WO2012008465A1 - 核酸多糖複合体 - Google Patents

核酸多糖複合体 Download PDF

Info

Publication number
WO2012008465A1
WO2012008465A1 PCT/JP2011/065908 JP2011065908W WO2012008465A1 WO 2012008465 A1 WO2012008465 A1 WO 2012008465A1 JP 2011065908 W JP2011065908 W JP 2011065908W WO 2012008465 A1 WO2012008465 A1 WO 2012008465A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
polysaccharide
nucleic acid
complex
polydeoxyadenine
phosphorothioated
Prior art date
Application number
PCT/JP2011/065908
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
櫻井 和朗
Original Assignee
ナパジェン ファーマ,インコーポレテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ナパジェン ファーマ,インコーポレテッド filed Critical ナパジェン ファーマ,インコーポレテッド
Priority to JP2012524564A priority Critical patent/JPWO2012008465A1/ja
Priority to US13/810,533 priority patent/US20130267576A1/en
Priority to EP11806795.8A priority patent/EP2594592A4/en
Publication of WO2012008465A1 publication Critical patent/WO2012008465A1/ja

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/715Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/56Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule
    • A61K47/61Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule the organic macromolecular compound being a polysaccharide or a derivative thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08BPOLYSACCHARIDES; DERIVATIVES THEREOF
    • C08B37/00Preparation of polysaccharides not provided for in groups C08B1/00 - C08B35/00; Derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08BPOLYSACCHARIDES; DERIVATIVES THEREOF
    • C08B37/00Preparation of polysaccharides not provided for in groups C08B1/00 - C08B35/00; Derivatives thereof
    • C08B37/0006Homoglycans, i.e. polysaccharides having a main chain consisting of one single sugar, e.g. colominic acid
    • C08B37/0024Homoglycans, i.e. polysaccharides having a main chain consisting of one single sugar, e.g. colominic acid beta-D-Glucans; (beta-1,3)-D-Glucans, e.g. paramylon, coriolan, sclerotan, pachyman, callose, scleroglucan, schizophyllan, laminaran, lentinan or curdlan; (beta-1,6)-D-Glucans, e.g. pustulan; (beta-1,4)-D-Glucans; (beta-1,3)(beta-1,4)-D-Glucans, e.g. lichenan; Derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/111General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315Phosphorothioates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • C12N2310/3517Marker; Tag
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/50Methods for regulating/modulating their activity
    • C12N2320/51Methods for regulating/modulating their activity modulating the chemical stability, e.g. nuclease-resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/50Methods for regulating/modulating their activity
    • C12N2320/53Methods for regulating/modulating their activity reducing unwanted side-effects

