of a hydroxyl group to which the hydrogen atom is directly bonded, and an oxygen atom of an ether group which is a proton acceptor are respectively It corresponds to the above 3 atoms and forms a pseudo 6-membered ring.
  • the intramolecular hydrogen bond is characterized in that it can be structurally converted into a cyclized form and a non-cyclized form according to the surrounding environment. By adopting such a cyclized structure, it is expected that a compound having a functional group capable of intramolecular hydrogen bonding is improved in membrane permeability.
  • the compound having a functional group for intramolecular hydrogen bonding has a non-cyclized structure, thereby providing a proton donor Both or one of the proton acceptors is expected to bind to the target molecule, and it becomes possible to more efficiently form an intermolecular hydrogen bond between the compound and the target molecule.
  • a schematic diagram in which a part of the structure capable of intramolecular hydrogen bonding forms an intermolecular mutual bond with the amide site of the target molecule is shown below (* indicates the ⁇ carbon of Ser(nPrOH) , And ** and *** represent the binding points of the target molecule to the protein).
  • an amino acid having a side chain capable of intramolecular hydrogen bonding may form a pseudo 4- to 7-membered ring in the partial structure forming the intramolecular hydrogen bond, and a pseudo 5- to 7-membered ring.
  • a pseudo 4- to 7-membered ring in the partial structure forming the intramolecular hydrogen bond
  • a pseudo 5- to 7-membered ring are preferably formed, and it is particularly preferable to form a pseudo 5- to 6-membered ring.
  • the structure of the present invention that can form an intramolecular hydrogen bond is exemplified below (* represents a point of attachment to Q 1 of Formula 1 or Q 2 of Formula 2).
  • amino acids that can form hydrogen bonds within the side chain can be represented by Formula A below.
  • R 1 is hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, or a group represented by formula 1 or formula 2, wherein (a) R 2A and or R 2B, either R 2A is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl, or a group represented by formula 1 or formula 2, and R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl Alternatively, (b) R 2A and R 2B together with the carbon atom to which they are attached form a 4-6 membered ring. When R 1 is C 1 -C 6 alkyl, R 1 is preferably methyl. When R 2B is C 1 -C 6 alkyl, R 2B is preferably methyl.
  • R 2A is preferably a group represented by formula 1 or formula 2 or C 1 -C 6 alkyl.
  • R 2A and R 2B together with the carbon atom to which they are bonded form a 4- to 6-membered ring the 4- to 6-membered ring may be cyclopropyl, cyclobutyl, cyclopentyl, cyclohexyl. Is preferred.
  • R 1 together with the nitrogen atom to which R 1 is bonded, R 2A , and the carbon atom to which R 2A is bonded form a 4- to 6-membered heterocycle
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl.
  • R 2B is preferably methyl.
  • the 4- to 6-membered heterocycle may have one or more substituents selected from the group consisting of the group represented by Formula 1 or Formula 2, —OH, and an alkoxy group.
  • the 4- to 6-membered heterocycle is preferably pyrrolidine (that is, a proline-like structure).
  • R 1 , R 2A and R 2B when R 2A is a group represented by formula 1 or formula 2, R 1 is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl, and R 2B is hydrogen or is preferably a C 1 -C 6 alkyl, it is preferred that the C 1 -C 6 alkyl is methyl.
  • R 1 is a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2A is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2B is hydrogen, C 1 -C 6 alkyl, or R 2A and R 2B are preferably taken together to form a 4 to 6 membered ring, and the C 1 -C 6 alkyl is preferably methyl.
  • R 3 is a single bond or —CHR 4 —, wherein R 4 is hydrogen, C 1 -C 4 alkyl, or is represented by formula 1 or formula 2. It is a base.
  • R 4 is preferably hydrogen or a group represented by Formula 1 or Formula 2.
  • R 1 is a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2A is hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, preferably hydrogen
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 Alkyl, preferably hydrogen
  • R 3 is a single bond, or —CHR 4 —
  • R 4 is hydrogen, or C 1 -C 4 alkyl, preferably hydrogen.
  • R 1 is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2A is a group represented by formula 1 or formula 2
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl, preferably hydrogen
  • R 3 is a single bond, or —CHR 4 —, preferably a single bond
  • R 4 is hydrogen or C 1 -C 4 alkyl, preferably hydrogen.
  • R 1 is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl
  • R 2A is hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, preferably hydrogen
  • R 2B is hydrogen, or C 1 -C 6 alkyl, preferably Is hydrogen
  • R 3 is —CHR 4 —
  • R 4 is a group represented by Formula 1 or Formula 2.
  • R 1 a nitrogen atom to which R 1 is bound, R 2A , and a carbon atom to which R 2A is bound together form a 4- to 6-membered heterocycle (preferably a pyrrolidine ring),
  • the ring has a group represented by formula 1 or formula 2,
  • R 2B is hydrogen or C 1 -C 6 alkyl, preferably hydrogen
  • R 3 is a single bond, or —CHR 4 —, preferably It is a single bond
  • R 4 is hydrogen or C 1 -C 4 alkyl, preferably hydrogen.
  • Formula 1 and Formula 2 are respectively the following formulas: Is shown in the formula, and * in the formula represents a point of attachment.
  • the amino acid represented by formula A contains at least one of the groups represented by formula 1 or formula 2.
  • the amino acid represented by Formula A can include either one of the groups represented by Formula 1 or Formula 2, in which case any of R 1 , R 2 , or R 4 in Formula A can be included.
  • Q 1 is a single bond, C 1 -C 4 alkylene, or C 2 -C 4 heteroalkylene containing one oxygen atom.
  • Q 1 is preferably —CH 2 — or —(CH 2 ) 2 —.
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—.
  • L 1 is substituted with one or more substituents selected from the group consisting of fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O). It may be a straight chain C 1 -C 3 alkylene.
  • L 1 examples include —CH 2 —, —(CH 2 ) 2 —, —(CH 2 ) 3 —, —CH 2 CH(CH 3 )—, —CH 2 CH(CF 3 )—, — CH 2 C(CH 3 ) 2 —, —(CH 2 ) 2 CH(CH 3 )—, —CH 2 C(CH 3 ) 2 CH 2 —, —(CH 2 ) 2 C(CH 3 ) 2 —, —CH 2 CO— and the like can be mentioned. In one aspect, it is preferred that L 1 is not unsubstituted —(CH 2 ) 2 —.
  • X is —OH, —NR Z1 R Z2 , or —CONR Z1 R Z2 , or contains 1 to 3 heteroatoms, and is substituted with oxo or one or more halogens. 5 to 6 membered saturated or unsaturated heterocyclyl, wherein R Z1 and R Z2 are independently hydrogen, —OH, C 1 -C 4 alkyl, and C 1 -C 4 alkylsulfonyl. Is selected from the group consisting of When X is -NR Z1 R Z2 , X is preferably -NH 2 , -NHMe, -NHEt, -NH(nPr), -NH(iPr), -NH(tBu).
  • X is preferably -CONH 2 , -CONHMe, -CONHEt, -CONH(nPr), -CONH(iPr), -CONH(tBu).
  • X is oxo or a 5- to 6-membered saturated or unsaturated heterocyclyl optionally substituted with one or more halogen
  • the saturated or unsaturated heterocyclyl is 4,5-dihydro-1,2,4 -Oxadiazolyl, 4,5-dihydro-1,2,4-thiadiazolyl and pyrrolidyl are preferable, and the following groups are represented as X: Is preferred.
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—
  • L 1 is C 1 -C
  • X is --OH.
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—
  • L 1 is C 1 -C. 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and straight chain C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of oxo ( ⁇ O), preferably Is —CH 2 —
  • X is —NR Z1 R Z2
  • R Z1 is C 1 -C 4 alkyl
  • R Z2 is hydrogen.
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—
  • L 1 is C 1 -C. 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and straight chain C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of oxo ( ⁇ O), preferably Is —CH 2 —
  • X is —CONR Z1 R Z2
  • R Z1 is C 1 -C 4 alkyl and R Z2 is hydrogen.
  • Q 1 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—
  • L 1 is C 1 -C. 2 alkyl groups, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and straight chain C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of oxo ( ⁇ O), preferably Is —CH 2 —, wherein X contains 1 to 3 heteroatoms and is 5 to 6 membered saturated or unsaturated optionally substituted by oxo or one or more halogen (preferably fluorine). It is a saturated heterocyclyl.
  • Q 1 is a single bond
  • a 1 is —O— or —S—, preferably —O—
  • L 1 is a C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, And a linear C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of and oxo ( ⁇ O), and X is —OH.
  • Q 2 is a single bond, C 1 -C 4 alkylene, or C 2 -C 4 heteroalkylene containing one oxygen atom.
  • Q 2 is preferably —CH 2 — or —(CH 2 ) 2 —.
  • L 2 is a single bond, or one or more selected from the group consisting of fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O) Is a linear C 1 -C 3 alkylene which may be substituted by the substituent of.
  • Specific examples of L 2 include a single bond, —CH 2 —, —CO—, —(CH 2 ) 2 —, —(CH 2 ) 3 —, —CH 2 CH(CH 3 )—, —CH 2 CH.
  • Y is —OH, C 1 -C 4 alkylsulfonylamino, —NR Z3 R Z4 , or —CONR Z3 R Z4 , or contains 1 to 3 heteroatoms, and is oxo or halogen. 5 to 6 membered saturated or unsaturated heterocyclyl optionally substituted by wherein R Z3 and R Z4 are independently hydrogen, —OH, C 1 -C 4 alkyl, and C 1 -C It is selected from the group consisting of 4 alkylsulfonyl.
  • Y is preferably —NH 2 , NHMe, NHEt, NH(nPr), NH(iPr), NH(tBu).
  • Y is C 1 -C 4 alkylsulfonylamino
  • Y is preferably methylsulfonylamino.
  • L 2 is —CO—.
  • a 2 is a single bond, —O—, or —S—, and preferably —O—.
  • Z is hydrogen or C 1 -C 4 alkyl, and when Z is C 1 -C 4 alkyl, the C 1 -C 4 alkyl is preferably methyl.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • L 2 is fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo
  • Y is —NR Z3 R Z4 , preferably methyl.
  • a 2 is —O—, or —S—, preferably —O—, and Z is C 1 -C 4 alkyl, preferably methyl.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —, L 2 is a single bond, and Y is —CONR Z3 R Z4 , preferably methylaminocarbonyl or —CON(OH).
  • a 2 is —O—, or —S—, preferably —O—, and Z is C 1 -C 4 alkyl, preferably methyl.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • L 2 is fluorine, a C 1 -C 2 alkyl group, a C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O) Is a straight chain C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of, preferably —CO—
  • Y is —NR Z3 R Z4 , preferably — N(OH)Me
  • a 2 is a single bond
  • Z is hydrogen.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —, L 2 is a single bond, Y is —CONR Z3 R Z4 , preferably —CON(OH)Me, A 2 is a single bond and Z is hydrogen.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • L 2 is fluorine, C 1 -C 2 alkyl group, C 1 -C 2 fluoroalkyl, and oxo ( ⁇ O)
  • a linear C 1 -C 3 alkylene optionally substituted by one or more substituents selected from the group consisting of, preferably —CO—
  • Y is a C 1 -C 4 alkylsulfonylamino, It is preferably methylsulfonylamino
  • a 2 is —O—, or —S—, preferably —O—
  • Z is C 1 -C 4 alkyl, preferably methyl.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —
  • L 2 is a single bond
  • Y is C 1 -C 4 alkylsulfonylaminocarbonyl, preferably methylsulfonylaminocarbonyl.
  • a 2 is —O—, or —S—, preferably —O—
  • Z is C 1 -C 4 alkyl, preferably methyl.
  • Q 2 is C 1 -C 4 alkylene, preferably —CH 2 —, L 2 is a single bond, Y is —OH, A 2 is —O—, or —S—, It is preferably —O— and Z is C 1 -C 4 alkyl, preferably methyl.
  • amino acid capable of forming a hydrogen bond in the side chain and/or the amino acid capable of forming a pseudo 4- to 7-membered ring in the side chain include the following amino acids.
  • the amino acid represented by the formula A of the present invention when the amino acid represented by the formula A of the present invention is contained in a peptide compound, it is preferable to link the adjacent amino acid by an amino group and a carboxyl group of the main chain of the amino acid.
  • the amino acid represented by the formula (A) can also be represented as follows (* represents a bonding point with an adjacent amino acid in the peptide compound).
  • the present invention relates to a protected amino acid in which an amino group and/or a carboxyl group of the amino acid capable of forming an intramolecular hydrogen bond are protected with a protecting group.
  • the protecting group for the amino group of the protected amino acid include Fmoc group, Boc group, Cbz group, Alloc group, nosyl group, dinitronosyl group, t-Bu group, trityl group and cumyl group.
  • the protective group for the carboxyl group of the protected amino acid include a methyl group, an allyl group, a t-Bu group, a trityl group, a cumyl group, a methoxytrityl group and a benzyl group.
  • these protecting groups can be introduced using the method described in "Greene's, "Protective Groups in Organic Synthesis” (5th edition, John Wiley & Sons 2014).
  • the position of the proton donor is limited to the position close to the main chain amide bond that can form hydrogen bonds. It will be what was done.
  • the amino acid of the present specification can form a hydrogen bond “inside the side chain” thereof, which may increase the degree of freedom in side chain design. For example, it is possible to lengthen the side chains while maintaining the formation of hydrogen bonds that may mask the protons, which may increase the likelihood that the protons on the side chains will be used for interaction with the target.
  • an amino acid having an ether bond in its side chain can be produced by the following two synthetic methods.
  • Manufacturing method 1 A compound having an aziridine in which an amino group and a carboxylic acid group are protected is reacted with an alcohol having an appropriate corresponding protecting group in the presence of Lewis acid to perform a ring-opening reaction, and then an unnecessary protecting group is deprotected.
  • Cbz group as P 1 Fmoc group, Alloc group, and nosyl groups (Ns group), as the P 2 Me group, an allyl group, can be used a benzyl group.
  • the Lewis acid used in the ring-opening reaction is preferably exemplified by a catalytic amount of BF 3 .OEt 2 .
  • Dichloromethane is preferably exemplified as the solvent, but alcohol (ROH) used as a reagent can also be used as the solvent.
  • R contains a functional group that may participate in the reaction, it is preferable to protect the functional group with a protective group that is stable in the presence of Lewis acid.
  • R contains a hydroxyl group, it is preferable to protect the hydroxyl group with a benzyl group or the like, and when R contains a secondary amino group, the amino group is protected with an Alloc group or the like.
  • the desired amino acid (P 3 is a Cbz group, Fmoc group, Boc group, Alloc group, nosyl group (Ns group), etc.) Protected amino acids or unprotected amino acids where P 3 is hydrogen).
  • Manufacturing method 2 After performing an alkylation reaction between an amino group-protected amino acid having a hydroxyl group in the side chain and an ⁇ -halocarbonyl compound such as 2-bromo-N-methylacetamide, or bromoacetonitrile, the following functional group conversion is performed.
  • the production shown in the scheme can be carried out.
  • P 1 is preferably a protective group that is stable under basic conditions such as a Cbz group, a Boc group, and a Trt group.
  • Preferable examples of the ⁇ -halocarbonyl compound include those in which R a is NMe, NtBu, or the like.
  • X 1 is halogen and is preferably a bromo group.
  • Examples of the base used in the alkylation reaction include NaH, NaOtBu, and NaOt-Pent, and the hydroxyl group of the amino acid is selectively selected by using 2 equivalents or more of the amino acid having a hydroxyl group in the side chain and having an amino group protected.
  • the site can be alkylated.
  • Preferable examples of the solvent used include DMF and DMI.
  • an amino acid basic skeleton can be constructed by constructing a heterocycle based on the obtained nitrile group. In the scheme below, hydroxylamine is allowed to act on the resulting nitrile group, and then an oxadiazolone ring cyclized with CDI is constructed.
  • Desired amino acid is Cbz group by performing the appropriate transformation of the protective group after building the backbone of an amino acid, Fmoc group, Boc group, Alloc group, nosyl group (Ns group) protected amino acids, etc. Alternatively, it can be converted to an unprotected amino acid) in which P 3 is hydrogen.
  • the phenylalanine derivative is a method described in Jackson-Negishi coupling (Journal of Organic Chemistry, 2010, 75, 245) or asymmetric benzylation of benzophenone imine of glycine tert-butyl ester using a phase transfer catalyst (J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 6519) and the like. It can also be produced by carrying out a cross-coupling reaction involving decarboxylation using an N-hydroxyphthalimide ester (NHPI ester) represented by the following general formula and an aromatic iodine compound or an aromatic bromo compound as raw materials. ..
  • NHPI ester N-hydroxyphthalimide ester
  • P 1 a group that is stable under cross-coupling conditions is used, and preferably a Fmoc group is exemplified.
  • R 4 -X 1 is an aromatic halogen compound, and R 4 represents an aromatic moiety.
  • R 4 contains a functional group that can be converted under the cross-coupling reaction conditions, it is preferably protected with a protective group that is stable under the cross-coupling reaction conditions.
  • R 4 contains a hydroxyl group, it is preferable to protect the hydroxyl group with a tetrahydropyranyl (THP) group or the like.
  • THP tetrahydropyranyl
  • X 1 is a halogen, preferably a bromo (Br) group or an iodo (I) group.
  • the catalyst used in the cross-coupling reaction is preferably nickel and zinc, and the ligand of the catalyst is 4,4′-di-tert-butyl-2,2′-bipyridyl (dtbbby). Is preferred. It is preferable to use dimethylacetamide as the solvent.
  • a desired amino acid (P 3 is a Cbz group, an Fmoc group, a Boc group, an Alloc group, a nosyl group (P 3 is Ns group) or the like, or an unprotected amino acid in which P 3 is hydrogen.
  • P 3 is a side chain site on the N atom of the amino acid.
  • the corresponding ⁇ -amino acid can be produced by using Arndt-Eistert synthesis (organic synthetic strategy learned from personal name reaction, p18).
  • a ring-opening reaction with ammonia is performed on an epoxide having a corresponding functional group, a protecting group is introduced at the amine site of the resulting compound, and then the resulting secondary alcohol is converted to a leaving group. It can be produced by converting to a nitrile group accompanied by steric inversion by a nucleophilic substitution reaction, and then converting to a carboxylic acid.
  • R contains a functional group involved in the reaction, it is preferable to protect with a suitable protecting group.
  • R contains a hydroxyl group, it is preferable to protect the hydroxyl group with a Trt group.
  • Preferred examples of P 1 which is the amino-protecting group obtained after the ring-opening reaction include Cbz group, Boc group and Alloc group.
  • the produced secondary alcohol is converted into a leaving group X 2 (preferably, X 2 is exemplified by a mesyl group (OMs group) and the like).
  • a basic skeleton of an amino acid can be constructed by converting the resulting leaving group into a nitrile group by nucleophilic substitution reaction with cyanohydrin (CN ⁇ ) with steric inversion and converting it into a carboxylic acid.
  • the conversion of a nitrile group into a carboxylic acid is exemplified by hydrolysis under acidic conditions.
  • the desired amino acid (P 3 was protected with a Cbz group, Fmoc group, Boc group, Alloc group, nosyl group (Ns group), etc. Amino acid or an unprotected amino acid in which P 3 is hydrogen).
  • a cyclic amino acid having a hydroxyl group and protected with an amino group and a halogen compound are subjected to an alkylation reaction using a base, and then a suitable functional group is converted to give a cyclic amino acid as shown in the following scheme.
  • the cyclic amino acid used as a starting material is preferably a 4- to 8-membered cyclic amino acid, and a 5-membered ring is exemplified in the following scheme.
  • the position of the hydroxyl group present in the cyclic portion is not particularly limited, but as shown in the general formula, it is preferably at a position separated by 2 or more atoms from the N atom of the amino acid.
  • Cbz group, Boc group, Alloc group, nosyl group (Ns group) or the like can be used as P 1 .
  • the base used in the alkylation reaction is preferably sodium hydride (NaH), and the solvent is preferably dimethylformamide.
  • the halogen compound (R—X) when the halogen compound (R—X) has a functional group on R that may participate in the reaction, it is preferable to protect the functional group with a stable protecting group under basic conditions. ..
  • R when R contains a hydroxyl group, it is preferable to protect the hydroxyl group with a silyl ether such as a tetrahydropyranyl (THP) group, a benzyl (Bn) group and a t-butyldimethylsilyl (TBDMS) group.
  • a silyl ether such as a tetrahydropyranyl (THP) group, a benzyl (Bn) group and a t-butyldimethylsilyl (TBDMS) group.
  • THP tetrahydropyranyl
  • Bn benzyl
  • TDMS t-butyldimethylsilyl
  • X 1 is halogen, and examples thereof include a chloro (Cl) group, a bromo (Br) group, and an iodo (I) group.
  • the desired amino acid (P 3 is a Cbz group, Fmoc group, Boc group, Alloc group, nosyl group (Ns group), etc.) Protected amino acids or unprotected amino acids where P 3 is hydrogen).
  • Process 7 According to the scheme below, the above amino acid undergoes a cyclization reaction using paraformaldehyde under acidic conditions, and then the resulting cyclized product is subjected to ring opening under acidic conditions to reduce the resulting imine. , N-methylation can be performed.
  • the basic unit is not particularly limited as long as it is a combination having an Fmoc-protected amino group and a carboxyl group.
  • a dipeptide may be used as a basic unit.
  • the basic unit placed at the N-terminus may be other than the Fmoc amino acid.
  • it may be a Boc amino acid or a carboxylic acid analog having no amino group.
  • a side chain carboxyl group of an amino acid having a carboxyl group on the main chain carboxyl group or a side chain whose main chain carboxyl group is protected by a suitable protecting group is supported on a solid phase by a chemical reaction with a functional group of a solid phase carrier.
  • the Fmoc group is deprotected with a base such as piperidine or DBU, and the newly formed amino group is subjected to a condensation reaction with a protected amino acid having a basic unit carboxyl group to be subsequently added to form a peptide bond.
  • a base such as piperidine or DBU
  • various combinations such as a combination of DIC and HOBt, a combination of DIC and HOAt, and a combination of HATU and DIPEA can be used as the carboxyl group activator.
  • the desired peptide sequence can be generated by repeating the Fmoc-eliminating group and the subsequent peptide bond formation reaction.
  • cleavage from the solid phase and, if necessary, deprotection of the protecting group of the introduced side chain functional group are performed. It is also possible to carry out structural conversion or cyclization of the peptide before excising it from the solid phase. Cleavage from the solid phase and deprotection may be performed under the same conditions, for example, 90:10 TFA/H 2 O, or may be deprotected under different conditions if necessary.
  • Cleavage from the solid phase some can be cleaved with a weak acid such as 1% TFA, and Pd or the like can be used as a protecting group to utilize the orthogonality of both chemical reactions. Steps such as cyclization can also be carried out between or at the end of these steps.
  • a side chain carboxylic acid can be condensed with an amino group of the N-terminal main chain, or a side chain amino group can be condensed with a carboxylic acid of a C-terminal main chain.
  • the reaction orthogonality is required between the carboxylic acid on the C-terminal side and the side-chain carboxylic acid to be cyclized, or between the main chain amino group or hydroxy group on the N-terminal side and the side-chain amino group to be cyclized.
  • the protecting group is selected in consideration of the orthogonality of the protecting group.
  • the reaction product thus obtained can be purified by a reverse phase column, a molecular sieve column or the like.
  • the resin for solid phase synthesis a commercially available resin can be used, and examples thereof include CTC resin, Wang resin, and SASRIN resin.
  • the compound when the defined group undergoes an undesired chemical conversion under the conditions of the method for carrying out the method, for example, by protecting the functional group, deprotecting it,
  • the compound can be prepared.
  • the protective group selection and desorption operations include the method described in “Greene's, “Protective Groups in Organic Synthesis” (5th edition, John Wiley & Sons 2014)”, and these are used as reaction conditions. It may be used as appropriate. Further, the order of reaction steps such as introduction of substituents can be changed as necessary.
  • the protecting group for the amino group is exemplified by Fmoc, Boc, Cbz, or Alloc group.
  • carbamate groups can be introduced by reacting an amino group with a carbamate agent in the presence of a base catalyst.
  • a carbamate agent include Boc 2 O, BocOPh, FmocOSu, FmocCl, CbzCl, AllocCl and the like.
  • the base catalyst include lithium carbonate, sodium carbonate, sodium hydrogen carbonate, potassium carbonate, potassium hydrogen carbonate, cesium carbonate, cesium hydrogen carbonate, lithium hydroxide, sodium hydroxide, potassium hydroxide, cesium hydroxide, sodium phosphate and phosphorus.
  • Examples thereof include potassium acid salt, N-methylmorpholine, triethylamine, diisopropylethylamine, N,N-dimethylaminopyridine and the like.
  • the carbamate group which is a protective group for the amino group, can be removed under basic conditions, acidic conditions, hydrogenolysis reaction conditions, or the like.
  • Method for Translational Synthesis of Peptide Compound As a method for translational synthesis of a peptide compound in the present specification, a method of synthesizing using a cell-free translation system is exemplified, and the method includes a method of synthesizing by a reconstituted cell-free translation system. It is preferable to use the reconstituted cell-free translation system because the factor to be eliminated can be removed.
  • the present specification provides a method for translationally synthesizing a peptide compound according to the present specification, which comprises at least one kind, two or more kinds, or three or more kinds of amino acids in the present specification.
  • Such translation synthesis methods may include, but are not limited to, the following (i) and (ii): (i) a step of preparing a tRNA having at least one kind, two or more kinds, or three or more kinds of amino acids in the present specification bound thereto; (ii) a step of translating a nucleic acid containing at least one codon corresponding to the anticodon of the tRNA in a cell-free translation system to obtain the peptide compound.
  • the method of translational synthesis herein may be a method of translational synthesis of a cyclic peptide compound.
  • the "cell-free translation system” is a combination of a ribosome extracted from a cell, a protein factor group involved in translation, an energy source such as tRNA, amino acid, ATP, and its regeneration system. However, it is not limited as long as it can translate mRNA into protein. A system in which a translation synthesis reaction is in progress may also be included in the "cell-free translation system" in the present specification.
  • the cell-free translation system in the present specification may include a nucleic acid serving as a template for translating a peptide, and may further include an initiation factor, an elongation factor, a dissociation factor, an aminoacyl-tRNA synthetase, and the like. .
  • the cells for purifying the factor can include, for example, prokaryotic cells or eukaryotic cells.
  • Prokaryotic cells can include E. coli cells, hyperthermophilic cells, or Bacillus subtilis cells.
  • Known eukaryotic cells are yeast cells, wheat germ, rabbit reticulocytes, plant cells, insect cells, or animal cells.
  • tRNAs and aminoacyl-tRNA synthetases ARS
  • artificial tRNAs and artificial aminoacyl-tRNA synthetases that recognize unnatural amino acids can be used.
  • RNA polymerase such as T7 RNA polymerase can be added to the cell-free translation system to cause transcription from the template DNA.
  • the phrase "comprising a substance having a cell-free translation system” means that the substance is synthesized and contained in the system during the translation synthesis process even if the substance is not contained at the initiation of translation synthesis. It also includes a mode that becomes. For example, when a tRNA in which an amino acid is acylated is synthesized in the process of translation synthesis, it is understood that the cell-free translation system includes the aminoacyl tRNA.
  • PURESYSTEM (registered trademark) (BioComber, Japan) is a reconstituted cell-free translation that extracts and purifies protein factors, energy regeneration system enzymes, and ribosomes required for E. coli translation, and mixes them with tRNA, amino acids, ATP, GTP, etc. It is a system. Not only is the content of impurities small, but since it is a reconstituted system, it is possible to easily prepare a system that does not contain the protein factor or amino acid to be excluded. ((i)Nat Biotechnol. 2001;19:751-5. Cell-free translationreconstituted with purified components.
  • translational synthesis includes, for example, protein factors necessary for translation of E. coli (methionyl tRNA transformylase, EF-G, RF1, RF2, RF3, RRF, IF1, IF2, IF3, EF-Tu, EF-Ts, ARS (AlaRS, ArgRS, AsnRS, AspRS, CysRS, GlnRS, GluRS, GlyRS, HisRS, IleRS, LeuRS, LysRS, MetRS, PheRS, ProRS, SerRS, ThrRS, TrpRS, TyrRS, ValRS )), ribosome, amino acid, creatine kinase, myokinase, inorganic pyrophosphatase, nucleoside diphosphate kinase, E.
  • E. coli methionyl tRNA transformylase, EF-G, RF1, RF2, RF3, RRF, IF1, IF2, IF3, EF-Tu, EF-Ts
  • coli tRNA creatine phosphate, potassium glutamate, HEPES-KOH pH 7.6, magnesium acetate, spermidine, dithiothrey. It can be performed by adding mRNA to a known cell-free translation system such as PURE SYSTEM in which Tol, GTP, ATP, CTP, UTP and the like are appropriately selected and mixed.
  • PURE SYSTEM in which Tol, GTP, ATP, CTP, UTP and the like are appropriately selected and mixed.
  • T7 RNA polymerase is added, transcription and translation from the template DNA containing the T7 promoter can be performed in a coupled manner.
  • a peptide compound containing an unnatural amino acid can be translationally synthesized by adding to the system an unnatural amino acid group (for example, F-Tyr) allowed by a desired aminoacyl-tRNA group or aminoacyl-tRNA synthetase (ARS) ( Kawakami T, et al. Ribosomal synthesis polypeptoids and peptoid-peptide hybrids. J Am Chem Soc. 2008, 130, 16861-3., Kawakami T, et al. Diverse backbone-cyclized peptides via codon at , 5, 888-90.).
  • an unnatural amino acid group for example, F-Tyr
  • ARS aminoacyl-tRNA synthetase
  • a peptide compound containing an unnatural amino acid can be translationally synthesized by including a modified form of ARS in the system instead of or in addition to the natural ARS and by including an unnatural amino acid group in the system.
  • it is possible to increase the efficiency of translation introduction of unnatural amino acids by utilizing variants such as ribosomes and EF-Tu (DedkovaLM, et al. Construction of modified ribosomes for incorporation D-amino acids toto proteins. Biochemistry. 2006, 45, 15541-51., Doi Y, et al. Elongation factor Tumutants expand amino acid tolerance of protein biosynthesis system. J AmChem Soc. 2007, 129, 14458-62., Park HS, etal. Expanding the genetic code of Escherichia coli with phosphoserine.Science. 2011, 333, 1151-4.).
  • the cell-free translation system herein may be a translation system for producing a peptide compound, preferably a cyclic peptide compound. Is a translation system for manufacturing.
  • the translation system herein may include 5 to 32, 5 to 28, or 5 to 20 unnatural amino acids, 8 to 20, 10 to 20, Preferable examples are 13 to 20 kinds. In one embodiment, 50% or more, 60% or more, 70% or more, 80% or more of the number of types of amino acids contained in the translation system in the present specification may be unnatural amino acids.
  • the translation system herein may include 5 to 28 kinds, or 5 to 20 kinds of N-substituted amino acids, and 5 to 18 kinds and 5 to 15 kinds are preferably exemplified.
  • 40% or more, 50% or more, 60% or more, 70% or more of the number of types of amino acids contained in the translation system in the present specification may be N-substituted amino acids.
  • the N-substituted amino acid herein may mean an N-alkyl amino acid or an N-methyl amino acid, but even in that case, it is not necessary for the translation system in the present specification to include other N-substituted amino acids. I do not deny it.
  • the translation system in the present specification may be adjusted so that the average number of aromatic rings contained in the peptide compound produced using the translation system is within a certain range. ..
  • the average ratio of the number of amino acids having an aromatic ring to the number of amino acids constituting the cyclic portion is 40% or less, 35% or less, 30% or less, 27% or less, 25%. Or less, or 20% or less, or the average number of aromatic rings contained in the side chain of the cyclic part of the peptide compound having a cyclic part composed of 8 to 11 amino acids becomes 0 to 3
  • the translation system herein may be adjusted.
  • the adjusting method is not particularly limited, and examples thereof include adjusting the number of kinds of amino acids having an aromatic ring in the number of kinds of amino acids contained in the translation system.
  • the translation system herein may include an amino acid having an aromatic ring, and the ratio of the number of amino acid types having an aromatic ring to the number of amino acid types included in the translation system is 40% or less is preferable, and 35% or less, 30% or less, 27% or less, 25% or less, 20% or less are preferably exemplified.
  • the cell-free translation system herein comprises a cell-free translation system for producing a peptide compound of the present specification, which comprises at least one amino acid of the present specification, two or more, or three or more of them. It may be a translation system.
  • Such cell-free translation systems may include, but are not limited to, the following (i) and (ii): (i) tRNA having at least one kind, two or more kinds, or three or more kinds of amino acids in the present specification bound thereto; (ii) a nucleic acid encoding the peptide compound,
  • the nucleic acid may include at least one codon corresponding to the anticodon of the tRNA.
  • tRNA For translational introduction of unnatural amino acids into peptides, tRNA ((i)Biochemistry. 2003;42:9598-608. Adaptation of an orthogonal archaeal leucyl-tRNA and synthetase pair for four-base, amber, and opal suppression.Anderson JC, Schultz PG., (ii)Chem Biol. 2003;10:1077-84.
  • a solid-phase ribozyme aminoacylation system to reprogram the genetic code.Murakami H, Kourouklis D , Suga H.
  • the following five methods can be used for aminoacylating tRNA.
  • aminoacyl-tRNA synthetase is prepared for each amino acid as an enzyme for aminoacylation of tRNA. Therefore, as the first method, a method of utilizing that certain ARS allows unnatural amino acids such as N-MeHis and a mutant aminoacyl-tRNA synthetase that allows unnatural amino acids are prepared and used. ((I)Proc Natl Acad Sci U S A. 2002;99:9715-20.
  • aminoacyl-tRNA can be obtained by ligating the 3'-terminal CCA sequence of tRNA without CA and separately prepared aminoacylated pdCpA with RNA ligase (Biochemistry. 1984;23:1468). -73.T4 RNAligase mediated preparation of of novel "chemically misacylated" tRNAPheS.Heckler TG, Chang LH, Zama Y, Naka T, ChorghadeMS, Hecht SM.). There is also aminoacylation by flexizyme, which is a ribozyme that supports active esters of various unnatural amino acids on tRNA (J Am Chem Soc.
  • aminoacylation is also possible by adding to the tRNA the amino acid active ester linked to the PNA complementary to the 3'end of the tRNA (J Am ChemSoc. 2004;126:15984-9. In situ chemical aminoacylation with amino acid thioesters linkedto to a peptide.Nucleic acid.NinomiyaK,MinohataT,NishimuraM,Sisido M.).
  • aminoacyl-tRNA can be produced using the following method. Prepare a template DNA that encodes the desired tRNA sequence and has a T7, T3 or SP6 promoter placed upstream, and synthesizes RNA by transcription using RNA polymerase suitable for the promoter such as T7 RNA polymerase or T3, SP6 RNA polymerase. You can do it. It is also possible to extract and purify tRNA from cells, and to extract the target tRNA produced using a probe having a sequence complementary to the tRNA sequence. At this time, a cell transformed with the target tRNA expression vector can also be used as a source. RNA having a target sequence can also be synthesized by chemical synthesis.
  • an aminoacyl-tRNA can be obtained by ligating the tRNA obtained by removing the CA from the CCA sequence at the 3′ end thus obtained with separately prepared aminoacylated pdCpA or pCpA with RNA ligase (the pdCpA method). , PCpA method).
  • the tRNA is useful in the production of peptide compounds.
  • full-length tRNA is prepared, and aminoacylation with flexizyme, which is a ribozyme supporting various active esters of unnatural amino acids on tRNA, is also possible.
  • naturally occurring ARS or its variants can also be used to make aminoacyl tRNAs.
  • the aminoacyl tRNA once consumed in the translation system can be regenerated by the natural ARS or its modified form. Therefore, it is necessary to make a large amount of aminoacyl tRNA produced in advance in the translation system. Absent. Such ARS variants are described in WO2016/148044. These aminoacyl-tRNA production methods can be combined as appropriate.
  • the cyclic portion of the peptide compound is formed by subjecting a linear peptide compound to a cyclization reaction.
  • the “cyclization reaction” means a reaction for forming a cyclic part at the peptide site of a peptide compound.
  • a peptide compound obtained by further chemically modifying or reacting a peptide compound having a cyclic portion formed by a cyclization reaction is also included in the peptide compound in the present specification. Moreover, you may perform chemical modification etc. before cyclization reaction.
  • Scheme A shows an example of the cyclization reaction of the peptide moiety of the peptide compound in the present specification.
  • a black circle ( ⁇ ) unit main chain unit
  • a D unit aspartic acid unit
  • a triangle ( ⁇ ) unit cyclized N-terminal unit
  • White circles represent resins for solid phase synthesis.
  • the ring portion is a portion composed of one triangular unit, nine black circle units and one D unit. Each unit may be the same amino acid or different amino acids.
  • the cyclic peptide of the present invention can be produced, for example, by the method described in WO 2013/100132.
  • the “unit” means any of an amino acid after synthesis of the chain peptide compound before cyclization, an amino acid after cyclization, and an amino acid at the time of completion of chemical modification after cyclization.
  • the amino acid residue at the time of completion of the chemical modification after the cyclization includes, for example, an amino acid residue chemically or skeleton-converted by the chemical modification after the production of the peptide compound.
  • a peptide compound or a library of nucleic acids encoding them in the present disclosure is a library consisting essentially of the peptide compounds described herein or nucleic acids encoding them, respectively.
  • the libraries herein include libraries containing the peptide compounds herein, and libraries containing nucleic acids encoding the peptide compounds herein.
  • the library in the present specification includes a peptide compound library and a peptide compound-nucleic acid complex library in the present specification. Among them, a cyclic peptide compound or a cyclic peptide-nucleic acid complex library is preferable, and a cyclic peptide-particularly A library of mRNA complexes is preferred.
  • a display library is preferable as the library.
  • Examples of the display library include a library using a display, and among them, an mRNA display library, a DNA display library, and a ribosome display library are preferable, and an mRNA display library is more preferable.
  • the present inventors think as follows. In peptide libraries so far, it has been accidentally relied on to mask the proton donors contained in the side chains of the amino acids that make up the peptide by intramolecular hydrogen bond formation. In particular, in a peptide library in which constituent amino acids are randomly arranged to give diversity, it has been difficult to form hydrogen bonds between amino acids in a targeted manner. In the case of a peptide compound containing an amino acid of the present specification, an amino acid in which a hydrogen bond has already been formed at the proton donor site contained in the side chain of an amino acid is used, and therefore a hydrogen atom in the molecule at the side chain site of the peptide compound The bond can be formed intentionally.
  • the peptide compound library obtained by using the amino acid of the present specification is a peptide compound having a high frequency of appearance of a peptide compound capable of masking a side-chain proton donor by forming a hydrogen bond in the molecule, that is, a peptide compound having high membrane permeability. Can be more likely to be included.
  • a peptide compound may be a “peptide compound encoded by a nucleic acid”.
  • the term "peptide compound encoded by a nucleic acid” is not limited to a peptide compound directly synthesized by translating the nucleic acid as a template, but includes a peptide compound that can be synthesized by post-translational modification. There is.
  • the cyclic peptide compound may be referred to as a cyclic peptide compound encoded by the nucleic acid. ..
  • a peptide compound that is translationally synthesized using a nucleic acid as a template, or a complex of the peptide compound that has been post-translationally modified with the nucleic acid is also encoded by the nucleic acid. Included in (cyclic) peptide compounds.
  • the number of unnatural amino acids, N-substituted amino acids, or amino acids having an aromatic ring contained in the peptide compound contained in the library or the peptide compound encoded by the nucleic acid contained in the library is used.
  • the average can be adjusted by the appearance frequency of the codon assigned to the amino acid when the DNA library is synthesized. For example, in a library of peptides containing variable positions of 10 amino acid residues, assuming that the amino acids are selected from 20 kinds, by setting 10 kinds of N-substituted amino acids in the 20 kinds, the codon unit of the N-substituted amino acids can be obtained. Can be synthesized so that each variable point occupies 10/20 (50%). In this way, the average of the ratio of the number of unnatural amino acids, the number of N-substituted amino acids, the number of aromatic rings, or the number of amino acids having an aromatic ring in the present specification may be calculated.
  • the phrase “consisting essentially of” means the theory of variations of the peptide compounds contained in the library and/or the nucleic acids encoding them.
  • the ratio of the theoretical number of variations of the listed peptide compounds and/or nucleic acids encoding them to the above total number is 90% or more, 93% or more, 95% or more, 97% or more, 98% Or more, or 99% or more, but not limited to these.
  • a codon table in which one set of codon units corresponds to one type of amino acid is used, and a peptide having 11 residues is selected from a base sequence in which the codon units are randomly arranged.
  • the theoretical number of variations is 20 10 .
  • the library herein comprises peptide compounds, and/or nucleic acids encoding them, as well as other components necessary for screening peptide compounds capable of specifically binding to a target molecule. You can stay. Further, other components may be contained within a range not negatively affecting the effect of the library in the present specification.
  • the library in the present specification includes a plurality of peptide compounds or nucleic acids encoding them.
  • the number of variations (types) of peptide compounds contained in the library is called “diversity”.
  • the diversity of the peptide compounds contained in the library in the present specification, or the nucleic acids encoding these is not particularly limited, but 10 3 or more, 10 4 or more, 10 5 or more, 10 6 or more, 10 7 or more, 10 8 or more, Examples include 10 9 or more, 10 10 or more, 10 11 or more, and 10 12 or more. These varieties are not limited to actually measured values and may be theoretical values.
  • the average molecular weight of the peptide portion other than the nucleic acid junction of the peptide compound contained in the library or encoded by the nucleic acid contained in the library, or the molecular weight of the cyclic portion of the cyclic peptide compound is used. May average from 500 to 2000.
  • a display library is a library in which a phenotypic peptide is associated with an RNA or a DNA encoding the genotypic peptide.
  • This library can be used to identify peptide compounds that can specifically bind to a target molecule. For example, by contacting the library with a desired fixed target and washing away molecules that do not bind to the target, it is possible to concentrate the peptide that binds to the target (panning method). The sequence of the peptide bound to the target can be clarified by analyzing the genetic information associated with the selected peptide through such a process.
  • a method utilizing the fact that the antibiotic puromycin, which is an analog of aminoacyl-tRNA, is nonspecifically linked to a protein during mRNA translation elongation by the ribosome is mRNA display (Proc Natl Acad Sci USA. 1997;94:12297- 302.RNA-peptide fusions for the in vitro selection of peptides and proteins.Roberts RW, Szostak JW.) or in vitro virus (FEBS Lett. 1997;414:405-8.
  • In vitro virus bonding of mRNA bearing puromycin at the 3'-terminal end to the C-terminal end of its encoded protein on the ribosome in vitro. Nemoto N, Miyamoto-Sato E, Husimi Y, Yanagawa H.).
  • a spacer such as puromycin is bound to the 3'end of a library of mRNA obtained by transcription from a DNA library containing a promoter such as T7 promoter, and the mRNA is translated into a protein in a cell-free translation system, puromycin becomes a ribosome. Is mistakenly taken as an amino acid into a protein and linked to the mRNA and the protein encoded by the mRNA, resulting in a library in which the mRNA and its product are associated with each other. Since this process does not involve transformation of E. coli and the like, high efficiency is realized and a large-scale display library can be constructed.
  • the sequence of the bound protein can be clarified by synthesizing cDNA from mRNA, which is a tag containing gene information of the molecule selected and enriched by panning, PCR-amplified, and analyzing the nucleotide sequence.
  • a display library utilizing a cell-free translation system is a cDNA display library (Nucleic Acids Res. 2009; 37, which is a library consisting of a cDNA encoding a peptide in which a peptide-puromycin complex is bound).
  • CISdisplay Invitro selection of peptides from libraries of protein-DNA complexes. Odegrip R, Coomber D, Eldridge B, HedererR, Kuhlman PA, Ullman C, FitzGerald K, McGregor.D. In addition, in vitro compartmentalization (Nat Biotechnol. 1998;16:652-6. Man- made cell-like compartmentsfor molecular evolution.Tawfik DS, Griffiths AD.) are also known. The above method can be appropriately used by using a known method.
  • Nucleic acid library The "nucleic acid” in the present invention can also include deoxyribonucleic acid (DNA), ribonucleic acid (RNA), or a nucleotide derivative having an artificial base. It may also include peptide nucleic acid (PNA).
  • the nucleic acid of the present invention may be any of these nucleic acids or a hybrid thereof as long as the desired genetic information is retained. That is, a chimeric nucleic acid in which different nucleic acids such as a DNA-RNA hybrid nucleotide and DNA and RNA are linked in a single strand is also included in the nucleic acid of the present invention.
  • a nucleic acid library can be obtained by synthesizing bases at positions where amino acid residues are not fixed on the peptide sequence. For example, for a DNA library, A, T, G, C, and for an RNA library, each of A, U, G, and C is a multiple of 3 repeated 4 nucleotides (N).
  • the third letter is synthesized as a mixture of two bases such as N, the third letter is W, M, K, S, etc., and if the number of introduced amino acids is 16 or less, the third letter should be one type of base. There is also a way to do it.
  • the appearance frequency of amino acid residues can be freely adjusted by preparing codon units corresponding to the three letters of the codon, mixing them at an arbitrary ratio and using them for synthesis.
  • nucleic acid libraries can be translated using a cell-free translation system.
  • a sequence encoding a spacer downstream of the target nucleic acid examples include, but are not limited to, sequences including glycine and serine.
  • a linker formed of RNA, DNA, a polymer of hexaethylene glycol (spc18) (for example, 5 polymers) is included between the nucleic acid library and a compound that is incorporated into a peptide during translation by the ribosome, such as puromycin or a derivative thereof.
  • spc18 hexaethylene glycol
  • the library according to the present disclosure can be produced according to the above-described method for producing a peptide compound according to the present disclosure, and can be appropriately combined with a known method.
  • the cell-free translation system of the present disclosure described above can be used to produce a library of peptide compounds of the present disclosure. That is, the method for producing a library according to the present disclosure may include a step of synthesizing a peptide compound using the cell-free translation system according to the present disclosure.
  • the exemplification, the preferred range, and the aspect described in the cell-free translation system of the present disclosure can be directly applied to the method for producing a library of the present disclosure.
  • the mRNA display library can be produced as follows in a non-limiting aspect. First, a library of DNA in which a desired sequence is arranged downstream of a promoter such as T7 promoter is chemically synthesized, and this is used as a template to form a double-stranded DNA by a primer extension reaction. Using this as a template, RNA polymerase such as T7 RNA polymerase is used to transcribe it into mRNA. A linker (spacer) in which an antibiotic puromycin or the like which is an analog of aminoacyl-tRNA is connected to the 3'end of this RNA is bound.
  • a promoter such as T7 promoter
  • the library in the present disclosure is a peptide compound containing a peptide compound containing at least one, two or more, or three or more amino acids selected from the group consisting of the amino acids described herein. It may be a library.
  • a method for producing such a library may include a step of translationally synthesizing a peptide compound in a cell-free translation system including the following (i) and (ii): (i) tRNA having at least one, two or more, or three or more amino acids selected from the group consisting of the amino acids described in the present specification; (ii) a nucleic acid library encoding the peptide compound library,
  • the nucleic acid library may include a nucleic acid containing at least one codon corresponding to the anticodon of the tRNA.
  • the reaction solvent used for peptide synthesis and solid phase synthesis was used for peptide synthesis (purchased from Watanabe Kagaku and Wako Pure Chemical Industries). For example, DCM, DMF, NMP, 2% DBU in DMF, 20% piperidine in DMF and the like. Further, in the reaction in which water was not added as a solvent, a dehydrated solvent, a super dehydrated solvent, or an anhydrous solvent (purchased from Kanto Kagaku, Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) was used.
  • the LC/MS analysis conditions are as follows.
  • Example 1 Chemical Synthesis of Peptide Compound According to the peptide synthesis method by the Fmoc method described in WO2013/100132, the peptide was extended according to the following basic route. That is, 1) the carboxylic acid of the Asp side chain was carried on 2-chlorotrityl resin, but the peptide extension reaction by the Fmoc method from the N terminus of Asp was performed, 2) the process of excising the peptide from 2-chlorotrityl resin, 3 ) Amide cyclization by condensation of the carboxylic acid of the Asp side chain generated outside the 2-chlorotrityl resin by the excision process and the amino group at the N-terminal (triangle unit) of the peptide chain, 4) side chain function contained in the peptide chain It is a 5-step process including deprotection of the protecting group of the group, 5) purification of the compound by prepparative HPLC.
  • Fmoc-nPrGly-OH, Fmoc-MePhe(3-Cl)-OH, Fmoc-MeAla(4-Thz)-OH and the like were synthesized by the method described in WO2013/100132.
  • Fmoc-Thr(THP)-OH (Compound aa01), Fmoc-nBuGly-OH (Compound aa02), Fmoc-Ser(iPen)-OH (Compound aa04), Fmoc-MeHph-OH (Compound aa05), Fmoc- Ser(3-F-5-Me-Pyr)-OH (Compound aa12), Fmoc-Ser(Ph-3-Cl)-OH (Compound aa16), Fmoc-Nle(6-OTHP)-OH (Compound aa17) , Fmoc-Ser(EtOTHP)-OH (Compound aa22), Fmoc-MeSer(EtOTHP)-OH (Compound aa27), Fmoc-Ser(S-2-PrOTHP)-OH (Compound aa34), Fmoc-MeSer(S-).
  • BuOTHP -OH (Compound aa64), Fmoc-Hnl(7-F3-6-OH)-OH (Compound aa68), Fmoc-Ser(1-CF3-EtOH)-OH (Compound aa70), Fmoc-MeSer(1).
  • a sequence containing an amino acid having a tertiary alcohol in the side chain for example, Ser(tBuOH), MeSer(tBuOH), Ser(2-Me-2-BuOH), MeSer(2-Me-2-BuOH), etc.
  • the peptide was extended without any problem even if an Fmoc amino acid in which the tertiary alcohol portion of the side chain was not protected with THP was used (eg, Fmoc-Ser(tBuOH)-OH (compound aa53), Fmoc-Ser(2-Me-2). -BuOH)-OH (compound aa61) was used).
  • An amino acid having a structure in which the side chain is a secondary alcohol and the carbon to which the alcohol is bonded has a CF3 group bonded thereto eg, Hnl(7-F3-6-OH), Ser(1-CF3-EtOH) ) Etc.
  • the peptide was extended (eg, Fmoc-Hnl(7-F3-6-OH)-OH) without any problem even if an Fmoc amino acid that does not protect the side chain secondary alcohol site with THP was used.
  • Compound aa68 Fmoc-Ser(1-CF3-EtOH)-OH (Compound aa70) and the like were used).
  • a saturated aqueous sodium chloride solution (30 mL) was added to wash the organic layer, and the aqueous layer was extracted with ethyl acetate (30 mL). All the obtained organic layers were mixed, and this was further washed twice with a saturated aqueous sodium chloride solution (30 mL). The organic layer was dried over sodium sulfate, and the solvent was evaporated under reduced pressure to give a crude product (9.3 g). Of the obtained crude product, 4.65 g was dissolved in tetrahydrofuran (THF) (30 mL), and then 1.0 M phosphate buffer (30 mL) adjusted to pH 8.0 was added. The mixture was stirred at 50 degrees for 4 hours.
  • THF tetrahydrofuran
  • N-(tert-butoxycarbonyl)-O-isopentyl-L-serine (Boc-Ser(iPen)-OH) (183 g). ..
  • the obtained N-(tert-butoxycarbonyl)-O-isopentyl-L-serine (Boc-Ser(iPen)-OH) (175 g) was dissolved in 1,4-dioxane (500 mL), and concentrated hydrochloric acid ( (300 mL) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 16 hours.
  • the reaction mixture was concentrated under reduced pressure, the obtained crude product (122 g) was dissolved in 1,4-dioxane/water (1000 mL/1000 mL), potassium carbonate (239 g, 1.73 mol) and N- (9-Fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide (Fmoc-OSu) (234 g, 694.36 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 16 hours. Then, the reaction solution was washed with hexane three times. After washing, a hydrochloric acid aqueous solution (6M) was added to adjust the pH of the aqueous layer to 2 to 3, and the mixture was extracted twice with ethyl acetate.
  • 1,4-dioxane/water 1000 mL/1000 mL
  • potassium carbonate 239 g, 1.73 mol
  • N- (9-Fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide Fm
  • Triethylsilane (Et 3 SiH) and trifluoroacetic acid (TFA) (700 mL) were added, and the mixture was stirred at 25° C. for 16 hr.
  • the reaction mixture was concentrated under reduced pressure, aqueous potassium carbonate solution was added to the obtained residue, and the mixture was washed with petroleum ether.
  • reaction solution was cooled to ⁇ 60° C. or lower, and a THF solution of LiAlH 4 (lithium aluminum hydride) (2.5 M, 40 mL, 100 mmol) was added to the reaction solution ⁇ 20.
  • LiAlH 4 lithium aluminum hydride
  • the solution was added dropwise over 5 minutes so that the temperature did not exceed °C.
  • the reaction solution was stirred at ⁇ 78° C. for 3 hours, and ethyl acetate (69 mL) was added so that the reaction solution did not exceed ⁇ 20° C.
  • the mixture was further stirred for 1 hour using an ice bath, water (18 mL) was added, and the mixture was stirred for 15 minutes at room temperature.
  • reaction solution was stirred at room temperature for another hour, and water (125 mL) was added.
  • the obtained mixed liquid was washed with t-butyl methyl ether (TBME), and the organic layer was extracted with water.
  • TBME t-butyl methyl ether
  • the obtained organic layers were combined, washed three times with a solution obtained by diluting saturated saline twice, and then washed twice with saturated saline.
  • N-succinimidyl carbonate 9-fluorenylmethyl carbonate (Fmoc-OSu) (7.86 g, 23.3 mmol) was added to the reaction solution at room temperature, and the mixture was stirred at room temperature.
  • water (56.2 mL) was added to the reaction solution at room temperature, and the mixture was washed twice with a 25% t-butyl methyl ether (MTBE)/hexane solution.
  • MTBE 25% t-butyl methyl ether
  • the obtained residue was dissolved in tetrahydrofuran (15 mL), dihydropyran (5.41 mL, 56.8 mmol) was added, and the mixture was stirred at 50°C for 1 hr. Ethyl acetate was added to the reaction solution at room temperature, and the organic layer was washed twice with saturated saline, then, the obtained organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure. The obtained residue was dissolved in tetrahydrofuran (30 mL), phosphate buffer (30 mL) with pH adjusted to 8 was added, and the mixture was stirred at 50° C. for 3 hours.
  • the reaction solution was extracted twice with ethyl acetate at room temperature, the obtained organic layer was washed with saturated brine, the organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
  • the obtained residue was dissolved in diethyl ether (50 mL), heptane (50 mL) was added thereto to precipitate a crude product, which was concentrated under reduced pressure to remove diethyl ether, and the remaining supernatant solution was added. It was removed by decantation. A crude product was obtained by repeating this operation twice.
  • the obtained crude product was dissolved in tert-butyl methyl ether (150 mL), 0.05M phosphoric acid aqueous solution (150 mL) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hr. The organic layer was collected, and the aqueous layer was extracted with ethyl acetate.
  • Triethylsilane (24.4 g, 210 mmol) and trifluoroacetic acid (450 mL) were added to the solution (450 mL), and the mixture was stirred at room temperature for 48 hours.
  • the reaction solution was evaporated under reduced pressure, dried under reduced pressure using a vacuum pump, redissolved in an aqueous potassium carbonate solution, washed with diethyl ether, and concentrated hydrochloric acid was added until pH 2 was reached. Extracted.
  • reaction solution was evaporated under reduced pressure, further dried under reduced pressure with a vacuum pump, redissolved in an aqueous potassium carbonate solution, washed with diethyl ether, and concentrated hydrochloric acid was added until pH 2 was reached. Extracted. The obtained organic layers were mixed and dried over anhydrous sodium sulfate, the solvent was evaporated under reduced pressure, and the residue was dried under reduced pressure with a vacuum pump to give N-((benzyloxy)carbonyl)-O-((S)-2.
