【명세서】
【발명의 명칭】
미생물을 이용한 D-카이로 이노시를의 생산 방법
【기술 분야】
본 발명은 미생물을 이용한 D-카이로 이노시를의 생산 방법에 관한 것이다. 보다 상세하게는 형질전환 미생물 숙주세포에 의한 마이오- 이노시를로부터 D-카이로 이노시를로의 생산 방법에 관한 것이다.
【배경 기술】
D-카이로-이노시를 (D-chi ro- inositol , cis~l,2, 4-t r ans— 3 ,5,6- cyclohexol)은 마이오一이노시를 (inyo—inositol , cis— l,2,3,5—trans—4,6— cyclohexanehexol)의 스테레오이소머로서 3번 하이드록실 그룹이 에피머화 된 형태이다 (도 1). D-카이로 -이노시를은 이노시를 포스포글리칸 (IPG)의 주요 구성성분으로 인슐린 신호전달의 중요한 매개체로 보고되어 있으며, 제 2형 당뇨의 치료에 효과가 있다고 알려져 있다. D-카이로 -이노시를은 주로 진핵생물에서 발견되며, 마이오ᅳ이노시를의 에피머화에 의해 생합성된다.
D-카이로 -이노시를은 주로 피니를 (D-pinitol)이나 카스가마이신 (kasugamycin)의 염산 가수분해에 의해 생산하고 있다 (U.S. Pat No. 5827896, U.S. Pat No. 5091596, U.S. Pat No. 5463142, U.S. Pat No.5714643). 그러나, 원료인 피니를이나 카스가마이신이 고가이며, 유기합성법 (U.S. Pat No. 5406005, W0 96/25381)도 알려져 있으나, 부산물의 분리가 용이하지 않아 경제성이 낮다.
Yamamoto 등은 Agrobacter ium sp. AB10121의 MI 에피머라제 (epimerase)를 발현시킨 세균을 이용하여 마이오-이노시를로부터 카이로 -이노시를로 전환하는 방법을 제시하였다 (JP2001-006878, W02002/055715) . Yamamoto 등에 의한 방법은 마이오ᅳ이노시를로부터 약 15% 수율로 D-카이로 -이노시틀을 생산할 수 있다.
본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.
【발명의 상세한 설명】
【기술적 과제】
본 발명자들은 미생물을 이용하여 마이오-이노시를로부터 카이로- 이노시를을 생산하고자 연구 노력하였으며 , 그 결과 , 마이오ᅳ이노시를 트랜스포터 (myo一 inositol transporter) , 이노시를 디하이드로게나아제 (inositol dehydrogenase) 및 이노시를 이소머라아제 (inositol isomer ase) "^- ¾i지" § ΐ¾ "ᄒ ΗΞ" ᅫ;2:¾" 발현백터로 형질전환된 숙주세포를 이용하면 마이오-이노시를로부터 으 카이로 -이노시를을 높은 수율로 생산할 수 있음을 확인하여 본 발명을 완성하였다.
따라서, 본 발명의 목적은 형질전환 숙주세포를 이용하여 마이오- 이노시를로부터 D-카이로ᅳ이노시를을 생산하는 방법을 제공하는 데에 있다. 본 발명의 다른 목적은 마이오—이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제를 발현하는 형질전환 숙주세포를 제공하는 데에 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 형질전환 숙주세포를 포함하는 D- 카이로-이노시를 생산용 조성물을 제공하는 데에 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 마이오-이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제를 코딩하는 DNA 서열을 갖는 재조합 백터를 포함하는 D-카이로ᅳ이노시를 생산용 키트를 제공하는 데에 있다. 본 발명의 목적 및 장점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구의 범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.
【기술적 해결방법】
본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 다음의 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이오-이노시를 (myo— inositol)로부터 으카이로- 이노시를 (D-chiro-inositol)을 생산하는 방법을 제공한다: (a) (i) 프로모터에 작동적으로 결합된 마이오-이노시틀 트랜스포터 (my으 inositol transporter) 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터 ; ( ii ) 프로모터에 작동적으로 결합된 이노시를 디하이드로게나아제 (inositol dehydrogenase) 코딩 DNA 서열 및 이노소스 이소머라아제 (inosose isomerase) 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터로 숙주세포를 형질전환시켜 형질전환된 숙주세포를 얻는 단계; 및 (b) 상기 형질전환된 숙주세포를 마이오- 이노시를을 포함하는 배지에서 배양하는 단계. 이하에서 본 발명을 각 단계에 따라 보다 상세하게 설명한다. 단계 (a): 마이오-이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터로 숙주세포를 형질전환시켜 형질전환된 숙주세포를 얻는 단계. 본 명세서에서 용어 "마이오ᅳ이노시를 트랜스포터 (myo— inositol transporter)"는 마이오 -이노시를을 세포내로 이동시키는 수송효소를 의미한다. 대부분의 세포는 배지내의 이노시를을 세포내로 흡수하는 이노시를 수송 시스템을 갖고 있으며, 마이오-이노시를 트랜스포터는 포유동물 세포에서부터 박테리아에 이르기 까지 다양한 세포에서 확인되어 있다. 에어로박터 에어로게네스 (Aerobacter aerogenes) [Deshusses, J., and Reber , G. , 1972, Biochim. Biophys. Acta 274, Bacteriol . 126, 243- 250] , 슈도모나스 푸티다 (Pseudomonas put i da) [Reber , G. , Belet, M. , and Deshusses, J., 1977, J. Bacterol . 131, 872-875] , 슈도모나스 (Pseudomonas) 종 [Gauchat-Feiss, D. , Frey , J., Belet , M. , and Deshusses, J. , 1985, J. Bacteriol. 162, 324-32기와 같은 박테리아에서 마이오-이노시를 트랜스포터 유전자가 분리되었다고 . 보고 되었으며, 사카로마이세스 세레비지애 (Saccharomyces cerevisiae) (Nikawa, J. , Nagumo, T., and Yamashita, S. (1982) J. Bacteriol. 150, 441-446)와
같은 효모에서도 마이오-이노시를 트랜스포터 유전자가 분리되어 보고되었다. 또한, 마이오ᅳ이노시를 트랜스포터는 주타입 (major)과 부타입 (minor)이 존재하는 것으로 알려져 있다.
본 발명에서 사용되는 마이오-이노시를 트랜스포터는 포유동물 세포, 효모세포 또는 박테리아로부터 유래된 것을 사용할 수 있으며, 바람직하게는 박테리아 유래 트랜스포터를 사용할 수 있다. 보다 바람직하게는 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtilis), 살모넬라 티피무리엄 (Salmonella typhi murium) 또는 아그로박테리움 투메파시엔스 (Agrobacterium imef aciens)로부터 분리된 것을 사용할 수 있으며, 가장 바람직하게는 살모넬라 티피무리엄 (Salmonella typhi murium) 유래의 트랜스포터를 사용한다.
바람직하게는 본 발명의 마이오-이노시를 트랜스포터는 서열번호 1 내지 서열번호 6 에 개시된 아미노산 서열을 갖는 단백질들로 이루어지는 군에서 선택된 하나 이상의 트랜스포터를 사용할 수 있다.
본 명세서에서 용어 "이노시를 디하이드로게나아제' '은 하기 반웅식
1 에 나타낸 바와 같이 마이오 -이노시를을 NAD 의존성 산화작용에 의해 2- 케토 -마이오-이노시를 (2-keto-myo-inositol)로 변환시키는 화학반웅 또는 이의 역방향 반웅을 촉매하는 활성을 갖는 효소이다. 본 명세서에서 "이노시를 디하이드로게나아제 "는 이를 코딩하는 유전자 명칭 "iolG"으로도 기재한다.
