TW202325709A - 化合物、包括其的固態載體以及製備核酸的方法 - Google Patents
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Abstract
本發明提供一種化合物、包括其的固態載體以及製備核酸的方法。化合物具有下述式(1)表示的結構。
在式(1)中,Y
1、Y
2、Z及*的定義與詳細說明中所定義的相同。
Description
本發明是有關於一種化合物,且特別是有關於一種化合物、包括其的固態載體以及製備核酸的方法。
隨著生物技術的蓬勃發展,核酸被大量地使用。為此,對於製備核酸的需求逐漸上升。然而,目前市售的製備核酸的管柱在切斷核酸與固態載體的鍵結時,固態載體會降解,使得固態載體只能使用一次,進而增加製備核酸的成本。
本發明提供一種在核酸製備方法中可重複使用且具有改善結合位置數量的化合物、包括其的固態載體以及製備核酸的方法。
本發明的一種化合物具有下述式(1)表示的結構。
式(1)
式(1)中,Y
1表示氫或乙醯基;
Y
2表示氫、*-COOH、*-NH
2或*-NCO;
Z表示二價有機基團,且
*表示鍵結位置。
在本發明的一實施例中,上述Z包括伸烷基、*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,*表示鍵結位置。
在本發明的一實施例中,上述式(1)包括下述式(2)表示的結構。
式(2)
式(2)中,Y
1表示氫或乙醯基;
Y
2表示氫、*-COOH、*-NH
2或*-NCO;
Z
1表示二價有機基團;
m表示0至8的整數;
n表示0至6的整數,且
*表示鍵結位置。
在本發明的一實施例中,上述Z
1包括*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,*表示鍵結位置。
本發明的一種固態載體包括上述的化合物。
在本發明的一實施例中,上述固態載體更包括表面有連接分子的基板。化合物與連接分子鍵結。
在本發明的一實施例中,上述連接分子的末端官能基包括胺基或羧基。末端官能基與化合物鍵結。
在本發明的一實施例中,上述化合物與連接分子之間形成醯胺鍵或尿素官能基。
本發明的一種製備核酸的方法包括上述的固態載體。
在本發明的一實施例中,上述固態載體為可重複使用的固態載體。
基於上述,本發明的化合物包括特定結構。藉此,可使化合物用於固態載體及製備核酸的方法時,具有改善的結合位置數量及使其在核酸製備方法中可重複使用,而適用製備核酸。
為讓本發明的上述特徵和優點能更明顯易懂,下文特舉實施例作詳細說明如下。
以下是詳細敘述本發明內容之實施例。實施例所提出的實施細節為舉例說明之用,並非對本發明內容欲保護之範圍做限縮。任何所屬技術領域中具有通常知識者當可依據實際實施態樣的需要對該些實施細節加以修飾或變化。
在本文中,所謂「二價有機基團」是來自有機化合物的取代基,其來自從有機化合物的原子上移除兩個氫原子所形成的基團。藉此,可與其他原子形成兩個化學鍵。
依據本實施例的一種化合物,其具有下述式(1)表示的結構。接著,對式(1)表示的結構進行詳細地說明。
式(1)
式(1)中,Y
1表示氫或乙醯基;
Y
2表示氫、*-COOH、*-NH
2或*-NCO;
Z表示二價有機基團,且
*表示鍵結位置。
在本實施例中,Z可包括伸烷基、*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,較佳為伸烷基、*-COO-*、*-HNCO-*或其組合,更佳為伸烷基、*-COO-*或其組合;*表示鍵結位置。
在本實施例中,式(1)包括下述式(2)表示的結構。
式(2)
式(2)中,Y
1表示氫或乙醯基;
Y
2表示氫、*-COOH、*-NH
2或*-NCO;
Z
1表示二價有機基團;
m表示0至8的整數;
n表示0至6的整數,且
*表示鍵結位置。
在本實施例中,Z