  • Methyl N-((benzyloxy)carbonyl)-O-((R)-2-(benzyloxy)propyl)-L-serinate (Compound aa42, Cbz-Ser(R-2-PrOBn)-OMe)( A solution of 25.0 g, 62.3 mmol) in 2-propanol/tetrahydrofuran (1.50 L/150 mL) was added at room temperature, and the mixture was stirred for 5 hours. A 2M aqueous hydrochloric acid solution was added until the pH reached 2, the organic layer was removed, and the aqueous layer was extracted 3 times with ethyl acetate.
  • the pH of the aqueous layer was adjusted to 1 by adding a 2 M aqueous hydrochloric acid solution (26.9 mL, 53.8 mmol) to the aqueous layer, and then extracted with t-butyl methyl ether (60 mL) three times.
  • the organic layer is dried over anhydrous magnesium sulfate, filtered, and t-butyl methyl ether is concentrated under reduced pressure.
  • the residue obtained is purified by reverse phase column chromatography (0.1% formic acid aqueous solution/0.1 formic acid acetonitrile solution).
  • the obtained residue was dissolved in tetrahydrofuran (24.0 mL), 1.0 M phosphate buffer (24.0 mL) adjusted to pH 6.8 was added, and the mixture was stirred at 50° C. for 3 hr.
  • the reaction solution was diluted with ethyl acetate (45 mL), washed with saturated brine (45 mL) three times, and the organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate.
  • a toluene/methanol (90 mL/60 mL) solution was added to the residue obtained by concentrating the reaction solution under reduced pressure using a rotary evaporator, and after dissolving it, a 2M (trimethylsilyl)diazomethane/hexane solution (24.26) was added. (mL, 48.5 mmol) was added dropwise at room temperature, and the mixture was stirred for 6 hours.
  • the reaction solution was concentrated under reduced pressure using a rotary evaporator to give a crude product of methyl (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-6-hydroxyhexanoate (Boc-Nle(6-OH)- OMe) (13 g) was obtained.
  • reaction solution was concentrated under reduced pressure with a rotary evaporator to remove tetrahydrofuran, ethyl acetate and a 1N aqueous hydrochloric acid solution were added, and the mixture was extracted twice with ethyl acetate. The organic layer was washed with saturated brine, dried over anhydrous magnesium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
  • the obtained residue was purified by reverse phase column chromatography (0.1% formic acid aqueous solution/0.1% formic acid acetonitrile solution) and normal phase column chromatography (dichloromethane/methanol), and then further reverse phase column chromatography ( Fractions obtained by purification with 10 mM ammonium acetate aqueous solution/methanol) were collected, methanol was evaporated under reduced pressure, extraction was performed twice with ethyl acetate, and the extract was washed with saturated potassium hydrogen sulfate solution and saturated saline.
  • the obtained residue was dissolved in dichloromethane (60 mL) and heptane (60 mL), and dichloromethane was concentrated under reduced pressure to precipitate an oily crude product.
  • the heptane solution was removed by decantation. This operation was repeated twice.
  • the obtained crude product was dissolved in ethyl acetate and washed twice with a 0.05 M phosphoric acid aqueous solution and once with a saturated saline solution.
  • N,N-diisopropylethylamine (DIPEA) 127 mL
  • DIPEA 9H-fluoren-9-yl)methyl carbonochloride
  • Fmoc-Cl 9H-fluoren-9-ylmethyl carbonochloride
  • 1,4-dioxane solution 145 mL was added dropwise, and the reaction mixture was stirred at 0° C. for 1 hr 30 min.
  • the solvent of the reaction solution was evaporated under reduced pressure, diluted with ethyl acetate, and then washed twice with water and a saturated aqueous solution of ammonium chloride and twice with a saturated saline solution.
  • N-ethyl-isopropylpropan-2-amine DIPEA
  • DIPEA N-ethyl-isopropylpropan-2-amine
  • DIPEA 1,4-dioxane
  • DIPEA N-ethyl-isopropylpropan-2-amine
  • Succinimide Fmoc-OSu (22.3 g, 231 mmol) was added, and the mixture was stirred at 25° C. for 16 hours.
  • boron trifluoride diethyl ether complex (BF 3 ⁇ OEt 2 ) (0.580 mL, 4.57 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 24 hours.
  • a saturated aqueous ammonium chloride solution was added to the reaction solution, the mixture was stirred at room temperature for 40 minutes, and then extracted twice with dichloromethane (DCM).
  • DCM dichloromethane
  • the reaction solution was added to a mixed solution of ethyl acetate (300 mL), water (60 mL) and 1N aqueous hydrochloric acid solution (4.8 mL), and the obtained organic layer was evaporated under reduced pressure to obtain a crude product.
  • the above two crude products were combined and purified by reverse phase column chromatography (0.1% formic acid aqueous solution/0.1% formic acid acetonitrile solution) to give O-(2-(methylamino)-2-oxoethyl).
  • -N-Trityl-L-serine (Trt-Ser(NMe-Aca)-OH) (2.5 g) was obtained.
  • N-Ethyl-N-isopropylpropan-2-amine (DIPEA) (2.231 mL, 12.77 mmol) in 1,4-dioxane (14.0 mL) was added at room temperature, and then N- (9-Fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide (Fmoc-OSu) (1.723 g, 5.11 mmol) was added at room temperature, and the mixture was stirred for 30 minutes.
  • the reaction solution was added to a mixed solution of ethyl acetate (150 mL), water (30 mL) and 1N hydrochloric acid aqueous solution (3.0 mL), and the obtained organic layer was evaporated under reduced pressure.
  • a tetrahydrofuran solution (134 mL) of 762 mmol) was added at room temperature and stirred for 5 hours.
  • a 6N aqueous hydrochloric acid solution was added to the reaction solution until the pH reached 3, the organic solvent was removed under reduced pressure, and the aqueous layer was extracted with ethyl acetate.
  • N-(9-Fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide (Fmoc-OSu) (388 mg, 1.15 mmol) was added again to the reaction solution at 0° C., and the mixture was stirred for 40 minutes.
  • Water and t-butyl methyl ether (TBME) were added to the reaction solution, the obtained aqueous layer was acidified with a 1N aqueous hydrochloric acid solution, and extracted three times with ethyl acetate. The obtained organic layers were combined, washed with saturated brine, dried over anhydrous magnesium sulfate and filtered, and then the solvent was evaporated under reduced pressure.
  • TMS diazomethane 2-methylsilyldiazomethane (2.62 mL, 5.23 mmol) was again added dropwise to the reaction solution at 0 degrees, and then 2.0M trimethylsilyldiazomethane (TMS diazomethane) was added in hexane.
  • the solution (3.93 mL, 7.85 mmol) was further added dropwise at 0°C.
  • the reaction was stopped by adding acetic acid (2.0 mL), 50% saturated aqueous sodium hydrogen carbonate solution and ethyl acetate were added, and the mixture was washed with ethyl acetate.
  • a diethyl ether solution of diazomethane separately prepared was added dropwise to the reaction solution while cooling using an ice bath prepared with ice and sodium chloride, and the mixture was stirred for 30 minutes.
  • Acetic acid (0.88 mL, 15.37 mmol) was added to the reaction mixture, the mixture was stirred for 10 minutes, ethyl acetate and water were added, the mixture was extracted with ethyl acetate, and the obtained organic layer was washed with saturated brine, It was dried over anhydrous sodium sulfate and filtered.
  • Diazomethane Diethyl Ether Solution 1-Methyl-3-nitro-1-nitrosoguanidine (5.0 g, purchased from Tokyo Kasei or Fuji Film Wako Pure Chemical Industries) containing about 50% water was added with diethyl ether (17. 0 mL) was added, and a 50% aqueous potassium hydroxide solution (9.5 mL) was added dropwise at 0°C. After stirring the reaction solution for 1 hour, the yellow diethyl ether layer was separated using a Pasteur with a tanned tip, and the obtained solution was used as it was in the above reaction.
  • the obtained organic layer was washed with saturated saline, dried over anhydrous sodium sulfate, and filtered.
  • Water 50 mL was added to the reaction solution, and the mixture was extracted with t-butyl methyl ether/hexane (40 mL/10 mL).
  • the obtained organic layer was washed with saturated saline, dried over anhydrous sodium sulfate, and filtered.
  • methyltriphenylphosphonium bromide 562 mg, 1.57 mmol
  • diethyl ether solution 3.57 mmol
  • potassium 2-methylpropane-2-olate tBuOK
  • 0.57 mmol was added and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours.
  • a separately prepared aldehyde intermediate (185 mg, 0.786 mmol) in diethyl ether (0.79 mL) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour.
  • a 10% aqueous ammonium chloride solution was added to the reaction solution, followed by extraction with ethyl acetate, and the obtained organic layer was washed with water.
  • Second generation Hoveyda-Grubbs catalyst (0.94 g, 1.50 mmol) was added to the solution and stirred at 60° C. overnight. After cooling to room temperature, it was filtered through Celite, and the filtrate was concentrated under reduced pressure. The obtained residue was purified by reverse phase silica gel column chromatography (0.1% formic acid aqueous solution/0.1% formic acid acetonitrile solution) to obtain a crude product (7.58 g).
  • the obtained crude product (7.58 g) was dissolved in methanol (186 mL), 10% palladium carbon (1.6 g) was added, and the mixture was stirred under a hydrogen atmosphere at room temperature for 2 days.
  • the reaction solution was filtered through Celite, and the filtrate was concentrated under reduced pressure.
  • the obtained residue was dissolved in methanol (34.9 mL), saturated aqueous sodium hydrogen carbonate solution (34.9 mL), N-(9-fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide (Fmoc-OSu) (7.07). g, 20.95 mmol) was added and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours.
  • the insoluble material was filtered off, the filtrate was acidified with a 1M aqueous hydrochloric acid solution, and then extracted with ethyl acetate. The organic layer was washed with saturated brine, dried over anhydrous magnesium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
  • Tetrahydrofuran (THF) of (S)-4,4-difluoropyrrolidine-1,2-dicarboxylic acid 2-methyl 1-allyl (compound aa123) (6.81 g, 27.3 mmol) obtained as described above
  • a lithium borohydride/tetrahydrofuran (THF) solution (10.24 mL, 41.0 mmol) was added dropwise to the solution (82.0 mL) at 0° C., and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours.
  • lithium hydroxide monohydrate (1.89 g, 44.9 mmol) was added at room temperature to an aqueous solution (46.8 mL) of calcium chloride (18.7 g, 168 mmol), and at room temperature. Stir for 5 minutes.
  • (2S,4R)-1-((benzyloxy)carbonyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxylic acid (Cbz-Hyp-OH) (12.0 g, 45 at ⁇ 10° C.
  • Step 1 Methyl 3-((2-(tert-butoxy)-2-oxoethyl)amino)propanoate (31.0) prepared by the method described in the literature (Journal of Medicinal Chemistry (1991), 34(4), 1297-1301). g, 142.683 mmol) and N-(9-fluorenylmethoxycarbonyloxy)succinimide (Fmoc-OSu) (48.13 g, 142.683 mmol) in 1,4-dioxane solution (200 mL) was carbonated. An aqueous solution (200 mL) of sodium (30.25 g, 285.366 mmol) was added at room temperature, and the mixture was stirred for 16 hours.
  • Step 2 After adding water (250 mL) and isopropanol (1000 mL) to calcium chloride (84.54 g, 761.761 mmol) and lithium hydroxide monohydrate (8.52 g, 203.136 mmol), The above crude product methyl 3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(2-(tert-butoxy)-2-oxoethyl)amino)propanoate (62 g, 50.784) A tetrahydrofuran solution (250 mL) of (mmol) was added at 0° C., and the mixture was stirred for 16 hours.
  • Step 3 Under a nitrogen atmosphere, the above crude product 3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(2-(tert-butoxy)-2-oxoethyl)amino)propanoic acid (14 g, 32.904 mmol), N-hydroxyphthalimide (5.90 g, 36.194 mmol), N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (DCC) (7.47 g, 36.194 mmol) in tetrahydrofuran (140 mL) was stirred at room temperature for 16 hours.
  • N-hydroxyphthalimide 5.90 g, 36.194 mmol
  • DCC N,N'-dicyclohexylcarbodiimide
  • Step 4 Under a nitrogen atmosphere, trihydrate nickel bromide (II) (NiBr 2 ⁇ 3H 2 O) (5.73 g, 21.031mmol) and 4,4'-di -tert- butyl-2,2'- A solution of bipyridyl (dtbbpy) (5.64 g, 21.031 mmol) in dimethylacetamide (DMA) (200 mL) was stirred at 50° C. for 3 hours and then cooled to room temperature to obtain a nickel catalyst solution. Under a nitrogen atmosphere, zinc powder (22.93 g, 350.509 mmol), crude product 3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(2) obtained as described above.
  • II trihydrate nickel bromide
  • DMA dimethylacetamide
  • Step 5 The above tert-butyl N-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-N-(3-methoxy-4-(methylcarbamoyl)phenethyl)glycinate (14.0 g, 25.705 mmol) 4N hydrochloric acid/1,4-dioxane solution (65 mL) was stirred at room temperature for 48 hours. The reaction mixture was concentrated under reduced pressure, and the obtained residue was purified by reverse phase column chromatography (water/acetonitrile) to give N-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-N.
  • Step 1 Commercially available (S)-4-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-5-(tert-butoxy)-5-oxopentanoic acid (Fmoc-Glu-OtBu) under nitrogen atmosphere.
  • Step 2 Under a nitrogen atmosphere, nickel (II) bromide trihydrate (NiBr 2 .3H 2 O) (141 mg, 0.526 mmol) and 4,4′-di-tert-butyl-2,2′-bipyridyl were used.
  • a dimethylacetamide (DMA) solution (5 mL) of (dtbbpy) (140 mg, 0.526 mmol) was stirred at 50° C. for 3 hours and then cooled to room temperature to obtain a nickel catalyst solution.
  • DMA dimethylacetamide
  • Zinc powder (617 mg, 8.75 mmol) under a nitrogen atmosphere, (((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-L-glutamic acid 5-(1,3-di) obtained as described above.
  • DMA dimethylacetamide
  • Step 3 (S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-(3-methoxy-4-(methylcarbamoyl)phenyl)butanoic acid tert obtained as described above -Chlorotrimethylsilane (TMS-Cl) (1.80 g, 16.568 mmol) was added to a trifluoroethanol (TFE) solution (30 mL) of butyl (3.00 g, 5.508 mmol) at room temperature. Stir for 3 hours.
  • TFE trifluoroethanol
  • Aqueous ammonium chloride solution was added to the reaction solution, the mixture was extracted twice with ethyl acetate, and the obtained organic layer was concentrated under reduced pressure.
  • An aqueous solution of sodium hydrogen carbonate was added to the residue to dissolve it, and the mixture was washed 3 times with hexane/ethyl acetate (5/1).
  • the organic layer was washed with water and saturated brine, dried over anhydrous sodium sulfate and filtered, and the filtrate was concentrated under reduced pressure.
  • (2S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-(4-(methyl((tetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)carbamoyl)phenyl) Propanic acid compound aa139, Fmoc-Phe(4-CONMeOTHP)-OH
  • (2S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-(3-methoxy- 4-(((tetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)carbamoyl)phenyl)propanoic acid compound aa140, Fmoc-Phe(3-OMe-4-CONHOTHP)-OH was synthesized according to the following scheme.
  • Zinc powder (17.13 g, 261.856 mmol) under nitrogen atmosphere, (((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-L-aspartic acid 1-methyl 4-(synthesized as above. 1,3-dioxoisoindoline-2-yl) (26.94 g, 52.371 mmol), tert-butyl 4-iodo-2-methoxybenzoate (35 as the crude product synthesized as described above).
  • Step 1 Under a nitrogen atmosphere, an aqueous solution (100 mL) of commercially available (S)-morpholine-3-carboxylic acid (CAS. No. 741288-31-3) (14.0 g, 107 mmol) was added at room temperature to sodium hydrogen carbonate ( 20.26 g, 241.172 mmol) was added. A 1,4-dioxane solution (100 mL) of allyl chloroformate (Alloc-Cl) (17.44 g, 120.53 mmol) was added dropwise to the reaction solution at room temperature, and the mixture was stirred for 2 hours. Water was added to the reaction solution, followed by extraction with ethyl acetate.
  • Step 2 A solution of 3-methyl-4-allyl (S)-morpholine-3,4-dicarboxylate (19.5 g, 85.067 mmol) obtained as described above in a tetrahydrofuran (THF) solution (283 mL) was added at 0 degree. Lithium borohydride (5.56 g, 255.233)/tetrahydrofuran (THF) solution was added dropwise, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Water and a 2N hydrochloric acid aqueous solution were added to the reaction solution at 0° C., followed by extraction with ethyl acetate.
  • THF tetrahydrofuran
  • Step 3 In a nitrogen atmosphere, (S) was synthesized by the above-mentioned allyl (R)-3-(hydroxymethyl)morpholine-4-carboxylate (7.0 g, 34.8 mmol) and the method described in the patent (WO2015/179823).
  • -Aziridin-1,2-dicarboxylic acid 2-methyl-1-((9H-fluoren-9-yl)methyl) (7.50 g, 23.2 mmol) in dichloromethane solution (47 mL) at 0°C.
  • a dichloromethane solution of boron fluoride-ethyl ether complex (1.48 g, 10.45 mmol) was added dropwise, and the mixture was stirred for 2 hours.
  • Step 4 Under a nitrogen atmosphere, lithium hydroxide monohydrate (0.91 g, 37.999 mmol) was added at room temperature to an aqueous solution (50 mL) of calcium chloride (15.87 g, 142.974 mmol), and at room temperature. Stir for 10 minutes.
  • Resin synthesis used for peptide synthesis by peptide synthesizer was synthesized as follows. 2-Chlorotrityl chloride resin (100-200 mesh, 1% DVB) was purchased from Watanabe Chemical Industry and Chem-Impex.
  • the polymer or resin portion when a polymer or resin and a compound are bound to each other, the polymer or resin portion may be indicated by a circle.
  • the reaction site of the resin site it may be connected to a circle to indicate the chemical structure of the reaction site.
  • the 2-chlorotrityl group on the resin is bonded to the side chain carboxylic acid of Asp via an ester bond. It shows how they are doing.
  • a 5% aqueous sodium hydrogen carbonate solution was added to the reaction solution, and the mixture was washed twice with t-butyl methyl ether (TBME).
  • TBME t-butyl methyl ether
  • the pH of the obtained aqueous layer was acidified with a 6 M aqueous hydrochloric acid solution and then extracted with ethyl acetate.
  • the obtained organic layer was washed twice with 50% saline, dried over anhydrous magnesium sulfate, and the obtained mixture was filtered and concentrated under reduced pressure.
  • Peptide solid phase synthesis by an automatic synthesizer was performed by Fmoc method using a peptide synthesizer (Multipep RS; manufactured by Intavis) by the method described in WO2013/100132. The detailed procedure of the operation was according to the manual attached to the synthesizer.
  • 2-Chlorotritylresin eg (S)-3-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)carbonyl having a side chain carboxylic acid moiety of aspartic acid with N-terminal Fmoc protected attached to the synthesizer )Amino)-4-oxo-4-(piperidin-1-yl)butanoic acid-2-chlorotrityl resin (compound pd01, Fmoc-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pip))(1 100 mg per column), various Fmoc-amino acids (0.6 mol/L) and 1-hydroxy-7-azabenzotriazole (HOAt) or oxyma (0.375 mol/L) N-methyl-2-pyrrolidone A (NMP) solution and a N,N-dimethylformamide (DMF) solution of diisopropylcarbodiimide (DIC)
  • Fmoc-Thr(THP)-OH (compound aa01) is made to coexist with oxyma in an NMP solution, and molecular sieves 4A1/8 (Wako Pure Chemical Industries) or molecular sieves 4A1/16 (Wako Pure Chemical Industries) is added to set. did.
  • molecular sieves 4A1/8 (Wako Pure Chemical Industries) or molecular sieves 4A1/16 (Wako Pure Chemical Industries) is added to set.
  • an amino acid having a THP group as a protecting group of the amino acid side chain eg, Fmoc-Ser(EtOTHP)-OH (Compound aa22) is also oxyma in NMP solution.
  • a peptide containing an amino acid having an Alloc group in its side chain is Zinc chloride (1.0 equivalent to the number of moles on the resin used), tetrakis(triphenylphosphine)palladium(0)(Pd(PPh 3 ) 4 ) (based on the number of moles on the resin used) 1.0 equivalent), poly(methylhydrosiloxane) (PMHS, CAS#63148-57-2) (0.9 M relative to the number of moles on the resin used), tetrahydrofuran (number of moles on the resin used) 0.1 M) was used to deprotect the Alloc group by stirring at room temperature for 3 hours and 30 minutes or more, and then 0.05 M tetramethylammonium hydrogensulfate/1,1M prepared in the reaction solution was prepared.
  • Zinc chloride 1.0 equivalent to the number of moles on the resin used
  • tetrakis(triphenylphosphine)palladium(0)(Pd(PPh 3 ) 4 )
  • HFIP 1,3,3,3-hexafluoroisopropyl alcohol
  • TIPS triisopropylsilane
  • DIPEA diisopropylethylamine
  • TMDS tetramethyldisiloxane
  • Example 2 Evaluation of membrane permeability of an amino acid having a donor in the side chain and an intramolecular hydrogen bond in the donor moiety 2-1
  • Membrane permeability comparison of amino acids having a donor in the side chain and those not having an intramolecular hydrogen bond in the donor moiety There are amino acids having a donor in the side chain and those having an intramolecular hydrogen bond in the donor moiety
  • two cyclic peptides containing each amino acid were synthesized, and the membrane permeability was compared by the improved method described in International Publication No. 2018/124162. ..
  • the generality was confirmed by synthesizing and evaluating a plurality of combinations of the above two cyclic peptides.
  • sequences of the two cyclic peptides to be compared were designed to minimize the influence of factors related to the membrane permeability other than the side chain partial structure having the donor.
  • the amino acids to be compared were inserted so that they would be at the same position in the two cyclic peptides, and the number of amino acids constituting the cyclic part and linear part was made the same (resulting in the same total AA).
  • the two cyclic peptides were arranged so that the number of donors in the side chain was the same (Thr and the like can be mentioned as examples of amino acids having a donor in the side chain in addition to the amino acid to be evaluated).
  • the positions were designed to be the same.
  • the number of N-alkyl groups in the amide group portion on the two main chains of the cyclic peptide was made uniform.
  • N-alkyl groups eg NMe groups
  • NH groups N-alkyl patterns
  • amide groups eg, amide groups on two cyclic peptide main chains and Gly derivatives
  • the positions and positions of cyclic amino acids such as Pro were designed to have the same conformation.
  • the ClogP/totalAA value of the two peptides to be compared was adjusted to be between ⁇ 0.03 so that Trp was not included.
  • the number of aromatic rings (Aromatic Ring Count: ARC) was made uniform.
  • ClogP in this specification is a distribution coefficient calculated by a computer, and was calculated using Daylight Version 4.9 of Daylight Chemical Information Systems, Inc.
  • A01 is a cyclic peptide consisting of 11 residues and forms a ring with 11 residues of amino acids.
  • the cyclized portion is defined as the first amino acid, and Asp corresponds in the case of A01.
  • the amino acid that constitutes the cyclic part next to Asp is defined as the second amino acid (MeLeu in the case of A01), and is repeated up to the third, fourth and N-terminals (the third MePhe, the fourth Ser(A01). iPen) and the cyclic part consists of 11 residues, so the N-terminus is the 11th D-Val).
  • the C-term column means a functional group that condenses with the carboxylic acid site of the C-terminal amino acid, and pip means piperidine.
  • Table 4 Table 6, Table 8, Table 10, Table 12, and Table 14, it is a peptide in which the N-terminal amino group and the side chain carboxylic acid of the amino acid in the cyclization part are cyclized by an amide bond.
  • cyclic peptides A01 to B10 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • cyclic peptides C01 to D17 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • cyclic peptides E01 to F08 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • cyclic peptides G01 to H10 The structures of cyclic peptides G01 to H10 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • cyclic peptides I01 to J06 The structures of cyclic peptides I01 to J06 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • cyclic peptides AP01 to AP143 and AP200 to AP266 evaluated for membrane permeability are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • Example 3 Conformational analysis of side chain partial structure
  • Example 3-1 Calculation Method of Low Energy Conformation of Side Chain Partial Structure
  • the low energy conformation of the side chain partial structure uses a partial structure in which the side chain part of the amino acid is extracted from the side chain ⁇ position (carbon directly connected to the main chain). Calculated.
  • Examples of Ser(EtOH), bAla(3R-MeOEtOH), bAla(2S-MeOEtOH), Phe(3-OMe-4-CONMe) are shown in the scheme below.
  • Hyp(2-EtOH) pyrrolidine ring in the case of Hyp(2-EtOH)
  • Hyp(2-EtOH) pyrrolidine ring in the case of Hyp(2-EtOH)
  • Ser(EtOH), bAla(3R-MeOEtOH), bAla(2S-MeOEtOH), Hyp(2-EtOH) can be considered to have the same side chain partial structure.
  • an amino acid of a type having a substituent on the amino group of an amino acid such as (Ph(3-OMe-4-CONMe)Et)Gly has a partial structure in which the side chain portion of the amino acid is extracted from the atom directly connected to the N atom.
  • Low energy conformation was calculated by the following procedure.
  • (1) Generation of initial structure The initial dihedral angles of rotatable single bonds were given as 0, 90, 180 and 270 degrees. The initial dihedral angle was given as 0,180 degrees for the amide bond and the bond between C and OH.
  • the initial dihedral angles of 4 for each of the two single bonds and the initial dihedral angles of 2 for the bond between C and OH are taken into consideration.
  • 32 initial conformations were generated.
  • Structural optimization Using Gaussian09, structural optimization of all the conformations generated in (1) was performed. Structural optimization in pseudo water was performed by adding Polarizable Continuum Model (PCM) to B3LYP/6-31G(d) level.
  • PCM Polarizable Continuum Model
  • Example 3-2 Calculation Method of Potential Energy Surface 1
  • potential energy surface (FIG. 3-1) in the following partial structure (eg, side chain partial structure of Ser(NMe-Aca))
  • Low energy conformations were calculated by the above procedure.
  • Energy calculation of each conformation (grid point)
  • ⁇ 1 is 180° ⁇ 2
  • ⁇ 3 is 0°
  • 15°...24x24 576 as grid points are generated at 15° intervals up to 345°.
  • ⁇ 1 is 0°
  • 270° ⁇ 2 is 0°
  • ⁇ 3 is 0° 180°
  • ⁇ 2 180°
  • 90°, 180°, 270° ⁇ 3 0°
  • ⁇ 2 fixed at the initial value
  • Structural optimization in pseudo water was performed by adding Polarizable Continuum Model (PCM) to B3LYP/6-31G(d) level.
  • PCM Polarizable Continuum Model
  • E( ⁇ 2) The lowest energy among E( ⁇ 2) was defined as E lowest ( ⁇ 2).
  • the energies ( ⁇ E( ⁇ 2)) of 24 conformations in which ⁇ 2 was calculated at 15° intervals were calculated by the following formula.
  • Example 3-3 Investigation of conformational distribution of crystal structures (FIGS. 3-2 and 4-2) using the results of X-ray structural analysis registered in CSD (The Cambridge Structural Database) The following queries were searched using CSD (The Cambridge Structural Database) 5.39+2 updates.
  • amide NH group which is the donor moiety that forms the intramolecular hydrogen bond
  • Fig. 3-1 membrane permeation
  • intermolecular hydrogen bond that is advantageous for bond formation when interacting with a target. It was confirmed that the conformation can be set according to the surrounding environment, such as the conformation that forms the.
  • Example 3-4 Low energy conformation calculation result of side chain partial structure
  • the side chain partial structure is computationally shown to be a structure having an intramolecular hydrogen bond and easily in a conformation. It was Ser(EtOH), bAla(3R-MeOEtOH), bAla(2S-MeOEtOH), Hyp(2-EtOH): These three amino acids have the same side chain partial structure. The calculation result shows that the conformation having intramolecular hydrogen bond is the most stable conformation.
  • Ser(1-CF3-EtOH) This amino acid has a racemic carbon moiety to which a CF 3 group is bonded, and therefore Ser (R-1-CF3-EtOH) which is an R-form and Ser (R-CF3-EtOH) which is an S-form
  • the stable conformation was calculated for each (S-1-CF3-EtOH). In all the calculation results, the conformation having an intramolecular hydrogen bond was the most stable conformation. Only the most stable conformation is described in the calculation result column of Table 18.
  • Ser (3-Me-5-Oxo-Odz) The calculation result shows that the conformation having an intramolecular hydrogen bond is 0.89 kJ/mol away from the most stable conformation.
  • the column of the calculation result in the table describes the column that is 0.89 kJ/mol away from the most stable conformation.
  • the side chain of an amino acid is a chain bonded to a carbon atom (eg, ⁇ , ⁇ , or ⁇ -carbon atom) contained in an amino acid. , And chains attached to the nitrogen atom.
  • the side chain length of amino acids can be determined by the following method.
  • the N-terminal of the amino acid unit is capped with an acetyl group and the C-terminal with a methylamino group, a conformation is generated by LowModeMD of molecular modeling software MOE (Chemical Computing Group), and the atom to which the side chain site is bonded ( In the case of a natural amino acid, it can be determined by measuring the distance from the ⁇ -carbon atom (C ⁇ carbon)) to the farthest atom on the same side chain (excluding hydrogen atom). As an example, the method for determining the length of the side chain of Phe or nBuGly is shown below.
  • the amino acid side chain forms a ring with a part of the main chain structure, there are a plurality of atoms to which the side chain part is bonded.
  • the length of the side chain is calculated by performing the same calculation as above for the atom to which each side chain is bonded and the atom of the farthest side chain (excluding hydrogen atom), and calculate the longest distance. Let's be long.
  • Hyp(Et) the side chain distance obtained from the nitrogen atom is 6.04 ⁇
  • the side chain distance obtained from C ⁇ carbon is 6.09 ⁇ .
  • the distance is 6.09 ⁇ .
  • the length of the amino acid side chain calculated by the above method is shown below.
  • the calculated pKa of the side chain force ruboxi group of Asp is 4.3
  • the calculated pKa of the side differential phenolic hydroxyl group of Tyr is 9.9
  • 3-fluorotyrosine (Tyr(Tyr( 3-F)) had a calculated pKa for the laterally differential phenolic hydroxyl group of 8.7 and a calculated pKa for tetrazole of 3.7.
  • the base the basic calculated pKa of the side chain guanidino group of Arg was 12.7
  • the basic calculated pKa of the imidazolyl group of His was 7.6, and the basic calculated pKa of pyridine was 5.4. .
  • Examplementation procedure 0.15 M KCl was added to about 100 mg of a test substance powder (about 1 mg) or 10 mM DMSO solution, and in the case of a basic compound, 0.5 M HCl was added until pH 2 was reached, and then 0.5 M KOH was added. Titration was performed to pH 12. In the case of an acidic compound, 0.5 M KOH was added until the pH reached 12, and then titration was performed with 0.5 M HCl until the pH reached 2. The titration operation was automatically performed by T3 manufactured by Sirius, and pKa was determined from the obtained titration curve using sirius T3 Refinement software.
  • pKa was similarly determined using imipramine.HCl, propranolol.HCl, and warfarin as reference compounds, and it was confirmed that the pKa was within the test result range obtained by Sirius.
  • the pKa of the amino acid side chain was determined by synthesizing a sequence in which the amino acid to be evaluated was introduced into the second residue (position X in the table below) of the peptide consisting of the three residues shown below.
  • N-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-N-methylglycine-2-chlorotrityl resin (compound pd11, Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin) (14.4 mg) was placed in a reaction vessel, DMF (2 mL) was added, and the mixture was shaken for 1 hour. DBU (0.04 mL) was added to the reaction solution, shaken for 30 minutes, DMF (10 mL) was added, 1 mL was taken out, and further diluted with DMF until the solution amount became 12.5 mL.
  • the absorbance (294 nm) of the obtained solution was measured (Shimadzu, UV-1600PC (cell length 1.0 cm) was used), and N-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-N was measured.
  • the loading amount of -methylglycine-2-chlorotrityl resin (compound pd11, Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin) was calculated to be 0.789 mmol/g.
  • the sequence containing Ser(Et-2-NMe2) which is an amino acid having a measured basic pKa of 9.1 and a calculated basic pKa of 8.9, has a range of 1.21 ⁇ ClogP/total aa ⁇ 1.36.
  • MeAbu pip-4-F2
  • MeAbu MeAbu
  • Ser Et-2-Mor
  • MeAbu pip-3-F2
  • Abu Abu (5-Oxo-Odz) in the sequence including the membrane permeability. Examples of those achieving P app ⁇ 1.0 ⁇ 10 ⁇ 6 cm/sec are shown below (pd386-pd395, pd452-pd454, pd482-pd487).
  • cyclic peptides pd50 to pd70 are shown below. (Note that in the structural formula of the cyclic peptide, the hydrogen atom bonded to the hetero atom may be omitted in order to clarify the structure.)
  • the obtained residue was dissolved in 2,2,2-trifluoroethanol (10 mL), trimethylchlorosilane (745 ⁇ L, 5.83 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hr.
  • the reaction mixture was concentrated under reduced pressure, the obtained residue was dissolved in 1,4-dioxane (5 mL) and 2N hydrochloric acid aqueous solution (10 mL), and the mixture was stirred at room temperature for 1 hr.
  • the reaction solution was extracted twice with tert-butyl methyl ether, and the organic layer was concentrated under reduced pressure.
  • the reaction mixture was concentrated under reduced pressure, dissolved in dichloromethane, washed with saturated aqueous sodium hydrogen carbonate solution, water, and saturated brine, and the obtained organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
  • the obtained residue was purified by normal phase silica gel column chromatography (petroleum ether/ethyl acetate) to obtain an intermediate (S)-4-(2-(4,4-difluoropiperidin-1-yl)ethyl). There was obtained (9H-fluoren-9-yl)methyl-5-oxooxazolidin-3-carboxylic acid (10.9 g, 82%).
  • the obtained intermediate (6 g, 13.14 mmol) was dissolved in trifluoroacetic acid (65 mL) and dichloroethane (65 mL), triethylsilane (13.5 g, 116.1 mmol) was added at room temperature, and the temperature was 70° C. for 4 hours. It was stirred. The reaction solution was returned to room temperature and then concentrated under reduced pressure, and the obtained residue was dissolved in dichloromethane. The organic layer was washed with water, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
  • N′-Dicyclohexylcarbodiimide (2.756 g, 1.337 mmol) was added. After stirring at room temperature for 5 hours, the solid was removed by filtration. The filtrate was diluted with dichloromethane (DCM), washed with saturated brine, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered, and concentrated under reduced pressure.
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Abstract

ペプチド化合物を構成するアミノ酸の少なくとも１つを分子内水素結合を形成し得る側鎖を有するアミノ酸とすることで、ペプチド化合物の膜透過性を改善できることを見出した。

Description

分子内水素結合可能な官能基を有するアミノ酸とそれらのアミノ酸を含むペプチド化合物、およびそれらの製造方法
　本発明は、ペプチド化合物の膜透過性を向上させることのできるアミノ酸、および該アミノ酸を含むペプチド化合物、およびそれらの製造方法に関する。
　タンパク―タンパク相互作用の阻害に代表される、tough targetへのアクセスは低分子化合物と比較して、中分子化合物(分子量：500～2000)が優れている可能性がある。また、抗体と比較して、中分子化合物は細胞内に移行できる点でも優れている可能性がある。生理活性を有する中分子化合物の中でもペプチド医薬品はすでに４０種類以上が上市されている価値の高い分子種である（非特許文献１）。
　ペプチド医薬品の代表例として、シクロスポリンＡやポリミキシンＢが挙げられる。これらの構造に着目してみるとＮ－メチルアミノ酸に代表される、いくつかの非天然アミノ酸を含むペプチドである点、あるいは、環状ペプチドである点が特徴点として挙げられる。非天然アミノ酸とは、天然でｍＲＮＡ上にコードされていないアミノ酸のことで、天然由来のシクロスポリンＡやポリミキシンＢに非天然アミノ酸が含まれていることに加え、これら非天然の構造部位や環状構造が生体内の作用部位と相互作用や体内動態に寄与して薬理活性を発現することは非常に興味深い。
　近年、中分子ペプチドが体内動態の改善に寄与しうる膜透過性の向上のための条件（ドラッグライクネスを満たすために必要な条件）として、例えば、環状部を有すること、Ｎ置換アミノ酸数、アミノ酸残基数の範囲、脂溶性などの条件が報告されている（特許文献１）。また、非天然アミノ酸であるＮ－メチルアミノ酸に着目し、翻訳合成によりＮ－メチルペプチドライブラリを作製したとの報告もある（特許文献２）。また、標的と薬物が複合体を形成するためには標的と薬物との相互作用が重要であり、その中で重要であるものが水素結合である（非特許文献３）。水素結合を形成するためにはプロトンドナーが必須であるが、膜透過性に対しては負の影響を与えうる。実際、膜透過性の改善方法のひとつとして、アミノ酸のＮ－メチル化が奏功することが知られている（特許文献１）。アミノ酸のＮ－メチル化以外でも、主鎖に含まれるアミド結合を利用してプロトンをマスクすることの膜透過性への影響が考察されている（非特許文献２）。
　一方で、アミノ酸の側鎖にプロトンとプロトンをマスクできるような官能基を有する非天然アミノ酸をデザインし、そのプロトンをマスクする機能によってペプチドの膜透過性が改善されたという報告はない。
国際公開第２０１３／１００１３２号 国際公開第２０１２／０３３１５４号
Future Med. Chem. 2009, 1, 1289-1310. Angew. Chem. Int. Ed. 2018, 57, 14414-14438. 最新創薬化学上巻, p87
　医薬に有用なペプチドの創生には、標的分子とペプチドとの相互作用の向上が必須といえる。標的分子とペプチドとの相互作用の向上には、アミノ酸の主鎖だけでなく、側鎖の構造が標的分子と相互作用することがさらに重要といえる。標的分子との相互作用を改善するためには、２０種類の天然アミノ酸からなるペプチドだけでなく、標的分子との相互作用がより強固になるようにデザインされた非天然アミノ酸をペプチドに組み込むことがより有利である。特許文献１、および特許文献２に記載の方法では、ペプチドの構成単位であるアミノ酸のアミド結合部位のＮ－メチル化、アミノ酸残基数、脂溶性の観点からの示唆が記載されている一方で、標的分子との結合に有利であると考えられる水素結合を形成するために必要な酸素原子や窒素原子などに代表されるヘテロ原子がアミノ酸の側鎖に導入された場合の構造特性に関する考察はなされていない。非特許文献１では、ペプチド医薬品や環状ペプチドの環化方法の例示は記載されているものの、膜透過性とアミノ酸の構造との相関の示唆はない。非特許文献２では、ペプチド医薬品の例示はされているが、ペプチドを構成するアミノ酸の構造変換が、医薬への有用性に結びついているという示唆はなく、あくまでも既知化合物の考察がなされているにすぎず、医薬への汎用性は限定的である。
　本発明は、ペプチド化合物のデザイン、特に膜透過性に与える影響の研究が、アミノ酸各々の構造特性に着目されずに行われてきた状況を鑑みてなされたものであり、ペプチド化合物の膜透過性を改善するアミノ酸、および該アミノ酸を含むペプチド化合物を提供することを課題とする。
　本発明者らは、上記課題の解決手段として、以下を見出し、発明を完成した。すなわち、標的分子との相互作用の向上に必要なヘテロ原子をアミノ酸の側鎖に持ち、さらにそのアミノ酸側鎖上のプロトンを、同一のアミノ酸側鎖内で分子内水素結合によりマスクできるようなアミノ酸側鎖をデザインし、該アミノ酸を含むペプチド化合物を製造して膜透過性を評価したところ、驚くべきことに、該アミノ酸を含むペプチド化合物は、分子内水素結合をしないアミノ酸を含むペプチド化合物と比較して、膜透過性が優れていることを見出した。また、分子内水素結合をする側鎖を有するアミノ酸のデザインは、プロトンドナーとプロトンアクセプターが疑似環状構造、好ましくは４員環、５員環、６員環、あるいは７員環を取りうるような構造が効果を発揮することを見出した。また、該アミノ酸を含むペプチド化合物の膜透過に最適なペプチドを構成するアミノ酸残基の数、Ｎ置換アミノ酸残基の数、Ｎ置換アミノ酸残基がペプチド中に含まれる割合、ｃＬｏｇＰの範囲、芳香環の数を見出した。
　本発明は、非限定の具体的な一態様において以下を包含する。
〔１〕２以上のアミノ酸が連結されたペプチド化合物であって、アミノ酸の少なくとも１つがその側鎖内で水素結合を形成し得る、ペプチド化合物。
〔２〕側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸が、側鎖内で擬似４～７員環を形成し得る、〔１〕に記載のペプチド化合物。
〔３〕側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸が、下記式Ａで表される、〔１〕または〔２〕に記載のペプチド化合物：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000012
式中、
　Ｒ１は、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、この場合、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、Ｒ２Ａが水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、かつＲ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成し、あるいは
　Ｒ１は、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子と一緒になって４～６員の複素環を形成し、該複素環は、式１もしくは式２で表される基、－ＯＨ、およびアルコキシ基からなる群より選択される、１つまたは複数の置換基を有していてもよく、この場合、Ｒ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
　Ｒ３は、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
　Ｒ４は、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、
　式１および式２は、それぞれ下記式：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000013
で表され、式中、
　＊は、結合点を示し、
　Ｑ１およびＱ２は、独立して、単結合、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、または酸素原子を１つ含むＣ２－Ｃ４ヘテロアルキレンであり、
　Ａ１は、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
　Ｌ１は、フッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ａ２は、単結合、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
　Ｌ２は、単結合であるか、またはフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ｘは、－ＯＨ、－ＮＲＺ１ＲＺ２、もしくは－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり；
　ＲＺ１およびＲＺ２は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
　Ｙは、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノ、－ＮＲＺ３ＲＺ４、もしくは－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくはハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり、
　ＲＺ３およびＲＺ４は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
　Ｚは、水素またはＣ１－Ｃ４アルキルであり、
　但し、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－である場合、Ｚは水素ではなく、
　ここで、式Ａで表されるアミノ酸は、式１または式２で表される基のいずれかを少なくとも１つ含む。
〔４〕Ｒ１が、式１または式２で表される基であり、
　Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂが、独立して水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成し、
　Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
　Ｒ４が、水素、またはＣ１－Ｃ４アルキルである
〔３〕に記載のペプチド化合物。
〔５〕Ｒ１が、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子と一緒になって４～６員の複素環を形成し、該複素環は、式１または式２で表される基を有しており、
　Ｒ２Ｂが、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
　Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
　Ｒ４が、水素、またはＣ１－Ｃ４アルキルである
〔３〕に記載のペプチド化合物。
〔６〕Ｒ１が、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであり
　Ｒ２Ａが、式１もしくは式２で表される基であり、
　Ｒ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
　Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
　Ｒ４が、水素、またはＣ１－Ｃ４アルキルである
〔３〕に記載のペプチド化合物。
〔７〕Ｒ１が、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
　Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂが、独立して水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成し、
　Ｒ３が、－ＣＨＲ４－であり、
　Ｒ４が、式１もしくは式２で表される基である、
〔３〕に記載のペプチド化合物。
〔８〕Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－であり、
　Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ｘが－ＯＨである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔９〕Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－であり、
　Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ｘが－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であり、
　ＲＺ１がＣ１－Ｃ４アルキルであり、
　ＲＺ２が水素である、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１０〕Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－であり、
　Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ｘが１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１１〕Ｑ１が単結合であり、
　Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－であり、
　Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
　Ｘが－ＯＨである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１２〕Ｑ１がＣＨ２－である、〔３〕～〔１１〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１３〕Ａ１が－Ｏ－である、〔３〕～〔１２〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１４〕Ｌ１が、－ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２－、－（ＣＨ２）３－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＦ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２－、－（ＣＨ２）２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２Ｃ（ＣＨ３）２－、および－ＣＨ２ＣＯ－からなる群より選択される、〔３〕～〔１３〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１５〕Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ｌ２が単結合であり、
　Ｙが－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であり、
　Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
　ＺがＣ１－Ｃ４アルキルである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１６〕Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ｌ２が単結合であり、
　Ｙが－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であり、
　Ａ２が単結合であり、
　Ｚが水素である、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１７〕Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ｌ２が単結合であり、
　ＹがＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノカルボニルであり、
　Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
　ＺがＣ１－Ｃ４アルキルである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１８〕Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレンであり、
　Ｌ２が単結合であり、
　Ｙが－ＯＨであり、
　Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
　ＺがＣ１－Ｃ４アルキルである、
〔３〕～〔７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔１９〕Ｑ２が－ＣＨ２－である、〔３〕～〔７〕、〔１６〕～〔１８〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２０〕Ｙが、メチルアミノカルボニル、－ＣＯＮ（ＯＨ）Ｍｅ、または－ＣＯＮＨ（ＯＨ）である、〔３〕～〔７〕、〔１５〕、および〔１９〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２１〕Ｙが、－ＣＯＮ（ＯＨ）Ｍｅである、〔３〕～〔７〕、〔１６〕、および〔１９〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２２〕Ａ２が－Ｏ－である、〔３〕～〔７〕、〔１５〕、および〔１７〕～〔２１〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２３〕Ｚがメチルである、〔３〕～〔７〕、〔１５〕、〔１７〕～〔２２〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２４〕式Ａで表されるアミノ酸が以下からなる群：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000014
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000015
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000016
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000017
より選択される、〔３〕に記載のペプチド化合物。
〔２５〕５～３０のアミノ酸から構成される、〔１〕～〔２４〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２６〕環状である、〔１〕～〔２５〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２７〕２～１５のアミノ酸から構成される環状部を含む、〔２６〕に記載のペプチド化合物。
