TWI757759B - 細胞毒性苯并二氮呯衍生物 - Google Patents

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Abstract

本發明係關於具有抗增殖活性之苯并二氮呯衍生物,且更具體言之,係關於具有式(I)-(VI)之新穎苯并二氮呯化合物。本發明亦提供該等苯并二氮呯化合物連接至細胞結合劑之偶聯物。本發明進一步提供可用於在哺乳動物中使用本發明之化合物或偶聯物抑制異常細胞生長或治療增生性病症的組成物及方法。

Description

細胞毒性苯并二氮呯衍生物
本發明係關於新穎細胞毒性化合物及包含該等細胞毒性化合物及細胞結合劑之細胞毒性偶聯物。更具體言之,本發明係關於可用作藥物,特別是用作抗增生劑之新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物、其中間物、其偶聯物及其醫藥學上可接受之鹽。 [相關申請案之引用]
本申請案依據35 U.S.C. §119(e)要求在2014年9月3日提交之美國臨時申請案號62/045,248、2014年12月3日提交之美國臨時申請案號62/087,040、2015年4月17日提交之美國臨時申請案號62/149,370及2015年5月20日提交之美國臨時申請案號62/164,305之提交日之權益,各案之完整內容,包括所有附圖、化學式、說明書及申請專利範圍,均以引用之方式併入本文中。
苯并二氮呯衍生物為適用於治療各種病症之化合物,並且包括諸如抗癲癇藥(咪唑并[2,1-b][1,3,5]苯并硫雜二氮呯,美國專利號4,444,688;美國專利號4,062,852)、抗細菌劑(嘧啶并[1,2-c][1,3,5]苯并硫雜二氮呯,GB 1476684)、利尿劑及降血壓劑(吡咯并(1,2-b)[1,2,5]苯并硫雜二氮呯5,5二氧化物,美國專利號3,506,646)、降血脂藥(WO 03091232)、抗抑鬱劑(美國專利號3,453,266)、骨質疏鬆症(JP 2138272)之藥物。
在動物腫瘤模型中已顯示,苯并二氮呯衍生物,例如吡咯并苯并二氮呯(PBD),充當抗腫瘤劑(N-2-咪唑基烷基取代之1,2,5-苯并硫雜二氮呯-1,1-二氧化物,美國專利號6,156,746)、苯并-吡啶并或二吡啶并硫雜二氮呯(WO 2004/069843)、吡咯并[1,2-b] [1,2,5]苯并硫雜二氮呯及吡咯并[1,2-b][1,2,5]苯并二氮呯衍生物(WO2007/015280)、茅屋黴素衍生物(tomaymycin derivative)(例如,吡咯并[1,4]苯并二氮呯),諸如WO 00/12508、WO2005/085260、WO2007/085930及EP 2019104中描述之該等苯并二氮呯衍生物。亦已知苯并二氮呯可影響細胞生長及分化(Kamal A.等人, Bioorg Med Chem. 2008年8月15日;16(16):7804-10 (及其中引用之參考文獻);Kumar R, Mini Rev Med Chem. 2003年6月; 3(4):323-39 (及其中引用之參考文獻);Bednarski J J等人, 2004;Sutter A. P等人, 2002;Blatt N B等人, 2002), Kamal A.等人, Current Med. Chem., 2002;2;215-254, Wang J-J., J.Med. Chem., 2206;49:1442-1449, Alley M.C.等人, Cancer Res. 2004;64:6700-6706, Pepper C. J., Cancer Res 2004;74:6750-6755, Thurston D.E.及Bose D.S., Chem Rev 1994;94:433-465;及Tozuka, Z.等人, Journal of Antibiotics, (1983) 36;1699-1708。PBD之一般結構描述於美國公開案號20070072846中。各PBD在取代基之數量、類型及位置;其芳族A環及吡咯并C環;以及C環飽和度方面有所不同。其在小溝中形成加合物及交聯DNA之能力使其能夠干擾DNA加工,由此其有可能用作抗增生劑。
最先進入臨床之吡咯并苯并二氮呯SJG-136 (NSC 694501)係引起DNA鏈間交聯之有效細胞毒性劑(S.G Gregson等人, 2001,J. Med. Chem ., 44: 737-748;M.C. Alley等人, 2004,Cancer Res ., 64: 6700-6706;J.A. Hartley等人, 2004,Cancer Res ., 64: 6693-6699;C. Martin等人, 2005,Biochemistry ., 44: 4135-4147;S. Arnould等人, 2006,Mol. Cancer Ther ., 5: 1602-1509)。由SJG-136之I期臨床評價得到的結果揭露,此藥物在極低劑量(最大耐受劑量為45 μg/m2 )下具有毒性,且觀察到若干不良作用,包括血管滲漏症候群、外周性水腫、肝毒性及疲勞。在所有劑量下,在循環淋巴細胞中觀察到DNA損傷(D. Hochhauser等人, 2009,Clin. Cancer Res ., 15: 2140-2147)。因此,需要毒性較低且仍對於治療諸如癌症之多種增生性疾病具有治療活性的改良之苯并二氮呯衍生物。
本文所描述之新穎苯并二氮呯化合物及其偶聯物針對各種腫瘤細胞具有意外地高效力。
本發明一個目的係提供一種由下式中之任一個表示之細胞毒性化合物:
Figure 02_image003
Figure 02_image005
Figure 02_image007
Figure 02_image009
Figure 02_image011
;或
Figure 02_image013
, 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: L’、L’’及L’’’之一係由下式表示: -Z1 -P-Z2 -Rx -J            (A) 且其餘兩個相同或不同,且獨立地選自-H;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;鹵素;胍鎓[-NH(C=NH)NH2 ];-OR;-NR’R’’;-NO2 ;-NR’COR’’;-SR;-SOR’;-SO2 R’;-SO3 H;-OSO3 H;-SO2 NR’R’’;氰基;疊氮基;-COR’;-OCOR’;及-OCONR’R’’; Z1 及Z2 之一為-C(=O)-,且另一個為–NR5 -; P為胺基酸殘基或含有介於2至20個之間之胺基酸殘基的肽; Rx 為視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基; J為包含能夠將該細胞毒性化合物共價連接至細胞結合劑之反應性基團的部分; 在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示單鍵或雙鍵,條件為當其為雙鍵時,X不存在且Y為-H或具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基,且當其為單鍵時,X為-H或胺保護部分; Y為選自以下之離去基團:-OR、-OCOR’、-OCOOR’、-OCONR’R’’、-NR’R’’、-NR’COR’’、-NR’NR’R’’、視情況經取代之5員或6員含氮雜環(例如,經由氮原子附接之哌啶、四氫吡咯、吡唑、嗎啉等)、由-NR’(C=NH)NR’R’’表示之胍鎓、胺基酸殘基或由-NRCOP’表示之肽、-SR、-SOR’、鹵素、氰基、疊氮基、-OSO3 H、亞硫酸酯基(-SO3 H或-SO2 H)、偏亞硫酸氫酯(H2 S2 O5 )、單-、二-、三-及四-硫代磷酸酯(PO3 SH3 、PO2 S2 H2 、POS3 H2 、PS4 H2 )、硫代磷酸酯(Ri O)2 PS(ORi )、Ri S-、Ri SO、Ri SO2 、Ri SO3 、硫代硫酸酯(HS2 O3 )、連二亞硫酸酯(HS2 O4 )、二硫代磷酸酯(P(=S)(ORk’ )(S)(OH))、羥肟酸(Rk’ C(=O)NOH)及甲醛次硫酸根(HOCH2 SO2 - ),或其混合物,其中Ri 為具有1至10個碳原子之直鏈或分支鏈烷基,且經至少一個選自-N(Rj )2 、-CO2 H、-SO3 H及-PO3 H之取代基取代;Ri 可進一步視情況經本文關於烷基所描述之取代基取代;Rj 為具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基;Rk’ 為具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;芳基;雜環基;或雜芳基; P’為胺基酸殘基或含有介於2至20個之間之胺基酸殘基的多肽; R在每次出現時獨立地選自由以下各物組成之群:-H;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;視情況經取代的具有6至18個碳原子之芳基;視情況經取代的含有一個或多個獨立地選自氮、氧及硫之雜原子的5員至18員雜芳基;或視情況經取代的含有1至6個獨立地選自O、S、N及P之雜原子的3員至18員雜環; R’及R’’各自獨立地選自-H;-OH;-OR;-NHR;-NR2 ;-COR;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;及視情況經取代的具有1至6個獨立地選自O、S、N及P之雜原子的3員至18員雜環; Rc 為-H,或視情況經取代的具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基; n為1至24之整數; X’係選自-H;胺保護基;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;視情況經取代的具有6至18個碳原子之芳基;視情況經取代的含有一個或多個獨立地選自氮、氧及硫之雜原子的5員至18員雜芳基環;及視情況經取代的含有1至6個獨立地選自O、S、N及P之雜原子的3員至18員雜環; Y’係選自-H;側氧基;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;視情況經取代之6員至18員芳基;視情況經取代的含有一個或多個獨立地選自氮、氧及硫之雜原子的5員至18員雜芳基環;視情況經取代的含有1至6個雜原子之3員至18員雜環; R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’各自獨立地選自由以下各物組成之群:-H;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;鹵素;胍鎓[-NH(C=NH)NH2 ];-OR;-NR’R’’;-NO2 ;-NCO;-NR’COR’’;-SR;-SOR’;-SO2 R’;-SO3 - H;-OSO3 H;-SO2 NR’R’’;氰基;疊氮基;-COR’;-OCOR’;及-OCONR’R’’; R6 為-H、-R、-OR、-SR、-NR’R’’、-NO2 或鹵素; G為–CH-或–N-; A與A’相同或不同,且獨立地選自-O-、側氧基(-C(=O)-)、-CRR’O-、-CRR’-、-S-、-CRR’S-、-NR5 及-CRR’N(R5 )-;且 R5 在每次出現時獨立地為-H,或視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈或分支鏈烷基。
在一個實施例中,對於具有結構式(I)-(VI)之化合物,G為–CH-。
本發明另一目的係提供細胞結合劑與本發明之新穎苯并二氮呯化合物或其衍生物的偶聯物。該等偶聯物可用作治療劑,其特異性遞送至靶細胞且具有細胞毒性。
詳言之,本發明之偶聯物可包含:細胞毒性化合物與細胞結合劑(CBA),其中該細胞毒性化合物共價連接至該CBA,且其中該細胞毒性化合物係由下式中之任一個表示:
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Figure 02_image019
Figure 02_image021
Figure 02_image023
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;或
Figure 02_image027
, 或其醫藥學上可接受之鹽,其中: L’、L’’及L’’’之一係由下式表示: -Z1 -P-Z2 -Rx -J’           (A’) 且其餘兩個相同或不同,且獨立地選自-H;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元-(CH2 CH2 O)n -Rc ;鹵素;胍鎓[-NH(C=NH)NH2 ];-OR;-NR’R’’;-NO2 ;-NR’COR’’;-SR;由-SOR’表示之亞碸;由-SO2 R’表示之碸;磺酸酯基-SO3 M;硫酸酯基-OSO3 M;由-SO2 NR’R’’表示之磺醯胺;氰基;疊氮基;-COR’;-OCOR’;及-OCONR’R’’; J’為包含共價連接至該細胞結合劑之連接基團的部分;且 其餘變數係如以上關於式(I)-(VI)所描述。
在一個實施例中,對於具有結構式(I’)-(VI’)之偶聯物,G為–CH-。
在另一實施例中,對於具有結構式(I’)-(VI’)之偶聯物,該細胞結合劑為抗葉酸受體抗體或其抗體片段。更具體言之,該抗葉酸受體抗體為huMOV19抗體。
在又另一實施例中,對於具有結構式(I’)-(VI’)之偶聯物,該細胞結合劑為抗EGFR抗體或其抗體片段。在一個實施例中,該抗EGFR抗體為非拮抗劑抗體,包括例如WO2012058592(以引用之方式併入本文中)中所描述之抗體。在另一實施例中,抗EGFR抗體為非功能性抗體,例如人類化ML66。更具體言之,抗EGFR抗體為huML66。
本發明亦包括一種組成物(例如醫藥組成物),其包含新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)及載劑(醫藥學上可接受之載劑)。本發明另外包括一種組成物(例如醫藥組成物),其包含新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)及載劑(醫藥學上可接受之載劑),另外包含第二治療劑。本發明之組成物可用於在哺乳動物(例如人類)中抑制異常細胞生長或治療增生性病症。本發明之組成物可用於治療哺乳動物(例如人類)之病狀,諸如癌症、類風濕性關節炎、多發性硬化、移植物抗宿主疾病(GVHD)、移植排斥反應、狼瘡、肌炎、感染、免疫缺陷(諸如AIDS)及發炎性疾病。
本發明包括一種在哺乳動物(例如人類)中抑制異常細胞生長或治療增生性病症之方法,該方法包括向該哺乳動物施用單獨或與第二治療劑組合的治療有效量之新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)或其組成物。
本發明包括一種合成及使用新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物及其偶聯物以在活體外、原位及活體內診斷或治療哺乳動物細胞、生物體或相關病理病狀的方法。
本發明之化合物、其衍生物或其偶聯物及包含其之組成物可用於治療或減輕諸如以細胞異常生長為特徵之病症(例如癌症)之嚴重程度。本發明之化合物及組成物的其他應用包括但不限於,治療哺乳動物(例如人類)之病狀,諸如癌症、類風濕性關節炎、多發性硬化、移植物抗宿主疾病(GVHD)、移植排斥反應、狼瘡、肌炎、感染、免疫缺陷(諸如AIDS)及發炎性疾病。
現將更詳細地提及本發明某些實施例,其實例以所附結構及化學式說明。儘管本發明將結合所列舉之實施例進行描述,但應瞭解,其不意欲將本發明局限於該等實施例。正相反,本發明意欲涵蓋可包括在由申請專利範圍所界定之本發明之範圍內的所有替代方案、修改及等效內容。熟習此項技術者將認識到與本文所描述之方法及材料類似或等效的許多方法及材料,其可用於實踐本發明。
應瞭解,除非清楚地否定或不恰當,否則本文所描述之任何實施例,包括在本發明不同態樣及本說明書不同部分(包括僅在實例中描述之實施例)下描述之該等實施例(例如化合物、化合物-連接子分子、偶聯物、組成物、製備及使用方法)可與本發明之一個或多個其他實施例組合。實施例組合不限於經由多個附屬申請專利範圍要求之該等具體實施例。 定義
如本文所使用,術語「細胞結合劑 」或「CBA 」係指可結合細胞(例如,在細胞表面配體上)或結合與細胞相連或鄰近細胞之配體(較佳以一種特異性方式結合)之化合物。在某些實施例中,與細胞或者細胞上或細胞附近之配體結合係特異性的。CBA可包括肽及非肽。
如本文所使用,「直鏈分支鏈烷基 」係指具有一至二十個碳原子之飽和直鏈或分支鏈單價烴基。烷基之實例包括但不限於,甲基、乙基、1-丙基、2-丙基、1-丁基、2-甲基-1-丙基、-CH2 CH(CH3 )2 、2-丁基、2-甲基-2-丙基、1-戊基、2-戊基、3-戊基、2-甲基-2-丁基、3-甲基-2-丁基、3-甲基-1-丁基、2-甲基-1-丁基、1-己基、2-己基、3-己基、2-甲基-2-戊基、3-甲基-2-戊基、4-甲基-2-戊基、3-甲基-3-戊基、2-甲基-3-戊基、2,3-二甲基-2-丁基、3,3-二甲基-2-丁基、1-庚基、1-辛基及類似基團。較佳地,烷基具有一至十個碳原子。更佳地,烷基具有一至四個碳原子。
直鏈分支鏈烯基 」係指具有兩個至二十個碳原子及至少一個不飽和位點(亦即,碳-碳雙鍵)之直鏈或分支鏈單價烴基,其中烯基包括具有「順式」及「反式」取向,或替代地具有「E」及「Z」取向之基團。實例包括但不限於,乙烯基(-CH=CH2 )、丙烯基(-CH2 CH=CH2 )及類似基團。較佳地,烯基具有兩個至十個碳原子。更佳地,烯基具有兩個至四個碳原子。
直鏈分支鏈炔基 」係指具有兩個至二十個碳原子及至少一個不飽和位點(亦即,碳-碳參鍵)之直鏈或分支鏈單價烴基。實例包括但不限於,乙炔基、丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-戊炔基、己炔基及類似基團。較佳地,炔基具有兩個至十個碳原子。更佳地,炔基具有兩個至四個碳原子。
術語「碳環 」、「碳環基 」及「碳環狀環 」係指具有3至12個碳原子(單環形式)或具有7至12個碳原子(雙環形式)的單價非芳族飽和或部分不飽和環。具有7至12個碳原子之雙環碳環可例如按雙環[4,5]、[5,5]、[5,6]或[6,6]系統形式佈置,且具有9或10個環原子之雙環碳環可按雙環[5,6]或[6,6]系統形式佈置,或按橋接系統形式佈置,諸如雙環[2.2.1]庚烷、雙環[2.2.2]辛烷及雙環[3.2.2]壬烷。單環碳環之實例包括但不限於,環丙基、環丁基、環戊基、1-環戊-1-烯基、1-環戊-2-烯基、1-環戊-3-烯基、環己基、1-環己-1-烯基、1-環己-2-烯基、1-環己-3-烯基、環己二烯基、環庚基、環辛基、環壬基、環癸基、環十一烷基、環十二烷基及類似基團。
術語「環狀烷基 」及「環烷基 」可互換使用。該等術語係指單價飽和碳環基團。較佳地,環狀烷基為3員至7員單環基團。更佳地,環狀烷基為環己基。
術語「環狀烯基 」係指在環結構中具有至少一個雙鍵之碳環基團。
術語「環狀炔基 」係指在環結構中具有至少一個參鍵之碳環基團。
芳基 」意思指藉由自母體芳族環系統之單一碳原子移除一個氫原子得到的具有6至18個碳原子之單價芳族烴基。一些芳基在示例性結構中以「Ar」表示。芳基包括含與飽和、部分不飽和環或芳族碳環或雜環稠合之芳族環的雙環基團。典型的芳基包括但不限於,衍生自苯(苯基)、經取代苯、萘、蒽、茚基、二氫茚基、1,2-二氫萘、1,2,3,4-四氫萘基及類似基團之基團。較佳地,芳基為苯基。
術語「雜環 」、「雜環基 」及「雜環狀環 」在本文中可互換使用,且指至少一個環原子為選自氮、氧、磷及硫之雜原子且其餘環原子為C的具有3至18個環原子之飽和或部分不飽和(亦即,在環內具有一個或多個雙鍵及/或參鍵)碳環基團,其中一個或多個環原子視情況獨立地經一個或多個以下描述之取代基取代。雜環可為具有3至7個環成員(2至6個碳原子及1至4個選自N、O、P及S之雜原子)之單環,或具有7至10個環成員(4至9個碳原子及1至6個選自N、O、P及S之雜原子)之雙環,例如:雙環[4,5]、[5,5]、[5,6]或[6,6]系統。雜環描述於Paquette, Leo A.; 「Principles of Modern Heterocyclic Chemistry」 (W. A. Benjamin, New York, 1968),具體言之,第1、3、4、6、7及9章;「The Chemistry of Heterocyclic Compounds, A series of Monographs」 (John Wiley & Sons, New York, 1950至今),具體言之,第13、14、16、19及28卷;及J. Am. Chem. Soc. (1960) 82:5566中。「雜環基 」亦包括雜環基團與飽和、部分不飽和環或芳族碳環或雜環稠合的基團。雜環之實例包括但不限於,吡咯啶基、四氫呋喃基、二氫呋喃基、四氫噻吩基、四氫哌喃基、二氫哌喃基、四氫硫代哌喃基、N-哌啶基(piperidino)、N-嗎啉基(morpholino)、硫代嗎啉基、氧硫雜環己基、哌嗪基、高哌嗪基、吖丁啶基、氧雜環丁基、硫雜環丁基、高哌啶基、氧雜環庚基、硫雜環庚基、氧氮呯基、二氮呯基、硫氮呯基(thiazepinyl)、2-吡咯啉基、3-吡咯啉基、吲哚啉基、2H-哌喃基、4H-哌喃基、二噁烷基、1,3-二氧雜環戊基、吡唑啉基、二硫雜環己基、二硫雜環戊烯基、二氫哌喃基、二氫噻吩基、二氫呋喃基、吡唑啶基、咪唑啉基、咪唑啶基、3-氮雜雙環[3.1.0]己基、3-氮雜雙環[4.1.0]庚基及氮雜雙環[2.2.2]己基。在此定義之範圍內亦包括螺部分。環原子經側氧基(=O)部分取代之雜環基團的實例有嘧啶酮基及1,1-二側氧基-硫嗎啉基。
術語「雜芳基 」係指含有一個或多個獨立地選自氮、氧及硫之雜原子的具有5員或6員環之單價芳族基團,且包括具有5-18個原子之稠環系統(其中至少一個為芳族環)。雜芳基之實例為吡啶基(包括例如,2-羥基吡啶基)、咪唑基、咪唑并吡啶基、嘧啶基(包括例如,4-羥基嘧啶基)、吡唑基、三唑基、吡嗪基、四唑基、呋喃基、噻吩基、異噁唑基、噻唑基、噁唑基、異噻唑基、吡咯基、喹啉基、異喹啉基、吲哚基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、噌啉基、吲唑基、吲哚嗪基、呔嗪基、噠嗪基、三嗪基、異吲哚基、喋啶基、嘌呤基、噁二唑基、三唑基、噻二唑基、呋呫基、苯并呋呫基、苯并噻吩基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、喹唑啉基、喹喏啉基、萘啶基及呋喃并吡啶基。
若可能,雜環或雜芳基可為碳附接的(碳連接的)或氮附接的(氮連接的)。舉例而言且非限制,碳鍵結之雜環或雜芳基係在吡啶之2、3、4、5或6位鍵結,在噠嗪之3、4、5或6位鍵結,在嘧啶之2、4、5或6位鍵結,在吡嗪之2、3、5或6位鍵結,在呋喃、四氫呋喃、硫代呋喃、噻吩、吡咯或四氫吡咯之2、3、4或5位鍵結,在噁唑、咪唑或噻唑之2、4或5位鍵結,在異噁唑、吡唑或異噻唑之3、4或5位鍵結,在氮丙啶之2或3位鍵結,在吖丁啶之2、3或4位鍵結,在喹啉之2、3、4、5、6、7或8位鍵結,或在異喹啉之1、3、4、5、6、7或8位鍵結。
舉例而言且非限制,氮鍵結之雜環或雜芳基係在氮丙啶、吖丁啶、吡咯、吡咯啶、2-吡咯啉、3-吡咯啉、咪唑、咪唑啶、2-咪唑啉、3-咪唑啉、吡唑、吡唑啉、2-吡唑啉、3-吡唑啉、哌啶、哌嗪、吲哚、吲哚啉、1H-吲唑之1位;異吲哚或異吲哚啉之2位;嗎啉之4位;及咔唑或O-咔啉之9位處鍵結。
雜芳基或雜環基中存在之雜原子包括氧化形式,諸如NO、SO及SO2
術語「鹵基 」或「鹵素 」係指F、Cl、Br或I。
上述烷基、烯基、炔基、環狀烷基、環狀烯基、環狀炔基、碳環基、芳基、雜環基及雜芳基可視情況經超過一個(例如2、3、4、5、6或更多個)取代基取代。
若取代基被描述為「經取代 ,則非氫取代基係在該取代基之碳、氧、硫或氮上氫取代基之位置。因此,例如,經取代之烷基取代基係至少一個非氫取代基處於烷基取代基上氫取代基之位置的烷基取代基。為了說明,單氟烷基係經氟取代基取代之烷基,且二氟烷基係經兩個氟取代基取代之烷基。應認識到,若在一個取代基上存在超過一個取代,則每一非氫取代基可相同或不同(除非另作陳述)。
若一個取代基被描述為「視情況經取代 」,則該取代基可為(1)未經取代,或(2)經取代的。若取代基之碳被描述為視情況經取代基清單中之一個或多個取代,則該碳上之一個或多個氫(其範圍為存在之任何數量)可獨立地及/或一起經獨立選擇的視情況存在之取代基置換。若取代基之氮被描述為視情況經取代基清單中之一個或多個取代,則該氮上之一個或多個氫(其範圍為存在之任何數量)可各自經獨立選擇的視情況存在之取代基置換。一個示例性取代基可以-NR’R’’描繪,其中R’及R’’連同其所附接之氮原子一起可形成雜環。由R’及R’’連同其所附接之氮原子一起形成之雜環可為部分或完全飽和的。在一個實施例中,雜環由3至7個原子組成。在另一個實施例中,該雜環係選自由吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基、四唑基、異噁唑基、吡啶基及噻唑基組成之群。
本說明書使用了可互換之術語「取代基 」、「基團 (radical )」及「基團 (group )」。
若一組取代基共同地描述為視情況經取代基清單中之一個或多個取代,則該組可包括:(1)不可取代之取代基;(2)未經視情況存在之取代基取代的可取代之取代基;及/或(3)經一個或多個視情況存在之取代基取代的可取代之取代基。
若一個取代基被描述為視情況經特定數量之非氫取代基取代,則該取代基可(1)未經取代;或(2)經至多該特定數量之非氫取代基或經至多該取代基上最大數量之可取代位置取代,以數量較小的為準。因此,例如,若一個取代基被描述為視情況經至多3個非氫取代基取代之雜芳基,則具有少於3個可取代位置之任何雜芳基將視情況經至多僅該雜芳基所具有之可取代位置之數量的非氫取代基取代。在非限制性實例中,此類取代基可選自具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;芳基;雜芳基;雜環基;鹵素;胍鎓[-NH(C=NH)NH2 ];-OR100 ;NR101 R102 ;-NO2 ;-NR101 COR102 ;-SR100 ;以-SOR101 表示之亞碸;以-SO2 R101 表示之碸;磺酸酯基-SO3 M;硫酸酯基-OSO3 M;以-SO2 NR101 R102 表示之磺醯胺;氰基;疊氮基;-COR101 ;-OCOR101 ;-OCONR101 R102 ;及聚乙二醇單元(-CH2 CH2 O)n R101 ,其中M為H或陽離子(諸如Na+ 或K+ ),R101 、R102 及R103 各自獨立地選自H;具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元(-CH2 CH2 O)n -R104 ,其中n係1至24之整數;具有6至10個碳原子之芳基;具有3至10個碳原子之雜環,及具有5至10個碳原子之雜芳基,且R104 為H,或具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基,其中以R100 、R101 、R102 、R103 及R104 表示之基團中的烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基及雜環基視情況經一個或多個(例如2、3、4、5、6或更多個)獨立地選自以下之取代基取代:鹵素、-OH、-CN、-NO2 ,及具有1至4個碳原子之未經取代之直鏈或分支鏈烷基。較佳地,上述視情況經取代之烷基、烯基、炔基、環狀烷基、環狀烯基、環狀炔基、碳環基、芳基、雜環基及雜芳基的取代基包括鹵素、-CN、-NR102 R103 、-CF3 、-OR101 、芳基、雜芳基、雜環基、-SR101 、-SOR101 、-SO2 R101 及-SO3 M。
術語「化合物 或「細胞毒性化合物 」、「細胞毒性二聚體 」及「細胞毒性二聚體化合物 」可互換使用。其意欲包括結構或化學式或其任何衍生物已在本發明中揭示,或結構或化學式或其任何衍生物已以引用之方式併入的化合物。該術語亦包括本發明中所揭示之所有化學式之化合物的立體異構體、幾何異構體、互變異構體、溶劑化物、代謝物、鹽(例如醫藥學上可接受之鹽)及前藥,以及前藥鹽。該術語亦包括前述任一種之任何溶劑化物、水合物及多晶形物。在本申請案中所描述的本發明之某些態樣中,有關「立體異構體」、「幾何異構體」、「互變異構體」、「溶劑化物」、「代謝物」、「鹽」、「前藥」、「前藥鹽」、「偶聯物」、「偶聯物鹽」、「溶劑化物」、「水合物」或「多晶形物」之具體陳述不應解釋為意圖在未使用該等其他形式陳述術語「化合物」的本發明之其他態樣中省略該等形式。
如本文所使用,術語「偶聯物 」係指連接至細胞結合劑的本文所描述之化合物或其衍生物。
如本文所使用,術語「可連接至細胞結合劑 」係指包含至少一個適於將化合物或其衍生物鍵結至細胞結合劑之連接基團或其前驅物的本文所描述之化合物或其衍生物。
術語給定基團之「前驅物 」係指可藉由任何脫保護、化學改質或偶合反應而產生該基團的任何基團。
術語「連接至細胞結合劑 」係指包含經由適合連接基團或其前驅物結合至細胞結合劑的本文所描述之化合物(例如式(I)-(IV)及(VIII)-(XI)之化合物及本文所描述之藥物-連接子化合物)或其衍生物中至少一種的偶聯物分子。
術語「手性 」係指具有鏡像搭配物不可重疊性之特性的分子,而術語「非手性」係指在其鏡像搭配物可重疊上之分子。
術語「立體異構體 」係指具有相同化學構造及連接性,但其原子在空間中之取向不同且無法藉由關於單鍵旋轉而互變的化合物。
非對映異構體 」係指具有兩個或更多個手性中心且分子間不呈鏡像之立體異構體。非對映異構體具有不同的物理特性,例如熔點、沸點、光譜特性及反應性。非對映異構體混合物可依據高解析度分析程序,諸如結晶、電泳及層析法分離。
對映異構體 」係指一種化合物的具有彼此不可重疊之鏡像的兩種立體異構體。
本文所使用之立體化學定義及慣例一般遵循S. P. Parker編輯, McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms (1984) McGraw-Hill Book Company, New York;以及Eliel, E.及Wilen, S., 「Stereochemistry of Organic Compounds」, John Wiley & Sons, Inc., New York, 1994。本發明之化合物可含有不對稱或手性中心,且因此以不同立體異構形式存在。預期本發明化合物之所有立體異構形式,包括但不限於,非對映異構體、對映異構體及構型異構體,以及其混合物,諸如外消旋混合物,形成本發明之一部分。許多有機化合物以光學活性形式存在,亦即,其能夠旋轉平面偏振光之平面。在描述光學活性化合物時,使用了前綴D及L,或R及S來指示該分子關於其手性中心之絕對構型。前綴d及l或(+)及(-)用於指示化合物旋轉平面偏振光之標記,其中(-)或1意味著該化合物為左旋的。具有前綴(+)或d之化合物為右旋的。對於指定化學結構,該等立體異構體係相同的,不過其彼此呈鏡像。特定立體異構體亦可稱為對映異構體,且此類異構體之混合物常稱為對映異構體混合物。對映異構體之50:50混合物稱為外消旋混合物或外消旋物,其可在化學反應過程中無立體選擇性或立體特異性情況下出現。術語「外消旋混合物」及「外消旋物」係指兩種對映異構物質之等莫耳量混合物,不管光學活性如何。
術語「互變異構體 」或「互變異構形式 」係指可經由低能量障壁互變的具有不同能量之結構異構體。舉例而言,質子互變異構體(亦稱為質子轉移互變異構體)包括經由質子移動引起之互變,諸如酮-烯醇及醯亞胺-烯胺異構。價鍵異構體包括由一些鍵結電子再組織引起的互變。
如本申請案中所使用,術語「前藥 」係指能夠酶促或水解活化或者轉化成更具活性之活性母體形式的本發明化合物之前驅物或衍生物形式。參見例如,Wilman, 「Prodrugs in Cancer Chemotherapy」, Biochemical Society Transactions, 14, 第375-382頁, 615th Meeting Belfast (1986);及Stella等人, 「Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery」, Directed Drug Delivery, Borchardt等人(編輯), 第247-267頁, Humana Press (1985)。本發明之前藥包括但不限於,含酯前藥、含磷酸酯前藥、含硫代磷酸酯前藥、含硫酸酯前藥、含肽前藥、D-胺基酸修飾之前藥、糖基化前藥、含β-內醯胺之前藥、含視情況經取代之苯氧基乙醯胺的前藥、含視情況經取代之苯基乙醯胺的前藥、5-氟胞嘧啶及其他5-氟尿嘧啶前藥,其可轉化成更具活性之細胞毒性遊離藥物。可衍生化成用於本發明中之前藥形式的細胞毒性藥物之實例包括但不限於,本發明之化合物及化學治療劑,如以上所描述。
術語「前藥 」亦意欲包括在生物條件(活體外或活體內)下可水解、氧化或以其他方式反應而提供本發明化合物的化合物之衍生物。前藥可能僅在生物條件下反應時變得有活性,或其可在呈其未反應形式時具有活性。本發明所涵蓋之前藥的實例包括但不限於,具有本文所揭示之任一化學式之化合物的類似物或衍生物,其包含可生物水解部分,諸如可生物水解之醯胺、可生物水解之酯、可生物水解之胺基甲酸酯、可生物水解之碳酸酯、可生物水解之醯脲及可生物水解之磷酸酯類似物。前藥之其他實例包括了包含-NO、-NO2 、-ONO或-ONO2 部分的具有本文所揭示之任一化學式之化合物的衍生物。前藥可典型地使用熟知方法製備,諸如Burger’s Medicinal Chemistry and Drug Discovery (1995) 172-178, 949-982 (Manfred E. Wolff編輯, 第5版)所描述之方法;亦參見Goodman及Gilman, The Pharmacological basis of Therapeutics, 第8版, McGraw-Hill, Int.編輯, 1992, 「Biotransformation of Drugs」。
本發明前藥之一種較佳形式包括含本發明之化合物/偶聯物之亞胺鍵與亞胺反應性試劑之間形成之加合物的本發明化合物(存在或不存在連接基團)及偶聯物。本發明前藥之另一較佳形式包括諸如具有式(I) - (IV)之化合物,其中當N與C之間之雙線
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表示單鍵時,X為H或胺保護基,且該化合物變為前藥。本發明之前藥可含有本文所述前藥之一種或兩種形式(例如含有在化合物/偶聯物之亞胺鍵與亞胺反應性試劑之間形成的加合物,及/或當X為-H時含有Y離去基團)。
術語「亞胺反應性試劑 」係指能夠與亞胺基團反應之試劑。亞胺反應性試劑之實例包括但不限於,亞硫酸鹽(H2 SO3 、H2 SO2 ,或HSO3 - 、SO3 2- 或HSO2 - 與陽離子形成之鹽);偏亞硫酸氫鹽(H2 S2 O5 ,或S2 O5 2- 與陽離子形成之鹽);單-、二-、三-及四-硫代磷酸鹽(PO3 SH3 、PO2 S2 H3 、POS3 H3 、PS4 H3 ,或PO3 S3- 、PO2 S2 3- 、POS3 3- 或PS4 3- 與陽離子形成之鹽);硫代磷酸酯((Ri O)2 PS(ORi )、Ri SH、Ri SOH、Ri SO2 H、Ri SO3 H);各種胺(羥胺(例如NH2 OH)、肼(例如NH2 NH2 )、NH2 O-Ri 、Ri ’NH-Ri 、NH2 -Ri )、NH2 -CO-NH2 、NH2 -C(=S)-NH2 ;硫代硫酸鹽(H2 S2 O3 ,或S2 O3 2- 與陽離子形成之鹽);連二亞硫酸鹽(H2 S2 O4 ,或S2 O4 2- 與陽離子形成之鹽);二硫代磷酸鹽(P(=S)(ORk )(SH)(OH),或其與陽離子形成之鹽);異羥肟酸(Rk C(=O)NHOH,或與陽離子形成之鹽);醯肼(Rk CONHNH2 );甲醛次硫酸鹽(HOCH2 SO2 H,或HOCH2 SO2 - 與陽離子形成之鹽,諸如HOCH2 SO2 - Na+ );糖化核苷酸(諸如GDP-甘露糖);氟達拉濱(fludarabine);或其混合物,其中Ri 及Ri’ 各自獨立地為具有1至10個碳原子之直鏈或分支鏈烷基且經至少一個選自-N(Rj )2 、-CO2 H、-SO3 H及-PO3 H之取代基取代;Ri 及Ri’ 可進一步視情況本文所述之烷基取代基取代;Rj 係具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基;且Rk 係具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;芳基;雜環基;或雜芳基(較佳Rk 係具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基;更佳Rk 為甲基、乙基或丙基)。較佳地,該陽離子為單價陽離子,諸如Na+ 或K+ 。較佳地,亞胺反應性試劑係選自亞硫酸鹽、羥胺、尿素及肼。更佳地,亞胺反應性試劑為NaHSO3 或KHSO3
如本文所使用且除非另作指示,否則術語「可生物水解之醯胺 」、「可生物水解之酯 」、「可生物水解之胺基甲酸酯 」、「可生物水解之碳酸酯 」、「可生物水解之醯脲 」及「可生物水解之磷酸酯類似物 」分別意謂這樣一種醯胺、酯、胺基甲酸酯、碳酸酯、醯脲或磷酸酯類似物,其1)不會破壞該化合物之生物活性且賦予該化合物有利的活體內特性,諸如吸收、作用持續時間或作用起始;2)本身不具生物活性,但在活體內轉化成生物活性化合物。可生物水解之醯胺的實例包括但不限於,低級烷基醯胺、α-胺基酸醯胺、烷氧基醯基醯胺及烷基胺基烷基羰基醯胺。可生物水解之酯之實例包括但不限於,低級烷基酯、烷氧基醯氧基酯、烷基醯胺基烷基酯及膽鹼酯。可生物水解之胺基甲酸酯之實例包括但不限於,低級烷基胺、經取代之伸乙基二胺、胺基酸、羥基烷基胺、雜環及雜芳族胺,及聚醚胺。特別有益之前藥及前藥鹽係當將本發明化合物施用給哺乳動物時,增加該等化合物之生物利用率者。
如本文所使用,短語「醫藥學上可接受之鹽 」係指本發明化合物之醫藥學上可接受之有機或無機鹽。示例性鹽包括但不限於,硫酸鹽、檸檬酸鹽、乙酸鹽、草酸鹽、氯化物、溴化物、碘化物、硝酸鹽、硫酸氫鹽、磷酸鹽、酸式磷酸鹽、異煙鹼酸鹽、乳酸鹽、水楊酸鹽、酸式檸檬酸鹽、酒石酸鹽、油酸鹽、丹寧酸鹽、泛酸鹽、酒石酸氫鹽、抗壞血酸鹽、琥珀酸鹽、順丁烯二酸鹽、龍膽酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡糖酸鹽、葡糖醛酸鹽、糖酸鹽、甲酸鹽、苯甲酸鹽、麩胺酸鹽、甲烷磺酸鹽(「甲磺酸鹽」)、乙烷磺酸鹽、苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、雙羥萘酸鹽(亦即,1,1’-亞甲基-雙-(2-羥基-3-萘酸鹽))、鹼金屬(例如鈉及鉀)鹽、鹼土金屬(例如鎂)鹽,及銨鹽。醫藥學上可接受之鹽可涉及包含另一分子,諸如乙酸根離子、琥珀酸根離子或其他相對離子。該相對離子可為使母體化合物上之電荷穩定的任何有機或無機部分。另外,醫藥學上可接受之鹽可在其結構中具有超過一個帶電原子。多個帶電原子作為該醫藥學上可接受之鹽之一部分的情形可具有多個相對離子。因此,醫藥學上可接受之鹽可具有一個或多個帶電原子及/或一個或多個相對離子。
若本發明之化合物為一種鹼,則所需醫藥學上可接受之鹽可藉由此項技術中可用之任何適合方法製備,例如,用諸如鹽酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、甲烷磺酸、磷酸及類似物之無機酸,或用諸如乙酸、順丁烯二酸、琥珀酸、扁桃酸、反丁烯二酸、丙二酸、酮戊酸、草酸、乙醇酸、水楊酸、哌喃糖苷酸(諸如葡糖醛酸或半乳糖醛酸)、α羥基酸(諸如檸檬酸或酒石酸)、胺基酸(諸如天冬胺酸或麩胺酸)、芳族酸(諸如苯甲酸或肉桂酸)、磺酸(諸如對甲苯磺酸或乙烷磺酸)或類似物處理遊離鹼。
