WO2016084993A1 - 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물 - Google Patents

신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물 Download PDF

Info

Publication number
WO2016084993A1
WO2016084993A1 PCT/KR2014/011381 KR2014011381W WO2016084993A1 WO 2016084993 A1 WO2016084993 A1 WO 2016084993A1 KR 2014011381 W KR2014011381 W KR 2014011381W WO 2016084993 A1 WO2016084993 A1 WO 2016084993A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
antibody
seq
variable region
egfrviii
chain variable
Prior art date
Application number
PCT/KR2014/011381
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
윤재봉
유진상
유진산
이원섭
김성우
심상렬
변상순
이영애
이혁준
김도윤
최진희
Original Assignee
주식회사 파멥신
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 주식회사 파멥신 filed Critical 주식회사 파멥신
Priority to ES14906712T priority Critical patent/ES2871598T3/es
Priority to CA2968510A priority patent/CA2968510C/en
Priority to US15/528,753 priority patent/US10597457B2/en
Priority to EP14906712.6A priority patent/EP3239177B1/en
Priority to JP2017528179A priority patent/JP6616833B2/ja
Priority to PT149067126T priority patent/PT3239177T/pt
Priority to AU2014412643A priority patent/AU2014412643B2/en
Priority to DK14906712.6T priority patent/DK3239177T3/da
Priority to PCT/KR2014/011381 priority patent/WO2016084993A1/ko
Priority to CN201480084380.XA priority patent/CN107108735B/zh
Publication of WO2016084993A1 publication Critical patent/WO2016084993A1/ko

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2863Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for growth factors, growth regulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/46Hybrid immunoglobulins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/21Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from primates, e.g. man
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/515Complete light chain, i.e. VL + CL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/77Internalization into the cell
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value