Definitions

  • the present invention relates to a nucleic acid polysaccharide complex having excellent stability and low cytotoxicity, and a method for producing the same.
  • Non-Patent Document 1 The concept of antisense therapy was proposed by Zamecnik and Stephenson in the 1970s. They found for the first time that a short sequence of oligonucleotides complementary to a specific part of the target mRNA can inhibit the expression of the corresponding protein (see Non-Patent Document 1). Such biologically functional oligonucleotides are used as antisense oligonucleotides (ASOs) and a large number of ASOs are currently in preclinical and clinical trials in the areas of HIV / AIDS and cancer. Previous studies have shown that poor ASO cell transfer and nuclease vulnerability significantly reduce in vivo activity.
  • ASOs antisense oligonucleotides
  • nucleic acid analogs In order to overcome such drawbacks, two main approaches have been proposed: nucleic acid analogs and target delivery.
  • ASO in which phosphorothioate (S) is applied to the phosphodiester bond portion is known to be excellent in terms of nuclease resistance and cellular uptake.
  • Phosphorothioated ASO is obtained by replacing the oxygen atom of a phosphodiester (PO) group with a sulfur atom.
  • SPG schizophyllan
  • dectin-1 of antigen-presenting cells can be used as a transport carrier.
  • SPG belongs to the ⁇ -1,3-glucan family and has a clockwise triple helix structure in a neutral aqueous solution and a single-stranded structure in an alkaline solution (sodium hydroxide aqueous solution of 0.25N or more). It is known. When the alkaline solution of SPG is neutralized to pH 7-8, the single strand regenerates the original triple helix structure by hydrophobic and hydrophilic binding interactions.
  • a specific polynucleotide for example, a nucleic acid homopolymer such as polydeoxyadenine
  • two SPGs and one polynucleotide form a complex.
  • a technique using ⁇ -1,3-glucan such as SPG has been energetically studied.
  • a technology for adding a nucleic acid homopolymer such as polydeoxyadenine to a functional nucleic acid so that a complex of a functional nucleic acid and ⁇ -1,3-glucan such as SPG has been reported (for example, see Patent Document 1).
  • ASO to which a polydeoxyadenine chain is added does not usually form a complex with SPG in a short heterosequence (for example, a polynucleotide in which bases are randomly arranged such as antisense DNA). This is because particularly long polydeoxyadenine chains form a stable complex.
  • PS complex stable SPG complex
  • the main object of the present invention is to provide a nucleic acid polysaccharide complex of an antisense DNA excellent in stability and reduced in cytotoxicity and a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton.
  • the inventors of the present invention have made extensive studies to solve the above problems, and by adjusting the degree of S-binding (phosphorothioate) of a polysaccharide binding site (ie, polydeoxyadenine moiety) in a nucleic acid polysaccharide complex, It was found that a nucleic acid polysaccharide complex having excellent stability and sufficient antisense activity for suppressing the expression of a target gene can be obtained efficiently. Furthermore, the present inventors have also found that such a nucleic acid polysaccharide complex has reduced cytotoxicity. The present invention has been completed by making further improvements based on such findings. That is, the present invention provides the following aspects of the invention. Item 1.
  • Item 3. The nucleic acid polysaccharide complex according to claim 1, wherein at least 20% of the phosphodiester bond of polydeoxyadenine is phosphorothioated.
  • Item 4. The nucleic acid polysaccharide complex according to any one of Items 1 to 3, wherein 25 to 90% of the phosphodiester bond of polydeoxyadenine is phosphorothioated.
  • Item 5. The nucleic acid polysaccharide complex according to any one of Items 1 to 4, which is used for suppressing expression of a target gene.
  • Item 6. Item 6.
  • a pharmaceutical composition comprising the nucleic acid polysaccharide complex according to any one of Items 1 to 5 and a pharmaceutically acceptable carrier.
  • a method for producing a nucleic acid polysaccharide complex comprising a step of binding an antisense DNA having polydeoxyadenine (dA) as a polysaccharide binding site and a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton via the polysaccharide binding site here
  • dA polydeoxyadenine
  • the nucleic acid polysaccharide complex at least a part of the phosphodiester bond at the polysaccharide binding site is phosphorothioated, but the phosphodiester bond between the antisense DNA and polydeoxyadenine is all phosphorothioated. Absent.
  • a method for introducing a nucleic acid polysaccharide complex into a target cell comprising the step of bringing the nucleic acid polysaccharide complex according to any one of Items 1 to 5 into contact with the target cell.
  • Item 6. A method for suppressing expression of a target gene, comprising the step of bringing the nucleic acid polysaccharide complex according to any one of Items 1 to 5 into contact with a cell having the target gene.
  • Cytotoxicity of nucleic acid polysaccharide complex including the step of binding antisense DNA having polydeoxyadenine (dA) as a polysaccharide binding site and polysaccharide having ⁇ -1,3-glucan skeleton via the polysaccharide binding site How to reduce, Here, 20 to 90% of the phosphodiester bonds of polydeoxyadenine are phosphorothioated. Item 12.
  • dA polydeoxyadenine
  • the nucleic acid polysaccharide complex is a complex of an antisense DNA having polydeoxyadenine (dA) as a polysaccharide binding site and a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton, which is a polysaccharide.
  • dA polydeoxyadenine
  • a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton which is a polysaccharide.
  • the nucleic acid polysaccharide complex composed of a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton and antisense DNA of the present invention is excellent in stability and has reduced cytotoxicity, so that it can be safely used in antisense therapy. Can be used.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention can exhibit an excellent antisense effect.
  • (A) shows the migration pattern of polyacrylamide gel electrophoresis of the complex (c), naked (n) (dA) 20 , (dA) 30 , and (dA) 40 samples.
  • (B) shows the migration pattern of polyacrylamide gel electrophoresis of AS- (dA) 20 , AS- (dA) 30 , and AS- (dA) 40 samples. Naked (n) (dA) 20 means dA that does not form a complex with SPG.
  • (A) shows the migration pattern of polyacrylamide gel electrophoresis of complex (c) and naked (n) (dA) 40 samples having different PS contents.
  • (B) shows gel permeation chromatograms of a complex composed of PS, SPG and AS-ODN, and a complex composed of PO, SPG and AS-ODN.
  • the chromatogram detected the UV absorbance at 260nm.
  • the PS content dependence of CD spectrum of naked (dA) 40 ((A) in the figure) and (dA) 40 complex ((B) in the figure) measured at 20 ° C. is shown.
  • (C) shows the temperature dependence of the CD spectrum of the complex at 282 nm.
  • (D) shows Tm of (dA) 40 with different PS content. The comparison of the migration pattern of the gel electrophoresis of the composite consisting of SPG and ASO- (dA) 40 with different PS contents is shown.
  • n and c represent complexes with naked ASO and SPG, respectively.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention has a triple helical structure composed of a double strand of polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton and a single strand of antisense DNA having a base sequence complementary to a target sequence.
  • a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton which is a triple-helical polysaccharide, is once dissolved in an organic solvent or an alkaline aqueous solution to form a single-chain solution.
  • the antisense DNA constituting the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention has a polydeoxyadenine (dA) tail at the end.
  • Antisense DNA is single-stranded DNA that can suppress the expression of a target gene by suppressing transcription of the target gene into mRNA.
  • the number of bases constituting the antisense DNA is not particularly limited, but is usually 10 to 35, preferably 15 to 30, and more preferably 16 to 24. There are no particular limitations on the type of target gene that is subject to antisense DNA expression suppression, and it can be appropriately determined according to the therapeutic purpose and the like.
  • the base sequence of antisense DNA can be designed by a conventionally known method according to the type of target gene.
  • the dA tail constituting the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention functions as a polysaccharide binding site.
  • the number of deoxyadenines constituting the dA tail is not particularly limited as long as it can form a complex with a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton described later. 10 to 100, preferably 20 to 100, more preferably 20 to 80, and still more preferably 40 to 60.
  • a good complex is formed with a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton, and the nucleic acid polysaccharide complex thus obtained has high resistance to degrading enzymes.
  • the antisense DNA may be one obtained by adding various modifications by a commonly used method.
  • S phosphorothioated
  • the present invention does not include those in which dA tail and antisense DNA all phosphodiester binding moieties are converted to S.
  • the degree of S conversion in the antisense portion varies depending on the intended treatment and can be adjusted as appropriate. For example, when the enzyme resistance to nuclease is required, the S conversion rate is preferably close to 100%, and when there is a concern about side reactions due to S conversion, the closer to the natural type (ie, S conversion rate 0%) preferable.
  • the yield and stability of the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention are improved by phosphorylating (S) the phosphodiester bond of polydeoxyadenine (dA) at the polysaccharide binding site within a predetermined range. Cytotoxicity can be reduced.
  • Polydeoxyadenine can be converted to S according to a conventionally known method.
  • the distribution of S conversion in the dA tail portion is not particularly limited, and desired S conversion may be performed at an arbitrary position.
  • the S conversion is about 20 to 90%, preferably about 30 to 70%, more preferably about 50 to 70%.
  • the S conversion rate of the dA tail portion indicates the ratio (%) of phosphodiester bonds that have been converted to S with respect to the total number of phosphodiester bonds in the dA tail.
  • the S-phosphodiester bond is a bond structure in which one oxygen atom of the phosphoric acid residue of the phosphodiester bond is substituted with a sulfur atom.
  • the SA conversion rate is about 20 to 90%, preferably about 30 to 70%, more preferably 50 to 50%, assuming that the total length of the dA tail is 100%. About 70%.
  • the S conversion rate is about 20 to 90%, preferably about 30 to 70%.
  • the polydeoxyadenine S conversion rate is at least 20% or more, preferably about 25 to 90%, more preferably 30 to 30%. It is desirable to be about 70%.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention contains a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton as a part having a desired function other than the antisense effect.
  • Polysaccharides having a ⁇ -1,3-glucan skeleton are delivered into the details through signals induced by binding to the aforementioned cell surface receptor, Dctin-1.
  • ⁇ -1,3-glucan is a polysaccharide in which glucose is bound by ⁇ 1 ⁇ 3 glucoside bonds, and the ratio of the number of glucose residues in the side chain to the number of glucose residues in the main chain (hereinafter abbreviated as the side chain rate).
  • the side chain rate Various types are known.
  • the side chain A polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton having a relatively high rate is preferred.
  • the polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton used in the present invention include schizophyllan, curdlan, lentinan, perchiman, glyforane, Examples include scleroglucan.
  • schizophyllan is a preferred polysaccharide in the present invention because it can make the introduction into cells and the resistance to enzymatic degradation more remarkable.
  • a functional group (amino group, amino acid group, peptide group, cholesterol group, etc.) having affinity for a cell receptor is obtained by chemically converting the glucose residue of the side chain of schizophyllan. It is possible to introduce.
  • the molecular weight of the polysaccharide used in the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention is not particularly limited, and may be appropriately set according to the type of polysaccharide used, the chain length of the dA tail described above, and the like. Specifically, the molecular weight of the polysaccharide is usually 25,000 to 2500,000, preferably 25,000 to 150,000. In addition, a functional molecule may be bound to the polysaccharide directly or via a linker.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention has a useful function based on the functional molecule.
  • a linker for example, PEG etc. are mentioned.