1可包括*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,較佳為*-COO-*或*-HNCO-*,更佳為*-COO-*;m較佳為0至5的整數;n較佳為0至6的整數;*表示鍵結位置。
式(1)表示的化合物可選自下述式(1-1)表示的化合物1、下述式(1-2)表示的化合物2、下述式(1-3)表示的化合物4、下述式(1-4)表示的化合物5及下述式(1-5)表示的化合物6中的一者。
式(1-1)
式(1-2)
式(1-3)
式(1-4)
式(1-5)
依據本實施例的一種固態載體,其包括上述的化合物。固態載體可更包括表面有連接分子的基板。化合物可以與基板表面上的連接分子鍵結,以使化合物固定在基板上,進而可將鍵結有上述化合物的固態載體用於製備核酸。基板沒有特別的限制,例如可選用不鏽鋼基板或其他合適的基板。
在本實施例中,連接分子的末端官能基可包括胺基或羧基。舉例來說,連接分子可包括胺基矽烷類化合物(例如胺基丙基三乙氧基矽烷(aminopropyltriethoxysilane)或其他合適的化合物。連接分子的末端官能基與上述化合物鍵結,以使化合物固定在基板上。連接分子的末端官能基與化合物之間可形成醯胺鍵或尿素官能基。舉例來說,當化合物具有式(1)表示的結構且Y
2表示*-COOH,且連接分子的末端官能基為胺基時,化合物與連接分子之間形成醯胺鍵。當化合物具有式(1)表示的結構且Y
2表示*-NH
2,且連接分子的末端官能基為羧基時,化合物與連接分子之間形成醯胺鍵。當化合物具有式(1)表示的結構且Y
2表示*-NCO,且連接分子的末端官能基為胺基時,化合物與連接分子之間形成尿素官能基。
將化合物鍵結至基板表面上的連接分子的合成方法及條件沒有特別的限制,例如可採用周知的有機合成方法。
依據本實施例的一種製備核酸的方法,其包括上述的固態載體。製備核酸的方法沒有特別的限制,例如可採用周知的製備核酸的方法。舉例來說,將固態載體用於製備核酸的方法中,可在合成核酸序列的過程中使核酸前驅物取代化合物中的二甲氧基三苯甲基(4,4’-dimethoxytriphenylmethyl,DMT);接著,以氨水進行降解,使得核酸前驅物脫落,以得到製備的核酸以及鍵結有經降解的化合物之固態載體。在降解的過程中,固態載體中與基板上的連接分子鍵結的化合物不會脫落。也就是說,基板上的連接分子與化合物之間形成的醯胺鍵(或尿素官能基)不會斷裂,且化合物仍保留在基板上。然後,將鍵結有經降解的化合物之固態載體重新接回保護基,以得到鍵結有式(1)表示的化合物的固態載體。藉此,固態載體可重複使用。
在下文中,將參照實例來詳細描述本發明。提供以下實例用於描述本發明,且本發明的範疇包含以下申請專利範圍中所述的範疇及其取代物及修改,且不限於實例的範疇。
以下說明合成例1至合成例5、實施例1至實施例12、比較例1、製備例1至製備例3以及製備比較例1。
合成例
1
:製備化合物
1
以31.3 mmol ß-馬來醯亞胺基丙酸(ß-maleimidopropionic acid)為起始物,加入31.3 mmol對甲苯磺酸(para-toluene sulfonic acid,PTSA)固體後,再依序加入12.5 mL苯甲醇(benzyl alcohol)及6.5 mL苯(benzene),以超音波震盪機震搖至瓶中無顆粒固體後,架設好冷凝管開啟攪拌,並在70~75℃下進行迴流反應12小時。反應結束後,以二氯甲烷(dichloromethane,DCM)/純水進行萃取,再以硫酸鎂(MgSO
4)除水後進行過濾濃縮以移除溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得中間體R1(產率:40%~57%)。