若本發明之化合物為一種酸,則所需醫藥學上可接受之鹽可藉由任何適合方法製備,例如,用無機或有機鹼,諸如胺(一級胺、二級胺或三級胺)、鹼金屬氫氧化物或鹼土金屬氫氧化物,或類似物處理遊離酸。適合鹽的說明性實例包括但不限於,衍生自胺基酸(諸如甘胺酸及精胺酸)、氨、一級胺、二級胺及三級胺,以及環狀胺(諸如哌啶、嗎啉及哌嗪)之有機鹽,以及衍生自鈉、鈣、鉀、鎂、錳、鐵、銅、鋅、鋁及鋰之無機鹽。
如本文所使用,術語「溶劑化物 」意思指進一步包括藉由非共價分子間力結合的化學計算量或非化學計算量之溶劑的化合物,該溶劑為諸如水、異丙醇、丙酮、乙醇、甲醇、DMSO、乙酸乙酯、乙酸及乙醇胺、二氯甲烷、2-丙醇或類似物。化合物之溶劑化物或水合物易於藉由向該化合物中添加至少一莫耳當量羥基溶劑(諸如甲醇、乙醇、1-丙醇、2-丙醇或水)以引起亞胺部分之溶劑化或水合作用來製備。
術語「異常細胞生長 」及「增生性病症 」在本申請案中可互換使用。除非另作指示,否則如本文中所使用,「異常細胞生長 」係指獨立於正常調控機制(例如喪失接觸抑制作用)的細胞生長。此包括例如以下各物之異常生長:(1)藉由表現突變之酪胺酸激酶或過表現受體酪胺酸激酶來增殖的腫瘤細胞(腫瘤);(2)發生異常酪胺酸激酶活化之其他增生性疾病之良性及惡性細胞;(3)在受體酪胺酸激酶作用下增殖之任何腫瘤;(4)藉由異常絲胺酸/蘇胺酸激酶活化而增殖之任何腫瘤;及(5)發生異常絲胺酸/蘇胺酸激酶活化之其他增生性疾病的良性及惡性細胞。
術語「癌症 」及「 」係指或描述哺乳動物中典型地以不受調控之細胞生長為特徵的生理病狀。「腫瘤 」包含一個或多個癌細胞,及/或良性或癌變前細胞。
治療劑 」涵蓋生物試劑,諸如抗體、肽、蛋白質、酶或化學治療劑。
化學治療劑 」係可用於治療癌症之化合物。
代謝產物 」係經由特定化合物、其衍生物或其偶聯物,或其鹽在體內代謝產生的產物。化合物、其衍生物或其偶聯物之代謝產物可使用此項技術中已知之常規技術鑑別,且其活性可使用多項測試(諸如本文所描述之該等測試)測定。此類產物可例如由所施用之化合物的氧化、羥基化、還原、水解、醯胺化、脫醯胺、酯化、去酯化、酶促裂解及類似反應產生。因此,本發明包括本發明之化合物、其衍生物或其偶聯物的代謝產物,包括藉由使本發明之化合物、其衍生物或其偶聯物與哺乳動物接觸一段足以得到其代謝產物之時間的方法產生的化合物、其衍生物或其偶聯物。
短語「醫藥學上可接受 」指示,該物質或組成物必須在化學上及/或毒理學上與構成配製物之其他成分及/或用其治療之哺乳動物相容。
術語「保護基 」或「保護部分 」係指在化合物、其衍生物或其偶聯物上之其他官能基反應時,常用於阻斷或保護特定官能基之取代基。舉例而言,「胺保護基 」或「胺保護部分 」係附接至胺基以阻斷或保護化合物中之胺基官能基的取代基。此類基團係此項技術中熟知的(參見例如,P. Wuts及T. Greene, 2007, Protective Groups in Organic Synthesis, 第7章, J. Wiley & Sons, NJ),且其實例有胺基甲酸酯,諸如胺基甲酸甲酯及胺基甲酸乙酯、FMOC、經取代之胺基甲酸乙酯、經1,6-β-消除裂解之胺基甲酸酯(亦稱為「自降解 」)、尿素、醯胺、肽、烷基及芳基衍生物。適合胺基保護基包括乙醯基、三氟乙醯基、第三丁氧基羰基(BOC)、苯甲氧基羰基(CBZ)及9-茀基甲氧羰基(Fmoc)。有關保護基及其用途之一般說明,參見P. G.M. Wuts & T. W. Greene, Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, New York, 2007。
術語「離去基團 」係指在取代或置換期間離開的帶電荷基團或不帶電荷部分。此類離去基團為此項技術中熟知的且包括但不限於,鹵素、酯、烷氧基、羥基、甲苯磺酸酯基、三氟甲磺酸酯基、甲磺酸酯基、腈、疊氮化物、胺基甲酸酯基、二硫化物、硫酯及重氮鎓化合物。
術語「雙官能交聯劑 」、「雙官能連接子 」或「交聯劑 」係指具有兩個反應性基團之改質劑;其中一個反應性基團能夠與細胞結合劑反應,而另一個與細胞毒性化合物反應,由此將兩個部分連接在一起。此類雙官能交聯劑係此項技術中熟知的(參見例如,Isalm及Dent,Bioconjugation, 第5章, 第218-363頁, Groves Dictionaries Inc. New York, 1999)。舉例而言,能夠經由硫酯鍵來鍵聯的雙官能交聯劑包括用以引入順丁烯二醯亞胺基的N -琥珀醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-甲酸酯(SMCC),或用以引入碘代乙醯基的N -琥珀醯亞胺基-4-(碘代乙醯基)-胺基苯甲酸酯(SIAB)。在細胞結合劑上引入順丁烯二醯亞胺基或鹵代乙醯基之其他雙官能交聯劑係此項技術中熟知的(參見美國專利申請案號2008/0050310、20050169933,自Pierce Biotechnology Inc. P.O. Box 117、Rockland、IL 61105、USA獲得),且包括但不限於,雙-順丁烯二醯亞胺基聚乙二醇(BMPEO)、BM(PEO)2 、BM(PEO)3 、N-(β-順丁烯二醯亞胺基丙氧基)琥珀醯亞胺酯(BMPS)、γ-順丁烯二醯亞胺基丁酸N-琥珀醯亞胺基酯(GMBS)、ɛ-順丁烯二醯亞胺基己酸N-羥基琥珀醯亞胺酯(EMCS)、5-順丁烯二醯亞胺基戊酸NHS、HBVS、N-琥珀醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-羧基-(6-醯胺基己酸酯)(其為SMCC之「長鏈」類似物(LC-SMCC))、間順丁烯二醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯(MBS)、4-(4-N-順丁烯二醯亞胺基苯基)-丁酸醯肼或鹽酸鹽(MPBH)、N-琥珀醯亞胺基3-(溴代乙醯胺基)丙酸酯(SBAP)、N-琥珀醯亞胺基碘代乙酸酯(SIA)、κ-順丁烯二醯亞胺基十一烷酸N-琥珀醯亞胺基 酯(KMUA)、N-琥珀醯亞胺基4-(p-順丁烯二醯亞胺基苯基)-丁酸酯(SMPB)、琥珀醯亞胺基-6-(β-順丁烯二醯亞胺基丙醯胺基)己酸酯(SMPH)、琥珀醯亞胺基-(4-乙烯基磺醯基)苯甲酸酯(SVSB)、二硫代雙-順丁烯二醯亞胺基乙烷(DTME)、1,4-雙-順丁烯二醯亞胺基丁烷(BMB)、1,4雙順丁烯二醯亞胺基-2,3-二羥基丁烷(BMDB)、雙-順丁烯二醯亞胺基己烷(BMH)、雙-順丁烯二醯亞胺基乙烷(BMOE)、磺基琥珀醯亞胺基4-(N-順丁烯二醯亞胺基-甲基)環己烷-1-甲酸酯(磺基-SMCC)、磺基-琥珀醯亞胺基(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸酯(磺基-SIAB)、間順丁烯二醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基磺基琥珀醯亞胺酯(磺基-MBS)、N-(γ-順丁烯二醯亞胺基丁氧基)磺基琥珀醯亞胺酯(磺基-GMBS)、N-(ɛ-順丁烯二醯亞胺基辛醯氧基)磺基琥珀醯亞胺酯(磺基-EMCS)、N-(κ-順丁烯二醯亞胺基十一烷醯氧基)磺基琥珀醯亞胺酯(磺基-KMUS)及磺基琥珀醯亞胺基4-(對順丁烯二醯亞胺基苯基)丁酸酯(磺基-SMPB)。
雜雙官能交聯劑為具有兩個不同反應性基團之雙官能交聯劑。含有胺反應性N -羥基琥珀醯亞胺基(NHS基團)及羰基反應性肼基之雜雙官能交聯劑亦可用於連接本文所描述之細胞毒性化合物與細胞結合劑(例如抗體)。此類可商購之雜雙官能交聯劑的實例包括琥珀醯亞胺基6-肼基煙鹼醯胺丙酮腙(SANH)、琥珀醯亞胺基4-肼基對苯二甲酸酯鹽酸鹽(SHTH)及琥珀醯亞胺基肼煙鹼酸酯鹽酸鹽(SHNH)。帶有酸不穩定性鍵聯之偶聯物亦可使用本發明之帶有肼之苯并二氮呯衍生物製備。可使用之雙官能交聯劑的實例包括琥珀醯亞胺基-對甲醯基苯甲酸酯(SFB)及琥珀醯亞胺基-對甲醯基苯氧基乙酸酯(SFPA)。
能夠經由二硫鍵連接細胞結合劑與細胞毒性化合物的雙官能交聯劑係此項技術中已知的且包括用以引入二硫代吡啶基的N -琥珀醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)戊酸酯(SPP)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)丁酸酯(SPDB)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)2-磺基丁酸酯(磺基-SPDB)。可用於引入二硫基團之其他雙官能交聯劑係此項技術中已知的且揭示於美國專利6,913,748、6,716,821,及美國專利公開案20090274713及20100129314中,全部以引用之方式併入本文中。或者,亦可使用引入硫醇基團之交聯劑,諸如2-亞胺基硫雜環戊烷、高半胱胺酸硫代內酯或S-乙醯基琥珀酸酐。
如本文所定義,「連接子 」、「連接部分 」或「連接基團 」係指將兩個基團(諸如細胞結合劑及細胞毒性化合物)連接在一起的部分。典型地,該連接子在連接其所連接之兩個基團的條件下基本上呈惰性。雙官能交聯劑可包含兩個反應性基團,連接部分之每一端一個,由此使一個反應性基團可首先與細胞毒性化合物反應以提供帶有連接部分及第二反應性基團之化合物,接著該第二反應性基團可與細胞結合劑反應。或者,雙官能交聯劑之一端可首先與細胞結合劑反應以提供帶有連接部分及第二反應性基團之細胞結合劑,接著該第二反應性基團可與細胞毒性化合物反應。連接部分可含有允許該細胞毒性部分在特定位元元元元點釋放的化學鍵。適合化學鍵係此項技術中熟知的且包括二硫鍵、硫醚鍵、酸不穩定性鍵、光不穩定性鍵、肽酶不穩定性鍵及酯酶不穩定性鍵(參見例如,美國專利5,208,020、5,475,092、6,441,163、6,716,821、6,913,748、7,276,497、7,276,499、7,368,565、7,388,026及7,414,073)。較佳為二硫鍵、硫醚鍵及肽酶不穩定性鍵。可用於本發明中之其他連接子包括不可裂解之連接子,諸如美國公開案號20050169933中詳細描述的該等連接子;或帶電荷之連接子或親水性連接子,其描述於US 2009/0274713、US 2010/01293140及WO 2009/134976,各專利以引用之方式明確地併入本文中。
在一個實施例中,在一端附接有反應性基團(諸如反應性酯)之連接基團係選自以下各物:-O(CR20 R21 )m (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-O(CR20 R21 )m (CR26 =CR27 )m’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-O(CR20 R21 )m (炔基)n’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-O(CR20 R21 )m (哌嗪基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-O(CR20 R21 )m (吡咯基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-O(CR20 R21 )m A”m” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m (CR26 =CR27 )m’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m (炔基)n’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m (哌嗪基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m (吡咯基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-S(CR20 R21 )m A”m” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m (CR26 =CR27 )m’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m (炔基)n’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q -(CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m (哌嗪基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m (吡咯基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q - (CO)t X’’、-NR33 (C=O)p” (CR20 R21 )m A”m” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR26 =CR27 )m’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (炔基)n’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (哌嗪基)t’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m A”m” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR29 =N-NR30 )n” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR29 =N-NR30 )n” (CR26 =CR27 )m’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR29 =N-NR30 )n” (炔基)n’ (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q - (CO)t X’’、-(CR20 R21 )m (CR29 =N-NR30 )n” A”m” (CR22 R23 )n (OCH2 CH2 )p (CR40 R41 )p” Y’’(CR24 R25 )q (CO)t X’’, 其中: m、n、p、q、m’、n’、t’為1至10之整數或視情況為0; t、m”、n”及p”為0或1; X”係選自OR36 、SR37 、NR38 R39 ,其中R36 、R37 、R38 、R39 為H,或具有1至20個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基,及或聚乙二醇單元-(OCH2 CH2 )n ,當t=1時R37 視情況為硫醇保護基,COX’’形成選自N-羥基琥珀醯亞胺酯、N-羥基鄰苯二甲醯亞胺酯、N-羥基磺基琥珀醯亞胺酯、對硝基苯酯、二硝基苯酯、全氟苯酯及其衍生物之反應性酯,其中該等衍生物有助於醯胺鍵之形成; Y’’不存在或選自O、S、S-S或NR32 ,其中R32 具有以上關於R所給相同之定義;或 當Y”不為S-S且t = 0時,X”係選自順丁烯二醯亞胺基、鹵代乙醯基或SR37 ,其中R37 具有與上述相同之定義; A”為胺基酸殘基或含有介於2至20個之間之胺基酸殘基的多肽; R20 、R21 、R22 、R23 、R24 、R25 、R26 及R27 相同或不同,且為-H或具有1至5個碳原子之直鏈或分支鏈烷基; R29 與R30 相同或不同,且為-H或具有1至5個碳原子之烷基; R33 為-H;或具有1至12個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;聚乙二醇單元R-(OCH2 CH2 )n -,或R33 為-COR34 、-CSR34 -SOR34 或-SO2 R34 ,其中R34 為H,或具有1至20個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基,或聚乙二醇單元-(OCH2 CH2 )n ;且 R40 及R41 之一為視情況帶負電荷或帶正電荷之官能基且另一個為H或具有1至4個碳原子之烷基、烯基、炔基。
以上連接基團中之任一個均可存在於本發明之化合物、藥物-連接子化合物或偶聯物中之任一個中,包括置換本文所描述之任一式中之連接基團。
術語「胺基酸 」係指天然存在之胺基酸或非天然存在之胺基酸。在一個實施例中,胺基酸係由NH2 -C(Raa’ Raa )-C(=O)OH表示,其中Raa 及Raa’ 各自獨立地為H;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;芳基;雜芳基;或雜環基,或Raa 與N末端氮原子一起可形成雜環(例如在脯胺酸中)。術語「胺基酸殘基 」係指當自胺基酸之胺端及/或羧基端移除一個氫原子時的相應殘基,諸如-NH-C(Raa’ Raa )-C(=O)O-。
術語「陽離子 」係指帶有正電荷之離子。陽離子可為單價的(例如Na+ 、K+ 等)、二價的(例如Ca2+ 、Mg2+ 等)或多價的(例如Al3+ 等)。較佳陽離子為單價的。
術語「治療有效量 」意思指,在受試者體內引起所希望之生物反應的活性化合物或偶聯物之量。此類反應包括相較於不存在該治療,或預防、抑制或延遲疾病症狀或疾病本身之發展的情況,減輕所治療之疾病或病症的症狀,預防、抑制或延遲疾病症狀或疾病本身之復發,增加受試者之壽命。有效量之確定恰在熟習此項技術者之能力範圍內,尤其是依據本文所提供之詳細揭示內容。化合物I之毒性及治療功效可藉由在細胞培養及實驗動物中進行的標準醫藥程序確定。本發明化合物或偶聯物或者擬施用給受試者之其他治療劑的有效量將取決於多發性骨髓瘤之分期、類別及狀態,以及受試者之特徵,諸如一般健康狀況、年齡、性別、體重及耐藥性。本發明化合物或偶聯物或者擬施用之其他治療劑的有效量亦將取決於施用途徑及劑型。可單獨地調整劑量及時間間隔以提供足以維持所希望之治療效果的活性化合物之血漿含量。 細胞毒性化合物
在第一實施例中,本發明係針對本文所描述之細胞毒性化合物(例如具有結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽)。在某些實施例中,該細胞毒性化合物係由結構式(I)或其醫藥學上可接受之鹽表示。
在某些實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),L’、L”及L’”之一係由式(A)表示,且其餘各自獨立地為–H、具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基、鹵素、-OH、(C1 -C6 )烷氧基或-NO2 。具體言之,L’、L”及L’”之一係由式(A)表示,且其餘為-H。
在第1個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),L’係由式(A)表示,且L”及L”’均為–H;且其餘變數係如以上在第一實施例中所描述。
在第2個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),Rx 為視情況經鹵素、-OH、(C1 -C3 )烷基、(C1 -C3 )烷氧基、鹵(C1 -C3 )烷基或帶電荷之取代基或可離子化基團Q取代的具有1至6個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Q為i) -SO3 H、-Z’-SO3 H、-OPO3 H2 、-Z’-OPO3 H2 、-PO3 H2 、-Z’-PO3 H2 、-CO2 H、-Z’-CO2 H、-NR11 R12 或-Z’-NR11 R12 ,或其醫藥學上可接受之鹽;或ii) -N+ R14 R15 R16 X- 或-Z’-N+ R14 R15 R16 X- ;Z’為視情況經取代之伸烷基、視情況經取代之伸環烷基或視情況經取代之伸苯基;R14 至R16 各自獨立地為視情況經取代之烷基;且X- 為醫藥學上可接受之陰離子;且其餘變數係如以上在第2個具體實施例中所描述。更具體言之,Q為–SO3 H或其醫藥學上可接受之鹽。
在第3個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),J為包含選自由NHRc1 、-COOH及-COE組成之群之反應性基團的部分,其中-COE表示反應性酯且Rc1 為-H或視情況經鹵素、-OH或(C1 -C3 )烷氧基取代的具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1個或第2個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,J為COE,該COE選自N-羥基琥珀醯亞胺酯、N-羥基磺基琥珀醯亞胺酯、硝基苯基(例如2-硝基苯基或4-硝基苯基)酯、二硝基苯基(例如2,4-二硝基苯基)酯、磺基-四氟苯基(例如4-磺基-2,3,5,6-四氟苯基)酯及全氟苯基酯;且其餘變數係如以上在第3個具體實施例中所描述。更具體言之,COE為N-羥基琥珀醯亞胺酯。
在第4個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),L’係由下式表示: -NR5 -P-C(=O)-(CRa Rb )m -J     (B1); -NR5 -P-C(=O)-Cy-(CRa Rb )m’- J     (B2); -C(=O)-P-NR5 -(CRa Rb )m -J     (C1);或 -C(=O)-P-NR5 -Cy-(CRa Rb )m’ -J     (C2), 其中: J為–COE; Ra 及Rb 在每次出現時各自獨立地為–H、(C1 -C3 )烷基,或帶電荷之取代基或可離子化之基團Q; m為1至6之整數; m’為0或1至6之整數; Cy為視情況經鹵素、-OH、(C1 -C3 )烷基、(C1 -C3 )烷氧基或鹵(C1 -C3 )烷基取代的具有5或6個環碳原子之環狀烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2或3個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Ra 及Rb 均為H;式(B2)及(C2)中之Cy為環己烷;且R5 為H或Me;且其餘變數係如以上在第4個具體實施例中所描述。更具體言之,式(B2)及(C2)中之m’為0或1。
在第5個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),L’係由下式表示: -NR5 -P-C(=O)-(CRa Rb )m -S-Zs (B3);或 -C(=O)-P-NR5 -(CRa Rb )m -S-Zs (C3), 其中: Ra 及Rb 在每次出現時各自獨立地為–H、(C1 -C3 )烷基,或帶電荷之取代基或可離子化之基團Q; m為1至6之整數; Zs 為–H、-SRd 、-C(=O)Rd1 ,或選自下式中之任一個:
Figure 02_image030
(a1’);
Figure 02_image032
(a2’);
Figure 02_image034
(a3’);
Figure 02_image036
(a4’);
Figure 02_image038
(a5’);
Figure 02_image040
(a6’);
Figure 02_image042
(a7’);
Figure 02_image044
(a8’);
Figure 02_image046
(a9);
Figure 02_image048
(a10’);
Figure 02_image050
(a11’);
Figure 02_image052
(a12’);
Figure 02_image054
(a13’);
Figure 02_image056
(a14’);
Figure 02_image058
(a15’); 其中: q為1至5之整數; n’為2至6之整數; M為陽離子(例如H+ 、Na+ 或K+ ); Rd 為具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基,或選自苯基、硝基苯基(例如2-硝基苯基或4-硝基苯基)、二硝基苯基(例如2,4-二硝基苯基)、羧基硝基苯基(例如3-羧基-4-硝基苯基)、吡啶基或硝基吡啶基(例如4-硝基吡啶基); Rd1 為具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基; 且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3或4個具體實施例中所描述。
在一個實施例中,Zs 為–H。在另一個實施例中,Zs 為–SMe或–SPy (Py為吡啶基)。
在又另一個實施例中,Zs 係選自下式中之任一個:
Figure 02_image060
(a1);
Figure 02_image062
(a2);
Figure 02_image064
(a3);
Figure 02_image066
(a4);
Figure 02_image068
(a5);
Figure 02_image070
(a6);
Figure 02_image072
(a7);
Figure 02_image074
(a8);
Figure 02_image076
(a9);
Figure 02_image078
(a10);
Figure 02_image080
(a11);
Figure 02_image082
(a12);
Figure 02_image084
(a13);
Figure 02_image086
(a14);或
Figure 02_image088
(a15); 其中U為-H或-SO3 M;且其餘變數係如以上關於式(a1’)-(a15’)所描述。
在某些實施例中,帶電荷之取代基或可離子化基團Q為i) -SO3 H、-Z’-SO3 H、-OPO3 H2 、-Z’-OPO3 H2 、-PO3 H2 、-Z’-PO3 H2 、-CO2 H、-Z’-CO2 H、-NR11 R12 或-Z’-NR11 R12 ,或其醫藥學上可接受之鹽;或ii) -N+ R14 R15 R16 X- 或-Z’-N+ R14 R15 R16 X- ;Z’為視情況經取代之伸烷基、視情況經取代之伸環烷基或視情況經取代之伸苯基;R14 至R16 各自獨立地為視情況經取代之烷基;且X- 為醫藥學上可接受之陰離子;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。更具體言之,Q為–SO3 H或其醫藥學上可接受之鹽。
在某些實施例中,Ra 及Rb 均為–H且R5 為H或Me;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,-(CRa Rb )m -為–(CH2 )m” -C(Me2 )-且m”為1至5之整數;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。
在第6個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),P為含有2至10個胺基酸殘基之肽;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4或5個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P為含有2至5個胺基酸殘基之肽;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P係選自Gly-Gly-Gly、Ala-Val、Val-Ala、Val-Cit、Val-Lys、Phe-Lys、Lys-Lys、Ala-Lys、Phe-Cit、Leu-Cit、Lle-Cit、Trp、Cit、Phe-Ala、Phe-N9 -甲苯磺醯基-Arg、Phe-N9 -硝基-Arg、Phe-Phe-Lys、D-Phe-Phe-Lys、Gly-Phe-Lys、Leu-Ala-Leu、Ile-Ala-Leu、Val-Ala-Val、Ala-Leu-Ala-Leu、β-Ala-Leu-Ala-Leu及Gly-Phe-Leu-Gly、Val-Arg、Arg-Val、Arg-Arg、Val-D-Cit、Val-D-Lys、Val-D-Arg、D-Val-Cit、D-Val-Lys、D-Val-Arg、D-Val-D-Cit、D-Val-D-Lys、D-Val-D-Arg、D-Arg-D-Arg、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala、D-Ala-D-Ala、Ala-Met及Met-Ala;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P為Gly-Gly-Gly、Ala-Val、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala及D-Ala-D-Ala;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在第7個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示雙鍵;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5或6個具體實施例中所描述。
在第8個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示單鍵,X為-H或胺保護基;且Y係選自-H、-OR、-OCOR’、-SR、-NR’R”、視情況經取代之5或6員含氮雜環、-SO3 H、-SO2 H及-OSO3 H;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6或7個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Y係選自-H、-SO3 M、-OH、-OMe、-OEt或–NHOH,其中M為–H、Na+ 或K+ ;且其餘變數係如以上在第8個具體實施例中所描述。更具體言之,Y為–H、-SO3 M或-OH。
在第9個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),X’係選自由以下各物組成之群:-H;-OH;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;或苯基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7或8個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,X’為–H、-OH、(C1 -C3 )烷基、鹵(C1 -C3 )烷基或苯基;且其餘變數係如以上在第9個具體實施例中所描述。更具體言之,X’為-H、-OH或–Me。甚至更具體言之,X’為-H。
在第10個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),Y’為-H、側氧基、(C1 -C3 )烷基或鹵(C1 -C3 )烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8或9個具體實施例中所描述。更具體言之,Y’為–H或側氧基。甚至更具體言之,Y’為-H。
在第11個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),A與A’相同或不同,且選自-O-、-S-、-NR5 -及側氧基-(C=O)-;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個具體實施例中所描述。更具體言之,A與A’相同或不同,且選自-O-及-S-。甚至更具體言之,A及A’為–O-。
在第12個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),R6 為–OMe;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11個具體實施例中所描述。
在第13個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’獨立地為–H、鹵素、-NO2 、-OH、(C1 -C3 )烷基、鹵(C1 -C3 )烷基或(C1 -C3 )烷氧基;且其餘變數係如在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12個具體實施例中所描述。更具體言之,R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’均為-H。
在第14個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),R、R’、R”及R5 各自獨立地為–H或(C1 -C3 )烷基;且其餘變數係如在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13個具體實施例中所描述。
在第15個具體實施例中,對於結構式(I)、(II)、(III)、(IV)、(V)及(VI),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示單鍵或雙鍵,條件為當其為雙鍵時,X不存在且Y為-H,且當其為單鍵時,X為-H,Y為-OH或-SO3 M; R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’均為-H; R6 為-OMe; X’及Y’均為-H; A及A’為-O-; M為H、Na+ 或K+ ;且其餘變數係如第一實施例或第1、2、3、4、5或6個具體實施例 所描述。
在第16個具體實施例中,本發明之細胞毒性化合物係選自下式:
Figure 02_image090
Figure 02_image092
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Figure 02_image122
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: R100 為–OH、–OMe或
Figure 02_image124
; Y為–H、-OH或-SO3 M;且 M為醫藥學上可接受之陽離子(例如H+ 、Na+ 或K+ ); Zs 為–H、-SRd 、-C(=O)Rd1 ,或選自以上描述之式(a1’)-(a15’)。
在一具體實施例中,Zs 係選自以上描述之式(a1)-(a15)。
在一更具體之實施例中,Zs 係選自式(a7)、(a8)、(a9)及(a15)。在一甚至更具體之實施例中,Zs 係由式(a9)表示。或者,Zs 係由式(a7)表示。
在另一具體實施例中,Zs 為–H。
在另一具體實施例中,Y為–SO3 M。或者,Y為–OH。
本發明亦包括本文所描述之任何細胞毒性化合物或細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物之代謝產物。 合成細胞毒性化合物
本發明之細胞毒性化合物可根據美國專利號8,765,740及美國申請公開案號2012/0238731中所描述之方法製備。
用於製備本發明之細胞毒性二聚體化合物之代表性方法顯示於實例1-10中。 細胞結合劑
本發明之偶聯物作為治療劑之效用取決於適當細胞結合劑之謹慎選擇。細胞結合劑可為目前已知或將瞭解之任何類別,包括肽類及非肽類。一般而言,該等類別可為抗體(諸如多株抗體及單株抗體,尤其是單株抗體)、淋巴因子、激素、生長因子、維生素(諸如葉酸等,其可結合至其細胞表面受體,例如葉酸受體)、養分轉運分子(諸如轉鐵蛋白)或任何其他細胞結合分子或物質。
適當細胞結合劑之選擇係一個選擇問題,其部分取決於欲靶向之特定細胞群,而在許多(但非全部)情形中,人類單株抗體係良好的選擇,若適當抗體係可獲得的。舉例而言,單株抗體MY9係特異性結合至CD33抗原之鼠類IgG1 抗體(J.D. Griffin等人, Leukemia Res. , 8:521 (1984)),且在靶細胞表現CD33,如在急性骨髓性白血病(AML)中時可使用。
在某些實施例中,細胞結合劑不為蛋白質。舉例而言,在某些實施例中,細胞結合劑可為結合至維生素受體(諸如細胞表面受體)之維生素。就此而言,維生素A結合至視黃醇結合蛋白(RBP),形成複合物,該複合物又以高親和力結合STRA6受體且增加維生素A之攝入。在另一實例中,葉酸/葉酸鹽/維生素B9 以高親和力結合細胞表面葉酸受體(FR),例如FRα。可使用葉酸或結合至FRα之抗體靶向在卵巢腫瘤及其他腫瘤上表現之葉酸受體。此外,維生素D及其類似物結合至維生素D受體。
在其他實施例中,細胞結合劑為一種蛋白質或多肽,或包含蛋白質或多肽的化合物,包括抗體、非抗體蛋白質或多肽。較佳地,該等蛋白質或多肽包含一個或多個帶有側鏈–NH2 基團之Lys殘基。Lys側鏈–NH2 基團可共價連接至雙官能交聯劑,該等交聯劑又連接至本發明之二聚體化合物,由此將細胞結合劑偶聯至本發明之二聚體化合物。每一基於蛋白質之細胞結合劑均可含有多個可用於經雙官能交聯劑連接本發明之化合物的Lys側鏈–NH2 基團。
在一個實施例中,GM-CSF,一種結合至骨髓細胞之配體/生長因子,可用作針對來自急性骨髓性白血病之患病細胞的細胞結合劑。結合至活化T細胞之IL-2可用於預防移植物排斥反應,用於治療及預防移植物抗宿主疾病,及用於治療急性T細胞白血病。結合至黑素細胞之MSH及可針對黑素瘤之抗體可用於治療黑素瘤。表皮生長因子可用於靶向鱗狀細胞癌,諸如肺及頭頸部之鱗狀細胞癌。生長抑素可用於靶向神經母細胞瘤及其他腫瘤類型。雌激素(或雌激素類似物)可用於靶向乳癌。雄激素(或雄激素類似物)可用於靶向睪丸。
在某些實施例中,細胞結合劑可為淋巴因子、激素、生長因子、集落刺激因子或養分轉運分子。
在某些實施例中,細胞結合劑為抗體模擬物,諸如錨蛋白重複序列蛋白、Centyrin、或adnectin/單抗體。
在其他實施例中,細胞結合劑為抗體、單鏈抗體、特異性結合至靶細胞之抗體片段、單株抗體、單鏈單株抗體、特異性結合至靶細胞之單株抗體片段(或「抗原結合部分」)、嵌合抗體、特異性結合至靶細胞之嵌合抗體片段(「抗原結合部分」)、結構域抗體(例如sdAb),或特異性結合至靶細胞之結構域抗體片段。
在某些實施例中,細胞結合劑為人類化抗體、人類化單鏈抗體或人類化抗體片段(或「抗原結合部分」)。在一具體實施例中,人類化抗體為huMy9-6或另一相關抗體,如美國專利號7,342,110及7,557,189中所描述。在另一具體實施例中,人類化抗體為美國臨時申請案號61/307,797、61/346,595及61/413,172以及美國申請案號13/033,723(以US 2012/0009181 A1公開)所描述之抗葉酸受體抗體。所有該等申請案之教示內容以引用之方式整體併入本文中。
在某些實施例中,細胞結合劑為表面重塑之抗體、表面重塑之單鏈抗體、表面重塑之抗體片段(或「抗原結合部分」)或雙特異性抗體。
在某些實施例中,細胞結合劑為微型抗體、avibody、雙鏈抗體、三鏈抗體、四鏈抗體、奈米抗體、probody、結構域抗體或單抗體。