[반웅식 1]
마이오ᅳ이노시를 + NAD+ <― > 2-케토 -마이오-이노시틀 + NADH + H+ 이노시를 디하이드로게나아제는 에어로박터 에어로게네스 (Aerobacter aerogenes) [Berman T, Magasanik Β (1966). J. Biol . Chem. 241 (4): 800- 806; LARNER J, JACKSON WT, GRAVES DJ, STAMER JR (1956). Arch. Biochem. Biophys. 60 (2): 352-363)과 효모 크립토코커스 멜리비오숨 (Cryptococcus mel ibiosum) [Vidal-Leir ia M, van Uden N (1973) . Biochim. Biophys . Acta. 293 (2): 295-303]에서 분리되었다고 보고 되어 있다.
본 발명에서 사용할 수 있는 이노시를 디하이드로게나아제는 바람직하게는 아그로박테리움 투메파시엔스 (Agrobacterium tumefaciens) , 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtilis), 코리네박테리움
클루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum), 또는 판토에아 아나나티스 (Pantoea ananantis)로 부터 분리된 것이다. 보다 바람직하게는 본 발명의 이노시를 디하이드로게나아제는 서열번호 21, 서열번호 23, 서열번호 25, 서열번호 27, 서열번호 29 및. 서열번호 31 에 개시된 아미노산 서열을 갖는 단백질들로 이루어지는 군에서 선택된 어느 하나를 사용할 수 있다.
본 명세서에서 용어 "이노소스 이소머라아제 "는 하기 반웅식 2 에 나타낸 바와 같이, 2ᅳ케토-마이오 -이노시를을 1-케토 -D-카이로-이노시를 (1- keto-으 chiro-inositol)로 전환하는 이성질체화 반웅 또는 이의 역방향 반웅을 촉매하는 활성을 갖는 효소이다. 본 명세서에서 "이노소스 이소머라아제 "는 이를 코딩하는 유전자 명칭 "ioll"으로도 기재한다.
[반웅식 2]
2-케토-마이오 -이노시를 <——> 1ᅳ케토ᅳ으카이로-이노시를
본 발명에서 사용할 수 있는 이노소스 이소머라아제는 바람직하게는 아그로박테리움 투메파시엔스 (Agrobacterium tumefaciens) , 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtil is), 코리네박테리움 클루타미큼 (Corynebacterium glutamicum) , 또는 판토에아 아나나티스 (Pantoea ananantis)로 부터 분리된 것이다. 보다 바람직하게는 본 발명의 이노소스 이소머라아제는 서열번호 22, 서열번호 24, 서열번호 26, 서열번호 28 및 서열번호 30 에 개시된 아미노산 서열을 갖는 단백질들로 이루어지는 군에서 선택된 어느 하나를 사용할 수 있다. 상기 반웅식 2 에 의해 생성된 1-케토 -D-카이로 -이노시를은 하기 반웅식 3에 의해 본 발명에서의 최종산물인 D-카이로ᅳ이노시를을 생성한다. 하기 반응식 3 의 반웅은 앞서 설명된 효소인 "이노시를 디하이드로게나아제 "가 촉매한다 .
[반웅식 3]
1-케토 -D-카이로ᅳ이노시를 + NADH + H+ <—ᅳᅳ > D-카이로-이노시를 + 励 +
본 발명에서 마이오ᅳ이노시를은 숙주세포내에서 반웅식 1 내지 반웅식 3 의 연속반웅에 의해 D-카이로 -이노시를로 전환되며, 설명된 바와
같이 반웅식 1 및 반웅식 3 의 반웅은 "이노시를 디하이드로게나아제 "가 촉매하며, 반웅식 2의 반응은 "이노소스 이소머라아제 "가 촉매한다.
본 발명에서 마이오-이노시를 트랜스포터, 이노시톨 디하이드로게나아제, 이노소스 이소머라아제 코딩 . DNA 서열은 재조합 백터내에서 프로모터에 작동적으로 결합되어 있다.
본 명세서에서 용어 "작동적으로 결합된 (operatively linked)' '은 DNA 서열의 발현조절 서열과 기능적으로 결합되어 있다는 의미로서, 기능적 결합에 의해 DNA 서열의 발현이 발현조절 서열에 의해 조절된다.
본 명세서에서 용어 "프로모터' '는 유전자 코딩 서열 또는 기능적 RNA의 발현을 조절할 수 있는 DNA서열을 의미한다.
본 발명에서의 백터는 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 구축될 수 있으며, 이에 대한 구체적인 방법은 Sambrook et al.의 "Molecular Cloning, A Laboratory Manual "(Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001)에 개시되어 있으며, 이 문헌은 본 명세서에 참조로 삽입된다.
본 발명의 재조합 백터는 클로닝 또는 발현을 위한 백터로서 구축될 수 있으며, 원핵 세포 또는 진핵 세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다.
예를 들어, 본 발명의 백터가 발현 백터이고, 원핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터 (예컨대, ρίλ프로모터, trp 프로모터, lac 프로모터, T7 프로모터, tac 프로모터 등)ᅳ 해독의 개시를 위한 라이보좀 결합 자리 및 전사 /해독 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주 세포로서 대장균 (E. coli)가 이용되는 경우, 대장균 (E. coli) 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위 (Yanofsky, C. , J. Bacteriol . , 158: 1018-1024(1984)) 그리고 파아지 λ의 좌향 프로모터 (ρίλ프로모터 , Herskowitz, I. and Hagen, D. , Ann. Rev. Genet., 14 :399ᅳ 445 (1980))가 조절 부위로서 이용될 수 있다.
본 발명의 백터는 선택표지로서, 당업계에서 통상적으로 이용되는 항생제 내성 유전자를 포함할 수 있으며, 예를 들어 암피실린, 겐타마이신, 카베니실린, 클로람페니콜, 스트렙토마이신, 카나마이신, 게네티신, 네오마이신 및 테트라사이클린에 대한 내성 유전자가 있으며, 이에 한정되지 않는다. 상기 항생제 내성 유전자는 이의 발현을 위한 프로모터와 작동가능하게 연결되어 있다.
본 발명에 이용될 수 있는 백터는 당업계에서 종종 사용되는 플라스미드 (예: pSClOl, ColEl, pBR322, pUC8/9, pHC79, pGEX 시리즈ᅳ ET 시리즈 및 pUCl9 등), 파지 (예: Xgt4 ο λΒ, λ -Charon, λ Δζΐ 및 M13 등) 또는 바이러스 (예: SV40등)를 조작하여 제작될 수 있다.
본 발명의 백터는 바람직하게는 원핵세포용 백터이며, 원핵 숙주세포, 특히 대장균 (E. coli)에서 복제가 가능하도록 하는 핵산 서열을 포함한다. 따라서, 본 발명의 백터는 coIA, colEl 또는 ρ15Α 의 박테리아의 복제 원점 또는 fl origin과 같은 박테리오파아지의 복제 원점을 포함할 수 있다.
본 발명의 재조합 백터를 안정되면서 연속적으로 클로닝 및 발현시킬 수 있는 숙주 세포는 당업계에 공지되어 있는 어떠한 숙주 세포도 이용할 수 있다. 예를 들어, 포유동물세포, 곤충세포, 효모와 같은 진핵세포 또는 원핵세포를 들 수 있으나, 바람직하게는 원핵세포를 사용한다. 원핵세포로서는 예컨대, 대장균인 E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스, 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 그리고 살모넬라 티피무리움, 세라티아 마르세슨스, 코리네박테리움 글루타미큼 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주 등이 있다.
