TW202317753A - 經武裝之嵌合受體及其使用方法 - Google Patents
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Abstract
本文闡述免疫反應性細胞,其經工程改造以表現細胞介素、嵌合受體及合成轉錄因子系統。本文亦闡述核酸、細胞及關於其之方法。
Description
基於細胞之治療平臺為治療各種疾病提供有前景之途徑。一種此類有前景之平臺係基於CAR-T之治療癌症之療法。鑑於其前景,需要改良基於細胞之療法。一個活躍的探索領域係工程改造基於細胞之療法以產生及/或分泌效應分子,諸如細胞介素,該過程被稱為裝甲(armoring),其增強基於細胞之療法。舉例而言,未裝甲之CAR-T療法在實體瘤中功效不佳,且裝甲可影響整個癌症免疫週期並增強CAR-T之活性。然而,不受控制或不受調控之裝甲策略可對治療產生負面影響,諸如個體之脫靶效應及毒性。因此,需要控制及調控基於細胞之療法之裝甲(諸如調控酬載(payload)效應分子之產生及/或分泌)之額外方法。
在一些實施例中,本文提供基於細胞之療法平臺,其涉及基於細胞之療法之受調控裝甲,諸如酬載效應分子之受調控分泌。在一些實施例中,本文亦提供基於細胞之組合免疫療法,其涉及用於靶向治療癌症(諸如卵巢癌、乳癌、結腸癌、肺癌及胰臟癌)之受調控裝甲。
然而,本文所提供之療法可限制裝甲之全身毒性。舉例而言,本文所提供之免疫療法可為腫瘤特異性的及有效的,同時限制全身毒性及/或由於裝甲引起之其他脫靶效應。該等療法以受調控之方式(包括分泌動力學、細胞狀態特異性及細胞或組織特異性之調控)遞送所關注蛋白,諸如免疫調節效應分子。將遞送媒劑之設計最佳化以改良基於細胞之療法(諸如癌症療法)之總體功能,包括但不限於免疫調節效應分子之膜切割位點、啟動子、連接體、信號肽、遞送方法、組合、調控及順序之最佳化。
本揭示案所涵蓋之效應分子之非限制性實例包括細胞介素、抗體、趨化介素、核苷酸、肽、酶及溶瘤病毒。舉例而言,細胞可經工程改造以受調控之方式表現及分泌以下效應分子中之至少一種、兩種、三種或更多種:IL-12、IL-16、IFN-β、IFN-γ、IL-2、IL-15、IL-7、IL-36γ、IL-18、IL-1β、IL-21、OX40-配位體、CD40L、抗PD-1抗體、抗PD-L1抗體、抗CTLA-4抗體、抗TGFβ抗體、抗TNFR2、MIP1α (CCL3)、MIP1β (CCL5)、CCL21、CpG寡去氧核苷酸及抗腫瘤肽(例如,具有抗腫瘤活性之抗微生物肽,參見例如Gaspar, D.等人
Front Microbiol. 2013; 4: 294;Chu, H.等人PLoS One. 2015; 10(5): e0126390及website:aps.unmc.edu/AP/main.php)。
本文提供免疫反應性細胞,其包含:(a)第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包含第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列,及第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,該第二經工程改造之核酸包含第三表現盒,該第三表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及第四表現盒,該第四表現盒包含第四啟動子,該第四啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第三外源性多核苷酸序列之表現,其中第一外源性多核苷酸序列及第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S,其中S包含可分泌效應分子,該可分泌效應分子包含該第一及/或第二細胞介素,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈(tethering)結構域,且其中
S - C - MT或
MT - C - C經構形以表現為單一多肽。
在一些態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼IL15之第一外源性多核苷酸序列,及第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,其中第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,其中S包含包括IL15之可分泌效應分子,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在另一態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼IL12p70融合蛋白之第一外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第二外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第一外源性多核苷酸序列之表現,其中第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,
其中S包含包括IL12p70融合蛋白之可分泌效應分子,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在一些態樣中,第一表現盒經構形以相對於第二表現盒之轉錄以相反定向轉錄。在一些態樣中,第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。在一些態樣中,第一表現盒經構形以相對於第二表現盒之轉錄以相同定向轉錄。在一些態樣中,第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向。
在另一態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:(a)第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包含第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼第一細胞介素之第二外源性多核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,該第二經工程改造之核酸包含第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第三外源性多核苷酸序列之表現,其中第二外源性多核苷酸序列及第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,其中S包含可分泌效應分子,該可分泌效應分子包含該第一及/或第二細胞介素,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。在一些態樣中,第二表現盒之轉錄在第一經工程改造之核酸內相對於第三表現盒之轉錄以相反方向定向。在一些態樣中,第二表現盒及第三表現盒在第二經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
在一些態樣中,第一啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。在一些態樣中,第一啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
在一些態樣中,第二啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。在一些態樣中,第二啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
在一些態樣中,第三表現盒經構形以在第二經工程改造之核酸內相對於第四表現盒之轉錄以相反方向轉錄。在一些態樣中,第三表現盒及第四表現盒在第二經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。在一些態樣中,第三表現盒及第四表現盒在第二經工程改造之核酸內以尾對尾方向性定向。
在一些態樣中,第四啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。在一些態樣中,第四啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
本文亦提供免疫反應性細胞,其包含:第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包含第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列及編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列;及第二經工程改造之核酸,該第二經工程改造之核酸包含第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第三外源性多核苷酸序列之表現,其中ACP包含合成轉錄因子,其中第一外源性多核苷酸序列及第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S,其中S包含可分泌效應分子,該可分泌效應分子包含該第一及/或第二細胞介素,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在一些態樣中,第一表現盒之轉錄在第一經工程改造之核酸內相對於第二表現盒之轉錄以相反方向定向。在一些態樣中,第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。在一些態樣中,第一表現盒經構形以相對於第二表現盒之轉錄以相同定向轉錄。在一些態樣中,第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向。
在一些態樣中,第一啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。在一些態樣中,第一啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
在一些態樣中,第一外源性多核苷酸序列及第二外源性多核苷酸序列係由連接體多核苷酸序列隔開。在一些態樣中,連接體多核苷酸序列與作為單獨多肽之第一細胞介素及CAR之轉譯可操作地締合。在一些態樣中,連接體多核苷酸序列編碼一或多個2A核糖體跳躍元件(skipping element)。在一些態樣中,一或多個2A核糖體跳躍元件各自選自由以下組成之群:P2A、T2A、E2A及F2A。在一些態樣中,一或多個2A核糖體跳躍元件包含E2A/T2A。在一些實施例中,E2A/T2A包含SEQ ID NO: 281之胺基酸序列。在一些態樣中,連接體多核苷酸序列編碼內部核糖體進入位點(IRES)。在一些態樣中,連接體多核苷酸序列編碼可切割多肽。在一些態樣中,可切割多肽包含弗林蛋白酶(furin)多肽序列。
在一些態樣中,第三啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。在一些態樣中,第三啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
在一些態樣中,第一細胞介素係IL-15。在一些實施例中,IL-15包含SEQ ID NO: 285之胺基酸序列。
在一些態樣中,第二細胞介素係選自由以下組成之群:IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些態樣中,第二細胞介素係IL12p70融合蛋白。在一些實施例中,IL12p70融合蛋白包含SEQ ID NO: 293之胺基酸序列。
在一些態樣中,第一細胞介素係IL12或IL12p70融合蛋白。在一些態樣中,第二細胞介素係選自由以下組成之群:IL15、IL18及IL21。
在一些態樣中,蛋白酶切割位點係選自由以下組成之群:1型跨膜蛋白酶切割位點、II型跨膜蛋白酶切割位點、GPI錨定蛋白酶切割位點、ADAM8蛋白酶切割位點、ADAM9蛋白酶切割位點、ADAM10蛋白酶切割位點、ADAM12蛋白酶切割位點、ADAM15蛋白酶切割位點、ADAM17蛋白酶切割位點、ADAM19蛋白酶切割位點、ADAM20蛋白酶切割位點、ADAM21蛋白酶切割位點、ADAM28蛋白酶切割位點、ADAM30蛋白酶切割位點、ADAM33蛋白酶切割位點、BACE1蛋白酶切割位點、BACE2蛋白酶切割位點、SIP蛋白酶切割位點、MT1-MMP蛋白酶切割位點、MT3-MMP蛋白酶切割位點、MT5-MMP蛋白酶切割位點、弗林蛋白酶切割位點、PCSK7蛋白酶切割位點、蛋白裂解酶(matriptase)蛋白酶切割位點、蛋白裂解酶-2蛋白酶切割位點、MMP9蛋白酶切割位點及NS3蛋白酶切割位點。在一些態樣中,蛋白酶切割位點可由選自由以下組成之群之蛋白酶切割:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶、MMP9蛋白酶及NS3蛋白酶。
在一些態樣中,蛋白酶切割位點可由ADAM17蛋白酶切割。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含具有PRAE (SEQ ID NO: 176)之胺基酸序列之第一區。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含具有KGG (SEQ ID NO: 177)之胺基酸序列之第二區。在一些態樣中,第一區定位於第二區之N末端。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEX1X2KGG (SEQ ID NO: 178)之胺基酸序列,其中X1係A、Y、P、S或F,且其中X2係V、L、S、I、Y、T或A。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEAVKGG (SEQ ID NO: 179)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEALKGG (SEQ ID NO: 180)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEYSKGG (SEQ ID NO: 181)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEPIKGG (SEQ ID NO: 182)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEAYKGG (SEQ ID NO: 183)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAESSKGG (SEQ ID NO: 184)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEFTKGG (SEQ ID NO: 185)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PRAEAAKGG (SEQ ID NO: 186)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含DEPHYSQRR (SEQ ID NO: 187)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PPLGPIFNPG (SEQ ID NO: 188)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含PLAQAYRSS (SEQ ID NO: 189)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含TPIDSSFNPD (SEQ ID NO: 190)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含VTPEPIFSLI (SEQ ID NO: 191)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含ITQGLAVSTISSFF (SEQ ID NO: 198)之胺基酸序列。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含在肽連接體內。在一些態樣中,蛋白酶切割位點在肽連接體之N末端。在一些實施例中,肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體。
在一些態樣中,細胞膜系鏈結構域包含跨膜-細胞內結構域或跨膜結構域。在一些態樣中,跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自PDGFR-β、CD8、CD28、CD3ζ鏈、CD4、4-1BB、OX40、ICOS、CTLA-4、PD-1、LAG-3、2B4、LNGFR、NKG2D、EpoR、TNFR2、B7-1或BTLA。在一些態樣中,跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自B7-1。在一些實施例中,跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域包含SEQ ID NO: 219之胺基酸序列。在一些態樣中,細胞膜系鏈結構域包含細胞表面受體或其細胞膜結合部分。
在一些態樣中,細胞膜系鏈結構域包含轉譯後修飾標籤、或能夠進行轉譯後修飾以修飾嵌合蛋白以包括轉譯後修飾標籤之模體,其中該轉譯後修飾標籤能夠與細胞膜締合。在一些態樣中,轉譯後修飾標籤包含脂質錨結構域,視情況其中脂質錨結構域係選自由以下組成之群:GPI脂質錨、肉豆蔻醯化標籤及棕櫚醯化標籤。
在一些態樣中,當在細胞中表現時,可分泌效應分子(例如,本文所述之任何細胞介素)系鏈至該細胞之細胞膜。在一些態樣中,當在表現能夠切割蛋白酶切割位點之蛋白酶的細胞中表現時,可分泌效應分子自細胞膜釋放。在一些態樣中,蛋白酶在細胞之細胞膜上表現。
在一些態樣中,在細胞膜上表現之蛋白酶對於細胞而言係內源性的。在一些態樣中,蛋白酶係選自由以下組成之群:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶及MMP9蛋白酶。在一些態樣中,蛋白酶係ADAM17蛋白酶。
在一些態樣中,在細胞膜上表現之蛋白酶對於細胞而言係異源性的。在一些態樣中,蛋白酶係C型肝炎病毒(HCV)非結構蛋白3 (NS3)。在一些態樣中,蛋白酶切割位點包含NS3蛋白酶切割位點。在一些態樣中,NS3蛋白酶切割位點包含NS3/NS4A、NS4A/NS4B、NS4B/NS5A或NS5A/NS5B接合部切割位點。在一些態樣中,蛋白酶可被蛋白酶抑制劑阻遏。在一些態樣中,蛋白酶抑制劑係選自由以下組成之群:西美瑞韋(simeprevir)、達諾瑞韋(danoprevir)、阿舒瑞韋(asunaprevir)、西魯瑞韋(ciluprevir)、波普瑞韋(boceprevir)、索伐瑞韋(sovaprevir)、帕利瑞韋(paritaprevir)、替拉瑞韋(telaprevir)、格拉瑞韋(grazoprevir)、格卡瑞韋(glecaprevir)及伏西瑞韋(voxiloprevir)。在一些態樣中,蛋白酶之表現及/或定位能夠調控。在一些態樣中,表現及/或定位受細胞之細胞狀態調控。
在一些態樣中,第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。在一些態樣中,第一外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。在一些態樣中,第二外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。在一些態樣中,第二外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。在一些態樣中,分泌信號肽源自選自由以下組成之群之蛋白:IL-12、胰蛋白酶原-2、高斯螢光素酶(Gaussia Luciferase)、CD5、IgKVII、VSV-G、泌乳素、血清白蛋白前蛋白原、天青殺素前蛋白原、骨結合素(BM40)、CD33、IL-6、IL-8、CCL2、TIMP2、VEGFB、骨保護素、絲胺酸蛋白酶抑制劑-E1、GROα、CXCL12、IL-21、CD8、GMCSFRa、NKG2D及IgE。在一些態樣中,分泌信號肽源自GMCSFRa。在一些態樣中,分泌信號肽包含SEQ ID NO: 216之胺基酸序列。在一些態樣中,其中分泌信號肽源自IgE。在一些實施例中,分泌信號肽包含SEQ ID NO: 218之胺基酸序列。在一些態樣中,第三外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。在一些態樣中,分泌信號肽與第二細胞介素可操作地締合。在一些態樣中,分泌信號肽對於第二細胞介素而言係天然的。在一些態樣中,分泌信號肽對於第二細胞介素而言係非天然的。
在一些態樣中,第三外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。在一些態樣中,第一表現盒進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。在一些態樣中,分泌信號肽與第一細胞介素可操作地締合。在一些態樣中,分泌信號肽對於第一細胞介素而言係天然的。在一些態樣中,分泌信號肽對於第一細胞介素而言係非天然的。
在一些態樣中,第一外源性多核苷酸序列編碼第一膜可切割嵌合蛋白,且第三外源性多核苷酸序列編碼第二膜可切割嵌合蛋白。在一些態樣中,第二外源性多核苷酸序列編碼第一膜可切割嵌合蛋白,且第三外源性多核苷酸序列編碼第二膜可切割嵌合蛋白。
在一些態樣中,經工程改造之核酸係選自由以下組成之群之單鏈或雙鏈核酸:DNA、cDNA、RNA、mRNA及裸質體。
在一些態樣中,由表現盒編碼之外源性多核苷酸序列進一步包含3’非轉譯區(UTR),該UTR包含可操作地連接至外源性多核苷酸序列之mRNA去穩定元件。在一些態樣中,mRNA去穩定元件包含富含AU之元件及/或莖-環去穩定元件(SLDE)。在一些態樣中,mRNA去穩定元件包含富含AU之元件。在一些態樣中,富含AU之元件包括序列ATTTA (SEQ ID NO: 209)之至少兩個重疊模體。在一些態樣中,富含AU之元件包含ATTTATTTATTTATTTATTTA (SEQ ID NO: 210)。在一些態樣中,mRNA去穩定元件包含莖-環去穩定元件(SLDE)。在一些態樣中,SLDE包含CTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 211)。在一些態樣中,mRNA去穩定元件包含至少一個富含AU之元件及至少一個SLDE。在一些態樣中,AuSLDE序列包含ATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 212)。在一些態樣中,mRNA去穩定元件包含2X AuSLDE。在一些態樣中,2X AuSLDE序列提供為ATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAGtgcggtaagcATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 213)。
在一些態樣中,CAR包含抗原結合結構域,該抗原結合結構域包含重鏈可變(VH)區及輕鏈可變(VL)區,其中VH包含:具有KNAMN (SEQ ID NO: 199)之胺基酸序列之重鏈互補決定區1 (CDR-H1)、具有RIRNKTNNYATYYADSVKA (SEQ ID NO: 200)之胺基酸序列之重鏈互補決定區2 (CDR-H2)及具有GNSFAY (SEQ ID NO: 201)之胺基酸序列之重鏈互補決定區3 (CDR-H3),且其中VL包含:具有KSSQSLLYSSNQKNYLA (SEQ ID NO: 202)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區1 (CDR-L1)、具有WASSRES (SEQ ID NO: 203)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區2 (CDR-L2)及具有QQYYNYPLT (SEQ ID NO: 204)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區3 (CDR-L3)。
在一些態樣中,VH區包含與EVQLVETGGGMVQPEGSLKLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVARIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSQSMLYLQMNNLKIEDTAMYYCVAGNSFA YWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 205)或EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 206)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。在一些實施例中,VH區包含與SEQ ID NO: 206之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
在一些態樣中,VL區包含與DIVMSQSPSSLVVSIGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASSRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYNYPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 207)或DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 208)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。在一些實施例中,VL區包含與SEQ ID NO: 2NO: 208之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
在一些態樣中,抗原結合結構域包含單鏈可變片段(scFv)。在一些態樣中,VH及VL係由肽連接體隔開。在一些態樣中,scFv包含結構VH-L-VL或VL-L-VH,其中VH係重鏈可變結構域,L係肽連接體,且VL係輕鏈可變結構域。在一些態樣中,肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體。在一些實施例中,GS連接體包含(GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223)之胺基酸序列。
在一些態樣中,CAR包含一或多個細胞內傳訊結構域,且該一或多個細胞內傳訊結構域中之每一者係選自由以下組成之群:CD3ζ鏈細胞內傳訊結構域、CD97細胞內傳訊結構域、CD11a-CD18細胞內傳訊結構域、CD2細胞內傳訊結構域、ICOS細胞內傳訊結構域、CD27細胞內傳訊結構域、CD154細胞內傳訊結構域、CD8細胞內傳訊結構域、OX40細胞內傳訊結構域、4-1BB細胞內傳訊結構域、CD28細胞內傳訊結構域、ZAP40細胞內傳訊結構域、CD30細胞內傳訊結構域、GITR細胞內傳訊結構域、HVEM細胞內傳訊結構域、DAP10細胞內傳訊結構域、DAP12細胞內傳訊結構域、MyD88細胞內傳訊結構域、2B4細胞內傳訊結構域、CD16a細胞內傳訊結構域、DNAM-1細胞內傳訊結構域、KIR2DS1細胞內傳訊結構域、KIR3DS1細胞內傳訊結構域、NKp44細胞內傳訊結構域、NKp46細胞內傳訊結構域、FceRlg細胞內傳訊結構域、NKG2D細胞內傳訊結構域及EAT-2細胞內傳訊結構域。在一些態樣中,一或多個細胞內傳訊結構域包含OX40細胞內傳訊結構域。在一些態樣中,OX40細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 269之胺基酸序列。在一些態樣中,一或多個細胞內傳訊結構域包含CD28細胞內傳訊結構域。在一些態樣中,CD28細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 267之胺基酸序列。在一些態樣中,一或多個細胞內傳訊結構域包含CD3z細胞內傳訊結構域。在一些態樣中,CD3z細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 277或SEQ ID NO: 279之胺基酸序列。
在一些態樣中,CAR包含跨膜結構域,且該跨膜結構域係選自由以下組成之群:CD8跨膜結構域、CD28跨膜結構域、CD3ζ鏈跨膜結構域、CD4跨膜結構域、4-1BB跨膜結構域、OX40跨膜結構域、ICOS跨膜結構域、CTLA-4跨膜結構域、PD-1跨膜結構域、LAG-3跨膜結構域、2B4跨膜結構域、BTLA跨膜結構域、OX40跨膜結構域、DAP10跨膜結構域、DAP12跨膜結構域、CD16a跨膜結構域、DNAM-1跨膜結構域、KIR2DS1跨膜結構域、KIR3DS1跨膜結構域、NKp44跨膜結構域、NKp46跨膜結構域、FceRlg跨膜結構域及NKG2D跨膜結構域。在一些態樣中,跨膜結構域係OX40跨膜結構域。在一些態樣中,OX40跨膜結構域包含SEQ ID NO: 244之胺基酸序列。在一些態樣中,跨膜結構域係CD8跨膜結構域。在一些態樣中,CD8跨膜結構域包含SEQ ID NO: 236或SEQ ID NO: 242之胺基酸序列。
在一些態樣中,CAR包含介於抗原結合結構域與跨膜結構域之間之間隔區。在一些態樣中,間隔區源自選自由以下組成之群之蛋白:CD8、CD28、IgG4、IgG1、LNGFR、PDGFR-β及MAG。在一些態樣中,間隔區係CD8鉸鏈。在一些態樣中,CD8鉸鏈包含SEQ ID NO: 226或SEQ ID NO: 228之胺基酸序列。
在一些態樣中,ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域。在一些態樣中,轉錄效應物結構域包含轉錄活化劑結構域。在一些態樣中,轉錄活化劑結構域係選自由以下組成之群:單純疱疹病毒蛋白16 (VP16)活化結構域;包含VP16之四個串聯拷貝之活化結構域,即VP64活化結構域;NFκB之p65活化結構域;艾司坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus) R反式活化劑(Rta)活化結構域;包含VP64、p65及Rta活化結構域(VPR活化結構域)之三重活化劑;人類E1A相關蛋白p300之組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)核心結構域(p300 HAT核心活化結構域)。在一些態樣中,轉錄活化劑結構域包含VPR活化結構域。在一些態樣中,VPR活化結構域包含SEQ ID NO: 325之胺基酸序列。在一些態樣中,轉錄效應物結構域包含轉錄阻遏物結構域。在一些態樣中,轉錄阻遏物結構域係選自由以下組成之群:Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;截短之Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;阻遏物元件沈默轉錄因子(REST)阻遏結構域;毛狀相關鹼性螺旋-環-螺旋阻遏蛋白(hairy-related basic helix-loop-helix repressor protein)之WRPW模體(SEQ ID NO: 346),該模體稱為WRPW阻遏結構域(SEQ ID NO: 346);DNA (胞嘧啶-5)-甲基轉移酶3B (DNMT3B)阻遏結構域;及HP1α色影(chromoshadow)阻遏結構域。
在一些態樣中,DNA結合結構域包含鋅指(ZF)蛋白結構域。在一些態樣中,ZF蛋白結構域在設計上係模組化的且包含鋅指模體陣列。在一些態樣中,ZF蛋白結構域包含1至10個鋅指模體之陣列。在一些態樣中,ZF蛋白結構域包含SEQ ID NO: 320之胺基酸序列。
在一些態樣中,ACP進一步包含阻遏性蛋白酶及阻遏性蛋白酶之一或多個同源切割位點。在一些態樣中,阻遏性蛋白酶係C型肝炎病毒(HCV)非結構蛋白3 (NS3)。在一些態樣中,NS3蛋白酶包含SEQ ID NO: 321之胺基酸序列。在一些態樣中,可阻遏蛋白酶之同源切割位點包含NS3蛋白酶切割位點。在一些態樣中,NS3蛋白酶切割位點包含NS3/NS4A、NS4A/NS4B、NS4B/NS5A或NS5A/NS5B接合部切割位點。在一些態樣中,NS3蛋白酶可被蛋白酶抑制劑阻遏。在一些態樣中,蛋白酶抑制劑係選自由以下組成之群:西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋、格卡瑞韋及伏西瑞韋。在一些態樣中,蛋白酶抑制劑係格拉瑞韋(GRZ)。在一些態樣中,ACP進一步包含核定位信號(NLS)。在一些態樣中,NLS包含SEQ ID NO: 296之胺基酸序列。在一些態樣中,阻遏性蛋白酶之一或多個同源切割位點定位於DNA結合結構域與轉錄效應物結構域之間。
在一些態樣中,ACP進一步包含雌激素受體變異體ERT2之激素結合結構域。
在一些態樣中,ACP反應性啟動子係合成啟動子。在一些態樣中,ACP反應性啟動子包含ACP結合結構域序列及最小啟動子序列。在一些態樣中,ACP結合結構域序列包含一或多個鋅指結合位點。
在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第二經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,第二經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
在另一態樣中,本文提供免疫反應性細胞,其包含:(a)包含SEQ ID NO: 310之核苷酸序列的第一經工程改造之核酸;及(b)包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列的第二經工程改造之核酸。
在另一態樣中,本文提供免疫反應性細胞,其包含:(a)包含SEQ ID NO: 327之核苷酸序列的第一經工程改造之核酸;及(b)包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列的第二經工程改造之核酸。在一些態樣中,細胞係選自由以下組成之群:T細胞、CD8+T細胞、CD4+T細胞、γ-δT細胞、細胞毒性T淋巴球(CTL)、調控性T細胞、病毒特異性T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、自然殺手(NK)細胞、B細胞、腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)、先天性淋巴樣細胞、肥大細胞、嗜酸性球、嗜鹼性球、嗜中性球、骨髓細胞、巨噬細胞、單核球、樹突細胞、紅血球、血小板細胞、人類胚胎幹細胞(ESC)、ESC源細胞、多潛能幹細胞、間質基質細胞(MSC)、誘導性多潛能幹細胞(iPSC)及iPSC源細胞。在一些態樣中,細胞係自然殺手(NK)細胞。在一些態樣中,細胞係自體的。在一些態樣中,細胞係同種異體的。
在一些態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼IL15之第一外源性多核苷酸序列,及第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,其中第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,其中S包含包括IL15之可分泌效應分子,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在一些態樣中,
a. 第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向,
b. 第一外源性多核苷酸序列及第二外源性多核苷酸序列係由包含E2A/T2A核糖體跳躍元件之連接體多核苷酸序列隔開,且
c. 結合至GPC3之CAR包含CD28細胞內傳訊結構域或OX40細胞內傳訊結構域。
在另一態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼IL15之第二外源性多核苷酸序列,其中第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,其中S包含包括IL15之可分泌效應分子,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。在一些態樣中,a. 第一外源性多核苷酸序列及第二外源性多核苷酸序列係由包含E2A/T2A核糖體跳躍元件之連接體多核苷酸序列隔開,且b. 結合至GPC3之CAR包含CD28細胞內傳訊結構域或OX40細胞內傳訊結構域。
在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
在另一態樣中,本文提供包含SEQ ID NO: 310之核苷酸序列的經工程改造之核酸。
在另一態樣中,本文提供包含SEQ ID NO: 327之核苷酸序列的經工程改造之核酸。
在另一態樣中,本文提供經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼IL12p70融合蛋白之第一外源性多核苷酸序列,及第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第二外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第一外源性多核苷酸序列之表現,其中第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:S - C - MT或MT - C - S,其中
S包含包括IL12p70融合蛋白之可分泌效應分子,C包含蛋白酶切割位點,且MT包含細胞膜系鏈結構域,且其中S - C - MT或MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在一些態樣中,
a. 第一表現盒及第二表現盒在第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向,且
b. ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中轉錄活化劑結構域包含VPR活化結構域。
在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。在一些態樣中,經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
在另一態樣中,本文提供包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列的經工程改造之核酸。
在另一態樣中,本文提供包含本文所述任一種經工程改造之核酸之表現載體。
在一些態樣中,本文提供包含以上態樣中任一者之經工程改造之核酸或表現載體的免疫反應性細胞。
本文亦提供醫藥組成物,該醫藥組成物包含本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸及/或本文所述之任一種表現載體以及醫藥學上可接受之載劑、醫藥學上可接受之賦形劑或其組合。
本文亦提供治療有需要之個體之方法,該方法包括投與治療有效劑量的本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸、本文所述之任一種表現載體及/或本文所述之醫藥組成物。
本文亦提供在個體中刺激細胞介導的對腫瘤細胞之免疫反應之方法,該方法包括向患有腫瘤之個體投與治療有效劑量的本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸、本文所述之任一種表現載體及/或本文所述之醫藥組成物。
本文亦提供降低個體之腫瘤體積之方法,該方法包括向患有腫瘤之個體投與包含本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸、本文所述之任一種表現載體及/或本文所述之醫藥組成物之組成物。
本文亦提供在個體中提供抗腫瘤免疫之方法,該方法包括向有需要之個體投與治療有效劑量的本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸、本文所述之任一種表現載體及/或本文所述之醫藥組成物。
在一些態樣中,腫瘤包含表現GPC3之腫瘤。在一些態樣中,腫瘤係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤(Wilms tumor))及卵黃囊瘤。
一種治療患有癌症之個體之方法,該方法包括投與治療有效劑量的本文所述之任何免疫反應性細胞、本文所述之任一種經工程改造之核酸、本文所述之任一種表現載體及/或本文所述之醫藥組成物。在一些態樣中,癌症包含表現GPC3之癌症。在一些態樣中,癌症係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤)及卵黃囊瘤。
在一些態樣中,投與包含全身投與。在一些態樣中,投與包含腫瘤內投與。在一些態樣中,免疫反應性細胞源自個體。在一些態樣中,免疫反應性細胞就個體而言係同種異體的。
交叉引用
本申請案主張於2021年6月16日提出申請之美國臨時專利申請案第63/211,468號及於2022年1月31日提出申請之美國臨時專利申請案第63/305,155號的權益,該等美國臨時專利申請案皆出於所有目的特此以全文引用之方式併入。
序列表引用
本申請案含有電腦可讀形式之序列表。該電腦可讀形式以引用方式併入本文。該ASCII複本創建於2022年8月12日,命名為STB-029WO_SL.txt且大小為406,236位元組。
本文提供免疫反應性細胞。
在第一種情況下,免疫反應性細胞經工程改造以具有以下核酸:
(a) 第一經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列,及第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列;及
(b) 第二經工程改造之核酸,其包含:
第三表現盒,該第三表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及第四表現盒,該第四表現盒包含第四啟動子,該第四啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第三外源性多核苷酸序列之表現,
其中第一外源性多核苷酸序列及第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S,其經構形以表現為單一多肽。
在第二種情況下,免疫反應性細胞經工程改造以具有以下核酸:
(a) 第一經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列及編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列;及
(b) 第二經工程改造之核酸,其包含:
第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導第三外源性多核苷酸序列之表現,其中ACP包含合成轉錄因子,
其中第一外源性多核苷酸序列及第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S,其經構形以表現為單一多肽。
S係指可分泌效應分子。C係指蛋白酶切割位點。MT係指細胞膜系鏈結構域。
免疫反應性細胞之ACP包括合成轉錄因子。合成轉錄因子係包括DNA結合結構域及轉錄效應物結構域的非天然存在之蛋白,且能夠藉助結合至由DNA結合結構域識別之同源啟動子(ACP反應性啟動子)來調節(亦即,活化或阻遏)轉錄。在一些實施例中,ACP係轉錄阻遏物。在一些實施例中,ACP係轉錄活化劑。
膜可切割嵌合蛋白經工程改造,使得效應分子之分泌可以蛋白酶依賴性方式來調控。特定而言,膜可切割嵌合蛋白經工程改造,使得效應分子之分泌可作為「膜可切割」系統之一部分來調控,其中蛋白酶切割位點(「C」)及細胞膜系鏈結構域(「MT」)之併入容許以蛋白酶依賴性方式調控效應分子之分泌。不希望受理論束縛,存在於膜可切割嵌合蛋白中之膜可切割系統之組分一般藉助以下細胞過程來調控分泌:
- MT:細胞膜系鏈結構域含有跨膜結構域(或跨膜-細胞內結構域),該跨膜結構域引導嵌合蛋白之細胞轉運,使得該蛋白插入細胞膜中或以其他方式與細胞膜締合(「系鏈」)
- C:在嵌合蛋白表現並定位至細胞膜中後,蛋白酶切割位點引導嵌合蛋白之切割,使得效應分子釋放(「分泌」)至細胞外空間中。一般地,蛋白酶切割位點係蛋白酶特異性的,包括經工程改造成蛋白酶特異性之位點。可對蛋白酶切割位點加以選擇或工程改造以達成最佳蛋白表現、細胞類型特異性切割、細胞狀態特異性切割及/或酬載以期望動力學(例如,膜結合嵌合蛋白水準與經分泌嵌合蛋白水準之比率)之切割及釋放
在一些態樣中,本文提供具有所關注蛋白(例如,本文所述之任何效應分子)、蛋白酶切割位點及細胞膜系鏈結構域之膜可切割嵌合蛋白(或編碼膜可切割嵌合蛋白之經工程改造之核酸)。
「效應分子」係指結合至另一分子並調節其所結合之該分子之生物活性的分子(例如,核酸,諸如DNA或RNA,或蛋白(多肽)或肽)。舉例而言,效應分子可用作配位體以增加或減少酶活性、基因表現或細胞傳訊。因此,在一些實施例中,效應分子調節(活化或抑制)不同免疫調節機制。藉由直接結合並調節分子,效應分子亦可間接調節第二下游分子。
一般而言,對於本文所述之所有膜可切割嵌合蛋白而言,效應分子係細胞介素或其活性片段(可分泌效應分子在式
S - C - MT或
MT - C - S中稱為「S」),其包括細胞介素或其活性片段。
術語「調節」涵蓋生物活性之維持、生物活性之抑制(部分或完全)及生物活性之刺激/活化(部分或完全)。該術語亦涵蓋降低或增加(例如,增強)生物活性。當一種效應分子調節的腫瘤介導之免疫抑制機制(例如,刺激T細胞傳訊)不同於由另一效應分子調節的腫瘤介導之免疫抑制機制(例如,刺激抗原呈現及/或加工)時,認為該兩種不同的效應分子「調節不同的腫瘤介導之免疫抑制機制」。
藉由效應分子之調節可為直接或間接的。當效應分子結合至另一分子並調節該分子之活性時,發生直接調節。當效應分子結合至另一分子,調節該分子之活性,且作為該調節之結果,再一分子(效應分子未與之結合)之活性受到調節時,發生間接調節。
在一些實施例中,至少一種效應分子對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應(例如,全身性地或在腫瘤微環境中)增加至少10% (例如,10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%或200%)。舉例而言,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節可導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應增加至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少100%。在一些實施例中,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應增加10-20%、10-30%、10-40%、10-50%、10-60%、10-70%、10-80%、10-90%、10-100%、10-200%、20-30%、20-40%、20-50%、20-60%、20-70%、20-80%、20-90%、20-100%、20-200%、50-60%、50-70%、50-80%、50-90%、50-100%或50-200%。應當理解,免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應例如全身性地或在腫瘤微環境中之「增加」係相對於在不存在一或多種效應分子之情況下原本會發生的免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應而言。
在一些實施例中,至少一種效應分子對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應(例如,全身性地或在腫瘤微環境中)增加至少2倍(例如,2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、25倍、20倍、25倍、50倍或100倍)。舉例而言,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節可導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應增加至少3倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍或至少100倍。在一些實施例中,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫刺激及/或抗腫瘤免疫反應增加2-10倍、2-20倍、2-30倍、2-40倍、2-50倍、2-60倍、2-70倍、2-80倍、2-90倍或2-100倍。
免疫刺激及/或抗腫瘤免疫機制之非限制性實例包括T細胞傳訊、活性及/或募集;抗原呈現及/或加工;自然殺手細胞介導之細胞毒性傳訊、活性及/或募集;樹突細胞分化及/或成熟;免疫細胞募集;促炎性巨噬細胞傳訊、活性及/或募集;基質降解;免疫刺激代謝物之產生;干擾素基因刺激物(STING)傳訊(其增加IFN之分泌及Th1極化,促進抗腫瘤免疫反應)及/或I型干擾素傳訊。效應分子可刺激上述免疫刺激機制中之至少一種(一或多種),因而導致免疫刺激反應之增加。可例如使用用於T細胞增殖或細胞毒性之活體外分析、活體外抗原呈現分析、表現分析(例如,關於特定標記物)及/或細胞分泌分析(例如,細胞介素)來評估前述免疫刺激及/或抗腫瘤免疫機制之變化。
在一些實施例中,至少一種效應分子對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫抑制反應(例如,全身性或在腫瘤微環境中)降低至少10% (例如,10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%或200%)。舉例而言,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節可導致免疫抑制反應降低至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少100%。在一些實施例中,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫抑制反應降低10-20%、10-30%、10-40%、10-50%、10-60%、10-70%、10-80%、10-90%、10-100%、10-200%、20-30%、20-40%、20-50%、20-60%、20-70%、20-80%、20-90%、20-100%、20-200%、50-60%、50-70%、50-80%、50-90%、50-100%或50-200%。應當理解,免疫抑制反應例如全身性地或在腫瘤微環境中之「降低」係相對於在不存在一或多種效應分子之情況下原本會發生的免疫抑制反應而言。
在一些實施例中,至少一種效應分子對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫抑制反應(例如,全身性地或在腫瘤微環境中)降低至少2倍(例如,2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、25倍、20倍、25倍、50倍或100倍)。舉例而言,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節可導致免疫抑制反應降低至少3倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍或至少100倍。在一些實施例中,對腫瘤介導之免疫抑制機制之調節導致免疫抑制反應降低2-10倍、2-20倍、2-30倍、2-40倍、2-50倍、2-60倍、2-70倍、2-80倍、2-90倍或2-100倍。
免疫抑制機制之非限制性實例包括負共刺激傳訊、細胞毒性細胞(例如,T細胞及/或NK細胞)之促凋亡傳訊、T調控性(Treg)細胞傳訊、腫瘤檢查點分子產生/維持、髓源性抑制性細胞傳訊、活性及/或募集、免疫抑制因子/代謝物產生及/或血管內皮生長因子傳訊。效應分子可抑制上述免疫抑制機制中之至少一種(一或多種),因而導致免疫抑制反應之降低。可例如藉由分析以下來評估前述免疫抑制機制之變化:T細胞增殖之增加及/或IFNγ產生之增加(負共刺激信號、T
reg細胞傳訊及/或MDSC);膜聯蛋白V/PI流式染色(促凋亡傳訊);用於表現(例如,PDL1表現)之流式染色(腫瘤檢查點分子產生/維持);ELISA、LUMINEX®、經由qPCR之RNA、酶促分析,例如,IDO色胺酸分解代謝(免疫抑制因子/代謝物產生);及PI3K、Akt、p38之磷酸化(VEGF傳訊)。
在一些實施例中,效應分子加性地發揮功能:兩種效應分子之作用可例如等於兩種效應分子單獨發揮功能之作用之總和。在其他實施例中,效應分子協同地發揮功能:兩種效應分子之作用可例如大於兩種效應分子之組合功能。
調節腫瘤介導之免疫抑制機制及/或改變腫瘤微環境之效應分子可為本文所述之任何細胞介素。
在一些實施例中,至少一種效應分子刺激腫瘤微環境中之免疫刺激機制及/或抑制腫瘤微環境中之免疫抑制機制。
在一些實施例中,至少一種效應分子(a)刺激T細胞傳訊、活性及/或募集,(b)刺激抗原呈現及/或加工,(c)刺激自然殺手細胞介導之細胞毒性傳訊、活性及/或募集,(d)刺激樹突細胞分化及/或成熟,(e)刺激免疫細胞募集,(f)刺激促炎性巨噬細胞傳訊、活性及/或募集或抑制抗炎性巨噬細胞傳訊、活性及/或募集,(g)刺激基質降解,(h)刺激免疫刺激代謝物產生,(i)刺激I型干擾素傳訊,(j)抑制負共刺激傳訊,(k)抑制抗腫瘤免疫細胞之促凋亡傳訊,(l)抑制T調控性(T
reg)細胞傳訊、活性及/或募集,(m)抑制腫瘤檢查點分子,(n)刺激干擾素基因刺激物(STING)傳訊,(o)抑制髓源性抑制性細胞傳訊、活性及/或募集,(p)降解免疫抑制因子/代謝物,(q)抑制血管內皮生長因子傳訊,及/或(r)直接殺傷腫瘤細胞。
細胞介素之非限制性實例列於表1中,且編碼例示性效應分子之特定序列列於表2中。效應分子可為人類的,諸如列於表1或表2中之彼等,或列於表1或表2中之鼠類效應分子之人類等效物。效應分子可為人類來源的,諸如內源性人類效應分子,或針對功能加以修飾及/或最佳化(例如,經密碼子最佳化以改良表現,經修飾以改良穩定性,或於其信號序列處修飾)之效應分子(參見下文)。用於最佳化功能之各種程式及算法為熟習此項技術者已知且可基於期望之改良來選擇,諸如針對特定物種(例如,人類、小鼠、細菌等)之密碼子最佳化。
表 1. 例示性效應分子
表 2 :編碼例示性效應分子之序列
效應物名稱 | 類別 | 功能 |
IFNβ | 細胞介素 | T細胞反應,腫瘤細胞殺傷 |
IFNγ | 細胞介素 | T細胞反應,腫瘤細胞殺傷 |
IL-12 (例如,IL12p70融合物) | 細胞介素 | T細胞、NK細胞 |
IL-1β | 細胞介素 | T細胞、NK細胞 |
IL-15 | 細胞介素 | 刺激T細胞及NK |
IL-2 | 細胞介素 | 刺激T細胞及NK |
IL-21 | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL-24 | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL36-γ | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL-7 | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL-22 | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL-18 | 細胞介素 | 刺激T細胞 |
IL-12 (人類) (SEQ ID NO: 56) |
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IL-12p70 (人類;經密碼子最佳化;粗體表示信號序列) (SEQ ID NO: 57) |
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IL-12 (小鼠) (SEQ ID NO: 58) |
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IL21 (人類;經密碼子最佳化;粗體表示信號序列) (SEQ ID NO: 59) |
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IL-12p70_T2A_IL21 (人類;經密碼子最佳化;粗體表示信號序列) (SEQ ID NO: 60) |
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IL-12_2A_CCL21a (人類) (SEQ ID NO: 61) |
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IL-12_2A_CCL21a (小鼠) (SEQ ID NO: 62) |
ATGTGTCCACAGAAGCTGACAATAAGTTGGTTTGCCATTGTCCTCCTGGTGAGCCCACTCATGGCAATGTGGGAACTCGAAAAGGATGTCTACGTGGTAGAAGTAGATTGGACTCCAGACGCGCCAGGGGAGACAGTGAATTTGACATGTGACACACCAGAAGAAGATGACATTACATGGACATCTGACCAACGCCATGGCGTAATAGGGAGTGGGAAAACACTCACGATCACAGTTAAAGAGTTCTTGGATGCTGGTCAATATACTTGCCATAAAGGCGGCGAGACACTCAGCCACTCACATTTGCTTTTGCATAAAAAAGAGAATGGCATTTGGAGCACTGAAATACTTAAGAACTTTAAGAACAAGACATTTCTCAAGTGTGAGGCCCCTAATTACAGCGGCAGGTTCACGTGCTCATGGCTGGTCCAGCGCAACATGGACCTCAAGTTTAACATAAAATCTTCTTCCTCTTCACCTGACTCCAGAGCTGTTACTTGCGGCATGGCTTCTCTGAGCGCAGAAAAAGTAACGTTGGATCAAAGAGACTACGAAAAGTACTCTGTTTCTTGTCAAGAGGATGTTACGTGCCCGACGGCCGAAGAAACGCTTCCAATTGAACTCGCGTTGGAAGCTCGCCAACAAAACAAGTATGAAAACTACAGTACAAGCTTCTTTATACGGGATATAATTAAACCCGATCCCCCCAAGAACTTGCAAATGAAACCACTTAAGAACAGCCAGGTGGAAGTTTCCTGGGAGTATCCAGACTCATGGAGTACTCCTCACAGCTATTTTTCTCTGAAATTCTTTGTAAGGATACAACGGAAGAAAGAGAAGATGAAAGAGACCGAGGAGGGTTGTAATCAGAAGGGAGCGTTTCTCGTGGAGAAAACGTCTACCGAAGTCCAATGTAAAGGTGGCAATGTGTGCGTCCAAGCTCAGGATAGATACTATAATTCAAGTTGCTCCAAGTGGGCCTGTGTTCCATGCCGCGTTCGGAGCGGGGGAGGTAGCGGAGGAGGTAGTGGGGGTGGGTCAGGAGGAGGGAGTCGAGTTATCCCGGTGTCAGGCCCCGCACGCTGCTTGAGCCAGAGTCGCAACCTCCTTAAGACAACAGATGACATGGTGAAAACAGCACGCGAAAAGCTTAAACACTACTCTTGTACGGCGGAGGATATTGATCACGAGGATATTACCCGAGACCAAACTAGCACTTTGAAAACCTGTCTGCCCCTTGAACTTCATAAAAATGAGAGCTGTCTGGCTACACGAGAGACGTCAAGTACGACTAGGGGCAGCTGTCTCCCGCCGCAAAAGACAAGCCTCATGATGACGCTCTGTTTGGGTTCCATTTACGAGGACTTGAAAATGTATCAAACGGAGTTCCAGGCTATAAATGCGGCGTTGCAGAACCATAACCATCAACAAATTATACTTGATAAAGGCATGTTGGTGGCGATTGATGAACTCATGCAGAGTCTCAATCACAACGGGGAAACGTTGAGACAGAAACCCCCAGTCGGTGAAGCGGACCCATATCGAGTAAAAATGAAGCTCTGCATTCTGCTTCACGCATTCAGCACTAGAGTTGTTACCATCAACCGGGTAATGGGATATCTCTCCAGTGCGCGGCGCAAGAGGGGTTCCGGAGAGGGAAGGGGTAGTCTGCTCACCTGCGGCGATGTTGAAGAAAATCCTGGTCCCATGGCGCAAATGATGACCCTTTCCCTGCTGAGTCTTGTCCTCGCGCTCTGCATCCCGTGGACGCAGGGGTCTGATGGGGGGGGCCAAGACTGTTGCCTGAAGTATTCACAAAAAAAGATACCGTACTCTATTGTCAGAGGGTACAGGAAGCAAGAACCCTCCTTGGGTTGCCCTATACCAGCAATTCTTTTCTCCCCACGCAAGCATTCCAAACCAGAACTGTGTGCGAACCCCGAGGAGGGTTGGGTACAGAACTTGATGCGAAGGCTTGACCAGCCCCCAGCCCCTGGCAAGCAGTCACCTGGGTGCAGAAAAAACAGAGGTACTTCAAAGAGCGGCAAGAAAGGCAAAGGGAGTAAAGGATGTAAAAGAACGGAGCAGACCCAGCCTTCACGAGGCtaG |
IL7 (小鼠) (SEQ ID NO: 64) |
ATGTTTCATGTGTCCTTCAGGTACATATTTGGTATCCCACCACTTATATTGGTGCTCTTGCCTGTAACCAGCTCTGAATGTCATATAAAAGACAAGGAGGGCAAAGCATACGAGTCCGTATTGATGATCTCAATCGATGAACTTGACAAGATGACAGGGACCGATTCTAATTGTCCAAATAACGAGCCAAACTTCTTTCGGAAACACGTGTGTGATGATACAAAAGAAGCTGCTTTTCTTAACAGAGCTGCCAGAAAACTCAAGCAGTTCCTCAAGATGAATATATCCGAGGAATTTAACGTGCATCTCCTCACAGTATCTCAGGGAACTCAAACCCTTGTAAACTGCACTTCTAAGGAGGAGAAGAATGTCAAAGAGCAGAAGAAAAATGATGCATGTTTTTTGAAACGGCTGTTGAGGGAGATCAAAACATGCTGGAATAAAATCCTCAAGGGCTCAATTtaG |
IL-15 (人類) (SEQ ID NO: 65) |
ATGGAAACAGACACATTGCTGCTTTGGGTATTGTTGCTCTGGGTGCCTGGATCAACAGGAAACTGGGTAAACGTAATTTCAGATCTGAAGAAGATCGAGGACCTTATTCAATCCATGCACATCGATGCCACTCTCTACACCGAAAGCGACGTTCACCCATCTTGCAAGGTGACCGCTATGAAATGTGAATTGTTGGAACTTCAGGTAATTTCTCTGGAGAGCGGCGATGCCTCAATACATGACACCGTTGAAAATCTTATCATCCTTGCTAATGATTCACTCTCTAGTAATGGGAACGTAACAGAGAGCGGGTGTAAGGAGTGTGAAGAACTGGAGGAGAAAAACATTAAGGAATTTTTGCAGTCATTCGTCCATATAGTGCAAATGTTCATAAACACTTCCAGAAGAAAGCGAGGCTCTGGGGAGGGGCGAGGCTCTCTGCTGACCTGTGGGGATGTAGAAGAGAATCCAGGTCCCATGGACCGGCTGACCAGCTCATTCCTGCTTCTGATTGTGCCAGCCTACGTGCTCTCCATCACATGTCCTCCCCCAATGAGCGTCGAGCATGCTGACATCTGGGTGAAGTCATACTCCTTGTACAGCAGAGAGAGATACATTTGTAATTCCGGATTCAAGCGCAAGGCCGGCACCTCCTCTCTGACAGAGTGCGTCCTTAACAAAGCAACCAACGTAGCACATTGGACCACACCATCCTTGAAGTGCATACGAGAACCTAAATCTTGCGATAAGACTCATACTTGTCCACCTTGTCCAGCCCCAGAACTGCTTGGCGGACCCTCAGTATTTTTGTTCCCACCAAAGCCAAAAGACACACTCATGATATCCAGAACTCCTGAGGTGACCTGTGTCGTTGTAGACGTTTCCCACGAAGATCCTGAAGTAAAATTCAACTGGTACGTGGATGGGGTCGAAGTCCATAACGCCAAGACTAAACCAAGGGAGGAACAGTATAACTCTACTTACCGAGTAGTTTCTGTGTTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGTTGAACGGGAAGGAGTACAAATGCAAGGTGAGCAATAAAGCTCTGCCCGCACCAATCGAAAAGACAATATCTAAGGCCAAGGGGCAGCCACGAGAGCCCCAGGTATACACACTGCCACCCTCACGCGATGAATTGACTAAGAACCAGGTTTCCCTGACCTGTCTTGTAAAAGGTTTCTACCCTTCCGACATAGCTGTTGAGTGGGAAAGTAACGGGCAGCCAGAGAACAATTACAAGACAACTCCACCCGTTCTTGATAGCGATGGATCATTTTTTCTGTATTCCAAACTCACTGTCGATAAAAGTCGCTGGCAGCAAGGCAATGTTTTTAGCTGCTCAGTCATGCACGAAGCACTGCATAATCACTACACACAAAAAAGTTTGTCCCTTAGCCCTGGTAAGtaG |
IL-15 (人類) (SEQ ID NO: 66) |
ATGTACTCAATGCAGTTGGCCTCCTGTGTAACATTGACCTTGGTCCTCTTGGTCAACAGCAATTGGATCGATGTACGCTACGACTTGGAGAAGATTGAGTCCCTTATACAGAGTATACACATAGATACAACCTTGTATACTGACAGTGACTTCCATCCCAGCTGTAAAGTGACTGCAATGAACTGTTTTTTGTTGGAGTTGCAAGTAATTCTGCATGAATACAGCAACATGACCCTCAATGAAACCGTTAGGAATGTCCTTTATCTCGCAAATTCTACTCTGAGTAGCAATAAGAATGTTGCCGAAAGCGGCTGCAAGGAGTGCGAAGAACTGGAGGAAAAAACTTTCACCGAGTTTCTCCAGAGTTTCATCAGAATTGTCCAAATGTTCATTAATACAAGTAGTGGTGGTGGGAGCGGGGGTGGAGGCAGTGGGGGAGGTGGGAGCGGAGGTGGAGGGTCCGGAGGGGGGAGCCTTCAAGGCACTACTTGTCCTCCACCCGTATCCATCGAGCACGCCGATATTCGAGTTAAAAATTATAGTGTTAATAGCAGAGAACGATACGTCTGCAACTCAGGGTTTAAGAGAAAGGCCGGAACTTCAACTCTCATAGAATGCGTGATTAATAAGAATACTAACGTCGCACATTGGACTACTCCCAGTCTCAAGTGCATACGCGATCCATCTCTCGCTCATTACTCACCAGTACCTACAGTGGTTACTCCTAAGGTGACCTCTCAGCCCGAATCACCATCTCCCAGCGCAAAAGAGCCTGAGGCCTTTTCTCCTAAATCAGACACTGCTATGACTACAGAAACAGCCATAATGCCAGGAAGCCGGCTGACACCATCTCAAACTACCAGCGCAGGCACAACTGGGACTGGCTCCCACAAAAGCTCACGCGCACCAAGTCTCGCCGCAACAATGACATTGGAGCCTACAGCCAGCACATCTCTTAGAATCACAGAAATTTCTCCCCACAGTAGCAAGATGACCAAGGTGGCAATTAGTACCAGCGTCCTTCTTGTAGGAGCTGGAGTTGTGATGGCATTTTTGGCATGGTATATCAAAAGCAGGtaG |
IL-15 (小鼠) (SEQ ID NO: 67) |
ATGAAGATCCTCAAGCCATACATGCGAAACACTAGTATTAGCTGTTACTTGTGTTTTCTGCTGAATAGTCATTTTTTGACTGAAGCAGGAATCCATGTATTTATACTCGGTTGTGTGTCTGTAGGTCTGCCAAAGACTGAGGCTAATTGGATTGACGTGCGCTATGATCTTGAAAAAATAGAGTCCTTGATTCAATCAATACACATCGATACCACTCTCTACACCGACAGTGATTTCCATCCTTCCTGCAAGGTAACAGCTATGAATTGCTTCCTCCTGGAGCTCCAAGTCATTCTCCATGAGTACTCCAACATGACTTTGAACGAAACTGTAAGAAACGTATTGTATCTGGCTAATAGCACCTTGTCTAGTAACAAAAATGTGGCAGAGAGCGGCTGCAAAGAATGTGAAGAATTGGAAGAGAAAACATTTACAGAGTTCCTGCAATCCTTTATTCGCATCGTCCAAATGTTTATCAATACCTCTtaG |
IL-15 (小鼠) (SEQ ID NO: 68) |
ATGTATTCCATGCAACTTGCCAGTTGTGTAACCCTTACTCTCGTCCTGCTCGTTAATTCCGCTGGTGCTAACTGGATAGATGTTCGATACGATCTGGAAAAGATTGAGTCCCTTATCCAATCCATTCATATAGATACCACCCTTTATACTGACAGCGACTTCCATCCTTCTTGCAAGGTGACCGCTATGAATTGTTTCCTGCTGGAACTCCAAGTTATTCTGCATGAATACTCTAATATGACACTTAACGAGACCGTAAGAAATGTTCTCTATCTCGCTAATAGTACTTTGAGCTCAAATAAGAACGTGGCCGAGTCTGGGTGTAAGGAATGCGAAGAGCTGGAAGAAAAGACATTCACCGAGTTTCTCCAGTCTTTCATACGGATTGTGCAGATGTTTATCAACACATCAGATTACAAAGACGACGATGATAAGtaG |
IL-18 (小鼠) (SEQ ID NO: 69) |
ATGGCAGCCATGTCTGAGGACTCTTGTGTGAACTTTAAAGAAATGATGTTCATAGACAATACACTCTACTTTATACCTGAGGAGAATGGAGATTTGGAATCTGACAACTTTGGCAGGCTGCATTGCACTACCGCAGTTATCCGAAACATCAACGATCAGGTACTGTTTGTTGATAAAAGACAACCTGTATTCGAGGACATGACCGACATAGATCAGTCTGCCTCAGAGCCCCAGACTAGGCTTATCATCTATATGTACAAGGACAGCGAAGTACGAGGCCTGGCTGTTACACTCTCAGTCAAAGACTCTAAGATGAGCACCCTGTCATGCAAGAACAAAATTATCAGTTTTGAGGAGATGGACCCACCTGAAAACATAGATGACATTCAGTCAGACCTCATTTTTTTTCAAAAGCGGGTACCAGGACACAACAAAATGGAATTTGAATCATCACTCTACGAAGGACATTTCCTTGCATGCCAGAAAGAGGATGACGCATTCAAATTGATCCTGAAAAAAAAGGACGAAAATGGTGATAAATCAGTCATGTTTACATTGACCAATCTTCACCAAAGTtaG |
IL-18 (小鼠) (SEQ ID NO: 70) |
ATGGCTGCAATGTCTGAAGATAGCTGTGTCAACTTTAAGGAGATGATGTTCATTGATAATACTTTGTACTTTATACCTGAAGAAAATGGAGACCTTGAGTCAGACAACTTCGGGAGACTGCACTGCACAACTGCCGTTATCCGAAACATAAATGATCAAGTATTGTTCGTGGACAAAAGACAACCAGTCTTTGAGGATATGACAGACATCGACCAATCCGCATCTGAACCTCAGACTAGGCTGATCATCTATATGTACGCCGACTCCGAAGTAAGAGGCCTTGCTGTGACACTTAGTGTTAAGGATAGTAAGATGAGCACACTGTCCTGTAAGAATAAGATTATATCTTTTGAAGAGATGGACCCTCCCGAGAACATAGATGACATCCAGAGCGACTTGATCTTCTTTCAGAAGCGAGTGCCAGGCCATAACAAGATGGAATTTGAATCATCTCTTTATGAAGGCCATTTCCTCGCATGTCAAAAGGAGGACGATGCCTTCAAGCTCATTCTGAAAAAAAAAGACGAGAACGGTGATAAGAGCGTGATGTTCACTCTGACAAATCTGCACCAGTCAtaG |
IL-18 (人類) (SEQ ID NO: 71) |
ATGTATCGCATGCAACTCCTGTCCTGCATTGCTCTGAGCTTGGCTTTGGTAACCAACTCATACTTCGGGAAACTGGAGAGTAAACTCTCCGTAATCAGGAATCTTAATGACCAAGTATTGTTTATTGACCAGGGCAACCGCCCGTTGTTCGAGGATATGACTGATTCTGACTGTCGGGATAACGCTCCGAGAACTATCTTTATCATTTCAATGTACAAGGACAGCCAACCGCGGGGTATGGCTGTGACAATCAGTGTCAAATGTGAGAAGATTTCCACGCTGTCCTGCGAAAACAAGATAATTTCTTTCAAAGAAATGAACCCCCCTGACAATATAAAGGATACAAAGAGTGATATCATCTTCTTTCAGAGGTCCGTGCCCGGCCACGATAATAAGATGCAATTTGAAAGTTCATCTTATGAGGGGTACTTTTTGGCATGCGAGAAAGAAAGGGATCTCTTCAAGTTGATCCTGAAGAAGGAGGACGAATTGGGCGACCGCTCCATCATGTTCACAGTCCAGAACGAGGACtaG |
IL-18 (人類) (SEQ ID NO: 72) |
ATGTACCGCATGCAGCTCCTGAGTTGTATTGCCCTTTCCCTCGCTCTCGTTACCAATTCTTACTTCGGTAAGCTTGCCTCTAAACTCTCTGTTATTAGGAACTTGAACGACCAAGTCCTTTTCATAGACCAAGGGAACAGACCACTGTTTGAAGATATGACGGATAGCGATTGCCGAGATAATGCCCCTAGGACGATTTTTATCATTAGTATGTATGCGGACTCTCAACCGAGGGGGATGGCCGTTACTATAAGTGTGAAATGCGAGAAAATATCAACGCTCAGTTGTGAGAACAAAATCATAAGTTTCAAGGAGATGAATCCACCTGATAACATCAAAGACACTAAGTCTGATATTATATTTTTCCAACGAAGTGTTCCGGGACACGATAACAAAATGCAATTTGAGAGCTCCTCATACGAGGGCTACTTCCTCGCGTGTGAGAAAGAAAGGGATTTGTTTAAGCTTATCCTCAAGAAAGAGGACGAGTTGGGGGATCGGAGCATAATGTTTACCGTACAGAATGAGGACtaG |
IL-21 (小鼠) (SEQ ID NO: 73) |
ATGGAGCGGACACTCGTGTGTCTTGTCGTAATTTTTCTCGGGACAGTCGCACACAAGTCCTCACCCCAGGGTCCTGATCGCCTTCTCATACGCCTCCGACATTTGATCGACATTGTAGAGCAGCTCAAAATTTACGAGAATGACCTCGATCCCGAGCTTTTGAGTGCTCCCCAAGACGTTAAGGGTCATTGCGAGCACGCAGCTTTTGCTTGCTTCCAGAAGGCCAAGTTGAAACCAAGCAACCCTGGTAATAATAAGACTTTCATCATCGACTTGGTCGCCCAACTCCGAAGGAGGCTGCCTGCCCGGCGCGGAGGAAAAAAACAAAAGCATATTGCAAAGTGTCCTTCATGTGATTCATACGAAAAGCGGACTCCCAAAGAGTTCTTGGAAAGGTTGAAATGGCTTCTTCAGAAGATGATTCATCAACATTTGTCAtaG |
IFN-β (人類) (SEQ ID NO: 74) |
ATGACCAACAAATGCCTTTTGCAAATTGCCCTGCTTTTGTGTTTTAGCACTACCGCATTGAGCATGTCATATAACCTCCTCGGCTTCCTTCAGAGATCATCAAACTTTCAGTGTCAGAAACTGCTTTGGCAACTTAATGGCAGGCTCGAATATTGTCTGAAAGATCGGATGAATTTCGACATTCCAGAAGAAATAAAACAGCTTCAACAATTCCAGAAAGAGGACGCCGCCCTGACTATTTACGAGATGCTCCAGAATATCTTCGCCATTTTCCGGCAGGACAGCTCATCCACGGGGTGGAATGAGACTATTGTAGAAAATCTTCTGGCTAATGTGTACCATCAAATTAATCACCTCAAAACGGTGCTTGAGGAAAAACTTGAAAAGGAAGATTTCACACGGGGCAAGTTGATGTCCTCCCTGCACCTTAAACGATACTACGGCAGGATTCTTCATTACTTGAAGGCTAAGGAGTATAGCCATTGCGCGTGGACAATTGTACGGGTAGAAATACTGCGAAACTTTTATTTCATCAACCGGCTCACTGGATACCTTAGAAATtaG |
IFN-β (小鼠) (SEQ ID NO: 75) |
ATGAACAATCGGTGGATACTCCACGCCGCATTTCTCCTCTGCTTTAGCACGACGGCCCTGTCCATCAACTACAAACAGCTTCAGTTGCAGGAGCGGACTAACATAAGGAAGTGCCAGGAACTGCTGGAACAGCTTAATGGTAAAATTAATCTTACATACCGAGCTGACTTCAAAATTCCTATGGAAATGACCGAGAAGATGCAGAAATCCTACACGGCATTCGCCATCCAGGAAATGCTCCAGAACGTATTTCTCGTGTTCCGCAATAATTTCTCTTCTACGGGTTGGAACGAAACCATTGTTGTTAGACTGCTTGACGAACTGCATCAGCAAACCGTGTTCCTTAAAACCGTGCTTGAGGAGAAGCAGGAGGAGCGCCTGACTTGGGAGATGTCTAGTACCGCACTTCACTTGAAATCCTACTACTGGCGCGTTCAGCGGTATCTGAAGCTGATGAAGTATAACTCATACGCCTGGATGGTAGTGCGCGCAGAGATCTTCAGAAACTTTCTTATCATCCGGCGACTGACCCGAAACTTTCAGAATtaG |
IFN-γ (人類) (SEQ ID NO: 76) |
ATGAAGTACACTAGCTATATATTGGCCTTCCAGCTTTGCATCGTATTGGGTAGCCTCGGATGCTATTGCCAAGACCCGTATGTCAAAGAAGCCGAAAATCTCAAAAAGTATTTCAATGCCGGACACTCAGACGTCGCGGATAACGGTACACTGTTTCTTGGCATCCTGAAAAATTGGAAGGAAGAGAGTGACAGAAAAATAATGCAGTCACAAATAGTGTCCTTTTACTTTAAGCTGTTCAAAAATTTCAAGGATGACCAAAGTATCCAGAAGAGTGTTGAAACTATCAAAGAGGACATGAATGTGAAATTCTTTAACAGTAATAAGAAGAAGCGCGATGACTTCGAGAAACTCACTAATTACAGCGTAACGGATCTTAACGTCCAACGCAAGGCAATCCACGAGCTTATACAGGTAATGGCTGAGCTTAGTCCCGCAGCCAAGACAGGGAAGAGAAAAAGGTCTCAAATGCTTTTTCGGGGCCGGCGAGCTTCACAAtaG |
IFN-γ (小鼠) (SEQ ID NO: 77) |
ATGAACGCTACGCATTGCATCCTCGCACTCCAATTGTTCCTCATGGCTGTGTCAGGGTGTTACTGTCACGGTACTGTCATAGAAAGCCTCGAATCCCTGAATAACTATTTTAACAGTAGCGGTATAGATGTAGAAGAAAAGTCTCTCTTTCTTGACATCTGGAGGAATTGGCAAAAGGATGGAGACATGAAGATTCTCCAATCTCAGATTATATCATTTTACTTGAGGCTTTTTGAGGTTCTGAAGGATAACCAGGCGATCAGCAATAATATCAGCGTAATTGAATCTCACCTTATTACAACATTTTTCTCAAATTCCAAGGCAAAGAAAGATGCTTTCATGTCTATCGCGAAATTTGAGGTGAACAATCCTCAGGTACAAAGGCAAGCCTTTAACGAGCTGATTAGAGTTGTACATCAGTTGTTGCCCGAAAGTAGTCTTAGAAAACGCAAACGGAGCCGATGCtaG |
IFN-α (小鼠) (SEQ ID NO: 78) |
ATGGCAAGGTTGTGCGCTTTTCTCATGGTACTGGCTGTGCTCTCCTATTGGCCTACTTGTTCTCTGGGATGCGACTTGCCACAGACCCACAATCTGCGGAATAAGAGGGCTCTGACTCTGCTGGTGCAAATGAGACGGCTCTCTCCACTTAGCTGTTTGAAAGATAGAAAGGATTTCGGGTTCCCCCAGGAGAAGGTGGATGCCCAGCAGATCAAGAAGGCACAGGCTATCCCCGTCCTTTCCGAGCTGACCCAGCAAATTTTGAACATCTTTACAAGTAAGGATAGTTCAGCTGCATGGAATACCACACTTTTGGATTCTTTTTGTAACGATCTGCATCAGCAGCTGAACGATCTCCAGGGATGCCTGATGCAGCAAGTCGGCGTGCAAGAATTTCCACTCACCCAGGAGGACGCTCTGCTCGCAGTGCGAAAGTATTTTCACCGAATTACCGTGTACCTCCGGGAGAAAAAGCATTCACCCTGCGCTTGGGAAGTAGTCAGGGCCGAAGTATGGAGAGCCCTTAGTAGCTCCGCTAATGTACTGGGCCGGTTGCGGGAAGAGAAAtaG |
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 309中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 326中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 314中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 315中所示序列之核苷酸序列。
第二經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第二經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
第二經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。第二經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 318中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列;且(b)第二經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列;且(b)第二經工程改造之核酸可包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;且(b)第二經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
第一經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;且(b)第二經工程改造之核酸可包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括本文所述任一種經工程改造之核酸。本文所提供之免疫反應性細胞可包括本文所述任一種經工程改造之核酸之組合。本文所提供之免疫反應性細胞可包括本文所述任一種經工程改造之核酸中之兩種或更多種。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 309中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 326中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 314中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 315中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之免疫反應性細胞可包括具有SEQ ID NO: 318中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
本文所提供之免疫反應性細胞可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括本文所述任一種經工程改造之核酸。本文所提供之表現載體可包括本文所述任一種經工程改造之核酸之組合。本文所提供之表現載體可包括本文所述任一種經工程改造之核酸中之兩種或更多種。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 309中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 326中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 314中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 315中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。本文所提供之表現載體可包括具有SEQ ID NO: 318中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括具有SEQ ID NO: 310中所示序列之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括具有SEQ ID NO: 327中所示序列之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括具有SEQ ID NO: 317中所示序列之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
本文所提供之表現載體可包括第一經工程改造之核酸,該第一經工程改造之核酸包括與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列;及(b)第二經工程改造之核酸,其包括與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
分泌信號及信號錨
本文所提供之膜可切割嵌合蛋白之一或多種效應分子(例如,本文所述之任何細胞介素)通常為在嵌合蛋白之N末端(例如,
S - C - MT之效應分子之N末端)具有分泌信號肽(亦稱為信號肽或信號序列)之可分泌效應分子,該分泌信號肽將預定用於分泌或膜定位(亦稱為膜插入)之新合成蛋白引導至適當的蛋白加工路徑。對於具有式
MT - C - S之嵌合蛋白而言,膜系鏈結構域一般具有將預定用於膜定位之新合成蛋白引導至適當的蛋白加工路徑之信號錨序列(例如,II型跨膜蛋白之信號錨序列)。對於具有式
S - C - MT之嵌合蛋白而言,可使用具有反向信號錨序列(例如,某些III型跨膜蛋白之信號錨序列)之膜系鏈結構域,其一般沒有將預定用於膜定位之新合成蛋白引導至適當的蛋白加工路徑之單獨分泌信號肽。
一般而言,對於本文所述之所有膜可切割嵌合蛋白而言,一或多種效應分子係可分泌效應分子(在式
S - C - MT或
MT - C - S中稱為「S」)。在具有兩種或更多種嵌合蛋白之實施例中,每一嵌合蛋白皆可包含分泌信號。在具有兩種或更多種嵌合蛋白之實施例中,每一嵌合蛋白皆可包含分泌信號,使得每一效應分子皆能夠在蛋白酶切割位點切割後自經工程改造之細胞中分泌。
與效應分子可操作地締合之分泌信號肽可為天然分泌信號肽(例如,一般與給定效應分子內源性締合之分泌信號肽,諸如細胞介素之內源性分泌信號肽)。與效應分子可操作地締合之分泌信號肽可為非天然分泌信號肽天然分泌信號肽。非天然分泌信號肽可促進特定環境(諸如腫瘤微環境)中之改良表現及功能,諸如維持分泌。非天然分泌信號肽之非限制性實例示於表3中。
表 3. 例示性信號分泌肽
蛋白酶切割位點
名稱 | 蛋白序列 | 來源(Uniprot) | DNA 序列 |
IL-12 | MCHQQLVISWFSLVFLASPLVA (SEQ ID NO: 112) | P29460 | ATGTGTCACCAGCAGCTCGTTATATCCTGGTTTAGTTTGGTGTTTCTCGCTTCACCCCTGGTGGCA (SEQ ID NO: 31) |
IL-12 ( 經密碼子最佳化) | MCHQQLVISWFSLVFLASPLVA (SEQ ID NO: 112) | - | ATGTGCCATCAGCAACTCGTCATCTCCTGGTTCTCCCTTGTGTTCCTCGCTTCCCCTCTGGTCGCC (SEQ ID NO: 32) |
IL-2 ( 經最佳化) | MQLLSCIALILALV (SEQ ID NO: 113) | - | ATGCAACTGCTGTCATGTATCGCACTCATCCTGGCGCTGGTA (SEQ ID NO: 33) |
IL-2 ( 天然) | MYRMQLLSCIALSLALVTNS (SEQ ID NO: 114) | P60568 | ATGTATCGGATGCAACTTTTGAGCTGCATCGCATTGTCTCTGGCGCTGGTGACAAATTCC (SEQ ID NO: 34) |
胰蛋白酶原-2 | MNLLLILTFVAAAVA (SEQ ID NO: 115) | P07478 | ATGAATCTCTTGCTCATACTTACGTTTGTCGCTGCTGCCGTTGCG (SEQ ID NO: 35) |
高斯螢光素酶 | MGVKVLFALICIAVAEA (SEQ ID NO: 116) | - | ATGGGCGTGAAGGTCTTGTTTGCCCTTATCTGCATAGCTGTTGCGGAGGCG (SEQ ID NO: 36) |
CD5 | MPMGSLQPLATLYLLGMLVASCLG (SEQ ID NO: 117) | P06127 | ATGCCGATGGGGAGCCTTCAACCTTTGGCAACGCTTTATCTTCTGGGGATGTTGGTTGCTAGTTGCCTTGGG (SEQ ID NO: 37) |
IgKVII ( 小鼠) | METDTLLLWVLLLWVPGSTGD (SEQ ID NO: 118) | ATGGAAACTGACACGTTGTTGCTGTGGGTATTGCTCTTGTGGGTCCCAGGATCTACGGGCGAC (SEQ ID NO: 38) | |
IgKVII ( 人類) | MDMRVPAQLLGLLLLWLRGARC (SEQ ID NO: 119) | P01597 | ATGGATATGAGGGTTCCCGCCCAGCTTTTGGGGCTGCTTTTGTTGTGGCTTCGAGGGGCTCGGTGT (SEQ ID NO: 39) |
VSV-G | MKCLLYLAFLFIGVNC (SEQ ID NO: 120) | - | ATGAAGTGTCTGTTGTACCTGGCGTTTCTGTTCATTGGTGTAAACTGT (SEQ ID NO: 40) |
泌乳素 | MNIKGSPWKGSLLLLLVSNLLLCQSVAP (SEQ ID NO: 121) | P01236 | ATGAATATCAAAGGAAGTCCGTGGAAGGGTAGTCTCCTGCTGCTCCTCGTATCTAACCTTCTCCTTTGTCAATCCGTGGCACCC (SEQ ID NO: 41) |
血清白蛋白前蛋白原 | MKWVTFISLLFLFSSAYS (SEQ ID NO: 122) | P02768 | ATGAAATGGGTAACATTCATATCACTTCTCTTTCTGTTCAGCTCTGCGTATTCT (SEQ ID NO: 42) |
天青殺素前蛋白原 | MTRLTVLALLAGLLASSRA (SEQ ID NO: 123) | 20160 | ATGACAAGGCTTACTGTTTTGGCTCTCCTCGCTGGACTCTTGGCTTCCTCCCGAGCA (SEQ ID NO: 43) |
骨結合素(BM40) | MRAWIFFLLCLAGRALA (SEQ ID NO: 124) | P09486 | ATGAGGGCTTGGATTTTTTTTCTGCTCTGCCTTGCCGGTCGAGCCCTGGCG (SEQ ID NO: 44) |
CD33 | MPLLLLLPLLWAGALA (SEQ ID NO: 125) | P20138 | ATGCCTCTTCTGCTTTTGCTTCCTCTTTTGTGGGCAGGTGCCCTCGCA (SEQ ID NO: 45) |
IL-6 | MNSFSTSAFGPVAFSLGLLLVLPAAFPAP (SEQ ID NO: 126) | P05231 | ATGAACTCTTTCTCAACCTCTGCGTTTGGTCCGGTCGCTTTCTCCCTTGGGCTCCTGCTTGTCTTGCCAGCAGCGTTTCCTGCGCCA (SEQ ID NO: 46) |
IL-8 | MTSKLAVALLAAFLISAALC (SEQ ID NO: 127) | P10145 | ATGACAAGTAAACTGGCGGTAGCCTTGCTCGCGGCCTTTTTGATTTCCGCAGCCCTTTGT (SEQ ID NO: 47) |
CCL2 | MKVSAALLCLLLIAATFIPQGLA (SEQ ID NO: 128) | P13500 | ATGAAGGTAAGTGCAGCGTTGCTTTGCCTTCTCCTCATTGCAGCGACCTTTATTCCTCAAGGGCTGGCC (SEQ ID NO: 48) |
TIMP2 | MGAAARTLRLALGLLLLATLLRPADA (SEQ ID NO: 129) | P16035 | ATGGGAGCGGCAGCTAGAACACTTCGACTTGCCCTTGGGCTCTTGCTCCTTGCAACCCTCCTTAGACCTGCCGACGCA (SEQ ID NO: 49) |
VEGFB | MSPLLRRLLLAALLQLAPAQA (SEQ ID NO: 130) | P49765 | ATGTCACCGTTGTTGCGGAGATTGCTGTTGGCCGCACTTTTGCAACTGGCTCCTGCTCAAGCC (SEQ ID NO: 50) |