  • functional molecules include peptides, proteins, sugars, amino acids, DNA, RNA, low molecular organic / inorganic materials, cholesterol, dendrimers, lipids, polymer materials, and the like.
  • peptides examples include peptides composed of 3 to 40, preferably 6 to 30, more preferably 8 to 25 amino acids.
  • cell membrane permeation peptides octaarginine (R8), penetratin, etc.
  • nuclear localization signal peptide sequences HV-1 Tat, SV40 T antigen, etc.
  • nuclear export signal peptides HV-1 Rev, MAPKK etc.
  • cell membrane fusion peptides gp41, vial fusion peptides etc.
  • R8 is preferably used in the present invention.
  • R8 has an action of promoting introduction into the cell, and the use of a polysaccharide to which R8 is bound provides the advantage that the nucleic acid polysaccharide complex can be more efficiently introduced into the cell.
  • proteins existing in vivo proteins having a pharmacological action, proteins having a molecular recognition action, etc. can be used.
  • Examples of the protein include exportin / importin protein, febronectin, avidin, antibody, etc. Can be mentioned.
  • sugar examples include monosaccharides such as glucose, galactose, glucosamine, and galactosamine, and oligosaccharides or polysaccharides obtained by arbitrarily combining these.
  • low-molecular organic / inorganic materials examples include cationic molecules such as spermine and spermidine; fluorescent substances such as FITC, Alexa, Cy3, and Cy5; biotin; quantum dots; and gold fine particles.
  • dendrimer examples include polyamide amine dendrimer.
  • lipid examples include linoleic acid and DOPE (1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine).
  • polymer material examples include polyethylene glycol and polyethyleneimine.
  • a peptide, a cationic molecule, and polyethylene glycol are preferable, and a peptide is more preferable.
  • molecules having cell membrane permeability (cell membrane-permeable molecules) and molecules capable of imparting degrading enzyme resistance to antisense DNA are preferred.
  • examples of the cell membrane-permeable molecule include peptides and the like, and examples of the molecule capable of imparting degrading enzyme resistance to antisense DNA include polyethylene glycol.
  • modified polysaccharides are also included in the polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton in the present invention.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention is formed by complexing the above-mentioned polysaccharide with the antisense DNA having the dA tail.
  • the complex structure of the antisense DNA and the polysaccharide is not particularly limited, but usually a triple-stranded helical structure in which a double-stranded polysaccharide is complexed with a single-stranded antisense DNA is preferable. .
  • the formation of such a triple chain helical structure can be specifically performed according to the following method.
  • the polysaccharide has a triple helical structure in nature or in water.
  • This polysaccharide is dissolved in a polar solvent such as DMSO (dimethyl sulfoxide) to form a single strand, and then antisense DNA having a dA tail is added, and the solvent is returned to water (regeneration process).
  • a structure (association structure) complexed in a triple helix type consisting of the main chain portion and the two polysaccharides is formed.
  • Such a complex of a polynucleotide and a polysaccharide is considered to be formed mainly through hydrogen bonding and hydrophobic interaction.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention having such a structure can be prepared according to a known method. Specifically, a method of production in the following steps (1) to (3) is exemplified: (1) A polynucleotide-binding antisense DNA to which polydeoxyadenine is bound is prepared according to a known method. ) Separately preparing the polysaccharide, or preparing the polysaccharide to which a functional molecule is bound directly or via a linker. (3) Then, using polydeoxyadenine bound to antisense DNA and the polysaccharide To form a complex.
  • the present invention relates to a nucleic acid polysaccharide complex that binds an antisense DNA having polydeoxyadenine (dA) as a polysaccharide binding site and a polysaccharide having a ⁇ -1,3-glucan skeleton via the polysaccharide binding site.
  • a manufacturing method is also provided.
  • at least a part of the polydeoxyadenine part (dA tail part) is converted to S, and the S conversion rate is as described above.
  • the number of bases of the antisense strand and the dA tail added thereto are It is appropriately set according to the number of adenine and the molecular weight of ⁇ -1,3-glucan and cannot uniquely limit the preferred molecular number ratio.
  • the number ratio (mole) of antisense DNA is about 1: 2 to 1:30.
  • the number ratio (mole) is 1: 8 to 1:20.
  • a molecular number ratio (mole) of 1: 2 to 1: 5 is more preferable.
  • the stoichiometric ratio of the complex is 2: 1 as the ratio of the number of moles of glucose sugar, which is a repeating unit of ⁇ -1,3-glucan skeleton, to the number of moles of base of polydeoxyadenine. Since polysaccharides and polydeoxyadenine are usually polymers, the stoichiometric ratio of the complex cannot be defined by the number of moles of polysaccharide and polydeoxyadenine. Experimentally, it is convenient to discuss the weight ratio of sugar to nucleic acid to react and the ratio of the number of molecules.
  • the stoichiometric ratio of the complex is 2: 1, but if it is necessary to protect the nucleic acid firmly, more sugar is added, and in order to exert the effect of antisense nucleic acid, more nucleic acid is added. be able to.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention can be used as a pharmaceutical composition for the purpose of suppressing the expression of a target gene since it can suppress the expression of a target gene in the cell by being introduced into the cell.
  • the pharmaceutical composition can be prepared by appropriately combining a pharmaceutically acceptable carrier with the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention as an active ingredient.
  • a pharmaceutically acceptable carrier include aqueous carriers such as purified water, sugar-containing aqueous solutions, buffers, physiological saline, and RNase-free water; excipients and the like.
  • the dose of the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention is not particularly limited as long as a desired gene suppression action can be exerted, but the amount of nucleic acid to be administered once per 1 kg of body weight is preferably 0.001 mg to 10 mg, It can be appropriately set according to the symptom of the administration subject, administration route, and the like.
  • the dosage form, administration method, and the like of the pharmaceutical composition can be a known form as a pharmaceutical, and can be appropriately set according to the type and use of antisense DNA, the disease site, and the like.
  • the present invention provides a method for introducing a nucleic acid polysaccharide complex into a target cell.
  • the amount and method of introduction of the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention into the cell are the same as in the case of conventional antisense DNA, and the target gene has an amount of the nucleic acid polysaccharide complex effective for suppressing the expression of the target gene. What is necessary is just to make it contact with a cell and take up the said nucleic acid polysaccharide complex in the said cell.
  • the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention alone exhibits excellent intracellular translocation ability, it can be used without using a conventional gene transfer reagent used for introducing antisense DNA into cells, It is also possible to reduce the amount of gene introduction reagent used and introduce it into cells.
  • the expression suppression of the target gene of the nucleic acid polysaccharide complex of the present invention may be performed in vivo, or in vitro or ex vivo.
  • the present invention provides a method for stabilizing a nucleic acid polysaccharide complex, characterized in that the phosphodiester bond of the dA tail moiety is converted to 20-90%, preferably 30-70%, more preferably 50-70% phosphorothioate, Also provided is a method for reducing the cytotoxicity of a nucleic acid polysaccharide complex, characterized by phosphorylating 20-90%, preferably 30-70%, of the phosphodiester bond of the dA tail moiety.
  • the present invention also provides use of the nucleic acid polysaccharide complex for suppressing expression of a target gene in a cell. Furthermore, the present invention provides a method for suppressing the expression of a target gene using the nucleic acid polysaccharide complex. In these uses and methods, the nucleic acid polysaccharide complex, its method of use and the like are as described above.
  • schizophyllan is sometimes referred to as “SPG” and polydeoxyadenine is sometimes referred to as “(dA) x”.
  • antisense DNA may be referred to as “AS”.
  • Circular dichroism spectroscopy Circularly polarized light in the 240 to 320 nm region was measured with a Jasco J-802 circular dichroism dispersometer (manufactured by JASCO Corporation) at 20 to 80 ° C. using a 1 cm quartz cell with a thermostatic bath.
  • mice were injected intraperitoneally with 3 mL of 3% thioglycolate medium, 3 days later, intraperitoneally washed with RPMI 1640 (6 mL), and intraperitoneal macrophages were collected. The washing solution was stored and centrifuged at 100 ⁇ g for 5 minutes. Primary macrophages were cultured in RPMI 1640 medium supplemented with 10% FCS, 100 U / ml penicillin, 0.1 mg / ml streptomycin under conditions of 37 ° C. and 5% CO 2 .
  • the (dA) 40 samples were 6 (dA) 40 samples with different PS content (S conversion rate) (PS content: 0 / 39PS, 8 / 39PS, 13 / 39PS, 20 / 39PS, 26 / 39PS, 39 / 39, PS) was prepared.
  • the six (dA) 40 samples are shown in Table 1 below.
  • the (dA) 40 sample is one in which various dA tails are directly bound to the 3 ′ end of antisense TNF- ⁇ (aTNF).
  • FIG. 2A is a comparison of gel permeation chromatograms (UV ⁇ 260 nm) after 39 / 39PS and 0 / 39PS are complexed respectively.
  • FIG. 3-1 shows CD spectra in the 240 to 320 nm region of all PS (dA) 40 and PO (dA) 40 samples at 20 ° C. Although the overall shape of the spectrum is common to all samples, the intensity of the negative peak at 248 nm was slightly attenuated as the PS content increased. Since this wavelength region is associated with increased CD between base regions, the similarity of the CD spectrum means that all (dA) 40 have the same structure.
  • the CD spectrum changes significantly as shown in FIG. In B of FIG. 3-1, formation and PO- (dA) 40 of the SPG complex, and by comparing the naked PO- (dA) 40, as previously reported, the dA is SPG complex It has been shown to adopt a new structure (J. Kurreck, Eur J Biochem 270 (2003) 1628-44 and SM Boye et al., Antisense Nucleic Acid Drug Dev 12 (2002) 95-102). Comparing the combined spectra, the four complexes from 0 / 39PS to 20 / 39PS / SPG showed almost the same spectrum. On the other hand, when the S content was increased to 39/39, a spectrum different from that of other complexes was shown. The negative peak at 39/39 PS decreased at 248 nm and increased at 264 nm.
  • C in FIG. 3-2 is a plot of CD intensity at 282 nm versus temperature.
  • the CD strength of the composite is stronger than that of naked at low temperatures.
  • the CD intensity of the composite decreased and overlapped with the corresponding (dA) 40 sample intensity.
  • the dissociation temperature Tm (melting temperature) was plotted in D of FIG. 3-2.
  • PS content increased from 0/39 to 8/39
  • Tm increased from 49 ° C to 59 ° C, but further increases in PS content did not significantly increase Tm. From these results, the modification of the PS skeleton leads to a more stable complex than the PO skeleton, and 20% modification (S) alone is sufficient to give the same increase in Tm as 100% modification. It was confirmed that there was.
  • the present inventors conducted tests as follows for the TNF- ⁇ gene silencing effect using the ASO sample prepared as described above.
  • the SPG complex is taken up into cells via dectin-1, which is a major receptor that recognizes ⁇ -1,3-glucan on various antigen-presenting cells (APC) including macrophages and dendritic cells.
  • APC antigen-presenting cells
  • ODN / SPG complex was administered, and then stimulated with LPS to secrete TNF- ⁇ .
  • the amount of TNF- ⁇ secreted against PS content was plotted in the graph of FIG. None of the naked antisense oligonucleotides reduced TNF- ⁇ secretion.
  • the SPG complex showed TNF- ⁇ silencing. As PS content increased, the silencing effect gradually increased.
  • the antisense portion does not necessarily have to be a PS skeleton.
  • SEQ ID NO: 1 is the nucleotide sequence A 40 is attached to the 3 'end of the sequence (aTNF).
  • SEQ ID NO: 2 is a base sequence in which (AsAAAA) 8 is bound to the 3 ′ end of the sequence (aTNF).
  • SEQ ID NO: 3 is a base sequence in which (AsAA) 13 A is bound to the 3 ′ end of the sequence (aTNF).
  • SEQ ID NO: 4 is a base sequence in which (AsA) 20 is bound to the 3 ′ end of the sequence (aTNF).
  • SEQ ID NO: 5 is the base sequence in which (AsAsA) 13 A. is bound to the 3 ′ end of the sequence (aTNF).
  • SEQ ID NO: 6 is the base sequence in which (As) 39 A is bound to the 3 ′ end of the sequence (aTNF).