본 발명의 백터를 숙주 세포 내로 운반하는 방법은, 숙주 세포가 원핵 세포인 경우, CaCl2 방법 (Cohen, S.N. et al. , Proc. Natl. Acac. Sci . USA, 9:2110-2114(1973)), 하나한 방법 (Cohen, S.N. et al., Proc. Natl. Acac. Sci. USA, 9:2110-2114(1973); 및 Hanahan, D., J. Mol . Biol., 166:557-580(1983)) 및 전기 천공 방법 (Dower, W.J. et al . , Nucleic .Acids Res. , 16 :612그 6145(1988)) 등에 의해 실시될 수 있다. 단계 (b): 상기 형질전환된 숙주세포를 마이오ᅳ이노시를을 포함하는 배지에서 배양하는 단계
상기 형질전환 숙주세포가 배양되는 동안, 재조합 발현백터 내의 마이오-이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제가 발현되고, 배양액내의 마이오ᅳ이노시를이 세포내로 흡수되어 상기 효소들의 촉매 작용에 의해 D-카이로 이노시를로 전환된다.
형질전환된 숙주세포의 배양은 공지된 숙주세포 배양 방법 또는 이를 변형한 방법으로 행할 수 있다. 예를 들어, 숙주세포가 대장균 (E.coH)인 경우 형질전환 숙주세포의 배양을 위한 배지는 대장균이 효율적으로 이용할 수 있는 탄소원, 질소원, 무기염 등을 포함한다면 천연 배지 또는 합성 배지를 사용할 수 있다. 사용될 수 있는 탄소원은 글루코오스, 프럭토오스 수크로오스와 같은 탄수화물; 녹말, 녹말의 가수분해물; 아세트산 및 프로피은산과 같은 유기산; 에탄을, 프로판을, 글리세를과 같은 알코을 등을 포함한다. 질소원은 암모니아; 염화암모늄, 암모늄설페이트, 암모늄아세테이트 및 암모늄포스페이트와 같은 무기산 또는 유기산의 암모늄염; 펩톤, 육추출,물 (meat extract), 이스트추출물 옥수수 침지액, 카제인 가수분해물, 대두추출물, 대두가수분해물; 다양한 발효된 세포 및 이들의 분해물 등을 포함한다. 무기염은 포타슘디하이드로젠 포스페이트, 다이포타슘하이드로젠 포스페이트ᅳ 마그네슘 포스페이트, 마그네슘 설페이트, 소디엄 클로라이드, 망간 설페이트, 구리 설페이트, 칼슘 카보네이트 등을 포함한다.
배양은 통상적으로 진탕배양 또는 회전기에 의한 회전에 의한 것과 같은 호기성 조건하에서 행한다. 배양 온도는 바람직하게는 10 내지 40°C의 범위에서 행하고, 배양시간은 일반적으로 5 시간 내지 7 일간 행한다. 배지의 pH 는 배양 중에서 바람직하게는 3.0 내지 9.0 의 범위를 유지한다. 배지의 pH 는 무기 또는 유기산, 알칼리 용액, 우레아, 칼슘 카보네이트, 암모니아 등으로 조절할 수 있다. 배양 중에는 필요한 경우 재조합 백터의 유지 및 발현을 위해 암피실린, 스트렙토마이신, 클로람페니콜, 카나마이신 및 테트라사이클린과 같은 항생제를 첨가할 수 있다. 유도 (induct ion) 가능한 프로모터를 갖는 재조합 발현 백터로 형질전환된 숙주세포를 배양하는 경우 필요하다면 배지에 적합한 유도제 (inducer)를 첨가할 수 있다. 예를 들어, 발현 백터가 lac 프로모터를 함유하는 경우 IPTG (isopropyl-β— D— thiogalactopyranoside)를 첨가하고, trp 프로모터를 포함하는 경우 인돌아크릴산 Gndoleacrylic acid)을 배지에 첨가할 수 있다.
본 발명의 바람직한 구현예에 의하면, 본 발명의 방법은 상기 단계
(b) 이후에, 상기 형질전환 숙주세포를 배양한 배양물로부터 D-카이로- 이노시를을 분리하는 단계 (c)를 더 포함한다. 단계 (C): 상기 숙주세포를 배양한 배양액으로부터 D-카이로- 이노시를을 분리하는 단계
형질전환된 숙주세포를 배양한 배양액으로부터 으카이로 -이노시를의 분리는 탄수화물 (carbohydrate) 또는 당 (sugar)을 분리 및 정제하는 공지된 방법 및 이의 변형된 방법을 이용하여 행한다.
으카이로—이노시를이 배지 상에 용해된 상태로 존재하는 경우, 배지로부터 배양된 형질전환체를 제거한다. 예를 들어, 배양한 형질전환 체는 원심분리 또는 마이크로여과 (microfiltration) 방법 등에 의해 배양액으로부터 제거하여 배양 상층액만을 얻는다. 배양 상층액으로부터 으카이로 -이노시를을 얻는 방법은 종래의 공지된 당의 분리 정제 방법 및 이를 변형한 방법을 이용할 수 있다.
종래 공지된 당의 분리 정제방법으로는, 제을라이트 분자체를 이용한 선택적 흡착 방법에 의한 분리방법 (미국특허 제 4,482,761 호), 양이온교환수지를 이용한 컬럼크로마토그래피에 의한 분리방법 (미국특허 제 5,096,594 호), 음이온 교환수지를 사용하는 컬럼크로마토그래피에 의한 분리방법 (미국특허 제 5,482,631 호), 활성탄에 의한 흡착 및 유기용매에 의한 용출 방법 (대한민국특허 제 1으 0753982 호), 등결건조 및 재결정화 방법 등이 있으며, 이러한 방법을 이용하거나 이 방법의 변형된 방법 및 이 방법들을 조합하여 이용할 수 있으나, 이에 한정되지 않는다. 본 발명의 다른 일 양태에 따르면, 본 발명은 (ί) 프로모터에 작동적으로 결합된 마이오-이노시를 트랜스포터 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터; 및 (ii) 프로모터에 작동적으로 결합된 이노시를 디하이드로게나아제 코딩 DNA 서열 및 이노소스 이소머라아제 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터로 형질전환된 숙주세포를 제공한다.
본 발명의 또 다른 일 양태에 따르면, 본 발명은 상기 설명된 형질전환 숙주세포를 포함하는 마이오-이노시를로부터 으카이로 -이노시를을 생산하기 위한 용도의 조성물을 제공한다. 본 발명의 또 다른 일 양태에 따르면, 본 발명은 (i) 프로모터에 작동적으로 결합된 마이오-이노시를 트랜스포터 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터; 및 (Π) 프로모터에 작동적으로 결합된 이노시를 디하이드로게나아제 코딩 DNA 서열 및 이노소스 이소머라아제 코딩 DNA 서열을 포함하는 재조합 백터를 유효성분으로 포함하는, 마아오- 이노시를로부터 D-카이로 -이노시를의 생산용 재조합 백터 키트를 제공한다. 본 발명의 다른 일 양태인 숙주세포, 이를 포함하는 조성물 및 재조합 백터를 포함하는 키트에서, 상기 마이오-이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제; 이를 코딩하는 DNA 서열을 포함하는 재조합 발현 백터; 이 재조합 발현 백터를 포함하는 숙주세포에 관한 내용은 상술된 본 발명의 일 양태의 내용과 동일하므로, 중복하여 설명하지 않는다.
【유리한 효과】
본 발명은 상기 효소 마이오—이노시를 트랜스포터, 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제를 발현하는 형질전환 숙주세포를 이용하여 마이오-이노시를로부터 D-카이로 -이노시틀을 생산하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법에 의하면 마이오 -이노시를을 으 카이로ᅳ이노시를로 전환시킬 수 있다.