〔２８〕２～３０のＮ置換アミノ酸を含む、〔１〕～〔２７〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔２９〕全アミノ酸数に対するＮ置換アミノ酸数の割合が３０％以上である、〔１〕～〔２８〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔３０〕４．０～１８のＣｌｏｇＰを有する、〔１〕～〔２９〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔３１〕１．０ｘ１０－７ｃｍ／秒以上のＰａｐｐを有する、〔１〕～〔３０〕のいずれかに記載のペプチド化合物。
〔３２〕〔１〕～〔３１〕のいずれかに記載のペプチドおよび／または当該ペプチドをコードする核酸を含むライブラリ。
〔３３〕〔３〕～〔２３〕のいずれかに記載の式Ａで表されるアミノ酸。
〔３４〕以下からなる群：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000018
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000019
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000020
より選択される、〔３３〕に記載のアミノ酸。
〔３５〕〔３３〕または〔３４〕に記載のアミノ酸に含まれるアミノ基、および／またはカルボキシル基が保護基で保護されている、保護アミノ酸。
〔３６〕アミノ基の保護基が、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ｃｂｚ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基、ジニトロノシル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、およびクミル基からなる群より選択される、および／または
　カルボキシル基の保護基が、メチル基、アリル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、クミル基、メトキシトリチル基、およびベンジル基からなる群より選択される、〔３５〕に記載の保護アミノ酸。
　本発明によれば、ペプチド医薬品の探索、具体的には膜透過性に優れ標的分子に特異的に結合するアミノ酸、および該アミノ酸を含むペプチド、またはこれらアミノ酸及びペプチドを供給することが可能となる。
Trpの側鎖を有しない環状ペプチド化合物を母集団とした場合のClogP/total AAとPappの関係を示した図である。 Trpの側鎖を有する環状ペプチド化合物を母集団とした場合のClogP/total AAとPappの関係を示した図である。 環状ペプチド化合物のARCと細胞膜透過性の関係を示した図である。 例えば、Ser(NMe-Aca)の側鎖部分構造でのポテンシャルエネルギー曲面（Potential energy surface）の図である。 例えば、Ser(NMe-Aca)の側鎖部分構造でのCSDに登録されているＸ線構造解析の結果を用いた、結晶構造（Crystal structures）のコンフォメーション分布を示した図である。 例えば、Ser(EtOH)、bAla(3R-MeOEtOH)、bAla(2S-MeOEtOH)の側鎖部分構造でのポテンシャルエネルギー曲面の図である。 例えば、Ser(EtOH)、bAla(3R-MeOEtOH)、bAla(2S-MeOEtOH)の側鎖部分構造でのCSDに登録されているＸ線構造解析の結果を用いた、結晶構造のコンフォメーション分布を示した図である。
　以下に、本明細書の好ましい非限定的な実施態様を説明する。
　後述する本実施例に記載されるあらゆる要素(element)は、本特許出願の権利化を意図する国における、実施例に記載の内容を限定的に解釈しようとし得るいかなる特許実務、慣習、法令等の制限に縛られることなく、本「発明を実施するための形態」においても同等に記載されていると当然にみなされることを意図して記載される。
　本明細書におけるいずれかに記載の一又は複数の要素(element)の一部又は全部を任意に組み合わせたものも、当業者の技術常識に基づいて技術的に矛盾しない限り、本明細書に含まれることが意図され、かつ、当業者には当然に理解されるものとして記載される。
　本明細書では、以下の略号を用いる。Ａｌａ（アラニン）、Ａｒｇ（アルギニン）、Ａｓｎ（アスパラギン）、Ａｓｐ（アスパラギン酸）、Ｃｙｓ（システイン）、Ｇｌｕ（グルタミン酸）、Ｇｌｎ（グルタミン）、Ｇｌｙ（グリシン）、Ｈｉｓ（ヒスチジン）、Ｉｌｅ（イソロイシン）、Ｌｅｕ（ロイシン）、Ｌｙｓ（リシン）、Ｍｅｔ（メチオニン）、Ｐｈｅ（フェニルアラニン）、Ｐｒｏ（プロリン）、Ｓｅｒ（セリン）、Ｔｈｒ（トレオニン）、Ｔｒｐ（トリプトファン）、Ｔｙｒ（チロシン）、Ｖａｌ（バリン）。また、これらに加えて、後述の略号表および表１に記載した略号を用いる。
（官能基等の定義）
　本明細書において「アルキル」とは、脂肪族炭化水素から任意の水素原子を１個除いて誘導される１価の基であり、骨格中にヘテロ原子（炭素及び水素原子以外の原子をいう。）または不飽和の炭素－炭素結合を含有せず、水素及び炭素原子を含有するヒドロカルビルまたは炭化水素基構造の部分集合を有する。該アルキル基は直鎖状、又は分枝鎖状のものを含む。アルキル基としては、炭素原子数１～２０（Ｃ１－Ｃ２０、以下「Ｃｐ－Ｃｑ」とは炭素原子数がｐ～ｑ個であることを意味する。）のアルキル基であり、好ましくはＣ１－Ｃ６アルキル基、Ｃ１－Ｃ５アルキル基、Ｃ１－Ｃ４アルキル基、Ｃ１－Ｃ３アルキル基などが挙げられる。アルキルとしては、具体的には、メチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル、ヘキシル、イソプロピル、ｔｅｒｔ－ブチル基、ｓｅｃ－ブチル基、１－メチルプロピル基、１，１－ジメチルプロピル基、２，２－ジメチルプロピル、１，２－ジメチルプロピル、１，１，２－トリメチルプロピル、１，２，２－トリメチルプロピル、１，１，２，２－テトラメチルプロピル、１－メチルブチル、２－メチルブチル、３－メチルブチル、１，１－ジメチルブチル、１，２－ジメチルブチル、１，１－ジメチルブチル、１，２－ジメチルブチル、１，３－ジメチルブチル、２，２－ジメチルブチル、２，３－ジメチルブチル、３，３－ジメチルブチル、１－エチルブチル、２－エチルブチル、イソペンチル、ネオペンチル等が挙げられる。
　本明細書における「ヘテロアルキル」は、前記「アルキル」の骨格中に好ましくは１～５個のヘテロ原子を含む基を意味し、好ましくはＣ２－Ｃ１０ヘテロアルキル、Ｃ２－Ｃ６ヘテロアルキルなどが挙げられる。ヘテロアルキルとして具体的には、－ＣＨ２ＯＣＨ３、－ＣＨ２ＯＣＨ２ＣＨ３、－ＣＨ（ＣＨ３）ＯＣＨ３、－ＣＨ２ＣＨ２Ｎ（ＣＨ３）２などが挙げられる。
　本明細書における「ハロゲン原子」としては、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、及びＩが挙げられ、Ｆ又はＣｌが好ましく例示される。
　本明細書における「フルオロアルキル」は、前記「アルキル」の１つまたは複数の水素原子がフッ素原子で置換された基を意味し、好ましくはＣ１－Ｃ６フルオロアルキル、Ｃ１－Ｃ４フルオロアルキル、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキルなどが挙げられる。フルオロアルキルとして具体的には、トリフルオロメチル基、２，２，２－トリフルオロエチル基，ペンタフルオロエチル基、２，２，３，３－テトラフルオロプロピル基、ヘプタフルオロプロピル基、トリフルオロメトキシ基、２，２，２－トリフルオロエトキシ基、ペンタフルオロエトキシ基、２，２，３，３－テトラフルオロプロポキシ基、ヘプタフルオロプロポキシ基などが挙げられる。
　本明細書における「アルキルスルホニル」は、前記「アルキル」が結合したスルホニル基（即ち、－ＳＯ２－アルキル）であることを意味する。アルキルスルホニルとして、好ましくは、Ｃ１－Ｃ６アルキルスルホニル、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルなどが挙げられ、具体的には、メチルスルホニル、エチルスルホニル、ｎ－プロピルスルホニル、ｉ－プロピルスルホニルなどが挙げられる。
　本明細書における「アルキルスルホニルアミノ」は、アミノ基（－ＮＨ２）の一つの水素原子が、前記「アルキルスルホニル」で置換された基を意味する。アルキルスルホニルアミノとして、好ましくは、Ｃ１－Ｃ６アルキルスルホニルアミノ、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノなどが挙げられ、具体的には、メチルスルホニルアミノ、エチルスルホニルアミノ、ｎ－プロピルスルホニルアミノ、ｉ－プロピルスルホニルアミノなどが挙げられる。
　本明細書における「アルケニル基」は、少なくとも１個の二重結合（２個の隣接ｓｐ２炭素原子）を有する１価の基である。二重結合および置換分（存在する場合）の配置によって、二重結合の幾何学的形態は、エントゲーゲン（Ｅ）またはツザンメン（Ｚ）、シスまたはトランス配置をとることができる。アルケニル基としては、直鎖状または分枝鎖状のものが挙げられ、内部オレフィンを含む直鎖などを含む。好ましくはＣ２－Ｃ１０アルケニル基、さらに好ましくはＣ２－Ｃ６アルケニル基が挙げられる。このようなアルケニルは、具体的には、たとえば、ビニル基、アリル基、１－プロペニル基、２－プロペニル基、１－ブテニル基、２－ブテニル基（シス、トランスを含む）、３－ブテニル基、ペンテニル基、ヘキセニル基などが挙げられる。
　本明細書において「アルキニル」は、少なくとも１個の三重結合（２個の隣接ＳＰ炭素原子）を有する、１価の基である。直鎖状または分枝鎖状のアルキニル基が挙げられ、内部アルキレンを含む。好ましくはＣ２－Ｃ１０アルキニル基、さらに好ましくはＣ２－Ｃ６アルキニル基が挙げられる。アルキニルとしては具体的には、たとえば、エチニル基、１－プロピニル基、プロパルギル基、３－ブチニル基、ペンチニル基、ヘキシニル基などが挙げられる。
　本明細書において「シクロアルキル」とは、飽和または部分的に飽和した環状の１価の脂肪族炭化水素基を意味し、単環、ビシクロ環、スピロ環を含む。好ましくはＣ３－Ｃ１０シクロアルキルが挙げられる。シクロアルキル基は、部分的に不飽和であってもよい。シクロアルキルとしては具体的には、たとえば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、ビシクロ［２．２．１］ヘプチルなどが挙げられる。
　本明細書において「アリール」とは１価の芳香族炭化水素環を意味し、好ましくはＣ６－Ｃ１０アリールが挙げられる。アリールとしては具体的には、例えば、フェニル、ナフチルが挙げられる。
　本明細書において「ヘテロアリール」とは、環を構成する原子中（本明細書において「環内」ともいう。）に好ましくは１～５個のヘテロ原子を含有する芳香族性の環の１価の基を意味し、部分的に飽和されていてもよい。環は単環、または２個の縮合環（例えば、ベンゼンまたは単環へテロアリールと縮合した２環式ヘテロアリール）であってもよい。環を構成する原子の数は好ましくは５～１０である（５員－１０員ヘテロアリール）。ヘテロアリールとしては具体的には、例えば、イミダゾリル、チアゾリル、オキサジアゾリル、チアジアゾリル、オキサジアゾロニル、チアジアゾロニル、テトラゾリル、ピリジル、インドリルなどが挙げられる。
　本明細書において、「ヘテロ原子を環内に有する」とは、環を構成する原子中にヘテロ原子を含有することを意味し、そのような環としては、ピリジンなどの芳香族複素環、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、またはアゼチジンなどの非芳香族複素環が例示される。また、前記ヘテロ原子が酸素原子の場合に、「環内に酸素原子を有する」などと表記される。
　本明細書において「複素環基」とは、ヘテロ原子（例えばＮ、Ｏ、Ｓなど）を環内に少なくとも一つ有する基をいい、飽和ヘテロシクリル基、または不飽和ヘテロシクリル基ともいう。ヘテロ原子としてはＮ又はＯが好ましく、ヘテロ原子の数は１又は２個が好ましく、４～６員環であることが好ましい。また複素環基は、アルキル基、フルオロアルキル基、オキソ、ハロゲン原子で置換されていてもよい。複素環基としては、ピリジル基、ピペリジノ基、モルホリノ基、ピロリジノ基、オキサジアゾロニル基、またはアゼチジニル基が好ましく例示される。
　本明細書において「アリールアルキル（アラルキル）」とは、アリールとアルキルを共に含む基であり、例えば、前記アルキルの少なくとも一つの水素原子がアリールで置換された基を意味し、好ましくは、「Ｃ５－Ｃ１０アリールＣ１－Ｃ６アルキル」が挙げられる。たとえば、ベンジルなどが挙げられる。
　本明細書において「アルキレン」とは、前記「アルキル」からさらに任意の水素原子を１個除いて誘導される二価の基を意味する。アルキレンとしては好ましくはＣ１－Ｃ２アルキレン、Ｃ１－Ｃ３アルキレン、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、Ｃ１－Ｃ５アルキレン、Ｃ１－Ｃ６アルキレンが挙げられる。アルキレンとして具体的には、－ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２－、－（ＣＨ２）３－、ＣＨ（ＣＨ３）ＣＨ２－、－Ｃ（ＣＨ３）２－、－（ＣＨ２）４－、ＣＨ（ＣＨ３）ＣＨ２ＣＨ２－、－Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＨ３）ＣＨ２－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２－、－ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ（ＣＨ３）－、－（ＣＨ２）５－、－（ＣＨ２）６－などが挙げられる。　
　本明細書において「ヘテロアルキレン」とは、前記「ヘテロアルキル」からさらに任意の水素原子を１個除いて誘導される二価の基を意味しＣ２－Ｃ６ヘテロアルキレン、Ｃ２－Ｃ５ヘテロアルキレン、Ｃ２－Ｃ４ヘテロアルキレン、Ｃ２－Ｃ３ヘテロアルキレン、Ｃ２ヘテロアルキレンなどが挙げられる。例えば、ヘテロ原子として酸素原子を基中に含むヘテロアルキレンとして具体的には、－ＣＨ２Ｏ－、－ＯＣＨ２－、－ＣＨ２ＯＣＨ２－、－ＯＣＨ２ＣＨ２－、－ＣＨ２ＣＨ２Ｏ－などが挙げられる。
　本明細書において「アリーレン」とは、前記アリールからさらに任意の水素原子を１個除いて誘導される２価の基を意味する。アリーレンは、単環でも縮合環でもよい。環を構成する原子の数は特に限定されないが、好ましくは６～１０である（Ｃ６－Ｃ１０アリーレン）。アリーレンとして具体的には、たとえば、フェニレンなどが挙げられる。　
　本明細書において「ヘテロアリーレン」とは、前記ヘテロアリールからさらに任意の水素原子を１個除いて誘導される２価の基を意味する。ヘテロアリーレンは、単環でも縮合環でもよい。環を構成する原子の数は特に限定されないが、好ましくは５～１０である（５員～１０員ヘテロアリーレン）。ヘテロアリーレンとして具体的には、イミダゾールジイル、ピリジンジイル、オキサジアゾールジイル、チアゾールジイル、チアジアゾールジイルなどが挙げられる。　
　本明細書において「縮環構造」とは、二つまたはそれ以上の環を有する環式化合物において、複数の環が２個またはそれ以上の原子を共有している環式構造をいう。「２以上の芳香環による縮環構造」とは、二つまたはそれ以上の芳香環を有する環式化合物において、複数の芳香環が２個またはそれ以上の原子を共有している環式構造をいう。限定を意図しないが、縮環構造としては、インドール骨格、ベンゾフラン骨格、ベンゾイミダゾール骨格、キノリン骨格、ビシクロ[4.4.0]デカンなどが例示される。
　本明細書において、「置換されていてもよい」という修飾語句が付与されている場合、その置換基としては、例えば、アルキル基、フルオロアルキル基、アルコシキ基、フルオロアルコキシ基、アルケニル基、アルケニルオキシ基、アルキニル基、アルキニルオキシ基、シクロアルキル基、アリール基、ヘテロアリール基、ヘテロシクリル基、アリールアルキル基、ヘテロアリールアルキル基、ハロゲン原子、ニトロ基、アミノ基、モノアルキルアミノ基、ジアルキルアミノ基、シアノ基、カルボキシル基、アルコキシカルボニル基、ホルミル基などが挙げられる。
　本明細書における「複素環」は、環を構成する原子中に好ましくは１～５個のヘテロ原子を含有する、非芳香族の１価または２価の複素環を意味する。複素環は、環中に二重およびまたは三重結合を有していてもよく、環中の炭素原子は酸化されてカルボニルを形成してもよく、単環、縮合環、スピロ環でもよい。環を構成する原子の数は好ましくは３～１２であり（３～１２員複素環）、より好ましくは４～７であり（４～７員複素環）、さらに好ましくは５～６である（５～６員複素環）。複素環として具体的には、たとえば、ピペラジン、ピロリジン、ピペリジン、モルホリン、ホモモルホリン、（Ｒ）－ヘキサヒドロピロロ［１，２－ａ］ピラジン、（Ｓ）－ヘキサヒドロピロロ［１，２－ａ］ピラジン、３－オキソピペラジン、２－オキソピロリジン、アゼチジン、２－オキソイミダゾリジン、オキセタン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、ジヒドロピラン、テトラヒドロピラン、テトラヒドロピリジン、チオモルホリン、ピラゾリジン、イミダゾリン、オキサゾリジン、イソオキサゾリジン、チアゾリジン、イミダゾリジン、イソチアゾリジン、チアジアゾリジン、オキサゾリドン、ベンゾジオキサン、ベンゾオキサゾリン、ジオキソラン、ジオキサン、テトラヒドロチオピランなどが挙げられる。
（ペプチド化合物）
　ある局面において、本発明は、２以上のアミノ酸が連結されたペプチド化合物であって、アミノ酸の少なくとも１つ（具体的には、例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上）がその側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸である、ペプチド化合物に関する。
ペプチド化合物の構造
　本発明における「ペプチド化合物」には、２以上のアミノ酸が連結された、直鎖状または環状のペプチド化合物が含まれる。なお、環状ペプチド化合物は、「環状部を有するペプチド化合物」と同意義である。
　本明細書における「アミノ酸」には、天然アミノ酸、及び非天然アミノ酸が含まれる。本明細書における「天然アミノ酸」とは、Ｇｌｙ、Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｇｌｎ、Ａｓｎ、Ｃｙｓ、Ｍｅｔ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｐｒｏを指す。非天然アミノ酸は特に限定されないが、β－アミノ酸、Ｄ型アミノ酸、Ｎ置換アミノ酸、α，α－二置換アミノ酸、側鎖が天然アミノ酸と異なるアミノ酸、ヒドロキシカルボン酸などが例示される。本明細書におけるアミノ酸としては、任意の立体配置が許容される。アミノ酸の側鎖の選択は特に制限を設けないが、水素原子の他にも例えばアルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アリール基、ヘテロアリール基、アラルキル基、シクロアルキル基、スピロ結合した、シクロアルキル基から自由に選択される。それぞれには置換基が付与されていてもよく、それら置換基も制限されず、例えば、ハロゲン原子、Ｏ原子、Ｓ原子、Ｎ原子、Ｂ原子、Ｓｉ原子、又はＰ原子を含む任意の置換基の中から独立して１つ又は２つ以上自由に選択されてよい。すなわち、置換されていてもよいアルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アリール基、ヘテロアリール基、アラルキル基、シクロアルキル基などが例示される。また、本明細書におけるアミノ酸は、後述する「分子内水素結合を形成し得る」側鎖として有していてもよい。非限定の一態様において、本明細書におけるアミノ酸は、同一分子内にカルボキシ基とアミノ基を有する化合物であってよい（この場合であっても、プロリン、ヒドロキシプロリンのようなイミノ酸もアミノ酸に含まれる）。
　ハロゲン由来の置換基としては、フルオロ（－Ｆ）、クロロ（－Ｃｌ）、ブロモ（－Ｂｒ）、ヨウド（－Ｉ）などが挙げられる。
　Ｏ原子由来の置換基としては、ヒドロキシル（－ＯＨ）、オキシ（－ＯＲ）、カルボニル（－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）、カルボキシル（－ＣＯ２Ｈ）、オキシカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ）、カルボニルオキシ（－Ｏ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）、チオカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＳＲ）、カルボニルチオ基（－Ｓ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）、アミノカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＮＨＲ）、カルボニルアミノ（－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）、オキシカルボニルアミノ（－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ）、スルホニルアミノ（－ＮＨ－ＳＯ２－Ｒ）、アミノスルホニル（－ＳＯ２－ＮＨＲ）、スルファモイルアミノ（－ＮＨ－ＳＯ２－ＮＨＲ）、チオカルボキシル（－Ｃ（＝Ｏ）－ＳＨ）、カルボキシルカルボニル（－Ｃ（＝Ｏ）－ＣＯ２Ｈ）が挙げられる。
　オキシ（－ＯＲ）の例としては、アルコキシ、シクロアルコキシ、アルケニルオキシ、アルキニルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、アラルキルオキシなどが挙げられる。
　カルボニル（－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）の例としては、ホルミル（－Ｃ＝Ｏ－Ｈ）、アルキルカルボニル、シクロアルキルカルボニル、アルケニルカルボニル、アルキニルカルボニル、アリールカルボニル、ヘテロアリールカルボニル、アラルキルカルボニルなどが挙げられる。
　オキシカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ）の例としては、アルキルオキシカルボニル、シクロアルキルオキシカルボニル、アルケニルオキシカルボニル、アルキニルオキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、ヘテロアリールオキシカルボニル、アラルキルオキシカルボニルなどが挙げられる。
（－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ）
　カルボニルオキシ（－Ｏ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）の例としては、アルキルカルボニルオキシ、シクロアルキルカルボニルオキシ、アルケニルカルボニルオキシ、アルキニルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、ヘテロアリールカルボニルオキシ、アラルキルカルボニルオキシなどが挙げられる。
　チオカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＳＲ）の例としては、アルキルチオカルボニル、シクロアルキルチオカルボニル、アルケニルチオカルボニル、アルキニルチオカルボニル、アリールチオカルボニル、ヘテロアリールチオカルボニル、アラルキルチオカルボニルなどが挙げられる。
　カルボニルチオ（－Ｓ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）の例としては、アルキルカルボニルチオ、シクロアルキルカルボニルチオ、アルケニルカルボニルチオ、アルキニルカルボニルチオ、アリールカルボニルチオ、ヘテロアリールカルボニルチオ、アラルキルカルボニルチオなどが挙げられる。
　アミノカルボニル（－Ｃ＝Ｏ－ＮＨＲ）の例としては、アルキルアミノカルボニル、シクロアルキルアミノカルボニル、アルケニルアミノカルボニル、アルキニルアミノカルボニル、アリールアミノカルボニル、ヘテロアリールアミノカルボニル、アラルキルアミノカルボニルなどが挙げられる。これらに加えて、－Ｃ＝Ｏ－ＮＨＲ中のＮ原子と結合したＨ原子が、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルでさらに置換された化合物が挙げられる。
　カルボニルアミノ（－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ）の例としては、アルキルカルボニルアミノ、シクロアルキルカルボニルアミノ、アルケニルカルボニルアミノ、アルキニルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノなどが挙げられる。これらに加えて－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－Ｒ中のＮ原子と結合したＨ原子が、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルでさらに置換された化合物が挙げられる。
　オキシカルボニルアミノ（－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ）の例としては、アルコキシカルボニルアミノ、シクロアルコキシカルボニルアミノ、アルケニルオキシカルボニルアミノ、アルキニルオキシカルボニルアミノ、アリールオキシカルボニルアミノ、ヘテロアリールオキシカルボニルアミノ、アラルキルオキシカルボニルアミノなどが挙げられる。これらに加えて、－ＮＨ－Ｃ＝Ｏ－ＯＲ中のＮ原子と結合したＨ原子がアルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルでさらに置換された化合物が挙げられる。
　スルホニルアミノ（－ＮＨ－ＳＯ２－Ｒ）の例としては、アルキルスルホニルアミノ、シクロアルキルスルホニルアミノ、アルケニルスルホニルアミノ、アルキニルスルホニルアミノ、アリールスルホニルアミノ、ヘテロアリールスルホニルアミノ、アラルキルスルホニルアミノなどが挙げられる。これらに加えて、－ＮＨ－ＳＯ２－Ｒ中のＮ原子と結合したＨ原子がアルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルでさらに置換された化合物が挙げられる。
　アミノスルホニル（－ＳＯ２－ＮＨＲ）の例としては、アルキルアミノスルホニル、シクロアルキルアミノスルホニル、アルケニルアミノスルホニル、アルキニルアミノスルホニル、アリールアミノスルホニル、ヘテロアリールアミノスルホニル、アラルキルアミノスルホニルなどが挙げられる。これらに加えて、－ＳＯ２－ＮＨＲ中のＮ原子と結合したＨ原子がアルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルでさらに置換された化合物が挙げられる。
　スルファモイルアミノ（－ＮＨ－ＳＯ２－ＮＨＲ）の例としては、アルキルスルファモイルアミノ、シクロアルキルスルファモイルアミノ、アルケニルスルファモイルアミノ、アルキニルスルファモイルアミノ、アリールスルファモイルアミノ、ヘテロアリールスルファモイルアミノ、アラルキルスルファモイルアミノなどが挙げられる。さらに、－ＮＨ－ＳＯ２－ＮＨＲ中のＮ原子と結合した２つのＨ原子はアルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、およびアラルキルからなる群より独立して選択される置換基で置換されていてもよく、またこれらの２つの置換基は環を形成しても良い。
　Ｓ原子由来の置換基として、チオール（－ＳＨ）、チオ（－Ｓ－Ｒ）、スルフィニル（－Ｓ＝Ｏ－Ｒ）、スルホニル（－Ｓ（Ｏ）２－Ｒ）、スルホ（－ＳＯ３Ｈ）が挙げられる。
　チオ（－Ｓ－Ｒ）の例としては、アルキルチオ、シクロアルキルチオ、アルケニルチオ、アルキニルチオ、アリールチオ、ヘテロアリールチオ、アラルキルチオなどの中から選択される。
　スルフィニル（－Ｓ＝Ｏ－Ｒ）の例としては、アルキルスルフィニル、シクロアルキルスルフィニル、アルケニルスルフィニル、アルキニルスルフィニル、アリールスルフィニル、ヘテロアリールスルフィニル、アラルキルスルフィニルなどが挙げられる。
　スルホニル（－Ｓ（Ｏ）２－Ｒ）の例としては、アルキルスルホニル、シクロアルキルスルホニル、アルケニルスルホニル、アルキニルスルホニル、アリールスルホニル、ヘテロアリールスルホニル、アラルキルスルホニルなどが挙げられる。
　Ｎ原子由来の置換基として、アジド（－Ｎ３、「アジド基」ともいう）、シアノ（－ＣＮ）、１級アミノ（－ＮＨ２）、２級アミノ（－ＮＨ－Ｒ）、３級アミノ（－ＮＲ（Ｒ'））、アミジノ（－Ｃ（＝ＮＨ）－ＮＨ２）、置換アミジノ（－Ｃ（＝ＮＲ）－ＮＲ'Ｒ"）、グアニジノ（－ＮＨ－Ｃ（＝ＮＨ）－ＮＨ２）、置換グアニジノ（－ＮＲ－Ｃ（＝ＮＲ'''）－ＮＲ'Ｒ"）、アミノカルボニルアミノ（－ＮＲ－ＣＯ－ＮＲ'Ｒ"）が挙げられる。
　２級アミノ（－ＮＨ－Ｒ）の例としては、アルキルアミノ、シクロアルキルアミノ、アルケニルアミノ、アルキニルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アラルキルアミノなどが挙げられる。
　３級アミノ（－ＮＲ（Ｒ'））の例としては、例えばアルキル（アラルキル）アミノなど、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルなどの中からそれぞれ独立して選択される、任意の２つの置換基を有するアミノ基が挙げられ、これらの任意の２つの置換基は環を形成しても良い。
　置換アミジノ（－Ｃ（＝ＮＲ）－ＮＲ'Ｒ"）の例としては、Ｎ原子上の３つの置換基Ｒ、Ｒ'、およびＲ"が、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルの中からそれぞれ独立して選択された基、例えばアルキル（アラルキル）（アリール）アミジノなどが挙げられる。
　置換グアニジノ（－ＮＲ－Ｃ（＝ＮＲ'''）－ＮＲ'Ｒ"）の例としては、Ｒ，Ｒ'、Ｒ"、およびＲ'''が、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルの中からそれぞれ独立して選択された基、あるいはこれらが環を形成した基などが挙げられる。
　アミノカルボニルアミノ（－ＮＲ－ＣＯ－ＮＲ'Ｒ"）の例としては、Ｒ、Ｒ'、およびＲ"が、水素原子、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルの中からそれぞれ独立して選択された基、あるいはこれらは環を形成した基などが挙げられる。
　Ｂ原子由来の置換基として、ボリル（－ＢＲ（Ｒ'））やジオキシボリル（－Ｂ（ＯＲ）（ＯＲ'））などが挙げられる。これらの２つの置換基ＲおよびＲ'は、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキルなどの中からそれぞれ独立して選択されるか、あるいはこれらは環を形成してもよい。
　一般には、アミノ酸とは、分子内にアミノ基とカルボキシル基をそれぞれ１つ以上有する分子のことを意味するが、本明細書においては。分子内にヒドロキシル基とカルボキシル基を有するヒドロキシカルボン酸も本発明のアミノ酸に含めることができる。本明細書では、ヒドロキシカルボン酸をヒドロキシアミノ酸ということもある。
　αアミノ酸は、アミノ酸分子内のアミノ基とカルボキシル基が結合している炭素が同一のものを意味し、該炭素上の置換基をアミノ酸の側鎖という。アミノ酸分子内のアミノ基、カルボキシル基、およびこれらが結合している炭素の一連の部分をアミノ酸の主鎖という。
　アミノ酸の主鎖アミノ基は、非置換（ＮＨ２基）でもよく、置換されていてもよい（即ち、－ＮＨＲ基：Ｒは置換基を有していてもよいアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、シクロアルキルを示し、またプロリンのようにＮ原子に結合した炭素鎖とα位の炭素原子とが環を形成していてもよい。）。このような主鎖アミノ基が置換されているアミノ酸を、本明細書において「Ｎ置換アミノ酸」と称する。本明細書における「Ｎ置換アミノ酸」としては、好ましくはＮ－アルキルアミノ酸、Ｎ－Ｃ１－Ｃ６アルキルアミノ酸、Ｎ－Ｃ１－Ｃ４アルキルアミノ酸、Ｎ－メチルアミノ酸、「分子内水素結合を形成し得る」側鎖を有するＮ置換アミノ酸が例示されるが、これらに限定されるものではない。
　本明細書におけるペプチド化合物を構成する「アミノ酸」にはそれぞれに対応する全ての同位体を含む。「アミノ酸」の同位体は、少なくとも１つの原子が、原子番号（陽子数）が同じで、質量数（陽子と中性子の数の和）が異なる原子で置換されたものである。本発明のペプチド化合物を構成する「アミノ酸」に含まれる同位体の例としては、水素原子、炭素原子、窒素原子、酸素原子、リン原子、硫黄原子、フッ素原子、塩素原子などがあり、それぞれ、２Ｈ、３Ｈ、１３Ｃ、１４Ｃ、１５Ｎ、１７Ｏ、１８Ｏ、３２Ｐ、３５Ｓ、１８Ｆ、３６Ｃｌ等が含まれる。
　本発明における「直鎖状のペプチド化合物」は、天然アミノ酸および／または非天然アミノ酸がアミド結合あるいはエステル結合で連結されることにより形成されたものであり、環状部を有しない化合物である限り、特に限定されない。直鎖状のペプチド化合物を構成する天然アミノ酸あるいは非天然アミノ酸の総数は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、２５、３０個であることができ、好ましい範囲は６～２０個、７～１９個、７～１８個、７～１７個、７～１６個、７～１５個、８～１４個、９～１３個である。
　本発明における「環状ペプチド化合物」は、天然アミノ酸および／または非天然アミノ酸がアミド結合あるいはエステル結合で連結されることにより形成されたものであり、環状部を有する化合物である限り、特に限定されない。環状のペプチド化合物を構成する天然アミノ酸あるいは非天然アミノ酸の総数は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、２５、３０個であることができ、好ましい範囲は６～２０個、７～１９個、７～１８個、７～１７個、７～１６個、７～１５個、８～１４個、９～１３個である。
　本明細書において、ペプチド化合物の「環状部」とは、２以上のアミノ酸残基が連結され、形成されている環状の部分を意味する。また本明細書において、環状ペプチド化合物の部分構造を指す際に使用される「直鎖部」とは、環状部の主鎖構造に含まれない部分であって、該部分の鎖上に少なくとも一つのアミド結合及び／又はエステル結合を有するものをいう。
　本明細書における環状ペプチド化合物の環状部を構成するアミノ酸の数は限定されないが、例えば、２以上、３以上、４以上、６以上、７以上、８以上、９以上、１０以上、１１以上、１２以上、３０以下、２０以下、１８以下、１６以下、１５以下、１４以下、１３以下、１２以下、１１以下、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、及び１６が挙げられる。膜透過性と代謝安定性の両立を考慮すると、前記環状部を構成するアミノ酸の数は、２～３０、２～１５、又は５～１５が好ましく、５～１４、７～１４、又は８～１４がより好ましく、８～１３、９～１３、８～１２、８～１１、又は９～１２がさらに好ましく、９～１１が特に好ましい。
　非限定の一態様において、直鎖部のアミノ酸の数（ユニットの数）は０～８であることが好ましく、０～５がより好ましく、０～３がより好ましい。なお、非限定の一態様において、本明細書における「直鎖部」には天然アミノ酸や非天然アミノ酸（化学修飾や骨格変換されたアミノ酸を含む）が含まれる場合がある。
　非限定の一態様において、本明細書におけるペプチド化合物、または環状ペプチド化合物は環状部または直鎖部にエステル結合を有さないものが好ましい。
　非限定の一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物は、環状部又は直鎖部のペプチド部位の側鎖に以下（Ａ）～（Ｃ）からなる群より選択される少なくとも一つを有しない環状ペプチド化合物であってよい：
（Ａ）インドール骨格；
（Ｂ）２以上の芳香環による縮環構造；
（Ｃ）無置換のヒドロキシフェニル基。
　このうち、環状部の側鎖に前記（Ａ）、（Ｃ）を有しない環状ペプチド化合物が好ましく、環状部の側鎖に前記（Ｂ）、（Ｃ）を有しない環状ペプチド化合物がより好ましい。前記「２以上の芳香環による縮環構造」は、「縮環構造」であってもよい。
　非限定の一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物の分子量は５００～２０００であってよい。
　非限定の一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物は、環状部又は直鎖部のペプチド部位の側鎖に（Ａ）メチルチオ基および（Ｂ）チオール基からなる群より選択される少なくとも一つ、又は両方を有しない、環状ペプチド化合物であることができる。
　本発明において、２つのアミノ酸がアミド結合することによりペプチド化合物が形成される場合、第一のアミノ酸中の主鎖のカルボキシル基のＯＨ基が、第二のアミノ酸中の主鎖のアミノ基の窒素原子部分で置換することによってペプチド化合物が形成される。
　本発明において、２つのアミノ酸がエステル結合することによりペプチド化合物が形成される場合、第一のアミノ酸中の主鎖のカルボキシル基のＯＨ基が、第二のヒドロキシアミノ酸中の主鎖の水酸基の酸素原子部分で置換することによってペプチド化合物が形成される。
　本発明において、天然アミノ酸および／または非天然アミノ酸がアミド結合あるいはエステル結合で連結されることによりペプチド化合物が形成される場合、２つ以上のアミノ酸が、アミド結合および／またはエステル結合により、連続して結合していることにより、ペプチド化合物が形成される。
　本明細書におけるペプチド化合物のアミド結合及び／又はエステル結合により連結される部位を本明細書において「ペプチド部位」ということがある。ただし、ペプチド化合物が環状である場合には、環化部の結合様式はアミド結合やエステル結合に限定されない。環化部の結合様式としては、例えば、アミド結合、炭素－炭素結合、ジスルフィド結合、エステル結合、チオエステル結合、チオエーテル結合、ラクタム結合、トリアゾール構造を介した結合、フルオロフォア構造を介した結合などの共有結合が挙げられ、これらのうちでは代謝安定性が高いことから、アミド結合が好ましい。すなわち、一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物は、環化部にアミド結合を有することが好ましい。「環化部の結合様式」とは、環化反応により環化が形成された部位の結合様式のことである。
　本発明における「ペプチド化合物」としては、上述の天然アミノ酸及び非天然アミノ酸の総数の条件に加えて、又は単独で、Ｎ置換アミノ酸を少なくとも２つ（好ましくは２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、２５、３０個、特に好ましくは５、６または７個、好ましい範囲は２～３０個、３～３０個、６～２０個、７～１９個、７～１８個、７～１７個、７～１６個、７～１５個、８～１４個、９～１３個）含み、Ｎ置換されていないアミノ酸を少なくとも１つ含む、直鎖または環状ペプチドであることができる。「Ｎ置換」としてはＮ原子に結合した水素原子のメチル基、エチル基、プロピル基、ブチル基、ヘキシル基への置換などが挙げられるがこれに限定されない。Ｎ置換アミノ酸として、好ましくは天然アミノ酸に含まれるアミノ基がＮ－メチル化、Ｎ－エチル化、Ｎ－プロピル化、Ｎ－ブチル化、Ｎ－ペンチル化されたアミノ酸が挙げられ、これらを、Ｎ－メチルアミノ酸、Ｎ－エチルアミノ酸、Ｎ－プロピルアミノ酸、Ｎ－ブチルアミノ酸、Ｎ－ペンチルアミノ酸という。Ｎ未置換アミノ酸をＮ置換アミノ酸に変換することをＮ置換化するといい、Ｎ－アルキル化、Ｎ－メチル化、またはＮ－エチル化ということがある。本発明におけるペプチド化合物に含まれるＮ置換アミノ酸数の割合としては、ペプチド化合物を構成する総アミノ酸数の３０％以上、４０％以上、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上が例示される。
　非限定の一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物のペプチド部位に含まれるＮ置換アミノ酸の数は、２以上又は３以上が好ましく、４以上、５以上、又は６以上がより好ましく、７以上が更に好ましく、８以上が特に好ましく、また、２０以下、１５以下、１４以下、１３以下、１２以下、１０以下、９以下が好ましく例示される。本明細書における環状ペプチド化合物に含まれるＮ置換アミノ酸の数としては、環状部を構成するアミノ酸の数の３０％以上、４０％以上、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上が例示される。ここでいうＮ置換アミノ酸は、好ましくはＮ－アルキルアミノ酸、より好ましくはＮ－メチルアミノ酸であってよい。すなわち、非限定の一態様においては、前記Ｎ置換アミノ酸の数は、Ｎ－アルキルアミノ酸の数、又はＮ－メチルアミノ酸の数として、例示される。環状部を構成するアミノ酸の数が８の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は３～７が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が９の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は３～８が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が１０の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は３～８が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が１１の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は４～９が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が１２の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は４～１０が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が１３の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は４～１１が好ましい。環状部を構成するアミノ酸の数が１４の場合、Ｎ置換アミノ酸の数は５～１２が好ましい。
　本明細書において、ペプチド化合物を構成する「アミノ酸」を「アミノ酸残基」ということがある。
　本明細書における「ペプチド化合物」には、その薬学的に許容される塩、またはこれらの溶媒和物が含まれてもよい。
　本明細書において「側鎖」とは、アミノ酸の側鎖、又は環状ペプチド化合物の環状部の側鎖などの文脈で使用され、それぞれの主鎖構造に含まれない部分を意味する。
　本明細書において「アミノ酸の数」とは、ペプチド化合物を構成するアミノ酸残基（アミノ酸ユニット）の数のことであり、アミノ酸を連結しているアミド結合、エステル結合、及び環化部の結合を切断した際に生じるアミノ酸ユニットの数を意味する。
ペプチド化合物の膜透過性
　非限定の一態様において、本明細書におけるペプチド化合物、または環状ペプチド化合物は、高い膜透過性を達成するために、中性（例えばpH=7.0）で極度にイオン化される官能基を有しない環状ペプチド化合物であってよい。本明細書で用いるpKaは別段示さない限り実測値のpKaのことを指す。また、後述するADMETPredictorによって求めたpKa値を計算pKaと称する。本明細書で用いるBasic pKaは別段示さない限り実測値のBasic pKaのことを指す。また、後述するADMETPredictorによって求めたBasic pKa値をBasic計算pKaと称する。
　pKa、及びBasic pKaは、常法により求めることができる。例えば、実験化学講座５「熱的測定および平衡」、４６０頁（日本化学会編、丸善株式会社発行）に記載の方法などにより測定することができる。より具体的には、参照例３－１に記載の方法で測定できる。また、測定しようとするアミノ酸の側鎖のpKa値、及びBasic pKa値が他の官能基の影響を受けて求められにくい時は、目的の官能基のpKa、及びBasic pKaのみが測定できるよう、適宜他の官能基を保護基などで保護して測定することができる。
　本明細書において「酸性の側鎖」とは、pKaが１０以下の側鎖を意味し、「塩基性の側鎖」とは、Basic pKaが４以上の側鎖を意味する。本明細書において、pKaが１０を超える側鎖、Basic pKaが４未満の側鎖は、中性の側鎖と定義される。
　非限定の一態様において、本明細書におけるペプチド化合物、または環状ペプチド化合物は、分子内水素結合をしうる側鎖を持つアミノ酸以外に分子内水素結合しない酸性の側鎖を有するアミノ酸を含むことができる。この場合、その酸性の側鎖のpKaは３．５～１０であってよい。前記酸性の側鎖のpKaは３．５以上であることが好ましく、３．９以上がより好ましく、４．５以上がより好ましく、５．０以上がより好ましく、５．５以上がより好ましく、５．７以上がより好ましい。また前記Basic pKaは、１０以下であることが好ましい。前記pKaの範囲としては、３．５～１０、３．９～１０、４．５～１０、５．０～１０、又は５．５～１０、５．７～１０が好ましく例示される。これらpKaを計算値であらわすと、計算pKaは３．５以上であることが好ましく、４．５以上、５．０以上、５．４以上、８．０以上、８．３以上がより好ましい。また計算pKaは、１０以下であることが好ましい。前記計算pKaの範囲としては、３．５～１０、４．５～１０、５．０～１０、５．４～１０、８．０～１０、又は８．３～１０が好ましく例示される。
　非限定の一態様において、本明細書におけるペプチド化合物、または環状ペプチド化合物は、分子内水素結合をしうる側鎖を持つアミノ酸以外に分子内水素結合しない塩基性の側鎖を有するアミノ酸を含むことができる。この場合、その塩基性の側鎖のBasic pKaは４．０～１０であってよい。前記塩基性の側鎖のBasic pKaは１０以下であることが好ましく、９．５以下、９．０以下、８．５以下、７．５以下、または７．２以下がより好ましく、６．５以下が特に好ましい。また前記Basic pKaは、４．０以上であることが好ましい。前記Basic pKaの範囲としては、４．０～１０、４．０～９．５、４．０～９．０、４．０～８．５、４．０～７．５、４．０～７．２、４．０～６．５好ましく例示される。これらBasic pKaを計算値であらわすと、Basic計算pKaは１０以下であることが好ましく、９．５以下、９．０以下、８．８以下、８．６以下、８．５以下、７．５以下、または６．５以下がより好ましい。また前記Basic計算pKaは、４．０以上であることが好ましい。前記Basic計算pKaの範囲としては、４．０～１０、４．０～９．５、４．０～９．０、４．０～８．８、４．０～８．６、４．０～８．５、４．０～７．５、４．０～６．５が好ましく例示される。
　限定を意図しないが、後述の参照例に示されるように、ペプチド部位の側鎖に含まれる芳香環の数、又は割合は、環状ペプチド化合物の膜透過性に影響を与え得る。ペプチド部位の側鎖に含まれる芳香環の数、又は割合が一定数を超えると、高い膜透過性を有する化合物が得られる確率が低下し得る。すなわち、芳香環の数は、膜透過性に負の影響を与えうる。
　本明細書において、発明の効果に関する文脈で使用される「負の影響」とは、発明の効果を打ち消してしまうような影響をいう。例えば、本来発揮されるはずの発明の効果を１００％とした場合に、その効果が３０％、２０％、１０％、又は５％以下になるような場合に「負の影響」があるとすることができる。
　非限定の一態様において、高い膜透過性のためには、本明細書における環状ペプチド化合物のペプチド部位の側鎖に含まれる芳香環の数は５以下であることが好ましく、０、１、２、又は３が好ましく例示され、０～３、１～３が好ましい範囲として例示される。また、ペプチド部位を構成するアミノ酸の数に対する、ペプチド部位の側鎖に含まれる芳香環の数の割合としては、４０％以下が好ましく、３５％以下、３０％以下、２７％以下、２５％以下、２０％以下が好ましく例示される。
　本明細書において「芳香環の数」（「Aromatic Ring Count」（ＡＲＣ）ともいう。）とは、環状ペプチド化合物のペプチド部位の側鎖に含まれる芳香環の数をいい、例えば、フェノール基は１個、インドール骨格のような二環式縮環は２個、アントラセンのような三環式縮環は３個と数える。
　非限定の一態様において、高い膜透過性のためには、本明細書における環状ペプチド化合物に含んでよい芳香環の数に制限がある一方で、分子内水素結合を形成し得る側鎖を含むアミノ酸は、標的分子との結合に寄与し得る部位である環状部に存在するのが好ましい。すなわち、一態様において、本明細書におけるペプチド化合物が、環状ペプチド化合物であり、かつ該環状ペプチド化合物の環状部に、分子内水素結合を形成し得る側鎖に芳香環を含むアミノ酸が含まれる場合には、ペプチド化合物の環状部に含まれる芳香環の数として、１、２、又は３が例示され、芳香環数の範囲として１～３又は２～３が例示される。また、本明細書におけるペプチド化合物が、環状ペプチド化合物であり、かつ該環状ペプチド化合物の環状部に、分子内水素結合を形成し得る側鎖に芳香環を含むアミノ酸が含まれる場合には、ペプチド化合物に含まれる芳香環の総数のうち環状部に含まれる芳香環の数の割合としては、３０％以上、４０％以上、６０％以上、８０％以上、又は１００％が例示される。
　本発明におけるペプチド化合物の膜透過性は、国際公開第２０１８／１２４１６２号に記載の膜透過性の測定方法により測定することができる。
　非限定の一態様において、本発明のペプチド化合物のＰａｐｐは、１．０×１０－７ｃｍ／秒以上、５．０×１０－７ｃｍ／秒以上、８．０×１０－７ｃｍ／秒以上が好ましく、９．０×１０－７ｃｍ／秒以上がより好ましく、１．０×１０－６ｃｍ／秒以上が更に好ましく、３．０×１０－６ｃｍ／秒以上が特に好ましい。
　本明細書における「膜透過係数（Papp）」は、特に断りがない限り、国際公開第２０１８／１２４１６２号に記載の測定方法（改良法）を用いて測定した値を意味する。
　非限定の一態様において、本明細書における環状ペプチド化合物のＣｌｏｇＰは、４以上が好ましく、５以上がより好ましく、６以上が更に好ましく、８以上が特に好ましく、１８以下、１７以下、１６以下が好ましく例示され、４～１８、５～１７、及び６～１６が例示される。本明細書におけるＣｌｏｇＰは、コンピューターで計算した分配係数であって、Daylight Chemical Information Systems, Inc.のDaylight Version 4.9を用いて計算できる。
　非限定の一態において、本明細書における環状ペプチド化合物のClogP/total aaの下限としては、１．０以上が好ましく、１．１以上がより好ましく、１．２以上が更に好ましい。またClogP/total aaの上限としては、１．８以下、１．７以下、１．６以下、１．５以下が好ましい。ClogP/total aaの範囲としては、１．０～１．８、１．０～１．７、１．１～１．６、及び１．１～１．５が例示される。本明細書において「total aa」 (「total AA」とも表記される。)とは、ペプチド化合物のペプチド部位を構成するアミノ酸の数を意味する。例えば、環状部が１０個のアミノ酸からなり、直鎖部が１個のアミノ酸からなる環状ペプチド化合物のtotal aaは１１である。本明細書においてClogP/total aaとは、ClogPをtotal aaで除することにより算出される。
ペプチド化合物の代謝安定性
　非限定の一態様において、本明細書におけるペプチド化合物は、良好な代謝安定性を有することが好ましい。良好な代謝安定性のためには、ペプチド化合物中に含まれるアミノ酸の数が８以上であることが好ましく、９以上がより好ましく、１１以上が更に好ましい。また、一態様において、容易に酸化される可能性のあるチオエーテル結合を有しないことが好ましい。また、一態様において、酸化されやすく代謝安定性の妨げとなり得ることから、メチルチオ基を有しないことが好ましい。
（分子内水素結合を形成し得るアミノ酸）
　非限定の一態様において、本発明のペプチド化合物は、その側鎖内で水素結合（即ち、分子内水素結合）を形成できるアミノ酸を少なくとも１つ、具体的には、例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上含む。
　本明細書におけるアミノ酸の側鎖には、アミノ酸に含まれる炭素原子（例えば、α、β、又はγ－炭素原子）に結合している鎖、及び窒素原子に結合している鎖が含まれる。本明細書において、アミノ酸の側鎖の長さは、参照例１に記載の方法により求めることができる。すなわち、アミノ酸単位のＮ末をアセチル基、Ｃ末をメチルアミノ基でキャッピングし、分子モデリングソフトＭＯＥ（Chemical Computing Group社）のLowModeMDにより配座を発生させ、側鎖部位が結合している原子（天然アミノ酸の場合はα－炭素原子（Ｃα炭素））から最も遠い同側鎖の原子（水素原子は除く）までの距離を測定することで求めることができる。
　本明細書において「長側鎖」とは、５．４オングストローム以上の長さの側鎖をいう。分子内水素結合のためにアミノ酸の側鎖は長側鎖であることが好ましい。長側鎖の長さとしては、５．４オングストローム以上が好ましく、５．６オングストローム以上がより好ましく、５．８オングストローム以上がさらに好ましく、６．０オングストローム以上が特に好ましい。前記側鎖の長さの上限は特に限定されないが、２０オングストローム以下、１５オングストローム以下、１３オングストローム以下、１２オングストローム以下、１１オングストローム以下、１０オングストローム以下、９．０オングストローム以下、８．８オングストローム以下、８．５オングストローム以下、及び８．０オングストローム以下が例示される。前記長側鎖の長さの範囲としては、５．４～２０オングストローム、６．０～２０オングストローム、６．０～１５オングストローム、６．０～１３オングストローム、６．０～１０オングストロームが例示される。
　非限定の一態様において、「長側鎖」は、（ｉ）その側鎖上にアミド結合を含まないか又は１個のアミド結合を含む側鎖が好ましく、（ｉｉ）その側鎖上にアミド結合を含まない側鎖であってもよい。すなわち、非限定の一態様において、その側鎖に２個以上のアミド結合を有さず、かつ、長さが６．０～１１オングストロームの長側鎖を有するアミノ酸を環状部に有する環状ペプチド化合物が好ましく例示される。本明細書における長側鎖は、芳香環を有していても、有していなくてもよい。
　非限定の一態様において、分子内水素結合を形成し得るアミノ酸は長側鎖のアミノ酸であることが好ましい。
　分子内水素結合の有無は例えばX線構造解析や1HNMRによるケミカルシフトにより判別できる。一般的に、温度依存的化学シフト変化量が<2 ppb/Kの場合は明確な水素結合をしており、>4 ppb/Kの場合は水素結合していないとされている。また実施例３に例示されるような計算化学によるコンフォメーション解析も分子内水素結合を形成する可能性があるか判断するのに用いられる手法である。
　ある局面において、本発明のペプチド化合物は、その側鎖内で擬似Ｗ員環を形成し得るアミノ酸を少なくとも１つ、具体的には、例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上含む。
　本明細書において「擬似Ｗ員環」とは、共有結合による環状構造は有していないが、分子内水素結合により配座が固定されることで擬似的な環状構造を形成することを意味する。「Ｗ」は、３以上の自然数から選ばれる環の大きさを表しており、擬似的な環状部分を構成する原子にはプロトンドナーである水素原子およびその水素原子と直接結合している原子、プロトンドナーと水素結合を形成できるプロトンアクセプターの３原子が必ず含まれる。疑似環状構造の環状構造の環の大きさを表すＷは、３以上であればよく、好ましくは４～７、または５～７、さらに好ましくは５～６である。以下に例示するSer(nPrOH)の側鎖部分構造の場合は、プロトンドナーである水酸基の水素原子およびその水素原子が直接結合する水酸基の酸素原子、プロトンアクセプターであるエーテル基の酸素原子がそれぞれ前記３原子に該当し、擬似６員環を形成している。また、分子内水素結合は周辺の環境に合わせて環化体と、非環化体とに構造変換できることが特徴であり、生体膜中のような疎水性の環境下ではプロトンドナーをマスクするような環化体構造をとることで、分子内水素結合をする官能基を有する化合物の膜透過性向上が期待できる。一方で、標的分子の阻害剤として、ある化合物が該標的分子と結合する場合を例示すると、分子内水素結合をする官能基を有する該化合物が非環化体構造をとることで、プロトンドナーとプロトンアクセプターの双方もしくはいずれか一方が該標的分子と結合することが期待され、該化合物と標的分子との間で、より効率よく分子間水素結合を形成することが可能となる。下記にはその１例として分子内水素結合をしうる構造の一部が、標的分子のアミド部位と分子間相互結合を形成する模式図を記載している（＊はＳｅｒ（ｎＰｒＯＨ）のα炭素との、＊＊、および＊＊＊はそれぞれ標的分子のタンパクとの結合点をあらわす）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000021
　非限定の一態様において、分子内水素結合し得る側鎖を有するアミノ酸は、その分子内水素結合を形成する部分構造において擬似４～７員環を形成してもよく、擬似５～７員環を形成することが好ましく、擬似５～６員環を形成することが特に好ましい。
　非限定の一態様において、本明細書において、分子内水素結合を形成し得る構造として以下が例示される（＊は式１のＱ１または式２のＱ２との結合点をあらわす）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000022
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000023
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000024
　非限定の一態様において、側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸は、下記式Ａで表すことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000025
　ある局面において、式（Ａ）中、Ｒ１は、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、この場合、（ａ）Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、Ｒ２Ａが水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、かつＲ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、（ｂ）Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成する。Ｒ１がＣ１－Ｃ６アルキルである場合、Ｒ１として好ましくはメチルである。Ｒ２ＢがＣ１－Ｃ６アルキルである場合、Ｒ２Ｂはメチルが好ましい。またＲ２ＢがＣ１－Ｃ６アルキルである場合、Ｒ２Ａは式１もしくは式２で表される基であるか、またはＣ１－Ｃ６アルキルであることが好ましい。またＲ２ＡおよびＲ２Ｂが、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成する場合、該４～６員環として、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロへキシルが好ましい。
　別の局面において、式（Ａ）中、Ｒ１は、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子と一緒になって４～６員の複素環を形成し、この場合、Ｒ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルである。Ｒ２ＢがＣ１－Ｃ６アルキルである場合、Ｒ２Ｂはメチルが好ましい。前記４～６員の複素環は、式１もしくは式２で表される基、－ＯＨ、およびアルコキシ基からなる群より選択される、１つまたは複数の置換基を有していてもよい。また前記４～６員の複素環としては、ピロリジン（即ち、プロリン様の構造）が好ましい。
　Ｒ１、Ｒ２Ａ、Ｒ２Ｂの組み合わせとしては、Ｒ２Ａが式１または式２で表される基である場合、Ｒ１が水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、かつＲ２Ｂが水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであることが好ましく、該Ｃ１－Ｃ６アルキルはメチルであることが好ましい。また、Ｒ１が式１または式２で表される基である場合、Ｒ２Ａが水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、かつＲ２Ｂは水素、Ｃ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいはＲ２ＡとＲ２Ｂは一緒になって４～６員の環を形成することが好ましく、該Ｃ１－Ｃ６アルキルはメチルが好ましい。
　式（Ａ）中、Ｒ３は、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、ここでＲ４は、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基である。Ｒ３が－ＣＨＲ４－である場合、Ｒ４として好ましくは水素、または式１もしくは式２で表される基である。
　式（Ａ）中、式１および／または式２で表される基は２つ以上含まれていてもよいが、式１または式２で表される基のいずれか１つのみが含まれていることが好ましい。式１または式２で表される基のいずれかが１つが含まれている態様として具体的には、たとえば、以下が挙げられる。
(i)Ｒ１が、式１または式２で表される基であり、Ｒ２Ａが水素、またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ２Ｂが、水素またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、Ｒ４が、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくは水素である。
(ii)Ｒ１が水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、Ｒ２Ａが式１または式２で表される基であり、Ｒ２Ｂが水素またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－、好ましくは単結合であり、Ｒ４が、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくは水素である。
(iii)Ｒ１が水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、Ｒ２Ａが水素、またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ２Ｂが水素、またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ３が－ＣＨＲ４－であり、Ｒ４が式１または式２で表される基である。
(iv) Ｒ１、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子が一緒になって、４～６員の複素環（好ましくはピロリジン環）を形成し、該複素環が式１もしくは式２で表される基を有し、Ｒ２Ｂが、水素またはＣ１－Ｃ６アルキル、好ましくは水素であり、Ｒ３が、単結合、または－ＣＨＲ４－、好ましくは単結合であり、Ｒ４が、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくは水素である。
　式１および式２は、それぞれ下記式：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000026
で表され、式中の＊は結合点を示す。式Ａで表されるアミノ酸は、式１または式２で表される基のいずれかを少なくとも１つ含む。例えば、式Ａで表されるアミノ酸は、式１または式２で表される基のいずれか一方を含むことができ、この場合、式Ａ中のＲ１、Ｒ２、またはＲ４のいずれか１つが式１または式２で表される基である。
　式１中、Ｑ１は、単結合、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、または酸素原子を１つ含むＣ２－Ｃ４ヘテロアルキレンである。Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレンである場合、Ｑ１として好ましくは－ＣＨ２－もしくは－(ＣＨ２)２－である。
　式１中、Ａ１は、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、好ましくは－Ｏ－である。
　式１中、Ｌ１は、フッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンである。Ｌ１として具体的には、－ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２－、－（ＣＨ２）３－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＦ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２－、－（ＣＨ２）２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２Ｃ（ＣＨ３）２－、－ＣＨ２ＣＯ－などが挙げられる。ある局面において、Ｌ１は、非置換の－（ＣＨ２）２－でないことが好ましい。
　式１中、Ｘは、－ＯＨ、－ＮＲＺ１ＲＺ２、もしくは－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり、ここでＲＺ１およびＲＺ２は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択される。Ｘが－ＮＲＺ１ＲＺ２である場合、Ｘは－ＮＨ２、－ＮＨＭｅ、－ＮＨＥｔ、－ＮＨ（ｎＰｒ）、－ＮＨ（ｉＰｒ）、－ＮＨ（ｔＢｕ）が好ましい。Ｘが－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２である場合、Ｘは－ＣＯＮＨ２、－ＣＯＮＨＭｅ、－ＣＯＮＨＥｔ、－ＣＯＮＨ（ｎＰｒ）、－ＣＯＮＨ（ｉＰｒ）、－ＣＯＮＨ（ｔＢｕ）が好ましい。またＸがオキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルである場合、該飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルとして４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾリル、４，５－ジヒドロ－１，２，４－チアジアゾリル、ピロリジルが好ましく、Ｘとして以下の基：
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000027
が好ましい。
　このような－Ｑ１－Ａ１－Ｌ１－Ｘの好ましい組み合わせとして、具体的には、以下が挙げられる。
(i) Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、Ｘが－ＯＨである。
(ii) Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｘが－ＮＲＺ１ＲＺ２であり、ＲＺ１がＣ１－Ｃ４アルキルであり、ＲＺ２が水素である。
(iii) Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｘが－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であり、ＲＺ１がＣ１－Ｃ４アルキルであり、ＲＺ２が水素である。
(iv) Ｑ１がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｘが１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲン（好ましくはフッ素）によって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルである。
(v) Ｑ１が単結合であり、Ａ１が－Ｏ－または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、Ｌ１が、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、Ｘが－ＯＨである。
　式２中、Ｑ２は、単結合、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、または酸素原子を１つ含むＣ２－Ｃ４ヘテロアルキレンである。Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレンである場合、Ｑ２として好ましくは－ＣＨ２－もしくは－(ＣＨ２)２－である。
　式２中、Ｌ２は、単結合であるか、またはフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンである。Ｌ２として具体的には、単結合、－ＣＨ２－、－ＣＯ－、－（ＣＨ２）２－、－（ＣＨ２）３－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２ＣＨ（ＣＦ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２－、－（ＣＨ２）２ＣＨ（ＣＨ３）－、－ＣＨ２Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２－、－（ＣＨ２）２Ｃ（ＣＨ３）２－、－ＣＨ２ＣＯ－などが挙げられる。
　式２中、Ｙは、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノ、－ＮＲＺ３ＲＺ４、もしくは－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくはハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり、ここでＲＺ３およびＲＺ４は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択される。Ｙが－ＮＲＺ３ＲＺ４である場合、Ｙは－ＮＨ２、ＮＨＭｅ、ＮＨＥｔ、ＮＨ（ｎＰｒ）、ＮＨ（ｉＰｒ）、ＮＨ（ｔＢｕ）が好ましい。また、ＹがＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノである場合、Ｙはメチルスルホニルアミノが好ましい。さらにまた、ＹがＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノである場合、Ｌ２は－ＣＯ－であることが好ましい。
　式２中、Ａ２は、単結合、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、好ましくは－Ｏ－である。
　式２中、Ｚは、水素、またはＣ１－Ｃ４アルキルであり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキルである場合、該Ｃ１－Ｃ４アルキルとして好ましくはメチルである。
　式２中、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－である場合、Ｚは水素ではない。すなわち、－Ａ２－Ｚとして具体的には、Ａ２が単結合であり、かつＺが水素であるか、Ａ２が－Ｏ－であり、かつＺがＣ１－Ｃ４アルキルであるか、またはＡ２が－Ｓ－であり、かつＺがＣ１－Ｃ４アルキルである。
　このような－Ｑ２－、－Ｌ２－Ｙ、および－Ａ２－Ｚの好ましい組み合わせとして、具体的には、以下が挙げられる。
(i) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２がフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは－ＣＯ－であり、Ｙが－ＮＲＺ３ＲＺ４、好ましくはメチルアミノ、－Ｎ（ＯＨ）Ｍｅ、または－ＮＨ（ＯＨ）であり、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくはメチルである。
(ii) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２が単結合であり、Ｙが－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４、好ましくはメチルアミノカルボニルまたは－ＣＯＮ（ＯＨ）Ｍｅ、または－ＣＯＮＨ（ＯＨ）であり、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくはメチルである。
(iii) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２がフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは－ＣＯ－であり、Ｙが－ＮＲＺ３ＲＺ４、好ましくは－Ｎ（ＯＨ）Ｍｅであり、Ａ２が単結合であり、Ｚが水素である。
(iv) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２が単結合であり、Ｙが－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４、好ましくは－ＣＯＮ（ＯＨ）Ｍｅであり、Ａ２が単結合であり、Ｚが水素である。
(v) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２がフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレン、好ましくは－ＣＯ－であり、ＹがＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノ、好ましくはメチルスルホニルアミノであり、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくはメチルである。
(vi) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２が単結合であり、ＹがＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノカルボニル、好ましくはメチルスルホニルアミノカルボニルであり、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくはメチルである。
(vii) Ｑ２がＣ１－Ｃ４アルキレン、好ましくは、－ＣＨ２－であり、Ｌ２が単結合であり、Ｙが－ＯＨであり、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－、好ましくは－Ｏ－であり、ＺがＣ１－Ｃ４アルキル、好ましくはメチルである。
　このような側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸、および／または側鎖内で擬似４～７員環を形成し得るアミノ酸としてより具体的には、以下のアミノ酸が挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000028
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000029
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000030
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000031
　非限定の一態様において、本発明の式Ａで表されるアミノ酸が、ペプチド化合物に含まれる場合、該アミノ酸の主鎖のアミノ基およびカルボキシル基によって隣接するアミノ酸と連結することが好ましい。この場合、式（Ａ）で表されるアミノ酸は、以下のように表すこともできる（＊はペプチド化合物中で、隣接するアミノ酸との結合点をあらわす）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000032
　非限定の一態様において、本発明は、前記分子内水素結合を形成し得るアミノ酸のアミノ基、および／またはカルボキシル基が保護基で保護されている保護アミノ酸に関する。保護アミノ酸のアミノ基の保護基としては、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ｃｂｚ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基、ジニトロノシル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、クミル基などが挙げられる。また保護アミノ酸のカルボキシル基の保護基としては、メチル基、アリル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、クミル基、メトキシトリチル基、ベンジル基などが挙げられる。例えば、「Greene’s,“Protective Groups in Organic Synthesis″（第５版，John Wiley & Sons 2014）」に記載の方法を利用してこれらの保護基を導入することができる。
　特定の理論に拘束されることを意図しないが、本発明者らは以下のように考える。ペプチドに含まれるアミノ酸の側鎖上のプロトンを水素結合でマスクする手段として、ペプチドの主鎖に含まれるアミド結合を利用する場合、ペプチドのコンフォメーションがペプチドごとに異なることから、側鎖上のプロトンをマスクするような水素結合の形成は偶然に頼らざるを得ない。したがって、側鎖のプロトンを常に水素結合の形成によってマスクすることは難しい。また、隣接するアミノ酸の主鎖に含まれるアミド結合を利用して側鎖のプロトンをマスクするような水素結合を形成させる場合、採用し得る側鎖のバリエーションが限られてしまう。隣接するアミノ酸の主鎖に含まれるアミド結合と水素結合を形成することが想定されるアミノ酸の場合、プロトンドナーの位置は水素結合を形成することが可能な主鎖のアミド結合と近い位置に限定されたものになる。一方、非限定の一態様において、本明細書のアミノ酸はその「側鎖内」で水素結合を形成することが可能なため、側鎖デザインの自由度が高まり得る。例えば、プロトンをマスクし得る水素結合の形成を維持したまま側鎖を長くすることも可能であり、側鎖上のプロトンが標的との相互作用に用いられる可能性が高まり得る。
（一般的製造方法）
　次に本発明の側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸、およびペプチド化合物の一般的な製造方法について説明する。
（分子内水素結合を形成し得るアミノ酸の製造方法）
　側鎖に分子内水素結合を有するアミノ酸の製造において、側鎖にエーテル結合を有するアミノ酸に関しては、以下の２つの合成法により製造できる。
製法１：
　アミノ基とカルボン酸基が保護されたアジリジンを有する化合物と対応する適切な保護基を有するアルコールをLewis酸存在下反応させ、開環反応を行った後、不要な保護基の脱保護を行う。下記一般式中、Ｐ１としてはＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などを、Ｐ２としてはＭｅ基、アリル基、ベンジル基などを用いることが出来る。開環反応に用いるLewis酸としては触媒量のBF3・OEt2が好ましく例示される。溶媒はジクロロメタンが好ましく例示されるが、試薬として使用するアルコール（ＲＯＨ）を溶媒として用いることも可能である。Ｒ上に反応に関与する可能性のある官能基が含まれる場合、該官能基をLewis酸存在下において安定な保護基で保護することが好ましい。例えばＲが水酸基を含む場合はベンジル基などで該水酸基を、２級アミノ基を含む場合はＡｌｌｏｃ基などで該アミノ基を保護することが好ましい。開環反応によりアミノ酸の基本骨格を構築した後は保護基の適切な変換を行うことで所望のアミノ酸（Ｐ３がＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などで保護されたアミノ酸あるいはＰ３が水素である無保護のアミノ酸）に変換できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000033
製法２：
　側鎖に水酸基を有する、アミノ基が保護されたアミノ酸と２―ブロモ―Ｎ―メチルアセトアミドのようなαハロカルボニル化合物あるいはブロモアセトニトリルとのアルキル化反応を行った後、適切な官能基変換により下記スキームに示す製造を実施することができる。下記一般式中、Ｐ１としてはＣｂｚ基、Ｂｏｃ基、Ｔｒｔ基などの塩基性条件下で安定な保護基が好ましい。αハロカルボニル化合物としては、ＲａがＮＭｅやＮｔＢｕなどであるものが好ましく例示される。Ｘ１はハロゲンであり、ブロモ基が好ましい。アルキル化反応において用いられる塩基はＮａＨ、ＮａＯｔＢｕ、ＮａＯｔ－Ｐｅｎｔなどが例示され、側鎖に水酸基を有する、アミノ基が保護されたアミノ酸に対し、２当量以上用いることで選択的に該アミノ酸の水酸基部位をアルキル化することができる。用いる溶媒としてはＤＭＦ、ＤＭＩなどが好ましく例示される。ブロモアセトニトリルを用いたアルキル化の後、得られたニトリル基を元にヘテロ環を構築することでアミノ酸基本骨格を構築できる。下記スキームには生じたニトリル基にヒドロキシルアミンを作用させた後、ＣＤＩで環化したオキサジアゾロン環を構築したものを例示している。アミノ酸の基本骨格を構築した後は保護基の適切な変換を行うことで所望のアミノ酸（Ｐ３がＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などで保護されたアミノ酸あるいはＰ３が水素である無保護のアミノ酸）に変換できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000034
製法３：
　フェニルアラニン誘導体はJackson-Negishi coupling (Journal of Organic Chemistry, 2010, 75, 245)に記載の方法や、相関移動触媒を用いたグリシンｔｅｒｔ－ブチルエステルのベンゾフェノンイミンの不斉ベンジル化（J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 6519）などを用いて製造することができる。また、下記一般式に示すようなＮ－ヒドロキシフタルイミドエステル(NHPIエステル)と芳香族ヨウ素化合物あるいは芳香族ブロモ化合物を原料に用いた脱炭酸をともなうクロスカップリング反応を行うことでも製造することができる。下記一般式中、ｎは炭素原子の数を表しており、特に限定はされないが、ｎ＝１、もしくは２が好ましい。Ｐ１としてはクロスカップリング条件下で安定な基が用いられ、好ましくはＦｍｏｃ基が例示される。Ｒ４－Ｘ１は芳香族ハロゲン化合物であり、Ｒ４が芳香族部位を表している。Ｒ４にクロスカップリング反応条件下で変換されうる官能基が含まれる場合、クロスカップリング反応条件下において安定な保護基で保護することが好ましい。例えばＲ４に水酸基が含まれる場合、水酸基をテトラヒドロピラニル（ＴＨＰ）基などで保護することが好ましい。Ｘ１はハロゲンであり、好ましくはブロモ（Ｂｒ）基、ヨード（Ｉ）基が例示される。クロスカップリング反応に用いる触媒としてはニッケルと亜鉛を触媒として用いるのが好ましく、触媒の配位子としては４，４’－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２’－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）を用いるのが好ましい。溶媒としてはジメチルアセトアミドを用いるのが好ましい。脱炭酸をともなうクロスカップリング反応によりアミノ酸の基本骨格を構築した後は保護基の適切な変換を行うことで所望のアミノ酸（Ｐ３がＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などで保護されたアミノ酸あるいはＰ３が水素である無保護のアミノ酸）に変換できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000035
　下記のように側鎖部位がアミノ酸のＮ原子上にあるアミノ酸においても同様の反応にて製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000036
製法４：
　アーント・アイシュタート（Arndt-Eistert）合成（人名反応に学ぶ有機合成戦略 、p18）を用いることで対応するβ―アミノ酸を製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000037
製法５：
　β―アミノ酸は、対応する官能基を有するエポキシドに対しアンモニアを用いた開環反応を行い、得られる化合物のアミン部位に保護基を導入し、次いで生じる２級アルコールを脱離基に変換した後、求核置換反応による立体反転を伴ったニトリル基への変換を行い、これに続くカルボン酸への変換を行うことで製造できる。下記一般式中、Ｒに反応に関与する官能基が含まれる場合、適切な保護基で保護することが好ましく、例えばＲに水酸基が含まれる場合、該水酸基をＴｒｔ基で保護することが好ましい。開環反応後に得られるアミノ基の保護基であるＰ１としてはＣｂｚ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基などが好ましく例示される。生じた２級アルコールは脱離基Ｘ２へと変換され（Ｘ２としては好ましくはメシル基（ＯＭｓ基）などが例示される）。得られた脱離基をシアノヒドリン（ＣＮ－）による求核置換反応により立体反転を伴いながらニトリル基へと誘導し、カルボン酸へと変換することでアミノ酸の基本骨格を構築できる。ニトリル基からカルボン酸への変換は例えば酸性条件下における加水分解が例示される。アミノ酸の基本骨格を構築した後は保護基の適切な架けかえを行うことで所望のアミノ酸（Ｐ３がＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などで保護されたアミノ酸あるいはＰ３が水素である無保護のアミノ酸）に変換できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000038
製法６
　水酸基を有し、かつアミノ基が保護された環状アミノ酸とハロゲン化合物とを、塩基を用いたアルキル化反応に供した後、適切な官能基の変換を行うことにより下記スキームに示すとおりに環状アミノ酸を製造することができる。用いる原料の環状アミノ酸としては４～８員環のものが好ましく、下記スキームでは５員環のものを例示した。環状部分に存在する水酸基の位置は特に限定されないが、一般式にあるようにアミノ酸のＮ原子から２原子以上離れた位置にあることが好ましい。下記一般式中、Ｐ１としてはＣｂｚ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などを用いることが出来る。アルキル化反応に用いる塩基としては水素化ナトリウム（ＮａＨ）が好ましく例示され、溶媒はジメチルホルムアミドが好ましく例示される。アルキル化反応において、ハロゲン化合物（Ｒ－Ｘ）がＲ上に該反応に関与する可能性のある官能基を有する場合、その官能基を塩基性条件下において安定な保護基で保護することが好ましい。例えばＲが水酸基を含む場合はテトラヒドロピラニル（ＴＨＰ）基、ベンジル（Ｂｎ）基、ｔ－ブチルジメチルシリル（ＴＢＤＭＳ）基などのシリルエーテルなどで該水酸基を保護することが好ましい。またＸ１はハロゲンであり、クロロ（Ｃｌ）基、ブロモ（Ｂｒ）基、ヨード（Ｉ）基が例示される。アルキル化反応によりアミノ酸の基本骨格を構築した後は保護基の適切な変換を行うことで所望のアミノ酸（Ｐ３がＣｂｚ基、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基（Ｎｓ基）などで保護されたアミノ酸あるいはＰ３が水素である無保護のアミノ酸）に変換できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000039
製法７
　上記のアミノ酸は、下記スキームに沿って、酸性条件下、パラホルムアルデヒドを用いた環化反応を行い、続いて得られた環化体を酸性条件下で開環しながら生じるイミンを還元することで、Ｎ－メチル化を行うことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000040
（ペプチド化合物の製造方法）
ペプチド化合物の化学合成方法
　本明細書におけるペプチド化合物、または環状ペプチド化合物の化学合成方法としては、液相合成法、Fmoc合成やBoc合成等を用いた固相合成法、及びこれらの組み合わせ等が例示される。Fmoc合成では、主鎖アミノ基がFmoc基により保護され、側鎖官能基が必要に応じてピペリジンやｔ－Ｂｕ基、ＴＨＰ基、Ｔｒｔ基などの塩基性で切断されない保護基で保護され、主鎖カルボン酸を保護しないアミノ酸を基本単位とする。基本単位としては、その他、Fmoc保護されたアミノ基とカルボキシル基を有する組み合わせであれば、特に限定されない。例えばジペプチドを基本単位としてもよい。Ｎ末端に配置させる基本単位は、Fmocアミノ酸以外であってもよい。例えば、Bocアミノ酸であってもよく、アミノ基を有しないカルボン酸類縁体であってもよい。主鎖カルボキシル基あるいは主鎖カルボキシル基が適切な保護基で保護された側鎖にカルボキシル基を有するアミノ酸の側鎖カルボキシル基を固相担体の官能基との化学反応により固相に担持させる。続いてピペリジンやDBUなどの塩基によりFmoc基を脱保護し、新たに生じたアミノ基と続いて添加される基本単位のカルボキシル基を有する保護アミノ酸とを縮合反応させることで、ペプチド結合を生成させる。縮合反応では、カルボキシル基の活性化剤として、DICとHOBtの組み合わせ、DICとHOAtの組み合わせ、HATUとDIPEAとの組み合わせなど様々な組み合わせが可能である。脱Fmoc基とそれに続くペプチド結合生成反応の繰り返しにより、望みのペプチド配列を生成させることができる。望みの配列が得られた後、固相からの切り出しと必要に応じて導入した側鎖官能基の保護基の脱保護が行われる。また、固相からの切り出しを行う前にペプチドの構造変換や環化を行うことも可能である。固相からの切り出しと、脱保護は同一の条件、例えば９０：１０のＴＦＡ／Ｈ２Ｏで行っても良いし、必要に応じて別々の条件で脱保護しても良い。固相からの切り出しは、１％ ＴＦＡなどの弱酸での切り出しが可能なものもあれば、保護基としてＰｄなどを利用して、両者の化学反応の直行性を利用することが可能である。これらの工程の間もしくは最後に、環化などの工程を実施することもできる。例えば、側鎖カルボン酸とＮ末端主鎖のアミノ基とを縮合させることや、側鎖アミノ基とＣ末端主鎖のカルボン酸を縮合させることができる。この際、Ｃ末端側のカルボン酸と環化させる側鎖カルボン酸の間、もしくはＮ末端側の主鎖アミノ基またはヒドロキシ基と環化させる側鎖アミノ基の間で反応直行性が必要であり、前述のとおり保護基の直行性を考慮して保護基の選択が行われる。このようにして得られた反応物を逆相カラムや、分子ふるいカラムなどで精製することができる。これらの詳細は、例えばメルク株式会社が平成14年5月1日に発行した固相合成ハンドブックなどに記載されている。固相合成用樹脂は市販されているものを使うことができ、ＣＴＣ樹脂、Ｗａｎｇ樹脂、またはＳＡＳＲＩＮ樹脂が例示される。
　本明細書に記載の化合物の製造において、定義した基が実施方法の条件下で望まない化学的変換を受けてしまう場合、例えば、官能基の保護、脱保護等の手段を用いることにより、該化合物を製造することができる。ここで保護基の選択および脱着操作は、例えば、「Greene’s,“Protective Groups in Organic Synthesis″（第５版，John Wiley & Sons 2014）」に記載の方法を挙げることができ、これらを反応条件に応じて適宜用いればよい。また、必要に応じて置換基導入等の反応工程の順序を変えることもできる。たとえば、アミノ基の保護基は、Ｆｍｏｃ、Ｂｏｃ、Ｃｂｚ、またはＡｌｌｏｃ基などが例示される。これらカーバメート基は、アミノ基をカーバメート化剤と塩基触媒存在下、反応させることで導入することができる。カーバメート化剤は、例えばＢｏｃ２Ｏ、ＢｏｃＯＰｈ、ＦｍｏｃＯＳｕ、ＦｍｏｃＣｌ、ＣｂｚＣｌ、ＡｌｌｏｃＣｌ等が挙げられる。塩基触媒としては例えば炭酸リチウム、炭酸ナトリウム、炭酸水素ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸水素カリウム、炭酸セシウム、炭酸水素セシウム、水酸化リチウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化セシウム、リン酸ナトリウム、リン酸カリウム、Ｎ－メチルモルホリン、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン、Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノピリジン等を挙げることができる。アミノ基の保護基であるカーバメート基は、塩基性条件下、酸性条件下、または加水素分解反応の条件下などで除去することができる。
ペプチド化合物の翻訳合成方法
　本明細書におけるペプチド化合物の翻訳合成方法としては、無細胞翻訳系を用いて合成する方法が例示され、同方法には再構成無細胞翻訳系による合成法が含まれる。排除したい因子を除くことができる点で、再構成無細胞翻訳系を利用するのが好ましい。
　一局面において、本明細書は、本明細書におけるアミノ酸を少なくとも１種、２種以上、又は３種以上含む、本明細書におけるペプチド化合物の翻訳合成方法を提供する。限定はされないが、このような翻訳合成方法は、以下(i)および(ii)を含んでよい：
　(i) 本明細書におけるアミノ酸を少なくとも１種、２種以上、又は３種以上結合したtRNAを用意する工程；
　(ii) 前記tRNAのアンチコドンに対応するコドンを少なくとも１つ含む核酸を無細胞翻訳系で翻訳し、前記ペプチド化合物を得る工程。
　非限定の一態様において、本明細書における翻訳合成方法は、環状ペプチド化合物の翻訳合成方法であってよい。
無細胞翻訳系
　本明細書において「無細胞翻訳系」とは、細胞より抽出したリボソームの他、翻訳に関与する蛋白因子群、ｔＲＮＡ、アミノ酸、ＡＴＰなどのエネルギー源、その再生系を組み合わせたもので、ｍＲＮＡを蛋白質に翻訳することが出来るものであれば限定されない。また、翻訳合成反応が進行している間の系も、本明細書における「無細胞翻訳系」に含まれてよい。本明細書における無細胞翻訳系は、ペプチドを翻訳する際の鋳型となる核酸を含んでいてよく、これら以外にも、開始因子、伸長因子、解離因子、アミノアシルｔＲＮＡ合成酵素などを含むことができる。これらの因子は、種々の細胞の抽出液から精製することによって得ることができる。因子を精製するための細胞は、例えば原核細胞、または真核細胞を挙げることができる。原核細胞としては、大腸菌細胞、高度好熱菌細胞、または枯草菌細胞を挙げることができる。真核細胞としては、酵母細胞、小麦胚芽、ウサギ網状赤血球、植物細胞、昆虫細胞、または動物細胞を材料にしたものが知られている。またｔＲＮＡやアミノアシルｔＲＮＡ合成酵素（ARS）は天然に存在するものに加え、人工ｔＲＮＡや非天然アミノ酸を認識する人工アミノアシルｔＲＮＡ合成酵素を用いることもできる。人工ｔＲＮＡや人工アミノアシルｔＲＮＡ合成酵素を用いることにより部位特異的に非天然アミノ酸を導入したペプチドを合成することができる。なお、必要に応じて、無細胞翻訳系にT7 RNA polymeraseなどのRNAポリメラーゼを加えることで、鋳型DNAから転写させることもできる。
　本明細書において、「無細胞翻訳系がある物質を含む」とは、翻訳合成の開始時に該物質を含んでいなくても、翻訳合成の過程において系内で該物質が合成され含まれることになる態様も含む。例えば、翻訳合成の過程で、アミノ酸がアシル化されたｔＲＮＡが合成される場合には、無細胞翻訳系が該アミノアシルｔＲＮＡを含むと理解される。
　PURESYSTEM（登録商標）(BioComber, Japan)は大腸菌の翻訳に必要な蛋白因子類、エネルギー再生系酵素、リボソームそれぞれを抽出、精製し、tRNA、アミノ酸、ATP、GTPなどと混合した再構成無細胞翻訳系である。不純物の含有量が少ないだけでなく、再構成系であるため排除したい蛋白因子、アミノ酸を含まない系を容易に作製することができる。((i)Nat Biotechnol. 2001;19:751-5. Cell-free translation reconstituted with purified components. Shimizu Y, Inoue A, Tomari Y, Suzuki T, Yokogawa T, Nishikawa K, Ueda T.(ii)Methods Mol Biol. 2010;607:11-21.PURE technology.Shimizu Y, Ueda T.)。
　例えば、非天然アミノ酸を導入するコドンとして終止コドンを利用する方法が多く報告されているが、前述のPURESYSTEMを用いることで天然アミノ酸、ARSを除いた合成系を構築できる。これにより、除外する天然アミノ酸をコードするコドンに、非天然アミノ酸を対応付けることが出来る(J Am Chem Soc. 2005;127:11727-35.Ribosomal synthesis of unnatural peptides. Josephson K, Hartman MC, Szostak JW.)。さらにコドンの縮重を解くことにより天然アミノ酸を除外することなく非天然アミノ酸を加えることが出来る（Kwon I,et al. Breaking the degeneracy of the genetic code. J Am Chem Soc. 2003, 125, 7512-3.）。N-メチルアミノ酸を含むペプチドがPURESYSTEMなどの無細胞翻訳系の活用によりリボソームにて合成できる。
