WO2006022411A1 - 標的糖鎖における構造変化を検出する方法 - Google Patents

標的糖鎖における構造変化を検出する方法 Download PDF

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WO2006022411A1
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sugar chain
lectin
binding
amount
lectins
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PCT/JP2005/015686
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French (fr)
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Masayuki Machida
Jun Natsuki
Koichi Tamamo
Hideji Tajima
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National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology
Precision System Science Co., Ltd.
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Publication date
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    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/566Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor using specific carrier or receptor proteins as ligand binding reagents where possible specific carrier or receptor proteins are classified with their target compounds
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/66Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving blood sugars, e.g. galactose

Definitions

  • the present invention relates to a method for detecting a structural change in a target sugar chain.
  • the structure of a sugar chain may change due to various causes.
  • a sugar chain contained in a-fetoprotein (AFP) As hepatocellular carcinoma progresses, a-L-fucose residue, N-acetylyldarcosamine residue (bisecting N-acetylyl) Dalcosamine) is added. Therefore, it is considered that hepatocellular carcinoma can be diagnosed by detecting structural changes in the sugar chains contained in AFP.
  • AFP a-fetoprotein
  • the detection of the structural change in the target sugar chain that may exist as the first sugar chain and the second sugar chain due to the structural change is performed by, for example, binding to the target sugar chain and the first sugar chain and the second sugar chain.
  • the lectin binding property to the target sugar chain when mixed with lectins having different binding properties to sugar chains can be used as an index (see Patent Document 1).
  • the first sugar chain and the second sugar chain are glycoproteins having different sugar chain structures but substantially the same protein structure
  • detection of a structural change in the target sugar chain is, for example, A target sugar chain, a lectin that recognizes a specific sugar chain structure that has the first sugar chain but not the second sugar chain, and the lectin bind to each other, so that the first sugar chain and the second sugar chain
  • the antibody is mixed with an antibody that has the property of binding to the glycan but has the property of preventing the binding to the first glycan to which the lectin is bound. (See Patent Document 2). However, in this case, it has the property of binding to the first sugar chain and the second sugar chain to which the lectin is not bound, but the binding to the first sugar chain to which the lectin is bound is hindered. It is necessary to use special antibodies with properties.
  • Patent Document 1 International Publication WO2002Z066634 Pamphlet
  • Patent Document 2 Japanese Patent No. 3070418 Disclosure of the invention
  • the present invention aims to provide a method capable of easily and efficiently detecting a structural change in a target sugar chain that can exist as the first sugar chain and the second sugar chain due to a structural change.
  • Target a target sugar chain that can exist as the first sugar chain and the second sugar chain due to a structural change.
  • the present invention relates to a target sugar chain that can exist as a first sugar chain and a second sugar chain due to a structural change, and a first sugar chain and a second sugar chain. Ratio of the binding amount of the first lectin and the binding amount of the second lectin to the target sugar chain when the 1st to nth lectins (n is an integer of 2 or more) capable of binding are mixed. Is a method for detecting the presence or absence of structural change in the target sugar chain using the following formula (I):
  • A is a mixture of the first sugar chain and the first lectin in the absence of other lectins.
  • 11 represents the binding amount of the first lectin to one molecule of the first glycan when the glycan and the 1st to nth lectins are mixed
  • B represents the first glycan and the 1st to 1st lectins.
  • Binding of the first lectin to one molecule of the second sugar chain when mixed with the nth lectin B represents the second sugar when the second sugar chain and the 1st to nth lectins are mixed.
  • the target sugar chain may exist only as the first sugar chain, may exist only as the second sugar chain, and exists as a mixed state of the first sugar chain and the second sugar chain there's a possibility that. That is, the total number of target sugar chains (N) is [number of target sugar chains existing as the first sugar chain (N)] + [number of target sugar chains existing as the second sugar chain ( N;)].
  • N are forces that represent an integer greater than or equal to 0 N and N cannot be 0 at the same time.
  • the binding amount (D) of the first lectin to the target sugar chain is expressed as [first glycan Binding amount of lectin (B)] X
  • the binding of the first lectin to the target sugar chain when the target sugar chain and the first to n-th lectins are mixed
  • the ratio (D ZD or D ZD) between the amount (D) and the binding amount (D) of the second lectin to the target sugar chain when the target sugar chain and the 1st to nth lectins are mixed
  • the presence state of the target sugar chain i.e., N and
  • D means a certain value range in addition to a certain value.
  • the binding amount (D) of the first lectin to the target sugar chain, the target sugar chain and the first to n-th lectins are mixed.
  • the target sugar chain exists only as the second sugar chain or as a mixed state of the first sugar chain and the second sugar chain, that is, It can be determined that a structural change has occurred in the target sugar chain.
  • the target sugar chain is the first sugar chain alone or the first sugar chain and the second sugar chain.
  • the sugar chain is present in a mixed state, that is, a structural change occurs in the target sugar chain.
  • the binding amount (C) of the first lectin to the target sugar chain, the target sugar chain and the first lectin are mixed.
  • the ratio (C / C or C ZC) to the binding amount of the second lectin to the target sugar chain (C) is also D / D or D As with / ⁇ ,
  • It can be used as an index for detecting the presence or absence of structural change.
  • N The presence state of the target sugar chain in the measurement of 2 (i.e., N
  • the presence or absence of structural change in the target sugar chain can be detected more easily and efficiently than when 1 2 2 1 1 2 2 1 is used.
  • the presence or absence of structural changes in the target sugar chain can be detected with higher accuracy than when 1 2 2 1 1 2 2 1
  • B / B and B / B should be distinguished more clearly than A / and A /
  • the presence or absence of structural change in the target sugar chain can be detected with higher accuracy than in the case of 1 2 2 1 1 2 2 1.
  • A Since there is a difference in the sugar chain structure caused by the structural change between the first sugar chain and the second sugar chain, A may have a value or a range different from A. Similarly, A is different from A or
  • a / A can indicate a different value or range than A / A.
  • A corresponds to the first sugar chain when the first sugar chain and the first to n-th lectins are mixed.
  • the amount of binding of the first lectin to one molecule of the first sugar chain when the binding of the first lectin is not affected by the binding of other lectins to the first sugar chain . Therefore, when the first sugar chain and the 1st to n-th lectins are mixed, the binding force of the first lectin to the first sugar chain is affected by the binding of other lectins to the first sugar chain.
  • B may have a different value or range than A.
  • the first sugar may have a different value or range than A.
  • the binding force of the second lectin to the first sugar chain is affected by the binding of other lectins to the first sugar chain when the chain is mixed with the 1st to nth lectins.
  • the first sugar chain and the 1st to nth lectins may indicate a value or range different from A. Therefore, the first sugar chain and the 1st to nth lectins
  • the binding of the first lectin and the second lectin to the first sugar chain is affected by the binding of the other lectin to the first sugar chain, respectively. May indicate different values or ranges.
  • the binding strength of the first lectin and the second lectin to the second sugar chain is affected by the binding of other lectins to the second sugar chain, respectively.
  • B may represent a value or range different from A / A.
  • the 1st to n-th lectins are not particularly limited as long as they can bind to the first sugar chain and the second sugar chain so as to satisfy the above formula (I). . It is preferable that each of the first to nth lectins can specifically bind to a predetermined sugar chain structure. In this case, since the binding behavior of the 1st to n-th lectins to the first sugar chain and the second sugar chain is easy to grasp, it is easy to select the 1st to n-th lectins satisfying the above formula (I). It becomes.
  • a lectin whose specific affinity for a predetermined sugar chain structure is not strict usually can also show affinity for sugar chain structures other than the predetermined sugar chain structure.
  • n is small, the binding behavior of the first to n-th lectins to the first sugar chain and the second sugar chain can be easily grasped, so the above formula (I) is satisfied. Selection of the 1st to n-th lectins is facilitated.
  • n is not particularly limited as long as it is an integer of 2 or more, preferably 2 to 5, and more preferably 2 to 3.
  • the first sugar chain can be bound with the first lectin.
  • the structure of both sugar chains is different in that it has a chain structure, but the second sugar chain does not have the first sugar chain structure, and the structure of both sugar chains may be substantially the same in other points. Can be mentioned. In this case, A is greater than A
  • A is substantially the same as A, so A / A> A / A.
  • the first sugar chain has the first sugar chain structure to which the first lectin can bind, but the structure of both sugar chains is that the second sugar chain does not have the first sugar chain structure. Otherwise, if the structures of both sugar chains are substantially the same in other respects, when the first lectin binds to the first sugar chain structure in the first sugar chain, the first sugar chain By selecting the 1st to nth lectins so that the binding of the second lectin to is suppressed, B /> A / A is established.
  • the second lectin when the second lectin can bind to a plurality of sugar chain structures in the first sugar chain, it is only necessary to suppress the binding of the second lectin to one or more sugar chain structures.
  • the binding of the second lectin to the first sugar chain is suppressed.
  • the first sugar chain and the second sugar chain have a second sugar chain structure to which the second lectin can bind, and the first sugar chain has a first sugar chain structure that is first with respect to the first sugar chain structure.
  • the lectin binds, the binding of the second lectin to the second sugar chain structure is suppressed.
  • the binding of the second lectin to the second sugar chain structure is suppressed, for example, In the first sugar chain, the first sugar chain structure and the second sugar chain structure are close to each other, and the binding force of the first lectin to the first sugar chain structure is related to the second sugar chain structure. For example, it may be greater than the binding strength of the second lectin. In this case, the binding of the first lectin to the first glycan structure competes with the binding of the second lectin to the second glycan structure, but the binding of the first lectin to the first glycan structure.
  • the binding of the first lectin to the first glycan structure occurs preferentially, and the first lectin bound to the first glycan structure becomes a steric hindrance.
  • the binding of the second lectin to the second sugar chain structure is suppressed.
  • the first sugar chain structure and the second sugar chain structure are close to each other means that a part of the first sugar chain structure and a part of the second sugar chain structure overlap. Is also included.
  • the method for measuring the binding amount of the first lectin and the binding amount of the second lectin to the target sugar chain is not particularly limited.
  • the amount of the first lectin bound to the target sugar chain and the amount of the first lectin are bound based on the amount of the label substance.
  • the amount of binding of 2 lectins can be measured.
  • the target sugar chain to be mixed with the first to n-th lectins is preferably immobilized on a solid support.
  • impurities attached to the solid support for example, sugar chains other than the target sugar chain contained together with the target sugar chain in the sample
  • target sugar chains In contrast, unbound lectins can be easily removed.
  • the material, shape, etc. of the solid support to which the target sugar chain is immobilized are not particularly limited. However, it is preferably a particle or magnetic particle.
  • the binding of the target sugar chain and the 1st to n-th lectin efficiently proceeds by dispersing the particles or magnetic particles with the target sugar chain immobilized together with the 1st to n-th lectin in the liquid.
  • the operability of the particles is improved, the magnetic particles dispersed in the liquid can be easily collected by the action of the magnet, and the magnetic action can be obtained by releasing the action of the magnet.
  • the particles can be dispersed in the liquid.
  • the target sugar chain may be a sugar chain bound to a protein, a lipid, or the like (that is, a sugar chain contained in a glycoprotein, a glycolipid, or the like). Even if it is a sugar chain, it is preferably a sugar chain contained in a glycoprotein.
  • an antibody or fragment thereof that can specifically bind to the protein portion of the glycoprotein is immobilized on a solid support, and the target sugar in the sample is brought into contact with the sample by contacting the sample with the solid support.
  • the chain can be fixed to a solid support.
  • the solid support can be washed to separate impurities contained in the sample from the target sugar chain.
  • a method capable of easily and efficiently detecting a structural change in a target sugar chain that may exist as the first sugar chain and the second sugar chain due to a structural change.
  • FIG. 1 is a diagram relating to a T test.
  • the method according to the present embodiment is a standard that can exist as sugar chain G and sugar chain G due to structural changes.
  • the target sugar chain T is a sugar chain contained in the glycoprotein.
  • the glycoprotein containing the target sugar chain T is not particularly limited.
  • transferrin, blood group glycoprotein, Physiologically active substances such as human chorionic gonadotropin (hCG), thyroid stimulating hormone (TSH), luteinizing hormone (LH); prostate specific antigen (PSA), ⁇ 2-Macroglobulin, carcinoembryonic antigen (CEA), a- Examples include cancer-related antigens such as fetoprotein (AFP); sugar chain antigens such as CA19-9 and CA125.
  • the sugar chain antigen may not be bound to the cell surface, or may be bound to the cell surface (cell surface sugar chain antigen).
