TWI803455B - 單股寡核苷酸 - Google Patents

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TWI803455B
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Abstract

提供一種高效率地控制標的基因,且可容易製造之單股寡核苷酸。
以式X-L-Y所表示,X與Y為以第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分雜交的單股寡核苷酸。X係由7~100個核苷酸所構成,包含至少1個修飾核苷酸,可與第二寡核苷酸雜交,具有包含被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的第一核苷酸序列。Y係由4~100個核苷酸所構成,可與前述第一寡核苷酸雜交,具有包含至少1個核糖核苷酸的第二核苷酸序列。核苷酸序列X及Y之至少一者具有可與標的RNA雜交之反義序列。L係源自在生理條件下被分解之第三寡核苷酸的基。

Description

單股寡核苷酸
本發明係關於單股寡核苷酸。
反義寡核苷酸(ASO)為與標的基因之mRNA、mRNA前驅體或核糖體RNA、轉送RNA、miRNA等之ncRNA(非編碼RNA)互補的寡核苷酸,由約8~30鹼基構成之單股的DNA、RNA及/或該等之構造類似體。ASO藉由與該反義寡核苷酸作為標的之mRNA、mRNA前驅體、或ncRNA形成雙股而抑制mRNA、mRNA前驅體或ncRNA之功能。
然而,由於ASO容易因生物體內之核酸酶而被分解,又被標的細胞攝取的效率低,難以實用化。為了克服此等2大問題點,長年進行著有效成分之寡核苷酸本身的化學修飾、與使寡核苷酸送達至標的細胞內之藥物輸送系統(DDS)的研究。
作為ASO本身的化學修飾之例,已知磷酸部分經修飾之S-寡(硫代磷酸酯)[S-oligo(phosphorothioate)]、糖部分經修飾之2’,4’-BNA( bridged nucleic acid)/LNA(locked nucleic acid)(參照專利文獻1~5)等。
作為DDS之例,已知利用陽離子性微脂體或高分子微胞等之載體的方法等。又,專利文獻6中記載透過鏈接序列(linker)鍵結有與唾液酸糖蛋白受體具有相互作用之糖衍生物即GalNac(N-乙醯半乳胺糖)衍生物之ASO,若投予該ASO,肝臓中標的基因之表現被抑制。
專利文獻7及非專利文獻1中記載,藉由使生殖酚(Toc)與含有與ASO互補的RNA寡核苷酸之雙股寡核苷酸(HDO)鍵結,在小鼠中,可比ASO效率好地送達、累積至肝臓,抑制肝臓中之標的基因的表現。專利文獻8中記載有GalNac衍生物透過鏈接序列鍵結於HDO之ASO,若皮下投予該反義寡核苷酸,較生殖酚(Toc)修飾物有效率地抑制表現。
專利文獻9中記載,DNA與RNA之雙股寡核苷酸單位的RNA鏈末端鍵結有ASO之寡核苷酸(HCDO),可比ASO效率好地抑制標的RNA。
[先前技術文獻] [非專利文獻]
[非專利文獻1]Nature Communications,6卷,文章編號7969(2015年)
[專利文獻]
[專利文獻1]國際公開第98/39352號
[專利文獻2]國際公開第2005/021570號
[專利文獻3]國際公開第2003/068795號
[專利文獻4]國際公開第2011/052436號
[專利文獻5]國際公開第2011/156202號
[專利文獻6]國際公開第2014/179620號
[專利文獻7]國際公開第2013/089283號
[專利文獻8]國際公開第2015/105083號
[專利文獻9]國際公開第2014/192310號
作為醫藥品在臨床現場適合包括人類之哺乳動物之情形中,期望有可有效率地抑制標的基因之表現的新穎核酸醫藥品。又,製造雙股寡核苷酸(例如,前述HDO、HCDO)時,在分別合成與反義鏈互補的RNA鏈後,最後將此等鏈雜交的步驟為必須。進而,投予至動物或細胞時,有抑制解離成單股狀態之必要,預想其操作條件的設定亦需費一番功夫。
本發明之目的在於以提供一種可高效率地抑制標的基因之表現的新穎寡核苷酸為目的。又,以提供一種可較雙股寡核苷酸更容易製造的寡核苷酸為目的。
本發明者們發現,將寡去氧核糖核苷酸和與其相對之包括RNA的互補鏈,以在DNA、RNA等生理條件下分解之鏈接序列連結,成為具有於分子內部分雜交之構造的單股寡核苷酸,該單股寡核苷酸藉由具有可抑制標的基因表現之反義序列,顯示出與雙股寡核苷酸同等以上的反義效果。又,該單股寡核苷酸由於為單股,沒有使其形成雙股的雜交步驟,可效率良好地製造。本發明包含以下態樣。
1.一種單股寡核苷酸,其係式X-L-Y所表示,X-L-Y(式中,X係源自第一寡核苷酸的基,該第一寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸的7~100個核苷酸所構成者,Y係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~100個核苷酸所構成之第二寡核苷酸的基,L係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第二寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解之第三寡核苷酸的基,前述第一寡核苷酸具有核苷酸序列X,前述第二寡核苷酸具有核苷酸序列Y, 前述核苷酸序列X包含可與第二寡核苷酸之至少一部分雜交且含有被RNaseH所辨識之至少4個連續的核苷酸的第一核苷酸序列,前述核苷酸序列Y包含可與第一寡核苷酸之至少一部分雜交且含有至少1個核糖核苷酸的第二核苷酸序列,前述核苷酸序列X及核苷酸序列Y之至少一者,包含至少1個可與標的RNA雜交之反義序列,具有2個以上前述反義序列時,個別的反義序列部分所雜交的標的RNA可相同亦可不同),X與Y為以第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分雜交。
2.如1.記載之單股寡核苷酸,其中X包含至少1個糖部修飾核苷酸,前述第一核苷酸序列為前述反義序列,為與前述標的RNA雜交時含有被RNaseH所辨識之至少4個連續的核苷酸之序列。
3.如1.或2.記載之單股寡核苷酸,其中X以3’側與L鍵結,Y以5’側與L鍵結。
4.如1.或2.記載之單股寡核苷酸,其中X以5’側與L鍵結,Y以3’側與L鍵結。
5.如1.至4.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸所含之核苷酸以磷酸二酯鍵互相連結。
6.如1.至5.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為DNA或RNA。
7.如1.至6.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第 一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
8.如1.至7.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側的糖部修飾核苷酸。
9.如1.至8.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
10.如1.至9.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
11.如1.至10.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列係包含被RNaseH所切斷之至少4個連續的核苷酸之序列。
12.如11.記載之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
13.如11.或12.記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
14.如1.至13.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y包含至少1個反義序列。
15.如14.記載之單股寡核苷酸,其中前述Y在前述反義序列部分與L之間具有前述第二核苷酸序列部分。
16.如14.或15.記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷 酸序列Y所包含之反義序列,係在與標的RNA雜交時含有被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸之序列。
17.如14.或15.記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所包含的反義序列部分,包含至少1個糖部修飾核苷酸,不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
18.如16.或17.記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X包含可與前述Y所包含之反義序列部分的至少一部分雜交且被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸之序列。
19.如1.至18.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中X包含5’端或3’端。
20.如1.至18.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中進一步包含式X’-L’-所示之基,X’-L’-(式中,X’係源自第四寡核苷酸的基,該第四寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸的7~100個核苷酸所構成者,L’係源自第五寡核苷酸的基,該第五寡核苷酸係以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第四寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解者,前述第四寡核苷酸具有可與標的RNA雜交之反義序列)。
21.如20.記載之單股寡核苷酸,其中X’包含至少1個糖部修飾核苷酸,前述第四寡核苷酸所具有之反義序列,為與標的RNA雜交時含有被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸之序列。
22.如20.記載之單股寡核苷酸,其中前述第四寡核苷酸所包含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,不包含由連續4個去氧核糖核苷酸構成之寡核苷酸鏈。
23.如21.或22.記載之單股寡核苷酸,其中前述第四寡核苷酸所包含之反義序列部分與前述第二寡核苷酸之至少一部分雜交。
24.如20.至23.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸所含之核苷酸以磷酸二酯鍵互相連結。
25.如20.至24.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為DNA或RNA。
26.如1.至25.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中包含鄰接鍵結於前述反義序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
27.如1.至26.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中包含鄰接鍵結於前述反義序列部分之5’側及3’側的糖部修飾核苷酸。
28.如1.至27.中任一項記載之單股寡核苷酸,前述反義序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核 苷酸所構成之序列。
29.如1.至28.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中前述反義序列部分包含硫代磷酸酯鍵。
30.如1.至29.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中Y包含5’端或3’端。
31.如1.至30.中任一項記載之單股寡核苷酸,其中進一步包含源自具有選自由標識機能、純化機能及送達至標的部位的機能所成群組中之至少1種機能的機能性分子之基。
32.如31.記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子選自由糖、脂質、胜肽及蛋白質以及該等之衍生物所成群組中。
33.如31.或32.記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由膽固醇、生殖酚及參雙鍵生殖酚所成群組中之脂質。
34.如31.或32.記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為與唾液酸糖蛋白受體相互作用之糖衍生物。
35.如31.或32.記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由受體之配體及抗體所成群組中之胜肽或蛋白質。
36.一種醫藥組成物,其包含如1.至35.中任一項記載之單股寡核苷酸,與藥理學上許可之載體。
37.一種控制標的RNA之機能的方法,其特徵為包含使如1.至35.中任一項記載之單股寡核苷酸與細胞接觸 之步驟。
38.一種哺乳動物中控制標的RNA之機能的方法,其特徵為包含將含有如1.至35.中任一項記載之單股寡核苷酸之醫藥組成物投予至該哺乳動物之步驟。
39.一種在哺乳動物中用以控制標的RNA之機能之如1.至35.中任一項記載之單股寡核苷酸的使用。
40.一種製造方法,其係如1.至35.中任一項記載之單股寡核苷酸之製造方法,其特徵為包含於含有X、L及Y之至少1個的寡核苷酸之3’端或5’端使核苷酸鏈伸長的步驟。
依據本發明,可以高效率提供可控制標的基因之表現的寡核苷酸。又,可提供較雙股寡核苷酸(例如,HDO、HCDO)更容易製造之寡核苷酸。
本發明之單股寡核苷酸,可藉由其構成要素之反義寡核苷酸有效地控制標的基因之表現,作為核酸醫藥品為有用的。
[圖1]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖2]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖3]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖4]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖5]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2及X’所含之反義序列部分X’2,分別與包含第二核苷酸序列部分及第六核苷酸序列部分之Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖6]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2及X’所含之反義序列部分X’2,分別與包含第二核苷酸序列部分及第六核苷酸序列部分之Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖7]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖8]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖9]本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷 酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖10]本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交,Y所含之反義序列部分YZ 2與X所含之核苷酸序列部分X5在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖11]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交,Y所含之反義序列部分YZ 2與X所含之核苷酸序列部分X5在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖12]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交,Y所含之反義序列部分YZ 2與X所含之核苷酸序列部分X5在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖13]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y0在分子內雜交,Y所含之反義序列部分YZ 2與X所含之核苷酸序列部分X5在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖14]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖15]表示本實施形態之一例的單股寡核苷酸之第一核苷酸序列部分X2與第二核苷酸序列部分Y2在分子內雜交之一態樣的概念圖。
[圖16]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對小鼠腦內皮細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖17]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖18]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之ApoB的表現水平之影響的圖。
[圖19]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對小鼠腦內皮細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖20]本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖21]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之ApoB的表現水平之影響的圖。
[圖22]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對小鼠腦內皮細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖23]本實施形態之單股寡核苷酸之雜交處理前後的凝膠電泳結果。
[圖24]本實施形態之單股寡核苷酸之雜交處理前後的凝膠電泳結果。
[圖25]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖26]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之ApoB的表現水平之影響的圖。
[圖27]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之PTEN的表現水平之影響的圖。
[圖28]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對小鼠中之ApoB的表現水平之影響的圖。
[圖29]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對小鼠中之血漿總膽固醇值之影響的圖。
[圖30]顯示本實施形態之單股寡核苷酸之對源自人類肝癌的細胞中之Aldolase A的表現水平之影響的圖。
[圖31]顯示投予本實施形態之單股寡核苷酸之對C57BL/6J小鼠的肝臓中之ApoB的表現水平之影響的圖。
[圖32]顯示投予本實施形態之單股寡核苷酸之對C57BL/6J小鼠的血漿中之總膽固醇值之影響的圖。
[圖33]本實施形態之單股寡核苷酸之雜交處理前後的凝膠電泳結果。
本說明書中所使用之用語,除非有特別提及,否則係以該領域中所通常使用的意思來使用。以下,說明本說明書中使用之各用語。此外,本說明書中,不論是各用語單獨使用之情形中,或與其他用語一起使用的情形中,若無特別記載,則具有相同意義。
所謂「反義效果」,係指藉由對應標的基因而選擇之標的RNA,與例如其部分序列具有互補的序列之寡核苷酸進行雜交,而控制標的RNA之機能的意思。例如,標的RNA為mRNA時,係指藉由雜交而阻礙前述標的RNA之轉譯、外顯子跳讀等之剪接機能變換效果、 雜交之部分被辨識而前述標的RNA被分解等的意思。作為產生前述反義效果之寡核苷酸,雖可舉例例如DNA及寡去氧核糖核苷酸等,但產生反義效果之寡核苷酸並不限定於此等,RNA、寡核糖核苷酸或以通常會產生反義效果之方式設計之寡核苷酸等亦可。
「標的RNA」,係指mRNA、mRNA前驅體或ncRNA的意思,包含由編碼標的基因之基因體DNA轉錄而成之mRNA、未受到鹼基修飾之mRNA、未受到剪接之mRNA前驅體及ncRNA等。作為藉由反義效果控制機能之「標的RNA」,無特別限制,可舉例與各種疾病中表現亢進之基因相關的RNA。「標的RNA」可為藉由DNA依賴性RNA聚合酶合成之任何RNA,較佳為mRNA或mRNA前驅體。更佳為哺乳動物之mRNA或mRNA前驅體,再更佳為人類之mRNA或mRNA前驅體。
所謂「雜交」,係指使源自包含互補的序列之寡核苷酸或寡核苷酸的基彼此形成雙鍵之行為、及源自包含互補的序列之寡核苷酸或寡核苷酸之基彼此形成雙鍵之現象的意思。
所謂「互補」,係指2個核酸鹼基可透過氫鍵形成華生-克里克型鹼基對(天然型鹼基對)或非華生-克里克型鹼基對(胡斯坦(Hoogsteen)型鹼基對等)的意思。2個寡核苷酸或源自寡核苷酸的基,該等之序列為互補時可進行「雜交」。為了使2個寡核苷酸或源自寡核苷酸的基進行雜交,該等雖不需要完全互補,但為了使2 個寡核苷酸或源自寡核苷酸的基進行雜交的互補性,較佳為70%以上,更佳為80%以上,再更佳為90%以上(例如,95%、96%、97%、98%、或99%以上)。序列之互補性,可藉由利用自動鑑定寡核苷酸之部分序列的電腦程式來決定。例如,OligoAnalyzer為這一類的軟體的一種,Integrated DNA Technologies公司所提供。此程式亦可在網站利用。該業者可輕易地決定2個寡核苷酸或源自寡核苷酸的基可進行雜交的條件(溫度、鹽濃度等)。又,該業者基於例如標的RNA之核苷酸序列的情報,藉由利用BLAST程式等,可輕易地設計與標的RNA互補的反義寡核苷酸。關於BLAST程式,可參照Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America(1990年、87卷、2264~68頁;1993年、90卷、5873~77頁)、及Journal of Molecular Biology(1990年、215卷、403頁)等。
「源自寡核苷酸的基」,係指由寡核苷酸之3’端及5’端之至少一方去除氫原子、羥基等而形成之寡核苷酸的部分構造的意思,寡核苷酸之3’端及5’端之至少一方與其他的基(例如,源自寡核苷酸的基等)共價鍵結。
「核苷酸序列」係指構成寡核苷酸之核苷酸的鹼基序列的意思。
「核苷酸序列部分」係指寡核苷酸鏈之中具有前述核苷酸序列區域的部分構造的意思。
此外,本說明書中,「核苷酸序列」包含或不包含核苷酸或寡核苷酸鏈等,與對應之「核苷酸序列部分」包含或不包含該核苷酸或該寡核苷酸鏈等具有相同的意思。又,該「核苷酸序列」,與包含或不包含該核苷酸或該寡核苷酸鏈等之「核苷酸序列部分」的鹼基序列具有相同的意思。
「序列部分」係指寡核苷酸鏈之部分構造的意思。例如,包含核苷酸之序列部分為寡核苷酸鏈之中包含該核苷酸之區域的部分構造。
核苷酸序列為選自核苷酸的序列,連續核苷酸的序列等,分別與對應之核苷酸序列部分為選自該核苷酸的序列部分、連續該核苷酸的序列部分等具有相同的意思。
「RNaseH」,一般而言,已知辨識DNA與RNA雜交之雙鍵,作為切斷該RNA使單股DNA產生的核糖核酸酶。RNaseH不僅限於辨識DNA與RNA雜交之雙鍵,亦能辨識DNA及RNA之至少一者之鹼基部分、磷酸二酯鍵部分及糖部分之至少1者經修飾的雙鍵。例如,亦能辨識寡去氧核糖核苷酸與寡核糖核苷酸雜交之雙鍵。
因此,DNA與RNA雜交時,可被RNaseH辨識。DNA及RNA之至少一者中,鹼基部分、磷酸二酯鍵部分及糖部分之至少一者經修飾時亦相同。例如,作為代表者,可舉例DNA之磷酸二酯鍵部分經修飾成硫代磷酸酯的寡核苷酸等。
RNA與DNA雜交時,可被RNaseH切斷。DNA及 RNA之至少一者中,鹼基部分、磷酸二酯鍵部分及糖部分之至少一者經修飾時亦相同。
可被RNaseH所辨識之DNA及/或RNA的修飾例,記載於例如Nucleic Acids Research(2014年、42卷、8號、5378~89頁)、Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters(2008年、18卷、2296~2300頁)、Molecular BioSystems(2009年、5卷、838~843頁)、Nuclear Acid Therapeutics(2015年、25卷、5號、266~274頁)、The Journal of Biological Chemistry(2004年、279卷、35號、36317~36326頁)等。
本發明所用之RNaseH,較佳為哺乳動物之RNaseH,更佳為人類之RNaseH,特佳為人類RNaseH1。
「去氧核糖核苷酸」為2’-去氧核糖之1’位的碳原子鍵結有鹼基,3’位或5’位具有磷酸基之分子。本發明中之去氧核糖核苷酸,可為天然存在之去氧核糖核苷酸,亦可為天然存在之去氧核糖核苷酸的鹼基部分或磷酸二酯鍵部分經修飾之去氧核糖核苷酸。鹼基部分之修飾或磷酸二酯鍵部位之修飾亦可為對於1個去氧核糖核苷酸,施以複數種組合。前述經修飾之去氧核糖核苷酸,記載於例如Journal of Medicinal Chemistry(2016年、59卷、21號、9645-9667頁)、Medicinal Chemistry Communications(2014年、5卷、1454-1471頁)、Future Medicinal Chemistry(2011年、3卷、3號、339-365頁)等。本發明中之「去氧核糖核苷酸」亦可稱為「糖部去氧 核糖核苷酸(deoxyribonucleotide)」或「糖部去氧核糖核苷酸(deoxyribose nucleotide)」等。
前述「去氧核糖核苷酸」構成本發明之單股寡核苷酸分子時,通常,去氧核糖核苷酸之3’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與其他核苷酸連結,去氧核糖核苷酸之5’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與另一個核苷酸連結。本發明之單股寡核苷酸分子之3’端的去氧核糖核苷酸,其3’位較佳為具有羥基或磷酸基,5’位如前述。單股寡核苷酸分子之5’端的去氧核糖核苷酸,其5’位較佳為具有羥基或磷酸基,3’位如前述。
「寡去氧核糖核苷酸」係指由前述去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的意思。構成寡去氧核糖核苷酸之去氧核糖核苷酸,各自可相同或相異。
「DNA」係指由天然之去氧核糖核苷酸所構成的寡核苷酸的意思。構成DNA之天然之去氧核糖核苷酸,各自可相同或相異。
「核糖核苷酸」為核糖之1’位的碳原子鍵結有鹼基,2’位、3’位或5’位具有磷酸基之分子。本發明中之核糖核苷酸,可為天然存在之核糖核苷酸,亦可為天然存在之核糖核苷酸的鹼基部分或磷酸二酯鍵部分經修飾之核糖核苷酸。鹼基部分之修飾或磷酸二酯鍵部位之修飾亦可為對於1個核糖核苷酸,施以複數種組合。前述經修飾之核糖核苷酸,記載於例如Journal of Medicinal Chemistry(2016年、59卷、21號、9645-9667頁)、 Medicinal Chemistry Communications(2014年、5卷、1454-1471頁)、Future Medicinal Chemistry(2011年、3卷、3號、339-365頁)等。本發明中之「核糖核苷酸」亦可稱為「糖部核糖核苷酸(ribonucleotide)」或「糖部核糖核苷酸(ribose nucleotide)」等。
前述「核糖核苷酸」構成本發明之單股寡核苷酸分子時,典型的為,核糖核苷酸之3’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與其他核苷酸連結,核糖核苷酸之5’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與另一個核苷酸連結。本發明之單股寡核苷酸分子之3’端的核糖核苷酸,其3’位較佳為具有羥基或磷酸基,5’位如前述。單股寡核苷酸分子之5’端的核糖核苷酸,其5’位較佳為具有羥基或磷酸基,3’位如前述。
「寡核糖核苷酸」係指由前述核糖核苷酸構成之寡核苷酸的意思。構成寡核糖核苷酸之核糖核苷酸,各自可相同或相異。
「RNA」係指由天然之核糖核苷酸所構成的寡核苷酸的意思。構成RNA之天然之核糖核苷酸,各自可相同或相異。
「糖部修飾核苷酸」係指前述去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸之糖部分,一部分被1個以上之取代基取代,或其糖骨架全體置換成與核糖及2’-去氧核糖不同的糖骨架(例如己醣醇、蘇糖等之5至6員的糖骨架),或其糖骨架全體置換成5至6員之飽和或不飽和環(例如環 己烷、環己烯、嗎啉等)或5至6員之環藉由氫鍵可形成之部分構造(例如,胜肽構造)的核苷酸的意思。「糖部修飾核苷酸」之鹼基部分,可為天然存在之鹼基亦可為經修飾之鹼基。又,「糖部修飾核苷酸」之磷酸二酯鍵部分,可為磷酸二酯鍵亦可為經修飾之磷酸二酯鍵。鹼基部分之修飾或磷酸二酯鍵部位之修飾,亦可對於1個糖部修飾核苷酸施以複數種組合。
「糖部修飾核苷酸」可為橋接化核苷酸,亦可為非橋接化核苷酸。作為糖部修飾核苷酸,可舉例例如日本特開平10-304889號公報、國際公開第2005/021570號、日本特開平10-195098號公報、日本特表2002-521310號公報、國際公開第2007/143315號、國際公開第2008/043753號、國際公開第2008/029619號及國際公開第2008/049085號(以下此等文獻稱為「反義法相關文獻」)等中,揭示作為適合反義法使用的核苷酸等。前述文獻中揭示有己醣醇核苷酸(HNA)、環己烯核苷酸(CeNA)、胜肽核酸(PNA)、甘醇核酸(GNA)、蘇糖核苷酸(TNA)、嗎啉基核酸、三環-DNA(tcDNA)、2’-O-甲基化核苷酸、2’-MOE(2’-O-甲氧基乙基)化核苷酸、2’-AP(2’-O-胺基丙基)化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸(2’-F-ANA)、橋接化核苷酸(BNA(Bridged Nucleic Acid))、2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸(MCE)等之核苷酸。又,Journal of Medicinal Chemistry(2016年、59卷、21號、9645-9667頁)、 Medicinal Chemistry Communications(2014年、5卷、1454-1471頁)、Future Medicinal Chemistry(2011年、3卷、3號、339-365頁)等中,亦揭示有糖部修飾核苷酸。
前述「糖部修飾核苷酸」構成本發明之單股寡核苷酸分子時,例如,該糖部修飾核苷酸之3’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與其他核苷酸連結,該糖部修飾核苷酸之5’位以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵與另一個核苷酸連結。本發明之單股寡核苷酸分子之3’端的糖部修飾核苷酸,例如其3’位較佳為具有羥基或磷酸基,5’位如前述。單股寡核苷酸分子之5’端之糖部修飾核苷酸,例如其5’位較佳為具有羥基或磷酸基,3’位如前述。
去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之鹼基部分,較佳為選自腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)及5-甲基胞嘧啶(5-me-C)所成群組中之至少1種。
作為去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之鹼基部分的修飾之例,可舉例鹵化、甲基化、乙基化、n-丙基化、異丙基化、環丙基化、n-丁基化、異丁基化、s-丁基化、t-丁基化、環丁基化、氫氧化、胺基化、硫化及去甲基化等。更具體而言,胞嘧啶之5-甲基化、5-氟化、5-溴化、5-碘化及N4-甲基化;胸腺嘧啶之2-硫化、5-去甲基化、5-氟化、5-溴化及5-碘化;尿嘧啶之2-硫化、5-氟化、5-溴化及5-碘化;腺嘌呤之 N6-甲基化及8-溴化;鳥嘌呤之N2-甲基化及8-溴化等。又,Journal of Medicinal Chemistry(2016年、59卷、21號、9645-9667頁)、Medicinal Chemistry Communications(2014年、5卷、1454-1471頁)、Future Medicinal Chemistry(2011年、3卷、3號、339-365頁)中揭示有核苷酸中之鹼基部分之修飾的例,此等可用於去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之鹼基部分。
作為去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之磷酸二酯鍵部分的修飾之例,可舉例例如硫代磷酸酯化、甲基膦酸酯化(包含掌性-甲基膦酸酯化)、甲基硫代膦酸酯化、二硫代膦酸酯化、胺基膦酸酯化、二胺基膦酸酯化、硫代磷醯胺化及硼烷磷酸酯化等。
作為去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸之糖部分一部分被1個取代基取代之修飾的例,可舉例例如2’-O-甲基化、2’-O-甲氧基乙基(MOE)化、2’-O-胺基丙基(AP)化、2’-氟化及2’-O-甲基胺甲醯基乙基(MCE)化等。
所謂「橋接化核苷酸」,係指藉由糖部分中之2處的取代取代橋接單位而成之糖部修飾核苷酸,可舉例例如2’位與4’位經橋接之核苷酸。
作為2’位與4’位經橋接之核苷酸(2’,4’-BNA),2’位之碳原子與4’位之碳原子,只要是具有藉由2以上之原子橋接之糖部分的核苷酸即可,可舉例例如具 有以C2-6伸烷基(該伸烷基為未取代,或被選自由鹵素原子、側氧基或硫酮基所成群組中之1個以上的取代基所取代;又,該伸烷基之1或2個亞甲基未被置換,或獨立被選自由-O-、-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)及-S-所成群組中之基所置換)橋接之糖部分的核苷酸。
組合前述取代與置換,橋接2’,4’-BNA之2’位與4’位的基,亦可包含-C(O)-O-、-O-C(O)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-C(O)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-C(S)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)等所示之基。此處,包含-C(S)-NR1-之糖部修飾核苷酸,可由包含-C(O)-NR1-之糖部修飾核苷酸或其中間體,使用硫羰基化試藥(例如勞森試劑等),應需要進行保護反應及去保護反應來合成。
作為如此之BNA,可舉例例如亦稱為LNA之鎖核酸(Locked Nucleic Acid(註冊商標)、α-L-亞甲基氧基(4’-CH2-O-2’)BNA或β-D-亞甲基氧基(4’-CH2-O-2’)BNA、亦稱為ENA之伸乙基氧基(4’-(CH2)2-O-2’)BNA)、β-D-硫(4’-CH2-S-2’)BNA、胺基氧基(4’-CH2-O-N(R11)-2’)BNA(R11為H或CH3)、亦稱為2’,4’-BNANC之氧基胺基(4’-CH2-N(R12)-O-2’)BNA(R12為H或CH3)、2’,4’-BNACOC、3’-胺基-2’,4’-BNA、5’-甲基BNA、亦稱為cEt-BNA之(4’-CH(CH3)-O-2’)BNA、 亦稱為cMOE-BNA之(4’-CH(CH2OCH3)-O-2’)BNA、亦稱為AmNA之醯胺型BNA(4’-C(O)-N(R13)-2’)BNA(R13為H或CH3)、該業者已知的其他BNA等。
「寡核苷酸」為具有1個以上之核苷酸聚合而成的構造之分子。「寡核苷酸」由1個核苷酸構成時,該寡核苷酸可稱為「核苷酸」。
「核苷酸」係指可成為核酸(寡核苷酸)的構成單位之分子的意思,通常,作為構成要素為具有鹼基。核苷酸例如由糖、鹼基及磷酸所構成。核苷酸包含前述去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸。本發明之單股寡核苷酸分子所含之核苷酸,各自獨立,彼此以磷酸二酯鍵或前述經修飾之磷酸二酯鍵連結。本發明之單股寡核苷酸分子之3’端的核苷酸,其3’位較佳為具有羥基或磷酸基,更佳為具有羥基,通常為具有羥基。單股寡核苷酸分子之5’端的核苷酸,其5’位較佳為具有羥基或磷酸基,更佳為具有羥基,通常為具有羥基。
「糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸」係指天然存在之去氧核糖核苷酸的鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之去氧核糖核苷酸、天然存在之核糖核苷酸之鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核糖核苷酸或糖部修飾核苷酸的意思。
「被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」包含4個以上之連續的核苷酸,雖只要是由RNaseH辨識者便無特別限定,但連續的核苷酸較佳為自去氧核糖核苷 酸及糖部修飾核苷酸中獨立選擇,更佳為自去氧核糖核苷酸中獨立選擇。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
「被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸」包含4個連續的核苷酸,只要是由RNaseH切斷者便無特別限定,但包含至少1個核糖核苷酸。又,包含寡核糖核苷酸較佳,包含RNA更佳。該連續的核苷酸自核糖核苷酸中獨立選擇再更佳。又,該連續的核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結再更佳。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
所謂「C1-6烷基」,係指碳數1至6之直鏈或分枝狀的飽和烴基的意思,可舉例例如甲基、乙基、n-丙基、異丙基、n-丁基、異丁基、s-丁基、t-丁基、n-戊基、異戊基、新戊基、n-己基及異己基等。
所謂「C1-6伸烷基」,係指由前述「C1-6烷基」去除1個任意位置之氫原子而成之2價取代基的意思,可舉例例如亞甲基、伸乙基(乙烷二基)基、丙烷-1,3-二基、丙烷-2,2-二基、2,2-二甲基-丙烷-1,3-二基、己烷-1,6-二基及3-甲基丁烷-1,2-二基等。
所謂「C2-6伸烷基」,係指前述「C1-6伸烷基」之中,碳數為2至6之直鏈或分枝狀的2價取代基的意思,可舉例例如伸乙基(乙烷二基)基、丙烷-1,3-二基、2,2-二甲基-丙烷-1,3-二基、己烷-1,6-二基及3-甲基丁烷-1,2-二基等。
「n-」係指正、「s-」係指第二、「t-」係指第三的意思。
所謂「C2-20伸烷基」,係指由碳數2至20之直鏈或分枝狀的飽和烴基去除1個任意位置之氫原子而成之2價取代基的意思。
所謂「C8-12伸烷基」,係指由碳數8至12之直鏈或分枝狀的飽和烴基去除1個任意位置之氫原子而成之2價取代基的意思。
所謂「C2-20伸烯基」,係指由碳數2至20之直鏈或分枝狀的不飽和烴基去除1個任意位置之氫原子而成之2價取代基的意思。
所謂「鹵素原子」係指氟原子、氯原子、溴原子或碘原子的意思。
所謂「鹵C1-6烷基」,係指前述「C1-6烷基」之任意位置的氫原子被獨立選自由氟原子、氯原子、溴原子及碘原子構成之取代基群組中的1個以上之鹵素原子所取代之取代基的意思。
所謂「側氧基」係表示氧原子透過雙鍵取代之取代基(=O)。側氧基於碳原子取代時與該碳原子一起形成羰基。
所謂「硫酮基」係表示氧原子透過雙鍵取代之取代基(=S)。硫酮基於碳原子取代時與該碳原子一起形成硫羰基。
糖部修飾核苷酸並非限定於此處例示者。多數糖部修飾核苷酸在該領域中為已知,可利用例如Tachas等之美國專利第8299039號說明書(尤其是17至22 欄)、Journal of Medicinal Chemistry(2016年、59卷、21號、9645-9667頁)、Medicinal Chemistry Communications(2014年、5卷、1454-1471頁)或Future Medicinal Chemistry(2011年、3卷、3號、339-365頁)等所記載之糖部修飾核苷酸作為本發明之實施態樣。
若為該業者,可從如此之糖部修飾核苷酸之中,考慮到反義效果、對標的RNA之部分序列的親和性、對核酸分解酵素的耐性等之觀點,適宜地選擇利用糖部修飾核苷酸。