Definitions

  • the present invention includes an antibody that specifically binds to EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III), a nucleic acid encoding the antibody, a vector comprising the nucleic acid, a host cell, a method for preparing the antibody, and the antibody as an active ingredient. It relates to a pharmaceutical composition for treating cancer or tumor.
  • EGFRvIII epidermal growth factor receptor variant III
  • EGFR Extracellular growth factor receptor
  • ErbB-1 ErbB-1
  • HER1 in humans is an ErbB family tyrosine kinase receptor (RTK) expressed on the cell surface found by Stanley Cohen of Vanderbilt University. Function (Zhang H. et al, 2007).
  • EGFR family of receptors EGFR (ErbB-1), HER2 / c-neu (ErbB-2), Her 3 (ErbB-3) and Her 4 (ErbB-4)
  • ligands such as EGF and TGF-?
  • Her2 there are no known ligands
  • homozygous or heterodimers are made to transmit activation signals into cells.
  • EGFRvIII mutations are often found in brain tumors, resulting in poor prognosis after treatment through surgery, radiotherapy, or chemotherapy.
  • GBM glioblastoma multiforme
  • Recombinant EGFR mutants have deletions or duplications of specific exons. EGFR and recombinant EGFR mutants are shown in FIG. 3.
  • EGFRvIII is the most frequent EGFR variant of SEQ ID NO: 1, which lacks amino acids in the exons 2 to 7, and is expressed in more than 50% of patients with terminal brain tumors.
  • EGFRvIII lacks 267 amino acids in the amino acid sequence of EGFRwt, and exons 1 and 8 are combined to form a new amino acid glycine, which induces phosphorylation of intracellular domains and contributes to the cancerous process. Downward J et al., 1984).
  • EGFRvIII is considered the most suitable EGFR variant as an anticancer target, and a number of research and development are in progress.
  • EGFRvIII transmits cellular signals through major signaling pathways mainly through PI3K and AKT, and through activation of Stat-3, AP-1 or MAPK as a non-mainstream pathway, for cancer cell proliferation and apoptosis. It contributes to resistance, neovascularization, increased cancer cell infiltration, and cancer stem cell formation (Gan HK, et al., 2013). Recent studies have reported that EGFRvIII plays an important role in cancerous activity by activating NF- ⁇ B via mTORC2 (Bonavia et al., 2012; Tanaka et al., 2011). Signal transduction pathways following activation of EGFRvIII are shown in FIG. 4.
  • EGFRvIII induces subsequent activation of c-Met phosphorylation (Huang PH. Et al., 2007), which results in high expression of EGFRvIII when administered to patients in combination with EGFR or EGFRvIII inhibitors. It is believed that the efficacy can be improved while reducing the patient's resistance to chemotherapy.
  • EGFRvIII is usually expressed concurrently with EGFR wild-type (WT) in brain tumors (Ekstrand et al., 1991), and EGFRvIII itself is expressed in tumors in which the EGFR gene is amplified (Biernat et al., 2004, Frederick et al. , 2000), individual cancer cells are thought to interact by simultaneously performing EGFRwt amplification and EGFRvIII expression.
  • WT EGFR wild-type
  • EGFRvIII is expressed at a relatively high frequency in brain tumors, but other studies require further study. Recent studies using brain tumor cell lines transformed to express EGFRvIII have revealed that networks using EGFRvIII and EGFR wt are likely to be mutually active (Shia Q. et al., PNAS, 2012). Such interactions between EGFRvIII and EGFRwt need to be reconfirmed using EGFRvIII, which is naturally expressed through xenografts models, GBM spheroid lines or other cell lines.
  • (brain) tumor therapeutics that are being developed targeting EGFRvIII can be divided into five categories.
  • the first method is to prevent the internal signaling of EGFRwt and EGFRvIII by using the existing EGFR therapeutics, and the second is to use external antibodies and receptors by using antibodies that simultaneously target EGFR and EGFRvIII, such as ABT-806 (mAb806, ABOT).
  • the third method is to develop an anti-EGFRvIII antibody in the form of an antibody drug conjugate (ADC), as shown in AMG-595, which is being developed by Amgen, and the fourth is CAR-T (Chimeric It can be used as a cell immunotherapy agent in the form of antigen receptor-T cell).
  • ADC antibody drug conjugate
  • the EGFRvIII specific 14 amino acid sequence is conjugated to KLH (Keyhole limpet hemocyanin) and administered with EGFRvIII anticancer vaccine.
  • KLH Keyhole limpet hemocyanin
  • Anticancer drugs targeting only EGFRvIII, but not EGFR, are currently not commercialized, and as shown in FIG. 6, the leading in clinical development is the EGFRvIII vaccine CDX-110 being developed by Celldex Therapeutics.
  • the inventors of the present application have produced novel antibodies that specifically bind to EGFRvIII.
  • the novel antibody can be produced that binds only to EGFRvIII without binding to EGFRvIII without cross-reaction with EGFRwt, and specifically binds to EGFRvIII.
  • An object of the present invention is a novel antibody that specifically binds to EGFRvIII, a nucleic acid encoding the antibody, a vector comprising the nucleic acid, a host cell, a method for preparing the same, and a pharmaceutical for treating cancer or tumors comprising the antibody as an active ingredient. It is to provide a composition.
  • the present invention relates to an antibody that does not cross reactive to wild type EGFR but specifically binds to the 1-13th amino acid region of the amino acid sequence of the epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) represented by SEQ ID NO: 1. .
  • the present invention relates to a nucleic acid encoding the antibody.
  • the present invention relates to a vector comprising the nucleic acid.
  • the present invention relates to a host cell comprising the vector.
  • the present invention relates to a method for producing an antibody comprising the step of culturing the host cell to express the antibody.
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition for treating cancer or tumor comprising the antibody as an active ingredient.
  • the present invention relates to a method for treating cancer or tumors, wherein said antibody is administered to a subject in need thereof in a pharmacologically effective amount.
  • Figure 2 shows the development of known antagonists targeting EGFR receptor.
  • Figure 3 is a schematic diagram showing the structure of EGFR and EGFR mutants of recombinant form.
  • FIG. 4 is a schematic diagram showing the signal transduction flow according to the activation of EGFRvIII.
  • FIG. 5 shows a list of clinically developing EGFRvIII targeting therapeutic candidates obtained at www.clinicaltrials.gov.
  • 6A shows Western blot results showing receptor expression of CHOK1-EGFRvIII single cell lines.
  • 6B shows Western blot results showing receptor expression of U87MG-EGFRvIII single cell line.
  • Figure 7 shows the bead panning monophagy ELISA results for peptides containing the EGFRvIII specific sequence used to select EGFRvIII antibody.
  • Figure 9a is a result of confirming the IgG obtained by processing in a non-reducing buffer through SDS-PAGE.
  • Figure 9b is a result of confirming the IgG obtained by treating the reducing buffer through the SDS-PAGE.
  • Figure 11 shows binding specificity of human IgG clones to EGFRvIII cell line using flow cytometry.
  • Figure 12 shows the results confirming the binding capacity of the decrease in the concentration of human IgG in the anti-EGFRvIII flow cytometry.
  • Figure 13 shows the results confirmed by ELISA binding capacity of the light chain changes of human IgG.
  • Figure 14 shows the results confirmed by the flow cytometry binding capacity of the light chain changes of human IgG.
  • 15a shows the results of internalization of anti-EGFRvIII human IgG confirmed by flow cytometry using U87 MG 13.
  • FIG. 15B shows the results of confirming the internalization of anti-EGFRvIII human IgG by flow cytometry using CHOK1 22-2.
  • the present invention relates to an antibody that does not cross-react to an EGFR wild type and specifically binds to the 1-13th amino acid region of the amino acid sequence of the epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) represented by SEQ ID NO: 1. .
  • EGFRvIII epidermal growth factor receptor variant III
  • EGFRvIII is a deletion mutant of EGFR in which 267 amino acids in the extracellular domain of EGFR are deleted with a single amino acid substitution of glycine at the junction, having the sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • the antibody was prepared using a peptide comprising EGFRvIII peptide specific sequence 13mer as an antigen.
  • the antibody according to the present invention may specifically bind to a sequence represented by SEQ ID NO: 2 LEEKKGNYVVTDHCSGGKN (N is biotin) including an EGFRvIII peptide specific sequence 13mer, a linker of 4mer, and biotin.
  • a peptide having a sequence represented by TTACCDRII for example SEQ ID NO: 3 NEINPGNGHTNYNEKFKS (N is biotin), was used as a negative antigen for blocking nonspecific binding.
  • antibody refers to an immunoglobulin molecule that is immunologically reactive with a specific antigen, and refers to a protein molecule that acts as a receptor that specifically recognizes an antigen, and includes polyclonal and monoclonal antibodies as well as whole antibodies and antibody fragments. It can include both.
  • chimeric antibodies eg, humanized murine antibodies
  • bivalent or bispecific molecules eg, bispecific antibodies
  • diabodies, triabodies, and tetrabodies can be included.
  • the total antibody is a structure having two full length light chains and two full length heavy chains, each of which is linked by heavy and disulfide bonds.
  • the total antibody includes IgA, IgD, IgE, IgM and IgG, and IgG is a subtype, including IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4.
  • the antibody fragment refers to a fragment having an antigen binding function, and includes Fab, Fab ', F (ab') 2, Fv and the like.
  • the Fab has one antigen binding site in a structure having a variable region of the light and heavy chains, a constant region of the light chain, and a first constant region of the heavy chain (CH1 domain).
  • F (ab ') 2 antibodies are produced by disulfide bonds of cysteine residues in the hinge region of Fab'.
  • variable fragment refers to a minimum antibody fragment having only a heavy chain variable region and a light chain variable region.
  • Double-chain Fv (dsFv) is a disulfide bond is linked to the heavy chain variable region and light chain variable region, and short-chain Fv (scFv) is generally covalently linked to the variable region of the heavy chain and the light chain through a peptide linker.
  • Such antibody fragments can be obtained using proteolytic enzymes (e.g., the entire antibody can be restricted to papain and Fabs can be obtained and pepsin can be used to obtain F (ab ') 2 fragments).
  • Recombinant techniques e.g., DNA encoding the heavy chain or variable region thereof and DNA encoding the light chain or variable region thereof as a template, amplified by PCR using primer pairs, and encoding peptide linkers DNA and both ends are amplified by combining a pair of primers such that the heavy chain or its variable region and the light chain or its variable region, respectively.
  • Immunoglobulins have heavy and light chains and each heavy and light chain comprises a constant region and a variable region (the site is also known as a domain).
  • the variable regions of the light and heavy chains comprise three multivariable regions and four framework regions called complementarity-determining regions (hereinafter referred to as "CDRs").
  • the CDRs mainly serve to bind epitopes of antigens.
  • the CDRs of each chain are typically called CDR1, CDR2, CDR3, starting sequentially from the N-terminus and also identified by the chain in which the particular CDR is located.
  • monoclonal antibody means an antibody molecule of a single molecular composition obtained from substantially the same antibody population and may exhibit single binding specificity and affinity for a particular epitope.
  • human antibody refers to a molecule derived from human immunoglobulin, in which all of the amino acid sequences constituting the antibody including the complementarity determining region and the structural region are composed of the amino acid sequence of human immunoglobulin.
  • Human antibodies are commonly used in the treatment of human diseases, i) better interacting with the human immune system, such as complement-dependent cytotoxicity (CDC) or antibody-dependent cellular cells
  • CDC complement-dependent cytotoxicity
  • ADCC antibody-dependent cellmediated cytotoxicity
  • the human immune system does not recognize the antibody as foreign, and iii) less, less
  • the half-life in the human circulatory system is advantageous in that it is similar to naturally occurring antibodies.
  • the antibody according to the present invention is a monoclonal antibody that specifically binds to EGFRvIII, and may exhibit excellent affinity and specificity for EGFRvIII, and because it is human-derived, thus exhibiting low immunogenicity. It is suitable for the treatment of diseases such as
  • the term “antibody that specifically binds to EGFRvIII” refers to an antibody that binds to EGFRvIII and results in inhibition of biological activity of EGFRvIII, and may be used in combination with an anti-EGFRvIII antibody.
  • K D for the EGFRvIII may be, for example, 10 ⁇ 8 or less, preferably 10 ⁇ 9 or less, and more preferably 10 ⁇ 10 or less.
  • the term “does not cross-react to EGFR” may mean that antibodies that bind to EGFR wild type and antibodies that bind to EGFRvIII do not exhibit cross-reactivity to each antigen.
  • the antibody that does not cross-react to the EGFR for example, the K D of the antibody to the EGFR wild type may be, for example, 10 ⁇ 5 or more, preferably 10 ⁇ 4 or more, more preferably 10 ⁇ 3 or more
  • Antibodies that do not substantially cross-react to the EGFR may refer to antibodies that are unable to detect antibodies that bind to the EGFR wild type in a non-limiting form of standard binding assay.
  • the antibody according to the invention does not cross-react to EGFR, for example as described in detail in Example 1, and amino acids 1-13 of the amino acid sequence of EGFRvIII represented by SEQ ID NO: 1
  • Monoclonal human antibodies PA430, PD27, PD52, and PD10 that are structurally characterized and isolated to specifically bind to a region.
  • the amino acid sequences for the heavy and light chain CDRs of each antibody are as described in Tables 1 and 2 below.
  • Antibodies according to the present invention comprise, for example, the V H CDR1, 2 and 3 sequences described in Tables 1 and 2, and the V L CDR1, 2 and 3 sequences having a structurally similar V H and V L sequences mixed with V H / It can be formed and arranged in CDR1, 2 and 3 of the V L pair, and can comprise, for example, a heavy chain variable region comprising the following heavy chain CDRs:
  • a heavy chain CDR1 comprising one or more amino acid sequences selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 4-7;
  • a heavy chain CDR2 comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 8-11;
  • a heavy chain CDR3 comprising one or more amino acid sequences selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 12-15.
  • an antibody according to the invention may comprise a light chain variable region comprising the following light chain CDRs:
  • Light chain CDR1 comprising one or more amino acid sequences selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 16-19;
  • Light chain CDR2 comprising one or more amino acid sequences selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 20-23;
  • a light chain CDR3 comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 24-27.
  • the antibody according to the invention may specifically comprise an amino acid sequence of the heavy chain light region and the light chain variable region as described in Table 3 or a sequence having homology therewith:
  • the antibody according to the present invention may include, for example, a heavy chain variable region comprising a sequence having at least 80% homology with at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 28-31.
  • the antibody has at least 80% homology, preferably at least 90%, at least 95%, at least 97%, at least 98%, at least 99% homology, more preferably, with at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 28-31 100% homology, that is, the sequence of SEQ ID NOs: 29-32 may be included as a heavy chain variable region.
  • the antibody according to the present invention may comprise a light chain variable region comprising a sequence having at least 80% homology with at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 32-35.
  • the antibody has at least 80% homology, preferably at least 90%, at least 95%, at least 97%, at least 98%, at least 99% homology, more preferably, with at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 32-35 100% homology, that is, SEQ ID NOs: 33-36 may be included as a heavy chain variable region.
  • the antibody according to the present invention may include the following heavy chain variable region and light chain variable region, wherein the V H sequence and V L sequence described in Table 3 are mixed with structurally similar V H and V L sequences, It can be formed by arranging without limitation in a V H / V L pair:
  • antibodies according to the invention may comprise the following heavy chain variable regions and light chain variable regions:
  • a heavy chain variable region of SEQ ID NO: 31 and a light chain variable region of SEQ ID NO: 35 are identical to each other.
  • nucleic acid may be present in cells, cell lysates, or in partially purified form or in substantially pure form. Nucleic acids can be added to other cellular components or other contaminants, for example, by standard techniques, including alkali / SDS treatment, CsCl banding, column chromatography, agarose gel electrophoresis, and others well known in the art. When purified from a nucleic acid or protein in a cell, it is “isolated” or “substantially pure.” Nucleic acids of the invention may be, for example, DNA or RNA and may or may not include intron sequences.
  • the nucleic acid according to the present invention encodes a V H sequence and a V L sequence as set forth in Table 4, comprising a sequence encoding at least one heavy chain variable region selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 36-39 and 95
  • a light chain comprising a heavy chain variable region comprising a sequence having at least% homology and / or a light chain comprising a sequence encoding at least 95% homology with a sequence encoding at least one light chain variable region selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 40-43 It may include a variable region.
  • the antibody has at least 95% homology, preferably at least 98% homology, more preferably at least 100% homology with at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 36-39 and / or SEQ ID NOs: 40-43 Can be.
  • the present invention may include a conjugate in which a toxin, a drug, or the like is conjugated to the antibody.
  • the toxin or drug may comprise any compound as desired.
  • the toxin may be duocarmycin, calicheamicin, maytansine or auristatin, and the compound may be a known anticancer or antitumor compound such as taxol, etoposide, tenofoside, vincristine.
  • Alkylating agents eg cisplatin, anthracycline (eg doxorubicin), etc.
  • the conjugates can be prepared using linker utilization techniques available in the art.
  • the present invention may also include bispecific binding molecules in which peptides, proteins or antibodies that bind to the antibody and other antigen binding sites are combined to include two or more different binding sites.
  • bispecific binding molecules can be prepared by linking binding specific moieties using methods known in the art.
  • when the antibody is linked can be linked through the sulf-hydryl link in the C-terminal region of the heavy chain. In some cases, they may be encoded in the same vector and expressed and combined in the same host cell.
  • the present invention relates to a vector comprising the nucleic acid.
  • DNA encoding partial or full length light and heavy chains can be obtained by standard molecular biology techniques (e.g., PCR amplification or cDNA cloning using hybridomas expressing the antibody of interest). DNA can be coupled to work into transcriptional and translational control sequences and inserted into expression vectors.