換言之,示例性細胞結合劑可包括抗體、單鏈抗體、特異性結合至靶細胞之抗體片段、單株抗體、單鏈單株抗體、特異性結合至靶細胞之單株抗體片段、嵌合抗體、特異性結合至靶細胞之嵌合抗體片段、雙特異性抗體、結構域抗體、特異性結合至靶細胞之結構域抗體片段、干擾素(例如α、β、γ)、淋巴因子(例如IL-2、IL-3、IL-4及IL-6)、激素(例如胰島素、促甲狀腺激素釋放激素(TRH)、黑素細胞刺激激素(MSH)及類固醇激素(例如雄激素及雌激素))、維生素(例如葉酸)、生長因子(例如EGF、TGF-α、FGF、VEGF)、集落刺激因子、養分轉運分子(例如轉鐵蛋白;參見O'Keefe等人(1985)J. Biol. Chem . 260:932-937,以引用之方式併入本文中)、Centyrin (基於III型纖維連接蛋白(FN3)重複序列之共同序列的蛋白質支架;參見美國專利公開案2010/0255056、2010/0216708及2011/0274623,以引用之方式併入本文中)、錨蛋白重複序列蛋白(例如經設計之錨蛋白重複序列蛋白,稱為DARPin;參見美國專利公開案號2004/0132028、2009/0082274、2011/0118146及2011/0224100,以引用之方式併入本文中;且亦參見C. Zahnd等人,Cancer Res. (2010) 70:1595-1605;Zahnd等人,J. Biol. Chem. (2006) 281(46):35167-35175;及Binz, H.K., Amstutz, P. & Pluckthun, A.,Nature Biotechnology (2005) 23:1257-1268,以引用之方式併入本文中)、錨蛋白樣重複序列蛋白或合成肽(參見例如,參見美國專利公開案號2007/0238667;美國專利號7,101,675;WO 2007/147213;及WO 2007/062466,以引用之方式併入本文中)、Adnectin (纖維連接蛋白結構域支架蛋白;參見美國專利公開案號2007/0082365、2008/0139791,以引用之方式併入本文中)、Avibody (包括雙鏈抗體、三鏈抗體及四鏈抗體;參見美國公開案號2008/0152586及2012/0171115)、雙受體重靶向(dual receptor retargeting,DART)分子(P.A. Moore等人,Blood , 2011; 117(17):4542-4551;Veri MC等人,Arthritis Rheum. , 2010年3月30日; 62(7):1933-43;Johnson, S等人, J. Mol. Biol., 2010年4月9日;399(3):436-49)、細胞穿透超荷電蛋白(cell penetrating supercharged protein)(Methods in Enzymol. 502, 293-319 (2012)及其他細胞結合分子或物質。
在某些實施例中,細胞結合劑可為結合至靶細胞上之部分(諸如細胞表面受體)之配體。舉例而言,該配體可為生長因子或其結合至生長因子受體之片段,或可為細胞因子或其結合至細胞因子受體之片段。在某些實施例中,該生長因子受體或細胞因子受體為細胞表面受體。
在細胞結合劑為抗體或其抗原結合部分(包括抗體衍生物),或某些抗體模擬物之某些實施例中,CBA可結合至靶細胞上之配體,諸如細胞表面配體,包括細胞表面受體。
具體示例性抗原或配體可包括腎素;生長激素(例如人生長激素及牛生長激素);生長激素釋放因子;副甲狀腺激素;促甲狀腺激素;脂蛋白;α-1-抗胰蛋白酶;胰島素A鏈;胰島素B鏈;胰島素原;促卵泡激素;降鈣素;促黃體激素;胰高血糖素;凝血因子(例如因子vmc、因子IX、組織因子及血管性血友病因子);抗凝血因子(例如蛋白質C);心房利鈉肽;肺表面活性物質;纖溶酶原活化物(例如尿激酶、人尿或組織型纖溶酶原活化物);蛙皮素;凝血酶;造血生長因子;腫瘤壞死因子-α及腫瘤壞死因子-β;腦啡肽酶;RANTES (亦即,正常T細胞表現及分泌之活性調控蛋白);人巨噬細胞炎性蛋白-1-α;血清白蛋白(人血清白蛋白);苗勒抑制物質(Muellerian-inhibiting substance);鬆弛素A鏈;鬆弛素B鏈;鬆弛素原;小鼠促性腺激素相關肽;微生物蛋白(β-內醯胺酶);DNA酶;IgE;細胞毒性T-淋巴細胞相關抗原(例如CTLA-4);抑制素;活化素;血管內皮生長因子;激素或生長因子受體;蛋白質A或D;類風濕因子;神經營養因子(例如骨源性神經營養因子、神經營養素-3、神經營養素-4、神經營養素-5或神經營養素-6)、神經生長因子(例如NGF-β);血小板源性生長因子;纖維母細胞生長因子(例如aFGF及bFGF);纖維母細胞生長因子受體2;表皮生長因子;轉化生長因子(例如TGF-α、TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β4及TGF-β5);胰島素樣生長因子-I及胰島素樣生長因子-II;des(1-3)-IGF-I (腦IGF-I);胰島素樣生長因子結合蛋白;黑素轉鐵蛋白;EpCAM;GD3;FLT3;PSMA;PSCA;MUC1;MUC16;STEAP;CEA;TENB2;EphA受體;EphB受體;葉酸受體;FOLR1;間皮素;cripto;αv β6 ;整合素;VEGF;VEGFR;EGFR;轉鐵蛋白受體;IRTA1;IRTA2;IRTA3;IRTA4;IRTA5;CD蛋白(例如CD2、CD3、CD4、CD5、CD6、CD8、CD11、CD14、CD19、CD20、CD21、CD22、CD25、CD26、CD28、CD30、CD33、CD36、CD37、CD38、CD40、CD44、CD52、CD55、CD56、CD59、CD70、CD79、CD80 CD81、CD103、CD105、CD123、CD134、CD137、CD138及CD152)、一種或多種腫瘤相關抗原或細胞表面受體(參見美國公開案號2008/0171040或美國公開案號2008/0305044,以引用之方式整體併入);紅細胞生成素;骨誘導因子;免疫毒素;骨形態發生蛋白;干擾素(例如干擾素-α、干擾素-β及干擾素-γ);集落刺激因子(例如M-CSF、GM-CSF及G-CSF);介白素(例如IL-1至IL-10);超氧化物歧化酶;T細胞受體;表面膜蛋白;衰變加速因子;病毒抗原(例如HIV包膜蛋白之一部分);轉運蛋白、歸巢受體;地址素;調控蛋白;整合素(例如CD11a、CD11b、CD11c、CD18、ICAM、VLA-4及VCAM);腫瘤相關抗原(例如HER2、HER3及HER4受體);內皮素;c-Met;c-kit;1GF1R;PSGR;NGEP;PSMA;PSCA;TMEFF2;LGR5;B7H4;及以上所列多肽中任一種之片段。
如本文所使用,術語「抗體 」包括免疫球蛋白(Ig)分子。在某些實施例中,該抗體為全長抗體,其包含四條多肽鏈,即,藉由二硫鍵互連之兩條重鏈(HC)及兩條輕鏈(LC)。每一重鏈包含重鏈可變區(HCVR或VH)及重鏈恆定區(CH)。重鏈恆定區包含三個結構域,即CH1、CH2及CH3。每一輕鏈包含輕鏈可變區(LCVR或VL)及輕鏈恆定區(CL),該輕鏈恆定區包含一個結構域,即CL。VH區及VL區可進一步細分為高變區,稱為互補決定區(CDR)。在該等區域中間雜有保守性較強之構架區(FR)。每一VH及VL係由自胺基末端至羧基末端按以下次序排列之三個CDR及四個FR構成:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4。
在某些實施例中,該抗體為IgG、IgA、IgE、IgD或IgM。在某些實施例中,該抗體為IgG1、IgG2、IgG3或IgG4;或IgA1或IgA2。
在某些實施例中,細胞結合劑為單株抗體之「抗原結合部分」,其共有對於抗原與抗體結合至關重要之序列(諸如美國專利號7,342,110及7,557,189中所描述之huMy9-6或其相關抗體,該等專利以引用之方式併入本文中)。
如本文所使用,術語抗體之「抗原結合部分 」(或有時可互換稱為「抗體片段」)包括抗體之保持特異性結合至抗原之能力的一個或多個片段。經顯示,抗體之抗原結合功能可由全長抗體之某些片段執行。術語抗體之「抗原結合部分」內所涵蓋之結合片段的實例包括(但不限於):(i)Fab 片段,一種由VL、VH、CL及CH1結構域組成之單價片段(例如,由木瓜蛋白酶消化之抗體得到三個片段:兩個抗原結合Fab片段,及一個不結合抗原之Fc片段);(ii)F(ab’)2 片段,一種包含在鉸鏈區藉由二硫橋連接之兩個Fab片段的二價片段(例如,由胃蛋白酶消化之抗體得到兩個片段:二價抗原結合F(ab’)2 片段,及不結合抗原之pFc’片段)及其相關F(ab’) 單價單元;(iii)由VH及CH1結構域組成之Fd 片段(亦即,重鏈中包括在Fab中之部分);(iv)由抗體單一臂之VL及VH結構域組成之Fv 片段,及相關二硫鍵連接之 Fv ;(v)dAb (結構域抗體)或sdAb (單結構域抗體)片段(Ward等人, Nature 341:544-546, 1989),其由VH結構域組成;及(vi)分離之互補決定區(CDR )。在某些實施例中,該抗原結合部分為sdAb (單結構域抗體)。
在某些實施例中,抗原結合部分亦包括某些工程改造或重組之衍生物(或「衍生物抗體 」),該等衍生物除可能未見於天然存在之抗體中之元件或序列外,亦包括抗體中保持特異性結合至抗原之能力的一個或多個片段。
舉例而言,儘管Fv片段之兩個結構域VL及VH係由獨立基因編碼,但其可使用重組法由合成連接子接合,該連接子能夠使其製造成VL區與VH區配對形成單價分子之單一蛋白鏈(稱為單鏈Fv (scFv );參見例如,Bird等人, Science 242:423-426, 1988;及Huston等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883, 1988)。
在本文所描述之所有實施例中,scFv之N末端可為VH結構域(亦即,N-VH-VL-C)或VL結構域(亦即,N-VL-VH-C)。
二價(或雙價)單鏈可變片段(di-scFv bi-scFv )可藉由連接兩個scFv進行工程改造。由此產生具有兩個VH區及兩個VL區之單一肽鏈,得到串聯scFv (tascFv )。可藉由以頭至尾之方式連接三個或更多個scFv,類似地產生更多串聯重複序列,諸如tri-scFv。
在某些實施例中,scFv可經由連接肽連接,該等連接肽過短(約五個胺基酸)而無法使兩個可變區折疊在一起,迫使scFv二聚合,並形成雙鏈抗體 (參見例如,Holliger等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448, 1993;Poljak等人,Structure 2:1121-1123, 1994)。雙鏈抗體可為雙特異性或單特異性的。經顯示,雙鏈抗體之解離常數比相應scFv低40倍,即對於靶具有高得多的親和力。
又,較短之連接子(一個或兩個胺基酸)導致形成三聚體,或所謂的三鏈抗體 (triabody/tribody )。四鏈抗體 亦以類似之方式產生。其對其靶之親和力甚至高於雙鏈抗體。雙鏈抗體、三鏈抗體及四鏈抗體有時統稱為「AVIBODYTM 」細胞結合劑(或簡稱為「AVIBODY」)。即,具有兩個、三個或四個靶結合區(TBR)之AVIBODY常稱為雙鏈抗體、三鏈抗體及四鏈抗體。有關詳情,參見例如,美國公開案號2008/0152586及2012/0171115,其完整教示內容以引用之方式併入本文中。
所有該等形式均可由對兩種或更多種不同抗原具有特異性之可變片段構成,在此情形中,其為雙特異性或多特異性抗體類型。舉例而言,某些雙特異性串聯di-scFv稱為雙特異性T細胞接合物(BiTE )。
在某些實施例中,串聯scFv或雙鏈抗體/三鏈抗體/四鏈抗體中之每個scFv可具有相同或不同之結合特異性,且各自可獨立地具有N末端VH或N末端VL。
單鏈Fv(scFv)亦可與Fc部分,諸如人IgG Fc部分融合以獲得類IgG特性,但儘管如此,其仍由單一基因編碼。由於此類scFv-Fc 蛋白質在哺乳動物體內之短暫產生可易於達到毫克量,故此衍生物抗體形式特別適合於許多研究應用。
Fcab 為由抗體之Fc恆定區工程改造之抗體片段。Fcab可表現為可溶性蛋白質,或其可重新工程改造成全長抗體,諸如IgG,由此產生mAb2mAb2 係Fcab代替正常Fc區之全長抗體。利用該等另外之結合位點,mAb2雙特異性單株抗體可同時結合兩種不同靶。
在某些實施例中,該等工程改造之抗體衍生物具有減小之大小的抗原結合Ig源性重組蛋白(「微型化」之完整大小mAb),其係藉由移除認為對功能不重要之結構域而產生。一個最佳實例為SMIP。
小模組免疫藥物SMIP 係主要由抗體(免疫球蛋白)之部分構建的人工蛋白質且擬用作藥物。SMIP具有與抗體類似之生物半衰期,但小於抗體,且因此可具有更佳之組織滲透特性。SMIP係包含一個結合區、作為連接子之一個鉸鏈區及一個效應子結構域之單鏈蛋白質。該結合區包含經修飾之單鏈可變片段(scFv),且該蛋白質之其餘部分可由抗體(諸如IgG1)之Fc(諸如CH2及作為效應子結構域之CH3)及鉸鏈區構造。經遺傳修飾之細胞產生呈抗體樣二聚體形式之SMIP,其比實際抗體小約30%。
此類工程改造之微型化抗體的另一實例為「單抗體 」,其中鉸鏈區已自IgG4分子移除。IgG4分子不穩定且可彼此交換輕鏈-重鏈異二聚體。鉸鏈區之缺失防止重鏈-重鏈完全配對,留下高度特異性之單價輕鏈/重鏈異二聚體,同時保持Fc區以確保活體內穩定性及半衰期。
單結構域抗體 (sdAb ,包括但不限於Ablynx稱為奈米抗體 之該等抗體)係由單一單體可變抗體結構域組成之抗體片段。與完整抗體相同,其能夠選擇性結合至特定抗原,但由於其分子量僅為12-15 kDa而小得多。在某些實施例中,單結構域抗體係由重鏈抗體(hcIgG)工程改造得到。首例此類sdAb係基於在駱駝中發現之hcIgG工程改造得到,稱為VH H片段。在某些實施例中,單結構域抗體係使用VNAR 片段,由IgNAR (「免疫球蛋白新抗原受體」,參見下文)工程改造得到。軟骨魚類(諸如鯊魚)具有此類重鏈IgNAR抗體。在某些實施例中,sdAb係藉由將來自常見免疫球蛋白G (IgG),諸如來自人類或小鼠之免疫球蛋白G的二聚體可變結構域分離成單體來進行工程改造。在某些實施例中,奈米抗體係衍生自重鏈可變結構域。在某些實施例中,奈米抗體係衍生自輕鏈可變結構域。在某些實施例中,sdAb係藉由針對與靶抗原之結合篩選單結構域重鏈序列(例如人單結構域HC)文庫來獲得。
單一可變新抗原受體結構域抗體片段(VNAR ,或VNAR 結構域 )係衍生自軟骨魚類(例如鯊魚)免疫球蛋白新抗原受體抗體(IgNAR )。作為已知最小的基於免疫球蛋白之蛋白質支架之一,此類單結構域蛋白質展現出有利的大小及隱蔽表位識別特性。成熟IgNAR抗體由一個可變新抗原受體(VNAR )結構域及五個恆定新抗原受體(CNAR )結構域之同二聚體組成。此分子具有高度穩定性,且具有高效之結合特徵。其固有穩定性可能歸因於(i)潛在的Ig支架,相較於鼠類抗體中所見之習知抗體VH及VL結構域,其呈現相當大數量的帶電荷及親水性表面暴露殘基;及(ii)使包括環間二硫橋及環內氫鍵模式在內之互補決定區(CDR)環中的結構特徵穩定。
微型抗體 係包含連接至CH結構域,諸如CH3γ1 (IgG1之CH3結構域)或CH4ε (IgE之CH4結構域)之scFv的工程改造之抗體片段。舉例而言,癌胚抗原(CEA)特異性scFv連接至CH3γ1,產生微型抗體,先前已證實,其結合活體內快速清除作用而具有優良的腫瘤靶向性(Hu等人,Cancer Res. 56: 3055–3061, 1996)。scFv可具有N末端VH或VL。連接可為產生非共價、無鉸鏈之微型抗體的短肽(例如,兩個胺基酸之連接子,諸如ValGlu)。或者,該連接可為產生共價、鉸鏈-微型抗體之IgG1鉸鏈及GlySer連接肽。
天然抗體為單特異性但二價的,因為其表現兩個相同的抗原結合結構域。相比之下,在某些實施例中,某些工程改造之抗體衍生物為雙特異性或多特異性分子,其具有兩個或更多個不同的抗原結合結構域,各自具有不同的靶特異性。雙特異性抗體可藉由融合兩個抗體產生細胞來產生,其各自具有不同的特異性。該等「四源雜交瘤」產生多種分子物質,因為兩個不同的輕鏈與兩個不同的重鏈在四源雜交瘤中以多種配置自由重組。自此,已使用多種技術(參見上文)產生雙特異性Fab、scFvs及完整大小之mAb。
雙可變結構域免疫球蛋白(DVD-Ig )係一類同時靶向兩個抗原/表位之雙特異性IgG (DiGiammarino等人,Methods Mol Biol. 899:145-56, 2012)。該分子含有Fc區及恆定區,其配置類似於習知IgG。然而,DVD-Ig蛋白之獨特性在於,該分子之每個臂均含有兩個可變結構域(VD)。一個臂內的VD係串聯連接且可具有不同結合特異性。
亦可藉由例如表現具有兩個不同Fab及一個Fc之雙特異性抗體來產生三特異性抗體衍生物分子。一個實例為小鼠IgG2a抗Ep-CAM、大鼠IgG2b抗CD3四源雜交瘤(稱為BiUII),其被認為容許表現Ep-CAM之腫瘤細胞、表現CD3之T細胞及表現FCγRI之巨噬細胞共定位,由此增強免疫細胞之共刺激及抗腫瘤功能。
Probody 為在健康組織中保持惰性,但在疾病環境中特異性活化(例如,經由疾病環境中富集或特有之蛋白酶的蛋白酶裂解)的完全重組之經掩蔽單株抗體。參見Desnoyers等人,Sci. Transl. Med., 5:207ra144, 2013。可對本文所描述之任何抗體或其抗原結合部分使用類似掩蔽技術。
內抗體 係經修飾以在細胞內定位,在細胞內作用以結合至細胞內抗原之抗體。內抗體可保留在細胞質中,或可具有核定位信號,或可具有供ER靶向之KDEL序列。內抗體可為單鏈抗體(scFv)、具有超穩定性之經修飾免疫球蛋白VL結構域、選擇的對還原性較強之細胞內環境具有抗性之抗體,或以與麥芽糖結合蛋白或其他穩定細胞內蛋白質之融合蛋白形式表現。此類優化使內抗體之穩定性及結構得到改善,且可大體上適用於本文所描述之任何抗體或其抗原結合部分。
本發明之抗原結合部分或衍生物抗體與衍生/工程改造得到其之抗體相比較,可具有基本上相同或同一的(1)輕鏈及/或重鏈CDR3區;(2)輕鏈及/或重鏈CDR1、CDR2及CDR3區;或(3)輕鏈及/或重鏈區。在該等區域內之序列可含有保守性胺基酸取代,包括在CDR區內之取代。在某些實施例中,存在不超過1、2、3、4或5個保守性取代。在一替代方案中,該等抗原結合部分或衍生物抗體具有與衍生/工程改造得到其之抗體至少約90%、95%、99%或100%同一的輕鏈區及/或重鏈區。相較於該抗體,該等抗原結合部分或衍生物抗體可對靶抗原具有基本上相同之特異性及/或親和力。在某些實施例中,該等抗原結合部分或衍生物抗體之Kd 及/或koff 值在本文所描述之抗體的10倍(更高或更低)、5倍(更高或更低)、3倍(更高或更低)或2倍(更高或更低)內。
在某些實施例中,該等抗原結合部分或衍生物抗體可衍生自/工程改造自完全人類抗體、人類化抗體或嵌合抗體,且可根據任何技術認可之方法製備。
單株抗體技術允許產生特異性極高的呈特異性單株抗體形式之細胞結合劑。此項技術中尤其熟知的是藉由用所關注之抗原,諸如完整靶細胞、自靶細胞分離之抗原、完整病毒、減毒之完整病毒及病毒蛋白(諸如病毒外殼蛋白)使小鼠、大鼠、倉鼠或任何其他哺乳動物免疫來產生單株抗體的技術。亦可使用敏化之人類細胞。產生單株抗體之另一方法係使用scFv(單鏈可變區),尤其是人scFv之噬菌體文庫(參見例如,Griffiths等人,美國專利號5,885,793及5,969,108;McCafferty等人, WO 92/01047;Liming等人, WO 99/06587)。此外,亦可使用美國專利號5,639,641中所揭示之表面重塑抗體,以及嵌合抗體及人類化抗體。
細胞結合劑亦可為由噬菌體呈現技術(參見例如,Wang等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2011) 108(17), 6909-6914)或肽文庫技術(參見例如,Dane等人,Mol. Cancer. Ther. (2009) 8(5):1312-1318)得到之肽。
在某些實施例中,本發明之CBA亦包括抗體模擬物,諸如DARPin、親和體、人類泛素、affitin、抗運載蛋白、高親和性多聚體、Fynomer、Kunitz結構域肽、單抗體或nanofitin。
如本文所使用,術語「DARPin 」及「( 經設計 ) 錨蛋白重複序列蛋白 」可互換使用,指典型地展現優先(有時特異性)靶結合的某些遺傳工程改造之抗體模擬蛋白。該靶可為蛋白質、碳水化合物或其他化學實體,且結合親和力可相當高。DARPin可衍生自含天然錨蛋白重複序列之蛋白質,且較佳由該等蛋白質之至少三個、通常四個或五個錨蛋白重複基元(典型地,每一錨蛋白重複基元中約33個殘基)組成。在某些實施例中,DARPin含有約四個或五個重複序列,且分子質量可分別為約14或18 kDa。可在DNA層面上,使用多種技術,諸如核糖體呈現或信號識別顆粒(SRP)噬菌體呈現來產生具有隨機化潛在靶相互作用殘基及超過1012 個變異體之多樣性的DARPin文庫,以用於選擇以皮莫耳濃度之親和力及特異性結合所希望靶之DARPin (例如,充當受體促效劑或拮抗劑、反促效劑、酶抑制劑或簡單的靶蛋白結合劑)。有關DARPin製備,參見例如美國專利公開案號2004/0132028、2009/0082274、2011/0118146及2011/0224100;WO 02/20565及WO 06/083275 (其完整教示內容以引用之方式併入本文中),且亦參見C. Zahnd等人(2010)Cancer Res., 70:1595-1605;Zahnd等人(2006)J. Biol. Chem. , 281(46):35167-35175;及Binz, H.K., Amstutz, P. & Pluckthun, A. (2005)Nature Biotechnology , 23:1257-1268 (皆以引用之方式併入本文中)。有關相關錨蛋白樣重複序列蛋白或合成肽,亦參見美國專利公開案號2007/0238667;美國專利號7,101,675;WO 2007/147213;及WO 2007/062466 (其完整教示內容以引用之方式併入本文中)。
親和體 分子係工程改造成以高親和力結合至大量靶蛋白或肽,由此模擬單株抗體的小蛋白質。親和體由含58個胺基酸之三個α螺旋組成且莫耳質量為約6 kDa。經顯示,其可經受住高溫(90℃)或酸性及鹼性條件(pH 2.5或pH 11),且已藉由原生文庫選擇獲得親和力低至亞奈莫耳濃度範圍之結合劑,且已在親和力成熟後獲得具有皮莫耳濃度親和力之結合劑。在某些實施例中,親和體與弱親電子試劑偶聯以共價結合至靶。
單抗體 (又稱為Adnectin )係能夠結合至抗原的遺傳工程改造之抗體模擬蛋白。在某些實施例中,單抗體由94個胺基酸組成且分子質量為約10 kDa。其係基於人纖連蛋白之結構,更具體言之基於其III型第十個細胞外結構域,其結構類似於抗體可變結構域,具有形成桶狀之七個β折疊且在每一側上具有對應於三個互補決定區的三個暴露之環。可藉由修飾環BC (在第二個β折疊與第三個β折疊之間)及FG (在第六個折疊與第七個折疊之間)來定制對不同蛋白質具有特異性的單抗體。
三鏈抗體 係基於小鼠及人軟骨基質蛋白(CMP)之C末端捲曲螺旋區設計的自組裝抗體模擬物,其自組裝成為平行的三聚體複合物。其係藉由使特定靶結合部分與衍生自CMP之三聚化結構域融合而產生的高度穩定之三聚體靶向配體。所得融合蛋白可高效地自組裝成為充分確定的具有高穩定性之平行同源三聚體。關於該等三聚體靶向配體之表面電漿共振(SPR)分析證實相較於相應單體明顯增強之靶結合強度。細胞結合研究確定,此類三鏈抗體對於其對應受體具有優良結合強度。
Centyrin 係可使用基於共同FN3結構域序列之構架構建之文庫獲得的另一抗體模擬物(Diem等人,Protein Eng. Des. Sel. , 2014)。該文庫採用FN3結構域之C鏈、CD環、F鏈及FG環內之各種位置,且可針對特定靶選擇高親和力Centyrin變異體。
在一個實施例中,細胞結合劑為抗葉酸受體抗體。更具體言之,抗葉酸受體抗體為特異性結合人葉酸受體1(又稱為葉酸受體α (FR-α))之人類化抗體或其抗原結合片段。除非另外指示,否則如本文所使用,術語「人葉酸受體1」、「FOLR1」或「葉酸受體α (FR-α)」係指任何天然人FOLR1。因此,所有該等術語均可指如本文所指示之蛋白質或核酸序列。術語「FOLR1」涵蓋「全長」未加工之FOLR1以及由在細胞中加工得到的任何FOLR1形式。FOLR1抗體包含:(a)包含GYFMN (SEQ ID NO: 1)之重鏈CDR1、包含RIHPYDGDTFYNQXaa1 FXaa2 Xaa3 (SEQ ID NO: 2)之重鏈CDR2,及包含YDGSRAMDY (SEQ ID NO: 3)之重鏈CDR3;及(b)包含KASQSVSFAGTSLMH (SEQ ID NO: 4)之輕鏈CDR1、包含RASNLEA (SEQ ID NO: 5)之輕鏈CDR2,及包含QQSREYPYT (SEQ ID NO: 6)之輕鏈CDR3;其中Xaa1 係選自K、Q、H及R;Xaa2 係選自Q、H、N及R;且Xaa3 係選自G、E、T、S、A及V。較佳地,重鏈CDR2序列包含RIHPYDGDTFYNQKFQG (SEQ ID NO: 7)。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體為特異性結合人葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段,該人葉酸受體1包含具有胺基酸序列QVQLVQSGAEVVKPGASVKISCKASGYTFTGYFMN WVKQSPGQSLEWIGRIHPYDGDTFYNQKFQG KATLTVDKSSNTAHMELLSLTSEDFAVYYCTRYDGSRAMDY WGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 8)之重鏈。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體係由2010年4月7日保藏在ATCC且ATCC保藏號為PTA-10772及PTA-10773或PTA-10774之質體DNA編碼的人類化抗體或其抗原結合片段。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體為特異性結合人葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段,該人葉酸受體1包含具有胺基酸序列DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMH WYHQKPGQQPRLLIYRASNLEA GVPDRFSGSGSKTDFTLNISPVEAEDAATYYCQQSREYPYT FGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 9);或DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMH WYHQKPGQQPRLLIYRASNLEA GVPDRFSGSGSKTDFTLTISPVEAEDAATYYCQQSREYPYT FGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 10)之輕鏈。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體為特異性結合人葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段,該人葉酸受體1包含具有胺基酸序列SEQ ID NO: 8之重鏈,及具有胺基酸序列SEQ ID NO: 9或SEQ ID NO: 10之輕鏈。較佳地,該抗體包含具有胺基酸序列SEQ ID NO: 8之重鏈及具有胺基酸序列SEQ ID NO: 10之輕鏈(hu FOLR1)。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體係由2010年4月7日保藏在ATCC且ATCC保藏號為PTA-10772及PTA-10773或10774之質體DNA編碼的人類化抗體或其抗原結合片段。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體為特異性結合人葉酸受體1且包含與QVQLVQSGAEVVKPGASVKISCKASGYTFTGYFMNWVKQSPGQSLEWIGRIHPYDGDTFYNQKFQGKATLTVDKSSNTAHMELLSLTSEDFAVYYCTRYDGSRAMDYWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 11)具有至少約90%、95%、99%或100%同一性之重鏈可變結構域,及與DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLNISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKR (SEQ ID NO: 12)或DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLTISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKR (SEQ ID NO: 13)具有至少約90%、95%、99%或100%同一性之輕鏈可變結構域的人類化抗體或其抗原結合片段。
在另一實施例中,抗葉酸受體抗體為huMov19或M9346A (參見例如,美國專利號8,709,432、美國專利號8,557,966,及WO2011106528,均以引用之方式併入本文中)。
在另一實施例中,細胞結合劑為抗EGFR抗體或其抗體片段。在一個實施例中,該抗EGFR抗體為非拮抗劑抗體,包括例如WO2012058592(以引用之方式併入本文中)中所描述之抗體。在另一實施例中,抗EGFR抗體為非功能性抗體,例如人類化ML66或EGFR-8。更具體言之,抗EGFR抗體為huML66。
在又另一實施例中,抗EGFR抗體包含具有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之重鏈及具有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之輕鏈。如本文所使用,帶雙底線之序列表示重鏈或輕鏈序列之可變區(亦即,重鏈可變區或HCVR,及輕鏈可變區或LCVR),而粗體序列表示CDR區(亦即,自N末端至C末端,分別來自重鏈或輕鏈序列之CDR1、CDR2及CDR3)。
抗體 全長重鏈/輕鏈胺基酸序列
huML66HC QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGLSLASNSVS WIRQPPGKGLEWMGVIWNHG GTDYNPSIKS RLSISRDTSKSQVFLKMNSLTAADTAMYFCVRKGGIYFDY WGQGV LVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKT HTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYV DGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIE KTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPEN NYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLS PG (SEQ ID NO:14)
huML66LC DTVLTQSPSLAVSPGERATISCRASESVSTLMH WYQQKPGQQPKLLIYLASHRES G VPARFSGSGSGTDFTLTIDPMEAEDTATYYCQQSRNDPWT FGQGTKLELKR TVAA PSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQD SKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC  (SEQ ID NO:15)
在又另一實施例中,抗EGFR抗體包含SEQ ID NO: 14之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 15之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合EGFR。
在又另一實施例中,抗EGFR抗體包含與SEQ ID NO: 14具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 15具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合EGFR。
在另一實施例中,抗EGFR抗體為8,790,649及WO 2012/058588(以引用之方式併入本文中)所描述之抗體。在一個實施例中,抗EGFR抗體為huEGFR-7R抗體。
在一個實施例中,抗EGFR抗體包含具有胺基酸序列QVQLVQSGAEVAKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMQ WVKQRPGQGLECIGTIYPGDGDTT YTQKFQGKATLTADKSSSTAYMQLSSLRSEDSAVYYCARYDAPGYAMDY WGQGTLVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG  (SEQ ID NO: 16)之免疫球蛋白重鏈區,及具有胺基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDINNYLA WYQHKPGKGPKLLIHYTSTLHP GIPSRFSGSGSGRDYSFSISSLEPEDIATYYCLQYDNLLYT FGQGTKLEIKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC  (SEQ ID NO: 17)之免疫球蛋白輕鏈區,或具有胺基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDINNYLA WYQHKPGKGPKLLIHYTSTLHP GIPSRFSGSGSGRDYSFSISSLEPEDIATYYCLQYDNLLYT FGQGTKLEIKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 18)之免疫球蛋白輕鏈區。
在另一實施例中,抗EGFR抗體包含具有SEQ ID NO:16中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區,及具有SEQ ID NO: 17中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區。
在另一實施例中,抗EGFR抗體包含具有SEQ ID NO:16中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區,及具有SEQ ID NO: 18中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區。
在又另一實施例中,抗EGFR抗體包含SEQ ID NO: 16之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 17或18之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合EGFR。
在又另一實施例中,抗EGFR抗體包含與SEQ ID NO: 16具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 17或18具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合EGFR。
在另一實施例中,細胞結合劑為抗CD19抗體,諸如美國專利號8,435,528及WO2004/103272(以引用之方式併入本文中)中所描述之該等抗體。在一個實施例中,抗CD19抗體包含具有胺基酸序列QVQLVQPGAEVVKPGASVKLSCKTSGYTFTSNWMH WVKQAPGQGLEWIGEIDPSDSYTN YNQNFQGKAKLTVDKSTSTAYMEVSSLRSDDTAVYYCARGSNPYYYAMDY WGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 19)之免疫球蛋白重鏈區,及具有胺基酸序列EIVLTQSPAIMSASPGERVTMTCSASSGVNYMH WYQQKPGTSPRRWIYDTSKLAS GVPARFSGSGSGTDYSLTISSMEPEDAATYYCHQRGSYT FGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 20)之免疫球蛋白輕鏈區。
在另一實施例中,抗CD19抗體為huB4抗體。
在又另一實施例中,抗CD19抗體包含SEQ ID NO: 19之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 20之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合CD19。
在又另一實施例中,抗CD19抗體包含與SEQ ID NO: 19具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 20具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合CD19。
在又另一實施例中,細胞結合劑為抗Muc1抗體,諸如美國專利號7,834,155、WO 2005/009369及WO 2007/024222(以引用之方式併入本文中)中所描述之該等抗體。在一個實施例中,抗Muc1抗體包含具有胺基酸序列QAQLVQSGAEVVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMH WVKQTPGQGLEWIGYIYPGNGATNYNQKFQG KATLTADTSSSTAYMQISSLTSEDSAVYFCARGDSVPFAY WGQGTLVTVSA ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 21)之免疫球蛋白重鏈區,及具有胺基酸序列EIVLTQSPATMSASPGERVTITCSAHSSVSFMH WFQQKPGTSPKLWIYSTSSLAS GVPARFGGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQRSSFPLT FGAGTKLELKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:22)之免疫球蛋白輕鏈區。
在另一實施例中,抗Muc1抗體為huDS6抗體。
在又另一實施例中,抗Muc1抗體包含SEQ ID NO: 21之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 22之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合Muc1。
在又另一實施例中,抗Muc1抗體包含與SEQ ID NO: 21具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 22具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合Muc1。
在另一實施例中,細胞結合劑為抗CD33抗體或其片段,諸如美國專利號7,557,189、7,342,110、8,119,787及8,337,855以及WO2004/043344(以引用之方式併入本文中)中所描述之抗體或其片段。在另一實施例中,抗CD33抗體為huMy9-6抗體。
在一個實施例中,抗CD33抗體包含具有胺基酸序列QVQLQQPGAEVVKPGASVKMSCKASGYTFTSYYIH WIKQTPGQGLEWVGVIYPGNDDISYNQKFQ GKATLTADKSSTTAYMQLSSLTSEDSAVYYCAREVRLRYFDV WGQGTTVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO:23)之免疫球蛋白重鏈區,及具有胺基酸序列EIVLTQSPGSLAVSPGERVTMSCKSSQSVFFSSSQKNYL AWYQQIPGQSPRLLIYWASTRES GVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVQPEDLAIYYCHQYLSSRT FGQGTKLEIKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:24)之免疫球蛋白輕鏈區。