接著說明本發明中之反義序列、反義序列部分、反義序列與於分子內雜交之核苷酸序列部分。
所謂「反義序列」係指構成可與標的RNA雜交之寡核苷酸的核苷酸之鹼基序列的意思。
「反義序列部分」係指寡核苷酸鏈之中具有前述反義序列區域之部分構造的意思。
此外,本說明書中,「反義序列」包含或不包含核苷酸或寡核苷酸鏈等,與對應之「反義序列部分」包含或不包含該核苷酸或該寡核苷酸鏈等具有相同的意思。又,該「反義序列」,與包含或不包含該核苷酸或該寡核苷酸鏈等之「反義序列部分」的鹼基序列具有相同的意思。
雖前述反義序列部分與標的RNA之全體進行雜交並非必要,與標的RNA之至少一部分進行雜交即 可,但通常與標的RNA之至少一部分進行雜交。例如,藉由具有與標的RNA之部分序列互補的反義序列的寡核苷酸(DNA、寡去氧核糖核苷酸或通常以可產生反義效果之方式設計而成的寡核苷酸等)與標的RNA之至少一部進行雜交而抑制標的基因之表現。又,雖反義序列部分之全體進行雜交並非必要,一部分未進行雜交亦可,但反義序列部分之全體進行雜交較佳。
前述反義序列與標的RNA之部分序列的互補性,較佳為70%以上,更佳為80%以上,再更佳為90%以上(例如,95%、96%、97%、98%、99%以上)。為了反義序列部分與標的RNA之至少一部分進行雜交,雖該等之序列完全互補並非必要,但完全互補進而更佳、。
前述反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列,或「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列較佳。
該業者藉由利用BLAST程式等可輕易決定適合於「可與標的RNA雜交」之反義序列的鹼基序列。適合於「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的核苷酸序列亦相同。
「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」,雖通常為4~30之連續的核苷酸,但較佳為4~20之連續的核苷酸,更佳為5~16之連續的核苷酸,再更佳為6~12之連續的核苷酸,特佳為8~10之連 續的核苷酸。前述連續的核苷酸,較佳為獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,更佳為獨立選自去氧核糖核苷酸中。特佳為8~10個連續的去氧核糖核苷酸。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
又,由體內動力學優異的觀點來看,此連續的核苷酸之中,至少1個核苷酸經硫代磷酸酯化較佳。此連續的核苷酸之中,3’端及5’端之核苷酸之中的至少一方經硫代磷酸酯化更佳。此連續的核苷酸之中,80%的核苷酸經硫代磷酸酯化再更佳,90%的核苷酸經硫代磷酸酯化進而更佳。此連續的核苷酸的全部經硫代磷酸酯化特佳。
反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」之序列時,由增加對標的RNA之部分序列的親和性或對核酸分解酵素的耐性的觀點來看,鄰接於「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」(反義序列部分)之3’側及5’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸較佳,鄰接於該3’側及5’側之至少一方鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鄰接於該3’側及5’側之至少一方鍵結有2~3個糖部修飾核苷酸再更佳。此處,該3’側及5’側之至少一方中之複數的糖部修飾核苷酸之間,雖可包含一或複數之去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其兩者,但該複數之糖部修飾核苷酸為連續較佳。又,該一或複數之糖部修飾核苷酸,鄰接鍵結於前述反義序列部分之3’側及5’側兩方較佳。鄰接於該反義序列部分之3’側及5’側之至少一方 鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,所謂「鄰接鍵結有複數之糖部修飾核苷酸」,係指鄰接鍵結有由該複數之糖部修飾核苷酸、及該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸構成之寡核苷酸鏈的意思。鄰接於該3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,個別的糖部修飾核苷酸可相同亦可不同。
鄰接鍵結於前述「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,可與標的RNA雜交,或不雜交亦可,但由與前述相同的觀點來看與標的RNA雜交較佳。
又,由體內動力學優異的觀點來看,位於前述「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」之3’側及5’側的糖部修飾核苷酸之至少1個經硫代磷酸酯化較佳,位於3’側之糖部修飾核苷酸之至少1個及位於5’側之糖部修飾核苷酸之至少1個經硫代磷酸酯化更佳,50%經硫代磷酸酯化再更佳,80%經硫代磷酸酯化進而更佳。又,全部經硫代磷酸酯化較佳。複數的糖部修飾核苷酸位於該3’側時,該核苷酸之間的鍵結經硫代磷酸酯化較佳,複數的糖部修飾核苷酸位於該5’側時亦相同。
「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」之至少一部分可在分子內雜交,或不雜交亦可。鄰接鍵結於「與標的RNA雜交時被RNaseH 辨識之至少4個連續的核苷酸」之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸亦可在分子內雜交,或不雜交亦可。
反義序列為「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之序列時,該反義序列部分(Mixmer)可包含亦可不包含核糖核苷酸,雖可包含亦可不包含去氧核糖核苷酸,但包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。該反義序列部分,較佳為由獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸之核苷酸所構成之寡核苷酸的部分構造,糖部修飾核苷酸之含有率為例如25%以上。糖部修飾核苷酸之含有率,由增強對於標的RNA之部分序列的親和性或對核酸分解酵素的耐性的觀點來看,較佳為30%以上,更佳為50%以上。由相同的觀點來看,此反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸之至少一者為糖部修飾核苷酸較佳,前述3’側的核苷酸及5’側的核苷酸為糖部修飾核苷酸更佳。
作為其他態樣,前述反義序列部分之糖部修飾核苷酸的含有率,較佳為100%。
「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反義序列部分,不包含由連續的3個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈更佳。
「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反 義序列部分(Mixmer),雖通常為4~30之連續的核苷酸,但較佳為8~25之連續的核苷酸,更佳為10~20之連續的核苷酸,再更佳為14~16之連續的核苷酸,特較佳為15之連續的核苷酸。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
又,由體內動力學優異的觀點來看,構成該「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反義序列部分(Mixmer)的核苷酸之中,至少1個核苷酸經硫代磷酸酯化較佳。該反義序列部分之3’端及5’端之核苷酸之中至少一者經硫代磷酸酯化更佳。包含該反義序列部分之核苷酸之間的鍵結之中,80%經硫代磷酸酯化再更佳,90%經硫代磷酸酯化進而更佳,全部經硫代磷酸酯化特佳。
「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反義序列部分(Mixmer)之至少一部分,雖可在分子內雜交,但不在分子內雜交較佳。因此,單股寡核苷酸分子,以該反義序列部分(Mixmer)、第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分的順序具有該反義序列部分,前述反義序列部分以分子內不雜交的方式,設定Y所含核苷酸的數目,或以第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分、該反義序列部分(Mixmer)的順序具有反義序列部分,前述反義序列部分以分子內不雜交之方式,設定X(及X’)所含核苷酸的數目較佳。由L之5’端至單股寡 核苷酸分子之5’端之間單股寡核苷酸分子所含核苷酸的數目,與由L之3’端至單股寡核苷酸分子之3’端之間單股寡核苷酸分子所含核苷酸的數目的差,接近前述反義序列部分所含核苷酸之數目較佳,前述差通常為6~30,較佳為8~25,更佳為10~20,再更佳為14~16之連續的核苷酸,特佳為15之連續的核苷酸。
鄰接於「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反義序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸雖並非必要,但可鍵結。此時,該一或複數之糖部修飾核苷酸,與包含前述「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」之序列的情形相同,可在分子內雜交,亦可不雜交,但在分子內不雜交較佳。
反義序列部分所含之「糖部修飾核苷酸」,藉由取代等,雖只要是對於標的RNA之部分序列的親和性增強之苷酸或對核酸分解酵素的耐性增強之核苷酸即可,較佳為2’-O-甲基化核苷酸、2’-MOE(2’-O-甲氧基乙基)化核苷酸、2’-AP(2’-O-胺基丙基)化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸(2’-F-ANA)、橋接化核苷酸(BNA(Bridged Nucleic Acid))或2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸(MCE),更佳為BNA或2’-O-甲基化核苷酸,進而更佳為包含下述式(I)所表示之部分構造的LNA、或2’-O-甲基化核苷酸,特佳為LNA。關於鄰接鍵 結於反義序列部分之3’側的一或複數之糖部修飾核苷酸及鄰接鍵結於反義序列部分之5’側的一或複數之糖部修飾核苷酸亦相同。
Figure 106103330-A0202-12-0035-125
式中,Base表示鹼基部分,為嘌呤-9-基或2-側氧-嘧啶-1-基,該嘌呤-9-基及2-側氧-嘧啶-1-基可未經修飾,或經修飾。此處2-側氧-嘧啶-1-基與2-側氧-1H-嘧啶-1-基同義。又,嘌呤-9-基及2-側氧-嘧啶-1-基亦包含其個別的互變異構物。
反義序列部分中之糖部修飾核苷酸、去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸的種類、數目及位置,可影響此處所揭示之單股寡核苷酸發揮的反義效果等。由於其種類、數目及位置依標的RNA之序列等亦有所不同,故不能一概而論,但該業者可參酌前述反義法相關文獻的記載,來決定較佳態樣。又,測定鹼基部分、糖部分或磷酸二酯鍵部分之修飾後的單股寡核苷酸所具有的反義效果,只要所得之測定值是較修飾前之單股寡核苷酸之該值不顯著地降低(例如,修飾後單股寡核苷酸之測定值為修飾前之單股寡核苷酸之測定值的30%以上的話),可評估為該修飾較 佳態樣評價。反義效果的測定,可例如後述實施例中所示,於細胞內導入被測寡核苷酸等,藉由適當地利用北方墨點法、定量的PCR、西方墨點法等之周知手法來進行由該被測寡核苷酸所發揮的反義效果所控制之標的RNA的表現量、標的RNA相關之cDNA的表現量、標的RNA相關之蛋白質的量等之測定。關於鄰接鍵結於反義序列部分之3’側的一或複數之糖部修飾核苷酸、該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸、鄰接鍵結於反義序列部分之5’側的一或複數之糖部修飾核苷酸、及該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸亦相同。
「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」之反義序列部分之3’側及5’側之至少一側的2個核苷酸為糖部修飾核苷酸較佳,該糖部修飾核苷酸較佳為橋接化核苷酸,特佳為LNA。該反義序列部分之3’側的2個核苷酸為糖部修飾核苷酸時,5’側之3個核苷酸的2個以上為糖部修飾核苷酸,由該反義序列部分之末端側依序以下述順序之任一者連結較佳。該反義序列部分之5’側的2個核苷酸為糖部修飾核苷酸時,3’側之3個核苷酸的2個以上為糖部修飾核苷酸,由該反義序列部分之末端側依序以下述順序之任一者連結較佳。此外,此等順序之中,左側為反義序列部分之末端側,右側為反義序列部分之內側。該糖部修飾核苷酸較佳為橋接化核苷酸,特佳為LNA。
糖部修飾核苷酸-糖部修飾核苷酸-糖部修飾核苷酸
糖部修飾核苷酸-糖部修飾核苷酸-去氧核糖核苷酸
糖部修飾核苷酸-去氧核糖核苷酸-糖部修飾核苷酸
單股寡核苷酸包含與前述反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分時,前述「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」中之糖部修飾核苷酸、去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸的種類、數目及修飾之位置,有時會影響單股寡核苷酸所發揮的反義效果等。其較佳態樣,由於依成為修飾對象之核苷酸的種類、序列等有所不同,故不能一概而論,但與前述反義序列部分相同,可藉由測定修飾後之單股寡核苷酸所具有的反義效果來限定。特定之細胞內藉由RNaseH等之核酸酶而使該「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」分解,由易發揮包含反義序列部分之寡核苷酸所生成之反義效果的觀點來看,該「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」,包含「被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸」較佳,包含至少1個核糖核苷酸較佳。又,包含寡核糖核苷酸較佳,包含RNA更佳。該連續的核苷酸獨立選自核糖核苷酸再更佳。又,該連續的核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結再更佳。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
前述反義序列部分與前述「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」之互補性,較佳為70%以上,更佳為80%以上,再更佳為90%以上(例如, 95%、96%、97%、98%、或99%以上)。為了反義序列部分與「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」進行雜交,該等之序列完全互補並非必要,亦可完全互補。又,前述「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」之全體與反義序列部分進行雜交並非必要,一部分未雜交亦可,但全體進行雜交亦可。
「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」可與反義序列部分部分進行雜交,部分進行雜交之核苷酸的數目,通常對應在分子內雜交而成之構造的穩定性、對於前述標的RNA之反義效果的強度、或費用、合成收率等其他要素來選擇。
接著說明本發明中之X、X’及Y。本發明雖有數個實施態樣,但首先說明共通點。
X係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之7~100個核苷酸所構成之第一寡核苷酸的基,該去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸為各自獨立未經修飾,或糖部、鹼基部及磷酸部之至少1個經修飾。第一寡核苷酸包含至少一個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸。第一寡核苷酸具有核苷酸序列X,核苷酸序列X包含可與第二寡核苷酸之至少一部分雜交且含有被RNaseH所辨識之至少4個連續的核苷酸的第一核苷酸序列。
核苷酸序列X為構成第一寡核苷酸之核苷酸的鹼基序列,包含第一核苷酸序列。第一核苷酸序列為構 成第一核苷酸序列部分之核苷酸的鹼基序列。
X所含之核苷酸的數目為7~100,較佳為7~50。X所含之核苷酸的數目,通常對應對於前述標的RNA之反義效果的強度、在分子內雜交而成之構造的穩定性、費用、合成收率等之其他要素來選擇。詳細內容記述於後。
Y係源自第二寡核苷酸的基,該第二寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~100個核苷酸所構成者,該去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸為各自獨立未經修飾,或糖部、鹼基部及磷酸部之至少1個經修飾。第二寡核苷酸具有核苷酸序列Y,核苷酸序列Y包含可與第一寡核苷酸之至少一部分雜交且含有至少1個核糖核苷酸的第二核苷酸序列。
核苷酸序列Y為構成第二寡核苷酸之核苷酸的鹼基序列,包含第二核苷酸序列。第二核苷酸序列為構成第二核苷酸序列部分之核苷酸的鹼基序列。
Y所含之核苷酸的數目為4~100,較佳為4~50。Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目相同亦可,不同亦可。Y所含之核苷酸的數目,通常對應對於前述標的RNA之反義效果的強度、在分子內雜交而成之構造的穩定性、費用、合成收率等之其他要素來選擇。詳細內容記述於後。
X與Y以第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序 列部分在分子內進行雜交。
第一核苷酸序列與第二核苷酸序列,為了第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分雜交而為完全互補雖非必要,但互補性較佳為70%以上,更佳為80%以上,再更佳為90%以上(例如,95%、96%、97%、98%、99%以上)。第一核苷酸序列與第二核苷酸序列亦可完全互補。
核苷酸序列X與核苷酸序列Y,為了X與Y雜交而為完全互補雖非必要,但互補性較佳為70%以上,更佳為80%以上,再更佳為90%以上(例如,95%、96%、97%、98%、99%以上)。核苷酸序列X與核苷酸序列Y亦可完全互補。
第一核苷酸序列包含4~25個連續的核苷酸較佳,包含8~20個連續的核苷酸更佳。為了單股寡核苷酸被細胞內之RNaseH辨識,第一核苷酸序列較佳為獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中的序列,更佳為去氧核糖核苷酸為連續的序列。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。
又,由體內動力學優異的觀點來看,第一核苷酸序列部分之中,至少1個核苷酸經硫代磷酸酯化較佳。第一核苷酸序列部分之3’側及5’側的核苷酸之中至少一者經硫代磷酸酯化更佳。第一核苷酸序列部分之中,80%的核苷酸經硫代磷酸酯化再更佳,90%的核苷酸經硫代磷酸酯化進而更佳。包含第一核苷酸序列部分之核苷 酸,彼此以硫代磷酸酯鍵連結特佳。更詳細的內容記述於後。
第二核苷酸序列包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸較佳,包含4~25個連續的核苷酸更佳,包含8~22個連續的核苷酸再更佳。此連續的核苷酸分別可相同亦可不同。為了第二核苷酸序列部分被細胞內之RNaseH切斷,第二核苷酸序列部分包含寡核糖核苷酸較佳,包含RNA更佳。第二核苷酸序列部分所含之核苷酸,彼此以磷酸二酯鍵連結特佳。更詳細的內容記述於後。
核苷酸序列X及核苷酸序列Y之至少一者,包含可與標的RNA之至少一部分雜交的反義序列。
X’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之7~100個核苷酸所構成之第四寡核苷酸的基,該去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸各自獨立未經修飾,或糖部、鹼基部及磷酸部之至少1個經修飾。第四寡核苷酸包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸。第四寡核苷酸具有核苷酸序列X’,核苷酸序列X’包含可與標的RNA雜交之反義序列即第四核苷酸序列。
核苷酸序列X’為構成第四寡核苷酸之核苷酸的鹼基序列,包含第四核苷酸序列。第四核苷酸序列為構成第四核苷酸序列部分之核苷酸的鹼基序列。
X’所含之核苷酸的數目為7~100,下限較佳為 8,更佳為10,再更佳為12,進而更佳為13。X’所含之核苷酸的數目的上限較佳為50,更佳為35,再更佳為25,進而更佳為20。X’所含之核苷酸的數目較佳為10~50,更佳為10~35,再更佳為12~25鹼基,進而更佳為13~20鹼基,特佳為14~15。X’所含之核苷酸的數目,通常對應對於前述標的RNA之反義效果的強度、在分子內雜交而成之構造的穩定性、費用、合成收率等之其他要素來選擇。
X中之糖部修飾核苷酸、去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸的種類、數目及修飾的位置,有時會影響單股寡核苷酸所發揮之反義效果等。其較佳態樣,由於依成為修飾對象之核苷酸的種類、序列等有所不同,故不能一概而論,但與前述反義序列部分相同,可藉由測定修飾後之單股寡核苷酸所具有之反義效果來界定。Y及X’亦與X相同。
X’、Y及X之2個以上,與同一標的RNA進行雜交時,該等所具有的反義序列分別可相同,亦可不同。X’、Y及X分別與不同的標的RNA進行雜交亦可。
核苷酸序列X具有反義序列時,該反義序列包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」,或「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」較佳,包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」更佳。第一核苷酸序列為反義序列時, 該反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列。
核苷酸序列Y具有反義序列時,該反義序列包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」,或「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」較佳,包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」更佳。核苷酸序列X’包含反義序列之情形亦相同。
由前述反義序列部分如以下所述在分子內進行雜交時,藉由特定之細胞內,由RNaseH等之核酸酶辨識該反義序列部分,「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」被分解,而容易發揮包含反義序列部分之寡核苷酸所生成之反義效果的觀點來看,前述反義序列部分包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」較佳。
核苷酸序列X具有反義序列時,Y亦可包含該「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」(第八核苷酸序列部分)。第一核苷酸序列為反義序列時,該反義序列部分(第一核苷酸序列部分)與第二核苷酸序列部分雜交。
核苷酸序列X’具有反義序列時,Y亦可包含該「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」(第六核苷酸序列部分)。
核苷酸序列Y具有反義序列時,X亦可包含該「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」(第七核苷酸序列部分)。
接著,依序說明〔A〕核苷酸序列X包含反義序列之情形,與〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形的個別態樣。
〔A〕核苷酸序列X包含反義序列之情形
核苷酸序列X包含反義序列之情形中,第一核苷酸序列為反義序列較佳。又,作為其他態樣,前述X於前述反義序列部分與L之間具有第一核苷酸序列部分較佳。以下,雖依序說明,但本發明之實施形態並不限定於該等,例如,第一核苷酸序列與前述反義序列一部分重複亦可。
〔A-1〕第一核苷酸序列包含反義序列之情形
第一核苷酸序列為反義序列時,前述反義序列即第一核苷酸序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列。前述第一核苷酸序列及第一核苷酸序列部分之較佳態樣等,與於反義序列及反義序列部分所述之包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列等相同。又,鄰接於第一核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸較佳,此等一或複數之糖部修飾核苷酸,與鄰接於「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識 之至少4個連續的核苷酸」(反義序列部分)之3’側及5’側之至少一方的一或複數之糖部修飾核苷酸相同。
又,單股寡核苷酸包含成為X’-L’-X的部分構造時,核苷酸序列X’所含之反義序列即前述第四核苷酸序列,為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列,或「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列較佳,包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列更佳。前述核苷酸序列X’所含之反義序列的較佳形態等,與前述反義序列、前述反義序列部分的說明相同,關於鄰接鍵結於反義序列部分之3’側的一或複數之糖部修飾核苷酸及鄰接鍵結於反義序列部分之5’側的一或複數之糖部修飾核苷酸亦與前述相同。
第一核苷酸序列在前述共通點所述特徵之外,包含4~20之連續的核苷酸較佳,包含5~16之連續的核苷酸更佳,包含6~12之連續的核苷酸再更佳,包含8~10之連續的核苷酸進而更佳,包含8~10之連續的去氧核糖核苷酸特佳。
某一實施形態中,X所含之核苷酸的數目之下限值較佳為8,更佳為10,再更佳為12,進而更佳為13。X所含之核苷酸的數目之上限值較佳為50,更佳為35,再更佳為25,進而更佳為20。X所含之核苷酸的數目較佳為10~50,更佳為10~35,再更佳為12~25,進而 更佳為13~20,特佳為13~15。
某一實施形態中,Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差,較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
又,單股寡核苷酸包含成為X’-L’-X的部分構造時,某一實施形態中,Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差,較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。X’所含之核苷酸的數目,共通點如前述。
單股寡核苷酸包含成為X’-L’-X的部分構造時,另一實施形態中,X’-L’-X所含之核苷酸的數目與Y所含之核苷酸的數目的差,較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。X’所含之核苷酸的數目,共通點如前述。
又此時,Y在第二核苷酸序列之外,亦可進而包含可與第四核苷酸序列部分雜交,且包含至少1個核糖核苷酸之第六核苷酸序列,亦可進而包含可與源自第五寡核苷酸的基即L’雜交的第十核苷酸序列。即,Y可為第二核苷酸序列部分與第六核苷酸序列部分依此順序連結而成者,亦可為第二核苷酸序列部分與第十核苷酸序列部分與第六核苷酸序列部分依此順序連結而成者。第六核苷酸序列之較佳態樣,與以下所述之第二核苷酸序列相同。第十核苷酸序列部分之較佳態樣,與以下所述之L’相同。
又此時,如以下所述,雖第二核苷酸序列部 分之5’側及3’側之至少一方可與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結,但此時以磷酸二酯鍵連結較佳。雖鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方可鍵結有一或複數之糖部修飾核苷酸,但此時不鍵結較佳。第六核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結較佳,該態樣與以下所述之第二核苷酸序列之情形相同。鄰接於第六核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有一或複數之糖部修飾核苷酸較佳,該態樣與以下所述之第二核苷酸序列之情形相同。
第二核苷酸序列在前述共通點之外,包含4~20之連續的核苷酸較佳,包含5~16之連續的核苷酸更佳,包含6~12之連續的核苷酸進而更佳,包含8~12之連續的核苷酸進而更佳,10~12之連續的核苷酸特佳。
由該單股寡核苷酸直至送達至特定細胞之核內為止,因RNaseA等之RNA分解酵素的分解被抑制,同時藉由在特定細胞內因RNaseH等之核酸酶而該源自第二寡核苷酸的基被分解,第一寡核苷酸之至少一部分且包含前述反義序列部分之寡核苷酸生成,從而容易發揮反義效果的觀點來看,第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結較佳。Y以5’側與L鍵結時,第二核苷酸序列部分之3’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳,Y以3’側與L鍵結時,第二核苷酸序列部分之5’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳。又,由抑制因RNA分解酵素等酵素之分 解的觀點來看,鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸較佳。Y以5’側與L鍵結時,鄰接於第二核苷酸序列部分之3’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。Y在3’側與L鍵結時,鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。此處,該3’側及5’側之至少一方中之複數之糖部修飾核苷酸之間,雖可包含複數之去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其兩者,但該複數之糖部修飾核苷酸為連續較佳。鄰接於第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,所謂「鄰接鍵結有複數之糖部修飾核苷酸」,係指鄰接鍵結有由該複數之糖部修飾核苷酸、及該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸構成之寡核苷酸鏈的意思。鄰接於第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,個別的糖部修飾核苷酸可相同亦可不同。
鄰接鍵結於前述第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,雖可與第一寡核苷酸的一部分雜交,或不雜交亦可,但與第一寡核苷酸的一部分雜交較佳。
鄰接鍵結於前述第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸,較佳為2’-O-甲基化核苷酸、2’-MOE(2’-O-甲氧基乙基)化核苷酸、2’-AP (2’-O-胺基丙基)化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸(2’-F-ANA)、橋接化核苷酸(BNA(Bridged Nucleic Acid))或2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸(MCE),更佳為BNA或2’-O-甲基化核苷酸,進而更佳為包含下述式(I)所表示之部分構造之LNA或2’-O-甲基化核苷酸,特佳為2’-O-甲基化核苷酸。
Figure 106103330-A0202-12-0049-126
式中,Base表示鹼基部分,為嘌呤-9-基或2-側氧-嘧啶-1-基,該嘌呤-9-基及2-側氧-嘧啶-1-基未經修飾或經修飾。
鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的寡核苷酸之核苷酸數,雖與鄰接於第一核苷酸序列部分(例如,第二核苷酸序列部分所雜交之反義序列部分)之5’側及3’側之至少一方的寡核苷酸之核苷酸數可相同亦可不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第二核苷酸序列部分之3’側鍵結有包含前述一或複數之糖部修飾核苷酸的寡核苷酸鏈時,該寡核苷酸鏈之核苷酸數,雖與鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側的包含一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核 苷酸數可相同亦可不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側鍵結有包含前述一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈時,該寡核苷酸鏈之核苷酸數,雖與鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之3’側的包含1或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數可相同亦可不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。
作為其他態樣,進而核苷酸序列Y包含反義序列之情形中,前述Y於前述反義序列部分與L之間具有第二核苷酸序列部分較佳。前述反義序列部分的序列,與後述之〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形中核苷酸序列Y所含之反義序列相同。
核苷酸序列Y包含反義序列之情形中,第二核苷酸序列在前述共通點所述之第二核苷酸序列之外,與後述之〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形的第二核苷酸序列相同。第一核苷酸序列為反義序列且核苷酸序列Y包含反義序列之情形中,第二核苷酸序列包含4~25之連續的核苷酸較佳,包含10~25之連續的核苷酸更佳,包含12~22之連續的核苷酸進而更佳,包含12~18之連續的核苷酸特佳。
鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之核苷酸的態樣,與該核苷酸之鍵結,與後述之〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形相同。
核苷酸序列Y包含反義序列之情形,某一實 施形態中,X所含之核苷酸的數目較佳為10~35,更佳為12~25,進而更佳為12~16,特佳為14~15。
Y所含之核苷酸的數目,相較X所含之核苷酸的數目,與「Y所含之反義序列部分」所含之核苷酸的數目同程度大較佳。Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差較佳為6~30,更佳為8~25,再更佳為10~20,進而更佳為13~15。
核苷酸序列Y包含反義序列之情形、另一實施形態中,X所含之核苷酸的數目較佳為20~40,更佳為24~38,再更佳為26~38,進而更佳為28~33,進而更佳為30~32。
此時,Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
此時,核苷酸序列X可與Y所含之反義序列部分雜交,亦可進一步包含含有至少1個核糖核苷酸之第七核苷酸序列。核苷酸序列X包含第七核苷酸序列時,前述式X-L-Y所示之單股寡核苷酸依序具有第七核苷酸序列部分、第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分、Y所含之反義序列部分。
前述第七核苷酸序列部分之較佳態樣,與前述「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」相同。其中,第七核苷酸序列包含10~20之核苷酸較佳,包含12~19之核苷酸更佳,包含13~15之核糖核苷酸 再更佳。
由該單股寡核苷酸直至送達至特定細胞之核內為止,因RNaseA等之RNA分解酵素的分解被抑制,同時藉由在特定之細胞內因RNaseH等之核酸酶而該源自第二寡核苷酸的基被分解,第一寡核苷酸之至少一部分且包含前述反義序列部分的寡核苷酸生成,進而第二寡核苷酸之至少一部分且包含前述Y所含之反義序列部分的寡核苷酸生成,從而容易發揮反義效果的觀點來看,第七核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結較佳。X以5’側與L鍵結時,第七核苷酸序列部分之3’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳,X以3’側與L鍵結時,第七核苷酸序列部分之5’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳。又,由抑制因RNA分解酵素等酵素之分解的觀點來看,鄰接於第七核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸較佳。X以5’側與L鍵結時,鄰接於第七核苷酸序列部分之3’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。X以3’側與L鍵結時,鄰接於第七核苷酸序列部分之5’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。此處,於該3’側及5’側之至少一方中之複數之糖部修飾核苷酸之間雖可包含複數之去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其兩者,但該複數之糖部修飾核苷酸為連續較佳。鄰接於第七核苷酸序列部分之3’側及5’側之 至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,所謂「鄰接鍵結有複數之糖部修飾核苷酸」,係指鄰接鍵結有由該複數之糖部修飾核苷酸、及該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈的意思。鄰接於第七核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,個別的糖部修飾核苷酸可相同亦可不同。
鄰接鍵結於前述第七核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,雖可與第二寡核苷酸之一部分雜交,或不雜交亦可,但與第二寡核苷酸之一部分雜交較佳。
鄰接於第七核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方之寡核苷酸的核苷酸數,與鄰接於前述Y所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之寡核苷酸的核苷酸數雖可相同或不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第七核苷酸序列部分之3’側鍵結有包含前述一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈時,其核苷酸數,與鄰接鍵結於Y所含之反義序列部分之5’側的包含一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數雖可相同或不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第七核苷酸序列部分之5’側鍵結有包含前述一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈時,其寡核苷酸鏈之核苷酸數,與鄰接鍵結於Y所含之反義序列部分之3’側的包含1或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷 酸數雖可相同或不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。
鄰接鍵結於前述第七核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方之糖部修飾核苷酸部分的態樣,與鄰接鍵結於前述第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方之糖部修飾核苷酸部分相同。