  • binding to work may mean that the antibody gene is ligated into the vector such that the transcriptional and translational control sequences in the vector serve the intended function of regulating the transcription and translation of the antibody gene.
  • the expression vector and expression control sequences are chosen to be compatible with the expression host cell used.
  • the light chain gene of the antibody and the heavy chain gene of the antibody are inserted into separate vectors, or both genes are inserted into the same expression vector.
  • the antibody is inserted into the expression vector by standard methods (eg ligation of complementary restriction enzyme sites on antibody gene fragments and vectors, or blunt terminal ligation if no restriction enzyme sites are present).
  • the recombinant expression vector may encode a signal peptide that facilitates secretion of the antibody chain from the host cell.
  • the antibody chain gene can be cloned into the vector such that the signal peptide binds to the amino terminus of the antibody chain gene in frame.
  • the signal peptide may be an immunoglobulin signal peptide or a heterologous signal peptide (ie, a signal peptide derived from an immunoglobulin non-protein).
  • the recombinant expression vector has a regulatory sequence that controls the expression of the antibody chain gene in the host cell.
  • a “regulatory sequence” can include promoters, enhancers and other expression control elements (eg, polyadenylation signals) that control the transcription or translation of antibody chain genes.
  • Those skilled in the art can recognize that the design of the expression vector can vary by differently selecting regulatory sequences depending on factors such as the choice of host cell to be transformed, the expression level of the protein, and the like.
  • the present invention may also include a host cell comprising the nucleic acid or the vector.
  • the nucleic acid or the vector is transfected.
  • Many different types of techniques commonly used to introduce exogenous DNA into prokaryotic or eukaryotic host cells for “transfection”, such as electrophoresis, calcium phosphate precipitation, DEAE-dextran transfection or lipofection, etc. can be used.
  • the antibodies according to the invention can be expressed in eukaryotic cells, preferably mammalian host cells, in view of their applicability to mammalian cells.
  • Mammalian host cells suitable for expression of the antibody include Chinese Hamster Ovary (CHO) cells (including, for example, dhfr-CHO cells used with DHFR selectable markers), NSO myeloma cells, COS cells or SP2. Cells and the like.
  • CHO Chinese Hamster Ovary
  • the present invention relates to a method for producing an antibody comprising culturing a host cell to express the antibody.
  • a recombinant expression vector encoding the antibody gene is introduced into a mammalian host cell, the antibody is allowed to secrete the antibody for a period of time sufficient to allow the antibody to be expressed in the host cell, or more preferably into the culture medium in which the host cell is cultured. It can be prepared by culturing the host cell for a sufficient period of time.
  • the antibody may be prepared by biopanning using EGFRvIII comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • the expressed antibody may be purified from the host cell to be homogeneous. Separation or purification of the antibody can be carried out by separation, purification methods, such as chromatography, which are used in conventional proteins.
  • the chromatography can include, for example, affinity chromatography comprising a Protein A column, Protein G column, ion exchange chromatography or hydrophobic chromatography.
  • the antibody can be isolated and purified by further combining filtration, ultrafiltration, salting out, dialysis and the like.
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition for treating cancer or tumor, comprising the antibody as an active ingredient.
  • cancer or tumor is not particularly limited as long as it is a kind of cancer or tumor that can be treated by the antibody of the present invention, but may be, for example, breast cancer, lung cancer or anal cancer due to overexpression of EGFRvIII, and brain tumor
  • brain tumor For example, primary brain tumors (ie, occurring in the brain) and secondary or metastatic brain tumors.
  • the antibodies according to the invention may be administered in combination with other anticancer agents (ie, before, during or after chemotherapy).
  • chemotherapeutic drugs known to those skilled in the art, for example alkylating agents such as carmustine, chlorambucil, cisplatin, carboplatin, oxyplatin, procarbazine, and cyclophosphamide;
  • Antimetabolites such as fluorouracil, phloxuridine, fludarabine, gemcitabine, methotrexate and hydroxyurea
  • Natural products such as plant alkaloids or antibiotics such as bleomycin, doxorubicin, daunorubicin, idarubicin, etoposide, mitomycin, mitoxantrone, vinblastine, vincristine, and taxol (paclitaxel) Or related compounds such as Taxotere®;
  • Therapeutic agents such as temozolomide or carmustine containing Gliadel® wafers for the treatment of brain tumor
  • EGF receptor antagonist drugs such as monoclonal antibodies, such as Herceptin TM against the HER2 antigen, Avastin TM against VEGF, antibodies against the EGF receptor, such as Erbitux® ), And other EGF receptor antagonist drugs.
  • the pharmaceutical composition may be formulated to include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • pharmaceutically acceptable carrier refers to a carrier or diluent that does not irritate an organism and does not inhibit the biological activity and properties of the administered compound.
  • Acceptable pharmaceutical carriers in compositions formulated as liquid solutions are sterile and physiologically compatible, including saline, sterile water, Ringer's solution, buffered saline, albumin injectable solutions, dextrose solution, maltodextrin solution, glycerol, ethanol and One or more of these components may be mixed and used, and other conventional additives such as antioxidants, buffers and bacteriostatic agents may be added as necessary.
  • diluents may be additionally added to formulate injectable formulations, pills, capsules, granules or tablets such as aqueous solutions, suspensions, emulsions and the like.
  • the pharmaceutical composition may be in various oral or parenteral formulations. When formulated, it may be prepared using diluents or excipients such as fillers, extenders, binders, wetting agents, disintegrating agents, surfactants, etc. which are commonly used. Solid form preparations for oral administration include tablets, pills, powders, granules, capsules, and the like, which form at least one excipient such as starch, calcium carbonate, sucrose or lactose (at least one compound). lactose), gelatin and the like can be mixed. In addition to simple excipients, lubricants such as magnesium stearate, talc and the like can also be used.
  • lubricants such as magnesium stearate, talc and the like can also be used.
  • Liquid preparations for oral administration include suspensions, liquid solutions, emulsions, and syrups, and various excipients such as wetting agents, sweeteners, fragrances, and preservatives, in addition to commonly used simple diluents such as water and liquid paraffin, may be included. have.
  • Formulations for parenteral administration may include sterile aqueous solutions, non-aqueous solvents, suspensions, emulsions, lyophilized preparations, suppositories.
  • non-aqueous solvent and the suspension solvent propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oil such as olive oil, injectable ester such as ethyl oleate, and the like can be used.
  • base of the suppository witepsol, macrogol, tween, cacao butter, laurin butter, glycerogelatin and the like may be used.
  • the pharmaceutical composition is any one selected from the group consisting of tablets, pills, powders, granules, capsules, suspensions, liquid solutions, emulsions, syrups, sterile aqueous solutions, non-aqueous solutions, suspensions, emulsions, lyophilized preparations and suppositories. It may have a formulation of. It may also be single or multiple doses. At this time, the composition may be administered in the form of a liquid, powder, aerosol, capsule, enteric skin tablets or capsules or suppositories. Routes of administration include, but are not limited to, intraperitoneal, intravenous, intramuscular, subcutaneous, endothelial, oral, topical, nasal, pulmonary, rectal, and the like. However, upon oral administration, the peptide is digested and must be formulated to coat the active agent or protect it from degradation in the stomach. In addition, the active agent may be administered by any device that can migrate to the target cell.
  • composition may be administered in a therapeutically effective amount, and “therapeutically effective amount” may mean an amount sufficient to treat the disease at a reasonable benefit / risk ratio applicable to medical treatment.
  • Effective dose levels may be determined by the type of subject and its severity, age, sex, type of cancer, activity of the drug, sensitivity to the drug, time of administration, route of administration and rate of release, duration of treatment, factors including concurrently used drugs and other medical fields. It can be determined according to well known factors. Usually 0.1 to 5 mg / kg, for example 1, 2, 3 or 4 mg / kg, but can be administered at a high dose of 10 mg / kg or 15 or 20 mg / kg. In fixed unit doses, for example 50, 100, 200, 500 or 1000 mg.
  • Is administered in 1 to 8 doses eg, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 8 to cause regression of the cancer or tumor or more preferably to remove the tumor, but 10 , 20 or more.
  • doses eg, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 8
  • it can be administered twice a week, weekly, biweekly, monthly, or at other intervals for one week, two weeks, four weeks, eight weeks, three to six months, or longer.
  • Genes of EGFRvIII including HindIII and XbaI restriction sites were obtained using DNA synthesis (Invitrogen, SEQ ID NO: 1) and cleaved using HindIII and XbaI restriction enzymes.
  • the cleaved template DNA was cloned into the expression vector pcDNA3.1 cleaved by HindIII and XbaI restriction enzyme to combine pcDNA3.1-EGFRvIII.
  • pcDNA3.1-EGFRvIII was transformed into DH5 ⁇ Escherichia coli cells to select ampicillin resistant strains.
  • the EGFRvIII gene was inserted by cleavage by HindIII and XbaI restriction enzymes.
  • the pcDNA3.1-EGFRvIII vector prepared to prepare the EGFRvIII cell line was transfected with Lipofectamine 2000 against CHOK1, U87MG, and A431, and the cells were incubated for 48 hours in 10% FBS and DMEM.
  • the cultured cells were cultured in 1:10 dilution in DMEM or RPMI added with 10% FBS 1000 ⁇ g / ml, 400 ⁇ g / ml, 400 ⁇ g / ml G418, and then colonized cells were selected and grown in 6-well.
  • the cells were lysed for 12 days and lysed and then subjected to Western blot, the cells were treated with anti-EGFR antibody and anti-human IgG HRP and reacted with ECL substrate (FIGS. 6A and 6B).
  • the EGFRvIII peptide used as the antigen was synthesized to include the specific sequence 13mer and 4mer and biotin used as the linker (SEQ ID NO: 2).
  • Biotin-TTACCDRII peptide was also synthesized (SEQ ID NO: 3) as a negative antigen to block nonspecific binding.
  • Each peptide was prepared by conjugating 7.8ng of peptide per 5ul using M-280 streptavidin (Invitrogen. USA) bead.
  • Human antibody phage library induced non-specific phage antibody binding by reacting TTACCDRII peptide conjugated to bead at 25 ° C. for 30 minutes in advance. Then, the TTACCDRII peptide bound to the bead was grasped using a magnetic bar, and only the supernatant was taken separately. The supernatant was added to the bead conjugated EGFRvIII peptide and reacted for 2 hours at 25 ° C. to induce binding of antibody phage. The magnetic bar was used to hold the EGFRvIII peptide bound to the bead, and the phage supernatant was removed.
  • the neutralized phage eluate was added to 10 ml of mid-log XL1-Blue Escherichia coli cell line and reacted for 30 minutes at 37 ° C to induce infection.
  • Infected XL1-Blue Escherichia coli cell line was spread on 2 ⁇ YT / C plates containing 1% glucose and incubated at 30 ° C. for 16 hours.
  • the first panning, the second panning and the third panning were performed in the same manner.
  • Example 3 Selection of phage antibodies that specifically bind to EGFRvIII
  • E. coli clones were randomly selected from the completed panning, incubated with a medium of 500ul 2xYT / C, incubated in a mid-log at 37 ° C and 300rpm in 96well plates, followed by the addition of M13 helperphage. Phage infection was induced for 30 minutes at 37 ° C. Infected E. coli clones were incubated for 15 hours at 30 ° C. and 30 rpm to prepare for phage-antibody eluting. Cells of the cultured E. coli clones were centrifuged at 6000 rpm for 10 minutes to remove the cells and only supernatant was obtained.
  • CHOK1 22-2 the CHOK1-EGFRvIII cell line prepared in Example 1, and A431 expressing the parent cells CHOK1 and EGFR wildtype, were washed with PBS and washed with 1% SDS, 1 mM Na3VO3, 10 mM Tris (pH7.4), and 1 mM PMSF. It was dissolved using an elution buffer of 10 uM Leupeptin, 1.5 uM pepstein and 10 ⁇ g / ml aprotinin. After lysing the lysate of each cell by 6% SDS-PAGE, 15 ⁇ g of protein was transferred to the PVDF membrane.
  • Block 1 hour with 3% skim milk TBST then treat 5 ⁇ 10 10 pfu PA430 phage, PD54 phage for 1 hour, followed by anti-M13-HRP (Horse Radish Peroxidase) antibody (GE) 1: 24000 After dilution in TBST, color development was performed using ECL (GE healthcare, USA) substrate for 1 hour, and the blots were confirmed by Odyssey Fc imaging system (Licor, USA).
  • ECL GE healthcare, USA
  • Conversion to the IgG form was obtained by double cleavage with a sfiI restriction enzyme containing a variable heavy chain of phage-antibody, and fragment fragmentation by double cleavage of sfiI restriction enzyme with pIgGHD-6A6Hvy, a vector containing a heavy chain region. It was. Fragments were obtained by double cleavage with a BstX I restriction enzyme comprising the variable light chain of the phage-antibody and ligated with the fragments in the same manner as pIgGLD-6A6Lgt, a vector comprising the light chain region. 0109417).
  • IgG The expression of IgG was inoculated with HEK293T cells inoculated with 8 ⁇ 10 6 cells per 100 mm cell culture dish and left in a 37 ° C. CO 2 5% incubator for 24 hours to incubate the cell adhesion and density to 80-90%.
  • 10 ⁇ g of the heavy chain expression vector, 10 ⁇ g of the light chain expression vector, and 20 ⁇ g of the prepared IgG were mixed with PEI at a ratio of 1: 3 (DNA: PEI) ⁇ g to react for 15 minutes to form a complex.
  • the obtained supernatant was injected into a protein A column (GE healthcare, USA) equilibrated with 20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 5 mM EDTA pH 7.0, 50 mM Tris-HCl (pH 7.0) and 5 mM EDTA, 500 mM NaCl, 0.2 After washing with a solution of% Polysorbate 20, affinity chromatography eluted with 50 mM NaCl, 0.1 M glycine-HCl (pH 3.5) solution and neutralized with 1 M Tris. The eluted protein was packed on a MWCO 10,000 spectra / por dialysis membrane (spectrum, USA) and replaced with a solution of PBS dialysis.
  • each antibody was treated in Non-reducing or Reducing LDS sample buffer (Invitrogen, USA) through SDS-PAGE and loaded onto Nupage 4-12% Bis-Tris Gel (Invitrogen, USA).
  • IgG was obtained which included a heavy chain of 50 kDA and a light chain of 25 kDa and was equivalent to 150 kDa.
  • ELISA was performed to confirm the antigen specific binding capacity of the clones converted to IgG.
  • EGFRvIII peptide, TTACCDRII peptide, and BSA were coated on 1 ⁇ g / ml 96well plate for 2 hours at 37 ° C.
  • 1 ⁇ g / ml IgG was added to the plate and reacted at 37 ° C. for 1 hour, and the anti-human IgG HRP (pierce, USA) was diluted 1: 3000.
  • the reaction was carried out for 1 hour.
  • the reaction was stopped by developing TMB substrate (BD, USA) for 10 minutes and treating with 2N H 2 SO 4 .
  • the developed ELISA was measured for absorbance at 450nm-650nm using Sunrise ELISA reader (TECAN, Switzerland).
  • fluorescence staining flow cytometry was performed to confirm whether the four antibodies were maintained in the EGFRvIII expression cell line.
  • the subjects were CHOK1 22-2, an EGFRvIII expressing cell line, CHOK1, a parent cell, and A431 expressing EGFR wildtype.
  • Each cell was obtained with a cell number of 1 ⁇ 10 6 , diluted with 1 ⁇ g / ml of each antibody in PBS with 2% FBS, added to the cells, and reacted for 1 hour at 4 ° C., anti-human IgG PE (Bethyl, USA ) Was diluted 1: 200 and reacted at 4 ° C. for 45 minutes to fluoresce.
  • Each sample measured 1 ⁇ 10 4 cells per sample using a FACS Caliber (BD, USA) instrument.
  • PA431, PD27, and PD10 showed binding ability to CHOK1 22-2, an EGFRvIII expressing cell line, and showed no binding ability to CHOK1 and A431, EGFRvIII non-expressing cell lines. In addition, no binding was observed in A431, a cell expressing the EGFR wild type.
  • the concentration of the antibody was prepared up to 31 ng / ml by diluting sequentially with 1000 ng / ml. Fluorescent staining flow cytometry was performed in the same order as listed above.
  • the light chain was modified to enhance the antigen-specific affinity of PA430. Examining the CDRs of the variable light chains of PA430, PD52, and PD27, it can be seen that they are similar to the sequences of the variable light chains of PA430, which had high antigen specific affinity (see Table 1-3). Using this point, in addition to the original light chain of PA430, the light chain chain vectors of PD52, PD27, and PD10 were mixed with the heavy chain vector of PA430 to transfect to produce IgG, which is the same as in Example 5.
  • Example 6 The fluorescence staining flow cytometry of Example 6 was performed on PA430, 430H52L, 430H27L, and PD10 IgG in the same manner, and the EGFRvIII expressing cell line was constructed based on U87 MG 13 cell line and A431 cells, which were made of EGFRvIII expressing cell line based on U87MG cell.
  • A431 16-3 cell line was added, 430H52L and 430H27L were found to maintain their binding ability even in EGFRvIII-specific cell lines.
  • 430H52L was observed that the binding signal is superior to the same concentrations compared to PA430 having a circular light chain (Fig. 14).
  • Reaction was carried out. After centrifugation and washing with 4 ° C. PBS, 0.1M Glycine and 0.5M NaCl pH 2.2 were repeated three times for 10 minutes to remove the antibody bound to EGFRvIII on the cell surface. After centrifugation, washing with PBS was performed at 4 ° C. for 10 minutes using 4% paraformaldehyde (USB, USA). Each sample was allowed to penetrate 0.1% triton-100 (sigma Aldrich, USA) PBS solution by reacting 4 °C 10 minutes, or treated with 2% FBS PBS solution to prevent permeation.
  • FIGS. 15A and 15B The results are shown in FIGS. 15A and 15B, respectively.
  • 15A and 15B when 430H52L antibody was treated to U87 MG 13 or CHOK1 22-2 cells, which are EGFRvIII expressing cell lines, and fluoresceined by permeablization through a temperature and time-dependent reaction, compared to 4 ° C. The signal was observed to increase with increasing time at 37 ° C.
  • non-permeablized fluorescence staining was performed without cell permeation as a control, there was no increase in signal with increasing temperature and time. This is evidenced by the fluorescence signal that 430H52L IgG binds to EGFRvIII and its internalization increased with time at 37 ° C.
  • the antibody specifically binding to EGFRvIII according to the present invention is a novel antibody which binds only to EGFRvIII without binding to wild-type EGFR (EGFRwt), and shows excellent binding ability in cells expressing EGFRvIII, and it has been confirmed that internalization occurs. Can act as an effective antagonist targeting EGFRvIII. Based on this, the antibody specifically binding to EGFRvIII according to the present invention can be usefully used for the treatment of diseases induced by the expression of EGFRvIII.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