骨保護素 | MNNLLCCALVFLDISIKWTTQ (SEQ ID NO: 131) | O00300 | ATGAATAACCTGCTCTGTTGTGCGCTCGTGTTCCTGGACATTTCTATAAAATGGACAACGCAA (SEQ ID NO: 51) |
絲胺酸蛋白酶抑制劑E1 | MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSA (SEQ ID NO: 132) | P05121 | ATGCAAATGTCTCCTGCCCTTACCTGTCTCGTACTTGGTCTTGCGCTCGTATTTGGAGAGGGATCAGCC (SEQ ID NO: 52) |
GROα | MARAALSAAPSNPRLLRVALLLLLLVAAGRRAAG (SEQ ID NO: 133) | P09341 | ATGGCAAGGGCTGCACTCAGTGCTGCCCCGTCTAATCCCAGATTGCTTCGAGTTGCATTGCTTCTTCTGTTGCTGGTTGCAGCTGGTAGGAGAGCAGCGGGT (SEQ ID NO: 53) |
CXCL12 | MNAKVVVVLVLVLTALCLSDG (SEQ ID NO: 134) | P48061 | ATGAATGCAAAAGTCGTGGTCGTGCTGGTTTTGGTTCTGACGGCGTTGTGTCTTAGTGATGGG (SEQ ID NO: 54) |
IL-21 ( 經密碼子最佳化) | MERIVICLMVIFLGTLVHKSSS (SEQ ID NO: 135) | Q9HBE4 | ATGGAACGCATTGTGATCTGCCTGATGGTCATCTTCCTGGGCACCTTAGTGCACAAGTCGAGCAGC (SEQ ID NO: 55) |
CD8 | MALPVTALLLPLALLLHAARP (SEQ ID NO: 136) | - | ATGGCCTTACCAGTGACCGCCTTGCTCCTGCCGCTGGCCTTGCTGCTCCACGCCGCCAGGCCG (SEQ ID NO: 139) |
CD8 ( 經密碼子最佳化) | MALPVTALLLPLALLLHAARP (SEQ ID NO: 137) | - | ATGGCGCTCCCGGTGACAGCACTTCTCTTGCCTCTTGCCCTGCTGTTGCATGCCGCGCGCCCA (SEQ ID NO: 140) |
GMCSFRa | MLLVTSLLLCELPHPAFLLIP (SEQ ID NO: 138) | - | ATGTTGCTCGTGACATCCCTCTTGCTTTGTGAGTTGCCTCATCCCGCATTCCTGCTCATCCCA (SEQ ID NO: 141) |
GM-CSFRa | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP (SEQ ID NO: 216) | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT (SEQ ID NO: 217) | |
NKG2D | PFFFCCFIAVAMGIRFIIMVA (SEQ ID NO: 192) | CCCTTCTTCTTCTGTTGCTTTATCGCCGTGGCCATGGGCATCCGCTTCATCATTATGGTGGCC (SEQ ID NO: 193) | |
IgE | MDWTWILFLVAAATRVHS (SEQ ID NO: 218) | - | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC (SEQ ID NO: 214) |
一般而言,本文所述之所有膜可切割嵌合蛋白皆含有蛋白酶切割位點(在式
S - C - MT或
MT - C - S中,稱為「C」)。一般而言,蛋白酶切割位點可為能夠被蛋白酶切割之任何胺基酸序列模體。蛋白酶切割位點之實例包括但不限於1型跨膜蛋白酶切割位點、II型跨膜蛋白酶切割位點、GPI錨定蛋白酶切割位點、ADAM8蛋白酶切割位點、ADAM9蛋白酶切割位點、ADAM10蛋白酶切割位點、ADAM12蛋白酶切割位點、ADAM15蛋白酶切割位點、ADAM17蛋白酶切割位點、ADAM19蛋白酶切割位點、ADAM20蛋白酶切割位點、ADAM21蛋白酶切割位點、ADAM28蛋白酶切割位點、ADAM30蛋白酶切割位點、ADAM33蛋白酶切割位點、BACE1蛋白酶切割位點、BACE2蛋白酶切割位點、SIP蛋白酶切割位點、MT1-MMP蛋白酶切割位點、MT3-MMP蛋白酶切割位點、MT5-MMP蛋白酶切割位點、弗林蛋白酶切割位點、PCSK7蛋白酶切割位點、蛋白裂解酶蛋白酶切割位點、蛋白裂解酶-2蛋白酶切割位點、MMP9蛋白酶切割位或NS3蛋白酶切割位點。
蛋白酶切割位點之一個實例係C型肝炎病毒(HCV)非結構蛋白3 (NS3)蛋白酶切割位點,包括但不限於NS3/NS4A、NS4A/NS4B、NS4B/NS5A或NS5A/NS5B切割位點。對於各種HCV毒株之NS3蛋白酶及其切割位點之代表性序列之描述,參見例如Hepatitis C Viruses: Genomes and Molecular Biology (S.L. Tan編輯,Taylor及Francis,2006),第6章,第163-206頁;其以全文引用之方式併入本文中。舉例而言,提供HCV NS4A/4B蛋白酶切割位點、HCV NS5A/5B蛋白酶切割位點、具有NS4A/4B蛋白酶切割位點之C末端降解決定子、具有HCV NS5A/5B蛋白酶切割位點之N末端降解決定子之序列。代表性NS3序列列於國家生物技術資訊中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)資料庫中。參見例如NCBI條目:登錄號YP_001491553、YP_001469631、YP_001469632、NP_803144、NP_671491、YP_001469634、YP_001469630、YP_001469633、ADA68311、ADA68307、AFP99000、AFP98987、ADA68322、AFP99033、ADA68330、AFP99056、AFP99041、CBF60982、CBF60817、AHH29575、AIZ00747、AIZ00744、ABI36969、ABN05226、KF516075、KF516074、KF516056、AB826684、AB826683、JX171009、JX171008、JX171000、EU847455、EF154714、GU085487、JX171065、JX171063;所有該等序列(如以該申請案之提交日期輸入)皆以引用方式併入本文中。
蛋白酶切割位點之另一實例係ADAM17特異性蛋白酶(亦稱為腫瘤壞死因子-α轉化酶[TACE])切割位點。ADAM17特異性蛋白酶切割位點可為被ADAM17自然切割之受質之內源序列。ADAM17特異性蛋白酶切割位點可為能夠被ADAM17切割之經工程改造之序列。經工程改造之ADAM17特異性蛋白酶切割位點可針對特定期望性質經工程改造,該等性質包括但不限於嵌合蛋白之最佳表現、對ADAM17之特異性、藉由ADAM17之切割速率、經分泌嵌合蛋白水準與膜結合嵌合蛋白水準之比率,以及在不同細胞狀態下之切割。可針對藉由ADAM17之特異性切割來選擇蛋白酶切割位點。舉例而言,某些能夠被ADAM17切割之蛋白酶切割位點亦能夠被額外ADAM家族蛋白酶(諸如ADAM10)切割。因此,ADAM17特異性蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得減少或消除藉由諸如ADAM10等其他蛋白酶之切割。可針對藉由ADAM17之切割速率來選擇蛋白酶切割位點。舉例而言,可能期望選擇表現出藉由ADAM17之特定切割速率(諸如相對於被ADAM17自然切割之受質之內源序列降低之切割動力學)之蛋白酶切割位點。在該等情況下,一般而言,可選擇特定切割速率以調控嵌合蛋白之加工速率,此進而調控酬載效應分子之釋放/分泌速率。因此,ADAM17特異性蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得該序列表現出藉由ADAM17之期望切割速率。可針對藉由ADAM17之特異性切割及藉由ADAM17之切割速率二者來選擇蛋白酶切割位點。例示性ADAM17特異性蛋白酶切割位點(包括彼等表現出特定特異性及切割速率動力學者)參考切割位點示於下
表 4A中(P5-P1:N末端;P1'-P5':C末端)。ADAM17及ADAM10之其他細節(包括表現及蛋白酶切割位點)闡述於以下文獻中:Sharma等人(J Immunol 2017年10月15日,199 (8) 2865-2872);Pham等人(Anticancer Res. 2017年10月;37(10):5507-5513);Caescu等人(Biochem J. 2009年10月23日;424 (1):79-88)及Tucher等人(J. Proteome Res. 2014, 13, 4, 2205-2214),每篇皆出於目的以引用方式併入本文中。
表 4A - 潛在 ADAM17 蛋白酶切割位點序列
P5 | P4 | P3 | P2 | P1 | P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | 全序列 | SEQ ID NO | |
P | R | A | E | A | V | K | G | G | PRAEAVKGG | 179 | ||
P | R | A | E | A | L | K | G | G | PRAEALKGG | 180 | ||
P | R | A | E | Y | S | K | G | G | PRAEYSKGG | 181 | ||
P | R | A | E | P | I | K | G | G | PRAEPIKGG | 182 | ||
P | R | A | E | A | Y | K | G | G | PRAEAYKGG | 183 | ||
P | R | A | E | S | S | K | G | G | PRAESSKGG | 184 | ||
P | R | A | E | F | T | K | G | G | PRAEFTKGG | 185 | ||
D | E | P | H | Y | S | Q | R | R | DEPHYSQRR | 187 | ||
P | P | L | G | P | I | F | N | P | G | PPLGPIFNPG | 188 | |
P | L | A | Q | A | Y | R | S | S | PLAQAYRSS | 189 | ||
T | P | I | D | S | S | F | N | P | D | TPIDSSFNPD | 190 | |
V | T | P | E | P | I | F | S | L | I | VTPEPIFSLI | 191 | |
P | R | A | E | A | A | K | G | G | PRAEAAKGG | 186 |
在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含具有PRAE (SEQ ID NO: 176)之胺基酸序列之第一區。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含具有KGG (SEQ ID NO: 177)之胺基酸序列之第二區。在一些實施例中,第一區定位於第二區之N末端。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEX
1X
2KGG (SEQ ID NO: 178)之胺基酸序列,其中X
1係A、Y、P、S或F,且其中X
2係V、L、S、I、Y、T或A。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEAVKGG (SEQ ID NO: 179)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEALKGG (SEQ ID NO: 180)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEYSKGG (SEQ ID NO: 181)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEPIKGG (SEQ ID NO: 182)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEAYKGG (SEQ ID NO: 183)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAESSKGG (SEQ ID NO: 184)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEFTKGG (SEQ ID NO: 185)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PRAEAAKGG (SEQ ID NO: 186)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含DEPHYSQRR (SEQ ID NO: 187)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PPLGPIFNPG (SEQ ID NO: 188)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含PLAQAYRSS (SEQ ID NO: 189)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含TPIDSSFNPD (SEQ ID NO: 190)之胺基酸序列。在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含VTPEPIFSLI (SEQ ID NO: 191)之胺基酸序列。
在某些實施例中,切割位點包含連接體序列。切割位點可在N末端側及/或C末端側側接有連接體序列。舉例而言但無限制,切割位點可在N末端側及C末端側兩側側接有部分甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體序列。在切割後,N末端部分GS連接體及C末端部分GS連接體接合以形成GS連接體序列,諸如SEQ ID NO: 215。
在某些實施例中,切割位點及連接體包含SGGGGSGGGGSGVTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 287)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 287之例示性核酸序列係TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA(SEQ ID NO: 288)。在一些實施例中,編碼SEQ ID NO: 287之核酸可包含SEQ ID NO: 288,或與SEQ ID NO: 288至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核酸序列。
在某些實施例中,蛋白酶切割位點在連接體之N末端。在某些實施例中,蛋白酶切割位點及連接體包含PRAEALKGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 289)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 289之例示性核酸序列係CCCAGAGCCGAGGCTCTGAAAGGCGGATCAGGCGGCGGTGGTAGTGGAGGCGGAGGCTCAGGCGGCGGAGGTTCCGGAGGTGGCGGTTCCGGCGGAGGATCTCTTCAAT (SEQ ID NO: 292)。在一些實施例中,編碼SEQ ID NO: 289之核酸可包含SEQ ID NO: 292,或與SEQ ID NO: 292至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核酸序列。
在一些實施例中,蛋白酶切割位點包含ITQGLAVSTISSFF (SEQ ID NO: 198)之胺基酸序列,其係CD16天然之切割位點且可由ADAM17切割。在某些實施例中,SEQ ID NO: 198包含在連接體內。在某些實施例中,連接體包含SGGGGSGGGGSGITQGLAVSTISSFFGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 290)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 290之例示性核酸序列係AGCGGCGGAGGTGGTAGCGGAGGCGGAGGATCTGGAATTACACAGGGACTCGCCGTGTCTACAATCTCCAGCTTCTTTGGTGGCGGTAGTGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGTGGATCTCTTCAA (SEQ ID NO: 291)。在一些實施例中,編碼SEQ ID NO: 290之核酸可包含SEQ ID NO: 291,或與SEQ ID NO: 291至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核酸序列。
蛋白酶切割位點可為可分泌效應分子之C末端。蛋白酶切割位點可為可分泌效應分子之N末端。一般而言,對於本文所述之所有膜可切割嵌合蛋白而言,蛋白酶切割位點係:(1)可分泌效應分子之C末端及細胞膜系鏈結構域之N末端(換言之,蛋白酶切割位點在可分泌效應分子與細胞膜系鏈結構域之間);或(2)可分泌效應分子之N末端及細胞膜系鏈結構域之C末端(亦在可分泌效應分子與顛倒結構域定向之細胞膜系鏈結構域之間)。蛋白酶切割位點可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為效應分子或蛋白酶切割位點之一部分之多肽序列)連接至可分泌效應分子。蛋白酶切割位點可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為細胞膜系鏈結構域或蛋白酶切割位點之一部分之多肽序列)連接至細胞膜系鏈結構域。多肽連接體可為連接第一多肽序列及第二多肽序列之任何胺基酸序列。多肽連接體可為撓性連接體(例如,Gly-Ser-Gly序列)。多肽連接體之實例包括但不限於GSG連接體(例如,[GS]
4GG[SEQ ID NO: 347])、A(EAAAK)
3A (SEQ ID NO: 348)及Whitlow連接體(例如,「KEGS」連接體,諸如胺基酸序列KESGSVSSEQLAQFRSLD (SEQ ID NO: 349),eGK連接體,諸如胺基酸序列EGKSSGSGSESKST (SEQ ID NO: 350),LR1連接體,諸如胺基酸序列SGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 215),及更詳細地闡述於已頒佈之美國專利第5,990,275號中之連接體,該美國專利以引用方式併入本文中)。額外例示性多肽連接體包括SGGGGSGGGGSG (SEQ ID NO: 194)、TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 196)及GGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 197)。其他多肽連接體可基於期望之性質(例如,長度、撓性、胺基酸組成
等)來選擇且係熟習此項技術者已知的。編碼SEQ ID NO: 196之例示性核酸序列係ACCACCACACCAGCTCCTCGGCCACCAACTCCAGCTCCAACAATTGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCCGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC (SEQ ID NO: 337)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 196之核酸包含與SEQ ID NO: 337至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
在膜可切割系統中,在嵌合蛋白表現並定位至細胞膜中後,蛋白酶切割位點引導嵌合蛋白之切割,使得效應分子釋放(「分泌」)至細胞之細胞外空間中。
一般而言,切割蛋白酶切割位點之蛋白酶係對該特異性蛋白酶切割位點特異之蛋白酶。舉例而言,在去整聯蛋白及金屬蛋白酶(「ADAM」)家族蛋白酶之情況下,切割特定ADAM蛋白酶切割位點之蛋白酶一般限於一或多種特異性識別特定ADAM蛋白酶切割位點模體之ADAM蛋白酶。蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得減少或消除藉由不期望蛋白酶之切割。蛋白酶可為膜結合或膜締合的。蛋白酶可分泌,例如,在特定細胞環境(諸如腫瘤微環境(「TME」))中分泌。
切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶可在表現嵌合蛋白之同一細胞中表現。切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶對於表現嵌合蛋白之細胞而言可為內源性的。換言之,經工程改造以表現嵌合蛋白之細胞可內源性地表現對存在於嵌合蛋白中之蛋白酶切割位點特異之蛋白酶。蛋白酶之內源性表現係指在一般穩態條件下之表現(例如,一般視為健康之細胞),且亦係指在非穩態條件下之差異表現(例如,腫瘤細胞中之上調表現)。蛋白酶切割位點可基於由期望細胞群體內源表現之已知蛋白酶來選擇。在該等情況下,一般而言,蛋白酶切割位點之切割(及因此酬載之釋放/分泌)可僅限於彼等所關注細胞,此乃因細胞限制性蛋白酶需要與同一細胞中表現之嵌合蛋白之蛋白酶切割位點接觸。舉例而言,但不希望受理論束縛,鹹信ADAM17之內源性表現受限於NK細胞及T細胞。因此,ADAM17特異性蛋白酶切割位點之選擇可將蛋白酶切割位點之切割限制於共表現嵌合蛋白之NK細胞及T細胞。在其他實例中,可針對已知在所關注具體腫瘤群體中(例如,在經工程改造以表現嵌合蛋白之特定腫瘤細胞中)表現之特定腫瘤相關蛋白酶來選擇蛋白酶切割位點。蛋白酶及/或表現資料庫可用於選擇適當蛋白酶切割位點,諸如藉助諮詢Oncomine (www.oncomine.org)、歐洲生物資訊研究院(European Bioinformatic Institute) (www.ebi.ac.uk) (具體而言(www.ebi.ac.uk/gxa))、PMAP (www.proteolysis.org)、ExPASy Peptide Cutter (ca.expasy.org/tools/peptide cutter)及PMAP.Cut DB (cutdb.burnham.org) (其每一者皆出於所有目的以引用方式併入)來選擇由腫瘤相關蛋白酶切割之蛋白酶切割位點。
切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶對於表現嵌合蛋白之細胞而言可為異源性的。舉例而言,經工程改造以表現嵌合蛋白之細胞亦可經工程改造以表現該細胞一般不表現的對存在於嵌合蛋白中之蛋白酶切割位點特異之蛋白酶。經工程改造以表現嵌合蛋白及蛋白酶二者之細胞可經工程改造以自單獨的經工程改造之核酸或多順反子系統(多順反子及多啟動子系統更詳細地闡述於本文標題為「多順反子及多啟動子系統」之部分中」)表現每一者。異源蛋白酶及其對應蛋白酶切割位點可如上文所述參考內源蛋白酶來選擇。
切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶可在與表現嵌合蛋白之細胞不同之單獨細胞上表現。舉例而言,蛋白酶一般可在特定細胞環境(諸如腫瘤微環境)中表現。在該等情況下,一般而言,蛋白酶切割位點之切割可僅限於彼等所關注細胞環境(例如,腫瘤微環境),此乃因環境限制性蛋白酶需要與蛋白酶切割位點接觸。在具有膜可切割嵌合蛋白之實施例中,一般而言,效應分子之分泌可僅限於彼等所關注細胞環境(例如,腫瘤微環境),此乃因環境限制性蛋白酶需要與蛋白酶切割位點接觸。切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶對於單獨之不同細胞而言可為內源性的。切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之蛋白酶對於單獨之不同細胞而言可為異源性的。舉例而言,單獨之不同細胞可經工程改造以表現一般不被單獨之不同細胞表現之蛋白酶。
蛋白酶包括但不限於1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶及MMP9蛋白酶。蛋白酶可為NS3蛋白酶。蛋白酶可為ADAM17蛋白酶。
蛋白酶可為腫瘤相關蛋白酶,諸如細胞自溶酶、半胱胺酸蛋白酶、天冬胺醯基蛋白酶、絲胺酸蛋白酶或金屬蛋白酶。腫瘤相關蛋白酶之特定實例包括細胞自溶酶B、細胞自溶酶L、細胞自溶酶S、細胞自溶酶D、細胞自溶酶E、細胞自溶酶A、細胞自溶酶G、凝血酶、纖維蛋白溶酶、尿激酶、組織纖維蛋白溶酶原活化劑、金屬蛋白酶1 (MMP1)、MMP2、MMP3、MMP4、MMP7、MMP8、MMP9、MMP10、MMP11、MMP12、MMP13、MMP14、MMP15、MMP16、MMP17、MMP20、MMP21、MMP23、MMP24、MMP25、MMP26、MMP28、ADAM、ADAMTS、CD10 (CALLA)或前列腺特異性抗原。蛋白酶亦可包括但不限於下表4B中列出之蛋白酶。用於某些蛋白酶之例示性同源蛋白酶切割位點亦列於表4B中。
表 4B :例示性蛋白酶與同源切割位點及抑制劑
蛋白酶 (UniProt 登錄號) | 同源切割位點 | 蛋白酶抑制劑 |
HCV NS4A/4B | DEMEECSQHL (SEQ ID NO: 142) EDVVPCSMG (SEQ ID NO: 143) | 西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋 |
HCV NS5A/5B | DEMEECSQHL (SEQ ID NO: 142) EDVVPCSMG (SEQ ID NO: 143) | 西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋 |
HCV NS3 | DEMEECSQHL (SEQ ID NO: 142) EDVVPCSMG (SEQ ID NO: 143) | 西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋 |
HCV NS2-3 | DEMEECSQHL (SEQ ID NO: 142) EDVVPCSMG (SEQ ID NO: 143) | 西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋 |
HIV-1蛋白酶 (SEQ ID NO: 144) | 安普那韋(Amprenavir)、阿紮那韋(Atazanavir)、達蘆那韋(Darunavir)、福沙那韋(Fosamprenavir)、茚地那韋(Indinavir)、洛匹那韋(Lopinavir)、奈非那韋(Nelfinavir)、利托那韋(Ritonavir)、沙奎那韋(Saquinavir)、替拉那韋(Tipranavir) | |
信號肽酶(P67812、P15367、P00804、P0803) | 真核信號肽酶在pre(Δpro)apoA-II之殘基20 (Xaa 20↓)後切割較佳:Ala、Cys > Gly > Ser、Thr > Pro > Asn、Val、Ile、Leu、Tyr、His、Arg、Asp。 | |
在疏水性殘基(例如,Leu、Phe、Val或Met)處切割之蛋白原轉化酶(Q16549、Q8NBP7、Q92824、P29120、Q6UW60、P29122、Q9QXV0) | (R/K)-X-(疏水性)-X↓,其中X係任何胺基酸 | |
在諸如Ala或Thr等小胺基酸殘基處切割之蛋白原轉化酶(Q16549、Q8NBP7、Q92824、P29120、Q6UW60、P29122) | (K/R)-(X)n-(K/R)↓,其中n係0、2、4或6且X係任何胺基酸 | |
阿黑皮素原(proopiomelanocortin)轉化酶(PCE) (Q9UO77615、O776133) | 在某些激素原中之配對鹼性殘基處或在其之間或在羧基側切割 | |
嗜鉻顆粒天冬胺酸蛋白酶(CGAP) | 傾向於切割具有疏水性殘基以及β-亞甲基之二肽鍵 | |
激素原硫醇蛋白酶(細胞自溶酶L1) (P07154、P07711、P06797、P25975、Q28944) | ||
羧肽酶(例如,羧肽酶E/H、羧肽酶D及羧肽酶Z) (Q9M099、P15169、Q04609、P08819、P08818、O77564、P70627、O35409、P07519、Q8VZU3、P22792、P15087、P16870、Q9JHH6、Q96IY4、Q7L8A9) | 在蛋白或肽之羧基末端(C末端)處切割肽鍵 | |
胺肽酶(例如,精胺酸胺肽酶、離胺酸胺肽酶、胺肽酶B) | 在蛋白或肽之胺基末端(N末端)處切割肽鍵 | |
脯胺醯基內肽酶(Q12884、P48147、P97321、Q4J6C6) | 寡肽中之Pro-|-Xaa >> Ala-|-Xaa之水解。 當Yaa係Pro時,優先自多肽釋放N末端二肽(Xaa-Yaa-|-Zaa-),條件係Zaa既非Pro,亦非羥脯胺酸 | |
胺肽酶N (P97449、P15144、P15145、P15684) | 自肽、醯胺或芳基醯胺釋放N末端胺基酸(Xaa-|-Yaa-)。Xaa較佳係Ala,但可為大多數胺基酸,包括Pro (緩慢作用)。當末端疏水性殘基後跟脯胺醯基殘基時,二者可作為完整的Xaa-Pro二肽釋放 | |
胰島素降解酶(P14735、P35559、Q9JHR7、P22817、Q24K02) | 降解胰島素、升糖素及其他多肽。對蛋白無作用。 切割多個序列變化相當大之短多肽 | |
鈣蛋白酶(O08529、P17655、Q07009、Q27971、P20807、P07384、O35350、O14815、P04632、Q9Y6Q1、O15484、Q9HC96、A6NHC0、Q9UMQ6) | 無特定胺基酸序列由鈣蛋白酶唯一地識別。在蛋白受質中,三級結構元件而非一級胺基酸序列似乎負責將切割引導至特定受質。在肽及小分子受質中,最一致報導之特異性係針對P2位之小的疏水性胺基酸(例如,白胺酸、纈胺酸及異白胺酸)及P1位之大的疏水性胺基酸(例如,苯丙胺酸及酪胺酸)。一種螢光鈣蛋白酶受質係(EDANS)-Glu-Pro-Leu-Phe=Ala-Glu-Arg-Lys-(DABCYL), (EDANSEPLFAERKDABCYL (SEQ ID NO: 145)),在Phe=Ala鍵處發生切割。 | |
半胱天冬酶1 (P29466、P29452) | P1位嚴格要求為Asp殘基且具有Tyr-Val-Ala-Asp-|- (YVAD; SEQ ID NO: 146)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶2 (P42575、P29594) | P1位嚴格要求為Asp殘基,316-asp對於蛋白分解活性至關重要,且具有Val-Asp-Val-Ala-Asp-|- (VDVAD; SEQ ID NO: 147)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶3 (P42574、P70677) | P1位及P4位嚴格要求為Asp殘基。其具有Asp-Xaa-Xaa-Asp-|-之較佳切割序列,在P2處具有疏水性胺基酸殘基且在P3處具有親水性胺基酸殘基,儘管在該位亦接受Val或Ala。 | |
半胱天冬酶4 (P70343、P49662) | P1位嚴格要求為Asp。其具有Tyr-Val-Ala-Asp-|- (YVAD; SEQ ID NO: 146)之較佳切割序列,但亦在Asp-Glu-Val-Asp-|-(DEVD; SEQ ID NO: 148)處切割。 | |
半胱天冬酶5 (P51878) | P1位嚴格要求為Asp。其具有Tyr-Val-Ala-Asp-|-(YVAD;SEQ ID NO: 146)之較佳切割序列,但亦在Asp-Glu-Val-Asp-|--|-(DEVD;SEQ ID NO: 148)處切割。 | |
半胱天冬酶6 (P55212) | P1位嚴格要求為Asp且具有Val-Glu-His-Asp-|-(VEHD; SEQ ID NO: 149)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶7 (P97864、P55210) | P1位嚴格要求為Asp殘基且具有Asp-Glu-Val-Asp-|- (DEVD; SEQ ID NO: 148)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶8 (Q8IRY7、O89110、Q14790) | P1位嚴格要求為Asp且具有(Leu/Asp/Val)-Glu-Thr-Asp-|-(Gly/Ser/Ala)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶9 (P55211、Q8C3Q9、Q5IS54) | P1位嚴格要求為Asp殘基且P2位明顯較佳為His。其具有Leu-Gly-His-Asp-|-Xaa (LGHD; SEQ ID NO: 150)之較佳切割序列。 | |
半胱天冬酶10 (Q92851) | P1位嚴格要求為Asp且具有Leu-Gln-Thr-Asp-|-Gly (LQTDG; SEQ ID NO: 151)之較佳切割序列。 | |
嘌呤黴素敏感性胺肽酶(P55786、Q11011) | 自寬範圍之肽、醯胺及芳基醯胺釋放N末端胺基酸,優先係丙胺酸。 | |
血管收縮素轉化酶(ACE) (P12821、P09470、Q9BYF1) SEQ ID NO: 156 | 當Xaa不為Pro,且Yaa既非Asp亦非Glu時,釋放C末端二肽(寡肽-|-Xaa-Yaa)。 | 貝那普利(Benazepril) (洛汀新(Lotensin))、卡托普利(Captopril)、伊那拉普利(Enalapril) (凡索特(Vasotec))、福辛普利(Fosinopril)、 賴諾普利(Lisinopril) (心甯衛(Prinivil)、捷賜瑞(Zestril))、莫西普利(Moexipril)、培哚普利(Perindopril) (阿司昂(Aceon))、喹那普利(Quinapril) (恩久平(Accupril))、雷米普利(Ramipril) (阿爾塔斯(Altace))、群多普利(Trandolapril) (馬維克(Mavik))、 佐芬普利(Zofenopril) |
焦麩胺醯基肽酶II (Q9NXJ5) | 自pGlu--His-Xaa三肽及pGlu--His-Xaa-Gly四肽釋放N末端焦麩胺醯基 | |
二肽基肽酶IV (P27487、P14740、P28843) | 當Yaa係Pro時,優先自多肽釋放N末端二肽(Xaa-Yaa-|-Zaa-),條件係Zaa既非Pro,亦非羥脯胺酸 | |
N-精胺酸二元轉化酶(O43847、Q8BHG1) | 較佳在-Xaa-|-Arg-Lys-處且較不常見地在-Arg-|-Arg-Xaa-處水解多肽,其中Xaa不為Arg或Lys | |
內肽酶24.15 (thimet寡肽酶) (P52888、P24155) | 在5至15個殘基之受質中優先切割在P1、P2及P3'處具有疏水性殘基以及P1'處具有小殘基之鍵 | |
內肽酶24.16 (溶神經素) (Q9BYT8、Q91YP2) | 神經調壓素之優先切割:10-Pro-|-Tyr-11 | |
類澱粉前驅物蛋白分泌酶α (P05067、P12023、Q9Y5Z0、P56817) | 具有廣泛特異性之內肽酶。 | |
類澱粉前驅物蛋白分泌酶β (P05067、P12023、Q9Y5Z0、P56817) | 廣泛內肽酶特異性。在阿茲海默氏澱粉樣前驅物蛋白之瑞典變異體中切割Glu-Val-Asn-Leu-|-Asp-Ala-Glu-Phe (EVNLDAEF; SEQ ID NO: 152) | |
類澱粉前驅物蛋白分泌酶γ (P05067、P12023、Q9Y5Z0、P56817) | 整合膜蛋白之膜內切割 | |
MMP 1 (P03956、Q9EPL5uy) | 在α-1(I)鏈中之775-Gly-|-Ile-776處,自N末端開始,在分子長度之約四分之三處切割膠原之三螺旋。在P1'係疏水性殘基之鍵處切割合成受質及α-巨球蛋白。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 2 (P08253、P33434) | 切割I型明膠及IV、V、VII、X型膠原。切割膠原樣序列Pro-Gln-Gly-|-Ile-Ala-Gly-Gln (PQGIAGQ; SEQ ID NO: 153)。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 3 (P08254、P28862) | 優先切割P1'、P2'及P3'係疏水性殘基處。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 7 (P09237、Q10738) | 胰島素B鏈中14-Ala-|-Leu-15及16-Tyr-|-Leu-17之切割。對I、II、IV、V型膠原無作用。切割明膠鏈α-2(I) > α-1(I)。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 8 (P22894、O70138) | 可降解纖維性I、II及III型膠原。 三螺旋結構域中間質膠原之切割。與EC 3.4.24.7不同,該酶比I型更慢地切割III型膠原。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 9 (P14780、P41245) | 切割I型及V型明膠以及IV型及V型膠原。 於Gly-|-Leu鍵處切割KiSS1。 將IV型及V型膠原切割成大的C末端四分之三片段及較短的N末端四分之一片段。降解纖網蛋白,但不降解層黏連蛋白或Pz肽。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 10 (P09238、O55123) | 可降解纖網蛋白、I型、III型、IV型及V型明膠;較弱地降解膠原III、IV及V。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 11 (P24347、Q02853) | A(A/Q)(N/A)↓(L/Y)(T/V/M/R)(R/K) G(G/A)E↓LR (SEQ ID NO: 344) ↓表示切割位點 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 12 (P39900、P34960) | 可溶性及不溶性彈性蛋白之水解。在胰島素B鏈中之14-Ala-|-Leu-15及16-Tyr-|-Leu-17處亦產生特異性切割 具有顯著的彈性蛋白分解活性。在P1'位點處可接受大胺基酸及小胺基酸,但白胺酸較佳。P1位點處芳族或疏水性殘基較佳,其中小的疏水性殘基(較佳丙胺酸)佔據P3 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 13 (P45452、P33435) | 切割三螺旋膠原,包括I型、II型及III型膠原,但對可溶性II型膠原之活性最高。亦可降解IV型、XIV型及X型膠原 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
MMP 14 (P50281、P53690) | 藉由在37-Asn-|-Leu-38處切割原肽來活化明膠酶原A。其他水解之鍵包括膠原酶3之前肽中之35-Gly-|-Ile-36,以及聚集蛋白聚糖小球間結構域中之341-Asn-|-Phe-342、441-Asp-|-Leu-442及354-Gln-|-Thr-355。 | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 |
尿激酶纖維蛋白溶酶原活化劑(uPA) (P00749、P06869) | 特異性切割纖維蛋白溶酶原中之Arg-|-Val鍵以形成纖維蛋白溶酶。 | 纖維蛋白溶酶原活化劑抑制劑(PAI) |
組織纖維蛋白溶酶原活化劑(tPA) (P00750、P11214) | 特異性切割纖維蛋白溶酶原中之Arg-|-Val鍵以形成纖維蛋白溶酶。 | 纖維蛋白溶酶原活化劑抑制劑(PAI) |
組織纖維蛋白溶酶原活化劑(tPA) (P00750、P11214) | 特異性切割纖維蛋白溶酶原中之Arg-|-Val鍵以形成纖維蛋白溶酶。 | 纖維蛋白溶酶原活化劑抑制劑(PAI) |
纖維蛋白溶酶(P00747、P20918) | 優先切割:Lys-|-Xaa > Arg-|-Xaa,選擇性高於胰蛋白酶。將纖維蛋白轉化為可溶性產物。 | α-2-抗纖維蛋白溶酶(AP) |
凝血酶(P00734、P19221) | 在Arg及Lys之後切割鍵 將纖維蛋白原轉化為纖維蛋白並活化因子V、VII、VIII、XIII,且與血栓調節蛋白(蛋白C)複合。 | |
BMP-1 (原膠原C-肽酶) (P13497、P98063) | 在I型及II型原膠原中之Ala-|-Asp以及III型中之Arg-|-Asp處切割C末端原肽。 | |
ADAM (Q9P0K1、Q9UKQ2、Q9JLN6、O14672、Q13444、P78536、Q13443、O43184、P78325、Q9UKF5、Q9BZ11、Q9H2U9、Q99965、O75077、Q9H013、O43506) | SB-3CT p-OH SB-3CT O-磷酸SB-3CT酯 RXP470.1 | |
顆粒酶A (P12544、P11032) | 優先切割:在小分子受質中,-Arg-|-Xaa-、-Lys-|-Xaa- >> -Phe-|-Xaa-。 | |
顆粒酶B (P10144、P04187) | P1位處龐大芳族殘基較佳,且P3'及P4'位點處酸性殘基較佳。 | |
顆粒酶M (P51124、Q03238) | 在甲硫胺酸、白胺酸及正白胺酸之後切割肽受質。 | |
菸草蝕紋病毒(TEV)蛋白酶(P04517、P0CK09) | E-Xaa-Xaa-Y -Xaa-Q-(G/S),其中切割發生在Q與G/S之間。最常見的序列係ENLYFQS (SEQ ID NO: 154) | |
胰凝乳蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶(P08217、Q9UNI1、Q91X79、P08861、P09093、P08218) | -褐色高溫雙岐菌( Thermobifida fusca) Thermopin -好氧熱棒菌( Pyrobaculum aerophilum) Aeropin -柯達卡拉熱球菌( Thermococcus kodakaraensis) Tk-絲胺酸蛋白酶抑制劑 -交替單胞菌屬種( Alteromonas sp.)海藻抑素(Marinostatin) -米修鏈黴菌( Streptomyces misionensis) SMTI -鏈黴菌屬種胰凝乳蛋白酶抑制劑(chymostatin) | |
α病毒蛋白酶(P08411、P03317、P13886、Q8JUX6、Q86924、Q4QXJ8、Q8QL53、P27282、Q5XXP4) | ||
胰凝乳蛋白酶樣半胱胺酸蛋白酶(Q86TL0、Q14790、Q99538、O15553) | -褐色高溫雙岐菌Thermopin -好氧熱棒菌Aeropin -柯達卡拉熱球菌Tk-絲胺酸蛋白酶抑制劑 -交替單胞菌屬種海藻抑素 -米修鏈黴菌SMTI -鏈黴菌屬種胰凝乳蛋白酶抑制劑 | |
木瓜酶樣半胱胺酸蛋白酶(P25774、P53634、Q96K76) | ||
微小RNA病毒前導蛋白酶(P03305、P03311、P13899) | ||
HIV蛋白酶(P04585、P03367、P04584、P03369、P12497、P03366、P04587) | ||
疱疹病毒蛋白酶(P10220、Q2HRB6、O40922、Q69527) | ||
腺病毒蛋白酶(P03252、P24937、Q83906、P68985、P09569、P11825、P10381) | ||
灰色鏈黴菌(Streptomyces griseus)蛋白酶A (SGPA) (P00776) | ||
灰色鏈黴菌蛋白酶B (SGPB) (P00777) | ||
α-裂解蛋白酶(P85142、P00778) | ||
絲胺酸蛋白酶(P48740、P98064、Q9UL52、P05981、O60235) | ||
半胱胺酸蛋白酶(Q86TL0、Q14790、Q8WYN0、Q96DT6、P55211) | ||
天冬胺酸蛋白酶(Q9Y5Z0、P56817、Q00663、Q53RT3、P0CY27) | ||
蘇胺酸蛋白酶(Q9UI38、Q16512、Q9H6P5、Q8IWU2) | ||
肥大細胞(MC)凝乳酶(CMA1) (NM_001836) | Abz-HPFHL-Lys(Dnp)-NH2(SEQ ID NO: 155) | BAY 1142524 SUN13834 |
大鼠肥大細胞蛋白酶-1、-2、-3、-4、-5 (NM_017145、NM_172044、NM_001170466、NM_019321、NM_013092) | Abz-HPFHL-Lys(Dnp)-NH2(SEQ ID NO: 155) | TY-51469 |
大鼠血管凝乳酶(RVCH) (O70500) | Abz-HPFHL-Lys(Dnp)-NH2(SEQ ID NO: 155) | |
DENV NS3pro (NS2B/NS3) SEQ ID NO:157、158、159、160 | 觀察到P1位極佳(strong preference)為鹼性胺基酸殘基(Arg/Lys),而P2-4位點之優先性按以下順序:P2為Arg > Thr > Gln/Asn/Lys,P3為Lys > Arg > Asn,且P4為Nle > Leu > Lys > Xaa。主要位點受質特異性係針對P1及P3中之小極性胺基酸。 | 蒽醌 BP13944 ZINC04321905 MB21 聚甲酚磺醛 SK-12 NSC135618 膽綠素 |
蛋白酶可為以下人類蛋白酶中之任一種(於括號中提供之MEROPS肽酶資料庫編號;Rawlings N. D., Morton F. R., Kok, C. Y., Kong, J.及Barrett A. J. (2008) MEROPS: the peptidase database. Nucleic Acids Res. 36 Database issue, D320-325;其出於所有目的以引用方式併入本文中):胃蛋白酶A (MER000885)、胃亞蛋白酶(MER000894)、memapsin-2 (MER005870)、腎素(MER000917)、細胞自溶酶D (MER000911)、細胞自溶酶E (MER000944)、memapsin-1 (MER005534)、胃酶樣天冬胺酸蛋白酶(napsin) A (MER004981)、Mername-AA034肽酶(MER014038)、胃蛋白酶A4 (MER037290)、胃蛋白酶A5 (智人) (MER037291)、hCG1733572 (智人)型推定肽酶(MER107386)、胃酶樣天冬胺酸蛋白酶B偽基因(MER004982)、CYMP g.p. (智人) (MER002929)、亞家族A1A未指定肽酶(MER181559)、小鼠乳房腫瘤病毒逆轉錄胃蛋白酶(retropepsin) (MER048030)、兔內源性逆轉錄病毒內肽酶(MER043650)、S71相關人類內源性逆轉錄胃蛋白酶(MER001812)、RTVL-H型推定肽酶(MER047117)、RTVL-H型推定肽酶(MER047133)、RTVL-H型推定肽酶(MER047160)、RTVL-H型推定肽酶(MER047206)、RTVL-H型推定肽酶(MER047253)、RTVL-H型推定肽酶(MER047260)、RTVL-H型推定肽酶(MER047291)、RTVL-H型推定肽酶(MER047418)、RTVL-H型推定肽酶(MER047440)、RTVL-H型推定肽酶(MER047479)、RTVL-H型推定肽酶(MER047559)、RTVL-H型推定肽酶(MER047583)、RTVL-H型推定肽酶(MER015446)、人類內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶同源物1 (MER015479)、人類內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶同源物2 (MER015481)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因1 (智人染色體14) (MER029977)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因2 (智人染色體8) (MER029665)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因3 (智人染色體17) (MER002660)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因3 (智人染色體17) (MER030286)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因3 (智人染色體17) (MER047144)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因5 (智人染色體12) (MER029664)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因6 (智人染色體7) (MER002094)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因7 (智人染色體6) (MER029776)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因8 (智人染色體Y) (MER030291)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因9 (智人染色體19) (MER029680)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因10 (智人染色體12) (MER002848)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因11 (智人染色體17) (MER004378)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因12 (智人染色體11) (MER003344)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因13 (智人染色體2及類似) (MER029779)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因14 (智人染色體2) (MER029778)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因15 (智人染色體4) (MER047158)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因15 (智人染色體4) (MER047332)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因15 (智人染色體4) (MER003182)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER047165)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER047178)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER047200)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER047315)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER047405)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因16 (MER030292)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因17 (智人染色體8) (MER005305)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因18 (智人染色體4) (MER030288)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因19 (智人染色體16) (MER001740)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因21 (智人) (MER047222)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因21 (智人) (MER047454)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因21 (智人) (MER047477)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因21 (智人) (MER004403)、內源性逆轉錄病毒逆轉錄胃蛋白酶偽基因22 (智人染色體X) (MER030287)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047046)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047052)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047076)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047080)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047088)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047089)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047091)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047092)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047093)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047094)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047097)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047099)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047101)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047102)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047107)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047108)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047109)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047110)、亞家族A2A非肽酶同源物MER047111)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047114)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047118)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047121)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047122)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047126)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047129)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047130)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047134)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047135)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047137)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047140)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047141)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047142)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047148)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047149)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047151)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047154)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047155)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047156)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047157)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047159)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047161)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047163)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047166)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047171)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047173)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047174)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047179)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047183)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047186)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047190)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047191)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047196)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047198)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047199)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047201)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047202)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047203)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047204)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047205)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047207)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047208)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047210)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047211)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047212)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047213)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047215)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047216)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047218)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047219)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047221)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047224)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047225)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047226)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047227)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047230)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047232)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047233)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047234)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047236)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047238)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047239)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047240)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047242)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047243)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047249)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047251)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047252)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047254)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047255)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047263)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047265)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047266)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047267)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047268)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047269)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047272)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047273)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047274)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047275)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047276)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047279)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047280)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047281)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047282)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047284)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047285)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047289)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047290)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047294)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047295)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047298)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047300)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047302)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047304)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047305)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047306)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047307)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047310)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047311)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047314)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047318)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047320)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047321)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047322)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047326)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047327)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047330)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047333)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047362)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047366)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047369)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047370)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047371)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047375)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047376)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047381)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047383)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047384)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047385)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047388)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047389)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047391)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047394)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047396)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047400)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047401)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047403)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047406)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047407)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047410)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047411)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047413)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047414)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047416)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047417)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047420)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047423)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047424)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047428)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047429)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047431)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047434)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047439)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047442)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047445)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047449)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047450)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047452)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047455)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047457)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047458)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047459)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047463)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047468)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047469)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047470)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047476)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047478)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047483)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047488)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047489)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047490)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047493)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047494)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047495)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047496)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047497)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047499)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047502)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047504)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047511)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047513)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047514)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047515)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047516)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047520)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047533)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047537)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047569)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047570)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047584)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047603)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047604)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047606)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047609)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047616)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047619)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047648)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047649)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER047662)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER048004)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER048018)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER048019)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER048023)、亞家族A2A非肽酶同源物(MER048037)、亞家族A2A未指定肽酶(MER047164)、亞家族A2A未指定肽酶(MER047231)、亞家族A2A未指定肽酶(MER047386)、皮膚天冬胺酸蛋白酶(MER057097)、早老素1 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(MER043126)、芳基乙醯胺去乙醯基酶(MER033237)、KIAA1363樣蛋白(MER033242)、激素敏感性脂肪酶(MER033274)、神經連接蛋白1 (MER033280)、神經連接蛋白2 (MER033283)、家族S9非肽酶同源物(MER212939)、家族S9非肽酶同源物(MER211490)、亞家族S9C未指定肽酶(MER192341)、家族S9未指定肽酶(MER209181)、家族S9未指定肽酶(MER200434)、家族S9未指定肽酶(MER209507)、家族S9未指定肽酶(MER209142)、絲胺酸羧肽酶A (MER000430)、卵黃羧肽酶樣蛋白(MER005492)、RISC肽酶(MER010960)、家族S15未指定肽酶(MER199442)、家族S15未指定肽酶(MER200437)、家族S15未指定肽酶(MER212825)、溶酶體Pro-Xaa羧肽酶(MER000446)、二肽基-肽酶II (MER004952)、胸腺物異性絲胺酸肽酶(MER005538)、環氧化物水解酶樣推定肽酶(MER031614)、Loc328574樣蛋白(MER033246)、含α/β-水解酶(abhydrolase)結構域之蛋白4 (MER031616)、環氧化物水解酶(MER000432)、中胚層特異性轉錄物蛋白(MER199890)、中胚層特異性轉錄物蛋白(MER017123)、細胞溶質環氧化物水解酶(MER029997)、細胞溶質環氧化物水解酶(MER213866)、類似於假定蛋白FLJ22408 (MER031608)、CGI-58推定肽酶(MER030163)、Williams-Beuren症候群臨界區蛋白21環氧化物水解酶(MER031610)、環氧化物水解酶(MER031612)、假定蛋白922408 (環氧化物水解酶) (MER031617)、單甘油酯脂肪酶(MER033247)、假定蛋白(MER033249)、伐昔洛韋(valacyclovir)水解酶(MER033259)、Ccg1相互作用因子b (MER210738)、糖基天冬醯胺酸酶前驅物(MER003299)、異天冬胺醯基二肽酶(蘇胺酸型) (MER031622). 蘇胺酸天冬胺酸酶-1 (MER016969)、γ-麩胺醯基轉移酶5 (哺乳動物型) (MER001977)、γ-麩胺醯基轉移酶1 (哺乳動物型) (MER001629)、γ-麩胺醯基轉移酶2 (智人) (MER001976)、γ-麩胺醯基轉移酶樣蛋白4 (MER002721). γ-麩胺醯基轉移酶樣蛋白3 (MER016970). 類似於γ-麩胺醯基轉移酶1前驅物(智人) (MER026204). 類似於γ-麩胺醯基轉移酶1前驅物(智人) (MER026205). Mername-AA211推定肽酶(MER026207). γ-麩胺醯基轉移酶6 (MER159283). γ-麩胺醯基轉肽酶同源物(染色體2,智人) (MER037241). 多囊蛋白-1 (MER126824)、KIAA1879蛋白(MER159329). 多囊腎病1樣3 (MER172554). γ-麩胺醯基水解酶(MER002963). 鳥嘌呤5″-單磷酸合成酶(MER043387). 胺基甲醯基-磷酸合成酶(智人型) (MER078640). 二氫乳清酸酶(N末端單元) (智人型) (MER060647). DJ-1推定肽酶(MER003390). Mername-AA100推定肽酶(MER014802). Mername-AA101非肽酶同源物(MER014803). KIAA0361蛋白(智人型) (MER042827). F1134283蛋白(智人) (MER044553). 非肽酶同源物染色體21開讀框33 (智人) (MER160094). 家族C56非肽酶同源物(MER177016)、家族C56非肽酶同源物(MER176613). 家族C56非肽酶同源物(MER176918). 含EGF樣模組之黏蛋白樣激素受體樣2 (MER037230). CD97抗原(人類型) (MER037286). 含EGF樣模組之黏蛋白樣激素受體樣3 (MER037288). 含EGF樣模組之黏蛋白樣激素受體樣1 (MER037278). 含EGF樣模組之黏蛋白樣激素受體樣4 (MER037294). 鈣黏蛋白EGF LAG七經G型受體2前驅物(智人) (MER045397)、Gpr64 (家鼷鼠)型蛋白(MER123205). GPR56 (智人)型蛋白(MER122057). 蜘蛛毒素親和蛋白2 (MER122199). 蜘蛛毒素親和蛋白-1 (MER126380). 蜘蛛毒素親和蛋白3 (MER124612). 原鈣黏蛋白紅鸛2 (MER124239). ETL蛋白(MER126267). G蛋白偶聯受體112 (MER126114). 七次跨膜螺旋受體(MER125448). Gpr114蛋白(MER159320). GPR126血管誘導型G蛋白偶聯受體(MER140015). GPR125 (智人)型蛋白(MER159279). GPR116 (智人)型G蛋白偶聯受體(MER159280). GPR128 (智人)型G蛋白偶聯受體(MER162015). GPR133 (智人)型蛋白(MER159334) GPR110 G蛋白偶聯受體(MER159277)、GPR97蛋白(MER159322)、KPG_006蛋白(MER161773) KPG_008蛋白(MER161835)、KPG_009蛋白(MER159335)、未指定同源物(MER166269)、GPR113蛋白(MER159352)、腦特異性血管生成抑制劑2 (MER159746)、PIDD自動加工蛋白單元1 (MER020001)、PIDD自動加工蛋白單元2 (MER063690)、MUC1自切割黏蛋白(MER074260)、肌萎縮蛋白聚糖(MER054741)、蛋白原轉化酶9 (MER022416)、位點-1肽酶(MER001948)、弗林蛋白酶(MER000375)、蛋白原轉化酶1 (MER000376)、蛋白原轉化酶2 (MER000377)、蛋白原轉化酶4 (MER028255)、PACE4蛋白原轉化酶(MER000383)、蛋白原轉化酶5 (MER002578)、蛋白原轉化酶7 (MER002984)、三肽基-肽酶II (MER000355)、亞家族S8A非肽酶同源物(MER201339)、亞家族S8A非肽酶同源物(MER191613)、亞家族S8A未指定肽酶(MER191611)、亞家族S8A未指定肽酶(MER191612)、亞家族S8A未指定肽酶(MER191614)、三肽基-肽酶I (MER003575)、脯胺醯基寡肽酶(MER000393)、二肽基-肽酶IV (真核生物) (MER000401)、醯基胺基醯基-肽酶(MER000408)、纖維母細胞活化蛋白α次單元(MER000399)、PREPL A蛋白(MER004227)、二肽基-肽酶8 (MER013484)、二肽基-肽酶9 (MER004923)、FLJ1推定肽酶(MER017240)、Mername-AA194推定肽酶(MER017353)、Mername-AA195推定肽酶(MER017367)、Mername-AA196推定肽酶(MER017368)、Mername-AA197推定肽酶(MER017371)、C14orf29蛋白(MER033244)、假定蛋白(MER033245)、假定酯酶/脂肪酶/硫酯酶(MER047309)、蛋白bat5 (MER037840)、假定蛋白flj40219 (MER033212)、假定蛋白flj37464 (MER033240)、假定蛋白flj33678 (MER033241)、二肽基肽酶同源物DPP6 (MER000403)、二肽基肽酶同源物DPP10 (MER005988)、類似於家鼷鼠染色體20開讀框135之蛋白(MER037845)、犬尿胺酸甲醯胺酶(MER046020)、甲狀腺球蛋白前驅物(MER011604)、乙醯膽鹼酯(MER033188)、膽鹼酯酶(MER033198)、羧基酯酶D1 (MER033213)、肝臟羧基酯酶(MER033220)、羧基酯酶3 (MER033224)、羧基酯酶2 (MER033226)、膽鹽依賴性脂肪酶(MER033227)、羧基酯酶相關蛋白(MER033231)、神經連接蛋白3 (MER033232)、神經連接蛋白4, X連鎖(MER033235)、神經連接蛋白4, Y連鎖(MER033236)、酯酶D (MER043126)、芳基乙醯胺去乙醯基酶(MER033237)、KIAA1363樣蛋白(MER033242)、激素敏感性脂肪酶(MER033274)、神經連接蛋白1 (MER033280)、神經連接蛋白2 (MER033283)、家族S9非肽酶同源物(MER212939)、家族S9非肽酶同源物(MER211490)、亞家族S9C未指定肽酶(MER192341)、家族S9未指定肽酶(MER209181)、家族S9未指定肽酶(MER200434)、家族S9未指定肽酶(MER209507)、家族S9未指定肽酶(MER209142)、絲胺酸羧肽酶A (MER000430)、卵黃羧肽酶樣蛋白(MER005492)、RISC肽酶(MER010960)、家族S15未指定肽酶(MER199442)、家族S15未指定肽酶(MER200437)、家族S15未指定肽酶(MER212825)、溶酶體Pro-Xaa羧肽酶(MER000446)、二肽基-肽酶II (MER004952)、胸腺物異性絲胺酸肽酶(MER005538)、環氧化物水解酶樣推定肽酶(MER031614)、Loc328574樣蛋白(MER033246)、含α/β-水解酶結構域之蛋白4 (MER031616)、環氧化物水解酶(MER000432)、中胚層特異性轉錄物蛋白(MER199890)、中胚層特異性轉錄物蛋白(MER017123)、細胞溶質環氧化物水解酶(MER029997)、細胞溶質環氧化物水解酶(MER213866)、類似於假定蛋白FLJ22408 (MER031608)、CGI-58推定肽酶(MER030163)、Williams-Beuren症候群臨界區蛋白21環氧化物水解酶(MER031610)、環氧化物水解酶(MER031612)、假定蛋白flj22408 (環氧化物水解酶) (MER031617)、單甘油酯脂肪酶(MER033247)、假定蛋白(MER033249)、伐昔洛韋(valacyclovir)水解酶(MER033259)、Ccg1相互作用因子b (MER210738)。
可調控蛋白酶酶促活性。舉例而言,某些蛋白酶可藉由特定劑(例如,結合至蛋白酶之劑,諸如特定小分子抑制劑)之存在或缺失而失活。該等蛋白酶可稱為「阻遏性蛋白酶」。用於某些蛋白酶之例示性抑制劑列於表4B中。舉例而言,NS3蛋白酶可被包括但不限於以下之蛋白酶抑制劑阻遏:西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋、格卡瑞韋及伏西瑞韋。在另一實例中,蛋白酶活性可藉助調控蛋白酶本身之表現來調控,諸如對細胞進行工程改造以使用誘導型啟動子系統(例如,Tet On/Off系統)或細胞特異性啟動子(可用於表現異源性蛋白酶之啟動子更詳細地闡述於本文標題為「啟動子」之部分中)表現蛋白酶。蛋白酶亦可含有降解決定子,諸如本文所述之任何降解決定子,且可使用本文所述之任何降解決定子系統來調控。
蛋白酶之酶促活性亦可藉助選擇特異性蛋白酶切割位點來調控。舉例而言,蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得該序列表現出藉由期望蛋白酶之期望切割速率,諸如相對於被期望蛋白酶自然切割之受質之內源序列降低之切割動力學。作為另一實例,蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得該序列以細胞狀態特異性方式表現出期望切割速率。舉例而言,各種細胞狀態(例如,在細胞傳訊之後,諸如免疫細胞活化)可影響某些蛋白酶之表現及/或定位。作為說明性實例,已知ADAM17蛋白水準及定位受傳訊影響,諸如藉助蛋白激酶C (PKC)傳訊路徑(例如,由PKC活化劑(佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯[Phorbol-12-myristat-13-acetat, PMA])活化)傳訊。因此,蛋白酶切割位點可經選擇及/或工程改造,使得蛋白酶切割位點之切割及效應分子之隨後釋放視需要增加或減少,此取決於特定細胞狀態下之蛋白酶性質(例如,表現及/或定位)。作為另一實例,蛋白酶切割位點(尤其是與特定膜系鏈結構域組合)可經選擇及/或工程改造以達成嵌合蛋白之最佳蛋白表現。
細胞膜系鏈結構域
本文所提供之膜可切割嵌合蛋白包含細胞膜系鏈結構域(在式
S - C - MT或
MT - C - S中稱為「MT」)。一般而言,細胞膜系鏈結構域可為能夠引導嵌合蛋白定位至(例如,插入)表現嵌合蛋白之細胞之細胞膜中或以其他方式與該細胞膜締合之任何胺基酸序列模體。細胞膜系鏈結構域可為跨膜-細胞內結構域。細胞膜系鏈結構域可為跨膜結構域。細胞膜系鏈結構域可為整合膜蛋白結構域(例如,跨膜結構域)。細胞膜系鏈結構域可源自I型、II型或III型跨膜蛋白。細胞膜系鏈結構域可包括轉譯後修飾標籤、或能夠進行轉譯後修飾以修飾嵌合蛋白以包括轉譯後修飾標籤之模體,其中該轉譯後修飾標籤容許與細胞膜締合。轉譯後修飾標籤之實例包括但不限於脂質錨結構域(例如,GPI脂質錨、肉豆蔻醯化標籤或棕櫚醯化標籤)。細胞膜系鏈結構域之實例包括但不限於源自PDGFR-β、CD8、CD28、CD3ζ鏈、CD4、4-1BB、OX40、ICOS、CTLA-4、PD-1、LAG-3、2B4、LNGFR、NKG2D、EpoR、TNFR2、B7-1或BTLA之跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域。細胞膜系鏈結構域可為細胞表面受體或其細胞膜結合部分。例示性細胞膜系鏈結構域之序列提供於
表 4C中。
表 4C.