  • the target sugar chain T is a sugar chain that can exist as sugar chains G and G due to the sugar chain structure.
  • Glycan G has a sugar chain structure S to which lectin L can bind.
  • Glycan G has a different sugar chain G and G in that it does not have a sugar chain structure S.
  • the sugar chain structure is not attached to the part where lectins L and L cannot bind.
  • the sugar chain G is preferably present as one kind of sugar chain without any difference in sugar chain structure, but the sugar chain G when the sugar chain G, the lectin L, and the lectin L are mixed. Rectangle for one molecule
  • the ratio (B /) of the binding amount of B (L) and the binding amount (B) of lectin L is constant or
  • the sugar chain G is preferably present as one kind of sugar chain without any difference in sugar chain structure.
  • the ratio (B /) of the binding amount of B (L) and the binding amount (B) of lectin L is constant or
  • Structural changes in the target sugar chain T include, for example, addition of sugar chain structure S, deletion of sugar chain structure S, change from sugar chain structure S to sugar chain structure S, sugar chain structure S '' To the sugar chain structure S.
  • the structural change is the addition of sugar chain structure s
  • the sugar chain before the structural change is sugar chain G
  • the sugar chain after the structural change is sugar chain G
  • the structural change is the sugar chain structure S.
  • the sugar chain before the structural change is sugar chain G
  • the sugar chain after the structural change is sugar chain G
  • the structural change is from the sugar chain structure S to the sugar chain structure S ′.
  • Change in structure The previous sugar chain is sugar chain G
  • the sugar chain after the structural change is sugar chain G
  • the structural change is the sugar chain structure.
  • sugar chain G 1 1 2
  • sugar chain G 1 1 2
  • causes of structural changes in the target sugar chain T include, for example, diseases such as hepatocellular carcinoma, rectal cancer, lung cancer, knee cancer, thyroid cancer, myeloma, rheumatoid arthritis; sialidase, galactosidase, N— Treatment with glycosidases such as acetylyldarcosaminidase, mannosidase, fucosidase; differences in blood type, etc. Even if a structural change occurs in the sugar chain contained in the glycoprotein, the structural change does not occur in the protein contained in the glycoprotein. Therefore, the protein bound to sugar chain G and the tamper bound to sugar chain G
  • the cuticle has substantially the same structure.
  • the target sugar chain is a sugar chain contained in oc-fetoprotein (AFP)
  • the target sugar chain T contains an a-L-fucose residue, N- Acetyldarcosamine residues (bisecting N-acetylcylcosamine) etc. are added.
  • the sugar chain structure added as hepatocellular carcinoma progresses is sugar chain structure S
  • the sugar chain before the addition of sugar chain structure S is sugar chain G
  • sugar chain structure S is added.
  • the latter sugar chain is sugar chain G.
  • Lectins L and L have the following formula (I):
  • A is the sugar when glycan G and lectin L are mixed in the absence of lectin L.
  • A represents a sugar chain when sugar chain G and lectin L are mixed in the absence of lectin L.
  • G represents the amount of lectin L bound to one molecule
  • A represents glycan G and lectin L.
  • 1 2 2 and B is a pair of sugar chain G, lectin L, and lectin L. Represents the binding amount of lectin L, and B is a mixture of sugar chain G, lectin L, and lectin L.
  • B is the sugar chain G 1 molecule when sugar chain G, lectin L and lectin L are mixed.
  • Lectin L can bind to sugar chain structure S in sugar chain G and can also bind to sugar chain structures other than sugar chain structure S. Lectin L preferably exhibits specific affinity for sugar chain structure S. However, the specific affinity of lectin L for sugar chain structure S is not strict. Even if lectin L shows specific affinity for sugar chain structure S, lectin L is not sugar chain structure S. Affinity can also be exhibited for the sugar chain structure.
  • Sugar chain G has a sugar chain structure S to which lectin L can bind.
  • Sugar chain G does not have sugar chain structure S, and sugar chains G and G have different structures. Since the structures of chains G and G are substantially identical, the amount of lectin L bound to the G chain molecule (A)
  • B may represent a value or range different from A /.
  • B / B is different from A / because one of 2 2 1 2 is affected by the other
  • glycan G when lectin L binds to glycan structure S, binding of lectin L to glycan G is suppressed.
  • B is A and
  • glycan G when lectin L binds to glycan structure S, binding of lectin L to glycan G is suppressed, for example, glycan G and G1S lectin L
  • Binding of lectin L to sugar chain structure S may be suppressed when tin L is bound.
  • Examples of cases where the binding of lectin L to 1 1 1 2 is suppressed include, for example, sugar chain structure in sugar chain G.
  • Structure S and sugar chain structure S are close to each other, and the binding power of lectin L to sugar chain structure S is
  • “Sugar chain structure S and sugar chain structure S are close to each other” means that a part of sugar chain structure S and the sugar chain structure
  • Lectins L and L are special as long as they can bind to sugar chains G and G so as to satisfy the above formula (I).
  • Hirochawantake lectin AAL
  • Mashroom lectin ABA
  • Murasakixosin lectin BPA
  • Vandelia bean glucuron BS A-11
  • Conkanaparin A ConA
  • Doricos bean lectin DBA
  • Datura bean lectin DSA
  • Digo bean lectin EAA
  • Lentil bean lectin Lentil bean lectin
  • MAA MAH
  • Inuenyu lectin MAM
  • Peanut lectin PNA
  • Endo bean lectin PSA
  • American pokeweed lectin PWM
  • Castor bean lectin RCA120 or RCA60
  • Soybean lectin SBA
  • -Kojito collectin SNA
  • Potato lectin STA
  • Nihon-KojitoCollectin SSA
  • Roh, Rije-Soda Lectin UAA-I
  • Wheat Germ Lectin WGA
  • the ratio of the amount of tin binding (D) and the amount of lectin L binding (D) (D ZD) is determined by the following process (
  • the sample is not particularly limited as long as it contains the target sugar chain T, and examples thereof include biological samples such as serum, blood, plasma, urine, lymphocytes, blood cells, and cells.
  • the sample contains multiple molecules of the target sugar chain T, all of the molecules may have undergone structural changes, some of the molecules may have undergone structural changes, and all molecules There may be no structural changes.
  • the method for immobilizing the target sugar chain T to the solid support is not particularly limited, and can be performed according to a conventional method. For example, by immobilizing an antibody or fragment thereof that can specifically bind to the protein portion of a glycoprotein containing the target sugar chain T on a solid support, and contacting the sample with the solid support, The target sugar chain T in the sample can be fixed to the solid support.
  • the material of the solid support is not particularly limited.
  • glass silicon; ceramic Tuss; polystyrene resin such as polystyrene, acrylic resin such as polymethylmethalate (methacrylic resin), polyamide resin, polyester such as polyethylene terephthalate, synthetic resin such as polycarbonate; agarose, dextran, cellulose, etc.
  • polysaccharides such as gelatin, collagen, casein and the like.
  • the shape of the solid support is not particularly limited, and examples thereof include a plate shape and a particle shape, and a particle shape is preferable.
  • the solid support is a particle
  • the target sugar chain T in the sample can be efficiently fixed to the particle by dispersing the particle in the sample.
  • the particle preferably has magnetism.
  • the solid support is a magnetic particle
  • the operability of the particle is improved, and particles dispersed in the sample can be easily collected by the action of the magnet, and the action of the magnet is released to release the particle. Can be dispersed in the sample.
  • Such characteristics of the magnetic particles are also advantageous when washing the solid support (see steps (b) and (d)).
  • the method for immobilizing the antibody or fragment thereof on the solid support is not particularly limited, and can be performed according to a conventional method.
  • a method for immobilizing an antibody or a fragment thereof on a solid support for example, a functional group on the surface of the solid support is reacted with a functional group on the antibody or a fragment thereof, and the antibody or the fragment thereof is reacted on the surface of the solid support.
  • One example is a method of covalently binding fragments.
  • the functional group capable of forming a covalent bond include a carboxyl group and an amino group, and these functional groups can be introduced into a solid support and an antibody or a fragment thereof according to a conventional method.
  • the carboxyl group is activated with carboimides and then reacted with the amino group of the antibody or fragment thereof, thereby allowing the antibody or fragment thereof to react via an amide bond. It can be fixed to a solid support.
  • the amino group is converted into a carboxyl group using a cyclic acid anhydride such as succinic anhydride, and then reacted with an amino group possessed by the antibody or a fragment thereof.
  • the antibody or fragment thereof can be immobilized to the solid support via an amide bond.
  • a method using a piotin-avidin system for example, a method of immobilizing a pyotiny antibody or a fragment thereof on the surface of a solid support coated with avidin or streptavidin can be used.
  • impurities contained in the sample for example, sugar chains other than the target sugar chain T
  • the washing liquid may be, for example, water, an alcohol or other relatively high solvent; a water solution containing salts such as salt sodium, salt potassium, salt magnesium, etc.
  • Liquids aqueous solutions containing alcohols; aqueous solutions containing proteins, nucleic acids, etc .; the above-mentioned solvents or aqueous solutions containing appropriate pH buffering agents such as phosphoric acid and Tris can be used.
  • Step (b) may be omitted.
  • Lectins L and L are preliminarily provided with labeling substances LB and LB that can be detected separately.
  • Labeling substances LB and LB are particularly limited as long as they can be detected separately
  • fluorescent substances such as fluorescein, rhodamine, phycoerythrin; chemiluminescent substances such as luminol, lucigenin, and ataridium ester; bioluminescent substances such as luciferase and luciferin; alkaline phosphatase, horseradish peroxidase, etc. 99 ⁇ c 131 I, 125 I, "C, 3 H, etc. Radioisotopes; Semiconductor nanoparticles; Oligonucleotides; Magnetic materials; Antibodies etc. Labeled substance bound to lectin L 1 molecule It is preferable that the mass is substantially the same between molecules, and the same applies to lectin L.
  • the amount of labeling substance bound to one molecule of lectin is substantially the same between molecules, the amount of lectin can be accurately determined from the amount of labeling substance.
  • the mixing order is not particularly limited. After mixing lectins L and L, the target sugar
  • Chain T may be mixed, or one of lectins L and L mixed with target sugar chain
  • the other lectin may be mixed.
  • target sugar chain T, lectin L, and lectin L are mixed, target sugar chain T and lectin L are in contact with each other.
  • Target sugar chain T exists as sugar chain G
  • lectin L binds to sugar chain structure S of target sugar chain T and sugar chain structures other than sugar chain structure S, and lectin L binds to a predetermined sugar chain structure of target sugar chain T. Mark
  • the target sugar chain T When a typical sugar chain T is present as sugar chain G, the target sugar chain T has a specific glycan structure. Lectin L binds to a predetermined sugar chain structure of the target sugar chain T. Mark
  • examples of the solvent include a salt.
  • An aqueous solution containing salts such as sodium chloride, potassium chloride, magnesium chloride, etc .; an aqueous solution containing alcohols; an aqueous solution containing proteins, nucleic acids, etc .; the above solvent or aqueous solution containing an appropriate pH buffer such as phosphoric acid, tris, etc. Can be used.
  • the temperature is usually 4-60 ° C, preferably 25-37 ° C, the time is usually 1-120 minutes, preferably 5-60 minutes, and the pH is usually 2-10, preferably 5 ⁇ 8.
  • the amount of lectin L and L mixed is the target
  • washing liquid examples include water, alcohol and other relatively polar solvents; aqueous solutions containing salts such as sodium chloride, potassium chloride and magnesium chloride; aqueous solutions containing alcohols; proteins, nucleic acids, etc.
  • aqueous solutions containing an appropriate pH buffer such as phosphoric acid or Tris can be used.
  • the method of measuring the amount of labeling substances LB and LB depends on the type of labeling substances LB and LB.
  • the binding amount (D) of lectin L to sugar chain sugar chain T can be determined based on the amount of labeling substance LB. The Similarly, binding of lectin L to target sugar chain T based on the amount of labeling substance LB
  • sugar chain G is a sugar chain before the structural change
  • sugar chain G is a sugar chain after the structural change
  • target sugar chain T is sugar chain G only or sugar chain
  • sugar chain G is the sugar chain before the structural change If G / G is a sugar chain after structural change, B / ⁇ D / D> B /
  • target sugar chain T exists as sugar chain G only or as a mixed state of sugar chain G and sugar chain G
  • the binding amount (D) of lectin L to target sugar chain T and lectin L is the binding amount (D) of lectin L to target sugar chain T and lectin L
  • D ZD is used as the ratio of the amount of bond (D), D ZD may be used.