接著,將17.74 mmol中間體R1、乙腈(acetonitrile,MeCN)及40.8 mmol呋喃(furan),在80℃下進行加熱迴流反應5小時。反應結束後,直接以減壓濃縮裝置移除反應溶液中的溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得中間體IM1(產率:59%~67%)。
然後,將4.14 mmol中間體IM1、10 mL丙酮(acetone)及2.2 mL過氧化氫(H
2O
2)進行攪拌以溶解,以形成反應溶液。另外,將0.0414 mmol四氧化鋨(OsO
4)固體溶解於1.1 mL第三丁醇(
t-BuOH)中,以形成第三丁醇溶液。接著,將第三丁醇溶液逐滴加入至反應溶液中,待第三丁醇溶液滴完後,升溫至55~60℃下進行加熱迴流反應4小時。反應完成後,將反應溶液回復至室溫,之後再移至冰浴下,逐滴加入飽和硫代硫酸鈉溶液將反應溶液中和。中和完成後,反應溶液呈分層狀態,此時取上層的清液並以減壓濃縮裝置移除溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得中間體IM2(產率:49%~50%)。
接著,將除水完畢的4.5 mL吡啶(pyridine)預先溶解3.02 mmol二甲氧基三苯甲基氯(4,4'-dimethoxytrityl chloride,DMT-Cl),以形成溶液A。然後,再取除水完畢的4.5 mL吡啶溶解2.02 mmol中間體IM2,以形成溶液B。接著,將溶液A抽出且加入至溶液B的反應瓶中,持續於室溫下反應至少12小時。反應完成後,在反應瓶中加入適量甲苯(toluene),並直接以減壓濃縮裝置移除溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得中間體IM3(產率:49%~51%)。
接著,將0.75 mmol中間體IM3以4 mL二氯甲烷(DCM)溶解,再依序加入0.075 mmol 4-二甲胺基吡啶(4-dimethylaminopyridine,DMAP)、1.13 mmol三乙胺(triethylamine,TEA)及1.13 mmol乙酸酐(acetic anhydride)至溶有中間體IM3的反應溶液中,持續於室溫下反應2小時。反應完成後,取飽和碳酸氫鈉水溶液逐滴加入反應溶液中以進行中和,直到pH值回到中性為止。中和後,將反應溶液轉移至萃取瓶中,並且加入與反應溶液等量的二氯甲烷(DCM)。接著,以純水水洗兩次後,取出有機層,再以硫酸鎂(MgSO
4)除水後進行過濾濃縮以移除溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得中間體IM4(產率:83%~93%)。
接著,將0.135 mmol中間體IM4置於反應瓶中,依序加入3 mL甲醇(MeOH)、10 mL的10% Pd/C粉末及0.135 mmol三乙胺(TEA)。然後,以氫氣(H
2)置換氣體三次後,於室溫下反應2小時。反應完成後,以海砂過濾Pd/C殘餘粉末,且過濾收集濾液後以減壓濃縮裝置移除濾液中的溶劑,且藉由管柱層析法進行純化,以獲得最終產物化合物1(產率:91%~96%)。
合成例
2
:製備化合物
2
合成例2所製備的化合物2是以與合成例1相同的步驟、反應物使用量之比例以及反應條件來合成,並且其不同處在於:將起始物改變為ß-馬來醯亞胺基庚酸(ß-maleimidoheptanoic acid)。在製備化合物2的過程中,依序產生的5個中間體的產率分別為68.5%、79.5%、65.5%、28.5%以及85.0%。化合物2的產率為90.0%。
合成例
3
:製備化合物
4
合成例3所製備的化合物4是以與合成例1相同的步驟、反應物使用量之比例以及反應條件來合成,並且其不同處在於:將起始物改變為ß-馬來醯亞胺基己酸(ß-maleimidohexanoic acid)。在製備化合物4的過程中,依序產生的5個中間體的產率分別為51.8%、99.0%、31.3%、49.7%以及89.1%。化合物4的產率為95.3%。