본 발명은 EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III)에 특이적으로 결합하는 항체, 상기 항체를 코딩하는 핵산, 상기 핵산을 포함하는 벡터, 숙주세포, 상기 항체의 제조방법 및 상기 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.

Description

신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물
본 발명은 EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III)에 특이적으로 결합하는 항체, 상기 항체를 코딩하는 핵산, 상기 핵산을 포함하는 벡터, 숙주세포, 상기 항체의 제조방법 및 상기 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
EGFR (Epidermal growth factor receptor; ErbB-1; HER1 in humans)은 Vanderbilt 대학의 Stanley Cohen에 의해 발견된 세포표면에 발현하는 ErbB계열의 타이로신 카이네이즈 수용체(RTK)로써 이 수용체의 과 발현 또는 활성화 변이는 암화작용을 한다(Zhang H. et al, 2007). EGFR 계열의 수용체들(EGFR (ErbB-1), HER2/c-neu (ErbB-2), Her 3 (ErbB-3) and Her 4 (ErbB-4))은 EGF, TGF-?등의 리간드에 반응하여(Her2의 경우는 알려진 리간드가 없음) 동형(homo) 또는 이형(hetero)의 이합체를 만들어 활성화 신호를 세포 내로 전달한다.
이합체 형성으로 인해 그림과 같은 자가인산화(Downward J. et al., 1984)를 통해 MAPK, Akt 또는 JNK를 경유하는 신호를 전달하여, 세포주기나, 세포증식을 활성화한다(Oda K. et al., 2005). EGFR의 각 도메인과 인산화 부위는 도 1에 도시된 바와 같다.
이러한, 종양 관련 EGFR의 활성화를 억제하기 위한 다양한 치료요법들이 등장하여 현재 강력한 항암효과를 보이고 있으며, 치료요법에 따른 부작용, 내성 등 단점을 보완하기 위해 새로운 형태의 EGFR 길항제들이 개발되고 있다. 현재 개발 진행 중인 EGFR 길항제에 대한 구체적 내용은 도 2에 기재된 바와 같다.
EGFR 의 과량발현 및 돌연변이는 폐암, 항문암, 뇌종양(GBM, glioblastoma multiforme)등에서 다양한 형태로 나타나는데, EGFRvIII 돌연변이의 경우 뇌종양에서 종종 발견되어, 수술, 방사능요법, 화합요법을 통한 치료 후 좋지 않은 예후를 반영한다(Kuan CT et al., 2003). 재조합 형태의 EGFR 돌연변이체들은 특정 엑손(exon)의 삭제(deletion)나 중복(duplication)을 가지고 있다. EGFR과 재조합 형태의 EGFR 돌연변이체들은 도 3에 나타낸 바와 같다.
EGFRvIII는 2번부터 7번까지의 엑손 내의 아미노산이 결핍되어있는 가장 자주 나타나는 서열번호 1의 EGFR 변이체이며, 말기 뇌종양 환자로부터 50% 이상이 발현된다. EGFRvIII는 EGFRwt의 아미노산 서열 중 267 아미노산을 결핍하고 있으며, 1번과 8번 엑손이 결합되며 새로운 아미노산인 글라이신이 생성되고, 세포 내 도메인의 인산화를 유도하여 지속적인 활성을 나타내어 암화 과정에 기여하게 된다(Downward J et al., 1984). 물론, 다른 형태의 EGFR도 타겟팅이 가능하지만, 현재로서는 EGFRvIII가 항암 표적으로서 가장 적당한 EGFR 변이체로 여겨지며, 다수의 연구 개발이 진행 중에 있다.
특히, 뇌종양에서 EGFRvIII의 주로 PI3K와 AKT를 경유하는 주요 신호전달 경로에 의하여 세포신호를 전달하며, 비주류 경로로 Stat-3, AP-1 또는 MAPK의 활성화를 통하여, 암세포의 증식, 세포사멸에 대한 저항성, 신생혈관형성, 암세포의 침투 증가, 암줄기세포 형성 등에 기여한다(Gan HK, et al., 2013). 최근 연구에서는 EGFRvIII가 mTORC2를 경유하여 NF-κB 를 활성화하여 암화 작용에 중요한 역할을 담당한다는 보고가 있다(Bonavia et al., 2012; Tanaka et al., 2011). EGFRvIII의 활성화에 따른 신호 전달 경로는 도 4에 나타낸 바와 같다.
또한, EGFRvIII에 의해서 c-Met 인산화에 이은 활성화가 유도되므로(Huang PH. et al., 2007), EGFR 또는 EGFRvIII 저해제와 함께 c-Met 저해제를 병합하여 환자에 적용 투여할 경우 EGFRvIII를 고발현하는 환자의 화학요법에 대한 저항성을 경감시키면서 효능을 향상시킬 수 있을 것으로 판단된다.
EGFRvIII는 뇌종양에서 보통 EGFR wild-type (WT)과 동시에 발현하며(Ekstrand et al., 1991), EGFRvIII 자체는 EGFR 유전자가 증폭된 종양에서 발현되기 때문에 (Biernat et al., 2004, Frederick et al., 2000), 개개의 암세포들은 EGFRwt 증폭과 EGFRvIII의 발현을 동시에 수행하여 상호작용을 할 것으로 생각되어졌다.
EGFRvIII은 뇌종양에서 비교적 높은 빈도로 발현되지만, 다른 암종에서는 추가 연구가 필요하다. EGFRvIII를 발현하도록 형질전환된 뇌종양 세포주를 이용한 최근 연구에서는 EGFRvIII과 EGFR wt을 사용하는 네트워크가 확실히 상호간 활성화될 가능성이 있음이 밝혀졌다(Shia Q. et al., PNAS, 2012). 이와 같은 EGFRvIII, EGFRwt 간의 상호작용은 이종이식(xenografts) 모델, GBM 스페로이드(spheroid lines)나 여타의 다른 세포주를 통해서 자연적으로 발현되는 EGFRvIII를 이용하여 재차 확인할 필요가 있다.
EGFR이 EGFRvIII를 인산화하여 STAT3/5 활성화 경로를 주도하여, 뇌종양의 진행에 큰 영향을 준다는 보고도 있으며(Fan QW et al., 2013), EGFRvIII 이합체 형성이 신호전달의 활성화에 큰 영향을 주는데, EGFRwt의 발현이 증가할수록 EGFRvIII의 인산화와 활성화를 증대시키므로, EGFRwt의 이합체형성을 이루는 팔(dimerization arm)과 카이네이즈 활성이 EGFRvIII의 활성화에 기여한다고 생각되며, 정위이식(orthotopic) 모델에서 EGFRwt또는 HB-EGF의 발현을 억제하였을 때, EGFRvIII에 의해 유도된 암화를 억제한다는 결과(Li L. et al., 2014)로 부터, EGFRwt을 둘러싸고 있는 활성화 경로가 EGFRvIII 의 활성화를 경유한 종양형성에 매우 중요한 역할을 수행한다고 할 수 있다.
현재, EGFRvIII를 타겟하여 개발되고 있는 (뇌)종양 치료제는 다섯 가지 범주로 나눌 수 있다. 첫번째는 기존의 EGFR 치료제를 이용하여, EGFRwt 및 EGFRvIII의 내부 신호전달을 막는 방법, 두번째는 ABT-806(mAb806, 애봇)와 같이 EGFR과 EGFRvIII를 동시에 타겟팅하는 항체를 이용하여 외부 신호전달과 수용체들간의 상호작용을 억제하는 방법, 세번째는, 암젠(Amgen)에서 개발중인 AMG-595에서 보듯이, anti-EGFRvIII 항체를 ADC(antibody drug conjugate) 형태로 개발 중인 것이 있고, 네번째는 CAR-T(Chimeric antigen receptor-T cell) 형태로 세포 면역 치료제로 사용할 수 있다. 다섯번째는 EGFRvIII 특이적인 14개의 아미노산서열을 KLH(Keyhole limpet hemocyanin)에 접합하여, EGFRvIII 항암 백신으로 투여하는 방법이다. EGFR이 아닌, EGFRvIII만을 타겟팅하는 항암 치료제는 현재 상품화 된 예가 없으며, 도 6에 나타낸 바와 같이 임상개발에 있어 가장 선두에 있는 것이 셀덱스(Celldex Therapeutics)에서 개발중인 EGFRvIII 백신 CDX-110이다.
이러한 기술적 배경하에서, 본 출원의 발명자들은 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 신규 항체를 제조하였다. 특히, EGFRwt에 교차반응(cross reactive)을 하지 않고, EGFRvIII에 특이적으로 결합하도록 제작하여, EGFRwt에는 결합하지 않고 EGFRvIII에만 결합하는 신규 항체를 제조할 수 있음을 확인하고, 본 발명을 완성하였다.
발명의 요약
본 발명의 목적은 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 신규 항체, 상기 항체를 코딩하는 핵산, 상기 핵산을 포함하는 벡터, 숙주세포, 이의 제조방법 및 상기 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명은 야생형 EGFR에 교차반응(cross reactive)하지 않고, 서열번호 1로 표시되는 EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III)의 아미노산 서열 중 1-13번째 아미노산 영역에 특이적으로 결합하는 항체에 관한 것이다.
본 발명은 상기 항체를 코딩하는 핵산에 관한 것이다.
본 발명은 상기 핵산을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
본 발명은 상기 벡터를 포함하는 숙주세포에 관한 것이다.
본 발명은 상기 숙주세포를 배양하여 항체를 발현시키는 단계를 포함하는 항체의 제조방법에 관한 것이다.
본 발명은 상기 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
본 발명은 상기 항체를 약리학적 유효량으로 필요한 개체에 투여하는 암 또는 종양 치료 방법에 관한 것이다.
도 1은 EGFR의 각 도메인과 인산화 부위를 나타낸 것이다.
도 2는 EGFR 수용체를 타겟팅하는 공지의 길항체의 개발 진행 상황을 나타낸 것이다.
도 3은 EGFR과 재조합 형태의 EGFR 돌연변이체들의 구조를 나타낸 모식도이다.
도 4는 EGFRvIII의 활성화에 따른 신호 전달 흐름을 나타내는 모식도이다.
도 5는 www.clinicaltrials.gov에서 입수된, 임상 개발중인 EGFRvIII 타겟팅 치료제 후보 리스트를 나타낸 것이다.
도 6a는 CHOK1-EGFRvIII 단일 세포주의 수용체 발현을 보여주는 웨스턴 블랏 결과를 나타낸 것이다.
도 6b는 U87MG-EGFRvIII 단일 세포주의 수용체 발현을 보여주는 웨스턴 블랏 결과를 나타낸 것이다.
도 7은 EGFRvIII 항체를 선별하기 위해 사용된 EGFRvIII 특이서열을 포함하는 peptide에 대한 비드 패닝 모노파지 ELISA 결과를 나타낸 것이다.
도 8은 bead panning에 의해 선별된 단일 파지-항체의 항원 특이적 결합능을 확인하는 웨스턴 블랏 결과를 나타낸 것이다.
도 9a는 SDS-PAGE를 통해 non-reducing 버퍼에 처리하여 획득한 IgG를 확인하는 결과이다.
도 9b는 SDS-PAGE를 통해 reducing 버퍼에 처리하여 획득한 IgG를 확인하는 결과이다.
도 10은 ELISA를 이용하여 인간 IgG 클론의 항 EGFRvIII-peptide 결합을 확인한 것이다.
도 11은 유세포 분석법을 이용하여 인간 IgG 클론의 EGFRvIII 세포주에 대한 결합 특이성을 나타낸 것이다.
도 12는 항-EGFRvIII 유세포 분석법에서 인간 IgG의 농도 저하가 미치는 결합능을 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 13은 인간 IgG의 경쇄사슬 변화에 따른 결합능을 ELISA로 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 14는 인간 IgG의 경쇄사슬 변화에 따른 결합능을 유세포 분석법으로 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 15a는 항 EGFRvIII 인간 IgG의 내재화를 U87 MG 13을 이용하여 유세포 분석법으로 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 15b는 항 EGFRvIII 인간 IgG의 내재화를 CHOK1 22-2를 이용하여 유세포 분석법으로 확인한 결과를 나타낸 것이다.
발명의 상세한 설명 및 바람직한 구현예
본 발명은 일 관점에서, EGFR 야생형에 교차반응하지 않고, 서열번호 1로 표시되는 EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III)의 아미노산 서열 중 1-13번째 아미노산 영역에 특이적으로 결합하는 항체에 관한 것이다. 각 구성에 대한 구체적 설명은 다음과 같다.
항원 EGFRvIII
위에서 논의한 바와 같이, EGFRvⅢ는 EGFR의 세포외 도메인에서 267 아미노산이 접합부에서 글리신의 단일 아미노산 치환과 함께 결실되어 있는 EGFR의 결실 돌연변이체로, 서열번호 1로 표시되는 서열을 가진다.
본 출원의 발명자들은 EGFR 야생형에 교차반응하지 않으면서 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 항체를 제작하고자, EGFRvIII 펩타이드 특이서열 13mer를 포함하는 펩타이드를 항원으로 사용하여 항체를 제작하였다. 본 발명에 따른 항체는 구체적으로, EGFRvIII 펩타이드 특이서열 13mer, 4mer의 링커 및 비오틴이 포함된 서열번호 2 LEEKKGNYVVTDHCSGGKN (N은 비오틴)로 표시되는 서열에 특이적으로 결합할 수 있다. 동시에, 비특이적 결합을 차단하기 위한 negative 항원으로 TTACCDRII, 예를 들어 서열번호 3 NEINPGNGHTNYNEKFKS (N은 비오틴)으로 표시되는 서열을 가지는 펩타이드를 이용하였다. 이를 통해, EGFR 야생형에 교차반응하지 않으면서도, EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 항체를 제작하였다.
항체