〔A-2〕X在前述反義序列部分與L之間具有第一核苷酸序列部分之情形
雖第一核苷酸序列部分與前述反義序列部分可直接鍵結,亦可在該等之間透過寡核苷酸間接鍵結,但包含寡核苷酸而間接鍵結較佳。
雖該反義序列可為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列,亦可為「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列,但該反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列較佳。該序列之較佳形態等與前述反義序列及反義序列部分之說明相同,關於鄰接鍵結於反義序列部分之3’側的一或複數之糖部修飾核苷酸及鄰接鍵結於反義序列部分之5’側的一或複數之糖部修飾核苷酸亦相同。
反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列,第一核 苷酸序列部分與前述反義序列部分透過寡核苷酸間接鍵結時,該寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述反義序列部分之3’側及5’側之至少一方的一或複數之糖部修飾核苷酸較佳。糖部修飾核苷酸之態樣如前述。又,該寡核苷酸進而包含在生理條件下被分解之寡核苷酸較佳。在生理條件下被分解之寡核苷酸的態樣,與後述之L’相同。因此,第一寡核苷酸以第一核苷酸序列部分、前述源自在生理條件下被分解之寡核苷酸的基、前述一或複數之糖部修飾核苷酸、前述X所含之反義序列部分、前述一或複數之糖部修飾核苷酸的順序具有此等較佳。
反義序列為「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列,第一核苷酸序列部分與前述X所含之反義序列部分透過寡核苷酸間接鍵結時,該寡核苷酸為在生理條件下被分解之寡核苷酸較佳。在生理條件下被分解之寡核苷酸的態樣,與後述之L’相同。
又,單股寡核苷酸包含X’-L’-X之部分構造時,核苷酸序列X’所含之反義序列即第四核苷酸序列,與〔A-1〕所述之第四核苷酸序列相同。
第一核苷酸序列在前述之共通點之外,其中包含8~17之連續的核苷酸較佳,包含8~10之連續的核苷酸更佳。
第二核苷酸序列在前述之共通點之外,其中包含4~20之連續的核苷酸較佳,包含8~19之連續的核苷 酸更佳,包含9~11之連續的核苷酸更佳。
鄰接鍵結於前述第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,與前述〔A-1〕中詳細敘述之鄰接鍵結於第二核苷酸序列之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分相同。
X所含之核苷酸的數目較佳為10~50,更佳為20~40,再更佳為20~30,進而更佳為22~28,特佳為25~28。
某一實施形態中,Y所含之核苷酸的數目較佳為4~25,更佳為8~20,再更佳為10~20,特佳為10~16。
此時,X所含之核苷酸的數目較Y所含之核苷酸的數目大,且其差接近前述反義序列部分所含之核苷酸的數目較佳,較佳為6~30,更佳為8~25,再更佳為10~20,進而更佳為12~15。
又,另一實施形態中,Y所含之核苷酸的數目較佳為10~50,更佳為20~40,再更佳為20~30,進而更佳為22~28,特佳為25~28。
此時,Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差,較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
此時,Y在第二核苷酸序列部分之外,亦可進一步含有可與前述X所具有之反義序列部分雜交,且包含至少1個核糖核苷酸的第八核苷酸序列部分,亦可進一 步含有可與連結第一核苷酸序列部分與前述X所具有之反義序列部分之寡核苷酸進行雜交的第九核苷酸序列部分。即,Y可為依序連結第二核苷酸序列部分與第八核苷酸序列部分而成者,亦可為依序連結第二核苷酸序列部分與第九核苷酸序列部分與第八核苷酸序列部分而成者。
前述第八核苷酸序列部分之較佳態樣,與前述「與反義序列部分在分子內進行雜交之核苷酸序列部分」相同,與前述第二核苷酸序列部分相同。
鄰接鍵結於前述第八核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方之糖部修飾核苷酸部分的態樣,亦與鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方之糖部修飾核苷酸部分相同。鄰接鍵結於第八核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方之糖部修飾核苷酸部分,雖可與第一寡核苷酸的一部分雜交,或不雜交亦可,但與第一寡核苷酸的一部分雜交較佳。鄰接於第八核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方之包含1或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數,與鄰接於前述X所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之包含1或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數雖可相同或不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第八核苷酸序列部分之3’側鍵結有包含前述一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈時,其核苷酸數,與鄰接鍵結於前述X所含之反義序列部分之5’側之包含一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數雖可相同或不同,但其差 為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。鄰接於第八核苷酸序列部分之5’側鍵結有前述包含一或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈時,其核苷酸數,與鄰接鍵結於前述X所含之反義序列部分之3’側之包含1或複數之糖部修飾核苷酸之寡核苷酸鏈的核苷酸數雖可相同或不同,但其差為3以內較佳,1以內更佳,相同特佳。
此時,第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方,雖可與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結,但以磷酸二酯鍵連結較佳。又,雖鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方可鍵結有一或複數之糖部修飾核苷酸,但不鍵結較佳。
第九核苷酸序列部分之較佳態樣,與以下所述之L’相同。
又,單股寡核苷酸包含X’-L’-X之部分構造時,某一實施形態中,Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
單股寡核苷酸包含X’-L’-X之部分構造時,另一實施形態中,X’-L’-X所含之核苷酸的數目與Y所含之核苷酸的數目的差較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
又此時,Y在第二核苷酸序列部分之外,亦可進一步包含可與第四核苷酸序列部分雜交,包含至少1個核糖核苷酸的第六核苷酸序列部分,亦可進一步包含可與源自第 五寡核苷酸的基即L’雜交的第十核苷酸序列部分。即,Y可為依序連結第二核苷酸序列部分與第八核苷酸序列部分與第六核苷酸序列部分而成者,亦可為依序連結第二核苷酸序列部分、第八核苷酸序列部分、第十核苷酸序列部分及第六核苷酸序列部分而成者,亦可為依序連結第二核苷酸序列部分、第九核苷酸序列部分、第八核苷酸序列部分及第六核苷酸序列部分而成者,亦可為依序連結第二核苷酸序列部分、第九核苷酸序列部分、第八核苷酸序列部分、第十核苷酸序列部分及第六核苷酸序列部分而成者。第六核苷酸序列與前述〔A-1〕所述之第六核苷酸序列相同。第八核苷酸序列及第九核苷酸序列如前述。
又此時,第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方,雖可與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結,但此時以磷酸二酯鍵連結較佳。雖鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方可鍵結有一或複數之糖部修飾核苷酸,但此時不鍵結較佳。同樣地,雖第八核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方可與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結,但此時以磷酸二酯鍵連結較佳。雖鄰接於第八核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方可鍵結有一或複數之糖部修飾核苷酸,但此時不鍵結較佳。第六核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結較佳,其態樣,與前述〔A-1〕中詳細敘述之第二核苷酸序列之情形相同。鄰接於第六核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有1或複數 之糖部修飾核苷酸較佳,其態樣與前述前述〔A-1〕中詳細敘述之第二核苷酸序列之情形相同。
進而,核苷酸序列Y包含反義序列時,前述Y在前述反義序列部分與L之間具有第二核苷酸序列部分較佳,前述反義序列部分與後述之〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形相同。
此時,第二核苷酸序列部分之態樣,與〔A-1〕所述之進而核苷酸序列Y包含反義序列之情形的第二核苷酸序列部分之態樣相同。鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之核苷酸的態樣、與該核苷酸之鍵結,與後述之〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形相同。
此時,核苷酸序列X亦可進一步包含可與Y所含之反義序列部分雜交,且包含至少1個核糖核苷酸的第七核苷酸序列。
此時,某一實施態樣中,式X-L-Y所示之單股寡核苷酸依序具有X所含之反義序列部分、第七核苷酸序列部分、第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分及Y所含之反義序列部分,進而依序具有前述第九核苷酸序列部分及前述第八核苷酸序列部分。
另一實施態樣中,式X-L-Y所示之單股寡核苷酸依序具有第七核苷酸序列部分、X所含之反義序列部分、第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分、前述第九核苷酸序列部分、前述第八核苷酸序列部分及Y所含之反義序列部分。
〔B〕核苷酸序列Y包含反義序列之情形
前述Y在前述反義序列部分與L之間具有第二核苷酸序列部分較佳。第二核苷酸序列部分與前述反義序列部分可直接鍵結,亦可該等之間透過寡核苷酸間接鍵結。
該反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列,或「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列較佳,該反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列更佳。該序列之較佳形態等,與前述反義序列、反義序列部分的說明相同,關於鄰接鍵結於反義序列部分之3’側的一或複數之糖部修飾核苷酸及鄰接鍵結於反義序列部分之5’側的一或複數之糖部修飾核苷酸亦相同。
反義序列為包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」的序列時,第二核苷酸序列部分與前述反義序列部分透過寡核苷酸間接鍵結較佳。該寡核苷酸為鄰接鍵結於前述反義序列部分之3’側及5’側之至少一方的一或複數之糖部修飾核苷酸較佳,其態樣如前述。
反義序列為「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」的序列時,雖第二核苷酸序列部分與前述反義序 列部分可直接鍵結,亦可該等之間透過寡核苷酸間接鍵結,但直接鍵結較佳。透過寡核苷酸間接鍵結時,該寡核苷酸與後述之L’相同。
由該單股寡核苷酸直至送達至特定細胞之核內為止,因RNaseA等之RNA分解酵素的分解被抑制,同時藉由在特定細胞內因RNaseH而該第二核苷酸序列部分被分解,第二寡核苷酸之一部分且包含前述反義序列部分之寡核苷酸生成,從而容易發揮反義效果的觀點來看,第二核苷酸序列部分之5’側及3’側與鄰接之核苷酸以磷酸二酯鍵連結較佳。
又,鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有至少1個糖部修飾核苷酸較佳。Y以5’側與L鍵結時,鄰接於第二核苷酸序列部分之3’側鍵結有至少1個糖部修飾核苷酸更佳,Y以3’側與L鍵結時,鄰接於第二核苷酸序列部分之5’側鍵結有至少1個糖部修飾核苷酸更佳。
反義序列包含「與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸」時,該糖部修飾核苷酸為鄰接鍵結於該反義序列部分之3’側及5’側之一方的一或複數之糖部修飾核苷酸較佳,其態樣與前述相同。
反義序列為「包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈」時,該糖部修飾核苷酸為該反義序列部分之3’側及5’側 之一方的糖部修飾核苷酸較佳,其態樣與前述相同。
第二核苷酸序列,在前述共通點所述之第二核苷酸序列之態樣之外,包含4~25之連續的核苷酸較佳,包含10~22之連續的核苷酸更佳,包含10~16之連續的核苷酸再更佳,包含12~14之連續的核糖核苷酸進而更佳,包含12~13之連續的核糖核苷酸特佳。
由與前述相同,該單股寡核苷酸直至送達至特定細胞之核內為止,因RNaseA等之RNA分解酵素的分解被抑制,同時藉由在特定細胞內因RNaseH等之核酸酶而該源自第二寡核苷酸的基被分解,第二寡核苷酸之至少一部分且包含前述反義序列部分之寡核苷酸生成,從而容易發揮反義效果的觀點來看,第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結較佳。X在5’側與L鍵結時,第一核苷酸序列部分之3’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳,X在3’側與L鍵結時,第一核苷酸序列部分之5’側,與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結更佳。某一實施態樣中,第一寡核苷酸所含之核苷酸以硫代磷酸酯鍵互相連結較佳。
又,由抑制因RNA分解酵素等酵素之分解的觀點來看,鄰接於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方鍵結有1~10個糖部修飾核苷酸較佳。X在5’側與L鍵結時,鄰接於第一核苷酸序列部分之3’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。X在3’側與L鍵結時,鄰接於第一核苷酸序 列部分之5’側鍵結有1~7個糖部修飾核苷酸更佳,鍵結有2或3個糖部修飾核苷酸再更佳。此處,於該3’側及5’側之至少一方中之複數之糖部修飾核苷酸之間,雖亦可包含複數之去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其兩者,但該複數之糖部修飾核苷酸為連續較佳。鄰接於第一核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,所謂「鄰接鍵結有複數之糖部修飾核苷酸」,係指鄰接鍵結有由該複數之糖部修飾核苷酸、及該複數之糖部修飾核苷酸之間所含之去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈的意思。鄰接於第一核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方鍵結有複數之糖部修飾核苷酸時,個別的糖部修飾核苷酸可相同亦可不同。
鄰接鍵結於前述第一核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,雖可與第二寡核苷酸之一部分雜交,或不雜交亦可,但與第二寡核苷酸之一部分雜交較佳。
鄰接鍵結於前述第一核苷酸序列部分之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分,與前述〔A-1〕中詳細敘述之鄰接鍵結於第二核苷酸序列之3’側及5’側之至少一方的糖部修飾核苷酸部分相同。
第一核苷酸序列之態樣,與前述共通點所述之第一核苷酸序列相同,其中為4~20之連續的核苷酸,較佳為6~16之連續的核苷酸,更佳為8~12之連續的核苷酸,特佳為9~11之連續的去氧核糖核苷酸。
某一實施態樣中,X所含之核苷酸的數目較佳為7~50,更佳為8~30,進而更佳為10~20,特佳為10~16。
此時,X所含之核苷酸的數目較Y所含之核苷酸的數目小,且其差較佳為6~30,更佳為8~25,再更佳為10~20,特佳為13~15。
核苷酸序列X亦可進一步包含可與Y所含之反義序列部分雜交,且包含至少1個核糖核苷酸的第七核苷酸序列。此時,某一實施態樣中,式X-L-Y所示之單股寡核苷酸依序具有第七核苷酸序列部分、第一核苷酸序列部分、L、第二核苷酸序列部分及Y所含之反義序列部分。第七核苷酸序列之態樣,如前述〔A-1〕中所述。
此時,X所含之核苷酸的數目較佳為10~50,更佳為20~45,再更佳為25~40,進而更佳為26~38,特佳為28~33。
Y所含之核苷酸的數目與X所含之核苷酸的數目的差較佳為10以內,更佳為5以內,再更佳為4以內,進而更佳為2以內,特佳為0。
進而核苷酸序列X亦可包含反義序列,關於該情形之態樣,如〔A-1〕及〔A-2〕中所說明。
又,單股寡核苷酸包含X’-L’-X之部分構造時,核苷酸序列X’所含之前述第四核苷酸序列,與〔A-1〕所述之第四核苷酸序列相同。
接著,說明關於L,L’及機能性分子。以下, 與前述數個態樣共通。
L為源自在生理條件下被分解之寡核苷酸的基,為將前述X與Y連結之鏈接序列。L與前述X與Y,以X-L-Y之順序連結。
L’為源自在生理條件下被分解之寡核苷酸的基,為將前述X與X’連結之鏈接序列。L’與前述X與X’,以X’-L’-X之順序連結。
L與X以共價鍵連結,例如,L與X之各自的末端核苷酸之糖部分(糖部修飾核苷酸中,包含由糖骨架置換而成的部分構造)以磷酸二酯鍵連結較佳。L與Y以共價鍵連結,例如,L與Y之各自的末端核苷酸之糖部分(糖部修飾核苷酸中,包含由糖骨架置換而成的部分構造)以磷酸二酯鍵連結較佳。又同樣地,Y中之第二核苷酸序列部分與L,以磷酸二酯鍵連結較佳。同樣地L’與X’,以磷酸二酯鍵連結較佳,L’與X,以磷酸二酯鍵連結較佳。
此處,所謂「源自在生理條件下被分解之寡核苷酸的基」,只要是源自在生理條件下因各種DNase(去氧核糖核酸酶)及RNase(核糖核酸酶)等之酵素被分解之寡核苷酸的基即可,構成該寡核苷酸之核苷酸,其一部分或全部中,於鹼基、糖或磷酸鹽鍵結可經化學修飾,未經修飾亦可。
L較前述反義序列部分更快被分解為宜。L較佳為源自以磷酸二酯鍵連結之寡核苷酸的基,再更佳為源 自寡去氧核糖核苷酸或寡核糖核苷酸的基,進而更佳為源自DNA或RNA的基。L’與L相同。
雖L在源自L之寡核苷酸的基內可包含部分互補的序列,不含亦可,但L較佳為源自在源自L之寡核苷酸的基內不包含部分互補的序列之寡核苷酸的基。作為源自如此之寡核苷酸的基的例,可舉例以磷酸二酯鍵連結而成之(N)n(N各自獨立為腺苷、尿苷、胞苷、鳥苷、2’-去氧腺苷、胸苷、2’-去氧胞苷、或2’-去氧鳥苷,n為1~40之整數(重複數))。其中,n較佳為3~20,更佳為4~10,再更佳為4~7,進而更佳為4或5,特佳為4。關於L’,與L相同。關於L’,作為其他態樣,n較佳為2~5,更佳為2~4。
L’可為與L相同的序列,亦可為另外的序列。
第一寡核苷酸、第二寡核苷酸、第三寡核苷酸、第四寡核苷酸或第五寡核苷酸中,亦可直接或間接地鍵結有機能性分子。第一寡核苷酸包含反義序列部分時,機能性分子鍵結於第二寡核苷酸較佳。機能性分子與第二寡核苷酸之鍵結,雖可為直接的,或透過其他物質間接的亦可,但第二寡核苷酸與機能性分子以共價鍵、離子鍵或氫鍵鍵結較佳。由其鍵結的穩定性高的觀點來看,以共價鍵直接鍵結,或以共價鍵透過鏈接序列(連結基)鍵結更佳。第二寡核苷酸包含反義序列部分時,機能性分子鍵結於第一寡核苷酸較佳。機能性分子與第一寡核苷酸之鍵結,與機能性分子與第二寡核苷酸之鍵結相同。第一寡核 苷酸及第二寡核苷酸分別具有反義序列部分之情形中,第二寡核苷酸包含離L最遠之反義序列部分時,機能性分子鍵結於第一寡核苷酸較佳,第一寡核苷酸包含離L最遠之反義序列部分時,機能性分子鍵結於第二寡核苷酸較佳。機能性分子與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸之鍵結,與前述相同。第四寡核苷酸具有反義序列部分時,機能性分子鍵結於第二寡核苷酸較佳。機能性分子與第二寡核苷酸之鍵結,與前述相同。
前述機能性分子以共價鍵鍵結於單股寡核苷酸時,前述機能性分子直接或間接鍵結於單股寡核苷酸分子之3’端或5’端較佳。前述鏈接序列或機能性分子與單股寡核苷酸分子之末端核苷酸的鍵結,對應機能性分子來選擇。
前述鏈接序列或機能性分子與單股寡核苷酸分子之末端核苷酸,以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵連結較佳,以磷酸二酯鍵連結更佳。某一實施態樣中,第二寡核苷酸之末端核苷酸與前述鏈接序列或機能性分子,以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵連結較佳,以磷酸二酯鍵連結更佳。某一實施態樣中,第一寡核苷酸之末端核苷酸與前述鏈接序列或機能性分子,以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵連結較佳,以磷酸二酯鍵連結更佳。
前述鏈接序列或機能性分子,亦可直接連結於單股寡核苷酸分子之3’端之核苷酸所具有的3’位之氧原子或5’端之核苷酸所具有的5’位之氧原子。
「機能性分子」之構造無特別限制,其藉由鍵結賦予單股寡核苷酸期望的機能。作為期望的機能,可舉例標識機能、純化機能及送達至標的部位的機能。作為賦予標識機能之分子的例,可舉例螢光蛋白質、螢光素酶等之化合物。作為賦予純化機能之分子的例,可舉例生物素、抗生物素蛋白、His標籤胜肽、GST標籤胜肽、FLAG標籤胜肽等之化合物。
又,由將單股寡核苷酸特異性高且有效率地送達至標的部位(例如,標的細胞),且因該單股寡核苷酸非常有效地抑制標的基因之表現的觀點來看,作為機能性分子,鍵結有具有將單股寡核苷酸送達至標的部位之機能的分子較佳。該具有送達機能的分子,可參照例如European Journal of Pharmaceuticals and Biofermatics、107卷、321~340頁(2016年),Advanced Drug Delivery Reviews、104卷、78~92頁(2016年),Expert Opinion on Drug Delivery、11卷、791~822頁(2014年)等。
作為賦予送達至標的RNA之機能的分子,例如由可特異性高且有效率地將單股寡核苷酸送達至肝臓等的觀點來看,可舉例脂質、糖。作為如此之脂質,可舉例膽固醇;脂肪酸;維生素E(生殖酚類、參雙鍵生殖酚類)、維生素A、維生素D、維生素K等之脂溶性維生素;醯基肉鹼、醯基CoA等之中間代謝物;糖脂質;甘油酯;該等之衍生物等。此等之中,由安全性更高的觀點來看,膽固醇、維生素E(生殖酚類、參雙鍵生殖酚類) 較佳。其中,生殖酚類更佳,生殖酚再更佳,α-生殖酚特佳。作為糖,可舉例與唾液酸糖蛋白受體具有相互作用之糖衍生物。
「唾液酸糖蛋白受體」存在於肝臓細胞表面,辨識唾液酸糖蛋白之半乳糖殘基,具有將該分子攝入細胞內分解的作用。「與唾液酸糖蛋白受體進行相互作用之糖衍生物」,為具有類似半乳糖殘基的構造,且藉由與唾液酸糖蛋白受體之相互作用而被攝入細胞內的化合物較佳,可舉例例如GalNac(N-乙醯半乳胺糖)衍生物、半乳糖衍生物及乳糖衍生物。又,在可特異性高且有效率地將本發明之單股寡核苷酸送達至腦的觀點中,作為「機能性分子」,可舉例糖(例如葡萄糖、蔗糖等)。又,在藉由與各臓器之細胞表面擁有的各種蛋白質進行相互作用,可特異性高且有效率地將單股寡核苷酸送達至該臓器的觀點中,作為「機能性分子」,可舉例受體之配體、抗體、該等之片段之胜肽或蛋白質。
機能性分子,與第一寡核苷酸、第二寡核苷酸、第三寡核苷酸、第四寡核苷酸或第五寡核苷酸之鍵結所中介的鏈接序列,作為單股寡核苷酸分子可發揮機能性分子所具有的機能即可,故只要是使該機能性分子與該寡核苷酸穩定鍵結的鏈接序列便無特別限定。作為該鏈接序列,雖可舉例例如源自核苷酸數為2~20之寡核苷酸的基、源自胺基酸數為2~20之多肽鏈的基、碳數為2~20之伸烷基及碳數為2~20之伸烯基等,但較佳為C2-20伸烷 基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基,各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基,各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2-置換)。此處,組合前述取代與置換,鏈接序列亦可包含-C(O)-O-、-O-C(O)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-C(O)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-C(S)-NR1-(R1表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-NR1-C(O)-NR1-(R1各自獨立表示氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)等所示之基。
鏈接序列更佳為C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或被羥基或被保護之羥基取代),再更佳為C8-12伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或被羥基取代),特佳為1,8-伸辛基。又作為其他態樣,鏈接序列特佳為下述式(III)所示之基。
Figure 106103330-A0202-12-0071-127
式中,一個*表示與源自寡核苷酸的基的鍵 結位置(構成核苷酸之原子),另一個*表示與源自機能性分子的基的鍵結位置(構成源自機能性分子的基之原子)。
作為其他態樣,鏈接序列更佳為C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-或-NRB-(RB為氫原子或C1-6烷基)置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或為未取代,或被側氧基取代),再更佳為式-N(H)C(O)-(CH2)e-N(H)C(O)-(CH2)e-C(O)-(式中e各自獨立為1至6之整數)所示之基,特佳為-N(H)C(O)-(CH2)2-N(H)C(O)-(CH2)2-C(O)-所示之基。
由於前述「被保護之羥基」之保護基,只要在使機能性分子與寡核苷酸鍵結時為穩定即可,故無特別限定。可舉例例如有機合成中之保護基(PROTECTIVE GROUPS IN ORGANIC SYNTHESIS),第3版,約翰威立(JOHN WILLY & SONS)出版(1999年)等所記載之任意的保護基。具體而言,可舉例甲基、苄基、p-甲氧基苄基、tert-丁基、甲氧基甲基、甲氧基乙基、2-四氫哌喃基、乙氧基乙基、氰基乙基、氰基乙氧基甲基、苯基胺甲醯基、1,1-二側氧硫嗎啉-4-硫胺甲醯基、乙醯基、三甲基乙醯基、苯甲醯基、三甲基矽烷基、三乙基矽烷基、三異丙基矽烷基、tert-丁基二甲基矽烷基、〔(三異丙基矽烷基)氧基〕甲基(Tom)基、1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基(Cpep)基、三苯基甲基(三苯甲基)基、單甲 氧基三苯甲基、二甲氧基三苯甲基(DMTr)基、三甲氧基三苯甲基、9-苯基二苯并哌喃-9-基(Pixyl)基、9-(p-甲氧基苯基)二苯并哌喃-9-基(MOX)基等。「被保護之羥基」的保護基,較佳為苯甲醯基、三甲基矽烷基、三乙基矽烷基、三異丙基矽烷基、tert-丁基二甲基矽烷基、三苯基甲基(三苯甲基)基、單甲氧基三苯甲基、二甲氧基三苯甲基、三甲氧基三苯甲基、9-苯基二苯并哌喃-9-基或9-(p-甲氧基苯基)二苯并哌喃-9-基,更佳為單甲氧基三苯甲基、二甲氧基三苯甲基或三甲氧基三苯甲基,進而更佳為二甲氧基三苯甲基。
作為用於核酸醫藥品的較佳單股寡核苷酸可舉例以下所示者。
1)一種單股寡核苷酸,其係式X-L-Y所表示,X-L-Y(式中,X係源自第一寡核苷酸的基,該第一寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸的7~100個核苷酸所構成者,Y係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~100個核苷酸所構成之第二寡核苷酸的基,L係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第二寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解之第三寡核苷酸的基,第三寡核苷酸包含磷酸二酯鍵, 前述第一寡核苷酸具有核苷酸序列X,前述第二寡核苷酸具有核苷酸序列Y,前述核苷酸序列X包含可與第二寡核苷酸之至少一部分雜交且含有被RNaseH所辨識之至少4個連續的核苷酸的第一核苷酸序列,前述核苷酸序列Y包含可與第一寡核苷酸之至少一部分雜交且含有至少1個核糖核苷酸的第二核苷酸序列,前述核苷酸序列X及核苷酸序列Y之至少一者,包含至少1個可與標的RNA雜交之反義序列,具有2個以上前述反義序列時,個別的反義序列部分所雜交的標的RNA可相同亦可不同),X與Y為以第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分雜交。
2)如1)所記載之單股寡核苷酸,其中X以3’側與L鍵結,Y以5’側與L鍵結。
3)如1)所記載之單股寡核苷酸,其中X以5’側與L鍵結,Y以3’側與L鍵結。
4)如1)至3)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述反義序列與標的RNA序列之互補性為70%以上。
5)如1)至4)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列與第二核苷酸序列之互補性為70%以上。
6)如1)至5)中任1項所記載之單股寡核苷 酸,其中前述式X-L-Y所示之單股寡核苷酸所含之核苷酸,以獨立選自由磷酸二酯鍵、硫代磷酸酯鍵、甲基膦酸酯鍵、甲基硫代膦酸酯鍵、二硫代膦酸酯鍵及胺基膦酸酯鍵所成群組中之至少一種互相連結。
7)如1)至6)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-L-Y所示之單股寡核苷酸所含之各核苷酸,以獨立選自磷酸二酯鍵及硫代磷酸酯鍵中之至少一種互相連結。
8)如1)至8)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸所含之核苷酸以磷酸二酯鍵互相連結。
9)如1)至8)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸係由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之3~10個核苷酸所構成。
10)如1)至9)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸係由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之4~7個核苷酸所構成。
11)如1)至10)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為寡去氧核糖核苷酸或寡核糖核苷酸。
12)如1)至11)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為DNA或RNA。
13)如1)至12)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為RNA。
14)如1)至13)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列 部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
15)如1)至14)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
16)如1)至15)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為包含彼此以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
17)如1)至16)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
18)如1)至17)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為由4~20個去氧核糖核苷酸所構成之序列。
19)如1)至18)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列係包含被RNaseH所切斷之至少4個連續的核苷酸之序列。
20)如1)至19)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列為由4~25個核糖核苷酸所構成之序列。
21)如1)至20)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
22)如1)至21)中任1項所記載之單股寡核苷酸,第二寡核苷酸包含磷酸二酯鍵。
23)如1)至22)中任1項所記載之單股寡核苷酸, 其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
24)如1)至23)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列為包含彼此以磷酸二酯鍵連結之核苷酸的序列。
25)如1)至24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X包含至少1個糖部修飾核苷酸,前述核苷酸序列X包含至少1個反義序列。
26)如25)所記載之單股寡核苷酸,其中前述第一核苷酸序列為前述反義序列。
27)如25)或26)所記載之單股寡核苷酸,其中前述第一核苷酸序列為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續之核苷酸的序列。
28)如25)至27)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之糖部修飾核苷酸。
29)如25)至28)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述第一寡核苷酸所含之核苷酸以硫代磷酸酯鍵互相連結。
30)如25)至29)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列為由4~20個核糖核苷酸所構成之序列。
31)如25)至30)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方 與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
32)如25)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X在前述反義序列部分與L之間具有前述第一核苷酸序列部分。
33)如32)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X在前述第一核苷酸序列部分與前述反義序列部分之間包含在生理條件下被分解之寡核苷酸。
34)如33)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X所含之在生理條件下被分解之寡核苷酸為由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之2~10個核苷酸所構成。
35)如33)或34)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X所含之在生理條件下被分解之寡核苷酸中所含之核苷酸,係以磷酸二酯鍵互相連結。
36)如33)至35)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述X所含之在生理條件下被分解之寡核苷酸為由2~7個核苷酸所構成之DNA或RNA。
37)如32)至36)中任1項所記載之單股寡核苷酸,前述X所含之反義序列部分包含硫代磷酸酯鍵。
38)如32)至37)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為包含彼此以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
39)如32)至38)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述X所含之 反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸。
40)如32)至39)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述X所含之反義序列部分之5’側及3’側之糖部修飾核苷酸。
41)如39)或40)所記載之單股寡核苷酸,其中鄰接鍵結於前述X所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸,與前述X所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方以硫代磷酸酯鍵連結。
42)如32)至41)所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為由獨立選自糖部修飾核苷酸及去氧核糖核苷酸之4~30個核苷酸所構成之序列。
43)如32)至42)所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
44)如32)至43)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
45)如32)至44)所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為由4~20個去氧核糖核苷酸所構成之序列。
46)如32)至43)中任1項所記載之單股寡 核苷酸,其中前述X所含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
47)如46)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸之至少一方為糖部修飾核苷酸。
48)如46)或47)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸為糖部修飾核苷酸。
49)如32)至42)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X所含之反義序列為由4~30個糖部修飾核苷酸所構成之序列。
50)如32)至49)中任1項所記載之單股寡核苷酸,核苷酸序列Y包含可與前述X所含之反義序列部分之至少一部分雜交,且包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列。
51)如50)所記載之單股寡核苷酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列為由4~20個核糖核苷酸所構成之序列。
52)如50)或51)所記載之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
53)如50)至52)中任1項所記載之單股寡核苷 酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
54)如32)至53)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
55)如1)至28)及32)至53)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y包含至少1個反義序列。
56)如55)所記載之單股寡核苷酸,前述Y在前述反義序列部分與L之間具有前述第二核苷酸序列部分。
57)如55)或56)所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側與鄰接之核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