來源 | 胺基酸序列 | DNA 序列 |
B7-1 | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV (SEQ ID NO: 219) | CTGCTGCCAAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGTTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTCGGTGCAGAGAGCGGAGAAGAAACGAACGGCTGCGGAGAGAATCTGTGCGGCCTGTG (SEQ ID NO: 220) 或 CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT (SEQ ID NO: 331) |
一般而言,對於本文所述之所有膜可切割嵌合蛋白而言,細胞膜系鏈結構域係:(1)蛋白酶切割位點之C末端及任何細胞內結構域之N末端(若存在) (換言之,細胞膜系鏈結構域在蛋白酶切割位點與細胞內結構域(若存在)之間);或(2)蛋白酶切割位點之N末端及任何細胞內結構域之C末端(若存在) (亦在蛋白酶切割位點與倒轉結構域定向之細胞內結構域(若存在)之間)。在以與嵌合蛋白締合之降解決定子為特徵之實施例中,降解決定子結構域係末端細胞質定向結構域,特定而言關於細胞膜系鏈(換言之,細胞膜系鏈結構域在蛋白酶切割位點與降解決定子之間)。細胞膜系鏈結構域可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為細胞膜系鏈結構域或蛋白酶切割位點之一部分之多肽序列)連接至蛋白酶切割位點。細胞膜系鏈結構域可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為細胞膜系鏈結構域或細胞內結構域之一部分之多肽序列)連接至細胞內結構域(若存在)。細胞膜系鏈結構域可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為細胞膜系鏈結構域或降解決定子之一部分之多肽序列)連接至降解決定子(若存在)。多肽連接體可為連接第一多肽序列及第二多肽序列之任何胺基酸序列。多肽連接體可為撓性連接體(例如,Gly-Ser-Gly序列)。多肽連接體之實例包括但不限於GSG連接體(例如,[GS]
4GG[SEQ ID NO: 347])、A(EAAAK)
3A (SEQ ID NO: 348)及Whitlow連接體(例如,「KEGS」連接體,諸如胺基酸序列KESGSVSSEQLAQFRSLD (SEQ ID NO: 349),eGK連接體,諸如胺基酸序列EGKSSGSGSESKST (SEQ ID NO: 350),LR1連接體,諸如胺基酸序列SGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 215),及更詳細地闡述於已頒佈之美國專利第5,990,275號中之連接體,該美國專利以引用方式併入本文中)。額外多肽連接體包括SEQ ID NO: 194、SEQ ID NO: 196及SEQ ID NO: 197。其他多肽連接體可基於期望之性質(例如,長度、撓性、胺基酸組成等)來選擇且係熟習此項技術者已知的。
一般而言,細胞膜系鏈結構域定向成使得經分泌效應分子及蛋白酶切割位點在插入細胞膜中或與細胞膜締合後暴露於細胞外,使得蛋白酶切割位點能夠被其各別蛋白酶切割且將效應分子釋放(「分泌」)至細胞外空間中。
降解決定子系統及結構域
在一些實施例中,本文所述之任何蛋白可包括降解決定子結構域,包括但不限於細胞介素、CAR、蛋白酶、轉錄因子、啟動子或啟動子系統之組成部分(例如,ACP),及/或本文所述之任何膜可切割嵌合蛋白。一般而言,降解決定子結構域可為能夠引導受調控降解(諸如藉助泛素介導之路徑之受調控降解)之任何胺基酸序列模體。在存在免疫調節藥物(IMiD)之情況下,降解決定子結構域引導泛素介導之降解決定子融合蛋白之降解。
降解決定子結構域可為能夠因應免疫調節藥物(IMiD)而結合羥腦苷脂(CRBN)之CRBN多肽受質結構域,包括但不限於IKZF1、IKZF3、CKla、ZFP91、GSPT1、MEIS2、GSS E4F1、ZN276、ZN517、ZN582、ZN653、ZN654、ZN692、ZN787及ZN827或其能夠藥物誘導性結合CRBN之片段。CRBN多肽受質結構域可為天然CRBN多肽序列之嵌合融合產物,諸如具有FNVLMVHKRSHTGERPLQCEICGFTCRQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLCNYACQRRDAL (SEQ ID NO: 175)之胺基酸序列之IKZF3/ZFP91/IKZF3嵌合融合產物。降解決定子結構域且具體而言CRBN降解決定子系統更詳細地闡述於國際申請公開案第WO2019/089592Al號中,該國際申請公開案出於所有目的以引用方式併入本文中。降解決定子結構域之其他實例包括但不限於HCV NS4降解決定子、PEST (人類IκBα之殘基277-307之兩個拷貝;SEQ ID NO: 161)、GRR (人類p105之殘基352-408;SEQ ID NO: 162)、DRR (酵母Cdc34之殘基210-295;SEQ ID NO: 163)、SNS (SP2及NB之銜接重複(A型流感或B型流感之SP2-NB-SP2;例如,SEQ ID NO: 164)、RPB (酵母RPB之殘基1688-1702之四個拷貝;SEQ ID NO: 165)、SPmix (SP1及SP2之銜接重複(A型流感病毒M2蛋白之SP2-SP1-SP2-SP1-SP2;SEQ ID NO: 166)、NS2 (A型流感病毒NS蛋白之殘基79-93之三個拷貝;SEQ ID NO: 167)、ODC (鳥胺酸去羧酶之殘基106-142;SEQ ID NO: 168)、Nek2A、小鼠ODC (殘基422-461;SEQ ID NO: 169)、小鼠ODC_DA (mODC之殘基422-461,包括D433A及D434A點突變)、APC/C降解決定子、COP1 E3連接酶結合降解決定子模體、CRL4-Cdt2結合PIP降解決定子、actinfilin結合降解決定子、KEAP1結合降解決定子、KLHL2及KLHL3結合降解決定子、MDM2結合模體、N-降解決定子、缺氧傳訊中之羥脯胺酸修飾、植物激素依賴性SCF-LRR結合降解決定子、SCF泛素連接酶結合磷酸化降解決定子、植物激素依賴性SCF-LRR-結合降解決定子、DSGxxS磷酸依賴性降解決定子(SEQ ID NO: 345)、Siah結合模體、SPOP SBC對接模體或PCNA結合PIP框。
受調控之降解可為藥物誘導型。能夠介導/調控降解之藥物可為小分子化合物。能夠介導/調控降解之藥物可包括「免疫調節藥物」(IMiD)。一般而言,如本文所用,IMiD係指一類含有醯亞胺基團之小分子免疫調節藥物。羥腦苷脂(CRBN)係IMiD之已知靶標,且IMiD結合至CRBN或CRBN多肽受質結構域改變CRBN E3泛素連接酶複合物之受質特異性,導致具有CRBN多肽受質結構域之蛋白(例如,本文所述之任何可分泌效應分子或其他所關注蛋白)之降解。對於具有CRBN多肽受質結構域之降解決定子結構域而言,含醯亞胺之IMiD之實例包括但不限於沙利竇邁(thalidomide)、雷利竇邁(lenalidomide)或泊馬竇邁(pomalidomide)。IMiD可為經FDA批準之藥物。
本文所述之蛋白可含有降解決定子結構域(例如,在用於本文所述之膜可切割嵌合蛋白之式
S - C - MT - D或
D - MT - C - S中,稱為「D」)。在不存在IMiD之情況下,不會發生降解決定子/泛素介導之嵌合蛋白降解。在嵌合蛋白表現並定位至細胞膜中後,蛋白酶切割位點引導嵌合蛋白之切割,使得效應分子釋放(「分泌」)至細胞外空間中。在存在免疫調節藥物(IMiD)之情況下,降解決定子結構域引導泛素介導之嵌合蛋白之降解,使得效應分子之分泌減少或消除。一般而言,對於融合至降解決定子結構域之膜可切割嵌合蛋白而言,降解決定子結構域係末端細胞質定向結構域,特定而言關於細胞膜系鏈結構域,例如,式
S - C - MT - D中之最C末端結構域或式
D - MT - C - S中之最N末端結構域。降解決定子結構域可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為細胞膜系鏈結構域或降解決定子結構域之一部分之多肽序列)連接至細胞膜系鏈結構域。多肽連接體可為連接第一多肽序列及第二多肽序列之任何胺基酸序列。多肽連接體可為撓性連接體(例如,Gly-Ser-Gly序列)。多肽連接體之實例包括但不限於GSG連接體(例如,[GS]
4GG[SEQ ID NO: 347])、A(EAAAK)
3A (SEQ ID NO: 348)及Whitlow連接體(例如,「KEGS」連接體,諸如胺基酸序列KESGSVSSEQLAQFRSLD (SEQ ID NO: 349),eGK連接體,諸如胺基酸序列EGKSSGSGSESKST (SEQ ID NO: 350),LR1連接體,諸如胺基酸序列SGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 215),及更詳細地闡述於已頒佈之美國專利第5,990,275號中之連接體,該美國專利以引用方式併入本文中)。額外多肽連接體包括SEQ ID NO: 194、SEQ ID NO: 196及SEQ ID NO: 197。其他多肽連接體可基於期望之性質(例如,長度、撓性、胺基酸組成等)來選擇且係熟習此項技術者已知的。一般而言,降解決定子相對於細胞膜系鏈結構域定向,使得降解決定子在定位至細胞膜後暴露於細胞溶質,使得降解決定子結構域能夠介導降解(例如,暴露於細胞溶質及細胞溶質)且能夠介導泛素介導之降解。
對於降解決定子融合蛋白,降解決定子結構域可為所關注蛋白(例如,效應分子)之N末端或C末端。降解決定子結構域可藉由多肽連接體(亦即,一般不視為所關注蛋白或降解決定子結構域之一部分之多肽序列)連接至所關注蛋白。多肽連接體可為連接第一多肽序列及第二多肽序列之任何胺基酸序列。多肽連接體可為撓性連接體(例如,Gly-Ser-Gly序列)。多肽連接體之實例包括但不限於GSG連接體(例如,[GS]
4GG[SEQ ID NO: 347])、A(EAAAK)
3A (SEQ ID NO: 348)及Whitlow連接體(例如,「KEGS」連接體,諸如胺基酸序列KESGSVSSEQLAQFRSLD (SEQ ID NO: 349),eGK連接體,諸如胺基酸序列EGKSSGSGSESKST (SEQ ID NO: 350),LR1連接體,諸如胺基酸序列SGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ (SEQ ID NO: 215),及更詳細地闡述於已頒佈之美國專利第5,990,275號中之連接體,該美國專利以引用方式併入本文中)。額外多肽連接體包括SEQ ID NO: 194、SEQ ID NO: 196及SEQ ID NO: 197。其他多肽連接體可基於期望之性質(例如,長度、撓性、胺基酸組成等)來選擇且係熟習此項技術者已知的。多肽連接體可為可切割的,例如,本文所述之任何蛋白酶切割位點。
經工程改造之核酸
本文提供經工程改造之核酸(例如,表現盒),其編碼至少一種本揭示案之蛋白,諸如本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。本文提供經工程改造之核酸(例如,表現盒),其編碼兩種或更多種蛋白,諸如本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白中之兩種或更多種。
在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子以及編碼細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白之外源性多核苷酸序列,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S。S係指可分泌效應分子。C係指蛋白酶切割位點。MT係指細胞膜系鏈結構域。啟動子可操作地連接至外源性多核苷酸序列,且
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子及編碼細胞介素之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子及編碼CAR之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子及編碼膜可切割嵌合蛋白之外源性多核苷酸序列,該膜可切割嵌合蛋白具有所關注蛋白(例如,本文所述之任何效應分子)。啟動子可操作地連接至外源性多核苷酸序列,且膜可切割嵌合蛋白經構形以表現為單一多肽。
在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子及編碼本文所述細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白之組合之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子以及編碼細胞介素及CAR之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼表現盒,該表現盒含有啟動子以及編碼細胞介素及ACP之外源性多核苷酸序列。
在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼兩個或更多個表現盒,該等表現盒各自含有啟動子及編碼本文所述細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼兩個或更多個表現盒,該等表現盒分別各自含有啟動子且各自單獨地編碼編碼細胞介素及CAR之外源性多核苷酸序列。在本文所述之某些實施例中,經工程改造之核酸編碼兩個或更多個表現盒,該等表現盒分別各自含有啟動子且各自單獨地編碼編碼細胞介素及ACP之外源性多核苷酸序列。在某些實施例中,兩個或更多個表現盒以頭對尾定向來定向。在某些實施例中,兩個或更多個表現盒以頭對頭定向來定向。在某些實施例中,兩個或更多個表現盒以尾對尾定向來定向。在一些情況下,各表現盒含有其自身啟動子以驅動編碼細胞介素及/或CAR之多核苷酸序列之表現。在某些實施例中,細胞介素及CAR照此組織:5’-細胞介素-CAR-3’或5’-CAR-細胞介素-3’。
「經工程改造之核酸」係指自然界中不存在之核酸。然而,應當理解,雖然經工程改造之核酸整體上並非天然存在的,但其可包括天然存在之核苷酸序列。在一些實施例中,經工程改造之核酸包含來自不同生物體(例如
,來自不同物種)之核苷酸序列。舉例而言,在一些實施例中,經工程改造之核酸包括鼠類核苷酸序列、細菌核苷酸序列、人類核苷酸序列及/或病毒核苷酸序列。術語「經工程改造之核酸」包括重組核酸及合成核酸。「重組核酸」係指藉由接合核酸分子構築之分子,且在一些實施例中,可在活細胞中複製。「合成核酸」係指經擴增或以化學方式或藉由其他手段合成之分子。合成核酸包括經化學修飾或以其他方式修飾、但可與天然存在之核酸分子鹼基配對之彼等。修飾包括但不限於一或多種經修飾之核苷酸間鍵聯及非天然核酸。修飾進一步詳細闡述於美國專利第6,673,611號及美國申請公開案2004/0019001中,且該等專利中之每一者皆以全文引用方式併入。經修飾之核苷酸間鍵聯可為二硫代磷酸酯或硫代磷酸酯鍵聯。非天然核酸可為鎖核酸(LNA)、肽核酸(PNA)、二醇核酸(GNA)、磷二醯胺(phosphorodiamidate)嗎啉代寡聚物(PMO或「嗎啉代」)及蘇糖核酸(TNA)。非天然核酸進一步詳細地闡述於國際申請案WO 1998/039352、美國申請公開案第2013/0156849號及美國專利第6,670,461號、第5,539,082號、第5,185,444號中,各自全文以引用方式併入本文中。重組核酸及合成核酸亦包括由前述中任一者之複製產生之彼等分子。本揭示案之經工程改造之核酸可由單一分子(例如,包括在同一質體或另一載體中)或由多種不同分子(例如,多種獨立複製之不同分子)編碼。經工程改造之核酸可為經分離核酸。經分離核酸包括但不限於cDNA多核苷酸、RNA多核苷酸、RNAi寡核苷酸(例如,siRNA、miRNA、反義寡核苷酸、shRNA等)、mRNA多核苷酸、環狀質體、線性DNA片段、載體、微環、ssDNA、細菌人工染色體(BAC)及酵母人工染色體(YAC)以及寡核苷酸。
本揭示案之經工程改造之核酸可使用標準分子生物學方法產生(參見,例如,Green及Sambrook,Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2012, Cold Spring Harbor Press)。在一些實施例中,經工程改造之核酸構築體係使用GIBSON ASSEMBLY® Cloning (參見例如Gibson, D.G.等人Nature Methods, 343-345, 2009;及Gibson, D.G.等人Nature Methods, 901-903, 2010,每篇以引用方式併入本文中)來產生。GIBSON ASSEMBLY®通常在單管反應中使用三種酶活性:5'核酸外切酶、DNA聚合酶之Ύ延伸活性及DNA連接酶活性。5'核酸外切酶活性回切(chew back) 5'端序列並暴露互補序列用於退火。接著聚合酶活性填充退火區域上之間隙。接著DNA連接酶密封切口並將DNA片段共價地連接在一起。毗連片段之重疊序列比用於Golden Gate Assembly中之序列長得多,且因此產生更高百分比之正確組裝。在一些實施例中,經工程改造之核酸構築體係使用IN-FUSION®選殖(Clontech)產生。
啟動子
一般而言,在本文所述之所有實施例中,編碼本文中之蛋白(例如,本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白)的經工程改造之核酸編碼含有啟動子及編碼該蛋白之外源性多核苷酸序列之表現盒。在一些實施例中,經工程改造之核酸(例如,包含表現盒之經工程改造之核酸)包含可操作地連接至編碼至少2種不同蛋白之核苷酸序列(例如,外源性多核苷酸序列)之啟動子。舉例而言,經工程改造之核酸可包含可操作地連接至編碼至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少8種、至少9種或至少10種不同蛋白之核苷酸序列之啟動子。在一些實施例中,經工程改造之核酸包含可操作地連接至編碼1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種不同蛋白之核苷酸序列之啟動子。在一些實施例中,經工程改造之核酸(例如,包含表現盒之經工程改造之核酸)包含可操作地連接至編碼至少2種細胞介素之核苷酸序列(例如,外源性多核苷酸序列)之啟動子。舉例而言,經工程改造之核酸可包含可操作地連接至編碼至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少8種、至少9種或至少10種細胞介素之核苷酸序列之啟動子。在一些實施例中,經工程改造之核酸包含可操作地連接至編碼1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種細胞介素之核苷酸序列之啟動子。在一些實施例中,經工程改造之核酸(例如,包含表現盒之經工程改造之核酸)包含可操作地連接至編碼至少2種膜可切割嵌合蛋白之核苷酸序列(例如,外源性多核苷酸序列)之啟動子。舉例而言,經工程改造之核酸可包含可操作地連接至編碼至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少8種、至少9種或至少10種膜可切割嵌合蛋白之核苷酸序列之啟動子。在一些實施例中,經工程改造之核酸包含可操作地連接至編碼1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種膜可切割嵌合蛋白之核苷酸序列之啟動子。
「啟動子」係指核酸序列之控制區,在該區控制核酸序列剩餘部分之轉錄起始及速率。啟動子亦可含有調控蛋白及分子(諸如RNA聚合酶及其他轉錄因子)可結合之次區。啟動子可為組成型、誘導型、阻遏型、組織特異性的或其任一組合。啟動子驅動其調控之核酸序列之表現或轉錄。在本文中,當啟動子相對於其調控之核酸序列處於正確功能位置及定向以控制(「驅動」)該序列之轉錄起始及/或表現時,認為該啟動子「可操作地連接」。
啟動子可為與基因或序列天然締合之啟動子,如可藉由分離位於給定基因或序列之編碼區段上游之5'非編碼序列而獲得。該啟動子可稱為「內源性的」。在一些實施例中,編碼核酸序列可位於受重組或異源啟動子之控制下,該啟動子係指在其天然環境中通常不與編碼序列締合之啟動子。該等啟動子可包括其他基因之啟動子;自任何其他細胞分離之啟動子;及非「天然存在」之合成啟動子或增強子,諸如例如含有不同轉錄調控區之不同元件及/或藉助此項技術中已知之基因工程改造方法改變表現之突變之彼等。除了合成產生啟動子及增強子之核酸序列外,亦可使用重組選殖及/或核酸擴增技術(包括聚合酶鏈反應(PCR))產生序列(參見例如美國專利第4,683,202號及美國專利第5,928,906號)。
經工程改造之核酸之啟動子可為「誘導型啟動子」,其係指特徵在於當存在信號、受信號影響或被信號接觸時調控(例如,起始或活化)轉錄活性之啟動子。信號可為內源性或通常外源性條件(例如,光)、化合物(例如,化學或非化學化合物)或蛋白(例如,細胞介素),其以在自誘導型啟動子調控轉錄活性方面有活性之方式接觸誘導型啟動子。轉錄之活化可涉及直接作用於啟動子以驅動轉錄,或藉由使阻止啟動子驅動轉錄之阻遏物不活化而間接作用於啟動子。反之,轉錄之去活化可涉及直接作用於啟動子以阻止轉錄,或藉由活化接著作用於啟動子之阻遏物而間接作用於啟動子。
若在存在局部腫瘤狀態(例如,發炎或缺氧)或信號之情況下,使來自啟動子之轉錄活化、去活化、增加或減少,則啟動子對該狀態或信號「有反應」或「受其調節」。在一些實施例中,啟動子包含反應元件。「反應元件」係啟動子區內之短DNA序列,其結合調節(調控)自啟動子之基因表現之特定分子(例如,轉錄因子)。可根據本揭示案使用之反應元件包括但不限於根皮素可調控制元件(PEACE)、鋅指DNA結合結構域(DBD)、干擾素-γ-活化序列(GAS) (Decker, T.等人,
J Interferon Cytokine Res. 1997年3月;17(3):121-34,其以引用方式併入本文中)、干擾素刺激反應元件(ISRE) (Han, K. J.等人,
J Biol Chem. 2004年4月9日;279(15):15652-61,其以引用方式併入本文中)、NF-κB反應元件(Wang, V.等人,Cell Reports. 2012; 2(4): 824-839,其以引用方式併入本文中)及STAT3反應元件(Zhang, D.等人,
J of Biol Chem. 1996; 271: 9503-9509,其以引用方式併入本文中)。本文中亦涵蓋其他反應元件。反應元件亦可含有銜接重複(例如,編碼反應元件之相同核苷酸序列之連續重複)以大體增加反應元件對其同源結合分子之敏感性。銜接重複可標記為2X、3X、4X、5X
等以表示存在之重複數。
反應性啟動子(亦稱為「誘導型啟動子」) (例如,TGF-β反應性啟動子)之非限制性實例列於表5A中,該表顯示啟動子及轉錄因子之設計,以及顯示誘導分子對轉錄因子(TF)及轉基因轉錄(T)之作用(B,結合;D,解離;n.d.,未確定) (A,活化;DA,去活化;DR,去阻遏) (參見Horner, M.及Weber, W.
FEBS Letters586 (2012) 20784-2096m,以及其中引用之參考文獻)。誘導型啟動子之組分之非限制性實例包括
表 5B中呈現之彼等。
表 5A. 反應性啟動子之實例
表 5B. 誘導型啟動子之例示性組分
系統 | 啟動子及操縱子 | 轉錄因子(TF) | 誘導物分子 | 對誘導物之反應 | |
TF | T | ||||
轉錄活化劑反應性啟動子 | |||||
AIR | PAIR (OalcA-PhCMVmin) | AlcR | 乙醛 | n.d. | A |
ART | PART (OARG-PhCMVmin) | ArgR-VP16 | l-精胺酸 | B | A |
BIT | PBIT3 (OBirA3-PhCMVmin) | BIT (BirA-VP16) | 生物素 | B | A |
Cumate-活化劑 | PCR5 (OCuO6-PhCMVmin) | cTA (CymR-VP16) | Cumate | D | DA |
Cumate-反向活化劑 | PCR5 (OCuO6-PhCMVmin) | rcTA (rCymR-VP16) | Cumate | B | A |
E-OFF | PETR (OETR-PhCMVmin) | ET (E-VP16) | 紅黴素 | D | DA |
NICE-OFF | PNIC (ONIC-PhCMVmin) | NT (HdnoR-VP16) | 6-羥基-菸鹼 | D | DA |
PEACE | PTtgR1 (OTtgR-PhCMVmin) | TtgA1 (TtgR-VP16) | 根皮素 | D | DA |
PIP-OFF | PPIR (OPIR-Phsp70min) | PIT (PIP-VP16) | 原始黴素(Pristinamycin) I | D | DA |
QuoRex | PSCA (OscbR-PhCMVmin)PSPA (OpapRI-PhCMVmin) | SCA (ScbR-VP16) | SCB1 | D | DA |
Redox | PROP (OROP-PhCMVmin) | REDOX (REX-VP16) | NADH | D | DA |
TET-OFF | PhCMV∗-1 (OtetO7-PhCMVmin) | tTA (TetR-VP16) | 四環素 | D | DA |
TET-ON | PhCMV∗-1 (OtetO7-PhCMVmin) | rtTA (rTetR-VP16) | 去氧羥四環素 | B | A |
TIGR | PCTA (OrheO-PhCMVmin) | CTA (RheA-VP16) | 熱 | D | DA |
TraR | O7x(tra box)-PhCMVmin | p65-TraR | 3-側氧基-C8-HSL | B | A |
VAC-OFF | P1VanO2 (OVanO2-PhCMVmin) | VanA1 (VanR-VP16) | 香草酸 | D | DA |
轉錄阻遏物反應性啟動子 | |||||
Cumate-阻遏物 | PCuO (PCMV5-OCuO) | CymR | Cumate | D | DR |
E-ON | PETRON8 (PSV40-OETR8) | E-KRAB | 紅黴素 | D | DR |
NICE-ON | PNIC (PSV40-ONIC8) | NS (HdnoR-KRAB) | 6-羥基-菸鹼 | D | DR |
PIP-ON | PPIRON (PSV40-OPIR3) | PIT3 (PIP-KRAB) | 原始黴素I | D | DR |
Q-ON | PSCAON8 (PSV40-OscbR8) | SCS (ScbR-KRAB) | SCB1 | D | DR |
基於TET-ON阻遏物 | OtetO-PHPRT | tTS-H4 (TetR-HDAC4) | 去氧羥四環素 | D | DR |
T-REX | PTetO (PhCMV-OtetO2) | TetR | 四環素 | D | DR |
UREX | PUREX8 (PSV40-OhucO8) | mUTS (KRAB-HucR) | 尿酸 | D | DR |
VAC-ON | PVanON8 (PhCMV-OVanO8) | VanA4 (VanR-KRAB) | 香草酸 | D | DR |
雜合啟動子 | |||||
QuoRexPIP-ON(反若閘(NOT IF gate)) | OscbR8-OPIR3-PhCMVmin | SCAPIT3 | SCB1原始黴素I | DD | DADR |
QuoRexE-ON(反若閘) | OscbR-OETR8-PhCMVmin | SCAE-KRAB | SCB1紅黴素 | DD | DADR |
TET-OFFE-ON(反若閘) | OtetO7-OETR8-PhCMVmin | tTAE-KRAB | 四環素紅黴素 | DD | DADR |
TET-OFFPIP-ONE-ON | OtetO7-OPIR3-OETR8-PhCMVmin | tTAPIT3E-KRAB | 四環素原始黴素I紅黴素 | DDD | DADRDR |
名稱 | DNA 序列 |
最小啟動子;minP | AGAGGGTATATAATGGAAGCTCGACTTCCAG (SEQ ID NO: 1) |
NFkB反應元件蛋白啟動子;5× NFkB-RE | GGGAATTTCCGGGGACTTTCCGGGAATTTCCGGGGACTTTCCGGGAATTTCC (SEQ ID NO: 2) |
CREB反應元件蛋白啟動子;4× CRE | CACCAGACAGTGACGTCAGCTGCCAGATCCCATGGCCGTCATACTGTGACGTCTTTCAGACACCCCATTGACGTCAATGGGAGAA (SEQ ID NO: 3) |
NFAT反應元件蛋白啟動子;3× NFAT結合位點 | GGAGGAAAAACTGTTTCATACAGAAGGCGTGGAGGAAAAACTGTTTCATACAGAAGGCGTGGAGGAAAAACTGTTTCATACAGAAGGCGT (SEQ ID NO: 4) |
SRF反應元件蛋白啟動子;5× SRE | AGGATGTCCATATTAGGACATCTAGGATGTCCATATTAGGACATCTAGGATGTCCATATTAGGACATCTAGGATGTCCATATTAGGACATCTAGGATGTCCATATTAGGACATCT (SEQ ID NO: 5) |
SRF反應元件蛋白啟動子2;5× SRF-RE | AGTATGTCCATATTAGGACATCTACCATGTCCATATTAGGACATCTACTATGTCCATATTAGGACATCTTGTATGTCCATATTAGGACATCTAAAATGTCCATATTAGGACATCT (SEQ ID NO: 6) |
AP1反應元件蛋白啟動子;6× AP1-RE | TGAGTCAGTGACTCAGTGAGTCAGTGACTCAGTGAGTCAGTGACTCAG (SEQ ID NO: 7) |
TCF-LEF反應元件啟動子;8× TCF-LEF-RE | AGATCAAAGGGTTTAAGATCAAAGGGCTTAAGATCAAAGGGTATAAGATCAAAGGGCCTAAGATCAAAGGGACTAAGATCAAAGGGTTTAAGATCAAAGGGCTTAAGATCAAAGGGCCTA (SEQ ID NO: 8) |
SBEx4 | GTCTAGACGTCTAGACGTCTAGACGTCTAGAC (SEQ ID NO: 9) |
SMAD2/3 - CAGACA ×4 | CAGACACAGACACAGACACAGACA (SEQ ID NO: 10) |
STAT3結合位點 | Ggatccggtactcgagatctgcgatctaagtaagcttggcattccggtactgttggtaaagccac (SEQ ID NO: 11) |
minCMV | taggcgtgtacggtgggaggcctatataagcagagctcgtttagtgaaccgtcagatcgcctgga (SEQ ID NO: 170) |
YB_TATA | TCTAGAGGGTATATAATGGGGGCCA (SEQ ID NO: 171) |
minTK | Ttcgcatattaaggtgacgcgtgtggcctcgaacaccgagcgaccctgcagcgacccgcttaa (SEQ ID NO: 172) |
啟動子之非限制性實例包括細胞巨大病毒(CMV)啟動子、延長因子1-α (EF1a)啟動子、延長因子(EFS)啟動子、MND啟動子(含有具有骨髓增生性肉瘤病毒增強子之經修飾MoMuLV LTR之U3區的合成啟動子)、磷酸甘油酸酯激酶(PGK)啟動子、脾病灶形成病毒(SFFV)啟動子、猿猴病毒40 (SV40)啟動子及泛素C (UbC)啟動子(參見表5C)。
表 5C. 例示性組成型啟動子
名稱 | DNA 序列 |
CMV | GTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTC (SEQ ID NO: 12) |
EF1a | GGCTCCGGTGCCCGTCAGTGGGCAGAGCGCACATCGCCCACAGTCCCCGAGAAGTTGGGGGGAGGGGTCGGCAATTGAACCGGTGCCTAGAGAAGGTGGCGCGGGGTAAACTGGGAAAGTGATGCCGTGTACTGGCTCCGCCTTTTTCCCGAGGGTGGGGGAGAACCGTATATAAGTGCAGTAGTCGCCGTGAACGTTCTTTTTCGCAACGGGTTTGCCGCCAGAACACAGGTAAGTGCCGTGTGTGGTTCCCGCGGGCCTGGCCTCTTTACGGGTTATGGCCCTTGCGTGCCTTGAATTACTTCCACCTGGCTGCAGTACGTGATTCTTGATCCCGAGCTTCGGGTTGGAAGTGGGTGGGAGAGTTCGAGGCCTTGCGCTTAAGGAGCCCCTTCGCCTCGTGCTTGAGTTGAGGCCTGGCCTGGGCGCTGGGGCCGCCGCGTGCGAATCTGGTGGCACCTTCGCGCCTGTCTCGCTGCTTTCGATAAGTCTCTAGCCATTTAAAATTTTTGATGACCTGCTGCGACGCTTTTTTTCTGGCAAGATAGTCTTGTAAATGCGGGCCAAGATCTGCACACTGGTATTTCGGTTTTTGGGGCCGCGGGCGGCGACGGGGCCCGTGCGTCCCAGCGCACATGTTCGGCGAGGCGGGGCCTGCGAGCGCGACCACCGAGAATCGGACGGGGGTAGTCTCAAGCTGGCCGGCCTGCTCTGGTGCCTGTCCTCGCGCCGCCGTGTATCGCCCCGCCCCGGGCGGCAAGGCTGGCCCGGTCGGCACCAGTTGCGTGAGCGGAAAGATGGCCGCTTCCCGGTCCTGCTGCAGGGAGCTCAAAATGGAGGACGCGGCGCTCGGGAGAGCGGGCGGGTGAGTCACCCACACAAAGGAAAAGGGCCTTTCCGTCCTCAGCCGTCGCTTCATGTGACTCCACGGAGTACCGGGCGCCGTCCAGGCACCTCGATTAGTTCTCGAGCTTTTGGAGTACGTCGTCTTTAGGTTGGGGGGAGGGGTTTTATGCGATGGAGTTTCCCCACACTGAGTGGGTGGAGACTGAAGTTAGGCCAGCTTGGCACTTGATGTAATTCTCCTTGGAATTTGCCCTTTTTGAGTTTGGATCTTGGTTCATTCTCAAGCCTCAGACAGTGGTTCAAAGTTTTTTTCTTCCATTTCAGGTGTCGTGA (SEQ ID NO: 13) |
EFS | GGATCTGCGATCGCTCCGGTGCCCGTCAGTGGGCAGAGCGCACATCGCCCACAGTCCCCGAGAAGTTGGGGGGAGGGGTCGGCAATTGAACCGGTGCCTAGAGAAGGTGGCGCGGGGTAAACTGGGAAAGTGATGTCGTGTACTGGCTCCGCCTTTTTCCCGAGGGTGGGGGAGAACCGTATATAAGTGCAGTAGTCGCCGTGAACGTTCTTTTTCGCAACGGGTTTGCCGCCAGAACACAGCTGAAGCTTCGAGGGGCTCGCATCTCTCCTTCACGCGCCCGCCGCCCTACCTGAGGCCGCCATCCACGCCGGTTGAGTCGCGTTCTGCCGCCTCCCGCCTGTGGTGCCTCCTGAACTGCGTCCGCCGTCTAGGTAAGTTTAAAGCTCAGGTCGAGACCGGGCCTTTGTCCGGCGCTCCCTTGGAGCCTACCTAGACTCAGCCGGCTCTCCACGCTTTGCCTGACCCTGCTTGCTCAACTCTACGTCTTTGTTTCGTTTTCTGTTCTGCGCCGTTACAGATCCAAGCTGTGACCGGCGCCTAC (SEQ ID NO: 14) |
MND | TTTATTTAGTCTCCAGAAAAAGGGGGGAATGAAAGACCCCACCTGTAGGTTTGGCAAGCTAGGATCAAGGTTAGGAACAGAGAGACAGCAGAATATGGGCCAAACAGGATATCTGTGGTAAGCAGTTCCTGCCCCGGCTCAGGGCCAAGAACAGTTGGAACAGCAGAATATGGGCCAAACAGGATATCTGTGGTAAGCAGTTCCTGCCCCGGCTCAGGGCCAAGAACAGATGGTCCCCAGATGCGGTCCCGCCCTCAGCAGTTTCTAGAGAACCATCAGATGTTTCCAGGGTGCCCCAAGGACCTGAAATGACCCTGTGCCTTATTTGAACTAACCAATCAGTTCGCTTCTCGCTTCTGTTCGCGCGCTTCTGCTCCCCGAGCTCAATAAAAGAGCCCA (SEQ ID NO: 15) |
PGK | GGGGTTGGGGTTGCGCCTTTTCCAAGGCAGCCCTGGGTTTGCGCAGGGACGCGGCTGCTCTGGGCGTGGTTCCGGGAAACGCAGCGGCGCCGACCCTGGGTCTCGCACATTCTTCACGTCCGTTCGCAGCGTCACCCGGATCTTCGCCGCTACCCTTGTGGGCCCCCCGGCGACGCTTCCTGCTCCGCCCCTAAGTCGGGAAGGTTCCTTGCGGTTCGCGGCGTGCCGGACGTGACAAACGGAAGCCGCACGTCTCACTAGTACCCTCGCAGACGGACAGCGCCAGGGAGCAATGGCAGCGCGCCGACCGCGATGGGCTGTGGCCAATAGCGGCTGCTCAGCGGGGCGCGCCGAGAGCAGCGGCCGGGAAGGGGCGGTGCGGGAGGCGGGGTGTGGGGCGGTAGTGTGGGCCCTGTTCCTGCCCGCGCGGTGTTCCGCATTCTGCAAGCCTCCGGAGCGCACGTCGGCAGTCGGCTCCCTCGTTGACCGAATCACCGACCTCTCTCCCCAG (SEQ ID NO: 16) |
SFFV | GTAACGCCATTTTGCAAGGCATGGAAAAATACCAAACCAAGAATAGAGAAGTTCAGATCAAGGGCGGGTACATGAAAATAGCTAACGTTGGGCCAAACAGGATATCTGCGGTGAGCAGTTTCGGCCCCGGCCCGGGGCCAAGAACAGATGGTCACCGCAGTTTCGGCCCCGGCCCGAGGCCAAGAACAGATGGTCCCCAGATATGGCCCAACCCTCAGCAGTTTCTTAAGACCCATCAGATGTTTCCAGGCTCCCCCAAGGACCTGAAATGACCCTGCGCCTTATTTGAATTAACCAATCAGCCTGCTTCTCGCTTCTGTTCGCGCGCTTCTGCTTCCCGAGCTCTATAAAAGAGCTCACAACCCCTCACTCGGCGCGCCAGTCCTCCGACAGACTGAGTCGCCCGGG (SEQ ID NO: 17) |
SV40 | CTGTGGAATGTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAAAAGCT (SEQ ID NO: 18) |
SV40 alt | GTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAA (SEQ ID NO: 295) |
UbC | GCGCCGGGTTTTGGCGCCTCCCGCGGGCGCCCCCCTCCTCACGGCGAGCGCTGCCACGTCAGACGAAGGGCGCAGGAGCGTTCCTGATCCTTCCGCCCGGACGCTCAGGACAGCGGCCCGCTGCTCATAAGACTCGGCCTTAGAACCCCAGTATCAGCAGAAGGACATTTTAGGACGGGACTTGGGTGACTCTAGGGCACTGGTTTTCTTTCCAGAGAGCGGAACAGGCGAGGAAAAGTAGTCCCTTCTCGGCGATTCTGCGGAGGGATCTCCGTGGGGCGGTGAACGCCGATGATTATATAAGGACGCGCCGGGTGTGGCACAGCTAGTTCCGTCGCAGCCGGGATTTGGGTCGCGGTTCTTGTTTGTGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTTGCGGGCTGCTGGGCTGGCCGGGGCTTTCGTGGCCGCCGGGCCGCTCGGTGGGACGGAAGCGTGTGGAGAGACCGCCAAGGGCTGTAGTCTGGGTCCGCGAGCAAGGTTGCCCTGAACTGGGGGTTGGGGGGAGCGCACAAAATGGCGGCTGTTCCCGAGTCTTGAATGGAAGACGCTTGTAAGGCGGGCTGTGAGGTCGTTGAAACAAGGTGGGGGGCATGGTGGGCGGCAAGAACCCAAGGTCTTGAGGCCTTCGCTAATGCGGGAAAGCTCTTATTCGGGTGAGATGGGCTGGGGCACCATCTGGGGACCCTGACGTGAAGTTTGTCACTGACTGGAGAACTCGGGTTTGTCGTCTGGTTGCGGGGGCGGCAGTTATGCGGTGCCGTTGGGCAGTGCACCCGTACCTTTGGGAGCGCGCGCCTCGTCGTGTCGTGACGTCACCCGTTCTGTTGGCTTATAATGCAGGGTGGGGCCACCTGCCGGTAGGTGTGCGGTAGGCTTTTCTCCGTCGCAGGACGCAGGGTTCGGGCCTAGGGTAGGCTCTCCTGAATCGACAGGCGCCGGACCTCTGGTGAGGGGAGGGATAAGTGAGGCGTCAGTTTCTTTGGTCGGTTTTATGTACCTATCTTCTTAAGTAGCTGAAGCTCCGGTTTTGAACTATGCGCTCGGGGTTGGCGAGTGTGTTTTGTGAAGTTTTTTAGGCACCTTTTGAAATGTAATCATTTGGGTCAATATGTAATTTTCAGTGTTAGACTAGTAAAGCTTCTGCAGGTCGACTCTAGAAAATTGTCCGCTAAATTCTGGCCGTTTTTGGCTTTTTTGTTAGAC (SEQ ID NO: 19) |
hEF1aV1 | GGCTCCGGTGCCCGTCAGTGGGCAGAGCGCACATCGCCCACAGTCCCCGAGAAGTTGGGGGGAGGGGTCGGCAATTGAACCGGTGCCTAGAGAAGGTGGCGCGGGGTAAACTGGGAAAGTGATGTCGTGTACTGGCTCCGCCTTTTTCCCGAGGGTGGGGGAGAACCGTATATAAGTGCAGTAGTCGCCGTGAACGTTCTTTTTCGCAACGGGTTTGCCGCCAGAACACAGGTAAGTGCCGTGTGTGGTTCCCGCGGGCCTGGCCTCTTTACGGGTTATGGCCCTTGCGTGCCTTGAATTACTTCCACCTGGCTGCAGTACGTGATTCTTGATCCCGAGCTTCGGGTTGGAAGTGGGTGGGAGAGTTCGAGGCCTTGCGCTTAAGGAGCCCCTTCGCCTCGTGCTTGAGTTGAGGCCTGGCCTGGGCGCTGGGGCCGCCGCGTGCGAATCTGGTGGCACCTTCGCGCCTGTCTCGCTGCTTTCGATAAGTCTCTAGCCATTTAAAATTTTTGATGACCTGCTGCGACGCTTTTTTTCTGGCAAGATAGTCTTGTAAATGCGGGCCAAGATCTGCACACTGGTATTTCGGTTTTTGGGGCCGCGGGCGGCGACGGGGCCCGTGCGTCCCAGCGCACATGTTCGGCGAGGCGGGGCCTGCGAGCGCGGCCACCGAGAATCGGACGGGGGTAGTCTCAAGCTGGCCGGCCTGCTCTGGTGCCTGGTCTCGCGCCGCCGTGTATCGCCCCGCCCTGGGCGGCAAGGCTGGCCCGGTCGGCACCAGTTGCGTGAGCGGAAAGATGGCCGCTTCCCGGCCCTGCTGCAGGGAGCTCAAAATGGAGGACGCGGCGCTCGGGAGAGCGGGCGGGTGAGTCACCCACACAAAGGAAAAGGGCCTTTCCGTCCTCAGCCGTCGCTTCATGTGACTCCACGGAGTACCGGGCGCCGTCCAGGCACCTCGATTAGTTCTCGAGCTTTTGGAGTACGTCGTCTTTAGGTTGGGGGGAGGGGTTTTATGCGATGGAGTTTCCCCACACTGAGTGGGTGGAGACTGAAGTTAGGCCAGCTTGGCACTTGATGTAATTCTCCTTGGAATTTGCCCTTTTTGAGTTTGGATCTTGGTTCATTCTCAAGCCTCAGACAGTGGTTCAAAGTTTTTTTCTTCCATTTCAGGTGTCGTGA (SEQ ID NO: 20) |
hCAGG | ACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGGAGTCGCTGCGACGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCTCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGTCGGTCGGGCTGCAACCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTC (SEQ ID NO: 21) |
hEF1aV2 | Gggcagagcgcacatcgcccacagtccccgagaagttggggggaggggtcggcaattgaaccggtgcctagagaaggtggcgcggggtaaactgggaaagtgatgtcgtgtactggctccgcctttttcccgagggtgggggagaaccgtatataagtgcagtagtcgccgtgaacgttctttttcgcaacgggtttgccgccagaacacag (SEQ ID NO: 22) |
hACTb | CCACTAGTTCCATGTCCTTATATGGACTCATCTTTGCCTATTGCGACACACACTCAATGAACACCTACTACGCGCTGCAAAGAGCCCCGCAGGCCTGAGGTGCCCCCACCTCACCACTCTTCCTATTTTTGTGTAAAAATCCAGCTTCTTGTCACCACCTCCAAGGAGGGGGAGGAGGAGGAAGGCAGGTTCCTCTAGGCTGAGCCGAATGCCCCTCTGTGGTCCCACGCCACTGATCGCTGCATGCCCACCACCTGGGTACACACAGTCTGTGATTCCCGGAGCAGAACGGACCCTGCCCACCCGGTCTTGTGTGCTACTCAGTGGACAGACCCAAGGCAAGAAAGGGTGACAAGGACAGGGTCTTCCCAGGCTGGCTTTGAGTTCCTAGCACCGCCCCGCCCCCAATCCTCTGTGGCACATGGAGTCTTGGTCCCCAGAGTCCCCCAGCGGCCTCCAGATGGTCTGGGAGGGCAGTTCAGCTGTGGCTGCGCATAGCAGACATACAACGGACGGTGGGCCCAGACCCAGGCTGTGTAGACCCAGCCCCCCCGCCCCGCAGTGCCTAGGTCACCCACTAACGCCCCAGGCCTGGTCTTGGCTGGGCGTGACTGTTACCCTCAAAAGCAGGCAGCTCCAGGGTAAAAGGTGCCCTGCCCTGTAGAGCCCACCTTCCTTCCCAGGGCTGCGGCTGGGTAGGTTTGTAGCCTTCATCACGGGCCACCTCCAGCCACTGGACCGCTGGCCCCTGCCCTGTCCTGGGGAGTGTGGTCCTGCGACTTCTAAGTGGCCGCAAGCCACCTGACTCCCCCAACACCACACTCTACCTCTCAAGCCCAGGTCTCTCCCTAGTGACCCACCCAGCACATTTAGCTAGCTGAGCCCCACAGCCAGAGGTCCTCAGGCCCTGCTTTCAGGGCAGTTGCTCTGAAGTCGGCAAGGGGGAGTGACTGCCTGGCCACTCCATGCCCTCCAAGAGCTCCTTCTGCAGGAGCGTACAGAACCCAGGGCCCTGGCACCCGTGCAGACCCTGGCCCACCCCACCTGGGCGCTCAGTGCCCAAGAGATGTCCACACCTAGGATGTCCCGCGGTGGGTGGGGGGCCCGAGAGACGGGCAGGCCGGGGGCAGGCCTGGCCATGCGGGGCCGAACCGGGCACTGCCCAGCGTGGGGCGCGGGGGCCACGGCGCGCGCCCCCAGCCCCCGGGCCCAGCACCCCAAGGCGGCCAACGCCAAAACTCTCCCTCCTCCTCTTCCTCAATCTCGCTCTCGCTCTTTTTTTTTTTCGCAAAAGGAGGGGAGAGGGGGTAAAAAAATGCTGCACTGTGCGGCGAAGCCGGTGAGTGAGCGGCGCGGGGCCAATCAGCGTGCGCCGTTCCGAAAGTTGCCTTTTATGGCTCGAGCGGCCGCGGCGGCGCCCTATAAAACCCAGCGGCGCGACGCGCCACCACCGCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGgtaagcccggccagccgaccggggcaggcggctcacggcccggccgcaggcggccgcggccccttcgcccgtgcagagccgccgtctgggccgcagcggggggcgcatggggggggaaccggaccgccgtggggggcgcgggagaagcccctgggcctccggagatgggggacaccccacgccagttcggaggcgcgaggccgcgctcgggaggcgcgctccgggggtgccgctctcggggcgggggcaaccggcggggtctttgtctgagccgggctcttgccaatggggatcgcagggtgggcgcggcggagcccccgccaggcccggtgggggctggggcgccattgcgcgtgcgcgctggtcctttgggcgctaactgcgtgcgcgctgggaattggcgctaattgcgcgtgcgcgctgggactcaaggcgctaactgcgcgtgcgttctggggcccggggtgccgcggcctgggctggggcgaaggcgggctcggccggaaggggtggggtcgccgcggctcccgggcgcttgcgcgcacttcctgcccgagccgctggccgcccgagggtgtggccgctgcgtgcgcgcgcgccgacccggcgctgtttgaaccgggcggaggcggggctggcgcccggttgggagggggttggggcctggcttcctgccgcgcgccgcggggacgcctccgaccagtgtttgccttttatggtaataacgcggccggcccggcttcctttgtccccaatctgggcgcgcgccggcgccccctggcggcctaaggactcggcgcgccggaagtggccagggcgggggcgacctcggctcacagcgcgcccggctat (SEQ ID NO: 23) |
heIF4A1 | GTTGATTTCCTTCATCCCTGGCACACGTCCAGGCAGTGTCGAATCCATCTCTGCTACAGGGGAAAACAAATAACATTTGAGTCCAGTGGAGACCGGGAGCAGAAGTAAAGGGAAGTGATAACCCCCAGAGCCCGGAAGCCTCTGGAGGCTGAGACCTCGCCCCCCTTGCGTGATAGGGCCTACGGAGCCACATGACCAAGGCACTGTCGCCTCCGCACGTGTGAGAGTGCAGGGCCCCAAGATGGCTGCCAGGCCTCGAGGCCTGACTCTTCTATGTCACTTCCGTACCGGCGAGAAAGGCGGGCCCTCCAGCCAATGAGGCTGCGGGGCGGGCCTTCACCTTGATAGGCACTCGAGTTATCCAATGGTGCCTGCGGGCCGGAGCGACTAGGAACTAACGTCATGCCGAGTTGCTGAGCGCCGGCAGGCGGGGCCGGGGCGGCCAAACCAATGCGATGGCCGGGGCGGAGTCGGGCGCTCTATAAGTTGTCGATAGGCGGGCACTCCGCCCTAGTTTCTAAGGACCATG (SEQ ID NO: 24) |
hGAPDH | AGTTCCCCAACTTTCCCGCCTCTCAGCCTTTGAAAGAAAGAAAGGGGAGGGGGCAGGCCGCGTGCAGTCGCGAGCGGTGCTGGGCTCCGGCTCCAATTCCCCATCTCAGTCGCTCCCAAAGTCCTTCTGTTTCATCCAAGCGTGTAAGGGTCCCCGTCCTTGACTCCCTAGTGTCCTGCTGCCCACAGTCCAGTCCTGGGAACCAGCACCGATCACCTCCCATCGGGCCAATCTCAGTCCCTTCCCCCCTACGTCGGGGCCCACACGCTCGGTGCGTGCCCAGTTGAACCAGGCGGCTGCGGAAAAAAAAAAGCGGGGAGAAAGTAGGGCCCGGCTACTAGCGGTTTTACGGGCGCACGTAGCTCAGGCCTCAAGACCTTGGGCTGGGACTGGCTGAGCCTGGCGGGAGGCGGGGTCCGAGTCACCGCCTGCCGCCGCGCCCCCGGTTTCTATAAATTGAGCCCGCAGCCTCCCGCTTCGCTCTCTGCTCCTCCTGTTCGACAGTCAGCCGCATCTTCTTTTGCGTCGCCAGgtgaagacgggcggagagaaacccgggaggctagggacggcctgaaggcggcaggggcgggcgcaggccggatgtgttcgcgccgctgcggggtgggcccgggcggcctccgcattgcaggggcgggcggaggacgtgatgcggcgcgggctgggcatggaggcctggtgggggaggggaggggaggcgtgggtgtcggccggggccactaggcgctcactgttctctccctccgcgcagCCGAGCCACATCGCTGAGACAC (SEQ ID NO: 25) |
hGRP78 | AGTGCGGTTACCAGCGGAAATGCCTCGGGGTCAGAAGTCGCAGGAGAGATAGACAGCTGCTGAACCAATGGGACCAGCGGATGGGGCGGATGTTATCTACCATTGGTGAACGTTAGAAACGAATAGCAGCCAATGAATCAGCTGGGGGGGCGGAGCAGTGACGTTTATTGCGGAGGGGGCCGCTTCGAATCGGCGGCGGCCAGCTTGGTGGCCTGGGCCAATGAACGGCCTCCAACGAGCAGGGCCTTCACCAATCGGCGGCCTCCACGACGGGGCTGGGGGAGGGTATATAAGCCGAGTAGGCGACGGTGAGGTCGACGCCGGCCAAGACAGCACAGACAGATTGACCTATTGGGGTGTTTCGCGAGTGTGAGAGGGAAGCGCCGCGGCCTGTATTTCTAGACCTGCCCTTCGCCTGGTTCGTGGCGCCTTGTGACCCCGGGCCCCTGCCGCCTGCAAGTCGGAAATTGCGCTGTGCTCCTGTGCTACGGCCTGTGGCTGGACTGCCTGCTGCTGCCCAACTGGCTGGCAC (SEQ ID NO: 26) |
hGRP94 | TAGTTTCATCACCACCGCCACCCCCCCGCCCCCCCGCCATCTGAAAGGGTTCTAGGGGATTTGCAACCTCTCTCGTGTGTTTCTTCTTTCCGAGAAGCGCCGCCACACGAGAAAGCTGGCCGCGAAAGTCGTGCTGGAATCACTTCCAACGAAACCCCAGGCATAGATGGGAAAGGGTGAAGAACACGTTGCCATGGCTACCGTTTCCCCGGTCACGGAATAAACGCTCTCTAGGATCCGGAAGTAGTTCCGCCGCGACCTCTCTAAAAGGATGGATGTGTTCTCTGCTTACATTCATTGGACGTTTTCCCTTAGAGGCCAAGGCCGCCCAGGCAAAGGGGCGGTCCCACGCGTGAGGGGCCCGCGGAGCCATTTGATTGGAGAAAAGCTGCAAACCCTGACCAATCGGAAGGAGCCACGCTTCGGGCATCGGTCACCGCACCTGGACAGCTCCGATTGGTGGACTTCCGCCCCCCCTCACGAATCCTCATTGGGTGCCGTGGGTGCGTGGTGCGGCGCGATTGGTGGGTTCATGTTTCCCGTCCCCCGCCCGCGAGAAGTGGGGGTGAAAAGCGGCCCGACCTGCTTGGGGTGTAGTGGGCGGACCGCGCGGCTGGAGGTGTGAGGATCCGAACCCAGGGGTGGGGGGTGGAGGCGGCTCCTGCGATCGAAGGGGACTTGAGACTCACCGGCCGCACGTC (SEQ ID NO: 27) |
hHSP70 | GGGCCGCCCACTCCCCCTTCCTCTCAGGGTCCCTGTCCCCTCCAGTGAATCCCAGAAGACTCTGGAGAGTTCTGAGCAGGGGGCGGCACTCTGGCCTCTGATTGGTCCAAGGAAGGCTGGGGGGCAGGACGGGAGGCGAAAACCCTGGAATATTCCCGACCTGGCAGCCTCATCGAGCTCGGTGATTGGCTCAGAAGGGAAAAGGCGGGTCTCCGTGACGACTTATAAAAGCCCAGGGGCAAGCGGTCCGGATAACGGCTAGCCTGAGGAGCTGCTGCGACAGTCCACTACCTTTTTCGAGAGTGACTCCCGTTGTCCCAAGGCTTCCCAGAGCGAACCTGTGCGGCTGCAGGCACCGGCGCGTCGAGTTTCCGGCGTCCGGAAGGACCGAGCTCTTCTCGCGGATCCAGTGTTCCGTTTCCAGCCCCCAATCTCAGAGCGGAGCCGACAGAGAGCAGGGAACCC (SEQ ID NO: 28) |
hKINb | GCCCCACCCCCGTCCGCGTTACAACCGGGAGGCCCGCTGGGTCCTGCACCGTCACCCTCCTCCCTGTGACCGCCCACCTGATACCCAAACAACTTTCTCGCCCCTCCAGTCCCCAGCTCGCCGAGCGCTTGCGGGGAGCCACCCAGCCTCAGTTTCCCCAGCCCCGGGCGGGGCGAGGGGCGATGACGTCATGCCGGCGCGCGGCATTGTGGGGCGGGGCGAGGCGGGGCGCCGGGGGGAGCAACACTGAGACGCCATTTTCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACTGGCTGGGTCGGCTGGGCTGCTGGTGCGAGGAGCCGCGGGGCTGTGCTCGGCGGCCAAGGGGACAGCGCGTGGGTGGCCGAGGATGCTGCGGGGCGGTAGCTCCGGCGCCCCTCGCTGGTGACTGCTGCGCCGTGCCTCACACAGCCGAGGCGGGCTCGGCGCACAGTCGCTGCTCCGCGCTCGCGCCCGGCGGCGCTCCAGGTGCTGACAGCGCGAGAGAGCGCGGCCTCAGGAGCAACAC (SEQ ID NO: 29) |
hUBIb | TTCCAGAGCTTTCGAGGAAGGTTTCTTCAACTCAAATTCATCCGCCTGATAATTTTCTTATATTTTCCTAAAGAAGGAAGAGAAGCGCATAGAGGAGAAGGGAAATAATTTTTTAGGAGCCTTTCTTACGGCTATGAGGAATTTGGGGCTCAGTTGAAAAGCCTAAACTGCCTCTCGGGAGGTTGGGCGCGGCGAACTACTTTCAGCGGCGCACGGAGACGGCGTCTACGTGAGGGGTGATAAGTGACGCAACACTCGTTGCATAAATTTGCGCTCCGCCAGCCCGGAGCATTTAGGGGCGGTTGGCTTTGTTGGGTGAGCTTGTTTGTGTCCCTGTGGGTGGACGTGGTTGGTGATTGGCAGGATCCTGGTATCCGCTAACAGgtactggcccacagccgtaaagacctgcgggggcgtgagaggggggaatgggtgaggtcaagctggaggcttcttggggttgggtgggccgctgaggggaggggagggcgaggtgacgcgacacccggcctttctgggagagtgggccttgttgacctaaggggggcgagggcagttggcacgcgcacgcgccgacagaaactaacagacattaaccaacagcgattccgtcgcgtttacttgggaggaaggcggaaaagaggtagtttgtgtggcttctggaaaccctaaatttggaatcccagtatgagaatggtgtcccttcttgtgtttcaatgggatttttacttcgcgagtcttgtgggtttggttttgttttcagtttgcctaacaccgtgcttaggtttgaggcagattggagttcggtcgggggagtttgaatatccggaacagttagtggggaaagctgtggacgcttggtaagagagcgctctggattttccgctgttgacgttgaaaccttgaatgacgaatttcgtattaagtgacttagccttgtaaaattgaggggaggcttgcggaatattaacgtatttaaggcattttgaaggaatagttgctaattttgaagaatattaggtgtaaaagcaagaaatacaatgatcctgaggtgacacgcttatgttttacttttaaactagGTCACC (SEQ ID NO: 30) |
CAG | gacattgattattgactagttattaatagtaatcaattacggggtcattagttcatagcccatatatggagttccgcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtcgaggtgagccccacgttctgcttcactctccccatctcccccccctccccacccccaattttgtatttatttattttttaattattttgtgcagcgatgggggcggggggggggggggggcgcgcgccaggcggggcggggcggggcgaggggcggggcggggcgaggcggagaggtgcggcggcagccaatcagagcggcgcgctccgaaagtttccttttatggcgaggcggcggcggcggcggccctataaaaagcgaagcgcgcggcgggcg (SEQ ID NO: 173) |
HLP | Tgtttgctgcttgcaatgtttgcccattttagggtggacacaggacgctgtggtttctgagccagggggcgactcagatcccagccagtggacttagcccctgtttgctcctccgataactggggtgaccttggttaatattcaccagcagcctcccccgttgcccctctggatccactgcttaaatacggacgaggacagggccctgtctcctcagcttcaggcaccaccactgacctgggacagtgaat (SEQ ID NO: 174) |
啟動子可為組織特異性啟動子。一般而言,組織特異性啟動子引導核酸(例如,編碼本文中之蛋白(例如,本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白)之經工程改造之核酸)之轉錄,使得表現限於特定細胞類型、細胞器或組織。組織特異性啟動子包括但不限於白蛋白(肝臟特異性,Pinkert等人,(1987))、淋巴特異性啟動子(Calame及Eaton,1988)、T細胞受體之特定啟動子(Winoto及Baltimore,(1989))及免疫球蛋白之特定啟動子(Banerji等人,(1983);Queen及Baltimore,1983)、神經元特異性啟動子(例如神經絲啟動子;Byrne及Ruddle,1989)、胰臟特異性啟動子(Edlund等人,(1985))或乳腺特異性啟動子(乳清啟動子,美國專利第4,873,316號及歐洲申請公開案第264,166號)以及發育調控之啟動子,諸如鼠類hox啟動子(Kessel及Gruss,Science 249:374-379 (1990))或α-甲胎蛋白啟動子(Campes及Tilghman,Genes Dev. 3:537-546 (1989)),該等文獻中之每一者之內容皆以引用方式完全併入本文中。啟動子在各別特定細胞類型、細胞器或組織中可為組成型。組織特異性啟動子及/或調控元件亦可包括來自以下之啟動子:對結腸上皮細胞特異之肝臟脂肪酸結合(FAB)蛋白基因;對胰臟細胞特異之胰島素基因;對肝臟細胞特異之轉甲狀腺素蛋白(transphyretin)、.α1.-抗胰蛋白酶、纖維蛋白溶酶原活化劑抑制劑1型(PAI-I)、脂蛋白元AI及LDL受體基因;對寡樹突細胞特異之髓磷脂鹼性蛋白(MBP)基因;對膠質細胞特異之神經膠質原纖維酸性蛋白(GFAP)基因;對靶向眼特異之OPSIN;以及對神經細胞特異之神經特異性烯醇酶(NSE)啟動子。組織特異性啟動子之實例包括但不限於用於肌酸激酶之啟動子(其已用於引導在肌肉及心臟組織中之表現)及用於在B細胞中表現之免疫球蛋白重鏈或輕鏈啟動子。其他組織特異性啟動子包括人類平滑肌α-肌動蛋白啟動子。用於肝臟之例示性組織特異性表現元件包括但不限於HMG-COA還原酶啟動子、固醇調控元件1、磷酸烯醇丙酮酸羧基激酶(PEPCK)啟動子、人類C-反應蛋白(CRP)啟動子、人類葡萄糖激酶啟動子、膽固醇L 7-α羥化酶(hydroylase) (CYP-7)啟動子、β-半乳糖苷酶α-2,6唾液酸轉移酶(sialylkansferase)啟動子、胰島素樣生長因子結合蛋白(IGFBP-I)啟動子、醛縮酶B啟動子、人類轉鐵蛋白啟動子及I型膠原啟動子。用於前列腺之例示性組織特異性表現元件包括但不限於前列腺酸性磷酸酶(PAP)啟動子、前列腺分泌蛋白94 (PSP 94)啟動子、前列腺特異性抗原複合物啟動子及人類腺激肽釋放酶基因啟動子(hgt-1)。用於胃組織之例示性組織特異性表現元件包括但不限於人類H+/K+-ATP酶α次單元啟動子。用於胰臟之例示性組織特異性表現元件包括但不限於胰臟炎相關蛋白啟動子(PAP)、彈性蛋白酶1轉錄增強子、胰臟特異性澱粉酶及彈性蛋白酶增強子啟動子以及胰臟膽固醇酯酶基因啟動子。用於子宮內膜之例示性組織特異性表現元件包括但不限於子宮珠蛋白啟動子。用於腎上腺細胞之例示性組織特異性表現元件包括但不限於膽固醇側鏈切割(SCC)啟動子。用於一般神經系統之例示性組織特異性表現元件包括但不限於γ-γ烯醇酶(神經元特異性烯醇酶,NSE)啟動子。用於腦之例示性組織特異性表現元件包括但不限於神經絲重鏈(NF-H)啟動子。用於淋巴球之例示性組織特異性表現元件包括但不限於人類CGL-1/顆粒酶B啟動子、末端去氧轉移酶(TdT)、λ 5、VpreB及lck (淋巴球特異性酪胺酸蛋白激酶p561ck)啟動子、人類CD2啟動子及其3'轉錄增強子,以及人類NK及T細胞特異性活化(NKG5)啟動子。用於結腸之例示性組織特異性表現元件包括但不限於pp60c-src酪胺酸激酶啟動子、器官特異性新抗原(OSN)啟動子及結腸特異性抗原-P啟動子。用於乳房細胞之組織特異性表現元件係例如但不限於人類α-乳白蛋白啟動子。用於肺之例示性組織特異性表現元件包括但不限於囊性纖維化跨膜傳導調控物(CFTR)基因啟動子。
在一些實施例中,本揭示案之啟動子受腫瘤微環境內之信號調節。若在存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低至少10%,則認為腫瘤微環境調節啟動子。在一些實施例中,啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少100%。舉例而言,啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低10-20%、10-30%、10-40%、10-50%、10-60%、10-70%、10-80%、10-90%、10-100%、10-200%、20-30%、20-40%、20-50%、20-60%、20-70%、20-80%、20-90%、20-100%、20-200%、50-60%、50-70%、50-80%、50-90%、50-100%或50-200%。
在一些實施例中,啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低至少2倍(例如,2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、25倍、20倍、25倍、50倍或100倍)。舉例而言,啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低至少3倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少50倍或至少100倍。在一些實施例中,啟動子之活性相對於不存在腫瘤微環境之情況下啟動子之活性增加或降低2-10倍、2-20倍、2-30倍、2-40倍、2-50倍、2-60倍、2-70倍、2-80倍、2-90倍或2-100倍。
在一些實施例中,本揭示案之啟動子在缺氧條件下受到活化。「缺氧條件」係身體或身體區域在組織水準上缺乏足夠氧供應之條件。缺氧條件可引起發炎(例如,在缺氧條件下炎性細胞介素之水準增加)。在一些實施例中,在缺氧條件下活化之啟動子可操作地連接至編碼蛋白之核苷酸,該蛋白降低炎性細胞介素活性之表現,因而減少缺氧條件引起之發炎。在一些實施例中,在缺氧條件下活化之啟動子包含缺氧反應性元件(HRE)。「缺氧反應性元件(HRE)」係對缺氧誘導因子(HIF)作出反應之反應元件。在一些實施例中,HRE包含共有模體NCGTG (其中N係A或G)。
活化條件控制多肽 (ACP) 啟動子系統
在一些實施例中,合成啟動子係包括活化條件控制多肽- (ACP-)結合結構域序列及啟動子序列之啟動子系統。該系統在本文中亦稱為「ACP反應性啟動子」。一般而言,ACP啟動子系統包括編碼活化條件控制多肽(ACP)之第一表現盒及編碼ACP反應性啟動子之第二表現盒,該ACP反應性啟動子可操作地連接至外源性多核苷酸序列,諸如編碼本文所述之細胞介素(包括細胞介素之膜可切割嵌合蛋白形式)或任何其他所關注蛋白(例如,蛋白酶或CAR)之外源性多核苷酸序列。在一些實施例中,第一表現盒及第二表現盒各自由單獨的經工程改造之核酸編碼。在其他實施例中,第一表現盒及第二表現盒由相同的經工程改造之核酸編碼。ACP反應性啟動子可以可操作地連接至編碼單一所關注蛋白或多種所關注蛋白之核苷酸序列。在一些實施例中,合成啟動子包含AATTAACGGGTTTCGTAACAATCGCATGAGGATTCGCAACGCCTTTGAAGCAGTCGACGCCGAAGTCCCGTCTCAGTAAAGGTTGAAGCAGTCGACGCCGAAGAATCGGACTGCCTTCGTATGAAGCAGTCGACGCCGAAGGTATCAGTCGCCTCGGAATGAAGCAGTCGACGCCGAAGATTCGTAAGAGGCTCACTCTCCCTTACACGGAGTGGATAACTAGTTCTAGAGGGTATATAATGGGGGCCAACGCGTACCGGTGTC (SEQ ID NO: 298)之核酸序列。在一些實施例中,合成啟動子包含與SEQ ID NO: 298至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。在一些實施例中,合成啟動子包含CGGGTTTCGTAACAATCGCATGAGGATTCGCAACGCCTTCGGCGTAGCCGATGTCGCGCTCCCGTCTCAGTAAAGGTCGGCGTAGCCGATGTCGCGCAATCGGACTGCCTTCGTACGGCGTAGCCGATGTCGCGCGTATCAGTCGCCTCGGAACGGCGTAGCCGATGTCGCGCATTCGTAAGAGGCTCACTCTCCCTTACACGGAGTGGATAACTAGTTCTAGAGGGTATATAATGGGGGCCA (SEQ ID NO: 299)之核酸序列。在一些實施例中,合成啟動子包含與SEQ ID NO: 299至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
ACP啟動子系統之啟動子(例如,驅動ACP表現之啟動子或ACP反應性啟動子之啟動子序列)可包括本文所述之任何啟動子序列(參見上文之「啟動子」)。ACP反應性啟動子可源自minP、NFkB反應元件、CREB反應元件、NFAT反應元件、SRF反應元件1、SRF反應元件2、AP1反應元件、TCF-LEF反應元件啟動子融合物、缺氧反應性元件、SMAD結合元件、STAT3結合位點、minCMV、YB_TATA、minTK、誘導物分子反應性啟動子及其銜接重複。在一些實施例中,ACP反應性啟動子包括最小啟動子。
在一些實施例中,ACP結合結構域包括一或多個鋅指結合位點。在一些實施例中,ACP反應性啟動子包括最小啟動子且ACP結合結構域包括一或多個鋅指結合位點。ACP結合結構域可包括1個、2個、3個、4個、5個、6個 7個、8個、9個、10個或更多個鋅指結合位點。在一些實施例中,轉錄因子係含鋅指之轉錄因子。在一些實施例中,含鋅指之轉錄因子係合成轉錄因子。在一些實施例中,ACP結合結構域包括一或多個鋅指結合位點且ACP具有結合DNA之鋅指蛋白結構域(ZF蛋白結構域)。在一些實施例中,ACP具有結合DNA之鋅指蛋白結構域(ZF蛋白結構域)及效應物結構域。在一些實施例中,ACP結合結構域包括一或多個鋅指結合位點且ACP具有結合DNA之鋅指蛋白結構域(ZF蛋白結構域)及效應物結構域。在一些實施例中,ZF蛋白結構域在設計上係模組化的且由鋅指陣列(ZFA)構成。鋅指陣列包含多個連接在一起之鋅指蛋白模體。每一鋅指模體結合至不同的核酸模體。此導致對任何期望核酸序列具有特異性之ZFA,例如,對具有特定鋅指結合位點組成及/或構形之ACP結合結構域具有期望特異性之ZFA。ZF模體可彼此直接相鄰,或由撓性連接體序列隔開。在一些實施例中,ZFA係串聯佈置之ZF模體之陣列、串或鏈。ZFA可具有1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個或15個鋅指模體。ZFA可具有1-10個、1-15個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-6個、1-7個、1-8個、1-9個、2-3個、2-4個、2-5個、2-6個、2-7個、2-8個、2-9個、2-10個、3-4個、3-5個、3-6個、3-7個、3-8個、3-9個、3-10個、4-5個、4-6個、4-7個、4-8個、4-9個、4-10個、5-6個、5-7個、5-8個、5-9個、5-10個或5-15個鋅指模體。ZF蛋白結構域可具有1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個或更多個ZFA。ZF結構域可具有1-10個、1-15個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-6個、1-7個、1-8個、1-9個、2-3個、2-4個、2-5個、2-6個、2-7個、2-8個、2-9個、2-10個、3-4個、3-5個、3-6個、3-7個、3-8個、3-9個、3-10個、4-5個、4-6個、4-7個、4-8個、4-9個、4-10個、5-6個、5-7個、5-8個、5-9個、5-10個或5-15個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含1至10個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少一個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少2個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少3個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少4個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少5個ZFA。在一些實施例中,ZF蛋白結構域包含至少10個ZFA。
在一些實施例中,DNA結合結構域包含四環素(或其衍生物)阻遏物(TetR)結構域。
ACP亦可進一步包括效應物結構域,諸如轉錄效應物結構域。舉例而言,轉錄效應物結構域可為轉錄因子之效應物或活化劑結構域。轉錄因子活化結構域亦稱為反式活化結構域,且充當用於蛋白(諸如用於活化或阻遏基因轉錄之轉錄共調控劑)之支架結構域。任何適宜轉錄效應物結構域皆可用於ACP,包括但不限於單純疱疹病毒蛋白16 (VP16)活化結構域;由VP16之四個串聯拷貝組成之活化結構域,即VP64活化結構域;NFκB之p65活化結構域;艾司坦-巴爾病毒R反式活化劑(Rta)活化結構域;包含VP64、p65及Rta活化結構域之三重活化劑,該三重活化劑稱為VPR活化結構域;人類E1A相關蛋白p300之組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)核心結構域,稱為p300 HAT核心活化結構域;Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;阻遏物元件沈默轉錄因子(REST)阻遏結構域;毛狀相關鹼性螺旋-環-螺旋阻遏蛋白之WRPW模體(SEQ ID NO: 346),該模體稱為WRPW阻遏結構域(SEQ ID NO: 346);DNA (胞嘧啶-5)-甲基轉移酶3B (DNMT3B)阻遏結構域;及HP1α色影阻遏結構域或其任一組合。
在一些實施例中,效應物結構域係選自以下之轉錄效應物結構域:單純疱疹病毒蛋白16 (VP16)活化結構域;由VP16之四個串聯拷貝組成之活化結構域,即VP64活化結構域;NFκB之p65活化結構域;艾司坦-巴爾病毒R反式活化劑(Rta)活化結構域;包含VP64、p65及Rta活化結構域之三重活化劑,該三重活化劑稱為VPR活化結構域;人類E1A相關蛋白p300之組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)核心結構域,稱為p300 HAT核心活化結構域;Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;阻遏物元件沈默轉錄因子(REST)阻遏結構域;毛狀相關鹼性螺旋-環-螺旋阻遏蛋白之WRPW模體(SEQ ID NO: 346),該模體稱為WRPW阻遏結構域(SEQ ID NO: 346);DNA (胞嘧啶-5)-甲基轉移酶3B (DNMT3B)阻遏結構域;及HP1α色影阻遏結構域。
在一些實施例中,ACP係小分子(例如,藥物)誘導型多肽。舉例而言,在一些實施例中,ACP可由四環素(或其衍生物)誘導,且包含TetR結構域及VP16效應物結構域。在一些實施例中,ACP包括雌激素受體變異體,諸如ERT2,且可由他莫昔芬(tamoxifen)或其代謝物(諸如4-羥基-他莫昔芬[4-OHT]、N-去甲基他莫昔芬、他莫昔芬-N-氧化物或內昔芬),藉助他莫昔芬控制之核定位來調控。在一些實施例中,ACP包含核定位信號(NLS)。在某些實施例中,NLS包含MPKKKRKV (SEQ ID NO: 296)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 296之例示性核酸序列係ATGCCCAAGAAGAAGCGGAAGGTT (SEQ ID NO: 297)或ATGCCCAAGAAAAAGCGGAAGGTG (SEQ ID NO: 340)。在一些實施例中,編碼SEQ ID NO: 296之核酸序列可包含SEQ ID NO: 297或SEQ ID NO: 340,或包含與SEQ ID NO: 297或SEQ ID NO: 340至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
在一些實施例中,ACP係小分子(例如,藥物)誘導型多肽,其包括阻遏性蛋白酶及阻遏性蛋白酶之一或多個同源切割位點。在一些實施例中,阻遏性蛋白酶在不存在特定劑之情況下係有活性(切割同源切割位點),且在存在特定劑之情況下無活性(不切割同源切割位點)。在一些實施例中,特定劑係蛋白酶抑制劑。在一些實施例中,蛋白酶抑制劑特異性地抑制本揭示案之給定阻遏性蛋白酶。阻遏性蛋白酶可為能夠藉由特定劑之存在或缺失而不活化之本文所述任何蛋白酶(關於例示性阻遏性蛋白酶、同源切割位點及蛋白酶抑制劑,參見上文之「蛋白酶切割位點」)。
在一些實施例中,ACP具有降解決定子結構域(關於例示性降解決定子序列,參見上文之「降解決定子系統及結構域」)。降解決定子結構域可相對於ACP之個別結構域處於任何順序或位置。舉例而言,降解決定子結構域可為阻遏性蛋白酶之N末端、阻遏性蛋白酶之C末端、ZF蛋白結構域之N末端、ZF蛋白結構域之C末端、效應物結構域之N末端或效應物結構域之C末端。
本揭示案之ACP之組分及例示性ACP之例示性序列提供於
表 5D中。在一些實施例中,核酸可包含表5D中之序列,或與表5D中之序列至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核酸序列。
表 5D.