본 명세서에서 사용되는 "항체"는 특정 항원과 면역학적으로 반응성인 면역글로블린 분자로, 항원을 특이적으로 인식하는 수용체 역할을 하는 단백질 분자를 의미하며, 다클론 및 단클론 항체와 전체 항체 및 항체 단편을 모두 포함할 수 있다. 또한, 키메라성 항체(예를 들면, 인간화 뮤린 항체) 및 이가 (bivalent) 또는 양특이성 분자 (예를 들어, 양특이성 항체), 디아바디, 트리아바디 및 테트라바디를 포함할 수 있다.
전체 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 구조이며, 각각의 경쇄는 중쇄와 다이설파이드 결합으로 연결되어 있다. 상기 전체 항체는 IgA, IgD, IgE, IgM 및 IgG를 포함하며, IgG는 아형 (subtype)으로, IgG1, IgG2, IgG3 및 IgG4를 포함한다. 상기 항체 단편은 항원결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, Fab', F(ab')2 및 Fv 등을 포함한다.
상기 Fab는 경쇄 및 중쇄의 가변영역과 경쇄의 불변 영역 및 중쇄의 첫 번째 불변 영역(CH1 도메인)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C 말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다.
상기 Fv(variable fragment)는 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위만을 가지고 있는 최소의 항체조각을 의미한다. 이중쇄Fv(dsFv)는 디설파이드 결합으로 중쇄 가변부위와 경쇄 가변부위가 연결되어 있고 단쇄 Fv(scFv)는 일반적으로 펩타이드 링커를 통하여 중쇄의 가변 영역과 경쇄의 가변 영역이 공유 결합으로 연결되어 있다. 이러한 항체 단편은 단백질 가수분해 효소를 이용해서 얻을 수 있고 (예를 들어, 전체 항체를 파파인으로 제한 절단하며 Fab를 얻을 수 있고 펩신으로 절단하면 F(ab')2 단편을 얻을 수 있다), 유전자 재조합 기술 (예를 들어, 항체의 중쇄 또는 이의 가변영역을 코딩하는 DNA 및 경쇄 또는 이의 가변영역을 코딩하는 DNA를 주형으로 하고, 프라이머쌍을 이용하여 PCR법에 의해 증폭시키고, 펩티드 링커를 코딩하는 DNA와 양 말단이 각각 중쇄 또는 이의 가변영역 및 경쇄 또는 이의 가변영역과 연결되도록 하는 프라이머쌍을 조합하여 증폭)을 통하여 제작할 수 있다.
면역글로불린은 중쇄 및 경쇄를 가지며 각각의 중쇄 및 경쇄는 불변 영역 및 가변 영역(상기 부위는 도메인으로 또한 알려져 있음)을 포함한다. 경쇄 및 중쇄의 가변 영역은, 상보성 결정 영역 (complementarity-determining region, 이하 "CDR"이라 함)이라 불리우는 3개의 다변가능한 영역 및 4개의 구조 영역(framework region)을 포함한다. 상기 CDR은 주로 항원의 에피토프(epitope)에 결합하는 역할을 한다. 각각의 사슬의 CDR은 전형적으로 N-말단으로부터 시작하여 순차적으로 CDR1, CDR2, CDR3로 불리우고, 또한 특정 CDR이 위치하고 있는 사슬에 의해서 식별된다.
본 명세서에서 사용하는 “단클론항체”는 실질적으로 동일한 항체 집단에서 수득한 단일 분자 조성의 항체 분자를 의미하고, 특정 에피토프에 대해 단일 결합 특이성 및 친화도를 나타낼 수 있다.
본 명세서에서 사용하는 “인간항체”는 인간 면역글로불린으로부터 유래하는 분자로서, 상보성 결정영역, 구조 영역을 포함한 항체를 구성하는 모든 아미노산 서열 전체가 인간 면역글로불린의 아미노산 서열로 구성되어 있는 것을 의미한다. 인간 항체는 통상적으로 인간의 질병의 치료에 사용되는데, i) 인간 면역 체계와 보다 양호하게 상호작용하여, 예를 들어 보체-의존성 세포독성 (complement-dependent cytotoxicity, CDC) 또는 항체-의존성 세포성 세포독성(antibody-dependent cellmediated cytotoxicity, ADCC)에 의하여 목적 세포를 보다 효율적으로 파괴시킬 수 있다는 점, ii) 인간 면역 체계가 상기 항체를 외래의 것으로 인식하지 않는다는 점, 및 iii) 더 적은 양, 보다 적은 빈도의 약물을 투여하였을 때에도 인간 순환계 내 반감기가 천연 발생 항체와 유사하다는 점에서 장점이다.
이를 고려하여, 본 발명에 따른 항체는 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 단클론항체로 EGFRvIII에 대한 우수한 친화도 및 특이도를 나타낼 수 있을 뿐 아니라, 인간 유래이기 때문에 낮은 면역원성을 나타내므로, 암 또는 종양과 같은 질병의 치료에 있어 적합하다.
본 명세서에서 사용되는 용어 “EGFRvⅢ에 특이적으로 결합하는 항체”는 EGFRvⅢ에 결합하여 EGFRvⅢ의 생물학적 활성의 억제를 초래하는 항체를 의미하며, 항-EGFRvⅢ 항체와 혼용하여 사용할 수 있다. 이 때, 상기 EGFRvⅢ에 대한 KD는 예를 들어, 10-8 이하, 바람직하게 10-9 이하, 더욱 바람직하게 10-10 이하일 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어 “EGFR에 교차반응하지 않음”은 EGFR 야생형에 결합하는 항체 및 EGFRvⅢ에 결합하는 항체가 각 항원에 대하여 교차반응성을 나타내지 않음을 의미할 수 있다. 이 때, 상기 EGFR에 교차반응하지 않는 항체는 예를 들어 EGFR 야생형에 대한 항체의 KD가 예를 들어, 10-5 이상, 바람직하게 10-4 이상, 더욱 바람직하게 10-3 이상일 수 있으며, 실질적으로 상기 EGFR에 교차반응하지 않는 항체는 제한되지 않는 형태의 표준 결합 분석에서 EGFR 야생형에 결합하는 항체를 검출할 수 없는 항체를 의미할 수 있다.
하나의 실시예에서, 본 발명에 따른 항체는 예를 들어, 실시예 1에 상세하게 기술된 바와 같이, EGFR에 교차반응하지 않고, 서열번호 1로 표시되는 EGFRvIII의 아미노산 서열 중 1-13번째 아미노산 영역에 특이적으로 결합하도록 구조적으로 특성화되어 분리된 단클론 인간항체 PA430, PD27, PD52 및 PD10일 수 있다. 각 항체의 중쇄 CDR, 경쇄 CDR에 대한 아미노산 서열은 다음 표 1 및 2에 기재된 바와 같다.
표 1
Figure PCTKR2014011381-appb-T000001
표 2
Figure PCTKR2014011381-appb-T000002
본 발명에 따른 항체는 예를 들어, 표 1 및 2에 기술된 VH CDR1, 2 및 3 서열과 VL CDR1, 2 및 3 서열은 구조적으로 유사한 VH 및 VL 서열이 혼합되어 VH/VL 쌍의 CDR1, 2 및 3로 배치되어 형성될 수 있으며, 예를 들어 다음의 중쇄 CDR을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함할 수 있다:
서열번호 4-7로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
서열번호 8-11로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2; 및
서열번호 12-15으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3.
또한, 본 발명에 따른 항체는 다음의 경쇄 CDR을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있다:
서열번호 16-19로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
서열번호 20-23로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
서열번호 24-27로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3.
하나의 실시예에서, 본 발명에 따른 항체는 구체적으로, 다음 표 3에 기재된 바와 같은 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역의 아미노산 서열 또는 이와 상동성을 가지는 서열을 포함할 수 있다:
표 3
Figure PCTKR2014011381-appb-T000003
본 발명에 따른 항체는 예를 들어, 예를 들어 다음의 서열번호 28-31로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함할 수 있다. 상기 항체는 서열번호 28-31로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성, 바람직하게 90% 이상, 95% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상의 상동성, 더욱 바람직하게 100%의 상동성 즉, 서열번호 29-32의 서열을 중쇄 가변 영역으로 포함할 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 항체는 서열번호 32-35로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있다. 상기 항체는 서열번호 32-35로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성, 바람직하게 90% 이상, 95% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상의 상동성, 더욱 바람직하게 100%의 상동성 즉, 서열번호 33-36을 중쇄 가변 영역으로 포함할 수 있다.
구체적으로, 본 발명에 따른 항체는 다음의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있으며, 표 3에 기술된 VH 서열과 VL 서열은 구조적으로 유사한 VH 및 VL 서열이 혼합되어, VH/VL 쌍으로 제한없이 배치되어 형성될 수 있다:
서열번호 28의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32-35으로 이루어진 군에서 선택된 서열의 경쇄 가변 영역;
서열번호 29의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32-35으로 이루어진 군에서 선택된 서열의 경쇄 가변 영역;
서열번호 30의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32-35으로 이루어진 군에서 선택된 서열의 경쇄 가변 영역;
서열번호 31의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32-35으로 이루어진 군에서 선택된 서열의 경쇄 가변 영역.
특히, 본 발명에 따른 항체는 다음의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있다:
서열번호 28의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32의 경쇄 가변 영역;
서열번호 29의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 33의 경쇄 가변 영역;
서열번호 30의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 34의 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 31의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 35의 경쇄 가변 영역.
본 발명은 다른 관점에서, 상기 항체를 코딩하는 핵산에 관한 것이다. 본 명세서에서 사용되는 “핵산”은 세포, 세포 용해물 (lysate) 중에 존재하거나, 또는 부분적으로 정제된 형태 또는 실질적으로 순수한 형태로 존재할 수도 있다. 핵산은 알칼리/SDS 처리, CsCl 밴드화 (banding), 컬럼 크로마토그래피, 아가로스 겔 전기 영동 및 당업계에 잘 알려진 기타의 것을 포함하는 표준 기술에 의해 다른 세포 성분 또는 기타 오염 물질, 예를 들어 다른 세포의 핵산 또는 단백질로부터 정제되어 나올 경우 "단리"되거나 "실질적으로 순수하게 되는" 것이다. 본 발명의 핵산은 예를 들어 DNA 또는 RNA일 수 있으며 인트론 서열을 포함하거나 포함하지 않을 수 있다.
하나의 실시예에서, 본 발명에 따른 핵산은 표 4에 기술된 VH 서열과 VL 서열을 코딩하는 것으로, 서열번호 36-39로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 가변 영역을 코딩하는 서열과 95% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함 및/또는 서열번호 40-43으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 가변 영역을 코딩하는 서열과 95% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함할 수 있다. 상기 항체는 서열번호 36-39 및/또는 서열번호 40-43으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 95% 이상의 상동성, 바람직하게 98% 이상의 상동성, 더욱 바람직하게 100%의 상동성을 가질 수 있다.
표 4
Figure PCTKR2014011381-appb-T000004
본 발명은 상기 항체에 독소, 약물 등이 접합된 접합체를 포함할 수 있다. 상기 독소 또는 약물은 목적하는 바에 따른 임의의 화합물을 포함할 수 있다. 상기 독소의 예시로는 듀오카마이신, 칼리케아마이신, 마이탄신 또는 아우리스타틴일 수 있으며, 상기 화합물은 공지의 항암 또는 항종양 화합물 예를 들어, 탁솔, 에토포시드, 테노포시드, 빈크리스틴, 독소루비신 등, 알킬화제 (예를 들어 시스플라틴, 안트라시클린 (예를 들어 독소루비신) 등일 수 있다. 상기 접합체는 당업계에서 이용가능한 링커 이용 기술을 사용하여 제조될 수 있다.
또한, 본 발명은 상기 항체 이외에도, 상기 항체와 다른 항원 결합 부위에 결합하는 펩티드, 단백질 또는 항체가 결합되어, 2개 이상의 상이한 결합 부위를 포함하는 이특이성 (bispecific) 결합 분자를 포함할 수 있다. 상기 이특이성 결합 분자는 당업계에 공지된 방법을 사용하여 결합 특이적 부분을 연결함으로써 제조할 수 있다. 또한, 항체가 연결되는 경우 중쇄의 C 말단 영역에서 sulf-hydryl link를 통하여 연결될 수 있다. 경우에 따라서, 동일한 벡터에서 코딩되고 동일한 숙주세포에서 발현되어 조합되도록 할 수 있다.