　より具体的には、翻訳合成は、例えば、大腸菌の翻訳に必要な蛋白因子類（メチオニルtRNAトランスフォルミラーゼ、EF-G、RF1、RF2、RF3、RRF、IF1、IF2、IF3、EF-Tu、EF-Ts、ARS（AlaRS、ArgRS、AsnRS、AspRS、CysRS、GlnRS、GluRS、GlyRS、HisRS、IleRS、LeuRS、LysRS、MetRS、PheRS、ProRS、SerRS、ThrRS、TrpRS、TyrRS、ValRSから必要なものを選ぶ））、リボソーム、アミノ酸、クレアチンキナーゼ、ミオキナーゼ、無機ピロフォスファターゼ、ヌクレオシド二リン酸キナーゼ、E. coli 由来tRNA、クレアチンリン酸、グルタミン酸カリウム、HEPES-KOH pH7.6、酢酸マグネシウム、スペルミジン、ジチオスレイトール、GTP、ATP、CTP、UTPなどを適宜取捨選択して混合したPURESYSTEM等の公知の無細胞翻訳系にmRNAを加えることによって行うことが出来る。また、T7 RNA polymeraseを加えておけば、T7プロモーターを含む鋳型DNAからの転写、翻訳を共役して行なうこともできる。また、所望のアミノアシルtRNA群やアミノアシルtRNA合成酵素（ARS）が許容する非天然アミノ酸群（例えばF-Tyr）を系に添加することによって非天然アミノ酸を含むペプチド化合物を翻訳合成することが出来る（Kawakami T, et al. Ribosomal synthesis of polypeptoids and peptoid-peptide hybrids. J Am Chem Soc. 2008, 130, 16861-3., Kawakami T, et al. Diverse backbone-cyclized peptides via codon reprogramming. Nat Chem Biol. 2009, 5, 888-90.）。さらに、天然のARSに代えて又はこれら加えて、ARSの改変体を系に含めるとともに、非天然アミノ酸群を系に含めることによっても、非天然アミノ酸を含むペプチド化合物を翻訳合成することが出来る。あるいは、リボソームやEF-Tuなどの変異体を利用することによって非天然アミノ酸の翻訳導入の効率を高めることも出来る(Dedkova LM, et al. Construction of modified ribosomes for incorporation of D-amino acids into proteins. Biochemistry. 2006, 45, 15541-51., Doi Y, et al. Elongation factor Tu mutants expand amino acid tolerance of protein biosynthesis system. J Am Chem Soc. 2007, 129, 14458-62., Park HS, et al. Expanding the genetic code of Escherichia coli with phosphoserine. Science. 2011, 333, 1151-4.)。
　非限定の一態様において、本明細書にける無細胞翻訳系（「本明細書における翻訳系」ともいう。）は、ペプチド化合物を製造するための翻訳系であってよく、好ましくは環状ペプチド化合物を製造するための翻訳系である。
　非限定の一態様において、本明細書における翻訳系は、５～３２種類、５～２８種類、又は５～２０種類の非天然アミノ酸を含んでいてよく、８～２０種類、１０～２０種類、１３～２０種類が好ましく例示される。一態様において、本明細書における翻訳系に含まれるアミノ酸の種類の数のうち、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上が非天然アミノ酸であってよい。
　非限定の一態様において、本明細書における翻訳系は、５～２８種類、又は５～２０種類のＮ置換アミノ酸を含んでいてよく、５～１８種類、５～１５種類が好ましく例示される。一態様において、本明細書における翻訳系に含まれるアミノ酸の種類の数のうち、４０％以上、５０％以上、６０％以上、７０％以上がＮ置換アミノ酸であってよい。ここでのＮ置換アミノ酸は、Ｎ－アルキルアミノ酸、又はＮ－メチルアミノ酸を意味してもよいが、その場合であっても、本明細書における翻訳系に他のＮ置換アミノ酸が含まれることを否定するものではない。
　非限定の一態様において、本明細書における翻訳系は、該翻訳系を用いて製造されるペプチド化合物に含まれる芳香環の数の平均が一定の範囲内となるように調整されていてもよい。例えば、翻訳合成されるペプチド化合物において、環状部を構成するアミノ酸の数に占める芳香環を有するアミノ酸の数の割合の平均が４０％以下、３５％以下、３０％以下、２７％以下、２５％以下、若しくは２０％以下になるように、又は、８～１１個のアミノ酸から構成される環状部を有するペプチド化合物の環状部の側鎖に含まれる芳香環の数の平均が０～３になるように、本明細書における翻訳系を調整してよい。調整方法は特に限定されないが、例えば、翻訳系に含まれるアミノ酸の種類の数に占める芳香環を有するアミノ酸の種類の数を調整することが挙げられる。
　非限定の一態様において、本明細書における翻訳系は、芳香環を有するアミノ酸を含んでいてよく、翻訳系に含まれるアミノ酸の種類の数に占める芳香環を有するアミノ酸の種類の数の割合は４０％以下が好ましく、３５％以下、３０％以下、２７％以下、２５％以下、２０％以下が好ましく例示される。
　非限定の一態様において、本明細書における無細胞翻訳系は、本明細書におけるアミノ酸を少なくとも１種、２種以上、又は３種以上含む、本明細書におけるペプチド化合物を製造するための無細胞翻訳系であってよい。限定はされないが、このような無細胞翻訳系は、以下(i)および(ii)を含んでよい：
　(i) 本明細書におけるアミノ酸を少なくとも１種、２種以上、又は３種以上結合したtRNA；
　(ii) 前記ペプチド化合物をコードする核酸、
ここで該核酸は前記tRNAのアンチコドンに対応するコドンを少なくとも１つ含んでよい。
ｔＲＮＡ
　非天然アミノ酸のペプチドへの翻訳導入には、直交性を有し効率よくリボソームに取り込まれるｔＲＮＡ（(i)Biochemistry. 2003;42:9598-608.Adaptation of an orthogonal archaeal leucyl-tRNA and synthetase pair for four-base, amber, and opal suppression. Anderson JC, Schultz PG., (ii)Chem Biol. 2003;10:1077-84.Using a solid-phase ribozyme aminoacylation system to reprogram the genetic code.Murakami H, Kourouklis D, Suga H.）のアミノアシル化が必要である。tRNAをアミノアシル化する方法として以下の５つの方法を用いることができる。
　細胞内ではtRNAのアミノアシル化のための酵素として、アミノ酸別にアミノアシルtRNA合成酵素（ARS）が用意されている。そのため第一の方法としては、ある種のARSがN-Me Hisなど非天然アミノ酸を許容することを利用する方法や、非天然アミノ酸を許容する変異アミノアシルtRNA合成酵素を用意し、これを利用する方法が挙げられる（(i)Proc Natl Acad Sci U S A. 2002;99:9715-20. An engineered Escherichia coli tyrosyl-tRNA synthetase for site-specific incorporation of an unnatural amino acid into proteins in eukaryotic translationand its application in a wheat germ cell-free system.Kiga D, Sakamoto K, Kodama K, Kigawa T, Matsuda T, Yabuki T, Shirouzu M, Harada Y, Nakayama H, Takio K, Hasegawa Y, Endo Y, Hirao I, Yokoyama S.(ii)Science. 2003;301:964-7.An expanded eukaryotic genetic code.Chin JW, Cropp TA, Anderson JC, Mukherji M, Zhang Z, Schultz PG. Chin,JW.(iii) Proc Natl Acad Sci U S A. 2006;103:4356-61.Enzymatic aminoacylation of tRNA with unnatural amino acids.Hartman MC, Josephson K, Szostak JW.）。第二に、試験管内でtRNAをアミノアシル化しその後アミノ酸を化学修飾する方法も用いることができる（J Am Chem Soc. 2008;130:6131-6.Ribosomal synthesis of N-methyl peptides.Subtelny AO, Hartman MC, Szostak JW.）。第三に、tRNAの3'末端のCCA配列からCAを除いたものと別途調製したアミノアシル化したpdCpAとをRNAリガーゼで結合させることでアミノアシルtRNAを得ることが出来る(Biochemistry. 1984;23:1468-73.T4 RNA ligase mediated preparation of novel "chemically misacylated" tRNAPheS.Heckler TG, Chang LH, Zama Y, Naka T, Chorghade MS, Hecht SM.)。種々の非天然アミノ酸の活性エステルをtRNAに担持させるリボザイムであるフレキシザイムによるアミノアシル化もある（J Am Chem Soc. 2002;124:6834-5.Aminoacyl-tRNA synthesis by a resin-immobilized ribozyme.Murakami H, Bonzagni NJ, Suga H.)。第四に、tRNAとアミノ酸活性エステルとをカチオン性ミセル中で超音波混合する方法も用いることができる(Chem Commun (Camb). 2005;(34):4321-3.Simple and quick chemical aminoacylation of tRNA in cationic micellar solution under ultrasonic agitation. Hashimoto N, Ninomiya K, Endo T, Sisido M.)。第五として、tRNAの3'末端付近に相補的なPNAにアミノ酸活性エステルを結合したものをtRNAに加えることによってもアミノアシル化が可能である（J Am Chem Soc. 2004;126:15984-9.In situ chemical aminoacylation with amino acid thioesters linked to a peptide nucleic acid.Ninomiya K, Minohata T, NishimuraM, Sisido M.）。
　より具体的には、以下のような方法を用いてアミノアシルtRNAを作製することができる。所望のtRNA配列をコードし、上流にＴ７、Ｔ３もしくはＳＰ６プロモーターを配置した鋳型ＤＮＡを用意し、T7 RNA polymeraseやT3, SP6 RNA polymeraseなどプロモーターに適応したＲＮＡポリメラーゼを利用して転写によってＲＮＡを合成することが出来る。細胞からｔＲＮＡを抽出精製し、ｔＲＮＡの配列の相補配列のプローブを用いて目的の生成ｔＲＮＡを抽出することも出来る。この際目的のｔＲＮＡの発現ベクターで形質転換した細胞をソースにすることも出来る。化学合成によって目的の配列のＲＮＡを合成することも出来る。例えば、このようにして得られた３'末端のＣＣＡ配列からＣＡを除いたｔＲＮＡと別途調製したアミノアシル化したｐｄＣｐＡまたはｐＣｐＡとをＲＮＡリガーゼで結合させることでアミノアシルｔＲＮＡを得ることが出来る（ｐｄＣｐＡ法、ｐＣｐＡ法）。当該ｔＲＮＡは、ペプチド化合物の製造において有用である。あるいは、全長ｔＲＮＡを用意し、種々の非天然アミノ酸の活性エステルをｔＲＮＡに担持させるリボザイムであるフレキシザイムによるアミノアシル化も可能である。また、限定を意図しないが、天然のＡＲＳ又はその改変体を用いて、アミノアシルｔＲＮＡを作製することもできる。天然ＡＲＳ又はその改変体を用いると、翻訳系内で一旦消費されたアミノアシルｔＲＮＡが、天然ＡＲＳやその改変体によって再生成され得るため、予め作製したアミノアシルｔＲＮＡを翻訳系に大量に存在させる必要がない。このようなＡＲＳ改変体は、WO2016/148044に記載される。これらのアミノアシルtRNAの作製方法を適宜組み合わせることもできる。
環状部の形成
　非限定の一態様において、ペプチド化合物の環状部は、直鎖状のペプチド化合物を環化反応に供することにより形成される。
　本明細書において「環化反応」とは、ペプチド化合物のペプチド部位に環状部を形成させる反応をいう。一態様において、環化反応により環状部が形成されたペプチド化合物を更に化学修飾、又は反応させて得られるペプチド化合物も、本明細書におけるペプチド化合物に含まれる。また、環化反応の前に化学修飾等を行ってもよい。
　スキームＡに、本明細書におけるペプチド化合物のペプチド部位の環化反応の一例を示す。黒丸（●）ユニット（主鎖ユニット）、Ｄユニット（アスパラギン酸ユニット）、三角（▲）ユニット（環化Ｎ末端ユニット）はそれぞれペプチド部位を構成するアミノ酸残基を意味する。白丸は固相合成用樹脂をあらわす。スキームＡにおいては、環状部とは１つの三角ユニットと９つの黒丸ユニット及び１つのＤユニットからなる部位である。それぞれのユニットは同一のアミノ酸であっても、異なるアミノ酸であってもよい。本発明の環状ペプチドは、例えば、国際公開第２０１３／１００１３２号に記載の方法によって製造することができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000041
　本明細書における「ユニット」とは、本明細書における鎖状ペプチド化合物の合成後環化前のアミノ酸、環化後のアミノ酸、環化後の化学修飾が完了した時点でのアミノ酸のいずれかを意味する。環化後の化学修飾が完了した時点でのアミノ酸残基には、例えば、ペプチド化合物の製造後の化学修飾により、化学変換や骨格変換されたアミノ酸残基が含まれる。
ライブラリ
　非限定の一態様において、本開示におけるペプチド化合物、又はこれらをコードする核酸のライブラリは、それぞれ、本明細書に記載のペプチド化合物、又はこれらをコードする核酸から実質的になるライブラリであってよい。
　本明細書におけるライブラリには、本明細書におけるペプチド化合物を含むライブラリ、及び本明細書におけるペプチド化合物をコードする核酸を含むライブラリが含まれる。本明細書におけるライブラリには、本明細書におけるペプチド化合物のライブラリ、ペプチド化合物－核酸複合体のライブラリが含まれ、中でも環状ペプチド化合物、又は環状ペプチド－核酸複合体のライブラリが好ましく、特に環状ペプチド－ｍＲＮＡ複合体のライブラリが好ましい。ライブラリとしては、ディスプレイライブラリが好ましい。ディスプレイライブラリとしては、ディスプレイを利用したライブラリが例示され、中でもｍＲＮＡディスプレイライブラリ、ＤＮＡディスプレイライブラリ、リボソームディスプレイライブラリが好ましく、ｍＲＮＡディスプレイライブラリがより好ましい。
　特定の理論に拘束されることを意図しないが、本発明者らは以下のように考える。これまでのペプチドライブラリでは、ペプチドを構成するアミノ酸の側鎖に含まれるプロトンドナーを分子内水素結合形成によりマスクさせることは偶然に頼ってきた。特に、構成アミノ酸をランダムに配置して多様性を持たせるようなペプチドライブラリにおいては、アミノ酸の間で狙い通りに水素結合を形成させることは困難であった。本明細書のアミノ酸を含むペプチド化合物であれば、アミノ酸の側鎖に含まれるプロトンドナー部位に水素結合がすでに形成されているアミノ酸を用いているため、ペプチド化合物の側鎖部位において分子内で水素結合を意図的に形成させることが可能になる。本明細書のアミノ酸を用いて得られるペプチド化合物のライブラリは、分子内で水素結合形成することで側鎖のプロトンドナーをマスクし得るペプチド化合物の出現頻度が高い、すなわち膜透過性の高いペプチド化合物を含む確率が高くなり得る。
　本明細書において、ペプチド化合物は「核酸によりコードされるペプチド化合物」であってよい。本明細書において「核酸によりコードされるペプチド化合物」とは、該核酸を鋳型として翻訳することにより直接合成されるペプチド化合物に限定されず、翻訳後修飾を受けて合成され得るペプチド化合物を含むことがある。例えば、核酸を翻訳することにより直鎖ペプチド化合物が合成され、その後の環化工程により環状ペプチド化合物が合成される場合、該環状ペプチド化合物を、前記核酸によりコードされる環状ペプチド化合物ということがある。また、一態様において、核酸を鋳型として翻訳合成されるペプチド化合物、又はその後に翻訳後修飾を受けたペプチド化合物と該核酸との複合体（ペプチド化合物－核酸複合体）も、核酸によりコードされる（環状）ペプチド化合物に含まれる。
　非限定の一態様において、本明細書におけるライブラリに含まれるペプチド化合物、又はライブラリに含まれる核酸によりコードされるペプチド化合物に含まれる非天然アミノ酸、Ｎ置換アミノ酸、又は芳香環を有するアミノ酸の数の平均は、ＤＮＡライブラリを合成する際に、前記アミノ酸に当てたコドンの出現頻度にて調整することができる。例えば１０のアミノ酸残基可変箇所を含むペプチドのライブラリでは、アミノ酸が２０種類から選択されると仮定した場合、該２０種類のうちＮ置換アミノ酸を１０種類とすることで、Ｎ置換アミノ酸のコドンユニットが可変箇所１箇所当り10/20(５０％)を占めるように合成することができる。このようにして、本明細書における非天然アミノ酸の数、Ｎ置換アミノ酸の数、芳香環の数、又は芳香環を有するアミノ酸の数の割合の平均を算出してもよい。
　本明細書におけるペプチド化合物、及び／又はこれらをコードする核酸のライブラリについて、「～から実質的になる」とは、該ライブラリに含まれるペプチド化合物、及び／又はこれらをコードする核酸のバリエーションの理論上の総数に対する、そこに挙げられたペプチド化合物、及び／又はこれらをコードする核酸のバリエーションの理論上の数の割合が、９０％以上、９３％以上、９５％以上、９７％以上、９８％以上、又は９９％以上であってよいが、これらに限定されるものではない。
　本明細書におけるライブラリにおいて、ペプチド化合物の「バリエーションの理論上の（総）数」を求める際、実際にペプチド化合物として製造され得ないものは、理論上の（総）数には算入しない。例えば、以下（１）及び（２）のような場合には、該当するアミノ酸は翻訳合成されないことから、このようなアミノ酸を含むペプチド化合物は、理論上の（総）数に算入しない：（１）ペプチド化合物の材料として翻訳液中にアミノ酸が添加されていても、同アミノ酸をコードする核酸を鋳型として含まない場合；（２）ペプチド化合物の鋳型となる核酸には塩基配列を含むが、これに対応するアミノ酸を含まない翻訳液を使用する場合。また、環状ペプチド化合物を製造する過程での副反応物や未反応物が存在する場合には、これらは前記理論上の（総）数には算入しない。
　例えば、計２０種類の天然アミノ酸を用いて、１種のアミノ酸に対して１組のコドンユニットを対応させたコドン表により、前記コドンユニットがランダムに配置された塩基配列から、１１残基のペプチドを翻訳合成する場合において、翻訳開始アミノ酸がメチオニンに固定されていたとすると、バリエーションの理論上の数は、２０１０となる。
　非限定の一態様において、本明細書におけるライブラリは、ペプチド化合物、及び／又はこれらをコードする核酸に加えて、標的分子に特異的に結合できるペプチド化合物のスクリーニングに必要な他の成分を含んでいてよい。また、本明細書におけるライブラリの効果に負の影響を与えない範囲で他の成分を含んでよい。
　本明細書におけるライブラリには、ペプチド化合物、又はこれらをコードする核酸が複数含まれる。本明細書において、ライブラリに含まれるペプチド化合物のバリエーション（種類）の数のことを「多様性」という。本明細書におけるライブラリに含まれるペプチド化合物、又はこれらをコードする核酸の多様性は特に限定されないが、１０３以上、１０４以上、１０５以上、１０６以上、１０７以上、１０８以上、１０９以上、１０１０以上、１０１１以上、及び１０１２以上が例示される。これら多様性は、実測値に限定されるものではなく、理論値であってよい。
　非限定の一態様において、本明細書におけるライブラリに含まれる、又はライブラリに含まれる核酸によりコードされるペプチド化合物の核酸連結部以外のペプチド部位の分子量の平均、又は環状ペプチド化合物の環状部の分子量の平均は５００～２０００であってよい。
ディスプレイライブラリ
　ディスプレイライブラリは表現型であるペプチドとその遺伝子型であるペプチドをコードするＲＮＡもしくはＤＮＡが対応付けられているライブラリである。このライブラリを使用して、標的分子に特異的に結合できるペプチド化合物を同定することができる。例えば、所望の固定した標的にライブラリを接触させ、標的に結合しない分子を洗い流すことで、標的に結合するペプチドの濃縮が可能である(パニング法)。このような過程を経て選択されたペプチドに対応付けられている遺伝子情報を解析することで標的に結合したペプチドの配列を明らかにすることができる。例えば、アミノアシルｔＲＮＡのアナログである抗生物質ピューロマイシンがリボソームによるｍＲＮＡ翻訳伸長中の蛋白質に非特異的に連結されることを利用する方法がmRNAディスプレイ(Proc Natl Acad Sci USA. 1997;94:12297-302. RNA-peptide fusions for the in vitro selection of peptides and proteins. Roberts RW, Szostak JW.)ないしはin vitro virus(FEBS Lett. 1997;414:405-8. In vitro virus: bonding of mRNA bearing puromycin at the 3'-terminal end to the C-terminal end of its encoded protein on the ribosome in vitro. Nemoto N, Miyamoto-Sato E, Husimi Y, Yanagawa H.)として報告されている。
　Ｔ７プロモーターなどのプロモーターを含むＤＮＡライブラリから転写にて得たｍＲＮＡのライブラリの３'端にピューロマイシンなどのスペーサーを結合しておき、無細胞翻訳系でｍＲＮＡをタンパク質に翻訳させるとピューロマイシンがリボソームによってアミノ酸と間違ってタンパク質に取り込まれ、ｍＲＮＡとこれにコードされる蛋白質が連結され、ｍＲＮＡとその産物が対応付けられたライブラリになる。この過程では大腸菌などの形質転換を含まないため高い効率が実現され、大規模なディスプレイライブラリを構築することが出来る。パニングで濃縮、選択された分子についている遺伝子情報を含むタグであるｍＲＮＡからｃＤＮＡを合成し、ＰＣＲ増幅し、塩基配列を解析することで結合した蛋白の配列を明らかにすることが出来る。
　無細胞翻訳系を利用したディスプレイライブラリには、mRNAディスプレイの他に、ペプチドとピューロマイシンの複合体が結合しているペプチドをコードするｃＤＮＡからなるライブラリであるcDNAディスプレイ(Nucleic Acids Res. 2009;37(16):e108.cDNA display: a novel screening method for functional disulfide-rich peptides by solid-phase synthesis and stabilization ofmRNA-protein fusions.Yamaguchi J, Naimuddin M, Biyani M, Sasaki T, Machida M, Kubo T, Funatsu T, Husimi Y, Nemoto N.)、ｍＲＮＡ翻訳中にリボソームと翻訳産物が比較的安定な複合体であることを利用したリボソームディスプレイ(Proc Natl Acad Sci U S A. 1994;91:9022-6. An in vitro polysome display system for identifying ligands from very large peptide libraries. Mattheakis LC, Bhatt RR, Dower WJ.)、bacteriophage endonuclease P2AがDNAと共有結合を形成することを利用したcovalent display(Nucleic AcidsRes. 2005;33:e10.Covalent antibody display--an in vitro antibody-DNA library selection system.Reiersen H, Lobersli I, Loset GA, Hvattum E, Simonsen B, Stacy JE, McGregor D, Fitzgerald K, Welschof M, Brekke OH, Marvik OJ.)、微生物のプラスミドの複製開始蛋白RepAが複製開始点oriに結合することを利用したCIS display(Proc Natl Acad Sci U S A. 2004;101:2806-10. CIS display: In vitro selection of peptides from librariesof protein-DNA complexes. Odegrip R, Coomber D, Eldridge B, HedererR, Kuhlman PA, Ullman C, FitzGerald K, McGregor D.)が知られている。また、DNAライブラリを構成するDNAの1分子毎に転写翻訳系をwater-in-oilエマルジョンやリポソームに封入し、翻訳反応を行うin vitro compartmentalization(Nat Biotechnol. 1998;16:652-6. Man-made cell-like compartments for molecular evolution. Tawfik DS, Griffiths AD.)も知られている。適宜、公知の方法を用いて上記方法を使用することができる。
核酸ライブラリ
　本発明における「核酸」には、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、リボ核酸（ＲＮＡ）あるいは、人工塩基を有するヌクレオチド誘導体を含むこともできる。また、ペプチド核酸（ＰＮＡ）を含むこともできる。本発明の核酸は、目的とする遺伝情報が保持される限り、これらの核酸のいずれか、あるいは混成とすることもできる。すなわち、ＤＮＡ－ＲＮＡのハイブリッドヌクレオチドやＤＮＡとＲＮＡのような異なる核酸が一本鎖に連結されたキメラ核酸も本発明における核酸に含まれる。
　ペプチド化合物ライブラリに含まれるペプチド化合物の鋳型となる核酸のライブラリとしては、mRNAライブラリ、DNAライブラリ等が例示される。ペプチド配列上でアミノ酸残基を固定しない箇所は塩基を混ぜて合成することによって、核酸ライブラリを得ることができる。例えば、DNAライブラリとしては、A、T、G、C、RNAライブラリとしては、A、U、G、Cのそれぞれ4塩基の混合(N)の３の倍数個の繰り返し、もしくはコドンの一文字目二文字目はN、三文字目はW、M、K、Sなどの2塩基の混合として合成する、さらに導入するアミノ酸の種類を16以下に抑えるのであれば、三文字目を1種類の塩基にする方法もある。また、コドンの3文字に相当するコドンユニットを用意し、これを任意の割合で混合して合成に用いることによってアミノ酸残基の出現頻度を自由に調整できる。
　無細胞翻訳系を用いてこれら核酸ライブラリを翻訳することができる。無細胞翻訳系を使用する場合、目的の核酸の下流にスペーサーをコードする配列を含むことが好ましい。スペーサー配列としては、グリシンやセリンを含む配列が挙げられるがこれに限定しない。またピューロマイシン、その誘導体などリボソームによる翻訳時にペプチドに取り込まれる化合物と核酸ライブラリの間には、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ヘキサエチレングリコール（ｓｐｃ１８）のポリマー（例えば５つのポリマー）などで形成されるリンカーを含むことが好ましい。
ライブラリの製造方法
　非限定の一態様において、本開示におけるライブラリの製造は、上述した本開示におけるペプチド化合物の製造方法に準じて行うことができ、適宜公知の方法と組み合わせることができる。一態様において、上述した本開示における無細胞翻訳系を使用して本開示におけるペプチド化合物のライブラリを製造できる。すなわち、本開示におけるライブラリの製造方法には、本開示における無細胞翻訳系を使用してペプチド化合物を合成する工程を含んでよい。一態様において、本開示における無細胞翻訳系において記述した、例示、好ましい範囲、態様が、本開示におけるライブラリの製造方法においてもそのまま適用できる。
　ｍＲＮＡディスプレイライブラリは、非限定の一態様において、以下のように製造することができる。まずＴ７プロモーターなどのプロモーターの下流に所望の配列を配置したＤＮＡのライブラリを化学合成し、これを鋳型にプライマー伸長反応にて二本鎖ＤＮＡにする。これを鋳型にT7 RNApolymeraseなどのRNAポリメラーゼを用いてｍＲＮＡに転写する。このＲＮＡの３'末端にアミノアシルｔＲＮＡのアナログである抗生物質ピューロマイシンなどがつながったリンカー（スペーサー）を結合させる。これを上記のPURESYSTEMなど公知の無細胞翻訳系に加え、保温することによってｍＲＮＡが翻訳され、ｍＲＮＡとこれにコードされるペプチドがピューロマイシンなどを含むリンカーを介して連結される。このようにしてｍＲＮＡとその産物が対応付けられたｍＲＮＡとその産物の複合体からなるディスプレイライブラリを構築することが出来る。リンカーはさらに、当業者に周知のスペーサーを含むことができる。また、必要に応じて、上述の方法や公知の方法により、環化等の翻訳後修飾を行うことができる。
　非限定の一態様において、本開示におけるライブラリは、本明細書に記載されたアミノ酸からなる群より選択される少なくとも１種、２種以上、又は３種以上のアミノ酸を含むペプチド化合物を含むペプチド化合物ライブラリであってよい。このようなライブラリの製造方法としては、以下(i)および(ii)を含む無細胞翻訳系でペプチド化合物を翻訳合成する工程を含んでよい：
　(i) 本明細書に記載されたアミノ酸からなる群より選択される少なくとも１種、２種以上、又は３種以上のアミノ酸が結合したtRNA；
　(ii) 前記ペプチド化合物ライブラリをコードする核酸ライブラリ、
　ここで該核酸ライブラリには前記tRNAのアンチコドンに対応するコドンを少なくとも１つ含む核酸が含まれてよい。
　なお、本明細書において引用された全ての先行技術文献は、参照として本明細書に組み入れられる。
　本発明は、以下の実施例によってさらに例示されるが、下記の実施例に限定されるものではない。
　実施例中では以下の略号表に記載の略号を使用した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000042
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000043
　ペプチド合成及び、固相合成に用いる反応溶媒はペプチド合成用（渡辺化学、和光純薬から購入）を用いた。例えばＤＣＭ、ＤＭＦ、ＮＭＰ、２％　ＤＢＵ　ｉｎ　ＤＭＦ、２０％　ｐｉｐｅｒｉｄｉｎｅ　ｉｎ　ＤＭＦなどである。また、水を溶媒として加えない反応では、脱水溶媒、超脱水溶媒、無水溶媒（関東化学、和光純薬などから購入）を用いた。
　ＬＣ／ＭＳの分析条件は、下記のとおりである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000044
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000045
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000046
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000047
実施例１　ペプチド化合物の化学合成
　ＷＯ２０１３／１００１３２に記載のＦｍｏｃ法によるペプチド合成法に従い、下記の基本ルートでペプチドの伸長を行った。すなわち、１）Ａｓｐ側鎖のカルボン酸を２－クロロトリチルレジンに担持させたものの、ＡｓｐのＮ末からのＦｍｏｃ法によるペプチド伸長反応、２）２－クロロトリチルレジンからのペプチドの切り出し過程、３）切り出し過程によって２－クロロトリチルレジンから外れて生じたＡｓｐ側鎖のカルボン酸と、ペプチド鎖Ｎ末端（三角ユニット）のアミノ基との縮合によるアミド環化、４）ペプチド鎖に含む側鎖官能基の保護基の脱保護、５）ｐｒｅｐａｒａｔｉｖｅＨＰＬＣによる化合物の精製、の５段階の工程である。また、側鎖に酸性官能基を有するアミノ酸を含むペプチド化合物においては、脱保護剤の残留に起因するペプチドの過剰伸長を抑えるため、ペプチド伸長反応時のレジン洗浄に０．０８　Ｍトリエチルアミン塩酸塩のジクロロメタン溶液を用いることもできる。本実施例において、特に記述がない限り、この基本ルートをもとにペプチド化合物の合成をおこなった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000048
１－１．ペプチド合成機によるペプチド合成に用いるＦｍｏｃ－アミノ酸
　本明細書内に記載するペプチド合成において、ペプチド合成機による合成には、以下のＦｍｏｃ－アミノ酸を用いた。側鎖に反応性の官能基を有するアミノ酸の場合、適切な保護基で保護されているものを用いた。なおアミノ酸の略語は下記表３に記載した。
　Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｖａｌ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＬｅｕ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＰｈｅ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｙ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ｇＭｅＡｂｕ－ＯＨ（Ｆｍｏｃ－ｇ－ＭｅＡｂｕ－ＯＨと記載する場合もある）、Ｆｍｏｃ－Ｌｅｕ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｉｌｅ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｌａ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＶａｌ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ａｂｕ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｖａｌ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ―ＭｅＡｂｕ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＩｌｅ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｌｅｕ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕ）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ａｌａ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（Ｃｌｔ）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＦ３）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ａｌａ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｈｐｈ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｙ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ｂ－ＭｅＡｌａ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ａｌａ（３－Ｐｙｒ）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｄ－ＭｅＡｌａ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ｛＃（ＣＨ２）２｝－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ａｌａ（Ｔｈｚ）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｐｒｏ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｐｒｏ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｂｎ）－ＯＨなどは渡辺化学もしくはＣｈｅｍｐｅｐ社もしくはＣｈｅｍ－Ｉｍｐｅｘ社もしくはＢａｃｈｅｍ社から購入した。またＦｍｏｃ－ｎＰｒＧｌｙ－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＰｈｅ（３－Ｃｌ）－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｌａ（４－Ｔｈｚ）－ＯＨなどはＷＯ２０１３／１００１３２に記載の方法にて合成した。また、Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ０１）、Ｆｍｏｃ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯＨ（化合物ａａ０２）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ（化合物ａａ０４）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ－ＯＨ（化合物ａａ０５）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ（化合物ａａ１２）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ（化合物ａａ１６）、Ｆｍｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１７）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ２２）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ２７）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ３４）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ３９）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ４６）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ５１）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ５４）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ５５）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ６２）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ６４）、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ６８）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ７０）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ７１）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ７２）、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯＨ（化合物ａａ７５）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ（化合物ａａ７８）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ（化合物ａａ７９）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）－ＯＨ（化合物ａａ８１）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ８５）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ８９）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ９５）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１０１）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＣｌｔ－３－ＯＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１０４）、Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）の側鎖フェノール部位がクロロトリチル基で保護されたもの）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ（化合物ａａ１０９）、Ｆｍｏｃ－ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１１１）、Ｆｍｏｃ－ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１１７）、Ｆｍｏｃ－Ｎｖａ（２Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ））－ＯＨ（化合物ａａ１２１）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ）－Ｍｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１２６）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１２７）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１２８）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯＨ（化合物ａａ１２９）、Ｆｍｏｃ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１３３）、Ｆｍｏｃ－（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ－ＯＨ（化合物１３４）、Ｆｍｏｃ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１３５）、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１３６）、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１３７）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１３９）、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ１４０）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－（Ａｌｌｏｃ）Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）－ＯＨ（化合物ａａ１４１）などは以下のとおり合成した。
　側鎖に３級アルコールを有するアミノ酸（例えば、Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）、ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＨ）、ＭｅＳｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＨ）など）を含む配列に関しては、側鎖の３級アルコール部位をＴＨＰで保護しないＦｍｏｃアミノ酸を用いても問題無くペプチドは伸長した（例えば、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ５３）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ６１）などを用いた）。
　側鎖に２級アルコールであり、かつアルコールが結合している炭素にＣＦ３基が結合している構造を持つアミノ酸（例えば、Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）、Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）など）を含む配列に関しては、側鎖の２級アルコール部位をＴＨＰで保護しないＦｍｏｃアミノ酸を用いても問題無くペプチドは伸長した（例えば、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ６８）、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ（化合物ａａ７０）などを用いた）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000049
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000050
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000051
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000052
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000053
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000054
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000055
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000056
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000057
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000058
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000059
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000060
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000061
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000062
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000063
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000064
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000065
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000066
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000067
１－２．ペプチド合成機によるペプチド合成に用いるアミノ酸合成
（２Ｓ，３Ｒ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブタン酸（化合物ａａ０１、Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000068
　（２Ｓ，３Ｒ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－ヒドロキシブタン酸一水和物（Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ－ＯＨの一水和物、東京化成より購入、５．０　ｇ、１３．９　ｍｍｏｌ）とｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（０．１７５　ｇ、０．７０　ｍｍｏｌ）の混合物にトルエン（５０　ｍＬ）を加えて、減圧下トルエンを留去することで共沸により含まれている水分を除去した。得られた残渣に超脱水テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（２８　ｍＬ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（８．８　ｍＬ、９７　ｍｍｏｌ）を加え、窒素雰囲気下、５０度にて４時間攪拌した。ＬＣＭＳ（ＳＱＤＦＡ０５）にて原料の消失を確認後、混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチル（３０　ｍＬ）を加えた。続いて飽和塩化ナトリウム水溶液（３０　ｍＬ）を加えて有機層を洗浄し、水層を酢酸エチル（３０　ｍＬ）で抽出した。得られた全ての有機層を混合し、これをさらに飽和塩化ナトリウム水溶液（３０　ｍＬ）にて２度洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去し、粗生成物（９．３　ｇ）を得た。
　得られた粗生成物のうち、４．６５　ｇをテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（３０　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ８．０に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（３０　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で４時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチル（３０　ｍＬ）を加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチル（３０　ｍＬ）を加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和塩化ナトリウム水溶液（３０　ｍＬ）で２度洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらにポンプにて減圧下、２５度で３０分乾燥させた。
　得られた残渣をジエチルエーテル（５０　ｍＬ）に溶解させ、次いでヘプタン（５０　ｍＬ）を加えた。制御した減圧下（～１００　ｈＰａ）、ジエチルエーテルのみを留去し、得られた混合物をろ過して固体を得た。このヘプタンでの洗浄操作を２度繰り返した。得られた固体をポンプにて減圧下、２５度で２時間乾燥させ、Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨのナトリウム塩（２．８０　ｇ、６．２６　ｍｍｏｌ）を得た。
　得られた全量のＦｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨのナトリウム塩に酢酸エチル（５０　ｍＬ）とｐＨ２．１の０．０５Ｍリン酸水溶液（１４０　ｍＬ）を加えて、２５度にて５分間攪拌した後、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチル（５０　ｍＬ）を加えて抽出した後、得られた全ての有機層を混合し、飽和塩化ナトリウム水溶液（５０　ｍＬ）にて２度洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムにて乾燥させ、減圧下溶媒を留去した。残渣をポンプにて減圧下、２５度で２時間乾燥させた後、得られた固体をｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）（５０　ｍＬ）に溶解させ、溶媒を減圧下留去した。さらにポンプにて減圧下、２５度で１時間乾燥させることで、（２Ｓ，３Ｒ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブタン酸（化合物ａａ０１、Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨ、２．７０　ｇ、３０　ｍｏｌ％のｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）が残留）をＴＨＰ保護上の不斉炭素に由来するジアステレオマーとして得た。得られたＦｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨは－２５度の冷凍庫にて保存した。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４２４．２（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．８４分、０．８５分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－ブチルグリシン（化合物ａａ０２、Ｆｍｏｃ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000069
　水素化ナトリウム（２６　ｇ、１．０８　ｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（５００　ｍＬ）にｔｅｒｔ－ブチル（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）グリシナート（Ｂｏｃ－Ｇｌｙ－ＯｔＢｕ）（１００　ｇ、４３２．３６　ｍｍｏｌ）を少しずつ室温で加え、３０分撹拌した後、１－ヨードブタン（２３９　ｇ、１．３０　ｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（５０　ｍＬ）を滴下しながら加えた。反応液を１６時間室温にて撹拌したのち、水を加えた。テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）を減圧下除去した後、酢酸エチルを用いて３回抽出し、得られた有機溶媒を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、ｔｅｒｔ－ブチルＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｎ－ブチルグリシナート（Ｂｏｃ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯｔＢｕ）（１３０　ｇ）を定量的に得た。
　上述の方法で得たｔｅｒｔ－ブチルＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｎ－ブチルグリシナート（Ｂｏｃ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯｔＢｕ）（２６０　ｇ、９０４．６８　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（１０００　ｍＬ）に濃塩酸（１０００　ｍＬ）を０度にて滴下しながら加えた。反応液を室温に昇温した後、１６時間室温にて撹拌した。反応液を濃縮することでブチルグリシン（Ｈ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯＨ）（２００　ｇ）の塩酸塩を粗生成物として得た。
　粗生成物であるブチルグリシン（Ｈ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯＨ）（６０　ｇ）、炭酸カリウム（１８８．９　ｇ、１．３７　ｍｏｌ）、水／１，４－ジオキサン（１：１）（３０００　ｍＬ）の混合物を室温にて３０分間撹拌した後、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１８３．２　ｇ、５４３．０９　ｍｍｏｌ）を少しずつ室温にて加えた。反応液を室温にて１６時間撹拌した後、エーテルで３回洗浄した。得られた水層がｐＨ＝３になるまで５Ｍ塩酸水溶液を加えた後、酢酸エチルで３回抽出した。有機溶媒を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去した。得られた粗生成物をエーテルで洗浄することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－ブチルグリシン（化合物ａａ０２、Ｆｍｏｃ－ｎＢｕＧｌｙ－ＯＨ）（１２１　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　３５４　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
　Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ（化合物ａａ０４）の合成は、以下のスキームに従って行った。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000070
Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（３－メチルブタ－２－エン－１－イル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ０３）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000071
　（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ－ＯＨ）（５０　ｇ、２３４．６５　ｍｍｏｌ）をジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）（２５０　ｍＬ）に溶解し、氷冷下（０度）で水素化ナトリウム（２２　ｇ、９１６．６７　ｍｍｏｌ、６０％オイルディスパージョン）を加えた。氷冷下で３０分撹拌した後、１－ブロモ－３－メチルブタ－２－エン（４４　ｇ、２９５．２４　ｍｍｏｌ）を滴下して加えた。添加後、反応液を２５度で１６時間撹拌した後、氷水を加えて反応をクエンチし、塩酸水溶液（５Ｍ）を加えてｐＨを２から３に調節した。その後、酢酸エチルで２回抽出し、有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。ろ過後、減圧濃縮により酢酸エチルを除去し、目的物を含む粗生成物を得た。この粗生成物を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル＝１００／０→８０／２０）で精製し、Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（３－メチルブタ－２－エン－１－イル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ０３）（３２　ｇ、４８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　２９６　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．３９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ７）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－イソペンチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ０４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000072
　Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（３－メチルブタ－２－エン－１－イル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ０３）（１８５　ｇ、６７６．８５　ｍｍｏｌ）、アンモニアのメタノール溶液（２Ｍ、５５５　ｍＬ）、Ｐｄ／Ｃ（１８．５　ｇ）およびメタノール（１５００　ｍＬ）を混合し、水素雰囲気下（５　ａｔｍ）、室温で１６時間撹拌した。固体を濾過により除去した後、減圧濃縮により溶媒を除去することでＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－イソペンチル－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ）（１８３　ｇ）を得た。
　得られたＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－イソペンチル－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ）（１７５　ｇ）を１，４－ジオキサン（５００　ｍＬ）に溶解し、濃塩酸（３００　ｍＬ）を加えた後、室温で１６時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、得られた粗生成物（１２２　ｇ）を１，４－ジオキサン／水（１０００　ｍＬ／１０００　ｍＬ）に溶解し、炭酸カリウム（２３９　ｇ、１．７３　ｍｏｌ）およびＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（２３４　ｇ、６９４．３６　ｍｍｏｌ）を加えて室温で１６時間撹拌した。その後、反応液をヘキサンで３回洗浄した。洗浄後、塩酸水溶液（６Ｍ）を加えて水層のｐＨを２から３に調節し、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過後に減圧濃縮して溶媒を除去した。得られた粗生成物をエーテル、ヘキサン、酢酸エチルで洗浄し、さらに逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル＝１００／０→３０／７０）で精製してＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－イソペンチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ０４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）－ＯＨ）（９５　ｇ、４１％）を白色固体として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３９８　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．２９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１８）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－フェニルブタン酸（化合物ａａ０５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000073
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－フェニルブタン酸（１００　ｇ、２４４．１１　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（１．５Ｌ）にトシル酸（ＴｓＯＨ）（２．５７５　ｇ、１４．９５　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒト（１５．９６　ｇ、４８８．７７　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１１０℃で１６時間撹拌した。有機層に水を加え、水で３回洗浄した後、得られた有機層と得られた水層を酢酸エチルで抽出した有機層をあわせて無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、１００　ｇの（Ｓ）－５－オキソ－４－フェネチルオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチルを粗生成物として得た。
　上記のように得られた（Ｓ）－５－オキソ－４－フェネチルオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）（５０　ｇ、１１８．５１　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（７００　ｍＬ）にトリエチルシラン（Ｅｔ３ＳｉＨ）、トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（７００　ｍＬ）を加え、２５℃で１６時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、得られた残渣に炭酸カリウム水溶液を加え、石油エーテルで洗浄した。得られた水層を濃塩酸を用いてｐＨ＝３になるように調整し、酢酸エチルで抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、得られた残渣にメタノール、ヘキサンを加え再び減圧濃縮し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－フェニルブタン酸（化合物ａａ０５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ－ＯＨ）（２９．５　ｇ、５８％、２工程）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４１６（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９５分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）の合成
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）は下記のルートにて合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000074
（５－フルオロピリジン－３－イル）メタノール（化合物ａａ０７）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000075
　窒素雰囲気下、市販の５－フルオロニコチン酸（化合物ａａ０６）（１４．１　ｇ、１００　ｍｍｏｌ）にＴＨＦ（２００　ｍＬ）を加え、メカニカルスターラーを用い撹拌した。次いで、トリエチルアミン（１９．５１　ｍＬ、１４０　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、固体が完全に溶解するまで撹拌した後、反応液を氷浴を用いて冷却した。その後、エチルクロロフォメート（１１．５　ｍＬ、１２０　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、氷浴下３０分撹拌した。その後、ドライアイスバスを用い、反応液が－６０℃以下になるように冷却し、ＬｉＡｌＨ４（水素化アルミニウムリチウム）のＴＨＦ溶液（２．５Ｍ、４０　ｍＬ、１００　ｍｍｏｌ）を反応液が－２０℃を超えないように、５分以上かけて滴下した。反応液を－７８℃で３時間撹拌した後、酢酸エチル（６９　ｍＬ）を反応液が－２０℃を超えないように加えた。その後、氷浴を用いてさらに１時間撹拌し、水（１８　ｍＬ）を加え１５分室温で撹拌した。反応液をＮＨシリカゲルを用いてろ過、減圧濃縮することで（５－フルオロピリジン－３－イル）メタノール（化合物ａａ０７）（９．２８　ｇ、７３％）を黄色の油状成分として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝１２８（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．２８分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
３－（ブロモメチル）－５－フルオロピリジン臭化水素酸塩（化合物ａａ０８）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000076
　丸底フラスコにアセトン／ドライアイスで冷却したコンデンサーを接続し、窒素雰囲気下、（５－フルオロピリジン－３－イル）メタノール（化合物ａａ０７）（８．２１　ｇ、６４．６　ｍｍｏｌ）、２５％ＨＢｒ酢酸溶液（９６　ｍＬ、３８８　ｍｍｏｌ）を加えた。なお、反応は開放系で行い、生じたＨＢｒをトラップするために１Ｍ水酸化ナトリウム水溶液を用いている。反応液を室温から１００℃まで徐々に撹拌しながら昇温し、さらに３時間撹拌した。その後反応液を室温まで冷却し、ジイソプロピルエーテル（４８　ｍＬ）をゆっくりと加えることを３回繰り返し、得られた固体をろ過することで３－（ブロモメチル）－５－フルオロピリジン臭化水素酸塩（化合物ａａ０８）（１２．４３　ｇ、７１％）を灰色の固体として得た。
１Ｈ　ＮＭＲ（Ｖａｒｉａｎ４００－ＭＲ、４００ＭＨｚ、ｄ－ＤＭＳＯ）δ４．７７（２Ｈ、ｓ）、７．８５－７．８８（１Ｈ、ｍ）、８．５５－８．５６（２Ｈ、ｍ）
Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000077
　窒素雰囲気下、ｔ－ペントキサイドナトリウム（ＮａＯｔＰｅｎ）（１３．７　ｇ、１２５ｍｍｏｌ）にＴＨＦ（４５．８ｍＬ）を加え撹拌したのち、市販のトリチルセリンのトリエチルアミン塩（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ－ＯＨトリエチルアミン塩）（化合物ａａ０９）（１１．２４　ｇ、２５　ｍｍｏｌ）を３回に分けて加え、３０分室温にて撹拌した。反応液を氷浴を用いて１５分撹拌し、冷却した後、３－（ブロモメチル）－５－フルオロピリジン臭化水素酸塩（化合物ａａ０８）（８．１３　ｇ、３０　ｍｍｏｌ）のＤＭＦ溶液（１６　ｍＬ）を滴下しながら加え、さらにＤＭＦ（１４　ｍＬ）を加えた。反応液を氷浴下４５分撹拌した後、３－（ブロモメチル）－５－フルオロピリジン臭化水素酸塩（化合物ａａ０８）（２．０３　ｇ、７．５　ｍｍｏｌ）のＤＭＦ溶液（４．０　ｍＬ）を滴下しながら加え、さらにＤＭＦ（４．０　ｍＬ）を加えた。その後、反応液を室温にてさらに１時間撹拌し、水（１２５　ｍＬ）を加えた。得られた混合液をｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）で洗浄し、有機層を水で抽出した。得られた水層をまとめて、飽和リン酸二水素ナトリウム水溶液（１５　ｍＬ）を用いてｐＨ＝７に調整した後、酢酸エチルを用いて２回抽出した。得られた有機層をまとめて、飽和食塩水を２倍に希釈した溶液を用いて３回洗浄し、その後、飽和食塩水で２回洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）（１１．０７　ｇ、９７％）を黄色のアモルファスとして得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４５５（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．８６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１１、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ））の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000078
　Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）（１０．７６　ｇ、２３．５７　ｍｍｏｌ）の１．４－ジオキサン溶液（２１．５　ｍＬ）に５～１０％の塩酸／メタノール溶液（６４．２　ｍＬ）を室温にて加えた。１０分から２０分室温にて反応液を撹拌した後、１．４－ジオキサン（１３５　ｍＬ）を加えた。さらに追加で１．４－ジオキサン（９０　ｍＬ）を加えた後、下記に示す通り、事前に少量調製した種晶（５　ｍｇ）を加え室温で３０分さらに撹拌した。得られた固体をろ過し、ジイソプロピルエーテル（５０　ｍＬ）で４回洗浄し、減圧下乾燥することで、Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１１、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ））（６．５８　ｇ、９５％）を塩酸塩として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝２１３（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．２４分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５）
Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１１、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ））の種晶の調整
　Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）（９８　ｍｇ、２．６９　ｍｍｏｌ）の１．４－ジオキサン溶液（８１９　μＬ）に５～１０％の塩酸／メタノール溶液（２．４５　ｍＬ）を室温にて加え、５時間撹拌した。反応液に１．４－ジオキサン（６．０　ｍＬ）を加え、得られた固体をろ過し、ジイソプロピルエーテルで洗浄、減圧下乾燥することでＯ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１１、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ））（２２２．５　ｍｇ、８６％）を塩酸塩として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝２１３（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．２４分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000079
　Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１１、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ））の塩酸塩（６．３７　ｇ、２２．１９　ｍｍｏｌ）に水（４２　ｍＬ）、１．４－ジオキサン（１１５　ｍＬ）、ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１３．５３　ｍＬ、７８　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、撹拌した。その後、反応液に炭酸Ｎ－スクシンイミジル９－フルオレニルメチル（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（７．８６　ｇ、２３．３　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、室温で撹拌した。原料の消失をＬＣ－ＭＳで確認した後、反応液に水（５６．２　ｍＬ）を室温にて加え、２５％　ｔ－ブチルメチルエーテル（ＭＴＢＥ）／ヘキサン溶液で２回洗浄した。得られた水層を飽和リン酸二水素ナトリウム水溶液（ＮａＨ２ＰＯ４）を用いてｐＨ＝６．１になるように調整した。その後、酢酸エチルで２回抽出し、得られた有機層をまとめて、飽和食塩水を２倍に希釈した溶液、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－フルオロピリジン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｆ－５－Ｍｅ－Ｐｙｒ）－ＯＨ）（９．４７　ｇ、９８％）を黄色の固体として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４３７（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８６分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）の合成
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）は下記のルートにて合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000080
３－（３－クロロフェノキシ）－２－（トリチルアミノ）プロパン酸（Ｓ）－メチル（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＭｅ）（化合物ａａ１４）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000081
　窒素雰囲気下、市販の３－ヒドロキシ－２－（トリチルアミノ）プロパン酸（Ｓ）－メチル（化合物ａａ１３、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ－ＯＭｅ）（６．０　ｇ、１６．６　ｍｍｏｌ）とトリフェニルフォスフィン（ＰＰｈ３）（８．７１　ｇ、３３．２　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（３５　ｍＬ）に２．２Ｍのジエチルアゾカルボキシレート（ＤＥＡＤ）のトルエン溶液（１５．０６　ｍＬ、３３．２　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、反応液を５０℃で３０分撹拌した。反応液を減圧濃縮した後、得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）にて精製し、３－（３－クロロフェノキシ）－２－（トリチルアミノ）プロパン酸（Ｓ）－メチル（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＭｅ）（化合物ａａ１４）（４．４３　ｇ、５７％）を得た。
１Ｈ　ＮＭＲ（Ｖａｒｉａｎ４００－ＭＲ、４００ＭＨｚ、ｄ－ＤＭＳＯ）δ７．４２－７．４４（６Ｈ、ｍ）、７．２８－７．３０（７Ｈ、ｍ）、７．２０－７．２１（３Ｈ、ｍ）、６．９９－７．０１（２Ｈ、ｍ）、６．８３－６．８５（１Ｈ、ｍ）、４．１９－４．２２（１Ｈ、ｍ）、４．０６－４．０８（１Ｈ、ｍ）、３．４９－３．５１（１Ｈ、ｍ）、３．１７（３Ｈ、ｓ）
（Ｓ）－２－アミノ－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１５、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000082
　３－（３－クロロフェノキシ）－２－（トリチルアミノ）プロパン酸（Ｓ）－メチル（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＭｅ）（化合物ａａ１４）（３．９　ｇ、８．２６　ｍｍｏｌ）の１．４－ジオキサン溶液（８０　ｍＬ）に１．０Ｍ水酸化リチウム／メタノール溶液（８３　ｍＬ）を室温にて加え、反応液を５０℃で３時間撹拌した。反応液を減圧濃縮した後、得られた残渣にトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（３０　ｍＬ）を加え、５０℃で１０分間撹拌した。その後、反応液を減圧濃縮し、得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル）にて精製し、（Ｓ）－２－アミノ－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１５、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）（８５０　ｍｇ、４８％、２工程）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝２１６（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．３７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000083
　（Ｓ）－２－アミノ－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１５、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）（８５０　ｍｇ、３．９４　ｍｍｏｌ）と炭酸Ｎ－スクシンイミジル９－フルオレニルメチル（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１．３３　ｇ、３．９４　ｍｍｏｌ）に１，４－ジオキサン（２０　ｍＬ）と水（２０　ｍＬ）を室温にて加えた後、炭酸セシウム（２．５６９　ｇ、７．８８　ｍｍｏｌ）を加え、室温で撹拌した。原料の消失をＬＣ－ＭＳで確認した後、水（２０　ｍＬ）を加え、ジエチルエーテル（４０　ｍＬ）で２回洗浄した。得られた水層を５Ｎ塩酸水溶液を用いてｐＨ＝２になるまで調整し、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－クロロフェノキシ）プロパン酸（化合物ａａ１６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｐｈ－３－Ｃｌ）－ＯＨ）（１．４２　ｇ、８２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４３８（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９１分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－６－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ヘキサン酸（化合物ａａ１７、Ｆｍｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000084
　市販で購入した（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－６－ヒドロキシヘキサン酸（Ｆｍｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＨ）（３　ｇ、８．１２　ｍｍｏｌ）とｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（４０８　ｍｇ、１．６２　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（１０　ｍＬ）を減圧濃縮し共沸脱水をおこなった。得られた残渣をテトラヒドロフラン（１５　ｍＬ）に溶解しジヒドロピラン（５．４１　ｍＬ、５６．８　ｍｍｏｌ）を加え５０度にて１時間撹拌した。室温下、反応液に酢酸エチルを加え飽和食塩水で２回有機層を洗浄した後、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣をテトラヒドロフラン（３０　ｍＬ）に溶解し、ｐＨを８に調節したリン酸緩衝液（３０　ｍＬ）を加え５０度にて３時間撹拌した。室温下、反応液を酢酸エチルで２度抽出を行い、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄し、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣をジエチルエーテル（５０　ｍＬ）に溶解し、そこへヘプタン（５０　ｍＬ）を加える事で粗生成物を沈殿させ、減圧濃縮を行う事でジエチルエーテルを除去し、残った上澄み溶液をデカンテーションにて取り除いた。この作業を２度繰り返す事で粗生成物を得た。得られた粗生成物をｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテル（１５０　ｍＬ）に溶解し、０．０５Ｍリン酸水溶液（１５０　ｍＬ）を加え室温にて１時間撹拌した。有機層を回収し、酢酸エチルで水層を抽出した。得られた有機層を合わせその後、飽和食塩水で２回洗浄し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮し、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－６－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ヘキサン酸（化合物ａａ１７、Ｆｍｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＴＨＰ）－ＯＨ）（２．９２５　ｇ、７９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５４　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ１８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000085
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（２５．０　ｇ、１０６　ｍｍｏｌ）および２－（ベンジルオキシ）エタン－１－オール（２３．８　ｇ、１５６　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１００　ｍＬ）に溶解し０度に冷却したのち、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（２．００　ｍＬ、１５．９　ｍｍｏｌ）を加えて０度で１時間攪拌した。反応液に水を加えジクロロメタンで２回抽出後、炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水で有機層を洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、メチルＮ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ１８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＭｅ）（３０．０　ｇ、７３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３８８　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１３分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ９）
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000086
　窒素雰囲気下、水酸化リチウム１水和物（１３．９　ｇ、３３１　ｍｍｏｌ）、塩化カルシウム（１２９　ｇ、１．２４　ｍｏｌ）を水（３２１　ｍＬ）に溶解させた。そこへメチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ１８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＭｅ）（３０．０　ｇ、７７．４　ｍｍｏｌ）の２－プロパノール／テトラヒドロフラン溶液（１．２８　Ｌ／３２１　ｍＬ）を室温で加え３時間攪拌した。２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、有機層を除去したのち、水層を酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）（３０．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２０、Ｈ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000087
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）（３４．０　ｇ、９１．１　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（６．８０　ｇ、２０％　ｗ／ｗ）をメタノール（５００　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２０、Ｈ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１０．７　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000088
　窒素雰囲気下、Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２０、Ｈ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（５．００　ｇ、３３．５　ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１２．４　ｇ、３６．９　ｍｍｏｌ）および炭酸ナトリウム（１０．６　ｇ、１００　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（１３６　ｍＬ／５６．０　ｍＬ）に溶解させ室温で３時間攪拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで３回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで３回抽出した、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１２．０　ｇ、９６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３７２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．３１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ３３）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000089
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１．６　ｇ、４．３１　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（２．７２８　ｍＬ、３０．３　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（８．６１６　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（５４．１　ｍｇ、０．２１５　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて２時間攪拌した。混合物を冷却した後、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を３回洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をテトラヒドロフラン（１０　ｍＬ）に溶解させ、次いで０．０５Ｍのリン酸緩衝液（１００　ｍＬ）（１Ｍのリン酸２水素ナトリウム（ＮａＨ２ＰＯ４）水溶液（９４．３　ｍＬ）と１Ｍのリン酸水素２ナトリウム（Ｎａ２ＨＰＯ４）水溶液（５．７　ｍＬ）を混ぜて調製）を加えた。この混合物を室温で１０分間攪拌した後、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出し、飽和食塩水で有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１．７５　ｇ、９６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８１分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－４－（（２－（ベンジルオキシ）エトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ２３）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000090
　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）（３０．０　ｇ、８０．３　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（７．２０　　ｇ）およびパラトルエンスルホン酸（０．８３　　ｇ、４．８２　ｍｍｏｌ）をトルエン中（３００　ｍＬ）に溶解させ１１０度で１６時間攪拌した。室温に冷却後、炭酸水素ナトリウム水溶液で洗浄し、有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、（Ｓ）－４－（（２－（ベンジルオキシ）エトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ２３）（２７．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２４、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000091
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－４－（（２－（ベンジルオキシ）エトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ２３）（２７．０　ｇ、７０．１　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（４５０　ｍＬ）にトリエチルシラン（２４．４　ｇ、２１０　ｍｍｏｌ）とトリフルオロ酢酸（４５０　ｍＬ）を加え、室温で４８時間撹拌した。反応液を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させたのち、炭酸カリウム水溶液で再溶解し、ジエチルエーテルで洗浄し、濃塩酸をｐＨ２になるまで加えたのち、酢酸エチルで２回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２４、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）（２４．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２５、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000092
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）エチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２４、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＢｎ）－ＯＨ）（２４．０　ｇ、６２．０　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（２．４０　ｇ、１０％　ｗ／ｗ）をメタノール（４００　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２５、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１２．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000093
　窒素雰囲気下、Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２５、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１２　ｇ、７３．５４　ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（２７．３　ｇ、８１．０　ｍｍｏｌ）および炭酸ナトリウム（２７．３　ｇ、２５８　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（３２０　ｍＬ／１６０　ｍＬ）に溶解させ室温で３時間攪拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで３回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（２０．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000094
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ２６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１８．０　ｇ、４６．７　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（１００　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（０．５９　ｇ、２．３４　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（２７．５　ｇ、３２７　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間攪拌した。混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣（３１　ｇ）のうち、２５．０　ｇをテトラヒドロフラン（２００　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（２００　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で３時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチルを加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチルを加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（２０．０　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８７　（Ｍ＋ＮＨ４）＋