在又另一實施例中,抗CD33抗體包含SEQ ID NO: 23之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 24之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合CD33。
在又另一實施例中,抗CD33抗體包含與SEQ ID NO: 23具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 24具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合CD33。
在另一實施例中,細胞結合劑為抗CD37抗體或其抗體片段,諸如美國專利號8,765,917及WO 2011/112978(以引用之方式併入本文中)中所描述之該等抗體。在一個實施例中,抗CD37抗體為huCD37-3抗體。
在一個實施例中,抗CD37抗體包含具有胺基酸序列DIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLA WYQQKPGKSPKLLVNVATNLAD GVPSRFSGSGSGTDYSLKINSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWT FGQGTKLEIKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(SEQ ID NO: 25)之免疫球蛋白輕鏈區,及具有胺基酸序列QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVS WVRQPPGKGLEWLGVIWGDGSTN YHPSLKSRLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKGGYSLAH WGQGTLVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO: 26)之免疫球蛋白重鏈區,或具有胺基酸序列QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVS WVRQPPGKGLEWLGVIWGDGSTN YHSSLKSRLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKGGYSLAH WGQGTLVTVSS ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO: 27)之免疫球蛋白重鏈區。
在另一實施例中,抗CD37抗體包含具有SEQ ID NO:25中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區,及具有SEQ ID NO: 26中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含具有SEQ ID NO:25中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白輕鏈區,及具有SEQ ID NO: 27中陳述之胺基酸序列之免疫球蛋白重鏈區。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含SEQ ID NO: 26或27之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 25之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合CD37。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含與SEQ ID NO: 26或27具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 25具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合CD37。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含具有胺基酸序列EIVLTQSPATMSASPGERVTMTCSATSSVTYMH WYQQKPGQSPKRWIYDTSNLPY GVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSDNPPT FGQGTKLEIKR TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 28)之免疫球蛋白輕鏈區,及具有胺基酸序列QVQLQESGPGLLKPSQSLSLTCTVSGYSITSGFAWH WIRQHPGNKLEWMGYILYSGSTV YSPSLKSRISITRDTSKNHFFLQLNSVTAADTATYYCARGYYGYGAWFAY WGQGTLVTVSA ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO: 29)之免疫球蛋白重鏈區。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含SEQ ID NO: 29之重鏈CDR1-CDR3,及/或SEQ ID NO: 28之輕鏈CDR1-CDR3,且較佳特異性結合CD37。
在又另一實施例中,抗CD37抗體包含與SEQ ID NO: 29具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之重鏈可變區(HCVR)序列,及/或與SEQ ID NO: 28具有至少約90%、95%、97%、99%或100%同一性之輕鏈可變區(LCVR)序列,且較佳特異性結合CD37。
在又另一實施例中,抗CD37抗體為huCD37-50抗體。 細胞結合劑-藥物偶聯物
本發明亦提供細胞結合劑-藥物偶聯物,其包含經由多種連接子,包括但不限於,二硫化物連接子、硫醚連接子、醯胺鍵結之連接子、肽酶不穩定性連接子、酸不穩定性連接子、酯酶不穩定性連接子連接至一個或多個本發明之細胞毒性化合物的細胞結合劑。
在一第二實施例中,本發明提供一種偶聯物,其包含:細胞毒性化合物及細胞結合劑(CBA),其中該細胞毒性化合物共價連接至該CBA,且其中該細胞毒性化合物係由結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)或(VI’)表示,其中變數係如以上所描述。
在某些實施例中,該細胞毒性化合物係由結構式(I’)或其醫藥學上可接受之鹽表示。
在某些實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),L’、L”及L’”之一係由式(A’)表示: -Z1 -P-Z2 -Rx -J’         (A’), 且其餘為-H、具有1至6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基、鹵素、-OH、(C1 -C6 )烷氧基或-NO2 。具體言之,L’、L”及L’”之一係由式(A’)表示,且其餘為-H。
在第1個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),L’係由式(A’)表示,且L”及L”’均為–H;且其餘變數係如以上在第一實施例中所描述。
在第2個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),Rx 為視情況經鹵素、-OH、(C1 -C3 )烷基、(C1 -C3 )烷氧基、鹵(C1 -C3 )烷基或帶電荷之取代基或可離子化基團Q取代的具有1至6個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Q為i) -SO3 H、-Z’-SO3 H、-OPO3 H2 、-Z’-OPO3 H2 、-PO3 H2 、-Z’-PO3 H2 、-CO2 H、-Z’-CO2 H、-NR11 R12 或-Z’-NR11 R12 ,或其醫藥學上可接受之鹽;或ii) -N+ R14 R15 R16 X- 或-Z’-N+ R14 R15 R16 X- ;Z’為視情況經取代之伸烷基、視情況經取代之伸環烷基或視情況經取代之伸苯基;R14 至R16 各自獨立地為視情況經取代之烷基;且X- 為醫藥學上可接受之陰離子;且其餘變數係如以上在第2個具體實施例中所描述。更具體言之,Q為–SO3 H或其醫藥學上可接受之鹽。
在第3個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),J’包含共價連接至該CBA之部分,且為-NRc1 或-C(=O)-,其中Rc1 為-H或視情況經鹵素、-OH或(C1 -C3 )烷氧基取代的具有1至4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1或2個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,J’為–C(=O)-;且其餘變數係如以上在第3個具體實施例中所描述。
在第4個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),L’係由下式表示: -NR5 -P-C(=O)-(CRa Rb )m -J’    (B1’); -NR5 -P-C(=O)-Cy-(CRa Rb )m’- J’    (B2’); -C(=O)-P-NR5 -(CRa Rb )m -J’    (C1’);或 -C(=O)-P-NR5 -Cy-(CRa Rb )m’ -J’    (C2’), 其中: J’為–C(=O)-; Ra 及Rb 在每次出現時各自獨立地為–H、(C1 -C3 )烷基,或帶電荷之取代基或可離子化之基團Q; m為1至6之整數; m’為0或1至6之整數;且 Cy為視情況經鹵素、-OH、(C1 -C3 )烷基、(C1 -C3 )烷氧基或鹵(C1 -C3 )烷基取代的具有5或6個環碳原子之環狀烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2或3個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Ra 及Rb 均為H;式(B2’)及(C2’)中之Cy為環己烷;且R5 為H或Me;且其餘變數係如以上在第4個具體實施例中所描述。更具體言之,式(B2’)及(C2’)中之m’為0或1。
在第5個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),L’係由下式表示: -NR5 -P-C(=O)-(CRa Rb )m -S-Zs1 (B3’);或 -C(=O)-P-NR5 -(CRa Rb )m -S-Zs1 (C3’), 其中: Ra 及Rb 在每次出現時各自獨立地為–H、(C1 -C3 )烷基,或帶電荷之取代基或可離子化之基團Q; m為1至6之整數; Zs1 係選自下式中之任一個:
Figure 02_image126
(b1);
Figure 02_image128
(b2);
Figure 02_image130
(b3);
Figure 02_image132
(b4);
Figure 02_image134
(b5);
Figure 02_image136
(b6);
Figure 02_image138
(b7);
Figure 02_image140
(b8);
Figure 02_image142
(b9);
Figure 02_image144
(b10);
Figure 02_image146
(b11);
Figure 02_image148
(b12);
Figure 02_image150
(b13);
Figure 02_image152
(b14);及
Figure 02_image154
(b15), 其中: q為1至5之整數; n’為2至6之整數; U為–H或SO3 M; M為醫藥學上可接受之陽離子(例如,H+ 、Na+ 或K+ );且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3或4個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,帶電荷之取代基或可離子化基團Q為i) -SO3 H、-Z’-SO3 H、-OPO3 H2 、-Z’-OPO3 H2 、-PO3 H2 、-Z’-PO3 H2 、-CO2 H、-Z’-CO2 H、-NR11 R12 或-Z’-NR11 R12 ,或其醫藥學上可接受之鹽;或ii) -N+ R14 R15 R16 X- 或-Z’-N+ R14 R15 R16 X- ;Z’為視情況經取代之伸烷基、視情況經取代之伸環烷基或視情況經取代之伸苯基;R14 至R16 各自獨立地為視情況經取代之烷基;且X- 為醫藥學上可接受之陰離子;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。更具體言之,Q為–SO3 H或其醫藥學上可接受之鹽。
在某些實施例中,Ra 及Rb 均為–H且R5 為H或Me;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,-(CRa Rb )m -為–(CH2 )m” -C(Me2 )-且m”為1至5之整數;且其餘變數係如以上在第5個具體實施例中所描述。
在第6個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),P為含有2至10個胺基酸殘基之肽;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4或5個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P為含有2至5個胺基酸殘基之肽;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P係選自Gly-Gly-Gly、Ala-Val、Val-Ala、Val-Cit、Val-Lys、Phe-Lys、Lys-Lys、Ala-Lys、Phe-Cit、Leu-Cit、Lle-Cit、Trp、Cit、Phe-Ala、Phe-N9 -甲苯磺醯基-Arg、Phe-N9 -硝基-Arg、Phe-Phe-Lys、D-Phe-Phe-Lys、Gly-Phe-Lys、Leu-Ala-Leu、Ile-Ala-Leu、Val-Ala-Val、Ala-Leu-Ala-Leu、β-Ala-Leu-Ala-Leu及Gly-Phe-Leu-Gly、Val-Arg、Arg-Val、Arg-Arg、Val-D-Cit、Val-D-Lys、Val-D-Arg、D-Val-Cit、D-Val-Lys、D-Val-Arg、D-Val-D-Cit、D-Val-D-Lys、D-Val-D-Arg、D-Arg-D-Arg、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala、D-Ala-D-Ala、Ala-Met、Met-Ala;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,P為Gly-Gly-Gly、Ala-Val、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala及D-Ala-D-Ala;且其餘變數係如以上在第6個具體實施例中所描述。
在第7個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示雙鍵;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5或6個具體實施例中所描述。
在第8個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示單鍵,X為-H或胺保護基;且Y係選自-H、-OR、-OCOR’、-SR、-NR’R”、視情況經取代之5-或6-員含氮雜環、-SO3 H、-SO2 H及-OSO3 H;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6或7個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,Y係選自-H、-SO3 M、-OH、-OMe、-OEt或–NHOH,其中M為–H、Na+或K+;且其餘變數係如以上在第8個具體實施例中所描述。更具體言之,Y為–H、-SO3 M或-OH。
在第9個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),X’係選自由以下各物組成之群:-H;-OH;視情況經取代的具有1至10個碳原子之直鏈、分支鏈或環狀烷基、烯基或炔基;及苯基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7或8個具體實施例中所描述。
在某些實施例中,X’為–H、-OH、(C1 -C3 )烷基、鹵(C1 -C3 )烷基或苯基;且其餘變數係如以上在第9個具體實施例中所描述。更具體言之,X’為-H、-OH或–Me。甚至更具體言之,X’為-H。
在第10個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),Y’為-H、側氧基、(C1 -C3 )烷基或鹵(C1 -C3 )烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8或9個具體實施例中所描述。更具體言之,Y’為–H或側氧基。甚至更具體言之,Y’為-H。
在第11個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),A與A’相同或不同,且選自-O-、-S-、-NR5 -及側氧基-(C=O)-;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個具體實施例中所描述。更具體言之,A與A’相同或不同,且選自-O-及-S-。甚至更具體言之,A及A’為–O-。
在第12個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),R6 為–OMe;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或11個具體實施例中所描述。
在第13個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’獨立地為–H、鹵素、-NO2 、-OH、(C1 -C3 )烷基、鹵(C1 -C3 )烷基或(C1 -C3 )烷氧基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12個具體實施例中所描述。更具體言之,R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’均為-H。
在第14個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),R、R’、R”及R5 各自獨立地為–H或(C1 -C3 )烷基;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13個具體實施例中所描述。
在第14個具體實施例中,對於結構式(I’)、(II’)、(III’)、(IV’)、(V’)及(VI’),在N與C之間之雙線
Figure 02_image015
表示單鍵或雙鍵,條件為當其為雙鍵時,X不存在且Y為-H,且當其為單鍵時,X為-H,Y為-OH或-SO3 M; R1 、R2 、R3 、R4 、R1 ’、R2 ’、R3 ’及R4 ’均為-H; R6 為-OMe; X’及Y’均為-H; A及A’為-O-; M為H、Na+ 或K+ ;且其餘變數係如以上在第一實施例或第1、2、3、4、5或6個具體實施例中所描述。
在第15個具體實施例中,本發明之偶聯物係由以下結構式中之任一個表示:
Figure 02_image156
Figure 02_image158
Figure 02_image160
Figure 02_image162
Figure 02_image164
Figure 02_image166
Figure 02_image168
Figure 02_image170
Figure 02_image172
Figure 02_image174
Figure 02_image176
Figure 02_image178
Figure 02_image180
Figure 02_image182
Figure 02_image184
Figure 02_image186
Figure 02_image188
Figure 02_image190
Figure 02_image192
Figure 02_image194
Figure 02_image196
Figure 02_image198
Figure 02_image200
Figure 02_image202
Figure 02_image204
Figure 02_image206
Figure 02_image208
Figure 02_image210
Figure 02_image212
Figure 02_image214
Figure 02_image216
Figure 02_image218
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: r為1至10之整數; Y為–H、-OH或-SO3 M;且 M為醫藥學上可接受之陽離子(例如H+ 、Na+ 或K+ )。 更具體言之,Y為–SO3 M。或者,Y為–OH。
在某些實施例中,本文所描述之偶聯物,諸如第二實施例或第1至15個具體實施例中所描述之該等偶聯物可包含1-10個細胞毒性化合物、2-9個細胞毒性化合物、3-8個細胞毒性化合物、4-7個細胞毒性化合物或5-6個細胞毒性化合物,每一細胞毒性化合物包含將該細胞毒性化合物連接至CBA之連接基團,且在偶聯物上之每一細胞毒性化合物均相同。
在任何偶聯物實施例,諸如第二實施例或第1至15個具體實施例中,細胞結合劑可結合至選自以下之靶細胞:腫瘤細胞、感染病毒之細胞、感染微生物之細胞、感染寄生蟲之細胞、自體免疫細胞、活化之細胞、骨髓細胞、活化之T細胞、B細胞或黑素細胞;表現CD4、CD6、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、CD38、CD40、CD44、CD56、EpCAM、CanAg、CALLA或Her-2抗原;Her-3抗原之細胞;或表現胰島素生長因子受體、表皮生長因子受體及葉酸受體之細胞。
在任何偶聯物實施例,諸如第二實施例或第1至15個具體實施例中,該細胞結合劑可為抗體、單鏈抗體、特異性結合至該靶細胞之抗體片段、單株抗體、單鏈單株抗體或特異性結合至靶細胞之單株抗體片段、嵌合抗體、特異性結合至該靶細胞之嵌合抗體片段、結構域抗體、特異性結合至該靶細胞之結構域抗體片段、淋巴因子、激素、維生素、生長因子、集落刺激因子或養分轉運分子。
該抗體可為表面重塑抗體、表面重塑之單鏈抗體或表面重塑之抗體片段。
該抗體可為單株抗體、單鏈單株抗體或其單株抗體片段。
該抗體可為人類化抗體、人類化單鏈抗體或人類化抗體片段。
在以上任何偶聯物實施例,諸如第二實施例或第1至15個具體實施例中,細胞結合劑可為抗葉酸受體抗體或其抗體片段。更具體言之,該抗葉酸受體抗體為huMOV19抗體。
或者,在以上任何偶聯物實施例,諸如第二實施例或第1至15個具體實施例中,細胞結合劑可為抗EGFR抗體或其抗體片段。在一個實施例中,該抗EGFR抗體為非拮抗劑抗體,包括例如WO2012058592(以引用之方式併入本文中)中所描述之抗體。在另一實施例中,抗EGFR抗體為非功能性抗體,例如人類化ML66。更具體言之,抗EGFR抗體為huML66。
本發明另外提供一種醫藥組成物,其包含本文所描述之任何偶聯物及醫藥學上可接受之載劑。
本發明亦提供一種包含連接至細胞結合劑之任何主題化合物的偶聯物。
本發明另外提供一種在哺乳動物中抑制異常細胞生長或治療增生性病症、自體免疫病症、破壞性骨病、感染性疾病、病毒疾病、纖維化疾病、神經退化性疾病、胰腺炎或腎病之方法,該方法包括向該哺乳動物施用治療有效量的本發明之任何化合物(含或不含任何連接子基團)或偶聯物及視情況使用之第二化學治療劑。
在某些實施例中,第二化學治療劑係依序或連續地施用給哺乳動物。
在某些實施例中,該方法係用於治療選自癌症、類風濕性關節炎、多發性硬化、移植物抗宿主疾病(GVHD)、移植排斥反應、狼瘡、肌炎、感染及免疫缺陷之病狀。
在某些實施例中,該方法或偶聯物係用於治療癌症。
在某些實施例中,該癌症為血液科癌症或實體腫瘤。更具體言之,該癌症為卵巢癌、胰腺癌、子宮頸癌、黑素瘤、肺癌(例如非小細胞肺癌(NSCLC))、乳癌、頭頸部鱗狀細胞癌、前列腺癌、子宮內膜癌、淋巴瘤(例如非霍奇金淋巴瘤)、骨髓增生異常症候群(MDS)、腹膜癌或白血病(例如急性骨髓性白血病(AML)、急性單核細胞性白血病、早幼粒細胞性白血病、嗜伊紅性白血病、急性淋巴母細胞性白血病(例如B-ALL)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)及慢性骨髓性白血病(CML))。 細胞結合劑-藥物偶聯物之製備
為了將本發明之細胞毒性化合物或其衍生物連接至細胞結合劑,該細胞毒性化合物可包含鍵結至反應性基團之連接部分,諸如化合物14 (實例1)、23 (實例2)、35 (實例3)、49 (實例4)、80 (實例5)、90 (實例6)、63 (實例7)或70 (實例8)。該等化合物可直接連接至細胞結合劑。用於將鍵結有反應性基團之細胞毒性化合物與細胞結合劑連接以製造細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物的代表性方法描述於實例11、13、14-17、19及20中。
在一個實施例中,可首先使雙官能交聯劑與細胞毒性化合物反應以提供帶有鍵結至一個反應性基團之連接部分的化合物(亦即,藥物-連接子化合物),其可接著與細胞結合劑反應。或者,可首先使雙官能交聯試劑之一端與細胞結合劑反應以提供帶有鍵結至一個反應性基團之連接部分的細胞結合劑,接著可使其與細胞毒性化合物反應。連接部分可含有允許該細胞毒性部分在特定位點釋放的化學鍵。適合化學鍵係此項技術中熟知的且包括二硫鍵、硫醚鍵、酸不穩定性鍵、光不穩定性鍵、肽酶不穩定性鍵及酯酶不穩定性鍵(參見例如,美國專利5,208,020、5,475,092、6,441,163、6,716,821、6,913,748、7,276,497、7,276,499、7,368,565、7,388,026及7,414,073)。較佳為二硫鍵、硫醚鍵及肽酶不穩定性鍵。可用於本發明中之其他連接子包括不可裂解之連接子,諸如美國公開案號2005/0169933中詳細描述的該等連接子;或帶電荷之連接子或親水性連接子,其描述於US 2009/0274713、US 2010/01293140及WO 2009/134976,各專利以引用之方式明確地併入本文中。
在一個實施例中,可將細胞結合劑(例如抗體)於水性緩衝液中之溶液與莫耳過量之雙官能交聯劑,諸如N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)戊酸酯(SPP)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)丁酸酯(SPDB)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)2-磺基丁酸酯(磺基-SPDB)一起溫育,以引入二硫吡啶基。接著使經修飾之細胞結合劑(例如經修飾之抗體)與本文所描述的含硫醇之細胞毒性化合物,諸如化合物9899 (實例9及10)反應,以製備本發明的二硫化物連接之細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物。
在另一實施例中,可使本文所描述的含硫醇之細胞毒性化合物,諸如化合物9899 與雙官能交聯劑,諸如N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)戊酸酯(SPP)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)丁酸酯(SPDB)、N -琥珀醯亞胺基-4-(2-吡啶基二硫基)2-磺基丁酸酯(磺基-SPDB)反應,以形成細胞毒性劑-連接子化合物,接著可使其與細胞結合劑反應,以製備本發明的二硫化物連接之細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物。細胞毒性劑-連接子化合物可在與細胞結合劑反應之前原位製備,無需純化。代表性方法描述於實例12及18中。或者,細胞毒性劑-連接子化合物可在與細胞結合劑反應之前經純化。
細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物可使用此項技術中已知之任何純化方法,諸如美國專利號7,811,572及美國公開案號2006/0182750(均以引用之方式併入本文中)中所描述之該等方法純化。舉例而言,細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物可使用切向流過濾、吸附層析法、吸附過濾法、選擇性沈澱法、非吸附過濾法或其組合進行純化。較佳使用切向流過濾(TFF,又稱為橫流式過濾、超濾及透濾)及/或吸附層析樹脂純化該等偶聯物。
或者,可將細胞結合劑(例如抗體)與莫耳過量之抗體修飾劑,諸如2-亞胺基硫雜環戊烷、L-高半胱胺酸硫內酯(或衍生物)或N-琥珀醯亞胺基-S-乙醯基硫代乙酸酯(SATA)一起溫育,以引入硫氫基。接著使經修飾之抗體與適當的含二硫化物之細胞毒性劑反應,以製備二硫化物連接之抗體-細胞毒性劑偶聯物。接著,可藉由以上描述之方法純化抗體-細胞毒性劑偶聯物。細胞結合劑亦可經工程改造以引入硫醇部分,諸如美國專利號7,772485及7.855,275中所揭示的半胱胺酸工程改造之抗體。
在另一實施例中,可將細胞結合劑(例如抗體)於水性緩衝液中之溶液與莫耳過量之抗體修飾劑一起溫育,諸如與N -琥珀醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-甲酸酯一起溫育以引入順丁烯二醯亞胺基,或與N -琥珀醯亞胺基-4-(碘代乙醯基)-胺基苯甲酸酯(SIAB)一起溫育,以引入碘代乙醯基。接著使經修飾之細胞結合劑(例如經修飾抗體)與含硫醇之細胞毒性劑反應,以製備硫醚連接之細胞結合劑-細胞毒性劑偶聯物。接著,可藉由以上描述之方法純化該偶聯物。
可藉由量測在280 nm與在330 nm下吸光度之比率,以分光光度法測定每一抗體分子結合之細胞毒性分子之數量。每一抗體分子可藉由本文所描述之方法連接平均1-10個細胞毒性化合物。每一抗體分子連接之細胞毒性化合物之平均數量較佳為2-5個,且最佳為2.5-4.0個。
用於製備本發明之細胞結合劑-藥物偶聯物之代表性方法描述於8,765,740及美國申請公開案號2012/0238731中。該等參考文獻之完整教示內容以引用之方式併入本文中。 化合物及偶聯物之細胞毒性
可對本發明之細胞毒性化合物及細胞結合劑-藥物偶聯物在活體外抑制各種癌細胞增殖之能力進行評價。舉例而言,可使用細胞株,諸如人子宮頸癌細胞株KB、人急性單核細胞性白血病細胞株THP-1、人早幼粒細胞性白血病細胞株HL60、人急性骨髓性白血病細胞株HNT-34來評估該等化合物及偶聯物之細胞毒性。可使待評價之細胞暴露於該等化合物或偶聯物1-5天,且藉由已知方法在直接分析中量測細胞之存活分數。接著,可由該等分析之結果計算IC50 值。或者或另外,可使用活體外細胞株敏感性篩選,諸如美國國家癌症協會(U.S. National Cancer Institute)所描述之篩選法(參見Voskoglou-Nomikos等人, 2003,Clinical Cancer Res. 9: 42227-4239,以引用之方式併入本文中)作為一種指導以確定可能對本發明之化合物或偶聯物治療敏感的癌症類型。
本發明之抗體-細胞毒性劑偶聯物之活體外效力及靶特異性的實例顯示於圖2及4中。所有該等偶聯物對抗原陽性癌細胞具有極高細胞毒性,且IC50 在較低皮莫耳濃度範圍內。抗原陰性細胞當暴露於該等偶聯物時仍保持活力。
在一個實例中,量測了細胞結合劑/細胞毒性劑偶聯物之活體內功效。用huMov19-80 及huMov19-90 偶聯物處理帶有NCI-H2110腫瘤細胞之SCID小鼠且觀察到在多種劑量下腫瘤顯著消退,而未處理之小鼠腫瘤生長迅速(圖6)。在低至5 μg/kg劑量下觀察到huMov19-90 偶聯物之活性。 組成物及使用方法
本發明包括一種組成物(例如醫藥組成物),其包含本文所描述之新穎苯并二氮呯化合物(例如,吲哚啉并苯并二氮呯或噁唑啶并苯并二氮呯)、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)及載劑(醫藥學上可接受之載劑)。本發明亦包括一種組成物(例如醫藥組成物),其包含本文所描述之新穎苯并二氮呯化合物、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)及載劑(醫藥學上可接受之載劑),另外包含第二治療劑。本發明之組成物可用於在哺乳動物(例如人類)中抑制異常細胞生長或治療增生性病症。本發明之組成物亦可用於治療哺乳動物(例如人類)之抑鬱症、焦慮症、應激症、恐怖症、驚慌、煩躁、心理障礙、疼痛及炎性疾病。
本發明包括一種在哺乳動物(例如人類)中抑制異常細胞生長或治療增生性病症之方法,該方法包括向該哺乳動物施用單獨或與第二治療劑組合的治療有效量之本文所描述之新穎苯并二氮呯化合物(例如,吲哚啉并苯并二氮呯或噁唑啶并苯并二氮呯)、其衍生物或其偶聯物(及/或其溶劑化物、水合物及/或鹽)或其組成物及載劑(醫藥學上可接受之載劑)。
本發明亦提供治療方法,該方法包括向需要治療之受試者施用有效量的以上所描述之任何偶聯物。
類似地,本發明提供一種用於誘導所選細胞群中細胞死亡之方法,該方法包括使靶細胞或含有靶細胞之組織與有效量的本發明之包含細胞毒性劑之任何細胞毒性化合物-結合劑(例如連接至細胞結合劑之吲哚啉并苯并二氮呯或噁唑啶并苯并二氮呯二聚體)、其鹽或溶劑化物接觸。靶細胞係細胞結合劑能結合之細胞。
必要時,可與該偶聯物一起施用其他活性劑,諸如其他抗腫瘤劑。
適合醫藥學上可接受之載劑、稀釋劑及賦形劑係熟知的且可由熟習此項技術者依據臨床情況所允許來確定。
適合載劑、稀釋劑及/或賦形劑之實例包括:(1)杜貝卡氏磷酸鹽緩衝生理食鹽水(Dulbecco’s phosphate buffered saline),約pH 7.4,含有或不含約1 mg/mL至25 mg/mL人血清白蛋白;(2) 0.9%生理食鹽水(0.9% w/v NaCl);及(3) 5% (w/v)右旋葡萄糖;且亦可含有抗氧化劑(諸如色胺)及穩定劑(諸如Tween 20)。
用於誘導所選細胞群中細胞死亡之方法可在活體外、活體內或離體實行。
活體外應用之實例包括自體骨髓在植入同一患者體內之前進行處理以便殺死患病細胞或惡性細胞;骨髓在移植之前進行處理以便殺死勝任T細胞且防止移植物抗宿主疾病(GVHD);處理細胞培養物以便殺死除所需變異體外的不表現靶抗原之所有細胞;或殺死表現非所需抗原之變異體。
非臨床活體外應用之條件易於由熟悉此項技術者決定。
臨床上離體應用之實例係在自體移植以治療癌症或治療自體免疫疾病之前自骨髓移除腫瘤細胞或淋巴樣細胞,或在移植之前由自體或異體骨髓移除T細胞及其他淋巴樣細胞以便防止GVHD。治療可進行如下。自患者或其他個體採集骨髓,且接著在約37℃下,在添加有濃度範圍為約10 μM至1 pM之本發明細胞毒性劑的含血清培養基中孵育約30分鐘至約48小時。濃度及孵育時間(亦即,劑量)之確切條件易於由熟習此項技術者決定。在孵育之後,用含血清之培養基洗滌骨髓細胞且根據已知方法,將其經靜脈內回輸給患者。在患者于骨髓採集時間與經處理細胞回輸之間接受其他治療,諸如消融性化學療法或全身照射療程之情況下,使用標準醫療設備將經處理骨髓細胞冷凍儲存在液氮中。
對於臨床上活體內應用,所供應的本發明之細胞毒性劑將係針對無菌性及內毒素含量進行測試之溶液或凍乾粉。適合施用偶聯物之方案的實例如下。偶聯物係每週一次以靜脈內推注給與,持續4周。推注劑量係在添加有5至10 mL人血清白蛋白之50至1000 mL標準生理食鹽水中給與。每次靜脈內施用的劑量將為10 μg至2000 mg(在每天100 ng至20 mg/kg範圍內)。治療四周之後,患者可每週繼續接受治療。有關施用途徑、賦形劑、稀釋劑、劑量、時間等之具體臨床方案可由普通熟習此項技術者根據臨床情況之允許來決定。
可根據誘導所選細胞群中細胞死亡之活體內或離體方法治療的醫療病況之實例包括任何類型之惡性疾病,包括例如,癌症;自體免疫疾病;諸如全身性狼瘡、類風濕性關節炎及多發性硬化;移植物排斥,諸如腎移植排斥反應、肝移植排斥反應、肺移植排斥反應、心臟移植排斥反應及骨髓移植排斥反應;移植物抗宿主疾病;病毒感染,諸如CMV感染、HIV感染、AIDS等;及寄生蟲感染,諸如賈第鞭毛蟲病、阿米巴病、血吸蟲病及普通熟習此項技術者所確定之其他疾病。
癌症療法及其劑量、施用途徑及推薦劑量係此項技術中已知的且已描述於如Physician's Desk Reference (PDR)之文獻中。PDR揭示了用於治療各種癌症之藥劑的劑量。該等以上提及的在治療上有效之化學治療藥物之給藥方案及劑量將取決於所治療之特定癌症、疾病程度及熟習此項技術之醫師所熟悉之其他因素,且可由醫師決定。PDR之內容係以引用之方式清楚地整體併入本文中。熟習此項技術者可評述PDR,使用以下一個或多個參數來確定可根據本發明之教示內容使用的化學治療藥物及偶聯物之給藥方案及劑量。該等參數包括: 綜合指數 製造商 產品(公司或商標藥物名) 種類索引 通用名/化學物質索引(非商標通用藥物名) 藥物之彩色圖像 產品資訊,與FDA標貼相符 化學特性資訊 功能/作用 適應症與禁忌症 試驗研究、副作用、警告 類似物及衍生物
熟習細胞毒性劑領域之技術人員將易於瞭解,本文所描述之每一細胞毒性劑可藉由使所得化合物仍保持起始化合物之特異性及/或活性之方式進行修飾。熟練技術人員亦應瞭解,該等化合物中有許多可代替本文所描述之細胞毒性劑使用。因此,本發明之細胞毒性劑包括本文所描述之偶聯劑的類似物及衍生物。
本文及以下實例中引用之所有參考文獻均以引用之方式清楚地整體併入本文中。實例
現將參照非限制性實例說明本發明。除非另作規定,否則所有百分比、比率、份數等均以重量計。所有試劑均購自Aldrich Chemical Co.(New Jersey)或其他商業來源。核磁共振(1 H NMR)譜係在Bruker 400 MHz儀器上獲得。質譜係在Bruker Daltonics Esquire 3000儀器上獲得且LCMS係在帶有Agilent 6120單級四極桿MS之Agilent 1260 Infinity LC上使用電噴霧電離法獲得。