  • B is used as the ratio of the amount of bond (D)
  • target sugar chain T is sugar chain G only or sugar chain
  • the target sugar chain T is the sugar chain G alone or the sugar chain G and
  • the sugar chain contained in the glycoprotein is the target sugar chain T.
  • the sugar chain contained in the glycolipid, the sugar chain not bound to the protein, lipid, etc. is the target sugar chain T. It is good.
  • glycolipids containing the target sugar chain ⁇ include galactoceleb mouthside and darcocerebroside
  • Globoside latatosyl ceramide, trihexosyl ceramide, paragloboside, forssman antigen glycolipid, fucosyl ganglioside, fucosyl ceramide, blood group active glycolipid and the like.
  • Transferrin (TF) (Serologicals proteins, Inc.) was adsorbed specifically to anti-transferrin antibody (INTER-CELL TECHNOLOGIES, INC.)-Coupled magnetic beads. Thereafter, only when the sugar chain of transferrin was partially decomposed, sialidase was added to the magnetic bead suspension for reaction to remove sialic acid present at the non-reducing end of the sugar chain. Thereafter, the magnetic bead suspension was mixed with and reacted with pectin-labeled RCA lectin and FITC-labeled SSA lectin, and further reacted with Cy5-labeled streptavidin to specifically bind Cy5 to the RCA lectin.
  • SSA lectin strongly recognizes the Sia a 2-6 Gal / GalNAc structure containing sialic acid present at the non-reducing end of the sugar chain, and the RCA lectin recognizes the Gal j8 l-4GlcNAc structure in the sugar chain. recognize.
  • the amount of Cy5 and FITC in the magnetic bead group is measured with a fluorometer to determine the ratio Rl (Cy5 amount / FITC amount), and sialidase relative to R1 of the sialidase-untreated sample.
  • the ratio R2 of the treated sample R1 (R1 of the sialidase treated sample / R1 of the sialidase untreated sample) was determined.
  • the magnetic bead suspension was mixed with piotin-labeled RCA lectin in the absence of FITC-labeled SSA lectin and magnetic bead suspension.
  • a system that mixes pectin-labeled RCA lectin and FITC-labeled SSA lectin into a magnetic bead suspension is referred to as a “mixed system”.
  • a system in which one of the lectins is mixed in the absence of the other is called an “unmixed system”.
  • Magnetic beads were prepared by the method described in the attached document of Dynabeads M-270 Carboxylic acid (Dynal). First, put Dynabeads suspension 10 1 (30 g beads) into a 1.5 ml Eppendorf tube, stand the Eppendorf tube on a magnetic stand to separate the magnetic beads, and wash the magnetic beads. went. The magnetic beads were washed three times using MiliQ 1001. After washing, 0.005M CMC dissolved in MiliQ [N-cyclohexy ⁇ ⁇ '- (2-morph ohnoethyl) carbodnmide metnyl-p-toluensulfonate] 10 ⁇ 1 The mixture was rotated and mixed for 10 minutes to activate the carboxy group.
  • the magnetic beads were suspended in order by sequentially adding 1.1 ⁇ l of lOmg / ml BSA solution prepared with MiliQ and transferrin stock solution (lmg / ml) 101. The mixture was tumbled at room temperature for 1 hour. Next, after removing the supernatant of the magnetic bead solution, the magnetic beads were washed three times with 200 ⁇ l of TBS buffer. Next, CP buffer (50 mM Na PO, 1 ⁇ ) was added to the magnetic beads.
  • Citric acid 97 ⁇ 1 and sialidase (10 mU / 1) 3 1 were added in order, suspended, and mixed by rotation at 37 ° C. for 3.5 hours.
  • sialidase treatment 31 mg of lmg / ml BSA solution prepared with Mili Q was used instead of sialidase.
  • the magnetic beads were washed 3 times with 200 ⁇ l of TBS buffer.
  • 2 ⁇ BW buffer [10 mM Tris-HCl (pH-7.5), ImM EDTA, 2.0 M NaCl] 20 ⁇ 1, and Cy5-labeled streptavidin ((mg / ml ⁇ O / zl) were sequentially added to the magnetic beads. After suspension, spin-mix at room temperature for 40 minutes, remove the supernatant of the magnetic bead solution, and then wash the magnetic beads three times with 1 X BW buffer 200 ⁇ l.
  • the ratio R2 (average 9.66) in the mixed system was larger than the ratio R2 (average 6.31) in the non-mixed system.
  • the SSA binding site and the RCA binding site partially overlap. Therefore, in the mixed-system sialidase-untreated sample, the SSA binding to the transferrin sugar chain and the RCA binding Competition, and SSA binding preferentially occurs, resulting in suppression of RCA binding. On the other hand, in the sialidase-treated sample of the mixed system, SSA binding to the transferrin sugar chain is suppressed by removal of sialic acid, so that RCA binding to the transferrin sugar chain is not suppressed.
  • the amount of RCA bound to one transferrin sugar chain molecule is smaller in the mixed-type non-mixed sialidase-treated sample than in the non-mixed-type sialidase-treated sample, whereas it is not mixed with the mixed-type sialidase-treated sample. It is virtually identical to the sialidase treated sample of the system.
  • the amount of SSA bound to one transferrin sugar chain molecule is determined between the untreated sialidase-treated sample and the unmixed sialidase-treated sample, and the mixed sialidase-treated sample and the unmixed sialidase treated sample. It is considered substantially the same between the samples.
  • the ratio R1 in the mixed system shows a value or a range that more reflects the presence or absence of sialic acid, and the ratio R1 (2.85) of the sialidase-untreated sample in the mixed system and the ratio R1 (28.54) of the sialidase-treated sample. ) Is greater than the difference between the ratio R1 (1.33) of the sialidase-untreated sample in the unmixed system and the ratio R1 (9.46) of the sialidase-treated sample, which results in a ratio R2 (average 9.66 in the mixed system).
  • J8-mannosidase was added to the bead suspension for reaction. Then, the magnetic bead suspension is reacted with Piotin-labeled ConA and FITC-labeled WGA (reaction solvent: TBS + 0.5M NaCl, each lectin concentration: 0.3 mg / mL), and further reacted with Cy5-labeled streptavidin.
  • Piotin-labeled ConA reaction solvent: TBS + 0.5M NaCl, each lectin concentration: 0.3 mg / mL
  • Cy5-labeled streptavidin Cy5-labeled streptavidin.
  • Mannosidase treatment cleaves mannose from the transferrin sugar chain, so that the binding of WGA to the transferrin sugar chain remains almost unchanged, while the binding of ConA to the transferrin sugar chain is weak.
  • the amount of Cy5 and FI in the magnetic beads Measure the amount of TC with a fluorometer to determine the ratio Rl (Cy5 amount / FITC amount) and the ratio of R1 of the 13 mannosidase-treated sample to R1 of the ⁇ -mannosidase-untreated sample R2 (Rl / of the j8 mannosidase-treated sample) R1) of the untreated sample of j8 mannosidase was determined (ratio R2 in the mixed system).
  • piotin-labeled ConA was mixed with magnetic bead suspension in the absence of FITC-labeled WGA, and magnetic bead suspension was labeled with FIT C-labeled WGA.
  • the amount of Cy5 and FITC in the magnetic beads is measured with a fluorimeter, and the ratio Rl (Cy5 / FITC) is determined and the ⁇ -mannosidase-untreated sample is obtained.
  • the R1 ratio R2 of the j8-mannosidase treated sample to Rl was determined (ratio R2 in the unmixed system).
  • ratio R2 in the unmixed system was determined (ratio R2 in the unmixed system).
  • the average value of the ratio R2 in the mixed system (1.24)
  • the ratio R1 in the mixed system is used as an index, the structural change of the transferrin sugar chain due to sialidase treatment or j8-mannosidase treatment can be detected more accurately than the ratio R1 in the non-mixed system as an index. Can do.
  • the variation in the measured value in the mixed system is smaller than the variation in the measured value in the non-mixed system, and if the ratio R1 in the mixed system is used as an index, the variation R1 in the non-mixed system is more accurate than the index. Changes in the structure of the transferrin sugar chain due to sialidase treatment can be detected.
  • T T value obtained by T test
  • the T value at the significance level of 5% is 5.1976 in the mixed system, and the t (N + N-2) a Z2
  • the one cent point is 2.04227. On the other hand, it is 3.3411 in the unmixed system, and t (N + N ⁇ 2
  • the confidence space of the mixed system is 2.85—0.58 ⁇ ⁇ 2.85 + 0.58 for the non-sialidase-treated sample.
  • the confidence space of the mixed system is 1.33-0.47 ⁇ ⁇ 1.33 + 0.47.
  • the confidence space of the mixed system is 28.54—1053 ⁇ ⁇ 28.54 + 10.53, and the confidence space of the unmixed system is 9.46-5.40 ⁇ ⁇ 9.46 + 5.40.
  • the difference between the ratio R1 of the sialidase untreated sample in the mixed system and the ratio R1 of the sialidase treated sample in the mixed system is the ratio R1 of the sialidase untreated sample in the unmixed system and the ratio of the sialidase treated sample.
  • the ratio R2 in the mixed system was greater than the ratio R2 in the unmixed system.
  • the ratio R1 in the mixed system is used as an index, the structural change of the thyroglobulin sugar chain due to the sialidase treatment can be detected with higher accuracy than the ratio R1 in the non-mixed system as the index.