保持時間：０．６８分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１１）
（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ２８）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000095
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－プロパン－１，２－ジオール（２０．０　ｇ、２６３　ｍｍｏｌ）のトルエン（２００　ｍＬ）溶液に、ベンズアルデヒド（２９．３　ｇ、２７６　ｍｍｏｌ）およびｐ－トルエンスルホン酸（０．４５　ｇ、２．６１　ｍｍｏｌ）を加え、１３０度にて１６時間攪拌した。反応液を濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ２８）（３１．５　ｇ、７３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１６５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１２）
（２Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ２９）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000096
　窒素雰囲気下、（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ２８）（３２　ｇ、１９４．８８　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（１．００　Ｌ）溶液に、水素化ジイソブチルアルミニウムの１Ｍヘキサン溶液（３９０　ｍＬ、３９０　ｍｍｏｌ）を－５０度において加え、当該温度で１５分撹拌後、室温にて２時間攪拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液を加え反応を停止したのち、ジクロロメタンで２回抽出した。混合した有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、（２Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ２９）（３５．５　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ３０、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000097
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（２５．０　ｇ、１０６　ｍｍｏｌ）および（２Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ２９）（２６．５　ｇ、１５９　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１８８　ｍＬ）に溶解し０度に冷却したのち、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（２．７５　ｍＬ）を加えて０度で１時間３０分攪拌した。反応液に水を加えジクロロメタンで抽出後、飽和炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水で有機層を洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、メチルＮ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ３０、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）（３０．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３１、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000098
　窒素雰囲気下、水酸化リチウム１水和物（１０．５　ｇ）塩化カルシウム（１０３　ｇ）を水（３００　ｍＬ）に溶解させた。そこへメチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ３０、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２５　ｇ、６２．３　ｍｍｏｌ）の２－プロパノール／テトラヒドロフラン溶液（１．２０　Ｌ／３００　ｍＬ）を室温で加え５時間攪拌した。２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、有機層を除去したのち、水層を酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３１、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３２、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000099
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３１、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（３．００　ｇ、７．７４　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（０．３０　ｇ、１０％　ｗ／ｗ）をメタノール（５０．０　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３２、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（０．７８　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000100
　窒素雰囲気下、Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３２、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（０．７８　ｇ、４．７８　ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１．６１　ｇ、４．７８　ｍｍｏｌ）およびＮ－エチル－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）（０．９３　ｍｇ、７．１７　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（８．００　ｍＬ／２２．０　ｍＬ）に溶解させ室温で３０分攪拌した。反応液をヘキサン（１８．０　ｍＬ）／ｔ－ブチルメチルエーテル（６．００　ｍＬ）で２回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチル（２０．０　ｍＬ）で２回抽出した、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１．６２　ｇ、８８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３８６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６８分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（２Ｓ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000101
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８３　ｍｇ、０．２２　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（１．００　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（２．７１　ｍｇ、０．０１　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（０．１３　ｇ、１．５１　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて２時間攪拌した。混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をテトラヒドロフラン（１．００　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（１．００　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で３時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチル（１７５　ｍＬ）を加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチル（１７５　ｍＬ）を加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（２Ｓ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（８８．０　ｍｇ、８７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４６８　（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．８６分、０．８７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－４－（（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ３５）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000102
　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３１、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ、６４．５３　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（５．８０　ｇ）およびパラトルエンスルホン酸（０．６７　ｇ、３．８９　ｍｍｏｌ）をトルエン中（２５０　ｍＬ）に溶解させ１１０度で１６時間攪拌した。室温に冷却後、炭酸水素ナトリウム水溶液で洗浄し、有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、（Ｓ）－４－（（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ３５）（１８．６　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３６、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000103
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－４－（（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ３５）（１８．６　ｇ、４６．６　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（２９６　ｍＬ）にトリエチルシシラン（１６．２　ｇ、１３９　ｍｍｏｌ）とトリフルオロ酢酸（２９６　ｍＬ）を加え、室温で４８時間撹拌した。反応液を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた後、炭酸カリウム水溶液で再溶解し、ジエチルエーテルで洗浄し、濃塩酸をｐＨ２になるまで加えたのち、酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３６、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（９．４　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３７、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000104
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３６、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（９．４０　ｇ、２３．４　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（１．８０　ｇ、１０％　ｗ／ｗ）をメタノール（１８５　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３７、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（３．４０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000105
　窒素雰囲気下、Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３７、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（３．４０　ｇ、１９．２　ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（７．１２　ｇ、２２．１　ｍｍｏｌ）および炭酸ナトリウム（７．１３　ｇ、６７．３　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（８０．０　ｍＬ／４０．０　ｍＬ）に溶解させ室温で３時間攪拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで３回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで３回抽出した、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８．００　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（（２Ｓ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３９、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000106
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８０．０　ｇ、２０．０　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（４０．０　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（０．２６　ｇ、１．０２　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１１．８　ｇ、１４０　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて２時間攪拌した。混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣（９．３０　ｇ）をテトラヒドロフラン（５０．０　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（５０．０　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で３時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチルを加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチルを加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．５％炭酸水素アンモニウム水溶液／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（（２Ｓ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ３９、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（７．００　ｇ、７２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　５０１　（Ｍ＋ＮＨ４）＋
保持時間：０．８２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１０）
（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ４０）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000107
　窒素雰囲気下、（Ｒ）－プロパン－１，２－ジオール（２０　ｇ、２６２．８３　ｍｍｏｌ）のトルエン（２００　ｍＬ）溶液に、ベンズアルデヒド（２９．３　ｇ、２７６　ｍｍｏｌ）およびｐ－トルエンスルホン酸（０．４５　ｇ、２．６１　ｍｍｏｌ）を加え、１３０度にて１６時間攪拌した。反応液を濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ４０）（３１．５　ｇ、７３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１６３　（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：７．２１分（分析条件ＧＣ０１）
（２Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ４１）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000108
　窒素雰囲気下、（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキソラン（化合物ａａ４０）（３２．０　ｇ、１９５　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（１．００　Ｌ）溶液に、水素化ジイソブチルアルミニウムの１Ｍヘキサン溶液（３９０　ｍＬ、３９０　ｍｍｏｌ）を－５０度において加え、当該温度で１５分撹拌後、室温にて２時間攪拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液を加え反応を停止したのち、ジクロロメタンで２回抽出した。混合した有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、（２Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ４１）（３５．５　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ４２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000109
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（２５　ｇ、１０６．２８　ｍｍｏｌ）および（２Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロパン－１－オール（化合物ａａ４１）（２６．５　ｇ、１５９　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１８８　ｍＬ）に溶解し０度に冷却したのち、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（２．７５　ｍＬ）を加えて０度で１時間３０分攪拌した。反応液に水を加えジクロロメタンで抽出後、飽和炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水で有機層を洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、メチルＮ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ４２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）（５０．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000110
　窒素雰囲気下、水酸化リチウム１水和物（１０．５　ｇ）塩化カルシウム（１０３　ｇ）を水（３００　ｍＬ）に溶解させた。そこへメチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ４２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２５．０　ｇ、６２．３　ｍｍｏｌ）の２－プロパノール／テトラヒドロフラン溶液（１．５０　Ｌ／１５０　ｍＬ）を室温で加え５時間攪拌した。２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、有機層を除去したのち、水層を酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４４、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000111
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（２．８７　ｇ、７．４１　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（５７０　ｍｇ、２０％　ｗ／ｗ）をメタノール（５０　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を酢酸エチルにて６０度で再結晶することで、Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４４、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（９００　ｍｇ、７４％）を得た。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000112
　窒素雰囲気下、上述に記載の方法で合成したＯ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４４、Ｈ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（５．０　ｇ、３０．６４　ｍｍｏｌ）、炭酸水素ナトリウム（７．７１　ｇ、９１．８　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（１２７　ｍＬ／５２．９　ｍＬ）に溶解させ、室温にてＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１０．８５　ｇ、３２．２　ｍｍｏｌ）を加え４時間撹拌した。反応液に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで洗浄した後、水層に濃塩酸をｐＨ３になるまで加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出した、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８　ｇ、６８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３８６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．０８分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４９）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（２Ｒ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000113
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（４．４　ｇ、１１．４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（５０　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（１４３　ｍｇ、５．７　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（６．７　ｇ、７９．８　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間攪拌した。混合物を室温にて冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加えた後、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過を行い、得られた溶媒を減圧下留去し、粗生成物（８　ｇ）を得た。得られた粗生成物（８００　ｍｇ）にテトラヒドロフラン（１０　ｍＬ）とｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（１０　ｍＬ）の混合液を加え、５０度で３時間攪拌した。反応液を室塩で冷却した後、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄し、ろ過を行った。得られた溶液を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．５％炭酸水素アンモニウム水溶液／アセトニトリル）で精製し、得られたフラクションをまとめてアセトニトリルを減圧下留去した。得られた水層にｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで３回抽出し、減圧下溶媒を留去することでＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（２Ｒ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（４００　ｍｇ、２工程６５％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４６８　（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．８５分、０．８７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－４－（（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ４７）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000114
　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ４３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ、６４．５　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（５．８０　ｇ）およびパラトルエンスルホン酸（０．６７　ｇ、３．８９　ｍｍｏｌ）をトルエン中（２５０　ｍＬ）に溶解させ１１０度で１６時間攪拌した。室温に冷却後、炭酸水素ナトリウム水溶液で洗浄し、有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、（Ｓ）－４－（（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ４７）（１８．６　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４８、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000115
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－４－（（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ａａ４７）（１８．６　ｇ、４６．６　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（２９６　ｍＬ）にトリエチルシラン（１６．２　ｇ、１３９　ｍｍｏｌ）とトリフルオロ酢酸（２９６　ｍＬ）を加え、室温で４８時間撹拌した。反応液を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させたのち、炭酸カリウム水溶液で再溶解し、ジエチルエーテルで洗浄し、濃塩酸をｐＨ２になるまで加えたのち、酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、ささらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４８、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（９．４０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４９、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000116
　水素雰囲気下、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－（ベンジルオキシ）プロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４８、Ｃｂｚ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＢｎ）－ＯＨ）（９．４０　ｇ、２３．４　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（１．８０　ｇ、１０％　ｗ／ｗ）をメタノール（１８５　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４９、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（３．４０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ５０、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000117
　窒素雰囲気下、Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ４９、Ｈ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（３．４０　ｇ、１９．２　ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（７．１２　ｇ、２２．１　ｍｍｏｌ）および炭酸ナトリウム（７．１３　ｇ、６７．３　ｍｍｏｌ）を水／１，４－ジオキサン（８０．０　ｍＬ／４０．０　ｍＬ）に溶解させ室温で３時間攪拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで３回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで３回抽出した、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ５０、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８．００　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（（２Ｒ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５１、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000118
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－２－ヒドロキシプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ５０、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８．００　　ｇ、２０．０　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（４０．０　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（０．２６　ｇ、１．０２　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１１．８　ｇ、１３９　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて２時間攪拌した。混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣（９．３　ｇ）をテトラヒドロフラン（１００　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（１００　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で３時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチルを加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチルを加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（（２Ｒ）－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５１、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（８．５０　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　５０１　（Ｍ＋ＮＨ４）＋
保持時間：０．８２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１０）
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成は、以下のスキームに従って行った。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000119
メチル　Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）－２－メチルプロピル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000120
　（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（２．０　ｇ、８．５０　ｍｍｏｌ）および２－ベンジルオキシ－２－メチル－プロパン－１－オール（２．３０　ｇ、１２．７５　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（７．５　ｍＬ）に溶解し、氷冷下で三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（０．１６０　ｍＬ、１．２８　ｍｍｏｌ）を５分かけて滴下した。氷冷下で３０分撹拌後、水（２．０　ｍＬ）を加えて１０分撹拌して反応を停止し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えた。ジクロロメタンで水層を抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。ろ過後、有機溶媒を減圧濃縮により除去し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル＝１００／０→７５／２５）で精製し、メチルＯ－（２－（ベンジルオキシ）－２－メチルプロピル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２．３６　ｇ、６７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９３　分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000121
　メチルＯ－（２－（ベンジルオキシ）－２－メチルプロピル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２．３６　ｇ、５．６８　ｍｍｏｌ）をメタノール（８．０　ｍＬ）に溶解させた。これに、水酸化リチウム一水和物（０．４７７　ｇ、１１．３６　ｍｍｏｌ）を水（８．０　ｍＬ）に溶解させた水溶液を添加し、室温で１時間撹拌した。その後、２Ｍの塩酸水溶液（８．５２　ｍＬ、１７．０４　ｍｍｏｌ）を加えた。水層を酢酸エチルで３回抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。ろ過後、酢酸エチルを減圧濃縮により除去し、Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）－２－メチルプロピル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）を得た。
　上で得られた、Ｏ－（２－（ベンジルオキシ）－２－メチルプロピル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）をメタノール（４５　ｍＬ）に溶解し、Ｐｄ／Ｃ（４５６　ｍｇ）を加えて水素雰囲気化、室温で終夜撹拌した。セライトろ過によりＰｄ／Ｃを除いた後、減圧濃縮によりメタノールを除去することでＯ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（１．０５　ｇ）を定量的に得た。
　得られたＯ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（１．５９　ｇ、８．９７　ｍＬ）および炭酸ナトリウム（２．８５　ｇ、２６．９　ｍｍｏｌ）を水（３６　ｍＬ）および１，４－ジオキサン（１５　ｍＬ）に溶解し、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３．１８　ｇ、９．４２　ｍｍｏｌ）をゆっくり加えた。室温で３０分撹拌後、反応液に水（４０　ｍＬ）を加え、ｔ－ブチルメチルエーテル（６０　ｍＬ）で３回洗浄した。その後、水層に２Ｍの塩酸水溶液（２６．９　ｍＬ、５３．８　ｍｍｏｌ）を加えて水層のｐＨを１とした後、ｔ－ブチルメチルエーテル（６０　ｍＬ）で３回抽出した。有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、ろ過後、ｔ－ブチルメチルエーテルを減圧濃縮して得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１ギ酸アセトニトリル溶液）で精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（２．６２　ｇ、７３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４００　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７１分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000122
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（１．２　ｇ、３．００　ｍｍｏｌ）および３．４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１．９０　ｍＬ、２１．０３　ｍｍｏｌ）をテトラヒドロフラン（６．０　ｍＬ）に溶解し、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（０．０３８　ｇ、０．１５０　ｍｍｏｌ）を加えて５０度で２時間撹拌した。その後、反応液を酢酸エチル（１５　ｍＬ）で希釈し、飽和食塩水（１５　ｍＬ）で３回洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過し、減圧濃縮により溶媒を除去した。得られた残渣をテトラヒドロフラン（２４．０　ｍＬ）に溶解し、ｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（２４．０　ｍＬ）を加えて５０度で３時間撹拌した。反応液を酢酸エチル（４５　ｍＬ）で希釈後、飽和食塩水（４５　ｍＬ）で３回洗浄し、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。ろ過後、減圧濃縮して得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）で精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１．０５　ｇ、７２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４８４（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９１分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成は、以下のスキームに従って行った。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000123
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000124
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５３、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（１２　ｇ、３０．０４　ｍｍｏｌ）およびパラホルムアルデヒド（２．７５　ｇ、９１．６７　ｍｍｏｌ）をトリフルオロ酢酸（３１．４　ｇ、２７７．７８　ｍｍｏｌ）およびトルエン（６０　ｍＬ）に溶解させ、室温で４時間撹拌した。反応液を減圧濃縮後、得られた残渣をジクロロメタンに溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。ろ過後、ジクロロメタンを減圧濃縮により除去することで（Ｓ）－４－（（２－ヒドロキシ－２－メチルプロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１２　ｇ、９７％）を得た。
　得られた（Ｓ）－４－（（２－ヒドロキシ－２－メチルプロポキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１　ｇ、２．４３　ｍｍｏｌ）をトリフルオロ酢酸／ジクロロメタン（１３　ｍＬ／１３　ｍＬ）に溶解し、トリエチルシラン（Ｅｔ３ＳｉＨ）（８３２　ｍｇ、７．１６　ｍｍｏｌ）を滴下して加えた。室温で１６時間撹拌後、反応液を減圧濃縮して得られた残渣を炭酸カリウム水溶液に溶解し、ｔ－ブチルメチルエーテルで洗浄後、水層に塩酸水溶液（１Ｍ）を加えてｐＨを２に調節した。水層をｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出した後、有機層を水、飽和食塩水で各２回洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。ろ過後、減圧濃縮して得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル＝１００／０→５０／５０）で精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（７００　ｍｇ、７０％）を得た。
　得られたＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－ヒドロキシ－２－メチルプロピル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＨ）－ＯＨ）（６　ｇ、１４．５１　ｍｍｏｌ）とｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（１８２　ｍｇ、０．７３　ｍｍｏｌ）をテトラヒドロフラン（４８　ｍＬ）に溶解し、３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（８．５　ｇ、１０１．０５　ｍｍｏｌ）を窒素雰囲気化、室温で滴下して加えた。反応液を５０度で５時間撹拌後、反応液に酢酸エチルを添加し、抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過後、減圧濃縮してＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリンおよびテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イルＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリナートを混合物として得た。
　得られた混合物（５０　ｇ）をリン酸緩衝液（１Ｍ、ｐＨ＝６．８、１０００　ｍＬ）およびテトラヒドロフラン（１０００　ｍＬ）に溶解させ、５０度で４時間撹拌した。その後、反応液を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過後に減圧濃縮した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０～４０％　０．５％炭酸水素アンモニウム水溶液／アセトニトリル）で精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（２－メチル－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ｔＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）（２０　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４９８　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９４分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ２０）
４，４－ジメチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ５６）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000125
　窒素雰囲気下、３－メチルブタンー１，３－ジオール（４０．０　ｇ、３８４　ｍｍｏｌ）のクロロホルム（４００　ｍＬ）溶液に、ジメトキシメチルベンゼン（８７．６　ｇ、５７６　ｍｍｏｌ）およびｐ－トルエンスルホン酸（３．５９　ｇ、１８．９　ｍｍｏｌ）を加え、０度にて１．５時間攪拌した。反応液を濃縮し、残渣をカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、４，４－ジメチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ５６）（７０．０　ｇ、９５％）を得た。
３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブタンー１－オール（化合物ａａ５７）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000126
　窒素雰囲気下、上述の方法で得た４，４－ジメチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ５６）（５．００　ｇ、２６．０　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（１３０　ｍＬ）溶液に、水素化ジイソブチルアルミニウムの１Ｍヘキサン溶液（１５６　ｍＬ、１５６　ｍｍｏｌ）を－５０度において加え、当該温度で１５分撹拌後、室温にて１時間攪拌した。メタノール加え反応を停止したのち、ジクロロメタンで２回抽出した。混合した有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、残渣をカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブタンー１－オール（化合物ａａ５７）（２．００　ｇ、４０％）を得た。
メチル　Ｏ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000127
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（２５　ｇ、１０６　ｍｍｏｌ）および３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブタンー１－オール（化合物ａａ５７）（３１．０　ｇ、１５９　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１１３　ｍＬ）に溶解し０度に冷却したのち、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（２．２６　ｇ、１５．９　ｍｍｏｌ）を加えて０度で３時間攪拌した。反応液に水を加えジクロロメタンで抽出後、飽和炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水で有機層を洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、残渣をカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、メチルＯ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２８．０　ｇ、５５％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４５２　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．４６分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｏ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000128
　窒素雰囲気下、水酸化リチウム１水和物（１１．２　ｇ）塩化カルシウム（１１０　ｇ）を水（２７８　ｍＬ）に溶解させた。そこへメチル　Ｏ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ５８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（２８．７　ｇ、６８．４　ｍｍｏｌ）の２－プロパノール／テトラヒドロフラン溶液（２７８　ｍＬ／１１１５　ｍＬ）を室温で加え５時間攪拌した。２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、有機層を除去したのち、水層を酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を混合し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（２８．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６０、Ｈ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000129
　水素雰囲気下、Ｏ－（３－（ベンジルオキシ）－３－メチルブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ５９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（２８．０　ｇ、６７．４　ｍｍｏｌ）とパラジウム炭素（６．００　ｇ、２０％　ｗ／ｗ）をメタノール（５００　ｍＬ）に溶解させ、室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過したのち、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させたのちに、メタノール／ジクロロメタン（１／５）から再結晶を行い、Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６０、Ｈ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（７．００　ｇ、５４％）を得た。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000130
　窒素雰囲気下、Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６０、Ｈ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（２．８０　ｇ、１４．６　ｍｍｏｌ）、炭酸ナトリウム（４．６６　ｇ、４４．０　ｍｍｏｌ）を１，４－ジオキサン（２４．５　ｍＬ）／水（５８．８　ｍＬ）に溶解させた後に、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（５．１８　ｇ、１５．４　ｍｍｏｌ）を加え、室温で３時間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで３回洗浄後、水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで３回抽出した、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（５．８０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－メチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000131
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（６．８０　ｇ、１６．５　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（３５．０　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（０．２０　ｇ、０．８２　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１０．３　ｍＬ）を加え、５０度にて５時間攪拌した。混合物を２５度まで冷却し、酢酸エチルを加えた。続いて飽和食塩水にて有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣（１１．０　ｇ）のうち、０．７５　ｇをテトラヒドロフラン（２０．０　ｍＬ）に溶解させ、次いでｐＨ６．８に調製した１．０Ｍリン酸緩衝液（２０．０　ｍＬ）を加えた。この混合物を５０度で４時間攪拌した。２５度まで冷却した後、酢酸エチルを加え、有機層と水層を分離した。水層に酢酸エチルを加えて抽出を行った後、得られた全ての有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し得られた残渣を、逆相カラムクロマトグラフィー（０．５％炭酸水素アンモニウム水溶液／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－メチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）（０．６０　ｇ、８０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４９８　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１１）
（Ｓ）－４－（（３－ヒドロキシ－３－メチルブトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ６３）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000132
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ６１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（０．２０　ｇ、０．４８　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（０．０６　ｇ）およびトリフルオロ酢酸（０．６４　ｇ、５．６２　ｍｍｏｌ）をトルエン中（１０．０　ｍＬ）に溶解させ室温で１６時間攪拌した。反応液を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、（Ｓ）－４－（（３－ヒドロキシ－３－メチルブトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ６３）（０．１６　ｇ、８０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４４８　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：２．４７分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１４）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ６４、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000133
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－４－（（３－ヒドロキシ－３－メチルブトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ６３）（１．００　ｇ、２．３５　ｍｍｏｌ）、塩化アルミニウム（０．６３　ｇ、４．７０　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（５０．０　ｍＬ）に、０度においてトリエチルシラン（０．７５　ｍＬ）をゆっくり滴下し、室温で２時間撹拌した。反応液をジクロロメタンで希釈し、２Ｍ塩酸水溶液および飽和食塩水で洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－３－メチルブチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ６４、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（２－Ｍｅ－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（０．３０　ｇ、３０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４５０　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：２．１２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１５）
（Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－６－オキソヘキサン酸メチル（化合物ａａ６５）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000134
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－６－ヒドロキシヘキサン酸（Ｂｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＨ）（１０　ｇ、４０．４　ｍｍｏｌ）のトルエン／メタノール（９０　ｍＬ／６０　ｍＬ）溶液に２Ｍの（トリメチルシリル）ジアゾメタン／ヘキサン溶液（２４．２６　ｍＬ、４８．５　ｍｍｏｌ）を滴下しながら室温にて加え、終夜撹拌した。反応液をロータリーエバポレーターを用いて減圧濃縮することで得られた残渣にトルエン／メタノール（９０　ｍＬ／６０　ｍＬ）溶液を加え、溶解させた後、２Ｍの（トリメチルシリル）ジアゾメタン／ヘキサン溶液（２４．２６　ｍＬ、４８．５　ｍｍｏｌ）を滴下しながら室温にて加え、６時間撹拌した。反応液をロータリーエバポレーターを用いて減圧濃縮することで、粗生成物として（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（Ｂｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（１３　ｇ）を得た。
　得られた粗生成物である（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（Ｂｏｃ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（１３　ｇ）に４Ｎ塩酸／１．４－ジオキサン溶液（５０　ｍＬ、２００　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、６時間撹拌した。反応液をロータリーエバポレーターを用いて減圧濃縮することで、粗生成物として（Ｓ）－２－アミノ－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（Ｈ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＭｅ）の塩酸塩（９．２　ｇ）を得た
　得られた粗生成物である（Ｓ）－２－アミノ－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（Ｈ－Ｎｌｅ（６－ＯＨ）－ＯＭｅ）の塩酸塩（９．２　ｇ）のアセトニトリル溶液（１００　ｍＬ）に１，３－ジオキソイソインドリン－２－カルボン酸エチル（９．７４　ｇ、４４．４　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１５．５２　ｍＬ、８９　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、終夜撹拌した。反応液をロータリーエバポレーターを用いて減圧濃縮することで、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール）で精製することで（Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（１４．６　ｇ）を得た。
　上述の（Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－６－ヒドロキシヘキサン酸メチル（７．０８　ｇ、２４．３　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１００　ｍＬ）にデス－マーチンペルヨージナン（ＣＡＳ＃８７４１３－０９－０、１１．３４　ｇ、２６．７　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、室温にて３時間撹拌した。反応液をジクロロメタンで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液／水（１／１）の溶液、飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過を行った後、減圧濃縮することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製することで、（Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－６－オキソヘキサン酸メチル（化合物ａａ６５）（３．６　ｇ、４工程５１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２９０　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７０分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５）
（２Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６６）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000135
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－６－オキソヘキサン酸メチル（化合物ａａ６５）（３．６２　ｇ、１２．５１　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（５０　ｍＬ）に０度にて（トリフルオロメチル）トリメチルシラン（１．３９０　ｍＬ、９．３９　ｍｍｏｌ）、１Ｍのテトラブチルアンモニウムフルオリド（ＴＢＡＦ）／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（０．６２６　ｍＬ、０．６２６　ｍｍｏｌ）を加え、０度にて１０分間撹拌した。反応液に（トリフルオロメチル）トリメチルシラン（１．３９０　ｍＬ、９．３９　ｍｍｏｌ）、１Ｍのテトラブチルアンモニウムフルオリド（ＴＢＡＦ）／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（０．６２６　ｍＬ、０．６２６　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、３０分撹拌した。さらに反応液に（トリフルオロメチル）トリメチルシラン（１．３９０　ｍＬ、９．３９　ｍｍｏｌ）、１Ｍのテトラブチルアンモニウムフルオリド（ＴＢＡＦ）／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（０．６２６　ｍＬ、０．６２６　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、２時間３０分撹拌した。反応液に１Ｎ塩酸水溶液（３７．５　ｍＬ）を０度にて加え、室温で２０分間撹拌した後、酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過を行い、減圧濃縮することで得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）で精製することで、（２Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６６）（１．８　ｇ、４０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　３５８　（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：０．８１分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５）
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６７、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000136
　上述の方法で得た、（２Ｓ）－２－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６６）（３．１　ｇ、８．６３　ｍｍｏｌ）のメタノール溶液（３０　ｍＬ）にヒドラジンの１水和物（１．２５８　ｍＬ、２５．９　ｍｍｏｌ）、酢酸（１．４８２　ｍＬ、２５．９　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、終夜撹拌した。メタノールを除去するために、反応液をロータリーエバポレーターで減圧濃縮し、得られた溶液をジメチルスルホキシドで希釈した後、逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）で精製することで、（２Ｓ）－２－アミノ－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（Ｈ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（２　ｇ）を得た。
　上記の（２Ｓ）－２－アミノ－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（Ｈ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（２　ｇ、８．７３　ｍｍｏｌ）に水（２５　ｍＬ）、炭酸ナトリウム（２．９３　ｇ、３４．９　ｍｍｏｌ）、テトラヒドロフラン（５０　ｍＬ）、炭酸Ｎ－スクシンイミジル９－フルオレニルメチル（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３．５３　ｇ、１０．４７　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、反応液を２時間撹拌した。テトラヒドロフランを除去するために反応液をロータリーエバポレーターで減圧濃縮し、酢酸エチル、１Ｎ塩酸水溶液を加え、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）、順相カラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール）で精製した後、さらに、逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）で精製することで得られたフラクションを集め、メタノールを減圧下留去し、酢酸エチルで２回抽出し、飽和硫酸水素カリウム溶液、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機溶媒を減圧下留去しすることで、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６７、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（１．４　ｇ、２工程３６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４５２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸（化合物ａａ６８、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000137
　塩化カルシウム（５．１６　ｇ、４６．５　ｍｍｏｌ）の水溶液（７．００　ｍＬ）に水酸化リチウムの１水和物（０．５２１　ｇ、１２．４０　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、５分間撹拌した。（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸メチル（化合物ａａ６７、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＭｅ）（１．４　ｇ、３．１０　ｍｍｏｌ）のイソプロパノール／テトラヒドロフラン溶液（２８　ｍＬ／７　ｍＬ）を室温にて滴下しながら加え、反応液を終夜撹拌した。反応液に１Ｎ塩酸水溶液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出し、飽和食塩水で洗浄、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮を行うことで得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－７，７，７－トリフルオロ－６－ヒドロキシヘプタン酸（化合物ａａ６８、Ｆｍｏｃ－Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）－ＯＨ）（９５０　ｍｇ、７０％）で得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４３８．６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
メチルＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ６９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000138
　窒素雰囲気下、別途合成した（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（０．２０　ｇ、０．６２　ｍｍｏｌ）と３，３，３－トリフルオロプロパン－１，２－ジオール（０．２４　ｇ、１．９　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（３．０　ｍＬ）に三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（７．８　μＬ、０．０６２　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、３０分間撹拌した。また、窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（５．０　ｇ、１５．４６　ｍｍｏｌ）と３，３，３－トリフルオロプロパン－１，２－ジオール（６．０３　ｇ、４６．４　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（７７．０　ｍＬ）に三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（０．１９　ｍＬ、１．５５ｍｍｏｌ）を０度にて加え、３０分間撹拌した。さらに、窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（３．６　ｇ、１１．１３　ｍｍｏｌ）と３，３，３－トリフルオロプロパン－１，２－ジオール（４．３４　ｇ、３３．４　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（５５．７　ｍＬ）に三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（０．１４　ｍＬ、１．１１　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、３０分間撹拌した。
　上記３つの反応液にそれぞれ飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えた後、全ての反応液を合わせ減圧下、大部分の有機溶媒を留去し、残った溶液に酢酸エチル（３００　ｍＬ）を加え抽出した。有機層を飽和食塩水溶液で洗浄した後、有機溶媒を減圧下留去した。得られた残渣を順相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）にて精製し、メチルＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ６９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＭｅ）（６．５７　ｇ、５３％、純度９５％）および同化合物（３．１　ｇ、２５％、純度８７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５４　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１８分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７０、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000139
　塩化カルシウム（２．０６　ｇ、１８．５　ｍｍｏｌ）を水（５．２　ｍＬ）に溶解し、水酸化リチウムの１水和物（２０７　ｍｇ、４．９４　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて１０分撹拌した。その溶液にメチルＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ６９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＭｅ）（５６０　ｍｇ、１．２４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（５．１５　ｍＬ）、イソプロパノール（２０．６　ｍＬ）溶液を加え、室温にて２時間撹拌した。１Ｎ塩酸水溶液を加え反応を終結させた。さらに、０．１５　ｇ、１．１１　ｇ、０．４８　ｇ、０．９６　ｇのＦｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＭｅをそれぞれ用いて、同様に反応を実施した。全ての反応液を集め、減圧下大部分の溶媒を留去した。得られた溶液に酢酸エチルと水を加え、抽出した。有機層を減圧下留去した後、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７０、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（３．１０　ｇ、９８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４６２　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：２．２４分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４６）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７１、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000140
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７０、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（１．８４　ｇ、４．１９　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（２０．９　ｍＬ）にパラホルムアルデヒド（１５１　ｍｇ、５．０３　ｍｍｏｌ）、無水硫酸マグネシウム（１．２６　ｇ、１０．５　ｍｍｏｌ）、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（５２６　μＬ、４．１９　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて３時間撹拌した。不溶物を除去するため反応液をろ過した後、ジクロロメタン（１０　ｍＬ）で洗浄した。
　ろ過した反応液にトリエチルシラン（２．０　ｍＬ、１２．６　ｍｍｏｌ）、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（１．５８　ｍＬ、１２．６　ｍｍｏｌ）を加え、室温で３０分間撹拌した。反応液を飽和食塩水で希釈し、ジクロロメタンで抽出した。得られた有機層を減圧濃縮した後、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７１、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（６４０　ｍｇ、３４％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４５２　（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：２．３３分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４７）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000141
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７０、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）－ＯＨ）（２．５２　ｇ、５．７４　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１９．１２　ｍＬ）に３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（３．９２　ｍＬ、４３．０　ｍｍｏｌ）、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（０．１４４　ｇ、０．５７４　ｍｍｏｌ）を加え、４０度にて終夜撹拌した。その後、反応液に水を加え、ジクロロメタンにて抽出し、有機層を飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過し、減圧濃縮により溶媒を除去した。得られた残渣をテトラヒドロフラン（２９　ｍＬ）に溶解し、１Ｍのリン酸水溶液（ｐＨ＝８，２９　ｍＬ）を加え５０度で３時間撹拌した。反応液を水で希釈し、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を合わせ飽和食塩水にて洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過し、減圧濃縮により溶媒を除去した。得られた残渣をジクロロメタン（６０　ｍＬ）とヘプタン（６０　ｍＬ）に溶解後、ジクロロメタンを減圧濃縮することで油状粗生成物を沈殿させた。ヘプタン溶液をデカンテーションにて除去した。この操作を２度繰り返した。得られた粗生成物を酢酸エチルに溶解し、０．０５Ｍリン酸水溶液で２回、飽和食塩水で１回洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過後、減圧濃縮しＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３，３，３－トリフルオロ－２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（２．８９　ｇ、９６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝５２２（Ｍ－Ｈ）－
保持時間：１．００分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５－２）
（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000142
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－１－トリチルアジリジン－２－カルボン酸メチル（Ｔｒｔ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（５０　ｇ、１４５．６０　ｍｍｏｌ）のクロロホルム／メタノール溶液（１４５　ｍＬ／１４５　ｍＬ）に０度にてトリフルオロ酢酸（３３　ｍＬ）を滴下しながら加え、反応液を７時間撹拌した。反応液に０度にてＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１２７　ｍＬ）、カルボノクロリド酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（Ｆｍｏｃ－Ｃｌ）（３６　ｇ、１３９．１６　ｍｍｏｌ）の１、４－ジオキサン溶液（１４５　ｍＬ）を滴下しながら加え、反応液を０度にて１時間３０分撹拌した。反応液の溶媒を減圧下留去し、酢酸エチルで希釈した後、水、飽和塩化アンモニウム水溶液で２回、飽和食塩水で２回洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、減圧下溶媒留去することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製することで、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（４０　ｇ、２工程８５％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝３２４（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
ｔｅｒｔ－ブチル　Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－メチル－Ｌ－グルタミナート（化合物ａａ７４、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯｔＢｕ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000143
　氷冷下、（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－Ｇｌｕ－ＯｔＢｕ）（２０．０　ｇ、４７．０　ｍｍｏｌ）および１－ヒドロキシ－７－アザベンゾトリアゾール（ＨＯＡｔ）（８．８　ｇ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）（３００　ｍＬ）溶液に、１－（３－ジメチルアミノプロピル）－３－エチルカルボジイミド塩酸塩（ＷＳＣ・ＨＣｌ）（１３．５　ｇ）を加え、１０分間撹拌した。反応液の温度を５度以下に保ちつつ、２ｍｏｌ／Ｌのメチルアミンのテトラヒドロフラン溶液（２９．５　ｍＬ）を加え、室温で１６時間攪拌した。反応液をヘキサン／酢酸エチル（１／１、１４００　ｍＬ）と塩化アンモニウム水溶液（５００　ｍＬ）で希釈し、有機層を分離した。有機層を炭酸水素ナトリウム水溶液と飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、減圧下溶媒留去し、ｔｅｒｔ－ブチルＮ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－メチル－Ｌ－グルタミナート（化合物ａａ７４、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯｔＢｕ）（３６．２　ｇ）を粗生成物として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４３９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．０５分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ２３）
Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－メチル－Ｌ－グルタミン（化合物ａａ７５、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000144
　ｔｅｒｔ－ブチル　Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－メチル－Ｌ－グルタミナート（化合物ａａ７４、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯｔＢｕ）（４３．６　ｇ）のジクロロメタン（ＤＣＭ）（３００　ｍＬ）溶液に、氷冷下、トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（３００　ｍＬ）を滴下し、室温で１６時間攪拌した。減圧下溶媒留去し、得られた残渣にジエチルエーテルと炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、有機相を分離した。得られた水層を５ｍｏｌ／Ｌの塩酸水溶液でｐＨを１から２の間に調整し、沈殿した固体をろ取し、Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－メチル－Ｌ－グルタミン（化合物ａａ７５、Ｆｍｏｃ－Ｇｌｎ（Ｍｅ）－ＯＨ）（２６．７　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３８３　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．７５分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５）
２－ブロモーＮ－ｔｅｒｔ－ブチルアセトアミド（化合物ａａ７６）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000145
　窒素雰囲気下、２－ブロモ酢酸（５０．０　ｇ、３６０　ｍｍｏｌ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド（８０．０　ｍＬ）溶液に、２－メチルプロパン－２－アミン（２６．７　ｇ、３６５　ｍｍｏｌ）、Ｎ－エチル－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）（１３９　ｇ、１．０８　ｍｏｌ）およびプロピルホスホン酸無水物（Ｔ３Ｐ）（２２９　ｇ、７２０　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて２時間攪拌した。反応液に水を加え酢酸エチルで２回抽出し、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣をヘキサンで洗浄し、２－ブロモ－Ｎ－ｔｅｒｔ－ブチルアセトアミド（化合物ａａ７６、３６．５　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ７７、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000146
　窒素雰囲気下、トリチル－Ｌ－セリン（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ－ＯＨ）のトリエチルアミン塩（１．５０　ｇ、４．３２　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）（２．００　ｍＬ）溶液に、水素化ナトリウム（０．５２　ｇ、１３．０　ｍｍｏｌ、６０％オイルディスパージョン）を加え、室温で２時間撹拌した。そこへ２－ブロモ－Ｎ－ｔｅｒｔ－ブチルアセトアミド（化合物ａａ７６）（０．９６　ｇ）のＤＭＦ（１．００　ｍＬ）溶液を加え、室温で１時間撹拌した。反応液に水を加え酢酸エチルで２回抽出し、得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ７７、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（１．６０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000147
　窒素雰囲気下、Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ７７、Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（１５．３　ｇ、３３．２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（１５０　ｍＬ）／水（１５０　ｍＬ）溶液に、４度にてトリフルオロ酢酸（１１．２　ｇ、９９．１　ｍｍｏｌ）を加え同温度において２時間攪拌した。水層を分離し、Ｎ－エチル－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）をｐＨ７になるまで加えた。そこへ１，４－ジオキサン（１５０　ｍＬ）を加えたのち、Ｎ－エチル－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）（１４．９　ｇ、１１５　ｍｍｏｌ）およびＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（２２．３　ｇ、２３１　ｍｍｏｌ）を加え、２５度で１６時間撹拌した。反応液に水を加え、ヘキサンで２回洗浄したのち、水層に濃塩酸をｐＨ２になるまで加え、酢酸エチルで２回抽出した。得られた有機層を混合し、飽和食塩水で有機層を洗浄したのち、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し得られた残渣を、逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製しＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（１４．２　ｇ、９８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４４１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．０８分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ９）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ７９、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000148
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ７８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（１．０　ｇ、２．２７０　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（２０３　ｍｇ、６．８１　ｍｍｏｌ）、（（１Ｓ，４Ｒ）－７，７－ジメチル－２－オキソビシクロ［２．２．１］ヘプタン－１－イル）メタンスルホン酸（２６　ｍｇ、０．１１４　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（１．２　ｍＬ）を８０度にて１時間撹拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルで３回抽出し、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮することで、（Ｓ）－４－（（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１．０３５　ｇ）を粗生成物として得た。
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物である（Ｓ）－４－（（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエトキシ）メチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１．０３５　ｇ）のジクロロメタン（ＤＣＭ）溶液（２．８６　ｍＬ）にトリエチルシラン（Ｅｔ３ＳｉＨ）（１．０９６　ｍＬ、６．８６　ｍｍｏｌ）と水（４０　μＬ）を加え室温にて２分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（０．５８０　ｍＬ、４．５７　ｍｍｏｌ）を加え、２４時間室温にて撹拌した。反応液に飽和塩化アンモニウム水溶液を加え、室温で４０分撹拌した後、ジクロロメタン（ＤＣＭ）で２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮することで得られた残渣にアセトニトリルを加え、ヘキサンで洗浄した。アセトニトリルを減圧下留去することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ｔｅｒｔ－ブチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－メチル－Ｌ－セリン（化合物ａａ７９、Ｆｍｏｃ－ＭｅＳｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（０．９４４９　ｇ、２工程９２％）を得た
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７９分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
２－ブロモ－Ｎ－メチルアセトアミド（化合物ａａ８０）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000149
　窒素雰囲気下、炭酸カリウム（１１．６１　ｇ、８４　ｍｍｏｌ）にジクロロメタン（１００　ｍＬ）を加えた後、室温にてメチルアミン塩酸塩（２．８４　ｇ、４２．０　ｍｍｏｌ）を加えた。反応液に０度にて臭化　２－ブロモアセチル（３．４７　ｍＬ、４０　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、室温にて１時間撹拌した。反応液に水（２０　ｍＬ）を加え、ジクロロメタンで抽出した後、減圧下濃縮し、オイルポンプで乾燥させ２－ブロモ－Ｎ－メチルアセトアミド（化合物ａａ８０）（５．２　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000150