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Materials Engineering (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

 本発明は、収率が高く、安定性に優れ、細胞毒性が低減された核酸多糖複合体を提供する。すなわち、本発明は、多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖との核酸多糖複合体であって、ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されている複合体(但し、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されている場合を除く)を提供する。

Description

核酸多糖複合体
 本発明は、安定性に優れた低細胞毒性の核酸多糖複合体、及びその製造方法に関する。
 アンチセンス療法のコンセプトは、1970年代にZamecnikとStephensonによって提案された。彼らは、標的mRNAの特定部分に対する相補的なオリゴヌクレオチドの短配列が対応するタンパク質の発現を阻害し得ることを初めて見出した(非特許文献1を参照)。そのような生体機能を有するオリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)として使用され、現在多数のASOがHIV/AIDS及び癌の領域において前臨床及び臨床試験の段階にある。過去の研究により、ASOの細胞移入の乏しさ、ヌクレアーゼに対する脆弱性は、in vivoでの活性を著しく低下させることが知られている。また、In vivo試験では、十分な生物学的効果を達成するため、動物モデルに対して10mg/kg以上もの過剰投与試験が行われることがあった。しかしながら、過剰なASOは毒性及び副作用を引き起こす可能性があり、そもそも商業的及び医学的観点からは実用的とは言えなかった。このような欠点を克服するため、核酸アナログと標的輸送(target delivery)の主に2つのアプローチが提案された。
 様々な核酸アナログのうち、ホスホジエステル結合部分にホスホロチオエート化(S化)が施されたASOはヌクレアーゼ耐性と細胞取り込みの点で優れていることが知られている。ホスホロチオエート化ASOは、ホスホジエステル(PO)基の酸素原子が、硫黄原子で置換されたものである。
 一方、標的輸送に使用される天然型多糖であるシゾフィラン(SPG)は、抗原提示細胞のdectin-1によって認識され、輸送担体として使用できることが知られている。SPGは、β-1,3-グルカンファミリーに属し、中性水溶液中で右回りの3重螺旋構造をとり、アルカリ溶液(0.25N 以上の水酸化ナトリウム水溶液)中で1本鎖の構造をとることが知られている。SPGのアルカリ溶液がpH7~8に中和されると、一本鎖は疎水性及び親水性の結合相互作用により本来の3重螺旋構造を再生する。中和工程において特定のポリヌクレオチド(例えば、ポリデオキシアデニン等の核酸ホモポリマー)が存在すれば、2本のSPGと1本のポリヌクレオチドが複合体を形成する。このような技術を基礎として、SPG等のβ-1,3-グルカンを利用する技術が精力的に検討されている。例えば、これまでに、機能性核酸と、SPG等のβ-1,3-グルカンとの複合体の形成が可能になるように、ポリデオキシアデニン等の核酸ホモポリマーを機能性核酸に付加させる技術が報告されている(例えば、特許文献1参照)。また、SPG等のβ-1,3-グルカンの上記特性を利用することにより、β-1,3-グルカンを遺伝子キャリアーとして使用する技術についても報告されている(例えば、特許文献2参照)。更に、SPG等のβ-1,3-グルカンと核酸との親和性を高めるために、β-1,3-グルカンの1,6グルコピラノシド分岐の少なくとも一部に、カチオン性官能基、ステロイド官能基、アミノ酸性官能基、インターカレーター性官能基等の核酸結合性官能基を付加する技術も報告されている(例えば、特許文献3参照)。
 一方、ポリデオキシアデニン鎖を付加したASOは、短いヘテロ配列(例えばアンチセンスDNA等の様なランダムに塩基が配列しているようなポリヌクレオチド)部分には、通常SPGと複合体を形成しない。特に長いポリデオキシアデニン鎖は安定な複合体を形成するからである。これまでに、本発明者らは、ホスホロチオエート化されたASOにホスホロチオエート化されたポリデオキシアデニンを付加したものは安定なSPG複合体(PS複合体)を形成することを確認している(非特許文献2を参照)。しかしながら、PS複合体を使用する場合、ホスホロチオエートに起因する副作用(細胞毒性)が引き起こされることが懸念されている。このような副作用を抑制するための技術については、未だ解決策が見出されていないのが現状である。
 このような背景から、SPGとアンチセンスDNAの安定な複合体を効率よく得るための方法、ならびにPS複合体の副作用抑制するための技術の開発が望まれていた。
P.S.Zamecnik et al., Proc Natl Acad Sci USA 75(1978) 280-4 Bull. Chem. Soc. Jpn., 77, 1101-1110 (2004)
国際公開第2007/058323号パンフレット 国際公開第01/34207号パンフレット 国際公開第02/072152号パンフレット
 本発明は、安定性に優れ、細胞毒性が低減されたアンチセンスDNAとβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との核酸多糖複合体を提供することを主な目的とする。
 本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意研究を行ったところ、核酸多糖複合体における多糖結合部位(すなわちポリデオキシアデニン部分)のS化(ホスホロチオエート化)の程度を調節することにより、安定性に優れ、標的遺伝子の発現抑制に十分なアンチセンス活性を有する核酸多糖複合体が効率よく得られることを見出した。さらに、本発明者らは、このような核酸多糖複合体は、細胞毒性が低減されることも見出した。本発明は、かかる知見に基づいて、更に改良を重ねることにより完成したものである。
 即ち、本発明は、下記の態様の発明を提供する。
項1. 多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、多糖であるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との核酸多糖複合体であって、ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されている複合体、
 但し、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されている場合を除く。
項2. 前記β-1,3-グルカン骨格を有する多糖がシゾフィランである、項1に記載の核酸多糖複合体。
項3. ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の少なくとも20%がホスホロチオエート化されていることを特徴とする請求項1又は2に記載の核酸多糖複合体。
項4. ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の25~90%がホスホロチオエート化されていることを特徴とする、項1~3のいずれかに記載の核酸多糖複合体。
項5. 標的遺伝子の発現抑制のために使用される、項1~4のいずれかに記載される核酸多糖複合体。
項6. 項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
項7. 多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む核酸多糖複合体の製造方法
 ここで、前記核酸多糖複合体は、多糖結合部位のホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されているが、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されているものではない。
項8. 項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体を、標的細胞に接触させる工程を含む、核酸多糖複合体を標的細胞に導入する方法。
項9. 項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体を、標的遺伝子を有する細胞に接触させる工程を含む、標的遺伝子の発現抑制方法。
項10. 多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む、核酸多糖複合体の安定化方法、
 ここで、前記ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち20~90%がホスホロチオエート化されているものである。
項11. 多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む、核酸多糖複合体の細胞毒性を低減する方法、
 ここで、前記ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち20~90%がホスホロチオエート化されているものである。
項12. 標的遺伝子の発現抑制剤の製造のための、核酸多糖複合体の使用であって、
 前記核酸多糖複合体が、多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、多糖であるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との複合体であって、ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されているが、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されているものではない。
 本発明のβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖とアンチセンスDNAにより構成される核酸多糖複合体は、安定性に優れ、細胞毒性が低減されていることから、アンチセンス療法においても安全に使用することができる。また、本発明の核酸多糖複合体は、優れたアンチセンス効果を発揮し得るものである。