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Abstract

 構造変化により第1の糖鎖及び第2の糖鎖として存在し得る標的糖鎖における構造変化を容易かつ効率的に検出することができる方法を提供することを目的とし、この目的を達成するために、本発明においては、構造変化により第1の糖鎖及び第2の糖鎖として存在し得る標的糖鎖と、第1の糖鎖及び第2の糖鎖に結合し得る第1~第nのレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対する第1のレクチンの結合量及び第2のレクチンの結合量の比を指標として、標的糖鎖における構造変化の有無を検出する。

Description

明 細 書
標的糖鎖における構造変化を検出する方法
技術分野
[0001] 本発明は、標的糖鎖における構造変化を検出する方法に関する。
背景技術
[0002] 糖鎖の構造は、種々の原因により変化し得る。例えば、 aーフエトプロテイン (AFP )に含まれる糖鎖に関しては、肝細胞ガンの進行に伴って、 a—L—フコース残基、 N -ァセチルダルコサミン残基 (バイセクティング N -ァセチルダルコサミン)等が付 カロされる。したがって、 AFPに含まれる糖鎖の構造変化を検出することにより、肝細 胞ガンの診断が可能になると考えられる。
[0003] 構造変化により第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖として存在し得る標的糖鎖における構造 変化の検出は、例えば、標的糖鎖と、第 1の糖鎖に対する結合性及び第 2の糖鎖に 対する結合性が異なるレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対するレクチンの結 合性を指標として行うことができる (特許文献 1参照)。しかしながら、この場合、標的 糖鎖とレクチンとの結合挙動を詳細に調べ、結合定数等の結合性に関する情報を求 める必要がある。
[0004] また、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖が、糖鎖構造は異なるがタンパク質構造は実質的 に同一な糖タンパク質である場合、標的糖鎖における構造変化の検出は、例えば、 標的糖鎖と、第 1の糖鎖は有するが第 2の糖鎖は有しない特定の糖鎖構造を認識す るレクチンと、当該レクチンが結合して 、な 、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖に結合する 性質を有するが、当該レクチンが結合した第 1の糖鎖への結合が妨げられる性質を 有する抗体とを混合し、標的糖鎖に抗体がしたカゝ否かを指標として行うことができる( 特許文献 2参照)。し力しながら、この場合、レクチンが結合していない第 1の糖鎖及 び第 2の糖鎖に結合する性質を有するが、当該レクチンが結合した第 1の糖鎖への 結合が妨げられる性質を有する特殊な抗体を用いる必要がある。
特許文献 1:国際公開 WO2002Z066634号パンフレット
特許文献 2:特許第 3070418号公報 発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0005] 本発明は、構造変化により第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖として存在し得る標的糖鎖に おける構造変化を容易かつ効率的に検出することができる方法を提供することを目 的とする。
課題を解決するための手段
[0006] 上記目的を達成するために、本発明は、構造変化により第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖 として存在し得る標的糖鎖と、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖に結合し得る第 1〜第 nの レクチン (nは 2以上の整数である。)とを混合したときの、標的糖鎖に対する第 1のレ クチンの結合量及び第 2のレクチンの結合量の比を指標として、標的糖鎖における構 造変化の有無を検出する方法であって、次式 (I):
[0007] [数 1]
B n / B 1 2 A n ZA 1 2
> > 1 t» 2 i z b 2 2 A 2 1 / A 2 2
[0008] [式中、 A は、第 1の糖鎖と第 1のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合したと
11
きの、第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結合量を表し、 A は、第 1の糖鎖
12
と第 2のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合したときの、第 1の糖鎖 1分子に 対する第 2のレクチンの結合量を表し、 A は、第 2の糖鎖と第 1のレクチンとを他のレ
21
クチンの不存在下で混合したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結 合量を表し、 A は、第 2の糖鎖と第 2のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合
22
したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表し、 B は、第 1の
11 糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレク チンの結合量を表し、 B は、第 1の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、
12
第 1の糖鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表し、 B は、第 2の糖鎖と第 1
21
〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結 合量を表し、 B は、第 2の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 2の糖
22
鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表す。 ]
を満たす第 1〜第 nのレクチンを用いる方法を提供する。
[0009] 標的糖鎖は、第 1の糖鎖のみとして存在する可能性、第 2の糖鎖のみとして存在す る可能性、並びに第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖の混合状態として存在する可能性があ る。すなわち、標的糖鎖の総分子数 (N)は、 [第 1の糖鎖として存在する標的糖鎖の 分子数 (N ) ] + [第 2の糖鎖として存在する標的糖鎖の分子数 (N;) ]で表される。な
1 2 お、 N及び Nは 0以上の整数を表す力 N及び Nが同時に 0となることはない。
1 2 1 2
[0010] 標的糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対する第 1のレク チンの結合量 (D )は、 [第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結合量 (B ) ] X
1 11
[第 1の糖鎖として存在する標的糖鎖の分子数 (N ) ] + [第 2の糖鎖 1分子に対する 第 1のレクチンの結合量 (B ) ] X [第 2の糖鎖として存在する標的糖鎖の分子数 (N
21 2
) ]で表され、標的糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対する 第 2のレクチンの結合量 (D )は、 [第 1の糖鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合
2
量 (B ) ] X [第 1の糖鎖として存在する標的糖鎖の分子数 (N ) ] + [第 2の糖鎖 1分
12 1
子に対する第 2のレクチンの結合量 (B ) ] X [第 2の糖鎖として存在する標的糖鎖の
22
分子数 (N ) ]で表される。
2
[0011] 上記式 (I)を満たす第 1〜第 nのレクチンを使用すると、標的糖鎖と第 1〜第 nのレク チンとを混合したときの、標的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量 (D )と、標的糖 鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対する第 2のレクチンの結 合量 (D )との比 (D ZD又は D ZD )は、標的糖鎖の存在状態 (すなわち、 N及
2 1 2 2 1 1
ΧβΝの値)に応じて、次のように変動する。
2
[0012] (1)標的糖鎖が第 1の糖鎖のみとして存在する場合 (Ν ≥1 , Ν =0)
1 2
D /Ό =Β /Β
1 2 11 12
D /Ό =Β /Β
2 1 12 11
[0013] (2)標的糖鎖が第 2の糖鎖のみとして存在する場合 (Ν =0, Ν ≥1)
1 2
D /Ό =Β /Β
1 2 21 22
D /Ό =Β /Β
2 1 22 21 [0014] (3)標的糖鎖が第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖の混合状態として存在する場合 (Ν Ι, Ν ≥1)
2
Β /Β > D /Ό > Β /Β
11 12 1 2 21 22
Β /Β < D /D < Β /Β
12 11 2 1 22 21
[0015] なお、「Β /Β 」、 「Β /Β 」、 「Β /Β 」、 「Β /Β 」、 「D /Ό」及び「D /
11 12 12 11 21 22 22 21 1 2 2
D は、一定の値を意味する他、一定の値域を意味する。また、「=」は完全に同一 であることを意味する他、実質的に同一であることを意味する。
[0016] したがって、標的糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、標的糖鎖に対す る第 1のレクチンの結合量 (D )と、標的糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したとき の、標的糖鎖に対する第 2のレクチンの結合量 (D )との比(D /Ό又は D ZD )は
2 1 2 2 1
、標的糖鎖における構造変化の有無を検出するための指標とすることができる。すな わち、第 1の糖鎖が構造変化前の糖鎖であり、第 2の糖鎖が構造変化後の糖鎖であ る場合、 B / >D /Ό ≥ B / 又は B / < D /Ό ≤ B /B
11 12 1 2 21 22 12 11 2 1 22 21 であれば、標的糖鎖が第 2の糖鎖のみとして又は第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖の混合 状態として存在している、すなわち、標的糖鎖において構造変化が生じていると判別 することができる。また、第 2の糖鎖が構造変化前の糖鎖であり、第 1の糖鎖が構造変 化後の糖鎖である場合、 B /B ≥ D /D > B /B 又は B ZB ≤D /
11 12 1 2 21 22 12 11 2
D < B /B であれば、標的糖鎖が第 1の糖鎖のみとして又は第 1の糖鎖及び第 2
1 22 21
の糖鎖の混合状態として存在している、すなわち、標的糖鎖において構造変化が生 じていると判別することができる。
[0017] 一方、標的糖鎖と第 1のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合したときの、標 的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量 (C )と、標的糖鎖と第 2のレクチンとを他の レクチンの不存在下で混合したときの、標的糖鎖に対する第 2のレクチンの結合量( C )との比(C /C又は C ZC )も、 D /Ό又は D /Όと同様に、標的糖鎖にお
2 1 2 2 1 1 2 2 1
ける構造変化の有無を検出するための指標とすることができる。
[0018] し力しながら、 C /C又は C /Cを指標とする場合、 Cの測定は、標的糖鎖と第 1
1 2 2 1 1
のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合するという条件下で行われ、 Cの測定
2 は、標的糖鎖と第 2のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合するという条件下 で行われるため、 C及び Cの測定は、別々の反応系で行われる必要がある。し力も
1 2
、各反応系における標的糖鎖の存在状態 (すなわち、 N及び Nの値)は同一である
1 2
必要がある。
[0019] これに対して、 D /Ό又は D /Όを指標とする場合、 D及び Dの測定は、標的
1 2 2 1 1 2
糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合するという同一の条件下で行われるので、同一 の反応系で行うことができる。同一の反応系で測定すれば、 D
1及び D
2の測定時にお ける標的糖鎖の存在状態 (すなわち、 N
1及び N
2の値)は同一である。
[0020] したがって、 D ZD又は D ZDを指標とする場合は、 C /C又は C /Cを指標
1 2 2 1 1 2 2 1 とする場合よりも容易かつ効率的に、標的糖鎖における構造変化の有無を検出する ことができる。
[0021] また、同一の反応系で D及び Dを複数回測定した場合における各測定値のバラ
1 2
ツキは、異なる反応系で C及び Cを複数回測定した場合における各測定値のバラ
1 2
ツキよりも/ J、さくなる。
[0022] したがって、 D ZD又は D ZDを指標とする場合は、 C /C又は C /Cを指標
1 2 2 1 1 2 2 1 とする場合よりも精度よぐ標的糖鎖における構造変化の有無を検出することができる
[0023] さらに、上記式 (I)を満たす第 1〜第 nのレクチンを使用すると、 B /B 及び B /
11 12 21
B の区別を、 A /A 及び A /A の区別よりも明確に行うことができるとともに、
22 11 12 21 22
B /B 及び B /B の区別を、 A / と A / の区別よりも明確に行うこと
12 11 22 21 12 11 22 21
ができる。
[0024] したがって、 D /Ό又は D /Όを指標とする場合、 C /C又は C /Cを指標と
1 2 2 1 1 2 2 1 する場合よりも精度よぐ標的糖鎖における構造変化の有無を検出することができる。