合成例
4
:製備化合物
5
將3.93 g外-3,6-環氧-1,2,3,6-四氫鄰苯二甲酸酐(7-Oxabicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2,3-exo,exo-dicarboxylic anhydride;CAS編號:6118-51-0)溶於30ml丙酮中且進行攪拌。另外,將3.78 g的N-第三丁氧羰基乙二胺(tert-butyl 2-aminoethylcarbamate)加入攪拌中的丙酮溶液中。約2小時後,將溶液進行過濾以取得其中的白色固體,且將其用丙酮清洗後並烘乾以獲得約6.65 g半成品。接著,將半成品、20 mL丙酮、5.19 g乙酸酐(Ac
2O)及0.1 g乙酸鈉(CH
3COONa)混合,加熱回流2小時後,在減壓條件下去除丙酮,且將剩下的殘餘物加入10 mL碳酸鈉飽和水溶液(Na
2CO
3(aq))。然後,將其中的固體進行過濾及水洗後,取出烘乾,以獲得約2.72 g中間體2(產率:37.3%)
接著,將1.55 g中間物2溶於5 mL二氯甲烷(CH
2Cl
2)中,在0℃下加入3 mL三氟乙酸(CF
3COOH)後,攪拌並逐漸回溫至常溫,且攪拌2小時 。反應完畢後,於減壓條件下去除溶劑,並加入甲苯,再於減壓條件下蒸除甲苯後留存,以獲得第一批殘餘物。另外,將1.052 g丁二酸單苄酯(4-(benzyloxy)-4-oxobutanoic acid)溶於0℃ 5 mL 二氯甲烷中且攪拌,且此時加入1.2 g乙二醯氯(oxalyl chloride),再小心加入1滴二甲基甲醯胺(dimethylformamide,DMF)後,逐漸回復至常溫,並攪拌1小時。接著,將反應溶液於減壓條件下去除溶劑,並重新加入甲苯。再次蒸乾後,加入新的二氯甲烷以得到第二批溶液。將第一批殘餘物加入5 mL二氯甲烷,保持在0℃下進行攪拌,並小心加入3當量(eq)三乙胺(Et
3N)。隨即將第二批二氯甲烷溶液慢慢加入後,逐漸回溫並攪拌1小時。然後,加水進行萃取,取出有機層且將其以1 N鹽酸(HCl)清洗後,再以水清洗至中性。將有機層經乾燥濃縮後於減壓條件下移除溶劑,以獲得殘餘物。將殘餘物加入2.5 mL甲醇中。放隔夜後,將析出的固體進行過濾,並以冰甲醇清洗後,取出固體,經烘乾以獲得約0.768 g中間體5(產率:38.3%)
接著,將0.644g中間體5溶於7 mL丙酮中,再加入2.3 mL雙氧水進行攪拌。另外,將3.4 mmol四氧化鋨(OsO
4)溶於1 mL第三丁醇(tert-butanol)後,將它滴加入上述丙酮溶液中,在常溫下攪拌。攪拌隔夜後,有固體析出。先將固體過濾,再將濾液於減壓條件下去除大部分丙酮後,加入硫代硫酸鈉水溶液(Na
2S
2O
3(aq)),且緩慢攪拌,可觀察到白色物慢慢生成。約2小時後,將固體過濾,再用3 mL二氯甲烷洗固體。固體經烘乾,以獲得約0.197 g中間體6(產率:28%)。
接著,取另一反應瓶,先加入3 mL二氯甲烷,再於冰水浴0℃的條件下依序加入0.2821 g中間體6及0.331 g(1.5當量) 二甲氧基三苯甲基氯(DMT-Cl),最後再緩慢加入2.5當量三乙胺及5 mol的4-二甲胺基吡啶(DMAP)。待反應溶液回復至常溫後,在常溫下攪拌3.5小時,再加入水攪拌以使其分層。取出有機層並將其乾燥後,進行減壓以移除溶劑,且得到殘餘物。將殘餘物以管柱層析法進行純化,以獲得約0.217 g呈油狀物的中間體7(產率:45%)。
接著,取20 mg中間體7溶於3 mL甲醇中,再加入3當量三乙胺及7 mg的10% Pd/C,在1.5 atm的氫氣氣壓下反應1.5小時。然後,將反應溶液過濾,以去除Pd觸媒。接著,將反應溶液中的溶劑移除,以獲得最終固體產物化合物5(產率:92%)。
合成例
5
:製備化合物
6