【도면의 간단한 설명】
도 1 은 마이오ᅳ이노시를 (myo-inositol)과 D-카이로-이노시를 (D- chir으 inositol)의 화학 구조를 보여준다.
도 2 는 마이오ᅳ이노시를과 D-카이로-이노시틀 및 이들의 입체이성질체 또는 유도체들에 관한 HPLC 크로마토그램을 보여준다.
도 3 은 마이오-이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제를 발현하는 대장균에, 다양한 기원의 이노시를 트랜스포터를 추가로 도입하여 얻은 형질전환 대장균에서 마이오-이노시를로부터 D- 카이로-이노시를 전환율 및 균체 성장율올 측정한 결과를 보여준다. 각 이노시틀 트랜스포터에 대한 시험군은 트랜스포터 발현 백터를 pCOLAD- sAtiep-sAtiepf 를 함께 도입하여 제조한 재조합 대장균올 24 시간 및 48 시간 배양한 결과이다. 흰색 막대는 24 시간 배양후 측정한 값을 나타내고, 회색 막대는 48시간 배양후 측정한 값을 나타낸다.
도 4 는 마이오-이노시를 디하이드로게나아제 (iolG)의 상동성 분석에 의한 계통도 (phylogenetic tree)를 보여준다.
도 5 는 이노소스 이소머라아제 (ioll)의 상동성 분석에 의한 계통도 (phylogenetic tree)를 보여준다.
도 6a 내지 도 6c 는 배양 온도에 따른 본 발명의 형질전환 대장균의 마이오-이노시를로부터 D-카이로-이노시를로의 전환율을 측정한 결과를 보여준다. 각각의 심볼에 대한 실험군은 다음과 같다. 도 6a 에서 ·: 30 °C, O: 37 °C, 도 6b 에서 ' 30°C 일 경우 O: 균체성장, ·: H, ▲: 남은 글리세롤의 양, 도 6c 에서 37°C 일 경우 O: 균체성장, ·: pH, A: 남은 글리세를의 양이다.
도 7 은 본 발명의 형질전환 대장균의 배양시 유도 (induction) 시기에 따른 마이오ᅳ이노시를로부터 으카이로-이노시틀로의 전환율을 측정한 결과를 보여준다. 각각의 심볼에 대한 실험군은 다음과 같다. ■: 유도하지 않음 (No induction), O: 0 시간에서 유도 ( induct ion), A: 0D 0.6 에서 유도 (induct ion), V: 0D 3 에서 유도 ( induct ion), ♦: 0D 10 에서 유도 ( induct ion) .
도 8 은 본 발명의 형질전환 대장균의 배양시 유도제 종류에 따른 마이오ᅳ이노시를로부터 D-카이로—이노시를로의 전환율을 측정한 결과를 보여준다. 각각의 심볼에 대한 실험군은 다음과 같다. 醒: 0D 0.6 에서 1 mM IPTG 첨가ᅳ O: 0 시간에 0.5% 락토스 (lactose) 첨가, A: 0D 0.6 에서 0.5% 락토스 (lactose) 첨가, ▽: 0D 7 에서 0.5% 락토스 (lactose) 첨가, ♦: 0D 0.6에서 0.1% 락토스 (lactose) 첨가.
도 9 는 다양한 균주 유래의 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라제 유전자, 또는 이들의 조합을 도입한 재조합 균주의 D- 카이로-이노시를 생산율 (패널 A), 균체 성장 (패널 B), 및 생산속도에 대한 기을기 (패널 C)를 측정한 결과를 보여준다. 형질전환 대장균에 이노시를 트랜스포터 발현 재조합 플라스미드 백터 pACYCD-StiolTl-StiolT2 를 함께 도입하여 실험을 수행하였다. 각각의 심볼에 대한 실험군은 다음과 같다. ■ : pCOLAD-Cgiep-PaiolI, ◦: pCOLAD-sAt iep-sAt iepf , ▲: pCOLAD- AGRL628-AGRL627, V: pCOLAD-BsiolG-Bsiol I , ♦: pCOLAD-CgiolG- Cgiol 10169, t>: pCOLAD-Paidh-PaiolI.
도 10 은 본 발명에서 선별된 형질전환 대장균을 이용하여 최적의 배양조건에서 1 리터 발효를 행하여 마이오-이노시를로부터 D-카이로ᅳ 이노시를로의 생산을 확인한 실험 결과이다.
도 11 은 본 발명의 균주에 의해 생산된 D—카이로ᅳ이노시를 분획물의 GC-MS분석 결과이다.
【발명의 실시를 위한 형태】
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에、있어서 자명할 것이다. 실시예 실시예 1: 마이오-이노시를 트랜스포터 유전자의 클로닝 및 트랜스포터를 포함하는 재조합 백터의 제작
마이오ᅳ이노시를을 탄소원으로 사용한다고 보고된 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtilis), 살모넬라 티피무리엄 (Salmonel la typhimurium) , 아그로박테리움 투메파시엔스 (Agrobacter ium tumefaciens) 균주로부터 마이오-이노시를 트랜스포터 (my으 inositol transporter )의 주타입 (major) 및 부타입 (minor) 유전자를 각각 클로닝하였다.
바실러스 서브틸리스 (B. subtilis)의 경우 마이오ᅳ이노시를 트랜스포터
유전자는 iolT 유전자와 iolF 유전자이며, 살모넬라 티피무리엄 (S. typhi murium)의 경우 iolTl 유전자와 iolT2 유전자이며, 아그로박테리움 투메파시엔스 (A. iefaciens)에서는 Atu5935 유전자와 Atu2525 유전자이다. 이상의 유전자에 대한 정보는 표 1과 같다.
【표 1】
1-1. 재조합 백터 pACYCD-BsiolT(F2) 및 PACYCD-BsiolT-BsiolF(F2)의 제조
바실러스 서브틸리스 (B. subtil is) 균주의 경우, Bacillus subt i 1 i s subsp. subtil is str. 168 (tax id :224308; GenBank NID: NC_000964, ATCC23857)의 지놈 DNA 로부터 주타입 트랜스포터 iolT 및 부타입 트랜스포터 iolF 를 pACYCDuet-1 발현백터에 도입하여 pACYCD-BsiolT(F2)와 pACYCD-BsiolT-BsiolF(F2)를 구축하였다. 구체적으로 설명하면, 바실러스 서브틸리스 (B. subtilis)의 지놈 DNA로부터 프라이머 BsiolT— F2 와 BsiolT- R 을 이용하여 iolT 를 증폭한 후 제한효소 Sacl 과 BamHI 으로 절단하여 백터 pACYCDuet-l (Novagen)의 동일 부위에 삽입하여 pACYC으 BsiolT(F2)를 제작하였다. 또한, 프라이머 BsiolF-F 와 BsiolF-R 을 이용하여 iolF 를 증폭한 후 제한효소 Ndel 과 Sail 으로 절단하여 상기 제작한 pACYCD- BsiolT(F2)의 Ndel 과 Xhol 부위로 삽입하여 pACYCD-BsiolT— BsiolF(F2)를 제작하였다.