多順反子及多啟動子系統
設計 | 胺基酸序列 | 核酸序列 |
NLS +微型VPR活化結構域+ NS3蛋白酶+ ZFBD DNA結合結構域 | MPKKKRKVDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLFEDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQHMSRPGERPFQCRICMRNFSNMSNLTRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSVLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSDPSNLARHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSSLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSQSGTLHRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSQRPNLTRHLRTHLRGS (SEQ ID NO: 301) | ATGCCCAAGAAAAAGCGGAAGGTGGACGCCCTGGACGACTTCGATCTGGATATGCTGGGCAGCGACGCTCTGGATGATTTTGACCTGGACATGCTCGGCTCTGATGCACTCGACGATTTCGACCTCGATATGTTGGGATCTGATGCCCTTGATGACTTTGATCTCGACATGTTGATCAATAGCCGGTCCAGCGGCAGCCCCAAGAAGAAGAGAAAAGTCGGCTCTGGCGGCGGATCTGGCGGTTCTGGATCTGTTTTGCCCCAAGCTCCTGCTCCTGCACCAGCTCCAGCTATGGTTTCTGCTCTGGCTCAGGCTCCAGCTCCTGTGCCTGTTCTTGCTCCTGGACCTCCTCAGGCTGTTGCTCCACCAGCACCTAAACCTACACAGGCCGGCGAGGGAACACTGTCTGAAGCTCTGCTGCAGCTCCAGTTCGACGACGAAGATCTGGGAGCCCTGCTGGGCAATAGCACAGATCCTGCCGTGTTCACCGATCTGGCCAGCGTGGACAATAGCGAGTTCCAGCAGCTCCTGAACCAGGGCATTCCTGTGGCTCCTCACACCACCGAGCCTATGCTGATGGAATACCCCGAGGCCATCACCAGACTGGTCACCGGTGCTCAAAGACCACCTGATCCGGCTCCAGCACCTCTTGGAGCACCTGGACTGCCTAATGGACTGCTGTCTGGCGACGAGGACTTCAGCTCTATCGCCGACATGGATTTCAGCGCCCTGCTCAGTGGCGGTGGAAGCGGAGGAAGTGGCAGCGATCTTTCTCACCCTCCACCTAGAGGCCACCTGGACGAGCTGACAACCACACTGGAATCCATGACCGAGGACCTGAACCTGGACAGCCCTCTGACACCCGAGCTGAACGAGATCCTGGACACCTTCCTGAACGACGAGTGTCTGCTGCACGCCATGCACATCTCTACCGGCCTGAGCATCTTCGACACCAGCCTGTTTGAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGCAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTACCGGTACATCGGCAGCTCTGGCACAGGCTGTGTGGTCATCGTGGGCAGAATCGTGCTGTCTGGCAGCGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTATGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGAACCAGAACAATCGCCTCTCCTAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCTCTAGCGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCACATGTCTAGACCTGGCGAGAGGCCCTTCCAGTGCCGGATCTGCATGCGGAACTTCAGCAACATGAGCAACCTGACCAGACACACCCGGACACACACAGGCGAGAAGCCTTTTCAGTGCAGAATCTGTATGCGCAATTTCTCCGACAGAAGCGTGCTGCGGAGACACCTGAGAACCCACACCGGCAGCCAGAAACCATTCCAGTGTCGCATCTGTATGAGAAACTTTAGCGACCCCTCCAATCTGGCCCGGCACACCAGAACACATACCGGGGAAAAACCCTTTCAGTGTAGGATATGCATGAGGAATTTTTCCGACCGGTCCAGCCTGAGGCGGCACCTGAGGACACATACTGGCTCCCAAAAGCCGTTCCAATGTCGGATATGTATGCGCAACTTTAGCCAGAGCGGCACCCTGCACAGACACACAAGAACCCATACTGGCGAGAAACCTTTCCAATGTAGAATCTGCATGCGAAATTTTTCCCAGCGGCCTAATCTGACCAGGCATCTGAGGACCCACCTGAGAGGATCT (SEQ ID NO: 306) |
NLS + ZFBD DNA結合結構域+ NS3蛋白酶+微型VPR活化結構域 | MPKKKRKVMSRPGERPFQCRICMRNFSNMSNLTRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSVLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSDPSNLARHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSSLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSQSGTLHRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSQRPNLTRHLRTHLRGSEDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQHDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF (SEQ ID NO: 302) | ATGCCCAAGAAAAAGCGGAAGGTGATGTCTAGACCTGGCGAGAGGCCCTTCCAGTGCCGGATCTGCATGCGGAACTTCAGCAACATGAGCAACCTGACCAGACACACCCGGACACACACAGGCGAGAAGCCTTTTCAGTGCAGAATCTGTATGCGCAATTTCTCCGACAGAAGCGTGCTGCGGAGACACCTGAGAACCCACACCGGCAGCCAGAAACCATTCCAGTGTCGCATCTGTATGAGAAACTTTAGCGACCCCTCCAATCTGGCCCGGCACACCAGAACACATACCGGGGAAAAACCCTTTCAGTGTAGGATATGCATGAGGAATTTTTCCGACCGGTCCAGCCTGAGGCGGCACCTGAGGACACATACTGGCTCCCAAAAGCCGTTCCAATGTCGGATATGTATGCGCAACTTTAGCCAGAGCGGCACCCTGCACAGACACACAAGAACCCATACTGGCGAGAAACCTTTCCAATGTAGAATCTGCATGCGAAATTTTTCCCAGCGGCCTAATCTGACCAGGCATCTGAGGACCCACCTGAGAGGATCTGAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGCAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTACCGGTACATCGGCAGCTCTGGCACAGGCTGTGTGGTCATCGTGGGCAGAATCGTGCTGTCTGGCAGCGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTATGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGAACCAGAACAATCGCCTCTCCTAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCTCTAGCGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCACGACGCCCTGGACGACTTCGATCTGGATATGCTGGGCAGCGACGCTCTGGATGATTTTGACCTGGACATGCTCGGCTCTGATGCACTCGACGATTTCGACCTCGATATGTTGGGATCTGATGCCCTTGATGACTTTGATCTCGACATGTTGATCAATAGCCGGTCCAGCGGCAGCCCCAAGAAGAAGAGAAAAGTCGGCTCTGGCGGCGGATCTGGCGGTTCTGGATCTGTTTTGCCCCAAGCTCCTGCTCCTGCACCAGCTCCAGCTATGGTTTCTGCTCTGGCTCAGGCTCCAGCTCCTGTGCCTGTTCTTGCTCCTGGACCTCCTCAGGCTGTTGCTCCACCAGCACCTAAACCTACACAGGCCGGCGAGGGAACACTGTCTGAAGCTCTGCTGCAGCTCCAGTTCGACGACGAAGATCTGGGAGCCCTGCTGGGCAATAGCACAGATCCTGCCGTGTTCACCGATCTGGCCAGCGTGGACAATAGCGAGTTCCAGCAGCTCCTGAACCAGGGCATTCCTGTGGCTCCTCACACCACCGAGCCTATGCTGATGGAATACCCCGAGGCCATCACCAGACTGGTCACCGGTGCTCAAAGACCACCTGATCCGGCTCCAGCACCTCTTGGAGCACCTGGACTGCCTAATGGACTGCTGTCTGGCGACGAGGACTTCAGCTCTATCGCCGACATGGATTTCAGCGCCCTGCTCAGTGGCGGTGGAAGCGGAGGAAGTGGCAGCGATCTTTCTCACCCTCCACCTAGAGGCCACCTGGACGAGCTGACAACCACACTGGAATCCATGACCGAGGACCTGAACCTGGACAGCCCTCTGACACCCGAGCTGAACGAGATCCTGGACACCTTCCTGAACGACGAGTGTCTGCTGCACGCCATGCACATCTCTACCGGCCTGAGCATCTTCGACACCAGCCTGTTT (SEQ ID NO: 305) |
NLS + ZFBD DNA結合結構域+ NS3蛋白酶+微型VPR活化結構域 | MPKKKRKVSRPGERPFQCRICMRNFSRRHGLDRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDHSSLKRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSVRHNLTRHLRTHTGEKPFQCRICMRNFSDHSNLSRHLKTHTGSQKPFQCRICMRNFSQRSSLVRHLRTHTGEKPFQCRICMRNFSESGHLKRHLRTHLRGSEDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQHDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF (SEQ ID NO: 303) | ATGCCCAAGAAGAAGCGGAAGGTTTCCCGGCCTGGCGAGAGGCCTTTCCAGTGCAGAATCTGCATGCGGAACTTCAGCAGACGGCACGGCCTGGACAGACACACCAGAACACACACAGGCGAGAAACCCTTCCAGTGCCGGATCTGTATGAGAAATTTCAGCGACCACAGCAGCCTGAAGCGGCACCTGAGAACCCATACCGGCAGCCAGAAACCATTTCAGTGTAGGATATGCATGCGCAATTTCTCCGTGCGGCACAACCTGACCAGACACCTGAGGACACACACCGGGGAGAAGCCTTTTCAATGTCGCATATGCATGAGAAACTTCTCTGACCACTCCAACCTGAGCCGCCACCTCAAAACCCACACCGGCTCTCAAAAGCCCTTCCAATGTAGAATATGTATGAGGAACTTTAGCCAGCGGAGCAGCCTCGTGCGCCATCTGAGAACTCACACTGGCGAAAAGCCGTTTCAATGCCGTATCTGTATGCGCAACTTTAGCGAGAGCGGCCACCTGAAGAGACATCTGCGCACACACCTGAGAGGCAGCGAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGAAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTATCGGTACATCGGCAGCAGCGGCACAGGCTGTGTTGTGATCGTGGGCAGAATCGTGCTGAGCGGCTCTGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGCACAAGAACAATCGCCTCTCCAAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCACGACGCTCTTGATGACTTTGACCTGGATATGCTCGGATCAGATGCCCTGGACGATTTCGATCTGGACATGTTGGGGTCTGATGCTCTCGACGACTTCGATCTGGATATGCTTGGAAGTGACGCGCTGGATGATTTCGACCTTGACATGCTCATCAATTCTCGATCCAGTGGAAGCCCGAAAAAGAAACGCAAGGTGGGAAGTGGGGGCGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTGTATTGCCTCAAGCTCCCGCGCCCGCTCCTGCTCCGGCAATGGTTTCAGCTCTGGCACAAGCTCCAGCTCCAGTGCCTGTGCTCGCCCCTGGCCCTCCGCAGGCCGTAGCACCTCCCGCCCCCAAACCGACGCAAGCCGGTGAGGGGACTCTCTCTGAAGCCTTGCTGCAGCTTCAGTTCGATGATGAAGATCTGGGCGCGCTCTTGGGGAACAGCACGGATCCGGCAGTATTTACGGACCTCGCATCAGTTGACAATAGTGAATTTCAACAACTTCTTAACCAGGGAATACCGGTTGCGCCCCATACGACGGAACCTATGCTGATGGAGTACCCTGAAGCTATAACCAGACTCGTAACTGGCGCCCAACGCCCGCCCGACCCGGCTCCTGCGCCGCTGGGTGCGCCGGGTCTTCCGAATGGTCTTCTCTCAGGGGACGAAGATTTCAGTTCCATTGCGGATATGGACTTTTCCGCGCTCCTGAGTGGGGGTGGCTCTGGAGGCTCTGGTTCCGACCTCAGCCATCCTCCACCGAGAGGACACCTCGACGAGCTGACAACCACCCTCGAAAGTATGACGGAAGATCTGAACTTGGATTCCCCCCTTACCCCAGAACTGAATGAAATCCTCGATACGTTCTTGAACGATGAGTGCCTTTTGCACGCCATGCATATATCAACAGGTTTGTCTATCTTCGACACGTCCCTCTTTTGA (SEQ ID NO: 304) |
微型VPR活化劑結構域 | DALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF (SEQ ID NO: 325) | GACGCCCTGGACGACTTCGATCTGGATATGCTGGGCAGCGACGCTCTGGATGATTTTGACCTGGACATGCTCGGCTCTGATGCACTCGACGATTTCGACCTCGATATGTTGGGATCTGATGCCCTTGATGACTTTGATCTCGACATGTTGATCAATAGCCGGTCCAGCGGCAGCCCCAAGAAGAAGAGAAAAGTCGGCTCTGGCGGCGGATCTGGCGGTTCTGGATCTGTTTTGCCCCAAGCTCCTGCTCCTGCACCAGCTCCAGCTATGGTTTCTGCTCTGGCTCAGGCTCCAGCTCCTGTGCCTGTTCTTGCTCCTGGACCTCCTCAGGCTGTTGCTCCACCAGCACCTAAACCTACACAGGCCGGCGAGGGAACACTGTCTGAAGCTCTGCTGCAGCTCCAGTTCGACGACGAAGATCTGGGAGCCCTGCTGGGCAATAGCACAGATCCTGCCGTGTTCACCGATCTGGCCAGCGTGGACAATAGCGAGTTCCAGCAGCTCCTGAACCAGGGCATTCCTGTGGCTCCTCACACCACCGAGCCTATGCTGATGGAATACCCCGAGGCCATCACCAGACTGGTCACCGGTGCTCAAAGACCACCTGATCCGGCTCCAGCACCTCTTGGAGCACCTGGACTGCCTAATGGACTGCTGTCTGGCGACGAGGACTTCAGCTCTATCGCCGACATGGATTTCAGCGCCCTGCTCAGTGGCGGTGGAAGCGGAGGAAGTGGCAGCGATCTTTCTCACCCTCCACCTAGAGGCCACCTGGACGAGCTGACAACCACACTGGAATCCATGACCGAGGACCTGAACCTGGACAGCCCTCTGACACCCGAGCTGAACGAGATCCTGGACACCTTCCTGAACGACGAGTGTCTGCTGCACGCCATGCACATCTCTACCGGCCTGAGCATCTTCGACACCAGCCTGTTT (SEQ ID NO: 322) 或 GACGCTCTTGATGACTTTGACCTGGATATGCTCGGATCAGATGCCCTGGACGATTTCGATCTGGACATGTTGGGGTCTGATGCTCTCGACGACTTCGATCTGGATATGCTTGGAAGTGACGCGCTGGATGATTTCGACCTTGACATGCTCATCAATTCTCGATCCAGTGGAAGCCCGAAAAAGAAACGCAAGGTGGGAAGTGGGGGCGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTGTATTGCCTCAAGCTCCCGCGCCCGCTCCTGCTCCGGCAATGGTTTCAGCTCTGGCACAAGCTCCAGCTCCAGTGCCTGTGCTCGCCCCTGGCCCTCCGCAGGCCGTAGCACCTCCCGCCCCCAAACCGACGCAAGCCGGTGAGGGGACTCTCTCTGAAGCCTTGCTGCAGCTTCAGTTCGATGATGAAGATCTGGGCGCGCTCTTGGGGAACAGCACGGATCCGGCAGTATTTACGGACCTCGCATCAGTTGACAATAGTGAATTTCAACAACTTCTTAACCAGGGAATACCGGTTGCGCCCCATACGACGGAACCTATGCTGATGGAGTACCCTGAAGCTATAACCAGACTCGTAACTGGCGCCCAACGCCCGCCCGACCCGGCTCCTGCGCCGCTGGGTGCGCCGGGTCTTCCGAATGGTCTTCTCTCAGGGGACGAAGATTTCAGTTCCATTGCGGATATGGACTTTTCCGCGCTCCTGAGTGGGGGTGGCTCTGGAGGCTCTGGTTCCGACCTCAGCCATCCTCCACCGAGAGGACACCTCGACGAGCTGACAACCACCCTCGAAAGTATGACGGAAGATCTGAACTTGGATTCCCCCCTTACCCCAGAACTGAATGAAATCCTCGATACGTTCTTGAACGATGAGTGCCTTTTGCACGCCATGCATATATCAACAGGTTTGTCTATCTTCGACACGTCCCTCTTTTGA (SEQ ID NO: 343) |
ZF5-7鋅指結構域 | MSRPGERPFQCRICMRNFSNMSNLTRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSVLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSDPSNLARHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSSLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSQSGTLHRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSQRPNLTRHLRTHLRGS (SEQ ID NO: 320) | ATGTCTAGACCTGGCGAGAGGCCCTTCCAGTGCCGGATCTGCATGCGGAACTTCAGCAACATGAGCAACCTGACCAGACACACCCGGACACACACAGGCGAGAAGCCTTTTCAGTGCAGAATCTGTATGCGCAATTTCTCCGACAGAAGCGTGCTGCGGAGACACCTGAGAACCCACACCGGCAGCCAGAAACCATTCCAGTGTCGCATCTGTATGAGAAACTTTAGCGACCCCTCCAATCTGGCCCGGCACACCAGAACACATACCGGGGAAAAACCCTTTCAGTGTAGGATATGCATGAGGAATTTTTCCGACCGGTCCAGCCTGAGGCGGCACCTGAGGACACATACTGGCTCCCAAAAGCCGTTCCAATGTCGGATATGTATGCGCAACTTTAGCCAGAGCGGCACCCTGCACAGACACACAAGAACCCATACTGGCGAGAAACCTTTCCAATGTAGAATCTGCATGCGAAATTTTTCCCAGCGGCCTAATCTGACCAGGCATCTGAGGACCCACCTGAGAGGATCT (SEQ ID NO: 323) |
NS3蛋白酶 | EDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQH (SEQ ID NO: 321) | GAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGCAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTACCGGTACATCGGCAGCTCTGGCACAGGCTGTGTGGTCATCGTGGGCAGAATCGTGCTGTCTGGCAGCGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTATGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGAACCAGAACAATCGCCTCTCCTAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCTCTAGCGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCAC (SEQ ID NO: 195) 或 GAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGAAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTATCGGTACATCGGCAGCAGCGGCACAGGCTGTGTTGTGATCGTGGGCAGAATCGTGCTGAGCGGCTCTGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGCACAAGAACAATCGCCTCTCCAAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCAC (SEQ ID NO: 342) |
在一些實施例中,經工程改造之核酸(例如,包含表現盒之經工程改造之核酸)經構形以產生多種蛋白(例如,細胞介素、CAR、ACP、膜可切割嵌合蛋白及/或其組合)。舉例而言,核酸可經構形以產生2-20種不同的蛋白。在一些實施例中,核酸經構形以產生2-20種、2-19種、2-18種、2-17種、2-16種、2-15種、2-14種、2-13種、2-12種、2-11種、2-10種、2-9種、2-8種、2-7種、2-6種、2-5種、2-4種、2-3種、3-20種、3-19種、3-18種、3-17種、3-16種、3-15種、3-14種、3-13種、3-12種、3-11種、3-10種、3-9種、3-8種、3-7種、3-6種、3-5種、3-4種、4-20種、4-19種、4-18種、4-17種、4-16種、4-15種、4-14種、4-13種、4-12種、4-11種、4-10種、4-9種、4-8種、4-7種、4-6種、4-5種、5-20種、5-19種、5-18種、5-17種、5-16種、5-15種、5-14種、5-13種、5-12種、5-11種、5-10種、5-9種、5-8種、5-7種、5-6種、6-20種、6-19種、6-18種、6-17種、6-16種、6-15種、6-14種、6-13種、6-12種、6-11種、6-10種、6-9種、6-8種、6-7種、7-20種、7-19種、7-18種、7-17種、7-16種、7-15種、7-14種、7-13種、7-12種、7-11種、7-10種、7-9種、7-8種、8-20種、8-19種、8-18種、8-17種、8-16種、8-15種、8-14種、8-13種、8-12種、8-11種、8-10種、8-9種、9-20種、9-19種、9-18種、9-17種、9-16種、9-15種、9-14種、9-13種、9-12種、9-11種、9-10種、10-20種、10-19種、10-18種、10-17種、10-16種、10-15種、10-14種、10-13種、10-12種、10-11種、11-20種、11-19種、11-18種、11-17種、11-16種、11-15種、11-14種、11-13種、11-12種、12-20種、12-19種、12-18種、12-17種、12-16種、12-15種、12-14種、12-13種、13-20種、13-19種、13-18種、13-17種、13-16種、13-15種、13-14種、14-20種、14-19種、14-18種、14-17種、14-16種、14-15種、15-20種、15-19種、15-18種、15-17種、15-16種、16-20種、16-19種、16-18種、16-17種、17-20種、17-19種、17-18種、18-20種、18-19種或19-20種蛋白。在一些實施例中,核酸經構形以產生1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白。
在一些實施例中,經工程改造之核酸可為多順反子,亦即,可自單一mRNA轉錄本產生超過一種單獨多肽(例如,多種嵌合蛋白,諸如本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白)。藉助使用各種連接體,經工程改造之核酸可為多順反子,例如,編碼第一蛋白之多核苷酸序列可連接至編碼第二蛋白之核苷酸序列,諸如在第一基因:連接體:第二基因5’至3’定向上進行連接。連接體可編碼2A核糖體跳躍元件,諸如T2A。其他2A核糖體跳躍元件包括但不限於E2A、P2A及F2A。2A核糖體跳躍元件容許在轉譯期間產生由第一及第二基因編碼之單獨多肽之產生。連接體可編碼可切割連接體多肽序列,諸如弗林蛋白酶切割位點或TEV切割位點,其中在表現後,切割可切割連接體多肽,使得產生由第一及第二基因編碼之單獨多肽。可切割連接體可包括進一步促進切割之多肽序列,諸如撓性連接體(例如,Gly-Ser-Gly序列)。在一些實施例中,本文所揭示經工程改造之核酸包含E2A/T2A核糖體跳躍元件。在某些實施例中,E2A/T2A核糖體跳躍元件包含GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP (SEQ ID NO: 281)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 281之例示性核酸係GGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT (SEQ ID NO: 282)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 281之核酸包含與SEQ ID NO: 282至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。在一些實施例中,本文所揭示經工程改造之核酸包含E2A/T2A核糖體跳躍元件。在某些實施例中,E2A/T2A核糖體跳躍元件包含QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP (SEQ ID NO: 283)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 283之例示性核酸係CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT (SEQ ID NO: 284)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 283之核酸包含與SEQ ID NO: 284至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
連接體可編碼內部核糖體進入位點(IRES),使得在轉譯期間產生由第一及第二基因編碼之單獨多肽。連接體可編碼剪接受體,諸如病毒剪接受體。
連接體可為連接體之組合,諸如弗林蛋白酶-2A連接體,其可藉助2A核糖體跳躍、之後進一步切割弗林蛋白酶位點以容許完全去除2A殘基來產生單獨多肽。在一些實施例中,連接體之組合可包括弗林蛋白酶序列、撓性連接體及2A連接體。因此,在一些實施例中,連接體係弗林蛋白酶-Gly-Ser-Gly-2A融合多肽。在一些實施例中,本揭示案之連接體係弗林蛋白酶-Gly-Ser-Gly-T2A融合多肽。
一般而言,多順反子系統可使用任何數目或組合之連接體來表現任何數目之基因或其部分(例如,經工程改造之核酸可編碼第一、第二及第三蛋白,各自由連接體隔開,使得產生由第一、第二及第三蛋白編碼之單獨多肽)。
經工程改造之核酸可使用多個啟動子自多個ORF表現基因,亦即,可自單一經工程改造之核酸產生超過一種單獨的mRNA轉錄本。舉例而言,第一啟動子可以可操作地連接至編碼第一蛋白之多核苷酸序列,且第二啟動子可以可操作地連接至編碼第二蛋白之多核苷酸序列。一般而言,可使用任何數目之啟動子來表現任何數目之蛋白。在一些實施例中,自多個啟動子表現之ORF中之至少一個可為多順反子。
相同的經工程改造之核酸上編碼之表現盒可以適於表現經編碼外源性多核苷酸序列之任何方式定向。相同的經工程改造之核酸上編碼之表現盒可以相同方向定向,亦即,單獨盒之轉錄以相同方向進行。以相同方向定向之構築體可以頭對尾形式組織,該形式係指第一基因之5′端(頭)毗鄰於上游基因之3′端(尾)。相同的經工程改造之核酸上編碼之表現盒可以相反方向定向,亦即,單獨盒之轉錄以相反方向(在本文中亦稱為「雙向」)進行。相同的經工程改造之核酸上編碼之表現盒(以相反方向定向)可以「頭對頭」方向性定向。如本文所用,頭對頭係指雙向構築體之第一基因之5′端(頭)毗鄰於雙向構築體之上游基因之5′端(頭)。相同的經工程改造之核酸上編碼之表現盒(以相反方向定向)可以「尾對尾」方向性定向。如本文所用,尾對尾係指雙向構築體之第一基因之3′端(尾)毗鄰於雙向構築體之上游基因之3′端(尾)。舉例而言且無限制,
圖 1示意性地繪示呈頭對頭方向性(
圖 1A)、頭對尾方向性(
圖 1B)及尾對尾方向性(
圖 1C)之細胞介素-CAR雙向構築體。
如本文所用之「連接體」可指連接第一多肽序列及第二多肽序列之多肽、上述多順反子連接體或可操作地連接至上述額外ORF之額外啟動子。
由表現盒編碼之外源性多核苷酸序列可包括3’非轉譯區(UTR),該UTR包含可操作地連接至外源性多核苷酸序列(諸如編碼細胞介素(例如,IL12或IL12p70)之外源性多核苷酸序列)之mRNA去穩定元件。在一些實施例中,mRNA去穩定元件包含富含AU之元件及/或莖-環去穩定元件(SLDE)。在一些實施例中,mRNA去穩定元件包含富含AU之元件。在一些實施例中,富含AU之元件包括序列ATTTA (SEQ ID NO: 209)之至少兩個重疊模體。在一些實施例中,富含AU之元件包含ATTTATTTATTTATTTATTTA (SEQ ID NO: 210)。在一些實施例中,mRNA去穩定元件包含莖-環去穩定元件(SLDE)。在一些實施例中,SLDE包含CTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 211)。在一些實施例中,mRNA去穩定元件包含至少一個富含AU之元件及至少一個SLDE。如本文所用之「AuSLDE」係指可操作地連接至莖-環去穩定元件(SLDE)的富含AU之元件。例示性AuSLDE序列包含ATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 212)。在一些實施例中,mRNA去穩定元件包含2X AuSLDE。例示性AuSLDE序列提供為ATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAGtgcggtaagcATTTATTTATTTATTTATTTAacatcggttccCTGTTTAATATTTAAACAG (SEQ ID NO: 213)。
在某些實施例中,本文所述經工程改造之核酸包含絕緣子序列(insulator sequence)。此類絕緣子序列之功能係防止構築體之毗鄰區之間的不當相互作用。在某些實施例中,絕緣子序列包含ACAATGGCTGGCCCATAGTAAATGCCGTGTTAGTGTGTTAGTTGCTGTTCTTCCACGTCAGAAGAGGCACAGACAAATTACCACCAGGTGGCGCTCAGAGTCTGCGGAGGCATCACAACAGCCCTGAATTTGAATCCTGCTCTGCCACTGCCTAGTTGAGACCTTTTACTACCTGACTAGCTGAGACATTTACGACATTTACTGGCTCTAGGACTCATTTTATTCATTTCATTACTTTTTTTTTCTTTGAGACGGAATCTCGCTCT (SEQ ID NO: 300)之核酸序列。在某些實施例中,絕緣子序列包含與SEQ ID NO: 300至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
經工程改造之細胞
本文提供經工程改造之免疫反應性細胞,以及產生經工程改造之免疫反應性細胞之方法,其產生本文所述之蛋白(例如,本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白)。一般而言,本揭示案之經工程改造之免疫反應性細胞可經工程改造以表現本文所提供之蛋白,諸如本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。該等細胞在本文中稱為「經工程改造之細胞」。該等通常含有經工程改造之核酸之細胞在自然界中並不存在。在一些實施例中,細胞經工程改造以包括包含啟動子之核酸,該啟動子可操作地連接至編碼蛋白(例如細胞介素、CAR、ACP及/或膜可切割嵌合蛋白)之核苷酸序列。經工程改造之細胞可包含整合至細胞基因體中之經工程改造之核酸。經工程改造之細胞可包含能夠在不整合至細胞基因體(例如,用諸如質體或mRNA等瞬時表現系統工程改造)中之情況下表現的經工程改造之核酸。
本揭示案亦涵蓋一或多種蛋白與產生其之經工程改造之細胞之間的相加性及協同作用。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少兩種(例如,2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種)蛋白,例如細胞介素、CAR、ACP及膜可切割嵌合蛋白中之至少每一者。一般而言,本文所提供之免疫反應性細胞經工程改造以產生至少一種具有並非由細胞天然產生之細胞介素效應分子之膜可切割嵌合蛋白、CAR及ACP。一般而言,本文所提供之免疫反應性細胞經工程改造以產生至少兩種細胞介素(其中至少一種係具有細胞介素效應分子之膜可切割嵌合蛋白)、CAR及ACP。該效應分子可例如補充由細胞天然產生之效應分子之功能。
在一些實施例中,細胞(例如,免疫細胞)經工程改造以產生多種蛋白。舉例而言,細胞可經工程改造以產生2-20種不同的蛋白,諸如2-20種不同的膜可切割蛋白。在一些實施例中,細胞(例如,免疫反應性細胞)經工程改造以產生至少4種對於該細胞而言外源之不同蛋白。在一些實施例中,細胞(例如,免疫反應性細胞)經工程改造以產生4種對於該細胞而言外源之不同蛋白。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生2-20種、2-19種、2-18種、2-17種、2-16種、2-15種、2-14種、2-13種、2-12種、2-11種、2-10種、2-9種、2-8種、2-7種、2-6種、2-5種、2-4種、2-3種、3-20種、3-19種、3-18種、3-17種、3-16種、3-15種、3-14種、3-13種、3-12種、3-11種、3-10種、3-9種、3-8種、3-7種、3-6種、3-5種、3-4種、4-20種、4-19種、4-18種、4-17種、4-16種、4-15種、4-14種、4-13種、4-12種、4-11種、4-10種、4-9種、4-8種、4-7種、4-6種、4-5種、5-20種、5-19種、5-18種、5-17種、5-16種、5-15種、5-14種、5-13種、5-12種、5-11種、5-10種、5-9種、5-8種、5-7種、5-6種、6-20種、6-19種、6-18種、6-17種、6-16種、6-15種、6-14種、6-13種、6-12種、6-11種、6-10種、6-9種、6-8種、6-7種、7-20種、7-19種、7-18種、7-17種、7-16種、7-15種、7-14種、7-13種、7-12種、7-11種、7-10種、7-9種、7-8種、8-20種、8-19種、8-18種、8-17種、8-16種、8-15種、8-14種、8-13種、8-12種、8-11種、8-10種、8-9種、9-20種、9-19種、9-18種、9-17種、9-16種、9-15種、9-14種、9-13種、9-12種、9-11種、9-10種、10-20種、10-19種、10-18種、10-17種、10-16種、10-15種、10-14種、10-13種、10-12種、10-11種、11-20種、11-19種、11-18種、11-17種、11-16種、11-15種、11-14種、11-13種、11-12種、12-20種、12-19種、12-18種、12-17種、12-16種、12-15種、12-14種、12-13種、13-20種、13-19種、13-18種、13-17種、13-16種、13-15種、13-14種、14-20種、14-19種、14-18種、14-17種、14-16種、14-15種、15-20種、15-19種、15-18種、15-17種、15-16種、16-20種、16-19種、16-18種、16-17種、17-20種、17-19種、17-18種、18-20種、18-19種或19-20種蛋白。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白。
在一些實施例中,經工程改造之細胞包含一或多種編碼啟動子之經工程改造之核酸,該啟動子可操作地連接至編碼蛋白之核苷酸序列(例如,表現盒)。在一些實施例中,細胞經工程改造以包括複數種經工程改造之核酸,例如,至少兩種經工程改造之核酸,各自編碼可操作地連接至編碼至少一種(例如,1種、2種或3種)蛋白之核苷酸序列的啟動子。舉例而言,細胞可經工程改造以包含至少2種、至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少8種、至少9種或至少10種經工程改造之核酸,各自編碼可操作地連接至編碼至少一種(例如,1種、2種或3種)蛋白之核苷酸序列的啟動子。在一些實施例中,細胞經工程改造以包含2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種經工程改造之核酸,各自編碼可操作地連接至編碼至少一種(例如,1種、2種或3種)蛋白之核苷酸序列的啟動子。經工程改造之細胞可包含編碼至少一種上述連接體之經工程改造之核酸,該等連接體諸如連接第一多肽序列及第二多肽序列之多肽、一或多種上述多順反子連接體、一或多種可操作地連接至額外ORF之額外啟動子或其組合。
在一些實施例中,細胞(例如,免疫細胞)經工程改造以表現蛋白酶。在一些實施例中,細胞經工程改造以表現對於細胞而言異源之蛋白酶。在一些實施例中,細胞經工程改造以表現對於表現蛋白之細胞而言異源之蛋白酶,諸如切割膜可切割嵌合蛋白之蛋白酶切割位點之異源性蛋白酶。在一些實施例中,經工程改造之細胞包含一或多種編碼啟動子之經工程改造之核酸,該啟動子可操作地連接至編碼蛋白酶(諸如異源性蛋白酶)之核苷酸序列。蛋白酶及蛋白酶切割位點更詳細地闡述於本文標題為「蛋白酶切割位點」之部分中。
本文亦提供經工程改造以產生多種蛋白之經工程改造之細胞,該等蛋白中之至少兩種包括調節不同腫瘤介導之免疫抑制機制之效應分子。在一些實施例中,至少一種(例如,1種、2種、3種、4種、5種或更多種)蛋白包括刺激腫瘤微環境中之至少一種免疫刺激機制或抑制腫瘤微環境中之至少一種免疫抑制機制之效應分子。在一些實施例中,至少一種(例如,1種、2種、3種、4種、5種或更多種)蛋白包括抑制腫瘤微環境中之至少一種免疫抑制機制之效應分子,且至少一種蛋白(例如,1種、2種、3種、4種、5種或更多種)抑制腫瘤微環境中之至少一種免疫抑制機制。在其他實施例中,至少兩種(例如,2種、3種、4種、5種或更多種)蛋白係各自刺激腫瘤微環境中之至少一種免疫刺激機制之效應分子。在其他實施例中,至少兩種(例如,1種、2種、3種、4種、5種或更多種)蛋白係各自抑制腫瘤微環境中之至少一種免疫抑制機制之效應分子。
在一些實施例中,細胞(例如,免疫細胞)經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激T細胞或NK細胞傳訊、活性及/或募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激抗原呈現及/或加工之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激自然殺手細胞介導之細胞毒性傳訊、活性及/或募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激樹突細胞分化及/或成熟之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激免疫細胞募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激M1巨噬細胞傳訊、活性及/或募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激Th1極化之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激基質降解之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激免疫刺激代謝物產生之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括刺激I型干擾素傳訊之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制負共刺激傳訊之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制抗腫瘤免疫細胞之促凋亡傳訊(例如,經由TRAIL)之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制T調控性(T
reg)細胞傳訊、活性及/或募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制腫瘤檢查點分子之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括活化干擾素基因刺激物(STING)傳訊之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制髓源性抑制性細胞傳訊、活性及/或募集之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括降解免疫抑制因子/代謝物之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括抑制血管內皮生長因子傳訊之效應分子。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種蛋白,該蛋白包括直接殺傷腫瘤細胞之效應分子(例如,顆粒酶、穿孔蛋白、溶瘤病毒、溶細胞肽及酶、抗腫瘤抗體,該等抗腫瘤抗體例如觸發ADCC)。
在一些實施例中,至少一種蛋白,其包括效應分子,該效應分子刺激T細胞傳訊、活性及/或募集,刺激抗原呈現及/或加工,刺激自然殺手細胞介導之細胞毒性傳訊、活性及/或募集,刺激樹突細胞分化及/或成熟,刺激免疫細胞募集,刺激巨噬細胞傳訊,刺激基質降解,刺激免疫刺激代謝物產生,或刺激I型干擾素傳訊;及至少一種蛋白,其包括效應分子,該效應分子抑制負共刺激傳訊,抑制抗腫瘤免疫細胞之促凋亡傳訊,抑制T調控性(Treg)細胞傳訊、活性及/或募集,抑制腫瘤檢查點分子,活化干擾素基因刺激物(STING)傳訊,抑制髓源性抑制性細胞傳訊、活性及/或募集,降解免疫抑制因子/代謝物,抑制血管內皮生長因子傳訊,或直接殺傷腫瘤細胞。
在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以產生至少一種選自以下之效應分子細胞介素:IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以產生至少兩種選自以下之效應分子細胞介素:IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以產生至少兩種選自以下之效應分子細胞介素:IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以至少產生效應分子細胞介素:IL15及IL12p70融合蛋白。在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以產生至少一種包括選自以下之效應分子細胞介素之膜可切割嵌合蛋白:IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些實施例中,免疫反應性細胞經工程改造以產生至少兩種包括選自以下之效應分子細胞介素之膜可切割嵌合蛋白:IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。
在某些實施例中,IL15包含NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (SEQ ID NO: 285)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 285之例示性核酸序列係AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC (SEQ ID NO: 286)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 285之核酸包含與SEQ ID NO: 286至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
在某些實施例中,IL12p70包含MCHQQLVISWFSLVFLASPLVAIWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGSGGGSGGGSGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS (SEQ ID NO: 293)之胺基酸序列。編碼SEQ ID NO: 293之例示性核酸序列係ATGTGTCACCAGCAGCTGGTCATCAGCTGGTTCAGCCTGGTGTTCCTGGCCTCTCCTCTGGTGGCCATCTGGGAGCTGAAGAAAGACGTGTACGTGGTGGAACTGGACTGGTATCCCGATGCTCCTGGCGAGATGGTGGTGCTGACCTGCGATACCCCTGAAGAGGACGGCATCACCTGGACACTGGATCAGTCTAGCGAGGTGCTCGGCAGCGGCAAGACCCTGACCATCCAAGTGAAAGAGTTTGGCGACGCCGGCCAGTACACCTGTCACAAAGGCGGAGAAGTGCTGAGCCACAGCCTGCTGCTGCTCCACAAGAAAGAGGATGGCATTTGGAGCACCGACATCCTGAAGGACCAGAAAGAGCCCAAGAACAAGACCTTCCTGAGATGCGAGGCCAAGAACTACAGCGGCCGGTTCACATGTTGGTGGCTGACCACCATCAGCACCGACCTGACCTTCAGCGTGAAGTCCAGCAGAGGCAGCAGTGATCCTCAGGGCGTTACATGTGGCGCCGCTACACTGTCTGCCGAAAGAGTGCGGGGCGACAACAAAGAATACGAGTACAGCGTGGAATGCCAAGAGGACAGCGCCTGTCCAGCCGCCGAAGAGTCTCTGCCTATCGAAGTGATGGTGGACGCCGTGCACAAGCTGAAGTACGAGAACTACACCTCCAGCTTTTTCATCCGGGACATCATCAAGCCCGATCCTCCAAAGAACCTGCAGCTGAAGCCTCTGAAGAACAGCAGACAGGTGGAAGTGTCCTGGGAGTACCCCGACACCTGGTCTACACCCCACAGCTACTTCAGCCTGACCTTTTGCGTGCAAGTGCAGGGCAAGTCCAAGCGCGAGAAAAAGGACCGGGTGTTCACCGACAAGACCAGCGCCACCGTGATCTGCAGAAAGAACGCCAGCATCAGCGTCAGAGCCCAGGACCGGTACTACAGCAGCTCTTGGAGCGAATGGGCCAGCGTGCCATGTTCTGGCGGAGGAAGCGGTGGCGGATCAGGTGGTGGATCTGGCGGCGGATCTAGAAACCTGCCTGTGGCCACTCCTGATCCTGGCATGTTCCCTTGTCTGCACCACAGCCAGAACCTGCTGAGAGCCGTGTCCAACATGCTGCAGAAGGCCAGACAGACCCTGGAATTCTACCCCTGCACCAGCGAGGAAATCGACCACGAGGACATCACCAAGGATAAGACCAGCACCGTGGAAGCCTGCCTGCCTCTGGAACTGACCAAGAACGAGAGCTGCCTGAACAGCCGGGAAACCAGCTTCATCACCAACGGCTCTTGCCTGGCCAGCAGAAAGACCTCCTTCATGATGGCCCTGTGCCTGAGCAGCATCTACGAGGACCTGAAGATGTACCAGGTGGAATTCAAGACCATGAACGCCAAGCTGCTGATGGACCCCAAGCGGCAGATCTTCCTGGACCAGAATATGCTGGCCGTGATCGACGAGCTGATGCAGGCCCTGAACTTCAACAGCGAGACAGTGCCCCAGAAGTCTAGCCTGGAAGAACCCGACTTCTACAAGACCAAGATCAAGCTGTGCATCCTGCTGCACGCCTTCCGGATCAGAGCCGTGACCATCGACAGAGTGATGAGCTACCTGAACGCCTCT(SEQ ID NO: 294)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 293之核酸包含與SEQ ID NO: 294至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
一般而言,細胞(例如,免疫細胞或幹細胞)經工程改造以產生兩種或更多種細胞介素,包括至少一種呈膜可切割嵌合蛋白形式之細胞介素(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)。
在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL15、IL12、IL12p70融合蛋白、IL18或IL21。
在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL-15。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外細胞介素。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生IL12、IL12p70融合蛋白、IL18或IL21。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生IL-12。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生IL12p70融合蛋白。
在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外之膜可切割嵌合蛋白。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL-15,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外之膜可切割嵌合蛋白,包括IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL15,且細胞進一步經工程改造以產生額外之膜可切割嵌合蛋白,包括IL12p70。
在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL12p70。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外細胞介素。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生IL15、IL18或IL21。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生IL15。
在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外之膜可切割嵌合蛋白。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生一或多種額外之膜可切割嵌合蛋白,包括IL15、IL18及IL21。在一些實施例中,細胞經工程改造以產生至少一種膜可切割嵌合蛋白,其中可分泌效應分子(例如,式
S - C - MT或
MT - C - S中之「S」)係IL12p70,且細胞進一步經工程改造以產生額外之膜可切割嵌合蛋白,包括IL15。
細胞亦可進一步經工程改造以表現除本文所述細胞介素及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白之外之額外蛋白。如本文所提供,免疫反應性細胞經工程改造以表現結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)。亦如本文所提供的,免疫反應性細胞經工程改造以表現包括合成轉錄因子之ACP。
CAR可包括抗原結合結構域,諸如抗體、抗體之抗原結合片段、F(ab)片段、F(ab')片段、單鏈可變片段(scFv)或單結構域抗體(sdAb)。抗原識別受體可包括scFv。scFv可包括可由肽連接體隔開之重鏈可變結構域(VH)及輕鏈可變結構域(VL)。舉例而言,scFv可包括結構VH-L-VL或VL-L-VH,其中VH係重鏈可變結構域,L係肽連接體,且VL係輕鏈可變結構域。在某些實施例中,肽連接體係gly-ser連接體。在某些實施例中,肽連接體係包含GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 223)之序列之(GGGGS)3連接體(SEQ ID NO: 223)。編碼SEQ ID NO: 223之例示性核酸序列係GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT (SEQ ID NO: 224)或GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT (SEQ ID NO: 332)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 223之核酸包含與SEQ ID NO: 224或SEQ ID NO: 332至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
CAR可具有一或多個細胞內傳訊結構域,諸如CD3ζ鏈細胞內傳訊結構域、CD97細胞內傳訊結構域、CD11a-CD18細胞內傳訊結構域、CD2細胞內傳訊結構域、ICOS細胞內傳訊結構域、CD27細胞內傳訊結構域、CD154細胞內傳訊結構域、CD8細胞內傳訊結構域、OX40細胞內傳訊結構域、4-1BB細胞內傳訊結構域、CD28細胞內傳訊結構域、ZAP40細胞內傳訊結構域、CD30細胞內傳訊結構域、GITR細胞內傳訊結構域、HVEM細胞內傳訊結構域、DAP10細胞內傳訊結構域、DAP12細胞內傳訊結構域、MyD88細胞內傳訊結構域、2B4細胞內傳訊結構域、CD16a細胞內傳訊結構域、DNAM-1細胞內傳訊結構域、KIR2DS1細胞內傳訊結構域、KIR3DS1細胞內傳訊結構域、NKp44細胞內傳訊結構域、NKp46細胞內傳訊結構域、FceRlg細胞內傳訊結構域、NKG2D細胞內傳訊結構域、EAT-2細胞內傳訊結構域、其片段、其組合或其片段之組合。在一些實施例中,細胞內傳訊結構域包含來自
表 6A之序列。
表 6A.
胺基酸序列 | 核苷酸序列 | 描述 |
KSRQTPPLASVEMEAMEALPVTWGTSSRDEDLENCSHHL (SEQ ID NO: 265) | AAGTCCAGACAGACACCTCCTCTGGCCAGCGTGGAAATGGAAGCCATGGAAGCTCTGCCTGTGACCTGGGGCACCAGCTCCAGAGATGAGGACCTGGAAAACTGCTCCCACCACCTG (SEQ ID NO: 266) | IL-15Rα ICD |
RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS (SEQ ID NO: 267) | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC (SEQ ID NO: 268) | CD28 ICD |
ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI (SEQ ID NO: 269) | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT (SEQ ID NO: 270) | OX40 ICD |
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL (SEQ ID NO: 271) | AAGCGGGGCAGAAAGAAGCTGCTGTACATCTTCAAGCAGCCCTTCATGCGGCCCGTGCAGACCACACAAGAGGAAGATGGCTGCTCCTGCAGATTCCCCGAGGAAGAAGAAGGCGGCTGCGAGCTG (SEQ ID NO: 272) 或 AAGCGGGGCAGAAAGAAGCTGCTGTACATCTTCAAGCAGCCCTTCATGCGGCCCGTGCAGACCACACAAGAGGAAGATGGCTGCAGCTGTCGGTTCCCCGAGGAAGAAGAAGGCGGCTGCGAGCTG (SEQ ID NO: 339) | 4-1BB ICD |
RKRTRERASRASTWEGRRRLNTQTL (SEQ ID NO: 273) | CGGAAGCGGACAAGAGAGAGAGCCAGCAGAGCCTCTACCTGGGAGGGAAGAAGAAGGCTGAACACCCAGACACTC (SEQ ID NO: 274) | Nkp46 ICD |
WRRKRKEKQSETSPKEFLTIYEDVKDLKTRRNHEQEQTFPGGGSTIYSMIQSQSSAPTSQEPAYTLYSLIQPSRKSGSRKRNHSPSFNSTIYEVIGKSQPKAQNPARLSRKELENFDVYS (SEQ ID NO: 275) | TGGCGCCGCAAGCGGAAAGAGAAGCAGTCTGAGACAAGCCCCAAAGAGTTCCTGACCATCTACGAGGACGTGAAGGACCTGAAAACCCGGCGGAACCACGAGCAAGAGCAGACCTTTCCTGGCGGCGGAAGCACCATCTACAGCATGATCCAGAGCCAGTCTAGCGCCCCTACCAGCCAAGAGCCTGCCTACACACTGTACTCCCTGATCCAGCCTAGCAGAAAGAGCGGCAGCCGGAAGAGAAATCACAGCCCCAGCTTCAACAGCACGATCTACGAAGTGATCGGCAAGAGCCAGCCAAAGGCTCAGAACCCTGCCAGGCTGAGCCGGAAAGAGCTGGAAAACTTCGACGTGTACAGC (SEQ ID NO: 276) | 2B4 ICD |
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 277) | AGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA (SEQ ID NO: 278) 或 AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC (SEQ ID NO: 334) | CD3z mut |
RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 279) | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA (SEQ ID NO: 280) | CD3z |
在一些實施例中,CAR亦可包含將細胞外抗原結合結構域連接至跨膜結構域之間隔區。間隔區可足夠撓性以容許抗原結合結構域以不同方向定向,以促進抗原識別。在一些實施例中,間隔區可為來自人類蛋白之鉸鏈。舉例而言,鉸鏈可為人類Ig (免疫球蛋白)鉸鏈,包括但不限於IgG4鉸鏈、IgG2鉸鏈、CD8a鉸鏈或IgD鉸鏈。在一些實施例中,間隔區可包含IgG4鉸鏈、IgG2鉸鏈、IgD鉸鏈、CD28鉸鏈、KIR2DS2鉸鏈、LNGFR鉸鏈或PDGFR-β細胞外連接體。在一些實施例中,間隔區包含來自
表 6B之序列。
表 6B.
胺基酸序列 | 核酸序列 | 描述 |
TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 226) | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGAT (SEQ ID NO: 227) | CD8鉸鏈(S2L) |
GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 228) 或 ALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 353) | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC (SEQ ID NO: 229) 或 GCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC (SEQ ID NO: 335) | CD8鉸鏈(FA) |
AAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP (SEQ ID NO: 246) | GCAGCAGCTATCGAGGTGATGTATCCTCCGCCCTACCTGGATAATGAAAAGAGTAATGGGACTATCATTCATGTAAAAGGGAAGCATCTTTGTCCTTCTCCCCTTTTCCCCGGTCCGTCTAAACCT (SEQ ID NO: 247) | CD28鉸鏈 |
ESKYGPPCPSCP (SEQ ID NO: 248) | GAAAGCAAGTACGGTCCACCTTGCCCTAGCTGTCCG (SEQ ID NO: 249) | IgG4最小鉸鏈 |
ESKYGPPAPSAP (SEQ ID NO: 250) | GAATCCAAGTACGGCCCCCCAGCGCCTAGTGCCCCA (SEQ ID NO: 251) | 無二硫化物之IgG4最小鉸鏈 |
ESKYGPPCPPCP (SEQ ID NO: 252) | GAATCTAAATATGGCCCGCCATGCCCGCCTTGCCCA (SEQ ID NO: 253) | 增強二硫化物形成之IgG4 S228P最小鉸鏈 |
EPKSCDKTHTCP (SEQ ID NO: 254) | GAACCGAAGTCTTGTGATAAAACTCATACGTGCCCG (SEQ ID NO: 255) | IgG1最小鉸鏈 |
AAAFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHRN (SEQ ID NO: 256) | GCTGCTGCTTTCGTACCCGTGTTCCTCCCTGCTAAGCCTACGACTACCCCCGCACCGAGACCACCCACGCCAGCACCCACGATTGCTAGCCAGCCCCTTAGTTTGCGACCAGAAGCTTGTCGGCCTGCTGCTGGTGGCGCGGTACATACCCGCGGCCTTGATTTTGCTTGCGATATATATATCTGGGCGCCTCTGGCCGGAACATGCGGGGTCCTCCTCCTTTCTCTGGTTATTACTCTCTACTGTAATCACAGGAAT (SEQ ID NO: 257) | 延伸之CD8a鉸鏈 |
ACPTGLYTHSGECCKACNLGEGVAQPCGANQTVCEPCLDSVTFSDVVSATEPCKPCTECVGLQSMSAPCVEADDAVCRCAYGYYQDETTGRCEACRVCEAGSGLVFSCQDKQNTVCEECPDGTYSDEADAEC (SEQ ID NO: 258) | GCCTGCCCGACCGGGCTCTACACTCATAGCGGGGAATGTTGTAAGGCATGTAACTTGGGTGAGGGCGTCGCACAGCCCTGCGGAGCTAACCAAACAGTGTGCGAACCCTGCCTCGATAGTGTGACGTTCTCTGATGTTGTATCAGCTACAGAGCCTTGCAAACCATGTACTGAGTGCGTTGGACTTCAGTCAATGAGCGCTCCATGTGTGGAGGCAGATGATGCGGTCTGTCGATGTGCTTACGGATACTACCAAGACGAGACAACAGGGCGGTGCGAGGCCTGTAGAGTTTGTGAGGCGGGCTCCGGGCTGGTGTTTTCATGTCAAGACAAGCAAAATACGGTCTGTGAAGAGTGCCCTGATGGCACCTACTCAGACGAAGCAGATGCAGAATGC (SEQ ID NO: 259) | LNGFR鉸鏈 |
ACPTGLYTHSGECCKACNLGEGVAQPCGANQTVC (SEQ ID NO: 260) | GCCTGCCCTACAGGACTCTACACGCATAGCGGTGAGTGTTGTAAAGCATGCAACCTCGGGGAAGGTGTAGCCCAGCCATGCGGGGCTAACCAAACCGTTTGC (SEQ ID NO: 261) | 截短之LNGFR鉸鏈(TNFR-Cys1) |
AVGQDTQEVIVVPHSLPFKV (SEQ ID NO: 262) | GCTGTGGGCCAGGACACGCAGGAGGTCATCGTGGTGCCACACTCCTTGCCCTTTAAGGTG (SEQ ID NO: 263) | PDGFR-β細胞外連接體 |
YPPVIVEMNSSVEAIEGSHVSLLCGADSNPPPLLTWMRDGTVLREAVAESLLLELEEVTPAEDGVYACLAENAYGQDNRTVGLSVMYAPWKPTVNGTMVAVEGETVSILCSTQSNPDPILTIFKEKQILSTVIYESELQLELPAVSPEDDGEYWCVAENQYGQRATAFNLSVEFAPVLLLESHCAAARDTVQCLCVVKSNPEPSVAFELPSRNVTVNESEREFVYSERSGLVLTSILTLRGQAQAPPRVICTARNLYGAKSLELPFQGAHRLMWAKIGP (SEQ ID NO: 264) | TACCCTCCAGTGATCGTGGAAATGAACAGCAGCGTGGAAGCCATCGAGGGCTCTCATGTGTCTCTGCTGTGTGGCGCCGACAGCAATCCTCCTCCTCTGCTGACCTGGATGAGAGATGGCACCGTGCTGAGAGAAGCCGTGGCCGAATCTCTGCTGCTGGAACTGGAAGAAGTGACCCCTGCCGAGGATGGCGTGTACGCTTGTCTGGCCGAGAATGCCTACGGCCAGGACAATAGAACCGTGGGCCTGTCCGTGATGTACGCCCCTTGGAAGCCTACCGTGAACGGCACAATGGTGGCCGTGGAAGGCGAGACAGTGTCCATCCTGTGTAGCACCCAGAGCAACCCCGATCCTATCCTGACCATCTTCAAAGAGAAGCAGATCCTGAGCACCGTGATCTACGAGAGCGAACTGCAGCTCGAACTGCCCGCTGTGTCCCCAGAGGATGATGGCGAATATTGGTGCGTGGCAGAGAACCAGTACGGCCAGAGAGCCACCGCCTTCAACCTGAGCGTGGAATTTGCTCCCGTGCTGCTGCTCGAGAGCCATTGTGCTGCCGCCAGAGATACCGTGCAGTGCCTGTGTGTGGTCAAGTCTAACCCCGAGCCTAGCGTGGCCTTTGAGCTGCCCAGCAGAAACGTGACCGTGAATGAGAGCGAGCGCGAGTTCGTGTACAGCGAGAGATCTGGACTGGTGCTGACCAGCATCCTGACACTGAGAGGACAGGCTCAGGCCCCTCCTAGAGTGATCTGCACCGCCAGAAATCTGTACGGCGCCAAGAGCCTGGAACTGCCATTTCAGGGCGCCCACAGACTCATGTGGGCCAAGATTGGACCT (SEQ ID NO: 351) | MAG鉸鏈 |
CAR可具有跨膜結構域,諸如CD8跨膜結構域、CD28跨膜結構域、CD3ζ鏈跨膜結構域、CD4跨膜結構域、4-1BB跨膜結構域、OX40跨膜結構域、ICOS跨膜結構域、CTLA-4跨膜結構域、PD-1跨膜結構域、LAG-3跨膜結構域、2B4跨膜結構域、BTLA跨膜結構域、OX40跨膜結構域、DAP10跨膜結構域、DAP12跨膜結構域、CD16a跨膜結構域、DNAM-1跨膜結構域、KIR2DS1跨膜結構域、KIR3DS1跨膜結構域、NKp44跨膜結構域、NKp46跨膜結構域、FceRlg跨膜結構域、NKG2D跨膜結構域、其片段、其組合或其片段之組合。CAR可具有介於抗原結合結構域與跨膜結構域之間之間隔區。例示性跨膜結構域序列提供於
表 6C中。
表 6C.