秤取2.687 g的3-(4-胺基苯基)丙酸芐酯(benzyl 3-(4-aminophenyl)propanoate)溶於15 mL丙酮中且進行攪拌。另外,將1.93 g外-3,6-環氧-1,2,3,6-四氫鄰苯二甲酸酐加入攪拌中的丙酮溶液中。約2小時後,以薄層層析(thin layer chromatography,TLC)進行分析,確認反應是否完全。確認反應完全後,加入2.5當量乙酸酐(Ac
2O)及0.5當量乙酸鈉(CH
3COONa),加熱回流3小時後,在減壓條件下去除丙酮,且將剩下的殘餘物加入10 mL碳酸鈉飽和水溶液(Na
2CO
3(aq))。然後,攪拌30分鐘後,加入乙酸乙酯(ethyl acetate,EA)進行萃取。接著,將萃取液經乾燥濃縮後,以管柱層析法進行純化後,於甲醇中再一次結晶純化,以獲得約1.9 g中間體2(產率:44.7%)。
將25.4 mg中間體2溶於2 mL丙酮中,再加入0.2 mL雙氧水進行攪拌。另外,將1.8 mg四氧化鋨(OsO
4)溶於0.2 mL第三丁醇(tert-butanol)後,將它滴加入上述丙酮溶液中攪拌。攪拌隔夜後,加入大量水以析出白色固體。將固體經過濾水洗後,且烘乾以得到約17 mg中間體3(產率:61%)。
接著,取另一反應瓶,先加入3 mL二氯甲烷,再依序加入0.167 g中間體3及,0.081 g(1.3當量)二甲氧基三苯甲基氯(DMT-Cl),最後再緩慢加入2.5當量三乙胺及5 mol的4-二甲胺基吡啶(DMAP)。將反應溶液於常溫下攪拌隔夜後,加入水進行攪拌以分層。然後,取出有機層並將其乾燥後,進行減壓以移除溶劑,且得到殘餘物。將殘餘物重新加入乙酸乙酯,以將不溶物過濾後,重新取出含乙酸乙酯的有機層以移除溶劑。然後,以管柱層析法進行純化,以得到油狀物。接著,加入甲醇以析出固體中間體4(產率:40~50%)。
接著,將22 mg中間體4溶於3 mL甲醇中,再加入3當量三乙胺及8 mg的10% Pd/C,在1.5 atm的氫氣氣壓下反應2小時。然後,將反應溶液過濾,以去除Pd觸媒。接著,將反應溶液中的溶劑移除,以獲得最終固體產物化合物6(產率:95%)。
實施例 1
將0.05莫耳的胺基丙基三乙氧基矽烷溶解於甲醇,然後加入管柱A中,停留24小時。接著,以丙酮清洗並去除甲醇,在60℃的溫度下烘乾。然後,將0.05莫耳的化合物1溶解於二氯甲烷,再加入管柱A中,停留24小時。接著,以丙酮清洗並去除二氯甲烷,在60℃的溫度下烘乾,即可製得實施例1的固態載體。將所製得的固態載體以下列評價方式進行評價,其結果如表2及表3所示。
實施例 2 至實施例 12
實施例2至實施例12的固態載體是以與實施例1相同的步驟來製備,並且其不同處在於:改變鍵結至基板的化合物及管柱(如表2所示),其中表2中標號所對應的化合物及管柱如表1所示。將所製得的固態載體以下列評價方式進行評價,其結果如表2及表3所示。
比較例 1
取市售商品DS200(商品名稱,K&A實驗有限公司(K&A Labs GmbH)製造),其包含可與核酸前驅物鍵結的化合物。將DS200(商品名稱)以下列評價方式進行評價,其結果如表2及表3所示。
製備核酸的製備例 1 至製備例 3 以及製備比較例 1
將實施例3至實施例5製得的固態載體以及比較例1的固態載體分別裝載至K&A合成儀(K&A Labs GmbH)製造),以進行5' TGA CTG TGA ACG TTC GAG ATG A序列核酸的製備。將完成核酸製備的管柱以下列評價方式進行評價,其結果如表4所示。
[表1]
標號 | 成分/化合物 | |
化合物 | 化合物1 | 式(1-1)表示的化合物 |
化合物2 | 式(1-2)表示的化合物 | |
化合物4 | 式(1-3)表示的化合物 | |
化合物5 | 式(1-4)表示的化合物 | |
化合物6 | 式(1-5)表示的化合物 | |
管柱 | 管柱A | V2-A1(自製管柱,其表面的連接分子為胺基丙基三乙氧基矽烷)。 |