以下溶劑、試劑、保護基、部分及其他名稱可藉由括弧中之縮寫提及。 Me =甲基;Et =乙基;Pr =丙基;i -Pr =異丙基;Bu =丁基;t -Bu =第三丁基;Ph =苯基;及Ac =乙醯基 AcOH或HOAc =乙酸 ACN或CH3 CN =乙腈 Ala =丙胺酸 aq =水溶液 BH3 ·DMS =硼烷二甲硫醚錯合物 Bn =苯甲基 Boc或BOC =第三丁氧羰基 CBr4 = 四溴化碳 Cbz或Z =苯甲氧羰基 DCM或CH2 Cl2 =二氯甲烷 DCE = 1,2-二氯乙烷 DMAP = 4-二甲基胺基吡啶 DI water =去離子水 DIBAL =氫化二異丁基鋁 DIEA或DIPEA = N,N-二異丙基乙胺 DMA = N,N-二甲基乙醯胺 DMF = N,N-二甲基甲醯胺 DMSO =二甲亞碸 DTT =二硫蘇糖醇 EDC = 1-乙基-3-(3-二甲基胺基丙基)碳化二亞胺 EEDQ = N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氫喹啉 ESI或ES =電噴霧電離 EtOAc =乙酸乙酯 Gly =甘胺酸 g =公克 h =小時 HATU = 六磷酸N,N,N’N’-四甲基-O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)脲鎓鹽 HPLC = 高效液相層析 HOBt或HOBT = 1-羥基苯并三唑 LAH = 氫化鋰鋁 LC = 液相層析 LCMS = 液相層析質譜法 min = 分鐘 mg = 毫克 mL = 毫升 mmol = 毫莫耳 µg = 微克 µL = 微升 µmol = 微莫耳 Me = 甲基 MeOH = 甲醇 MeI = 碘甲烷 MS = 質譜法 MsCl = 甲烷磺醯氯(甲磺醯氯) Ms2 O = 甲烷磺酸酐 NaBH(OAc)3 =三乙醯氧基硼氫化鈉 NHS = N-羥基琥珀醯胺 NMR =核磁共振波譜 PPh3 = 三苯基膦 PTLC = 製備型薄層層析法rac = 外消旋混合物 Rf = 滯留因子 RPHPLC或RP-HPLC =反相高效液相層析法 RT或rt =室溫(環境溫度,約25℃) sat或sat’d =飽和 STAB =三乙醯氧基硼氫化鈉(NaBH(OAc)3 ) TBSCl或TBDMSCl =氯化第三丁基二甲基矽烷 TBS =第三丁基二甲基矽烷 TCEP·HCl = 參(2-羧基乙基)膦鹽酸鹽 TEA =三乙胺(Et3 N) TFA =三氟乙酸 THF =四氫呋喃 TLC =薄層層析 Val =纈胺酸實例 1. 合成6-((2-((2-((2-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物14 )
Figure 02_image220
步驟 1 將Z-Gly-Gly-OH化合物1 (5.0 g,18.78 mmol)及H-Gly-Ot- Bu·HCl化合物2 (3.46 g,20.66 mmol)溶解於DMF (37.6 mL)中。將EDC∙HCl (3.96 g,20.66 mmol)及HOBt (2.88 g,18.78 mmol)添加至反應燒瓶中,隨後添加DIPEA (8.18 mL,46.9 mmol)。在Ar下,在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋,用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 ,隨後水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM,梯度0%至5%)純化,得到呈白色固體狀之純化合物3 (6.35 g,89%產率)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.18-8.13 (m, 2H), 7.48 (t, 1H,J = 6.0 Hz), 7.37-7.36 (m, 3H), 7.34-7.32 (m, 1H), 5.04 (s, 2H), 4.09 (q, 1H,J = 5.2 Hz), 3.74 (t, 4H,J = 6.1 Hz), 3.67 (d, 2H,J = 6.0 Hz), 3.17 (d, 2H,J = 5.2 Hz), 1.41 (s, 9H)。LCMS = 4.28 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 324.15 (M-t- Bu+H)。
Figure 02_image222
步驟 2 :將化合物3 (6.3 g,16.60 mmol)溶解於MeOH (52.7 mL)及水(2.64 mL)中。反應混合物用Ar淨化且脫氣5分鐘。緩慢添加Pd/C (潮濕,10%) (0.884 g,0.830 mmol)。接著,以來自氣球之H2 鼓泡1分鐘。在氫氣球下,在室溫下攪拌反應隔夜。使反應混合物濾過Celite且濾餅用MeOH (30 mL)洗滌並濃縮。將CH3 CN (20 mL)添加至殘餘物中並濃縮。將此操作再重複2次,得到粘性固體。使殘餘物在EtOAc/己烷(2:1,50 mL)中形成漿液且過濾,並用EtOAc/己烷(1:1,30 mL)沖洗。固體在真空/N2 下乾燥1小時,得到呈白色固體狀之化合物4 (3.66 g,90%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.21-8.18 (m, 1H), 8.12 (bs, 1H), 3.76 (bs, 2H), 3.73 (d, 2H,J = 6.0 Hz), 3.13 (s, 2H), 1.93 (bs, 2H), 1.41 (s, 9H)。
Figure 02_image224
步驟 3 將胺化合物4 (1.0 g,4.08 mmol)及己二酸單甲酯(664 µL,4.48 mmol)溶解於DMF (13.59 mL)中。將EDC·HCl (860 mg,4.48 mmol)及HOBt (624 mg,4.08 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (1.424 mL,8.15 mmol)。在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用DCM/MeOH (20 mL,5:1)稀釋且用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 、水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物藉由矽膠急驟層析法(梯度,0%至20% MeOH/DCM)純化,得到呈白色固體狀之純化合物5 (1.5 g,95%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.17-8.06 (m, 3H), 3.74-3.71 (m, 6H), 3.59 (s, 3H), 2.32 (bt, 2H,J = 6.9 Hz), 2.14 (bt, 2H,J = 6.7 Hz), 1.52-1.49 (m, 4H), 1.41 (s, 9H)。
Figure 02_image226
步驟 4 在室溫下,在TFA (5.97 mL,77.0 mmol)及去離子水(300 µL)中攪拌化合物5 (1.5 g,3.87 mmol)隔夜。將CH3 CN (10 mL)添加至反應混合物中並攪拌5分鐘。混合物變濃稠並具有許多白色沈澱。再添加CH3 CN (30 mL)且再攪拌5分鐘。混合物過濾且在真空/N2 下乾燥1小時,得到呈白色固體狀之純化合物6 (0.7 g,55%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 12.56 (s, 1H), 8.16-8.06 (m, 3H), 3.73 (dt, 6H,J = 8.6, 6.1 Hz), 3.59 (s, 3H), 2.32-2.29 (m, 2H), 2.16-2.13 (m, 2H), 1.51 (bt, 4H,J = 3.5 Hz)。
Figure 02_image228
步驟 5 在室溫下,將苯胺化合物7 (100 mg,0.653 mmol)及酸化合物6 (227  mg,0.685 mmol)懸浮於CH2 Cl2 /MeOH (4.35 mL/2.2 mL)中。添加EEDQ (323 mg,1.306 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。濃縮溶劑且使殘餘物在EtOAc (15 mL)中形成漿液並過濾。固體用EtOAc (2 × 15 mL)洗滌且在真空/N2 下乾燥,得到呈白色固體狀之化合物8 (260 mg,85%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.74 (s, 1H), 8.21-8.19 (m, 2H), 8.11-8.08 (m, 1H), 7.45 (s, 2H), 6.96 (s, 1H), 5.17 (t, 2H,J = 5.7 Hz), 4.45 (d, 4H,J = 5.6 Hz), 3.87 (d, 2H,J = 5.8 Hz), 3.75 (dd, 4H,J = 5.7, 13.4 Hz), 3.58 (s, 3H), 2.31-2.27 (m, 2H), 2.16-2.13 (m, 2H),1.52-1.48 (m, 4H)。LCMS = 0.886 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 489.3 (M+Na)。
Figure 02_image230
步驟 6 將二醇化合物8 (260 mg,0.557 mmol)及四溴化硼(555 mg,1.672 mmol)溶解於DMF (5.57 mL)中。添加三苯基膦(439 mg,1.672 mmol)且褐色混合物在Ar下在室溫下攪拌4小時。反應混合物用DCM/MeOH (10:1,30 mL)稀釋且用水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM,0%至10%,梯度)純化,得到呈黃色固體狀之化合物9 。產物在CH2 Cl2 /EtOAc (1:10,30 mL)中形成漿液且接著過濾。固體用EtOAc洗滌且在真空/N2 下乾燥,得到呈灰白色固體狀之純化合物9 (170 mg,52%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.95 (s, 1H), 8.25-8.20 (m, 2H), 8.12-8.10 (m, 1H), 7.65 (s, 2H), 7.22 (s, 1H), 4.68 (s, 3H), 3.89 (d, 2H,J = 5.8 Hz), 3.77 (dd, 4H,J = 5.7, 7.4 Hz), 3.58 (s, 3H), 2.31-2.27 (m, 2H), 2.16-2.13 (m, 2H), 1.51-1.49 (m, 4H)。LCMS = 3.335 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 593.2 (M+H)。
Figure 02_image232
步驟 7 將二溴化物化合物9 (109 mg,0.184 mmol)及IGN單體化合物10 (119 mg,0.405 mmol)溶解於DMF (1.84 mL)中。添加碳酸鉀(63.6 mg,0.460 mmol)且在室溫下攪拌隔夜。將水(20 mL)添加至反應混合物中以以使產物沈澱。漿液在室溫下攪拌5分鐘且接著過濾,並在真空/N2 下乾燥1小時。粗產物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/CH2 Cl2 ,梯度0%至5%)純化,得到呈黃色固體狀之化合物11 (160 mg,60%產率,70%純度)。LCMS = 5.240 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1019.7 (M+H)。
Figure 02_image234
步驟 8 將二亞胺化合物11 (140 mg,0.11 mmol)溶解於1,2-二氯乙烷(1.1 mL)中。將NaBH(OAc)3 (23.29 mg,0.11 mmol)添加至反應混合物中且在室溫下攪拌1小時。反應物用CH2 Cl2 (30 mL)稀釋且用sat’d aq NH4 Cl溶液(15 mL)淬滅。分離各層且用鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並濃縮。粗殘餘物藉由RPHPLC (C18管柱,CH3 CN/H2 O,梯度35%至55%)純化,得到呈白色蓬鬆固體狀之單亞胺化合物12 (33 mg,29%產率)且亦回收到起始物質化合物11 (25 mg). LCMS = 7.091 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1021.7 (M+H)。
Figure 02_image236
步驟 9 將甲酯化合物12 (33 mg,0.029 mmol)溶解於THF (1.09 mL)及水(364 µL)中。添加LiOH (6.97 mg,0.291 mmol)且在室溫下攪拌反應1.5小時。反應混合物用H2 O (5 mL)稀釋且用0.5 M HCl水溶液酸化直至約pH 4。水層用CH­2 Cl2 /MeOH (3:1,3 × 20 mL)萃取。合併之有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮,得到呈黃色固體狀之粗化合物13 (29 mg,99%產率)。LCMS = 5.356 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1007.7 (M+H)。
Figure 02_image238
步驟 10 在室溫下,將EDC·HCl (22.08 mg,0.115 mmol)添加至酸化合物13 (29 mg,0.023 mmol)及N-羥基琥珀醯胺(21.21 mg,0.184 mmol)於CH2 Cl2 (2.3 mL)中之經攪拌溶液中。攪拌反應混合物2小時。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋且用水(1 × 15 mL)及鹽水(1 × 15 mL)洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物藉由RPHPLC (C18管柱,CH3 CN/H2 O,梯度35%至55%)純化。合併含產物之溶離份並凍乾,得到呈白色蓬鬆固體狀之6-((2-((2-((2-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物14 (8 mg,31%產率)。LCMS = 5.867 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1104.7 (M+H)。實例 2. 合成(1r,4r)-4-((2-((2-((2-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺甲醯基)環己烷-甲酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物23 )
Figure 02_image240
步驟 1 將胺化合物4 (200 mg,0.815 mmol)及1,4- - 環己烷二甲酸單甲酯化合物15 (182 mg,0.978 mmol)溶解於DMF (2.72 mL)中。將EDC·HCl (188 mg,0.978 mmol)及HOBt (125  mg,0.815 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (285 µL,1.631 mmol)。混合物在室溫下攪拌隔夜。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋且用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 、鹽水及水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥且濃縮成粘性殘餘物。將CH3 CN (15 mL)添加至殘餘物中並濃縮。將此操作再重複2次,得到呈乾燥白色粉末狀之化合物16 (300 mg,85%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.16 (t, 1H,J = 5.9 Hz), 8.04 (dt, 2H,J = 5.6, 14.8 Hz), 3.74-3.69 (m, 6H), 3.59 (s, 3H), 2.31-2.25 (m, 1H), 2.20-2.13 (m, 1H), 1.94-1.91 (m, 2H), 1.82-1.79 (m, 2H), 1.41 (s, 9H), 1.34 (d, 3H,J = 11.7 Hz)。
Figure 02_image242
步驟 2 在室溫下,將TFA (1.40 mL,18.14 mmol)及DI水(67.8 µL)添加至淨化合物16 (300 mg,0.726 mmol)中並攪拌3小時。將CH3 CN (20 mL)添加至反應混合物中並濃縮。將此操作再重複2次,得到呈白色固體狀之化合物17 (230 mg,89%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.16-8.13 (m, 1H), 8.07-8.01 (m, 2H), 3.76-3.73 (m, 4H), 3.70 (bd, 2H,J = 5.1 Hz), 3.59 (s, 3H), 2.31-2.25 (m, 1H), 2.19-2.14 (m, 1H), 1.94-1.91 (m, 2H), 1.82-1.79 (m, 2H), 1.42-1.26 (m, 4H)。
Figure 02_image244
步驟 3 在室溫下,將苯胺化合物7 (135 mg,0.881 mmol)及酸化合物17 (331  mg,0.925 mmol)懸浮於CH2 Cl2 /MeOH (2.9 mL/1.5 mL)中。添加EEDQ (436 mg,1.763 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。濃縮溶劑且使殘餘物在EtOAc (15 mL)中形成漿液並過濾。固體用EtOAc (2 × 15 mL)洗滌且在真空/N2 下乾燥,得到呈白色固體狀之化合物18 (330 mg,61%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.73 (s, 1H), 8.18 (dt, 2H,J = 6.0, 19.2 Hz), 8.09-8.01 (m, 2H), 7.45 (s, 2H), 6.96 (s, 1H), 5.17 (t, 2H,J = 5.7 Hz), 4.45 (d, 4H,J = 5.6 Hz), 3.88-3.84 (m, 3H), 3.77-3.69 (m, 8H), 3.63 (s, 2H), 3.59 (s, 6H), 2.30-2.22 (m, 2H), 2.19-2.13 (m, 2H), 1.94-1.90 (m, 4H), 1.82-1.78 )m, 4H), 1.41-1.26 (m, 8H)。
Figure 02_image246
步驟 4 將化合物18 (330 mg,0.536 mmol)及CBr4 (533 mg,1.608 mmol)溶解於DMF (5.36 mL)中。將PPh3 (422 mg,1.608 mmol)添加至反應混合物中,此時反應物變為黃色並伴隨輕微放熱。在Ar下攪拌反應4小時。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋並用水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/CH2 Cl2 ,梯度0%至10%)純化,得到呈白色固體狀之化合物19 (234 mg,64%產率)。LCMS = 4.453 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 617.10 (M+H)。
Figure 02_image248
步驟 5 化合物20 係以與實例1中化合物11 類似之方式製備。在純化後獲得呈黃色固體狀之化合物20 (264 mg,60%產率)。LCMS = 4.831 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1045.20 (M+H)。
Figure 02_image250
步驟 6 化合物21 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之化合物21 (51 mg,31%產率)。LCMS = 5.127 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1047.30 (M+H)。
Figure 02_image252
步驟 7 將甲酯化合物21 (48 mg,0.046 mmol)溶解於1,2-二氯乙烷(3.06 mL)中。將三甲基錫烷醇(124 mg,0.688 mmol)添加至反應混合物中且在80℃下加熱隔夜。反應混合物冷卻至室溫且用水(15 mL)稀釋。水層用1 M HCl酸化至約pH 4。混合物用CH2 Cl2 /MeOH (10:1,3 × 20 mL)萃取。合併之有機層用鹽水洗滌且經Na2 SO4 乾燥並濃縮。粗殘餘物經由短矽膠塞塞住且用CH2 Cl2 /MeOH (10:1,接著5:1,2 × 30 mL)沖洗並濃縮。獲得呈黃色固體狀之酸化合物22 且不經進一步純化即用於下一步驟中(48 mg,100%產率)。LCMS = 5.338 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1033.7 (M+H)。
Figure 02_image254
步驟 8 化合物23 係以與實例1中化合物13 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之(1r,4r)-4-((2-((2-((2-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺甲醯基)環己烷甲酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物23 (8 mg,19%產率)。LCMS = 6.007 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1130.8 (M+H)。實例 3. 合成6-(((S)-1-(((S)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12, 12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-3-甲基-1-側氧基丁-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物35 )
Figure 02_image256
步驟 1 將Z-Val-OH 化合物24 (3.0 g,11.94 mmol)及L-Ala-Ot Bu化合物25 (1.907 g,13.13 mmol)溶解於DMF (23.88 mL)中。將EDC·HCl (2.52 g,13.13 mmol)及HOBt (2.011 g,13.13 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (4.59 mL,26.3 mmol)。在Ar下在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋且用sat'd NaHCO3 、sat'd NH4 Cl、水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至50%)純化,得到呈白色固體狀之化合物26 (3.68 g,81%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.39-7.29 (m, 5H), 6.29 (bd, 1H,J = 6.9 Hz), 5.34 (bd, 1H,J = 8.4 Hz), 5.11 (s, 2H), 4.45 (p, 1H,J = 7.2 Hz), 4.02-3.98 (m, 1H), 2.18-2.09 (m, 1H), 1.56 (s, 9H), 1.37 (d, 3H,J = 7.0 Hz), 0.98 (d, 3H,J = 6.8 Hz), 0.93 (d, 3H,J = 6.8 Hz)。LCMS = 5.571 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 323.25 (M-t Bu+H)。
Figure 02_image258
步驟 2 將化合物26 (3.68 g,9.72 mmol)溶解於MeOH (30.9 mL)及水(1.543 mL)中。溶液用Ar淨化並脫氣5分鐘。將Pd/C (10%, 潮濕,0.517 g)緩慢添加至反應混合物中。接著使H2 在其中鼓泡一分鐘。中止鼓泡且接著在氫氣球下攪拌反應隔夜。使反應混合物濾過Celite且濾餅用MeOH (30 mL)洗滌並濃縮,得到呈白色固體狀之化合物27 (2.35 g,99%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.79-7.77 (m, 1H), 4.50 (p, 1H,J = 7.3 Hz), 3.27 (d, 1H,J = 3.9 Hz), 2.34-2.26 (m, 1H), 1.49 (s, 9H), 1.40 (d, 3H,J = 7.1 Hz), 1.01 (d, 3H,J = 7.0 Hz), 0.86 (d, 3H,J = 6.9 Hz)。
Figure 02_image260
步驟 3 將胺化合物27 (2.35 g,9.62 mmol)及己二酸單甲酯(1.69 g,10.58 mmol)溶解於DMF (32.1 mL)中。將EDC·HCl (1.94 g,10.10 mmol)及HOBt (1.47 g,9.62 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (3.36 mL,19.24 mmol)。在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用DCM/MeOH (20 mL,5:1)稀釋且用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 、水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至50%)純化,得到呈白色固體狀之化合物28 (2.77 g,75%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 6.29 (d, 1H,J = 7.2 Hz), 6.12 (d, 1H,J = 8.6 Hz), 4.43(p, 1H,J = 7.2 Hz), 4.27 (dd, 1H,J = 6.4, 8.6 Hz), 3.66 (s, 3H), 2.35-2.31 (m, 2H), 2.26-2.23 (m, 2H), 2.12-2.03 (m, 1H), 1.70-1.63 (m, 4H), 1.46 (s, 9H), 1.36 (d, 3H,J = 7.1 Hz), 0.95 (明顯t, 6H,J = 6.6 Hz)。
Figure 02_image262
步驟 4 在室溫下,將TFA (8.28 mL,108.0 mmol)及水(0.56 mL)添加至淨化合物28 (2.77 g,7.17 mmol)中並攪拌2.5小時。將CH3 CN (30 mL)添加至反應混合物中並濃縮。將此操作再重複2次,得到呈淺黃色固體狀之化合物29 (2.0 g,84%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 8.11 (bs, 1H), 7.29 (d, 1H,J = 8.9 Hz), 7.14 (d, 1H, 6.8 Hz), 4.58 (p, 1H,J = 7.1 Hz), 4.37 (t, 1H,J = 8.7 Hz), 3.68 (s, 3H), 2.37-2.32 (m, 4H), 2.03-1.99 (m, 2H), 1.69-1.63 (m, 4H), 1.49 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 0.97 (d, 3H,J = 4.8 Hz), 0.96 (d, 3H,J = 4.8 Hz)。
Figure 02_image264
步驟 5 在室溫下,將苯胺化合物7 (150 mg,0.98 mmol)及酸化合物29 (340 mg,1.03 mmol)懸浮於CH2 Cl2 /MeOH (3.26 mL,1.62 mL)中。添加EEDQ (484 mg,1.96 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。濃縮溶劑且使殘餘物在EtOAc/Et2 O (15 mL,15 mL)中形成漿液並過濾。固體用Et2 O (2 × 15 mL)洗滌並在真空/N2 下乾燥,得到呈白色固體狀之化合物30 (150 mg,33%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.61 (s, 2H), 7.47 (d, 1H,J = 7.1 Hz), 7.14 (s, 1H), 6.64 (d, 1H,J = 8.0 Hz), 4.82-4.75 (m, 1H), 4.45-4.40 (m, 4H), 3.64 (s, 3H), 2.36-2.27 (m, 4H), 2.16-2.07 (m, 1H), 1.68-1.59 (m, 4H), 1.47 (d, 3H,J = 7.0 Hz), 0.98 (d, 3H,J = 3.6 Hz), 0.95 (d, 3H,J = 4.8 Hz)。LCMS = 3.073 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 466.25 (M+H)。
Figure 02_image266
步驟 6 將二醇化合物30 (150 mg,0.322 mmol)及CBr4 (321 mg,0.967 mmol)溶解於DMF (3222 µl)中。將PPh3 (254 mg,0.967 mmol)添加至反應混合物中,此時反應物變為粉紅色且伴隨輕微放熱。在Ar下攪拌反應4小時。反應混合物用CH2 Cl2 稀釋並用水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至100%)純化,得到呈灰白色固體狀之化合物31 (473 mg,75%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.19 (d, 1H,J = 6.6 Hz), 7.85 (d, 1H,J = 8.5 Hz), 7.64 (s, 2H), 7.21 (s, 1H), 4.68 (s, 3H), 4.37 (p, 1H,J = 7.0 Hz), 4.18 (dd, 1H,J = 7.2, 8.4 Hz), 3.58 (s, 3H), 2.32-2.29 (m, 2H), 2.33-2.12 (m, 2H), 2.01-1.91 (m, 1H), 1.53-1.49 (m, 4H), 1.31 (d, 3H,J = 7.1 Hz), 0.89 (d, 3H,J = 6.8 Hz), 0.85 (d, 3H,J = 6.8 Hz)。LCMS = 5.259 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 592.05 (M+H)。
Figure 02_image268
步驟 7 化合物32 係以與實例1中化合物11 類似之方式製備。在純化後獲得呈黃色固體狀之化合物32 (162 mg,57%產率,70%純度)。LCMS = 6.461 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1018.7 (M+H)。
Figure 02_image270
步驟 8 化合物33 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之化合物33 (40 mg,31%產率)。LCMS = 5.528 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1020.30 (M+H)。
Figure 02_image272
步驟 9 化合物34 係以與實例2中化合物22 類似之方式製備。在二氧化矽塞後獲得呈黃色固體狀之化合物34 (38 mg,100%產率)。LCMS = 5.211 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1006.35 (M+H)。
Figure 02_image274
步驟 10 化合物35 係以與實例1中化合物14 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之6-(((S)-1-(((S)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-3-甲基-1-側氧基丁-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物35 (8 mg,20%產率)。LCMS = 7.031 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1103.7 (M+H)。實例 4. 合成2-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)-3,6,9,12-四側氧基-2,5,8,11-四氮雜十七碳-17酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物49 )
Figure 02_image276
步驟 1 將(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇化合物7 (5.0 g,32.6 mmol)溶解於THF (65.3 mL)中。添加TBSCl (12.30 g,82 mmol)及咪唑(6.67 g,98 mmol)且在Ar下,在室溫下攪拌隔夜。反應混合物用EtOAc稀釋且用sat'd NH4 Cl及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥且濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至30%)純化,得到呈黃色油狀之化合物37 (13 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 6.71 (s, 1H), 6.60 (s, 2H), 4.65 (s, 4H), 0.94 (s, 18 H), 0.10 (s, 12 H)。
Figure 02_image278
步驟 2 將Cs2 CO3 (8.54 g,26.2 mmol)添加至苯胺化合物37 (10 g,26.2 mmol)於DMF (52.4 mL)中之經攪拌溶液中。添加碘甲烷(1.474 mL,23.58 mmol)且在室溫下攪拌反應3小時。將水(10 mL)及EtOAc (30 mL)添加至反應混合物中。分離各層且用EtOAc (2×)萃取。有機層用水(4×)洗滌,經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至10%)純化,得到所需單甲基化產物化合物38 (3.8 g,37%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 6.63 (s, 1H), 6.52 (s, 2H), 4.67 (s, 4H), 2.84 (s, 3H), 0.94 (s, 18H), 0.10 (s, 12H)。
Figure 02_image280
步驟 3 將苯胺化合物38 (1.0 g,2.53 mmol)及Z-Gly-OH (0.582 g,2.78 mmol)溶解於DMF (8.42 mL)中。將EDC·HCl (1.21 g,6.32 mmol)及DMAP (340 mg,2.78 mmol)添加至反應混合物中且在80℃下加熱隔夜。反應混合物用EtOAc稀釋且用sat'd NaHCO3 及水(2×)洗滌,經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠層析法(EtOAc/己烷,梯度0%至30%至100%)純化,得到呈黃色粘性固體狀之化合物39 (780 mg,53%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.27 (m, 6H), 6.90 (s, 2H), 4.94 (s, 2H), 4.62 (s, 4H), 3.58 (s, 2H), 3.16 (s. 3H), 0.83 (s, 18H), 0.00 (s, 12 H)。
Figure 02_image282
步驟 4 將化合物39 (1.26 g,2.147 mmol)溶解於MeOH (6.82 mL)及THF (6.8 mL)中且溶液用N2 淨化。添加Pd/C (10%, 0.228 g,0.215 mmol)且使H2 在其中鼓泡數分鐘。在氫氣球下攪拌反應隔夜。使反應混合物濾過Celite且用MeOH洗滌並濃縮,得到純化合物40 (1 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 7.41-7.30 (m, 2H), 7.27-7.21 (m, 1H), 7.06 (s, 2H), 4.65 (s, 4H), 3.23 (s, 3H), 3.12 (s, 2H), 0.82 (s, 18H), 0.00 (s, 12H)。
Figure 02_image284
步驟 5 將胺化合物40 (1.0 g,1.988 mmol)及Z-Gly-Gly-Gly-OH (662  mg,2.385 mmol)溶解於DMF (6.63 mL)中。將EDC·HCl (457 mg,2.385 mmol)及HOBT (304 mg,1.988 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (694 µL,3.98 mmol)。在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用EtOAc稀釋且用sat'd NaHCO3 、鹽水及水(2×)洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM,梯度0%至10%)純化,得到呈白色粘性泡沫狀之化合物41 (994 mg,71%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.38-7.32 (m, 7H), 7.31-7.27 (m, 2H), 7.01 (s, 2H), 5.13 (s, 2H), 4.74 (s, 4H), 3.97 (d, 2H,J = 4.6 Hz), 3.92 (d, 2H,J = 5.3 Hz), 3.74 (d, 2H,J = 3.7 Hz), 3.27 (s, 3H), 0.94 (s, 18H), 0.11 (s, 12H)。
Figure 02_image286