胺基酸序列 | 核苷酸序列 | 描述 |
VAISTSTVLLCGLSAVSLLACYL (SEQ ID NO: 230) | GTGGCCATCAGCACAAGCACCGTGCTGCTGTGTGGACTGTCTGCCGTTTCTCTGCTGGCCTGCTACCTG (SEQ ID NO: 231) | IL-15Rα跨膜結構域 |
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV (SEQ ID NO: 232) | TTCTGGGTGCTCGTGGTTGTTGGCGGAGTGCTGGCCTGTTACTCTCTGCTGGTCACCGTGGCCTTCATCATCTTTTGGGTC (SEQ ID NO: 233) | CD28跨膜結構域 |
VAAILGLGLVLGLLGPLAIL (SEQ ID NO: 234) | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCT (SEQ ID NO: 235) | OX40跨膜結構域* |
VAAILGLGLVLGLLGPLAILL (SEQ ID NO: 244) | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTG (SEQ ID NO: 245) | OX40跨膜結構域 |
IYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT (SEQ ID NO: 236) | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGCGGAGTGTTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACC (SEQ ID NO: 237) 或 ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCTTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACC (SEQ ID NO: 338) | CD8跨膜結構域 |
IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR (SEQ ID NO: 242) | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG (SEQ ID NO: 243) | CD8 FA跨膜結構域 |
MGLAFLVLVALVWFLVEDWLS (SEQ ID NO: 238) | ATGGGCCTCGCCTTTCTGGTGCTGGTGGCCCTTGTGTGGTTCCTGGTGGAAGATTGGCTGAGC (SEQ ID NO: 239) | NKp46跨膜結構域 |
FLVIIVILSALFLGTLACFCV (SEQ ID NO: 240) | TTCCTGGTCATCATCGTGATCCTGAGCGCCCTGTTCCTGGGCACCCTGGCCTGTTTTTGCGTG (SEQ ID NO: 241) | 2B4跨膜結構域 |
在一些實施例中,結合至GPC3之CAR抗原結合結構域包括重鏈可變(VH)區及輕鏈可變(VL)區,其中VH包括:具有KNAMN (
SEQ ID NO: 199)之胺基酸序列之重鏈互補決定區1 (CDR-H1)、具有RIRNKTNNYATYYADSVKA (
SEQ ID NO: 200)之胺基酸序列之重鏈互補決定區2 (CDR-H2)及具有GNSFAY (
SEQ ID NO: 201)之胺基酸序列之重鏈互補決定區3 (CDR-H3),且其中VL包括:具有KSSQSLLYSSNQKNYLA (
SEQ ID NO: 202)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區1 (CDR-L1)、具有WASSRES (
SEQ ID NO: 203)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區2 (CDR-L2)及具有QQYYNYPLT (
SEQ ID NO: 204)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區3 (CDR-L3)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有KNAMN (
SEQ ID NO: 199)之胺基酸序列之重鏈互補決定區1 (CDR-H1)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有RIRNKTNNYATYYADSVKA (
SEQ ID NO: 200)之胺基酸序列之重鏈互補決定區2 (CDR-H2)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有GNSFAY (
SEQ ID NO: 201)之胺基酸序列之重鏈互補決定區3 (CDR-H3)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有KSSQSLLYSSNQKNYLA (
SEQ ID NO: 202)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區1 (CDR-L1)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有WASSRES (
SEQ ID NO: 203)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區2 (CDR-L2)。在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括具有QQYYNYPLT (
SEQ ID NO: 204)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區3 (CDR-L3)。
在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括VH區,該VH區之胺基酸序列與EVQLVETGGGMVQPEGSLKLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVARIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSQSMLYLQMNNLKIEDTAMYYCVAGNSFA YWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 205)或EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 206)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性。編碼SEQ ID NO: 206之例示性核酸序列係GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT (SEQ ID NO: 222)或GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC (SEQ ID NO: 330)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 206之核酸包含與SEQ ID NO: 222或SEQ ID NO: 330至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
在一些實施例中,結合至GPC3之抗原結合結構域包括VL區,該VL區之胺基酸序列與DIVMSQSPSSLVVSIGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASSRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYNYPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 207)或DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 208)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性。編碼SEQ ID NO: 208之例示性核酸序列係GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA (SEQ ID NO: 221)或GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA (SEQ ID NO: 333)或GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG(SEQ ID NO: 336)。在某些實施例中,編碼SEQ ID NO: 208之核酸包含與SEQ ID NO: 221或SEQ ID NO: 336至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之序列。
一般而言,本文所述免疫反應性細胞之ACP包括合成轉錄因子。合成轉錄因子係包括DNA結合結構域及轉錄效應物結構域的非天然存在之蛋白,且能夠藉助結合至由DNA結合結構域識別之同源啟動子來調節(亦即,活化或阻遏)轉錄。在一些實施例中,ACP係轉錄阻遏物。在一些實施例中,ACP係轉錄活化劑。
經工程改造之細胞類型
本文亦提供經工程改造之免疫反應性細胞。免疫反應性細胞可經工程改造以包含本文所述之任何經工程改造之核酸(例如,編碼本文所述細胞介素、膜可切割嵌合蛋白及/或CAR之任何經工程改造之核酸)。細胞可經工程改造以具有本文所述之任何經工程改造之細胞之任何特徵。在具體態樣中,本文提供經工程改造以產生兩種細胞介素及CAR之細胞,其中該等細胞介素中之至少一種係本文所述具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。
經工程改造之免疫反應性細胞包括但不限於T細胞、CD8+ T細胞、CD4+ T細胞、γ-δT細胞、細胞毒性T淋巴球(CTL)、調控性T細胞、病毒特異性T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、自然殺手(NK)細胞、B細胞、腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)、先天性淋巴樣細胞、肥大細胞、嗜酸性球、嗜鹼性球、嗜中性球、骨髓細胞、巨噬細胞、單核球、樹突細胞、紅血球、血小板細胞、人類胚胎幹細胞(ESC)、ESC源細胞、多潛能幹細胞、間質基質細胞(MSC)、誘導性多潛能幹細胞(iPSC)及iPSC源細胞。
可使用熟習此項技術者已知之方法對細胞進行工程改造以產生本文所述蛋白。舉例而言,可轉導細胞以對腫瘤進行工程改造。在實施例中,使用病毒轉導細胞。
在具體實施例中,使用溶瘤病毒轉導細胞。溶瘤病毒之實例包括但不限於溶瘤單純疱疹病毒、溶瘤腺病毒、溶瘤麻疹病毒、溶瘤流感病毒、溶瘤印第安納水疱病毒(Indiana vesiculovirus)、溶瘤新城雞瘟病毒(Newcastle disease virus)、溶瘤牛痘病毒、溶瘤脊髓灰白質炎病毒、溶瘤黏液瘤病毒、溶瘤里奧病毒(reovirus)、溶瘤腮腺炎病毒、溶瘤馬拉巴病毒(Maraba virus)、溶瘤狂犬病病毒、溶瘤輪狀病毒、溶瘤肝炎病毒、溶瘤風疹病毒、溶瘤登革熱病毒(dengue virus)、溶瘤屈公病病毒(chikungunya virus)、溶瘤呼吸道融合細胞病毒、溶瘤淋巴球性脈絡叢腦膜炎病毒、溶瘤麻疹病毒屬(morbillivirus)、溶瘤慢病毒、溶瘤複製逆轉錄病毒、溶瘤棒狀病毒、溶瘤矽尼卡谷病毒(Seneca Valley virus)、溶瘤辛德比病毒(sindbis virus)及其任一變異體或衍生物。
病毒(包括本文所述之任何溶瘤病毒)可為編碼一或多種編碼一或多種蛋白之轉基因(諸如本文所述任何經工程改造之核酸)之重組病毒。病毒(包括本文所述之任何溶瘤病毒)可為編碼一或多種編碼兩種或更多種蛋白中一或多種之轉基因(諸如本文所述任何經工程改造之核酸)之重組病毒。
本文亦提供經工程改造之細菌細胞。細菌細胞可經工程改造以包含本文所述之任何經工程改造之核酸。細菌細胞可經工程改造以具有本文所述之任何經工程改造之細胞之任何特徵。在具體態樣中,本文提供經工程改造以產生兩種或更多種本文所述蛋白之細菌細胞。細菌細胞可經工程改造以產生一或多種哺乳動物來源之蛋白。細菌細胞可經工程改造以產生兩種或更多種哺乳動物來源之蛋白。細菌細胞之實例包括但不限於拜氏梭菌(
Clostridium beijerinckii)、產芽孢梭菌(
Clostridium sporogenes)、諾維氏梭菌(
Clostridium novyi)、大腸桿菌(
Escherichia coli)、銅綠假單胞菌(
Pseudomonas aeruginosa)、單核球增多性李氏菌(
Listeria monocytogenes)、鼠傷寒沙氏桿菌(
Salmonella typhimurium)及豬霍亂沙氏桿菌(
Salmonella choleraesuis)。
經工程改造之細胞可為人類細胞。經工程改造之細胞可為人類原代細胞。經工程改造之原代細胞可為腫瘤浸潤性原代細胞。經工程改造之原代細胞可為原代T細胞。經工程改造之原代細胞可為造血幹細胞(HSC)。經工程改造之原代細胞可為自然殺手(NK)細胞。經工程改造之原代細胞可為任何體細胞。經工程改造之原代細胞可為MSC。人類細胞(例如,免疫細胞)可經工程改造以包含本文所述之任何經工程改造之核酸。人類細胞(例如,免疫細胞)可經工程改造以具有本文所述之任何經工程改造之細胞之任何特徵。在具體態樣中,本文提供經工程改造以產生一或多種本文所述蛋白之人類細胞(例如,免疫細胞)。在具體態樣中,本文提供經工程改造以產生兩種或更多種本文所述蛋白之人類細胞(例如,免疫細胞)。
經工程改造之細胞可自個體(自體) (諸如已知或懷疑患有癌症之個體)分離。細胞分離方法係熟習此項技術者已知的且包括但不限於基於細胞表面標記物表現之分選技術(諸如FACS分選)、陽性分離技術及陰性分離、磁分離及其組合。
就投與治療之個體而言,經工程改造之細胞可為同種異體的。同種異體修飾細胞可與投與治療之個體進行HLA匹配。經工程改造之細胞可為經培養細胞,諸如離體培養細胞。經工程改造之細胞可為離體培養細胞,諸如自個體分離之原代細胞。經培養細胞可與一或多種細胞介素一起培養。
本文亦提供包括培養本揭示案之經工程改造之細胞之方法。已知培養本文所述之經工程改造之細胞之方法。熟習此項技術者將認識到培養條件將取決於所關注具體經工程改造之細胞。熟習此項技術者將認識到培養條件將取決於經工程改造之細胞之特定下游用途,例如用於隨後將經工程改造之細胞投與個體之特定培養條件。
工程改造細胞之方法
本文亦提供用於工程改造免疫反應性細胞以產生一或多種所關注蛋白(例如,本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白)之組成物及方法。
一般而言,細胞藉助以下方式經工程改造以產生所關注蛋白:將編碼一或多種所關注蛋白或效應分子(例如,包括所關注蛋白或效應分子之本文所述嵌合蛋白)之多核苷酸引入(亦即,遞送)至細胞之細胞溶質及/或細胞核中。舉例而言,編碼一或多種嵌合蛋白之多核苷酸可為編碼本文所述之細胞介素、CAR或具有式
S - C - MT或
MT - C- S之膜可切割嵌合蛋白之任何經工程改造之核酸。遞送方法包括但不限於病毒介導之遞送、脂質介導之轉染、奈米粒子遞送、電穿孔、音波處理及藉由物理手段之細胞膜變形。熟習此項技術者將瞭解遞送方法之選擇可取決於欲工程改造之特定細胞類型。
病毒介導之遞送
基於病毒載體之遞送平臺可用於對細胞進行工程改造。一般而言,基於病毒載體之遞送平臺藉助引入(亦即遞送)至宿主細胞中來工程改造細胞。舉例而言,基於病毒載體之遞送平臺可藉助引入本文所述任何經工程改造之核酸(例如,編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白之任何外源性多核苷酸序列,及/或含有啟動子及編碼蛋白(自N末端至C末端定向)之外源性多核苷酸序列之本文所述任何表現盒)來工程改造細胞。基於病毒載體之遞送平臺可為核酸,且因此,經工程改造之核酸亦可涵蓋經工程改造之病毒來源之核酸。該等經工程改造之病毒來源之核酸亦可稱為重組病毒或經工程改造之病毒。
基於病毒載體之遞送平臺可在同一核酸內編碼超過一種之經工程改造之核酸、基因或轉基因。舉例而言,經工程改造之病毒來源之核酸(例如,重組病毒或經工程改造之病毒)可編碼一或多種轉基因,包括但不限於編碼一或多種本文所述蛋白的本文所述任何經工程改造之核酸。一或多種編碼一或多種蛋白之轉基因可經構形以表現一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白。基於病毒載體之遞送平臺亦可編碼一或多種除一或多種轉基因(例如,編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之轉基因)之外之基因,諸如病毒感染性及/或病毒產生所需之病毒基因(例如,衣殼蛋白、包膜蛋白、病毒聚合酶、病毒轉錄酶
等),稱為順式作用元件或基因。
基於病毒載體之遞送平臺可包含超過一種病毒載體,諸如編碼本文所述且稱為反式作用元件或基因之經工程改造之核酸、基因或轉基因的單獨病毒載體。舉例而言,基於輔助病毒(helper)依賴型病毒載體之遞送平臺可在一或多種除編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之載體之外之額外單獨載體上提供病毒感染性及/或病毒產生所需之額外基因。一種病毒載體可遞送超過一種經工程改造之核酸,諸如一種遞送經工程改造之核酸之載體,該等經工程改造之核酸經構形以產生兩種或更多種蛋白及/或其他所關注蛋白。超過一種病毒載體可遞送超過一種經工程改造之核酸,諸如超過一種遞送一或多種經工程改造之核酸之載體,該經工程改造之核酸經構形以產生一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白。所用病毒載體之數目可取決於上述基於病毒載體之疫苗平臺之包裝能力,且熟習此項技術者可選擇適當數目之病毒載體。
一般而言,任何基於病毒載體之系統皆可用於分子(諸如本文所述之蛋白、效應分子及/或其他所關注蛋白)之活體外產生,或用於活體內及離體基因療法程序,例如,用於活體內遞送編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之經工程改造之核酸。適當的基於病毒載體之系統之選擇將取決於多種因素,諸如貨物(cargo)/酬載大小、病毒系統之免疫原性、所關注靶細胞、基因表現強度及定時,以及熟習此項技術者所瞭解之其他因素。
基於病毒載體之遞送平臺可為基於RNA之病毒或基於DNA之病毒。例示性基於病毒載體之遞送平臺包括但不限於單純疱疹病毒、腺病毒、麻疹病毒、流感病毒、印第安納水疱病毒、新城雞瘟病毒、牛痘病毒、脊髓灰白質炎病毒、黏液瘤病毒、里奧病毒、腮腺炎病毒、馬拉巴病毒、狂犬病病毒、輪狀病毒、肝炎病毒、風疹病毒、登革熱病毒、屈公病病毒、呼吸道融合細胞病毒、淋巴球性脈絡叢腦膜炎病毒、麻疹病毒屬、慢病毒、複製逆轉錄病毒、棒狀病毒、矽尼卡谷病毒、辛德比病毒及其任一變異體或衍生物。此項技術中闡述了其他例示性的基於病毒載體之遞送平臺,諸如牛痘、禽痘、自複製α病毒、馬拉巴病毒、腺病毒(參見例如Tatsis等人,Adenoviruses,
Molecular Therapy(2004) 10, 616-629)或慢病毒,包括但不限於第二代、第三代或雜交第二代/第三代慢病毒及任一代之重組慢病毒(其經設計以靶向特定細胞類型或受體) (參見例如Hu等人,Immunization Delivered by Lentiviral Vectors for Cancer and Infectious Diseases,
Immunol Rev.(2011) 239(1): 45-61;Sakuman等人,Lentiviral vectors: basic to translational,
Biochem J.(2012) 443(3):603-18;Cooper等人,Rescue of splicing-mediated intron loss maximizes expression in lentiviral vectors containing the human ubiquitin C promoter,
Nucl. Acids Res.(2015) 43 (1): 682-690;Zufferey等人,Self-Inactivating Lentivirus Vector for Safe and Efficient
In vivoGene Delivery,
J. Virol.(1998) 72 (12): 9873-9880)。
序列之前可有一或多個靶向亞細胞區室之序列。在引入(亦即遞送)至宿主細胞中後,受感染細胞(亦即,經工程改造之細胞)可表現蛋白及/或其他所關注蛋白。可用於免疫方案中之牛痘載體及方法闡述於例如美國專利第4,722,848號中。另一載體係BCG (卡介苗,Bacille Calmette Guerin)。BCG載體闡述於Stover等人(Nature 351:456-460 (1991))中。熟習此項技術者根據本文中之描述將明瞭可用於引入(亦即,遞送)經工程改造之核酸之眾多種其他載體,例如,傷寒沙氏桿菌(Salmonella typhi)載體及諸如此類。
基於病毒載體之遞送平臺可為靶向細胞之病毒,在本文中稱為溶瘤病毒。溶瘤病毒之實例包括但不限於溶瘤單純疱疹病毒、溶瘤腺病毒、溶瘤麻疹病毒、溶瘤流感病毒、溶瘤印第安納水疱病毒、溶瘤新城雞瘟病毒、溶瘤牛痘病毒、溶瘤脊髓灰白質炎病毒、溶瘤黏液瘤病毒、溶瘤里奧病毒、溶瘤腮腺炎病毒、溶瘤馬拉巴病毒、溶瘤狂犬病病毒、溶瘤輪狀病毒、溶瘤肝炎病毒、溶瘤風疹病毒、溶瘤登革熱病毒、溶瘤屈公病病毒、溶瘤呼吸道融合細胞病毒、溶瘤淋巴球性脈絡叢腦膜炎病毒、溶瘤麻疹病毒屬、溶瘤慢病毒、溶瘤複製逆轉錄病毒、溶瘤棒狀病毒、溶瘤矽尼卡谷病毒、溶瘤辛德比病毒及其任一變異體或衍生物。本文所述之任何溶瘤病毒可為重組溶瘤病毒,其包含一或多種編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之轉基因(例如,經工程改造之核酸)。編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之轉基因可經構形以表現蛋白及/或其他所關注蛋白。
基於病毒載體之遞送平臺可基於逆轉錄病毒。一般而言,逆轉錄病毒載體包含包裝容量高達6-10 kb外源序列之順式作用之長末端重複。最小順式作用之LTR足以複製及包裝載體,接著將其用於將一或多種經工程改造之核酸(例如,編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之轉基因)整合至靶細胞中以提供永久性轉基因表現。基於逆轉錄病毒之遞送系統包括但不限於基於鼠類白血病病毒(MuLV)、長臂猿白血病病毒(GaLV)、猿猴免疫缺失病毒(SIV)、人類免疫缺失病毒(HIV)及其組合之彼等(參見例如Buchscher等人,J. Virol. 66:2731-2739 (1992);Johann等人,J. Virol. 66:1635-1640 (1992);Sommnerfelt等人,Virol. 176:58-59 (1990);Wilson等人,J. Virol. 63:2374-2378 (1989);Miller等人,J, Virol. 65:2220-2224 (1991);PCT/US94/05700)。其他逆轉錄病毒系統包括Phoenix逆轉錄病毒系統。
基於病毒載體之遞送平臺可基於慢病毒。一般而言,慢病毒載體係能夠轉導或感染非分裂細胞且通常產生高病毒效價之逆轉錄病毒載體。基於慢病毒之遞送平臺可基於HIV,諸如ViraPower系統(ThermoFisher)或pLenti系統(Cell Biolabs)。基於慢病毒之遞送平臺可基於SIV或FIV。其他例示性的基於慢病毒之遞送平臺更詳細地闡述於美國專利第7,311,907號、第7,262,049號、第7,250,299號、第7,226,780號、第7,220,578號、第7,211,247號、第7,160,721號、第7,078,031號、第7,070,993號、第7,056,699號、第6,955,919號中,該等美國專利各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
基於病毒載體之遞送平臺可基於腺病毒。一般而言,基於腺病毒之載體能夠在許多細胞類型中具有非常高之轉導效率,無需細胞分裂,達成高效價及高水準之表現,且可在相對簡單之系統中大量生產。一般而言,腺病毒可用於轉基因在受感染細胞內之瞬時表現,此乃因腺病毒通常不會整合至宿主基因體中。基於腺病毒之遞送平臺詳細地闡述於以下文獻中:Li等人,Invest Opthalmol Vis Sci 35:2543 2549, 1994;Borras等人,Gene Ther 6:515 524, 1999;Li及Davidson,PNAS 92:7700 7704, 1995;Sakamoto等人,H Gene Ther 5:1088 1097, 1999;WO 94/12649;WO 93/03769;WO 93/19191;WO 94/28938;WO 95/11984及WO 95/00655,該等文獻各自出於所有目的以引用方式併入本文中。其他例示性的基於腺病毒之遞送平臺更詳細地闡述於美國專利第5585362號、第6,083,716號、第7,371,570號、第7,348,178號、第7,323,177號、第7,319,033號、第7,318,919號及第7,306,793號以及國際專利申請案WO96/13597中,該等專利及申請案各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
基於病毒載體之遞送平臺可基於腺相關病毒(AAV)。腺相關病毒(「AAV」)載體可用於用經工程改造之核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)轉導細胞。AAV系統可用於所關注蛋白(諸如本文所述蛋白及/或效應分子)之活體外產生,或用於活體內及離體基因療法程序,例如,用於活體內遞送編碼一或多種蛋白及/或其他所關注蛋白之經工程改造之核酸(參見例如West等人,Virology 160:38-47 (1987);美國專利第4,797,368號、第5,436,146號、第6,632,670號、第6,642,051號、第7,078,387號、第7,314,912號、第6,498,244號、第7,906,111號;美國專利公開案US 2003-0138772、US 2007/0036760及US 2009/0197338;Gao等人,J. Virol, 78(12):6381-6388 (2004年6月);Gao等人,Proc Natl Acad Sci USA, 100(10):6081-6086 (2003年5月13日);及國際專利申請案WO 2010/138263及WO 93/24641;Kotin, Human Gene Therapy 5:793-801 (1994);Muzyczka, J. Clin. Invest. 94:1351 (1994),該等文獻各自出於所有目的以引用方式併入本文中)。構築重組AAV載體之例示性方法更詳細地闡述於以下文獻中:美國專利第5,173,414號;Tratschin等人,Mol. Cell. Biol. 5:3251-3260 (1985);Tratschin等人,Mol. Cell, Biol. 4:2072-2081 (1984);Hermonat及Muzyczka,PNAS 81:64666470 (1984);及Samuiski等人,J. Virol. 63:03822-3828 (1989),該等文獻各自出於所有目的以引用方式併入本文中。一般而言,基於AAV之載體包含具有對應於AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV.Rh10、AAV11及其變異體中之任一種之胺基酸序列之衣殼蛋白。在具體實例中,基於AAV之載體具有具對應於AAV2之胺基酸序列之衣殼蛋白。在具體實例中,基於AAV之載體具有具對應於AAV8之胺基酸序列之衣殼蛋白。
AAV載體可經工程改造以具有編碼本文所述蛋白(諸如細胞介素、CAR、ACP及/或本文所述具有下式之膜可切割嵌合蛋白:
S - C - MT或
MT - C - S)之任何外源性多核苷酸序列。
基於病毒載體之遞送平臺可為病毒樣粒子(VLP)平臺。一般而言,VLP係藉由產生病毒結構蛋白並純化所得病毒粒子來構築。接著,在純化之後,將貨物/酬載(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)離體囊封在經純化之粒子內。因此,VLP之產生維持了編碼病毒結構蛋白之核酸與編碼貨物/酬載之核酸之分離。用於VLP產生中之病毒結構蛋白可在多種表現系統(包括哺乳動物、酵母、昆蟲、細菌或活體內轉譯表現系統)中產生。可使用熟習此項技術者已知之方法,在期望貨物存在下使經純化之病毒粒子變性及重整以產生VLP。VLP之產生更詳細地闡述於Seow等人(Mol Ther. 2009年5月;17(5): 767-777)中,該文獻出於所有目的以引用方式併入本文中。
基於病毒載體之遞送平臺可經工程改造以靶向(亦即,感染)一定範圍之細胞,靶向窄子集之細胞或靶向特定細胞。一般而言,為基於病毒載體之遞送平臺選擇之包膜蛋白將決定病毒向性。用於基於病毒載體之遞送平臺中之病毒可經假型化以靶向所關注特定細胞。基於病毒載體之遞送平臺可為泛向性的且感染一定範圍之細胞。舉例而言,泛向性的基於病毒載體之遞送平臺可包括VSV-G包膜。基於病毒載體之遞送平臺可為雙向性的且感染哺乳動物細胞。因此,熟習此項技術者可選擇適當向性、假型及/或包膜蛋白以用於靶向期望細胞類型。
脂質結構遞送系統
可使用脂質介導之遞送系統將經工程改造之核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)引入細胞中。一般而言,脂質介導之遞送系統使用由包封內部區室之外部脂質膜構成之結構。基於脂質之結構之實例包括但不限於基於脂質之奈米粒子、脂質體、膠束、胞外體、囊泡、細胞外囊泡、細胞或組織。脂質結構遞送系統可活體外、活體內或離體遞送貨物/酬載(例如,本文所述任何經工程改造之核酸)。
基於脂質之奈米粒子可包括但不限於單層脂質體、多層脂質體及脂質製劑。如本文所用,「脂質體」係涵蓋脂質媒劑之活體外製劑之一般術語,該等脂質媒劑係藉由將期望貨物(例如,經工程改造之核酸,諸如本文所述任何經工程改造之核酸)封閉在脂質殼或脂質聚集物內而形成。脂質體可表徵為具有囊泡結構,其具有一般包含磷脂之雙層膜,以及一般包含水性組成物之內部介質。脂質體包括但不限於乳液、發泡體、膠束、不溶性單層、液晶、磷脂分散體、層狀層及諸如此類。脂質體可為單層脂質體。脂質體可為多層脂質體。脂質體可為多泡脂質體。脂質體可帶正電荷、帶負電荷或帶電中性。在某些實施例中,脂質體在電荷上係中性的。可自標準囊泡形成脂質形成脂質體,該等脂質一般包括中性及帶負電荷之磷脂及固醇,諸如膽固醇。脂質之選擇一般藉由考慮期望目的(例如,用於活體內遞送之準則,諸如脂質體大小、酸不穩定性及脂質體在血流中之穩定性)來指導。多種方法可用於製備脂質體,如例如以下文獻中所述:Szokan等人,Ann. Rev. Biophys. Bioeng. 9; 467 (1980);美國專利第4,235,871號、第4,501,728號、第4,501,728號、第4,837,028號及第5,019,369號,各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
當包含磷脂之脂質懸浮於過量水溶液中,使得多個脂質層由水性介質分開時,自發生成多層脂質體。在脂質組分經受自我重排後,水及溶解之溶質包埋在脂質雙層之間之閉合結構中。期望貨物(例如,多肽、核酸、小分子藥物、經工程改造之核酸(諸如本文所述之任何經工程改造之核酸)、病毒載體、基於病毒之遞送系統
等)可囊封在脂質體之水性內部,經由與脂質體及多肽/核酸締合之連接分子附接至脂質體,散佈在脂質體之脂質雙層內,包埋在脂質體中,與脂質體複合,或以其他方式與脂質體締合,使得可將其遞送至靶實體。親脂性分子或具有親脂性區域之分子亦可溶解於脂質雙層中或與脂質雙層締合。
根據本實施例使用之脂質體可藉由如熟習此項技術者將已知之不同方法制得。脂質體之製備進一步詳細闡述於WO 2016/201323、國際申請案PCT/US85/01161及PCT/US89/05040,以及美國專利4,728,578、4,728,575、4,737,323、4,533,254、4,162,282、4,310,505及4,921,706中;該等申請案及專利各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
脂質體可為陽離子脂質體。陽離子脂質體之實例更詳細地闡述於美國專利第5,962,016號、第5,030,453號、第6,680,068號、美國申請案2004/0208921及國際專利申請案WO03/015757A1、WO04029213A2及WO02/100435A1中,該等專利各自全文特此以引用併入。
脂質介導之基因遞送方法闡述於例如以下文獻中:WO 96/18372;WO 93/24640;Mannino及Gould-Fogerite,BioTechniques 6(7): 682-691 (1988);美國專利第5,279,833號;Rose,美國專利第5,279,833號;WO91/06309;及Felgner等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 7413-7414 (1987),該等文獻各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
胞外體係內吞來源之小膜囊泡,其在多泡體與質膜融合後釋放至細胞外環境中。胞外體之直徑大小在介於30 nm與100 nm之間之範圍內。其表面由來自供體細胞之細胞膜之脂質雙層組成,且其含有來自產生胞外體之細胞之細胞溶質,且在表面上展示來自親代細胞之膜蛋白。可用於遞送核酸之胞外體係熟習此項技術者已知的,例如,更詳細地闡述於美國專利第9,889,210號中之胞外體,該美國專利出於所有目的以引用方式併入本文中。
如本文所用,術語「細胞外囊泡」或「EV」係指包含封閉內部空間之膜之細胞來源囊泡。一般而言,細胞外囊泡包含直徑小於其所來源之細胞之所有膜結合囊泡。一般地,細胞外囊泡在20 nm至1000 nm之直徑範圍內,且可包含在內部空間內、展示在細胞外囊泡之外表面上及/或跨越膜之各種大分子貨物。貨物可包含核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)、蛋白、碳水化合物、脂質、小分子及/或其組合。舉例而言且不受限制,細胞外囊泡包括凋亡體、細胞碎片、藉由直接或間接操作(例如,藉由系列擠出或用鹼性溶液處理)自細胞獲得之囊泡、囊泡化細胞器及由活細胞產生(例如,藉由直接質膜出芽或晚期內體與質膜融合)之囊泡。細胞外囊泡可源自活的或死的生物體、經外植組織或器官及/或經培養細胞。
如本文所用,術語「胞外體」係指細胞來源之小(直徑在20-300 nm之間,更佳直徑為40-200 nm)囊泡,其包含封閉內部空間之膜,且係藉由直接質膜出芽或藉由晚期內體與質膜融合,由細胞生成。胞外體包含脂質或脂肪酸及多肽,且視情況包含酬載(例如,治療劑)、接收體(receiver) (例如,靶向部分)、多核苷酸(例如,核酸、RNA或DNA,諸如本文所述任何經工程改造之核酸)、糖(例如,單糖、多糖或聚糖)或其他分子。胞外體可源自生產細胞,且基於其大小、密度、生物化學參數或其組合自生產細胞分離。胞外體係一種細胞外囊泡。一般地,胞外體之產生/生體合成不會導致生產細胞之破壞。胞外體及胞外體之製備進一步詳細地闡述於WO 2016/201323中,該專利特此以全文引用方式併入。
如本文所用,術語「奈米囊泡」(亦稱為「微泡」)係指細胞來源之小(直徑在20-250 nm之間,更佳直徑為30-150 nm)囊泡,其包含封閉內部空間之膜,且係藉由直接或間接操作,自細胞生成,使得在沒有該操作之情況下該奈米囊泡將不會由該生產細胞產生。一般而言,奈米囊泡係細胞外囊泡之亞種。生產細胞之適當操作包括但不限於系列擠出、用鹼性溶液處理、音波處理或其組合。在一些情況下,奈米囊泡之產生可導致該生產細胞之破壞。較佳地,奈米囊泡群體實質上不含藉由自質膜直接出芽或晚期內體與質膜融合而自生產細胞獲得之囊泡。奈米囊泡包含脂質或脂肪酸及多肽,且視情況包含酬載(例如,治療劑)、接收體(例如,靶向部分)、多核苷酸(例如,核酸、RNA或DNA,諸如本文所述任何經工程改造之核酸)、糖(例如,單糖、多糖或聚糖)或其他分子。奈米囊泡在其根據該操作自生產細胞獲得後,可基於其大小、密度、生物化學參數或其組合自生產細胞分離。
一般而言,脂質奈米粒子(LNP)係合成脂質結構,其依靠脂質之兩親性質以形成膜及囊泡樣結構(Riley 2017)。一般而言,該等囊泡藉由吸收至靶細胞之膜中並將貨物釋放至細胞溶質中來遞送貨物/酬載,諸如本文所述之任何經工程改造之核酸或病毒系統。用於LNP形成中之脂質可為陽離子、陰離子或中性的。脂質可為合成的或天然來源的,且在一些情況下係可生物降解的。脂質可包括脂肪、膽固醇、磷脂、脂質偶聯物(包括但不限於聚乙二醇(PEG)偶聯物(聚乙二醇化脂質))、蠟、油、甘油酯及脂溶性維生素。脂質組成物一般包括諸如陽離子脂質、中性脂質、陰離子脂質及兩親脂質等材料之限定混合物。在一些情況下,包括特定脂質以防止LNP聚集,防止脂質氧化或提供促進額外部分連接之官能性化學基團。脂質組成物可影響總體LNP大小及穩定性。在實例中,脂質組成物包含4-二甲基胺基丁酸二亞油醯基甲酯(MC3)或MC3樣分子。MC3及MC3樣脂質組成物可經調配以包括一或多種其他脂質,諸如PEG或PEG偶聯之脂質、固醇或中性脂質。另外,LNP可進一步經工程改造或官能化,以促進特定細胞類型之靶向。LNP設計中之另一考慮因素係靶向效率與細胞毒性之間之平衡。
一般而言,膠束係使用單鏈脂質形成之球形合成脂質結構,其中單鏈脂質之親水頭部形成外層或外膜,且單鏈脂質之疏水尾部形成膠束中心。膠束通常係指僅含有脂質單層之脂質結構。膠束更詳細地闡述於Quader等人(Mol Ther. 2017年7月5日;25(7): 1501-1513)中,該文獻出於所有目的以引用方式併入本文。
直接暴露於血清之核酸載體(諸如表現載體)可具有若干不期望後果,包括血清核酸酶對核酸之降解或游離核酸對免疫系統之脫靶刺激。類似地,直接暴露於血清之病毒遞送系統可觸發不期望之免疫反應及/或病毒遞送系統之中和。因此,經工程改造之核酸及/或病毒遞送系統之囊封可用於避免降解,同時亦避免潛在脫靶效應。在某些實例中,將經工程改造之核酸及/或病毒遞送系統完全囊封在遞送媒劑內,諸如囊封在LNP之水性內部內。可藉由熟習此項技術者熟知之技術(諸如在微流體液滴生成裝置上實施之微流體混合及液滴生成)來實施在LNP內囊封經工程改造之核酸及/或病毒遞送系統。該等裝置包括但不限於標準T型接合部裝置或流動聚焦裝置。在實例中,將期望脂質調配物(諸如含有MC3或MC3樣之組成物)與經工程改造之核酸或病毒遞送系統及任何其他期望劑平行地提供給液滴生成裝置,使得遞送載體及期望劑完全囊封在基於MC3或MC3樣之LNP之內部內。在實例中,液滴生成裝置可控制所產生之LNP之大小範圍及大小分佈。舉例而言,LNP之直徑大小可在1至1000奈米範圍內,例如,1、10、50、100、500或1000奈米。在液滴生成之後,囊封貨物/酬載(例如
,經工程改造之核酸及/或病毒遞送系統)之遞送媒劑可進一步經處理或工程改造以準備其用於投與。
奈米粒子遞送
奈米材料可用於遞送經工程改造之核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)。重要的是,奈米材料媒劑可由非免疫原性材料製成,且一般避免誘發對遞送載體本身之免疫性。該等材料可包括但不限於脂質(如先前所述)、無機奈米材料及其他聚合物材料。奈米材料粒子更詳細地闡述於Riley等人(Recent Advances in Nanomaterials for Gene Delivery—A Review. Nanomaterials 2017, 7(5), 94)中,該文獻出於所有目的以引用方式併入本文中。
基因體編輯系統
基因體編輯系統可用於對宿主基因體進行工程改造以編碼經工程改造之核酸,諸如編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白的經工程改造之核酸。一般而言,「基因體編輯系統」係指用於將外源基因整合至宿主細胞基因體中之任何系統。基因體編輯系統包括但不限於轉位子系統、核酸酶基因體編輯系統及基於病毒載體之遞送平臺。
轉位子系統可用於將經工程改造之核酸(本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白)整合至宿主基因體中。轉位子一般包含側接貨物/酬載核酸及轉位酶之末端反向重複(TIR)。轉位子系統可提供與TIR側接貨物呈
順式或
反式之轉位子。轉位子系統可為逆轉錄轉位子系統或DNA轉位子系統。一般而言,轉位子系統將貨物/酬載(例如,經工程改造之核酸)隨機整合至宿主基因體中。轉位子系統之實例包括使用Tc1/mariner轉位子超家族轉位子之系統,諸如更詳細地闡述於以下文獻中之睡美人轉位子系統(Sleeping Beauty transposon system):Hudecek等人(Crit Rev Biochem Mol Biol. 2017年8月;52(4):355-380);以及美國專利第6,489,458號、第6,613,752號及第7,985,739號中,該等文獻中之每一者皆出於所有目的以引用方式併入本文中。轉位子系統之另一實例包括更詳細地闡述於美國專利第6,218,185號及第6,962,810號中之PiggyBac轉位子系統,該等美國專利中之每一者皆出於所有目的以引用方式併入本文中。
核酸酶基因體編輯系統可用於對宿主基因體進行工程改造以編碼經工程改造之核酸,諸如編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白的經工程改造之核酸。不希望受理論束縛,一般而言,用於引入外源基因之核酸酶介導之基因編輯系統利用細胞之天然DNA修復機制,特別是同源重組(HR)修復路徑。簡言之,在基因體DNA受到傷害(通常係雙鏈斷裂)之後,細胞可藉由在DNA合成期間使用在5’及3’端二者處皆具有一致或實質上一致之序列的另一DNA源作為模板以修復損傷來解決該傷害。在天然背景下,HDR可使用存在於細胞中之另一染色體作為模板。在基因編輯系統中,將外源性多核苷酸引入細胞中以用作同源重組模板(HRT或HR模板)。一般而言,包括在HRT內之5’及3’互補端之間的任何最初未在具有損傷之染色體中發現之額外外源序列(例如,基因或基因之一部分)皆可在模板化HDR期間併入(亦即,「整合」)至給定基因體基因座中。因此,用於給定基因體基因座之典型HR模板具有與內源性基因體靶基因座之第一區一致之核苷酸序列、與內源性基因體靶基因座之第二區一致之核苷酸序列及編碼貨物/酬載核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸,諸如編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C- S之膜可切割嵌合蛋白的任何經工程改造之核酸)之核苷酸序列。
在一些實例中,HR模板可為線性。線性HR模板之實例包括但不限於線性化質體載體、ssDNA、合成DNA及PCR擴增之DNA。在具體實例中,HR模板可為環狀,諸如質體。環狀模板可包括超螺旋模板。
在HR模板之5’及3’端發現之一致或實質上一致之序列就欲引入之外源性序列而言一般稱為臂(HR臂)。HR臂可與內源性基因體靶基因座之區域一致(亦即,100%一致)。一些實例中之HR臂可與內源性基因體靶基因座之區域實質上一致。雖然可使用實質上一致之HR臂,但HR臂一致可能有利,此乃因HDR路徑之效率可能受到具有小於100%一致性之HR臂影響。
每一HR臂(亦即,5’及3’ HR臂)可為相同大小或不同大小。每一HR臂之長度可各自大於或等於50個、100個、200個、300個、400個或500個鹼基。儘管HR臂一般而言可為任何長度,但亦可慮及實際考慮因素,諸如HR臂長度及總體模板大小對總體編輯效率之影響。HR臂可與緊鄰切割位點之內源性基因體靶基因座之區域一致或實質上一致。每一HR臂皆可與緊鄰切割位點之內源性基因體靶基因座之區域一致或實質上一致。每一HR臂皆可與內源性基因體靶基因座在切割位點一定距離(諸如彼此為1個鹼基對、小於或等於10個鹼基對、小於或等於50個鹼基對或小於或等於100個鹼基對)內之區域一致或實質上一致。
核酸酶基因體編輯系統可使用多種核酸酶來切割靶基因體基因座,包括但不限於成簇規則間隔短迴文重複(CRISPR)家族核酸酶或其衍生物、轉錄活化劑樣效應物核酸酶(TALEN)或其衍生物、鋅指核酸酶(ZFN)或其衍生物及歸巢內核酸酶(HE)或其衍生物。
CRISPR介導之基因編輯系統可用於對宿主基因體進行工程改造以編碼經工程改造之核酸,諸如編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白的經工程改造之核酸。CRISPR系統更詳細地闡述於M. Adli (「The CRISPR tool kit for genome editing and beyond」Nature Communications;第9卷(2018年),論文編號:1911)中,該文獻教示之所有內容以引用方式併入本文中。一般而言,CRISPR介導之基因編輯系統包含CRISPR相關(Cas)核酸酶及一或多個引導切割成特定靶序列之RNA。例示性CRISPR介導之基因編輯系統係CRISPR/Cas9系統,其包含Cas9核酸酶及一或多種RNA,該RNA具有CRISPR RNA (crRNA)結構域及反式活化CRISPR (tracrRNA)結構域。crRNA通常具有兩個RNA結構域:嚮導RNA序列(gRNA),其藉助鹼基對雜交引導對靶序列(「所定義之核苷酸序列」) (例如,基因體序列)之特異性;及與tracrRNA雜交之RNA結構域。tracrRNA可與核酸酶(例如,Cas9)相互作用,且由此促進其募集至基因體基因座。crRNA及tracrRNA多核苷酸可為單獨之多核苷酸。crRNA及tracrRNA多核苷酸可為單一多核苷酸,亦稱為單一嚮導RNA (sgRNA)。雖然此處說明Cas9系統,但可使用其他CRISPR系統,諸如Cpf1/Cas12或Cas13系統。核酸酶可包括其衍生物,諸如Cas9功能突變體,例如,Cas9「切口酶」突變體,其一般介導所限定核苷酸序列之單鏈之切割,而非通常由Cas9酶產生之完全雙鏈斷裂。
一般而言,CRISPR系統之組分彼此相互作用以形成核糖核蛋白(RNP)複合物,以介導序列特異性切割。在一些CRISPR系統中,每一組分皆可單獨產生且用於形成RNP複合物。在一些CRISPR系統中,每一組分皆可在活體外單獨產生且在活體外相互接觸(亦即,「複合」)以形成RNP複合物。接著可將活體外產生之RNP引入(亦即,「遞送」)至細胞之細胞溶質及/或細胞核(例如,T細胞之細胞溶質及/或細胞核)中。可藉由多種手段將活體外產生之RNP複合物遞送至細胞,該等手段包括但不限於電穿孔、脂質介導之轉染、藉由物理手段之細胞膜變形、脂質奈米粒子(LNP)、病毒樣粒子(VLP)及音波處理。在具體實例中,可使用基於Nucleofactor/Nucleofection®電穿孔之遞送系統(Lonza®)將活體外產生之RNP複合物遞送至細胞。其他電穿孔系統包括但不限於MaxCyte電穿孔系統、Miltenyi CliniMACS電穿孔系統、Neon電穿孔系統及BTX電穿孔系統。CRISPR核酸酶(例如,Cas9)可使用熟習此項技術者已知之多種蛋白產生技術在活體外產生(亦即,合成且純化)。CRISPR系統RNA (例如,sgRNA)可使用熟習此項技術者已知之多種RNA產生技術(諸如活體外轉錄或化學合成)在活體外產生(亦即,合成且純化)。
活體外產生之RNP複合物可以不同比率之核酸酶與gRNA進行複合。活體外產生之RNP複合物亦可以不同量用於CRISPR介導之編輯系統中。舉例而言,取決於期望編輯之細胞之數目,可調整所添加之總RNP量,諸如在反應中編輯大量細胞時減少所添加之RNP複合物之量。
在一些CRISPR系統中,每一組分(例如,Cas9及sgRNA)皆可由多核苷酸單獨編碼,每一多核苷酸係一起或單獨引入細胞中。在一些CRISPR系統中,每一組分皆可由單一多核苷酸(亦即,多啟動子或多順反子載體,參見下文之例示性多順反子系統之描述)編碼且引入細胞中。在細胞內表現每一多核苷酸編碼之CRISPR組分(例如,核酸酶之轉譯及CRISPR RNA之轉錄)後,RNP複合物可在細胞內形成,且接著可引導位點特異性切割。
一些RNP可經工程改造以具有促進RNP遞送至細胞核中之部分。舉例而言,Cas9核酸酶可具有核定位信號(NLS)結構域,使得若Cas9 RNP複合物遞送至細胞之細胞溶質中或在Cas9轉譯及隨後之RNP形成之後,NLS可促進Cas9 RNP進一步轉運至細胞核中。
可使用非病毒方法對本文所述之經工程改造之細胞進行工程改造,例如,可使用非病毒方法將本文所述之核酸酶及/或CRISPR介導之基因編輯系統遞送至細胞。可使用病毒方法對本文所述之經工程改造之細胞進行工程改造,例如,可使用病毒方法(諸如本文所述之腺病毒、逆轉錄病毒、慢病毒或任何其他基於病毒之遞送方法)將本文所述之核酸酶及/或CRISPR介導之基因編輯系統遞送至細胞。
在一些CRISPR系統中,可提供超過一種CRISPR組成物,使得各自單獨地靶向相同基因或一般基因體基因座處之超過一種靶核苷酸序列。舉例而言,可提供兩種單獨的CRISPR組成物以引導在彼此相距一定距離內的兩種不同靶核苷酸序列處之切割。在一些CRISPR系統中,可提供超過一種CRISPR組成物,使得各自單獨地靶向相同基因或一般基因體基因座之相對鏈。舉例而言,可提供兩種單獨的CRISPR「切口酶」組成物以引導相同基因或一般基因體基因座相對鏈處之切割。
一般而言,本文所述之CRISPR介導之編輯系統之特徵可應用於其他基於核酸酶之基因體編輯系統。TALEN係經工程改造之位點特異性核酸酶,其係由TALE (轉錄活化劑樣效應物)之DNA結合結構域及限制性內核酸酶Fokl之催化結構域構成。藉由改變存在於DNA結合結構域單體之高度可變殘基區中之胺基酸,可產生不同人工TALEN以靶向各種核苷酸序列。DNA結合結構域隨後將核酸酶引導至靶序列並產生雙鏈斷裂。基於TALEN之系統更詳細地闡述於美國系列第12/965,590號;美國專利第8,450,471號;美國專利第8,440,431號;美國專利第8,440,432號;美國專利第10,172,880號;及美國系列第13/738,381號中,該等美國專利之全文皆以引用方式併入本文中。基於ZFN之編輯系統更詳細地闡述於美國專利第6,453,242號、第6,534,261號、第6,599,692號、第6,503,717號、第6,689,558號、第7,030,215號、第6,794,136號、第7,067,317號、第7,262,054號、第7,070,934號、第7,361,635號、第7,253,273號;及美國專利公開案第2005/0064474號、第2007/0218528號、第2005/0267061號中,該等美國專利及公開案之全文出於所有目的全部以引用方式併入本文中。
其他工程改造遞送系統
將經工程改造之核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)引入細胞或其他靶接受者實體(諸如本文所述之任何脂質結構)中之各種額外手段。
電穿孔可用於將多核苷酸遞送至接受者實體。電穿孔係藉助施加電場以瞬時透化靶細胞或實體之外膜或外殼,將貨物/酬載內化至該靶細胞或實體之內部區室中之方法。一般而言,該方法涉及將細胞或靶實體置於含有所關注貨物(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)之溶液中的兩個電極之間。接著藉由施加容許貨物進入實體內部(諸如細胞之細胞質)之瞬時設定電壓來破壞細胞之脂質膜,亦即,使其透化。在細胞之實例中,至少一些(若非大部分)細胞保持存活。可在活體外、活體內或離體對細胞及其他實體進行電穿孔。電穿孔條件(例如,細胞數目、貨物濃度、回收條件、電壓、時間、電容、脈衝類型、脈衝長度、體積、比色管長度、電穿孔溶液組成
等)取決於若干因素而變化,包括但不限於細胞或其他接受者實體之類型、欲遞送之貨物、期望之內化效率及期望之活力。該等準則之最佳化在熟習此項技術者之範圍內。多種裝置及方案可用於電穿孔。實例包括但不限於Neon
®轉染系統、MaxCyte
®Flow Electroporation™、Lonza
®Nucleofector™系統及Bio-Rad
®電穿孔系統。
用於將經工程改造之核酸(例如,本文所述之任何經工程改造之核酸)引入細胞或其他靶接受者實體之其他手段包括但不限於音波處理、基因槍、流體動力學注射及藉由物理手段之細胞膜變形。
用於活體內遞送經工程改造之mRNA (諸如裸質體或mRNA)之組成物及方法詳細闡述於Kowalski等人(Mol Ther. 2019年4月10日;27(4): 710-728)及Kaczmarek等人(Genome Med. 2017; 9: 60.)中,該等文獻各自出於所有目的以引用方式併入本文中。
遞送媒劑
本文亦提供用於遞送貨物/酬載之組成物(「遞送媒劑」)。
貨物可包含如上文所述之核酸(例如,本文所述任何經工程改造之核酸,諸如編碼本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白的本文所述任何經工程改造之核酸)。貨物可包含蛋白、碳水化合物、脂質、小分子及/或其組合。
遞送媒劑可包含適於遞送貨物之任何組成物。遞送媒劑可包含適於遞送蛋白(例如,本文所述之任何蛋白)之任何組成物。遞送媒劑可為本文所述之任何脂質結構遞送系統。舉例而言,遞送媒劑可為基於脂質之結構,包括但不限於基於脂質之奈米粒子、脂質體、膠束、胞外體、囊泡、細胞外囊泡、細胞或組織。遞送媒劑可為本文所述之任何奈米粒子,諸如包含脂質(如先前所述)、無機奈米材料及其他聚合物材料之奈米粒子。
遞送媒劑可以能夠將貨物遞送至細胞,諸如將本文所述之任何蛋白遞送至細胞。遞送媒劑可以能夠將貨物遞送至細胞,諸如將本文所述之任何蛋白遞送至細胞。遞送媒劑可經構形以靶向特定細胞,諸如用重定向抗體構形以靶向特定細胞。遞送媒劑可以能夠將貨物遞送至活體內細胞。
遞送媒劑可以能夠將貨物遞送至組織或組織環境(例如,腫瘤微環境),諸如將本文所述之任何蛋白活體內遞送至組織或組織環境。遞送貨物可包括分泌貨物,諸如分泌本文所述之任何蛋白。因此,遞送媒劑可以能夠分泌貨物,諸如分泌本文所述之任何蛋白。遞送媒劑可以能夠將貨物分泌至組織或組織環境(例如,腫瘤微環境),諸如將本文所述之任何蛋白分泌至組織或組織環境中。遞送媒劑可經構形以靶向特定組織或組織環境(例如,腫瘤微環境),諸如用重定向抗體構形以靶向特定組織或組織環境。
治療方法
本文進一步提供如下方法,其包括向個體(例如,人類個體)遞送或投與如本文所提供之經工程改造之細胞以在活體內產生至少一種由經工程改造之細胞產生的所關注蛋白(例如,本文所述之任何細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白,或在蛋白酶切割嵌合蛋白之後為本文所提供之經分泌效應分子)。本文進一步提供如下方法,其包括向個體(例如,人類個體)遞送或投與如本文所提供之經工程改造之細胞以在活體內產生至少兩種由經工程改造之細胞產生的所關注蛋白,例如,至少兩種本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。
本文進一步提供如下方法,其包括向個體(例如,人類個體)遞送或投與本文所述之任何遞送媒劑,諸如包含如下蛋白之本文所述任何遞送媒劑:本文所述之任何所關注蛋白,例如,本文所述之任何細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。本文進一步提供如下方法,其包括向個體(例如,人類個體)遞送或投與本文所述之任何遞送媒劑,諸如包含如下蛋白之本文所述任何遞送媒劑:兩種或更多種所關注蛋白,例如,至少兩種本文所述之細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白。
在一些實施例中,經工程改造之細胞或遞送媒劑係經由靜脈內、腹膜內、氣管內、皮下、腫瘤內、經口、肛門、鼻內(例如,填充在遞送粒子中)或動脈(例如,頸內動脈)途徑投與。因此,經工程改造之細胞或遞送媒劑可經全身或局部投與(例如,至TME或經由腫瘤內投與)。經工程改造之細胞可自個體(諸如已知或懷疑患有癌症之個體)分離。就投與治療之個體而言,經工程改造之細胞可為同種異體的。同種異體修飾細胞可與投與治療之個體進行HLA匹配。遞送媒劑可為本文所述之任何脂質結構遞送系統。遞送媒劑可為本文所述之任何奈米粒子。
取決於欲治療之疾患,經工程改造之細胞或遞送媒劑可單獨或與其他治療組合,同時或依序投與。舉例而言,經工程改造之細胞或遞送媒劑可與本文所述之一或多種IMiD組合投與。FDA批準之IMiD可以其經批準之方式投與。在另一實例中,經工程改造之細胞或遞送媒劑可與檢查點抑制劑療法組合投與。例示性檢查點抑制劑包括但不限於抗PD-1抗體、抗PD-L1抗體、抗PD-L2抗體、抗CTLA-4抗體、抗LAG-3抗體、抗TIM-3抗體、抗TIGIT抗體、抗VISTA抗體、抗KIR抗體、抗B7-H3抗體、抗B7-H4抗體、抗HVEM抗體、抗BTLA抗體、抗GAL9抗體、抗A2AR抗體、抗磷脂醯絲胺酸抗體、抗CD27抗體、抗TNFa抗體、抗TREMl抗體及抗TREM2抗體。說明性免疫檢查點抑制劑包括派姆單抗(pembrolizumab) (抗PD-1;MK-3475/Keytruda® - Merck)、納武單抗(nivolumamb) (抗PD-1;Opdivo® - BMS)、匹利珠單抗(pidilizumab) (抗PD-1抗體;CT-011 - Teva/CureTech)、AMP224 (抗PD-1;NCI)、阿維單抗(avelumab)(抗PD-L1;Bavencio® - Pfizer)、德瓦魯單抗(durvalumab) (抗PD-L1;MEDI4736/Imfinzi® - Medimmune/AstraZeneca)、阿替珠單抗(atezolizumab) (抗PD-L1;Tecentriq® - Roche/Genentech)、BMS-936559 (抗PD-L1 - BMS)、替西木單抗(tremelimumab) (抗CTLA-4;Medimmune/AstraZeneca)、伊匹單抗(ipilimumab) (抗CTLA-4;Yervoy ® - BMS)、利瑞魯單抗(lirilumab) (抗KIR;BMS)、莫納珠單抗(monalizumab) (抗NKG2A;Innate Pharma/AstraZeneca)。在其他實例中,經工程改造之細胞或遞送媒劑可與TGFβ抑制劑、VEGF抑制劑或HPGE2組合投與。在另一實例中,經工程改造之細胞或遞送媒劑可與抗CD40抗體組合投與。
一些方法包括選擇患有腫瘤(或癌症)之個體(或患者群體)及用調節腫瘤介導之免疫抑制機制之經工程改造之細胞或遞送媒劑治療該個體。
在一些情況下,本揭示案之經工程改造之細胞或遞送媒劑可用於治療癌症,諸如卵巢癌。本文闡述其他癌症。舉例而言,經工程改造之細胞可用於治療膀胱腫瘤、腦腫瘤、乳房腫瘤、子宮頸瘤、結腸直腸腫瘤、食道腫瘤、神經膠質瘤、腎腫瘤、肝腫瘤、肺腫瘤、黑色素瘤、卵巢腫瘤、胰臟腫瘤、前列腺腫瘤、皮膚腫瘤、甲狀腺腫瘤及/或子宮腫瘤。本揭示案之經工程改造之細胞或遞送媒劑可用於治療具有位於個體腹膜空間中之腫瘤之癌症。
本文所提供之方法亦包括遞送經工程改造之細胞或遞送媒劑之製劑。在一些實施例中,製劑係實質上純之製劑,其含有例如小於5% (例如,小於4%、3%、2%或1%)之除經工程改造之細胞外之細胞。製劑可包含1×10
5個細胞/kg至1×10
7個細胞/kg。經工程改造之細胞或遞送媒劑之製劑可包括具有一或多種醫藥學上可接受之載劑之醫藥組成物。舉例而言,經工程改造之細胞或遞送媒劑之製劑可包括本文所述之任何經工程改造之病毒,諸如經工程改造之AAV病毒,或任何經工程改造之病毒載體,諸如AAV載體。
活體內表現
本文所提供之方法亦包括活體內遞送能夠產生本文所述之經工程改造之細胞(例如,能夠將本文所述之任何經工程改造之核酸活體內遞送至細胞)之組成物。該等組成物包括任何病毒介導之遞送平臺、任何脂質結構遞送系統、任何奈米粒子遞送系統、任何基因體編輯系統或本文所述能夠在活體內對細胞進行工程改造之任何其他工程改造遞送系統。
本文所提供之方法亦包括活體內遞送能夠產生本文所述之任何所關注蛋白(例如,本文所述之任何細胞介素、CAR、ACP及/或具有式
S - C - MT或
MT - C - S之膜可切割嵌合蛋白)之組成物。本文所提供之方法亦包括活體內遞送能夠產生兩種或更多種本文所述所關注蛋白之組成物。能夠活體內產生所關注蛋白之組成物包括但不限於本文所述之任何經工程改造之核酸。能夠活體內產生所關注蛋白之組成物可為裸mRNA或裸質體。
額外實施例
下文提供闡述本發明具體實施例之列舉實施例:
實施例 1 :一種免疫反應性細胞,其包含:
(a) 第一經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列;及
(b) 第二經工程改造之核酸,其包含:
第三表現盒,該第三表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及
第四表現盒,該第四表現盒包含第四啟動子,該第四啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第三外源性多核苷酸序列之表現,
其中該第一外源性多核苷酸序列及該第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該第一及/或第二細胞介素之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 2 :如實施例1之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒經構形以相對於該第二表現盒之轉錄以相反定向轉錄。
實施例 3 :如實施例2之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
實施例 4 :如實施例1之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒經構形以相對於該第二表現盒之該轉錄以相同定向轉錄。
實施例 5 :如實施例4之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向。
實施例 6 :如實施例1至5中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。
實施例 7 :如實施例6之免疫反應性細胞,其中該第一啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
實施例 8 :如實施例1至7中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。
實施例 9 :如實施例8之免疫反應性細胞,其中該第二啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
實施例 10 :如實施例1至9中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三表現盒經構形以在該第二經工程改造之核酸內相對於該第四表現盒之轉錄以相反方向轉錄。
實施例 11 :如實施例1至10中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三表現盒及該第四表現盒在該第二經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
實施例 12 :如實施例1至11中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三表現盒及該第四表現盒在該第二經工程改造之核酸內以尾對尾方向性定向。
實施例 13 :如實施例1至11中任一項之免疫反應性細胞,其中該第四啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。
實施例 14 :如實施例13之免疫反應性細胞,其中該第四啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
實施例 15 :一種免疫反應性細胞,其包含:
(a) 第一經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼第一細胞介素之第一外源性多核苷酸序列及編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列;及
(b) 第二經工程改造之核酸,其包含:
第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第三外源性多核苷酸序列之表現,
其中該第一外源性多核苷酸序列及該第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該第一及/或第二細胞介素之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 16 :如實施例15之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒之轉錄在該第一經工程改造之核酸內相對於該第二表現盒之轉錄以相反方向定向。
實施例 17 :如實施例16之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
實施例 18 :如實施例15之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒經構形以相對於該第二表現盒之轉錄以相同定向轉錄。
實施例 19 :如實施例18之免疫反應性細胞,其中該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向。
實施例 20 :一種免疫反應性細胞,其包含:
(a) 第一經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼第一細胞介素之第二外源性多核苷酸序列;及
(b) 第二經工程改造之核酸,其包含:
第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第三外源性多核苷酸序列之表現,
其中該第二外源性多核苷酸序列及該第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該第一及/或第二細胞介素之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 21 :如實施例20之免疫反應性細胞,其中該第二表現盒之轉錄在該第一經工程改造之核酸內相對於該第三表現盒之轉錄以相反方向定向。
實施例 22 :如實施例20或實施例21之免疫反應性細胞,其中該第二表現盒及該第三表現盒在該第二經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
實施例 23 :如實施例15至22中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。
實施例 24 :如實施例23之免疫反應性細胞,其中該第一啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
實施例 25 :如實施例15至24中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一外源性多核苷酸序列及該第二外源性多核苷酸序列係由連接體多核苷酸序列隔開。
實施例 26 :如實施例25之免疫反應性細胞,其中該連接體多核苷酸序列與作為單獨多肽之該第一細胞介素及該CAR之轉譯可操作地締合。
實施例 27 :如實施例26之免疫反應性細胞,其中該連接體多核苷酸序列編碼一或多個2A核糖體跳躍元件。
實施例 28 :如實施例27之免疫反應性細胞,其中該一或多個2A核糖體跳躍元件各自選自由以下組成之群:P2A、T2A、E2A、F2A及其組合。
實施例 29 :如實施例28之免疫反應性細胞,其中該一或多個2A核糖體跳躍元件包含E2A/T2A組合。
實施例 30 :如實施例29之免疫反應性細胞,其中該E2A/T2A組合包含SEQ ID NO: 281之胺基酸序列。
實施例 31 :如實施例25或實施例26之免疫反應性細胞,其中該連接體多核苷酸序列編碼內部核糖體進入位點(IRES)。
實施例 32 :如實施例25至31中任一項之免疫反應性細胞,其中該連接體多核苷酸序列編碼可切割多肽。
實施例 33 :如實施例32之免疫反應性細胞,其中該可切割多肽包含弗林蛋白酶多肽序列。
實施例 34 :如實施例15至33中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子。
實施例 35 :如實施例34之免疫反應性細胞,其中該第三啟動子係選自由以下組成之群的組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb。
實施例 36 :如實施例1至35中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一細胞介素係IL-15。
實施例 37 :如實施例36之免疫反應性細胞,其中該IL-15包含SEQ ID NO: 285之胺基酸序列。
實施例 38 :如實施例1至36中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二細胞介素係選自由以下組成之群:IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21。
實施例 39 :如實施例38之免疫反應性細胞,其中該第二細胞介素係該IL12p70融合蛋白。
實施例 40 :如實施例39之免疫反應性細胞,其中該IL12p70融合蛋白包含SEQ ID NO: 293之胺基酸序列。
實施例 41 :如實施例1至35中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一細胞介素係IL12或IL12p70融合蛋白。
實施例 42 :如實施例1至36中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二細胞介素係選自由以下組成之群:IL15、IL18及IL21。
實施例 43 :如實施例1至42中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點可由選自由以下組成之群之蛋白酶切割:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶、MMP9蛋白酶及NS3蛋白酶。
實施例 44 :如實施例43之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點可由ADAM17蛋白酶切割。
實施例 45 :如實施例1至44中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含具有PRAE (SEQ ID NO:176)之胺基酸序列之第一區。
實施例 46 :如實施例1至45中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含具有KGG (SEQ ID NO:177)之胺基酸序列之第二區。
實施例 47 :如實施例46之免疫反應性細胞,其中該第一區定位於該第二區之N末端。
實施例 48 :如實施例1至47中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEX
1X
2KGG (SEQ ID NO: 178)之胺基酸序列,
其中X
1係A、Y、P、S或F,且
其中X
2係V、L、S、I、Y、T或A。
實施例 49 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEAVKGG (SEQ ID NO:179)之胺基酸序列。
實施例 50 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEALKGG (SEQ ID NO: 180)之胺基酸序列。
實施例 51 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEYSKGG (SEQ ID NO: 181)之胺基酸序列。
實施例 52 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEPIKGG (SEQ ID NO: 182)之胺基酸序列。
實施例 53 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEAYKGG (SEQ ID NO: 183)之胺基酸序列。
實施例 54 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAESSKGG (SEQ ID NO: 184)之胺基酸序列。
實施例 55 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEFTKGG (SEQ ID NO: 185)之胺基酸序列。
實施例 56 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PRAEAAKGG (SEQ ID NO: 186)之胺基酸序列。
實施例 57 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含DEPHYSQRR (SEQ ID NO: 187)之胺基酸序列。
實施例 58 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PPLGPIFNPG (SEQ ID NO: 188)之胺基酸序列。
實施例 59 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含PLAQAYRSS (SEQ ID NO: 189)之胺基酸序列。
實施例 60 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含TPIDSSFNPD (SEQ ID NO: 190)之胺基酸序列。
實施例 61 :如實施例48之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含VTPEPIFSLI (SEQ ID NO: 191)之胺基酸序列。
實施例 62 :如實施例1至44中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含ITQGLAVSTISSFF (SEQ ID NO: 198)之胺基酸序列。
實施例 63 :如實施例1至62中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點包含在肽連接體內。
實施例 64 :如實施例1至62中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點在肽連接體之N末端。
實施例 65 :如實施例63或實施例64之免疫反應性細胞,其中該肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體。
實施例 66 :如實施例1至62中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞膜系鏈結構域包含跨膜-細胞內結構域或跨膜結構域。
實施例 67 :如實施例66之免疫反應性細胞,其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自PDGFR-β、CD8、CD28、CD3ζ鏈、CD4、4-1BB、OX40、ICOS、CTLA-4、PD-1、LAG-3、2B4、LNGFR、NKG2D、EpoR、TNFR2、B7-1或BTLA。
實施例 68 :如實施例67之免疫反應性細胞,其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自B7-1。
實施例 69 :如實施例68之免疫反應性細胞,其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域包含SEQ ID NO: 219之胺基酸序列。
實施例 70 :如實施例1至67中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞膜系鏈結構域包含轉譯後修飾標籤、或能夠進行轉譯後修飾以修飾該嵌合蛋白以包括轉譯後修飾標籤之模體,其中該轉譯後修飾標籤能夠與細胞膜締合。
實施例 71 :如實施例70之免疫反應性細胞,其中該轉譯後修飾標籤包含脂質錨結構域,視情況其中該脂質錨結構域係選自由以下組成之群:GPI脂質錨、肉豆蔻醯化標籤及棕櫚醯化標籤。
實施例 72 :如實施例1至71中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞膜系鏈結構域包含細胞表面受體或其細胞膜結合部分。
實施例 73 :如實施例1至72中任一項之免疫反應性細胞,其中該膜可切割嵌合蛋白之該細胞介素系鏈至該細胞之細胞膜。
實施例 74 :如實施例1至73中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞進一步包含能夠切割該蛋白酶切割位點之蛋白酶。
實施例 75 :如實施例74之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶對於該細胞而言係內源性的。
實施例 76 :如實施例74之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶係選自由以下組成之群:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶及MMP9蛋白酶。
實施例 77 :如實施例76之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶係ADAM17蛋白酶。
實施例 78 :如實施例74至77中任一項之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶在該細胞之該細胞膜上表現。
實施例 79 :如實施例78之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶能夠切割該蛋白酶切割位點。
實施例 80 :如實施例79之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶切割位點之切割自該細胞之該細胞膜釋放該膜可切割嵌合蛋白之該細胞介素。
實施例 81 :如實施例1至19及23至80中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。
實施例 82 :如實施例15至81中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。
實施例 83 :如實施例20至80中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。
實施例 84 :如實施例15至83中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。
實施例 85 :如實施例82或實施例84之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽源自選自由以下組成之群之蛋白:IL-12、胰蛋白酶原-2、高斯螢光素酶、CD5、IgKVII、VSV-G、泌乳素、血清白蛋白前蛋白原、天青殺素前蛋白原、骨結合素(BM40)、CD33、IL-6、IL-8、CCL2、TIMP2、VEGFB、骨保護素、絲胺酸蛋白酶抑制劑-E1、GROα、CXCL12、IL-21、CD8、GMCSFRa、NKG2D及IgE。
實施例 86 :如實施例82之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽源自GMCSFRa。
實施例 87 :如實施例86之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽包含SEQ ID NO: 216之胺基酸序列。
實施例 88 :如實施例84之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽源自IgE。
實施例 89 :如實施例88之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽包含SEQ ID NO: 218之胺基酸序列。
實施例 90 :如實施例15至89中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。
實施例 91 :如實施例90之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽與該第二細胞介素可操作地締合。
實施例 92 :如實施例82或實施例91之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽對於該第二細胞介素而言係天然的。
實施例 93 :如實施例82或實施例91之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽對於該第二細胞介素而言係非天然的。
實施例 94 :如實施例20至93中任一項之免疫反應性細胞,其中該第三外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白。
實施例 95 :如實施例94之免疫反應性細胞,其中該第二表現盒進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列。
實施例 96 :如實施例15至95中任一項之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽與該第一細胞介素可操作地締合。
實施例 97 :如實施例96之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽對於該第一細胞介素而言係天然的。
實施例 98 :如實施例96之免疫反應性細胞,其中該分泌信號肽對於該第一細胞介素而言係非天然的。
實施例 99 :如實施例15至98中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一外源性多核苷酸序列編碼第一膜可切割嵌合蛋白,且該第三外源性多核苷酸序列編碼第二膜可切割嵌合蛋白。
實施例 100 :如實施例20至98中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二外源性多核苷酸序列編碼第一膜可切割嵌合蛋白,且該第三外源性多核苷酸序列編碼第二膜可切割嵌合蛋白。
實施例 101 :如實施例1至100中任一項之免疫反應性細胞,其中該CAR包含抗原結合結構域,該抗原結合結構域包含重鏈可變(VH)區及輕鏈可變(VL)區,
其中該VH包含:
具有KNAMN (SEQ ID NO: 199)之胺基酸序列之重鏈互補決定區1 (CDR-H1)、
具有RIRNKTNNYATYYADSVKA (SEQ ID NO: 200)之胺基酸序列之重鏈互補決定區2 (CDR-H2)及
具有GNSFAY (SEQ ID NO: 201)之胺基酸序列之重鏈互補決定區3 (CDR-H3),且
其中該VL包含:
具有KSSQSLLYSSNQKNYLA (SEQ ID NO: 202)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區1 (CDR-L1)、
具有WASSRES (SEQ ID NO: 203)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區2 (CDR-L2)及
具有QQYYNYPLT (SEQ ID NO: 204)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區3 (CDR-L3)。
實施例 102 :如實施例101之免疫反應性細胞,其中該VH區包含與EVQLVETGGGMVQPEGSLKLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVARIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSQSMLYLQMNNLKIEDTAMYYCVAGNSFA YWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 205)或EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 206)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
實施例 103 :如實施例101之免疫反應性細胞,其中該VH區包含與SEQ ID NO: 206之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
實施例 104 :如實施例101至103中任一項之免疫反應性細胞,其中該VL區包含與DIVMSQSPSSLVVSIGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASSRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYNYPLTFGAGTKLELK(SEQ ID NO: 207)或DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO: 208)之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
實施例 105 :如實施例104之免疫反應性細胞,其中該VL區包含與SEQ ID NO: 208之胺基酸序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%一致性之胺基酸序列。
實施例 106 :如實施例101至98中任一項之免疫反應性細胞,其中該抗原結合結構域包含單鏈可變片段(scFv)。
實施例 107 :如實施例101至106中任一項之免疫反應性細胞,其中該VH及該VL係由肽連接體隔開。
實施例 108 :如實施例107之免疫反應性細胞,其中該肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體。
實施例 109 :如實施例108之免疫反應性細胞,其中該GS連接體包含(GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223)之胺基酸序列。
實施例 110 :如實施例107之免疫反應性細胞,其中該scFv包含結構VH-L-VL或VL-L-VH,其中VH係該重鏈可變結構域,L係該肽連接體,且VL係該輕鏈可變結構域。
實施例 111 :如實施例1至110中任一項之免疫反應性細胞,其中該CAR包含一或多個細胞內傳訊結構域,且該一或多個細胞內傳訊結構域中之每一者係選自由以下組成之群:CD3ζ鏈細胞內傳訊結構域、CD97細胞內傳訊結構域、CD11a-CD18細胞內傳訊結構域、CD2細胞內傳訊結構域、ICOS細胞內傳訊結構域、CD27細胞內傳訊結構域、CD154細胞內傳訊結構域、CD8細胞內傳訊結構域、OX40細胞內傳訊結構域、4-1BB細胞內傳訊結構域、CD28細胞內傳訊結構域、ZAP40細胞內傳訊結構域、CD30細胞內傳訊結構域、GITR細胞內傳訊結構域、HVEM細胞內傳訊結構域、DAP10細胞內傳訊結構域、DAP12細胞內傳訊結構域、MyD88細胞內傳訊結構域、2B4細胞內傳訊結構域、CD16a細胞內傳訊結構域、DNAM-1細胞內傳訊結構域、KIR2DS1細胞內傳訊結構域、KIR3DS1細胞內傳訊結構域、NKp44細胞內傳訊結構域、NKp46細胞內傳訊結構域、FceRlg細胞內傳訊結構域、NKG2D細胞內傳訊結構域及EAT-2細胞內傳訊結構域。
實施例 112 :如實施例111之免疫反應性細胞,其中該一或多個細胞內傳訊結構域包含OX40細胞內傳訊結構域。
實施例 113 :如實施例112之免疫反應性細胞,其中該OX40細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 269之胺基酸序列。
實施例 114 :如實施例111之免疫反應性細胞,其中該一或多個細胞內傳訊結構域包含CD28細胞內傳訊結構域。
實施例 115 :如實施例114之免疫反應性細胞,其中該CD28細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 267之胺基酸序列。
實施例 116 :如實施例111之免疫反應性細胞,其中該一或多個細胞內傳訊結構域包含CD3z細胞內傳訊結構域。
實施例 117 :如實施例116之免疫反應性細胞,其中該CD3z細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 277或SEQ ID NO: 279之胺基酸序列。
實施例 118 :如實施例1至117中任一項之免疫反應性細胞,其中該CAR包含跨膜結構域,且該跨膜結構域係選自由以下組成之群:CD8跨膜結構域、CD28跨膜結構域、CD3ζ鏈跨膜結構域、CD4跨膜結構域、4-1BB跨膜結構域、OX40跨膜結構域、ICOS跨膜結構域、CTLA-4跨膜結構域、PD-1跨膜結構域、LAG-3跨膜結構域、2B4跨膜結構域、BTLA跨膜結構域、OX40跨膜結構域、DAP10跨膜結構域、DAP12跨膜結構域、CD16a跨膜結構域、DNAM-1跨膜結構域、KIR2DS1跨膜結構域、KIR3DS1跨膜結構域、NKp44跨膜結構域、NKp46跨膜結構域、FceRlg跨膜結構域及NKG2D跨膜結構域。
實施例 119 :如實施例118之免疫反應性細胞,其中該跨膜結構域係OX40跨膜結構域。
實施例 120 :如實施例119之免疫反應性細胞,其中該OX40跨膜結構域包含SEQ ID NO: 244之胺基酸序列。
實施例 121 :如實施例118之免疫反應性細胞,其中該跨膜結構域係CD8跨膜結構域。
實施例 122 :如實施例121之免疫反應性細胞,其中該CD8跨膜結構域包含SEQ ID NO: 236或SEQ ID NO: 242之胺基酸序列。
實施例 123 :如實施例118至122中任一項之免疫反應性細胞,其中該CAR包含介於該抗原結合結構域與該跨膜結構域之間之間隔區。
實施例 124 :如實施例123之免疫反應性細胞,其中該間隔區源自選自由以下組成之群之蛋白:CD8、CD28、IgG4、IgG1、LNGFR、PDGFR-β及MAG。
實施例 125 :如實施例124之免疫反應性細胞,其中該間隔區係CD8鉸鏈。
實施例 126 :如實施例125之免疫反應性細胞,其中該CD8鉸鏈包含SEQ ID NO: 226或SEQ ID NO: 228之胺基酸序列。
實施例 127 :如實施例1至123中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域。
實施例 128 :如實施例127之免疫反應性細胞,其中該轉錄效應物結構域包含轉錄活化劑結構域。
實施例 129 :如實施例128之免疫反應性細胞,其中該轉錄活化劑結構域係選自由以下組成之群:單純疱疹病毒蛋白16 (VP16)活化結構域;包含VP16之四個串聯拷貝之活化結構域,即VP64活化結構域;NFκB之p65活化結構域;艾司坦-巴爾病毒R反式活化劑(Rta)活化結構域;包含VP64、p65及Rta活化結構域(VPR活化結構域)之三重活化劑;人類E1A相關蛋白p300之組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)核心結構域(p300 HAT核心活化結構域)。
實施例 130 :如實施例129之免疫反應性細胞,其中該轉錄效應物結構域包含VPR活化結構域。
實施例 131 :如實施例131之免疫反應性細胞,其中該VPR活化結構域包含SEQ ID NO: 325之胺基酸序列。
實施例 132 :如實施例128之免疫反應性細胞,其中該轉錄效應物結構域包含轉錄阻遏物結構域。
實施例 133 :如實施例132之免疫反應性細胞,其中該轉錄阻遏物結構域係選自由以下組成之群:Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;截短之Krüppel相關框(KRAB)阻遏結構域;阻遏物元件沈默轉錄因子(REST)阻遏結構域;毛狀相關鹼性螺旋-環-螺旋阻遏蛋白之WRPW模體(SEQ ID NO: 346),該模體稱為WRPW阻遏結構域(SEQ ID NO: 346);DNA (胞嘧啶-5)-甲基轉移酶3B (DNMT3B)阻遏結構域;及HP1α色影阻遏結構域。
實施例 134 :如實施例127至133中任一項之免疫反應性細胞,其中該DNA結合結構域包含鋅指(ZF)蛋白結構域。
實施例 135 :如實施例134之免疫反應性細胞,其中該ZF蛋白結構域在設計上係模組化的且包含鋅指模體陣列。
實施例 136 :如實施例134之免疫反應性細胞,其中該ZF蛋白結構域包含1至10個鋅指模體之陣列。
實施例 137 :如實施例136之免疫反應性細胞,其中該ZF蛋白結構域包含SEQ ID NO: 320之胺基酸序列。
實施例 138 :如實施例1至136中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP進一步包含阻遏性蛋白酶及該阻遏性蛋白酶之一或多個同源切割位點。
實施例 139 :如實施例138之免疫反應性細胞,其中該阻遏性蛋白酶係C型肝炎病毒(HCV)非結構蛋白3 (NS3)。
實施例 140 :如實施例139之免疫反應性細胞,其中該NS3蛋白酶包含SEQ ID NO: 321之胺基酸序列。
實施例 141 :如實施例138或實施例139之免疫反應性細胞,其中該阻遏性蛋白酶之該同源切割位點包含NS3蛋白酶切割位點。
實施例 142 :如實施例141之免疫反應性細胞,其中該NS3蛋白酶切割位點包含NS3/NS4A、NS4A/NS4B、NS4B/NS5A或NS5A/NS5B接合部切割位點。
實施例 143 :如實施例139至142中任一項之免疫反應性細胞,其中該NS3蛋白酶可被蛋白酶抑制劑阻遏。
實施例 144 :如實施例143之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶抑制劑係選自由以下組成之群:西美瑞韋、達諾瑞韋、阿舒瑞韋、西魯瑞韋、波普瑞韋、索伐瑞韋、帕利瑞韋、替拉瑞韋、格拉瑞韋、格卡瑞韋及伏西瑞韋。
實施例 145 :如實施例144之免疫反應性細胞,其中該蛋白酶抑制劑係格拉瑞韋(GRZ)。
實施例 146 :如實施例1至145中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP進一步包含核定位信號(NLS)。
實施例 147 :如實施例146之免疫反應性細胞,其中該NLS包含SEQ ID NO: 296之胺基酸序列。
實施例 148 :如實施例138至144中任一項之免疫反應性細胞,其中該阻遏性蛋白酶之該一或多個同源切割位點定位於該DNA結合結構域與該轉錄效應物結構域之間。
實施例 149 :如實施例1至148中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP進一步包含雌激素受體變異體ERT2之激素結合結構域。
實施例 150 :如實施例1至149中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP反應性啟動子係合成啟動子。
實施例 151 :如實施例1至150中任一項之免疫反應性細胞,其中該ACP反應性啟動子包含ACP結合結構域序列及最小啟動子序列。
實施例 152 :如實施例151之免疫反應性細胞,其中該ACP結合結構域序列包含一或多個鋅指結合位點。
實施例 153 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 154 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 155 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 156 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 157 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 158 :如實施例1、15或20中任一項之免疫反應性細胞,其中該第一經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 159 :如實施例1至11或20至152中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 160 :如實施例1至11或20至152中任一項之免疫反應性細胞,其中該第二經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 161 :一種免疫反應性細胞,其包含:
a) 包含SEQ ID NO: 310之核苷酸序列的第一經工程改造之核酸;及
b) 包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列的第二經工程改造之核酸。
實施例 162 :一種免疫反應性細胞,其包含:
a) 包含SEQ ID NO: 327之核苷酸序列的第一經工程改造之核酸;及
c) 包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列的第二經工程改造之核酸。
實施例 163 :如實施例1至162中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞係選自由以下組成之群:T細胞、CD8+ T細胞、CD4+ T細胞、γ-δT細胞、細胞毒性T淋巴球(CTL)、調控性T細胞、病毒特異性T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、自然殺手(NK)細胞、B細胞、腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)、先天性淋巴樣細胞、肥大細胞、嗜酸性球、嗜鹼性球、嗜中性球、骨髓細胞、巨噬細胞、單核球、樹突細胞、紅血球、血小板細胞、人類胚胎幹細胞(ESC)、ESC源細胞、多潛能幹細胞、間質基質細胞(MSC)、誘導性多潛能幹細胞(iPSC)及iPSC源細胞。
實施例 164 :如實施例1至162中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞係自然殺手(NK)細胞。
實施例 165 :如實施例163或實施例164之免疫反應性細胞,其中該細胞係自體的。
實施例 166 :如實施例163或實施例164之免疫反應性細胞,其中該細胞係同種異體的。
實施例 167 :一種經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼IL15之第一外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第二外源性多核苷酸序列,
其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該IL15之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 168 :如實施例167之經工程改造之核酸,其中
a) 該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對尾方向性定向,
b) 該第一外源性多核苷酸序列及該第二外源性多核苷酸序列係由包含E2A/T2A核糖體跳躍元件之連接體多核苷酸序列隔開,且
c) 該結合至GPC3之CAR包含CD28細胞內傳訊結構域或OX40細胞內傳訊結構域。
實施例 169 :一種經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼IL15之第二外源性多核苷酸序列,
其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該IL15之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 170 :如實施例169之經工程改造之核酸,其中
a) 該第一外源性多核苷酸序列及該第二外源性多核苷酸序列係由包含E2A/T2A核糖體跳躍元件之連接體多核苷酸序列隔開,且
b) 該結合至GPC3之CAR包含CD28細胞內傳訊結構域或OX40細胞內傳訊結構域。
實施例 171 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 309至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 172 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 326至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 173 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 310至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 174 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 327至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 175 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 314至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 176 :如實施例167至170中任一項之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 315至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 177 :一種經工程改造之核酸,其包含SEQ ID NO: 310之核苷酸序列。
實施例 178 :一種經工程改造之核酸,其包含SEQ ID NO: 327之核苷酸序列。
實施例 179 :一種經工程改造之核酸,其包含:
第一表現盒,該第一表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼IL12p70融合蛋白之第一外源性多核苷酸序列,及
第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第二外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,
其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第一外源性多核苷酸序列之表現,
其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式:
S - C - MT或
MT - C - S其中
S包含包括該IL12p70融合蛋白之可分泌效應分子,
C包含蛋白酶切割位點,且
MT包含細胞膜系鏈結構域,且
其中
S - C - MT或
MT - C - S經構形以表現為單一多肽。
實施例 180 :如實施例179之經工程改造之核酸,其中
a) 該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向,且
b) 該ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中該轉錄活化劑結構域包含VPR活化結構域。
實施例 181 :如實施例179或180之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 317至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 182 :如實施例179或180之經工程改造之核酸,其中該經工程改造之核酸包含與SEQ ID NO: 318至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致之核苷酸序列。
實施例 183 :一種經工程改造之核酸,其包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列。
實施例 184 :一種表現載體,其包含如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸。
實施例 185 :一種免疫反應性細胞,其包含如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸或如實施例184之表現載體。
實施例 186 :一種醫藥組成物,該醫藥組成物包含如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸或如實施例184之表現載體及醫藥學上可接受之載劑、醫藥學上可接受之賦形劑或其組合。
實施例 187 :一種治療有需要之個體之方法,該方法包括投與治療有效劑量之如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸、如實施例184之表現載體或如實施例186之醫藥組成物中之任一者。
實施例 188 :一種在個體中刺激細胞介導的對腫瘤細胞之免疫反應之方法,該方法包括向患有腫瘤之個體投與治療有效劑量之如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸、如實施例184之表現載體或如實施例186之醫藥組成物中之任一者。
實施例 189 :一種減小個體之腫瘤體積之方法,該方法包括向患有腫瘤之個體投與包含以下之組成物:如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸、如實施例184之表現載體或如實施例186之醫藥組成物中之任一者。
實施例 190 :一種在個體中提供抗腫瘤免疫之方法,該方法包括向有需要之個體投與治療有效劑量之如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸、如實施例184之表現載體或如實施例186之醫藥組成物中之任一者。
實施例 191 :如實施例188至190中任一項之方法,其中該腫瘤包含表現GPC3之腫瘤。
實施例 192 :如實施例188至191中任一項之方法,其中該腫瘤係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤)及卵黃囊瘤。
實施例 193 :一種治療患有癌症之個體之方法,該方法包括投與治療有效劑量之如實施例1至166或185中任一項之免疫反應性細胞、如實施例167至183中任一項之經工程改造之核酸、如實施例184之表現載體或如實施例186之醫藥組成物中之任一者。
實施例 194 :如實施例193之方法,其中該癌症包含表現GPC3之癌症。
實施例 195 :如實施例193或實施例194之方法,其中該癌症係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤)及卵黃囊瘤。
實施例 196 :如實施例187至195中任一項之方法,其中該投與包括全身投與。
實施例 197 :如實施例187至195中任一項之方法,其中該投與包括腫瘤內投與。
實施例 198 :如實施例187至197中任一項之方法,其中該免疫反應性細胞源自該個體。
實施例 199 :如實施例187至198中任一項之方法,其中該免疫反應性細胞就該個體而言係同種異體的。
實例
以下係用於實施本發明之特定實施例之實例。實例僅係出於說明目的而提供,且並不意欲以任何方式限制本發明之範疇。舉例而言,下面闡述及實施之實驗證實對細胞進行工程改造以分泌酬載(例如,效應分子)及遞送彼等細胞以誘導針對腫瘤之免疫原性反應之一般效用。
已努力確保所用數值(例如,量、溫度等)之精確性,但當然應當容許一些實驗誤差及偏差。
實例 1 :抗 GPC3 CAR + IL15 雙向構築體之表現及功能
評估用抗GPC3 CAR + IL15雙向構築體轉導之細胞之蛋白表現、細胞活化及殺傷活性。構築體之雙向定向之草圖示於
圖 1中。
材料及方法
在非TC處理之retronectin包被板中,用慢病毒(感染複數MOI為40)或逆轉錄病毒(SinVec,各約400 μl)編碼構築體轉導(50,000至100,000個細胞/轉導)原代、供體來源之NK細胞,該等構築體具有編碼抗GPC3 CAR之第一表現盒及編碼IL15之第二表現盒,該兩個表現盒處於頭對頭雙向定向。對於各構築體比較在CAR之細胞內結構域方面變化之構築體(該等構築體具有4-1BB及CD3-ζ傳訊結構域(41BBz)、CD28及CD3-ζ傳訊結構域(CD28z)、OX40及CD3-ζ傳訊結構域(OX40z)或KIR3DS1傳訊結構域(KIR3DS1)),及使用慢病毒或逆轉錄病毒系統之轉導。作為對照,亦使用編碼各相同CAR之逆轉錄病毒及慢病毒實施轉導,但不使用IL15表現盒(“僅CAR”)。轉導後,將NK細胞在相同板中靜置3天,接著轉移至24孔非附著細胞最佳化板。將NK細胞擴增至總共5 ml,在轉導後第7天摻入第一細胞介素且在第15天摻入第二細胞介素(各摻入包括500 IU/ml IL12 (對於CAR+IL15轉導及僅CAR轉導而言)及10 ng/ml IL15 (對於僅CAR構築體而言))。
在轉導後第5天及第7天,藉由流式細胞術評估各構築體之CAR表現。來自用編碼雙向CAR + IL15雙向構築體之慢病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之慢病毒轉導之細胞的第7天CAR表現示於
圖 2中。來自用編碼雙向CAR + IL15雙向構築體之逆轉錄病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之逆轉錄病毒轉導之細胞的第7天CAR表現示於
圖 3中。來自用編碼雙向CAR + IL15雙向構築體之慢病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之慢病毒轉導之細胞的第15天CAR表現示於
圖 4中。來自用編碼雙向CAR + IL15雙向構築體之逆轉錄病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之逆轉錄病毒轉導之細胞的第15天CAR表現示於
圖 5中。
在轉導後第7天,進行酬載分析以評估每種構築體之IL15水準。將每孔200,000個細胞平鋪於96孔板中之200 μl培養基(含IL2之NK MAC完全培養基)中。將NK細胞孵育48小時,接著藉由免疫分析評估IL15水準。IL15表現示於
圖 6中。
接著實施共培養殺傷分析。將每孔約25,000個靶細胞(Huh7 mKate細胞株或HepG2 mKate細胞株)平鋪於96孔板中。將效應細胞(表現各構築體之NK細胞)以1:1或0.5:1之效應細胞與靶(E與T)細胞比添加至板中,且用無細胞介素之NK MAC完全培養基培養該等細胞,總體積為200 μl。在共培養後的2至3天,進行即時的基於螢光之分析以量測mKate水準,以評估靶細胞殺傷。藉由表現各構築體之經慢病毒轉導之NK細胞之殺傷示於
圖 7中,且藉由表現各構築體之經逆轉錄病毒轉導之NK細胞之殺傷示於
圖 8中。
結果
評估用各構築體轉導之NK細胞之CAR表現。如
圖 2中所示,在第7天,經轉導NK細胞對於各構築體具有可量測之CAR表現,其中各經轉導群體中至少10%之細胞對於CAR表現為陽性。如
圖 3中所示,在第15天,經慢病毒轉導之NK細胞對於各構築體具有可量測之CAR表現(頂部圖),其中各經轉導群體中至少20%之細胞對於CAR表現為陽性。另外,如
圖 3中所示,經逆轉錄病毒轉導之表現28z CAR + IL15雙向構築體之NK細胞具有可量測之CAR表現,其中經轉導群體中至少42%之細胞對於CAR表現為陽性。
亦評估用各構築體轉導之NK細胞之IL15表現。實施藉由非轉導細胞及僅Ox40z CAR細胞之IL15表現之分析作為陰性對照。如
圖 6中所示,表現雙向CAR + IL15的經逆轉錄病毒轉導之NK細胞相對於對等(reciprocal)經慢病毒轉導之NK細胞具有IL15產生之統計學顯著增加。
接著評估用各構築體轉導之NK細胞之殺傷。如
圖 7中所示,表現CAR + IL15雙向構築體的經慢病毒轉導之NK細胞相對於表現單獨CAR (無IL15表現盒)的經慢病毒轉導之NK細胞具有統計學顯著增加之殺傷。如
圖 8中所示,表現CAR + IL15雙向構築體的經逆轉錄病毒轉導之NK細胞相對於表現單獨CAR (無IL15表現盒)的經逆轉錄病毒轉導之NK細胞具有統計學顯著增加之殺傷。
實例 2 : IL12 自編碼可調控 IL12 及合成轉錄因子之雙向構築體之表現
評估經轉導以表現雙向構築體之NK細胞之IL12表現,該等構築體包括編碼可調控IL12之第一表現盒及編碼合成轉錄因子之第二表現盒。可調控IL12可操作地連接至合成轉錄因子反應性啟動子,該啟動子包括ZF-10-1結合位點及最小啟動子序列(YBTATA)。合成轉錄因子包括DNA結合結構域(稱為ZF-10-1之六鋅指模體陣列)及轉錄活化結構域(Vpr)。在DNA結合結構域與轉錄活化結構域之間係蛋白酶結構域(NS3)及用於該蛋白酶之同源切割位點。在缺失蛋白酶抑制劑之情況下,蛋白酶在切割位點處誘導切割,產生非功能性合成轉錄因子。在存在蛋白酶抑制劑之情況下,合成轉錄因子不受切割且因此能夠調節IL12之表現。所測試構築體包括在3’非轉譯區中具有mRNA去穩定元件之IL12表現盒。構築體之雙向定向之草圖示於
圖 9中。
材料及方法
產生雙向構築體,其包括兩個表現盒,即編碼可調控IL12之第一表現盒及編碼小分子可調控合成轉錄因子之第二表現盒。第一構築體缺乏mRNA去穩定元件(「WT」),且4種構築體各自包括添加至5’非編碼區之不同mRNA去穩定元件。使用4種去穩定元件:1)富含AU之模體(「AU」或「1XAU」);2)莖-環去穩定元件(「SLDE」或「1XSLDE」);3)串聯AU模體及SLDE模體(「AuSLDE」或「1X AuSLDE」);及4)兩個重複AuSLDE模體(2X AuSLDE)。添加去穩定元件以嘗試在缺失合成啟動子之小分子調控劑(例如,格拉瑞韋)之情況下降低IL12表現之滲漏性(leakiness)。
在Bx795預處理之後的經retronectin包被之24孔板中將原代、供體來源之NK細胞擴增10天且在IL21及IL15中與K562飼養細胞一起生長,接著以40之感染複數(MOI) (藉由感染單位效價確定)轉導。於32℃下在800g下旋轉接種(spinoculation) 2小時來實施轉導。
在轉導後第3天,對NK細胞計數且將其以1e6個細胞/mL接種,無藥物或有0.1 μM格拉瑞韋(GRZ),保持24小時。
在轉導後第4天(24小時藥物處理),收穫上清液且藉由免疫分析來分析IL12水準。各細胞類型及條件之IL12濃度示於
圖 10中。
結果
如
圖 10中所示,與缺失藥物之情況相比,在用格拉瑞韋處理後,用各構築體轉導之NK細胞表現出增加之IL12表現。用缺乏去穩定元件之IL12 (「WT」)轉導之NK細胞在用格拉瑞韋處理後具有大於19倍之IL12表現之誘導。然而,用包括去穩定標籤之構築體轉導之NK細胞在用格拉瑞韋處理後,分別對於2X AuSLDE、1X AuSLDE、1X AU及1X SLDE而言表現出IL12之約457倍、58倍、50倍及89倍之誘導。另外,在缺失格拉瑞韋之情況下,各去穩定標籤皆降低基線IL12表現。此外,在缺失格拉瑞韋之情況下,具有2X AuSLDE去穩定元件之編碼IL12之構築體產生不可檢測水準之IL12表現。
實例 3 :抗 GPC3 CAR + IL15 雙向構築體之表現及功能
評估用抗GPC3 CAR + 可切割釋放IL15雙向構築體轉導之細胞之蛋白表現、細胞活化及殺傷活性。編碼可切割釋放IL15之表現盒包括包含IL15及跨膜結構域之嵌合多肽。在IL15與跨膜結構域之間係可由為NK細胞內源之蛋白酶切割的蛋白酶切割結構域。編碼可切割釋放IL15之雙向構築體之草圖示於
圖 11中。
簡言之,用編碼構築體之病毒載體轉導原代、供體來源之NK細胞,該等構築體具有編碼抗GPC3 CAR之第一表現盒及編碼可切割釋放IL15表現盒之第二表現盒,該兩個表現盒處於頭對頭雙向定向。
培養上清液:實施NK細胞之旋轉接種(第0天)。在1天、第2天及第6天實施部分培養基交換。在第8天收穫細胞培養上清液。
流式細胞術:在轉導後第10天,藉由流式細胞術評估各構築體之CAR及mbIL15表現。將NK細胞用IL-15一級抗體、PE二級抗體以及rhGPC3-FITC及Sytox藍(活力染色劑)染色。在Cytoflex上運行細胞且使用Flowjo分析CAR/mbIL15表現。
酬載分析:在轉導後第7天或第8天,進行酬載分析以評估每種構築體之IL15水準。將每孔200,000個細胞平鋪於96孔板中之200 μl培養基(僅含IL2之NK MAC完全培養基)中,以一式兩份運行。將細胞孵育48小時,接著藉由Luminex免疫分析評估經切割之IL15水準。
系列殺傷分析:實施共培養殺傷分析。將每孔約25,000個靶細胞(Huh7 mKate細胞株或HepG2 mKate細胞株)平鋪於96孔板中。將效應細胞(表現各構築體之NK細胞)以1:1之效應細胞與靶(E與T)細胞比一式三份添加至板中,且用NK MAC完全培養基(無細胞介素)培養該等細胞,總體積為200 μl。將即時的基於螢光之分析用於量測mKate,以評估在37℃下實施之系列殺傷分析中之靶細胞殺傷;初始殺傷係在轉導後第9天,系列1係在轉導後第11天,且系列2係在轉導後第14天。
設計超過150種IL15可切割釋放(crIL15)構築體,且選擇33種構築體用於實驗測試。(參見
表 7A)。在兩種病毒骨架(例如,SB06250及SB06256,如
表 7A中所示)中測試各構築體。表現雙順反子構築體子集之細胞之表現及殺傷活性的彙總示於
表 7B中。構築體子集之全長序列示於
表 7C中。所測試雙順反子構築體及其功能活性之彙總提供於
圖 12中。
表 7A.