　窒素雰囲気下、トリチル－Ｌ－セリン（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ－ＯＨ）のトリエチルアミン塩（１．８０　ｇ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（２．００　ｍＬ）溶液に、１．９Ｍナトリウムビス（トリメチルシリル）アミド（ＮａＨＭＤＳ）のＴＨＦ溶液（４．８６　ｍＬ、９．２３　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、１５分間撹拌した。反応液に２－ブロモ－Ｎ－メチルアセトアミド（化合物ａａ８０）（１．２２　ｇ）のＴＨＦ（２．００　ｍＬ）溶液を０度にて加え、室温で１５分間撹拌した。反応液を酢酸エチル（３００　ｍＬ）、水（６０　ｍＬ）、１Ｎ塩酸水溶液（４．８　ｍＬ）の混合液に加え、得られた有機層を減圧下留去し粗生成物を得た。また、窒素雰囲気下、トリチル－Ｌ－セリン（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ－ＯＨ）のトリエチルアミン塩（１．８０　ｇ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（２．００　ｍＬ）溶液に、１．９Ｍナトリウムビス（トリメチルシリル）アミド（ＮａＨＭＤＳ）のＴＨＦ溶液（４．６５　ｍＬ、８．８３　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、１５分間撹拌した。反応液に２－ブロモ－Ｎ－メチルアセトアミド（化合物ａａ８０）（１．２２　ｇ）のＴＨＦ（２．００　ｍＬ）溶液を０度にて加え、室温で１５分間撹拌した。反応液を酢酸エチル（３００　ｍＬ）、水（６０　ｍＬ）、１Ｎ塩酸水溶液（４．８　ｍＬ）の混合液に加え、得られた有機層を減圧下留去し粗生成物を得た。上記２つの粗生成物を合わせて、逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、Ｏ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）－ＯＨ）（２．５　ｇ）を得た。
　得られたＯ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（Ｔｒｔ－Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）－ＯＨ）（２．４　ｇ、５．７３　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン（ＤＣＭ）溶液（２．８７　ｍＬ）にトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（１．３２５　ｍＬ、１７．２０　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、３０分間撹拌した。反応液に水（２．８７　ｍＬ）を加え、得られた水層を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製することで、Ｏ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（９００　ｍｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
　得られた粗生成物であるＯ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）－ＯＨ）（９００　ｍｇ）に水（４．２　ｍＬ）、Ｎ－エチル－Ｎ－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）（２．２３１　ｍＬ、１２．７７　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（１４．０　ｍＬ）を室温にて加えた後、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１．７２３　ｇ、５．１１　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、３０分間撹拌した。反応液を酢酸エチル（１５０　ｍＬ）、水（３０　ｍＬ）、１Ｎ塩酸水溶液（３．０　ｍＬ）の混合液に加え、得られた有機層を減圧下留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（メチルアミノ）－２－オキソエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）－ＯＨ）（１．８　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３９９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６３分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000151
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（５００　ｍｇ、２．１２５　ｍｍｏｌ）およびプロパン－１，３－ジオール（８１０　ｍｇ、１０．６４５　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１０　ｍＬ）に溶解し０度に冷却したのち、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・Ｅｔ２Ｏ）（４６　ｍｇ、０．３２４　ｍｍｏｌ）を加えて０度で４時間攪拌した。反応液にジクロロメタンを加え、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）（３９０　ｍｇ、５９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３３４　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．０９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000152
　窒素雰囲気下、水酸化リチウム（３．１４　ｇ、１３１．０４９　ｍｍｏｌ）、塩化カルシウム（５４．５４　ｇ、４９１．４３４　ｍｍｏｌ）に水（１３４　ｍＬ）、２－プロパノール（５３８　ｍＬ）を室温にて加え、撹拌した後、メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）（１０．２　ｇ、３２．７６２　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（１３４　ｍＬ）を室温にて加え、５時間攪拌した。反応液に６Ｎ塩酸水溶液をｐＨ３になるまで加え、有機溶媒を減圧下除去した後、水層を酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１０．６　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000153
　水素雰囲気下（～３　ａｔｍ）、上述のように得た粗生成物であるＮ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１３　ｇ）、１０％　パラジウム炭素（４．６５　ｇ）、メタノール（１３０　ｍＬ）の混合物を室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過した後、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を酢酸エチルで再結晶することで、Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（５．５　ｇ、２工程７８％）を得た。
　窒素雰囲気下、Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（５．５　ｇ、３３．７０７　ｍｍｏｌ）、炭酸水素ナトリウム（８．６　ｇ、１０２　ｍｍｏｌ）の水／１，４－ジオキサン（５０　ｍＬ／１３０　ｍＬ）溶液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１１．９４　ｇ、３５．３９６　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、４時間撹拌した。反応液に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回洗浄した後、水層のｐＨが３になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（８　ｇ、６７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３８６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５０）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000154
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１　ｇ、２．５９５　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１．５　ｇ、１７．８３　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（５　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（３２．６　ｍｇ、０．１３０　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて４時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）（１．５　ｇ）を混合物として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）の混合物（１．５　ｇ）にテトラヒドロフラン（８　ｍＬ）、１Ｍリン酸緩衝液（８　ｍＬ、ｐＨ　８．０）を加え、５０度で３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をジエチルエーテル／ヘプタンで再結晶することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）をナトリウム塩（１　ｇ）として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）のナトリウム塩（５　ｇ）にｔ－ブチルメチルエーテル（１００　ｍＬ）、０．０５Ｍリン酸水溶液（２５０　ｍＬ）を加え、室温で５分間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出した後、飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、粗生成物としてＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（４．９　ｇ）を得た。これをさらなる精製をすることなくペプチド合成に用いた。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４６８　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．８４分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８６、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000155
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（３０　ｇ、１２７．５３　ｍｍｏｌ）および２，２－ジメチルプロパン－１，３－ジオール（２６．５６　ｇ、２５５．０６　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（４００　ｍＬ）に溶解し、０度に冷却した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・Ｅｔ２Ｏ）（２．７２　ｇ、１９．１２９　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え１時間攪拌した。反応液を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と飽和食塩水で洗浄した後、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行い、減圧下溶媒を留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８６、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）（２６．７　ｇ、６２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３２６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８７、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000156
　窒素雰囲気下、水酸化リチウムの１水和物（１３．１６　ｇ、３１３．５０５　ｍｍｏｌ）、塩化カルシウム（１３０．４８　ｇ、１１７５．６４６　ｍｍｏｌ）に水（２６０　ｍＬ）、２－プロパノール（１０５０　ｍＬ）を室温にて加え、撹拌した後、メチル　Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ８６、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＭｅ）（２６．６　ｇ、７８．３７６　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（２６０　ｍＬ）を室温にて加え、２時間攪拌した。反応液に６Ｎ塩酸水溶液をｐＨ３になるまで加え、有機溶媒を減圧下除去した後、水層を酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過を行い、得られた溶媒を減圧下留去することで、Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８７、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000157
　水素雰囲気下（～３　ａｔｍ）、上述のように得た粗生成物であるＮ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８７、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（２５．０　ｇ）、１０％　パラジウム炭素（５　ｇ、２０％　ｗ／ｗ）、メタノール（２５０　ｍＬ）の混合物を室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過した後、溶媒を減圧下留去し、得られた固体を酢酸エチルで３回洗浄することで、Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１３．１　ｇ、２工程８７％）を得た。
　窒素雰囲気下、Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（１３　ｇ、６７．９８２　ｍｍｏｌ）、炭酸水素ナトリウム（１７．１３　ｇ、２０３．９４６　ｍｍｏｌ）の水／１，４－ジオキサン（２６０　ｍＬ／１０４　ｍＬ）溶液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（２４．０８　ｇ、７１．３８１　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、２時間撹拌した。反応液に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回洗浄した後、水層に６Ｎ塩酸水溶液をｐＨ３になるまで加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（２６．５　ｇ、９４％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１４　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．４４分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５１）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000158
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（３－ヒドロキシ－２，２－ジメチルプロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８８、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）－ＯＨ）（２０　ｇ、４８．３７１　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（２８．４８　ｇ、３３８．５９８　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（１６１　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（６０７．７９　ｍｇ、２．４１９　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）を混合物として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）の混合物にテトラヒドロフラン（１６１　ｍＬ）、１Ｍリン酸緩衝液（１６１　ｍＬ、ｐＨ　８．０）を加え、５０度で３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をジエチルエーテル／ヘプタンで再結晶することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）をナトリウム塩（１７．１　ｇ）として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）のナトリウム塩（８　ｇ）にｔ－ブチルメチルエーテル（１２０　ｍＬ）、０．０５Ｍリン酸水溶液（３５０　ｍＬ）を加え、室温で５分間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで抽出し、飽和食塩水で２回洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、粗生成物としてＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２，２－ジメチル－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）プロピル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ８９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＴＨＰ）－ＯＨ）（７　ｇ）を得た。これをさらなる精製をすることなくペプチド合成に用いた。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４９６　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．９７分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９０）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000159
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－ブタン－１，３－ジオール（２５　ｇ、２７７．４０７　ｍｍｏｌ、ＣＡＳ＃２４６２１－６１－２）と（ジメトキシメチル）ベンゼン（６３．３７　ｇ、４１６．６８８　ｍｍｏｌ）のクロロホルム（ＣＨＣｌ３）溶液（２１０　ｍＬ）に０度にてｐ－トルエンスルホン酸（ＴｓＯＨ）（２．６４　ｇ、１３．８８０　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて１６時間撹拌した。反応液にジクロロメタンを加え、炭酸ナトリウム水溶液、水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行い、減圧下溶媒留去した。得られた残渣をエタノール（ＥｔＯＨ）（１３５　ｍＬ）に溶解し、水素化ホウ素ナトリウム（ＮａＢＨ４）（５．２５　ｇ、１３８．７７８　ｍｍｏｌ）を加え、室温で３０分間撹拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液（２１０　ｍＬ）を加え、室温で２時間撹拌した後、酢酸エチルを加えて抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過を行い、減圧下溶媒留去した。得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９０）（４２．７　ｇ、８６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１７９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．２６分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９１）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000160
　窒素雰囲気下、上述のようにして得た（４Ｓ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９０）（３５　ｇ、１９６．６２９　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（９６０　ｍＬ）にー５０度にて１Ｍ　水素化ジイソブチルアルミニウム（ＤＩＢＡＬ）のヘキサン溶液（３９０　ｍＬ、３９０　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加えた。反応液を－５０度で３０分間撹拌した後、室温でさらに２時間撹拌した。反応液にメタノール（ＭｅＯＨ）をー３０度で加え、反応を停止させた後、水を加えた。反応液がｐＨ＝２になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加えた後、ジクロロメタンで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。減圧下溶媒を留去し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９１）（２１．６　ｇ、６１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１８１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１６分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
メチル　Ｏ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000161
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（１８．８　ｇ、８０．０　ｍｍｏｌ）および上述のようにして得た（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９１）（２１．６　ｇ、１２０　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１９０　ｍＬ）に溶解し、０度にて三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・Ｅｔ２Ｏ）（１．５１　ｍＬ、１１．９７６　ｍｍｏｌ）を加えて室温で２時間攪拌した。反応液にジクロロメタンを加え、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、メチル　Ｏ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（１５　ｇ、３０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．３９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｏ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000162
　窒素雰囲気下、水酸化リチウムの１水和物（６．１　ｇ、１４５．２３８　ｍｍｏｌ）、塩化カルシウム（６０．２　ｇ、５４２．３４２　ｍｍｏｌ）に水（１５５　ｍＬ）、２－プロパノール（６１５　ｍＬ）を室温にて加え、撹拌した後、上述のようにして得たメチル　Ｏ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９２、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（１５　ｇ、３６．１４４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（１５５　ｍＬ）を室温にて加えた。反応液を室温にて５時間攪拌した後、反応液のｐＨが３になるまで、６Ｎ塩酸水溶液を加えた。有機溶媒を減圧下除去した後、水層を酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（１６．５　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000163
　水素雰囲気下（～　３　ａｔｍ）、上述のように得た粗生成物であるＯ－（（Ｓ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９３、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（１６．５　ｇ）、１０％　パラジウム炭素（８．２５　ｇ、５０％　ｗ／ｗ）、メタノール（２８０　ｍＬ）の混合物を室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過した後、溶媒を減圧下留去し、得られた固体を酢酸エチルで３回洗浄することで、Ｏ－（（Ｓ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（５．８５　ｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のようにして得たＯ－（（Ｓ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（５．８５　ｇ、３３．０３　ｍｍｏｌ）、炭酸水素ナトリウム（８．３０　ｇ、９８．８１　ｍｍｏｌ）の水／１，４－ジオキサン（１３５　ｍＬ／５５　ｍＬ）溶液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１１．７　ｇ、３４．６８１５　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、２時間撹拌した。反応液に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回洗浄した後、水層のｐＨが３になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（８．１　ｇ、６１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４００　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．２１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000164
　窒素雰囲気下、上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｓ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９４、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（８．１０　ｇ、２０．２９２　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１１．９４　ｇ、１４１．９４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（９０　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（２５５　ｍｇ、１．０１４　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）を混合物として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）の混合物にテトラヒドロフラン（９０　ｍＬ）、１Ｍリン酸緩衝液（９０　ｍＬ、ｐＨ　８．０）を加え、５０度で３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をジエチルエーテル／ヘプタンで再結晶することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）をナトリウム塩（７．４　ｇ）として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）のナトリウム塩（７．４　ｇ）にｔ－ブチルメチルエーテル（１３０　ｍＬ）、０．０５Ｍリン酸水溶液（３６０　ｍＬ）を加え、室温で５分間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで抽出し、飽和食塩水で２回洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、粗生成物としてＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｓ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）（６．９　ｇ）を得た。これをさらなる精製をすることなくペプチド合成に用いた。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８２　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．８７分、０．８８分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９６）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000165
　窒素雰囲気下、（Ｒ）－ブタン－１，３－ジオール（２０　ｇ、２２１．９２１　ｍｍｏｌ、ＣＡＳ＃６２９０－０３－５）と（ジメトキシメチル）ベンゼン（５０．６６　ｇ、３３２．８６７　ｍｍｏｌ）のクロロホルム（ＣＨＣｌ３）溶液（２００　ｍＬ）に０度にてｐ－トルエンスルホン酸（ＴｓＯＨ）（１．９１　ｇ、１１．０９６　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて１６時間撹拌した。反応液にジクロロメタンを加え、炭酸ナトリウム水溶液、水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行い、減圧下溶媒留去した。得られた残渣をエタノール（ＥｔＯＨ）（１３　ｍＬ）に溶解し、水素化ホウ素ナトリウム（ＮａＢＨ４）（４．２０　ｇ、１１０．９６１　ｍｍｏｌ）を加え、室温で３０分間撹拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液（１３　ｍＬ）を加え、室温で２時間撹拌した後、酢酸エチルを加えて抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過を行い、減圧下溶媒留去した。得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９６）（２５　ｇ、６３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１７９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．２９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９７）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000166
　窒素雰囲気下、上述のようにして得た（４Ｒ）－４－メチル－２－フェニル－１，３－ジオキサン（化合物ａａ９６）（２０　ｇ、１１２．３６　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（５６１　ｍＬ）にー５０度にて１Ｍ　水素化ジイソブチルアルミニウム（ＤＩＢＡＬ）のヘキサン溶液（２２５　ｍＬ、２２５　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加えた。反応液を－５０度で３０分間撹拌した後、室温でさらに２時間撹拌した。反応液にメタノール（ＭｅＯＨ）をー３０度で加え、反応を停止させた後、水を加えた。反応液がｐＨ＝２になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加えた後、ジクロロメタンで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。減圧下溶媒を留去し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９７）（１６．６　ｇ、８２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　１８１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
メチル　Ｏ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000167
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸２－メチル１－ベンジル（Ｃｂｚ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（１４．４　ｇ、６１．４８１　ｍｍｏｌ）および上述のようにして得た（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブタン－１－オール（化合物ａａ９７）（１６．６　ｇ、９２．２　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１４５　ｍＬ）に溶解し、０度にて三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・Ｅｔ２Ｏ）（１．３１　ｇ、９．２２２　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加えて、室温で２時間攪拌した。反応液にジクロロメタンを加え、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、メチル　Ｏ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（１３．４　ｇ、５２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．４２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｏ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000168
　窒素雰囲気下、水酸化リチウムの１水和物（５．４１　ｇ、１２８．９２　ｍｍｏｌ）、塩化カルシウム（５３．６９　ｇ、４８３．７７１　ｍｍｏｌ）に水（１３４　ｍＬ）、２－プロパノール（５３８　ｍＬ）を室温にて加え、撹拌した後、上述のようにして得たメチル　Ｏ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリナート（化合物ａａ９８、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＭｅ）（１３．４　ｇ、３２．２５１　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（１３４　ｍＬ）を室温にて加えた。反応液を室温にて５時間攪拌した後、反応液のｐＨが３になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加えた。有機溶媒を減圧下除去した後、水層を酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させ、Ｏ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（１３．６　ｇ）を粗生成物として得た。これを精製することなく次工程に用いた。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１００、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000169
　水素雰囲気下（～　３　ａｔｍ）、上述のように得た粗生成物であるＯ－（（Ｒ）－３－（ベンジルオキシ）ブチル）－Ｎ－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ９９、Ｃｂｚ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＢｎ）－ＯＨ）（１３．６　ｇ）、１０％　パラジウム炭素（５．４４　ｇ）、メタノール（２７０　ｍＬ）の混合物を室温で１６時間撹拌した。反応液をろ過した後、溶媒を減圧下留去し、得られた固体を酢酸エチルで３回洗浄することで、Ｏ－（（Ｒ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（５．３　ｇ、２工程９３％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のようにして得たＯ－（（Ｒ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（Ｈ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（５．３　ｇ、２９．９１　ｍｍｏｌ）、炭酸水素ナトリウム（７．５４　ｇ、８９．７３　ｍｍｏｌ）の水／１，４－ジオキサン（１３４　ｍＬ／５７　ｍＬ）溶液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１０．５８　ｇ、３１．４０５　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、２時間撹拌した。反応液に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回洗浄した後、水層のｐＨが３になるまで６Ｎ塩酸水溶液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過後、溶媒を減圧下留去し、さらに減圧ポンプで減圧下乾燥させた。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製し、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１００、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（７．４　ｇ、６２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４００　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．２０分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１３）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000170
　窒素雰囲気下、上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（Ｒ）－３－ヒドロキシブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１００、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）－ＯＨ）（８．９０　ｇ、２２．２８１　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（１３．１２　ｇ、１５５．９７１　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（７４　ｍＬ）溶液に、ｐ－トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（２８０　ｍｇ、１．１１４　ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）を混合物として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）とテトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリナート（Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＴＨＰ）の混合物にテトラヒドロフラン（７４　ｍＬ）、１Ｍリン酸緩衝液（７４　ｍＬ、ｐＨ　８．０）を加え、５０度で３時間攪拌した。反応液を冷却し、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、溶媒を減圧下留去した。得られた残渣をジエチルエーテル／ヘプタンで再結晶することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）をナトリウム塩（１０．２　ｇ）として得た。
　上述のようにして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）のナトリウム塩（１０　ｇ）にｔ－ブチルメチルエーテル（１６０　ｍＬ）、０．０５Ｍリン酸水溶液（４４０　ｍＬ）を加え、室温で５分間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテルで抽出し、飽和食塩水で２回洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。溶媒を減圧下留去することで、粗生成物としてＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（３Ｒ）－３－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）ブチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＴＨＰ）－ＯＨ）（８．８　ｇ）を得た。これをさらなる精製をすることなくペプチド合成に用いた。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８２　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．８６分、０．８８分（分析条件　ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸（化合物ａａ１０２、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000171
　市販の（Ｓ）－２－アミノ－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸（Ｈ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＨ）（２．５　ｇ、１１．４８　ｍｍｏｌ）に水（４９．９　ｍＬ）、炭酸ナトリウム（３．６５　ｇ、３４．４　ｍｍｏｌ）、１，４－ジオキサン（１４．９　ｍＬ）を室温にて加えた。反応液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３．１０　ｇ、９．１８　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（５０　ｍＬ）を０度にて滴下しながら加え、０度で２０分間撹拌した後、反応液にさらにＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３８８　ｍｇ、１．１５　ｍｍｏｌ）を加え２０分間撹拌した。反応液に０度にて、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３８８　ｍｇ、１．１５　ｍｍｏｌ）を再び加え、４０分間撹拌した。反応液に水、ｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）を加え、得られた水層を１Ｎ　塩酸水溶液用いて酸性にした後、酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層をまとめて飽和食塩水で洗浄、無水硫酸マグネシウムで乾燥、ろ過を行った後、減圧下溶媒を留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸（化合物ａａ１０２、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＨ）（３．５３　ｇ、９３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４３４　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７３分（分析条件ＳＱＤ２ＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸メチル（化合物ａａ１０３、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000172
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸（化合物ａａ１０２、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＨ）（２．２９　ｇ、５．２３　ｍｍｏｌ）に室温にてメタノール（２０．７５　ｍＬ）とアセトニトリル（５．４０　ｍＬ）を加え、０度で１０分間撹拌した後、２．０Ｍトリメチルシリルジアゾメタン（ＴＭＳジアゾメタン）のヘキサン溶液（２．６２　ｍＬ、５．２３　ｍｍｏｌ）を０度にて滴下しながら加えた。反応液に再び２．０Ｍトリメチルシリルジアゾメタン（ＴＭＳジアゾメタン）のヘキサン溶液（２．６２　ｍＬ、５．２３　ｍｍｏｌ）を０度にて滴下しながら加えた後、２．０Ｍトリメチルシリルジアゾメタン（ＴＭＳジアゾメタン）のヘキサン溶液（３．９３　ｍＬ、７．８５　ｍｍｏｌ）を０度にて滴下しながらさらに加えた。酢酸（２．０　ｍＬ）を加えることで反応を停止させた後、５０％飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と酢酸エチルを加え、酢酸エチルで洗浄した。有機層を５０％飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で抽出し、得られた水層をまとめて酢酸エチルで３回洗浄した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた後、ろ過を行い、減圧下溶媒留去した。粗生成物として得られた（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸メチル（化合物ａａ１０３、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＭｅ）（２．３９　ｇ）はさらなる精製を行わずに次の工程に用いた。
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（（２－クロロフェニル）ジフェニルメトキシ）－３－メトキシフェニル）プロパン酸（化合物ａａ１０４、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＣｌｔ－３－ＯＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000173
　窒素雰囲気下、粗生成物である（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－ヒドロキシ－３－メトキシフェニル）プロパン酸メチル（化合物ａａ１０３、Ｆｍｏｃ－Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）－ＯＭｅ）（２．３９　ｇ）にアセトニトリル（１０．５８　ｍＬ）、塩化　２－クロロトリチル（１．６５６　ｇ、５．２９　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（０．９０６　ｍＬ、５．２９　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間撹拌した。反応液に水、ｔ－ブチルメチルエーテルを加え、有機層を減圧下濃縮することで得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（（２－クロロフェニル）ジフェニルメトキシ）－３－メトキシフェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＣｌｔ－３－ＯＭｅ）－ＯＭｅ）（２．６　ｇ、６８％）を得た。
　塩化カルシウム（５．９８　ｇ、５３．８　ｍｍｏｌ）に水（１４．９６　ｍＬ）、水酸化リチウムの１水和物（０．６０３　ｇ、１４．３６　ｍｍｏｌ）を加え、室温で５分間撹拌した。反応液にイソプロパノール（５９．８　ｍＬ）と（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（（２－クロロフェニル）ジフェニルメトキシ）－３－メトキシフェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＣｌｔ－３－ＯＭｅ）－ＯＭｅ）（２．６　ｇ、３．５９　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（１４．９６　ｍＬ）を加え、４時間撹拌した後、０．０５Ｍリン酸水溶液とｔ－ブチルメチルエーテルを加えた。水層をｔ－ブチルメチルエーテルで３回抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過を行った後、減圧下溶媒留去した。粗生成物として得られた（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（（２－クロロフェニル）ジフェニルメトキシ）－３－メトキシフェニル）プロパン酸（化合物ａａ１０４、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＣｌｔ－３－ＯＭｅ）－ＯＨ）（２．８　ｇ）はさらなる精製を行わずにペプチド合成に用いた。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　７０８　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．７４分（分析条件ＳＱＤ２ＡＡ５０）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）の合成
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）は下記のスキームに従って合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000174
　窒素雰囲気下、市販の（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ－ＯＨ）（５０　ｇ、２４３．６５　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（１０００　ｍＬ）に０度にて水素化ナトリウム（３４　ｇ、１４２０　ｍｍｏｌ、６０％オイルディスパージョン）を加え、１時間撹拌した。反応液に２－ブロモアセトニトリル（３７．２　ｍＬ、５３６．０３　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（５０　ｍＬ）を滴下しながら０度にて加え、さらに１時間撹拌した。反応液に水を加えた後、酢酸エチルで３回抽出し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（シアノメチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０５、Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（ＣＨ２ＣＮ）－ＯＨ）（２９　ｇ、４９％）を得た。
　上記のようにして得たＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（シアノメチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０５、Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（ＣＨ２ＣＮ）－ＯＨ）（３８．５　ｇ、１５７．６３　ｍｍｏｌ）のエタノール（ＥｔＯＨ）溶液（４００　ｍＬ）に室温にてヒドロキシルアミン塩酸塩（２２．４　ｇ、３１５．２６　ｍｍｏｌ）およびトリエチルアミン（５８．８　ｍＬ、４２５．６０　ｍｍｏｌ）を加え、８５度で２時間撹拌した。減圧下溶媒を留去し、粗生成物であるＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（２－（ヒドロキシアミノ）－２－イミノエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０６）（１０７　ｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、得られた粗生成物であるＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（２－（ヒドロキシアミノ）－２－イミノエチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０６）（１２　ｇ）の１、４－ジオキサン溶液（１２０　ｍＬ）に室温にてカルボニルジイミダゾール（ＣＤＩ）（３．９６　ｇ、２４．４２　ｍｍｏｌ）、１，８－ジアザビシクロ［５．４．０］－７－ウンデセン（ＤＢＵ）（４．９２　ｇ、３２．３２　ｍｍｏｌ）を加え、１１０度で２時間撹拌した。濃塩酸を用い、反応液をｐＨ＝２に調節した後、ジクロロメタン（ＤＣＭ）で２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行ったを行った後、ろ液を減圧下濃縮することで、粗生成物としてＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０７、Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）（１．２　ｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、得られた粗生成物であるＮ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０７、Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）（２５８　ｍｇ）の１、４－ジオキサン溶液（１０　ｍＬ）に室温にて４Ｎ塩酸／１，４－ジオキサン溶液（１５　ｍＬ）を加え、１６時間撹拌した。減圧下溶媒を留去し、粗生成物であるＯ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０８、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）（１６０　ｍｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、上記のように得た粗生成物であるＯ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０８、Ｈ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）（２２．４　ｇ）と炭酸カリウム（１８．８　ｇ、１３５．０４　ｍｍｏｌ）の１．４－ジオキサン／水（１６５　ｍＬ／１１０　ｍＬ）溶液にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（２３　ｇ、６８．２　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、３時間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテル／ヘキサン（１／３）で洗浄し、得られた水層を濃塩酸を用いてｐＨ＝２になるまで調節した後、ジクロロメタン（ＤＣＭ）で２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１０９、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）－ＯＨ）（５．６９　ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４２６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７２分（分析条件ＳＱＤ２ＦＡ０５）
（（２Ｓ）－４－ジアゾ－３－オキソ－１－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ブタン－２－イル）カルバミン酸　（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ１１０）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000175
　窒素雰囲気下、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ２２、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１．４　ｇ、３．０７　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（５．０　ｍＬ）に氷と食塩で調製したアイスバスを用いて冷却しながら４－メチルモルホリン（０．３５５　ｍＬ、３．２３　ｍｍｏｌ）、クロロギ酸エチル（０．３１０　ｍＬ、３．２３　ｍｍｏｌ）を加え、１時間１０分間撹拌した。続いて、氷と食塩で調製したアイスバスを用いて冷却しながら反応液に別途調整したジアゾメタンのジエチルエーテル溶液を滴下しながら加え、３０分間撹拌した。反応液に酢酸（０．８８　ｍＬ、１５．３７　ｍｍｏｌ）を加え、１０分間撹拌した後、酢酸エチル、水を加え、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過を行った。ろ液を減圧下溶媒留去することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）で精製し、（（２Ｓ）－４－ジアゾ－３－オキソ－１－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ブタン－２－イル）カルバミン酸　（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ１１０）（１．１３　ｇ、７７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝５０２（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：０．８７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
ジアゾメタンのジエチルエーテル溶液の調整
　約５０％の水が含まれる１－メチル－３－ニトロ－１－ニトロソグアニジン（５．０　ｇ、東京化成あるいは富士フィルム和光純薬より購入）にジエチルエーテル（１７．０　ｍＬ）を加え０度にて５０％水酸化カリウム水溶液（９．５　ｍＬ）を滴下しながら加えた。反応液を１時間撹拌した後、黄色のジエチルエーテル層を先端をなめしたパスツールを用い分離し、得られた溶液をそのまま上記の反応に使用した。
（３Ｒ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ブタン酸（化合物ａａ１１１、Ｆｍｏｃ－ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000176
　窒素雰囲気下、上述のようにして得た（（２Ｓ）－４－ジアゾ－３－オキソ－１－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ブタン－２－イル）カルバミン酸　（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ａａ１１０）（１．７　ｇ、３．５５　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン／水（１８　ｍＬ／１．８　ｍＬ）溶液に、０度にて４－メチルモルホリン（０．９７４　ｍＬ、８．８６　ｍｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸銀（ＡｇＯＣＦ３）（０．０７８　ｍＬ、０．３５５　ｍｍｏｌ）を加えた後、室温で２時間３０分間撹拌した。反応液にジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）を加え、逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製することで、（３Ｒ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ブタン酸（化合物ａａ１１１、Ｆｍｏｃ－ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１．４　ｇ、８４％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４６８（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．７８分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
　（２Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－２－（（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）メチル）プロパン酸（化合物ａａ１１７）は以下のスキームにより合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000177
（２Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－２－（（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）メチル）プロパン酸（化合物ａａ１１７、Ｆｍｏｃ－ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＴＨＰ）―ＯＨ）の合成
　窒素雰囲気下、論文記載の方法（Ｂｅｉｌｓｔｅｉｎ　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｏｒｇａｎｉｃ　Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，　２０１７，　１３，　２４２８－２４４１．）で合成した２－（トリチルオキシ）エタン－１－オール（ＣＡＳ．　Ｎｏ．　１８３２５－４５－６）（８．８　ｇ、２８．９　ｍｍｏｌ）と市販の４－メチルベンゼンスルホン酸　（Ｒ）－オキシラン－２－イルメチル（６．０　ｇ、２６．３　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（１００　ｍＬ）に０度にて水素化ナトリウム（１．１６　ｇ、２８．９　ｍｍｏｌ、６０％オイルディスパージョン）を加え、室温にて１２時間撹拌した。反応液に水を加えた後、酢酸エチルで２回抽出し、得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル＝５／１）にて精製することで、（Ｒ）－２－（（２－（トリチルオキシ）エトキシ）メチル）オキシラン（化合物ａａ１１２）（７．３２　ｇ、７７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　３８３　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．４０分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　上記のようにして得た（Ｒ）－２－（（２－（トリチルオキシ）エトキシ）メチル）オキシラン（化合物ａａ１１２）（３８．５　ｇ、１５７．６３　ｍｍｏｌ）に７Ｍのアンモニアのメタノール溶液（１９６　ｍＬ）を室温にて加え、室温で１５時間撹拌した。反応液を減圧下で溶媒を留去し、得られた残渣に水を加え、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製した。さらに得られたフラクションを集め、その溶液に飽和炭酸水素ナトリウム溶液（２１．４　ｍＬ）と二炭酸ジ－ｔｅｒｔ－ブチル（Ｂｏｃ２Ｏ）（５．５５　ｇ）を加え、室温にて１０分間撹拌した。反応液を減圧下で溶媒を留去し、得られた残渣に水を加え、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル＝４／１）にて精製することで、（Ｒ）－（２－ヒドロキシ－３－（２－（トリチルオキシ）エトキシ）プロピル）カルバミン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１１３）（４．２５　ｇ、７０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５００　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．４０分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　窒素雰囲気下、得られた（Ｒ）－（２－ヒドロキシ－３－（２－（トリチルオキシ）エトキシ）プロピル）カルバミン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１１３）（４．５３　ｇ、９．４８　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（４７．４　ｍＬ）に室温にてトリエチルアミン（３．９７　ｍＬ、２８．５　ｍｍｏｌ）とメタンスルホン酸　無水物（２．４８　ｇ、１４．２　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、メタンスルホン酸　（Ｒ）－１２，１２－ジメチル－１０－オキソ－１，１，１－トリフェニル－２，５，１１－トリオキサ－９－アザトリデカン－７－イル（化合物ａａ１１４）（４．６２　ｇ、８８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５７８　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．４７分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　窒素雰囲気下、得られたメタンスルホン酸　（Ｒ）－１２，１２－ジメチル－１０－オキソ－１，１，１－トリフェニル－２，５，１１－トリオキサ－９－アザトリデカン－７－イル（化合物ａａ１１４）（４．４１　ｇ、７．９３　ｍｍｏｌ）のジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）溶液（３９．６　ｍＬ）に室温にてシアン化ナトリウム（１．９５　ｇ、３９．７　ｍｍｏｌ）を加え、８０度で１０時間撹拌した。反応液にアセトニトリルと水を加え、逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｒ）－（２－シアノ－３－（２－（トリチルオキシ）エトキシ）プロピル）カルバミン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１１５）（２．１６ｇ、５３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５０９　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．４９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　窒素雰囲気下、得られた（Ｒ）－（２－シアノ－３－（２－（トリチルオキシ）エトキシ）プロピル）カルバミン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１１５）（３．６３　ｇ、７．４６　ｍｍｏｌ）のクロロベンゼン溶液（９．３　ｍＬ）に０度にてトリフルオロメタンスルホン酸（３．５　ｍＬ、３９．５　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間撹拌した。続いて室温にて反応液に水（３．６　ｍＬ、２０１　ｍｍｏｌ）を加え、１１０度で３時間撹拌した。反応液に水（２０　ｍＬ）とヘキサン（７　ｍＬ）とトルエン（２０　ｍＬ）を加え、水層を除去した。得られた有機層に水（１２　ｍＬ）を加え、洗浄した。得られた水層を集め、アセトニトリル（３７．３　ｍＬ）と炭酸水素ナトリウム（６．２７　ｇ、７４．６　ｍｍｏｌ）を加え、（１－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３．７７　ｇ、１１．２　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、３０分間撹拌した。さらにＦｍｏｃ－ＯＳｕ（１．２６　ｇ、３．７３　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、終夜撹拌した。反応液をろ過した後、ｔ－ブチルメチルエーテルで抽出した。得られた水層に６Ｎ濃塩酸をｐＨ＝１になるまで加えた後、逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－２－（（２－ヒドロキシエトキシ）メチル）プロパン酸（化合物ａａ１１６）（１．３１　ｇ、４６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　３８６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．７８分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４７）
　窒素雰囲気下、上記で得た（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－２－（（２－ヒドロキシエトキシ）メチル）プロパン酸（化合物ａａ１１６）（１．０３　ｇ、２．６７　ｍｍｏｌ）と３，４－ジヒドロ－２Ｈ－ピラン（０．７３　ｍＬ、８．０２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１３．４　ｍＬ）溶液にパラトルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）（６７　ｍｇ、０．２７　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、４０度にて１０時間撹拌した。反応液に水を加え、ジクロロメタンで抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られた粗生成物のテトラヒドロフラン溶液（１３．４　ｍＬ）に、別途調製したリン酸緩衝液（ｐＨ＝８、１３．４　ｍＬ）を加え、５０度で２０時間撹拌した。反応液に水（５０　ｍＬ）を加え、ｔ－ブチルメチルエーテル／ヘキサン（４０　ｍＬ／１０　ｍＬ）で抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（２Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－２－（（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）メチル）プロパン酸（化合物ａａ１１７）（１．０４　ｇ、８３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４９２　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：０．９５分（分析条件ＳＱＤＡＡ０５－２）
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（（Ｒ）－１－（（アリルオキシ）カルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）ペンタン酸（化合物ａａ１２２、Ｆｍｏｃ－Ｎｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ））―ＯＨ）は以下のスキームにより合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000178
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（（Ｒ）－１－（（アリルオキシ）カルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）ペンタン酸（化合物ａａ１２２、Ｆｍｏｃ－Ｎｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ））―ＯＨ）の合成
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－カルボン酸メチル塩酸塩（ＣＡＳ．　Ｎｏ．　１５６０４６－０５－８）（６．９　ｇ、３４．２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（６８．５　ｍＬ）に室温にてトリエチルアミン（１１．９　ｍＬ、８６　ｍｍｏｌ）を加えた。反応液に二炭酸ジ－ｔｅｒｔ－ブチル（Ｂｏｃ２Ｏ）（１１．２　ｇ、５１．３　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１時間撹拌した。反応液に水を加えた後、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１１８）（６．８５　ｇ、７５％）を得た。
　上記のようにして得た（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１１８）（６．４３　ｇ、２４．２　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（１２１　ｍＬ）に０度にてリチウムホウ水素化物／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（６．６７　ｍＬ、２６．７　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１．５時間撹拌した。さらに０度にてリチウムホウ水素化物／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（１．５　ｍＬ、６．０　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間撹拌した。０度にて反応液に１０％塩化ナトリウム水溶液を加えた後、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－（ヒドロキシメチル）ピロリジン－１－カルボン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１１９）（５．７０　ｇ、９９％）を得た。
　窒素雰囲気下、得られた（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－（ヒドロキシメチル）ピロリジン－１－カルボン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（３３５　ｍｇ、１．４１　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（７．０　ｍＬ）に市販の１，１，１－トリアセトキシ－１，１－ジヒドロ－１，２－ベンゾヨードキソール－３（１Ｈ）－オン（Ｄｅｓｓ－Ｍａｒｔｉｎ　ｒｅａｇｅｎｔ）（７１９　ｍｇ、１．６９　ｍｍｏｌ）を０度にて加え、室温で３０分間撹拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えた後、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を水で洗浄した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製し、アルデヒド中間体を得た。
　窒素雰囲気下、臭化メチルトリフェニルホスホニウム（５６２　ｍｇ、１．５７　ｍｍｏｌ）のジエチルエーテル溶液（３．１　ｍＬ）に室温にてカリウム　２－メチルプロパン－２－オラート（ｔＢｕＯＫ）（１７７　ｍｇ、１．５７　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて２時間撹拌した。反応液に、別途調製したアルデヒド中間体（１８５　ｍｇ、０．７８６　ｍｍｏｌ）のジエチルエーテル溶液（０．７９　ｍＬ）を加え、室温にて１時間撹拌した。反応液に１０％塩化アンモニウム水溶液を加えた後、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を水で洗浄した。得られた有機層を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製し、（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－ビニルピロリジン－１－カルボン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１２０）（１３５　ｍｇ、７４％）を得た。
　窒素雰囲気下、得られた（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－ビニルピロリジン－１－カルボン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ａａ１２０）（３．５０　ｇ、１５．０　ｍｍｏｌ）と（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）ペンタ－４－エン酸（ＣＡＳ＃：１４６５４９－２１－５、Ｆｍｏｃ－Ａｌｇｌｙ－ＯＨ）（９．５２　ｇ、２８．２　ｍｍｏｌ）を２－メチルテトラヒドロフラン（２－ＭｅＴＨＦ）（６０ｍＬ）に溶解した。その溶液に第２世代Ｈｏｖｅｙｄａ－Ｇｒｕｂｂｓ触媒（０．９４ｇ、１．５０ｍｍｏｌ）を加え、６０度にて終夜撹拌した。室温に冷却した後、セライトろ過し、ろ液を減圧下濃縮した。得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、粗生成物（７．５８　ｇ）を得た。
　得られた粗生成物（７．５８　ｇ）をメタノール（１８６　ｍＬ）に溶解し、１０％パラジウム炭素（１．６　ｇ）を加え水素雰囲気下、室温で２日間撹拌した。反応液をセライトろ過し、ろ液を減圧下濃縮した。得られた残渣をメタノール（３４．９　ｍＬ）に溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液（３４．９　ｍＬ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（７．０７　ｇ、２０．９５　ｍｍｏｌ）を加え室温で２時間撹拌した。不溶物を濾別し、ろ液を１Ｍ塩酸水溶液にて酸性化した後、酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥し、ろ過し、減圧濃縮した。得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（（Ｒ）－１－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）ペンタン酸（化合物ａａ１２１）（２．５４　ｇ、３３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５６７　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．３２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　得られた（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（（Ｒ）－１－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）ペンタン酸（化合物ａａ１２１）（２．１７　ｇ、３．９８　ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（ＤＣＭ）（５３．１　ｍＬ）に溶解し、トリフルオロ酢酸（９．１５　ｍＬ、１１９．８　ｍｍｏｌ）を加え室温で１時間３０分間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、残渣にトルエンを加え再度減圧下濃縮し、粗生成物（２．６６　ｇ）を得た。
　得られた粗生成物（２．６６　ｇ）を１，４－ジオキサン／水（１２．６７　ｍＬ／１２．６７ｍＬ）溶液に溶解し、炭酸水素ナトリウム（１．９２　ｇ、２２．８０　ｍｍｏｌ）とＮ－（アリルオキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ａｌｌｏｃ－ＯＳｕ）（０．６１　ｍＬ、３．９１　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、３０分間撹拌した。反応液にギ酸とジメチルスルホキシドを加え逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（（Ｒ）－１－（（アリルオキシ）カルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）ペンタン酸（化合物ａａ１２２、Ｆｍｏｃ－Ｎｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ））―ＯＨ）（１．９７　ｇ、９４％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５２９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．７５分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４７）
　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（（Ｓ）－１－（（アリルオキシ）カルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ）－Ｍｅ）－ＯＨ）は以下のスキームにより合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000179
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－カルボン酸メチル塩酸塩（ＣＡＳ．　Ｎｏ．　１５６０４６－０５－８）（５．０８　ｇ、２５．２　ｍｍｏｌ）の水溶液（１１．４３　ｍＬ）に室温にて炭酸水素ナトリウム（５．２９　ｇ、６３．０　ｍｍｏｌ）を加えた。反応液に室温でクロロギ酸アリル（４．０　ｍＬ、３７．８　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（２２．９　ｍＬ）を滴下しながら加え、さらに１．５時間撹拌した。反応液に水を加えた後、酢酸エチルで２回抽出し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－アリル（化合物ａａ１２３）（６．２１　ｇ、９９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２５０　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　上記のようにして得た（Ｓ）－４，４－ジフルオロピロリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－アリル（化合物ａａ１２３）（６．８１　ｇ、２７．３　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（８２．０　ｍＬ）に０度にてリチウムホウ水素化物／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（１０．２４　ｍＬ、４１．０　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、室温で２時間撹拌した。反応液に０度にて水と２Ｎ塩酸水溶液（２０．５　ｍＬ、４１．０　ｍｍｏｌ）を加えた後、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－（ヒドロキシメチル）ピロリジン－１－カルボン酸アリル（化合物ａａ１２４）（５．１３　ｇ、８５％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２２２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７６分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４５）
　窒素雰囲気下、得られた（Ｓ）－４，４－ジフルオロ－２－（ヒドロキシメチル）ピロリジン－１－カルボン酸アリル（化合物ａａ１２４）（５．１　ｇ、２３．０６　ｍｍｏｌ）と（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（化合物ａａ７３、Ｆｍｏｃ－Ａｚｙ－ＯＭｅ）（４．９７　ｇ、１５．３７　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（３６　ｍＬ）に０度にて三フッ化ホウ素－エチルエーテルコンプレックス（０．８７６　ｍＬ、６．９２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液を滴下しながら加え、さらに１．５時間撹拌した。反応液に水を加えた後、ジクロロメタンで抽出し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ｎ－ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロポキシ）メチル）－４，４－ジフルオロピロリジン－１－カルボン酸アリル（化合物１２５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ）－Ｍｅ）－ＯＭｅ）（５．６８　ｇ、６８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５４５（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：３．０２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４７）
　窒素雰囲気下、塩化カルシウム（１８．７　ｇ、１６８　ｍｍｏｌ）の水溶液（４６．８　ｍＬ）に室温にて水酸化リチウム一水和物（１．８９　ｇ、４４．９　ｍｍｏｌ）を加え、室温で５分間撹拌した。イソプロピルアルコール（１８７　ｍＬ）と（Ｓ）－２－（（（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロポキシ）メチル）－４，４－ジフルオロピロリジン－１－カルボン酸アリル（化合物１２５、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ）－Ｍｅ）－ＯＭｅ）（６．１２　ｇ、１１．２３　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（４６．８　ｍＬ）を室温にて加え、６．５時間撹拌した。２Ｎ塩酸（３３．７　ｍＬ、６７．４　ｍｍｏｌ）を加えた後、減圧下溶媒を留去し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（（Ｓ）－１－（（アリルオキシ）カルボニル）－４，４－ジフルオロピロリジン－２－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１２６、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ（Ｎ－Ａｌｌｏｃ）－Ｍｅ）－ＯＨ）（３．７６　ｇ、６３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５３１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．６９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４７）
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２７、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）および（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－メトキシ－３－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２８、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）および（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（メチルスルホニル）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯＨ）は以下のスキームに従って合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000180
（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１３０）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000181
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－４－オキソブタン酸（Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ－ＯｔＢｕ）（３００　ｇ、７２９．１２　ｍｍｏｌ）とＮ－ヒドロキシフタルイミド（１３０．８　ｇ、８０１．８　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（３０００　ｍＬ）に室温にてＮ，Ｎ'－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（１８１．８　ｇ、１．１０　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、３時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮することで得られた残渣にトルエンを加え、ろ過を行った後、得られた固体をトルエンで洗浄した。ろ液を減圧下濃縮することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１３０）（２７２　ｇ、６７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５７４　（Ｍ＋ＮＨ４）＋
保持時間：１．００分（分析条件ＳＱＤ２ＦＡ０５）
４－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３１）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000182
　窒素雰囲気下、市販の４－ヨード－２－メトキシ安息香酸（５　ｇ、１７．９８３　ｍｍｏｌ）、１－（３－ジメチルアミノプロピル）－３－エチルカルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣＩ・ＨＣｌ）（４．１５　ｇ、２１．１４８　ｍｍｏｌ）、１－ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）（４．１５　ｇ、２１．１４８　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（５０　ｍＬ）に室温にて２Ｍのメチルアミンのテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（２２．５　ｍＬ、４５．０　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１２．５３　ｍＬ、９４．９４２　ｍｍｏｌ）を加え、１６時間撹拌した。反応液に水を加え、酢酸エチルで３回抽出した後、得られた有機層を水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）にて精製することで、４－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３１）（３．３　ｇ、６３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２９２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７８分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５０）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２７、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｒ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000183
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（２．１５　ｇ、７．５９　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（２．１５　ｇ、７．５９　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１２０　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（８．６１　ｇ、１３４．５　ｍｍｏｌ）、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１３０）（１４．６　ｇ、２６．３　ｍｍｏｌ）、４－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３１）（１１．５　ｇ、３９．５　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１２０　ｍＬ）を室温で３０分間撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、酢酸エチルで３回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、減圧下溶媒を留去することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯｔＢｕ）（９．２　ｇ、８４％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のように得た（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯｔＢｕ）（１１　ｇ、２０．８　ｍｍｏｌ）とクロロトリメチルシラン（ＴＭＳＣｌ）（７．９６　ｍＬ、６２．３　ｍｍｏｌ）の２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）溶液（１０４　ｍＬ）を室温にて１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２７、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｒ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）（５．０　ｇ、５１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４７５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６８分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
５－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３２）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000184