항체의 제조방법
본 발명은 다른 관점에서, 상기 핵산을 포함하는 벡터에 관한 것이다. 항체 또는 그의 항체 단편의 발현을 위하여, 부분적이거나 전장인 경쇄 및 중쇄를 코딩하는 DNA를 표준 분자 생물학 기술 (예를 들어 PCR 증폭 또는 목적 항체를 발현하는 하이브리도마를 사용한 cDNA 클로닝)로 수득할 수 있으며, DNA가 전사 및 번역 제어 서열에 작동되도록 결합되어 발현 벡터 내로 삽입될 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 “작동되도록 결합”은 벡터 내의 전사 및 번역 제어 서열이 항체 유전자의 전사 및 번역을 조절하는 의도된 기능을 하도록 항체 유전자가 벡터 내로 라이게이션된다는 것을 의미할 수 있다. 발현 벡터 및 발현 제어 서열은 사용되는 발현용 숙주세포와 상용성 있도록 선택된다. 항체의 경쇄 유전자 및 항체의 중쇄 유전자는 별개의 벡터 내로 삽입되거나, 두 유전자 모두 동일한 발현 벡터 내로 삽입된다. 항체는 표준 방법 (예를 들어 항체 유전자 단편 및 벡터 상의 상보성 제한 효소 부위의 라이게이션, 또는 제한 효소 부위가 전혀 존재하지 않을 경우 블런트 (blunt) 말단 라이게이션)으로 발현 벡터 내로 삽입된다. 경우에 따라서, 상기 재조합 발현 벡터는 숙주세포로부터의 항체 사슬의 분비를 용이하게 하는 신호 펩티드를 코딩할 수 있다. 항체 사슬 유전자는 신호 펩티드가 프레임에 맞게 항체 사슬 유전자의 아미노 말단에 결합되도록 벡터 내로 클로닝될 수 있다. 신호 펩티드는 면역글로불린 신호 펩티드 또는 이종성 신호 펩티드 (즉, 면역글로불린 외 단백질 유래의 신호 펩티드)일 수 있다. 또한, 상기 재조합 발현 벡터는 숙주세포에서 항체 사슬 유전자의 발현을 제어하는 조절 서열을 지닌다. "조절서열"은 항체 사슬 유전자의 전사 또는 번역을 제어하는 프로모터, 인핸서 및 기타 발현 제어 요소 (예를 들어 폴리아데닐화 신호)를 포함할 수 있다. 당업자는 형질전환시킬 숙주세포의 선택, 단백질의 발현 수준 등과 같은 인자에 따라 조절 서열을 달리 선택하여, 발현 벡터의 디자인이 달라질 수 있음을 인식할 수 있다.
본 발명은 또한, 상기 핵산 또는 상기 벡터를 포함하는 숙주세포를 포함할 수 있다. 상기 핵산 또는 상기 벡터는 트랜스펙션된다. “트랜스펙션”시키기 위해 원핵 또는 진핵 숙주세포 내로 외인성 DNA를 도입하는 데에 통상 사용되는 여러 종류의 다양한 기술, 예를 들어 전기 영동법, 인산칼슘 침전법, DEAE-덱스트란 트랜스펙션 또는 lipofection 등을 사용할 수 있다. 본 발명에 따른 항체는 포유류 세포에의 적용 가능성을 고려하여, 진핵 세포, 바람직하게는 포유류 숙주세포에서 발현될 수 있다. 상기 항체의 발현에 적합한 포유류 숙주세포는 중국 햄스터 난소 (Chinese Hamster Ovary, CHO) 세포 (예를 들어 DHFR 선발 가능한 마커와 함께 사용되는 dhfr- CHO 세포를 포함함), NSO 골수종 세포, COS 세포 또는 SP2 세포 등을 예시할 수 있다.
본 발명은 다른 관점에서, 숙주세포를 배양하여 항체를 발현시키는 단계를 포함하는 항체의 제조방법에 관한 것이다. 상기 항체 유전자를 코딩하는 재조합 발현 벡터가 포유류 숙주세포 내로 도입될 경우 항체는 숙주세포에서 항체가 발현되게 하기에 충분한 기간 동안, 또는 더 바람직하게는 숙주세포가 배양되는 배양 배지 내로 항체가 분비되게 하기에 충분한 기간 동안 숙주세포를 배양함으로써 제조될 수 있다. 또한, 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 EGFRvIII을 사용하여 바이오패닝 (biopanning)하는 단계를 포함하여 항체를 제조할 수도 있다.
경우에 따라서, 발현된 항체는 숙주세포로부터 분리하여 균일하도록 정제할 수 있다. 상기 항체의 분리 또는 정제는 통상의 단백질에서 사용되고 있는 분리, 정제 방법, 예를 들어 크로마토그래피에 의해 수행될 수 있다. 상기 크로마토그래피는 예를 들어, 프로틴 A 컬럼, 프로틴 G 컬럼을 포함하는 친화성 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피 또는 소수성 크로마토그래피를 포함할 수 있다. 상기 크로마토그래피 이외에, 추가로 여과, 초여과, 염석, 투석 등을 조합함으로써 항체를 분리, 정제할 수 있다
의약 조성물
본 발명은 다른 관점에서, 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
본 명세서에서 사용되는 "암 또는 종양"은 본 발명의 항체에 의하여 치료될 수 있는 암 또는 종양의 종류라면 특별히 제한되지 않으나, 예를 들어 EGFRvIII의 과발현에 의한 유방암, 폐암 또는 항문암일 수 있고, 뇌종양 예를 들어, 원발성 뇌종양 (즉, 뇌에서 발생) 및 속발성 또는 전이성 뇌종양일 수 있다.
경우에 따라서, 본 발명에 따른 항체는 기타 항암제와 병용 (즉, 항암 치료전, 치료 동안 또는 치료후) 하여 투여될 수 있다. 당업자에게 공지된 임의의 하나 이상의 화학요법 약물, 예를 들어 알킬화제, 예를들어 카르무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, 카르보플라틴, 옥시플라틴, 프로카르바진, 및 시클로포스파미드; 항대사물질, 예를 들어 플루오로우라실, 플록스우리딘, 플루다라빈, 젬시타빈, 메토트렉세이트 및 히드록시우레아; 천연 생성물, 예를들어 식물 알칼로이드 또는 항생제, 예를 들어 블레오마이신, 독소루비신, 다우노루비신, 이다루비신, 에토포시드, 미토마이신, 미톡산트론, 빈블라스틴, 빈크리스틴, 및 탁솔 (파클리탁셀) 또는 관련 화합물, 예를 들어 탁소테레 (Taxotere®); 뇌종양 치료에 치료제, 예를 들어 테모졸로미드 또는 카르무스틴 함유 글리아델 (Gliadel®) 웨이퍼; 및 기타 약물, 예를 들어 이리노테칸 및 글리벡 등과 병용하여 투여될 수 있다. 이외에도, 기타 생물학적 약제, 예를들어 모노클로날 항체, 예를들어 HER2 항원에 대한 허셉틴 (Herceptin™), VEGF에 대한 아바스틴 (Avastin™), EGF 수용체에 대한 항체, 예를들어 어비툭스 (Erbitux®), 기타 EGF 수용체 길항 약물을 포함할 수 있다.
상기 약학 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하여 제제화될 수 있다. 상기 “약학적으로 허용가능한 담체”는 생물체를 자극하지 않고 투여 화합물의 생물학적 활성 및 특성을 저해하지 않는 담체 또는 희석제를 말한다. 액상 용액으로 제제화되는 조성물에 있어서 허용되는 약학적 담체로는, 멸균 및 생체에 적합한 것으로서, 식염수, 멸균수, 링거액, 완충 식염수, 알부민 주사용액, 덱스트로즈 용액, 말토 덱스트린 용액, 글리세롤, 에탄올 및 이들 성분 중 1 성분 이상을 혼합하여 사용할 수 있으며, 필요에 따라 항산화제, 완충액, 정균제 등 다른 통상의 첨가제를 첨가할 수 있다. 또한, 희석제, 분산제, 계면활성제, 결합제 및 윤활제를 부가적으로 첨가하여 수용액, 현탁액, 유탁액 등과 같은 주사용 제형, 환약, 캡슐, 과립 또는 정제로 제제화할 수 있다.
상기 약학 조성물은 경구 또는 비경구의 여러 가지 제형일 수 있다. 제제화할 경우에는 보통 사용하는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제될 수 있다. 경구투여를 위한 고형제제에는 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제 등이 포함되며, 이러한 고형제제는 하나 이상의 화합물에 적어도 하나 이상의 부형제 예를 들면, 전분, 탄산칼슘, 수크로오스(sucrose) 또는 락토오스(lactose), 젤라틴 등을 섞어 조제될 수 있다. 또한 단순한 부형제 이외에 스테아린산 마그네슘, 탈크 등과 같은 윤활제들도 사용될 수 있다. 경구투여를 위한 액상제제로는 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제 등이 해당되는데 흔히 사용되는 단순 희석제인 물, 리퀴드 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등이 포함될 수 있다.
비경구투여를 위한 제제에는 멸균된 수용액, 비수성용제, 현탁제, 유제, 동결건조제제, 좌제가 포함될 수 있다. 비수성용제, 현탁용제로는 프로필렌글리콜(propylene glycol), 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 기름, 에틸올레이트와 같은 주사 가능한 에스테로 등이 사용될 수 있다. 좌제의 기제로는 위텝솔(witepsol), 마크로골, 트윈(tween), 카카오지, 라우린지, 글리세로젤라틴 등이 사용될 수 있다.
상기 약학 조성물은 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제, 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제, 멸균된 수용액, 비수성용제, 현탁제, 유제, 동결건조제제 및 좌제으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 제형을 가질 수 있다. 또한, 단일 또는 다중 투여될 수 있다. 이 때, 조성물은 액제, 산제, 에어로졸, 캡슐제, 장용피 정제 또는 캡슐제 또는 좌제의 형태로 투여할 수 있다. 투여 경로는 복강 내 투여, 정맥 내 투여, 근육 내 투여, 피하 내 투여, 내피 투여, 경구 투여, 국소 투여, 비 내 투여, 폐 내 투여, 직장 내 투여 등을 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. 그러나 경구 투여시, 펩타이드는 소화가 되기 때문에 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한, 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
상기 조성물은 치료적 유효량으로 투여될 수 있으며, “치료적 유효량”은 의학적 치료에 적용 가능한 합리적인 수혜/위험 비율로 질환을 치료하기에 충분한 양을 의미할 수 있다. 유효 용량 수준은 개체 종류 및 중증도, 연령, 성별, 암의 종류, 약물의 활성, 약물에 대한 민감도, 투여 시간, 투여 경로 및 배출 비율, 치료기간, 동시 사용되는 약물을 포함한 요소 및 기타 의학 분야에 잘 알려진 요소에 따라 결정될 수 있다. 보통 0.1 내지 5 mg/kg, 예를 들어 1, 2, 3 또는 4 mg/kg이나, 10 mg/kg 또는 15 또는 20 mg/kg의 높은 용량으로 투여될 수 있다. 고정된 단위 용량으로, 예를 들어 50, 100, 200, 500 또는 1000 mg으로 제공될 수 있다. 암 또는 종양의 퇴행을 야기시키거나, 더욱 바람직하게는 종양을 제거하기 위해 1 내지 8회의 투여 (예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8)로 투여되나, 10, 20 또는 그 이상으로 투여될 수 있다. 항체의 반감기를 기초로, 1주일에 2회, 매주, 격주, 매월 또는 기타 간격으로 1주, 2주, 4주, 8주, 3-6개월 또는 그 이상 동안 투여될 수 있다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1: EGFRvIII 세포주의 확립
HindIII와 XbaI 제한효소자리를 포함하는 EGFRvIII의 유전자를 DNA합성(Invitrogen, 서열번호 1)을 이용하여 획득하고 HindIII와 XbaI 제한효소를 이용하여 절단하였다. 절단된 주형 DNA는 HindIII와 XbaI 제한효소에 절단된 발현 벡터 pcDNA3.1에 클로닝 하여 pcDNA3.1-EGFRvIII를 조합하였다. pcDNA3.1-EGFRvIII는 DH5α 대장균 세포에 트랜스포메이션(transformation)하여 앰피실린(ampicillin) 저항성이 있는 균주를 선별하였다. HindIII와 XbaI 제한효소에 의해 절단되어 EGFRvIII유전자의 삽입여부를 확인하였다.
EGFRvIII 세포주를 제작하기 위하여 제조된 pcDNA3.1-EGFRvIII벡터를 CHOK1, U87MG, A431에 대하여 Lipofectamine 2000을 이용하여 트랜스펙션 시키고, 세포는 10% FBS, DMEM에서 48시간 배양하였다. 배양된 세포는 1:10 dilution하여 10%FBS 1000μg/ml, 400μg/ml, 400μg/ml의 G418이 첨가된 DMEM 또는 RPMI에서 배양된 후, 콜로니화되는 세포를 선택하여 6-well에서 증식하였다. 12일 동안 증식된 각 세포들을 용해시켜 전기영동 후 웨스턴블랏을 수행할 때, 항-EGFR 항체와 항-인간 IgG HRP로 처리하고 ECL기질로 반응하였다 (도 6a 및 도 6b).
실시예 2: 바이오패닝
항원으로 사용되는 EGFRvIII peptide는 특이서열 13mer와 linker로 사용되는 4mer 및 biotin이 포함되도록 합성 (서열번호 2)하였다. 비특이적 결합을 차단하기 위한 negative 항원으로 biotin-TTACCDRII peptide도 합성 (서열번호 3)하였다. 각 peptide는 M-280 streptavidin (Invitrogen. USA) bead를 이용하여 5ul당 7.8ng의 peptide가 접합되도록 제조하였다.
인간 항체 파지 라이브러리는 bead에 접합 시킨 TTACCDRII peptide에 미리 25℃ 30분간 반응 하여 비특이적 파지 항체가 결합되도록 유도하였다. 그 후 magnetic bar를 이용하여 bead에 결합된 TTACCDRII peptide를 잡고, 상등액만 따로 취하였다. 상등액은 다시 bead에 접합시킨 EGFRvIII peptide에 첨가하여 25℃ 2시간 반응하여 항체파지의 결합이 일어나도록 반응하였다. Magnetic bar를 이용하여 bead에 결합된 EGFRvIII peptide를 잡고, 파지 상등액은 제거하였다. Magnetic bar에 당겨진 Bead EGFRvIII peptide는 PBST (0.1% Tween 20을 포함하는 PBS)로 5회 반복 세척하고 마지막으로 PBS를 이용하여 1회 세척하였다. 100ul의 100mM 트리에틸아민 용액을 10분간 반응 시켜 항원에 결합된 파지가 용출될수 있도록 하고, 용출된 파지는 50ul의 1M 트리스 pH7.5에 의해 중화시켰다.