步驟 6 將化合物41 (994 mg,1.418 mmol)懸浮於MeOH (6.65 mL)及水(443 µL)中且用N2 淨化。添加Pd/C (10%濕度,302 mg,0.284 mmol)且使H2 在其中鼓泡數分鐘。在氫氣球下攪拌反應隔夜。使溶液濾過Celite且用MeOH洗滌並濃縮,得到純化合物42 (725 mg,90%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.10-7.97 (m, 1H), 7.91-7.85 (m, 1H), 7.31-7.23 (m, 1H), 7.05 (s, 2H), 7.65 (s, 4H), 3.68-3.62 (m, 2H), 3.56-3.45 (m, 1H), 3.09 (s, 3H), 3.08-3.06 (m, 2H), 3.06-3.03 (m, 2H), 0.82 (s, 18H), 0.00 (s, 12H)。LCMS = 5.574 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 567.30 (M+H)。
Figure 02_image288
步驟 7 將胺化合物42 (725 mg,1.279 mmol)及己二酸單甲酯(246 mg,1.535 mmol)溶解於DMF (6.5 mL)中。將EDC·HCl (294 mg,1.535 mmol)及HOBt (196 mg,1.279 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (447 µL,2.56 mmol)。在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用DCM (20 mL)稀釋且用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 、水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM,梯度0%至10%)純化,得到化合物43 (425 mg,33%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.30 (s, 1H), 7.01 (s, 2H), 6.89-6.85 (m, 1H), 6.75-6.72 (m, 1H), 6.41-6.40 (m, 1H), 4.73 (s, 4H), 3.98-3.96 (m, 4H), 3.74 (bd, 2H,J = 3.5 Hz), 3.66 (s, 3H), 3.27 (s, 3H), 2.33 (t, 2H,J = 6.8 Hz), 2.28 (t, 2H,J = 6.5 Hz), 0.94 (s, 18H), 0.11 (s, 12H)。LCMS = 7.709 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 709.35 (M+H)。
Figure 02_image290
步驟 8 將化合物43 (422 mg,0.417 mmol)溶解於THF (1.89 mL)及水(189 µL)中。添加HCl (水溶液,5 M) (833 µL,4.17 mmol)且在室溫下攪拌反應2.5小時。濃縮反應混合物。將ACN (約15 mL)添加至殘餘物中並濃縮。將此操作再重複兩次,得到呈白色泡沫狀之化合物44 (200 mg,100%產率)。LCMS = 0.389 min (8分鐘方法)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.09-8.04 (m, 2H), 7.93-7.90 (m, 1H), 7.30 (bs, 1H), 7.14 (s, 2H), 4.52 (s, 4H), 3.71-3.68 (m, 4H), 3.58 (s, 3H), 3.17 (bs, 3H), 2.22-2.18 (m, 2H), 2.15-2.12 (m, 2H), 1.53-1.47 (m, 4H)。
Figure 02_image292
步驟 9 將二醇化合物44 (110 mg,0.229 mmol)及CBr4 (228 mg,0.687 mmol)溶解於DMF (2.29 mL)中。將PPh3 (180 mg,0.687 mmol)添加至反應混合物中,此時反應物變為粉紅色並伴隨輕微放熱。在Ar下攪拌反應6小時。反應混合物用CH2 Cl2 /MeOH (10:1)稀釋並用水及鹽水洗滌。有機層經Na2 SO4 乾燥並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/CH2 Cl2 ,梯度0%至10%)純化,得到化合物45 (30 mg,22%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.46 (bs, 1H), 7.32-7.26 (m, 2H), 7.26-7.19 (m, 2H), 6.89-6.85 (m, 1H), 4.60 (d, 2H,J = 3.6 Hz), 4.48 (d, 2H,J = 3.9 Hz), 3.98 (d, 4H,J = 5.1 Hz), 3.76 (bs, 1H), 3.67 (s, 3H), 3.30 (bs, 3H), 2.34 (bt, 2H,J = 6.7 Hz), 2.30 (bt, 2H,J = 6.6 Hz), 1.70-1.64 (m, 4H)。LCMS = 4.326 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 605.10 (M+H)。
Figure 02_image294
步驟 10 化合物46 係以與實例1中化合物11 類似之方式製備。在純化後獲得呈黃色固體狀之化合物46 (40 mg,59%產率)。LCMS = 4.751 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1033.35 (M+H)。
Figure 02_image296
步驟 11 :化合物47 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之化合物47 (14 mg,32%產率)。LCMS = 5.857 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1035.7 (M+H)。
Figure 02_image298
步驟 12 :化合物48 係以與實例2中22 類似之方式製備。在二氧化矽塞後獲得呈黃色固體狀之化合物48 (7 mg,100%產率)。LCMS = 4.817 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1021.35 (M+H)。
Figure 02_image300
步驟 13 :化合物49 係以與實例1中化合物14 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之2-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4] 二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6 ][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)-3,6,9,12-四側氧基-2,5,8,11-四氮雜十七碳-17-酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物49 (6.5 mg,74%產率)。LCMS = 5.805 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1118.7 (M+H)。實例 5. 合成6-(((S)-1-(((R)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((R)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物80 )
Figure 02_image302
步驟 1 將(S )-2-(((苯甲氧基)羰基)胺基)丙酸(5 g,22.40 mmol)及(R )-2-胺基丙酸第三丁酯鹽酸鹽(4.48 g,24.64 mmol)溶解于無水DMF (44.8 ml)中。添加EDC·HCl (4.72 g,24.64 mmol)、HOBt (3.43 g,22.40 mmol)且接著添加DIPEA (9.75 ml, 56.0 mmol)。在氬氣下在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用二氯甲烷稀釋且接著用飽和氯化銨、飽和碳酸氫鈉、水及鹽水洗滌。有機層經硫酸鈉乾燥並濃縮。粗油狀物經由矽膠層析法(己烷/乙酸乙酯)純化,得到化合物71 (5.6 g,71%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.39-7.34 (m, 5H), 6.54 (s, 1H) 5.28 (s, 1H), 5.15 (s, 2H), 4.47-4.43 (m, 1H), 4.48 (s, 1H), 1.49 (s, 9H), 1.42-1.37 (m, 6H)。
Figure 02_image304
步驟 2 將化合物71 (5.6 g,15.98 mmol)溶解於甲醇(50.7 mL)及水(2.54 mL)中。溶液用氬氣淨化五分鐘。緩慢添加鈀/碳(潮濕,10%) (0.850 g,0.799 mmol)。攪在氫氣氛圍下拌反應隔夜。使溶液濾過Celite,用甲醇沖洗並濃縮。殘餘物與甲醇及乙腈共沸且所得油狀物直接放于高真空上,得到化合物72 (3.57 g,100%產率),直接用於下一步驟中。1 H NMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.67 (s, 1H), 4.49-4.42 (m, 1H), 3.54-3.49 (m, 1H), 1.48 (s, 9H), 1.40 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.36 (d, 3H,J = 6.8 Hz)。
Figure 02_image306
步驟 3 將化合物72 (3.57 g,16.51 mmol)及己二酸單甲酯(2.69 mL,18.16 mmol)溶解于無水DMF (55.0 mL)中。添加EDC·HCl (3.48 g,18.16 mmol)及HOBt ( (2.53 g,16.51 mmol),隨後添加DIPEA (5.77 mL,33.0 mmol)。混合物在室溫下攪拌隔夜。反應物用二氯甲烷/甲醇(80 mL,5:1)稀釋且用飽和氯化銨、飽和碳酸氫鈉及鹽水洗滌。將其經硫酸鈉乾燥,過濾並汽提。將該化合物與乙腈(5x)共沸,接著在高真空上在35℃下抽吸,得到化合物73 (5.91 g,100%產率)。粗物質不經純化即用於下一步驟。1 H NMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 6.67 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 6.22 (d, 1H,J = 7.2 Hz), 4.56-4.49 (m, 1H), 4.46-4.38 (m, 1H), 3.68 (s, 3H), 2.37-2.33 (m, 2H), 2.27-2.24 (m, 2H), 1.70 -1.68 (m, 4H), 1.47 (s, 9H), 1.40 (s, 3H), 1.38 (s, 3H)。
Figure 02_image308
步驟 4 在室溫下,在TFA (25.4 mL,330 mmol)及去離子水(1.3 mL)中攪拌化合物73 (5.91 g,16.5 mmol)三小時。在乙腈存在下濃縮反應混合物且將其放于高真空上乾燥,得到粗化合物74 (4.99 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.44 (d, 1H,J = 7.2 Hz,), 6.97 (d, 1H,J = 8.0 Hz), 4.81-4.73 (m, 1H), 4.59-4.51 (m, 1H), 3.69 (s, 3H), 2.39-2.32 (m, 2H), 2.31-2.23 (m, 2H), 1.70-1.61 (m, 4H), 1.48(d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.40 (d, 3H,J = 7.2 Hz)。
Figure 02_image310
步驟 5 將化合物74 (4.8 g,15.88 mmol)溶解于無水二氯甲烷(101 mL)及無水甲醇(50.4 mL)中。添加(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇(2.316 g,15.12 mmol)及EEDQ (7.48 g,30.2 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。去除溶劑且粗物質藉由矽膠層析法(二氯甲烷/甲醇)純化,得到化合物75 (1.65 g,25%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.68 (s, 1H), 8.29 (d, 1H,J = 7.2 Hz), 8.11 (d, 1H,J = 6.4 Hz), 7.52 (s, 2H), 6.97 (s, 1H), 5.15 (s, 2H), 4.45 (s, 4H), 4.39-4.32 (m, 1H), 4.28-4.21 (m, 1H), 3.57 (s, 3H), 2.30-2.27 (m, 2H), 2.17-2.13 (m, 2H), 1.54-1.45 (m, 4H) 1.30 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.20 (d, 3H,J = 7.2 Hz)。MS (m/z): 460.2 (M + Na)+
Figure 02_image312
步驟 6 將化合物75 (0.486 g,1.111 mmol)及四溴化碳(1.105 g,3.33 mmol)溶解于無水DMF (11.11 mL)中。添加三苯基膦(0.874  g,3.33 mmol)且在氬氣下攪拌反應四小時。反應混合物用DCM/MeOH (10:1)稀釋且用水及鹽水洗滌。將其經硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。粗物質藉由矽膠層析法(DCM/MeOH)純化,得到化合物76 (250 mg,40%產率)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.82 (s, 1H), 8.38 (d, 1H,J = 7.2 Hz), 8.17 (d, 1H,J = 6.0 Hz), 7.76 (s, 2H), 7.22 (s, 1H), 4.66 (s, 4H), 4.38-4.31 (m, 1H), 4.25-4.19 (m, 1H),  3.56 (s, 3H), 2.30-2.27 (m, 2H), 2.18-2.15 (m, 2H), 1.53-1.51 (m, 4H), 1.32 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.21 (d, 3H,J = 6.8 Hz)。
Figure 02_image314
步驟 7 化合物77 係以與實例1中11 類似之方式製備。粗物質藉由矽膠層析法(二氯甲烷/甲醇)純化,得到化合物77 (340 mg,60%產率,77%純度)。LCMS = 5.87 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 990.6 (M + 1)+
Figure 02_image316
步驟 8 化合物78 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。粗物質經由RPHPLC (C18管柱,乙腈/水)純化,得到化合物78 (103 mg,30%產率)。LCMS = 6.65 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 992.7 (M + 1)+
Figure 02_image318
步驟 9 化合物78 係以與實例2中22 類似之方式製備。使粗物質通過二氧化矽塞,得到化合物79 (38 mg,55%產率,75%純度)。LCMS = 5.83 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 978.6 (M + 1)+
Figure 02_image320
步驟 10 化合物80 係以與實例1中化合物14 類似之方式製備。粗物質經由RPHPLC (C18管柱,乙腈/水)純化,得到6-(((S)-1-(((R)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((R)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物80 (6.5 mg,30%產率)。LCMS = 6.53 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 1075.7 (M + 1)+ 及1097.7(M + Na)+實例 6. 合成6-(((S)-1-(((S)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((R)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基) 苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物90
Figure 02_image322
步驟 1 將(S )-2-(((苯甲氧基)羰基)胺基)丙酸(5 g,22.40 mmol)及(S )-2-胺基丙酸第三丁酯鹽酸鹽(4.48 g,24.64 mmol)溶解于無水DMF (44.8 mL)。添加EDC·HCl (4.72 g,24.64 mmol)、HOBt (3.43 g,22.40 mmol)及DIPEA (9.75 mL,56.0 mmol)。在氬氣下,在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用二氯甲烷稀釋且接著用飽和氯化銨、飽和碳酸氫鈉、水及鹽水洗滌。有機層經硫酸鈉乾燥並濃縮。粗油狀物經由矽膠層析法(己烷/乙酸乙酯)純化,得到化合物81 (6.7 g,85%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.38-7.31 (m, 5H), 6.53-6.42 (m, 1H), 5.42-5.33 (m, 1H), 5.14 (s, 2H), 4.48-4.41 (m, 1H), 4.32-4.20 (m, 1H), 1.49 (s, 9H), 1.42 (d, 3H,J = 6.8 Hz), 1.38 (d, 3H,J = 7.2 Hz)。
Figure 02_image324
步驟 2 將化合物81 (6.7 g,19.12 mmol)溶解於甲醇(60.7 mL)及水(3.03 mL)中。溶液用氬氣淨化五分鐘。緩慢添加鈀/碳(潮濕,10%) (1.017 g,0.956 mmol)。在氫氣氛圍下攪拌反應隔夜。使溶液濾過Celite,用甲醇沖洗並濃縮。使其與甲醇及乙腈共沸且所得油狀物直接放于高真空上,得到化合物82 (4.02 g,97%產率),直接用於下一步驟中。1 H NMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.78-7.63 (m, 1H), 4.49-4.42 (m, 1H), 3.55-3.50 (m, 1H), 1.73 (s, 2H), 1.48 (s, 9H), 1.39 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.36 (d, 3H,J = 6.8 Hz)。
Figure 02_image326
步驟 3 將化合物82 (4.02 g,18.59 mmol)及己二酸單甲酯 (3.03 mL,20.45 mmol)溶解于無水DMF (62.0 mL)中。添加EDC·HCl (3.92 g,20.45 mmol)、HOBt (2.85 g,18.59 mmol)及DIPEA (6.49 mL,37.2 mmol)。混合物在室溫下攪拌隔夜。反應物用二氯甲烷/甲醇(150 mL,5:1)稀釋且用飽和氯化銨、飽和碳酸氫鈉及鹽水洗滌。將其經硫酸鈉乾燥,過濾並汽提。使該化合物與乙腈(5×)共沸,接著在高真空上在35℃下抽吸,得到化合物83 (6.66 g,100%產率)。粗物質不經純化即用於下一步驟。1 H NMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 6.75 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 6.44 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 4.52-4.44 (m, 1H), 4.43-4.36 (m, 1H), 3.65 (s, 3H), 2.35-2.29 (m, 2H), 2.25-2.18 (m, 2H), 1.71-1.60 (m, 4H), 1.45 (s, 9H), 1.36 (t, 6H,J = 6.0 Hz)。
Figure 02_image328
步驟 4 在室溫下,在TFA (28.6 mL,372 mmol)及去離子水(1.5 mL)中攪拌化合物83 (5.91 g,16.5 mmol)三小時。在乙腈存在下濃縮反應混合物且將其放于高真空上,得到呈黏性固體狀之粗化合物84 (5.88 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, CDCl3 ): δ 7.21 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 6.81 (d, 1H,J = 7.6 Hz), 4.69-4.60 (m, 1H), 4.59-4.51 (m, 1H), 3.69 (s, 3H), 2.40-2.33 (m, 2H), 2.31-2.24 (m, 2H), 1.72-1.63 (m, 4H), 1.51-1.45 (m, 3H), 1.42-1.37 (m, 3H)。
Figure 02_image330
步驟 5 將化合物84 (5.6 g,18.52 mmol)溶解于無水二氯甲烷(118 mL)及無水甲醇(58.8 mL)中。添加(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇(2.70 g,17.64 mmol)及EEDQ (8.72 g,35.3 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。去除溶劑且添加乙酸乙酯。過濾所得漿液,用乙酸乙酯洗滌且在真空/N2 下乾燥,得到化合物85 (2.79 g,36%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.82 (s, 1H), 8.05, (d, 1H,J = 9.2 Hz), 8.01 (d, 1H,J = 7.2 Hz), 7.46 (s, 2H), 6.95 (3, 1H), 5.21-5.12 (m, 2H), 4.47-4.42 (m, 4H), 4.40-4.33 (m, 1H), 4.33-4.24 (m, 1H), 3.58 (s, 3H), 2.33-2.26 (m, 2H), 2.16-2.09 (m, 2H), 1.54-1.46 (m, 4H), 1.30 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.22 (d, 3H,J = 4.4 Hz)。
Figure 02_image332
步驟 6 將化合物85 (0.52 g,1.189 mmol)及四溴化碳(1.183 g,3.57 mmol)溶解于無水DMF (11.89 mL)中。添加三苯基膦(0.935 g,3.57 mmol)且在氬氣下攪拌反應四小時。反應混合物用DCM/MeOH (10:1)稀釋且用水及鹽水洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。粗物質藉由矽膠層析法(DCM/MeOH)純化,得到化合物86 (262 mg,39%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 10.01 (s, 1H), 8.11 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 8.03 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 7.67 (s, 2H), 7.21 (s, 1H), 4.70-4.64 (m, 4H), 4.40-4.32 (m, 1H), 4.31-4.23 (m, 1H), 3.58 (s, 3H), 2.34-2.26 (m, 2H), 2.18-2.10 (m, 2H), 1.55-1.45 (m, 4H), 1.31 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.21 (d, 3H,J = 7.2 Hz)。
Figure 02_image334
步驟 7 化合物87 係以與實例1中化合物11 類似之方式製備。粗物質藉由矽膠層析法(二氯甲烷/甲醇)純化,得到化合物87 (336 mg,74%產率)。LCMS = 5.91 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 990.6 (M + 1)+
Figure 02_image336
步驟 8 化合物88 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。粗物質經由RPHPLC (C18管柱,乙腈/水)純化,得到化合物88 (85.5 mg,25%產率)。LCMS =6.64 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 992.6 (M + 1)+
Figure 02_image338
步驟 9 化合物88 係以與實例2中22 類似之方式製備。使粗物質通過二氧化矽塞,得到化合物89 (48.8 mg,80%產率)。LCMS = 5.89 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 978.6 (M + 1)+
Figure 02_image340
步驟 10 化合物90 係以與實例1中14 類似之方式製備。粗物質經由RPHPLC (C18管柱,乙腈/水)純化,得到6-(((S)-1-(((S)-1-((3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((R)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基) -1-側氧基丙-2-基)胺基)-6-側氧基己酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物90 (8.2 mg,30%產率)。LCMS = 6.64 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 1075.4 (M + 1)+實例 7. 合成1-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)-1,4,7,10-四側氧基-2,5,8,11-四氮雜十四碳-14-酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物63 )
Figure 02_image342
步驟 1 將Z-Gly-Gly-GlyOH化合物50 (1.0 g,3.09 mmol)及β-丙胺酸甲酯·HCl (453 mg,3.25 mmol)溶解於DMF (12.37 mL)中。將EDC·HCl (623 mg,3.25 mmol)及HOBt (497 mg,3.25 mmol)添加至反應混合物中,隨後添加DIEA (1.08 mL,6.19 mmol)。在室溫下攪拌反應隔夜。次日,形成部分白色沈澱。反應混合物用CH2 Cl2 /MeOH (5:1,30 mL)稀釋且用sat'd NaHCO3 、sat'd NH4 Cl及鹽水洗滌。有機層變渾濁。添加EtOAc (15 mL)至有機層中以使產物沈澱析出。過濾混合物且固體用水(10 mL)及CH3 CN (2 × 15 mL)洗滌,不經純化得到呈白色粉末狀之純化合物51 (880 mg,70%產率)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.16 (bt, 1H,J = 5.4 Hz), 8.11 (bt, 1H,J = 5.6 Hz), 7.88-7.85 (m, 1H), 7.49 (bt, 1H,J = 5.5 Hz), 7.40-7.31 (m, 5H), 5.04 (s, 2H), 3.74 (d, 2H,J = 5.5 Hz), 3.67 (t, 4H,J = 6.2 Hz), 3.60 (s, 3H), 3.29 (q, 1H,J = 6.4 Hz), 2.47 (t, 3H,J = 6.9 Hz)。
Figure 02_image344
步驟 2 將化合物51 (876 mg,2.145 mmol)溶解於MeOH (20.4 mL)及水(1.02 mL)中且用Ar淨化。使溶液脫氣5分鐘。緩慢添加Pd/C (10%,用50%水潤濕,228 mg)。使H2 經由氣球在其中鼓泡一分鐘。在氫氣球下攪拌反應隔夜。將H2 O (約3 mL)添加至反應混合物中以溶解形成的所有白色固體。接著使溶液濾過Celite且濾餅用MeOH (30 mL)洗滌並濃縮。殘餘物溶解於CH3 CN (20 mL)中並濃縮。將此操作再重複2次。藉由添加CH3 CN (約15 mL)使所得粘性固體沈澱析出。將濃稠白色漿液攪拌10分鐘,過濾並用CH3 CN洗滌。固體在真空/N2 下乾燥1.5小時,得到呈白色固體狀之化合物52 (450 mg,76%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.18-8.12 (m, 2H), 7.88 (t, 1H,J = 5.4 Hz), 3.75 (s, 2H), 3.65 (d, 2H,J = 5.9 Hz), 3.6 (s, 3H), 3.33-3.27 (m, 4H), 2.47 (t, 2H,J = 7.0 Hz), 1.94 (bs, 1H)。
Figure 02_image346
步驟 3 將NaOH (1.665 g,41.6 mmol)添加至三甲基苯-1,3,5-三甲酸酯化合物53 (5 g,19.82 mmol)於MeOH (66.1 mL)及水(13.22 mL)中之經攪拌溶液中。使反應混合物在Ar下回流3小時。形成大量白色沈澱。將溶液冷卻至室溫且用H2 O稀釋,直至所有固體均溶解。將混合物用5 N HCl水溶液酸化至約pH 2-3,用EtOAc (3×)萃取,經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物溶解於熱EtOAc (50 mL)中且緩慢冷卻至室溫。過濾沈澱(沈澱為副產物且並非產物)。濃縮母液,得到呈白色固體狀之化合物54 (3.45 g,78%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 13.62 (bs, 2H), 8.65 (s, 3H), 3.93 (s, 3H)。LCMS = 3.209 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 244.90 (M+H)。
Figure 02_image348
步驟 4 將二酸化合物54 (1.0 g,4.46 mmol)溶解於THF (17.84 mL)中。將溶液冷卻至0℃且在Ar下緩慢添加BH3 ·DMS (2 M之THF溶液) (8.92 mL,17.84 mmol)。在0℃下攪拌反應5分鐘,接著升溫至室溫並攪拌隔夜。將反應物對空氣敞開且緩慢用MeOH淬滅,隨後緩慢添加H2 O,直至觀察不到氣體放出。混合物用EtOAc (2×)萃取且分離各層。有機層用約3% H2 O2 水溶液、檸檬酸水溶液及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度20%至100%)純化,得到呈白色固體狀之二醇化合物55 (385 mg,44%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 7.81 (s, 2H), 7.52 (s, 1H), 5.33 (bs, 2H), 4.56 (s, 4H), 3.86 (s, 3H)。
Figure 02_image350
步驟 5 在Ar下,將二醇化合物55 (320 mg,1.631 mmol)溶解於DCM (10.9 mL)中。將溶液冷卻至-5℃且添加TEA (0.568 mL,4.08 mmol),隨後緩慢添加MsCl (0.292 mL,3.75 mmol),此時顏色在添加後立即變為黃色,接著變為深紅/褐色。反應混合物在Ar下在-5℃下攪拌1.5小時。反應混合物用冰水淬滅且用EtOAc (2×)萃取。有機層用水(2×)洗滌,經乾燥Na2 SO4 ,過濾並濃縮,得到粗二甲磺酸酯化合物56 (435 mg,76%產率)。
Figure 02_image352
步驟 6 將二甲磺酸酯化合物56 (435 mg,1.11 mmol)溶解於DMF (5.55 mL)中。添加IGN單體化合物10 (719 mg,2.444 mmol) ,隨後添加K2 CO3 (384 mg,2.78 mmol)且在室溫下在Ar下攪拌隔夜。添加水(20 mL)以使產物沈澱析出。漿液攪拌5分鐘,過濾且在真空/N2 下乾燥1.5小時。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(EtOAc/己烷,梯度50%至100%;接著5% MeOH/DCM)純化,得到呈黃色固體狀之化合物57 (535 mg,64%產率,2個步驟)。LCMS = 6.973 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 749.4 (M+H)。
Figure 02_image354
步驟 7 將化合物57 (100 mg,0.134 mmol)溶解於DCE (1.34 mL)中。添加三甲基錫烷醇(362 mg,2.003 mmol)且在80℃下加熱隔夜。將反應混合物冷卻至室溫且用水稀釋。水層用1 M HCl酸化至約pH 4且用DCM (3×)萃取,經Na2 SO4 乾燥,過濾並濃縮。粗產物經由短二氧化矽塞塞住且用DCM/MeOH (10:1,50 mL)沖洗並濃縮,得到呈淺黃色固體狀之化合物58 (100 mg,100%產率)。LCMS = 5.872 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 735.3 (M+H)。
Figure 02_image356
步驟 8 將酸化合物58 (80 mg,0.087 mmol)及胺化合物52 (36  mg,0.131 mmol)溶解於DMF (871 µL)中。添加EDC·HCl (25 mg,0.131 mmol)及DMAP (10.6 mg,0.087 mmol)且在室溫下攪拌4小時。添加水(4 mL)以使產物沈澱析出。將漿液攪拌5分鐘,過濾並在真空/N2 下乾燥。粗殘餘物藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM,梯度0%至20%)純化,得到呈黃色固體狀之化合物60 (37 mg , 43%產率)。LCMS = 4.605 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 991.35 (M+H)。
Figure 02_image358
步驟 9 化合物61 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之化合物61 (8 mg,25%產率)。LCMS = 5.421 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 993.7 (M+H)。
Figure 02_image360
步驟 10 化合物62 係以與實例2中化合物22 類似之方式製備。在經由短二氧化矽塞塞住之後,獲得呈黃色固體狀之粗化合物62 (13 mg,90%產率)。LCMS = 4.693 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 979.35 (M+H)。
Figure 02_image362
步驟 11 :化合物63 係以與實例1中化合物14 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之1-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4] 二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-benzo [5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)-1,4,7,10-四側氧基-2,5,8,11-四氮雜十四碳-14-酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物63 (4 mg,31%產率)。LCMS = 5.495 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1076.7 (M+H)。實例 8. 合成3-((S)-2-((S)-2-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯甲醯胺基)丙醯胺基)丙醯胺基)丙酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(化合物70 )
Figure 02_image364
步驟 1 將Z-L-Ala-L-Ala-OH 化合物64 (3.0 g,10.19 mmol)及β-丙胺酸甲酯·HCl (1.565 g,11.21 mmol)溶解於DMF (20.39 mL)中。添加EDC·HCl (2.150 g,11.21 mmol)及HOBt (1.561 g,10.19 mmol),隨後添加DIPEA (4.44 mL,25.5 mmol)。在Ar下,在室溫下攪拌反應隔夜。反應混合物用EtOAc稀釋且用sat'd NH4 Cl、sat'd NaHCO3 及鹽水洗滌。將己烷添加至有機層中,此時溶液變渾濁並沈澱。將漿液攪拌數分鐘,過濾並用EtOAc/己烷(3:1)洗滌固體。固體在真空/N2 下乾燥,得到呈白色固體狀之純化合物65 (3.11 g,80%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 7.91 (d, 2H,J = 7.0 Hz), 7.46 (d, 1H,J = 7.4 Hz), 6.39-7.30 (m, 5H), 5.02 (d, 2H,J = 2.3 Hz), 4.20 (p, 1H,J = 7.2 Hz), 4.04 (p, 1H,J = 7.3 Hz), 3.59 (s, 3H), 3.30-3.22 (m, 1H), 2.45 (t, 2H,J = 6.8 Hz), 1.18 (apparent t, 6H,J = 7.2 Hz)。LCMS = 3.942 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 380.10 (M+H)。