58)如55)至57)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列部分包含硫代磷酸酯鍵。
59)如55)至58中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列為包含彼此以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
60)如55)至59)中任1項所記載之單股寡核苷酸,第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述Y所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸。
61)如55)至60)中任1項所記載之單股寡核苷 酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述Y所含之反義序列部分之5’側及3’側之糖部修飾核苷酸。
62)如60)或61)所記載之單股寡核苷酸,其中鄰接鍵結於前述Y所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸,與前述Y所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方以硫代磷酸酯鍵連結。
63)如55)至62)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y所含之反義序列為由獨立選自糖部修飾核苷酸及去氧核糖核苷酸之4~30個核苷酸所構成之序列。
64)如55)至63)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
65)如55)至64)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y所含之反義序列為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
66)如55)至65)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列為由4~20個去氧核糖核苷酸所構成之序列。
67)如55)至63)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
68)如67)所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸之至少一方為糖部修飾核苷酸。
69)如67)或68)所記載之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸為糖部修飾核苷酸。
70)如55)至63)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y所含之反義序列為由4~30個糖部修飾核苷酸所構成之序列。
71)如55)至70)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X包含可與前述Y所含之反義序列部分之至少一部分雜交,且包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列。
72)如71)所記載之單股寡核苷酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列為由4~20個核糖核苷酸所構成之序列。
73)如71)或72)所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
74)如71)至73)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少一方,與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
75)如1)至74)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中進一步包含式X’-L’-所示之基,X’-L’-(式中,X’係源自第四寡核苷酸的基,該第四寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸的7~100個核苷酸所構成者,L’係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第四寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解之第五寡核苷酸的基,前述第四寡核苷酸具有核苷酸序列X’,核苷酸序列X’包含可與標的RNA雜交之反義序列)。
76)如75)所記載之單股寡核苷酸,其中X’包含5’端或3’端。
77)如75)或76)所記載之單股寡核苷酸,其中核苷酸序列X’所含之反義序列與標的RNA序列的互補性為70%以上。
78)如75)至77)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X’-L’-X-L-Y所示之單股寡核苷酸所含之核苷酸係各自獨立以選自磷酸二酯鍵、硫代磷酸酯鍵、甲基膦酸酯鍵、甲基硫代膦酸酯鍵、二硫代膦酸酯鍵及胺基膦酸酯鍵所成群組中之至少一種互相連結。
79)如75)至78)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X’-L’-X-L-Y所示之單股寡核苷酸所含之各核 苷酸係各自獨立以選自磷酸二酯鍵及硫代磷酸酯鍵中之至少一種互相連結。
80)如75)至79)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸包含磷酸二酯鍵。
81)如75)至80)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸所含之核苷酸係以磷酸二酯鍵互相連結。
82)如75)至81)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸係由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之3~10個核苷酸所構成。
83)如75)至82)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為由3~7個核苷酸所構成之寡去氧核糖核苷酸或寡核糖核苷酸。
84)如75)至83)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為由4或5個核苷酸所構成之寡去氧核糖核苷酸或寡核糖核苷酸。
85)如75)至84)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為DNA或RNA。
86)如75)至85)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為RNA。
87)如75)至86)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
88)如75)至87)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X’所含之反義序列為包含彼此 以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
89)如75)至88)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸所含之核苷酸以硫代磷酸酯鍵互相連結。
90)如75)至89)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述X’所含之反義序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸。
91)如75)至90)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述X’所含之反義序列部分之5’側及3’側之糖部修飾核苷酸。
92)如75)至91)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X’所含之反義序列為由獨立選自糖部修飾核苷酸及去氧核糖核苷酸之4~30個核苷酸所構成之序列。
93)如75)至92)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X’所含之反義序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
94)如75)至93)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X’包含至少1個糖部修飾核苷酸,核苷酸序列X’所含之反義序列為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
95)如75)至94)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X’所含之反義序列為由4~20個 去氧核糖核苷酸所構成之序列。
96)如75)至93)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述X’所含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
97)如96)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X’所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸之至少一方為糖部修飾核苷酸。
98)如96)或97)所記載之單股寡核苷酸,其中前述X’所含之反義序列部分之3’側的核苷酸及5’側的核苷酸為糖部修飾核苷酸。
99)如75)至92)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X’所含之反義序列為由4~30個糖部修飾核苷酸所構成之序列。
100)如75)至99)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中核苷酸序列Y包含可與前述X’所含之反義序列部分之至少一部分雜交,且包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列。
101)如100)所記載之單股寡核苷酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列為由4~20個核糖核苷酸所構成之序列。
102)如100)或101)所記載之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少 一方之糖部修飾核苷酸。
103)如100)至102)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述包含被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸的序列部分之5’側及3’側之至少一方,與鄰接的核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
104)如1)至74)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X包含5’端或3’端。
105)如1)至103)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y包含5’端或3’端。
106)如1)至103)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中進一步包含源自機能性分子的基,該機能性分子具有選自由標識機能、純化機能及送達至標的RNA的機能所成群組中之至少1種的機能。
107)如1)至103)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基直接或間接鍵結於第二寡核苷酸。
108)如1)至103)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基直接或間接鍵結於第一寡核苷酸。
109)如106)至108)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基,透過C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所 取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換)或直接藉由共價鍵,與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸鍵結。
110)如106)至109)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基所連結之C2-20伸烷基或C2-20伸烯基與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸,以磷酸二酯鍵或經修飾之磷酸二酯鍵連結。
111)如106)至110)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基所連結之C2-20伸烷基或C2-20伸烯基與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸,以磷酸二酯鍵連結。
112)如106)至111)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係由糖、脂質、胜肽及蛋白質及該等之衍生物所成群組中選擇。
113)如106)至112)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為選自膽固醇、脂肪酸、脂溶性維生素、糖脂質及甘油酯所成群組中之脂質。
114)如106)至113)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為選自由膽固醇、生殖酚及參雙鍵生殖酚所成群組中之脂質。
115)如106)至114)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為生殖酚,生殖酚之羥基透過C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或 被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基)與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸鍵結。
116)如115)所記載之單股寡核苷酸,其中生殖酚之羥基透過1,8-伸辛基與第一寡核苷酸或第二寡核苷酸鍵結。
117)如106)至112)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係與唾液酸糖蛋白受體進行相互作用之糖衍生物。
118)如106)至112)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由受體之配體及抗體所成群中之胜肽或蛋白質。
119)如1)至118)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中糖部修飾核苷酸係各自獨立為2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸、2’-O-胺基丙基化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸、橋接化核苷酸或2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸。
120)如1)至119)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中糖部修飾核苷酸係各自獨立為2’-O-甲基化核苷酸或LNA。
121)如75)所記載之單股寡核苷酸,其中包含式X’-L’-X-所示之部分構造,該部分構造為式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-所示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-(式中,X’1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核 苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X’2為X’所含之反義序列部分,X’3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第五寡核苷酸共價鍵結,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸之2~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2為第一核苷酸序列部分,前述第一核苷酸序列為反義序列,且為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,X3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結)。
122)如121)所記載之單股寡核苷酸,其中X’1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
123)如121)或122)所記載之單股寡核苷酸,X’1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
124)如121)至123)中任1項所記載之單股寡核苷酸,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由獨立選自LNA中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
125)如75)所記載之單股寡核苷酸,其中包含式X’Z-L’-X-所示之部分構造,該部分構造為式X’Z-I’-X1-X2-X3-所示,X’Z-L’-X1-X2-X3-(式中,X’Z係包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈的反義序列部分,與第五寡核苷酸共價鍵結,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,前述第一核苷酸序列係 反義序列,且為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,X3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結)。
126)如125)所記載之單股寡核苷酸,其中X’Z係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸中之2至5個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
127)如125)或126)所記載之單股寡核苷酸,其中X’Z係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
128)如125)或126)所記載之單股寡核苷酸,其中X’Z係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及LNA中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
129)如121)至128)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所 構成之寡核苷酸的基。
130)如121)至129)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
131)如121)至130)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自LNA中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
132)如1)至24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式X4-X5-X1-X2-X3-所示,X4-X5-X1-X2-X3-(式中,X4係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X5係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~20個核苷酸所構成,且包含至少1個核糖核苷酸之寡核苷酸的基,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含 至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,前述第一核苷酸序列係反義序列,且為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,X3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結)。
133)如132)所記載之單股寡核苷酸,其中X4係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X5係源自由10~19個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
134)如132)或133)所記載之單股寡核苷酸,其中X4係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及 2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
135)如132)至134)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
136)如1)~24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式X1-X2-X3-所示,X1-X2-X3-(式中,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,前述第一核苷酸序列係反義序列,且為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,X3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結)。
137)如136)所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自獨立選自糖部修飾核 苷酸中之2個或3個之寡核苷酸的基。
138)如136)或137)所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
139)如136)至138)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
140)如1)至24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式XZ 1-XZ 2-XZ 3-X0-X2-所示,XZ 1-XZ 2-XZ 3-X0-X2-(式中,XZ 1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,XZ 2包含X所含之反義序列部分,XZ 3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X0係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸 中之2至7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,與第三寡核苷酸共價鍵結)。
141)如140)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ 1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,XZ 2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,XZ 3係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~17個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
142)如140)或141)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ 1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,XZ 3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
143)如140)至142)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中XZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,XZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
144)如1)至24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式XZ-X0-X2-所示,XZ-X0-X2- (式中,XZ係包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈的反義序列部分,X0係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2至7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,與第三寡核苷酸共價鍵結)。
145)如144)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X0係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸中之2至5個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~17個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
146)如144)或145)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
147)如144)或145)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及LNA中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
148)如1)至24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式X1-X2-所示,X1-X2- (式中,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,與第三寡核苷酸共價鍵結)。
149)如148)所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~12個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
150)如148)或149)所記載之單股寡核苷酸,X1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
151)如148)至150)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
152)如1)至24)及121)至147)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式-Y所示之部分構造為式-Y2-Y1所示,-Y2-Y1(式中,Y2係第二核苷酸序列部分,係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~20個核苷酸所構成,且包含至少1個核糖核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結, Y1係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基)。
153)如152)所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
154)如152)或153)所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
155)如152)至154)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
156)如1)至24)及121)至147)中任1項所記載之單股寡核苷酸,式-Y所示之部分構造為式-Y2-Y1所示,-Y2-Y1(式中,Y2係源自包含第二核苷酸序列部分,由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~40個核苷酸所構成,且包含至少1個核糖核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結,Y1係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至 少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基)。
157)如156)所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由25~36個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
158)如156)或157)所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
159)如156)至158)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
160)如1)至24)及121)至151)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式-Y所示之部分構造為式-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1所示,-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1(式中,Y0係第二核苷酸序列部分,與第三寡核苷酸共價鍵結,YZ 3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,YZ 2係Y所含之反義序列部分,YZ 1係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至 少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基)。
161)如160)所記載之單股寡核苷酸,Y0係源自由10~22個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 1係源自由獨立選自糖部修飾核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
162)如160)或161)所記載之單股寡核苷酸,其中YZ 1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
163)如160)至162)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
164)如1)至24)及121)至151)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式-Y所示之部分構造為式-Y0-YZ所示,-Y0-YZ(式中,Y0係第二核苷酸序列部分,與第三寡核苷酸共價鍵結, YZ係包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈的反義序列部分)。
165)如164)所記載之單股寡核苷酸,Y0係源自由10~22個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
166)如164)或165)所記載之單股寡核苷酸,其中YZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
167)如164)或165)所記載之單股寡核苷酸,其中YZ係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及LNA中之6至30個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-1)一種單股寡核苷酸,其係式X-L-Y所表示,X-L-Y(式中,X係源自第一寡核苷酸的基,該第一寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之7~100個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸,第一寡核苷酸具有可與標的RNA雜交之第一核苷酸序列,第一核苷酸序列係包含與前述標的RNA雜交時被 RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,Y係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~100個核苷酸所構成之第二寡核苷酸的基,第二寡核苷酸具有可與前述第一寡核苷酸雜交,且包含至少1個核糖核苷酸之第二核苷酸序列,L係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第二寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解之第三寡核苷酸的基,第三寡核苷酸包含磷酸二酯鍵),X與Y以前述第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交。
B-2)如B-1)所記載之單股寡核苷酸,其中X以3’側與L鍵結,Y以5’側與L鍵結。
B-3)如B-1)所記載之單股寡核苷酸,其中X以5’側與L鍵結,Y以3’側與L鍵結。
B-4)如B-1)至B-3)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列與標的RNA序列的互補性為70%以上。
B-5)如B-1)至B-4)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列與第二核苷酸序列之互補性為70%以上。
B-6)如B-1)至B-5)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸所含之核苷酸以磷酸二酯鍵互相連結。
B-7)如B-1)至B-6)中任1項所記載之單股寡核苷 酸,其中第三寡核苷酸係由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之3~10個核苷酸所構成。
B-8)如B-1)至B-7)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為寡去氧核糖核苷酸或寡核糖核苷酸。
B-9)如B-1)至B-8)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為DNA或RNA。
B-10)如B-1)至B-9)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為RNA。
B-11)如B-1)至B-10)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為由4或5個腺苷所構成之寡核苷酸。
B-12)如B-1)至B-11)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
B-13)如B-1)至B-12)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側的糖部修飾核苷酸。
B-14)如B-1)至B-13)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
B-15)如B-1)至B-14)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為包含彼此以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
B-16)如B-1)至B-15)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸所含之核苷酸以硫代磷酸酯鍵互相連結。
B-17)如B-1)至B-16)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
B-18)如B-1)至B-17)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列為由4~20個去氧核糖核苷酸所構成之序列。
B-19)如B-1)至B-18)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列係包含被RNaseH所切斷之至少4個連續的核苷酸之序列。
B-20)如B-1)至B-19)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列為由4~20個核糖核苷酸所構成之序列。
B-21)如B-19)或B-20)所記載之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
B-22)如B-19)至B-21)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
B-23)如B-1)至B-22)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y包含5’端或3’端。
B-24)如B-1)至B-22)中任1項所記載之單 股寡核苷酸,其中進一步包含源自機能性分子的基,該機能性分子具有選自由標識機能、純化機能及送達至標的RNA的機能所成群組中之至少1種之機能。
B-25)如B-24)所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基直接或間接鍵結於第二寡核苷酸。
B-26)如B-24)或B-如25)所記載之單股寡核苷酸,其中前述源自機能性分子的基透過C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換)或直接藉由共價鍵,鍵結於第二寡核苷酸。
B-27)如B-24)至B-26)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係由糖、脂質、胜肽及蛋白質及該等之衍生物所成群中所選擇。
B-28)如B-24)至B-27)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由膽固醇、脂肪酸、脂溶性維生素、糖脂質及甘油酯所成群組中之脂質。
B-29)如B-24)至B-28)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由膽固醇、生殖酚及參雙鍵生殖酚所成群組中之脂質。
B-30)如B-24)至B-29)中任1項所記載之單股寡 核苷酸,其中前述機能性分子包含生殖酚,生殖酚之羥基透過C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基)與第二寡核苷酸鍵結。
B-31)如B-24)至B-30)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子包含生殖酚,生殖酚之羥基透過1,8-伸辛基或下述式(II)
Figure 106103330-A0202-12-0109-128
(式中,一個*表示與第二寡核苷酸之鍵結位置,另一個*表示與生殖酚之鍵結位置)所示之基與第二寡核苷酸鍵結。
B-32)如B-24)至B-27)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為與唾液酸糖蛋白受體進行相互作用之糖衍生物。
B-33)如B-24)至B-27)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子為選自由受體之配體及抗體所成群組中之胜肽或蛋白質。