　窒素雰囲気下、市販の５－ヨード－２－メトキシ安息香酸（５　ｇ、１７．９８３　ｍｍｏｌ）、１－（３－ジメチルアミノプロピル）－３－エチルカルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣＩ・ＨＣｌ）（４．１５　ｇ、２１．１４８　ｍｍｏｌ）、１－ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）（４．１５　ｇ、２１．１４８　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（５０　ｍＬ）に室温にて２Ｍのメチルアミンのテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（２２．５　ｍＬ、４５．０　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１２．５　ｍＬ、９４．９４２　ｍｍｏｌ）を加え、１６時間撹拌した。反応液に水を加え、酢酸エチルで２回抽出した後、得られた有機層を水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、５－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３２）（３．３　ｇ、６３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２９２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７９分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５０）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－メトキシ－３－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２８、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000185
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（２．８６　ｇ、１０．５０　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（２．８６　ｇ、１０．６６　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１６１　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（１１．４　ｇ、１７４　ｍｍｏｌ）、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１３０）（１９．７４　ｇ、３５．４７　ｍｍｏｌ）、５－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３２）（１５．５　ｇ、５３．２　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１６１　ｍＬ）を室温で３０分間撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、セライトろ過を行った後、得られたろ液の有機層を分離し、飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた。混合物をろ過した後、ろ液を減圧下溶媒留去することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－メトキシ－３－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯｔＢｕ）（１０．２　ｇ、３６％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のように得た（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－メトキシ－３－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯｔＢｕ）（１０．２　ｇ、１９．２２　ｍｍｏｌ）とクロロトリメチルシラン（ＴＭＳＣｌ）（７．２６　ｍＬ、５６．８　ｍｍｏｌ）の２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）溶液（９６　ｍＬ）を室温にて１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－メトキシ－３－（メチルカルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２８、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）（６．１２　ｇ、３６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４７５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７１分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（メチルスルホニル）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000186
　窒素雰囲気下、市販の４－ブロモ－２－メトキシ安息香酸（４５　ｇ、１９４．７６７　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（２２０　ｍＬ）にカルボニルジイミダゾール（ＣＤＩ）（４７．３７　ｇ、２９２．１５１　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、２時間撹拌した。反応液にメタンスルホンアミド（５５．５８　ｇ、５８４．３１５　ｍｍｏｌ）、１，８－ジアザビシクロ［５．４．０］－７－ウンデセン（ＤＢＵ）（８８．９５　ｇ、５８４．３０２　ｍｍｏｌ）を加え、１６時間撹拌した後、酢酸エチルを加えた。混合物に２Ｎの塩酸水溶液をｐＨ　５になるまで加えた後、得られた有機層を水、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、４－ブロモ－２－メトキシ－Ｎ－（メチルスルホニル）ベンズアミド（５７．５　ｇ、９５％）を得た。
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（２．９３　ｇ、１０．７８　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（２．８９　ｇ、１０．７８　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１００　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（１１．７５　ｇ、１７９．６７２　ｍｍｏｌ）、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（化合物ａａ１３０）（２０．０　ｇ、３５．９３４　ｍｍｏｌ）、４－ブロモ－２－メトキシ－Ｎ－（メチルスルホニル）ベンズアミド（３３．２２　ｇ、１０７．８０３　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１００　ｍＬ）を室温撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、酢酸エチルで３回抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮を行うことで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（メチルスルホニル）カルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯｔＢｕ）（５．０５ｇ、１９％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のように得た（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（メチルスルホニル）カルバモイル）フェニル）プロパン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯｔＢｕ）（１０．１　ｇ、１６．９８４　ｍｍｏｌ）とクロロトリメチルシラン（ＴＭＳＣｌ）（５．５４　ｇ、５０．９５２　ｍｍｏｌ）の２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）溶液（１００　ｍＬ）を室温にて１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（メチルスルホニル）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１２９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）－ＯＨ）（５．０６　ｇ、５５％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５３９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７２分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（２Ｓ，４Ｒ）－１－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（化合物ａａ１３３、Ｆｍｏｃ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000187
　窒素雰囲気下、－１０℃にて市販の（２Ｓ，４Ｒ）－１－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－４－ヒドロキシピロリジン－２－カルボン酸（Ｃｂｚ－Ｈｙｐ－ＯＨ）（１２．０　ｇ、４５．２　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド溶液（１２０　ｍＬ）に水素化ナトリウム（ＮａＨ）　（１８．１　ｇ、４５１．９　ｍｍｏｌ、６０ｗｔ％）を少しづつ加え、－１０℃で１時間撹拌した。反応液に２－（２－ブロモエトキシ）テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン（２８．３　ｇ、１３５．７　ｍｍｏｌ）を－１０℃にて滴下しながら加え、反応液を３０℃にて３時間撹拌した。反応を炭酸水素ナトリウム水溶液（１２０　ｍＬ）で停止し、酢酸エチル（１２０　ｍＬ）を加え洗浄した。得られた水層に１Ｎ塩酸水溶液をｐＨ＝６になるまで加えた後、酢酸エチル（１２０　ｍＬ）で２回抽出した。得られた有機層を飽和食塩水、５％チオ硫酸ナトリウム水溶液で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮することで（２Ｓ，４Ｒ）－１－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（Ｃｂｚ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１０．４　ｇ）を粗生成物として得た。
　水素雰囲気下、得られた粗生成物である（２Ｓ，４Ｒ）－１－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（Ｃｂｚ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１０．１　ｇ）とパラジウム炭素（Ｐｄ／Ｃ）（３．０　ｇ）のメタノール溶液（１００　ｍＬ）を室温にて２時間撹拌した。反応液をろ過した後、得られた固体をメタノール（１００　ｍＬ）で洗浄した。ろ液を減圧下濃縮することで得られた残渣をエーテルで洗浄することで（２Ｓ，４Ｒ）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（Ｈ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（６．１　ｇ）を粗生成物として得た。
　得られた粗生成物である（２Ｓ，４Ｒ）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（Ｈ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（６．１　ｇ）と炭酸水素ナトリウム（５．９　ｇ、７０．５　ｍｍｏｌ）の１、４－ジオキサン／水＝１／１溶液（１３０　ｍＬ）にＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（７．９　ｇ、２３．５　ｍｍｏｌ）を加え、室温にて２時間撹拌した。反応液にｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）／ヘキサン＝１／３溶液（１００　ｍＬ）を加え、洗浄する操作を３回行った後、得られた水層に１Ｎ塩酸水溶液をｐＨ＝６になるまで加え、ｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）（１００　ｍＬ）で抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（２Ｓ，４Ｒ）－１－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－４－（２－（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）エトキシ）ピロリジン－２－カルボン酸（化合物ａａ１３３、Ｆｍｏｃ－Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＴＨＰ）－ＯＨ）（１．８８　ｇ、３工程３０％）で得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８０分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェネチル）グリシン（化合物ａａ１３４、Ｆｍｏｃ－（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000188
Ｓｔｅｐ　１
　文献記載の方法（Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ　Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ　（１９９１），　３４（４），　１２９７－１３０１）により調整した３－（（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸メチル（３１．０　ｇ、１４２．６８３　ｍｍｏｌ）とＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（４８．１３　ｇ、１４２．６８３　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（２００　ｍＬ）に炭酸ナトリウム（３０．２５　ｇ、２８５．３６６　ｍｍｏｌ）の水溶液（２００　ｍＬ）を室温にて加え１６時間撹拌した。反応液にアセトニトリルを加え、ろ過をした後、ろ液を減圧下濃縮した。得られた残渣に酢酸エチルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。
　得られたろ液を減圧下濃縮することで粗生成物として３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸メチル（６２　ｇ、３６％）を得た。
Ｓｔｅｐ　２
　塩化カルシウム（８４．５４　ｇ、７６１．７６１　ｍｍｏｌ）と水酸化リチウムの１水和物（８．５２　ｇ、２０３．１３６　ｍｍｏｌ）に水（２５０　ｍＬ）とイソプロパノール（１０００　ｍＬ）を加えた後、上述の粗生成物である３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸メチル（６２　ｇ、５０．７８４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（２５０　ｍＬ）を０℃にて加え、１６時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮した後、得られた残渣に水を加え、ｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）で洗浄した。得られた水層に１Ｎ塩酸水溶液を溶液のｐＨが酸性になるまで加えた後、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を水、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮することで粗生成物として３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸（１４　ｇ、５８％）を得た。
Ｓｔｅｐ　３
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物である３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸（１４　ｇ、３２．９０４　ｍｍｏｌ）、Ｎ－ヒドロキシフタルイミド（５．９０　ｇ、３６．１９４　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ'－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（７．４７　ｇ、３６．１９４　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（１４０　ｍＬ）を室温にて１６時間撹拌した。反応液をろ過した後、減圧下濃縮することで得られた残渣に酢酸エチルを加え、飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られたろ液を減圧下濃縮することで粗生成物として３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸　１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル（１４　ｇ、７５％）を得た。
Ｓｔｅｐ　４
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（５．７３　ｇ、２１．０３１ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（５．６４　ｇ、２１．０３１　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（２００　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（２２．９３　ｇ、３５０．５０９　ｍｍｏｌ）、上述の様にして得た粗生成物である３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（２－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－２－オキソエチル）アミノ）プロパン酸　１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル（４０．０　ｇ、７０．１０２　ｍｍｏｌ）、実施例に記載の通り合成した４－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３１）（４０．８１　ｇ、１４０．２０４　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（２００　ｍＬ）を室温で１０分間撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、ろ過した後、酢酸エチルで３回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィーにて精製することで、ｔｅｒｔ－ブチル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェネチル）グリシナート（１４　ｇ、３７％）を得た。
Ｓｔｅｐ　５
　上述のｔｅｒｔ－ブチル　Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェネチル）グリシナート（１４．０　ｇ、２５．７０５　ｍｍｏｌ）の４Ｎ塩酸／１，４－ジオキサン溶液（６５　ｍＬ）を室温にて４８時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮した後、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェネチル）グリシン（化合物ａａ１３４、Ｆｍｏｃ－（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ－ＯＨ）（６　ｇ、４７％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７０分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３５、Ｆｍｏｃ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000189
Ｓｔｅｐ　１
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－Ｇｌｕ－ＯｔＢｕ）（１７５　ｇ、４１１．２９９　ｍｍｏｌ）、Ｎ－ヒドロキシフタルイミド（６７．１　ｇ、４１１．２９９　ｍｍｏｌ）、１－エチル－３－（３－ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣＩ・ＨＣｌ）（７８．８５　ｇ、４１１．２９９　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジメチル－４－アミノピリジン（ＤＭＡＰ）（２．５１　ｇ、２０．５６５　ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド溶液（２０００　ｍＬ）を室温にて１６時間撹拌した。反応液に１　Ｍ塩酸水溶液を加えた後、ｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）で抽出した。得られた有機層を水、５０％飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－グルタミン酸　５－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（１０５　ｇ、４５％）を得た。
Ｓｔｅｐ　２
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（１４１　ｍｇ、０．５２６　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（１４０　ｍｇ、０．５２６　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（５　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（６１７　ｍｇ、８．７５　ｍｍｏｌ）、上述の様にして得た（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－グルタミン酸　５－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）（１．０　ｇ、１．７５　ｍｍｏｌ）、実施例に記載の通り合成した４－ヨード－２－メトキシ－Ｎ－メチルベンズアミド（化合物ａａ１３１）（１．１９　ｇ、３．５０　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（５　ｍＬ）を室温で１時間撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、ろ過した後、酢酸エチルで３回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（５５０　ｍｇ、５７％）を得た。
Ｓｔｅｐ　３
　上述の様にして得た（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸　ｔｅｒｔ－ブチル（３．００　ｇ、５．５０８　ｍｍｏｌ）のトリフルオロエタノール（ＴＦＥ）溶液（３０　ｍＬ）に室温にてクロロトリメチルシラン（ＴＭＳ－Ｃｌ）（１．８０　ｇ、１６．５６８　ｍｍｏｌ）を加え、３時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮した後、得られた残渣を酢酸エチルで精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３５、Ｆｍｏｃ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）（１．９　ｇ、７０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７１分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｒ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３６、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000190
　市販の（Ｒ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｇｌｕ－ＯｔＢｕ）を用い化合物ａａ１３５の合成と同様な手法により（Ｒ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３６、Ｆｍｏｃ－Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）（５　ｇ、３工程２０％）で合成した。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４８７　（Ｍ―Ｈ）―
保持時間：０．８３分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000191
　別途合成した（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸　（化合物ａａ１３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｕ－ＯｔＢｕ）を用い化合物ａａ１３５の合成と同様な手法により（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３－メトキシ－４－（メチルカルバモイル）フェニル）ブタン酸（化合物ａａ１３７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ）（２．８　ｇ、３工程２０％）で合成した。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５０３　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７３分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸　（化合物ａａ１３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｕ－ＯｔＢｕ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000192
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（アリルオキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－Ｇｌｕ（ＯＡｌｌ）－ＯＨ）（１００　ｇ、２４４．２３７　ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（２２　ｇ、７３３．３３３　ｍｍｏｌ）、ｐ－トルエンスルホン酸（ＴｓＯＨ）（０．４２　ｇ、２．４３８　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（１０００　ｍＬ）を１１０℃にて１．５時間撹拌した。反応液を室温にて冷却した後、減圧下濃縮することで得られた残渣に酢酸エチルを加え、炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、減圧下濃縮することで粗生成物として、（Ｓ）－４－（３－（アリルオキシ）－３－オキソプロピル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸　（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１１０　ｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物として得られた（Ｓ）－４－（３－（アリルオキシ）－３－オキソプロピル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸　（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１１０　ｇ）、トリエチルシラン（Ｅｔ３ＳｉＨ）（６０．６　ｇ、５２２．５６５　ｍｍｏｌ）、水（４．７　ｍＬ、２６４．２８２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１１００　ｍＬ）に０℃にて三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（７４．２　ｇ、５２２．５６５　ｍｍｏｌ）を加え、１６時間撹拌した。反応液に塩化アンモニウム水溶液を加え、酢酸エチルで２回抽出した後、得られた有機層を減圧下濃縮した。残渣に炭酸水素ナトリウム水溶液を加え溶解させた後、ヘキサン／酢酸エチル（５／１）で３回洗浄した。水層に６Ｎ塩酸水溶液をｐＨ＝２になるまで加え、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を水、飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮した。得られた残渣を１％トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）のアセトニトリル／水（１／５）溶液を用いて再結晶することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－５－（アリルオキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｕ（ＯＡｌｌ）－ＯＨ）（９５　ｇ、２工程８６％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述の様に得た（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－５－（アリルオキシ）－５－オキソペンタン酸（Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｕ（ＯＡｌｌ）－ＯＨ）（１００　ｇ、２３６．４０６　ｍｍｏｌ）と三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（０．１６　ｇ、２．３６４　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（２６０　ｍＬ）に０℃にて２，２，２－トリクロロアセトイミド酸　ｔｅｒｔ－ブチル（５１　ｇ、４７２．８１３　ｍｍｏｌ）のシクロヘキサン溶液を加えた後、１時間撹拌した。反応液にピリジンを加え、ろ過を行った後、ろ液を炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮することで得られた残渣をアセトニトリル／水（１／５）溶液を用いて再結晶することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｌ－グルタミン酸　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）　５－アリル（１０２　ｇ）を定量的に得た。
　窒素雰囲気下、上述の様にして得たＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチル－Ｌ－グルタミン酸　１－（ｔｅｒｔ－ブチル）　５－アリル（２９０　ｇ、６０５．４２７　ｍｍｏｌ）とテトラキス（トリフェニルホスフィン）パラジウム（０）（Ｐｄ（ＰＰｈ３）４）（７．０　ｇ、６．０５４　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１４５０　ｍＬ）にフェニルシラン（ＰｈＳｉＨ３）（４５．７７　ｇ、４２３．７９９　ｍｍｏｌ）を滴下しながら室温にて加え、撹拌した。原料の消失をＬＣ－ＭＳにて確認した後、反応液をろ過し、得られたろ液を減圧下濃縮した。残渣に炭酸ナトリウム水溶液を加え溶解させた後、ヘキサン／ｔ－ブチルメチルエーテル（１／３）溶液で３回洗浄した。水層にリン酸をｐＨ＝２になるまで加えた後、ｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、得られたろ液を減圧下濃縮することで、（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸　（化合物ａａ１３８、Ｆｍｏｃ－ＭｅＧｌｕ－ＯｔＢｕ）（２４７　ｇ、９３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４６２　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：１．３８０分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５２）
　（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１３９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＨ）、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１４０、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＨ）は以下のスキームに従って合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000193
（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　１－メチル　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000194
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－メトキシ－４－オキソブタン酸（Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ－ＯＭｅ）（１５．０　ｇ、４０．６　ｍｍｏｌ）とＮ－ヒドロキシフタルイミド（７．３　ｇ、４４．７　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ'－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（８．４　ｇ、４０．６　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（２２５　ｍＬ）を室温にて、２５℃で２時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮することで得られた残渣に酢酸エチルを加え、ろ過を行った後、得られた固体を酢酸エチルで洗浄した。ろ液を減圧下濃縮することで得られた残渣に酢酸エチル（１．５　Ｌ）を加え、５０℃で１６時間撹拌した。室温に冷却した後、ろ過を行い、固体を酢酸エチルで洗浄した後、ろ液を減圧下濃縮することで、粗生成物である（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　１－メチル　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）（１０．４　ｇ）を得た。
（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯｔＢｕ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000195
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（１．６４９　ｇ、６．０６４　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（１．６２７　ｇ、６．０６４　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（５０　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（６．６１　ｇ、１０１．０７１　ｍｍｏｌ）、（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　１－メチル　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）（１０．４　ｇ、２０．２１４　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（５０　ｍＬ）に４－ブロモ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（１０．４　ｇ、４０．４４７　ｍｍｏｌ）を滴下しながら０℃にて加え、室温にて１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を０℃にて加え、ろ過を行い、固体を酢酸エチルで洗浄した後、ろ液を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮することで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯｔＢｕ）－ＯＭｅ）（１１．９　ｇ、７６％）を得た。
（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000196
　窒素雰囲気下、上述の（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（１１．９　ｇ、２３．７　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（２３８　ｍＬ）にトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（７１．４　ｍＬ）を加え、室温にて３時間撹拌した。反応液に水（２５０　ｍＬ）を加えた後、ジクロロメタン（２５０　ｍＬ）で抽出した。有機層を水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮することで、粗生成物として（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＯＨ）－ＯＭｅ）（１０．１　ｇ）を得た。
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000197
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物である（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）安息香酸（１０．１　ｇ、２２．６　ｍｍｏｌ）と文献記載の方法（Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｏｒｇａｎｉｃ　Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，　２０１４，　７９（２０），　９６９９－９７０３）で別途合成したＮ－メチル－Ｏ－（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）ヒドロキシルアミン（１４．９　ｇ、１１３．５　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（１００　ｍＬ）にＯ－（７－アザ－１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－Ｎ，Ｎ，Ｎ′，Ｎ′－テトラメチルウロニウム　ヘキサフルオロリン酸塩（ＨＡＴＵ）（１２．９　ｇ、３４．０　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（４．４　ｇ、３４．０　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に水（１００　ｍＬ）を加え、酢酸エチル（２００　ｍＬ）で抽出した後、水（１００　ｍＬ）、飽和食塩水（１００　ｍＬ）で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮することで得られる残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）（７．２　ｇ、５５％）を得た。
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１３９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000198
　塩化カルシウム（２１．４６　ｇ、１９３．３３　ｍｍｏｌ）と水酸化リチウムの１水和物（２．１６　ｇ、５１．４７　ｍｍｏｌ）に水（７２　ｍＬ）を加え、室温にて１５分撹拌した後、上述の（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）（７．２０　ｇ、１２．８９　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン／ｔ－ブタノール（７２　ｍＬ／２８８　ｍＬ）溶液を室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液をろ過し、固体をテトラヒドロフラン（２００　ｍＬ）で洗浄した後、ろ液を減圧下濃縮し、水（５０　ｍＬ）を加え、酢酸エチル（２００　ｍＬ）で２回抽出した。有機層を０．０５Ｎリン酸水溶液（３５０　ｍＬ）で洗浄した後、得られた水層を再び酢酸エチル（２００　ｍＬ）で抽出した。有機層を合わせて、減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製することで、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（４－（メチル（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１３９、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＴＨＰ）－ＯＨ）（５．１　ｇ、７１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５４５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７９分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
４－ヨード－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチルの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000199
　窒素雰囲気下、市販の４－ヨード－２－メトキシ安息香酸（１５．０　ｇ、５３．９４８　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（６０．０　ｍＬ）に２，２，２－トリクロロアセトイミド酸　ｔｅｒｔ－ブチル（２３．５８　ｇ、１０７．８９６　ｍｍｏｌ）のシクロヘキサン溶液（１２０　ｍＬ）を室温にて滴下しながら加えた後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体（ＢＦ３・ＯＥｔ２）（７６．５７　ｍｇ、０．５３９　ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、室温で２時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣にヘキサンを加え、１時間撹拌し、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮することで、粗生成物として４－ヨード－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（２１　ｇ）を得た。
（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯｔＢｕ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000200
　窒素雰囲気下、臭化ニッケル（ＩＩ）の３水和物（ＮｉＢｒ２・３Ｈ２Ｏ）（４．２８　ｇ、１５．７１１　ｍｍｏｌ）と４，４'－ジ－ｔｅｒｔ－ブチル－２，２'－ビピリジル（ｄｔｂｂｐｙ）（４．２２　ｇ、１５．７１１　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１５０　ｍＬ）を５０℃で３時間撹拌した後、室温に冷却することでニッケル触媒溶液を得た。窒素雰囲気下、亜鉛粉末（１７．１３　ｇ、２６１．８５６　ｍｍｏｌ）、上述の様に合成した（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸　１－メチル　４－（１，３－ジオキソイソインドリン－２－イル）（２６．９４　ｇ、５２．３７１　ｍｍｏｌ）、上述の様に合成した粗生成物である４－ヨード－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（３５．０　ｇ、１０４．７４２　ｍｍｏｌ）のジメチルアセトアミド（ＤＭＡ）溶液（１５０　ｍＬ）を室温で１０分間撹拌した後、上述のニッケル触媒溶液を滴下しながら室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に１０％ＥＤＴＡ・２Ｎａ（エチレンジアミン四酢酸の２ナトリウム塩）水溶液を加え、ろ過を行った後、得られたろ液を酢酸エチルで２回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮を行うことで得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯｔＢｕ）－ＯＭｅ）（８．４　ｇ、１３％）を得た。
（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＯＨ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000201
　窒素雰囲気下、上述のように得た（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸　ｔｅｒｔ－ブチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯｔＢｕ）－ＯＭｅ）（２６．８　ｇ、５０．４　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（３０．０　ｍＬ）に室温にて４Ｎ　塩酸／１，４－ジオキサン溶液（２６８　ｍＬ）を加え、１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮することで得られた残渣をヘキサン／酢酸エチル（５／１）で洗浄することで、粗生成物として（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＯＨ）－ＯＭｅ）（２２　ｇ）を得た。
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000202
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物である（Ｓ）－４－（２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロピル）－２－メトキシ安息香酸（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＯＨ）－ＯＭｅ）（２２．０　ｇ、４６．２６７　ｍｍｏｌ）と市販のＯ－（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）ヒドロキシルアミン（２７．１　ｇ、２３１．３３７　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（４００　ｍＬ）にＯ－（７－アザ－１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－Ｎ，Ｎ，Ｎ′，Ｎ′－テトラメチルウロニウム　ヘキサフルオロリン酸塩（ＨＡＴＵ）（２１．１１　ｇ、５５．５２１　ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（７．１８　ｇ、５５．５２１　ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液に水を加え、酢酸エチルで２回抽出した後、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、ろ液を減圧下濃縮することで粗生成物として（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）　（３５．０　ｇ）を得た。
（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１４０、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000203
　塩化カルシウム（１０１．４０　ｇ、９１３．６３１　ｍｍｏｌ）と水酸化リチウムの１水和物（５．８３　ｇ、２４３．６３５　ｍｍｏｌ）に水（３６０　ｍＬ）、イソプロパノール（１４４０　ｍＬ）を０℃にて加え、上述の粗生成物である（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸メチル（Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＭｅ）（３５．０　ｇ、６０．９０９　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（３６０　ｍＬ）を滴下しながら加えた後、室温にて１６時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、有機溶媒を除去した後、得られた水層に２Ｍ塩酸水溶液をｐＨ＝７になるまで加え、酢酸エチルで２回抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、得られたろ液を減圧下濃縮し、残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製することで、（２Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－（３－メトキシ－４－（（（テトラヒドロ－２Ｈ－ピラン－２－イル）オキシ）カルバモイル）フェニル）プロパン酸（化合物ａａ１４０、Ｆｍｏｃ－Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＴＨＰ）－ＯＨ）　（７．３　ｇ、４０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５６１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（（Ｓ）－４－（（アリルオキシ）カルボニル）モルホリン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１４１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－（Ａｌｌｏｃ）Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）－ＯＨ）は下記のスキームにより合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000204
Ｓｔｅｐ　１
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－モルホリン－３－カルボン酸（ＣＡＳ．　Ｎｏ．　７４１２８８－３１－３）（１４．０　ｇ、１０７　ｍｍｏｌ）の水溶液（１００　ｍＬ）に室温にて炭酸水素ナトリウム（２０．２６　ｇ、２４１．１７２　ｍｍｏｌ）を加えた。反応液に室温でクロロギ酸アリル（Ａｌｌｏｃ－Ｃｌ）（１７．４４　ｇ、１２０．５３　ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（１００　ｍＬ）を滴下しながら加え、２時間撹拌した。反応液に水を加えた後、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－モルホリン－３，４－ジカルボン酸　３－メチル　４－アリル（１９　ｇ、８６％）を得た。
Ｓｔｅｐ　２
　上記の様にして得た（Ｓ）－モルホリン－３，４－ジカルボン酸　３－メチル　４－アリル（１９．５　ｇ、８５．０６７　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液（２８３　ｍＬ）に０度にてリチウムホウ水素化物（５．５６　ｇ、２５５．２３３）／テトラヒドロフラン（ＴＨＦ）溶液を滴下しながら加え、室温で２時間撹拌した。反応液に０度にて水と２Ｎ塩酸水溶液を加えた後、酢酸エチルで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｒ）－３－（ヒドロキシメチル）モルホリン－４－カルボン酸アリル（１０．１　ｇ、５９％）を得た。
Ｓｔｅｐ　３
　窒素雰囲気下、上述の（Ｒ）－３－（ヒドロキシメチル）モルホリン－４－カルボン酸アリル（７．０　ｇ、３４．８　ｍｍｏｌ）と特許記載の方法（ＷＯ２０１５／１７９８２３）で合成した（Ｓ）－アジリジン－１，２－ジカルボン酸　２－メチル　１－（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル）（７．５０　ｇ、２３．２　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（４７　ｍＬ）に０度にて三フッ化ホウ素－エチルエーテルコンプレックス（１．４８　ｇ、１０．４５　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液を滴下しながら加え、２時間撹拌した。反応液に水を加えた後、ジクロロメタンで抽出し、得られた有機層を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、（Ｓ）－３－（（（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロポキシ）メチル）モルホリン－４－カルボン酸アリル（４．５　ｇ、３７％）を得た。
Ｓｔｅｐ　４
　窒素雰囲気下、塩化カルシウム（１５．８７　ｇ、１４２．９７４　ｍｍｏｌ）の水溶液（５０　ｍＬ）に室温にて水酸化リチウム一水和物（０．９１　ｇ、３７．９９９　ｍｍｏｌ）を加え、室温で１０分間撹拌した。反応液に上述の様にして得た（Ｓ）－３－（（（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－３－メトキシ－３－オキソプロポキシ）メチル）モルホリン－４－カルボン酸アリル（５．０　ｇ、９．５３２　ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（５０　ｍＬ）、イソプロパノール（２００　ｍＬ）を０℃にて加え、室温にて９時間撹拌した後、１Ｍ塩酸水溶液を加え、減圧下溶媒を留去した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）にて精製することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（（（Ｓ）－４－（（アリルオキシ）カルボニル）モルホリン－３－イル）メチル）－Ｌ－セリン（化合物ａａ１４１、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（Ｓ－（Ａｌｌｏｃ）Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）－ＯＨ）（２．４　ｇ、４９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５１１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．７７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
１－３．ペプチド合成機によるペプチド合成に用いるレジン合成
　ペプチド合成機によるペプチド合成に用いるレジンは、以下のとおり合成した。２－クロロトリチルクロライドレジン（１００－２００ｍｅｓｈ、１％ＤＶＢ）は渡辺化学工業及びＣｈｅｍ－Ｉｍｐｅｘ社から購入した。
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０１、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000205
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０１、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）は、ＷＯ２０１３／１００１３２に記載の方法にて合成した。
　なお、本明細書では、ポリマーやレジンと化合物が結合した場合、ポリマーやレジン部位を○にて表記する場合がある。また、レジン部位の反応点を明確にさせる目的で、○に接続させて反応部位の化学構造を表記させる場合がある。上の構造では、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ（化合物ｐｄ０１）において、レジン上の２－クロロトリチル基がＡｓｐの側鎖カルボン酸とエステル結合を介して結合している様子を示している。
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－Ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000206
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－Ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）は下記のルートにて合成した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000207
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（アリルオキシ）－４－オキソブタン酸（化合物ｐｄ０４、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000208
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（アリルオキシ）－４－オキソブタン酸（化合物ｐｄ０２、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（ＯＡｌ）－ＯＨ）（１０．０　ｇ、２５．３　ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（１００　ｍＬ）に室温にてパラホルムアルデヒド（１．５２　ｇ）、トシル酸（ＴｓＯＨ）（２６０　ｍｇ、１．５１　ｍｍｏｌ）を加え、１１０℃にて１６時間撹拌した。その後、室温まで反応液を冷却し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液による洗浄を２回行った。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、粗生成物として（Ｓ）－４－（２－（アリルオキシ）－２－オキソエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ｐｄ０３）（８．０　ｇ）を得た。
　窒素雰囲気下、前工程にて得られた（Ｓ）－４－（２－（アリルオキシ）－２－オキソエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ｐｄ０３）（５．０　ｇ、１２．３　ｍｍｏｌ）とトリエチルシラン（Ｅｔ３ＳｉＨ）（４．３　ｇ、３７．０　ｍｍｏｌ）のジクロロメタン／トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）＝１／１（８０　ｍＬ／８０　ｍＬ）の溶液を室温にて２日間撹拌した後、反応液を減圧濃縮した。得られた残渣に炭酸カリウム（Ｋ２ＣＯ３）水溶液を加え、石油エーテルで３回洗浄した後、塩酸を用いてｐＨ３まで調整し、酢酸エチルを用いて３回抽出した。有機層をまとめて、無水硫酸ナトリウムにて乾燥し、ろ過、減圧濃縮し、得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（アリルオキシ）－４－オキソブタン酸（化合物ｐｄ０４、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ＯＨ）（３．０　ｇ、４６％、２工程）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４１０（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．８４分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸アリル（化合物ｐｄ０５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000209
　窒素雰囲気下、１－エチル－３－（３－ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（ＷＳＣＩ・ＨＣｌ）（１６．５　ｇ、８６　ｍｍｏｌ）のＤＭＦ溶液（１４３　ｍＬ）に１－ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）（１０．６　ｇ、７９　ｍｍｏ）を０℃にて加え、続いて（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（アリルオキシ）－４－オキソブタン酸（化合物ｐｄ０４、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ＯＨ）（２９．３　ｇ、７１．６　ｍｍｏｌ）のＤＭＦ／ＤＣＭ＝１／１の混合溶液（１１７　ｍＬ）を０℃にて滴下しながら加え、３０分撹拌した。その後、ピペリジン（８．４９　ｍＬ、８６　ｍｍｏｌ）を０℃で滴下しながら加え、３０分撹拌した。反応の進行をＬＣ－ＭＳにて確認した後、反応液に酢酸エチルを加え、室温まで昇温した。得られた有機層を２Ｍの塩酸水溶液で２回、５％炭酸水素ナトリウム水溶液で２回、飽和食塩水で２回洗浄した後、硫酸マグネシウムにて乾燥した。得られた混合物をろ過、減圧濃縮し、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸アリル（化合物ｐｄ０５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ｐｉｐ）（３３．７　ｇ、９９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４７７（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．３２分（分析条件ＳＭＤｍｅｔｈｏｄ６）
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｐｄ０６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000210
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸アリル（化合物ｐｄ０５、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（ＯＡｌ）－ｐｉｐ）（３１．４　ｇ、６５．９　ｍｍｏｌ）、４－メチルベンゼンスルフィン酸ナトリウム（１１．２　ｇ、６２．６　ｍｍｏｌ）、テトラキストリフェニルフォスフィンパラジウム（Ｐｄ（ＰＰｈ３）４）（７６１　ｍｇ、０．６５９　ｍｍｏｌ）にジクロロメタン（１３２　ｍＬ）を加え、室温で１．５時間撹拌した。その後、反応液に５％炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、ｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）で２回洗浄した。得られた水層のｐＨを６Ｍ塩酸水溶液を用い酸性にした後、酢酸エチルで抽出した。得られた有機層を５０％食塩水で２回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥した後、得られた混合物をろ過、減圧下濃縮した。得られた残渣を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル）にて精製し、さらに順相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（ＣＯ２Ｈシリカゲル、ヘキサン／酢酸エチル）で精製することで（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｐｄ０６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ－ｐｉｐ）（１７．１　ｇ、６０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ＝４３７（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１０分（分析条件ＳＭＤｍｅｔｈｏｄ６）
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000211
　フィルター付きの反応容器に２－クロロトリチルクロライドレジン（１．６０　ｍｍｏｌ／ｇ、１００－２００ｍｅｓｈ、１％ＤＶＢ、渡辺化学から購入、２５　ｇ、４０．０　ｍｍｏｌ）と脱水ジクロロメタン（４００　ｍＬ）を入れ、室温にて１０分間振とうした。窒素圧をかけてジクロロメタンを除いた後、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｐｄ０６、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ－ｐｉｐ）（８．３７　ｇ、２０．０　ｍｍｏｌ）と脱水ジクロロメタン（４００　ｍＬ）に脱水メタノール（６．４８　ｍＬ）及びジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１６．７　ｍＬ）を加えた混合液を反応容器に添加し、３０分間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた後、脱水ジクロロメタン（４００　ｍＬ）に脱水メタノール（５０．０　ｍＬ）とジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（１６．７　ｍＬ）を加えた混合液を反応容器に添加し、１時間３０分振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた後、ジクロロメタンを入れ、５分間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた。このジクロロメタンでのレジンの洗浄を２回繰り返し、得られたレジンを減圧下で一晩乾燥させ、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）（２９．９　ｇ）を得た。
　得られた（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）（１０．７　ｍｇ）を反応容器に入れ、ＤＭＦ（２００　μＬ）、ピペリジン（２００　μＬ）を加えて室温にて１時間振とうした。その後、反応混合液にＤＭＦ（１．６　ｍＬ）を加え、４００　μＬを取りだし、その吸光度（３０１．２　ｎｍ）を測定し（Ｓｈｉｍａｄｚｕ、ＵＶ－１６００ＰＣ（セル長１．０　ｃｍ）を用いて測定）、（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０７、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ）のローディング量を０．４１６　ｍｍｏｌ／ｇと算出した。
　なお、同様に合成したローディング量が異なる別ロットについてもペプチド合成に使用した。
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０８、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－Ａｌａ－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000212
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０８、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－Ａｌａ－ｐｉｐ）は、文献記載の方法にて合成した（文献：国際公開番号：ＷＯ２０１３／１００１３２Ａ１）。
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－３－フェニル－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０９、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－Ｐｈｅ－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000213
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－３－フェニル－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０９、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－Ｐｈｅ－ｐｉｐ）は、文献記載の方法を用い、化合物ｐｄ０８と同様の手法にて合成した（文献：国際公開番号：ＷＯ２０１３／１００１３２Ａ１）。
（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１０、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－ＭｅＰｈｅ－Ａｌａ－ｐｉｐ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000214
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（メチル（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（（（Ｓ）－１－オキソ－１－（ピペリジン－１－イル）プロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－３－フェニルプロパン－２－イル）アミノ）－４－オキソブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１０、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ＭｅＰｈｅ－ＭｅＰｈｅ－Ａｌａ－ｐｉｐ）は、ＷＯ２０１３／１００１３２に記載の方法にて合成した。
１－４．ペプチドの化学合成
　特別な記載がない限り、Ａ０１－Ａ１０、Ｂ０１－Ｂ１０、Ｃ０１－Ｃ１７、Ｄ０１－Ｄ１７、Ｅ０１－Ｅ０８、Ｆ０１－Ｆ０８、Ｇ０１－Ｇ１１、Ｈ０１－Ｈ１１、Ｉ０１－Ｉ０６、Ｊ０１－Ｊ０６、ＡＰ０１－ＡＰ１４３、ｐｄ３０－ｐｄ３６、ｐｄ５０－ｐｄ７０、ｐｄ１００－ｐｄ１２９、ｐｄ１６２、ｐｄ１６３、ｐｄ１６７、ｐｄ１７７－ｐｄ２４７、ｐｄ３８６－ｐｄ３９５、ｐｄ４５２－ｐｄ４５４、ｐｄ４８２－ｐｄ４８７のペプチド化合物の合成は実施例１の冒頭に記載した基本ルートで、以下の方法にて行った。
１）自動合成機によるペプチド固相合成
　ＷＯ２０１３／１００１３２に記載の方法にてペプチド合成機（Ｍｕｌｔｉｐｅｐ　ＲＳ；Ｉｎｔａｖｉｓ社製）を用いて、Ｆｍｏｃ法によりペプチド合成を行った。なお、操作の詳細な手順については合成機に付属のマニュアルに従った。
　合成機にＮ末端がＦｍｏｃで保護されたアスパラギン酸の側鎖カルボン酸部位が結合した２－クロロトリチルレジン（例えば（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソ－４－（ピペリジン－１－イル）ブタン酸－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ０１、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（Ｏ－Ｔｒｔ（２－Ｃｌ）－ｒｅｓｉｎ）－ｐｉｐ））（１カラムあたり１００　ｍｇ）と、各種Ｆｍｏｃ－アミノ酸（０．６　ｍｏｌ／Ｌ）と１－ヒドロキシ－７－アザベンゾトリアゾール（ＨＯＡｔ）もしくはｏｘｙｍａ（０．３７５　ｍｏｌ／Ｌ）のＮ－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）溶液と、ジイソプロピルカルボジイミド（ＤＩＣ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（１０％　ｖ／ｖ）をセットした。Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ０１）はＮＭＰ溶液においてｏｘｙｍａと共存させ、さらにモレキュラシーブス４Ａ１／８（和光純薬工業）もしくはモレキュラシーブス４Ａ１／１６（和光純薬工業）を添加してセットした。Ｆｍｏｃ－Ｔｈｒ（ＴＨＰ）－ＯＨ（化合物ａａ０１）と同様にアミノ酸側鎖の保護基にＴＨＰ基を有するアミノ酸（例えば、Ｆｍｏｃ－Ｓｅｒ（ＥｔＯＴＨＰ）―ＯＨ（化合物ａａ２２）など）もまたＮＭＰ溶液においてｏｘｙｍａと共存させ、さらにモレキュラシーブス４Ａ１／８（和光純薬工業）もしくはモレキュラシーブス４Ａ１／１６（和光純薬工業）を添加してセットした。使用するアミノ酸が塩酸塩などの塩を用いる場合、ＤＩＰＥＡ／ＤＭＦ＝３／１の溶液をセットし、ペプチド伸長の際に使用するアミノ酸に対して、０．９６等量分のＤＩＰＥＡを上記のＤＭＦ溶液として別途添加した。また、側鎖に酸性官能基を有するアミノ酸を含むペプチド化合物においては、脱保護剤の残留に起因するペプチドの過剰伸長を抑えるため、ペプチド伸長反応時のレジン洗浄に０．０８　Ｍトリエチルアミン塩酸塩のジクロロメタン溶液を用いた。
２）伸長したペプチドのレジンからの切り出し
　ＷＯ２０１３／１００１３２に記載の方法にて、上記の方法によって得られた固相上に担持された鎖状ペプチドに対し、ＤＣＭを加えレジンを再膨潤させた後、レジンに２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）／ＤＣＭ（１／１，ｖ／ｖ，２　ｍＬ）を加えて室温にて２時間振とうした。続いてチューブ内の溶液を合成用カラムでろ過することによりレジンを除き、残ったレジンをさらに２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）／ＤＣＭ（１／１，ｖ／ｖ，１　ｍＬ）にて２回洗浄した。得られた全ての切り出し溶液を混合した溶液、あるいはその溶液をさらにジクロロエタン（ＤＣＥ）（４　ｍＬ）で希釈したものを減圧下濃縮した。なお２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）／ＤＣＭ（１／１，ｖ／ｖ，２　ｍＬ）による切り出し時には用いたレジン上のモル数（ローディング量（ｍｍｏｌ／ｇ）に使用したレジン量（通常は０．１０ｇ）をかけたもの）に対して１．８等量となる容量のＤＩＰＥＡを添加することも出来る。
３）切り出したペプチドの環化法
　切り出し後に減圧下濃縮した残渣をＤＭＦ／ＤＣＭ（１／１，ｖ／ｖ，８ｍＬ）に溶解した。０．５ＭのＯ－（７－アザ－１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－Ｎ，Ｎ，Ｎ，Ｎ－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＡＴＵ）／ＤＭＦ溶液（用いたレジン上のモル数（ローディング量（ｍｍｏｌ／ｇ）に使用したレジン量（通常は０．１０　ｇ）をかけたもの）に対して１．５等量となる容量）と、ＤＩＰＥＡ（用いたレジン上のモル数に対して１．８等量）を加え、室温にて２時間以上撹拌した。その後、減圧下溶媒を留去した。目的の環状ペプチドの生成はＬＣＭＳ測定によって確認した。
４）５）環状ペプチドが有する側鎖官能基の保護基の脱保護
　調製した０．０５Ｍの硫酸水素テトラメチルアンモニウム／１，１，１，３，３，３－ヘキサフルオロイソプロピルアルコール（ＨＦＩＰ）溶液（２％トリイソプロピルシラン（ＴＩＰＳ））を４　ｍＬ加え、残渣を溶解させた後、室温にて４時間以上撹拌した。一定時間静置した後、ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（７０μＬ）を加え、減圧下溶媒を留去した。
　なお、側鎖にＡｌｌｏｃ基を有するアミノ酸を含むペプチド（例えばＮｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ）、Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）などを配列中に含むペプチド）は、塩化亜鉛（用いたレジン上のモル数に対して１．０等量）、テトラキス（トリフェニルフォスフィン）パラジウム（０）（Ｐｄ（ＰＰｈ３）４）（用いたレジン上のモル数に対して１．０等量）、ポリ（メチルヒドロシロキサン）（ＰＭＨＳ、ＣＡＳ＃６３１４８－５７－２）（用いたレジン上のモル数に対して０．９　Ｍ）、テトラヒドロフラン（用いたレジン上のモル数に対して０．１　Ｍ）を用いて室温で３時間３０分以上撹拌することでＡｌｌｏｃ基の脱保護を行った後、反応液に調製した０．０５Ｍの硫酸水素テトラメチルアンモニウム／１，１，１，３，３，３－ヘキサフルオロイソプロピルアルコール（ＨＦＩＰ）溶液（２％トリイソプロピルシラン（ＴＩＰＳ））を４　ｍＬ加え、室温にて４時間以上撹拌した。一定時間静置した後、ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（７０μＬ）を加え、減圧下溶媒を留去した。Ａｌｌｏｃ基の脱保護においては、上記のＰＭＨＳを用いる代わりにテトラメチルジシロキサン（ＴＭＤＳ、ＣＡＳ＃３２７７－２６－７）（用いたレジン上のモル数に対して４．０等量）を用いることができる。
　いずれの場合においても、減圧下、溶媒を留去した後、ＤＭＦ、ＤＭＳＯ、もしくは２０％メタノール水溶液を加え、不溶物をフィルターろ過にて取り除いた後、ｐｒｅｐａｒａｔｉｖｅ－ＨＰＬＣで精製した。
　０．０５Ｍの硫酸水素テトラメチルアンモニウム／ＨＦＩＰ溶液（２％ＴＩＰＳ）は、ＨＦＩＰ（１１．６６ｍＬ）、ＴＩＰＳ（０．２４ｍＬ）、ＤＣＥ（０．１０ｍＬ）を混合した溶液から４ｍＬを抜き取り、これに３４．３ｍｇの硫酸水素テトラブチルアンモニウムを溶解させて調製した。この溶液（０．０５Ｍの硫酸水素テトラメチルアンモニウム／ＨＦＩＰ溶液（２％ＴＩＰＳ））はＨＦＩＰの代わりに別のフルオロアルコール、例えば２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）なども用いることができる。
実施例２　側鎖にドナー（ｄｏｎｏｒ）を有し、該ドナー部分に分子内水素結合を有するアミノ酸の膜透過性評価
２－１　側鎖にドナーを有するアミノ酸でドナー部分に分子内水素結合を有するものと有しないものの膜透過性の比較
　側鎖にドナーを有するアミノ酸でドナー部分に分子内水素結合を有するものが有しないものよりも良好な膜透過性をもつことを確認するため、それぞれのアミノ酸を含有する２つの環状ペプチドを合成し、国際公開第２０１８／１２４１６２号に記載の改良法により膜透過性を比較した。上記のような２つの環状ペプチドの組み合わせを複数個合成、評価することで一般性を確認した。その結果、（１）Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）とＮｌｅ（６－ＯＨ）、（２）Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）とＨｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）、（３）Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）とＴｙｒ、（４）Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）とＮｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ）、（５）Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）とＧｌｎ（Ｍｅ）の組み合わせにおいて側鎖にドナーを有するアミノ酸でドナー部分に分子内水素結合を有するものを含有するペプチドの方が有しないものを含むペプチドよりも良好な膜透過性をもつことが確認できた。
　比較する２つの環状ペプチドの配列設計はドナーを有する側鎖部分構造以外の膜透過性に関係する要因の影響が最小限になるように行った。
　例えば、比較するアミノ酸同士が２つの環状ペプチドの同じ位置になるようにそれぞれ挿入し、環状部および直鎖部を構成するアミノ酸の数を同じにした（結果としてtotal AAが同じになる）。２つの環状ペプチド全体の側鎖部分のドナーの数が同じになるように揃えた（評価したいアミノ酸以外に側鎖にドナーを持つアミノ酸の例としてはＴｈｒなどが挙げられる）。さらに比較したいアミノ酸以外に側鎖にドナーを持つアミノ酸が存在する場合、その位置が同じになるように設計した。また、２つの環状ペプチド主鎖上のアミド基部分のＮ－アルキル基の数を揃えた。さらに２つの環状ペプチド主鎖上のアミド基のＮ－アルキル基（例えばＮＭｅ基）とＮＨ基の出現パターン（Ｎ－アルキルパターン）、Ｇｌｙ誘導体（例えばＭｅＧｌｙ、ｎＢｕＧｌｙなどのアルキル－Ｇｌｙも含む）の位置やＰｒｏのような環状アミノ酸の位置を同じにすることで、比較する２つの環状ペプチドのコンフォメーションが同じになるように設計した。参照例４に記載の通り、比較する２つのペプチドのClogP/total AAの値が±０．０３の間となるように調節し、Ｔｒｐを含まないようにした。参照例６に記載の通り、芳香環の数（Aromatic Ring Count: ARC）を揃えた。
　また、本明細書におけるＣｌｏｇＰは、コンピューターで計算した分配係数であって、Daylight Chemical Information Systems, Inc.のDaylight Version 4.9を用いて計算した。
（１）Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）とＮｌｅ（６－ＯＨ）の比較（表４）
　上記の概念をもとに設計したＳｅｒ（ＥｔＯＨ）もしくはＮｌｅ（６－ＯＨ）を含む環状ペプチドを合成し、国際公開第２０１８／１２４１６２号に記載の改良法により膜透過性を比較した。Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）を含む配列の化合物番号がＡＸＸ（ＸＸは数字を意味する）、Ｎｌｅ（６－ＯＨ）を含む配列の化合物番号がＢＸＸ（ＸＸは数字を意味する）である。化合物番号Ａ０１とＢ０１がそれぞれ対応する化合物であり、以下同様にＡＸＸ、ＢＸＸとＸＸの部分が同じ配列同士がそれぞれ対応している組み合わせである。１０個の組み合わせを比較したところ、全ての組み合わせでＳｅｒ（ＥｔＯＨ）を含有する環状ペプチドの方がＮｌｅ（６－ＯＨ）を含有する環状ペプチドよりも膜透過性に優れていた。
　以下、特に記載のない限り同様の方法で解析した。
　なお、Ａ０１を例にとり、表４、表６、表８、表１０、表１２および表１４のカラムについて説明する。Ａ０１は１１残基からなる環状ペプチドであり、１１残基のアミノ酸で環を形成している。環化部分を１番目のアミノ酸と定義し、Ａ０１の場合ではＡｓｐが該当する。Ａｓｐの隣で環状部を構成するアミノ酸を２番目のアミノ酸と定義し（Ａ０１の場合ＭｅＬｅｕが該当）、以下３番目、４番目とＮ末端まで繰り返す（Ａ０１の場合３番目ＭｅＰｈｅ、４番目Ｓｅｒ（ｉＰｅｎ）となり、環状部が１１残基からなるためＮ末端は１１番目のＤ－Ｖａｌ）。またＣ－ｔｅｒｍのカラムはＣ末端のアミノ酸のカルボン酸部位と縮合する官能基を意味しており、ｐｉｐはピペリジンを意味している。そして、Ｎ末端のアミノ基と環化部のアミノ酸の側鎖カルボン酸をアミド結合により環化させたペプチドであるということを表４、表６、表８、表１０、表１２および表１４で表している。例えば、Ａ０１はＮ末端であるＤ－Ｖａｌのアミノ基と環化部のＡｓｐの側鎖カルボン酸がアミド結合により環化している。本文中に記載の環状ペプチドに関しては特に記述が無い限り、全て同様の手法で表現している。
（２）Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）とＨｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）の比較（表６）
　Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）を含む配列の化合物番号がＣＸＸ、Ｈｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）を含む配列の化合物番号がＤＸＸである。１７個の組み合わせを比較したところ、１５個の組み合わせでＳｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）を含有する環状ペプチドの方がＨｎｌ（７－Ｆ３－６－ＯＨ）を含有する環状ペプチドよりも膜透過性に優れていた。
（３）Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）とＴｙｒの比較（表８）
　Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）を含む配列の化合物番号がＥＸＸ、Ｔｙｒを含む配列の化合物番号がＦＸＸである。８個の組み合わせを比較したところ、全ての組み合わせでＴｙｒ（３－ＯＭｅ）を含有する環状ペプチドの方がＴｙｒを含有する環状ペプチドよりも膜透過性に優れていた。
（４）Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）とＮｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ）の比較（表１０）
　Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）を含む配列の化合物番号がＧＸＸ、Ｎｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ）を含む配列の化合物番号がＨＸＸである。１１個の組み合わせを比較したところ、１０個の組み合わせでＳｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）を含有する環状ペプチドの方がＮｖａ（２－Ｒ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ）を含有する環状ペプチドよりも膜透過性に優れていた。
（５）Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）とＧｌｎ（Ｍｅ）の比較（表１２）
　Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）を含む配列の化合物番号がＩＸＸ、Ｇｌｎ（Ｍｅ）を含む配列の化合物番号がＪＸＸである。６個の組み合わせを比較したところ、全ての組み合わせでＳｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）を含有する環状ペプチドの方がＧｌｎ（Ｍｅ）を含有する環状ペプチドよりも膜透過性に優れていた。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000215
　環状ペプチドＡ０１～Ｂ１０の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000216
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000217
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000218
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000219
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000220
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000221
　環状ペプチドＣ０１～Ｄ１７の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000222
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000223
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000224
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000225
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000226
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000227
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000228
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000229
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000230
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000231
　環状ペプチドＥ０１～Ｆ０８の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000232
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000233
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000234
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000235
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000236
　環状ペプチドＧ０１～Ｈ１０の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000237
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000238
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000239
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000240
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000241
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000242
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000243
　環状ペプチドＩ０１～Ｊ０６の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000244
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000245
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000246
　実施例３に記載の低エネルギーコンフォメーション（Low energy conformation）の計算方法により、Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）、Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）、Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）、Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）、Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）の側鎖部分構造を計算するといずれも最安定なコンフォメーションが分子内水素結合を有しているコンフォメーションであった。その結果、膜透過性の改善が側鎖に存在するドナーを分子内水素結合でマスクするものによることであることが計算の結果からも確認された。
２－２　側鎖にドナー（ｄｏｎｏｒ）を有するアミノ酸でドナー部分に分子内水素結合を有するものを含有するペプチドの膜透過性の結果
　Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭe）、Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）、Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ、ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）、Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＨ）の膜透過性を評価した。結果は下記の通りであった。共に擬似６員環を形成するＳｅｒ（ｎＰｒＯＨ）とＳｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）の膜透過性を比較するとジェミナルにメチル基が存在するＳｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）の膜透過性の方がジェミナルにメチル基を有さないＳｅｒ（ｎＰｒＯＨ）よりも良好な傾向がみられた。この理由としてソープ・インゴールド効果による配座自由度の減少やドナー部分付近にジメチル基のような立体的に大きな脂溶性の置換基が存在することで極性表面積（Polar Surface Area：ＰＳＡ）が減少しているなどといったことが考えられる。
　環状ペプチドＡＰ０１～ＡＰ１４３、ＡＰ２００～ＡＰ２６６の膜透過性を評価した結果を以下に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000247
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000248
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000249
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000250
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000251
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000252
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000253
　実施例３に記載のLow energy conformationの計算方法により、Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭe）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭe－４－ＣＯＮＨＭｓ）、Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ、ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）、Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＨ）の側鎖部分構造を計算するといずれも最安定なコンフォメーションが分子内水素結合を有しているコンフォメーションであった。またＳｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）、の側鎖部分構造を計算すると、分子内水素結合を有するコンフォメーションは最安定コンフォメーションから０．８９ｋＪ／ｍｏｌ離れたものであった。そのため、これらのアミノ酸も膜透過する際に分子内水素結合を形成し、分子内水素結合を有しないアミノ酸よりも良好な膜透過性を有していると考えられる。
　膜透過性を評価した環状ペプチドＡＰ０１～ＡＰ１４３、ＡＰ２００～ＡＰ２６６の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000254
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000255
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000256
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000257
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000258
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000259
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000260
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000261