(A)は、複合体(c)、ネイキッド(n)(dA)20、(dA)30、(dA)40試料のポリアクリルアミドゲル電気泳動の移動パターンを示す。(B)は、AS-(dA)20、AS-(dA)30、AS-(dA)40試料のポリアクリルアミドゲル電気泳動の移動パターンを示す。なお、ネイキッド(n)(dA)20とはSPGと複合体を形成していないdAを意味する。 (A)は、複合体(c)及び、異なるPS含量のネイキッド(n)(dA)40試料のポリアクリルアミドゲル電気泳動の移動パターンを示す。(B)は、PSとSPG及びAS-ODNからなる複合体、並びにPOとSPG及びAS-ODNからなる複合体のゲル浸透クロマトグラムを示す。クロマトグラムは260nmにおける紫外吸光度を検出した。 20℃にて計測されたネイキッド(dA)40(図中(A))及び(dA)40複合体(図中(B))のCDスペクトラムのPS含量依存性を示す。 (C)は、282nmにおける複合体のCDスペクトラムの温度依存性を示す。(D)は、異なるPS含量の(dA)40のTmを示す。 SPG及び異なるPS含量のASO-(dA)40からなる複合体のゲル電気泳動の移動パターンの比較を示す。図中n及びcは、それぞれ、ネイキッドASO及びSPGとの複合体を表す。 ASO/SPG複合体による処置後のLPS誘導TNF-α分泌の比較を示す。結果は、mean ± SD (n=3)で示される*P<0.05, **P<0.01
 本発明の核酸多糖複合体は、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖の2本鎖と標的配列に相補的な塩基配列を有するアンチセンスDNAの1本鎖によって構成される三重螺旋構造を有している。具体的には、3重螺旋構造の多糖であるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖を、一度有機溶媒やアルカリ性の水溶液に溶解して単一鎖の溶液にし、この溶媒を元の中性の水に戻す過程において、ある長さ以上のpoly(dA)が存在すると核酸1塩基に対して多糖の主鎖1グルコースの長さの割合でポリヌクレオチド1本に対し多糖2本の複合体を形成する。
 本発明の核酸多糖複合体を構成するアンチセンスDNAは、ポリデオキシアデニン(dA)テイルを末端に有している。アンチセンスDNAとは、標的遺伝子のmRNAへの転写を抑制することにより標的遺伝子の発現を抑制できる一本鎖DNAである。アンチセンスDNAを構成する塩基数については特に限定されるものではないが、通常10~35個、好ましくは15~30個、更に好ましくは16~24個が挙げられる。アンチセンスDNAの発現抑制対象となる標的遺伝子の種類は特に限定されるものではなく、治療目的等に応じて適宜決定することができる。また、アンチセンスDNAの塩基配列については、標的遺伝子の種類等に応じて、従来公知の手法で設計することができる。また、本発明の核酸多糖複合体を構成するdAテイルは多糖結合部位として機能する。dAテイルを構成するデオキシアデニンの数としては、後述するβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との複合体形成が可能であることを限度として、特に限定されるものではないが、例えば、10~100個、好ましくは20~100個、より好ましくは20~80個、更に好ましくは40~60個が挙げられる。
 アンチセンスDNAにdAテイルを修飾することにより、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖と良好な複合体を形成し、このようにして得られる核酸多糖複合体は高い分解酵素耐性を有する。
 アンチセンスDNA鎖の5’末端にdAテイルを直接結合させるには、具体的には、アンチセンスDNA鎖の5’末端のリボヌクレオチドの5’の炭素原子と、dAテイルの3’末端の3’の炭素原子とエステル結合したリン酸残基とをエステル結合させればよい。また、アンチセンスDNA鎖の3’末端に、dAテイルを直接結合させるにはアンチセンスDNA鎖の3’末端のリボヌクレオチドに結合したリン酸残基と、dAテイルの5’端とをエステル結合させればよい。
 また、アンチセンスDNAは、通常用いられる方法によって種々の修飾を加えたものであってもよい。例えば、安定化のために、ホスホロチオエート化(S化)したS-オリゴや、糖の2’位にフッ素やヒドロキシメチル基等で修飾した核酸を使用することも可能である。ただし、本発明においては、dAテイルとアンチセンスDNAの全てのホスホジエステル結合部分をS化したものは含まないものとする。なお、アンチセンス部分のS化の程度は目的とする治療によって異なり、適宜調整することが可能である。例えば、ヌクレアーゼに対する酵素耐性が必要とされる場合のS化率は100%に近いものが好ましく、S化による副反応が懸念される場合は天然型(すなわちS化率0%)に近い方が好ましい。
 本発明においては、多糖結合部位のポリデオキシアデニン(dA)のホスホジエステル結合を、所定の範囲でホスホロチオエート化(S化)することにより、本発明の核酸多糖複合体の収率や安定性を高め、細胞毒性を低減させることができる。
 ポリデオキシアデニンのS化は、従来公知の方法に従って行うことができる。dAテイル部分におけるS化の分布は特に限定されず、任意の位置に所望のS化を行えばよい。ここで、核酸多糖複合体の収率を高めることを目的とする場合、S化率が20~90%程度、好ましくは30~70%程度、より好ましくは50~70%程度である。なお、本明細書において、dAテイル部分のS化率とは、dAテイル中のホスホジエステル結合の総数に対して、S化されているホスホジエステル結合の割合(%)を示す。また、S化されているホスホジエステル結合とは、ホスホジエステル結合のリン酸残基の酸素原子の一つが硫黄原子に置換されている結合構造である。
 また、核酸多糖複合体の安定性を高めることを目的とする場合、dAテイルの全長を100%として、S化率が20~90%程度、好ましくは30~70%程度、より好ましくは50~70%程度である。
 さらに、核酸多糖複合体の細胞毒性を低減することを目的とする場合、dAテイルの全長を100%として、S化率が20~90%程度、好ましくは30~70%程度である。
 本発明においては、高収率、安定性、細胞毒性低減の全ての効果を奏するために、ポリデオキシアデニンのS化率を少なくとも20%以上、好ましくは25~90%程度、より好ましくは30~70%程度とすることが望ましい。
 本発明の核酸多糖複合体には、アンチセンス効果以外の所望の機能を担う部分として、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖を含む。β-1,3-グルカン骨格を有する多糖は、前述の細胞表面に存在する受容体、Dctin-1と結合することによって誘導されるシグナルを通じ、細部内に送達される。
 β-1,3-グルカンとは、グルコースがβ1→3グルコシド結合により結合された多糖であり、主鎖のグルコース残基数に対する側鎖のグルコース残基数の割合(以下、側鎖率と略記する)の異なる各種のものが知られている。本発明に使用される多糖類については、前記1本鎖ポリデオキシアデニンとの複合化を容易ならしめ、本発明の核酸多糖複合体の細胞内導入率をより一層向上させるという観点から、側鎖率の比較的高いβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖が好適である。
 本発明において使用されるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖(以下、単に『前記多糖』と略記することがある)として、具体的には、シゾフィラン、カードラン、レンチナン、パーキマン、グリフォラン、スクレログルカン等が例示される。これらの中でも、シゾフィランは、細胞内導入性及び酵素分解耐性の向上を一層顕著ならしめることができるので、本発明において好適な多糖である。また、前記多糖としてシゾフィランを用いる場合、シゾフィランの側鎖のグルコース残基を化学変換することにより、細胞のレセプターに親和性を有する官能基(アミノ基、アミノ酸基、ペプチド基、コレステロール基等)を導入することが可能である。
 本発明の核酸多糖複合体に使用される前記多糖の分子量については、特に制限されず、使用する多糖の種類、前述のdAテイルの鎖長等に応じて適宜設定すればよい。具体的には、該多糖の分子量として、通常25,000~2500,000、好ましくは25,000~150,000が例示される。
 また、前記多糖には、直接又はリンカーを介して機能性分子が結合していてもよい。このように機能性分子が結合した前記多糖(修飾型のβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖)を使用することによって、本発明の核酸多糖複合体に、該機能性分子に基づく有用機能を備えさせることが可能になる。リンカーは、従来公知のものを利用することができ、例えばPEG等が挙げられる。
 機能性分子としては、具体的には、ペプチド、タンパク質、糖、アミノ酸、DNA、RNA、低分子有機・無機材料、コレステロール、デンドリマー、脂質、高分子材料等が例示される。
 前記ペプチドとしては、例えば、3~40個、好ましくは6~30個、更に好ましくは8~25個のアミノ酸から構成されるペプチドが挙げられる。具体的には、細胞膜透過ペプチド(オクタアルギニン(R8)、ペネトラチン等)、核局在化シグナルペプチド配列(HIV-1 Tat、SV40 T抗原等)、核外移行性シグナルペプチド(HIV-1 Rev、MAPKK等)、細胞膜融合ペプチド(gp41、バイアルフュージョンペプチド等)が挙げられる。中でも、本発明において、R8は好適に使用される。R8は細胞内への導入を促進する作用があり、R8が結合した多糖を使用すれば、核酸多糖複合体を細胞内に一層効率的に導入できるという利点が得られる。
 前記タンパク質としては、生体内に存在するタンパク質、薬理作用を有するタンパク質、分子認識作用を有するタンパク質等を使用でき、該タンパク質の一例として、エクスポーチン/インポーチン・タンパク質、フェブロネクチン、アビジン、抗体等を挙げることができる。
 前記糖としては、例えば、グルコース、ガラクトース、グルコサミン、ガラクトサミン等の単糖、これらを任意に組み合わせたオリゴ糖又は多糖等が挙げられる。
 前記低分子有機・無機材料としては、例えば、スペルミン、スペルミジン等のカチオン性分子;FITC、Alexa、Cy3、Cy5等の蛍光物質;ビオチン;量子ドット;金微粒子等が挙げられる。
 前記デンドリマーとしては、例えば、ポリアミドアミンデンドリマー等が挙げられる。