B-34)如B-1)至B-33)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X包含5’端或3’端。
B-35)如B-1)至B-33)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中進一步包含式X’-L’-所示之基,X’-L’- (式中X’係源自第四寡核苷酸的基,該第四寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之7~100個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸,第四寡核苷酸具有可與標的RNA雜交之第四核苷酸序列,第四核苷酸序列係包含前述與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,L’係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第四寡核苷酸共價鍵結,且在生理條件下被分解之第五寡核苷酸的基。此處,第一核苷酸序列部分所雜交的標的RNA與第四核苷酸序列部分所雜交的標的RNA可相同或不同)。
B-36)如B-35)所記載之單股寡核苷酸,其中X’包含5’端或3’端。
B-37)如B-35)或B-36)所記載之單股寡核苷酸,其中第四核苷酸序列與標的RNA序列的互補性為70%以上。
B-38)如B-35)至B-37)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸所含之核苷酸係以磷酸二酯鍵互相連結。
B-39)如B-35)至B-38)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸係由獨立選自由去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸所成群組中之3~10個核苷酸所構成。
B-40)如B-35)至B-39)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為DNA或RNA。
B-41)如B-35)至B-40)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸係由3~7個核苷酸所構成之RNA。
B-42)如B-35)至B-41)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含鄰接鍵結於第四核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方之糖部修飾核苷酸。
B-43)如B-35)至B-42)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含鄰接鍵結於第四核苷酸序列部分之5’側及3’側之糖部修飾核苷酸。
B-44)如B-35)至B-43)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
B-45)如B-35)至B-44)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四核苷酸序列為包含彼此以硫代磷酸酯鍵連結之核苷酸的序列。
B-46)如B-35)至B-45)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四寡核苷酸所含之核苷酸以硫代磷酸酯鍵互相連結。
B-47)如B-35)至B-46)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第四核苷酸序列為由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成之序列。
B-48)如B-35)至B-47)中任1項所記載之單股寡 核苷酸,其中第四核苷酸序列為由4~20個去氧核糖核苷酸所構成之序列。
B-49)如B-1)至B-48)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中糖部修飾核苷酸係各自獨立為2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸、2’-O-胺基丙基化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸、橋接化核苷酸或2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸。
B-50)如B-1)至B-49)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中糖部修飾核苷酸係各自獨立為2’-O-甲基化核苷酸或LNA。
B-51)如B-1)至B-50)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之鹼基部分係選自由腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)及5-甲基胞嘧啶(5-me-C)所成群組中之至少1種。
B-52)如B-1)至B-51)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X-所示之部分構造為式X1-X2-X3-所示,X1-X2-X3-(式中,X1係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸 及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結)。
B-53)如B-52)所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由2個或3個糖部修飾核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個糖部修飾核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-54)如B-52)或B-53)所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-55)如B-52)至B-54)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
B-56)如B-1)至B-55)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式-Y所示之部分構造為式-Y2-Y1所示,-Y2-Y1(式中,Y2係源自第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的 基,且係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~20個核苷酸所構成,且包含至少1個核糖核苷酸之寡核苷酸的基,該寡核苷酸與第三寡核苷酸共價鍵結,Y1係源自獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之1至10個核苷酸所構成,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之寡核苷酸的基)。
B-57)如B-56)所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個糖部修飾核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-58)如B-56)或B-57)所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由獨立選自LNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-59)如B-56)至B-58)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
B-60)如B-1)所記載之單股寡核苷酸,其係式X1-X2-X3-L-Y2-Y1所表示,X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且 係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1、X2、X3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-61)如B-24)所記載之單股寡核苷酸,其係式X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所表示,X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基, Y2係源自第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B為C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A為源自機能性分子的基,X1、X2、X3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-62)如B-61)所記載之單股寡核苷酸,其中B為C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
B-63)如B-60)至B-62)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸,分別以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L及L與Y2之各自的末端核苷酸,分別以磷酸二酯鍵連結。
B-64)如B-35)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1所表示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1 (式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係源自第四核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-65)如B-35)所記載之單股寡核苷酸,其係式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係源自第四核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之 寡核苷酸的基,B為C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基,X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-66)如B-65)所記載之單股寡核苷酸,其中B為C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
B-67)如B-64)至B-66)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3、X’1與X’2、X’2與X’3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y2、X’3與L’及L’與X1之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
B-68)如B-60)至B-67)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與Y1係在分子內雜交。
B-69)如B-60)至B-68)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X1之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核 苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
B-70)如B-60)至B-69)中任1項所記載之單股寡核苷酸,X3與Y2係在分子內雜交。
B-71)如B-60)至B-70)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X2-X3之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
B-72)如B-35)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1所示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係源自第四核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由2個或3個LMA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中 之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自包含第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由25~36個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-73)如B-35)所記載之單股寡核苷酸,其係式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係源自第一核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LMA所構成之寡核苷酸的基,X’2係源自第四核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且 係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自包含第二核苷酸序列部分之寡核苷酸的基,且係源自由25~36個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B為C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基,X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
B-74)如B-73)所記載之單股寡核苷酸,其中B為 C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
B-75)如B-72)至B-74)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3、X’1與X’2、X’2與X’3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y2、X’3與L’及L’與X1之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
B-76)如B-72)至B-75)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X’1與Y1係在分子內雜交。
B-77)如B-72)至B-76)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X’1之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
B-78)如B-72)至B-77)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X’2-X’3-L’-X1與Y2係在分子內雜交。
B-79)如B-72)至B-78)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X’2-X’3-L’-X1-X2-X3之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
B-80)如B-56)至B-79)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自RNA的基。
B-81)如B-56)至B-71)中任1項所記載之單股寡核苷酸,Y2係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
B-82)如B-1)至B-81)中任1項所記載之單股寡核 苷酸,其中L係源自由4~7個核苷酸所構成之DNA或RNA的基。
C-1)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係式X1-X2-X3-L-Y2-Y1所示,X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-2)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所表示,X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A (式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-3)如C-2)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取 代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-4)如C-2)或C-3)所記載之單股寡核苷酸,其中B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-5)如C-1)至C-4)所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、X3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結)。
C-6)如C-1)至C-5)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L及L與Y2之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-7)如75)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’Z-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1所表示,X’Z-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’Z係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、 2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-8)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’Z-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所表示,X’Z-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’Z係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之 寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-9)如C-8)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-10)如C-8)或C-9)所記載之單股寡核苷酸,其中B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-11)如C-7)至C-10)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、X3、X’Z及Y1所含之核苷酸 彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-12)如C-7)至C-11)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y2、X’Z與L’及L’與X1之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-13)如C-7)至C-12)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中XZ不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
C-14)如C-13)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ之3’側及5’側之至少一方的核苷酸係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-15)如C-13)或C-14)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ之3’側及5’側的核苷酸係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-16)如C-13)至C-15)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
C-17)如C-1)至C-16)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與Y1係在分子內雜交。
C-18)如C-1)至C-17)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X1之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-19)如C-1)至C-18)中任1項所記載之單股寡核 苷酸,其中X3與Y2係在分子內雜交。
C-20)如C-1)至C-19)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-21)如75)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1所表示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係X’所含之反義序列部分即第四核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第四核苷酸序列,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的 基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-22)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所表示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係X’所含之反義序列部分即第四核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸 的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第四核苷酸序列,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-23)如C-22)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-24)如C-22)或C-23)所記載之單股寡核苷酸,其中B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-25)如C-21)至C-24)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-26)如C-21)至C-25)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2、X2與X3、X’1與X’2、X’2與X’3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y2、X’3與L’及L’與X1之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-27)如C-21)至C-26)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與Y1係在分子內雜交。
C-28)如C-21)至C-27)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X1之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-29)如C-21)至C-28)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X3與Y2係在分子內雜交。
C-30)如C-21)至C-29)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-31)如75)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1所表示, X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係X’所含之反義序列部分即第四核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第四核苷酸序列,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自包含第二核苷酸序列部分,且由25~36個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基, Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-32)如106)所記載之單股寡核苷酸,係以式X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A所表示,X’1-X’2-X’3-L’-X1-X2-X3-L-Y2-Y1-B-A(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第一核苷酸序列,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X’2係X’所含之反義序列部分即第四核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,為包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列,具有反義序列即第四核苷酸序列,X’3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基, L’係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自包含第二核苷酸序列部分,且由25~36個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-33)如C-32)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-34)如C-32)或C-33)所記載之單股寡核苷酸,其中B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-35)如C-31)至C-34)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、X3、X’1、X’2、X’3及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L、L’及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-36)如C-31)至C-35)中任1項所記載之單股寡 核苷酸,其中X1與X2、X2與X3、X’1與X’2、X’2與X’3及Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y2、X’3與L’及L’與X1之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-37)如C-31)至C-36)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X’1與Y1係在分子內雜交。
C-38)如C-31)至C-37)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X’1之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-39)如C-31)至C-38)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中式X’2-X’3-L’-X1-X2所示之部分構造與Y2係在分子內雜交。
C-40)如C-31)至C-39)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X’2-X’3-L’-X1-X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-41)如C-1)至C-30)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-42)如C-31)至C-40)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由25~36個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-43)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X1-X2-L-Y0-YZ所表示, X1-X2-L-Y0-YZ(式中,X1係源自獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~12個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,係源自由10~15個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ係源自由包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-44)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式A-B-X1-X2-L-Y0-YZ所表示,A-B-X1-X2-L-Y0-YZ(式中,A係源自機能性分子的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),X1係源自由獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之 2個或3個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~12個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由10~15個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-45)如C-44)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-46)如C-44)或C-45)所記載之單股寡核苷酸,其中B與X1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-47)如C-43)至C-46)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、YZ所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L及Y0所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-48)如C-43)至C-47)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X2與L、L與Y0及Y0與YZ之各自的末端核 苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-49)如C-43)至C-48)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y0係在分子內雜交。
C-50)如C-43)至C-49)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X1-X2所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y0之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-51)如C-43)至C-50)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y0係源自由10~15個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-52)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X1-X2-X3-L-Y0-YZ所表示,X1-X2-X3-L-Y0-YZ(式中,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由12~16個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷 酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-53)如C-52)所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係反義序列,且係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
C-54)如C-52)或C-53)所記載之單股寡核苷酸,其中X1、X2、X3及YZ所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,L及Y0所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-55)如C-52)至C-54)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X1與X2及X2與X3之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X3與L、L與Y0及Y0與YZ之各自的末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-56)如C-52)至C-如55)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y0係在分子內雜交。
C-57)如C-52)至C-56)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X1-X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y0之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-58)如C-52)至C-57)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y0係源自由12~16個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-59)如C-43)至C-58)中任1項所記載之 單股寡核苷酸,其中式-YZ所示之部分構造以式-YZ 3-YZ 2-YZ 1所表示,YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,YZ 2係Y所含之反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
C-60)如C-43)至C-58)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中YZ不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
C-61)如C-60)所記載之單股寡核苷酸,其中YZ之3’側及5’側之至少一方的核苷酸係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-62)如C-60)或C-61)所記載之單股寡核苷酸,其中YZ之3’側及5’側的核苷酸係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-63)如C-60)至C-62)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中YZ係源自由獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
C-64)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1所表示,X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1(式中,X4係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構 成之寡核苷酸的基,X5係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由12~16個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,YZ 2係Y所含之反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基)。
C-65)如C-64)所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係反義序列,且係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
C-66)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式A-B-X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1所表示, A-B-X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1(式中,A係源自機能性分子的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),X4係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X5係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由12~16個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基, YZ 2係Y所含之反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基)。
C-67)如C-66)所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係反義序列,且係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
C-68)如C-66)或C-67)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-69)如C-66)至C-68)中任1項所記載之單股寡核苷酸,B與X4之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-70)如C-64)至C-69)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4、X1、X2、X3、YZ 3、YZ 2及YZ 1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,X5、L及Y0所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-71)如C-64)至C-70)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4與X5、X1與X2、X2與X3之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X5與X1、X3與L、L與Y0及Y0與YZ 3之各自的末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-72)如C-64)至C-71)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y0係在分子內雜交。