중화된 파지 용출액은 10ml의 미드 로그(mid-log)기 XL1-Blue 대장균 세포주에 첨가되어 37℃에서 30분간 반응 하여 감염되도록 유도하였다. 감염된 XL1-Blue 대장균 세포주는 1% glucose가 함유된 2xYT/C 플레이트에 스프레딩 하여 30℃ 16시간 배양하였다. 1차 패닝과 2차, 3차 패닝은 동일한 방법으로 진행 하였다.
실시예 3: EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 파지항체의 선별
완료된 패닝으로부터 무작위로 E.coli 클론을 선별하여 500ul 2xYT/C 의 배지를 첨가하여 96well 플레이트에서 37℃ 300rpm에서 미드 로그(mid-log)기로 배양 시킨 후, M13 헬퍼파지(helperphage)를 첨가한 다음 37℃ 30분간 파지의 감염을 유도하였다. 감염된 E.coli 클론은 30℃ 30rpm의 조건으로 15시간 배양되어 파지-항체가 용출되도록 준비하였다. 배양된 E.coli클론의 세포들은 6000rpm 10분간 원심분리하여 세포는 제거하고 상등액만 획득하였다.
EGFRvIII peptide, TTACCDRII peptide, BSA를 1μg/ml로 Maxisorb 96well ELISA 플레이트 (Nunc, Denmark)에 코팅하고, 실온에서 1시간 동안 3% 탈지우유/PBS로 먼저 차단시킨 다음, 획득된 상등액을 접종하여 1시간 실온에서 반응 시켰다. 상기 ELISA 플레이트는 PBST 0.05%로 3회 세척 후, 항-M13-HRP(Horse Radish Peroxidase) 항체 (GE)를 1:300 PBST 0.05%에 희석하여 1시간, TMB 기질 (BD, USA)을 10분 처리 하여 발색시킨 후 2N H2SO4를 처리하여 반응을 중지시켰다. 발색된 ELISA는 Sunrise ELISA reader (TECAN, Switzerland)기를 이용하여 450nm-650nm에서 흡광도를 측정하였다 (도 7).
실시예 4: 웨스턴 블랏
파지-항체에 의해 EGFRvIII 결합능을 CHOK1-EGFRvIII 세포 용해물을 이용한 웨스턴블랏으로 관찰하였다.
실시예 1에서 제조된 CHOK1-EGFRvIII 세포주인 CHOK1 22-2와 이에 대한 모세포인 CHOK1 및 EGFR wildtype을 발현하는 A431을 PBS로 세척하고 1% SDS, 1mM Na3VO3, 10mM Tris (pH7.4), 1mM PMSF, 10uM Leupeptin, 1.5uM pepstein, 10μg/ml aprotinin의 용출버퍼를 이용하여 용해시켰다. 6% SDS-PAGE로 각 세포의 용해물을 15μg씩 분리한 후, PVDF membrane으로 단백질을 전이시켰다. 3% 탈지우유 TBST로 1시간 block한 다음, 5×1010 pfu의 PA430 파지, PD54 파지를 처리하여 1시간, 그 다음으로 항-M13-HRP(Horse Radish Peroxidase) 항체 (GE)를 1:24000 TBST에 희석하여 1시간, ECL (GE healthcare, USA)기질을 이용하여 발색 시킨 후 Odyssey Fc 이미징 시스템 (Licor, USA)으로 블랏을 확인하였다.
그 결과를 도 8에 나타내었으며, 도 8을 참조하면 PA430 파지와 PD54 파지는 EGFRvIII를 발현하는 세포주에서만 결합함을 알 수 있었다.
실시예 5: IgG 발현 및 정제
IgG 형태로의 전환은 파지-항체의 가변 중쇄 사슬을 포함하는 sfiI 제한효소로 이중 절단하여 단편을 취득하고, 중쇄 영역을 포함하는 벡터인 pIgGHD-6A6Hvy에 sfiI 제한효소를 이중절단 하여 단편과 라이게이션하였다. 파지-항체의 가변 경쇄 사슬을 포함하는 BstX I 제한효소로 이중 절단하여 단편을 취득하고, 경쇄 영역을 포함하는 벡터인 pIgGLD-6A6Lgt에 마찬가지로 단편과 라이게이션하였다 (위 방법은 특허출원공개 제 2008-0109417호 참조).
IgG의 발현은 HEK293T세포를 100mm 세포배양 디쉬당 8×106세포를 접종하여 37℃ CO2 5% 배양기에서 24시간 방치하도록 하여 세포의 부착 및 밀도가 80~90%가 되도록 배양하였다. 제작된 IgG 의 중쇄 발현벡터 10μg과 경쇄 발현벡터 10μg, 총 20μg의 벡터는 1:3(DNA:PEI)μg의 비율로 PEI와 혼합하여 15분간 반응하여 복합체를 형성 되도록 하였다. 배양된 세포에 DNA PEI복합체를 첨가하여 10시간 동안 반응한 후, DMEM으로 1회 세척 후 Freestyle 293 (GIBCO, USA)에 10% penicillin streptomycin (GIBCO, USA)이 첨가된 배지 10ml을 첨가하여 48시간 방치하고 IgG가 발현된 상등액을 취하도록 하였다.
획득된 상등액은 20mM Tris-HCl, 50mM NaCl, 5mM EDTA pH7.0으로 평형화시킨 protein A 컬럼(GE healthcare, USA)에 주입하고, 50mM Tris-HCl(pH7.0)과 5mM EDTA, 500mM NaCl, 0.2% Polysorbate 20의 용액으로 세척한 후, 50mM NaCl, 0.1M glycine-HCl (pH 3.5) 용액으로 용출하고 1M Tris로 중화 하는 친화력 크로마토그래피를 실시 하였다. 용출된 단백질은 MWCO 10,000 spectra/por dialysis membrane(spectrum, USA)에 팩킹하여, PBS 투석하여 용액을 교체하였다.
그 결과를 도 9a 및 9b에 도시하였다. 도 9a 및 9b를 참조하면, SDS-PAGE를 통해 각 항체를 Non-reducing 또는 Reducing LDS sample buffer (Invitrogen, USA)에 처리하여 Nupage 4~12% Bis-Tris Gel (Invitrogen, USA)에 Loading하였을시 50kDA의 중쇄 사슬 및 25kDa의 경쇄 사슬을 포함하고 150kDa에 준하는 IgG를 획득하였다.
실시예 6: EGFR vIII에 특이적으로 결합하는 IgG의 선별
IgG로 전환된 클론들의 항원 특이적 결합력을 확인하기 위해 ELISA를 수행하였다. EGFRvIII peptide와 TTACCDRII peptide, BSA를 각각 1μg/ml 96well 플레이트에 37℃에서 2시간 반응시켜 코팅하였다. 이후 3% 탈지우유/PBST 0.05%로 코팅되지 않은 부분을 차단시킨 후, 1μg/ml의 IgG를 플레이트에 첨가하여 37℃에서 1시간 반응하였고 항 인간 IgG HRP (pierce, USA)를 1:3000 희석하여 1시간 반응하였다. 다음으로 TMB 기질 (BD, USA)을 10분 처리 하여 발색시킨 후 2N H2SO4를 처리하여 반응을 중지시켰다. 발색된 ELISA는 Sunrise ELISA reader (TECAN, Switzerland)기를 이용하여 450nm-650nm에서 흡광도를 측정하였다.
그 결과를 도 10에 나타내었으며, 도 10을 참조하면 PA430, PD27, PD52, PD10은 비특이적 결합없이, EGFRvIII peptide에서만 특이적인 결합능이 있음을 보였다.
이러한 결과를 바탕으로 상기의 항체 4종을 대상으로 EGFRvIII 발현 세포주에서 결합력을 유지하는지 확인하고자 형광 염색 유세포 분석법을 실시하였다. EGFRvIII 발현 세포주인 CHOK1 22-2와 이에 대한 모세포인 CHOK1 그리고 EGFR wildtype을 발현하는 A431을 그 대상으로 하였다. 각 세포는 1×106의 세포수로 획득하고, 2% FBS가 첨가된 PBS에 각 항체를 1μg/ml로 희석하여 세포에 첨가하여 4℃ 1시간 반응하고, 항 인간 IgG PE (Bethyl, USA)를 1:200 희석하여 4℃ 45분간 반응 시켜 형광 염색하였다. 각 샘플은 FACS Caliber (BD, USA)기기를 이용하여 샘플당 1×104개의 세포를 측정하였다.
그 결과를 도 11에 나타내었다. 도 11을 참조하면, PA431, PD27, PD10은 EGFRvIII 발현세포주인 CHOK1 22-2에 결합능을 보였고 EGFRvIII 비발현 세포주인 CHOK1과 A431에서는 결합능이 없는 것으로 보였다. 또한, EGFR wild type을 발현하는 세포인 A431에서도 결합이 이루어지지 않음을 보였다.
EGFRvIII 발현 세포주에 결합능을 보이는 항체 3종이 항체 농도의 저하에 따라 미치는 결합특성을 확인하기 위해 아래와 같이 실시하였다. 항체의 농도는 1000ng/ml을 시작으로 2배씩 차순 희석하여 31ng/ml까지 준비하였다. 형광 염색 유세포 분석법은 상기에 열거된 순으로 동일하게 실시하였다.
그 결과를 도 12에 나타내었으며, 도 12를 참조하면 PA430은 PD27과 PD10에 비하여 같은 농도의 IgG를 처리함에도 높은 결합능을 보임이 관찰되었다.
실시예 7: 친화도 증진을 위한 경쇄사슬의 변경
PA430의 항원 특이적 친화도 증진을 위하여 경쇄사슬의 변경해 주었다. PA430과 PD52, PD27의 가변 경쇄사슬의 CDR을 살펴보면 항원 특이적 친화도가 높았던 PA430의 가변 경쇄사슬의 서열과 유사함을 확인할 수 있다 (표 1-3 참조). 이러한 점을 이용하여 PA430의 원래 경쇄사슬 외에 PD52, PD27, PD10의 경쇄사슬 벡터를 PA430의 중쇄사슬 벡터와 혼합하여 트랜스팩션하여 IgG를 생산하였고, 이는 실시예 5와 동일하다.
생산 및 동정된 430H10L, 430H52L, 430H27L을 실시예 6의 ELISA와 동일하게 실시하였을 때, 항원특이적 결합능이 유지되었음을 확인하였다 (도 13).
PA430과 430H52L, 430H27L, PD10 IgG를 대상으로 실시예 6의 형광 염색 유세포 분석법을 동일하게 실시하고 U87MG세포를 기반으로 EGFRvIII 발현세포주로 제작된 U87 MG 13 세포주, A431세포를 기반으로 EGFRvIII 발현세포주로 제작된 A431 16-3 세포주를 추가하여 실시하였을 때 430H52L, 430H27L은 EGFRvIII 특이 세포주에서도 결합능이 유지됨을 확인하였다. 또한, 430H52L은 원형 경쇄사슬을 가진 PA430에 비해 같은 농도를 처리함에도 결합 시그널이 우수함이 관찰되었다 (도 14).
실시예 8: 형광 염색 유세포 분석법을 이용한 항체 내재화 분석
EGFRvIII 특이적 결합능을 보이는 430H52L 항체를 이용하여, 항체-EGFRvIII 결합에 의한 내재화가 이루어지는지 확인하고자 형광 염색 유세포 분석법을 실시하였다.
U87 MG 13세포와 CHOK1 22-2세포를 대상으로 2×106세포를 Trypsin EDTA 처리하여 취득한 후, 세포의 활성을 저해시키기 위해 4℃에서 30분간 cooling 하였다. DMEM 배지에 430H52L 1μg/ml을 희석하여 세포에 처리하여 4℃ 에서 30분간 항체 항원 결합을 유도하였다. 2차 항체만 처리될 샘플은 DMEM만을 처리하였다. 다음으로 1300rpm 3분간 원심분리 후 잔여 항체가 제거되도록 세포를 PBS로 세척하고 DMEM 배지를 첨가하여 4℃ 반응하는 샘플, 37℃ 15분, 37℃ 30분, 37℃ 60분 CO2 5% 인큐베이팅 샘플로 반응시켰다. 원심 분리하여 4℃ PBS로 세척한 후 0.1M Glycine, 0.5M NaCl pH 2.2를 10분간 3회 반복 처리하여 세포 표면의 EGFRvIII에 결합되어 있는 항체를 인위 제거시켰다. 원심 분리하여 PBS 세척 후 4% paraformaldehyde (USB, USA)로 10분 4℃ 고정화 작업을 하였다. 각 샘플은 0.1% triton-100(sigma Aldrich, USA) PBS 용액을 4℃ 10분 반응하여 투과 할 수 있게 만들거나, 2%FBS PBS용액을 처리하여 투과가 일어나지 않게 하였다. 원심 분리하여 PBS 세척후 2%FBS PBS를 처리하여 블로킹 하였고 항 인간 IgG PE (bethyl, USA)를 1:400 처리하여 염색하였다. 각 샘플은 FACS Caliber (BD, USA)기기를 이용하여 샘플당 1×104개의 세포를 측정하였다.
그 결과를 도 15a 및 15b에 각각 나타내었다. 도 15a 및 15b를 참조하면, EGFRvIII 발현 세포주인 U87 MG 13이나 CHOK1 22-2세포에 430H52L 항체를 처리하고 온도 및 시간별 반응을 거쳐 세포투과 (permeablization)를 이용해 형광염색을 하였을 때, 4℃에 비하여 37℃에서의 시간이 증가됨에 따라 시그널이 증가되는 것으로 관찰되었다. 대조군의 의미로 세포 투과를 거치지 않고 (Non-permeablized) 형광염색을 하였을시, 온도 및 시간의 증가에 따른 시그널의 증가는 없었다. 이는 430H52L IgG가 EGFRvIII에 결합되어 37℃의 조건에서 시간의 증가에 따라 내재화가 증가하였음을 형광 시그널로 증명한 것이다.
본 발명에 따른 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 항체는 야생형 EGFR (EGFRwt)에는 결합하지 않고 EGFRvIII에만 결합하는 신규 항체로, EGFRvIII를 발현하는 세포에서 우수한 결합능을 나타내며, 내재화(internalization)가 일어남이 확인되었으므로, EGFRvIII를 타겟으로 하는 유효한 길항제로 작용할 수 있다. 이를 바탕으로, 본 발명에 따른 EGFRvIII에 특이적으로 결합하는 항체는 EGFRvIII의 발현에 의해 유도되는 질병의 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
본 발명이 속한 분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 상기 내용을 바탕으로 본 발명의 범주내에서 다양한 응용 및 변형을 행하는 것이 가능할 것이다.
전자파일 첨부하였음.