1-2. 재조합 백터 pACYCD-StiolTl(F2) 및 pACYCD-StiolTl- StiolT2(F2)의 제조
4
살모넬라 티피무리엄 (S. typhimurium) 균주의 경우, Salmonella enter ica subsp. enter ica serovar Typhimurium str . LT2 ATCC700720 (taxid: 99287; GenBank NID: NC_006511, ATCC700720)으로부터 주타입 트랜스포터로 알려진 iolTl 및 부타입 트랜스포터로 알려진 iolT2 를 증폭하여 pACYCDuet -1 발현백터에 도입하여, pACYCD-St iolTl(F2)와 pACYCD- StiolTl-StiolT2(F2)를 구축하였다. 구체적으로 설명하면, 살모넬라 티피무리엄 (S.. typhimurium)의 지놈 DNA 로부터 프라이머 StiolTl-F2 및 StiolTl- 을 이용하여 iolTl 을 증폭한 후 제한효소 Ncol 과 BamHI 으로 절단하여 pACYCDuet-1 백터의 동일 부위에 삽입하여 pACYCD-St iolTl(F2)를 제작하였다. 또한, 프라이머 StiolT2-F 와 StiolT2-R을 이용하여 iolT2를 증폭한 후 제한효소 Ndel 과 Sail 으로 절단하여 상기 제작한 백터 pACYCD— StiolTl(F2)의 Ndel 과 Xhol 부위로 삽입하여 pACYCD— St iolTl— St iolT2(F2)를 제작하였다. 1-3. 재조합 백터 pACYCD-Atu5935(F2) 및 pACYCD-Atu5935-
Atu2525(F2)의 제조
아그로박테리움 투메파시엔스 (A. imefaciens)의 경우, Agrobacter ium tumefaciens str . C58 (taxid: 176299; GenBank NID: NC— 003062, ATCC33970)의 지놈 DNA로부터 프라이머 Atu5935-F2 와 Atu5935- R을 이용하여 Atu5935를 증폭한 후 제한효소 Ncol 과 BamHI 으로 절단하여 pACYCDuet -1백터의 동일 부위에 삽입하여 pACYC으 Atu5935(F2)를 제작하였다. 또한, 프라이머 Atu2525-F 와 Atu2525-R 을 이용하여 Atu2525 를 증폭한 후 제한효소 Ndel 과 Sail 으로 절단하여 상기 제작한 pACYCD-Atu2525(F2)의 Ndel과 Xhol 부위로 삽입하여 pACYCD-Atu5935-Atu2525(F2)를 제작하였다.
1-4. 재조합 백터 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf 의 제조
상기 클로닝한 마이오-이노시를 트랜스포터의 활성을 평가하기 위해, 마이오 -이노시를을 D-카이로 -이노시를로 전환하는 이노시를 디하이드로게나아제 (inositol dehydrogenase) 유전자 (iolG) 및 이노소스 이소머라아제 (inosose isomerase) 유전자 (ioll)를 아그로박테리움 투메파시엔스 (A. tumefaciens)로부터 클로닝하여, 이들을 백터 pCOLADuet-
l(Novagen)에 도입하여 재조합 플라스미드 백터 pCOLAD— sAt iep-sAt iepf 를 제작하였다. 보다 상세히 설명하면, Agrobacterium sp. AB1012KWO 02/055715A)의 BD171257_CDS1 과 CDS2 의 아미노산 서열을 토대로 DNA 합성 [GenScript Inc.ᅳ 860 Centennial Ave. , Pi scat away, NJ 08854, USA]을 행하여, 합성한 DNA 분자 sAti印 (서열번호 50)와 합성한 DNA 분자 sAtiepf (서열번호 51)를 각각 제작하였다. 상기 합성한 DNA 분자 sA ep을 주형으로 프라이머 sAtiep-TF 와 sAtiep-TR 을 사용하여 PCR 증폭한 후 제한효소 BspHI 과 Sacl 으로 절단하고, 이를 pCOLADuet— 1 의 동일 제한효소 부위로 삽입하여 pCOLAD-sA ep 를 제작하였다. 이어서, 상기 합성한 DNA 분자 sAtiepf 을 Ndel 과 Sail 으로 절단하고, 이를 상기 제작한 백터 pCOLAD-sAtiep 의 Ndel 과 Xhol 부위로 삽입하여 최종적으로 재조합 백터 pCOLAD-sAt i ep-sAt i epf 를 제작하였다 .
상기 재조합 백터의 제작에 사용한 프라이머는 표 2 에 정리하였으며, 제작한 재조합 백터 및 이와 관련된 서열 정보는 표 3에 정리하였다.
【표 2】
실시예 2: 마이오-이노시를 트랜스포터의 활성 평가
상기 실시예 1 에서 제작된 것으로서, 바실러스 서브틸리스 (Β. subtilis), 살모넬라 티피무리엄 (S. typhi murium), 아그로박테리움 투메파시엔스 (A. t ume faci ens) 유래의 마이오ᅳ이노시를 트랜스포터를 함유하는 각각의 재조합 플라스미드, pACYCD-BsiolT(F2), pACYCD-BsiolT- BsiolF(F2), pACYCD-StiolTKF2), pACYCD-St i o 1 Tl-St i o 1 T2 ( F2 ) , pACYCD- Atu5935(F2) , pACYCI)-AUi5935-Atu2525(F2)을, 마이오-이노시를로부터 으 카이로-이노시를로로 전환시키는 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제 코딩 유전자를 포함하는 재조합 플라스미드 pCOLAD-sA epᅳ sAtiepf 와 함께, 대장균 (£; coin BL21(DE3)에 형질전환 하여 형질전환 균주를 제작하였다.
제작한 재조합 형질전환 균주는 직경 25 mm, 높이 150 mm 의 유리시험관에서 5 mL 배양하였다. 배양조건은 l%(w/v) 마이오 -이노시를, 50 mg/L 클로람페니콜, 50 mg/L 카나마이신을 함유한 M9 최소배지를 이용하여, 30°C, 250 rpm 의 조건에서 균체가 0D 0.6 에 도달하였을때 1 mM
IPTG를 첨가하여 유도 (induct ion)한 후 48 시간 동안 배양하였다. 마이오- 이노시를 및 D-카이로ᅳ이노시를 분석을 위하여 배양액을 원심분리하여 배양 상층액 1 mL 을 취하고 10 분간 끓인 후 다시 원심분리하여 상층액 500 UL 를 취하였다. 전처리한 배양상층액은 HPUXShimadzu LClOAvp)로 분석하였으며, 분석조건은 Kromasil 5NH2 칼럼 (4.6 mm X 250 mm), 이동상 75% 아세토니트릴, 칼럼 은도 40°C, RI 검출기를 이용하였다. 마이오ᅳ 이노시를 및 D-카이로 -이노시를과 이들의 이성질체에 대한 HPLC 크로마토그램을 도 2에 나타내었다. 각 마이오-이노시를 트랜스포터의 활성을 측정한 결과는 도 3 에 나타내었다. 도 3 의 결과에 의하면, pACYCDuet-1 에 살모넬라 티피무리엄 (S. typhimurium) 유래의 주타입과 부타입의 트랜스포터 StiolTl 과 StiolT2 을 모두 함유한 PACYCD-StiolTl-StiolT2 의 경우에서 D- 카이로 -이노시를의 전환율이 가장 우수하였으며, 바실러스 서브틸리스 (B. subtilis)와 아그로박테리움 투메파시엔스 (A. t Lime faci ens) 유래의 마이오- 이노시를 트랜스포터에서는 D-카이로 -이노시를의 전환율이 매우 낮았다. 전환율이 가장 우수한 살모넬라 티피무리엄의 트랜스포터의 경우 10g/L 마이오-이노시를로부터 24 시간에 약 1.2 g/L 의 D—카이로—이노시를이 전환되었으며, 48 시간에는 약 l.lg 의 D-카이로ᅳ이노시를이 전환되어 24 시간 이후 전환율이 증가하지 않는 것으로 나타났다. 균체성장은 유전자를 도입했을 경우 약간 저해되는 양상을 보였으며, 이는 트랜스포터 단백질의 특성상 세포막에 위치하므로 과발현시 독성을 나타내는 것으로 보인다. 실시예 3: 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제 유전자의 클로닝 및 이를 포함하는 재조합 백터의 제작
하기 반웅식 1 내지 반웅식 3 의 연속적 반웅을 통해 마이오- 이노시를로부터 D-카이로 -이노시를이 전환된다. 반웅식 1 및 반웅식 3 의 반응은 이노시를 디하이드로게나아제 (inositol . dehydrogenase)에 '의해 촉매되고, 반웅식 2의 반웅은 이노소스 이소머라아제 (inosose isomerase)에 의해 촉매된다.