C-73)如C-64)至C-72)中任1項所記載之單股寡 核苷酸,其中構成式X1-X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y0之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-74)如C-64)至C-73)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X5與YZ 2係在分子內雜交。
C-75)如C-64)至C-74)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X5之核苷酸的鹼基序列與構成式YZ 2-YZ 3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-76)如C-64)至C-如75)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4與YZ 1係在分子內雜交。
C-77)如C-64)至C-76)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X4之核苷酸的鹼基序列與構成YZ 1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-78)如C-64)至C-77)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X5係源自由10~13個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-79)如C-52)至C-78)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y0係源自由12~16個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-80)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1所表示,X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1(式中,X4係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構 成之寡核苷酸的基,X5係源自由12~19個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由14~22個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,YZ 2係Y所含之反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基)。
C-81)如C-74)所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係反義序列,且係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
C-82)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式A-B-X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-YZ 2-YZ 1所表示, A-B-X4-X5-X1-X2-X3-L-Y0-YZ 3-yZ 2-YZ 1(式中,A係源自機能性分子的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),X4係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X5係源自由12~19個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y0係第二核苷酸序列部分,且係源自由14~22個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基, YZ 2係Y所含之反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,YZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基)。
C-83)如C-82)所記載之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序列係反義序列,前述反義序列係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
C-84)如C-82)或C-83)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-85)如C-82)至C-84)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中B與X4之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-86)如C-80)至C-85)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4、X1、X2、X3、YZ 3、YZ 2及YZ 1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,X5、L及Y0所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-87)如C-80)至C-86)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4與X5、X1與X2、X2與X3之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,X5與X1、X3與L、L與Y0及Y0與YZ 3之各自的末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-88)如C-80)至C-87)中任1項所記載之單股寡核苷,其中X2與Y0係在分子內雜交。
C-89)如C-80)至C-88)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成式X1-X2-X3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列與構成Y0之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-90)如C-80)至C-89)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X5與YZ 2係在分子內雜交。
C-91)如C-80)至C-90)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X5之核苷酸的鹼基序列與構成式YZ 2-YZ 3所示之部分構造之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-92)如C-80)至C-91)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X5之一部分與Y0之一部分係在分子內雜交。
C-93)如C-80)至C-92)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X5之一部分之核苷酸的鹼基序列與構成Y0之一部分之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-94)如C-80)至C-93)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X4與YZ 1係在分子內雜交。
C-95)如C-80)至C-94)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X4之核苷酸的鹼基序列與構成YZ 1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-96)如C-80)至C-95)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X5係源自由12~19個核糖核苷酸所 構成之RNA的基。
C-97)如C-80)至C-96)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y0係源自由14~22個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-98)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式XZ-X0-X2-L-Y2-Y1所表示,XZ-X0-X2-L-Y2-Y1(式中,XZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X0係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~5個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~17個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由8~19個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-99)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式XZ-X0-X2-L-Y2-Y1-B-A所表示,XZ-X0-X2-L-Y2-Y1-B-A (式中,XZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X0係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~5個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係第一核苷酸序列部分,且係源自由8~17個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係第二核苷酸序列部分,且係源自由8~19個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-100)如C-99)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取 代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-101)如C-99)或C-100)所記載之單股寡核苷酸,其中B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-102)如C-98)至C-101)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中XZ、X2及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,X0、L及Y2所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-103)如C-98)至C-102)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y2與Y1之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,XZ與X0、X0與X2、X2與L及L與Y2之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-104)如C-98)至C-103)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X0與Y1係在分子內雜交。
C-105)如C-98)至C-104)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X0之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-106)如C-98)至C-105)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y2係在分子內雜交。
C-107)如C-98)至C-如106)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X2之核苷酸的鹼基序列與Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-108)如C-98)至C-107)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
C-109)如C-98)至C-108)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ之3’端及5’端之至少一方的核苷酸,係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-110)如C-98)至C-109)所記載之單股寡核苷酸,XZ之3’端及5’端的核苷酸,係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-111)如C-98)至C-107)所記載之單股寡核苷酸,其中式XZ-所示之部分構造係以式XZ 1-XZ 2-XZ 3-所表示,XZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,XZ 2係反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,XZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
C-112)如C-98)至C-107)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
C-113)如C-98)至C-112)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y2係源自由8~19個核糖核苷酸所構成之RNA的基。
C-114)如1)所記載之單股寡核苷酸,其係以式XZ-X2-X3-L-Y3-Y2-Y1所表示,XZ-X2-X3-L-Y3-Y2-Y1 (式中,XZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由獨立選自核糖核苷酸中之4~8個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X3係第一核苷酸序列部分,且係源自由4~8個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y3係第二核苷酸序列部分,且係源自由4~8個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自由4~8個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基)。
C-115)如106)所記載之單股寡核苷酸,其係以式XZ-X2-X3-L-Y3-Y2-Y1-B-A所表示,XZ-X2-X3-L-Y3-Y2-Y1-B-A(式中,XZ係源自包含反義序列部分,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者,且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,X2係源自由獨立選自核糖核苷酸中之4~8個核苷酸 所構成之寡核苷酸的基,X3係第一核苷酸序列部分,係源自由4~8個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,L係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y3係第二核苷酸序列部分,係源自由4~8個核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y2係源自由4~8個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,Y1係源自由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之寡核苷酸的基,B係C2-20伸烷基或C2-20伸烯基(該伸烷基及伸烯基所含之亞甲基係各自獨立為未取代,或被選自由鹵素原子、羥基、被保護之羥基、側氧基及硫酮基所成群組中1個以上之取代基所取代。又,該伸烷基及伸烯基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-、-NRB-(RB為氫原子、C1-6烷基或鹵C1-6烷基)、-S-、-S(O)-或-S(O)2所置換),A係源自機能性分子的基)。
C-116)如C-99)所記載之單股寡核苷酸,其中B係C2-20伸烷基(該伸烷基之亞甲基各自獨立未經置換,或被-O-置換。未經置換之亞甲基各自獨立為未取代,或取代成羥基),A係源自生殖酚的基。
C-117)如C-115)或C-116)所記載之單股寡核苷酸,B與Y1之末端核苷酸以磷酸二酯鍵連結。
C-118)如C-114)至C-117)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中XZ、X3、Y2及Y1所含之核苷酸彼此以硫代磷酸酯鍵連結,X2、L及Y3所含之核苷酸彼此以磷酸二酯鍵連結。
C-119)如C-114)至C-118)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中Y3與Y2、Y2與Y1及X2與X3之各自的末端核苷酸係以硫代磷酸酯鍵連結,XZ與X3、X3與L及L與Y3之各自的末端核苷酸係以磷酸二酯鍵連結。
C-120)如C-114)至C-119)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y2係在分子內雜交,X3與Y3係在分子內雜交。
C-121)如C-114)至C-120)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中構成X2之核苷酸的鹼基序列與構成Y2之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上,構成X3之核苷酸的鹼基序列與構成Y3之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-122)如C-114)至C-121)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中X2與Y1係在分子內雜交。
C-123)如C-114)至C-122)中任1項所記載之單股寡核苷酸,構成X2之核苷酸的鹼基序列與構成Y1之核苷酸的鹼基序列的互補性為70%以上。
C-124)如C-114)至C-123)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
C-125)如C-114)至C-124)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ之3’端及5’端之至少一方的核苷酸,係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-126)如C-114)至C-125)所記載之單股寡核苷酸,其衝XZ之3’端及5’端的核苷酸,係獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸。
C-127)如C-114)至C-123)所記載之單股寡核苷酸,其中式XZ-所示之部分構造係以式XZ 1-XZ 2-XZ 3-所表示,XZ 1係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基,XZ 2係反義序列部分,且係源自由8~10個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸的基,XZ 3係源自由2個或3個LNA所構成之寡核苷酸的基。
C-128)如C-114)至C-123)所記載之單股寡核苷酸,其中XZ係源自由獨立選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之寡核苷酸的基。
C-129)如1)至167)及C-1)至C-128)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之鹼基部分,係選自由腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)及5-甲基胞嘧啶(5-me-C)所成群組中之至少1種。
C-130)如1)至167)及C-1)至C-129)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中L係源自由4~7個核苷酸所構成之DNA或RNA的基。
C-131)如1)至167)及C-1)至C-130)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4或5個核苷酸所構成。
C-132)如1)至167)及C-1)至C-131)中任1項所記載之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸係由腺苷所構成之寡核苷酸。
D-1)一種醫藥,其含有如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸作為有效成分。
D-2)一種醫藥,其含有如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸作為有效成分。
將第一核苷酸序列係反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之如B-60)或C-1)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖1。圖1所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、及由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所 構成之Y1。X1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖1中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X3與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將第一核苷酸序列係反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之B-61)或C-2)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖2。圖2所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1、C2-20伸烷基等之B、及源自機能性分子的基之A。X1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖2中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X3與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將第一核苷酸序列係反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之B-64)或C-21)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖3。圖3所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個 LNA所構成之X’1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第四核苷酸序列之X’2、由2或3個LNA所構成之X’3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之L’、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、及由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1。X’1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖3中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X3與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將第一核苷酸序列係反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之B-65)或C-22)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖4。圖4所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X’1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第四核苷酸序列之X’2、由2或3個LNA所構成之X’3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之L’、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷 酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1、C2-20伸烷基等之B、及源自機能性分子的基之A。X’1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖4中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X3與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將第一核苷酸序列係反義序列,第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交,且第四核苷酸序列部分與第六核苷酸序列部分在分子內雜交之B-72)或C-31)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖5。圖5所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X’1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第四核苷酸序列之X’2、由2或3個LNA所構成之X’3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之L’、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由25~36個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列及第六核苷酸序列之Y2、及由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1。X’1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’ 至5’方向。圖5中,具有第一核苷酸序列之X2與Y2之具有第二核苷酸序列的部分形成雙鍵,具有第四核苷酸序列之X’2與Y2之具有第六核苷酸序列的部分形成雙鍵。X’1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X’3、X3、L’及X1各自獨立與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。又,第二核苷酸序列與第六核苷酸序列可相同亦可不同。
將第一核苷酸序列係反義序列,第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交,且第四核苷酸序列部分與第六核苷酸序列部分在分子內雜交之B-73)或C-32)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖6。圖6所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X’1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第四核苷酸序列之X’2、由2或3個LNA所構成之X’3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之3~7個核苷酸所構成之L’、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由25~36個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列及第六核苷酸序列之Y2、由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1、C2-20伸烷基等之B、及源自機能性分子的基之A。X’1至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖6中,具有第一核苷酸序列之X2與Y2之具有第二核苷 酸序列的部分形成雙鍵,具有第四核苷酸序列之X’2與Y2之具有第六核苷酸序列的部分形成雙鍵。X’1與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X’3、X3、L’及X1各自獨立與Y2雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。又,第二核苷酸序列與第六核苷酸序列可相同亦可不同。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-43)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖7。圖7所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個之選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之X1、由8~12個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~15個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、及具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷酸所構成且具有反義序列之YZ。X1至YZ的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖7中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y0形成雙鍵。X1與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-44)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖8。圖8所 示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有源自機能性分子的基A、C2-20伸烷基等之B、由2或3個之選自2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成之X1、由8~12個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由10~15個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、及具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者且由10~20個之獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成且具有反義序列之YZ。X1至YZ的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖8中,具有第一核苷酸序列之X2與Y0之具有第二核苷酸序列的部分形成雙鍵。X1與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-52)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖9。第一核苷酸序列亦可為反義序列。圖9所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由12~16個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、及具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者且由獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之10~20個核苷 酸所構成且具有反義序列之YZ。X1至YZ的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖9中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y0形成雙鍵。X1及X3自獨立與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之如C-64)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖10。圖10所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之X4、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第七核苷酸序列之X5、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由12~16個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、由2或3個LNA所構成之YZ 3、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有Y所含之反義序列部分之YZ 2、及由2或3個LNA所構成之YZ 1。X4至YZ 1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。第一核苷酸序列亦可為反義序列。圖10中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y0形成雙鍵,具有Y所含之反義序列部分之YZ 2與具有第七核苷酸序列之X5形成雙鍵。X1及X3各自獨立與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X5與YZ 3雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙 鍵較佳。X4與YZ 1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-66)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖11。圖11所示之單股寡核苷酸,依序鍵結有源自機能性分子的基A、C2-20伸烷基等之B、由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之X4、由10~13個核糖核苷酸所構成且具有第七核苷酸序列之X5、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由12~16個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、由2或3個LNA所構成之YZ 3、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有Y所含之反義序列部分之YZ 2、及由2或3個LNA所構成之YZ 1。A至YZ 1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。第一核苷酸序列亦可為反義序列。圖11中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y0形成雙鍵,具有Y所含之反義序列部分之YZ 2與具有第七核苷酸序列之X5形成雙鍵。X1及X3各自獨立與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X5與YZ 3雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X4與YZ 1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷 酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之如C-80)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖12。圖12所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之X4、由11~19個核糖核苷酸所構成且具有第七核苷酸序列之X5、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由14~22個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、由2或3個LNA所構成之YZ 3、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有Y所含之反義序列部分之YZ 2、及由2或3個LNA所構成之YZ 1。X4至YZ 1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。第一核苷酸序列亦可為反義序列。圖12中,具有第一核苷酸序列之X2與Y0之具有第二核苷酸序列的部分形成雙鍵,具有Y所含之反義序列部分之YZ 2與具有第七核苷酸序列之X5形成雙鍵,Y0與X5部分形成雙鍵。X1及X3各自獨立與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X5與YZ 3雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X4與YZ 1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列Y包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-82)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖13。圖13所示之單股寡核苷酸,依序鍵結有自機能性分子的基A、 C2-20伸烷基等之B、由2或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之X4、由11~19個核糖核苷酸所構成且具有第七核苷酸序列之X5、由2或3個LNA所構成之X1、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由2或3個LNA所構成之X3、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由14~22個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y0、由2或3個LNA所構成之YZ 3、由8~10個去氧核糖核苷酸所構成且具有Y所含之反義序列部分之YZ 2、及由2或3個LNA所構成之YZ 1。A至YZ 1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。第一核苷酸序列亦可為反義序列。圖13中,具有第一核苷酸序列之X2與Y0之具有第二核苷酸序列的部分形成雙鍵,具有Y所含之反義序列部分之YZ 2與具有第七核苷酸序列之X5形成雙鍵,Y0與X5部分形成雙鍵。X1及X3各自獨立與Y0雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X5與YZ 3雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。X4與YZ 1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列X包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之如C-98)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖14。圖14所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有,具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者且由10~20個之獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構 成且具有反義序列之XZ、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~5個核苷酸所構成之X0、由8~17個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由8~19個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、及由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1。XZ至Y1的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方向。圖14中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X0與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