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000262
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000263
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000264
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000265
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000266
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000267
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000268
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000269
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000270
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000271
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000272
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000273
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000274
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000275
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000276
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000277
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000278
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000279
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000280
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000281
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000282
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000283
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000284
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000285
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000286
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000287
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Figure JPOXMLDOC01-appb-I000289
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000290
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000291
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Figure JPOXMLDOC01-appb-I000295
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000296
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000297
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Figure JPOXMLDOC01-appb-I000300
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000301
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000302
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000303
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Figure JPOXMLDOC01-appb-I000305
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000306
　上記実施例において膜透過性を評価した環状ペプチドの分析情報を以下に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000307
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000308
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000309
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000310
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000311
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000312
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000313
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000314
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000315
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000316
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Figure JPOXMLDOC01-appb-I000318
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000319
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000320
実施例３　側鎖部分構造のコンフォメーション解析
実施例３－１　側鎖部分構造のLow energy conformationの計算方法
　側鎖部分構造のLow energy conformationは側鎖β位（主鎖に直結する炭素）からアミノ酸の側鎖部分を抜き出した部分構造を用いて計算した。下スキームにＳｅｒ（ＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）の例を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000321
　また、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）のような環状部（Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）の場合はピロリジン環）をもつアミノ酸に関しては環状部に直結する原子からアミノ酸の側鎖部分を抜き出した部分構造を用いて計算した。下スキームにＨｙｐ（２－ＥｔＯＨ）の例を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000322
　例えばＳｅｒ（ＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）は側鎖部分構造としては同一のものを有していると考えることができる。
　また、（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙのようなアミノ酸のアミノ基に置換基を有するタイプのアミノ酸はＮ原子に直結する原子からアミノ酸の側鎖部分を抜き出した部分構造を用いて計算した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000323
　Low energy conformationは以下の手順で計算した。
（１）初期構造発生
　回転可能な単結合に関して初期二面角を０、９０、１８０、２７０度と与えた。アミド結合ならびにＣとＯＨの間の結合に関して初期二面角を０、１８０度と与えた。Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）の側鎖の部分構造を計算する場合、２個の単結合に４個づつ初期二面角、ＣとＯＨの間の結合に２個の初期二面角を考慮するので、合計３２個の初期コンフォメーションを発生した。
（２）構造最適化
　Gaussian09を用いて（１）で発生させたすべてのコンフォメーションの構造最適化を行った。B3LYP/6-31G(d) レベルにPolarizable Continuum Model (PCM)を加えて疑似水中での構造最適化を行った。
（３）Low energy conformationの選択
　（２）で得たminimized conformationのエネルギーの低い順からユニークなLow energy conformationを選んだ。コンフォメーションのユニークさは、構造発生の際に考慮した二面角でのコンフォメーション間の距離（違い）で判断する。二面角空間でのコンフォメーション間の距離（定義式は下記参照）が他のすべてのLow energy conformationと６０°以上あるコンフォメーションをユニークと定義する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000324
実施例３－２　ポテンシャルエネルギー曲面（Potential energy surface）の計算方法
１）下記部分構造(例えばSer(NMe-Aca)の側鎖部分構造)でのポテンシャルエネルギー曲面（図３－１）の場合
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000325
（１）Low energy conformationsは上述の手順で計算した。
（２）各コンフォメーション（grid point）のエネルギー計算
　初期値としてφ１は１８０°φ２、φ３は０°、１５°・・・３４５°まで１５°間隔で初期コンフォメーション（grid point）として２４ｘ２４＝５７６個生成した。
　φ２とφ３を初期値に固定し、Gaussian09を用いて発生させたすべてのコンフォメーションの構造最適化を行った。B3LYP/6-31G(d) レベルにPolarizable Continuum Model (PCM)を加えて疑似水中での構造最適化を行った。その結果、φ２とφ３を１５°間隔で計算した５７６個のコンフォメーションのエネルギー（Ｅ（φ２、φ３））を求めた。下記の式から求めたΔＥ（φ２、φ３）をプロットしたものが図３－１である。
ΔＥ（φ２、φ３）＝Ｅ（φ２、φ３）―Ｅｌｏｗｅｓｔ
Ｅｌｏｗｅｓｔ　：　lowest energy conformationのエネルギー
２）下記部分構造（例えば、Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）の側鎖部分構造）でのポテンシャルエネルギー曲面（図４－１）の場合
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000326
（１）Low energy conformationsは上述の手順で計算した。
（２）各コンフォメーション（grid point）のエネルギー計算
　初期値としてφ１は０°、９０°、１８０°、２７０°φ２は０°、１５°・・・３４５°まで１５°間隔、φ３は０°１８０°で初期コンフォメーション（ｇｒｉｄ　ｐｏｉｎｔ）として４ｘ２４ｘ２＝１９２個を生成した。ただし、φ２＝１８０°の時はさらにφ１＝０°、９０°、１８０°、２７０°φ３＝０°、９０°、１８０°、２７０°として４ｘ４＝１６個のコンフォメーションを発生させた。
φ２を初期値に固定して、Gaussian09を用いて発生させたすべてのコンフォメーションの構造最適化を行った。B3LYP/6-31G(d) レベルにPolarizable Continuum Model (PCM)を加えて疑似水中での構造最適化を行った。その結果、各φ２に対して４ｘ２＝８個のＥ（φ２）が得られる。このＥ（φ２）の中で最もエネルギーの低いものをＥｌｏｗｅｓｔ（φ２）とした。φ２を１５°間隔で計算した２４個のコンフォメーションのエネルギー（ΔＥ（φ２））は下記の式で求めた。ΔＥ（φ２）をプロットしたものが図４－１である。
ΔＥ（φ２）＝Ｅｌｏｗｅｓｔ（φ２）―Ｅｌｏｗｅｓｔ
Ｅｌｏｗｅｓｔ　：　lowest energy conformationのエネルギー
実施例３－３　ＣＳＤ（The Cambridge Structural Database）に登録されているＸ線構造解析の結果を用いた、結晶構造（Crystal structures）のコンフォメーション分布（図３－２、図４－２）の調査
　ＣＳＤ（The Cambridge Structural Database）5.39+2 updatesを用いてqueryを以下のものとして検索した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000327
　検索条件として3D coordinates determined、R factor≦０．０５、Not disordered、No errors、Not polymeric、No ions、No powder structures、Only Organicsとしてそれぞれ検索を行った。その結果をプロットしたものが図３－２、図４－２である。解析の結果、図３－２、図４－２は計算結果である図３－１および図４－１と大きな矛盾がなかった。つまり、いずれの部分構造も分子内水素結合を取りやすい構造であることが確認された。さらに図３－２のφ２＝１８０°付近に存在する２つの結晶構造（CSD code： MAPPAVおよびMUVJOE）を解析してみると、分子内水素結合を形成するドナー部分であるアミドＮＨ基が自分以外の他の分子と分子間水素結合を形成し、相互作用するのに用いられていることが確認できた。これは図３－１で解析した構造が膜透過する場合は膜透過に有利である分子内水素結合を形成するコンフォメーション、標的との相互作用の際には結合に有利である分子間水素結合を形成するコンフォメーションといったように、周りの環境に応じたコンフォメーションをとり得ることが確認できた。
実施例３－４　側鎖部分構造のLow energy conformation計算結果
　下記に記載のいずれアミノ酸においても、側鎖部分構造は分子内水素結合を有するコンフォメーションを取りやすい構造であることが計算的に示された。
　Ｓｅｒ（ＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（３Ｒ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、ｂＡｌａ（２Ｓ－ＭｅＯＥｔＯＨ）、Ｈｙｐ（２－ＥｔＯＨ）：これら３つのアミノ酸は側鎖部分構造は同一になる。計算結果は分子内水素結合を有するコンフォメーションが最安定コンフォメーションであった。
　Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ、Ｄ－Ｈｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ、ＭｅＨｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）－ＯＨ、（Ｐｈ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）Ｅｔ）Ｇｌｙ：これら４つのアミノ酸は側鎖部分構造は同一になる。計算結果は分子内水素結合を有するコンフォメーションが最安定コンフォメーションであった。
　表１７の計算結果のカラムは最安定コンフォメーションのみを記載した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000328
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000329
　Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（ｔＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（ｎＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｓ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（Ｒ－２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ２－ＰｒＯＨ）、Ｓｅｒ（２－Ｍｅ―２－ＢｕＯＨ）、Ｓｅｒ（ＮＭｅ－Ａｃａ）、Ｓｅｒ（ＮｔＢｕ－Ａｃａ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＭｅ）、Ｐｈｅ（４－ＯＭｅ－３－ＣＯＮＭｅ）、Ｔｙｒ（３－ＯＭｅ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＭｓ）、Ｐｈｅ（４－ＣＯＮＭｅＯＨ）、Ｐｈｅ（３－ＯＭｅ－４－ＣＯＮＨＯＨ）：いずれの計算結果も分子内水素結合を有するコンフォメーションが最安定コンフォメーションであった。表１８の計算結果のカラムは最安定コンフォメーションのみを記載した。
　Ｓｅｒ（１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）：本アミノ酸はＣＦ３基が結合している炭素部分がラセミ体であるため、Ｒ体であるＳｅｒ（Ｒ－１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）、Ｓ体であるＳｅｒ（Ｓ－１－ＣＦ３－ＥｔＯＨ）それぞれについて安定コンフォメーションを計算した。いずれの計算結果も分子内水素結合を有するコンフォメーションが最安定コンフォメーションであった。表１８の計算結果のカラムは最安定コンフォメーションのみを記載した。
　Ｓｅｒ（３－Ｍｅ－５－Ｏｘｏ－Ｏｄｚ）：計算結果は分子内水素結合を有するコンフォメーションは最安定コンフォメーションから０．８９ｋＪ／ｍｏｌ離れたものであった。表の計算結果のカラムは最安定コンフォメーションから０．８９ｋＪ／ｍｏｌ離れたものを記載した。
　Ｓｅｒ（Ｓ－４－Ｆ２－Ｐｙｒｒｏ－Ｍｅ）、Ｓｅｒ（Ｓ－Ｍｏｒ－３－Ｍｅ）：これらのアミノ酸は側鎖部位に２級アミノ基を有しているため、チャージをもつ可能性がある。チャージを持たない場合（neutral）、チャージをもつ場合（charged）の２つの場合についてそれぞれ計算を行ったが、いずれの計算結果も分子内水素結合を有するコンフォメーションが最安定コンフォメーションであった。表１８の計算結果のカラムは最安定コンフォメーションのみを記載した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000330
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000331
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000332
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000333
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000334
（参照例１）アミノ酸側鎖の長さの求め方
　本明細書におけるアミノ酸の側鎖には、アミノ酸に含まれる炭素原子（例えば、α、β、又はγ－炭素原子）に結合している鎖、及び窒素原子に結合している鎖が含まれる。本明細書において、アミノ酸の側鎖の長さは、以下の方法により求めることができる。すなわち、アミノ酸単位のＮ末をアセチル基、Ｃ末をメチルアミノ基でキャッピングし、分子モデリングソフトＭＯＥ（Chemical Computing Group社）のLowModeMDにより配座を発生させ、側鎖部位が結合している原子（天然アミノ酸の場合はα－炭素原子（Ｃα炭素））から最も遠い同側鎖の原子（水素原子は除く）までの距離を測定することで求めることができる。例としてＰｈｅまたはｎＢｕＧｌｙの側鎖の長さの求め方を以下に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000335
　また、アミノ酸側鎖が主鎖構造の一部と環を形成している場合は、側鎖部分が結合している原子が複数個存在することになる。その場合の側鎖の長さは上記と同様の計算をそれぞれの側鎖部分が結合している原子と最も遠い側鎖の原子（水素原子は除く）に対して行い、求めた距離のうち最も長いものとする。例としてＨｙｐ（Ｅｔ）を示すと、窒素原子からもとめた側鎖の距離は６．０４Å、Ｃα炭素から求めた側鎖の距離は６．０９Åであることから、Ｈｙｐ（Ｅｔ）の側鎖の距離は６．０９Åとする。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000336
　上述の方法により算出したアミノ酸の側鎖の長さを下記に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000337
（参照例２）ｐＫａの求め方
　本明細書においてアミノ酸の側鎖、又は環状ペプチド化合物の環状部の側鎖の計算pKa及びBasic 計算pKaは、ADMETPredictor（Simulations Plus Inc.社、ver.8.0）を用いて求めることができる。計算pKa及びBasic 計算pKaは側鎖β位（主鎖に直結する炭素）から側鎖部分を抜き出した部分構造を用いて計算される。例としてＬｙｓの場合を以下に示す。側鎖β位（主鎖に直結する炭素）を含む部分構造を用いてBasic 計算pKaを計算すると１０．５であった。同様に計算すると、酸としては、Ａｓｐの側鎖力ルボキシ基の計算pKaが４．３であり、Ｔｙｒの側差フェノール性水酸基の計算pKaが９．９であり、３－フルオロチロシン（Ｔｙｒ（３－Ｆ））の側差フェノール性水酸基の計算pKaが８．７であり、テトラゾールの計算pKaが３．７であった。一方、塩基としては、Ａｒｇの側鎖グアニジノ基のBasic 計算pKaが１２．７であり、Ｈｉｓのイミダゾリル基のBasic 計算pKaが７．６であり、ピリジンのBasic 計算pKaが５．４であった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000338
　本明細書に記載の方法でbasic pKaを計算した塩基性側鎖を有するアミノ酸の一部を下記の表に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000339
　本明細書に記載の方法でpKaを計算した酸性側鎖を有するアミノ酸の一部を下記の表に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000340
（参照例３－１）アミノ酸側鎖のpKaの実測
　本明細書においてアミノ酸側鎖のpKaの実測は以下の手順に従って行った。
（使用装置）
　Sirius T3（Sirius Analytical Instruments Ltd., Forest Row, East Sussex, RH18 5DW, UK）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000341
（実施手順）
　被験物質約１ｍｇの粉体または１０ｍＭのＤＭＳＯ溶液約１００ｕＬに０．１５ＭのＫＣｌを添加し、塩基性化合物の場合はｐＨ２となるまで０．５ＭのＨＣｌを添加後、０．５ＭのＫＯＨにてｐＨ１２まで滴定を行った。
　酸性化合物の場合は、ｐＨ１２となるまで０．５ＭのＫＯＨ添加後、０．５ＭのＨＣｌにてｐＨ２まで滴定を行った。
　滴定操作はSirius社製Ｔ３にて自動で行い、得られた滴定曲線からsirius T3 Refinementソフトを用いてｐＫａを求めた。
　また参照化合物としてイミプラミン・ＨＣｌ、プロプラノロール・ＨＣｌ、ワルファリンを用いて同様にｐＫａを求め、Sirius社で得られた試験結果範囲内であることを確認した。
　アミノ酸側鎖のｐＫａは評価したいアミノ酸を下記に示す３残基からなるペプチドの２残基目（下記表のＸの位置）に導入した配列を合成することで求めた。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000342
　以下にその結果を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000343
（参照例３－２）ｐＫａ実測に用いた３残基ペプチドの合成
　実施例１に記載のペプチド化合物の化学合成と同様の手法を用いペプチドの伸長、レジン上からの切り出しを行った後、Ｃ末端のカルボン酸とピペリジンを縮合することでｐｄ３０－ｐｄ３７を合成した。また、ペプチド合成に用いたFmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin（化合物ｐｄ１１）は下記の通り合成した。ZMeGly（Cbz-MeGly-OH、CAS#39608-31-6）は東京化成工業より購入した。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチルグリシン－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１１、Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000344
　フィルター付きの反応容器に２－クロロトリチルクロライドレジン（１．５８ｍｍｏｌ／ｇ、１００－２００ｍｅｓｈ、１％ＤＶＢ、渡辺化学から購入、１０ｇ、１５．８ｍｍｏｌ）と脱水ジクロロメタンを入れ、室温にて１時間振とうした。窒素圧をかけてジクロロメタンを除いた後、市販のＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチルグリシン（Fmoc-MeGly-OH）（３．５４ｇ、１１．３９ｍｍｏｌ）とジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（５．２９ｍＬ、３０．４ｍｍｏｌ）の脱水ジクロロメタン（１３０ｍＬ）溶液を反応容器に添加し、３０分間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた後、脱水ジクロロメタン（１３０ｍＬ）に脱水メタノール（５．７６ｍＬ）とジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（５．２９ｍＬ、３０．４ｍｍｏｌ）を加えた混合液を反応容器に添加し、１時間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた後、ジクロロメタンを入れ、５分間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた後、ジクロロメタンを入れ、５分間振とうした。窒素圧をかけて反応液を除いた。得られたレジンを減圧下で一晩乾燥させ、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチルグリシン－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１１、Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin）（１３．２ｇ）を得た。
　得られたレジンのローディング量は文献記載（Letters in Peptie Science, 2002, 9, 203）の方法を用い算出した。Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチルグリシン－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１１、Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin）（１４．４ｍｇ）を反応容器に入れ、ＤＭＦ（２ｍＬ）を加え１時間振とうした。反応液にＤＢＵ（０．０４ｍＬ）を加え、３０分振とうした後、ＤＭＦ（１０ｍＬ）を加え、１ｍＬを取りだし、さらに溶液量が１２．５ｍＬになるまでＤＭＦで希釈した。得られた溶液の吸光度（２９４ｎｍ）を測定し（Shimadzu、UV-1600PC（セル長１．０ｃｍ）を用いて測定）、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ－メチルグリシン－２－クロロトリチルレジン（化合物ｐｄ１１、Fmoc-MeGly-Trt(2-Cl)-resin）のローディング量を０．７８９ｍｍｏｌ／ｇと算出した。
（参照例３－３）ｐＫａを実測したペプチド化合物の分析情報
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000345
（参照例３－４）ｐＫａを実測したペプチド化合物の構造情報
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000346
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000347
　実測値のbasic pKaが９．１、計算値のbasic pKaが８．９のアミノ酸であるSer(Et-2-NMe2)を含む配列は、１．２１≦ClogP/total aa≦１．３６の範囲で、実測値のｐＫａが３．８、計算値のｐＫａが５．３のアミノ酸であるＧｌｎ（Ｍｓ）を含む配列は１．２０≦ClogP/total aa≦１．３３の範囲で膜透過性の評価を行った（ｐｄ５０～ｐｄ７０）。一方、MeAbu(pip-4-F2)、MeAbu(Mor)、Ser(Et-2-Mor)、MeAbu(pip-3-F2)、Abu(5-Oxo-Odz)を含む配列で膜透過性、Papp≧１．０ｘ１０－６ｃｍ／秒を達成したものの例を以下に示す（ｐｄ３８６－ｐｄ３９５、ｐｄ４５２－ｐｄ４５４、ｐｄ４８２－ｐｄ４８７）。
（参照例３－５）Ser(Et-2-NMe2)またはGln(Ms)を含む環状ペプチド化合物の膜透過性
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000348
　環状ペプチドｐｄ５０～ｐｄ７０の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000349
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000350
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000351
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000352
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000353
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000354
（参照例３－６）MeAbu(pip-4-F2)、MeAbu(Mor)、Ser(Et-2-Mor)、MeAbu(pip-3-F2)、Abu(5-Oxo-Odz)を含む環状ペプチド化合物でP app ≧１．０ｘ１０ －６ ｃｍ／秒を達成したものの例
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000355
　環状ペプチドｐｄ３８６～ｐｄ３９５、ｐｄ４５２～ｐｄ４５４、ｐｄ４８２～４８７の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000356
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000357
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000358
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000359
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000360
（参照例３－７）Ｆｍｏｃアミノ酸の合成
　ｐＫａ実測に用いた３残基ペプチドおよび膜透過性を評価した環状ペプチドを合成するために使用したFmoc-Ser(Et-2-NMe2)-OH（化合物ｔｍ０１）、Fmoc―MeAbu(pip-4-F2)-OH（化合物ｔｍ０４）、Fmoc―MeAbu(pip-3-F2)-OH（化合物ｔｍ１０）、Fmoc-MeAbu(Mor)-OH（化合物ｔｍ１９）、Fmoc-Ser(Et-2-Mor)-OH（化合物ｔｍ２０）、Fmoc-Abu(5-Oxo-Odz)-OH（化合物ｔｍ２１）、Fmoc-Gln(Ms)-OH（化合物ｔｍ２２）は以下のように合成した。
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ０１、Fmoc-Ser(Et-2-NMe2)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000361
　窒素雰囲気下、市販のトリチル－Ｌ－セリン（Trt-Ser-OH）のトリエチルアミン塩（５ｇ、１１．１５ｍｍｏｌ）にジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）（４０ｍＬ）を加えた後、ナトリウムｔｅｒｔ－ペントキシド（７．３６ｇ、６６．９ｍｍｏｌ）を室温にて加え、３０分撹拌した。反応液に室温にて、２－クロロ－Ｎ，Ｎ－ジメチルエタン－１－アミン塩酸塩（４．０１ｇ、２７．９ｍｍｏｌ）を加え、終夜撹拌した。反応液にギ酸（６．４１ｍＬ、１６７ｍｍｏｌ）を加え、逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍＭ酢酸アンモニウム水溶液／メタノール）で精製し、Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（Trt-Ser(Et-2-NMe2)-OH）（４．１ｇ）を得た。
　得られた、Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｎ－トリチル－Ｌ－セリン（Trt-Ser(Et-2-NMe2)-OH）（４．１ｇ、９．８０ｍｍｏｌ）にジクロロメタン（１０ｍＬ）を加えた後、４Ｎ塩酸／１，４－ジオキサン溶液（４０ｍＬ、１６０ｍｍｏｌ）、水（４ｍＬ）を加え、室温で３時間撹拌した。反応液に水（８０ｍＬ）を加え、ヘキサンで２回洗浄し、得られた水層に０度にて炭酸ナトリウム（２６．０ｇ、２４５ｍｍｏｌ）、１、４－ジオキサン（１２０ｍＬ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（３．９７ｇ、１１．７６ｍｍｏｌ）を加え、室温にて２時間撹拌した。反応液にギ酸（１１．２８ｍＬ、２９４ｍｍｏｌ）を加えた後、減圧下１，４－ジオキサンを留去し、得られた水層を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）で精製することでＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ０１、Fmoc-Ser(Et-2-NMe2)-OH）のギ酸塩（３．０７ｇ、３工程６９％）を得た。得られたＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ０１、Fmoc-Ser(Et-2-NMe2)-OH）のギ酸塩（３．０ｇ、７．５３ｍｍｏｌ）にジクロロメタン（４ｍＬ）、４Ｎ塩酸／１、４－ジオキサン溶液（９．４１１ｍＬ、３７．６ｍｍｏｌ）を加え、室温にて２０分撹拌した。反応液を減圧濃縮することで、Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－（ジメチルアミノ）エチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ０１、Fmoc-Ser(Et-2-NMe2)-OH）の塩酸塩（２．７ｇ、８２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　３９９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．５０分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ０２、Ｆｍｏｃ－Ａｓｐ（ｐｉｐ－４－Ｆ２）－ＯｔＢｕ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000362
　窒素雰囲気下、１－（３－ジメチルアミノプロピル）－３－エチルカルボジイミド塩酸塩（ＷＳＣ・ＨＣｌ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド溶液（１２ｍＬ）に０度で１－ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）（７２３ｍｇ、５．３５ｍｍｏｌ）と市販で購入した（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－４－オキソブタン酸（Fmoc-Asp-OtBu）（２ｇ、４．８６ｍｍｏｌ）を加え１時間撹拌した。反応液に４，４－ジフルオロピペリジン塩酸塩（８４３ｍｇ、５．３５ｍｍｏｌ）とＮ－エチル－Ｎ－イソプロピルプロパン－２－アミン（ＤＩＰＥＡ）（９３１μＬ、５．３５ｍｍｏｌ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド溶液（２ｍＬ）を加え０度で３時間撹拌した。反応液に水を加え酢酸エチルで２回抽出した。有機層を合わせたものを０．５Ｍ塩酸水溶液、水、５０％炭酸水素ナトリウム水溶液、５０％食塩水で洗浄後、得られた有機層を減圧濃縮する事で（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ０２、Fmoc-Asp(pip-4-F2)-OtBu）（２．６３５ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　５１５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９７分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ０３、Fmoc-Abu(pip-4-F2)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000363
　窒素雰囲気下、三ルテニウムドデカカルボニル（６２ｍｇ、０．０９７ｍｍｏｌ）のテトラヒドロフラン溶液（５ｍＬ）に１，１，３，３－テトラメチルジシロキサン（２．７６ｍＬ，１５．５５ｍｍｏｌ）を加え室温にて１０分間撹拌した。反応液にテトラヒドロフラン（７ｍＬ）に溶解した（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ０２、Fmoc-Asp(pip-4-F2)-OtBu）（１．０ｇ、１．９４３ｍｍｏｌ）を加え、５０度にて３時間撹拌した後、反応液を減圧濃縮した。得られた残渣を２，２，２－トリフルオロエタノール（１０ｍＬ）に溶解し、トリメチルクロロシラン（７４５μＬ、５．８３ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間撹拌した。反応液を減圧濃縮した後、得られた残渣を１，４－ジオキサン（５ｍＬ）と２Ｎ塩酸水溶液（１０ｍＬ）に溶解し、室温で１時間撹拌した。反応液をｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテルで２回抽出し、有機層を減圧濃縮した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％ギ酸水溶液／０．１％ギ酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ０３、Fmoc-Abu(pip-4-F2)-OH)）（５４０ｍｇ、６３％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４４５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．５６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ０４、Fmoc-MeAbu(pip-4-F2)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000364
　窒素雰囲気下、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ０３、Fmoc-Abu(pip-4-F2)-OH)）（１３ｇ、９．２５ｍｍｏｌ）、パラホルムアルデヒド（２．６ｇ、２８．８６ｍｍｏｌ）とトリフルオロ酢酸（３０．５９ｇ、２６３．７１ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（６０ｍＬ）を室温で１６時間撹拌した。反応液を減圧濃縮した後、ジクロロメタンに溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、水、飽和食塩水で洗浄した後、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣を順相シリカゲルカラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製し、中間体である（Ｓ）－４－（２－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）エチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（１０．９ｇ、８２％）を得た。得られた中間体（６ｇ、１３．１４ｍｍｏｌ）をトリフルオロ酢酸（６５ｍＬ）とジクロロエタン（６５ｍＬ）に溶解し室温にてトリエチルシラン（１３．５ｇ、１１６．１ｍｍｏｌ）を加え、７０度にて４時間撹拌した。反応液を室温に戻した後、減圧濃縮し得られた残渣をジクロロメタンに溶解した。有機層を水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．５％塩酸水溶液／０．５％塩酸アセトニトリル溶液）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（４，４－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ０４、Fmoc-MeAbu(pip-4-F2)-OH)(4.0 g、66%)を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．７１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ２８）
１－ベンジル－３，３－ジフルオロピペリジン（化合物ｔｍ０５）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000365
　窒素雰囲気下、１－ベンジルピペリジン－３－オン（６０ｇ、３１７．０３ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液に０度にてジメチルアミノ三フッ化硫黄（ＤＡＳＴ）（１５０ｇ、４．０４ｍｏｌ）を加え２時間撹拌した。その後、反応液に３００ｍＬの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルにて３回抽出を行い、有機層を合わせた物を飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過を行い、得られた有機層を減圧濃縮することで粗生成物である１－ベンジル－３，３－ジフルオロピペリジン（化合物ｔｍ０５）（３１ｇ、４６％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　２１２　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．９４分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ３１）
（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０７、Ｃｂｚ－ＭｅＡｂｕ（ｐｉｐ－３－Ｆ２）－ＯＢｎ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000366
　得られた粗生成物１－ベンジル－３，３－ジフルオロピペリジン（化合物ｔｍ０５）を２００ｍＬのメタノールに溶解し、１０％パラジウム／炭素（１ｇ）を加え、水素雰囲気下室温にて４８時間撹拌した。反応液をろ過し、得られたろ液を減圧濃縮する事で３，３－ジフルオロピペリジン（化合物ｔｍ０６）（１９ｇ）を粗生成物として得た。
　別途合成した、（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０８、Cbz-MeAsp(SEt)-OBn）（２０ｇ、４８．１３ｍｍｏｌ）、３，３－ジフルオロピペリジン（化合物ｔｍ０６）（８．２６ｇ、６８．１９ｍｍｏｌ）、トリエチルシラン（４０ｍＬ）、１０％パラジウム／炭素（２．６ｇ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド溶液（２０ｍＬ）に０度にてナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（ＮａＢＨ（ＯＡｃ）３）（２０．４ｇ、２０４ｍｍｏｌ）を加え、室温にて３０分間撹拌した。反応液をろ過、減圧濃縮することで得た粗生成物を順相シリカゲルクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０７、Cbz-MeAbu(pip-3-F2)-OBn）（１１ｇ、５０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４６１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．４２分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ３２）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ１０、Ｆｍｏｃ－ＭｅＡｂｕ（ｐｉｐ－３－Ｆ２）－ＯＨ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000367
　（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０７、Cbz-MeAbu(pip-3-F2)-OBn）（２０ｇ、４３．４３ｍｍｏｌ）を３３％臭化水素酢酸溶液に溶解し、室温にて２時間撹拌した後、５０度にてさらに１時間撹拌した。反応溶液を減圧濃縮することで得た残渣をジエチルエーテルにて沈殿させ、（２Ｓ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）－２－（メチルアミノ）ブタン酸の臭化物（化合物ｔｍ０９）（２９ｇ）を粗生成物として得た。
　上述の粗生成物である（２Ｓ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）－２－（メチルアミノ）ブタン酸の臭化物（化合物ｔｍ０９）（７．０８ｇ、２９．９７ｍｍｏｌ）とＮ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１６ｇ、４７．４８ｍｍｏｌ）を炭酸カリウムの水／１，４－ジオキサン溶液＝１／１（３００ｍＬ）に溶解し室温にて４時間撹拌した。その後反応液をジエチルエーテルにて３回洗浄し、塩酸で水層のｐＨを３に調節し、酢酸エチルにて２度抽出した。得られた有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過、減圧濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（１０ｍｍｏｌ炭酸水素アンモニウム水溶液／アセトニトリル）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（３，３－ジフルオロピペリジン－１－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ１０、Fmoc-MeAbu(pip-3-F2)-OH)）（７．２ｇ、７１％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　４５９　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．６１分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ５）
（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸（化合物ｔｍ１３、Cbz-MeAsp(SEt)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000368
　窒素雰囲気下、（（ベンジルオキシ）カルボニル）－Ｌ－アスパラギン酸（Cbz-Asp-OH）（２００ｇ、７４８．４１ｍｍｏｌ）とパラホルムアルデヒド（６７．５ｇ、７４９．３５ｍｍｏｌ）とｐ－トルエンスルホン酸（７．７４ｇ、４４．９５ｍｍｏｌ）のトルエン溶液（２０００ｍＬ）を１１０度に昇温し、３日間撹拌した。反応液を室温にした後、水を加え酢酸エチルにて３回抽出した。合わせた有機層を飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮することで、（Ｓ）－２－（３－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－５－オキソオキサゾリジン－４－イル）酢酸（化合物ｔｍ１１）を粗生成物として得た（２００ｇ）。
　上述と同様の方法で合成した（Ｓ）－２－（３－（（ベンジルオキシ）カルボニル）－５－オキソオキサゾリジン－４－イル）酢酸（化合物ｔｍ１１）（２６５ｇ、９４８．９９ｍｍｏｌ）の粗生成物とエタンチオール（８８．３ｇ、１．４２ｍｏｌ）と４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ）（１１．５９ｇ、９５ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液に０度にてＮ，Ｎ’－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（２１４ｇ、１．０４ｍｏｌ）を加え、室温にて５時間撹拌した。反応溶液をろ過し、得られたろ液を飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮した。得られた粗生成物を順相シリカゲルクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製し、（Ｓ）－４－（２－（エチルチオ）－２－オキソエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ｔｍ１２）（１６７ｇ）の混合物を得た。
　得られた（Ｓ）－４－（２－（エチルチオ）－２－オキソエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸ベンジル（化合物ｔｍ１２）（１３９ｇ、１．２０ｍｏｌ）のジクロロメタン（ＤＣＭ）とトリフルオロ酢酸溶液（１５００ｍＬ／１５００ｍＬ）にトリエチルシラン（１３９ｇ、１．２ｍｏｌ）を加え、室温にて３日間撹拌した。反応液を減圧濃縮し得られた残渣に炭酸カリウム水溶液を加え、ジエチルエーテルで３度洗浄した。得られた水層を２Ｎ塩酸水溶液でｐＨを３に調節したものに対して酢酸エチルで２度抽出した。合わせた有機層を飽和食塩水で洗浄し、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、減圧濃縮し、（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸（化合物ｔｍ１３、Cbz-MeAsp(SEt)-OH）（７５ｇ）の粗生成物を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ　＝　３２６　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．００分（分析条件ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１６）
（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０８、Ｃｂｚ－ＭｅＡｓｐ（ＳＥｔ）－ＯＢｎ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000369
　室温下、（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸（化合物ｔｍ１３、Cbz-MeAsp(SEt)-OH）（３ｇ、９．２２ｍｍｏｌ）の粗生成物と炭酸カリウム（１．９ｇ、１３．６５ｍｍｏｌ）のＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド溶液（４６ｍＬ）にベンジルブロミド（１．７３ｇ、１０．１１ｍｍｏｌ）を加え１６時間撹拌した後ろ過をした。得られたろ液を減圧濃縮し、得られた残渣を順相シリカゲルクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製し、（Ｓ）－２－（（（ベンジルオキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ベンジル（化合物ｔｍ０８、Cbz-MeAsp(SEt)-OBn）（１．５ｇ）を得た。
１ＨＮＭＲ（３００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ３）：δ７．３６－７．３１（ｍ，１０Ｈ），５．１９－４．８９（ｍ，５Ｈ），３．３４－２．８５（ｍ，７Ｈ），１．３０－１．２１（ｍ，３Ｈ）
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１７、Fmoc-Abu(Mor)-OH）の合成は、以下のスキームに従って行った。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000370
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１４、Fmoc-Asp(SEt)-OtBu）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000371
　（Ｓ）－３－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－４－オキソブタン酸（Fmoc-Asp-OtBu）（５ｇ、１２．１５ｍｍｏｌ）、４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ）（１４８ｍｇ、１．２２ｍｍｏｌ）およびエタンチオール（ＥｔＳＨ）（１．１３ｇ、１８．１９ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（ＤＣＭ）（５０ｍＬ）に溶解し、氷冷下でＮ，Ｎ’－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（２．７５６ｇ、１．３３７ｍｍｏｌ）を加えた。室温で５時間撹拌した後、固体をろ過により除去した。ろ液をジクロロメタン（ＤＣＭ）で希釈した後、飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、減圧濃縮した。得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（０～４０％酢酸エチル／石油エーテル）で精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１４、Fmoc-Asp(SEt)-OtBu）（３．９ｇ、７０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４７８　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：３．１３分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ１４）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１５）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000372
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（エチルチオ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１４、Fmoc-Asp(SEt)-OtBu）（１ｇ、２．２０ｍｍｏｌ）をアセトン（４．４ｍＬ）に溶解し、Ｐｄ／Ｃ（ｗｅｔ、１０％、４４ｍｇ）を加えた。氷冷下、トリエチルシラン（１．２７６ｇ、１０．９７ｍｍｏｌ）を加えて１時間撹拌した。その後、ろ過によりＰｄ／Ｃを除去し、ろ液を減圧濃縮して得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（０～６０％酢酸エチル／石油エーテル）で精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１５）（６８０ｍｇ、７８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１８　（Ｍ＋Ｎａ）＋
保持時間：２．０７分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４０）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１６、Ｆｍｏｃ－Ａｂｕ（Ｍｏｒ）－ＯｔＢｕ）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000373
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－オキソブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１５）（１．６ｇ、４．０５ｍｍｏｌ）およびモルホリン（３８７ｍｇ、４．４４ｍｍｏｌ）をジクロロエタン（ＤＣＥ）（８ｍＬ）に溶解し、室温で１時間撹拌した。その後、氷冷下でナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（ＮａＢＨ（ＯＡｃ）３）（１．７１７ｇ、８．１０ｍｍｏｌ）のジクロロエタン（ＤＣＥ）（８ｍＬ）溶液を加え、４時間撹拌した。その後、反応液をジクロロメタンで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過後、減圧濃縮した。得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１６、Fmoc-Abu(Mor)-OtBu）（１．７ｇ、９８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４６７　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：２．０２分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４１）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１７、Fmoc-Abu(Mor)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000374
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸ｔｅｒｔ－ブチル（化合物ｔｍ１６、Fmoc-Abu(Mor)-OtBu）（９ｇ、１９．２９ｍｍｏｌ）をトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）／ジクロロエタン（ＤＣＥ）（２５ｍＬ／２５ｍＬ）に溶解させ、４０度で２時間撹拌した。室温まで冷却後、反応液をジクロロメタンで希釈し、水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、減圧濃縮することで（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１７、Fmoc-Abu(Mor)-OH）（７ｇ、９０％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．２０分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４２）
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１９、Fmoc-MeAbu(Mor)-OH）の合成は、以下のスキームに従って行った。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000375
（Ｓ）－４－（２－モルホリノエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ｔｍ１８）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000376
　（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１７、Fmoc-Abu(Mor)-OH）（６００ｍｇ、１．４６ｍｍｏｌ）およびパラホルムアルデヒド（１３１．４ｍｇ、１．４６ｍｍｏｌ）をトルエン（３ｍＬ）およびトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）（１．５２７ｇ、１３．１６ｍｍｏｌ）に懸濁させ、室温で１６時間撹拌した。その後、反応液を減圧濃縮し、得られた残渣をジクロロメタンで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、水、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過し、ろ液を減圧濃縮して得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製し、（Ｓ）－４－（２－モルホリノエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ｔｍ１８）（４８６ｍｇ、７９％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４２３　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．１４分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ４０）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１９、Fmoc-MeAbu(Mor)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000377
　（Ｓ）－４－（２－モルホリノエチル）－５－オキソオキサゾリジン－３－カルボン酸（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メチル（化合物ｔｍ１８）（４８６ｍｇ、１．１５ｍｍｏｌ）およびトリエチルシラン（１．５ｍＬ、１０．３５ｍｍｏｌ）をトリフルオロ酢酸／ジクロロエタン（１／１、１２ｍＬ）に溶解し、７０度で４時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応液を減圧濃縮して得られた残渣をジクロロメタンで希釈し、水で洗浄後、有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過後、ろ液を減圧濃縮した。得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（５～７０％　０．５％塩酸水溶液／０．５％塩酸アセトニトリル溶液）で精製し、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）（メチル）アミノ）－４－モルホリノブタン酸（化合物ｔｍ１９、Fmoc-MeAbu(Mor)-OH）（４００ｍｇ、８２％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４２５　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：１．４０分（分析条件　ＳＭＤ　ｍｅｔｈｏｄ３４）
Ｎ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－モルホリノエチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ２０、Fmoc-Ser(Et-2-Mor)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000378
　窒素雰囲気下、市販の（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ－ＯＨ）（２０ｇ、９７．４６ｍｍｏｌ）のジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）溶液（１００ｍＬ）に水素化ナトリウム（７．７１８ｇ、３２１．６２ｍｍｏｌ、６０％オイルディスパージョン）を室温にて加え、１時間撹拌した。反応液を０度に冷却し、４－（２－クロロエチル）モルホリン（１６．０４０ｇ、１０７．２１ｍｍｏｌ）を滴下しながら加え、室温にて１６時間撹拌した。反応液に０度にて５０％ギ酸水溶液を加え、ろ過を行った後、得られたろ液を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製し、Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（２－モルホリノエチル）－Ｌ－セリン（Boc-Ser(Et-2-Mor)-OH）（５．６ｇ、１８％）を得た。
　Ｎ－（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｏ－（２－モルホリノエチル）－Ｌ－セリン（Ｂｏｃ－Ｓｅｒ（Ｅｔ－２－Ｍｏｒ）－ＯＨ）（５．６ｇ、１７．５９ｍｍｏｌ）に４Ｎ塩酸／１，４－ジオキサン溶液（２８．０ｍＬ、９２１．５３ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１時間撹拌した。減圧下溶媒を留去し、得られた残渣をジクロロメタンで洗浄した後、水（１０ｍＬ）を加え溶液とした。得られた溶液に炭酸カリウムを加えｐＨ７に調節し、水（１００ｍＬ）と１．４－ジオキサン（１５０ｍＬ）を加えた後、室温にて炭酸カリウム（４．４６５ｇ、３２．０７ｍｍｏｌ）、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（５．６８ｇ、１６．８４ｍｍｏｌ）を加え、１６時間撹拌した。反応液をジエチルエーテルで洗浄し、濃塩酸を用いて水層のｐＨを１に調節し、ジクロロメタンで３回抽出した。得られた有機層を水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（０．１％塩酸水溶液／０．１％塩酸アセトニトリル溶液）で精製することでＮ－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｏ－（２－モルホリノエチル）－Ｌ－セリン（化合物ｔｍ２０、Fmoc-Ser(Et-2-Mor)-OH）の塩酸塩（３．２ｇ、２工程４８％）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４４１　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．５０分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ２１、Fmoc-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000379
　窒素雰囲気下、市販の（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）－Ｌ－グルタミン（Ｂｏｃ－Ｇｌｎ－ＯＨ）（５０ｇ、２０３．０３ｍｍｏｌ）のピリジン溶液（３５０ｍＬ）にＮ，Ｎ’－ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）（４６．１ｇ、２２３．４３ｍｍｏｌ）を室温にて加え、２時間撹拌した。反応液をろ過し、ろ液を濃縮することで得られた残渣にジクロロメタン、濃塩酸をｐＨ＝３になるように調整しながら加え、ジクロロメタンで２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、減圧下溶媒留去した。得られた残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）にて精製することで、（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－４－シアノブタン酸（４５．５ｇ、９８％）を得た。
　上述のように得られた（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－４－シアノブタン酸（５０ｇ、２１９．０６ｍｍｏｌ）のエタノール溶液（５００ｍＬ）に室温にてヒドロキシルアミンの塩酸塩（３２ｇ、４６０．５０ｍｍｏｌ）とトリエチルアミン（８３ｍＬ）を加え、８０度で２時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮することで、（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－５－（ヒドロキシアミノ）－５－イミノペンタン酸（１０７ｇ）を粗生成物として得た。
　窒素雰囲気下、上述の粗生成物である（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－５－（ヒドロキシアミノ）－５－イミノペンタン酸（４４ｇ、１６８．４０ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（５００ｍＬ）に室温にて１，１’－カルボニルジイミダゾール（ＣＤＩ）（３９ｇ、２４０．５２ｍｍｏｌ）と１，８－ジアザビシクロ［５．４．０］－７－ウンデセン（ＤＢＵ）（５５ｇ、３６１．２７ｍｍｏｌ）を加え、１１０度で４時間撹拌した。反応液を室温にて冷却した後、濃塩酸を加えｐＨ＝２になるように調整し、ジクロロメタンで２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った後、減圧下溶媒留去することで、（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（Boc-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）（１１ｇ）を粗生成物として得た。
　窒素雰囲気下、上述のように得られた（Ｓ）－２－（（ｔｅｒｔ－ブトキシカルボニル）アミノ）－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（Boc-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）（１３．５ｇ、４６．９９ｍｍｏｌ）の１，４－ジオキサン溶液（１０ｍＬ）に室温にて４Ｎ塩酸／１，４－ジオキサン溶液（１４０ｍＬ）を加え、１６時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮することで、（Ｓ）－２－アミノ－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（H-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）（８．８ｇ）を粗生成物として得た。
　窒素雰囲気下、得られた粗生成物である（Ｓ）－２－アミノ－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（H-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）（８．８ｇ、４７．０２ｍｍｏｌ）と炭酸カリウム（１３ｇ、９４．０６ｍｍｏｌ）の水／１，４－ジオキサン溶液（１００ｍＬ／１００ｍＬ）に室温にて、Ｎ－（９－フルオレニルメトキシカルボニルオキシ）スクシンイミド（Ｆｍｏｃ－ＯＳｕ）（１４．３ｇ、４２．４ｍｍｏｌ）を加え、３時間撹拌した。反応液をｔ－ブチルメチルエーテル／ヘキサン（１／３）で洗浄し、濃塩酸を用いて水層のｐＨを２に調節し、ジクロロメタンで２回抽出した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。ろ液を減圧下濃縮し、得られた残渣を逆相カラムクロマトグラフィー（水／アセトニトリル）で精製することで、（Ｓ）－２－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－４－（５－オキソ－４，５－ジヒドロ－１，２，４－オキサジアゾール－３－イル）ブタン酸（化合物ｔｍ２１、Fmoc-Abu(5-Oxo-Odz)-OH）（２．６７ｇ）を得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４１０　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６６分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－（メチルスルホニル）－Ｌ－グルタミン（化合物ｔｍ２２、Fmoc-Gln(Ms)-OH）の合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000380
　窒素雰囲気下、市販の（Ｓ）－４－（（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）アミノ）－５－（ｔｅｒｔ－ブトキシ）－５－オキソペンタン酸（Fmoc-Glu-OtBu）（２０ｇ、４７ｍｍｏｌ）、メタンスルホンアミド（２０ｇ、２１０ｍｍｏｌ）、４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ）（１．３ｇ、１０．６ｍｍｏｌ）のジクロロメタン溶液（３６０ｍＬ）に１－（３－ジメチルアミノプロピル）－３－エチルカルボジイミド塩酸塩（ＷＳＣ・ＨＣｌ）（９．６４ｇ、５０．３ｍｍｏｌ）を室温にて加え、１６時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、酢酸エチルを加え、０．１％塩酸水溶液で３回、水で１回洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過を行った。得られた溶液を減圧下濃縮し、残渣を順相カラムクロマトグラフィー（石油エーテル／酢酸エチル）で精製することで、ｔｅｒｔ－ブチルＮ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－（メチルスルホニル）－Ｌ－グルタミナート（Fmoc-Gln(Ms)-OtBu）（９．３ｇ、３９％）を得た。
　窒素雰囲気下、上述のようにして得られた、ｔｅｒｔ－ブチルＮ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－（メチルスルホニル）－Ｌ－グルタミナート（Fmoc-Gln(Ms)-OtBu）（５．５ｇ、１０．９ｍｍｏｌ）の２，２，２－トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）溶液（１００ｍＬ）に０度にてクロロトリメチルシラン（ＴＭＳＣｌ）（３．５７ｇ、３２．８６１ｍｍｏｌ））を加え、１時間撹拌した。反応液を減圧下濃縮し、得られた残渣にｔ－ブチルメチルエーテルを加え再び濃縮した。この操作をさらに２回繰り返し、アセトニトリル／ジクロロメタンで再結晶を行うことで、Ｎ２－（（（９Ｈ－フルオレン－９－イル）メトキシ）カルボニル）－Ｎ５－（メチルスルホニル）－Ｌ－グルタミン（化合物ｔｍ２２、Fmoc-Gln(Ms)-OH）（３．８１７８ｇ、７７％）を白色固体として得た。
ＬＣＭＳ（ＥＳＩ）　ｍ／ｚ　＝　４４７　（Ｍ＋Ｈ）＋
保持時間：０．６５分（分析条件ＳＱＤＦＡ０５）
（参照例４）ClogPが膜透過性に与える影響
　Trpの側鎖を有する環状ペプチド化合物、及び同側鎖を有しない環状ペプチド化合物を合成し、改良法により膜透過性試験を行った。なお、MeTrpはTrpの側鎖を含むことから、構成アミノ酸にMeTrpを含む環状ペプチド化合物も、Trpの側鎖を有する環状ペプチド化合物に含まれる。その結果、Trpの側鎖を持たない環状ペプチド化合物はClogPを上昇させることによりＰａｐｐ≧１．０×１０－６ｃｍ／秒を達成することが可能であった（図１－１）。一方、Trpの側鎖を１つ以上有しているとClogPを上昇させてもＰａｐｐ≧１．０×１０－６ｃｍ／秒まで膜透過性を上げるのは難しかった（図１－２）。例えばTrp側鎖の位置、Ｎアルキルのパターンを変えたもので、１．０６≦ClogP/total aa≦１．４３の範囲にある環状ペプチド化合物の配列を表３１に示すが、これらはＰａｐｐ≧１．０×１０－６ｃｍ／秒の膜透過性を達成することは難しかった。
　以上のことから、Trpの側鎖を持たない環状ペプチド化合物の膜透過性を評価したところ、ＣｌｏｇＰを上昇させることにより膜透過性が向上することが確認できたため（図１－１）、比較する２つのペプチドのClogP/total AAの値が±０．０３の間となるように調節した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000381
　環状ペプチドｐｄ１００～ｐｄ１１１の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000382
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000383
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000384
（参照例５）Tyr(3-F)又はTyrの側鎖を有する環状ペプチド化合物の膜透過性試験
　Tyr(3-F)又はTyrの側鎖を有する環状ペプチド化合物を合成し、改良法により膜透過性試験を行った。その結果、Tyr(3-F)又はTyrの側鎖を有する環状ペプチド化合物もTrpの側鎖を有する環状ペプチド化合物と同様の傾向であった。１．０６≦ClogP/total aa≦１．２９の範囲にある環状ペプチド化合物の配列を表３３に示すが、Ｔｒｐの場合と同様、これらがＰａｐｐ≧１．０×１０－６ｃｍ／秒を達成することは困難であった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000385
　環状ペプチドｐｄ１１２～ｐｄ１２９の構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000386
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000387
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000388
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000389
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000390
（参照例６）環状ペプチド中の芳香環の数（ＡＲＣ）が膜透過性に与える影響
　ＡＲＣが増加するにともなって環状ペプチド化合物のＰａｐｐが低下、すなわち膜透過性が低下する傾向が確認できた（図２）。そのため、比較する２つのペプチドの芳香環の数（Aromatic Ring Count: ARC）を揃えた。
　なお、本解析では、環状部の側鎖に縮環構造を有するもの、並びに置換及び無置換のヒドロキシフェニル基を有する環状ペプチド化合物を解析対象から除外した。ＡＲＣ＝３の場合、ClogP/total AAが０．８８以上の配列で、１．０×１０－６以上のＰａｐｐが認められた。一方、ＡＲＣ＝４の場合は前記ＡＲＣ＝３の化合物群と同程度のClogP/total AA（０．８８以上）の化合物であっても、Ｐａｐｐが１．０×１０－６以上となるものはほとんど存在しなかった。このことから、同程度の脂溶性の配列群であるにも関わらず、ＡＲＣ＝３とＡＲＣ＝４を比較すると、ＡＲＣ＝３の方が良好な膜透過性を示すことが示された（表３５、表３６、表３７）。
　また、ｐｄ１９８を例にとり、表３５、表３６及び表３７のカラムについて説明する。ｐｄ１９８は１２残基からなる環状ペプチドであり、１０残基のアミノ酸で環を形成している。環化部分を１番目のアミノ酸と定義し、ｐｄ１９８の場合ではＡｓｐが該当する。Ａｓｐの隣で環状部を構成するアミノ酸を２番目のアミノ酸と定義し（ｐｄ１９８の場合Ｐｈｅが該当）、以下３番目、４番目とＮ末端まで繰り返す（ｐｄ１９８の場合３番目ＭｅＶａｌ、４番目ＭｅＬｅｕとなり、環状部が１０残基からなるためＮ末端は１０番目のｇ－ＭｅＡｂｕ）。また環化部のアミノ酸のＣ末端から近い順に、Ｈ－１、Ｈ－２、Ｈ－３と示している。ｐｄ１９８の場合Ｈ－１はＭｅＰｈｅ、Ｈ－２はＡｌａであるので、ＡｓｐのＣ末端にＭｅＰｈｅが結合しており、ついでＡｌａが結合していることを意味している。またＣ－ｔｅｒｍのカラムはＣ末端のアミノ酸のカルボン酸部位と縮合する官能基を意味しており、ｐｉｐはピペリジンを表し、ｐｙｒｒｏはピロリジンを意味している（ｐｄ１９８の場合、Ｃ末端のアミノ酸はＨ－２のＡｌａであり、そのカルボン酸部位がｐｉｐ（ピペリジン）と縮合した構造になる）。そして、Ｎ末端のアミノ基と環化部のアミノ酸の側鎖カルボン酸をアミド結合により環化させたペプチドであるということを表３５、表３６及び表３７で表している。例えば、ｐｄ１９８はＮ末端であるｇ－ＭｅＡｂｕのアミノ基と環化部のＡｓｐの側鎖カルボン酸がアミド結合により環化している。本文中に記載の環状ペプチドに関しては特に記述が無い限り、全て同様の手法で表現している。　
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000391
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000392
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000393
　上記に記載の環状ペプチドの構造を以下に示す。（なお環状ペプチドの構造式において、構造を明瞭にする目的でヘテロ原子に結合している水素原子を省略している場合もある）
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000394
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000395
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000396
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000397
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000398
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000399
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000400
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000401
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000402
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000403
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000404
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000405
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000406
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000407
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000408
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000409
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000410
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000411
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000412
　参照例において膜透過性を評価した環状ペプチドの分析情報を以下に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000413
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000414
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000415
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000416
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000417
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000418
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000419
　本発明は、ペプチドの膜透過性を改善するアミノ酸、および該アミノ酸を含むペプチド化合物を提供することができる。

Claims (16)

  1. 　２以上のアミノ酸が連結されたペプチド化合物であって、アミノ酸の少なくとも１つがその側鎖内で水素結合を形成し得る、ペプチド化合物。
  2. 　側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸が、側鎖内で擬似４～７員環を形成し得る、請求項１に記載のペプチド化合物。
  3. 　側鎖内で水素結合を形成し得るアミノ酸が、下記式Ａで表される、請求項１または２に記載のペプチド化合物：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000001
    式中、
    　Ｒ１は、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、この場合、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、Ｒ２Ａが水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、かつＲ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成し、あるいは
    　Ｒ１は、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子と一緒になって４～６員の複素環を形成し、該複素環は、式１もしくは式２で表される基、－ＯＨ、およびアルコキシ基からなる群より選択される、１つまたは複数の置換基を有していてもよく、この場合、Ｒ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
    　Ｒ３は、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
    　Ｒ４は、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、
    　式１および式２は、それぞれ下記式：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000002
    で表され、式中、
    　＊は、結合点を示し、
    　Ｑ１およびＱ２は、独立して、単結合、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、または酸素原子を１つ含むＣ２－Ｃ４ヘテロアルキレンであり、
    　Ａ１は、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
    　Ｌ１は、フッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
    　Ａ２は、単結合、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
    　Ｌ２は、単結合であるか、またはフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
    　Ｘは、－ＯＨ、－ＮＲＺ１ＲＺ２、もしくは－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり；
    　ＲＺ１およびＲＺ２は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
    　Ｙは、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノ、－ＮＲＺ３ＲＺ４、もしくは－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくはハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり、
    　ＲＺ３およびＲＺ４は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
    　Ｚは、水素またはＣ１－Ｃ４アルキルであり、
    　但し、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－である場合、Ｚは水素ではなく、
    　ここで、式Ａで表されるアミノ酸は、式１または式２で表される基のいずれかを少なくとも１つ含む。
  4. 　式Ａで表されるアミノ酸が以下からなる群：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000003
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000004
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000005
    より選択される、請求項３に記載のペプチド化合物。
  5. 　５～３０のアミノ酸から構成される、請求項１～４のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  6. 　環状である、請求項１～５のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  7. 　２～１５のアミノ酸から構成される環状部を含む、請求項６に記載のペプチド化合物。
  8. 　２～３０のＮ置換アミノ酸を含む、請求項１～７のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  9. 　全アミノ酸数に対するＮ置換アミノ酸数の割合が３０％以上である、請求項１～８のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  10. 　４．０～１８のＣｌｏｇＰを有する、請求項１～９のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  11. 　１．０ｘ１０－７ｃｍ／秒以上のＰａｐｐを有する、請求項１～１０のいずれか１項に記載のペプチド化合物。
  12. 　請求項１～１１のいずれか１項に記載のペプチドおよび／または当該ペプチドをコードする核酸を含むライブラリ。
  13. 　下記式Ａで表される、アミノ酸：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000006
    式中、
    　Ｒ１は、水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、この場合、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、Ｒ２Ａが水素、もしくはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、かつＲ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであるか、あるいは、Ｒ２ＡおよびＲ２Ｂは、それらが結合している炭素原子と一緒になって４～６員の環を形成し、あるいは
    　Ｒ１は、Ｒ１が結合する窒素原子、Ｒ２Ａ、およびＲ２Aが結合する炭素原子と一緒になって４～６員の複素環を形成し、該複素環は、式１もしくは式２で表される基、－ＯＨ、およびアルコキシ基からなる群より選択される、１つまたは複数の置換基を有していてもよく、この場合、Ｒ２Ｂは、水素またはＣ１－Ｃ６アルキルであり、
    　Ｒ３は、単結合、または－ＣＨＲ４－であり、
    　Ｒ４は、水素、もしくはＣ１－Ｃ４アルキルであるか、または式１もしくは式２で表される基であり、
    　式１および式２は、それぞれ下記式：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000007
    で表され、式中、
    　＊は、結合点を示し、
    　Ｑ１およびＱ２は、独立して、単結合、Ｃ１－Ｃ４アルキレン、または酸素原子を１つ含むＣ２－Ｃ４ヘテロアルキレンであり、
    　Ａ１は、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
    　Ｌ１は、フッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
    　Ａ２は、単結合、－Ｏ－、または－Ｓ－であり、
    　Ｌ２は、単結合であるか、またはフッ素、Ｃ１－Ｃ２アルキル基、Ｃ１－Ｃ２フルオロアルキル、およびオキソ（＝Ｏ）からなる群より選択される１つまたは複数の置換基によって置換されていてもよい直鎖のＣ１－Ｃ３アルキレンであり、
    　Ｘは、－ＯＨ、－ＮＲＺ１ＲＺ２、もしくは－ＣＯＮＲＺ１ＲＺ２であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくは１つまたは複数のハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり；
    　ＲＺ１およびＲＺ２は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
    　Ｙは、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキルスルホニルアミノ、－ＮＲＺ３ＲＺ４、もしくは－ＣＯＮＲＺ３ＲＺ４であるか、または１～３個のヘテロ原子を含有し、オキソもしくはハロゲンによって置換されていてもよい５～６員の飽和もしくは不飽和ヘテロシクリルであり、
    　ＲＺ３およびＲＺ４は、独立して、水素、－ＯＨ、Ｃ１－Ｃ４アルキル、およびＣ１－Ｃ４アルキルスルホニルからなる群より選択され、
    　Ｚは、水素またはＣ１－Ｃ４アルキルであり、
    　但し、Ａ２が－Ｏ－、または－Ｓ－である場合、Ｚは水素ではなく、
    　ここで、式Ａで表されるアミノ酸は、式１または式２で表される基のいずれかを少なくとも１つ含む。
  14. 　以下からなる群：
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000008
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000009
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000010
    Figure JPOXMLDOC01-appb-I000011
    より選択される、請求項１３に記載のアミノ酸。
  15. 　請求項１３または１４に記載のアミノ酸に含まれるアミノ基、および／またはカルボキシル基が保護基で保護されている、保護アミノ酸。
  16. 　アミノ基の保護基が、Ｆｍｏｃ基、Ｂｏｃ基、Ｃｂｚ基、Ａｌｌｏｃ基、ノシル基、ジニトロノシル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、およびクミル基からなる群より選択される、および／または
    　カルボキシル基の保護基が、メチル基、アリル基、ｔ－Ｂｕ基、トリチル基、クミル基、メトキシトリチル基、およびベンジル基からなる群より選択される、請求項１５に記載の保護アミノ酸。
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