[반웅식 1]
마이오-이노시를 + NAD+ <― > 2—케토 -마이오-이노시를 + NADH + H+
[반응식 2]
2-케토ᅳ마이오-이노시를 <—ᅳ > 1ᅳ케토 -I)ᅳ카이로-이노시를
[반응식 3]
1-케토 -D-카이로-이노시를 + NADH + H+ <ᅳᅳ >으카이로-이노시를 + 励 + 이노시를 디하이드로게나아제 유전자 (iolG) 및 이노소스 이소머라아제 유전자 (ioll)와 동등한 기능을 갖는 유전자를 아그로박테리움 투메파시엔스 (A. tumefaciens), 바실러스 서브틸리스 (B. subt i 1 i s ) , 코리네박테리움 글루타미큼 (Corynebacter ium glutamicum) , 판토에아 아나나티스 (Pantoea ananat is)으로부터 클로닝하였다. 상기 균주들의 지놈 DNA 로부터 iolG 유전자 및 ioll 유전자에 대웅하는 유전자들을 증폭하고, 증폭한 iolG 및 ioll 유전자들의 쌍 및 조합을 pCOLADuet-1 발현백터 (Novagen)에 삽입하여 6 종류의 재조합 플라스미드를 제작하였다. 상기 열거한 iolG 와 ioll 상동 유전자들의 정보는 하기 표 4에 나타내었다.
【표 4】
3-1. 재조합 백터 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf 의 제조
Agrobacterium sp. AB10121 균주 (TO 02/055715A)로부터의 iolG 및 ioll 유전자를 포함하는 재조합 백터 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf 의 제조방법은 상기 실시예 1에서 설명하였다.
3-2. 재조합 백터 pC0LAD-AGRL628-AGRL627의 제조
아그로박테리움 투메파시엔스 (A. tumefaciens) 유래 iolG 와 ioll 유전자를 포함한 재조합 백터는 다음의 방법을 통해 제작하였다. Agrobacterium tumefaciens str . C58( tax id: 176299; GenBank NID: NC_003062, ATCC33970)의 지놈 DNA 로부터 프라이머 AGRL628-F 와 AGRL628- R 을 이용하여 iolG 에 해당하는 AGRL628 유전자를 증폭하였고, 이것을 제한효소 Pcil 과 Sacl 으로 절단하여 pCOLADuet-l(Novagen)의 Ncol 과 Sacl 부위에 도입하여 pC0LAD-AGRL628 을 제작하였다. 또한, AGRL627-F 와 AGRL627-R 프라이머를 이용하여 ioll 에 해당하는 AGRL_627 을 증폭하고 이를 제한효소 Ndel 과 Sail 으로 절단하여 pCOLAD— AGRL628 의 Ndel 과 Xhol 부위에 삽입하여 pC0LAD-AGRL628-AGRL627 재조합 백터를 제작하였다.
3-3. 재조합 백터 pCOLAD-BsiolG-BsiolI의 제조
바실러스 서브틸리스 (B. subtilis) 유래 iolG 와 ioll 유전자를 포함한 재조합 백터는 다음의 방법을 통해 제작하였다. Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 (taxi (1:224308; GenBank NID: NC_000964, ATCC23857)의 지놈 DNA 로부터 BsiolGᅳ F 및 BsiolGᅳ R 프라이머를 이용하여 iolG 에 해당하는 BsiolG 를 증폭한 후, 제한효소 Pcil 과 Notl 으로 절단하여 pCOLADuet-1 의 Ncol 과 Notl 부위로 삽입하여 pCOLAD-BsiolG 를 제작하였다. 또한, Bsioll— F 와 Bsioll-R 프라이머를 이용하여 ioll 에 해당하는 Bsioll 를 증폭하고 이를 제한효소 Ndel 과 Pacl 으로 처리하여 앞서 구축한 플라스미드 pCOLAD-BsiolG 의 동일 제한효소 부위로 삽입하여 pCOLAD-BsiolG-BsiolI를 제작하였다.
3-4. 재조합 백터 pCOLAD— CgiolG-CgiolI0169의 제조
코리네박테리움 글루타미쿰 (C. glutamicum) 유래 iolG 와 ioll 유전자를 포함한 재조합 백터는 하기 방법을 통해 제작하였다. Corynebacter ium lutamicum ATCC 13032 (tax id-' 196627; GenBank NID:NC_003450, ATCC13032)의 지놈 DNA 로부터 CgiotG_F 와 CgiolG-R 프라이머를 이용하여 iolG 에 해당하는 CgioIG 를 증폭한 후 제한효소 BspHI 과 Notl 으로 절단하여 pCOLADuet-1 의 Ncol 과 Notl 부위로 삽입하여 pCOLAD-CgiolG 를 제작하였다. 또한, CgiolI0169-F 와 CgiolI0169-R 프라이머를 이용하여 ioll에 해당하는 CgiolI0169를 증폭하고 이를 Ndel과 Pad 으로 처리하여 앞서 구축한 pCOLAD-CgiolG 의 동일한 제한효소 부위로 삽입하여 pCOLAD-CgiolG-Cgi ol 10169 백터를 제조하였다.
3-5. 재조합 백터 pCOLAD-Paidh-PaiolI의 제조
판토에아 아나나티스 (Pant oea ananatis) 유래 iolG 와 ioll 유전자를 포함한 재조합 백터는 하기 방법을 통해 제작하였다. Pantoea ananatis LMG 20103 (taxid: 706191, GenBank NID:NC_013956, KCCM40419)의 지놈 DNA 로부터 Paidh-F와 Paidh-R프라이머를 이용하여 iolG에 해당하는 Paidh를 증폭한 후, 제한효소 Pcil 과 Notl 으로 절단하여 pCOLADuet-1 의 Ncol 과 Notl 부위로 삽입하여 pCOLAD-Paidh 를 제작하였다. 또한, Paioll-F 와 Paioll-R 프라이머를 이용하여 ioll 에 해당하는 Paioll 를 증폭하고 이를 Ndel 과 Pacl 으로 처리한 후, 상기 제작한 백터 pCOLAD-Paidh 의 동일한 제한효소 부위로 삽입하여 pCOLAD— Paidh— Paioll를 제작하였다.