表 7B.
a 正規化至單獨的靶細胞
* crIL-15對照未如預期發揮作用
* crIL-15 對照未如預期進行殺傷 表 7C.
構築體 | SB 編號(CD3 Senti) | SB 編號(CD3mut) |
GPC3-CAR (41BB) 2A crIL15(Tace10) | SB06250 | SB06290 |
SB06256 | SB06296 | |
GPC3-CAR (OX40) 2A crIL15(Tace10) | SB06251 | SB06291 |
SB06257 | SB06297 | |
GPC3-CAR (CD28) 2A crIL15(Tace10) | SB06252 | SB06292 |
SB06258 | SB06298 | |
crIL15(Tace10) 2A GPC3-CAR (41BB) | SB06253 | SB06293 |
SB06259 | SB06299 | |
crIL15(Tace10) 2A GPC3-CAR (OX40) | SB06254 | SB06294 |
SB06260 | SB06300 | |
crIL15(Tace10) 2A GPC3-CAR (CD28) | SB06255 | SB06295 |
SB06261 | SB06301 | |
crIL15(TaceOPT) 2A GPC3-CAR (41BB) | SB06685 | SB06688 |
SB06691 | SB06694 | |
crIL15(TaceOPT) 2A GPC3-CAR (OX40) | SB06686 | SB06689 |
SB06692 | SB06695 | |
crIL15(TaceOPT) 2A GPC3-CAR (CD28) | SB06687 | SB06690 |
SB06693 | SB06696 |
病毒 | SB 編號 | CAR% | IL15% | IL15 (pg/ml) | 靶細胞生長% ( 第3 輪) a | 鉸鏈 | TM | Co-stim | CD3z | IL15 | 描述 |
Retrovec | SB06252 | 76.7 60.6 | 64.8 51.2 | 151 117 | n/a 70 | CD8FA | CD8FA | CD28 | wt | Tace10 | CAR 2A crIL15 |
SinVec | SB06258 | 66.8 52.5 | 38.5 30.6 | 84 74 | n/a 62 | ||||||
Retrovec | SB06255 | 59.8 37.5 | 67.6 41.0 | 54 68 | n/a 81.4 | crIL15 2A CAR | |||||
Retrovec | SB06251 | 64.2 44.2 | 30.9 18.5 | 17 65 | 11.2* 22 | CD8 S2L | OX40 | OX40 | wt | Tace10 | CAR 2A crIL15 |
SinVec | SB06257 | 78.3 55.8 | 30.1 15.8 | 53 40 | 59* 39 | ||||||
Retrovec | SB06254 | 67.5 48.9 | 52.2 30.1 | 137 43 | 89* 74 | crIL15 2A CAR | |||||
Retrovec | SB06294 | 60 71 | 39 58 | 50 27 | 8 | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z-Alt | Tace10 | crIL15 2A CAR |
構築體 | 全核苷酸序列 |
SB06251 | aagctttgctcttaggagtttcctaatacatcccaaactcaaatatataaagcatttgacttgttctatgccctagggggcggggggaagctaagccagctttttttaacatttaaaatgttaattccattttaaatgcacagatgtttttatttcataagggtttcaatgtgcatgaatgctgcaatattcctgttaccaaagctagtataaataaaaatagataaacgtggaaattacttagagtttctgtcattaacgtttccttcctcagttgacaacataaatgcgctgctgagaagccagtttgcatctgtcaggatcaatttcccattatgccagtcatattaattactagtcaattagttgatttttatttttgacatatacatgtgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaaatacataactgagaatagaaaagttcagatcaaggtcaggaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtccagccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatggatcttatatggggcacccccgccccttgtaaacttccctgaccctgacatgacaagagttactaacagcccctctctccaagctcacttacaggctctctacttagtccagcacgaagtctggagacctctggcggcagcctaccaagaacaactggaccgaccggtggtacctcacccttaccgagtcggcgacacagtgtgggtccgccgacaccagactaagaacctagaacctcgctggaaaggaccttacacagtcctgctgaccacccccaccgccctcaaagtagacggcatcgcagcttggatacacgccgcccacgtgaaggctgccgaccccgggggtggaccatcctctagactgccggatccGCCGCCACCATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAAGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCTGAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCCACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGATGTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTGGCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATTAGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTtaaagatctagatccggattagtccaatttgttaaagacaggatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaaatacataactgagaatagagaagttcagatcaaggtcaggaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtccagccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcacatgcagcatgtatcaaaattaatttggttttttttcttaagtatttacattaaatggccatagtacttaaagttacattggcttccttgaaataaacatggagtattcagaatgtgtcataaatatttctaattttaagatagtatctccattggctttct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(SEQ ID NO: 307) |
SB06252 | 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(SEQ ID NO: 308) |
SB06257 (GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM)) | aagcttgaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgaggtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccgggGCCGCCACCATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAAGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCTGAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCCACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGATGTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTGGCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATTAGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttccatggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacgtccttctgctacgtcccttcggccctcaatccagcggaccttccttcccgcggcctgctgccggctctgcggcctcttccgcgtcttcgccttcgccctcagacgagtcggatctccctttgggccgcctccccgcctggagaattcgatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccggccgcttcgagcagacatgataagatacattgatgagtttggacaaaccacaactagaatgcagtgaaaaaaatgctttatttgtgaaatttgtgatgctattgctttatttgtaaccattataagctgcaataaacaagttaacaacaacaattgcattcattttatgtttcaggttcagggggagatgtgggaggttttttaaagcaagtaaaacctctacaaatgtggtaaaatcgataaggatcgggtacccgtgtatc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(SEQ ID NO: 309) |
SB06258(GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vH - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vL - CD8FA (鉸鏈) - CD8 (TM) - CD28 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM)) | aagcttgaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgaggtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccgggGCCGCCACCATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCTGGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCTGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAATCTGGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGACATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGGCGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCCAGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttccatggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacgtccttctgctacgtcccttcggccctcaatccagcggaccttccttcccgcggcctgctgccggctctgcggcctcttccgcgtcttcgccttcgccctcagacgagtcggatctccctttgggccgcctccccgcctggagaattcgatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccggccgcttcgagcagacatgataagatacattgatgagtttggacaaaccacaactagaatgcagtgaaaaaaatgctttatttgtgaaatttgtgatgctattgctttatttgtaaccattataagctgcaataaacaagttaacaacaacaattgcattcattttatgtttcaggttc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SB06298 | 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(SEQ ID NO: 312) |
SB06255 | 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(SEQ ID NO: 313) |
SB06294(IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z mut (ICD)) | aagctttgctcttaggagtttcctaatacatcccaaactcaaatatataaagcatttgacttgttctatgccctagggggcggggggaagctaagccagctttttttaacatttaaaatgttaattccattttaaatgcacagatgtttttatttcataagggtttcaatgtgcatgaatgctgcaatattcctgttaccaaagctagtataaataaaaatagataaacgtggaaattacttagagtttctgtcattaacgtttccttcctcagttgacaacataaatgcgctgctgagaagccagtttgcatctgtcaggatcaatttcccattatgccagtcatattaattactagtcaattagttgatttttatttttgacatatacatgtgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaaatacataactgagaatagaaaagttcagatcaaggtcaggaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtccagccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatggatcttatatggggcacccccgccccttgtaaacttccctgaccctgacatgacaagagttactaacagcccctctctccaagctcacttacaggctctctacttagtccagcacgaagtctggagacctctggcggcagcctaccaagaacaactggaccgaccggtggtacctcacccttaccgagtcggcgacacagtgtgggtccgccgacaccagactaagaacctagaacctcgctggaaaggaccttacacagtcctgctgaccacccccaccgccctcaaagtagacggcatcgcagcttggatacacgccgcccacgtgaaggctgccgaccccgggggtggaccatcctctagactgccggatccGCCGCCACCATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAAGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCTGAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCCACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGATGTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTGGCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATTAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCtaaagatctagatccggattagtccaatttgttaaagacaggatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaaatacataactgagaatagagaagttcagatcaaggtcaggaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggaacagctgaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtccagccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcacatgcagcatgtatcaaaattaatttggttttttttcttaagtatttacattaaatggccatagtacttaaagttacattggcttccttgaaataaacatggagtattcagaatgtgtcataaatatttctaattttaagatagtatctccattggctttctactttttct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(SEQ ID NO: 314) |
SB06692 | 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(SEQ ID NO: 315) |
SB06261 | 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(SEQ ID NO: 316) |
如上文所述針對構築體之表現評估包含CAR之NK細胞,該等CAR包含OX40跨膜(TM)及共刺激(co-stim)結構域(SB06251、SB06257及SB06254)。如藉由流式細胞術所確定之結果示於
圖 13A 及圖 13B中。如上文所述量測經分泌IL-15;結果彙總於
圖 14A及
圖 14B中。為了評估靶細胞群體之殺傷,如上文所述確定細胞生長(
圖 15A及
圖 15B)。
亦評估藉由包含SB06257之NK細胞之系列殺傷。在第0天、第2天及第5天添加靶細胞,且使用Incucyte計算Huh7靶細胞計數。結果示於
圖 16中。
如上文所述針對構築體之表現評估包含CAR之NK細胞,該等CAR包含CD28共刺激(co-stim)結構域(SB06252、SB06258及SB06255)。如藉由流式細胞術FACS所確定之結果示於
圖 17A及圖
17B中。如上文所述量測經分泌IL-15;結果彙總於
圖 18A及
圖 18B中。為了評估靶細胞群體之殺傷,如上文所述確定細胞生長(
圖 19A及
圖 19B)。
亦評估藉由包含SB06252及SB06258之NK細胞之系列殺傷。在第0天、第2天及第5天添加靶細胞,且使用Incucyte計算Huh7靶細胞計數。結果示於
圖 20中。
篩選雙順反子構築體
在retronectin包被之非TC 24孔板上,在新近輻照之mbIL21/IL15 K562飼養細胞存在下擴增0.5e6個NK供體7B細胞。於32℃下在800 g下實施旋轉接種2 hr。對於病毒轉導,添加300 µl病毒,總轉導體積為500 µl。
將細胞在相同的板中培養整個擴增期,最終體積為2 ml。如上文所述實施三次部分培養基交換,接著在功能分析中評估表現且使用細胞。表現及針對靶細胞之細胞毒性之結果示於
表 8中。如所示,SB06261、SB6294及SB6298顯示出如藉由流式細胞術所確定之良好CAR及IL-15表現水準以及在系列殺傷分析(n=2)中之良好細胞毒性。流式細胞術表現資料示於
圖 21A及
圖 21B中,IL-15水準示於
圖 22A及
圖 22B中,且靶細胞群體之細胞生長(作為藉由NK細胞之細胞殺傷之量度)示於
圖 23A及
圖 23B中。
由於SB06294 (具有crIL15 2A OX40 CAR設計之逆轉錄病毒載體)在功能分析中之高CAR及IL-15表現及效能,因此選擇其用於進一步研究。
表 8.
TACE-OPT 構築體之分析
SB編號 | 病毒 | 插入物1 | 2A | 插入物2 | 實驗編號 | CAR% | mbIL15% | 雙+ % | sIL15 (pg/mL) | 第1輪 | 第2輪 | 第3輪 |
6261 | Sinvec | crIL15 TACE-10 | E2A T2A | CD28 | CARn-173 | 37 | 32 | 24.5 | 62 | 9.8 | 8.5 | 16.6 |
CARn-174 | 63.3 | 49 | 46 | 36 | 9.5 | 39 | 100 | |||||
6294 | Retrovec | crIL15 TACE-10 | E2A T2A | OX40-CD3 alt | CARn-173 | 59.8 | 38.7 | 32.8 | 50 | 8.8 | 7.7 | 8 |
CARn-174 | 74 | 53 | 52 | 27 | 9.2 | 32 | 98 | |||||
6298 | Sinvec | CD28-CD3 alt | E2A T2A | crIL15 TACE-10 | CARn-173 | 48.7 | 27.9 | 23.1 | 75 | 5.3 | 3.6 | 6.2 |
CARn-174 | 65 | 39 | 39 | 82 | 13.8 | 41 | 98 |
如上文所述,針對CAR及IL-15表現、CNA分析及用於經分泌細胞介素之酬載分析來分析包含TACE10切割位點之雙順反子TACE-OPT構築體。對TACE10切割位點進行修飾,以增加切割動力學,從而產生「TACE-OPT」,其與親本TACE10相比,產生更高之細胞介素分泌水準。針對CAR及IL-15表現以及IL-12誘導來分析三順反子構築體。
簡言之,在retronectin包被之非TC 24孔板上,在新近輻照之mbIL21/IL15 K562飼養細胞存在下擴增0.5e6個NK供體7B細胞。於32℃下在800 g下實施旋轉接種2 hr。對於病毒轉導,添加300 µl病毒,總轉導體積為500 µl。
藉由流式細胞術針對CAR及IL-15之表現來評估雙順反子構築體SB6691 (包含41BB共刺激結構域)、SB6692 (包含OX40共刺激結構域)及SB6693 (包含CD28共刺激結構域) (
圖 24A)。每個細胞之各構築體之拷貝數示於
表 9中。在轉導後48小時及24週,如上文所述對IL-15分泌進行定量(
圖 24B)。所測試之TACE-OPT構築體具有類似之表現水準及細胞介素分泌,而SB06692 (包含OX40共刺激結構域)具有最高CAR表現。
表 9.
拷貝數 | YP7 [CAR] ( 拷貝/ 細胞) | IL-15 ( 拷貝/ 細胞) | WPRE ( 拷貝/ 細胞) |
SB06691 | 116.6 | 120.2 | 147.2 |
SB06692 | 308.3 | 318.3 | 313.0 |
SB06693 | 48.8 | 49.4 | 57.6 |
SB06258、SB06257、SB06294及SB06692在活體外展示高CAR表現、高crIL-15表現(膜結合的及分泌的兩者)及高系列殺傷功能。
實例 4 : IL12 自編碼可調控、可切割釋放 IL12 及合成轉錄因子之雙向構築體之表現
評估用編碼可調控、可切割釋放IL12及合成轉錄因子之雙向構築體轉導之NK細胞的IL12表現,如上文實例3中所述實施轉導。可調控、可切割之IL12可操作地連接至合成轉錄因子反應性啟動子,該啟動子包括ZF-10-1結合位點及最小啟動子序列。合成轉錄因子包括DNA結合結構域及轉錄活化結構域。在DNA結合結構域與轉錄活化結構域之間係可由蛋白酶抑制劑調控之蛋白酶結構域及用於該蛋白酶之同源切割位點。在缺失蛋白酶抑制劑之情況下,蛋白酶在切割位點處誘導切割,產生非功能性合成轉錄因子。在存在蛋白酶抑制劑之情況下,合成轉錄因子不受切割且因此能夠調節可切割IL12之表現。編碼可切割釋放IL12之表現盒包括包含IL12及跨膜結構域之嵌合多肽。在IL12與跨膜結構域之間係可由為NK細胞內源之蛋白酶切割的蛋白酶切割結構域。編碼可切割釋放IL12之雙向構築體之草圖示於
圖 25中。本文所測試之構築體之參數彙總於
表 10中。所測試之設計包括:可切割釋放IL12 (crIL12)調控之構築體(32種所測試之構築體)、可溶性IL12 (sIL12)調控及/或WPRE及聚A +不同去穩定結構域(32種所測試之構築體)、去穩定結構域及/或WPRE及聚A (26種所測試之構築體)。初始研究證實通常歸因於IL-12之滲漏表現之毒性,導致轉導後之差NK細胞活力及擴增(資料未顯示)。設計篩選,以通過修改表10中之參數來發現可克服或降低IL-12相關毒性之構築體。篩選準則之彙總示於
表 11A中。鑑別出適宜候選物SB05058及SB05042 (兩種γ逆轉錄病毒載體)及SB04599 (慢病毒載體)。該等候選物之彙總提供於
表 11B中。
表 10.
表 11A.
表 11B.
所測試之參數 | ||||
啟動子 | ZF 拷貝 | IL12 | 效應物結構域定向 | 修飾 |
SFFV | 10-1 | crIL12 CD16 | N末端 | UTR |
SV40 | 5-7 | crIL12 TACE 10 | C末端 | 去穩定結構域 |
sIL12 | 去除WPRE/聚A |
篩選 | |
度量 | 建議 |
活體外24小時內0.1 μM GRZ下之IL12誘導 | >50倍 >1000 pg/ml |
轉導後10天之NK細胞活力 | >75% |
10天內之擴增倍數(中等規模,6孔G-rex) | > 10倍(研究) |
候選物 | |||||
病毒載體 | SB 編號 | ZF | IL12 | NS3 啟動子 | 效應物結構域定向 |
Gamma retro | SB05058 | 5-7 | CD16 crIL12 | SV40 | C末端 |
Gamma retro | SB05042 | 5-7 | CD16 crIL12 | SV40 | N末端 |
Lenti | SB04599 | 10-1 | 1X SLDE sIL12 | SFFV | C末端 |
實施γ逆轉錄病毒載體及慢病毒載體之評估。量測IL12分泌之格拉瑞韋(GRZ)劑量反應分析證實兩種γ逆轉錄病毒構築體與慢病毒構築體相比皆顯示出更高的對GRZ之敏感性(
圖 26及
表 12A)。
表 12A.
u.d = <5 pg/ml,不可偵測
[GRZ] µM | SB04599 | SB05042 | SB05058 |
2 | 1762.68 | 10629.99 | 7167.37 |
0.6 | 1387.37 | 8722.87 | 10922.93 |
0.16 | 514.02 | 2031.82 | 1470.22 |
0.05 | 112.14 | 173.44 | 151.69 |
0.013 | 4.80 | 31.57 | 29.72 |
0.004 | u.d | 28.48 | 35.83 |
0.001 | u.d | 28.48 | 14.83 |
0 | u.d | 11.27 | 17.56 |
在NK細胞轉導後10天確定構築體表現及細胞活力。結果示於
表 12B中且展示高於10倍之於中等規模板中之細胞擴增、高於85%之活力及大於2個拷貝/細胞。γ逆轉錄病毒載體展示高於慢病毒載體之NK細胞轉導效率,特別對於所測試之雙向載體而言。
表 12B.
病毒載體 | SB 編號 | MOI | 活力(%) | 擴增倍數 | CNA ( 平均拷貝/ 細胞) |
NV | n/a | 88 | 29.9 | n/a | |
Lenti | 4599 | 29.7 | 89 | 19.6 | 1.0 |
Gamma retro | 5042 | 83.5 | 89 | 15.1 | 1.6 |
Gamma retro | 5058 | 0.8 | 86 | 11.6 | 1.8 |
另外,在活體內評估IL12誘導。簡言之,以15e6個細胞之劑量以200 µL體積,對小鼠靜脈內注射經轉導之NK細胞。在注射後24小時收集血液且分析IL12表現水準。SB05042及SB05058顯示最高IL12誘導倍數。在10 mg/kg劑量組中未觀察到誘導(資料未顯示)。確定所有構築體在小鼠血液中之hNK%百分比皆小於2%。結果彙總於
表 12C中。IL12水準示於
圖 27A中且倍數變化示於
圖 27B中。
表 12C.
病毒載體 | SB 編號 | - GRZ (pg/ml) | + GRZ (pg/ml) | 倍數變化 |
NV | 0.6 | 1.35 | 1.35 | |
Lenti | 4599 | 1.35 | 14.16 | 9.30 |
Gamma retro | 5042 | 0.71 | 49.0 | 48.99 |
Gamma retro | 5058 | 1.0 | 117.62 | 118.12 |
γ逆轉錄病毒載體(SB05042及SB05058)與慢病毒載體(SB04599)相比,展示出活體外優越之IL12誘導,同時維持轉導後之良好活力及細胞生長。重要的是,兩種所測試之γ逆轉錄病毒載體皆在活體內NK細胞中顯示IL12誘導。
本實例中所述構築體之全長序列示於
表 13中。
表 13.
實例 5 : GPC3 CAR / IL15 表現構築體之篩選
構築體 | 全核苷酸序列 |
SB05042 (B7-1 (TM) - CD16 TACE (切割位點) - IL12 - YB_TATA ZFBD (合成啟動子) - A2 (絕緣子) - SV40 (啟動子) - Syn TF (NLS +微型VPR活化結構域+ NS3蛋白酶+ ZFBD DNA結合結構域) | aagcttggaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgagtccccagcatgcctgctattctcttcccaatcctcccccttgctgtcctgccccaccccaccccccagaatagaatgacacctactcagacaatgcgatgcaatttcctcattttattaggaaaggacagtgggagtggcaccttccagggtcaaggaaggcacgggggaggggcaaacaacagatggctggcaactagaaggcacagttacttaCACAGGCCGCACAGATTCTCTCCGCAGCCGTTCGTTTCTTCTCCGCTCTCTGCACCGAGGGGCGAAGCAGTAGGTCAGGCAACAGATCACGAAGATGCCGTTCACGGAGATCAGTGTGATGGCCCAGCTTGGCAGCAGTTGAAGAGATCCACCGCCACTGCCACCGCCGCCACTACCGCCACCAAAGAAGCTGGAGATTGTAGACACGGCGAGTCCCTGTGTAATTCCAGATCCTCCGCCTCCGCTACCACCTCCGCCGCTAGAGGCGTTCAGGTAGCTCATCACTCTGTCGATGGTCACGGCTCTGATCCGGAAGGCGTGCAGCAGGATGCACAGCTTGATCTTGGTCTTGTAGAAGTCGGGTTCTTCCAGGCTAGACTTCTGGGGCACTGTCTCGCTGTTGAAGTTCAGGGCCTGCATCAGCTCGTCGATCACGGCCAGCATATTCTGGTCCAGGAAGATCTGCCGCTTGGGGTCCATCAGCAGCTTGGCGTTCATGGTCTTGAATTCCACCTGGTACATCTTCAGGTCCTCGTAGATGCTGCTCAGGCACAGGGCCATCATGAAGGAGGTCTTTCTGCTGGCCAGGCAAGAGCCGTTGGTGATGAAGCTGGTTTCCCGGCTGTTCAGGCAGCTCTCGTTCTTGGTCAGTTCCAGAGGCAGGCAGGCTTCCACGGTGCTGGTCTTATCCTTGGTGATGTCCTCGTGGTCGATTTCCTCGCTGGTGCAGGGGTAGAATTCCAGGGTCTGTCTGGCCTTCTGCAGCATGTTGGACACGGCTCTCAGCAGGTTCTGGCTGTGGTGCAGACAAGGGAACATGCCAGGATCAGGAGTGGCCACAGGCAGGTTTCTAGATCCGCCGCCAGATCCACCACCTGATCCGCCACCGCTTCCTCCGCCAGAACATGGCACGCTGGCCCATTCGCTCCAAGAGCTGCTGTAGTACCGGTCCTGGGCTCTGACGCTGATGCTGGCGTTCTTTCTGCAGATCACGGTGGCGCTGGTCTTGTCGGTGAACACCCGGTCCTTTTTCTCGCGCTTGGACTTGCCCTGCACTTGCACGCAAAAGGTCAGGCTGAAGTAGCTGTGGGGTGTAGACCAGGTGTCGGGGTACTCCCAGGACACTTCCACCTGTCTGCTGTTCTTCAGAGGCTTCAGCTGCAGGTTCTTTGGAGGATCGGGCTTGATGATGTCCCGGATGAAAAAGCTGGAGGTGTAGTTCTCGTACTTCAGCTTGTGCACGGCGTCCACCATCACTTCGATAGGCAGAGACTCTTCGGCGGCTGGACAGGCGCTGTCCTCTTGGCATTCCACGCTGTACTCGTATTCTTTGTTGTCGCCCCGCACTCTTTCGGCAGACAGTGTAGCGGCGCCACATGTAACGCCCTGAGGATCACTGCTGCCTCTGCTGGACTTCACGCTGAAGGTCAGGTCGGTGCTGATGGTGGTCAGCCACCAACATGTGAACCGGCCGCTGTAGTTCTTGGCCTCGCATCTCAGGAAGGTCTTGTTCTTGGGCTCTTTCTGGTCCTTCAGGATGTCGGTGCTCCAAATGCCATCCTCTTTCTTGTGGAGCAGCAGCAGGCTGTGGCTCAGCACTTCTCCGCCTTTGTGACAGGTGTACTGGCCGGCGTCGCCAAACTCTTTCACTTGGATGGTCAGGGTCTTGCCGCTGCCGAGCACCTCGCTAGACTGATCCAGTGTCCAGGTGATGCCGTCCTCTTCAGGGGTATCGCAGGTCAGCACCACCATCTCGCCAGGAGCATCGGGATACCAGTCCAGTTCCACCACGTACACGTCTTTCTTCAGCTCCCAGATGGCCACCAGAGGAGAGGCCAGGAACACCAGGCTGAACCAGCTGATGACCAGCTGCTGGTGACACATCATGGTGGCGACACCGGTACGCGTTGGCCCCCATTATATACCCTCTAGAACTAGTtatccactccgtgtaagggagagtgagcctcttacgaatcTTCGGCGTCGACTGCTTCattccgaggcgactgataccTTCGGCGTCGACTGCTTCatacgaaggcagtccgattcTTCGGCGTCGACTGCTTCaacctttactgagacgggacTTCGGCGTCGACTGCTTCaaaggcgttgcgaatcctcatgcgattgttacgaaacccgTTAATTAAAGAGCGAGATTCCGTCTCAAAGAAAAAAAAAGTAATGAAATGAATAAAATGAGTCCTAGAGCCAGTAAATGTCGTAAATGTCTCAGCTAGTCAGGTAGTAAAAGGTCTCAACTAGGCAGTGGCAGAGCAGGATTCAAATTCAGGGCTGTTGTGATGCCTCCGCAGACTCTGAGCGCCACCTGGTGGTAATTTGTCTGTGCCTCTTCTGACGTGGAAGAACAGCAACTAACACACTAACACGGCATTTACTATGGGCCAGCCATTGTCCATCTAGATGGccgataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagctgcaGTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAAGGATCCGCCACCATGCCCAAGAAAAAGCGGAAGGTGGACGCCCTGGACGACTTCGATCTGGATATGCTGGGCAGCGACGCTCTGGATGATTTTGACCTGGACATGCTCGGCTCTGATGCACTCGACGATTTCGACCTCGATATGTTGGGATCTGATGCCCTTGATGACTTTGATCTCGACATGTTGATCAATAGCCGGTCCAGCGGCAGCCCCAAGAAGAAGAGAAAAGTCGGCTCTGGCGGCGGATCTGGCGGTTCTGGATCTGTTTTGCCCCAAGCTCCTGCTCCTGCACCAGCTCCAGCTATGGTTTCTGCTCTGGCTCAGGCTCCAGCTCCTGTGCCTGTTCTTGCTCCTGGACCTCCTCAGGCTGTTGCTCCACCAGCACCTAAACCTACACAGGCCGGCGAGGGAACACTGTCTGAAGCTCTGCTGCAGCTCCAGTTCGACGACGAAGATCTGGGAGCCCTGCTGGGCAATAGCACAGATCCTGCCGTGTTCACCGATCTGGCCAGCGTGGACAATAGCGAGTTCCAGCAGCTCCTGAACCAGGGCATTCCTGTGGCTCCTCACACCACCGAGCCTATGCTGATGGAATACCCCGAGGCCATCACCAGACTGGTCACCGGTGCTCAAAGACCACCTGATCCGGCTCCAGCACCTCTTGGAGCACCTGGACTGCCTAATGGACTGCTGTCTGGCGACGAGGACTTCAGCTCTATCGCCGA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(SEQ ID NO: 317) |
SB05058 | 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(SEQ ID NO: 318) |
SB04599 | acgcgtgtagtcttatgcaatactcttgtagtcttgcaacatggtaacgatgagttagcaacatgccttacaaggagagaaaaagcaccgtgcatgccgattggtggaagtaaggtggtacgatcgtgccttattaggaaggcaacagacgggtctgacatggattggacgaaccactgaattgccgcattgcagagatattgtatttaagtgcctagctcgatacataaacgggtctctctggttagaccagatctgagcctgggagctctctggctaactagggaacccactgcttaagcctcaataaagcttgccttgagtgcttcaagtagtgtgtgcccgtctgttgtgtgactctggtaactagagatccctcagacccttttagtcagtgtggaaaatctctagcagtggcgcccgaacagggacctgaaagcgaaagggaaaccagagctctctcgacgcaggactcggcttgctgaagcgcgcacggcaagaggcgaggggcggcgactggtgagtacgccaaaaattttgactagcggaggctagaaggagagagatgggtgcgagagcgtcagtattaagcgggggagaattagatcgcgatgggaaaaaattcggttaaggccagggggaaagaaaaaatataaattaaaacatatagtatgggcaagcagggagctagaacgattcgcagttaatcctggcctgttagaaacatcagaaggctgtagacaaatactgggacagctacaaccatcccttcagacaggatcagaagaacttagatcattatataatacagtagcaaccctctattgtgtgcatcaaaggatagagataaaagacaccaaggaagctttagacaagatagaggaagagcaaaacaaaagtaagaccaccgcacagcaagcggccactgatcttcagacctggaggaggagatatgagggacaattggagaagtgaattatataaatataaagtagtaaaaattgaaccattaggagtagcacccaccaaggcaaagagaagagtggtgcagagagaaaaaagagcagtgggaataggagctttgttccttgggttcttgggagcagcaggaagcactatgggcgcagcctcaatgacgctgacggtacaggccagacaattattgtctggtatagtgcagcagcagaacaatttgctgagggctattgaggcgcaacagcatctgttgcaactcacagtctggggcatcaagcagctccaggcaagaatcctggctgtggaaagatacctaaaggatcaacagctcctggggatttggggttgctctggaaaactcatttgcaccactgctgtgccttggaatgctagttggagtaataaatctctggaacagattggaatcacacgacctggatggagtgggacagagaaattaacaattacacaagcttaatacactccttaattgaagaatcgcaaaaccagcaagaaaagaatgaacaagaattattggaattagataaatgggcaagtttgtggaattggtttaacataacaaattggctgtggtatataaaattattcataatgatagtaggaggcttggtaggtttaagaatagtttttgctgtactttctatagtgaatagagttaggcagggatattcaccattatcgtttcagacccacctcccaaccccgaggggacccgacaggcccgaaggaatagaagaagaaggtggagagagagacagagacagatccattcgattagtgaacggatctcgacggtATCGGTtaacTTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAGTAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAATTTTCGGGGGATCaGCGGAATTCtagagtcgcggccgctccccagcatgcctgctattctcttcccaatcctcccccttgctgtcctgccccaccccaccccccagaatagaatgacacctactcagacaatgcgatgcaatttcctcattttattaggaaaggacagtgggagtggcaccttccagggtcaaggaaggcacgggggaggggcaaacaacagatggctggcaactagaaggcacagCTGTTTAAATATTAAACAGggaaccgatgtGTTTAAACTAGAGTCGCGGCCTCAGTCAGTCACGCATGCCTGCAGTttaACTGGCGTTCAGGTAGGACATCACGCGGTCAATGGTCACGGCTCGAATGCGGAAAGCGTGCAACAGGATGCACAGCTTGATCTTGGTCTTGTAGAAGTCCGGTTCTTCCAGGCTGGACTTTTGAGGCACAGTCTCGGAGTTGAAATTCAGGGCCTGCATCAGTTCATCAATCACGGCGAGCATATTCTGGTCCAGGAAGATCTGCCGCTTCGGGTCCATGAGCAGCTTGGCGTTCATGGTCTTGAACTCGACCTGATACATCTTCAGATCTTCGTAGATCGAGGAAAGACAGAGCGCCATCATGAATGAGGTCTTTCTCGACGCCAGGCAGCTGCCGTTAGTGATAAAGCTTGTCTCGCGGGAGTTCAGACACGATTCGTTCTTGGTCAGTTCCAGCGGCAGGCAGGCTTCCACGGTCGAGGTCTTGTCCTTGGTGATGTCCTCGTGATCAATTTCTTCCGAGGTGCAGGGGTAGAACTCAAGGGTCTGGCGGGCCTTCTGCAACATGTTCGACACAGCCCTCAGGAGGTTTTGGGAGTGGTGTAGGCACGGGAACATTCCAGGGTCGGGGGTTGCCACAGGGAGGTTCCGGGAACCTCCTCCGGAGCCTCCTCCTGAACCTCCGCCTGATCCGCCACCGGAACAAGGCACGCTGGCCCATTCGCTCCAGGAGGACGAGTAGTATCTATCCTGCGCCCGGACGCTGATTGACGCGTTCTTCCGACAAATCACAGTGGCGGAGGTTTTGTCGGTGAACACCCGGTCTTTCTTCTCCCGTTTGGACTTTCCCTGCACTTGCACACAGAAAGTGAGCGAGAAGTATGAGTGCGGGGTGCTCCAAGTGTCTGGATATTCCCAAGACACTTCCACTTGGCGGGAGTTCTTGAGTGGCTTCAGCTGCAAGTTCTTGGGGGGGTCAGGCTTGATGATGTCGCGGATAAAGAAGGAGGAAGTGTAGTTCTCGTATTTCAGCTTATGCACGGCATCGACCATGACCTCGATAGGCAGGGACTCTTCCGCGGCAGGGCAGGCGCTGTCCTCCTGGCATTCCACGGAGTACTCATATTCCTTGTTGTCTCCCCTGACTCTCTCGGCGGACAGAGTGGCGGCTCCACAGGTCACGCCCTGAGGATCGCTTGATCCCCGTGACGACTTCACGGAGAAAGTCAGGTCGGTGGAGATTGTCGTCAGCCACCAACAGGTGAACCGACCGCTGTAGTTCTTGGCTTCGCAGCGGAGGAAGGTCTTGTTCTTCGGTTCTTTTTGGTCCTTGAGGATGTCAGTGGACCAGATTCCATCCTCTTTCTTGTGCAGCAGCAGCAGGGAGTGGGACAGCACTTCGCCACCCTTGTGGCAAGTGTACTGGCCCGCGTCGCCGAACTCCTTGACTTGAATGGTCAGGGTCTTTCCGCTTCCGAGCACCTCGGAGCTCTGATCCAGGGTCCAGGTTATGCCGTCCTCTTCTGGCGTATCGCAAGTCAGCACGACCATTTCTCCAGGGGCGTCCGGGTACCAATCCAGCTCGACCACGTAGACGTCCTTCTTCAGTTCCCAAATGGCGACCAGAGGGGAAGCGAGGAACACAAGGGAGAACCAGGAGATGACGAGTTGCTGATGGCACATCATGGTGGCGACACCGGTACGCGTTGGCCCCCATTATATACCCTCTAGAACTAGTtatccactccgtgtaagggagagtgagcctcttacgaatgCGCGACATCGGCTACGCCgttccgaggcgactgatacgCGCGACATCGGCTACGCCgtacgaaggcagtccgattgCGCGACATCGGCTACGCCgacctttactgagacgggagCGCGACATCGGCTACGCCgaaggcgttgcgaatcctcatgcgattgttacgaaacccgTTAATTAAAGAGCGAGATTCCGTCTCAAAGAAAAAAAAAGTAATGAAATGAATAAAATGAGTCCTAGAGCCAGTAAATGTCGTAAATGTCTCAGCTAGTCAGGTAGTAAAAGGTCTCAACTAGGCAGTGGCAGAGCAGGATTCAAATTCAGGGCTGTTGTGATGCCTCCGCAGACTCTGAGCGCCACCTGGTGGTAATTTGTCTGTGCCTCTTCTGACGTGGAAGAACAGCAACTAACACACTAACACGGCATTTACTATGGGCCAGCCATTGTCCATCTAGATGGccgataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagctgcagtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccgggGGATCCGCCACCATGCCCAAGAAGAAGCGGAAGGTTTCCCGGCCTGGCGAGAGGCCTTTCCAGTGCAGAATCTGCATGCGGAACTTCAGCAGACGGCACGGCCTGGACAGACACACCAGAACACACACAGGCGAGAAACCCTTCCAGTGCCGGATCTGTATGAGAAATTTCAGCGACCACAGCAGCCTGAAGCGGCACCTGAGAACCCATACCGGCAGCCAGAAACCATTTCAGTGTAGGATATGCATGCGCAATTTCTCCGTGCGGCACAACCTGACCAGACACCTGAGGACACACACCGGGGAGAAGCCTTTTCAATGTCGCATATGCATGAGAAACTTCTCTGACCACTCCAACCTGAGCCGCCACCTCAAAACCCACACCGGCTCTCAAAAGCCCTTCCAATGTAGAATATGTATGAGGAACTTTAGCCAGCGGAGCAGCCTCGTGCGCCATCTGAGAACTCACACTGGCGAAAAGCCGTTTCAATGCCGTATCTGTATGCGCAACTTTAGCGAGAGCGGCCACCTGAAGAGACATCTGCGCACACACCTGAGAGGCAGCGAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGAAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTATCGGTACATCGGCAGCAGCGGCACAGGCTGTGTTGTGATCGTGGGCAGAATCGTGCTGAGCGGCTCTGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGCACAAGAACAATCGCCTCTCCAAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCACGACGCTCTTGATGACTTTGACCTGGATATGCTCGGATCAGATGCCCTGGACGATTTCGATCTGGACATGTTGGGGTCTGATGCTCTCGACGACTTCGATCTGGATATGCTTGGAAGTGACGCGCTGGATGATTTCGACCTTGACATGCTCATCAATTCTCGATCCAGTGGAAGCCCGAAAAAGAAACGCAAGGTGGGAAGTGGGGGCGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTGTATTGCCTCAAGCTCCCGCGCCCGCTCCTGCTCCGGCAATGGTTTCAGCTCTGGCACAAGCTCCAGCTCCAGTGCCTGTGCTCGCCCCTGGCCCTCCGCAGGCCGTAGCACCTCCCGCCCCCAAACCGACGCAAGCCGGTGAGGGGACTCTCTCTGAAGCCTTGCTGCAGCTTCAGTTCGATGATGAAGATCTGGGCGCGCTCTTGGGGAACAGCACGGATCCGGCAGTATTTACGGACCTCGCATCAGTTGACAATAGTGAATTTCAACAACTTCTTAACCAGGGAATACCGGTTGCGCCCCATACGACGGAACCTATGCTGATGGAGTACCCTGAAGCTATAACCAGACTCGTAACTGGCGCCCAACGCCCGCCCGACCCGGCTCCTGCGCCGCTGGGTGCGCCGGGTCTTCCGAATGGTCTTCTCTCAGGGGACGAAGATTTCAGTTCCATTGCGGATATGGACTTTTCCGCGCTCCTGAGTGGGGGTGGCTCTGGAGGCTCTGGTTCCGACCTCAGCCATCCTCCACCGAGAGGACACCTCGACGAGCTGACAACCACCCTCGAAAGTATGACGGAAGATCTGAACTTGGATTCCCCCCTTACCCCAGAACTGAATGAAATCCTCGATACGTTCTTGAACGATGAGTGCCTTTTGCACGCCATGCATATATCAACAGGTTTGTCTATCTTCGACACGTCCCTCTTTTGAGTCGACAATCAACCTCtggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaaatcatcgtcctttccttggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacgtccttctgctacgtcccttcggccctcaatccagcggaccttccttcccgcggcctgctgccggctctgcggcctcttccgcgtctacgccttcgccctcagacgagtcggatctccctttgggccgcctccccgcctggtacctttaagaccaatgacttacaaggcagctgtagatcttagccactttttaaaagaaaaggggggactggaagggctaattcactcccaacgaaaataagatctgctttttgcttgtactgggtctctctggttagaccagatctgagcctgggagctctctggctaactagggaacccactgcttaagcctcaataaagcttgccttgagtgcttcaagtagtgtgtgcccgtctgttgtgtgactctggtaactagagatccctcagacccttttagtcagtgtggaaaatctctagcagtagtagttcatgtcatcttattattcagtatttataacttgcaaagaaatgaatatcagagagtgagaggaacttgtttattgcagcttataatggttacaaataaagcaatagcatcacaaatttcacaaataaagcatttttttcactgcattctagttgtggtttgtccaaactcatcaatgtatcttatcatgtctggctctagctatcccgcccctaactccgcccagttccgcccattctccgccccatggctgactaattttttttatttatgcagaggccgaggccgcctcggcctctgagctattccagaagtagtgaggaggcttttttggaggcctagacttttgcagagacggcccaaattcgtaatcatggtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaagcctggggtgcctaatgagtgagctaactcacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcactgactcgctgcgctcggtcgttcggctgcggcgagcggtatcagctcactcaaaggcggtaatacggttatccacagaatcaggggataacgcaggaaagaacatgtgagcaaaaggccagcaaaaggccaggaaccgtaaaaaggccgcgttgctggcgtttttccataggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgctcaagtcagaggtggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaagctccctcgtgcgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttctcccttcgggaagcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgtaggtcgttcgctccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcgccttatccggtaactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactggcagcagccactggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttcttgaagtggtggcctaactacggctacactagaaggacagtatttggtatctgcgctctgctgaagccagttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccgctggtagcggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctcaagaagatcctttgatcttttctacggggtctgacgctcagtggaacgaaaactcacgttaagggattttggtcatgagattatcaaaaaggatcttcacctagatccttttaaattaaaaatgaagttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagttaccaatgcttaatcagtgaggcacctatctcagcgatctgtctatttcgttcatccatagttgcctgactccccgtcgtgtagataactacgatacgggagggcttaccatctggccccagtgctgcaatgataccgcgagacccacgctcaccggctccagatttatcagcaataaaccagccagccggaagggccgagcgcagaagtggtcctgcaactttatccgcctccatccagtctattaattgttgccgggaagctagagtaagtagttcgccagttaatagtttgcgcaacgttgttgccattgctacaggcatcgtggtgtcacgctcgtcgtttggtatggcttcattcagctccggttcccaacgatcaaggcgagttacatgatcccccatgttgtgcaaaaaagcggttagctccttcggtcctccgatcgttgtcagaagtaagttggccgcagtgttatcactcatggttatggcagcactgcataattctcttactgtcatgccatccgtaagatgcttttctgtgactggtgagtactcaaccaagtcattctgagaatagtgtatgcggcgaccgagttgctcttgcccggcgtcaatacgggataataccgcgccacatagcagaactttaaaagtgctcatcattggaaaacgttcttcggggcgaaaactctcaaggatcttaccgctgttgagatccagttcgatgtaacccactcgtgcacccaactgatcttcagcatcttttactttcaccagcgtttctgggtgagcaaaaacaggaaggcaaaatgccgcaaaaaagggaataagggcgacacggaaatgttgaatactcatactcttcctttttcaatattattgaagcatttatcagggttattgtctcatgagcggatacatatttgaatgtatttagaaaaataaacaaataggggttccgcgcacatttccccgaaaagtgccacctgacgtctaagaaaccattattatcatgacattaacctataaaaataggcgtatcacgaggccctttcgtctcgcgcgtttcggtgatgacggtgaaaacctctgacacatgcagctcccggagacggtcacagcttgtctgtaagcggatgccgggagcagacaagcccgtcagggcgcgtcagcgggtgttggcgggtgtcggggctggcttaactatgcggcatcagagcagattgtactgagagtgcaccatatgcggtgtgaaataccgcacagatgcgtaaggagaaaataccgcatcaggcgccattcgccattcaggctgcgcaactgttgggaagggcgatcggtgcgggcctcttcgctattacgccagctggcgaaagggggatgtgctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacgacggccagtgccaagctg (SEQ ID NO: 319) |
評估NK細胞中GPC3 CAR/IL15表現構築體之表現及功能。將2e6個NK細胞平鋪至6孔非TC處理之retronectin包被板中。對經平鋪之NK細胞實施經由旋轉接種之單一病毒轉導(MOI = 15)。使用含有表現構築體之慢病毒或逆轉錄病毒轉導NK細胞。如
圖 28A中所見評估CAR及膜IL15之表現。用構築體
SB06257、
SB06258、
SB06294及
SB06692轉導之NK細胞在選通群體中展現出大於65%之細胞之表現。此外,
圖 28A顯示各經轉導NK細胞群體之YP7及IL15之量測拷貝數。
除評估CAR表現之外,亦使用相同的表現構築體量測經分泌之IL-15。為了量測經分泌IL-15之水準,將200,000個經轉導NK細胞懸浮於200 μL存在IL2之MACS培養基中。在轉導後48小時量測經分泌IL-15。針對各構築體量測經分泌IL-15之濃度且將結果示於
圖 28B 中。
亦評估用構築體轉導之NK細胞之系列殺傷。在第0天、第2天及第5天添加靶細胞,且在研究過程中量測靶細胞殺傷。HepG2靶細胞之系列NK細胞殺傷之結果示於
圖 28C及
圖 29A中。
圖 29B顯示HuH-7靶細胞之系列NK細胞殺傷之結果。
表 14顯示用於本研究中之例示性構築體及其組分。
表 14
實例 6 : 量測經擴增 NK 細胞中之 GPC3 CAR / IL15 表現及功能
構築體 | 基本載體 | Co-Stim | 定向 |
SB06257 | SinVec | OX40 | CAR 2A crIL15 (T10) |
SB06258 | SinVec | CD28 | CAR 2A crIL15 (T10) |
SB06294 | RetroVec | OX40 | crIL15 2A CAR (T10) |
SB06692 | SinVec | OX40 | crIL15 2A CAR (T-OPT) |
在本研究中,針對使用G-Rex (Gas快速擴增)系統擴增之NK細胞量測GPC3 CAR/IL15之表現及功能。
在兩種不同的G-Rex實驗方法中,對7日齡供體來源之7B NK細胞(mbIL21/IL15 K562飼養細胞)進行轉導及擴增。實驗1在G-Rex 6M培養容器中轉導7日齡供體7B NK細胞(mbIL21/IL15 K562飼養細胞) 11天,且在轉導後11天收穫。實驗2在G-Rex 1L培養容器中轉導7日齡供體7B NK細胞(mbIL21/IL15 K562飼養細胞) 7天,且在轉導後10天收穫。
圖 30A展示不同擴增條件對經工程改造之NK細胞中不同所關注蛋白之表現之作用。
圖 30B顯示來自源自不同實驗之NK細胞之系列殺傷分析量測結果。
表 15顯示
實例 6中實施之研究之彙總。頂部數字對應於自使用實驗1之方法擴增之NK細胞獲得的結果。底部數字對應於自使用實驗2之方法擴增之NK細胞獲得的結果。
表 15
實例 7 :在異種移植腫瘤模型中評估 GPC3 CAR / IL15 雙順反子構築體
SB 編號 | 骨架 | Co-stim | IL15 | 定向 | GPC3 CAR% | mIL15% | pg/ml sIL15 | 第1 輪- HepG2 殺傷% | 第2 輪- HepG2 殺傷% | 第3 輪- HepG2 殺傷% | CAN ( 每個細胞之拷貝) | MOI |
NV | - | - | - | - | 1.02 0.2 | 1.37 1.9 | 4.9 4.9 | 0 77.2 | 0 11.0 | 0 3.9 | - | - |
6257 | SinVec | OX40 | Tace10 | CAR/ crIL15 | 37.5 57.4 | 1.69 10.3 | 5.1 17.0 | 71.6 81.2 | 37.2 78.8 | 17.8 83.2 | 23.3 23.9 | 30.6 30.6 |
6258 | SinVec | CD28 | Tace10 | CAR/ crIL15 | 36.8 70.7 | 10.7 35.9 | 5.5 56.7 | 18.3 87.6 | 1.4 79.0 | 0 73.0 | 39.2 54.1 | 15.5 15.5 |
6294 | RetroVec | OX40 | Tace10 | crIL15/ CAR | 78.4 91.9 | 58.9 63.9 | 26.2 60.1 | 58.5 85.2 | 33.2 83.8 | 12.5 84.2 | 41.7 35.0 | 10.5 8.8 |
6692 | SinVec | OX40 | TaceOPT | crIL15/ CAR | - 78.8 | - 16.9 | - 104.5 | - 83.4 | - 83.0 | - 83.2 | - 47.5 | - 15.0 |
使用HepG2異種移植腫瘤模型評估所選經工程改造之NK細胞之活體內功能。進行兩項研究:雙倍NK劑量及三倍NK劑量。
雙倍 NK 劑量活體內異種移植腫瘤模型
在第0天將腫瘤植入NSG小鼠中。在第9天將小鼠隨機分配。在研究過程之第10天及第17天,注射NK細胞兩次。
表 16彙總研究設置。
表 16 :雙倍NK給藥活體內異種移植腫瘤模型之彙總
* 由於細胞數限制,第二劑量係約 15e6 個
腫瘤模型 | 群組名稱 | 每劑量之 NK 數 | 給藥日 |
IP HepG2, 6e6 | PBS | - | 第10天、第17天 |
無病毒(NV) | 30e6 | ||
SB06257 | |||
SB06258 | |||
SB06294* |
在本存活研究中,亦向Jackson Labs NSG小鼠每隻小鼠注射50,000 IU rhIL2,每週兩次。每週兩次進行生物發光成像(BLI)、體重及總體健康量測。在將小鼠實施安樂死後,收集腫瘤,稱重,且使用福馬林固定之石蠟包埋(FFPE)以進行組織學研究。從IP空間收集IP流體及細胞,且藉由流式細胞術評估NK細胞%。圖31彙總HepG2異種移植腫瘤模型中正規化平均BLI量測結果之倍數變化結果。SB06258與其他治療組相比,顯示出最低之正規化平均BLI,且發現與無病毒(NV)組相比,係統計學顯著的。
圖 32A顯示動物之存活曲線且
圖 32B顯示各治療組之中值存活期之彙總。發現所測試不同CAR構築體中之每一者與未經工程改造之NK細胞相比,皆係統計學顯著的。
圖 33顯示如藉助生物發光成像(BLI)所量測並觀察的用不同CAR-NK細胞治療之小鼠之時程。使此處所示之動物在治療後3天、10天、34天、48天及69天成像。在
圖 34中,將BLI量測結果正規化至第10天(第一劑量)。
三倍給藥 - 活體內 HepG2 異種移植腫瘤模型
使用HepG2異種移植腫瘤模型評估所選經工程改造之NK細胞之活體內功能。在另一活體內實驗中,在第0天將腫瘤植入NSG小鼠中。在第9天及第20天將小鼠隨機分配。在研究過程之第10天、第15天及第22天,注射(IP) 30e6個NK細胞3次。
表 17彙總研究設置。第21天,將一半小鼠安樂死。在研究之第50天將另一半小鼠安樂死。在將小鼠實施安樂死後,收集腫瘤,稱重,且使用福馬林固定之石蠟包埋(FFPE)以進行組織學研究。
表 17 :HepG2異種移植模型之研究設計
腫瘤模型 | 群組名稱 | 每劑量之NK 數 | NK 給藥日 |
IP 6e6 HepG2 | PBS | - | 第10天、第15天、第22天 |
無病毒(NV) | IP 30e6 | ||
SB06257 | |||
SB06258 | |||
SB06294 | |||
SB06692 |
在本存活研究中,亦向Jackson Labs NSG小鼠每隻小鼠注射50,000 IU rhIL2,每週兩次。每週兩次進行生物發光成像(BLI)、體重及總體健康量測。從IP空間收集IP流體及細胞,且藉由流式細胞術評估NK細胞%。
圖 35A顯示研究之第23天之代表性BLI影像。
圖 35B彙總HepG2異種移植腫瘤模型中正規化平均BLI量測結果之倍數變化結果。
在實驗不同階段評估BLI量測結果之倍數變化,以評估單劑量或雙倍劑量之經工程改造之NK細胞所具有之作用。
圖 36A顯示第13天之BLI量測結果之倍數變化,其中小鼠已經受一個劑量之經工程改造之NK細胞。
圖 36B顯示第20天之BLI量測結果之倍數變化,其中小鼠已經受兩個劑量之經工程改造之NK細胞。
來自兩次活體內實驗之結果之比較呈現於圖37A及圖37B中。在圖37A中,在異種移植模型中測試不同CAR構築體,標繪研究過程中之BLI之倍數變化。如圖37A及圖37B中所見,兩次活體內實驗展現出SB06257及SB06258之抗腫瘤功能差異。在IP HCC (HepG2+螢光素酶)異種移植模型中,GPC3 CAR- crIL-15 NK細胞療法與未經工程改造之NK細胞相比,顯示出統計學顯著的活體內抗腫瘤功效。與未經治療(PBS)及未經工程改造之NK細胞治療組相比,用經GPC3 CAR-crIL-15工程改造之NK細胞治療的所有3組皆顯示出顯著增加之存活率。
活體內異種移植模型 -NK 細胞之腫瘤內注射
另一實驗方法用於證實針對HepG2 (HCC)皮下異種移植腫瘤模型之NK介導之抗腫瘤殺傷。在本存活研究中,在第20天、第25天及第32天向小鼠注射3次3e6個NK細胞。
圖 38A展示在所注射經工程改造之NK細胞缺失或存在下小鼠中之腫瘤生長。在皮下HCC (HepG2+螢光素酶)異種移植模型內,GPC3 CAR- crIL-15 NK細胞療法與經腫瘤內注射(IT)的未經工程改造之NK細胞相比,顯示出顯著的活體內抗腫瘤功效。與未經治療(PBS)及未經工程改造之NK細胞治療組相比,用SB05605轉導之NK細胞顯示出顯著增加之存活率。
表 18提供用於腫瘤內注射NK細胞之構築體。SB05009及SB06205含有分開之IL15及GPC3 CAR,且其表現由分開之啟動子(SV40啟動子= GPC3 CAR,hPGK啟動子= IL15)驅動。此外,該等構築體定向成使得閱讀框以相反方向定向。
表 18
實例 8 :格拉瑞韋對自然殺手細胞中 IL12 之誘導之評估
SEQ ID NO: | 構築體 | 序列 |
328 | SB05009 | aagcttgaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgagtccccagcatgcctgctattctcttcccaatcctcccccttgctgtcctgccccaccccaccccccagaatagaatgacacctactcagacaatgcgatgcaatttcctcattttattaggaaaggacagtgggagtggcaccttccagggtcaaggaaggcacgggggaggggcaaacaacagatggctggcaactagaaggcacagcttaAACGGGCCGCACAGATTCTCTTCTCAGCCGTTCGTTTCTCCGCCGCTCTCTGCATCTAGGGGCGAAGCAGTAGGTCAGGCAGCAGATCACGAAGATGCCGTTCACGGAGATCAGTGTGATGGCCCAGCTAGGCAGCAGTTGCAGAGATCCGCCACCACTTCCTCCGCCTCCGCTACCGCCTCCGATCAGGCTGAAGATAGGCTCGGGTGTAACTCCGCTTCCACCTCCGCCAGATCCTCCGCCGCCAGAGCTTGTGTTGATGAACATCTGCACGATGTGCACGAAGCTCTGCAGGAACTCTTTGATATTCTTCTCTTCCAGTTCCTCGCACTCTTTGCAGCCGGACTCGGTCACATTGCCGTTGCTGCTCAGGCTGTTGTTGGCCAGGATGATCAGGTTTTCCACGGTGTCGTGGATGCTGGCGTCGCCGCTTTCCAGGCTGATCACTTGCAGTTCCAGCAGAAAGCACTTCATGGCGGTCACTTTACAGCTAGGGTGCACGTCGCTCTCGGTGTACAGTGTGGCGTCGATGTGCATGCTCTGGATCAGGTCCTCGATCTTCTTCAGGTCGCTGATCACGTTGACCCAATTGCTGTGCACTCTTGTGGCAGCGGCCACCAGAAACAGGATCCAGGTCCAGTCCATGGTGGCGGCacgcgtctggggagagaggtcggtgattcggtcaacgagggagccgactgccgacgtgcgctccggaggcttgcagaatgcggaacaccgcgcgggcaggaacagggcccacactaccgccccacaccccgcctcccgcaccgccccttcccggccgctgctctcggcgcgccctgctgagcagccgctattggccacagcccatcgcggtcggcgcgctgccattgctccctggcgctgtccgtctgcgagggtaatagtgagacgtgcggcttccgtttgtcacgtccggcacgccgcgaaccgcaaggaaccttcccgacttaggggcggagcaggaagcgtcgccggggggcccacaagggtagcggcgaagatccgggtgacgctgcgaacggacgtgaagaatgtgcgagacccagggtcggcgccgctgcgtttcccggaaccacgcccagagcagccgcgtccctgcgcaaacccagggctgccttggaaaaggcgcaaccccaaccccgaattcccgataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagctgcaGTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAAggatccgccaccATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCTGGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCTGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAATCTGGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGACATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGGCGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCCAGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGAtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggc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329 | SB05605 | aagcttgaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgagtccccagcatgcctgctattctcttcccaatcctcccccttgctgtcctgccccaccccaccccccagaatagaatgacacctactcagacaatgcgatgcaatttcctcattttattaggaaaggacagtgggagtggcaccttccagggtcaaggaaggcacgggggaggggcaaacaacagatggctggcaactagaaggcacagcttaAACGGGCCGCACAGATTCTCTTCTCAGCCGTTCGTTTCTCCGCCGCTCTCTGCATCTAGGGGCGAAGCAGTAGGTCAGGCAGCAGATCACGAAGATGCCGTTCACGGAGATCAGTGTGATGGCCCAGCTAGGCAGCAGTTGCAGAGATCCGCCACCACTTCCTCCGCCTCCGCTACCGCCTCCGATCAGGCTGAAGATAGGCTCGGGTGTAACTCCGCTTCCACCTCCGCCAGATCCTCCGCCGCCAGAGCTTGTGTTGATGAACATCTGCACGATGTGCACGAAGCTCTGCAGGAACTCTTTGATATTCTTCTCTTCCAGTTCCTCGCACTCTTTGCAGCCGGACTCGGTCACATTGCCGTTGCTGCTCAGGCTGTTGTTGGCCAGGATGATCAGGTTTTCCACGGTGTCGTGGATGCTGGCGTCGCCGCTTTCCAGGCTGATCACTTGCAGTTCCAGCAGAAAGCACTTCATGGCGGTCACTTTACAGCTAGGGTGCACGTCGCTCTCGGTGTACAGTGTGGCGTCGATGTGCATGCTCTGGATCAGGTCCTCGATCTTCTTCAGGTCGCTGATCACGTTGACCCAATTGCTGTGCACTCTTGTGGCAGCGGCCACCAGAAACAGGATCCAGGTCCAGTCCATGGTGGCGGCacgcgtctggggagagaggtcggtgattcggtcaacgagggagccgactgccgacgtgcgctccggaggcttgcagaatgcggaacaccgcgcgggcaggaacagggcccacactaccgccccacaccccgcctcccgcaccgccccttcccggccgctgctctcggcgcgccctgctgagcagccgctattggccacagcccatcgcggtcggcgcgctgccattgctccctggcgctgtccgtctgcgagggtaatagtgagacgtgcggcttccgtttgtcacgtccggcacgccgcgaaccgcaaggaaccttcccgacttaggggcggagcaggaagcgtcgccggggggcccacaagggtagcggcgaagatccgggtgacgctgcgaacggacgtgaagaatgtgcgagacccagggtcggcgccgctgcgtttcccggaaccacgcccagagcagccgcgtccctgcgcaaacccagggctgccttggaaaaggcgcaaccccaaccccgaattcccgataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagctgcaGTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAAggatccgccaccATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCTGGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCTGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGACCACCACACCAGCTCCTCGGCCACCAACTCCAGCTCCAACAATTGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCCGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGACATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCTTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCAAGCGGGGCAGAAAGAAGCTGCTGTACATCTTCAAGCAGCCCTTCATGCGGCCCGTGCAGACCACACAAGAGGAAGATGGCTGCAGCTGTCGGTTCCCCGAGGAAGAAGAAGGCGGCTGCGAGCTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttccatggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacg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tatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgaccatgattacgcc |
對於本研究,在格拉瑞韋(HCV NS3蛋白酶抑制劑)存在或缺失下量測IL12之誘導。用於本研究中之構築體先前已闡述於實例2中。兩種可調控之IL-12構築體藉由GRZ以劑量-反應方式展示出受控之crIL-12表現,且顯示低的供體間變異性。
所測試之構築體候選物在缺失GRZ (小於100 pg/ml)之情況下產生低IL-12基礎水準且藉由0.1 μM GRZ產生IL-12之大於100倍誘導(p=<0.0001)。圖39A-圖39B顯示向表現SB05042及SB05058構築體之NK細胞添加GRZ後的兩個不同時間點(分別為24小時及72小時)。
為了評估格拉瑞韋可用於在小鼠模型中以開啟至關閉還是關閉至開啟狀態轉換迴路,設計以下研究。第0天,在格拉瑞韋或媒劑存在下注射(IV) NK細胞。在第1天、第9天及第10天,注射另一劑量之格拉瑞韋或媒劑。在第2天、第9天及第11天對小鼠放血,以評估IL-12之表現。圖40顯示研究結果。在第2天,與對照相比,IL12表現在20、50及100 mg/kg GRZ存在下增加。在第9天,其中8天未發生GRZ投與,IL12之表現與第2天之取樣相比降低。在第11天,表現相對於對照再次增加。
實例 9 : GPC3 CAR / IL15 及受調控之 IL12 構築體之共轉導之評估
在用GPC/IL15構築體及受調控之IL12構築體共轉導之NK細胞中評估GPC3 CAR、IL15及IL12之功能及表現。
GPC3 CAR / IL15 之表現
測試三種構築體組合:1) SB05042 + SB0257、2) SB05042 + SB06258以及3) SB05042及SB06294。用SB05042 + SB06257或SB05042 + SB06258共轉導之NK細胞表現GPC3 CAR及IL15群體以及每個細胞類似之拷貝。用SB06294共轉導之NK細胞展現出更高之雙陽性(GPC+/IL15+)群體,以及略微降低之僅CAR之群體且具有每個細胞類似之拷貝(
圖 41)。
經分泌 IL12 及 IL15 之表現
在格拉瑞韋存在或缺失下,在NK細胞中量測測試經分泌IL12及IL15之表現。將200,000個經轉導之NK細胞懸浮於200 μL補充有IL-2之NK MACS培養基中。將格拉瑞韋以0.1 μM之莫耳濃度添加至「+」條件。將NK細胞在37℃下孵育48小時,接著量測上清液中之IL15 (
圖 42A)及IL12 (
圖 42B)濃度。IL15表現在格拉瑞韋存在下略有增加,共轉導之NK細胞在GRZ存在下,顯示出統計學顯著之IL15表現。與格拉瑞韋缺失下之12 pg/mL相比,用SB05042 +SB06257共轉導之NK細胞在格拉瑞韋存在下表現2201 pg/mL IL12 (1100倍誘導)。SB05042 +SB06258共轉導在格拉瑞韋存在下展現出1003倍誘導。SB05042 +SB06294共轉導展現出736倍誘導。3種共轉導組合與用單獨SB05042轉導之NK細胞相比係統計學顯著的。評估IL12表現,用單獨SB05042轉導之NK細胞在格拉瑞韋存在下顯示出對IL12之誘導,顯示表現之390倍增加。
系列殺傷期間之細胞介素分泌 (Huh7)
如先前所述使用用GPC3 CAR/IL15 (SB06257、SB06258、SB06294)及/或IL12構築體(SB05042)單轉導或共轉導之NK細胞實施靶細胞之系列殺傷。
在GRZ存在下,共轉導樣品維持低量IL12誘導進入第3輪。IL12及IL15二者之總體細胞介素分泌隨時間降低(圖43)。在格拉瑞韋存在下,SB05042及SB05042 + SB06257轉導在第一輪殺傷中顯示出對IL12表現之顯著誘導。在第二輪中,用不同的GPC3 CAR表現構築體(SB06257、SB06258、SB06294)及SB05042進行之3次共轉導顯示出對IL12的統計學顯著之誘導。在第三輪中,僅SB05042 + SB06257及SB05042 + SB06294顯示出顯著的IL12誘導。
用共轉導 NK 細胞進行之系列殺傷分析
使用系列殺傷分析來評估用GPC3 CAR/IL15 (SB06257、SB06258、SB06294)及/或IL12構築體(SB05042)共轉導之NK細胞之細胞殺傷作用。將用SB05042 + SB06258 (
圖 44A)、SB05042 + SB06257 (
圖 44B)及SB05042 + SB06294 (
圖 44C)共轉導之NK細胞用於系列殺傷分析,其中在第一輪及第三輪細胞殺傷添加GRZ。當與HepG2共培養時,發現與huh7相比,在+/- GRZ (誘導IL12與否)之間有更大差異。
圖 44D顯示
圖 44A- 圖 44C中所示資料之組合。
實例 10 : GPC3 CAR / IL15 純系之選擇
藉由轉導已穩定整合表現構築體之NK細胞來實施純系之選擇。將較低MOI (MOI=3)用於SB06258之純系選擇。亦使用SB06258及SB07273 (與SB06258相同,但含有康黴素(kanamycin)抗性標記而非安比西林(ampicillin)抗性標記)實施對照瞬時轉導(MOI = 15)。在轉導後8天,評估細胞。與使用SB06258之瞬時轉導相比,PCB純系中每個細胞之拷貝較低(圖45A)。CAR表現在不同PCB純系(圖45B)中,以及在IL15+群體(圖45C)中相對恆定。PCB純系之經分泌IL15量測為大於30 pg/mL (圖45D)。
亦使用流式細胞術來評估GPC3 CAR及IL15於PCM純系中之表現。作為對照,將SB07473用於以MOI=15轉導NK細胞。以3.0之MOI轉導PCB純系。對於所有PCR純系而言,GPC3 CAR表現皆大於20% (圖46A)。
對於所選純系,亦將SB05042共轉導以評估在轉導後9天GPC3 CAR、膜結合IL15及膜結合IL12之表現。將純系3 (MOI=3.0)及純系4 (MOI=3.0)與SB05042 (MOI = 0.05)共轉導。在共轉導期間,GPC3 CAR及膜結合IL12有類似表現(圖46B)。
表 19顯示用SB06258轉導之PCB純系的表現水準之彙總。
表 19
表 20
表 21 :
表22:
解釋
PCB 純系 | ||||||||||
6258 | 7473 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 9 | 10 | |
拷貝數 | 19.8 | 3.9 | 8.88 | 6.2 | 10.7 | 14.4 | 7.9 | 9 | 12.1 | |
19.2 | 2.4 | 10.4 | 10.9 | 6.2 | ||||||
24.2 | 8.3 | 11.6 | 10.2 | |||||||
CAR % | 59.5 | 22.5 | 35.2 | 29 | 40.9 | 43.1 | 36.7 | 38.8 | 46.3 | |
59.5 | 16.5 | 46.8 | 41.5 | 31.6 | ||||||
75.1 | 37.1 | 46.8 | 54.6 | 44.8 | ||||||
memb-IL-15 | 32.7 | 9.23 | 15.2 | 13.4 | 18.8 | 20.1 | 15.4 | 16.1 | 21.6 | |
20.4 | 9.9 | 14.6 | 19.2 | 15.2 | ||||||
55.1 | 20.6 | 25.5 | 36.3 | 31.5 | ||||||
Sec-IL15 | 73.0 | 11.9 | 30.6 | 49.9 | 39.9 | 51.0 | 51.5 | 33.8 | ||
63.8 | 13.9 | 29.8 | 44.8 | 30.4 | 45.8 | 46.5 | 29.0 | |||
67.6 | 13.5 | 28.3 | 52.4 | 35.4 | 47.1 | 51.3 | 29.8 |
SEQ ID NO | 構築體 | 序列 |
326 | SB07472 | aagcttggaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgaggtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccgggGCCGCCACCATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAAGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCTGAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCCACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGATGTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTGGCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATTAGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttccatggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacgtccttctgctacgtcccttcggccctcaatccagcggaccttccttcccgcggcctgctgccggctctgcggcctcttccgcgtcttcgccttcgccctcagacgagtcggatctccctttgggccgcctccccgcctggagaattcgatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccggccgcttcgagcagacatgataagatacattgatgagtttggacaaaccacaactagaatgcagtgaaaaaaatgctttatttgtgaaatttgtgatgctattgctttatttgtaaccattataagctgcaataaacaagttaacaacaacaattgcattcattttatgtttcaggttcagggggagatgtgggaggttttttaaagcaagtaaaacctctacaaatgtggtaaaatcgataaggatcgggtacccgtgtat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327 | SB07473 | aagcttgGaattcgagcttgcatgcctgcaggtcgttacataacttacggtaaatggcccgcctggctgaccgcccaacgacccccgcccattgacgtcaataatgacgtatgttcccatagtaacgccaatagggactttccattgacgtcaatgggtggagtatttacggtaaactgcccacttggcagtacatcaagtgtatcatatgccaagtacgccccctattgacgtcaatgacggtaaatggcccgcctggcattatgcccagtacatgaccttatgggactttcctacttggcagtacatctacgtattagtcatcgctattaccatggtgatgcggttttggcagtacatcaatgggcgtggatagcggtttgactcacggggatttccaagtctccaccccattgacgtcaatgggagtttgttttggcaccaaaatcaacgggactttccaaaatgtcgtaacaactccgccccattgacgcaaatgggcggtaggcgtgtacggtgggaggtctatataagcagagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgattgactgagtcgcccgggtacccgtgtatccaataaaccctcttgcagttgcatccgacttgtggtctcgctgttccttgggagggtctcctctgagtgattgactacccgtcagcgggggtctttcatttgggggctcgtccgagatcgggagacccctgcccagggaccaccgacccaccaccgggaggtaagctggccagcaacttatctgtgtctgtccgattgtctagtgtctatgactgattttatgcgcctgcgtcggtactagttagctaactagctctgtatctggcggacccgtggtggaactgacgagttcggaacacccggccgcaaccctgggagacgtcccagggacttcgggggccgtttttgtggcccgacctgagtcctaaaatcccgatcgtttaggactctttggtgcaccccccttagaggagggatatgtggttctggtaggagacgagaacctaaaacagttcccgcctccgtctgaatttttgctttcggtttgggaccgaagccgcgccgcgcgtcttgtctgctgcagcatcgttctgtgttgtctctgtctgactgtgtttctgtatttgtctgaaaatatgggccccccctcgaggtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccgggGCCGCCACCATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCTCACATGGAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCTGGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCTGACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAATCTGGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGACATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGGCGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCCAGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGAGGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCTATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGCAATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGCTCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAACTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTTtaaggatccggattagtccaatttgttaaagacaggatgggctgcaggaattccgataatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactggtattcttaactatgttgctccttttacgctatgtggatacgctgctttaatgcctttgtatcatgctattgcttcccgtatggctttcattttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtcaggcaacgtggcgtggtgtgcactgtgtttgctgacgcaacccccactggttggggcattgccaccacctgtcagctcctttccgggactttcgctttccccctccctattgccacggcggaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctcggctgttgggcactgacaattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttccatggctgctcgcctgtgttgccacctggattctgcgcgggacgtccttctgctacgtcccttcggccctcaatccagcggaccttccttcccgcggcctgctgccggctctgcggcctcttccgcgtcttcgccttcgccctcagacgagtcggatctccctttgggccgcctccccgcctggagaattcgatatcagtggtccaggctctagttttgactcaacaatatcaccagctgaagcctatagagtacgagccatagataaaataaaagattttatttagtctccagaaaaaggggggaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcaataaaagagcccacaacccctcactcggggcgccagtcctccgattgactgagtcgcccggccgcttcgagcagacatgataagatacattgatgagtttggacaaaccacaactagaatgcagtgaaaaaaatgctttatttgtgaaatttgtgatgctattgctttatttgtaaccattataagctgcaataaacaagttaacaacaacaattgcattcattttatgtttcaggtt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catgattacgcc |