管柱B | V5-B11(自製管柱,其表面的連接分子為胺基丙基三乙氧基矽烷)。 | |
管柱C | V6-C16(自製管柱,其表面的連接分子為胺基丙基三乙氧基矽烷)。 | |
管柱D | DS200(商品名稱,K&A實驗有限公司(K&A Labs GmbH)製造)。 |
[表2]
成份 | 實施例 | |||||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | |||
化合物 | 化合物1 | V | V | - | - | - | - | |
化合物2 | - | - | V | - | - | - | ||
化合物4 | - | - | - | V | - | - | ||
化合物5 | - | - | - | - | V | - | ||
化合物6 | - | - | - | - | - | V | ||
管柱 | 管柱A | V | - | - | - | - | - | |
管柱B | - | V | V | V | V | V | ||
管柱C | - | - | - | - | - | - | ||
管柱D | - | - | - | - | - | - | ||
結合位置數量 (單位:nmol) | 447 | 331 | 228 | 280 | 287 | 194 | ||
[表2](續)
成份 | 實施例 | 比較例 | ||||||
7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 1 | ||
化合物 | 化合物1 | V | - | - | - | - | - | - |
化合物2 | - | V | - | - | - | - | - | |
化合物4 | - | - | V | - | - | V | - | |
化合物5 | - | - | - | V | - | - | - | |
化合物6 | - | - | - | - | V | - | - | |
管柱 | 管柱A | - | - | - | - | - | V | - |
管柱B | - | - | - | - | - | - | - | |
管柱C | V | V | V | V | V | - | - | |
管柱D | - | - | - | - | - | - | V | |
結合位置數量 (單位:nmol) | 582 | 433 | 460 | 478 | 319 | 475 | 200 |
[表3]
成份 | 實施例 | 比較例 | |
1 | 12 | 1 | |
回收量(單位:nmol) | 326 | 296 | 0 |
回收率(單位:%) | 73 | 62 | 0 |
[表4]
< 評價方式 > a. 結合位置數量
製備例 | 製備比較例 | |||
1 | 2 | 3 | 1 | |
固態載體 | 實施例3 | 實施例4 | 實施例5 | 比較例1 |
粗產量(單位:ng/μL) | 131 | 70 | 107 | 185 |
將所製備的固態載體以濃度為3%的三氯醋酸(trichloroacetic acid,TCA)浸泡1分鐘,以使三氯醋酸將化合物上的二甲氧基三苯甲基降解,並露出可以與核酸前驅物鍵結的位置(即,結合位置)。接著,藉由測量溶液中二甲氧基三苯甲基的濃度,以推算結合位置的當量數。
b. 回收量、回收率
將上述測完二甲氧基三苯甲基濃度的固態載體(即,鍵結有經降解的化合物之固態載體)置於二甲氧基三苯甲基氯與吡啶形成的溶液中(DMT-Cl/Pyridine),以使化合物重新接回保護基。24小時後,再將其以濃度為3%的三氯醋酸(trichloroacetic acid,TCA)浸泡1分鐘,以使三氯醋酸將化合物上的二甲氧基三苯甲基降解,並露出可以與核酸前驅物鍵結的位置(即,結合位置)。接著,藉由測量溶液中二甲氧基三苯甲基的濃度,以推算結合位置的當量數,即可得到回收量。並可藉由回收量與結合位置數量,經計算而得到回收率。