3-6. 재조합 백터 pCOLAD-Cgiep-PaiolI의 제조
서로 다른 균주에서 유래한 iolG 유전자 및 ioll 유전자를 조합한 재조합 백터를 제조하기 위해, 먼저 코리네박테리움 글루타미쿰 (C. glutamicum) 지놈상에 iolG 유전자인 BD171257_CDS 1(GI :27877069)과 상동성이 낮으면서 기능이 보고되지 않은 iolG 상동 유전자 Cgiep (NCgl2957 또는 GI: 19554252)를 클로닝 하였다. 또한, ioll 해당 유전자의 경우, 역시 ioll 유전자인 BD17125그 CDS 2 (GI :27877069)와 상동성이 낮으면서 기능이 보고되지 않은 판토에아 아나나티스 (P. ananatis) 유래
1
ioll 인 Paioll 를 조합에 사용하였다. 보다 상세히 설명하면,
Corynebacter ium glut ami cum ATCC 13032 (taxid: 196627; GenBank NID:NC_003450, ATCC13032)의 지놈 DNA 로부터 프라이머 Cgiep-F 와 Cgiep- R 을 이용하여 Cgiep 를 증폭한 후 제한효소 BspHI 과 Notl 으로 처리하여 절단하고, pCOLADuet-1 의 Ncol 과 Notl 부위로 삽입하여 pCOLAD-Cgiep 를 제작하였다. 이어서 , pCOLAD-Cgiep를 Ndel과 Pacl으로 처리하여 절단하고 여기에 동일한 제한 효소로 절단한 Paioll 를 삽입하여 최종적으로 pCOLAD- Cgiep-Paioll 백터를 제작하였다. 상기 실시예 3 에서 재조합 백터의 제조에 사용한 프라이머는 하기 표 5 에 나타내었고 상기 제작한 재조합 백터에 대해서는 하기 표 6 에 정리하였다.
【표 5】
3-7. 클로닝한 유전자들의 상동성
클로닝한 이노시를디하이드로게나아제 (iolG) 및 이노소스 이소머라아제 (ioll) 유전자들의 계통도는 도 4 및 도 5 에 나타내었으며, 이들 유전자들의 상동성 분석 결과는 하기 표 7 및 표 8에 나타내었다.
【표 7]
실시예 4: D-카이로-이노시를 생산균주의 최적 배양조건 확립 실시예 3 에서 제작한 재조합 플라스미드 증 pCOLAD-Cgiep-PaiolI 를 pACYCD-StiolTl-StiolT2(F2)와 함께 대장균 BL2KDE3) 균주에 도입하여 재조합 균주의 배양 최적화를 시도하였다.
4-1. 배양 온도에 따른 D-카이로 -이노시를의 생산성 조사
300 mL 의 홈이 파인 (baffled) 삼각플라스크에서 50 mL 배양하였다. 배양조건은 15%(w/v) 마이오—이노시를, 50 mg/L 클로람페니콜, 50 mg/L 카나마이신을 함유한 TB(terrific broth)를 이용하여 30°C와 37°C, 180 rpm 의 조건에서 약 40 시간 동안 배양하였다. 유도 ( induct ion)은 0D 0.6 에서 IPTG 를 1 mM 농도로 첨가하였다. 배양조건 중 첨가한 마이오- 이노시를의 농도는 해당 온도에서의 용해도 (약 16— 17%(w/v))에 준하여 정하였다.
마이오-이노시를 및 으카이로-이노시를 분석을 위하여 배양액을 원심분리 하여 배양 상층액 1 tnL 을 취하고 10 분간 끓인 후 다시 원심분리하여 상층액 500 yL 를 취하였다. 전처리한 배양 상층액은 HPLC(Shimadzu LClOAvp)로 분석하였으며, 분석조건은 Kromasil 5NH2
칼럼 (4.6 mm X 250 瞧), 이동상 75% 아세토니트릴, 칼럼 은도 40°C, RI 검출기를 이용하였다. 이상의 결과를 도 6에 나타내었다.
TB 배지중의 탄소원 글리세를은 30°C 및 37°C에서 모두 약 24 시간에 고갈되었으며, 균체성장도 이에 맞춰 약 24 시간에 정지되었다. 탄소원이 고갈되고 균체성장이 정지된 24시간에 D-카이로-이노시틀은 30 °C에서 약 12 g/L으로 생성되었고, 37°C에서 약 14 g/L로서 약 1.2 배 높게 생성되었다. 균체 성장이 정지된 후에도 D-카이로 -이노시를은 계속 전환되어 37°C에서 약 28시간, 30°C에서 약 32시간에 약 19 g/L으로 증가하였다.
이러한 마이오-이노시를로부터 D-카이로-이노시를로의 전환은 반웅평형이 관여한다고 알려져 있다 (Yoshida et al. , ΑΕΜ72, 2006)). 즉, 마이오 -이노시를과 D-카이로-이노시를간에 약 86:14 의 물리화학적 반웅평형이 관여하므로, 150 g/L 마이오ᅳ이노시를에 해당하는 D-카이로- 이노시를의 양은 약 20 g/L 이다. 이는 본 실시예에서도 실험적으로 확인되었다. 즉, 으카이로 -이노시를을 첨가하여 배양했을 경우 이상의 반웅 평형 비율에 가깝게 마이오 -이노시를이 생성되었다 (결과는 나타내지 않았음). 이러한 결과로 인해 생산된 19 g/L 의 D-카이로-이노시를 양은 150 g/L 의 마이오—이노시를을 첨가한 배양의 최대치이다. 37°C의 경우 이러한 반응평형에 도달하는 시점 역시 30°C에서 보다 약 4 시간 빠른 것으로 나타났다. 결과적으로 배양 온도에 관해서는 37°C가 적합한 배양 은도인 것을 확인하였다.
4-2. 유도시기에 따른 D-카이로 이노시를의 생산성
pACYCD-StiolTl-StiolT2(F2)와 ' pCOLAD-Cgiep-Paiol I 를 도입한 대장균 BL2KDE3) 균주의 유도 (induct ion) 시기에 따른 D_카이로— 이노시를의 생산성을 살펴보았다. 유도제인 IPTG 를 첨가하지 않는 군을 음성대조구로 하여, 배양초기인 0 시간, 0D 0.6, 0D 3, 0D 10 에 각각 투여하면서 37°C에서 생산성을 확인하였다. 이외의 배양조건은 상기 항목 4-1. 에서와 같으며, 배양결과는 도 7에 나타내었다.
IPTG 에 의한 유도 (induct ion)를 행하지 않은 그룹과, 완전히 성장을 멈춘 후인 0D 10 에서 IPTG 를 첨가하여 유도한 그룹에서는 매우 저조한 D- 카이로-이노시를 생산량을 보였다. 배양시작 시에 IPTG 를 투여한
그룹에서는 초기에 심각한 균체 성장저해 양상이 나타났다. 0D 0.6 와 0D 3 에서도 유도 (induct ion)가 되면 곧바로 균체 성장이 저해되는 양상을 보였으며, IPTG 에 의해 단백질이 발현되면서 균체 성장에 사용되어야 할 질소원, 탄소원 등이 단백질 합성에 소모되거나, 이노시를 트랜스포터 단백질에 의한 막의 손상도 원인일 수 있다. 결과적으로 0D 0.6 또는 0D 3 즉, 대수기 초기에 균체가 새로운 배지 환경에 어느 정도 적응하고 대수 성장을 시작할 무렵에 유도제 (inducer)를 투여하는 것이 가장 바람직한 것으로 확인되었다. 4-3. 유도제의 종류에 따른 D-카이로-이노시톨 생산성 확인
pACYCD-StiolTl-StiolT2(F2)와 pCOLAD-Cgiep— Paiol I 를 도입한 대장균 BL2 DE3) 균주의 유도제 (inducer)의 종류에 따른 D-카이로- 이노시를의 생산성을 살펴보았다. 유도제인 IPTG 가 세포성장을 저해하는 양상을 가지므로 이를 대체할 수 있는 락토스 (lactose)를 유도제로 첨가하였다. 락토스는 첨가시기와 양을 조절하여 첨가하였으며, 0.5¾¾(w/v) 락토스를 초기, 0D 0.6, 0D 7 에서 첨가하거나, 0D 0.6 에서 0.1%를 첨가하였다. 이 외의 배양조건은 상기 항목 4-1.에서 설명된 내용과 같으며, 결과는 도 8 에 나타내었다. IPTG 의 경우 상기 항목 4-2.의 결과와 마찬가지로 초기 성장이 저해됨을 확인하였으며, 락토스를 첨가한 군에서는 이러한 양상이 확인되지 않았다. 락토스 0.5%를 초기에 첨가했을 경우 D-카이로 -이노시틀의 생산속도가 가장 빨랐으며, 0D 7 에서 첨가한 경우 그만큼 D-카이로 -이노시를도 늦게 생산되기 시작하는 양상을 확인하였다. 락토스는 균체가 성장하면서 발현되는 lacZ 유전자에 의해 알로락토스 (allolactose)가 형성되며 이것이 본 발명의 발현백터의 T7 프로모터를 작동시키게 된다. 즉, 균체가 고농도의 마이오ᅳ이노시를, 즉 높은 삼투압 환경에 적웅이 되며 성장하기 시작해야만 프로모터가 작동하므로, 이러한 락토스에 의한 발현이 균체에 대한 독성을 감소시키는 것으로 보인다.