SB ID | 描述 | 骨架 | 序列類型 | SS | scFV | 連接體 | scFV | 鉸鏈 | TM | Co-stim ICD | CD3z ICD | E2A | SS | IL15 | 切割位點 | TM 結構域 | |
SB06251 | GM-CSF-Ra | hPY7 VL | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VH | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z | E2A/T2A | IgE | IL15 | LR1分割(split) N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | ||||
GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) | DNA | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGAT | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCT | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT | AGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | GGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | |||
SEQ ID NO | 217 | 221 | 224 | 330 | 227 | 235 | 270 | 278 | 282 | 214 | 286 | 288 | 331 | ||||
AA | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GGGGSGGGGSGGGGS | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | VAAILGLGLVLGLLGPLAIL | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | ||||
SEQ ID NO | 216 | 208 | 223 | 206 | 226 | 234 | 269 | 277 | 281 | 218 | 285 | 287 | 219 | ||||
SB06252 | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z | E2A/T2A | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | ||||
GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vH - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vL - CD8FA (鉸鏈) - CD8FA (TM) - CD28 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) | DNA | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | GGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | |||
SEQ ID NO | 217 | 222 | 332 | 333 | 229 | 243 | 268 | 280 | 282 | 214 | 286 | 288 | 331 | ||||
AA | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | GSG QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSG EGRGSLLTCGDVEENPGP | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | ||||
SEQ ID NO | 216 | 206 | 223 | 208 | 228 | 242 | 267 | 279 | 281 | 218 | 285 | 287 | 219 | ||||
SB06257 | GM-CSF-Ra | hPY7 VL | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VH | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z | E2A/T2A | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | ||||
GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) | SinVec | DNA | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGAT | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTG | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT | AGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | GGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | ||
SEQ ID NO | 217 | 221 | 224 | 330 | 227 | 245 | 270 | 278 | 282 | 214 | 286 | 288 | 331 | ||||
AA | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GGGGSGGGGSGGGGS | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | VAAILGLGLVLGLLGPLAILL | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | RVKFSRSADAPAY KQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | ||||
SEQ ID NO | 216 | 208 | 223 | 206 | 226 | 244 | 269 | 277 | 281 | 218 | 285 | 287 | 219 | ||||
SB06258 | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z | E2A/T2A | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | ||||
GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vH - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vL - CD8FA (鉸鏈) - CD8 (TM) - CD28 (ICD) - CD3z (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) | SinVec | DNA | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | GGTAGCGGCCAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | ||
SEQ ID NO | 217 | 330 | 224 | 221 | 229 | 243 | 268 | 280 | 282 | 214 | 286 | 288 | 331 | ||||
AA | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAY QQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGP GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | ||||
SEQ ID NO | 216 | 206 | 223 | 208 | 228 | 242 | 267 | 279 | 281 | 218 | 285 | 287 | 219 | ||||
SB06298 | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z mut | E2A/T2A | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | ||||
GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vH - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vL - CD8FA (鉸鏈) - CD8 (TM) - CD28 (ICD) - CD3z mut (ICD) - E2A T2A - IgE (SS) - IL-15 - Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) | SinVec | DNA | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | ||
SEQ ID NO | 217 | 222 | 332 | 333 | 229 | 243 | 268 | 334 | 284 | 214 | 286 | 288 | 331 | ||||
AA | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | ||||
SEQ ID NO | 216 | 206 | 223 | 208 | 228 | 242 | 267 | 277 | 283 | 218 | 285 | 287 | 219 | ||||
SB ID | 描述 | 骨架 | 序列類型 | SS | IL15 | 切割位點 | TM 結構域 | E2A | SS | scFV VL | 連接體 | scFV VH | 鉸鏈 | TM | Co-stim ICD | CD3z ICD |
SB06254 | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VL | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VH | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z | |||
IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z (ICD) | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGAT | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTG | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT | AGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | ||
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 284 | 217 | 221 | 224 | 330 | 227 | 245 | 270 | 278 | |||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GGGGSGGGGSGGGGS | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | VAAILGLGLVLGLLGPLAILL | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 283 | 216 | 208 | 223 | 206 | 226 | 244 | 269 | 277 | |||
SB06255 | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z | |||
IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8FA (鉸鏈) - CD8FA (TM) -CD28 (ICD) - CD3z (ICD) | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | ||
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 284 | 217 | 222 | 332 | 333 | 229 | 243 | 268 | 280 | |||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 283 | 216 | 206 | 223 | 208 | 228 | 242 | 267 | 279 | |||
SB06294 | IgE | IL15 | LR1分割N末端連接體+ Tace10 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VL | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VH | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z mut | |||
IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 S2L (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z mut (ICD) | RetroVec | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGATG | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTG | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT | AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC | |
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 284 | 217 | 221 | 224 | 330 | 352 | 245 | 270 | 334 | |||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GGGGSGGGGSGGGGS | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | VAAILGLGLVLGLLGPLAILL | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | RVKFSRSADAPAY KQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 283 | 216 | 208 | 223 | 206 | 226 | 244 | 269 | 277 | |||
SB06692 | IgE | IL15 | TaceOPT + LR1連接體 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VL | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VH | CD8 S2L | OX40 | OX40 | CD3z | |||
IgE (SS) - IL-15 - TaceOPT (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8 (鉸鏈) - OX40 (TM) - OX40 (ICD) - CD3z (ICD) | SinVec | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | CCCAGAGCCGAGGCTCTGAAAGGCGGATCAGGCGGCGGTGGTAGTGGAGGCGGAGGCTCAGGCGGCGGAGGTTCCGGAGGTGGCGGTTCCGGCGGAGGATCTCTTCAAT | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGTGGCGGAGGCGGATCT | GAAGTGCAGCTGGTTGAATCAGGTGGCGGCCTGGTTCAACCTGGCGGATCTCTGAGACTGAGCTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGATTCACCATCAGCCGGGACGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTATTATTGCGTGGCCGGCAACAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCTGCC | ACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCCTGCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCAGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGACTTCGCCTGTGAT | GTGGCCGCCATTCTCGGACTGGGACTTGTTCTGGGACTGCTGGGACCTCTGGCCATTCTGCTG | GCTCTGTATCTGCTGCGGAGGGACCAAAGACTGCCTCCTGATGCTCACAAGCCTCCAGGCGGAGGCAGCTTCAGAACCCCTATCCAAGAGGAACAGGCCGACGCTCACAGCACCCTGGCCAAGATT | AGAGTGAAGTTCAGCAGAAGCGCCGACGCACCCGCCTATAAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | |
SEQ ID NO | 214 | 286 | 292 | 331 | 284 | 217 | 221 | 224 | 330 | 227 | 245 | 270 | 278 | |||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | PRAEALKGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GGGGSGGGGSGGGGS | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | TTTPAPRPPTPAPTIALQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | VAAILGLGLVLGLLGPLAILL | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | RVKFSRSADAPAY KQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 289 | 219 | 283 | 216 | 208 | 223 | 206 | 226 | 244 | 269 | 277 | |||
SB06261 | IgE | IL15 | TaceOPT + LR1連接體 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z | |||
IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM) - E2A T2A - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8FA (鉸鏈) - CD8FA (TM) -CD28 (ICD) - CD3z (ICD) | SinVec | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | CAGTGTACCAACTACGCCCTGCTGAAACTGGCCGGCGACGTGGAATCTAATCCTGGACCTGGATCTGGCGAGGGACGCGGGAGTCTACTGACGTGTGGAGACGTGGAGGAAAACCCTGGACCT | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GGCGCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | |
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 284 | 217 | 222 | 332 | 333 | 229 | 243 | 268 | 280 | |||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | QCTNYALLKLAGDVESNPGPGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | GALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 283 | 216 | 206 | 223 | 208 | 228 | 242 | 267 | 279 | |||
SB05009 | IgE | IL15 | TaceOPT + LR1連接體 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | CD8FA | CD8FA | CD28 | CD3z | |||
(IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM)) (反向定向) - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8FA (鉸鏈) - CD8FA (TM) -CD28 (ICD) - CD3z (ICD) | SinVec | DNA | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | 無 | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA | GCCCTGAGCAACAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACCCCTGCTCCTAGACCTCCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCAGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCCTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACCCTGTACTGCAACCACCGG | CGGAGCAAGAGAAGCAGACTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCTAGACGGCCCGGACCTACCAGAAAGCACTACCAGCCTTACGCTCCTCCTAGAGACTTCGCCGCCTACCGGTCC | AGAGTGAAGTTCAGCAGATCCGCCGATGCTCCCGCCTATCAGCAGGGACAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAACCTGGGGAGAAGAGAAGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGGAGAGGCAGAGATCCTGAGATGGGCGGCAAGCCCAGACGGAAGAATCCTCAAGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAAGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGAATGAAGGGCGAGCGCAGAAGAGGCAAGGGACACGATGGACTGTACCAGGGCCTGAGCACCGCCACCAAGGATACCTATGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCAAGA | |
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 217 | 222 | 332 | 333 | 335 | 243 | 268 | 280 | ||||
AA | MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSG VTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | 無 | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | ALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCNHR | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | |||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 216 | 206 | 223 | 208 | 3 5 3 | 242 | 267 | 279 | ||||
SB05605 | IgE | IL15 | TaceOPT + LR1連接體 | B7-1 | E2A/T2A | GM-CSF-Ra | hPY7 VH | (GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223) | hPY7 VL | 鉸鏈CD8a | CD8FA | 41BB | CD3z | |||
(IgE (SS) - IL-15 Tace10 (切割位點) - B7-1 (TM)) (反向定向) - GM-CSF-Ra (SS) - aGPC3 hPY7 vL - (GGGGS)3 - aGPC3 hPY7 vH - CD8a (鉸鏈) - CD8 (TM) -41BB (ICD) - CD3z (ICD) | ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTTCTGGTGGCCGCTGCCACAAGAGTGCACAGC | AATTGGGTCAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACACTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCTAGCTGTAAAGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAAGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAAAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAATGTGACCGAGTCCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAATATCAAAGAGTTCCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACAAGC | TCTGGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGTTACACCCGAGCCTATCTTCAGCCTGATCGGAGGCGGTAGCGGAGGCGGAGGAAGTGGTGGCGGATCTCTGCAA | CTGCTGCCTAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGCTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTAGATGCAGAGAGCGGCGGAGAAACGAACGGCTGAGAAGAGAATCTGTGCGGCCCGTT | 無 | ATGCTGCTGCTGGTCACATCTCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCCCATCCTGCCTTTCTGCTGATCCCT | GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGACTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCACCTTCAACAAGAACGCCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTTGAATGGGTCGGACGGATCCGGAACAAGACCAACAACTACGCCACCTACTACGCCGACAGCGTGAAGGCCAGGTTCACCATCTCCAGAGATGACAGCAAGAACAGCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAAAACCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGCGTGGCCGGCAATAGCTTTGCCTACTGGGGACAGGGCACCCTGGTTACAGTTTCTGCT | GGCGGCGGAGGAAGCGGAGGCGGAGGATCCGGTGGTGGTGGATCT | GACATCGTGATGACACAGAGCCCCGATAGCCTGGCCGTGTCTCTGGGAGAAAGAGCCACCATCAACTGCAAGAGCAGCCAGAGCCTGCTGTACTCCAGCAACCAGAAGAACTACCTGGCCTGGTATCAGCAAAAGCCCGGCCAGCCTCCTAAGCTGCTGATCTATTGGGCCAGCTCCAGAGAAAGCGGCGTGCCCGATAGATTTTCTGGCTCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACAATTTCTAGCCTGCAAGCCGAGGACGTGGCCGTGTATTACTGCCAGCAGTACTACAACTACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG | ACCACCACACCAGCTCCTCGGCCACCAACTCCAGCTCCAACAATTGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCCGAAGCTTGTAGACCTGCTGCAGGCGGAGCCGTGCATACAAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGAC | ATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGTGTCTTGCTGCTGAGCCTGGTCATCACC | AAGCGGGGCAGAAAGAAGCTGCTGTACATCTTCAAGCAGCCCTTCATGCGGCCCGTGCAGACCACACAAGAGGAAGATGGCTGCAGCTGTCGGTTCCCCGAGGAAGAAGAAGGCGGCTGCGAGCTG | AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC | |||
SEQ ID NO | 214 | 286 | 288 | 331 | 217 | 222 | 332 | 336 | 337 | 338 | 339 | 334 | ||||
MDWTWILFLVAAATRVHS | NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS | SGGGGSGGGGSGVTPEPIFSLIGGGSGGGGSGGGSLQ | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | 無 | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA | GGGGSGGGGSGGGGS | DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK | TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT | KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL | RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | ||||
SEQ ID NO | 218 | 285 | 287 | 219 | 216 | 206 | 223 | 208 | 196 | 236 | 271 | 277 |
SB ID | 描述 | 骨架 | 序列類型 | TM 結構域 | 切割位點 | IL-12 | 合成啟動子 | 絕緣子 | 啟動子 | SynTF | |||
SB05042 | B7-1 | LR1分割N末端連接體+ CD16 TACE | IL12p70 | YB_TATA 4X ZF5 BD | A2 | SV40 | SV40 NLS | 微型VPR | NS3 | ZF5-7 DBD | |||
B7-1 (TM) - CD16 TACE (切割位點) - IL12 - YB_TATA ZFBD (合成啟動子) - A2 (絕緣子) - SV40 (啟動子) - Syn TF (NLS +微型VPR活化結構域+ NS3蛋白酶+ ZFBD DNA結合結構域) | SinVec | DNA | CTGCTGCCAAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGTTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTCGGTGCAGAGAGCGGAGAAGAAACGAACGGCTGCGGAGAGAATCTGTGCGGCCTGTG | AGCGGCGGAGGTGGTAGCGGAGGCGGAGGATCTGGAATTACACAGGGACTCGCCGTGTCTACAATCTCCAGCTTCTTTGGTGGCGGTAGTGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGTGGATCTCTTCAA | ATGTGTCACCAGCAGCTGGTCATCAGCTGGTTCAGCCTGGTGTTCCTGGCCTCTCCTCTGGTGGCCATCTGGGAGCTGAAGAAAGACGTGTACGTGGTGGAACTGGACTGGTATCCCGATGCTCCTGGCGAGATGGTGGTGCTGACCTGCGATACCCCTGAAGAGGACGGCATCACCTGGACACTGGATCAGTCTAGCGAGGTGCTCGGCAGCGGCAAGACCCTGACCATCCAAGTGAAAGAGTTTGGCGACGCCGGCCAGTACACCTGTCACAAAGGCGGAGAAGTGCTGAGCCACAGCCTGCTGCTGCTCCACAAGAAAGAGGATGGCATTTGGAGCACCGACATCCTGAAGGACCAGAAAGAGCCCAAGAACAAGACCTTCCTGAGATGCGAGGCCAAGAACTACAGCGGCCGGTTCACATGTTGGTGGCTGACCACCATCAGCACCGACCTGACCTTCAGCGTGAAGTCCAGCAGAGGCAGCAGTGATCCTCAGGGCGTTACATGTGGCGCCGCTACACTGTCTGCCGAAAGAGTGCGGGGCGACAACAAAGAATACGAGTACAGCGTGGAATGCCAAGAGGACAGCGCCTGTCCAGCCGCCGAAGAGTCTCTGCCTATCGAAGTGATGGTGGACGCCGTGCACAAGCTGAAGTACGAGAACTACACCTCCAGCTTTTTCATCCGGGACATCATCAAGCCCGATCCTCCAAAGAACCTGCAGCTGAAGCCTCTGAAGAACAGCAGACAGGTGGAAGTGTCCTGGGAGTACCCCGACACCTGGTCTACACCCCACAGCTACTTCAGCCTGACCTTTTGCGTGCAAGTGCAGGGCAAGTCCAAGCGCGAGAAAAAGGACCGGGTGTTCACCGACAAGACCAGCGCCACCGTGATCTGCAGAAAGAACGCCAGCATCAGCGTCAGAGCCCAGGACCGGTACTACAGCAGCTCTTGGAGCGAATGGGCCAGCGTGCCATGTTCTGGCGGAGGAAGCGGTGGCGGATCAGGTGGTGGATCTGGCGGCGGATCTAGAAACCTGCCTGTGGCCACTCCTGATCCTGGCATGTTCCCTTGTCTGCACCACAGCCAGAACCTGCTGAGAGCCGTGTCCAACATGCTGCAGAAGGCCAGACAGACCCTGGAATTCTACCCCTGCACCAGCGAGGAAATCGACCACGAGGACATCACCAAGGATAAGACCAGCACCGTGGAAGCCTGCCTGCCTCTGGAACTGACCAAGAACGAGAGCTGCCTGAACAGCCGGGAAACCAGCTTCATCACCAACGGCTCTTGCCTGGCCAGCAGAAAGACCTCCTTCATGATGGCCCTGTGCCTGAGCAGCATCTACGAGGACCTGAAGATGTACCAGGTGGAATTCAAGACCATGAACGCCAAGCTGCTGATGGACCCCAAGCGGCAGATCTTCCTGGACCAGAATATGCTGGCCGTGATCGACGAGCTGATGCAGGCCCTGAACTTCAACAGCGAGACAGTGCCCCAGAAGTCTAGCCTGGAAGAACCCGACTTCTACAAGACCAAGATCAAGCTGTGCATCCTGCTGCACGCCTTCCGGATCAGAGCCGTGACCATCGACAGAGTGATGAGCTACCTGAACGCCTCT | AATTAAcgggtttcgtaacaatcgcatgaggattcgcaacgcctttGAAGCAGTCGACGCCGAAgtcccgtctcagtaaaggttGAAGCAGTCGACGCCGAAgaatcggactgccttcgtatGAAGCAGTCGACGCCGAAggtatcagtcgcctcggaatGAAGCAGTCGACGCCGAAgattcgtaagaggctcactctcccttacacggagtggataACTAGTTCTAGAGGGTATATAATGGGGGCCAACGCGTACCGGTGTC | ACAATGGCTGGCCCATAGTAAATGCCGTGTTAGTGTGTTAGTTGCTGTTCTTCCACGTCAGAAGAGGCACAGACAAATTACCACCAGGTGGCGCTCAGAGTCTGCGGAGGCATCACAACAGCCCTGAATTTGAATCCTGCTCTGCCACTGCCTAGTTGAGACCTTTTACTACCTGACTAGCTGAGACATTTACGACATTTACTGGCTCTAGGACTCATTTTATTCATTTCATTACTTTTTTTTTCTTTGAGACGGAATCTCGCTCT | GTGTGTCAGTTAGGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCAGGTGTGGAAAGTCCCCAGGCTCCCCAGCAGGCAGAAGTATGCAAAGCATGCATCTCAATTAGTCAGCAACCATAGTCCCGCCCCTAACTCCGCCCATCCCGCCCCTAACTCCGCCCAGTTCCGCCCATTCTCCGCCCCATGGCTGACTAATTTTTTTTATTTATGCAGAGGCCGAGGCCGCCTCTGCCTCTGAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTGCAAA | ATGCCCAAGAAAAAGCGGAAGGTG | 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SEQ ID NO | 220 | 291 | 294 | 298 | 300 | 295 | 340 | 322 | 195 | 323 | |||
AA | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | SGGGGSGGGGSG ITQGLAVSTISSFFGGGSGGGGSGGGSLQ | MCHQQLVISWFSLVFLASPLVAIWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGSGGGSGGGSGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS | MPKKKRKV | DALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF | EDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQH | MSRPGERPFQCRICMRNFSNMSNLTRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSVLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSDPSNLARHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSSLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSQSGTLHRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSQRPNLTRHLRTHLRGS | ||||||
SEQ ID NO | 219 | 290 | 293 | 296 | 325 | 321 | 320 | ||||||
SB05058 | B7-1 | LR1分割N末端連接體+ CD16 TACE | IL12p70 | YB_TATA 4X ZF5 BD | A2 | SV40 | SV40 NLS | ZF5-7 DBD | NS3 | 微型VPR | |||
B7-1 (TM) - CD16 TACE (切割位點) - IL12 YB_TATA ZFBD (合成啟動子) - A2 (絕緣子) - SV40 (啟動子) - Syn TF (NLS + ZFBD DNA結合結構域+ NS3蛋白酶+微型VPR活化結構域) | SinVec | DNA | CTGCTGCCAAGCTGGGCCATCACACTGATCTCCGTGAACGGCATCTTCGTGATCTGTTGCCTGACCTACTGCTTCGCCCCTCGGTGCAGAGAGCGGAGAAGAAACGAACGGCTGCGGAGAGAATCTGTGCGGCCTGTG | AGCGGCGGAGGTGGTAGCGGAGGCGGAGGATCTGGAATTACACAGGGACTCGCCGTGTCTACAATCTCCAGCTTCTTTGGTGGCGGTAGTGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGTGGATCTCTTCAA | 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GAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGCAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTACCGGTACATCGGCAGCTCTGGCACAGGCTGTGTGGTCATCGTGGGCAGAATCGTGCTGTCTGGCAGCGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTATGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGAACCAGAACAATCGCCTCTCCTAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCTCTAGCGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCAC | 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SEQ ID NO | 220 | 291 | 294 | 298 | 300 | 295 | 340 | 323 | 195 | 322 | |||
AA | LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | SGGGGSGGGGSG ITQGLAVSTISSFFGGGSGGGGSGGGSLQ | MCHQQLVISWFSLVFLASPLVAIWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGSGGGSGGGSGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS | MPKKKRKV | MSRPGERPFQCRICMRNFSNMSNLTRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSVLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSDPSNLARHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDRSSLRRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSQSGTLHRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSQRPNLTRHLRTHLRGS | EDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQH | DALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF | ||||||
SEQ ID NO | 219 | 290 | 293 | 296 | 320 | 321 | 325 | ||||||
SB04599 | IL12p70 | YB_TATA 4X ZF10-1 BD | A2 | SFFV | SV40 NLS | ZF10-1 DBD | NS3 | 微型VPR | |||||
s IL12 YB_TATA ZFBD (合成啟動子) - A2 (絕緣子) - SV40 (啟動子) - Syn TF (NLS + ZFBD DNA結合結構域+ NS3蛋白酶+微型VPR活化結構域) | Lenti | DNA | ATGTGCCATCAGCAACTCGTCATCTCCTGGTTCTCCCTTGTGTTCCTCGCTTCCCCTCTGGTCGCCATTTGGGAACTGAAGAAGGACGTCTACGTGGTCGAGCTGGATTGGTACCCGGACGCCCCTGGAGAAATGGTCGTGCTGACTTGCGATACGCCAGAAGAGGACGGCATAACCTGGACCCTGGATCAGAGCTCCGAGGTGCTCGGAAGCGGAAAGACCCTGACCATTCAAGTCAAGGAGTTCGGCGACGCGGGCCAGTACACTTGCCACAAGGGTGGCGAAGTGCTGTCCCACTCCCTGCTGCTGCTGCACAAGAAAGAGGATGGAATCTGGTCCACTGACATCCTCAAGGACCAAAAAGAACCGAAGAACAAGACCTTCCTCCGCTGCGAAGCCAAGAACTACAGCGGTCGGTTCACCTGTTGGTGGCTGACGACAATCTCCACCGACCTGACTTTCTCCGTGAAGTCGTCACGGGGATCAAGCGATCCTCAGGGCGTGACCTGTGGAGCCGCCACTCTGTCCGCCGAGAGAGTCAGGGGAGACAACAAGGAATATGAGTACTCCGTGGAATGCCAGGAGGACAGCGCCTGCCCTGCCGCGGAAGAGTCCCTGCCTATCGAGGTCATGGTCGATGCCGTGCATAAGCTGAAATACGAGAACTACACTTCCTCCTTCTTTATCCGCGACATCATCAAGCCTGACCCCCCCAAGAACTTGCAGCTGAAGCCACTCAAGAACTCCCGCCAAGTGGAAGTGTCTTGGGAATATCCAGACACTTGGAGCACCCCGCACTCATACTTCTCGCTCACTTTCTGTGTGCAAGTGCAGGGAAAGTCCAAACGGGAGAAGAAAGACCGGGTGTTCACCGACAAAACCTCCGCCACTGTGATTTGTCGGAAGAACGCGTCAATCAGCGTCCGGGCGCAGGATAGATACTACTCGTCCTCCTGGAGCGAATGGGCCAGCGTGCCTTGTTCCGGTGGCGGATCAGGCGGAGGTTCAGGAGGAGGCTCCGGAGGAGGTTCCCGGAACCTCCCTGTGGCAACCCCCGACCCTGGAATGTTCCCGTGCCTACACCACTCCCAAAACCTCCTGAGGGCTGTGTCGAACATGTTGCAGAAGGCCCGCCAGACCCTTGAGTTCTACCCCTGCACCTCGGAAGAAATTGATCACGAGGACATCACCAAGGACAAGACCTCGACCGTGGAAGCCTGCCTGCCGCTGGAACTGACCAAGAACGAATCGTGTCTGAACTCCCGCGAGACAAGCTTTATCACTAACGGCAGCTGCCTGGCGTCGAGAAAGACCTCATTCATGATGGCGCTCTGTCTTTCCTCGATCTACGAAGATCTGAAGATGTATCAGGTCGAGTTCAAGACCATGAACGCCAAGCTGCTCATGGACCCGAAGCGGCAGATCTTCCTGGACCAGAATATGCTCGCCGTGATTGATGAACTGATGCAGGCCCTGAATTTCAACTCCGAGACTGTGCCTCAAAAGTCCAGCCTGGAAGAACCGGACTTCTACAAGACCAAGATCAAGCTGTGCATCCTGTTGCACGCTTTCCGCATTCGAGCCGTGACCATTGACCGCGTGATGTCCTACCTGAACGCCAGT | cgggtttcgtaacaatcgcatgaggattcgcaacgccttcGGCGTAGCCGATGTCGCGctcccgtctcagtaaaggtcGGCGTAGCCGATGTCGCGcaatcggactgccttcgtacGGCGTAGCCGATGTCGCGcgtatcagtcgcctcggaacGGCGTAGCCGATGTCGCGcattcgtaagaggctcactctcccttacacggagtggataACTAGTTCTAGAGGGTATATAATGGGGGCCA | ACAATGGCTGGCCCATAGTAAATGCCGTGTTAGTGTGTTAGTTGCTGTTCTTCCACGTCAGAAGAGGCACAGACAAATTACCACCAGGTGGCGCTCAGAGTCTGCGGAGGCATCACAACAGCCCTGAATTTGAATCCTGCTCTGCCACTGCCTAGTTGAGACCTTTTACTACCTGACTAGCTGAGACATTTACGACATTTACTGGCTCTAGGACTCATTTTATTCATTTCATTACTTTTTTTTTCTTTGAGACGGAATCTCGCTCT | gtaacgccattttgcaaggcatggaaaaataccaaaccaagaatagagaagttcagatcaagggcgggtacatgaaaatagctaacgttgggccaaacaggatatctgcggtgagcagtttcggccccggcccggggccaagaacagatggtcaccgcagtttcggccccggcccgaggccaagaacagatggtccccagatatggcccaaccctcagcagtttcttaagacccatcagatgtttccaggctcccccaaggacctgaaatgaccctgcgccttatttgaattaaccaatcagcctgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgcttcccgagctctataaaagagctcacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgacagactgagtcgcccggg | ATGCCCAAGAAGAAGCGGAAGGTT | TCCCGGCCTGGCGAGAGGCCTTTCCAGTGCAGAATCTGCATGCGGAACTTCAGCAGACGGCACGGCCTGGACAGACACACCAGAACACACACAGGCGAGAAACCCTTCCAGTGCCGGATCTGTATGAGAAATTTCAGCGACCACAGCAGCCTGAAGCGGCACCTGAGAACCCATACCGGCAGCCAGAAACCATTTCAGTGTAGGATATGCATGCGCAATTTCTCCGTGCGGCACAACCTGACCAGACACCTGAGGACACACACCGGGGAGAAGCCTTTTCAATGTCGCATATGCATGAGAAACTTCTCTGACCACTCCAACCTGAGCCGCCACCTCAAAACCCACACCGGCTCTCAAAAGCCCTTCCAATGTAGAATATGTATGAGGAACTTTAGCCAGCGGAGCAGCCTCGTGCGCCATCTGAGAACTCACACTGGCGAAAAGCCGTTTCAATGCCGTATCTGTATGCGCAACTTTAGCGAGAGCGGCCACCTGAAGAGACATCTGCGCACACACCTGAGAGGCAGC | GAGGATGTCGTGTGCTGCCACAGCATCTACGGAAAGAAGAAGGGCGACATCGACACCTATCGGTACATCGGCAGCAGCGGCACAGGCTGTGTTGTGATCGTGGGCAGAATCGTGCTGAGCGGCTCTGGAACAAGCGCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGGCCGTGTATCACGGCGCTGGCACAAGAACAATCGCCTCTCCAAAGGGCCCCGTGATCCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAAGGCAGCAGAAGCCTGACACCTTGCACCTGTGGCTCCAGCGATCTGTACCTGGTCACCAGACACGCCGACGTGATCCCTGTCAGAAGAAGAGGGGATTCCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGACCTCTGCTTTGTCCTGCTGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGACACTGACACACCCCATCACCAAGATCGACAGAGAGGTGCTGTACCAAGAGTTCGACGAGATGGAAGAGTGCAGCCAGCAC | GACGCTCTTGATGACTTTGACCTGGATATGCTCGGATCAGATGCCCTGGACGATTTCGATCTGGACATGTTGGGGTCTGATGCTCTCGACGACTTCGATCTGGATATGCTTGGAAGTGACGCGCTGGATGATTTCGACCTTGACATGCTCATCAATTCTCGATCCAGTGGAAGCCCGAAAAAGAAACGCAAGGTGGGAAGTGGGGGCGGCTCCGGTGGGAGCGGTAGTGTATTGCCTCAAGCTCCCGCGCCCGCTCCTGCTCCGGCAATGGTTTCAGCTCTGGCACAAGCTCCAGCTCCAGTGCCTGTGCTCGCCCCTGGCCCTCCGCAGGCCGTAGCACCTCCCGCCCCCAAACCGACGCAAGCCGGTGAGGGGACTCTCTCTGAAGCCTTGCTGCAGCTTCAGTTCGATGATGAAGATCTGGGCGCGCTCTTGGGGAACAGCACGGATCCGGCAGTATTTACGGACCTCGCATCAGTTGACAATAGTGAATTTCAACAACTTCTTAACCAGGGAATACCGGTTGCGCCCCATACGACGGAACCTATGCTGATGGAGTACCCTGAAGCTATAACCAGACTCGTAACTGGCGCCCAACGCCCGCCCGACCCGGCTCCTGCGCCGCTGGGTGCGCCGGGTCTTCCGAATGGTCTTCTCTCAGGGGACGAAGATTTCAGTTCCATTGCGGATATGGACTTTTCCGCGCTCCTGAGTGGGGGTGGCTCTGGAGGCTCTGGTTCCGACCTCAGCCATCCTCCACCGAGAGGACACCTCGACGAGCTGACAACCACCCTCGAAAGTATGACGGAAGATCTGAACTTGGATTCCCCCCTTACCCCAGAACTGAATGAAATCCTCGATACGTTCTTGAACGATGAGTGCCTTTTGCACGCCATGCATATATCAACAGGTTTGTCTATCTTCGACACGTCCCTCTTTTGA | |||
SEQ ID NO | 57 | 299 | 300 | 17 | 297 | 341 | 342 | 343 | |||||
AA | MCHQQLVISWFSLVFLASPLVAIWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGSGGGSGGGSGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS | MPKKKRKV | SRPGERPFQCRICMRNFSRRHGLDRHTRTHTGEKPFQCRICMRNFSDHSSLKRHLRTHTGSQKPFQCRICMRNFSVRHNLTRHLRTHTGEKPFQCRICMRNFSDHSNLSRHLKTHTGSQKPFQCRICMRNFSQRSSLVRHLRTHTGEKPFQCRICMRNFSESGHLKRHLRTHLRGS | EDVVCCHSIYGKKKGDIDTYRYIGSSGTGCVVIVGRIVLSGSGTSAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWAVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVTLTHPITKIDREVLYQEFDEMEECSQH | DALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLGSDALDDFDLDMLINSRSSGSPKKKRKVGSGGGSGGSGSVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSGGGSGGSGSDLSHPPPRGHLDELTTTLESMTEDLNLDSPLTPELNEILDTFLNDECLLHAMHISTGLSIFDTSLF | ||||||||
SEQ ID NO | 293 | 296 | 3 5 4 | 321 | 325 |
本文所揭示之所有參考文獻、專利及專利申請案皆關於其每一者所列舉之標的物以引用方式併入,其在一些情形中可涵蓋整個文件。
除非明確指示相反之情形,否則如本文在說明書中及在申請專利範圍中所用之不定冠詞「一(a及an)」應理解為意指「至少一」。
亦應理解,除非明確指示相反之情形,否則在本文所主張之包括超過一個步驟或動作之任何方法中,該方法之步驟或動作之順序不必受限於列舉該方法之步驟或動作之順序。
在申請專利範圍中以及在上文說明書中,所有過渡片語(諸如「包含」、「包括」、「攜載」、「具有」、「含有」、「涉及」、「固持」、「由...構成」及諸如此類)皆應理解為係開放式的,亦即,意指包括但不限於。僅過渡片語「由……組成」及「基本上由……組成」應分別係封閉式或半封閉式過渡片語,如美國專利局專利審查程序手冊(United States Patent Office Manual of Patent Examining Procedures)第2111.03節中所陳述。
圖 1圖解說明呈頭對頭方向性(
圖 1A)、頭對尾方向性(
圖 1B)、尾對尾方向性(
圖 1C)之細胞介素-CAR雙向構築體及例示性抗GPC3 CAR + IL15雙向構築體(
圖 1D)之示意圖。
圖 2提供藉由流式細胞術針對用編碼CAR + IL15雙向構築體之慢病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之慢病毒轉導之細胞所評估之CAR表現圖(第7天)。
圖 3提供藉由流式細胞術針對用編碼CAR + IL15雙向構築體之逆轉錄病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之逆轉錄病毒轉導之細胞所評估之CAR表現圖(第7天)。
圖 4提供藉由流式細胞術針對用編碼CAR + IL15雙向構築體之慢病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之慢病毒轉導之細胞所評估之CAR表現圖(第15天)。
圖 5提供藉由流式細胞術針對用編碼CAR + IL15雙向構築體之逆轉錄病毒轉導之細胞及用編碼僅CAR之逆轉錄病毒轉導之細胞所評估之CAR表現圖(第15天)。
圖 6提供藉由免疫分析針對用編碼CAR + IL15雙向構築體之慢病毒(「Lenti」)或編碼CAR + IL15雙向構築體之γ逆轉錄病毒(「SinVec」)轉導之NK細胞所評估之IL15水準。
圖 7提供如藉由共培養殺傷分析所評估的用編碼僅CAR或CAR + IL15雙向構築體之慢病毒轉導之NK細胞之殺傷。
圖 8提供如藉由共培養殺傷分析所評估的用編碼僅CAR或CAR + IL15雙向構築體之γ逆轉錄病毒轉導之NK細胞之殺傷。
圖 9圖解說明包括在3’非轉譯區中具有mRNA去穩定元件之IL12表現盒之雙向定向構築體的示意圖。
圖 10提供藉由免疫分析針對用包括誘導型IL12表現盒及編碼合成轉錄因子之表現盒之雙向構築體轉導之NK細胞所評估的IL12水準。
圖 11圖解說明編碼可切割釋放IL15之雙向構築體之示意圖。
圖 12提供所測試之IL15雙順反子構築體及在功能分析中之效能之彙總。
圖 13A及
圖 13B提供如藉由流式細胞術針對用SB06251、SB06257及SB06254轉導之NK細胞所評估的關於GPC3 CAR及IL15之表現圖。顯示兩個獨立重複(
圖 13A及
圖 13B)。
圖 14A及
圖 14B提供如藉由免疫分析針對用SB06251、SB06257及SB06254轉導之NK細胞所評估的經分泌IL15之水準。顯示兩個獨立重複(
圖 14A及
圖 14B)。
圖 15A及
圖 15B提供在與用SB06251、SB06257及SB06254轉導之NK細胞共培養後靶細胞群體之細胞生長。顯示兩個獨立重複(
圖 15A及
圖 15B)。
圖 16提供當與用SB06251、SB06257及SB06254轉導之NK細胞共培養時在系列殺傷分析中之靶細胞計數。
圖 17A及
圖 17B提供如藉由流式細胞術針對用SB06252、SB06258及SB06255轉導之NK細胞所評估的關於GPC3 CAR及IL15之表現圖。顯示兩個獨立重複(
圖 17A及
圖 17B)。
圖 18A及
圖 18B提供如藉由免疫分析針對用SB06252、SB06258及SB06255轉導之NK細胞所評估的經分泌IL15之水準。顯示兩個獨立重複(
圖 18A及
圖 18B)。
圖 19A及
圖 19B提供在與用SB06252、SB06258及SB06255轉導之NK細胞共培養後靶細胞群體之細胞生長。顯示兩個獨立重複(
圖 19A及
圖 19B)。
圖 20提供當與用SB06252、SB06258及SB06255轉導之NK細胞共培養時在系列殺傷分析中之靶細胞計數。
圖 21A及
圖 21B提供如藉由流式細胞術針對用雙順反子構築體SB06261、SB6294及SB6298轉導之NK細胞所評估的關於GPC3 CAR及IL15之表現圖。顯示兩個獨立重複(
圖 21A及
圖 21B)。
圖 22A及
圖 22B提供如藉由免疫分析針對用SB06261、SB6294及SB6298轉導之NK細胞所評估的經分泌IL15之水準。顯示兩個獨立重複(
圖 22A及
圖 22B)。
圖 23A及
圖 23B提供在與用SB06252、SB06258及SB06255轉導之NK細胞共培養後靶細胞群體之細胞生長。顯示兩個獨立重複(
圖 23A及
圖 23B)。
圖 24A及
圖 24B提供可切割釋放IL15雙順反子構築體SB06691、SB06692及SB06693之表徵。如藉由流式細胞術針對用SB06691、SB06692及SB06693轉導之NK細胞所評估的關於GPC3 CAR及IL15之表現圖示於
圖 24A 中。如藉由免疫分析針對用SB06691、SB06692及SB06693轉導之NK細胞所評估的經分泌IL15之水準示於
圖 24B 中。 圖 25圖解說明編碼可切割釋放IL12之雙向構築體之示意圖。
圖 26提供在用格拉瑞韋(GRZ)處理後NK細胞之IL12分泌之劑量-反應曲線。
圖 27A及
圖 27B提供展示在注射用SB04599、SB05042及SB05058轉導之NK細胞之後的小鼠血液中之IL12水準的活體內小鼠資料。IL12水準示於
圖 27A中且IL12倍數變化示於
圖 27B中。
圖 28A 至圖 28C提供用表現GPC3 CAR及IL15之不同構築體轉導的細胞之表徵。
圖 28A顯示展示用不同GPC3 CAR/IL15表現構築體轉導之NK細胞上之GPC3 CAR、膜結合IL15之表現及各別拷貝數的流式細胞術圖。
圖 28B顯示經分泌IL-15之量測結果。
圖 28C顯示如藉由系列殺傷分析所評估之HepG2之細胞殺傷。
圖 29A及
圖 29B提供使用所轉導NK細胞之系列殺傷之額外資料。
圖 29A顯示HepG2細胞之系列殺傷。
圖 29B顯示HuH-7細胞之系列殺傷。
圖 30A及
圖 30B提供使用快速擴增(G-Rex)評估所轉導NK細胞功能之資料。
圖 30A顯示GPC3 CAR、膜結合IL 15 (mIL15)及經分泌IL15 (sIL15)之表現。
圖 30B顯示所轉導NK細胞之系列殺傷。
圖 31提供來自如藉由生物發光成像所量測之異種移植腫瘤模型之結果,其中對小鼠注射NK細胞。
圖 32A及
圖 32B提供注射NK細胞之小鼠之異種移植腫瘤模型之結果及彙總。
圖 32A提供用NK細胞處理之小鼠之存活曲線。
圖 32B提供用NK細胞處理之小鼠之中值存活期之彙總。
圖 33提供評估注射NK細胞之小鼠之腫瘤減小的BLI實驗結果。
圖 34提供就正規化至第10天之BLI量測結果而言對各條件之定量。
圖 35A及
圖 35B提供來自異種移植腫瘤(HepG2)小鼠模型之結果,其中在研究過程中對小鼠注射NK細胞三次。
圖 35A提供使用BLI成像之小鼠之結果。
圖 35B提供在研究過程中BLI之倍數變化之時程。
圖 36A及
圖 36B提供注射所轉導NK細胞之小鼠之BLI的倍數變化。
圖 36A提供對應於在腫瘤植入後13天實施之量測之結果。
圖 36B提供對應於在腫瘤植入後20天實施之量測之結果。
圖 37A及
圖 37B提供異種移植模型中之腫瘤減小之結果。
圖 37A顯示兩種不同活體內實驗中之BLI倍數變化之彙總。
圖 37B顯示兩種不同活體內實驗中之正規化平均BLI倍數變化之彙總,但將治療組分開,且對動物進行個別地追蹤。
圖 38A及
圖 38B提供來自異種移植腫瘤模型之結果,其中經腫瘤內注射NK細胞。
圖 38A提供腫瘤體積之量測結果。
圖 38B顯示存活曲線。
圖 39A及
圖 39B提供在格拉瑞韋存在或缺失下IL-12之表現之結果。
圖 39A提供在用格拉瑞韋誘導後24小時濃度及倍數變化之量測結果。
圖 39B提供在誘導後72小時濃度及倍數變化之量測結果。
圖 40提供在整個實驗中在不同濃度下來自注射表現受調控IL12之NK細胞之小鼠的結果。
圖 41提供用IL-12及GPC3 CAR/IL15構築體共轉導至NK細胞中之表現(GPC3 CAR及IL15)結果。
圖 42A及
圖 42B提供在存在或缺失格拉瑞韋之情況下經分泌IL15及經分泌IL12表現之結果。
圖 42A提供經分泌IL15濃度之量測結果。
圖 42B提供經分泌IL12表現之量測結果。
圖 43提供在系列殺傷分析期間NK細胞之經分泌IL15及經分泌IL12之量測結果。
圖 44A- 圖 44D提供NK細胞中之不同共轉導針對Huh-7及HepG2細胞之細胞殺傷的系列殺傷分析結果。
圖 44A提供用SB05042 + SB06258共轉導之NK細胞之系列殺傷結果。
圖 44B提供用SB05042 + SB06257共轉導之NK細胞之系列殺傷結果。
圖 44C提供用SB05042 + SB06294共轉導之NK細胞之系列殺傷結果。
圖 44D提供
圖 44A- 圖 44C中之結果之組合。
圖 45A- 圖 45C提供來自表現GPC3 CAR之NK細胞之純系選擇之評估的結果。
圖 45A提供關於每個細胞之拷貝之結果。
圖 45B提供GCP3 CAR表現之結果。
圖 45C提供IL15表現之結果。
圖 45D提供經分泌IL15之量測結果。
圖 46A及
圖 46B提供用SB06258轉導的所選純系上GPC3 CAR及IL15表現之流式細胞術資料。
圖 46A提供所選純系之結果。
圖 46B提供進一步用SB05042 (IL12)轉導之所選純系之結果。
<![CDATA[<110> 美商聖堤生物科技股份有限公司(SENTI BIOSCIENCES, INC.)]]> <![CDATA[<120> 經武裝之嵌合受體及其使用方法]]> <![CDATA[<130> STB-029WO]]> <![CDATA[<140> TW 111122516]]> <![CDATA[<141> 2022-06-16]]> <![CDATA[<150> US 63/211,468]]> <![CDATA[<151> 2021-06-16]]> <![CDATA[<150> US 63/305,155]]> <![CDATA[<151> 2022-01-31]]> <![CDATA[<160> 354 ]]> <![CDATA[<170> PatentIn version 3.5]]> <![CDATA[<210> 1]]> <![CDATA[<211> 31]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 1]]> agagggtata taatggaagc tcgacttcca g 31 <![CDATA[<210> 2]]> <![CDATA[<211> 52]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 2]]> gggaatttcc ggggactttc cgggaatttc cggggacttt ccgggaattt cc 52 <![CDATA[<210> 3]]> <![CDATA[<211> 85]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 3]]> 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<![CDATA[<210> 130]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 130]]> Met Ser Pro Leu Leu Arg Arg Leu Leu Leu Ala Ala Leu Leu Gln Leu 1 5 10 15 Ala Pro Ala Gln Ala 20 <![CDATA[<210> 131]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 131]]> Met Asn Asn Leu Leu Cys Cys Ala Leu Val Phe Leu Asp Ile Ser Ile 1 5 10 15 Lys Trp Thr Thr Gln 20 <![CDATA[<210> 132]]> <![CDATA[<211> 23]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 132]]> Met Gln Met Ser Pro Ala Leu Thr Cys Leu Val Leu Gly Leu Ala Leu 1 5 10 15 Val Phe Gly Glu Gly Ser Ala 20 <![CDATA[<210> 133]]> <![CDATA[<211> 34]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 133]]> Met Ala Arg Ala Ala Leu Ser Ala Ala Pro Ser Asn Pro Arg Leu Leu 1 5 10 15 Arg Val Ala Leu Leu Leu Leu Leu Leu Val Ala Ala Gly Arg Arg Ala 20 25 30 Ala Gly <![CDATA[<210> 134]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> 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<![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 143]]> Glu Asp Val Val Pro Cys Ser Met Gly 1 5 <![CDATA[<210> 144]]> <![CDATA[<400> 144]]> 000 <![CDATA[<210> 145]]> <![CDATA[<211> 8]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 145]]> Glu Pro Leu Phe Ala Glu Arg Lys 1 5 <![CDATA[<210> 146]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 146]]> Tyr Val Ala Asp 1 <![CDATA[<210> 147]]> <![CDATA[<211> 5]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Ar]]>tificial Sequence) <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 147]]> Val Asp Val Ala Asp 1 5 <![CDATA[<210> 148]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 148]]> Asp Glu Val Asp 1 <![CDATA[<210> 149]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Ar]]>tificial Sequence) <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 149]]> Val Glu His Asp 1 <![CDATA[<210> 150]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 150]]> Leu Gly His Asp 1 <![CDATA[<210> 151]]> <![CDATA[<211> 5]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 151]]> Leu Gln Thr Asp Gly 1 5 <![CDATA[<210> 152]]> <![CDATA[<211> 8]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 152]]> Glu Val Asn Leu Asp Ala Glu Phe 1 5 <![CDATA[<210> 153]]> <![CDATA[<211> 7]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 153]]> Pro Gln Gly Ile Ala Gly Gln 1 5 <![CDATA[<210> 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<br/><![CDATA[ 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 173]]> gacattgatt attgactagt tattaatagt aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc 60 catatatgga gttccgcgtt acataactta cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca 120 acgacccccg cccattgacg tcaataatga cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga 180 ctttccattg acgtcaatgg gtggagtatt tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc 240 aagtgtatca tatgccaagt acgcccccta ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct 300 ggcattatgc ccagtacatg accttatggg actttcctac ttggcagtac atctacgtat 360 tagtcatcgc tattaccatg gtcgaggtga gccccacgtt ctgcttcact ctccccatct 420 cccccccctc cccaccccca attttgtatt tatttatttt ttaattattt tgtgcagcga 480 tgggggcggg gggggggggg gggcgcgcgc caggcggggc ggggcggggc gaggggcggg 540 gcggggcgag gcggagaggt gcggcggcag ccaatcagag cggcgcgctc cgaaagtttc 600 cttttatggc gaggcggcgg cggcggcggc cctataaaaa gcgaagcgcg cggcgggcg 659 <![CDATA[<210> 174]]> <![CDATA[<211> 251]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 174]]> tgtttgctgc ttgcaatgtt tgcccatttt agggtggaca caggacgctg tggtttctga 60 gccagggggc gactcagatc ccagccagtg gacttagccc ctgtttgctc ctccgataac 120 tggggtgacc ttggttaata ttcaccagca gcctcccccg ttgcccctct ggatccactg 180 cttaaatacg gacgaggaca gggccctgtc tcctcagctt caggcaccac cactgacctg 240 ggacagtgaa t 251 <![CDATA[<210> 175]]> <![CDATA[<211> 60]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 175]]> Phe Asn Val Leu Met Val His Lys Arg Ser His Thr Gly Glu Arg Pro 1 5 10 15 Leu Gln Cys Glu Ile Cys Gly Phe Thr Cys Arg Gln Lys Gly Asn Leu 20 25 30 Leu Arg His Ile Lys Leu His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Lys Cys His 35 40 45 Leu Cys Asn Tyr Ala Cys Gln Arg Arg Asp Ala Leu 50 55 60 <![CDATA[<210> 176]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 176]]> Pro Arg Ala Glu 1 <![CDATA[<210> 177]]> <![CDATA[<211> 3]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 177]]> Lys Gly Gly 1 <![CDATA[<210> 178]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (5)..(5)]]> <![CDATA[<223> Ala、Tyr、Pro、Ser或Phe]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (6)..(6)]]> <![CDATA[<223> Va、Leu、Ser、Ile、Tyr、Thr或Ala]]> <![CDATA[<400> 178]]> Pro Arg Ala Glu Xaa Xaa Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 179]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 179]]> Pro Arg Ala Glu Ala Val Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 180]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 180]]> Pro Arg Ala Glu Ala Leu Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 181]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 181]]> Pro Arg Ala Glu Tyr Ser Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 182]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 182]]> Pro Arg Ala Glu Pro Ile Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 183]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 183]]> Pro Arg Ala Glu Ala Tyr Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 184]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 184]]> Pro Arg Ala Glu Ser Ser Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 185]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 185]]> Pro Arg Ala Glu Phe Thr Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 186]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 186]]> Pro Arg Ala Glu Ala Ala Lys Gly Gly 1 5 <![CDATA[<210> 187]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 187]]> Asp Glu Pro His Tyr Ser Gln Arg Arg 1 5 <![CDATA[<210> 188]]> <![CDATA[<211> 10]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 188]]> Pro Pro Leu Gly Pro Ile Phe Asn Pro Gly 1 5 10 <![CDATA[<210> 189]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 189]]> Pro Leu Ala 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Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 194]]> Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 <![CDATA[<210> 195]]> <![CDATA[<211> 795]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 195]]> gaggatgtcg tgtgctgcca cagcatctac ggcaagaaga agggcgacat cgacacctac 60 cggtacatcg gcagctctgg cacaggctgt gtggtcatcg tgggcagaat cgtgctgtct 120 ggcagcggaa caagcgcccc tatcacagcc tatgctcagc agacaagagg cctgctgggc 180 tgcatcatca caagcctgac cggcagagac aagaaccagg tggaaggcga ggtgcagatc 240 gtgtctacag ctacccagac cttcctggcc acctgtatca atggcgtgtg ctgggccgtg 300 tatcacggcg ctggaaccag aacaatcgcc tctcctaagg gccccgtgat ccagatgtac 360 accaacgtgg accaggacct cgttggctgg cctgctcctc aaggcagcag aagcctgaca 420 ccttgcacct gtggctccag cgatctgtac ctggtcacca gacacgccga cgtgatccct 480 gtcagaagaa gaggggattc cagaggcagc ctgctgagcc ctagacctat cagctacctg 540 aagggctcta gcggcggacc tctgctttgt cctgctggac atgccgtggg cctgtttaga 600 gccgccgtgt gtacaagagg cgtggccaaa gccgtggact tcatccccgt ggaaaacctg 660 gaaaccacca tgcggagccc cgtgttcacc gacaattcta gccctccagc cgtgacactg 720 acacacccca tcaccaagat cgacagagag gtgctgtacc aagagttcga cgagatggaa 780 gagtgcagcc agcac 795 <![CDATA[<210> 196]]> <![CDATA[<211> 45]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 196]]> Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala 1 5 10 15 Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly 20 25 30 Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp 35 40 45 <![CDATA[<210> 197]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 197]]> Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Leu Gln 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 198]]> <![CDATA[<211> 14]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 198]]> Ile Thr Gln Gly Leu Ala Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Phe 1 5 10 <![CDATA[<210> 199]]> <![CDATA[<211> 5]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 199]]> Lys Asn Ala Met Asn 1 5 <![CDATA[<210> 200]]> <![CDATA[<211> 19]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 200]]> Arg Ile Arg Asn Lys Thr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser 1 5 10 15 Val Lys Ala <![CDATA[<210> 201]]> <![CDATA[<211> 6]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 201]]> Gly Asn Ser Phe Ala Tyr 1 5 <![CDATA[<210> 202]]> <![CDATA[<211> 17]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 202]]> Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Ser Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu 1 5 10 15 Ala <![CDATA[<210> 203]]> <![CDATA[<211> 7]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 203]]> Trp Ala Ser Ser Arg Glu Ser 1 5 <![CDATA[<210> 204]]> <![CDATA[<211> 9]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 204]]> Gln Gln Tyr Tyr Asn Tyr Pro Leu Thr 1 5 <![CDATA[<210> 205]]> <![CDATA[<211> 117]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 205]]> Glu Val Gln Leu Val Glu Thr Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Glu Gly 1 5 10 15 Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Asn 20 25 30 Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Arg Ile Arg Asn Lys Thr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp 50 55 60 Ser Val Lys Ala Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Gln Ser Met 65 70 75 80 Leu Tyr Leu Gln Met Asn Asn Leu Lys Ile Glu Asp Thr Ala Met Tyr 85 90 95 Tyr Cys Val Ala Gly Asn Ser Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 100 105 110 Val Thr Val Ser Ala 115 <![CDATA[<210> 206]]> <![CDATA[<211> 117]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 206]]> Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Asn 20 25 30 Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Gly Arg Ile Arg Asn Lys Thr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp 50 55 60 Ser Val Lys Ala Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser 65 70 75 80 Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr 85 90 95 Tyr Cys Val Ala Gly Asn Ser Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 100 105 110 Val Thr Val Ser Ala 115 <![CDATA[<210> 207]]> <![CDATA[<211> 113]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 207]]> Asp Ile Val Met Ser Gln Ser Pro Ser Ser Leu Val Val Ser Ile Gly 1 5 10 15 Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Ser 20 25 30 Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 35 40 45 Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Ser Arg Glu Ser Gly Val 50 55 60 Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 65 70 75 80 Ile Ser Ser Val Lys Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln 85 90 95 Tyr Tyr Asn Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu 100 105 110 Lys <![CDATA[<210> 208]]> <![CDATA[<211> 113]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 208]]> Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Ser 20 25 30 Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 35 40 45 Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Ser Arg Glu Ser Gly Val 50 55 60 Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 65 70 75 80 Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln 85 90 95 Tyr Tyr Asn Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile 100 105 110 Lys <![CDATA[<210> 209]]> <![CDATA[<211> 5]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 209]]> attta 5 <![CDATA[<210> 210]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 