Claims (16)

  1. EGFR에 교차반응(cross reactive)하지 않고, 서열번호 1로 표시되는 EGFRvIII (epidermal growth factor receptor variant III)의 아미노산 서열 중 1-13번째 아미노산 영역에 특이적으로 결합하는 항체.
  2. 제1항에 있어서, 서열번호 2로 표시되는 아미노산에 특이적으로 결합하는 것을 특징으로 하는 항체.
  3. 제1항에 있어서, 다음의 중쇄 CDR을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체:
    서열번호 4-7로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
    서열번호 8-11로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2; 및
    서열번호 12-15으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3.
  4. 제1항에 있어서, 다음의 경쇄 CDR을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체:
    서열번호 16-19로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
    서열번호 20-23로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
    서열번호 24-27로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3.
  5. 1항에 있어서, 서열번호 28-31로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는 특징으로 하는 항체.
  6. 제1항에 있어서, 서열번호 32-35로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 서열과 80% 이상의 상동성을 가지는 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 특징으로 하는 항체.
  7. 제1항에 있어서, 다음의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체:
    서열번호 28의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 32-35으로 이루어진 군에서 선택된 서열의 경쇄 가변 영역;
    서열번호 29의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 33의 경쇄 가변 영역;
    서열번호 30의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 34의 경쇄 가변 영역; 및
    서열번호 31의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 35의 경쇄 가변 영역.
  8. 제1항에 있어서, 인간항체인 것을 특징으로 하는 항체.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 항체를 코딩하는 핵산.
  10. 제9항에 있어서, 서열번호 36-39로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 중쇄 가변 영역을 코딩하는 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 핵산.
  11. 제9항에 있어서, 서열번호 40-43로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 경쇄 가변 영역을 코딩하는 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 핵산.
  12. 제9항의 핵산을 포함하는 벡터.
  13. 제9항의 핵산 또는 제12항의 벡터를 포함하는 숙주세포.
  14. 제13항의 숙주세포를 배양하여 항체를 발현시키는 단계를 포함하는 제1항에 따른 항체의 제조방법.
  15. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 항체를 유효성분으로 포함하는 암 또는 종양 치료용 약학 조성물.
  16. 제15항에 있어서, 상기 암 또는 종양은 폐암, 항문암 또는 뇌종양인 것을 특징으로 하는 조성물.
PCT/KR2014/011381 2014-11-25 2014-11-25 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물 WO2016084993A1 (ko)

Priority Applications (10)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ES14906712T ES2871598T3 (es) 2014-11-25 2014-11-25 Anticuerpo novedoso contra EGFRvIII y composición que comprende el mismo
CA2968510A CA2968510C (en) 2014-11-25 2014-11-25 Novel egfrviii antibody and composition comprising same
US15/528,753 US10597457B2 (en) 2014-11-25 2014-11-25 EGFRvIII antibody and composition comprising same
EP14906712.6A EP3239177B1 (en) 2014-11-25 2014-11-25 Novel egfrviii antibody and composition comprising same
JP2017528179A JP6616833B2 (ja) 2014-11-25 2014-11-25 新規EGFRvIII抗体及びこれを含む組成物
PT149067126T PT3239177T (pt) 2014-11-25 2014-11-25 Novo anticorpo egfrviii e composição compreendendo o mesmo
AU2014412643A AU2014412643B2 (en) 2014-11-25 2014-11-25 Novel EGFRvIII antibody and composition comprising same
DK14906712.6T DK3239177T3 (da) 2014-11-25 2014-11-25 Nyt egfrviii antistof og sammensætning omfattende samme
PCT/KR2014/011381 WO2016084993A1 (ko) 2014-11-25 2014-11-25 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물
CN201480084380.XA CN107108735B (zh) 2014-11-25 2014-11-25 新型egfrviii抗体和包含所述抗体的组合物

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/KR2014/011381 WO2016084993A1 (ko) 2014-11-25 2014-11-25 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2016084993A1 true WO2016084993A1 (ko) 2016-06-02

Family

ID=56074535

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/KR2014/011381 WO2016084993A1 (ko) 2014-11-25 2014-11-25 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물

Country Status (10)

Country Link
US (1) US10597457B2 (ko)
EP (1) EP3239177B1 (ko)
JP (1) JP6616833B2 (ko)
CN (1) CN107108735B (ko)
AU (1) AU2014412643B2 (ko)
CA (1) CA2968510C (ko)
DK (1) DK3239177T3 (ko)
ES (1) ES2871598T3 (ko)
PT (1) PT3239177T (ko)
WO (1) WO2016084993A1 (ko)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2021509105A (ja) * 2017-12-13 2021-03-18 エックスディーシーエクスプローラー (シャンハイ) カンパニー リミテッド EGFRvIII抗体ならびにその複合体、製造方法および使用

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019114793A1 (zh) * 2017-12-13 2019-06-20 凯惠科技发展(上海)有限公司 一种egfr抗体及其制备方法和应用
CN114014928B (zh) * 2021-10-27 2023-05-12 南京安吉生物科技有限公司 抗hmmw抗体、包含该抗体的组合物、编码该抗体的核酸分子及其用途

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6224868B1 (en) * 1994-11-28 2001-05-01 Thomas Jefferson University Reagent and processes for targeting mutant epidermal growth factor receptors
US20050222059A1 (en) * 2002-02-25 2005-10-06 Tang Careen K Egfrviii specific monoclonal antibody and egfrviii ribozymes and use to detect, treat or prevent egfrviii associated cancer
US20120115739A1 (en) * 2007-07-19 2012-05-10 Duke University ASSAY FOR ANTI-EGFRvIII ANTIBODIES
WO2013075048A1 (en) * 2011-11-16 2013-05-23 Amgen Inc. Methods of treating epidermal growth factor deletion mutant viii related disorders
KR20140024046A (ko) * 2003-06-27 2014-02-27 암젠 프레몬트 인코포레이티드 상피 성장 인자 수용체의 결실 돌연변이체 지향 항체 및 그 용도

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001062931A2 (en) * 2000-02-25 2001-08-30 The Government Of The United States, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services ANTI-EGFRvIII SCFVS WITH IMPROVED CYTOTOXICITY AND YIELD, IMMUNOTOXINS BASED THEREON, AND METHODS OF USE THEREOF
EP2335728A1 (en) * 2001-05-11 2011-06-22 Ludwig Institute for Cancer Research Ltd. Specific binding proteins and uses thereof
KR100883430B1 (ko) 2007-06-13 2009-02-12 한국생명공학연구원 혈관내피성장인자 수용체를 중화하는 인간 단클론항체 및그 용도
US9249217B2 (en) * 2010-12-03 2016-02-02 Secretary, DHHS Bispecific EGFRvIII x CD3 antibody engaging molecules
CA2832738A1 (en) * 2011-04-08 2012-10-11 Duke University Herpes simplex virus
DK3030581T3 (da) * 2013-08-07 2021-04-12 Affimed Gmbh Antistofbindingssteder, der er specifikke for egfrviii

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6224868B1 (en) * 1994-11-28 2001-05-01 Thomas Jefferson University Reagent and processes for targeting mutant epidermal growth factor receptors
US20050222059A1 (en) * 2002-02-25 2005-10-06 Tang Careen K Egfrviii specific monoclonal antibody and egfrviii ribozymes and use to detect, treat or prevent egfrviii associated cancer
KR20140024046A (ko) * 2003-06-27 2014-02-27 암젠 프레몬트 인코포레이티드 상피 성장 인자 수용체의 결실 돌연변이체 지향 항체 및 그 용도
US20120115739A1 (en) * 2007-07-19 2012-05-10 Duke University ASSAY FOR ANTI-EGFRvIII ANTIBODIES
WO2013075048A1 (en) * 2011-11-16 2013-05-23 Amgen Inc. Methods of treating epidermal growth factor deletion mutant viii related disorders

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
See also references of EP3239177A4 *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2021509105A (ja) * 2017-12-13 2021-03-18 エックスディーシーエクスプローラー (シャンハイ) カンパニー リミテッド EGFRvIII抗体ならびにその複合体、製造方法および使用
EP3753952A4 (en) * 2017-12-13 2022-04-13 XDCExplorer (Shanghai) Co., Ltd. EGFRVIII ANTIBODY AND CONJUGATE, METHOD FOR THE PREPARATION AND USE THEREOF
JP7290645B2 (ja) 2017-12-13 2023-06-13 エックスディーシーエクスプローラー (シャンハイ) カンパニー リミテッド EGFRvIII抗体ならびにその複合体、製造方法および使用

Also Published As

Publication number Publication date
US20170327585A1 (en) 2017-11-16
DK3239177T3 (da) 2021-04-26
CN107108735A (zh) 2017-08-29
EP3239177A1 (en) 2017-11-01
CA2968510A1 (en) 2016-06-02
CN107108735B (zh) 2021-05-04
ES2871598T3 (es) 2021-10-29
CA2968510C (en) 2020-11-03
AU2014412643B2 (en) 2018-08-30
JP6616833B2 (ja) 2019-12-04
PT3239177T (pt) 2021-05-14
JP2018501783A (ja) 2018-01-25
AU2014412643A1 (en) 2017-06-15
EP3239177B1 (en) 2021-03-17
US10597457B2 (en) 2020-03-24
EP3239177A4 (en) 2018-05-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2020076105A1 (ko) 신규 항-c-kit 항체
KR101916553B1 (ko) 항-her2 항체-약물 접합체
KR102527160B1 (ko) 예정 사멸 1(pd-1)에 대한 신규한 단일클론성 항체
WO2017052241A1 (en) Novel anti-mesothelin antibody and composition comprising the same
WO2020111913A1 (en) Anti-4-1bb antibody and use thereof
WO2019225777A1 (ko) 항-ror1 항체 및 그 용도
CN109069633A (zh) 新颖的b7-h3-结合分子、其抗体药物缀合物及其使用方法
KR101870145B1 (ko) 신규 EGFRvlll 항체 및 이를 포함하는 조성물
JP2008520186A (ja) 哺乳類eag1イオンチャネルタンパク質に対する新規の抗体
WO2021228141A1 (zh) 抗体药物缀合物及其制备方法和用途
CA3199566A1 (en) Anti-cd276 antibody, antibody-drug conjugate, and use thereof
WO2021107566A1 (ko) C-kit에 대한 항체 및 이의 용도
KR20200128544A (ko) Pd1 결합제
WO2016084993A1 (ko) 신규 EGFRvIII 항체 및 이를 포함하는 조성물
WO2019212253A1 (ko) C-met에 특이적으로 결합하는 항체 및 그의 용도
WO2017074013A1 (ko) 인간 및 마우스 sema3a에 교차결합하는 항체 및 그의 용도
WO2020004937A1 (ko) 항-bcma 항체-약물 접합체 및 그 용도
WO2014021693A2 (ko) Tm4sf5 단백질에 특이적으로 결합하는 신규한 단일클론항체 및 이의 용도
WO2017142294A1 (ko) EGFRvIII에 대한 항체 및 이의 용도
WO2022244908A1 (ko) 항-bcam 항체 또는 그의 항원 결합 단편
WO2024136594A1 (ko) 클라우딘-18.2에 특이적으로 결합하는 단클론항체 및 이의 용도
WO2021029746A2 (ko) 항-tie2 항체 및 이의 용도
WO2024106939A1 (ko) B7-h3에 특이적으로 결합하는 항체
WO2023182866A1 (ko) Hla-g 특이적 항체 및 이의 용도
WO2021118246A1 (en) Anti-bcma/anti-4-1bb bispecific antibodies and uses thereof

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 14906712

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2968510

Country of ref document: CA

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 15528753

Country of ref document: US

REEP Request for entry into the european phase

Ref document number: 2014906712

Country of ref document: EP

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2017528179

Country of ref document: JP

Kind code of ref document: A

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2014412643

Country of ref document: AU

Date of ref document: 20141125

Kind code of ref document: A