이상의 실시예 4 를 통해 확립한 최적의 배양조건은 TB 배지를 사용하여 락토스를 배양배지에 미리 첨가하고 37°C에서 배양하는 것으로 정하였으며, 이 조건을 이용하여 이후 실험을 수행하였다.
실시예 5: D-카이로-이노시를 전환 유전자들의 활성 비교 상기 실시예 3 에서 구축한 이노시를 디하이드로게나아제 및 이노소스 이소머라아제를 발현하는 발현 백터들인 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf , PC0LAD-AGRL628-AGRL627, pCOLAD-Bs iolG-BsiolI, pCOLAD-Cg i o 1 G-Cg i o 110169 pCOLAD-Paidh-PaiolI, pCOLAD-Cgiep-Paiol I 각각의 백터들을, 실시예 2 에서 트랜스포터 활성을 확인한 이노시를 트랜스포터인 pACYCD-StiolTl-StiolT2 재조합 플라스미드 백터와 함께 대장균 E. coli) BL21 (DE3)에 도입하여 6 종의 재조합 균주를 제작하였다. 제작한 재조합 균주들은 실시예 4 에서 실험한 최적 발효조건을 이용하여 배양하였다. 배양의 측정 결과는 도 9에 나타내었다.
D-카이로 -이노시를의 대수적인 생산시기 (약 8 시간 에서 24 시간)의 생산속도 (도 9 의 패널 C)에서 볼 때 재조합 플라스미드 pCOLAD— AGRL628- AGRL627 의 경우 0.09 로서 가장 낮았으며, pCOLAD-sAt iep-sAt iepf (W0 02/055715)의 경우 0.14로서 역시 낮았다. 본 발명에서 선별한 유전자에서 마이오-이노시를 디하이드로게나아제는 Cgiep 와 이노소스 이소머라아제는 Paioll 의 조합, 즉, pCOLAD-Cgiep-PaiolI 에서 기울기 0.48 로서 가장 빠르게 D-카이로 -이노시를로 전환되는 것으로 나타났으며, 이 값은 가장 낮은 pC0LAD-AGRL628-AGRL627 의 경우보다 약 5.3 배 빠르며, 두 번째 속도를 나타낸 pCOLAD-CgiolG-Cgi ol 10169 (0.26)의 경우 보다도 1.8 배 높았다. 40 시간 배양 후의 생산된 D-카이로-이노시를 농도 역시 pCOLAD- Cgiep-Paioll 의 경우에서 가장 높았다. 최종 균체 성장속도는 전체적으로 약 12 시간 이전에 정지기에 들었으며, 균체 농도 역시 이상의 D-카이로- 이노시를의 생산 속도에 비례하여 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf 에서 가장 낮았고, pCOLAD-Cgiep-PaiolI 에서 가장 높았다. 결과적으로 pCOLAD-Cgiep- Paioll 를 도입했을 경우 150g/L 의 마이오-이노시를로부터 22.7 g/L 의 D- 카이로 -이노시를을 전환하였으며, 전환율은 약 15.1%였다. 전환율이 가장 낮았던 pCOLAD-sAtiep-sAtiepf 의 경우 약 12.5 g/L 를 전환하여 전환율은 약 8.3%에 머물렀다. 상기 결과로부터 pCOLAD-Cgiep-PaiolI 를 도입한 재조합 대장균주를 생산균주로 하여 발효 실험을 진행하였다.
실시예 6: 재조합 균주의 발효를 통한 생산량 증대
상기에서 수행한 배양 최적화 결과와 우수한 유전자의 선별 결과 얻어진 최적 재조합 균주를 이용하여 1 리터 발효를 수행하였다. 발효는
MARADO-PDA [ (주)씨엔에스, 대전, 한국)] 3 리터 발효조에 1 리터 용량으로 실시하였다. 종배양 (seed culture)은 2YT 배지를 이용하였으며 , 본 배양은 TB 배지에 15% 마이오 -이노시를, 0.5% 락토스를 첨가하였다. 0D 3 까지 배양한 종배양액 50 mL 을 온도, pH, DO 를 안정화시킨 발효조에 접종한후 약 20 시간 동안 배양하였다. 발효온도는 37°C로 조절하고ᅳ pH 는 암모니아수를 이용하여 7.0 으로 조절하였으며, DO 는 40%이하로 감소한 후부터 RPM 을 증가시키면서 40%이상으로 유지하였다. 발효결과는 도 10 에 나타내었다. 균체는 18 시간에 최대 약 0D 18 에 도달하였으며, D- 카이로 -이노시를은 약 12 시간에 평형농도인 약 20 g/L 에 도달한 후 이후 증가하지 않았다. 실시예 7: 생산된 D-카이로 -이노시틀의 분획 및 GC-MS 분석
미생물로부터 생산된 D—카이로 -이노시를의 분획은 HPLCXShimadzu LClOAvp)를 이용하여 행하였다. 분석조건은 Kromasil 5NH2 프렙 칼럼 (10 睡 X 250 mm) , 이동상 75% 아세토니트릴, 칼럼 온도 40°C, RI 검출기를 이용하였고, 100 ^의 시료를 주입하여 4 mL/분의 유속으로 홀리면서 해당 피크 (peak)에 대한 용출액을 취하였다. 수집한 용출액은 진공 농축기 (EYELA, 일본)를 이용하여 농축 및 건조한 후 5 mL 의 증류수에 녹여 GC-MS 분석을 실시하였다.
GC-MS 분석은 Shimadzu GCMS-QP2010을 이용하였다. 분석 전 처리는 1-트리메틸실릴-이미다졸 (1-trimethylsylyl-imidazole)과
피리딘 (pyridine)을 1:1로 흔합한 용액 1 mL에 시료 1 mg을 녹인 후,
70°C에서 30분 반응시켜 분석에 이용하였다. 분석조건은 HP-1 capillary column (30 m Length, 0.25 Dim ID, 0.25 Film)을 이용하였고, Split mode injector (1:50)에 1 의 시료를 주입하여, 1 mL/분의 유속으로 분석하였다. 시료 주입 온도는 28CTC, 오븐 온도는 150°C에서 2분 동안 유지한 후 20°C/분 속도로 300°C까지 상승 후 2분 유지하였다. 분석결과에 대한 MS 프로파일을 표준시료 D-카이로-이노시를 (Sigma 468045, 미국)의
프로파일과 비교하였으며, 그 결과를 도 11에 나타내었다. 표준시료와 비교한 결과 정확히 일치하는 것을 확인하였다. 이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 실시예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.