210]]> atttatttat ttatttattt a 21 <![CDATA[<210> 211]]> <![CDATA[<211> 19]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 211]]> ctgtttaata tttaaacag 19 <![CDATA[<210> 212]]> <![CDATA[<211> 51]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial ]]>Sequence) <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 212]]> atttatttat ttatttattt aacatcggtt ccctgtttaa tatttaaaca g 51 <![CDATA[<210> 213]]> <![CDATA[<211> 112]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 213]]> atttatttat ttatttattt aacatcggtt ccctgtttaa tatttaaaca gtgcggtaag 60 catttattta tttatttatt taacatcggt tccctgttta atatttaaac ag 112 <![CDATA[<210> 214]]> <![CDATA[<211> 54]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 214]]> atggactgga cctggatcct gtttctggtg gccgctgcca caagagtgca cagc 54 <![CDATA[<210> 215]]> <![CDATA[<211> 27]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 215]]> Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 10 15 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Leu Gln 20 25 <![CDATA[<210> 216]]> <![CDATA[<211> 22]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 216]]> Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro 1 5 10 15 Ala Phe Leu Leu Ile Pro 20 <![CDATA[<210> 217]]> <![CDATA[<211> 66]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 217]]> atgctgctgc tggtcacatc tctgctgctg tgcgagctgc cccatcctgc ctttctgctg 60 atccct 66 <![CDATA[<210> 218]]> <![CDATA[<211> 18]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 218]]> Met Asp Trp Thr Trp Ile Leu Phe Leu Val Ala Ala Ala Thr Arg Val 1 5 10 15 His Ser <![CDATA[<210> 219]]> <![CDATA[<211> 46]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 219]]> Leu Leu Pro Ser Trp Ala Ile Thr Leu Ile Ser Val Asn Gly Ile Phe 1 5 10 15 Val Ile Cys Cys Leu Thr Tyr Cys Phe Ala Pro Arg Cys Arg Glu Arg 20 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<![CDATA[<210> 222]]> <![CDATA[<211> 351]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 222]]> gaagtgcagc tggtggaatc tggcggagga ctggttcaac ctggcggctc tctgagactg 60 tcttgtgccg ccagcggctt caccttcaac aagaacgcca tgaactgggt ccgacaggcc 120 cctggcaaag gccttgaatg ggtcggacgg atccggaaca agaccaacaa ctacgccacc 180 tactacgccg acagcgtgaa ggccaggttc accatctcca gagatgacag caagaacagc 240 ctgtacctgc agatgaactc cctgaaaacc gaggacaccg ccgtgtacta ttgcgtggcc 300 ggcaatagct ttgcctactg gggacagggc accctggtta cagtttctgc t 351 <![CDATA[<210> 223]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 223]]> Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 224]]> <![CDATA[<211> 45]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400]]>> 224]]> <br/><![CDATA[ggcggcggag gatctggcgg aggtggaagt ggcggaggcg gatct 45 <![CDATA[<210> 225]]> <![CDATA[<400> 225]]> 000 <![CDATA[<210> 226]]> <![CDATA[<211> 45]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 226]]> Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala 1 5 10 15 Leu Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly 20 25 30 Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp 35 40 45 <![CDATA[<210> 227]]> <![CDATA[<211> 135]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 227]]> acaacaaccc ctgctcctag acctcctaca ccagctccta caatcgccct gcagcctctg 60 tctctgaggc cagaagcttg tagaccagct gctggcggag ccgtgcatac aagaggactg 120 gacttcgcct gtgat 135 <![CDATA[<210> 228]]> <![CDATA[<211> 67]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 228]]> Gly Ala Leu Ser Asn Ser Ile Met Tyr Phe Ser His Phe Val Pro Val 1 5 10 15 Phe Leu Pro Ala Lys Pro Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr 20 25 30 Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala 35 40 45 Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe 50 55 60 Ala Cys Asp 65 <![CDATA[<210> 229]]> <![CDATA[<211> 201]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 229]]> ggcgccctga gcaacagcat catgtacttc agccacttcg tgcccgtgtt tctgcccgcc 60 aagcctacaa caacccctgc tcctagacct cctacaccag ctcctacaat cgccagccag 120 cctctgtctc tgaggccaga agcttgtaga cctgctgcag gcggagccgt gcatacaaga 180 ggactggatt tcgcctgcga c 201 <![CDATA[<210> 230]]> <![CDATA[<211> 23]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 230]]> Val Ala Ile Ser Thr Ser Thr Val Leu Leu Cys Gly Leu Ser Ala Val 1 5 10 15 Ser Leu Leu Ala Cys Tyr Leu 20 <![CDATA[<210> 231]]> <![CDATA[<211> 69]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 231]]> gtggccatca gcacaagcac cgtgctgctg tgtggactgt ctgccgtttc tctgctggcc 60 tgctacctg 69 <![CDATA[<210> 232]]> <![CDATA[<211> 27]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 232]]> Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu 1 5 10 15 Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val 20 25 <![CDATA[<210> 233]]> <![CDATA[<211> 81]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 233]]> ttctgggtgc tcgtggttgt tggcggagtg ctggcctgtt actctctgct ggtcaccgtg 60 gccttcatca tcttttgggt c 81 <![CDATA[<210> 234]]> <![CDATA[<211> 20]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 234]]> Val Ala Ala Ile Leu Gly Leu Gly Leu Val Leu Gly Leu Leu Gly Pro 1 5 10 15 Leu Ala Ile Leu 20 <![CDATA[<210> 235]]> <![CDATA[<211> 62]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 235]]> gtggccgcca ttctcggact gggacttgtt ctgggactgc tgggacctct ggccattctg 60 ct 62 <![CDATA[<210> 236]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 236]]> Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu 1 5 10 15 Ser Leu Val Ile Thr 20 <![CDATA[<210> 237]]> <![CDATA[<211> 63]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 237]]> atctacatct gggcccctct ggctggaaca tgcggagtgt tgctgctgag cctggtcatc 60 acc 63 <![CDATA[<210> 238]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 238]]> Met Gly Leu Ala Phe Leu Val Leu Val Ala Leu Val Trp Phe Leu Val 1 5 10 15 Glu Asp Trp Leu Ser 20 <![CDATA[<210> 239]]> <![CDATA[<211> 63]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 239]]> atgggcctcg cctttctggt gctggtggcc cttgtgtggt tcctggtgga agattggctg 60 agc 63 <![CDATA[<210> 240]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 240]]> Phe Leu Val Ile Ile Val Ile Leu Ser Ala Leu Phe Leu Gly Thr Leu 1 5 10 15 Ala Cys Phe Cys Val 20 <![CDATA[<210> 241]]> <![CDATA[<211> 63]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 241]]> ttcctggtca tcatcgtgat cctgagcgcc ctgttcctgg gcaccctggc ctgtttttgc 60 gtg 63 <![CDATA[<210> 242]]> <![CDATA[<211> 27]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 242]]> Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu 1 5 10 15 Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Asn His Arg 20 25 <![CDATA[<210> 243]]> <![CDATA[<211> 81]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 243]]> atctacatct gggcccctct ggctggaaca tgtggtgtcc tgctgctgag cctggtcatc 60 accctgtact gcaaccaccg g 81 <![CDATA[<210> 244]]> <![CDATA[<211> 21]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 244]]> Val Ala Ala Ile Leu Gly Leu Gly Leu Val Leu Gly Leu Leu Gly Pro 1 5 10 15 Leu Ala Ile Leu Leu 20 <![CDATA[<210> 245]]> <![CDATA[<211>]]> 63 <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 245]]> gtggccgcca ttctcggact gggacttgtt ctgggactgc tgggacctct ggccattctg 60 ctg 63 <![CDATA[<210> 246]]> <![CDATA[<211> 42]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 246]]> Ala Ala Ala Ile Glu Val Met Tyr Pro Pro Pro Tyr Leu Asp Asn Glu 1 5 10 15 Lys Ser Asn Gly Thr Ile Ile His Val Lys Gly Lys His Leu Cys Pro 20 25 30 Ser Pro Leu Phe Pro Gly Pro Ser Lys Pro 35 40 <![CDATA[<210> 247]]> <![CDATA[<211> 126]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213]]>> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <br/> <br/><![CDATA[<220>]]> <br/><![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> <br/><![CDATA[ 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 247]]> gcagcagcta tcgaggtgat gtatcctccg ccctacctgg ataatgaaaa gagtaatggg 60 actatcattc atgtaaaagg gaagcatctt tgtccttctc cccttttccc cggtccgtct 120 aaacct 126 <![CDATA[<210> 248]]> <![CDATA[<211> 12]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 248]]> Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro 1 5 10 <![CDATA[<210> 249]]> <![CDATA[<211> 36]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 249]]> gaaagcaagt acggtccacc ttgccctagc tgtccg 36 <![CDATA[<210> 250]]> <![CDATA[<211> 12]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 250]]> Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Ala Pro Ser Ala Pro 1 5 10 <![CDATA[<210> 251]]> <![CDATA[<211> 36]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 251]]> gaatccaagt acggcccccc agcgcctagt gcccca 36 <![CDATA[<210> 252]]> <![CDATA[<211> 12]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 252]]> Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro 1 5 10 <![CDATA[<210> 253]]> <![CDATA[<211> 36]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 253]]> gaatctaaat atggcccgcc atgcccgcct tgccca 36 <![CDATA[<210> 254]]> <![CDATA[<211> 12]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 254]]> Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 1 5 10 <![CDATA[<210> 255]]> <![CDATA[<211> 36]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 255]]> gaaccgaagt cttgtgataa aactcatacg tgcccg 36 <![CDATA[<210> 256]]> <![CDATA[<211> 86]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 256]]> Ala Ala Ala Phe Val Pro Val Phe Leu Pro Ala Lys Pro Thr Thr Thr 1 5 10 15 Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro 20 25 30 Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val 35 40 45 His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro 50 55 60 Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu 65 70 75 80 Tyr Cys Asn His Arg Asn 85 <![CDATA[<210> 257]]> <![CDATA[<211> 258]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 257]]> gctgctgctt tcgtacccgt gttcctccct gctaagccta cgactacccc cgcaccgaga 60 ccacccacgc cagcacccac gattgctagc cagcccctta gtttgcgacc agaagcttgt 120 cggcctgctg ctggtggcgc ggtacatacc cgcggccttg attttgcttg cgatatatat 180 atctgggcgc ctctggccgg aacatgcggg gtcctcctcc tttctctggt tattactctc 240 tactgtaatc acaggaat 258 <![CDATA[<210> 258]]> <![CDATA[<211> 132]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 258]]> Ala Cys Pro Thr Gly Leu Tyr Thr His Ser Gly Glu Cys Cys Lys Ala 1 5 10 15 Cys Asn Leu Gly Glu Gly Val Ala Gln Pro Cys Gly Ala Asn Gln Thr 20 25 30 Val Cys Glu Pro Cys Leu Asp Ser Val Thr Phe Ser Asp Val Val Ser 35 40 45 Ala Thr Glu Pro Cys Lys Pro Cys Thr Glu Cys Val Gly Leu Gln Ser 50 55 60 Met Ser Ala Pro Cys Val Glu Ala Asp Asp Ala Val Cys Arg Cys Ala 65 70 75 80 Tyr Gly Tyr Tyr Gln Asp Glu Thr Thr Gly Arg Cys Glu Ala Cys Arg 85 90 95 Val Cys Glu Ala Gly Ser Gly Leu Val Phe Ser Cys Gln Asp Lys Gln 100 105 110 Asn Thr Val Cys Glu Glu Cys Pro Asp Gly Thr Tyr Ser Asp Glu Ala 115 120 125 Asp Ala Glu Cys 130 <![CDATA[<210> 259]]> <![CDATA[<211> 396]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 259]]> gcctgcccga ccgggctcta cactcatagc ggggaatgtt gtaaggcatg taacttgggt 60 gagggcgtcg cacagccctg cggagctaac caaacagtgt gcgaaccctg cctcgatagt 120 gtgacgttct ctgatgttgt atcagctaca gagccttgca aaccatgtac tgagtgcgtt 180 ggacttcagt caatgagcgc tccatgtgtg gaggcagatg atgcggtctg tcgatgtgct 240 tacggatact accaagacga gacaacaggg cggtgcgagg cctgtagagt ttgtgaggcg 300 ggctccgggc tggtgttttc atgtcaagac aagcaaaata cggtctgtga agagtgccct 360 gatggcacct actcagacga agcagatgca gaatgc 396 <![CDATA[<210> 260]]> <![CDATA[<211> 34]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 260]]> Ala Cys Pro Thr Gly Leu Tyr Thr His Ser Gly Glu Cys Cys Lys Ala 1 5 10 15 Cys Asn Leu Gly Glu Gly Val Ala Gln Pro Cys Gly Ala Asn Gln Thr 20 25 30 Val Cys <![CDATA[<210> 261]]> <![CDATA[<211> 102]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 261]]> gcctgcccta caggactcta cacgcatagc ggtgagtgtt gtaaagcatg caacctcggg 60 gaaggtgtag cccagccatg cggggctaac caaaccgttt gc 102 <![CDATA[<210> 262]]> <![CDATA[<211> 20]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequen]]>ce) <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 262]]> Ala Val Gly Gln Asp Thr Gln Glu Val Ile Val Val Pro His Ser Leu 1 5 10 15 Pro Phe Lys Val 20 <![CDATA[<210> 263]]> <![CDATA[<211> 60]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 263]]> gctgtgggcc aggacacgca ggaggtcatc gtggtgccac actccttgcc ctttaaggtg 60 <![CDATA[<210> 264]]> <![CDATA[<211> 279]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 264]]> Tyr Pro Pro Val Ile Val Glu Met Asn Ser Ser Val Glu Ala Ile Glu 1 5 10 15 Gly Ser His Val Ser Leu Leu Cys Gly Ala Asp Ser Asn Pro Pro Pro 20 25 30 Leu Leu Thr Trp Met Arg Asp Gly Thr Val Leu Arg Glu Ala Val Ala 35 40 45 Glu Ser Leu Leu Leu Glu Leu Glu Glu Val Thr Pro Ala Glu Asp Gly 50 55 60 Val Tyr Ala Cys Leu Ala Glu Asn Ala Tyr Gly Gln Asp Asn Arg Thr 65 70 75 80 Val Gly Leu Ser Val Met Tyr Ala Pro Trp Lys Pro Thr Val Asn Gly 85 90 95 Thr Met Val Ala Val Glu Gly Glu Thr Val Ser Ile Leu Cys Ser Thr 100 105 110 Gln Ser Asn Pro Asp Pro Ile Leu Thr Ile Phe Lys Glu Lys Gln Ile 115 120 125 Leu Ser Thr Val Ile Tyr Glu Ser Glu Leu Gln Leu Glu Leu Pro Ala 130 135 140 Val Ser Pro Glu Asp Asp Gly Glu Tyr Trp Cys Val Ala Glu Asn Gln 145 150 155 160 Tyr Gly Gln Arg Ala Thr Ala Phe Asn Leu Ser Val Glu Phe Ala Pro 165 170 175 Val Leu Leu Leu Glu Ser His Cys Ala Ala Ala Arg Asp Thr Val Gln 180 185 190 Cys Leu Cys Val Val Lys Ser Asn Pro Glu Pro Ser Val Ala Phe Glu 195 200 205 Leu Pro Ser Arg Asn Val Thr Val Asn Glu Ser Glu Arg Glu Phe Val 210 215 220 Tyr Ser Glu Arg Ser Gly Leu Val Leu Thr Ser Ile Leu Thr Leu Arg 225 230 235 240 Gly Gln Ala Gln Ala Pro Pro Arg Val Ile Cys Thr Ala Arg Asn Leu 245 250 255 Tyr Gly Ala Lys Ser Leu Glu Leu Pro Phe Gln Gly Ala His Arg Leu 260 265 270 Met Trp Ala Lys Ile Gly Pro 275 <![CDATA[<210> 265]]> <![CDATA[<211> 39]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 265]]> Lys Ser Arg Gln Thr Pro Pro Leu Ala Ser Val Glu Met Glu Ala Met 1 5 10 15 Glu Ala Leu Pro Val Thr Trp Gly Thr Ser Ser Arg Asp Glu Asp Leu 20 25 30 Glu Asn Cys Ser His His Leu 35 <![CDATA[<210> 266]]> <![CDATA[<211> 117]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 266]]> aagtccagac agacacctcc tctggccagc gtggaaatgg aagccatgga agctctgcct 60 gtgacctggg gcaccagctc cagagatgag gacctggaaa actgctccca ccacctg 117 <![CDATA[<210> 267]]> <![CDATA[<211> 41]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 267]]> Arg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met Thr 1 5 10 15 Pro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala 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ctgcctcctg atgctcacaa gcctccaggc 60 ggaggcagct tcagaacccc tatccaagag gaacaggccg acgctcacag caccctggcc 120 aagatt 126 <![CDATA[<210> 271]]> <![CDATA[<211> 42]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 271]]> Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met 1 5 10 15 Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe 20 25 30 Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu 35 40 <![CDATA[<210> 272]]> <![CDATA[<211> 126]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 272]]> aagcggggca gaaagaagct gctgtacatc ttcaagcagc ccttcatgcg gcccgtgcag 60 accacacaag aggaagatgg ctgctcctgc agattccccg aggaagaaga aggcggctgc 120 gagctg 126 <![CDATA[<210> 273]]> <![CDATA[<211> 25]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 273]]> Arg Lys Arg Thr Arg Glu Arg Ala Ser Arg Ala Ser Thr Trp Glu Gly 1 5 10 15 Arg Arg Arg Leu Asn Thr Gln Thr Leu 20 25 <![CDATA[<210> 274]]> <![CDATA[<211> 75]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 274]]> cggaagcgga caagagagag agccagcaga gcctctacct gggagggaag aagaaggctg 60 aacacccaga cactc 75 <![CDATA[<210> 275]]> <![CDATA[<211> 120]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 275]]> Trp Arg Arg Lys Arg Lys Glu Lys Gln Ser Glu Thr Ser Pro Lys Glu 1 5 10 15 Phe Leu Thr Ile Tyr Glu Asp Val Lys Asp Leu Lys Thr Arg Arg Asn 20 25 30 His Glu Gln Glu Gln Thr Phe Pro Gly Gly Gly Ser Thr Ile Tyr Ser 35 40 45 Met Ile Gln Ser Gln Ser Ser Ala Pro Thr Ser Gln Glu Pro Ala Tyr 50 55 60 Thr Leu Tyr Ser Leu Ile Gln Pro Ser Arg Lys Ser Gly Ser Arg Lys 65 70 75 80 Arg Asn His Ser Pro Ser Phe Asn Ser Thr Ile Tyr Glu Val Ile Gly 85 90 95 Lys Ser Gln Pro Lys Ala Gln Asn Pro Ala Arg Leu Ser Arg Lys Glu 100 105 110 Leu Glu Asn Phe Asp Val Tyr Ser 115 120 <![CDATA[<210> 276]]> <![CDATA[<211> 360]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 276]]> tggcgccgca agcggaaaga gaagcagtct gagacaagcc ccaaagagtt cctgaccatc 60 tacgaggacg tgaaggacct gaaaacccgg cggaaccacg agcaagagca gacctttcct 120 ggcggcggaa gcaccatcta cagcatgatc cagagccagt ctagcgcccc taccagccaa 180 gagcctgcct acacactgta ctccctgatc cagcctagca gaaagagcgg cagccggaag 240 agaaatcaca gccccagctt caacagcacg atctacgaag tgatcggcaa gagccagcca 300 aaggctcaga accctgccag gctgagccgg aaagagctgg aaaacttcga cgtgtacagc 360 <![CDATA[<210> 277]]> <![CDATA[<211> 112]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial S]]>equence) <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 277]]> Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly 1 5 10 15 Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr 20 25 30 Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys 35 40 45 Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys 50 55 60 Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg 65 70 75 80 Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala 85 90 95 Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 100 105 110 <![CDATA[<210> 278]]> <![CDATA[<211> 336]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 278]]> agagtgaagt tcagcagaag cgccgacgca cccgcctata agcagggaca gaaccagctg 60 tacaacgagc tgaacctggg gagaagagaa gagtacgacg tgctggacaa gcggagaggc 120 agagatcctg agatgggcgg caagcccaga cggaagaatc ctcaagaggg cctgtataat 180 gagctgcaga aagacaagat ggccgaggcc tacagcgaga tcggaatgaa gggcgagcgc 240 agaagaggca agggacacga tggactgtac cagggcctga gcaccgccac caaggatacc 300 tatgatgccc tgcacatgca ggccctgcct ccaaga 336 <![CDATA[<210> 279]]> <![CDATA[<211> 112]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 279]]> Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly 1 5 10 15 Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr 20 25 30 Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys 35 40 45 Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys 50 55 60 Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg 65 70 75 80 Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala 85 90 95 Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 100 105 110 <![CDATA[<210> 280]]> <![CDATA[<211> 336]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 280]]> agagtgaagt tcagcagatc cgccgatgct cccgcctatc agcagggaca gaaccagctg 60 tacaacgagc tgaacctggg gagaagagaa gagtacgacg tgctggacaa gcggagaggc 120 agagatcctg agatgggcgg caagcccaga cggaagaatc ctcaagaggg cctgtataat 180 gagctgcaga aagacaagat ggccgaggcc tacagcgaga tcggaatgaa gggcgagcgc 240 agaagaggca agggacacga tggactgtac cagggcctga gcaccgccac caaggatacc 300 tatgatgccc tgcacatgca ggccctgcct ccaaga 336 <![CDATA[<210> 281]]> <![CDATA[<211> 44]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 281]]> Gly Ser Gly Gln Cys Thr Asn Tyr Ala Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp 1 5 10 15 Val Glu Ser Asn Pro Gly Pro Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu 20 25 30 Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro 35 40 <![CDATA[<210> 282]]> <![CDATA[<211> 132]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 282]]> ggtagcggcc agtgtaccaa ctacgccctg ctgaaactgg ccggcgacgt ggaatctaat 60 cctggacctg gatctggcga gggacgcggg agtctactga cgtgtggaga 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gcagatgttc atcaacacaa gc 342 <![CDATA[<210> 287]]> <![CDATA[<211> 37]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 287]]> Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Val Thr Pro Glu 1 5 10 15 Pro Ile Phe Ser Leu Ile Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 20 25 30 Gly Gly Ser Leu Gln 35 <![CDATA[<210> 288]]> <![CDATA[<211> 111]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 288]]> tctggcggcg gaggatctgg cggaggtgga agcggagtta cacccgagcc tatcttcagc 60 ctgatcggag gcggtagcgg aggcggagga agtggtggcg gatctctgca a 111 <![CDATA[<210> 289]]> <![CDATA[<211> 36]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 289]]> Pro Arg Ala Glu Ala Leu Lys Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 20 25 30 Gly Ser Leu Gln 35 <![CDATA[<210> 290]]> <![CDATA[<211> 41]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<22]]>0>]]> <br/><![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> <br/><![CDATA[ 合成多肽 <![CDATA[<400> 290]]> Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ile Thr Gln Gly 1 5 10 15 Leu Ala Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Phe Gly Gly Gly Ser Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Leu Gln 35 40 <![CDATA[<210> 291]]> <![CDATA[<211> 123]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 291]]> agcggcggag gtggtagcgg aggcggagga tctggaatta cacagggact cgccgtgtct 60 acaatctcca gcttctttgg tggcggtagt ggcggcggtg gcagtggcgg tggatctctt 120 caa 123 <![CDATA[<210> 292]]> <![CDATA[<211> 109]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 292]]> cccagagccg aggctctgaa aggcggatca ggcggcggtg gtagtggagg cggaggctca 60 ggcggcggag gttccggagg tggcggttcc ggcggaggat ctcttcaat 109 <![CDATA[<210> 293]]> <![CDATA[<211> 541]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213]]>> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <br/> <br/><![CDATA[<220>]]> <br/><![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> <br/><![CDATA[ 合成多肽 <![CDATA[<400> 293]]> Met Cys His Gln Gln Leu Val Ile Ser Trp Phe Ser Leu Val Phe Leu 1 5 10 15 Ala Ser Pro Leu Val Ala Ile Trp Glu Leu Lys Lys Asp Val Tyr Val 20 25 30 Val Glu Leu Asp Trp Tyr Pro Asp Ala Pro Gly Glu Met Val Val Leu 35 40 45 Thr Cys Asp Thr Pro Glu Glu Asp Gly Ile Thr Trp Thr Leu Asp Gln 50 55 60 Ser Ser Glu Val Leu Gly Ser Gly Lys Thr Leu Thr Ile Gln Val Lys 65 70 75 80 Glu Phe Gly Asp Ala Gly Gln Tyr Thr Cys His Lys Gly Gly Glu Val 85 90 95 Leu Ser His Ser Leu Leu Leu Leu His Lys Lys Glu Asp Gly Ile Trp 100 105 110 Ser Thr Asp Ile Leu Lys Asp Gln Lys Glu Pro Lys Asn Lys Thr Phe 115 120 125 Leu Arg Cys Glu Ala Lys Asn Tyr Ser Gly Arg Phe Thr Cys Trp Trp 130 135 140 Leu Thr Thr Ile Ser Thr Asp Leu 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His His Ser Gln Asn Leu Leu Arg 355 360 365 Ala Val Ser Asn Met Leu Gln Lys Ala Arg Gln Thr Leu Glu Phe Tyr 370 375 380 Pro Cys Thr Ser Glu Glu Ile Asp His Glu Asp Ile Thr Lys Asp Lys 385 390 395 400 Thr Ser Thr Val Glu Ala Cys Leu Pro Leu Glu Leu Thr Lys Asn Glu 405 410 415 Ser Cys Leu Asn Ser Arg Glu Thr Ser Phe Ile Thr Asn Gly Ser Cys 420 425 430 Leu Ala Ser Arg Lys Thr Ser Phe Met Met Ala Leu Cys Leu Ser Ser 435 440 445 Ile Tyr Glu Asp Leu Lys Met Tyr Gln Val Glu Phe Lys Thr Met Asn 450 455 460 Ala Lys Leu Leu Met Asp Pro Lys Arg Gln Ile Phe Leu Asp Gln Asn 465 470 475 480 Met Leu Ala Val Ile Asp Glu Leu Met Gln Ala Leu Asn Phe Asn Ser 485 490 495 Glu Thr Val Pro Gln Lys Ser Ser Leu Glu Glu Pro Asp Phe Tyr Lys 500 505 510 Thr Lys Ile Lys Leu Cys Ile Leu Leu His Ala Phe Arg Ile Arg Ala 515 520 525 Val Thr Ile Asp Arg Val Met Ser Tyr Leu Asn Ala Ser 530 535 540 <![CDATA[<210> 294]]> <![CDATA[<211> 1623]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 294]]> atgtgtcacc agcagctggt catcagctgg ttcagcctgg tgttcctggc ctctcctctg 60 gtggccatct gggagctgaa gaaagacgtg tacgtggtgg aactggactg gtatcccgat 120 gctcctggcg agatggtggt gctgacctgc gatacccctg aagaggacgg catcacctgg 180 acactggatc agtctagcga ggtgctcggc agcggcaaga ccctgaccat ccaagtgaaa 240 gagtttggcg acgccggcca gtacacctgt cacaaaggcg gagaagtgct gagccacagc 300 ctgctgctgc tccacaagaa agaggatggc atttggagca ccgacatcct gaaggaccag 360 aaagagccca agaacaagac cttcctgaga tgcgaggcca agaactacag cggccggttc 420 acatgttggt ggctgaccac catcagcacc gacctgacct tcagcgtgaa gtccagcaga 480 ggcagcagtg atcctcaggg cgttacatgt ggcgccgcta cactgtctgc cgaaagagtg 540 cggggcgaca acaaagaata cgagtacagc gtggaatgcc aagaggacag cgcctgtcca 600 gccgccgaag agtctctgcc tatcgaagtg atggtggacg ccgtgcacaa gctgaagtac 660 gagaactaca cctccagctt tttcatccgg gacatcatca agcccgatcc tccaaagaac 720 ctgcagctga agcctctgaa gaacagcaga caggtggaag tgtcctggga gtaccccgac 780 acctggtcta caccccacag ctacttcagc ctgacctttt gcgtgcaagt gcagggcaag 840 tccaagcgcg agaaaaagga ccgggtgttc accgacaaga ccagcgccac cgtgatctgc 900 agaaagaacg ccagcatcag cgtcagagcc caggaccggt actacagcag ctcttggagc 960 gaatgggcca gcgtgccatg ttctggcgga ggaagcggtg gcggatcagg tggtggatct 1020 ggcggcggat ctagaaacct gcctgtggcc actcctgatc ctggcatgtt cccttgtctg 1080 caccacagcc agaacctgct gagagccgtg tccaacatgc tgcagaaggc cagacagacc 1140 ctggaattct acccctgcac cagcgaggaa atcgaccacg aggacatcac caaggataag 1200 accagcaccg tggaagcctg cctgcctctg gaactgacca agaacgagag ctgcctgaac 1260 agccgggaaa ccagcttcat caccaacggc tcttgcctgg ccagcagaaa gacctccttc 1320 atgatggccc tgtgcctgag cagcatctac gaggacctga agatgtacca ggtggaattc 1380 aagaccatga acgccaagct gctgatggac cccaagcggc agatcttcct ggaccagaat 1440 atgctggccg tgatcgacga gctgatgcag gccctgaact tcaacagcga gacagtgccc 1500 cagaagtcta gcctggaaga acccgacttc tacaagacca agatcaagct gtgcatcctg 1560 ctgcacgcct tccggatcag agccgtgacc atcgacagag tgatgagcta cctgaacgcc 1620 tct 1623 <![CDATA[<210> 295]]> <![CDATA[<211> 330]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 295]]> gtgtgtcagt tagggtgtgg aaagtcccca ggctccccag caggcagaag tatgcaaagc 60 atgcatctca attagtcagc aaccaggtgt ggaaagtccc caggctcccc agcaggcaga 120 agtatgcaaa gcatgcatct caattagtca gcaaccatag tcccgcccct aactccgccc 180 atcccgcccc taactccgcc cagttccgcc cattctccgc cccatggctg actaattttt 240 tttatttatg cagaggccga ggccgcctct gcctctgagc tattccagaa gtagtgagga 300 ggcttttttg gaggcctagg cttttgcaaa 330 <![CDATA[<210> 296]]> <![CDATA[<211> 8]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 296]]> Met Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val 1 5 <![CDATA[<210> 297]]> <![CDATA[<211> 24]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 297]]> atgcccaaga agaagcggaa ggtt 24 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<![CDATA[<211> 266]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 300]]> acaatggctg gcccatagta aatgccgtgt tagtgtgtta gttgctgttc ttccacgtca 60 gaagaggcac agacaaatta ccaccaggtg gcgctcagag tctgcggagg catcacaaca 120 gccctgaatt tgaatcctgc tctgccactg cctagttgag accttttact acctgactag 180 ctgagacatt tacgacattt actggctcta ggactcattt tattcatttc attacttttt 240 ttttctttga gacggaatct cgctct 266 <![CDATA[<210> 301]]> <![CDATA[<211> 763]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 301]]> Met Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu 1 5 10 15 Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu 20 25 30 Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp 35 40 45 Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Ile Asn Ser Arg Ser Ser 50 55 60 Gly Ser Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly 65 70 75 80 Gly Ser Gly Ser Val Leu Pro Gln Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro 85 90 95 Ala Met Val Ser Ala Leu Ala Gln Ala Pro Ala Pro Val Pro Val Leu 100 105 110 Ala Pro Gly Pro Pro Gln Ala Val Ala Pro Pro Ala Pro Lys Pro Thr 115 120 125 Gln Ala Gly Glu Gly Thr Leu Ser Glu Ala Leu Leu Gln Leu Gln Phe 130 135 140 Asp Asp Glu Asp Leu Gly Ala Leu Leu Gly Asn Ser Thr Asp Pro Ala 145 150 155 160 Val Phe Thr Asp Leu Ala Ser Val Asp Asn Ser Glu Phe Gln Gln Leu 165 170 175 Leu Asn Gln Gly Ile Pro Val Ala Pro His Thr Thr Glu Pro Met Leu 180 185 190 Met Glu Tyr Pro Glu Ala Ile Thr Arg Leu Val Thr Gly Ala Gln Arg 195 200 205 Pro Pro Asp Pro Ala Pro Ala Pro Leu Gly Ala Pro Gly Leu Pro Asn 210 215 220 Gly Leu Leu Ser Gly Asp Glu Asp Phe Ser Ser Ile Ala Asp Met Asp 225 230 235 240 Phe Ser Ala Leu Leu Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser Gly Ser Asp 245 250 255 Leu Ser His Pro Pro Pro Arg Gly His Leu Asp Glu Leu Thr Thr Thr 260 265 270 Leu Glu Ser Met Thr Glu Asp Leu Asn Leu Asp Ser Pro Leu Thr 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ttccgaatgg tcttctctca 660 ggggacgaag atttcagttc cattgcggat atggactttt ccgcgctcct gagtgggggt 720 ggctctggag gctctggttc cgacctcagc catcctccac cgagaggaca cctcgacgag 780 ctgacaacca ccctcgaaag tatgacggaa gatctgaact tggattcccc ccttacccca 840 gaactgaatg aaatcctcga tacgttcttg aacgatgagt gccttttgca cgccatgcat 900 atatcaacag gtttgtctat cttcgacacg tccctctttt ga 942 <![CDATA[<210> 344]]> <![CDATA[<211> 11]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (2)..(2)]]> <![CDATA[<223> Ala或Gln]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (3)..(3)]]> <![CDATA[<223> Asn或Ala]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (4)..(4)]]> <![CDATA[<223> Leu或Tyr]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (5)..(5)]]> <![CDATA[<223> Thr、Val、Met或Arg]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (6)..(6)]]> <![CDATA[<223> Arg或Lys]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (8)..(8)]]> <![CDATA[<223> Gly或Ala]]> <![CDATA[<400> 344]]> Ala Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Glu Leu Arg 1 5 10 <![CDATA[<210> 345]]> <![CDATA[<211> 6]]> <![CDATA[<212]]>> PRT]]> <br/><![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <br/> <br/><![CDATA[<220>]]> <br/><![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> <br/><![CDATA[ 合成多肽 <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<221> MOD_RES]]> <![CDATA[<222> (4)..(5)]]> <![CDATA[<223> 任何胺基酸]]> <![CDATA[<400> 345]]> Asp Ser Gly Xaa Xaa Ser 1 5 <![CDATA[<210> 346]]> <![CDATA[<211> 4]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人(Homo sapiens)]]> <![CDATA[<400> 346]]> Trp Arg Pro Trp 1 <![CDATA[<210> 347]]> <![CDATA[<211> 10]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 347]]> Gly Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser Gly Gly 1 5 10 <![CDATA[<210> 348]]> <![CDATA[<211> 17]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 348]]> Ala Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys 1 5 10 15 Ala <![CDATA[<210> 349]]> <![CDATA[<211> 18]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 349]]> Lys Glu Ser Gly Ser Val Ser Ser Glu Gln Leu Ala Gln Phe Arg Ser 1 5 10 15 Leu Asp <![CDATA[<210> 350]]> <![CDATA[<211> 14]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 350]]> Glu Gly Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr 1 5 10 <![CDATA[<210> 351]]> <![CDATA[<211> 837]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 351]]> taccctccag tgatcgtgga aatgaacagc agcgtggaag ccatcgaggg ctctcatgtg 60 tctctgctgt gtggcgccga cagcaatcct cctcctctgc tgacctggat gagagatggc 120 accgtgctga gagaagccgt ggccgaatct ctgctgctgg aactggaaga agtgacccct 180 gccgaggatg gcgtgtacgc ttgtctggcc gagaatgcct acggccagga caatagaacc 240 gtgggcctgt ccgtgatgta cgccccttgg aagcctaccg tgaacggcac aatggtggcc 300 gtggaaggcg agacagtgtc catcctgtgt agcacccaga gcaaccccga tcctatcctg 360 accatcttca aagagaagca gatcctgagc accgtgatct acgagagcga actgcagctc 420 gaactgcccg ctgtgtcccc agaggatgat ggcgaatatt ggtgcgtggc agagaaccag 480 tacggccaga gagccaccgc cttcaacctg agcgtggaat ttgctcccgt gctgctgctc 540 gagagccatt gtgctgccgc cagagatacc gtgcagtgcc tgtgtgtggt caagtctaac 600 cccgagccta gcgtggcctt tgagctgccc agcagaaacg tgaccgtgaa tgagagcgag 660 cgcgagttcg tgtacagcga gagatctgga ctggtgctga ccagcatcct gacactgaga 720 ggacaggctc aggcccctcc tagagtgatc tgcaccgcca gaaatctgta cggcgccaag 780 agcctggaac tgccatttca gggcgcccac agactcatgt gggccaagat tggacct 837 <![CDATA[<210> 352]]> <![CDATA[<211> 136]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多核苷酸 <![CDATA[<400> 352]]> acaacaaccc ctgctcctag acctcctaca ccagctccta caatcgccct gcagcctctg 60 tctctgaggc cagaagcttg tagaccagct gctggcggag ccgtgcatac aagaggactg 120 gacttcgcct gtgatg 136 <![CDATA[<210> 353]]> <![CDATA[<211> 66]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 353]]> Ala Leu Ser Asn Ser Ile Met Tyr Phe Ser His Phe Val Pro Val Phe 1 5 10 15 Leu Pro Ala Lys Pro Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro 20 25 30 Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys 35 40 45 Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala 50 55 60 Cys Asp 65 <![CDATA[<210> 354]]> <![CDATA[<211> 176]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列(Artificial Sequence)]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 人工序列之描述:]]> 合成多肽 <![CDATA[<400> 354]]> Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn 1 5 10 15 Phe Ser Arg Arg His Gly Leu Asp Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly 20 25 30 Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp His 35 40 45 Ser Ser Leu Lys Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Ser Gln Lys Pro 50 55 60 Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Val Arg His Asn Leu 65 70 75 80 Thr Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg 85 90 95 Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp His Ser Asn Leu Ser Arg His Leu 100 105 110 Lys Thr His Thr Gly Ser Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met 115 120 125 Arg Asn Phe Ser Gln Arg Ser Ser Leu Val Arg His Leu Arg Thr His 130 135 140 Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser 145 150 155 160 Glu Ser Gly His Leu Lys Arg His Leu Arg Thr His Leu Arg Gly Ser 165 170 175
Claims (15)
- 一種免疫反應性細胞,其包含: a) 第一經工程改造之核酸,其包含:第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼第一細胞介素之第二外源性多核苷酸序列;及 b) 第二經工程改造之核酸,其包含:第二表現盒,該第二表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼第二細胞介素之第三外源性多核苷酸序列,及第三表現盒,該第三表現盒包含第三啟動子,該第三啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第四外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域, 其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第三外源性多核苷酸序列之表現, 其中該第二外源性多核苷酸序列及該第三外源性多核苷酸序列中之至少一者編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式: S - C - MT或 MT - C - S其中 S包含包括該第一及/或第二細胞介素之可分泌效應分子, C包含蛋白酶切割位點,且 MT包含細胞膜系鏈結構域, 其中 S - C - MT或 MT - C - S經構形以表現為單一多肽, 視情況其中該第二表現盒之轉錄在該第一經工程改造之核酸內相對於該第三表現盒之轉錄以相反方向定向,且視情況其中該第二表現盒及該第三表現盒在該第二經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向。
- 如請求項1之免疫反應性細胞,其中: a) 該第一啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子,視情況其中該第一啟動子係選自由以下組成之群之組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb;及/或 b) 該第一外源性多核苷酸序列及該第二外源性多核苷酸序列係由連接體多核苷酸序列隔開,視情況其中該連接體多核苷酸序列與作為單獨多肽之該第一細胞介素及該CAR之轉譯可操作地締合,視情況其中該連接體多核苷酸序列編碼一或多個2A核糖體跳躍元件,視情況其中該一或多個2A核糖體跳躍元件各自選自由以下組成之群:P2A、T2A、E2A、F2A及其組合,視情況其中該一或多個2A核糖體跳躍元件包含E2A/T2A組合,視情況其中該E2A/T2A組合包含SEQ ID NO: 281之胺基酸序列;及/或 c) 該第三啟動子包含組成型啟動子、誘導型啟動子或合成啟動子,視情況其中該第三啟動子係選自由以下組成之群之組成型啟動子:CAG、HLP、CMV、EFS、SFFV、SV40、MND、PGK、UbC、hEF1aV1、hCAGG、hEF1aV2、hACTb、heIF4A1、hGAPDH、hGRP78、hGRP94、hHSP70、hKINb及hUBIb;及/或 d) 該第一細胞介素係IL-15,視情況其中該IL-15包含SEQ ID NO: 285之胺基酸序列,且該第二細胞介素係選自由以下組成之群:IL12、IL12p70融合蛋白、IL18及IL21,視情況其中該第二細胞介素係該IL12p70融合蛋白,視情況其中該IL12p70融合蛋白包含SEQ ID NO: 293之胺基酸序列。
- 如請求項1或2之免疫反應性細胞,其中: a) 該蛋白酶切割位點可由選自由以下組成之群之蛋白酶切割:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶(furin protease)、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶、MMP9蛋白酶及NS3蛋白酶;或 b) 該蛋白酶切割位點可由ADAM17蛋白酶切割;或 c) 該蛋白酶切割位點包含具有PRAE (SEQ ID NO:176)之胺基酸序列之第一區及/或該蛋白酶切割位點包含具有KGG (SEQ ID NO:177)之胺基酸序列之第二區,視情況其中該第一區位於該第二區之N末端;或 d) 該蛋白酶切割位點包含PRAEX1X2KGG (SEQ ID NO: 178)之胺基酸序列,其中X1係A、Y、P、S或F,且其中X2係V、L、S、I、Y、T或A;或 e) 該蛋白酶切割位點包含PRAEAVKGG (SEQ ID NO: 179)之胺基酸序列;或 f) 該蛋白酶切割位點包含PRAEALKGG (SEQ ID NO: 180)之胺基酸序列;或 g) 該蛋白酶切割位點包含PRAEYSKGG (SEQ ID NO: 181)之胺基酸序列;或 h) 該蛋白酶切割位點包含PRAEPIKGG (SEQ ID NO: 182)之胺基酸序列;或 i) 該蛋白酶切割位點包含PRAEAYKGG (SEQ ID NO: 183)之胺基酸序列;或 j) 該蛋白酶切割位點包含PRAESSKGG (SEQ ID NO: 184)之胺基酸序列;或 k) 該蛋白酶切割位點包含PRAEFTKGG (SEQ ID NO: 185)之胺基酸序列;或 l) 該蛋白酶切割位點包含PRAEAAKGG (SEQ ID NO: 186)之胺基酸序列;或 m) 該蛋白酶切割位點包含DEPHYSQRR (SEQ ID NO: 187)之胺基酸序列;或 n) 該蛋白酶切割位點包含PPLGPIFNPG (SEQ ID NO: 188)之胺基酸序列;或 o) 該蛋白酶切割位點包含PLAQAYRSS (SEQ ID NO: 189)之胺基酸序列;或 p) 該蛋白酶切割位點包含TPIDSSFNPD (SEQ ID NO: 190)之胺基酸序列;或 q) 該蛋白酶切割位點包含VTPEPIFSLI (SEQ ID NO: 191)之胺基酸序列;或 r) 該蛋白酶切割位點包含ITQGLAVSTISSFF (SEQ ID NO: 198)之胺基酸序列, 視情況其中該蛋白酶切割位點包含在肽連接體內, 視情況其中該蛋白酶切割位點在肽連接體之N末端,及/或 視情況其中該肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體。
- 如請求項1至3中任一項之免疫反應性細胞,其中: a) 該細胞膜系鏈結構域包含跨膜-細胞內結構域或跨膜結構域,視情況其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自PDGFR-β、CD8、CD28、CD3ζ鏈、CD4、4-1BB、OX40、ICOS、CTLA-4、PD-1、LAG-3、2B4、LNGFR、NKG2D、EpoR、TNFR2、B7-1或BTLA,視情況其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域源自B7-1,視情況其中該跨膜-細胞內結構域及/或跨膜結構域包含SEQ ID NO: 219之胺基酸序列;及/或 b) 該細胞膜系鏈結構域包含轉譯後修飾標籤、或能夠進行轉譯後修飾以修飾該嵌合蛋白以包括轉譯後修飾標籤之模體,其中該轉譯後修飾標籤能夠與細胞膜締合,視情況其中該轉譯後修飾標籤包含脂質錨結構域,視情況其中該脂質錨結構域係選自由以下組成之群:GPI脂質錨、肉豆蔻醯化標籤及棕櫚醯化標籤;及/或 c) 該細胞膜系鏈結構域包含細胞表面受體或其細胞膜結合部分;及/或 d) 該膜可切割嵌合蛋白之該細胞介素系鏈至該細胞之細胞膜;及/或 e) 其中該細胞進一步包含能夠切割該蛋白酶切割位點之蛋白酶,視情況其中該蛋白酶對於該細胞而言係內源性的,視情況其中該蛋白酶係選自由以下組成之群:1型跨膜蛋白酶、II型跨膜蛋白酶、GPI錨定蛋白酶、ADAM8蛋白酶、ADAM9蛋白酶、ADAM10蛋白酶、ADAM12蛋白酶、ADAM15蛋白酶、ADAM17蛋白酶、ADAM19蛋白酶、ADAM20蛋白酶、ADAM21蛋白酶、ADAM28蛋白酶、ADAM30蛋白酶、ADAM33蛋白酶、BACE1蛋白酶、BACE2蛋白酶、SIP蛋白酶、MT1-MMP蛋白酶、MT3-MMP蛋白酶、MT5-MMP蛋白酶、弗林蛋白酶、PCSK7蛋白酶、蛋白裂解酶蛋白酶、蛋白裂解酶-2蛋白酶及MMP9蛋白酶,視情況其中該蛋白酶係ADAM17蛋白酶,視情況其中該蛋白酶在該細胞之該細胞膜上表現,視情況其中該蛋白酶能夠切割該蛋白酶切割位點,視情況其中該蛋白酶切割位點之切割自該細胞之該細胞膜釋放該膜可切割嵌合蛋白之該細胞介素;及/或 f) 該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白;及/或 g) 該第一外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列,視情況其中該分泌信號肽源自選自由以下組成之群之蛋白:IL-12、胰蛋白酶原-2、高斯螢光素酶(Gaussia Luciferase)、CD5、IgKVII、VSV-G、泌乳素、血清白蛋白前蛋白原、天青殺素前蛋白原、骨結合素(BM40)、CD33、IL-6、IL-8、CCL2、TIMP2、VEGFB、骨保護素、絲胺酸蛋白酶抑制劑-E1、GROα、CXCL12、IL-21、CD8、GMCSFRa、NKG2D及IgE,視情況其中該分泌信號肽源自GMCSFRa,視情況其中該分泌信號肽包含SEQ ID NO: 216之胺基酸序列,視情況其中該分泌信號肽與該CAR可操作地締合;及/或 h) 該第二外源性多核苷酸序列進一步包含編碼分泌信號肽之多核苷酸序列,視情況其中該分泌信號肽源自選自由以下組成之群之蛋白:IL-12、胰蛋白酶原-2、高斯螢光素酶、CD5、IgKVII、VSV-G、泌乳素、血清白蛋白前蛋白原、天青殺素前蛋白原、骨結合素(BM40)、CD33、IL-6、IL-8、CCL2、TIMP2、VEGFB、骨保護素、絲胺酸蛋白酶抑制劑-E1、GROα、CXCL12、IL-21、CD8、GMCSFRa、NKG2D及IgE,視情況其中該分泌信號肽源自IgE,視情況其中該分泌信號肽包含SEQ ID NO: 218之胺基酸序列,視情況其中該分泌信號肽與該第一細胞介素可操作地締合;及/或 i) 該第三外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白;及/或 j) 該第二外源性多核苷酸序列編碼第一膜可切割嵌合蛋白,且該第三外源性多核苷酸序列編碼第二膜可切割嵌合蛋白。
- 如請求項1至4中任一項之免疫反應性細胞,其中: a) 該CAR包含抗原結合結構域,該抗原結合結構域包含重鏈可變(VH)區及輕鏈可變(VL)區, 其中該VH包含: 具有KNAMN (SEQ ID NO: 199)之胺基酸序列之重鏈互補決定區1 (CDR-H1)、 具有RIRNKTNNYATYYADSVKA (SEQ ID NO: 200)之胺基酸序列之重鏈互補決定區2 (CDR-H2)及 具有GNSFAY (SEQ ID NO: 201)之胺基酸序列之重鏈互補決定區3 (CDR-H3),且 其中該VL包含: 具有KSSQSLLYSSNQKNYLA (SEQ ID NO: 202)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區1 (CDR-L1)、 具有WASSRES (SEQ ID NO: 203)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區2 (CDR-L2)及 具有QQYYNYPLT (SEQ ID NO: 204)之胺基酸序列之輕鏈互補決定區3 (CDR-L3);及/或 b) 該VH區包含 EVQLVETGGGMVQPEGSLKLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVARIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSQSMLYLQMNNLKIEDTAMYYCVAGNSFA YWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 205)或EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNKNAMNWVRQAPGKGLEWVGRIRNKTNNYATYYADSVKARFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCVAGNSFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 206)之胺基酸序列;及/或 c) 該VH區包含SEQ ID NO: 206之胺基酸序列;及/或 d) 該VL區包含 DIVMSQSPSSLVVSIGEKVTMTCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASSRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYNYPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 207)或 DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQPPKLLIYWASSRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYNYPLTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 208)之胺基酸序列;及/或 e) 該VL區包含SEQ ID NO: 208之胺基酸序列, 視情況其中該抗原結合結構域包含單鏈可變片段(scFv), 視情況其中該VH及該VL係由肽連接體隔開, 視情況其中該肽連接體包含甘胺酸-絲胺酸(GS)連接體, 視情況其中該GS連接體包含(GGGGS)3 (SEQ ID NO: 223)之胺基酸序列, 視情況其中該scFv包含結構VH-L-VL或VL-L-VH,其中VH係該重鏈可變結構域,L係該肽連接體,且VL係該輕鏈可變結構域, 視情況其中該CAR包含一或多個細胞內傳訊結構域,且該一或多個細胞內傳訊結構域中之每一者係選自由以下組成之群:CD3ζ鏈細胞內傳訊結構域、CD97細胞內傳訊結構域、CD11a-CD18細胞內傳訊結構域、CD2細胞內傳訊結構域、ICOS細胞內傳訊結構域、CD27細胞內傳訊結構域、CD154細胞內傳訊結構域、CD8細胞內傳訊結構域、OX40細胞內傳訊結構域、4-1BB細胞內傳訊結構域、CD28細胞內傳訊結構域、ZAP40細胞內傳訊結構域、CD30細胞內傳訊結構域、GITR細胞內傳訊結構域、HVEM細胞內傳訊結構域、DAP10細胞內傳訊結構域、DAP12細胞內傳訊結構域、MyD88細胞內傳訊結構域、2B4細胞內傳訊結構域、CD16a細胞內傳訊結構域、DNAM-1細胞內傳訊結構域、KIR2DS1細胞內傳訊結構域、KIR3DS1細胞內傳訊結構域、NKp44細胞內傳訊結構域、NKp46細胞內傳訊結構域、FceRlg細胞內傳訊結構域、NKG2D細胞內傳訊結構域及EAT-2細胞內傳訊結構域, 視情況其中該一或多個細胞內傳訊結構域包含CD28細胞內傳訊結構域,其中該CD28細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 267之胺基酸序列, 視情況其中該一或多個細胞內傳訊結構域包含CD3z細胞內傳訊結構域,其中該CD3z細胞內傳訊結構域包含SEQ ID NO: 277或SEQ ID NO: 279之胺基酸序列, 視情況其中該CAR包含跨膜結構域,且該跨膜結構域係選自由以下組成之群:CD8跨膜結構域、CD28跨膜結構域、CD3ζ鏈跨膜結構域、CD4跨膜結構域、4-1BB跨膜結構域、OX40跨膜結構域、ICOS跨膜結構域、CTLA-4跨膜結構域、PD-1跨膜結構域、LAG-3跨膜結構域、2B4跨膜結構域、BTLA跨膜結構域、OX40跨膜結構域、DAP10跨膜結構域、DAP12跨膜結構域、CD16a跨膜結構域、DNAM-1跨膜結構域、KIR2DS1跨膜結構域、KIR3DS1跨膜結構域、NKp44跨膜結構域、NKp46跨膜結構域、FceRlg跨膜結構域及NKG2D跨膜結構域, 視情況其中該跨膜結構域係CD8跨膜結構域,其中該CD8跨膜結構域包含SEQ ID NO: 236或SEQ ID NO: 242之胺基酸序列, 視情況其中該CAR包含介於該抗原結合結構域與該跨膜結構域之間之間隔區,其中該間隔區源自選自由以下組成之群之蛋白:CD8、CD28、IgG4、IgG1、LNGFR、PDGFR-β及MAG,視情況其中該間隔區係包含SEQ ID NO: 226或SEQ ID NO: 228之胺基酸序列之CD8鉸鏈。
- 如請求項1至5中任一項之免疫反應性細胞,其中: a) 該ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中該轉錄效應物結構域包含轉錄活化劑結構域,視情況其中該轉錄活化劑結構域係選自由以下組成之群:單純疱疹病毒蛋白16 (VP16)活化結構域;包含VP16之四個串聯拷貝之活化結構域,即VP64活化結構域;NFκB之p65活化結構域;艾司坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus) R反式活化劑(Rta)活化結構域;包含VP64、p65及Rta活化結構域(VPR活化結構域)之三重活化劑;人類E1A相關蛋白p300之組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)核心結構域(p300 HAT核心活化結構域),視情況其中該轉錄活化劑結構域包括包含SEQ ID NO: 325之胺基酸序列之VPR活化結構域;及/或 b) 該DNA結合結構域包含鋅指(ZF)蛋白結構域,其中該ZF蛋白結構域在設計上係模組化的且包含鋅指模體陣列,視情況其中該ZF蛋白結構域包含1至10個鋅指模體之陣列,視情況其中該ZF蛋白結構域包含SEQ ID NO: 320之胺基酸序列;及/或 c) 該ACP進一步包含阻遏性蛋白酶及該阻遏性蛋白酶之一或多個同源切割位點,視情況其中該阻遏性蛋白酶係包含SEQ ID NO: 321之胺基酸序列之C型肝炎病毒(HCV)非結構蛋白3 (NS3),視情況其中該阻遏性蛋白酶之該同源切割位點包含NS3蛋白酶切割位點,該NS3蛋白酶切割位點包含NS3/NS4A、NS4A/NS4B、NS4B/NS5A或NS5A/NS5B接合部切割位點,視情況其中該NS3蛋白酶可被選自由以下組成之群之蛋白酶抑制劑阻遏:西美瑞韋(simeprevir)、達諾瑞韋(danoprevir)、阿舒瑞韋(asunaprevir)、西魯瑞韋(ciluprevir)、波普瑞韋(boceprevir)、索伐瑞韋(sovaprevir)、帕利瑞韋(paritaprevir)、替拉瑞韋(telaprevir)、格拉瑞韋(grazoprevir)、格卡瑞韋(glecaprevir)及伏西瑞韋(voxiloprevir),視情況其中該阻遏性蛋白酶之該一或多個同源切割位點定位於該DNA結合結構域與該轉錄效應物結構域之間;及/或 d) 該ACP進一步包含核定位信號(NLS),該NLS包含SEQ ID NO: 296之胺基酸序列;及/或 e) 該ACP進一步包含雌激素受體變異體ERT2之激素結合結構域;及/或 f) 該ACP反應性啟動子係合成啟動子,該合成啟動子包含ACP結合結構域序列及最小啟動子序列,視情況其中該ACP結合結構域序列包含一或多個鋅指結合位點。
- 如請求項1至6中任一項之免疫反應性細胞,其中: a) 該第一經工程改造之核酸包含SEQ ID NO: 309之核苷酸序列、SEQ ID NO: 326之核苷酸序列、SEQ ID NO: 310之核苷酸序列、SEQ ID NO: 327之核苷酸序列、SEQ ID NO: 314之核苷酸序列或SEQ ID NO: 315之核苷酸序列;且 b) 該第二經工程改造之核酸包含SEQ ID NO: 317之核苷酸序列或SEQ ID NO: 318之核苷酸序列。
- 如請求項1至7中任一項之免疫反應性細胞,其中該細胞係選自由以下組成之群:T細胞、CD8+ T細胞、CD4+ T細胞、γ-δT細胞、細胞毒性T淋巴球(CTL)、調控性T細胞、病毒特異性T細胞、自然殺手T (NKT)細胞、自然殺手(NK)細胞、B細胞、腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)、先天性淋巴樣細胞、肥大細胞、嗜酸性球、嗜鹼性球、嗜中性球、骨髓細胞、巨噬細胞、單核球、樹突細胞、紅血球、血小板細胞、人類胚胎幹細胞(ESC)、ESC源細胞、多潛能幹細胞、間質基質細胞(MSC)、誘導性多潛能幹細胞(iPSC)及iPSC源細胞, 視情況其中該細胞係自體的,或該細胞係同種異體的。
- 一種經工程改造之核酸,其包含: 第一表現盒,該第一表現盒包含第一啟動子,該第一啟動子可操作地連接至編碼結合至GPC3之嵌合抗原受體(CAR)之第一外源性多核苷酸序列及編碼IL15之第二外源性多核苷酸序列, 其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式: S - C - MT或 MT - C - S其中 S包含包括該IL15之可分泌效應分子, C包含蛋白酶切割位點,且 MT包含細胞膜系鏈結構域,且 其中 S - C - MT或 MT - C - S經構形以表現為單一多肽, 視情況其中該第一外源性多核苷酸序列及該第二外源性多核苷酸序列係由包含E2A/T2A核糖體跳躍元件之連接體多核苷酸序列隔開, 視情況其中該結合至GPC3之CAR包含CD28細胞內傳訊結構域, 視情況其中該經工程改造之核酸包含選自由以下組成之群之核苷酸序列:SEQ ID NO: 309、326、310、327、314及315。
- 一種經工程改造之核酸,其包含: 第一表現盒,該第一表現盒包含合成轉錄因子反應性啟動子,該合成轉錄因子反應性啟動子可操作地連接至編碼IL12p70融合蛋白之第一外源性多核苷酸序列,及 第二表現盒,該第二表現盒包含第二啟動子,該第二啟動子可操作地連接至編碼活化條件控制多肽(ACP)之第二外源性多核苷酸序列,其中該ACP包含合成轉錄因子,該合成轉錄因子包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域, 其中該ACP能夠藉由結合至ACP反應性啟動子來誘導該第一外源性多核苷酸序列之表現, 其中該第一外源性多核苷酸序列編碼膜可切割嵌合蛋白,該膜可切割嵌合蛋白自N末端至C末端定向,具有下式: S - C - MT或 MT - C - S其中 S包含包括該IL12p70融合蛋白之可分泌效應分子, C包含蛋白酶切割位點,且 MT包含細胞膜系鏈結構域,且 其中 S - C - MT或 MT - C - S經構形以表現為單一多肽, 視情況其中該第一表現盒及該第二表現盒在該第一經工程改造之核酸內以頭對頭方向性定向, 視情況其中該ACP包含DNA結合結構域及轉錄效應物結構域,其中該轉錄活化劑結構域包含VPR活化結構域, 視情況其中該經工程改造之核酸包含選自由SEQ ID No: 317及318組成之群之核苷酸序列。
- 一種表現載體,其包含如請求項9或10之經工程改造之核酸。
- 一種免疫反應性細胞,其包含如請求項9或10之經工程改造之核酸或如請求項11之表現載體。
- 一種醫藥組成物,該醫藥組成物包含如請求項1至8或12中任一項之免疫反應性細胞、如請求項9或10之經工程改造之核酸或如請求項11之表現載體及醫藥學上可接受之載劑、醫藥學上可接受之賦形劑或其組合。
- 一種在個體中刺激細胞介導的對腫瘤細胞之免疫反應、減小腫瘤體積或提供抗腫瘤免疫之方法,該方法包括向有需要之個體投與治療有效劑量之如請求項1至8或12中任一項之免疫反應性細胞、如請求項9或10之經工程改造之核酸、如請求項11之表現載體或如請求項13之醫藥組成物中之任一者, 視情況其中該腫瘤包含表現GPC3之腫瘤,視情況其中該腫瘤係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤(Wilms tumor))及卵黃囊瘤, 視情況其中該投與包括全身投與或腫瘤內投與, 視情況其中該免疫反應性細胞源自該個體,或就該個體而言係同種異體的。
- 一種治療患有癌症之個體之方法,該方法包括投與治療有效劑量之如請求項1至8或12中任一項之免疫反應性細胞、如請求項9或10之經工程改造之核酸、如請求項11之表現載體或如請求項13之醫藥組成物中之任一者, 視情況其中該癌症包含表現GPC3之癌症, 視情況其中該癌症係選自由以下組成之群:肝細胞癌(HCC)、卵巢透明細胞癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、肝胚細胞瘤、腎胚細胞瘤(威爾姆斯瘤)及卵黃囊瘤, 視情況其中該投與包括全身投與或腫瘤內投與, 視情況其中該免疫反應性細胞源自該個體,或就該個體而言係同種異體的。
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