Figure 02_image366
步驟 2 將化合物65 (1.0 g,2.64 mmol)溶解於甲醇(12.55 mL)、水(0.628 mL)及THF (2 mL)中。溶液用Ar淨化且接著脫氣5分鐘。緩慢添加Pd/C (10%,用50%水潤濕,0.140 g)。使H2 在溶液中鼓泡一分鐘且在氫氣球(1 atm)下再攪拌反應隔夜。使反應混合物濾過Celite且用MeOH (30 mL)洗滌並濃縮。將CH3 CN (15 mL)添加至殘餘物中並濃縮。將此操作再重複2次,得到呈灰白色固體狀之化合物66 (650 mg,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.03-7.99 (m, 2H), 4.24-4.18 (m, 1H), 3.60 (s, 3H), 3.31-3.22 (m, 5H), 2.46 (t, 2H,J = 6.8 Hz), 1.17 (d, 3H,J = 7.0 Hz), 1.12 (d, 3H,J = 6.9 Hz)。
Figure 02_image368
步驟 3 化合物67 係以與實例7中60 類似之方式製備。在矽膠急驟層析法之後,獲得呈黃色固體狀之化合物67 (69 mg,53%產率)。LCMS = 4.843 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 962.25 (M+H)。
Figure 02_image370
步驟 4 化合物68 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。在C18純化後獲得呈白色固體狀之化合物68 (11.5 mg,19%產率)。LCMS = 5.136 min (8分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 964.35 (M+H)。
Figure 02_image372
步驟 5 化合物69 係以與實例2中化合物22 類似之方式製備。在經由短二氧化矽塞塞住之後,獲得呈黃色固體狀之粗化合物69 (13 mg,100%產率)。LCMS = 5.640 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 950.4 (M+H)。
Figure 02_image374
步驟 6 化合物70 係以與實例1中化合物14 類似之方式製備。在C18純化後,獲得呈白色固體狀之3-((S)-2-((S)-2-(3-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4] 二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-12a,13-二氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯甲醯胺基)丙醯胺基)丙醯胺基)丙酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯,即化合物70 (5 mg,35%產率)。LCMS = 6.138 min (15分鐘方法)。質量觀測值(ESI+ ): 1047.4 (M+H)。實例 9. 合成(12S,12aS)-9-((3-(2-(2-(2-(4-巰基-4-甲基戊醯胺基)乙醯胺基)乙醯胺基)乙醯胺基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯甲基)氧基)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-12-磺酸(化合物98 )
Figure 02_image376
步驟 1 將化合物4 (2.0 g,8.15 mmol)及4-甲基-4-(甲基二硫基)戊酸(1.743 g,8.97 mmol)溶解于無水DMF (27.2 mL)中。添加EDC·HCl (1.719 g,8.97 mmol)及HOBt (1.249 g,8.15 mmol),隨後添加DIPEA (2.85 mL,16.31 mmol)。混合物在室溫下攪拌隔夜。反應物用二氯甲烷/甲醇(5:1)稀釋且用飽和氯化銨、飽和碳酸氫鈉及鹽水洗滌。將其經硫酸鈉乾燥,過濾並汽提。粗油狀物與乙腈(3×)共沸,接著在高真空上在35℃下抽吸約1.5小時,得到化合物91 ,不經進一步純化即使用(3.44 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.18-8.09 (m, 3H), 3.76-3.68 (m, 6H), 2.41 (s, 3H), 2.28-2.21 (m, 2H), 1.84-1.77 (m, 2H), 1.41 (s, 9H), 1.25 (s, 6H)。
Figure 02_image378
步驟 2 在室溫下,在TFA (12.56 mL,163 mmol)及去離子水(0.65mL)中攪拌化合物91 (3.44 g,8.15 mmol) 3.5小時。反應物用乙腈稀釋且蒸發至幹。用乙酸乙酯使粗固體形成漿液,過濾並用乙酸乙酯且接著二氯甲烷/甲醇(1:1)沖洗,得到化合物92 (2.98 g,100%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 8.19-8.08 (m, 3H), 3.80-3.68 (m, 6H), 2.41 (s, 3H), 2.28-2.20 (m, 2H), 1.85-1.76 (m, 2H), 1.25 (s, 6H)。
Figure 02_image380
步驟 3 將化合物92 (1.74 g,4.76 mmol)溶解於二氯甲烷(30.2 mL)及甲醇(15.11 mL)中。添加N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氫喹啉(2.243 g,9.07 mmol)及(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇(0.695 g,4.53 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。移除溶劑且添加乙酸乙酯。使固體濾過Celite且用乙酸乙酯且接著甲醇洗滌。蒸發濾液且藉由矽膠層析法(二氯甲烷/甲醇)純化,得到化合物93 (569 mg,25%產率)。1 HNMR (400 MHz, DMSO-d6 ): δ 9.74 (s, 1H), 8.24-8.15 (m, 3H), 7.45 (s, 2H), 6.96 (s, 1H), 5.17 (t, 2H,J = 5.6 Hz), 4.45 (d, 4H,J = 5.6 Hz,), 3.87 (d, 2H,J = 6.0 Hz,), 3.77 (d, 2H,J = 6.0 Hz,), 3.73 (d, 2H,J = 5.6 Hz,), 2.40 (s, 3H), 2.28-2.21 (m, 2H), 1.83 -1.76 (m, 2H), 1.24 (s, 6H)。
Figure 02_image382
步驟 4 將化合物93 (305 mg,0.609 mmol)懸浮于無水DCM (5.992 mL)中。添加無水DMF,直至溶液變均質(約2.5 mL)。在丙酮/乾冰浴中將溶液冷卻至¯ 10℃。添加三乙胺(0.425 mL,3.05 mmol),隨後添加甲烷磺酸酐(274 mg,1.523 mmol)。混合物在¯ 10℃下攪拌1小時。反應物用冰水淬滅且用冷乙酸乙酯/甲醇(20:1)萃取。有機層用冰水洗滌且經無水硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。粗物質在高真空上乾燥,得到化合物94 (380 mg,95%產率)。LCMS = 4.2 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 655.0 (M-1)-
Figure 02_image384
步驟 5 化合物95 係以與實例7中化合物57 類似之方式製備。將粗固體溶解於二氯甲烷/甲醇(10:1)中,用水洗滌且有機物經無水硫酸鈉乾燥。在真空中移除溶劑且藉由矽膠層析法(二氯甲烷/甲醇)純化,得到化合物95 (445 mg,42%產率,54%純度)。LCMS = 6.64 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 1053.4 (M + 1)+ and 1051.3 (M -1)-
Figure 02_image386
步驟 6 將化合物95 (445 mg,0.423 mmol)溶解於1,2-二氯乙烷(2.82 mL)中。在室溫下添加三乙醯氧基硼氫化鈉(80 mg,0.359 mmol)並攪拌1小時。反應物用二氯甲烷稀釋且用飽和氯化銨洗滌。有機層用鹽水洗滌並乾燥,得到化合物959696a 之混合物(496 mg)。將此粗混合物溶解於2-丙醇(39.17 mL)及水(19.59 mL)中。添加亞硫酸氫鈉(245 mg,2.35 mmol)且在室溫下攪拌3.5小時。將混合物冷凍並凍乾,得到蓬鬆白色固體,藉由RPHPLC (C18,乙腈/水)純化,得到化合物97 (54 mg,10%產率)及化合物96a (24 mg,5%產率)。LCMS (化合物97 ) = 4.83 min (15分鐘方法)且LCMS (化合物96a ) = 8.05 min (15分鐘方法)。
Figure 02_image388
步驟 7 向化合物97 (54 mg,0.047 mmol)於CH3 CN (3.85 mL)中之經攪拌溶液中添加新制的TCEP/pH 6.5緩衝溶液(TCEP·HCl (46.7 mg)溶解於數滴去離子水中,隨後逐滴添加飽和碳酸氫鈉直至約pH 6.5。溶液用0.55 mL的pH=6.5,1 M磷酸鈉緩衝液稀釋)及甲醇(2.75 mL)。混合物在室溫下攪拌3小時且接著冷凍並凍乾。固體藉由RPHPLC (C18,乙腈/水)純化,得到(12S,12aS)-9-((3-(2-(2-(2-(4-巰基-4-甲基戊醯胺基)乙醯胺基)乙醯胺基)乙醯胺基)-5-((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯甲基)氧基)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-12-磺酸,即化合物98 (2 mg,4%產率)。LCMS = 4.32 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 1089.3 (M -1)-實例 10. 合成N-(2-((2-((2-((3,5-雙((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-4-巰基-4-甲基戊醯胺(化合物99 )
Figure 02_image390
化合物99 係以與實例9中化合物98 類似之方式製備。在C18純化後,獲得呈白色固體狀之N-(2-((2-((2-((3,5-雙((((S)-8-甲氧基-6-側氧基-11,12,12a,13-四氫-6H-苯并[5,6][1,4]二氮呯并[1,2-a]吲哚-9-基)氧基)甲基)苯基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-4-巰基-4-甲基戊醯胺,即化合物99 (6.3 mg,27%產率)。LCMS = 7.26 min (15分鐘方法)。MS (m/z): 1033.5 (M +Na)+實例 11. 製備huMOV19-14
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及8莫耳當量化合物14 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯6小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 20,000 MWCO)以相同緩衝液透析20小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均3.0個IGN91分子(藉由UV-Vis,對於化合物14 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30, 115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有90%單體(藉由尺寸排阻層析法),<0.1%之未偶聯化合物14 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為0.78 mg/ml。藉由凝膠晶片分析發現,偶聯之抗體為>87%完整的。MS光譜資料顯示於圖7A中。實例 12 . 製備huMOV19- 磺基 -SPDB-98
將在含10 mMN,N -二異丙基乙胺(DIPEA)之DMA中含有最終濃度為3.9 mM之化合物98 及3 mM磺基-SPDB連接子的原位混合物溫育60分鐘,隨後將20倍過量的所得化合物98 -磺基-SPDB-NHS添加至在15 mM HEPES pH 8.5 (90:10水: DMA)中含有4 mg/ml huMOV19抗體之反應物中。使該溶液在25℃下偶聯隔夜。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成100 mM精胺酸、20 mM組胺酸、2%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 10,000 MWCO)以相同緩衝液透析隔夜。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均3.7個分子之化合物98 (藉由SEC,對於化合物98 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有99%單體(藉由尺寸排阻層析法)且最終蛋白質濃度為0.18 mg/ml。MS光譜資料顯示於圖7A中。實例 13 . 製備huMOV19-35
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.5 mg/mL huMOV19抗體及5莫耳當量化合物35 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯6小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在室溫下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 10,000 MWCO)以相同緩衝液透析8小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.9個分子之化合物35 (藉由UV-Vis,對於IGN128,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有97%單體(藉由尺寸排阻層析法),<1%之未偶聯化合物35 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為1.4 mg/ml。MS光譜資料顯示於圖7A中。實例 14. 製備huMOV19-63
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及7莫耳當量化合物63 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯6小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 20,000 MWCO)以相同緩衝液透析20小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.7個分子之化合物63 (藉由UV-Vis,對於IGN131,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有99%單體(藉由尺寸排阻層析法),<0.1%之未偶聯化合物63 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為1.6 mg/ml。藉由凝膠晶片分析發現,偶聯之抗體為>90%完整的。MS光譜資料顯示於圖7B中。實例 15. 製備huMOV19-80
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及7莫耳當量化合物80 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯6小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 20,000 MWCO)以相同緩衝液透析20小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.5個分子之化合物80 (藉由UV-Vis,對於化合物80 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有99%單體(藉由尺寸排阻層析法),<0.1%之未偶聯化合物80 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為2.4 mg/ml。藉由凝膠晶片分析發現,偶聯之抗體為>90%完整的。實例 16. 製備huMOV19-90
使在15 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及3.9莫耳當量化合物90 (在25℃用溶於95:5 DMA:50 mM琥珀酸酯pH 5.5中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理4小時)的反應物在25℃下偶聯4小時。反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成10 mM琥珀酸酯、50 mM氯化鈉、8.5% w/v蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 30,000 MWCO)在室溫下以相同緩衝液透析4小時且接著在4℃下透析隔夜。
發現經純化之偶聯物的最終蛋白質濃度為1.8 mg/ml且每個抗體連接有平均2.7個分子之化合物90 (藉由UV-Vis,對於IGN152,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有98.3%單體(藉由尺寸排阻層析法);及<1.1%之未偶聯化合物90 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)。MS光譜資料顯示於圖7B中。實例 17. 製備huMOV19-49
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及10% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及5莫耳當量化合物49 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯4小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在室溫下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 20,000 MWCO)以相同緩衝液透析4小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.8個分子之化合物49 (藉由UV-Vis,對於化合物49 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有94%單體(藉由尺寸排阻層析法),<0.1%之未偶聯化合物49 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為1.5 mg/ml。藉由凝膠晶片分析發現,偶聯之抗體為>95%完整的。MS光譜資料顯示於圖7C中。實例 18. 製備huMOV19- 磺基 -SPDB-99
將在含10 mMN,N -二異丙基乙胺(DIPEA)之DMA中含有最終濃度為1.95 mM之化合物99 及1.5 mM磺基-SPDB連接子的原位混合物溫育20分鐘,隨後用4 mM順丁烯二醯亞胺基丙酸MPA封端。將6倍過量的所得99 -磺基-SPDB-NHS添加至在15 mM HEPES pH 8.5 (82:18水: DMA)中含有2.5 mg/ml huMOV19抗體之反應物中。使該溶液在25℃下偶聯隔夜。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成20 mM組胺酸、50 mM氯化鈉、8.5%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 10,000 MWCO)以相同緩衝液透析隔夜。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均1.6個分子之化合物99 (藉由UV/Vis,對於化合物99 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有99%單體(藉由尺寸排阻層析法)且最終蛋白質濃度為0.59 mg/ml。MS光譜資料顯示於圖7C中。實例 19. 製備huMOV19-70
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及10% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huMOV19抗體及5莫耳當量化合物70 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯4小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成20 mM組胺酸、100 mM精胺酸、2%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。純化後,在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 20,000 MWCO)以相同緩衝液透析18小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均3.0個分子之化合物70 (藉由UV-Vis,對於化合物70 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有94%單體(藉由尺寸排阻層析法),<0.1%之未偶聯化合物70 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為1.3 mg/ml。實例 20. 製備huMOV19-23
使在50 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及15% v/v DMA (N,N -二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.5 mg/mL huMOV19抗體及4莫耳當量化合物23 (用溶於90:10 DMA:水中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理)的反應物在25℃下偶聯6小時。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成250 mM甘胺酸、10 mM組胺酸、1%蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。在室溫下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 10,000 MWCO)以相同緩衝液透析8小時。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.8個分子之化合物23 (藉由UV-Vis,對於化合物23 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有98%單體(藉由尺寸排阻層析法),<3%之未偶聯化合物23 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)且最終蛋白質濃度為1.3 mg/ml。MS光譜資料顯示於圖7D中。實例 21 . 有關huMOV19-14huMOV19-90 huMOV19-107 偶聯物之結合親和力的流動式細胞測量術分析
在4℃下,在96孔盤(Falcon,圓底)中,一式兩份用FACS緩衝液(1% BSA,1x PBS)稀釋起始濃度為3× 10-8 M的每孔100 μl偶聯物huMOV19-14huMOV19-90huMOV19-107 或抗體huMOV19且以FACS緩衝液進行3倍連續稀釋。在PBS中將在補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)、0.1 mg/ml/ml慶大黴素(gentamycin)(Life Technologies)及0.2 IU牛胰島素/ml (Sigma)之RPMI-1640 (Life Technologies)中生長的T47D細胞(人乳房腫瘤)洗滌一次,且用Versene (Life Technologies)移除。將T47D細胞再懸浮於生長培養基(參見上文)中以中和versene,並在Coulter計數器上計數。接著在冷FACS緩衝液中洗滌細胞兩次,在每次洗滌之間以1200 rpm離心5分鐘。將100 μl/ml的2×104 個細胞/孔添加至含有偶聯物、抗體或僅含FACS緩衝液之孔中並在4℃下孵育2小時。孵育之後,如先前所述對細胞進行離心,且在每孔200 µl之冷FACS緩衝液中洗滌一次。接著,在4℃下用每孔200 μl偶聯FITC之山羊抗人IgG-Fcγ二次抗體(所包括之對照物為未染色細胞及僅用二次抗體染色之該等細胞)對細胞染色,保持40分鐘,離心且在每孔200 µl之冷PBS-D中洗滌一次。將細胞固定于每孔200 µl之1%甲醛/ PBS-D中且在4℃下儲存。儲存之後,使用流動式細胞測量術,在FACS Calibur (BD Biosciences)上偵測偶聯物或抗體之細胞表面染色。使用GraphPad Prism將幾何平均值對偶聯物或抗體之對數濃度作圖,且經由非線性4參數邏輯斯蒂回歸分析(non-linear 4-parameter logistic regression analysis)計算EC50
對於huMOV19-90偶聯物重複該結合分析且資料顯示於圖15B中。
如圖1、圖15A、圖15B及圖20中所示,在流動式細胞測量術中該等偶聯物以與未偶聯抗體類似之方式結合至表現靶抗原之T47D細胞的表面,由此證實,結合不受偶聯過程之影響。實例 22. 關於 huMOV19-14 偶聯物之細胞毒性分析
在環境溫度下,在96孔盤(Corning,平底)中,一式三份用補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)及0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)之RPMI-1640 (Life Technologies)稀釋起始濃度為3.5×10-9 M至3.5×10-8 M的每孔100 μlhuMOV19-14 偶聯物,並在上述培養基中進行3倍連續稀釋。在PBS中洗滌在補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)及0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)之EMEM (ATCC)中生長的KB細胞(口腔表皮腫瘤)一次,並用0.05%胰蛋白酶-EDTA (Life Technologies)移除。將KB細胞再懸浮於生長培養基(參見上文)中以中和胰蛋白酶,並在Coulter計數器上計數。將100 μl/ml之1×103 個細胞/孔添加至含有偶聯物或僅含培養基之孔中,且在37℃且含5% CO2 之恆溫箱中,在存在及不存在1 μM阻斷性抗FOLR1抗體(huMOV19)情況下孵育5天。總體積為每孔200 μl。孵育之後,藉由添加每孔20 μl WST-8 (Dojindo)並使其顯影2小時來分析細胞活力。在板讀取器上,在450及620 nm下讀取吸光度。用450 nm下之吸光度減去620 nm下之吸光度。進一步用經校正之吸光度減去僅含培養基之孔中的背景值且以Excel計算未處理細胞之存活分數(SF)。使用Graph Pad Prism創建ADC濃度(M)隨SF變化之XY曲線。
如圖2中所示,該偶聯物對KB細胞具有高效力且IC50 值為4×10-12 M。添加過量未偶聯抗體使細胞毒性效應顯著降低,從而展現出抗原特異性。實例 23. 關於huMOV19-14huMOV19-90 偶聯物之旁觀者細胞毒性分析
在96孔盤(Falcon,圓底)中,一式六份用補充有熱滅活之10% FBS (Life Technologies)、0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)及βME (Life Technologies)之RPMI-1640 (Life Technologies)中稀釋濃度介於1 e-10 M至4 e-10 M之間的每孔100 μlhuMOV19-14huMOV19-90 。在Coulter計數器上對表現重組FOLR1 (FR1#14)或無表現載體(親本)之300.19細胞(小鼠)進行計數。將50 µl/ml每孔1000個FR1#14細胞添加至含有該偶聯物或僅含培養基之孔中,將50 µl/ml每孔2000個親本細胞添加至含有該偶聯物或僅含培養基之孔中且將FR1#14與親本細胞一起添加至含有該偶聯物或僅含培養基之孔中。所有盤在含5% CO2 之37℃恆溫箱中孵育4天。總體積為每孔150 μl。孵育之後,藉由添加每孔75 µl Cell Titer Glo (Promega)且使其顯影45分鐘來分析細胞活力。在光度計上讀取發光度且自所有值減去僅含培養基之孔的背景值。使用Graph Pad Prism繪製每一細胞處理之平均值的直條圖。
如圖3中所示,偶聯物huMOV19-14 對相鄰抗原陰性細胞展現出較弱的旁觀者細胞毒性效應。
如圖13中所示,偶聯物huMov19-90 展現較強的旁觀者殺滅活性。實例 24 . 關於huMy9-6-14 偶聯物之活體外細胞毒性分析
將偶聯物稀釋液添加至96孔盤中在適當生長培養基中含有每孔2 × 103 至1 × 104 個細胞的孔中。在每一分析盤中納入含有細胞及培養基但無測試化合物之對照孔,以及僅含培養基之孔。在含有6% CO2 之潮濕氛圍中在37℃下孵育該等盤四至六天。接著將10% v/v WST-8試劑(Dojindo Molecular Technologies, Gaithersburg, MD)添加至孔中,且該等盤在37℃下孵育2至6小時。接著,在板讀取器分光光度計上以雙波長模式450 nm/650 nm量測吸光度,且減去在650 nm下之吸光度(由細胞引起之非特異性光散射)。藉由首先針對培養基背景吸光度校正,且接著用每一值除以對照孔(未處理孔)中該等值之平均值來計算每個孔中細胞之表觀存活分數。
如圖3中所示,該偶聯物對各種抗原陽性癌細胞具有高效力;而抗原陰性L-540細胞當暴露於該偶聯物時仍保持活力。實例 25 . 關於huMy9-6-14 偶聯物之旁觀者細胞毒性分析
進行初步測試以測定對抗原陰性RADA-1細胞無細胞毒性但殺死所有抗原陽性KARA細胞的huMy9-6-14 濃度。將RADA-1 (每孔500個細胞)及KARA (每孔500、1000、2000、4000個細胞)接種于96孔圓底盤中。在細胞培養基(補充有10%熱滅活胎牛血清及50 mg/L慶大黴素之RPMI1640培養基)中製備huMy9-6-14 之稀釋液 且將其添加至細胞中。在37℃下孵育盤4天,且使用WST-8試劑(Dojindo Molecular Technologies, Inc.)測定每個孔中之細胞活力。為了測試偶聯物之旁觀者效力,將RADA-1細胞與KARA細胞以不同比率((500個RADA-1細胞加無KARA細胞;500個RADA-1細胞加500個KARA細胞;500個RADA-1細胞加1000個KARA細胞;500個RADA-1細胞加2000個KARA細胞;500個RADA-1細胞加4000個KARA細胞)混合在一起,且將其接種于96孔圓底盤中。接著,將1.0e-9M或5.0e-10MhuMy9-6-14 (對RADA-1細胞無毒但殺死所有KARA細胞之濃度)添加至細胞混合物中。在37℃下孵育盤4天,且使用WST-8試劑(Dojindo Molecular Technologies, Inc.)測定每個孔中RADA-1細胞之活力。在板讀取器分光光度計上以雙波長模式450 nm/650 nm量測吸光度,且減去在650 nm下之吸光度(由細胞引起之非特異性光散射)。
如圖5中所示,該偶聯物對相鄰抗原陰性細胞展現出旁觀者殺滅效應。實例 26. 單次劑量之 huMOV19-80 huMOV19-90 針對雌性 SCID 小鼠中 NCI-H2110 NSCLC 異種移植物之抗腫瘤活性
自Charles River Laboratories獲得6周齡之雌性CB.17 SCID小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.1 ml 50%基質膠/無血清培養基中之1 × 107 個NCI-H2110腫瘤細胞接種小鼠。當腫瘤體積達到約100 mm3 (接種後第7天)時,基於腫瘤體積將動物隨機分入5個組中,每組6只小鼠。第1天(接種後第8天),動物接受單次靜脈內施用之媒劑對照物(每只小鼠0.2 ml)、基於huMOV19-80huMOV19-90 濃度之5 μg/kg及25 μg/kg的huMOV19-80huMOV19-90 。huMOV19為選擇性結合至葉酸受體1 (FOLR1)之人類化單株抗體。
每週兩到三次使用測徑器以三個尺寸量測腫瘤大小。腫瘤體積係使用式V = 長度 × 寬度 × 高度 × ½計算,以mm3 表示。當腫瘤體積減小50%或更多時,認為小鼠具有部分消退(PR),當無法偵測到明顯腫瘤時,認為具有完全腫瘤消退(CR)。腫瘤體積係藉由StudyLog軟體測定。
腫瘤生長抑制(T/C值)係使用下式測定: T/C (%) = 治療組之中值腫瘤體積/對照組之中值腫瘤體積 × 100。
當媒劑對照組之腫瘤體積達到預定大小1000 mm3 時,同時測定治療組(T)及媒劑對照組(C)之腫瘤體積。測定每一治療組之每日中值腫瘤體積,包括無腫瘤小鼠(0 mm3 )。根據NCI標準,T/C ≤ 42%為抗腫瘤活性之最低水準。T/C <10%被視為高抗腫瘤活性水準。
如圖6中所示,huMOV19-90 偶聯物在5 µg/kg及25 µg/kg劑量下具有高活性;而huMOV19-80 偶聯物在25 µg/kg劑量下具有高活性。實例 27. 製備 huML66-90
使在15 mM HEPES (4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙烷磺酸) pH 8.5緩衝液及10% v/v DMA (N,N-二甲基乙醯胺)共溶劑中含有2.0 mg/mL huML66抗體、抗EGFR抗體(參見WO 2012/058592,以引用之方式整體併入本文中)及3.5莫耳當量化合物90 (在25℃用溶於90:10 DMA:50 mM琥珀酸酯pH 5.5中的5倍過量之亞硫酸氫鈉預處理4小時)的反應物在25℃下偶聯4小時。反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成20 mM組胺酸、50 mM氯化鈉、8.5% w/v蔗糖、0.01% Tween-20、50 µM亞硫酸氫鈉配製緩衝液(pH 6.2)。利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 30,000 MWCO)在室溫下以相同緩衝液透析4小時且接著在4℃下透析隔夜。
發現經純化之偶聯物的最終蛋白質濃度為0.9 mg/ml且每個抗體連接有平均2.7個分子之化合物90 (藉由UV-Vis,對於化合物90 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,280 cm-1M-1及ɛ280 nm = 30,115 cm-1M-1,且對於huML66抗體,使用ɛ280 nm = 205,520 cm-1M-1),具有99.1%單體(藉由尺寸排阻層析法);及<1%之未偶聯IGN149 (藉由丙酮沈澱,反相HPLC分析)。MS光譜資料顯示於圖8中。實例 28. 關於 huML66-90 偶聯物之活體外細胞毒性分析
使用活體外細胞毒性分析量測huML66-90 偶聯物抑制細胞生長之能力。將靶細胞以每孔1-2,000個細胞接種于100 μL完全RPMI培養基(RPMI-1640、10%胎牛血清、2 mM麩醯胺酸、1%青黴素-鏈黴素,所有試劑均來自Invitrogen)中。使用3倍連續稀釋在完全RPMI培養基中稀釋抗體,且每孔添加100 μL。最終濃度通常在3 × 10-8 M至4.6 × 10-12 M範圍內。在37℃下,在含5% CO2之潮濕恆溫箱中孵育細胞5至6天。藉由比色WST-8分析(Dojindo Molecular Technologies, Inc., Rockville, MD, US)測定殘留細胞之活力。WST-8經活細胞中之脫氫酶還原成可溶於組織培養基中的橙色甲臢產物。所產生的甲臢量與活細胞數量成正比。將WST-8添加至10%最終體積中且在37℃下,在含5% CO2之潮濕恆溫箱中再孵育盤2-4小時。藉由在多孔板讀取器中量測在450 nm下之吸光度(A450)來分析盤。自所有值中減去僅含培養基及WST-8之孔的背景A450吸光度。藉由用每一經處理樣品值除以含未處理細胞之孔的平均值來計算活力百分比。活力百分比= 100* (A450經處理樣品 – A450背景)/ (A450未處理樣品 – A450背景)。對於每一處理,以半對數曲線繪製活力百分比值針對抗體濃度之曲線。藉由非線性回歸生成劑量-反應曲線且使用GraphPad Prism (GraphPad software, San Diego, CA)計算每一曲線之EC50 值。 活體外細胞毒性活性
在存在及不存在過量未偶聯抗體情況下評價huML66-90 偶聯物之活體外細胞毒性且將其與非特異性huIgG-90 偶聯物在表現EGFR細胞中之活性相比較,且由典型細胞毒性分析得到的結果示於圖9中。huML66-90 偶聯物引起Detroit-562 SCC-HN細胞之特異性細胞殺滅作用,且EC50 值為16 pM。過量未偶聯抗體之存在使活性顯著降低且產生的EC50 值為約2 nM。類似地,含有非結合性huIgG對照抗體之huIgG-90 偶聯物引起細胞殺滅作用且EC50 值為約8 nM。
同樣,huML66-90 偶聯物引起NCI-H292 NSCLC細胞之特異性細胞殺滅作用,且EC50 值為12 pM。過量未偶聯抗體之存在使活性顯著降低且產生的EC50 值為約2 nM。類似地,含有非結合性huIgG對照抗體之huIgG-90 偶聯物引起細胞殺滅作用且EC50 值為約8 nM。
類似地,亦觀察到對於NCI-H1703細胞之特異性細胞殺滅作用。 1.