將核苷酸序列X包含反義序列,且第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分在分子內雜交之C-99)所記載之單股寡核苷酸的概念圖表示於圖15。圖15所示之單股寡核苷酸中,依序鍵結有具有2’-O-甲基化核苷酸及LNA之至少一者且由10~20個之獨立選自去氧核糖核苷酸、2’-O-甲基化核苷酸及LNA中之核苷酸所構成且具有反義序列之XZ、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之2~5個核苷酸所構成之X0、由8~17個去氧核糖核苷酸所構成且具有第一核苷酸序列之X2、由獨立選自去氧核糖核苷酸及核糖核苷酸中之4~7個核苷酸所構成之L、由8~19個核糖核苷酸所構成且具有第二核苷酸序列之Y2、由2個或3個2’-O-甲基化核苷酸所構成之Y1、C2-20伸烷基等之B、及源自機能性分子的基之A。XZ至A的鍵結方向,可為5’至3’方向,亦可為3’至5’方 向。圖15中,具有第一核苷酸序列之X2與具有第二核苷酸序列之Y2形成雙鍵。X0與Y1雖可形成亦可不形成雙鍵,但形成雙鍵較佳。
作為使用本發明之單股寡核苷酸的較佳方法可舉出以下所示者。
E-1)一種控制標的RNA之機能的方法,其包含使如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸與細胞接觸的步驟。
E-2)一種哺乳動物中之控制標的RNA之機能的方法,其包含將包含如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸之醫藥組成物投予至該哺乳動物的步驟。
E-3)如E-2)所記載之方法,其中哺乳動物為人類。
E-4)如E-2)或E-3)所記載之方法,其中投予路徑為經腸道。
E-5)如E-2)或E-3)所記載之方法,其中投予路徑為非經腸道。
E-6)一種用以在哺乳動物中控制標的RNA機能之如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-7)一種用以製造在哺乳動物中控制標的RNA機能的藥劑之如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-8)如E-6)或E-7)所記載之使用,其中哺乳動物 為人類。
E-9)一種控制標的RNA之機能的方法,其包含使如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸與細胞接觸的步驟。
E-10)一種降低哺乳動物中之標的RNA機能表現的方法,其包含將包含如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸之醫藥組成物投予至哺乳動物的步驟。
E-11)如E-10)所記載之方法,其中哺乳動物為人類。
E-12)投予路徑為經腸道、如E-10)或E-11)所記載之方法。
E-13)投予路徑為非經腸道、如E-10)或E-11)所記載之方法。
E-14)一種用以在哺乳動物中控制標的RNA機能之如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-15)一種用以製造在哺乳動物中控制標的RNA機能的藥劑之如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-16)如E-14)或E-15)所記載之使用,其中哺乳動物為人類。
本發明中之標的RNA機能的控制,係指藉由反義序列部分因雜交而被覆標的RNA之一部分而產生,轉譯之阻礙或外顯子跳讀等之剪接機能被調節或變換、 或、藉由反義序列部分與標的RNA之一部分雜交而成的部分被辨識而可產生之前述標的RNA的分解,標的RNA機能被抑制等的意思。
E-17)一種控制標的基因表現的方法,其包含使如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸與細胞接觸的步驟。
E-18)一種控制哺乳動物中之標的基因之表現的方法,其包含將包含如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸的醫藥組成物投予至該哺乳動物的步驟。
E-19)如E-18)所記載之方法,其中哺乳動物為人類。
E-20)如E-18)或E-19)所記載之方法,其中投予路徑為經腸道。
E-21)如E-18)或E-19)所記載之方法,其中投予路徑為非經腸道。
E-22)一種用以在哺乳動物中控制標的基因表現之如1)至167)及如C-1)至C-117)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-23)一種用以製造在哺乳動物中控制標的基因表現的藥劑之如1)至167)及C-1)至C-132)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-24)如E-22)或E-23)所記載之使用,其中哺乳動物為人類。
E-25)一種控制標的基因表現的方法,其包含使如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸與細胞接觸的步驟。
E-26)一種哺乳動物中之控制標的基因表現的方法,其包含將包含如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸的醫藥組成物投予至該哺乳動物的步驟。
E-27)如E-26)所記載之方法,其中哺乳動物為人類。
E-28)如E-26)或E-27)所記載之方法,其中投予路徑為經腸道。
E-29)如E-26)或E-27)所記載之方法,其中投予路徑為非經腸道。
E-30)一種用以在哺乳動物中控制標的基因表現之如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-31)一種用以製造在哺乳動物中控制標的基因表現的藥劑之如B-1)至B-82)中任1項所記載之單股寡核苷酸的使用。
E-32)如E-30)或E-31)所記載之使用,其中哺乳動物為人類。
以上雖說明關於單股寡核苷酸之適合的態樣,但本發明之單股寡核苷酸並不限定於上述態樣。單股寡核苷酸,例如其所包含之經由不論環內、環外該等之互變異構性、幾何異構性而存在之外,亦包含作為其混合物或各自的異構物之混合物存在者。又,不對稱中心存在 時,或異構化的結果,產生不對稱中心時,亦包含作為各自的光學異構物及任意比率之混合物存在者。又,具有2個以上不對稱中心之化合物之情形,進而因各自的光學異構性所致之非鏡像異構物亦存在。本發明亦包含此等所有類型以任意比例包含者。
本發明中亦包含式(I)所示之單股寡核苷酸之醫藥上可容許的鹽。
式(I)所示之單股寡核苷酸,應需要亦可變換成醫藥上可容許的鹽,或使其由生成之鹽游離。作為式(I)所示之單股寡核苷酸之醫藥上可容許的鹽,可舉例例如與鹼金屬(鋰、鈉、鉀等)、鹼土類金屬(鎂、鈣等)、銨、有機鹼(三乙胺、三甲胺等)、胺基酸(甘胺酸、離胺酸、麩胺酸等)、無機酸(鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸等)或有機酸(乙酸、檸檬酸、馬來酸、富馬酸、酒石酸、苯磺酸、甲磺酸、p-甲苯磺酸等)的鹽。
特別是,-P(=O)(OH)-所示之部分構造變換成-P(=O)(O-)-所示之陰離子性的部分構造,與鹼金屬(鋰、鈉、鉀等)、鹼土類金屬(鎂、鈣等)或銨等形成鹽亦可。又,形成硫代磷酸酯鍵之-P(=O)(SH)-所示之部分構造變換成-P(=O)(S-)-所示之陰離子性的部分構造,同樣地,與鹼金屬、鹼土類金屬或銨等形成鹽亦可。
本發明中亦包含式(I)所示之單股寡核苷酸的前驅藥。
所謂前驅藥,係具有可化學性或代謝性分解的基之醫 藥品化合物的衍生物,藉由溶劑分解或生理條件下之體內(in vivo)中分解而往藥理學上活性之醫藥品化合物衍生的化合物。選擇適當之前驅藥衍生物的方法及製造的方法,記載於例如前驅藥設計(愛思唯爾、阿姆斯特丹1985)(Design of Prodrugs(Elsevier,Amsterdam 1985))。本發明之情形,具有羥基時,例示有如藉由使其化合物與適當之醯基鹵化物、適當之酸酐或適當之鹵化烷基氧基羰基化合物進行反應而製造之醯氧基衍生物的前驅藥。作為前驅藥之特佳構造,可舉例-O-COC2H5、-O-CO(t-Bu)、-O-COC15H31、-O-CO(m-CO2Na-Ph)、-O-COCH2CH2CO2Na-OCOCH(NH2)CH3、-O-COCH2N(CH3)2或-O-CH2OC(=O)CH3等。形成本發明之單股寡核苷酸具有胺基時,例示有藉由使具有胺基之化合物與適當之酸鹵化物、適當之混合酸酐或適當之鹵化烷基氧基羰基化合物進行反應而製造之前驅藥。作為前驅藥之特佳構造,可舉例-NH-CO(CH2)20OCH3、-NH-COCH(NH2)CH3、-NH-CH2OC(=O)CH3等。
本發明之式(I)所示之單股寡核苷酸或其醫藥上容許之鹽,依製造條件雖可作為任意結晶形存在,作為任意水合物存在,此等結晶形或水合物及該等之混合物亦包含在本發明之範圍內。又,亦有作為包含丙酮、乙醇、1-丙醇、2-丙醇等之有機溶劑的溶劑合物存在,此等形態皆包含在本發明之範圍內。
單股寡核苷酸,該業者可適當地選擇周知的 方法來調製。例如,該業者可基於標的RNA之核苷酸序列的情報,設計單股寡核苷酸之核苷酸序列,使用市售之核酸自動合成機(應用生命系統公司製、貝克曼公司製、Gene design公司等)來合成。又,亦可藉由使用酵素之反應來合成。作為前述酵素,雖可舉例聚合酶、連接酶及限制酶等,但不限定於此等。即,本實施形態之單股寡核苷酸之製造方法,可包含在包含X、L及Y之至少1個的寡核苷酸之3’端或5’端使核苷酸鏈伸長的步驟。
用以使機能性分子與該寡核苷酸鍵結的多種方法,在該領域中廣為人知,可參照例如European Journal of Pharmaceuticals and Biofermatics、107卷、321~340頁(2016年)、Advanced Drug Delivery Reviews、104卷、78~92頁(2016年)、Expert Opinion on Drug Delivery、11卷、791~822頁(2014年)等。例如,使機能性分子與鏈接序列藉由周知的方法鍵結後,可使其藉由胺基亞酸酯化試藥衍生成胺基亞酸酯體、或藉由H-膦酸酯試藥衍生成H-膦酸酯體,與寡核苷酸鍵結。
可將所得之寡核苷酸藉由逆相管柱色層分析法等進行純化,調製單股寡核苷酸。然後,可將調製之單股寡核苷酸在適當的緩衝液中混合,以90~98℃數分鐘(例如,5分鐘)使其變性後,以30~70℃ 1~8小時使其雜交,藉以調製在分子內雜交之單股寡核苷酸。有時可省略該在分子內雜交的步驟。
單股寡核苷酸可有效地控制標的基因之表 現。因此,本發明可提供含有單股寡核苷酸作為有效成分之,例如,用於藉由反義效果控制標的基因之表現的組成物。特別是,單股寡核苷酸可藉由低濃度投予得到高藥效,在數個實施形態中亦可提供用以治療、預防、改善代謝性疾病、腫瘤、感染症等標的基因之表現亢進所伴隨之疾病的醫藥組成物。
包含單股寡核苷酸之組成物,可藉由周知之製劑學的方法來製劑化。例如,作為膠囊劑、錠劑、丸劑、液劑、散劑、顆粒劑、細粒劑、膜衣劑、粒劑(pellet)、片劑(troche)、舌下劑、咀嚼劑、口頰劑、糊劑、糖漿劑、懸濁劑、酏劑、乳劑、塗佈劑、軟膏劑、硬膏劑、敷劑、經皮吸收型製劑、洗劑、吸入劑、氣霧劑、注射劑、栓劑等,可使用於經腸道(口服等)或非經腸道。
此等製劑化中,作為藥理學上或飲食品容許之載體,具體而言,可適當組合滅菌水或生理食鹽水、植物油、溶劑、基劑、乳化劑、懸濁劑、界面活性劑、pH調節劑、安定劑、香味劑、芳香劑、賦形劑、載體(vehicle)、防腐劑、鍵結劑、稀釋劑、等張化劑、舒緩劑、增量劑、崩解劑、緩衝劑、包衣劑、潤滑劑、著色劑、甜味劑、增稠劑、矯味矯臭劑、增溶解輔助劑或其他添加劑等。
作為包含單股寡核苷酸之組成物的投予形態雖無特別限制,但可舉例經腸道(口服等)或非經腸道的 投予。更佳為靜脈內投予、動脈內投予、腹腔內投予、皮下投予、皮內投予、氣管內投予、直腸投予、肌肉內投予、以輸液之投予、髓腔內投予、腦室內投予、鼻腔投予及玻璃體內投予等。
利用單股寡核苷酸而成之核酸醫藥品所可治療、預防、改善的疾病無特別限制,可舉例例如代謝性疾病、循環器官疾病、腫瘤、感染症、眼疾病、炎症性疾病、自體免疫疾病、遺傳性罕見疾病等、基因之表現為原因之疾病等。更具體而言,可舉例高膽固醇血症、高三酸甘油酯血症、脊髓肌萎縮症、肌肉萎縮症(裘馨氏肌肉萎縮症、肌強直型肌肉萎縮症、先天性肌肉萎縮症(福山型先天性肌肉萎縮症、渥里克氏(Ullrich)型先天性肌肉萎縮症、分層蛋白(merosin)缺乏型先天性肌肉萎縮症、整合素缺乏症、沃克-瓦布爾格(Walker-Worldburg)症候群等)、貝克氏肌肉萎縮症、肢帶型肌肉萎縮症、三好氏肌肉萎縮症、顏肩肱型肌肉萎縮症等)、杭丁頓氏症、阿滋海默症、運甲狀腺素蛋白(Transthyretin)型澱粉樣變性、家族性澱粉樣性心肌症、多發性硬化症、克隆氏病、炎症性大腸疾病、肢端肥大症、2型糖尿病、慢性腎臟症、RS病毒感染症、伊波拉出血熱、馬爾堡病毒熱、HIV、流感、B型肝炎、C型肝炎、肝硬化、慢性心力衰竭、心肌纖維化、心房顫動、前列腺癌、黑色素瘤、乳癌、胰臓癌、大腸癌、腎細胞癌、膽管癌、子宮頸癌、肝癌、肺癌、白血病、非何傑金氏淋巴瘤、異位性皮膚炎、 青光眼、年齡相關性黃斑變性等。對應前述疾病之種類,設定成為該疾病原因之基因為前述標的基因,進而,可對應前述標的基因之序列,適當地設定前述表現控制序列(例如,反義序列)。
人類等之靈長類之外,藉由包含單股寡核苷酸之組成物可治療、預防、改善各種其他哺乳類的疾病。例如,雖不限定於此,但可治療包含牛(cow)、羊(sheep)、山羊、馬(horse)、狗(dog)、貓(cat)、天竺鼠、或其他牛(bovine)、綿羊(ovine)、馬(equine)、狗(canine)、貓(feline)、小鼠等之囓齒類之種的哺乳類之種的疾病。又,包含單股寡核苷酸之組成物,亦可適用於鳥類(例如,雞)等之其他種之中。
投予或攝取包含單股寡核苷酸之組成物至包括人類之動物時,其投予量或攝取量,對應對象之年齡、體重、症狀、健康狀態、組成物之種類(醫藥品、飲食品等)等,可適當地選擇,但其投予量或攝取量以單股寡核苷酸換算計為0.0001mg/kg/日~100mg/kg/日較佳。
單股寡核苷酸可非常有效地控制標的基因之表現。因此,投予單股寡核苷酸至包括人類之動物,可提供藉由反義效果控制標的基因之表現的方法。又,亦可提供包含將包含單股寡核苷酸之組成物投予至包括人類之動物之治療、預防、改善標的基因之表現亢進等所伴隨之各種疾病的方法。
[實施例]
以下,雖基於實施例及比較例更具體說明本發明,但實施形態並不限定於以下之實施例。
(實施例1至4、比較例1至5)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表1所記載之寡核苷酸。標的基因為小鼠Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)。此外,表1中之序列註釋中,「(L)」意指LNA,「(M)」意指2’-O-甲基化核苷酸,小寫的字母意指去氧核糖核苷酸,大寫的字母(除了前述(L)及(M)的字母)意指核糖核苷酸,「^」意指硫代磷酸酯鍵,「5」意指該核苷酸之鹼基為5-甲基胞嘧啶,「C8Toc-」意指在5’端之磷酸基的1個氧原子上,透過1,8-伸辛基鍵結有由下述式(IV)所示之生殖酚之羥基去除氫原子之部分。又,表1所記載之寡核苷酸的3’端為羥基,5’端為羥基。
Figure 106103330-A0202-12-0181-5
Figure 106103330-A0202-12-0182-6
實施例1~4中之分子內雜交、及比較例1~3中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例1〕
將小鼠腦內皮細胞株b.END之細胞以成為2000細胞/孔之方式播種至96孔盤,5% CO2下於37℃培養24小時。使用Lipofectamine(註冊商標)RNAiMax(Thermo Fisher Scientific公司製),以其終濃度成為1nM或10nM之方式,將表1之各寡核苷酸添加(轉染)至各孔。4小時後交換培養基,進而20小時後回收細胞,使用RNeasy mini kit(QIAGEN公司製)從細胞萃取全RNA(Total RNA)。
使用PrimeScript RT Master Mix(Takara Bio股份有限公司製)從全RNA得到cDNA。使用所得之cDNA及TaqMan(註冊商標)Gene Expression ID(Applied Biosystems公司製)藉由7500 Real-Time PCR System(Applied Biosystems公司製)進行即時聚合酶連鎖反應(Real-Time PCR),定量PTEN之mRNA量。即時聚合酶連鎖反應中,亦同時定量持家基因之cyclophilin之mRNA量,將PTEN之mRNA量相對於cyclophilin之mRNA量的作為PTEN表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖16。
此外,所使用的引子為TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems公司製),Assay ID如下列:小鼠PTEN定量用:Mm00477208_m1
小鼠cyclophilin定量用:Mm0234230_g1
由圖16可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例1~4)相較於HDO(比較例1~3)及ASO(比較例4、5),顯示較高的反義效果。
(實施例5及6、比較例4、6及7)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表2所記載之寡核苷酸。標的基因為人類Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)及人類apolipoprotein B(ApoB)。此外,表2中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0184-7
實施例5~6中之分子內雜交、及比較例6中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例2〕
將源自人類肝癌的細胞株HuH-7之細胞以成為3000細胞/孔之方式播種至96孔盤,5% CO2下於37℃培養24小時。使用Lipofectamine(註冊商標)RNAiMax(Thermo Fisher Scientific公司製),以其終濃度成為設定之濃度之方式,將表2之各寡核苷酸添加(轉染)至各 孔。4小時後交換培養基,進而20小時後回收細胞,使用RNeasy mini kit(QIAGEN公司製)從細胞萃取全RNA。
使用PrimeScript RT Master Mix(Takara Bio股份有限公司製)從全RNA得到cDNA。使用所得之cDNA及TaqMan(註冊商標)Gene Expression ID(Applied Biosystems公司製)藉由7500 Real-Time PCR System(Applied Biosystems公司製)進行即時聚合酶連鎖反應,定量PTEN及ApoB之mRNA量。即時聚合酶連鎖反應中,亦同時定量持家基因之GAPDH(Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase)的mRNA量,將PTEN及ApoB之mRNA量相對於GAPDH之mRNA量分別作為PTEN及ApoB的表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖17及圖18。
此外,所使用的引子為TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems公司製),Assay ID如下列:人類PTEN定量用:Hs02621230
人類ApoB定量用:Hs00181142
人類GAPDH定量用:Hs99999905_m1
由圖17及圖18可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例5~6)相較於HDO(比較例6)及ASO(比較例4、7)顯示較高的反義效果。
(實施例2及7、比較例1及4)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表3所記載之寡核苷酸。標的基因為小鼠Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)。此外,表3中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0186-8
實施例2及7中之分子內雜交、及比較例1中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例3〕
使用與評估例1相同的評估方法,以表3之各寡核苷酸之終濃度成為設定之濃度的方式,將PTEN之mRNA量相對於cyclophilin之mRNA量的作為PTEN表現水平來評估。結果表示於圖19。
由圖19可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例7)與HDO(比較例1)及ASO(比較例4)相比,顯示較高的反義效果。
(實施例5、6、8及9、比較例6)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表4所記載之寡核苷酸。標的基因為人類Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)及人類apolipoprotein B(ApoB)。此外,表4中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0187-9
實施例5、6、8及9中之分子內雜交、及比較例6中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例4〕
與評估例2使用相同的評估方法,以表4之各寡核苷酸之終濃度成為1nM或10nM之方式,將PTEN及ApoB之mRNA量相對於GAPDH之mRNA量分別作為PTEN及ApoB之表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖20及圖21。
由圖20及圖21可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例5、6、8及9)與HDO(比較例6)相比,顯示較高的反義效果。
(實施例10及11、比較例4、8及9)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表5所記載之寡核苷酸。標的基因為小鼠Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)。此外,表5中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0189-10
實施例10及11中之分子內雜交、及比較例8、9中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例5〕
使用與評估例1相同的評估方法,以表5之各寡核苷酸的終濃度成為設定之1nM或10nM之方式,將PTEN之mRNA量相對於cyclophilin之mRNA量的作為PTEN表現水平來評估。結果表示於圖22。
由圖22可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例10及11)顯示與HCDO(比較例8、9)同程度的反義效果,與ASO(比較例4、7)相比,顯示較高的反義效果。
〔評估例6〕
將實施例4及實施例10中之前述分子內雜交處理前後的非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳結果表示於圖23及圖24。作為單股DNA之尺寸標記,使用Gene design公司製電泳用單股DNA尺寸標記。其包含核苷酸數為15、20、30、40、50、60及80之單股的DNA。作為雙股RNA之尺寸標記,使用Gene design公司製電泳用雙股RNA尺寸標記。其包含鹼基對數為17、21、25及29之雙股的RNA。此外,圖23及圖24中,「Lane No.」係指前述電泳試驗中之泳道(lane)號碼、「Example No.」係指實施例號碼、「before」係指上述雜交處理前、「after」係指上述雜交處理後、「ss-DNA size marker」係指單股DNA之尺寸標記、「ds-RNA size marker」係指雙股RNA之尺寸標記、「mer」係指鹼基數、「bp」係指鹼基對數的意思。
由圖23及圖24可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸不經過特別的雜交步驟而成為分子內雜交的構造。
(實施例5及12、比較例10)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表6所記載之寡核苷酸。標的基因為人類Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)及人類apolipoprotein B(ApoB)。此外,表6中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0305-02-0193-1
實施例5及12中之分子內雜交、及比較例10中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例7〕
使用與評估例2相同的評估方法,以表6之各寡核苷酸的終濃度成為1nM或10nM之方式,將PTEN及ApoB之mRNA量相對於GAPDH之mRNA量分別作為PTEN及ApoB之表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖25及圖26。
由圖25及圖26可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例5及12)與HDO(比較例10)相比,顯示較高的反義效果。
(實施例13及14、比較例6)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表7所記載之寡核苷酸。標的基因為人類Phosphatase and Tensin Homolog Deleted from Chromosome 10(PTEN)。此外,表7中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0305-02-0194-3
實施例13及14中之分子內雜交、及比較例6中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例8〕
使用與評估例2相同的評估方法,以表7之各寡核苷酸的終濃度成為1nM或10nM之方式,將PTEN之mRNA量相對於GAPDH之mRNA量作為PTEN之表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖27。
由圖27可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例13及14)顯示與HDO(比較例6)同程度的反義效果。
(實施例15、比較例11)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表8所記載之寡核苷酸。標的基因為小鼠apolipoprotein B(ApoB)。表8中之序列註釋的「Toc-TEG-」係指於5’端磷酸基的1個氧原子上,透過下述式(III-2)所示之基,鍵結有由下述式(IV)所示之生殖酚之羥基去除氫原子而成的部分的意思。
Figure 106103330-A0202-12-0193-13
(式中,*表示與第二寡核苷酸之鍵結位置,**表示與生殖酚之鍵結位置)。
Figure 106103330-A0202-12-0193-14
其他註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0194-15
實施例15中之分子內雜交、及比較例11中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例9〕
以每小鼠個體之投予量成為以反義寡核苷酸量換算為8.1nmol/kg或81nmol/kg之方式,將溶解於生理食鹽水(大塚生食注,大塚製藥工場)之實施例15及比較例11靜脈投予至C57BL/6J小鼠(雄5週齡,日本Charles River公司)。作為對照組,僅投予生理食鹽水(大塚生食注,大塚製藥工場)。投予3日後自眼窩靜脈叢採血後,異氟烷麻醉下採取肝臓組織。自肝臓的RNA萃取係使用RNeasy Mini Kit(Qiagen公司製)依照Qiagen公司的建議實驗方法來進行。使用PrimeScript RT Master Mix(Takara Bio股份有限公司製)從全RNA得到cDNA。使用所得之cDNA及TaqMan(註冊商標)Gene Expression ID(Applied Biosystems公司製)藉由7500 Real-Time PCR System(Applied Biosystems公司製)進行即時聚合酶連鎖反應,定量ApoB之mRNA量。即時聚合酶連鎖反 應中,亦同時定量持家基因之cyclophilin之mRNA量,將ApoB之mRNA量相對於Cyclophilin之mRNA量作為ApoB之表現水平來評估。結果表示於圖28。
此外,所使用的引子為TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems公司製),Assay ID如下列:小鼠ApoB定量用:Mm01545150_m1
小鼠cyclophilin定量用:Mm0234230_g1
又,將採取之血液室溫靜置20分鐘後,以5000rpm、4℃離心15分鐘分離血漿。對於個別的血漿,使用Determiner L TC(Kyowa Medex公司製)定量血漿總膽固醇值。於血漿3.2μL中加入240μL試藥R-1於37℃加溫5分鐘,接著加入80μL試藥R-2於37℃加溫5分鐘,使用分光光度計測定600nm之吸光度。使用標準試藥之校正曲線算出值。結果表示於圖29。此外,圖中total cholesterol係指前述血漿總膽固醇值的意思。
由圖28及圖29可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例15)與HDO(比較例11)相比,顯示較高的反義效果。
(實施例16、17及18、比較例12及13)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表9所記載之寡核苷酸。標的RNA為miRNA-122。此外,表9中之序列註釋與表1相同。
Figure 106103330-A0202-12-0196-16
實施例16、17及18中之分子內雜交、及比較例13中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例10〕
將源自人類肝癌的細胞株HuH-7細胞以成為2000細胞/孔之方式播種至96孔盤,5% CO2下於37℃培養24小時。以終濃度成為0.4nM之方式,使用Lipofectamine(註冊商標)RNAiMax(Thermo Fisher Scientific公司製),將表9之各寡核苷酸添加(轉染)至各孔。4小時後交換培養基,進而20小時後回收細胞,使用RNeasy mini kit(QIAGEN公司製)從細胞萃取全RNA。
使用PrimeScript RT Master Mix(Takara Bio股份有限公司製)從全RNA得到cDNA。使用所得之cDNA及 TaqMan(註冊商標)Gene Expression ID(Applied Biosystems公司製)藉由7500 Real-Time PCR System(Applied Biosystems公司製)進行即時聚合酶連鎖反應,定量miRNA-122之標的基因即Aldolase A之mRNA量。即時聚合酶連鎖反應中,亦同時定量持家基因之GAPDH(Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase)的mRNA量,將Aldolase A之mRNA量相對於GAPDH之mRNA量作為Aldolase A之表現水平來評估。使用未進行轉染操作之細胞作為對照組。結果表示於圖30。此時,Aldolase A之表現量越高,則反義效果越高。
此外,所使用的引子為TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems公司製),Assay ID如下列:人類Aldolase A定量用:Hs00605108_g1
人類GAPDH定量用:Hs99999905_m1
由圖30可明白,顯示了本發明之單股寡核苷酸(實施例16~18)顯示較ASO(比較例12)高的反義效果,與HDO(比較例13)同程度或顯示較高的反義效果。
(實施例15、比較例7及11)
使用核酸自動合成機nS-8II(Gene design公司製)調製表10所記載之寡核苷酸。標的基因為小鼠apolipoprotein B(ApoB)。表10中之序列註釋與表1及表8相同。
Figure 106103330-A0202-12-0198-17
實施例15中之分子內雜交、及比較例11中之2個寡核苷酸之分子間雜交,係藉由以95℃加熱5分鐘後,定溫放置於37℃ 1小時來進行。雜交的確認係藉由非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳來確認。
〔評估例11〕
以每小鼠個體之投予量成為以反義寡核苷酸量換算為81nmol/kg之方式,將溶解於生理食鹽水(大塚生食注,大塚製藥工場)之實施例15、比較例11及比較例7靜脈投予至C57BL/6J小鼠(雄5週齡,日本Charles River公司)。作為對照組,僅投予生理食鹽水(大塚生食注,大塚製藥工場)。投予3日後自眼窩靜脈叢採血後,異氟烷麻醉下採取肝臓組織。自肝臓的RNA萃取使用RNeasy Mini Kit(Qiagen公司製)依照Qiagen公司之建議實驗方法來進行。使用PrimeScript RT Master Mix(Takara Bio股份有限公司製)從全RNA得到cDNA。使用所得之cDNA及TaqMan(註冊商標)Gene Expression ID (Applied Biosystems公司製)藉由7500 Real-Time PCR System(Applied Biosystems公司製)進行即時聚合酶連鎖反應,定量ApoB之mRNA量。即時聚合酶連鎖反應中,亦同時定量持家基因之cyclophilin之mRNA量,將ApoB之mRNA量相對於Cyclophilin之mRNA量作為ApoB之表現水平來評估。結果表示於圖31。
此外,所使用的引子為TaqMan Gene Expression Assay(Applied Biosystems公司製),Assay ID如下列:小鼠ApoB定量用:Mm01545150_m1
小鼠cyclophilin定量用:Mm0234230_g1
又,將採取之血液室溫靜置20分鐘後,以5000rpm、4℃離心15分鐘分離血漿。對於個別的血漿,使用Determiner L TC(Kyowa Medex公司製)定量血漿總膽固醇值。於血漿3.2μL中加入240μL試藥R-1於37℃加溫5分鐘,接著加入80μL試藥R-2於37℃加溫5分鐘,使用分光光度計測定600nm之吸光度。使用標準試藥之校正曲線算出值。結果表示於圖32。此外,圖中total cholesterol係指前述血漿總膽固醇值的意思。
由圖31及圖32可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸(實施例15)與HDO(比較例11)及ASO(比較例7)相比,顯示較高的反義效果。
〔評估例12〕
將實施例5中之前述分子內雜交處理前後之非變性聚 丙烯醯胺凝膠電泳結果表示於圖33。作為單股DNA之尺寸標記,使用Gene design公司製電泳用單股DNA尺寸標記。其包含核苷酸數為15、20、30、40、50、60及80之單股的DNA。作為雙股RNA之尺寸標記,使用Gene design公司製電泳用雙股RNA尺寸標記。其包含鹼基對數為17、21、25及29之雙股的RNA。此外,圖33中之記號與圖23及圖24相同。
由圖33可明白,確認了本發明之單股寡核苷酸不經過特別之雜交步驟而做成分子內雜交的構造。
[產業上之可利用性]
藉由使用本發明之單股寡核苷酸,在數個實施形態中,可將反義核酸特異性高且有效率地送達至特定之臓器(細胞),且藉由該核酸,有效地控制標的RNA之機能、及/或有效地抑制標的基因之表現。又,由於數個實施形態中之單股寡核苷酸,作為用以使其送達至特定臓器的機能性分,可運用脂質(例如生殖酚、膽固醇)、糖(例如葡萄糖、蔗糖)、蛋白質、胜肽、抗體等之多種多樣的分子,故數個實施形態中之單股寡核苷酸可以各種臓器、組織、細胞作為標的。進而,由於即使對數個實施形態中之單股寡核苷酸施以用以賦予對RNase等之耐性的修飾,其反義效果亦未減低,故數個實施形態中之單股寡核苷酸亦可以經腸投予之態樣來利用。
因此,數個實施形態中之單股寡核苷酸,藉由低濃度 投予可得到較高的藥效,且藉由抑制反義核酸之標的以外的臓器中之分布,亦可減低副作用之點為優異,故作為用以治療、預防代謝性疾病、腫瘤、感染症等之標的RNA機能及/或標的基因之表現亢進所伴隨的疾病的醫藥組成物等,單股寡核苷酸為有用。
藉由參照日本國專利申請案2016-012804號(申請日:2016年1月26日)及日本國專利申請案2016-158833(申請日:2016年8月12日)之揭示之全部援引至本說明書。關於本說明書所記載之所有文獻、專利申請案及技術規格,藉由參照各個文獻、專利申請案及技術規格來援引者係與具體分別記載之情形為同等程度地藉由參照援引至本說明書。
<110> 日產化學工業股份有限公司(NISSAN CHEMICAL INDUSTRIES,LTD)
<120> 單股寡核苷酸
<130> FP4121PCT
<160> 37
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(30)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (30)..(32)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (32)..(32)
<223> gm
<400> 1
Figure 106103330-A0305-02-0205-4
<210> 2
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(18)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(32)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(20)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(19)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(32)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> m5c