[0025] 第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖の間には、構造変化により生じた糖鎖構造上の相違が あるので、 A は A と異なる値又は値域を示し得る。同様に、 A は A と異なる値又
11 21 12 22
は値域を示し得る。したがって、 A /A は A /A と異なる値又は値域を示し得
11 12 21 22
る。本発明の方法においては、 A /A > A /A を満たす第 1のレクチン及び
11 12 21 22
第 2のレクチンを選択する。
[0026] A は、第 1の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときに、第 1の糖鎖に対する 第 1のレクチンの結合が、第 1の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって影響を受 けない場合の、第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結合量と実質的に同一で ある。したがって、第 1の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときに、第 1の糖鎖 に対する第 1のレクチンの結合力 第 1の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって 影響を受けることにより、 B は A と異なる値又は値域を示し得る。同様に、第 1の糖
11 11
鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときに、第 1の糖鎖に対する第 2のレクチンの結 合力 第 1の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって影響を受けることにより、 B
12 は A と異なる値又は値域を示し得る。したがって、第 1の糖鎖と第 1〜第 nのレクチン
12
とを混合したときに、第 1の糖鎖に対する第 1のレクチン及び第 2のレクチンの結合が 、それぞれ第 1の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって影響を受けることにより、 B ZB は A / と異なる値又は値域を示し得る。同様に、第 2の糖鎖と第 1〜第
11 12 11 12
nのレクチンとを混合したときに、第 2の糖鎖に対する第 1のレクチン及び第 2のレクチ ンの結合力 それぞれ第 2の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって影響を受ける ことにより、 B /B は A /A と異なる値又は値域を示し得る。本発明の方法にお
21 22 21 22
いては、上記式 (I)を満たす第 1〜第 nのレクチンを選択する。
[0027] なお、上記式 (I)が成立する場合としては、例えば、以下の次式 (i)〜(iv)のいずれ 力が成立する場合が挙げられる。
B / > A /A > A /A ≥ B ZB (i)
11 12 11 12 21 22 21 22
B / ≥ A /A > A /A > B /B (ii)
11 12 11 12 21 22 21 22
A /A ≥ B ZB > A /A > B /B (iii)
11 12 11 12 21 22 21 22
B ZB > A /A > B ZB ≥ A /A (iv)
11 12 11 12 21 22 21 22
[0028] 本発明の方法において、第 1〜第 nのレクチンは、上記式 (I)を満たすように第 1の 糖鎖及び第 2の糖鎖に結合し得る限り特に限定されるものではない。第 1〜第 nのレ クチンは、それぞれ所定の糖鎖構造に特異的に結合し得ることが好ましい。この場合 、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖に対する第 1〜第 nのレクチンの結合挙動が把握しやす いので、上記式 (I)を満たす第 1〜第 nのレクチンの選択が容易となる。但し、一般的 に、所定の糖鎖構造に対するレクチンの特異的親和性は厳密なものではなぐレクチ ンは、通常、所定の糖鎖構造以外の糖鎖構造に対しても親和性を示し得る。 [0029] 本発明の方法において、 nが小さい場合、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖に対する第 1 〜第 nのレクチンの結合挙動が把握しやす 、ので、上記式 (I)を満たす第 1〜第 nの レクチンの選択が容易となる。 nは 2以上の整数である限り特に限定されるものではな いが、好ましくは 2〜5であり、さらに好ましくは 2〜3である。
[0030] 本発明の方法において、第 1の糖鎖と第 2の糖鎖との糖鎖構造上の相違が微小で ある場合、第 1の糖鎖に対する第 1〜第 nのレクチンの結合挙動と、第 2の糖鎖に対 する第 1〜第 nのレクチンの結合挙動との相違を把握しやす 、ので、上記式 (I)を満 たす第 1〜第 nのレクチンの選択が容易となる。
[0031] 第 1の糖鎖と第 2の糖鎖との糖鎖構造上の相違が微小である場合としては、例えば 、第 1の糖鎖は第 1のレクチンが結合し得る第 1の糖鎖構造を有するが、第 2の糖鎖 は第 1の糖鎖構造を有しない点で両糖鎖の構造は異なり、それ以外の点で両糖鎖の 構造は実質的に同一である場合が挙げられる。この場合、 A は A よりも大きい
11 21 一 方、 A は A と実質的に同一であるので、 A /A > A /A が成立する。なお
12 22 11 12 21 22
、「両糖鎖の構造が実質的に同一である」には、第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖のうち、 第 1〜第 nのレクチンが結合し得ない部分に糖鎖構造上の相違がある場合も含まれ る。
[0032] 第 1の糖鎖は第 1のレクチンが結合し得る第 1の糖鎖構造を有するが、第 2の糖鎖 は第 1の糖鎖構造を有しない点で両糖鎖の構造は異なり、それ以外の点で両糖鎖の 構造は実質的に同一である場合、第 1の糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 1の糖鎖に対する第 2のレクチンの結合が抑制されるよ うに、第 1〜第 nのレクチンを選択することにより、 B / > A /A が成立する。
11 12 11 12
なお、第 1の糖鎖における複数の糖鎖構造に対して第 2のレクチンが結合し得る場合 、そのうち 1以上の糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合が抑制されればよい。
[0033] B /B > A /A が成立する場合において、第 2の糖鎖と第 1〜第 nのレクチ
11 12 11 12
ンとを混合したときに、第 2の糖鎖に対する第 1のレクチン及び第 2のレクチンの結合 力 それぞれ第 2の糖鎖に対する他のレクチンの結合によって影響を受けなければ、 B /B = A /A が成立する結果、上記式 (I)が成立する。また、第 2の糖鎖に
21 22 21 22
対して第 2〜第 nのレクチンが結合すると、第 2の糖鎖に対する第 1のレクチンの結合 が抑制されれば、 B / < A /A が成立する結果、上記式 (I)が成立する。
21 22 21 22
[0034] 第 1の糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 1の 糖鎖に対する第 2のレクチンの結合が抑制される場合としては、例えば、第 1の糖鎖 及び第 2の糖鎖が、第 2のレクチンが結合し得る第 2の糖鎖構造を有しており、第 1の 糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 2の糖鎖構 造に対する第 2のレクチンの結合が抑制される場合が挙げられる。
[0035] 第 1の糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 2の 糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合が抑制される場合としては、例えば、第 1の 糖鎖において、第 1の糖鎖構造と第 2の糖鎖構造とが近接しており、第 1の糖鎖構造 に対する第 1のレクチンの結合力が、第 2の糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合 力よりも大きい場合が挙げられる。この場合、第 1の糖鎖構造に対する第 1のレクチン の結合と、第 2の糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合とが競合するが、第 1の糖 鎖構造に対する第 1のレクチンの結合力の方が大きいため、第 1の糖鎖構造に対す る第 1のレクチンの結合が優先的に起こり、第 1の糖鎖構造に対して結合した第 1のレ クチンが立体障害となって、第 2の糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合が抑制さ れる。なお、「第 1の糖鎖構造と第 2の糖鎖構造とが近接する」には、第 1の糖鎖構造 の一部と第 2の糖鎖構造の一部とが重複している場合も含まれる。
[0036] 本発明の方法において、標的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量及び第 2のレク チンの結合量の測定方法は特に限定されるものではない。例えば、第 1のレクチン及 び第 2のレクチンにそれぞれ区別して検出可能な標識物質が結合している場合、標 識物質の量に基づいて、標的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量及び第 2のレク チンの結合量を測定することができる。
[0037] 本発明の方法において、第 1〜第 nのレクチンと混合する標的糖鎖が固体支持体 に固定されていることが好ましい。この場合、固体支持体を洗浄することにより、固体 支持体に付着した夾雑物 (例えば、試料中に標的糖鎖とともに含まれて ヽた標的糖 鎖以外の糖鎖等)や、標的糖鎖に対して未結合のレクチンを容易に除去することが できる。
[0038] 標的糖鎖が固定されている固体支持体の材質、形状等は特に限定されるものでは ないが、粒子又は磁性粒子であることが好ましい。この場合、標的糖鎖が固定された 粒子又は磁性粒子を第 1〜第 nのレクチンとともに液体中に分散させることにより、標 的糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとの結合を効率よく進行させることができる。特に磁性 粒子である場合、粒子の操作性が向上し、磁石を作用させることにより液体中に分散 した磁性粒子を容易に捕集することができるとともに、磁石の作用を解除することによ り磁性粒子を液体中に分散させることができる。
[0039] 本発明の方法において、標的糖鎖は、タンパク質、脂質等に結合した糖鎖 (すなわ ち、糖タンパク質、糖脂質等に含まれる糖鎖)であってもよいし、タンパク質、脂質等 に結合して ヽな 、糖鎖であってもよ 、が、糖タンパク質に含まれる糖鎖であることが 好ましい。この場合、糖タンパク質のタンパク質部分に対して特異的に結合し得る抗 体又はその断片を固体支持体に固定しておき、試料と固体支持体とを接触させるこ とにより、試料中の標的糖鎖を固体支持体に固定することができる。また、試料中の 標的糖鎖を固体支持体に固定した後、固体支持体を洗浄することにより、試料中に 含まれる夾雑物と標的糖鎖とを分離することができる。
発明の効果
[0040] 本発明によれば、構造変化により第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖として存在し得る標的 糖鎖における構造変化を容易かつ効率的に検出することができる方法が提供される 図面の簡単な説明
[0041] [図 1]T検定に関する図である。
発明を実施するための最良の形態
[0042] 本実施形態に係る方法は、構造変化により糖鎖 G及び糖鎖 Gとして存在し得る標
1 2
的糖鎖 Τと、糖鎖 G及び糖鎖 Gに結合し得るレクチン L及びレクチン Lとを混合し
1 2 1 2
たときの、標的糖鎖 Τに対するレクチン Lの結合量 (D )及びレクチン Lの結合量 (D
1 1 2
)の比 (D ZD )を指標として、標的糖鎖 Tにおける構造変化の有無を検出する方
2 1 2
法である。
[0043] 標的糖鎖 Tは、糖タンパク質に含まれる糖鎖である。標的糖鎖 Tを含む糖タンパク 質は特に限定されるものではないが、例えば、トランスフェリン、血液型糖タンパク質、 ヒト絨毛性ゴナドトロピン (hCG)、甲状腺刺激ホルモン (TSH)、黄体形成ホルモン( LH)等の生理活性物質;前立腺特異抗原 (PSA)、 《2—マクログロブリン、癌胎児 性抗原(CEA)、 a—フエトプロテイン (AFP)等の癌関連抗原; CA19— 9、 CA125 等の糖鎖抗原等が挙げられる。なお、糖鎖抗原には、細胞表面に結合していないも のであってもよいし、細胞表面に結合しているもの(細胞表面糖鎖抗原)であってもよ い。
[0044] 標的糖鎖 Tは、糖鎖構造により糖鎖 G及び Gとして存在し得る糖鎖である。
1 2
糖鎖 Gはレクチン Lが結合し得る糖鎖構造 Sを有する力 糖鎖 Gは糖鎖構造 S を有しない点で糖鎖 G及び Gの構造は相違し、それ以外の点で糖鎖 G及び Gの
1 2 1 2 構造は実質的に同一である。なお、「糖鎖 G及び Gの構造が実質的に同一である」
1 2
には、糖鎖 G及び糖鎖 Gのうち、レクチン L及び Lが結合し得ない部分に糖鎖構
1 2 1 2
造上の相違がある場合も含まれる。
[0045] 糖鎖 Gは、糖鎖構造上の相違がな 、 1種類の糖鎖として存在することが好ま 、が 、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチ
1 1 2 1
ン Lの結合量 (B )及びレクチン Lの結合量 (B )の比(B / )が一定の値又は
1 11 2 12 11 12
値域をとる限り、糖鎖構造上の相違がある 2種類以上の糖鎖として存在していてもよ い。
[0046] 糖鎖 Gは、糖鎖構造上の相違がな 、 1種類の糖鎖として存在することが好ま 、が
2
、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチ
2 1 2 2
ン Lの結合量 (B )及びレクチン Lの結合量 (B )の比(B / )が一定の値又は
1 21 2 22 21 22
値域をとる限り、糖鎖構造上の相違がある 2種類以上の糖鎖として存在していてもよ い。