偶聯物 Detroit EC50 ,pM NCI-H292 EC50 ,pM NCI-H1703 EC50 ,pM
huML66-90 16 12 20
huML66-90 +阻斷劑 2,350 1,570 2,140
huIgG-90 對照物 8,350 8,350 N/A
實例 29. huMOV19-90 之活體外細胞毒性活性
在環境溫度下,在96孔盤(Corning,平底)中,一式三份用補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)及0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)之RPMI-1640 (Life Technologies)分別稀釋起始濃度為3.5e-9 M至3.5 e-8 M的每孔100 μlhuMOV19-90 偶聯物,並在上述培養基中進行3倍連續稀釋。在PBS中洗滌在補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)及0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)之EMEM (ATCC)中生長的KB細胞(口腔表皮腫瘤)一次,並用0.05%胰蛋白酶-EDTA (Life Technologies)移除。所測試的其他細胞為在補充有熱滅活10% FBS (Life Technologies)及0.1 mg/ml慶大黴素(Life Technologies)之RPMI-1640 (LifeTechnologies)中生長的NCI-H2110 (NSCLC)及T47D (乳房上皮細胞)。T47D培養基還補充有0.2 IU/ml牛胰島素。所有細胞再懸浮於生長培養基(參見上文)中以中和胰蛋白酶,並在血細胞計數器上計數。將100 μl/ml之1000個KB細胞/孔或2000個T47D及NCI-H2110細胞/孔添加至含有偶聯物或僅含培養基之孔中,且在37℃且含5% CO2 之恆溫箱中,在存在及不存在1 μM阻斷性抗FOLR1抗體(huMOV19)情況下孵育5天。總體積為每孔200 µl。在KB細胞上每一偶聯物之起始濃度為3.5e-9 M,且對於T47D細胞及NCI-H2110細胞,每一偶聯物之起始濃度為3.5e-8 M。孵育之後,藉由添加每孔20 μl WST-8 (Dojindo)並使其顯影2小時來分析細胞活力。在板讀取器上,在450及620 nm下讀取吸光度。用450 nm下之吸光度減去620 nm下之吸光度。進一步用經校正之吸光度減去僅含培養基之孔中的背景值且以Excel計算未處理細胞之存活分數(SF)。使用Graph Pad Prism創建ADC濃度(M)隨SF變化之XY曲線。
如圖10-12及表2中所示,huMOV19-90 偶聯物對KB細胞、T47D細胞及NCI-H2110細胞具有高效力。添加過量未偶聯抗體使細胞毒性效應顯著降低,從而展現出抗原特異性。 2.
KB NCI-H2110 T47D
-阻斷劑 +阻斷劑 -阻斷劑 +阻斷劑 -阻斷劑 +阻斷劑
IC50 4e-12 M 8e-10 M 2e-11 M 1e-8 M 3e-11 M 8e-9 M
在另一實驗中,使用基於WST-8之活體外細胞毒性分析來量測偶聯物抑制細胞生長之能力。用在適當細胞培養基中各種濃度之偶聯物處理96孔盤中之細胞(通常每孔1×103 個),且總體積為0.2 ml。在每一分析盤中納入含有細胞及培養基但無測試化合物之對照孔,以及僅含培養基之孔。在含有6% CO2 之潮濕氛圍中在37℃下孵育該等盤4至6天。接著將WST-8試劑(10%,體積/體積;Dojindo Molecular Technologies)添加至孔中,且取決於細胞株,將該等盤在37℃下孵育2至6天。接著,在板讀取器分光光度計上以雙波長模式450 nm/620 nm量測吸光度,且減去在620 nm下之吸光度(由細胞引起之非特異性光散射)。利用所得OD450 值,使用GraphPad Prism v4 (GraphPad software, San Diego, CA)計算細胞之表觀存活分數。藉由首先針對培養基背景吸光度校正,且接著用每一值除以對照孔(未處理孔)中該等值之平均值來計算每個孔中細胞之表觀存活分數。使用S形曲線擬合,在Graph Pad Prism中利用可變斜率,藉由非線性回歸來生成劑量反應曲線。藉由該軟體產生IC50 (抑制濃度50%)。
如圖21及表3中所示,該等偶聯物針對所測試之細胞株Ishikawa(子宮內膜癌)、KB(子宮頸癌)及NCI-H2110(非小細胞肺癌)具有活性。細胞殺滅活性具有FOLR1依賴性,因為過量的未偶聯huMOV19抗體(1 μM)使該偶聯物之效力明顯降低(20至200倍)。
3.            
細胞株 IC50,nM
huMOV19-90 huMOV19-107
偶聯物 偶聯物+未修飾抗體 偶聯物 偶聯物+未修飾抗體
Ishikawa 0.05 1.0 0.05 2.0
KB 0.005 1.0 0.005 0.8
NCI-H2110 0.1 4.0 0.1 7.0
實例 30. 單次劑量之 huMOV19-90 偶聯物針對雌性 SCID 小鼠中 NCI-H2110 NSCLC 異種移植物之抗腫瘤活性
自Charles River Laboratories獲得6周齡之雌性CB.17 SCID小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.1 ml 50%基質膠/無血清培養基中之1 × 107個NCI-H2110腫瘤細胞接種小鼠。當腫瘤體積達到約100 mm3 (接種後第7天)時,基於腫瘤體積將動物隨機分入4個組中,每組6只小鼠。第1天(接種後第8天),動物接受單次靜脈內施用之媒劑對照物(每只小鼠0.2 ml),或基於化合物90 濃度之1 μg/kg、3 μg/kg及5 μg/kg的huMOV19-90
每週兩到三次使用測徑器以三個尺寸量測腫瘤大小。腫瘤體積係使用式V = 長度 × 寬度 × 高度 × ½計算,以mm3 表示。當腫瘤體積減小50%或更多時,認為小鼠具有部分消退(PR),當無法偵測到明顯腫瘤時,認為具有完全腫瘤消退(CR)。腫瘤體積係藉由StudyLog軟體測定。
腫瘤生長抑制(T/C值)係使用下式測定: T/C (%) = 治療組之中值腫瘤體積/對照組之中值腫瘤體積 × 100。
當媒劑對照組之腫瘤體積達到預定大小1000 mm3時,同時測定治療組(T)及媒劑對照組(C)之腫瘤體積。測定每一治療組之每日中值腫瘤體積,包括無腫瘤小鼠(0 mm3)。根據NCI標準,T/C ≤ 42%為抗腫瘤活性之最低水準。T/C <10%被視為高抗腫瘤活性水準。
如圖14中所示,huMOV19-90 偶聯物在3 μg/kg劑量下具有活性且在5 μg/kg劑量下具有高活性。實例 31. 合成化合物 107
Figure 02_image392
步驟 1 將化合物82 (500 mg,2.31 mmol)、4-甲基-4-(甲基二硫基)戊酸(449 mg,2.31 mmol)、EDC·HCl (465 mg,2.43 mmol)、HOBt (354 mg,2.31 mmol)及DIPEA (0.81 mL,4.62 mmol)溶解於DMF (7.7 mL)中且攪拌隔夜,直至反應完成。反應物用乙酸乙酯稀釋且用飽和碳酸氫鈉、飽和氯化銨洗滌且用水洗滌兩次。乾燥有機物並真空濃縮,得到化合物100 (875 mg,96%產率),直接用於下一步驟中。1 H NMR (400 MHz, DMSO): δ 8.15 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 8.02 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 4.26-4.33 (m, 1H), 4.03-4.12 (m, 1H), 2.41 (s, 3H), 2.18-2.22 (m, 2H), 1.76-1.80 (m, 2H), 1.39 (s, 9H), 1.24 (s, 6H), 1.24 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.19 (d, 3H,J = 7.2 Hz)。
Figure 02_image394
步驟 2 將TFA (2.6ml)及水(0.17ml)添加至淨化合物100 (875  mg,2.23 mmol)中且在室溫下攪拌,直至反應完成。稀釋反應物且使其與乙腈共沸,得到粘性油狀物。接著將其用乙腈及水稀釋,冷凍並凍乾,得到呈灰白色固體狀之化合物101 (1 g,100%產率),不經進一步純化即使用。LCMS = 3.99 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 337.0 (M + 1)+
Figure 02_image396
步驟 3 將化合物101 (923 mg,1.65mmol)及(5-胺基-1,3-伸苯基)二甲醇(240mg, 1.57mmol)溶解於DMF (5.2ml)中。在室溫下添加EDC·HCl (601 mg,3.13 mmol)及DMAP (96 mg,0.78 mmol)且在室溫下攪拌反應隔夜。反應物用乙酸乙酯稀釋且用水洗滌三次。乾燥有機層,真空濃縮且藉由矽膠層析法(DCM/MeOH)純化,得到化合物102 (150 mg,20%產率)。LCMS = 3.91 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 472.2 (M + 1)+1 H NMR (400 MHz, MeOD): δ 9.69 (s, 1H), 8.21 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 8.18 (d, 1H,J = 6.8 Hz), 7.52 (s, 2H), 7.12 (s, 1H), 4.58 (s, 4H), 4.44-4.48 (m, 1H), 4.29-4.32 (m, 1H), 3.34 (s, 2H), 2.38 (s, 3H), 2.34-2.40 (m, 2H), 1.90-1.95 (m, 2H), 1.43 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.36 (d, 3H,J = 7.2 Hz), 1.30 (s, 6H)。
Figure 02_image398
步驟 4 化合物102 係以與實例9中化合物94 類似之方式製備。粗物質在高真空下乾燥,得到化合物103 (174 mg,101%產率),不經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS = 4.95 min (8分鐘方法)。
Figure 02_image400
步驟 5 化合物103 係以與實例7中化合物57 類似之方式製備。粗固體含有化合物104 (203 mg,44%產率,60%純度),不經進一步純化即使用。LCMS = 5.68 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 1024.3(M + 1)+
Figure 02_image402
步驟 6 化合物104 係以與實例1中化合物12 類似之方式製備。粗殘餘物藉由RPHPLC (C18管柱,CH3 CN/H2 O,梯度50%至65%)純化,得到呈固體狀之單亞胺化合物105 (22 mg,16%產率,90%純度)。LCMS = 6.00 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 1027.3(M + 1)+
Figure 02_image404
步驟 7 在室溫下,將化合物106 溶解於THF (0.5 mL)及ACN (0.23 mL)中。接著以與實例9中化合物98 類似之方式製備。攪拌混合物直至完成且接著用DCM及DI水稀釋。有機層用鹽水洗滌,乾燥並過濾。濃縮濾液,得到粗硫醇,即化合物106 (21 mg,100%產率),直接用於下一反應中。LCMS = 5.67 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 980.4 (M + 1)+
Figure 02_image406
步驟 8 將化合物106 (21 mg,0.021 mmol)懸浮於2-丙醇(1428 µl)及水(714 µl)中。添加偏亞硫酸氫鈉(22.30 mg,0.214 mmol)且在室溫下攪拌反應直至完成。反應混合物用乙腈/水稀釋,冷凍並凍乾。所得白色粉末藉由RPHPLC (C18管柱,CH3 CN/H2 O,梯度20%至40%)純化且收集所需溶離份並凍乾,得到化合物107 (5.3 mg,23%產率)。LCMS = 5.67 min (8分鐘方法)。MS (m/z): 1060.2 (M - 1)-實例 32. huMOV19- 磺基 -SPDB-107 (或huMOV19-107 )偶聯物之製備
將在琥珀酸鹽緩衝液(pH 5) : DMA (30 : 70)中含有最終濃度為1.95 mM之化合物107 及1.5 mM磺基-SPDB連接子的原位混合物溫育6小時,隨後將7倍過量的107 -磺基-SPDB-NHS添加至在15 mM HEPES pH 8.5 (87:13,水: DMA)中含有4 mg/ml huMOV19抗體之反應物中。使該溶液在25℃下偶聯隔夜。
反應後,使用NAP脫鹽柱(Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)純化該偶聯物且緩衝液交換成10 mM Tris、80 mM NaCl、50 uM亞硫酸氫鹽、3.5%蔗糖、0.01% Tween-20配製緩衝液(pH 7.6)。在4℃下,利用Slide-a-Lyzer透析盒(ThermoScientific 10,000 MWCO)以相同緩衝液透析隔夜。
發現經純化之偶聯物每個抗體連接有平均2.7個分子之化合物107 (藉由UV/Vis及SEC,對於化合物107 ,使用莫耳消光係數ɛ330 nm = 15,484 cm-1 M-1 及ɛ280 nm = 30,115 cm-1 M-1 ,且對於huMOV19抗體,使用ɛ280 nm = 201,400 cm-1 M-1 ),具有95%單體(藉由尺寸排阻層析法)且最終蛋白質濃度為1.1 mg/ml。MS光譜資料顯示於圖16中。實例 33. 單次劑量之 huML66-90 偶聯物針對雌性 SCID 小鼠中 NCI-H1703 NSCLC 異種移植物之抗腫瘤活性
自Charles River Laboratories獲得6周齡之雌性CB.17 SCID小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.2 ml 50%基質膠/無血清培養基中之5 × 106 個NCI-H1703腫瘤細胞接種小鼠。當腫瘤體積達到約100 mm3 (接種後第16天)時,基於腫瘤體積將動物隨機分入4個組中,每組6只小鼠。第1天(接種後第17天),動物接受單次靜脈內施用之媒劑對照物(每只小鼠0.1 ml),或基於化合物90 濃度之5 μg/kg、20 μg/kg及50 μg/kg的huML66-90 偶聯物。
每週兩到三次使用測徑器以三個尺寸量測腫瘤大小。腫瘤體積係使用式V = 長度 × 寬度 × 高度 × ½計算,以mm3 表示。當腫瘤體積減小50%或更多時,認為小鼠具有部分消退(PR),當無法偵測到明顯腫瘤時,認為具有完全腫瘤消退(CR)。腫瘤體積係藉由StudyLog軟體測定。
腫瘤生長抑制(T/C值)係使用下式測定: T/C (%) = 治療組之中值腫瘤體積/對照組之中值腫瘤體積 × 100。
當媒劑對照組之腫瘤體積達到預定大小1000 mm3 時,同時測定治療組(T)及媒劑對照組(C)之腫瘤體積。測定每一治療組之每日中值腫瘤體積,包括無腫瘤小鼠(0 mm3 )。根據NCI標準,T/C ≤ 42%為抗腫瘤活性之最低水準。T/C <10%被視為高抗腫瘤活性水準。
如圖17中所示,huML66-90 偶聯物在20 μg/kg及50 μg/kg下具有高活性,其中20 μg/kg為最低有效劑量(MED)。實例 34. 單次劑量之 huMov19-90 偶聯物在雌性 CD-1 小鼠中之藥物動力學
自Charles River Laboratories獲得7周齡之雌性CD-1 小鼠。小鼠接受經側尾靜脈以單次靜脈內快速注射單次靜脈內施用的huMov19-90 偶聯物。每只小鼠接受基於Ab之2.5 mg/kg劑量。該劑量及注射體積係基於每只小鼠之體重個別地考慮。注射係使用配備27號½吋針之1.0 mL注射器進行。在施用huMov19-90 偶聯物之後2分鐘及30分鐘,以及2小時、4小時及8小時,及1天、2天、3天、5天、7天、10天、14天、21及28天,藉由吸入異氟烷使小鼠麻醉,且經由右眼眶後血竇自小鼠收集約150 µL血液放入肝素化之毛細管中。在每一時間點(自0至21天),自一組全部三隻小鼠收集血液。各組依序抽血;由此使該組中之小鼠在24小時之時段內不會抽血超過兩次。在最後一個時間點,即在施藥後28天,所有小鼠均納入樣品收集。對血液樣品離心以分離血漿。對於每一樣品及時間點,將30 μl血漿轉移至獨立標記之微量離心管中,且接著在-80℃下冷凍儲存以便隨後藉由ELISA分析,使用抗吲哚啉并苯并二氮呯抗體,測定總Ab(未偶聯Ab加完整偶聯物)及完整偶聯物之濃度。
如圖18中所示,huMov19-90 偶聯物具有與該抗體類似之清除率。實例 35. 藉由用蛋白質 A 樹脂親和力捕獲來富集分解代謝物
在5 × T150組織培養盤中培養表現葉酸受體α (FRα)之KB細胞。37℃下,在用5% CO2 緩衝之潮濕恆溫箱中將飽和量的FRα靶向性huMov19-90 偶聯物與KB細胞一起孵育24小時。24小時之後,採集含有細胞流出之分解代謝物之培養基且彙集用於隨後分析。
藉由在4℃下孵育隔夜,使飽和量之抗吲哚啉并苯并二氮呯抗體結合至蛋白質A樹脂之漿液。在端至端旋轉器上,用25 mL培養基孵育1 mL預先結合之蛋白質A/抗吲哚啉并苯并二氮呯抗體複合物數小時。以1000 rpm輕柔地離心樹脂且傾析上清液。用PBS洗滌結合至分解代謝物之蛋白質A/抗吲哚啉并苯并二氮呯抗體樹脂。藉由丙酮萃取將分解代謝物釋放至有機相中。將分解代謝物真空乾燥隔夜,直至有機溶液完全蒸發。分解代謝物用20%乙腈水溶液複水,且藉由LC-MS進行分析。MS 分析
藉由UHPLC/MS/MS,使用Q-Exactive高解析度質譜儀(Thermo)鑒別細胞分解代謝物。使用萃取離子層析圖(XIC)鑒別並表徵靶細胞分解代謝物。鑒別含有特徵性吲哚啉并苯并二氮呯(286 m/z)質量標誌之所有分解代謝物質(參見圖19A及19B)。實例 36. 單次劑量之 huMov19-90 針對雌性 CB.17 SCID 小鼠中之 NCI-H2110 NSCLC 異種移植物、 Hec-1b 子宮內膜異種移植物及 Ishikawa 子宮內膜異種移植物之抗腫瘤活性
自Charles River Laboratories獲得6周齡之雌性CB.17 SCID小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.1 ml 50%基質膠/無血清培養基中之1 × 107 個NCI-H2110腫瘤細胞接種一組小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.1 ml無血清培養基中之1 × 107 個Hec-1b腫瘤細胞接種第二組小鼠。藉由在右側腹中皮下注射,用懸浮於0.1 ml 50%基質膠/無血清培養基中之1 × 107 個Ishikawa腫瘤細胞接種第三組小鼠。
當腫瘤體積達到約100 mm3 (NCI-H2110在接種後第7天,Hec-1b在接種後第7天且Ishikawa在接種後第17天)時,基於腫瘤體積,將動物隨機分成陣列,每組6只小鼠。
在NCI-H2110異種移植物實驗中,小鼠在第1天(接種後第8天)接受單次靜脈內施用的媒劑對照物(每只小鼠0.2 ml)或基於藥物濃度之1 µg/kg、3 µg/kg或5 µg/kg的huMov19-90。
在Hec-1b異種移植物實驗中,小鼠在第1天(接種後第8天)接受單次靜脈內施用的媒劑對照物(每只小鼠0.2 ml)或基於藥物濃度之10 µg/kg或30 µg/kg的huMov19-90,或30 µg/kg的非靶向性對照偶聯物chKTI-90。
在Ishikawa異種移植物實驗中,小鼠在第1天(接種後第18天)接受單次靜脈內施用的媒劑對照物(每只小鼠0.2 ml)或基於藥物濃度之10 µg/kg或30 µg/kg的huMov19-90,或30 µg/kg的非靶向性對照偶聯物chKTI-90。
對於所有實驗,每週兩到三次使用測徑器以三個尺寸量測腫瘤大小。腫瘤體積係使用式V = 長度 × 寬度 × 高度 × ½計算,以mm3 表示。當腫瘤體積減小50%或更多時,認為小鼠具有部分消退(PR),當無法偵測到明顯腫瘤時,認為具有完全腫瘤消退(CR)。腫瘤體積係藉由StudyLog軟體測定。
腫瘤生長抑制(T/C值)係使用下式測定: T/C (%) = 治療組之中值腫瘤體積/對照組之中值腫瘤體積 × 100。
當媒劑對照組之腫瘤體積達到預定大小1000 mm3 時,同時測定治療組(T)及媒劑對照組(C)之腫瘤體積。測定每一治療組之每日中值腫瘤體積,包括無腫瘤小鼠(0 mm3 )。根據NCI標準,T/C ≤ 42%為抗腫瘤活性之最低水準。T/C <10%被視為高抗腫瘤活性水準。
如圖22中所示,在NCI-H2110異種移植物模型中,huMov19-90偶聯物在1 µg/kg劑量下不具活性,在3 µg/kg劑量下具有活性且具有13%之T/C及1/6 PR,並在5 µg/kg劑量下具有高活性且具有2%之T/C、6/6 PR及4/6 CR。
如圖23中所示,在Hec-1b異種移植物模型中,huMov19-90偶聯物在10 µg/kg劑量下具有活性且具有15%之T/C及1/6 PR,並在30 µg/kg劑量下具有高活性且具有9%之T/C、6/6 PR及6/6 CR。非靶向性對照偶聯物chKTI-90在30 µg/kg劑量下具有活性,且T/C為34%。
如圖24中所示,在Ishikawa異種移植物模型中,huMov19-90偶聯物在10 µg/kg劑量下具有活性且具有27%之T/C、6/6 PR及6/6 CR,並在30 µg/kg劑量下具有活性且具有15%之T/C、6/6 PR及6/6 CR。非靶向性對照偶聯物chKTI-90在30 µg/kg劑量下具有活性,且具有24%之T/C及4/6 PR。實例 37. 單次劑量之 huMov19-107 針對雌性 CB.17 SCID 小鼠中 NCI-H2110 NSCLC 異種移植物之抗腫瘤活性
根據以上實例30中所描述之方案,在SCID小鼠中測定huMOV19-107之活體內抗腫瘤活性。如圖25中所示,huMov19-107 偶聯物在10 μg/kg劑量下具有高活性且具有6/6 CR。實例 38. CD123-90 偶聯物之結合親和力
使用HNT-34細胞,藉由流動式細胞測量術分析示例性人類化抗CD123抗體,即huCD123-6Gv4.7S3抗體之ADC偶聯物的結合親和力,並將其與相應未偶聯抗體相比較。將HNT-34細胞(每份樣品5×104 個細胞)與在200 μL FACS緩衝液(補充有2%正常山羊血清之DMEM培養基)中不同濃度之ADC及未偶聯huCD123-6Gv4.7S3抗體一起孵育。接著使細胞集結成團,洗滌兩次,並與100 μL藻紅蛋白(PE)偶聯之山羊抗人IgG抗體(Jackson Laboratory)一起孵育1小時。再使細胞集結成團,用FACS緩衝液洗滌且使其再懸浮於含有1%甲醛之200 μL PBS中。使用帶有HTS多孔取樣器之FACSCalibur流式細胞儀,或FACS陣列流式細胞儀獲取樣品,且使用CellQuest Pro (均來自BD Biosciences, San Diego, US)進行分析。對於每一樣品,計算出FL2之幾何平均螢光強度且在半對數曲線中針對抗體濃度作圖。藉由非線性回歸生成劑量-反應曲線,且使用GraphPad Prism v4 (GraphPad software, San Diego, CA)計算每一曲線之EC50值,其對應於每一抗體之表觀解離常數(Kd)。
如圖26中所示,偶聯僅適度地影響示例性抗CD123抗體之結合親和力。實例 39. huCD123-90 之活體外細胞毒性活性
使用活體外細胞毒性分析量測huCD123-6(一種抗CD123抗體)之抗體-藥物偶聯物(ADC)殺滅在細胞表面上表現CD123之細胞的能力。在由細胞供應商(ATCC或DSMZ)所推薦之細胞培養基中培養細胞株。將細胞以100 μL培養基中2,000至10,000個添加至平底96孔盤之每個孔中。為了阻斷細胞表面上之Fc受體,細胞培養基補充有100 nM chKTI抗體(屬於相同同型之抗體)。使用3倍連續稀釋在培養基中稀釋偶聯物,且每孔添加100 μL。為了確定不依賴於CD123之細胞毒性貢獻,在測試偶聯物之前,向一些孔中添加CD123阻斷劑(例如100 nM chCD123-6抗體)。在每一分析盤中納入含有細胞及培養基但無偶聯物之對照孔,以及僅含培養基之孔。對於每一資料點,一式三份進行分析。在37℃下,在含6% CO2 之潮濕恆溫箱中孵育該等盤4至7天。接著,使用基於WST-8之Cell Counting Kit-8 (Dojindo Molecular Technologies, Inc., Rockville, MD)測定每個孔中存活細胞之相對數量。藉由首先針對培養基背景吸光度校正,且接著用每一值除以對照孔(未處理孔)中該等值之平均值來計算每個孔中細胞之表觀存活分數。將細胞存活分數以半對數曲線針對偶聯物濃度作圖。
在本研究中使用了不同起源(AML、B-ALL、CML及NHL)的十五種CD123陽性細胞株(表4)。大多數細胞株源自於帶有惡性腫瘤且具有至少一個不良預後因子(例如P-糖蛋白之過表現、EVI1之過表現、p53改變、DNMT3A突變、FLT3內部串聯重複)的患者。該等偶聯物對該等細胞株展現高效力且IC50值在亞皮莫耳濃度至低奈莫耳濃度範圍內(表4)。 表4.huCD123-6-90 偶聯物針對不同起源之CD123陽性細胞株之活體外細胞毒性
細胞株 起源 不良預後因子 IC50 (M)
THP1 AML p53缺失 6.7E-12
SHI-1 AML p53基因改變 1.3E-11
KO52 AML p53突變,Pgp過表現 1.4E-11
KASUMI-3 AML EVI1及Pgp過表現 9.8E-12
KG-1 AML p53突變,Pgp過表現 2.2E-10
OCI-AML2 AML DNMT3A突變 8.8E-11
HNT-34 AML MECOM (EVI1)過表現 2.0E-12
MV4-11 AML FLT3內部串聯重複 5.6E-13
MOLM-13 AML FLT3內部串聯重複 4.9E-13
EOL-1 AML    2.5E-12
MOLM-1 CML EVI1及Pgp過表現 2.9E-11
KOPN8 B-ALL    1.1E-11
JM-1 B-ALL    2.4E-11
KCL-22 CML    3.0E-11
Granta519 NHL    1.2E-12
本文引用之所有出版物、專利、專利申請、互聯網站及登錄號/資料庫序列(包括多聚核苷酸及多肽序列)均以引用之方式整體併入本文中用於所有目的,其引用程度就如同特定且個別地指示每一個別出版物、專利、專利申請、互聯網站或登錄號/資料庫序列如此以引用之方式併入一般。
[圖1]顯示了huMOV19-14 偶聯物與未偶聯之抗體huMOV19在T47D細胞上之結合親和力的比較。
[圖2]顯示了huMOV19-14 偶聯物之活體外細胞毒性及特異性。
[圖3]顯示,huMOV19-14 偶聯物對相鄰抗原陰性細胞展現出較弱的旁觀者細胞毒性效應。
[圖4]4A、4B及4C顯示了huMy9-6-14 偶聯物針對各種細胞株之活體外細胞毒性。
[圖5]5A及5B顯示,huMy9-6-14 偶聯物對相鄰抗原陰性細胞展現出旁觀者細胞毒性效應。
[圖6]顯示了huMOV19-80huMOV19-90 偶聯物在帶有NCI-H2110之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖7]7A-7D顯示了本發明之代表性偶聯物之質譜曲線。
[圖8]顯示了huML66-90 偶聯物之質譜曲線。
[圖9]顯示了huML66-90 偶聯物之活體外細胞毒性及特異性。
[圖10、11及12]顯示了huMOV19-90 偶聯物之活體外細胞毒性及特異性。
[圖13]顯示,huMOV19-90偶聯物對相鄰抗原陰性細胞展現出較強的旁觀者細胞毒性效應。
[圖14]顯示了huMOV19-90 偶聯物在帶有NCI-H2110之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖15]15A及15B顯示了huMOV19-90 偶聯物與未偶聯之抗體huMOV19在T47D細胞上之結合親和力的比較。
[圖16]顯示了本發明之代表性偶聯物之質譜曲線。
[圖17]顯示了huML66-90 偶聯物在帶有NCI-H1703 NSCLC之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖18]顯示了huMOV19-90 在CD-1小鼠中之藥物動力學。
[圖19]19A及19B顯示了huMOV19-90 偶聯物之結構(圖19A),以及由在KB子宮頸癌細胞中活體外形成的huMOV19-90 偶聯物得到的分解代謝物之孵育、純化及分離方案(圖19B)。顯示了由LC-MS鑒別之三種分解代謝物以及質量計算值。
[圖20]顯示了huMOV19-107 偶聯物與未偶聯之抗體huMOV19在T47D細胞上之結合親和力的比較。
[圖21]顯示了huMOV19-90 偶聯物及huMOV19-107 偶聯物之活體外細胞毒性及特異性。
[圖22]顯示了huMOV19-90 偶聯物在帶有NCI-H2110 NSCLC異種移植物之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖23]顯示了huMOV19-90 偶聯物在帶有Hec-1b子宮內膜異種移植物之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖24]顯示了huMOV19-90 偶聯物在帶有Ishikawa子宮內膜異種移植物之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖25]顯示了huMOV19-107 偶聯物在帶有NCI-H2110 NSCLC異種移植物之SCID小鼠中之活體內功效。
[圖26]顯示了huCD123-6Gv4.7S3-90 偶聯物與未偶聯之抗體在HNT-34細胞上之結合親和力的比較。
 
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002
Figure 12_A0101_SEQ_0003
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Figure 12_A0101_SEQ_0040
Figure 12_A0101_SEQ_0041
Figure 109118465-A0101-11-0002-1

Claims (15)

  1. 一種由下式所表示的偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,
    Figure 109118465-A0305-02-0237-1
    Figure 109118465-A0305-02-0237-2
    其中:r是從1至10的整數;M是H+、Na+或K+;且CBA是抗葉酸受體抗體,其包含:a)SEQ ID NO:1之重鏈CDR1;SEQ ID NO:2之重鏈CDR2及SEQ ID NO:3之重鏈CDR3;以及b)SEQ ID NO:4之輕鏈CDR1;SEQ ID NO:5之輕鏈CDR2;及SEQ ID NO:6之輕鏈CDR3。
  2. 如請求項1之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,其中所述重鏈CDR2包含SEQ ID NO:7。
  3. 如請求項1之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,其中所述抗葉酸受體抗體包含具有SEQ ID NO:11之胺基酸序列的重鏈可變區;以及具有SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:13之胺基酸序列的輕鏈可變區。
  4. 如請求項1之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,其中所述抗葉酸受體抗體包含具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈;以及具有SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10之胺基酸序列的輕鏈。
  5. 如請求項4之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,其中所述抗葉酸受體抗體包含具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈;以及具有SEQ ID NO:10之胺基酸序列的輕鏈。
  6. 如請求項1之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,其中所述抗葉酸受體抗體是huMOV19抗體。
  7. 一種醫藥組成物,其包含如請求項1至6中任一項之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽,以及醫藥學上可接受之載劑。
  8. 一種如請求項1至6中任一項之偶聯物或其醫藥學上可接受的鹽且視需要地與化學治療劑組合之用途,其係用於製備用於治療哺乳動物中之癌症的方法之醫藥品。
  9. 如請求項8之用途,其中該癌症為卵巢癌、胰腺癌、子宮頸癌、黑素瘤、肺癌、乳癌、頭頸部鱗狀細胞癌、前列腺癌、子宮內膜癌、淋巴瘤、骨髓增生異常症候群(MDS)、腹膜癌或白血病。
  10. 如請求項9之用途,其中所述癌症為急性骨髓性白血病(AML)、急性單核細胞性白血病、早幼粒細胞性白血病、嗜伊紅性白血病、急性淋巴母細胞性白血病、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)及慢性骨髓性白血病(CML)。
  11. 如請求項10之用途,其中所述癌症為急性骨髓性白血病(AML)。
  12. 如請求項10之用途,其中所述癌症為B細胞急性淋巴母細胞性 白血病(B-ALL)。
  13. 如請求項9之用途,其中所述癌症為非小細胞肺癌。
  14. 如請求項9之用途,其中所述癌症為卵巢癌。
  15. 如請求項9之用途,其中所述癌症為非霍奇金淋巴瘤。
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