<400> 2
Figure 106103330-A0305-02-0206-6
<210> 3
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(3)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(17)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(30)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(19)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (28)..(30)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (28)..(29)
<223> m5c
<400> 3
Figure 106103330-A0305-02-0207-9
<210> 4
<211> 14
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<400> 4
Figure 106103330-A0305-02-0207-11
<210> 5
<211> 14
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(14)
<223> gm
<400> 5
Figure 106103330-A0305-02-0208-12
<210> 6
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(12)
<223> m5c
<400> 6
Figure 106103330-A0305-02-0209-13
<210> 7
<211> 13
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(3)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(13)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<400> 7
Figure 106103330-A0305-02-0209-14
<210> 8
<211> 14
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<400> 8
Figure 106103330-A0305-02-0210-15
<210> 9
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(12)
<223> m5c
<400> 9
Figure 106103330-A0305-02-0211-16
<210> 10
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(30)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(44)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(32)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(44)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(43)
<223> m5c
<400> 10
Figure 106103330-A0305-02-0212-17
<210> 11
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(31)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (32)..(33)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (32)..(44)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(33)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(44)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(43)
<223> m5c
<400> 11
Figure 106103330-A0305-02-0213-18
<210> 12
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(13)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(14)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(15)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(27)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (26)..(26)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (26)..(27)
<223> LNA
<400> 12
Figure 106103330-A0305-02-0214-20
<210> 13
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<400> 13
Figure 106103330-A0305-02-0215-22
<210> 14
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<400> 14
Figure 106103330-A0305-02-0215-23
<210> 15
<211> 68
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(36)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(37)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(38)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(50)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (49)..(49)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (49)..(50)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (51)..(54)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (55)..(55)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (55)..(56)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (55)..(68)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (67)..(67)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (67)..(68)
<223> LNA
<400> 15
Figure 106103330-A0305-02-0217-26
<210> 16
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(17)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(18)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(19)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(31)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (30)..(30)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (30)..(31)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (32)..(53)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (54)..(55)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (54)..(66)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (55)..(55)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (64)..(66)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (65)..(65)
<223> m5c
<400> 16
Figure 106103330-A0305-02-0219-27
<210> 17
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(35)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (36)..(36)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (36)..(37)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (36)..(49)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (48)..(48)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (48)..(49)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (50)..(53)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (54)..(55)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (54)..(66)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (55)..(55)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (64)..(66)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (65)..(65)
<223> m5c
<400> 17
Figure 106103330-A0305-02-0220-30
<210> 18
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(12)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(28)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(29)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(30)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(42)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(41)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(42)
<223> LNA
<400> 18
Figure 106103330-A0305-02-0221-31
<210> 19
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(30)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(42)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(41)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(42)
<223> um
<400> 19
Figure 106103330-A0305-02-0222-32
<210> 20
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(12)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(26)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(25)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(26)
<223> LNA
<400> 20
Figure 106103330-A0305-02-0223-33
<210> 21
<211> 12
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(12)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(11)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> um
<400> 21
Figure 106103330-A0305-02-0224-34
<210> 22
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(24)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (24)..(26)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(25)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(26)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (26)..(26)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<400> 22
Figure 106103330-A0305-02-0225-35
<210> 23
<211> 12
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(12)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(11)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> um
<400> 23
Figure 106103330-A0305-02-0226-37
<210> 24
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(32)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(34)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(45)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (34)..(34)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(45)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (44)..(44)
<223> m5c
<400> 24
Figure 106103330-A0305-02-0227-38
<210> 25
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(14)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(16)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (15)..(27)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (16)..(16)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(27)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (26)..(26)
<223> m5c
<400> 25
Figure 106103330-A0305-02-0228-39
<210> 26
<211> 14
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<400> 26
Figure 106103330-A0305-02-0229-40
<210> 27
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(14)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (17)..(26)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (27)..(40)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (40)..(42)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(41)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(42)
<223> gm
<400> 27
Figure 106103330-A0305-02-0230-41
<210> 28
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(8)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (8)..(16)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (17)..(22)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (22)..(28)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(29)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(30)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(42)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(41)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (41)..(42)
<223> LNA
<400> 28
Figure 106103330-A0305-02-0231-43
<210> 29
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(17)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(19)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (18)..(30)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (28)..(30)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (29)..(29)
<223> m5c
<400> 29
Figure 106103330-A0305-02-0232-45
<210> 30
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<400> 30
Figure 106103330-A0305-02-0233-47
<210> 31
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> um
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(11)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> cm
<400> 31
Figure 106103330-A0305-02-0234-50
<210> 32
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(30)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(45)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(33)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (36)..(37)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (40)..(40)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (40)..(40)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(42)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(42)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (44)..(45)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (44)..(45)
<223> LNA
<400> 32
Figure 106103330-A0305-02-0235-53
<210> 33
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(15)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (6)..(7)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (10)..(10)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (10)..(10)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(15)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(15)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (16)..(32)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(45)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(43)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (43)..(45)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (45)..(45)
<223> m5c
<400> 33
Figure 106103330-A0305-02-0237-54
<210> 34
<211> 51
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> 2'-O-甲基腺苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(3)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(18)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(19)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(20)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(32)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(31)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (31)..(32)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (33)..(36)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(37)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(37)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (37)..(51)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (39)..(39)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (42)..(43)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (46)..(46)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (46)..(46)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (48)..(48)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (48)..(48)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (50)..(51)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (50)..(51)
<223> LNA
<400> 34
Figure 106103330-A0305-02-0239-55
<210> 35
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(15)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (6)..(7)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (10)..(10)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (10)..(10)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (12)..(12)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(15)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(15)
<223> LNA
<400> 35
Figure 106103330-A0305-02-0240-57
<210> 36
<211> 13
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(2)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(13)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(11)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (11)..(13)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (13)..(13)
<223> m5c
<400> 36
Figure 106103330-A0305-02-0241-59
<210> 37
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成寡核苷酸序列
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(1)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (1)..(4)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (2)..(2)
<223> cm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (3)..(3)
<223> gm
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (4)..(13)
<223> 核糖核苷
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(14)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(14)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (14)..(28)
<223> 核酸之間的硫代磷酸酯鍵
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (16)..(16)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (19)..(20)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (23)..(23)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (23)..(23)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(25)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (25)..(25)
<223> LNA
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (27)..(28)
<223> m5c
<220>
<221> 經修飾之鹼基
<222> (27)..(28)
<223> LNA
<400> 37
Figure 106103330-A0305-02-0242-61

Claims (38)

  1. 一種單股寡核苷酸,其係以式X-L-Y所表示,X-L-Y(式中,X係源自第一寡核苷酸之基,該第一寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部修飾核苷酸之7~50個的核苷酸所構成,Y係源自由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中之4~50個核苷酸所構成之第二寡核苷酸的基,L係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第二寡核苷酸共價鍵結且在生理條件下被分解之第三寡核苷酸的基,前述第一寡核苷酸具有核苷酸序列X,前述第二寡核苷酸具有核苷酸序列Y,前述核苷酸序列X包含可與第二寡核苷酸之至少一部分雜交,且含有被RNaseH所辨識之至少4個連續的核苷酸的第一核苷酸序列,前述核苷酸序列Y包含可與第一寡核苷酸之至少一部分雜交,且含有至少1個核糖核苷酸的第二核苷酸序列,前述核苷酸序列X,包含至少1個可與標的RNA雜交之反義序列,第一寡核苷酸為產生反義效果之寡核苷酸,標的RNA為藉由反義效果而機能被控制之標的RNA, 具有2個以上前述反義序列時,個別的反義序列部分所雜交的標的RNA可相同亦可不同,前述第一核苷酸序列係前述反義序列,且係包含前述與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列),X與Y係以第一核苷酸序列部分與第二核苷酸序列部分雜交。
  2. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中X以3’側與L鍵結,Y以5’側與L鍵結。
  3. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中X以5’側與L鍵結,Y以3’側與L鍵結。
  4. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸所含之核苷酸以磷酸二酯鍵互相連結。
  5. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第三寡核苷酸為DNA或RNA。
  6. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
  7. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含鄰接鍵結於第一核苷酸序列部分之5’側及3’側的糖部修飾核苷酸。
  8. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第一寡核苷酸包含硫代磷酸酯鍵。
  9. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第一核苷酸序 列係由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成的序列。
  10. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列係包含被RNaseH所切斷之至少4個連續的核苷酸的序列。
  11. 如請求項10之單股寡核苷酸,其中第二寡核苷酸包含鄰接鍵結於第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
  12. 如請求項10之單股寡核苷酸,其中第二核苷酸序列部分之5’側及3’側之至少一方與鄰接之核苷酸以硫代磷酸酯鍵連結。
  13. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y包含至少1個反義序列。
  14. 如請求項13之單股寡核苷酸,其中前述Y在前述反義序列部分與L之間具有前述第二核苷酸序列部分。
  15. 如請求項13之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列Y所含之反義序列係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
  16. 如請求項13之單股寡核苷酸,其中前述Y所含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
  17. 如請求項15之單股寡核苷酸,其中前述核苷酸序列X包含可與前述Y所含之反義序列部分之至少一部分雜交,且含有被RNaseH切斷之至少4個連續的核苷酸 的序列。
  18. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中X包含5’端或3’端。
  19. 如請求項1之單股寡核苷酸,其進一步包含式X’-L’-所示之基,X’-L’-(式中,X’係源自第四寡核苷酸的基,該第四寡核苷酸係由獨立選自去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸及糖部修飾核苷酸中,且包含至少1個糖部、鹼基部及磷酸部之至少1者經修飾之核苷酸的7~100個核苷酸所構成,L’係源自以其兩端分別與前述第一寡核苷酸及第四寡核苷酸共價鍵結且在生理條件下被分解之第五寡核苷酸的基,前述第四寡核苷酸具有可與標的RNA雜交之反義序列)。
  20. 如請求項19之單股寡核苷酸,其中X’包含至少1個糖部修飾核苷酸,前述第四寡核苷酸所具有的反義序列係包含與標的RNA雜交時被RNaseH辨識之至少4個連續的核苷酸的序列。
  21. 如請求項19之單股寡核苷酸,其中前述第四寡核苷酸所包含之反義序列部分包含至少1個糖部修飾核苷酸,且不包含由連續之4個去氧核糖核苷酸所構成之寡核苷酸鏈。
  22. 如請求項20之單股寡核苷酸,其中前述第四寡核苷酸所包含之反義序列部分與前述第二寡核苷酸之至少一部分雜交。
  23. 如請求項19之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸所含之核苷酸係以磷酸二酯鍵互相連結。
  24. 如請求項19之單股寡核苷酸,其中第五寡核苷酸為DNA或RNA。
  25. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中包含鄰接鍵結於前述反義序列部分之5’側及3’側之至少一方的糖部修飾核苷酸。
  26. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中包含鄰接鍵結於前述反義序列部分之5’側及3’側的糖部修飾核苷酸。
  27. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中前述反義序列係由包含至少1個去氧核糖核苷酸之4~20個核苷酸所構成的序列。
  28. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中前述反義序列部分包含硫代磷酸酯鍵。
  29. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中前述糖部修飾核苷酸係選自由己醣醇核苷酸、環己烯核苷酸、胜肽核酸、甘醇核酸、蘇糖核苷酸、嗎啉基核酸、三環-DNA、2’-O-甲基化核苷酸、2’-O-甲氧基乙基化核苷酸、2’-O-胺基丙基化核苷酸、2’-氟化核苷酸、2’-F-阿糖核苷酸、橋接化核苷酸及2’-O-甲基胺甲醯基乙基化核苷酸所成群中之至少1種。
  30. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中Y包含5’端或3’端。
  31. 如請求項1之單股寡核苷酸,其中進一步包含源自機能性分子的基,該機能性分子具有選自由標識機能、純化機能及送達至標的部位的機能所成群組中之至少1種的機能。
  32. 如請求項31之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係自由糖、脂質、胜肽及蛋白質以及該等之衍生物所成群組中選擇。
  33. 如請求項31之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由膽固醇、生殖酚及參雙鍵生殖酚所成群組中之脂質。
  34. 如請求項31之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係與唾液酸糖蛋白受體進行相互作用之糖衍生物。
  35. 如請求項31之單股寡核苷酸,其中前述機能性分子係選自由受體之配體及抗體所成群組中之胜肽或蛋白質。
  36. 一種醫藥組成物,其包含如請求項1至35中任1項之單股寡核苷酸與藥理學上許可之載體。
  37. 一種控制標的RNA之機能的方法,其包含使如請求項1至35中任1項之單股寡核苷酸與培養細胞接觸的步驟。
  38. 一種如請求項1至35中任1項之單股寡核苷酸之製造方法,其包含在包含X、L及Y之至少1個的寡核 苷酸之3’端或5’端伸長核苷酸鏈的步驟。
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