 前記脂質としては、例えば、リノール酸、DOPE(1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine)等が挙げられる。
 前記高分子材料としては、例えば、ポリエチレングリコール、ポリエチレンイミン等が挙げられる。
 前記機能性分子の中でも、好ましくはペプチド、カチオン性分子、ポリエチレングリコールであり、更に好ましくはペプチドである。また、前記機能性分子の中でも、細胞膜透過性を有する分子(細胞膜透過性分子)、及びアンチセンスDNAに対して分解酵素耐性を付与できる分子が好適である。上記機能性分子の内、細胞膜透過性分子としてはペプチド等が挙げられ、アンチセンスDNAに対して分解酵素耐性を付与できる分子としてはポリエチレングリコールが挙げられる。このような修飾型の多糖も本発明におけるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖に包含されるものとする。
 本発明の核酸多糖複合体は、前述のdAテイルを有するアンチセンスDNAと前記多糖が複合化することによって形成されている。アンチセンスDNAと前記多糖との複合化構造については、特に制限されないが、通常、1本鎖アンチセンスDNAに対して2本鎖の前記多糖を複合化させた3重鎖螺旋構造が好適である。このような3重鎖螺旋構造の形成は、具体的には以下の方法に従って実施できる。前記多糖は、天然若しくは水中では、3重螺旋構造をとっている。この多糖を、DMSO(ジメチルスルホオキシド)等の極性溶媒に溶解して1本鎖にした後、dAテイルを有するアンチセンスDNAを加え、溶媒を水に戻すこと(再生過程)によって、アンチセンスDNA1本鎖部分と2つの前記多糖からなる、3重螺旋型に複合化された構造(会合構造)が形成される。このようなポリヌクレオチドと多糖の複合化は、主に、水素結合と疎水性相互作用を介して形成されると考えられる。
 このような構造を有する本発明の核酸多糖複合体は、公知の方法に従って調製することができる。具体的には、以下の(1)~(3)の工程で製造する方法が例示される:(1)ポリデオキシアデニンが結合したポリヌクレオチド結合アンチセンスDNAを公知の方法に従って調製する、(2)別途、前記多糖を用意する、或いは機能性分子が直接又はリンカーを介して結合している前記多糖を調製する、(3)次いで、アンチセンスDNAに結合したポリデオキシアデニンと前記多糖とを用いて複合体を形成させる。
 すなわち、本発明は、多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる核酸多糖複合体の製造方法をも提供するものである。ここで、ポリデオキシアデニン部分(dAテイル部分)の少なくとも一部はS化されており、そのS化率は前述の通りである。
 前記方法の(3)の工程で形成させる複合体において、dAテイルを有するアンチセンスDNAとβ-1,3-グルカンの分子数比については、アンチセンス鎖の塩基数とそれに付加するdAテイルのアデニンの数、及びβ-1,3-グルカンの分子量等に応じて適宜設定され、一意的に好ましい分子数比を限定することができないが、通常、β-1,3-グルカンに対するdAテイルを有するアンチセンスDNAの分子数比(モル)は1:2~1:30程度である。β-1,3-グルカン1分子に対して多くのアンチセンス鎖が複合化されていることにより効果が一層有効に発揮できる場合は分子量が数万以上のβ-1,3-グルカンと複合化することが好ましく、分子数比(モル)で1:8~1:20がより好ましい。逆に、上記複合体が小さい粒子の方が効果がある場合は、分子数比(モル)で1:2から1:5がより好ましい。このようなモル比で、前記アンチセンスDNAと、シゾフィランを複合体形成条件下に晒すことにより、両者を効率的に相互作用させることが可能になり、本発明の核酸多糖複合体の製造効率を向上させることができる。
 複合体の化学量論比は、β-1,3-グルカン骨格の繰り返し単であるグルコース糖のモル数と、ポリデオキシアデニンの塩基のモル数の比で2:1である。通常、多糖やポリデオキシアデニンは高分子であるため、多糖とポリデオキシアデニンとのモル数で複合体の化学量論比を規定することはできない。実験的には、反応させる糖と核酸の重量比や、分子数比で議論することが便利である。このように、複合体の化学量論比は、2:1であるが、核酸を強固に守る必要がある場合は糖を多く、アンチセンス核酸の効果を強く出すためには、核酸を多く入れることができる。
 本発明の核酸多糖複合体は、細胞内に導入されることにより、細胞内での標的遺伝子の発現を抑制することができるので、標的遺伝子の発現抑制を目的とした医薬組成物として使用できる。当該医薬組成物は、有効成分として本発明の核酸多糖複合体に薬学的に許容される担体を適宜組み合わせて調製することができる。このような担体としては、精製水、糖含有水溶液、緩衝液、生理食塩水、RNase free水等の水性担体;賦形剤等が挙げられる。
 本発明の核酸多糖複合体の投与量は、所望の遺伝子抑制作用を発揮し得る限り特に限定されないが、体重1kg当たりに一回で投与する核酸量として、0.001mg~10mgとすることが望ましく、投与対象の症状、投与経路等に応じて適宜設定することができる。
 また、当該医薬組成物の剤形、投与方法等は、医薬品として公知の形態を適用可能であり、アンチセンスDNAの種類や用途、疾患部位等に応じて適宜設定することができる。
 さらに、本発明は、核酸多糖複合体を標的細胞に導入する方法を提供する。本発明の核酸多糖複合体の細胞内への導入量や方法は、従来のアンチセンスDNAの場合と同様であり、標的遺伝子の発現抑制に有効な量の核酸多糖複合体を、標的遺伝子を有する細胞に接触させ、当該細胞内に当該核酸多糖複合体を取り込ませればよい。なお、本発明の核酸多糖複合体は、単独でも優れた細胞内移行能を示すので、アンチセンスDNAの細胞内への導入に使用されている従来の遺伝子導入試薬を用いずに、或いは従来の遺伝子導入試薬の使用量を低減して、細胞内に導入することも可能である。なお、本発明の核酸多糖複合体の標的遺伝子の発現抑制は、in vivoで行ってもよく、またin vitro又はex vivoで行うこともできる。
 さらに、上述のようにポリデオキシアデニン(dA)テイル部分のS化を調節することにより、安定性が高い核酸多糖複合体、細胞毒性が低減された核酸多糖複合体を得ることができる。すなわち、本発明は、dAテイル部分のホスホジエステル結合を20~90%、好ましくは30~70%、より好ましくは50~70%ホスホロチオエート化することを特徴とする核酸多糖複合体の安定化方法、ならびにdAテイル部分のホスホジエステル結合を20~90%、好ましくは30~70%ホスホロチオエート化することを特徴とする核酸多糖複合体の細胞毒性を低減する方法を提供する。
 また、本発明は、細胞内で標的遺伝子の発現を抑制するための、上記核酸多糖複合体の使用をも提供する。更に、本発明は、上記核酸多糖複合体を利用した標的遺伝子の発現抑制方法を提供する。これらの使用及び方法において、核酸多糖複合体、その使用方法等については上述の通りである。
 以下、実施例に基づいて本発明をより詳細に説明するが、本発明はこれらによって限定されるものではない。なお、本実施例において、シゾフィランを、「SPG」、ポリデオキシアデニンを「(dA)x」と表記することがある。また、本実施例において、アンチセンスDNAを「AS」と表記することがある。
 1.試験材料と試験方法
 (1.1)試験材料
 Schizophyllum commune由来SPG(Mw=1.5×105;多角光散乱解析とゲル浸透クロマトグラフィーを併用して測定)は、三井製糖株式会社からの提供されたものである。ホスホロチオエート化アンチセンスDNA試料は株式会社ファスマックにおいて合成され、高速液体クロマトグラフィーにより精製された。
 (1.2)SPGとのホスホロチオエート化アンチセンスDNA複合体の調製
 SPGの三重らせんを解離して1本鎖にするため、0.25N NaOH水溶液に2日以上かけて溶解した。適量のSPG溶液、オリゴヌクレオチド(水中)及びリン酸緩衝溶液(330mM NaH2PO4, pH=4.7)を混合した。その後、混合物(オリゴヌクレオチド 60μM, pH=7.4)を4℃で一晩置いた。SPGとオリゴヌクレオチド(ODN)の分子数比で表したモル比([SPG]/[ODN])を0.27に調整した。
 (1.3)ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)
 オリゴヌクレオチド(20ng)又はオリゴヌクレオチドとSPGとの複合体を、15%アクリルアミドゲルを用いて100Vで1時間かけて分離した。ゲルをSYBR Gold(Invitrogen社製)で染色した後、PharosFX(Bio-Rad社製)を用いて蛍光画像を得た。
 (1.4)ゲル浸透クロマトグラフィー(GPC)
 GPCは、昭和電工DU-H2130ポンプ装置を用い、OHpak SB802.5及びOHpak 806カラムで流速0.8ml/minにて実施した。0.5M KCL含有0.1Mリン酸緩衝溶液(pH7.4)を移動相に使用した。溶出物を多角光散乱(LS)検出器(DAWN-HELEOS, Wyatt Technology社製)、UV検出器(SPD-10A, 株式会社島津製作所製)及び屈折率(RI)検出器(RI-71S,昭和電工株式会社)により検出した。DAWN-HELEOSの取扱説明書に従って、RI及びLS信号を重量平均分子量(Mw)の計算に用いた。屈折率増分(dn/dc値)は0.157ml/gであった。
 (1.5)円偏光二色性分光法(circular dichroism spectroscopy)
 240~320nm領域における円偏光を、Jasco J-802円二色性分散計(日本分光株式会社製)で、20~80℃にて、恒温槽つきの1cm石英セルを用いて計測した。
 (1.6)動物試験
 動物試験は、九州工業大学動物実験委員会によるガイドラインに従って実施した。チオグリコレート誘発マクロファージを、標準的な手順に従ってC57BL/6マウス(九動株式会社より入手)から単離した。簡潔には、マウスに3mLの3%チオグリコレート培地を腹腔内注射し、3日後にRPMI 1640(6mL)で腹腔内洗浄を行い、腹腔内マクロファージを採取した。洗浄液を貯留し、100×gで5分間遠心分離を行った。初代マクロファージを10% FCS、100U/mlペニシリン、0.1mg/mlストレプトマイシン添加RPMI 1640培地中で、37℃、5%CO2条件下で培養した。
 (1.7)サイトカインアッセイ