c. 粗產量
將核酸樣品以紫外光吸光儀器進行分析:濃度值(單位:ng/μL) = 以(A
260讀值 – A
320讀值) × 稀釋倍率 × 33 ng/μL (單鏈核酸濃度定值) × 樣品體積,即可得到粗產量值。
< 評價結果 >
由表2及表3可知,具有特定結構的化合物所製備的固態載體(實施例1~12)具有良好的結合位置數量、回收量及回收率,而可重複使用且適用於製備核酸。相對於此,不包括特定結構的化合物的固態載體(比較例1)的結合位置數量不佳且無法回收,即無法重複使用。
此外,在使用相同管柱的情況下,相較於化合物2或化合物6所製備的固態載體(實施例3、6、8、11),化合物1、化合物4或化合物5所製備的固態載體(實施例1~2、4~5、7、9~10、12)具有較佳的結合位置數量。由此可知,當化合物具有式(1)表示的結構且Z為伸烷基、*-COO-*或其組合時,由化合物製備的固態載體可具有較佳的結合位置數量;特別是,伸烷基為碳數為2~5的伸烷基。當化合物具有式(2)表示的結構且Z
1為*-COO-*、m為2至5的整數以及n為0時,由化合物製備的固態載體可具有較佳的結合位置數量。
此外,由表4可知,具有特定結構的化合物所製備的固態載體用於製備核酸(製備例1~3)時,其可得到良好的核酸粗產量。由表3及表4可知,相較於不具有特定結構的化合物所製備的固態載體用於製備核酸(製備比較例1),具有特定結構的化合物所製備的固態載體用於製備核酸時可得到良好的核酸粗產量且固態載體可經回收而重複使用。
綜上所述,本發明藉由在基板的表面上鍵結具有式(1)表示的結構的化合物,使化合物可與基板表面的連接分子形成醯胺鍵或尿素官能基,以使包括特定結構化合物的固態載體具有較佳的結合位置數量,使其適用於製備核酸。此外,包括特定結構化合物的固態載體可在製備核酸後回收再使用,故具有可重複使用的特性,而有助於降低製備核酸的成本。
雖然本發明已以實施例揭露如上,然其並非用以限定本發明,任何所屬技術領域中具有通常知識者,在不脫離本發明的精神和範圍內,當可作些許的更動與潤飾,故本發明的保護範圍當視後附的申請專利範圍所界定者為準。
無
無。
無。
Claims (10)
- 一種化合物,具有下述式(1)表示的結構: 式(1), 式(1)中,Y 1表示氫或乙醯基; Y 2表示氫、*-COOH、*-NH 2或*-NCO; Z表示二價有機基團,且 *表示鍵結位置。
- 如請求項1所述的化合物,其中Z包括伸烷基、*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,*表示鍵結位置。
- 如請求項1所述的化合物,其中式(1)包括下述式(2)表示的結構: 式(2), 式(2)中,Y 1表示氫或乙醯基; Y 2表示氫、*-COOH、*-NH 2或*-NCO; Z 1表示二價有機基團; m表示0至8的整數; n表示0至6的整數,且 *表示鍵結位置。
- 如請求項3所述的化合物,其中Z 1包括*-COO-*、伸芳基、*-HNCO-*、*-NHCONH-*、伸雜環烷基、伸雜芳基或其組合,*表示鍵結位置。
- 一種固態載體,包括如請求項1至4中任一項所述的化合物。
- 如請求項5所述的固態載體,更包括表面有連接分子的基板,所述化合物與所述連接分子鍵結。
- 如請求項6所述的固態載體,其中所述連接分子的末端官能基包括胺基或羧基,且所述末端官能基與所述化合物鍵結。
- 如請求項6或7所述的固態載體,其中所述化合物與所述連接分子之間形成醯胺鍵或尿素官能基。
- 一種製備核酸的方法,包括使用請求項5至8中任一項所述的固態載體。
- 如請求項9所述的製備核酸的方法,其中所述固態載體為可重複使用的固態載體。
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