[0047] 標的糖鎖 Tにおける構造変化としては、例えば、糖鎖構造 Sの付加、糖鎖構造 S の欠失、糖鎖構造 Sから糖鎖構造 S,への変化、糖鎖構造 S ' 'から糖鎖構造 Sへ の変化等が挙げられる。構造変化が糖鎖構造 sの付加である場合、構造変化前の 糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化後の糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化が糖鎖構造 S
2 1 1 の欠失である場合、構造変化前の糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化後の糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化が糖鎖構造 Sから糖鎖構造 S 'への変化である場合、構造変化 前の糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化後の糖鎖が糖鎖 Gであり、構造変化が糖鎖構
1 2
造 S ' 'から糖鎖構造 Sへの変化である場合、構造変化前の糖鎖が糖鎖 Gであり、
1 1 2 構造変化後の糖鎖が糖鎖 Gである。
[0048] 標的糖鎖 Tにおける構造変化の原因としては、例えば、肝細胞ガン、直腸ガン、肺 ガン、膝ガン、甲状腺ガン、骨髄腫、慢性関節リウマチ等の疾患;シァリダーゼ、ガラ クトシダーゼ、 N—ァセチルダルコサミニダーゼ、マンノシダーゼ、フコシダーゼ等の グリコシダーゼによる処理;血液型の相違等が挙げられる。糖タンパク質に含まれる 糖鎖に構造変化が生じても、糖タンパク質に含まれるタンパク質に構造変化は生じな い。したがって、糖鎖 Gに結合しているタンパク質及び糖鎖 Gに結合しているタンパ
1 2
ク質は、実質的に同一の構造を有する。
[0049] 標的糖鎖丁が oc—フエトプロテイン (AFP)に含まれる糖鎖である場合、標的糖鎖 T には、肝細胞ガンの進行に伴って、 a—Lーフコース残基、 N—ァセチルダルコサミ ン残基 (バイセクティング N—ァセチルダルコサミン)等が付加される。この場合、肝細 胞ガンの進行に伴って付加される糖鎖構造が糖鎖構造 Sであり、糖鎖構造 Sの付 加前の糖鎖が糖鎖 Gであり、糖鎖構造 Sの付加後の糖鎖が糖鎖 Gである。
2 1 1
レクチン L及び Lは、次式 (I):
1 2
[0050] [数 2]
> > 1 ノ b 2 2 A 2 1 /
[式中、 A は、糖鎖 Gとレクチン Lとをレクチン Lの不存在下で混合したときの、糖
11 1 1 2
鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量を表し、 A は、糖鎖 Gとレクチン Lとをレク
1 1 12 1 2 チン Lの不存在下で混合したときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量を
1 1 2
表し、 A は、糖鎖 Gとレクチン Lとをレクチン Lの不存在下で混合したときの、糖鎖
21 2 1 2
G 1分子に対するレクチン Lの結合量を表し、 A は、糖鎖 Gとレクチン Lとをレクチ
2 1 22 2 2 ン Lの不存在下で混合したときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量を表
1 2 2 し、 B は、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖 G 1分子に対 するレクチン Lの結合量を表し、 B は、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合し
12
たときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量を表し、 B は、糖鎖 Gとレクチ
1 2 21 2 ン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量を
1 2 2 1 表し、 B は、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖 G 1分子に
22 2 1 2 2 対するレクチン Lの結合量を表す。 ]
2
を満たすように、糖鎖 G及び Gに対して結合し得る。
1 2
[0052] レクチン Lは、糖鎖 Gのうち糖鎖構造 Sに対して結合し得るとともに、糖鎖構造 S 以外の糖鎖構造に対しても結合し得る。レクチン Lは糖鎖構造 Sに対して特異的親 和性を示すことが好ましい。但し、レクチン Lの糖鎖構造 Sに対する特異的親和性 は厳密なものではなぐレクチン Lが糖鎖構造 Sに対して特異的親和性を示す場合 であっても、レクチン Lは糖鎖構造 S以外の糖鎖構造に対しても親和性を示し得る。
[0053] 糖鎖 Gはレクチン Lが結合し得る糖鎖構造 Sを有する力 糖鎖 Gは糖鎖構造 S を有しない点で糖鎖 G及び Gの構造は相違し、それ以外の点で糖鎖 G及び Gの 構造は実質的に同一であるから、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量 (A )
1 1 11 は、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量 (A )よりも大きい一方、糖鎖 G 1分
2 1 21 1 子に対するレクチン Lの結合量 (A )と、糖鎖 G 1分子に対するレクチン Lの結合量
(A )とは実質的に同一である。
21
したがって、 A /A > A /A が成立する。
11 12 21 22
[0054] よって、例えば、 B / > A /A 及び A /A ≥B / を満たすように
11 12 11 12 21 22 21 22
レクチン L及び Lを選択することにより、上記式 (I)は満たされる。また、 B ZB ≥
1 2 11 12
A / 及び A /A > B ZB となるようにレクチン L及び Lを選択すること
11 12 21 22 21 22 1 2
により、上記式 (I)は満たされる。
[0055] 糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときに、糖鎖 Gに対するレクチン Lの 結合及びレクチン Lの結合のうち一方が他方によって影響を受けることにより、 B /
2 11
B は A / と異なる値又は値域を示し得る。同様に、糖鎖 Gとレクチン Lとレク
12 11 12 2 1 チン Lとを混合したときに、糖鎖 Gに対するレクチン Lの結合及びレクチン Lの結合
2 2 1 2 のうち一方が他方によって影響を受けることにより、 B /B は A / と異なる値
21 22 21 22 又は値域を示し得る。したがって、 B /B > A /A 及び A /A ≥B /B
11 12 11 12 21 22 21 を満たすようにレクチン L及び Lを選択することが可能であるとともに、 B ZB ≥
22 1 2 11 12
A / 及び A /A > B ZB となるようにレクチン L及び Lを選択すること
11 12 21 22 21 22 1 2
が可能である。
[0056] 糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときに、糖鎖 Gに対するレクチン Lの 結合及びレクチン Lの結合のうち一方が他方に影響によって影響を受ける場合とし
2
ては、例えば、糖鎖 Gにおいて、糖鎖構造 Sに対してレクチン Lが結合すると、糖鎖 Gに対するレクチン Lの結合が抑制される場合が挙げられる。この場合、 B は A と
1 2 11 11 実質的に同一であるが、 B は A よりも小さくなるので、 B ZB > A /A が成
12 12 11 12 11 12 立する。なお、糖鎖 Gにおける複数の糖鎖構造に対してレクチン Lが結合し得る場
1 2
合、そのうち 1以上の糖鎖構造に対するレクチン Lの結合が抑制されればよい。
2
[0057] B / > A /A が成立する場合において、糖鎖 Gとレクチン Lとレクチン L
11 12 11 12 2 1 2 とを混合したときに、糖鎖 Gに対するレクチン L及び Lの結合が、それぞれ糖鎖 G
2 1 2 2 に対する他のレクチンの結合によって影響を受けなければ、 B /B = A /A
21 22 21 22 が成立する結果、上記式 (I)が成立する。また、糖鎖 Gに対してレクチン Lが結合す
2 2 ると、糖鎖 Gに対するレクチン Lの結合が抑制されれば、 B ZB < A ZA が
2 1 21 22 21 22 成立する結果、上記式 (I)が成立する。
[0058] 糖鎖 Gにおいて、糖鎖構造 Sに対してレクチン Lが結合すると、糖鎖 Gに対する レクチン Lの結合が抑制される場合としては、例えば、糖鎖 G及び G 1S レクチン L
2 1 2 2 が結合し得る糖鎖構造 Sを有しており、糖鎖 Gにおいて、糖鎖構造 Sに対してレク
2 1 1
チン Lが結合すると、糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合が抑制される場合が挙
1 2 2
げられる。
[0059] 糖鎖 Gにおいて、糖鎖構造 Sに対してレクチン Lが結合すると、糖鎖構造 Sに対
1 1 1 2 するレクチン Lの結合が抑制される場合としては、例えば、糖鎖 Gにおいて、糖鎖構
2 1
造 Sと糖鎖構造 Sとが近接しており、糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合力が、
1 2 1 1 糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合力よりも大きい場合が挙げられる。この場合、
2 2
糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合と、糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合と
1 1 2 2 が競合するが、糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合力の方が大きいため、糖鎖構 造 Sに対するレクチン Lの結合が優先的に起こり、糖鎖構造 Sに対して結合したレ クチンしが立体障害となって、糖鎖構造 Sに対するレクチン Lの結合が抑制される。
1 2 2
なお、「糖鎖構造 Sと糖鎖構造 Sとが近接する」には、糖鎖構造 Sの一部と糖鎖構
1 2 1
造 Sの一部とが重複している場合も含まれる。
2
[0060] レクチン L及び Lは、上記式 (I)を満たすように糖鎖 G及び Gに結合し得る限り特
1 2 1 2 に限定されるものではなぐ例えば、ヒィロチャワンタケレクチン (AAL)、マッシュルー ムレクチン (ABA)、ムラサキソシンカレクチン(BPA)、バンデリアマメァグルチュン(BS A- 11)、コンカナパリン A (ConA)、ドリコスマメレクチン(DBA)、チョウセンアサガオレク チン(DSA)、ディゴマメレクチン(ECA)、レンズマメレクチン(LCA)、ィヌェンジユレク チン(MAA (MAH) )、ィヌェンジユレクチン(MAM (MAL) )、ピーナッツレクチン(PNA) 、エンドゥマメレクチン(PSA)、アメリカャマゴボウレクチン(PWM)、ヒママメレクチン(R CA120又は RCA60)、ダイズレクチン(SBA)、 -ヮトコレクチン(SNA)、ジャガイモレク チン(STA)、二ホン-ヮトコレクチン(SSA)、ノ、リエ-シダレクチン(UEA-I)、小麦胚芽 レクチン (WGA)等の公知のレクチンの中力も適宜選択することができる。
[0061] 標的糖鎖 Tとレクチン Lとレクチン Lとを混合したときの、糖鎖糖鎖 Tに対するレク
1 2
チンしの結合量 (D )及びレクチン Lの結合量 (D )の比(D ZD )は、以下の工程(
1 1 2 2 1 2
a)〜(e)により求めることができる。
[0062] 工程 (a):試料中の標的糖鎖 Tを固体支持体に固定する。
[0063] 試料は、標的糖鎖 Tを含む限り特に限定されるものではなぐ例えば、血清、血液、 血漿、尿、リンパ球、血球、細胞等の生体由来の試料が挙げられる。試料には、複数 分子の標的糖鎖 Tが含まれており、全ての分子が構造変化を生じている可能性、一 部の分子が構造変化を生じて 、る可能性、及び全ての分子が構造変化を生じて 、 ない可能性がある。
[0064] 標的糖鎖 Tの固体支持体への固定方法は特に限定されるものではなぐ常法に従 つて行うことができる。例えば、標的糖鎖 Tを含む糖タンパク質のタンパク質部分に対 して特異的に結合し得る抗体又はその断片を固体支持体に固定しておき、試料と固 体支持体とを接触させることにより、試料中の標的糖鎖 Tを固体支持体に固定するこ とがでさる。
[0065] 固体支持体の材質は特に限定されるものではなぐ例えば、ガラス;シリコン;セラミ ッタス;ポリスチレン等のポリスチレン系榭脂、ポリメチルメタタリレート等のアクリル榭 脂 (メタクリル榭脂)、ポリアミド榭脂、ポリエチレンテレフタレート等のポリエステル、ポ リカーボネート等の合成樹脂;ァガロース、デキストラン、セルロース等の多糖類;ゼラ チン、コラーゲン、カゼイン等の蛋白質等が挙げられる。
[0066] 固体支持体の形状は特に限定されるものではなぐ例えば、プレート状、粒子状等 が挙げられるが、粒子状であることが好ましい。固体支持体が粒子である場合、試料 中に粒子を分散させることにより、試料中の標的糖鎖 Tを効率よく粒子に固定するこ とができる。固体支持体が粒子である場合、粒子は磁性を有することが好ましい。固 体支持体が磁性粒子である場合、粒子の操作性が向上し、磁石の作用により試料中 に分散した粒子を容易に捕集することができるとともに、磁石の作用を解除することに より粒子を試料中に分散させることができる。このような磁性粒子の特性は、固体支持 体の洗浄(工程 (b)、 (d)参照)のときにも有利である。
[0067] 固体支持体への抗体又はその断片の固定方法は特に限定されるものではなぐ常 法に従って行うことができる。固体支持体への抗体又はその断片の固定方法として は、例えば、固体支持体が表面に有する官能基と、抗体又はその断片が有する官能 基とを反応させ、固体支持体の表面に抗体又はその断片を共有結合させる方法が 挙げられる。共有結合を形成し得る官能基としては、例えば、カルボキシル基、ァミノ 基等が挙げられ、これらの官能基は常法に従って固体支持体及び抗体又はその断 片に導入することができる。固体支持体がカルボキシル基を表面に有する場合、カル ポジイミド類でカルボキシル基を活性化させた後、抗体又はその断片が有するァミノ 基と反応させることにより、アミド結合を介して、抗体又はその断片を固体支持体へ固 定することができる。また、固体支持体がアミノ基を表面に有する場合、無水コハク酸 等の環状酸無水物を用いてアミノ基をカルボキシル基に変換した後、抗体又はその 断片が有するァミノ基と反応させることにより、アミド結合を介して、抗体又はその断片 を固体支持体へ固定することができる。この他、ピオチン アビジン系を用いた方法 、例えば、ピオチンィ匕抗体又はその断片を、アビジン又はストレプトアビジンでコーテ イングされた固体支持体の表面に固定する方法を用いることができる。