 上記(1.6)で得たマクロファージを94ウェルプレートに5×104cell/wellの濃度で播種し、24時間置いた。細胞にODN/SPG複合体又はODN(0.5μM)を添加し、37℃で30分インキュベーションを行い、LPS(10ng/ml)含有新鮮培地で37℃にて5時間インキュベーションを行った。上清中に放出されたTNF-αレベルについては、げっ歯類TNF-α ELISA Developmentキット(Pepro Tech社製)を用いて計測した。
 2.結果及び考察
 (2.1)SPG及び(dA)x間の複合体形成
 図1Aは、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)によって検出される、ホスホロチオエート化(dA)x(PS-(dA)x)の複合体形成における配列の長さ依存性を示す。dAxにおいてx>30では、SPGとの複合体形成後にフリーの(dA)xは検出されなかった。一方、X=20ではわずかにフリーの(dA)20が検出された。図1Aと1Bの第2レーンを比較すると理解できるように、20merのアンチセンスTNF-αのような生物学的に実在するヘテロ配列が(dA)20に結合した場合、その収率は(dA)20そのものよりも少なくなることが示された。また、末端が長くなるに従って、AS-(dA)30及びAS-(dA)40はほとんどフリーの(dA)xを示さなくなった。これらの結果は、長いdA末端が高い収率に貢献しており、結合されたヘテロ配列が収率を低下させることを示している。この収率における末端長の効果は、共同的な高分子効果に起因する複合体の安定化によるものであると理解される。
 本発明者らは、異なるPS含量(S化率)を有する6種の(dA)40試料(PS含量:0/39PS, 8/39PS, 13/39PS, 20/39PS, 26/39PS, 39/39,PS)を調製した。この6種の(dA)40試料は下表1に示される。なお、(dA)40試料は、アンチセンスTNF-α(aTNF)の3’末端に各種のdAテイルを直接結合させたものである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
 これらの複合体は、前記『1.試験材料と試験方法』の記載に従って調製されたものである。図2AのPAGE画像に示されるように、13/39、20/39、26/39及び39/39PS複合体ではいずれもフリー(dA)xは観察されなかったが、8/39PS複合体ではいくらかのフリー(dA)xが認められた。収率は8/39PSでは90%、0/39PSでは70%であった。図2Bは、39/39PS及び0/39PSがそれぞれ複合体形成した後のゲル浸透クロマトグラム(UV 260nm)を比較したものである。複合体のピーク領域(16~20分あたり)とフリー(dA)x(20~25分あたり)より、収率は39/39PSが90%、0/39PSが60%と測定され、PAGEの結果と合致した。上記結果は、ほぼ30%のホスホロチオエート化は100%の収率を与え、またPO(ホスホジエステル)よりもPS(ホスホロチオエート)の方がより安定した複合体を形成することが確認できた。
 リン酸化と複合体安定性の関係は興味深く、複合体の分子構造に関連していることが推測された。計算化学により、SPG主鎖グルコースと塩基領域間の水素結合が複合体形成の原動力であり、特にSPG主鎖グルコースに沿って共同的に配置された水素結合が複合体を安定化することが示唆される(K. Miyoshi, et al., Biomacromolecules 6(2005) 1540-6)。リン酸ジエステル領域が隣接する2つのリボースに結合し、隣接する2つの(dA)40環の可変角度及びスタッキング特性を決定することから、PSはそのような水素結合を形成するためにPOよりも好ましい立体配置を提供する可能性がある。隣接する2つのdA環の空間的関係は、円偏光二色性(CD)に詳細に反映される。
 (2.2)複合体の熱安定性
 図3-1のAは、20℃での全てのPS(dA)40及びPO(dA)40試料の240~320nm領域におけるCDスペクトルを示す。スペクトルの全体的な形状は全ての試料で共通しているが、PS含量が増加すると248nmでの負ピークの強度がわずかに減弱した。この波長領域は塩基領域間での増加したCDに関連することから、CDスペクトルの類似は、全ての(dA)40が同じ構造を有することを意味している。
 SPG複合体形成において、CDスペクトルは図3-1のBに示されるように大幅に変化する。図3-1のBにおいては、PO-(dA)40のSPG複合体と、ネイキッドPO-(dA)40とを比較しており、既に報告されているように、dAがSPG複合体を形成するために新たな構造をとることが示されている(J. Kurreck, Eur J Biochem 270 (2003) 1628-44及びS.M. Boye et al., Antisense Nucleic Acid Drug Dev 12 (2002) 95-102)。複合化されたスペクトルを比較すると、0/39PSから20/39PS/SPGの4種の複合体は、ほぼ同じスペクトルを示した。一方、S含量が39/39にまで増加すると、他の複合体とは異なるスペクトルを示した。39/39PSの負ピークは、248nmで減少し、264nmで増加した。
 前述のように、図3-1のAにおいて、POからPSへS化率を増加させていくと、250nmあたりのCDバンドがそれに伴って減少したが、これはS化が進むと分子の形態が天然型から非天然型に移行していくことを示している。合成核酸医薬の副作用は、天然型ではない形態が原因とされている。従って、複合化前のアンチセンスオリゴヌクレオチドでは、S化率の増加とともに非天然型の効果が表れる。一方、図3-1のBに示されるように、複合体ではPOからPSへS化率を増加させていくと、265nmあたりのCDバンドが変化するが、S化が26/39までの変化は極めて小さく、少なくともS化が0/39~26/39ではほぼ同一である。すなわち、PS複合体ではS化が26/39まででは、天然型の形態が保持されており、副作用が表れにくいと考えられる。
 以上の結果は、PSがPOよりもより好ましい構造を与えるという上記推測と定性的にも一致する。しかしながら、これらはCD及びPAGEの結果で定性的に相違する。すなわち、S化率33%(13/39PS)で収率100%を達成するために十分であるのに対し、CDを変化させるためには66%(26/39PS)以上のS化が必要であった。
 図3-2のCは、温度に対する282nmにおけるCD強度をプロットしたものである。上述のように、低温では複合体のCD強度はネイキッドのものよりも強い。所定の温度領域内では複合体のCD強度は減少し、対応する(dA)40試料の強度と重なった。この推移に基づいて、解離温度Tm(融解温度)を図3-2のDにプロットした。PS含量が0/39から8/39に増加するに従い、Tmは49℃から59℃に上昇したが、さらなるPS含量の増加は大きくTmを上昇させなかった。これらの結果より、PS骨格の修飾はPO骨格よりもより安定した複合体を導き、さらに、20%の修飾(S化)のみでも100%修飾したものと同じTmの増加を与えるのに十分であることが確認された。
 (2.3)複合体による遺伝子サイレンシング
 本発明者らは、PO TNF-αアンチセンス配列の3’末端に(dA)40テイルが直接結合された、異なるS含量を有する試料と、完全にホスホロチオエート化された試料の5種類のアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)試料を調製した。試料の調製は上記(1.1)及び(1.2)に記載の方法に従った。各試料のS化率と収率を下記表2に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
 全ての複合体のPAGE画像を図4に示す。AS-0/39複合体については、大量のフリーのアンチセンスオリゴヌクレオチドが存在し、収率(複合体化率)は50%であった。この値は0/39PS(dA40)テイルそのものよりも小さい。S含量が増加するに従い、フリーのアンチセンスオリゴヌクレオチドのバンドは消滅し、複合体化率が上昇したことを示す。AS-13/39複合体はフリーのアンチセンスオリゴヌクレオチドのバンドは示さず、(dA)40そのものと同様の結果を示した。
 本発明者らは、上述のように調製されたASO試料を用いたTNF-α遺伝子サイレンシング効果について、以下のように試験を実施した。
 SPG複合体は、マクロファージや樹状細胞を含む様々な抗原提示細胞(APC)上のβ-1,3-グルカンを認識する主要な受容体であるdectin-1を介して細胞内に取り込まれる。チオグリコレート誘発腹腔内マクロファージ(チオマクロファージ)を調製後、ODN/SPG複合体を投与し、その後LPSで刺激してTNF-αを分泌させた。PS含量に対する分泌されたTNF-αの量を図5のグラフにプロットした。ネイキッドアンチセンスオリゴヌクレオチドはいずれもTNF-αの分泌を減少させなかった。一方、SPG複合体はTNF-αのサイレンシングを示した。PS含量が増加するに従い、サイレンシング効果は徐々に増強した。これは、おそらくポリデオキシアデニンテイルにおけるS化率の高いPS複合体が培地中でより安定であり、細胞に取り込まれやすいからだと考えられる。また、アンチセンスの抑制能はPS及びPO間でほぼ同一であるか、PS複合体の方がやや効果が高かったことから、アンチセンス部分は必ずしもPS骨格でなくてもよいと考えられる。
 (2.4)以上より、ホスホロチオエート化(dA)40との複合体は、リン酸ジエステル(dA)40よりも熱安定性が高く、リン酸ジエステル領域の酸素を20~30%置換するだけで完全にホスホロチオエート化されたものと同レベルにまで安定性が高められることが示された。解離温度が高いということは、熱力学的に安定であるということであり、生体内で本発明の核酸多糖複合体が安定に存在することを示す。PSとPO間のアンチセンス遺伝子抑制能は同程度かもしくはPSがやや上でであった。これらの知見は、β-1,3-グルカンとDNA間の相互作用について新たな理解を導き、副作用が低減された治療用PSオリゴヌクレオチド輸送に役立つ可能性がある。
 配列番号1は、配列(aTNF)の3’末端にA40が結合した塩基配列である。
 配列番号2は、配列(aTNF)の3’末端に(AsAAAA)8が結合した塩基配列である。
 配列番号3は、配列(aTNF)の3’末端に(AsAA)13Aが結合した塩基配列である。
 配列番号4は、配列(aTNF)の3’末端に(AsA)20が結合した塩基配列である。
 配列番号5は、配列(aTNF)の3’末端に(AsAsA)13A.が結合した塩基配列である。
 配列番号6は、配列(aTNF)の3’末端に(As)39Aが結合した塩基配列である。