[0068] 工程 (b):標的糖鎖 Tが固定された固体支持体を洗浄する。 [0069] 試料と固体支持体とを接触させると、試料中に含まれる夾雑物 (例えば、標的糖鎖 T以外の糖鎖等)が固体支持体に付着するが、固体支持体の洗浄により、固体支持 体に付着した夾雑物を除去することができる。
[0070] 固体支持体を洗浄する際、洗浄液としては、例えば、水、アルコール等の比較的極 性の高い溶媒;塩ィ匕ナトリウム、塩ィ匕カリウム、塩ィ匕マグネシウム等の塩類を含む水溶 液;アルコール類を含む水溶液;タンパク質、核酸等を含む水溶液;リン酸、トリス等 の適当な pH緩衝剤を含む上記溶媒又は水溶液等を用いることができる。
試料に夾雑物が含まれて!/、な!/、場合、工程 (b)は省略してもよ 、。
[0071] 工程 (c):固体支持体に固定された標的糖鎖 Tとレクチン Lとレクチン Lとを混合す
1 2 る。
[0072] レクチン L及び Lにはそれぞれ区別して検出可能な標識物質 LB及び LBを予め
1 2 1 2 結合しておく。標識物質 LB及び LBは区別して検出可能である限り特に限定される
1 2
ものではなぐ例えば、フルォレセイン、ローダミン、フィコエリトリン等の蛍光物質;ル ミノール、ルシゲニン、アタリジゥムエステルの化学発光物質;ルシフェラーゼ、ルシフ エリン等の生物発光物質;アルカリホスファターゼ、ホースラディッシュペルォキシダー ゼ等の酵素;99 ^c 131I、 125I、 "C、 3H等の放射性同位元素;半導体ナノ粒子;オリゴ ヌクレオチド;磁性体;抗体等が挙げられる。レクチン L 1分子に結合している標識物 質量は、分子間で実質的に同一であることが好ましい。レクチン Lについても同様で
2
ある。レクチン 1分子に結合している標識物質量が分子間で実質的に同一であること により、標識物質量からレクチン量を正確に求めることができる。
[0073] 混合順序は特に限定されるものではなぐレクチン L及び Lを混合した後、標的糖
1 2
鎖 Tを混合してもよいし、レクチン L及び Lのうち一方のレクチンと標的糖鎖とを混合
1 2
した後、他方のレクチンを混合してもよい。
[0074] 標的糖鎖 Tとレクチン Lとレクチン Lとを混合すると、標的糖鎖 Tとレクチン Lとが接
1 2 1 触するとともに、標的糖鎖 Tとレクチン Lとが接触する。標的糖鎖 Tが糖鎖 Gとして存
2 1 在する場合、標的糖鎖 Tの糖鎖構造 S及び糖鎖構造 S以外の糖鎖構造にレクチン Lが結合するとともに、標的糖鎖 Tの所定の糖鎖構造にレクチン Lが結合する。標
1 2
的糖鎖 Tが糖鎖 Gとして存在する場合には、標的糖鎖 Tの所定の糖鎖構造にレクチ ン Lが結合するとともに、標的糖鎖 Tの所定の糖鎖構造にレクチン Lが結合する。標
1 2
的糖鎖 Tに対するレクチン L及び Lの結合はやがて平衡状態に達する。
1 2
[0075] 標的糖鎖 Tとレクチン Lとレクチン Lとを混合させる際、溶媒としては、例えば、塩
1 2
化ナトリウム、塩ィ匕カリウム、塩化マグネシウム等の塩類を含む水溶液;アルコール類 を含む水溶液;タンパク質、核酸等を含む水溶液;リン酸、トリス等の適当な pH緩衝 剤を含む上記溶媒又は水溶液等を使用することができる。温度は、通常 4〜60°C、 好ましくは 25〜37°Cであり、時間は、通常 1〜120分間、好ましくは 5〜60分間であ り、 pHは、通常 2〜10、好ましくは 5〜8である。レクチン L及び Lの混合量は、標的
1 2
糖鎖 Tの混合量に対して過剰量とする。
[0076] 工程 (d):固体支持体を洗浄し、標的糖鎖 Tに結合して 、な 、レクチン L及び Lを
1 2 除去する。
[0077] 洗浄液としては、例えば、水、アルコール等の比較的極性の高い溶媒;塩ィ匕ナトリウ ム、塩化カリウム、塩化マグネシウム等の塩類を含む水溶液;アルコール類を含む水 溶液;タンパク質、核酸等を含む水溶液;リン酸、トリス等の適当な pH緩衝剤を含む 上記溶媒又は水溶液等を用いることができる。
[0078] 工程 ):標識物質 LB及び LBの量を測定し、標識物質 LB及び LBの量に基づ
1 2 1 2 き、糖鎖糖鎖 Tに対するレクチン Lの結合量 (D )及びレクチン Lの結合量 (D )の
1 1 2 2 比 (D ZD )を測定する。
1 2
[0079] 標識物質 LB及び LBの量の測定方法は、標識物質 LB及び LBの種類に応じ、
1 2 1 2
常法に従って行うことができる。
[0080] レクチン Lの量と標識物質 LBの量とを予め対応付けておくことにより、標識物質 L Bの量に基づき、糖鎖糖鎖 Tに対するレクチン Lの結合量 (D )を求めることができ る。同様にして、標識物質 LBの量に基づき、標的糖鎖 Tに対するレクチン Lの結合
2 2 量 (D )を求めることができる。
2
[0081] 糖鎖 Gが構造変化前の糖鎖であり、糖鎖 Gが構造変化後の糖鎖である場合、 B
1 2 11
/B > D /D ≥ B /B であれば、標的糖鎖 Tが糖鎖 Gのみとして又は糖鎖
12 1 2 21 22 2
G及び糖鎖 Gの混合状態として存在している、すなわち、標的糖鎖 Tにおいて構造
1 2
変化が生じていると判別することができる。また、糖鎖 Gが構造変化前の糖鎖であり 、糖鎖 Gが構造変化後の糖鎖である場合、 B / ≥ D /D >B / であれ
1 11 12 1 2 21 22 ば、標的糖鎖 Tが糖鎖 Gのみとして又は糖鎖 G及び糖鎖 Gの混合状態として存在
1 1 2
している、すなわち、標的糖鎖 Tにおいて構造変化が生じていると判別することがで きる。
[0082] 本実施形態では、標的糖鎖 Tに対するレクチン Lの結合量 (D )及びレクチン Lの
1 1 2 結合量 (D )の比として D ZDを用いたが、 D ZDを用いてもよい。この場合、 B
2 1 2 2 1 12
/B < D /D ≤ B /B であれば、標的糖鎖 Tが糖鎖 Gのみとして又は糖鎖
11 2 1 22 21 2
G及び糖鎖 Gの混合状態として存在していると判別することができる。また、 B /B
1 2 12
≤ D /D < B /B であれば、標的糖鎖 Tが糖鎖 Gのみとして又は糖鎖 G及
11 2 1 22 21 1 1 び糖鎖 Gの混合状態として存在して!/ヽると判別することができる。
2
[0083] 本実施形態では、糖タンパク質に含まれる糖鎖を標的糖鎖 Tとしたが、糖脂質に含 まれる糖鎖、タンパク質、脂質等に結合していない糖鎖等を標的糖鎖 Tとしてもよい。 標的糖鎖 τを含む糖脂質としては、例えば、ガラクトセレブ口シド、ダルコセレブロシド
、グロボシド、ラタトシルセラミド、トリへキソシルセラミド、パラグロボシド、フォルスマン 抗原糖脂質、フコシルガングリオシド、フコシルセラミド、血液型活性糖脂質等が挙げ られる。
実施例
[0084] 〔実施例 1〕
抗トランスフェリン抗体結合磁気ビーズの作製及びトランスフェリン糖鎖の混合レク チンによる構造解析
トランスフェリン(TF) (Serologicals proteins,Inc.)を抗トランスフェリン抗体(INTER- C ELL TECHNOLOGIES,INC.)結合磁気ビーズに特異的に吸着させた。その後、トラ ンスフエリンの糖鎖を部分分解する場合にのみ、磁気ビーズ懸濁液にシァリダーゼを 加えて反応させ、糖鎖非還元末端に存在するシアル酸を除いた。その後、磁気ビー ズ懸濁液にピオチン標識 RCAレクチン及び FITC標識 SSAレクチンを混合して反応さ せ、さらに Cy5標識ストレプトアビジンを反応させることで RCAレクチンに Cy5を特異的 に結合させた。 SSAレクチンは糖鎖非還元末端に存在するシアル酸を含む Sia a 2-6 Gal/GalNAc構造を強く認識し、 RCAレクチンは糖鎖の中の Gal j8 l-4GlcNAc構造を 認識する。シァリダーゼ処理サンプル及びシァリダーゼ未処理サンプルについて、磁 気ビーズ群の Cy5量及び FITC量を蛍光光度計で測定し、その比 Rl (Cy5量/ FITC量 )を求めるとともに、シァリダーゼ未処理サンプルの R1に対するシァリダーゼ処理サン プルの R1の比 R2 (シァリダーゼ処理サンプルの R1/シァリダーゼ未処理サンプルの R 1)を求めた。
[0085] また、シァリダーゼ処理サンプル及びシァリダーゼ未処理サンプルにつ!/、て、磁気 ビーズ懸濁液にピオチン標識 RCAレクチンを FITC標識 SSAレクチンの不存在下で混 合したときの、及び磁気ビーズ懸濁液に FITC標識 SSAレクチンをピオチン標識 RCA レクチンの不存在下で混合したときの、磁気ビーズ群の Cy5量及び FITC量を蛍光光 度計で測定し、その比 Rl (Cy5量/ FITC量)を求めるとともに、シァリダーゼ未処理サ ンプルの R1に対するシァリダーゼ処理サンプルの R1の比 R2 (シァリダーゼ処理サン プルの R1/シァリダーゼ未処理サンプルの R1)を求めた。
[0086] なお、以下、磁気ビーズ懸濁液にピオチン標識 RCAレクチン及び FITC標識 SSAレ クチンを混合する系を「混合系」 t ヽ、磁気ビーズ懸濁液にピオチン標識 RCAレク チン及び FITC標識 SSAレクチンのうち一方を他方の不存在下で混合する系を「非混 合系」という。
[0087] 実験方法の詳細は以下の通りである。
磁気ビーズ Dynabeads M-270 Carboxylic acid (Dynal社製)の添付書類に記載され た方法で作製した。まず、 Dynabeads懸濁液原液 10 1 (ビーズ 30 g分)を 1.5ml容 のエツペンドルフチューブに入れ、磁石台にエツペンチューブを立てることで磁気ビ ーズを分離し、磁気ビーズの洗浄を行った。磁気ビーズの洗浄は MiliQ 100 1を用 いて 3回行った。洗浄後、 MiliQに溶解した 0.005M CMC [N- cyclohexy卜 Ν'- (2- morph ohnoethyl) carbodnmide metnyl-p-toluensulfonate] 10 μ 1に條 5¾ヒ ~~スを懸淘し、 4 °Cで 10分間回転混和してカルボキル基を活性ィ匕した。磁気ビーズ液の上澄みを除 いた後、そこに 0.3M MES [2- (N- morpholino) ethane sulfonic acid]バッファー(pH 4. 8) 6 /z 1及び 0.005 M CMC 4 μ 1をカ卩えて懸濁し、 4°Cで 30分間回転混和した。次いで 、磁気ビーズ液の上澄みを除いた後、 0.1 M MESバッファー(pH 4.8) 100 /z lで 2回洗 浄し、磁気ビーズを同バッファー 2 1及び抗トランスフェリン抗体(lmg/ml) 8 1に懸 濁し、 4°Cで 20分間回転混和した。次いで、 MiliQで作製した lOmg/mlの BSA液を磁気 ビーズ液に 5 μ 1添加し、混合後、 4°Cで一晩回転混和した。翌日、磁気ビーズを PBS バッファー 200 μ 1で 3回洗浄した後、磁気ビーズに MiliQで作製した lOmg/mlの BSA液 1.1 μ 1及びトランスフェリン原液(lmg/ml) 10 1を順にカ卩えて懸濁し、室温で 1時間回 転混和した。次いで、磁気ビーズ液の上澄みを除いた後、磁気ビーズを TBSバッファ 一 200 μ 1で 3回洗浄した。次いで、磁気ビーズに C-Pバッファー(50mM Na PO , 1Μ
2 4
Citric acid) 97 μ 1及びシァリダーゼ(10mU/ 1) 3 1を順に加えて懸濁し、 37°Cで 3.5 時間回転混和した。シァリダーゼ処理を行わな 、場合はシァリダーゼの代わりに Mili Qで作製した lmg/mlの BSA液を 3 1カ卩えた。次いで、磁気ビーズ液の上澄みを除い た後、磁気ビーズを TBSバッファー 200 μ 1で 3回洗浄した。次いで、磁気ビーズにビ ォチン標識 RCAレクチン(0.3 mg/ml)及び FITC標識 SSAレクチン(0.3 mg/ml)各 35 1、並びに MiliQで作製した lOmg/mlの BSA液 3.85 1を順に加え、懸濁後、室温で 1時 間回転混和した。非混合系においては、磁気ビーズにピオチン標識 RCAレクチン及 び FITC標識 SSAレクチンの一方のみをカ卩えた。次いで、磁気ビーズ液の上澄みを除 いた後、磁気ビーズを TBSバッファー 200 1で 3回洗浄した。次いで、磁気ビーズに 2 X BWバッファー [10mM Tris-HCl (pH-7.5), ImM EDTA, 2.0M NaCl] 20 μ 1、及び Cy5標識ストレプトアビジン (( mg/ml^O /z lを順にカ卩え、懸濁後、室温で 40分間回 転混和した。次いで、磁気ビーズ液の上澄みを除いた後、磁気ビーズを 1 X BWバッ ファー 200 μ 1で 3回洗浄した。次いで、磁気ビーズを TBSバッファー 100 μ 1に懸濁し 、それを 20 μ 1取り、 TBSバッファー 100 μ 1で希釈したものを 96ゥエル黒色平底プレー トのゥエルに入れ、蛍光プレートリーダーにより Cy5及び FITCの蛍光強度を測定した 混合系における測定結果を表 1に、非混合系における測定結果を表 2に示す。
[表 1] シァリダ一ゼ未処理 シァリダ一ゼ処理
サンプル No. FITC量 Cy5量 比 R1 FITC量 Cy5量 比 R1 比 R2
1 3.191 7.23 2.27 1.434 29.344 20, 47 9.03
2 3.005 9.398 3.13 0.606 18.821 31.09 9.94
3 5.149 9.787 1.90 0.86 19.905 23.16 12.18
4 1.821 7.944 4.36 0.491 23.752 48.43 11.10
5 1.709 5.587 2.10 0.186 5.472 29.52 14.06
6 5.817 12.812 2.20 1.761 32.964 17.99 8.17
7 2.865 6.695 2.34 1.723 23.4 13.58 5.81
8 2.543 7.549 2.97 0.43 29.789 69.24 23.32
9 1.21 6.597 5.46 0.104 7.868 76.23 13.98
10 1.128 2.176 1.93 0.677 7.592 11.22 5.82
11 1.699 4.888 2.88 0.284 6.432 22.65 7.87
12 0.741 3.596 4.85 0.156 4.259 27.27 5.62
13 2.096 4.181 1.99 0.824 9.245 11.21 5.62
14 3.976 8.679 2.18 1.436 20.665 14.39 6.60
15 2.089 4.396 2.11 0.513 6.622 12.92 6.14
16 3.298 9.672 2.93 1.001 27.244 27.21 9.28 平均 2.646 6.949 2.85 0.78 17.085 28.54 9.66 標準偏差 1.41 2.76 1.10 0.55 10.11 19.74 4.64 相対標準偏差 0.53 0.39 0.39 0.70 0.53 0.69 0.48 ] シァリダーゼ未処理 シァリダ一ゼ処
サンプル No. FITC量 Cy5量 比 R1 FITC量 Gy5量 比 R1 比 R2
1 5.899 14.242 2.41 1.973 26.306 13.3 5.5
2 4.94 7.997 1.62 1.627 19.331 11.9 7.3
3 4.939 6.961 1.41 0, 846 15.324 18.1 12.8
4 6.827 7.734 1.13 1.772 11.9 10.5
5 3.751 3.965 1.06 1.968 6.122 3.11 2.93
6 3.3 2.646 0.8 1.733 3.679 2.12 2.62
7 3.16 3.141 1 0.736 5.081 6.9 6.9
8 2.606 2.476 0.95 0.709 3.549 5 5.26
9 3.416 3.173 0.93 1.761 4.964 2.82 3
10 3.289 1.799 0.54 1.303 2.089 1.62 2.95
11 4.018 11.256 2.8 0.729 19.902 27.3 9.7 平均 4.195 5.945 1.33 1.378 11.595 9.46 6.31 標準偏差 1.304 4.063 0.7 0.526 8.863 8.04 3.49 相対摞準偏差 0.31 0.68 0.52 0.38 0.76 0.85 0.55
[0090] 表 1及び 2に示すように、混合系における比 R2(平均 9.66)は、非混合系における比 R2(平均 6.31)よりも大きかった。
この理由は次のように考えられる。
[0091] トランスフェリン糖鎖のうち SSA結合部位と RCA結合部位とは一部が重複して 、るた め、混合系のシァリダーゼ未処理サンプルにおいては、トランスフェリン糖鎖に対する SSAの結合と RCAの結合とが競合し、 SSAの結合の方が優先的に起こる結果、 RCAの 結合が抑制される。一方、混合系のシァリダーゼ処理サンプルにおいては、シアル 酸の除去によりトランスフェリン糖鎖に対する SSAの結合が抑制される結果、トランスフ エリン糖鎖に対する RCAの結合は抑制されない。
[0092] これに対して、非混合系のシァリダーゼ未処理サンプル及びシァリダーゼ処理サン プルにぉ 、ては、トランスフェリン糖鎖に対する SSAの結合と RCAの結合とは競合しな V、ので、トランスフェリン糖鎖に対する RCAの結合は抑制されな 、。
[0093] したがって、トランスフェリン糖鎖 1分子に対する RCAの結合量は、混合系のシァリ ダーゼ未処理サンプルの方が非混合系のシァリダーゼ未処理サンプルよりも小さい 一方、混合系のシァリダーゼ処理サンプルと非混合系のシァリダーゼ処理サンプル との間で実質的に同一である。なお、トランスフェリン糖鎖 1分子に対する SSAの結合 量は、混合系のシァリダーゼ未処理サンプルと非混合系のシァリダーゼ未処理サン プルとの間、及び混合系のシァリダーゼ処理サンプルと非混合系のシァリダーゼ処 理サンプルとの間で実質的に同一であると考えられる。
[0094] このため、混合系における比 R1はシアル酸の有無をより反映した値又は値域を示 し、混合系におけるシァリダーゼ未処理サンプルの比 R1 (2.85)とシァリダーゼ処理サ ンプルの比 R1 (28.54)との差は、非混合系におけるシァリダーゼ未処理サンプルの 比 R1 (1.33)とシァリダーゼ処理サンプルの比 R1 (9.46)との差よりも大きくなり、この結 果、混合系における比 R2 (平均 9.66)は、非混合系における比 R2(平均 6.31)よりも大 きくなる(混合系における比 R2の平均値 Z非混合系における比 R2の平均値 = 1.53) 。このような傾向は、 RCA及び SSAの組み合わせの代わりに、コンカナパリン A (ConA )及び小麦胚芽レクチン (WGA)の組み合わせを使用して、 β マンノシダーゼ処理 によるトランスフェリン糖鎖構造の変化を検出した場合にも観察された。すなわち、トラ ンスフヱリン(TF) (Serologicals proteins,Inc.)を抗トランスフェリン抗体(INTER- CELL TECHNOLOGIESJNC.)結合磁気ビーズに特異的に吸着させた後、トランスフェリン の糖鎖を部分分解する場合にのみ、磁気ビーズ懸濁液に j8—マンノシダーゼを加え て反応させた。その後、磁気ビーズ懸濁液にピオチン標識 ConA及び FITC標識 WGA を混合して反応させ (反応溶媒: TBS + 0.5M NaCl,各レクチン濃度: 0.3mg/mL)、さ らに Cy5標識ストレプトアビジンを反応させることで ConAに Cy5を特異的に結合させた 。 13 マンノシダーゼ処理によってトランスフェリン糖鎖からマンノースが切り取られる ため、トランスフェリン糖鎖に対する WGAの結合はほぼそのままであるのに対して、ト ランスフェリン糖鎖に対する ConAの結合は弱くなる。 β—マンノシダーゼ処理サンプ ル及び j8—マンノシダーゼ未処理サンプルについて、磁気ビーズ群の Cy5量及び FI TC量を蛍光光度計で測定し、その比 Rl (Cy5量/ FITC量)を求めるとともに、 β マ ンノシダーゼ未処理サンプルの R1に対する 13 マンノシダーゼ処理サンプルの R1の 比 R2 ( j8 マンノシダーゼ処理サンプルの Rl/ j8 マンノシダーゼ未処理サンプル の R1)を求めた(混合系における比 R2)。また、 β マンノシダーゼ処理サンプル及 び 13 マンノシダーゼ未処理サンプルについて、磁気ビーズ懸濁液にピオチン標識 ConAを FITC標識 WGAの不存在下で混合したときの、及び磁気ビーズ懸濁液に FIT C標識 WGAをピオチン標識 ConAの不存在下で混合したときの、磁気ビーズ群の Cy5 量及び FITC量を蛍光光度計で測定し、その比 Rl (Cy5量/ FITC量)を求めるとともに 、 β マンノシダーゼ未処理サンプルの Rlに対する j8—マンノシダーゼ処理サンプ ルの R1の比 R2 ( j8 マンノシダーゼ処理サンプルの Rl/ j8 マンノシダーゼ未処理 サンプルの R1)を求めた (非混合系における比 R2)。その結果、混合系における比 R2 の平均値(1.24) Z非混合系における比 R2の平均値 (0.77) = 1.61であった。
[0095] したがって、混合系における比 R1を指標とすれば、非混合系における比 R1を指標 とするよりも精度よぐシァリダーゼ処理又は j8—マンノシダーゼ処理によるトランスフ エリン糖鎖の構造変化を検出することができる。また、混合系における測定値のバラ ツキは、非混合系における測定値のバラツキよりも小さくなり、混合系における比 R1を 指標とすれば、非混合系における比 R1を指標とするよりも精度よぐシァリダーゼ処 理によるトランスフェリン糖鎖の構造変化を検出することができる。
このことは、以下の信頼性一統計処理によって証明される。
[0096] シァリダーゼ未処理サンプル又はシァリダーゼ処理サンプルが与えられたときに、 それがどちらのサンプルであるかを評価する試験を想定し、混合系の測定結果及び 非混合系の測定結果を 2つの母平均と仮定して、 2つの母平均の差を検定した (T検 定)。
[0097] 仮説 H0 : 1 = 2
母分散未知だが、 σ 1 = σ 2と考える、場合において検定統計量 Τは図 1に示す式 (1)及び (2)に基づいて計算した。
[0098] ここで、各変数の意味は以下の通りである。
μ:正規母集団の平均値 σ:正規母集団の分散
m :標本の平均値
s :標準偏差
N :自由度又は標本 (サンプル)の大きさ
t : t分布
T : T検定により得られた Tの値
mean:平 3¾/
[0099] 有意水準 5%のときの T値は、混合系では 5.1976であり、 t(N +N - 2) a Z2のパ
1 2
一セント点は 2.04227である。一方、非混合系では 3.3411となっており、 t(N +N —2
1 2
) α Ζ2のパーセント点は 2.085962である。混合系及び非混合系の Τ値≥t(N +N
1 2
— 2) α Ζ2となっており、 TER (棄却域)(図 1参照)である。有意水準 5%のとき仮説 ΗΟは棄てられる。つまり、混合系と非混合系で、 2つの母平均は同じではない。
[0100] 正規母集団の平均値を図 1の式(3)に基づいて求めると、シァリダーゼ未処理サン プルについて、混合系の信頼空間は、 2.85— 0.58≤ μ≤2.85 + 0.58であり、非混合 系の信頼空間は、 1.33 - 0.47≤ μ≤ 1.33 + 0.47である。シァリダーゼ処理サンプル について、混合系の信頼空間は、 28.54— 10.53≤ μ≤28.54+ 10.53であり、非混合 系の信頼空間は、 9.46 - 5.40≤ μ≤ 9.46 + 5.40である。
[0101] 有意水準 5%のとき、 2つの母平均差の信頼区間 100(1—ひ)%を図 1の式 (4)に基 づいて求めると、混合系の場合、 25.69 ± 10.09であり、非混合系の場合、 8.13 ± 5.07 である。
[0102] 例えば、非混合系の場合には混合系と同じ誤差範囲 10.09 (95%信頼性)と仮定し た場合に求めた t(N +N — 2) α Ζ2のパーセント点は 4.1483となり、信頼空間は 99.
1 2
9%と推測される。したがって、混合系の方が信頼性は高いと考えられる。
[0103] 〔実施例 2〕
腫瘍マーカーの 1つであるチログロブリンの糖鎖構造の識別を、実施例 1に記した 方法においてトランスフェリン及び抗トランスフェリン抗体をそれぞれチログロブリン (Β iogenesis)及び抗チログロブリン抗体(SIGMA)に変更して行った。混合系の測定結 果を表 3に、非混合系の測定結果を表 4示す。 [0104] [表 3]
Figure imgf000027_0001
[0105] [表 4]
Figure imgf000027_0002
表 3及び 4に示すように、混合系におけるシァリダーゼ未処理サンプルの比 R1とシ ァリダーゼ処理サンプルの比 R1との差は、非混合系におけるシァリダーゼ未処理サ ンプルの比 R1とシァリダーゼ処理サンプルの比 R1との差よりも大きぐその結果、混 合系における比 R2は、非混合系における比 R2よりも大き力 た。
したがって、混合系における比 R1を指標とすれば、非混合系における比 R1を指標 とするよりも精度よぐシァリダーゼ処理によるチログロブリン糖鎖の構造変化を検出 することができる。

Claims

請求の範囲 構造変化により第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖として存在し得る標的糖鎖と、第 1の糖 鎖及び第 2の糖鎖に結合し得る第 1〜第 nのレクチン (nは 2以上の整数である。 )とを 混合したときの、標的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量及び第 2のレクチンの結 合量の比を指標として、標的糖鎖における構造変化の有無を検出する方法であって 、次式 (I) :
[数 1]
B n / B ^ A n ZA 1 2
> > 1
B 2 1 / 2 2 Α 2 ι / 2 2
[式中、 A は、第 1の糖鎖と第 1のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合したと
11
きの、第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結合量を表し、 A は、第 1の糖鎖
12
と第 2のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合したときの、第 1の糖鎖 1分子に 対する第 2のレクチンの結合量を表し、 A は、第 2の糖鎖と第 1のレクチンとを他のレ
21
クチンの不存在下で混合したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結 合量を表し、 A は、第 2の糖鎖と第 2のレクチンとを他のレクチンの不存在下で混合
22
したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表し、 B は、第 1の
11 糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 1の糖鎖 1分子に対する第 1のレク チンの結合量を表し、 B は、第 1の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、
12
第 1の糖鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表し、 B は、第 2の糖鎖と第 1
21
〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 2の糖鎖 1分子に対する第 1のレクチンの結 合量を表し、 B は、第 2の糖鎖と第 1〜第 nのレクチンとを混合したときの、第 2の糖
22
鎖 1分子に対する第 2のレクチンの結合量を表す。 ]
を満たす第 1〜第 nのレクチンを用いる方法。
第 1の糖鎖は第 1のレクチンが結合し得る第 1の糖鎖構造を有するが、第 2の糖鎖 は第 1の糖鎖構造を有しない点で両糖鎖の構造は異なり、それ以外の点で両糖鎖の 構造は実質的に同一である請求項 1記載の方法。
[3] 第 1の糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 1の 糖鎖に対する第 2のレクチンの結合が抑制される請求項 2記載の方法。
[4] 第 1の糖鎖及び第 2の糖鎖が、第 2のレクチンが結合し得る第 2の糖鎖構造を有し ており、
第 1の糖鎖において、第 1の糖鎖構造に対して第 1のレクチンが結合すると、第 2の 糖鎖構造に対する第 2のレクチンの結合が抑制される請求項 3記載の方法。
[5] 第 1のレクチン及び第 2のレクチンにそれぞれ区別して検出可能な標識物質が結合 しており、標識物質の量に基づいて、標的糖鎖に対する第 1のレクチンの結合量及 び第 2のレクチンの結合量を測定する請求項 1〜4のいずれかに記載の方法。
[6] 第 1〜第 nのレクチンと混合する標的糖鎖が固体支持体に固定されている請求項 1 〜5の!、ずれかに記載の方法。
[7] 固体支持体が粒子又は磁性粒子である請求項 6記載の方法。
[8] 標的糖鎖が、糖タンパク質に含まれる糖鎖である請求項 1〜7のいずれかに記載の 方法。
PCT/JP2005/015686 2004-08-27 2005-08-29 標的糖鎖における構造変化を検出する方法 WO2006022411A1 (ja)

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