Claims (12)

  1.  多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、多糖であるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との核酸多糖複合体であって、ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されている複合体、
     但し、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されている場合を除く。
  2.  前記β-1,3-グルカン骨格を有する多糖がシゾフィランである、請求項1に記載の核酸多糖複合体。
  3.  ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の少なくとも20%がホスホロチオエート化されていることを特徴とする請求項1又は2に記載の核酸多糖複合体。
  4.  ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の25~90%がホスホロチオエート化されていることを特徴とする、請求項1~3のいずれかに記載の核酸多糖複合体。
  5.  標的遺伝子の発現抑制のために使用される、請求項1~4のいずれかに記載される核酸多糖複合体。
  6.  請求項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  7.  多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む核酸多糖複合体の製造方法、
     ここで、前記核酸多糖複合体は、多糖結合部位のホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されているが、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されているものではない。
  8.  請求項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体を、標的細胞に接触させる工程を含む、核酸多糖複合体を標的細胞に導入する方法。
  9.  請求項1~5のいずれかに記載の核酸多糖複合体を、標的遺伝子を有する細胞に接触させる工程を含む、標的遺伝子の発現抑制方法。
  10.  多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む、核酸多糖複合体の安定化方法、
     ここで、前記ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち20~90%がホスホロチオエート化されているものである。
  11.  多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、β-1,3-グルカン骨格を有する多糖とを、多糖結合部位を介して結合させる工程を含む、核酸多糖複合体の細胞毒性を低減する方法、
     ここで、前記ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち20~90%がホスホロチオエート化されているものである。
  12.  標的遺伝子の発現抑制剤の製造のための、核酸多糖複合体の使用であって、
     前記核酸多糖複合体が、多糖結合部位としてポリデオキシアデニン(dA)を有するアンチセンスDNAと、多糖であるβ-1,3-グルカン骨格を有する多糖との複合体であって、ポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合のうち少なくとも一部がホスホロチオエート化されているが、アンチセンスDNAとポリデオキシアデニンのホスホジエステル結合の全てがホスホロチオエート化されているものではない。
     
PCT/JP2011/065908 2010-07-16 2011-07-12 核酸多糖複合体 WO2012008465A1 (ja)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2012524564A JPWO2012008465A1 (ja) 2010-07-16 2011-07-12 核酸多糖複合体
US13/810,533 US20130267576A1 (en) 2010-07-16 2011-07-12 (nucleic acid)-polysaccharide complex
EP11806795.8A EP2594592A4 (en) 2010-07-16 2011-07-12 COMPLEX (NUCLEIC ACID) -POLYSACCHARIDE

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2010-162039 2010-07-16
JP2010162039 2010-07-16

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2012008465A1 true WO2012008465A1 (ja) 2012-01-19

Family

ID=45469462

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2011/065908 WO2012008465A1 (ja) 2010-07-16 2011-07-12 核酸多糖複合体

Country Status (4)

Country Link
US (1) US20130267576A1 (ja)
EP (1) EP2594592A4 (ja)
JP (1) JPWO2012008465A1 (ja)
WO (1) WO2012008465A1 (ja)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP6383740B2 (ja) * 2014-02-06 2018-08-29 国立研究開発法人科学技術振興機構 ペプチド/β−1,3−グルカン複合体及びそれを含む医薬組成物
US20190175728A1 (en) * 2016-06-16 2019-06-13 Napajen Pharma, Inc. Nucleic acid-antigen peptide conjugate

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH07194385A (ja) * 1993-11-12 1995-08-01 Hoechst Ag 安定化されたオリゴヌクレオチドおよびそれらの使用
WO2001034207A1 (fr) 1999-11-10 2001-05-17 Japan Science And Technology Corporation Supports de genes
WO2002072152A1 (fr) 2001-03-13 2002-09-19 Japan Science And Technology Corporation Supports de gene mettant en oeuvre un polysaccharide et leur procede de production
WO2007058323A1 (ja) 2005-11-17 2007-05-24 Napa Jenomics Co., Ltd. 核酸ホモポリマー結合機能性核酸医薬品の製造法

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7790189B2 (en) * 2003-05-15 2010-09-07 Mitsui Sugar Co., Ltd. Immunostimulating agents
JPWO2007058323A1 (ja) * 2005-11-17 2009-05-07 Napa Jenomics 株式会社 核酸ホモポリマー結合機能性核酸医薬品の製造法

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH07194385A (ja) * 1993-11-12 1995-08-01 Hoechst Ag 安定化されたオリゴヌクレオチドおよびそれらの使用
WO2001034207A1 (fr) 1999-11-10 2001-05-17 Japan Science And Technology Corporation Supports de genes
WO2002072152A1 (fr) 2001-03-13 2002-09-19 Japan Science And Technology Corporation Supports de gene mettant en oeuvre un polysaccharide et leur procede de production
WO2007058323A1 (ja) 2005-11-17 2007-05-24 Napa Jenomics Co., Ltd. 核酸ホモポリマー結合機能性核酸医薬品の製造法

Non-Patent Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BULL. CHEM. SOC. JPN., vol. 77, 2004, pages 1101 - 1110
GHOSH, M. K. ET AL.: "Phosphorothioate- phosphodiester oligonucleotide co-polymers: assessment for antisense applicaiton", ANTI-CANCER DRUG DESIGN, vol. 8, 1993, pages 15 - 32, XP002110959 *
J. KURRECK, EUR J BIOCHEM, vol. 270, 2003, pages 1628 - 44
K. MIYOSHI ET AL., BIOMACROMOLECULES, vol. 6, 2005, pages 1540 - 6
KAZUYA KOMOTO ET AL.: "Exploitation of Nonviral Gene Carriers Utilizing NaturalPolysaccharides toward Efficient Antisense Therapy", BIO INDUSTRY, vol. 20, no. 10, 2003, pages 30 - 37, XP003009084 *
MIZU, M. ET AL.: "Enhancement of the Antisense Effect of Polysaccharide-Polynucleotide Complexes by Preventing the Antisense Oligonucleotide from Binding to Proteins in the Culture Medium", BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, vol. 77, no. 6, 2004, pages 1101 - 1110, XP008168537 *
P. S. ZAMECNIK ET AL., PROC NATLACAD SCI USA, vol. 75, 1978, pages 280 - 4
S. M. BOYE ET AL., ANTISENSE NUCLEIC ACID DRUG DEV, vol. 12, 2002, pages 95 - 102
See also references of EP2594592A4

Also Published As

Publication number Publication date
EP2594592A1 (en) 2013-05-22
US20130267576A1 (en) 2013-10-10
EP2594592A4 (en) 2014-11-26
JPWO2012008465A1 (ja) 2013-09-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11767531B2 (en) Defined multi-conjugates oligonucleotides
Zhou et al. Aptamer-targeted cell-specific RNA interference
JP2018518186A5 (ja)
KR101223483B1 (ko) 전하결합 및 생분해성 공유결합으로 동시에 연결된 고분자―siRNA 나노입자 전달체
CA2860527C (en) High-efficiency nanoparticle-type double-helical oligo-rna structure and method for preparing same
AU2018215684B2 (en) Multimeric oligonucleotides having decreased kidney clearance
KR20100122405A (ko) 자기 집합체 고분자 나노입자를 이용한 siRNA 전달 시스템
KR101223484B1 (ko) 사람 혈청 알부민-siRNA 나노입자 전달체
JP5536334B2 (ja) Rna治療用ペプチドリボ核酸縮合体粒子のための化合物及び方法
CA3144467A1 (en) Subcutaneous delivery of multimeric oligonucleotides with enhanced bioactivity
WO2012008465A1 (ja) 核酸多糖複合体
WO2021026490A1 (en) Cns targeting with multimeric oligonucleotides
WO2011135140A1 (es) Método para la administración de oligonucleótidos
TW202241460A (zh) 微胞奈米粒子及其用途
TW202241461A (zh) 微胞奈米粒子及其用途
KR20220115579A (ko) 표적화된 핵산 전달을 위한 펩티드 도킹 비히클
JP4712333B2 (ja) ハイブリッド多糖系キャリアーを用いる核酸類の導入方法。
WO2022075460A1 (ja) 均質なβ-1,3-グルカン/核酸複合体、及びその用途
CA3132505A1 (en) Multimeric oligonucleotides with enhanced bioactivity

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 11806795

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2012524564

Country of ref document: JP

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2011806795

Country of ref document: EP

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 13810533

Country of ref document: US